TARIFNAMESISTEIN DEGISTIRILMIS ANTIKORLAR VE MBULUSUN ALANIBu bulus, sistein degistirilmis antikorlarla, bir sistein degistirilmis antikor ile bir ilaç moiyetesi arasinda olusturulan antikor-ilaç konjugatlariyla, antikor-ilaç konjugatlarmin farmasötik bilesimleri vetibbi kullaniin alanlariyla ilgilidir.BULUS HAKKINDA ON BILGIAntikor tedavisi, kanser, immünolojik bozukluklar ve anjiyogenik bozukluklar görülen hastalarin hedefli tedavi için bilinen ve kullanilan bir tedavi yöntemidir. Arastirmacilar, antikorlarla kanser tanisi ve tedavisi için etkin ve etkili selüler hedefleri kesfetmek amaciyla, kanseröz olmayan normal hücre(ler)e kiyasla kanser hücrelerinin yüzeyinde spesifik eksprese edilen transmembran ya da tümör-iliskili polieptidleri tanimlamaya çalismislardir. Bu tümör-iliskili hücre yüzeyi anti jen polipeptidlerinin, yani tümör iliskili anti jenlerin (TAA) tanimlanmasi, antikor-bazli tedaviler araciligiyla yikim için kanserhücrelerini spesifik hedefleme kabiliyetine yol açmistir.Kanser tedavisinde sitotoksik ya da sitostatik ajanlari, yani tümör hücrelerini Öldüren ya da hücrelerin çogalmasini inhibe eden ilaçlari lokal olarak uygulamak için kullanilan antikor-ilaç konjugatlari (ADC), Yani immünokonjugatlar (Lambert, J. (2005) Curr. Opinion in Pharmacology 5:543-549; Wu ve ark. (2005) Nature Biotechnology 23(9):1137-1146; Payne, G. (2003) Cancer Cell 3:207-212; Syrigos and Epenetos (1999) Anticancer Research 19:605-614;Niculescu- Duvaz and Springer (1997) AdV. Drug Deliv. ReV. 26:151- 172; 4.975.278 sayili ABD Patenti), teorik olarak, bir ilaç moietesinin spesifik olarak bir tümöre tasinmasina ve orada intraselüler olarak akümüle olmasina olanak saglarlar, konjuge edilmemis ilaçlarla yapilan sistemik uygulama ise, ortadan kaldirilinalari hedeflenen tümör hücrelerinin yani sira normal hücrelerin de kabul edilemez düzeyde toksisiteye inaruz kalinalarina sebep olabilir (Baldwin ve ark., Lancet (Mar. 15, 1986) sayfa 603-05; Thorpe (1985) "Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents 111 Cancer Therapy: A Review," in Monoclonal Antibodies '84: Biological And Clinical Applications A. Pinchera ve ark., (eds) sayfa 475-506). Minimum toksisiteyle maksimum etkinlik elde edilmeye çalisilmaktadir. ADC tasarlamak ve gelistirmek için gösterilen çabalarin odak noktasi, monoklonal antikorlarin (mAb11er) selektivitesi ve ilaç-baglama ve ilaç-salma özellikleridir (Lambert, J. (2005) Curr. Opinion in Pharmacology :543-549. Bu stratejiler kapsaminda hem poliklonal hem de monoklonal antikorlarla iyi sonuçlara erisildigi rapor edilmistir (Rowland ve ark., (1986) Cancer Iinmunol. Immunother., 21:183-87). Bu yöntemler kapsaminda kullanilan ilaçlar arasinda, daunomisin, doksorubisin, metotreksat ve Vindesin bulunur (bkz: yukarida atifyapilan Rowland ve ark., (1986)). Antikor-toksin konjugatlarindakullanilan toksinler arasinda, difteri toksini gibi bakteriyel toksinler, risin gibi bitkisel toksinler ve geldanamisin (Mandler ve ark (2000) J . Nat. Cancer Inst. 92(l9):1573-1581;Mandler ve ark (2000) Bioorganic & Med. Chem. Letters 10:1025-1028;Mand1er ve ark (2002) Bioconjugate Chein. 13:786-791), maytansinoidler (EP 1391213;Liu ve ark., (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:8618- 8623) ve kalikainisin (Lode ve ark (1998) Cancer Res. 58:2928;Hinman ve ark (1993) Cancer Res. 53:3336-3342) gibi küçük inoleküllü toksinler sayilabilir. Toksinler, sitotoksik ve sitostatik etkilerini, tübülin baglanimi, DNA baglanimi veya topoizomeraz inhibisyonu dahil olmak üzere muhtelif mekanizmalar araciligiyla ortaya koyabilirler. Bazi sitotoksik ilaçlar, büyük antikorlara veya protein reseptörü ligandlarina konjuge edildiklerindeinaktif olina veya daha az aktif olina egiliini gösterirler.Bir antikor-radyoizotop konjugati onaylanmistir. ZEVALIN® (ibritumomab tiuksetan, Biogen/Idec), normal ve malign B leiifositlerinin yüzeylerinde bulunan CD20 antijenine karsi yönlendirilmis bir fare IgGl kappa nionoklonal antikoru ve yani sira, bir tiyoüre baglayici-selatörle bagli li'In veya g'OY radyoizotopundan olusan bir antikor-radyoizotop konjugatidir (Wiseman ve ark (2000) Eur. Jour. Nucl. Med. 27(7):766-77; Wiseman ve ark (2002) Blood 99(12):4336-42; Witzig ve ark (2002) J. Clin. Oncol. 20(lO):2453- 63;Witzig ve ark (2002) J. Clin. Oncol. 20(15):3262-69). Her ne kadar ZEVALIN®, B-hücreli non-Hodgkin Lenfomasina (NHL) karsi etkinlige sahip olsa da, uygulamasi hastalarin çogunda siddetli ve uzun süreli sitopenilere yol açar. Kalikainisine bagli bir hu CD33antikorundan olusan bir antikor-ilaç konjugati olan MYLOTARGTM(gemtuzumab ozogamisin, Wyeth Pharmaceuticals), enjeksiyonla akut miyeloid lösemi tedavisi için 2000 senesinde onay alinistir (Drugs of the Future (2000) 25(7):686; 4970198; 5079233; 5585089; 5606040; 5693762; 5739116; 5767285 ve 5773001 sayili ABD Patentleri). Cantuzuinab mertansin (Immunogen, Inc), CanAg eksprese eden kolon, pankreas, gastrik ve benzeri kanser tiplerinin tedavisi için Faz II deney asainasina dogru giden ve disülfur baglayicisi SPP araciligiyla maytansinoid ilaç moietesi DMl "e (Xie ve ark (2004) J. of Pharm. and Exp. Ther. 308(3)21073-1082) baglanmis huC242 antikorundan olusan bir antikor-ilaç konjugatidir. MLN-2704 (Millennium Pharm., BZL Biologics, Immunogen 1110.), prostat tümörlerinin potansiyel tedavisi olarak gelistirilmekte olan ve maytansinoid ilaç inoietesi DMl"e baglanmis anti-prostat spesifik membran antijeni (PSMA) monoklonal antikorundan olusan birantikor-ilaç konjugatidir.Dolastatinin sentetik analoglari olan auristatin peptidleri auristatin E (AB) ve monometilauristatin (MMAE) ise (WO 02/088172), (i) kimerik monoklonal antikorlar cBR96°ya (karsinomlarda eksprese olan Lewis Y"yi hedef alir) ve (ii) (hematolojik malignitelerde eksprese olan CD30'u hedef alan cAClO"a (Klussman, ve ark (2004), Bioconjugate Chemistry 15(4):765-773;Doronina ve ark (2003) Nature Biotechnology 21(7):778-784; Francisco ve ark (2003) Blood 102(4):1458-1465;US 2004/0018194; (iii) CD20-eksprese eden kanserler ve immün bozukluklarin tedavisi için rituksan (WO 04/032828) gibi anti-CD20 antikorlarina; (iv) kolorektal kanserin tedavisi için anti-EphB2R antikorlari 2H9 ve anti-IL-8°e (Mao ve ark (2004) Cancer Research 64(3):781-788); (v) E-selektin antikoruna(Bhaskar ve ark (2003) Cancer Res. 63:6387-6394) ve (vi) baska anti- CD30 aiitikorlarina (WO 03/043583) konjuge edilmislerdir. Auristatin E varyantlari, US 5767237 ve US 6124431 numarali dokünianlarda açiklanmaktadir. Monoklonal antikorlara konjuge edilmis monometil auristatiii E, "Senter ve ark, Proceedings of the American Association for Cancer Research, Cilt 45, Abstrakt No 623, presented Mart 28, 2004" referansinda açiklanmaktadir. Auristatin analoglari MMAE ve MMAF, çesitli farkli antikorlara konjuge edilmistir (WO 2005/081711).Bir ilaç moiyetesinin bir antikora baglanmasi, yani kovalent baglarla baglanmasi için geleneksel araçlar, genelde, ilaç moiyetelerinin aiitikorun bir dizi bölgesinde baglandigi bir heterojen molekül karisimina yol açar. Ornegin, sitotoksik ilaçlar tipik olarak bir antikoruii siklikla çok sayida lizin artiklari vasitasiyla aiitikorlara konjuge edilerek bir heterojen antikor-ilaç konjugati karisimi olusturulmustur. Reaksiyon kosullarina bagli olarak, heterojen karisim tipik olarak 0'dan yaklasik 8°e kadar veya daha fazla bagli ilaç moiyetesine sahip bir antikor dagiliini içerir. Ilave olarak, belirli bir tamsayida ilaç moiyetesi/antikor oranina sahip her bir konjugat alt- grubu içinde, ilaç inoiyetesinin antikor üzerinde çesitli bölgelere baglandigi bir potansiyel heterojen karisim bulunur. Analitik ve preparatif yöntemler heterojen karisim içinde bir konjugat reaksiyonundaii kaynaklanan antikor-ilaç konjugati türü moleküllerini ayirmak ve karakterize etmek için yetersiz olabilir. Antikorlar büyük, karmasik ve yapisal olarak çesitli biyomoleküllerdir ve siklikla pek çok reaktif fonksiyonel gruba sahiptir. Bunlarin baglayici ajanlarla Veilaç baglayici ara ürünlerle reaktiviteleri pH, konsantrasyon, tuzkonsantrasyonu ve es çözücüler gibi faktörlere baglidir. Ayrica, çok kademeli konjugasyon prosesi, reaksiyon kosullarinin kontrolündeki ve reaktanlar ile ara ürünlerin karakterizasyonundaki güçlüklerdendolayi tekrarlanamayabilir.Sistein tiyoller, protonlanmis çogu aminin aksine nötr pH°ta reaktiftir ve pH 7 yakininda daha az nükleofiliktir. Serbest tiyol (RSH, sülfhidril) gruplari nispeten reaktif oldugundan, sistein artiklarina sahip proteinler genelde bunlarin oksidize formunda disülfûr bagli oligomerler olarak bulunur veya dahili köprülü disülfür gruplarina sahiptir. Ekstraselüler proteinler genelde serbest tiyollere sahip degildir (Garman, 1997, Non-Radioactive Labelling: A Practical Approach, Academic Press, London, sayfa 55). Bir proteindeki serbest tiyol miktari standart Ellman testiyle tahmin edilebilir. Immünoglobülin M bir disüliür-bagli pentamerine örnektir; immünoglobülin G ise alt-birimleri birbirine baglayan dahili disülfür köprülerine sahip bir proteine ömektir. Bu gibi proteinlerde, reaktif serbest tiyolü üretmek için disülfûr baglarinin ditiyotreitol (DTT) veya selenol gibi bir reaktifle indirgenmesi gerekir (Singh ve ark (2002) Anal. Biochem. 304:147-156). Bu yaklasim antikor tersiyer yapisindave anti jen baglama spesifisitesinde kayba yol açabilir.Antikor sistein tiyol gruplari genelde elektrofilik konjugasyon reaktiflerine dogru antikor amin veya hidroksil gruplarindan daha reaktiftir, yani daha nükleofiliktir. Sistein artiklari, ligandlara kovalent baglar olusturmak veya yeni intramoleküler disültür baglari olusturmak için genetik mühendislik teknikleriyle proteinlere dahil edilmistir (Better ve ark (1994) J. Biol. Chem. 13:9644-9650; Bemhard ve ark (1994) Bioconjugate Chem. 5:›126- 132; Greenwood ve ark (1994) Therapeutic Immunology 12247- 255; Tu ve ark (1999) Proc. Natl. Acad. Sci USA 96:4862- 4867; Karino ve ark (2000) J. of Biotechnology, 76:207-214; Chmura ve ark (2001) Proc. Nat. Acad. Sci. USA 98(15):8480-8484; US 6248564). Bununla birlikte, sistein tiyol gruplarinda, bir proteinin çesitli amino asit artiklarinin sistein amino asitlerine mutasyonuyla uygulanan mühendislik, özellikle eslestirilmemis (serbest Cys) artiklar veya reaksiyon ya da oksidasyon için nispeten erisilebilir olan artiklar durumunda olmak üzere potansiyel olarak problematiktir. E. coli periplazmasi, kültür süpernatanlari veya kismen ya da tamamen saflastirilmis olan protein olmak üzere proteinin konsantre çözeltilerinde, proteinin yüzeyindeki eslestirilmemis Cys artiklari, moleküller arasi disülfürleri ve dolayisiyla da protein dimerlerini veya multimerlerini olusturmak için eslestirilebilir ve oksidize olabilir. Disülfür dimer olusumu, bir ilaca, liganda veya baska bir etikete konjugasyon için yeni Cys"yi reaktif durumdan çikarir. Ayrica, protein, yeni tasarlanan Cys artigi ile mevcut Cys artigi arasinda oksidatif olarak bir intramoleküler disülfür bagi olusturursa, Cys gruplarinin ikisi de aktif bölge katilimi ve etkilesimi için kullanilamaz. Ayrica, protein, yanlis katlanma veya tersiyer yapi kaybiyla inaktif ya da non-spesifik hale getirilebilir (Zhang ve ark (2002) Anal. Biochem. 3ll:l-9).WO 2004/050849 numarali doküman, immünotoksinlerle ve onlarintümör tedavisinde kullanilmasiyla ilgilidir.WO 03/049704 numarali doküman, kanser tedavisi için kullanilacakantikorlarla ilgilidir.WO 03/060080 numarali doküman, kanin immünoglobulin degisken domainleri, kaninize antikorlar ve bunlari hazirlama ve kullanmaaaincina yönelik yöntemlerle ilgilidir.WO 94/06474 numarali doküman, Helicobacter pylori antikor tedavisiyle ilgilidir."Shopes B., 1993, Molecular Immunology, Elmsford, NY, US, 30(6): 603-609" referansi, tamamlayici araciligiyla sitolizi tamamen baslatan sinirli fleksibiliteye sahip bir genetigi degistirilmis insan lgG"siyleilgilidir."Hafner F. T. ve ark., 2000, Analytical Chemistry, 72(23): 5779- 5786" referansi, afinite probu kapiler elektroforeziyle feintomolar seviyede küçük analitlerin non-kompetitif immünoeseyiyle ve onun bir üniform-etiketli SCFV immünoreaktifi kullanilan digoksin dogrudananalizinde kullanimiyla ilgilidir."Renard M. ve ark., 2003, Journal of Molecular Biology, London, GB, 326(1): 167-175" referansi, reaktifsiz floresaii immünosens'orlerin tasariini için fonksiyonel verilerden topolojik kisitlamalarintüretilmesiyle ilgilidir."Corneillie T. M. ve ark., 2004, Bioconjugate Chemistry, 15(6): 1389- 1391" referansi, zayif elektrofilik metal kompleksler için artanafiniteye sahip monoklonal antikor 2D12.5"in bir G54C mutantiylailgilidir."Trail P. A. ve ark., 2003, Cancer Immunology, Immunotherapy: CII, 52(5): 328-337" referansi, kanserin hedefli tedavisi için monoklonalantikor ilaç immünokonjugatlariyla ilgilidir."Schelte P. ve ark., 2000, Bioconjugate Chemistry, ACS, Washington, DC, US, 11(1): 118-123" referansi, inaleiinid ve broinoasetil fonksiyonlarinin tiyollerle diferansiyel reaktivitesi ve onlarin lipozomal diepitop yapilari hazirlamak amaciyla uygulanmasiylailgilidir."Lyons A. ve ark., 1990, Proteiii Engineering, Oxford University Press, Surrey, GB, 3(8): 703-709" referansi, zincire sokulan yüzey sistein artiklari araciligiyla rekoinbinan antikorlara yere-özgübaglanmayla ilgilidir."Wright S.K. ve ark., 1998, Analytical Biochemsitry, 265(1): 8-14" referansi, proteinlerde sisteinlerin iniktar tayini için yöntemlerindegerlendirmesiyle ilgilidir.ÖZETBu dogrultuda, bir özellikte, bu bulus, 0,6 ile 1,0 araliginda bir tiyol reaktivitesi degerine ve SEKANS KOD NO.: 10, 11, 13, 14, 31, 34, 37, 38 ve 42 arasindan seçilen agir zincirde bir sekansa ve asagidaki sekanslara sahip bir veya daha fazla sayida serbest sistein amino asidiiçeren bir sistein degistirilmis antikora yönelik bir proses sunar:10NSLRCEDTAV (SEKANS KOD NO.: 10) LVTVCSASTKGPS (SEKANS KOD NO.: 11) LVTVSSCSTKGPS (SEKANS KOD NO.: 13) LVTVSSACTKGPS (SEKANS KOD NO.: 14) HEDPEVKFNWYVDGCEVHNAKTKPR (SEKANS KOD NO.: 31)YKCKVCNKALP (SEKANS KOD NO.: 34)KGFYPCDIAVE (SEKANS KOD NO.: 37)PPVLDCDGSFF (SEKANS KOD NO.: 38) GQGTLVTVSACSTKGPSVFPL (SEKANS KOD NO.: 42);burada, SEKANS KOD NO.: 10, 11, 13, 14, 31, 34, 37, 38 ve 42"de gösterilen sistein, serbest sistein amino asididir, ya da SEKANS KOD NO.: 17, 19, 20, 21, 22, 24, 25 ve 27 arasindan seçilen hafif zincirdebir sekans:SLSASCGDRVT (SEKANS KOD NO.: 17) EIKRTCAAPSV (SEKANS KOD NO.: 19) TCAAPCVFIFPP (SEKANS KOD NO.: 20) FIFPPCDEQLK (SEKANS KOD NO.: 21) DEQLKCGTASV (SEKANS KOD NO.: 22) WKVDNCLQSGN (SEKANS KOD NO.: 24) ALQSGCSQESV (SEKANS KOD NO.: 25) GLSSPCTKSFN (SEKANS KOD NO.: 27)burada, SEKANS KOD NO.: 17, 19, 20, 21, 22, 24, 25 ve 27"de gösterilen sistein, serbest sistein amino asididir; burada, sisteindegistirilmis antikor, bir insan antikoru, kimerik antikor ya da11hümanize antikordur.Baska bir yönde mevcut bulus, bir ilaç kisma baglanan mevcut bulusun bir sistein ile yapilandirilmis antikorunu (Ab) içeren birantikor-ilaç konjugat bilesigini saglar.Ilaç inoiyeteleri arasinda bir maytansinoit, bir auristatin, bir dolastatin, bir trikoteken, CC1065, bir kalikeainisin ve diger enedin antibiyotikleri, bir taksan, bir antrasiklin ve bunlarin stereoizomerleri, izosterleri, analoglari ya da türevleri bunlarla sinirli olmaksizin yeralir. Ornek ilaç moiyeteleri arasinda DMl , MMAE ve MMAF vardir.Formül 1 ile temsil edilen antikor-ilaç konjugati, bir albümin- baglanma peptidi (ABF) sekansi da içerebilir ve bilesim, Formül Ia iletemsil edilen bilesiine sahiptir:ABP-Ab-(L-D)p IaBu bulusun baska bir özelligi, bir sistein degistirilmis antikor ya da bir sistein degistirilmis antikor-ilaç kon jugati ve fizyolojik ya da farmakolojik açidan kabul edilebilir tasiyici ya da seyreltici içeren bir bilesimle ilgilidir. Terapötik kullanima yönelik bu bilesim sterildir veliyofilize edilebilir.Bu bulusun baska bir özelligi, burada açiklanan antikor-ilaç konjugatlarinin ve bilesimlerinin tibbi kullanimlarini kapsar. Farmasötik bilesimler, Formül 1 bilesikleri ile bir veya daha fazlasayida kemoterapötik a janin kombinasyonlarini kapsar.12Bazi özelliklerinde, bu bulus, Örnegin kanserin bir ErbB reseptörünün asiri-ekspresyonuyla karakterize edildigi durumlarda kanseri bir anti- ErbB antikorunun bir antikor-ilaç kon jugatini kullanarak tedavi etmekamaciyla antikor-ilaç kon jugatlarmin tibbi kullanimlarini kapsar.Alternatif ya da ek olarak, bu bulus, bulus konusu konjugatlarin, HER2 reseptörü ve EGF reseptöründen olusan gruptan seçilen bir büyüme faktörü reseptörünü asiri eksprese eden tümör hücrelerinin çogalmasini inhibe ederek kanseri tedavi etme amacina yönelik olan ve bir hastaya atif yapilan büyüme faktörü reseptörüne spesifik baglanan bir antikor-ilaç konjugati bilesigi ve bir kemoterapötik ajanuygulama basamagindan olusan tibbi kullanimlarini kapsar.Alternatif ya da ek olarak, bu bulus, bulus konusu konjugatlarin, bir insan kanser hastasini, örnegin ErbB2 reseptörü asiri-ekspresyonuyla karakterize edilen bir bozukluk oldugundan süphelenilen ya da böyle bir tani konulmus olan bir insan hastayi tedavi etme amacina yönelik olan ve bir antikor-ilaç koiijugati bilesigi ile bir kemoterapötik ajanin kombinasyonun etkin ve etkili miktarini uygulama basamagindanolusan tibbi kullanimlari kapsar.SEKILLERIN KISA TANIMISekil 1A, X-isini kristal koordinatlariyla türetilen hu4D5Fabv7 antikor fragmani üç boyutlu temsilini göstermektedir. Agir ve hafif zincirlerin degistirilmis Cys artiklarinin örneklerinin yapi pozisyonlari numaralandirilir (bir sirali numaralandirmasistemine göre).13Sekil 18, 4D5V7fabH için Kabat nuinaralandirma semasina (alt sira) kiyasla N-terminusundan baslayarak bir sirali numaralandirma semasini (üst sira) göstermektedir. Kabat numaralandirmasi insersiyonlari, a, b, c ile gösterilir.Sekil 2A ve Sekil 2B, BSA (içi bos çubuk), HER2 (çizgili çubuk) ya da streptavidinle (içi dolu çubuk) etkilesimler için PHESELECTOR eseyiyle hu4D5FabV8 ve hu4D5FabV8 Cys mutanti (ThioFab) faj varyantlari olan (A) biyotinlenmemis faj- hu4D5FabV8 ve (B) biyotinlenmis faj-hu4D5FabV8 (B),nin 450 nm°de absorbans belirlemesiyle birlikte baglanma ölçümlerini göstermektedir.Sekil 3A ve Sekil 33, BSA (içi bos çubuk), HER2 (çizgili çubuk) ya da streptavidirile (içi dolu çubuk) etkilesimler için PHESELECTOR eseyiyle hu4D5FabV8 (sol) ve hu4D5FabV8 Cys mutanti (ThioFab) varyantlari olan (A) biyotinlenmemis faj-hu4D5Fabv8 ve (B) biyotinleninis faj-hu4D5FabV8"in 450 nm"de absorbans belirlemesiyle birlikte baglanma ölçümlerini göstermektedir. Hafif zincir varyantlari sol tarafta gösterilmektedir ve agir zincir varyantlari sag tarafta gösterilmektedir. Tiyol reaktivitesi = streptavidin baglanmasi için OD450 nm + HER2 (antikor) baglanmasi için OD450 nmSekil 4A, yabani tip hu4D5FabV8"de bulunan artiklarin Fraksiyonel Yüzey Erisilebilirlik degerlerini göstermektedir. Hafif zincir yerleri sol tarafta gösterilmektedir ve agir zincir yerleri sag tarafta gösterilmektedir.Sekil 4B, HER2 (gün 2), streptavidin (SA) (gün 2), HER2 (gün 4) ve SAiyla (gün 4) etkilesimler için biyotinlenmis hu4D5FabV8 (sol) ve hu4D5Fabv8 Cys mutanti (ThioFab)14varyantlarinin 450 nm"de absorbans belirlemesiyle birlikte baglanma ölçümlerini göstermektedir. Faj-hu4D5FabV8 Cys varyantlari izole edildi ve 4°C sicaklikta saklandi. Biyotin konjugasyonu 2. günde ya da 4. günde gerçeklestirildi ve ardindan, Ornek 2"de tarif edildigi gibi Her2 ve streptavidinle etkilesimlerini izlemek ve degistirilmis ThioFab varyantlarinda reaktif tiyol gruplarinin stabilitesini derinlemesine incelemek için PHESELECTOR analizleri yapildi.Sekil 5, streptavidin ve HER2"ye baglanma için, biyotin- maleiinid konjuge-hu4D5FabV8 (A'121C) ve biyotinlenmemis yabani tip hu4D5FabV83in 450 nm"de absorbans belirleinesiyle birlikte baglanma ölçümlerini göstermektedir. Her bir Fab, 2 ng ve 20 ng°de test edildi.Sekil 6, tavsan albümini, streptavidin (SA) ve HER2°yle baglanma için, biyotinlenmis ABP-hu4DSFabV8 yabani tip (wt) ve ABP-hu4D5FabV8 sistein inutantlari V1 lOC ve A121C7nin 450 nm'de absorbans belirlemesiyle birlikte ELISA analizi sonuçlarini göstermektedir.Sekil 7, tavsan albümini, HER2 ve streptavidinle (SA) baglanma ve Fab-HRP or SA-HRP'yle inceleme için, biyotinlenmis ABP-hu4D5FabV8 sistein mutantlari (ThioFab varyantlari) olan (soldan saga) tekli Cys varyantlari ABP- VllOC, ABP-AlZlC ve ikili Cys varyantlari ABP-VllOC- A88C ve ABP-VllOC-A121C°nin 450 nm"de absorbans belirlemesiyle birlikte ELISA analizi sonuçlarini göstermektedir.Sekil 8, biyotinlenmis ThioFab fajinm ve bir anti-faj HRPantikorunun HERTye (üst) ve Streptavidine (alt) baglanmasini15göstermektedir. Sekil 9, bir HER2 reseptörü antijenine baglanan bir ABP- ThioFab füzyon proteini ilaç konjugatinin bir örnek temsilinigöstermektedir. ABP : albümin baglanma proteini. Sekil 10, -°-trastuzumab;-A-trastuzumab-SMCC-DMI ve -O-hu4D5FabV8 sistein mutanti-(Al21C)-BMPEO-DM1 ile tedavi edilen SK-BR-3 hücrelerinin bir in-Vitro hücre proliferasyonu eseyini göstermektedir.Sekil 11, -o- trastuzuinab; -O-trastuzumab-SMCC-DMI; ve -D- hu4D5FabV8 sistein mutanti (V110C) -BMPEO-DM] ile tedavi edilen SK-BR-3 hücrelerinin bir in-Vitro hücre proliferasyonu eseyini göstermektedir.Sekil 12, 0. Günde î? Vehül (Tampon); -I- ABP-hu4D5FabV8 sistein mutanti (V1 IOC hafif zinciri)-DM1 ve -o- ABP- hu4D5FabV8 sistein mutanti (A121C agir zinciri)-DM1 dozu uygulanan MMTV-HER2 F05 memeli tümör allograftli atimik tüysüz farelerde zaman içerisinde ortalama tümör hacmi degisikligini göstermektedir.Sekil 13A, absorbans belirlemesi için HRP etiketli sekonder antikor baglanmasiyla birlikte iinmobilize HER2"ye biyotinlenmis antikor baglanmasinin bir resimli görüntüsünü sunmaktadir.Sekil 13B, immobilize HER2°ye baglanma için, biyotin- nialeimid kon juge tiyo-trastuzumab varyantlari ve biyotinlenmemis yabani tip trastuzumabin 450 nm"de absorbans belirlemesiyle birlikte baglanma ölçümlerini göstermektedir.Soldan saga: VllOC (tekli cys), A121C (tekli cys).16V110C1A121C (ikili cys) ve trastuzumab. Her bir tiyo IgG varyanti ve trastuzuinab, 1,10 ve 100 ng"de test edildi.Sekil 14A, absorbans belirlemesi için biyotinin anti-IgG- HRP,ye baglaninasiyla birlikte biyotinlenmis antikorun iminobilize HER2°ye baglaninasinin bir resimli görüntüsünü sunmaktadir.Sekil 14B, immobilize streptavidine baglanma için, biyotin- maleiinid kon juge-tiyo trastuzumab varyantlari ve biyotinlenmemis yabani tip trastuzumabin 450 nm"de absorbaiis belirlemesiyle birlikte baglanma ölçümlerini göstermektedir. Soldan saga VllOC (tekli cys), A121C (tekli cys), V1 lOC/A121C (ikili cys) ve trastuzumab. Her bir tiyo IgG varyanti ve trastuzumab, 1,10 ve 100 ng"de test edildi.Sekil 15, konjugasyon için hücre kültüründen eksprese edilen bir sistein degistirilmis antikor (ThioMab) hazirlamak amacina yönelik genel prosesi göstermektedir.Sekil 16, iminobilize Protein A"da saflastirma isleminden sonra 2H9 ThioMab Fc varyantlari (soldan saga, serit 1-9) A339C; S337C; S324C; A287C; V284C; V282C; V279C; V273C°nin ve 2H9 yabani tipinin indirgeyici olinayan (üst) ve indirgeyici (alt) denatüran poliakrilamid jel elektroforezi analizini göstermektedir. Sagdaki serit, intakt proteinlerin yaklasik 150 kDa, agir zincir fragmanlarinin yaklasik 50 kDa ve hafif zincir fragmanlarinin yaklasik 25 kDa oldugunu gösteren bir boyut inarkeri merdivenidir.Sekil 17A, immobilize Protein A'da saflastirma isleminden sonra 2H9 ThioMab varyantlari (soldan saga, serit 1-4) L- V15C; Sl79C; S375C; S400C A°nin indirgeyici olmayan (sol)17ve indirgeyici (+DTT) (sag) denatüran poliakrilamid jel elektroforezi analizini göstermektedir.Sekil 17B, immobilize Protein A"da saflastirma isleminden sonra 2H9 ve 3A5 ThioMab varyantlarinin indirgeyiei olmayan (sol) ve indirgeyici (+DTT) (sag) denatüran poliakrilainid jel elektroforezi analizini göstermektedir.Sekil 18, biyotinlenmis Thio-IgG varyantlarinin western blot analizini göstermektedir. 2H9 ve 3A5 ThioMab varyantlari, indirgenmis denatüran poliakrilamid jel elektroforezinde analiz edildi; proteinler, nitroselüloz membrana aktarildi. Antikorun ve konjuge biyotinin varligi, sirasiyla anti-IgG-HRP"yle (üst) ve streptavidin-HRP"yle incelendi (alt). Serit l: 3A5 H-A121C. Serit 2: 3A5 L-VllOC. Serit 3: 2H9H-A121C. Serit 4: 2H9 L- V110C. Serit 5: 2H9 yabani tip.Sekil 19, anti-IgG-HRP"yle inceleme ve 450 nin'de absorbans ölçümü (üst çubuk grafigi) yoluyla, biyotinlenmis 2H9 varyantlarinin streptavidine baglanmasi için ELISA analizini göstermektedir. Alt seinatik diyagram, ELISA analizinde kullanilan deney tasariinini göstermektedir.Sekil 20, -o- trastuzuinab; -A- ilaç yükü 3,4 DMl/Ab olan trastuzumab-SMCC-DMl ve -0- ilaç yükü 1,6 DMI/Ab olan tiyo-trastuzumab (A121C)-BMPEO-DM1 ile tedavi edilen SK- BR-3-hücrelerinin bir in-vitro hücre proliferasyonu eseyinigöstermektedir.Sekil 21A, -O- ana 2H9 anti-EphBZR ve -D- tiyo 2H9 (A121C) BMPEO-DM] ile tedavi edilen HT lOSOEphBZ hücrelerinin birin-vitro hücre proliferasyonu eseyini göstermektedir.18Sekil 21 B, -O- ana 2H9 anti-EphB2R ve -El- tiyo 2H9 (A121 C) BMPEO-DMI ile tedavi edilen BT 474 hücrelerinin bir in-vitro hücre proliferasyonu eseyini göstermektedir.Sekil 22, -9- 3A5 anti MUC16-SMCC-DM1 ve -I- tiyo 3A5 (A121C) BMPEO-DM] ile tedavi edilen PC3/ne0 hücrelerinin bir in-vitro hücre proliferasyonu eseyini göstermektedir.Sekil 23, -9- 3A5 anti MUClö-SMCC-DMI ve -I- tiyo 3A5 (A121C) BMPEO-DM] ile tedavi edilen PC3/MUC16 hücrelerinin bir in-vitro hücre proliferasyonu eseyini göstermektedir.Sekil 24, -0- 3A5 anti MUC16-SMCC-DM1 ve -I- tiyo 3A5 (A121C) BMPEO-DMl ile tedavi edilen OVCAR-3 hücrelerinin bir in-vitro hücre proliferasyonu eseyini göstermektedir.Sekil 25, i? Vehikül (Tampon); _o_ ilaç yükü 3,4 DMl/Ab olan trastuzumab-SMCC-DMI 10 mg/kg; -i- ilaç yükü 1,6 DMl/Ab olan tiyo trastuzumab (A121C)-SMCC-DM1 21 mg/kg ve -i:i- ilaç yükü 1,6 DM l/Ab olan tiyo trastuzumab (A121C)-SMCC- DMl 10 ing/kg ile 0. Günde bir tekli doz uygulamasindan sonra, MMTV-HER2 F05 memeli tümör allograftli atimik tüysüz farelerde 21 gün boyunca ortalama tümör hacmidegisikligini göstermektedir.ÖRNEK YAPILARIN DETAYLI TANIMIBu bölümde, bulusun belirli yapilarina detayli olarak atif yapilacaktirve bu bulus yapilarinin örnekleri, ekli kimyasal yapilarda ve19formüllerde gösterilmektedir. Bu bulus, siralanan yapilarla baglantili olarak açiklanirken, bulusun kapsaminin bu yapilarlasinirlandirilmasiiiin düsünülmedigi anlasilacaktir.Aksi belirtilmedikçe, burada kullanilan teknik ve bilimsel terimler, bu bulusun ait oldugu sektörde olagan bilgi ve beceri sahibi kisilerin yaygin olarak anlayacaklari anlamdadir ve asagida atif yapilan referanslarda kullanilanlara uygundur: Singleton ve ark (1994) Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2. Ed., J. Wiley & Sons, New York, NY; and Janeway, C., Travers, P., Walport, M., Shlomchik (2001) Immunobiology, 5. Ed., Garland Publishing, New YorkTANIMLARAksi belirtilmedikçe, bu dokümanda kullanilan asagidaki terimler veibareler, asagida açiklandiklari anlamda kullanilmislardir.Bu dokümanda ticari adlar kullanildiginda, basvuru sahipleri, birbirinden bagimsiz olarak ticari adin verildigi ürününün formülasyonunu, jenerik ilaci ve ticari adin verildigi ürününün etkinfarmasötik bilesen(ler)ini kasteder.Burada kullanilan "antikor" terimi, en genis anlamiyla kullanilir ve spesifik olarak monoklonal antikorlar, poliklonal antikorlar, dimerler, multimerler, multispesifik antikorlar (örnegin, bispesifik antikorlar) ve istenen biyolojik aktiviteyi gösterdikleri sürece, antikor fragmanlarinikapsar (Miller ve ark (2003) Jour. of lminunology 170:4854-4861).20Antikorlar, murin antikorlari, insan antikorlari, hümanize antikorlar, kimerik antikorlar ya da baska türlerden türetilen antikorlar olabilir. Bir antikor, immün sistem tarafindan olusturulan ve bir spesifik antijeni taniyabilen ve ona baglanabilen bir proteindir (Janeway, C., Travers, P., Walport, M., Shloinchik (2001) Immuno Biology, 5. Ed., Garland Publishing, New York). Bir hedef antijen genellikle çoklu antikorlar üzerinde CDR°ler tarafindan taninan ve epitoplar da denilen birçok baglanma yeri içerir. Farkli bir epitopa Spesifik baglanan her bir antikor farkli bir yapiya sahiptir. Bundan dolayi, bir anti jen, birden fazla tekabül eden antikor içerebilir. Bir antikor, bir tam-boy immünoglobulin molekülünü ya da bir tam-boy immünoglobulin molekülünün immünolojik açidan aktif kismini, yani ilgili bir hedefin ya da onun parçasinin bir anti jenini immünospesifik olarak baglayan bir antijen baglanina yeri içeren bir molekülü kapsar; atif yapilan hedefler arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, kanser hücresi ya da bir otoimmün hastalikla iliskili otoimmün antikorlar üreten hücreler vardir. Burada açiklanna immünoglobulin, herhangi bir inimüiioglobulin molekülü tipinde (örnegin IgG, IgE, IgM, lgD ve IgA), sinifinda (örnegin IgGl, IgGZ, lgG3, lgG4, lgA] ve lgAZ) ya da alt-sinifinda olabilir. Immünoglobulinler, herhangi bir türeden türetilebilir. Bununla birlikte, bu bulusun bir özelliginde,immünoglobulin insan, inurin ya da tavsan kaynaklidir."Antikor fragmanlari", bir tam-boy antikorun bir kismini, genellikle antijen baglanma ya da degisken bölgesini kapsar. Antikor fragmanlarina örnek olarak Fab, Fab', F(ab')2 ve FV fragmanlari; diabody"ler; lineer antikorlar; minibodysler (Olafsen ve ark (2004) Protein Eng. Design & Sel. l7(4):315-323); bir Fab ekspresyon21kütüphanesi tarafindan üretilen fragmanlar; anti-idiyotipik (anti-1d) antikorlar; CDR (tamainlayicilik belirleme bölgesi) ve kanser hücresi antijenleri, Viral antijenler ya da mikrobiyal antijenlere immünospesifik olarak baglanan yukaridakilerin herhangi birisinin epitop-baglayici fragmanlari; tek-Zincirli antikor molekülleri ve ayrica, antikor fragmanlarindan olusturulan inultispesifik antikorlargösterilebilir.Bu dokümanda kullanilan "monoklonal antikor" terimi, büyük ölçüde homojen antikorlardan olusan, yani popülasyonu olusturan münferit antikorlarin çok küçük miktarlarda bulunabilecek olasi dogada mevcut mutasyonlar hariç özdes oldugu bir popülasyondan elde edilen bir antikora atif yapar. Monoklonal antikorlar yüksek düzeyde spesifiktir ve tek bir anti jenik yere yönlendirilirler. Ek olarak, normalde farkli determinantlara (epitoplar) karsi yönlendirilen farkli antikorlari kapsayan poliklonal antikor preparatlarinin aksine, her bir monoklonal antikor, antijen üzerindeki tek bir determinanta karsi yönlendirilir. Monoklonal antikorlar, spesifisitelerinin yani sira, diger antikorlar tarafindan kontamine edilmeden sentezlenebilmeleri açisindan da avantajlidirlar. Niteleyici "monoklonal" sözcügü, antikorun büyük ölçüde homojen bir antikor popülasyonundan elde edilmis oldugunu gösteren bir terimdir ve antikor üretiminin belirli bir yöntemle gerçeklestirilmesini zorunlu kilacak sekilde anlasilmainali ve yorumlanmamalidir. Örnegin, bu bulusa göre kullanilacak monoklonal antikorlar, ilk olarak "Kohler ve ark., Nature 2562495 (1975)" referansinda tanimlanan hibridom yöntemiyle hazirlanabilecegi gibi, rekombinan DNA yöntemleriyle de (bakiniz örnegin, ABD Patent No.: 4816567 ve 5807715) hazirlanabilir. Monoklonal antikorlar,22örnegin "Clackson ve ark (1991) Nature, 3522624-628" ve "Marks ve ark (1991) J. Mol. Biol., 222:581-597" referanslarinda açiklanan teknikler kullanilarak faj antikor kütüphanelerinden de izoleedilebilirler.Burada inonoklonal antikorlar spesifik olarak agir ve/veya hafif zincirin bir kismi belirli bir türden türetilmis olan ya da belirli bir antikor sinifi ya da alt-sinifina ait olan antikorlarda kendilerine tekabül eden sekanslara özdes ya da homolog olan, zincir(ler)in geri kalan kismi ise baska bir türden türetilmis olan ya da baska bir antikor sinifi ya da alt-sinifina ait olan antikorlarda kendilerine tekabül eden sekanslara özdes ya da homolog olan "kimerik" antikorlari ve ayni zamanda, istenen biyolojik aktiviteyi gösterdikleri sürece bu antikorlarin fragmanlarini kapsar (US 4816567 ve Morrison ve ark (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855). Ilgili kimerik antikorlar arasinda, insan sabit bölge sekanslarindan ve yani sira, insan-disi bir primattan (örnegin, Eski Dünya Maymunu ya da Insansilar) türetilen degisken domain anti jen-baglanma sekanslarindanolusan "primatize" antikorlar da bulunur.Bu dokümanda kullanilan bir "intakt antikor" terimi, VL ve VH domainlerinin yam sira, bir hafif zincir sabit domaini (CL) ve agir zincir sabit domainleri CHl, CH2 ve CH3°ten olusan bir antikordur. Sabit domainler, nativ sekans sabit domainleri (örnegin, insan nativ sekans sabit domainleri) ya da onlarin amino asit sekansi varyantlari olabilirler. Intakt antikorda, bir antikorun Fc sabit bölgesine (bir nativ sekans FC bölgesi ya da amino asit sekans varyanti Fc bölgesi)atfedilebilecek biyolojik aktivitelere atif yapan bir ya da daha fazla23sayida "efektör fonksiyon" bulunabilir. Antikor efektör fonksiyonlarina 'Örnek olarak asagida sayilanlar gösterilebilir: C lq baglama; tainamlayici bagimli sitotoksisite; Fc reseptörü baglanmasi; antikor-bagimli hücre-aracili sitotoksisite (ADCC); fagositoz; B hücresi reseptörü gibi hücre yüzeyi reseptörlerinin asagi regülasyonu ve BCR.Agir zincirlerinin sabit domaininin amino asit sekansina bagli olarak, intakt antikorlar, farkli "siniflara" atanabilir. Bes ana intakt immünoglobulin antikoru sinifi vardir: IgA, IgD, IgE, lgG ve lgM ve bunlarin birkaçi, `Örnegin IgGl, IgG2, IgG3, IgG4, IgA ve IgA2 gibi "alt-siniflara" da (izotipler) bölünebilir. Antikorlarin farkli siniflarina tekabül eden agir-Zincir sabit domainleri, sirasiyla (1., 5, 8, y ve p olarak adlandirilir. Immünoglobulinlerin farkli siniflarinin alt-birim yapilari ve üç-boyutlu konfigürasyonlari iyi bilinmektedir. lg formlari arasinda mentese modifikasyonlari ya da mentesesiz formlar vardir (Roux ve ark (1998) J. Immunol. 161:4083-4090; Lund ve ark (2000) Eur. J. Biochem. 267:7246-7256; US 2005/0048572; US 2004/0229310).Bir "ErbB reseptörü", hücre çogalmasi, diferasyasyonu ve sürvisinin önemli aracilari olan ErbB reseptör ailesine ait bir reseptör protein tirozin kinazdir. ErbB reseptör ailesinin epidermal büyüme faktörü reseptörü (EGFR, ErbBl, HERl), HER2 (ErbB2 or p185neu), HER3 (ErbB3) ve HER4 de (ErbB4 ya da tyr02) dahil dört ayri üyesi vardir. Bir anti-ErbB2 antikorlari grubu, insan meme tümörü hücre hatti SKBR3 kullanilarak karakterize edilmistir (Hudziak ve ark (1989) Mol. Cell. BioL 9(3):1165-1172). Hücre proliferasyonunu %5624oraninda inhibe eden 4D5 isimli antikorla maksimum inhibisyon elde edildi. Gruptaki diger antikorlar, bu eseyde hücre proliferasyonunu daha düsük bir seviyeye kadar azaltti. 4D5 antikorunun ErbB2-asiri eksprese eden meme tümörü hücre hatlarini TNF-(x sitotoksik etkilerine karsi sensitize ettigi de tespit edildi (US 5677171). Hudziak ve arkadaslarinin referansinda açiklanan anti-ErbB2 antikorlari asagida atif yapilan referanslarda ilaveten karakterize edilir: Fendly ve ark (1990) Cancer Research 50:1550-1558; Kotts ve ark. (1990) In Vitro 26(3)59A; Sarup ve ark (1991) Growth Regulatioii 1:72- 82; Shepard ve ark. .1. (1991) Clin. lmmunol. ll(3):117-127; Kumar ve ark. (1991) Mol. Cell. Biol. 11(2):979-986; Lewis ve ark. (1993) Cancer ImmunoL Immunother. 37:255-263; Pietras ve ark. (1994) Oncogene 9:1829-1838; Vitetta ve ark. (1994) Cancer Research 545301-5309; SliWkowski ve ark (1994) J. Biol. Chem. 269(20):14661-14665; Scott ve ark. (1991) J. BioL Chein. 266:]4300- ; D'souza ve ark. Proc. Natl. Acad. Sci. (1994) 91:7202-7206; Lewis ve ark. (1996) Cancer Research 56:1457-1465 ve Schaefer ve ark. (1997) Oncogene 15:1385-1394.ErbB reseptörü genellikle bir ErbB ligandini baglayabilen bir ekstraselüler domain; bir lipofilik transmembran domain; bir korunan intraselüler tirozin kinaz domaini ve fosforile edilebilecek birkaç tirozin artigi bulunan bir karboksil-terminal sinyalleme domaini içerir. ErbB reseptörü, bir "natiV sekans" ErbB reseptörü ya da onun bir "amino asit sekansi varyanti" olabilir. Tercihen, ErbB reseptörü, native sekans insan ErbB reseptörüdür. Bu dogrultuda, bir "ErbB reseptör ailesi üyesi", EGFR (ErbBl), ErbB2, ErbB3, ErbB4 ya dagünümüzde bilinen ya da gelecekte tanimlanacak olan baska herhangi25bir ErbB reseptörüdür."ErbBl", "epidermal büyüme faktörü reseptörü", "EGFR" ve "HERl" terimleri bu dokümanda dönüsümlü kullanilir ve dogal ortamda kendiliginden olusan mutant formlari da (örnegin "Humphrey ve ark (1990) Proc. Nat. Acad. Sci. (USA) 87:4207-4211" referansinda açiklandigi gibi olan bir EGFR delesyon inutanti) dahil olmak üzere, örnegin "Carpenter ve ark (1987) Ann. ReV. Biochem, 56:881-914" eserinde açiklandigi gibi olan EGFRsye atif yaparlar. erbBl terimi, EGFR protein ürününü kodlayan gene atif yapar. HERl"e karsi antikorlar örnegin "Murthy ve ark (1987) Arch. Biochem. Biophys., 252z549-560" referansmda ve WO 9525167 sayili patentteaçiklanmaktadir."ERRP", "EGF-Reseptörü Iliskili Protein", "EGFR Iliskili Protein" ve "epidermal büyüine faktörü reseptörü iliskili protein" ibareleri bu dokümanda dönüsümlü kullanilir ve örnegin US 6399743 sayili patentte ve ABD Yayin No. 2003/0096373 olan dokümanda açiklandigi gibi ERRP°yc atif yapar."ErbBZ" ve "HER2" terimleri bu dokümanda dönüsümlü kullanilir ve örnegin "Seniba ve ark (1985) Proc. Nat. Acad. Sci. (USA) 82:6497- 6501" ve "Yamamoto ve ark (1986) Nature, 319:230-234" referanslarinda açiklanan insan HERZ proteinine (GenBank erisim numarasi X03363) atif yapar. "erbB2" terimi, insan HERZssini kodlayan gene atif yapar ve "neu" terimi, sican p185neu"sunu kodlayan gene atif yapar. Tercih edilen ErbB2, natiV sekans insan ErbB2"sidir.26"ErbB3" ve "HER3", ömegin ABD Patent No. 5183884 ve 5480968sde ve "Kraus ve ark (1989) Proc. Nat Acad. Sci. (USA) 86:9193-9197" referansinda açiklandigi gibi reseptör polipeptidine atif yapmaktadir. ErbB3"e karsi antikorlar sektörde bilinmektedir ve örnegin ABD Patent No. 5183884 ve 5480968°de ve WO 97/35885sayili patentte tarif edilmektedir.Burada kullanilan "ErbB4" ve "HER4" teriinleri, örnegin 599.274 numarali EP Patent Basvurusunda ve "P10Wman ve ark (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:1746-1750" ve "Plowman ve ark (1993) Nature 366:473-475" referanslarinda açiklandigi gibi olan reseptör polipeptidine ve bu reseptör polipeptidinin WO 99/ 19488 numarali patentte açiklandigi gibi olan izoformlarina atif yapar. HER4"e karsi antikorlar, örnegin WO 02/ 18444 sayili patentte açiklanmaktadir.ErbB reseptörlerine karsi antikorlar, örnegin Santa Cruz Biotechnology, Inc., California, ABD dahil birçok kaynaktan ticariolarak temin edilebilir."Amino asit sekansi varyanti" terimi, bir nativ sekans polipeptidden bir ölçüde farklilasan amino asit sekanslarina sahip polipeptidlere atif yapar. Normalde, amino asit sekansi varyantlari, bir nativ ErbB ligandinin en az bir reseptör baglanma domainiyle ya da bir nativ ErbB reseptörünün en az bir ligand baglanma domainiyle en az yaklasik %70 oraninda sekans özdesligine sahip olacaktir ve bu reseptör ya da ligand baglanma domainleriyle sekans açisindan tercihen en az yaklasik %80, daha çok tercihen en az yaklasik %90oraninda homolog olacaktir. Amino asit sekansi varyantlarinda nativ27amino asit sekansinin amino asit sekansi içinde belirli pozisyonlarda sübstitüsyonlar, delesyonlar ve/Veya insersiyonlar bulunur. Aminoasitler geleneksel adlarla, tek harfli ve üç harfli kodlarla adlandirilir."Sekans özdesligi" ibaresi, sekanslar hizalandiktan ve gerekirse maksimuin yüzde sekans özdesligi elde etmek için bosluklar eklendikten sonra özdes olan bir ainino asit sekansi varyantindaki artik yüzdesi olarak taniinlanir. Hizalama için kullanilan yöntemler ve bilgisayar programlari sektörde iyi bilinmektedir. Bu bilgisayar programlarindan birisi, Genentech, Inc sirketinin yazdigi ve patent koruinasi için 10 Aralik 1991 tarihinde Ainerika Birlesik Devletleri Telif Haklari Ofisi, Washington, DC 20559'a gerekli kullanici dokümantasyonuyla birlikte basvuru yapmis oldugu "Align 2"programidir."Antikor-bagimli hücre-aracili sitotoksisite" ya da "ADCC" terimi, Fc reseptörlerini (FcR'ler) ekSprese eden Spesifik olmayan sitotoksik hücrelerin (örnegin Dogal Katil (NK) hücreler, nötrofiller ve makrofajlar) bir hedef hücreye bagli bulunan antikoru tanidigi ve akabinde hedef hücrenin lize olmasina yol açtigi bir hücre-aracili reaksiyona atif yapar. ADCC"ye aracilik eden primer hücreler olarak NK hücreleri yalnizca FcyRIII eksprese ederken, monositler FcyRI, FcyRII and FcyRIII"yi eksprese ederler. Heinatopoetik hücrelerdeki FCR ekspresyonu, Ravetch ve Kinet°e ait eserde ""Annu. Rev. Iinmunol 9:457-92, 1991" sayfa 464"te yer alan Tablo 3"te özetlenmektedir. Ilgi konusu bir molekülün ADCC aktivitesini degerlendirmek için, örnegin 5500362 veya 5821337 sayili ABDPatentlerinde tarif edilen bir in vitro ADCC eseyi gerçeklestirilebilir.28Bu gibi eseyler için faydali ve uygun efektör hücreler arasinda, periferal kan mononükleer hücreleri (PBMC) ve Dogal Katil (NK) hücreler bulunur. Alternatif ya da ek olarak, ilgi konusu molekülün ADCC aktivitesi, bir örnegi "Clynes ve ark (1998) PROC. NAT. ACAD. SCL (USA) (USA) 95:652-656" referansinda aktarilan birhayvan modeli kullanilarak in vivo ortamda degerlendirilebilir."Insan efektör hücreleri", bir ya da daha fazla sabit bölge reseptörü (FcR) eksprese eden ve efektör fonksiyonlar ortaya koyan lökositlerdir. Hücreler, tercihen, en azindan FcyRIIl°yi eksprese ederler ve ADCC efektör fonksiyonunu gerçeklestirirler. ADCC fonksiyonuna aracilik eden insan lökositlerine verilebilecek örnekler arasinda, periferal kan mononükleer hücreleri (PBMC), dogal katil (NK) hücreler, monositler, sitotoksik T hücreleri ve nötrofiller de bulunmakla beraber, PBMC°ler ve NK hücreler tercih edilmektedir. Efektör hücreler, bir nativ kaynaktan, örnegin kandan ya da buradaaçiklandigi gibi PBMC"lerden izole edilebilirler."Fc reseptörü" ve "FcR" terimleri, bir antikorun Fc bölgesine baglanan bir reseptörü. tanimlamak için kullanilmaktadir. Tercih edilen FcR, bir nativ sekans insan FcR"sidir. Öte yandan, tercih edilen bir FcR, bir IgG antikoruna (bir gama reseptörü) baglanan ve FcyRI, FcyRII ve FcyRIII alt-sinifi reseptörlerinden ve bunlara bagli olarak, bu reseptörlerin allelik varyantlari ve alternatif splicing islemine ugratilmis formlarindan biri olan bir reseptördür. FcyRII reseptörleri arasinda, temelde sitoplazmik domainleri açisindan farklilik gösteren benzer amino asit sekanslarina sahip FcyRIIA (bir "aktive edicireseptör") ve FclelB (bir inhibe edici reseptör) bulunur. Aktive edici29reseptör FclelA, sitoplazmik domaininde bir immünoreseptör tirozin-bazli aktivasyon motifi (ITAM) içerir. Inhibe edici reseptör FcyRIIB, sitoplazmik domaininde bir immünoreseptör tirozin-bazli inhibisyon motifi (ITIM) içerir. ("Da'eron, Annu. Rev. Iinmunol. :203-234 (1997)" referansinda derlenmistir). FcR°ler; "Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991)", "Capel ve ark., Iinmunomethods 4225-34 (1994)" ve de "Haas ve ark (1995) J. Lab. Clin. Med. 126:330-41" referanslarinda derleninektedir. Gelecekte tanimlanacaklar da dahil olmak üzere diger FCR"ler, burada kullanilan "FcR" teriminin kapsamina girmektedir. Bu terim, ayrica inatemal IgG"lerin fetusa transferinden sorumlu olan neonatal reseptör FcRnsyi de kapsamaktadir (Guyer ve ark (1976) J. lmmunoL. l 17:587 ve Kim ve ark (1994) J. ImmunoL 24:249)."Tamamlayici-bagimli sitotoksisite" veya "CDC" terimi, bir molekülün tamamlayici varliginda bir hedefini lize etme kabiliyetine atif yapar. Tamamlayici aktivasyon yolagi, tamamlayici sisteminin (Clq) ilk bileseninin bir kognat antijenle kompleks halinde bulunan bir moleküle (örnegin, bir antikora) baglanimi neticesinde baslar. Tamamlayici aktivasyonunu degerlendirmek maksadiyla, örnegin Gazzano-Santoro ve arkadaslarinin (J. Immunol. Methods 202:]63,1996) aktardiklari gibi, bir CDC eseyi gerçeklestirilebilir."Nativ antikorlar", genellikle, iki özdes hafif (L) zincir ve iki özdes agir (H) zincirden olusan, yaklasik 150.000 Dalton agirligindaki heterotetramerik glikoproteinlerdir. Hafif zincirlerden her biri, bir kovalent disülfûr bagiyla agir zincirlerden birine baglidir; disülfûrbagi sayisi, farkli immünoglobulin izotiplerinin agir zincirleri arasinda30farklilik gösterir. Agir ve hafif zincirlerin her birinde, ayrica düzenli araliklarla ayrilmis zincir-içi disülfur köprüleri bulunur. Her agir zincirin bir ucunda bir degisken domain (VH) ve bunu takip eden bir dizi sabit domain bulunur. Her hafif zincirin bir ucunda bir degisken domain (VL) ve diger ucunda bir sabit domain bulunur. Hafif zincirin sabit domaini, agir zincirin ilk sirada bulunan sabit domainiyle hizalanir; hafif zincir degisken domaini ise, agir zincir degisken domainiyle hizalanir. Hafif ve agir zincir degisken domaiiileri arasinda belirli ainino asit artiklarinin bir arayüz olusturduklaridüsünülmektedir."Degisken" terimi, degisken domainlerin belirli kisimlarinin antikorlar genelinde sekans açisindan genis ölçüde farkli olduklari ve belirli her bir antikorun kendisine iliskin aiitijene yönelik baglanimi ve spesifisitesini saglamak için kullanildiklari olgusuna atif yapar. Ancak degiskenlik, antikorlara ait degisken domainler arasinda esit ölçüde dagilim gösterinez. Hem hafif zincir hem de agir zincir degisken domainlerinde hiperdegisken bölgeler olarak adlandirilan üç segmentte yogunlasir. Degisken domainlerin en fazla korunan kisimlari, çerçeve bölgeleri (FR) olarak adlandirilirlar. Nativ agir ve hafif ziiicirlerin degisken domainlerinin her biri, büyük oranda bir ß- yaprak konfigürasyonu kullanilan ve ayrica, ß-yaprak yapisini baglayan ve bazen de bu yapinin bir parçasi olan luplar olusturan üç hiperdegisken bölgeyle birbirlerine baglanan dört FR°den olusur. Zincirlerin her birindeki hiperdegisken bölgeler, FR,1erle yakin proksimitede bir arada tutulur ve diger zincirin hiperdegisken bölgeleriyle birlikte, antikorlarin antijen baglanma yeri olusumunakatkida bulunurlar (bakiniz: Kabat ve ark (1991), Sequences of31Proteins of Iminunological Interest, 5. Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD.). Sabit domainler, bir antikorun bir anti jene baglanma islevine dogrudan katilmazlar, ancak antikorun antikor-bagimli selüler sitotoksisiteye (ADCC) katilimi gibiçesitli farkli efektör fonksiyonlar gösterirler.Bu dokümanda kullanilan "hiperdegisken bölge" terimi, antijen baglanmasindan sorumlu bir antikorun amino asit artiklarina atif yapar. Hiperdegisken bölge genellikle bir "tamamlayicilik belirleme bölgesi" ya da "CDR"den elde edilen ainino asit artiklarindan (yani, hafif zincir degisken domaininde 24-34 (Ll), 50-56 (L2) ve 89-97 (L3) artiklari ve agir zincir degisken domaininde 31-35 (Hl), 50-65 (H2) ve 95-102 (H3) artiklari; Kabat ve ark., yukarida atif yapilmaktadir) ve/Veya bir "hiperdegisken lup"tan elde edilen artiklardan (yani, hafif zincir degisken doinaininde 26-32 (Ll), 50-52 (L2) ve 91-96 (L3) artiklari ve agir zincir degisken domaininde 26-32 (Hl), 53-55 (H2) ve 96-101 (H3) artiklari; Chothia and Lesk (1987) I. Mol. Biol., l96:901-9l7) olusur. "Çerçeve" veya "FR" artiklari, burada tanimlanan hiperdegisken bölge artiklari disindaki degiskendomain artiklaridir.Antikorlariii papain sindirimi, her birinde tek bir anti jen-baglanma yeri bulunan ve "Fab" fragmanlari olarak adlandirilan iki özdes antijen-baglanma fragmanini ve ismi kolayca kristalize olma kabiliyetini yansitan bir artik "FC" fragmanini üretir. Pepsin uygulamasi, iki anti jen-baglanma yeri bulunan ve buna ragmen hâlâaiitijeni çapraz baglayabilen bir F(ab,)2 fraginani ortaya çikarir.32"FV", bir tam antijen-tanima ve -baglanma yeri içeren en küçük antikor fragmanidir. Bu bölge, kovalent olmayan siki bir bagla birbirine bagli bir agir zincir ve bir hafif zincir degisken domaininin bir diinerinden olusur. Bu konfigürasyonda, degisken doinainlerin her birinin üç adet hiperdegisken bölgesi etkilesime girerek, VH-VL dimerinin yüzeyi üzerinde bir antijen-baglanma yeri olusturur. Bir bütün olarak bu alti hiperdegisken bölge, antikora, anti jene baglanma Spesifisitesi kazandirirlar. Bununla birlikte, her ne kadar baglanma yerinin tamamindan daha düsük bir afinitede olsa da, tek bir degisken domain (ya da bir anti jene özgü olarak yalnizca üç hiperdegisken bölge içeren bir Fv°nin yarisi) dahi antijeni tanima ve baglamakabiliyetine sahiptir.Fab fragmani da hafif zincirin sabit domainini ve agir zincirin ilk sabit domainini (CHl) içerir. Fab" fragmanlari, antikor mentese bölgesi kaynakli bir veya daha fazla sayida sistein de dahil, agir zincir CH 1 domaini karboksil terminal ucunda birkaç artik ilavesiyle Fab fragmanlarindan ayrilir. Fab°-SH, sabit domainlere ait sistein artik(lar)1n1n en az bir serbest tiyol grubu tasidigi Fab, için burada kullanilan adlandirmadir. F(ab")2 antikoru fragmanlari, aslen, aralarinda mentese sisteinleri bulunan Fab" fragmanlari çiftleri olarak üretilmislerdir. Antikor fragmanlarina iliskin baska kimyasaleslesmeler de bilinmektedir.Herhangi bir omurgali türünden elde edilen antikorlarin "hafif zincirleri", sabit domainlerinin amino asit sekanslarina bagli olarak kappa (K) ve lambda (l) olarak adlandirilan açikça ayri iki tiptenbirine atanabilirler.33"Tek-Zincirli FV" ya da "scFV" antikor fragmanlari, antikorun VH ve VL domainlerini kapsarlar; bu domainler, tek bir polipeptid zincirinde bulunurlar. FV polipeptidi, tercihen, ayrica VH ve VL domainleri arasinda scFv1nin istenen antijen baglanma yapisini olusturmasini mümkün kilan bir polipeptid baglayicisi da içerir. scFV hakkinda yapilmis bir gözden geçirme ve derleme çalismasi için "Pluckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, cilt 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, sayfa 269-315 (1994)" referansina bakiniz. ScFV fragmanlarinin anti-ErbB2 antikoru, WO93/16185 dokümaninda ve 5.571.894 ve 5.587.458 sayili ABDPatentlerinde anlatilmaktadir."Diabody°ler" terimi, iki anti jen baglanma yeri bulunan ve her biri ayni polipeptid zincirinde (VH-VL) bir hafif zincir degisken domainine (VL) bagli halde bir agir zincir degisken domaini (VH) içeren küçük antikor fragmanlarina atif yapar. Ayni zincirde yer alan iki domain arasinda eslesme olmasini saglamak için çok kisa olan bir baglayici kullanilarak, domainler, baska bir zincirin tamamlayici domainleriyle eslesmeye ve iki adet anti jen baglanma yeri olusturmaya zorlanirlar. Diabody"ler, 'örnegin EP 404.097, WO 93/ l 1 161 ve "Hollinger ve ark. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. ABD 90:6444-6448" referanslarindadaha ayrintili anlatilmaktadir.Insan-disi (örnegin, kemirgen) antikorlarin "hümanize" formlari, insan-disi immünoglobulinden türetilmis minimum sekans içeren kimerik antikorlardir. Hümanizasyon, murin antijen baglama bilgilerini bir immünojik olmayan insan antikoru alicisina aktarmayöntemidir ve terapötik açidan faydali ve kullanisli birçok ilaç34üretilmesini saglamistir. Hümanizasyon yöntemi genellikle alti inurin tamamlayicilik belirleme bölgesinin (CDR) hepsinin bir insan antikoru çerçevesine transferiyle baslar (Jones ve ark, (1986) Nature 3212522-525). Bu CDR-graftli antikorlar genellikle antijen baglama için orijinal afinitesini koruinaz ve esasinda, afinite çogunlukla oldukça bozulur. CDRSIere ek olarak, seçili insan-disi antikor çerçeve artiklari da uygun CDR konformasyonunu korumak için dahil edilebilir (Chothia ve ark (1989) Nature 3422877). Graftlanan CDR"lerin yapisal konforinasyonunu destekleinek için kilit fare çerçeve artklarinin insan aliciya transferinin antijen baglamasini ve afinitesini gelistirdigi gösterilmistir (Riechmann ve ark (1992) J. Mol. Biol. 224, 487-499; Foote and Winter, (1992) J. Mol. Biol. 224z487- 499; Presta ve ark (1993) J. Iinmunol. 151,2623-2632; Werther ve ark (1996) J. Iminunol. Methods 157:4986-4995 ve Presta ve ark (2001) Thromb. Haemost 85:379-3 89). Çogu durumda ve çogunlukla, hümanize antikorlar, insan immüiioglobulinleridir (alici antikoru); bu immünoglobulinlerde, alicinin hiperdegisken bölge artiklari, istenen spesifisite, afinite ve kapasiteye sahip, fare, siçan, tavsan ya da insan- disi primat gibi bir insan-disi türden elde edilen hiperdegisken bölge artiklariyla (donör antikoru) ikame edilirler. Bazi durumlarda, insan immünoglobulininin çerçeve bölge (FR) artiklari, bunlara tekabül eden insan-disi artiklarla ikame edilirler. Ek olarak, hümanize antikorlar, ne alici antikorunda ne de donör antikorunda bulunan artiklari içerebilirler. Bu modifikasyonlar, antikor performansini daha da arttirmak ve düzeltmek için yapilirlar. Hümanize antikor, genelde, hiperdegisken bölgelerin hepsinin ya da hemen hemen hepsinin bir insan-disi immünoglobulininkine tekabül ettigi ve FR bölgelerininhepsinin ya da hemen hemen hepsinin bir insan immünoglobulin35sekansinin bölgeleri oldugu en az bir ve normalde iki degisken doinainin hemen hemen hepsini kapsar. Hümanize antikor, istege göre, bir immünoglobulinin, normalde bir insan immünoglobulininin sabit bölgesinin (FC) en azindan bir kismini da içerebilir. Ilave detayli bilgi için bakiniz: US 6407213; Jones ve ark. (1986) Nature 321 :522- 525; Riechmann ve ark (1988) Nature 332z323-329 ve Presta, (1992) Curr. Op. Struct. Biol., 2:593-596.Bir "serbest sistein amino asidi", degistirilerek bir ana antikora dönüsürülmüs olan, bir tiyol fonksiyonel grubuna (-SH) sahip olan ve bir intramoleküler ya da intermoleküler disülfûr köprüsü olarakeslestirilmeyen sistein amino asit artigina atif yapar."Tiyol reaktivite degeri", serbest sistein amino asitlerinin reaktivitesinin bir kantitatif karakterizasyonudur. Tiyol reaktivite degeri, bir sistein degistirilmis antikorda, bir tiyol-reaktif nitelikte reaktif maddeyle reaksiyona giren bir serbest sistein amino asidi yüzdesidir ve maksimum 1 degerine dönüstürülür. Örnegin, bir sistein degistirilmis antikorda, bir biyotin-maleimid reaktifi gibi bir tiyol- reaktif nitelikte reaktif maddeyle %100"1'uk bir verimle reaksiyona giren bir serbest sistein amino asidi, tiyol reaktivite degeri 1,0 olan biyotin etiketli bir antikor olusturur. Ayni veya farkli ana antikor halinde tasarlanmis olan ve bir tiyol-reaktif nitelikte reaktif maddeyle %80°lik bir verimle reaksiyona giren bir baska sistein amino asidinin tiyol reaktivite degeri 0,8"dir. Ayni veya farkli ana antikor halinde tasarlanmis olan ve bir tiyol-reaktif nitelikte reaktif maddeyle hiç reaksiyona girmeyen bir baska sistein amino asidinin tiyol reaktivitedegeri 0°d1r. Belirli bir sisteinin tiyo] reaktivite degeri ELISA testiyle,36kütle spektroskopisiyle, sivi kromatografisiyle, otoradyografiyle veyabaska kantitatif analitik testlerle belirlenebilir.Bir "ana antikor", bir veya daha fazla sayida ainino asit artiginin bir veya daha fazla sayida sisteiii artigiyla ikame ediligi bir amino asit sekansi içeren bir antikordur. Ana antikor, bir nativ veya yabani tip sekans içerebilir. Ana antikor, bir antikorun baska nativ, yabani tip ya da modifiye formlarina kiyasla önceden-mevcut amino asit sekans modifikasyonlari (örnegin eklemeler, delesyoiilar ve/Veya sübstitüyonlar) içerebilir. Bir ana antikor, ilgili hedef anti jene, önregin biyolojik açidan önemli polipeptide karsi yönlendirilebilir. Polipeptid- disi antijenlere (ömegin tümör-iliskili glikolipid antijenleri; bakinizUS 5091178) karsi yönlendirilen antikorlar da Öngörülmektedir.Ornek ana antikorlar arasinda hücre yüzeyi ve transmembran reseptörler ve tümör-iliskili antijenler (TAA) için afiniteye veselektiviteye sahip antikorlar vardir.Ornek baska ana antikorlar arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, asagida sayilanlar arasiiidan seçilenler vardir: anti-'Östrojen reseptör antikoru, anti-progesteron reseptör antikoru, anti-p53 antikoru, anti- HER-2/neu antikoru, anti-EGFR antikoru, anti-katepsin D antikoru, anti-Bcl-Z antikoru, anti-l3-kadheriii antikoru, aiiti-CA125 antikoru, and-CA15-3 antikoru, anti-CAI9-9 antikoru, anti-c-erbB-2 antikoru, anti-P-glikoprotein antikoru, anti-CEA antikoru, anti-retinoblastom protein antikoru, anti-ras onkoprotein antikoru, anti-Lewis X antikoru, anti-Ki-67 antikoru, anti-PCNA antikoru, anti-CD3 antikoru, anti- CD4 antikoru, anti-CD5 antikoru, anti-CD7 antikoru, anti-CBS37antikoru, anti-CD9/p24 antikoru, anti-CDIO antikoru, anti-CDllc antikoru, anti-CD13 antikoru, anti-CD14 aiitikoru, anti-CD15 antikoru, anti-CD19 antikoru, anti-CDZO antikoru, anti-CD22 antikoru, anti-CD23 antikoru, anti-CD30 antikoru, anti-CD3l antikoru, anti-CD33 antikoru, anti-CD34 antikoru, anti-CD35 antikoru, anti-CD38 antikoru, anti-CD41 antikoru, anti-LCA/CD45 antikoru, anti-CD45RO antikoru, anti-CD45RA antikoru, anti-CD39 antikoru, anti-CDIOO antikoru, anti-CD95/Fas antikoru, anti-CD99 antikoru, anti-CD106 antikoru, anti-ubikutin antikoru, anti-CD7l antikoru, anti-c-myc antikoru, anti-sitokeratin antikoru, anti-vimentin antikoru, anti-HPV protein antikoru, anti-kappa hafif zincir antikoru, anti-lambda hafif zincir antikoru, anti-melanozom antikoru, anti- prostat spesifik anti jeii antikoru, anti-S-lOO antikoru, anti-tau antijen antikoru, anti-fibrin antikoru, anti-keratin antikoru ve anti-Tn-antijenantikoru.Bir "izole" antikor, kendi dogal ortainina ait bir bilesen çerçevesinde taiiimlaninis ve ondan ayrilmis ve/veya geri kazanilmis bir antikordur. Dogal ortaminin kontaminant bilesenleri, antikorun diyagnostik veya terap'otik kullanim olanaklarina müdahale edebilecek nitelikte olan materyallerdir ve bunlar arasinda, enzimler, hormonlar ve diger proteinli veya proteinsiz solütler sayilabilir. Bulusun tercih edilen yapilarinda, antikor, (l) Lowry yöntemi çerçevesiiide belirlenen degerlere göre, antikor agirliginin %95"inden daha fazla ve en çok tercihen %99"undan daha fazla bir noktaya kadar, (2) bir döner kap tipi sekanslayici kullanilarak, N-terminal ya da internal amino asit sekansina ait en az 15 artigi elde etmek için yeterli bir düzeye kadarya da (3) Coomassie mavi veya tercihen gümüs boya kullanilarak38indirgen kosullar ya da indirgen olmayan kosullar altinda SUS-PAGE yoluyla yapilan ölçüme göre hoinojenlik kaydedilene dek saflastirilir. Izole antikorlar arasinda, rekombinan hücreler içerisinde in situ bulunan antikorlar bulunur, zira bu durumda antikorun dogal ortaininda mevcut bulunan bilesenlerden en az biri mevcut olmayacaktir. Bununla birlikte, bu izole antikorlar hazirlanirkengenelde en az bir adet saflastirma basamagi gerçeklestirilecektir.Bir moleküler hedefi ya da ilgili antijeni, örnegin ErbB2 antijenini "baglayan" bir antikor, anti jen eksprese eden bir hücreyi hedef alma konusunda faydali olacak sekilde yeterli afiniteyle 0 antijeni baglayabilen bir antikordur. Antikor ErbBZ"yi baglayan bir antikor oldugunda, genellikle tercihen baska ErbB reseptörlerinin aksine ErbB2"yi baglar ve EGFR, ErbB3 ya da ErbB4 gibi baska proteinlerle anlamli ve önemli çapraz reaksiyona girmeyen bir antikor olabilir. Bulusun böyle yapilarinda, antikorun bu non-ErbB2 proteinlerine baglanma düzeyi (örnegin, endojen reseptöre hücre yüzeyi baglanmasi), floresan aktive hücre ayirma (FACS) analiziyle ya da radyoiinmünopresipitasyonla (RIA) tayin edildigi gibi %10"dan azdir. Zaman zaman, örnegin, "Schecter ve ark. (1984) Nature 312:513" ve "Drebin ve ark (1984) Nature 312:545-548" referanslarinda tarif edildigi gibi, anti-ErbB2 antikoru siçan neu proteiniyle anlamli ve önemli çapraz reaksiyona girmezBu bulus kapsaminda yer alan antikorlar için moleküler hedefler arasinda 'Örnegin bunlarla siiiirli kalmaksizin asagida sayilanlar da dahil CD proteinleri ve oiilarin ligandlari vardir: (i) CD3, CD4, CD8, CDl9, CD20, CD22, CD34, CD40, CD7901 (CD79a) ve CD79ß (CD79b); (ii) ErbB reseptör ailesinin üyeleri, örnegin EGF reseptörü,39HERZ, HER3 ya da HER4 reseptörü; (iii) hücre adezyon molekülleri, örnegin LFA-l, Macl, p150,95, VLA-4, ICAM-l, VCAM ve 0tV/ß3 integrin ve bunlarin alfa ya da beta alt-birimleri (örnegin, anti-CDI la, anti-CD18 ya da anti-CDI lb antikorlari); (iv) büyüme faktörleri, örnegin VEGF; IgE; kan grubu anti jenleri; flk2/flt3 reseptörü; obezite (OB) reseptörü; mp1 reseptörü, CTLA-4; protein C, BR3, c-met, doku faktörü, B7 ve benzeri ve (V) hücre yüzeyi ve transmembran tümör-iliskili anti jenler (TAA).Aksi belirtilmedikçe, "monoklonal antikor 4D5" terimi, murin 4D5 antikorunun (ATCC CRL 10463) ya da ondan türetilen anti jen baglanma artiklarina sahip bir antikora atif yapar. Örnegin, nionoklonal antikor 4D5, murin monoklonal antikora 4D5 ya da onun bir varyanti, örnegin bir hümanize 4D5 olabilir. Hümanize 4D5 antikorlarina öniek olarak, ABD Patent No. 5821337°de açiklandigi gibi, huMAb4D5-l, huMAb4D5-2, huMAb4D5-3, huMAb4D5-4, huMAb4D5-5, huMAb4D5-6, huMAb4D5-7 ve huMAb4D5-8 (trastuzumab, HERCEPTIN®) gösterilebilir."Tedavi etme" ya da "tedavi" terimleri, hem terap'otik tedaviye hem de amaci örnegin kanserin gelismesi ya da yayilmasi gibi bir istenmeyen fizyolojik degisikligi ya da bozuklugu önlemek ya da yavaslatmak (azaltmak) olan profilaktik veya önleyici tedbirlere atif yapar. Bu bulusun amaçlari dogrultusunda, faydali ya da istenen klinik sonuçlar arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, belirlenebilir düzeyde olsun ya da olmasin, semptomlarin hafifletilmesi, hastaligin boyutunun azaltilmasi, stabil (yani, kötülesmeyen) hastalik durumu, hastalikprogresyonunun gecikmesi ya da yavaslamasi, hastalik durumunun40iyilesmesi ya da palyasyonu ve (kismen ya da tamamen) reinisyon vardir. "Tedavi", tedavi alinmadiginda beklenen sürviye kiyasla sürvinin uzamasi anlamina da gelebilir. Tedaviye ihtiyaci olanlar arasinda, rahatsizligin ya da bozuklugun zaten mevcut oldugu hastalar ve rahatsizliga ya da bozukluga egilimli olanlar ya da rahatsizligin yada bozuklugun önlenecegi hastalar vardir."Terapötik açidan etkin ve etkili miktar" ibaresi, bir memelide bir hastaligi ya da bozuklugu tedavi etmek için etkin ve etkili bir ilaç miktarina atif yapar. Kanser söz konusu oldugunda, terapötik açidan etkin ve etkili ilaç miktari, kaiiser hücrelerinin sayisini azaltabilir; tümörün boyutunu küçültebilir; periferal organlara kanser hücresi infiltrasyonunu inhibe edebilir (yani bir ölçüye kadar yavaslatabilir ve tercihen durdurabilir); tümör inetastaziiii inhibe edebilir (yani, bir ölçüye kadar yavaslatabilir ve tercihen durdurabilir); tümör büyümesini bir ölçüye kadar inhibe edebilir ve/veya kanserle iliskili bir veya daha fazla sayida semptomu bir ölçüye kadar hafifletebilir. Ilaç kanser hücrelerinin çogalmasini önleyebildigi ve/veya mevcut kanser hücrelerini öldürebildigi düzeyde sitostatik ve/veya sitotoksik olabilir. Kanser tedavisi için, etkinlik, örnegin hastalik progresyonuna kadar geçen zaman (TTP) degerlendirilerek ve/veya cevap orani (RR)tayin edilerek ölçülebilir."Biyoyararlanim" terimi, bir hastaya uygulanan belirli bir ilaç miktarinin sistemik yararlanimina (yani, kan/plazma seviyeleri) atif yapar. Biyoyararlanim, uygulanan dozaj formundan genel dolasima ulasan ilaç için hem zaman (hiz) ölçütünü hem de toplam miktar(düzey) ölçüiiü gösteren bir mutlak terimdir.41"Kanser" ve "kanseröz" terimleri, memelilerde görülen ve tipik olarak regüle edilmemis hücre çogalmasiyla karakterize olan fizyolojik duruma atif yapar ve onu tanimlar. Bir "tümör", bir veya daha fazla sayida kanseröz hücre içerir. Kansere 'Örnek olarak, bunlarla sinirli kalmaksizin, karsinom, lenfoma, blastom, sarkoina ve lösemi ya da lenfoid malignensiler gösterilebilir. Bu kanserlerin daha somut 'Örnekleri arasinda skuamöz hücreli kanser (örnegin, epitelyal skuamöz hücreli kanser), küçük-hücreli akciger kanseri, küçük hücreli-disi akciger kanseri ("NSCLC"), akciger adenokarsinomu ve skuain'oz akciger karsinomu da dahil akciger kanseri, peritoneum kanseri, hepatoselüler kanser, gastrointestinal kanser de dahil gastrik kanser ya da mide kanseri, pankreas kanseri, glioblastom, serviks kanseri, yumurtalik kanseri, karaciger kanseri, mesane kanseri, hepatom, meme kanseri, kolon kanseri, rektal kanser, colorektal kanser, endometrium ya da uterin karsinomu, tükürük bezi karsinomu, böbrek kanseri ya da renal kanser, prostat kanseri, vulva kanseri, tiroid kanseri, hepatik karsinom, anal karsinom, penil karsinom ve bas veboyun kanseri sayilabilir.Bir "ErbB-eksprese eden kanser", hücre yüzeyinde ErbB proteini bulunan hücreler içeren bir kanserdir. Bir "ErbBZ-eksprese eden kanser", bir anti-ErbB2 antikoru baglanabilecek ve kanser açisindan terapötik bir etki yapabilecek sekilde, hücrelerinin yüzeyi üzerindeyeterli düzeyde ErbB2 üreten bir kanserdir.Bir antijenik reseptörü "asiri-eksprese eden" bir kanser, ayni doku tipinden kanseröz olmayan bir hücreye kiyasla, hücre yüzeyi üzerindeanlamli ve önemli düzeyde daha yüksek seviyelerde reseptör, örnegin42ErbB2 içeren bir kanserdir. Bu asiri-ekspresyona, gen amplifikasyonu ya da transkripsiyonda veya translasyonda artis neden olabilir. Reseptör asiri-ekspresyonu, bir hücrenin yüzeyi üzerinde bulunan reseptör proteininin seviyelerinde artis (örnegin, bir iminünohistokimya eseyiyle; IHC) degerlendirilerek bir diyagnostik ya da prognostik eseyde tayin edilebilir. Alternatif ya da ek olarak, örnegin, floresan in-situ hibridizasyon (FISH; bakiniz WO 98/45479), southern blotlaina ya da polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) teknikleriyle, örnegin gerçek-zamanli kantitatif PCR (RT-PCR) teknigiyle hücrede reseptör-kodlayici nükleik asit seviyeleriölçülebilir.ErbB2 (HER2) asiri eksprese eden tümörler, beher hücrede eksprese edilen HER2 moleküllerinin birçok kopyasina tekabül eden imniünohistokimyasal skorlarla siniflandirilir ve biyokimyasal olarak tayin edilebilir: 0 = 0-10.000 kopya/hücre, l+ = en az yaklasik 200.000 k0pya/hücre, 2+ = en az yaklasik 500.000 k0pya/hücre, 3+ = yaklasik 1-2 X 106 kopya/hücre. Tirozin kinazin ligand-bagimsiz aktivasyonuna yol açan 3+ seviyesinde HERZ asiri ekspresyonu (Hudziak ve ark (1987) Proc. Natl Acad Sci. USA, 84:7159-7163), meme kanserlerinin yaklasik %30"unda meydana gelir ve bu hastalarda, relaps görülmeyen sürvi ve genel sürvi azalir (Slamon ve ark (1989) Science, 244:707-712; Slamon ve ark (1987) Science, 2352177-182).Bu dokümanda kullanilan "sitotoksik ajan" terimi, hücrelerin fonksiyonunu inhibe eden ya da önleyen ve/veya hücre yikiminaneden olan bir maddeye atif yapar. Bu teriinin isaret ettigi maddeler43arasinda, radyoaktif izotoplar (örnegin "At, 1311, '251,90Y, '86Re, 188Re, 15'7'Sm, mBi, 32P, 60C ve Lu radyoaktif izotoplari), kemoterapötik ajanlar ve toksinler, örnegin, küçük molekül toksinleri ya da enzimatik açidan aktif bakteriyel, fungal, bitkisel ya da hayvansal toksinler ve bunlarin sentetik analoglari vetürevleri bulunur.Bu dokümanda kullanilan bir "otoimmün hastalik" terimi, kisinin kendi dokularindan ya da organlarindan kaynaklanan ya da kendi dokularina ya da organlarina karsi yönlendirilen bir hastaliga ya da bozukluga ya da bu gibi hastaliklarin ya da bozukluklarin kosegregasyonu veya birlikte tezahürüne ya da bu gibi hastaliklardan dolayi meydana gelen rahatsizliklara atif yapar. Bu otoimmün ve inflamatuar hastaliklarin birçogunda, bir dizi klinik marker ve laboratuvar markeri bulunabilir, bu markerler arasinda, sadece bunlarla sinirli kalmaksizin, hipergamaglobulinemi, yüksek otoantikor seviyeleri, dokularda antijen-antikor kompleksi birikiinleri, kortikosteroid tedavileri veya iinmünosüpresif tedavilerden saglanan fayda ve etkilenen dokulardaki lenfoid hücre agregatlari bulunur. B hücresi aracili otoimmün hastaliklarla ilgili teorilerin çizdigi çerçeve göz ardi edildiginde, B hücrelerinin insan otoimmün hastaliklarinda çok sayida mekanik yolak araciligiyla patojenik etki gösterdiklerine inanilmaktadir, bu yolaklar arasinda, otoantikor üretimi, immün kompleks olusumu, dendritik ve T hücresi aktivasyonu, sitokin sentezi, direkt kemokin salimi ve ektopik neo-lenfogenez için bir nidus temini bulunur. Otoimmün hastaliklarin patolojisinde bu yolaklarin her biri farkli düzeylerde rol oynayabilir. Bir otoimmünhastalik, bir organ-spesifik hastalik (yani, endokrin sistemi,44hematopoetik sistem, cilt, kardiyopulinoner sistem, gastrointestinal ve karaciger sistemleri, renal sistem, tiroid, kulaklar, nöromüsküler sistem, merkezi sinir sistemi, Vb. gibi bir organ sistemini spesifik olarak hedef alan immün cevap) olabilecegi gibi, birden çok organ sistemini etkileme potansiyeli bulunan bir sistemik hastalik da (örnegin sistemik lupus eritematozus (SLE), romatoid artrit,polimiyozitis, Vb.) olabilir."Sitostatik" terimi, hücrelerin fonksiyonunu sinirlandirma, 'Örnegin selüler büyümeyi veya hücre proliferasyonunu sinirlandirma etkisineatif yapar.Bir "kemoterapötik ajan", kanser tedavisinde kullanilabilecek bir kimyasal bilesiktir. Kemoterap'otik ajanlara 'Örnek olarak asagida sayilanlar gösterilebilir: Erlotinib (TARCEVA®, Genentech/OSI Pharin.), Bortezomib (VELCADE®, Milleniuin Pharm.), Fulvestrant (FASLODEX®, Astrazeneca), Sutent (SU11248, Pfizer), Letrozol (FEMARA®, Novartis), Imatinib mesilat (GLEEVECC'D, Novartis), PTK787/ZK 222584 (Novartis), Oksaliplatin (Eloxatin®, Sanofi), 5- FU (5-florourasil), Lökovorin, Rapamisin (Sirolimus, RAPAMUNE®, Wyeth), Lapatinib (GSK572016, GlaxoSmithKline). Lonafarnib (SCH 66336), Sorafenib (BAY43-9006, Bayer Labs.) ve Gefitinib (IRESSA®, Astrazeneca), AG1478, AG1571 (SU 5271; Sugen), tiyotepa ve CYTOXAN® siklosfosfamid gibi alkilleme ajanlari; busülfan, improsülfan ve piposülfan gibi alkil sülfonatlar; benzodopa, karbokuon, meturedopa ve üredopa gibi aziridinler; altretamin, trietilenmelamin, trietilenfosforamid, trietilentiyofosforamid vetrimetiloloinelaimin de dahil etileniminler ve metilainelaininler;45asetogeninler (özellikle de bullatakin ve bul]atakin0n); kamptotesin (sentetik analog topotekan dahil); bryostatin; kallistatin; CC-1065 (onun adozelesin, karzelesin ve bizelesin sentetik analoglari da dahil); kriptofisinler (özellikle kriptofisin 1 ve kriptofisin 8); dolastatin; duokarmisin (sentetik analoglar KW-2189 ve CBl-TMl dahil); eleuterobin; pankratistatin; bir sarkodiktyin; spongistatin; klorambusil, klomafazin, kolofosfamid, estramustin, ifosfainid, mekloretamin, mekloretamin oksit hidroklor'ür, melfalan, noveinbisin, fenesterin, prednimustin, trofosfamid, urasil mustard gibi nitrojen mustardlar; karmustin, klorozotokin, fotemustin, lomustin, nimustin ve raniinnustin gibi nitrozüreler: enediyne antibiyotikler (örnegin kalikeamisin, 'Özellikle de kalikeamisin gama 11 ve kalikeamisin omegall (örnegin bkz: AgneW, Chem Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 (1994)) gibi antibiyotikler; dinemisin A da dahil dinemisin; klodronat gibi bisfosfonatlar; bir esperamisin; bunlarin yani sira, neokarzinostatin kromofor ve iliskili kromoprotein enediyne antibiyotik kromoforlari; aklasinomisinler, aktinomisin, antramisin, azaserin, bleomisinler, kaktinomisin, karabisin, karminomisin, karzinofilin, kromomisinler, daktinomisin, daunorubisin, detorubisin, 6-diazo-5-okso-L-norlösin, ADRIAMYCIN® doksorubisini (morfolino-doksorubisin, siyanomorfolino-doksorubisin, Z-pirrolino- doksorubisin ve deoksidoksorubisin dahil), epirubisin, esorubisin, idarubisin, marsellomisin, mitomisinler, örnegin mitomirin C, mikofenolik asit, nogalamisin, olivomisinler, peplomisin, potfiromisin, puromisin, kuelamisin, rodorubisin, streptonigrin, streptozosin, tubersidin, ubenimeks, zinostatin, zombisin; metotreksat ve 5-f10r0urasil (5-FU) gibi anti-inetabolitler; denopterin, metotreksat,pteropterin, trimetreksat gibi folik asit analoglari; fludarabin, 6-46merkaptopurin, tiyamiprin, tiyoguanin gibi purin analoglari; ansitabin, azasitidin, 6-azauridin, karmofur, sitarabin, dideoksi'ûridin, doksifluridin, enositabin, floksuridin gibi pirimidin analoglari; kalusteron, dromostanolon propionat, epitiostanol, mepitiostan, testolakton gibi androjenler; aminoglutetimid, mitotan, trilostan gibi anti-adrenaller; frolinik asit gibi folik asit canlandiricilar; aseglaton; aldofosfamid glikozit; aminolevulinik asit; enilurasil; amsakrin; bestrabusil; bisantren; edatraksat; defofamin; demekolsin; diazikuon; elfornitin; elliptinyuin asetat; bir epotilon; etoglusid; galyuin nitrat; hidroksiüre; lentinan; lonidainin; maytansin ve ansamitokinler gibi maytansinoidler; mitoguazon; mitoksantron; mopidanmol; nitraerin; pentostatin; fenamet; pirambisin; losoksantron; podofillinik asit; 2- etilhidrazit; prokarbazin; PSK® polisakkarit kompleksi (JHS Natural Products, Eugene, OR); razoksan; rizoksin; sizofiran; spirogermanyum; tenuazonik asit; triazikuon; 2,2',2"- triklorotrietilamin; trikotesenler (Özellikle de T-2 toksini, verrak'ürin A, roridin A ve anguidin); üretan; vindesin; dakarbazin; mannomüstin; mitobronitol; mitolaktol; pipobroman; gasitozin; arabinozit ("Ara-C"); siklofosfamid; tiyotepa; taksoidler, örnegin paklitaksel TAXOL®; (Bristol- Myers Squibb Oncology, Princeton, N.J.), paklitakselin albümin-islenmis nanopartikül formülasyonu olan Cremophor- içermeyen ABRAXANETM (American Pharmaceutical Partners, Schaumberg, Illinois) ve doksetaksel TAXOTERE®; (Rhöne- Poulenc Rorer, Antony, France); kloranbusil; GEMZAR® gemsitabin; 6- tiyoguanin; merkaptopurin; metotreksat; platin analoglari, örnegin cisplatin ve karboplatin; Vinblastin; platin; etopozit (VP-16); ifosfamid; mitoksantron; Vinkristin; NAVELBINE® Vinorelbin;novantron; tenipozit; edatreksat; daunomisin; aminopterin; kseloda;47ibandronat; CPT-ll; topoizomeraz inhibitörü RFS 2000; diflorometilornithine (DMFO); retinoidler, örnegin retinoik asit; kapesitabin ve yukarida sayilanlarin herhangi birisinin farmasötikaçidan kabul edilebilir tuzlari, asitleri ya da türevleri.Asagida siralananlar da burada verilen "kemoterapötik ajan" tanimina dahildirler: (i) hormonlarin tümörler üzerindeki etkinligini regüle ya da inhibe etme islevini gören anti-hormonal ajanlar, örnegin tamoksifen (NOLVADEX® tamoksifen dahil), raloksifen, droloksifen, 4-hidroksitamoksifen, trioksifen, keoksifen, LYl 17018, onapriston ve FARESTON® toremifen de dahil anti-östrojenler ve selektif östrojen reseptör modülatörleri (SERM°ler); (ii) adrenal bezlerdeki östrojen üretimini regüle eden aromataz enzimini inhibe eden aromataz inhibitörleri, örnegin 4(5)-imidazoller, aminoglutetimid, MEGASE® megestrol asetat, AROMASIN® eksemestan, formestan, fadrozol, RIVISOR® vorozol, FEMARA® letrozol ve ARIMIDEX® anastrozol; (iii) flutamid, nilutamid, bikalutamid, löprolid ve goserelin gibi anti- androjenler ve yani sira troksasitabin (bir 1,3-dioksolan nükleozit sitozin analogu); (iv) aroinataz inhibitörleri; (V) protein kinaz inhibitörleri; (vi) lipid kinaz inhibitörleri; (vii) antisens oligonükleotidleri, özellikle de anormal hücre proliferasyonunda rol oynayan sinyal yolaklarindaki genlerin ekspresyonunu inhibe edenler, örnegin PKC-alfa, Ralf ve H-Ras; (viii) ribozimler, örnegin VEGF ekspresyon inhibitörleri (örnegin ANGIOZYME® ribozim) ve HER2 ekspresyon inhibitörleri; (iX) gen tedavisi asilari gibi asilar, örnegin ALLOVECTIN® asisi, LEUVECTIN® asisi ve VAXID® asisi; PROLEUKIN®, rIL-2; bir topoizomeraz 1 inhibitörü olan LURTOTECAN®; ABARELIX® rmRH; (x) anti-anjiyogenik ajanlar,48örnegin bevasizumab (AVASTIN®, Genentech) ve (xi) yukarida sayilanlarin herhangi birisinin farinasötik açidan kabul edilebilirtuzlari, asitleri ve türevleri.Burada geçen "EGFR-hedefli ilaç" terimi, EGFR'ye baglanan ve istege bagli olarak EGFR aktivasyonunu inhibe eden bir terapötik ajana atif yapar. Bu gibi ajanlara verilebilecek örnekler arasinda, EGFR'ye baglanan antikorlar ve küçük moleküller sayilabilir. EGFR"ye baglanan antikorlara verilebilecek 'Örnekler arasinda, MAb 579 (ATCC CRL HB 8506), MAb 455 (ATCC CRL HB8507), MAb 225 (ATCC CRL 8508), MAb 528 (ATCC CRL 8509) (bkz: 4.943.533 sayili ABD Patenti, Mendelsohn ve ark.) ve örnegin bunlarin kiinerize 225 (C225 veya Setuksimab; ERBUTIX®) ve yeniden sekillendirilmis insan 225 (H225) gibi varyantlari (bkz: WO 96/40210, Imclone Systems Inc.); tip II mutant EGFR"ye baglanan antikorlar (5.212.290 sayili ABD Patenti); EGFR"ye baglanan hümanize ve kimerik antikorlar (5.891.996 sayili ABD Patenti) ve EGFR°ye baglanan 'Örnegin ABX-EGF gibi insan antikorlari (bkz: WO98/50433, Abgenix/Amgen) vardir. Anti-EGFR antikoru, bir sitotoksik ajanla konjuge edilebilir ve bu yolla, bir immünokonjigat olusturulabilir (bakiniz örnegin, EP 659,439A2, Merck Patent GmbH). EGFR,ye baglanan küçük moleküllere örnek olarak ZD1839 ya da Gefitinib (IRESSATM; Astra Zeneca), Erlotinib HCl (CP-358774, TARCEVATM; Genentech/OSI) ve AG1478, AG1571 (SU 5271;Sugen) gösterilebilir.Protein kinaz inhibitörleri, ErbB reseptörü gibi bir tirozin kinazintirozin kinaz aktivitesini belirli bir dereceye kadar inhibe eden tirozin49kinaz inhibitörlerini kapsar. Bu gibi inhibitörlere verilebilecek örnekler asagida sayilmaktadir: bir 'Önceki paragrafta geçen EGFR- hedefli ilaçlar ve bunlarin yani sira, PD l53035.4-(3-kloroanilino) kuinazolin gibi kuinazolinler; piridopirimidinler; piriinidopirimidinler; CGP 59326, CGP 60261 ve CGP 62706 gibi pirolopirimidinler ve pirazolopirimidinler, 4-(fenilaniino)-7H-pirr010[2,3-d] pirimidinler; kürküinin (diferuloil metan, 4,5-bis (4-f10roanilin0)ftalimid); nitrotiofen moieteleri içeren tirfostinler; PD-0183805 (Warner- Lambert); antisens molekülleri (örnegin ErbB-kodlayici nükleik aside baglananlar); kinoksalinler (5.804.396 sayili ABD Patenti); trifostinler (5.804.396 sayili ABD Patenti); ZD6474 (Astra Zeneca); PTK-787 (Novartis/Schering AG); CI-1033 (Pfizer) gibi pan-ErbB inhibitörleri; Affinitac (1818 3521; Isis/Lilly); Imatinib mesilat (Gleevac; Novartis); PKI 166 (Novartis); GW2016 (Glaxo SinithKline); CI-1033 (Pfizer); EKB-569 (Wyeth); Semaksinib (Sugen); ZD6474 (AstraZeneca); PTK-787 (Novartis/Schering AG); INC-lCll (Imclone) ya da asagidaki patent yayinlarinin herhangi birinde isaret edilenler: WO 99/09016 (American Cyanamid); WO 98/43960 (American Cyanamid); WO 97/38983 (Warner Lambert); WO 99/06378 (Warner Lainbert); WO 99/06396 (Warner Lambert); WO 96/30347 (Pfizer, Inc); WO 96/33978 (Zeneca); WO 96/3397 (Zeneca) ve WO 96/33980 (Zeneca).Bir "anti-anjiyogenik ajan", kan damarlarinin gelisimini belirli bir dereceye kadar bloke eden veya engelleyen bir bilesige atif yapar. Anti-anjiyogenik faktör, örnegin, an jiyogenez kolaylastirilmasinda rol oynayan bir büyüme faktörüne veya büyüme faktörü reseptörüne baglanan bir küçük molekül ya da antikordur. Burada tercih edilenanti-anjiyogenik faktör, Vasküler Endotelyal Büyüme Faktörüne50(VEGF) baglanan bir antikordur."Sitokin" terimi, baska bir hücre üzerinde etki gösteren bir hücre popülasyonunca interselüler aracilar olarak serbest birakilan proteinlere isaret eden bir jenerik terimdir. Bu gibi sitokinlere verilebilecek örnekler arasinda, lenfokinler, monokinler ve geleneksel polipeptid hormonlari bulunur. Sitokinlere örnek olarak asagida sayilanlar da verilebilir: insan büyüine hormonu, N-metionil insan büyüme faktörü ve bovin büyüme hormonu gibi büyüme hormonlari; tiroksin; paratiroid hormonu; tiroksin; insülin; proinsülin; relaksin; prorelaksin; folikül stimüle edici horinon (FSH), tiroid stimüle edici hormon (TSH) ve lüteinleyici horinon (LH) gibi glikoprotein hormonlari; hepatik büyüme faktörü; fibroblast büyüme faktörü; prolaktin; plasental laktojen; tümör nekroz faktörü-Ot ve [3; inüllerian inhibe edici madde; fare gonadotropini baglantili peptid; inhibin; aktivin; vasküler endotelyal büyüme faktörü; integrin; trombopoietin (TPO); NGF-ß gibi sinir büyüme faktörleri; trombosit büyüine faktörü; TGF-a ve TGF-ß gibi transforme edici büyüme faktörleri (TGF°ler); insülin-benzeri büyüine faktörü-l ve _11; eritropoietin (EPO); osteoindüktif faktörler; interferon-oi, -B ve -y gibi interferonlar; makrofaj-CSF (M-CSF), granülosit-makrofaj-CSF (GM-CSF) ve granülosit-CSF (G-CSF) gibi koloni stimüle edici faktörler (CSF'ler); IL-l, IL-la, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-lO, IL- 11 ve IL-12 gibi interlökinler (IL°ler); TNF-oi veya TNF-ß gibi bir tümör nekroz faktörü ve LIF ve kit ligandi (KL) dahil diger polipeptid faktörleri. Burada geçen sitokin teriminin kapsamina, dogal kaynagindan veya rekombiiian hücre kültüründen elde edilenproteinler ve nativ sekans sitokinlerinin biyolojik olarak aktif51esdegerleri de girer.Bu patent basvurusunda kullanilan "ön-ilaç" terimi, bir farmas'otik açidan kabul edilebilir etkin maddenin ana ilaca kiyasla tümör hücrelerine karsi daha düsük bir sitotoksisiteye sahip olan ve enzimatik veya hidrolitik olarak aktive edilebilecek ya da daha aktif ana forma dönüstürülebilecek olan bir prek'ûrsor veya türev formuna atif yapar. Bakiniz örnegin, Wilman, "Prodrugs in Cancer Chemotherapy" Biochemical Society Transactions, 14, sayfa 375-382, 615. Meeting Belfast (1986) ve Stella ve ark., "Prodrugs: A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery," Directed Drug Delivery, Borchardt ve ark., (ed), sayfa 247-267, Humana Press (1985). Bu bulusa konu olan 'Ön-ilaçlar arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, fosfat-içeren 'Ön-ilaçlar, tiofosfat-içeren 'Ön-ilaçlar, sülfat-içeren `Ön- ilaçlar, peptid-içeren 'Ön-ilaçlar, D-amino asit-modifiye edilmis ön- ilaçlar, glikosile 'Ön-ilaçlar, ß-laktam-içeren 'Ön-ilaçlar, istege göre substit'üe edilen fenoksiasetamid-içeren 'Ön-ilaçlar, istege göre substitüe edilen fenilasetamid-içeren `Ön-ilaçlar, 5-f10r0sitozin ve daha aktif sitotoksik serbest ilaç formuna dönüstürülebilecek baska 5- floroüridin Ön-ilaçlari sayilabilir. Bu bulusta kullanmak üzere bir ön- ilaç formuna derivatize edilebilecek sitotoksik ilaçlara örnek olarak, bunlarla sinirli kalmaksizin, yukarida açiklananlar gibi kemoterapötikajanlar gösterilebilir.Bir "lipozom", bir ilaci (örnegin burada açiklanan anti-ErbBZ antikorlari ve istege göre, bir kemoterap'otik ajan) bir memeliye tasimak ainaciyla kullanilan, çesitli farkli tiplerde lipid, fosfolipidve/veya yüzey-aktif maddeden olusan küçük bir veziküldür. Lipozom52bilesenleri, genellikle, biyolojik ineinbranlarin lipid düzenlemesinebenzer sekilde, bir çift-katmanli olusum halinde dizilirler."Kullanma talimati" ibaresi, geleneksel olarak terapötik ürünlerin ticari paketlerine dahil edilen ve endikasyonlar, kullanim, dozaj, uygulama ve kontrendikasyonlar konusunda bilgiler ve/veya bu terapötik ürünlerin kullanimina iliskin uyarilar içeren talimatlara atfenkullanilir."Faj görüntüleme", varyant polipeptidlerin faj partiküllerinin, örnegin filamentöz faj partiküllerinin yüzeyi üzerinde bulunan bir kilif proteinine füzyon proteinleri olarak görüntülenmesine dayanan bir tekniktir. Randomize protein varyantlarindan olusan büyük kütüphanelerin bir hedef moleküle yüksek afiniteyle baglanan sekanslar bakimindan hizli ve verimli bir siralama ve siniflandirmaya tâbi tutulabilecek olmasi, faj görüntüleme tekniginin sagladigi avantajlardan biridir. Fajda peptid ve protein kütüphanelerini görüntüleme yöntemi, spesifik baglanma özellikleri sergileyen polipeptidleri bulmak ainaciyla milyonlarca polipeptid arasinda tarama yapmak için kullanilmaktadir. Polivalent faj görüntüleme yöntemleri, filamentöz fajin plll veya pVlll ürünüyle kurulan füzyonlar araciligiyla küçük random peptidleri ve küçük proteinleri görüntülemek için kullanilinaktadirlar (bkz: "Wells and Lowman (1992) Curr. Opin. Struct. Biol. 3:355-362" eseri ve orada atif yapilan diger eserler). Bir movolanet faj görüntülemede, bir protein veya peptid kütüphanesi bir faj kilif proteinine veya onun bir kismina füzyonlanir ve yabani tip proteinin varliginda düsük seviyelerdeeksprese edilir. Polivalent faj görüntüleineye kiyasla avidite etkileri53daha düsüktür, dolayisiyla siralama ve siniflandirma intrinsik ligand afinitesine dayanir ve DNA manipülasyonlarini kolaylastiran ve basitlestiren fajmid vektörleri kullanilir. Bkz: Lowman and Wells, Methods: A companion to Methods in Enzmology, 3:205-0216 (1991). Faj görüntüleme, antikor-benzeri inoleküller üretme tekniklerini kapsar (Janeway, C., Travers, P., Walport, M., Shlomchik (2001) Immunobiology, 5. Ed., Garland Publishing, NeW York, p627- 628; Lee ve ark).Bir "fajmid", ColEl gibi bir bakteriyel replikasyon orijini ve bir bakteriyofa j intergenik bölgesinin bir kopyasini barindiran bir plazmid vektörüdür. Fajmid, filamentöz bakteriyofaj ve lambdoid bakteriyofaj dahil olmak üzere bilinen herhangi bir bakteriyofajda kullanilabilir. Plazmid, bunlarin yani sira, bir seçilebilir antibiyotik direnç inarkeri de içerecektir. Bu vektörlere klonlanan DNA segmentleri, plazmid olarak çogaltilabilirler. Faj partikülllerinin üretimi için gereken tüm genlerle birlikte bu vektörleri tasiyan hücreler temin edildiginde, plazinidin replikasyon modu degiserek döner daire replikasyonu olur ve bu sayede, plazmid DNA'nin iplikçiklerinden birinin kopyalari olusur ve faj partikülleri paketlenir. Fajmid, enfeksiyöz olan veya olmayan faj partikülleri olusabilir. Bu terim, bir heterolog polipeptid genine bagli olan ve onunla birlikte bir gen füzyonu olusturarak heterolog polipeptidin faj partikülünün yüzeyi üzerinde görüntülenmesini saglayan bir faj kilif