TW202233232A - 遞送mRNA疫苗的脂質奈米顆粒 - Google Patents

Abstract

提供了用於遞送核酸如mRNA的新型脂質奈米顆粒。還提供了製備和使用用於遞送核酸如mRNA的脂質奈米顆粒的方法。

Description

遞送mRNA疫苗的脂質奈米顆粒

相關申請的交叉引用

本申請要求2020年11月6日提交的美國臨時申請號63/110,965、2021年6月18日提交的美國臨時申請號63/212,523和歐洲優先權申請號21315198.8的優先權權益，將每一個的內容出於所有目的通過引用以其整體而併入。

基於信使RNA（mRNA）的疫苗為傳統次單位疫苗提供了有希望的替代品，後者含有源自病原體的抗原蛋白。抗原蛋白通常是重組製備的，並且需要細菌發酵和/或細胞培養以及複雜的純化。基於mRNA的疫苗允許在接種疫苗的受試者中重新（de novo）表現複雜的抗原，這進而允許抗原的正確的轉譯後修飾和呈遞處於其自然構形的抗原。與傳統技術不同，mRNA疫苗的製造不需要複雜且昂貴的細菌發酵、組織培養和純化過程。此外，一旦建立，mRNA疫苗的製造方法便可以用於各種抗原，使得能夠快速開發和部署mRNA疫苗。進一步地，mRNA疫苗是固有的安全遞送載體，因為它們僅暫態表現抗原並不整合到宿主基因組中。因為由mRNA編碼的抗原在接種疫苗的個體中體內地產生，所以mRNA疫苗特別有效地引發體液免疫和T細胞介導的免疫兩者。

然而，RNA不穩定並且經受快速降解。也沒有促進RNA的細胞攝取的天然細胞表面受體。實際上，mRNA疫苗的開發一直受到mRNA的體內遞送效率低下的阻礙。因此，仍然需要開發可以改善體內mRNA遞送的疫苗調配物。

本公開文本提供了一種醫藥組成物，所述醫藥組成物包含包封在脂質奈米顆粒（lipid nanoparticle，LNP）中的核酸分子（例如，mRNA分子），其中每種LNP包含莫耳比在35%與45%之間的陽離子脂質、莫耳比在0.25%與2.75%之間的聚乙二醇（polyethylene glycol，PEG）綴合的（PEG化的）脂質、莫耳比在20%與35%之間的基於膽固醇的脂質和莫耳比在25%與35%之間的輔助脂質，其中所有莫耳比均相對於所述LNP的總脂質含量。所述組成物可以用作疫苗，以在有需要的受試者（例如，人類受試者）中引發免疫保護。

在一些實施例中，所述陽離子脂質是OF-02、cKK-E10、GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10或GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14。

在一些實施例中，所述LNP包含莫耳比為40%的陽離子脂質、莫耳比為1.5%的PEG化的脂質、莫耳比為28.5%的基於膽固醇的脂質和莫耳比為30%的輔助脂質。

在一些實施例中，所述陽離子脂質是OF-02、cKK-E10、GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10或GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14，所述PEG化的脂質是二肉豆蔻醯基-PEG2000（DMG-PEG2000），所述基於膽固醇的脂質是膽固醇，和/或所述輔助脂質是1,2-二油醯基-SN-甘油-3-磷醯乙醇胺（DOPE）。在特定實施例中，所述LNP包含莫耳比為40%的OF-02、cKK-E10、GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10或GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14，莫耳比為1.5%的DMG-PEG2000，莫耳比為28.5%的膽固醇，和莫耳比為30%的DOPE。

在一些實施例中，所述LNP包含1至20個、視情況地5至10或6至8個核酸分子。在一些實施例中，所述LNP包含一種或多種編碼抗原（例如，病毒抗原如流感病毒抗原、或細菌抗原）的mRNA分子。

在一些實施例中，所述LNP包含兩個或更多個mRNA分子，其中各mRNA分子編碼不同的抗原，視情況地其中所述不同的抗原來自相同的病原體或來自不同的病原體。在一些實施例中，所述組成物包含兩個或更多個LNP，其中各LNP包含編碼不同抗原的mRNA，視情況地其中所述不同的抗原來自相同的病原體或來自不同的病原體。

例如，所述組成物可以包含兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個或更多個編碼以下抗原的mRNA分子：(i) 不同的血球凝集素（HA）抗原，(ii) 不同的神經胺糖酸酶（NA）抗原，或 (iii) 至少一個HA抗原和至少一個NA抗原。

在一些實施例中，mRNA分子包含編碼呼吸道合胞病毒（RSV）F蛋白抗原的開放閱讀框（ORF）。

在一些實施例中，所述RSV F蛋白抗原包含與SEQ ID NO: 16具有至少98%同一性的胺基酸序列，或者由SEQ ID NO: 16的胺基酸序列組成。

在一些實施例中，所述RSV F蛋白抗原是融合前蛋白。

在一些實施例中，所述ORF是經密碼子最佳化的。

在一些實施例中，所述mRNA分子包含至少一個5'非轉譯區（5' UTR）、至少一個3'非轉譯區（3' UTR）和至少一個多腺苷酸化（聚(A)）序列。

在一些實施例中，所述mRNA包含至少一個化學修飾。

在一些實施例中，所述mRNA中至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%的尿嘧啶核苷酸是經化學修飾的。

在一些實施例中，所述ORF中至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%的尿嘧啶核苷酸是經化學修飾的。

在一些實施例中，所述化學修飾選自假尿苷、N1-甲基假尿苷、2-硫代尿苷、4'-硫代尿苷、5-甲基胞嘧啶、2-硫代-l-甲基-1-去氮-假尿苷、2-硫代-l-甲基-假尿苷、2-硫代-5-氮雜-尿苷、2-硫代-二氫假尿苷、2-硫代-二氫尿苷、2-硫代-假尿苷、4-甲氧基-2-硫代-假尿苷、4-甲氧基-假尿苷、4-硫代-l-甲基-假尿苷、4-硫代-假尿苷、5-氮雜-尿苷、二氫假尿苷、5-甲基尿苷、5-甲基尿苷、5-甲氧基尿苷和2'-O-甲基尿苷。

在一些實施例中，所述化學修飾選自假尿苷、N1-甲基假尿苷、5-甲基胞嘧啶、5-甲氧基尿苷及其組合。

在一些實施例中，所述化學修飾是N1-甲基假尿苷。

在一些實施例中，所述mRNA包含與SEQ ID NO: 17所示的核酸序列具有至少80%同一性的核酸序列。

在一些實施例中，所述mRNA包含與SEQ ID NO: 21所示的核酸序列具有至少80%同一性的核酸序列。

在一些實施例中，所述mRNA包含以下結構元件： (i) 具有以下結構的5'帽：

； (ii) 具有SEQ ID NO: 19的核酸序列的5'非轉譯區（5' UTR）； (iii) 具有SEQ ID NO: 17的核酸序列的蛋白質編碼區； (iv) 具有SEQ ID NO: 20的核酸序列的3'非轉譯區（3' UTR）；以及 (v) 聚(A)尾。

在一些實施例中，所述LNP的平均直徑為30至200 nm（例如，80至150 nm）。在一些實施例中，所述組成物包含1至10 mg/mL、視情況地1 mg/mL的所述LNP。所述組成物可以配製用於肌內或皮內注射，並且可以包含磷酸鹽緩衝鹽水。在一些實施例中，所述組成物包含海藻糖，視情況地為所述組成物的10%（w/v）。

在另一個方面，本公開文本提供了一種製備本文的LNP組成物的方法，所述方法包括提供包含所述核酸分子的水性緩衝溶液，提供包含所述陽離子脂質、所述PEG化的脂質、所述基於膽固醇的脂質和所述輔助脂質的兩親溶液，以及以5 : 1至3 : 1、視情況地4 : 1的比率混合所述水性緩衝溶液和所述兩親溶液。所述水性緩衝溶液可以是例如酸性緩衝溶液（例如，包含1 mM檸檬酸鹽和150 mM氯化鈉，pH為約4.5）。所述兩親溶液可以是例如乙醇溶液。

在另一個方面，本公開文本提供了一種在有需要的受試者中引發免疫反應的方法，所述方法包括向所述受試者投予，視情況地肌內、鼻內、靜脈內、皮下或皮內投予預防有效量的本發明的LNP組成物。在一些實施例中，將所述受試者用一或多劑（例如，兩劑）的所述組成物治療，每劑包含1至250 μg，視情況地2.5、5、15、45或135 μg的mRNA。所述劑量可以以2至24週，視情況地4、8、12、16或20週，或者一、二、三、四、五或六個月的間隔給予。

本文還提供了本發明的組成物用於製造藥物的用途，該藥物用於治療有需要的受試者，以及用於治療有需要的受試者的所述組成物。

本公開文本還提供了一種套組，所述套組包含容器，該容器含有單次使用或多次使用劑量的本發明的組成物，視情況地其中所述容器是小瓶或者預填充針筒或注射器。

本發明的其他特徵、目的和優勢在以下的具體實施方式中是清楚的。然而，應當理解，儘管指示了本發明的實施例和方面，但具體實施方式是通過僅說明而非限制的方式給出的。根據具體實施方式，在本發明範圍內的各種變化和修改對於熟習此項技術者而言應變得清楚。

本公開文本提供了用於體內遞送mRNA疫苗的新型脂質奈米顆粒（LNP）調配物以及製備所述疫苗的方法。LNP由以下四種脂質的混合物製成：陽離子脂質、聚乙二醇（PEG）綴合的脂質、基於膽固醇的脂質和輔助脂質。LNP包封mRNA分子。所包封的mRNA分子可以由天然存在的核糖核苷酸、經化學修飾的核苷酸或其組合組成，並且可以各自或共同編碼一或多個蛋白質。

諸位發明人已經通過篩選脂質組分的組合文庫發現了本發明的調配物。本發明的LNP包封並保護mRNA有效載荷免於降解，並且促進所包封的mRNA的細胞攝取。本文所述的LNP具有增強的轉染效率，促進mRNA的內體逃逸，並且因此當與在文獻中所述的工業調配物相比時，具有改善的效力，如通過增強的體內和體外表現所顯示的。例如，與已知的LNP例如三十七烷-6,9,28,31-四烯-19-基 4-(二甲基胺基)丁酸酯（亦稱DLin-MC3-DMA或MC3；Semple等人， Nat Biotechnol.(2010) 28:172-6）或二((Z)-壬-2-烯-1-基) 9-((4-(二甲基胺基)丁醯基)氧基) 十七烷二酸酯（亦稱L319；Maier等人， Mol Ther.(2013) 21(8):1570-8）相比，本文公開的LNP具有優異的穩定性和/或效力概況。如下文進一步所述的，當在體內遞送時，包封編碼hEPO的mRNA的本發明的調配物在6小時和24小時導致高水準的在血液中循環的紅血球生成素，其中相對於工業標準品MC3 LNP調配物，增加高達12倍。類似地，在鼠和非人靈長類動物模型兩者中，已經在其他mRNA（如編碼流感抗原的那些）的情況下發現了高效力。

如本文配製的mRNA疫苗可以用於誘發平衡的免疫反應，包括細胞免疫和體液免疫兩者。因為本發明的LNP調配物的優勢是不具有序列特異性，所以可以使用這些調配物來遞送編碼各種抗原的mRNA，允許在流行或大流行情況下進行快速部署。進一步地，本發明的LNP配製的mRNA疫苗具有高度免疫原性，並且因此提供了顯著的劑量節省可能性。 I. 本發明的脂質奈米顆粒的組成物

本發明的LNP包含四類脂質：(i) 可離子化的脂質；(ii) PEG化的脂質；(iii) 基於膽固醇的脂質；和 (iv) 輔助脂質。 A. 可離子化的脂質

可離子化的脂質促進mRNA包封，並且可以是陽離子脂質。陽離子脂質在低pH下提供帶正電荷的環境，以促進帶負電荷的mRNA藥物的有效包封。

在一些實施例中，陽離子脂質是OF-02：

式 (I) OF-02是OF-Deg-Lin的不可降解的結構類似物。OF-Deg-Lin含有可降解的酯鍵聯以連接二酮哌𠯤核和雙不飽和尾，而OF-02含有不可降解的1,2-胺基-醇鍵聯以連接相同的二酮哌𠯤核和雙不飽和尾（Fenton等人， Adv Mater.(2016) 28:2939；美國專利10,201,618）。本文的示例性LNP調配物，脂質A，含有OF-2。

在一些實施例中，陽離子脂質是cKK-E10（Dong等人， PNAS(2014) 111(11):3955-60；美國專利9,512,073）：

cKK-E10 式 (II) 本文的示例性LNP調配物，脂質B，含有cKK-E10。

在一些實施例中，陽離子脂質是GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1（2-(4-(2-((3-(雙((Z)-2-羥基十八-9-烯-1-基)胺基)丙基)二硫烷基)乙基)哌𠯤-1-基)乙基 4-(雙(2-羥基癸基)胺基)丁酸酯），其是具有哌𠯤核的基於HEPES的二硫化物陽離子脂質，具有式III：

式 (III) 本文的示例性LNP調配物，脂質C，含有GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1。脂質C具有與脂質A或脂質B相同的組成，如果沒有陽離子脂質的差異的話。

在一些實施例中，陽離子脂質是GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10（2-(4-(2-((3-(雙(2-羥基癸基)胺基)丁基)二硫烷基)乙基)哌𠯤-1-基)乙基 4-(雙(2-羥基十二基)胺基)丁酸酯），其是具有哌𠯤核的基於HEPES的二硫化物陽離子脂質，具有式IV：

式 (IV) 本文的示例性LNP調配物，脂質D，含有GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10。脂質D具有與脂質A或脂質B相同的組成，如果沒有陽離子脂質的差異的話。

在一些實施例中，陽離子脂質是GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14（2-(4-(2-((3-(雙(2-羥基十四基)胺基)丙基)二硫烷基)乙基)哌𠯤-1-基)乙基 4-(雙(2-羥基十二基)胺基)丁酸酯），其是具有哌𠯤核的基於HEPES的二硫化物陽離子脂質，具有式V：

式 (V) 本文的示例性LNP調配物，脂質E，含有GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14。脂質E具有與脂質A或脂質B相同的組成，如果沒有陽離子脂質的差異的話。

陽離子脂質GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1 (III)、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10 (IV) 和GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14 (V) 可以根據方案1所述的一般程序合成： 方案 1 ：式 (III) 、 (IV) 和 (V) 的脂質的一般合成方案

可以使用的其他陽離子脂質包括Dong（同上註）和美國專利10,201,618中所述的那些。 B. PEG 化的脂質

PEG化的脂質組分提供了對奈米顆粒的細微性和穩定性的控制。此類組分的添加可以防止複合物聚集，並且提供用於增加脂質-核酸醫藥組成物的循環壽命並增加其至靶組織的遞送的手段（Klibanov等人， FEBS Letters(1990) 268 (1):235-7）。可以選擇這些組分以在體內快速交換出醫藥組成物（例如參見，美國專利5,885,613）。

所考慮的PEG化的脂質包括但不限於長度長達5 kDa的聚乙二醇（PEG）鏈，其共價連接至具有C ₆-C ₂₀（例如，C ₈、C ₁₀、C ₁₂、C ₁₄、C ₁₆或C ₁₈）長度的一或多條烷基鏈的脂質，如衍生化的神經醯胺（例如，N-辛醯基-鞘胺醇-1-[琥珀醯基(甲氧基聚乙二醇)]（C8 PEG神經醯胺））。在一些實施例中，PEG化的脂質是1,2-二肉豆蔻醯基-rac-甘油-3-甲氧基聚乙二醇（DMG-PEG）；1,2-二硬脂醯基-sn-甘油-3-磷醯乙醇胺-聚乙二醇（DSPE-PEG）；1,2-二月桂醯基-sn-甘油-3-磷醯乙醇胺-聚乙二醇（DLPE-PEG）；或1,2-二硬脂醯基-rac-甘油-聚乙二醇（DSG-PEG）。

在特別具示例性的實施例中，PEG具有高分子量，例如2000-2400 g/mol。在一些實施例中，PEG是PEG2000（或PEG-2K）。在特定實施例中，本文的PEG化的脂質是DMG-PEG2000、DSPE-PEG2000、DLPE-PEG2000、DSG-PEG2000或C8 PEG2000。 C. 基於膽固醇的脂質

膽固醇組分為奈米顆粒內的脂質雙層結構提供了穩定性。在一些實施例中，LNP包含一種或多種基於膽固醇的脂質。合適的基於膽固醇的脂質包括例如：DC-Choi（N,N-二甲基-N-乙基甲醯胺基膽固醇）、l,4-雙(3-N-油烯基胺基-丙基)哌𠯤（Gao等人， Biochem Biophys Res Comm. (1991) 179:280；Wolf等人， BioTechniques(1997) 23:139；美國專利5,744,335）、咪唑膽固醇酯（「ICE」；WO 2011/068810）、β-穀固醇、岩藻固醇、豆固醇和膽固醇的其他修飾形式。在一些實施例中，在LNP中使用的基於膽固醇的脂質是膽固醇。 D. 輔助脂質

輔助脂質增強了LNP的結構穩定性，並且説明LNP在內體中逃逸。它改善了mRNA藥物有效載荷的攝取和釋放。在一些實施例中，輔助脂質是兩性離子脂質，其具有用於增強藥物有效載荷的攝取和釋放的促融合特性。輔助脂質的例子是1,2-二油醯基-SN-甘油-3-磷醯乙醇胺（DOPE）；1,2-二硬脂醯基-sn-甘油-3-磷醯膽鹼（DSPC）；1,2-二油醯基-sn-甘油-3-磷酸-L-絲胺酸（DOPS）；1,2-二反油醯基-sn-甘油-3-磷醯乙醇胺（DEPE）；以及1,2-二油醯基-sn-甘油-3-磷醯膽鹼（DPOC）；二棕櫚醯磷脂醯膽鹼（DPPC）；1,2-二月桂醯基-sn-甘油-3-磷醯膽鹼（DLPC）；1,2-二硬脂醯基磷脂醯乙醇胺（DSPE）；和1,2-二月桂醯基-sn-甘油-3-磷醯乙醇胺（DLPE）。

其他示例性輔助脂質是二油醯磷脂醯膽鹼（DOPC）、二油醯磷脂醯甘油（DOPG）、二棕櫚醯磷脂醯甘油（DPPG）、棕櫚醯油醯磷脂醯膽鹼（POPC）、棕櫚醯油醯基-磷脂醯乙醇胺（POPE）、二油醯基-磷脂醯乙醇胺 4-(N-馬來醯亞胺基甲基)-環己烷-l-甲酸酯（DOPE-mal）、二棕櫚醯磷脂醯乙醇胺（DPPE）、二肉豆蔻醯磷醯乙醇胺（DMPE）、磷脂醯絲胺酸、鞘脂、腦苷脂、神經節苷脂、16-O-單甲基PE、16-O-二甲基PE、18-1-反式PE、l-硬脂醯基-2-油醯基-磷脂醯乙醇胺（SOPE）或其組合。

在特定實施例中，輔助脂質是DOPE。在進一步的實施例中，本發明的LNP包含 (i) 選自OF-02、cKK-E10、GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10或GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14的陽離子脂質；(ii) DMG-PEG2000；(iii) 膽固醇；和 (iv) DOPE。 E. 脂質組分的莫耳比

諸位發明人已經發現，上述組分的特定莫耳比對於LNP在遞送mRNA中的有效性是重要的。陽離子脂質、PEG化的脂質、基於膽固醇的脂質和輔助脂質的莫耳比是A : B : C : D，其中A + B + C + D = 100%。在一些實施例中，在LNP中陽離子脂質相對於總脂質的莫耳比（即，A）是35%至45%（例如，38%至42%，如40%）。在一些實施例中，PEG化的脂質組分相對於總脂質的莫耳比（即，B）是0.25%至2.75%（例如，1%至2%，如1.5%）。在一些實施例中，基於膽固醇的脂質相對於總脂質的莫耳比（即，C）是20%至35%（例如，27%至30%，如28.5%）。在一些實施例中，輔助脂質相對於總脂質的莫耳比（即，D）是25%至35%（例如，28%至32%，如30%）。在一些實施例中，（PEG化的脂質 + 膽固醇）組分具有與輔助脂質相同的莫耳量。在一些實施例中，LNP所含有的陽離子脂質與輔助脂質的莫耳比大於1。

在特定實施例中，LNP含有莫耳比為40 : 1.5 : 28.5 : 30的陽離子脂質、PEG化的脂質、基於膽固醇的脂質和輔助脂質。在進一步的具體實施例中，LNP含有40 : 1.5 : 28.5 : 30的 (i) OF-02、cKK-E10、GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10或GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14；(ii) DMG-PEG2000；(iii) 膽固醇；和 (iv) DOPE。

為了計算待放入LNP調配物中的每種脂質的實際量，首先基於所需的N/P比確定陽離子脂質的莫耳量，其中N是陽離子脂質中氮原子的數量，並且P是待由LNP轉運的mRNA中的磷酸基團的數量。接下來，基於陽離子脂質的莫耳量和所選擇的莫耳比計算每種其他脂質的莫耳量。然後使用每種脂質的分子量將這些莫耳量轉化為重量。 F. LNP 的活性成分

本發明的LNP疫苗組成物的活性成分是編碼目的抗原的mRNA。抗原可以是源自病毒的多肽，所述病毒例如流感病毒、冠狀病毒（例如，SARS-CoV-1、SARS-CoV-2或MERS相關病毒）、埃博拉病毒、登革病毒、人免疫缺陷病毒（HIV）、甲型肝炎病毒（HAV）、乙型肝炎病毒（HBV）、丙型肝炎病毒（HCV）、單純皰疹病毒（HSV）、呼吸道合胞病毒（RSV）、鼻病毒、巨細胞病毒（CMV）、寨卡病毒、人乳頭瘤病毒（HPV）、人偏肺病毒（hMPV）、人副流感病毒3型（PIV3）、EB病毒（EBV）、基孔肯雅病毒或呼吸道合胞病毒（RSV）。

抗原還可以源自細菌，例如金黃色葡萄球菌（ Staphylococcus aureus）、莫拉菌屬（ Moraxella）（例如，卡他莫拉菌（ Moraxella catarrhalis）；引起耳炎、呼吸道感染和/或竇炎）、沙眼衣原體（ Chlamydia trachomatis）（引起衣原體）、疏螺旋體屬（ borrelia）（例如，博氏疏螺旋體（ Borrelia burgdorferi），引起萊姆病）、炭疽芽孢桿菌（ Bacillus anthracis）（引起炭疽）、傷寒沙門氏菌（ Salmonella typhi）（引起傷寒熱）、結核分枝桿菌（ Mycobacterium tuberculosis）（引起結核）、痤瘡丙酸桿菌（ Propionibacterium acnes）（引起痤瘡）或不可分型流感嗜血桿菌（ Haemophilus influenzae） 。

在所需的情況下，LNP或LNP調配物可以是多價的。在一些實施例中，LNP可以攜帶編碼來自相同或不同病原體的超過一種抗原（如兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個或更多個抗原）的mRNA。例如，LNP可以攜帶多個mRNA分子，各編碼不同的抗原；或者攜帶可以轉譯成超過一種抗原的多順反子mRNA（例如，各抗原編碼序列由編碼自切割肽（如2A肽）的核苷酸接頭隔開）。攜帶不同mRNA分子的LNP通常包含（包封）每種mRNA分子的多個拷貝。例如，攜帶或包封兩種不同mRNA分子的LNP通常攜帶這兩種不同mRNA分子中的每一種的多個拷貝。

在一些實施例中，單一LNP調配物可以包含多個（例如，兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個或更多個）LNP，各攜帶不同的mRNA。

多價LNP疫苗的例子是含有編碼來自上文列出的病原體的兩個或更多個抗原的mRNA的那些，如包含編碼源自流感病毒的多肽的mRNA的LNP疫苗。在一些實施例中，多價LNP疫苗含有編碼源自兩個或更多個（例如，三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個或十個）選自血球凝集素（例如，血球凝集素1（HA1）和血球凝集素2（HA2））的流感病毒蛋白、神經胺糖酸酶（NA）、核蛋白（NP）、基質蛋白1（M1）、基質蛋白2（M2）、非結構蛋白1（NS1）和非結構蛋白2（NS2）的多肽的mRNA分子。在進一步的實施例中，多價LNP疫苗含有兩個或更多個（例如，三個、四個、五個、六個、七個、八個或更多個）編碼源自HA蛋白、源自NA蛋白以及源自HA和NA蛋白兩者的抗原多肽的mRNA分子。在一些實施例中，編碼抗原多肽的mRNA分子源自不同的流感毒株。

在某些實施例中，組成物可以包含一種或多種編碼A型流感、B型流感和C型流感病毒的抗原的mRNA分子。在一個實施例中，組成物可以包含一或多個編碼A型流感和B型流感病毒的HA和/或NA抗原的mRNA分子。在一個實施例中，A型流感病毒的HA抗原選自亞型H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7、H8、H9、H10、H11、H12、H13、H14、H15、H16、H17和H18。在一個實施例中，A型流感病毒的NA抗原選自亞型N1、N2、N3、N4、N5、N6、N7、N8、N9、N10和N11。在一個實施例中，B型流感病毒的HA和NA抗原來自B型流感/山形譜系。在一個實施例中，B型流感病毒的HA和NA抗原來自B型流感/維多利亞譜系。在一些實施例中，所述一種或多種HA和NA抗原來自世界衛生組織（WHO）在其流感疫苗調配物的年度推薦中所推薦的流感病毒毒株。

在某些實施例中，所述一或多個流感病毒蛋白中的至少一個包含具有從機器學習模型所鑒定或設計的分子序列的流感病毒HA蛋白和/或流感病毒NA蛋白，並且在某些實施例中，所述一或多個核糖核酸分子中的至少一個編碼一或多個具有從機器學習模型所鑒定或設計的分子序列的流感病毒蛋白。

在某些實施例中，組成物包含兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個或更多個編碼以下抗原的mRNA分子：(i) 一或多個HA抗原，(ii) 一或多個NA抗原，或 (iii) 一或多個HA抗原和NA抗原的組合。

在一個實施例中，組成物包含兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個或更多個編碼以下抗原的mRNA分子：(i) 一或多個HA抗原，(ii) 一或多個NA抗原，或 (iii)選自H1N1、H3N2、H2N2、H5N1、H7N9、H7N7、H1N2、H9N2、H7N2、H7N3、H5N2和H10N7亞型和/或B/山形和B/維多利亞譜系的一或多個HA抗原和NA抗原的組合。

在一個實施例中，組成物包含一個編碼H3 HA抗原的mRNA分子、一個編碼H1 HA抗原的mRNA分子、一個編碼來自B型流感/山形譜系的HA抗原的mRNA分子和一個編碼來自B型流感/維多利亞譜系的HA抗原的mRNA分子。

在一個實施例中，組成物包含一個編碼H3 HA抗原的mRNA分子、一個編碼N2 NA抗原的mRNA分子、一個編碼H1 HA抗原的mRNA分子、一個編碼N1 NA抗原的mRNA分子、一個編碼來自B型流感/山形譜系的HA抗原的mRNA分子、一個編碼來自B型流感/山形譜系的NA抗原的mRNA分子、一個編碼來自B型流感/維多利亞譜系的HA抗原的mRNA分子和一個編碼來自B型流感/維多利亞譜系的NA抗原的mRNA分子。

在一個實施例中，組成物進一步包含一或多個編碼具有從機器學習模型所鑒定或設計的分子序列的機器學習流感病毒HA的mRNA分子，其中所述一或多個機器學習流感病毒HA可以選自H1 HA、H3 HA、來自B/維多利亞譜系的HA、來自B/山形譜系的HA或其組合。

當選擇一或多個機器學習流感病毒HA時，可以使用任何機器學習演算法。例如，本文設想的是以下PCT申請號中揭露的任何機器學習演算法和方法：標題為用於設計疫苗的系統和方法（Systems and Methods for Designing Vaccines）的WO 2021/080990 A1以及標題為用於預測生物反應的系統和方法（Systems and Methods for Predicting Biological Responses）的WO 2021/080999 A1，將其兩者均通過引用以其整體併入本文。

mRNA分子可以是未經修飾的（即，僅含有由磷酸二酯鍵連接的天然核糖核苷酸A、U、C和/或G），或者可以是經化學修飾的（例如，包括核苷酸類似物，如假尿苷（例如，N-1-甲基假尿苷）、2'-氟核糖核苷酸和2'-甲氧基核糖核苷酸；和/或硫代磷酸酯鍵）。mRNA分子可以包含5'帽和聚A尾。

RSV F 蛋白：

呼吸道合胞病毒（RSV）是屬於肺泡病毒科（ Pneumoviridae）的反義單鏈RNA病毒。RSV可能引起呼吸道感染。RSV是在表面上具有糖蛋白（G蛋白）、小疏水蛋白（SH蛋白）和融合蛋白（F蛋白）的包膜病毒。

