JP7346565B2 - Kras g12c阻害剤 - Google Patents
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Description
本出願は、米国特許法第120条の下で2018年11月14日に出願された米国仮特許出願第16/191,190号に基づく優先権を主張し、米国特許法第119条(e)の下で2017年11月15日に出願された米国仮特許出願第62/586,775号に基づく優先権を主張し、これらの出願の各々の内容は全て、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
式中、
Xが、4~12員の飽和または部分飽和の単環式、架橋環またはスピロ環であり、飽和または部分飽和単環式環が、1個以上のR8で任意に置換されており、
Yが、結合、O、S、またはNR5であり、
R1が、
R2が、水素、アルキル、ハロアルキル、ヒドロキシアルキル、ジヒドロキシアルキル、アルキルアミニルアルキル、ジアルキルアミニルアルキル、-Z-NR5R10、ヘテロシクリル、シクロアルキル、ヘテロシクリルアルキル、アリール、ヘテロアリール、またはヘテロアリールアルキルであり、Z、ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、アリール、ヘテロアリール、およびヘテロアリールアルキルの各々が、1個以上のR9で任意に置換されていてもよく、
各Zが、C1-C4アルキレンであり、
各R3が、独立して、C1-C3アルキル、オキソ、ハロアルキル、ヒドロキシル、またはハロゲンであり、
Lが、結合、-C(O)-、またはC1-C3アルキレンであり、
R4が、水素、シクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、アラルキル、またはヘテロアリールであり、シクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、アラルキル、およびヘテロアリールの各々が、1個以上のR6、R7、またはR8で任意に置換されていてもよく、
各R5が、独立して、水素またはC1-C3アルキルであり、
R6が、シクロアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、シクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールの各々が、1個以上のR7で任意に置換されていてもよく、
各R7が、独立して、ハロゲン、ヒドロキシル、C1-C6アルキル、シクロアルキル、アルコキシ、ハロアルキル、アミノ、シアノ、ヘテロアルキル、ヒドロキシアルキル、またはQ-ハロアルキルであり、式中、Qが、OまたはSであり、
R8が、オキソ、C1-C3アルキル、C2-C4アルキニル、ヘテロアルキル、シアノ、-C(O)OR5、-C(O)N(R5)2、-N(R5)2であり、C1-C3アルキルが、シアノ、ハロゲン、-OR5、-N(R5)2、またはヘテロアリールで任意に置換されていてもよく、
各R9が、独立して、水素、オキソ、アシル、ヒドロキシル、ヒドロキシアルキル、シアノ、ハロゲン、C1-C6アルキル、アラルキル、ハロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、アルコキシ、アミノ、ジアルキルアミニル、ジアルキルアミドアルキル、ジアルキルアミニルアルキル、またはオキソであり、C1-C6アルキルは、シクロアルキルまたはシアノで任意に置換されていてもよく、
各R10が、独立して、水素、アシル、C1-C3アルキル、ハロアルキル、ヘテロアルキル、またはヒドロキシアルキルであり、
R11が、ハロアルキルであり、
RAが、不在、水素、重水素、シアノ、ハロゲン、C1-C3アルキル、ハロアルキル、ヘテロアルキル、-C(O)N(R5)2、またはヒドロキシアルキルであり、
各RBが、独立して、水素、重水素、シアノ、C1-C3アルキル、ヒドロキシアルキル、ヘテロアルキル、C1-C3アルコキシ、ハロゲン、ハロアルキル、-ZNR5R11、-C(O)N(R5)2、-NHC(O)C1-C3アルキル、-CH2NHC(O)C1-C3アルキル、ヘテロアリール、ヘテロアリールアルキル、ジアルキルアミニルアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり、ヘテロシクリル部分が、ハロゲン、ヒドロキシル、アルコキシ、およびC1-C3アルキルから独立して選択される1個以上の置換基で置換されており、ヘテロアリールまたはヘテロアリールアルキルのヘテロアリール部分が、1個以上のR7で任意に置換されており、
あるいは
mが、ゼロであるか、または1~2の整数であり、
pが、1または2であり、
あるいは
特に定義しない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書において参照される全ての特許、特許出願、および刊行物は、参照により本明細書に組み込まれる。
本発明の一態様では、式(II)により表される化合物、
式中、
Xが、4~12員の飽和または部分飽和の単環式、架橋環またはスピロ環であり、飽和または部分飽和単環式環が、1個以上のR8で任意に置換されており、
Yが、結合、O、S、またはNR5であり、
R1が、
R2が、水素、アルキル、ハロアルキル、ヒドロキシアルキル、ジヒドロキシアルキル、アルキルアミニルアルキル、ジアルキルアミニルアルキル、-Z-NR5R10、ヘテロシクリル、シクロアルキル、ヘテロシクリルアルキル、アリール、ヘテロアリール、またはヘテロアリールアルキルであり、Z、ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、アリール、ヘテロアリール、およびヘテロアリールアルキルの各々が、1個以上のR9で任意に置換されていてもよく、