protein geni veya genfragmaninin yer aldigi fajmidleri kapsar."Baglayici", "Baglayici Birimi" ya da "bag", bir kovalent bag ya da birantikoru bir ilaç moiyetesine kovalent baglayan bir atom zinciri içeren54bir kimyasal moiyete anlamina gelir. Bu bulusun çesitli farkli yapilarinda, bir baglayici L olarak belirtilir. Baglayicilar, bir alkildiil, bir arilen, bir heteroarilen gibi bir divalent radikali; -(CR2)nO(CR2)n-, alkiloksi tekrarlama biriinleri (örnegin polietilenoksi, PEG, polimetilenoksi) ve alkilainino (örnegin polietilenamino, J effamineTM) gibi moiyeteleri ve süksinat, süksinamid, diglikolat, malonat vekaproainid dahil diasit ester and amidleri kapsar."Etiket" terimi, bir antikora kovalent baglanabilen ve asagida açiklanan islevleri gören herhangi bir moiyete anlamina gelir: (i) belirlenebilir bir sinyal verme; (ii) bir ikinci etiketle etkilesiine girerek birinci ya da ikinci etiketin sagladigi belirlenebilir sinyali (örnegin, FRET, yani floresans rezonans enerji transferi) modifiye etme; (iii) antijenle ya da ligandla etkilesimleri stabilize etme ya da baglanma afinitesini arttirma; (iv) yük, hidrofobisite, sekil ya da baska fiziksel parametrelerle mobiliteyi, 'örnegin elektroforetik mobiliteyi ya da hücre geçirgenligini etkileme ya da (v) ligand afinitesi, antikor/antijen baglanmasi ya da iyonik kompleks olusturmayi module etmek için biryakalama moiyetesi sunma.Burada kullanilan stereokimyasal tanimlar ve teamüller genellikle "8. P. Parker, Ed., McGraW-Hill Dictionary of Chemical Terins (1984) McGraW-Hill Book Company, NeW York" ve "Eliel, E. and Wilen, S., "Stereochemistry of Organic Compounds", John Wiley & Sons, Inc., New York, 1994" referanslarina uygundur. Birçok organik bilesik, optik açidan aktif formda bulunur, yani düzlem-polarize isigin düzlemini döndürme kabiliyetine sahiptir. Optik açidan aktif bilesikaçiklanirken, molekülün kiral merkez(ler)i etrafindaki mutlak55konfigürasyonunu tanimlamak için D ve L ya da R ve S Önekleri kullanilir. Bilesik tarafindan düzlem-polarize isigin rotasyon yönünü tanimlamak için (1 ve 1 ya da (+) ve (-) önekleri kullanilir; (-) ya da 1 önekleri, bilesigin sola çeviren oldugu anlainina gelir. (+) ya da (1 önekli bir bilesik, saga çevirendir. Belirli bir kimyasal yapi için, bu stereoizomerler birbirlerinin ayna görüntüleri olmalari hariç özdestir. Bir spesifik stereoizomer, bir enantiomer olarak da anilabilir ve bu izomelerin bir karisimi çogunlukla bir eiiantiomerik karisimi olarak adlandirilir. Enantiomerlerin 50:50 oraninda bir karisimi, bir rasemik karisim ya da bir rasemat olarak anilir ve bu karisim, bir kimyasal reaksiyonda ya da proseste herhangi bir stereoseleksiyon ya da stereospesifisitenin olmadigi durumlarda elde edilebilir. "Rasemik karisim" ve "rasemat" terimleri, optik aktivitesi olmayan ve ikienaiitomerik türden olusan bir esmolar karisima atif yapar.Bu dokümanda kullanilan "farmas'otik açidan kabul edilebilir tuz" ibaresi, bir ADC"nin farmas'otik açidan kabul edilebilir organik ya da inorganik tuzlarina atif yapar. Tuzlara 'Örnek olarak, bunlarla sinirli kalmaksizin, sülfat, sitrat, asetat, oksalat, klorür, bromür, iyodür, nitrat, bisülfat, fosfat, asit fosfat, izonikotinat, laktat, salisilat, asit sitrat, tartrat, oleat, tannat, pantotenat, bitartrat, askorbat, süksinat, maleat, gentisinat, fumarat, glukonat, glukuronat, sakkarat, format, benzoat, glutamat, metansülfonat, etansülfonat, benzensülfonat, p- tolüensülfonat ve pamoat (yani, 1,1'-metilen-bis-(2-hidroksi-3- naftoat)) tuzlari gösterilebilir. Farmasötik açidan kabul edilebilir bir tuz, bir asetat iyonu, bir süksinat iyonu ya da baska karsit-iyon gibi baska bir molekülün dahil edilmesini kapsayabilir. Karsit-iyon, anabilesik üzerindeki yükü stabilize eden herhangi bir organik ya da56inorganik moiyete olabilir. Ek olarak, farmasötik açidan kabul edilebilir bir tuzun yapisinda birden fazla yüklü atom bulunabilir. Çoklu yüklü atomlarin farmasötik açidan kabul edilebilir tuzun parçasi oldugu durumlarda, tuz, çoklu karsit iyonlar içerebilir. Sonuç olarak, farmas'Ötik açidan kabul edilebilir bir tuz, bir veya daha fazla sayidayüklü atom ve/Veya bir veya daha fazla sayida karsit-iyon içerebilir."Farmasötik açidan kabul edilebilir solvat", bir veya daha fazla sayida çözücü molekülü ve bir ADC"nin birlesmesine atif yapar. Farmasötik açidan kabul edilebilir solvatlar olusturan çözücülere örnek olarak, bunlarla sinirli kalmaksizin, su, izopropanol, etanol, metanol, DMSO,etil asetat, asetik asit ve etanolamin gösterilebilir.Asagida verilen kisaltmalar, bu dokümanda kullanilmaktadir ve belirtilen anlama sahiptirler: BME, beta-merkaptoetanoldür; Boc, N- (t-bütoksikarbonil) bilesigidir; çit, sitrullindir (2-amin0-5-üreid0 pentanoik asit); dap, dolaproindir; DCC, 1,3-disikloheksilkarbodiimid bilesigidir; DCM, diklorometan bilesigidir; DEA, dietilamin bilesigidir; DEAD, dietilazodikarboksilat bilesigidir; DEPC, dietilfosforilsiyanidat bilesigidir; DIAD, diizopropilazodikarboksilat bilesigidir; DlEA, N,N-diizopropi1etilamin bilesigidir; dil, dolaizolösindir; DMA, dimetilasetamid bilesigidir; DMAP, 4- dimetilaminopiridin bilesigidir; DME, etilenglikol dimetil eter (ya da 1,2-dimetoksietan) bilesigidir; DMF, N,N-dimetilformamid bilesigidir; DMSO, dimetilsülfoksit bilesigidir; doe, dolafenindir; dov, N,N- dimetilvalindir; DTNB, 5,5'-ditiyobis(2-nitrobenzoik asit) bilesigidir; DTPA, dietilentriaminpentaasetik asit bilesigidir; DTT, ditiyotreitoldür; EDCI, 1-(3-diinetilaminopropi1)-3-etilkarbodiimid57hidroklorür bilesigidir; EEDQ, 2-etoksi-1-etoksikarboriil-l ,2- dihidrokinolin bilesigidir; ES-MS, elektrosprey kütle spektrometrisidir; EtOAc, etil asetattir; Fmoc, N-(9- florenilmetoksikarbonil) bilesigidir; gly, glisindir, HATU, O-(7- azabenzotriazol-l -il)-N,N,N',N'-tetrametiluronyum heksaflorofosf at bilesigidir; HOBt, 1-hidr0ksibenzotriazol bilesigidir; HPLC, yüksek basinçli SlVl kromatografisidir; ile, izolösindir; lys, lizindir; MeCN (CH3CN), asetonitrildir; MeOH, metanoldi'ir; Mtr, 4-anisildifenilmetil (ya da 4-met0ksitritil) bilesigidir; nor, (lS, 2R)-(+)-n0refedrin bilesigidir; PAB, p-amiriobenzilkarbamoil bilesigidir; PBS, fosfat- tamponlu salindir (pH 7); PEG, polietilen glikoldür; Ph, fenildir; Pnp, p-nitrofenildir; MC, 6-maleimid0kapr0ildir; phe, L-fenilalanin bilesigidir; PyBrop, bromo tris-pirrolidino fosfonyum heksaflorofosfat bilesigidir; SEC, boyut dislama kromatografisidir; Su, süksinimiddir; TFA, trifloroasetik asittir; TLC, ince tabaka kromatografisidir; UV,ultraviyoledir ve val, valindir.SISTEIN DEGISTIRILMIS ANTIKORLARBu bulus açiklamasina konu olan bilesikler, bir yabani-tip ya da ana antikorun bir veya daha fazla sayida amino asidinin bir sistein amino asidiyle ikame edildigi sistein degistirilmis antikorlari kapsar. Antikorun herhangi bir formu bu sekilde degistirilebilir, yani mutasyona ugratilabilir. Örnegin, bir ana Fab antikoru fragmani, burada "ThioFab" olarak anilan bir sistein degistirilmis Fab olusturacak sekilde degistirilebilir. Benzer sekilde, bir ana monoklonal antikor, bir "ThioMab" olusturacak sekilde degistirilebilir. Tekbölgedeki mutasyonun bir ThioFab'da tek bir degistirilmis sistein58artigi olusturdugu, buna karsilik IgG antikorunun dimerik yapisindan dolayi bir ThioMabsda iki adet degistirilmis sistein artigi olusturdugu vurgulanmalidir. Ikame edilmis ("degistirilmis") sistein (Cys) artiklari bulunan mutantlar, yeni sokulan, degistirilmis sistein tiyol gruplarinin reaktivitesi açisiiidan degerlendirilir. Tiyol reaktivitesi degeri, 0 ile 1,0 araliginda bagil sayisal birimdir ve herhangi bir sistein degistirilmis antikor için ölçülebilir. Bu bulus açiklamasina konu olan sistein degistirilmis antikorlarin tiyol reaktivitesi degerleri 0,6 ile 1,0araliginda; 0,7 ile 1,0 araliginda ya da 0,8 ile 1,0 araligindadir.Bu bulusa konu olan tasarlama, seçme ve hazirlama yöntemleri, elektrofilik fonksiyonellikle reaktif olan sistein degistirilmis antikorlara olanak saglar. Bu yöntemler, ayrica, belirtilen, tasarlanan, selektif bölgelerde ilaç moleküllerine sahip antikor-ilaç konjugati (ADC) bilesikleri gibi antikor konjugat bilesiklerine de olanak saglar. Bir antikor yüzeyindeki reaktif sistein artiklari bir ilaç moiyetesinin maleiinid veya haloasetil gibi bir tiyol reaktif grubu vasitasiyla spesifik olarak konjuge edilmesine izin verir. Bir Cys artiginin tiyol fonksiyoiielliginin bir inaleimid grubuna nükleofilik reaktivitesi, lizin artiklarinin ainino grubu veya N-terminal amino grubu gibi bir proteindeki baska herhangi bir amino asit fonksiyonelligine kiyasla yaklasik 1000 kat daha yüksektir. Iyodoasetil ve maleimid reaktiflerindeki tiyol spesifik fonksiyonellik ainin gruplariyla reaksiyona girebilir, fakat daha yüksek pH ( 9,0) ve daha uzun reaksiyon süreleri gerekir (Garman, 1997, Non-Radioactive Labelling:A Practical Approach, Academic Press, London).Bu bulus açiklamasina konu olan sistein degistirilmis antikorlar59tercihen yabani tip, ana antikor inuadillerinin antijen baglama kapasitesini korur ve sürdürürler. Bundan dolayi, sistein degistirilinis antikorlar, antijenlere tercihen spesifik olarak baglanabilirler. Bu antijenler arasinda, örnegin tümör-iliskili antijenler (TAA), hücre yüzeyi reseptör proteinleri ve diger hücre yüzeyi molekülleri, transmembran proteinleri, sinyal proteinleri, hücre sürvisi regülatör faktörleri, hücre çogalmasi regülatör faktörleri, doku gelisimi ve diferansiyasyonuyla baglantili (örnegin, fonksiyonel olarak ona katkida bulundugu bilinen veya süphelenilen) moleküller, lenfokinler, sitokinler, hücre siklusu regülasyonunda rol oynayan moleküller, vaskülojenezde rol oynayan moleküller ve anjiyojenezle baglantili (örnegin, fonksiyonel olarak ona katkida bulundugu bilinen veya süphelenilen) moleküller bulunur. Tümör iliskili antijen bir küme diferansiyasyon faktörü (yani, bir CD protein) olabilir. Sistein degistirilmis antikorun baglanabildigi bir anti jen, yukarida atif yapilan kategorilerden birinin bir alt-setinin bir üyesi olabilir; burada, atif yapilan kategorinin diger alt-set(ler)i, (ilgili antijene göre) ayri birözellige sahip baska moleküller/antijenler içerir.Ana antikor; US 5821337 numarali patentte Tablo 3°de gösterildigi gibi huMAb4D5-1, huMAb4D5-2, huMAb4D5-3, huMAb4D5-4, huMAb4D5-5, huMAb4D5-6, huMAb4D5-7 ve huMAb4D5-8 (Trastuzumab, HERCEPTIN®); hümanize 520C9 (WO 93/21319) ve burada açiklandigi gibi hümanize 2C4 antikorlari arasindan seçilen bir hümanize antikor da olabilir. Bu bulus açiklamasina konu olan sistein degistirilmis antikorlar, bir tiyol-reaktif nitelikte reaktif maddeyle yere özgü biçimde ve etkili olarak kuplajlanabilir. Tiyol-reaktif niteliktereaktif madde, bir inultifonksiyonel baglayici reaktifi, bir yakalama,60yani afinite, etiket reaktifi (örnegin, bir biyotin-baglayici reaktifi), bir belirleme etiketi (örnegin, bir florofor reaktifi), bir kati faz immobilizasyon reaktifi (örnegin, SEPHAROSETM, polistiren veya cam) veya bir ilaç-baglayici ara ürünü olabilir. Bir tiyol-reaktif nitelikte reaktif maddenin bir 'Örnegi N-etil maleimid (NEM) bilesigidir. Bir örnek yapida, bir ThioFabün bir biyotin-baglayici reaktifiyle reaksiyonu bir biyotinlenmis ThioFab ortaya çikarir ve bununla, sistein degistirilmis artigin varligi ve reaktivitesi teSpit edilebilir ve 'Ölçülebilir, Bir ThioFaan bir multifonksiyonel baglayici reaktifiyle reaksiyonu, bir ilaç moiyetesi reakifiyle veya baska bir etiketle reaksiyona sokulabilecek bir fonksiyonalize baglayicili bir ThioFab temin eder. Bir ThioFaan bir ilaç-baglayici ara ürünüylereaksiyonu bir ThioFab ilaç kon jugati temin eder.Burada tarif edilen örnek yöntemler, genel olarak antikorlarin tanimlanmasina ve üretimine ve daha genel olarak da burada tarif edilen tasarlama ve tarama basamaklarinin uygulanmasi yoluyla digerproteinlere uygulanabilir.Böyle bir yaklasim, reaktif grubunun Örnegin bir maleimid, bir iyodoasetamid, bir piridil disülfur veya baska tiyol-reaktif konjugasyon partneri oldugu baska tiyol-reaktif nitelikte reaktif maddelerin konjugasyonuna uygulanabilir (Haugland, 2003, Molecular Probes Handbook of Fluorescent Probes and Research Chemicals, Molecular Probes, Inc.;Brinkley, 1992, Bioconjugate Chem. 3:2; Garman, 1997, Non-Radioactive Labelling: A Practical Approach, Academic Press, London; Means (1990) Bioconjugate Chem. 1:2;Hermans0n, G. in Bioconjugate Techniques (1996)61Academic Press, San Diego, sayfa 40-55, 643-671). Partner, bir sitotoksik ajan (örnegin, doksorubisin ya da bogmaca toksini gibi bir toksin), bir floresan boya, örnegin floresein ya da rodamin gibi bir florofor, bir görüntüleme ya da radyoterapötik metal için bir selatlama ajani, bir peptidil ya da peptidil-disi etiket ya da belirleme tagi ya da polietilen glikolün çesitli farkli izomerleri gibi klirens-modifiye edici ajan, bir üçüncü komponente baglanan bir peptid ya da baska birkarbonhidrat ya da lipofilik ajan olabilir.Burada örnek antikor fragmani hu4D5 Fabv8°de tanimlanan yerler esas olarak tüm antikor türelerinde iyi korunan bir sabit antikor domaininde bulunur. Bu yerler, ilave yapisal tasarim ya da spesifik antikor yapisi bilgisine ihtiyaç olmadan ve antikorun degisken domainlerinde dogasi geregi bulunan antijen baglama özelliklerine müdahale etmeden baska antikorlara da kapsamli bir biçimdeuygulanabilir olmalidir.Kanser tedavisinde kullanilabilecek ve faydali olabilecek sistein degistirilmis antikorlar arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, hücre yüzeyi reseptörlerine ve tümör-iliskili antijenlere (TAA) karsi antikorlar vardir. Bu antikorlar, çiplak antikorlar (bir ilaç veya etiket moiyetesine konjuge edilmemis) olarak veya Formül 1 antikor-ilaç konjugatlari (ADC) olarak kullanilabilir. Tümör-iliskili antijenler sektörde bilinmektedir ve sektörde iyi bilinen yöntemler ve bilgiler kullanilarak antikorlar üretme prosesinde kullanmak amaciyla hazirlanabilir. Arastirmacilar, kanser tanisi ve tedavisi için etkin ve etkili selüler hedefler kesfetmek amaciyla, bir veya daha fazla sayidakanseröz olmayan normal hücreye(hücrelere) kiyasla bir veya daha62fazla sayida belirli tipte(tiplerde) kanser hücresinin yüzeyinde spesifik eksprese edilen transmenibran ya da tümör-iliskili polieptidleri tanimlamaya çalismislardir. Çogunlukla, bu tümör-iliskili polipeptidler, kanseröz olmayan hücrelerin yüzeyine kiyasla kanser hücrelerinin yüzeyinde daha fazla eksprese edilirler. Bu tümör-iliskili hücre yüzeyi anti jen polipeptidlerinin tanimlanmasi, antikor-bazli tedaviler araciligiyla yikim için kanser hücreleriiii spesifik hedeflemekabiliyetine yol açmistir.TAA°ya örnek olarak, bunlarla sinirli kalmaksizin, asagida listelenen TAA (1)-(36) gösterilebilir. Kolaylik olmasi ainaciyla, tümü sektörde bilinen bu antijenlere iliskin bilgiler, Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi"nin (NCBI) nükleik asit ve protein sekansi tanimlama teamülleri izlenerek asagida listelenmekte ve adlar, alternatif adlar, Genbank erisim numaralari ve primer referans(lar)1 kapsamaktadir. TAA (1)-(36)"ya tekabül eden nükleik asit ve protein sekanslari, GenBank gibi herkese açik veritabanlarinda mevcuttur. Antikorlarin hedef aldigi tümör-iliskili antijenler, atif yapilan referanslarda tanimlanan sekanslara en az yaklasik %70, %80, %85, %90 ya da %95 sekaiis Özdesligine sahip olan ya da atif yapilaii referanslarda bulunan bir sekansa sahip bir TAA°yla hemen hemen ayni biyolojik özellikler ya da karakteristikler gösteren tüm amino asit sekaiis varyantlariiii ve izoformlarini kapsar. Örnegin, bir varyant sekansa sahip bir TAA genellikle listede ona tekabül eden sekansa sahip TAA"ya spesifikbaglanan bir antikora spesifik baglanabilir.63TUMOR-ILISKILI ANTIJENLER (1)-(36):(1) BMPRIB (kemik morfogenetik protein reseptörü-tip IB, Genbank erisim no.: NM_001203); ten Di jke, P., ve ark Science 264 (5155):101-104 (1994), Oncogene 14 (11):1377-1382 (1997)): WO2004063362 (Istem 2); W02003042661 (Istem 12); US2003134790-A1 (Sayfa 38-39); W02002102235 (Istem 13; Sayfa 296); WO2003055443 (Sayfa 91-92); W0200299122 (Ornek 2; Sayfa 528-530); W02003029421 (Istem 6); W02003024392 (Istem 2; Sekil 112); WO200298358 (Istem 1; Sayfa 183); WO20025494O (Sayfa 100-101); W0200259377 (Sayfa 349-350); W0200230268 (Istem 27; Sayfa 376); W0200148204 (Ornek; Sekil 4); NP_001 194 kemik morfogenetik protein reseptörü, tip IB /pid=NP_001194.1; Çapraz-referanslar: MIM:603248; NP_001 194.1; AY065 994(2) E16 (LATl, SLC7A5, Genbank erisim no.: NM_003486); Biochem. Biophys. Res. Commun. 255 (2), 283-288 (1999), Nature 395 (6699):288-291 (1998), Gaugitsch, H.W., ve ark (1992) J. Biol. Chem. 267 (16):1 1267- 11273);WO2004048938 (Örnek 2); W02004032842 (Ornek IV); W02003042661 (Istem 12); W02003016475 (Istem 1); W0200278524 (Örnek 2); WO200299074 (Istem 19; Sayfa 127-129); W0200286443 (Istem 27; Sayfa 222, 393); W02003003906 (Istem 10; Sayfa 293); W0200264798 (istem 33; Sayfa 93-95); W0200014228(Istem 5; Sayfa 133-136); USZOO3224454 (Sekil 3); W02003025138 (Istem '12; Sayfa64150); NP_003477 çözünen madde tasiyici ailesi 7 (katyonik amino asit transporteri, y+sistein), üye 5 /pid=NP_003477.3 - Homo sapiens; Çapraz-referanslar: MIM2600182; NP_003477.3; NM_015923; NM_003486_1(3) STEAP] (alti transmembranli prostat epitelyal antijeni, Genbank erisim no.: NM_012449); Cancer Res. 61 (15), 5857- 5860 (2001), Hubert, R.S., ve ark (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (25):14523-14528); W02004065577 (Istem 6); W02004027049 (Sekil 1L); EP1394274 (Ornek 11); W02004016225 (Istem 2); W02003042661 (Istem 12); USZOO3157089 (Örnek 5); USZOO3185830 (Ornek 5); U82003064397 (Sekil 2); W0200289747 (Ornek 5; Sayfa 618- 619); W02003022995 (Örnek 9; Sekil 13A, Ornek 53; Sayfa 173, Örnek 2; Sekil 2A); NP_036581 alti transmembranli prostat epitelyal antijeni; Çapraz-referanslar: MIM2604415; NP_036581.1; NM_012449_1(4) 0772P (CA125, MUC16, Genbank erisim no.: AF361486); J. Biol. Chem. 276 (29):27371-27375 (2001)); W02004045553 (Istem 14); W0200292836 (istem 6; Sekil 12); W0200283866 (Istem 15; Sayfa 116-121); U82003124140 (Ornek 16); Çapraz-referanslar: GI:34501467; AAK74120.3; AF361486_1(5) MPF (MPF, MSLN, SMR, megakaryosit güçlendirici faktör, mezotelin, Genbank erisim no.: NM_005823); Yamaguchi, N., ve ark Biol. Chem. 269 (2), 805-808 (1994), Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (20):1 1531-] 1536 (1999), Proc. Natl. Acad. Sci.65USA. 93 (1):]36-140 (1996), J. Biol. Chem. 270 (37):21984- 21990 (1995)); WO2003101283 (Istem 14); (W02002102235 (Istem 13; Sayfa 287-288); WO2002101075 (Istem 4; Sayfa 308-309); WO200271928 (Sayfa 320-321); WO9410312 (Sayfa 52-57); Çapraz- referanslar: MIM:601051; NP_005814.2; NM_005823_1(6) Napi3b (NAPI-3B, NPTIIb, SLC34A2, çözünen madde tasiyici ailesi 34 (sodyum fosfat), üye 2, tip II sodyum-bagimli fosfat transporteri 3b, Genbank erisim no.: NM_006424);J. Biol. Chem. 277 (22):19665-19672 (2002), Genoinics 62 (2):281-284 (1999), Feild, J.A., ve ark (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun. 258 (3):578- 582); W02004022778 (Istem 2); EP1394274 (Ornek 11); W02002102235 (Istem 13; Sayfa 326); EP875569 (Istem 1; Sayfa 17-19);W0200157188 (Istem 20; Sayfa 329); W02004032842 (Ornek IV); WO200175177 (Istem 24; Sayfa 139-140_); Çapraz-referanslar: MIM:604217; NP_006415.1; NM_006424_1(7) Sema 5b (FLJ10372, KIAA1445, Mm.42015, SEMASB, SEMAG, Seiriaforin 5b Hlog, seina domain, yedi trombospondin tekrari (tip 1 ve tip l-benzeri), transmembran domaini (TM) ve kisa sitoplazmik domain, (semaforin) 5B, Genbank erisim no.: AB040878);Nagase T., ve ark (2000) DNA Res. 7 (2):143-150); W02004000997 (istem 1); W02003003984 (Istem 1); W0200206339 (Istem 1; Sayfa 50); W0200188133 (Istem 1; Sayfa 41-43, 48-58);66W02003054152(Istem 20); W02003101400(Istem 11); Erisim No.: Q9P283; EMBL; AB040878; BAA95969.1. Genew; HGNC: 10737;(8) PSCA hlg (2700050C12Rik, C530008016Rik, RIKEN cDNA 2700050C12, RIKEN cDNA 2700050C12 geni, Genbank erisim no.: AY358628); Ross ve ark (2002) Cancer Res. 62:2546-2553; US2003129192 (Istem 2); US2004044180 (Istem 12); USZOO4044179 (Istem 1 1); U82003096961 (Istem 11); U82003232056 (Örnek 5); W02003105758 (Istem 12); US2003206918 (Ornek 5); EP1347046 (Istem 1); W02003025148 (Istem 20); Çapraz-referanslar: GII37182378; AAQ88991.1; AY358628_1(9) ETBR (Endotelin tip B reseptörü, Genbank erisim no.: AY275463); Nakamuta M., ve ark Biochem. Biophys. Res. Cominun. 177, 34-39, 1991;Ogawa Y., ve ark Biochem. Biophys. Res. C0mmun. 178,248-255, 1991;Arai H., ve ark Jpn. Circ. J. 56, 1303-1307, 1992;Arai H., ve ark J. 8101. Chem. 268, 3463-3470, 1993; Sakamoto A., Yanagisawa M., ve ark Biochem. Biophys. Res. C0mmun.178, 656- 663,1991; Elshourbagy N.A., ve ark J. Biol. Chem. 268, 3873- 3879,1993;Haend1er B., ve ark J. Cardiovasc. Pharmacol. 20, 51-84, 1992; Tsutsumi M., ve ark Gene 228, 43-49, 1999; Strausberg R.L., ve ark Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99, 16899-16903, 2002; Bourgeois C., ve ark J. Clin. Endocrinol. Metab. 82, 3116-3123, 1997; Okamoto Y., ve ark Biol. Chem. 272, 21589-21596, 1997;Verheij JB., ve ark Am. J. Med.67Genet. 108, 223-225, 2002; Hofstra R.M.W., ve ark Eur. J. Hum. Genet. 5180-1235, 1997; Puffenberger EG., ve ark Cell 79,1257-1266,l994;Attie T., ve ark, Hum. Mol. Genet. 4, 2407-2409, 1995; Auricchio A., ve ark Hum. Mol. Genet. :351-354,l996; Amiel J., ve ark Hum. Mol. Genet 5, 355-357, 1996; Hofstra R.M.W., ve ark Nat. Genet. 12, 445- 447,1996; Svensson PJ., ve ark Hum. Genet. 103,145- 148,1998;Fuchs S., ve ark Mol. Med. 7,115-124, 2001; Pingault V., ve ark (2002) Hum. Genet. 111,198- 206; W0004045516 (Istem 1); W02004048938 (Ornek 2);W02004040000 (Istem 151); W02003087768 (Istem 1); W0200301647 (Istem 1); WO2003016475 (Istem 1); W0200261087 (Sekil 1); W0200301649 (Sekil 6); WO2003025138 (Istem 12; Sayfa 144); W0200198351 (lstem 1; Sayfa 124-125);EP522868 (Istem 8; Sekil 2); W0200177172 (Istem 1; Sayfa 297-299); U82003109676; US6518404 (Sekil 3); USS773223 (Istem la; Kolon 31-34); WOOO4001004;(10) MSG783 (RNF124, hipotetik protein FLJ20315, Genbank erisim no.: NM_017763); W02003104275 (Istem 1); W02004046342 (Ornek 2); W02003042661 (Istem 12); W02003083074 (Istein 14; Sayfa 61); W02003018621 (Istem 1); W02003024392 (Istem 2; Sekil 93); W0200166689 (Örnek 6); Cross-references: LocusID: 54894; NP_060233.2; NM_017763_168(11) STEAP2 (HGNC_8639, IPCA-l, PCANAPI, STAMPI, STEAP2, STMP, prostat kanseri iliskili gen 1, prostat kanseri iliskili protein l, alti transmembranli prostat epitelyal anti jeni 2, alti transmembranli prostat proteini, Genbank erisim no.: AF455138); Lab. Invest. 82 (l 1): 1573-1582 (2002)); W02003087306; U82003064397 (Istem 1; Sekil 1); W0200272596 (Istem 13; Sayfa 54-55); WO200172962 (Istem 1; Sekil 4B);WO2003104270 (istem 11); W02003104270 (Istein 16); USZOO4005598 (Istem 22); W02003042661 (Istem 12); US2003060612 (Istem 12; Sekil ); W0200226822 (Istem 23; Sekil 2); W0200216429 (Istem 12; Sekil 10); Çapraz referanslar: G1222655488; AAN04080.1; AF455138_1(12) TrpM4 (BR22450, FL120041, TRPM4, TRPM4B, geçici reseptör potansiyel katyon kanali, alt-aile M, üye 4, Genbank erisim no.: NM_017636);Xu, X.Z, ve ark Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (19)310692- 10697 (2001), Cell 109 (3):397-407 (2002), J. 8101. Chem. 278(33):30813-30820 (2003)); U82003143557 (Istein 4); W0200040614 (Istem 14; Sayfa 100-103); WO200210382 (Istem 1; Sekil 9A); W02003042661 (istem 12); W0200230268 (Istem 27; Sayfa 391);U82003219806 (Istem 4); W0200162794 (Istem 14; Sekil 1A- D); Çapraz referanslar: MIM:606936; NP_060106.2; NM_017636_169(13) CRIPTO (CR, CRI, CRGF, CRIPTO, TDGFi, teratokarsinom-kaynakli büyüme faktörü, Genbank erisim no.: NP_OO3203 ya da NM_OO3212); Ciccodicola, A., ve ark EMBO J. 8 (7):1987-l99l (1989), Am. J. Hum. Genet. 4943):555-565 (1991)): USZOO3224411 (Istem 1); W02003083041 (Örnek 1); WO2003034984 (Istem 12);W020028817O (Istem 2; Sayfa 52-53); W02003024392 (Istem 2; Sekil 58); W02002164l3 (Istem 1; Sayfa 94-95, 105); W0200222808 (Istem 2; Sekil 1);USS854399 (Örnek 2; Col 17-'18); USS792616 (Sekil 2); Çapraz referanslar: MIM: 187395; NP_003203.1; NM_()O3212_1(14) CD21 (CR2 (Tamamlayici reseptörü 2) ya da C3DR (C3d/Epstein Barr Virüs reseptörü) ya da Hs. 73792, Genbank erisim no.: M26004); Fu jisaku ve ark (1989) J. Biol. Chem. 264 (4):2118-2125);Weis J.J., ve ark J. Exp. Med. 167,1047- 1066,l988; Moore M., ve ark Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84,9194-9198,1987; Barel M., ve ark Mol. lmmunol. 35,1025- 1031,1998;Weis JJ., ve ark Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 83, 5639-5643, 1986; Sinha SK., ve ark (1993) J. Immun01.150, 5311-5320; W02004045520 (Örnek 4); U82004005538 (Örnek 1); W02003062401 (Istem 9); W02004045520 (Ornek 4); WO9102536 (Sekil 9.1.-9.9); W02004020595 (Istem 1); Erisim No.: P20023; Ql3866; Q14212; EMBL; M26004; AAA35786.1.70(15) CD79b (CD79B, CD79ß, le (immünoglobulin-iliskili beta), B29, Genbank erisim no.: NM_000626 ya da 11038674); Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2003) 100 (7):4l26-413l, Blood (2002) 100 (9):3068-3076, Muller ve ark (1992) Eur.J. Immunol. 22 (6):1621-1625); W02004016225 (istein 2, Sekil 140);W02003087768. U82004101874 (istem 1. sayfa 102); W02003062401 (istem 9); W0200278524 (Örnek 2); US 2002150573 (istem 5, sayfa 15); USS644033; W02003048202 (istem 1, sayfa 306 ve 309); WO 99/558658, U86534482 (istem 13, Sekil 17A/B); WO200055351 (istem 11, sayfa 1145-1146); Çapraz referanslar: MIM: 147245; NP_000617. 1; NM_000626_1(16) FCRH2 (1FGP4, IRTA4, SPAPlA (fosfataz ankor proteini la içeren SH2 domaini), SPAPlB, SPAPlC, Genbank erisim no.: NM_030764, AY358130); Genome Res. 13 (10):2265- 2270 (2003),Immunogenetics 54 (2):87-95 (2002), Blood 99 (8):2662-2669 (2002), Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (17):9772-9777 (2001), Xu, MJ., ve ark (2001) Biochem. Biophys. Res. Commun. 280 (3):768-775; W02004016225 (Istem 2); W02003077836; WO 200138490 (Istem 5; Sekil 18D-1-18D-2); WO 2003097803 (Istem 12); W02003089624 (Istem 25); Çapraz referanslar: MIM2606509; NP_1103912; NM_030764_1 (17) HER2 (ErbB2, Genbank erisim no.: Ml730); Coussens L., ve ark Science (1985) 230(4730):1132-1139); Yamamoto T., ve ark Nature 319, 230-234,1986; Semba K., ve ark Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82, 6497-6501, 1985; SWiercz LM., ve ark 1.71Cell Biol. 165, 869-880, 2004; Kuhns JJ., ve ark J. Biol. Chem. 274, 36422-36427, 1999; Cho H.-S., ve ark Nature 421, 756- 760, 2003; Ehsani A., ve ark (1993) Genomics 15, 426-429; W02004048938 (Örnek 2); W02004027049 (Sekil 11); W02004009622; W02003081210; W02003089904 (Istem 9); W02003016475 (istem 1); US2003118592; W02003008537 (Istem 1); W02003055439 (Istem 29; Sekil 1A-B); WO2003025228 (Istein 37; Sekil 5C);W0200222636 (Ornek 13; Sayfa 95-107); W0200212341 (Istem 68; Sekil 7); W0200213847 (Sayfa 71-74); W0200214503 (Sayfa 114- 117); W0200153463 (Istem 2; Sayfa 41-46); WO 200141787 (Sayfa 15); W0200044899 (Istem 52; Sekil 7);W0200020579 (Istem 3; Sekil 2); U85869445 (Istem 3; Kolon 31-38); WO9630514 (Istem 2; Sayfa 56-61); EP1439393 (istem 7); W02004043361 (istem 7); WO 2004022709; W0200100244 (Örnek 3; Sekil 4); Erisim No.: P04626; EMBL; M11767; AAA35808.1. EMBL; M11761; AAA35808.1.(18) NCA (CEACAM6, Genbank erisim no.: M18728);Bamett T., ve ark Genomics 3,59-66,l988; Tawaragi Y., ve ark Biochem. Biophys. Res. Commun. 150, 89-96, 1988; Strausberg RL., ve ark Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:16899-16903, 2002; WO2004063709; EP1439393 (Istem 7); WO2004044178 (Ornek 4); WO2004031238; W02003042661 (Istem 12); W0200278524 (Ornek 2); W0200286443 (Istem 27; Sayfa 427); W0200260317 (Istem722); Erisim NO.: P40199; Ql4920; EMBL; M29541; AAA59915.1. EMBL; M18728;(19) MDP (DPEPl, Genbank erisim no. BC017023) Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26):16899-16903 (2002));W02003016475 (Istem 1); W0200264798(Istem 33; Sayfa 85-87);JP05003790 (Sekil 6-8);WO9946284 (Sekil 9); Çapraz referanslar: MIM2179780; AAH17023.1; BC017023_1(20) 1L20Ru (1L20Ra, ZCYTOR7, Genbank erisim no. AF184971); Clark H.F., ve ark Genome Res. 13, 2265-2270, 2003; Mungall AJ., ve ark Nature 425, 805-811, 2003; Blumberg H., ve ark Cell 104, 9-19, 2001; Dumoutier L., Ve ark J. Immunol. 167, 3545-3549. 2001; Parrish-Novak J., ve ark J. Biol. Chem. 277, 47517-47523, 2002; Pletnev S., ve ark (2003) Biochemistry 42: 12617-12624; Sheikh F., ve ark (2004) J. Immunol. 172, 2006-2010; EP1394274 (Ornek 11); US2004005320 (Omek 5); W02003029262 (Sayfa 74-75); W02003002717 (Istem 2; Sayfa 63); W0200222153 (Sayfa 45- 47); U82002042366 (Sayfa 20-21); WO200146261 (Sayfa 57- 59); WO200146232 (Sayfa 63-65); WO9837193 (Istem 1; Sayfa 55-59); Erisim No.: Q9UHF4; Q6UWA9; Q96SH8; EMBL; AF184971; AAF01320.1.(21) Brevican (BCAN, BEHAB, Genbank erisim no. AF229053) Gary 8.0. ve ark Gene 256, 139-147, 2000; Clark HP., ve ark Genome Res. 13, 2265-2270, 2003; Strausberg RL., ve ark Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99, 16899-7316903, 2002; U82003186372(Istem 11); USZOO3186373 (Istem 11); USZOO3119131(Istem 1; Sekil 52); USZOO3119122 (Istem 1; Sekil 52); USZOO3119126 (Istem 1); USZOO3119121(Istem 1; Sekil 52);U82003119129(Istem 1); US2003ll9l30 (Istem 1); US2003119128 (Istem 1; Sekil 52); USZOO3119125 (Istem 1); W02003016475 (Istem 1); W0200202634 (Istem 1);(22) EphBZR (DRT, ERK, Hek5, EPHT3, Ty105. Genbank erisim no. NM_O4442) Chan, J. and Watt, V.M., Oncogene 6 (6), 1057-1061 (1991) Oncogene 10 (5):897-905 (1995), Annu. Rev. Neurosci. 21:309-345 (1998), Int. Rev. Cytol. 196:177- 244 (2000)); WO 2003042661 (Istem 12); WO 200053216 (Isteln 1; Sayfa 41); W02004065576 (Isteln 1); W02004020583 (Istem 9); W02003004529 (Sayfa 128-132); W0200053216 (Istem 1; Sayfa 42);Çapraz referanslar: MIMz600997; NP_004433.2; N0_004442_1(23) ASLG659 (B7h, Genbank erisim no. AX092328) US 20040101899 (Isteln 2); WO 2003104399 (Istem 11); WO 2004000221 (Sekil 3); USZOO3165504(Istem 1); US 2003124140 (Ornek 2); US2003065143 (Sekil 60); WO 2002102235 (Isteln 13; Sayfa 299); US 2003091580 (Ornek 2);W0200210187(Istem 6; Sekil 10);W0200194641(Istem 12; Sekil 7b);W0 200202624 (Istem 13; Sekil 1A-lB); US 2002034749 (Istem 54; Sayfa 45-46); WO 200206317 (Ornek 2;Sayfa 320-321, Isteln 34; Sayfa 321-322);W0 200271928 (Sayfa 468-469); W0200202587 (Örnek 1; Sekil 1);74wo 200140269 (Ornek 3; Sayfa 190-192);wo 200036107 (Ornek 2; Sayfa 205-207); W02004053079 (Istem 12); W02003004989 (Istem 1); W0200271928 (Sayfa 233- 234, 452-453); wo 0116318;(24) PSCA (Prostat kök hücre antijen prekürsörü, Genbank erisim no.: A1297436); Reiter RE., ve ark Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95,1735-1740,l998; Gu Z, ve ark Oncogene 19; 1288- 1296,2000;Biochem. Biophys. Res. Commun. (2000) 275(3):783-788; W02004022709, EP1394274 (Ornek 11); USZOO4018553 (Istem 17); W02003008537 (Istem 1); W0200281646 (Istem 1; Sayfa 164); WO2003003906 (Istem ; Sayfa 288); WO200140309 (Örnek 1; Sekil 17); U82001055751 (Ornek 1; Sekil 1b); W0200032752 (Istem 18; Sekil 1);WO9851805 (Istem 17; Sayfa 97); WO9851824 (Istem 10; Sayfa 94); WO9840403 (Istem 2; Sekil lB); Erisim No.: 043653; EMBL; AF043498; AAC39607.1.(25) GEDA (Genbank erisim no.: AY260763); AAP14954 lipoma HMGIC füzyon-partneri-benzeri protein /pid=AAP14954.1 Homo sapiens (insan); WO2003054152 (Istem 20); WO2003000842 (Istem 1); W02003023013 (Örnek 3, Istem 20); U82003194704 (Istem 45);Çapraz referanslar: GI:30102449; AAP14954.1; AY260763_1(26) BAFF-R (B hücresi - aktive edici faktör reseptörü, BLyS reseptörü 3, BR3, Genbank erisim no.: AF 116456); BAFF75reseptörü/pid=NP_443l77.1 - Homo sapiens; Thompson, JS., ve ark Science 293 (5537), 2108-21] 1 (2001); W02004058309; W02004011611; W02003045422 (Ornek; Sayfa 32-33); W02003014294 (Istem 35; Sekil 6B); W02003035846 (Istem 70; Sayfa 615-616); W0200294852 (Kolon 136-137); W0200238766 (Istem 3; Sayfa 133); W0200224909 (Örnek 3; Sekil 3); Çapraz referanslar: MIMz606269; NP_443 177. 1; NM_052945_1; AF132600(27) CD22 (B-hücresi reseptör'ü CD22-B izoformu, BL-CAM, Lyb-8, Lyb8, SlGLEC-Z, FLJ22814, Genbank erisim no.: AK026467); Wilson ve ark (1991) .1. Exp. Med. 173:137- 146; W02003072036 (Istem 1; Sekil 1); Çapraz referanslar: MIM: 107266; NP_001762. 1; NM_001771_1(28) CD79a (CD79A, CD790t, immünoglobulin-iliskili alfa, Ig betayla (CD79B) kovalent etkilesime giren ve yüzey üzerinde lg M molekülleriyle bir kompleks olusturan, B-h'ûcresi diferansiyasyonundan rol oynayan bir sinyali transd'ûse eden bir B hücresi-spesifik protein); pI: 4,84, MW: 25028 TM: 2 [P] Gen Kromozomu: 19q13.2, Genbank erisim no.: NP_001774.10); W02003088808, U820030228319; W020030 62401 (istem 9); US2002150573 (istem 4, sayfa 13-14); WO9958658 (istem 13, Sekil 16); WO9207574 (Sekil 1); U85644033; Ha ve ark (1992) J. Immunol. 148(5):1526- 1531; Mueller ve ark (1992) Eur. J. Biochem. 22:1621-761625; Hashimoto ve ark (1994) Immunogenetics 40(4):287- 295;Preud'h0mme ve ark (1992) Clin. Exp. Immunol. 90(l):l4l-146; Yu ve ark (1992) J. Immunol. 148(2) 633- 637; Sakaguchi ve ark (1988) EMBO J. 7(l 1):3457-3464;(29) CXCRS (Burkitt'in lenfoma reseptörü 1, CXCL 13 kemokiniyle aktive edilen, lenfosit migrasyonunda ve humoral savunmada islev gören, HIV-2 enfeksiyonunda ve muhtemelen AIDS, lenfoma, miyelom ve lösemi gelisiminde rol oynayan bir G protein-kuplajli reseptör); 372 aa), pl: 8,54 MW: 41959 TM: 7 [P] Gen Kromozomu: llq23.3, Genbank erisim no.: NP_001707. 1);W02004040000; W02004015426; U82003105292 (Örnek 2); U86555339 (Ornek 2); W0200261087 (Sekil 1); WC 200157188 (Istein 20, sayfa 269); WO 200172830 (sayfa 12- 13); W0200022l29 (Örnek 1, sayfa 152-153, Örnek 2, sayfa 254-256); WO9928468 (istem 1, sayfa 38); USS440021 (Ornek 2, kolon 49-52); WO9428931 (sayfa 56- 58); WO9217497 (istem 7, Sekil 5); Dobner ve ark (1992) Eur. J. Immunol. 22:2795-2799; Barella ve ark (1995) Biochem. J. 309:773-779;(30) HLA-DOB (peptidleri baglayan ve onlari CD4+ T lenfositlerine sunan MHC sinif 11 molekül (la anti jen) beta alt- birimi); 273 aa, pl: 6,56 MW: 30820 TM: 1 [P] Gen Kromozomu: 6p21.3, Genbank erisim no.: NP_002111.1); Tonnelle ve ark (1985) EMBOJ. 4(l l):2839-2847; Jonsson ve ark (1989) lmmunogenetics 29(6):4l 1-413; Beck ve ark (1992)77J. Mol. Biol. 228:433-441; Strausberg ve ark (2002) Proc. Natl. Acad. Sci USA 99:16899-16903; Servenius ve ark (1987') J. Biol. Chem. 26218759-8766; Beck ve ark (1996) J. Mol. Biol. 25521-13; Naruse ve ark (2002) Tissue Antigens 592512- 519; WO9958658 (istem 13, Sekil 15); US6153408 (Col 35- 38); U85976551 (c01 168-170);US6011146 (col 145- 146); Kasahara ve ark (1989) Immunogenetics 30(1):66- 68; Larhammar ve ark (1985) J. Biol. Chem. 260(26):14111- 14119;(31) P2X5 (Purinerjik reseptör P2X ligand-kapili iyon kanali 5, ekstraselüler ATP kapili bir iyon kanali; sinaptik transmisyon ve nörogenezde rol oyiiayabilir; yoksunluk, idiyopatik detrusor instabilitesinin patofizyolojisine katkida bulunabilir); 422 aa), pl: 7,63, MW: 47206 TM: 1 [P] Gen Kromozomu: 17p13.3), Genbank erisim no.: NP_002552.2); Le ve ark (1997) FEBS Lett. 418(1-2):195-1995; WO 2004047749; WO 2003072035 (istem 10); Touchman ve ark (2000) Genome Res. :165-173; WO200222660 (istem 20); W02003093444 (istem 1);W02003087768 (istem 1); W02003029277 (sayfa 82);(32) CD72 (B-hücresi diferansiyasyori antijeni CD72, Lyb-2); PROTEIN SEKANSI Full maeaity... tafrfpd (i..359; 359 aa), pI: 8,66, MW: 40225 TM: 1 [P] Gen Kromozomu: 9p13.3, Genbank erisim 110.: NP_001773.1); WO2004042346 (istem 65); WO2003026493 (sayfa 51-52, 57-58), WO 200075655 (sayfa IOS-106); Von Hoegen ve ark (1990) J.78Immunol. 144(12):4870-4877; Strausberg ve ark (2002) Proc. Natl. Acad. Sci USA 99:16899-16903;(33) LY64 (Lenfosit anti jeni 64 (RP105), lösince zengin tekrar (LRR) ailesinin tip I membran proteini, B-hücresi aktivasyonunu ve apoptozu regüle eder; fonksiyon kaybi, sistemik lupus eritematozus görülen hastalarda hastalik aktivitesinde artisla iliskilidir); 661 aa, pl: 6,20, MW: 74147 TM: 1 [P] Gen Kromozomu: 5q12, Genbank erisim no.: NP_005573.1); US2002193567; WO9707198 (istem l 1, sayfa 39-42); Miura ve ark (1996) Genomics 38(3):299-304; Miura ve ark (1998) Blood 9222815-2822; WO2003083047; WO9744452 (istem 8, sayfa 57-61);W0200012130 (sayfa 24- 26);(34) FCRHl (Fc reseptörü-benzeri protein 1, C2 tip Ig-benzeri ve ITAM domainleri içeren immünoglobulin Fc domaini için bir putatif reseptör; B-lenfosit diferansiyasyonunda rol oynayabilir), 429 aa, pl: 5,28, MW: 46925 TM: 1 [P] Gen Kromozomu: lq21-1q22, Genbank erisim no.: NP_443170.1); W02003077836; W0200138490 (istem 6, Sekil 18E-1-18-E- 2); Davis ve ark (2001) Proc. Natl. Acad. Sci USA 98(l7):9772-9777; WO 2003089624 (istem 8); EP 1347046 (istem 1); W02003089624 (istem 7);(35) IRTA2 (FCRHS, lmmünoglobulin üst-aile reseptör translokasyonu iliskili 2, B hücresi gelisimi ve lenfomagenezdeolasi rolleri olan bir putatif immünoreseptör; bazi B hücresi79malignensilerinde translokasyon yoluyla genin deregülasyonu meydana gelir); 977 aa, pl: 6,88, MW: 106468, TM: 1 [P] Gen Kromozomu: lq21, (Genbank erisim no.: Human:AF343662, AF343663, AF343664, AF343665, AF369794, AF397453, AKO90423, AKO90475, AL834187, AY358085; Fare: AK089756, AY158090, AY506558; NP_112571.1); NP_112571.1 W02003024392 (istem 2, Sekil 97); Nakayaina ve ark (2000) Biochem. Bi0phys. Res. Commun. 277(l):124- 127;W02003077836; WO200138490 (istem 3, Sekil l8B-1- 188-2);(36) TENBZ (TMEFFZ, tomoregulin, TPEF, HPPl, TR, büyüme faktörlerinin EGF/heregulin ailesiyle iliski putatif transmembran proteoglikan ve follistatin), 374 aa, NCBI Erisim No.: AAD55776, AAF91397, AAG49451, NCBI RefSeq: NP_057276; NCBI Geni: 23671; OMIM: 605734; SwissProt Q9UIK5; (Genbank erisim no.: AF179274; AY358907, CAF85723, CQ782436); W02004074320 (SEKANS KOD NO. 810);JP2004113151(SEKANS KOD NO.: 2,4, 8); WO2003042661 (SEKANS KOD NO. 580); W02003009814 (SEKANS KOD NO. 411); EP1295944 (sayfa 69-70); W0200230268 (sayfa 329);WO200190304(SEKANS KOD NO. 2706); U82004249l30; USZOO4022727; W02004063355; US2004197325; U82003232350; U82004005563; US2003124579;H0rie ve ark (2000) Genomics 67:146-152;Uchida ve ark (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun. 266:593-602;Liang ve ark (2000)80Cancer Res. 60:4907-12;G1ynne-Jones ve ark (2001) Int .l Cancer. Oct 15;94(2):l78-84.Ana antikor, bir albümin-baglanma peptidi (ABP) sekansi içeren bir füzyon proteini de olabilir (Dennis ve ark. (2002) "Albumin Binding As A General Strategy For lmproving The Pharmacokinetics Of Proteins" J Biol Chem. 277:35035-35043; WO 01/45746). Bu bulusa konu olan antikorlar, asagida atif yapilan referanslarda açiklanan ABP sekanslarina sahip füzyon proteinlerini kapsar: (i) "Dennis ve ark (2002) .1 Biol Chem. 277z35035-35043" dokümaninda sayfa 35038°de Tablo III ve IV; (ii) US 2004/0001827 numarali dokümanda [0076] nuinarali paragrafta SEKANS KOD NO.: 9-22 ve (iii) WO 01/45746 numarali dokümanda sayfa 12-l3°te SEKANS KOD NO.: zl-zl4.MUTAJENEZBaslangiç polipeptidinin bir amino asit sekansi varyantini kodlayan DNA, sektörde bilinen çesitli farkli yöntemlerle hazirlanir. Bu yöntemler arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, yere-yönlendirilmis (ya da oligonükleotid-aracili) mutajenez, PCR mutajenezi ve polipeptidi kodlayan daha önce hazirlanmis bir DNA"n1n kaset mutajenezi yoluyla hazirlama yöntemleri vardir. Rekombinant antikorlarin varyantlari, ayni zamanda, restriksiyon fragmaiii manipülasyonuyla veya sentetik oligonükleotidle üst üste bindirme uzatina PCR"siyle de olusturulabilir. Mutajenik primerler sistein kodon ikame(ler)ini kodlar. Bu mutant sistein degistirilmis antikorlari kodlayan DNA,yi üretmek için standart mutajenez tekniklerikullanilabilir. Genel kilavuzlar, "Sambrook ve ark Molecular Cloning,81A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989" ve "Ausubel ve ark Current Protocols in Molecular Biology, Greene Publishing and Wiley-Interscience. NewYork, N.Y., 1993" referanslarinda bulunabilir.Yere-yönlendirilmis mutajenez, sübstitüsyon varyantlari, yani mutant proteinler hazirlainak için kullanilan bir yöntemdir. Bu teknik sektörde iyi bilinmektedir (bakiniz örnegin, Carter (1985) ve ark Nucleic Acids Res. 13:4431-4443; Ho ve ark (1989) Gene (Ainst.) 77:51-59 ve Kunkel ve ark (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 822488). Kisaca açiklamak gerekirse, DNA›nin yere-yönlendirilmis mutagenezi gerçeklestirilirken, baslangiç DNA°si, ilk önce istenen niutasyonu kodlayan bir oligonükleotid bu baslangiç DNA"sinin bir tekli iplikçigine hibridize edilerek degistirilir. Hibridizasyondan sonra, bir DNA polimeraz, hibridize edilmis oligonükleotidi bir primer olarak ve baslangiç DNA7sinm tekli iplikçigini bir sablon olarak kullanarak bir tani ikinci iplikçigi sentezlemek ainaciyla kullanilir. Sonuçta, istenen mutasyonu kodlayan oligonükleotid, elde edilen çift iplikçikli cDNA"ya dahil edilir. Yere-yönlendirilmis mutajenez, bir ekspresyon plazmidinde mutajeneze tâbi tutulacak proteini eksprese eden gen içinde gerçeklestirilebilir ve elde edilen plazmid, istenen sistein ikame mutasyonlarinin sokulmasini teyit etmek ainaciyla sekanslanabilir (Liu ve ark (1998) J. Biol. Chem. 273:20252-20260). Örnegin QuikChange® Multi Yere-Yönlendirilmis Mutajenez Kiti (Stratagene, La Jolla, CA) gibi ticari piyasada mevcut olanlar dahil yere-yönlendirilmis mutajenez protokolleri ve formatlari kullanilir.PCR mutajenezi, baslangiç polipeptidiiiin ainino asit seknasivaryantlarini hazirlamak için de uygundur. Bakiniz: Higuchi, (1990)82in PCR Protocols, sayfa 177-183, Academic Press; lto ve ark (1991) Gene 102:67-70; Bemhard ve ark (1994) Bioconjugate Chein. 