JP2010233578A - 増加したFcレセプター結合親和性およびエフェクター機能を有する抗体を作製するための融合構築物およびその使用 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】本発明は、タンパク質のグリコシル化操作分野に関する。より詳細には、本発明は、触媒活性を有する核酸分子(融合構築物が含まれる)、治療特性が改良されたポリペプチド(Fcレセプター結合およびエフェクター機能が増加した抗体が含まれる)を作製するための宿主細胞のグリコシル化操作におけるその使用に関する。本発明は、広義には、宿主細胞によって産生された1つまたは複数のポリペプチドのグリコシル化プロフィールを変化させるための宿主細胞の糖操作に関する。本発明の方法を使用して、Fc領域中のグリコシル化が改変されて(フコシル化の減少が含まれる)グリコシル化の改変の結果としてエフェクター機能および/またはFcレセプター結合が増加した治療抗体を産生することができる。
【選択図】図24
Description
(発明の分野)
本発明は、タンパク質のグリコシル化操作分野に関する。より詳細には、本発明は、触媒活性を有する核酸分子(融合構築物が含まれる)、治療特性が改良されたポリペプチド(Fcレセプター結合およびエフェクター機能が増加した抗体が含まれる)を作製するための宿主細胞のグリコシル化操作におけるその使用に関する。
糖タンパク質は、ヒト、他の真核生物、およびいくつかの原核生物における多数の不可欠な機能(触媒、シグナル伝達、細胞−細胞伝達、ならびに分子の認識および結合が含まれる)を媒介する。これらは、真核生物における非サイトゾルタンパク質の大部分を構成する。(Lis et al.,Eur.J Biochem.218:1−27(1993))。多数の糖タンパク質が治療目的のために活用されており、この20年間で、天然に存在する分泌糖タンパク質の組換え形態はバイオ産業の主要製品であった。例には、エリスロポイエチン(EPO)、治療モノクローナル抗体(治療mAb)、組織プラスミノゲンアクチベーター(tPA)、インターフェロン−β(IFN−β)、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、ヒト絨毛性性腺刺激ホルモン(hCG)が含まれる。(Cumming et al.,Glycobiology 1:115−130(1991)。
Fcレセプター結合親和性およびエフェクター機能が増加した抗体の驚異的な治療潜在性の認識により、本発明者らは、抗体のFc領域のグリコシル化プロフィールの操作を含むこのような抗体の産生方法を開発した。
(項目1)
融合ポリペプチドをコードする配列を含む単離された核酸であって、該融合ポリペプチドが、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII活性またはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性を有し、そして、ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインを含む、核酸。
(項目2)
項目1に記載の単離された核酸であって、上記融合ポリペプチドが、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIIまたはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼの触媒ドメインを含む、核酸。
(項目3)
項目2に記載の単離された核酸であって、上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIIの局在化ドメインである、核酸。
(項目4)
項目3に記載の単離された核酸であって、図24および配列番号14に示されるヌクレオチド配列を有する、核酸。
(項目5)
項目2に記載の単離された核酸であって、上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIの局在化ドメインである、核酸。
(項目6)
項目5に記載の単離された核酸であって、図25および配列番号12に示されるヌクレオチド配列を有する、核酸。
(項目7)
項目2に記載の単離された核酸であって、上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIの局在化ドメインである、核酸。
(項目8)
項目2に記載の単離された核酸であって、上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIの局在化ドメインである、核酸。
(項目9)
項目2に記載の単離された核酸であって、上記ゴルジ局在化ドメインが、α1−6コアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである、核酸。
(項目10)
項目3に記載の単離された核酸であって、図24および配列番号15に示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、核酸。
(項目11)
項目5に記載の単離された核酸であって、図25および配列番号13に示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、核酸。
(項目12)
項目3に記載の単離された核酸であって、ハイブリダイゼーションプローブに対してストリンジェントな条件下で、図24および配列番号14に示されるヌクレオチド配列からなるヌクレオチド配列にハイブリダイズする配列を含む、核酸。
(項目13)
項目5に記載の単離された核酸であって、ハイブリダイゼーションプローブに対してストリンジェントな条件下で、図25および配列番号12に示されるヌクレオチド配列からなるヌクレオチド配列にハイブリダイズする配列を含む、核酸。
(項目14)
項目3に記載の単離された核酸であって、図24および配列番号14に示されるヌクレオチド配列に少なくとも80%同一である配列を含む、核酸。
(項目15)
項目5に記載の単離された核酸であって、図25および配列番号12に示されるヌクレオチド配列に少なくとも80%同一である配列を含む、核酸。
(項目16)
項目3に記載の単離された核酸であって、図24および配列番号15のアミノ酸配列に少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、核酸。
(項目17)
項目5に記載の単離された核酸であって、図25および配列番号13のアミノ酸配列に少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、核酸。
(項目18)
項目3に記載の単離された核酸であって、保存的アミノ酸置換基を有する、図24および配列番号15のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、核酸。
(項目19)
項目5に記載の単離された核酸であって、保存的アミノ酸置換基を有する、図25および配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、核酸。
(項目20)
項目1〜19のいずれか1項に記載の単離された核酸を含む、発現ベクター。
(項目21)
β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII活性またはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性を有し、そして、異種ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインを含む、融合ポリペプチド。
(項目22)
項目21に記載の融合ポリペプチドであって、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIIまたはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼの触媒ドメインを含む、融合ポリペプチド。
(項目23)
項目21に記載の融合ポリペプチドであって、上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIIの局在化ドメインである、融合ポリペプチド。
(項目24)
項目21に記載の融合ポリペプチドであって、上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIの局在化ドメインである、融合ポリペプチド。
(項目25)
項目21に記載の融合ポリペプチドであって、上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIの局在化ドメインである、融合ポリペプチド。
(項目26)
項目21に記載の融合ポリペプチドであって、上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIの局在化ドメインである、融合ポリペプチド。
(項目27)
項目21に記載の融合ポリペプチドであって、上記ゴルジ局在化ドメインが、α1−6コアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである、融合ポリペプチド。
(項目28)
項目20に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
(項目29)
β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII活性またはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性を有する融合ポリペプチドを産生するための方法であって、該方法は、該融合ポリペプチドをコードする上記核酸の発現を可能にする条件下で、培地で、項目28に記載の宿主細胞を培養する工程、および生じた培養物から該融合ポリペプチドを回収する工程、を包含する、方法。
(項目30)
宿主細胞によって産生されたポリペプチドのグリコシル化プロフィールを改変するための方法であって、項目1〜19のいずれか1項に記載の核酸を、該宿主細胞に導入する工程を包含する、方法。
(項目31)
宿主細胞によって産生されたポリペプチドのグリコシル化プロフィールを改変するための方法であって、項目20に記載の発現ベクターを、該宿主細胞に導入する工程を包含する、方法。
(項目32)
上記ポリペプチドが、IgGまたはそのフラグメントである、項目30または31に記載の方法。
(項目33)
上記ポリペプチドが、IgG1またはそのフラグメントである、項目32に記載の方法。
(項目34)
上記ポリペプチドが、ヒトIgGのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質である、項目32に記載の方法。
(項目35)
宿主細胞によって産生されたポリペプチドのFc領域中のオリゴ糖を改変するのに十分な量の、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII活性またはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性を有する融合ポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞であって、該ポリペプチドが、全抗体分子、抗体フラグメントおよび免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質からなる群より選択される、宿主細胞。
(項目36)
上記宿主細胞により産生された上記ポリペプチドが、IgGまたはそのフラグメントである、項目35に記載の宿主細胞。
(項目37)
上記宿主細胞により産生された上記ポリペプチドが、IgG1またはそのフラグメントである、項目35に記載の宿主細胞。
(項目38)
上記宿主細胞により産生された上記ポリペプチドが、ヒトIgGのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質である、項目35に記載の宿主細胞。
(項目39)
上記宿主細胞により産生された上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したFcレセプター結合親和性を示す、項目35に記載の宿主細胞。
(項目40)
上記宿主細胞により産生された上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したエフェクター機能を示す、項目35に記載の宿主細胞。
(項目41)
上記融合ポリペプチドが、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIIまたはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼの触媒ドメインを含む、項目35に記載の宿主細胞。
(項目42)
上記融合ポリペプチドが、異種ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインをさらに含む、項目41に記載の宿主細胞。
(項目43)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIIの局在化ドメインである、項目42に記載の宿主細胞。
(項目44)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIの局在化ドメインである、項目42に記載の宿主細胞。
(項目45)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIの局在化ドメインである、項目42に記載の宿主細胞。
(項目46)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIの局在化ドメインである、項目42に記載の宿主細胞。
(項目47)
上記ゴルジ局在化ドメインが、α1−6コアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである、項目42に記載の宿主細胞。
(項目48)
上記増加したエフェクター機能が、増加したFc媒介性細胞傷害性である、項目40に記載の宿主細胞。
(項目49)
上記増加したエフェクター機能が、NK細胞に対する増加した結合である、項目40に記載の宿主細胞。
(項目50)
上記増加したエフェクター機能が、マクロファージに対する増加した結合である、項目40に記載の宿主細胞。
(項目51)
上記増加したエフェクター機能が、多形核細胞に対する増加した結合である、項目40に記載の宿主細胞。
(項目52)
上記増加したエフェクター機能が、単球に対する増加した結合である、項目40に記載の宿主細胞。
(項目53)
上記増加したエフェクター機能が、増加した、直接シグナル伝達に誘導されたアポトーシスである、項目40に記載の宿主細胞。
(項目54)
上記増加したエフェクター機能が、増加した樹状細胞成熟である、項目40に記載の宿主細胞。
(項目55)
上記増加したエフェクター機能が、増加したT細胞プライミングである、項目40に記載の宿主細胞。
(項目56)
上記Fcレセプターが、Fcγ活性化レセプターである、項目39に記載の宿主細胞。
(項目57)
上記Fcレセプターが、FcγRIIIAレセプターである、項目39に記載の宿主細胞。
(項目58)
上記宿主細胞が、CHO細胞、BHK細胞、NSO細胞、SP2/0細胞、YO骨髄腫細胞、P3X63マウス骨髄腫細胞、PER細胞、PER.C6細胞またはハイブリドーマ細胞である、項目35に記載の宿主細胞。
(項目59)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、抗CD20抗体である、項目35に記載の宿主細胞。
(項目60)
上記抗CD20抗体が、IDEC−C2B8である、項目59に記載の宿主細胞。
(項目61)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、キメラ抗ヒト腎細胞癌モノクローナル抗体chG250である、項目35に記載の宿主細胞。
(項目62)