各Zが、C1-C4アルキレンであり、
各R3が、独立して、C1-C3アルキル、オキソ、ハロアルキル、ヒドロキシル、またはハロゲンであり、
Lが、結合、-C(O)-、またはC1-C3アルキレンであり、
R4が、水素、シクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、アラルキル、またはヘテロアリールであり、シクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、アラルキル、およびヘテロアリールの各々が、1個以上のR6、R7、またはR8で任意に置換されていてもよく、
各R5が、独立して、水素またはC1-C3アルキルであり、
R6が、シクロアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、シクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールの各々が、1個以上のR7で任意に置換されていてもよく、
各R7が、独立して、ハロゲン、ヒドロキシル、C1-C6アルキル、シクロアルキル、アルコキシ、ハロアルキル、アミノ、シアノ、ヘテロアルキル、ヒドロキシアルキル、またはQ-ハロアルキルであり、式中、Qが、OまたはSであり、
R8が、オキソ、C1-C3アルキル、C2-C4アルキニル、ヘテロアルキル、シアノ、-C(O)OR5、-C(O)N(R5)2、-N(R5)2であり、C1-C3アルキルが、シアノ、ハロゲン、-OR5、-N(R5)2、またはヘテロアリールで任意に置換されていてもよく、
各R9は、独立して、水素、オキソ、アシル、ヒドロキシル、ヒドロキシアルキル、シアノ、ハロゲン、C1-C6アルキル、アラルキル、ハロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、アルコキシ、ジアルキルアミニル、ジアルキルアミドアルキル、またはジアルキルアミニルアルキルであり、C1-C6アルキルは、シクロアルキルまたはシアノで任意に置換されていてもよく、
各R10が、独立して、水素、アシル、C1-C3アルキル、ハロアルキル、ヘテロアルキル、またはヒドロキシアルキルであり、
R11が、ハロアルキルであり、
RAが、不在、水素、重水素、シアノ、ハロゲン、C1-C3アルキル、ハロアルキル、ヘテロアルキル、-C(O)N(R5)2、またはヒドロキシアルキルであり、
各RBが、独立して、水素、重水素、シアノ、C1-C3アルキル、ヒドロキシアルキル、ヘテロアルキル、C1-C3アルコキシ、ハロゲン、ハロアルキル、-ZNR5R11、-C(O)N(R5)2、-NHC(O)C1-C3アルキル、-CH2NHC(O)C1-C3アルキル、ヘテロアリール、ヘテロアリールアルキル、ジアルキルアミニルアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり、ヘテロシクリル部分が、ハロゲン、ヒドロキシル、アルコキシ、およびC1-C3アルキルから独立して選択される1個以上の置換基で置換されており、ヘテロアリールまたはヘテロアリールアルキルのヘテロアリール部分が、1個以上のR7で任意に置換されており、
あるいは
mが、ゼロであるか、または1~2の整数であり、
pが、1または2であり、
あるいは
別の実施形態では、本発明は、本発明によるKRas G12C阻害剤および薬学的に許容される担体、賦形剤、または希釈剤を含む医薬組成物を提供する。本発明の化合物は、当該技術分野において周知の任意の方法により製剤化され得、非経口、経口、舌下、経皮、局所、鼻腔内、気管内、または直腸内を含むがこれらに限定されない任意の経路により投与するために調製され得る。ある特定の実施形態では、本発明の化合物は、病院で静脈内投与される。一実施形態では、投与は、経口経路によるものであり得る。
さらに別の態様では、本発明は、細胞におけるKRas G12C活性を阻害するための方法を提供し、この方法は、KRas G12C活性の阻害が所望される細胞を、有効量の式(II)、式II-A、もしくは式II-Bの化合物、それらの薬学的に許容される塩、または化合物もしくはその薬学的に許容される塩を含有する医薬組成物と接触させることを含む。一実施形態では、接触は、インビトロで行われる。一実施形態では、接触は、インビボで行われる。
本発明の化合物は、本明細書に記載される合成方法および反応スキームを使用して市販の試薬から、または他の試薬および当業者に周知の従来的な方法を使用して調製され得る。
(a)式(II)(式中、Yが結合であり、R2が水素である)の化合物について、式5
(b)式(II)(式中、Lが結合であり、-Y-R2が水素以外である)の化合物について、式(11)
任意に、その塩を形成することも含む。
ステップB:tert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、171mmol、1.00当量)のDCM(500mL)中の0℃での撹拌懸濁液に、DIEA(44.3g、343mmol、59.9mL、2.00当量)、続いて、トリフルオロメタンスルホン酸無水物(72.6g、257mmol、42.4mL、1.50当量)を窒素下で加えた。直ちに褐色の溶液が形成された。25℃で16時間撹拌後、反応物を濃縮して褐色油を得た。