52126- 132; ve Vallette ve ark (1989) Nuc. Acids Res. 17:723-733. Kisaca açiklamak gerekirse, küçük miktarlarda sablon DNA bir PCR"de baslangiç malzemesi olarak kullanildiginda, yalnizca priinerlerin sablondan farklilastigi pozisyonlarda sablon sekanstaii farklilik gösteren bir spesifik DNA fragmaninin nispeten büyük miktarlarini olusturmak için, bir sablon DNA°da tekabül eden bölgeden sekansaçisindan hafif farklilik gösteren priinerler kullanilabilir.Varyantlar hazirlamak için kullanilan baska bir yöntem olan kaset mutajenezi, "Wells ve ark (1985) Gene 34:315-323" referansinda tarif edilen teknige dayanir. Baslangiç malzemesi, niutasyona ugratilacak baslangiç polipeptid DNA"sini içeren plaziniddir (ya da baska vektördür). Mutasyona ugratilacak baslangiç DNA'sinda kodon(lar) taniinlanir. Tanimlaninis mutasyoii yer(ler)inin her bir tarafinda bir özgün restriksiyon endonükleaz yeri bulunmalidir. Böyle restriksiyon yerleri inevcut degilse, bunlar yukarida tarif edilen oligon'ûkleotid- aracili mutajenez yöntemi kullanilarak olusturularak baslangiç polipeptid DNAssinda uygun lokasyonlara sokulabilirler. Plazmid DNA°si, bu yerlerde kesilerek linearize edilir. Restriksiyon yerleri arasinda DNA sekansini kodlayan, fakat istenen mutasyon(lar)i içeren bir çift-iplikçikli oligonükleotid, standart prosedürler kullanilararak sentezlenir; bu prosedürlerde, iki oligonükleotid iplikçigi ayri ayri sentezlenir ve ardindan, standart teknikler kullanilarak birlikte hibiridize edilir. Bu çift-iplikçikli oligoni'ikleotid, kaset olarak anilir. Bu kaset, linearize plazinidin uçlariyla uyumlu 5' ve 3' uçlarina sahipolacak sekilde tasarlanir ve böylece, plazinide dogrudan dogruya83ligate edilebilir. Bu durumda, bu plazinid, mutasyonlu DNA sekansi içerir. Kodlanan sistein ikamelerini içeren mutant DNA, DNAsekanslaina yoluyla teyit edilebilir.PCR esasli mutajenezle sablon olarak çift iplikçikli plazmid DNA kullanilarak oligonükleotid yönlendinneli mutajenezle tekli mutasyonlar da 'üretilir (Sambrook and Russel, (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd edition; Zoller ve ark (1983) Methods Enzyinol. 100:468-500;Zoller, MJ. and Smith, M. (1982) Nucl. Acids Res. 10:6487-6500).Bu bulusta, Ml3 faji üzerinde gösterilen hu4D5FabV8 (Gerstner ve ark (2002) "Sequence Plasticity In The Antigen-Binding Site Of A Therapeutic Anti-HER2 Antibody", J Mol Biol. 321:851-62), deneylerde bir model sistem olarak kullanildi. hu4D5FabV8-faj, hu4D5FabV8 ve ABP-hu4D5Fabv8 yapilarina, sistein inutasyonlari sokuldu. hu4D5-ThioFab-Faj hazirlama prosedürleri, daha önce tarif edilen polietilen glikol (PEG) çökeltme yöntemi kullanilarak gerçeklestirildi (Lowman, Henry B. (1998) Methods in Molecular Biology (Totowa, New Jersey) 87 (Coinbinatorial Peptide Library Protocols) 249-264).Oligonükleotidler, fosforamidit sentez yöntemiyle (US 4415732; US 4458066; Beaucage, S. and Iyer, R. (1992) "Advances in the synthesis of oligonucleotides by the phosphorainidite approach", Tetrahedron 48:2223-2311) hazirlanir. Fosforamidit yöntemi, reaktif 3' fosforamidit moiyeteli nükleotid inonomer birimlerinin kontrollügözenekli cam ya da yüksek düzeyde çapraz-bagli polistirenden84olusan bir kati destek üzerinde ve çogunlukla sentezin basinda kati destege 3' terminusu nükleozitinin eklendigi 3' ilâ 5' yönünde bir oligonükleotid zincirine siklik ilavesine yol açar (US 5047524; US 5262530). Yöntem genellikle ticari piyasada inevcut otomatik sentezleyici kullanilarak gerçeklestirilir (Applied Biosystems, Foster City, CA). Oligonükleotidler, belirleme, yakalama, stabilizasyon ya da baska amaçlarla non-izotopik moiyetelerle kiinyasal olarak etiketleiiebilir (Andrus, A. "Chemical methods for 5' non-isotOpic labelling of PCR probes and primers" (1995) in PCR 2: A Practical Approach, Oxford University Press, Oxford, sayfa 39- 54; Hermanson, G. in Bioconjugate Techniques (1996) Academic Press, San Diego, sayfa 40-55, 643-671; Keller, G. and Manak, M. in DNA Probes Second Edition (1993), Stockton Press, New York, sayfa 121-23).PHESELECTOR ESEYI PHESELECTOR (Faj ELISA for Selection of Reactive Thiols) eseyi bir ELISA faj forinatinda antikorlardaki reaktif sistein gruplarinin tespitine izin verir. Ornek 2°de detayli tarif edildigi gibi, ilgili protein (örnegin, antikor) kuyucuk yüzeyleri üzerine kaplanir ve ardindan, faj partikülleriyle inkübasyon yapilir ve daha sonra, HRP etiketli sekonder antikor eklenir ve absorbans belirlemesi yapilir. Fa j üzerinde görüntülenen inutant proteinler hizli, istikrarli ve yüksek verimli bir sekilde taranabilir. Antikorlarin ve diger proteinlerin rastgele protein faj kütüphanelerinden serbest Cys"nin uygun reaktif bölgelerinin alimini tanimlamak için, sistein degistirilmis antikor kütüphaneleriayni yaklasiin kullanilarak üretilebilir ve baglaina seçimine tâbi85tutulabilir. Bu teknik, faj üzerinde görüntülenen sistein mutant proteinlerinin bir afinite reaktifiyle veya ayni zamanda tiyol-reaktif olan raporlama grubuyla reaksiyona sokulmasini içerir. Sekil 8, Fab ya da ThioFabsin HER2°ye (üst) ve biyotinlenmis ThioFab°1n Streptavidine (alt) baglanmasini gösteren bir sematik temsillePHESELECTOR Eseyini göstermektedir.PROTEIN EKSPRESYONU VE SAFLASTIRMASI Sistein degistirilmis antikrolari kodlayan DNA, geleneksel prosedürler kullanilarak (örnegin, murin antikorlarinin agir ve hafif Zincirlerini kodlayan genlere spesifik baglananbilen oligonükleotid problari kullanilarak) kolaylikla izole edilir ve sekanslanir. Hibridom hücreleri, bu gibi DNA için bir kaynak islevini görür. DNA izole edildikten sonra, ekspresyon vektörleri içine konulabilir ve bu ekspresyon vektörleri de, daha sonra, aksi halde antikor proteinini üretmesi mümkün olmayan E. coli hücreleri, simian COS hücreleri, Çin hamsteri yumurtalik (CHO) hücreleri ya da baska memeli konakçi hücreleri, örnegin, niiyelom hücreleri gibi konakçi hücrelere transfekte edilerek (US 5807715; US 2005/0048572; US 2004/0229310) rekombinan konakçi hücrelerde monoklonal antikorlarin sentezini saglarlar. hu4D5FabV8 sistein degistirilmis antikorlarinin verimleri, yabani tip hu4D5FabV8,e benzerdi. Antikoru kodlayan DNA bakterilerinde rekombinan ekspresyona iliskin inceleme makaleleri arasinda "Skerra ve ark (1993) Curr. Opinion in Immunol. 5:256-262" ve "Pluckthun (1992) Immunol. Revs. 130:151- 188" vardir.86Tasarim ve seçim islemlerinden sonra, yüksek düzeyde reaktif eslesmemis Cys artiklari içeren sistein degistirilmis antikorlar, örnegin ThioFab"lar asagida tarif edilen islemlerle üretilebilir: (i) `Örnegin E. coli sistemi gibi bir bakteriyel sistemde ya da 'Örnegin Çin Hamsteri Yumurtalik hücreleri (CHO) gibi bir memeli hücre kültürü sisteminde (WO 01/00245) ekspresyon ve (ii) yaygin protein saflastirma teknikleri kullanilaral saflastirma (Lowman ve ark (1991)J. Biol.Chem. 266(17): 10982-10988).ThioFab°lar, bir non-supresör E. Coli susu olan 34B8°de indüksiyondan sonra eksprese edilmislerdir (Baca ve ark (1997) Journal Biological Chemistry 272(16)210678-84). Ornek 3a"ya bakiniz. Hasat edilen hücre peleti, PBS (fosfat tampoiilu salin) içinde yeniden süspanse edilmis; bir mikro-akiskanlistirici içinden geçirilerek toplam hücre lizisi gerçeklestirilmis ve ThioFablar, afinite kromatografisi yoluyla protein G SEPHAROSETM (Amersham) ile saflastirilmislardir. ThioFab°lar, yukarida açiklandigi gibi biyotin- PEO-maleimid ile konjuge edilmislerdir ve Biyotinlenmis- ThioFab°lar, Superdex-ZOOW (Amershain) jel filtrasyon kromatografisiyle ek olarak saflastirilmislardir ve bu islem, serbest biyotin-PEO-maleimidi ve ThioFab"larin oligomerik fraksiyonunuelimine etmistir.KUTLE SPEKTROSKOPISI ANALIZIBiyotiii konuge edilmis Fabîn hassas molekül agirligi tayini için, sivi kromatografisi elektrosprey iyonizasyon kütle spektrometrik (LC-ESI- MS) analizi yapildi (Cole, R.B. Electro Spray lonization Mass87Spectrometry: Fundamentals, Instruinentation And Applications. (1997) Wiley, New York). Biyotinlenmis hu4D5FabV8 (A121C) peptidinin amino asit sekansi, triptik sindirim ve ardindan, LC-ESI-Tandem MS analiziyle (Tablo 4, Örnek 3b).Antikor Fab fragmani hu4D5FabV8, 10 Cys artigi (hafifi zincirde bes, agir zincirde bes) dahil yaklasik 445 amino asit artigi içerir. Hümanize 4D5 degisken fragmaninin (FV4D5) yüksek rezolüsyonlu yapisi belirlenmistir; bakiniz: Eigenbrot ve ark "X-Ray Structures Of The Anti gen-Binding Domains Froin Three Variants Of Humanized Anti- P185her2 Antibody 4D5 And Comparison With Molecular Modeling" (1993) .1 M0] Biol. 229:969-995). Cys artiklarinin hepsi disülfûr baglari forinunda mevcuttur; bundan dolayi, bu artiklar, (bir indirgeyici ajanla isleme tâbi tutulmadigi sürece) ilaç-maleimidle konjuge olacak herhangi bir reaktif tiyol grubu içermez. Bu sebeple, yeni tasarlanan Cys artigi eslestirilmemis olarak kalabilir ve bir ilaç- maleimid gibi bir elektrofilik baglayici reaktifiyle veya ilaç-baglayici ara ürünüyle reaksiyona girebilir, yani ona konjuge olabilir. Sekil 1A, X-isini kristal koordinatlariyla türetilen hu4D5 F abv7 antikor fragmani üç boyutlu temsilini göstermektedir. Agir ve hafif zincirlerin degistirilmis Cys artiklarinin yapi pozisyonlari bir sirali numaralandirma sistemine göre numaralandirilir. Bu sirali numaralandirma sistemi, Kabat numaralandirma sisteminden (üst sira) a, b, c olarak belirtilen insersiyonlarla farklilasan ve N-terminalinden baslayan sirali numaralandirma semasini (üst sira) gösteren Sekil lB'ye göre, trastuzumabin 4d5v7fabH varyanti için Kabat nuinaralandirma sistemiyle baglantilidir (Kabat ve ark., (1991)Sequences of Proteins of lmmunological Interest, 5th Ed. Public88Health Service, National lnstitutes of Health, Bethesda, MD). Kabat numaralandirma sisteminin kullanimiyla, gerçek lineer amino asit sekansi, degisken domainin bir FR veya CDR"sinin kisaltmasina veya ona yapilan insersiyona karsilik gelen daha az ve ilave amino asit içerebilir. Sistein degistirilmis, asagida gösterilen agir zincir varyantbölgeleri sirali numaralandirma ve Kabat numaralandirma semalariyla tanimlanir. 4D5Fab Agir zincir Sirali Kabat varyantlari Numaralandirma Numaralandirmasi A40C Ala-40 Ala-40 A88C Ala-88 Ala-84 Sll9C Ser-119 Ser-112 SlZOC Ser-120 Ser-1 13 A121C Ala-121 Ala-114 S 1 22C Ser-122 Ser-115 A175C Ala-175 Ala-168 Ml3 fajinid-Cys mutant Fab°lari (Sekil 3A ve Sekil 3B), Fab proteinlerine kiyasla hizla taranabilir. Antijene ve streptavidine fajmid-ThioFab baglanmasi, Ornek 2°de tarif edildigi ve Sekil 8°de gösterildigi gibi, sirasiyla HER2 ve streptavidin ELISA plakalari üzerine kaplanarak ve ardindan, anti-Fab-HRP°yle (bayirturbu peroksidazi) problanarak test edilebilir. Bu yöntem, degistirilmis Cys artigi/konjuge edilmis biyotin molekülünün antijen baglanmasi ve tiyol grubu reaktivitesi üzerindeki etkisinin eszainanli izlenmesineolanak saglamistir. Bu yöntem ayrica reaktif tiyol gruplarini M13 faj89üzerinde görüntülenen herhangi bir protein açisindan taramak için de uygulanabilir. Konjuge edilmis ya da edilmemis fajinid-ThioFab"lar, basit PEG çökeltme yöntemiyle saflastirilir.Hümanize 4D5°in (hu4D5Fab) antijen-baglanma fragmani, E. Coli°de iyi eksprese edilir ve bakteriyofaj üzerinde görüntülenmistir (Garrard ve ark (1993) Gene 128:103-109). Antikor Fab fragmani hu4D5FabV8, tiyol reaktivitesini problamak için ELISA bazli eseyde bir model sistem olarak Ml3 faj üzerinde görüntülendi. Sekil 8, biyotinleninis ThioFab fajinin ve bir anti-faj HRP antikorunun HER2"ye (üst) ve Streptavidine (alt) baglanmasini gösteren bir PHESELECTOR Eseyi grafiksel temsilini göstermektedir. Kristal yapisi bilgilerinden, baslangiçta, antijen baglanma yüzeyinden uzak bes amino asitli artiklar (L-Ala43, H-A1a40, H-Serl 19, H-AlalZl ve H-Ser122) seçildi (Eigenbrot ve ark (1993) J Mol Biol. 2291969-995). Protein Veritabani X-isini kristal yapisi, lFVC olarak atandi. Cys artiklari, bu pozisyonlarda yere yönlendirilmis mutajenezle degistirildi. ThioFab-faj preparatlari izoel edildi ve biyotinilasyonreaktifiyle reaksiyona sokuldu.Biyotin kon juge edilmis ve edilmemis varyantlar, bir HRP (bayirturbu peroksidazi)-k0njuge anti-faj antikoruyla bir ELISA bazli PHESELECTOR eseyi (Sekil 8, Örnek 2) yapilarak HERZ ve streptavidin baglanmasi açisindan test edildi. Biyotinlenmemis faj- hu4D5FabV8 (Sekil 2A) ve biyotinlenmis faj-hu4D5Fabv85in (Sekil 2B) BSA°yla (içi bos kutu), HER2"yle (gri kutu) ya da streptavidinle (içi dolu kutu) etkilesimi, bir standart HRP reaksiyonu gelistirilerek ve 450 nm'de absorbans ölçülerek anti-Ml3-bayirturbu peroksidaz90(HRP) antikoru yoluyla izlendi. Bir koloriinetrik sübstrat döngüsüyle üretilen absorbans 450 nm°de ölçüldü. ThioFab°in HER2"yle reaktivitesi, antijen baglanmasini ölçer. ThioFab7m streptavidinle reaktivitesi, biyotinilasyon düzeyini ölçer. ThioFab°in BSA"yla reaktivitesi, spesifik olmayan etkilesim için bir negatif kontroldür. Sekil 2A'da görüldügü gibi, ThioFab-faj varyantlarinin hepsinin HERTye baglanma özellikleri, yabani tip hu4D5Fabv8-faj1nkine benzerdir. Ek olarak, biyotinle konjugasyon, ThioFab°in HER2'ye baglanmasina müdahale etmemistir (Sekil 2B).Sasirtici ve beklenmedik bir biçimde, ThioFab-faj numuneleri, degisen seviyelerde streptavidin baglama aktivitesi gösterdiler. Test edilen faj-ThioFab°larin hepsi arasindan, A121C sistein degistirilmis antikor maksimum tiyol reaktivitesi gösterdi. Yabani tip hu4D5Fabv8- faj ayni miktarlarda biyotin-maleimidle inkübe edilmesine ragmen, bu fajin streptavidin baglama aktivitesi düsüktü; bu bulgu, hu4D5Fabv8 ve M13 faj kilif proteinlerinden elde edilen öiiceden mevcut sistein artiklarinin (disülfür bagi olusumunda rol oynar), biyotin-maleimidin yere-özgü konjugasyonuna müdahale etinedigine isaret eder. Bu sonuçlar, Fab yüzeyi reaktif tiyol gruplarini taraiiiak için faj ELISAeseyinin basarili bir biçimde kullanilabilecegini gösterir.PHESELECTOR eseyi, antikorlarda reaktif tiyol gruplarinin tespitine izin verir. Bu yöntemle A121C varyantinin tanimlanmasi, buna örnek olarak gösterilebilir. Reaktif tiyol gruplarina sahip daha fazla ThioFab varyanti tanimlamak için tam Fab molekülü etkin olarak taranabilir. Çözücünün bir polipeptiddeki amino asit artiklarina erisebilirligini tanimlamak ve miktarini tayin etmek için fraksiyonel yüzeyerisilebilirligi parametresi kullanilmistir. Yüzey erisilebilirligi, bir91çözücü molekülüyle (örnegin, su) temas ettirilebilecek yüzey alani (ÄZ) olarak ifade edilebilir. Isgal edilen su alani yaklasik 1,4 IA yariçapli bir küre olarak bulunur. Yazilim bir proteinin her bir amino asidinin yüzey erisilebilirligini bilinen x isini kristalografisi türeVli koordinatlarla hesaplainak için algoritinalar kullanan CCP4 Suite kristalografi programlari ("The CCP4 Suite: Programs for Protein Crystallography" (1994) Acta. Cryst. D50r760-763) olarak ücretsiz olarak temin edilebilir veya lisanslanabilir ("Secretary to CCP4, Daresbury Laboratory, Warrington, WA4 4AD, United Kingdom, Fax: (+44) 1925 603 825 " veya "intemetz WWW.ccp4.ac.uk/dist/html/INDEX.html"). Yüzey erisilebilirlik hesaplamalarini gerçeklestiren iki örnek yazilim modülü, "B.Lee and F.M.Richards (1971) J.Mol.Biol. 55:379-400" referaiisinda açiklanan algoritinalari esas alan "AREAIMOL" ve "SURFACE"dir. AREAIMOL, bir prob küresinin (bir çözücü molekülünü temsil eder) merkezinin yeri olarak bir proteinin çözücü erisebilir yüzeyini, proteinin Van der Waals yüzeyi üzerinde yuvarlanirken tanimlar. AREAIMOL, her bir atom çevresinde (atomun merkezinden, atoin ve prob yariçaplarinin toplamina esit belirli bir mesafede) uzatilmis bir küre üzerinde yüzey noktalari olusturarak ve komsu atomlarla baglantili esdeger küreler içinde bulunanlari elimine ederek çözücü erisebilir yüzeyi alanini hesaplar. AREAIMOL bir PDB koordinat dosyasindaki atoinlarin solvent erisebilir alaniiii bulur ve erisim alanini artiga göre, zincire göre ve tam molekül için özetler. Münferit atomlar için erisilebilir alanlar (veya alan farklari) bir sözde PDB çikti dosyasina yazilabilir. AREAIMOL her bir eleman için tek bir yariçap kabul eder ve sadece sinirli sayida farkli eleman tanimlar. Bilinmeyenatoin tipleri (yani, AREAIMOL'ün dahili veritabaninda olmayanlar)92için 1,8 A varsayilan yariçap atanacaktir. Tanimlanan atomlarin listesiasagida verilmektedir:Atom Atomik no. Van der Waals yariçapi (Ã) C 6 1,80 N 7 1,65 0 8 1,60 Mg 12 1,60 s 16 1,85 P 15 1,90 C1 17 1,80 C0 27 1,80AREAIMOL ve SURFACE, mutlak erisilebilirlikleri, yani kare Angstroms (A) sayisini rapor eder. Fraksiyonel yüzey erisilebilirligi, bir polipeptid içindeki bir amino asit için ilgili bir standart duruma atifta bulunularak hesaplanir. Referans durum, Gly-X-Gly tripeptididir; burada, X simgesi, ilgili amino asittir ve referans durum, beta iplikçiklerindekiler gibi bir "uzatilmis" konformasyon olmalidir. Uzatilmis konformasyon X"in erisilebilirligini azami düzeye çikarir. Bir hesaplanmis erisilebilir alan bir Gly-X-Gly tripeptid referans durumundaki erisilebilir alanla bölünür ve fraksiyonel erisilebilirlik olan bölümü rapor eder. Yüzde erisilebilirlik, fraksiyonel erisilebilirlikçarpi `100Sdür.Yüzey erisilebilirligini hesaplamak için bir baska 'Örnek algoritma,polipeptidin X isini koordinatlari temelinde bir amino asit artiginin bir 93su küresine fraksiyonel erisebilirligini hesaplayan xsae programininSOLV modülüne dayanir (Broger, C., F. Hoffman-LaRoche. Basel).hu4D5FabV7"deki her amino asit için fraksiyonel yüzey erisilebilirligi, kristal yapisi bilgisi kullanilarak hesaplanabilir (Eigenbrot ve ark. (1993) J Mol Biol. 2292969-995). hu4D5FabV7 hafif zincir ve agirzincir amino asitleri için fraksiyonel yüzey erisilebilirlik degerleri, Tablo 1"de azalan sirayla gösterilmektedir.Tablo 1 .hu4D5FabV7-hafif zinciriSER A 202 frac acc= 101,236 ASP A 151 frac ace: 41,586 GLY A 41 frac ace: 90,775 SER A 12 frac ace: 40,633 GLY A 157 frac ace: 88,186 ASN A 210 frac ace: 40,158 ASP A1 frac ace: 87,743 SER A 63 frac ace: 39,872 SER A 156 frac ace: 83,742 ARG A 66 frac ace: 39,669 GLY A 57 frac ace: 81,611 PRO A 8 frac ace: 39,297 SER A 168 f rac ace: 79,680 SER A 65 frac acc= 39,219 SER A 56 frac ace: 79,181 SER A77 frac ace: 38,820 LYS A 169 frac ace: 77,591 THR A 180 frac acc= 38,296 SER A 60 frac ace: 75,291 ASP A 185 frac ace: 38,234 THR A 109 frac ace: 74,603 THR A 31 frac ace: 38,106 CYS A 214 frac ace: 72,021 THR A 94 frac ace: 37,452 LYS A 126 frac ace: 71,002 THR A 93 frac acc= 37,213 SER A 67 frac ace: 66,694 THR A 197 frac ace: 36,709 hu4D5FabV7-hafif zinciriARG A 18 frac ace: 66,126ASN SER LYS LYS GLN GLU GLN LYSARG A 24PHB SER GLN ALA SER LYS GLY LYS PRO GLU ALAVALA 152 frac A 127 frac A 190 frac A 145 frac A 199 frac A 143 frac A 3 frac A 188 frac frac A 53 frac A 9 frac A 27 frac A 153 frac A 203 frac A 42 frac A 16 frac A 45 frac A 204 frac A 213 frac A 184 fracA 15 fracacc= 65,415 ace: 65,345 2100: 65,189 acc= 63,342 acc= 62,470 ace: 61,681 ace: 59,976 acc= 59,680 ace: 59,458 acc= 58,705 acc= 58,446 ace: 57,247 ace: 56,538 ace: 55,864 ace: 54,730 ace: 54,612 ace: 54,464 ace: 53,172 ace: 53,084 ace: 52,556ace: 52,460SER A 182 f rac ace:GLY A 128 fracLYS A 207 fracASPA 17 fracGLY A 200 fracGLU A 165 fracALA A 112 fracGLN A 79 fracVAL A 191 fracSER A 208 fracLYS A 39 fracGLU A 123 fracTHR A 69 fracSER A 76 fracHISA 189 fracARG A 108 fracASN A 158 fracVAL A 205 fracSER A 14 fracGLN A 155 fracGLU A 187 fracARG A 211 fracacc=acc=::ICC=acc=ace:ace:ace:acc=ace:acc=ace:acc:ace:acc=acc=acc:acc=ace:ace:acc:acc=36,424 ,779 ,638 ,413 ,274 ,067 34,912 34,601 33,935 33,525 33,446 32,486 32,276 32,108 31,984 31,915 31,447 31,305 31,094 ,630 ,328 ,027 hu4D5FabV7-hafif zinciriSER LEU GLN SER THR THR ASP GLY THR ASP PRO SER SER TYR LYS GLU VAL GLU PRO ASN GLN SERA 7 frac A 154 frac A 100 frac A 10 frac A 5 frac A 206 frac A 28 frac A 68 frac A 20 frac A 122 frac A 80 frac A 52 frac A 26 frac A 92 frac A 107 frac A 161 frac A 110 frac A 81 frac A 59 frac A 30 frac A 160 fracA 114 fracace: 51,936 acc= 51,525 ace: 51,195 2100: 49,907 acc= 48,879 acc= 48,853 ace: 48,758 ace: 48,690 acc= 48,675 ace: 47,359 acc= 46,984 acc= 46,917 ace: 46,712 ace: 46,218 ace: 45,912 ace: 45,100 ace: 44,844 ace: 44,578 ace: 44,290 ace: 42,721 ace: 42,692ace: 42,374LYSASN ASPSERGLN THR ALA ARG LEU ASPTHR ALA VAL PRO ALA LYSLEU THR GLU THR THRASPA 183 frac A 138 frac A 170 frac A 159 frac A 147 frac A 22 frac A43 frac A 142 frac A 54 frac A 167 frac A 129 frac A 144 frac A 163 frac A 95 frac A 111 frac A 103 frac A 181 frac A 72 frac A 195 frac A 178 frac A 85 fracA 70 fracace: 29,751acc= 29,306acc= 29,041acc= 27,70527,485acc= ace: 27,121 ace: 26,801 ace: 26,447 acc= 25,882 ace: 25,785 2100: 23,880 ace: 23,652 acc: 22,261 ace: 20,607ace: 19,942acc= 18,647ace: 18,312acc= 18,226ace: 18,006ace: 17,499 300: 17,343acc= 17,194 hu4D5FabV7-hafif zinciriPRO PHE THRARG A 61TYR SER LYS GLU LEU GLY GLY PHE THR SER PRO PHE THR ALA HISVAL SERALAA 40 frac A 116 frac A 97 frac frac A 49 frac A 50 frac A 149 frac A 55 frac A 201 frac A 64 frac A 212 frac A 98 frac A 74 frac A 171 frac A 141 frac A 83 frac A 164 frac A 32 frac A 198 frac A 146 frac A 121 fracA 13 fracace: 41,928acc= 16,406ace: 16,2042100: 16,19216,076acc= acc= 15,74615,510ace: ace: 14,927 acc= 14,012 ace: 13,735 acc= 13,396 acc= 12,852ace: 12,169 ace: 11,536 acc= 11,073 ace: 10,871 ace: 10,325 ace: 9,971 ace: 9,958 ace: 9,861 ace: 9,833ace: 9,61596LEU LEU PRO LEU ALA PHEPHEALA VAL ASPLEU GLNMETA4SER S ER LEU PHE TRP PHE TYR LEUVALA 11 frac A 125 frac A 96 frac A 47 frac A 51 frac A 118 frac A 62 frac A 25 frac A 133 frac A 82 frac A 179 frac A 124 frac frac A 177 frac A 131 frac A 135 frac A 71 frac A 35 frac A 209 frac A 186 frac A 78 fracA 196 fracace:acc=acc=::ICC=acc=ace:ace:ace:acc=ace:acc=ace:acc:ace:acc=acc=acc:acc=ace:ace:acc:acc=16,568 2,398 2,387 2,180 1,837 1,779 1,581 1,538 1,315 1,141 0,872 0,787 0,778 0,693 0,693 0,654 0,593 0,448 0,395 0,259 0,157 0,000 hu4D5FabV7-hafif zinciriGLU A 105 frac ace: 9,416SER ILE HIS ALA GLN VAL PRO GLN PRO GLY TYR VAL TYR SER ILE ASN TRP GLY PRO LEUVALA 162 frac A 117 frac A 91 frac A 193 frac A 37 frac A 58 frac A 120 frac A 38 frac A 113 frac A 101 frac A 140 frac A 115 frac A 87 frac A 5176 frac A 2 frac A 137 frac A 148 frac A 99 frac A 44 frac A 175 fracA 19 fracacc= 9,304 ace: 8,780 2100: 8,557 acc= 8,547 acc= 8,442 ace: 8,281 ace: 8,095 acc= 6,643 ace: 6,594 acc= 6,558 acc= 5,894 ace: 5,712 ace: 4,539 acc= 4,106 ace: 4,080 ace: 3,906 ace: 3,676 ace: 3,550 ace: 3,543 ace: 3,488ace: 3,420VAL VAL VAL VAL TYR TYR TYR THR SER PHE LEU LEU ILE ILE ILE GLN GLN CYS CYS CYS CYS ALAA 132 frac A 104 frac A 33 frac A 29 frac A 192 frac A 86 frac A 36 frac A 102 frac A 174 frac A 139 frac A 136 frac A 73 frac A 75 frac A 48 frac A 21 frac A 90 frac A 89 frac A 194 frac A 134 frac A 88 frac A 23 fracA 130 fracace:acc=acc=::ICC=acc=ace:ace:ace:acc=ace:acc=ace:acc:ace:acc=acc=acc:acc=acc=ace:acc:acc=0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 hu4D5FabV7-hafif zinciriILE A 106 frac PRO A 119 frac LEU A 46 frac GLN A 6 frac TYR A 173 frac VAL A 150 frac GLN A 166 fracTHR A 172 fracace: 3,337 acc= 2,953 ace: 2,887 2100: 2,860 acc= 2,825 acc= 2,525 ace: 2,525ace: 2,436hu4D5Fabv7-agir zinciriSER B 179 frac GLY B 42 frac GLUB 1 fracGLY B 66 frac ASP B 102 frac SER B 75 frac GLY B 140 frac ASN B 211 frac GLY B 197 frac ASP B 62 frac GLY B 103 frac SER B 163 fracSER B 139 fracacc= 99,479acc= 95,850 3.00: 87,276ace: 84,541ace: 83,794acc= 80,567ace: 80,344acc: 79,588ace: 78,676ace: 77,716ace: 77,176ace: 76,664ace: 74,94698ALA A 84 frac ace:ALA A 34 frac acc=PRO THR THR LEU GLY S ER THR PRO LYS LYS ALA GLU SERB 14 frac B 54 frac B 200 frac B `177 frac B 8 frac B 7 frac B 69 frac B 220 frac B 208 frac B 30 frac B 23 frac B 46 fracB 25 fracace:acc=ace:acc:acc=acc=acc=acc:acc=ace:ace:acc:ace:0,0000,00045,729 45,503 45,369 45,337 44,898 43,530 43,503 43,378 43,138 42,380 41,952 41,43041,323 hu4D5FabV7-agir zinciriLYS B 213 frac ace:ALA THR SER SER PRO THR SER LYS GLY THR ASP GLY SER SER LYS GLY SER TYR GLU SERLYSB 165 frac B 167 frac B 122 frac B 194 frac B 41 frac B 198 frac B 222 frac B 43 frac B 26 frac B 138 frac B 31 frac B '15 frac B 168 frac B '120 frac B 76 frac B 141 frac B 137 frac B 57 frac B 89 frac B 180 fracB 65 fracace:ace:.'CICC=acc=ace:ace:ace:ace:acc=acc='clCC=ace:acc=acc=ace:acc:acc=acc:ace:ace:ace:74,442 74,339 73,934 72,870 71,959 71,540 68,668 68,128 67,782 67,782 65,826 64,222 64,172 62,100 61,332 61,092 59,419 59,179 58,916 58,483 56,289 55,04499ARG LYSASN GLN THR SERGLY GLY THR PRO GLY TYR LYSGLY GLY THR GLY VAL ALA SERGLY SERB 87 frac B 124 fracB 28 fracB 3 fracB 123 fracB 63 frac B 56 frac B 169 fracB 172 fracB 209 fracB 101 fracB 109 fracB 221 fracB 44 fracB `181 fracB 58 fracB 9 fraCB 5 fracB 121 fracB 127 fracB 10 fracB 71 fracace:acc=ace:acc=acc=ace:ace:ace:acc=ace:acc=ace:acc:acc=acc=acc=acc:acc=ace:ace:acc:ace:41,282 40,888 40,529 39,824 39,306 38,867 38,582 38,469 38,421 38,309 38,040 36,829 36,520 ,147 34,735 34,457 34,254 34,198 33,049 32,390 32,230 -659 100hu4D5FabV7-agir zinciriASP B 215 frac ace: 54,656 ASP B 73 frac ace: 30,245 GLN B 13 frac acc= 53,719 LEU B 115 frac acc= 29,867 GLN B 112 frac ace: 53,215 LEU B 11 frac ace: 29,825 TYR B 105 frac acc= 51,940 ASN B 84 frac acc= 29,765 ALA B 88 frac 2100: 51,602 SER B 210 frac acc= 28,656 GLY B 164 frac ace: 50,259 GLU B 155 frac ace: 28,162 PRO B 192 frac ace: 49,826 SER B 160 frac ace: 26,526 THR B 158 frac ace: 49,694 CYS B 223 frac ace: 26,270 THR B 142 frac acc= 48,896 GLY B 16 frac acc= 26,158 ASN B 55 frac acc= 48,344 ILE B 202 frac ace: 26,068 LYS B 136 frac acc= 48,312 GLN B 82 frac acc= 25,836 ARG B 19 frac 3.00: 48,082 SER B 193 frac ace: 25 ,550 PRO B '156 frac ace: 47,366 ASN B 77 frac acc: 25,418 PRO B 174 frac ace: 47,157 ARG B 59 frac acc= 25,301 LYS B 217 frac acc= 47,102 VAL B 93 frac ace: 25,254 GLN B 199 frac ace: 46,650 THR B 74 frac ace: 24,902 SER B 17 frac acc: 45,980 GLU B 219 frac acc: 24,778 SER B 85 frac ace: 45,824 ASN B 206 frac acc= 24,647 VAL B 170 frac ace: 24,549 PRO B 154 frac acc: 6,767TYR B 52 frac ace: 24,298 PRO B 133 frac ace: 6,767ALA B 175 frac ace: 23,804 TRP B 99 frac acc: 6,502LYS B 216 frac ace: 23,277 THR B 32 frac ace: 6,291 hu4D5FabV7-agir zinciriVAL B 214 frac ace: 23,150GLY ASN ALA ALA LEU THR LEU TYR THR VAL SERSERTHR AS PTHR SERLEU TYR TYR VAL PROB 125 frac B 162 frac B 72 frac B 40 frac B 18 frac B 212 frac B 182 frac B 33 frac B 190 frac B 176 frac B 21 frac B '119 frac B 91 frac B '151 frac B 114 frac B 134 frac B 196 frac B 60 frac B 183 frac B 2 fracB 130 fracace:ace:.'CICC=acc=ace:ace:ace:ace:acc=acc='clCC=ace:acc=acc=ace:acc:acc=acc:ace:ace:ace:22,802 22,245 22,166 21,974 ,273 ,170 19,619 19,398 19,365 18,941 18,929 18,877 18,237 17,849 17,601 17,571 17,090 16,575 ,968 ,90115,342101LEU VAL ILE SER PHE ARG TRP VAL ALA TYR GLU ALA ILE GLY LEU TYR LEU PHE VAL CYS TRP LEUB45 B 128 B 51 B 186 B 173 B 38 847 B 118 B 24 B 95 B 6B 144 B 70 B 111 B4B 201 B 148 B 68 B 188 B 22 B 161B 131frac frac frac frac frac frac frac frac frac frac frac frac frac frac frac frac fraC frac frac frac fracfracace:acc=ace:acc=acc=ace:ace:ace:acc=ace:acc=ace:acc:acc=acc=acc=acc:acc=ace:ace:acc:ace:4,649 4,515 4,307 4,084 3,969 3,734 3,561 3,409 3,376 3,242 3,216 3,167 1,958 1,868 1,808 1,758 1,744 1,708 1,315 0,935 0,876 0,654 102hu4D5FabV7-agir zinciriLEU B 166 frac ace: 15,268 VAL B 205 frac acc= 0,495 GLY B 100 frac acc= 15,003 ALA B 92 frac acc= 0,356 PHE B 27 frac ace: 14,383 ALA B 79 frac ace: 0,356 ASN B 204 frac acc= 13,873 VAL B 64 frac acc= 0,263 PHE B 104 frac 2100: 13,836 ILE B 29 frac acc= 0,227TYR B 80 frac ace: 13,490 VAL B 218 frac ace: 0,000 VAL B 159 frac ace: 12,782 VAL B 189 frac ace: 0,000 ARG B 67 frac ace: 12,362 VAL B 149 frac ace: 0,000 GLN B 178 frac acc= 12,131 VAL B 116 frac acc= 0,000 HIS B 171 frac acc= 11,412 VAL B 48 frac ace: 0,000 SER B 184 frac acc= 11,255 VAL B 37 frac acc= 0,000 ARG B 98 frac 3.00: 11,115 TYR B 152 frac ace: 0,000 PRO B 53 frac ace: `11,071 TYR B 94 frac acc: 0,000 GLN B 39 frac ace: 11,037 TRP B 36 frac acc= 0,000 SER B '195 frac acc= `10,909 SER B `187 frac acc= 0,000 ASP B 108 frac ace: 10,525 SER B 97 frac ace: 0,000 LEU B 185 frac acc: 10,464 MET B 107 frac acc: 0,000 GLY B 113 frac ace: 10,406 MET B 83 frac ace: 0,000 THR B 78 frac ace: 10,213 LEU B 145 frac acc: 0,000 THR B 117 frac ace: 9,990 LEU B 86 frac ace: 0,000 LYS B 150 frac ace: 9,447 LEU B 81 frac acc: 0,000 VAL B 157 frac ace: 9,323 LEU B 20 frac ace: 0,000103hu4D5FabV7-agir zinciriVAL TRP ALA SER PHE ARG ALA ALA VAL PRO PHEB 12 frac ace: 9,207 ILE B 34 frac acc= 0,000 B 110 frac acc= 9,069 HIS B 207 frac acc= 0,000 B 143 frac acc= 8,903 HIS B 35 frac acc= 0,000 B 135 frac acc= 8,897 GLY B 146 frac acc= 0,000 B 129 frac acc= 8,895 CYS B 203 frac ace: 0,000 B 50 frac acc= 8,639 CYS B 147 frac ace: 0,000 B 61 frac ace: 8,547 CYS B 96 frac ace: 0,000 B 132 frac ace: 7,882 ASP B 90 frac ace: 0,000 B 191 frac acc= 7,366 ALA B 106 frac ace: 0,000 B 126 frac acc= 7,258 ALA B 49 frac ace: 0,0000 B 153 frac acc= 6,918Cys artiklariyla ikame etmek için degistirilebilecek hu4D5FabV8artiklarini tanimlamak amaciyla asagida açiklanan iki kriteruygulandi:1. Tamamen yakilan, yani fraksiyonel yüzey erisilebilirligi %10"dan az olan amino asit artiklari elimine edildi. Tablo 1, erisilebilirligi (fraksiyonel yüzey erisilebilirligi) %10"un üzerinde olan 134 (hafif zincir) ve 151 (agir zincir) hu4D5FabV8 artigi oldugunu gösterir. En erisilebilir ilk 011 Ser, Ala ve Val artigi, yeni degistirilmis Cys tarafindan antikorda yalnizca minimal yapisal kisitlamalar ortaya çikarak, baskaamino asitlere kiyasla Cys°ye yakin yapisal benzerligi sayesinde104seçildi. Baska sistein ikamesi yerleri de taranabilir ve konjugasyon için kullanisli olabilir.2. Artiklar, fonksiyonel ve yapisal Fab etkilesiinleri oynadiklari rol baz alinarak ayrilirlar. Anti jen etkilesimlerinde rol oynainayan ve mevcut disülfur baglarindan uzak olan artiklar da seçildi. Yeiii degisitirilen Cys artiklari, antijen baglanmasindan uzak olmali ve ona müdahale etineinelidir ve dis'ulfur bagiolusumunda rol oynayan sisteinle eslesmemelidir.Asagida sayilan hu4D5FabV8 artiklari, yukarida açiklanan kriterleri karsiladi ve Cyssyle ikame edilmek üzere seçildi: L-V15,LA43, L- V110, L-Al44, L-SlöS, H-A88, H-AlZl, H-Sl22, H-Al75 ve H- 8179 (Sekil l"de gösterilmektedir).Tiyol reaktivitesi, herhangi bir antikora genellenebilir; burada, ainino asitlerin reaktif sistein ainino asitleriyle sübstitüsyonu, L-10 ilâ L-20; L-38 ilâ L-48; L-105 ilâ L-115; L-l39 ilâ L-l49; L-163 ilâ L-l73 arasiiidan seçilen hafif zincir araliklari dahilinde ve H-35 ilâ H-45; H- 83 ilâ H-93; H-l 14 ilâ l-I-127 ve H-l70 ilâ H-184 arasindan seçilen agir zincir araliklari dahilinde ve H-268 ilâ H-291; H-319 ilâ H-344; H-370 ilâ H-380 ve H-395 ilâ H-405 arasindan seçilen araliklarda Fc bölgesinde yapilabilir.Tiyol reaktivitesi, bir antikorun örnegin hafif zincir sabit domaini (CL) ve agir zincir sabit domaiiileri CHl, CH2 ve CH3 gibi belirli domaiiileriiie genellenebilir. 0,6 ya da daha yüksek tiyol reaktivitesi degerlerine yol açan sistein ikameleri, lgG alt-siniflari IgGl, IgGZ, lgG3, lgG4, lgA ve lgAZ de dahil lgA, lgD, IgE, lgG ve lgM intakt105antikorlarinin sirasiyla a, 5, 8, y ve u agir zincir sabit domainlerindeyapilabilir.Kristal yapisi verileri temelinde, seçilen 10 Cys mutantinin antijen birlesme yerinden, 'Örnegin bu durumda HER2°yle arayüzeyden uzak oldugu açiktir. Bu mutantlar, fonksiyonel etkilesimler üzerinde dolayli etkileri açisindan deneysel olarak test edilebilirler. Cys Fab varyantlarimn hepsinin tiyol reaktiviteleri, Ornek 1 ve 23de tarif edildigi gibi ve Tablo 2°de sunuldugu gibi ölçüldü ve hesaplandi. L- V15C, L-Vl 10C, H-A88C ve H-A121C artiklari, reaktif ve stabil tiyol gruplari (Sekil 3A ve 3B) içerir. V`15C, VllOC, Al44C, 5168C mutantlari, hafif zincir Cys varyantlaridir. A88C, A121C, Al75C, Sl79C mutantlari, agir zincir Cys varyantlaridir. Yüksek fraksiyonel yüzey erisilebilirligine sahip yerlerin, PHESELECTOR eseyiyle (Tablo 2) hesaplama yapildiginda, en yüksek tiyol reaktivitesine sahip olmamasi sasirtici ve beklenmedik bir durumdur. Baska bir deyisle, fraksiyonel yüzey erisilebilirligi (Tablo 1, 2), tiyol reaktivitesiyle (Tablo 2) bagintili degildi. Esasinda, %20 ile %80 araliginda orta yüzey erisilebilirligine sahip olan yerlerde (Sekil 4A, Tablo 1) ya da Ala ya da Val artiklari gibi kismen korumasiz yerlerde degistirilmis Cys artiklari, Ser artiklarinda sokulan Cys"ye kiyasla daha iyi tiyol reaktivitesi (yani, 0,6) (Sekil 3B, Tablo 2) gösterdi ve bunun sonucunda, tek basina kristal yapisi bilgileri bu yerleri seçmek için yeterli olmadigindan dolayi, tiyol reaktif yerlerin taramasindaPHESELECTOR eseyi kullanilmasi gerekti (Sekil ?B ve 4A).4D5 ThioFab Cys mutantlarinin amino asit artiklari için tiyol106reaktivitesi verileri Sekil 3A ve 3B°de gösterilmektedir: (3A) biyotinleninemis (kontrol) ve (3B) biyotinleninis faj-ThioFab°lar. Antikor/Fab yüzeyi üzerindeki reaktif tiyol gruplari, PHESELECTOR esey analizleriyle, biyotinlenmemis faj-hu4D5Fabv8iin (3A) ve biyotinleninis faj-hu4D5Fabv8"in (3B) BSA°yla (içi bos kutu), HER2"yle (gri kutu) ya da streptavidinle (içi dolu kutu) etkilesimi açisindan tanimlandi. Esey, Ornek 2"de tarif edildigi gibi gerçeklestirildi. Hafif zincir varyantlari sol tarafta, agir zincir varyantlari ise sag taraftadir. Biyotinlenmeinis 4D5 ThioFab Cys mutantlarinin baglanmasi, beklendigi gibi düsüktür, fakat HER2°ye kuvvetli baglanma sürdürülür. Biyotinlenmis 4D5 ThioFab Cys mutantlarinin streptavidine ve HERTye baglanma orani, Tablo 2"de gösterilen tiyol reaktivitesi degerlerini vermektedir. 450 nm°de arkaplan absorbansi ya da biyotinleninis 4D5 ThioFab Cys mutantlarinin BSA°ya küçük miktarlarda spesifik olmayan protein baglanmasi da Sekil 3B7de açikça görülmektedir. Bir Cys artigiyla ikame edilen seçili amino asit artiklarinin Fraksiyonel Yüzey Erisilebilirligi degerleri Sekil 4A7da gösterilmektedir. Fraksiyonel yüzey erisilebilirligi, mevcut hu4D5Fabv7 yapisindan hesaplanmistir ve Tablo 1"de gösterilmektedir (Eigenbrot ve ark. (1993) J Mol Biol. 229z969-995). hu4D5Fabv7 ve hu4D5Fabv8 yapilarinin konforinasyonel parametreleri yüksek düzeyde tutarlidir ve hu4D5Fabv7"nin fraksiyonel yüzey erisilebilirligi ile hu4D5FabV8 sistein mutantlarinin tiyol reaktivitesi arasindaki bagintinin tayinine olanak saglar. Kismen korumasiz artiklarda (Ala ya da Val) sokulan faj ThioFab Cys artiklarinin ölçülen tiyol reaktivitesi, Ser artiklarinda sokulanlara kiyasla daha iyidir (Tablo 2). Tablo 2,de gösterilenThioFab Cys mutantlarindan, tiyo reaktivitesi degerleri ile fraksiyonel107yüzey erisilebilirligi arasinda herhangi bir baginti olmadigi ya da çokaz baginti oldugu görülebilir.Bir antikorun L-15, L-43, L-110, L-144, L-168, H-40, H-88, H-119, H-121, H-122, H-l75 ve H-l79 pozisyonlarindaki amino asitler genellikle serbest sistein amino asitleriyle mutasyona ugratilabilir (ikame edilebilir). Bu pozisyonlarin her bir tarafindan yaklasik 5 amino asit artigi dahilindeki araliklar, yani L-lO ilâ L-ZO; L-38 ilâ L- 48; L-105 ilâ L-115;L-139 ilâ L-l49; L-163 ilâ L-l73; H-35 ilâ H-45; H-83 ilâ H-93; H-114 ilâ H-127 ve H-170 ilâ H-184 ve yani sira, H- 268 ilâ H-291; H-319 ilâ H-344; H-370 ilâ H-38O ve H-395 ilâ H-405 arasindan seçilen FC bölgesindeki araliklar da serbest sistein asitleriyle ikame edilerek bu bulusa konu olan sistein degistirilmis antikorlarelde edilebilir.Tablo 2. Fa j-ThioFab"1ar1n tiyol reaktivitesi Faj-ThioFab Tiyol Fraksiyonel Yüzey yapisi Reaktivitesi Erisilebilirligi (%) (Tablo 1"den) hu4D5FabV8 -Wt 0,125 - L-V15C 0934 52,46 L-A43C 0,385 26,80 L-vi lOC 0,850 44,84 L-A144C 0,373 23,65 L-si68C 0,514 79,68 H-A4OC 0,450 21,97 H-A88C 0914 51,60 108 Faj-ThioFab Tiyol Fraksiyonel Yüzey yapisi Reaktivitesi Erisilebilirligi (%) (Tablo lsden) H-Sl 19C 0,680 18,88 H-A121C 0,925 33,05 H-SlZZC 0,720 72,87 H-Al75C 0,19 23,80 H-S 1 79C 0,446 99,48 L = hafif zincir, [-1 = agir zincir, A = alanin, S = serin, V = valin, C = sisteinTiyol reaktivitesi, streptavidin baglanmasi için OD450 nm degerinin HER2 (antikor) baglanmasi için OD450 nm degerine orani olarakölçülür (Ornek 2). 1 tiyol reaktivitesi degeri, sistein tiyolün tam biyotinilasyonunu gösterir. Hafif zincirden iki Cys varyanti (L-V15C ve L-VllOC) ve agir zincirden iki Cys varyanti (H-A88C ve H-A121C) seçilerek ilave analize tâbi tutuldu, çünkü bu varyantlar, en yüksek tiyol reaktivitesidegerini gösterdi (Tablo 2).Faj saflastirmadan farkli olarak, F ab hazirlama islemi, üretim ölçegine bagli olarak 2-3 gün gerektirebilir. Bu süre esnasinda, tiyol gruplari, oksidasyondan dolayi reaktivite kaybedebilir. hu4D5FabV8-faj üzerinde tiyol gruplarinin stabilitesini problamak için, j-thioFab"larin tiyol reaktivitesinin stabilitesi ölçüldü (Sekil 4B). ThioFab-faj saflastirma isleminden sonra, 1. günde, 2. günde ve 4. günde, numunelerin hepsi, biyotin-PEO-maleimidle konjuge edildi ve faj ELISA eseyiyle (PHESELECTOR) problanarak HER2 ve streptavidin baglanmasi test edildi. L-V15C, L-VllOC, H-A88C ve H-A121C,109baska ThioFab varyantlarina kiyasla anlamli ve Önemli miktarlardatiyol reaktivitesini koru ve sürdürûr (Sekil 4B).ETIKETLI SISTEIN DEGISTIRILMIS ANTIKORLARBu bulusa konu olan sistein degistirilmis antikorlar, bir reaktif sistein tiyol grubu yoluyla antikora kovalent olarak baglanabilen herhangi bir etiket moiyetesiyle konjuge edilebilir (Singh ve ark (2002) Anal. Biochein. 304:147-15;Har10W E. and Lane, D. (1999) Using Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Springs Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY; Lundblad R.L. (1991) Chemical Reagents for Protein Modification, 2. ed. CRC Press, Boca Raton, FL). Bagli etiket asagidaki fonksiyonlari yerine getirebilir: (i) belirlenebilir bir sinyal verme; (ii) bir ikinci etiketle etkilesime girerek birinci ya da ikinci etiketin sagladigi belirlenebilir sinyali modifiye etme, 'örnegin F RET (floresans rezonans enerji transferi) saglama; (iii) antijenle ya da ligandla etkilesimleri stabilize etme ya da baglanma afinitesini arttirma; (iv) yük, hidrofobisite, sekil ya da baska fiziksel parainetrelerle mobiliteyi, örnegin elektroforetik inobiliteyi ya da hücre geçirgenligini etkileme ya da (v) ligand afinitesi, antikor/antijen baglanmasi ya da iyonik kompleks olusturmayi modüle etmek için biryakalama inoiyetesi sunma.Etiketli sistein degistirilmis antikorlar diyagnostik eseylerde, örnegin söz konusu bir anti jenin spesifik hücreler, dokular veya serum içinde ekspresyonunun tespiti için yararli olabilir. Diyagnostik uygulamalar için, antikor tipik olarak bir tespit edilebilir inoiyeteyle etiketlenir.Genel olarak asagidaki kategorilerde gruplandirilabilen çok sayida110etiket mevcuttur:(a) 3H, "C, "C, 181:, 32P, 358, 64Cu, 68Ga, 86Y, 99Tc, '"In, 1231, [241, '251, 13'I, 133Xe, 177Lu, 2"At veya 2i3Bi gibi radyoizotoplar (radyonüklidler). Radyoizotop etiketli antikorlar, reseptör hedefli görüntüleme deneylerinde yararlidir. Antikor, bir radyoizotop metali baglayan, selatlayan veya baska herhangi bir sekilde kompleks yapan ve "Current Protocols in Immunology, Ciltler 1 and 2, Coligen ve ark, Ed. Wiley-Interscience, NeW York, NY, Pubs. (1991)"de tarif edilen teknikler kullanilarak antikorun degistirilmis sistein tiyoliyle reaktif olan ligand reaktifleriyle etiketlenebilir. Bir metal iyonunu kompleks yapabilecek selatlaina ligandlari arasinda DOTA, DOTP, DOTMA, DTPA ve TETA bulunur (Macrocyclics, Dallas, TX). Radyonüklidler, bu bulusa konu olan antikor-ilaç kon jugatlariyla kompleksasyon vasitasiyla hedef alinabilir (Wu ve ark (2005) Nature Biotechnology 23(9): 1137-1146). Deneylerde görüntüleme yapmak için antikor etiketleri olarak kullanmaya uygun metal-selat kompleksleri asagida atif yapilan referanslarda açiklanmaktadir: US 5342606; US 5428155;US 5316757; US 5480990; US 5462725; US 5428139; US 5385893;US 5739294; US 5750660; US 5834456; Hnatowich ve ark (1983) J. Immunol. Methods 65:147-157; Meares ve ark (1984) Anal. Biochem. 142:68-78;Mirzadeh ve ark (1990) Bioconjugate Chem.l:59-65;Meares ve ark (1990) J. Cancerl990, Suppl. 10:21-26; Izard ve ark (1992) Bioconjugate Chein. 3:346-350;Nikula ve ark (1995) Nucl. Med. Biol. 22:387-90; Camera ve ark (1993) Nucl. Med. Biol. 202955-11162; Kukis ve ark (1998) J. NucL Med. 39:2105-2110; Verel ve ark (2003) J. Nucl. Med. 44:1663-1670; Camera ve ark (1994) J. Nucl. Med. 21:640-646; Ruegg ve ark (1990) Cancer Res. 50:4221-4226;Vere1 ve ark (2003) J. Nucl. Med. 4421663- 1670; Lee ve ark (2001) Cancer Res. 61:4474-4482; Mitchell, ve ark (2003) J. Nucl. Med. 44:1105-1112; Kobayashi ve ark (1999) Bioconjugate Chem. 10:103-111; Miederer ve ark (2004) J. Nucl. Med. 45:129-137; DeNardo ve ark(l998) Clinical Cancer Research 4:2483-90; Blend ve ark (2003) Cancer Biotherapy & Radiopharmaceuticals 18:355-363; Nikula ve ark (1999) J. Nucl. Med. 40:166-76;K0bayashi ve ark (1998) J. NucL Med. 39:829-36; Mardirossian ve ark (1993) Nucl. Med. Biol. 20:65-74;Rose11i ve ark (1999) Cancer Biotherapy & Radiopharmaceuticals, 14:209-20.(b) Nadir toprak selatlari (evropyum selatlari) gibi floresan etiketler, FITC, 5-karboksifloresein, 6-karboksi floresein dahil floresein tipleri; TAMRA dahil rodamin tipleri; dansil; Lizamin; siyaninler; fikoeritrinler; Texas Kirmizisi ve buiilariii analoglari. Floresan etiketler örnegin yukaridaki Güncel Immünoloji Protokollerinde açiklanan teknikler kullanilarak antikorlara kon juge edilebilir. Floresan boyalar ve floresan etiket reaktifleri arasinda Invitrogen/Molecular Probes (Eugene, OR) ve Pierce Biotechnology, Inc. (Rockford, IL),den temin edilebilenler yer alir.(0) Çesitli enzim-substrat etiketleri mevcuttur ve açiklanmaktadir (US 4275149). Enzim, genelde, bir kromojenik sübstratin çesitli teknikler kullanilarak ölçülebilen kimyasaldegisimini katalize eder. Örnegin, enzim, bir sübstratin112spektrofotometrik olarak ölçülebilen renk degisimini katalize edebilir. Alternatif olarak, enzim, sübstratin floresansini veya kemiluminesansini degistirebilir. Floresanstaki bir degisimin miktarini tayin etmek için teknikler yukarida tarif edilmistir. Kemiluminesans sübstrati bir kimyasal reaksiyonla elektronik olarak uyarilir ve daha sonra, ölçülebilen (ömegin bir kemiluminometre kullanilarak) isik yayabilir veya bir floresan aliciya enerji verebilir. Enzimatik etiketlerin 'örnekleri arasinda lusiferazlar (örnegin, ates böcegi lusiferazi ve bakteriyel lusiferaz; US 4737456), lusiferin, 2,3-dihidrofitalazindionlar, malat dehidrojenaz, üreaz, peroksidaz, örnegin, bayirturbu peroksidazi (HRP), alkaliii fosfataz (AP), ß-galaktosidaz, glukoamilaz, lizozim, sakkarid oksidazlar (örnegin, glukoz oksidaz, galaktoz oksidaz ve glukoz-Ö-fosfat dehidrojenaz), heterosiklik oksidazlar (örnegin, ürikaz ve ksaiitin oksidaz), laktoperoksidaz, mikroperoksidaz ve benzeri bulunur. Enzimleri antikorlara konjuge etme teknikleri "O"Sullivan ve ark (1981) "Methods for the Preparation of Enzyme-Antibody Con jugates for use in Enzyme Immunoassay", in Methods in Enzym. (ed J. Langone & H. Van Vunakis), Academic Press, New York, 73:147-166" referajinda tarif edilmistir.Enzim-sübstrat kombinasyonlarinin örnekleri arasinda `Örnegin sunlarbulunur:(i) Bir sübstrat olarak hidrojen peroksidazli bayirturbuperoksidazi (HRP); burada, hidrojen peroksidaz bir boya113prekursorunu (örnegin, ortofenilen diamin (OPD) veya 3,3,,5,5s-tetrametilbenzidin hidroklor'ûr (TMB)) okside eder.