項目35に記載の宿主細胞であって、抗体分子および抗体フラグメントまたは免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質をコードする少なくとも一つの切断された核酸をさらに含む、宿主細胞。
(項目63)
項目35に記載の宿主細胞であって、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII活性またはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性を有する融合ポリペプチドをコードする上記少なくとも一つの核酸が、構成的プロモーターエレメントに作動可能に連結される、宿主細胞。
(項目64)
項目62に記載の宿主細胞であって、上記少なくとも一つの切断された核酸が、抗CD20抗体、キメラ抗ヒト神経芽腫モノクローナル抗体chCE7、キメラ抗ヒト腎細胞癌モノクローナル抗体chG250、キメラ抗ヒト結腸癌、肺癌および乳癌モノクローナル抗体ING−1、ヒト化抗ヒト17−1A抗原モノクローナル抗体3622W94、ヒト化抗ヒト結腸直腸腫瘍抗体A33、GD3ガングリオシドに対して指向された抗ヒト黒色腫抗体R24、キメラ抗ヒト扁平上皮癌モノクローナル抗体SF−25、抗ヒトEGFR抗体、抗ヒトEGFRvIII抗体、抗ヒトPSMA抗体、抗ヒトPSCA抗体、抗ヒトCD22抗体、抗ヒトCD30抗体、抗ヒトCD33抗体、抗ヒトCD38抗体、抗ヒトCD40抗体、抗ヒトCD45抗体、抗ヒトCD52抗体、抗ヒトCD138抗体、抗ヒトHLA−DR改変抗体、抗ヒトEpCAM抗体、抗ヒトCEA抗体、抗ヒトMUC1抗体、抗ヒトMUC1コアタンパク質抗体、抗ヒト異所性グリコシル化MUC1抗体、ED−Bドメインを含むヒトフィブロネクチン改変体に対する抗体、または抗ヒトHER2/neu抗体をコードする、宿主細胞。
(項目65)
宿主細胞中で、ポリペプチドを産生するための方法であって、該方法は、以下:
a β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII活性またはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性を有する融合ポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞を、免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む全抗体分子、抗体フラグメントおよび融合タンパク質からなる群より選択されるポリペプチドの産生を可能にする条件下で、培養する工程であって、該融合ポリペプチドが、該宿主細胞によって産生された該ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖を改変するのに十分な量で発現される、工程;ならびに
b 該ポリペプチドを単離する、工程
を包含する、方法。
(項目66)
上記融合ポリペプチドが、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIIまたはβ(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼの触媒ドメインを含む、項目65に記載の方法。
(項目67)
上記融合ポリペプチドが、異種ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインをさらに含む、項目65に記載の方法。
(項目68)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIIの局在化ドメインである、項目67に記載の方法。
(項目69)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIの局在化ドメインである、項目67に記載の方法。
(項目70)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIの局在化ドメインである、項目67に記載の方法。
(項目71)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIの局在化ドメインである、項目67に記載の方法。
(項目72)
上記ゴルジ局在化ドメインが、α1−6コアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである、項目67に記載の方法。
(項目73)
上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したエフェクター機能を有する、項目65に記載の方法。
(項目74)
上記増加したエフェクター機能が、増加したFc媒介性細胞傷害性である、項目73に記載の方法。
(項目75)
上記増加したエフェクター機能が、NK細胞に対する増加した結合である、項目73に記載の方法。
(項目76)
上記増加したエフェクター機能が、マクロファージに対する増加した結合である、項目73に記載の方法。
(項目77)
上記増加したエフェクター機能が、単球に対する増加した結合である、項目73に記載の方法。
(項目78)
上記増加したエフェクター機能が、多形核細胞に対する増加した結合である、項目73に記載の方法。
(項目79)
上記増加したエフェクター機能が、直接シグナル伝達に誘導されたアポトーシスである、項目73に記載の方法。
(項目80)
上記増加したエフェクター機能が、増加した樹状細胞成熟である、項目73に記載の方法。
(項目81)
上記増加したエフェクター機能が、増加したT細胞プライミングである、項目73に記載の方法。
(項目82)
上記宿主細胞により産生された上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したFcレセプター結合親和性を示す、項目65に記載の方法。
(項目83)
上記Fcレセプターが、Fc活性化レセプターである、項目82に記載の方法。
(項目84)
上記Fcレセプターが、FcγRIIIAレセプターである、項目82に記載の方法。
(項目85)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、該ポリペプチドのFc領域における増加した割合の二分されたオリゴ糖を有する、項目65に記載の方法。
(項目86)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、該ポリペプチドのFc領域における増加した割合の非フコシル化オリゴ糖を有する、項目65に記載の方法。
(項目87)
上記非フコシル化オリゴ糖がハイブリッドである、項目86に記載の方法。
(項目88)
上記非フコシル化オリゴ糖が複合体である、項目86に記載の方法。
(項目89)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、該ポリペプチドのFc領域における増加した割合の二分された非フコシル化オリゴ糖を有する、項目65に記載の方法。
(項目90)
上記二分された非フコシル化オリゴ糖がハイブリッドである、項目89に記載の方法。
(項目91)
上記二分された非フコシル化オリゴ糖が複合体である、項目89に記載の方法。
(項目92)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも20%が、二分され、非フコシル化される、項目89に記載の方法。
(項目93)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも25%が、二分され、非フコシル化される、項目89に記載の方法。
(項目94)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも30%が、二分され、非フコシル化される、項目89に記載の方法。
(項目95)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも35%が、二分され、非フコシル化される、項目89に記載の方法。
(項目96)
項目65〜96のいずれか1項に記載の方法によって産生された、増加したエフェクター機能を有するように操作された、抗体。
(項目97)
項目65〜96のいずれか1項に記載の方法によって産生された、増加したFcレセプター結合親和性を有するように操作された、抗体。
(項目98)
上記増加したエフェクター機能が、増加したFc媒介性細胞傷害性である、項目97に記載の抗体。
(項目99)
上記増加したエフェクター機能が、NK細胞に対する増加した結合である、項目97に記載の抗体。
(項目100)
上記増加したエフェクター機能が、マクロファージに対する増加した結合である、項目97に記載の抗体。
(項目101)
上記増加したエフェクター機能が、単球に対する増加した結合である、項目97に記載の抗体。
(項目102)
上記増加したエフェクター機能が、多形核細胞に対する増加した結合である、項目97に記載の抗体。
(項目103)
上記増加したエフェクター機能が、直接シグナル伝達に誘導されたアポトーシスである、項目97に記載の抗体。
(項目104)
上記増加したエフェクター機能が、増加した樹状細胞成熟である、項目97に記載の抗体。
(項目105)
上記増加したエフェクター機能が、増加したT細胞プライミングである、項目97に記載の抗体。
(項目106)
上記Fcレセプターが、Fc活性化レセプターである、項目98に記載の抗体。
(項目107)
上記Fcレセプターが、FcγRIIIaレセプターである、項目98に記載の抗体。
(項目108)
Fc領域を含み、項目65〜96のいずれか1項に記載の方法によって産生された、増加したエフェクター機能を有するように操作された、抗体フラグメント。
(項目109)
免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含み、項目65〜96のいずれか1項に記載の方法によって産生された、増加したエフェクター機能を有するように操作された、融合タンパク質。
(項目110)
Fc領域を含み、項目65〜96のいずれか1項に記載の方法によって産生された、増加したFcレセプター結合親和性を有するように操作された、抗体フラグメント。
(項目111)
免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含み、項目65〜96のいずれか1項に記載の方法によって産生された、増加したFcレセプター結合親和性を有するように操作された、融合タンパク質。
(項目112)
項目97〜108のいずれか1項に記載の抗体および薬学的に受容可能なキャリアを含有する、薬学的組成物。
(項目113)
項目109または111に記載の抗体フラグメントおよび薬学的に受容可能なキャリアを含有する、薬学的組成物。
(項目114)
項目110または112に記載の融合タンパク質および薬学的に受容可能なキャリアを含有する、薬学的組成物。
(項目115)
処置の必要な患者に、治療的に有効量の項目113〜115のいずれか1項に記載の薬学的組成物を投与する工程を包含する、癌の処置のための方法。
(項目116)
B細胞枯渇に基づく疾患処置のための改良された方法であって、該方法は、治療的に有効量の抗体を、それを必要とするヒト被験体に投与する工程を包含し、該改良は、項目65〜96のいずれか1項に記載の方法により産生された抗体の治療的に有効量を投与する工程を包含する、方法。
(項目117)
上記抗体が、抗CD20モノクローナル抗体である、項目117に記載の改良された方法。
(項目118)
上記抗CD20抗体が、IDEC−C2B8である、項目118に記載の改良された方法。
(項目119)
融合ポリペプチドをコードする配列を含む単離された核酸であって、ここで、該融合ポリペプチドは、β(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性を有し、そして、ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインを含む、核酸。
(項目120)
上記融合ポリペプチドが、β(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼの触媒ドメインを含む、項目119に記載の単離された核酸。
(項目121)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIIの局在化ドメインである、項目2に記載の単離された核酸。
(項目122)
項目119〜121のいずれか1項に記載の単離された核酸を含む、発現ベクター。
(項目123)
β(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性を有し、そして、異種ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインを含む、融合ポリペプチド。
(項目124)
β(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼの触媒ドメインを含む、項目123に記載の融合ポリペプチド。
(項目125)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIIの局在化ドメインである、項目124に記載の融合ポリペプチド。
(項目126)
項目122に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
(項目127)
β(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性を有する融合ポリペプチドを産生するための方法であって、該方法は、該融合ポリペプチドをコードする上記核酸の発現を可能にする条件下で、培地で、項目126に記載の宿主細胞を培養する工程、および生じた培養物から該融合ポリペプチドを回収する工程、を包含する、方法。
(項目128)
宿主細胞によって産生されたポリペプチドのグリコシル化プロフィールを改変するための方法であって、項目119〜121のいずれか1項に記載の核酸を、該宿主細胞に導入する工程を包含する、方法。
(項目129)
宿主細胞によって産生されたポリペプチドのグリコシル化プロフィールを改変するための方法であって、項目122に記載の発現ベクターを、該宿主細胞に導入する工程を包含する、方法。
(項目130)
宿主細胞であって、以下:
(a)融合ポリペプチドをコードする核酸分子を含む発現ベクターであって、該融合ポリペプチドが、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(GnT III)活性を有し、ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインを含む、発現ベクター;および
(b)ポリペプチドをコードする核酸分子を含む発現ベクターであって、該ポリペプチドが、マンノシダーゼII(ManII)活性を有する、発現ベクター
を含む、宿主細胞。
(項目131)
項目130に記載の宿主細胞であって、上記融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子およびマンノシダーゼ活性IIを有する上記ポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目132)
項目130に記載の宿主細胞であって、上記融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子およびManII活性を有する上記ポリペプチドをコードする上記核酸分子が、別々の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目133)
上記融合ポリペプチドが、GnTIIIの触媒ドメインを含む、項目130に記載の宿主細胞。
(項目134)
上記ゴルジ局在化ドメインが、ManIIの局在化ドメインである、項目130に記載の宿主細胞。
(項目135)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIの局在化ドメインである、項目130に記載の宿主細胞。
(項目136)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIの局在化ドメインである、項目130に記載の宿主細胞。