褐色油をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:0~10:1)により精製して、tert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(46.0g、107mmol、62.4%収率)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 430.2[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(46.0g、107mmol、1.00当量)のDMF(500mL)中の撹拌溶液に、DIEA(27.7g、214mmol、37.4mL、2.00当量)、続いて、ベンジルピペラジン-1-カルボキシレート(25.9g、117mmol、22.7mL、1.10当量)を加えた。反応物を窒素雰囲気下、100℃に1時間加熱した。反応混合物を酢酸エチル(300mL)中に注ぎ込み、H2O(300mL×3)およびブライン(200mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:0~5:1)により精製して、tert-ブチル4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、96.9mmol、90.5%収率、92.0%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 500.3[M+H]+。
ステップD:ベンジル4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(25.0g、50.0mmol、1.00当量)のDCM(50.0mL)中溶液に、TFA(85.6g、750mmol、55.6mL、15.0当量)を加えた。25℃で1時間撹拌後、反応混合物を減圧下で濃縮した。残留物を300mLの酢酸エチルおよび300mLの水に溶解し、高速で撹拌した。混合物をNa2CO3でpH8に調節した。有機層を水(1×300mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮してベンジル4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(19.0g、46.6mmol、93.2%収率、98.0%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 400.2 [M+H]+。
ステップE:ベンジル4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-ナフタレン(16.3g、52.1mmol、1.30当量)、ベンジル4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(16.0g、40.1mmol、1.00当量)、Cs2CO3(32.6g、100mmol、2.50当量)、Pd2(dba)3(5.50g、6.01mmol、0.15当量)、および2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(3.74g、8.01mmol、0.20当量)のジオキサン(300mL)中混合物に、窒素により脱気およびパージを3回行った。混合物を窒素雰囲気下、85℃で5時間撹拌した。0℃で水(200mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、酢酸エチル(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×150mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=10/1~5/1)により精製して、ベンジル4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(16.0g、22.8mmol、56.9%収率、90.0%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 632.5[M+H]+。
ステップF:ベンジル4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(8.00g、12.7mmol、1.00当量)のDCM(200mL)中撹拌溶液に、m-CPBA(2.73g、12.7mmol、80.0%純度、1.00当量)を、窒素下、0℃で加えた。窒素雰囲気下、0℃で2時間撹拌後、0℃でNa2S2O3(10.0mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、水(100mL)で希釈し、DCM(200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=1/0~10/1)により精製して、ベンジル4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.50g、4.92mmol、38.8%収率、91.0%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 648.5[M+H]+。
ステップB:1-ベンジルオキシ-3-ブロモ-5-シクロプロピルベンゼン:1-ベンジルオキシ-3,5-ジブロモベンゼン(1.20g、3.51mmol、1.00当量)およびシクロプロピルボロン酸(392mg、4.56mmol、1.30当量)のH2O(4.00mL)およびジオキサン(20.0mL)中混合物に、Pd(dppf)Cl2(513mg、702μmol、0.20当量)およびCs2CO3(2.29g、7.02mmol、2.00当量)を加えた。反応混合物を、N2下、90℃で12時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)に加え、酢酸エチル(2×15mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:1)により精製して、1-ベンジルオキシ-3-ブロモ-5-シクロプロピルベンゼン(270mg、890μmol、25.4%収率)を無色油として得た。
