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CN105874072A - 人工核酸分子 - Google Patents

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CN105874072A
CN105874072A CN201480065035.1A CN201480065035A CN105874072A CN 105874072 A CN105874072 A CN 105874072A CN 201480065035 A CN201480065035 A CN 201480065035A CN 105874072 A CN105874072 A CN 105874072A
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CN
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ribosomal protein
protein
utr
nucleic acid
sequence
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CN201480065035.1A
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安德烈亚斯·特斯
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Curevac SE
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Curevac AG
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Abstract

本发明涉及人工核酸分子,其包含至少一个可读框和至少一个3’‑非翻译区元件(3’‑UTR),所述3’‑非翻译区元件(3’‑UTR)包含源自核糖体蛋白基因的3’‑UTR的核酸序列。本发明还涉及该人工核酸分子在基因治疗和/或基因疫苗接种中的用途。此外,本发明涉及包含源自核糖体蛋白基因的3’‑UTR的核酸序列的3’‑UTR元件用于增强、稳定和/或延长来自包含该3’‑UTR元件的核酸序列的蛋白表达的用途。

Description

人工核酸分子
本发明涉及人工核酸分子,其包含可读框、3’-非翻译区元件(3’-UTR元件)和任选地聚腺苷酸序列和/或聚腺苷酸化信号。本发明还涉及包含3’-UTR元件的载体,涉及包含所述人工核酸分子或所述载体的细胞,涉及包含所述人工核酸分子或所述载体的药物组合物,并且涉及包含所述人工核酸分子、所述载体和/或所述药物组合物的试剂盒,优选用于基因治疗和/或基因疫苗接种领域。
基因治疗和基因疫苗接种属于最有希望和快速发展的现代医学方法。它们可以为种种疾病的治疗提供高度特异和个性化选择。尤其是,不仅遗传病,而且自身免疫疾病、癌或肿瘤相关疾病以及炎性疾病可以是此种治疗方法的对象。而且,人们设想通过这些方法预防此类疾病的早期发病。
基因治疗背后的主要构思理念为适当调节与特定疾病的病理状态相关的受损的基因表达。病理学上改变的基因表达可以导致缺少或过量生产关键基因产物,例如,信号传导因子诸如激素,看家因子(housekeeping factors),代谢酶,结构蛋白等。改变的基因表达可以不仅由于转录和/或翻译的错误调节,而且还由于编码特定蛋白的ORF内的突变。病理突变可以由例如染色体畸变,或由更特异突变,如点或移码突变引起,它们全部都导致受限的功能和,可能完全丧失基因产物的功能。然而,转录或翻译的错误调节也可以发生,如果突变影响编码参与细胞的转录或翻译机制的蛋白的基因。此种突变可以导致基因病理上调或下调,其因此是功能性的。编码发挥此种调节功能的基因产物的基因,可以是例如,转录因子、信号受体、信使蛋白等。然而,此种编码调节蛋白的基因的功能缺失,在某些情况下可以由人工引入进一步作用于受损的基因产物下游的其它因子反转。此种基因缺陷还可以通过置换受影响基因本身的基因治疗补偿。
基因疫苗接种允许引起对选择的抗原所需的免疫应答,所述选择的抗原诸如细菌表面的特征组分、病毒粒子、肿瘤抗原等。一般而言,疫苗接种是现代医学的关键性成就之一。然而,目前仅对有限数量的疾病有可用的有效疫苗。因此,不能由疫苗接种预防的感染每年仍然影响数百万人。
通常,疫苗可以细分为“第一代”,“第二代”和“第三代”疫苗。“第一代”疫苗典型地是,全生物体疫苗。它们基于活的和减毒或被杀灭的病原体,例如病毒,细菌等。活疫苗和减毒疫苗的主要缺点是向危及生命的变体回复的风险。因此,尽管被减毒,但此种病原体本质上仍然可以带有不可预测的风险。杀灭的病原体可能不如所需要的那样有效产生特异免疫应答。为了最小化这些风险,开发了“第二代”疫苗。这些典型地为亚单位疫苗,所述亚单位疫苗由源自病原体的限定的抗原或重组蛋白组分组成。
基因疫苗,即用于基因接种的疫苗,通常被理解为“第三代”疫苗。它们典型地由遗传改造的核酸分子构成,所述遗传改造的核酸分子允许表达对于体内病原体或肿瘤抗原为特征性的肽或蛋白(抗原)片段。在施用于患者时,由靶细胞摄取后,基因疫苗表达。施用的核酸的表达导致产生编码的蛋白。如果这些蛋白被患者的免疫系统识别为外源,则引发免疫应答。
如从上文可以看出的,基因治疗和基因疫苗接种方法,基本上都基于向患者施用核酸分子并随后转录和/或翻译编码的遗传信息。备选地,基因疫苗接种或基因治疗还可以包含以下方法,所述方法包括从要治疗的患者分离特异体细胞,随后离体转染此种细胞,并将处理后的细胞再施用于患者。
DNA以及RNA可以用作在基因治疗或基因疫苗接种范畴内施用的核酸分子。已知DNA相对稳定并易于操作。然而,使用DNA承担施用的DNA-片段不希望的插入患者基因组中、从而可能导致诱变事件如受损基因功能的丧失的风险。作为进一步的风险,出现不希望产生的抗DNA抗体。另一个缺点是在DNA施用后可以获得的编码肽或蛋白的有限表达水平,因为DNA必须进入细胞核从而被转录,之后得到的RNA可以被翻译。在其它原因中,施用的DNA的表达水平将依赖于调节DNA转录的特定转录因子的存在。缺少此种因子的情况下,DNA转录将不产生令人满意量的RNA。从而,获得的翻译的肽或蛋白的水平有限。
通过使用RNA替代DNA用于基因治疗或基因疫苗接种,不希望的基因组整合和抗DNA抗体产生的风险被最小化或被避免。然而,RNA被认为是相当不稳定的分子种类,其可以容易地被遍在的RNA酶降解。
体内,RNA降解促进调节RNA半衰期。该效果被认为和证明是精细调整真核基因表达的调节(Friedel等人,2009.Conserved principles of mammaliantranscriptionalregulation revealed by RNA half-life,Nucleic Acid Research,37(17):1-12)。因此,每个天然存在的mRNA具有依赖于mRNA源自的基因和其在其中表达的细胞类型的其各自的半衰期。其促进调节该基因的表达水平。不稳定RNA对于及时在不同点实现瞬时基因表达是重要的。然而,耐久的RNA可能与不同蛋白的积累或基因的连续表达相关。在体内,mRNA的半衰期还可以依赖于环境因素,如激素处理,如例如对胰岛素样生长因子I,肌动蛋白,和白蛋白mRNA所显示的(Johnson等人,Newly synthesized RNA:Simultaneous measurement in intact cells of transcription rates and RNAstability of insulin-likegrowth factor I,actin,and albumin in growth hormone-stimulated hepatocytes,Proc.Natl.Acad.Sci.,第88卷,第5287-5291页,1991)。
对于基因治疗和基因疫苗接种,通常需要稳定的RNA。一方面,这是由于通常希望由RNA序列编码的产物在体内积累的事实。另一方面,当在其储存过程中制备合适剂型时,和当施用时,RNA必须保持其结构和功能完整性。因此,对提供用于基因治疗或基因疫苗接种的稳定RNA分子进行尝试,以阻止它们经历早期降解或衰变。
据报道,核酸分子的G/C-含量可以影响其稳定性。因此,包含增加量的鸟嘌呤(G)和/或胞嘧啶(C)残基的核酸可以比含有大量腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)核苷酸的核酸在功能上更稳定。在这方面,WO02/098443提供含有由编码区中的序列修饰稳定化的mRNA的药物组合物。此序列修饰利用遗传密码简并性。因此,含有不太有利的核苷酸组合(就RNA稳定性而言不太有利)的密码子可以在不改变编码的氨基酸序列的情况下被替代的密码子置换。该RNA稳定化方法受提供不允许留下所需氨基酸序列间隔的各个单个RNA分子的特定核苷酸序列限制。此外,该方法受限于RNA编码区。
作为mRNA稳定化的备选方案,已经发现天然存在的真核mRNA分子含有特征稳定化元件。例如,它们可以包含在其5′-末端(5′-UTR)和/或在其3′末端(3′-UTR)的所谓非翻译区(UTR)以及其它结构特征,如5′帽结构或3′-聚腺苷酸尾。5′-UTR和3′-UTR二者都典型地从基因组DNA转录并且因此是成熟前(premature)mRNA元件。在mRNA加工过程中,成熟mRNA的特有结构特征,如5′帽和3′-聚腺苷酸尾(也称为聚腺苷酸尾或聚腺苷酸序列)通常被添加于转录的(成熟前)mRNA。
3′-聚腺苷酸尾典型地是添加在转录的mRNA的3′末端的一段单调腺嘌呤核苷酸序列。其可以包含至多约400个腺嘌呤核苷酸。发现此种3′-聚腺苷酸尾的长度对于个体mRNA的稳定性是可能的关键要素。
此外,已显示α-珠蛋白mRNA的3′-UTR可能是对于公知的α-珠蛋白mRNA稳定性的重要因素(Rodgers等人,Regulatedα-globin mRNA decay is a cytoplasmic eventproceeding through 3′-to-5′exosome-dependent decapping,RNA,8,第1526-1537页,2002)。α-珠蛋白mRNA的3′UTR明显参与特定核蛋白-复合物(α-复合物)的形成,其存在与mRNA体外稳定性相关(Wang等人,An mRNA stability complex functions with poly(A)-binding protein to stabilize mRNA in vitro,Molecular and Cellular biology,第19卷,第7期,1999年7月,第4552-4560页)。
对于核糖体蛋白mRNA中的UTR,已经进一步证明了有趣的调节功能:在核糖体蛋白mRNA的5’-UTR控制mRNA的生长相关翻译的同时,该调控的严格度由核糖体蛋白mRNA中各个3’-UTR赋予(Ledda等人,Effect of the 3’-UTR length on the translationalregulation of 5’-terminal oligopyrimidine mRNAs,Gene,第344卷,2005,p.213-220)。该机制促进核糖体蛋白的特定表达模式,所述核糖体蛋白通常以恒定的方式转录,从而一些核糖体蛋白mRNA如核糖体蛋白S9或核糖体蛋白L32被称为看家基因(Janovick-Guretzky等人,Housekeeping Gene Expression in Bovine Liver is Affected byPhysiological State,Feed Intake,and Dietary Treatment,J.Dairy Sci.,Vol.90,2007,p.2246-2252)。核糖体蛋白的生长相关表达模式因此主要由于对翻译水平的调节。
不考虑影响mRNA稳定性的因素,由靶细胞或组织有效翻译施用的核酸分子对于任何使用用于基因治疗或基因疫苗接种的核酸分子的方法都至关重要。如可以从上文引用的实例看出的,与调节稳定性一起,大多数mRNA的翻译也由结构特征如UTR、5′帽和3′-聚腺苷酸尾调节。在此种情况下,据报道,聚腺苷酸尾的长度可以对于翻译效率也发挥重要作用。然而,稳定化3′-元件也可能对翻译具有减弱效果。
本发明的目的是提供可以适于应用于基因治疗和/或基因疫苗接种的核酸分子。尤其是,本发明的目的是提供mRNA种类,其在不呈现翻译效率的显著功能损失的情况下针对早期降解或衰变稳定化。此外本发明的目的是提供人工核酸分子,优选mRNA,其特征为所述核酸分子编码的各个蛋白的增强的表达。本发明的一个特定目的是提供mRNA,其中各个编码的蛋白的翻译效率增强。本发明的另一个目的是提供编码此种优异mRNA种类的核酸分子,其可以适于在基因治疗和/或基因疫苗接种中使用。本发明进一步的目的是提供用于基因治疗和/或基因疫苗接种的药物组合物。归纳起来,本发明的目的是提供改进的核酸种类,其通过节省成本和直接的途径克服上文讨论的现有技术的缺陷。
通过要求保护的主题解决本发明的基本目的。
在DARPA授予的协议号HR0011-11-3-0001下,在政府的支持下进行本发明。政府具有本发明中的某些权利。
为了清楚和易读,提供以下定义。对于这些定义所提到的任何技术特征,可以基于每个本发明的实施方案读懂。可以在这些实施方案范围内具体提供其它定义和解释。
适应性免疫应答:适应性免疫应答典型地理解为免疫系统的抗原-特异应答。抗原特异性允许产生适应特异病原体或病原体感染的细胞的应答。发起这些适应的应答的能力通常由“记忆细胞”保持在体内。假如病原体不止一次感染身体,这些特异记忆细胞用于快速消除它。在此种情况下,适应性免疫应答的第一步是激活能够通过抗原呈递细胞诱导抗原特异免疫应答的幼稚抗原特异T细胞或不同免疫细胞。这在幼稚T细胞不断通过的淋巴组织和器官中发生。可以用作抗原呈递细胞的三种细胞类型是树突细胞、巨噬细胞和B细胞。这些细胞中的每个在引起免疫应答方面具有不同功能。树突细胞可以通过吞噬作用和大胞饮摄取抗原并且可以通过与例如外来抗原相接触而被刺激,从而迁移至局部淋巴组织,在那它们分化为成熟树突细胞。巨噬细胞摄取颗粒抗原如细菌并通过由传染剂或其它合适的刺激物诱导以表达MHC分子。B细胞通过其受体结合和内化可溶蛋白抗原的独特能力对于诱导T细胞也可以是重要的。MHC-分子典型地负责向T-细胞呈递抗原。其中,将抗原呈递到MHC分子上导致T细胞的激活,其诱导其增殖和向武装的效应T细胞的分化。效应T细胞的最重要功能是通过CD8+细胞毒性T细胞杀灭感染的细胞和通过Th1细胞激活巨噬细胞(二者一起构成细胞介导的免疫),和通过Th2和Th1细胞激活B细胞以产生不同种类的抗体,从而驱动体液免疫应答。T细胞通过其T细胞受体识别抗原,其不直接识别和结合抗原,而是识别短肽片段例如源自病原体的蛋白抗原的片段,例如所谓的表位,其结合其它细胞表面上的MHC分子。
适应性免疫系统:适应性免疫系统基本上致力于消除或阻止病原体生长。其典型地通过向脊椎动物免疫系统提供识别和记忆特定病原体(以产生免疫性),并在每次遭遇病原体时产生更强烈的攻击的能力调节适应性免疫应答。该系统是高度可适应的,这是因为体细胞超变(加速的体细胞突变过程),和V(D)J重组(抗原受体基因片段的不可逆遗传重组)。该机制允许小量基因产生大量不同抗原受体,其随后独特地表达在每个个体淋巴细胞上。因为基因重排导致各个细胞DNA的不可逆改变,所以之后此种细胞的所有子代(后代)将遗传编码相同受体特异性的基因,包括为持久的特异免疫性的关键的记忆B细胞和记忆T细胞。
佐剂/佐剂组分:佐剂或佐剂组分广义上典型地是可以改良(例如增强)其它试剂(如药物或疫苗)的效果的药剂和/或免疫剂。将在广义上解释它并且指广谱的物质。典型地,这些物质能够增加抗原的免疫原性。例如,佐剂可以被先天免疫系统识别并且,例如可以引起先天免疫应答。“佐剂”典型地不引起适应性免疫应答。在这个程度,“佐剂”不算抗原。其作用模式不同于由导致适应性免疫应答的抗原引发的效果。
抗原:在本发明的背景下,“抗原”典型地指可以被免疫系统,优选被适应性免疫系统识别,并能够例如通过作为适应性免疫应答的一部分的抗体和/或抗原-特异T细胞的形成引发抗原-特异免疫应答的物质。典型地,抗原可以是或可以包含可以被MHC呈递到T-细胞的肽或蛋白。在本发明的意义中,抗原可以是提供的核酸分子,优选本文中定义的mRNA的翻译产物。在此情况下,包含至少一个表位的肽和蛋白的片段、变体和衍生物也理解为抗原。在本发明的情况下,如本文定义的肿瘤抗原和致病抗原是尤其优选的。
人工核酸分子:人工核酸分子可以典型地理解为天然不存在的核酸分子,例如DNA或RNA。换句话说,人工核酸分子可以理解为非天然核酸分子。此种核酸分子可以由于其个体序列(其天然不存在)和/或由于其它修饰,例如天然不存在的核苷酸的结构修饰而是非天然的。人工核酸分子可以是DNA分子,RNA分子或包含DNA和RNA部分的杂合分子。典型地,可以通过遗传工程方法设计和/或产生人工核酸分子以符合想要的人工核苷酸序列(异源序列)。在此种情况下,人工序列通常是可以天然不存在的序列,即其与野生型序列至少有一个核苷酸不同。术语“野生型”可以理解为天然存在的序列。进一步地,术语“人工核酸分子”不限于意为“一个单个分子”,而典型地理解为包含全体相同分子。因此,它可以涉及等分部分中含有的多个相同分子。
双顺反子RNA,多顺反子RNA:双顺反子或多顺反子RNA典型地是典型地可以具有两个(双顺反子)或更多个(多顺反子)可读框(ORF)的RNA,优选mRNA。在此种情况下,可读框是可翻译为肽或蛋白的密码子序列。
载体/聚合载体:本发明范围内的载体典型地可以是促进另一个化合物(货物)的转运和/或复合的化合物。聚合载体典型地是由聚合物形成的载体。载体可以通过共价或非共价相互作用与货物关联。载体可以将核酸,例如RNA或DNA转运至靶细胞。对于一些实施方案,载体可以是阳离子组分。
阳离子组分:术语“阳离子组分”典型地指在pH值典型地为从1至9,优选为或低于9(例如从5至9),为或低于8(例如从5至8),为或低于7(例如从5至7)的pH值,最优选在生理pH,例如从7.3至7.4带正电荷(阳离子)的带电分子。因此,阳离子组分可以是任何带正电荷的化合物或聚合物,优选在生理条件下,尤其是在体内生理条件下带正电荷的阳离子肽或蛋白。“阳离子肽或蛋白”可以含有至少一个带正电荷的氨基酸,或多于一个带正电荷的氨基酸,例如选自Arg,His,Lys或Orn。因此,“聚阳离子”组分也在给定条件下呈现多于一个正电荷的范围内。
5′帽:5′帽是实体,典型地是修饰的核苷酸实体,其通常“加帽(cap)”成熟mRNA的5′末端。5′帽可以典型地由修饰的核苷酸,尤其是由鸟嘌呤核苷酸衍生物形成。优选地,5′帽通过5′-5′-三磷酸酯键与5′-末端连接。5′帽可以是甲基化的,例如m7GpppN,其中N是携带5′帽的核酸的末端5′核苷酸,典型地是RNA的5′末端。5′帽结构的进一步实例包括甘油基(反转的脱氧脱碱基残基(部分))、4’,5′亚甲基核苷酸,1-(β-D-赤呋喃糖基)核苷酸,4’-硫代核苷酸,碳环核苷酸,1,5-失水己糖醇核苷酸,L-核苷酸,α-核苷酸,修饰碱基的核苷酸,苏式-戊呋喃糖核苷酸,无环3′,4’-开环核苷酸,无环3,4-二羟基丁基核苷酸,无环3,5二羟基戊基核苷酸,3′-3′-反向核苷酸部分,3′-3′-反向脱碱基部分,3′-2’-反向核苷酸部分,3′-2’-反向脱碱基部分,1,4-丁二醇磷酸酯,3′-氨基磷酸酯,己基磷酸酯,氨基己基磷酸酯,3′-磷酸酯,3′硫代磷酸,二硫代磷酸酯,或桥接或非桥接甲基磷酸酯部分。
细胞免疫性/细胞免疫应答:细胞免疫性典型地涉及巨噬细胞,天然杀伤细胞(NK),抗原特异性细胞毒性T-淋巴细胞的激活,和应答抗原时各种细胞因子的释放。更概括地,细胞免疫性不基于抗体,而基于免疫系统细胞的激活。典型地,细胞免疫应答可以例如特征在于激活能够在细胞(例如特定免疫细胞如树突细胞或其它细胞)中诱导凋亡的抗原特异性细胞毒性T-淋巴细胞,将外来抗原的表位展示在其表面。此种细胞可以是病毒感染的或细胞内细菌感染的,或展示肿瘤抗原的癌症细胞。进一步特性可以是巨噬细胞和天然杀伤细胞的激活,使它们能够破坏病原体并刺激细胞分泌多种影响参与适应性免疫应答和先天免疫应答的其它细胞的功能的细胞因子。
DNA:DNA是脱氧核糖核酸的常见缩写。其是核酸分子,即由核苷酸组成的聚合物。这些核苷酸通常是脱氧腺苷单磷酸酯,脱氧胸苷单磷酸酯,脱氧鸟苷单磷酸酯和脱氧胞苷单磷酸酯单体,其本身由糖部分(脱氧核糖),碱基部分和磷酸酯部分构成,并通过特征骨架结构聚合。所述骨架结构典型地通过第一个相邻单体的核苷酸的糖部分,即脱氧核糖和第二个相邻单体的磷酸酯部分之间的磷酸二酯键形成。单体的特定顺序,即与糖/磷酸酯-骨架连接的碱基的顺序,被称为DNA序列。DNA可以是单链或双链的。在双链形式中,第一链的核苷酸典型地与第二链的核苷酸例如通过A/T-碱基配对和G/C碱基配对杂交。
表位:表位(也称为“抗原决定簇”)可以在T细胞表位和B细胞表位相区别。本发明范围内的蛋白的T细胞表位或部分可以包含片段,所述片段优选具有约6至约20或甚至更多个氨基酸的长度,例如如由I类MHC分子加工和呈递的片段,优选具有约8至约10个氨基酸,例如8,9,或10个,(或甚至11,或12个氨基酸)的长度,或由II类MHC分子加工和呈递的片段,优选具有约13或更多个氨基酸,例如13,14,15,16,17,18,19,20或甚至更多个氨基酸的长度,其中这些片段可以选自氨基酸序列的任何部分。这些片段典型地以由肽片段和MHC分子组成的复合物形式被T细胞识别,即所述片段典型地不以其天然形式被识别。B细胞表位典型地是位于如本文限定的(天然)蛋白或肽抗原的外表面的片段,优选具有5至15个氨基酸,更优选具有5至12个氨基酸,甚至更优选具有6至9个氨基酸,其可以即以其天然形式被抗体识别。
此外蛋白或肽的此种表位可以选自任何本文提到的此种蛋白或肽的变体。在此种情况下抗原决定簇可以是由如本文限定的蛋白或肽氨基酸序列不连续的,但在三维结构中汇集在一起的蛋白或肽片段构成的构象或不连续表位或由单一多肽链构成的连续或线性表位。
序列片段:序列片段可以典型地是例如核酸分子或氨基酸序列的全长序列的较短部分。因此,典型地,片段由与全长序列内相应一段相同的序列组成。本发明范围内优选的序列片段,由与所述片段源自的分子中连续段实体对应的连续段的实体,如核苷酸或氨基酸组成,其代表所述片段源自的总(即全长)分子的至少5%、10%、20%,优选至少30%,更优选至少40%,更优选至少50%,甚至更优选至少60%,甚至更优选至少70%,和最优选至少80%。
G/C修饰的:G/C-修饰的核酸可以典型地是核酸,优选如本文限定的人工核酸分子,其基于优选包含与野生型序列相比增加的鸟苷和/或胞嘧啶核苷酸数量的修饰的野生型序列。此种增加的数量可以通过用含有鸟苷或胞嘧啶核苷酸的密码子置换含有腺苷或胸苷核苷酸的密码子产生。如果富集的G/C含量发生在DNA或RNA的编码区,则其使用遗传密码的简并性。因此,所述密码子置换优选不改变编码的氨基酸残基,但仅增加核酸分子的G/C含量。
基因治疗:基因治疗可以典型地理解为通过编码肽或蛋白的核酸治疗患者的身体或患者身体的分离的组成部分,例如分离的组织/细胞。其典型地可以包括至少一个以下步骤:a)直接将核酸,优选如本文限定的人工核酸分子通过任何给药途径施用于患者或体外施用于患者的分离的细胞/组织,其导致体内(in vivo)/离体(ex vivo)或体外(in vitro)转染患者的细胞;b)转录和/或翻译引入的核酸分子;和任选地c)如果核酸未直接施用于患者,则将分离、转染的细胞再施用于患者。
基因疫苗接种:基因疫苗接种可以典型地理解为通过施用编码抗原或免疫原或其片段的核酸分子疫苗接种。核酸分子可以施用于受试者的身体或施用于受试者的分离的细胞。当转染身体的某些细胞或当转染分离的细胞后,抗原或免疫原可以由那些细胞表达并随后呈递到免疫系统,引起适应性,即抗原特异性免疫应答。因此,基因疫苗接种典型地包含至少一个以下步骤:a)将核酸,优选如本文限定的人工核酸分子施用受试者,优选患者,或施用于受试者,优选患者的分离的细胞,其通常导致体内或体外转染受试者的细胞;b)转录和/或翻译引入的核酸分子;并且任选地c)如果核酸未直接施用于患者,则将分离、转染的细胞再施用于受试者,优选患者。
异源序列:如果它们不源于相同基因,则两条序列典型地被理解为‘异源的’。即,尽管异源序列可以源自相同生物体,但它们天然(在自然中)不存在于相同的核酸分子中,如不存在于相同的mRNA中。
体液免疫/体液免疫应答:体液免疫典型地指抗体产生和任选地指伴随抗体产生的附加过程。体液免疫应答可以典型地特征在于,例如Th2激活和细胞因子产生、生发中心形成和同种型转换、亲和力成熟和记忆细胞产生。体液免疫性典型地还可以指抗体的效应功能,其包括病原体和毒素中和、经典补体激活、和吞噬作用的调理素促进和病原体清除。
免疫原:在本发明范围内,免疫原可以典型地理解为能够刺激免疫应答的化合物。优选地,免疫原是肽、多肽、或蛋白。在特别优选的实施方案中,从本发明的意义上说,免疫原是提供的核酸分子,优选如本文限定的人工核酸分子的翻译产物。典型地,免疫原至少引起适应性免疫应答。
免疫刺激组合物:本发明范围内,免疫刺激组合物可以典型地理解为含有至少一个能够诱导免疫应答的组分或能够诱导免疫应答的组分源自的组分的组合物。此种免疫应答可以优选为先天免疫应答或适应性和先天免疫应答的组合。优选地,本发明范围内免疫刺激组合物含有至少一种人工核酸分子,更优选RNA,例如mRNA分子。免疫刺激组分,如mRNA可以与合适的载体复合。因此,所述免疫刺激组合物可以包含mRNA/载体-复合物。此外,所述免疫刺激组合物可以包含用于免疫刺激组分,如mRNA的佐剂和/或合适的载体。
免疫应答:免疫应答可以典型地是针对特定抗原的适应性免疫系统的特异反应(所谓特异或适应性免疫应答)或先天免疫系统的非特异反应(所谓非特异或先天免疫应答),或其组合。
免疫系统:免疫系统可以保护生物体免受感染。如果病原体成功通过生物体的物理屏障并进入该生物体,则先天免疫系统提供立即、但非特异的应答。如果病原体避开了该先天应答,则脊椎动物拥有第二层保护,适应性免疫系统。这里,免疫系统在感染过程中适应其应答以改善其对病原体的识别。病原体被消除之后,此种改善的应答随后以免疫记忆的形式保留,并且允许适应性免疫系统每次遭遇该病原体时发起更快速和更强烈的攻击。据此,免疫系统包含先天和适应性免疫系统。这些两部分的每个典型地含有所谓体液和细胞组分。
免疫刺激RNA:本发明范围内,免疫刺激RNA(isRNA)可以典型地是能够诱导先天免疫应答的RNA。其通常不具有可读框并且因此不提供肽-抗原或免疫原,但例如通过结合特定类型的Toll样受体(TLR)或其它合适的受体引起免疫应答。然而,当然具有可读框并编码肽/蛋白的mRNA也可以诱导先天免疫应答并且,因此可以是免疫刺激RNA。
先天免疫系统:先天免疫系统,也被称为非特异(non-specific)(或非特异(unspecific))免疫系统,典型地包含以非特异的方式保护宿主免受其它生物体感染的细胞和机制。这意味着先天系统的细胞可以以一般的方式识别和响应于病原体,但不像适应性免疫系统,它不赋予宿主持久或保护性免疫。先天免疫系统可以例如被以下激活:Toll样受体(TLRs)的配体或其它辅助物质如脂多糖,TNF-α,CD40配体,或细胞因子,单核因子,淋巴因子,白细胞介素或趋化因子,IL-1,IL-2,IL-3,IL-4,IL-5,IL-6,IL-7,IL-8,IL-9,IL-10,IL-11,IL-12,IL-13,IL-14,IL-15,IL-16,IL-17,IL-18,IL-19,IL-20,IL-21,IL-22,IL-23,IL-24,IL-25,IL-26,IL-27,IL-28,IL-29,IL-30,IL-31,IL-32,IL-33,IFN-α,IFN-β,IFN-γ,GM-CSF,G-CSF,M-CSF,LT-β,TNF-α,生长因子,和hGH,人Toll样受体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10的配体,鼠Toll样受体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10、TLR11、TLR12或TLR13的配体,NOD样受体的配体,RIG-I样受体的配体,免疫刺激核酸,免疫刺激RNA(isRNA),CpG-DNA,抗细菌剂,或抗病毒剂。根据本发明的药物组合物可以包含一种以上此种物质。典型地,先天免疫系统的应答包括:通过产生化学因子招募免疫细胞到感染位点,所述化学因子包括专用的化学介质,称为细胞因子;激活补体级联;通过专门的白细胞鉴别和去除器官、组织、血液和淋巴中的外来物质;激活适应性免疫系统;和/或用作针对传染剂的物理和化学屏障。
克隆位点:克隆位点典型地理解为适于插入核酸序列,例如包含可读框的核酸序列的核酸分子片段。插入可以通过任何本领域技术人员已知的分子生物学方法进行,例如通过限制酶切和连接。克隆位点典型地包含一个以上限制性酶识别位点(限制性位点)。这些一个以上限制性位点可以被在这些位点切割DNA的限制性酶识别。包含一个以上限制性位点的克隆位点也可以称为多克隆位点(MCS)或多聚接头。
核酸分子:核酸分子是包含核酸组分,优选由核酸组分组成的分子。术语核酸分子优选指DNA或RNA分子。其优选与术语“多核苷酸”同义使用。优选地,核酸分子是聚合物,包含通过糖/磷酸酯-骨架的磷酸二酯键彼此共价连接的核苷酸单体或由通过糖/磷酸酯-骨架的磷酸二酯键彼此共价连接的核苷酸单体组成。术语“核酸分子”还包括修饰的核酸分子,如碱基修饰的,糖修饰的或骨架修饰的等DNA或RNA分子。
可读框:本发明范围内可读框(ORF)可以典型地是一些核苷酸三联体的序列,其可以翻译为肽或蛋白。可读框优选在其5′末端含有起始密码子,即通常编码氨基酸甲硫氨酸的三个连续的核苷酸的组合(ATG),和通常呈现多个3核苷酸长度的紧接的区域。ORF优选由终止密码子(例如,TAA,TAG,TGA)终止。典型地,这是可读框仅有的终止密码子。因此,本发明范围内可读框优选为核苷酸序列,由可以被三整除的很多核苷酸组成,其以起始密码子(例如ATG)起始并且其优选以终止密码子(例如,TAA,TGA,或TAG)终止。可读框可以是分离的或其可以被整合入更长的核酸序列,例如载体或mRNA中。可读框还可以被称为“蛋白编码区”。
肽:肽或多肽典型地是通过肽键连接的氨基酸单体的聚合物。其典型地含有少于50个单体单元。尽管如此,术语肽不否认为具有多于50个单体单元的分子。长肽也称为多肽,典型地具有50到600个单体单元。
药学有效量:本发明范围内药学有效量典型地理解为例如在病理状况下足以诱导药学效应,如免疫应答、改变表达的肽或蛋白的病理水平、或替代缺少的基因产物的量。
蛋白:蛋白典型地包含一个以上肽或多肽。蛋白典型地折叠为3-维形式,其可以是蛋白发挥其生物学功能所需的。
聚腺苷酸序列:聚腺苷酸序列,也称为聚腺苷酸尾或3′-聚腺苷酸尾,典型地理解为例如多达约400个腺嘌呤核苷酸,例如从约20至约400,优选从约50至约400,更优选从约50至约300,甚至更优选从约50至约250,最优选从约60至约250个腺嘌呤核苷酸的腺嘌呤核苷酸序列。聚腺苷酸序列典型地位于mRNA的3′末端。本发明范围内,聚腺苷酸序列可以例如通过载体的转录位于mRNA内或位于任何其它核酸分子,诸如例如,载体,例如用作产生RNA的模板的载体,优选mRNA中。
聚腺苷酸化:聚腺苷酸化典型地理解为向核酸分子,如RNA分子,例如成熟前mRNA添加聚腺苷酸序列。聚腺苷酸化可以由所谓聚腺苷酸化信号诱导。该信号优选位于要被聚腺苷酸化的核酸分子,如RNA分子的3′末端的一段核苷酸内。聚腺苷酸化信号典型地包含由腺嘌呤和尿嘧啶/胸腺嘧啶核苷酸组成的六聚体,优选为六聚体序列AAUAAA。其它序列,优选六聚体序列,也是可能的。聚腺苷酸化典型地发生在前mRNA(也称为成熟前-mRNA)的加工过程中。典型地,RNA成熟(从前mRNA到成熟mRNA)包含聚腺苷酸化的步骤。
限制性位点:限制性位点,也称为限制性酶识别位点,为由限制性酶识别的核苷酸序列。限制性位点典型地是短的,优选回文核苷酸序列,例如包含4至8个核苷酸的序列。限制性位点优选由限制性酶特异识别。限制性酶典型地切割在此位点包含限制性位点的核苷酸序列。在双链核苷酸序列,如双链DNA序列中,限制性酶典型地切割核苷酸序列的两条链。
RNA,mRNA:RNA是核糖核酸的常见缩写。其是核酸分子,即由核苷酸组成聚合物。这些核苷酸通常是沿所谓骨架彼此连接的腺苷-单磷酸酯,尿苷-单磷酸酯,鸟苷-单磷酸酯和胞苷-单磷酸酯单体。所述骨架由第一相邻单体的糖,即核糖和第二相邻单体的磷酸酯部分之间的磷酸二酯键形成。单体的特定连续被称为RNA-序列。通常RNA是可以通过例如在细胞内DNA-序列的转录可获得的。真核细胞中,转录典型地在细胞核或线粒体中进行。在体内,DNA的转录通常产生所谓的成熟前RNA,其必须被加工为所谓的信使-RNA,通常简写为mRNA。例如在真核生物体中,成熟前RNA的加工包含多种不同转录后修饰如剪接、5′加帽、聚腺苷酸化、从细胞核或线粒体输出等。这些过程的总和也称为RNA的成熟。成熟信使RNA通常提供可以被翻译为特定肽或蛋白氨基酸序列的核苷酸序列。典型地,成熟mRNA包含5′帽、5′-UTR、可读框、3′-UTR和聚腺苷酸序列。除了信使RNA外,一些非编码RNA类型存在,其可以参与调节转录和/或翻译。
核酸分子序列:核酸分子序列典型地理解为特定和独特顺序,即其核苷酸的连续。蛋白或肽序列典型地理解为该顺序,即其氨基酸的连续。
序列同一性:如果它们呈现相同长度和顺序的核苷酸或氨基酸,则两条以上序列相同。同一性百分数典型地描述两条序列相同的程度,即其典型地描述与参照序列的相同核苷酸在其序列位置上对应的核苷酸的百分数。为了确定同一性程度,要比较的序列被认为是呈现相同长度,即要比较的序列的最长序列长度。这意为由8个核苷酸组成的第一序列与包含第一序列的由10个核苷酸组成的第二序列80%相同。换句话说,本发明范围内,序列同一性优选指具有相同长度的两条以上序列中具有相同位置的序列的核苷酸的百分数。通常将缺口认为是不相同的位置,而不考虑其在比对中的真正位置。
稳定的核酸分子:稳定的核酸分子是被修饰从而其对例如由环境因素或酶消化,如由核酸外切酶或核酸内切酶降解导致的分解或降解比无修饰的核酸分子更稳定的核酸分子,优选DNA或RNA分子。优选地,本发明范围内,稳定的核酸分子在细胞,如原核或真核细胞中,优选在哺乳动物细胞,如人细胞中稳定。稳定效应也可以在细胞外,例如在缓冲溶液等中,例如在包含所述稳定化的核酸分子的药物组合物的制造过程中发挥。
转染:术语“转染”指将核酸分子,如DNA或RNA(例如mRNA)分子引入细胞,优选引入真核细胞。在本发明范围内,术语“转染”包括本领域技术人员已知的用于将核酸分子引入细胞,优选引入真核细胞,如引入哺乳动物细胞的任何方法。此种方法包括例如,电穿孔、例如基于阳离子脂质和/或脂质体的脂转染、磷酸钙沉淀、基于纳米粒子的转染、基于病毒的转染、或基于阳离子聚合物(如DEAE-葡聚糖或聚乙烯亚胺)的转染等。优选地,所述引入是非病毒性的。
疫苗:疫苗典型地理解为提供至少一种抗原,优选免疫原的预防或治疗物质。所述抗原或免疫原可以源自任何适于疫苗接种的物质。例如,所述抗原或免疫原可以源自病原体,如源自细菌或病毒粒子等,或源自肿瘤或癌症组织。所述抗原或免疫原刺激身体的适应性免疫系统以提供适应性免疫应答。
载体:术语“载体”指核酸分子,优选指人工核酸分子。在本发明范围内,载体适于整合或包含所需核酸序列,如包含可读框的核酸序列。此种载体可以是储存载体、表达载体、克隆载体、转移载体等。储存载体是允许方便储存核酸分子(例如mRNA分子)的载体。因此,所述载体可以包含对应于例如所需mRNA序列或其部分的序列,如对应于mRNA的可读框和3′-UTR的序列。表达载体可以用于生产表达产物诸如RNA(例如mRNA)、或肽、多肽或蛋白。例如,表达载体可以包含载体的一段序列,如启动子序列(例如RNA聚合酶启动子序列)的转录所需的序列。克隆载体典型地是含有可以用于将核酸序列并入载体的克隆位点的载体。克隆载体可以是,例如质粒载体或噬菌体载体。转移载体可以是适于将核酸分子转移入细胞或生物体的载体,例如,病毒载体。在本发明范围内,载体可以是,例如RNA载体或DNA载体。优选地,载体是DNA分子。优选地,在本申请的意义中的载体包含克隆位点、选择标记(如抗生素抗性因子)、和适于载体扩增的序列,如复制起点。优选地,本申请范围内的载体是质粒载体。
载体(vehicle):载体典型地理解为适于储存、转运、和/或施用化合物,如药学活性化合物的材料。例如,其可以是生理学可接受的适于储存、转运、和/或施用药学活性化合物的液体。
3’-非翻译区(3’-UTR):通常,术语“3’-UTR”是指人工核酸分子的位于可读框的3’(即“下游”)并且不翻译为蛋白的部分。典型地,3’-UTR是mRNA的位于mRNA的蛋白编码区(可读框(ORF)或编码序列(CDS))和聚腺苷酸序列之间的部分。在本发明的情况下,术语3’-UTR还可以包含RNA被转录自的模板中不编码的,但在转录后成熟期间添加的元件,例如聚腺苷酸序列。mRNA的3′-UTR不翻译为氨基酸序列。3′-UTR序列通常由在基因表达过程中被转录为各自的mRNA的基因编码。基因组序列首先转录为包含任选内含子的成熟前mRNA。成熟前mRNA随后在成熟过程中进一步被加工为成熟mRNA。该成熟过程包含以下步骤:5′加帽、剪接成熟前mRNA以切除任选内含子和3′末端修饰(如成熟前mRNA 3′末端的聚腺苷酸化和任选的核酸内切酶/或核酸外切酶切割等)。在本发明范围内,3′-UTR对应于位于蛋白编码区终止密码子,优选紧接蛋白编码区终止密码子的3′端,和mRNA的聚腺苷酸序列之间的成熟mRNA的序列。术语“对应于”意为3′-UTR序列可以是如用于限定3′-UTR序列的mRNA序列中的RNA序列,或对应于此RNA序列的DNA序列中。在本发明范围内,术语“基因的3′-UTR”,如“核糖体蛋白基因的3′-UTR”,为对应于源自该基因的成熟mRNA的3′UTR的序列,所述成熟mRNA即通过基因转录和成熟前mRNA的成熟获得的mRNA。术语“基因的3′UTR”包括3′UTR的DNA序列和RNA序列(正义链和反义链二者和成熟和不成熟的二者)。
5′-非翻译区(5′UTR):5′-UTR典型地理解为信使RNA(mRNA)的特定部分。其位于mRNA可读框的5′侧。典型地,5′-UTR以转录起始位点开始并在可读框起始密码子前一个核苷酸结束。5′-UTR可以包含控制基因表达的元件,也称为调节元件。此种调节元件可以是,例如,核糖体结合位点。5′-UTR可以例如通过添加5′-帽而被转录后修饰。在本发明范围内,5′-UTR对应于位于5′帽和起始密码子之间的成熟mRNA序列。优选地,5′-UTR对应于从位于5′-帽的3′侧的核苷酸,优选从紧邻5′-帽的3′侧核苷酸,向位于蛋白编码区起始密码子5′侧的核苷酸,优选向紧接蛋白编码区起始密码子5′侧的核苷酸延伸的序列。紧接成熟mRNA5′-帽的3′侧的核苷酸典型地对应于转录起始位点。术语“对应于”意为5′-UTR序列可以是如用于限定5′-UTR序列的mRNA序列中的RNA序列,或与此RNA序列对应的DNA序列。在本发明范围内,术语“基因的5′-UTR”是对应于源自该基因的成熟mRNA的5′-UTR的序列,所述成熟mRNA即通过基因转录和成熟前mRNA的成熟获得的mRNA。术语“基因的5′-UTR”包括5′-UTR的DNA序列和RNA序列。通过本发明的实施方案,可以在所述ORF的5’-末端设置该5’-UTR。其长度通常小于500、400、300、250或小于200个核苷酸。在其他实施方案中,其长度可以在至少10、20、30或40,优选多至100或150个核苷酸的范围内。
5′末端寡嘧啶束(TOP):5′末端寡嘧啶束(TOP)典型地是位于核酸分子的5′末端区域,如某些mRNA分子的5′末端区域或功能实体的5′末端区域,例如某些基因的转录区中的一段嘧啶核苷酸。该序列以通常对应于转录起始位点的胞苷起始,并且之后是一段通常约3至30个嘧啶核苷酸。例如,TOP可以包含3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30或甚至更多个核苷酸。所述一段嘧啶序列和由此的5′TOP终止于位于TOP下游的第一个嘌呤核苷酸的5′侧的一个核苷酸。含有5′-末端寡嘧啶束的信使RNA常被称为TOP mRNA。因此,提供此种信使RNA的基因被称为TOP基因。例如,已经在编码肽延长因子和核糖体蛋白的基因和mRNA中发现了TOP序列。
TOP基序:在本发明范围内,TOP基序是对应于如上文限定的5′TOP的核酸序列。因此,本发明范围内的TOP基序优选为具有3-30个核苷酸长度的一段嘧啶核苷酸。优选地,所述TOP基序由至少3个嘧啶核苷酸,优选至少4个嘧啶核苷酸,优选至少5嘧啶核苷酸,更优选至少6个核苷酸,更优选至少7个核苷酸,最优选至少8个嘧啶核苷酸组成,其中所述一段嘧啶核苷酸优选在其5′末端以胞嘧啶核苷酸起始。在TOP基因和TOP mRNA中,所述TOP-基序优选在其5′末端以转录起始位点起始并终止于所述基因或mRNA中的第一个嘌呤残基的5′侧一个核苷酸。本发明意义中的“TOP基序”优选位于表示5′UTR的序列的5′末端或位于编码5′UTR的序列的5′末端。因此,优选地,从本发明的意义上说,如果该段序列位于各自序列(如人工核酸分子,人工核酸分子的5′UTR元件,或源自如本文描述的TOP基因的5′UTR的核酸序列)的5′末端,则一段3个以上嘧啶核苷酸的序列被称为“TOP基序”。换句话说,不位于5′UTR或5′UTR元件的5′末端而是位于5′UTR或5′UTR元件内任何位置的一段3个以上嘧啶核苷酸优选不称为“TOP基序”。
TOP基因:TOP基因典型地以存在5′末端寡嘧啶束为特征。此外,大多数TOP基因以生长相关翻译调节为特征。然而,还已知TOP基因有组织特异翻译调节。如上文限定的,TOP基因的5′UTR对应于源自TOP基因的成熟mRNA的5′UTR序列,其优选从位于5′-帽的3′侧的核苷酸向位于起始密码子5′侧的核苷酸延伸。TOP基因的5′UTR典型地不包含任何起始密码子,优选无上游AUG(uAUG)或上游可读框(uORF)。其中,上游AUG和上游可读框典型地理解为存在于应该被翻译的可读框的起始密码子(AUG)5′侧的AUG和可读框。TOP基因的5′UTR通常相当短。TOP基因的5′UTR的长度可以在20个核苷酸到高达500个核苷酸之间变化,并且典型地少于约200个核苷酸,优选少于约150个核苷酸,更优选少于约100个核苷酸。本发明意义中典型的TOP基因的5′UTR是在根据专利申请WO2013/143700的SEQ ID NOs.1-1363序列中,从位置5的核苷酸到紧接起始密码子(例如ATG)5′侧的核苷酸延伸的核酸序列。在该情况下,尤其优选的TOP基因的5’UTR的片段是缺少5’TOP基序的TOP基因的5’UTR。术语“TOP基因的5’UTR”或“5’-TOP UTR”优选是指天然存在的TOP基因的5’UTR。
在第一方面,本发明涉及人工核酸分子,其包含
a.至少一个可读框(ORF);和
b.至少一个3’-非翻译区元件(3’-UTR元件),其包含或由源自核糖体蛋白基因的3’-UTR的核酸序列组成。
术语“3’-UTR元件”是指包含或由源自3’-UTR或源自3’-UTR的变体的核酸序列组成的核酸序列。“3’-UTR元件”优选是指表示人工核酸序列,如人工mRNA的3’-UTR,或编码人工核酸分子的3’-UTR的核酸序列。因此,在本发明的意义中,优选地,3’-UTR元件可以是mRNA,优选人工mRNA的3’-UTR,或其可以是用于mRNA的3’-UTR的转录模板。因此,3’-UTR元件优选为对应于mRNA的3’-UTR,优选对应于人工mRNA,如通过转录遗传改造的载体构建体获得的mRNA的3’-UTR的核酸序列。优选为,在本发明的意义中,3’-UTR元件作为3’-UTR行使功能或编码执行3’-UTR的功能的核苷酸序列。
术语“核糖体蛋白基因”典型地是指编码核糖体蛋白的基因。如本文中使用的,该术语是指任何核糖体蛋白基因,不考虑其衍生自的物种。具体地,该术语是指真核核糖体蛋白基因。此外,在本发明的情况下,术语“核糖体蛋白基因”还可以指结构或功能之一与核糖体蛋白基因相似的基因。尤其是,该术语还包括“核糖体蛋白-样蛋白”基因、假基因与核糖体蛋白基因,尤其在其3’-UTR区共享序列或结构特征的基因。优选地,术语是指脊椎动物核糖体蛋白基因,更优选指哺乳动物核糖体蛋白基因,甚至更优选指灵长类核糖体蛋白基因,尤其是指人核糖体蛋白基因。此外,术语“核糖体蛋白基因”还包括啮齿类核糖体蛋白基因,尤其是鼠核糖体蛋白基因。在本发明的意义中核糖体蛋白基因的实例包括,但不限于,核糖体蛋白L9(RPL9)、核糖体蛋白L3(RPL3)、核糖体蛋白L4(RPL4)、核糖体蛋白L5(RPL5)、核糖体蛋白L6(RPL6)、核糖体蛋白L7(RPL7)、核糖体蛋白L7a(RPL7A)、核糖体蛋白L11(RPL11)、核糖体蛋白L12(RPL12)、核糖体蛋白L13(RPL13)、核糖体蛋白L23(RPL23)、核糖体蛋白L18(RPL18)、核糖体蛋白L18a(RPL18A)、核糖体蛋白L19(RPL19)、核糖体蛋白L21(RPL21)、核糖体蛋白L22(RPL22)、核糖体蛋白L23a(RPL23A)、核糖体蛋白L17(RPL17)、核糖体蛋白L24(RPL24)、核糖体蛋白L26(RPL26)、核糖体蛋白L27(RPL27)、核糖体蛋白L30(RPL30)、核糖体蛋白L27a(RPL27A)、核糖体蛋白L28(RPL28)、核糖体蛋白L29(RPL29)、核糖体蛋白L31(RPL31)、核糖体蛋白L32(RPL32)、核糖体蛋白L35a(RPL35A)、核糖体蛋白L37(RPL37)、核糖体蛋白L37a(RPL37A)、核糖体蛋白L38(RPL38)、核糖体蛋白L39(RPL39)、核糖体蛋白,Large,P0(RPLP0)、核糖体蛋白,Large,P1(RPLP1)、核糖体蛋白,Large,P2(RPLP2)、核糖体蛋白S3(RPS3)、核糖体蛋白S3A(RPS3A)、核糖体蛋白S4,X-连锁的(RPS4X)、核糖体蛋白S4,Y-连锁的1(RPS4Y1)、核糖体蛋白S5(RPS5)、核糖体蛋白S6(RPS6)、核糖体蛋白S7(RPS7)、核糖体蛋白S8(RPS8)、核糖体蛋白S9(RPS9)、核糖体蛋白S10(RPS10)、核糖体蛋白S11(RPS11)、核糖体蛋白S12(RPS12)、核糖体蛋白S13(RPS13)、核糖体蛋白S15(RPS15)、核糖体蛋白S15a(RPS15A)、核糖体蛋白S16(RPS16)、核糖体蛋白S19(RPS19)、核糖体蛋白S20(RPS20)、核糖体蛋白S21(RPS21)、核糖体蛋白S23(RPS23)、核糖体蛋白S25(RPS25)、核糖体蛋白S26(RPS26)、核糖体蛋白S27(RPS27)、核糖体蛋白S27a(RPS27a)、核糖体蛋白S28(RPS28)、核糖体蛋白S29(RPS29)、核糖体蛋白L15(RPL15)、核糖体蛋白S2(RPS2)、核糖体蛋白L14(RPL14)、核糖体蛋白S14(RPS14)、核糖体蛋白L10(RPL10)、核糖体蛋白L10a(RPL10A)、核糖体蛋白L35(RPL35)、核糖体蛋白L13a(RPL13A)、核糖体蛋白L36(RPL36)、核糖体蛋白L36a(RPL36A)、核糖体蛋白L41(RPL41)、核糖体蛋白S18(RPS18)、核糖体蛋白S24(RPS24)、核糖体蛋白L8(RPL8)、核糖体蛋白L34(RPL34)、核糖体蛋白S17(RPS17)、核糖体蛋白SA(RPSA)、泛蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)、Finkel-Biskis-Reilly鼠肉瘤病毒(FBR-MuSV)遍在表达的(FAU)(Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus(FBR-MuSV)ubiquitously expressed)、核糖体蛋白L22-样蛋白1(RPL22L1)、核糖体蛋白S17(RPS17)、核糖体蛋白L39-样蛋白(RPL39L)、核糖体蛋白L10-样蛋白(RPL10L)、核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)、核糖体蛋白L3-样蛋白(RPL3L)、核糖体蛋白S27-样蛋白(RPS27L)、核糖体蛋白L26-样蛋白1(RPL26L1)、核糖体蛋白L7-样蛋白1(RPL7L1)、核糖体蛋白L13a假基因(RPL13AP)、核糖体蛋白L37a假基因8(RPL37AP8)、核糖体蛋白S10假基因5(RPS10P5)、核糖体蛋白S26假基因11(RPS26P11)、核糖体蛋白L39假基因5(RPL39P5)、核糖体蛋白,Large,P0假基因6(RPLP0P6)和核糖体蛋白L36假基因14(RPL36P14)。优选地,术语“核糖体蛋白基因”是指源自哺乳动物,优选源自智人(Homo sapiens)或家鼠(Musmusculus)的上述基因中的一种。
优选为,所述至少一个可读框和至少一个3’-UTR元件是异源的。在该情况下术语“异源”意为由人工核酸分子包含的两个序列元件,如可读框和3’-UTR元件,不天然存在(天然)于该组合中。优选地,3’-UTR元件源自与可读框不同的基因。例如,ORF可以源自与3’-UTR元件不同的基因,例如编码不同蛋白或不同物种的相同蛋白等。优选地,可读框不编码核糖体蛋白。在优选的实施方案中,ORF不编码人核糖体蛋白或植物(尤其是拟南芥)核糖体蛋白,尤其是人核糖体蛋白S6(RPS6),人核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)或拟南芥核糖体蛋白S16(RPS16)。在进一步优选的实施方案中,可读框(ORF)不编码核糖体蛋白S6(RPS6)、核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)或核糖体蛋白S16(RPS16)。
在具体实施方案中,优选的是,可读框不编码例如,选自由以下各项组成的组的报告蛋白:珠蛋白(尤其是β-珠蛋白)、荧光素酶蛋白、GFP蛋白或其变体,例如,呈现与珠蛋白、荧光素酶蛋白或GFP蛋白的至少70%序列同一性的变体。在尤其优选的实施方案中,可读框(ORF)不编码报告基因或不源自报告基因,其中所述报告基因优选不选自由以下各项组成的组:珠蛋白(尤其是β-珠蛋白)、荧光素酶蛋白、β-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)和GFP蛋白或其变体,优选不选自EGFP,或任意上述基因的变体,所述变体典型地呈现与这些报告基因中的任一个,优选与珠蛋白、荧光素酶蛋白或GFP蛋白至少70%的序列同一性。
甚至更优选为,所述3’-UTR元件与如本文定义的人工核酸中包含的任何其他元件异源。例如,如果根据本发明的人工核酸包含来自给定基因的3’-UTR元件,其优选不包含任何其他核酸序列,尤其是没有来自相同基因的功能性核酸序列(例如编码或调节序列元件),包括其在基因的ORF的5’和3’末端的调节序列。在尤其优选的实施方案中,人工核酸分子包含ORF、3’-UTR和5’-UTR,其全部彼此异源,例如它们是重组的,因为它们每个源自不同基因(和它们的5’和3’UTR’的)。在另一优选的实施方案重,3’-UTR不源自病毒基因的3’-UTR或是非病毒来源的。
优选地,至少一个3’-UTR元件功能性地与ORF连接。这意为优选3’-UTR元件与ORF关联从而其可以发挥功能,如对编码的肽或蛋白的表达的增强或稳定功能或对人工核酸分子的稳定功能。优选地,ORF和3’-UTR元件以5’→3’方向关联。因此,优选人工核酸分子包含结构5’-ORF-(任选的)-接头-3’-UTR元件-3’,其中所述接头可以存在或不存在。例如,所述接头可以是一种以上核苷酸,如1-50或1-20个核苷酸的一段,例如,包含或由一种以上限制性酶识别位点(限制性位点)组成。
优选地,所述至少一个3’-UTR元件包含这样的核酸序列,所述核酸序列源自真核核糖体蛋白基因的3’-UTR,优选源自脊椎动物核糖体蛋白基因的3’-UTR,更优选源自哺乳动物核糖体蛋白基因的3’-UTR,甚至更优选源自灵长类核糖体蛋白基因、尤其是人核糖体蛋白基因的3’-UTR,或源自啮齿类核糖体蛋白基因、尤其是鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR。
在优选的实施方案中,所述至少一个3’-UTR元件包含或对应于这样的核酸序列,所述核酸序列源自选自由以下各项组成的组的转录本的3’-UTR序列:NM_000661.4、NM_001024921.2、NM_000967.3、NM_001033853.1、NM_000968.3、NM_000969.3、NM_001024662.1、NM_000970.3、NM_000971.3、NM_000972.2、NM_000975.3、NM_001199802.1、NM_000976.3、NM_000977.3、NM_033251.2、NM_001243130.1、NM_001243131、NM_000978.3、NM_000979.3、NM_001270490.1、NM_000980.3、NM_000981.3、NM_000982.3、NM_000983.3、NM_000984.5、NM_000985.4、NM_001035006.2、NM_001199340.1、NM_001199341.1、NM_001199342.1、NM_001199343.1、NM_001199344.1、NM_001199345.1、NM_000986.3、NM_000987.3、NM_000988.3、NM_000989.3、NM_000990.4、NM_001136134.1、NM_000991.4、NM_001136135.1、NM_001136136.1、NM_001136137.1、NM_000992.2、NM_000993.4、NM_001098577.2、NM_001099693.1、NM_000994.3、NM_001007073.1、NM_001007074.1、NM_000996.2、NM_000997.4、NM_000998.4、NM_000999.3、NM_001035258.1、NM_001000.3、NM_001002.3、NM_053275.3、NM_001003.2、NM_213725.1、NM_001004.3、NM_001005.4、NM_001256802.1、NM_001260506.1、NM_001260507.1、NM_001006.4、NM_001267699.1、NM_001007.4、NM_001008.3、NM_001009.3、NM_001010.2、NM_001011.3、NM_001012.1、NM_001013.3、NM_001203245.2、NM_001014.4、NM_001204091.1、NM_001015.4、NM_001016.3、NM_001017.2、NM_001018.3、NM_001030009.1、NM_001019.4、NM_001020.4、NM_001022.3、NM_001146227.1、NM_001023.3、NM_001024.3、NM_001025.4、NM_001028.2、NM_001029.3、NM_001030.4、NM_002954、NM_001135592.2、NM_001177413.1、NM_001031.4、NM_001032.4、NM_001030001.2、NM_002948.3、NM_001253379.1、NM_001253380.1、NM_001253382.1、NM_001253383.1、NM_001253384.1、NM_002952.3、NM_001034996.2、NM_001025071.1、NM_001025070.1、NM_005617.3、NM_006013.3、NM_001256577.1、NM_001256580.1、NM_007104.4、NM_007209.3、NM_012423.3、NM_001270491.1、NM_033643.2、NM_015414.3、NM_021029.5、NM_001199972.1、NM_021104.1、NM_022551.2、NM_033022.3、NM_001142284.1、NM_001026.4、NM_001142285.1、NM_001142283.1、NM_001142282.1、NM_000973.3、NM_033301.1、NM_000995.3、NM_033625.2、NM_001021.3、NM_002295.4、NM_001012321.1、NM_001033930.1、NM_003333.3、NM_001997.4、NM_001099645.1、NM_001021.3、NM_052969.1、NM_080746.2、NM_001001.4、NM_005061.2、NM_015920.3、NM_016093.2、NM_198486.2、NG_011172.1、NG_011253.1、NG_000952.4、NR_002309.1、NG_010827.2、NG_009952.2、NG_009517.1、NM_052835.3NM_011287.2、NM_001162933.1、NM_009076.3、NM_009438.5、NM_ 025974.2、NM_025586.3、NM_001002239.3、NM_009077.2、NM_029751.4、NM_009078.2、NM_ 019647.6、NM_009079.3、NM_022891.3、NM_024218.4、NM_011975.3、NM_009081.2、NM_ 009082.2、NM_009083.4、NM_053257.3、ENSMUST00000081840(NM_172086.2)、NM_026724.2、 NM_025592.3、NM_025589.4、NM_026069.3、NM_009084、NM_026055.1、NM_026594.2、NM_ 001163945.1、NM_024212.4、NM_016980.2、NM_011290.5、NM_011291.5、 ENSMUST00000102898(NM_013721.3)、NM_025433.3、NM_012053.2、NM_011292.2、NM_ 007475.5、NM_018853.3、NM_026020.6、NM_025963.3、NM_013725.4、NM_011295.6、NM_ 020600.4、NM_009091.2、NM_170669.2、NM_013647.2、NM_009092.3、NM_008503.5、NM_ 026147.5/ENSMUST00000138502、NM_207635.1、NM_024266.3、NM_013765.2、NM_024277.2、 NM_026467.3、NM_012052.2、NM_016959.4、ENSMUST00000071745、NM_009095.2、NM_ 009096.3、NM_011300.3、NM_011029.4、NM_018860.4、NM_001277113.1、NM_001277114.1、 NM_001271590.1、NM_007990、NM_025919、NM_016738、NM_026517、NM_207523、NM_009080、 NM_011289、NM_013762、NM_021338、NM_018730、NM_019865、NM_023372.2、NM_026533.3、NM_ 009092、NM_011296、NM_023133、ENSMUST00000059080(NM_025587.2)、NM_024175、NM_ 027015、NM_016844、NM_009093.2、NM_009094、NM_009098、NM_029767、和NM_019883。