(項目137)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIの局在化ドメインである、項目130に記載の宿主細胞。
(項目138)
上記ゴルジ局在化ドメインが、α1,6−Nコアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである、項目130に記載の宿主細胞。
(項目139)
上記宿主細胞が、哺乳動物細胞、酵母細胞、昆虫細胞または植物細胞からなる群より選択される、項目130に記載の宿主細胞。
(項目140)
上記宿主細胞が、CHO細胞、BHK細胞、NSO細胞、SP2/0細胞、YO骨髄腫細胞、P3X63マウス骨髄腫細胞、PER細胞、PER.C6細胞およびハイブリドーマ細胞からなる群より選択される、項目130に記載の宿主細胞。
(項目141)
項目130に記載の宿主細胞であって、ポリペプチドをコードする核酸分子を含む発現ベクターをさらに含み、ここで、該ポリペプチドが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニル−トランスフェラーゼII(GnT II)活性を有する、宿主細胞。
(項目142)
項目141に記載の宿主細胞であって、ここで、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子、ManII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目143)
項目141に記載の宿主細胞であって、ここで、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子、ManII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする核酸分子が、それぞれ別々の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目144)
項目141に記載の宿主細胞であって、ここで、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子が一つの発現ベクター上に存在し、そして、ManII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目145)
項目141に記載の宿主細胞であって、ここで、ManIIをコードする上記核酸分子が一つの発現ベクター上に存在し、そして、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目146)
項目141に記載の宿主細胞であって、ここで、上記GnT IIをコードする上記核酸分子が一つの発現ベクター上に存在し、そして、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子およびManII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目147)
宿主細胞であって、以下:
(a)融合ポリペプチドをコードする核酸分子を含む発現ベクターであって、該融合ポリペプチドが、β(1,4)−ガラクトシルトランスフェラーゼ(GalT)活性を有し、そしてゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインを含む、発現ベクター;および
(b)ポリペプチドをコードする核酸分子を含む発現ベクターであって、該ポリペプチドが、マンノシダーゼII(ManII)活性を有する、発現ベクター
を含む、宿主細胞。
(項目148)
項目147に記載の宿主細胞であって、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子およびマンノシダーゼ活性IIを有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目149)
項目147に記載の宿主細胞であって、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子およびManII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、別々の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目150)
上記融合ポリペプチドが、GalTの触媒ドメインを含む、項目147に記載の宿主細胞。
(項目151)
上記ゴルジ局在化ドメインが、ManIIの局在化ドメインである、項目147に記載の宿主細胞。
(項目152)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIの局在化ドメインである、項目147に記載の宿主細胞。
(項目153)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIの局在化ドメインである、項目147に記載の宿主細胞。
(項目154)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIの局在化ドメインである、項目147に記載の宿主細胞。
(項目155)
上記ゴルジ局在化ドメインが、α1,6−Nコアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである、項目147に記載の宿主細胞。
(項目156)
上記宿主細胞が、哺乳動物細胞、酵母細胞、昆虫細胞または植物細胞からなる群より選択される、項目147に記載の宿主細胞。
(項目157)
上記宿主細胞が、CHO細胞、BHK細胞、NSO細胞、SP2/0細胞、YO骨髄腫細胞、P3X63マウス骨髄腫細胞、PER細胞、PER.C6細胞およびハイブリドーマ細胞からなる群より選択される、項目147に記載の宿主細胞。
(項目158)
項目147に記載の宿主細胞であって、ポリペプチドをコードする核酸分子を含む発現ベクターをさらに含み、ここで、該ポリペプチドが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニル−トランスフェラーゼII(GnT II)活性を有する、宿主細胞。
(項目159)
項目158に記載の宿主細胞であって、ここで、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子、ManII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目160)
項目158に記載の宿主細胞であって、ここで、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子、ManII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、それぞれ別々の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目161)
項目158に記載の宿主細胞であって、ここで、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子が一つの発現ベクター上に存在し、そして、ManII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目162)
項目158に記載の宿主細胞であって、ここで、ManIIをコードする上記核酸分子が一つの発現ベクター上に存在し、そして、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目163)
項目158に記載の宿主細胞であって、ここで、上記GnT IIをコードする上記核酸分子が一つの発現ベクター上に存在し、そして、融合ポリペプチドをコードする上記核酸分子およびManII活性を有するポリペプチドをコードする上記核酸分子が、同一の発現ベクター上に存在する、宿主細胞。
(項目164)
上記融合ポリペプチドが、GalTの触媒ドメインを含む、項目158に記載の宿主細胞。
(項目165)
上記ゴルジ局在化ドメインが、ManIIの局在化ドメインである、項目158に記載の宿主細胞。
(項目166)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIの局在化ドメインである、項目158に記載の宿主細胞。
(項目167)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIの局在化ドメインである、項目158に記載の宿主細胞。
(項目168)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIの局在化ドメインである、項目158に記載の宿主細胞。
(項目169)
上記ゴルジ局在化ドメインが、α1,6−コアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである、項目158に記載の宿主細胞。
(項目170)
上記宿主細胞が、哺乳動物細胞、酵母細胞、昆虫細胞または植物細胞からなる群より選択される、項目158に記載の宿主細胞。
(項目171)
上記宿主細胞が、CHO細胞、BHK細胞、NSO細胞、SP2/0細胞、YO骨髄腫細胞、P3X63マウス骨髄腫細胞、PER細胞、PER.C6細胞およびハイブリドーマ細胞からなる群より選択される、項目159に記載の宿主細胞。
(項目172)
宿主細胞によって産生されたポリペプチドのFc領域中のオリゴ糖を改変するのに十分な量の、GnTIII活性を有する融合ポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸およびManII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞であって、該宿主細胞により産生される該ポリペプチドが、全抗体分子、抗体フラグメントおよび免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む融合
タンパク質からなる群より選択される、宿主細胞。
(項目173)
宿主細胞によって産生されたポリペプチドのFc領域中のオリゴ糖を改変するのに十分な量の、GnTIII活性を有する融合ポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸、ManIIを有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞であって、該宿主細胞により産生される該ポリペプチドが、全抗体分子、抗体フラグメントおよび免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質からなる群より選択される、宿主細胞。
(項目174)
宿主細胞によって産生されたポリペプチドのFc領域中のオリゴ糖を改変するのに十分な量の、GalT活性を有する融合ポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸およびManII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞であって、該宿主細胞により産生される該ポリペプチドが、全抗体分子、抗体フラグメントおよび免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質からなる群より選択される、宿主細胞。
(項目175)
宿主細胞によって産生されたポリペプチドのFc領域中のオリゴ糖を改変するのに十分な量の、GalT活性を有する融合ポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸、ManIIを有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞であって、該宿主細胞により産生される該ポリペプチドが、全抗体分子、抗体フラグメントおよび免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質からなる群より選択される、宿主細胞。
(項目176)
上記宿主細胞により産生された上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したFcレセプター結合親和性を示す、項目172〜175のいずれか1項に記載の宿主細胞。
(項目177)
上記宿主細胞により産生された上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したエフェクター機能を示す、項目172〜175のいずれか1項に記載の宿主細胞。
(項目178)
上記増加したエフェクター機能が、増加したFc媒介性細胞傷害性である、項目177に記載の宿主細胞。
(項目179)
上記増加したエフェクター機能が、NK細胞に対する増加した結合である、項目177に記載の宿主細胞。
(項目180)
上記増加したエフェクター機能が、マクロファージに対する増加した結合である、項目177に記載の宿主細胞。
(項目181)
上記増加したエフェクター機能が、多形核細胞に対する増加した結合である、項目177に記載の宿主細胞。
(項目182)
上記増加したエフェクター機能が、単球に対する増加した結合である、項目177に記載の宿主細胞。
(項目183)
上記増加したエフェクター機能が、増加した、直接シグナル伝達に誘導されたアポトーシスである、項目177に記載の宿主細胞。
(項目184)
上記増加したエフェクター機能が、増加した樹状細胞成熟である、項目177に記載の宿主細胞。
(項目185)
上記増加したエフェクター機能が、増加したT細胞プライミングである、項目177に記載の宿主細胞。
(項目186)
宿主細胞中で、ポリペプチドを産生するための方法であって、該方法は、以下:
a.GnTIII活性を有する融合ポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸およびManII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞を、全抗体分子、抗体フラグメントおよび免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質からなる群より選択されるポリペプチドの産生を可能にする条件下で、培養する工程であって、該融合ポリペプチドが、該宿主細胞によって産生された該ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖を改変するのに十分な量で発現される、工程;ならびに
b.該ポリペプチドを単離する、工程
を包含する、方法。
(項目187)
上記宿主細胞が、GnTII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するようにさらに操作される、項目186に記載の方法。
(項目188)
上記融合ポリペプチドが、GnTIIIの触媒ドメインを含む、項目186または187に記載の方法。
(項目189)
上記融合ポリペプチドが、異種ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインをさらに含む、項目188に記載の方法。
(項目190)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIIの局在化ドメインである、項目189に記載の方法。
(項目191)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIの局在化ドメインである、項目189に記載の方法。
(項目192)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIの局在化ドメインである、項目189に記載の方法。
(項目193)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIの局在化ドメインである、項目189に記載の方法。
(項目194)