RSV F蛋白負責病毒和宿主細胞膜的融合，並且具有至少三種構形（融合前、中間和融合後構形）。在處於融合前構形（融合前，Pre-F）時，F蛋白以三聚體形式存在，其中主要抗原位點Ø暴露。位點Ø充當由感染RSV的受試者產生的中和抗體的主要目標（參見，Coultas等人，Thorax. 74: 986-993. 2019；McLellan等人，Science. 340(6136): 1113-7. 2013）。在宿主細胞表面上與其目標結合之後，Pre-F經歷構形變化，在此期間位點Ø不再暴露。Pre-F過渡到暫態中間構形，使得F蛋白能夠插入宿主細胞膜中，導致病毒和宿主細胞膜的融合。最終的構形轉變導致更穩定和細長的蛋白質形式（融合後，Post-F）。F蛋白的位點II和位點IV是Post-F所特有的，而位點I存在於Pre-F和Post-F構形兩者中（McLellan等人，J. Virol. 85(15): 7788-7796. 2011）。

如本文所用，術語「F蛋白」或「RSV F蛋白」是指在病毒進入期間負責驅動病毒包膜與宿主細胞膜的融合的RSV蛋白。

如本文所用，術語「RSV F多肽」或「F多肽」是指包含F蛋白的至少一個表位的多肽。

如本文所用，關於RSV F的術語「融合後」是指RSV F的在病毒和細胞膜融合之後出現的穩定構形。

如本文所用，關於RSV F的術語「融合前」是指RSV F的在病毒-細胞相互作用之前所採取的構形。

本文提供了編碼抗原RSV F多肽的mRNA分子。

在一些實施例中，mRNA分子包含編碼呼吸道合胞病毒（RSV）F蛋白抗原的開放閱讀框（ORF）。

在一些實施例中，RSV F蛋白抗原包含與SEQ ID NO: 16所示的胺基酸序列具有至少85%、90%、95%、97%、98%、99%或99.5%同一性的序列。

在一些實施例中，RSV F蛋白抗原包含與SEQ ID NO: 16具有至少98%同一性的胺基酸序列，或者由SEQ ID NO: 16的胺基酸序列組成。

在一些實施例中，mRNA包含與SEQ ID NO: 17所示的核酸序列具有至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性的核酸序列。

在一些實施例中，mRNA包含與SEQ ID NO: 21所示的核酸序列具有至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性的核酸序列。

在一些實施例中，RSV F蛋白抗原是融合前蛋白。

在一些實施例中，其中ORF是經密碼子最佳化的。

在一些實施例中，其中mRNA分子包含至少一個5'非轉譯區（5' UTR）、至少一個3'非轉譯區（3' UTR）和至少一個多腺苷酸化（聚(A)）序列。

在一些實施例中，mRNA包含至少一個化學修飾。

在一些實施例中，mRNA中至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%的尿嘧啶核苷酸是經化學修飾的。

在一些實施例中，ORF中至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%的尿嘧啶核苷酸是經化學修飾的。

在一些實施例中，化學修飾選自假尿苷、N1-甲基假尿苷、2-硫代尿苷、4'-硫代尿苷、5-甲基胞嘧啶、2-硫代-l-甲基-1-去氮-假尿苷、2-硫代-l-甲基-假尿苷、2-硫代-5-氮雜-尿苷、2-硫代-二氫假尿苷、2-硫代-二氫尿苷、2-硫代-假尿苷、4-甲氧基-2-硫代-假尿苷、4-甲氧基-假尿苷、4-硫代-l-甲基-假尿苷、4-硫代-假尿苷、5-氮雜-尿苷、二氫假尿苷、5-甲基尿苷、5-甲基尿苷、5-甲氧基尿苷和2'-O-甲基尿苷。

在一些實施例中，化學修飾選自假尿苷、N1-甲基假尿苷、5-甲基胞嘧啶、5-甲氧基尿苷及其組合。在一些實施例中，化學修飾是N1-甲基假尿苷。

在一些實施例中，mRNA包含以下結構元件： (i) 具有以下結構的5'帽：

； (ii) 具有SEQ ID NO: 19的核酸序列的5'非轉譯區（5' UTR）； (iii) 具有SEQ ID NO: 17的核酸序列的蛋白質編碼區； (iv) 具有SEQ ID NO: 20的核酸序列的3'非轉譯區（3' UTR）；以及 (v) 聚(A)尾。 G. 緩衝液和其他組分

為了穩定核酸和/或LNP（例如，為了延長疫苗產品的保質期），為了促進LNP醫藥組成物的投予，和/或為了增強核酸的體內表現，核酸和/或LNP可以與一或多個載劑、靶向配體、穩定試劑（例如，防腐劑和抗氧化劑）和/或其他醫藥上可接受的賦形劑組合配製。此類賦形劑的例子是對羥基苯甲酸酯、硫柳汞（thimerosal）、硫柳汞鈉（thiomersal）、氯丁醇、苯紮氯銨、螯合劑（例如，EDTA）等。

本公開文本的LNP組成物可以作為冷凍液體形式或凍乾形式提供。可以使用各種冷凍保護劑，包括但不限於蔗糖、海藻糖、葡萄糖、甘露醇、甘露糖、右旋糖等。冷凍保護劑可以構成LNP組成物的5%至30%（w/v）。在一些實施例中，LNP組成物包含海藻糖，例如為5%至30%（例如，10%）（w/v）。一旦用冷凍保護劑配製，LNP組成物便可以在-20ºC至-80ºC下冷凍（或凍乾和冷凍保存）。

可以將LNP組成物在水性緩衝溶液中提供給患者：如果先前冷凍，則解凍，或者如果先前凍乾，則在床邊在水性緩衝溶液中重構。在特別具示例性的實施例中，緩衝溶液是等滲的，並且適用於例如肌內或皮內注射。在一些實施例中，緩衝溶液是磷酸鹽緩衝鹽水（PBS）。 II. RNA

本公開文本的本發明的LNP疫苗組成物可以包含編碼目的抗原的RNA分子（例如，mRNA）。本公開文本的RNA分子可以包含至少一種核糖核酸（RNA），其包含編碼目的抗原的ORF。在某些實施例中，RNA是包含編碼目的抗原的ORF的信使RNA（mRNA）。在某些實施例中，RNA（例如，mRNA）進一步包含至少一個5' UTR、3' UTR、聚(A)尾和/或5'帽。 II.A. 5' 帽

mRNA 5'帽可以提供對大多數真核細胞中發現的核酸酶的抗性，並且促進轉譯效率。已知幾種類型的5'帽。7-甲基鳥苷帽（也稱為「m ⁷G」或「帽-0」）包含鳥苷，其通過5' - 5'三磷酸鍵與第一轉錄核苷酸連接。

通常如下添加5'帽：首先，RNA末端磷酸酶從5'核苷酸中除去一個末端磷酸基團，留下兩個末端磷酸；然後，經由鳥苷醯基轉移酶向末端磷酸中添加鳥苷三磷酸（GTP），產生5 ‘5 ‘5三磷酸鍵聯；然後，通過甲基轉移酶甲基化鳥嘌呤的7-氮。帽結構的例子包括但不限於m7G(5')ppp、(5'(A,G(5')ppp(5')A和G(5')ppp(5')G。另外的帽結構描述於美國公開號US 2016/0032356和美國公開號US 2018/0125989中，將其通過引用併入本文。

多核苷酸的5'加帽可以根據製造商的方案使用以下化學RNA帽類似物在體外轉錄反應期間伴隨完成，以產生5'-鳥苷帽結構：3'-O-Me-m7G(5')ppp(5')G（ARCA帽）；G(5')ppp(5')A；G(5')ppp(5')G；m7G(5')ppp(5')A；m7G(5')ppp(5')G；m7G(5')ppp(5')(2'OMeA)pG；m7G(5')ppp(5')(2'OMeA)pU；m7G(5')ppp(5')(2'OMeG)pG（New England BioLabs，麻塞諸塞州伊普斯威奇；TriLink Biotechnologies）。經修飾的RNA的5'加帽可以使用痘苗病毒加帽酶在轉錄後完成，以產生帽0結構：m7G(5')ppp(5')G。可以使用痘苗病毒加帽酶和2'-O甲基轉移酶兩者產生帽1結構，以產生：m7G(5')ppp(5')G-2'-O-甲基。可以從帽1結構產生帽2結構，然後使用2'-O甲基轉移酶對5'倒數第三個核苷酸進行2'-O-甲基化。可以從帽2結構產生帽3結構，然後使用2'-O甲基轉移酶對5'倒數第四個核苷酸進行2'-O-甲基化。

在某些實施例中，本公開文本的mRNA包含選自以下的5'帽：3'-O-Me-m7G(5')ppp(5')G（ARCA帽）、G(5')ppp(5')A、G(5')ppp(5')G、m7G(5')ppp(5')A、m7G(5')ppp(5')G、m7G(5')ppp(5')(2'OMeA)pG、m7G(5')ppp(5')(2'OMeA)pU和m7G(5')ppp(5')(2'OMeG)pG。

在某些實施例中，本公開文本的mRNA包含以下的5'帽：

。 II.B. 非轉譯區（ UTR ）

在一些實施例中，本公開文本的mRNA包括5'和/或3'非轉譯區（UTR）。在mRNA中，5' UTR在轉錄起始位點處開始並繼續到起始密碼子，但是不包括起始密碼子。3' UTR緊接終止密碼子之後開始並繼續直到轉錄終止訊號。

在一些實施例中，本文公開的mRNA可以包含5' UTR，其包括影響mRNA的穩定性或轉譯的一或多個元件。在一些實施例中，5' UTR可以具有約10至5,000個核苷酸的長度。在一些實施例中，5' UTR可以具有約50至500個核苷酸的長度。在一些實施例中，5' UTR具有至少約10個核苷酸的長度、約20個核苷酸的長度、約30個核苷酸的長度、約40個核苷酸的長度、約50個核苷酸的長度、約100個核苷酸的長度、約150個核苷酸的長度、約200個核苷酸的長度、約250個核苷酸的長度、約300個核苷酸的長度、約350個核苷酸的長度、約400個核苷酸的長度、約450個核苷酸的長度、約500個核苷酸的長度、約550個核苷酸的長度、約600個核苷酸的長度、約650個核苷酸的長度、約700個核苷酸的長度、約750個核苷酸的長度、約800個核苷酸的長度、約850個核苷酸的長度、約900個核苷酸的長度、約950個核苷酸的長度、約1,000個核苷酸的長度、約1,500個核苷酸的長度、約2,000個核苷酸的長度、約2,500個核苷酸的長度、約3,000個核苷酸的長度、約3,500個核苷酸的長度、約4,000個核苷酸的長度、約4,500個核苷酸的長度或約5,000個核苷酸的長度。

在一些實施例中，本文公開的mRNA可以包含3' UTR，其包含以下中的一或多個：多腺苷酸化訊號、影響mRNA在細胞中的位置的穩定性的蛋白質的結合位點或miRNA的一或多個結合位點。在一些實施例中，3' UTR可以具有50至5,000個核苷酸或更長的長度。在一些實施例中，3' UTR可以具有50至1,000個核苷酸或更長的長度。在一些實施例中，3' UTR具有至少約50個核苷酸的長度、約100個核苷酸的長度、約150個核苷酸的長度、約200個核苷酸的長度、約250個核苷酸的長度、約300個核苷酸的長度、約350個核苷酸的長度、約400個核苷酸的長度、約450個核苷酸的長度、約500個核苷酸的長度、約550個核苷酸的長度、約600個核苷酸的長度、約650個核苷酸的長度、約700個核苷酸的長度、約750個核苷酸的長度、約800個核苷酸的長度、約850個核苷酸的長度、約900個核苷酸的長度、約950個核苷酸的長度、約1,000個核苷酸的長度、約1,500個核苷酸的長度、約2,000個核苷酸的長度、約2,500個核苷酸的長度、約3,000個核苷酸的長度、約3,500個核苷酸的長度、約4,000個核苷酸的長度、約4,500個核苷酸的長度或約5,000個核苷酸的長度。

在一些實施例中，本文公開的mRNA可以包含5'或3' UTR，其源自與由mRNA轉錄物編碼的基因不同的基因（即，UTR是異源UTR）。

在某些實施例中，5'和/或3' UTR序列可以源自穩定的mRNA（例如，珠蛋白、肌動蛋白、GAPDH、微管蛋白、組蛋白或檸檬酸循環酶），以增加mRNA的穩定性。例如，5' UTR序列可以包括部分序列的CMV立即早期1（IE1）基因或其片段，以改善mRNA的核酸酶抗性和/或改善mRNA的半衰期。還考慮了將編碼人類生長激素（hGH）的序列或其片段包含到mRNA的3'端或非轉譯區。通常，相對於其未經修飾的對應物，這些修飾可以改善mRNA的穩定性和/或藥代動力學特性（例如，半衰期），並且包括例如為改善mRNA對體內核酸酶消化的這種抗性而進行的修飾。

示例性5' UTR包括源自CMV立即早期1（IE1）基因的序列（美國公開號2014/0206753和2015/0157565，將其中的每一個通過引用併入本文）或序列GGGAUCCUACC（SEQ ID NO: 22）（美國公開號2016/0151409，通過引用併入本文）。

在各種實施例中，5' UTR可以源自TOP基因的5' UTR。TOP基因的特徵通常在於5'-末端寡嘧啶（TOP）束的存在。此外，大多數TOP基因的特徵在於生長相關的轉譯調節。然而，具有組織特異性轉譯調節的TOP基因也是已知的。在某些實施例中，源自TOP基因的5' UTR的5' UTR缺乏5' TOP基序（寡嘧啶束）（例如，美國公開號2017/0029847、2016/0304883、2016/0235864和2016/0166710，將其中的每一個通過引用併入本文）。

在某些實施例中，5' UTR源自核糖體蛋白大32（L32）基因（美國公開號2017/0029847，同上）。

在某些實施例中，5' UTR源自羥基類固醇（17-b）脫氫酶4基因（HSD17B4）的5' UTR（美國公開號2016/0166710，同上）。

在某些實施例中，5' UTR源自ATP5A1基因的5' UTR（美國公開號2016/0166710，同上）。

在一些實施例中，使用內部核糖體進入位點（IRES）代替5' UTR。

在一些實施例中，5'UTR包含SEQ ID NO: 19所示的核酸序列。在一些實施例中，3'UTR包含SEQ ID NO: 20所示的核酸序列。5' UTR和3' UTR進一步詳細描述於WO 2012/075040（通過引用併入本文）中。 II.C. 多腺苷酸化尾

如本文所用，術語「聚(A)序列」、「聚(A)尾」和「聚(A)區」是指mRNA分子的3'端處的腺苷核苷酸序列。聚(A)尾可以為mRNA賦予穩定性，並且保護其免於外切核酸酶降解。聚(A)尾可以增強轉譯。在一些實施例中，聚(A)尾實質上是同聚物的。例如，100個腺苷核苷酸的聚(A)尾實質上可以具有100個核苷酸的長度。在某些實施例中，聚(A)尾可以被與腺苷核苷酸不同的至少一個核苷酸（例如，不是腺苷核苷酸的核苷酸）中斷。例如，100個腺苷核苷酸的聚(A)尾可以具有超過100個核苷酸的長度（包含100個腺苷核苷酸和與腺苷核苷酸不同的至少一個核苷酸或一段核苷酸）。在某些實施例中，聚(A)尾包含序列AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAUAUGACUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA（SEQ ID NO: 23）。

如本文所用，「聚(A)尾」通常涉及RNA。然而，在本公開文本的上下文中，所述術語同樣涉及DNA分子中的相應序列（例如，「聚(T)序列」）。

聚(A)尾可以包含約10至約500個腺苷核苷酸、約10至約200個腺苷核苷酸、約40至約200個腺苷核苷酸或約40至約150個腺苷核苷酸。聚(A)尾的長度可以是至少約10、50、75、100、150、200、250、300、350、400、450或500個腺苷核苷酸。

在核酸是RNA的一些實施例中，在RNA體外轉錄期間從DNA範本獲得核酸的聚(A)尾。在某些實施例中，通過常用的化學合成方法在體外獲得聚(A)尾，而無需從DNA範本轉錄。在各種實施例中，使用可商購獲得的多腺苷酸化套組和相應的方案通過對RNA進行酶促多腺苷酸化（在RNA體外轉錄後），或者可替代地，通過使用固定化的聚(A)聚合酶，例如使用如WO2016/174271中所述的方法和手段，產生聚(A)尾。

核酸可以包含通過酶促多腺苷酸化獲得的聚(A)尾，其中大部分核酸分子包含約100（+/-20）至約500（+/-50）或約250（+/-20）個腺苷核苷酸。

在一些實施例中，核酸可以包含源自範本DNA的聚(A)尾，並且可以另外包含通過酶促多腺苷酸化產生的至少一個另外的聚(A)尾，例如如WO2016/091391（通過引用併入本文）中所述。

在某些實施例中，核酸包含至少一個多腺苷酸化訊號。

在各種實施例中，核酸可以包含至少一個聚(C)序列。

如本文所用，術語「聚(C)序列」旨在是多達約200個胞嘧啶核苷酸的胞嘧啶核苷酸序列。在一些實施例中，聚(C)序列包含約10至約200個胞嘧啶核苷酸、約10至約100個胞嘧啶核苷酸、約20至約70個胞嘧啶核苷酸、約20至約60個胞嘧啶核苷酸或約10至約40個胞嘧啶核苷酸。在一些實施例中，聚(C)序列包含約30個胞嘧啶核苷酸。 II.D. 化學修飾

本文公開的mRNA可以是經修飾的或未經修飾的。在一些實施例中，mRNA可以包含至少一種化學修飾。在一些實施例中，本文公開的mRNA可以含有一種或多種通常增強RNA穩定性的修飾。示例性修飾可以包括骨架修飾、糖修飾或堿基修飾。在一些實施例中，所公開的mRNA可以由天然存在的核苷酸和/或核苷酸類似物（經修飾的核苷酸）（包括但不限於嘌呤（腺嘌呤（A）和鳥嘌呤（G））或嘧啶（胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）和尿嘧啶（U）））合成。在某些實施例中，所公開的mRNA可以由嘌呤和嘧啶的經修飾的核苷酸類似物或衍生物合成，所述類似物或衍生物例如像1-甲基-腺嘌呤、2-甲基-腺嘌呤、2-甲基硫代-N-6-異戊烯基-腺嘌呤、N6-甲基-腺嘌呤、N6-異戊烯基-腺嘌呤、2-硫代-胞嘧啶、3-甲基-胞嘧啶、4-乙醯基-胞嘧啶、5-甲基-胞嘧啶、2,6-二胺基嘌呤、1-甲基-鳥嘌呤、2-甲基-鳥嘌呤、2,2-二甲基-鳥嘌呤、7-甲基-鳥嘌呤、肌苷、1-甲基-肌苷、假尿嘧啶（5-尿嘧啶）、二氫-尿嘧啶、2-硫代-尿嘧啶、4-硫代-尿嘧啶、5-羧基甲基胺基甲基-2-硫代-尿嘧啶、5-(羧基羥基甲基)-尿嘧啶、5-氟-尿嘧啶、5-溴-尿嘧啶、5-羧基甲基胺基甲基-尿嘧啶、5-甲基-2-硫代-尿嘧啶、5-甲基-尿嘧啶、N-尿嘧啶-5-氧基乙酸甲酯、5-甲基胺基甲基-尿嘧啶、5-甲氧基胺基甲基-2-硫代-尿嘧啶、5'-甲氧基羰基甲基-尿嘧啶、5-甲氧基-尿嘧啶、尿嘧啶-5-氧基乙酸甲酯、尿嘧啶-5-氧基乙酸 (v)、1-甲基-假尿嘧啶、辮苷、β-D-甘露糖基-辮苷、胺基磷酸酯、硫代磷酸酯、肽核苷酸、甲基膦酸酯、7-去氮鳥苷、5-甲基胞嘧啶和肌苷。

在一些實施例中，所公開的mRNA可以包含至少一種化學修飾，包括但不限於假尿苷、N1-甲基假尿苷、2-硫代尿苷、4'-硫代尿苷、5-甲基胞嘧啶、2-硫代-l-甲基-1-去氮-假尿苷、2-硫代-l-甲基-假尿苷、2-硫代-5-氮雜-尿苷、2-硫代-二氫假尿苷、2-硫代-二氫尿苷、2-硫代-假尿苷、4-甲氧基-2-硫代-假尿苷、4-甲氧基-假尿苷、4-硫代-l-甲基-假尿苷、4-硫代-假尿苷、5-氮雜-尿苷、二氫假尿苷、5-甲基尿苷、5-甲基尿苷、5-甲氧基尿苷和2'-O-甲基尿苷。

在一些實施例中，化學修飾選自假尿苷、N1-甲基假尿苷、5-甲基胞嘧啶、5-甲氧基尿苷及其組合。

在一些實施例中，化學修飾包含N1-甲基假尿苷。

在一些實施例中，mRNA中至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%的尿嘧啶核苷酸是經化學修飾的。

在一些實施例中，ORF中至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%的尿嘧啶核苷酸是經化學修飾的。

此類類似物的製備描述於例如美國專利號4,373,071、美國專利號4,401,796、美國專利號4,415,732、美國專利號4,458,066、美國專利號4,500,707、美國專利號4,668,777、美國專利號4,973,679、美國專利號5,047,524、美國專利號5,132,418、美國專利號5,153,319、美國專利號5,262,530和美國專利號5,700,642中。 II.E. mRNA 合成

本文公開的mRNA可以根據多種方法中的任一種合成。例如，根據本公開文本的mRNA可以經由體外轉錄（IVT）合成。一些用於體外轉錄的方法描述於例如Geall等人 (2013) Semin. Immunol. 25(2): 152-159；Brunelle等人 (2013) Methods Enzymol. 530:101-14中。簡而言之，通常用以下進行IVT：含有啟動子的線性或環狀DNA範本、一池核糖核苷三磷酸、可以包括DTT和鎂離子的緩衝系統、適當的RNA聚合酶（例如，T3、T7或SP6 RNA聚合酶）、DNA酶I、焦磷酸酶和/或RNA酶抑制劑。確切的條件可以根據具體應用而變化。這些試劑的存在通常在最終mRNA產物中是不希望的，並且這些試劑可以被認為是可以純化或除去的雜質或污染物，以提供適用於治療用途的無污染的和/或同質的mRNA。雖然在一些實施例中可能需要從體外轉錄反應提供的mRNA，但根據本公開文本可以使用其他來源的mRNA，包括由細菌、真菌、植物和/或動物產生的野生型mRNA。 III. 用於製備本發明的 LNP 疫苗的方法

本發明的LNP可以通過本領域目前已知的各種技術製備。例如，可以根據常規技術製備多層囊泡（MLV），如通過使所選擇的脂質沉積在合適的容器或器皿的內壁上（通過將脂質溶解在適當的溶劑中，然後蒸發溶劑以在器皿內部留下薄膜）或通過噴霧乾燥來製備。然後可以伴隨渦旋運動向器皿中添加水相，這導致MLV的形成。然後可以通過均質化、超聲處理或擠出多層囊泡來形成單層囊泡（ULV）。另外，可以通過洗滌劑去除技術形成單層囊泡。

各種方法描述於US 2011/0244026、US 2016/0038432、US 2018/0153822、US 2018/0125989和PCT/US2020/043223（2020年7月23日提交）中，並且可以用於實踐本發明。一種示例性方法需要通過將其與脂質的混合物混合來包封mRNA，而無需首先將脂質預形成脂質奈米顆粒，如US 2016/0038432中所述。另一種示例性方法需要通過將預形成的LNP與mRNA混合來包封mRNA，如US 2018/0153822中所述。

在一些實施例中，製備裝載mRNA的LNP的方法包括將一或多種溶液加熱到大於環境溫度的溫度的步驟，所述一或多種溶液是包含預形成的脂質奈米顆粒的溶液、包含mRNA的溶液和包含LNP包封的mRNA的混合溶液。在一些實施例中，所述方法包括在混合步驟之前加熱mRNA溶液和預形成的LNP溶液中的一或兩種的步驟。在一些實施例中，所述方法包括在混合步驟期間加熱包含預形成的LNP的溶液、包含mRNA的溶液和包含LNP包封的mRNA的溶液中的一或多種。在一些實施例中，所述方法包括在混合步驟之後加熱LNP包封的mRNA的步驟。在一些實施例中，一或多種溶液所加熱到的溫度是或大於約30ºC、37ºC、40ºC、45ºC、50ºC、55ºC、60ºC、65ºC或70ºC。在一些實施例中，一種或多種溶液所加熱到的溫度的範圍是從約25ºC至70ºC、約30ºC至70ºC、約35ºC至70ºC、約40ºC至70ºC、約45ºC至70ºC、約50ºC至70ºC或約60ºC至70ºC。在一些實施例中，溫度是約65ºC。

可以使用各種方法來製備適用于本發明的mRNA溶液。在一些實施例中，可以將mRNA直接溶解在本文所述的緩衝溶液中。在一些實施例中，可以通過在與用於包封的脂質溶液混合之前將mRNA儲備溶液與緩衝溶液混合來產生mRNA溶液。在一些實施例中，可以通過緊接在與用於包封的脂質溶液混合之前將mRNA儲備溶液與緩衝溶液混合來產生mRNA溶液。在一些實施例中，合適的mRNA儲備溶液可以含有在水或緩衝液中的濃度為或大於約0.2 mg/ml、0.4 mg/ml、0.5 mg/ml、0.6 mg/ml、0.8 mg/ml、1.0 mg/ml、1.2 mg/ml、1.4 mg/ml、1.5 mg/ml、或1.6 mg/ml、2.0 mg/ml、2.5 mg/ml、3.0 mg/ml、3.5 mg/ml、4.0 mg/ml、4.5 mg/ml或5.0 mg/ml的mRNA。

在一些實施例中，使用泵將mRNA儲備溶液與緩衝溶液混合。示例性泵包括但不限於齒輪泵、蠕動泵和離心泵。通常，將緩衝溶液以大於mRNA儲備溶液的速率的速率混合。例如，緩衝溶液可以按mRNA儲備溶液的速率的至少1x、2x、3x、4x、5x、6x、7x、8x、9x、10x、15x或20x的速率混合。在一些實施例中，將緩衝溶液以範圍在約100至6000 ml/分鐘之間（例如，約100至300 ml/分鐘、300至600 ml/分鐘、600至1200 ml/分鐘、1200至2400 ml/分鐘、2400至3600 ml/分鐘、3600至4800 ml/分鐘、4800至6000 ml/分鐘或60至420 ml/分鐘）的流速混合。在一些實施例中，將緩衝溶液以為或大於約60 ml/分鐘、100 ml/分鐘、140 ml/分鐘、180 ml/分鐘、220 ml/分鐘、260 ml/分鐘、300 ml/分鐘、340 ml/分鐘、380 ml/分鐘、420 ml/分鐘、480 ml/分鐘、540 ml/分鐘、600 ml/分鐘、1200 ml/分鐘、2400 ml/分鐘、3600 ml/分鐘、4800 ml/分鐘或6000 ml/分鐘的流速混合。

在一些實施例中，將mRNA儲備溶液以範圍在約10至600 ml/分鐘之間（例如，約5至50 ml/分鐘、約10至30 ml/分鐘、約30至60 ml/分鐘、約60至120 ml/分鐘、約120至240 ml/分鐘、約240至360 ml/分鐘、約360至480 ml/分鐘或約480至600 ml/分鐘）的流速混合。在一些實施例中，將mRNA儲備溶液以為或大於約5 ml/分鐘、10 ml/分鐘、15 ml/分鐘、20 ml/分鐘、25 ml/分鐘、30 ml/分鐘、35 ml/分鐘、40 ml/分鐘、45 ml/分鐘、50 ml/分鐘、60 ml/分鐘、80 ml/分鐘、100 ml/分鐘、200 ml/分鐘、300 ml/分鐘、400 ml/分鐘、500 ml/分鐘或600 ml/分鐘的流速混合。

將所需mRNA摻入脂質奈米顆粒中的過程稱為「加樣」。示例性方法描述於Lasic等人， FEBS Lett.(1992) 312:255-8中。LNP摻入的核酸可以完全或部分位於脂質奈米顆粒的內部空間中，脂質奈米顆粒膜的雙層膜內，或與脂質奈米顆粒膜的外表面相關。將mRNA摻入脂質奈米顆粒中在本文中也稱為「包封」，其中核酸完全或基本上包含在脂質奈米顆粒的內部空間內。

合適的LNP可以按各種尺寸製備。在一些實施例中，減小的脂質奈米顆粒尺寸與mRNA的更有效遞送相關。選擇適當的LNP尺寸可以考慮目標細胞或組織的位點以及在某種程度上脂質奈米顆粒將用於的應用。

本領域已知的各種方法可用於改變脂質奈米顆粒群的尺寸。在本文中特別具示例性的方法利用Zetasizer Nano ZS（Malvern Panalytical）來測量LNP細微性。在一種方案中，將10 μl的LNP樣品與990 μl的10%海藻糖混合。將此溶液裝入比色皿中，然後放入Zetasizer機器中。z-平均直徑（nm）或累積量平均值被認為是樣品中LNP的平均尺寸。Zetasizer機器還可以用於通過使用動態光散射（DLS）和自相關函數的累積量分析來測量多分散性指數（PDI）。可以通過對所形成的LNP進行超聲處理來減小平均LNP直徑。間歇超聲處理循環可以與准彈性光散射（QELS）評估交替，以指導有效的脂質奈米顆粒合成。