(ii) Kromojenik sübstrat olarak para-nitrofenil fosfatli alkalin fosfataz (AP) ve(iii) bir kromojenik sübstratli (ömegin, p-nitrofenil-ß-D- galaktosidaz) veya florojenik sübstratli (4-metilumbeliferil-B-D-galaktosidaz) ß-D-galaktosidaz (ß-D-Gal).Sektördeki uzmanlarca çok sayida baska enzim-sübstrat kombinasyonu bilinmektedir. Genel bir inceleine olarak, bkz. US4275149 ve US 4318980.Bir etiket bir sistein degistirilmis antikorla dolayli olarak konjuge edilebilir. Örnegin, antikor, biyotinle konjuge edilebilir ve yukarida sözü edilen üç genis etiket kategorisinden herhangi biri avidinle veya streptavidinle veya tersine konjuge edilebilir. Biyotin selektif olarak streptavidine baglanir ve dolayisiyla, etiket, bu dolayli yöntemle antikorla konjuge edilebilir. Alternatif olarak, etiketin polipeptid varyantiyla dolayli konjugasyonunu elde etmek için, polipeptid varyanti küçük bir haptenle (örnegin, digoksin) konjuge edilir ve yukarida sözü edilen farkli tipte etiketlerden biri bir anti-hapten polipeptid varyantiyla (Örnegin, anti-digoksin antikoru) konjuge edilebilir. Dolayisiyla, etiketin polipeptid varyantiyla dolayli konjugasyonu elde edilebilir (Hermanson, G. (1996) in BioconjugateTechniques Academic Press, San Diego).Bu bulusa konu olan polipeptid varyanti, ELISA, kompetitif baglanma114eseyleri, dogrudan ve dolayli sandviç eseyleri, iinmünopresipitasyon eseyleri gibi herhangi bir bilinen esey yönteminde kullanilabilir (Zola, (1987) Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques, sayfa 147- 158, CRC Press, Inc.).Bir baglama veya tanimlama olayini lokalize etmek, görüntülemek ve miktarini tayin etmek için bir belirleme etiketi yararli olabilir. Bu bulusa konu olan etiketli antikorlar hücre yüzeyi reseptörünü teSpit edebilir. Belirlenebilir sekilde etiketlenmis antikorlar için bir diger kullanim alani da, bir boncugun bir floresan etiketli antikorla kon juge edilmesini ve bir ligandin baglanmasiyla bir floresans sinyalin tespitini içeren boncuk esasli bir immüno-yakalama yöntemidir. Benzer baglanma belirleme metodolojileri, antikor-antijen etkilesimlerini Ölçmek ve tespit etmek için yüzey plazinon rezonansi(SPR) etkisinden yararlanir.Floresan boyalar ve keiniluminesan boyalar gibi belirleme etiketleri (Briggs ve ark (1997) "Synthesis of Functionalised Fluorescent Dyes and Their Coupling to Amines and Amino Acids,, J. Chem. Soc.. Perkin-Trans. 1:1051-1058) belirlenebilir bir sinyal temin eder ve genelde antikorlari etiketlemek için kullanilir ve tercihen asagidaki özelliklere sahiptir: (i) küçük miktarlarda antikorlarin hem hücresiz, hem de hücre esasli testlerde hassas sekilde tespit edilebilmesi için, etiketli antikor düsük arkaplanla çok yüksek bir sinyal üretmelidir ve (ii) floresan sinyalin 'Önemli bir foto beyazlatma olmadan gözlenebilmesi, izlenebilmesi ve kaydedilebilmesi için etiketli antikor fosfatlanabilir olmalidir. Etiketli antikorun inembranlara veya hücreyüzeylerine, 'ozellikle canli hücrelerin hücre yüzeyi baglaninasini115içeren uygulamalar için, etiketler tercihen (iii) etkin konjugat konsantrasyonu ve belirleine hassasiyeti elde etmek için iyi suda çözünürlüge sahiptir ve (iv) hücrelerin normal metabolik proseslerini bozmamasi veya prematüre hücre ölümüne sebep olmamasi için canlihücreler için non-toksiktir.Selüler floresans yogunlugunun dogrudan tayini ve floresan etiketli olaylarin, `Örnegin, peptid-boya konjugatlarinin hücre yüzeyine baglanmasinin sayimi, canli hücrelerle veya boncuklarla yapilan non- radyoaktif karistir-oku eseylerinin otoinasyonunu saglayan bir sistem (FMAT® 8100 HTS Sistemi, Applied Biosystems, Foster City, Calif.) üzerinde yürütülebilir (Miraglia, "Homogeneous cell- and head-based assays for high throughput screening using fluorometric microvolume assay technology", (1999) J. of Bioinolecular Screening 4:193-204). Etiketli antikorlarin kullanim alanlari arasinda, hücre yüzeyi reseptörü baglama eseyleri, immüno-yakalama eseyleri, floresans bagli immünosorbent eseyleri (FLISA), kaSpaz-klevaji (Zheng, "CaSpase-3 controls both cytoplasmic and nuclear events associated With Fas- mediated apoptosis in ViV0°, (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:618-23; US 6372907), apoptoz (Vermes, "A novel assay for apoptosis. Flow cytometric detection of phosphatidylserine expression on early apoptotic cells using fluorescein labelled Annexin V" (1995) J. Immunol. Methods 184r39-51) ve sitotoksisite eseyleri bulunur. Hücre yüzeyine hedeflenen bir molekülle yukari veya asagi regülasyonu tanimlamak için florometrik mikro-hacim eseyi teknolojisi kullanilabilir (Swartzman, 'A homogeneous and multiplexed immunoassay for high-throughput screening usingfluorometric microvolume assay technology', (1999) Anal. Biochem.116271:]43-51).Bu bulusa konusu etiketli sistein degistirilmis antikorlar, asagida sayilanlar gibi çesitli farkli biyomedikal ve moleküler görüntüleme yöntemleri ve tekniklerinde görüntüleme biyomarkerleri ve problari olarak yararlidir: (i) MRI (manyetik rezonans görüntüleme); (ii) MicroCT (bilgisayarli tomografi); (iii) SPECT (tek foton emisyonlu bilgisayarli tomografi); (iv) PET (pozitron emisyon tomografisi) (Chen ve ark (2004) Bioconjugate Chem. 15:41-49); (v) biyoluminesans; (vi) floresans ve (vii) ultrason. Immünosintigrafi, radyoaktif maddelerle etiketlenmis antikorlarin bir hayvan veya insan hastaya uygulandigi bir görüntüleme prosedürüdür ve vücutta antikorun lokalize oldugu bölgelerin bir resmi çekilir (US 6528624). Görüntüleme biyomarkerleri objektif olarak ölçülebilir ve normal biyolojik proseslerin, patojenik proseslerin veya bir terapötik müdahaleye farmakolojik cevaplarin bir göstergesi olarak degerlendirilebilir. Biyoniarkerler çesitli tipte olabilir: Tip 0 inarkerler bir hastaligin dogal hikaye markerleridir ve bilinen klinik indekslerle, örnegin, romatoid artritte sinovyal enflamasyonun MR] görüntülemesiyle boylamasina bagintilidir; Tip I markerler bir etki mekanizmasina göre, mekanizma klinik sonuçla baglantili olamayabilmesine ragmen bir müdahalenin etkisini yakalar; Tip II markerler, örnegin, romatoid artritte bilgisayarli tomografiyle (CT) ölçülen kemik erozyonu gibi, biyomarkerdeki degisimin veya biyomarkerden alinan sinyalin hedeflenen cevabi "valide etinek" için bir klinik fayda öngördügü temsilci sonlaiiini noktalari olarak görev yapar. Bu sebeple, görüntüleme biyomarkerleri, (i) bir hedef proteininekspresyonu, (ii) bir terapötigin hedef proteine baglanmasi, yani117selektivite ve (iii) klirens ve yari Ömür farmakokinetik verileri hakkinda farmakodinamik (PD) terap'Ötik bilgi temin edebilir. In vivo görüntüleme biyomarkerlerinin laboratuvar esasli biyomarkerlere göre avantajlari sunlardir: non-invazif tedavi, tayin edilebilirlik, tam vücut degerlendirmesi, tekrarlainali doz uygulainasi ve degerlendirme, yani çoklu zaman noktalari ve preklinik (küçük hayvan) sonuçlardan klinik (insan) sonuçlara kadar potansiyel olarak transfer edilebilir etkiler. Bazi uygulainalar için, biyo-görüntüleme preklinik çalismalardahayvan deneylerinin yerine alir veya sayilarini en aza indirir.Radyonüklid görüntüleme etiketleri arasinda 3H311C, MC, 181:, 321), 358, 64Cu, 68Ga, say, QQTC, mln, 1231, 241, 1 251,13'I,l33Xe, 177Lu,2']At ya da 213Bi gibi radyoni'iklidler vardir. Radyonüklid metal iyonu, DOTA gibi bir selatlaina baglayiciyla kompleks hale getirilebilir. DOTA-maleimid (4- maleimidobi'itiramidobenzil-DOTA) gibi baglayici reaktifler, "Axworthy ve ark (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97(4):1802- 1807)" referansinda tarif edilen prosedürler uygulanarak aminobenzil- DOTA"nin izopropilkloroformatla (Aldrich) aktive edilmis 4- maleimidobütirik asitle (Fluka) reaksiyonu. yoluyla hazirlanabilir. DOTA-maleimid reaktifleri, sistein degistirilmis antikorlarin serbest sistein amino asitleriyle reaksiyona girer ve antikor üzerinde bir inetal kompleksleine ligaiidi sunar (Lewis ve ark (1998) Bioconj. Chem. 9:72-86). DOTA-NHS (1 ,4,7,10-tetraazasiklododekan-l ,4,7,10- tetraasetik asit mono (N-hidroksisüksinimid ester) gibi selatlama baglayicisi etiketleme reaktifleri ticari piyasada mevcuttur (Macrosiklics, Dallas, TX). Radyonüklid etiketli antikorlarla reseptörhedefi görüntülemesi, tümör dokusunda antikorlarin progresif118akümülasyonunun belirlenmesi ve miktar tayini yoluyla yolak aktivasyonunun bir markerini sunabilir (Albert ve ark (1998) Bioorg. Med. Chem. Lett. 8:1207-1210). Konjuge edilmis radyo-metaller,lizozomal bozunmanin ardindan intraselüler ortamda kalabilir.Peptid etiketleme yöntemleri iyi bilinmektedir. Bakiniz: Haugland, 2003, Molecular Probes Handbook of Fluorescent Probes and Research Chemicals, Molecular Probes, Inc.; Brinkley, 1992, Bioconjugate Chem. 3:2; Garman, (1997) Non-Radioactive Labelling: A Practical Approach, Academic Press, London; Means (1990) Bioconjugate Chem. 1:2; Glazer ve ark (1975) Chemical Modification of Proteins Laboratory Techniques in Biocheinistry and Molecular Biology (T. S. Work and E. Work, Eds.) American Elsevier Publishing Co., New York; Lundblad, R. L. and Noyes, C. M. (1984) Chemical Reagents for Protein Modification, Ciltler 1 and it, CRC Press, New York; Pfleiderer, G. (1985) "Chemical Modification of Proteins", Modern Methods in Protein Chemistry, H. Tschesche, Ed., Walter DeGryter, Berlin and New York ve Wong (1991) Chemistry of Protein Conjugation and Cross-linking, CRC Press, Boca Raton, Fla.); De Leon-Rodriguez ve ark (2004) Chem.Eur. J. 10:1149- 1 155; Lewis ve ark (2001) Bioconjugate Chem. 12:320-324; Li ve ark (2002) Bioconjugate Chem. 13:110-115; Mier ve ark (2005) Bioconjugate Chem. 16:240-237.Yeterli yakinlik iki moiyeteyle, yani bir floresan raporlayici ve söndürücüyle etiketlenen peptidler ve proteinler, floresans rezonans enerji transferine (FRET) tâbi olur. Raporlayici gruplar, tipik olarak,belirli bir dalga boyunda isikla uyarilan floresan boyalardir ve119maksimum parlaklikta emisyon için enerjiyi uygun Stokes kayinasiyla bir alici veya söndürücü gruba transfer eder. Floresan boyalar arasinda, floresiii ve rodainin ve bunlarin türevleri gibi genisletilmis aromatiklige sahip moleküller bulunur. Floresan raporlayici, bir intakt peptid içinde söndürücü inoiyeteyle kismen veya önemli bir ölçüde söndürülebilir. Peptidin bir peptidaz veya proteazla klevajindan sonra, floresansta belirlenebilir bir artis ölçülebilir (Knight, C. (1995) "Fluorimetric Assays of Proteolytic Eiizymes,, Methods inEnzyinology, Acadeinic Press, 248: 18-34).Bu bulusa konu olan etiketli antikorlar bir afinite saflastirma ajani olarak da kullanilabilir. Bu proseste, etiketli antikor, sektörde iyi bilinen yöntemler kullanilarak bir Sephadex reçinesi veya filtre kagidi gibi bir kati faz üzerinde iininobilize edilir. Immobilize antikor, saflastirilacak antijeni içeren bir numuiieyle temas ettirilir ve daha sonra, destek, numunede bulunan ve iminobilize polipeptid varyantina bagli olan, saflastirilacak antijen haricindeki hemen hemen tüm maddeyi çikaracak uygun bir çözücüyle yikanir. Son olarak, destek, polipeptid varyantindan aiitijeiii çözecek olan, pH 5,0 glisin tainponugibi baska bir uygun çözücüyle yikanir.Etiketlenie reaktifleri, tipik olarak, (i) etiketli antikoru olusturniak için dogrudan bir sistein degistirilmis antikorun bir sistein tiyolüyle, (ii) bir baglayici-etiket ara ürünü olusturmak için bir baglayici reaktifiyle veya (iii) etiketli antikoru olusturmak için bir baglayici antikorla reaksiyona girebilecek reaktif fonksiyonelligine sahiptir. Baska fonksiyonel gruplar kullanilabilmesine ragmen, etiketlemereaktiflerinin reaktif fonksiyonelligi sunlari içerir: inaleiinid,120haloasetil, iyodoasetamid suksinimidil ester (ömegin, NHS, N- hidroksisüksinimid), izotiyosiyanat, sülfonil klor'ûr, 2,6-diklorotriazinil, pentaflorofenil ester ve fosforamidit.Bir örnek reaktif fonksiyonel grup, 'Örnegin, biyotin veya floresan boya gibi belirlenebilir bir etiketin bir karboksil grubu sübstitüentinin N-hidroksisuksinimidil esteri (NHS). Etiketin NHS esteri 'onceden olusturulabilir, izole edilebilir, saflastirilabilir ve/Veya karakterize edilebilir ya da yerinde olusturulabilir ve bir antikorun bir nükleofilik grubuyla reaksiyona sokulabilir. Tipik olarak, etiketin karboksil formu, bir karbodiimid reaktifi (örnegin, disiklohekzilkarbodiimid, diizopropilkarbodiimid) veya bir uronyum reaktifi, ömegin, TSTU (O- (N-Suksinimidil)-N,N,N°,N"-tetran1etilur0nyurn tetrafloroborat, HBTU (O-benzotriazol-l -il)-N,N,N°,N"-tetra1neti1uronyu1n heksafloro fosfat), veya HATU (O-(7-azabenzotriazol-l-il)-N,N,N",Ni-tetrametil uronyuin heksaflorofosfat), bir aktivatör, Örnegin, l-hidroksi benzotriazol (HOBt) ve N-hidroksisuksinimid'in bazi kombinasyonlariyla reaksiyona sokularak aktive edilebilir ve böylece, etiketin NHS esteri elde edilebilir. Bazi durumlarda, etiket ve antikor, etiketin yerinde aktivasyonu. ve antikorun reaksiyonu yoluyla kuplajlanarak etiket-antikor konjugati tek basamakta olusturulabilir. Baska aktivasyon ve kuplajlaina reaktifleri arasinda TBTU (2-(1H- benzotriazo- l -il)- l - 1 ,3,3 -tetrametiluronyum heksaflorof osf at), TFFH (N,N°,N", N'"-tetrametiluronyum 2-floro-heksaflorofosfat), PyBOP (benzotriazol- l -il-oksi-tris-pirolidino-fosfonyum heksaflorofosfat, EEDQ (2-etoksi- 1 -etoksikarbonil-l ,2-dihidr0-kuinolin), DCC (disikloheksil karbodiimid); DIPCDI (diizopropilkarbodiimid), MSNT(l-(mesitilen-2-sülfonil)-3-nitro-lH-l,2,4-triazol ve aril sülfonil121halo jenürler, örnegin triizopropilbenzensülfonil klorür bulunur.BIYOTIN-MALEIMIDIN THIOFAB9LARA KONJUGASYONUYukarida tanimlanan ThioFab özellikleri, fajin varliginda tespit edilmistir, çünkü Fab"in faj kaplama proteinine füzyonu, Cys tiyol erisebilirligiiii veya reaktivitesini degistirme potansiyeline sahip olabilir. Bu nedenle, ThioFab yapilari, alkalen fosfataz baslatici altinda bir ekspresyon vektörüne klonlanmis (Chang ve ark (1987) Gene 55:189-196) ve ThioFab ekspresyonu, fosfat içermeyen vasatta E. coli hücreleri büyütülerek indüklenmistir. ThioFab"lar bir Protein G SEPHAROSETM kolonunda saflastirilmis ve indirgen olan ve olmayan SDS-PAGE jellerinde analiz edilmislerdir. Bu analizler, ThioFab"1arin reaktif tiyol gruplarini koruduklarinin mi, yoksa intrainoleküler veya moleküller arasi disülfür baglari olusturarak inaktive mi edildiklerinin tespit edilmesine olanak vermektedir. ThioFab"lar L-V15C, L-Vl lOC, H-A88C ve H-A121C, Protein-G SEPHAROSETM kolon kromatografisiyle eksprese edilmis ve saflastirilmislardir (detayli bilgi için yöntemler bölümlerine bakiniz). Saflastirilmis proteinler, indirgen kosullar (DTT ile) ve indirgen olmayan kosullar (DTT"siz) altinda SDS-PAGE jelde analiz edilmislerdir. BME (beta-merkaptoetanol) gibi diger indirgen ajanlar, jelde, zincirler arasi disülfür gruplarini ayirmak amaciyla kullanilabilirler. ThioFabiin büyük bir kisminin (- %90) monomerik formda oldugu, yabani tip hu4D5Fabv8°nin temelde ve esas olarak inonomerik formda (47 kDa) oldugu SDS-PAGE jel analizinden anlasilmaktadir.ThioFab (A121C) ve yabani tip hu4D5FabV8, oda sicakliginda 3 saatsüreyle 100 kati fazla biyotin-maleimid ile inkibü edilinislerdir ve122biyotinlenmis Fablar bir SuperdeX-200l`M jel filtrasyon kolonuna yüklenmislerdir. Bu saflastirma basamagi, monomerik Fab"in oligomerik Fab°dan ve ayni zamanda fazla serbest biyotin- maleimidden (veya serbest sitotoksik ilaçtan) ayrilmasi için faydaliolmustur.Sekil 5, faj kontekstinin yoklugunda ThioFab varyantlarinin özelliklerinin validasyonunu göstermektedir. Faj füzyonu olinayan proteinler, hu4D5FabV8 ve hu4D5FabV8-A121C (ThioFab-AlZlC), önce protein-G agaroz boncuklari kullanilarak eksprese edilmis ve saflastirilmis ve ardindan, 100 kati molar biyotin-maleimid fazlasiyla inkibü edilmislerdir. Bir biyotinlenmis sistein degistirilmis ThioFab"m ve bir biyotinlenmemis yabani tip Fab"in Streptavidin ve HER2 baglanmasi karsilastirilmistir. Biyotin konjugasyonunun (streptavidin ile etkilesim) kapsami ve bunlarin HER2°ye baglanma kabiliyeti, ELISA analizleriyle gözlemlenmis ve izlenmistir. Her Fab, 2 ng ve 20 ng"de test edilmistir.Biyotinlenmis A`121C ThioFab, yabani tip hu4D5FabV8°e kiyaslanabilir ve denk HER2 baglanmasini muhafaza etmistir (Sekil ). Yabani tip Fab ve AlZlC-ThioFab, jel filtrasyon kolon kromatografisiyle saflastirilmislardir. Iki numune, ana antikor olarak keçi anti-Fab-HRP kullanilmak suretiyle ve ELISA yöntemiyle HER2 ve streptavidin baglanmasi açisindan test edilmislerdir. Hem yabani tip (açik kutu) hem de ThioFab"1n (noktali kutu) HERTye baglanmalari benzerdir, fakat sadece ThioFab, streptavidin baglanmasini muhafaza etmistir. Biyotinlenmemis yabani tiphu4D5FabV8 ile, streptavidin ile sadece temel düzeyde bir etkilesim123gözlemlenmistir (Sekil 5). Biyotinleninis-ThioFab°in (Al2lC) kütle spektral (LC-ESI-MS) analizi, yabani tip hu4D5FabV8°e (47737 dalton) kiyasla 48294.5 daltonluk bir majör pikle sonuçlaninistir. Bu iki molekül arasindaki 537.5 dalton fark, tam olarak, ThioFab,a konjuge olmus tek bir biyotin-maleimid°e tekabül etmektedir. Kütle spektral protein sekanslama (LC-ESI-Tandein kütle spektrum analizi) sonuçlari, ayrica, konjuge biyotin molekülünün yeni degistirilmissistein artigmda oldugunu da teyit etmislerdir (Tablo 4, Örnek 3).BIYOTIN-MALEIMIDIN ALBUMIN BAGLANMA PEPTIDI (ABP)-THIOFABLARA YERE OZGU KONJUGASYONU Plazma-protein baglanmasi, kisa ömürlü moleküllerin farmakokinetik özelliklerini gelistirmenin etkili ve etkin bir yoludur. Albümin, plazmada en fazla miktarda bulunan proteindir. Serum albümin baglanma peptidleri (ABP), doku alimi, penetrasyon ve difüzyon özelliklerinin degistirilmesi de dahil olinak üzere, kaynasmis aktif domain proteinlerin farmakodinamigini degistirebilirler. Bu farmakodinamik parametreler, uygun serum albümin baglanma peptidi sekansinin spesifik seleksiyonu yoluyla modüle edilebilir (US 20040001827). Faj görüntüleme yoluyla bir dizi albümin baglanma peptidi belirleninistir (Dennis ve ark. (2002) "Albumin Binding As A General Strategy For Improving The Pharmacokinetics Of Proteins" J Biol Chem 277:35035-35043;WO 01/45746). Bulusa konu olan bilesikler, (i) Dennis ve ark (2002) J Biol Chem. 277:35035- 35043 Tablolar III ve IV, sayfa 35038; (ii) US 20040001827 at [0076] SEKANS KOD NO.: 9-22 ve (iii) WO 01/45746 sayfalar 12-13, SEKANS KOD NO.: zl-z14 tarafindan ögretilen ABP sekanslarini124kapsamaktadir.Albümin Baglanma (ABP)-Fablari, bir albümin baglanma peptidi Fab agir zincirinin C-terminusuna l:l stoikiometrik oranda (1 ABP / 1 Fab) baglaninak ve kaynastirilmak suretiyle degistirilmistir. Bu ABP- Fablarinin albüminle baglanmasinin onlarin tavsanlar ve farelerdeki yari ömürlerini 25 katindan daha fazla artirdigi gösterilmistir. Bu nedenle, yukarida tanimlanan reaktif sistein artiklari, bu ABP-Fablara dahil edilebilir ve sitotoksik ilaçlarla yere özgü konjugasyon için ve ardindan in vivo hayvan çalismalarinda kullanilabilirler. Sekil 9, bir grafiksel albümin baglanma peptidi-Fab füzyonu (ABP-Fab) baglayiciilaç kon jugatini göstermektedir.Ornek albümin baglanma peptidi sekanslari, bunlarla sinirlikalmaksizin, SEKANS KOD NO. l-5°de sayilan amino asitsekanslarini kapsar: CDKTHTGGGSQRLMEDICLPRWGCLWEDDF SEKANS KOD NO. :1 QRLMEDICLPRWGCLWEDDF SEKANS KOD NO.:2 QRLIEDICLPRWGCLWEDDF SEKANS KOD NO.:3 RLIEDICLPRWGCLWEDD SEKANS KOD NO.:4 DICLPRWGCLW SEKANS KOD NO.:5Albümin baglanma peptidi (ABP) sekanslari, birden fazla hayvan cinsinden (fare, siçan, tavsan, büyükbas hayvanlar, alyanakli maymun, habes maymunu ve insan) elde edilen albimünü Kd (tavsan) = 0.3 uM ile baglarlar. Albümin baglanma peptidi, albümini bagladigi bilinenligandlarla rekabet etmez ve tavsanda 2,3 saatlik bir yari ömrü (TI/2)125vardir. ABP-ThioFab proteinleri, yukaridaki bölümlerde açiklandigi gibi, önce BSA-SEPHAROSETM'de saflastirilmis ve ardindan, Superdex-SZOO kolon kromatografisinde biyotin-maleimid konjugasyonu ve saflastirmasindan geçirilmislerdir. Saflastirilmis biyotinlenmis proteinler hoinojendi ve herhangi bir oligomerikformdan yoksundu (Ornek 4).Sekil 6, Albümin Baglanma Peptidi (ABP)-ThioFab varyantlarinin özelliklerini göstermektedir. ABP-hu4D5Fabv8-wt, ABP- hu4D5FabV8-V110C ve ABP-hu4D5FabV8-A121C°nin tavsan albümini, streptavidin ve HER2 ile baglanma kabiliyetini test etmek amaciyla ELISA analizleri yapilmistir. ELISA (Sekil 6) ve BIAcore baglanma kinetigi analiziyle (Tablo 3) tevsik edildigi gibi, biyotinlenmis ABP-ThioFab°lar, albümine ve HER2"ye yabani tip ABP-hu4D5Fabv8sninkine benzer bir afiniteyle baglanma kabiliyetine sahiptirler. Tanimlandigi gibi, bir ELISA plakasi albümin, HER2 ve SA ile kaplanmistir. Biyotinlenmis ABP-ThioFab°larin albümin, HER2 ve SA°ya baglanmalari, anti-Fab HRP ile test edilmistir. Biyotinlenmis ABP-ThioFab"larin, biyotinlenmemis kontrol ABP- hu4D5Fabv8-wt°ye kiyasla streptavidine baglanina kabiliyeti vardi; bu da, her iki varyant için de ayni sistein mutantlar kullanildigi için, ABP-ThioFab'larin biyotin maleimid ile ThioFab°lar gibi yere özgü bir tarzda ve sekilde konjuge olduklarini göstermektedir (Sekil 6).Tablo 3. Biyotinlenmis ABP-hu4D5Fabv8 yabani tipe ve ThioFab"1araHER2 ve tavsan albümin baglanmasi için BIAcore kinetik analizi126 Antikor kon(M`ls`l) 16,551) (nM) HER2baglanmasiYabani tip 4,57xio5 4,19xi05 0,0917 VllOC 4,18X105 4,05xi05 0,097 A121C 3,91xio5 4,15x10'5 0,106 Tavsan albümin baglanmasiYabani tip 1,66x105 0,0206 124 V110C 2,43x165 0,0331 136 A121C 1,70x105 0,0238 140 ABP = albümin baglanma peptidi Alternatif olarak, bir albümin-baglanma peptidi, antikora, bir baglayicimoiyete yoluyla kovalent baglanma yöntemiyle de baglanabilir.ABP-THIOFAB9LARIN BEHER FAB BASINA IKI SERBEST TIYOL GRUBUYLA DEGISTIRILMESIYukaridaki sonuçlar, mevcut dört (L-V15C, L-Vl lOC, H-A88C ve H- A121C) thioFab (sistein degistirilmis Fab antikorlari) varyantinin hepsinin, bir etiket reaktifi, baglayici reaktifi veya ilaç-baglayici ara ürünüyle yere özgü konjugasyon için kullanilabilecek reaktif tiyol gruplarina sahip olduklarini göstermektedir. L-VISC, ekspreseedilebilir ve saflastirilabilir, fakat bunlar nispeten düsük verim127oranlariyla yapilabilir. Bununla birlikte, L-Vl lOC, H-A88C ve H- A121C varyantlarinin ekspresyon ve saflastirma verimleri, hu4D5FabV8sinkine benzerdi. Bu nedenle, bu mutantlar daha detayli analiz için kullanilabilir ve beher Fab basina birden fazla tiyol grubu elde edecek sekilde rekombine edilebilirler. Bu hedefe yönelik olarak, beher Fab molekülü basina iki tiyol grubu elde edecek sekilde hafif zincirde bir tiyol grubu ve agir zincirde bir tiyol grubu olusturulmustur (L-Vl 10C/HA88C ve L-Vl lOC/H-A121C). Bu iki çift sistein varyanti, bir E. coli ekspresyon sisteminde eksprese edilinis ve saflastirilmislardir. Saflastirilinis biyotinlenmis ABP-ThioFab"lar1n homojenitesinin tek sistein varyantlarinin homojenitesine benzeroldugu tespit edilmistir.Beher Fab için iki reaktif sistein artigini degistirmenin etkileri arastirilmistir (Sekil 7). Biyotinlenmis ABP-ThioFab"in SA7ya baglanmasi streptavidin-HRP kullanilarak incelenmis ve bu yolla ikinci bir biyotinin varligi test edilmistir (Sekil 7). HER2/Fab analizi için, bir ELISA plakasi HER2 ile kaplanmis ve anti-Fab HRP ile denenmistir. SA/Fab analizi için, bir ELISA plakasi SA ile kaplanmis ve anti-Fab HRP ile denenmistir. SA/SA analizi için, bir ELISA plakasi SA ile kaplanmis ve SA-HRP ile denenmistir. Sekil 7. Biyotinlenmis ABP-hu4D5FabV8 sistein varyantlarinin HER2, streptavidin (SA), HER2/Fab, 10 SA/Fab ve SA/SA ile etkilesimine dair ELISA analizleri, bunlarin etkilesimlerinin sirasiyla anti-Fab- HRP ve SA-HRP izlendigini göstermektedir. SA/Fab, Fab basina tek bir biyotinin varligini gözlemlemistir; SA/SA analizi ile ise Fab basina birden fazla biyotin gözlemlenmistir. HER2snin çift sisteinmutantlarina baglanmasi, tek sistein varyantlarinin baglanmasina 128benzemektedir (Sekil 7). Bununla birlikte, Fab molekülü basina birden fazla serbest tiyol grubu bulunmasindan ötürü, çift sistein mutanti üzerinde biyotinlenme düzeyi, tek sistein varyantlarina kiyasla dahayüksekti (Sekil 7).TRASTUZUMABHN THlO lgG VARYANTLARININ DEGISTIRILMESIBelirli artiklarda tam-boy monoklonal antikor trastuzumab°in (HERCEPTIN®, Genentech Inc.) içine sistein sokuldu. Trastuzumab°1n tek sistein inutantlari l-l-A88C, H-Al2lC ve L- VllOC ile trastuzumabsin çift sistein inutantlari VllOC-A121C ve V1 lOC-AlZlC, CHO (Çin Hamster Yumurtalik) hücrelerinde, lmM sistein içeren vasat içinde geçici fermentasyon yoluyla eksprese edildiler. A88C niutant agir 20 zincir sekansi (450 aa), SEKANS KOD NO.:6"dir. Al2lC mutant agir zincir sekansi (450 aa), SEKANS KOD NO.:7"dir. VllOC mutant hafif zincir sekansi (214 aa) ise SEKANS KOD NO.:8"dir.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLS mscrm WIWKGLMRI YPTNGYTRY ADSVKG RH! SMS MAMWSMCWIAWYCSRwOGDGWWWGQGTLWVSB ÂSTKGPS VFPWSSKSTSGCTAWVKDYFPSMVSWN SGAL'ISGVBTPPAVIQSS GLYSISSVW'VPSSSIGTQTY I CNVNHKPSNTKVUKKVEPKSQKTBTCPPCPRVM PSW'LFPPKPWI SRTPMCVVWVSHBDPEVWWWWXPRBMW STY'RWSVLTVLHWKEYKCKVSWPAP I EK'I'I SWGQPREPOVYTLPPSRBB MTKNQVSLTGNKGPYPSDIAVEWESNGQPWPWLDSDGSPFLYSEMKBRU WSCSMWKSISEPGKSEKANS KOD NO:6wowzsooawopccsmiscmscmimimmimr Answc mi sammimmsmmnmcsnmmmmmms csmpswpmssxs'rsocrmmyrpxrmswnmrscvmmvims uymmssswmimnsmmmipmmmmum psmpppxpmmismpmcwvnvsaznpmwwvmmumm smwsnmommmsmpui mismpumvmppsm mvnmmmwnmsmpmwwemsmvsmmmnu wsammxswismSEKANS KOD NO:7129DI QMTQS PSSLSASVC DRVTI TCRASODVNTRVAWYQOKPGKÄPKLLI YSAS FLYSGVPS.RFSGSRSGTDFTLTX SSLQPBDFATYYCQQHYTTFPTFWGTKVBIKRTCMPSVFIFPP5DEQLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQHKVDNADQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSET LSICADYEIO'IKVYACWQGLSSPVTKSFNRGECBu bulusun bir yapisina göre, sistein degistirilmis tiyo-trastuzuniab antikorlari, bir serbest sistein amino asidiyle birlikte asagidakidegisken bölge agir zincir sekanslarindan birini veya birden fazlasiniSEKANS KOD N0:8olusturmaktadirlar (SEKANS KOD NO.: 9-16). Mutant Sekans SEKANS KOD NO.: A40C WVRQCPGKGL SEKANS KOD NO.:9 A88C NSLRCEDTAV SEKANS KOD NO.: 10 Sl 19C LVTVCSASTKGPS SEQ ED NO:1 1SlZOC LVTVSCASTKGPS SEKANS KOD NO.: 12 A121C LVTVSSCSTKGPS SEKANS KOD NO.: 13 S122C LVTVSSACTKGPS SEKANS KOD NO.: 14 A175C HTFPCVLQSSGLYS SEKANS KOD NO.:15 Sl79C HTFPAVLQCSGLYS SEKANS KOD NO:16 Bu bulusun baska bir yapisina göre, sistein degistirilmis tiyo- trastuzumab antikorlari, bir serbest sistein amino asitle birlikteasagidaki degisken bölge hafif zincir sekanslarindan birini veya birdenfazlasini olusturmaktadirlar (SEKANS KOD NO.: 17-27). 130 MutantSekansSEKANS KOD NO.: V15CSLSASCGDRVTSEKANS KOD NO.:17 A43CQKPGKCPKLLISEKANS KOD NO.:18 VllOCEIKRTCAAPSVSEKANS KOD NO.:19 Sll4CTCAAPCVFIFPPSEKANS KOD NO.:20 Sl21CFIFPPCDEQLKSEKANS KOD NO.:21 $127CDEQLKCGTASVSEKANS KOD NO.:22 A144CFYPRECKVQWKSEKANS KOD NO.:23 A153CWKVDNCLQSGNSEKANS KOD NO.:24 N158CALQSGCSQESVSEKANS KOD NO.:25 8168CVTEQDCKDSTYSEKANS KOD NO.:26 V205C GLSSPCTKSFN SEKANS KOD NO.:27 Sonuçta elde edilen tam-boy tiyo-trastuzumab lgG varyantlarinda, tiyol reaktivite ve HER2 baglanma aktivitesi eseyleri yapilmistir. Sekil 13A, absorbans belirlemesi için immobilize HER2 and HERP etiketli sekonder antikora biyotinlenmis antikor baglanmasinin bir resimli görüntüsünü sunmaktadir. Sekil 13B, 450 nm"de absorbans belirlemesiyle birlikte immobilize HER2°ye baglanma ölçümlerini göstermektedir (soldan saga): biyotinlenmemis yabani tip trastuzumab (Wt), biyotin-maleimid konjuge tiyo-trastuzumab varyantlari V110C (tekli cys), A121C (tekli cys) va V110C-A121C (ikili cys). Her bir tiyo lgG varyanti ve trastuzumab, 1, 10 ve 100 ng"de test edildi. Olçümler, biyotinlenmis anti-HER2 ThioMablarin HER2 baglanmaaktivitelerini koruduklarini göstermektedir. 131Sekil 14A, absorbans belirlemesi için biyotinin anti-IgG-HRP"ye baglanmasiyla birlikte biyotinlenmis antikorun iinmobilize HER2"ye baglanmasinin bir resimli görüntüsünü sunmaktadir. Sekil l4B, streptavidine baglanma konusunda, biyotin-maleimid konjuge tiyo- trastuzumab varyantlari ve biyotinlenmemis yabani tip trastuzumabin 450 nm"de absorbans belirlemesiyle birlikte baglanma ölçümlerini göstermektedir. Soldan saga: VllOC (tekli cys), A121C (tekli cys), Vl lOC/AlZlC (ikili cys) ve trastuzumab. Her bir tiyo IgG varyanti ve trastuzumab, l, 10 ve 100 ng°de test edildi. Olçümler, HER2 ThiolVlablarin yüksek bir tiyol reaktivitesine sahip olduklarinigöstermektedir.Belirli artiklarda tam-boy 2H9 anti-EphBZR antikorunun içine sistein sokuldu. 2H9°un tek sistein mutanti H-AlZlC, CHO (Çin Hamster Yumurtalik) hücrelerinde, lmM sistein içeren vasat içinde geçici fermentasyon yoluyla eksprese edildi. A121C 2H9 mutant agir zincirsekansi (450 aa), SEKANS KOD NO.:28,dir.EVQLVESGGGLVQ PGGSLRLSCMSGYTFTSYWMHWRQAPGKGLEHVGPINPSTGYTDY NOWRFTI SADTSKNTÂMMNSLRAEDTAVYYCTRRPKI PWTLWVSS CSTKGP SVFP LAPSSKSTSGGTMMCLVIGDYFPBPVTVSWSGALTSGVBTF PAVIOSS GLYSLSSVVTVPSS SLGTQ'I'YI CNVNHKPSNTKVDKJCVBPKSCDKTH'ICPPCPAPELDGG PSVPLFPPKPKDMI SRTPEVTCWVDVSHBDPEWVEVHNAXTKPREBOYN STYRWSVLTVIMQDULNGKEYKCKVSNKÂLGAPI EKTI SWGQPRBWPPSRBB MTKNQVSL'PCLVKGPYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSNSFPLYSKLWDKSRÜ QQGWFSCSWWKSLSWPGKSEKANS KOD NO:28Sistein degistirilmis tiy0-2H9 antikorlari, bir serbest sistein amino asitle birlikte asagidaki Fc sabit bölge agir zinzir sekanslariniolusturmaktadirlar (SEKANS KOD NO.: 29-38).132 MutantSekansSEKANS KOD NO.: V273CHEDPECKFNWYVDGVEVHNAKTKPRSEKANS KOD NO.:29 V279CHEDPEVKFNWYCDGVEVHNAKTKPRSEKANS KOD NO.:30 V282CHEDPEVKFNWYVDGCEVHNAKTKPRSEKANS KOD NO.:31 V284CHEDPEVKFNWYVDGVECHNAKTKPRSEKANS KOD NO.:32 A287CHEDPEVKFNWYVDGVEVHNCKTKPRSEKANS KOD NO.:33 8324CYKCKVCNKALPSEKANS KOD NO.:34 S337CIEKTICKAKGQPRSEKANS KOD NO.:35 A339CIEKTISKCKGQPRSEKANS KOD NO.:36 S375CKGFYPCDIAVESEKANS KOD NO.:37 S4OOC PPVLDCDGSFF SEKANS KOD NO.:38 Sekil 16, immobilize Protein A°da saflastirma isleminden sonra, 2H9 ThioMab FC varyantlari (soldan saga, serit 1-9) A339C; S337C; S324C; A287C; V284C; V282C; V279C ve V273C"nin ve 21-19 yabani tipinin indirgeyici olmayan (üst) ve indirgeyici (alt) denatüran SDS-PAGE (poliakrilamid jel elektroforezi) analizini göstermektedir. Sagdaki serit, intakt proteinlerin yaklasik 150 kDa, agir zincir fragmanlarinin yaklasik 50 kDa ve hafif zincir fragmanlarinin yaklasik kDa oldugunu gösteren bir boyut markeri merdivenidir. Sekil 17A, immobilize Protein A,da saflastirma isleminden sonra, 2H9 ThioMab varyantlari (soldan saga, serit 1-4) L-V15C; S'179C; S375C ve S400C"nin indirgeyici olmayan (sol) ve indirgeyici (sag) denatüran poliakrilamid jel elektroforezi analizini göstermektedir. Sekil l7B, iminobilize Protein A°da saflastirma isleminden sonra, ilave 2H9 ve 3A5 ThioMab varyantlarinin indirgeyici olmayan (sol) ve indirgeyici(+DTT) (sag) denatüran poliakrilamid jel elektroforezi analizini 133göstermektedir. 2H9 ThioMab varyantlari (hem Fab°da hem de Fc bölgesinde) tanimlandigi gibi eksprese edildiler ve saflastirildilar. Sekil 16, 17A ve l7B7de görüldügü gibi, proteinlerin hepsi, reaktif ThioMablari konjugasyon için hazirlamak amaciyla SDS-PAGE isleminde ve ardindan, Ornek ll°in indirgeme ve oksidasyonprosedüründe homojendirler (Ornek 12).Belirli artiklarda tam-boy 3A5 anti-MUC16 antikorunun içine sistein sokuldu. 3A57in tekli cys mutanti H-AlZlC, CHO (Çin Hamster Yumurtalik) hücrelerinde, 1 mM sistein içeren vasatlar içinde geçici fermentasyon yoluyla eksprese edildi. A121C 3A5 mutant agir Zincirsekansi (446 aa), SEKANS KOD NO.:39°dan olusmaktadir.SVQLQESGPG Lv:: FSQSLSLTCTVTGYS I mvaawi normmcyxmscvm NPSLKSRI s i msmornmswrsmammmnmoocnmmu G PSVFPIAPS SKSTSGGTAALGCLVKDY F PE: ?VTVSHRSGRLTSGVBTF ?RMS SELYS LSSVVTVPSSSLGTQTY I mvsmmmpmmppcpunmm LPPPKDKDTLH: snrpmmvenmpmmmnemmm WSVLMRQDNLNGKBY KCKVSNKALPAPI Em smoo PRBPQVYTLPPSREEMTKN QVSLTCLVXGFY PSDIAVEHSSNGQPENNYKTTP Pvwsmsrnvs icm'voxs RWVPS CSVPOIBALHNHYTQKSLSISPGKSEKANS KOD NO:39Sistein degistirilmis tiy0-3A5 anti-MUC16 antikorlari, bir serbest sistein amino asitle birlikte asagidaki degisken bölge agir zincirsekanslarindan olusmaktadirlar (SEKANS KOD NO.: 40-44).134 Mutant Sekans SEKANS KOD NO.: F45C NWIRQCPGNK SEKANS KOD NO:40 A90C LNSCTTEDTAT SEKANS KOD NO:41 A121C GQGTLVTVSACSTKGPSVFPL SEKANS KOD NO:42 A175C HTFPCVLQSSGLYS SEKANS KOD NO:43 V176C HTFPACLQSSGLYS SEKANS KOD NO.:44 Sistein degistirilmis tiy0-3A5 anti-MUC16 antikorlari, bir serbest sistein ainino asitle birlikte asagidaki degisken bölge hafif zincirsekanslarindan olusmaktadirlar (SEKANS KOD NO.: 45-49). Mutant Sekans SEKANS KOD NO.: L15C FLSVSCGGRVT SEKANS KOD NO:45 A43C QKPGNCPRLLI SEKANS KOD NO.:46 V1 10C ElKRTCAAPSV SEKANS KOD NO:47 A144C FYPRECKVQWK SEKANS KOD NO:48 8168C VTEQDCKDSTY SEKANS KOD NO.:49 THIOMABLARIN TIYOL REAKTIVITESITam-boy IgG sistein degistirilmis antikorlarin (ThioMablar) tiyol reaktivitesi, biyotinlenmeyle ve streptavidin baglanmasiyla ölçülmüstür. Biyotin-maleimid ile spesifik olarak baglanan ThioMab°1 incelemek amaciyla bir western blot eseyi gerçeklestirildi. Bu eseyde, antikorlar, indirgen SDS-PAGEyde analiz edildiler ve Biyotinin varligi Spesifik olarak streptavidin-HRP ile inkübasyon yöntemiyle arastirildi.Sekil 18"de görüldügü gibi, streptavidin-HRP etkilesimi, hangi135degistirilmis sistein varyantinin kullanildigina bagli olarak agir zincirde ya da hafif zincirde gözlemlendi ve yabani tipte herhangi bir etkilesim görülmedi; bu da, ThioMab varyantlarinin biyotini degistirilmis sistein artiginda spesifik olarak konjuge ettiklerini göstermektedir. Sekil 18, iminobilize anti-IgG-HRP"de (üst jel) ve streptavidin-HRP"de (alt jel) yakalandiktan sonra indirgenmis ve biyotinlenmis Thio-IgG varyantlarinin denatüran jel analizini göstermektedir. Serit l: 3A5 H-AlZlC. Serit 2: 3A5 L-Vl 10C. Serit 3: 2H9 H-AlZlC. Serit 4: ZH9 L-Vl 10C. Serit 5: anti-EphBZR 2H9 ana, yabani tip. Her bir mutant (serit l-4), HRP belirlemesiyle (üst) anti-IgG tarafindan yakalaninistir ve bu da, seçiciligin ve afinitenin muhafaza edildigini göstermektedir. Immobilize streptavidinin HRP belirlemesiyle (alt) yakalanmasi, biyotinin agir ve hafif zincirler üstündeki lokasyonunu teyit etti. Serit 1 ve 3°de sistein degistirilinis antikorlarda sistein mutasyonunun lokasyonu agir zincirdir. Serit 2 ve 4"de sistein degistirilmis antikorlarda sistein mutasyonunun lokasyonu hafif zincirdir. Sistein mutasyon yeri, biyotin-maleimid reaktifiylekon jugasyona girer. Sekil 18"in ThioMab sistein degistirilmis antikorlarinin ve bir 2H9V15C varyantinin LC/MS yöntemiyle analizi, tiyol reaktivitesini kantitatif olarak gösterdi (Tablo 5).Tablo 5 ThioMablarin biyotinlenmesinin LC/MS yöntemiyle miktar tayini 7 Tiyol reaktivitesi136 ThioMab varyanti Beher ThioMab basina biyotin adedi 2H9 wt 0,0 2H9 L-V15C 0,6 2H9 L-Vl 10C 0,5 2H9 H-AlZlC 2,0 3A5 L-Vl lOC 1,0 3A5 H-AlZlC 2,0 Sistein degistirme islemi, lgG antikorlarinin sabit domaini olan Fe bölgesinde yapildi. Çesitli farkli amino asit yerleri sistein yerlerine dönüstürüldüler ve eksprese edilen mutantlar olan sistein degistirilmis antikorlarin tiyol reaktivitesi incelendi ve degerlendirildi. Biyotinlenmis 2H9 ThioMab FC varyantlarinin tiyol reaktiVitesi ise, bir ELISA eseyinde immobilize streptavidinde yakalama yoluyla ve HRP miktar tayini yöntemiyle incelendi ve degerlendirildi (Sekil 19). Reaktif Tiyol gruplarini içeren sistein artiklarini hizla tespit etmek ve elemek amaciyla bir ELISA eseyi gerçeklestirildi. Sekil 19"un sematik diyagraminda gösterildigi gibi, streptavidin-biyotin etkilesimi, anti- IgG-HRP ile inceleme ve ardindan 450 nm°de absorbansi `Ölçme yoluyla izlendi. Bu sonuçlar, 2H9-ThioFc varyantlari V282C, A287C, A339C. S375C ve S400C,nin orta ile en yüksek arasi düzeyde Tiyol reaktivitesine sahip olduklarini teyit etti. Tablo 6°da açiklandigi gibi, 2H9 ThioMab FC varyantlarinin biyotik konjugasyonunun düzeyi ve miktari LS/MS analiziyle tespit edildi. LS/MS analizi, A282C, S375C ve S400C varyantlarinin %100 biyotin konjugasyonuna ve V284C ve A339C varyantlarinin %50 konjugasyona sahip olduklarini teyit etti 137ve bu da, reaktif bir sistein tiyol grubunun varligini gösterdi. Diger ThioFc varyantlari ve ana, yabani tip 2H9"un ya çok az biyotinlenmesivardi ya da hiç yoktu.Tablo 6 2H9 Fc ThioMablarm biyotinlenmesinin LC/MS yöntemiylemiktar tayini 2H9 ThioMab Fc varyantlari Biyotinlenme % V273C 0 V279C 31 V282C 100 V284C 50 A287C 0 8324C 71 S337C 0 A339C 54 S375C 100 S400C 100 (yabani tip 2H9) 0 THIO-4D5 FAB HAFIF ZINCIR VARYANTLARININ TIYOL REAKTIVITESISekil 8"de gösterilen PHESELECTOR eseyiyle Ölçüldügü gibi, antiErbBZ antikoru 4D5°un çesitli farkli sistein degistirilmis hafifzincir varyant Fablari üzerinde yapilan bir inceleme, tiyol reaktivitesi138degeri 0,6 ve daha fazla olan bir dizi varyantin bulundugunu ortaya koydu (Tablo 7). Tablo 7°de gösterilen tiyol reaktiVitesi degerleri, HC-AlZlC varyantinin komple biyotinlendigi varsayimiyla, %100 olarak belirlenen agir zincir 4D5 ThioFob varyantina (HC-AlZlC)norinallestirilmis degerlerdir ve yüzde biriiniyle gösterilinektedirler.Tablo 7 4D5 ThioFab hafif zincir varyantlarinin tiyol reaktivitesi degerleri4D5 ThioFab varyantlari Tiyol reaktivitesi degerleri (%) V15C 100 V] lOC 95Sl 14C 78 SlZlC 75 8127C 75 A153C 82 N158C 77 V205C 78 (HC-AlZlC) 100 (4D5 yabani tip) 25 ANTIKOR-ILAC KONJUGATLARIBu bulusa konu olan sistein degistirilmis antikorlar, herhangi bir terapötik ajanla, yani bir reaktif sistein tiyol grubu araciligiylaantikora kovalent baglanabilecek ilaç moiyetesiyle kon juge edilebilir.139Bir antikor-ilaç konjugati (ADC) bilesiginin bir örnek yapisi, bir sistein degistirilmis antikor (Ab) ve bir ilaç inoiyetesi (D) içerir; burada, antikor, 0,6 ile 1,0 araliginda bir tiyol reaktivitesi degerine sahip bir veya daha fazla sayida serbest sistein amino asidi içerir ve antikor, bir baglayici moiyetesi (L) yoluyla bir veya daha fazla sayida serbest sistein amino asidi araciligiyla D°ye baglanir ve bilesimFormül 1 ile temsil edilir:Ab-(L-D)p Iburada, p simgesi l, 2, 3 ya da 4"t`ur. Bir tiyol reaktif baglayici moiyetesi araciligiyla bir antikor molekülüne kon juge edilebilecek ilaç moiyetesi sayisi, burada tarif edilen yöntemlerle sokulan sistein artiklari sayisiyla sinirlidir. Sonuç olarak, Formül 1 ile temsil edilen örnek ADC, l, 2, 3 ya da 4 adet degistirilmis sistein amino asidiiiesahip antikorlar içerir.Bir antikor-ilaç konjugati bilesiginin (ADC) baska bir örnek yapisi, bir sistein degistirilmis antikor (Ab), bir albümin-baglanma peptidi (ABF) ve bir ilaç moiyetesi (D) içerir; burada, antikor, bir baglayici moiyetesi (L) araciligiyla ilaç moiyetesine baglanir ve antikor, bir amid bagi ya da bir ikinci baglayici inoiyetesi yoluyla albümin-baglama peptidine baglanir ve bilesim Formül Ia ile temsil edilir:ABP-Ab-(L-D)p Iaburada, p simgesi l, 2, 3 ya da 4it`ûr.140Bu bulusa konu olan ADC bilesikleri, antikanser aktivitesi açisindan faydali olanlari kapsar. Daha somut ifade etmek gerekirse, bilesikler, bir ilaç moiyetesine, yani toksine konjuge edilen, yani bir baglayici araciligiyla kovalent baglanan bir sistem-degistirilmis antikoru kapsar. Ilaç bir antikora konjuge edilmediginde, bir sitotoksik ya da sitostatik etkiye sahip olur. Sonuç olarak, ilaç moiyetesinin biyolojik aktivitesi, bir antikora kon jugasyon yoluyla modüle edilir. Bu bulusa konu olan antikor-ilaç konjugatlari (ADC) bir sitotoksik ajanin etkin ve etkili dozunu tümör dokusuna selektif tasir ve bu yolla, selektivitenin dahayüksek olmasi, yani etkin dozun daha düsük olmasi saglanabilir.Bu bulusun bir yapisinda, bir memelide bulus konusu ADC"nin biyoyararlaniini ya da ADC°nin bir intraselüler metaboliti, ADC'nin ilaç moiyetesini içeren bir ilaç bilesigine kiyasla artar. Bir ineinelide ADCanin biyoyararlanimi ya da ADC°nin bir intraselüler metaboliti,ilaç moiyetesi içerineyen ADC analoguna kiyasla da artar.ILAC MOIYETELERIAntikor-ilaç konjugatlarinin (ADC) ilaç moiyetesi (D), bir sitotoksik ya da sitostatik etkiye sahip bir bilesigi, moiyeteyi ya da grubu kapsar. Ilaç moiyeteleri arasinda (i) mikrot'ûbülin inhibitörleri, mitoz inhibitörleri, topoizomeraz inhibitörleri ya da DNA interkalatörleri islevini görebilen kemoterapötik ajanlar; (ii) enzimatik olarak islevgörebilen protein toksinleri ve (iii) radyoizotoplar vardir.Ornek ilaç inoiyeteleri arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, birmaytansinoid, bir auristatin, bir dolastatin, bir trikotesen, CC1065, bir141kalikeainisin ve baska enediyne antibiyotikleri, bir taksan, bir antrasiklin ve bunlarin stereoizomerleri, izosterleri, analoglari ya datürevleri vardir.Maytansinoid ilaç moiyeteleri olarak kullaniina uygun inaytansin bilesikleri sektörde iyi bilinmektedir ve bilinen yöntemlerle dogal kaynaklardan izole edilebilir veya genetik mühendisligi teknikleri kullanilarak üretilebilir (bakiniz Yu ve ark (2002) PROC. NAT. ACAD. SCL (USA) 99:7968-7973) ya da maytansinol ve inaytansinolanaloglari bilinen yöntemlerle sentetik olarak da hazirlanabilir.Ornek maytansinoid ilaç moiyeteleri arasinda C-l9-dekloro (ABD Patent No. 4256746) (ansainitosin P2"nin lityum alüminyum hidrid indirgeinesiyle hazirlanir); C-20-hidr0ksi (veya C-20-deineti1) +/-C- 19-dekloro (ABD Patent No. 4361650 ve 4307016) (Streptoniyces veya Actinomyces kullanilarak deinetilasyonla ya da LAH kullanilarak deklorinasyonla hazirlanir) ve C-20-demetoksi, C-20-asiloksi (-OCOR), +/-dekloro (ABD Patent No. 4.294.757) (asil klorürler kullanilarak asilasyonla hazirlanir) gibi modifiye aroniatik halkaya sahip olanlar ve baska pozisyonlarda modifikasyonlara sahip olanlarbulunur.Ornek maytansinoid ilaç inoiyeteleri arasinda ayrica C-9-SH (ABD Patent No. 4424219) (maytansinolün HZS veya P255°1e reaksiyonuyla hazirlanir); C-14-alkoksimetil(demetoksi/CH2 OR) (US 4331598); C- 14-hidroksimeti1 veya asiloksimetil (CH20H veya CH2OAC) (ABD Patent No. 4450254) (Nocardia'dan hazirlanir); C-lS-hidroksi/asiloksi (US 4364866) (maytansinolün Streptomycesqe dönüsümüyle 142hazirlanir); C-lS-metoksi (ABD Patent No. 4313946 ve 4315929) (TreWia nudl flora°dan izole edilir); C-lS-N-demetil (ABD Patent No. 4362663 ve 4322348) (maytansinolün Streptomyces°le demetilasyonuyla hazirlanir) ve 4,5-deoksi (US 4371533) (inaytansinolün titanyum triklorür/LAH indirgemesiyle) gibi modifikasyonlara sahip olanlar da bulunur. Maytansin bilesikleri üzerindeki pek çok pozisyonun, baglanti tipine bagli olarak baglanti pozisyonu olarak yararli oldugu bilinmektedir. Örnegin, bir ester baglantisi olusturmak için, bir hidroksil grubuna sahip C-3 pozisyonu, hidroksimetille modifiye edilmis C-14 pozisyonu, hidroksil grubuyla modifiye edilmis C-15 pozisyonu ve bir hidroksil grubuna sahip C-20 pozisyonunun tümü uygundur.Formül 1 ile temsil edilen antikor-ilaç konjugatlariinin (ADC) ilaçmoiyetesi (D), asagidaki yapiya sahip maytansinoidleri kapsar:Hac` tcnam-S-ê burada, dalgali çizgi, D°nin sülfür atomunun bir antikor-ilaç konjugati (ADC) baglayicisina (L) kovalent bagini gösterir. R simgesi birbirinden bagimsiz olarak H olabilecegi gibi, metil, etil, l-propil, 2- propil, l-bütil, 2-metil-l-pr0pil, 2-bütil, 2-metil-2-pr0pil, l-pentil, 2- pentil, 3-pentil, 2-metil-2-bütil, 3-metil-2-bütil, 3-metil-l-büti1, 2-143metil-l-bütil, I-heksil, 2-heksi1, 3-heksil, 2-meti1-2-pentil, 3-meti1-2- pentil, 4-metil-2-penti1, 3-meti1-3-pentil, 2-meti1-3-pentil, 2,3-dimetil- 2-bütil ve 3,3-dimeti1-2-bütil arasindan seçilen bir Ci-C6 alkil de olabilir. Amid grubunu sülfür atoinuna baglayan alkilen zincirimetanil, etanil ya da propel olabilir, yani m simgesi 1, 2 ya da 3"tür.Maytansin bilesikleri, mikrotübülin proteini tübülinin polimerizasyonunun inhibisyonu yoluyla mitoz esnasinda mikrotübüllerin olusiriasini inhibe ederek hücre proliferasyonunu inhibe eder (Remillard ve ark (1975) Science 189:]002-1005). Maytansin ve maytansinoidler yüksek düzeyde sitotoksiktir, fakat kanser tedavisinde klinik kullanimlari, esas olarak tümörler için selektivitelerinin zayif olmasina atfedilebilecek siddetli sistemik yan etkilerle büyük ölçüde sinirlandirilmistir. Maytansinle yapilan klinik deneyler, merkezi sinir sistemi ve gastrointestinal sistem üzerinde siddetli advers etkilerden dolayi kesilmistir (Issel ve ark (1978) Can. Treatment Rev. 5: 1 99-207).Maytansinoid ilaç moiyeteleri, antikor-ilaç konjugatlarinda çekici ilaç moiyeteleridir, çünkü bunlar: (i) fermentasyonla veya fermentasyon ürünlerinin kimyasal modifikasyonuyla veya türevlendirilmesiyle hazirlamak için kolay erisilebilirdir; (ii) disültür ve non-disültür baglayicilarla antikorlara konjugasyon için uygun fonksiyonel gruplarla türevlendirmeye tâbidir; (iii) plazmada stabildir ve (iv) çesitli tümör hücresi hatlarina karsi etkilidir (US 2005/0169933, WO 2005/037992, US 5208020).Baska ilaç moiyeteleriyle ilgili olarak, maytansinoid ilaç moiyetesinin 144bütün stereoizomerleri, bulus konusu bilesikler, yani D°nin kira] karbonlarinda R ve S7nin herhangi bir kombinasyonu için tasarlanir. Bu bulusun bir yapisinda, maytansinoid ilaç moiyetesi (D) asagidaki stereokimyaya sahip olur:Hac` (cazin-s--g 5 Maytansinoid ilaç moieitilerinin `Örnek yapilari arasinda sunlar bulunur: asagidaki yapilara sahip DMl, (CR2)m = CH2CH2; DM3, (CR2)m = CH2CH2CH(CH3) ve DM4. (CR2)m : CHZCH2C(CH3)2I DM1 145on,CH20Hzc-S_êDMS CH: â êHO CH30HBaglayici, baglayici tipine bagli olarak çesitli farkli pozisyonlarda maytansinoid molekülüne baglanabilir. Örnegin, geleneksel kuplajlama teknikleri kullanilarak bir hidroksil grubuyla reaksiyon yoluyla bir ester bagi olusturulabilir. Reaksiyon, bir hidroksil grubuna sahip C-3 pozisyonunda, hidroksimetille modifiye edilmis C-14 pozisyonunda, bir hidroksil grubuyla modifiye edilmis C-15 pozisyonunda ve bir hidroksil grubuyla modifiye edilmis C-20 pozisyonunda gerçeklesebilir. Bu bulusun tercih edilen bir yapisinda,maytansinol ya da bir maytansinol analogunun C-3 pozisyonunda bagolusur.Formül 1 ile temsil edilen antikor-ilaç konjugatlarinin (ADC) ilaç146moiyetesi (D) ayrica dolastatinleri ve onlarin peptidik analoglari ve türevlerini ve auristatinleri de (ABD Patent No. 5635483; 5780588) kapsar. Dolastatinler ve auristatinlerin mikrotübül dinamigine, GTP hidrolizine ve nükleer ve hücresel bölünmeye müdahale ettikleri (Woyke ve ark (2001) Anlimicrob. Agents and Chemother. 