上記ゴルジ局在化ドメインが、α1−6コアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである、項目189に記載の方法。
(項目195)
上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したエフェクター機能を有する、項目186に記載の方法。
(項目196)
宿主細胞中で、ポリペプチドを産生するための方法であって、該方法は、以下:
a.GalT活性を有する融合ポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸およびManII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞を、全抗体分子、抗体フラグメントおよび免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質からなる群より選択されるポリペプチドの産生を可能にする条件下で、培養する工程であって、該融合ポリペプチドが、該宿主細胞によって産生された該ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖を改変するのに十分な量で発現される、工程;ならびに
b.該ポリペプチドを単離する、工程
を包含する、方法。
(項目197)
上記宿主細胞が、GnTII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するようにさらに操作される、項目197に記載の方法。
(項目198)
上記融合ポリペプチドが、GalTの触媒ドメインを含む、項目196または197に記載の方法。
(項目199)
上記融合ポリペプチドが、異種ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインをさらに含む、項目198に記載の方法。
(項目200)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIIの局在化ドメインである、項目199に記載の方法。
(項目201)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIの局在化ドメインである、項目199に記載の方法。
(項目202)
上記ゴルジ局在化ドメインが、マンノシダーゼIの局在化ドメインである、項目199に記載の方法。
(項目203)
上記ゴルジ局在化ドメインが、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIの局在化ドメインである、項目199に記載の方法。
(項目204)
上記ゴルジ局在化ドメインが、α1−6コアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである、項目199に記載の方法。
(項目205)
上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したエフェクター機能を有する、項目199に記載の方法。
(項目206)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、該ポリペプチドのFc領域における増加した割合の二分された非フコシル化オリゴ糖を有する、項目186または196に記載の方法。
(項目207)
上記二分された非フコシル化オリゴ糖がハイブリッドである、項目206に記載の方法。
(項目208)
上記二分された非フコシル化オリゴ糖が複合体である、項目206に記載の方法。
(項目209)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも20%が、二分され、非フコシル化される、項目206に記載の方法。
(項目210)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも25%が、二分され、非フコシル化される、項目206に記載の方法。
(項目211)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも30%が、二分され、非フコシル化される、項目206に記載の方法。
(項目212)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも35%が、二分され、非フコシル化される、項目206に記載の方法。
(項目213)
項目196〜212のいずれか1項に記載の方法によって産生された、増加したエフェクター機能を有するように操作された、抗体。
(項目214)
項目213に記載される抗体および薬学的に受容可能なキャリアを含有する薬学的組成物。
(項目215)
処置の必要な患者に、治療的に有効量の項目214に記載の薬学的組成物を投与する工程を包含する、癌の処置のための方法。
(項目216)
宿主細胞中で、増加したFc媒介性細胞傷害性を有するポリペプチドを産生するための方法であって、該方法は、以下:
a.GalTをコードする少なくとも一つの核酸およびManIIをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞を、全抗体分子、免疫グロブリンのFc領域を含む抗体フラグメントからなる群より選択されるポリペプチドの産生を可能にする条件下で培養する工程であって、ここで、GalTまたはManIIのいずれか一つまたは両方の発現レベルが、該宿主細胞によって産生された該ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖を改変するのに十分であり、そして、該ポリペプチドが、該改変の結果として増加したFc媒介性細胞傷害性を有する、工程;ならびに
b.増加したFc媒介性細胞傷害性を有する該ポリペプチドを単離する、工程
を包含する、方法。
(項目217)
工程(a)において、上記宿主細胞が、全抗体をコードする核酸を少なくとも一つ含む、項目216に記載の方法。
(項目218)
工程(a)において、上記宿主細胞が、抗体フラグメントをコードする核酸を少なくとも一つ含む、項目216に記載の方法。
(項目219)
上記GalTの発現レベルが、増加したFc媒介性細胞傷害性を有する免疫グロブリンのFc領域を含む抗体分子または抗体フラグメントを産生する、項目216に記載の方法。
(項目220)
上記宿主細胞が、GnTIIIをコードする核酸を少なくとも一つさらに含み、該GnTIIIが、該宿主細胞によって産生される該ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖を改変するために十分な量で発現され、そして、該ポリペプチドが、該改変の結果として増加したFc媒介性細胞傷害性を有する、項目216に記載の方法。
(項目221)
GalT、ManIIまたはGnTIIIの一つ以上の発現レベルが、上記ポリペプチドのFc領域における二分されたオリゴ糖を形成するのに十分である、項目216または220のいずれか1項に記載の方法。
(項目222)
上記Fc領域における全オリゴ糖に対する該Fc領域における二分されたオリゴ糖の割合が、少なくとも45%である、項目221に記載の方法。
(項目223)
上記二分されたオリゴ糖が、複合体である、項目221に記載の方法。
(項目224)
上記二分されたオリゴ糖が、ハイブリッドである、項目221に記載の方法。
(項目225)
上記宿主細胞が、哺乳動物細胞、酵母細胞、昆虫細胞または植物細胞からなる群より選択される、項目216または220のいずれか1項に記載の方法。
(項目226)
上記宿主細胞が、植物細胞である、項目225に記載の方法。
(項目227)
上記宿主細胞が、CHO細胞、BHK細胞、NSO細胞、SP2/0細胞、YO骨髄腫細胞、P3X63マウス骨髄腫細胞、PER細胞、PER.C6細胞およびハイブリドーマ細胞からなる群より選択される、項目216または220のいずれか1項に記載の方法。
(項目228)
宿主細胞中で、ポリペプチドを産生するための方法であって、該方法は、以下:
a.α−マンノシダーゼII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸を発現するように操作された宿主細胞を、免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む、全抗体分子、抗体フラグメントおよび融合タンパク質からなる群より選択されるポリペプチドの産生を可能にする条件下で、培養する工程であって、α−マンノシダーゼII活性を有する該ポリペプチドが、該宿主細胞によって産生された該ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖を改変するのに十分な量で発現される、工程;ならびに
b.該宿主細胞によって産生された該ポリペプチドを単離する、工程
を包含する、方法。
(項目229)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したエフェクター機能を有する、項目228に記載の方法。
(項目230)
上記増加したエフェクター機能が、増加したFc媒介性細胞傷害性である、項目229に記載の方法。
(項目231)
上記増加したエフェクター機能が、NK細胞に対する増加した結合である、項目229に記載の方法。
(項目232)
上記増加したエフェクター機能が、マクロファージに対する増加した結合である、項目229に記載の方法。
(項目233)
上記増加したエフェクター機能が、多形核細胞に対する増加した結合である、項目229に記載の方法。
(項目234)
上記増加したエフェクター機能が、単球に対する増加した結合である、項目229に記載の方法。
(項目235)
上記増加したエフェクター機能が、増加した、直接シグナル伝達に誘導されたアポトーシスである、項目229に記載の方法。
(項目236)
上記増加したエフェクター機能が、増加した樹状細胞成熟である、項目229に記載の方法。
(項目237)
上記増加したエフェクター機能が、増加したT細胞プライミングである、項目229に記載の方法。
(項目238)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、上記改変の結果として増加したFcレセプター結合を示す、項目228に記載の方法。
(項目239)
上記Fcレセプターが、Fcγ活性化レセプターである、項目238に記載の方法。
(項目240)
上記Fcレセプターが、FcγRIIIAレセプターである、項目238に記載の方法。
(項目241)
上記宿主細胞が、CHO細胞、BHK細胞、NSO細胞、SP2/0細胞、YO骨髄腫細胞、P3X63マウス骨髄腫細胞、PER細胞、PER.C6細胞またはハイブリドーマ細胞である、項目228に記載の方法。
(項目242)
上記宿主細胞によって産生される上記ポリペプチドが、抗CD20抗体である、項目228に記載の方法。
(項目243)
上記抗CD20抗体が、IDEC−C2B8である、項目228に記載の方法。
(項目244)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、キメラ抗ヒト腎細胞癌モノクローナル抗体chG250である、項目228に記載の方法。
(項目245)
項目228に記載の方法であって、上記宿主細胞が、抗体分子および抗体フラグメントまたは免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含む融合タンパク質をコードする少なくとも一つの切断された核酸をさらに含む、方法。
(項目246)
項目245に記載の方法であって、上記少なくとも一つの切断された核酸が、抗CD20抗体、キメラ抗ヒト神経芽腫モノクローナル抗体chCE7、キメラ抗ヒト腎細胞癌モノクローナル抗体chG250、キメラ抗ヒト結腸癌、肺癌および乳癌モノクローナル抗体ING−1、ヒト化抗ヒト17−1A抗原モノクローナル抗体3622W94、ヒト化抗ヒト結腸直腸腫瘍抗体A33、GD3ガングリオシドに対して指向された抗ヒト黒色腫抗体R24、キメラ抗ヒト扁平上皮癌モノクローナル抗体SF−25、抗ヒトEGFR抗体、抗ヒトEGFRvIII抗体、抗ヒトPSMA抗体、抗ヒトPSCA抗体、抗ヒトCD22抗体、抗ヒトCD30抗体、抗ヒトCD33抗体、抗ヒトCD38抗体、抗ヒトCD40抗体、抗ヒトCD45抗体、抗ヒトCD52抗体、抗ヒトCD138抗体、抗ヒトHLA−DR改変抗体、抗ヒトEpCAM抗体、抗ヒトCEA抗体、抗ヒトMUC1抗体、抗ヒトMUC1コアタンパク質抗体、抗ヒト異所性グリコシル化MUC1抗体、ED−Bドメインを含むヒトフィブロネクチン改変体に対する抗体、抗ヒトTAG−72抗体または抗ヒトHER2/neu抗体をコードする、方法。
(項目247)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、該ポリペプチドのFc領域における増加した割合の二分されたオリゴ糖を有する、項目228に記載の方法。
(項目248)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、該ポリペプチドのFc領域における増加した割合の非フコシル化オリゴ糖を有する、項目228に記載の方法。
(項目249)
上記非フコシル化オリゴ糖が、ハイブリッドである、項目248に記載の方法。
(項目250)
上記非フコシル化オリゴ糖が、複合体である、項目248に記載の方法。
(項目251)
上記宿主細胞によって産生された上記ポリペプチドが、該ポリペプチドのFc領域における増加した割合の二分された非フコシル化オリゴ糖を有する、項目228に記載の方法。
(項目252)
上記二分された非フコシル化オリゴ糖がハイブリッドである、項目251に記載の方法。
(項目253)
上記二分された非フコシル化オリゴ糖が複合体である、項目251に記載の方法。
(項目254)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも20%が、非フコシル化される、項目248に記載の方法。
(項目255)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも25%が、非フコシル化される、項目248に記載の方法。
(項目256)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも30%が、非フコシル化される、項目248に記載の方法。
(項目257)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも35%が、非フコシル化される、項目248に記載の方法。
(項目258)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも40%が、非フコシル化される、項目248に記載の方法。
(項目259)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも45%が、非フコシル化される、項目248に記載の方法。
(項目260)
上記ポリペプチドのFc領域におけるオリゴ糖の少なくとも48%が、非フコシル化される、項目248に記載の方法。
(項目261)
項目228に記載の方法によって産生された、増加したエフェクター機能を有するように操作された、抗体。
(項目262)
項目228に記載の方法によって産生された、増加したFcレセプター結合親和性を有するように操作された、抗体。
(項目263)
上記増加したエフェクター機能が、増加したFc媒介性細胞傷害性である、項目261に記載の抗体。
(項目264)
上記増加したエフェクター機能が、NK細胞に対する増加した結合である、項目261に記載の抗体。
(項目265)
上記増加したエフェクター機能が、マクロファージに対する増加した結合である、項目261に記載の抗体。
(項目266)
上記増加したエフェクター機能が、単球に対する増加した結合である、項目261に記載の抗体。
(項目267)
上記増加したエフェクター機能が、多形核細胞に対する増加した結合である、項目261に記載の抗体。
(項目268)
上記増加したエフェクター機能が、直接シグナル伝達に誘導されたアポトーシスである、項目261に記載の抗体。
(項目269)
上記増加したエフェクター機能が、増加した樹状細胞成熟である、項目261に記載の抗体。
(項目270)