在一些實施例中，大部分經純化的LNP（即，大於約50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的LNP）的尺寸為約70至150 nm（例如，約145 nm、約140 nm、約135 nm、約130 nm、約125 nm、約120 nm、約115 nm、約110 nm、約105 nm、約100 nm、約95 nm、約90 nm、約85 nm或約80 nm）。在一些實施例中，基本上所有（例如，大於80%或90%）的經純化的脂質奈米顆粒的尺寸為約70至150 nm（例如，約145 nm、約140 nm、約135 nm、約130 nm、約125 nm、約120 nm、約115 nm、約110 nm、約105 nm、約100 nm、約95 nm、約90 nm、約85 nm或約80 nm）。

在一些實施例中，本發明的組成物中的LNP的平均尺寸小於150 nm、小於120 nm、小於100 nm、小於90 nm、小於80 nm、小於70 nm、小於60 nm、小於50 nm、小於30 nm或小於20 nm。

在一些實施例中，本發明的組成物中的大於約70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%的LNP的尺寸的範圍為從約40至90 nm（例如，約45至85 nm、約50至80 nm、約55至75 nm、約60至70 nm）或約50至70 nm（例如，55至65 nm），這特別適合於經由霧化進行肺部遞送。

在一些實施例中，通過本發明提供的醫藥組成物中的LNP的分散性或分子尺寸異質性量度（PDI）小於約0.5。在一些實施例中，LNP的PDI小於約0.5、小於約0.4、小於約0.3、小於約0.28、小於約0.25、小於約0.23、小於約0.20、小於約0.18、小於約0.16、小於約0.14、小於約0.12、小於約0.10或小於約0.08。PDI可以通過如上所述的Zetasizer機器測量。

在一些實施例中，本文提供的醫藥組成物中大於約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的經純化的LNP將mRNA包封在每個單獨的顆粒內。在一些實施例中，醫藥組成物中基本上所有（例如，大於80%或90%）的經純化的脂質奈米顆粒將mRNA包封在每個單獨的顆粒內。在一些實施例中，脂質奈米顆粒的包封效率在50%與99%之間；或者大於約60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、98%或99%。通常，用於在本文中使用的脂質奈米顆粒的包封效率為至少90（例如，至少91%、92%、93%、94%或95%）。

在一些實施例中，LNP的N/P比在1與10之間。在一些實施例中，脂質奈米顆粒的N/P比高於1、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7或約8。在進一步的實施例中，本文的典型LNP的N/P比為4。

在一些實施例中，根據本發明的醫藥組成物含有至少約0.5 μg、1 μg、5 μg、10 μg、100 μg、500 μg或1000 μg的所包封的mRNA。在一些實施例中，醫藥組成物含有約0.1 μg至1000 μg、至少約0.5 μg、至少約0.8 μg、至少約1 μg、至少約5 μg、至少約8 μg、至少約10 μg、至少約50 μg、至少約100 μg、至少約500 μg或至少約1000 μg的所包封的mRNA。

在一些實施例中，mRNA可以通過化學合成或通過DNA範本的體外轉錄（IVT）來製備。用於製備和純化mRNA的示例性方法描述於實例1中。在此方法中，在IVT過程中，使用cDNA範本來產生mRNA轉錄物，並且將DNA範本通過DNA酶降解。通過深度過濾和切向流過濾（TFF）純化轉錄物。通過添加帽和尾進一步修飾經純化的轉錄物，並且通過深度過濾和TFF再次純化經修飾的RNA。

然後在水性緩衝液中製備mRNA，並且將其與含有LNP的脂質組分的兩親溶液混合。用於溶解LNP的四個脂質組分的兩親溶液可以是醇溶液。在一些實施例中，醇是乙醇。水性緩衝液可以是例如檸檬酸鹽、磷酸鹽、乙酸鹽或琥珀酸鹽緩衝液，並且可以具有約3.0至7.0（例如，約3.5、約4.0、約4.5、約5.0、約5.5、約6.0或約6.5）的pH。緩衝液可以含有其他組分，如鹽（例如，鈉，鉀和/或鈣鹽）。在特定實施例中，水性緩衝液具有1 mM檸檬酸鹽、150 mM NaCl，pH 4.5。

用於製備mRNA-LNP組成物的示例性的非限制性方法描述於實例1中。所述方法涉及將經緩衝的mRNA溶液與脂質的乙醇溶液以受控的均勻方式混合，其中在整個混合過程中維持脂質 : mRNA的比率。在此說明性例子中，mRNA在含有檸檬酸一水合物、檸檬酸三鈉二水合物和氯化鈉的水性緩衝液中呈現。將mRNA溶液添加到溶液（1 mM檸檬酸鹽緩衝液、150 mM NaCl，pH 4.5）中。將四種脂質（例如，陽離子脂質、PEG化的脂質、基於膽固醇的脂質和輔助脂質）的脂質混合物溶解在乙醇中。將水性mRNA溶液和乙醇脂質溶液在具有近「無脈」泵系統的「T」形混合器中以4 : 1的體積比混合。然後對所得混合物進行下游純化和緩衝液交換。可以使用透析盒或TFF系統實現緩衝液交換。可以使用TFF來緊接在經由T混合過程形成之後對所得的新生LNP進行濃縮和緩衝液交換。滲濾過程是連續操作，通過以與滲透物流相同的速率添加適當的緩衝液使體積保持不變。 IV.       mRNA-LNP 疫苗的包裝和使用

mRNA-LNP疫苗可以包裝用於腸胃外（例如，肌內、皮內或皮下）投予或鼻咽（例如，鼻內）投予。疫苗組成物可以呈即用調配物的形式，其中LNP組成物被凍幹並剛好在使用前用生理緩衝液（例如，PBS）重構。疫苗組成物還可以按水性溶液或冷凍水性溶液的形式運送和提供，並且可以直接投予給受試者而無需重構（如果先前冷凍，則在解凍後）。

因此，本公開文本提供了製品（如套組），其在單個容器中提供mRNA-LNP疫苗，或者在一個容器中提供mRNA-LNP疫苗並且在另一個容器中提供用於重構的生理緩衝液。所述一個或多個容器可以含有單次使用劑量或多次使用劑量。容器可以是預處理的玻璃小瓶或安瓿。製品也可以包括使用說明書。

在特定實施例中，提供mRNA-LNP疫苗用於在肌內（IM）注射中使用。疫苗可以注射到受試者的例如他/她的上臂中的三角肌處。在一些實施例中，疫苗在預填充的針筒或注射器（例如，單室的或多室的）中提供。在一些實施例中，疫苗被提供以用於在吸入中使用，並且在預填充的幫浦、霧化器或吸入器中提供。

將mRNA-LNP疫苗以預防有效量投予給有需要的受試者，所述預防有效量即提供針對靶病原體的足夠免疫保護持續足夠量的時間（例如，一年、兩年、五年、十年或一生）的量。足夠的免疫保護可以是例如預防或減輕與病原體感染相關的症狀。在一些實施例中，將多劑（例如，兩劑）的疫苗注射給有需要的受試者，以實現所需的預防效果。劑量（例如，初免劑量和加強劑量）可以隔開例如1週、2週、3週、4週、一個月、兩個月、三個月、四個月、五個月、六個月、一年、兩年、五年或十年的間隔。

在一些實施例中，單次劑量的mRNA-LNP疫苗含有1至50 μg的mRNA（例如，單價的或多價的）。例如，單次劑量可以含有約2.5 μg、約5 μg、約7.5 μg、約10 μg、約12.5 μg或約15 μg的mRNA用於肌內（IM）注射。在進一步的實施例中，多價單次劑量的LNP疫苗含有多個（例如，2、3或4個）的LNP，各針對不同的抗原，並且每種LNP具有例如2.5 μg、約5 μg、約7.5 μg、約10 μg、約12.5 μg或約15 μg的mRNA量。

在另一個方面，本發明提供了針對一或多種流感病毒免疫受試者的方法。本發明進一步提供了在受試者中引發針對一或多種流感病毒的免疫反應的方法。在一些實施例中，本發明的方法包括向受試者投予有效量的本文所述的組成物。

在各種實施例中，本文提供的免疫方法引發針對一或多種流感病毒內的多個表位的廣泛的保護性免疫反應。在各種實施例中，本文提供的免疫方法引發針對一或多種流感病毒的廣泛的中和免疫反應。在一些實施例中，免疫反應包含抗體反應。因此，在各種實施例中，本文所述的組成物可以提供針對不同類型的流感病毒的廣泛的交叉保護。在一些實施例中，組成物提供針對禽流感、豬流感、季節性流感和/或大流行流感病毒的交叉保護。在一些實施例中，組成物提供針對一或多種流感A、B或C亞型的交叉保護。在一些實施例中，組成物提供針對以下病毒的多種毒株的交叉保護：流感A H1亞型病毒（例如，H1N1）、流感A H3亞型病毒（例如，H3N2）、流感A H5亞型病毒（例如，H5N1）和/或B型流感病毒（例如，山形譜系、維多利亞譜系）。

在一些實施例中，本發明的方法能夠引發針對一或多種季節性流感毒株的改善的免疫反應。示例性的季節性毒株包括但不限於A/波多黎各/8/1934、A/蒙茅斯堡/1/1947、A/智利/1/1983、A/德克薩斯/36/1991、A/新加坡/6/1986、A/北京/32/1992、A/新赫里多尼亞/20/1999、A/所羅門群島/03/2006、A/布里斯班/59/2007、A（H3N2）病毒 抗原性類似於細胞增殖的原型病毒A/維多利亞/361/2011、A/北京/262/95（H1N1）樣病毒、A/布里斯班/02/2018（H1N1）pdm09樣病毒、A/布里斯班/10/2007（H3N2）樣病毒、A/加利福尼亞/7/2004（H3N2）樣病毒、A/加利福尼亞/7/2009（H1N1）樣病毒、A/加利福尼亞/7/2009（H1N1）pdm09樣病毒、A/柬埔寨/e0826360/2020（H3N2）樣病毒、A/福建/411/2002（H3N2）樣病毒、A/福建/411/2002（H3N2）樣病毒、A/廣東-茂南區/SWL1536/2019（H1N1）pdm09樣病毒、A/夏威夷/70/2019（H1N1）pdm09樣病毒、A/香港/2671/2019（H3N2）樣病毒、A/香港/45/2019（H3N2）樣病毒、A/香港/4801/2014（H3N2）樣病毒、A/堪薩斯/14/2017（H3N2）樣病毒、A/密西根/45/2015（H1N1）pdm09樣病毒、A/莫斯科/10/99（H3N2）樣病毒、A/新赫里多尼亞/20/99（H1N1）樣病毒、A/佩斯/16/2009（H3N2）樣病毒、A/新加坡/INFIMH-16-0019/2016（H3N2）樣病毒、A/所羅門群島/3/2006（H1N1）樣病毒、A/南澳大利亞/34/2019（H3N2）樣病毒、A/瑞士/8060/2017（H3N2）樣病毒、A/瑞士/9715293/2013（H3N2）樣病毒、A/悉尼/5/97（H3N2）樣病毒、A/德克薩斯/50/2012（H3N2）樣病毒、A/維多利亞/2570/2019（H1N1）pdm09樣病毒、A/維多利亞/2570/2019（H1N1）pdm09樣病毒、A/維多利亞/361/2011（H3N2）樣病毒、A/威靈頓/1/2004（H3N2）樣病毒、A/威斯康辛/588/2019（H1N1）pdm09樣病毒、A/威斯康辛/588/2019（H1N1）pdm09樣病毒、A/威斯康辛/67/2005（H3N2）樣病毒、B/北京/184/93樣病毒、B/布里斯班/60/2008樣病毒、B/科羅拉多/06/2017樣病毒（B/維多利亞/2/87譜系）、B/佛羅里達/4/2006樣病毒、B/香港/330/2001樣病毒、B/馬來西亞/2506/2004樣病毒、B/麻塞諸塞/2/2012樣病毒、B/普吉島/3073/2013（B/山形譜系）樣病毒、B/普吉島/3073/2013樣病毒、B/普吉島/3073/2013樣病毒（B/山形/16/88譜系）、B/山東/7/97樣病毒、B/上海/361/2002樣病毒、B/四川/379/99樣病毒、B/華盛頓/02/2019（B/維多利亞譜系）樣病毒、B/華盛頓/02/2019樣（B/維多利亞譜系）病毒和B/威斯康辛/1/2010樣病毒。在一些實施例中，本發明的方法能夠引發針對一種或多種大流行流感毒株的改善的免疫反應。示例性大流行毒株包括但不限於A/加利福尼亞/07/2009、A/加利福尼亞/04/2009、A/比利時/145/2009、A/南卡羅來納/01/1918和A/新澤西/1976。大流行亞型尤其包括H1N1、H5N1、H2N2、H3N2、H9N2、H7N7、H7N3、H7N9和H10N7亞型。在一些實施例中，本發明的方法能夠引發針對一或多種豬流感毒株的改善的免疫反應。示例性豬毒株包括但不限於A/新澤西/1976分離株和A/加利福尼亞/07/2009。在一些實施例中，本發明的方法能夠引發針對一或多種禽流感毒株的改善的免疫反應。示例性禽毒株包括但不限於H5N1、H7N3、H7N7、H7N9和H9N2。另外的流感大流行毒株、季節性毒株、禽毒株和/或豬毒株是本領域已知的。

在一些實施例中，本發明提供了通過向有需要的受試者投予本發明的組成物來預防或治療流感感染的方法。在一些實施例中，受試者患有或易患流感感染。在一些實施例中，如果受試者顯示通常與流感感染相關的一種或多種症狀，則認為受試者患有流感感染。在一些實施例中，已知或認為受試者已經暴露於流感病毒。在一些實施例中，如果已知或相信受試者已經暴露於流感病毒，則認為受試者易患流感感染。在一些實施例中，如果受試者已經與已知或懷疑已經被流感病毒感染的其他個體接觸和/或如果受試者出現或已經出現在已知或相信流感感染流行的地方，則已知或相信受試者已經暴露於流感病毒。

在各種實施例中，如本文所述的組成物可以在出現一種或多種流感感染症狀之前或之後投予。在一些實施例中，將組成物作為預防劑投予。在此類實施例中，本發明的方法有效地預防或保護受試者免於流感病毒感染。在一些實施例中，將本發明的組成物用作季節性和/或大流行流感疫苗的組分或用作旨在賦予持久（多季節）保護的流感疫苗接種方案的一部分。在一些實施例中，使用本發明的組成物來治療流感感染的症狀。

在一些實施例中，受試者是非人類哺乳動物。在一些實施例中，受試者是農場動物或寵物（例如，狗、貓、綿羊、牛和/或豬）。在一些實施例中，受試者是非人靈長類動物。在一些實施例中，受試者是禽（例如，雞、鴨、鵝和/或火雞）。

在一些實施例中，受試者是人。在某些實施例中，受試者是成年人、青少年或嬰兒。在一些實施例中，人類受試者不到6月齡。在一些實施例中，人類受試者為6月齡或以上，為6月齡至35月齡，為36月齡至8歲，或者為9歲或以上。在一些實施例中，人類受試者是55歲或以上（如60歲或以上或者65歲或以上）的老年人。本發明還考慮了在子宮中投予組成物和/或在子宮中進行治療方法。

除非本文另有規定，否則與本發明結合使用的科學和技術術語應當具有本領域普通技術人員通常理解的含義。下文描述了示例性方法和材料，但在本發明的實踐或測試中也可以使用與本文所述的那些類似或等效的方法和材料。在發生衝突的情況下，應以包括定義在內的本說明書為准。通常，本文所述的結合細胞和組織培養、分子生物學、病毒學、免疫學、微生物學、遺傳學、分析化學、合成有機化學、醫學和藥物化學以及蛋白質和核酸化學和雜交使用的命名法以及其技術是本領域熟知且常用的那些。根據製造商的說明書如本領域通常所實現的或如本文所述的那樣進行酶促反應和純化技術。進一步地，除非上下文另有要求，否則單數術語應當包括複數，並且複數術語應當包括單數。在整個本說明書和實施例中，詞語「具有（have）」和「包含（comprise）」或變型如「具有（has）」、「具有（having）」、「包含（comprises）」或「包含（comprising）」應被理解為暗示包括所陳述的整數或整數組，但是不排除任何其他整數或整數組。將本文提及的所有出版物和其他參考文獻均通過引用以其整體併入。儘管本文引用了許多檔，但此引用並不意味著承認這些檔中的任一個構成本領域公知常識的一部分。如本文所用，如應用於一個或多個目的值的術語「大約」或「約」是指與所陳述的參考值類似的值。在某些實施例中，除非另有說明或另外從上下文顯而易見，所述術語是指落入所陳述的參考值的任一方向（大於或小於）的10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%或更少內的值的範圍。

為了可以更好地理解本發明，闡述了以下實例。這些實例僅用於說明目的，並不被解釋為以任何方式限制本發明的範圍。 實例 實例 1 ： LNP 調配物的最佳化

本實例描述了這樣的研究，其中從各種組分的組合文庫製備了mRNA疫苗的一系列LNP調配物。合成了合理設計的新型陽離子脂質。總共測試了超過150種脂質和超過430種調配物。將人類紅血球生成素（hEPO）mRNA用作測試mRNA。在下文所述的先導調配物中，使用陽離子脂質和以下三種其他脂質的組合以各種組合排列將mRNA配製到LNP中：輔助脂質；基於膽固醇的脂質；和PEG化的脂質。

LNP調配物由以下四種脂質組分組成：可離子化的脂質、輔助脂質DOPE、膽固醇和PEG化的脂質DMG-PEG-2K。將PEG化的脂質莫耳分數保持在1.5%下不變，同時評價可離子化的脂質和不同的輔助脂質及其莫耳比，以基於hEPO篩選研究鑒定最佳化比率。

在LNP調配物的製備中使用檸檬酸鹽緩衝液（1 mM檸檬酸鹽、150 mM NaCl，pH 4.5）。在配製過程期間，將添加到檸檬酸鹽緩衝液中的mRNA溶液與脂質的乙醇溶液混合。選擇緩衝液的pH和濃度，以在LNP調配物中實現高mRNA包封率。

LNP配製過程包括使用泵系統將脂質乙醇溶液和mRNA檸檬酸鹽溶液在「T」形混合器中混合。然後使用TFF/透析管對所得溶液進行緩衝液交換。基於投藥需求調整10%（w/v）海藻糖中的最終調配物的濃度。

將hEPO蛋白的小鼠體內表現用作測量LNP在體內遞送mRNA的效力的替代物。在本研究中，將單次劑量的在源自組分的各種組合的LNP中配製的hEPO mRNA（0.1 μg）肌內地（IM）注射給小鼠。使用ELISA測試在投予後6小時和24小時採集的血清的hEPO水準。將MC3調配物（行業基準）用作計算hEPO表現的倍數增加的參考（Angew, Chem Int Ed.(2012) 51:8529-33）。

針對各LNP調配物所見的hEPO表現水準指示調配物將mRNA遞送到細胞中的能力。初始調配物包括2-二油醯基-sn-甘油-3-磷醯乙醇胺（DOPE；輔助脂質）、DMG-PEG2000和膽固醇，陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE的莫耳比為40 : 1.5 : 28.5 : 30。當與MC3調配物相比時，發現這些調配物具有穩健的效力。

測試了進一步的調配物。經最佳化的調配物脂質A LNP和脂質B LNP示於 表 1中。這些調配物中的mRNA可以是經修飾的或未經修飾的，並且可以編碼源自病毒（如流感或SARS-CoV-2）的抗原。 表 1.示例性LNP調配物的組成

組分	功能	描述
mRNA	活性物質	mRNA構建體
脂質奈米顆粒（LNP）	陽離子脂質OF-02（A）或cKK-E10（B）	遞送	可離子化的脂質，促進mRNA包封
DOPE	兩性離子脂質，增強藥物有效載荷的攝取和釋放
膽固醇	為脂質雙層提供穩定性
DMG-PEG-2K	為脂質雙層提供控制和穩定性
海藻糖	賦形劑	冷凍保護劑
注射用水（WFI）	稀釋劑	N/A

在 表 1中，人類疫苗的最終投藥將是基於預期的單次人類劑量的上述最終散裝產品在磷酸鹽緩衝鹽水（PBS）中的稀釋液。基於最終藥物產品的標稱計算WFI的量。調配物中的海藻糖含量對應於10%（100 mg/mL）海藻糖二水合物，使用無水海藻糖和海藻糖二水合物的分子量值的比率轉化為無水基礎。

以下兩種經最佳化的調配物中脂質組分的莫耳比示於 表 2中：脂質A和脂質B LNP調配物（CL：陽離子脂質）。 表 2.示例性LNP中脂質組分的莫耳比

CL	LNP 代碼	CL : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 的莫耳比
OF-02	脂質A	40: 1.5: 28.5: 30
cKK-E10	脂質B	40: 1.5: 28.5: 30

如 表 3和 圖 1A所示，脂質A和脂質B與MC3相比hEPO表現的倍數增加表明了這些LNP相對於MC3用於遞送mRNA的優越性。在下表中，「P2」意指PEG2000；「倍數於MC3」意指相對於MC3的增加倍數；並且「Std Dev」意指標準差。 表 3. hEPO mRNA在小鼠中的體內遞送

研究編號	陽離子脂質	調配物組成	倍數於 MC3	Std Dev
1	OF-02 （P2，低DOPE）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 3 : 27 : 30	1.74	0.97
	OF-02 （P2，含DSPC）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DSPC 50 : 1.5 : 38.5 : 10	0.18	0.17
2	OF-02	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	5.04	1.79
3	OF-02 （高DOPE）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 13.5 : 45	7.35	3.90
4	OF-02	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	16.19	7.86
5	OF-02	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	12.13	6.56
6	cKK-E10	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	5.41	3.46
7	cKK-E10 （DEPE）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DEPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	5.77	2.09
8	OF-02 （177 nm）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	6.59	2.50
OF-02 （161 nm）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	4.94	1.75
OF-02 （153 nm）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	7.40	3.54
OF-02 （133 nm）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	7.15	3.86
OF-02 （115 nm）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	5.91	2.79
OF-02 （118 nm）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	10.54	4.38
9	OF-02（DSPC）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DSPC 40 : 5 : 25 : 30	0.00	0.00
OF-02（DSPC）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DSPC 40 : 3.5 : 26.5 : 30	0.00	0.00
OF-02（DSPC）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DSPC 40 : 2 : 28 : 30	0.00	0.00
OF-02（DSPC）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DSPC 40 : 2 : 53 : 5	0.99	0.70
10	OF-02（DOPS）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPS 40 : 1.5 : 28.5 : 30	3.26	1.97
OF-02（DEPE）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DEPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	11.83	6.89
OF-02（DOPC）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPC 40 : 1.5 : 28.5 : 30	3.32	1.20
OF-02	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	7.14	3.37
11	cKK-E10	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	5.58	2.01
OF-02 （PD批次）	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	8.81	3.22
cKK-E10	陽離子脂質 : DMG-PEG2000 : 膽固醇 : DOPE 40 : 1.5 : 28.5 : 30	5.16	3.25

圖 1B示出了在使用LNP脂質A和脂質B的小鼠和非人靈長類動物（NHP）中的hEPO表現。肌內地注射單次劑量的用脂質A或脂質B配製的hEPO mRNA（對於小鼠為0.1 μg，並且對於NHP為10 μg）。使用ELISA在投予後6、24、48和72小時定量血清hEPO水準。資料顯示出在小鼠和NHP中甚至超過4天的延長的體內hEPO蛋白表現。

在最佳化期間鑒定的關鍵過程參數之一是初始混合步驟期間的流速。通過在混合期間改變這些流速來製備具有不同的最終LNP尺寸（範圍為從108-177 nm）的調配物，允許對過程和產品屬性進行另外的控制。流速越高，細微性越小。當流量達到375 ml/min從而產生108 nM的平均LNP尺寸時，效力顯著增加。注意到尺寸對LNP效力的影響是相對於MC3的hEPO表現的倍數增加的量度，如 表 4所示。 表 4.LNP尺寸最佳化

調配物批號	總流速 （ ml/min ）	尺寸（ nm ）	PDI	包封（ % ）	陽離子脂質	倍數於 MC3
1	250	108	0.077	99	MC3	1.00
2	62.5	177	0.086	94	OF-02	6.59
3	75	161	0.075	95	OF-02	4.94
2-88	87.5	152	0.116	97	OF-02	7.40
2-89	125	133	0.089	97	OF-02	7.15
2-90	250	115	0.076	98	OF-02	5.91
2-91	375	108	0.042	98	OF-02	10.54

*PDI：多分散性指數（polydispersity index）。

上述篩選資料表明，輔助脂質DOPE有效地促進蛋白質表現。資料還確定了四種脂質的有前途的莫耳組成（OF-02或cKK-E10 : DMG-PEG-2K : 膽固醇 : DOPE = 40 : 1.5 : 28.5 : 30）。表徵了10%海藻糖中的LNP調配物的所有參數，包括細微性、PDI、mRNA包封和mRNA完整性。所測試的所有批次在凍/融循環中均顯示出所需的特徵和穩定性。評估了調配物在10%（w/v）海藻糖中在-80ºC下的長期穩定性。表明脂質A和脂質B調配物高度穩定。 實例 2 ：流感 H1N1 LNP 疫苗調配物

當新型流感病毒在人群中出現時，可能發生流感大流行。此類大流行仍然是對公共衛生的重大威脅，需要高度警惕和準備好在病毒在人與人之間持續傳播的情況下使用的對策。在本實例中所述的實驗中，將來自高致病性H1N1毒株A/加利福尼亞/7/2009（CA09）（2009年流感大流行的原因）的血球凝集素（HA）用作原型抗原來評價用脂質A和脂質B的LNP調配物製備的mRNA疫苗的效力。

如上所述製備HA mRNA。在LNP組成物的製備中使用檸檬酸鹽緩衝液（1 mM檸檬酸鹽、150 mM NaCl，pH 4.5）。在配製過程期間，將含有mRNA的檸檬酸鹽緩衝液與脂質的乙醇溶液混合。選擇緩衝液的pH和濃度，以在LNP調配物中實現高mRNA包封率。使用泵系統將兩種溶液（mRNA的檸檬酸鹽緩衝液溶液和脂質的乙醇溶液）在「T」形混合器中混合，導致同質的無脈流，其中在整個過程中將脂質和mRNA以恒定的比率混合。這對於獲得具有所需尺寸和低PDI（更均勻的尺寸分佈的指示）的同質調配物至關重要。此過程導致高mRNA包封，這對於實現高效力至關重要。然後使用TFF/透析管對所得溶液進行緩衝液交換。

在小鼠研究中，在與MC3 LNP調配物以及重組HA（rHA）的頭對頭比較中評估了脂質A和脂質B CA09 HA調配物的功效。在第0天（D0）和第28天（D28），將用不同陽離子脂質配製的CA09（H1）HA mRNA（0.4 μg）肌內地注射給Balb/C小鼠（n = 8）。疫苗的免疫原性（如通過HA抑制（HAI）力價所指示的）示於 圖 2A中。資料表明，在第0天（D0）和第28天（D28）脂質A或脂質B的兩次免疫引發了高HAI力價，並且允許完全保護動物免於同源病毒攻擊（Belgium09 H1N1病毒）（ 圖 2B）。在14天的攻毒後觀察期間，在脂質A和脂質B處理組內未觀察到明顯的發病跡象（體重減輕），而重組蛋白對照組內的少量動物表現出發病（ 圖 2B）。

類似地，用脂質A配製編碼來自Mich15流感毒株（Mich15 N1）的神經胺糖酸酶（NA）的mRNA，並且評價其效力。將兩劑（0.4或0.016 μg）的用脂質A配製的NA mRNA肌內地注射給Balb/c小鼠（n = 8）。給對照組（n = 8）注射0.6 μg的hEPO mRNA或稀釋劑。一半小鼠僅在研究第0天接受一次注射（1劑），而另外一半接受在研究第0天和第28天給予的兩次注射（2劑）。資料表明，此N1脂質A調配物引發了穩健的免疫反應，如通過NA抑制（NAI）力價所指示的（ 圖 3A）。資料進一步表明，用一劑或兩劑疫苗處理的小鼠被保護免於Belgium09 H1N1的致死病毒攻擊（ 圖 3B）。保護水準與疫苗處理組相比於陰性對照組（hEPO和稀釋劑）的NAI力價相關。

還在NHP模型中測試了用本發明的LNP配製的CA09 H1 mRNA。用脂質A和脂質B配製mRNA（10 μg），並且在研究第0天和第28天將其肌內地注射給食蟹猴（n = 6）。對於所有LNP，到第14天觀察到可檢測的HAI引發，並且到第28天觀察到HAI力價的顯著提高（ 圖 4，右小圖）。ELISA資料還證明了對於所測試的所有劑量，到第14天相對於基線的顯著引發，其中在加強後兩週檢測到穩健的提高（ 圖 4，左小圖）。結果表明，本發明的H1 mRNA調配物導致穩健的免疫反應，如通過HAI和終點ELISA力價所指示的。 實例 3 ：流感 H3N2 LNP 疫苗調配物