术语“源自核糖体蛋白基因的3’-UTR的核酸序列”优选是指基于核糖体蛋白基因的3’-UTR序列或基于其片段或部分的核酸序列。该术语包括对应于整个3’-UTR序列的序列,即核糖体蛋白基因的全长3’-UTR序列,和对应于核糖体蛋白基因的3’-UTR序列的片段的序列。优选地,核糖体蛋白基因的3’-UTR的片段由与核糖体蛋白基因的全长3’-UTR中的一段连续的核苷酸对应的一段连续的核苷酸组成,所述一段连续的核苷酸表示核糖体蛋白基因的全长3’-UTR的至少5%、10%、20%,优选至少30%,更优选至少40%,更优选至少50%,甚至更优选至少60%,甚至更优选至少70%,甚至更优选至少80%,并且最优选至少90%。这样的片段,在本发明的意义中,优选为如本文所述的功能性片段。优选地,所述片段保留用于翻译连接于3’-UTR或其片段的ORF的调节功能。术语“核糖体蛋白基因的3’-UTR”优选是指天然存在的核糖体蛋白基因的3’-UTR。
术语“核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体”和在核糖体蛋白基因的3’-UTR的情况下的“其变体”是指天然存在的核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体,优选为脊椎动物核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体,更优选为哺乳动物核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体,甚至更优选为灵长类核糖体蛋白基因,尤其是如上文所述的人核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体。这样的变体可以是核糖体蛋白基因的修饰的3’-UTR。例如,与变体源自的天然存在的3’-UTR相比,变体3’-UTR可以呈现一种以上核苷酸缺失、插入、添加和/或置换。优选地,核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体与变体源自的天然存在的3’-UTR至少40%,优选至少50%,更优选至少60%,更优选至少70%,甚至更优选至少80%,甚至更优选至少90%,最优选至少95%相同。优选地,变体是如本文所述的功能性变体。
术语“源自核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体的核酸序列”优选是指如上文所述的基于核糖体蛋白基因的3’-UTR序列的变体或基于其片段或部分的核酸序列。该术语包括对应于核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体的整体序列,即核糖体蛋白基因的全长变体3’-UTR序列的序列,和对应于核糖体蛋白基因的变体3’-UTR序列的片段的序列。优选地,核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体的片段由一段连续的核苷酸组成,所述一段连续的核苷酸对应于表示核糖体蛋白基因的3’-UTR的全长变体的至少20%,优选至少30%,更优选至少40%,更优选至少50%,甚至更优选至少60%,甚至更优选至少70%,甚至更优选至少80%,并且最优选至少90%的核糖体蛋白基因的3’-UTR的全长变体的一段连续的核苷酸。这样的变体片段,在本发明的意义中,优选为如本文所述的变体的功能性片段。
在本发明的情况下,术语“功能性变体”、“功能性片段”和“变体的功能性片段”(也称为“功能性变体片段”),意为核糖体蛋白基因的3’-UTR的片段,3’-UTR的变体,或3’-UTR的变体的片段执行变体、片段或变体的片段源自的天然存在的核糖体蛋白基因的3’-UTR的至少一个,优选多于一个功能。所述功能可以是,例如,优选在哺乳动物细胞,如人细胞中,稳定mRNA和/或增强、稳定和/或延长mRNA的蛋白生产和/或增加mRNA的蛋白表达或总蛋白生产。优选地,3’-UTR的功能涉及ORF编码的蛋白的翻译。更优选为,所述功能包括增强与3’-UTR或其片段或变体连接的ORF的翻译效率。尤其优选的是,在本发明的情况下,变体、片段和变体片段优选在哺乳动物细胞,如人细胞中执行稳定mRNA的功能(与包含参考3’-UTR或缺少3’-UTR的mRNA相比),和/或优选在哺乳动物细胞,如人细胞中执行增强、稳定和/或延长mRNA的蛋白生产的功能(与包含参考3’-UTR或缺少3’-UTR的mRNA相比),和/或优选在哺乳动物细胞,如人细胞中,增加mRNA的蛋白生产的功能包含参考3’-UTR或缺少3’-UTR的mRNA相比)。参考3’-UTR可以例如是天然与ORF3’-UTR组合存在。此外,核糖体蛋白基因的3’-UTR的功能性变体、功能性片段或功能性变体片段优选对包含3’-UTR的该变体、片段或变体片段的mRNA的翻译效率不具有基本上减少的影响(与变体、片段或变体片段源自的野生型3’-UTR相比)。在本发明的情况下,核糖体蛋白基因的3’-UTR的“功能性片段”、“功能性变体”或“变体的功能性片段”的尤其优选的功能是增强、稳定和/或延长通过表达携带如上文所述的变体的功能性片段、功能性变体或功能性片段的mRNA的蛋白生产。
优选地,就变体、片段或变体片段源自的天然存在的核糖体蛋白基因的3’-UTR显示的mRNA和/或蛋白生产稳定效率和/或蛋白生产增加效率而言,一种以上由功能性变体、功能性片段或功能性变体片段发挥的功能的效率,如mRNA和/或蛋白生产稳定效率和/或蛋白生产增加效率,以至少5%,更优选以至少10%,更优选以至少20%,更优选以至少30%,更优选以至少40%,更优选以至少50%,更优选以至少60%,甚至更优选以至少70%,甚至更优选以至少80%,最优选以至少90%增加。
在本发明的情况下,核糖体蛋白基因的3’-UTR的片段或核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体优选为至少约3个核苷酸,优选至少约5个核苷酸,更优选至少约10、15、20、25或30个核苷酸,甚至更优选至少约50个核苷酸,最优选至少约70个核苷酸的长度。优选地,核糖体蛋白基因的3’-UTR或核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体的该片段是如上文所述的功能性片段。在优选的实施方案中,核糖体蛋白基因的3’-UTR或其片段或变体呈现3至约500个核苷酸之间,优选5至约150个核苷酸之间,更优选10至100个核苷酸之间,甚至更优选15至90之间,最优选20至70之间的长度。
优选为,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件包含或由核糖体蛋白基因的3’-UTR的“功能性片段”、“功能性变体”或“变体的功能性片段”组成。
在优选的实施方案中,与缺少3’-UTR或包含参考3’-UTR,如天然与ORF组合存在的3’-UTR的核酸(参考核酸)相比,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件增加人工核酸分子的稳定性,例如增加根据本发明的mRNA的稳定性。优选地,与缺少3’-UTR或包含参考3’-UTR,如天然与ORF组合存在的3’-UTR的核酸(参考核酸)相比,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件增加根据本发明的人工核酸分子,例如根据本发明的mRNA的蛋白生产的稳定性。优选地,与各自的缺少3’-UTR或包含参考3’-UTR,如天然与ORF组合存在的3’-UTR的核酸相比,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件延长根据本发明的人工核酸分子,例如根据本发明的mRNA的蛋白生产。优选地,与各自的缺少3’-UTR或包含参考3’-UTR,如天然与ORF组合存在的3’-UTR的核酸相比,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件增加根据本发明的人工核酸分子,例如根据本发明的mRNA的蛋白表达和/或总蛋白生产。优选地,与各自的缺少3’-UTR或包含参考3’-UTR,如天然与ORF组合存在的3’-UTR的核酸的翻译效率相比,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件不负面影响核酸的翻译效率。甚至更优选地,与各自的天然情况下的ORF编码的蛋白的翻译效率相比,所述翻译效率由3’-UTR增强。
在该情况下,术语“各自的核酸分子”或“参考核酸分子”意为-除了不同的3’-UTR之外-参考核酸分子与本发明的包含3’-UTR元件的人工核酸分子相当,优选相同。
术语“稳定和/或延长”人工核酸分子如人工mRNA的“蛋白生产”优选意为,与参考核酸分子如例如包含参考3’-UTR或缺少3’-UTR的参考mRNA,优选在哺乳动物表达系统,如在HeLa或HDF细胞中的蛋白生产相比,人工核酸分子如人工mRNA的蛋白生产被稳定和/或延长。因此,与对于从参考核酸分子生产的蛋白可以观察到的时间相比,可以更长时期地观察到从人工核酸分子如人工mRNA生产的蛋白。换句话说,与随时间测量的从参考核酸分子如参考mRNA生产的蛋白的量相比,随时间测量的从人工核酸分子如人工mRNA生产的蛋白的量在较晚的时间点削弱阈值。该阈值可以是,例如,表达起始后,如转染核酸分子后如1、2、3、4、5或6小时的起始表达相中测量的蛋白量。
例如,在哺乳动物表达系统,比如哺乳动物细胞,例如HeLa或HDF细胞中,与参考核酸分子,比如参考mRNA的蛋白生产相比,所述人工核酸分子比如人工mRNA的蛋白生产-以至少在表达起始阶段,比如表达起始后,比如转染核酸分子后1,2,3,4,5,或6小时中观察到的量-以至少约5小时,优选至少约10小时,更优选至少约24小时延长。因此,根据本发明的人工核酸分子优选允许与缺少3′-UTR或包含参考3′-UTR的参考核酸分子相比,以至少在表达的起始阶段,比如表达起始后,比如转染后1,2,3,4,5,或6小时中观察到的量,以至少约5小时,优选至少约10小时,更优选至少约24小时的延长的蛋白生产。
在优选的实施方案中,与缺少3′-UTR或包含参考3′-UTR的参考核酸分子的蛋白生产相比,根据本发明的人工核酸分子的蛋白生产的时期被延长至少1.5倍,优选至少2倍,更优选至少2.5倍。
可以通过以下各项确定该延长蛋白生产的效果(i)随时间优选在哺乳动物表达系统比如HeLa或HDF细胞中测量例如通过表达编码的报告蛋白比如荧光素酶获得的蛋白量,(ii)确定蛋白量降低到(undercut)例如在表达起始后1,2,3,4,5,或6小时,例如转染所述人工核酸分子后1,2,3,4,5,或6小时观察到的蛋白量以下的时间点,和(iii)将蛋白量降低到(undercut)表达起始后1,2,3,4,5,或6小时观察到的蛋白量以下的时间点与对缺少3′-UTR或包含参考3′-UTR的核酸分子确定的所述时间点向比较。
优选地,在例如在48或72小时的时间间隔内,从根据本发明的人工核酸分子生产的蛋白总量至少是从缺少3′-UTR或包含参考3′-UTR(比如天然与人工核酸分子的ORF存在的3′-UTR)的参考核酸分子生产的蛋白量的同时,获得对蛋白生产的该稳定和/或延长效果。因此,本发明提供一种人工核酸分子,如上文具体说明的,在哺乳动物表达系统,比如哺乳动物细胞,例如HeLa或HDF细胞中,所述人工核酸分子允许延长的和/或稳定的蛋白生产,其中,例如在48或72小时的时间间隔内从所述人工核酸分子生产的蛋白总量,至少是例如在所述时间间隔内,从缺少3′-UTR或包含参考3′-UTR(比如天然与人工核酸分子存在的ORF的3′-UTR)的参考核酸分子生产的蛋白总量。
因此,“稳定的蛋白表达”优选意为在预定的时间段内,如24小时,更优选48小时,甚至更优选72小时,与参考核酸分子,例如包含参考3′-UTR或缺少3′-UTR的mRNA相比,存在根据本发明的人工核酸分子的更均一的蛋白生产。因此,例如在哺乳动物系统中,根据本发明的包含3′-UTR元件的人工核酸分子,例如根据本发明的mRNA的蛋白生产的水平,优选不降低到对于参考核酸分子,诸如如上文描述的参考mRNA所观察到的程度。例如,表达起始后6小时,例如将根据本发明的人工核酸分子转染入细胞,如哺乳动物细胞后6小时观察到的蛋白量(由ORF编码),可以是与表达起始后48小时,例如转染后48小时观察到的蛋白量可比的。因此,表达起始后48小时,例如转染后48小时观察到的由ORF编码的蛋白,如报告蛋白,例如,荧光素酶的量,与表达起始后6小时,例如转染后6小时观察到的蛋白量的比例,优选至少约0.4,更优选至少约0.5,更优选至少约0.6,甚至更优选至少约0.7。优选地,对于根据本发明的核酸分子,所述比例在约0.4和约4之间,优选在约0.65和约3之间,更优选在约0.7和约2之间。对于各自的参考核酸分子,例如包含参考3′-UTR或缺少3′-UTR的mRNA,所述比例可以,例如在约0.05和约0.3之间。
因此,本发明提供一种人工核酸分子,所述人工核酸分子包含如上文描述的ORF和3′-UTR元件,其中,优选在哺乳动物表达系统,比如哺乳动物细胞,例如HeLa细胞中,表达起始后48小时观察到的(报告)蛋白量,例如荧光素酶量,与表达起始后6小时观察到的(报告)蛋白量的比例优选高于约0.4,更优选高于约0.5,更优选高于约0.6,甚至更优选高于约0.7,例如在约0.4和约4之间,优选在约0.65和约3之间,更优选在约0.7和2之间,其中优选例如在48小时的时间间隔内,从所述人工核酸分子生产的蛋白总量,至少是例如在所述时间间隔内,从缺少3′-UTR或包含参考3′-UTR(比如天然与所述人工核酸分子的ORF存在的3′-UTR)的参考核酸分子生产的蛋白总量。在一个优选的实施方案中,本发明提供一种人工核酸分子,所述人工核酸分子包含如上文描述的ORF和3′-UTR元件,其中,优选在哺乳动物表达系统,比如哺乳动物细胞,例如HeLa细胞中,表达起始后72小时观察到的(报告)蛋白量,例如荧光素酶量与表达起始后6小时观察到的(报告)蛋白量的比例,优选为高于约0.4,更优选高于约0.5,更优选高于约0.6,甚至更优选高于约0.7,例如在约0.4和1.5之间,优选约0.65和约1.15之间,更优选约0.7和1.0之间,其中优选例如在72小时的时间间隔内,从所述人工核酸分子生产的蛋白总量,至少是,例如在所述时间间隔内,从缺少3′-UTR或包含参考3′-UTR(比如天然与人工核酸分子的ORF存在的3′-UTR)的参考核酸分子生产的蛋白总量。
在本发明的情况下“增加的蛋白表达”或“增强的蛋白表达”优选为与参考核酸分子诱导的表达相比,在起始表达后的一个时间点增加的/增强的蛋白表达或增加的/增强的表达的蛋白总量。因此,在起始表达后,例如转染根据本发明的人工核酸分子后,例如转染根据本发明的mRNA后的某个时间点,例如,转染后6,12,24,48或72小时观察到的蛋白水平,优选高于起始表达,例如转染参考核酸分子,如包含参考参考3’-UTR或缺少3’-UTR的mRNA后的相同时间点观察到的蛋白水平。在优选的实施方案中,就从包含参考3’-UTR或缺少3’-UTR的参考核酸表达的蛋白量而言,从人工核酸分子表达的最大蛋白量(如例如通过蛋白活性或质量确定)增加。优选在例如转染后48小时内,更优选在24小时内,甚至更优选为在12小时内达到峰表达水平。
在一个实施方案中,根据本发明的人工核酸分子的“增加的总蛋白生产”或“增强的总蛋白生产”是指与缺少3’-UTR或包含参考3’-UTR的参考核酸分子相比,优选在哺乳动物表达系统中,如在哺乳动物细胞中,例如在HeLa或HDF细胞中从人工核酸分子生产蛋白的时间间隔内增加的/增强的蛋白生产。根据优选的实施方案,当使用根据本发明的人工核酸分子时,随时间表达的蛋白的积累量增加。
根据本发明,提供人工核酸分子,其特征为与各自的缺少至少一个3’-UTR元件或包含参考3’-UTR(“参考核酸”)的核酸分子相比,增加的编码的蛋白的表达,所述人工核酸分子包含源自核糖体蛋白基因的3’-UTR或源自核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体的核酸序列。为了评价本发明的人工核酸分子的体内蛋白生产,编码的蛋白的表达按照将本发明的人工核酸分子注射/转染入靶细胞/组织来确定并且与由参考核酸诱导的蛋白表达相比较。用于确定蛋白表达的定量方法是本领域中已知的(例如蛋白质印记,FACS,ELISA,质谱)。在该情况下尤其有用的是确定报告蛋白如荧光素酶、绿色荧光蛋白(GFP)或分泌的碱性磷酸酶(SEAP)的表达。因此,例如通过转染或注射将根据本发明的人工核酸或参考核酸引入靶组织或细胞。起始表达或引入核酸分子后数小时或数天(例如6、12、24、48或72小时),收集靶细胞样品并且通过FACS测量和/或裂解。之后使用多种方法,例如蛋白印迹,FACS,ELISA,质谱或通过荧光或发光测量,将裂解物用于检测表达的蛋白(并且因此测定蛋白表达效率)。
因此,如果在特定时间点(例如起始表达或引入核酸分子后6,12,24,48或72小时),将根据本发明的人工核酸分子的蛋白表达与参考核酸分子的蛋白表达相比较,两种核酸分子分开引入靶组织/细胞,在特定时间点后收集来自组织/细胞的样品,根据对特定检测方法(例如如本领域中已知的蛋白印迹,ELISA等)进行调节的特定方案制备蛋白裂解物并且通过选择的检测方法检测蛋白。作为细胞裂解物中的表达的蛋白量的测量的备选方案-或,除了在裂解收集的细胞之前测量细胞裂解物中的蛋白量或使用平行的等份之外-蛋白量也可以通过使用FACS分析测定。
如果要测量特定时期的蛋白总量,在引入人工核酸分子后(例如起始表达或引入核酸分子后6,12,24,48和72小时;通常来自不同的测试动物)的数个时间点后收集组织或细胞,并且每个时间点的蛋白量可以如上所述测定。为了计算累积的蛋白量,可以使用蛋白总量的数学方法,例如曲线下面积(AUC)可以根据下式确定:
为了计算蛋白总量的曲线下面积,计算来自各个终点(a和b)的表达曲线的等式的积分。
因此,“总蛋白生产”优选是指代表随时间的蛋白生产的曲线下面积(AUC)。
优选通过与各自的缺少3′UTR的参考核酸分子,例如缺少3′UTR的mRNA,或包含参考3′UTR,比如天然与入上文描述的ORF存在的3′UTR的参考核酸分子相比较确定所述人工核酸分子稳定性的增加,所述蛋白生产稳定性的增加,所述蛋白生产的延长和/或所述蛋白表达和/或总蛋白生产的增加/增强。
可以通过技术人员已知的适于此目的的任何方法确定核糖体蛋白基因3′-UTR的变体、片段和/或变体片段的所述mRNA和/或蛋白生产稳定效应和效率和/或蛋白生产增加效应和效率以及根据本发明的人工核酸分子的至少一个3′-UTR元件的mRNA和/或蛋白生产稳定效应和效率和/或蛋白生产增加效应和效率。例如,可以产生包含报告蛋白,比如荧光素酶的编码序列/可读框(ORF),且不包含3′UTR,源自天然存在的核糖体蛋白基因的3′-UTR,源自参考基因的3′-UTR(即,参考3′-UTR,比如天然与ORF存在的3′-UTR)的人工mRNA分子,为核糖体蛋白基因3′-UTR变体的3′-UTR,为天然存在的核糖体蛋白基因片段的3′-UTR,或为核糖体蛋白基因3′-UTR变体片段的3′-UTR。可以例如通过体外转录各自的载体诸如例如包含T7启动子和编码各自的mRNA序列的序列的质粒载体产生此种mRNA。可以通过适于转染mRNA的任何转染方法将产生的mRNA分子转染入细胞,例如可以将它们电穿孔入哺乳动物细胞,如HELA细胞,并且可以在转染后某时间点,例如,转染后6小时、24小时、48小时、和72小时分析样品。可以通过技术人员公知的方法分析所述样品的mRNA数量和/或蛋白数量。例如,可以通过定量PCR方法确定在样品时间点细胞中存在的报告子mRNA的数量。可以例如通过蛋白质印迹、ELISA测定、FACS分析或依赖于使用的报告蛋白的报告子测定如荧光素酶测定,确定由各自的mRNA编码的报告蛋白的数量。例如可以通过确定转染后48小时观察到的蛋白水平和转染后6小时观察到的蛋白水平分析稳定蛋白表达和/或延长蛋白表达的效应。优选地,该比例的值大于1,即在较晚时间点的蛋白表达大于在较早时间点的蛋白表达。如果该比例的值小于1,蛋白越稳定,所述值越接近1。此种测量当然也可以在72小时以上进行并且可以确定转染后72小时观察到的蛋白水平和转染后6小时观察到的蛋白水平的比例以确定蛋白表达的稳定性。
在优选的实施方案中,根据本发明的人工核酸分子的3’-UTR元件源自编码核糖体蛋白的基因的3’-UTR区,优选源自核糖体蛋白L9(RPL9)、核糖体蛋白L3(RPL3)、核糖体蛋白L4(RPL4)、核糖体蛋白L5(RPL5)、核糖体蛋白L6(RPL6)、核糖体蛋白L7(RPL7)、核糖体蛋白L7a(RPL7A)、核糖体蛋白L11(RPL11)、核糖体蛋白L12(RPL12)、核糖体蛋白L13(RPL13)、核糖体蛋白L23(RPL23)、核糖体蛋白U8(RPL18)、核糖体蛋白L18a(RPL18A)、核糖体蛋白L19(RPL19)、核糖体蛋白L21(RPL21)、核糖体蛋白L22(RPL22)、核糖体蛋白L23a(RPL23A)、核糖体蛋白L17(RPL17)、核糖体蛋白L24(RPL24)、核糖体蛋白L26(RPL26)、核糖体蛋白L27(RPL27)、核糖体蛋白L30(RPL30)、核糖体蛋白L27a(RPL27A)、核糖体蛋白L28(RPL28)、核糖体蛋白L29(RPL29)、核糖体蛋白L31(RPL31)、核糖体蛋白L32(RPL32)、核糖体蛋白L35a(RPL35A)、核糖体蛋白L37(RPL37)、核糖体蛋白L37a(RPL37A)、核糖体蛋白L38(RPL38)、核糖体蛋白L39(RPL39)、核糖体蛋白,Large,P0(RPLP0)、核糖体蛋白,Large,P1(RPLP1)、核糖体蛋白,Large,P2(RPLP2)、核糖体蛋白S3(RPS3)、核糖体蛋白S3A(RPS3A)、核糖体蛋白S4,X-连锁的(RPS4X)、核糖体蛋白S4,Y-连锁的1(RPS4Y1)、核糖体蛋白S5(RPS5)、核糖体蛋白S6(RPS6)、核糖体蛋白S7(RPS7)、核糖体蛋白S8(RPS8)、核糖体蛋白S9(RPS9)、核糖体蛋白S10(RPS10)、核糖体蛋白S11(RPS11)、核糖体蛋白S12(RPS12)、核糖体蛋白S13(RPS13)、核糖体蛋白S15(RPS15)、核糖体蛋白S15a(RPS15A)、核糖体蛋白S16(RPS16)、核糖体蛋白S19(RPS19)、核糖体蛋白S20(RPS20)、核糖体蛋白S21(RPS21)、核糖体蛋白S23(RPS23)、核糖体蛋白S25(RPS25)、核糖体蛋白S26(RPS26)、核糖体蛋白S27(RPS27)、核糖体蛋白S27a(RPS27a)、核糖体蛋白S28(RPS28)、核糖体蛋白S29(RPS29)、核糖体蛋白L15(RPL15)、核糖体蛋白S2(RPS2)、核糖体蛋白L14(RPL14)、核糖体蛋白S14(RPS14)、核糖体蛋白L10(RPL10)、核糖体蛋白L10a(RPL10A)、核糖体蛋白L35(RPL35)、核糖体蛋白L13a(RPL13A)、核糖体蛋白L36(RPL36)、核糖体蛋白L36a(RPL36A)、核糖体蛋白L41(RPL41)、核糖体蛋白S18(RPS18)、核糖体蛋白S24(RPS24)、核糖体蛋白L8(RPL8)、核糖体蛋白L34(RPL34)、核糖体蛋白S17(RPS17)、核糖体蛋白SA(RPSA)或核糖体蛋白S17(RPS17)的3’-UTR区。在备选的实施方案中,3’-UTR元件可以源自编码核糖体蛋白的基因或源自选自泛蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)、Finkel-Biskis-Reilly鼠肉瘤病毒(FBR-MuSV)遍在表达的(FAU)、核糖体蛋白L22-样蛋白1(RPL22L1)、核糖体蛋白L39-样蛋白(RPL39L)、核糖体蛋白L10-样蛋白(RPL10L)、核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)、核糖体蛋白L3-样蛋白(RPL3L)、核糖体蛋白S27-样蛋白(RPS27L)、核糖体蛋白L26-样蛋白1(RPL26L1)、核糖体蛋白L7-样蛋白1(RPL7L1)、核糖体蛋白L13a假基因(RPL13AP)、核糖体蛋白L37a假基因8(RPL37AP8)、核糖体蛋白S10假基因5(RPS10P5)、核糖体蛋白S26假基因11(RPS26P11)、核糖体蛋白L39假基因5(RPL39P5)、核糖体蛋白,Large,P0假基因6(RPLP0P6)和核糖体蛋白L36假基因14(RPL36P14)的基因。此外,根据本发明的人工核酸分子的3’-UTR元件优选为源自选自由以下各项组成的组的基因的3’-UTR区:核糖体蛋白S4-样蛋白(RPS41)、推定的60S核糖体蛋白L13a、推定的60S核糖体蛋白L37a-样蛋白、推定的40S核糖体蛋白S10-样蛋白、推定的40S核糖体蛋白S26-样蛋白1、推定的60S核糖体蛋白L39-样蛋白5、或60S酸性核糖体蛋白P0-样蛋白。
在尤其优选的实施方案中,根据本发明的人工核酸分子的3’-UTR元件源自编码核糖体蛋白的基因的3’-UTR区,优选源自核糖体蛋白L3(RPL3)、核糖体蛋白L11(RPL11)、核糖体蛋白L13(RPL13)、核糖体蛋白L23(RPL23)、核糖体蛋白L23a(RPL23A)、核糖体蛋白L26(RPL26)、核糖体蛋白L27(RPL27)、核糖体蛋白L35a(RPL35A)、核糖体蛋白L38(RPL38)、核糖体蛋白S4,X-连锁的(RPS4X)、核糖体蛋白S8(RPS8)、核糖体蛋白S9(RPS9)、核糖体蛋白S13(RPS13)、核糖体蛋白S19(RPS19)、核糖体蛋白S21(RPS21)、核糖体蛋白S23(RPS23)、核糖体蛋白S27(RPS27)、核糖体蛋白S28(RPS28)、核糖体蛋白S29(RPS29)、核糖体蛋白L36(RPL36)、核糖体蛋白L36a(RPL36A)、核糖体蛋白S18(RPS18)或核糖体蛋白S17(RPS17)的3’-UTR区。在另一优选的实施方案中,3’-UTR元件可以是源自编码核糖体蛋白的基因或源自选自泛蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)、Finkel-Biskis-Reilly鼠肉瘤病毒(FBR-MuSV)遍在表达的(FAU)和核糖体蛋白L22-样蛋白1(RPL22L1)的基因。
优选为,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件包含或由与核糖体蛋白基因的3’-UTR的核酸序列,如与根据SEQ ID NOs:10至115或相应RNA序列的核酸序列具有至少约1,2,3,4,5,10,15,20,30或40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%,最优选为100%的同一性的核酸序列组成:
智人(Homo sapiens)核糖体蛋白L9(RPL9)
gatctaagagttacctggctacagaaagaagatgccagatgacacttaagacctacttgtgatatttaaatgatgcaataaaagacctattgatttggaccttcttctt
(SEQ ID NO:10)
智人核糖体蛋白L3(RPL3)
tgccaggaacagattttgcagttggtggggtctcaataaaagttattttccactgac
(SEQ ID NO:11)
智人核糖体蛋白L4(RPL4)
actcttaaatttgattattccataaaggtcaaatcattttggacagcttcttttgaataaagacctgattatacaggcagtgagaaacatg
(SEQ ID NO:12)
智人核糖体蛋白L5(RPL5)
acccagcaattttctatgattttttcagatatagataataaacttatgaacagcaact
(SEQ ID NO:13)
智人核糖体蛋白L6(RPL6)
atgtcttaagaacctaattaaatagctgactac
(SEQ ID NO:14)
智人核糖体蛋白L7(RPL7)
ggtgtctaccatgattatttttctaagctggttggttaataaacagtacctgctctcaaattgaaat
(SEQ ID NO:15)
智人核糖体蛋白L7a(RPL7A)
atgtacactgttgagttttctgtacataaaaataattgaaataatacaaattttccttc
(SEQ ID NO:16)
智人核糖体蛋白L11(RPL11)
attcccgtttctatccaaaagagcaataaaaagttttcagtgaaatgtgc
(SEQ ID NO:17)
智人核糖体蛋白L12(RPL12)
gcacaaaggaaaacatttcaataaaggatcatttgacaactggtgg
(SEQ ID NO:18)
智人核糖体蛋白L13(RPL13)
agccctcctggggacttggaatcagtcggcagtcatgctgggtctccacgtggtgtgtttcgtgggaacaactgggcctgggatggggcttcactgctgtgacttcctcctgccaggggatttggggctttcttgaaagacagtccaagccctggataatgctttactttctgtgttgaagcactgttggttgtttggttagtgactgatgtaaaacggttttcttgtggggaggttacagaggctgacttcagagtggacttgtgttttttctttttaaagaggcaaggttgggctggtgctcacagctgtaatcccagcactttgaggttggctgggagttcaagaccagcctggccaacatgtcagaactactaaaaataaagaaatcagccatgcttggtgctgcacacttgtagttgcagctcctgggaggcagaggtgagggatcacttaacccaggaggcagaggctgcactgagccaggatcacgccactgcactctagcctgggcaacagtgagactgtctcaaaaaaaaaaaaagagacagggtcttcggcacccaggctggagtacagtgccacaatcatggctcactgcagtcttgaactcatggcctcaagcagtcctccctcagcctcccaagtagaggggtttataggcacgagaccctgcacccaacctagagttgccttttttaagcaaagcagtttctagttaatgtagcatcttggactttggggcgtcattcttaagcttgttgtgcccggtaaccatggtcctcttgctctgattaacccttccttcaatgggcttcttcacccagacaccaaggtatgagatggccctgccaagtgtcggcctctcctgttaaacaaaaacattctaaagccattgttcttgcttcatggacaagaggcagccagagagagtgccagggtgccctggtctgagctggcatccccatgtcttctgtgtccgagggcagcatggtttctcgtgcagtgctcagacacagcctgccctagtcctaccagctcacagcagcacctgctctccttggcagctatggccatgacaaccccagagaagcagcttcagggaccgagtcagattctgttttgtctacatgcctctgccgggtgccggtattgaggcacccagggagctgttactggcgtggaaataggtgatgctgctacctctgctgctgcactcacagccacacttgatacacgatgacaccttgcttgtttggaaacatctaaacatctagtagatgacttgcaggctgttggctaccagtttcctgtctgaggtgtatatgttaacttcgtgatcagtttgtatgtttgggactcttgtcctatgtaaagttaaggtgggccgggtgcagtggctcacgcctgtaatcctaacactgggaggccgaggcgggtggatcacctgatggtgaaacctcatctctactgaaaatacaaaaattagctgagtggtgacacacgcctgtaatcccagctacttggtaggcttgaacccaggaggcagagattgcagtgagccgagctgcaccactgtgctccagcctgggtgacagcgagactcagtctcaaaaaaagttgtacaaggtggatggttggaagcttgagcctaggctcgaatccctctcacgtgagagggcctgaagatttctggtggattccaacctggctgaagactggccgtggggggtgcaggggtctccagcgctctgccctccagcctgcttcctccctgcccacaccgcactaggggaagggcctttcctgctgcctgcggggccgcacctggagtaggtaatgccatgtggtgacgtgaatggagcagaggtctgtgccccatcacaccgccttgctgtttttactgtgggacaaaagcactctgatctgcgtgttccgggggccctcctaccagccgacttgacgggaagtcagggttcaggtatcatctgtgcacctggggcggggtagtctgcactgaacctgccagagtcccctcctcatttcactgaaagtcacagtctccagggctgtgttgctaaccttacgttctctccgtttgcttaatctattaagagccctaacaggagaggatgggctttctctgttgtctggggccctgctgttggccggtgctcttagcaagaggtcatttttctaggttgcgctgggacattgtgagtttggtgagggtcatggatgtgggctgggctgggctgggctgggccgggctgcctgctgcctgctgctcccctacctgaaatgcagctagtgcggctctgcccttcctggggctgaggaaggcttctgcaggatagctggggggctgggcaggtgggtgaggcagcctccctgctgacactcagtccttgtagctggagcaagatctcctgatccaggtacgggcctgtctgctccaagaaagactctgccaccagatgcaaaggggccctttgttttaacttagtccctggggaccgcctgattcagcacctgtcggcccaggataccccgctggtggggacaagtgcctgagtgtgggccgtgcccgagtgtggccatccctgagtggggccgtcctgactaggaagtggcttttcagttgtgatgtgtgggcctgacctagggggcgctgtggaacccgggctggaaccagccctctgtgccaggccgcagacaggttccgccggccctgaggggcagctgccatggcgtgggtcactgggagctgagaggaagggcccccaccgcacctcaggcaaagcggctctgggaacaccttgatttcgtccatgtgagccgtcccagggagggcagccaagctgtgaagcctgagaaactgacctgtgtgccacgagcttgtggtctgctgcccggtggaggaagtgcaggtgcgcccaggctcctcattccgttttgcaggattccttcggggtgtgagcatttcctattcagcctgtcgcccccggggagcacgggctggctctgtggtgcccgtggccttttgtagaagcgttggttttacggcaggttcatctctggggcagcctcccacagtgggtggggctttgccagcagtgcccacgggggtcatggggccaggcgcgctccggcgcctgcagaactgatcggggatagtctcaggaggcgctagtcacgtgccccggtgatcggggatagtctcagaaggcgctagtctcctgccccggtgatcggggatagtctcaggaggcacgagtcgcctgcctcggtgatgcaccgtttctcacaccggctgctctggcccgagctaaaggggaagacgtgtgcggataggagctgcacacaattttcctccatgtattgtttattttgctttttcttttggctagacattaggaatttcagttttcccaagttgtatttttccttttctattttaaaattatcatgcagggctgggtgaggtcgctcacgcctatagtctcaaaactttgggaggctgaggggggaggatggcatgagcccaggagtttaaggctgcagtgagccgagatcgctccactgtcctccagcctgcatgacagagcgagaccctatctcaggaaaaaaaaaaacaaaactattatgcagtagtttcgaccctggaagacgagtgtgcatctttgagttgtaacacgtgtacctcgcccatccaggcgtagtttcatttggaatctggttatcctgtagttgctttgttaaaaatatatgtaattgcaaatcattt
(SEQ ID NO:19)
智人核糖体蛋白L23(RPL23)
ttctccagtatatttgtaaaaaataaaaaaaaaaactaaacccattaaaaagtatttgtttgc
(SEQ ID NO:20)
智人核糖体蛋白L18(RPL18)
ccctggatcctactctcttattaaaaagatttttgctgacagtgc
(SEQ ID NO:21)
智人核糖体蛋白L18a(RPL18A)
gtgcagggccctcgtccgggtgtgccccaaataaactcaggaacgccccggtgctcgccgc
(SEQ ID NO:22)
智人核糖体蛋白L19(RPL19)
aacctcccactttgtctgtacatactggcctctgtgattacatagatcagccattaaaataaaacaagccttaatctgc
(SEQ ID NO:23)
智人核糖体蛋白L21(RPL21)
taggtgttaaaaaaaaaaataaaggacctctgggctac
(SEQ ID NO:24)
智人核糖体蛋白L22(RPL22)
atttcatttatctggaaaattttgtatgagttcttgaataaaacttgggaaccaaaatggtggtttatccttgtatctctgcagtgtggattgaacagaaaattggaaatcatagtcaaagggcttcccttggttcgccactcatttatttgtaacttgacttctttttttttctgcttaaaaatttcaattctcgtggtaataccagagtagaaggagagggtgactttaccgaactgacagccattggggaggcagatgcgggtgtggaggtgtgggctgaaggtagtgactgtttgattttaaaaagtgtgactgtcagttgtatctgttgcttttctcaatgattcagggatacaaatgggcttctctcattcattaaaagaaaacgcgacatctttctaagattctctgtgggaaaatgactgtcaataaaatgcgggtttctgggccattcgtcttactttcattttttgattacaaatttctcttgacgcacacaattatgtctgctaatcctcttcttcctagagagagaaactgtgctccttcagtgttgctgccataaaggggtttggggaatcgattgtaaaagtcccaggttctaaattaactaaatgtgtacagaaatgaacgtgtaagtaatgtttctacaggtctttgcaacaaactgtcactttcgtctccagcagagggagctgtaggaatagtgcttccagatgtggtctcccgtgtggggcccagcaatgggggcccctgatgccaagagctctggaggttcttgaaagaggggacacgaaggaggagtgactgggaagcctcccatgccaaggaggtgggaggtgccctggaaatagctgcctcatgccacttaggccatgactggatttaatgtcagtggtgtgccacagtgcagaggctagacaactgaaaggggctaccaaggctgggaaaaaaatgcaattgttgctgtgagtgactttgaaagactctggtgccttgtggtgcccttctgaaattcaaacagtaatgcaaaagtgtctgcattagaatttacggtgtctaaaattcatgtttttaaaagagcttgcctacagatggtttccacacttgaaattgtgccctgcgagttgcatagctggaagttcaatgctcagtcctaccttggctcccattaaacatttggtgctctgtggattgagttgaacgtgttgaggctttgcaatttcacttgtgttaaaggctctggcatttttccatttctatgcaaatttctttgaagcagaattgcttgcatatttcttctctgccgtcacagaaagcagagtttctttcaaacttcactgaggcatcagttgctctttggcaatgtcccttaaccatgattattaactaagtttgtggcttgagtttacaaattctacttgttgcattgatgttcccatgtagtaagtcatttttagtttggttgtgaaaaaaccctgggctgaagttggcatttcagttaaaagaaaaaaagaaactagtcccagatttgaaaacttgtaataaaattgaaactcactggttttctatgtctttttgaactcttgtaatcgagttttgatcatattttctattaaagtggctaacacctggctactcttactgt
(SEQ ID NO:25)
智人核糖体蛋白L23a(RPL23A)
actgagtccagctgcctaattctgaatatatatatatatatatcttttcaccatatacatgcctgtctgtcaatttctggttgggctgggaggccacacacacacactgacatgacagggcttgggcaagactcctgttctacttatccttttgaaatacctcaccctgccactccaccatgtatgatcattccagagatctttgtgactagagttagtgtcctaggaaaaccagaactcagaacttgcctccatggttgagtaacaagctgtacaagaaccccttttatccctggaagaggctgtgtatgaaaccaatgcccagggtttgaagggtgttagcatccatttcaggggagtgtggattggctggctctctggtagcattttgtcctcacacacccatctactatgtccaaccggtctgtctgcttccctcaccccttgcccaataaaggacaaggacttcagagg
(SEQ ID NO:26)
智人核糖体蛋白L17(RPL17)
attcagcattaaaataaatgtaattaaaaggaaaag
(SEQ ID NO:27)
智人核糖体蛋白L24(RPL24)
actggcagattagatttttaaataaagattggattataactctag
(SEQ ID NO:28)
智人核糖体蛋白L26(RPL26)
agtaatcttatatacaagctttgattaaaacttgaaacaaagagcctg
(SEQ ID NO:29)
智人核糖体蛋白L27(RPL27)
atgctttgttttgatcattaaaaattataaag
(SEQ ID NO:30)
智人核糖体蛋白L30(RPL30)
accttttcacctacaaaatttcacctgcaaaccttaaacctgcaaaattttcctttaataaaatttgcttgttttaaaaacattgtatct
(SEQ ID NO:31)
智人核糖体蛋白L27a(RPL27A)
agccacatggagggagtttcattaaatgctaactactttttccttgtggtgtgagtgtaggttcttcagtggcacctctacatcctgtgtgcattgggagcccaggttctagtacttagggtatgaagacatggggtcctctcctgacttccctcaaatatatggtaaacgtaagaccaacacagacgttggccagttaaacatttctgtttataaagtcagaataatacctgttgatcactgaaaggcctgcatgtattgtactctgaattttacagtgaatgagagaatgtaccctaattgttcaacagggctcaaaaggaaagattccattttgatgggtcacattctaaagaggggcagtgtgataggaatgagatggtcctttaggacttaagttctcagcccaaggtttttccacgtggccccctcatcttttttttttttttaaacggagtctctcttgccaggctggagtgcagtggcacgatctcggctcactgcagcctccgcctcccaggttaagcgattctcctgcctcagcttcctgactaactgggattacaggcgcccaccaccatgcccagctaatttttgtattttcagtagagatggggtttcaccatgttggccatgctggtctctaactcctaacctcaagtgatctgcccacatcggcctccaaaagttctgggattatagtgtgagccactgcgcccggccatggctccttaatcttgatccaaattattgttacatccagaatgtgatgaatcaaaatctcgagatgggggtccagcaatctgaaatttcagtatgccagggcttttctgtatgtcaaagtgggtttgaaatagttaatttttcttctagtctgaaatgtatcgggaaaatttggaaatcctgaaggctggaaattgaaataagtttttctaggatttgtgtctcttgctattggaaaactgatggtgaccaattcatgtttacaaataagatcctcatagatctcggtaaattataatttgctacagttttatggttcttcctgtgattttgagctttttttgacccaaaataatacagtctaaaactatagacaaataagatggcacttagactcctgggttttagttagtggaggtttccttagtgcactgtggggtcataataagccgagaaccatggctgtctatgggacacatctgtcaggacaacctttagaggatgttggggatcaaatagaaggcacagagaagcactgaattggcttacataagaataggctagaattacaagtagtgaaacctcgattcagctggacaattttaaacaaatgtatcatttggcttgtatcttctgttgtgctggagaagttagaaataagggctctccagaccagcctgaccaacctggagaaaccttgtctctactaaatacacaaaattagccaggcgtggtggcacatgcctgtaatcccagctactttggaggctgagccaggagaatctccaggaggcggaggttgctgtgagccgagatcgtgccattgcactccagcttgggcaacaagagtgaaactctgtccaccccccccaaaaaaagtaagggctctccattagggcccatagaggacttgtaatatggaacctgaatccaaggatcccacaataagtggtcagtagttcatgatgaattaaaagactcaatatttggtcttcacccaatacctgtgtgacttttagtcctaatttcctcatctttaaaatttcagtgaaagtgcctacctgaggattgtgtagattaaaatggaaaccgtgcacttaattttttgttttgttttgagacggagtctcgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggtgcgatctcagatcactgcaagctccgcctcctaggttcagaccattctcctgcctcagcttcccaagtagctgggactacaggcgcccgccactgcgcccggctaattttttgcatttttagtagagacagggtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatctcctgatctgcccgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccgcgcccggcccaggcacttaatttttgtgtttgacttagtaacttaagtgcaaactattacgggagcagatggagtcaattggccttcatgtgattgtcagtgggaaattggtccaagcagagggaatactggttcaggaaactggtttgggaaggttaggcaaacgggaagtgctatggtggagagaaagattactctggccgggctgtaaaggacggctacaatgggaggctgaaggcagaaccaagaaaatgggagtgagtatggaaaaggtacgattcagacggcataatggacgggacttggagactgaattgtagtgggccgaccacaaaatgataaggcatggaaggaagtagagtttggggggaaggatccctagtcccttaatggctaccttcttccccaggagttgttaggccatccgatcccctggcctgggaaagaaacactgatttcgttgctggcttgttcactcaccagaagctacagctactaacagttctaaaaactgtttcatgtgatgaggaacagacgaaaatagttttgagccctaagtccgccgattccagtgctttcttgaacccgcatttactaaaatattttcatgactgccaagctttgaatagcctgctgtgttcatggaggctcatactggcgatctctagtggctggctaaagcttgaattgcaaaagatctaatttctggtctaatgtatatatgccttaaatatagttgcgttcaaacgtgggagctgcaggtgcaacttgattttatgacaaatggctgccacataatttgcacaagcagtgctcgtcaagggcagctaaatcaggcgagctttcaatcaaaataaatgtactactaaaccctacttagcggctaactagcccaagagcagacagcccacggacggactgcaagtcggaagcgcgggcggaagctgtgcagcgcccacctggtggctccatcggccgcgttcatcagtcagcacgacccgacctcagtggcgtcctcacaacacagaccggaccttgggtcttaccccggcacctgagaaccacttccggtgagtagcttctacttccggagacgatgactcccccgcgtcccagaccggaagaagcccggcggagaccggcctcgctcggccacttccggcaagggcggagccggccagtggtgcgcgagcgcagataactcccctggagaggcgggatgttcaactccacccctggtccttgggcggccgtgggtccccttcgaagcggaggaatggccaacctcgccgcacttcgagcccctttagggtgcgtttaagaacagtgggcgtggcctttacgtaaatcttcgagatgggaacctccagaatttgtctcaattgtctaaaaggtaatgagcgtcagcgacattcaagggcactttgggctaaaaaagaaagtgcttgtacacggatggaaatattctagaagaacataaaaggaatttcctcttaggaggttagggaaatgagcacgaagtatgttttggtgcagttttttgttcaacccaatgcgtattttcatattgagaggcaatataaatggagcgaaagtatcttgagaaaaaaaaaaaaactaccagaacttgccgttgctgaaaagtaatattttctctttcgagagttttcatggccttttaaattacacccccacctccacaggcaaataaatttgttttggaatgcataccacatcatctggctctagaaacgtattttgtgtagctcccctagcaagaatataggttaaagcgtaaatttaattcctggctctattttacatcccaatttttattttcctctcattcccactttacgttgtttcaaataacctagtttgtgtatccctgtaagtcattttggtataaagtaggttataagtgtacatgcgaaaagatgtttttaacaaaaatgtaactg
(SEQ ID NO:32)
智人核糖体蛋白L28(RPL28)
gccttgctctgctcccccgcccccaggcagccatccgcagggccagcgccatcctgcgcagccagaagcctgtgatggtgaagaggaagcggacccgccccaccaagagctcctgagccccctgcccccagagcaataaagtcagctggctttctcacctgcctcgactgggcctccctttttgaaacgctctggggagctctggccctgtgtgttgtcattcaggccatgtcatcaaaactctgcatgtcaccttgtccatctggaggtgatgtcaatggctggccatgcaggaggggtggggtagctgccttgtccctggtgagggcaagggtcactgtcttcacagaaaaagtttgctgacttgtgattgagacctactgtcccattgtgaggtggcctgaagaatcccagctggggcagtggcttccattcagaagaagaaaggccttttctagcccagaagggtgcaggctgagggctgggccctgggccctggtgctgtagcacggtttggggacttggggtgttcccaagacctgggggacgacagacatcacgggaggaagatgagatgacttttgcatccagggagtgggtgcagccacatttggaggggatgggctttacttgatgcaacctcatctctgagatgggcaacttggtgggtggtggcttataactgtaagggagatggcagccccagggtacagccagcaggcattgagcagccttagcattgtccccctactcccgtcctccaggtgtccccatccctcccctgtctctttgagctggctcttgtcacttaggtctcatctcagtggccgctcctgggccaccctgtcacccaagctttcctgattgcccagccctcttgtttcctttggcctgtttgctccctagtgtttattacagcttgtgaggccaggagtttgagaccatcctaggcaacataatgagacaccgtctctaaaataaaattagctgggtgtggtggtgcaccgcctgtggtcccagctcctcagaggttgagtagaggctgaggtgagcggagcacttgagccaagagtatgaggctgcagtgagcccatgagccccaccactacactccagcctggaagacaccatgacacacagtgaggcctggatggggaaagagtcctgctgttgatcctcacatgtttcctgggcacctaactctgtcagccactgccagggaccaaggatccagcatccatggcacccctggttcctgccatcctggggtacccgattcaaagaaggactctgctccctgtctgagaccacccccggctctgactgagagtaaggggactgtcagggcctcgacttgccattggttggggtcgtacggggctgggagccctgcgttttgaggcagaccactgcccttccgacctcagtcctgtctgctccagtcttgcccagctcgaaggagagcagatctgaccacttgccagcccctgtctgctgtgaattaccatttcctttgtccttcccttagttgggtctattagctcagattgagaggtgttgccttaaaactgagttgggtgacttggtacctgctcaggaccccccgcactgtcccaatcccactcaggcccacctccagctggcctcactccgctggtgacttcgtacctgctcaggagcccccactgtcccagtcccactcaggcccatctctggctggcctcactgcgctgggactccgccttcataaggagagctcactgctcacgttagtagatggccccttctcgtgaggcctctcccctggcacctgcttcagttgtcctccacagcactgatttgcagcccacaagctggcaggtttatctgtctcatgtttgtcttgtgctggtgggcaaggggtttgtctagcacaccagcatataatgagatgcttgatgaatggtgcatattgaatgtataaagcccaccggtcctgagagtttgctcactggagactttctggagatggagtctcgctctgttgcccaggctggcgagtgcaatggcgcgatcttggctcactgcagcctccacctcctgggttcaagcgattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggattacaggtgggtgtcaccacacccagctcagtattgtatttttagcagagatggggtttcaccattttgcccaggctggtttggaactcctgacttcaaattacccacctgcctcagcctcccaaagtgctggcattacaggcgctcgaggctttctgatgtggctgctgctgctcagaaggccttgtccttaaccacctccttgcctgccctggaggcttgtgcctctaggccccaccccctgtggagtcctgctggctttctccatccctatctgaatcctccctgctgtgtggcctcccctggtctcatccgtaacacagcccagcttagtgggcctctgttcctgcgggtggccagcctgtctgtgtggctgggctggggaggccacgtctggtatctgaatgctatcggtgggttggggtggaggaaccaggagagggctggagggagggagatggtctcagccccacagagtttggagtcctcagtgtgctgagcaaacgtggagacaccatttccctcctctagacctcatcttggagagagagatgttggatggggccatctattccagctttattcacacaaatcatgtctgttggcctggaaattggaaaaccagttaaaccaaaaacatgatattaagaaaacaggcaggctcaccatagtaaaaatgctgaaagccaaagacaaaattgggagaacaaaagaaaagcgtcttgtcacatacagaaggtccctgataaagttagtagctgccctcatcagaaaccaggcccaggcagtggggacacatccagagtgctgaaagaacctcccccaggtcatcctatccccaagagtgatgcccggcagcattcccagctcagggctaatggttcacggaagccaggaatcaaactgcctgggttccagtcccagctctgccagttatgcccagctgtggggacttgggcagctcgtttagtagcaccgtgcctcagtttcccatatgtaaaaggccattttgagtgcctttcacagccctgcataaggcaggtgtctcagtgttcactgctgtctctccagctcttagtccagtagctgcatggtgagtgagcgtagggcgcaccctggaaggctgccaagcccaaagttgtgcagagcgctggggactccagactccccacagcagcagagactcgggactgaggcatcctctgttcacaggacatgctggcatctactgggtcagggctctgctgctcggtggctgtgcaaccttgggcaagttcctcaacctctctgtgtcttcgtaccctcatctgtaacatgcgtgtcgatagaccctactactcagggttgatgagaagattaaatgtgcaaaacctgcttgactgtgcccacaaatcctgattgtaggaataaattaatgactttttataaatattttgatcagatggactcatgatcacagatgtcttcacatgcctatgactaatttgtacacaaactaatgctcgtgtttcccaagcacctggaagacatgccagatccatgtgcagtaatgcctggtggctccaggtctgccccgccgtcctgtggggctgtgagctttcccagcctcctgcccgtgtttgtgaatatcattctgt