45(12):3580-3584) ve anti-kanser akivitesine (ABD Patent No. 5663149) ve atifungal aktiviteye (Pettit ve ark (1998) Antimicrob. Agents Chemother. 42:2961-2965) sahip olduklari gösterilmistir. Dolastatin veya auristatin ilaç moiyetesinin çesitli farkli formlari, peptidik ilaç moiyetesinin N (amino) terminali veya C (karboksil) terminali vasitasiyla antikora kovalent baglanabilir (WO 02/088172; Doronina ve ark (2003) Nature Biotechnology 21(7):778- 784; Francisco ve ark (2003) Blood 102(4): 1458-1465).Ilaç moiyeteleri arasinda dolastatiiiler, auristatinler (US 5635483; US 5780588; US 5767237; US 6124431) ve bunlarin analoglari ve türevleri bulunur. Dolastatinler ve auristatinlerin mikrotübül dinamigine, GTP hidrolizine ve nükleer ve hücresel bölünmeye müdahale ettikleri (Woyke ve ark (2001) Anlimicrob. Agents and Chemother. 45(12):3580-3584) ve anti-kanser akivitesine (ABD Patent No. 5663149) ve atifungal aktiviteye (Pettit ve ark (1998) Antimicrob. Agents Chemother. 42:2961-2965) sahip olduklari gösterilmistir. Dolastatin veya auristatin ilaç moiyetesi, peptidik ilaç moiyetesinin N (ainino) terminali veya C (karboksil) terminalivasitasiyla antikora baglanabilir (WO 02/088172).Ornek auristatin yapilari arasinda N-terminal baglimonometilauristatin ilaç inoiyeteleri DE ve DF bulunur (WO 1472005/0817] 1 numarali dokümanda ve "Senter ve ark, Proceedings of the American Association for Cancer Research, Cilt 45, Abstrakt No 623, presented March 28, 2004" referansinda açiklanir; bu açiklamalarbu dokümana referans olarak açikça ve tümüyle dahil edilmistir).Formül 1 ile temsil edilen antikor-ilaç konjugatlarinin (ADC) ilaç moiyetesi (D), N-terminusu araciligiyla antikora baglananmonometilauristatin ilaç moiyeteleri MMAE ve MMAF5yi kapsar:wrêiûiârwîo / 3% yaww°\ ° MMAF Normalde, peptid-bazli ilaç moiyeteleri, iki veya daha fazla amino asit ve/Veya peptid fragmani arasinda bir peptid bagi olusturularak hazirlanabilir. Bu peptid baglari örnegin peptid kimyasi alaninda iyi bilinen siVi faz sentez yöntemine göre hazirlanabilir (bakiniz: E.Schröder and K. Lübke, "The Peptides", Cilt 1, sayfa 76-136,1965,Academic Press).Ilaç moiyetesi, kalikeamisin ve onun analoglari ve türevlerini kapsar. Kalikeamisin ailesi antibiyotikler, pikomolar alti konsantrasyonlarda çift iplikçikli DNA kopmalari üretebilir. Kalikeamisin ailesi konjugatlarin hazirlanmasi için bkz. US 5712374; US 5714586; US 5739116; US 5767285; US 5770701, US 5770710; US 5773001; US1485877296. Kullanilabilecek kalikeamisin yapisal analoglari arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, Yil, 09', 0(3', N-asetil-yH, PSAG ve 911 bulunur (Hinman ve ark Cancer Research 53:3336-3342 (1993), Lode ve ark Cancer Research 58:2925-2928 (1998)).Protein toksinleri arasinda asagida sayilanlar vardir: difteri A zinciri, baglayici olmayan aktif difteri toksini fragmanlari, ekzotoksin A zinciri (Pseudomonas aeruginosa'dan), risin A zinciri (Vitetta ve ark (1987) Science, 23821098), abrin A zinciri, inodesin A zinciri, alfa- sarkin, Aleurites fordii proteinleri, diantin proteinleri, Phytolaca americana proteinleri (PAPI, PAPI] ve PAP-S), momordica charantia inhibitör'û, kursin, krotin, sapaonaria officinalis inhibitör'u, gelonin, mitojelin, restriktosin, fenoinisin, enomisin ve trikotesenler (WO93/21232).Terap'otik radyoizotoplar arasinda 32P, 33P, 90Y, 1251, 1311, 131In, 153Sm,186Re, 188Re, 21'At, 212Bi, 2 12 Pb ve Lu radyoaktif izotoplari bulunur.Radyoizotop ya da baska etiketler, konjugata bilinen yollarla dahil edilebilir (Fraker ve ark (1978) Biochem. Biophys. Res. Commun. 80:49-57; "Monoclonal Antibodies in Immunoscintigraphy" Chatal, CRC Press 1989). Karbon-l4-etiketli 1-izotiyosiyanatobenzi1-3- nietildietilen trianiinpentaasetik asit (MX-DTPA), bir radyonüklidin antikora konjugasyonu için bir örnek selatlama ajanidir (WO94/11026).149BAGLAYICILARBir "Baglayici" (L), bir veya daha fazla sayida ilaç moiyetesini (D) ve bir antikor birimini (Ab) baglayarak Formül 1 ile temsil edilen antikor- ilaç konjugatlarini (ADC) olusturinak için kullanilabilecek bir bifonksiyonel ya da multifonksiyonel moiyetedir. Antikor-ilaç konjugatlari (ADC), Ilaca ve Antikora baglanma için reaktif fonksiyonelligine sahip bir Baglayici kullanilarak uygun sekilde hazirlanabilir. Bir sistein degistirilmis antikorun (Ab) bir sistein tiyolü, bir baglayici reaktifinin, bir ilaç moiyetesinin veya bir ilaç-baglayici ara ürününün bir fonksiyonel grubuyla bir bag olusturabilir.Bu bulusun bir 'Özelligine, bir Baglayici, bir antikorda mevcut bir nükleofilik sisteine reaktif olan bir elektrofilik gruba sahip bir reaktif yer içerir. Antikorun sistein tiyolü bir Baglayici üzerindeki bir elektrofilik grupla reaktiftir ve bir Baglayiciyla bir kovalent bag olusturur. Yararli elektrofilik gruplar arasinda, bunlarla sinirli kalmamak üzere, maleimid ve haloasetainid gruplari bulunur.20 adet sistein degistirilmis antikor, "Klussman, ve ark (2004), Bioconjugate Cheinistry 15(4):765-773" referansinda sayfa 766"da tarif edilen kon jugasyon yöntemine ve Ornek 4"te açiklanan protokole göre baglayici reaktifleriyle ya da ilaç-baglayici ara ürünleriyle, maleiinid ya da a-halo karbonil gibi elektrofilik fonksiyonel gruplarlareaksiyona girer.Bu bulusun bir yapisinda, bir ADC baglayicisi L asagida gösterilen forinülle temsil edilir:-Aa-WWYy-150burada: -A- simgesi antikorun (Ab) bir sistein tiyoli'ine kovaleiit baglanan bir Gerdirici birimdir; a simgesi 0 ya da l"dir; her bir -W- simgesi birbirinden bagimsiz olarak bir Amino Asit birimidir; W simgesi birbirinden bagimsiz olarak 0 ile 12 araliginda bir taiiisayidir; -Y- simgesi ilaç moiyetesine kovalent baglanan bir Aralayici birimdir vey simgesi O, 1 ya da 2°dir.GERDIRICI BIRIMGerdirici birim (-A-), eger varsa, bir antikor birimini bir aniiiio asit birimine (-W-) baglayabilir. Bu baglamda, bir antikor (Ab), bir Gerdirici Birimin bir elektrofilik fonksiyonel grubuyla bir bag olusturabilen bir serbest sisteiii tiyol grubuna sahiptir. Bu yapinin temsilci Gerdirici birimleri, Formül llla ve lllb°de köseli parantezler içinde gösterilmektedir; burada, Ab-, -W-, -Y-, -D, W ve y simgeleri yukarida açiklandigi gibidir ve R'7 simgesi (CH2)r, C3-Cg karbosiklil, O-(CH2)n arilen, (CH2)r-arilen, -arileii-(CH2)r-, (CH2)r-(C3- C8 karbosiklil), (C3-Cg karbosiklil)-(CH2)r, C3-C8 heterosiklil, (CH2)r- (C3-Cgheterosik1il), -(C3-C8 heterosiklil)-(CH2)r-, -(CH2)rC(O)NRb- (CH2)r-, -(CH2CH20).`-, -(CH2CH20)r-CH2-, -(CH2)rC(O)NRb (CH2CH2O)r-, -(CH2)I.C-(O)NRb(CH2CH20)r-CH2-, -(CH2CH20)r C(O)NRb(CH2CHZO)T-, -(CH2CHZO)rC(O)NRb(CH2 CHZO)r -CH2- ve - (CHZCHZO)rC(O)NRb(CH2)r- arasiiidan seçilen bir divaleiit radikaldir;151burada, Rb simgesi H, C1-C6 alkil, fenil ya da benzildir ve r simgesibirbirinden bagimsiz olarak 0 ile 10 araliginda bir tamsayidir.Arilen, ana aroinatik halka sisteminden iki hidrojen atomunun çikarilmasiyla türetilen 6-20 karbon atoinlu divalan aromatik hidrokarbon radikalleri içerir. Tipik arilen gruplari arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, benzen, sübstit'ue benzen, naftalen, antrasen,bifenil ve benzerinden türetilmis radikaller bulunur.Heterosiklil gruplari arasinda, bir veya daha fazla sayida halka atomunun nitro jen, oksijen ve sülfür gibi bir heteroatom oldugu bir halka sistemi bulunur. Heterosikl radikal 1 ila 20 karbon atomu ve N, O, P ve S'den seçilen l ilâ 3 hetero atom içerir. Bir heterosikl, 3 ilâ 7 halka elemanina sahip bir monosikl (2 ilâ 6 karbon atoinu ve N, O, P ve S7den seçilen 1 ilâ 3 hetero atom) veya 7 ilâ 10 halka eleinanina sahip bir bisikl (4 ilâ 9 karbon atomu ve N, O, P ve S"den seçilen 1 ilâ 3 hetero atom) olabilir; örnek olarak bir bisiklo [4,5], [5,5], [5,6] veya [6,6] sistemi gösterilebilir. Heterosikller "Paquette, Leo A., "Principles of Modem Heterosiklic Chemistry" (W.A. Benjamin, New York, 1968)" referansinda, özellikle Bölüm 1, 3, 4, 6, 7 ve 9"da; "The Chemistry of Heterosiklic Coinpounds, A series of Monographs (John Wiley & Sons, New York, 1950 to present)" referansinda, 'Özellikle Cilt 13, 14, 16, 19 ve 28"de; "1. Am. Chem. Soc. (1960) 82;5566"datarif edilmistir.Heterosikl 'Örnekleri arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, piridil, dihidropiridil, tetrahidropiridil (piperidil), tiyazolil, tetrahidrotiyofenil,sülfür oksidize tetrahidrotiyofenil, pirimidinil, furanil, tienil, pirrolil,152pirazolil, imidazolil, tetrazolil, benzofuranil, tiyanaftalenil, indolil, indolenil, kinolinil, izokinolinil, benzimidazolil, piperidinil, 4- piperidonil, pirrolidinil, 2-pirr01idonil, pirrolinil, tetrahidrofuranil, bis- tetrahidrofuranil, tetrahidropiranil, bis-tetrahidropiranil, tetrahidrokinolinil, tetrahidroizokinolinil, dekahidrokinolinil, oktahidroizokinolinil, azosinil, triazinil, 6H-l,2,5-tiyadiazinil, 2H,6H- 1,5,2-ditiyazinil, tienil, tiyantrenil, piranil, izobenzofuranil, kromenil, ksaiitenil, fenoksatinil, 2H-pirrolil, izotiyazolil, izoksazolil, pirazinil, piridazinil, indolizinil, izoindolil, 3H-indoli1, lH-indazolil, purinil, 4H-kinolizinil, ftalazinil, naftiridinil, kinoksalinil, kinazolinil, sinnolinil, pteridinil, 4Ah-karbazoli1, karbazolil, ß-karbolinil, fenantridinil, akridinil, pirimidinil, fenantrolinil, fenazinil, fenotiyazinil, furazanil, fenoksazinil, izokromanil, kromanil, imidazolidinil, imidazolinil, pirazolidinil, pirazolinil, piperazinil, indolinil, izoindolinil, kuinûklidinil, morfolinil, oksazolidinil, benzotriazolil, benzizoksazolil, oksindolil, benzoksazolinil ve izatinoil sayilabilir.Karbosiklil gruplari, monosikl olarak 3 ilâ 7 karbon atomuna ve bisikl olarak 7 ilâ 12 karbon atoinuna sahip bir doymus veya doymamis halka içerir. Monosiklik karbosikller 3 ilâ 6 halka atomuna, daha tipik olarak 5 veya 6 halka atomuna sahiptir. Bisiklik karbosikller örnegin, bir bisiklo [4,5], [5,5], [5,6] veya [6,6] sistemi olarak ayarlanmis olarak 7 ilâ 12 halka atomuna 'Örnegin, bir bisiklo [5,6] veya [6,6] sistemi olarak ayarlanmis olarak veya 9 ya da 10 halka atomuna sahiptir. Monosiklik karbosikl örnekleri arasinda siklopropil, siklobütil, siklopentil, l-siklopent-l-enil, l-siklopent-Z-enil, l- siklopent-3-enil, sikloheksil, l-sikloheks-l-enil, l-siklohekS-Z-enil, 1-sikloheks-3-enil, sikloheptil ve siklooktil vardir.153Formül 1 ADC°nIn bütün örnek yapilarindan, örnegin, lll-Vl°dan, açikça gösterilmediginde bile 1 ilâ 4 ilaç moiyetesinin, degistirilmissistein artiklari sayisina bagli olarak bir antikora (p=l-4) bagli olduguanlasilacaktir. Ab-S Ri7c(or__ww_Yy_D O p mi Ab-S* 9 mbGerdirici Birimin bir örnegi Formül IIIa ile gösterilmektedir ve maleimido-kaproilden (MC) türetilir; burada, R17 simgesi -(CH2)5- bilesigidir:*gGerdirici Birimin bir `Örnegi Formül IIIa ile gösterilmektedir ve maleiinido-propanoilden (MP) türetilir; burada, R" simgesi -(CH2)2- bilesigidir: 154Gerdirici Birimin baska bir örnegi Formül Illa ile gösterilmektedir;burada, R" simgesi -(CH2CHZO)I.-CH2- bilesigidir ve I' simgesi 2"dir:g NME"O 0Gerdirici Birimin baska bir örnegi Formül 11121 ile gösterilmektedir; burada, R" simgesi -(CH2)1.C(O)NRb(CH2CH20)i.-CH2- bilesigidir;burada, Rb simgesi H'dir ve her bir r simgesi 2,dir:gigN/JSNOwO/Ni/EMPEGGerdirici Birimin baska bir örnegi Formül IIIb ile gösterilmektedir;burada, R'7 simgesi -(CH2)5- bilesigidir:;QîSA/Vm/H.Bu bulusun baska bir yapisinda, Gerdirici birim, Antikor biriminin bir sülfür atomu ile Gerdirici biriminin bir sülfür atomu arasinda bir disülfi'ir bagiyla Antikor birimine baglanir. Bu yapinin temsilci Gerdirici birimi, Formül IV,te köseli parantezler içinde gösterilmektedir; burada, R", Ab-, -W-, -Y-, -D, W ve y simgeleriyukarida açiklandigi gibidir. 155Ab-Seâs-RW-CXOk-Ww-Yy-D ) P IVBu bulusun yine baska bir yapisinda, Gerdiricinin reaktif grubu, bir antikorun bir serbest sistein tiyoli'iyle bir bag olusturabilen bir tiyol- reaktif fonksiyonel grup içerir. Tiyol-reaktif fonksiyonel gruplarin 'Örnekleri arasinda, bunlarla sinirli kalmamak üzere, maleimid, 0(- haloasetil, aktive esterler, örnegin, süksinimid esterler, 4-nitrofenil esterler, pentaflorofenil esterler, tetraflorofenil esterler, anhidritler, asit klor'i'irler, sülfonil klor'i'irler, izosiyanatlar ve izotiyosiyanatlar bulunur. Bu yapinin temsilci Gerdirici birimleri Formül Va ve Vb°de köseli parantezler içinde gösterilir; burada -Rl7-, Ab-, -W-, -Y-, -D, W ve y yukarida tanimlandigi gibidir.AbAgs-qomH-RW-qor-wr-Yy- D ) p VaÃb-és-CßmH-W7-0(0)-w.,-Y,- D ) P vi›Bu bulusun baska bir yapisinda, baglayici, birden fazla ilaç moiyetesinin bir dallanan, multifonksiyonel baglayici moiyetesi vasitasiyla bir antikora kovalent baglanmasi için dendritik tipte bir baglayici olabilir (Sun ve ark (2002) Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 12:2213-2215; Sun ve ark (2003) Bioorganic & Medicinal Chemistry 11:1761-1768; King (2002) Tetrahedron Letters43:1987-1990). Dendritik baglayicilar ilacin antikora molar oranini,156yani ADC"nin potansiyla ilgili olan yükü artirabilir. Bu sebeple, bir sistein degistirilmis antikorun sadece bir reaktif sistein tiyol grubu tasidigi durumda, bir dendritik baglayici vasitasiyla çok sayida ilaçmoiyetesi baglanabilir.AMINO ASIT BIRIMI Baglayici, amino asit artiklari içerebilir. Amino asit birimi (-WW-), mevcut oldugunda, antikoru (Ab) bulus konusu sistein degistirilmisantikor-ilaç konjugatmin (ADC) ilaç moiyetesine (D) baglar.-WW- simgesi bir dipeptid, tripeptid, tetrapeptid, pentapeptid, hekzapeptid, heptapeptid, oktapeptid, nonapeptid, dekapeptid, undekapeptid veya dodekapeptid biriinidir. Amino asit biriini içeren amino asit artiklari arasinda, dogal olusumlu olanlar ve yani sira küçük ainino asitler ve dogal olusuinlu olmayan amino asit analoglari, örnegin, sitrulin bulunur. Her bir -W- birimi bagimsiz olarak asagidaköseli parantez içinde gösterilen formüle sahiptir ve W simgesi O ile 12g 1%burada, R19 simgesi hidrojen, inetil, izopropil, izobütil, sec-bütil, benzil, p-hidroksibenzil, -CHZOH, -CH(OH)CH3, -CHZCHZSCH3, - CHZCONHZ, -CHZCOOH, -CHZCHZCONHZ, -CH2CH2COOH,-araliginda bir tamsayidir: 5157(CH2)3NHC(=NH)NH2, -(CH2)3NH2, -(CH2)3NHCOCH3, - (CH2)3NHCHO, -(CH2)4NHC(=NH)NH2,-(CH2)4NH2, - (CH2)4NHCOCH3, -(CH2)4NHCHO, -(CH2)3NHCONH2, - (CH2)4NHCONH2,-CH2CH2CH(OH)CH2NH2, 2-piridilmetil-, 3- piridilmetil-, 4-piridilmetil-, fenil, sikloheksil ya da asagidagösterilenleren biridir."kö/O."(Vûßi *ah/ÜÇ.)VC:) ; ?bo› H .NAmino Asit birimi, bir tümör-iliskili proteaz dahil bir veya daha fazla sayida enzim tarafindan enzimatik olarak klevaja ugratilarak Ilaç moiyetesi (-D) serbest birakilir; bu bulusun bir yapisinda, bir Ilaç (D)temin etmek için salimin ardindan in ViV0 olarak protonlanir.Kullanilabilecek -WW- birimleri tasarlanabilir ve örnegin bir tümör-iliskili proteaz gibi belirli bir enzim tarafindan enzimatik klevaj için158selektivitesi açisindan optimize edilebilir. Bu bulusun bir yapisinda, bir -WW- birimi, klevaji katepsin B, C ve D ya da bir plazmin proteaztarafindan katalize edilen bir birimdir.Ornek -WW- Ainino Asit biriinleri arasinda bir dipeptid, bir tripeptid, bir tetrapeptid veya bir pentapeptid bulunur. Oniek dipeptidler arasiiida valin-sitrulin (ve veya val-Cit), alanin-fenilalanin (af veya ala-phe) bulunur. Ornek tripeptidler arasinda glisin-valine-sitrulin(gly-val-cit) ve glisin-glisin-glisin (gly-gly-gly) bulunur.R19 simgesi hidrojen haricinde bir bilesik oldugunda, R19"un baglandigi karbon atomu kiraldir. R19"un baglandigi her bir karbon atomu birbirinden bagimsiz olarak (S) veya (R) konfigürasyonlarina sahiptir veya bir raseinik karisimdir. Amino asit biriinleri bu sebeple enantiyomerik olarak saf, rasemik veya diastareomerik olabilir.ARALAYICI BIRIM Aralayici birim (-Yy-), mevcut oldugunda (y : 1 veya 2), bir Amino Asit birimi varsa (W : 1-12) Ainino Asit birimini (-WW-) ilaç moiyetesine (D) baglar. Alternatif olarak, Aralayici birim, bir Amino Asit biriini mevcut olmadiginda Gerdirici birimi ilaç inoiyetesine baglar. Aralayici birim, ayni zamanda, hem Ainino Asit birimi, hem de Gerdirici birimi bulunmadiginda (W, y : 0) ilaç inoiyetesini antikora baglar. Aralayici birimleri iki genel tiptedir: self-immolatif ve non-self-immolatif. Bir non-self-immolatif Aralayici birim, bir Amiiio Asit biriminin antikor-ilaç konjugatindan veya Ilaç moiyetisi baglayicisindan klevajindan, `Özellikle enzimatik sonra Aralayicibirimin bir kisminin veya tainaminin Ilaç moiyetesine bagli kaldigi bir159Aralayici birimdir. Bir glisin-glisin Aralayici biriini veya bir glisin Aralayici birimi içeren bir ADC, bir tümör hücresi iliskili proteaz, bir kanser hücresi iliskili proteaz veya bir lenfosit iliskili proteaz vasitasiyla enzimatik klevaja tâbi tutuldugunda, bir glisin-glisin-ilaç inoiyetesi veya bir glisin-ilaç moiyetesi Ab-Aa-WW-"den klevaja ugrar. Bu bulusun bir yapisinda, hedef hücre içinde bir bagimsiz hidroliz reaksiyonu gerçeklesir ve glisin-ilaç moiyetesi bagini klevajaugratir ve ilaci serbest birakir.Bu bulusun baska bir yapisinda, -Yy- simgesi fenilen kisnii Qm ile sübstitüe edilen bir p-aminobenzilkarbamoil (PAB) birimidir (bakiniz Sema 2 ve Sema 3); burada, Q simgesi -Ci-Cg alkil, -O-(Ci-Cg alkil), - halojen,- nitro ya da -siyanudur ve ni simgesi 0-4 araliginda birtaiiisayidir.Non-self-immolatif Aralayici birimin (-Y-) örnek yapilari söyledir: -Gly-Gly- ; -Gly- ; -Ala-Phe- ; -Val-Cit-.Bu bulusun bir yapisinda, Aralayici birimin bulunmadigi (y:0) bir Ilaç moiyetesi-baglayici veya bir ADC ya da onuii farinasötik olarak kabuledilebilir tuzu ya da solvati temin edilir.Alternatif olarak, bir self-immolatif Aralayici birim içeren bir ADC, - D salimi yapabilir. Bu bulusun bir yapisinda, -Y- simgesi, PAB grubunun amino nitro jen atomu vasitasiyla -WW-,ye baglanan ve bir karbonat, karbamat veya eter grubu vasitasiyla dogrudan -D"ye dogrudan baglanan bir PAB grubu olup, ADC asagidaki 'Örnek yapiya sahiptir:160Cm _1_ Ab Aa-ww-NH-<_:/-10 cburada, Q simgesi -C i-Cg alkil, -O-(C 1'Cg alkil), -halojen, -nitro ya da -siyanodur; m simgesi 0-4 araliginda bir tamsayidir ve 1:› simgesi 1 ile4 araligindadir.Self-immolatif aralayicilarin baska 'Örnekleri arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, 2-aminoimidazol-S-metanol türevleri gibi PAB grubuna elektronik olarak benzer olan aromatik bilesikler (Hay ve ark. (1999) Bioorg. Med. Chem. Lett. 922237) ve orto ya da para- aminobenzilasetaller bulunur. S'ûbstiti'ie edilmis veya edilmemis 4- aminobütirik asit ainidler (Rodrigues ve ark (1995) Cheinistry Biology 22223), uygun sekilde sübstit'ûe edilmis bisiklo[2.2.l] ve bisiklo[2.2.2] halka sistemleri (Storm ve ark (1972) J. Amer. Chem. Soc. 94:5815) ve 2-amin0fenilpr0piy0nik asit amidler (Amsberry, ve ark (1990) I. Org. Chem. 5525867) gibi amid baginin hidrolizinin ardindan siklizasyona tâbi tutulan aralayicilar kullanilabilir. Glisinde sübstiti'ie edilmis amin içeren ilaçlarin eliminasyonu da (Kingsbury ve ark (1984) J. Med. Chem. 27:1447) ADC'lerde yararli self-immolatifdolgularin örnekleridir.Bu bulusun bir yapisinda, Aralayici birim, çoklu ilaçlari dahil etmek ve salinak için kullanilabilecek olan ve asagida gösterilen yapiya sahipolan bir dallanmis bis(hidr0ksimetil)stiren (BHMS) bilesigidir:161CH2(OC)n_Ahh _W "s MCHüocln-Dbir 2-(4-aminobenziliden)propan-l,3-diol dendrimer birimi içerir (WO 2004/043493; de Groot ve ark (2003) Angew. Chem. Int. Ed. 42:4490- 4494); burada, Q simgesi -Ci-Cg alkil, -O-(Ci-Cg alkil), -halojen, - nitro veya -siyanodur; m simgesi 0 ile 4 araliginda bir tamsayidir; nsimgesi 0 veya lSdir; p simgesi ise 1 ile 4 araliginda degisir. DENDRITIK BAGLAYICILARBu bulusun baska bir yapisinda, baglayici L, bir dallanan, multifonksiyonel baglayici moiyetesi yoluyla birden fazla ilaç moiyetesinin bir antikora kovalant baglanmasi için bir dendritik tipte baglayici olabilir (Sun ve ark (2002) Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 12:2213-2215; Sun ve ark (2003) Bioorganic & Medicinal Chemistry 11:1761-1768). Dendritik baglayicilar, ADC potansiyla iliskili olarak, ilacin antikora molar oranini, yani yükü arttirabilir. Sonuç olarak, bir sistein degistirilmis antikorun yalnizca bir reaktif sistein tiyo] grubu içerdigi durumlarda, çok sayida ilaçmoiyetesi, bir dendritik baglayici yoluyla baglanabilir.Dendritik baglayici reaktiflerin asagida gösterilen `Örnek yapilari, dokuz adede kadar nükleofilik ilaç moiyetesi reaktifinin kloroetil nitrojen inustard fonksiyonel gruplariyla reaksiyon yoluyla konjugeedilmesine olanak saglar: 162C N/\/[/x3N H\ 0x.. cilzocu;crizciizwi-iccHacMacar<3~Nicmzcuzci)2&da ,sv,Y= CH200H2cH lNHcrgcmCHßHzcHwozH)NuîcuzcHzch-Mcnzcrmo,0 N ,cz, (ll)\ z , cnzocuprgcuncwcx,veyaCHZOGHQCHQÄNHCHZCYg Bir Aralayici birimin baska bir yapisinda, bulus konusu bilesiklerde baglayicilar olarak self-immolatif 2,6-bis(hidr0ksimetil)-p-kresol ve 2,4,6-tris(hidr0ksimetil)-fenol dendrimer birimleriyle dallanmis, dendritik baglayicilar (WO 2004/01993; Szalai ve ark (2003) J . Amer. Chem. Soc. 125215688-15689; Shamis ve ark (2004) J. Amer. Chem. Soc. 12621726-1731; Amir ve ark (2003) Angew. Chem. Int. Ed. 42:4494-4499) kullanilabilir. Bu bulusun baska bir yapisinda, D moiyeteleri aynidir.Bu bulusun yine baska bir yapisinda, D moiyeteleri farklidir. 163Bu bulusun bir özelliginde, Aralayici birimler (-Yy-), Formül (X)- (XII) ile temsil edilir:0 X burada, Q simgesi -C i-Cg alkil, -O-(Ci-Cg alkil), -halojen, -nitro ya da -siyanodur ve m simgesi 0-4 araliginda bir tamsayidir; g-HN-CHZ-co-g xi %-NHCHacwyNncnzqm- XI] Formül 1 antikor-ilaç konjugati bilesiklerinin yapilari arasinda XIIIa (val-cit), Xlllb (MC-val-cit), Xlllc (MC-val-cit-PAB) vardir: '1 N Yyo P0di..I~2H0%"Hz xmi 1645 Formül Ia antikor-ilaç konjugati bilesiklerinin baska örnek yapilariarasinda XIVa-e vardir:XL0 IIAb-S CHQC_Y_C"_D Ah s-cnzc-o 165Ab-o cm-O-ê-o pXIVdms-éwg-H HR):5 burada, X simgesi asagida gösterildigi gibidir:_GHz-O- . -rcnan- , _(CH2CH2°)n_ 0 -wOê--iw ÜRXIVe o "- (CHûii- -Q veya _(CHQn-g-rîl-(CHQn-- I R ;Y simgesi asagida gösterildigi gibidir: R __ _g / 'î' . \ / veya _N_(CH2)n'15 ve R simgesi birbirinden bagimsiz olarak H ya da C l-CÖ alkildir ve nsimgesi 1 ilâ 12"dir.Bu bulusun baska bir yapisinda, bir Baglayici, bir antikor üzerinde bulunan bir elektrofilik grupla reaktif olan bir nükleofilik grup içeren20 bir reaktif fonksiyonel gruba sahiptir. Bir antikor üzerinde bulunan166kullanisli elektrofilik gruplar arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, aldehid ve keton karbonil gruplari vardir. Bir baglayicinin bir nükleofilik grubunun heteroatomu, bir antikor üzerindeki bir elektrofilik grupla reaksiyona girebilir ve bir antikor birimine bir kovalent bag olusturabilir. Bir Baglayici üzerinde bulunan kullanisli nükleofilik gruplar arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, hidrazit, oksim, amino, hidrazin, tiyosemikarbazon, hidrazin karboksilat ve arilhidrazit vardir. Bir antikor 'üzerindeki elektrofilik grup, birBaglayiciya baglanina için uygun yer saglar.Normalde, iki veya daha fazla amino asit ve/Veya peptid fragmani arasinda bir peptid bagi olusturularak peptid-tipi Baglayicilar hazirlanabilir. Bu peptid baglari, `Örnegin peptid kiinyasi alaninda iyi bilinen sivi faz sentez yöntemine (E. Schroder and K. Lübke (1965) "The Peptides", Cilt 1, sayfa 76-136, Academic Press) görehzirlanabilir.Baglayici ara ürünleri, Aralayici, Gerdirici ve Amino Asit birimleri dahil reaksiyonlarin herhangi bir koinbinasyonuyla ya da sekansiyla monte edilebilir. Aralayici, Gerdirici ve Amino Asit birimleri, dogasi geregi elektrofilik, nükleofilik ve serbest radikal olan reaktif fonksiyonel gruplari kullanabilir. Reaktif fonksiyonel gruplar arasinda, bunlarla sinirli kalmaksizin, asagida gösterilenler vardir:-COOH-coon oi-i ,167H N\-0j`o-<_I-No2 . X/îii:burada, X simgesi bir ayrilma grrubu, örnegin O-mesil, O-tosil, -Cl, -Br, -1 ya da maleimiddir.Bu bulusun baska bir yapisinda, Baglayici, çözünürlügü ya da reaktiviteyi modüle eden gruplarla sübstitüe edilebilir. Örnegin, sülfonat (-SO3`) ya da amonyum gibi bir yüklü sübstitüent, reaktifin suda çözünürlügünü artirabilir ve baglayici reaktifinin antikorla veya ilaç moiyetesiyle kuplajlanma reaksiyonunu kolaylastirabilir ya da ADC°yi hazirlamak için kullanilan sentez yoluna bagli olarak Ab- L"nin (antikor-baglayici ara ürünü) D7yle ya da D-L'nin (ilaç- baglayici ara ürünü) Ab,yle kuplajlanma reaksiyonunukolaylastirabilir.Bu bulusa konu olan bilesikler, bunlarla sinirli kalmaksizin, Pierce Biotechnology, Inc., Customer Service Department, P.O. Box 117, Rockford, IL. 61105 U.S.A, U.S.A 1-800-874-3723, International +815-968-0747 firmasindan ticari olarak temin edilebilecek baglayici reaktifleriyle (BMPEO, BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP, SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, sulfo- EMCS, sülfo-GMBS, sülfo-KMUS, sülfo-MBS, sülfo-SIAB, sülfo- SMCC ve sülfo-SMPB ve SVSB (süksiniinidil-(4- Vinilsülfon)benzoat)) ve yani sira, bis-maleimide reaktifleriyle (DTME, BMB, BMDB, BMH, BMOE, BM(PEO)3 ve BM(PEO)4) hazirlanan ADC°yi açikça kapsamaktadir. Bakiniz: sayfalar 467-498,1682003-2004 Applications Handbook and Catalog. Bis-maleimid reaktifleri, bir sistein degistirilmis antikorun tiyol grubunun bir tiyol içeren ilaç moiyetesine, etikete veya baglayici ara ürününe sirali veya eszamanli olarak baglanmasina izin verir. Maleimidin yani sira bir sistein degistirilmis antikor, ilaç moiyetesi, etiket veya baglayici ara ürününün bir tiyol grubuyla reaktif olan baska fonksiyonel gruplar arasinda iyodoasetamid, bromoasetamid, Vinil piridin, disülfur, piridildisülfûr, izosiyanat ve izotiyosiyanat bulunur.00 \ o 0NNowO/VN NNOwONowN\ \ /o o o iaiviuaiaoi3 BM(PEO)4Kullanilabilecek baglayici reaktileri, Molecular Biosciences lnc. (Boulder, CO) gibi baska ticari kaynaklardan elde edilebilecegi, asagida atif yapilan referanslarda tarif edilen prosedürlere göre sentezlenebilir de: Toki ve ark (2002) J. Org. Chem. 6721866- 1872; Walker, M.A. (1995) J. Org. Chem. 60:5352-5355; Frisch ve ark (1996) Bioconjugate Chem. 7:180-186; US 6214345; WO 02/088172; US 2003130189; U82003096743; WO 03/026577; WO 03/043583 ve WO 04/032828.Formül (11121) ile temsil edilen gerdiriciler, asagidaki baglayici reaktifleri bir Amino Asit biriminin N-terminaliyle reaksiyonasokularak bir Baglayiciya dahil edilebilir: 1690 O *T &Hamam-&g o . o burada, n simgesi 1-10 araliginda bir tamsayidir ve T siingesi -H ya da -SOgNa bilesigidir; o ' _ gn-@qci-iân-cbyo- o o burada, 11 simgesi 0-3 araliginda bir tamsayidir; ' O woio_ ; \ 7 0 0 \ 0 0 W . N . ve 5170Gerdirici birimler, asagidaki bifonksiyonel reaktifler bir amino bir Amino Asit biriminin N-terminaliyle reaksiyona sokularak birbaglayiciya dahil edilebilir:wie& &mg; 09;:BKÂNHVîo 'WMOburada, X simgesi Br ya da I°d1r. Formülün gerdirme birimleri, asagidaki bifonksiyonel reaktifler bir Amino Asit biriminin N-terminaliyle reaksiyona sokularak bir baglayiciya dahil edilebilir.veFormül (Va) ile temsil edilen gerdirici birimler, asagidaki ara ürünler bir Amino Asit biriminin N-terminaliyle reaksiyona sokularak birBaglayiciya dahil edilebilir: 171o BohNH-NHg-.Äoý _ . ' ove o Bor-NH-NHz/YO`Ç _ 0 o5 Asagida gösterilen Formülün Izotiyosiyanat Gerdiricileri, ""Aiigew. Chem., (1975) 87(l4), 517" referansinda tarif edildigi gibi,izotiosiyanatkarboksilik asit klorürlerinden hazirlanabilir.S=C=N-R"-C(O)-g 1 0burada, -R17- simgesi burada açiklandigi gibidir.Bir maleiinid Gerdirici ve bir para-aminobenzilkarbamoil (PAB) self- immolatif Gerdirici içeren bir örnek valin-sitrulin (val-cit ya da VC)15 dipeptid baglayici reaktifi asagida gösterilen yapiya sahiptir:0 QMX 0% "30 CH; 0 \ &O &WR/"w \ "02 F -N H ITIOC H o \ NH HgNburada, Q simgesi -C i-Cg alkil, -O-(Ci-Cg alkil), -halojen, -nitro ya da -siyanodur ve m simgesi 0-4 araliginda bir tamsayidir.20172Bir maleimid Aralayici birimine ve bir p-aminobenzil self-immolatif Aralayici birimine sahip bir 'Örnek phe-lys(Mtr) dipeptid baglayici reaktifi "Dubowchik, ve ark. (1997) Tetrahedron Letters, 38:5257-60"referansina göre hazirlanabilir ve asagida gösterilen yapiya sahiptir:Qm\< OH Ph H 0 '\\ LWN» Fmoc-N 3 H H 0HN-Mtr burada, Mtr simgesi m0n0-4-metoksitritildir; Q simgesi 'Cl-C3 alkil, -O-(Cl-Cg alkil), -halojen, -nitro ya da -siyanodur ve m simgesi 0-4araliginda bir tamsayidir.Bu bulusa konu olan antikor-ilaç konjugati bilesiklerinin 'Örnekleriarasinda asagida gösterilenler vardir:fm m ;%5 "312795151 ;gpAb-MC-vc- ?AB MMAFWSSMWGNM )pAb-Mch-PAB-MMAE 173Ab- _.O 0 H on NWNIHINEWH p Ab-MC-MMAE Ab' 0 0 H 0 H NWN Ne» N N 0 l 0 ' ° om CH 9 Ab-MC-WAF5 burada, Val simgesi valindir; Cit simgesi sitrulindir; p simgesi 1, 2, 3, ya da 4°tî1r ve Ab siingesi bir sistein degistirilmis antikordur. Maytansinoid ilaç moiyetesi DMl°in bir BMPEO baglayici araciligiyla trastuzumabin bir tiyol grubuna baglandigi baska `Örnek antikor ilaç kon jugatlari asagida gösterilen yapiya sahiptir: burada, Ab simgesi bir sistein degistirilmis antikordur; n siingesi O, 115 ya da 2°dir ve p simgesi 1, 2, 3 ya da 4"tür.174AN TIKOR-ILAC KONJUGATLARININ HAZIRLANMASIFormül 1 ile temsil edilen ADC, asagida açiklananlar da dahil, sektörde bilgi ve beceri sahibi kisilerin bildikleri organik kimya reaksiyonlari, kosullari ve reakifleri kullanilarak birkaç yolla hazirlanabilir: (1) bir sistein degistirilmis antikorun bir sistein grubunun bir baglayici reaktifiyle reaksiyona girerek bir kovalent bag yoluyla antikor-baglayici ara ürünü Ab-L olusturmasi ve ardindan, bir aktive edilmis ilaç moiyetesi Diyle reaksiyona girinesi ve (2) bir ilaç moiyetesinin bir nükleofilik grubunun bir baglayici reaktifiyle reaksiyona girerek bir kovalent bag yoluyla ilaç-baglayici ara ürünü D-L olusturmasi ve ardindan, sistein degistirilmis antikorun bir sistein grubuyla reaksiyona girmesi. Konjugasyon yöntemleri (1) ve (2), Formül (1) ile temsil edilen antikor-ilaç konjugatlarini hazirlamak için çesitli farkli sistein degistirilmis antikorlar, ilaç moiyeteleri vebaglayicilarla uygulanabilir.Antikor sistein tiyol gruplari nükleofiliktir ve ve reaksiyona girerek baglayici reaktifleri ve ilaç-baglayici ara ürünleri üzerindeki elektrofilik gruplarla kovalent baglar olusturabilir: (i) NHS esterler, HOBt esterler, haloformatlar ve asit halojenürler gibi aktif esterler; (ii) haloasetamidler gibi alkil ve benzil halojenürler; (iii) aldehitler, ketonlar, karboksil ve maleimid gruplari ve (iv) sülfür degisimi yoluyla piridil disûlfurleri de içine alan disülfurler. Bir ilaç moiyetesi üzerindeki nükleofilik gruplar arasinda, bunlarla sinirli kalmamak 'uzere asagida sayilanlar bulunur: amin, tiyol, hidroksil, hidrazit, oksim, hidrazin, tiyosemikarbazon, hidrazin karboksilat ve baglayicimoiyeteleri ve baglayici reaktifleri üzerindeki elektrofilik gruplarla175kovalent bag olusturmak için reaksiyona girebilen arilhidrazit gruplari.Maytansin örnegin May-SSCH3 bilesigine dönüstürülebilir ve bu bilesik de serbest tiyol May-SHsye indirgenebilir ve bir modifiye antikorla reaksiyona sokularak (Chari ve ark (1992) Cancer Research 52:127-131) bir disülfur baglayicili bir maytansinoid-antikor immünokonjugati olusturabilir. Disülfur baglayicili antikor- maytansinoid konjugatlari rapor edilmistir (WO O4/O]6801;US 6884874; US 2004/039176 A1;WO 03/068144; US 2004/001838 AlgUS Patent Nos. 6441163,5208020,5416064;WO 01/024763). Disi'ilfur baglayici SPP, baglayici reaktifi N-süksinimidil 4-(2-piridiltiyo) pentanoatla olusturulur.Belirli kosullar altinda, sistein degistirilmis antikorlar, DTT (Cleland reaktifi, ditiyotreitol) veya TCEP (tris(2-karboksietil)fosfin hidroklorür; Getz ve ark (1999) Anal. Biochem. cilt 273:73-80; Soltec Ventures, Beverly, MA) gibi bir indirgeme ajaniyla tedavi yoluyla baglayici reaktifleriyle kon jugasyon için reaktif hale getirilebilir. CHO hücrelerinde eksprese edilen tam-boy sistein degistirilmis monoklonal antikorlar (ThioMabdar) 37°C sicaklikta 3 saat süreyle yaklasik 50 kat TCEP fazlasiyla indirgenerek yeni dahil edilen sistein artiklari ile kültür vasatinda mevcut sistein arasinda olusabilecek disülfid baglari indirgendi. Indirgenen ThioMab seyreltildi ve 10 mM sodyum asetat, pH 5 içinde HiTrap S kolona yüklendi ve 0,3M sodyum klorür içeren PBS°yle elüe edildi. Ana Mab°da bulunan sistein artiklari arasinda oda sicakliginda gece boyunca seyreltik (200 nM) aköz bakir sülfatla (CuSO4) disi'ilfûr baglari yeniden olusturuldu. Sektörde bilinen baskaoksidanlar, yani oksidize edici ajanlar ve oksidizasyon kosullari da176kullanilabilir. Ortam havasi oksidasyonu da etkin ve etkilidir. Bu hafif, kismi reoksidasyon basamagi, zincir-içi disülfürleri yüksek fideliteleyle ve etkin ve etkili biçimde olusturur. Ilaç-baglayici ara ürününün, örnegin BM(PEO)4-DMl"in yaklasik 10 kati fazlaligi ilave edildi, karistirildi ve oda sicakliginda yaklasik bir saat süreyle beklemeye birakilarak konjugasyon gerçeklestirildi ve ThioMab antikor-ilaç konjugati olusturuldu. Konjugasyon karisimi jelle filtrelendi ve bir HiTrap S kolona yüklendi ve bu kolonla elüe edildi Ve böylece, fazlalik ilaç-baglayic ara ürünü ve baska safsizliklarçikartildi.Sekil 15, konjugasyon için hücre kültüründen eksprese edilen bir sistein degistirilmis antikor hazirlamak amacina yönelik genel prosesi göstermektedir. Muhtemelen zincirler-arasi çesitli farkli disülfur baglariyla birlikte olusan disülfûr ekleme ürünleri indirgenerek klevaha ugratildi ve böylece, antikorun indirgenmis formu elde edildi. Eslestirilmis sistein artiklari arasindaki zincirler arasi disülfür baglari kismi oksidasyon kosullari altinda, örnegin ortam oksijenine maruz birakilarak yeniden olusturulur. Yeni dahil edilen, degistirilmis ve eslestirilineinis sistein artiklari, bulus konusu antikor konjugatlariiii olusturmak için baglayici reaktifleriyle veya ilaç-baglayici ara ürünleriyle reaksiyon için kullanilabilir. Memeli hücre hatlarinda eksprese edilen ThioMab°lar, -S-S- bagi olusuinu yoluyla bir degistirilmis Cys°ye harici olarak konjuge edilmis Cys ekleme ürününe sebep olur. Bu nedenle, reaktif ThioMab"1ar üretmek için saflastirilmis ThioMab'lar Ornek ll"de tarif edildigi gibi indirgeme ve oksidasyon prosedürleriyle islenmelidir. Bu ThioMab"lar inaleimidiçeren sitotoksik ilaçlar, floroforlar ve baska etiketlerle konjuge177etmede kullanilir.