本實例描述了這樣的實驗，其中評價了流感毒株Sing16（H3N2）的mRNA-LNP疫苗調配物的效力。在這些實驗中使用的mRNA之一是MRT1400。MRT1400是通過體外轉錄製造的生物合成的經密碼子最佳化的HA-H3（流感病毒血球凝集素，H3亞型）信使RNA（CO-HA-H3 mRNA）。

下文示出了流感病毒血球凝集素H3亞型的蛋白質序列： MKTIIALSYI LCLVFAQKIP GNDNSTATLC LGHHAVPNGT IVKTITNDRI EVTNATELVQ NSSIGEICDS PHQILDGENC TLIDALLGDP QCDGFQNKKW DLFVERSKAY SNCYPYDVPD YASLRSLVAS SGTLEFKNES FNWTGVTQNG TSSACIRGSS SSFFSRLNWL THLNYTYPAL NVTMPNKEQF DKLYIWGVHH PGTDKDQIFL YAQSSGRITV STKRSQQAVI PNIGSRPRIR DIPSRISIYW TIVKPGDILL INSTGNLIAP RGYFKIRSGK SSIMRSDAPI GKCKSECITP NGSIPNDKPF QNVNRITYGA CPRYVKHSTL KLATGMRNVP EKQTRGIFGA IAGFIENGWE GMVDGWYGFR HQNSEGRGQA ADLKSTQAAI DQINGKLNRL IGKTNEKFHQ IEKEFSEVEG RVQDLEKYVE DTKIDLWSYN AELLVALENQ HTIDLTDSEM NKLFEKTKKQ LRENAEDMGN GCFKIYHKCD NACIESIRNE TYDHNVYRDE ALNNRFQIKG VELKSGYKDW ILWISFAISC FLLCVALLGF IMWACQKGNI RCNICI* (SEQ ID NO:1)

此蛋白質的編碼序列是經密碼子最佳化的。編碼蛋白質的經密碼子最佳化的序列示於 圖 5A中（SEQ ID NO: 2），其中野生型序列顯示為SEQ ID NO: 3。mRNA結構和序列分別示於 圖 5B和 圖 5C中。如圖所示，HA-H3 mRNA編碼序列側接分別為140和100個核苷酸的5'和3'非轉譯區（UTR）。生物合成的HA-H3 mRNA還含有5'帽結構，其由經由倒5'‑5'三磷酸橋與5' UTR的第一個核苷連接的7-甲基鳥苷（m ⁷G）殘基組成，所述第一個核苷本身通過2'-O-核糖甲基化進行修飾。5'帽對於核糖體起始轉譯必不可少。整個線性結構在3'端以一束大約100至500個腺苷核苷（聚A）終止。聚A區為mRNA賦予穩定性，並且還被認為增強轉譯。所有這些結構元件均是天然存在的用於促進HA-H3 mRNA的有效轉譯的組分。

構建了DNA質粒，以用於通過體外轉錄產生經密碼子最佳化的mRNA序列。使用RNA聚合酶進行體外轉錄（IVT）反應。沈澱反應混合物。將沈澱出的RNA樣品裝到單獨的深度過濾盒上，用80%乙醇洗滌並用再循環水再溶解。以與第一步類似的方式泵送通過第二等分試樣的水。將此步驟再重複一次。使用50 kD中空纖維TFF盒對合併的洗脫物進行超濾/滲濾。然後稀釋每種IVT TFF合併物以為帽和尾反應做準備。沈澱帽-尾反應物，並且如上所述純化和收集來自反應的RNA。將過濾出的mRNA儲存在-20ºC下直到使用。

在這些實驗中，用脂質A或脂質B LNP配製編碼Sing16 NA（N2）或Sing16 HA（H3；MRT1400 mRNA）抗原的mRNA，並且在D0和D28將其以每劑0.4 μg的mRNA肌內地注射給Balb/c小鼠（n = 8）。為了比較，通過肌內途徑將1 μg的具有水包油乳液佐劑（AF03）的重組Sing16 H3或Sing16 N2蛋白注射給Balb/c小鼠（n = 8）。通過NAI和HAI測定測量免疫反應。

資料表明，用NA（N2）mRNA免疫的動物到第14天表現出可檢測的NAI引發，並且到第28天表現出NAI力價的顯著提高（ 圖 6，右小圖）。資料還表明，HA Sing16脂質A和脂質B調配物在第28天加強後引發了穩健的HAI反應（ 圖 6，左小圖）。

類似地，在非人靈長類動物（NHP）食蟹猴（n = 6）中評價了Sing16 HA mRNA脂質A和脂質B疫苗。通過肌內途徑將用脂質A或脂質B配製的HA Sing 16 mRNA（50 μg）注射給食蟹猴。在研究第0天給予第一次注射，並且在研究第28天給予第二次注射。資料表明，疫苗在第28天加強時引發了穩健的免疫功能反應（ 圖 7A）。

另外，在NHP中評價了以下四種劑量水準的在脂質A中配製的HA Sing16 mRNA（即，MRT5400疫苗）：15、45、135和250 µg。在研究第0天給予第一次免疫，在研究第28天給予第二次免疫。對於所測試的所有劑量，所有NHP均表現出IgG結合和HAI力價，其中在第二次注射後兩週（在D42）測試的各種劑量之間在免疫反應方面沒有差異（ 圖 7B和 圖 7C）。

在第二次疫苗接種後，還在NHP中評價了Sing16 HA mRNA脂質A疫苗的T細胞反應。在第42天收集外周血單個核細胞（PBMC），並且將其與Sing16 H3重組蛋白或代表整個HA開放閱讀框的肽合併物一起培育過夜。在ELISPOT測定中評估了通過再刺激誘發的細胞因子。分泌IFN-γ（Th1細胞因子）（ 圖 8A）或IL-13（Th2細胞因子）（ 圖 8B）的PBMC的頻率計算為每百萬PBMC的斑點形成細胞（SFC）。在所測試的三種劑量水準組（250 μg、135 μg和45 μg）中的大部分動物表現出IFN-γ分泌細胞的高頻存在，其中每百萬PBMC有超過100個SFC（ 圖 8A）。未觀察到劑量反應，因為較低劑量水準組和較高劑量水準組的動物顯示出相當頻率的IFN-γ分泌細胞。相比之下，在所測試的任何組中且在任何劑量水準下均未檢測到IL-13細胞因子分泌細胞的存在（ 圖 8B）。這些資料呈現了在NHP中在疫苗接種後對HA抗原的Th1偏向性細胞反應和缺乏Th2反應的明顯證據。 實例 4 ：具有經修飾的 mRNA 的流感 LNP 疫苗調配物

本實例描述了比較含有未經修飾的（未經修飾的非複製性或「UNR」）和經修飾的（經修飾的非複製性或「MNR」）mRNA的疫苗的效力的實驗。通過體外轉錄製備了UNR CA09 HA mRNA和MNR CA09 HA mRNA。在MNR中，所有尿苷均被假尿苷代替。

通過肌內途徑將五種不同劑量（0.016、0.08、0.4、2和10 μg）的用脂質A配製的CA09 HA mRNA（經修飾的或未經修飾的）注射給Balb/c小鼠（n = 15）。資料表明，LNP調配物增加了裸mRNA（UNR）的穩定性和遞送效率，因為UNR與MNR mRNA之間的效力相當，如通過HAI力價所指示的（ 圖 9A）。Balb/c小鼠的ELISA資料還證明了對於所測試的所有劑量，到第14天相對於基線的顯著引發（UNR和MNR mRNA兩者），其中在加強後兩週檢測到穩健的提高。資料還表明，UNR和MNR mRNA在引發ELISA力價方面是相當的（ 圖 9B）。

總之，本發明的劑量調整研究證明，用脂質A配製的未經修飾的和經修飾的CA09 HA mRNA在Balb/c小鼠中引發了統計上不可區分的免疫反應，如通過HAI或通過終點ELISA測定所指示的。用四種較高劑量的UNR和MNR mRNA免疫的Balb/c小鼠到第14天表現出可檢測的HAI引發，並且對於所有劑量，到第42天表現出HAI力價的顯著提高。這些第14天引發力價代表劑量效應和劑量節省可能性兩者，以用於在125倍的範圍內產生可檢測的力價。相同劑量範圍的第二次注射力價確認了對此mRNA-LNP調配物的免疫反應的穩健性。在非人靈長類動物中也觀察到類似的結果。 實例 5 ：多價流感疫苗 LNP 調配物

本實例描述了使用含有編碼CA09 HA的mRNA（如實例2中所述）和編碼Sing16 HA的mRNA（如實例3中所述）的基於脂質A的LNP疫苗的研究。

更具體地，在Balb/c小鼠（n = 8）中評價了在脂質A中共包封的CA09 HA mRNA和Sing16 HA mRNA。將mRNA-LNP作為共包封的兩種mRNA投予或者作為單獨包封的mRNA分開投藥。對於兩種方法，通過肌內注射將總共0.4 μg的LNP調配物注射給小鼠。在研究第0天給予第一次注射，並且在研究第28天給予第二次注射。資料表明，疫苗引發了穩健的免疫功能反應。兩種投予方法之間似乎沒有任何差異。這些資料表明，共包封沒有導致兩種mRNA之間的妨礙或干擾。 實例 6 ：對多價流感疫苗 LNP 調配物的進一步研究

製備了一組編碼以下的未經修飾的mRNA：CA09 HA、Sing16 HA、Sing16 NA、Mich15 NA、A/佩斯/16/2009流感病毒（Perth09 NA）以及螢火蟲螢光素酶（FF）和hEPO的報告抗原。然後在體外測試了HA和NA mRNA-LNP製劑的LNP調配物的表現，在動物中測試了所述LNP調配物的免疫反應，並且在臨床前模型中測試了所述LNP調配物的效力。對於本實例中的研究，所有的LNP調配物均是脂質A調配物。 材料與方法 mRNA-LNP 製備

通過使用未經修飾的核苷酸利用RNA聚合酶與編碼所需基因的質粒DNA範本的體外轉錄合成了編碼hEPO、FF、CA09 HA、Sing16 HA、Mich15 NA和Sing16 NA的mRNA轉錄物。如通過凝膠電泳確定的，經由酶促添加長度為大約200個核苷酸的5'帽結構（帽1）和3'聚(A)尾使所得的經純化的前體mRNA進一步反應，並且對其進行純化。在-20ºC下儲存之前，分析所有mRNA製劑的純度、完整性和帽1的百分比。上文描述了mRNA/脂質奈米顆粒（LNP）調配物的製備。簡而言之，在固定的脂質和mRNA比率下，將脂質（可離子化的脂質、磷脂醯乙醇胺、膽固醇和聚乙二醇-脂質）的混合物的乙醇溶液與靶mRNA的水性緩衝溶液在受控的條件下在酸性pH下合併，以得到均勻LNP的懸浮液。在超濾和滲濾到合適的稀釋劑體系中後，將所得的奈米顆粒懸浮液稀釋至最終濃度，過濾，並且在-80ºC下冷凍儲存直到使用。表徵了mRNA-LNP調配物的尺寸（通過動態光散射）、包封百分比，並且在-80ºC下以1 mg/mL儲存，直到通過用合適的緩衝液稀釋而進一步使用。利用hEPO-LNP和FF-LNP來檢查目標蛋白的體內表現水準。 在 HeLa 細胞中表現的 S 蛋白的視覺化

使用先前所述的方法（Kalnin等人， npj Vaccines(2021) 6:61），在用二價H3N2（Sing16 HA和Perth09 NA）mRNA LNP轉染的HeLa細胞中進行流感NA和HA蛋白的免疫細胞化學-免疫螢光分析。將細胞固定在4%多聚甲醛中，並且進行針對HA（GeneTex GTX40258）、NA和ER標記鈣聯蛋白（Abcam ab22595）的受試抗體染色。在共聚焦顯微鏡上捕獲圖像，然後進行圖像分析，以用於定量HA和NA到ER的共定位、平均信號強度和細胞面積百分比。 流式細胞術

在37ºC與5% CO ₂下在補充有GlutaMAX（Life Technologies）、鏈黴素、青黴素（Gibco）和20%熱滅活的FBS（VWR）的M199（Life Technologies）中培養人類骨骼肌細胞（HskMC，Lonza）。通過胰蛋白酶化收穫細胞，將其用PBS洗滌，並且按照製造商的電穿孔程式D-033在Nucleofector 2b（Lonza）上使用人原代肌細胞轉染套組以12 mg的mRNA/10 ⁶個細胞進行電穿孔。24小時後，將收穫的細胞固定，用Cytofix™/Perm（BD）透化，並且用CA09 HA（Immune Tech）、Sing16 HA（30-2F11-F7-A5，GeneTex）、Mich15 NA（6G6，Immune Tech）和Sing16 NA（40017-RP01，Sino Biologicals）特異性Ab染色，然後用PE綴合的山羊抗小鼠IgG第二Ab（Southern Biotech）或AF647綴合的山羊抗兔IgG（Life Technologies）染色。然後通過Fortessa（BD）獲得經抗體標記的細胞，並且通過FlowJo™（TreeStar）分析每種蛋白質的表現。 低溫透射電子顯微鏡檢查

使用PELCO easiGlow™裝置來在施加LNP樣品之前對網格進行等離子體清潔，並且使用將室保持在100%濕度和18ºC下的Vitrobot Mark IV系統（ThermoFisher）進行急速冷凍。將3.0 µl的LNP樣品微滴分配到具有碳膜和金條的300目R2/1 QUANTIFOIL®網格上。對網格印跡4秒，將其在原地保持10秒，然後立即在液體乙烷中急速冷凍以儲存並轉移到Krios顯微鏡上。使用在計數模式下操作的配備有BioQuantum能量過濾器和K3直接電子檢測器（Gatan）的Titan Krios透射電子顯微鏡（ThermoFisher）收集曝光。檢測器處的校準物理圖元尺寸為1.38 Å，對應於64,000x放大率。在散焦在-0.5至-1.7 µm之間的情況下，在每幀為1.045 e/Å2的劑量下收集了總共3,141個69幀的影片曝光。對於每個影片曝光，使用RELION-3.1.34進行基於貼片的移動校正、超解析度圖元的分箱和幀劑量加權。從校正圖像中提取了超過700個候選顆粒座標。用具有影像處理工具箱的MATLAB R2019a進行隨後的資料分析。 對小鼠和 NHP 進行免疫以用於表現研究

向各組四隻食蟹猴（NHP）（雄性和雌性）四至八隻雄性BALB/c小鼠肌內地投予劑量為10 µg（NHP）或者1、0.5、0.1和0.05 µg（小鼠）的以與旨在用於HA/NA mRNA-LNP調配物的比率相同的比率製備的hEPO-LNP。在投予前以及在投予後6 h、24 h、48 h、72 h和96 h取血樣，以便按照製造商的方案使用R and D Systems的Quantikine® IVD® ELISA人類紅血球生成素免疫測定套組經由ELISA監測血清hEPO表現，並且報告為mIU/ml和ng/ml的最終值。簡而言之，將用對EPO具特異性的小鼠單株抗體預包被的微孔板孔與標本或標準品一起培育。在除去過量的標本或標準品之後，將孔與綴合至辣根過氧化物酶的兔抗EPO多株抗體一起培育。在第二次培育期間，抗體-酶綴合物與固定的EPO結合。通過洗滌除去過量的綴合物。將色原添加到孔中，並且通過酶反應氧化以形成藍色的複合物。通過添加酸終止反應，這使藍色變為黃色。所產生的顏色的量與結合至EPO抗體複合物的綴合物的量成正比，後者反過來又與標本或標準品中EPO的量成正比。測量此複合物的吸光度，並且通過繪製吸光度相對於EPO標準品的濃度產生標準曲線。通過將標本的光密度與標準曲線進行比較來確定未知標本的EPO濃度。在此測定中使用的標準品是針對第二國際參考製劑（67/343）（尿液源形式的人類紅血球生成素）校準的重組hEPO。 對小鼠和 NHP 進行免疫以用於免疫原性研究

按照處理組將各組的Balb/c小鼠（小家鼠（ Mus musculus））在異氟醚麻醉下經由IM途徑在四頭肌中用一定劑量的0.05 mL的指定的疫苗製劑或稀釋劑免疫，在第0天在一條後腿中進行免疫，並且在第28天在對側腿中進行免疫。在研究終止之前，在獸醫對動物的健康進行評估之後，對減輕超過20%的初始體重和顯示嚴重臨床體徵的小鼠實施安樂死。

選擇未經處理的（naïve）雄性和雌性模里西斯源食蟹猴（Cynomolgus macaques/ Macaca fascicularis）用於研究。在研究開始時，動物稱重＞ 2 kg，並且年齡＞ 2歲。在分配到研究之前，為研究所選擇的動物進行了綜合體檢。根據NIRC SOP的適用情況，健康狀況的分配前評估包括實際操作的獸醫檢查和血樣採集用於CBC分析。通常成對地飼養動物並在研究開始之前適應至少3天。各組由最多6隻動物/處理組組成。在研究第0天，將所有動物在氯胺酮HCl（10 mg/kg，IM）或泰拉唑（telazol）（4-8 mg/kg，IM）鎮靜下經由IM途徑在每隻動物的一條前肢中瞄準三角肌用一定劑量的0.5 ml的各自的疫苗製劑或稀釋劑免疫。在第一次免疫發生後二十八天，在對側肢中向動物給予第二次免疫。 對小鼠和 NHP 進行免疫以用於攻毒研究

在最後一次免疫後大約9至12週為小鼠接種攻毒毒株。將儲備病毒的小瓶解凍並在冰冷的無菌PBS中稀釋至適當濃度。將所有小鼠用含有在PBS中的105.54 TCID ₅₀（其等於4LD ₅₀）的Belgium09病毒的50 μl的總體積攻毒。在增強的ABSL2實驗室中，在生物安全櫃內進行病毒攻毒。將小鼠首先通過IP注射氯胺酮/塞拉嗪溶液（50 mg/kg氯胺酮和5 mg/kg塞拉嗪）麻醉，然後使用微量移液管用總體積為50 μl的流感病毒IN攻毒（逐滴滴到兩個鼻孔中；每個鼻孔25 μl）。在攻毒程序後，將小鼠置於背臥位，並且觀察直到從麻醉中恢復。在H1N1攻毒後稱每日體重。對單次觀察體重減輕＞ 20%的任何個體動物實施安樂死。將體重測量值在攻毒後每日記錄在線上資料庫Pristima®（版本7.5.0 Build 8）中直到安樂死，或者寫在研究專用工作表中。 採血

對於小鼠，在鎮靜下經由下頜下或眶竇放血（活體放血，研究前和研究第14天、第28天和第42天，大約200 μl）和心臟穿刺（終末放血，第56天）從所有動物採集血液。在研究前給小鼠放血，以獲得基線免疫前血清樣品並用於預篩選目的。血清的處理，將血樣採集到SST管中，並且允許其在室溫下凝結30分鐘至1小時。然後在關閉制動的情況下，將樣品以1000 - 1300 g離心5至10分鐘。使用P200移液器採集血清，將其分到兩個0.5 ml的冷凍小瓶中，並且儲存在-20ºC下。所有放血均記錄在標本採集和處理日誌中，指示樣品採集時間和負責執行程序的技術人員。在HAI或ELLA和ELISA測定中評價了一部分血清樣品的抗體力價。

在使用10 mg/kg氯胺酮/1 mg/kg乙醯丙嗪肌內投予的麻醉下的同時給NHP放血以分離血清（第-4天、第2天、第7天、第14天、第28天、第30天、第35天、第42天、第56天、第90天和第180天）。所抽出的血液的體積未超過關於體重百分比和動物身體狀況的既定指導。使用與BD Vacutainer® SST™凝膠管連接的Vacutainer 21 ga x 1''採血針或Abbott Butterfly 23 ga x ¾''管，使用股靜脈穿刺從經麻醉的NHP抽血。通過使管在室溫下以1200 x g的速度旋轉10分鐘來分離血清。然後將血清等分到經標記的冷凍小瓶（1 ml/小瓶）中，並且儲存在≤ -20ºC下。在HAI或ELLA和ELISA測定中評價了一部分血清樣品的抗體力價。對於PBMC，在疫苗接種前給NHP預放血，並且在第一次注射後大約42至63天再次放血。為此目的，將血液採集到含有肝素抗凝血劑的BD Vacutainer®管中。簡而言之，將抗凝血的血樣在PBS中稀釋，並且使用Histopaque®分離溶液（Sigma）對其在400 x g下進行30分鐘梯度密度離心。然後收集含有單核細胞的不透明介面，將其在PBS中洗滌三次，使用低速（250 x g）離心用於最後一次離心以減少血小板的數量。使用Nexcelom Cellometer K2計數活vs死PBMC。使用Mr. Frosty®冷凍盒在具有10% DMSO的FBS中冷凍保存PBMC。將盒子立即置於-80ºC冷凍箱中24小時，然後轉移以儲存在液氮罐中。 ELISA

使用重組產生的Sing16 NA蛋白、Sing16 HA蛋白或CA09 HA蛋白進行抗體ELISA。在碳酸鹽-碳酸氫鹽緩衝液中以2 μg/ml的濃度在96孔高結合聚苯乙烯板上捕獲蛋白質。將板覆蓋並在2ºC-8ºC下培育過夜（16 ± 4小時）。在培育過夜後，將經抗原包被的板用洗滌緩衝液（PBS，0.5% Tween20）洗滌5次，並且在室溫下用阻斷溶液（PBS中10% BSA）阻斷60 ± 30分鐘。將測試樣品、未經處理的對照和參考樣品稀釋在樣品稀釋劑（PBS 10% BSA 0.5% Tween 20）中，並且一式兩份地添加到孔中，然後在室溫下培育90分鐘。將板用洗滌緩衝液洗滌5次，並且以1 : 10,000的稀釋度添加山羊抗小鼠HRP（對於小鼠血清）或山羊抗猴HRP（對於NHP血清）。然後將板在室溫下培育30分鐘，並且用洗滌緩衝液洗滌過量的HRP-IgG。將Sure-Blue TMB底物添加到每個板中，並且在約10分鐘後用TMB終止溶液終止反應。然後在450 nm下用Thermo Labsystems Multiskan™分光光度計讀取板。抗抗原（HA或NA）特異性抗體力價表示為吸光度值＞ 0.3的最高血清稀釋度的倒數。 HAI 測定

使用Sing16 H3N2和CA09 H1N1病毒儲備物（BIOQUAL, Inc.）進行HAI測定。通過用三份酶稀釋一份血清用受體破壞酶（receptor-destroying enzyme，RDE）處理血清，並且將其在37ºC水浴中培育過夜。通過在56ºC下培育30分鐘的時間，然後添加六份PBS至1/10的最終稀釋度來使酶失活。使用四個血凝單位（HAU）的病毒和0.5%火雞RBC在V形底96孔板中進行HAI測定。在每個測定板上包括每種毒株的參考血清作為陽性對照。每個板還包括反向滴定（back-titration）以確認抗原劑量（4 HAU/25 μl）以及陰性對照樣品（PBS或未經處理的對照血清）。HAI力價確定為導致血凝完全抑制的最高血清稀釋度。僅僅具有適當的返滴定結果（驗證添加了4 HAU/25 μl）且參考血清力價在預期力價的2倍內的板的結果有效。 NAI 測定

使用酶聯凝集素測定法（ELLA）測定的方法來確定神經胺糖酸酶抑制（NAI）抗體力價。調整抗原（病毒NA）的來源，並且選擇標準量以與血清的連續稀釋液一起培育。用血清（在56ºC下熱滅活1小時）的連續稀釋液進行血清的滴定，並且將標準量的病毒添加到經胎球蛋白包被的板的重複孔中。然後將此混合物培育過夜（16至18小時）；第二天，將HRP綴合的花生凝集素PNA（稀釋至2.5 μg/ml）添加到經洗滌的板中，並且在室溫下培育2小時。添加底物（在檸檬酸鈉中的ODP）並培育10分鐘以使顏色顯色。然後添加終止緩衝液（1N硫酸）以終止反應。掃描板以得到在OD 490 nm下的吸光度。由於存在NA特異性抗體，相對於病毒對照的顏色減少或不存在表明了NA活性的抑制。從OD讀數計算NAI力價（IC ₅₀值），並且在GraphPad Prism中繪製結果。如果ELLA滴定曲線不允許良好的擬合來確定可靠的IC50值，則使用不同的稀釋方案來重新測試樣品以達到50%終點。 T 細胞 ELISPOT 測定

將完全培養基（DMEM1640 + 10%熱滅活的FCS）在37ºC水浴中預熱。將PBMC在37ºC水浴中迅速解凍，並且逐滴轉移到具有預熱的培養基的錐形管中。將管以1,500 rpm離心5 min，並且將細胞重新懸浮並使用Guava細胞計數器計數。使用猴類IFN-γ ELISPOT套組（Mabtech 3421M-4APW）和IL-13 ELISPOT套組（Mabtech 3470M-4APW）。將由套組提供的預包被的板用無菌PBS洗滌四次，並且在37ºC培養箱中用200 µl的完全培養基封閉至少30分鐘。將Sing16 H3肽合併物（Genscript Custom Order）（每種肽為1 µg/ml）在測定中用作回憶（recall）抗原。將2 µg/ml的ConA（Sigma，目錄號C5275）用作陽性對照。將50 µl的回憶抗原和50 µl的300,000個PBMC添加到每個孔中以進行刺激。將板置於37ºC、5% CO ₂加濕培養箱中48小時。

在培育後，除去細胞，將板用PBS洗滌5次，並且將100 µl的1 µg/ml生物素化的抗IFN-γ或抗IL-13檢測抗體添加到板的每個孔中。在培育2小時後，將板用PBS洗滌5次，並且在室溫下與每個孔中100 µl的鏈黴親和素的1 : 1000稀釋液一起培育一小時。用100 µl的BCIP/NBT底物溶液使板顯色，直到出現斑點。將板用自來水沖洗，風乾並掃描，並且使用CTL ImmunoSpot®讀取器（Cellular Technology Ltd.）計數。資料包告為每百萬PBMC的斑點形成細胞（SFC）。 記憶 B 細胞（ MBC ） ELISPOT 測定

按照製造商的說明書，使用人類IgG單色記憶B細胞ELISPOT套組（目錄號NC1911372，CTL）來測量Sing16 H3特異性和總IgG ⁺抗體分泌細胞（ASC）。通過使用由套組提供的刺激混合物在PBMC中進行MBC到ASC的分化。簡而言之，將冷凍的PBMC在37ºC水浴中迅速解凍，與DNA酶I（目錄號90083，Fisher Scientific）混合並轉移到含有預熱的完全培養基（CM）（RPMI 1640（目錄號22400-089，Gibco），含有10% FCS（目錄號SH30073.03，HyClone™）和1%青黴素/鏈黴素（目錄號P4333，Sigma））的管中，並且以1,500 rpm離心5分鐘。將細胞沈澱以2 x 10 ⁶個細胞/ml重懸在5 ml的完全培養基中，並且轉移到37ºC下的5% CO ₂培養箱中的T25燒瓶中1小時。然後將細胞懸浮液的體積調整到6 ml，並且以1 : 1000稀釋度添加B-Poly-S。將細胞留在CO ₂培養箱中以刺激4天。將由套組提供的PVDF微孔板用70%乙醇預濕，沖洗，並且用80 µl/孔的由套組提供的抗人類IgG捕獲Ab或4 μg/ml的Sing16/H3重組蛋白包被過夜。

在刺激4天後收穫細胞，將其洗滌並計數，並且在CM中調整到指定的濃度。將經包被的微孔板用PBS洗滌，用CM封閉1小時並清空。將細胞懸浮液以100 µl/孔添加到板中，並且在37ºC下在CO ₂培養箱中培育18 h。在洗滌後，將80 µl/孔的1 : 400稀釋的抗人類IgG生物素檢測抗體添加到板中，並且在室溫下培育2小時。在洗滌後，將1 : 1000稀釋度的鏈黴親和素-AP以80 µl/孔添加到板中持續1小時。添加新鮮製備的底物溶液並在室溫下培育18 min。將板用自來水沖洗，風乾並掃描，並且使用CTL ImmunoSpot®讀取器（Cellular Technology Ltd）計數。對於每隻個體動物，計算每百萬PBMC的IgG ⁺ASC的數量和Sing16/H3特異性ASC的數量。抗原特異性ASC的頻率計算為抗原特異性ASC比總IgG ⁺ASC的%。為了評估測定背景，將每個板上的陰性對照孔用PBS包被（未檢測到背景）。 統計分析

為了估計輻射的T _max，使用非參數方法基於觀察到的資料來估計個體受試者的T _max。為了估計輻射半衰期，假設在達到最大值之後的輻射呈指數衰減模型，將線性模型擬合到每個受試者的從最大輻射衰減到基線的時間進程期間對數變換的資料（我們使用鹽水中的輻射平均值估計基線）。半衰期估計為當輻射對數值已經達到最大值與基線值之間的中間點時的時間點。為了分析結果總結為幾何平均值的不同讀出，從重複測量的混合效應模型估計基於SE模型的幾何平均值和SE，其中回應是對數變換的讀出，疫苗接種是固定效應並且時間是重複量度；然後，將來自模型的基於對數的平均值和SE估計值反向變換以得到幾何平均值和SE。對於體重變化，使用過描述性（over descriptive）統計分析。報告了每組的隨時間的相對於基線（第0天）的體重減輕最大值%的中值和範圍以評價更糕的情況；報告了在最後一次觀察時每組的相對於基線的體重變化%的中值和範圍以評價體重恢復。 抗原序列