cctcagctgcatttccagcccaggctgtttggcgctgcccaggaatggtatcaattcccctgtttctcttgtagccagttactagaataaaatcatctacttt
(SEQ ID NO:33)
智人核糖体蛋白L28(RPL28)
ttttttactgtcaggcaggaagagcggtaactgccatcgcggcgggcatccctggcgccagggtgttggtctgggtaccggcttccctctcggccgacttgtcagctctgtgagccgcgcgcgtctgagcccgtgtcctcacctgtaaagtggagaaatgaaaaaggacctgaacttcctcggtggttgttgagagttaaggcacggggttgatgttttcagatgaaattctcaaagcaagtcagggtggggatggatggtttcatcccacaggtgggaagattgagg
(SEQ ID NO:34)
智人核糖体蛋白L28(RPL28)
gtttttctcaggtccttgattggaactgcctcagagccaagggtccttttactcagtggcagcaacaaacgcagtctgttggctagtgatcctcctgtctcagggacacgtagtccagggagcagccaattgcttggcacttggggaccccgttctggggagtcctgaaagctttcacctcttggattgccgaatacatgggtggcccttcctagactaagggactggcctgagtgaggctgggcctctcagccaagctgatgttgaaccactgctgtggggatgggcctggggttcctgggaagctgttcatacccattgccaggagcgtgggctctggctggacctggatcagatcctaactgaagcggcagctttctggcatgagaaaggagtgttttcatggtggacagaattgggctatgagtgt
(SEQ ID NO:35)
智人核糖体蛋白L29(RPL29)
atatctctgccaacatgaggacagaaggactggtgcgaccccccacccccgcccctgggctaccatctgcatggggctggggtcctcctgtgctatttgtacaaataaacctgaggcagg
(SEQ ID NO:36)
智人核糖体蛋白L31(RPL31)
agggagccctcctggaagtggatgaggccttgggtctcggctcttcattgcttcctgagctgcagcagatgcctttacaaccaagctcaccgaggacgtctgtctcccatattaccctggcagagggccaggcctgttctacacggccggggtttcaacaaggtactgatgtcttctgcccttgcctcttcgacaggcaagtaataagacttaagtgaagagaattctttaggcacacaaattcacatttgatgtaatctcattatacttcctgatctgtgattgaaaactttcatttcgtaactagtatgtctgtcccacctttaaaaagtttttcattatgaaagtaagtatttgttagaattaagtctatttaaatgaaaaaaacttagatatgagtctgcatggcctcaggaaaatgatgttttaaaatagagattttaggttgtctgcactctagcttttttgtcgttttcttaaggcttttttaactgcatcaaaaattcagatacgaaacatacactaaaaaataatacatcatatcttaatttccactgaacttgatttaaattcagagttacacagtatgaatatcacaatcagatatgttcaaaaaggtctgaacaattgattttctgaaaccatgaaggactac
(SEQ ID NO:37)
智人核糖体蛋白L31(RPL31)
agccatttaaattcattagaaaaatgtccttacctcttaaaatgtgaattcatctgttaagctaggggtgacacacgtcattgtaccctttttaaattgttggtgtgggaagatgctaaagaatgcaaaactgatccatatctgggatgtaaaaaggttgtggaaaatagaatgcccagacccgtctacaaaaggtttttagagttgaaatatgaaatgtgatgtgggtatggaaattgactgttacttcctttacagatctacagacagtcaatgtggatgagaactaatcgctgatcgtcagatcaaataaagttataaaattgccttc
(SEQ ID NO:38)
智人核糖体蛋白L32(RPL32)
gcagctcatgtgcacgttttctgtttaaataaatgtaaaaactgccatctggcatcttccttccttgattttaagtcttcagcttcttggccaacttagtttgccacagagattgttcttttgcttaagccc
ctttggaatctcccatttggaggggatttgtaaaggacactcagtccttgaacaggggaatgtggcctcaagtgcacagactagccttagtcatctccagttgaggctgggtatgaggggtacagacttggccctcacaccaggtaggttctgagacacttgaagaagcttgtggctcccaagccacaagtagtcattcttagccttgcttttgtaaagttaggtgacaagttattccatgtgatgcttgtgagaattgagaaaatatgcatggaaatatccagatgaatttcttacacagattcttacgggatgcctaaattgcatcctgtaacttctgtccaaaaagaacaggatgatgtacaaattgctcttccaggtaatccaccacggttaactggaaaagcactttcagtctcctataaccctcccaccagctgctgcttcaggtataatgttacagcagtttgccaaggcggggacctaactggtgacaattgagcctcttgactggtactcagaatttagtgacacgtggtcctgattttttttggagacggggtcttgctctcacccaggctgggagtgcagtggcacactgactacagccttgacctccccaggctcaggtgatcttcccacctcagccttccaagtagctgggactacagatgcacacctccaaacctgggtagtttttgaagtttttttgtagaggtggtctagccatgttgcctaggctcccgaactcctgagctcaagcaatcctgcttcagcctcccaaagtactgggattacaggcatcttctgtagtatataggtcatgagggatatgggatgtggtacttatgagacagaaatgcttacaggatgtttttctgtaaccatcctggtcaacttagcagaaatgctgcgctgggtataataaagcttttctacttctagtctagacaggaatcttacagattgtctcctgttcaaaacctagtcataaatatttataatgcaaactggtccttc
(SEQ ID NO:39)
智人核糖体蛋白L35a(RPL35A)
actaacgaaaaatcaataaataaatgtggatttgtgctcttgtatttttaagtggattaaaaaacttactacctt
(SEQ ID NO:40)
智人核糖体蛋白L37(RPL37)
gaatgtcaacgattagtcatgcaataaatgttctggttttaaaaaatacatatctggttttggtaaggtatttttaatcaattaggcttgtagtatcagtgaaatactgtaggtttagggactgggctagcttcatatcagatttacttgttaagtgactgttttggaatgtttacttttggactgggtttgtaacacggttaaaggcaatgagaaacaagcagaattccaggagtccttgaagcagagggcactggaagacaatatagcagattaaaatagcacagctcatgtggcataggtgggtattttagatgtttgagtaaatttgaaagagtatgatgtttaaattacctttagcaacatgttcatctgctatgctgtcatgactagggggatgattattagtcacatagagcttgggagtaccactggaaacgtatgggtaggagtttaggtggcttctgtttttcaaaagatgatcttatcctagtatctgtaatgctcacttggcacacctgacttgtgggctgtgtgtaaggtggctagctaagtgaaaaaagcctgctaggtgtgagtcaacttaagaatatgtaaataggtttgagaaaaagtagggcttgggtgcaagtaaagattgagcaggaaataaaggaaaatcaagtataatccctgagatttgtagactaaaggcaatgatgtgggactacttggtcgaatttttttagccctcaacttggtaattgggtgtttctgtgttaaagcactgaaacttgctgtcgtgccttcctagttttcgtggtttattgacagggttgggggttttttttgtttttttaaaatgaagggacaaagtcaactggactgctgagtgagagggcaggggcagttgaagggaacatgaattgctggaacagctacataaaatagtgatgtagccaagtcatgctatttaaattataattctccactgtgtttagaataacatctgaggttcttaacctggccttggaagggtatcacttttacttgtaacctggaatggctttataatgtgctagctaattgctactctcatcttgtattttaactcctaatttacccttcaggtctcagcttcagaacattcacttataaagaaaccctgctgattaaatctctcttgggcttcctccc
(SEQ ID NO:41)
智人核糖体蛋白L37a(RPL37A)
acgctcctctactctttgagacatcactggcctataataaatgggttaatttatgtaac
(SEQ ID NO:42)
智人核糖体蛋白L38(RPL38)
accagacacactgattggaactgtattatattaaaatactaaaaatcct
(SEQ ID NO:43)
智人核糖体蛋白L39(RPL39)
ggaattgcacatgagtggcacacatatttatgctgtctgaaggtcacgatcatgttaccatatcaagctgaaaatgtcaccactatctggagatttcgacgtgttttcctctctgaatctgttatgaacacgttggttggctggattcagtaataaatatgtaaggcctttcttttt
(SEQ ID NO:44)
智人核糖体蛋白,Large,P0(RPLP0)
tcaccaaaaagcaaccaacttagccagttttatttgcaaaacaaggaaataaaggcttacttctttaaaaagt
(SEQ ID NO:45)
智人核糖体蛋白,Large,P1(RPLP1)
acctcttttataacatgttcaataaaaagctgaacttt
(SEQ ID NO:46)
智人核糖体蛋白,Large,P2(RPLP2)
attcctgctcccctgcaaataaagcctttttacacatctc
(SEQ ID NO:47)
智人核糖体蛋白S3(RPS3)
cagggtctccttggcagctgtattctggagtctggatgttgctctctaaagacctttaataaaattttgtacaaagacacaaggtctgactagactgttcagtattcagactgaggggcatgttggcctctggagcattacatatcttcttggttttaaccatacttgtggtatttgcaagggccagaacagtaagacccaagcagagccaaccagagaaataatatttgtgtgatagagaaggctgatagcaagcaaggcagcaccttgattcgttgtcctgtagttcaggattgtaggtttagaagagggatatgtttgagtttttcctatgcataaggcgatccacgttgcacatagaaagtgaatataaatggccattatattttgtgtcatgctgtgctctaagtgttctttacatatgtactcgttaatcaacctctctaaagtgtaaaggaaatttgcttgcaccactgaaggcacataaggctcagaagtaaatttgcctaagcagtataaagctatcattagaatccacattcctaagttgtgttctcttaggggatcatggaaccagtcattggtactacaggctattatgttctggagaactgtgaagaacatttaaattgtctctgattttatctatcaatgttttgaagtattttctaccagtgtctgtacttcacaagaaattcggcactattttttcaggcaaaactagtgagggacaggttggcttgaaaatcatgagactgttgttaaatcagatgctggttgatcacagaggggacttccagggaaagctgttatcaggtggctgcttcctggtgatgcagcctggctgatgagataaccctggctccacagatggcttagcaggtgctgtgatgatttggttttcttctcaattagactgagctgcacatggtgtttatattgcttggcacatggtaagggcttaatatttgaggtaattatgtagggcgtacactgacaagtatctgacccccccttcctttttgactcataaattggtcatcttaaccatttaagtgtacacttctatagtgacagagttagccctctgtccaagggatttgcatctgtggattcaaccaactttgggtcaaaaataatcaaaaaggatggttgtgtgtgtattgaacatgtagacttatttttcttattttcaaaatactatattttcttgtcacttattttcttgtacactgcagttgtaacagctatgtagcatgtacattaggtattaaaagtaatccagtgaagattgaaagtct
(SEQ ID NO:48)
智人核糖体蛋白S3(RPS3)
cagcctcttccatgagtggggagcccgctgcttgtctccagctcctagcagtgagtcctgataatctcaaatttaaggacagtaactttgtctgggatgagtgtgggaaaggatgtgtttgggaacagacgcgagcctgcagaggtgtttgtaaccatctctttctaagtggtgggaagcagacattttattctttaactgttaatatatatagtgtgtgttttttatgcatgaaatattttatagtttttaaaaatgcccacactactattttgaaagtaaatgaggtaatgtatgtgtcagaacccaatacccaaagcgatcgtagtaagaggtggggcctttgggaaggcattaaattgcttagggaatgagggtggaaccctcatgaatgagattagagccttataggagaggttggagggagttgcctggcctccctctcccatgtgaagactcagcaagaaaacattatttaggaagcagagagccctcatcaaacaccagatctgctggccacctgatctggcactttccagccttcagaactgtgagaaataaatttctgttgtctat
(SEQ ID NO:49)
智人核糖体蛋白S3A(RPS3A)
agttcagacttcaaatagtggcaaataaaaagtgctatttgtgatggtttgcttctg
(SEQ ID NO:50)
智人核糖体蛋白S3A(RPS3A)
agctcacgttgatgtcaagactaccgatggttacttgcttcgtctgttctgtgttggttttactaaaaaacgcaacaatcagatacggaagacctcttatgctcagcaccaacaggtccgccaaatccggaagaagatgatggaaatcatgacccgagaggtgcagacaaatgacttgaaagaagtggtcaataaattgtaagtgtttctttgcttcctcacacaacacaaccttgagtattggattattcctgagatgagagaacgcatatgagacaaggtaaaggtctgttgaaatcctgtctgtgaatccttctagctatatctctttaagtgaaagagtgttaagtactcagtaaatatgattattattactattattatttgagtcagagtcttgctctgttgcccaggctcgagtgcagtattgtgatcctccttggctcactgtaaccactgcttcctgggttcaagcagttcttgagcctcagcctcctgagtatctgggaatacaggggactgccaccatacccagctaatttttttaaatttttagtagagatggggtttcatcatgttggccaggctggtcttgaactcctgacttcaggtgatctgccagtactctaaatgataacagttttttcgtgtttatttattttgaatgaagctgtctcacagtagatggagttgaaggacaggaaatgtttttcccctacttggaaaatacactgaataagttgagtggggtgggatgtgcctggagtcccagctactcaggaggctgaggtggtaggattgtttgagcccaggagtttgaggccagcctgggcaatatagggagaccctgtcccaaaaaataaaaaatatacgtatatatatatacacacacaaagaaaaaatacactgaatagacaaaacctttcatgattaatgatgcacgggaataagtgatgaaaaaagtttcggtcccagatgatggccagtgataacaacatttttctgatgttcccatgcaatatacagttagctaagagggtgtaatggaaaaagcataaggcttggactcagaagactctactaactttgccactagctagctatgtaattcagatcatctatcctttacatgtgaaaggtaaataatggcttatcttaacaggaggatttatgcaggttaaatgaggtaggtgttatgtgtaggtttattccaaggcttctctacttttaaaggaaatggcttatatctgagaactaggacttttagaaaaaaatttactgttactggtttgcaggattccagacagcattggaaaagacatag
(SEQ ID NO:51)
智人核糖体蛋白S4,X-连锁的(RPS4X)
aatgggtccctgggtgacatgtcagatctttgtacgtaattaaaaatattgtggcaggattaatagca
(SEQ ID NO:52)
智人核糖体蛋白S4,Y-连锁的1(RPS4Y1)
attgcagtagcagcatatctttttttctttgcacaaataaacagtgaattctcgtttctt
(SEQ ID NO:53)
智人核糖体蛋白S5(RPS5)
ttttcccagctgctgcccaataaacctgtctgccctttggggcagtcccagcc
(SEQ ID NO:54)
智人核糖体蛋白S6(RPS6)
gattttttgagtaacaaataaataagatcagactctg
(SEQ ID NO:55)
智人核糖体蛋白S7(RPS7)
acaaaaatgactaaataaaaagtatatattcacagt
(SEQ ID NO:56)
智人核糖体蛋白S8(RPS8)
atccttgttttgtcttcacccatgtaataaaggtgtttattgttttgttcccaca
(SEQ ID NO:57)
智人核糖体蛋白S9(RPS9)
gtccacctgtccctcctgggctgctggattgtctcgttttcctgccaaataaacaggatcagcgctttac
(SEQ ID NO:58)
智人核糖体蛋白S10(RPS10)
aattggagaggattcttttgcattgaataaacttacagccaaaaaacctt
(SEQ ID NO:59)
智人核糖体蛋白S11(RPS11)
ggctggacatcggcccgctccccacaatgaaataaagttattttctcattcccaggccagacttgggatcttccgcg
(SEQ ID NO:60)
智人核糖体蛋白S12(RPS12)
agaaataaatctttggctcac
(SEQ ID NO:61)
智人核糖体蛋白S13(RPS13)
atttgtctgtgtactcaagcaataaaatgattgtttaacta
(SEQ ID NO:62)
智人核糖体蛋白S15(RPS15)
tggctcagctaataaaggcgcacatgactcc
(SEQ ID NO:63)
智人核糖体蛋白S15a(RPS15A)
ggatgtaatacatatatttacaaataaaatgcctcatggactctggtgcttcc
(SEQ ID NO:64)
智人核糖体蛋白S16(RPS16)
gcccatcgtgactcaaaactcacttgtataataaacagtttttgagggattttaaagtttcaag
(SEQ ID NO:65)
智人核糖体蛋白S19(RPS19)
aacaaaccatgctgggttaataaattgcctcattcgt
(SEQ ID NO:66)
智人核糖体蛋白S20(RPS20)
ctgcattctcctccgccaaaaaagtgaccaagcagagtctttctctgtcacccaggctggagtgcaatggcgtgatctcagctcactgcaacctctgcctcctgggttcaagtgattctcgtgtctcagcctcctgagtagctgagactacaggtgtgcaccagtgttcccagctgatttttgtattttatgtagagatggggttatgccattttggccaggctagtctcgaactcctgagctcaggtgatacacacacctcagcaaatcttttaaattatacattctgtgatatttccttgactttcttatccagcacttgtattgattatttttcattttgataatgttgggtttttaaaaactcctttatgatggaaaatttc
(SEQ ID NO:67)
智人核糖体蛋白S20(RPS20)
gtcaactattttaataaattgatgaccagttgttaacttctgttggtttttattcagaatactggcagattttaggaatataaaggtgtactatgagacttccacttttcaggtggaatatatgggtatcttagagtggtctatcctgttttcgttgtcgtttgagtcatttgaaaactggattccgttaactacataatatgtgagacctgactggttttattggacactggcagtttataactttggcatactctagataaattctgattggtatgggg
(SEQ ID NO:68)
智人核糖体蛋白S21(RPS21)
ctggagagaatcacagatgtggaatatttgtcataaataaataatgaaaacct
(SEQ ID NO:69)
智人核糖体蛋白S23(RPS23)
atattaatggtgaaaacactgtagtaataaattttcatatgccaaaaaatgtttgtatcttactgtcccctgttctcaccacgaagatcatgttcattaccaccaccacccccccttattttttttatcctaaaccagcaaacgcaggacctgtaccaattttaggagacaataagacagggttgtttcaggattctctagagttaataacatttgtaacctggcacagtttccctcatcctgtggaataagaaaatgggatagatctggaataaatgtgcagtattgtagtattactttaagaactttaagggaacttcaaaaactcactgaaattctagtgagatactttcttttttattcttggtattttccatatcgggtgcaacacttcagttaccaaatttcattgcacatagattatcttaggtacccttggaaatgcacattcttgtatccatcttacaggggcccaagatgataaatagtaaactcaaaattgctccccactctgtttattatttaaaggtgtcaggatctgtgttgtaatgtgtctacattaatgtgtttaggagaatacaggcattggatcatttagttgatggaagtatatgccaggcaagggagataaggtatacgacaagactgatgttttcagtatcttctcatgaggttgtcagagaccttcatgtcttcaaagactagtcagcaaatgaagtggtttagtgtagagacaagattggttgtgttttgataatttaagctaggtattgagtacatgtggattttgctgtccacaaatacttgtttcagagttttcatggatacagtggcatggttgaaatgaagctgtgagccttctgctttaaatctgatgtaagaaactcctgttaacaaatagtaagtatgggttaattagccctttgatcaaagcctagctttacattgtttaggatctttggaaaacaattggtttggttgcccactttccgtaggatcaagagcagaacctttcacatggcacagaagaacccaggttgcgcttcatacctgcatattccagccttagcctgccatttctctccttggcactttgtgctccagcaacactggtctcagttggtcatcctcaaacttgggttccatatccagcctcaggacctctgttcctgttactatggttccttgcatgtcgcctgctcttactaaagagctcgtgtgttttccagcacacttcggtttatctcttgatgatgatgctagtctctccctccgcaagggcggaaaggctgcctgttggtttgtaccagtgtttcctaacgtgtagctgcagtcagtatttggctaagctgttcccaggggctcaacagatgctttcggatgagccttaactgacccaatcctttgtgatgcgggagagattgctaggcctcgctcacctggccagaaccagggaaagaggccgcggttgcagcgcgattccaggccctgggcgtcaggcgcggggtgggcagctctccccgggcggtggggcccttgtgaccgcgaggcggggcgcaccaggaagggagtgggacagcgcgggcgcccagggatgtggcctggttacctgccttctctgatacgtcaagacaccttcaacaatggcttgcagctgtaccctgttggctgcacccaggacgcccttttcactgctaagcagtcctacctgaggcccaggggctgccagattgacccataaataatctccggcgcctcagatccagaagctgctgagcctgatcttagtgccttctcctttctctgtgtggccccccagcccctttccccactgccttgtgtccaaggccctttccttcatgtatccatggaggagagacaaaaatacacatcaataaaataagatagggaatccataaatagacattcagaagtatggccaacggatttatcttaaaaccaatggaggaagaagagtttcaataaatgttgtggacttccatttgtcaaagaccaaaacaaaggaaccccaaccttacatgtaatacaaacttaactcaaaatggatcatatatctaaatgtaaaatggaaagctataaaactgaaaacagactatctttacaacctaggcgtaggtatagtttttagacattacaccaaaagcacatgccgtaaaagaaaaaatagataaattggtggatttcattaaaattaaaaaactttttctctctgaaaaatcctgttaagctgggcgctgtggttcatgcctgtaatcccagcactttgggaggctgagttgggaagaaattaatagcttgaggccaggagttcaagatcatcctgggcagcaaagtcatacactcttgagggaagagagagaccttctcatattgttttatattgttttatactcagtacctgttttaagaaaaaaacaaggaagtgaaatcaaagacaggcagcccggcaccaggcctgaaaccagccctgggcctgcctggcctaaacctagtagttaaaaatcaacttacgacttagaacctgatgttatccgtagattccaagcattgtataaaaaaattgtgaaactccctgttgtgttctgtaccagtgcatgaaacccctgtcacatatcccct
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(SEQ ID NO:70)
智人核糖体蛋白S25(RPS25)
ataggtccaaccagctgtacatttggaaaaataaaactttattaaatc
(SEQ ID NO:71)
智人核糖体蛋白S26(RPS26)
ggagctgagttcttaaagactgaagacaggctattctctggagaaaaataaaatggaaattgtactt
(SEQ ID NO:72)
智人核糖体蛋白S27(RPS27)
aagcactctgagtcaagatgagtgggaaaccatctcaataaacacattttggataaatcctg
(SEQ ID NO:73)
智人核糖体蛋白S27a(RPS27a)
ctgtatgagttaataaaagacatgaactaacatttattgttgggttttattgcagtaaaaagaatggtttttaagcaccaaattgatggtcacaccatttccttttagtagtgctactgctatcgctgtgtgaatgttgcctctggggattatgtgacccagtggttctgtatacctgccaggtgccaaccacttgtaaaggtcttgatattttcaattcttagactacctatactttggcagaagttatatttaatgtaagttgtctaaatataa
(SEQ ID NO:74)
智人核糖体蛋白S28(RPS28)
gcttggctgctcgctgggtcttggatgtcgggttcgaccacttggccgatgggaatggtctgtcacagtctgctccttttttttgtccgccacacgtaactgagatgctcctttaaataaagcgtttgtgtttcaagt t
(SEQ ID NO:75)
智人核糖体蛋白S29(RPS29)
atgctcttccttcagaggattatccggggcatctactcaatgaaaaaccatgataattctttgtatataaaataaacatttgaaaaaacccttc
(SEQ ID NO:76)
智人核糖体蛋白L15(RPL15)
tataagtaaagtttgtaaaattcatacttaataaacaatttaggacagtcatgtctgcttacaggtgttatttgtctgttaaaactagtctgcagatgtttcttgaatgctttgtcaaattaagaaagttaaagtgcaataatgtttgaagacaataagtggtggtgtatcttgtttctaataagataaacttttttgtctttgctttatcttattagggagttgtatgtcagtgtataaaacatactgtgtggtataacaggcttaataaattctttaaaaggagagaactgaaactagccctgtagatttgtctggtgcatgtgatgaaacctgcagctttatcggagtgatggcaatgctctgctggtttattttcaagtggctgcgttttttttagtttggcaggtgtagactttttaagttgggctttagaaaatctgggttagcctgaagaaaattgcctcagcctccacagtaccattttaaattcacataaaaggtgaaagctcctggttcagtgccatggcttcatggcattcagtgattagtggtaatggtaaacactggtgtgttttgaagttgaatgtgcgataaaattattagccttaagattggtaagctagcaatgaatgctagggtgggaagctggtgagccagtggccattagataaatacctttcaagtgtgagcttagacgtcaaccctaaaatacttaaccgtaatgctaattgtgatcattatgaatcccttcagtcacattagggggaaagtagttggctataagtacgtcattcttagtccagtcagtcttaaaaacatcttgggttacccactctgtccactcccataggctacagaaaaagtcacaagcgcatggtttccaaccatatgtgttttctgcagttatttctcttgttctgg
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(SEQ ID NO:77)
智人核糖体蛋白L15(RPL15)
gcaattcttctgcctcggcctcccaaatagccaggactacaggcgcacactgccatgcccagctaagttttgtatttttagtagagactgggtttcactatgttggccaggctggtctcgaactcctgacctcaagtgatccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccacccccagcccaatttttattttttgtacagacaggatctcactatgttgcccaggttggtctcaaactactggcctcaagcaatcctgccttggcctcccaaagtgctggaattataggaatgagccaccacaccgggcccaaatttactttagtaataacaacaattggctgggtgcggtggctcacgcctgcaatcccaacactttcggtaaccaaggtgggcttgagctcatgagttagagagcagcctgagcaacgtggtgagagcccatctcacaaaaaataacaaatcagctgggcatggtgttgcacgcctgtagtctccgaaatcacaccactgcactcccatcttgggtgatagagccagaacttgtctcaaaaataacaattggtttcttacaatcccaaaaggtgcagttactagtattaatccttttttgccaatgaggaaacacaaagatgaagcaacttgctcaaagtcatacagtgacagtctgaattcaaatcctatacacttaaagtttatttgttttgttttggttttttttgagatggagtctcactgtgtcgcaaggctggagtgcagtggcacgatctcagctcactgcaacccgggttcaagcgattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggcacgcaccaccacacccagctaatttttgtatttttagtagagacggtttcaccatgttggccaggatggtctcgagctcctgacctcaggtgatcctcccgccttggcctcccaaagtgccgggattacaggtgtcagccactgcacgtggccaacttaaagtttttgatagataatacattaacgttaaaaattcaaaagataagtataggctctacagtacaaacccttctgcctcctagttcctctccctggaggcaaggtgatcagtttaacaatatttttttattttgagacagggtctcactgttgcccaggctggagtgtagtggcgcgttcacaacttactgtagcctcaacctcctggctcaagcaatcctcccacctcagcctgtcgagtagctggaaccacaggtgcacaccaccatgccaggctaatttttgtattttttgtagagacagggtttcaccatgttgttcaggctggtctcaaagtcctgggctcaagcaatcttcctgtctctgcttcccaaagtgctgggattacagatgtgggccacggtgcctggcctacatatgtattttttccttttcttccccaagtggtaggatatgatacacattgttgatttttttgtttagttatgtatctcagagcttattctttatcagctcatgaggaacttcatttttttttttttttttgagatgtagttttgctcttatagcccaggttggagtacagtaacacaatcttggctcgcagcaacttctgcctcccaggttcaagcgattctcctgcctcagcctccgagtagctaggattacaggtgcctgccactacatccagctatttttgtattttcagtagagacggggtttcaccattttggccaagctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccgcccatctcagcctcccaaagtagtgggattacaggcatgagcaaccgtgcccggctggaacttcattcttttggtataactgcatggtatcccatcatgtggatgtaccatgattcattggatgtggaccctcctgatggacatttaaatttcttccaatctgttgctattacaaaaagaaaaatgtgtgcatacatctttattcatctgtagaataaattcttagaagt
(SEQ ID NO:78)
智人核糖体蛋白S2(RPS2)
ggtttttatacaagaaaaataaagtgaattaagcgtg
(SEQ ID NO:79)
智人核糖体蛋白L14(RPL14)
gtggcaatcataaaaagtaataaaggttctttttgacctgttgacaaatgtatttaagcctttggatttaaagcctgttgaggctggagttaggaggcagattgatagtaggattataataaacattaaataatcagttc
(SEQ ID NO:80)
智人核糖体蛋白S14(RPS14)
acaagattcctcaaaatattttctgttaataaattgccttcatgtaaactgtttc
(SEQ ID NO:81)
智人核糖体蛋白L10(RPL10)
gggcttccaatgtgctgcccccctcttaatactcaccaataaattctacttcctgtccacctatgtctttgtatctacattcttgacggggaaggaacttcctctgggaacctttgggtcattgccctttcacttcagaaacaggttgacaactcagccctgctcatgaggcagcaaaccctgcaaagggctgggactggtggccttatgtcagttgtctactctggagcttgacttggacctccccaggtcctaggcagtaggttgaaaaacactgaagtgcttttcatgaagcacagctgcagcaaagccttgcaatcccaggctggggtcagcctacagttgtgttgcttattacaacacatgcggaccaagaggggcttgtgggctagaggctgaccagcagcgtttatttagcaagggtaggtgtgcatcacattgggcttgttctcacccatctggtttggccattcctccttggtgggaatcatccaggtactgctgaggtcacctgcgatttgccccatttcctatctctagcaacctcctgggccccatgcccccaccccttctagaacctgcattcccagggccttcaccacctgaccaaaggtctaggctaacctttggtcatttgtaacaagacctcggaacagacacgtgtgtggcatggtttggcctggggatcttagatgtctgacctgaactattgtagaacagcgctggcttttgggggagcagcaaaaatgagaggagtgctaggtgggtggcctgagcatctgtatccagggacaggactccaaaggcttttggtcccagagctggggtatgttggccccagcccccagcctgtggctcccaaaaggcctctggttttttgtaatctcagtttacagccatttcttaggtttttaattacctttattttattttgccaaacatacctgggaataccttttattttttttttaccttggggtgatggttccaaaccataaatgtgattatagttaacacatgacccttctagcgtcccagccagtgtttttcctgacctctgttctttggagaggaggatggaagggaggggtccggcacgctgctggcattttgctgtgtcctgcagcccctttccgggacacctgggttcacacagctttttagcttacataactggtgcagattttctgtgtggagatgttgccttgaccagccttggctggactttaccaggcatgcagaagcctgtaccaacacagactacagcacccaggaggtgcgagtgtggctgctcagcggttataacaggcctgactgcattgttcaccggattataatgagccaaaatgtttcccggtgtttgctggtttcagggaaggagtttgatatagcagattaaccaccctccttgtagctattggggcttaatggtttcctggtgattcttaccaatccacaataaacatggcccattggcatatctgc
(SEQ ID NO:82)
智人核糖体蛋白L10a(RPL10A)
ggcacatttgaataaattctattaccagttc
(SEQ ID NO:83)
智人核糖体蛋白L35(RPL35)
ggggcgcattgtcaataaagcacagctggctgagactgc
(SEQ ID NO:84)
智人核糖体蛋白L13a(RPL13A)
gcccaataaagactgttaattcctcatgcgttgcctgcccttcctccattgttgccctggaatgtacgggacccaggggcagcagcagtccaggtgccacaggcagccctgggacataggaagctgggagcaaggaaagggtcttagtcactgcctcccgaagttgcttgaaagcactcggagaattgtgcaggtgtcatttatctatgaccaataggaagagcaaccagttactatgagtgaaagggagccagaagactgattggagggccctatcttgtgagtggggcatctgttggactttccacctggtcatatactctgcagctgttagaatgtgcaagcacttggggacagcatgagcttgctgttgtacacagggtatttctagaagcagaaatagactgggaagatgcacaaccaaggggttacaggcatcgcccatgctcctcacctgtattttgtaatcagaaataaattgctttt
(SEQ ID NO:85)
智人核糖体蛋白L36(RPL36)
gcccctcccctgccctctccctgaaataaagaacagcttgacag
(SEQ ID NO:86)
智人核糖体蛋白L36a(RPL36A)
gtgtcatcttttattatgaagacaataaaatcttgagtttatgttcacttcatttgtttgctgttcatcttttgggagggaataagctagagccatcaatacaattccgcttgtggggaaatttatgcctcttactggtactacttgttttgcattgaagctgactggttgagttcacatcatatgttgcaattttctaatttggcacttcaatcactaggggccttatgaggcagtttgtcattatgcaatggttattggttatcatgtgagtagacacatttcaggctaatagggagaagtcagtaacacattcatagtgaatatgagatgtctttgctaagagttaagtgtcagatctttgttataacagttaatttaataaagaattttggcattgttcttc
(SEQ ID NO:87)
智人核糖体蛋白L36a(RPL36A)
ttgccgtaaggatatgcacttgtctctagtccacacacttcatgatataggtatagcgttagtttagcgaagttttcactgcactgatatatctagtaggtgatggagctgggaatgcaactcatgtctgactagtccacaatactgcactatttcagtgtttacgattttttatcctttcccttctgaagaggcaaaaaattgaggaatgtgccctgctttcctaagaactgaagtgtgagtacactggtaaatcctttcatttgccttgttccttatctgtcaatatgtctgaatcctcgcttgttggttgcactaagaattgttctgttgtttctcatcacagaaatctgcagtcaactacctgttctcgtgaagtcttaaaactcttatagaatagccatttaggcctttctgctagcctcctgaattctgtattctcaggctgagcgagtttctgtttactctcaaaccttaggtgatttggctaactcttaaagtaattagcacgatgattggaacggagcattctctccaacacagcatttcttttggcactttgcttcttgtgcagtttagctccagaaagtattaaggaatgactttagtgctcatttggatgcagtaagtggtttgatctcagggtggcaaaaagaatgctttttttataccttttcacattcggataacttgtttagaagacagaggttctaactaggttttggcctattaagaactgcaaactagcagcagcagaactctggctaaaggggcaagcttattaggaaattgagtatttaaaagttgagctaccatatgatccaacaatcccactgctgggtatatacccagaagaaaatcggtatatcaaagagatatctgcactcctatgtttgttgtagcactgtttataatagctaagatttagaagcaaccttagtgtccatcgggatgaatggataaagaaaatgtacctatacgcggccaggcacggtggcttgtgcctagcactttggaaagccgaggcgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaagatagtgaaaccccgtctctagtaaaaatacaaaaattagccgggcttgtggtgtgggcctgtaatctcagccacccgggaggctgaggcaggagaatcgctggaacctgggaggcagaggctgcagtgagccgagatcacgccactgtactccagcctgggcgacagagcaagactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagggaaaaagaaaatgcacctatacacagtggtactattcagccataaaaagaatgagatccagtcatttacaacaacatgggtggaactggagatcgttatgttaagtgaaataggcacacaaagacaagcatcacatgttcttgtttgtgggatctaaaaatcaaaacaagtggacttgtcatatagagagtagaaggatggttaccagaagctgagaacttctggtggcgggaggtggggatggttaatgggtacaaaaagaaaaaagaatgaattagaccaactatttgatagcacgacagcgtgactaaagtcaataacttagttacatattttaaaataacttagagtgtaattggattgtttgtacctcaaagaaaaaatgcaataaaactttacagtggagaaacctaacaagcactacctcagccaggtaatcaaggttaacatcaacagtcacgagtcatgttgatatatacccttgataaggtgtgatgaaaatgacacttaaacctaaaaatccataaccctatctaatgagaaaaataacaaatcccaagaggggcattttacaaaatacttgaccagtagtgcggaaattgtcaaggtcatcaaaaaagtctgagaaattgccacagccaaaggagtctagagacatgatgactaaatgttaggtggtgtcctgcgtggggtcctagaacagaaaaaggacattag
(SEQ ID NO:88)
智人核糖体蛋白L41(RPL41)
accgctagcttgttgcaccgtggaggccacaggagcagaaacatggaatgccagacgctggggatgctggtacaagttgtgggactgcatgctactgtctagagcttgtctcaatggatctagaacttcatcgccctctgatcgccgatcacctctgagacccaccttgctcataaacaaaatgcccatgttggtcctctgccctggacctgtgacattctggactatttctgtgtttatttgtggccgagtgtaacaaccatataataaatcacctcttccgctgttttagctgaagaattaaatc
(SEQ ID NO:89)
智人核糖体蛋白S18(RPS18)
gtctgtaggccttgtctgttaataaatagtttatatac
(SEQ ID NO:90)
智人核糖体蛋白S24(RPS24)
agtgtctagcagtgagctggagattggatcacagccgaaggagtaaaggtgctgcaatgatgttagctgtggccactgtggatttttcgcaagaacattaataaactaaaaacttcatgtgtctggttgtttg
(SEQ ID NO:91)
智人核糖体蛋白S24(RPS24)
tgtcactgccatggccgccttgctgcatttctgaggatgcttcatctctccaccttcttctccactcagcagccagcagggcactgtggaaatcggagtcacatgagctggcacctctgttcagaaccctccagggctccacatctctctcacccaaatgccaaagacctccccacgcccccacaatcccccacgacctggccactggcctcccaccaccttccagctccagcggctcctaccacatttaaggctttccttcctagttttaatttttcctcgtcagcagttgattttattattttcttgtttattggtattttcccactagaaatgaagctgcgtgaagttagagatttttttttttggtctgtgttcctaattagctcattgctatacccctggcgcccagaacaatgccttggacacagtacgcagtagactaaataaatacttgttgaatgactgactgacggaatgacggctgtgtggggagtggattgggtcgtgaggcagaggctgcggtggaaactcaggcaggaggtgatggtggttcttggggctgcggaatgccaagtttagaagctcttcctctgctgtggcacatgaaccggtcactcgagaaggcttttagatttactttgcctaatcccctcttagtgcatgtggggaaactgaggtacacaaaaggaattccccaccaagttaggggcagaacctagcccccttgtctcccagatggatatcttcttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggtaccatcttggctcactgcaacctctgcttcccaggttcaagcgattctcctgcctcagcctcctgagtgtctgcgattacaggtgcacacaaccacgcctggctaatttttgtatttttagtagagacggggtttcaccgtgttggtcagggtgacctcaaactcctgacctcatgatccacccagctcagcctcccaacgtgctgggattacaggcatgagccaccgtgcctggctggacatcttgttattaaagcttcttctctctttgtaggggagggggagatgcctctggtggagaagaccagtgtggcagtgactgtgtctgttagtgaacctggtggctggttgagggtctgtcgtggtgactgaggacacatacaaagtgcttttctcagtggtcaccttggtgttggtgaataagggtcagaagatggctcctgtcctagggcactgccagtcggtttggaagctgaaatgcctgcttagcagtttgaggaaacacagaccttggaggatcttctggttgcctcttcaagaattcattctattccccttctgctccccaaatttgcttttcttggggtgggtcttggttggcctaagccaagaaagtatggcatctactccttccatagcaatagctcaggaataggcagtgacccagacctgaaccaatcagtgcatggaattacccctggccaaagtggttgattgaggctgggtgcaagcagagttgtgagaaggctcccatttggtggttggagagatcgcacttgctccagaggtcataatgtgcagatctgaggcttggaactgctgcagacattttgctaccacaagtgaagccaccctgacgacacagttgacaatttggagcagggcagagctgagagaacagcagggaaacagccagagtcttgctcaagcctccctgaagtatctatacccctggactctagttatgggggctaataaatgttatatactgtttaaggt