上記増加したエフェクター機能が、増加したT細胞プライミングである、項目261に記載の抗体。
(項目271)
上記Fcレセプターが、Fc活性化レセプターである、項目262に記載の抗体。
(項目272)
上記Fcレセプターが、FcγRIIIaレセプターである、項目262に記載の抗体。
(項目273)
Fc領域を含み、項目228に記載の方法によって産生された、増加したエフェクター機能を有するように操作された、抗体フラグメント。
(項目274)
免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含み、項目228に記載の方法によって産生された、増加したエフェクター機能を有するように操作された、融合タンパク質。
(項目275)
Fc領域を含み、項目228に記載の方法によって産生された、増加したFcレセプター結合親和性を有するように操作された、抗体フラグメント。
(項目276)
免疫グロブリンのFc領域に相当する領域を含み、項目228に記載の方法によって産生された、増加したFcレセプター結合親和性を有するように操作された、融合タンパク質。
(項目277)
項目261〜272のいずれか1項に記載の抗体および薬学的に受容可能なキャリアを含有する、薬学的組成物。
(項目278)
項目273または275に記載の抗体フラグメントおよび薬学的に受容可能なキャリアを含有する、薬学的組成物。
(項目279)
項目274または276に記載の融合タンパク質および薬学的に受容可能なキャリアを含有する、薬学的組成物。
(項目280)
処置の必要な患者に、治療的に有効量の項目277〜279のいずれか1項に記載の薬学的組成物を投与する工程を包含する、腫瘍の処置のための方法。
(項目281)
B細胞枯渇に基づく疾患処置のための改良された方法であって、該方法は、治療的に有効量の抗体を、それを必要とするヒト被験体に投与する工程を包含し、該改良は、項目228に記載の方法により産生された抗体の治療的に有効量を投与する工程を包含する、方法。
(項目282)
上記抗体が、抗CD20モノクローナル抗体である、項目281に記載の改良された方法。
(項目283)
上記核酸分子が、配列番号17を含む、項目228に記載の方法。
(項目284)
上記α−マンノシダーゼIIを有するポリペプチドが、配列番号18を含む、項目228に記載の方法。
(項目285)
配列番号19を含む、項目121に記載の単離された核酸分子。
(項目286)
配列番号20を含む、項目125に記載の融合ポリペプチド。
以下で定義しない限り、当該分野で一般的に使用されている用語を本明細書中で使用する。
the International Union of Biochemistry
and Molecular Biology(NC−IUBMB)にしたがってUDP−Gal:GlcNAc β−1,4−ガラクトシルトランスフェラーゼ(EC 2.4.1.38)としても公知のβ−1,4−ガラクトシルトランスフェラーゼ活性に類似するが同一である必要はない酵素活性を示す融合ポリペプチドが含まれる。用量依存性である場合、β−1,4−ガラクトシルトランスフェラーゼ用量依存性と同一である必要はないが、むしろβ−1,4−ガラクトシルトランスフェラーゼと比較した所与の活性における用量依存性が実質的に類似する(すなわち、候補ポリペプチドは、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIIと比較して、多くとも約25倍未満の活性、好ましくは多くとも約10倍未満の活性、最も好ましくは多くとも約3倍未満の活性を示す)。
2)このアッセイは、エフェクター細胞として無作為に選択した健常なドナーの血液から単離したヒト末梢血単核細胞(PBMC)を使用する;
3)このアッセイは、以下のプロトコールにしたがって実施する:
i)標準的な密度遠心分離手順を使用してPBMCを単離し、RPMI細胞培養培地中で5×106細胞/mlに懸濁する;
ii)標準的な組織培養法によって標的細胞を成長させ、90%を超える生存度の指数成長期から回収し、RPMI細胞培養培地で洗浄し、100μCiの51Crで標識、細胞培養培地で2回洗浄し、105細胞/mlの密度で細胞培養培地中に懸濁する;
iii)100μlの上記最終標的細胞懸濁液を、96ウェルマイクロタイタープレートの各ウェルに移す;
iv)抗体を、細胞培養培地中で4000ng/mlから0.04ng/mlまで連続希釈し、50μlの得られた抗体溶液を、96ウェルマイクロタイタープレート中の標的細胞に添加し、上記全濃度範囲を対象とする三連の種々の抗体濃度で試験する;
v)最大放出(MR)コントロールのために、標識標的細胞を含むプレート中の3つのさらなるウェルに、抗体溶液の代わりに50μlの2%(V/V)非イオン性界面活性剤水溶液(Nonidet,Sigma,St.Louis)を加える(上記のiv);
vi)自発的放出(SR)コントロールのために、標識標的細胞を含むプレート中の3つのさらなるウェルに、抗体溶液の代わりに50μlのRPMI細胞培養培地を加える(上記のiv);
vii)次いで、96ウェルマイクロタイタープレートを、50×gで1分間遠心分離し、4℃で1時間インキュベートする;
viii)25:1のエフェクター:標的細胞比が得られるように50μlのPBMC上清(上記i)を各ウェルに添加し、プレートを5%CO2大気下にて37℃で4時間インキュベートする;
ix)各ウェル由来の無細胞上清を回収し、ガンマカウンターを使用して実験的に放出された放射能(ER)を定量する;
x)式(ER−MR)/(MR−SR)×100(式中、ERは抗体濃度について定量した平均放射能であり(上記ixを参照のこと)、MRはMRコントロールについて定量した平均放射能であり(上記vを参照のこと)、SRはSRコントロールについて定量した平均放射能である(上記viを参照のこと))にしたがって、各抗体濃度について特異的溶解の比率を計算する;
4)「ADCCの増加」は、上記試験抗体濃度範囲内で認められた特異的溶解の最大比率の増加および/または上記試験抗体濃度範囲内で認められた特異的溶解の最大比率の半分を達成するのに必要な抗体濃度の減少のいずれかと定義する。ADCCの増加は、当業者に公知の同一の標準的な産生、精製、処方、および保存方法を使用した同一の宿主細胞型によって産生されるが、グリコシルトランスフェラーゼGnTIIIを過剰発現するように操作された宿主細胞によって産生されない同一の抗体によって媒介される上記アッセイを使用して測定したADCCに比例する。
1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼII、マンノシダーゼI、またはα−1,6−コアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである。さらに好ましい実施形態では、宿主細胞は、哺乳動物細胞、酵母細胞、昆虫細胞、および植物細胞からなる群から選択される。好ましくは、宿主細胞は、CHO細胞、BHK細胞、NSO細胞、SP2/0細胞、YO骨髄腫細胞、P3X63マウス骨髄腫細胞、PER細胞、PER.C6細胞、またはハイブリドーマ細胞からなる群から選択される。
。
2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼI、マンノシダーゼI、β(1,2)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼII、またはα−1,6−コアフコシルトランスフェラーゼの局在化ドメインである。好ましくは、上記改変の結果としてポリペプチドのエフェクター機能が増加した。
a.全抗体分子、抗体フラグメント、および免疫グロブリンのFc領域と等価な領域を含む融合タンパク質からなる群から選択されるポリペプチドを産生させる条件下でα−マンノシダーゼII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも1つの核酸を発現するように操作された宿主細胞を培養する工程と、前記宿主細胞によって産生されたポリペプチドのFc領域中のオリゴ糖改変に十分な量で前記α−マンノシダーゼII活性を有するポリペプチドが発現することと、
b.前記宿主細胞によって産生されたポリペプチドを単離する工程とを含む、宿主細胞中でポリペプチドを産生する方法に関する。
本発明は、Fcレセプター、好ましくはFc活性化レセプターの結合親和性および/またはエフェクター機能(抗体依存性細胞傷害性が含まれる)が増加した抗体、Fc領域を含む抗体フラグメント、およびFc領域と等価な領域を含む融合タンパク質の糖形態の産生のための宿主細胞系の作製および使用方法を提供する。グリコシル化パターンの改変が望ましい潜在的な治癒的価値を有する抗体の標的エピトープの同定および作製ならびにそのそれぞれのコードする核酸配列は、本発明の範囲内である。
314:452−54(1985)を使用することができる。これらの技術を使用して、他の哺乳動物の抗体分子から構成されるキメラ抗体も産生することができる。あるいは、単鎖抗体の産生についての技術(米国特許第4,946,778号)を、所望の特異性を有する単鎖抗体を産生するように適合させることができる。本発明は、さらに、本発明の方法にしたがって糖操作したヒト化抗体に関する。ヒト化抗体の作製技術は、例えば、Queen et al.に付与された米国特許第6,180,320号(その内容全体が本明細書中で参考として援用される)に開示されている。
本発明は、グリコシル化パターンが改変されたタンパク質の作製のための宿主細胞発現系を提供する。特に、本発明は、治癒的価値が改良されたタンパク質の糖形態の作製のための宿主細胞系を提供する。したがって、1つの態様では、本発明は、例えば、β(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(GnTIII)活性を有し、且つ異種ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインを含む融合ポリペプチドを発現するように選択または操作された宿主細胞発現系を提供する。詳細には、このような宿主細胞発現系を、構成性または調節されたプロモーター系に作動可能に連結されたこのような融合ポリペプチドをコードする組換え核酸分子を含むように操作することができる。
4:794−805(October 2003)および本明細書中に引用した参考文献(その全体が本明細書中で参考として援用される)を参照のこと)。
当業者に周知の方法を使用して、適切な転写/翻訳調節シグナルと共に目的のタンパク質のコード配列およびβ(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(GnTIII)活性を有し、且つ異種ゴルジ常在ポリペプチドのゴルジ局在化ドメインを含む融合ポリペプチドのコード配列を含む発現ベクターを構築することができる。これらの方法には、インビトロ組換えDNA技術、合成技術、およびインビボ組換え/遺伝子組換えが含まれる。例えば、Maniatis et al.,Molecular Cloning A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,N.Y.(1989)およびAusubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing Associates andWiley Interscience,N.Y(1989)に記載の技術を参照のこと。
コード配列を含み、且つ生物活性遺伝子産物を発現する宿主細胞を、少なくとも4つの以下の一般的アプローチによって同定することができる:(a)DNA−DNAまたはDNA−RNAハイブリッド形成;(b)「マーカー」遺伝子機能の有無、(c)宿主細胞中の各mRNA転写物の発現によって測定した転写レベルのアッセイ、(d)免疫アッセイまたはその生物活性によって測定した遺伝子産物の検出。
(i.エフェクター機能(抗体依存性細胞傷害性が含まれる)が増加した抗体の作製および使用)
好ましい実施形態では、本発明は、Fcレセプター結合および/またはエフェクター機能(抗体依存性細胞傷害性が含まれる)が増加した抗体および抗体フラグメントの糖形態を提供する。
上記考察のように、本発明は、治療抗体のFcレセプター結合親和性および/またはエフェクター機能を増加させる方法に関する。このような抗体のFc領域のグリコシル化パターンの操作、特に、例えば、このような抗体のFc領域に結合するオリゴ糖を改変するGnTIII活性、GalT活性、またはManII活性を有するポリペプチドを産生するための抗体産生細胞の操作によってこれを行う。グリコシル化操作によって誘発された変化がFc領域のみに影響を与え、それによりADCC機構に関与するエフェクター細胞の表面上のFcレセプターとのその相互作用に影響を与えるので、治療抗体だけでなく免疫グロブリンのFc領域と等価な領域を保有する任意の分子によって媒介される望ましくない細胞に対するFc媒介性細胞傷害性を増加するためにこのストラテジーを適用することができる。現在開示されている方法を提供することができるFc含有分子には、(a)Fc領域のN末端に融合したターゲティングタンパク質ドメインから作製された溶解性融合タンパク質(Chamov and Ashkenazi,Trends Biotech.14:52(1996))および(b)Fc領域のN末端に融合した原形質膜に局在化するII型膜貫通ドメインから作製された原形質膜固定融合タンパク質(Stabila,P.F.,Nature Biotech.16:1357(1998))が含まれるが、これらに限定されない。
本発明の抗体(すなわち、抗体、抗体フラグメント、および免疫グロブリンのFc領域と等価な領域を含む融合タンパク質)のみを使用して、インビボで腫瘍細胞を標的および死滅させることができる。ヒト癌を治療するための適切な治療薬と組み合わせて抗体を使用することもできる。例えば、抗体を、化学療法、放射線療法などの標準的または従来の治療方法と組み合わせて使用することができるか、治療薬を癌部位に送達するための薬物または毒素およびリンホカインもしくは腫瘍阻害成長因子と抱合するか結合することができる。
(材料と方法)
(1.抗体発現ベクターの構築)
(抗CD20抗体発現ベクターpETR1502)
C2B8抗CD20抗体発現ベクターpETR1502は、4つの独立した個別の発現カセット(1つはC2B8抗体軽鎖であり、1つはC2B8抗体重鎖であり、1つはネオマイシン耐性遺伝子であり、1つはマウスdhfr遺伝子である)からなる。全遺伝子は、骨髄増殖性肉腫ウイルス(MPSV)プロモーターの調節下にあり、ウサギβ−グロビン遺伝子のポリアデニル化シグナル由来の合成コンセンサスポリアデニル化シグナルを含む。
pETR1520は、エピソームベクター複製およびエプスタイン・バーウイルス核抗原(EBNA)産生細胞中での維持のためにC2B8抗CD20抗体発現ベクターをエプスタイン・バーウイルス(oriP)由来の複製起点と組み合わせる。C2B8発現ベクターpETR1520の構築のために、pETR1416のC2B8発現モジュールをHinDIIIフラグメントとしてoriP含有ベクターpETR1507に挿入した。ベクターpETR1416は、このプラスミド中でネオマイシン耐性遺伝子が最小MPSVプロモーターの代わりに全長MPSVプロモーターの調節下にあること以外はpETR1502に類似する。
このベクターは、C2B8抗CD20抗体の可変重鎖および軽鎖コード領域が抗体L19(フィブロネクチンのED−Bドメインを認識するヒト抗体)の各コード領域に置換されていること以外はベクターpETR1520と同一である。L19抗体の可変領域の配列に基づいた合成オリゴヌクレオチドを使用した重複伸長PCR法によって可変領域コードDNAフラグメントを合成した(Pini,A.et al.J.Biol.Chem.273(34):21769−76(1998))。
このベクターは、C2B8抗CD20抗体の可変重鎖および軽鎖コード領域が抗体C225(ヒト上皮成長因子レセプターを認識するキメラ抗体)の各コード領域に置換されていること以外はpETR1520と同一である。C225抗体の可変領域の配列に基づいた合成オリゴヌクレオチドを使用した重複伸長PCR法によって可変領域コードDNAフラグメントを合成した(配列を、国際公開番号WO96/40210の公開特許出願で見出すことができる(重鎖および軽鎖については特許出願のそれぞれ図16および17))。