ステップB:ベンジル4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(7.70g、12.9mmol、1.00当量)のDCM(80.0mL)中混合物に、TFA(119g、1.04mol、76.9mL、80.6当量)を加え、反応混合物を15℃で1時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、次いでDCM(100mL)で希釈し、NaOH水溶液でpH8に調節した。有機層を分離し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、ベンジル4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(6.00g、11.2mmol、86.9%収率、92.8%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 497.4[M+H]+。
ステップB:3-フルオロピロリジン:tert-ブチル3-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(4.30g、22.7mmol、1.00当量)のDCM(50.00mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、35.0mL、6.16当量)を0℃で滴加した。混合物を20℃に温め、1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をジイソプロピルエーテル(20mL)を使用してトリチュレートし、沈殿物を濾過し、真空下で乾燥して、3-フルオロピロリジン(2.70g、21.5mmol、94.6%収率、HCl)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=5.51(t,J=3.6Hz,0.5H),5.38(t,J=3.6Hz,1H),3.66-3.27(m,5H),2.45-2.12(m,2H)。
ステップC:メチル2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)アセテート:3-フルオロピロリジン(2.70g、21.5mmol、1.00当量、HCl)のDCM(27.00mL)中の懸濁液を、0℃に冷却した。トリエチルアミン(5.44g、53.8mmol、7.45mL、2.50当量)およびメチル2-ブロモ酢酸(3.62g、23.7mmol、2.23mL、1.10当量)を加え、反応混合物を20℃で16時間撹拌した。反応混合物をCH2Cl2(100mL)および水(50mL)で希釈した。有機層を5%クエン酸水溶液(1×50mL)で洗浄した。水層を飽和炭酸ナトリウム水溶液(20mL)で塩基化し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥して、真空中で濃縮して、メチル2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)アセテート(2.20g、13.7mmol、63.5%収率)を得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=5.22-5.02(m,1H),3.66(s,3H),3.35(s,2H),3.07-2.93(m,1H),2.91-2.77(m,2H),2.67(dt,J=5.2,8.4Hz,1H),2.21-1.93(m,2H)。
ステップD:2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エタノール:LiAlH4(706mg、18.6mmol、1.50当量)のTHF(20mL)中溶液に、メチル2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)アセテート(2.00g、12.4mmol、1.00当量)のTHF(10mL)中溶液を0℃で滴加した。混合物を20℃まで温め、3時間撹拌した。混合物を飽和硫酸ナトリウム水溶液(1mL)でクエンチした。混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。生成物をシリカゲルクロマトグラフィーにより、DMC中5%MeOHを使用して精製した。所望の画分を集め、真空下で濃縮して、2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エタノール(1.20g、9.01mmol、72.6%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=5.28-5.05(m,1H),3.68-3.61(m,2H),2.99-2.73(m,4H),2.72-2.67(m,2H),2.58-2.45(m,1H),2.28-1.97(m,2H)。
ステップB:1-(tert-ブチル)3-メチルピペラジン-1,3-ジカルボキシレート:メチルピペラジン-2-カルボキシレート(4.30g、粗製)およびTEA(8.02g、79.2mmol、11.0mL)のMeOH(50.0mL)中溶液にジ-tert-ブチルジカルボネート(4.32g、19.8mmol、4.55mL)を加えた。25℃で12時間撹拌後、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=1:0~20:1)により精製して、1-(tert-ブチル)3-メチルピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(4.80g、19.7mmol、2ステップで99.0%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.10-3.85(m,1H),3.73(s,3H),3.71-3.65(m,1H),3.47-3.38(m,1H),3.10-2.98(m,2H),2.78-2.66(m,1H),2.17(s,1H),1.46(s,9H)。