(SEQ ID NO:92)
智人核糖体蛋白L8(RPL8)
tgctgagggcctcaataaagtttgtgtttatgcc
(SEQ ID NO:93)
智人核糖体蛋白L34(RPL34)
aaaaatgaaacttttttgagtaataaaaatgaaaagacgctgtccaatagaaaaagttggtgtgctggagctacctcacctcagcttgagagagccagttgtgtgcatctctttccagttttgcatccagtgacgtctgcttggcatcttgagattgttatggtgagagtatttacacctcagcaaatgctgcaaaatcctgttttcccccagagagctggaggttaaatactaccagcacatccctagatactactcaagtta
cagtatatgatcactaatatagtatgctcttggtaccaggagctctgatatatatctggtacatgtttgataatgacttgattgttattataagtacttattaatacttcgattctgtaaagagtttagggtttgattttataaaatccaaaatgagccttttattgaatccagttctctatgtgaccagttctctgtatgaatggaagggaaaagaattaaaaatcttgcaaagggg
(SEQ ID NO:94)
智人核糖体蛋白L34(RPL34)
aaaaatgaaacttttttgagtaataaaaatgaaaagacgctgtccaatagaaaaagttggtgtgctggagctacctcacctcagcttgagagagccagttgtgtgcatctctttccagttttgcatccagtgacgtctgcttggcatcttgagattgttatggtgagagtatttacacctcagcaaatgctgcaaaatcctgttttcccccagagagctggaggttaaatactaccagcacatccctagatactactcaagttacagtatatgatcactaatatagtatgctcttggtaccaggagctctgatatatatctggtacatgtttgataatgacttgattgttattataagtacttattaatacttcgattctgtaaagagtttagggtttgattttataaaatccaaaatgagccttttattgaatccagttctctatgtgaccagttctctgtatgaatggaagggaaaagaattaaaaatcttgcaaagggg
(SEQ ID NO:95)
智人核糖体蛋白S17(RPS17)
attttttctgtagtgctgtattattttcaataaatctgggacaacagc
(SEQ ID NO:96)
智人核糖体蛋白SA(RPSA)
gctgttcttgcataggctcttaagcagcataaaaatggttgatggaaaataaacatcagtttctaaaagttgtcttcatttagtttgctttttactccagatcagaatacctgggattgcatatcaaagcataataataaatacatgtctcgacatgagttgtacttct
(SEQ ID NO:97)
智人泛蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)
ggtggttctttccttgaagggcagcctcctgcccaggccccgtggccctggagcctcaataaagtgtccctttcattgactggagcagcaattggtgtcctcatggctgatctgtccagggaggtggctgaagagtgggcatctcccttagggactctactcagcactccattctgtgccacctgtggggtcttctgtcctagattctgtcacatcggcattggtccctgccctatgcccctgactctggatttgtcatctgtaaaactggagtaaaaacctcagtcgtgtaattggtgggactgaggatcagttttgtcattgctgggatcctgtcaggcactttgaggtgtccctcaggccttggccctgaagtgtctaggtgtgtggagatgggtagaaaattaggtacacccaatggtgtagaacgttgattctcaaatttttttattttatacaaatggggtctcactatgttgtccaggctggtcttgaactcctgggctcaagccatccgcccatctcagcccctcaaagtgttgggattacaagcaagaactgccatgcctgacccagttctcagttttttcgtttgtttgtttgtttgtttgttttgagacggagtcttgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggcgcagtctcggcttactacaacctctgcctccggggttcacatccttctcctgcctcagcctcccgagcagctgggactacaggtgcccgccacaactcctggctaattttttgtatttttagtagagacggggtttcactgggttagccaggttggtctcgatctcctgaccttgtgatccattcgccttggcctcccagaatgctggtattacaggcgtgagccagcacgcctggcccagttactcagttttgaatctgaggccgtgacatcactcatggtctgcagtcagtgctctgcccctgagctgtaccctctcctatgataatcactcttaagaagggcaacccttggtgttttccccttaaggtcacccaggctggaatgcagtggtgtggtcatggctccctgtaccctggaactcaggcttgggtgatcctctctcctttgcctccgaagtagccaggactacaggtgtgcacccaccaccacactcagataattgctttggtgtttttaaagcttgtaatgatcagtaggctgaggtgggcaaatcataaggtcaagagttttttagatggggtgagcacagaccaattcctgttttatttactgatttaaaattttgagacagtctcactgtcacccaggttggggtgcagtggtaggatcatagcttgctgcagccttgatctcccaggatcttgcctcagcctcccgagtagctgggactgcatgcttgtgccaccacactcggttaatattttgtagagatggggtcttgctatgttgcccaggctggcttcaaactcctgaacttaaaagcctcctgtttagttttggttttttatcactttttttttttttttttgagatggagccttgctcccatcgtgcaggctggagtgcggtggcgcagtctcggctcactgcagcttctgcctctcgggttcaagcgattctcctttctcagcctcttgagtagctggaattaccagtgtgcgccaccaccaccacgcctggctagtttttctgtttttagtagagacagggttttgctatgttggccaggctggtcttgaactactgacctcttgtgatctacctgtcttggccttccaaagtgctaggattacaagcgtaagccacagcgcctggccttgctacatttttttttttttttttttttttacagacatggtctcgctatgttgcccagaatggttttgcactgggtccaagcagttctgccgcagcctcccaaagtgctgggattacaggggtgaggcaccttgctggcccctgttttgattagggtgcagtgctggtgaagccggtgcacgaggccagtgatgcatcctaatgaggggtggagttggcgggacttcctgggccagtttggggactttcacaaaagacccccatgactcagggttttgagttcttaactgatcgaatgaaggattcaaaattaaccactccaaggggggattgaaggaagaaccactcttaatggacaaaaagaaagaaaggggagggagtaacagggatatgagctctagccgcccaagctagcaatggcaacccttctgggtccccttccagcatgtggaagctttcctttcgcttcattcaataaacagctgctgctc
(SEQ ID NO:98)
智人Finkel-Biskis-Reilly鼠肉瘤病毒(FBR-MuSV)遍在表达的(FAU)
gtcttttgtaattctggctttctctaataaaaaagccacttagttcagtcatcgaaaa
(SEQ ID NO:99)
智人核糖体蛋白L22-样蛋白1(RPL22L1)
gcaaaggctccccttacagggctttgcttattaataaaataaatgaagtatacatgagaaataccaagaaattggcttttagtttatcagtgaataaaaaatattatactcttgaacttttgtctcatttttttgagtatgctgtttatatgattttgatttccctctgataactatcaacagtatttaaatagcttatagctggtataattttttcccacgatttccaaaatcttttatgtactcaggtaaaagtagcgttatataggaaatcttttttttagacactctcgttctgtcacccaggctggagtgcagtgactcagcttcctaaatagctggaattacaggtgtgagccaccatgcccggctaattttttgtacttttagtagagtagggtttggccatgttggccaggctggtttcaaactcctgacctcaagtgatctacccacctcggcttcccaaagtgctgattatagctgtgaaccaccatgcccggccaggaaatcttactgtagaacaattttttatatagctgtataaaatgtatatgattgtcttgacagtctcaaatactgtttttaatagcttgtaaatgtaatctcaagtgcttagaacagttcttacatataagttgctctgtagtttgctcttatagttagcccaaagactctgggtgtgaggcctgctgtaaaccaatgttaaactgcttattagaaagccctaaccacctgctttgtaggcaccagaaactcaaaaccaaatctcaactcagctacagaatctactgtggtccttgtctgaaaaaattagttcactcggttggaatcttgtctcagagcatcctcatctctttctcaaaagcccctaccccaacaccggcgtgttggttgtctattgaaacttacaagtggatggaccctttctcccgaataaactggcctttgaaagctctaatcgaaatggtttggcaaaatccatactgcaggagattagggaggacaagaatgatgtgcctttttgtactgctgagcctgatggtggtgccactacttcaggtacttagatgagtcttgatgctaatagaattgtgtcgccaaacatatctggacagttacaacctaatctatgcattaattggtttgggaattgcttgaaattattgtttaattcaatgttttaattcgttttcctaaaaatttaagtgcccccatcatcgtgcaatacctcagtgcagcaactccttgattcttggatgactgaacttcctaacttggctctgccccattgttcccatttttcatgtttttcacaaatagttaaccaggtacctactactgtgcaccgctgcagagcattgaggatgtatgtgatgagtaaaaacacccagcctgctctgctgtgttagtattatgacggaaactgatcaaatcacatgtgaacaaatttactgctacaaaagggagggcttaataaaaggaatttcatctgggaaggc
(SEQ ID NO:100)
智人核糖体蛋白S17(RPS17)
attttttctgtagtgctgtattattttcaataaatctgggacaacagc
(SEQ ID NO:101)
智人核糖体蛋白L39-样蛋白(RPL39L)
ggaattgcacatgagatggcacacatatttatgctgtatcaagttcacgatcatcttacgatatcaagctgaaaatgtcaccactacctggacagttgcacatgttttactgggaatatttttttctgtttttctgtatgctctgtgctagtagggtggattcagtaataaatatgtgaaagcttttgtttcc
(SEQ ID NO:102)
智人核糖体蛋白L10-样蛋白(RPL10L)
aggttttggcagtactgtctccttgggccatgctggtctgacttatgcttactaataaattctgtttactggc
(SEQ ID NO:103)
智人核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)
actttgggatatttttcttcaattttgaagagaaaatggtgaagccatagaaaagttacccgagggaaaataaatacagtgatattcttacgc
(SEQ ID NO:104)
智人核糖体蛋白L3-样蛋白(RPL3L)
gctgtgtggggtggatgaaccctgaagcgcaccgcactgtctgccccaatgtctaacaaaggccggaggcgactcttcctgcgaggtctcagagcgctgtgtaaccgcccaaggggttcaccttgcctgctgcctagacaaagccgattcattaagacaggggaattgcaatagagaaagagtaattcacacagagctggctgtgcgggagaccggagttttatgttttattattactcaaatcgatctctttgagc
(SEQ ID NO:105)
智人核糖体蛋白S27-样蛋白(RPS27L)
tgattcaaacagcttcctgaattttaattttgtgttgtctcacagaaagccttatcataaattccataattctaattaatttaccaagataatgtaattacatttggttttgtaaggtatacagcagtaatctcctattttggtgtcagtttttcaataaagttttgattatgggcaaatcccctctttttctttttttaaaatatatttgagtatgccatacatttatatatatggtgtatatgaatttggtttaaacattttaaaatttattctgattagtttgtgtctttttttttttttttgagagagagagtcctgctctgtcactcaagctggagtgcagtggtgcgatctcggctcactgcaacctccgcctcccaggtccaagcaattctcttgccttgtcctcccaagtagctgggattataggcacacaccaccatgcctggctaatttgtgtctcattttcaagagtagaaaccctaaatattttattttcattccttttccaaattgctatgaatgggattaaaggattacagatgtaaagtctattatttgtgaattctaaatgtagttctgctgttgtacctgtggaaacatcttaaagaagtacatattttgcacgtcctgcacgtgtaccccagaacttaaactataattaaaaagaatagtttcaaaaaaataca
(SEQ ID NO:106)
智人核糖体蛋白L26-样蛋白1(RPL26L1)
atagaacctgttgtgcaaccacggtttaaccggagattttgaggctagggtgtgtttctttcgaacttttcggaatgtctggaacatttcatttcctgttttgttacctgtgcctctgtaaatctacttttgcaattttaagtaataattttatgaataaaaatgggaaatgcttcctaattccacatagtatttgcattgttttataaataaattccacttactatc
(SEQ ID NO:107)
智人核糖体蛋白L7-样蛋白1(RPL7L1)
acccaggtgaggcagggctgaaaactgcccttgggctgacttttgataggccatgccttgccactttacaagttctttttgcatttactagtatttaagagtaaccttgagattgggaggaatagaggaggctggtacaaatagatggagacctgctgggatcagtgaatgcctgattaggacatggggctatgcatagcctaagagttataggcttaaagatgtcgagtaactaaaaactgtattgctggccgggcgcggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggcagaccatgaggtcaggagattgagaccatcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaatgagctgggtgtggtggcacgtgcctgtagtcccagctactcgagaggctaaggcaggaaaatcgcttgaacccaggaggca
gagattgcagtgagccaagattgcaccagtgcactccagctgggcgacagagcgagactccatctcg
(SEQ ID NO:108)
智人核糖体蛋白L13a假基因(RPL13AP)
gtggaaaagaacatgaaaaagaaaactgacaaatacacacaggtctcctcaagatccatggacttctggtctgagcctaataaagactgtttgtttattcctcaaaaacaaacaaacaaaaaaaaaccctctgtattataaattattctgtgtaatggtgtgttaccatacatt
(SEQ ID NO:109)
智人核糖体蛋白L37a假基因8(RPL37AP8)
atgctcctctactctttgagacatctctggcctataacaaatgggttaatttatgttaaaaaaaaaaaaagagagagagagtgaaacaacaatctacacaatcagagaaaatatttgcaaatcttatatctgattagaaattagtatctggaacat
(SEQ ID NO:110)
智人核糖体蛋白S10假基因5(RPS10P5)
aattggagaggattatttcacattgaataaacttacagccaaaaaa
(SEQ ID NO:111)
智人核糖体蛋白S26假基因11(RPS26P11)
ggagctgagttcttaaagactgaagacaggctattctctggagaaaaataaaatggaaattgtactt
(SEQ ID NO:112)
智人核糖体蛋白L39假基因5(RPL39P5)
ggaattgaacatgagatggcacacatatttatgctgtctaaaggtcacaatcatgttaccatatcaagctgaaaatgtcaccactatctggacagttggacatgtttttttgggaatatactttttctctctgaatctgttaggaactttctggttggctgggttccgtaataaatacatgagacctttcatttcaaaaaaaagaaaaataggcctccttcccaggggctccggatttcatcagccttctgtgcatgcccagccatacaaaccacgcagggatggctccaagtg
(SEQ ID NO:113)
智人核糖体蛋白,Large,P0假基因6(RPLP0P6)
tcaccaaaaagcaaccaacttagccagctttatttgcaaaacaaggaaataaaggcttacttctttaaaaaataaataaataaataaataaataaataataaataaataaataaataaataaatagataaataaataaaaagttttctactcacactgaagtgacgaagtc
(SEQ ID NO:114)
智人核糖体蛋白L36假基因14(RPL36P14)
gcccccttcccctgccctctccctgaaataaagaatagcttgacagaaa
(SEQ ID NO:115)
还优选地,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件包含或由与核糖体蛋白基因的3’-UTR的核酸序列,如与根据SEQ ID NOs:116至205或相应RNA序列的核酸序列具有至少约1,2,3,4,5,10,15,20,30或40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%,最优选100%的同一性的核酸序列组成:
小家鼠(Mus musculus)核糖体蛋白L9(RPL9)
GGAGGCCTCAGTTCCTGGCCCCAGAAACGAGATCCTGACCACATGAACAATTTGGGCTCTTTTGGGAGAATAAAAGACTTATATATTG
(SEQ ID NO:116)
小家鼠核糖体蛋白L3(RPL3)
TTCCAGGACCACTTTGTGCAGATGGTGGGGTCTCACCAATAAAATATTTCTACTCACACTGGTTTTCCC
(SEQ ID NO:117)
小家鼠核糖体蛋白L4(RPL4)
ACTATTAAAAATTGTTAAATTCCAGAGAGCAAGTAGAGACCGCATATTTCAATAAATCAAACATGTGGTGACAAACCCTTGTGTGACTCTTAAATTGTGGATGTTTCCAAGCCCCTTG
(SEQ ID NO:118)
小家鼠核糖体蛋白L5(RPL5)
AGCAGTTTTCTATGAAGATTTTTTCATAAAGACAATAAACATATTGATCAAGCAGCTTTTTCTGTGTTAAGCTGTTATTAATGAGACTATAGGAAATAGTGTGAAATTACAAAAGCAAAGAAGTAGATAGTTATTTAATTAATTAAATTAATTTTACCTTTTGTGTTGCACCATAACCTACCACTGGTGGGATTAAGGGCAAGTATTACCATGCCTAGCTGAGAGTCTTTCTCCAGGAAAAACCAGCTTACATGGGTTCCTGCAAATCTCATGAGTGTTTCTTGGGTTTCTAGTCTTCCTGGGAGGTGTCCTTATCTTTCAGATTTTCAGATCTGGTAATTAGCATGATCATCAGGACATTTATTACAAACAAATTGATTAGTGGGAAGAAAGTATCTCAAGGTCAATCTTGGAAGTGAACAACTGGTGCTAATCCATGGCTTTAAAGATTTGAGAACAACGGTGAAATTTGGTTTGAGGAGAAGGGGGTGTCTAGGACGTTTCATTTTTATGGTACATGCCAGACATGAATGTACATAGGAAAATAACTTGAAAGGGTCAAATATTAAACCTTGAATATCAGGTTCACTTGGGAAAGCATTAGGTGCTTATGCCTCTTAGTAAATAGCCCTTCATCCCAGAAGGAGCAAGAATTGTCTTCCTGACTTAATCCAGTCTTAGCTGAGGTGCTGTGCATCTTTATCATCTTTGCCTTGCCTCACAGTGTCAGGCTCTGTGGTACTGGGGCTACACAGGTCAGGTAAACAGTTAACTGCTTACCTACATCCCCAGCAAAGATAATGTGACGATACTAAGATGAACCTATCAGAGCTTAAAGATAATGAGTTTCAGTCACAGTGATAACTGCATGCTAACTTCAGCATGTAGAATATATGCCGAAGCTAAAAGCCATTCCACAGTTGACTCCATCTGAAGTTAAAGTGTGTAAGTACACAGTAAATCATGCTATATTAACTGAACTTTTTAATAAATGAGTCATTTGAATTT
(SEQ ID NO:119)
小家鼠核糖体蛋白L6(RPL6)
ATTGTTAACCTAATTAAACAGCTTCATAGGTTCTTTTGGTGTCCTTTTTGTGTGTTGTGTGTGCACATGTTTGTTGGGTGGGTGTTTTGCTGGTGTCTTTTCCTCTGTGTCTTCCTCTGGCCCTTTCTGGAAAGACCTGCTTAATCTGAAGCATGTGAGCTAGGCTAGTCCACTGGGTCCTGCTCTCTGCCCATCCCCAGCTGGCTTTGGATTAGAGGCACATACACTGCCATGGCTGCCTTTTACTGTGGCTGTGGTTTTGCCCTTTTTTTTTAAGCAAATAGAAAATGCTGCTGACTATACTGG
(SEQ ID NO:120)
小家鼠核糖体蛋白L7(RPL7)
GGTGTCACCCATTGTATTTTTGTAATCTGGTCAGTTAATAAACAGTCACAGCTTGGCAAATTG
(SEQ ID NO:121)
小家鼠核糖体蛋白L7a(RPL7A)
ATGTACACTAAATTTTCTGTACCTAAATATAATTACAAAATTATCTTGA
(SEQ ID NO:122)
小家鼠核糖体蛋白L11(RPL11)
ACTTGATCCAAAAAGCTAATAAAATTTTCTCAGAAATGC
(SEQ ID NO:123)
小家鼠核糖体蛋白L12(RPL12)
GAAGCAACAAGAAAATATTCCAATAAAAGACTATCTGATAACCAGTG
(SEQ ID NO:124)
小家鼠核糖体蛋白L13(RPL13)
TTCTGTGTTGGAGAGCTGCAATAAATTTTCCATAAAGCAAAA
(SEQ ID N0:125)
小家鼠核糖体蛋白L23(RPL23)
TTCTCCAGTGTATTTGTAAAATATATTCATTAAAGTCTCTGCTCTGAGAGCTGGTCTTCTTGACACCTTTTCCAATATCAGCTTTGCAGAAGGAAACTTAAATTTCAGTTCAGGGCATGACCTTCATGACCTTGCAGAACTTCTTCACTTTCCAGGTTAAGTAAAGGCGATCTTTAGGGGCTGTCCAGATGGATCAGCTATAAAGATTCAATTGTAGAAGGTTCACGTCTCAATGCCCACGTGGTAGCTGTAACTTCAATTAAAAAACAAAAACAGCCGGGCGTGGTGGTGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGGCCAGCCTGATCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGAATACACAGAGAAACCCTTGTCTCCAAAAACCAAAAAAAACAAAACACGCATTCTTTTCAGGTCTTTGCTGGGACCAGGTACACATAACACAGATAAATATTAGAGCAAACCATGCACATATGGTAAATTATCTTTGGGTTTTGGGTCCCTAAAATAAAGTGGTGTGTTCATTGTG
(SEQ ID NO:126)
小家鼠核糖体蛋白L18(RPL18)
CCCTGGATCTTAACTGTTAATAAAAAAAACATTGGATGATGATGGTA
(SEQ ID NO:127)
小家鼠核糖体蛋白L18a(RPL18A)
ACACAGAGACCCACTGAATAAAAACTTGAGACTGTCCTTGCTTGTTTGCTTCTATGTCCCTGGAGAGGTCCCAGTTGGTCCCGTCCCTAACAACATGCTAGCCCTGCTCACCTGCCTGTCAGCCTTGCTCAGTGGCATCTTTCCATAGGTGTGTATCCCCTTAGATTAGCTTCAGCCCCACTACGATTTGTCTAGGACATAGCCTGAGCCCTGCCTGTGACACTGAGGGGTAGCAGTCTGTTTCTGGACTCCAGGGTGCTGCTGTCTCAGGCCTAAGAAATTCCAGACATGACTATAATCCAAGCCTGGGGACCTGGTTGAGCTTTTTATCCTGCTGGCTCTAAGCTTCAGCTAGGTGGAAATGAGGCCAGCCAAGCCCCACAGTGAGCTTGCAAGCTTTAGATGGGGACAGGGTTACGCTTTGGTGAATGATGGAGGAAACATGGGGGTTCCTTTTGTTGGGTGCAGCCAGCACGGCATCATCATGGTGCCCAATCTTGAAAGGGCACAGGCCTGAAGCTTCCTGGGACTGTTCTGTCACAGGGAGGAACCTACTGCAGTTGCCTACAATTGCTACCTCTGAGGGACTTGCCTCTGGCCCCTTGTAGACATTTCCATGTCTACACATGGCCCAGAGTACTTTCAGGGATAGCAATGTGTGAAATGGCACTTAGAAGATAACATGTGAAAGCCAT
(SEQ ID NO:128)
小家鼠核糖体蛋白L19(RPL19)
AGCTTCCCTCGTGTCTGTACATAGCGGCCTGGCTGTGGCCTCATGTGGATCAGTCTTTAAAATAAAACAAGCCTTTGTCTGTTGCCCTCTTGTTTAGC
(SEQ ID NO:129)
小家鼠核糖体蛋白L21(RPL21)
TGTACACAAAGAAATAAAATACCAGCACCAGGACTGTGAAGTGTTTTCCTTAGACTGTAGTGTGGGGTTTGCTCATTGGCTTTCTTGTTCAGATTTTACTAATTGTTCTAAATGATACAGCTTAGTGTGCAGAAAATATCCTCTTGATTGGAAAATAGCCAAATATTTACAAAACAGGTATACTAGTTTGAAGAGGCTCTATATGGGGGGAGGGGGTGCTGGAAAACATTAGTGGGTGACCAGTAATGGTGGTACAGCTCTAACTCCTAGCACCAGGAGTCCGAGGCAGGGGGATCTTCAGGCTGCATGATGTGCATAGTAGCATGCTGGTATTAGGGAGTGGGTATCTGTGGTTCCCACTTTGAAAATAACCAAAATTCTCCAAAGTGGGCAGACCTAAGCCAGGAGAGGGCTGGCCACAGACATTTGGTACTGCTTGCTGAGAAAGCACTGATTGTTTTCCTAACCTAAAGATTATATATGGCCCACCATACCATCTTTGAAACAATGTGTACTGGCCTTTGGTTCACCTTTCTTGTCTTTGAAGTTGTACTTGGTGGGTGCATTTAACCTTGCCACAGAGTGGGGAGGATAGAGTCTAATGGACCTTAAGTGGTCTCTGGTGGCCATGTCGGCAGTGCTTAGGTTGTAGCCCAGGGTTGGAGTCGGCAGTGACAAGCAAATAACTATATTCTTGCTTGCTGTGGCAGCTATACAGAAATTTACGGTATAGGTAAGAGGGTTCTCTAGAAGTACTACCTGTCTTAGTGAAAGAGATTGCTTGGTTAACATCCTGTTATGTAGTGGGGCTACTTTTAAACTGTGTGAAGTCCCCATTAGCCACCTCCATAGGCAATGGAGCTAACATTCTTGCTACAGTGGCCGCAGCTCATTAACACCTAATGATGTGTTTAACATGTGTCCACATGGTGTGAATGTGGGTACGCATGTGCCCAGTATTCAGTTCACAGAATTGTCATCATCTTCCATCATGTCTTCAGTGAGGGACTCTGCAGATGCCCACCCCAGTCCTTGGTTGTGGTGATTCTGTTAGCATTAAATGCACTGGAGAGCTTC
(SEQ ID NO:130)
小家鼠核糖体蛋白L22(RPL22)
GACACATTGGTCTGCAATGTTTTGTATTAATTCATAAATAAAATTTAGGAACAAAACCGGTGGTTTATCCTTGCATCTCTGCAGTGTGGATTGGACAGGAAGTTGGAAATGACAGGGACTTTAAACTGGGCTGCTGCTCCTTTGTATATAGACACTTTTTTCCTGCTCAGAAACTTGAGTTCTCCAGTAGCAATGGCCAAACAGAAGAACCAGGCTAGGGGGCTGCATCTGACAGAGCAAGTAGACGAGAGGCTGGGTGGTGGGCTCCGGCCAGCCCGAGTCTTAGAGCTGGTGGTTGGTTATATCTGGTGCCTGTCTCGAGGAGGGCTTGAGACACAGTGTGGTGCTCCTCAGAAGCAGACAGGTGATTTCTTTGTGTGATTTTTCTTTTCCCCTGGGACAATGACAGTCAGTAAGACAGGTTTCAGGGACTTTTGTGTCCAGGTCTGAGCACTAGTCGCTCACAGTTGTGTGTACTAACCTTCTTCCTTCCTATTGAAATGGCAGGGGTCTTTGAGTCTCACTGCTGCATGTTCTGCCTTCATAGGGATCTGTAAGTATGCTGGGCATCTGGGCTTTTAGGGGGCTCTCTATAGGGTGTCTGAGATAGAGGTCAACAAGGGCTTATAGACAACTCAAACAAAGCCCATGGCTTGAGCAAGTCTGCAACAAGCTGTTTGTCTAGCCTCCAGCAGAGGGCGAGGGAGACAGCTTCCAGATGTTCCCAGTAGGTGGAGCCCCTCCAAGCCCAGGGCTCAGGAGGCTTACAGGGTGGGAACTCCAATACTGGTGGAGGGAGGAGGGCGTTTGATGGGAAGATAGGGAAGTTGCTGCTTCCTAAACTGTCACAACTGGGCTTGGATAGGAGTCATAGTCTGGGACCACAGCCCTGTGGTAGAATGCTAGCCTGGTGTGCTCCAGGTTTAATCTCCATCACTGCAGAAATGAGTCCAAGCTGTGTGTACCTCCAGGGCACTGGGCATGGGGTTCCCTTGCCATTGTGTGTGCCCGGAGAACTGGCAGGCGGGAAATGTCTTTATCAAGGGTTACCTTGGAAGAGGTCCCAACACTGTAGGGTGCTCCTGTTGTCAAAACCTATGCAGAGGCATCTGCTTGCTCTCTAATAACAGTATGCAATGCTAAAGGGCTCGCTTACAGCCGGTGGCCACACTGGAGGCCTGCACATCAGGTGGCCACAAGTTCTGCTGCTGCGCCTCCGAGGAAACACTTGGTCCTCCGATCGATTTTAACCTGTTGAGGCTTTGCAATCCCCCTGTGGCAAAGGCTCCAGTGTTTTCTATTTCTATGCAAATTTCTTGAAGCAGAACTGTTACTGTCTTTCTCCTCTGCCCTGGGAGGAGGCGCTAGCGTTTCCTTCCAACTTCAGGTGCAGCCCCCCTCGTGGTTAGCGGTCTTAAGTTCGTGACTTGGGTTTGCAGATCTTTTTTGTTACATCGCCGGACCATGTGGTGGTCTTTAGCTGTAAACAACATTAACCCTGGGTTGATTAGCATATGCTTCTAAAAGATGGTCCCAGATTCTGCGACTTGTAATAAAATGGAAACTTGCTGGTTTTTATGCCTTTCTAACTCTTGTATTTGAATGAATGTTGATCACTTTTTGTATTAAAGTGGCTGACACATGGCTACTGTCACTGTG
(SEQ ID NO:131)
小家鼠核糖体蛋白L22(RPL22)
AATATCTCACCAAAAAATATTTGAAGAAGAACAACCTCCGAGACTGGCTGCGTGTTGTCGCCAACAGCAAAGAGAGTTACGAGCTGCGTTACTTCCAGATTAACCAGGATGAAGAGGAGGAGGAAGACGAGGATTAGGACACATTGGTCTGCAATGTTTTGTATTAATTCATAAATAAAATTTAGGAACAAAACCGGTGGTTTATCCTTGCATCTCTGCAGTGTGGATTGGACAGGAAGTTGGAAATGACAGGGACTTTAACTGGGCTGCTGCTCCTTTGTATATAGACACTTTTTTCCTGCTCAGAAACTTGAGTTCTCCAGTAGCAATGGCCAAACAGAAGAACCAGGCTAGGGGGCTGCATCTGACAGAGCAAGTAGACGAGAGGCTGGGTGGTGGGCTCCGGCCAGCCCGAGTCTTAGAGCTGGTGGTTGGTTATATCTGGTGCCTGTCTCGAGGAGGGCTTGAGACACAGTGTGGTGCTCCTCAGAAGCAGACAGGTGATTTCTTTGTGTGATTTTTCTTTTCCCCTGGGACAATGACAGTCAGTAAGACAGGTTTCAGGGACTTTTGTGTCCAGGTCTGAGCACTAGTCGCTCACAGTTGTGTGTACTAACCTTCTTCCTTCCTATTGAAATGGCAGGGGTCTTTGAGTCTCACTGCTGCATGTTCTGCCTTCATAGGGATCTGTAAGTATGCTGGGCATCTGGGCTTTTAGGGGGCTCTCTATAGGGTGTCTGAGATAGAGGTCAACAAGGGCTTATAGACAACTCAAACAAAAGCCCATGGCTTGAGCAAGTCTGCAACAAGCTGTTTGTCTAGCCTCCAGCAGAGGGCGAGGGAGACAGCTTCCAGATGTTCCCAGTAGGTGGAGCCCCTCCAAGCCCAGGGCTCAGGAGGCTTACAGGGTGGGAACTCCAATACTGGTGGAGGGAGGAGGGCGTTTGATGGGAAGATAGGGAAGTTGCTGCTTCCTAAACTGTCACAACTGGGCTTGGATAGGAGTCATAGTCTGGGACCACAGCCCTGTGGTAGAATGCTAGCCTGGTGTGCTCCAGGTTTAATCTCCATCACTGCAGAAATGAGTCCAAGCTGTGTGTACCTCCAGGGCACTGGGCATGGGGTTCCCTTGCCATTGTGTGTGCCCGGAGAACTGGCAGGCGGGAAATGTCTTTATCAAGGGTTACCTTGGAAGAGGTCCCAACACTGTAGGGTGCTCCTGTTGTCAAAACCTATGCAGAGGCATCTGCTTGCTCTCTAATAACAGTATGCAATGCTAAAGGGCTCGCTTACAGCCGGTGGCCACACTGGAGGCCTGCACATCAGGTGGCCACAAGTTCTGCTGCTGCGCCTCCGAGGAAACACTTGGTCCTCCGATCGATTTTAACCTGTTGAGGCTTTGCAATCCCCCTGTGGCAAAGGCTCCAGTGTTTTCTATTTCTATGCAAATTTCTTGAAGCAGAACTGTTACTGTCTTTCTCCTCTGCCCTGGGAGGAGGCGCTAGCGTTTCCTTCCAACTTCAGGTGCAGCCCCCCTCGTGGTTAGCGGTCTTAAGTTCGTGACTTGGGTTTGCAGATCTTTTTTGTTACATCGCCGGACCATGTGGTGGTCTTTAGCTGTAAACAACATTAACCCTGGGTTGATTAGCATATGCTTCTAAAAGATGGTCCCAGATTCTGCGACTTGTAATAAAATGGAAACTTGCTGGTTTTTATGCCTTTCTAACTCTTGTATTTGAATGAATGTTGATCACTTTTTGTATTAAAGTGGCTGACACATGGCTACTGTCACTGTG
(SEQ ID NO:132)
小家鼠核糖体蛋白L23a(RPL23A)
ACTGAGTCCAGATGGCTAATTCTAAATATATACTTTTTTCACCATAAA
(SEQ ID NO:133)
小家鼠核糖体蛋白L17(RPL17)
ATTCAGCATAAAATAAAGGCAGATAAAGTTAAAGGTCTTCTGGTGGTCTTTAATGAGCCCTGTTGGGAGTGAGGTGCTTTAACATGGAGAAGCATGTTATTAAACAGTGAAATAGATGGTTCAAAACCACGTGACCATGT
(SEQ ID NO:134)
小家鼠核糖体蛋白L24(RPL24)
TGTGGTAGAGCAGAGTTGGAAATAAAGCTCTATCTTTAACTCTAGG
(SEQ ID NO:135)
小家鼠核糖体蛋白L26(RPL26)
AGACATCTCGTGCACGGCTTTCATTAAAGACTGCTTAAGT
(SEQ ID NO:136)
小家鼠核糖体蛋白L27(RPL27)
GTATATTTTTGTTTTGGTCATTAAAAATTAAAAAAAAAAAAATACAAGTGTCTGCCTATTGCATTTGTGTGGGAAAGAGACTGG GGAAATAAAACAGGTGTGCTGTTGTG
(SEQ ID NO:137)
小家鼠核糖体蛋白L30(RPL30)
ACAAGAAAGTTTTCCTTTAATAAAACTTTGCCAGAGCTCCTTTTG
(SEQ ID NO:138)
小家鼠核糖体蛋白L27a(RPL27A)
AAGCCACACCGGAGGTTAATTAAATGCTAACATTTTCCATGTGGTCTTTGCATCCTTCCTTGTCTGCATGTTGGAAATCTGCCTAACATTCTAGGAAGAGGTGAGGTGTGGGCCCTTGAGAGTCAGTCTGTGGGAATAAGTGTAGCCCAACTATGCACAGTTGTAAATTCCTACATCCCCGTGTGTATTGGTCTTGATATTCAAAGAATTGATGAATGCCATTACTTTCAGTCCAAAGTGAAGAAACCTGGTCTCAAAAAATCCCGAGGACCAGAAATGAGATGGGTTTTCCTGAAAATCTAAAGTTCTTGAAAAACCTTGCCATCCAGATTGCTAGCAACTGCCTAGCTTTGTAAGCTTACTGTGATGGACAGGTAGCTCAGGACGACTGGTCACTTAATACTGGACAGATTAGCATGGAAAACTTAAGGGGAGGAGGAGGTAGTAGGTTCCATCCAGCTTCGCTTTGTTGGTGGCATCTAGGTGTTGTTCCAAGGGAGCATGCCTACCTGCAACAGGACATCACTGGTTGGGAATACTGTAGAACCAGAGCTGTGACCTTTGAACTACTAGAAAGATGAAATTTTATGTAAAGAGTACCTTGGAGTAAATAAATAAAGCCCAAGATCCTGATTGTCTA
(SEQ ID NO:139)
小家鼠核糖体蛋白L28(RPL28)
GCCCCACACGCCCGAAGCAATAAAGAGTCCACTGACTTCC
(SEQ ID NO:140)
小家鼠核糖体蛋白L29(RPL29)
AAAAGGCTCCTGCCAGTGTGAAGACAGACGGACTGCTGTGACACACCTCCCCACACACTATTTGCAGATGACCAGTGTCCTATGCTGTTCTTACAAATAAACTCAGGCAAGATCTGTTAGCTTG
(SEQ ID NO:141)
小家鼠核糖体蛋白L31(RPL31)
CCTGCTCGTGTCAAATAAAGTTGCAGAACTGCCTTCAGGGTTTGGTTTTCCTTTCTGTTGTCTGCCTCATGGGTGGAATTTTTGGGTCTACAGGGTGTTGGAAATTAATCTGAGAATCTCTGTTCTGGGTACATGGGAAATTAGAAATACGTGAAACATTCTTTTCACAGAAGTCACTTTATTAGGATTGTGGATTTGGGTTGGTTTTGAAACAGGGTTTCTTGTGGCACTGCTTGTTCTATAGAATAGGGTGGCCTTGAACTCAGAAATCCACCTGCCTTTTCCTCCCTAGTATTGGCAATTAAATGCCCAGCTTGTTTGTAAGCTCTCATTTTCAGTTCCAGGTTTATGTGTGAGCCTAAGATTAGGTAAAGATTGAGGTTATAACTTAAACGTACTGAATTAACTTATGTTGTGTGGGTCCCAGGAATTGGACCTGGGACATCAACTCTGCCTTTCCAGCCATCTTTGCCAACCAGTAGCTCATCTCTGGGATGTGTCTGCCCTCAAAATGACATTTTAAAAAAGTCAGTACAAAAGAACGATTTTTATTAAAAACCTTGAGGACAAACATT
(SEQ ID NO:142)
小家鼠核糖体蛋白L32(RPL32)
ATGGCTTGTGTGCATGTTTTATGTTTAAATAAAATCACAAAACCTGCCGTCGTA
(SEQ ID NO:143)
小家鼠核糖体蛋白L35a(RPL35A)
ACTAATGGAGAGTAAATAAATAAAAGTAGATTTGTGCTCTTGTATTTTTTTTTCACATCTGTCCTAAA
(SEQ ID NO:144)
小家鼠核糖体蛋白L37(RPL37)
GGATTTCAATCAGTCATAAAATAAATGTTCTGCTTTCAAAAATTCTGTGGTGATCTAAGGTACTTTAACATCGGTTCAGAGTTCGGTTATATGATTGCTCTGGGATCCTACGCTTCTTCCTTCATAGTTCCTGTGGGTCCGAAGCTGGGAGGGGCTGGGTGGACTCTCGGGAAAGATACTCTGAGCCTGTCTCGGTCCCCATCGTGTTTGCTTGGCCCTGGGCATGGAAGTGGGTGAGTGATGAGCTGAACGAGCAGGCTTGCTAGAGATGAGGACAGTTACTGGTGTGGTTATATCACTACCATGCCTACAGTGTCTTAAGACGCTTACAGTCTGTAAGGGACTTAAATGATTTGAGCTCTTACTTATCCTGTAGTTTCTGATTTTTAACATTTA
CTTGAATAAAGCCAAGCAAGATAAGCCTTTATTCCCAGCACTTGGTGACAGGTGGATCTATGAGTTGGGGATCAGAGCTACACATTAAAACTCTTAATTCATCTTACT
(SEQ ID NO:145)
小家鼠核糖体蛋白L37(RPL37)
GGATTTCAATCAGTCATAAAATAAATGTTCTGCTTTCAAAAAAAAAAAAAATTAATCCTCTGTGATGGCCAGCAGTTAACATTCAACAGTTTCTCTCTAGGCTCTTGATTCTCTGACTATTGTAGGGATTCGATCAGCACTCGCATACCAGAAGTGTGAGATGGTCCGTCCTTTTTCAAGACAAGATTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACCCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAATTTACAGAGATCCCCTTGCCTCCGCTTGCTGAGTGCTAGGATTAAAGGCATGCGCACTATG
(SEQ ID NO:146)
小家鼠核糖体蛋白L37a(RPL37A)
AAGCCCTGCTGTCTGAGACTTGCCTAGCCTGCAATAAACGGGTTATTTACGTAACTTTTTTTTTTTTGCCTTGTTTGTGGTTAATTAAAACATTTGGTGTGTGTTCTATTTTTTATTTTCGAAAGATGCTTGTTTTGAGACATACTGTGTGACCCTGGCTGGCCTTGAGTGCCTGGTTCTCCTTACAAGTGTAGATACATCTGGCTTAAGATTTTAGTCTTTCAGAAATAAAAATGTTGCTAAGAC
(SEQ ID NO:147)
小家鼠核糖体蛋白L38(RPL38)
ACCAGCCCTCTGCGTGTGACTATTAAAAACCCTGAAAAGTG
(SEQ ID NO:148)
小家鼠核糖体蛋白L39(RPL39)
GGATTCACACAATGGCAAGACTGAGGATTTATACTGAATTGTCATCAATCAGTCCTACCAGATGGATTTCAACATTTAAACCTGGAGACTCTTCGTGTCTTGAATTAGGATGTTTGTCCAGTAATAAAATATAGAACCTTTCAAAATGCTTTTCTGGTTTATAAAGTACTGAATTGCCCTT
(SEQ ID NO:149)
小家鼠核糖体蛋白,Large,P0(RPLP0)
TCCCGCCAAAGCAACCAAGTCAGCCTGCTTAATTTGAGAAAGATGGAAATAAAGGCTTACTTCTCTTAAAACTCCGGTCTGGATTTATTTAGTTTGTTCACTTAAGCAGGATGAAAAAGCAAAACCGCTACTGTTTACTTTGTGTTGGCATCTTTGTTTCTAAAATTAAAGCTCCTAGTGTTTTTGTGGGCTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGTCTCTTGACTTGGTGCCATAGCTAGTCTGGGACAAAGATTTTCCAGGTGTGAATTAAAGGTGTATGTCATCAA
(SEQ ID NO:150)
小家鼠核糖体蛋白,Large,P1(RPLP1)
ACTGCTTTTGTTAAGTTGGCTAATAAAGAGCTGAACCTGT
(SEQ ID NO:151)
小家鼠核糖体蛋白,Large,P2(RPLP2)
ATTCCTGCTCCCCTGCAAATAAAGTCTTTTTATGTATCTTGA
(SEQ ID NO:152)
小家鼠核糖体蛋白S3(RPS3)
CAGGGTCTTGGCAGCTGCATCTGGAGGCATTTAATAAAATAAAGACATTTAATAAAATCTTGAACAAAGACAAGGCCTGACTGGATTGTGTCCAGTATTCAACTGAGTTATGTTGTCTATGGAGCCATGCTTATTCTGTTGGTTTAAGCTGGAGGGCATGAGCAGAGCTGACCAGAGAAGTCATGAAGTTGGTGACCCTGTGTTGAACAATTGAGGGTTAGAAGAGCAGTTTGGTTTTGGTGCTCTTGATGGAACCCAGGTGCTTGGACATAGTAAGCACACATAAGACAGAGTAAGACTGCTGTGTCTCTGGCCTGGAGTAGTCTTTCTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTAGAATGAAAGCAGATGGCCCAGCGAGTTAGGTGCTTC
CTATGAAAGCATGTGTGCTGGTTTGTCATGCACACAGCCCTGCAGGAGAGAGTATGGCAACACAGCCGCTCAGCATCCCAAGATAAAAAGGGAGTTTCTACTGCCATTTTGAGCTTGGGAGTTTGAAATGTAAAGCCTGTCCATATGTTTTAAGGATCCATGTATTTCTGTTTTGTTTGTTTTTCAAAACAGGGTTTCTCTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACCCACTCTGTATGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGGCGATCCATATATTTCTAAGTCCTGTACTTAGACGCTGTTTTGGAAAATTCATTTTGGAAGCATTTACTGTTGGTGTGTTTTGTGGGGAATGAATGATAGCTTGGGAATTCTTTTCTGTTTGGTGAGAGTGAAGCTGTCAGCCCGGTTGTAGCCTGGCTGGTGCTCAAAGGCTTTCTCTCATTGTCTTCACCTACGTAGCTTTACGTGGGGTAAGGACTTAAGTTACTTAAGTTGGGTGCACACTGACCATGTCCACAACCTGTTAACCAACTCTACATGATGAGTACAGATGTACCTTTTTAGAAAGTGTTAATGTGTAGCCCTGGCTGGCCTCTGCCTCAGGGTATTATGAATAAAGTGTGCAACCTTCATCTGGTTGATTAAA
(SEQ ID NO:153)
小家鼠核糖体蛋白S3A(RPS3A)
AATCCAGATTTTTAATAGTGACAAATAAAAAGTCCTATTTGTGATCGTT
(SEQ ID NO:154)
小家鼠核糖体蛋白S4,X-连锁的(RPS4X)
AATGGTCTCTAGGAGACATGCTGGAAAAGTGTTTGTACAAGCCTTTCTAGGCAACATACATGCTAGATTAAACAGCATGGTGAAACT
(SEQ ID NO:155)
小家鼠核糖体蛋白S4-样蛋白(RPS41)
AGTGGACTCTGAGGGACATTGCGGGGAAGGGGCGTTTACGTTTGTTTATACTTAAAAGTTTTTTAAGCAGCATGTTGAATTAAAAAAGAAAGCAAGCTTC
(SEQ ID NO:156)
小家鼠核糖体蛋白S5(RPS5)
TTTCCCAGCTGCTGCCTAATAAACTGTGTCCTTTGGAACAACTAT
(SEQ ID NO:157)
小家鼠核糖体蛋白S6(RPS6)
GTCTTTAAGAGCAACAAATAAATAATGACCTTGAATCTTTCATTGGCTTTCATTAATAGTGTAACTAGATAAATGATGGGAAAGATGAGACAGAAGAAGGAATACATCTATAGGACTGCTAGAATATGGGGAGAGTGATTATTTTCAAATTAATATGTATCGAGCTTCTACCCCAAGGTAAATAAATAACATTTGGAGACCATTAAAATGTAGGATGGCATAGAAGAGGCCTTTACTAAGATTAATAATTAAAGAAACACAGCCTTTAAAGTAAAAAACACACTGTGCCTTTGAAACTTGCTAAAAAGATTAACTTCTGTCCCAAAAGGTATCAGCCATGCGCTACCAGCCTCCCTGCCCCTACAGTGGCAGTGGCTGCATTCTTGGTGAATGGTAGTGGAAGGGATTAAACCTAGGCCTCAGTCATGCTTCCCAGTCACTGGTACTGATTTGTATGCACCCGCTTAGGTGTGAAGGTAGTTTTGGTGTGTATCACAAGTTAGCCTGTGTAGCGAAGACAGGTTTTCTCCACCGTGTTTTTTGTTACACATGACTATTCACAAATGTGCTGCAGACAGTAAAATGAGAAATACCCTTCCAAGG
(SEQ ID NO:158)
小家鼠核糖体蛋白S7(RPS7)
AGAAAATGACTGAATAAAGTGTCATTCATAGTATTTGGTTGTAGTAACTTGTCAAAATCTCAGGGCCATGGGTGCACGACAGCAGTAGCTTCTTGAATGAACTGAAGTTTTCAAGAGGTGCCTGGAAGGTGAAAAACACACTGAAGCCAGTCATGTTGATATGGGGGCATTCTGCTGCTGTGAAACAGACTGGGGTTCACACCCACCTTGCGGGATTAGAACTTCACTGCCCTCCAACTTCTTTCTTTGTAAACAACTGTCCACATTTT
(SEQ ID NO:159)
小家鼠核糖体蛋白S8(RPS8)
GCCTCATGTGTAGTGTAATAAAGGTGTCTGCTGTTCTATCTG
(SEQ ID NO:160)