Çesitli farkli ThioFab ve ThioMab antikor-ilaç kon jugatlari hazirlandi (Örnek 4-8). Sistein mutant hu4D5FabV8 (V1 lOC), bir bis-maleimido baglayici reaktifi BMPEOIu maytansinoid ilaç moiyetesi DM1"le konjuge edilerek hu4D5Fabv8 (V1 lOC) -BMPEO-DMl (Ornek 8) olusturuldu.IN VITRO HUCRE PROLIFERASYON ESEYLERIGenelde, bir antikor-ilaç konjugasinin (ADC) sitotoksik veya sitostatik aktivitesi, reseptör proteinlerine, örnegin HER2°ye sahip olan memeli hücreleri bir hücre kültürü vasatinda ADCîiin antikoruna maruz birakilarak; hücreler yaklasik 6 saatten yaklasik 5 güne kadar degisen bir süreyle kültürlenerek ve hücre canliligi ölçülerek ölçülür. Bu bulusa konu olan ADC,nin canliligini (proliferasyon), sitotoksisitesini ve ap0ptoz indüksiyonunu (kaSpaz aktivasyonu)ölçmek amaciyla hücre-bazli in vitro eseyler kullanilmistir.Antikor-ilaç konjugalarinin in vitro potensi, bir hücre proliferasyon eseyiyle ölçülmüstür (Sekil 10 ve 11, Ornek 9). CellTiter- G10®Luminesan Hücre Canliligi Eseyi, Coleoptera lusiferazin rekombinan ekspresyoiiuna dayanan ve ticari piyasada bulunan (Promega Corp., Madison, WI) bir homojen esey yöntemidir (A.B.D. Patent No. 5583024; 5674713 ve 5700670). Bu hücre proliferasyon eseyi, metabolik olarak aktif hücrelerin bir göstergesi olan mevcut ATP miktar tayini temelinde, kültür içinde mevcut canli hücrelerinsayisini tespit eder (Crouch ve ark (1993) 1. lmmunol. Meth. 160:8'l-17888; US 6602677). CellTiter-Glo® Eseyi, 96 kuyucuklu formatta yapilmistir; bu da, bu eseyi, yüksek çiktili taramaya (HTS) mecbur birakmaktadir (HTS) (Cree ve ark (1995) AntiCancer Drugs 6:398- 404). Hoinojen esey prosedürü, tek reaktifin (CellTiter-Glo® Reagent) dogrudan dogruya serum-takviyeli vasat içinde kültürlenen hücrelere ilave edilmesini kapsamaktadir. Hücre yikama, vasatin kaldirilmasi ve multipl pipetleme basamaklarini uygulamak gerekmemektedir. Sistem, reaktifin eklenmesinden ve karistirilniasindan sonra 10 dakika içinde bir 384-kuyucuk formatinda kuyucuk basina 15 kadar düsük bir sayida hücreyi belirler ve yakalar. Hücreler ADC ile kesintisiz olarak muamele edilebilirler ya da ADC ile muamele edilebilir ve ADC°den ayrilabilirler. Genelde, kisa bir süreyle, ömegin 3 saat muamele edilen hücreler, kesintisiz muamele edilen hücrelerle ayni potens etkilerinigöstermislerdir.Hoinojen "ekle-karistir-Ölç" formati, hücre lizisiyle ve mevcut ATP miktarina orantili bir luminesans sinyalin üretilinesiyle sonuçlanir. ATP miktari, dogrudan dogruya, kültürde mevcut hücrelerin sayisina orantilidir. CellTiter-Glo® Eseyi, kullanilan hücre tipine ve vasata bagli olarak genelde bes saatten daha uzun bir yari ömre sahip bulunan ve lusiferaz reaksiyonunun ürettigi bir "akkor tipi" luminesans sinyal yaratir. Canli hücreler, bagil luminesans/isima biriniiyle (RLU) yansitilir. Sübstrat, Beetle Luciferin, eszamanli olarak ATP°nin AMP°ye dönüsmesi ve fotonlarin üretilmesiyle birlikte, rekombinan atesb'ocegi lusiferaziyla oksidatif olarak dekarboksile edilir. Uzatilmis yari-ömür, reaktif enjekt'orleri kullanma geregini ortadan kaldirir ve inultipl plakalarin kesintisiz veya yiginmodunda proseslenmesi için gerekli esnekligi saglar. Bu hücre179proliferasyon eseyi, çesitli farkli çoklu kuyucuk formatiyla, örnegin, 96 ya da 384 kuyucuk formatiyla kullanilabilir. Elde edilen veriler, luminometreyle ya da CCD kamera görüntüleme cihaziyla kaydedilebilir. Luminesans çiktisi, zamana göre ölçülen bagil isima birimiyle (RLU) sunulur. Alternatif olarak, luminesans fotonlari, bir sintilantin varliginda bir sintilasyon sayaciyla da sayilabilir. Isimabirimleri, bu durumda CPS -beher saniyede adet- birimiylesunulabilir: Lusiferaz ATP +Lusiferin+ Oz--Poksilusiferin+ AMP + PP! + 002 + isima Mg.?Antikor-ilaç konjugalarimn anti-proliferatif etkileri, SK-BR-3 meme tümörü hücre hattina karsi yukarida belirtilen in vitro hücre öldürme eseyiiide hücre proliferasyonuyla ölçüldü (Sekil 10 ve 11). ADC'nin IC50 degerleri, HER2 reseptör proteinini asiri eksprese ettikleri bilinen SK-BR-3 hücrelerine karsi tespit edildiler.Sekil 10, trastuzumab-SMCC-DMlün (IC50=0,008-O,015 tig/ml) agir zincir sistein mutant konjugasi hu4D5Fabv8 -(A121C)-BMPEO- DMl "den (IC50 = 0,04 tig/ml) daha kuvvetli oldugunu göstermektedir. Her iki kon juga da, hücre öldürme konusunda çiplak trastuzumab°dan önemli oranda daha kuvvetliydiler (1C50 = 0,1 tig/ml). Trastuzumab- SMCC-DMl için ilaç yükleinesi 2,8 DMl/Ab; hu4D5Fabv8 (A121C)-BMPEO-DM1 için ilaç yüklemesi ise 0,6 DMl/Ab idi.Sekil 11, trastuzumab-SMCC-DMPin (IC50= 0,008-0,015 tig/ml) hafif zincir sistein mutant hu4D5Fabv8 (Vl 10C)-BMPEO-DM1,den (IC50= 0,07 tig/ml) daha kuvvetli oldugunu göstermektedir. Her iki180konjuga da, hücre Öldürme konusunda çiplak trastuzumab'dan önemli oranda daha kuvvetliydiler (IC50 = 0,1 tig/ml). Trastuzumab-SMCC- DMl için ilaç yüklemesi 2,8 DMl/Ab; hu4D5Fabv8 (V1 10C)- BMPEO-DMl için ilaç yüklemesi ise 0,9 DMl/Ab idi.Tam-boy IgG ThioMab konjugalari, in vitro ortamda hücre proliferasyonu etkinligi açisindan test edildiler ve ana aiitikorlarla kiyaslandilar. Sekil 20, ana antikor trastuzuinab (HERCEPTIN®, Genentech, Inc._); yaklasik 3,4 DMl/Ab ilaç yüklemeli trastuzumab- SMCC-DM] ve yaklasik 1,6 DMl /Ab ilaç yüklemeli tiyo-trastuzumab (A121C)-BMPEO-DM ile muamele edilen SK-BR-3 hücrelerinde yapilan bir eseyin sonuçlarini göstermektedir. Trastuzumab-SMCC- DMl koiijugasi, antikora ainino reaktif NHS ester SMCC baglayici reaktif araciligiyla baglanir; tiyo-trastuzumab (A121C) -BMPEO- DMl kon jugalari ise tiyol reaktif nialeimid BMPEO baglayici reaktifi araciigiyla baglanirlar. Her iki konjuga da SK-BR-3 hücrelerine karsi kuvvetliydiler ve denk bir aktivite gösterdiler; trastuzumab ise bir sitotoksik etki göstermedi. Sekil 21A, ana 2H9 anti-EphBZR ve tiyo 2H9 (A121C) BMPEO-DM] konjugalariyla muamele edilmis HT 1080EphB2 hücrelerinde yapilan bir eseyin sonuçlariiii göstermektedir. Sekil 21B, ana 2H9 anti-EphBZR ve tiyo 2H9 (A121C) BMPEO-DMI konjugalariyla muamele edilmis BT 474 hücreleri üzerinde yapilan bir eseyin sonuçlarini göstermektedir. Hem HT 1080EphB2 hem de BT 474 hücrelerine karsi, 2H9 ThioMab konjugasi, ana 2H9 antikoru konjugasindan daha kuvvetliydi. Thio- 2H9-BMPEO-DM1 konjugasi, sadece marjinal bir aktivitenin gözlemlendigi bir EphB2-harici hücre hattina, BT474 kiyasla EphBZ spesifik hücre hattinda (HTlOSOEphHZ) fonksiyonel hücre öldürme181aktivitesi gösterdi.Antikor ilaç kon jugalari, antikorun bir ana antikor oldugu ve antikorun bir sistein degistirilmis antikor oldugu deneylerde karsilastirildilar. Sekil 22, 3A5 anti MUC16-SMCC-DM1 ve tiyo 3A5 (A121C) BMPEO-DMl ile muamele edilen PC3/neo hücreleri üzerinde yapilan bir eseyin sonuçlarini göstermektedir. Sekil 23, 3A5 anti MUC16- SMCC-DMl ve tiyo 3A5 (A121C) BMPEO-DMl ile muamele edilen PC3/MUC16 hücreleri üzerinde yapilan bir eseyin sonuçlarini göstermektedir. Sekil 24 ise, 3A5 anti MUC lÖ-SMCC-DM 1 ve tiyo 3A5 (A121C) BMPEO-DMl ile muamele edilen OVCAR-3 hücreleri üzerinde yapilan bir eseyiii sonuçlarini göstermektedir. Tiyo-3A5- BMPEO-DMl, kontrol PC3/neo hücre hatti üzerinde öneinli bir hücre öldürme aktivitesi göstermemis; PC3/MUC16 hücre hatti üzerinde ise 3A5-SMCC-DMl°e denk bir aktivite göstermistir. Tiyo-3A5-DM1 konjugasi da, endojen MUC16 antijenini eksprese eden OVCAR-3hücreleri üzerinde aktivite göstermistir.IN VIVO ETKINLIKBu bulusa konu olan iki albümin baglanma peptidi-DMI (maytansinoid)-antikor-ilaç konjugasinin (ADC) in Vivo etkinligi, ekspresyonu yüksek bir HER2 transgenik eksplaiit fare modeliyle ölçüldü (Sekil 12, Örnek 10). HERCEPTIN® tedavisine cevap vermeyen ya da zayif bir cevap veren F05 inmtv transgenik fareden aliiian bir allogreft yayildi. Deneklere ABP-rhuFab4D5-cys (hafif Zincir)-DMl; ABP-rhuFab4D5-cys (agir zincir)-DM1 ve plasebo PBStampon kontrol (Vehikül) bir kere uygulandi ve ardindan, tümörün iki 182katina çikmasi, log hücre ölümü ve tümörün küçülmesine kadar geçenzainani ölçmek amaciyla, denekler 3 hafta süreyle izlendiler. Numune Doz Ti PR CR TDV (gün) Vehikül(PBStamp0nu) 7/7 0/7 0/7 3 ABP-rhuFab4D5-V110C (hafif Beher kgsda 25 mg 7/7 7/7 0/7 14 zincir)-DM1 (0,9 DMl/Ab) (1012 tig/m2 DMI) ABP-rhuFab4D5-A121C (agir Beher kg"de 37,5 mg 7/7 4/7 0/7 16 ziiicir)-DM1 (0,6 DMl/Ab) (1012 tig/m2 DMI) Ti terimi, T = 0 seviyesinde çalisma grubunda bulunan tümörlühayvan sayisi + gruptaki toplam hayvan sayisini temsil etmektedir.PR terimi, tümörde kismi remisyon gösteren hayvanlarin sayisi + grup içinde T = 0 seviyesinde tümörlü hayvanlarin sayisini temsil etmektedir. CR terimi ise, tümörde tam remisyon gösteren hayvanlarin sayisi + grup içinde T = 0 seviyesinde tümörlü hayvanlarin sayisini temsil etmektedir. TDV terimi, tümörün iki katina çikma süresi, yani, kontrol tümörü hacminin iki katina çikmasi için geçen zaman günolarak anlamina gelmektedir.Beher kg°a 25 mg (1012 ug/m2 DMl) ABP-rhuFab4D5-cys (hafif zincir)-DM1 ile tedavi edilen yedi farenin hepsi tümör-pozitifti ve sadece bir hayvanda 20 gün sonra kismi remisyon gözlemlendi. Beher kg°a 37,5 mg (1012 ug/m2 DMI) ABP-rhuFab4D5-cys (agir zincir)- DMl ile tedavi edilen yedi farenin hepsi tümör-pozitifti ve dörthayvanda 20 gün sonra kismi remisyon gözlemlendi.183BMPEO baglayici ve DM] ilaç moiyetesine konjuge edilen ve A121C sistein mutasyonu bulunan tam-boy IgG ThioMab antikoru, MMTV- HER2 F05 tümör-tasiyan farelerde ana trastuzumab-SMCC-DMI konjugasina karsi test edildi. Gün 0 enjeksiyonda tümör büyüklügü, yaklasik 100-200 mm idi. Sekil 25, Gün 0,da Vehikül (Tampon); trastuzumab-SMCC-DMl 10 mg/kg; tiyo trastuzumab (A121C)- SMCC-DMI 21 mg/kg ve tiyo trastuzumab (A121C)-SMCC-DM1 10 mg/kg ile birlikte tek bir doz uygulamasindan sonra, MMTV-HER2 F05 memeli tümör allogreftli atimik çiplak farelerde 21 gün içindetümör hacminde meydana gelen ortalama degisimi göstermektedir. Numune Doz Ti PR CR Vehikül (PBS tampon) - 10/ 10 0/10 0/ 10 trastuzumab-SMCC-DMI Beher kg fare basina 10 10/ 10 7/10 0/10 3.4 DMl/Ab mg Ab (490 tig/m2 DMl) tiyo-trastuzumab (Al2lC)- Beher kg fare basina 21 8/10 6/10 4/10 BMPEO-DMI 1.6 mg Ab (496 lig/m2DMl/Ab DMl)tiyo-trastuzumab (A121C)- Beher kg fare basina 10 10/ 10 0/ 10 0/ 10 BMPEO-DMI 1.6 mg Ab (236 ug/m2DMl/Ab DMl) Sekil 25"den, konjugalarin her birinin tümör büyümesini geciktirme konusunda plaseboya (Vehikül) kiyasla 'önemli bir etki yaptigi anlasilabilmektedir. Yukarida belirtilen dört grup içindeki on farenin her birine, gün 1°de tek bir enjeksiyon yapildi. Ana trastuzumab- SMCC-DMI konjugasi, sistein degistirilmis tiyo-trastuzumab (A121C)-BMPEO-DM1 konjugasindan (1,6 DMl/Ab) iki katindan184daha fazla (3,4 DMl/Ab) sayida ilaç moiyetesiyle yüklendi. Dolayisiyla, DMl"in etkin miktari, ana trastuzuinab-SMCC-DMI ile daha yüksek doz (21 mg Ab) tiyo-trastuzuinab (A121C)-BMPEO- DMl arasinda yaklasik olarak esitti. Bu iki numune, en yüksek kuvveti gösterdiler. Enjeksiyondan 14 gün sonra, bu konjugalari alan hayvanlarin çogunda kismi veya tam remisyon gözlemlendi. Daha düsük doz tiyo-trastuzumab (A121C)-BMPEO-DM1 numunesinin daha düsük etkinligi, tedaviye bir DMl doz-baglantili cevap alindigini teyit etti. Tiyo-Trastuzuinab-DMI, kontrol trastuzumab-SMCC-DMI konjugasina esdeger antikor (10 mg/kg) ya da DM] ilaç (21 mg/kg) miktarinda dozlandi. Sekil 25"den görülebildigi gibi, Tiyo-BMPEO- DM] (21 mg/kg), tedaviye trastuzumab-SMCC-DM] grubundan biraz daha iyi bir cevap verdi, çünkü Thiomab-DMI tedavisinde hayvanlarin bazilari tedaviye tam cevap verirken, trastuzumab- SMCC-DMI tedavisinde sadece tek bir hayvandan kismi bir cevapalinabildi.ANTIKOR-ILAC KONJUGATLARININ UYGULANMASIBu bulusa konu olan antikor-ilaç kon jugatlari (ADC), tedavi edilecek duruma uygun herhangi bir yolla uygulanabilir. ADC normalde parenteral olarak, yani infûzyon yoluyla, subkutan yolla,intramüsküler yolla, intravenöz yolla, intradermal yolla, intratekalyolla ve epidural yolla uygulanacaktir.FARMAOTIK FORMULASYONLARBu bulusa konu olan terapötik antikor-ilaç konjugatlarinin (ADC)185farmasötik formülasyonlari normalde farmasötik açidan kabul edilebilir bir parenteral vehikülle ve bir enjeksiyonluk birim dozaj formu halinde parenteral uygulama, yani bolus, intravenöz, intratümör enjeksiyon için hazirlanir. Istenen saflik derecesine sahip bir antikor- ilaç konjugati (ADC) istege göre bir liyofilize formülasyon ya da bir aköz çözelti formunda, farmasötik açidan kabul edilebilir seyrelticiler, tasiyicilar, yardimci maddeler ya da stabilizörlerle karistirilir (Remington's Pharmaceutical Sciences (1980) 16. edisyon, 0501, A.Ed.).Kabul edilebilir seyrelticiler, tasiyicilar, yardimci maddeler ve stabilizörler, uygulandiklari dozajlarda ve konsantrasyonlarda alicilar için toksik degillerdir ve asagida sayilaiilari kapsarlar: fosfat, sitrat ve baska organik asitler gibi tamponlar; askorbik asit ve metionin de dahil antioksidanlar; koruyucular (örnegin oktadesildimetilbenzil amonyum klorür; heksametonyuin klorür; benzalkonyum klorür, benzetonyum klorür; fenol, bütil ya da benzil alkol; alkil parabenler, örnegin metil ya da propil paraben; katekol; resorkinol; sikloheksanol; 3-pentanol ve m-kresol); düsük molekül agirlikli (yaklasik 10 artiktan az) polipeptidler; proteinler, örnegin serum albumini, jelatin ya da immünoglobulinler; hidrofilik polimerler, örnegin polivinilpirrolidon; amino asitler, örnegin glisin, glutamin, asparajin, histidin, arginin ya da lizin; monosakkaritler, disakkaritler ve glukoz, mannoz ya da dekstrinler de dahil baska karbonhidratlar; EDTA gibi selatlama ajanlari; sukroz, mannitol, trehaloz ya da sorbitol gibi sekerler; tuz- olusturucu karsit-iyonlar, örnegin sodyum; metal kompleksleri (örnegin, Zn-protein kompleksleri) ve/Veya non-iyonik yüzey-aktifmaddeler, örnegin TWEENTM, PLURONICS"M ya da polietilen glikol186(PEG). Örnegin, liyofilize anti-ErbBZ antikor formülasyonlari, WO 97/04801 numarali dokümanda tarif edilmektedir.Etkin farmasötik bilesenler, örnegin koaservasyon teknikleriyle ya da arayüzey polimerizasyonu yoluyla hazirlanaii mikrokapsüller içine, örnegin sirasiyla hidroksimetilselüloz ya da jelatin-mikrokapsüller ve poli(meti1metasilat) mikrokaps'ûller içinde ya da kolloidal ilaç tasima sistemleri (örnegin lipozomlar, albümin mikrosferleri, mikroemülsiyonlar, nanopartiküller ve nanokapsüller) içinde ya da makroemülsiyonlar içine de hapsedilebilir. Bu teknikler "Remington's Pharmaceutical Sciences 16. edisyon, Osol, A. Ed. (1980)"referansinda tarif edilmektedir.Sürekli-salimli preparatlar hazirlanabilir. Sürekli-salimli preparatlara verilebilecek uygun örnekler arasinda, ADC içeren kati hidrofobik polimerlerin yari-geçirgen matrisleri sayilabilir; bu matrisler, sekillendirilmis maddeler formunda, 'Örnegin film ya da mikrokapsül formunda bulunurlar. Sürekli-salimli matrislere Örnek olarak polyesterler, hidrojeller [örnegin poli(2-hidroksietil-metakrilat) ya da poli(vinilalk01)], polilaktidler (3773919 sayili ABD Patenti), L- glutamik asit ve gamma-etil-L-glutamat kopolimerleri, bozuiidurulamayan etilen-Vinil asetat, bozuiidurulabilir laktik asit- glikolik asit kopolimerleri [örnegin, LUPRON DEPOTTM (laktik asit- glikolik asit kopolimeri ve löprolid asetattan olusan enjekte edilebilirmikrosferler)] ve poli-D-(-)-3-hidroksibütirik asit gösterilebilir.In-Vivo uygulama için kullanilacak formülasyonlar steril olmalidir;sterilizasyon islemi, steril filtrasyon ineinbranlariyla filtrasyon yoluyla187kolaylikla gerçeklestirilir.Formülasyonlar, daha önce atif yapilan uygulama yollarina uygun formülasyonlardir. Formülasyonlar, birim dozaj formunda uygun sekilde sunulabilir ve eczacilik sektöründe iyi bilinen yöntemlerin herhangi birisiyle hazirlanabilir. Teknikler ve formülasyonlar genellikle "Remington's Pharmaceutical Sciences (Mack Publishing Co., Easton, PA)" referansinda bulunmaktadir. Bu yöntemler, etkin maddeyi bir veya daha fazla sayida yardimci madde içeren tasiyiciyla birlestirme basamagini kapsar. Genelde, formülasyonlar, etkin maddenin s1V1 tasiyicilarla ya da ince bölünmüs kati tasiyicilarla ya da her ikisiyle üniform biçimde ve iyice birlestirilmesi ve ardindan, gerekirse, ürünün sekillendirilmesi suretiyle hazirlanir.Bu bulusa konu olan aköz süspansiyonlar, aköz süspansiyonlarin üretimi için uygun yardimci maddelerle karisim halinde etkin maddeler içerir. Bu yardimci maddeler arasinda örnegin sodyum karboksimetilselüloz, kroskarmelloz, povidon, metilselüloz, hidroksipropil metilselüloz, sodyum aljinat, polivinilpirrolidon, tragakant gami ve akasya gami gibi bir süspansiyon ajani ve örnegin dogada mevcut bir fosfatid (örnegin, lesitin), bir alkilen oksidin bir yag asidiyle bir kondensasyon ürünü (örnegin, polioksietilen stearat), etilen oksidin bir uzun Zincirli alifatik alkolle bir kondensasyon ürünü (örnegin, heptadekaetilenoksisetanol), etilen oksidin bir yag asidi ve bir heksitol anhidridden türetilen bir kismi esterle bir kondeiisasyon ürünü (örnegin, polioksietilen sorbitan monooleat) gibi dispersiyon ya da islatma ajanlari vardir. Aköz süspansiyon ayrica etil veya n-propil p-hidroksi-benzoat gibi bir veya daha fazla sayida koruyucu, bir veyadaha fazla sayida renklendirici ajan, bir veya daha fazla sayida aroma188ajani ve sukroz veya sakkarin gibi bir veya daha fazla sayidatatlandirici ajan da içerebilir.ADC farmasötik bilesimleri, steril en jeksiyonluk aköz ya da oleajinöz süspansiyon gibi bir steril enjeksiyonluk preparat formunda olabilir. Bu süspansiyon, uygun dispersiyon ya da islatma ajanlari ve yukarida atif yapilan süspansiyon ajanlari kullanilarak sektörde bilinen yönteinlere göre formüle edilebilir. Steril enjeksiyonluk preparat ayrica toksik olmayan parenteral açidan kabul edilebilir seyreltici ya da çözücü içinde bir steril enjeksiyonluk çözelti ya da süspansiyon, örnegin 1,3-bütan-diol içinde bir çözelti olabilecegi gibi, bir liyofilize toz olarak da hazirlanabilir. Kullanilabilecek kabul edilebilir vehiküller ve çözücüler arasinda su, Ringer çözeltisi ve izotonik sodyum klorür çözeltisi vardir. Ek olarak, bir çözücü ya da süspansiyon vasati olarak steril sabit yaglarin kullanilmasi da uygun olabilir. Bu amaçla, sentetik mono- ya da digliseridler de dahil tadi olmayan herhangi bir sabit yag kullanilabilir. Ek olarak, benzer sekilde, enjeksiyonluk preparatlar hazirlarken oleik asit gibi yagasitleri de kullanilabilir.Bir tekli dozaj formu üretmek için tasiyici malzemeyle kombine edilebilecek etkin madde miktari, tedavi edilen konakçiya ve belirli uygulama moduna bagli olarak degisecektir. Örnegin, intravenöz infüzyon için kullanilmasi hedeflenen bir aköz çözelti, yaklasik 30 mL/saat hizda uygun bir hacimde infüzyon yapilabilmesi için çözeltinin beher mililitresinde yaklasik 3 ilâ 500 ug etkin maddeiçerebilir.189Parenteral uygulaina için uygun formülasyonlar arasinda anti- oksidanlar, tamponlar, bakteriyostatlar ve formülasyonu hedeflenen alicinin kaniyla izotonik hale getiren çözünmüs maddeler içerebilecek aköz ve aköz-olmayan steril enjeksiyon çözeltileri ve süspansiyon ajanlari ve koyulastirici ajanlar içerebilecek aköz ve aköz-olmayansteril süspansiyonlar vardir.Bagirsakta hidroliz veya denatürasyon nedeniyle protein terapötiklerinin oral uygulamasi genellikle istenmemesine ragmen, oral uygulama için uygun ADC formülasyonlari kapsül, hap veya tablet gibi, her biri önceden belirlenmis miktarda ADC içeren ayribirimler halinde hazirlanabilir.Formülasyonlar, örnegin sizdirmaz kapatilmis ampuller ve flakonlar gibi birim-doz ya da çoklu-doz kaplarinda ambalajlanabilir ve sadece kullanmadan hemen önce örnegin enjeksiyonluk su gibi steril sivi tasiyicinin ilave edilmesini gerektiren dondurularak-kurutulmus (liyofilize) kosullarda saklanabilir. Ekstamporane enjeksiyon çözeltileri ve süspansiyonlari, daha önce tarif edilen tipte steril tozlardan, granûllerden ve tabletlerden hazirlanir. Tercih edilen birim dozaj formülasyonlari, yukarida atif yapildigi gibi etkin maddenin günlük dozunu ya da birim günlük alt-dozunu ya da uygun birfraksiyonunu içerir.Bu bulus, bir veterinerlik tasiyicisiyla birlikte yukarida tanimlandigi gibi olan en az bir adet etkin bilesen içeren veterinerlik bilesimleri temin edilmesini de saglar. Veterinerlik tasiyicilari, bilesimiuygulamak amaciyla kullanilabilecek malzeinelerdir ve kullanilan190etkin bilesenle uyumlu olan ve veterinerlik sektörü genelinde kabul gören veya inert nitelikte olan kati, sivi veya gaz halindeki inaddeler olabilir. Bu veterinerlik bilesinileri parenteral veya oral yolla ya datercih edilen baska herhangi bir uygun yolla uygulanabilirler.ANTIKOR-ILAC KONJUGATI TEDAVI YÖNTEMLERI Bu bulusa konu olan antikor-ilaç konjugatlarinin (ADC) ömegin bir tümör aiitijeninin asiri-eksresyonuyla karakterize edilen Çesitli farkli hastaliklari ya da bozukluklari tedavi etmek için kullanilabilmesi tasarlanmaktadir. Bu duruinlara ya da hiperproliferatif bozukluklara örnek olarak benign ya da malign tümörler; lösemi ve lenfoid nialignensiler gösterilebilir. Digerleri arasinda da, nöronal, gliyal, astrosital, hipotalamik, glandular, inakrofajal, epitelyal, stromal, blastokoelik, enflamatuvar, anjiyojenik ve otoimmün dahilimmünolojik bozukluklar bulunur.Hayvan modellerinde ve hücre bazli eseylerde tanimlanan ADC bilesikleri tüinörlü yüksek primatlar ve insan klinik deneylerinde de tanimlanabilir. Insan klinik deneyleri, "Baselga ve ark. (1996) J. Clin. Oncol. 142737-744" referansinda rapor edildigi gibi, daha önce yogun anti-kanser tedavisi almis olan HERZ asiri-eksprese eden metastatik meme kanseri hastalarinda anti-HER2 moiioklonal antikoru HERCEPTIN® ürününün etkinligini test eden klinik deneylere benzer sekilde tasarlanabilir. Klinik deney, bilinen kemoterapötik ve/veya sitotoksik ajanlari kapsayan radyasyon ve/veya kemoterapi gibi bilinen terapötik rejimlerle kombinasyonlar haliiide bir ADCsninetkinligini degerlendirmek için tasarlanabilir.191Genelde, tedavi edilecek hastalik ya da bozukluk, kanser gibi bir hiperproliferatif hastaliktir. Tedavi edilecek kansere örnek olarak, bunlarla sinirli kalmaksizin, karsinom, lenfoma, blastom, sarkoina ve lösemi ya da lenfoid malignensiler gösterilebilir. Bu kanserlerin daha somut örnekleri arasinda skuam'oz hücreli kanser (örnegin, epitelyal skuamöz hücreli kanser), küçük-hücreli akciger kanseri, küçük hücreli-disi akciger kanseri, akciger adenokarsinomu ve skuamöz akciger karsinomu da dahil akciger kanseri, peritoneum kanseri, hepatoselüler kanser, gastrointestinal kanser de dahil gastrik kanser ya da mide kanseri, pankreas kanseri, glioblastom, serviks kanseri, yumurtalik kanseri, karaciger kanseri, mesane kanseri, hepatom, meme kanseri, kolon kanseri, rektal kanser, colorektal kanser, endometrium ya da uterin karsinomu, tükürük bezi karsinomu, böbrek kanseri ya da renal kanser, prostat kanseri, vulva kanseri, tiroid kanseri, hepatik karsinom, anal karsinom, penil karsinom ve bas veboyun kanseri sayilabilir.Kanser, HER2-eksprese eden hücreler içerebilir ve böylece, bu bulusa konu olan ADC, kaiiser hücrelerine baglanabilir. Kanserde ERbBZ ekspresyonunu tayin etmek için çesitli farkli diyagnostik/prognostik eseyler mevcuttur. Bu bulusun bir yapisinda, ErbBZ asiri-ekspresyonu, örnegin HERCEPTEST (Dako) kullanilarak IHCsyle analiz edilebilir. Bir tümör biyopsisinden alman parafine gömülü doku kesitleri, IHC eseyine tâbi tutulabilir ve asagida gösterilen ErbB2 proteini boyama yogunlugu kriterleri esasinda puanlandirilabilirler: Skor 0: Herhangi bir boyaiima gözlemlenmez ya da sadece tümör hücrelerinin %10"undan azinda membranlarda boyanma gözlemlenir; Skor l+:Tümör hücrelerinin %10°undan fazlasinda membranlarda soluk/zor192algilanabilir boyanina tespit edilir, hücre meinbranlari sadece kismen boyanmis haldedirler; Skor 2+: Tümör hücrelerinin %10"undan fazlasinda zayif ilâ orta seviyede tam membran boyanmasi gözlemlenir; Skor 3+: Tümör hücrelerinin %losundan fazlasinda orta ilâ kuvvetli seviyede tam membran boyanmasi gözlemlenir. ErbBZ asiri ekspresyon degerlendirmesi bakimindan 0 veya l+ skorlarina atanan tümörler, ErbB2"yi asiri eksprese etmeyen tümörler olarak karakterize edilirken, 2+ veya 3+ skorlarina atanan tümörler, ErbB2°yiasiri eksprese eden tümörler olarak karakterize edilebilirler.Alternatif veya ek olarak, tümördeki ErbB2 asiri ekspresyonunun boyutlarini (varsa) belirlemek için, formalinde fikse edilip parafine gömülmüs tümör dokusunda, INF ORM® (Ventana Co., Arizona) veyaPATHVISION® (Vysis, III.) gibi FISH eseyleri gerçeklestirilebilir.ADC bilesiklerinin tedavide kullanilabilecegi otoimmün hastaliklar arasinda asagida sayilanlar vardir: romatolojik bozukluklar (örnegin, romatoid artrit, S jögren sendromu, skleroderma, SLE ve lupus nefritis gibi lupus, polimiyozit/dermatomiyozit, kriyoglobulinemi, anti- fosfolipid antikor sendromu ve psöriatik artrit), osteoartrit, otoimmün gastrointestinal bozukluklar ve karaciger bozukluklari (örnegin, iiiflamatuar bagirsak hastaliklari (örnegin ülseratif kolit ve Crohn hastaligi), otoimmün gastrit ve pernisiyöz anemi, otoimmün hepatit, primer biliyer siroz, primer sklerozan kolanjit ve çölyak hastaligi), vaskülit (örnegin Churg-Strauss vasküliti, Wegener granülomatözü ve poliarterit dahil ANCA-iliskili vaskülit gibi), otoimmün nörolojik bozukluklar (örnegin multipl skleroz, opsoklonus myoklonussendromu, myastenia gravis, nöroiniyelitis optika, Parkinson hastaligi,193Alzheimer hastaligi ve otoimmün polinöropatiler), renal bozukluklar (Örnegin glomerülonefrit, Goodpasture sendromu ve Berger hastaligi), otoimmün dermatolojik bozukluklar (örnegin psöriyazis, ürtiker, kurdesen, pemfigus vulgaris, büllöz pemfigoid ve kutanöz lupus eritematozus), hematolojik bozukluklar (örnegin trombositopenik purpura, trombotik trombositopenik purpura, post-transfüzyon purpurasi ve otoimmün hemolitik anemi gibi), ateroskleroz, üveit, otoimmün isitme hastaliklari (örnegin iç kulak hastaligi ve isitme kaybi gibi), Behçet hastaligi, Raynaud sendromu, organ transplanti ve otoimmün endokrin bozukluklari (örnegin insülin-bagimli diabetes mellitus (IDDM), Addison hastaligi ve otoimmün tiroid hastaligi (örnegin Graves hastaligi ve tiroidit) dahil diyabet baglantili otoimmün hastaliklari). Daha çok tercih edilen hastaliklar arasinda, örnegin roinatoid artrit, ülseratif kolit, ANCA-iliskili vaskülit, lupus, multipl skleroz, Sjögren sendromu, Graves hastaligi, IDDM,pernisiyöz anemi, tiroidit ve glomerülonefrit sayilabilir.Hastaligin önlenmesi ya da tedavisi için, bir ADC°nin uygun dozaji, yukarida açiklanan tedavi edilecek hastaligin tipine, hastaligin siddetine ve seyrine, molekülün önleyici amaçlarla mi, yoksa terapötik amaçlarla mi uygulandiginda, 'önceden uygulanan tedaviye, hastanin klinik hikayesine ve antikora cevaba ve tedaviyi yapan doktorun kararina bagli olacaktir. Molekülün hastaya bir defada ya da bir dizi tedavi boyunca uygulanmasi uygundur. Hastaligin tipine ve siddetine bagli olarak, yaklasik 1 tig/kg ilâ 15 mg/kg (örnegin 0,1 - 20 mg/kg) molekül, örnegin bir veya daha fazla sayida ayri uygulama yoluyla ya da kesintisiz infüzyon yoluyla hastaya uygulamak için ilk adaydozajdir. Bir tipik dozaj rejimi, wkarida atif yapilan faktörlere bagli194olarak yaklasik l ug/kg ilâ 100 mg/kg ya da daha fazla olabilir. Bir hastaya uygulanacak bir 'Örnek ADC dozaji, yaklasik 0,1 ile yaklasik mg/kg hasta agirligi araligindadir.Tedavi edilen duruma bagli olarak birkaç gün ya da daha uzun bir süre boyunca yinelenen uygulamalar için, tedavi, hastalik semptomlarinin istenen supresyonu saglanana kadar sürdürülür. Bir örnek dozaj rejimi, anti-ErbB2 antikorunun yaklasik 4 mg/kg baslangiç yükleme dozunu ve ardindan, haftada bir yaklasik 2 mg/kg idame dozunu uygulamayi kapsar. Baska dozaj rejimleri de kullanilabilir. Bu tedavinin seyrigeleneksel tekniklerle ve eseylerle kolaklikla izlenir.KOMBINASYON TEDAVISIBu bulusa konu olan bir antikor-ilaç konjugati (ADC), bir farmasötik kombinasyon formülasyonunda ya da kombinasyon tedavisi olarak dozlaina rejiminde anti-kanser özelliklerine sahip bir ikinci bilesikle kombine edilebilir. Farmasötik kombinasyon formülasyonu ya da dozlaina rejiminin ikinci bilesigi tercihen birbirlerini advers etkileineyecek sekilde koinbinasyonun ADC°sini tamamlayiciaktivitelere sahiptir.Ikinci bilesik, bir kemoterapötik ajan, sitotoksik ajan, sitokin, büyüme inhibitörü ajani, anti-hormonal ajan ve/veya kardiyoprotektan olabilir. Bu moleküllerin hedeflenen amaç için etkin ve etkili miktarlarda kombinasyon halinde mevcut olmasi uygundur. Bu bulusa konu olan bir ADC içeren bir farmas'otik bilesim, bir tubulin-olusturucu inhibitör, bir topoizomeraz inhibitörü ya da bir DNA baglayici gibi bir195kemoterapötik ajani da terapötik açidan etkin ve ekili miktarda daiçerebilir.Bu bulusa göre tanimlanan bir antikanser ajaniyla kombinasyon halinde baska terap'otik rejiinler de uygulanabilir. Kombinasyon tedavisi bir eszamanli ya da sirali rejim olarak uygulanabilir. Sirayla uygulandiginda, kombinasyon, iki veya daha fazla uygulama haliiide uygulanabilir. Kombine uygulama, ayri formülasyonlar ya da tekli farmasötik formülasyon kullanilarak yapilan es-uygulamayi ve tercihen etkin maddelerin her ikisinin (ya da hepsinin) biyolojik etkinliklerini eszamanli gösterecekleri bir sürenin mevcut oldugu herhangi bir sirasiyla yapilan ardisik uygulamayi kapsar.Bu bulusun bir yapisinda, bir ADC°yle tedavi, farkli kemoterapötik ajanlarin kokteyllerinin es zainanli uygulainasi da dahil, burada tanimlanan bir antikanser ajaiii ile bir veya daha fazla sayida kemoterapötik ajanin ya da büyüme inhibitörü ajaninin kombine uygulamasini kapsar. Kemoterapötik ajanlar arasinda taksanlar (örnegin, paklitaksel ve dosetaksel) ve/veya antrasiklin antibiyotikleri vardir. Bu kemoterapötik ajanlarin hazirlama prosedürü ve dozlaiiia programlari, üretici talimatlarina göre ya da bilgi ve beceri sahibi doktorlar tarafindan ampirik olarak tayin edildigi gibi kullanilabilir. Bu kemoterapi için hazirlama prosedürleri ve dozlama programlari ayrica "Cheinotherapy Service Ed., M.C. Perry, Williams & Wilkins, Baltimore, Md. (1992)" referansinda da tarif edilmektedir.ADC, bir anti-hormonal bilesikle; örnegin tamoksifeii gibi bir anti- östrojen bilesigiyle; onapristoii gibi bir anti-progesteronla (EP616812) ya da flutaniid gibi bir anti-androjenle, bu moleküller için196bilinen dozajlarda kombine edilebilir. Tedavi edilecek kanserin horinondan bagimsiz kanser oldugu duruinlarda, hasta önceden anti- hormonal tedaviye tâbi tutulmus olabilir ve kanser hormondan bagimsiz olmaya basladiktan sonra, hastaya ADC (ve istege göre, burada açiklanan baska ajanlar) uygulanabilir. Hastaya, (tedaviyle iliskili miyokardial disfonksiyonu `Önleme ya da azaltmak için) bir kardiyoprotektan ya da bir veya daha fazla sayida sitokini es- uygulama da faydali olabilir. Yukarida açiklanan terap'otik rejimlere ek olarak, hasta, kanser hücrelerinin cerrahi prosedürle çikartilmasiislemine ve/veya radyasyon tedavisine de tâbi tutulabilir.Yukarida es-uygulanan ajanlarin herhangi birisi için uygun dozajlar, günümüzde halihazirda kullanilmakta olan dozajlardir ve yeiii tanimlanan ajan ve baska kemoterapötik ajanlar ya da tedavilerinkombine etkinliginden (Sinerji) dolayi düsürülebilir.Koinbinasyon tedavisi "Sinerji" saglayabilir ve "sinerjistik" etkinin, yani etkin maddeler birlikte kullanildiginda elde edilen etkinin bilesiklerin ayri olarak kullanilmasindan kaynaklanan etkilerin toplamindan büyük oldugunu kanitlayabilir. Etkin maddeler (1) bir kombine, birim dozaj formülasyonunda birlikte formüle edildiginde ve eszamanli olarak uygulandiginda ya da verildiginde; (2) ayri formülasyonlar halinde dönüsümlü veya paralel olarak uygulandiginda veya (3) baska herhangi bir re jimle uygulandiginda bir sinerjistik etki elde edilebilir. Dönüsümlü tedavi olarak uygulandiginda, bilesikler sirayla, 'Örnegin ayri siringalarda farkli enjeksiyonlar halinde uygulandiginda ya da verildiginde bir sinerjistik etki elde edilebilir.Genelde, dönüsümlü tedavi sirasinda, her bir etkin maddenin etkin ve197etkili bir dozaji sirayla, yani seri olarak uygulanir; kombinasyon tedavisinde ise iki veya daha fazla etkin maddenin etkin ve etkilidozajlari birlikte uygulanir.ANTIKOR-ILAC KONJUGALARININ METABOLITLERIBu ürünler teknigin bilinen durumuna göre apaçik olmadiklari ve yeni ürünler olduklari sürece, burada tanimlanan ADC bilesiklerinin in vivo metabolik ürünleri de bu bulusun kapsami içine girmektedir. Bu ürünler örnegin verilen bilesigin oksidasyonu, redüksiyonu, hidrolizi, amidasyonu, esterifikasyonu, enzimatik klevaji ve benzeri proseslerden kaynaklanabilir. Dolayisiyla, bu bulus, bu bulusa konu olan bir bilesigin bir metabolik ürün vermek için yeterli bir süre boyunca bir memeli ile temas ettirilinesinden olusan bir prosesleüretilen ve apaçik olinayan yeni bilesikleri de kapsar.Metabolit ürünleri, normalde, bir radyoaktif isaretli (örnegin, "C veya 3 H) ADC"nin hazirlanmasi ve bunun metabolizasyonun gerçeklesmesi için yeterli bir süre (normalde yaklasik 30 saniye ile 30 saat arasinda bir süre) birakilmak suretiyle siçan, fare, hint domuzu, maymun veya insan gibi bir hayvana algilanabilir bir dozda (ömegin, yaklasik 0,5 mg/kg°dan fazla) parenteral yoldan verilmesi ve onun dönüsüm ürünlerinin idrar, kan veya diger biyolojik örneklerden izole edilmesi yoluyla hazirlanmak suretiyle tanimlanirlar. Bu ürünler, isaretli olduklari için kolaylikla izole edilirler (digerleri, metabolitin içinde varligini sürdüren epitoplari baglama kabiliyetine sahip antikorlar kullanilmak suretiyle izole edilirler). Metabolit yapilari,geleneksel tarzda, örnegin MS, LC/MS veya NMR analiziyle198belirlenirler. Genelde, inetabolitlerin analizi, teknikte uzman kisilerin iyi bildikleri geleneksel ilaç metabolizma çalismalariyla ayni sekilde ve tarzda yapilir. Baska bir yolla ve in vivo ortamda bulunmadiklari sürece dönüsüm ürünleri, bu bulusa konu olan ADC bilesiklerininterap'otik dozlamasi için yapilan diyagnostik eseylerde faydali olurlar.ISARETLI ANTIKOR GORUNTULEME YÖNTEMLERI Bu bulusun baska bir yapisinda, sistein degistirilinis antikorlar, sistein tiyol kullanilarak, radyonüklidlerle, flüoresan boyalariyla, biyoluminesans-tetikleyici sübstrat moieyeteleriyle, kimyasal luminesans-tetikleyici sübstrat moiyeteleriyle, enzimlerle ve diyagnostik, farniakodinamik ve terapötik uygulamalarla yapilan görünteleine deneyleri için baska belirleme etiketleriyle isaretlenebilirler. Genelde, isaretlenmis sistein degistirilmis antikor, yani "biyomarker" veya "prob", Örnegin insan, kemirgen veya baska küçük hayvanlar gibi bir canli organizmaya, bir disinlanmis organa veya doku numunesine enjeksiyon, perfüzyon ya da oral injestiyon yoluyla verilir. Probun dagilimi belirli bir zaman süreci içerisindetespit edilir ve bir görüntüyle gösterilir.ARAÇ VE GERECLERBu bulusun baska bir yapisinda, yukarida tanimlanan hastaliklarin tedavisi için faydali olan malzemeler içeren bir araç gereç veya "kit" tanitilmaktadir. Araç gereç, bir kaptan ve kabin üzerinde veya kapla baglantili bir etiketten veya bir prospektüsten olusur. Uygun kaplararasinda Örnegin siseler, flakonlar, siringalar, blister plakasi, Vb.°nden199söz edilebilir. Kaplar, cam veya plastik gibi çesitli farkli malzemelerden üretilebilir. Kabin içinde, hastaligin tedavisi için etkili bir antikor-ilaç konjugasi (ADC) bilesimi vardir ve kabin bir steril erisim portu bulunabilir (örnegin, kap, bir hipoderinik enjeksiyon ignesiyle delinebilen bir tipasi bulunan bir intravenöz çözelti torbasi veya bir flakon olabilir). Bilesikteki etken maddelerden en az bir tanesi bir ADC"dir. Etikette veya prospektüste, bilesimin kanser gibi seçilecek belirli bir hastaligin tedavisi için kullanildigi belirtilir. Alternatif olarak ya da ek olarak, araç gereç, ayrica, bakteriyostatik en jeksiyonluk su (BWFI), fosfat-tamponlu salin, Ringer's çözeltisi ve dekstroz çözeltisi gibi farmasötik olarak kabul edilebilir bir tampon içeren ikinci (veya üçüncü) bir kabi da içerebilir. Baska tamponlar, seyrelticiler, filtreler, igneler ve siringalar da dahil olmak üzere ticari açidan ve kullanici açisindan arzu edilebilecek baska malzemelere deiçerebilir.ÖRNEKLERÖrnek 1 - Biyotinlenmis ThioFab Faiin HazirlanmasiThioFab-faji (5 x 1012 faj partikülleri), 150 kati fazla biyotin-PEO- maleiinid ((+)-biotinil-3-maleimidopropiyonamidil-3,6- dioksaoktainediamin (Oda ve ark (2001) Nature Biotechnology 192379-382, Pierce Biotechnology, Inc.) ile oda sicakliginda 3 saat süreyle reaksiyona sokulmustur. Fazla biyotin-PEO-maleimid, biyotin-konjuge fajdan tekrarlainali PEG çökeltmeleriyle (3-4 kere) çikartilmistir. Biyotin-BMCC, PEO-Iodoacetyl Biotin, Iyodoasetil- LC-Biyotin ve Biyotin-HPDP (Pierce Biotechnology, Inc.) ve Na-(3- ina]simidilpropiyonil)biositin (MFB, Molecular Probes, Eugene, OR) 200de dahil olmak üzere, sistein tiyol gruplariyla reaktif olan elektrofilik gruplar içeren ve ticari piyasada bulunan baska biyotinlestirme reaktifleri de kullanilabilir. Biyotinlestirme, bifonksiyonel ve multifonksiyonel baglayici reaktifleri için kullanilabilecek diger ticari kaynaklar arasinda Molecular Probes, Eugene, OR ve Sigma, St.Louis, MO'dan söz edilebilir. 0mk.."Biyotin-PEO-maleîmidOrnek 2 - PHESELECTOR EseviBOVin seruin albümin (BSA), erbBZ ekstraselüler domain (HER2) ve streptavidin (100 pl 2 ug/ml), Maxisorp 96 kuyucuklu plakalara ayri ayri kaplanmislardir. %O,5 Tween-20 (PBS içinde) ile bloke edildikten sonra, biyotinlenmis ve biyotinlenmemis hu4D5Fabv8-ThioFab-Faji (2x10'0 faj partikülleri), önce oda sicakliginda 1 saat süreyle inki'ibe edilmisler ve ardindan, bayirturbu peroksidazi (HRP) etiketli sekonder antikorla (anti-M 13 faj kaplama proteini, pVIII protein antikoru) inkübasyona tâbi tutulmuslardir. Sekil 8, Fab"in veya ThioFab"in HERZ'ye (üst) ve biyotinlenmis ThioFab°in streptavidina (alt) baglanmasini tanimlayan sematik bir gösterimle PHESELECTOREseyini göstermektedir.Standart HRP reaksiyonu gerçeklestirilmis ve 450 nm"de absorbansölçülmüstür. Tiyol reaktivitesi, streptavidin için OD450 ile HER2 için201OD450 arasindaki oran hesaplanmak suretiyle ölçülmüstûr. Tiyol reaktivitesi degerinin 1 olmasi, sistein tiyolun tam ve eksiksiz biyotinlendigini gösterir. Fab protein baglanma ölçümlerinde, hu4D5FabV8 (2-20 ng) kullanilmis ve ardindan, HRP etiketli keçipoliklonal anti-Fab antikorlariyla inkübasyon gerçeklestirilmistir,Ornek 3a - Thi0Fab°larin Ekspresvonu ve SaflastirilmasiThioFab"lar, bir non-supresör E. Coli susu olan 34B8°de indüksiyondan sonra eksprese edilmislerdir (Baca ve ark (1997) Journal Biological Chemistry 272(16)210678-84). Kültür hücresi peleti, PBS (fosfat tamponlu salin) içinde yeniden süspanse edilmis; bir mikro-akiskanlistirici içinden geçirilerek toplam hücre lizisi gerçeklestirilmis ve ThioFabdar, afinite kromatografisi yoluyla protein G SEPHAROSETM (Amershain) ile saflastirilmislardir.ThioFab°lar L-VlSC, L-VllOC, H-A88C ve H-A121C, Protein-G SEPHAROSETM kolon kromatografisiyle eksprese edilmis ve saflastirilmislardir. Oligomerik-Fab, 26 ilâ 30 fraksiyonlarin içinde mevcuttu ve monomerik formun çogunlugu 3 1-34 fraksiyonlarindaydi. Monomerik formu olusturan fraksiyonlar, yabani tip hu4D5FabV8 ile birlikte SDS-PAGE ile havuzlanmis ve analiz edilmislerdir ve indirgen olan (DTT veya BME ile) ve indirgen olmayan (DTT veya BME°siz) kosullar altinda SDS-PAGE jelinde analiz edilmislerdir. AlZlC-ThioFab jel filtraspon fraksiyonlari, indirgen olmayan SDS-PAGE'de analiz edilmislerdir.202ThioFab°lar, yukarida açiklandigi gibi biyotin-PEO-maleimid ile konjuge edilmislerdir ve Biyotinlenmis-ThioFab"lar, SuperdeX-200TM (Amersham) jel filtrasyon kromatografisiyle ek olarak saflastirilmislardir ve bu islem, serbest biyotin-PEO-maleimidi ve ThioFab"larin oligoinerik fraksiyonunu elimine etmistir. Yabani tip hu4D5FabV8 ve hu4D5Fabv8 AlZlC-ThioFabsin (miktar olarak 0,5) her biri, oda sicakliginda 3 saat süreyle 100 kati molar fazla biyotin- PEO-maleimid ile ayrica inkübe edilmis ve hem serbest biyotini hem de oligomerik Fablari monomerik formdan ayirmak için bir Superdex-200 jel filtrasyon kolonuna yüklenmistir.Ornek 3b - ThioFabHarin AnaliziBiyotinlenmis hu4D5FabV8 (AlZlC) ThioFab ve Yabani tip hu4D5FabV8"in enzimatik dijest fragmanlari, sivi kromatografi elektrosprey iyonizasyon kütle spektroskopisiyle (LS-ESI-MS) analiz edildiler. Biyotinlenmis hu4D5FabV8 (AlZlC)°1n 482945 primer kütlesi ile yabani tip hu4D5Fabv8sin 47737,0 primer kütlesi arasindaki fark 557,5 kütle birimiydi. Bu fragman, bir tek biyotin- PEO-maleimid moieyetesinin (C23H36N5O782) mevcudiyetini göstermektedir. Tablo 4, fragmantasyon degerlerinin dagiliminigöstermekte ve bu da sekansi teyit etmektedir.Tablo 4. Triptik siiidiriinden sonra biyotinlenmis hu4D5Fabv8 ThioFab A121C"nin LC-ESI-Kütle spektruin analizi 203 Amino asitb Fragmaniy Fragmani A (Alanin) 72M (Metiyonin) 203 2505 D (Aspartik asiü) 318 2374 Y (Tirosin) 481 2259 W (Triptofan) 667 2096 G (Glisin) 724 1910 Q (glutamin) 852 1853 G (Glisin) 909 1725 T (Treonin) 1010 1668 L (Lösin) 1 123 1567 V (Valin) 1222 1454 T (Treonin) 1323 1355 V (Valin) 1422 1254 S (Serin) 1509 1155 S (Serin) 1596 1068 C (Sistein) + 2242 981 biyotinS (Serin) 2329 335 T (Treonin) 2430 248 K (Lisin) 175 204Superdex-ZOO jel filtrasyonundan önce ve sonra, biyotinlenmis ABP- hu4D5FabV8-Al2lC, biyotinlenmis ABP- hu4D5FabV8-V110C, biyotinlenmis çift Cys ABP-hu4D5FabV8-(VllOC-A88C) ve biyotinlenmis çift Cys ABP-hu4D5FabV8-(VllOC-AlZlCYnin DTT veya BME,le ya da DTT veya BME°siz SDS-PAGE jel analizleri yapildi.hu4D5FabV8-(V 1 10C)-BMPEO-DMl "nin (Superdex-ZOO jel filtrasyon saflastirmasindan sonra) kütle spektroskopisi analizi (MS/MS): Fab+l 516075, Fab 505155. Bu veriler, %91,2 oraninda konjugasyon oldugunu göstermektedir. hu4D5FabV8-(V110C)- BMPEO-DM]°nin (indirgenmis) MS/MS analizi: LC 234472, LC+1 245373, HC (Fab) 270725. Bu veriler, tüm DMI konjugasyonununFab hafif zinciri üzerinde gerçeklestigini göstermektedir.Ornek 4 - ABP-hu4D5Fabv8-(V110C) ve MC-MMAE Koniugasvonu Yoluyla ABP-hu4D5FabV8-(V110C)-MC- MMAE9nin HazirlanmasiIlaç baglayici reaktifi, maleimidokaproil-monometil auristatin E (MMAE), yani MC-MMAE, DMSO içinde çözündürülür; asetonitril ve su içinde bilinen bir konsantrasyonda seyreltilir ve fosfat tamponlu salin (PBS) içinde sogutulmus ABP-hu4D5FabV8-(Vl lOC) ThioFab"a ilave edilir. Yaklasik bir saat sonra, reaksiyonu sönümlendirmek ve reaksiyona girmemis antikor tiyol gruplarini örtmek ve saklamak için bir maleimid fazlasi ilave edilir. Reaksiyon karisimi santrifüjal ultrafiltrasyon yoluyla konsantre edilir ve ABP-hu4D5FabV8- (V1 10C)-MC-MMAE, PBS içinde G25 reçineden geçirilerek elüsyon205yoluyla saflastirilir ve tuzdan arindirilir; steril kosullar altinda 0,2 um filtrelerden geçirilerek filtrelenir ve depolama ve saklama içindondurulur.Ornek 5 - ABP-hu4D5FabV8-(V110C) ve MC-MMAF` Kon jugasvonu yoluyla ABP-hu4D5FabV8-(V110C)-MC- MMAF"nin Hazirlanmasi ABP-hu4D5FabV8-(VllOC)-MC-MMAF, Ornek 4"de tanimlanan prosedür izlenerek ABP-hu4D5FabV8-(V110C) ThioFab ve MC- MMAF kon ju gasyonu yoluyla hazirlanir.Örnek 6 - ABP-AlZlC-ThioFab ve MC-val-cit-PAB-MMAE Koniugasvonu voluvla ABP-A121C-ThioFab-MC-val-cit-PAB- MMAE9nin Hazirlanmasi ABP-hu4D5FabV8-(A121C)-MC-val-cit-PAB-MMAE, Ornek 4"de tanimlanan prosedür izlenerek ABP-hu4D5FabV8-(A121C) ve MC- val-cit-PAB-MMAE konjugasyonu yoluyla hazirlanir.Örnek 7 - ABP-AlZlC-ThioFab ve MC-val-cit-PAB-MMAF Koniugasvonu yoluyla ABP-A121C-ThioFab-MC-val-cit-PAB- MMAF5nin Hazirlanmasi ABP-hu4D5FabV8-(A121C)-MC-val-cit-PAB-MMAF, Ornek 4"de tanimlanan prosedür izlenerek ABP-hu4D5Fabv8-(A121C) ve MC- Val-cit-PAB-MMAF kon jugasyonu yoluyla hazirlanir. 206MCwaI-cil-PAB vMMAFÖrnek 8 - hu4D5Fabv8-(V110C) ThioFab-BMPEO-DMPnin Hazirlanmasihu4D5FabV8-(V110C) ThioFab°da serbest sistein, bis-maleimido reaktifi BM(PEO)4 (Pierce Chemical) ile modifiye edilmis ve antikorun yüzeyinde reaksiyona ugramamis bir maleimido grubu birakmisti. Bu, bir %50 etanol/su karisimi içerisinde BM(PEO)4, 10 mM konsantrasyonuna kadar çözündürülmek ve yaklasik olarak 1,6 mg/ml (10 mikromolar) konsantrasyonda fosfat tamponlu salin içinde hu4D5FabV8-(V110C) ThioFab içeren bir çözeltiye on kati molar fazla BM(PEO)4 ilave edilmek ve 1 saat süreyle reaksiyona birakilmak suretiyle gerçeklestirilmistir, Fazla BM(PEO)4, 150 mM NaCl tampon ile 30 mM sitrat, pH 6 içinde jel filtrasyonuyla (HiTrap kolon, Pharmacia) çikartilmistir. hu4D5FabV8-(V110C) ThioFab- BMPEO ara ürününe, dimetil asetamid (DMA) içinde çözündürülmüs yaklasik 10 kati molar fazla DMl ilave edilmistir. Ilaç moieyete reaktifini çözündürmek için dimetilformamid (DMF) de kullanilabilir. Reaksiyona ugramamis ilaci çikartmak için, reaksiyon karisimi, jel filtrasyonundan veya PBS'ye diyalizden önce gece boyunca reaksiyona birakilmistir. Yüksek molekül agirligina sahip agregalari çikartmak ve saflastirilmis hu4D5FabV8-(V110C) ThioFab-BMPEO- DMl elde etmek amaciyla, PBS içinde 8200 kolonlari üzerinde jel207filtrasyonu yöntemi kullanilmistir.Ayni protokolle, hu4D5FabV8 (AlZlC) ThioFab-BMPEO-DMI dehazirlanmistir.Ornek 9 -In vitro hücre proliferasvon eseyi ADC°nin etkinligi, asagidaki protokol uygulanarak bir hücre proliferasyon eseyiyle ölçülmüstür (CellTiter Glo Luininiscent Cell Viability Assay, Promega Corp. Technical Bulletin T8288; Mendoza ve ark (2002) Cancer Res. 62:5485-5488):1. 96 kuyucuklu ve opak duvarli bir plakanin her kuyucuguna, vasat içinde yaklasik 104 hücre (SKBR-3, BT474, MCF7 veya MDA-MB-468) içeren bir 100 hücre kültürü alikotu konulmustur.2. Vasat içeren ve hücre içermeyen kontrol kuyucuklari da hazirlanmistir.3. Deney kuyucuklarina ADC ilave edilmis ve 3-5 gün süreyle inkübe edilmistir.4. Plakalar, yaklasik 30 dakika süreyle oda sicakligina gelene kadar dengelenmeye birakilmistir.5. Her kuyucukta mevcut hücre kültürü vasatinin hacmine esithacimde CellTiter-Glo Reaktifi ilave edilmistir.içinde 2 dakika süreyle karistirilmistir. 7. Luminesans sinyalini stabilize etmek için, plaka, Odasicakliginda 10 dakika süreyle inkübe edilmistir.2088. Luminesans kaydedilmis ve grafiklerde RLU = bagi]luminesans birimi birimiyle rapor edilmistir.Belirli bazi hücreler, kuyucuk basina 50 uL alan 96 kuyucuklu bir plaka içinde 1000-2000/kuyucuk (PC3 hatlari) ya da 2000- 3000/kuyucuk (OVCAR-3) oraninda tohumlanmislardir. Bir (PC3) ya da iki (OVCAR-3) gün sonra, "hiçbir ADC" kontrol kuyucugu tek basina vasati almayacak sekilde, 9000, 3000, 1000, 333, 111, 37, 12.4, 4.1 veya 1.4 nglmL nihai konsantrasyonlara kadar 50 uL hacimlerde ADC ilave edilmistir. Kosullar düplikat veya triplikattir. 3 (PC3) ya da 4-5 (OVCAR-3) gün sonra, 100 uL/kuyucuk oraninda Cell TiterGlo II ilave edilmis (lusiferaz-bazli esey; ATP seviyeleriyle ölçülen proliferasyon) ve hücre adedi bir luminoinetre kullanilarak tespit edilmistir. Veriler, standart sapma hata çubuklariyla, her replika seti için bir luminesans araci olarak çizilmislerdir. Protokol, CellTiter GloLuminisan Hücre Canliligi Eseyinin (Promega) bir modifikasyonudur:1. 