這裡使用的Perth09 N2抗原的序列是： MNPNQKIITIGSVSLTISTICFFMQIAILITTVTLHFKQYEFNSPPNNQVMLCEPTIIERNITEIVYLTNTTIEKEICPKLAEYRNWSKPQCDITGFAPFSKDNSIRLSAGGDIWVTREPYVSCDPDKCYQFALGQGTTLNNVHSNNTVRDRTPYRTLLMNELGVPFHLGTKQVCIAWSSSSCHDGKAWLHVCITGDDKNATASFIYNGRLVDSVVSWSKEILRTQESECVCINGTCTVVMTDGSASGKADTKILFIEEGKIVHTSTLSGSAQHVEECSCYPRYPGVRCVCRDNWKGSNRPIVDINIKDHSIVSSYVCSGLVGDTPRKNDSSSSSHCLDPNNEEGGHGVKGWAFDDGNDVWMGRTISEKSRLGYETFKVIEGWSNPKSKLQINRQVIVDRGNRSGYSGIFSVEGKSCINRCFYVELIRGRKEETEVLWTSNSIVVFCGTSGTYGTGSWPDGADINLMPI* (SEQ ID NO:4)

這裡使用的Mich15 N1抗原的序列是： MNPNQKIITIGSICMTIGMANLILQIGNIISIWVSHSIQIGNQSQIETCNQSVITYENNTWVNQTYVNISNTNFAAGQSVVSVKLAGNSSLCPVSGWAIYSKDNSVRIGSKGDVFVIREPFISCSPLECRTFFLTQGALLNDKHSNGTIKDRSPYRTLMSCPIGEVPSPYNSRFESVAWSASACHDGINWLTIGISGPDSGAVAVLKYNGIITDTIKSWRNNILRTQESECACVNGSCFTIMTDGPSDGQASYKIFRIEKGKIIKSVEMKAPNYHYEECSCYPDSSEITCVCRDNWHGSNRPWVSFNQNLEYQMGYICSGVFGDNPRPNDKTGSCGPVSSNGANGVKGFSFKYGNGVWIGRTKSISSRKGFEMIWDPNGWTGTDNKFSIKQDIVGINEWSGYSGSFVQHPELTGLDCIRPCFWVELIRGRPEENTIWTSGSSISFCGVNSDTVGWSWPDGAELPFTIDK* (SEQ ID NO:5)

這裡使用的Sing16 H3抗原的序列是： MKTIIALSYILCLVFAQKIPGNDNSTATLCLGHHAVPNGTIVKTITNDRIEVTNATELVQNSSIGEICDSPHQILDGENCTLIDALLGDPQCDGFQNKKWDLFVERSKAYSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFKNESFNWTGVTQNGTSSACIRGSSSSFFSRLNWLTHLNYTYPALNVTMPNKEQFDKLYIWGVHHPGTDKDQIFLYAQSSGRITVSTKRSQQAVIPNIGSRPRIRDIPSRISIYWTIVKPGDILLINSTGNLIAPRGYFKIRSGKSSIMRSDAPIGKCKSECITPNGSIPNDKPFQNVNRITYGACPRYVKHSTLKLATGMRNVPEKQTRGIFGAIAGFIENGWEGMVDGWYGFRHQNSEGRGQAADLKSTQAAIDQINGKLNRLIGKTNEKFHQIEKEFSEVEGRVQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDLTDSEMNKLFEKTKKQLRENAEDMGNGCFKIYHKCDNACIESIRNETYDHNVYRDEALNNRFQIKGVELKSGYKDWILWISFAISCFLLCVALLGFIMWACQKGNIRCNICI* (SEQ ID NO:6)

這裡使用的Sing16 N2抗原的序列是： MNPNQKIITIGSVSLTISTICFFMQIAILITTVTLHFKQYEFNSPPNNQVMLCEPTIIERNITEIVYLTNTTIEKEICPKPAEYRNWSKPQCGITGFAPFSKDNSIRLSAGGDIWVTREPYVSCDPDKCYQFALGQGTTLNNVHSNNTVRDRTPYRTLLMNELGVPFHLGTKQVCIAWSSSSCHDGKAWLHVCITGDDKNATASFIYNGRLIDSVVSWSKDILRTQESECVCINGTCTVVMTDGNATGKADTKILFIEEGKIVHTSKLSGSAQHVEECSCYPRYPGVRCVCRDNWKGSNRPIVDINIKDHSIVSSYVCSGLVGDTPRKNDSSSSSHCLNPNNEEGGHGVKGWAFDDGNDVWMGRTINETSRLGYETFKVVEGWSNPKSKLQINRQVIVDRGDRSGYSGIFSVEGKSCINRCFYVELIRGRKEETEVLWTSNSIVVFCGTSGTYGTGSWPDGADLNLMHI* (SEQ ID NO:7)

這裡使用的CA09 H1抗原的序列是： MKAILVVLLYTFATANADTLCIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLLEDKHNGKLCKLRGVAPLHLGKCNIAGWILGNPECESLSTASSWSYIVETPSSDNGTCYPGDFIDYEELREQLSSVSSFERFEIFPKTSSWPNHDSNKGVTAACPHAGAKSFYKNLIWLVKKGNSYPKLSKSYINDKGKEVLVLWGIHHPSTSADQQSLYQNADAYVFVGSSRYSKKFKPEIAIRPKVRDREGRMNYYWTLVEPGDKITFEATGNLVVPRYAFAMERNAGSGIIISDTPVHDCNTTCQTPKGAINTSLPFQNIHPITIGKCPKYVKSTKLRLATGLRNIPSIQSRGLFGAIAGFIEGGWTGMVDGWYGYHHQNEQGSGYAADLKSTQNAIDEITNKVNSVIEKMNTQFTAVGKEFNHLEKRIENLNKKVDDGFLDIWTYNAELLVLLENERTLDYHDSNVKNLYEKVRSQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCDNTCMESVKNGTYDYPKYSEEAKLNREEIDGVKLESTRIYQILAIYSTVASSLVLVVSLGAISFWMCSNGSLQCRICI* (SEQ ID NO: 24)

這裡使用的HA毒株A/加利福尼亞/7/2009（H1N1）（CA09）抗原mRNA開放閱讀框（ORF）的序列是： AUGAAAGCUAUCCUGGUCGUCUUGCUGUAUACUUUCGCCACUGCCAACGCCGACACCCUGUGUAUCGGUUACCACGCGAACAACUCCACCGACACUGUGGACACCGUGCUCGAAAAGAACGUGACCGUGACUCAUUCUGUGAAUCUGCUCGAGGACAAGCACAACGGAAAGUUGUGCAAGCUGCGCGGAGUGGCACCGCUGCACCUUGGAAAGUGCAACAUUGCCGGAUGGAUCCUGGGAAACCCGGAGUGCGAAAGCCUGAGCACCGCGUCCUCAUGGUCCUACAUCGUGGAAACCCCGUCCUCUGACAACGGCACCUGUUACCCCGGCGAUUUCAUCGACUACGAAGAACUGCGGGAGCAGCUGUCCUCCGUGUCCUCGUUUGAACGCUUCGAGAUUUUCCCUAAGACCUCCAGCUGGCCUAAUCACGAUAGCAACAAGGGCGUGACGGCAGCCUGCCCGCACGCCGGAGCAAAGUCAUUCUACAAGAAUCUGAUUUGGCUCGUGAAGAAAGGGAACUCAUACCCCAAGCUGUCCAAGUCGUACAUCAACGACAAGGGAAAGGAAGUGCUCGUGCUCUGGGGGAUCCACCACCCAUCCACCUCCGCCGACCAGCAGAGCCUGUACCAGAACGCCGAUGCUUACGUGUUUGUGGGUUCCAGCCGGUACUCCAAGAAGUUCAAGCCUGAAAUCGCGAUCAGGCCUAAAGUCCGGGACCGCGAGGGCCGCAUGAACUACUACUGGACUCUCGUGGAGCCUGGAGACAAGAUCACCUUCGAGGCCACCGGAAAUCUCGUGGUGCCACGCUACGCUUUCGCCAUGGAACGGAACGCCGGAAGCGGCAUCAUCAUUAGCGAUACUCCUGUGCAUGACUGUAACACCACGUGCCAGACACCCAAGGGCGCCAUCAACACCAGCCUGCCGUUUCAAAACAUCCAUCCCAUUACCAUUGGGAAGUGCCCCAAAUACGUCAAGUCCACCAAGCUGAGGCUGGCGACCGGACUGCGGAACAUUCCGAGCAUCCAGUCGAGAGGCCUGUUCGGUGCCAUCGCGGGAUUCAUCGAGGGCGGCUGGACUGGAAUGGUGGACGGUUGGUACGGGUAUCACCACCAAAACGAACAGGGAUCAGGCUACGCGGCCGAUUUGAAGUCCACCCAGAACGCCAUUGAUGAAAUCACCAACAAGGUCAACUCCGUGAUUGAGAAGAUGAAUACUCAAUUCACCGCCGUGGGCAAAGAAUUCAAUCACCUGGAGAAGAGAAUAGAGAACCUGAACAAGAAGGUCGACGACGGGUUCCUCGACAUCUGGACCUAUAACGCCGAGUUGCUCGUGCUGCUGGAAAACGAACGGACCCUGGACUAUCACGACUCGAACGUGAAGAACCUGUACGAGAAAGUCCGCUCGCAACUGAAGAACAACGCCAAGGAAAUCGGAAAUGGUUGCUUCGAGUUCUACCAUAAGUGCGACAACACUUGCAUGGAGUCCGUGAAGAACGGCACUUACGAUUACCCCAAGUACUCCGAAGAGGCUAAACUUAACCGGGAAGAGAUCGAUGGCGUGAAGCUCGAGUCCACCAGAAUCUACCAGAUUCUCGCCAUCUACUCGACUGUGGCAUCGAGCCUCGUCCUUGUCGUGUCCCUGGGGGCCAUUUCAUUCUGGAUGUGCUCCAACGGGUCCCUGCAGUGCCGGAUUUGCAUCUAA (SEQ ID NO: 8)

這裡使用的A/密西根/45/2015（Mich15）神經胺糖酸酶（NA）抗原mRNA開放閱讀框（ORF）的序列是： AUGAACCCAAACCAGAAAAUCAUCACGAUUGGCUCGAUUUGCAUGACCAUUGGAAUGGCGAACCUUAUCCUCCAAAUUGGCAACAUUAUCUCGAUCUGGGUCAGCCACUCGAUCCAGAUCGGCAACCAAUCCCAGAUUGAAACUUGCAACCAGAGCGUGAUUACUUACGAAAACAACACGUGGGUGAACCAGACUUACGUCAAUAUUAGCAACACUAACUUCGCCGCUGGGCAGAGCGUCGUCAGCGUGAAGCUCGCCGGAAAUUCCUCGCUCUGCCCCGUGUCCGGCUGGGCGAUCUACAGCAAGGAUAACAGCGUCCGGAUUGGUAGCAAGGGCGACGUUUUCGUGAUCCGCGAACCCUUCAUAUCAUGCUCCCCGCUCGAAUGUCGCACGUUCUUCCUGACCCAAGGCGCCCUGCUGAACGACAAGCACUCCAAUGGCACUAUCAAGGAUCGGAGCCCUUACCGGACCUUGAUGUCCUGCCCUAUUGGAGAAGUGCCUUCACCAUAUAACUCGCGCUUUGAAAGCGUGGCUUGGUCAGCCUCCGCCUGCCAUGACGGGAUUAACUGGCUGACCAUUGGCAUAAGCGGCCCCGAUUCCGGCGCCGUGGCCGUCCUGAAGUACAACGGGAUCAUCACCGACACCAUUAAGUCCUGGCGCAACAACAUCCUGAGGACCCAGGAGUCCGAGUGCGCGUGCGUGAACGGGUCCUGCUUUACCAUCAUGACCGACGGACCGUCCGACGGUCAAGCCUCGUACAAGAUCUUCCGGAUCGAGAAAGGAAAGAUCAUCAAGAGCGUGGAGAUGAAGGCCCCGAACUACCACUACGAGGAAUGUUCAUGCUAUCCCGACUCGUCCGAGAUUACUUGCGUGUGCCGCGACAAUUGGCACGGAUCCAACAGGCCGUGGGUCAGCUUCAACCAGAACCUUGAAUACCAGAUGGGAUACAUUUGCAGCGGAGUGUUCGGGGACAACCCUCGCCCGAACGACAAGACCGGAUCGUGUGGGCCCGUGUCCUCCAACGGCGCAAACGGCGUCAAGGGAUUUUCCUUCAAAUACGGGAACGGGGUCUGGAUCGGACGGACCAAGAGCAUUUCAAGCAGAAAGGGAUUCGAGAUGAUUUGGGACCCGAACGGCUGGACUGGUACCGAUAACAAAUUCAGCAUCAAGCAGGACAUCGUGGGAAUUAACGAGUGGUCCGGUUACUCCGGGAGCUUCGUGCAGCAUCCCGAACUCACUGGACUGGACUGCAUUCGGCCGUGCUUUUGGGUGGAAUUGAUCCGGGGCAGACCUGAGGAGAACACGAUUUGGACCUCCGGCUCCUCGAUCUCGUUCUGCGGAGUGAACUCCGACACCGUGGGAUGGUCCUGGCCCGACGGUGCAGAGCUGCCCUUCACCAUUGAUAAGUAA (SEQ ID NO: 9)

這裡使用的A/新加坡.INFIMH160019/2016（Sing16；H3N2）HA血球凝集素抗原mRNA開放閱讀框（ORF）的序列是： AUGAAAACCAUAAUCGCGCUCUCAUACAUACUUUGCCUGGUCUUUGCCCAAAAGAUCCCUGGCAACGACAACUCAACCGCGACCCUUUGCCUCGGCCAUCACGCCGUGCCGAACGGCACUAUCGUCAAGACCAUCACAAACGACCGCAUCGAAGUGACCAACGCGACUGAGCUAGUGCAGAACUCCAGCAUUGGAGAGAUUUGCGAUUCUCCACACCAAAUCCUGGACGGAGAGAAUUGUACCUUGAUCGACGCGCUGCUGGGGGAUCCGCAGUGCGACGGAUUCCAGAACAAGAAAUGGGACCUUUUCGUGGAACGGAGCAAGGCAUACUCGAAUUGCUACCCCUACGAUGUGCCCGACUACGCCUCGCUGCGGUCCUUGGUCGCUUCCUCCGGGACCCUGGAAUUCAAAAACGAGAGCUUUAAUUGGACCGGAGUGACCCAGAAUGGCACCUCGAGCGCCUGCAUUCGGGGCUCCUCCUCGAGCUUCUUCAGCCGCCUGAACUGGCUCACUCACCUCAACUACACCUACCCGGCACUGAACGUGACCAUGCCGAACAAGGAACAAUUCGACAAGCUCUACAUUUGGGGGGUGCAUCACCCGGGUACCGAUAAGGACCAGAUCUUCCUCUACGCCCAAUCCUCGGGCCGGAUCACCGUGUCCACUAAGCGCUCGCAGCAGGCCGUGAUCCCGAACAUUGGAAGCAGACCCCGCAUUCGCGACAUUCCAUCGAGGAUCUCGAUCUACUGGACGAUUGUCAAGCCUGGCGACAUCCUCCUCAUUAACUCCACCGGGAACCUCAUCGCCCCUCGGGGUUAUUUCAAGAUCCGCAGCGGGAAGUCCUCCAUCAUGAGAAGCGAUGCCCCCAUUGGAAAGUGCAAGUCCGAGUGUAUCACACCUAACGGAAGCAUUCCCAAUGACAAGCCAUUCCAGAACGUGAACAGAAUUACCUACGGAGCUUGCCCUCGCUACGUCAAACAUUCGACCCUCAAGUUGGCGACUGGAAUGCGCAACGUGCCGGAGAAGCAAACCCGGGGGAUCUUCGGGGCUAUCGCGGGAUUCAUCGAAAAUGGAUGGGAAGGAAUGGUCGAUGGUUGGUACGGUUUCAGACACCAGAACUCCGAGGGGCGGGGCCAGGCCGCAGACCUGAAGUCCACUCAGGCCGCGAUUGACCAGAUCAACGGAAAGCUCAACAGACUCAUUGGAAAGACCAACGAAAAGUUCCACCAAAUCGAAAAGGAAUUCUCCGAAGUGGAGGGCCGGGUGCAAGACCUGGAGAAGUACGUGGAGGACACUAAGAUCGACCUUUGGAGCUAUAACGCAGAACUCCUUGUGGCCCUGGAAAACCAGCACACCAUCGACCUGACCGAUUCAGAGAUGAACAAGCUCUUUGAGAAAACUAAGAAGCAACUCCGGGAAAACGCUGAGGACAUGGGAAAUGGAUGCUUUAAGAUCUACCACAAGUGCGACAACGCCUGCAUUGAGUCCAUACGGAACGAAACUUACGACCAUAACGUCUACCGGGAUGAAGCCCUGAACAACAGAUUCCAGAUCAAGGGCGUGGAGCUGAAGUCCGGCUACAAAGAUUGGAUCCUGUGGAUUUCCUUCGCGAUUUCAUGCUUCUUGCUCUGCGUGGCCCUCCUGGGAUUCAUAAUGUGGGCCUGUCAGAAGGGCAACAUUAGGUGCAACAUAUGCAUAUAA (SEQ ID NO: 10)

這裡使用的佩斯/16/2009（H3N2）NA抗原mRNA開放閱讀框（ORF）的序列是： AUGAACCCUAACCAGAAGAUCAUCACAAUUGGAAGCGUGUCCCUGACCAUUUCGACGAUUUGCUUCUUCAUGCAAAUCGCGAUCUUGAUUACCACCGUCACCCUGCAUUUCAAGCAAUACGAAUUCAACUCCCCGCCAAACAACCAAGUCAUGCUCUGCGAGCCCACCAUCAUCGAACGCAACAUCACCGAGAUCGUGUACCUUACCAACACUACCAUCGAAAAGGAGAUUUGCCCCAAGUUGGCCGAAUACCGGAACUGGAGCAAGCCCCAGUGUGACAUCACGGGAUUUGCGCCAUUCAGCAAGGAUAACUCGAUCAGACUUUCCGCCGGGGGCGACAUUUGGGUCACUCGGGAGCCUUACGUGAGCUGCGACCCGGACAAGUGCUACCAAUUCGCACUCGGACAGGGUACCACCCUGAACAACGUCCAUAGCAACAACACCGUGCGCGAUAGAACCCCGUACCGCACCCUCCUCAUGAACGAACUGGGAGUGCCGUUCCACUUGGGAACCAAACAAGUCUGCAUUGCAUGGUCCUCCUCCUCCUGCCACGACGGCAAAGCCUGGCUUCACGUUUGCAUCACCGGCGACGACAAGAAUGCGACGGCCUCCUUCAUAUACAAUGGUAGACUCGUGGAUAGCGUGGUGUCAUGGUCCAAGGAAAUUCUCAGGACUCAGGAGUCAGAGUGCGUGUGCAUCAACGGGACUUGCACUGUCGUGAUGACCGACGGAUCGGCCUCCGGAAAGGCCGACACUAAGAUCCUCUUCAUCGAGGAGGGAAAGAUCGUGCACACUUCUACCCUGAGCGGCUCGGCUCAGCAUGUCGAAGAGUGCUCGUGCUACCCCCGGUAUCCCGGGGUCCGCUGCGUGUGCCGGGACAAUUGGAAAGGCUCAAACCGCCCCAUCGUGGACAUUAACAUCAAGGACCACUCCAUCGUGAGCUCCUACGUAUGCAGCGGGCUGGUCGGGGAUACCCCGCGGAAGAACGAUUCCUCGUCCUCCUCCCACUGCCUGGACCCUAACAACGAAGAGGGAGGCCACGGAGUGAAGGGAUGGGCUUUUGACGAUGGCAACGACGUGUGGAUGGGCAGGACUAUUUCCGAAAAGUCCCGGCUGGGAUACGAAACCUUCAAGGUCAUCGAGGGCUGGUCCAACCCGAAGUCAAAGCUCCAGAUCAACCGCCAGGUCAUCGUGGAUAGGGGCAAUAGAUCCGGCUACUCCGGGAUCUUCAGCGUGGAAGGGAAGUCCUGCAUUAACCGAUGCUUCUACGUGGAACUCAUUCGGGGUCGGAAGGAGGAAACCGAAGUGCUGUGGACUUCGAACUCAAUCGUGGUGUUUUGUGGGACCUCCGGAACUUACGGAACUGGGUCCUGGCCUGACGGUGCCGACAUCAACCUUAUGCCGAUCUAA (SEQ ID NO: 11)

這裡使用的A/威斯康辛/588/2019抗原mRNA開放閱讀框（ORF）的序列是： AUGAAAGCCAUCCUUGUUGUCAUGCUGUACACAUUCACCACCGCAAAUGCGGAUACCCUGUGUAUCGGCUACCACGCAAAUAAUUCCACCGACACCGUUGAUACCGUCCUGGAAAAGAACGUGACAGUGACUCACAGCGUCAAUCUCCUUGAGGAUAAACAUAAUGGCAAGCUGUGCAAGCUGAGAGGCGUGGCUCCCCUGCAUCUGGGAAAGUGCAACAUCGCUGGUUGGAUCCUCGGGAACCCAGAGUGUGAGUCCCUCUCAACCGCACGGUCUUGGUCAUACAUCGUGGAGACUAGCAAUUCAGACAACGGCACAUGCUACCCCGGUGACUUCAUUAACUACGAGGAGCUGAGAGAACAGCUGAGUUCCGUGUCAUCCUUCGAGAGAUUCGAAAUCUUCCCCAAAACCUCCUCCUGGCCCAAUCAUGACUCCGACAAUGGAGUGACAGCCGCUUGUCCCCACGCCGGUGCCAAGAGUUUCUAUAAGAACCUCAUCUGGCUGGUGAAAAAGGGCAAGUCCUAUCCCAAAAUUAACCAGACCUACAUUAACGAUAAGGGGAAAGAAGUCCUGGUCCUGUGGGGGAUACACCACCCCCCUACCAUCGCCGACCAGCAGUCUCUGUAUCAGAACGCCGACGCCUACGUGUUCGUGGGUACCAGCCGUUAUAGUAAAAAGUUCAAGCCAGAAAUUGCCACCAGACCUAAGGUGCGCGACCAGGAGGGCCGCAUGAACUACUACUGGACCCUGGUGGAACCUGGCGACAAGAUUACAUUCGAGGCCACUGGGAACCUGGUGGCACCCAGAUACGCCUUUACAAUGGAACGGGAUGCUGGGAGCGGAAUCAUUAUCUCCGAUACCCCUGUCCACGACUGCAAUACUACCUGUCAGACCCCAGAAGGCGCUAUCAAUACCUCUCUGCCUUUCCAAAACGUGCACCCUAUCACUAUCGGGAAAUGUCCCAAGUAUGUGAAAAGCACCAAACUGCGCCUGGCAACCGGUCUGAGAAAUGUGCCCUCCAUCCAGUCCCGCGGCUUGUUCGGUGCAAUCGCUGGCUUUAUCGAGGGUGGCUGGACUGGAAUGGUCGAUGGCUGGUACGGCUACCAUCACCAGAACGAGCAGGGGUCCGGGUAUGCUGCCGACCUGAAAAGCACUCAGAACGCCAUCGAUAAAAUCACUAACAAGGUGAACUCCGUGAUCGAAAAGAUGAAUACACAGUUCACAGCAGUUGGCAAGGAGUUCAACCACCUGGAAAAACGGAUAGAGAACCUGAAUAAGAAAGUCGAUGAUGGCUUUCUGGACAUCUGGACUUACAAUGCCGAGCUGCUGGUGCUCCUGGAAAACGAGCGGACACUGGAUUAUCACGACUCAAACGUGAAGAACCUGUAUGAAAAGGUGCGUAACCAGCUGAAAAACAACGCCAAGGAAAUCGGCAAUGGCUGUUUCGAAUUUUACCACAAGUGUGAUAAUACCUGUAUGGAGAGCGUUAAGAACGGGACUUACGACUACCCAAAAUACAGCGAGGAGGCCAAGCUGAACCGGGAGAAGAUCGACGGCGUCAAACUCGACUCCACUAGAAUAUACCAGAUUCUCGCCAUCUAUAGCACAGUGGCAUCAAGUCUCGUCCUGGUGGUGUCACUGGGAGCCAUCAGCUUUUGGAUGUGCAGCAAUGGAUCCCUCCAGUGUAGGAUCUGCAUCUAA (SEQ ID NO: 12)

這裡使用的A/塔斯馬尼亞/503/2020抗原mRNA開放閱讀框（ORF）的序列是： AUGAAGACCAUCAUCGCUCUGUCCUACAUCCUGUGCCUGGUGUUUGCUCAGAAAAUCCCCGGGAAUGACAAUUCCACUGCCACUCUCUGCCUGGGCCAUCAUGCCGUGCCAAAUGGAACCAUUGUCAAGACUAUAACAAAUGACCGCAUCGAAGUGACCAACGCUACCGAGCUGGUUCAGAACAGCAGUAUUGGAGAAAUCUGCGAUUCCCCACACCAGAUACUGGAUGGCGGCAACUGCACCCUGAUCGACGCACUGCUGGGUGACCCUCAGUGCGACGGAUUUCAGAAUAAGGAGUGGGACCUUUUCGUUGAGCGCAGCAGAGCCAAUAGCAACUGCUACCCGUACGACGUGCCGGAUUACGCCAGUCUUCGAAGCCUGGUCGCAUCCAGCGGGACACUGGAGUUUAAGAAUGAGUCCUUUAAUUGGACAGGCGUGAAGCAGAACGGGACUAGCAGCGCAUGCAUUCGGGGCAGUAGCUCAUCCUUCUUUAGCCGACUGAACUGGCUGACCCACCUCAACUACACAUACCCCGCACUGAAUGUGACUAUGCCAAACAAAGAACAGUUUGACAAACUGUACAUCUGGGGAGUGCACCAUCCUAGCACAGACAAGGACCAGAUCAGCCUGUUUGCCCAGCCCAGCGGCAGGAUUACCGUGUCCACAAAACGGUCACAGCAAGCCGUGAUCCCUAAUAUUGGAUCCCGCCCCCGGAUAAGGGACAUCCCUAGUCGCAUCAGUAUCUACUGGACCAUCGUGAAGCCCGGAGAUAUCUUGCUCAUCAAUAGCACUGGCAACCUCAUUGCCCCCAGGGGCUAUUUUAAGAUCAGAAGCGGCAAGUCCAGCAUUAUGCGCAGCGACGCACCCAUUGGCAAGUGCAAGUCCGAGUGCAUCACUCCUAAUGGGUCCAUCCCAAACGACAAGCCAUUCCAAAAUGUCAACAGAAUCACCUACGGGGCUUGCCCCCGCUACGUGAAGCAGAGUACACUGAAACUGGCCACCGGGAUGCGCAACGUGCCCGAGAAGCAAACUAGAGGCAUCUUUGGAGCUAUCGCUGGCUUCAUUGAGAAUGGCUGGGAGGGUAUGGUGGACGGCUGGUACGGAUUCCGCCACCAGAAUAGCGAAGGCAGAGGCCAGGCAGCAGACUUGAAGUCCACCCAGGCCGCCAUUGAUCAGAUCAACGGCAAACUGAAUCGGCUUAUUGGAAAAACAAACGAGAAGUUCCAUCAGAUUGAGAAGGAGUUUAGCGAGGUGGAGGGCCGCGUGCAGGAUCUGGAAAAGUACGUUGAAGACACCAAGAUCGACCUGUGGUCAUACAAUGCAGAGCUGCUCGUUGCCCUGGAAAAUCAGCACACAAUUGACCUUACAGACUCCGAAAUGAAUAAGCUCUUUGAAAAGACCAAGAAGCAGCUGCGCGAGAACGCCGAGGAUAUGGGGAACGGUUGUUUUAAGAUCUACCACAAGUGUGACAACGCCUGCAUUGGGUCCAUCCGAAAUGAAACAUACGACCACAACGUGUAUAGAGAUGAGGCCCUGAACAACCGAUUCCAGAUUAAGGGAGUCGAGCUGAAGAGUGGCUAUAAGGACUGGAUCCUGUGGAUCUCAUUCGCCAUGUCAUGCUUCCUUCUGUGUAUUGCUCUGCUCGGCUUCAUCAUGUGGGCUUGCCAGAAAGGCAAUAUCCGGUGCAACAUCUGCAUCUAA (SEQ ID NO: 13)