小家鼠核糖体蛋白S9(RPS9)
TTAATACTTGGCTGAACTGGAGGATTGTCTAGTTTTCCAGCTGAAAAATAAAAAAGAATTGATACTTGG
(SEQ ID NO:161)
小家鼠核糖体蛋白S10(RPS10)
AGTTGGAGTTTATGTTGTATTGAATAAACTTTAAAG
(SEQ ID NO:162)
小家鼠核糖体蛋白S11(RPS11)
GGGGACTCTGGCCAATGCCCTAGAACAAATAAAGTTATTTTCCAACG
(SEQ ID NO:163)
小家鼠核糖体蛋白S12(RPS12)
ATAAAATTTTGGCTGATTTTTCTCTTGTATTTCTTGTTTGCTGGTATAAAA
(SEQ ID NO:164)
小家鼠核糖体蛋白S13(RPS13)
ATGCTGTTGTGTGCACAAGCAATAAAATCACTTTGAGTAACTT
(SEQ ID NO:165)
小家鼠核糖体蛋白S15(RPS15)
CCGAGGCCAATAAAGACTGGTTTTGGTCCCTGGA
(SEQ ID NO:166)
小家鼠核糖体蛋白S15a(RPS15A)
ACGTAAAGCATAAATAAAAAGCCTTTGTGGACTGTGCTCAGGGTCAGTCCTTTTGAATCTCTGCAGCAGAGTAGCTGGCTGTGCTGACTGGTGACACTTCTGGTGATGCTCAGCTGTGAGGTTTTATGTAGATATTGAAAGCATGACCATTGTCTTCACTTCACCTCCAGCTTGGGTTGTATGCCAGTAACATCAGCATAAGGTGGTTAATGACAGGATGGTCCCTTGAGTGTGCAGTGAGTCTGGTTTATTTGCCAATGAGAAGCACAGGCCTCCTGTATGGGTCTTTGCCTACAGCCCCCTTTCATCACCCAGACTTGGTAGACTTACATTCTGTCACACTGTTGGCTCTTAATCTCAGCCCTGAAAAATGCCATTTCTTGGGTATCAAGGCTAGTCTAGATTCAGAAACCATATAAAGGTTGACAGCTGGTTTAAAAAAAAAAAGGCTTGGAGCTTGAGTTGGGTTCGCAGGTTATTCCAGGGTATCTGTCTGCACTTTGTCTCCCAGATTTAAAGGTAAGTGCCACCATGCCTAGCATGGTGACTTATTAGCTTTGTTGCTGTGGAACATACATCAAATGAAACATTGGTATGGCTCTGGTTTCACTGTCCATGGTTAGTATCTGGTGGGTGGACACCTGGTGGAACCAAGCTGCTCATCCCAGAACTAAGGAGCCATTCCCCAGAGACTTGTCTTCCTACTAAGTTCCATCCCTACAGCTTCTAGTAGTAGCTTCAGAGGTTGTGAATTGTGGACTTAGTCTGCCATAACATTTAAAATAGGTATTAAATTCAAGTCATTTGGTCACTCAGCACCCACGTGGCTCTTCAGAACAACAGAAGCCCCTCGGACTTGTCTGTTGGAAAAACCAGTTTGAAATAATGTACCTGCTTTAGTTGAGAAAACGCTACAACTGGTGCTGTGTCCTGCCATGCTGATGAGCTCTGCTCTGCGACCTGCCGAACTTGGGGGATCTCTACCCCCAGACTTTGCTCAGATCTGTTGATGATTTGTCCATGCAGGAAAGTTTACAAGGTCTCTGTGTGTCTACTACTTACTAGTTGCTGTGACAAAAATACTGAAAGTGTTTACTGTGTGTGAGGCACAAAGTTTGTGGGAAGCTGTACCCTCCCTCATTTTGGTGCTGCTCCTGCCTTGACTGACAGGATGAGCTGCCCCAACCATCGTTGCCATCTTCCATAAGAAGCAGGTGGCTCTATTGAGTTCCCTGGAGGTGATCCCAAGGGAAGGAGGAGCCTGGGAAAGTGGATCTCAAGTCCCCTAGTCTGGCAGTTGGCTGTTTAGGAAAGTCCAGTGTCAGTGTTTGATATGTTGTAAGGAAACAAATTCAGTTTTATTTAGCTTATTGGCTCTGGGGAAATGGCAGTTCCCATTAATTGGTGCTGTCTTTCTCTTTGAGGATCAAAATTAGCTTCCTGTTCAGTTGTTAAGCATATTTCATAGTCAAATAATCCTCTTATCTTTACAAGTGAGGTTTTCCTTCGAGTGGATATCAGAGTCCCTCCCACGGCTTCTATCCCTCCTATCCTTGTGTAGGAAGTTAAGCTTGCTCATTTGTAGATTAGTGGTCGGTTACACTGCAATTTAGAGTATCATGTGTACTCTACACATGATTGATTCTAAGCCCCCTTCCCTTTCCATGTCCTTCAAAAATTTTTTTATTGTGAGACAGTGTTAGGATTTTTCCTGGGCTAGCCAAATGCAAGAAGTGTTGGTCCCAGACTTGTAATCTTTCTGCCTTAGCCTCCCAAATTCTAGGATTATAGATTTATGTCATGTGATGAGTGGTCTTTTAAAGATTATCTTTTATTTTTTTTGAGATGGGGTTTTTCTGTGTAGTTTTGGCTTTCTTGGGACTTGCTCTGTAGACCCAGGATGGTCTTTACTCAGATCTGCTTGCCTCTGCCTCCCAACTGCTAGGATTAAAGCATGAGCCTGAGCCTTCATGCCTGGCTGACAGGTGAATTCTCAATACCTACCTAGCCATAGGGAAAGTGATTGTGTCCCCTTCCTCATAGAGGGGCATAGTCACCCAGGCCATACCTTTAGCTTGGGCTTTTGGTCAGTGAAGAAGTATGAAGGGACAAGAACACTATCAAGAGCCTAATGTGCTCTGGCCTGGATGGTCAGCACAAAATGAATAGACTTACCAAATTCTGCTGTCTCCTTGGTAGATGTGAAGTTGTTGGAAGAGTCCTAAATTTAGCAGACTATACTGTCAGCCTATCAGACTATAGGCTGCCGGAGGGCAAGTCTGCTACCTATTTCCATCTCATGCCTGCATTGTTCATCCCCCTATGTAACCCACCTACCTGTCACTCATTCCTCCATCCAAAAACTATTGTAGGTTCAGTGGAAATTTCAAGCTTGCCTGTCTCAGCATCTTTCTTACCTTACCCCTAAGGATGGCATCTCTCTTGGCTACATCTTTGGTTTATCTGGAGATCCTTGATTAATTTGAACAAGAGCTACCTTGGGTTATGCAGTTTATGCCTCCAGTGTCCCAGAGACCGGCATTTGAGAGATCCCTGATAGCAAACCCATAGGGTGGCCTTTTTTTCATCCACCCCATTCTCCCTCCCACCTCCCTCTTTTGACCTTGAGTCCTCACCAGAGAGAAACCAGGCCCACTTAATTAGTTCTACATGTGTACACTACATGGGTGCAGTGCCCAAGCAGGAGAGGTGTTAGATTCCCTTTTAACTATAGTTAATAGACAGTTTTTAAGCCCCAGTGGATGCTGGGAAGCAAACCTACATCCTCTAGAAGAGCAGCTATTTCTCTGAGCCATTTCTCCAGCACCATTTTCCCCTCTTTTAAAAGCAGGTCTTGCAGTGTGGCCTAGTCTGGCCCCCTGAGGTGTTTGCATTGCATGGCAGGCATGTCCACAGGAACACCATAGTTCTCACCACTCGTACAGCACAGCAAGTGGGGTGCCGCAGGGGATTATCACTTGAGTATAAAATAAGGGTTGCTTTAGATTGAATAGGATAACCACGCGTTCTCAGAACAATCAAGGAAGGCTGGGGTGAGCCAGCACCGACCTTAATTGTTTACTTAGTAAACTACTAAATGTATGCACGTGTAAGCTTTTGCCTTGATTGAGGTCAAGCTGTCGAGAAATGGTTCTCTTTACAGTGGATCCAGTCAGGATTGGCAGCAAGCACCTTTGCCTGCTGAGCCTACATGTTGTATAGAATGGCAACGTTGTGTAGAATGGCAGTACATTAAATGGGTTTTTCATTTA
(SEQ ID NO:167)
小家鼠核糖体蛋白S16(RPS16)
GCCCATCTCAAGGATCGGGGTTTACCTTTGTAATAAACATCCTAGGATTTTAACGTTCC
(SEQ ID NO:168)
小家鼠核糖体蛋白S19(RPS19)
AACAAAGGATGCTGGGTTAATAAATTGCCTCATTC
(SEQ ID NO:169)
小家鼠核糖体蛋白S20(RPS20)
GACAACTGAATAAATCGTCTTAATGGTCAAATTTTGCTGGCTTTTGTTCAGGTTTTTTTTTTTTAATTCATGTTTATGAGTGTAAATGTGTGTGTCACAGGGGTGTCAGATGTTCTTTGAACCACCATGTAGGTGCTGGAAACCCAACCTGCATCCTCGGAGAGAACAGGTTCCTTAACCACTGAGCAAGTACTGAAGCATTAAACTGCTTTTAAAAATGAAGGTGTGCTAACAGATTGGTCAGGTGAAAAAGAGACGTTAGGTTTCCTGCAGGGGGCGCTAAGCCAATTTAAAGACTAAGTTGGGTTAGAAAAGAGCAGATTGCATCCTTGATCTTTTAAGCCTGGGGATTTTGTTTTGTTTTGGGATAGGGTCCCAAACACAGAACAGGCTGACCTCATTAAAATATCAATCTTATTTGATTGCCTCTGCTCCCAGAGTACTGGAATTAAAGGCAGGGACCACTGTATTAGCCATTCTGAGTTATTTGAAATGGACTCTGCAGGCCATACTTGGTCAAAATTCTGCCTTCTCAATTACAGGCATGAGCCACTATGCCTGGTTTACTTACTAATAGATGTCCAAAGACTAGTGTATGAAAATTTTGCTTTTCCAGGTGATTTGTGAAAGGCAGGGTGGCCTCTCCCATGTCACACTACTTGGGTTACTCATGTTGCAACATATCTGCAACTTTAGGTTGAGGGGATTTGAGCCTGCATGTGCCACTTTGGCCAACTGAACTAATCTTTAATTCCATCTAAAACTTTTAAATCTCAGTCATGTGTTCAACTGGAAAATAACCTAGAGTGTGCTATGTTGACTTCAGGTACACATCAAAGCAGGTTTTAGTGATGTAGAAG
CTGTGTTTGAGTTGAACTAGTGTTGAGGCTAGGCTTAGGTACCATAGAACTTTGGTTTTTCAAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCTGCCTGCCTGTGCCTCCCAACACACCCAGCTCTAGCTTTAAATTCCTTGCACCAAGAGATGCTTTATCCCTCCGCTGAGAATACAGGTGCATGTCAGCATGCTAAACTCTAGATAAAATTTCATCTTGTTTGAAAGGACAATAATATAAGAAAAGTGTATTTGCACTGTATACCATGCCCTTTTGTGTTTAAAGTTAAACTGGCAACAGTGTCCCATAGAGGTTCCAGAAGAAACTGCTTCTAAGGGGAGGACCATAAAGGGAAATGCTTACCATAGAACTTTTTAAATGTTCCTACAGGTTGTACTCTGGATAGGTATATGAACACCTTTCTATTAGAACAGTTTTATAGTAGTACTTAGTGAATATGTAAATAATACTATTTGTGAAATAGTTTGAGGTTTCTCTATAGTCCTGGCTGGCTTGAGCTCTATACCAGATTGGCTTCTAAATCAGAAATCTGCCTCTATCTCCTGAATGGTTATGATAGAGATGCAAGTTACTTAATTTCTTACATGAATTGCACTTTGTACATGCTTTTGGATATGGGCCTAGGCTTTTGCTTTTGGATTAGACTGTCTTTATTACATTTACTGGCTTGATACTTTACAGTCTTAAGCCCACTTGCCTGGGTGTGATGCACACCTTTAATCCCAGCACTTTGGGATTTCTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACGCAGAGAAACCCTGTCTTGGAGGGGAAAAAAAGAAACTTTGGAAAATCAAAACTTCTTGGAAAGCCACTTTTAGAGACTTGAATCTAAGGATAACTAACCAGGTAGTAACCACGAGTCATTGATTCTGTGAATCTTGTATGAGTGGGTTACAGGCAGAAATTAACTTCCTCTGAGAGCACTGCTGTTTTAGAAATGCGACCTAGTAATTACCAAAAGGCATTGAAGCCACTTGACTACAGTCTCAGGTTTCTGCATCTGACATTGCTGGGACTGTGTGGGGTTTATGGGTGTAAAATAAAACAGGCGAAAGGATGTTGAGTGGAAAGCTTTGGCTTCAGAATCAAATTCCAAATCAATTACCAGATCAAATCAAATGCCAGATCAAATTACAAGACTTCCTTATGACTAAATTCTTCAGTGACTTAGGATACTAATAGTATCTGCCTCAAAAGTGTATGTGGTTATTTTTGTCCCAGTGAAGCCAAGATTCACATGCTATGGGCATGGATTTCCTGAGGACATGCTAGCCTATGGTATGAGTTACTTGAAAGGACTCTGAGAAATCTTAGTCCCCAGCTGTGAGGTTTTTAAAGATCATGCTCAATGGAAAGTGGGGCAGTAATTTGAGAGCATGGCACAAATGAGGTTTTATCTTTTGAAACTAAGTGAATCTATGTCCTTGGACTAGCATATTTTAAATCACACATCAAATGAAATTTCTGTTCAATTCCTATAAACAGTTTATTTCATATTTTGTAGTTACCATTTTCATTAACAGCATACACCCTTCAATTGTGTTGCTAAAACTGAGTCACATTATTCTGTAAGAACTTACTCCAGTATCACAACTTGGTGCTCATCCAATATTTTTATTTTCATTCTATTTTCCCTGTCTAGCCACGTATGGCCCTATTCTCTCTTCTTGGATTGACCCTAGCTTCAACACAAGAAAGCTTGCAGTATTTTTTTTTTGCGCCTGGTTCATTGTTTTGTCCTCAAGTTCTATCCATGTGTCCAGAAATTCGAGGATTTTTTAAAATTTACTTTTCTGCCTAAATACTGGTATGTGGATAGTCTGTTATTTTTACTGTTGGTTGCATATCTGTAGCATATTTCTGTATTTGCAATGACTACATTGAATGTCCCTTAGTTAACCTCATTCTTCTTAACTATTTTGTAGGCGTTTGCTATTCAAAGCACAATCTCAATTAAAATGTTTTTAATAGCATCTTTCCACTTGGATGTGTAAAGAAAGTATTTCTAGAAGTCTGAATTTTTGTTGCATTGTAGATGTGTACACAATAGGGCTGGGAAAGTAGCTCACAGTGGGTAAAAGCCATTTGTTGCCAATCCTAACAGCCTGAGTTCAATCCCAGAATCTATAAGGTAGAAGAAAAAAACCCCAGCTCCCACAAGTTATCTGGCCCTCTGCACACATATAAATAGTGCAATAAAAATTAACCATTTAAAAATATAAA
(SEQ ID NO:170)
小家鼠核糖体蛋白S21(RPS21)
GCAGAAGAAATCGGGAATTTGTTACAAATAAAAGTTTTAAGTACCTGTGACAGTTAAG
(SEQ ID NO:171)
小家鼠核糖体蛋白S23(RPS23)
AATTTGACAATGGAAACACAGTAATAAATTTTCATATTCTGAAAAAATA
(SEQ ID NO:172)
小家鼠核糖体蛋白S25(RPS25)
ACAGGTTCAATCAGCTGTACATTTGGAAAAATAAAACTTTATTGAATCAAATGAATGGGTGCATCTGTTTCCTAAGGCAGCCGGGGAGGATTTGGTCTTAGGAATAATAGCTGGAATTGGTTTGTTGGCCATGAAGTCAGATGCAATTGCGCCTGGGAACCTTCAGCTTTTCCCTTTACGTGGTTGCTTGCTTCTTGTTGCAGCTTCGGTTTTGAATTGATGCCTGAAAGAAAATAAAAACTTAGCAAGACTAATGGTAAATCT
(SEQ ID NO:173)
小家鼠核糖体蛋白S26(RPS26)
AGAGGCCGTTTTGTAAGGACGGAAGGAAAATTACCCTGGAAAAATAAAATGGAAGTTGTACTTTACATGGC
(SEQ ID NO:174)
小家鼠核糖体蛋白S27(RPS27)
AAGCCCCTGATTGAAGATGAGTGGGAACCTTCCCAATAAACACGTTTTGGATATAT
(SEQ ID NO:175)
小家鼠核糖体蛋白S27a(RPS27a)
TTGTGTATGCGTTAATAAAAAGAAGGAACTCGTACTTA
(SEQ ID NO:176)
小家鼠核糖体蛋白S28(RPS28)
TCTTGCAGCTGGGTTCTGGATATCCACTACTTAGCCCACGGAATGATCTGCAACTGTTAAATAAAGCATTTATATTAATTCTTGTCTAGAAA
(SEQ ID NO:177)
小家鼠核糖体蛋白S29(RPS29)
GCGACCTTGAATGGATTCGACTGACTACTACCAAGTGGAACCGATCATGCTAGTCTTTGTACACAAAGAATAAAAATGTGAAGAACTTTAA
(SEQ ID NO:178)
小家鼠核糖体蛋白L15(RPL15)
TACACGTGATATTTGTAAAATTCATATCCAATAAACAATTTAGGACAGTCATTTCTGCTTAAAGGTGTTATTTGTTAAAACTAGTCTACAGATTGTCATGAGTGTTCTGTGAAAATGTAGAAGTTAAGTGCAATAATTGAAAACTGCAGGTGATGGCATATCTTGTTTCTGATGTACTTTGCATTATCTGCTTATGAGATTAAGTGTATATAGTGTTTGTGCCAAGTGGTGTTCTGTGTGTAAGACCCTGTAAGAGGTAAAAAGTCCTGAAACTGACCCTGGATGTGTTGGTGCATGAGATAGAATCTACAGCTTTACGATGGCATCTTTTGGTTCACTGAAGTGGCTGCTTGGGAGTTTGATGAGTACAAACTTTATAGAGTTGGATTTTGCTTAGAAATGTGTAGGAAGAGAGGGTTTCAAAACCTGTTTTGTGCATAGAAAAGTGAGATCAACTATAACCCACATTTTGAGAATTGAATCCAGTGTTATTTTCAGAAGACCAGGTAAATTTGTTGGAAGAGGTTTCACTTTCTGTTGGATCTAGAGTATGGATTTGGAGATGAAGGTTGAACATTGGATGTAGTAGGGCTTATTTAGGGCAGATTATTTCCATTAGATTTGTAAACTTGGTTGTGGTTGCAAGTTAATATCAACCAAGCAAATATAAGTTTGATTAAGCTTGCAGACATTAAGCTTTTCTAGCAGCTGGTGTGTGCAGAGGCAGATGGCTCTCTGGTTCCAGGACTACCTACAATATAGAGAAATTTTCTCTATTCCAGTCAATTCATCATGGGTAAGAATAGTCCATTTTGGTAGTGTTATTTCATCGTTTACAATCTACCTATGGGTAGTGGCTGGTAACTGCCTGGATGTTGACATTTCACAAAGGCCATACTTAACCACACTTTTATTTCTATTTGTGCGATGCCTTGGAGTAGTTTCCCAAAGTGATTTTGAGTGTGGAAGAAATGGTATTGTCCCCGAACAGCTGGCTTGGTCTCAAAATCTAATTGATGCTTTTATTAAATTGGTTTTCCTTTGGAGATTTTAAAAGGATGATTTGATTTCCAGAAAATACTAGACTCAAAATCTTGATAGCTAAAATTCTTTTCTATTCAGCAAAACAAGTCACTGTATAGAGGTTGTTCAAATCAACTAAAGTAATAAATGTCTTAAACAAGTGG
(SEQ ID NO:179)
小家鼠核糖体蛋白S2(RPS2)
GGGTTTTTATATGAGAAAAATAAAAGAATTAAGTCTGCTGATT
(SEQ ID NO:180)
小家鼠核糖体蛋白L14(RPL14)
GGCTACACAGAATAATAAAGGTTCTTTTTGACGGTGGTAAATCTCATGTGTGGACTCTAAGCTTGTCGCCAAGTGGGAAATAGACTGGTGGGATTGTAGATAGGATGGGCTACTTAAACTCATTCTACCCAG
GCCTTAGTACTTAGCATACAGCCAGAGTCAAACTGATCCTTTATACAGGGGGTACCATGACAGTACAACAGTGTCGTTAACCCTAACAAATAAATTTCCCACCAACGGGTGGAATTCCTTCATTTTG
(SEQ ID NO:181)
小家鼠核糖体蛋白S14(RPS14)
ACAGGACTTCTCATTATTTTCTGTTAATAAATTGCTTTGTGTAAGCTA
(SEQ ID NO:182)
小家鼠核糖体蛋白L10(RPL10)
AGGCTTCAATAGTTCTCCTATACCCTACCAAATCGTTCAATAATAAAATCTCGCATCAAGTTCGCTT
(SEQ ID NO:183)
小家鼠核糖体蛋白L10a(RPL10A)
GATGCTCCAATAAACCTCACTGCTGCCACTCAG
(SEQ ID NO:184)
小家鼠核糖体蛋白L35(RPL35)
GATGACAACGACAATAAAGTGCGAGACTGACTGGCT
(SEQ ID NO:185)
小家鼠核糖体蛋白L13a(RPL13A)
ACCCAATAAAGACTGTTTGCCTCATGCCTGCCTGGCCTGCCCTTCCTCCGCCGCCAACTAGGGAAGTGGGGACCAAAGGTTCCTTAGGCACTGCTCCTGTGGGTAGAGGGGACATTAGAGAGCTGACAGCGCACCACCTGCATGAGTTTTTATTAAAGTGCAAACCATGGGATGAATCAGTTGAGCTTCAGTGTTGAAAATGAGTAGCAGGGCTGCCCCACCCACCTGACCAAGTACCCTATTCTGCAGCTATGAAAATGAGATCTGCACATGAGCTGGGGTTCACAAGTGCACACTTGGAGCACTGCCTTGCTCCTTCCCAGCAGACCACAAAGCAGTATTTTTCTGGAGGATTTTATGTGCTAATAAATTATTTGACTTAAGTGTG
(SEQ ID NO:186)
小家鼠核糖体蛋白L36(RPL36)
TGAACCCTCCCCCAATAAAAGATGGTTCCTAC
(SEQ ID NO:187)
小家鼠核糖体蛋白L36a(RPL36A)
GCAGATTTTGTTATGAAGACAATAAAATCTTGACCTTTCAACCCCTTTGATTGCAGTTGTTCGTTTGGGAGGGAATACATTAAAAGCTTTCAGAAATTACCTG
(SEQ ID NO:188)
小家鼠核糖体蛋白L41(RPL41)
GCCAGCCCGTGCACCTACGACGCCTGCAGGAGCAGAAGTGAGGGATGCTGAGGGCCGGGACAAGCTATCGGACTGTGTGCTGCCATCGGTAATGAGTCTCAGTAGACCTGGAACGTCACCTCGCCGCGATCGCCTGGAGAAATGACCGCCTTTCTTACAACCAAAACAGTCCCTCTGCCCTGGACCCCCGGCACTCTGGACTAGCTCTGTTCTCTTGTGGCCAAGTGTAGCTCGTGTACAATAAACCCTCTTGCAGTCAGCTGAAGAATCAAACTGC
(SEQ ID NO:189)
小家鼠核糖体蛋白S18(RPS18)
GTCTCTGGGCCTTTGCTGTTAATAAATAGTTTATATACCTATGA
(SEQ ID NO:190)
小家鼠核糖体蛋白S24(RPS24)
AATACCTAGCAGTGAGTGGAGATTGGATACAGCCAAAGGAGTAGATCTGCGGTGACTTGATGTTTTGCTGTGATGTGCAGATTTCTGAGAGGACAAATAAACTAAAAAGCTCCTACACGTCTGCTCTGCTGCTTATTGGGCATTAGAAGAATCAGGTGGCTGCTTGGGTGTTGATGCAGTCAAGTGCACTGGGCTTGGTGAAAAGCCCAGTGTAAGAGGCCGGTACAGATCCTTCCTGGCAGAGGGTGGTGATGGAGAGAACATAAATAACTACATGGGCAAAGTGTAGGACCAATTACCCTGTTAGCATCGTCTTTGCTCAACACCTTTCTGTGTCCCTAGACTCTGAGTTTTTTTCTAATTGATTTTTATTGAACACTGAGTGTTTTGAGGTTTTATTTTTT
(SEQ ID NO:191)
小家鼠核糖体蛋白L8(RPL8)
AGTTCAGGAGCTAATAAAGTACGTCCTTTGGCTAATCCG
(SEQ ID NO:192)
小家鼠核糖体蛋白L34(RPL34)
ATATGCACATTTTTTAAGTAATAAAAATCAAGACTTGATCTACGCTTC
(SEQ ID NO:193)
小家鼠核糖体蛋白S17(RPS17)
TCTGTTATGCCATATTTTCAATAAACCTGAAAACAA
(SEQ ID NO:194)
小家鼠核糖体蛋白SA(RPSA)
GCTGCTGTGCAGGTGCCTGAGCAAAGGGAAAAAAGATGGAAGGAAAATAAAGTTGCTAAAAGCTGTCTTATGGTCCTCACTGCAGACTGTACCTGGATTGGCATTTGGCTATACAACAGAGGCATGGTCCTACTGACATGTTTTGTGTTGAATACTTAAGCATGTGAACACATGGGTTTTTTTTTTTTTTAATGTAAAATGTAGTAACACAATGTTTAGGTGGCTTTGGTGTTAGCTCTGGAGACTTCATGTGTCATCTAGGTGAGGTGTTCTTTAACACAGGGTCTCTGTTCTGTCATGCCTCATAGATCCTTCTACCTCCAGATTGGAGAGGGAAAAGGCTTATGTCACTGAACCTGGCCAGATTGGGATTTTGTGTCCCAGGAACAAAGTTAATGCTAAAAAGTTAATGCCTTGGTGAGACTGATAGTCTGATGGTGTGAATTCACAGTAAGTGGTTGGGATTGCCAGATGGAATTCCCTGAGCTGCCGTGACAGGTGGCATTGCAGAAGTGAAGGATTCAGGAATTTGAGTGTTGGGTGGGGGCCTGTGAATAGCACTTGGGCTGGGAGGGGAGACTGCTGCCCCTGAATGTCCTGGAATTCAAGGACAGTACCTGGTTAAATGTTTTTCTAGCTTTTCTAAAAAGTTTGTTAGGCCTGGCATTGGCGGCGCACACCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGTCAGGCAGGTGGATTTCTGGCCTGGTCTACAGAGAGTTCCAGGATAGCCAGGGATACACAGAAATCCTGCCTCAGGAAAAAACCAAAAAGAAGTTTGCTAAAAATAAGCATTTTTGCTTGATGGTATTGAAGATTGTAAGACATTAAATTGTGTCATTACTTCTCCAGGTACT
(SEQ ID NO:195)
小家鼠泛蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)
AGCTGTGGTCATACCTGGCATGTGACCCCGGGACCAAATAAAGTCCCCTTCCATCCACTGGAGCAGC
(SEQ ID NO:196)
小家鼠Finkel-Biskis-Reilly鼠肉瘤病毒(FBR-MuSV)遍在表达的(FAU)
GTCCTATTGCCACCCTGCCATGCTAATAAAGCCACTGTGTCCAGACTTCT
(SEQ ID NO:197)
小家鼠核糖体蛋白L22-样蛋白1(RPL22L1)
TTGGCCTCTGCTTGTAATACAATGAAAGTATTCTAAAGAAATATAAAATTGGACTTTATGAGAAAATAAAAGTCATTTCACTCT
(SEQ ID NO:198)
小家鼠核糖体蛋白S17(RPS17)
TCTGTTATGCCATATTTTCAATAAACCTGAAAACAA
(SEQ ID NO:199)
小家鼠核糖体蛋白L39-样蛋白(RPL39L)
GGAACCACACGTACTTATGCTGTAACTTACTGTAGCGTTTACAGCGTTACCGCTGTCTGGACAGCTGAGTGTGTTTCTTAGGAATATAAGTTTTCTTTCTGTGCTTTAGTGAGTTCATTCAGCAGTTCAGTAATAAATATGTGAAACCTTTTGTTTCGAAAAAAATTGCTTCTGTGTTACAACTTACTTTGTTTTATGGTTCAGGATCATCTGCATAATAGACAAGTATTCTATCAGTGAGCGATATCCTGGATCTTGTTTGTGTAGTTTGGGGTTGAGACAAGTCCAGACTGCCCTAAAACTCACGATCTTCCTTCCTCGGCCTTCTAAATGATTGGAGGACTCCAAACCTAAGTGATGGAAGTAAAAAGAAACTTATATGTCAAGACTCATTTTCTCTATCATTTCATGTGACAATTGAAATTAGATTATTTCTTTTTTCAATC
(SEQ ID NO:200)
小家鼠核糖体蛋白L10-样蛋白(RPL10L)
GGACTTTGCTGGCAGAAAAGAAGTACAGATGAGGTTATAGTTTGAAAAACGTTAATTCCGTTTATTGACTTTAGAATGTTACTTTGCATAGTATAGACCATTACAATGGAAAGTACCTGCCTTAAGAAACAAGAAAACTGCAGTTTATAGAGAAAGAATTTTCAATTTTGACCCATGTACTTAAAATTTTTGGTGTATACTGCAGTGTAGCAAATGTTTTGTGGTGACGGTATAAATGGTACTGTTTGTTATCTTGGATTAAGAGTGGCTAGAGAAGTTGGAAGACGTGTGAGAAGTTCTTTATAGAGAATTAAACATGAAAATTACATCTC
(SEQ ID NO:201)
小家鼠核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)
AACTTGTGTTCTCTGAGAGGAAAATACTGAAGCAGTAGAGAAATGACCTGCTAGAGAATAAAGTTACTGTTAATGATACC
(SEQ ID NO:202)
小家鼠核糖体蛋白L3-样蛋白(RPL3L)
GATGTCTGGAATGGAGCACACCTGGGATGTAGCACTCTTGCTATCTGTCCGGTCCTTTTTGTTCAATAAAGTCCTGAGGCAACTCTCTCTGTC
(SEQ ID NO:203)
小家鼠核糖体蛋白S27-样蛋白(RPS27L)
TGAGCTATGAAGTTCCGGAATTTGTGTTTTTCACAGAAAGCCTTACCAACTTCAGTTACTTTACCAAGACAATGTAATTATTGTTTGATTTTATAAAGTCTACAACAATGATCTCCTATTTTGGTGTCAGTTTTTCAATAAAGTTTTAATTA
(SEQ ID NO:204)
小家鼠核糖体蛋白L7-样蛋白1(RPL7L1)
AGCAGGAGCAGGTTTTCCAAAAGCACCCCTCGGAAGTGTTTTTGTCGTCGTTTAAAATTATCAAGTATCTTCAGAGAAGATTATTTTCTGCCTTCAGAAACTGAAGGAAGGCTTGGGCCTAGAGAACGACAGTAAGGTGCGAGCACCGGAGACACTTAACACAGCTCAGTCCATGGAAGGACGAGTTCCCTCATTGGCTGCCTGTCTCGAAATCCACGCAAGCTGTGGAGGAAAGAATTACCCTGCTCATCCTGCCTTCTATCTTGGTGTTTAATGTTGGGTGGGCAACAAGCACAAACCTCCCTCCCACCCCCTCCAAGACTGTTAGAGCAGTGGGCCAGACCAAGCGGCGCACTTGAACATGGATCAAGAGGGTCCCGGTTTTACTTTTTATTTTTGTCAGGGTAGGCAGTCTTGTGTTTGCTTTGTTCAAAGCAGGGTCTCCCTGTTGGCCCTGGCTGGCCTTATACTCCACAGCAGTCCTGCCTCCTCCTCCTAGGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCACCACGCCCGGCTACAGCCTGCATTTTTATGCACATTGGTCTGTTAAGCTAGTTGCATTCTGTGCTACCGGAGGGGACTGAAGTTTAATCACTTGTCTTCTATTAAAAACTAGTGTTTGCCTGGGCCTGGTGTGTAT
ACCTTTAGTTGCAGCGCTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGACTTCATGAGTTCAGGGACAGGCAAGCCTGCTCTACAGATTTCCAGGATACCCAGGGCTACACATAGAGAAAATGTTAAAGATAAACAAAAAGCTGGACAGTGGGGGAGCACACCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGTCTCAGAAAAAAAACAAAACAAAAACCAATGCAGTGATAGATTGTTGTTTCCTAAACCACATGTACCCAGGAAATGCCCACTAAATTTCACCTGGATCAGTGTTAACTGATCATTGGGAAATGAGGTGACCAAAAATGCATCGCAACCTTGGACAAACAGCATGGCTATTTAACATTCTGGGATCCTGCAGAATCCTGCATCTTCCTAAGTAGGGAAGCACTGTAGCATTGGAGAGAGGCCTGGGCGAGCAGAGCTAAGGCTTCCATTTCTGGCTTGCTTGGAATTTAAAACAAGCTTTTTTCTATATAGTAAAAGATTGTTTTTAAGATTTTTGCGTGTGAGTACATGCCAAAGTAGCCAGGAAGTGTCACTTGCCCTGGAGCTAGAATTACTGGCAAATGAAGGCTCAGAGGTGGATGCTGGGACCAATTCTAGGCCCTCTGAGAAAGCAGGTGCACTTGGCTTGTGCCTCCAGCCCCAAAGGCGATGGCTTATTGTGAGCCTGAGGCCAGCCAGGGTTACAGAGACTCAAGAAACAAGTGGGGTTGTCCATGTTGCTGGAGATGACCCAGGTCTATTAGGACCTTGACTACATGGATAGACATTCTGGCAGCTAGTATACTGCCATTGGGGCCTATGGAGAAGTAGCCACCGAGCCTATTTAGAAAGAAGGACTGCTGGCAAGCTTGGTGTCACTATGAAGGCAGACAAAGATCGATGTATTAACGACCCCGACTCCAAAAACACTCGAGGGGGCCCAAGGTGGGCTCAGTGGTTAAGAGCCGTTCGCCCAGGGGCTGGAGAGTTGGCTCAGTGGTACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGAGATCTGACGCCCTCTTCTGGTGTATCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTACATAAAATAAATAAATCTTT
(SEQ ID NO:205)
在优选的实施方案中,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件包含或由与核糖体蛋白Small 9(RPS9)的3’-UTR序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%,最优选100%的同一性的核酸序列组成。最优选为,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件包含或由SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%,最优选100%的同一性的核酸序列组成。
SEQ ID NO:1
GTCCACCTGTCCCTCCTGGGCTGCTGGATTGTCTCGTTTTCCTGCCAAATAAACAGGATCAGCGCTTTAC
SEQ ID NO:2
GUCCACCUGUCCCUCCUGGGCUGCUGGAUUGUCUCGUUUUCCUGCCAAAUAAACAGGAUCAGCGCUUUAC
根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件还可以包含或由与核糖体蛋白基因的3’-UTR的核酸序列,如与根据SEQ ID NOs:10至205的序列的3’-UTR具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%,最优选100%的同一性的核酸序列的片段组成,其中所述片段优选为如上文所述的功能性片段或功能性变体片段。这样的片段优选为至少约3个核苷酸,优选至少约5个核苷酸,更优选至少约10,15,20,25或30个核苷酸,甚至更优选至少约50个核苷酸,最优选至少约70个核苷酸的长度。在优选的实施方案中,片段或其变体呈现3至约500个核苷酸之间,优选5至约150个核苷酸之间,更优选10至100个核苷酸之间,甚至更优选15至90之间,最优选20至70之间的长度。
优选为,所述变体、片段或变体片段是如上文所述的功能性变体、功能性片段或功能性变体片段,呈现根据SEQ ID NOs:10至205的核酸序列的至少一个功能,如稳定根据本发明的人工核酸分子,优选以包含根据SEQ ID No.1或SEQ ID NO.2的核酸序列的人工核酸分子显示的稳定效率和/或蛋白生产增加效率的至少40%,更优选至少50%,更优选至少60%,甚至更优选至少70%,甚至更优选至少80%,最优选至少90%的效率,稳定和/或延长根据本发明的人工核酸分子的蛋白表达,和/或增加蛋白生产。
优选为,根据本发明的人工核酸分子的至少一个3’-UTR元件显示至少约3核苷酸,优选至少约5核苷酸,更优选至少约10,15,20,25或30个核苷酸,甚至更优选至少约50个核苷酸,最优选至少约70个核苷酸的长度。3’-UTR元件的长度上限可以是500个核苷酸或更少,例如400,300,200,150或100个核苷酸。对于其他实施方案,上限可以在50至100个核苷酸的范围内。例如,片段或其变体可以显示3至约500个核苷酸之间,优选5至约150个核苷酸之间,更优选10至100个核苷酸之间,甚至更优选15至90之间,最优选20至70之间的长度。
此外,根据本发明的人工核酸分子可以包含多于一个如上文描述的3′-UTR元件。例如,根据本发明的人工核酸分子可以包含一个、两个、三个、四个或更多个3′-UTR元件,其中个体3′-UTR元件可以相同或它们可以不同。例如,根据本发明的人工核酸分子可以包含两个基本上相同的如上文描述的3′-UTR元件,例如两个包含以下或由以下组成的3′-UTR元件:源自核糖体蛋白基因,如源自根据SEQ ID NO:10至205序列的3′UTR或源自核糖体蛋白基因3′-UTR的片段或变体,如根据SEQ ID No.1或2的核酸序列,如上文描述的其功能性变体,其功能性片段,或其功能性变体片段的核酸序列。
出人意料的是,发明人发现包含如上文描述的3′-UTR元件的人工核酸分子可以表示或可以提供允许增强的、延长的和/或稳定的蛋白生产的mRNA分子。因此,如本文描述的3′-UTR元件可以改善mRNA分子的蛋白表达稳定性和/或改善翻译效率。
根据本发明的人工核酸分子可以是RNA,如mRNA,DNA,如DNA载体,或可以是修饰的RNA或DNA分子。其可以以具有正义链和反义链的双链分子,例如,以具有正义链和反义链的DNA分子提供。
根据本发明的人工核酸分子可以进一步包含任选地5-′UTR和/或5′-帽。所述任选的5′-帽和/或所述5′-UTR优选位于根据本发明的人工核酸分子内ORF的5′。
优选地,根据本发明的人工核酸分子还包含聚腺苷酸序列和/或聚腺苷酸化信号。优选地,所述任选的聚腺苷酸序列位于所述至少一个3′-UTR元件的3′,优选所述任选的聚腺苷酸序列连接于所述3′UTR元件的3′末端。该连接可以是直接或间接的,例如,通过一段2,4,6,8,10,20等的核苷酸,如通过例如包含一个以上限制性位点或由一个以上限制性位点组成的1-50,优选1-20个核苷酸的接头来连接。
在一个实施方案中,所述任选的聚腺苷酸化信号位于3-′UTR元件的3’的下游。优选地,所述聚腺苷酸化信号包含共有序列NN(U/T)ANA,其中N=A或U,优选AA(U/T)AAA或A(U/T)(U/T)AAA。此种共有序列可以被多数动物和细菌细胞系统,例如被聚腺苷酸化因子,如与CstF,PAP,PAB2,CFI和/或CFII配合的切割/聚腺苷酸化特异性因子(CPSF)识别。优选地,所述聚腺苷酸化信号,优选所述共有序列NNUANA,位于3′-UTR元件3′-末端的下游少于约50个核苷酸,更优选少于约30个碱基,最优选少于约25个碱基,例如21个碱基处。
根据本发明的在3′-UTR元件下游包含聚腺苷酸化信号的人工核酸分子,例如人工DNA分子的转录,将导致产生在其3′-UTR元件下游包含聚腺苷酸化信号的未成熟(premature)-RNA。例如,包含根据SEQ ID No.1的3’-UTR元件的DNA分子的转录将导致具有根据序列SEQ ID No.2的3’-UTR元件的RNA。
使用合适的转录系统将随后导致聚腺苷酸序列附着于未成熟-RNA。例如,本发明的人工核酸分子可以是包含如上文描述的3′-UTR元件和聚腺苷酸化信号的DNA分子,其可以导致该DNA分子转录时RNA的聚腺苷酸化。因此,产生的RNA可以包含本发明的3′-UTR元件随后是聚腺苷酸序列的组合。
可能的转录系统是体外转录系统或细胞转录系统等。因此,根据本发明的人工核酸分子的转录,例如包含可读框、3′-UTR元件和聚腺苷酸化信号的人工核酸分子的转录,可以产生包含可读框、3′-UTR元件和聚腺苷酸序列的mRNA分子。
因此,本发明还提供一种人工核酸分子,所述人工核酸分子是包含可读框、如上文描述的3′-UTR元件和聚腺苷酸序列的mRNA分子。
在一个实施方案中,本发明提供一种人工核酸分子,所述人工核酸分子是包含可读框和根据SEQ ID No.1的序列或与如上文描述的SEQ ID No.1具有至少约40%或更高同一性的序列或其片段的人工DNA分子。此外,本发明提供一种人工核酸分子,所述人工核酸分子是包含可读框和根据SEQ ID NO.2的序列或与如上文描述的SEQ ID No.2具有至少约40%或更高同一性的序列或其片段的人工RNA分子。
因此,本发明提供一种人工核酸分子,所述人工核酸分子可以用作RNA分子的,优选mRNA分子的模板,其就翻译效率而言是稳定化和优化的。换句话说,所述人工核酸分子可以是可以用作生产mRNA的DNA的模板。可获得的mRNA可以相应被翻译以生产由可读框编码的所需肽或蛋白。如果所述人工核酸分子是DNA,其可以例如用作双链储存形式以连续和重复地体外或体内生产mRNA。
在另一实施方案中,根据本发明的人工核酸分子的3’-UTR不包含聚腺苷酸化信号或聚腺苷酸序列。进一步优选地,根据本发明的人工核酸分子不包含聚腺苷酸化信号或聚腺苷酸序列。更优选地,人工核酸分子的,或本发明的人工核酸分子本身的3’-UTR,不包含聚腺苷酸化信号,尤其是其不包含聚腺苷酸化信号AAU/TAAA。
在一个实施方案中,根据本发明的人工核酸分子还包含聚腺苷酸序列。例如,包含ORF之后是核糖体3’UTR的DNA分子可以含有一段胸苷核苷酸,其可以在得到的mRNA中被转录为聚腺苷酸序列。聚腺苷酸序列的长度可以改变。例如,聚腺苷酸序列可以具有约20个腺嘌呤核苷酸多至约300个腺嘌呤核苷酸,优选约40至约200个腺嘌呤核苷酸,更优选约50至约100个腺嘌呤核苷酸,如约60,70,80,90或100个腺嘌呤核苷酸的长度。最优选地,本发明的核酸包含约60至约70个核苷酸,最优选为64个腺嘌呤核苷酸的聚腺苷酸序列。
例如,根据本发明的人工核酸分子可以包含对应于DNA-序列的核酸序列。
GTCCACCTGTCCCTCCTGGGCTGCTGGATTGTCTCGTTTTCCTGCCAAATAAACAGGATCAGCGCTTTACAGATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA(SEQ IDNo.3)。
该序列的转录可以得到包含以下序列的人工核酸分子
GUCCACCUGUCCCUCCUGGGCUGCUGGAUUGUCUCGUUUUCCUGCCAAAUAAACAGGAUCAGCGCUUUACAGAUCUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA(SEQ ID No.4)。
此种人工RNA-分子,即包含根据SEQ ID No.4的序列的人工核酸分子也可以体外通过化学合成的普通方法获得,而不必需从DNA祖先(progenitor)转录。
在一个特别优选的实施方案中,根据本发明的人工核酸分子是RNA分子,优选在5′到3′方向上包含可读框、如上文描述的3′-UTR元件和聚腺苷酸序列的mRNA分子。
优选地,可读框不编码核糖体蛋白。在优选的实施方案中,可读框不编码本发明的人工核酸的3’-UTR元件源自的核糖体蛋白,尤其是对于哺乳动物核糖体蛋白而言不编码,条件是3’-UTR元件与哺乳动物核糖体蛋白基因的3’-UTR相同。在一些进一步优选的实施方案中,可读框不编码RPS9或其变体,条件是3’-UTR元件是与SEQ ID No.1或SEQ ID No.2相同的序列。
在优选的实施方案中,ORF不编码人或植物,尤其是拟南芥,核糖体蛋白,尤其是不编码人核糖体蛋白S6(RPS6),人核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)或拟南芥核糖体蛋白S16(RPS16)。在进一步优选的实施方案中,可读框(ORF)不编码任何来源的核糖体蛋白S6(RPS6),核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)或核糖体蛋白S16(RPS16)。
在一个实施方案中,本发明提供人工DNA分子,其包含可读框,优选为编码不同于3’-UTR源自的核糖体蛋白的肽或蛋白的可读框;包含或由与SEQ ID No.1具有至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%;甚至更优选至少99%;甚至更优选100%序列同一性的序列组成的3’-UTR元件;和聚腺苷酸化信号和/或聚腺苷酸序列。此外,本发明提供人工DNA分子,其包含可读框,优选编码任何不同于3’-UTR源自的核糖体蛋白的肽或蛋白的可读框;a3’-UTR元件包含或由与SEQ ID No.3具有至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%;甚至更优选至少99%;甚至更优选100%序列同一性的序列组成。
此外,本发明提供人工RNA分子,优选人工mRNA分子或人工病毒RNA分子,其包含可读框,优选编码不同于3’-UTR源自的核糖体蛋白的肽或蛋白的可读框;包含或由与SEQ IDNo.2具有至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%;甚至更优选至少99%;甚至更优选为100%序列同一性的序列组成的3’-UTR元件;和聚腺苷酸化信号和/或聚腺苷酸序列。此外,本发明提供人工RNA分子,优选人工mRNA分子或人工病毒RNA分子,其包含可读框,优选编码不同于3’-UTR源自的核糖体蛋白的肽或蛋白的可读框;包含或由与SEQ ID No.4具有至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%;甚至更优选至少99%;甚至更优选为100%序列同一性的序列组成的3’-UTR元件。
本发明提供一种人工核酸分子,优选人工mRNA,其特征可以在于编码的肽或蛋白的增强的稳定性和延长的表达。不受任何理论限制,增强的蛋白表达稳定性和由此而来的延长的蛋白表达可以由根据本发明的人工核酸分子,比如人工mRNA分子的降解的减少引起。因此,本发明的3′-UTR元件可以阻止人工核酸免受降解和衰变。
在一些实施方案中,除了源自核糖体蛋白基因的3’-UTR的核酸序列,人工核酸分子还可以包含组蛋白茎环。根据本发明该人工核酸分子,例如,可以在5’-至-3’-方向上包含ORF、3’-UTR元件、任选的组蛋白茎环序列,任选的聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号和任选的聚胞苷酸序列。其在5’-至-3’-方向上还可以包含ORF、3’-UTR元件、任选的聚腺苷酸序列、任选的聚胞苷酸序列和任选的组蛋白茎环序列。
在优选的实施方案中,根据本发明的人工核酸分子包含至少一个组蛋白茎环序列。
该组蛋白茎环序列优选选自WO 2012/019780中公开的组蛋白茎环序列,其公开内容通过引用结合在本文中。
适于在本发明中使用的组蛋白茎环序列优选选自下式(I)或(II)中的至少一个:
式(I)(不具有茎边界元件的茎环序列):
式(II)(具有茎边界元件的茎环序列):
其中:
茎1或茎2边界元件N1-6 是1-6个、优选2-6个、更优选2-5个、甚至更优选3-5个、最优选4-5个或5个N的连续序列,其中每个N彼此独立地选自下述核苷酸:所述核苷酸选自A,U,T,G和C,或其核苷酸类似物;
茎1[N0-2GN3-5] 与元件茎2反向互补或部分反向互补,并且是5-7个核苷酸的连续序列;
其中N0-2是0-2个、优选0-1个、更优选1个N的连续序列,其中每个N彼此独立地选自下述核苷酸:所述核苷酸选自A,U,T,G和C或其核苷酸类似物;
其中N3-5是3-5个、优选4-5个、更优选4个N的连续序列,其中每个N彼此独立地选自下述核苷酸:所述核苷酸选自A,U,T,G和C或其核苷酸类似物,并且其中G是鸟苷或其类似物,并且可以任选地被胞苷或其类似物替代,条件是其在茎2中的互补核苷酸胞苷被鸟苷替代;
环序列[N0-4(U/T)N0-4] 位于元件茎1和茎2之间,并且是3-5个核苷酸、更优选4个核苷酸的连续序列;
其中每个N0-4彼此独立地是0-4个、优选1-3个、更优选1-2个N的连续序列,其中每个N彼此独立地选自下述核苷酸:所述核苷酸选自A,U,T,G和C或其核苷酸类似物;并且
其中U/T表示尿苷或任选地胸苷;
茎2[N3-5CN0-2] 与元件茎1反向互补或部分反向互补,并且是5-7个核苷酸的连续序列;
其中N3-5是3-5个、优选4-5个、更优选4个N的连续序列,其中每个N彼此独立地选自下述核苷酸:所述核苷酸选自A,U,T,G和C,或其核苷酸类似物;
其中N0-2是0-2个、优选0-1个、更优选1个N的连续序列,其中每个N彼此独立地选自下述核苷酸:所述核苷酸选自A,U,T,G和C,或其核苷酸类似物;并且
其中C是胞苷或其类似物,并且可以任选地被鸟苷或其类似物替代,条件是其在茎1中的互补核苷鸟苷被胞苷替代;
其中
茎1和茎2能够彼此碱基配对形成反向互补序列,其中碱基配对可以发生在茎1与茎2之间,例如,通过核苷酸A与U/T或G与C的沃森-克里克碱基配对或通过非沃森-克里克碱基配对,例如摆动碱基配对,反向沃森-克里克碱基配对,Hoogsteen碱基配对,反向Hoogsteen碱基配对,或者能够彼此碱基配对形成部分反向互补的序列,其中,基于一个茎中的一个或多个碱基在另一个茎的反向互补序列中不具有互补碱基,不完全的碱基配对可以发生在茎1和茎2之间。
根据进一步优选的实施方案,可以根据以下具体式(Ia)或(IIa)中的至少一个选择组蛋白茎环序列:
式(Ia)(不具有茎边界元件的茎环序列):
式(IIa)(具有茎边界元件的茎环序列):
其中:
N,C,G,T和U 如上文定义。
按照第一方面的另一个更特别优选的实施方案,人工核酸分子序列可以包含至少一种按照下述具体的式(Ib)或(IIb)中的至少一个所述的组蛋白茎环序列:
式(Ib)(不具有茎边界元件的茎环序列):
式(IIb)(具有茎边界元件的茎环序列):
其中:N,C,G,T和U 如上文定义。
一个特定的优选的组蛋白茎环序列是根据SEQ ID NO:5:CAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACCA的序列或更优选为根据SEQ ID NO:5的核酸序列的相应RNA序列。
作为实例,单个元件可以以以下顺序存在于人工核酸分子中:
5’-帽-5’-UTR-ORF-3’-UTR元件-组蛋白茎环-聚腺苷酸/胞苷酸序列;
5’-帽-5’-UTR-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-组蛋白茎环;
5’-帽-5’-UTR-ORF-IRES-ORF-3’-UTR元件-组蛋白茎环-聚腺苷酸/胞苷酸序列;
5’-帽-5’-UTR-ORF-IRES-ORF-3’-UTR元件-组蛋白茎环-聚腺苷酸/胞苷酸序列-聚腺苷酸/胞苷酸序列;
5’-帽-5’-UTR-ORF-IRES-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-组蛋白茎环;
5’-帽-5’-UTR-ORF-IRES-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-聚腺苷酸/胞苷酸序列-组蛋白茎环;
5’-帽-5’-UTR-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-聚腺苷酸/胞苷酸序列;
5’-帽-5’-UTR-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-聚腺苷酸/胞苷酸序列-组蛋白茎环;等。
在一些实施方案中,所述人工核酸分子还包含元件诸如5′帽、聚胞苷酸序列和/或IRES-基序。所述5′帽可以在转录期间或转录后添加于RNA的5′末端。此外,尤其是如果所述核酸是mRNA的形式或编码mRNA,本发明的人工核酸分子可以被至少10个胞苷,优选至少20个胞苷,更优选至少30个胞苷的序列(所谓的“聚胞苷酸序列”)修饰。尤其是,特别是如果核酸是(m)RNA的形式或编码mRNA,本发明的人工核酸分子可以含有典型地约10至200个胞苷核苷酸,优选约10至100个胞苷核苷酸,更优选约10至70个胞苷核苷酸或甚至更优选约20至50或甚至20至30个胞苷核苷酸的聚胞苷酸序列。最优选地,本发明的核酸包含聚胞苷酸因此,优选根据本发明的人工核酸分子,优选在5′-到-3′方向上包含,ORF,如上文描述的至少一个3′-UTR元件,聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号,和聚胞苷酸序列。
例如如果所述人工核酸分子编码两个以上肽或蛋白,内部核糖体进入侧(IRES)序列或IRES-基序可以分开一些可读框。如果人工核酸分子是双或多顺反子核酸分子,则IRES-序列可以尤其有用。
此外,所述人工核酸分子可以包含另外的5′-元件,优选5′-UTR,启动子,或5′-UTR和含启动子的序列。所述启动子可以驱动或调节根据本发明的人工核酸分子,例如根据本发明的人工DNA-分子的转录。此外,5’-UTR可以由如本文定义的基因的5’-UTR组成或可以包含如本文定义的基因的5’-UTR。此外,所述5′-UTR可以与发明的3′-UTR元件相互作用并且因此可以维持发明的3′-UTR元件的稳定效果。此种元件可以进一步维持稳定性和翻译效率。因此,在一些实施方案中,本发明提供人工核酸分子,优选mRNA-分子,所述分子在5′-至-3′-方向上包含以下结构中的至少一个
5’-帽-5’-UTR-ORF-3’-UTR元件-组蛋白茎环-聚腺苷酸/胞苷酸序列;
5’-帽-5’-UTR-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-组蛋白茎环;
5’-帽-5’-UTR-ORF-IRES-ORF-3’-UTR元件-组蛋白茎环-聚腺苷酸/胞苷酸序列;
5’-帽-5’-UTR-ORF-IRES-ORF-3’-UTR元件-组蛋白茎环-聚腺苷酸/胞苷酸序列-聚腺苷酸/胞苷酸序列;
5’-帽-5’-UTR-ORF-IRES-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-组蛋白茎环;
5’-帽-5’-UTR-ORF-IRES-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-聚腺苷酸/胞苷酸序列-组蛋白茎环;
5’-帽-5’-UTR-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-聚腺苷酸/胞苷酸序列;
5’-帽-5’-UTR-ORF-3’-UTR元件-聚腺苷酸/胞苷酸序列-聚腺苷酸/胞苷酸序列-组蛋白茎环.