ステップB:4-ブロモ-1-ジアゾニオ-ナフタレン-2-オレート:2,4-ジブロモナフタレン-1-アミン(60.0g、199mmol、1.00当量)のAcOH(900mL)およびプロピオン酸(150mL)中溶液に、NaNO2(16.5g、239mmol、13.0mL、1.20当量)を5~8℃で30分間かけて何度かに分けて加え、反応混合物を5~8℃で30分間撹拌した。反応混合物を氷水(4000mL)中に注ぎ込み、得られた固体を集め、水(2×50mL)で洗浄して、4-ブロモ-1-ジアゾニオ-ナフタレン-2-オレート(150g、湿潤粗製)を灰色固体として得て、これを次のステップで直接使用した。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.12-8.10(d,J=8.4Hz,1H),7.62-7.58(t,J=7.6Hz,1H),7.41-7.37(t,J=7.6Hz,1H),7.31-7.29(d,J=8.0Hz,1H),7.20(s,1H)。
ステップC:4-ブロモナフタレン-2-オール:4-ブロモ-1-ジアゾニオ-ナフタレン-2-オレート(100g、402mmol、1.00当量)のEtOH(2.00L)中溶液に、NaBH4(30.4g、803mmol、2.00当量)を13~15℃で1時間かけて何度かに分けて加え、反応混合物を15~18℃で3時間撹拌した。反応物を濾過し、濃縮乾固した。残留物をDCM(1000mL)に溶解し、水(500mL×2)で洗浄した。有機相をNa2SO4上で乾燥させて、濃縮乾固した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフにより、ジエチルエーテル/酢酸エチル(60:1~10:1)で溶出して精製した。単離した生成物を、逆相HPLCでさらに精製して、4-ブロモナフタレン-2-オール(40.0g、139mmol、17.3%収率、77.4%純度)を灰色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.07-8.05(d,J=8.0Hz,1H),7.60-7.58(d,J=7.6Hz,1H),7.41-7.36(m,3H),7.07(s,1H)。
ステップD:3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-ナフタレン:4-ブロモナフタレン-2-オール(30.0g、134mmol、1.00当量)、ベンジルブロミド(25.3g、148mmol、17.6mL、1.10当量)およびK2CO3(55.7g、403mmol、3.00当量)のMeCN(500mL)中混合物を、80℃で1時間加熱した。反応混合物を濾過し、濃縮乾固した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより、ジエチルエーテル/酢酸エチル(100:1~60:1)で溶出して精製し、3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-ナフタレン(40.0g、128mmol、95%収率)を黄色油として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.19-8.17(d,J=8.0Hz,1H),7.75-7.32(d,J=8.8Hz,1H),7.64-7.63(d,J=2.4Hz,1H),7.52-7.37(m,7H),7.23-7.21(d,J=2.0Hz,1H),5.2(s,2H)。
ステップB:(3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート:3-メトキシナフタレン-1-オール(2.10g、12.0mmol、1.00当量)のDCM(40.0mL)中溶液に、DIEA(7.79g、60.3mmol、10.5mL、5.00当量)およびトリフルオロメタンスルホン酸無水物(5.10g、18.1mmol、2.98mL、1.50当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物をDCM(30mL)および水(10mL)で希釈し、DCM(20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:酢酸エチル=20:1~10:1)により精製して、(3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(3.00g、8.52mmol、70.7%収率、87.0%純度)を褐色油として得た。ESI MS m/z 307.1[M+H]+。
ステップB:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:DIEA(30.1g、233mmol、40.7mL、3.00当量)のPOCl3(330g、2.15mol、200mL)中溶液に、7-ベンジル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(20.0g、77.7mmol、1.00当量)を加えた。反応混合物を110℃で5時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をDCM(400mL)に溶解し、飽和NaHCO3(200mL)中に注ぎ込んだ。混合物をDCM(2×400mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:DCM=10:1~0:1)により精製して、7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(7.70g、26.2mmol、33.7%収率)を褐色油として得た。1H NMR(300MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.28(m,5H),3.73(s,2H),3.66(br s,2H),2.84(br s,4H)。