(pETR1166(GnTIIIの構成性発現のためのベクター))
GnTIII発現ベクターpETR1166の構築のために、PCRによってラット腎臓cDNAライブラリー(Clontech)からラットGnTIIIを増幅した。ウェスタンブロットによるGnTIIIのその後の従来の検出のために、遺伝子の終止コドンのすぐ上流にC末端c−myc−エピトープタグを付加した(アミノ酸配列:PEQKLISEEDL)。GnTIIIの正確な配列の確認後、MPSVプロモーターの調節下で遺伝子を挿入し、合成ウサギβ−グロビンポリアデニル化シグナルを付加した。最終GnTIII発現ベクターは、選択のための個別のピューロマイシン耐性カセット、MPSVの調節下でのピューロマイシン耐性遺伝子、および合成ウサギβ−グロビンポリアデニル化シグナルも含んでいた。
その後の重複PCR反応によって、このハイブリッドグリコシルトランスフェラーゼ遺伝子を構築した。1つの反応では、プライマーGAB−179およびGAB−180を使用してヒトGnTIのステム領域を増幅した。このPCR反応中に、Kozakコンセンサス配列およびAscI制限部位も5’末端に移入した。得られたPCRフラグメントは、229位から始まるGnTIIIと23bp重複する。第2のPCR反応では、プライマーGAB−177およびGAB−178を使用して229位から380位までのGnTIII領域を増幅し、3’末端に固有のBstXI部位を有し、5’末端のGnTIステム領域と22bp重複したPCRフラグメントを作製した。両PCRフラグメントを精製し、第3のPCR反応のテンプレートとして使用した(プライマーGAB−179およびGAB−178)。得られたフラグメントを精製し、AscIで消化し、ベクターpETR1001(AscIおよびSmaIで切断)にライゲーションしてプラスミドpETR1404を得た。挿入配列を組み合わせた後、MPSVプロモーターエレメントをAscI(部分消化)/PmeIフラグメントとしてpETR1404に付加してプラスミドpETR1423を得た。pETR1166由来のSphI/BstXIフラグメント(元のラットGnTIII遺伝子を保有する発現ベクター)を、pETR1423の対応フラグメントと置換して、MPSVプロモーターの調節下でのGnTI−GnTIII融合および選択のためのピューロマイシン耐性カセットを含むpETR1425を得た。
pETR1425の構築と同様に、pETR1506を構築した。テンプレートとしてベクターpBlue−manを用いたプライマーGAB−252およびGAB−253を使用してヒトマンノシダーゼIIのステム領域を増幅した。このPCR中に、FseI部位およびKozakコンセンサス配列を5’末端に移入した。得られたPCRフラグメントは、229位から始まるGnTIIIと23bp重複する。第2のPCR反応では、プライマーGAB−254およびGAB−255を使用してGnTIII遺伝子の一部(229位〜460位)を増幅した。このPCR反応によって、5’末端にマンノシダーゼII遺伝子および3’末端に固有のStuI部位を有する43bp重複したフラグメントが作製された。両フラグメントを精製し、プライマーGAB−252およびGAB−255と共に第3のPCR反応のテンプレートとして使用した。得られたフラグメントをpIC19Hに挿入して、ベクターpETR1484を得た。正確な挿入配列を確認後、ベクターpETR12177(FseI/BamHI)中のpETR1166由来のStuI/BamHIフラグメントでのpETR1484のFseI/StuIフラグメントのライゲーションによって完全な融合遺伝子を構築した。得られたプラスミド(pETR1500)は、MPSVの調節下でハイブリッドmanII−GnTIII遺伝子(配列番号14)を含んでいた。哺乳動物細胞中でのプラスミドの選択のために、pETR1166由来のSpeIフラグメントとしてピューロマイシン耐性カセットを挿入してプラスミドpETR1506を得た。
プライマーGAB−261およびGAB−262を使用して、プラスミドpCEP4(Invitrogen)からoriPを含む2kbフラグメントを増幅した。このPCR反応中、フラグメントの両末端にSspI部位およびEcoRI部位を移入した。配列決定のために、oriPフラグメントをベクターpIC19Hに挿入した。正確な配列を確認した後、SspIフラグメントとしてoriPをベクターpETR1001(BsmBIで消化し、Klenowポリメラーゼを使用して5’重複末端を充填した)に挿入した。得られたプラスミドをpETR1507と命名した。pETR1510由来のSphI/NruI manII−GnTIII発現カセットを、同一の制限エンドヌクレアーゼで消化したpETR1507に挿入してpETR1519を得た。
短縮CD4細胞表面マーカー遺伝子のさらなる発現のためにpETR1506発現ベクターを改変した。簡単に述べれば、manII−GnTIII融合物の終止コドンの下流、ポリオウイルスIRESエレメント、その後の短縮ヒトCD4タンパク質をコードするcDNA(分泌のためのヒトCD4リーダー配列およびその後に膜貫通ドメインおよび細胞外ドメインを含む)の挿入によって、ハイブリッドmanII−GnTIII融合遺伝子発現カセットをモノシストロン性発現カセットからバイシストロン性発現カセットに変換した。
(BHK細胞のトランスフェクション)
エレクトロポレーションの24時間前に、指数関数的に成長している細胞(生存率90〜95%)を、適当な数のT75フラスコに0.9×106細胞/mlの濃度で播種した。培養培地として、10%ウシ胎児血清(FCS)を補足したInvitrus(CellCulture Technologies,Switzerland)を使用した。エレクトロポレーション前に細胞を計数した。遠心分離(200×gで5分間)によって8×106細胞を回収し、上清を破棄した。細胞を800μlInvitrus中に再懸濁し、既に8μg環状プラスミドDNAを含む滅菌エレクトロポレーションキュベット(0.4cmギャップ)に移し、室温で5分間インキュベートした。Gene PulserII(BioRad)を使用して以下の条件で細胞にエレクトロポレーションを行った:400V、960μFのパルスを30秒間隔で2回。エレクトロポレーション後、直ちに細胞を5mlの増殖培地(Invitrus/20%(V/V)FCS/1.25%(V/V)DMSO)を含むT25フラスコに移し、5%CO2−大気インキュベーター中37℃でインキュベートした。非改変(非糖操作)抗体の産生のために、細胞を抗体発現ベクターのみでトランスフェクトした。糖操作抗体の産生のために、細胞を、2つのプラスミド(一方は抗体発現用であり、他方は融合GnTIIIポリペプチド(配列番号15)発現用)をそれぞれ3:1の比で同時トランスフェクトした。
指数関数的に成長しているHEK293−EBNA細胞を、リン酸カルシウム法によってトランスフェクトした。10%FCSを補足したDMEM培養培地を使用したTフラスコ中で接着単層培養物として細胞を成長させ、50%と80%との間のコンフルエントに到達した場合にトランスフェクトした。T75フラスコのトランスフェクションのために、トランスフェクションの24時間前にFCS(最終10%V/V)、250μg/mlネオマイシンを補足した14mlDMEM培養培地中に800万個の細胞を播種し、細胞を、37℃で5%CO2のインキュベーターに置いた。トランスフェクトすべき各T75フラスコのために、47μgの全プラスミドベクターDNAと235μlの1M CaCl2溶液との混合および最終体積469μlの水の添加によって、DNA、CaCl2、および水を含む溶液を調製した。この溶液に、469μlの50mM HEPES、280mM NaCl、1.5mM Na2HPO4溶液(pH7.05)を添加し、直ちに10秒間混合し、室温で20秒間静置した。上清を2%FCSで補足した12mlのDMEMで希釈し、既存の培地の代わりにT75を添加した。細胞を37℃、5%CO2で約17〜20時間インキュベートし、その後培地を12mM DMEM、10%FCSに置換した。非改変(非糖操作)抗体の産生のために、細胞を抗体発現ベクターのみでトランスフェクトした。糖操作抗体の産生のために、細胞を、2つのプラスミド(一方は抗体発現用であり、他方は融合GnTIIIポリペプチド発現用)をそれぞれ4:1の比で同時トランスフェクトした。トランスフェクションから5日後に、上清を回収し、1200rpmで5分間遠心分離し、その後4000rpmで10分間第2の遠心分離を行い、4℃に保持した。
BHK細胞(BHK21−13c)を、エレクトロポレーションによってネオマイシン耐性遺伝子発現カセットを含むpETR1502 C2B8抗体発現ベクターでトランスフェクトした。ネオマイシン耐性クローンを、pETR1502ベクターDNAを染色体に組み込んだ1組のクローンを得るために最初に選択した。次いで、ELISAアッセイを使用して組換え抗体産生についてクローンをスクリーニングした。簡単に述べれば、24時間のエレクトロポレーション後、生存細胞を計数し、pEYFP発現ベクターを用いて行った並行コントロールエレクトロポレーションによる蛍光細胞の計数によってトランスフェクション効率を決定した。10%FCSおよび1mg/mlのネオマイシンを含むInvitrus選択培地で細胞を希釈した。通常8つの96ウェルプレートに、異なる濃度の生きたトランスフェクション細胞(1×103、5×102、および1×102細胞/ウェル)を播種し、クローンを同定することができるまで37℃でインキュベートした。一旦クローンがほぼコンフルエントまで成長すると、ELISAによって抗体産生のため上清を分析した。ELISA陽性クローンを最初に24ウェルに拡大し、その後6ウェルプレートに拡大し、その後T25フラスコに拡大した。T25フラスコでの5日間の成長後、ELISAアッセイを使用して最終抗体力価を決定した。このエレクトロポレーションおよび選択手順を使用して、上記培養条件下で13μg/mlの抗体を産生したC2B8抗CD20抗体発現BHK細胞クローン(BHK−1502−28)を単離した。
クローンBHK−1502−28、構成性発現抗CD20モノクローナル抗体遺伝子、およびネオマイシン耐性遺伝子を、エレクトロポレーションによってpETR1537発現ベクターでトランスフェクトした。pETR1537は、ManII−GntIII遺伝子およびヒトCD4の短縮形態の構成性発現のためのベクターであり、後者はIRES依存性で発現する。ベクターは、ピューロマイシン耐性遺伝子発現カセットも含む。pETR1537ベクターDNAを染色体に組み込んだ1組のクローンを得るためにピューロマイシン耐性クローンを最初に選択した。次いで、バイシストロン性ManII−GnTIII+tCD4遺伝子発現単位の発現レベルについてのマーカーとして作用する短縮CD4(tCD4)の表面発現についてクローンをスクリーニングした。選択したクローンの組換え抗体産生をELISAアッセイを使用して検証した。
(培養培地の回収)
抗体発現ベクターでトランスフェクトしたか抗体発現ベクターおよびGnTIII融合発現ベクターで同時トランスフェクトしたBHK細胞の場合、トランスフェクションから96時間のトランスフェクション細胞の培養後に培養上清を回収した。生産性の拡大に依存して、同一のベクターについていくつかのエレクトロポレーション(10〜15)を行った。
2つの連続クロマトグラフィ工程を使用して、培養上清からモノクローナル抗体を精製した。第1の工程は、ウシIgGとヒトIgGを有効に分離するpH勾配溶離を使用したプロテインAクロマトグラフィから構成された。これの後にサンプル緩衝液をリン酸緩衝化生理食塩水(PBS)に交換する陽イオン交換クロマトグラフィ工程を行った。
PNGアーゼF消化によってオリゴ糖をPVDF膜上に固定されているか溶液中の抗体から酵素的に放出させた。
PVDF膜(ImmobilonP,Millipore,Bedford,Massachusetts)を用いて作製した96ウェルプレートのウェルを100μlメタノールで湿らせ、Multiscreen vacuum manifold(Millipore,Bedford,Massachusetts)に適用した吸引を使用してPVDF膜から液体を吸引した。PVDF膜を300μlの水で3回洗浄した。次いで、ウェルを、50μlRCM緩衝液(8M尿素、360mM Tris、3.2mM EDTA(pH8.6))で洗浄した。30〜40μgの抗体を、10μl RCM緩衝液を含むウェルにロードした。ウェル中の液体を、吸引によって膜から取り出し、その後膜を50μlRCM緩衝液で2回洗浄した。50μlの0.1Mジチオスレイトールを含むRCMの添加および37℃で1時間のインキュベーションによってジスルフィド架橋を還元した。
40μgと50μgとの間の抗体を、最終体積が25μlの2.5mUのPNGアーゼF(Glyko,U.S.A.)を含む2mM Tris(pH7.0)と混合し、混合物を37℃で3時間インキュベートした。
その後PNGアーゼF放出オリゴ糖をエンドグリコシダーゼH(EC3.2.1.96)で消化した。EndoH消化のために、15mUのEndoH(Roche,Switzerland)をPNGアーゼF消化物(上記方法の抗体溶液)に添加して最終体積を30μlとし、混合物を37℃で3時間インキュベートした。EndoHは、N結合オリゴ糖のキトビオースコアのN−アセチルグルコサミン残基間を切断する。この酵素は、オリゴマンノースのみおよびほとんどのハイブリッド型グリカンを消化するのに対して、複合型オリゴは加水分解されない。
放出オリゴ糖を含む酵素消化物を、最終濃度150mMの酢酸の添加後に室内でさらに3時間インキュベートし、その後にmicro−bio−spinクロマトグラフィカラム(BioRad,Switzerland)にパッケージングした0.6mlの陽イオン交換樹脂(AG50W−X8樹脂、水素形態、100〜200メッシュ、BioRad,Switzerland)を通過させて陽イオンおよびタンパク質を除去した。1μlの得られたサンプルを、ステンレススチール製の標的プレートにアプライし、プレート上で1μlのsDHBマトリクスと混合した。2mgの2,5−ジヒドロキシ安息香酸および0.1mgの5−メトキシサリチル酸を含む1mlのエタノール/10mM塩化ナトリウム1:1水溶液(v/v)の溶解によってsDHBマトリクスを調製した。サンプルを乾燥させ、0.2μlエタノールをアプライし、最後にサンプルを大気下で再結晶させた。
質量スペクトルを獲得するために使用したMALDI/TOF−MS質量分析計は、Voyager Elite(Perspective Biosystems)であった。リニアモード(linear configuration)、20kVでの加速、および80nsの遅延を使用してこの装置を操作した。イオンの質量数決定にオリゴ糖標準を使用した外部較正を使用した。最終スペクトルを得るために、200回のレーザーショット由来のスペクトルをまとめた。
製造者の説明書に本質的にしたがってHistopaque−1077(Sigma Diagnostics Inc.,St.Louis,MO63178,USA)を使用して末梢血単核細胞(PBMC)を調製した。簡単に述べれば、ヘパリン処理シリンジを使用して血中のナチュラルキラー(NK)細胞の比率を増加させるために1分間全力疾走するように指示したボランティアから静脈血を採取した。血液をCaやMgを含まないPBSで0.75〜1.3倍に希釈し、Histopaque−1077上に重層した。勾配を破壊することなく400×gにて室温(RT)で30分間遠心分離した。PBMCを含む境界相を回収し、PBS(2つの勾配由来の細胞あたり50ml)で洗浄し、RTにおける300×gで10分間の遠心分離によって回収した。PBSでのペレットの再懸濁後、PBMCを計数し、RTにおける200×gで10分間の遠心分離によって2回洗浄した。次いで、その後の手順のために細胞を適切な培地に再懸濁した。
CD16およびCD56陽性細胞に結合しない磁性ビーズを使用した負の選択手順を適用してPBMCからヒトNK細胞を単離した(MACS system from Miltenyi Biotec GmbH,51429 Bergisch Gladbach,GER)。PBMCを氷冷MACS緩衝液(2%FCSおよび2mMEDTAを含むPBS)で1回洗浄し、FCSおよびMACS緩衝液の1:1混合物に20Mio細胞