在本发明的尤其优选的实施方案中,人工核酸分子包含至少一个长度小于500,400,300,250,200,150或100个核苷酸和/或多于20,30,40,50或60个核苷酸的5’-非翻译区元件(5’UTR元件),其优选包含或由源自TOP基因或源自TOP基因的5’UTR的片段、同源物或变体的5’UTR的核酸序列组成。
尤其优选的是,5’UTR元件不包含如上文定义的TOP-基序或5’TOP。
源自TOP基因的5’UTR的核酸序列源自真核TOP基因,优选植物或动物TOP基因,更优选为脊索动物TOP基因,甚至更优选脊椎动物TOP基因,最优选哺乳动物TOP基因,如人TOP基因。
例如,5’UTR元件优选选自包含或由核酸序列组成的5’-UTR元件,所述核酸序列源自选自由以下各项组成的组的核酸序列:专利申请WO2013/143700的SEQ ID NOs.1-1363,SEQ ID NO.1395,SEQ ID NO.1421和SEQ ID NO.1422,其公开内容通过引用结合于本文,选自专利申请WO2013/143700的SEQ ID NOs.1-1363,SEQ ID NO.1395,SEQ ID NO.1421和SEQID NO.1422的同源物,其变体,或优选选自相应RNA序列。术语“专利申请WO2013/143700的SEQ ID NOs.1-1363,SEQ ID NO.1395,SEQ ID NO.1421和SEQ ID NO.1422的同源物”是指除智人外的其他物种的,与根据专利申请WO2013/143700的SEQ ID NOs.1-1363,SEQ IDNO.1395,SEQ ID NO.1421和SEQ ID NO.1422的序列同源的序列。
在优选的实施方案中,5’UTR元件包含或由核酸序列组成,所述核酸序列源自从核苷酸位置5(即位于序列中的位置5的核苷酸)至紧接起始密码子的5’(位于序列的3’末端)的核苷酸位置,例如紧接选自专利申请WO2013/143700的SEQ ID NOs.1-1363,SEQ IDNO.1395,SEQ ID NO.1421和SEQ ID NO.1422,专利申请WO2013/143700的SEQ ID NOs.1-1363,SEQ ID NO.1395,SEQ ID NO.1421和SEQ ID NO.1422的同源物,选自其变体,或对应RNA序列的核酸序列的ATG序列的5’端的核苷酸位置延伸的核酸序列。尤其优选的是,5’UTR元件源自从紧接5’TOP的3’的核苷酸位置至紧接起始密码子(位于序列的3’末端)的5’的核苷酸位置,例如紧接选自专利申请W02013/143700的SEQ ID NOs.1-1363,SEQ ID NO.1395,SEQ ID NO.1421和SEQ ID NO.1422,选自专利申请WO2013/143700的SEQ ID NOs.1-1363,SEQ ID NO.1395,SEQ ID NO.1421和SEQ ID NO.1422的同源物,选自其变体,或相应RNA序列的核酸序列的ATG序列的5’的核苷酸位置延伸的核酸序列。
在尤其优选的实施方案中,5’UTR元件包含或由核酸序列组成,所述核酸序列源自编码核糖体蛋白的TOP基因的5’UTR或源自编码核糖体蛋白的TOP基因的5’UTR的变体。例如,5’UTR元件包含或由核酸序列组成,所述核酸序列源自根据如本文所述的专利中请WO2013/143700的SEQ ID NOs:170,232,244,259,1284,1285,1286,1287,1288,1289,1290,1291,1292,1293,1294,1295,1296,1297,1298,1299,1300,1301,1302,1303,1304,1305,1306,1307,1308,1309,1310,1311,1312,1313,1314,1315,1316,1317,1318,1319,1320,1321,1322,1323,1324,1325,1326,1327,1328,1329,1330,1331,1332,1333,1334,1335,1336,1337,1338,1339,1340,1341,1342,1343,1344,1346,1347,1348,1349,1350,1351,1352,1353,1354,1355,1356,1357,1358,1359,或1360,相应RNA序列,其同源物,或其变体中的任一个的核酸序列的5’UTR,其优选为缺少5’TOP基序。如上文所述的,从位置5至紧接ATG(其位于序列的3’端)的核苷酸5’侧延伸的序列的对应于所述序列的5’UTR。
优选地,5’UTR元件包含或由核酸序列组成,所述核酸序列源自编码核糖体大蛋白(RPL)的TOP基因的5’UTR或源自编码核糖体大蛋白(RPL)的TOP基因的5’UTR的类似物或变体。例如,5’UTR元件包含或由核酸序列组成,所述核酸序列源自如本文所述的根据专利申请WO2013/143700的SEQ ID NOs:SEQ ID NOs:67,259,1284-1318,1344,1346,1348-1354,1357,1358,1421和1422,相应RNA序列,其同源物,或其变体中的任一个的核酸序列的5’UTR,其优选为缺少5’TOP基序。
在尤其优选的实施方案中,5’UTR元件包含或由核酸序列组成,所述核酸序列源自核糖体蛋白Large 32基因,优选源自脊椎动物核糖体蛋白Large 32(L32)基因,更优选源自哺乳动物核糖体蛋白Large 32(L32)基因,最优选源自人核糖体蛋白Large 32(L32)基因的5’UTR,或源自核糖体蛋白Large 32基因,优选源自脊椎动物核糖体蛋白Large 32(L32)基因,更优选源自哺乳动物核糖体蛋白Large 32(L32)基因,最优选源自人核糖体蛋白Large32(L32)基因的5’UTR的变体,其中优选5’UTR元件不包含所述基因的5’TOP。
因此,在尤其优选的实施方案中,5’UTR元件包含或由核酸序列组成,所述核酸序列与根据SEQ ID No.6(对应于专利申请WO2013/143700的SEQ ID No.1368的,缺少5’末端寡嘧啶束:GGCGCTGCCTACGGAGGTGGCAGCCATCTCCTTCTCGGCATC的人核糖体蛋白Large 32的5’-UTR;)的核酸序列或优选与相应RNA序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%同一性,或其中至少一个5’UTR元件包含或由以下组成:与根据SEQ IDNo.6的核酸序列或更优选与相应RNA序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%的同一性的核酸序列的片段,其中,优选所述片段如上文所述,即表示全长5’UTR的至少20%等的一段连续的核苷酸。优选地,显示至少约20个核苷酸以上,优选至少约30个核苷酸以上,更优选至少约40个核苷酸以上的长度的片段。优选地,片段是如本文所述的功能性片段。
在一些实施方案中,人工核酸分子包含含有或由核酸序列组成的5’UTR元件,所述核酸序列源自脊椎动物TOP基因,如哺乳动物,例如人TOP基因的5’UTR,所述5’UTR选自RPSA,RPS2,RPS3,RPS3A,RPS4,RPS5,RPS6,RPS7,RPS8,RPS9,RPS10,RPS11,RPS12,RPS13,RPS14,RPS15,RPS15A,RPS16,RPS17,RPS18,RPS19,RPS20,RPS21,RPS23,RPS24,RPS25,RPS26,RPS27,RPS27A,RPS28,RPS29,RPS30,RPL3,RPL4,RPL5,RPL6,RPL7,RPL7A,RPL8,RPL9,RPL10,RPL10A,RPL11,RPL12,RPL13,RPL13A,RPL14,RPL15,RPL17,RPL18,RPL18A,RPL19,RPL21,RPL22,RPL23,RPL23A,RPL24,RPL26,RPL27,RPL27A,RPL28,RPL29,RPL30,RPL31,RPL32,RPL34,RPL35,RPL35A,RPL36,RPL36A,RPL37,RPL37A,RPL38,RPL39,RPL40,RPL41,RPLP0,RPLP1,RPLP2,RPLP3,RPLP0,RPLP1,RPLP2,EEF1A1,EEF1B2,EEF1D,EEF1G,EEF2,EIF3E,EIF3F,EIF3H,EIF2S3,EIF3C,EIF3K,EIF3EIP,EIF4A2,PABPC1,HNRNPA1,TPT1,TUBB1,UBA52,NPM1,ATP5G2,GNB2L1,NME2,UQCRB或其同源物或变体,其中优选所述5’UTR元件不包含TOP-基序或所述基因的5’TOP,并且其中任选地,5’UTR元件在其5’-端以位于5’末端寡嘧啶束(TOP)下游的位置1,2,3,4,5,6,7,8,9或10的核苷酸起始并且其中进一步任选地,源自TOP基因的5’UTR的5’UTR元件在其3’-端以位于其源自的基因的起始密码子(A(U/T)G)下游的位置1,2,3,4,5,6,7,8,9或10的核苷酸终止。
优选地,根据本发明的人工核酸分子,优选所述可读框,是至少部分G/C修饰的。因此,可以通过修饰所述分子的G(鸟苷)/C(胞苷)含量在热力学上稳定本发明的人工核酸分子。与相应野生型序列的可读框的G/C含量相比,可以优选通过使用遗传密码的简并增加根据本发明的人工核酸分子的可读框的G/C含量。因此,与特定野生型序列的编码氨基酸序列相比,优选不通过G/C修饰来修饰人工核酸分子的编码氨基酸序列。因此,与野生型编码序列相比,编码序列或整个人工核酸分子,例如mRNA的密码子,可以不同,从而在保持翻译的氨基酸序列的同时,他们包括增加的G/C核苷酸量。由于一些密码子编码一个且相同的氨基酸(所谓的遗传密码简并)的事实,易于改变密码子而不改变编码的肽/蛋白序列(所谓的备选密码子使用)。因此,可能具体引入某些密码子(替换各自的编码相同氨基酸的野生型密码子),就受试者中RNA的稳定性和/或密码子使用是更有利的(所谓的密码子优化)。
与其野生型编码区相比,依赖于将由如本文限定的发明的人工核酸分子的编码区编码的氨基酸,对于核酸序列,例如可读框的修饰,存在各种可能性。在由仅含有G或C核苷酸的密码子编码的氨基酸的情况下,不需要密码子修饰。因此,因为不存在A或U/T,对于Pro(CCC或CCG),Arg(CGC或CGG),Ala(GCC或GCG)和Gly(GGC或GGG)的密码子不需要修饰。
相反,含有A和/或U/T核苷酸的密码子可以通过编码相同氨基酸但不含有A和/或U/T的其它密码子的置换被修饰。例如
Pro的密码子可以从CC(U/T)或CCA被修饰为CCC或CCG;
Arg的密码子可以从CG(U/T)或CGA或AGA或AGG被修饰为CGC或CGG;
Ala的密码子可以从GC(U/T)或GCA被修饰为GCC或GCG;
Gly的密码子可以从GG(U/T)或GGA被修饰为GGC或GGG。
在其它情况下,尽管A或(U/T)核苷酸不能从密码子被消除,然而,通过使用含有更低含量A和/或(U/T)核苷酸的密码子降低A和(U/T)含量是可能的。这些的实例是:
Phe的密码子可以从(U/T)(U/T)(U/T)被修饰为(U/T)(U/T)C;
Leu的密码子可以从(U/T)(U/T)A,(U/T)(U/T)G,C(U/T)(U/T)或C(U/T)A被修饰为C(U/T)C或C(U/T)G;
Ser的密码子可以从(U/T)C(U/T)或(U/T)CA或AG(U/T)被修饰为(U/T)CC,(U/T)CG或AGC;
Tyr的密码子可以从(U/T)A(U/T)被修饰为(U/T)AC;
Cys的密码子可以从(U/T)G(U/T)被修饰为(U/T)GC;
His的密码子可以从CA(U/T)被修饰为CAC;
Gln的密码子可以从CAA被修饰为CAG;
Ile的密码子可以从A(U/T)(U/T)或A(U/T)A被修饰为A(U/T)C;
Thr的密码子可以从AC(U/T)或ACA被修饰为ACC或ACG;
Asn的密码子可以从AA(U/T)被修饰为AAC;
Lys的密码子可以从AAA被修饰为AAG;
Val的密码子可以从G(U/T)(U/T)或G(U/T)A被修饰为G(U/T)C或
G(U/T)G;
Asp的密码子可以从GA(U/T)被修饰为GAC;
Glu的密码子可以从GAA被修饰为GAG;
终止密码子(U/T)AA可以被修饰为(U/T)AG或(U/T)GA。
另一方面,关于Met(A(U/T)G)和Trp((U/T)GG)的密码子,不存在不改变编码的氨基酸序列的情况下序列修饰的可能性。
可以单独或以所有可能的组合使用上文所列的置换以与其特定野生型可读框(即原序列)相比增加如本文限定的发明的人工核酸分子的可读框的G/C含量。因此,例如,野生型序列中存在的Thr的所有密码子可以被修饰为ACC(或ACG)。
优选地,与野生型编码区的G/C含量相比,如本文限定的发明的人工核酸分子的可读框的G/C含量以至少7%,更优选至少15%,尤其优选至少20%增加,而不改变编码的氨基酸序列,即使用遗传密码的简并性。根据一个特定的实施方案,发明的人工核酸分子的可读框或其片段,变体或衍生物的可置换密码子的至少5%,10%,20%,30%,40%,50%,60%,更优选至少70%,甚至更优选至少80%和最优选至少90%,95%或甚至100%被置换,从而增加所述可读框的G/C含量。
在此种情况下,尤其优选与野生型可读框相比,将如本文限定的发明的人工核酸分子的可读框的G/C含量增加,至最大(即可置换密码子的100%),而不改变编码的氨基酸序列。
此外,所述可读框优选至少部分被密码子优化。密码子优化基于翻译效率可以由细胞中转移RNA(tRNA)出现的不同频率确定的研究结果。因此,如果所谓的“稀有密码子”存在于如本文限定的发明的人工核酸分子的编码区到增加的程度,相应修饰的核酸序列的翻译比存在编码相对“频繁的”tRNA的密码子的情况下效率低。
因此,与相应野生型编码区相比,本发明的人工核酸分子的可读框优选被修饰,从而编码在细胞中相对稀有的tRNA的野生型序列的至少一个密码子被交换为编码在细胞比较频繁并携带与相对稀有tRNA相同的氨基酸的tRNA的密码子。通过该修饰,如本文限定的发明的人工核酸分子的可读框被修饰,从而频繁出现的tRNA可用的密码子可以替换相当于稀有tRNA的密码子。换句话说,根据本发明,通过此种修饰,编码稀有tRNA的野生型可读框所有密码子可以交换为编码在细胞中更频繁且携带与稀有tRNA相同的氨基酸的tRNA的密码子。哪些tRNA在细胞中相对频繁存在和相反哪些相对极少存在是本领域技术人员已知的;参见例如Akashi,Curr.Opin.Genet.Dev.2001,11(6):660-666。因此,优选地,优选就根据本发明的人工核酸分子将在其中被表达的系统而言,优选就根据本发明的人工核酸分子将在其中被翻译的系统而言,所述可读框是密码子优化的。优选地,可读框的密码子使用是根据哺乳动物密码子使用,更优选根据人密码子使用密码子优化的。优选地,所述可读框是密码子优化和G/C-含量修饰的。
为了进一步改善降解抗性,例如对由核酸外切酶或核酸内切酶导致的体内降解的抗性,和/或为了进一步改善根据本发明的人工核酸分子的蛋白表达的稳定性,所述人工核酸分子可以还包含修饰,如骨架修饰,糖修饰和/或碱基修饰,例如,脂修饰等。优选地,根据本发明的人工核酸分子的转录和/或翻译不被所述修饰显著损害。
通常,本发明的人工核酸分子可以包含任何天然(=天然存在的)核苷酸,例如鸟苷、尿嘧啶、腺苷、和/或胞嘧啶或其类似物。在这方面,核苷酸类似物定义为天然存在的核苷酸腺苷、胞嘧啶、胸苷、鸟苷和尿苷的天然或非天然存在的变体。因此,类似物是例如具有非天然存在的功能基团(其优选为添加于天然存在的核苷酸或从天然存在的核苷酸删除或其替代核苷酸的天然存在的功能基团)化学衍生的核苷酸。因此,天然存在的核苷酸的各个成分可以被修饰,即碱组分、糖(核糖)组分和/或形成RNA序列的骨架(见上)的磷酸盐组分。鸟苷、尿苷、腺苷、胸苷和胞嘧啶的类似物包括(但不意味任何限制)例如从化学上,例如通过乙酰化、甲基化、羟基化等改变的任何天然存在的或非天然存在的鸟苷,尿苷,腺苷,胸苷或胞嘧啶,包括1-甲基-腺苷,1-甲基-鸟苷,1-甲基-次黄苷,2,2-二甲基-鸟苷,2,6-二氨基嘌呤,2′-氨基-2′-脱氧腺苷,2′-氨基-2′-脱氧胞苷,2′-氨基-2′-脱氧鸟苷,2′-氨基-2′-脱氧尿苷,2-氨基-6-氯嘌呤核糖苷,2-氨基嘌呤-核糖苷,2′-阿糖腺苷,2′-阿糖胞苷,2′-阿糖尿苷,2′-叠氮基-2′-脱氧腺苷,2′-叠氮基-2′-脱氧胞苷,2′-叠氮基-2′-脱氧鸟苷,2′-叠氮基-2′-脱氧尿苷,2-氯腺苷,2′-氟-2′-脱氧腺苷,2′-氟-2′-脱氧胞苷,2′-氟-2′-脱氧鸟苷,2′-氟-2′-脱氧尿苷,2′-氟胸苷,2-甲基-腺苷,2-甲基-鸟苷,2-甲基-硫代-N6-异戊烯基(isopenenyl)-腺苷,2′-O-甲基-2-氨基腺苷,2′-O-甲基-2′-脱氧腺苷,2′-O-甲基-2′-脱氧胞苷,2′-O-甲基-2′-脱氧鸟苷,2′-O-甲基-2′-脱氧尿苷,2′-O-甲基-5-甲基尿苷,2′-O-甲基次黄苷,2′-O-甲基假尿苷,2-硫代胞苷,2-硫代-胞嘧啶,3-甲基-胞嘧啶,4-乙酰基-胞嘧啶,4-硫代尿苷,5-(羧基羟基甲基)-尿嘧啶,5,6-二氢尿苷,5-氨基烯丙基胞苷,5-氨基烯丙基-脱氧-尿苷,5-溴尿苷,5-羧基甲基氨基甲基-2-硫代-尿嘧啶,5-羧基甲基氨基甲基-尿嘧啶,5-氯-阿糖-胞嘧啶,5-氟-尿苷,5-碘尿苷,5-甲氧基羰基甲基-尿苷,5-甲氧基-尿苷,5-甲基-2-硫代-尿苷,6-氮杂胞苷,6-氮杂尿苷,6-氯-7-去氮杂-鸟苷,6-氯嘌呤核糖苷,6-巯基-鸟苷,6-甲基-巯基嘌呤-核糖苷,7-去氮杂-2′-脱氧-鸟苷,7-去氮杂腺苷,7-甲基-鸟苷,8-氮杂腺苷,8-溴-腺苷,8-溴-鸟苷,8-巯基-鸟苷,8-氧代鸟苷,苯并咪唑-核糖苷,B-D-甘露糖基-queosine,二氢-尿嘧啶,次黄苷,N1-甲基腺苷,N6-([6-氨基己基]氨甲酰基甲基)-腺苷,N6-异丙烯基-腺苷,N6-甲基-腺苷,N7-甲基-黄苷,N-尿嘧啶-5-氧基乙酸甲酯,嘌呤霉素,Queosine,尿嘧啶-5-氧基乙酸,尿嘧啶-5-氧基乙酸甲酯,Wybutoxosine,黄苷和木糖(Xylo)-腺苷。本领域技术人员例如从美国专利4,373,071,US4,401,796,US 4,415,732,US 4,458,066,US 4,500,707,US 4,668,777,US 4,973,679,US5,047,524,US 5,132,418,US 5,153,319,US 5,262,530和5,700,642知晓所述类似物的制备。在如上文所述的类似物的情况下,特别的偏爱可以根据本发明针对那些增加编码的肽或蛋白的蛋白表达或增加本发明的人工核酸分子的免疫原性和/或不干扰已经引入的人工核酸分子的进一步修饰的类似物的某些实施方案给出。
根据特定实施方案,本发明的人工核酸分子可以还有脂修饰。
在优选的实施方案,人工核酸分子优选从5’至3’方向包含以下元件:
5’-UTR;
至少一个可读框(ORF),其中ORF优选包含至少一种关于野生型序列的修饰;
3’-UTR,其源自核糖体蛋白,优选源自根据SEQ ID NOs:10至115中任一个的核酸序列的3’-UTR,更优选RPS9的3’-UTR,更优选人RPS9的3’-UTR;
聚腺苷酸序列,其优选包含64个腺苷酸;
聚胞苷酸序列,优选包含30个胞苷酸;
组蛋白茎环序列。
在另一优选的实施方案中,人工核酸分子包含或由根据SEQ ID NO:7(参见图3)或互补DNA序列所示的核苷酸序列组成。
在尤其优选的实施方案中,根据本发明的人工核酸分子还可以包含一种以上以下描述的修饰:
化学修饰:
如本文中使用的就人工核酸分子而言的术语“修饰”可以指包含骨架修饰以及糖修饰或碱基修饰的化学修饰。
在该情况下,如本文定义的人工核酸分子,优选RNA分子,可以含有核苷酸类似物/修饰,例如骨架修饰,糖修饰或碱基修饰。与本发明相关的骨架修饰是这样的修饰,其中包含在如本文定义的核酸分子中的核苷酸的骨架的磷酸酯被化学修饰。与本发明相关的糖修饰是如本文定义的核酸分子的核苷酸的糖的化学修饰。此外,与本发明相关的碱基修饰是核酸分子的核酸分子的核苷酸的碱基部分的化学修饰。在该情况下,核苷酸类似物或修饰优选选自可用于转录和/或翻译的核苷酸类似物。
糖修饰:
如本文所述的可以结合入人工核酸分子,优选RNA中的修饰的核苷和核苷酸可以在糖部分中被修饰。例如,RNA分子的2′羟基(OH)可以用很多不同的″氧基″或″脱氧″取代基修饰或替代。″氧基″-2′羟基修饰的实例包括,但不限于,烷氧基或芳氧基(-OR,例如,R=H,烷基,环烷基,芳基,芳烷基,杂芳基或糖);聚乙二醇(PEG),-0(CH2CH2o)nCH2CH2OR;其中2′羟基,例如,通过亚甲基桥连接于相同核糖的4′碳的″锁″核酸(LNA);并且氨基(-O-氨基,其中氨基,例如,NRR,可以是烷基氨基、二烷基氨基、杂环基、芳基氨基、二芳基氨基、杂芳基氨基、或二杂芳基氨基、乙二胺、聚氨基)或氨基烷氧基.
″脱氧″修饰包括氢,氨基(例如NH2;烷基氨基、二烷基氨基、杂环基、芳基氨基、二芳基氨基、杂芳基氨基、二杂芳基氨基、或氨基酸);或氨基可以通过接头连接于糖,其中所述接头包含一个以上原子C、N和O。
糖基团还可以含有一个以上与核糖中相应碳相比具有相反立体化学构象的碳。因此,修饰的核酸分子可以包括含有例如阿拉伯糖作为糖的核苷酸。
骨架修饰:
还可以在可以结合入如本文所述的人工核酸分子,优选RNA的修饰的核苷和核苷酸中进一步修饰磷酸骨架。骨架的磷酸基团可以通过用不同取代基替代一个以上氧原子来修饰。此外,修饰的核苷和核苷酸可以包括用如本文所述的修饰的磷酸酯完全替代未修饰磷酸酯部分。修饰的磷酸基团的实例包括,但不限于,硫代磷酸根、硒代磷酸根(phosphoroselenates)、硼代磷酸根(borano phosphates)、硼代磷酸酯、氢磷酸酯、氨基磷酸酯(phosphoroamidates)、烷基或芳基膦酸酯和磷酸三酯。二硫代磷酸酯的两个未连接氧被硫替代。磷酸酯接头还可以通过用氮(桥接的氨基磷酸酯),硫(桥接的硫代磷酸酯)和碳(桥接的亚甲基-膦酸酯)替代连接的氧而被修饰。
碱基修饰:
如本文所述的可以结合入人工核酸分子,优选RNA分子的修饰的核苷和核苷酸,还可以在核碱基部分被修饰。RNA中发现的核碱基的实例包括,但不限于,腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶。例如,本文中所述的核苷和核苷酸可以在主沟表面被化学修饰。在一些实施方案中,主沟化学修饰可以包括氨基、巯基、烷基、或卤代基团。
在本发明的尤其优选的实施方案中,核苷酸类似物/修饰选自碱基修饰,其优选选自2-氨基-6-氯嘌呤核糖苷-5′-三磷酸酯,2-氨基嘌呤-核糖苷-5′-三磷酸酯;2-氨基腺苷-5′-三磷酸酯,2′-氨基-2′-脱氧胞苷-三磷酸酯,2-硫代胞苷-5′-三磷酸酯,2-硫代尿苷-5′-三磷酸酯,2′-氟胸苷-5′-三磷酸酯,2′-O-甲基次黄苷-5′-三磷酸酯4-硫代尿苷-5′-三磷酸酯,5-氨基烯丙基胞苷-5′-三磷酸酯,5-氨基烯丙基尿苷-5′-三磷酸酯,5-溴胞苷-5′-三磷酸酯,5-溴尿苷-5′-三磷酸酯,5-溴-2′-脱氧胞苷-5′-三磷酸酯,5-溴-2′-脱氧尿苷-5′-三磷酸酯,5-碘胞苷-5′-三磷酸酯,5-碘-2′-脱氧胞苷-5′-三磷酸酯,5-碘尿苷-5′-三磷酸酯,5-碘-2′-脱氧尿苷-5′-三磷酸酯,5-甲基胞苷-5′-三磷酸酯,5-甲基尿苷-5′-三磷酸酯,5-丙炔基-2′-脱氧胞苷-5′-三磷酸酯,5-丙炔基-2′-脱氧尿苷-5′-三磷酸酯,6-氮杂胞苷-5′-三磷酸酯,6-氮杂尿苷-5′-三磷酸酯,6-氯嘌呤核糖苷-5′-三磷酸酯,7-去氮杂腺苷-5′-三磷酸酯,7-去氮杂鸟苷-5′-三磷酸酯,8-氮杂腺苷-5′-三磷酸酯,8-叠氮基腺苷-5′-三磷酸酯,苯并咪唑-核糖苷-5′-三磷酸酯,N1-甲基腺苷-5′-三磷酸酯,N1-甲基鸟苷-5′-三磷酸酯,N6-甲基腺苷-5′-三磷酸酯,O6-甲基鸟苷-5′-三磷酸酯,假尿苷-5′-三磷酸酯,或嘌呤霉素-5′-三磷酸酯,黄苷-5′-三磷酸酯。对核苷酸给出对于选自由5-甲基胞苷-5′-三磷酸酯,7-去氮杂鸟苷-5′-三磷酸酯,5-溴胞苷-5′-三磷酸酯,和假尿苷-5′-三磷酸酯组成的碱基修饰的核苷酸的组的碱基修饰的特别偏爱。
在一些实施方案中,修饰的核苷包括吡啶-4-酮核糖核苷,5-氮杂-尿苷,2-硫代-5-氮杂-尿苷,2-硫代尿苷,4-硫代-假尿苷,2-硫代-假尿苷,5-羟基尿苷,3-甲基尿苷,5-羧基甲基-尿苷,1-羧基甲基-假尿苷,5-丙炔基-尿苷,1-丙炔基-假尿苷,5-牛磺酸甲基尿苷,1-牛磺酸甲基-假尿苷,5-牛磺酸甲基-2-硫代-尿苷,1-牛磺酸甲基-4-硫代-尿苷,5-甲基-尿苷,1-甲基-假尿苷,4-硫代-1-甲基-假尿苷,2-硫代-1-甲基-假尿苷,1-甲基-1-去氮杂-假尿苷,2-硫代-1-甲基-1-去氮杂-假尿苷,二氢尿苷,二氢假尿苷,2-硫代-二氢尿苷,2-硫代-二氢假尿苷,2-甲氧基尿苷,2-甲氧基-4-硫代-尿苷,4-甲氧基-假尿苷,和4-甲氧基-2-硫代-假尿苷。
在一些实施方案中,修饰的核苷包括5-氮杂-胞苷,假异胞苷,3-甲基-胞苷,N4-乙酰基胞苷,5-甲酰基胞苷,N4-甲基胞苷,5-羟基甲基胞苷,1-甲基-假异胞苷,吡咯并-胞苷,吡咯并-假异胞苷,2-硫代-胞苷,2-硫代-5-甲基-胞苷,4-硫代-假异胞苷,4-硫代-1-甲基-假异胞苷,4-硫代-1-甲基-1-去氮杂-假异胞苷,1-甲基-1-去氮杂-假异胞苷,折布拉林(zebularine),5-氮杂-折布拉林,5-甲基-折布拉林,5-氮杂-2-硫代-折布拉林,2-硫代-折布拉林,2-甲氧基-胞苷,2-甲氧基-5-甲基-胞苷,4-甲氧基-假异胞苷,和4-甲氧基-1-甲基-假异胞苷。
在其他实施方案中,修饰的核苷包括2-氨基嘌呤,2,6-二氨基嘌呤,7-去氮杂-腺嘌呤,7-去氮杂-8-氮杂-腺嘌呤,7-去氮杂-2-氨基嘌呤,7-去氮杂-8-氮杂-2-氨基嘌呤,7-去氮杂-2,6-二氨基嘌呤,7-去氮杂-8-氮杂-2,6-二氨基嘌呤,1-甲基腺苷,N6-甲基腺苷,N6-异丙烯基腺苷,N6-(顺式-羟基异丙烯基)腺苷,2-甲基硫代-N6-(顺式-羟基异丙烯基)腺苷,N6-甘氨酰氨甲酰基腺苷,N6-苏氨酰氨甲酰基腺苷,2-甲基硫代-N6-苏氨酰氨甲酰基腺苷,N6,N6-二甲基腺苷,7-甲基腺嘌呤,2-甲基硫代-腺嘌呤,和2-甲氧基-腺嘌呤。
在其他实施方案中,修饰的核苷包括次黄苷,1-甲基-次黄苷,wyosine,wybutosine,7-去氮杂-鸟苷,7-去氮杂-8-氮杂-鸟苷,6-硫代-鸟苷,6-硫代-7-去氮杂-鸟苷,6-硫代-7-去氮杂-8-氮杂-鸟苷,7-甲基-鸟苷,6-硫代-7-甲基-鸟苷,7-甲基次黄苷,6-甲氧基-鸟苷,1-甲基鸟苷,N2-甲基鸟苷,N2,N2-二甲基鸟苷,8-氧代-鸟苷,7-甲基-8-氧代-鸟苷,1-甲基-6-硫代-鸟苷,N2-甲基-6-硫代-鸟苷,和N2,N2-二甲基-6-硫代-鸟苷。
在一些实施方案中,核苷酸可以在主沟表面被修饰,并且可以包括用甲基或卤代基团替代尿嘧啶的C-5上的氢。
在特定实施方案中,修饰的核苷是5′-O-(1-硫代磷酸酯)-腺苷,5′-O-(1-硫代磷酸)-胞苷,5′-O-(1-硫代磷酸)-鸟苷,5′-O-(1-硫代磷酸)-尿苷或5′-O-(1-硫代磷酸)-假尿苷。
在进一步特定的实施方案中,人工核酸分子,优选RNA分子,可以包含选自以下各项的核苷修饰:6-氮杂-胞苷,2-硫代-胞苷,α-硫代-胞苷,假-异-胞苷,5-氨基烯丙基-尿苷,5-碘-尿苷,N1-甲基-假尿苷,5,6-二氢尿苷,α-硫代-尿苷,4-硫代-尿苷,6-氮杂-尿苷,5-羟基-尿苷,脱氧-胸苷,5-甲基-尿苷,吡咯并-胞苷,次黄苷,α-硫代-鸟苷,6-甲基-鸟苷,5-甲基-胞苷,8-氧代-鸟苷,7-去氮杂-鸟苷,N1-甲基-腺苷,2-氨基-6-氯-嘌呤,N6-甲基-2-氨基-嘌呤,假-异-胞苷,6-氯-嘌呤,N6-甲基-腺苷,α-硫代-腺苷,8-叠氮基-腺苷,7-去氮杂-腺苷。
脂修饰:
根据进一步实施方案,如本文定义的人工核酸分子,优选RNA,可以含有脂修饰。该脂-修饰的RNA典型地包含如本文定义的RNA。如本文定义的该脂-修饰的RNA分子典型地还包含至少一个与该RNA分子共价连接的接头,和至少一个与各自的接头共价连接的脂。备选地,脂-修饰的RNA分子包含至少一个如本文定义的RNA分子和至少一个与该RNA分子共价连接(无接头)的(双功能)脂。根据第三个备选方案,脂-修饰的RNA分子包含如本文定义的人工核酸分子,优选RNA分子,至少一个与该RNA分子共价连接的接头,和至少一个与各自的接头共价连接的脂,并且此外至少一个与该RNA分子共价连接(无接头)的(双功能)脂。在该情况下,尤其优选的是,脂修饰存在于线性RNA序列的末端。
修饰的RNA的5’末端的修饰:
根据本发明的另一优选的实施方案,如本文定义的人工核酸分子,优选RNA分子,可以通过加入所谓的″5′帽″结构来修饰。
5′-帽是实体,通常是修饰的核苷酸实体,其通常在成熟mRNA的5’端“加帽”。5′-帽可以典型地由修饰的核苷酸,尤其是由鸟嘌呤核苷酸的衍生物形成。优选地,5’-帽与5’-末端经由5′-5′-三磷酸酯连接来连接。5’-帽可以是甲基化的,例如m7GpppN,其中N是携带5’-帽,典型地RNA的5’-端的核酸的末端5’核苷酸。m7GpppN是由聚合酶II转录的mRNA中天然存在的5’-帽结构并且因此不被认为是包含在根据本发明的修饰的RNA中的修饰。这意为,根据本发明的人工核酸分子,优选RNA分子,可以包含m7GpppN作为5’-帽,但此外,所述人工核酸分子,优选RNA分子,包含至少一个如本文定义的进一步修饰。
5’帽结构的进一步实例包括甘油基,反向脱氧非碱性残基(部分),4’,5’亚甲基核苷酸,1-(β-D-赤呋喃糖基)核苷酸,4’-硫代核苷酸,碳环核苷酸,1,5-失水己糖醇核苷酸,L-核苷酸,α-核苷酸,修饰的碱基核苷酸,苏-戊呋喃糖基核苷酸,无环3’,4’-开环核苷酸,无环3,4-二羟基丁基核苷酸,无环3,5二羟基戊基核苷酸,3’-3’-反向核苷酸部分,3’-3’-反向非碱性部分,3’-2’-反向核苷酸部分,3’-2’-反向非碱性部分,1,4-丁二醇磷酸酯,3’-氨基磷酸酯,磷酸己酯,磷酸氨基己酯,3’-磷酸脂,3’硫代磷酸酯,二硫代磷酸酯,或桥接或非桥接的膦酸甲酯部分。这些修饰的5’-帽结构被认为是根据本发明的人工核酸分子,优选RNA分子中包含的至少一个修饰。
尤其优选的修饰的5’-帽结构是CAP1(m7G的相邻核苷酸的核糖的甲基化),CAP2(m7G下游第二个核苷酸的核糖甲基化),CAP3(m7G下游第三个核苷酸的核糖甲基化),CAP4(m7G下游第四个核苷酸的核糖甲基化),ARCA(抗逆CAP类似物,修饰的ARCA(例如硫代磷酸酯修饰的ARCA),次黄苷,N1-甲基-鸟苷,2’-氟-鸟苷,7-去氮杂-鸟苷,8-氧代-鸟苷,2-氨基-鸟苷,LNA-鸟苷,和2-叠氮基-鸟苷。
在优选的实施方案中,至少一个可读框编码治疗性蛋白或肽。在另一实施方案中,抗原由至少一个可读框,如致病抗原、肿瘤抗原,致敏抗原或自身免疫抗原编码。其中,编码抗原的人工核酸分子的施用用于针对涉及所述抗原的疾病的基因疫苗接种方法。
在备选实施方案中,抗体由根据本发明的人工核酸分子的至少一个可读框编码。
抗原:
致病抗原:
根据本发明的人工核酸分子可以编码这样的蛋白或肽,所述蛋白或肽包含致病抗原或其片段、变体或衍生物。所述致病抗原来源于致病性生物体,特别是细菌、病毒或原生动物(多细胞)致病性生物体,其激发受试者、特别是哺乳动物受试者、更特别是人中的免疫学反应。更特别地,致病抗原优选是表面抗原,例如,位于病毒或细菌或原生动物生物体的表面上的蛋白(或蛋白的片段,例如,表面抗原的外部部分)。
致病抗原是优选来源于与传染病相关的病原体的肽或蛋白抗原,其优选地选自来源于下述病原体的抗原:鲍氏不动杆菌(Acinetobacterbaumannii),无形体属(Anaplasmagenus),Anaplasma phagocytophilum,猫钩虫(Ancylostoma braziliense),十二指肠钩虫(Ancylostoma duodenale),溶血隐秘杆菌(Arcanobacterium haemolyticum),人蛔虫(Ascaris lumbricoides),曲霉菌属(Aspergillus genus),星状病毒科(Astroviridae),巴贝虫属(Babesia genus),炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis),蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus),汉氏巴尔通氏体(Bartonella henselae),BK病毒,人芽囊原虫(Blastocystis hominis),皮炎芽生菌(Blastomyces dermatitidis),百日咳博德特氏菌(Bordetella pertussis),伯氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi),疏螺旋体属(Borreliagenus),疏螺旋体属物种(Borrelia spp),布鲁杆菌属(Brucella genus),马来丝虫(Brugia malayi),布尼亚病毒科(Bunyaviridae family),洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderia cepacia)和其他伯克霍尔德氏菌属物种(Burkholderia species),鼻疽伯克霍尔德氏菌(Burkholderia mallei),类鼻疽伯克霍尔德氏菌(Burkholderia假mallei),嵌杯病毒科(Caliciviridae family),弯曲杆菌属(Campylobacter genus),白色念珠菌(Candida albicans),念珠菌属物种(Candida spp),砂眼衣原体(Chlamydiatrachomatis),肺炎衣原体(Chlamydophila pneumoniae),鹦鹉热衣原体(Chlamydophilapsittaci),CJD朊病毒,华支睾吸虫(Clonorchis sinensis),肉毒梭菌(Clostridiumbotulinum),艰难梭菌(Clostridium difficile),产气荚膜梭菌(Clostridiumperfringens),产气荚膜梭菌,梭菌属物种(Clostridium spp),破伤风梭菌(Clostridiumtetani),球孢菌属物种(Coccidioides spp),冠状病毒(coronaviruses),白喉棒杆菌(Corynebacterium diphtheriae),伯内特考克斯体(Coxiella burnetii),克里米亚-刚果出血热病毒(Crimean-Congo hemorrhagic fever virus),新型隐球菌(Cryptococcusneoformans),隐孢子虫属(Cryptosporidium genus),巨细胞病毒(Cytomegalovirus,CMV),登革热病毒(Dengue viruses)(DEN-1,DEN-2,DEN-3和DEN-4),脆弱双核阿米巴(Dientamoeba fragilis),埃博拉病毒(Ebolavirus,EBOV),棘球属(Echinococcusgenus),恰菲埃里希氏体(Ehrlichia chaffeensis),尤氏埃里希氏体(Ehrlichiaewingii),埃里希氏体属(Ehrlichia genus),溶组织内阿米巴(Entamoeba histolytica),肠球菌属(Enterococcus genus),肠道病毒属(Enterovirus genus),肠道病毒(Enteroviruses),主要为柯萨奇病毒A病毒(mainly Coxsackie A virus)和肠道病毒71(EV71),表皮癣菌属物种(Epidermophyton spp),埃巴病毒(Epstein-Barr Virus,EBV),大肠杆菌(Escherichia coli)O157:H7,O111和O104:H4,肝片形吸虫(Fasciola hepatica)和巨大片形吸虫(Fasciola gigantica),FFI朊病毒,丝虫目超家族(Filarioideasuperfamily),黄病毒(Flaviviruses),土拉热弗朗西丝菌(Francisella tularensis),梭杆菌属(Fusobacterium genus),白地霉(Geotrichum candidum),肠贾第虫(Giardiaintestinalis),颚口线虫属物种(Gnathostoma spp),GSS朊病毒,瓜纳里托病毒(Guanarito virus),杜克雷嗜血杆菌(Haemophilus ducreyi),流感嗜血菌(Haemophilusinfluenzae),幽门螺杆菌(Helicobacter pylori),亨尼病毒属(Henipavirus)(亨德拉病毒(Hendra virus)尼帕病毒(Nipah virus)),甲型肝炎病毒(Hepatitis AVirus),乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV),丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV),丁型肝炎病毒(Hepatitis D Virus),戊型肝炎病毒(Hepatitis E Virus),单纯疱疹病毒(Herpessimplex virus)1和2(HSV-1和HSV-2),荚膜组织胞浆菌(Histoplasma capsulatum),HIV(人免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus)),威尼克何德霉(Hortaeawerneckii),人博卡病毒(Human bocavirus,HBoV),人疱疹病毒6(HHV-6)和人疱疹病毒7(HHV-7),人偏肺病毒(Human metapneumovirus,hMPV),人乳头瘤病毒(Humanpapillomavirus,HPV),人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIV),日本脑炎病毒(Japanese encephalitis virus),JC病毒,胡宁病毒(Junin virus),金氏金氏菌(Kingella kingae),肉芽肿杆菌(Klebsiella granulomatis),库鲁朊病毒(Kuru prion),拉沙病毒(Lassa virus),嗜肺军团病杆菌(Legionella pneumophila),利什曼原虫属(Leishmania genus),钩端螺旋体属(Leptospira genus),单核细胞增生利斯特菌(Listeria monocytogenes),淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(Lymphocyticchoriomeningitis virus,LCMV),Machupo病毒,马拉色霉菌属物种(Malassezia spp),马堡病毒(Marburg virus),麻疹病毒(Measles virus),横川后殖吸虫(Metagonimusyokagawai),微孢子虫门(Microsporidia phylum),传染性软疣病毒(Molluscumcontagiosum virus,MCV),腮腺炎病毒(Mumps virus),麻风分枝杆菌(Mycobacteriumleprae)和Mycobacterium lepromatosis,结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis),溃疡分枝杆菌(Mycobacterium ulcerans),肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae),福氏耐格里原虫(Naegleria fowleri),美洲板口线虫(Necator americanus),淋病奈瑟球菌(Neisseria gonorrhoeae),脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis),星状诺卡尔菌(Nocardia asteroides),诺卡尔菌属物种(Nocardia spp),旋盘尾丝虫(Onchocercavolvulus),恙虫热立克次体(Orientia tsutsugamushi),正粘病毒科(Orthomyxoviridaefamily)(流感(Influenza)),巴西副球孢子菌(Paracoccidioides brasiliensis),并殖吸虫属物种(Paragonimus spp),卫斯特曼并殖吸虫(Paragonimus westermani),细小病毒(Parvovirus)B19,巴斯德菌属(Pasteurella genus),疟原虫属(Plasmodium genus),杰氏肺囊虫(Pneumocystis jirovecii),脊髓灰质炎病毒(Poliovirus),狂犬病病毒(Rabiesvirus),呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV),鼻病毒属(Rhinovirus),鼻病毒(rhinoviruses),痘立克次体(Rickettsia akari),立克次体属(Rickettsiagenus),普氏立克次体(Rickettsia prowazekii),立氏立克次体(Rickettsiarickettsii),斑疹伤寒立克次体(Rickettsia typhi),裂谷热病毒(Rift Valley fevervirus),轮状病毒属(Rotavirus),风疹病毒(Rubella virus),萨比亚病毒(Sabia virus),沙门菌属(Salmonella genus),疥螨(Sarcoptes scabiei),SARS冠状病毒(SARScoronavirus),血吸虫属(Schistosoma genus),志贺菌属(Shigella genus),辛诺柏病毒(Sin Nombre virus),汉坦病毒属(Hantavirus),申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii),葡萄球菌属(Staphylococcus genus),葡萄球菌属,无乳链球菌(Streptococcusagalactiae),肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae),酿脓链球菌(Streptococcuspyogenes),粪类圆线虫(Strongyloides stercoralis),绦虫属(Taenia genus),猪肉绦虫(Taenia solium),蜱传脑炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV),犬弓蛔线虫(Toxocara canis)或猫弓蛔虫(Toxocara cati),鼠弓形虫(Toxoplasma gondii),苍白密螺旋体(Treponema pallidum),旋毛线虫(Trichinella spiralis),阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis),发癣菌属物种(Trichophyton spp),鞭形鞭虫(Trichuristrichiura),布鲁斯锥虫(Trypanosoma brucei),克鲁斯锥虫(Trypanosoma cruzi),尿素分解尿素支原体(Ureaplasma urealyticum),水痘-带状疱疹病毒(Varicella zostervirus,VZV),水痘-带状疱疹病毒(VZV),重型天花(Variola major)或类天花(Variolaminor),vCJD朊病毒,委内瑞拉马脑炎病毒(Venezuelan equine encephalitis virus),霍乱弧菌(Vibrio cholerae),西尼罗河病毒(West Nile virus),西部马脑炎病毒(Westernequine encephalitis virus),班氏吴策线虫(Wuchereria bancrofti),黄热病病毒(Yellow fever virus),小肠结肠炎耶尔森氏菌(Yersinia enterocolitica),鼠疫耶尔森氏菌(Yersinia pestis)和假结核耶尔森氏菌(Yersinia pseudotuberculosis)。
在这一情形中,特别优选的是来自选自下述的病原体的抗原:流感病毒(Influenza virus),呼吸道合胞病毒(RSV),单纯疱疹病毒(HSV),人乳头瘤病毒(HPV),人免疫缺陷病毒(HIV),疟原虫属(Plasmodium),金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),登革热病毒,砂眼衣原体(Chlamydia trachomatis),巨细胞病毒(CMV),乙型肝炎病毒(HBV),结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis),狂犬病病毒和黄热病病毒。
肿瘤抗原:
在进一步实施方案中,根据本发明的人工核酸分子可以编码蛋白或肽,其包含包含肿瘤抗原,所述肿瘤抗原的片段、变体或衍生物的肽或蛋白,优选为,其中所述肿瘤抗原是黑素细胞特异的抗原、癌-睾丸抗原或肿瘤特异的抗原,优选为CT-X抗原、非-X CT-抗原、对于CT-X抗原的结合伙伴或对于非-X CT-抗原或肿瘤特异的抗原的结合伙伴,更优选为CT-X抗原、对于非-X CT-抗原或肿瘤特异的抗原的结合伙伴或所述肿瘤抗原的片段、变体或衍生物;并且其中各个核酸序列编码不同肽或蛋白;并且其中至少一个核酸序列编码5T4、707-AP、9D7、AFP、AlbZIP HPG1、α-5-β-1-整联蛋白、α-5-β-6-整联蛋白、α-辅肌动蛋白-4/m、α-甲基酰基-辅酶A消旋酶、ART-4、ARTC1/m、B7H4、BAGE-1、BCL-2、bcr/abl、β-联蛋白/m、BING-4、BRCA1/m、BRCA2/m、CA 15-3/CA 27-29、CA 19-9、CA72-4、CA125、钙网蛋白、CAMEL、CASP-8/m、组织蛋白酶B、组织蛋白酶L、CD19、CD20、CD22、CD25、CDE30、CD33、CD4、CD52、CD55、CD56、CD80、CDC27/m、CDK4/m、CDKN2A/m、CEA、CLCA2、CML28、CML66、COA-1/m、coactosin-样蛋白、胶原XXIII、COX-2、CT-9/BRD6、Cten、细胞周期蛋白B1、细胞周期蛋白D1、cyp-B、CYPB1、DAM-10、DAM-6、DEK-CAN、EFTUD2/m、EGFR、ELF2/m、EMMPRIN、EpCam、EphA2、EphA3、ErbB3、ETV6-AML1、EZH2、FGF-5、FN、Frau-1、G250、GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE7b、GAGE-8、GDEP、GnT-V、gp100、GPC3、GPNMB/m、HAGE、HAST-2、hepsin、Her2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A*0201-R17I、HLA-A11/m、HLA-A2/m、HNE、同源框NKX3.1、HOM-TES-14/SCP-1、HOM-TES-85、HPV-E6、HPV-E7、HSP70-2M、HST-2、hTERT、iCE、IGF-1R、IL-13Ra2、IL-2R、IL-5、不成熟层粘连蛋白受体、激肽释放酶-2、激肽释放酶-4、Ki67、KIAA0205、KIAA0205/m、KK-LC-1、K-Ras/m、LAGE-A1、LDLR-FUT、MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-B1、MAGE-B2、MAGE-B3、MAGE-B4、MAGE-B5、MAGE-B6、MAGE-B10、MAGE-B16、MAGE-B17、MAGE-C1、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE-D1、MAGE-D2、MAGE-D4、MAGE-E1、MAGE-E2、MAGE-F1、MAGE-H1、MAGEL2、乳腺珠蛋白A、MART-1/melan-A、MART-2、MART-2/m、基质蛋白22、MC1R、M-CSF、ME1/m、间皮素(mesothelin)、MG50/PXDN、MMP11、MN/CA IX-抗原、MRP-3、MUC-1、MUC-2、MUM-1/m、MUM-2/m、MUM-3/m、I型肌球蛋白I/m、NA88-A、N-乙酰基葡糖胺基转移酶-V、Neo-PAP、Neo-PAP/m、NFYC/m、NGEP、NMP22、NPM/ALK、N-Ras/m、NSE、NY-ESO-1、NY-ESO-B、OA1、OFA-iLRP、OGT、OGT/m、OS-9、OS-9/m、骨钙素、骨桥蛋白、p15、p190小bcr-abl、p53、p53/m、PAGE-4、PAI-1、PAI-2、PAP、PART-1、PATE、PDEF、Pim-1-激酶、Pin-1、Pml/PARα、POTE、PRAME、PRDX5/m、prostein、蛋白酶-3、PSA、PSCA、PSGR、PSM、PSMA、PTPRK/m、RAGE-1、RBAF600/m、RHAMM/CD168、RU1、RU2、S-100、SAGE、SART-1、SART-2、SART-3、SCC、SIRT2/m、Sp17、SSX-1、SSX-2/HOM-MEL-40、SSX-4、STAMP-1、STEAP-1、存活蛋白、存活蛋白-2B、SYT-SSX-1、SYT-SSX-2、TA-90、TAG-72、TARP、TEL-AML1、TGFβ、TGFβRII、TGM-4、TPI/m、TRAG-3、TRG、TRP-1、TRP-2/6b、TRP/INT2、TRP-p8、酪氨酸酶、UPA、VEGFR1、VEGFR-2/FLK-1、WT1和淋巴血细胞的免疫球蛋白独特型或淋巴血细胞的T细胞受体独特型,或所述肿瘤抗原片段、变体或衍生物;优选为存活蛋白或其类似物,MAGE-家族的抗原或其结合伙伴或所述肿瘤抗原的片段、变体或衍生物。尤其是优选在该情况下是肿瘤抗原NY-ESO-1、5T4、MAGE-C1、MAGE-C2、存活蛋白、Muc-1、PSA、PSMA、PSCA、STEAP和PAP。
在优选的实施方案中,人工核酸分子编码蛋白或肽,其包含治疗性蛋白或其片段、变体或衍生物。
本文定义的治疗性蛋白是有益于任何遗传或获得性疾病的治疗或改善个体的状况的肽或蛋白。具体地,除其他功能外,治疗性蛋白在产生可以修饰并修复遗传错误、破坏癌细胞或病原体感染的细胞、治疗免疫系统病症、治疗代谢或内分泌病症的治疗剂方面起重要作用。例如,红细胞生成素(EPO)(一种蛋白激素)可以用于治疗患有红细胞缺陷(erythrocyte deficiency)的患者,其是肾脏并发症的常见原因。此外,治疗性蛋白涵盖佐剂蛋白、治疗性抗体,以及例如用于绝经期妇女的治疗中的激素替代疗法。在最近的方法中,利用患者的体细胞来使其重新编程为多能干细胞,所述多能干细胞替代有争议的干细胞疗法。此外,用于使体细胞重新编程或用于使干细胞分化的这些蛋白在本文中定义为治疗性蛋白。此外,治疗性蛋白可以用于其他目的,例如,伤口愈合、组织再生、血管发生等。此外,抗原特异的B细胞受体和其片段和变体在本文中定义为治疗性蛋白。
因此,治疗性蛋白可以用于多利目的,包括多种疾病的治疗,所述疾病如例如,传染病、肿瘤(例如,癌症或肿瘤疾病)、血液和血液形成器官的疾病、内分泌、营养和代谢病、神经系统的疾病、循环系统的疾病、呼吸系统的疾病、消化系统的疾病、皮肤和皮下组织的疾病、肌肉骨骼系统和结缔组织的疾病和生殖泌尿系统的疾病,不管其是遗传的还是获得性的。