ステップB:tert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレートを得る:tert-ブチル4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(15.0g、50.4mmol、1.00当量)のDCM(200mL)中の撹拌懸濁液に、DIEA(26.1g、202mmol、35.2mL、4.00当量)を窒素下、0℃で加え、続いて、トリフルオロメタンスルホン酸無水物(28.5g、101mmol、16.6mL、2.00当量)をシリンジにより加えた。直ちに褐色の溶液が形成された。この反応混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:0~10:1)により精製して、tert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(16.7g、35.7mmol、70.9%収率、91.9%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 374.0[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(16.7g、38.9mmol、1.00当量)のDMF(100mL)中撹拌溶液に、DIEA(10.0g、77.9mmol、2.00当量)およびベンジルピペラジン-1-カルボキシレート(9.41g、42.8mmol、1.10当量)を加えた。反応物を100℃に加熱し、窒素雰囲気下で1時間撹拌した。反応混合物を水(150mL)で希釈し、反応混合物をHCl(2M)でpH5に調整し、DCM(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和NaHCO3(3×150mL)、ブライン(3×150mL)およびH2O(3×150mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、tert-ブチル4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(18.1g、36.2mmol、93.0%収率、94.1%純度)を黄色固体として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ESI MS m/z 500.1[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルホニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(14.4g、28.9mmol、1.00当量)のDCM(150mL)中の窒素下、0℃での撹拌溶液に、メタ-クロロペルオキシ安息香酸(17.4g、101mmol、3.50当量)を固体として加えた。窒素雰囲気下、0℃で2時間撹拌後、反応混合物を水(300mL)で希釈し、反応混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH8に調整し、DCM(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10:1~1:2)により精製して、tert-ブチル4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルホニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(11.0g、19.7mmol、68.6%収率、95.4%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 532.1[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル-[(3-メトキシ-1-ナフチル)オキシ]-ジメチル-シラン:3-メトキシナフタレン-1-オール(20.0g、115mmol、1.00当量)およびイミダゾール(23.5g、344mmol、3.00当量)のTHF(400mL)中の溶液に、TBSCl(26.0g、172mmol、21.1mL、1.50当量)を0℃で滴加した。混合物を25℃まで温め、16時間撹拌した。混合物を石油エーテル(600mL)および酢酸エチル(200mL)で希釈し、次いで、水(1×200mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1~10/1)により精製した。tert-ブチル-[(3-メトキシ-1-ナフチル)オキシ]-ジメチル-シラン(28.0g、97.1mmol、84.6%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.01(d,J=8.4Hz,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.35(dt,J=1.2,7.6Hz,1H),7.24(dt,J=1.2,7.6Hz,1H),6.71(d,J=2.0Hz,1H),6.48(d,J=2.4Hz,1H),3.82(s,3H),1.02(s,9H),0.23(s,6H)。