這裡使用的B/華盛頓/02/2019抗原mRNA開放閱讀框（ORF）的序列是： AUGAAAGCAAUCAUAGUGCUGCUGAUGGUGGUGACUAGCAAUGCCGAUCGGAUCUGCACCGGCAUCACUUCCAGUAACAGCCCUCAUGUGGUCAAAACCGCCACACAGGGCGAGGUGAACGUGACCGGAGUGAUUCCACUGACAACUACACCAACGAAGAGUCACUUCGCCAACCUGAAGGGCACCGAAACACGAGGCAAGCUCUGCCCCAAGUGUCUGAAUUGCACCGACCUGGACGUCGCUUUGGGCCGCCCUAAAUGUACCGGCAAAAUACCUUCCGCCAGAGUGUCCAUCCUGCACGAGGUGCGCCCCGUGACCUCCGGGUGUUUUCCCAUAAUGCACGACCGCACUAAAAUCCGCCAGCUGCCCAAUCUUCUGAGGGGGUACGAACAUGUCAGGCUGUCCACUCACAACGUGAUCAACGCAGAAGACGCCCCCGGAAGGCCUUAUGAGAUUGGAACCAGUGGGUCCUGCCCAAACAUUACCAACGGCAACGGCUUCUUCGCCACUAUGGCCUGGGCCGUGCCAAAGAACAAGACCGCCACCAACCCCCUGACAAUUGAAGUCCCUUACAUCUGCACAGAGGGAGAGGAUCAGAUCACCGUGUGGGGGUUUCACUCUGAUAACGAAACUCAGAUGGCCAAGCUGUACGGGGAUUCUAAACCCCAGAAGUUCACCAGUAGCGCUAACGGGGUGACCACCCAUUAUGUGUCUCAGAUCGGAGGUUUCCCAAAUCAGACCGAGGACGGCGGACUGCCCCAGUCUGGAAGGAUCGUAGUGGACUAUAUGGUGCAGAAGAGUGGAAAAACCGGCACCAUUACCUAUCAGCGCGGCAUACUGCUGCCACAGAAGGUGUGGUGUGCUUCCGGCAGGUCCAAGGUUAUCAAAGGGUCCCUCCCCCUGAUCGGCGAAGCAGAUUGUCUGCACGAGAAGUACGGCGGACUGAAUAAGAGCAAACCCUACUACACCGGAGAACACGCUAAGGCAAUUGGGAAUUGUCCGAUCUGGGUGAAGACGCCCCUGAAACUGGCCAAUGGCACAAAAUACCGGCCCCCCGCUAAGCUGCUGAAGGAACGGGGGUUCUUCGGCGCCAUAGCCGGCUUUCUGGAGGGAGGCUGGGAGGGCAUGAUAGCCGGGUGGCACGGCUACACUUCCCAUGGGGCUCACGGGGUGGCUGUGGCCGCCGACCUGAAGUCUACGCAGGAAGCUAUCAACAAAAUCACUAAGAACCUGAACAGCCUGUCGGAAUUGGAGGUCAAGAAUCUGCAGCGGCUGAGCGGCGCCAUGGAUGAGCUGCACAAUGAGAUCCUGGAGCUUGACGAGAAGGUCGAUGAUCUUCGGGCCGAUACAAUUAGUAGCCAAAUUGAGUUGGCCGUGCUGCUCAGCAACGAAGGCAUAAUCAACAGCGAGGACGAGCACCUCCUGGCUCUGGAGAGAAAGCUGAAGAAGAUGCUCGGCCCUAGCGCAGUUGAGAUCGGAAACGGCUGCUUCGAAACCAAGCACAAGUGCAACCAGACCUGCCUGGACAGGAUCGCGGCAGGAACAUUCGACGCUGGGGAAUUCAGCCUCCCCACCUUCGACAGCCUGAACAUCACAGCCGCCAGUCUGAAUGAUGACGGACUGGAUAACCAUACCAUCCUGCUGUACUACUCUACCGCUGCUUCCUCCCUGGCCGUGACAUUGAUGAUCGCAAUCUUUGUGGUUUAUAUGGUGAGCCGAGACAACGUCAGUUGCAGUAUCUGCCUUUAA (SEQ ID NO: 14)

這裡使用的B/普吉島/3073/2013抗原mRNA開放閱讀框（ORF）的序列是： AUGAAAGCCAUCAUUGUGCUGCUGAUGGUUGUUACAAGCAACGCCGACCGCAUCUGCACCGGGAUUACAAGCAGCAAUAGCCCUCACGUGGUGAAGACAGCAACACAGGGAGAGGUGAACGUGACCGGCGUGAUUCCACUGACAACCACCCCAACUAAAUCUUACUUUGCAAACCUGAAAGGGACACGGACCAGAGGAAAGCUGUGCCCUGAUUGCCUGAAUUGCACAGACCUGGACGUGGCCCUGGGCAGACCAAUGUGCGUGGGCACUACACCAAGCGCCAAGGCCUCCAUCCUCCAUGAGGUGCGGCCCGUGACUUCUGGAUGUUUCCCCAUUAUGCACGACAGAACCAAGAUUAGACAGCUGCCAAACCUGCUCCGCGGCUACGAGAAAAUUCGCCUGUCUACACAGAAUGUGAUCGACGCCGAGAAGGCUCCAGGAGGACCAUACAGACUGGGGACUUCUGGCAGCUGCCCUAACGCCACCUCUAAGAUCGGGUUCUUCGCAACCAUGGCUUGGGCCGUGCCUAAAGACAAUUACAAGAAUGCCACCAAUCCACUGACUGUCGAGGUGCCAUAUAUUUGCACAGAGGGGGAGGACCAGAUCACUGUGUGGGGCUUUCAUAGCGAUAAUAAGACUCAGAUGAAGUCUCUCUACGGCGACUCUAACCCUCAGAAGUUCACCUCCUCUGCCAACGGGGUGACAACACACUACGUGUCCCAGAUCGGGGACUUUCCUGACCAGACCGAGGAUGGAGGACUGCCUCAGUCUGGACGCAUCGUGGUGGACUAUAUGAUGCAGAAGCCUGGGAAGACCGGCACUAUCGUGUACCAGAGGGGCGUGCUGCUGCCCCAAAAGGUGUGGUGUGCCUCCGGAAGAAGCAAAGUGAUUAAGGGAUCCCUGCCUCUGAUUGGGGAGGCCGAUUGCCUGCAUGAAGAGUAUGGAGGGCUGAACAAGUCCAAGCCAUACUAUACAGGAAAGCACGCAAAAGCCAUCGGCAACUGUCCCAUCUGGGUCAAAACUCCUCUGAAGCUGGCCAACGGCACCAAAUACCGCCCUCCAGCCAAGCUGCUGAAAGAACGCGGAUUCUUCGGCGCCAUUGCAGGGUUUCUGGAAGGAGGCUGGGAGGGCAUGAUUGCUGGAUGGCACGGAUAUACCUCUCACGGCGCUCACGGGGUGGCCGUGGCCGCCGAUCUGAAGUCCACACAGGAGGCAAUUAACAAGAUCACCAAGAAUCUGAAUUCACUGUCCGAGCUCGAAGUGAAAAACCUGCAGCGCCUGUCCGGCGCCAUGGACGAGCUGCACAAUGAAAUCCUGGAGCUGGACGAGAAGGUGGACGACCUGCGGGCUGACACUAUCAGCAGCCAGAUCGAGCUGGCAGUGCUGCUGAGCAAUGAGGGCAUCAUCAACUCAGAAGACGAACACCUCCUGGCACUGGAAAGGAAACUCAAGAAGAUGCUGGGCCCCUCCGCAGUGGACAUUGGGAACGGCUGUUUCGAAACCAAGCAUAAGUGUAACCAGACUUGUCUGGAUAGGAUCGCAGCAGGAACCUUCAACGCCGGCGAAUUUUCUCUGCCAACAUUUGACUCCCUGAACAUCACAGCUGCAUCCCUGAACGACGACGGACUGGACAAUCACACCAUCCUGCUGUACUACUCUACUGCCGCUAGCUCCCUGGCCGUGACCCUGAUGCUGGCCAUCUUCAUCGUGUACAUGGUUUCCAGGGAUAACGUGUCUUGUAGCAUUUGCCUGUAA (SEQ ID NO: 15) 結果 mRNA 抗原製備，表徵和表現

使用未經修飾的核糖核苷酸酶促地合成了編碼各種流感毒株的經密碼子最佳化的全長HA和NA的mRNA。所有mRNA製劑均具有＞ 95%的5'帽1，並且在毛細管電泳上顯示出單個同質峰。通過將各種脂質組分與mRNA在受控的條件下且以固定的比率混合來製備mRNA-LNP調配物。所有mRNA-LNP均展現出＞ 95%的包封，其中均勻的流體動力半徑的範圍為從95至105 nm，並且多分散性指數（PDI）為0.060-0.136，如 表 5所示。 表 5. 在小鼠臨床前測試中使用的LNP調配物的屬性

LNP	尺寸（ nm ）	PDI	包封 %
CA09 HA	97.54	0.117	95.2
Sing16 HA	103.2	0.068	97.3
Sing16 NA	105.8	0.128	96.5
Mich15 NA	103.3	0.136	97.4

CA09 HA mRNA-LNP圖像的低溫電子顯微鏡檢查（Cryo-TEM）顯示出具有多層內核結構的均勻球形顆粒。通過傅裡葉變換進一步分析的固體核結構的層狀性表明在層之間有3.7 nm的週期性。在顯微照片中所見的顆粒的均勻形態表明同質LNP製劑具有LNP的正確組裝。

通過用CA09 HA、Sing16 HA、Sing16 NA或Mich15 NA的未包封的mRNA構建體暫態轉染人類骨骼肌細胞（HskMC）通過流式細胞術確認抗原表現，並且用蛋白質特異性抗體染色以用於分析。觀察到來自HskMC的高水準的HA和NA表現，確認在肌肉細胞中表現後天然形式HA三聚體和NA四聚體的正確組裝和運輸。為了研究所表現的HA和NA蛋白的亞細胞定位，用二價H3N2 LNP轉染HeLa細胞，並且通過免疫染色和共聚焦顯微鏡檢查使蛋白質視覺化。雖然NA信號指示了在ER中的強共定位（約90%），但發現當用相應蛋白質和鈣聯蛋白（內質網（ER）標記）的抗體對經透化的細胞染色時，HA適度地（25%）與ER共定位。這與以下認識是一致的，即新生NA和HA蛋白易位到ER中進行組裝（Dou等人， Front Immunol.(2018) 9:1581）。

使用報告mRNA表現評價了LNP遞送mRNA的效率和最佳配製參數的選擇（Thess等人， Molecular Therapy(2015) 23(1):S55）。在小鼠中肌內地（IM）投予單次劑量的0.05 μg、0.1 μg、1 μg、5 μg的未經修飾的FF-LNP調配物。螢光素酶活性（通過平均生物發光所測量的）表明了來自mRNA構建體的持續表現，其在所有劑量下在注射後6小時達到峰值，並且在超過72小時時可檢測（ 圖 11 ，小圖 (a)）。在小鼠中在單次0.1 μg劑量下並且在非人靈長類動物（NHP）中在10 μg下用hEPO進一步驗證了高水準的mRNA介導的蛋白質表現。本研究旨在使用標準品LNP Dlin-MC3-DMA25調配物作為對照來比較LNP。通過ELISA定量的血清hEPO在6 h表現出最大表現，其中與hEPO-MC3相比，用hEPO-LNP表現的紅血球生成素要高大約12倍（ 圖 11 ，小圖 (c)）。hEPO-LNP和hEPO-MC3兩者在NHP中顯示出類似的表現動力學，從6小時至72小時可檢測（ 圖 11 ，小圖 (d)）。結果確認了本發明的LNP調配物有效遞送mRNA以便在體外和在體內表現的效用。 HA （ H1 ， H3 ）和 NA （ N1 ， N2 ） mRNA-LNP 在小鼠中的免疫原性

自然歷史和疫苗研究表明，針對流感HA和NA的抗體具有抗病毒功能，並且認為兩種抗原對於有效流感疫苗均是重要的（Krammer等人， Nat Rev Immunol.(2019) 19(6):383-97）。在BALB/c小鼠（n = 8）中以兩劑方案在以4週間隔時間表投予的2、0.4、0.08或0.016 μg mRNA-LNP下評價了未經修飾的CA09 HA-LNP和Sing16 HA-LNP mRNA疫苗。使用相同毒株的重組HA（rHA）抗原來在ELISA中評價總IgG反應。在單次劑量後在所有組中均檢測到HA特異性抗體，但是在第二劑之後的第42天力價達到峰值（ 圖 12）。為了測量功能性抗體，針對同源毒株CA09和Sing16評價了血凝抑制（HAI）反應。儘管在第28天可以觀察到2 μg劑量的CA09-LNP和Sing16-LNP處理組的在第一劑後的HAI力價，分別地GMT為160和GMT 70，但在第二劑後觀察到HAI力價的更明顯的增加。在第42天，在CA09-HA-LNP組中，0.016 μg和0.4 μg組的GMT力價分別為80和2200；並且在Sing 16 HA-LNP組中，0.016 μg和0.4 μg組的GMT力價分別為14和100（ 圖 13）。

類似地，為了測試抗NA反應，將小鼠用2、0.4、0.08或0.016 μg的Sing16 NA-LNP或Mich15 NA-LNP免疫。用重組NA抗原進行ELISA，以評估由Mich15 NA-LNP或Sing16 NA-LNP調配物誘發的總IgG反應。動物在單次劑量後出現高抗體結合反應，其中在第二劑後在第42天NA結合抗體顯著增加（ 圖 14）。將酶聯凝集素測定（ELLA）用作針對H6N1或H6N2嵌合病毒的神經胺糖酸酶抑制（NAI）活性的功能性抗體力價的替代物。儘管與單次劑量相比，兩劑的疫苗大幅增加了功能性抗體反應，但在單次劑量後第28天記錄了令人鼓舞的NAI力價，其中GMT為800和GMT 60，甚至分別在低劑量的0.016 μg的Mich15 NA-LNP和Sing16 NA-LNP下也如此。在第42天，在Sing16 NA-LNP組中，在0.4 μg與0.016 μg之間的GMT力價分別為900和10200，表明了劑量依賴性反應，其中在Mich15 NA-LNP的情況下，力價達到高於ULOQ（ 圖 15）。 保護小鼠免於病毒攻擊

為了測試mRNA疫苗在小鼠流感病毒攻毒模型中的功效，我們在第0週和第4週為BALB/c小鼠IM接種0.4 μg的CA09 HA-LNP，並且為陰性對照組接種兩劑的LNP稀釋劑緩衝液。在研究第0天、第14天、第28天、第42天、第56天、第92天和第107天的疫苗組血清樣品的HAI力價證明了穩健的免疫反應，其中第56天和第92天的GMT分別為1660和1 : 830（ 圖 16A）。在第93天，將所有小鼠用與CA09同源的Belgium09病毒以四倍於可導致50%致命後果的劑量（4xLD ₅₀）鼻內攻毒。疫苗組中的所有小鼠均從攻擊中存活而沒有死亡，並且一些輕度的發病的特點是暫時體重減輕小於5%（ 圖 16B）。然而，稀釋劑對照組中的小鼠遭受顯著且快速的體重減輕，這到第9天導致了高死亡率（90%）。這些結果證明了基於HA的MRT調配物在致死小鼠流感攻毒模型中的高功效。

為了評估基於NA的MRT疫苗的保護功效，我們在BALB/c小鼠中進行了類似的攻毒實驗。由於Mich15 NA-LNP疫苗在未經處理的小鼠中在單次免疫後引發了穩健的NAI力價（ 圖 16A），因此我們評價了在4週的間隔內投予0.4或0.016 μg的Mich15 NA-LNP的一次或兩次投藥方案。以相同的方案接種對照組，接受0.6 μg hEPO-LNP或稀釋劑緩衝液。在單次投予後觀察到穩健的NAI力價，其中在第28天記錄的0.4 μg的Mich15 NA-LNP的GMT為14,000 NAI，並且0.016 μg的Mich15 NA-LNP的GMT為1,800 NAI（ 圖 17A）。在第二次免疫後，在第42天，對於0.4 μg組，NAI力價升至108,000 NAI；並且對於0.016 μg組，NAI力價升至37,000 NAI。在疫苗接種方案後超過12週之後，將所有組用4xLD ₅₀的Belgium09 H1N1病毒攻毒。依據處理組的隨時間的相對於基線的個體體重變化繪製在 圖 17B中。兩個對照組中的所有小鼠均遭受顯著的發病，由於體重減輕＞ 20%，到感染後第8天，不得不對所有動物實施安樂死。值得注意的是，除疫苗組中的一隻外，單次劑量0.016 μg組中的所有動物均從攻擊中存活，表明了針對死亡的高保護功效，甚至在低至0.016 μg的Mich15 NA-LNP的單次劑量後也如此。較高劑量（0.4 µg）表現出總體更高的保護，然而，與HA免疫相比，NA疫苗接種不足以保護免於體重減輕，因為接種疫苗的動物表現出10%初始體重的中值體重減輕，與針對其他NA疫苗報告的觀察結果一致。觀察到接種疫苗的組的體重恢復，導致與基線相比，在低劑量下平均最終體重變化為2.7%，並且對於較高劑量體重增加4.8%。總的來說，結果證明，單次低劑量MRT NA-LNP疫苗接種可以引發可測量的功能性抗體以阻斷流感NA活性，並且足以賦予小鼠針對致命攻擊的保護。 HA （ H3 ） mRNA-LNP 在 NHP 中的免疫原性

為了評價mRNA-LNP在NHP中的免疫原性，在NHP中進行了覆蓋15、45、135和250 μg的Sing16 HA-LNP的劑量範圍研究。在第一次免疫後，所有接種疫苗的NHP均出現對重組HA蛋白有反應性的抗體，如在ELISA中所注意到的（ 圖 18）。在第二劑後觀察到力價的進一步提高。令人驚訝的是，15 μg劑量所誘發的ELISA力價僅比135 μ劑量水準低1.8倍（95% CI 1.0，3.6），表明了劑量飽和度接近15 µg水準。在第42天，在所有劑量組中均誘發了穩健的HAI抗體，並且所記錄的GMT對於15 μg為400，對於45 μg為700，對於135 μg為900，且對於250 μg為570。在第42天，GMT力價的倍數增加與95% CI在135 μg與15 μg處理組之間為2.2倍（1.0；5.0），並且在135 μg與45 μg處理組之間為1.3倍（0.6；2.8），表明儘管隨著劑量的增加，觀察到較高力價的趨勢，但各組之間的差異很小（ 圖 19A）。通過微量中和（MN）測定評估的中和效力（ 圖 19B）顯示出劑量效應的更好趨勢，其中在D28的GMT對於15 µg為40，對於45 µg為180，且對於135 µg為300。

由於已經表明T細胞在動物模型中有效地降低病毒載荷和限制疾病的嚴重程度（Rimmelzwaan等人， Vaccine(2008) 26(4):D41–D44；Sridhar等人， Nat Med.(2013) 19(10):1305-12；Sridhar等人， Front Immunol.(2016) 7:195），因此我們評價了用45、135、250 μg的Sing16 HA-LNP或用45 μg的重組HA接種的NHP中的回憶T細胞。通過用跨越Sing16 HA的整個序列的合併的重疊肽進行回憶刺激在IFN-γ（Th1細胞因子）和IL-13（Th2細胞因子）ELISPOT測定中評價了在第42天收集的PBMC。除250 μg組中的一隻外，所有接種疫苗的動物均出現IFN-γ分泌細胞，範圍為從28至1328個斑點形成細胞（SFC）/百萬PBMC（ 圖 20A）。值得注意的是，未觀察到劑量反應，並且較低和較高劑量水準組的動物顯示出相當頻率的IFN-γ分泌細胞。相比之下，用重組Sing16 HA蛋白免疫的對照組中的所有動物均表現出IFN-γ產生細胞的不存在。在所測試的所有組中均未檢測到IL-13細胞因子分泌細胞的存在或非常低（ 圖 20B）。資料表明，Sing16 HA-LNP在NHP中誘發了強的Th1偏向性細胞反應，與目前正在開發的SARS-CoV-2疫苗MRT5500（Kalnin等人，同上註）所見的情況相當。

為了研究在用Sing16 HA-LNP免疫後NHP中的記憶B細胞（MBC）的頻率，開發了ELISPOT測定以定量抗原特異性MBC作為體液免疫記憶的讀出。在第180天，從用45 μg或15 μg的Sing16 HA mRNA-LNP調配物或用作為比較物的45 μg劑量的重組HA免疫的NHP收集PBMC。進行了4天的PBMC的多株刺激，其被最佳化以將記憶B細胞驅動成抗體分泌細胞（ASC），並且將受刺激的PBMC在抗原特異性ELISPOT中鋪板，其中可以確定抗原特異性ASC的頻率。然後抗原特異性記憶B細胞定量為總IgG+記憶B細胞的百分比。在所有動物中均檢測到抗原特異性記憶B細胞，並且其頻率範圍對於45 ug劑量組為從1%至5%，且對於15 μg劑量組為從0.3%至1.5%。在經rHA免疫的動物中，記憶B細胞反應似乎顯著降低，因為在六隻動物中的五隻中檢測不到抗原特異性記憶B細胞（ 圖 21）。得出結論，像其他mRNA疫苗一樣，Sing16 HA-LNP引發了有希望延長免疫的抗HA特異性記憶B細胞群（Lindgren等人， Front Immunol.(2019) 10:614）。 多價流感病毒抗原

mRNA-LNP平臺的優勢是LNP包封的靈活性以用於多種mRNA抗原構建體。然而，需要測試此潛力以解決對抗原干擾的擔憂。為了探索流感抗原的組合，將共包封的HA和NA mRNA在LNP中配製，作為在H3H1、H3N2或N1N2組合中含有0.2 μg的每種mRNA的二價調配物，或者在單價的情況下，含有0.2 μg的每種相應的抗原。在小鼠中投予這些調配物，以通過比較二價與單價調配物中單獨抗原的功能力價來確定對免疫原性的任何抗原干擾（ 圖 22 ，小圖 (a) 至 (c)和 表 6）。 表 6. 抗原特異性記憶B細胞在用H3 mRNA-LNP疫苗接種的NHP中的頻率

動物組	動物 ID	PBMC/ 孔的 Ag 特異性 IgG	Ag 特異性 IgG/ 百萬 PBMC 的斑點數量	PBMC/ 孔的總 IgG	總 IgG/ 百萬 PBMC 的斑點數量	Ag 特異性 IgG 比總 IgG 的 %
H3 mRNA-LNP （ 45 µg ）	1	3 x 10 5	1082	5 x 10 3	21700	5.0
2	3 x 10 5	232	5 x 10 3	6100	3.8
3	3 x 10 5	282	5 x 10 3	11700	2.4
4	3 x 10 5	2	5 x 10 3	100	2.0
5	3 x 10 5	283	5 x 10 3	8700	3.3
6	3 x 10 5	225	5 x 10 3	22800	1.0
H3 mRNA-LNP （ 15 µg ）	1	3 x 10 5	63	5 x 10 3	21600	0.3
2	3 x 10 5	58	5 x 10 3	11300	0.5
3	3 x 10 5	253	5 x 10 3	17300	1.5
4	3 x 10 5	173	5 x 10 3	17300	1.0
5	3 x 10 5	63	5 x 10 3	9300	0.7
6	3 x 10 5	107	5x10 3	19300	0.6
rHA （ 45 µg ）	1	3 x 10 5	2	5 x 10 3	19800	0.0
2	3 x 10 5	28	5 x 10 3	14300	0.2
3	3 x 10 5	2	5 x 10 3	17000	0.0
4	3 x 10 5	0	5 x 10 3	7900	0.0
5	3 x 10 5	0	5 x 10 3	21600	0.0
6	3 x 10 5	0	5 x 10 3	14600	0.0
稀釋劑	1	3 x 10 5	0	5 x 10 3	30900	0.0
2	3 x 10 5	0	5 x 10 3	7100	0.0

在H1H3組合中，在共包封與分開投予的疫苗之間，無論時間點如何，對於HAI力價，均未觀察到統計上顯著的差異（p = 0.2584）；並且對於H3力價，在D42未觀察到顯著差異（p = 0.8389）。在H3N2組合的情況下，疫苗的NA組分與HA組分組合引發了高中和抗體，證明了HA優勢的缺乏。在共包封與分開投予的疫苗之間，無論時間點如何，對於H3力價，均未觀察到統計上顯著的差異（p = 0.2960）；並且對於N2力價，在D42未觀察到顯著差異（p = 0.0904）。同樣，對於N2，N1N2組合沒有統計上顯著的差異（p = 0.3899）。共包封和分開投予的疫苗在第42天的N1力價高於定量極限。因此，N2N1、H3H1或H3N2的組合產生了與分開配製的單獨LNP等同的抗體力價。

進一步探索了共包封的H1、N1、H3和/或N2 mRNA的四價調配物。在NHP中以由2.5 μg的每種流感抗原mRNA和填充量的非編碼mRNA（如果需要）組合構成的總共10 μg測試了這些調配物，得到四價（H1N1H3N2）、二價（H1N1或H3N2）或單價（H1、H3、N1或N2）LNP（ 表 7）。 表 7. 在小鼠研究中流感病毒的二價組合

組	N	mRNA1	mRNA2	LNP	mRNA劑量（μg）	描述	CA09 HAI	Sing16 HAI	Mich15 NAI	Perth09 NAI
1	8	Sing16 H3	Perth09 N2	是	0.2，0.2	共配製		x		x
2	8	分開		x		x
3	8	CA09 H1	Sing16 H3	共配製	x	x
4	8	分開	x	x
5	8	Mich15 N1	Perth09 N2	共配製			x	x
6	8	分開			x	x
7	8	稀釋劑	-	-	0	單一	x	x	x	x

在單價調配物與二價或四價調配物之間比較了對H1或H3的HAI力價或者對N1或N2的NAI力價（ 圖 23）。在第42天，當分析H1單價組（p = 0.9054，非配對雙尾t檢驗）或H1N1二價組（p = 0.8002）的HAI力價時，四價組的H1的HAI力價相當。類似地，當分析H3單價組（p = 0.2504）或H3N2二價組（p = 0.5894）的H3 HAI力價時，四價組的H3 HAI力價相當。在用N1單價mRNA或H1N1二價mRNA或四價H1N1H3N2 mRNA調配物接種的各組動物中對N1的NAI力價幾乎相同。同樣，在N2單價mRNA調配物（p = 0.8485）或H3N2二價mRNA調配物（0.4545）與四價H1N1H3N2 mRNA調配物之間，N2 NAI力價沒有差異。

總的來說，這些發現表明，在此劑量水準下HA/NA mRNA-LNP的共包封的或組合多價疫苗可以有效地遞送所有四種抗原，而無需對抗原干擾有任何擔憂，並且所有抗原在調配物中均像單獨遞送這些抗原時一樣具有免疫原性。 實例 7 ：另外的 LNP 調配物

製備了mRNA疫苗的另外的LNP調配物，命名為脂質C（含有陽離子脂質GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1）、脂質D（含有陽離子脂質GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10）和脂質E（含有陽離子脂質GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14）。將人類紅血球生成素（hEPO）mRNA用作測試mRNA。通過ELISA測量來自從注射LNP的小鼠取的樣品的hEPO的表現。在注射後6小時、24小時、48小時和72小時取樣品。如 圖 24所示，與含有陽離子脂質MC3的對照LNP調配物相比，hEPO表現在LNP調配物脂質A、脂質B、脂質C、脂質D和脂質E的情況下在所有時間點始終更高。

下 表 8總結了相對於包含MC3陽離子脂質的對照LNP的結果。

表 8. 相對於MC3來自LNP調配物脂質A-E的hEPO的水準。

LNP調配物	在6小時hEPO高出的倍數 （與MC3相比）	STDEV
脂質A	10.35	4.15
脂質B	5.62	1.34
脂質D	7.78	2.79
脂質E	6.17	1.57

接下來在非人靈長類動物（NHP）中測試了相同的hEPO mRNA-LNP調配物。在注射後6小時、48小時和96小時取樣品。如 圖 25所示，每種LNP調配物均產生了與MC3對照調配物相當水準的hEPO。

還在NHP中測試了流感HA編碼mRNA-LNP調配物。經由肌內注射向NHP投予10 µg的LNP調配物，並且在注射後第28天和第42天取樣品。如上所述測量HAI力價。如 圖 26所示，每種LNP調配物均產生了與MC3對照調配物相當或更高的HAI力價。

進行了與 圖 26所示相同的實驗，同時測量了Cal09 H1流感抗原情況下的HAI力價。如 圖 27所示，每種LNP調配物均產生了與MC3對照調配物相當或更高的HAI力價。

如圖28所示，對於LNP調配物脂質C和脂質D，在Sing16 H3抗原情況下的HAI力價升高。 實例 8 ：呼吸道合胞病毒（ RSV ） F 蛋白編碼 mRNA LNP 調配物

針對LNP包封的RSV F蛋白mRNA測試了不同陽離子脂質在LNP中的影響。測試了脂質A、脂質B、脂質C、脂質D和脂質E的脂質調配物。每種LNP由40%的五種陽離子脂質之一、30%磷脂DOPE、1.5% PEG化的脂質DMG-PEG2000和28.5%膽固醇構成。還使用了具有陽離子脂質MC3的LNP，其被認為是行業基準（Jayaraman等人 Angew Chem Int Ed. 51:8529-33. 2012）。