1000 hücre/kuyucuk PC3/Mu016, PC3/neo (50 uL/kuyucuk) vasat kaplayiniz. Ovcar3 hücreleri, 2000 hücre/kuyucuk (50 uL) vasatlari içinde kaplanmalidirlar (tarifleri asagidadir). Hücreleri gece boyunca baglanmaya birakimz.2. ABC, 18 tig/ml çalisma konsantrasyonundan baslanmak suretiyle vasat içerisinde 1:3 oraninda seri olarak seyreltilir (bu da, 9 ug/ml nihai konsantrasyonla sonuçlanir). Kuyucugun içinde bulunan 50 uL hücrelere ve vasatlara 50 uL seyreltilinis ADC ilave edilir.3. 72-96 saat boyunca inkübe ediniz (standardi 72 saattir, fakathücreler %85-95 konflüent olduklarinda eseyi durdurmak için 0209ug/mL konsantrasyonu izleyiniz).4. 100 uL/kuyucuk Promega Cell Titer Glo reaktifi ilave ediniz; 3 dakika boyunca çalkalayiniz ve luminometrede okuyunuz. Vasatlar: %50/50/10FBS/glutamin içinde büyütülen PC3/ne0 ve PC3/MUC16 ve RFMI/20%FBS/glutamin içinde büyütüleii 250 ug/mL G-4180VCAR-3.Ornek 10 - Ekspresvonu yüksek HERZ transgenik eksplant faremodelinde tümör büvümesinin inhibisvonu, in vivo etkinlikTransgenik deneyler için uygun hayvanlar, Taconic (Germantown, N.Y.) gibi standart ticari kaynaklardan temin edilebilirler. Uygun olan pek çok sus vardir, fakat tümör olusumuna daha yüksek duyarliliklari sebebiyle FVB disi fareler tercih edilmektedir. Çiftlestirme için FVB erkekleri kullanilmis ve yalanci gebeligi stimüle etmek amaciyla vazektomize edilmis CD.1 damizliklari kullanilmistir. Vazektomize edilmis fareler herhangi bir ticari tedarikçiden temin edilebilirler. Kurucular, FVB farelerle ya da l29/BL6 X FVB p53 heterozigos farelerle çiftlestirilmislerdir. Tümör olusumunu potansiyel olarak artirmak amaciyla, P53 alelinde heterozigositesi bulunan fareler kullanilmistir. Ancak bunun gereksiz oldugu anlasilmistir. Bu nedenle, bazi Fl tümörleri karisik suslardir. Kurucu tümörler sadece FVB"dir. Yavrulari olmaksizin bir takim gelismekte olan tümörleri bulunan altikurucu elde edilmistir.Tümörleri bulunan hayvanlar (F05 mmtv transgenik farelerden yayilan allogreft), tek veya çoklu doz ADC"nin intravenöz (IV)enjeksiyonuyla tedavi edilmislerdir. Tümör hacmi, enjeksiyondan210sonra çesitli farkli zaman noktalarinda ölçülmüs vedegerlendirilmistir.Tümörler, HER2"nin siçan homologu olan neu"nun mutasyonal olarak aktive edilmis bir forinunu eksprese eden transgenik farelerde kolaylikla çikmaktadirlar, fakat insan meme kanserlerinde asiri eksprese edilen HER2 mutasyona ugramaz ve inutasyona ugrainamis HER2'yi asiri ekSprese eden transgenik farelerde tümör olusumu çok daha az saglamdir (Webster ve ark (1994) Semin. Cancer BioL 5:69- 76).Mutasyona ugramamis HER2 ile tümör olusumunu gelistirmek amaciyla, HER2"nin downstream özgün baslatma kodonundan translasyon baslatma sikligini aksi halde azaltacak olan bu upstream ATG kodonlarinda translasyonun baslatilmasini engellemek için bir upstream ATG°nin silindigi bir HER2 CDNA plazmidi kullanilarak transgenik fareler üretilmistir (Örnegin, Child ve ark (1999) J. Biol. Chem. 274: 24335-24341 referansina bakiniz). Ek olarak, 5' ucuna bir kimerik intron ilave edilmistir ve bu da, daha önce de rapor edildigi gibi ekspresyon seviyesini artirmalidir (Neuberger and Williams (1988) Nucleic Acids Res. 1626713; Buchman and Berg (1988) Mol. Cell. Biol. 8:4395; Brinster ve ark (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 852836). Kimerik intron, bir Promega vektörü, Pci-neo memeli ekspresyon vektöründen türetilmistir (bp 890-1022). cDNA 3'-ucu, insan büyüme hormonu eksonlari 4 ve 5 ile ve poliadenilasyon sekanslariyla yandan desteklenmistir. Ayrica, bu sus tümör olusumu ve gelisimine karsi daha duyarli oldugu için FVB fareler kullanilmistir. Meme bezinde dokuya-özgü HER2 ekspresyonunusaglamak için MMTV-LTR'den alinan promoter kullanilmistir.211Tümör olusumuna karsi duyarliligi artirmak amaciyla hayvanlar AlN 76A diyetiyle beslenmislerdir (Rao ve ark (1997) Breast Cancer Res. and Treatment 45: 149- l 58).Ornek 1 1 - Koniugasvon için ThioMablarinRedi'i ksivonu/Oksidasvonu CHO hücreleri içinde ekSprese edilmis tam-boy sistein degistirilmis monoklonal antikorlar (ThioMablar), yaklasik 50 kati fazla TCEP (tris(2-karboksietil)fosfin hidroklorûr ile 37°C sicaklikta 3 saat süreyle indirgeninislerdir; Getz ve ark (1999) Anal. Biochem Cilt 273:73-80; Soltec Ventures, Beverly, MA). Indirgenmis ThioMab (Sekil 15), 10 HM sodyum asetat, pH 5 içinde seyreltilmis ve bir HiTrap S kolonuna yüklenmistir ve 0.3M sodyum klorür içeren PBS ile ayristirilmistir. Ayristirilmis indirgenmis ThioMab, oda sicakliginda gece boyunca 200 nM aköz bakir sülfatla (CuSO4) muamele edilmistir. Çevre havasioksidasyonu da etkiliydi.Ornek 12 - ThioMablarin KoniugasvonuTiyo-trastuzumab (A121C)-BMPEO-DM1, tiyo-21-l9 (A121C)- BMPEO-DMl ve tiy0-3A5 (A121C)-BMPEO-DM1 de dahil ThioMab antikor-ilaç konjugalarini olusturmak ve konjugasyonu gerçeklestirmek amaciyla, tiyo-trastuzumab (A121C), tiyo-2H9 (A121C) ve tiy0-3A5 (A121C) de dahil, Ornek l l"in yeniden oksidize edilmis ThioMablari, bir 10 kati fazla ilaç-baglayici ara ürünü BM(PEO)4-DM1 ile kombine edilmis; karistirilmis ve Oda sicakliginda yaklasik bir saat bekletilmislerdir. Asiri ilaç-baglayici ara212ürününü ve diger safsizliklari çikartmak amaciyla, konjugasyon karisimi jel filtreleninis ya da yükleninis ve bir HiTrap S kolonundangeçirilerek ayristirilmistir.Bu bulusuii kapsami, sadece bulusun birkaç özelligini göstermeyi amaçlayan örneklerde açiklanan spesifik yapilarla sinirli degildir ve fonksiyonel olarak esdeger nitelikte olan baska yapilar da bu bulusunkapsami içindedir. 213TARIFNAME IÇERISINDE ATIF YAPILAN REFERANSLARBasvuru sahibi tarafindan atif yapilan referanslara iliskin bu liste,yalnizca okuyucunun yardimi içindir ve Avrupa Patent Belgesinin birkismini olusturmaz. Her ne kadar referanslarin derlenmesine büyükönem verilmis olsa da, hatalar veya eksiklikler engellenememektedirve EPO bu baglamda hiçbir sorumluluk kabul etmemektedir.Tarifname içerisinde atifta bulunulan patent dökümanlari:. US 4975278 A [0003] . EP 1391213 A [0003]. US 4970198 A [0004]- US 5079233 A [0004]- us 5585089 A [0004]. US 5606040 A [0004]. US 5693762 A [0004]. US 5739116 A [0004] [0207]. US 5767285 A [0004] [0207]- us 5773001 A [0004] [0207]. WO 02088172 A [0005] [0202] [0203] [0255] . US 20040018194 A [0005]. WO 04032828 A [0005] [0255]. WO 03043583 A [0005] [0255]- us 5767237 A [0005] [0203]. US 6124431 A [0005] [0203]. wo 2005081711 A [0005] [0204] . US 6248564 B [0008]. WO 2004050849 A [0009]. wo 03049704 A [0010]. wo 03060080 A [0011]. WO 9406474 A [0012]. US 4816567 A [0037] [0038]. US 5807715 A [0037]- us 20050048572 A [0040] [0119] . US 20040229310 A [0040] [0119] . US 5677171 A [0041]. wo 9525167 A [0043]. US 6399743 B [0044]- us 20030096373 A [0044]. US 5183884 A [0046]. US 5480968 A [0046]. US 480968 A [0046]. WO 9735885 A [0046]9 US 5212290 A [0086]° US 5891996 A [0086]0 WC 9850433 A [0086]o EP 659439 A2 [0086]o US 5804396 A [0087]o WO 9909016 A [0087]0 WC 9843960 A [0087]° WO 9738983 A, Wamer Lambert [0087] ° WO 9906378 A, Warner Lambert [0087] 9 WC 9906396 A, Warner Lambert [0087] 0 WC 9630347 A [0087]0 WC 9633978 A, Zeneca [0087] 0 WC 963397 A, Zeneca [0087] 0 WC 9633980 A, Zeneca [0087] 0 WC 9321319 A [0103]° WO 2004063362 A [0109]- WO 2003042661 A [0109]° US 2003134790 A1 [0109]o WO 2002102235 A [0109]° WO 2003055443 A [0109]o WO 200299122 A [0109]0 WO 2003029421 A [0109]0 WC 2003024392 A [0109]0 WC 200298358 A [0109]° WO 200254940 A [0109]o WO 200259377 A [0109]. WO 200230268 A [0109]- WO 200148204 A [0109]- WO 2004048938 A [0109]0 WC 2004032842 A [0109]0 WC 2003016475 A [0109]o WO 200278524 A [0109]0 WC 200299074 A [0109]o WO 200286443 A [0109] 214. EP 599274 A [0047] . WO 9919488 A [0047]. wo 0218444 A [0047]. US 5500362 A [0051]. us 5821337 A [0051] [0073] [0103] . wo 9316185 A [0062]. US 5571894 A [0062]- us 5587458 A [0062]. EP 404097 A [0063]. wo 9311161 A [0063]. US 6407213 B [0064]. US 5091178 A [0067]. wo 9845479 A [0079]. US 4943533 A, Mendelsohn [0086] . WO 9640210 A [0086]. WO 200292836 A [0109] . WO 200283866 A [0109] . US 2003124140 A [0109] - WO 2003101283 A [0109] . wo 2002101075 A [0109] . WO 200271928 A [0109] . WO 9410312 A [0109]. WO 2004022778 A [0109] . EP 875569 A [0109]- wo 200157188 A [0109] . WO 200175177 A [0109] . WO 2004000997 A [0109] . WO 2003003984 A [0109] . WO 200206339 A [0109] - wo 200188133 A [0109] . WO 2003054152 A [0109] . WO 2003101400 A [0109] . US 2003129192 A [0109] . US 2004044180 A [0109] - us 2004044179 A [0109] . US 2003096961 A [0109] . US 2003232056 A [0109] . WO 2003105758 A [0109] . US 2003206918 A [0109] - EP 1347046 A [0109]. WO 2003025148 A [0109] . WO 2004045516 A [0109] . WO 2004040000 A [0109] . wo 2003087768 A [0109] - wo 200261087 A [0109] . WO 2003016494 A [0109] . WO 200198351 A [0109] . EP 522868 A [0109]. WO 2003003906 A [0109] 0 wo 200264798 A [0109] . wo 200014228 A [0109] . US 2003224454 A [0109] . wo 2003025138 A10109] . wo 2004065577 A [0109] . WO 2004027049 A [0109] . EP 1394274 A [0109]. WO 2004016225 A [0109] 0 us 2003157089 A [0109] . US 2003185830 A [0109] . US 2003064397 A [0109] . wo 200289747 A [0109] . wo 2003022995 A [0109] . wo 2004045553 A [0109] . WO 2003034984 A [0109] . WO 200288170 A [0109] - wo 200216413 A [0109] . WO 200222808 A [0109] . us 5854399 A [0109]. US 5792616 A [0109]. WO 2004045520 A [0109] . us 2004005538 A [0109] - WO 2003062401 A [0109] ~ wo 9102536 A [0109]. WO 2004020595 A [0109] . US 2004101874 A [0109] . us 2002150573 A [0109] . US 5644033 A [0109]. wo 2003048202 A [0109] . wo 99558658 A [0109]. US 6534482 13 [0109]. wo 200055351 A [0109] 0 WC 2003077836 A [0109] ~ wo 200138490 A [0109] . WO 2003097803 A [0109] . WO 2003089624 A [0109] . wo 2004009622 A [0109] - WO 2003081210 A [0109] . wo 2003089904 A [0109] . US 2003118592 A [0109] . WO 2003008537 A [0109] . wo 2003055439 A [0109] . wo 2003025228 A [0109] . wo 200222636 A [0109] . wo 200212341 A [0109] . WO 200213847 A [0109] . wo 200214503 A [0109] . WO 200177172 A [0109] . US 2003109676 A [0109] - US 6518404 B [0109]. US 5773223 A [0109]. wo 2004001004 A [0109] . wo 2003104275 A [0109] . wo 2004046342 A [0109] - wo 2003083074 A [0109] . WO 2003018621 A [0109] . wo 200166689 A [0109] . WO 2003087306 A [0109] . WO 200272596 A [0109] . wo 200172962 A [0109] . WO 2003104270 A [0109] . us 2004005598 A [0109] . US 2003060612 A [0109] . WO 200226822 A [0109] - wo 200216429 A [0109] . US 2003143557 A [0109] . wo 200040614 A [0109] . wo 200210382 A [0109] . US 2003219806 A [0109] - wo 200162794 A [0109] . US 2003224411 A [0109] . WO 2003083041 A [0109]. US 2003186373 A [0109] . US 2003119131 A [0109] . US 2003119122 A [0109] . us 2003119126 A [0109] . US 2003119121 A [0109] . US 2003119129 A [0109] . US 2003119130 A [0109] . US 2003119128 A [0109] - us 2003119125 A [0109] . WO 200202634 A [0109] . WO 200053216 A [0109] . wo 2004065576 A [0109] . WO 2004020583 A [0109] - wo 2003004529 A [0109] . US 20040101899 A [0109] . WO 2003104399 A [0109] . WO 2004000221 A [0109] . US 2003165504 A [0109] - us 2003065143 A [0109] . US 2003091580 A [0109] . WO 200210187 A [0109] . WO 200194641 A [0109] . WO 200202624 A [0109]215. wo 200153463 A [0109] 0 WO 200141787 A [0109] . wo 200044899 A [0109] . wo 200020579 A [0109] . us 5869445 A [0109]. WO 9630514 A [0109]. EP 1439393 A [0109]. wo 2004043361 A [0109] . WO 2004022709 A [0109] 0 wo 200100244 A [0109] . WO 2004063709 A [0109] . WO 2004044178 A [0109] . wo 2004031238 A [0109] . wo 200260317 A [0109] 0113 05003790 B [0109]. WO 9946284 A [0109]. US 2004005320 A [0109] - wo 2003029262 A [0109] . WO 2003002717 A [0109] . wo 200222153 A [0109] . US 2002042366 A [0109] . WO 200146261 A [0109] . wo 200146232 A [0109] . WO 9837193 A [0109]. US 2003186372 A [0109]0 WO 200172830 A [0109] . WO 200022129 A [0109] . WO 9928468 A [0109]. us 5440021 A [0109]. WO 9428931 A [0109]. WO 9217497 A [0109]. US 6153408 A [0109]. Us 5976551 A [0109]. us 6011146 A [0109]. WO 2004047749 A [0109] . WO 2003072035 A [0109] . wo 200222660 A [0109] . WO 2003093444 A [0109] . wo 2003029277 A [0109] . WO 2004042346 A [0109] . WO 2003026493 A [0109] . WO 200075655 A [0109] . US 2002193567 A [0109] . wo 9707198 A [0109]. WO 2003083047 A [0109] . WO 9744452 A [0109]. WO 200012130 A [0109] . WO 2004074320 A [0109] 216. US 2002034749 A [0109] . WO 200206317 A [0109] . wo 200202587 A [0109] . WO 200140269 A [0109] . wo 200036107 A [0109] . wo 2004053079 A [0109] . wo 2003004989 A [0109] - wo 0116318 A [0109]. US 2004018553 A [0109] . wo 200281646 A [0109] . wo 200140309 A [0109] . US 2001055751 A [0109] . wo 200032752 A [0109] . WO 9851805 A [0109]. wo 9851824 A [0109]. WO 9840403 A [0109]. WO 2003000842 A [0109] - wo 2003023013 A [0109] . US 2003194704 A [0109] . wo 2004058309 A [0109] . wo 200401161 A [0109] . wo 2003045422 A [0109] - wo 2003014294 A [0109] . wo 2003035846 A [0109] . wo 200294852 A [0109] . WO 200238766 A [0109] . WO 200224909 A [0109] . wo 2003072036 A [0109] . WO 2003088808 A [0109] . us 20030228319 A [0109] . WO 9958658 A [0109]. wo 9207574 A [0109]- wo 2004015426 A [0109] . US 2003105292 A [0109] . us 6555339 B [0109]. US 4361650 A [0193]. US 4307016 A [0193]. us 4294757 A [0193]. US 4424219 A [0194]. us 4331598 A [0195]. US 4450254 A [0195]. US 4364866 A [0195]. us 4313946 A [0195]. US 4315929 A [0195]. us 4362663 A [0195]. US 4322348 A [0195]. US 4371533 A [0195]- us 20050169933 A [0198]. JP 2004113151 B [0109] 0 wo 2003009814 A [0109] . EP 1295944 A [0109]. wo 200190304 A [0109] . us 2004249130 A [0109] . US 2004022727 A [0109] . WO 2004063355 A [0109] . us 2004197325 A [0109] . us 2003232350 A [0109] « us 2004005563 A [0109] . US 2003124579 A [0109] . WO 0145746 A [0110] [0161] . us 20040001827 A [0110] [0161] . US 4415732 A [0117]. us 4458066 A [0117]. US 5047524 A [0117]. US 5262530 A [0117]- us 58017715 B [0119]. WO 0100245 A [0120]. us 5342606 A [0142]. US 5428155 A [0142]. US 5316757 A [0142]. us 5480990 A [0142]i US 5462725 A [0142]. us 5428139 A [0142]. US 5385893 A [0142]. US 5739294 A [0142]. us 5750660 A [0142]. US 5834456 A [0142]. us 4275149 A [0142] [0144] . US 4737456 A [0142]. US 4318980 A [0144]. us 6372907 B [0149]. US 6528624 B [0150]- us 4256746 A [0193]. WO 2004043493 A [0241] . WO 200401993 A [0244] . us 6214345 B [0255]i US 2003130189 A [0255] . us 2003096743 A [0255] . WO 03026577 A [0255]0 WO 04016801 A [0265]. us 6884874 B [0265]. US 2004039176 A1 [0265] . wo 03068144 A [0265]. US 2004001838 A1 [0265] . US 6441163 B [0265]. us 5416064 A [0265] 217. WO 2005037992 A [0198]. US 5208020 A [0198] [0265] . US 5635483 A [0202] [02031 . US 5780588 A [0202] [0203] . us 5663149 A [0202] [0203] . US 5712374 A [0207]. US 5714586 A [0207]- us 5770701 A [0207]. US 5770710 A [0207]. US 5877296 A [0207]. wo 9321232 A [0208]. wo 9411026 A [0210]. wo 01024763 A [0265] . US 5583024 A [0270]. us 5674713 A [0270i. US 5700670 A [0270]. us 6602677 B [0270]. wo 9704801 A [0284]. US 3773919 A [0286]. EP 616812 A [0308]. us 2005034353 W [0339] 0 us 60696353 8 [03391. US 60612468 B [0339]Tarifnamede belirtilen patentlestirilmemis literatür:° LAMBERT, J. Curr. Opinion in Pharmacology, 2005, vol. 5, 543-549 id="p-3" [0003]° WU et al. Nature Biotechnology, 2005, vol. 23 (9), 1137-1146 [0003] [0142]0 PAYNE, G. Cancer Cell, 2003, vol. 3, 207-212 [0003]° SYRIGOS ; EPENETOS. Anticancer Research, 1999, vol. 19, 605-614[0003]° NICULESCU-DUVAZ ; SPRINGER.Adv. Drug Del. Rev., 1997, vol. 26, 151- 172 [0003]o BALDWIN et al. Lancet, 15 March 1986, 603-05 [0003]° Antibody Carriers Of Cytotoxic Agentsln Cancer Therapy: A Review. THORPEet al. Monoclonal Antibodies 84: Biological And Clinical Applications. 1985, vol. 84, 475-506 [0003]0 ROWLAND et al. Cancer Immunol.- WISEMAN et al. Eur. J. Nucl. Med., 2000, vol. 27 (7), 766-77 [0004]~ WISEMAN et al. Blood, 2002, vol. 99 (12), 4336-42 [0004]° WITZIG et al. J. Clin. 011001., 2002, vol. 20 (10), 2453-63 [0004]o WITZIG et al. J. Clin. Oncol., 2002, vol. 20 (15), 3262-69 [0004]' XIE et al. J. of Pharin. and Exp. Ther., 2004, vol. 308 (3), 1073-1082 id="p-4" [0004]o KLUSSMAN et al. Bioconjugate Chemistry, 2004, vol. 15 (4), 765-773 id="p-5" [0005] [0213]- DORONINA et al. Nature Biotechnology, 2003, vol. 21 (7), 778- 784 [0005] [0202]o FRANCISCO et al. Blood, 2003, vol. 102 (4), 1458-1465 [0005]- MAO et al. Cancer Research, 2004, vol. 64 (3), 781-788 [0005]lmmunother., 1986, vol. 21, 183-87 [0003] ° MANDLER et al. J. of the Nat. Cancer Inst., 2000, vol. 92 (19), 1573-1581 [0003]- BHASKAR et al. Cancer Res., 2003, v01. 63, 6387-6394 [0005] ° SENTER et al. Proceedings of the- MANDLER et al. Bioorganic & Med. Chein. Letters, 2000, vol. 10, 1025-1028 id="p-3" [0003]° MANDLER et al. Bioconjugate Chem.,2002, vol. 13, 786-791 [0003] - LIU et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1996, vol. 93, 8618-8623 [0003]0 LODE et al. Cancer Res., 1998, vol. 58,2928 [0003]American Association for Cancer Research, 28 March 2004, vol. 45 id="p-5" [0005] [0204]° GARMAN. Non-Radioactive Labelling: A Practical Approach. Academic Press, 1997, 55 [0007]o SINGH et al. Anal. Biochem., 2002, vol. 304, 147-156 [0007]. BETTER et al. J. Biol. Chem., 1994, 218o HINMAN et al. Cancer Res., 1993, vol.53, 3336-3342 [0003]- BERNHARD et al. Bioconjugate Chem., 1994, vol. 5, 126-132 [0008] id="p-113" [0113]° GREENWOOD et al. TherapeuticImmunology, 1994, vol. 1, 247-255 [0008]- TU et al. Proc. Natl. Acad. Sci USA, 1999, vol. 96, 4862-4867 [0008]o KAN N O et al. .1 . of Biotechnology, 2000, vol. 76, 207-214 [0008]o CHMURA et al. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 2001, vol. 98 (15), 8480-8484 id="p-8" [0008]° ZHANG et al. Anal. Biochem., 2002, vol. 311, 1-9 [0008]° SHOPES B. Molecular Iminunology, 1993, vol. 30 (6), 603-609 [0013]0 HAFNER F. T. et al. AnalyticalChemistry, 2000, vol. 72 (23), 5779-5786[0014]° RENARD M. et al. Journal of Molecular Biology, 2003, vol. 326 (1), 167-175 [0015]o CORNEILLIE T. M. et al.Bioconjugate Chemistry, 2004, vol. 15 (6),1389-1391 [0016]- TRAIL P. A. et al. Cancer Immunology,Iminunotherapy: CII, 2003, vol. 52 (5), 328-337 [0017]° SCHELTE P. et al. Bioconjugate Chemistry. ACS, 2000, vol. 11, 118-123 id="p-18" [0018]0 LYONS A. et al. Protein Engineering. Oxford University Press, 1990, vol. 3, 703-709 [0019]° WRIGHT S.K. et al. Analytical Biochemsitry, 1998, vol. 265 (1), 8-14 id="p-20" [0020]° SINGLETON et al. Dictionary of Microbiology and Molecular Biology. J. Wiley & Sons, 1994 [0032]° JANEWAY, C. ; TRAVERS, P. ; WALPORT, M. ; SHLOMCHIK. lmmunobiology. Garland Publishing, 2001 [0032]° MILLER et al. J our. of Immunology, 2003, vol. 170, 4854-4861 [0035]vol. 13, 9644-9650 [0008]' SHEPARD et al. J. (1991) Clin. lmmunol., 1991, vol. 11 (3), 117-127 id="p-41" [0041]o KUMAR et al. Mol. Cell. Biol., 1991, vol. 11 (2), 979-986 [0041]' LEWIS et al. Cancer Iininunol. lmmunother., 1993, vol. 37, 255-263 id="p-41" [0041]o PIETRAS et al. Oncogene, 1994, vol. 9, 1829-1838 [0041]o VITETTA et al. Cancer Research, 1994, vol. 54, 5301-5309 [0041]- SLIWKOWSKI et al. J . Biol. Chem., 1994, vol. 269 (20), 14661 -14665 id="p-41" [0041]° SCOTT et al. J. Biol. Chem., 1991, vol. 266, 14300-5 [0041]° D,SOUZA et al. Proc. Natl. Acad. Sci., 1994, vol. 91, 7202-7206 [0041]- LEWIS et al. Cancer Research, 1996, vol. 56, 14457-1465 [0041]o SCHAEFER et al. Oncogene, 1997, vol. 15, 1385-1394 [0041]° CARPENTER et al. Ann. Rev. Biochem., 1987, vol. 56, 881-914 id="p-43" [0043]o HUMPHREY et al. Proc. Nat. Acad. Sci. (USA), 1990, vol. 87, 4207-4211 id="p-43" [0043]. MURTHY et al. Arch. Biochern. Biophys., 1987, vol. 252, 549-560 id="p-43" [0043]° SEMBA et al. Proc. Nat. Acad. Sci. (USA), 1985, vol. 82, 6497-6501 [0045] o YAMAMOTO et al. Nature, 1986, vol. 319, 230-234 [0045]- KRAUS et al. Proc. Nat. Acad. Sci. (USA), 1989, vol. 86, 9193-9197 [0046] o PLOWMAN et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1993, vol. 90, 1746-1750 id="p-47" [0047]o PLOWMAN et al. Nature, 1993, vol. 366, 473-475 [0047]o RAVETCH ; KIN ET. Annu. Rev. Immunol., 1991, vol. 9, 457-92 [0051]o CLYNES et al. PROC. NAT. ACAD. SCI. (USA) (USA), 1998, vol. 95, 652- 219° JANEWAY, C. ; TRAVERS, P. ; WALPORT, M. ; SHLOMCHIK. lmmuno Biology. 2001 [0035]0 OLAFSEN et al. Protein Eng. Design & Sel., 2004, vol. 17 (4), 315-323 [0036]° KOHLER et al. Nature, 1975, vol. 256, 495 [0037]- CLACKSON et al. Nature, 1991, vol. 352, 624-628 [0037]o MARKS et al. J. Mol. Biol., 1991, vol. 222, 581-597 [0037]o MORRISON et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1984, vol. 81, 6851-6855 [0038] ° ROUX et al. J. Immnnol., 1998, vol. 161, 4083-4090 [0040]o LUND et al. Eur. J. Biochem., 2000, vol. 267, 7246-7256 [0040]- HUDZIAK et al. Mol. Cell. Biol., 1989, vol. 9 (3), 1165-1172 [0041]0 FEN DLY et al. Cancer Research, 1990, vol. 50, 1550-1558 [0041]o KOTTS et al. In Vitro, 1990, vol. 26 (3), 59A [0041]° SARUP et al. Growth Regulation, 1991, vol. 1, 72-82 [0041]° PLUCKTHUN. Pharmacology of Monoclonal Antibodies. Springer-Verlag, 1994, vol. 113, 269-315 [0062]° HOLLINGER et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1993, vol. 90, 6444-6448 [0063] ° JONES et al. Nature, 1986, vol. 321, 522-525 [0064]- CHOTHIA et al. Nature, 1989, vol. 342, 877 [0064]° RIECHMANN et al. J. Mol. Biol., 1992, vol. 224, 487-499 [0064]0 FOOTE ; WINTER. J. Mol. Biol., 1992, vol. 224, 487-499 [0064]° PRESTA et al. J. lmmunol., 1993, vol. 151, 2623-2632 [0064]° WERTHER et al. J. Immunol. Methods, 1996, vol. 157, 4986-4995 [0064]- PRESTA et al. Thromb. Haemost., 2001, vol. 85,379-389 [0064]o RIECHMA NN et al. Nature, 1988, vol. 332, 323-329 [0064]° PRESTA. Curr. Op. Struct. Biol., 1992, vol. 2, 593-596 [0064]656 [0051]' DAERON. Annu. Rev. Iinmunol., 1997, vol. 15, 203-234 [0053]° RAVETCH ; KINET. Annu. Rev. lininunol, 1991, vol. 9, 457-92 [0053]- CAPEL et al. Immunomethods, 1994, vol. 4, 25-34 [0053]o HAAS et al. J. Lab. Clin. Med., 1995, vol. 126, 330-41 [0053]' GUYER et al. J. lmmunol., 1976, vol. 117, 587 [0053]° KIM et al. J. lmmunol., 1994, vol. 24, 249 [0053]- GAZZANO-SANTORO et al. J. linmunol. Methods, 1996, vol. 202, 163 id="p-54" [0054]o KABAT et al. Sequences of Proteins of lmmunological Interest. Public Health Service, National Institutesof Health, 1991 [0056] [0123]- CHOTHIA ; LESK. J. Mol. Biol., 1987, vol. 196, 901-917 [0057]o MEANS. Bioconjugate Chem., 1990, vol. 1, 2 [0105] [0152]o HERMANSON, G. Bioconjugate Techniques. Academic Press, 1996, 40- 55, 643-671 [0105]- DIJKE,P. et al. Science, 1994, vol. 264 (5155), 101-104 [0109]° Oncogene, 1997, vol. 14 (1 1), 1377- 1382 [0109]° Biochem. Biophys. Res. Commun., 1999, vol. 255 (2), 283-288 [0109]- Nature, 1998, vol. 395 (6699), 288- 291 [0109]o GAUGITSCH, H.W. et al. J. Biol. Chem., 1992, vol. 267 (16), 11267- 11273 [0109]- Cancer Res., 2001, vol. 61 (15), 5857- 5860 [0109]° HUBERT, R.S. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1999, vol. 96 (25), 14523-14528 [0109]0 J. Biol. Chem., 2001, vol. 276 (29), 27371-27375 [0109]- YAMAGUCHI, N. et al. Biol. Chem., 1994, vol. 269 (2), 805-808 id="p-109" [0109] 220o SCHECTER et al. Nature, 1984, vol. 312, 513 [0071]- DREBIN et al. Nature, 1984, vol. 312, 545-548 [0071]o HUDZIAK et al. Proc. Natl. Acad. Sci.USA, 1987, vol. 84, 7159-7163 [0080]° SLAMON et al. Science, 1989, vol. 244,707-7 1 2 [0080]° SLAMON et al. Science, 1987, vol. 235,177-182 [0080]° AngeW Chem Intl. Ed. Engl., 1994, vol. 33, 183-186 [0084]- WILMAN. Prodrugs in Cancer Chemotherapy. Biocheinical Society Transactions, 1986, vol. 14, 375-382 id="p-90" [0090]o prodrugs: A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery. STELLA et al. Directed Drug Delivery. HumanaPress, 247-267 [0090]° WELLS ; LOWMAN. Curr. Opin.Struct. Biol., 1992, vol. 3, 355-362 [0093]- LOWMAN; WELLS. Methods: A companion to Methods in Enzymology, 1991, vol. 3, 205-0216 [0093]° JANEWAY, C. ; TRAVERS, P. ; WALPORT, M. ; SHLOMCHIK. 1mmun0bio10gy. Garland Publishing, 2001, 627-628 [0093]° McGraW-Hill Dictionary of Chemical Terms. Mc- GraW-Hill Book Company, 1984 [0097]° ELIEL, E. ; WILEN, S. Stereochemistry of Organic Compounds. John Wiley & Sons, Inc, 1994 [0097]° GARMAN. Non-Radioactive Labelling:A Practical Approach. Academic Press, 1997 [0102]° HAUGLAND. Molecular Probes Handbook of Fluorescent Probes and Research Chemicals. Molecular Probes, Inc, 2003 [0105]- BRINKLEY. Bioconjugate Chem., 1992, vol. 3, 2 [0105]o GARMAN. Non-Radioactive Labelling:A Practical Approach. Academic Press, 1997 [0105] [0152]' VERHEIJ J.B. et al. Am. J. Med. Genet,- Proc.Natl.Acad. Sci. U.S.A., 1999, vol. 96 (20), 11531-11536 [0109]- Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1996, vol. 93 (1), 136-140 [0109]° .1. Biol. Chem., 1995, vol. 270 (37), 21984-21990 [0109]° J. Biol. Chem., 2002, vol. 277 (22), 19665-19672 [0109]' Genomics, 1999, vol. 62 (2), 281-284 id="p-109" [0109]° FEILD, J .A. et al. Biochem. Biophys. Res. Coinmun., 1999, vol. 258 (3), 578- 582 [0109]- NAGASE T. et al. DNA Res., 2000, vol. 7 (2), 143-150 [0109]o ROSS et al. Cancer Res., 2002, vol. 62, 2546-2553 [0109]° NAKAMUTA M. et al. Biochem. Biophys. Res. Coinmun., 1991, vol. 177, 34-39 [0109]- OGAWA Y. et al. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1991, vol. 178, 248-255 id="p-109" [0109]- ARAI H. et al. Jpn. Circ. J., 1992, vol. 56, 1303-1307 [0109]° ARAI H. et al. J. Biol. Chem., 1993, vol. 268, 3463-3470 [0109]- SAKAMOTO A. ; YANAGISAWA M. et al. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1991, vol. 178, 656-663 id="p-109" [0109]- ELSHOURBAGY N-A. et al. J. Biol. Chem., 1993, vol. 268, 3873-3879 id="p-109" [0109]- HAENDLER B. et al. 1. Cardiovasc. Pharmacol., 1992, vol. 20, sl-S4 id="p-109" [0109]- TSUTSUMI M. et al. Gene, 1999, vol. 228, 43-49 [0109]° STRAUSBERG R.L. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2002, vol. 99, 16899-16903 [0109]o BOURGEOIS C. et al. .1. Clin. Endocrinol. Metab., 1997, vol. 82, 3116-3123 [0109]- OKAMOTO Y. et al. Biol. Chem., 1997, vol. 272, 21589-21596 [0109]° SEMBA K. et al. Proc. Natl. Acad. 2212002, vol. 108, 223-225 [0109]0 HOFSTRA R.M.W. et al. Eur. J. Hum. Genet., 1997, vol. 5, 180-185 [0109]o PUFFENBERGER E.G. et al. Cell, 1994, vol. 79, 1257-1266 [0109]° ATTIE T. et al. Hum. Mol. Genet., 1995, vol. 4, 2407-2409 [0109]' AURICCHIO A. et al. Hum. MOI. Genet., 1996, vol. 5, 351-354 [0109]o AMIEL J. et al. Hum. Mol. Genet, 1996,vol. 5, 355-357 [0109]o HOFSTRA R.M.W. et al. Nat. Genet., 1996, vol. 12, 445-447 [0109]° SVENSSON P.J. et al. Hum. Genet., 1998, vol. 103, 145-148 [0109]o FUCHS S. et al. Mol. Med., 2001, vol. 7,115-124 [0109]- PINGAULT V. et al. Hurn. Genet., 2002, vol. 111, 198-206 [0109]° Lab. Invest., 2002, vol. 82 (1 1), 1573- 1582 [0109]° XU, X,Z. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2001, vol. 98 (19), 10692-10697 id="p-109" [0109]° Cell, 2002, vol. 109 (3), 397-407 [0109] 0 J. Biol. Chem., 2003, vol. 278 (33), 30813-30820 [0109]- CICCODICOLA, A. et al. EMBO J., 1989, vol. 8 (7), 1987-1991 [0109]0 Am. J. Hum. Genet., 1991, vol. 49 (3), 555-565 [0109]o FUJISAKU et al. J. Biol. Chem., 1989, vol. 264 (4), 21 18-2125 [0109]0 WEIS J.J. et al. J. Exp. Med., 1988, vol.167, 1047-1066 [0109]° MOORE M. et al. Proc. Natl. Acad. Sci.U.S.A., 1987, vol. 84, 9194-9198 [0109] - BAREL M. et al. Mol. lmmunol., 1998, vol. 35, 1025-1031 [0109]° WEIS J.J. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1986, vol. 83, 5639-5643 [0109] ° SINHA S.K. et al. J. lmmunol., 1993, vol. 150, 5311-5320 [0109]° Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2003, vol. 100 (7), 4126-4131 [0109]0 Blood, 2002, vol. 100 (9), 3068-3076 id="p-109" [0109]- MULLER et al. Eur. .1. lmmunol., 1992,Sci. U.S.A., 1985, vol. 82, 6497-6501 id="p-109" [0109]° SWIERCZ J.M. et al. J. Cell Biol., 2004, vol. 165, 869-880 [0109]° KUHNS JJ. et al. J. Biol. Chem., 1999, vol. 274, 36422-36427 [0109]' CI-IO H.-S. et al. Nature, 2003, vol. 421, 756-760 [0109]- EHSANI A et al. Genomics, 1993, vol. 15, 426-429 [0109]° BARNETT T. et al. Genomics, 1988, vol. 3, 59-66 [0109]- TAWARAGI Y. et al. Biochem. Bi0phys. Res. Coinmun., 1988, vol. 150, 89-96 [0109]o Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2002, vol. 99 (26), 16899-16903 [0109]° CLARK H.F. et al. Genome Res., 2003, vol. 13, 2265-2270 [0109]o MUNGALL A.J. et al. Nature, 2003, vol. 425, 805-811 [0109]- BLUMBERG H. et al. Cell, 2001, vol. 104, 9-19 [0109]- DUMOUTIER L. et al. J. lmmunol., 2001, vol. 167, 3545-3549 [0109]° PARRISH-NOVAK J. et al. J. Biol. Chem., 2002, vol. 277, 47517-47523 id="p-109" [0109]- PLETNEV S. et al. Biochemistry, 2003, vol. 42, 12617-12624 [0109]- SHEIKH F. et al. J. lmmunol., 2004, vol. 172, 2006-2010 [0109]° GARY S.C. et al. Gene, 2000, vol. 256, 139-147 [0109]o CLARK H-F. et al. Genome Res., 2003, vol. 13, 2265-2270 [0109]o CHAN,J. ; WATT, V.M. Oncogene, 1991, vol. 6 (6), 1057-1061 [0109]- Oncogene, 1995, vol. 10 (5), 897-905 id="p-109" [0109]° Annu. Rev. Neurosci., 1998, vol. 21, 309-345 [0109]. Int. Rev. Cytol., 2000, vol. 196, 177- 244 [0109]o REITER R.E. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1998, vol. 95, 1735- 1740 [0109]° GU Z. et al. Oncogene, 2000, vol. 19, 222vol. 22 (6), 1621-1625 [0109] ' Genome Res., 2003, V01. 13 (10), 2265- 2270 [0109]0 Immunogenetics, 2002, vol. 54 (2), 87-95[0109] . Blood, 2002, vol. 99 (8), 2662-2669 id="p-109" [0109]- Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2001, vol.98 (17), 9772-9777 [0109]o XU, MJ. et al. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2001, vol. 280 (3), 768-775 id="p-109" [0109]° COUSSENS L. et al. Science, 1985, vol.230 (4730), 1132-1139 [0109]0 YAMAMOTO T. et al. Nature, 1986, vol. 319, 230-234 [0109]0 YU et al. J. llnnlunol., 1992, vol. 148(2), 633-637 [0109]° SAKAGUCHI et al. EMBO J., 1988,vol. 7 (11), 3457-3464 [0109]° DOBNER et al. Eur. J, Immunol., 1992,vol. 22, 2795-2799 [0109]- BARELLA et al. Biochem. J., 1995, vol.309, 773-779 [0109]° TONNELLE et al. EMBO J., 1985, vol.4 (11), 2839-2847 [0109]° JONSSON et al. Immunogenetics, 1989,vol. 29 (6), 41 1-413 [0109] ° BECK et al. J. Mol. Biol., 1992,v01. 228, 433-441 [0109]° STRAUSBERG et al. Proc. Natl. Acad.Sci USA, 2002, vol. 99, 16899-16903 id="p-109" [0109]° SERVENIUS. J. Biol. Chem., 1987, vol.262, 8759-8766 [0109]° BECK. J.M01.Bi01., 1996, vol. 255, 1-13 [0109]- NARUSE et al. Tissue Antigens, 2002, vol. 59, 512-519 [0109]0 KASAHARA et al. lmmunogenetics, 1989, vol. 30 (1), 66-68 [0109]0 LARHAMMAR et al. J. Biol. Chem., 1985, vol. 260 (26), 141 1 1-141 19 [0109] o LE et al. FEBS Lett., 1997, vol. 418 (1-2), 1995-199 [0109]° TOUCHMAN et al. Genome. Res., 2000, vol. 10, 165-173 [0109]' VON HOEGEN et al. J. lmmunol.,1288-1296 [0109]' Biochein. Biophys. Res. Commun., 2000, vol. 275 (3), 783-788 [0109]° THOMPSON, J.S. et al. Science, 2001, vol. 293 (5537), 2108-2111 id="p-109" [0109]. WILSON et al. J. Exp. Med., 1991, vol. 173, 137-146 [0109]- HA et al. J. Immunol., 1992, vol. 148 (5), 1526-1531 [0109]° MUELLER et al. Eur. J. Biochem., 1992, vol. 22, 1621-1625 [0109]- HASHIMOTO et al. Iminunogenetics, 1994, vol. 40(4), 287-295 [0109]o PREUD"HOMME et al. Clin. Exp. Immunol., 1992, vol. 90 (1), 141-146 id="p-109" [0109]- CARTER et al. Nucleic Acids Res., 1985, v01. 13, 4431-4443 [0112]- HO et al. Gene (Amst.), 1989, vol. 77, 51-59 [0112]o KUNKEL et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1987, vol. 82, 488 [0112]o LIU et al. J. Biol. Chem., 1998, vol. 273, 20252-20260 [0112]' HIGUCHI. PCR Protocols. Academic Press, 1990, 177-183 [0113] - ITO et al. Gene, 1991, vol. 102, 67- 70 [0113]- VALLETTE et al. Nuc. Acids Res., 1989, vol. 17, 723-733 [0113]- WELLS et al. Gene, 1985, Vol. 34, 315-323 [0114]- SAMBROOK ; RUSSEL. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2001 id="p-115" [0115]- ZOLLER et al. Methods Enzymol., 1983, vol. 100, 468-500 [0115]' ZOLLER, M.J.;SM1TH, M. Nucl. Acids Res., 1982, vol. 10, 6487-6500 id="p-115" [0115]° GERSTNER et al. Sequence Plasticity In The Anti gen-Binding Site Of A Therapeutic Anti-HERZ Antibody.J Mol Biol., 2002, vol. 321, 851-62 [0116]- LOWMAN; HENRY B. 2231990, vol. 144 (12), 4870-4877[0109]- MIURA et al. Genomics, 1996, vol. 38 (3), 299-304 [0109]o MIURA et al. Blood, 1998, vol. 92, 2815-2822 [0109]o DAVIS et al. Proc. Natl. Acad. Sci USA, 2001, vol. 98 (17), 9772-9777 [0109]° NAKAYAMA et al. Biochem. Biophys. Res. Coinmun., 2000, vol. 277 (l), 124-Combinatorial Peptide Library Protocols. Methods in Molecular Biology, 1998, vol. 87, 249-264 [0116] - BEAUCAGE, S. ; LAYER, R. Advances in the synthesis of oligonucleotides by the phosphoramidite approach. Tetrahedron, 1992, vol. 48, 2223-23] 1 id="p-117" [0117]° Chemical methods for 5, non-isotopic127 [0109] labelling of PCR probes and primers. ° HORIE et al. Genomics, 2000, vol. 67, ANDRUS, A. PCR 2: A Practical 146-152 [0109] Approach. Oxford University Press,° UCHIDA et al. Biochem. Biophys. Res. Coininun., 1999, vol. 266, 593-602 [0109] o LIANG et al. Cancer Res., 2000, vol. 60, 4907-12 [0109]° GLYNNE-JONES et al. lntJ Cancer., October 2001, vol. 94 (2), 178-84 id="p-109" [0109]° DENNIS et al. Albumin Binding As A General Strategy For Improving The Pharmacokinetics Of Proteins. J Biol Chein., 2002, vol. 277, 35035-35043 id="p-110" [0110] [0161]° DENNIS et al. J Biol Chem., 2002, vol. 277, 35035-35043 [0110] [0161]- SAMBROOK et al. Molecular Cloning, A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989 [0111]o AUSUBEL et al. Current Protocols in Molecular Biology. Greene Publishing and Wiley-lnterscience, 1993 [0111]0 The CCP4 Suite: Programs for Protein Crystallography. Acta. Cryst., 1994, vol. DSO, 760-763 [0128]- B.LEE; F.M.RICHARDS. J .Ma1.Biol., 1971, vol. 55, 379-400 [0128]° SINGH et al. Anal. Biochem., 2002, vol. 304,147-15 [0141]° HARLOW E. ; LANE, D. Using1995, 39-54 [0117]- HERMANSON, G. Bioconjugate Techniques. Academic Press, 1996, vol. 40-55, 643-671 [0117]0 KELLER, G.; MANAK, M. DNA Probes Second Edition. Stockton Press, 1993,121-23[0117]- SKERRA et al. Curr. Opinion in lmmunol., 1993, vol. 5, 256-262 [0119] o PLUCKTHUN. lmmunol. Revs., 1992, vol. 130, 151-188 [0119]- LOWMAN et al. J. Biol. Chem., 1991, vol. 266 (17), 10982-10988 id="p-120" [0120]° BACA et al. Journal Biological Chemistry, vol. 272 (16), 10678-84 id="p-121" [0121]. Electro Spray Ionization Mass Spectrometry: Fundamentals.COLE, R.B. lnstrumentation And Applications. Wiley, 1997 [0122]o EIGENBROT et al. X-Ray Structures Of The Antigen-Binding Doinains From Three Variants Of Humanized Anti-P185her2 Antibody 4D5 And Comparison With Molecular Modeling. J Mol Biol., 1993, vol.229, 969-995 [0123]Antibodies: A Laboratory Manual. Cold Springs Harbor Laboratory Press, 1999 id="p-141" [0141]o LUNDBLAD R.L. Chemical Reagentsfor Protein Modification. CRC Press, 1991[0141] - Current Protocols in lmmunology.' GARRARD et al. Gene, 1993, vol. 128, 103-109 [0125]° EIGENBROT et al. J Mol Biol., 1993, vol. 229, 969-995 [0125] [0131] id="p-137" [0137]° HERMANSON, G. Bioconjugate Techniques. Academic Press, 1996 224Wiley-Interscience, 1991, vol. 1 and 2 id="p-142" [0142]- HNATOWICH et al. J. lmmunol. Methods, 1983, vol. 65, 147-157 [0142] o MEARES et al. Anal. Biochem., 1984, vol. 142, 68-78 [0142]o MIRZADEH et al. Bioconjugate Chem.,1990, vol. 1, 59-65 [0142]o MEARES et al. J. Cancer, 1990, 21-26 id="p-142" [0142]° IZARD et al. Bioconjugate Chem., 1992, vol. 3, 346-350 [0142]- NIKULA et al. Nucl. Med. Biol., 1995, vol. 22, 387-90 [0142]0 CAMERA et al. Nucl. Med. Biol., 1993,vol. 20, 955-62 [0142]o KUKIS et al. J. Nucl. Med., 1998, vol. 39, 2105-2110 [0142]0 VEREL et al. J. Nucl. Med., 2003, vol. 44, 1663-1670 [0142]° CAMERA et al. J. Nucl. Med., 1994, vol. 21, 640-646 [0142]- RUEGG et al. Cancer Res., 1990, vol. 50, 4221-4226 [0142]o LEE et al. Cancer Res., 2001, vol. 61, 4474-4482 [0142]o MITCHELL et al. J. Nucl. Med., 2003, vol. 44, 1 105-1112 [0142]° KOBAYASHI et al. Bioconjugate Chem., 1999, vol. 10, 103-111 [0142]- MIEDERER et al. J. Nucl. Med., 2004, vol. 45, 129-137 [0142]- DENARDO et al. Clinical Cancer Research, 1998, vol. 4, 2483-90[0142]° BLEND et al. Cancer Biotherapy &Radiopharmaceuticals, 2003, vol. 18, 355-363 [014210 NIKULA et al. J. Nucl. Med., 1999, vol.40, 166-76 [0142]° KOBAYASHI et al. J. Nucl. Med., 1998, vol. 39, 829-36 [0142]0 MARDIROSSIAN et al. Nucl. Med. Biol., 1993, vol. 20, 65-74 [0142]o ROSELLI et al. Cancer Biotherapy &Radiopharmaceuticals, 1999, vol. 14, 209-20 [0142] - Methods for the Preparation of Enzyme-[0145]0 ZOLA. Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques. C RC Press, Inc, 1987, 147-158 [0146]- BRIGGS et al. Synthesis of Functionalised Fluorescent Dyes and Their Coupling to Amines and Amino Acids. J. Chein. Soc., Perkin-Trans., 1997, vol. 1, 1051-1058 [0148]o MIRAGLIA. Homogeneous ce11- and bead-based assays for high throughput screening using Iluorometric microvolume assay technology. J. of Biomolecular Screening, 1999, vol. 4, 193-204 [0149]o ZHENG. Caspase-3 controls both cytoplasmic and nuclear events associated With Fas-mediated apoptosis in vivo. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1998, vol. 95, 6123-23 [0149]- VERMES. A novel assay for apoptosis. Flow cytometric detection of phosphatidylserine expression onearly apoptotic cells using fluorescein labelled Annexin V. J. lmmunol. Methods, 1995, vol. 184, 39-51 [0149] ' SWARTZMAN. A homogeneous and multiplexed immunoassay for high- throughput screening using fluorometric microvolume assay technology. Anal. Biochem., 1999, vol. 271, 143-51 [0149]- CHEN et al. Bioconjugate Chein., 2004, vol. 15, 41-49 [0150]- AXWORTHY et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, vol. 97 (4), 1802-1807 [0151]- LEWIS et al. Bioconj. Chein., 1998, vol. 9, 72-86 [0151]' ALBERT et al. Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, vol. 8, 1207-1210 [0151]' HAUGLAND. Molecular Probes Handbook of Fluorescent Prabes and Research Chemicals. Molecular Probes, lnc, 2003 [0152]- BRINKLEY. Bioconjugate Chem, 1992, vol. 3, 2 [0152]° GLAZER et al. Chemical 225Antibody Conjugates for use in Enzyme Immunoassay. O'SULLIVAN et al. Methods in Enzym. AcademicPress, 1981, vol. 73, 147-166 [0142]o Fluorimetric Assays of Proteolytic Enzymes.KNIGHT, C. Methods in Enzyrnology. Academic Press, 1995, vol. 248, 18-34 id="p-153" [0153]° CHANG et al. Gene, 1987, vol. 55, 189-196 [0157] 0 YN et al. PROC. NAT. ACAD. SCI. (USA), 2002, vol. 99, 7968-7973 [0192]° REMILLARD et al. Science, 1975, vol.189, 1002-1005 [0197]o ISSEL et al. Can. Treatment Rev., 1978,vol.5,199-207[0197]- WOYKE et al. Antimicrob. Agents and Chemother., 2001, vol. 45 (12), 3580-3584[0202] [0203]° PETTIT et al. Antimicrob. Agents Chemother., 1998, vol. 42, 2961-2965 id="p-202" [0202] [0203]° FRANCISCO et al. Blood, 2003, vol. 102 (4), 1438-1465 [0202]° E. SCHRODER ; K. LUBKE. The Peptides. Academic Press, 1965, vol. 1, 76-136 [0206] [0251]° HINMAN et al. Cancer Research, 1993,vol. 53, 3336-3342 [0207] - LODE et al. Cancer Research, 1998, vol. 58, 2925-2928 [0207]- VITETTA et al. Science, 1987, vol. 238,1098[0208]o FRAKER et al. Biochem. Biophys. Res.Commun., 1978, vol. 80, 49-57 [0210] ° Monoclonal Antibodies in Immunoscintigraphy. CRC Press, 1989 id="p-210" [0210]° PAQUETTE, LEO A. Principles of Modern Heterocyclic Chemistry. W.A. Benjamin, 1968 [0217]- The Chemistry of Heterocyclic Compounds, A series of Monographs. John Wiley & Sons, 1950, vol. 13,14,16,19,28 [0217]0 J. Am. Chem. Soc., 1960, vol. 82, 5566 id="p-217" [0217]Modification of Proteins. Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology. American Elsevier Publishing Co, 1975 [0152]o LUNDBLAD, R. L. ; NOYES, C. M. Chemical Reagents for Protein Modification. CRC Press, 1984, vol. land 11 [0152]- Chemical Modification of Proteins. PFLEIDERER, G. Modem Methods in Protein Chemistry. Walter De- Gryter, 1985 [0152]° WON G. Chemistry of ProteinCon jugation and Cross-linking. CRC Press, 1991 [0152]0 DE LEON-RODRIGUEZ et al. ChemEur. J., 2004, vol. 10, 1149-1155 id="p-152" [0152]- LEWIS et al. Bioconjugate Chein., 2001, vol. 12, 320-324 [0152]- LI et al. Bioconjugate Chem., 2002, vol. 13, 110-115 [0152]o MIER et al. Bioconjugate Chem., 2005, vol. 16, 240-237 [0152]' SZALAI et al. J. Amer. Chem. 806., 2003, vol. 125, 15688-15689 [0244]' SHAMIS et al. J. Amer. Chem. 800., 2004, vol. 126, 1726-1731 [0244]° AMIR et al. Angew. Chem. Int. Ed., 2003, vol. 42, 4494-4499 [0244]- Applications Handbook and Catalog. 2003, 467-498 [0254]- TOKI et al. 1. Org. Chem., 2002, vol. 67, 1866-1872 [0255]- WALKER, M.A. J. Org. Chem., 1995, vol. 60, 5352-5355 [0255]o FRISCH et al. Bioconjugate Chem., 1996, vol. 7, 180-186 [0255]- Angew. Chem., 1975, vol. 87 (14), 517 [0259]o DUBOWCHIK et al. Tetrahedron Letters, 1997, vol. 38, 5257-60 [0261] ° CHARI et al. Cancer Research, 1992, vol. 52, 127-131 [0265]. GETZ et al. Anal. Biochem., 1999, vol. 273, 73-80 [0266] [0336]° CROUCH et al. .1. Immunol. Meth., 1993, vol. 160, 81-88 [0270] 226o SUN et al. Bioorganic & Medicinal Cheinistry Letters, 2002, vol. 12, 2213- 2215 [0228] [0242]0 SUN et al. Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2003, vol. 1 1, 1761-1768 id="p-228" [0228] [0242]o KING. Tetrahedron Letters, 2002, vol. 43, 1987-1990 [0228]° HAY et al. Bioorg. Med. Chem. Lett., 1999, vol. 9, 2237 [0240]° RODRIGUES et al. Chemistry Biology,1995, vol. 2, 223 [0240] - STORM et al. .1. Amer. Chem. Soc., 1972, vol. 94, 5815 [0240]° AMSBERRY et al. J. Org. Chem., 1990,vol. 55, 5867 [0240]0 KINGSBURY et al. J. Med. Chem., 1984, vol. 27, 1447 [0240]0 GROOT et al. Angew. Chem. Int. Ed., 2003, vol. 42, 4490-4494 [0241]- CREE et al. AntiCancer Drugs, 1995, vol. 6, 398-404 [0270]- Remington°s Pharmaceutical Sciences. 1980 [0283] [0285]- Remingtonas Pharmaceutical Sciences. Mack Publishing Co, [0288] o BASELGA et al. J. Clin. Oncol., 1996, vol. 14, 737-744 [0297]- Chemotherapy Service. Williams & Wilkins, 1992 [0307]0 ODA et al. Nature Biotechnology. Pierce Biotechnology, Inc, 2001, vol. 19, 379-382 [0315]- BACA et al. Journal Biological Chemistry, 1997, vol. 272 (16), 10678- 84 [0318]o MENDOZA et al. Cancer Res., 2002, vol. 62, 5485-5488 [0330]- WEBSTER et al. Semin. Cancer Biol., 1994, vol. 5, 69-76 [0334]- CHILD et al. J. Biol. Chem., 1999, vol. 274, 24335-24341 [0335]o NEUBERGER ; WILLIAMS. Nucleic Acids Res., 1988, vol. 16, 6713 id="p-335" [0335]o BUCHMAN ; BERG. Mol. Cell. Biol., 1988, vol. 8, 4395 [0335]o BRINSTER et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1988, vol. 85, 836 [0335]- RAO et al. Breast Cancer Res. and Treatment, 1997, vol. 45, 149-158 id="p-335" [0335] TR TR TR