ステップC:tert-ブチル[[3-メトキシ-6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1-ナフチル]オキシ]-ジメチル-シランおよびtert-ブチル((3-メトキシ-7-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ナフタレン-1-イル)オキシ)ジメチルシラン:tert-ブチル[(3-メトキシ-1-ナフチル)オキシ]-ジメチル-シラン(26.0g、90.1mmol、1.00当量)、4,4,5,5-テトラメチル-2-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,3,2-ジオキサボロラン(45.8g、180mmol、2.00当量)、(1Z,5Z)-シクロオクタ-1,5-ジエン;2,4-ジメチル-ブラービシクロ[1.1.0]ブタン(2.39g、3.61mmol、0.04当量)および4-tert-ブチル-2-(4-tert-ブチル-2-ピリジル)ピリジン(1.45g、5.41mmol、0.06当量)のヘキサン(500mL)中混合物を、窒素雰囲気下、100℃で16時間撹拌した。混合物を、水(500mL)および酢酸エチル(1000mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×500mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1~10/1)により精製した。所望の画分を集め、真空下で濃縮して、tert-ブチル[[3-メトキシ-6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1-ナフチル]オキシ]-ジメチル-シランおよびtert-ブチル((3-メトキシ-7-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ナフタレン-1-イル)オキシ)ジメチルシランの混合物(38.0g、85.3mmol、94.6%収率、93%純度)を淡黄色油として得た。ESI MS m/z 415.5[M+H]+。
ステップD:8-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-6-メトキシ-ナフタレン-2-オール:tert-ブチル[[3-メトキシ-6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1-ナフチル]オキシ]-ジメチル-シランおよびtert-ブチル((3-メトキシ-7-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ナフタレン-1-イル)オキシ)ジメチルシランの混合物(36.0g、86.9mmol、1.00当量)のアセトン(400mL)中の溶液に、オキソン(58.7g、95.6mmol、1.10当量)のH2O(400mL)中の溶液を0℃で加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。混合物を5%チオ硫酸ナトリウム水溶液(50mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×300mL)で抽出した。抽出物を合わせて、水(1×200mL)、ブライン(1×200mL)で洗浄し、硫酸マグネシウム上で乾燥し、濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 200/1~20/1)により精製した。所望の画分を集め、真空下で濃縮して、8-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-6-メトキシ-ナフタレン-2-オール(9.00g、28.4mmol、32.7%収率、96%純度)を無色油として、および5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-ナフタレン-2-オール(9.00g、29.0mmol、33.4%収率、98%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 305.2[M+H]+。
ステップE:[5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-2-ナフチル]トリフルオロメタンスルホネート:5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-ナフタレン-2-オール(11.0g、36.1mmol、1.00当量)およびDIEA(14.0g、108mmol、18.9mL、3.00当量)のDCM(150mL)中溶液に、Tf2O(12.2g、43.4mmol、7.15mL、1.20当量)を-40℃で滴加した。混合物を1時間撹拌した。混合物をジクロロメタン(200mL)で希釈し、水(1×200mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1~10/1)により精製した。所望の画分を集め、真空下で濃縮して、[5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-2-ナフチル]トリフルオロメタンスルホネート(13.0g、29.8mmol、82.4%収率、100%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 436.9[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル[(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)オキシ]-ジメチル-シラン:[5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-2-ナフチル]トリフルオロメタンスルホネート(12.5g、28.6mmol、1.00当量)およびK2CO3(11.9g、85.9mmol、3.00当量)のジオキサン(160mL)中溶液に、Pd(PPh3)4(3.31g、2.86mmol、0.10当量)およびトリメチルボロキシン(14.4g、57.3mmol、16.0mL、2.00当量)を窒素雰囲気下で加えた。