所測試的F蛋白被命名為FD3，並且對應于融合前RSV F蛋白。下文敘述了FD3的胺基酸序列。

FD3 ：MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITIELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMGSGNVGLGGAIASGVAVSKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAVVSLSNGVSVLTFKVLDLKNYIDKQLLPILNKQSCSISNPETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYMLTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMSIIKEEVLAYVVQLPLYGVIDTPCWKLHTSPLCTTNTKNGSNICLTRTDRGWYCDNAGNVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSRTLPSEVNLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVSNKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNELINQSLAFINQSDELLHNVNAGKSTTNIMITTIIIVIIVILLSLIAVGLLLYCKARSTPVTLSKDQLSGINNIAFSN (SEQ ID NO: 16)

本文所述的mRNA分子包含編碼RSV F蛋白抗原的開放閱讀框（ORF）、至少一個5'非轉譯區（5' UTR）、至少一個3'非轉譯區（3' UTR）和至少一個多腺苷酸化（聚(A)）序列。mRNA進一步包含具有以下結構的5'帽：

下文敘述了編碼RSV F蛋白的mRNA開放閱讀框（ORF）的核酸序列。

FD3 mRNA ORF： AUGGAACUGCUGAUCCUCAAAGCCAACGCAAUCACCACCAUUCUCACCGCUGUGACCUUCUGCUUCGCAUCGGGGCAGAACAUCACUGAAGAGUUUUACCAGAGCACUUGCAGCGCGGUGUCAAAGGGUUACCUUUCCGCACUGCGGACCGGAUGGUACACUUCCGUGAUCACCAUUGAGCUCAGCAACAUCAAGGAAAACAAGUGCAAUGGCACCGACGCCAAGGUCAAGCUGAUCAAACAAGAACUGGACAAGUACAAGAACGCCGUGACAGAAUUGCAGCUCCUGAUGGGAUCCGGAAACGUCGGUCUGGGCGGAGCCAUCGCGAGUGGAGUGGCUGUGUCCAAGGUCUUGCACCUCGAGGGAGAAGUGAACAAGAUCAAGUCCGCGCUGCUGUCAACGAACAAGGCCGUGGUGUCCCUGUCUAACGGCGUCAGCGUGCUGACGUUCAAGGUCCUGGACCUGAAGAAUUACAUUGACAAGCAGCUGCUGCCCAUCCUCAACAAGCAAUCCUGCUCCAUCUCCAACCCCGAAACCGUGAUCGAGUUCCAGCAGAAGAACAACCGCCUGCUGGAAAUUACUCGCGAGUUCUCUGUGAAUGCCGGCGUGACCACCCCUGUGUCCACCUACAUGCUGACCAACUCCGAGCUUCUCUCCCUUAUCAAUGACAUGCCUAUCACGAACGACCAGAAGAAGCUGAUGUCGAACAACGUGCAGAUUGUGCGGCAGCAGUCAUACAGCAUCAUGUCGAUCAUCAAGGAAGAAGUGCUGGCGUACGUGGUGCAACUCCCGCUGUACGGCGUCAUCGAUACCCCGUGCUGGAAGCUGCACACCUCGCCUUUGUGUACCACCAACACCAAGAACGGAUCCAACAUCUGCUUAACCCGGACUGAUCGGGGUUGGUACUGCGACAACGCCGGGAAUGUUUCGUUCUUCCCACAAGCCGAGACUUGUAAAGUGCAGUCAAACAGAGUGUUCUGUGACACCAUGAACUCGAGAACCCUGCCCAGCGAAGUGAACCUGUGUAACGUCGACAUCUUUAACCCAAAAUACGAUUGCAAGAUUAUGACCAGCAAAACCGACGUGUCCUCCUCCGUGAUAACAAGCCUGGGGGCGAUUGUGUCAUGCUACGGAAAGACUAAGUGCACCGCCUCGAACAAGAACCGCGGCAUCAUUAAGACUUUCUCGAAUGGUUGCGACUAUGUGUCCAACAAGGGCGUGGAUACUGUGUCAGUCGGGAAUACUCUUUACUACGUGAACAAGCAGGAGGGGAAAAGCCUCUACGUGAAGGGAGAGCCUAUUAUCAACUUUUACGAUCCGCUGGUGUUCCCGUCCGACGAAUUCGACGCCAGCAUCAGCCAAGUCAACGAGCUGAUUAACCAGUCCCUCGCCUUCAUCAACCAAUCCGACGAGCUCCUGCAUAACGUGAACGCCGGAAAGUCCACCACCAACAUCAUGAUCACUACUAUUAUCAUCGUGAUCAUCGUCAUCCUGCUGAGCCUGAUUGCUGUGGGCCUGUUGCUGUAUUGCAAAGCCAGGUCCACCCCGGUCACCCUGUCGAAGGAUCAGCUGUCCGGAAUCAACAACAUUGCCUUCUCCAACUAA (SEQ ID NO: 17)

下文敘述了編碼RSV F蛋白的DNA範本的核酸序列。

FD3 DNA ：ATGGAACTGCTGATCCTCAAAGCCAACGCAATCACCACCATTCTCACCGCTGTGACCTTCTGCTTCGCATCGGGGCAGAACATCACTGAAGAGTTTTACCAGAGCACTTGCAGCGCGGTGTCAAAGGGTTACCTTTCCGCACTGCGGACCGGATGGTACACTTCCGTGATCACCATTGAGCTCAGCAACATCAAGGAAAACAAGTGCAATGGCACCGACGCCAAGGTCAAGCTGATCAAACAAGAACTGGACAAGTACAAGAACGCCGTGACAGAATTGCAGCTCCTGATGGGATCCGGAAACGTCGGTCTGGGCGGAGCCATCGCGAGTGGAGTGGCTGTGTCCAAGGTCTTGCACCTCGAGGGAGAAGTGAACAAGATCAAGTCCGCGCTGCTGTCAACGAACAAGGCCGTGGTGTCCCTGTCTAACGGCGTCAGCGTGCTGACGTTCAAGGTCCTGGACCTGAAGAATTACATTGACAAGCAGCTGCTGCCCATCCTCAACAAGCAATCCTGCTCCATCTCCAACCCCGAAACCGTGATCGAGTTCCAGCAGAAGAACAACCGCCTGCTGGAAATTACTCGCGAGTTCTCTGTGAATGCCGGCGTGACCACCCCTGTGTCCACCTACATGCTGACCAACTCCGAGCTTCTCTCCCTTATCAATGACATGCCTATCACGAACGACCAGAAGAAGCTGATGTCGAACAACGTGCAGATTGTGCGGCAGCAGTCATACAGCATCATGTCGATCATCAAGGAAGAAGTGCTGGCGTACGTGGTGCAACTCCCGCTGTACGGCGTCATCGATACCCCGTGCTGGAAGCTGCACACCTCGCCTTTGTGTACCACCAACACCAAGAACGGATCCAACATCTGCTTAACCCGGACTGATCGGGGTTGGTACTGCGACAACGCCGGGAATGTTTCGTTCTTCCCACAAGCCGAGACTTGTAAAGTGCAGTCAAACAGAGTGTTCTGTGACACCATGAACTCGAGAACCCTGCCCAGCGAAGTGAACCTGTGTAACGTCGACATCTTTAACCCAAAATACGATTGCAAGATTATGACCAGCAAAACCGACGTGTCCTCCTCCGTGATAACAAGCCTGGGGGCGATTGTGTCATGCTACGGAAAGACTAAGTGCACCGCCTCGAACAAGAACCGCGGCATCATTAAGACTTTCTCGAATGGTTGCGACTATGTGTCCAACAAGGGCGTGGATACTGTGTCAGTCGGGAATACTCTTTACTACGTGAACAAGCAGGAGGGGAAAAGCCTCTACGTGAAGGGAGAGCCTATTATCAACTTTTACGATCCGCTGGTGTTCCCGTCCGACGAATTCGACGCCAGCATCAGCCAAGTCAACGAGCTGATTAACCAGTCCCTCGCCTTCATCAACCAATCCGACGAGCTCCTGCATAACGTGAACGCCGGAAAGTCCACCACCAACATCATGATCACTACTATTATCATCGTGATCATCGTCATCCTGCTGAGCCTGATTGCTGTGGGCCTGTTGCTGTATTGCAAAGCCAGGTCCACCCCGGTCACCCTGTCGAAGGATCAGCTGTCCGGAATCAACAACATTGCCTTCTCCAACTAA (SEQ ID NO: 18)

下文敘述了5'UTR和3'UTR的核酸序列。

5'UTR ：GGACAGAUCGCCUGGAGACGCCAUCCACGCUGUUUUGACCUCCAUAGAAGACACCGGGACCGAUCCAGCCUCCGCGGCCGGGAACGGUGCAUUGGAACGCGGAUUCCCCGUGCCAAGAGUGACUCACCGUCCUUGACACG (SEQ ID NO: 19)

3'UTR ：CGGGUGGCAUCCCUGUGACCCCUCCCCAGUGCCUCUCCUGGCCCUGGAAGUUGCCACUCCAGUGCCCACCAGCCUUGUCCUAAUAAAAUUAAGUUGCAUC (SEQ ID NO: 20)

下文敘述了編碼RSV F蛋白的全長mRNA的核酸序列。

FD3 mRNA ：GGACAGAUCGCCUGGAGACGCCAUCCACGCUGUUUUGACCUCCAUAGAAGACACCGGGACCGAUCCAGCCUCCGCGGCCGGGAACGGUGCAUUGGAACGCGGAUUCCCCGUGCCAAGAGUGACUCACCGUCCUUGACACGAUGGAACUGCUGAUCCUCAAAGCCAACGCAAUCACCACCAUUCUCACCGCUGUGACCUUCUGCUUCGCAUCGGGGCAGAACAUCACUGAAGAGUUUUACCAGAGCACUUGCAGCGCGGUGUCAAAGGGUUACCUUUCCGCACUGCGGACCGGAUGGUACACUUCCGUGAUCACCAUUGAGCUCAGCAACAUCAAGGAAAACAAGUGCAAUGGCACCGACGCCAAGGUCAAGCUGAUCAAACAAGAACUGGACAAGUACAAGAACGCCGUGACAGAAUUGCAGCUCCUGAUGGGAUCCGGAAACGUCGGUCUGGGCGGAGCCAUCGCGAGUGGAGUGGCUGUGUCCAAGGUCUUGCACCUCGAGGGAGAAGUGAACAAGAUCAAGUCCGCGCUGCUGUCAACGAACAAGGCCGUGGUGUCCCUGUCUAACGGCGUCAGCGUGCUGACGUUCAAGGUCCUGGACCUGAAGAAUUACAUUGACAAGCAGCUGCUGCCCAUCCUCAACAAGCAAUCCUGCUCCAUCUCCAACCCCGAAACCGUGAUCGAGUUCCAGCAGAAGAACAACCGCCUGCUGGAAAUUACUCGCGAGUUCUCUGUGAAUGCCGGCGUGACCACCCCUGUGUCCACCUACAUGCUGACCAACUCCGAGCUUCUCUCCCUUAUCAAUGACAUGCCUAUCACGAACGACCAGAAGAAGCUGAUGUCGAACAACGUGCAGAUUGUGCGGCAGCAGUCAUACAGCAUCAUGUCGAUCAUCAAGGAAGAAGUGCUGGCGUACGUGGUGCAACUCCCGCUGUACGGCGUCAUCGAUACCCCGUGCUGGAAGCUGCACACCUCGCCUUUGUGUACCACCAACACCAAGAACGGAUCCAACAUCUGCUUAACCCGGACUGAUCGGGGUUGGUACUGCGACAACGCCGGGAAUGUUUCGUUCUUCCCACAAGCCGAGACUUGUAAAGUGCAGUCAAACAGAGUGUUCUGUGACACCAUGAACUCGAGAACCCUGCCCAGCGAAGUGAACCUGUGUAACGUCGACAUCUUUAACCCAAAAUACGAUUGCAAGAUUAUGACCAGCAAAACCGACGUGUCCUCCUCCGUGAUAACAAGCCUGGGGGCGAUUGUGUCAUGCUACGGAAAGACUAAGUGCACCGCCUCGAACAAGAACCGCGGCAUCAUUAAGACUUUCUCGAAUGGUUGCGACUAUGUGUCCAACAAGGGCGUGGAUACUGUGUCAGUCGGGAAUACUCUUUACUACGUGAACAAGCAGGAGGGGAAAAGCCUCUACGUGAAGGGAGAGCCUAUUAUCAACUUUUACGAUCCGCUGGUGUUCCCGUCCGACGAAUUCGACGCCAGCAUCAGCCAAGUCAACGAGCUGAUUAACCAGUCCCUCGCCUUCAUCAACCAAUCCGACGAGCUCCUGCAUAACGUGAACGCCGGAAAGUCCACCACCAACAUCAUGAUCACUACUAUUAUCAUCGUGAUCAUCGUCAUCCUGCUGAGCCUGAUUGCUGUGGGCCUGUUGCUGUAUUGCAAAGCCAGGUCCACCCCGGUCACCCUGUCGAAGGAUCAGCUGUCCGGAAUCAACAACAUUGCCUUCUCCAACUAACGGGUGGCAUCCCUGUGACCCCUCCCCAGUGCCUCUCCUGGCCCUGGAAGUUGCCACUCCAGUGCCCACCAGCCUUGUCCUAAUAAAAUUAAGUUGCAUC (SEQ ID NO: 21)

將LNP-RSV FD3 mRNA組成物投予給NHP。在D0和D21，通過肌內（IM）注射向各組6隻食蟹猴投予5 μg劑量的用上述LNP包封的mRNA或10 µg劑量的加有Al(OH) ₃佐劑的RSV Pre-F NP亞基對照疫苗。在每次疫苗投予之前以及在最後一次疫苗接種後兩週（D35），給食蟹猴放血。如 圖 29所示，所測試的所有陽離子脂質均有效地誘發了與具有鋁佐劑的Pre-F NP類似水準的抗RSV F蛋白抗體的產生。

如 圖 30所示，所測試的所有陽離子脂質均產生了與具有鋁佐劑的Pre-F NP類似水準的有效的RSV中和力價。

圖 29和 圖 30的累積結果示於下 表 9和 表 10中。 表 9. 免疫反應的幅度

LNP調配物	中和力價	相比於MC3的倍數
LIPID A	9.86	23.43
LIPID B	10.03	26.35
LIPID C	8.509	9.18
LIPID E	6.929	3.07
LIPID D	8.894	11.99
MC3	5.308	1.00
Pre-F NP	10.97	50.56

表 10. 免疫反應的定性

陽離子脂質	抗體力價	中和力價	抗體力價/中和力價比
LIPID A	15.58	9.86	52.71
LIPID B	15.56	10.03	46.21
LIPID C	14.67	8.51	71.51
LIPID E	13.27	6.93	81.01
LIPID D	14.71	8.89	56.49
MC3	11.3	5.31	63.56
Pre-F NP	17.59	10.97	98.36

證明了更好的免疫反應品質，因為抗體力價/中和力價比的值更低。這裡，LNP調配物脂質B表現出最好的免疫反應品質，同時與非mRNA疫苗Pre-F NP相比，所有LNP調配物均表現出優異品質的免疫反應，並且幾種比MC3的工業基準LNP調配物更好。 實例 9 ： SARS-CoV-2 刺突（ S ）蛋白編碼 mRNA LNP 調配物

具有 SARS-CoV-2 刺突（ S ）蛋白編碼 mRNA 的 LNP 調配物：

將含有SARS-CoV-2 S蛋白編碼mRNA的LNP調配物投予給人類受試者。向受試者投予調配物脂質B的LNP。使未經修飾的編碼SARS-CoV-2 S蛋白的mRNA突變，以除去弗林蛋白酶切割位點，並且以使殘基986和987突變為脯胺酸。在下文所述的NCT04798027的臨床試驗方案下，向受試者投予LNP-SARS-CoV-2疫苗。

這是一項由前哨（sentinel）群組、然後是完整招募群組組成的序貫組預防研究。在前哨群組中有3種劑量水準（對於每種劑量水準，最多有25名18-49歲的參與者），其是以開放標籤形式通過對每種劑量水準和每次疫苗接種進行逐步安全性評價來完成的。所有前哨參與者均接受2次疫苗接種，間隔21天。對於完整招募群組，將參與者基於招募時的年齡分層到以下2個年齡組中：年輕的成年人年齡組（140名18至49歲的參與者）和年老的成年人年齡組（168名≥ 50歲的參與者）。完整招募群組1（第1組至第4組）接受研究干預的單次注射，而群組2（第5組至第8組）中的參與者接受2次疫苗接種（間隔21天給予）。所有組的投予途徑均是肌內的（IM）。

實驗組：第1組 - 在第1天注射1次SARS-CoV-2 mRNA疫苗調配物1。

實驗組：第2組 - 在第1天注射1次SARS-CoV-2 mRNA疫苗調配物2。

實驗組：第3組 - 在第1天注射1次SARS-CoV-2 mRNA疫苗調配物3。

安慰劑比較組：第4組 - 在第1天注射1次安慰劑（0.9生理鹽水）。

實驗組：第5組 - 在第1天和第22天注射2次SARS-CoV-2 mRNA疫苗調配物1。

實驗組：第6組 - 在第1天和第22天注射2次SARS-CoV-2 mRNA疫苗調配物2。

實驗組：第7組 - 在第1天和第22天注射2次SARS-CoV-2 mRNA疫苗調配物3。

安慰劑比較組：第8組 - 在第1天和第22天注射2次安慰劑（0.9生理鹽水）。

來自研究的結果表明，在第二次注射後兩週，在所測試的所有3種劑量下，在91%至100%的研究參與者中均有中和抗體血清轉化（定義為相比于基線增加4倍）。尚未觀察到安全性問題，並且耐受性概況與其他未經修飾的mRNA SARS-CoV-2疫苗的耐受性概況相當。 實例 10 ：對四價或八價流感疫苗 LNP 調配物的進一步研究

從投予各種多價LNP-流感mRNA疫苗的小鼠測量HAI力價和NAI力價。針對流感毒株A/密西根/45/2015、A/新加坡/INFIMH160019/2016、B/馬里蘭/15/2016 BX69A和B/普吉島/3073/2013測量了HAI力價。針對流感毒株A/密西根/45/2015、A/新加坡/INFIMH160019/2016、B/科羅拉多/06/201和B/普吉島/3073/2013測量了NAI力價。

針對接受單價或四價HA或NA mRNA疫苗的小鼠比較了HAI力價和NAI力價。

在第0天給小鼠注射初免疫苗，並且在第21天注射相同劑量的加強疫苗。在第1天、第20天、第22天和第35天採集血液。對於含有編碼HA或NA抗原的mRNA的單價組成物，使用單獨編碼以下中的每一種的mRNA：來自B/維多利亞譜系的H1、H3、HA以及來自B/山形譜系的HA（具體地來自毒株A/密西根/45/2015；A/新加坡/Infimh160019/2016；B/馬里蘭/15/2016；和B/普吉島/3037/2013）。還製備了四價疫苗組成物，其含有編碼來自B/維多利亞譜系的N1、N2、NA中的每一種和來自B/山形譜系的NA以及來自B/維多利亞譜系的H1、H3、HA中的每一種和來自B/山形譜系的HA（具體地來自毒株A/密西根/45/2015；A/新加坡/Infimh160019/2016；B/科羅拉多/06/2017；和B/普吉島/3037/2013）的mRNA。最後，製備了八價疫苗組成物，其含有編碼來自B/維多利亞譜系的H1、H3、HA中的每一種，來自B/山形譜系的HA，來自B/維多利亞譜系的N1、N2、NA中的每一種和來自B/山形譜系的NA（具體地來自毒株A/密西根/45/2015；A/新加坡/Infimh160019/2016；B/科羅拉多/06/2017；和B/普吉島/3037/2013）的mRNA，並且將其作為八價疫苗投予。對於所有組成物，每種mRNA均以0.4 μg/毒株的量添加。對於每個組，n = 6只小鼠。

每個實驗組的概述敘述於下 表 11中。 表 11. 在小鼠中多價流感疫苗的實驗組的概述

組號	N	初免（D0）/加強（D21） - NA mRNA	mRNA NA劑量（µg/毒株）	初免（D0）/加強（D21） - HA（與NA一起）	rHA劑量（µg/毒株）	佐劑（rHA）
1	6	LNP稀釋劑	-	-	-	-
3	6	NA mRNA-LNP（N2 Perth）	0.4	-	-	-
4	6	NA mRNA-LNP（N1）	0.4	-	-	-
5	6	NA mRNA-LNP（N2）	0.4	-	-	-
6	6	NA mRNA-LNP（NV）	0.4	-	-	-
7	6	NA mRNA-LNP（NY）	0.4	-	-	-
8	6	NA mRNA-LNP（N1、N2、BV、BY）	0.4	-	-	-
9	6	-	-	HA mRNA-LNP（H1）	0.4	-
10	6	-	-	HA mRNA-LNP（H3）	0.4	-
11	6	-	-	HA mRNA-LNP（BV）	0.4	-
12	6	-	-	HA mRNA-LNP（BY）	0.4	-
13	6	-	-	HA mRNA-LNP（H1、H3、BV、BY）	0.4	-
14	6	NA mRNA-LNP（N1、N2、BV、BY）	0.4	HA mRNA-LNP（H1、H3、BV、BY）	0.4	-

如 圖 31所示，對於4種流感毒株中的3種，八價mRNA-LNP調配物所導致的HAI力價在四價調配物的4倍內。

上述各組的NAI力價結果的概述示於 圖 33中。八價mRNA-LNP調配物所導致的NAI力價與四價mRNA-LNP調配物相當。

因此，資料證明，八價疫苗能夠誘發穩健的HA和NA免疫反應，並且來自四種不同流感毒株的免疫顯性HA的存在似乎並不抑制或干擾抗NA免疫反應。

對於HA和NAI力價，另外從投予各種多價LNP-流感mRNA疫苗的雪貂測量基於高內涵成像的中和測試（HINT）力價。HINT測定進一步詳細描述於Jorquera等人（Scientific Reports. 9: 2676. 2019）（通過引用併入本文）中。針對流感毒株A/密西根/45/2015、A/新加坡/INFIMH160019/2016、B/愛荷華/06/2017和B/普吉島/3073/2013測量了HINT力價。針對流感毒株A/密西根/45/2015、A/新加坡/INFIMH160019/2016、B/科羅拉多/06/201和B/普吉島/3073/2013測量了NAI力價。

將用於評估多價疫苗免疫原性的雪貂用以下接種兩次，間隔21天：(1) 編碼NA抗原（N1、N2、BvNA和ByNA）的四種mRNA的混合物，(2) 編碼HA抗原（H1、H3、BvHA和ByHA）的四種mRNA的混合物，或 (3) 編碼NA抗原（N1、N2、BvNA和ByNA）的四種mRNA和編碼HA抗原（H1、H3、BvHA和ByHA）的四種mRNA的混合物，如下表12所示。每種HA包括來自以下四種毒株之一的HA：A/密西根/45/2015（H1）；A/新加坡/Infimh-16-0019/2016（H3）；B/愛荷華/06/2017（B/維多利亞譜系）；和B/普吉島/3073/2013（B/山形譜系）。所有抗原均以1 : 1的比率投予。

.每個實驗組的概述敘述於下 表 12中。

在基線時、在加強前一天或剛好在加強前、在加強疫苗接種時以及在攻毒後兩週（根據需要），在鎮靜（異氟醚）下給所有雪貂放血。通過ELLA測試血清樣品（儲存在-20ºC下直到需要）以評估NAI活性。另外，進行血凝抑制測定（HAI）以評估在多價疫苗接種後對血球凝集素抗原的抗體反應。 表 12. 在雪貂中多價流感疫苗的實驗組的概述

組號	N	初免（D0）/加強（D21） - NA	初免（D0）/加強（D21） - HA	劑量（µg/毒株）	佐劑
1	6	PBS	PBS	0	-
11	6	NA mRNA-LNP（N1、N2、BV、BY）	-	1	-
12	6	NA mRNA-LNP（N1、N2、BV、BY）	-	15	-
13	6	-	HA mRNA-LNP（H1、H3、BV、BY）	1	-
14	6	-	HA mRNA-LNP（H1、H3、BV、BY）	15	-
15	6	NA mRNA-LNP（N1、N2、BV、BY）	HA mRNA-LNP（H1、H3、BV、BY）	1	-
16	6	NA mRNA-LNP（N1、N2、BV、BY）	HA mRNA-LNP（H1、H3、BV、BY）	15	-

上述各組的HINT結果的概述示於 圖 32中。八價mRNA-LNP調配物所導致的HINT力價與四價mRNA-LNP調配物相當。

上述各組的NAI力價結果的概述示於 圖 34（第20天）和 圖 35（第42天）中。八價mRNA-LNP調配物所導致的NAI力價與四價mRNA-LNP調配物相當。這對於第20天和第42天的樣品是真實的。

無。

圖 1A是一對圖，其示出了人類紅血球生成素（hEPO）在用hEPO mRNA的各種LNP調配物處理的小鼠中的表現。小圖a)：與MC3相比的LNP調配物「脂質A」和「脂質B」。條表示平均值和標準差。小圖b)：用陽離子脂質OF-02製備的調配物。PEG：DMG-PEG2000。Cholest：膽固醇。「脂質A」：除非另有指示，否則LNP組成物含有OF-02、DMG-PEG2000、膽固醇和DOPE，按此順序的莫耳比為40 : 1.5 : 28.5 : 30。「脂質B」：LNP組成物含有cKK-E10、DMG-PEG2000、膽固醇和DOPE，按此順序的莫耳比為40 : 1.5 : 28.5 : 30。

圖 1B是一對圖，其示出了hEPO在使用LNP調配物脂質A和脂質B的小鼠和非人靈長類動物（NHP）中的表現。

圖 2A和 圖 2B是一對圖，其顯示具有編碼毒株A/加利福尼亞/7/2009（H1N1）（CA09）的血球凝集素（HA）的mRNA的脂質A和脂質B LNP調配物誘發穩健的功能性抗體（ 圖 2A），並且當用流感病毒的大流行毒株攻毒時，保護小鼠免於死亡或嚴重體重減輕（超過20%）（ 圖 2B）。在研究第0天、第14天、第28天、第42天、第56天、第92天和第107天取的血清樣品的血球凝集素抑制（HAI）力價報告為log10。條是幾何平均值和幾何標準差。在用4LD ₅₀的A/比利時/2009（H1N1）（Belgium09）鼻內攻毒（第93天）之後測量每日體重。體重呈現為從攻毒當天開始減輕的體重百分比。對減輕超過20%的起始體重的小鼠實施安樂死，並且在感染後14天（第107天）對所有小鼠實施安樂死。rHA：重組血球凝集素。AF03：水包油乳液佐劑。稀釋劑 = PBS。LLOQ = 定量下限。1/40 = 1/40最低目標，其是指與健康成年人的流感感染或疾病的風險降低50%相關的HAI抗體力價（Coudeville等人， BMC Med Res Methodol. (2010) 10:18）。 圖 2B中的虛線 = 相對於在攻毒當天的體重體重減輕20%的截止線。

圖 3A和 圖 3B是一對圖，其顯示用脂質A LNP配製的A/密西根/45/2015（Mich15）神經胺糖酸酶（NA）mRNA誘發穩健的功能性抗體（ 圖 3A），並且當用流感病毒的大流行毒株攻毒時，保護小鼠免於體重減輕和死亡（ 圖 3B）。在研究第14天、第28天、第42天、第56天、第88天和第114天取的血清樣品的神經胺糖酸酶抑制（NAI）力價報告為log10。在用4LD ₅₀的Belgium09鼻內攻毒（對於一劑組為第89天，或對於兩劑組為第117天）之後，觀察每日體重。體重呈現為從攻毒當天開始減輕的體重百分比。對減輕超過20%的起始體重的小鼠實施安樂死，並且在感染後14天（對於1劑組為第103天，或對於2劑組為第131天）對所有小鼠實施安樂死。條是平均值和標準差。 圖 3A中的上虛線 = 定量上限。 圖 3A中的下虛線 = 定量下限。 圖 3B中的虛線 = 相對於在攻毒當天的體重體重減輕20%的截止線。所投藥的mRNA：編碼Mich15 NA的0.4或0.016 μg mRNA。對照：編碼hEPO的0.6 μg mRNA或稀釋劑（PBS）。

圖 4是這樣的圖，其顯示具有CA09 HA mRNA（10 μg）的脂質A和脂質B LNP調配物在食蟹猴中誘發穩健的功能性抗體。在研究第0天、第14天、第28天、第42天和第56天取的血清樣品的HAI力價報告為log2。

圖 5A 至圖 5C示出了編碼流感病毒A/新加坡/INFIMH160019/2016（Sing16；H3N2）HA血球凝集素的MRT1400 mRNA。 圖 5A：HA抗原的野生型（WT）基因和經密碼子最佳化的基因（MRT10279）的比對。 圖 5B：mRNA的結構。 圖 5C：mRNA的序列。

圖 6是一對圖，其顯示具有MRT1400或NA mRNA的脂質A和脂質B LNP調配物在小鼠中誘發穩健的功能性抗體。在研究第0天給予第一次注射，並且在研究第28天給予第二次注射。左小圖：在研究第14天、第28天、第42天和第56天取的血清樣品的HAI力價報告為log10。右小圖：在研究第14天、第28天、第42天和第56天取的血清樣品的NAI力價報告為log10。條是幾何平均值和幾何標準差。虛線 = 定量下限。