/mlで再懸濁し、4℃で10分間インキュベートした。次いで、細胞をペレット化し、1000万個の細胞あたり80μlの10%FCSを含むMACS緩衝液に再懸濁した。次いで、1000万個の細胞あたり20μlハプテン−抗体溶液を添加した。チューブを繰り返し回転させながら4℃で10分間細胞をインキュベートした。少なくとも10倍の標識体積(labelling volume)でMACS緩衝液での2回の洗浄後、10%FCSを含むMACS緩衝液で細胞を再懸濁し、1000万個の細胞あたり80μlおよび20μlの抗ハプテン−マイクロビーズを添加した。チューブを繰り返し回転させながら4℃で15分間細胞をインキュベートした。MACS緩衝液での1回の洗浄後、500μlMACS緩衝液中に1億個までの細胞を再懸濁し、MINI−MACSマグネット中に置き、3mlMACS緩衝液で平衡化したLS MACSカラムにロードした。カラムを、3×3ml MACS緩衝液で洗浄した。通過画分中の細胞を回収し、その後NK細胞として使用した。CD56発現によって決定された純度は、88〜95%であった。
エフェクター細胞としてPBMCまたはNKを上記のように調製した。PBMC細胞およびNK細胞のエフェクター:標的比はそれぞれ25:1および10:1であった。丸底96ウェルプレートのウェルあたり50μlを添加するために、適切な濃度のAIM−V培地中にエフェクター細胞を調製した。C2B8抗体の標的細胞は、10%FCSを含むDMEMで成長させたSKW6.4またはNamalwaBリンパ腫細胞であった。標的細胞をPBSで洗浄し、計数し、マイクロウェルあたり100μlに30,000個の細胞を添加するためにmlあたり30万個の細胞をAIM−V中に再懸濁した。抗体をAIM−Vで希釈し、50μlを予めプレートした標的細胞に添加し、RTで10分間標的に結合させた。次いで、エフェクター細胞を添加し、プレートを5%CO2を含む加湿雰囲気下にて37℃で4時間インキュベートした。細胞傷害性検出キット(Roche Diagnostics,Rotkreuz,Switzerland)を使用した損傷細胞からの乳酸脱水素酵素(LDH)放出の測定によって標的細胞の死滅を評価した。4時間のインキュベーション後、プレートを800×gで遠心分離した。各ウェル由来の100μlの上清を、新しい透明な平底96ウェルプレートに移した。ウェルあたり100μlのキットの呈色基質緩衝液を添加した。呈色反応物のVmax値を、SOFTmaxPROソフトウェア(Molecular Devices,Sunnyvale,CA94089,USA)を使用した少なくとも10分間の490nmのELISAリーダーで決定した。標的細胞およびエフェクター細胞のみを含むが抗体を含まないウェルからの自発的LDH放出を測定した。標的細胞および1%TritonX−100のみを含むウェル由来の最大放出を決定した。特異的抗体媒介死滅率を以下のように計算した:(x−SR)/(MR−SR)*100(式中、xは特異的抗体濃度でのVmaxの平均であり、SRは自発的放出のVmaxの平均であり、MRは最大放出のVmaxの平均である)。
新たに単離したNK細胞を、200×gで5分間遠心分離し、NK細胞関連IgGを除去するために室温での3×105細胞/mlの5分間インキュベーションによって0.09%(wt/vol)乳酸溶液(140mM NaCl、5mM KCl(pH3.9))で予め処理した(De Haas M.,J.Immunol.156:2948(1996))。
unoResearch,West Grove,PA)および5μl/5×105細胞の抗ヒトCD56−PE(BD Pharmingen,san Diego,CA)との4℃で30分間のインキュベーションによって抗体結合を検出した。(Shields R.et al.J.Biol.Chem.277(30):26733−26740(2002))。
RajiB細胞ヒトリンパ腫細胞を、PBS(0.3Mio細胞/mlの濃度)にて37℃で20分間洗浄した。次いで、細胞を、PBS、0.1%BSA、0.01%NaN3中に222万細胞/mlで再懸濁し、FACSチューブあたり180μlを添加した。10倍希釈(0、0.1、0.3、1、3、10、30μg/ml)のL19非改変およびL19糖操作モノクローナル抗体をRaji細胞に添加し、4℃で30分間インキュベートした(最終細胞濃度は200万個の細胞/ml)。2回の洗浄後、200倍希釈のフルオレセインイソチオシアネート抱合F(ab’)2ヤギ抗ヒトIgG(Jackson ImmunoResearch,West Grove,PA)を細胞に添加し、4℃で30分間インキュベートした。1回の洗浄後、細胞を、0.5mlPBS、0.1%BSA、0.01%NaN3中に再懸濁し、FACSCalibur(BD Bioscience,San Jose,CA)において生細胞についての結合抗体変異型を参照した蛍光強度を決定した。
標的細胞を計数し、PBSで洗浄し、AIM−V(Invitrogen)で100万細胞/mlに再懸濁した。平底96ウェルプレート中のウェルあたり50μlの細胞をプレートした。AIM−V中に抗体希釈物を調製し、細胞に50μlを添加した。室温で10分間抗体を細胞に結合させた。ヒト血清補体(Quidel)を新たに解凍し、AIM−Vで3倍に希釈し、ウェルに50μlを添加した。製造者が説明するようにウサギ補体(Cedarlane Laboratories)を調製し、AIM−Vで3倍に希釈し、ウェルに50μlを添加した。コントロールとして、アッセイへの添加前に補体供給源を56℃で30分間加熱した。
抗体遺伝子発現のためのベクターおよびGnTIII活性を有する種々のポリペプチドをコードする遺伝子の発現のためのベクターでの哺乳動物細胞培養物の同時トランスフェクションによって、抗CD20キメラIgG1抗体(リツキシマブとしても公知のC2B8キメラ抗体)の糖操作バージョンを産生した。抗体遺伝子発現のためのベクターのみでの哺乳動物細胞のトランスフェクションによって同一の抗体の非改変(非糖操作)バージョンを産生した。トランスフェクション細胞を培養物中で少なくとも3日間保持し、分泌された組換え抗体をプロテインAアフィニティクロマトグラフィによって培養培地から精製した。GnTIII活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子の発現は、このようなポリペプチドを産生しない細胞と比較して、細胞生存率、細胞成長、または抗体産生に対していかなる有意な効果もなかった。
a)m/z 1502および1647のピーク:7+7%=14%(予想)両ピークのEndoH消化によりm/z 1298が得られる(EndoH後に13%得られた)。
b)m/z 1664および1810のピーク:49+13%=62%。EndoHによりm/z1460が得られる(60%得られた)。
c)m/z 1826および1972のピーク:4+3%=7%。EndoHによりm/z 1622が得られる(7%)。
まとめ、構造の全相対的比率
二分GlcNAc含有率:88%
非フコシル化ハイブリッド二分型:60%
フコシル化ハイブリッド二分型:22%
フコシル化複合体二分型:6%
上記データ(図1〜6)は、GnTIII発現レベルおよびGnTIII触媒ドメインをゴルジにターゲティングするために使用する特定の局在化ドメインが共に組換えGnTIII触媒ドメインと内因性コアα1,6−フコシルトランスフェラーゼ、(ManII)、およびGnTII酵素の間のGnTI改変オリゴ糖基質の競合に影響を与えることを示す。GnTIII発現が高いほど、この競合において、より高レベルの二分ハイブリッドおよび二分非フコシル化オリゴ糖ならびに二分複合体および二分フコシル化オリゴ糖レベルの同時減少を支持する。このことは、野生型GnTIIIについて以前にも留意されていた(Umana,P.et al.,Nature Biotechnol.17:176−180(1999))。さらに、類似の全二分オリゴ糖レベルが得られるにもかかわらず、GnTIまたはManII局在化ドメインを介したGnTIII触媒ドメインの局在により、野生型GnTIIIと比較して、内因性コアα1,6−フコシルトランスフェラーゼ、ManII、およびGnTII酵素とGnTI改変オリゴ糖基質をより有効に競合する。
Oncol Hematol.40(1):25−35(2001),Daeron,FM.Annu.Rev.Immunol.15:203−34(1997),Ravetch,J.V.and Bolland S.Annu.Rev.Immunol.19:275−90(2001))。
非フコシル化二分型の合計:37.8%(4+5+7+9)
フコシル化二分型の合計:50.8%(6+8+10+11+12)
複合体二分型:17%(6+7+10+12)
ハイブリッド二分型:71.6%(4+5+8+9+11)
オリゴ糖分析は、構造の88.6%が二分GlcNAc残基を有し、50.8%がフコシル化型であり、37.8%が非フコシル化型であることを示した。エンドグリコシダーゼHでのPNGアーゼF放出オリゴ糖の消化は、得られたピークのほとんどがハイブリッド二分型であることを示した(図19)。図20は、ヒトNK細胞上の活性化FcレセプターFcγRIIIAへのBHK−1502−28−11細胞株によって産生された糖操作抗体の結合親和性の増加を示す。懸濁液中で成長し、且つ抗体遺伝子および融合GnTIIIポリペプチドの両方を構成性に安定に発現する細胞株は、治療抗体の大量産生に理想的である。標準的な細胞操作方法を使用して、抗体遺伝子を含む細胞株への融合GnTIII遺伝子の移入、融合GnTIII遺伝子を含む細胞株(「前糖操作産生細胞株」)への抗体遺伝子の移入、または抗体およびGnTIII融合遺伝子の同時移入のいずれかによって糖操作を行うことができる。
al.Br J Haematol.115(4):807−11(2001)。しかし、上記のオリゴ糖プロフィールは、二分ハイブリッド非フコシル化オリゴ糖の中間レベル(15%超)が得られる中間の発現レベルでGnTIII融合ポリペプチドを発現するが、糖操作抗体のFcオリゴ糖集団内に有意な複合オリゴ糖画分を有するように抗体産生細胞を操作することも可能であることも示す。このような複合オリゴ糖は、正常な減少していないCMLレベルに関連する。したがって、データは、非操作抗体と比較して非常に類似したCML活性レベルを維持する方法でADCCが増加した抗体を産生することができることを示す。
(慢性移植片対宿主病患者の免疫媒介性血小板減少症の治療)
慢性移植片対宿主病における自己免疫性血小板減少症は、慢性疾患を引き起こすB細胞調節異常の例である。慢性移植片対宿主病を有する被験体における免疫媒介性血小板減少症を治療するために、記載のように、本発明の方法によって調製し、且つADCCが増加した抗CD20キメラモノクローナル抗体を被験体に投与する(Ratanatharathoron,V.et al.,Ann.Intern.Med.133(4):275−79(2000)(その内容全体が本明細書中で参考として援用される))。詳細には、抗体(375mg/m2)を被験体に4週間毎週注入する。抗体療法により、末梢血中のB細胞が顕著に枯渇し、血小板関連抗体レベルが減少する。
(重症免疫媒介性赤芽球癆および溶血性貧血の治療)
免疫媒介性後天性赤芽球癆(PRCA)は、他の自己免疫減少に頻繁に関連する稀な障害である。被験体の免疫媒介性後天性赤芽球癆を治療するために、記載のように、本発明の方法によって調製し、且つADCCが増加した抗CD20キメラモノクローナル抗体を被験体に投与する(Zecca,M.et al.,Blood 12:3995−97(1997)(その内容全体が本明細書中で参考として援用される))。詳細には、PRCAおよび自己免疫性溶血性貧血の被験体に、毎週抗体(375mg/m2)を投与する。抗体療法後、静脈内免疫グロブリンを使用した代替治療を開始した。この治療によってB細胞が顕著に枯渇し、ヘモグロビンレベルの増加によって網状赤血球数が有意に増加する。
(材料と方法)
(1.GalT融合発現ベクターの構築)
(GalTの構成性発現用ベクター)
GalT発現ベクターの構築のために、PCRによってGalT cDNAをcDNAライブラリー(Clontech)から増幅する。ウェスタンブロットによるGalTのその後の従来の検出のために、遺伝子の終止コドンのすぐ上流にC末端c−myc−エピトープタグを付加した(アミノ酸配列:PEQKLISEEDL)。GalTの正確な配列の確認後、MPSVプロモーターの調節下で遺伝子を挿入し、合成ウサギβ−グロビンポリアデニル化シグナルを付加した。最終GalT発現ベクターは、選択のための個別のピューロマイシン耐性カセット、MPSVプロモーターの調節下でのピューロマイシン耐性遺伝子、および合成ウサギβ−グロビンポリアデニル化シグナルも含んでいた。
例えば、重複PCR反応によってハイブリッドガラクトシルトランスフェラーゼ遺伝子を構築し、MPSVプロモーターの調節下でGnTI−GalT融合物および選択用のピューロマイシン耐性カセットを含むプラスミドを得る。
GalT発現ベクターを構築する。得られたプラスミドは、MPSVプロモーターの調節下でハイブリッドmanII−GalT遺伝子を含む。
実施例1に記載のように、oriPを有するDNAフラグメントを上記のハイブリッドManII−GalT発現ベクターにサブクローン化する。
短縮CD4細胞表面マーカー遺伝子のさらなる発現のために、発現ベクターを改変する。簡単に述べれば、manII−GalT融合物の終止コドンの下流、ポリオウイルスIRESエレメント、その後の短縮ヒトCD4タンパク質をコードするcDNA(分泌のためのヒトCD4リーダー配列およびその後に膜貫通ドメインおよび細胞外ドメインを含む)の挿入によって、ハイブリッドmanII−GalT融合遺伝子発現カセットを、モノシストロン性発現カセットからバイシストロン性発現カセットに変換した。
(BHK細胞のトランスフェクション)
実施例1に記載のように、指数関数的に成長している細胞(生存率90〜95%)を培養し、回収し、その後トランスフェクトする。糖操作抗体の産生のために、細胞を、2つのプラスミド(一方は抗体発現用であり、他方は融合GalTポリペプチド発現用)をそれぞれ3:1の比で同時トランスフェクトした。
実施例1に記載のように、指数関数的に成長しているHEK293−EBNA細胞をトランスフェクトする。糖操作抗体の産生のために、細胞を、2つのプラスミド(一方は抗体発現用であり、他方は融合GalTポリペプチド発現用)をそれぞれ4:1の比で同時トランスフェクトした。トランスフェクションから5日後に、上清を回収し、1200rpmで5分間遠心分離し、その後4000rpmで10分間第2の遠心分離を行い、4℃に保持した。
抗CD20モノクローナル抗体遺伝子およびネオマイシン耐性遺伝子を構成性に発現するクローンBHK−1502−28をエレクトロポレーションにより発現ベクターでトランスフェクトした。ベクターによってManII−GalT遺伝子およびヒトCD4の短縮形態が構成性に発現し、後者はIRES依存性に発現する。ベクターは、ピューロマイシン耐性遺伝子発現カセットも含む。ベクターDNAを染色体に組み込んだ1組のクローンを得るためにピューロマイシン耐性クローンを最初に選択した。次いで、バイシストロン性ManII−GalT+tCD4遺伝子発現単位の発現レベルについてのマーカーとして作用する短縮CD4(tCD4)の表面発現についてクローンをスクリーニングした。選択したクローンの組換え抗体産生をELISAアッセイを使用して検証した。
抗体発現ベクターでトランスフェクトしたか抗体発現ベクターおよびGalT融合発現ベクターで同時トランスフェクトしたBHK細胞の場合、トランスフェクションから96時間のトランスフェクション細胞の培養後に培養上清を回収した。生産性の拡大に依存して、同一のベクターについていくつかのエレクトロポレーション(10〜15)を行った。
実施例1に記載のように、2つの連続クロマトグラフィ工程(プロテインAクロマトグラフィおよび陽イオン交換クロマトグラフィ)を使用して、培養上清からモノクローナル抗体を精製した。
PNGアーゼF消化によってオリゴ糖をPVDF膜上に固定されているか溶液中の抗体から酵素的に放出させた。
実施例1に記載のように、その後PNGアーゼ放出オリゴ糖をエンドグリコシダーゼH(EC3.2.1.96)で消化する。