在这一情形中,可以用于包括代谢或内分泌病症的治疗的特别优选的治疗性蛋白选自(括号中是在治疗中使用治疗性蛋白的具体的疾病):酸性鞘磷脂酶(尼曼-皮克病(Niemann-Pick disease)),Adipotide(肥胖(obesity)),Agalsidase-β(人半乳糖苷酶A(human galactosidase A)法布里病(Fabry disease;防止可能导致肾脏和心血管并发症的脂肪累积)),Alglucosidase(庞贝病(Pompe disease)糖原贮积症II型(glycogenstorage disease type II)),α-半乳糖苷酶A(α-GAL A,Agalsidaseα)(法布里病),α-葡糖苷酶(糖原贮积症(Glycogen storage disease,GSD),Morbus Pompe),α-L-艾杜糖苷酸酶(黏多糖贮积症(mucopolysaccharidoses,MPS),胡尔勒综合征(Hurler syndrome),沙伊综合征(Scheie syndrome)),α-N-乙酰葡糖苷酶(桑菲利波综合征(Sanfilippo syndrome)),双调蛋白(癌症,代谢紊乱(metabolic disorder)),血管生成素((Ang1,Ang2,Ang3,Ang4,ANGPTL2,ANGPTL3,ANGPTL4,ANGPTL5,ANGPTL6,ANGPTL7)(血管发生,稳定血管),β动物纤维素(代谢紊乱(metabolic disorder)),β-葡糖醛酸糖苷酶(斯赖综合征(Sly syndrome)),骨形态发生蛋白BMPs(BMP1,BMP2,BMP3,BMP4,BMP5,BMP6,BMP7,BMP8a,BMP8b,BMP10,BMP15)(再生性作用,骨骼相关的病症,慢性肾病(chronic kidney disease,CKD)),CLN6蛋白(CLN6疾病-非典型性晚期婴儿期,晚期发作的变体,青少年早期,神经元蜡样脂脂褐质沉积症(Neuronal Ceroid Lipofuscinoses,NCL)),表皮生长因子(EGF)(伤口愈合,调节细胞生长、增殖和分化),Epigen(代谢紊乱),表皮调节素(代谢紊乱),成纤维细胞生长因子(FGF,FGF-1,FGF-2,FGF-3,FGF-4,FGF-5,FGF-6,FGF-7,FGF-8,FGF-9,FGF-10,FGF-11,FGF-12,FGF-13,FGF-14,FGF-16,FGF-17,FGF-17,FGF-18,FGF-19,FGF-20,FGF-21,FGF-22,FGF-23)(伤口愈合,血管发生,内分泌紊乱,组织再生),Galsulphase(黏多糖贮积症IV(Mucopolysaccharidosis VI)),葛瑞林(Ghrelin)(肠易激综合征(irritable bowelsyndrome,IBS),肥胖,普拉德-威利综合征(Prader-Willi syndrome),II型糖尿病(typeII diabetes mellitus)),葡糖脑苷脂酶(戈谢病(Gaucher′s disease)),GM-CSF(再生作用,产生白血细胞,癌症),肝素-结合EGF-样蛋白生长因子(HB-EGF)(伤口愈合,心脏肥大(cardiac hypertrophy)和心脏发育与功能),肝细胞生长因子HGF(再生作用,伤口愈合),Hepcidin(铁代谢紊乱(iron metabolism disorders),β-地中海贫血(Beta-thalassemia)),人白蛋白(减少的白蛋白产生(低蛋白血症(hypoproteinaemia)),增加的白蛋白损失(肾病综合征(nephrotic syndrome)),低血容量症(hypovolaemia),高胆红素血症(hyperbilirubinaemia)),艾度硫酸酯酶(Idursulphase)(艾杜糖醛酸-2-硫酸酯酶)(黏多糖贮积症II(Mucopolysaccharidosis II)(亨特综合征(Hunter syndrome))),整联蛋白αVβ3,αVβ5和α5β1(结合基质大分子和蛋白酶,血管发生),艾杜糖醛酸硫酸酯酶(亨特综合征(Hunter syndrome)),拉罗尼酶(Laronidase)(胡尔勒和胡尔勒-沙伊形式的黏多糖贮积症I(Hurler and Hurler-Scheie forms of mucopolysaccharidosis I)),N-乙酰半乳糖胺-4-硫酸酯酶(rhASB;galsulfase,芳基硫酸酯酶A(ARSA),芳基硫酸酯酶B(ARSB))(芳基硫酸酯酶B缺陷,马洛托-拉梅综合征(Maroteaux-Lamy syndrome),黏多糖贮积症VI(mucopolysaccharidosis VI)),N-乙酰葡糖胺-6-硫酸酯酶(桑菲利波综合征(Sanfilipposyndrome)),神经生长因子(NGF,脑源性神经营养因子(BDNF),神经营养因子-3(NT-3),和神经营养因子4/5(NT-4/5)(再生作用,心血管病(cardiovascular diseases),冠状动脉动脉粥样硬化(coronary atherosclerosis),肥胖,2型糖尿病,代谢综合征,急性冠状动脉综合征(acute coronary syndromes),痴呆(dementia),抑郁(depression),精神分裂症(schizophrenia),孤独症(autism),雷特综合征(Rett syndrome),神经性厌食症(anorexia nervosa),神经性贪食症(bulimia nervosa),伤口愈合,皮肤溃疡(skinulcers),角膜溃疡(corneal ulcers),阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease)),神经调节蛋白(NRG1,NRG2,NRG3,NRG4)(代谢紊乱,精神分裂症),神经毡蛋白(NRP-1,NRP-2)(血管发生,轴突导向,细胞存活,迁移),肥胖抑制素(Obestatin)(肠易激综合征(irritable bowelsyndrome,IBS),肥胖,普拉德-威利综合征(Prader-Willi syndrome),II型糖尿病),血小板衍生生长因子(PDGF(PDFF-A,PDGF-B,PDGF-C,PDGF-D)(再生作用,伤口愈合,血管发生中的紊乱(disorder in angiogenesis),动脉硬化(Arteriosclerosis),纤维化(Fibrosis),癌症),TGFβ受体(内皮因子,TGF-β1受体,TGF-β2受体,TGF-β3受体)(肾纤维化(renalfbrosis),肾病(kidney disease),糖尿病(diabetes),终末期肾病(ultimately end-stage renal disease,ESRD),血管发生),血小板生成素(THPO)(巨核细胞生长和发育因子(Megakaryocyte growth and development factor,MGDF))(血小板病症(plateletsdisorders),献血用血小板(platelets for donation),骨髓抑制性化疗后血小板计数的恢复),转化生长因子(TGF(TGF-α,TGF-β(TGFβ1,TGFβ2和TGFβ3)))(再生作用,伤口愈合,免疫性,癌症,心脏疾病,糖尿病,马方综合征(Marfan syndrome),Loeys-Dietz综合征(Loeys-Dietz syndrome)),VEGF(VEGF-A,VEGF-B,VEGF-C,VEGF-D,VEGF-E,VEGF-F undPIGF)(再生作用,血管发生,伤口愈合,癌症,渗透性),奈西立肽(Nesiritide)(急性代偿失调性充血性心力衰竭(Acute decompensated congestive heart failure)),胰蛋白酶(褥疮溃疡(Decubitus ulcer),静脉曲张性溃疡(varicose ulcer),焦痂清创(debridementof eschar),裂开性伤口(dehiscent wound),晒伤(sunburn),胎粪性肠梗阻(meconiumileus)),促肾上腺皮质激素(adrenocorticotrophic hormone,ACTH)(艾迪生病(″Addison′s disease),小细胞癌(Small cell carcinoma),肾上腺脑白质营养不良(Adrenoleukodystrophy),先天性肾上腺增生(Congenital adrenal hyperplasia),库欣综合征(Cushing′s syndrome),纳尔逊综合征(Nelson′s syndrome),婴儿痉挛(Infantilespasms)),心房钠尿肽(Atrial-natriuretic peptide,ANP)(内分泌紊乱(endocrinedisorders)),胆囊收缩素(Cholecystokinin)(不同的),低胃泌素血症(hypogastrinemia),瘦蛋白(糖尿病,高甘油三酯血症(hypertriglyceridemia),肥胖),催产素(刺激人乳喂养,分娩的不进展(non-progression of parturition)),生长抑素(类癌综合征(carcinoid syndrome)、急性静脉曲张破裂出血(acute variceal bleeding)和肢端肥大症(acromegaly),肝肾多囊性病(polycystic diseases of the liver andkidney),肢端肥大症和由神经内分泌瘤(neuroendocrine tumors)引起的症状的对症治疗),加压素(Vasopressin)(抗利尿激素)(尿崩症(diabetes insipidus)),降钙素(Calcitonin)(绝经后骨质疏松(Postmenopausal osteoporosis),高钙血症(Hypercalcaemia),佩吉特病(Paget′s disease),骨转移(Bone metastases),幻肢痛(Phantom limb pain),椎管狭窄(Spinal Stenosis)),Exenatide(对二甲双胍(metformin)和磺脲(sulphonylurea)治疗有耐药性的2型糖尿病),生长激素(Growthhormone,GH),生长素(somatotropin)(由于GH不足(GH deficiency)或慢性肾功能不全(chronic renal insufficiency)、普拉德-威利综合征(Prader-Willi syndrome)、特纳综合征(Turner syndrome)、艾滋病消瘦(AIDS wasting)或使用抗病毒疗法的恶病质(cachexia)导致的生长不足(Growth failure)),胰岛素(糖尿病,糖尿病酮症酸中毒(diabetic ketoacidosis),高钾血症(hyperkalaemia)),胰岛素样生长因子1IGF-1(具有GH基因缺失或严重的原发性IGF1不足(severe primary IGF1 deficiency)的儿童生长不足,神经变性疾病(neurodegenerative disease),心血管疾病(cardiovasculardiseases),心力衰竭(heart failure)),Mecasermin rinfabate,IGF-1类似物(具有GH基因缺失或严重的原发性IGF1不足的儿童生长不足,神经变性疾病,心血管疾病,心力衰竭),美卡舍明(Mecasermin),IGF-1类似物(有GH基因缺失或严重的原发性IGF1不足的儿童生长不足,神经变性疾病,心血管疾病,心力衰竭),培维索孟(Pegvisomant)(肢端肥大症),普兰林肽(Pramlintide)(糖尿病,与胰岛素组合),特立帕肽(Teriparatide)(人甲状旁腺素残基1-34)(严重的骨质疏松症(Severe osteoporosis)),贝卡普勒明(Becaplermin)(糖尿病性溃疡(diabetic ulcers)辅助性清创术(Debridement)),Dibotermin-α(骨形态发生蛋白2)(脊柱融合手术(Spinal fusion surgery),骨损伤修复(bone injury repair)),醋酸组氨瑞林(Histrelin acetate)(促性腺素释放激素(gonadotropin releasing hormone;GnRH))(早熟青春期(Precocious puberty)),奥曲肽(Octreotide)(肢端肥大症,VIP-分泌腺瘤(VIP-secreting adenoma)和转移性类癌肿瘤(metastatic carcinoid tumours)的症状缓和),和帕利夫明(Palifermin)(角质形成细胞生长因子(keratinocyte growthfactor;KGF))(经历化疗的患者中的严重的口粘膜炎(Severe oral mucositis),伤口愈合)。
这些和其他的蛋白应该理解为是治疗性的,原因在于其旨在通过以充分的量替代其功能蛋白的缺陷性内源产生而治疗受试者。因此,所述治疗性蛋白典型地是哺乳动物蛋白,特别是人蛋白。
为了治疗血液病症、循环系统的疾病、呼吸系统的疾病、癌症或肿瘤疾病、传染病或免疫缺陷,可以使用下述治疗性蛋白:阿替普酶(Alteplase)(组织型纤溶酶原激活物(tissue plasminogen activator;tPA))(肺栓塞(Pulmonary embolism),心肌梗死(myocardial infarction),急性局部缺血性卒中(acute ischaemic stroke),中央静脉通路装置的阻塞(occlusion of central venous access devices)),阿尼普酶(Anistreplase)(溶栓(Thrombolysis)),抗凝血酶III(AT-III)(遗传性AT-III不足(Hereditary AT-III deficiency),血栓栓塞(Thromboembolism)),比伐卢定(Bivalirudin)(冠状动脉血管成形术(coronary angioplasty)和肝素诱发的血小板减少症(heparin-induced thrombocytopaenia)中减少的血液凝结危险),达贝泊汀α(Darbepoetin-α)(治疗患有慢性肾功能不全(chronic renal insufficiency)和慢性肾衰竭(肾功能不全)(+/-透析)的患者的贫血症(anaemia)),屈曲克凝α(Drotrecogin-α)(活化的蛋白C)(具有高死亡危险的严重败血症(Severe sepsis)),促红细胞生成素,依泊汀α(Epoetin-α),促血红细胞生长素,红细胞生成素(erthropoyetin)(慢性疾病的贫血症,myleodysplasia,由于肾衰竭或化疗导致的贫血,术前准备),因子IX(血友病B(Haemophilia B)),因子VIIa(患有血友病A或B的患者中的出血和因子VIII或因子IX的抑制剂),因子VIII(血友病A(Haemophilia A)),来匹卢定(Lepirudin)(肝素诱发的血小板减少症(Heparin-induced thrombocytopaenia)),蛋白质C浓缩剂(静脉血栓形成(Venousthrombosis),暴发性紫癜(Purpura fulminans)),瑞替普酶(Reteplase)(tPA的缺失突变蛋白)(急性心肌梗死(acute myocardial infarction)的管理,心室功能的改善),链激酶(急性进展性透壁性心肌梗死(Acute evolving transmural myocardial infarction),肺栓塞(pulmonary embolism),深静脉血栓形成(deep vein thrombosis),动脉血栓形成(arterial thrombosis)或栓塞(embolism),动静脉插管闭塞(occlusion ofarteriovenous cannula)),替奈普酶(Tenecteplase)(急性心肌梗死),尿激酶(肺栓塞),血管抑素(癌症),抗-CD22免疫毒素(复发的CD33+急性髓性白血病(Relapsed CD33+acutemyeloid leukaemia)),地尼白介素-毒素连接物(Denileukin diftitox)(皮肤T细胞淋巴瘤(Cutaneous T-cell lymphoma,CTCL)),Immunocyanin(膀胱和前列腺癌(bladder andprostate cancer)),MPS(Metallopanstimulin)(癌症),Aflibercept(非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC),转移性结直肠癌(metastatic colorectal cancer,mCRC),激素难治性转移性前列腺癌(hormone-refractory metastatic prostatecancer),湿性黄斑变性(wet macular degeneration)),内皮抑素(Endostatin)(癌症,炎性疾病,如类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis)以及克罗恩病(Crohn’s disease),糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy),银屑病(psoriasis)和子宫内膜异位症(endometriosis)),胶原酶(慢性皮肤溃疡(chronic dermal ulcers)和严重烧伤区域(severely burned areas)的清创术,迪皮特朗挛缩(Dupuytren′s contracture),佩罗尼病(Peyronie′s disease)),人脱氧核糖核酸酶I,链道酶(dornase)(囊性纤维化(Cysticfibrosis);减少所选的患有FVC的患者中的呼吸道感染,大于预测的40%),透明质酸酶(用作佐剂以增加注射的药物的吸收和分散,特别是眼科手术中的麻醉剂和特定的成像剂的吸收和分散),木瓜蛋白酶(坏死组织的清创或急性和慢性损伤中腐肉的软化,诸如压力性溃疡(pressure ulcers),曲张性和糖尿病性溃疡(varicose and diabetic ulcers),烧伤(burns),术后伤口(postoperative wounds),藏毛囊肿伤口(pilonidal cyst wounds),痈(carbuncles),以及其他伤口),L-天冬酰胺酶(急性淋巴性白血病(Acute lymphocyticleukaemia),其需要外源性天冬酰胺进行增殖),Peg-天冬酰胺酶(急性淋巴性白血病,其需要外源性天冬酰胺进行增殖),拉布立酶(Rasburicase)(患有白血病(leukaemia)、淋巴瘤(lymphoma)和实体瘤的正在进行引起肿瘤溶解综合征(tumour lysis syndrome)的抗癌疗法的儿科患者),人慢性促性腺素(Human chorionic gonadotropin,HCG)(辅助的生殖),人促卵泡激素(follicle-stimulating hormone,FSH)(辅助的生殖),促黄体素-α(Lutropin-α)(具有促黄体激素不足的不育(Infertility with luteinizing hormonedeficiency)),催乳素(低泌乳素血症(Hypoprolactinemia),血清催乳素不足(serumprolactin deficiency),妇女卵巢功能不全(ovarian dysfunction in women),焦虑(anxiety),动脉生成性勃起功能障碍(arteriogenic erectile dysfunction),早泄(premature ejaculation),精子减少症(oligozoospermia),精子活力不足(asthenospermia),精囊功能不良(hypofunction of seminal vesicles),男性的雄激素缺乏症(hypoandrogenism)),α-1-蛋白酶抑制剂(先天性抗胰蛋白酶缺乏(Congenitalantitrypsin deficiency)),乳糖酶(由于乳糖消化不能(inability to digest lactose)引起的胀气(Gas)、胃气胀(bloating)、痛性痉挛(cramps)和腹泻(diarrhoea)),胰酶(脂肪酶,淀粉酶,蛋白酶(protease))(囊性纤维化,慢性胰腺炎(chronic pancreatitis),胰腺功能不全(pancreatic insufficiency),Billroth II胃分流术后(post-Billroth IIgastric bypass surgery),胰管阻塞(pancreatic duct obstruction),脂肪泻(steatorrhoea),消化不良(poor digestion),胀气(gas),胃气胀(bloating)),腺苷脱氨酶(牛培加酶(pegademase bovine,PEG-ADA))(由于腺苷脱氨酶不足导致的严重组合性免疫缺陷疾病(Severe combined immunodeficiency disease)),阿巴他塞(Abatacept)(类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis)(尤其是当耐受TNFo抑制时)),阿来法塞(Alefacept)(斑块状银屑病(Plaque Psoriasis)),阿那白滞素(Anakinra)(类风湿性关节炎),依那西普(Etanercept)(类风湿性关节炎,多关节病程幼年型类风湿关节炎(polyarticular-course juvenile rheumatoid arthritis),银屑病关节炎(psoriaticarthritis),强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis),斑块状银屑病,强直性脊柱炎),白细胞介素-1(IL-1)受体拮抗剂,阿那白滞素(Anakinra)(与类风湿关节炎相关的炎症和软骨降解(cartilage degradation)),胸腺素(Thymulin)(神经变性病(neurodegenerativediseases),风湿病(rheumatism),神经性厌食症(anorexia nervosa)),TNF-α拮抗剂(自身免疫病症,诸如类风湿性关节炎,强直性脊柱炎,克罗恩病,银屑病,化脓性汗腺炎(hidradenitis suppurativa),难治性哮喘(refractory asthma)),恩夫韦肽(Enfuvirtide)(HIV-1感染)和胸腺素α1(乙型和丙型肝炎(Hepatitis B and C))。
(括号中是在治疗中使用所述治疗性蛋白的具体的疾病)
在一个进一步的方面,本发明提供一种载体,所述载体包含
a.可读框(ORF)和/或克隆位点,所述克隆位点例如用于可读框或包含可读框的序列的插入;
b.至少一个3′-非翻译区元件(3′-UTR元件),所述3′-非翻译区元件包含源自核糖体蛋白基因的3′-UTR的核酸序列。
对于根据本发明的人工核酸分子,所述至少一个3′-UTR元件和所述ORF为如上文描述的。所述克隆位点可以是适于引入可读框或包含可读框的序列的任何序列,比如一种以上限制位点。因此,包含克隆位点的载体优选适于将可读框插入所述载体,优选适于将可读框插入3′-UTR元件的5′。优选所述克隆位点或所述ORF位于3′-UTR元件的5′,优选紧邻3′-UTR元件的5′端。例如,所述克隆位点或所述ORF可以紧接于所述3′-UTR元件的5′端或它们可以通过如上文描述的用于根据本发明的人工核酸分子的一段核苷酸,比如通过一段2,4,6,8,10,20等个核苷酸连接。
优选根据本发明的载体适于例如,通过任选地将可读框或包含可读框的序列插入载体并转录所述载体生产根据本发明的人工核酸分子,优选适于生产根据本发明的人工mRNA。因此,优选地,所述载体包含转录所需的元件,如启动子,例如RNA聚合酶启动子。优选地,所述载体适于使用真核、原核、病毒或噬菌体转录系统,如真核细胞、原核细胞,或真核、原核、病毒或噬菌体体外转录系统转录。因此,例如,所述载体可以包含启动子序列,所述启动子序列被聚合酶,如RNA聚合酶,例如真核、原核、病毒、或噬菌体RNA聚合酶识别。在一个优选的实施方案中,所述载体包含噬菌体RNA聚合酶启动子如SP6、Ts或T7,优选T7启动子。优选地,所述载体适于使用基于噬菌体的体外转录系统,如基于T7RNA聚合酶的体外转录系统体外转录。
在另一优选的实施方案中,载体可以直接用于在细胞或组织中表达编码的肽或蛋白。为此,载体包含在那些细胞/组织例如特定启动子序列中所必需的特定元件,如CMV启动子。
所述载体还可以包含如上文对于根据本发明的人工核酸分子描述的聚腺苷酸序列和/或聚腺苷酸化信号。
所述载体可以是RNA载体或DNA载体。优选地,所述载体是DNA载体。所述载体可以是技术人员已知的任何载体,如病毒载体或质粒载体。优选地,所述载体是质粒载体,优选DNA质粒载体。
在一个优选的实施方案中,根据本发明的载体包含根据本发明的人工核酸分子。
在一个实施方案中,根据本发明的DNA载体包含与核糖体蛋白基因的3’-UTR的核酸序列,如与根据SEQ ID NOs:10至115的核酸序列具有至少约1,2,3,4,5,10,15,20,30或40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%,最优选100%的同一性的核酸序列。
优选地,根据本发明的DNA载体包含根据SEQ ID No.1、SEQ ID No.3的序列,与SEQID No.7互补的序列或与如上文所述的根据SEQ ID No.1,SEQ ID No.3,SEQ ID No.7的核酸序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%;甚至更优选至少约99%序列同一性的序列,或其片段,优选其功能性片段。
优选地,根据本发明的RNA载体包含根据SEQ ID No.2,SEQ ID No.4,SEQ ID No.7的序列或与根据SEQ ID No.2,SEQ ID No.4,SEQ ID No.7的核酸序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%;甚至更优选至少约99%序列同一性的序列,或其片段,优选其功能性片段。
优选地,所述载体是环状分子。优选地,所述载体是双链分子,如双链DNA分子。此种环状,优选双链DNA分子对于本发明的人工核酸分子可以作为储存形式方便使用。此外,其可以用于转染细胞,例如,培养的细胞。其还可以用于体外转录以获得根据本发明的人工RNA分子。
优选地,所述载体,优选环状载体是例如,通过限制性酶消化线性化的。在一个优选的实施方案中,所述载体包含切割位点,如限制性位点,优选独特的切割位点,所述切割位点紧位于3′-UTR元件的3′,或-如果存在-位于聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号的3′,或-如果存在-位于聚胞苷酸序列的3′,或-如果存在-位于组蛋白茎环的3′。因此,优选通过线性化载体获得的产物在3′末端以3′-UTR元件的3′端,或-如果存在-以聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号的3′端,或-如果存在-以聚胞苷酸序列的3′端终止。在该实施方案中,其中根据本发明的载体包含根据本发明的人工核酸分子,限制位点,优选独特限制位点,所述限制位点优选紧位于人工核酸分子的3′端的3′。
在一个进一步地方面,本发明涉及一种细胞,所述细胞包含根据本发明的人工核酸分子或根据本发明的载体。所述细胞可以是任何细胞,如细菌细胞,昆虫细胞,植物细胞,脊椎动物细胞,例如哺乳动物细胞。此种细胞可以,例如,用于本发明的载体的复制,例如,在细菌细胞中。此外,所述细胞可以用于转录根据本发明的人工核酸分子或载体和/或翻译根据本发明的人工核酸分子或载体的可读框。例如,所述细胞可以用于重组蛋白生产。
根据本发明的细胞可,例如,通过标准核酸转移方法,如标准转染、转导或转化方法获得。例如,可以将根据本发明的人工核酸分子或载体通过电穿孔,脂转染,例如基于阳离子脂和/或脂质体,磷酸钙沉淀,基于纳米粒子的转染,基于病毒的转染,或基于阳离子聚合物,如DEAE-葡聚糖或聚乙烯亚胺等转入所述细胞。
优选地,所述细胞是哺乳动物细胞,如人受试者,家畜,实验室动物,如小鼠或大鼠细胞。优选所述细胞是人细胞。所述细胞可以是建立的细胞系的细胞,如CHO,BHK,293T,COS-7,HELA,HEK等,或所述细胞可以是原代细胞,比如人皮肤成纤维细胞HDF细胞等,优选分离自生物体的细胞。在一个优选的实施方案中,所述细胞是哺乳动物受试者,优选人受试者的分离的细胞。例如,所述细胞可以是优选哺乳动物受试者,优选人受试者的免疫细胞,如树突细胞,癌症或肿瘤细胞,或任何体细胞等。
在一个进一步地方面,本发明提供一种药物组合物,所述药物组合物包含根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,或根据本发明的细胞。根据本发明的药物组合物可以用作,例如疫苗,例如用于基因接种。因此,所述ORF可以,例如,编码将要施用于患者用于疫苗接种的抗原。因此,在一个优选的实施方案中,根据本发明的药物组合物是疫苗。此外,根据本发明的药物组合物可以用于例如基因治疗。
优选地,所述药物组合物还包含一个以上药学可接受载体、稀释剂和/或赋形剂和/或一种以上佐剂。在本发明范围内,药学可接受的载体典型地包括对于本发明的药物组合物的液体或非液体基础。在一个实施方案中,以液体形式提供所述药物组合物。在此种情况下,优选地,所述载体基于水,如无热原水,等渗盐水或缓冲的(含水)溶液,例如磷酸盐,柠檬酸盐等缓冲的溶液。所述缓冲液可以就特定参考介质而言是高渗的,等渗的或低渗的,即就特定参考介质而言,所述缓冲液可以具有更高,相同的或更低的含量,其中优选可以使用之前提到的盐的此种浓度,其不导致由于渗透或其他浓度效应的哺乳动物细胞的破坏。参考介质为例如在“体内”方法中存在的液体,如血液,淋巴,细胞内液,或其它液体,或例如可以在“体外”方法中用作参考介质的液体,如常见缓冲液或液体。此种常见缓冲液或液体是技术人员已知的。林格乳酸盐溶液作为液体基础是尤其优选的。
对于本发明的药物组合物,也可以使用适于施用于患者的一种以上相容的固体或液体填充物或稀释剂或形成包封化合物。如本文使用的术语“相容的”优选意为本发明的药物组合物的这些组分能够以无在典型的使用条件下将基本上降低本发明的药物组合物药学有效性的相互作用存在的方式与如本文限定的发明的人工核酸、载体或细胞混合。
根据本发明的药物组合物还可以任选地包含一个以上另外的药学活性组分。在此种情况下,药学活性组分是对治愈,缓解或预防特定适应证或疾病呈现治疗效果的化合物。此种化合物包括,不暗含任何限制,肽或蛋白,核酸,(治疗上活性的)低分子量有机或无机化合物(分子量小于5000,优选小于1000),糖,抗原或抗体,现有技术中已知的治疗剂,抗原细胞,抗原细胞片段,细胞级分,细胞壁组分(例如多糖),修饰的,减毒的或灭活的(例如化学地或通过放射)病原体(病毒,细菌等)。
此外,本发明的药物组合物可以包含用于人工核酸分子或载体(vector)的载体(carrier)。此种载体可以适于介导生理可接受液体中的溶解,药学活性人工核酸分子或载体的转运和细胞摄取。因此,此种载体可以是可以适于储存和递送根据本发明的人工核酸分子或载体的组分。此种组分可以是,例如,阳离子或聚阳离子载体或可以用作转染或复合剂的化合物。
在此利情况下,尤其优选的转染或复合剂是阳离子或聚阳离子化合物,包括鱼精蛋白,核仁蛋白(nucleoline),精胺或亚精胺,或其它阳离子肽或蛋白,如聚-L-赖氨酸(PLL),聚-精氨酸,碱性多肽,细胞穿透肽(CPPs),包括HIV-结合肽,HIV-1Tat(HIV),源自Tat的肽,Penetratin,源自VP22的或类似物肽,HSV VP22(单纯疱疹),MAP,KALA或蛋白转导结构域(PTDs),PpT620,富脯氨酸肽,富精氨酸肽,富赖氨酸肽,MPG-肽,Pep-1,L-寡聚物,降钙素肽,源自触角足的肽(尤其源自果蝇触角足),pAntp,pIsl,FGF,乳铁蛋白,Transportan,Buforin-2,Bac715-24,SynB,SynB(1),pVEC,源自hCT的肽,SAP,或组蛋白。
此外,此种阳离子或聚阳离子化合物或载体可以是阳离子或聚阳离子肽或蛋白,其优选包含或另外修饰以包含至少一个SH部分。优选地,阳离子或聚阳离子载体选自具有以下求和公式(I)的阳离子肽:
{(Arg)1;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x}; 公式(I)
其中l+m+n+o+x=3-100,并且假如Arg(精氨酸),Lys(赖氨酸),His(组氨酸)和Orn(鸟氨酸)的总含量代表寡肽的所有氨基酸的至少10%,l,m,n或o相互独立地是选自0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21-30,31-40,41-50,51-60,61-70,71-80,81-90和91-100的任何数;并且Xaa是选自除了Arg,Lys,His或Orn外的天然(=天然存在的)或非天然氨基酸的任何氨基酸;并且假设Xaa的总含量不超过寡肽的所有氨基酸的90%,x是选自0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21-30,31-40,41-50,51-60,61-70,71-80,81-90的任何数。氨基酸Arg,Lys,His,Orn和Xaa的任一个可以置于肽的任何位置。在此种情况下,在7-30个氨基酸范围内的阳离子肽或蛋白是特别优选的。
进一步地,当根据公式{(Arg)1;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x}(公式(I))限定的,如上文显示的,并包含或另外修饰以包含至少一个-SH部分的所述阳离子或聚阳离子肽或蛋白,可以,并不限于,选自子公式(Ia):
{(Arg)1;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa′)x(Cys)y} 子公式(Ia)
其中(Arg)1;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;和x为如本文限定的,Xaa′是选自除了Arg,Lys,His,Orn或Cys之外的天然(=天然存在的)或非天然氨基酸的任何氨基酸,并且假如Arg(精氨酸),Lys(赖氨酸),His(组氨酸)和Orn(鸟氨酸)的总含量代表寡肽的所有氨基酸的至少10%,y是选自0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21-30,31-40,41-50,51-60,61-70,71-80和81-90的任何数。进一步地,所述阳离子或聚阳离子肽可以选自子公式(Ib):
Cys1{(Arg)1;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x}Cys2 子公式(Ib)
其中凭经验的公式{(Arg)1;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x}(公式(III))为如本文限定的并且形成根据(半经验的)公式(III)的氨基酸序列的核心并且其中Cys1和Cys2是邻近,或位于(Arg)1;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x末端的半胱氨酸。
可以用作转染或复合剂的特别优选的阳离子或聚阳离子化合物可以包括阳离子多糖,例如,壳聚糖,1,5-二甲基-1,5-二氮十一亚甲基聚甲溴化物(polybrene),阳离子聚合物,例如,聚乙烯亚胺(PEI),阳离子脂质,例如,DOTMA:[1-(2,3-二油酰氧基)丙基)]-N,N,N-三甲基氯化铵,DMRIE,二-C14-脒,DOTIM,SAINT,DC-Chol,BGTC,CTAP,DOPC,DODAP,DOPE:二油基磷脂酰乙醇胺,DOSPA,DODAB,DOIC,DMEPC,DOGS:Dioctadecylamidoglicylspermin,DIMRI:二肉豆蔻酰-氧丙基二甲基羟乙基溴化铵,DOTAP:二油基氧基-3-(三甲基铵基)丙烷,DC-6-14:O,O-双十四酰基-N-(α-三甲基铵基乙酰基)二乙醇胺氯化物,CLIP1:外消旋-[(2,3-双十八基氧基丙基)(2-羟乙基)]-二甲基氯化铵,CLIP6:外消旋-[2(2,3-双十六基氧基丙基-氧基甲氧基)乙基]三甲基铵,CLIP9:外消旋-[2(2,3-双十六基氧基丙基-氧基琥珀酰基氧基)乙基]-三甲基铵,oligofectamine,或阳离子或聚阳离子聚合物,例如,修饰的聚氨基酸,诸如β-氨基酸-聚合物或反向聚酰胺(reversed polyamides)等,改性的聚乙烯,诸如PVP(聚(N-乙基-4-乙烯基吡啶溴化物))等,改性的丙烯酸酯,诸如pDMAEMA(聚(二甲基氨基乙基丙烯酸甲酯))等,改性的氨基胺(Amidoamines),诸如pAMAM(聚(氨基胺))等,改性的聚β氨基酯(PBAE),诸如二胺末端修饰的1,4丁二醇双丙烯酸酯-共-5-氨基-1-戊醇聚合物等,树枝状聚合物(dendrimers),诸如聚丙胺树枝状聚合物或基于pAMAM的树枝状聚合物等,聚亚胺,诸如PEI:聚(乙烯亚胺),聚(丙烯亚胺)等,聚烯丙基胺,基于糖骨架的聚合物,诸如基于环糊精的聚合物,基于葡聚糖的聚合物,壳聚糖等,基于甲硅烷骨架的聚合物,诸如PMOXA-PDMS共聚物等,由一个或多个阳离子嵌段(例如选自上文提及的阳离子聚合物)的组合和一个或多个亲水或疏水嵌段(例如,聚乙二醇)的组合组成的嵌段聚合物等。
根据另一实施方案,根据本发明的药物组合物可以包含佐剂以增强药物组合物的免疫刺激性质。在该情况下,佐剂可以理解为任何适于支持根据本发明的药物组合物中包含的组分如人工核酸分子或载体的施用和递送的化合物。此外,所述佐剂可以(但不限于其中)起始或增加先天免疫系统的免疫应答,即非特异性免疫应答。换句话说,当施用时,根据本发明的药物组合物典型地起始针对人工核酸分子编码的抗原的适应性免疫应答。此外,由于将如本文定义的佐剂加入至根据本发明的药物组合物,根据本发明的药物组合物可以产生(支持的)先天免疫应答。
所述佐剂可以选自技术人员已知的和适于目前情形,即支持在哺乳动物中又到免疫反应的佐剂。优选为,佐剂可以是选自但不限于由以下各项组成的组:TDM,MDP,胞壁酰二肽,普流罗尼克(pluronics),明矾溶液,氢氧化铝,ADJUMERTM(聚膦腈);磷酸铝凝胶;来自藻类的葡聚糖类;algammulin;氢氧化铝凝胶(明矾);高蛋白吸附的氢氧化铝凝胶;低粘度氢氧化铝凝胶;AF或SPT(角鲨烷乳液(5%),吐温80(0.2%),普流罗尼克(Pluronic)L121(1.25%),磷酸缓冲盐水,pH 7.4);AVRIDINETM(丙二胺);BAY R1005TM((N-(2-脱氧-2-L-亮氨酰氨基-b-D-吡喃葡糖基)-N-十八基-十二烷酰-酰胺氢乙酸盐);CALCITRIOLTM(1-α,25-二羟基-维生素D3);磷酸钙凝胶;CAPTM(磷酸钙纳米颗粒);霍乱全毒素,霍乱-毒素-A1-蛋白-A-D-片段融合蛋白,霍乱毒素的亚基B;CRL 1005(嵌段共聚物P1205);含有细胞一找你的脂质体;DDA(溴化二甲基二-十八基铵);DHEA(脱氢表雄酮);DMPC(二肉豆蔻酰磷脂酰胆碱);DMPG(二肉豆蔻酰磷脂酰甘油);DOC/明矾复合物(脱氧胆酸钠盐);完全弗氏佐剂;不完全弗氏佐剂;γ菊糖;Gerbu佐剂(下述的混合物:i)N-乙酰葡糖胺基-(P1-4)-N-乙酰胞壁酰基-L-丙氨酰-D-谷氨酰胺(GMDP),ii)氯化二甲基二-十八基铵(DDA),iii)锌-L-脯氨酸盐复合物(ZnPro-8);GM-CSF);GMDP(N-乙酰葡糖胺基-(β1-4)-N-乙酰胞壁酰基-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺);咪喹莫特(imiquimod)(1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-4-胺);ImmTherTM(N-乙酰葡糖胺基-N-乙酰胞壁酰基-L-Ala-D-异Glu-L-Ala-甘油二棕榈酸酯);DRVs(由脱水-再水合囊泡制备的免疫脂质体);干扰素-γ;白介素-1β;白介素-2;白介素-7;白介素-12;ISCOMSTM;ISCOPREP 7.0.3.TM;脂质体;LOXORIBINETM(7-烯丙基-8-氧代鸟苷);LT口服佐剂(大肠杆菌(E.coli)不稳定的肠毒素-原毒素);任意组成的微球体和微粒;MF59TM;(角鲨烯水乳液);MONTANIDE ISA 51TM(纯化的不完全弗氏佐剂);MONTANIDE ISA720TM(可代谢的油佐剂);MPLTM(3-Q-脱酰基-4′-单磷酰基脂质A);MTP-PE和MTP-PE脂质体((N-乙酰基-L-丙氨酰-D-异谷氨酰基-L-丙氨酸-2-(1,2-二棕榈酰-sn-甘油-3-(羟基磷酰基氧基))-乙基酰胺,一钠盐);MURAMETIDETM(Nac-Mur-L-Ala-D-Gln-OCH3);MURAPALMITINETM和D-MURAPALMITINETM(Nac-Mur-L-Thr-D-异GIn-sn-甘油二棕榈酰基);NAGO(神经氨酸酶-半乳糖氧化酶);任意组成的纳米球体或纳米颗粒;NISVs(非离子表面活性剂囊泡);PLEURANTM(β-葡聚糖);PLGA,PGA和PLA(乳酸和乙醇酸的均聚体和共聚体;微球体/纳米球体);普流罗尼克(PLURONIC)L121TM;PMMA(聚甲基丙烯酸甲酯);PODDSTM(类的内部微球体);聚乙烯氨基甲酸酯衍生物;聚-rA:聚-rU(聚腺苷酸-聚尿苷酸复合物);聚山醇酯80(吐温80);蛋白螺旋物(Avanti Polar脂s,Inc.,Alabaster,AL);STIMULONTM(QS-21);Quil-A(Quil-A皂苷);S-28463(4-氨基-otec-二甲基-2-乙氧基甲基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-1-乙醇);SAF-1TM(′Syntex佐剂制剂″);Sendai蛋白脂质体和Sendai含脂质基质;Span-85(三油酸脱水山梨酯);Specol(Marcol 52,Span 85和吐温85的乳液);角鲨烯或(2,6,10,15,19,23-六甲基二十四烷和2,6,10,15,19,23-六甲-2,6,10,14,18,22-二十四碳六烯);硬脂酰酪氨酸(十八基酪氨酸盐酸盐);(N-乙酰葡糖胺基-N-乙酰胞壁酰基-L-Ala-D-异Glu-L-Ala-二棕榈酰氧基丙酰胺);苏氨酰-MDP(TermurtideTM或[thr 1]-MDP;N-乙酰胞壁酰基-L-苏氨酰-D-异谷氨酰胺);Ty颗粒(Ty-VLPs或病毒样颗粒);Walter-Reed脂质体(包含吸附在氢氧化铝上的脂质A的脂质体),和脂肽,包括Pam3Cys,特别是铝盐,如Adju-phos,Alhydrogel,Rehydragel;乳液,包括CFA,SAF,IFA,MF59,Provax,TiterMax,Montanide,Vaxfectin;共聚物,包括Optivax(CRL1005),L121,Poloaxmer4010),等;脂质体,包括Stealth,螺旋物,包括BIORAL;植物来源的佐剂,包括QS21,Quil A,Iscomatrix,ISCOM;适于共刺激的佐剂,包括蕃茄素(Tomatine),生物聚合物,包括PLG,PMM,菊糖;微生物来源的佐剂,包括罗莫肽(Romurtide),DETOX,MPL,CWS,甘露糖,CpG核酸序列,CPG7909,人TLR 1-10的配体,鼠TLR 1-13的配体,ISS-1018,IC31,咪唑并喹啉,聚肌胞(Ampligen),Ribi529,IMOxine,IRIVs,VLPs,霍乱毒素,不耐热毒素,Pam3Cys,鞭毛蛋白(Flagellin),GPI锚定子,LNFPIII/Lewis X,抗微生物肽,UC-1V150,RSV融合蛋白,cdiGMP;和适于作为拮抗剂的佐剂,包括CGRP神经肽。
合适的佐剂还可以选自阳离子或聚阳离子化合物,其中所述佐剂优选为基于将药物组合物的人工核酸分子或载体与阳离子或聚阳离子化合物复合来制备。将药物组合物的人工核酸分子或载体与如本文定义的阳离子或聚阳离子化合物关联或复合优选提供佐剂性质并且赋予药物组合物的人工核酸分子或载体稳定的效果。尤其是如此优选的,如此阳离子或聚阳离子化合物选自阳离子或聚阳离子肽或蛋白,包括鱼精蛋白,核仁蛋白,精胺或亚精胺,其它阳离子肽或蛋白,如聚-L-赖氨酸(PLL),聚精氨酸,碱性多肽,碱性多肽(CPPs),包括HIV-结合肽,Tat,HIV-1Tat(HIV),Tat-衍生肽,穿透肽(Penetratin),VP22衍生的或类似物肽,HSV VP22(单纯疱疹病毒),MAP,KALA或蛋白转导结构域(PTDs,PpT620,富含脯氨酸的肽,富含精氨酸的肽,富含赖氨酸的肽,MPG-肽,Pep-1,L-寡聚物,降钙素肽,触角足-衍生肽(Antennapedia-derived peptides)(尤其是来自果蝇(Drosophilaantennapedia)),pAntp,pIsl,FGF,乳铁蛋白,Transportan,Buforin-2,Bac715-24,SynB,SynB(1),pVEC,hCT-衍生肽,SAP,鱼精蛋白,精胺,亚精胺,或组蛋白。此外优选的阳离子或聚阳离子化合物可以包括阳离子多糖,例如壳聚糖,聚凝胺,阳离子聚合物,例如聚乙烯亚胺(PEI),阳离子脂,例如DOTMA:1-(2,3-二油酰氧基)丙基)-N,N,N-三甲基氯化铵,DMRIE,二-C14-脒,DOTIM,SAINT,DC-Chol,BGTC,CTAP,DOPC,DODAP,DOPE:二油烯基磷脂酰乙醇胺,DOSPA,DODAB,DOIC,DMEPC,DOGS:二(十八烷基)酰氨基甘氨酰精胺(Dioctadecylamidoglicylspermin),DIMRI:二肉豆蔻酰-氧基丙基二甲基羟乙基溴化铵,DOTAP:二油酰氧-3-(三甲基胺基)丙烷,DC-6-14:O,O-二(四癸酰基)-N-(-三甲基胺基乙酰)氯化二乙醇胺,CLIP1:外消旋-[(2,3-双十八烷氧基丙基)(2-羟乙基)]-二甲基氯化铵,CLIP6:外消旋-[2(2,3-双十六烷氧基丙基-氧甲氧基)乙基]三甲基铵,CLIP9:外消旋-[2(2,3-双十六烷氧基丙基-氧琥珀酰氧)乙基]-三甲基铵,阳离子脂质体(oligofectamine),或阳离子或聚阳离子聚合物,例如修饰的聚氨基酸,如-氨基酸-聚合物或反向聚酰胺等,修饰的聚乙烯,如PVP(聚(N-乙基-4-溴化乙烯基吡啶鎓))等,修饰的丙烯酸盐,如pDMAEMA(聚(二甲基氨基乙基甲基丙烯酸盐))等,修饰的酰胺基胺如pAMAM(聚(酰胺基胺))等,修饰的聚β氨基酯(PBAE),如二胺末端修饰的1,4丁二醇二丙烯酸酯-共-5-氨基-1-戊醇聚合物等,树状聚合物,如聚丙基胺树状聚合物或基于pAMAM的树状聚合物等,聚亚胺,如PEI:聚(乙烯亚胺),聚(丙烯亚胺)等,聚丙烯基胺,基于糖骨架的聚合物,如基于环糊精的聚合物,基于葡聚糖的聚合物,壳聚糖等,基于硅烷骨架的聚合物,如PMOXA-PDMS共聚物等,由一个以上阳离子嵌段(例如选自如上文提到的阳离子聚合物)和一个以上亲水或疏水嵌段(如聚乙二醇)的组合组成的嵌段聚合物;等。
此外,可以通过将组合物的人工核酸分子或载体,优选RNA复合而用作佐剂的优选的阳离子或聚阳离子蛋白或肽,可以选自以下具有以下总式(I)的蛋白或肽:(Arg)l;(Lys)m;(His)n;(Orn)o;(Xaa)x,其中l+m+n+o+x=8-15,并且可以l、m、n或o彼此独立是选自0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15的任意数,条件是Arg、Lys、His和Orn的总含量代表寡肽的所有氨基酸的至少50%;并且Xaa可以是选自除了Arg、Lys、His或Orn的天然(=天然存在)或非天然氨基酸的任何氨基;并且x可以是选自0、1、2、3或4的任意数,条件是Xaa的含量总不超过寡肽的所有氨基酸的50%。在该情况下尤其优选的寡精氨酸是例如Arg7、Arg8、Arg9、Arg7、H3R9、R9H3、H3R9H3、YSSR9SSY、(RKH)4、Y(RKH)2R等。
人工核酸或载体与阳离子或聚阳离子化合物的比例可以基于整个核酸复合物的氮/磷比(N/P-比)确定。例如,1μg RNA通常含有约3nmol磷酸酯残基,条件是RNA显示碱基的统计学分布。此外,1μg肽通常含有约x nmol氮残基,这取决于碱性氨基酸的分子量和数量。当示例性地对(Arg)9(分子量1424g/mol,9个氮原子)进行计算时,1μg(Arg)9含有约700pmol(Arg)9并且因此700x9=6300pmol碱性氨基酸=6.3nmol氮原子。对于约1∶1RNA/(Arg)9的质量比,可以计算N/P比为约2。当利用2μg RNA示例性地计算鱼精蛋白(分子量约4250g/mol,21个氮原子,当使用来自鲑鱼的鱼精蛋白时)具有约2∶1的质量比时,对RNA计算为6nmol磷酸酯;1μg鱼精蛋白含有约235pmol鱼精蛋白分子并且因此235x21=4935pmol碱性氮原子=4.9nmol氮原子。对于约2∶1RNA/鱼精蛋白的质量比,可以计算出约0.81的N/P比。对于约8∶1RNA/鱼精蛋白的质量比,可以计算约0.2的N/P比。在本发明的情况下,关于复合物中核酸∶肽的比例,N/P-比优选在约0.1-10的范围内,优选在约0.3-4的范围内,并且最优选在约0.5-2或0.7-2的范围内,并且最优选在约0.7-1.5的范围内。
专利申请WO2010/037539(其公开内容通过引用并入本文),描述了免疫刺激组合物和用于制备免疫刺激组合物的方法。因此,在本发明的优选的实施方案中,以两个分开的步骤获得组合物,从而获得根据本发明的人工核酸分子的有效免疫刺激作用和有效翻译。其中,所谓的“佐剂组分”在第一步骤中将佐剂组分的人工核酸分子或载体,优选RNA与阳离子或聚阳离子化合物以特定比例复合从而形成稳定复合物来制备。在该情况下,重要的是,在复合核酸后,没有游离阳离子或聚阳离子化合物或仅可忽略的小量留存在佐剂组分中。因此,佐剂组分中核酸和阳离子或聚阳离子化合物的比例通常在核酸被整体复合并且在组合物中没有游离阳离子或聚阳离子化合物或仅有可忽略小量残留的范围内选择。优选地,佐剂组分的比例,即核酸与阳离子或聚阳离子化合物的比例选自约6∶1(w/w)至约0,25∶1(w/w),更优选约5∶1(w/w)至约0,5∶1(w/w),甚至更优选约4∶1(w/w)至约1∶1(w/w)或约3∶1(w/w)至约1∶1(w/w)的范围内,并且最优选约3∶1(w/w)至约2∶1(w/w)的比例。
根据优选的实施方案,在第二步,将根据本发明的人工核酸分子或载体,优选RNA分子,加入至佐剂组分的复合的核酸分子,优选RNA中,从而形成本发明的(免疫刺激)组合物。其中,加入本发明的人工核酸分子或载体,优选为RNA为游离核酸,即未与其他化合物复合的核酸。加入之前,游离人工核酸分子或载体未复合并且将优选在加入佐剂组分时不经历任何可检测或显著的复合反应。
合适的佐剂可以此外选自具有式(II)的核酸:GlXmGn,其中:G是鸟苷、尿嘧啶或鸟苷或尿嘧啶的类似物;X是鸟苷、尿嘧啶、腺苷、胸苷、胞嘧啶或上述核苷酸的类似物;l是1至40的整数,其中当l=1时,G是鸟苷或其类似物,当l>1时,至少50%的核苷酸是鸟苷或其类似物;m是整数并至少是3;其中当m=3时,X是尿嘧啶或其类似物,当m>3时,存在至少3个连续的尿嘧啶或尿嘧啶类似物;n是1至40的整数,其中当n=1时,G是鸟苷或其类似物,当n>1时,至少50%的核苷酸是鸟苷或其类似物。
此外其他合适的佐剂可以选自具有式(III)的核酸:ClXmCn,其中:C是胞嘧啶、尿嘧啶或胞嘧啶或尿嘧啶的类似物;X是鸟苷、尿嘧啶、腺苷、胸苷、胞嘧啶或上述核苷酸的类似物;l是1至40的整数,其中当l=1时,C是胞嘧啶或其类似物,当l>1时,至少50%的核苷酸是胞嘧啶或其类似物;m是整数并且至少是3;其中当m=3时,x是尿嘧啶或其类似物,当m>3时,存在至少3个连续的尿嘧啶或尿嘧啶的类似物;n是1至40的整数,其中当n=1时,C是胞嘧啶或其类似物,当n>1时,至少50%的核苷酸是胞嘧啶或其类似物。
根据本发明的药物组合物优选包含“安全和有效量”的药物组合物组分,尤其是如本文限定的本发明的人工核酸分子,载体和/或细胞。如本文使用的,“安全和有效量”意为足以显著诱导如本文限定的疾病或疾病的积极改进的量。然而同时,“安全和有效量”优选避免严重的副作用并且允许益处和风险间的合理关系。这些限制的确定典型地处于合理的医学判断范围中。
在一个进一步地方面,本发明提供(在基因接种中)或在基因治疗中用作药物,例如,用作疫苗的根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物。
根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物尤其适于任何医学应用,其使用肽、多肽或蛋白的治疗作用或效果,或其中需要特定肽或蛋白的补充。因此,本发明提供根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物用于治疗或预防接受通过肽、多肽或蛋白的治疗作用或效果的治疗或接受通过补充特定肽、多肽或蛋白的治疗的疾病或疾病。例如,根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物可以用于例如,通过基因接种或基因治疗治疗或预防遗传病,自身免疫疾病,癌症或肿瘤相关疾病,感染性疾病,慢性病等。
尤其,从在要被治疗的受试者中治疗肽、多肽或蛋白的稳定和延长的存在获益的此种治疗性处理尤其适合作为本发明范围内的医学应用,因为本发明的3′UTR元件提供稳定和延长的本发明的人工核酸分子或载体的编码的肽或蛋白的表达。因此,根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物的尤其合适的医学应用是疫苗接种。因此,本发明提供用于接种受试者,优选哺乳动物受试者,更优选人受试者的根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物。优选的疫苗接种治疗是针对感染性疾病,如细菌,原虫或病毒感染的接种,和抗肿瘤-接种。此种接种治疗可以是预防性的或治疗性的。