圖 7A是這樣的圖，其顯示具有MRT 1400的脂質A和脂質B LNP調配物在NHP中誘發穩健的功能性抗體。在研究第0天、第14天、第28天、第42天和第56天取的血清樣品的HAI力價報告為log2。在研究第0天給予第一次注射，並且在研究第28天給予第二次注射。條是平均值和標準差。上虛線 = 1/40最低目標。下虛線 = 檢測下限。

圖 7B和 圖 7C是一對圖，其顯示在以下四種劑量水準下在食蟹猴中，含有MRT1400 mRNA的脂質A LNP調配物（MRT5400）誘發功能性抗體（ 圖 7B）和穩健的ELISA力價（ 圖 7C）：15、45、135和250 µg的mRNA。在研究第0天、第14天、第28天、第42天和第56天取的血清樣品的HAI和ELISA力價報告為log2。在研究第0天給予第一次注射，並且在研究第28天給予第二次注射。條是平均值和標準差。虛線 = 1/40最低目標。

圖 8A和 圖 8B是一組圖，其示出了在三種劑量水準組（250 μg、135 μg和45 μg的mRNA）中，在用脂質A LNP調配物MRT5400第二次疫苗接種之後食蟹猴的T細胞細胞因子反應。通過ELISPOT測定在第42天在外周血單個核細胞（PMBC）中評估通過用重組HA（rHA）蛋白（左小圖）或合併的肽（右小圖）再刺激誘發的IFN-γ和IL-13。分泌IFN-γ（ 圖 8A）或IL-13（ 圖 8B）的PBMC的頻率計算為每百萬PBMC的斑點形成細胞（SFC）。每個符號表示單獨的樣品，並且條表示標準差。

圖 9A是一對圖，其顯示含有經修飾的和未經修飾的CA09 HA mRNA的脂質A LNP調配物是相當的，如通過接種疫苗的小鼠中的HAI力價所指示的。在研究第14天、第28天、第42天和第56天取的血清樣品的HAI力價報告為log2。在研究第0天給予第一次注射，並且在研究第28天給予第二次注射。條是平均值和標準差。上虛線 = 1/40最低目標。下虛線 = 定量下限。

圖 9B是一對圖，其顯示含有經修飾的和未經修飾的CA09 HA mRNA的脂質A LNP調配物是相當的，如通過小鼠中的ELISA力價所指示的。在研究第14天、第28天、第42天和第56天取的血清樣品的總IgG ELISA力價報告為log10。在研究第0天給予第一次注射，並且在研究第28天給予第二次注射。虛線 = 定量下限。

圖 10A和 圖 10B是一對圖，其顯示在0.4 µg的總mRNA的劑量下在Balb/c小鼠中，具有CA09 HA mRNA和Sing16 HA mRNA的二價脂質A LNP調配物誘發穩健的功能性抗體，如通過HAI力價（CA09（ 圖 10A）和Sing16（ 圖 10B））所評估的。將0.4 µg mRNA作為共包封的mRNA-LNP調配物投藥，或者將每種HA mRNA分開投予，其中每條腿投予0.2 µg。還將每種HA mRNA與非編碼mRNA一起共包封成調配物，以控制包裝到LNP中的總mRNA。稀釋劑組接受mRNA-LNP稀釋劑緩衝液。報告在研究第-2天（基線）、第14天、第28天和第42天取的血清樣品的HAI力價。 圖 10B僅示出了研究第-2天（來自合併的血清的基線）和第42天。在研究第0天給予第一次注射，並且在研究第28天給予第二次注射。條是幾何平均值和幾何標準差。虛線 = 定量下限。

圖 11示出了mRNA-LNP調配物的功能驗證。 小圖 (a)是這樣的圖，其示出了螢火蟲（FF）螢光素酶在BALB/c小鼠中的表現：在小鼠（n = 4）中通過IM途徑注射單次劑量的螢光素酶FF mRNA-LNP（5、1、0.1、0.05 μg）。在整個動物成像（使用IVIS Spectrum（Perkin Elmer）記錄生物發光強度）時注射螢光素（3 mg）。採集注射後6、24、48和72 h的整個動物平均輻射的圖像。在圖中示出了為Luc mRNA-LNP的1、0.5、0.1和0.05 μg劑量投予而記錄的輻射率。 小圖 (b)示出了在6至72小時的指示發光總通量的全動物圖像。示出了接受0.1 μg劑量的FF-LNP的小鼠（n = 4）的組中的發光總通量。 小圖 (c)示出了hEPO在BALB/c小鼠中的表現。在BALB/c小鼠中通過IM途徑注射單次劑量的hEPO mRNA-LNP（0.1 μg）。使用ELISA在投予後6小時和24小時在血清中定量hEPO表現。條表示平均值和標準差。 小圖 (d)示出了hEPO在NHP中的表現。在食蟹猴中通過IM途徑注射單次劑量的hEPO mRNA-LNP（10 μg）。使用ELISA在投予後6、24、48、72和96小時在血清中定量hEPO表現。條表示平均值和標準差。

圖 12示出了HA mRNA-LNP疫苗在小鼠中的血清學評價。將BALB/c小鼠（n = 8/組）用2、0.4、0.08和0.016 μg的Cal09 HA mRNA-LNP或Sing16 HA mRNA-LNP IM免疫兩次，間隔4週。示出了針對CA09（Cal09）H1N1流感病毒重組HA（左小圖）和Sing16 H3N2流感病毒重組HA（右小圖）為在第14天、第28天、第42天、第56天採集的血清而記錄的ELISA力價。

圖 13示出了HA mRNA-LNP疫苗在小鼠中的血清學評價。將BALB/c小鼠（n = 8/組）用2、0.4、0.08和0.016 μg的CA09 HA mRNA-LNP或Sing16 HA mRNA-LNP IM免疫兩次，間隔4週。示出了針對CA09 H1N1流感病毒（左小圖）和Sing16 H3N2流感病毒（右小圖）而記錄的Log ₁₀HAI力價。

圖 14示出了NA mRNA-LNP疫苗在小鼠中的血清學評價。將BALB/c小鼠（n = 8/組）用2、0.4、0.08和0.016 μg的Mich15 NA mRNA-LNP或Sing16 NA mRNA-LNP IM免疫兩次，間隔4週。示出了針對Mich15 N1流感病毒重組NA（左小圖）和Sing16 N2病毒重組NA（右小圖）為在第0天、第14天、第28天、第42天、第56天採集的血清而記錄的總IgG力價。

圖 15示出了NA mRNA-LNP疫苗在小鼠中的血清學評價。將BALB/c小鼠（n = 8/組）用2、0.4、0.08和0.016 μg的Mich15 NA mRNA-LNP或Sing16 NA mRNA-LNP IM免疫兩次，間隔4週。示出了針對Mich2015（N1）:A/野鴨/瑞典/2002（H6）嵌合流感病毒（左小圖）和Sing16（N2）:A/野鴨/瑞典/2002（H6）嵌合病毒（右小圖）為血清而記錄的Log ₁₀NAI（ELLA）力價。

圖 16A和 圖 16B示出了在致死A/比利時/2009 H1N1病毒攻毒之後，CA09 HA mRNA-LNP疫苗在小鼠中的保護功效。小鼠（n = 8）在第0天和第28天接受兩次IM劑量的CA09 HA mRNA-LNP（每次0.4 μg）。對照動物在第0天和第28天接受兩次IM劑量的稀釋劑。 圖 16A示出了在研究第0天、第14天、第28天、第42天、第56天、第92天和第107天取的血清樣品的報告為Log ₁₀的HAI力價。 圖 16B示出了在第93天用4LD ₅₀的A/比利時/2009 H1N1毒株攻毒之後的每日體重。體重呈現為從攻毒當天開始減輕的體重百分比。單獨的線表示每隻動物。

圖 17A 至圖 17C示出了在致命A/比利時/2009 H1N1病毒攻毒之後，單次劑量的未經修飾的Mich15 NA mRNA-LNP在小鼠中的保護功效。通過IM途徑為小鼠（n = 16）注射0.4 μg或0.016 μg的Mich15 NA mRNA-LNP。一半小鼠僅在研究第0天接受一次注射（1劑），而另外一半（2劑）接受在研究第0天和第28天給予的兩次注射。對照動物在第0天和第28天接受兩次IM劑量的hEPO mRNA-LNP（0.6 μg）。 圖 17A示出了在研究第0天、第14天、第28天、第42天、第56天、第88天和第114天取的血清樣品的報告為Log ₁₀的NAI力價。 圖 17B示出了在第89天（對於單劑組）和第117天（第二劑後89天）（對於兩劑組）用4LD50的Belgium09 H1N1鼻內攻毒之後的每日體重變化。體重呈現為從攻毒當天開始減輕的體重百分比。單獨的線表示每隻動物。

圖 18示出了HA Sing16 HA mRNA-LNP疫苗在NHP中的血清學評價。通過IM途徑為食蟹猴（n = 6/組）注射兩次15、45或135 μg的Sing16 HA mRNA-LNP，間隔4週。在第-6天、第14天、第28天、第42天和第56天採集血清樣品。示出了針對Sing16病毒的重組HA蛋白的Log ₁₀IgG力價。

圖 19A和 圖 19B示出了HA Sing16 HA mRNA-LNP疫苗在NHP中的血清學評價。通過IM途徑為食蟹猴（n = 6/組）注射兩次15、45或135 μg的Sing16 HA mRNA-LNP，間隔4週。在第0天、第14天、第28天、第42天和第56天採集血清樣品。示出了針對Sing2016病毒的Log ₁₀HAI力價（ 圖 19A）和Log ₁₀微量中和（MN）力價（ 圖 19B）。

圖 20A和 圖 20B示出了在用Sing16 HA mRNA-LNP疫苗接種的NHP中的T細胞反應。通過IM途徑為食蟹猴（n = 6/組）注射兩次45、135或250 μg的Sing16 HA mRNA-LNP，間隔4週。通過ELISPOT在第42天在用代表整個HA開放閱讀框的肽合併物體外刺激的PBMC中測定T細胞。示出了計算為每百萬PBMC的斑點形成細胞（SFC）的分泌IFN-γ（ 圖 20A）或IL-13（ 圖 20B）的PBMC的反應。每個符號表示單獨的樣品，並且條表示組的幾何平均值。

圖 21示出了在用Sing16 HA mRNA-LNP疫苗接種的NHP中在第180天記憶B細胞的Sing16 H3特異性IgG的分泌。通過IM途徑為食蟹猴（n = 6/組）注射兩次15或45 μg的Sing16 HA mRNA-LNP，間隔4週。使用人類IgG單色記憶B細胞ELISPOT套組（目錄號NC1911372，CTL）來測量Sing16/H3特異性和總IgG ⁺抗體分泌細胞（ASC）。通過使用由套組提供的刺激混合物在第180天收集的PBMC中進行MBC到ASC的分化。計算每隻動物的每百萬PBMC的IgG ⁺ASC的數量和Sing16/H3特異性ASC的數量，並且示出了抗原特異性ASC的頻率。

圖 22示出了流感疫苗的二價組合在小鼠中的遞送。將BALB/c小鼠（n = 8/組）用總量為0.4 μg的共包封的mRNA轉錄物的二價組合（1 : 1 wt/wt，每條腿一半體積）或0.2 μg的每種單價物（其分開配製並且免疫不同的腿）IM免疫兩次，間隔4週。在第0天、第14天、第28天、第42天採集的血清中針對相應的病毒測試構成為CA09 HA mRNA-LNP、Sing16 HA mRNA-LNP的H1H3組合；Sing16 HA mRNA-LNP和Sing16 NA mRNA-LNP的H3N2組合；以及Mich15 NA mRNA-LNP和Perth09 NA mRNA-LNP的N1N2組合。 小圖 (a)示出了針對CA09 H1N1流感病毒和Sing2016 H3N2而記錄的HAI力價。 小圖 (b)示出了分別針對Sing2016 H3N2和A/野鴨/瑞典/2002（H6）嵌合流感病毒以及H6N2 A/佩斯/09病毒F1919D（N2）病毒而記錄的HAI和NAI力價。 小圖 (c)示出了針對Mich15（N1）:A/野鴨/瑞典/2002（H6）嵌合流感病毒和H6N2 A/佩斯/09病毒F1919D（N2）病毒而記錄的NAI力價。

圖 23示出了流感疫苗的四價組合在NHP中的遞送。將食蟹猴（n = 6/組）用總量為10 μg的共包封的mRNA轉錄物的四價組合（1 : 1 : 1 : 1 wt/wt）IM免疫兩次，間隔4週。H2H3N1N2組合由CA09 HA mRNA、Sing16 HA mRNA、Mich15 NA mRNA和Perth09 NA mRNA組成。H1H3組合構成為CA09 HA mRNA、Sing16 HA mRNA和2x非編碼mRNA（ncmRNA）；H3N2組合由Sing16 HA mRNA和Perth09 NA mRNA和2x非編碼mRNA組成。N1N2組合由Mich15 NA mRNA、Perth09 NA mRNA-LNP和2x非編碼mRNA組成。H1由CA09 HA mRNA和3x非編碼mRNA組成。H3由Sing16 HA mRNA和3x非編碼mRNA組成。N1由Mich15 NA mRNA和3x非編碼mRNA組成。N2由Perth09 NA mRNA和3x非編碼mRNA組成。在第0天、第14天、第28天、第42天採集的血清中針對相應的病毒測試抑制力價。 小圖 (a)示出了針對CA09 H1N1流感病毒和Sing16 H3N2而記錄的HAI力價。 小圖 (b)示出了針對Mich15（N1）:A/野鴨/瑞典/2002（H6）嵌合流感病毒和H6N2佩斯/09病毒F1919D（N2）病毒而記錄的NAI力價。

圖 24描繪了這樣的圖，其示出了人類紅血球生成素（hEPO）在用hEPO mRNA的各種LNP調配物處理的小鼠中的表現。示出了LNP調配物「脂質A」、「脂質B」、「脂質C」、「脂質D」和「脂質E」。條表示平均值和標準差。LNP組成物含有陽離子脂質、DMG-PEG2000、膽固醇和DOPE，按此順序的莫耳比為40 : 1.5 : 28.5 : 30。

圖 25描繪了這樣的圖，其示出了hEPO在用hEPO mRNA的各種LNP調配物處理的非人靈長類動物（NHP）中的表現。示出了LNP調配物「脂質A」、「脂質B」、「脂質C」、「脂質D」和「脂質E」。條表示平均值和標準差。LNP組成物含有陽離子脂質、DMG-PEG2000、膽固醇和DOPE，按此順序的莫耳比為40 : 1.5 : 28.5 : 30。

圖 26描繪了這樣的圖，其示出了在注射HA mRNA的各種LNP調配物後的第28天和第42天的HAI力價。示出了LNP調配物「脂質A」、「脂質B」、「脂質C」、「脂質D」和「脂質E」。條表示平均值和標準差。LNP組成物含有陽離子脂質、DMG-PEG2000、膽固醇和DOPE，按此順序的莫耳比為40 : 1.5 : 28.5 : 30。

圖 27描繪了這樣的圖，其示出了在注射HA mRNA的各種LNP調配物後的第28天和第42天的Cal09 H1 HAI力價。示出了LNP調配物「脂質A」、「脂質B」、「脂質C」、「脂質D」和「脂質E」。條表示平均值和標準差。LNP組成物含有陽離子脂質、DMG-PEG2000、膽固醇和DOPE，按此順序的莫耳比為40 : 1.5 : 28.5 : 30。

圖 28描繪了這樣的圖，其示出了在注射HA mRNA的各種LNP調配物後的第28天和第42天的Sing16 H3 HAI力價。示出了LNP調配物「脂質A」、「脂質B」、「脂質C」、「脂質D」和「脂質E」。條表示平均值和標準差。LNP組成物含有陽離子脂質、DMG-PEG2000、膽固醇和DOPE，按此順序的莫耳比為40 : 1.5 : 28.5 : 30。

圖 29描繪了在用表現FD3 F蛋白的mRNA免疫的NHP中的RSV F蛋白抗體力價。用含有幾種陽離子脂質之一的脂質奈米顆粒（LNP）遞送mRNA。在第0天、第21天和第35天測量每種抗原組成物的抗體力價。

圖 30描繪了在用表現FD3 F蛋白的mRNA免疫的NHP中的RSV中和力價。用含有幾種陽離子脂質之一的脂質奈米顆粒（LNP）遞送mRNA。在第0天、第21天和第35天測量每種抗原組成物的抗體力價。

圖 31描繪了向小鼠投予的四價和八價mRNA-LNP疫苗對4種不同流感毒株的HAI力價。

圖 32描繪了向雪貂投予的四價和八價mRNA-LNP疫苗對4種不同流感毒株的HINT值。

圖 33描繪了向小鼠投予的四價和八價mRNA-LNP疫苗對4種不同流感毒株的NAI力價。

圖 34描繪了向雪貂投予的四價和八價mRNA-LNP疫苗對4種不同流感毒株的NAI力價。在第二劑疫苗後第20天（D20）獲得樣品。

圖 35描繪了向雪貂投予的四價和八價mRNA-LNP疫苗對4種不同流感毒株的NAI力價。在第二劑疫苗後第42天（D42）獲得樣品。

無。

無。

Claims (56)

1. 一種包含包封在脂質奈米顆粒（LNP）中的核酸分子的醫藥組成物，其中所述LNP包含： 莫耳比在35%與45%之間的陽離子脂質， 莫耳比在0.25%與2.75%之間的聚乙二醇（polyethylene glycol，PEG）綴合的（PEG化的）脂質， 莫耳比在20%與35%之間的基於膽固醇的脂質，和 莫耳比在25%與35%之間的輔助脂質， 其中所有莫耳比均相對於所述LNP的總脂質含量。
2. 如請求項1所述的組成物，其中所述LNP包含： 莫耳比為40%的陽離子脂質， 莫耳比為1.5%的PEG化的脂質， 莫耳比為28.5%的基於膽固醇的脂質，和 莫耳比為30%的輔助脂質。
3. 如請求項1或2所述的組成物，其中所述陽離子脂質是OF-02、cKK-E10、GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10或GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14。
4. 如前述請求項中任一項所述的組成物，其中所述PEG化的脂質是二肉豆蔻醯基-PEG2000（dimyristoyl-PEG2000，DMG-PEG2000）。
5. 如前述請求項中任一項所述的組成物，其中所述基於膽固醇的脂質是膽固醇。
6. 如前述請求項中任一項所述的組成物，其中所述輔助脂質是1,2-二油醯基-SN-甘油-3-磷醯乙醇胺（DOPE）。
7. 如請求項1所述的組成物，其中所述LNP包含： 莫耳比為40%的OF-02， 莫耳比為1.5%的DMG-PEG2000， 莫耳比為28.5%的膽固醇，和 莫耳比為30%的DOPE。
8. 如請求項1所述的組成物，其中所述LNP包含： 莫耳比為40%的cKK-E10， 莫耳比為1.5%的DMG-PEG2000， 莫耳比為28.5%的膽固醇，和 莫耳比為30%的DOPE。
9. 如請求項1所述的組成物，其中所述LNP包含： 莫耳比為40%的GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1， 莫耳比為1.5%的DMG-PEG2000， 莫耳比為28.5%的膽固醇，和 莫耳比為30%的DOPE。
10. 如請求項1所述的組成物，其中所述LNP包含： 莫耳比為40%的GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10， 莫耳比為1.5%的DMG-PEG2000， 莫耳比為28.5%的膽固醇，和 莫耳比為30%的DOPE。
11. 如請求項1所述的組成物，其中所述LNP包含： 莫耳比為40%的GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14， 莫耳比為1.5%的DMG-PEG2000， 莫耳比為28.5%的膽固醇，和 莫耳比為30%的DOPE。
12. 如前述請求項中任一項所述的組成物，所述LNP的平均直徑為30至200 nm。
13. 如請求項12所述的組成物，其中所述LNP的平均直徑為80至150 nm。
14. 如前述請求項中任一項所述的組成物，其中所述組成物包含1至10 mg/mL、視情況地1 mg/mL的所述LNP。
15. 如前述請求項中任一項所述的組成物，其中所述LNP包含1至20個、視情況地5至10或6至8個核酸分子。
16. 如前述請求項中任一項所述的組成物，其中所述一或多個核酸分子是包含開放閱讀框（ORF）的mRNA分子。
17. 如請求項16所述的組成物，其中所述mRNA分子編碼抗原，視情況地病毒抗原或細菌抗原。
18. 如請求項17所述的組成物，其中所述抗原源自流感病毒。
19. 如請求項17或18所述的組成物，其中所述LNP包含兩個或更多個mRNA分子，其中各mRNA分子編碼不同的抗原，視情況地其中所述不同的抗原來自相同的病原體或來自不同的病原體。
20. 如請求項17或18所述的組成物，其中所述組成物包含兩個或更多個LNP，其中各LNP包含編碼不同抗原的mRNA，視情況地其中所述不同的抗原來自相同的病原體或來自不同的病原體。
21. 如請求項19或20所述的組成物，其中所述組成物包含兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個或更多個編碼以下的mRNA分子：(i) 一或多個血球凝集素（HA）抗原，(ii) 一或多個神經胺糖酸酶（NA）抗原，或 (iii) 至少一個HA抗原和至少一個NA抗原。
22. 如請求項18至21中任一項所述的組成物，其中所述組成物包含一或多個編碼A型流感、B型流感和/或C型流感病毒的抗原的mRNA分子，視情況地其中所述抗原是A型流感和B型流感病毒的HA和/或NA抗原。
23. 如請求項22所述的組成物，其中A型流感病毒的所述HA抗原選自亞型H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7、H8、H9、H10、H11、H12、H13、H14、H15、H16、H17和H18；和/或A型流感病毒的所述NA抗原選自亞型N1、N2、N3、N4、N5、N6、N7、N8、N9、N10和N11。
24. 如請求項22或23所述的組成物，其中B型流感病毒的所述HA和NA抗原來自B型流感/山形譜系或B型流感/維多利亞譜系。
25. 如請求項22至24中任一項所述的組成物，其中所述組成物包含兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個或更多個編碼以下的mRNA分子：(i) 一或多個HA抗原，(ii) 一或多個NA抗原，或 (iii) 選自H1N1、H3N2、H2N2、H5N1、H7N9、H7N7、H1N2、H9N2、H7N2、H7N3、H5N2和H10N7亞型及/或B/山形和B/維多利亞譜系的一或多個HA抗原和NA抗原的組合。
26. 如請求項22至25中任一項所述的組成物，其中所述組成物包含一個編碼H3 HA抗原的mRNA分子、一個編碼H1 HA抗原的mRNA分子、一個編碼來自B型流感/山形譜系的HA抗原的mRNA分子和一個編碼來自B型流感/維多利亞譜系的HA抗原的mRNA分子。
27. 如請求項22至26中任一項所述的組成物，其中所述組成物包含一個編碼H3 HA抗原的mRNA分子、一個編碼N2 NA抗原的mRNA分子、一個編碼H1 HA抗原的mRNA分子、一個編碼N1 NA抗原的mRNA分子、一個編碼來自B型流感/山形譜系的HA抗原的mRNA分子、一個編碼來自B型流感/山形譜系的NA抗原的mRNA分子、一個編碼來自B型流感/維多利亞譜系的HA抗原的mRNA分子和一個編碼來自B型流感/維多利亞譜系的NA抗原的mRNA分子。
28. 如請求項16所述的組成物，其中所述mRNA分子包含編碼呼吸道合胞病毒（RSV）F蛋白抗原的開放閱讀框（ORF）。
29. 如請求項28所述的組成物，其中所述RSV F蛋白抗原包含與SEQ ID NO: 16具有至少98%同一性的胺基酸序列，或者由SEQ ID NO: 16的胺基酸序列組成。
30. 如請求項28或29所述的組成物，其中所述RSV F蛋白抗原是融合前蛋白。
31. 如請求項16至30中任一項所述的組成物，其中所述ORF是經密碼子最佳化的。
32. 如請求項16至31中任一項所述的組成物，其中所述mRNA分子包含至少一個5'非轉譯區（5' UTR）、至少一個3'非轉譯區（3' UTR）和至少一個多腺苷酸化（聚(A)）序列。
33. 如請求項16至32中任一項所述的組成物，其中所述mRNA包含至少一個化學修飾。
34. 如請求項16至33中任一項所述的組成物，其中所述mRNA中至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%的尿嘧啶核苷酸是經化學修飾的。
35. 如請求項16至33中任一項所述的組成物，其中所述ORF中至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%的尿嘧啶核苷酸是經化學修飾的。
36. 如請求項33至35中任一項所述的組成物，其中所述化學修飾選自假尿苷、N1-甲基假尿苷、2-硫代尿苷、4'-硫代尿苷、5-甲基胞嘧啶、2-硫代-l-甲基-1-去氮-假尿苷、2-硫代-l-甲基-假尿苷、2-硫代-5-氮雜-尿苷、2-硫代-二氫假尿苷、2-硫代-二氫尿苷、2-硫代-假尿苷、4-甲氧基-2-硫代-假尿苷、4-甲氧基-假尿苷、4-硫代-l-甲基-假尿苷、4-硫代-假尿苷、5-氮雜-尿苷、二氫假尿苷、5-甲基尿苷、5-甲基尿苷、5-甲氧基尿苷和2'-O-甲基尿苷。
37. 如請求項36所述的組成物，其中所述化學修飾選自假尿苷、N1-甲基假尿苷、5-甲基胞嘧啶、5-甲氧基尿苷及其組合。
38. 如請求項36所述的組成物，其中所述化學修飾是N1-甲基假尿苷。
39. 如請求項28至38中任一項所述的組成物，其中所述mRNA包含與SEQ ID NO: 17所示的核酸序列具有至少80%同一性的核酸序列。
40. 如請求項28至38中任一項所述的組成物，其中所述mRNA包含與SEQ ID NO: 21所示的核酸序列具有至少80%同一性的核酸序列。
41. 如請求項28至38中任一項所述的組成物，其中所述mRNA包含以下結構元件： (i) 具有以下結構的5'帽：

    

    ； (ii) 具有SEQ ID NO: 19的核酸序列的5'非轉譯區（5' UTR）； (iii) 具有SEQ ID NO: 17的核酸序列的蛋白質編碼區； (iv) 具有SEQ ID NO: 20的核酸序列的3'非轉譯區（3' UTR）；以及 (v) 聚(A)尾。
42. 如前述請求項中任一項所述的組成物，其中所述組成物配製用於肌內注射。
43. 如請求項42所述的組成物，其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水。
44. 如前述請求項中任一項所述的組成物，其中所述組成物包含海藻糖，視情況地為所述組成物的10%（w/v）。
45. 一種製備如前述請求項中任一項所述的組成物的方法，所述方法包括 提供包含所述核酸分子的水性緩衝溶液， 提供包含所述陽離子脂質、所述PEG化的脂質、所述基於膽固醇的脂質和所述輔助脂質的兩親溶液，以及 以5 : 1至3 : 1、視情況地4 : 1的比率混合所述水性緩衝溶液和所述兩親溶液。
46. 如請求項45所述的方法，其中所述水性緩衝溶液是酸性緩衝溶液，所述酸性緩衝溶液視情況地包含1 mM檸檬酸鹽和150 mM氯化鈉，pH為約4.5。
47. 如請求項45或46所述的方法，其中所述兩親溶液是乙醇溶液。
48. 一種在有需要的受試者中引發免疫反應的方法，所述方法包括向所述受試者投予，視情況地肌內、鼻內、靜脈內、皮下或皮內投予預防有效量的如請求項1至47中任一項所述的組成物。
49. 一種預防流感感染或減輕流感感染的一或多種症狀的方法，所述方法包括向受試者投予，視情況地肌內、鼻內、靜脈內、皮下或皮內投予預防有效量的如請求項18至27中任一項所述的組成物。
50. 如請求項49所述的方法，其中所述組成物引發針對一或多種季節性和/或大流行流感毒株的免疫反應。
51. 如請求項48至50中任一項所述的方法，所述方法包括向所述受試者投予一或多劑的所述組成物，每劑包含1至250 μg，視情況地2.5 μg、5 μg、15 μg、45 μg或135 μg的mRNA。
52. 如請求項48至51中任一項所述的方法，所述方法包括向所述受試者以2至6週、視情況地4週的間隔投予兩劑的所述組成物。
53. 如請求項1至44中任一項所述的組成物用於製造藥物的用途，該藥物係用於治療有需要的受試者、視情況地用於如請求項48至52中任一項所述的方法中。
54. 如請求項1至44中任一項所述的組成物，用於治療有需要的受試者、視情況地用於如請求項48至52中任一項所述的方法中。
55. 一種套組，所述套組包含容器，該容器含有單次使用或多次使用劑量的如請求項1至44中任一項所述的組成物，視情況地其中所述容器是小瓶或者預填充針筒或注射器。
56. 如請求項21至27中任一項所述的疫苗組成物，其中所述抗原包含具有從機器學習模型所鑒定或設計的分子序列的流感病毒HA抗原和/或流感病毒NA抗原。

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