実施例1に記載のように、放出オリゴ糖を含む酵素消化物を含むサンプルを調製し、その後MALDI/TOF質量分析計を運転する。
製造者の説明書および実施例1に記載のプロトコールに本質的にしたがってHistopaque−1077(Sigma Diagnostics Inc.,St.Louis,MO63178 USA)を使用して末梢血単核細胞(PBMC)を調製する。
エフェクター細胞としてPBMCまたはNKを上記のように調製し、実施例1に記載の抗体依存性細胞傷害性(ADCC)アッセイで細胞傷害性を媒介する能力についてアッセイする。
実施例1に記載のように、新たに単離したNK細胞へのFcγRIIIAの結合およびRajiリンパ腫細胞へのFcγRIIbの結合を決定する。
実施例1に記載の方法にしたがって、抗体希釈物を使用して補体依存性細胞傷害性アッセイを行う。
ポリペプチドを産生しない細胞と比較した、細胞生存度、細胞成長、または抗体産生に対するGalT活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子の発現の影響を証明するために、アッセイを行う。
(材料と方法)
(1.ManIIおよびGnTI発現ベクターの構築)
ManII発現ベクターの構築のために、発現ベクタープラスミドのMPSVプロモーターの下流且つ合成ウサギβ−グロビンポリアデニル化シグナルの上流にヒトマンノシダーゼIIcDNA(配列番号17)をサブクローン化した。GnTII発現のために、ヒトCMVプロモーター/エンハンサーの下流且つウシ成長ホルモンポリアデニル化シグナルの上流にサブクローン化したヒトGnTII cDNAと共に発現ベクタープラスミドを使用する。
実施例1に記載のように、oriPを有するDNAフラグメントを上記のManII発現ベクターにサブクローン化してManII発現ベクターpCLF9を得た。実施例1に記載のように、oriPを有するDNAフラグメントを上記のGnTII発現ベクターにサブクローン化してGnTII発現ベクターpGnTIIを得た。
実施例1に記載のように、指数関数的に成長しているHEK293−EBNA細胞をトランスフェクトした。非改変抗体「Cwt」の産生のために、細胞を抗体発現ベクター(pETR1520)でトランスフェクトした。糖操作抗体「Cbrt」の産生のために、細胞を、2つのプラスミド(一方は抗体発現(pETR1520)および他方は融合GnTIIIポリペプチド発現(pETR1519))を4:1の比で同時トランスフェクトした。糖操作抗体「Cm」の産生のために、細胞を、3つのプラスミド(抗体発現(pETR1520)、融合GnTIIIポリペプチド発現(pETR1519)、およびマンノシダーゼII発現(pCLF9))を3:1:1の比で同時トランスフェクトした。糖操作抗体「Cmg」の産生のために、細胞を4つのプラスミド(抗体発現(pETR1520)、融合GnTIIIポリペプチド発現(pETR1519)、マンノシダーゼII発現(pCLF9)、およびGnTII発現(pGnTII))を4:0.33:0.33:0.33の比で同時トランスフェクトした。
上記トランスフェクション細胞の培養培地を、トランスフェクションから約16時間後に新鮮な培養培地と置換し、トランスフェクション細胞のさらに120時間の培養後にその後培地を回収した。回収した上清を、1200rpmで5分間遠心分離し、4000rpmで10分間第2の遠心分離を行い、4℃で保持した。
実施例1に記載のように、2つの連続クロマトグラフィ工程(プロテインAクロマトグラフィおよび陽イオン交換クロマトグラフィ)を使用して、培養上清からモノクローナル抗体を精製した。抗体cwt7、cbrt5、およびcm1のために、Superdex200カラム(Amersham Pharmacia)およびリン酸緩衝化生理食塩水を使用したさらなるサイズ排除クロマトグラフィ工程を陽イオン交換工程後に加え、単量体抗体ピークを回収した。
実施例1に記載のように、PNGアーゼF消化によって溶液中で抗体からオリゴ糖が酵素的に放出された。
次いで、実施例1に記載のように、PNGアーゼ放出オリゴ糖をエンドグリコシダーゼH(EC 3.2.1.96)で消化した。
実施例1に記載のように、放出オリゴ糖を含む酵素消化物を含むサンプルを調製し、その後MALDI/TOF質量分析計を運転する。
製造者の説明書および実施例1に記載のプロトコールに本質的にしたがってHistopaque−1077(Sigma Diagnostics Inc.,St.Louis,MO63178 USA)を使用して末梢血単核細胞(PBMC)を調製する。
実施例1に記載の負の選択手順を適用して、PBMCからヒトNK細胞を単離した。
エフェクター細胞としてPBMCを上記のように調製し、実施例1に記載の抗体依存性細胞傷害性(ADCC)アッセイで細胞傷害性を媒介する能力についてアッセイする。
実施例1に記載のように、新たに単離したNK細胞へのFcγRIIIAの結合およびFcγRIIbの結合を決定する。
ヒト補体供給源の調製について以下のように修正した実施例1に記載の方法にしたがって、抗体希釈物を使用して補体依存性細胞傷害性アッセイを行う。簡単に述べれば、健常なボランティアの血液から正常ヒト血清(NHS)を調製した。血液を1時間凝血させ、1200gで20分間遠心分離した。無細胞上清血清を等分し、80℃で停止させた。20%の最終アッセイ体積でNHSを使用した。
抗CD20キメラIgG1抗体(リツキシマブとも呼ばれるC2B8キメラ抗体)の糖操作バージョンを、抗体遺伝子の発現ベクターおよびGnTIII活性およびマンノシダーゼII活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子の発現ベクターでの哺乳動物細胞の同時トランスフェクションによって産生した。さらなる糖操作抗体バージョンを、抗体遺伝子発現用ベクターおよびGnIII活性、マンノシダーゼII活性、およびGnTII活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子の発現用ベクターでの哺乳動物細胞の同時トランスフェクション培養物によっても作製する。糖操作抗体「Cbrt」のために、細胞を、2つのプラスミド(抗体発現(pETR1520)、融合GnTIIIポリペプチド発現(pETR1519))で同時トランスフェクトした。糖操作抗体「Cm」のために、細胞を、3つのプラスミド(抗体発現(pETR1520)、融合GnTIIIポリペプチド発現(pETR1519)、およびマンノシダーゼII発現(pCLF9))で同時トランスフェクトした。糖操作抗体「Cmg」のために、細胞を4つのプラスミド(抗体発現(pETR1520)、融合GnTIIIポリペプチド発現(pETR1519)、マンノシダーゼII発現(pCLF9)、およびGnTII発現(pGnTII))で同時トランスフェクトした。同一抗体の非改変(非糖操作)バージョン「Cwt」を、抗体遺伝子発現用ベクターのみでの哺乳動物細胞のトランスフェクションによって産生した。トランスフェクション細胞を、培地中で5日間保持し、分泌された組換え抗体を培養培地から精製した。GnTIIIおよびManII活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子の発現は、このようなグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドまたはグリコシダーゼポリペプチドを産生しない細胞と比較して、細胞生存度、細胞成長、または抗体産生に対して任意の有意な効果がなかった。
ゴルジ局在化ドメインを介して局在化されたManII−GnTIII融合ポリペプチドをコードする核酸の発現による抗体産生細胞の操作によって、Fc−オリゴ糖の大部分が二分非フコシル化ハイブリッドである抗体(Cbrt)が産生された(図27を参照のこと)。実施例1に記載するように、エンドグリコシダーゼH(EndoH)を使用して、MALDIプロフィールで認められた異なるオリゴ糖ピークへの二分非フコシル化構造および二分ハイブリッド構造の割り当てを確認した。
Oncol Hematol.40(1):25−35(2001),Daeron,FM.Annu.Rev.Immunol.15:203−34(1997),Ravetch,J.V.and Bolland S.Annu.Rev.Immunol.19:275−90(2001))。
(α−マンノシダーゼの過剰発現)
(分子クローニング)
(ヒトα−マンノシダーゼII)
MPSVプロモーターの調節下でのヒトα−マンノシダーゼII(「hManII」)(E.C.3.2.1.114)をコードする核酸(配列番号17)を、OriPエレメントを含む発現ベクター中でクローン化した。得られた発現ベクターpCLF9を図32Aに示す。抗CD20モノクローナル抗体の軽鎖および重鎖をコードする発現ベクターは、それぞれ、pETR1842およびpETR1843であった(図32Bおよび32C)。
hManII CTSおよびヒトβ1,4−ガラクトシルトランスフェラーゼの触媒ドメイン(M22921、アミノ酸126〜397)からなる融合タンパク質(配列番号20)を下記のように構築した。PCRによってpETR1484からhManII CTS領域を増幅した(CF33,GAB252)。GalTの触媒ドメイン(アミノ酸126〜397)を、CF31およびCF35を使用してpBlueGalTから増幅した。hManII CTSをGalTの触媒ドメインと組み合わせて、MPSVプロモーターによって調節される融合タンパク質を得た(pCLF24)。全GalT遺伝子をpBlueGalTから得た。GalTをコードする遺伝子を配列決定した(配列番号16)。
HEK293−EBNA細胞を、リン酸カルシウム法でトランスフェクトした。簡単に述べれば、T150のトランスフェクションのために、トランスフェクションの24時間前に1500万個の細胞を28mlのDMEM、10%FCS、250μg/mlネオマイシンに播種し、37℃、5%CO2で一晩インキュベートした。
血清中に存在するウシ抗体からモノクローナル抗体を分離するための2工程クロマトグラフィ(第1のプロテインAクロマトグラフィおよびその後のサンプルの緩衝液をPBSに交換するための陽イオン交換クロマトグラフィを含む)によって、30mlの上清からモノクローナル抗体を精製した。
(PNGアーゼF消化)
モノクローナル抗体サンプル(50μg)を、0.1mU/μlのN−グリコシダーゼF(組換え体、Roche,Switzerland)とインキュベートした。2mM Tris緩衝液(pH7.0)中にて37℃で3時間消化した。次いで、放出された中性オリゴ糖を、150mM酢酸中にて室温で3時間インキュベートした。次いで、サンプルを、micro−bio−spinクロマトグラフィカラム(BioRad,Hercules,CA)にパッケージングした0.6mlの陽イオン交換樹脂(AG50W−X8樹脂、水素形態、100〜200メッシュ、BioRad,Hercules,CA)で脱塩した。
PNGアーゼ放出オリゴ糖を、酢酸処理前にエンドグリコシダーゼH(EC3.2.1.96,ROCHE,Switzerland)(N結合オリゴ糖のキトビオースコアのN−アセチルグルコサミン残基間を切断する酵素)で消化した。この酵素は、オリゴマンノースおよびほとんどのハイブリッド型グリカンを消化するのに対して、複合型オリゴは加水分解されない。
2mgの2,5−ジヒドロキシ安息香酸+0.1mgの5−メトキシサリチル酸を含む1mlのエタノール/10mM塩化ナトリウムの1:1水溶液(v/v)の溶解によって2,5−ジヒドロキシ安息香酸マトリクス(sDHB)を調製した。1μlのサンプルをステンレススチール製の標的にアプライし、1μlのsDHBマトリクスを混合した。サンプルを風乾し、0.2μlエタノールをアプライした。
質量スペクトルを獲得するために使用したMALDI/TOF−MS質量分析計は、ディレイドエクストラクションを備えたVoyager Elite(Perspective Biosystems)であった。分析計はレフレクターモードで運転した。陽イオンを、75ns遅延後に20kVに加速した。40ショットの5つのスペクトル(200ショット)を組み合わせて最終スペクトルを得た。イオンの質量数決定にオリゴ糖標準を使用した外部較正を使用した。
ManIIの存在下で産生された抗CD20抗体のオリゴ糖プロフィールを図34に示す。抗体のFc部分への結合が見出されたオリゴ糖は複合体構造であり、その48%がコアフコースを欠く。α−マンノシダーゼIIはコアフコシルトランスフェラーゼと競合し、48%の非フコシル化オリゴ糖構造が得られる。α−マンノシダーゼIIの非存在下では、抗体のFc部分のオリゴ糖は、フコシル化構造のみから構成される(野生型抗体)。
コアフコシルトランスフェラーゼの競合におけるα−マンノシダーゼII作用およびManII−GalT酵素作用の効果を決定するために、関連する生物学的アッセイを行った。インビトロ抗体依存性細胞傷害性(ADCC)および操作CHO細胞株(CHO−1708−37)の表面上に発現するCD16レセプターへの結合についてサンプルを試験した。
細胞株CHO−1708−37は、その表面上にFcγRIIIAレセプター(CD16)およびFcγRIレセプターのγ鎖を発現した。FcγRIIIAレセプター(CD16)の発現を、3G8−FITCモノクローナル抗体を使用したFACS分析によって評価した(図36)。1Mio/mlのCHO−1708−37細胞を、三連の異なる濃度(10、3、1、0.3、0.1μg/ml)の異なる抗体変異型を含む0.1%BSAを補足したPBS中でインキュベートした。細胞を4℃で30分間インキュベートし、その後0.1%BSAを補足したPBSで洗浄した。200倍希釈のフルオレセインイソチオシアネート抱合F(ab’)2ヤギ抗ヒトIgG(Jackson ImmunoResearch,West Grove,PA)との4℃で30分間のインキュベーションによって抗体結合を検出した。生細胞をゲーティングしたFACSCalibur(BD Bioscience,San Jose,CA)において結合抗体変異型を参照した蛍光強度を決定した。
ManII(α−マンノシダーゼII)
α−マンノシダーゼII(ManII)の存在下で産生された抗体は、野生型抗体よりも高い親和性でFcγRIIIAレセプターに結合する。
製造者の説明書に本質的にしたがってHistopaque−1077(Sigma Diagnostics Inc.,St.Louis,MO63178 USA)を使用して末梢血単核細胞(PBMC)を調製した。簡単に述べれば、ヘパリン処理シリンジを使用して血中のナチュラルキラー(NK)細胞の比率を増加させるために1分間全力疾走するように指示したボランティアから静脈血を採取した。血液をCaやMgを含まないPBSで0.75〜1.3倍に希釈し、Histopaque−1077上に重層した。勾配を破壊することなく400×gにて室温(RT)で30分間遠心分離した。PBMCを含む境界相を回収し、PBS(2つの勾配由来の細胞あたり50ml)で洗浄し、RTにおける300×gで10分間の遠心分離によって回収した。PBSでのペレットの再懸濁後、PBMCを計数し、RTにおける200×gで10分間の遠心分離によって2回洗浄した。次いで、その後の手順のために細胞を適切な培地に再懸濁した。
(乾癬を治療するための糖操作抗EGFRモノクローナル抗体の使用)
本発明の方法で産生された糖操作抗EGFRモノクローナル抗体でヒト乾癬患者を治療することができる。特に、患者に糖操作抗体を400mg/m2の負荷量で毎週注入する。250mg/m2の維持量、完全に奏功するまで毎週投与する。
(転移性前立腺癌、転移性乳癌、転移性結腸直腸癌、および悪性度IIIbまたはIVの非小細胞肺癌の治療における糖操作抗ErbB2モノクローナル抗体の使用)
RhuMab2C4は、ErbB2に指向する全長ヒト化モノクローナル抗体(CHO細胞中で産生)である。RhuMab 2C4は、ErbB2の他のErbBファミリーメンバー辺の結合を遮断し、それによりErbB経路を介した細胞内シグナル伝達を阻害する。RhuMAb 2C4は、ErbB2過剰発現腫瘍の成長だけでなくErbBリガンド依存性シグナル伝達を必要とする腫瘍成長を遮断する。
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