根据要治疗或预防的疾病,可以选择ORF。例如,所述可读框可以编码必须提供给患有完全缺少或至少部分缺失蛋白的功能的患者,如患有遗传病的患者的蛋白。另外,所述可读框可以选自编码有利影响受试者疾病或病状的肽或蛋白的ORF。此外,所述可读框可以编码有效下调天然肽或蛋白的病理过量生产或消除病理表达蛋白或肽的细胞的肽或蛋白。此种功能的缺少、缺失或过量生产可以,例如,发生在肿瘤和瘤形成,自身免疫疾病,过敏,感染,慢性病等的情况下。此外,所述可读框可以编码抗原或免疫原,例如编码病原体的表位或编码肿瘤抗原。因此,在优选的实施方案中,根据本发明的人工核酸分子或载体包含编码包含以下或由以下组成的氨基酸序列的ORF:抗原或免疫原,例如病原体的表位或肿瘤相关抗原,如上文描述的3′-UTR元件,和任选的进一步组分,例如聚腺苷酸序列等。
在医学应用的情况下,尤其,在接种的情况下,优选根据本发明的人工核酸分子是RNA,优选mRNA,因为DNA含有引起抗DNA免疫应答的风险并且倾向于插入基因组DNA。然而,在一些实施方案中,例如,如果例如,在基因治疗处理的情况下,病毒递送载体,如腺病毒递送载体用于递送根据本发明的人工核酸分子或载体,所述人工核酸分子或所述载体是DNA分子可以是可取的。
根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物可以口服,肠胃外,通过吸入喷雾,局部,直肠,经鼻,经颊,阴道或通过移植的储器施用。如本文使用的术语肠胃外包括皮下,静脉内,肌肉内,关节内,滑膜内,胸骨内,鞘内,肝内,病灶内,颅内,经皮,皮内,肺内,腹膜内,心脏内,动脉内,和舌下注射或输注技术。在优选的实施方案中,根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物经由无针头注射(例如喷射注射)施用。
优选地,根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物例如通过肠胃外注射,更优选通过皮下,静脉内,肌肉内,关节内,滑膜内,胸骨内,鞘内,肝内,病灶内,颅内,经皮,皮内,肺内,腹膜内,心脏内,动脉内,舌下注射或通过输注技术被肠胃外施用。尤其优选的是皮内和肌肉内注射。本发明的药物组合物无菌可注射形式可以是水质或油质悬液。可以根据本领域已知的技术,使用合适的分散或湿润剂和悬浮剂制备这些悬液。优选为,所述溶液或悬浮液经由无针注射(例如喷射注射)施用。
根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物可以以任何口服可接受剂型口服施用,所述口服可接受剂型包括但不限于胶囊、片剂、水质悬液或溶液。
尤其当治疗的靶包括容易通过局部应用可到达的区域或器官,例如包括皮肤疾病或任何其它可到达的上皮组织的疾病时,根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物还可以局部施用。对于这些区域或器官中的每个,容易制备合适的局部制剂。为了局部应用,可以以悬浮或溶解在一个以上载体中的合适的软膏制备根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物。
在一个实施方案中,作为药物的使用包括转染哺乳动物细胞,优选体外或离体转染哺乳动物细胞,更优选体外转染要由所述药物治疗的受试者的分离的细胞的步骤。如果所述使用包括体外转染分离的细胞,作为药物的使用还可以包括向患者再施用转染的细胞。本发明的人工核酸分子或载体作为药物的使用还可以包括选择成功转染的分离的细胞的步骤。因此,如果载体还包含选择标记,可以是有利的。而且,作为药物的使用可以包括体外转染分离的细胞和从这些细胞纯化表达产物,即编码的肽或蛋白。该纯化的肽或蛋白可以随后施用于有其需要的受试者。
本发明还提供一种治疗或预防如上文描述的疾病或疾病的方法,所述方法包括向有其需要的受试者施用根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,或根据本发明的药物组合物。
此外,本发明提供一种治疗或预防疾病或疾病的方法,所述方法包括用根据本发明的人工核酸分子或用根据本发明的载体转染细胞。所述转染可以在体外、离体或体内进行。在一个优选的实施方案中,体外进行细胞转染并且将转染的细胞施用于有其需要的受试者,优选人患者。优选地,要体外转染的细胞是受试者,优选人患者的分离的细胞。因此,本发明提供一种治疗方法,所述方法包括从受试者,优选从人患者分离细胞,用根据本发明的人工核酸或根据本发明的载体转染所述分离的细胞,并将转染的细胞施用于受试者,优选人患者的步骤。
治疗或预防根据本发明的疾病的方法优选如上文描述的疫苗接种方法或基因治疗方法。
如上文描述的,发明的3′UTR元件能够增强、稳定mRNA分子和/或延长mRNA分子的蛋白生产。因此,在一个进一步的方面,本发明涉及一种稳定RNA分子,优选mRNA分子的方法,所述方法包括将所述RNA分子,优选所述mRNA分子,或编码所述RNA分子的载体,与包含源自核糖体蛋白基因的3′UTR或源自核糖体蛋白基因3′UTR的变体的核酸序列或由源自核糖体蛋白基因的3′UTR或源自核糖体蛋白基因3′UTR的变体的核酸序列组成的3′UTR元件,优选与如上文描述的3′UTR元件相关联的步骤。
此外,本发明涉及增强、稳定mRNA分子和/或延长人工核酸分子或载体,优选mRNA分子的蛋白生产,和/或稳定和/或延长人工核酸分子或载体,优选mRNA分子的蛋白生产的方法,所述方法包括将所述人工核酸分子或所述载体,优选所述mRNA分子,与包含源自核糖体蛋白基因的3′UTR或源自核糖体蛋白基因3′UTR的变体的核酸序列或由源自核糖体蛋白基因的3′UTR或源自核糖体蛋白基因3′UTR的变体的核酸序列组成的3′UTR元件,优选与如上文描述的3′UTR元件相关联的步骤。
在本发明的情况下,术语“将人工核酸分子或载体与3′-UTR元件相关联”优选意为将人工核酸分子或载体与3′-UTR元件功能上相关联或将人工核酸分子或载体与3′-UTR元件功能上组合。这意为所述人工核酸分子或所述载体和所述3′-UTR元件,优选如上文描述的3′-UTR元件,相关联或偶联,从而发挥所述3′-UTR元件的功能,例如,RNA和/或蛋白生产稳定功能。典型地,这意为任选地通过接头,比如包含一种以上限制位点或由一种以上限制位点组成的序列连接,将所述3′-UTR元件在可读框3′,优选在可读框的紧邻的3′,优选在可读框和聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号之间整合于所述人工核酸分子或所述载体,优选所述mRNA分子。优选地,将所述3′-UTR元件以3′-UTR整合于所述人工核酸分子或所述载体,优选所述mRNA,即从而所述3′UTR元件所述人工核酸分子或所述载体,优选所述mRNA的3′-UTR,即,从而其从可读框的3′侧向聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号的5′侧延伸。因此,优选地,术语“将人工核酸分子或载体与3′-UTR元件相关联”意为将3′-UTR元件与位于所述人工核酸分子或所述载体,优选所述mRNA分子内的可读框功能上相关联。用于根据本发明的人工核酸分子的3′-UTR和ORF如上文描述,例如,优选所述ORF和所述3′-UTR是异源的,例如如上文描述的,源自不同基因。
在一个进一步的方面,本发明提供3′-UTR元件,优选如上文描述的3′-UTR元件,用于增加RNA分子,优选mRNA分子的稳定性的用途,其中所述3′-UTR元件包含以下或由以下组成:源自核糖体蛋白基因的3′-UTR或源自核糖体蛋白基因3′UTR的变体的核酸序列。
此外,本发明提供3′-UTR元件,优选如上文描述的3′-UTR元件,用于增加人工核酸分子或载体,优选mRNA分子的蛋白生产,和/或用于稳定和/或延长人工核酸分子或载体分子,优选mRNA分子的蛋白生产的用途,其中所述3′-UTR元件包含以下或由以下组成:如上文描述的源自核糖体蛋白基因的3′-UTR或源自核糖体蛋白基因3′-UTR的变体的核酸序列。
根据本发明的用途优选包括将所述人工核酸分子,所述载体,或所述RNA与如上文描述的3′-UTR元件相关联。
还可以彼此分开制造和买卖本发明的药物组合物的化合物和成分。因此,本发明还涉及试剂盒或多部件的试剂盒,其包含根据本发明的人工核酸分子,根据本发明的载体,根据本发明的细胞,和/或根据本发明的药物组合物。优选,此种试剂盒或多部件的试剂盒可以,另外,包含使用说明书,用于转染的细胞,佐剂,用于施用所述药物组合物的工具,药学可接受的载体和/或用于溶解或稀释所述人工核酸分子,所述载体,所述细胞或所述药物组合物的药学可接受的溶液。
以下附图,序列和实施例意在进一步说明本发明。此外它们不意在限制本发明的主题。
图1至3显示编码可以通过在体外转录获得的mRNA的序列。使用以下缩写:
·rpl32:缺少5’末端寡嘧啶束的人核糖体蛋白Large 32的5’-UTR
·PpLuc(GC):编码萤火虫(Photinus pyralis)荧光素酶的富含GC的mRNA序列
·A64:具有64个腺苷酸的聚腺苷酸-序列
·ag:人α-珠蛋白的3’-UTR的中心,α-复合物结合部分
·rps9:源自人核糖体蛋白Small 9的3’-UTR的3’-UTR元件
·C30:具有30个胞苷酸的聚胞苷酸序列
·组蛋白SL:从(Cakmakci,Lerner,Wagner,Zheng,&William F Marzluff,2008.Mol.Cell.Biol.28(3):1182-94)获得的组蛋白茎环序列;
·白蛋白:人白蛋白的3’-UTR。
图1:显示编码mRNA rpl32-PpLuc(GC)-A64-C30-组蛋白SL的序列(SEQ ID NO:8)。
图2:显示编码mRNA rpl32-PpLuc(GC)-ag-A64-C30-组蛋白SL的序列(SEQ ID NO:9)。人α-珠蛋白的3’-UTR的中心、α-复合物-结合部分插入ORF和聚腺苷酸之间。PpLuc(GC)ORF以斜体突出。在源自α-珠蛋白的3’-UTR元件下划线。
图3:rpl32-PpLuc(GC)-rps9-A64-C30-hSL的mRNA序列(SEQ ID NO:7)。人核糖体蛋白Small 9的3’-UTR插入ORF和聚腺苷酸之间。PpLuc(GC)ORF以斜体突出,3’UTR元件源自rps9下划线。
图4:显示核糖体蛋白Small 9的3’-UTR显著增加mRNA的蛋白表达。
检查与缺少3’-UTR或含有人α-珠蛋白3’-UTR的mRNA的荧光素酶表达相比,本发明的人核糖体蛋白Small 9的3’-UTR对mRNA的荧光素酶表达的作用。因此通过脂转染将不同mRNAs转染到人皮肤成纤维细胞(HDF)中。在转染后6、24、48和72小时测量荧光素酶水平。从缺少3’-UTR的mRNA明确表达荧光素酶。然而,荧光素酶表达不由公知的α-珠蛋白3’-UTR增加。相比之下,核糖体蛋白Small 9的3’-UTR显著增加荧光素酶表达。将数据绘制图表为对于一式三份的转染的平均RLU±SEM(相对光单位±标准误差)。RLU在实施例5.1中总结。
图5:显示编码mRNA rpl32-PpLuc(GC)-白蛋白-A64-C30-组蛋白SL的序列(SEQ IDNO:206)。将人白蛋白的3’-UTR插入在ORF和聚腺苷酸之间。PpLuc(GC)ORF以斜体突出。源自白蛋白的3’-UTR元件下划线。
图6:显示源自鼠核糖体蛋白基因rps21、rps29、rps9、rps27、rps28、rps19、rpl35a、rpll3、rpl36和rpl23a的3’-UTR增加HDF细胞(人皮肤成纤维细胞)中mRNA的蛋白表达至少至与包含白蛋白基因的3’-UTR的mRNA(其已经显示增加mRNA的蛋白表达(WO2013143698))相同的程度。
图7:显示源自鼠核糖体蛋白基因rps21、rps29、rps9、rps27、rps28、rps19、rpl35a、rpl13、rpl36和rpl23a的3’-UTR增加HeLa细胞中mRNA的蛋白表达至少至与包含白蛋白基因的3’-UTR的mRNA(其已经显示增加mRNA的蛋白表达(WO2013143698))相同的程度。
图8:显示源自鼠核糖体蛋白基因rpl23、uba52、rpl22l1、rpl36a、rps4x、rpl27、rpl3、rps23、rps13、rpl26、rps17、rps18、rps8、Fau、rps13、rpl11和rpl38的3’-UTR增加HDF细胞(人皮肤成纤维细胞)中mRNA的蛋白表达至少至与包含白蛋白基因的3’-UTR的mRNA(其已经显示增加mRNA的蛋白表达(WO2013143698))相同的程度。
图9:显示源自鼠核糖体蛋白基因rpl23、uba52、rpl22l1、rpl36a、rps4x、rpl27、rpl3、rps23、rps13、rpl26、rps17、rps18、rps8、Fau、rps13、rpl11和rpl38的3’-UTR增加HeLa细胞中mRNA的蛋白表达至少至与包含白蛋白基因的3’-UTR的mRNA(其已经显示增加mRNA的蛋白表达(WO2013143698))相同的程度。
实施例
1.DNA-模板的制备
构建用于体外转录的载体,其包含T7启动子和编码萤火虫荧光素酶(PpLuc(GC))的富含GC的序列。将核糖体蛋白Large 32的5’非翻译区(5’-UTR)插入PpLuc(GC)的5’。将A64聚腺苷酸序列,之后是C30和组蛋白茎环序列插入PpLuc(GC)的3’。组蛋白茎环序列之后是用于在体外转录之前线性化载体的限制性位点。由此通过体外转录从该载体获得的mRNA命名为“rpl32-PpLuc(GC)-A64-C30-组蛋白SL”。
修饰该载体以包括可读框(3’-UTR)的3’的非翻译序列。总之,产生包含以下mRNA编码序列的载体(mRNA编码序列中的一些描述为图1至3中的实施例):
rpl32-PpLuc(GC)-A64-C30-组蛋白SL(SEQ ID NO:8,图1)
rpl32-PpLuc(GC)-ag-A64-C30-组蛋白SL(SEQ ID NO:9,图2)
rpl32-PpLuc(GC)-rps9-A64-C30-组蛋白SL(SEQ ID NO:7,图3)
rpl32-PpLuc(GC)-rps21-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps29-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps9-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps27-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps28-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps19-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl35a-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl13-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl36-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl23a-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl23-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-uba52-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl22l1-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl36a-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps4x-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl27-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl3-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps23-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps13-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl26-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps17-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps18-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-Fau-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rps13-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl11-A64-C30-组蛋白SL
rpl32-PpLuc(GC)-rpl38-A64-C30-组蛋白SL
2.体外转录
将根据实施例1所述的DNA-模板线性化并在体外使用T7-RNA聚合酶转录。然后将DNA模板用DNA酶出来来消化。mRNA转录本含有5′-帽结构,其通过将过量的N7-甲基-鸟苷-5′-三磷酸酯-5′-鸟苷加入至转录反应中来获得。将因此获得的mRNA纯化并重悬在水中。
3.mRNA脂转染导致的荧光素酶表达
将人皮肤成纤维细胞(HDF)或HeLa细胞种在24孔板上,三天之后以3x104细胞/孔的密度在培养基(具有L-谷氨酰胺和25mM Hepes(Lonza,Basel,Switzerland)的RPMI 1640培养基,向其中加入10%FCS,1%Pen/Strep,1%谷氨酰胺)中转染。脂转染前,将细胞在Opti-MEM中洗涤。将细胞用25ng的PpLuc-编码mRNA/孔与Lipofectamine2000复合来脂转染。将编码海肾(Renilla reniformis)荧光素酶(RrLuc)的mRNA与PpLuc mRNA一起转染以控制转染效率(2.5ng的RrLuc mRNA/孔)。转染起始后90分钟,将Opti-MEM交换为培养基。转染后6,24,48和72小时,将培养基吸出并且将细胞在100μl裂解缓冲液(Passive LysisBuffer,Promega)中裂解。将裂解物储存在-80℃,直到测量荧光素酶活性。
4.荧光素酶测量
在Hidex Chameleon板读数器中测量荧光素酶活性为相对光单位(RLU)。在2秒的测量时间,使用20μl的裂解物和50μl荧光素缓冲液(Beetle-Juice,PJK GmbH)测量PpLuc活性。在2秒的测量时间,使用20μl的裂解物和50μl腔肠素(coelenterazin)缓冲液(Renilla-Juice,PJK GmbH)测量RrLuc活性。
5.结果
5.1核糖体蛋白基因的3’-UTR增加蛋白表达。
为了研究核糖体蛋白基因的3’-UTR对mRNA的蛋白表达的影响,合成具有不同UTR的mRNA:缺少3’-UTR,或含有人α-珠蛋白(ag)的3’-UTR的中心、α-复合物-结合部分,或含有人核糖体蛋白Small 9(rps9)的3’-UTR的mRNA。将编码荧光素酶的mRNA转染入人皮肤成纤维细胞(HDF)。在转染6,24,48和72小时测量荧光素酶水平。从这些数据,计算0至72小时表达的总蛋白为曲线下面积(AUC)(参见下表1和图4)。
表1:
从缺少3’-UTR的mRNA明确表达荧光素酶。然而,公知的α-珠蛋白3’-UTR不增加荧光素酶表达。相比之下,核糖体蛋白Small 9的3’-UTR显著增加荧光素酶表达。
5.2鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR增加蛋白表达.
为了研究鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR对mRNA的蛋白表达的影响,合成具有不同UTR的mRNA:含有不同鼠核糖体蛋白(rps21,rps29,rps9,rps27,rps28,rpsl9,rpl35a,rpl13,rpl36和rpl23a)的3’-UTR和用于比较的已知增加mRNA的蛋白表达(WO2013143698)的白蛋白的3’-UTR的mRNA。将编码荧光素酶的mRNA转染入人皮肤成纤维细胞(HDF)。在转染后24、48和72小时测量荧光素酶水平。(参见下表2和图6)。
表2:
结果表明,与包含白蛋白的3’-UTR的mRNA(已经描述其增加蛋白生产)相比,从包含鼠核糖体蛋白的3’-UTR的mRNA表达更多的荧光素酶。
5.3鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR增加蛋白表达.
为了研究鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR对mRNA的蛋白表达的影响,合成具有不同UTR的mRNA:含有不同鼠核糖体蛋白(rps21,rps29,rps9,rps27,rps28,rps19,rpl35a,rpl13,rpl36和rpl23a)的3’-UTR以及用于比较的白蛋白的3’-UTR的mRNA。编码荧光素酶的mRNA转染入HeLa细胞。在转染后24、48和72小时测量荧光素酶水平。(参见下表3和图7)。
表3:
结果表明,与包含白蛋白的3’-UTR的mRNA(已经描述其增加蛋白生产)相比,从包含鼠核糖体蛋白的3’-UTR的mRNA表达更多的荧光素酶。
5.4鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR增加蛋白表达。
为了研究鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR对mRNA的蛋白表达的影响,合成具有不同UTR的mRNA:含有不同鼠核糖体蛋白(rpl23,uba52,rpl22l1,rpl36a,rps4x,rpl27,rpl3,rps23,rps13,rpl26,rps17,rps18,rps8,Fau,rps13,rpl11和rpl38)的3’-UTR和用于比较的白蛋白的3’-UTR的mRNA。将编码荧光素酶的mRNA转染入人皮肤成纤维细胞(HDF)。在转染后24,48和72小时测量荧光素酶水平。(参见下表4和图8)。
表4:
结果表明,与包含白蛋白的3’-UTR的mRNA(已经描述其增加蛋白生产)相比,从包含鼠核糖体蛋白的3’-UTR的mRNA表达更多的荧光素酶。
5.5鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR增加蛋白表达.
为了研究鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR对mRNA的蛋白表达的影响,合成具有不同UTR的mRNA:含有不同鼠核糖体蛋白(rpl23,uba52,rpl22l1,rpl36a,rps4x,rpl27,rpl3,rps23,rpsl3,rpl26,rps17,rps18,rps8,Fau,rps13,rpl11和rpl38)的3’-UTR和用于比较的白蛋白的3’-UTR的mRNA。将编码荧光素酶的mRNA转染入HeLa细胞。在转染后24,48和72小时测量荧光素酶水平。(参见下表5和图9)。
表5:
结果表明,与包含白蛋白的3’-UTR的mRNA(已经描述其增加蛋白生产)相比,从包含鼠核糖体蛋白的3’-UTR的mRNA表达更多的荧光素酶。

Claims (77)

1.一种人工核酸分子,其包含
a.至少一个可读框(ORF);和
b.至少一个3’-非翻译区元件(3’-UTR元件),其包含源自核糖体蛋白基因的3’-UTR或源自核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体的核酸序列。
2.根据权利要求1所述的人工核酸分子,其中所述至少一个3’-UTR元件增强、稳定和/或延长所述人工核酸分子的蛋白生产。
3.根据权利要求1或2所述的人工核酸分子,其中所述3’-UTR与所述ORF异源。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的人工核酸分子,其中所述至少一个3’-UTR元件包含核酸序列,所述核酸序列源自真核核糖体蛋白基因的3’-UTR,优选源自脊椎动物核糖体蛋白基因的3’-UTR,更优选源自哺乳动物核糖体蛋白基因的3’-UTR,甚至更优选源自灵长类核糖体蛋白基因、尤其是人核糖体蛋白基因、或啮齿类核糖体蛋白基因、尤其是鼠核糖体蛋白基因的3’-UTR。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的人工核酸分子,其中所述可读框(ORF)不编码报告基因或不源自报告基因,其中所述报告基因优选不选自由以下各项组成的组:珠蛋白(尤其是β-珠蛋白)、荧光素酶蛋白、β-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)和GFP蛋白或其变体,优选不是EGFP,或呈现与珠蛋白、荧光素酶蛋白、或GFP蛋白至少70%序列同一性的变体。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的人工核酸分子,其中所述可读框(ORF)不编码核糖体蛋白,优选不编码真核核糖体蛋白。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的人工核酸分子,其中所述可读框(ORF)不编码人或植物核糖体蛋白,尤其是人核糖体蛋白S6(RPS6)、人核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)或拟南芥核糖体蛋白S16(RPS16)。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的人工核酸分子,其中所述可读框(ORF)不编码核糖体蛋白S6(RPS6)、核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)或核糖体蛋白S16(RPS16)。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的人工核酸分子,其中所述3’-UTR不源自病毒。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的人工核酸分子,其中所述3’-UTR,优选所述人工核酸分子,不包含聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号,
其中所述3’-UTR,优选所述人工核酸分子,还包含聚腺苷酸序列和/或聚腺苷酸化信号。
11.根据权利要求10所述的人工核酸分子,其中所述聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号位于3’-UTR元件的3’-末端。
12.根据权利要求10或11所述的人工核酸分子,其中所述聚腺苷酸化信号包含共有序列NN(U/T)ANA,其中N=A或U,优选为AA(U/T)AAA或A(U/T)(U/T)AAA。
13.根据权利要求10至12中任一项所述的人工核酸分子,其中所述聚腺苷酸化信号,优选共有序列NNUANA,位于3’-UTR元件的3’-末端下游小于约50个核苷酸处。
14.根据权利要求10至13中任一项所述的人工核酸分子,其中所述聚腺苷酸序列具有约20至约300个腺嘌呤核苷酸,优选为约40至约200个腺嘌呤核苷酸,更优选为约50至约100个腺嘌呤核苷酸,甚至更优选为约60至约70个腺嘌呤核苷酸的长度。
15.根据权利要求1至14中任一项所述的人工核酸分子,其中所述核酸包含另外的5’-末端元件,优选5’-UTR,启动子,或5’-UTR和含有启动子的序列。
16.根据权利要求15所述的人工核酸分子,其中所述5’-UTR是5’-TOP UTR。
17.根据权利要求15或16所述的人工核酸分子,其中5’-UTR不包含5’TOP基序。
18.根据权利要求1至17中任一项所述的人工核酸分子,其中所述人工核酸分子还包含5’-UTR,并且其中所述3’-UTR、所述ORF和所述5’-UTR全部彼此异源。
19.根据权利要求1至18中任一项所述的人工核酸分子,其中所述至少一个3’-UTR元件包含源自选自由以下各项组成的组的序列的3’-UTR的核酸序列:核糖体蛋白L9(RPL9)、核糖体蛋白L3(RPL3)、核糖体蛋白L4(RPL4)、核糖体蛋白L5(RPL5)、核糖体蛋白L6(RPL6)、核糖体蛋白L7(RPL7)、核糖体蛋白L7a(RPL7A)、核糖体蛋白L11(RPL11)、核糖体蛋白L12(RPL12)、核糖体蛋白L13(RPL13)、核糖体蛋白L23(RPL23)、核糖体蛋白L18(RPL18)、核糖体蛋白L18a(RPL18A)、核糖体蛋白L19(RPL19)、核糖体蛋白L21(RPL21)、核糖体蛋白L22(RPL22)、核糖体蛋白L23a(RPL23A)、核糖体蛋白L17(RPL17)、核糖体蛋白L24(RPL24)、核糖体蛋白L26(RPL26)、核糖体蛋白L27(RPL27)、核糖体蛋白L30(RPL30)、核糖体蛋白L27a(RPL27A)、核糖体蛋白L28(RPL28)、核糖体蛋白L29(RPL29)、核糖体蛋白L31(RPL31)、核糖体蛋白L32(RPL32)、核糖体蛋白L35a(RPL35A)、核糖体蛋白L37(RPL37)、核糖体蛋白L37a(RPL37A)、核糖体蛋白L38(RPL38)、核糖体蛋白L39(RPL39)、核糖体蛋白,Large,P0(RPLP0)、核糖体蛋白,Large,P1(RPLP1)、核糖体蛋白,Large,P2(RPLP2)、核糖体蛋白S3(RPS3)、核糖体蛋白S3A(RPS3A)、核糖体蛋白S4,X-连锁的(RPS4X)、核糖体蛋白S4,Y-连锁的1(RPS4Y1)、核糖体蛋白S5(RPS5)、核糖体蛋白S6(RPS6)、核糖体蛋白S7(RPS7)、核糖体蛋白S8(RPS8)、核糖体蛋白S9(RPS9)、核糖体蛋白S10(RPS10)、核糖体蛋白S11(RPS11)、核糖体蛋白S12(RPS12)、核糖体蛋白S13(RPS13)、核糖体蛋白S15(RPS15)、核糖体蛋白S15a(RPS15A)、核糖体蛋白S16(RPS16)、核糖体蛋白S19(RPS19)、核糖体蛋白S20(RPS20)、核糖体蛋白S21(RPS21)、核糖体蛋白S23(RPS23)、核糖体蛋白S25(RPS25)、核糖体蛋白S26(RPS26)、核糖体蛋白S27(RPS27)、核糖体蛋白S27a(RPS27a)、核糖体蛋白S28(RPS28)、核糖体蛋白S29(RPS29)、核糖体蛋白L15(RPL15)、核糖体蛋白S2(RPS2)、核糖体蛋白L14(RPL14)、核糖体蛋白S14(RPS14)、核糖体蛋白L10(RPL10)、核糖体蛋白L10a(RPL10A)、核糖体蛋白L35(RPL35)、核糖体蛋白L13a(RPL13A)、核糖体蛋白L36(RPL36)、核糖体蛋白L36a(RPL36A)、核糖体蛋白L41(RPL41)、核糖体蛋白S18(RPS18)、核糖体蛋白S24(RPS24)、核糖体蛋白L8(RPL8)、核糖体蛋白L34(RPL34)、核糖体蛋白S17(RPS17)、核糖体蛋白SA(RPSA)、泛蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)、Finkel-Biskis-Reilly鼠肉瘤病毒(FBR-MuSV)遍在表达的(FAU)、核糖体蛋白L22-样蛋白1(RPL22L1)、核糖体蛋白S17(RPS17)、核糖体蛋白L39-样蛋白(RPL39L)、核糖体蛋白L10-样蛋白(RPL10L)、核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)、核糖体蛋白L3-样蛋白(RPL3L)、核糖体蛋白S27-样蛋白(RPS27L)、核糖体蛋白L26-样蛋白1(RPL26L1)、核糖体蛋白L7-样蛋白1(RPL7L1)、核糖体蛋白L13a假基因(RPL13AP)、核糖体蛋白L37a假基因8(RPL37AP8)、核糖体蛋白S10假基因5(RPS10P5)、核糖体蛋白S26假基因11(RPS26P11)、核糖体蛋白L39假基因5(RPL39P5)、核糖体蛋白,Large,P0假基因6(RPLP0P6)和核糖体蛋白L36假基因14(RPL36P14)。
20.根据权利要求1至19中任一项所述的人工核酸分子,其中所述至少一个3’-UTR元件包含或由以下组成:具有与选自由SEQ ID NOs:10至205组成的组的核酸序列至少约1、2、3、4、5、10、15、20、30或40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%的同一性的核酸序列,或其中所述至少一个3’UTR元件包含或由以下组成:与选自由SEQ ID NOs:10至205组成的组的核酸序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%的同一性的核酸序列的片段。
21.根据权利要求20所述的人工核酸分子,其中所述片段呈现3至约500个核苷酸之间,优选5至约150个核苷酸之间,更优选10至100个核苷酸之间,甚至更优选15至90之间,最优选20至70之间的长度。
22.根据权利要求1至21中任一项所述的人工核酸分子,其中所述至少一个3’-UTR元件呈现3至约500个核苷酸之间,优选5至约150个核苷酸之间,更优选10至100个核苷酸之间,甚至更优选15至90之间,最优选20至70之间的长度。
23.根据权利要求1至22中任一项所述的人工核酸分子,其还包含5’-帽结构、聚胞苷酸序列、组蛋白茎环、和/或IRES-基序。
24.根据权利要求1至23中任一项所述的人工核酸分子,其中所述组蛋白茎环包含根据SEQ ID NO:5的序列。
25.根据权利要求1至24中任一项所述的人工核酸分子,其中所述人工核酸分子,优选可读框,是至少部分G/C修饰的,优选其中与野生型可读框相比,所述可读框的G/C含量增加。
26.根据权利要求1至25中任一项所述的人工核酸分子,其中所述可读框包含密码子优化的区域,优选其中所述可读框是密码子优化的。
27.根据权利要求1至26中任一项所述的人工核酸分子,其是RNA,优选mRNA分子。
28.一种载体,其包含
a.可读框和/或克隆位点;和
b.至少一个3’-非翻译区元件(3’-UTR元件),其包含源自核糖体蛋白基因的3’-UTR或源自核糖体蛋白基因的3’-UTR的变体的核酸序列。
29.根据权利要求28所述的载体,其中所述至少一个3’-UTR元件包含或由以下核酸序列组成:所述核酸序列源自真核核糖体蛋白基因的3’-UTR,优选源自脊椎动物核糖体蛋白基因的3’UTR,更优选源自哺乳动物核糖体蛋白基因的3’-UTR,甚至更优选源自灵长类核糖体蛋白基因,尤其是人核糖体蛋白基因的3’UTR。
30.根据权利要求28或29所述的载体,其中所述可读框(ORF)不编码报告基因或不源自报告基因,其中所述报告基因优选为不选自由以下各项组成的组:珠蛋白(尤其是β-珠蛋白)、荧光素酶蛋白、β-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)和GFP蛋白或其变体,优选为不是EGFP,或呈现与珠蛋白、荧光素酶蛋白或GFP蛋白至少70%序列同一性的变体。
31.根据权利要求28至30中任一项所述的载体,其中所述可读框(ORF)不编码人核糖体蛋白S6(RPS6)、人核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)或拟南芥核糖体蛋白S16(RPS16)。
32.根据权利要求28至31中任一项所述的载体,其中所述可读框(ORF)不编码核糖体蛋白S6(RPS6)、核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)或核糖体蛋白S16(RPS16)。
33.根据权利要求28至32中任一项所述的载体,其中所述可读框(ORF)不编码核糖体蛋白基因,优选不编码真核核糖体蛋白基因。
34.根据权利要求28至33中任一项所述的载体,其中所述3’-UTR不源自病毒。
35.根据权利要求28至34中任一项所述的载体,其中所述载体包含另外的5’-元件,优选为5’-UTR、启动子,或5’-UTR和含启动子的序列。
36.根据权利要求35所述的载体,其中所述5’-UTR是5’-TOP UTR。
37.根据权利要求35或36所述的载体,其中所述5’-UTR不包含5’TOP基序。
38.根据权利要求28至37中任一项所述的载体,其中所述3’-UTR与所述ORF异源。
39.根据权利要求28至38中任一项所述的载体,其中所述人工核酸分子还包含5’-UTR并且其中所述3’-UTR、所述ORF和所述5’-UTR全部彼此异源。
40.根据权利要求28至39中任一项所述的载体,其中所述3’-UTR,优选所述载体,不包含聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号,
其中所述3’-UTR,优选所述载体,还包含聚腺苷酸序列和/或聚腺苷酸化信号。
41.根据权利要求40所述的载体,其中所述聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号位于所述3’-UTR元件的3’。
42.根据权利要求40或41所述的载体,其中所述聚腺苷酸化信号包含共有序列NN(U/T)ANA,其中N=A或U,优选为AA(U/T)AAA或A(U/T)(U/T)AAA。
43.根据权利要求40至42中任一项所述的载体,其中所述聚腺苷酸化信号,优选所述共有序列NNUANA,位于3’-UTR元件的3’-末端下游小于约50个核苷酸处。
44.根据权利要求40至43中任一项所述的载体,其中所述聚腺苷酸序列具有约20至约300个腺嘌呤核苷酸,优选约40至约200个腺嘌呤核苷酸,更优选约50至约100个腺嘌呤核苷酸,甚至更优选约60至约70个腺嘌呤核苷酸的长度。
45.根据权利要求28至44中任一项所述的载体,其中所述至少一个3’-UTR元件包含或由以下核酸序列组成,所述核酸序列源自选自由以下各项组成的组的序列的3’-UTR:核糖体蛋白L9(RPL9)、核糖体蛋白L3(RPL3)、核糖体蛋白L4(RPL4)、核糖体蛋白L5(RPL5)、核糖体蛋白L6(RPL6)、核糖体蛋白L7(RPL7)、核糖体蛋白L7a(RPL7A)、核糖体蛋白L11(RPL11)、核糖体蛋白L12(RPL12)、核糖体蛋白L13(RPL13)、核糖体蛋白L23(RPL23)、核糖体蛋白L18(RPL18)、核糖体蛋白L18a(RPL18A)、核糖体蛋白L19(RPL19)、核糖体蛋白L21(RPL21)、核糖体蛋白L22(RPL22)、核糖体蛋白L23a(RPL23A)、核糖体蛋白L17(RPL17)、核糖体蛋白L24(RPL24)、核糖体蛋白L26(RPL26)、核糖体蛋白L27(RPL27)、核糖体蛋白L30(RPL30)、核糖体蛋白L27a(RPL27A)、核糖体蛋白L28(RPL28)、核糖体蛋白L29(RPL29)、核糖体蛋白L31(RPL31)、核糖体蛋白L32(RPL32)、核糖体蛋白L35a(RPL35A)、核糖体蛋白L37(RPL37)、核糖体蛋白L37a(RPL37A)、核糖体蛋白L38(RPL38)、核糖体蛋白L39(RPL39)、核糖体蛋白,Large,P0(RPLP0)、核糖体蛋白,Large,P1(RPLP1)、核糖体蛋白,Large,P2(RPLP2)、核糖体蛋白S3(RPS3)、核糖体蛋白S3A(RPS3A)、核糖体蛋白S4,X-连锁的(RPS4X)、核糖体蛋白S4,Y-连锁的1(RPS4Y1)、核糖体蛋白S5(RPS5)、核糖体蛋白S6(RPS6)、核糖体蛋白S7(RPS7)、核糖体蛋白S8(RPS8)、核糖体蛋白S9(RPS9)、核糖体蛋白S10(RPS10)、核糖体蛋白S11(RPS11)、核糖体蛋白S12(RPS12)、核糖体蛋白S13(RPS13)、核糖体蛋白S15(RPS15)、核糖体蛋白S15a(RPS15A)、核糖体蛋白S16(RPS16)、核糖体蛋白S19(RPS19)、核糖体蛋白S20(RPS20)、核糖体蛋白S21(RPS21)、核糖体蛋白S23(RPS23)、核糖体蛋白S25(RPS25)、核糖体蛋白S26(RPS26)、核糖体蛋白S27(RPS27)、核糖体蛋白S27a(RPS27a)、核糖体蛋白S28(RPS28)、核糖体蛋白S29(RPS29)、核糖体蛋白L15(RPL15)、核糖体蛋白S2(RPS2)、核糖体蛋白L14(RPL14)、核糖体蛋白S14(RPS14)、核糖体蛋白L10(RPL10)、核糖体蛋白L10a(RPL10A)、核糖体蛋白L35(RPL35)、核糖体蛋白L13a(RPL13A)、核糖体蛋白L36(RPL36)、核糖体蛋白L36a(RPL36A)、核糖体蛋白L41(RPL41)、核糖体蛋白S18(RPS18)、核糖体蛋白S24(RPS24)、核糖体蛋白L8(RPL8)、核糖体蛋白L34(RPL34)、核糖体蛋白S17(RPS17)、核糖体蛋白SA(RPSA)、泛蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)、Finkel-Biskis-Reilly鼠肉瘤病毒(FBR-MuSV)遍在表达的(FAU)、核糖体蛋白L22-样蛋白1(RPL22L1)、核糖体蛋白S17(RPS17)、核糖体蛋白L39-样蛋白(RPL39L)、核糖体蛋白L10-样蛋白(RPL10L)、核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)、核糖体蛋白L3-样蛋白(RPL3L)、核糖体蛋白S27-样蛋白(RPS27L)、核糖体蛋白L26-样蛋白1(RPL26L1)、核糖体蛋白L7-样蛋白1(RPL7L1)、核糖体蛋白L13a假基因(RPL13AP)、核糖体蛋白L37a假基因8(RPL37AP8)、核糖体蛋白S10假基因5(RPS10P5)、核糖体蛋白S26假基因11(RPS26P11)、核糖体蛋白L39假基因5(RPL39P5)、核糖体蛋白,Large,P0假基因6(RPLP0P6)和核糖体蛋白L36假基因14(RPL36P14)。
46.根据权利要求28至45中任一项所述的载体,其中所述至少一个3’-UTR元件包含或由以下组成:与选自由SEQ ID NOs:10至205组成的组的序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%的同一性的核酸序列,或其中所述至少一个3’-UTR元件包含或由以下组成:与选自由SEQ ID NOs:10至205组成的组的序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%的同一性的核酸序列的片段。
47.根据权利要求46所述的载体,其中所述片段呈现3至约500个核苷酸之间,优选5至约150个核苷酸之间,更优选10至100个核苷酸之间,甚至更优选15至90之间,最优选20至70之间的长度。
48.根据权利要求28-47中任一项所述的载体,其中所述至少一个3’-UTR元件呈现3至约500个核苷酸之间,优选5至约150个核苷酸之间,更优选10至100个核苷酸之间,甚至更优选15至90之间,最优选20至70之间的长度。
49.根据权利要求28至48中任一项所述的载体,其还包含聚胞苷酸序列、组蛋白茎环、和/或IRES-基序。
50.根据权利要求28至49中任一项所述的载体,其是至少部分G/C修饰的,优选其中所述可读框是至少部分G/C修饰的,优选其中与野生型可读框相比,所述可读框的G/C含量增加。
51.根据权利要求28至50中任一项所述的载体,其中所述可读框包含密码子优化的区域,优选其中所述可读框是密码子优化的。
52.根据权利要求28至51中任一项所述的载体,其是DNA载体。
53.根据权利要求28至52中任一项所述的载体,其是质粒载体或病毒载体,优选为质粒载体。
54.根据权利要求28至53中任一项所述的载体,其包含根据权利要求1-25中任一项所述的人工核酸分子。
55.根据权利要求28至54中任一项所述的载体,其是环形分子。
56.根据权利要求55所述的载体,其中编码链的所述聚腺苷酸序列、所述聚胞苷酸序列、所述组蛋白茎环或所述3’-UTR元件通过用于线性化环形载体分子的限制性位点以5’→3’方向相接。
57.一种细胞,其包含根据权利要求1-27中任一项所述的人工核酸分子或根据权利要求28至56中任一项所述的载体。
58.根据权利要求57所述的细胞,其是哺乳动物细胞。
59.根据权利要求57或58所述的细胞,其是哺乳动物受试者的细胞,优选为哺乳动物受试者,优选人受试者的分离的细胞。
60.一种药物组合物,其包含根据权利要求1-27中任一项所述的人工核酸分子、根据权利要求28至56中任一项所述的载体、或根据权利要求57至59中任一项所述的细胞。
61.根据权利要求60所述的药物组合物,其还包含一种以上药用载体、稀释剂和/或赋形剂和/或一种以上佐剂。
62.根据权利要求1-27中任一项所述的人工核酸分子,根据权利要求28至56中任一项所述的载体,根据权利要求57至59中任一项所述的细胞,或根据权利要求60或61所述的药物组合物,其用作药物。
63.根据权利要求1-27中任一项所述的人工核酸分子,根据权利要求28至56中任一项所述的载体,根据权利要求57至59中任一项所述的细胞,或根据权利要求60或61所述的药物组合物,其用作疫苗或用于基因治疗。
64.一种用于治疗或预防病症的方法,其包括将根据权利要求1-27中任一项所述的人工核酸分子,根据权利要求28至56中任一项所述的载体,根据权利要求57至59中任一项所述的细胞,或根据权利要求60或61所述的药物组合物施用给有其需要的受试者。
65.一种治疗或预防病症的方法,其包括用根据权利要求1-27中任一项所述的人工核酸分子或用根据权利要求28至56中任一项所述的载体转染细胞。
66.根据权利要求65所述的方法,其中细胞的转染在体外/离体进行并且将转染的细胞施用给有其需要的受试者,优选为人患者。
67.根据权利要求66所述的方法,其中要体外转染的细胞是受试者,优选人患者的分离的细胞。
68.根据权利要求64至67中任一项所述的方法,其是疫苗接种方法或基因治疗方法。
69.一种用于增强、稳定和/或延长来自人工核酸分子,优选来自mRNA分子或载体的蛋白生产的方法,所述方法包括将核酸分子,优选mRNA分子或载体,与3’-UTR元件关联的步骤,其中所述3’-UTR元件包含或由源自核糖体蛋白基因的3’-UTR的核酸序列组成。
70.3’-UTR元件用于增强、稳定和/或延长来自核酸分子,优选来自mRNA分子或载体的蛋白生产的用途,其中所述3’-UTR元件包含或由源自核糖体蛋白基因的3’UTR的核酸序列组成。
71.根据权利要求69所述的方法或根据权利要求70所述的用途,其中所述3’-UTR元件包含或由以下核酸序列组成,所述核酸序列源自真核核糖体蛋白基因的3’-UTR,优选源自脊椎动物核糖体蛋白基因的3’-UTR,更优选源自哺乳动物核糖体蛋白基因的3’-UTR,甚至更优选源自灵长类核糖体蛋白基因,尤其是人核糖体蛋白基因的3’-UTR。
72.根据权利要求69至71中任一项所述的方法或用途,其中所述3’-UTR元件包含或由以下核酸序列组成,所述核酸序列源自选自由以下各项组成的组的序列的3’-UTR:核糖体蛋白L9(RPL9)、核糖体蛋白L3(RPL3)、核糖体蛋白L4(RPL4)、核糖体蛋白L5(RPL5)、核糖体蛋白L6(RPL6)、核糖体蛋白L7(RPL7)、核糖体蛋白L7a(RPL7A)、核糖体蛋白L11(RPL11)、核糖体蛋白L12(RPL12)、核糖体蛋白L13(RPL13)、核糖体蛋白L23(RPL23)、核糖体蛋白L18(RPL18)、核糖体蛋白L18a(RPL18A)、核糖体蛋白L19(RPL19)、核糖体蛋白L21(RPL21)、核糖体蛋白L22(RPL22)、核糖体蛋白L23a(RPL23A)、核糖体蛋白L17(RPL17)、核糖体蛋白L24(RPL24)、核糖体蛋白L26(RPL26)、核糖体蛋白L27(RPL27)、核糖体蛋白L30(RPL30)、核糖体蛋白L27a(RPL27A)、核糖体蛋白L28(RPL28)、核糖体蛋白L29(RPL29)、核糖体蛋白L31(RPL31)、核糖体蛋白L32(RPL32)、核糖体蛋白L35a(RPL35A)、核糖体蛋白L37(RPL37)、核糖体蛋白L37a(RPL37A)、核糖体蛋白L38(RPL38)、核糖体蛋白L39(RPL39)、核糖体蛋白,Large,P0(RPLP0)、核糖体蛋白,Large,P1(RPLP1)、核糖体蛋白,Large,P2(RPLP2)、核糖体蛋白S3(RPS3)、核糖体蛋白S3A(RPS3A)、核糖体蛋白S4,X-连锁的(RPS4X)、核糖体蛋白S4,Y-连锁的1(RPS4Y1)、核糖体蛋白S5(RPS5)、核糖体蛋白S6(RPS6)、核糖体蛋白S7(RPS7)、核糖体蛋白S8(RPS8)、核糖体蛋白S9(RPS9)、核糖体蛋白S10(RPS10)、核糖体蛋白S11(RPS11)、核糖体蛋白S12(RPS12)、核糖体蛋白S13(RPS13)、核糖体蛋白S15(RPS15)、核糖体蛋白S15a(RPS15A)、核糖体蛋白S16(RPS16)、核糖体蛋白S19(RPS19)、核糖体蛋白S20(RPS20)、核糖体蛋白S21(RPS21)、核糖体蛋白S23(RPS23)、核糖体蛋白S25(RPS25)、核糖体蛋白S26(RPS26)、核糖体蛋白S27(RPS27)、核糖体蛋白S27a(RPS27a)、核糖体蛋白S28(RPS28)、核糖体蛋白S29(RPS29)、核糖体蛋白L15(RPL15)、核糖体蛋白S2(RPS2)、核糖体蛋白L14(RPL14)、核糖体蛋白S14(RPS14)、核糖体蛋白L10(RPL10)、核糖体蛋白L10a(RPL10A)、核糖体蛋白L35(RPL35)、核糖体蛋白L13a(RPL13A)、核糖体蛋白L36(RPL36)、核糖体蛋白L36a(RPL36A)、核糖体蛋白L41(RPL41)、核糖体蛋白S18(RPS18)、核糖体蛋白S24(RPS24)、核糖体蛋白L8(RPL8)、核糖体蛋白L34(RPL34)、核糖体蛋白S17(RPS17)、核糖体蛋白SA(RPSA)、泛蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)、Finkel-Biskis-Reilly鼠肉瘤病毒(FBR-MuSV)遍在表达的(FAU)、核糖体蛋白L22-样蛋白1(RPL22L1)、核糖体蛋白S17(RPS17)、核糖体蛋白L39-样蛋白(RPL39L)、核糖体蛋白L10-样蛋白(RPL10L)、核糖体蛋白L36a-样蛋白(RPL36AL)、核糖体蛋白L3-样蛋白(RPL3L)、核糖体蛋白S27-样蛋白(RPS27L)、核糖体蛋白L26-样蛋白1(RPL26L1)、核糖体蛋白L7-样蛋白1(RPL7L1)、核糖体蛋白L13a假基因(RPL13AP)、核糖体蛋白L37a假基因8(RPL37AP8)、核糖体蛋白S10假基因5(RPS10P5)、核糖体蛋白S26假基因11(RPS26P11)、核糖体蛋白L39假基因5(RPL39P5)、核糖体蛋白,Large,P0假基因6(RPLP0P6)和核糖体蛋白L36假基因14(RPL36P14)。
73.根据权利要求69至72中任一项所述的方法或用途,其中所述3’-UTR元件包含或由以下组成:与选自由SEQ ID NOs:10至205组成的组的序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%的同一性的核酸序列,或其中所述3’-UTR元件包含或由以下组成:与选自由SEQ ID NOs:10至205组成的组的序列具有至少约40%,优选至少约50%,优选至少约60%,优选至少约70%,更优选至少约80%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约95%,甚至更优选至少约99%的同一性的核酸序列的片段。
74.根据权利要求73所述的方法或用途,其中所述片段呈现3至约500个核苷酸之间,优选5至约150个核苷酸之间,更优选10至100个核苷酸之间,甚至更优选15至90之间,最优选20至70之间的长度。
75.根据权利要求69至73中任一项所述的方法或用途,其中所述3’-UTR元件呈现3至约500个核苷酸之间,优选5至约150个核苷酸之间,更优选10至100个核苷酸之间,甚至更优选15至90之间,最优选20至70之间的长度。
76.一种试剂盒或成套试剂,其包含根据权利要求1-27中任一项所述的人工核酸分子,根据权利要求28至56中任一项所述的载体,根据权利要求57至59中任一项所述的细胞,和/或根据权利要求60或61所述的药物组合物。
77.根据权利要求76所述的试剂盒,其还包含使用说明、用于转染的细胞、佐剂、药物组合物的给药工具、药用载体和/或用于溶解或稀释所述人工核酸分子、所述载体、所述细胞或所述药物组合物的药用溶液。
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