反応物を100℃に16時間加熱した。混合物を酢酸エチル(200mL)で希釈し、次いで水(1×200mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1~5/1)により精製した。所望の画分を集め、真空下で濃縮して、tert-ブチル[(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)オキシ]-ジメチル-シラン(8.00g、24.6mmol、85.9%収率、93%純度)を無色油として赤色固体として得た。ESI MS m/z 303.2[M+H]+。
ステップG:3-メトキシ-6-メチル-ナフタレン-1-オール:tert-ブチル-[(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)オキシ]-ジメチル-シラン(8.00g、26.5mmol、1.00当量)のTHF(100mL)中溶液に、TBAF(10.4g、39.7mmol、1.50当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で3時間撹拌した。混合物を、水(100mL)および酢酸エチル(200mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 50/1~5/1)により精製した。所望の画分を集め、真空下で濃縮して、3-メトキシ-6-メチル-ナフタレン-1-オール(4.70g、25.0mmol、94.4%収率)を赤色固体として得た。ESI MS m/z 188.4[M+H]+。
ステップH:3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチルトリフルオロメタンスルホネート:3-メトキシ-6-メチル-ナフタレン-1-オール(4.70g、25.0mmol、1.00当量)およびDIEA(9.68g、74.9mmol、13.1mL、3.00当量)のDCM(3.00mL)中溶液に、Tf2O(8.45g、30.0mmol、4.94mL、1.20当量)を-40℃で滴加した。混合物を1時間撹拌した。混合物をジクロロメタン(200mL)で希釈し、水(1×200mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1~10/1)により精製した。3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチルトリフルオロメタンスルホネート(7.70g、24.0mmol、96.2%収率、99.9%純度)を無色油として得た。ESI MS m/z 320.7 [M+H]+。
ステップ2:2-ブロモ-3-フルオロフェノールの代わりに2-ブロモ-3-フルオロ-4-メチルフェノールを使用して、中間体8の手順に従って2-ブロモ-3-フルオロ-1-(メトキシメトキシ)-4-メチルベンゼンを調製した。
ステップ2:4-イソプロポキシフェニルアセテート(1.24g、6.585mmol)をACN(20mL)中に入れ、N-ブロモスクシンイミド(1.173g、6.590mmol)を加えた。混合物を18時間撹拌した。水を加え、混合物をエーテルで抽出した。有機層を合わせ、乾燥し、濃縮して、3-ブロモ-4-イソプロポキシフェニルアセテート(1.584g、5.800mmol、88.00%収率)を得て、これは次のステップにおいて直接であった。
ステップ3:3-ブロモ-4-イソプロポキシフェニルアセテート(500mg、1.83mmol)をMeOH(7mL)中に入れた。KOH(111mg、1.98mmol)の水(2mL)中溶液を混合物に加え、室温で1時間撹拌した。反応混合物を1N HClを加えてpH3に調整した。混合物をDCMで抽出した。抽出物を合わせ、乾燥し、濾過し、濃縮して、粗製3-ブロモ-4-イソプロポキシフェノールを得て、これを直接次の反応に使用した。
ステップ4:2-ブロモ-3-フルオロフェノールの代わりに3-ブロモ-4-イソプロポキシフェノールを使用して、中間体8の手順に従って、2-ブロモ-1-イソプロポキシ-4-(メトキシメトキシ)ベンゼンを調製した。
ステップ2:2-の代わりに3-ブロモ-5-クロロ-4-イソプロピルフェノールを使用して、中間体8の手順に従って、1-ブロモ-3-クロロ-2-イソプロピル-5-(メトキシメトキシ)ベンゼンを調製した。
ステップB:tert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、171mmol)のDCM(500mL)中溶液に、DIEA(44.3g、343mmol、59.9mL)およびTf2O(72.6g、257mmol、42.4mL)を、窒素下、0℃で順次加えた。反応混合物を25℃まで温め、16時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、残留物をEtOAc/石油 0~10%で溶出するカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(46.0g、107mmol、62.4%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 430.2 [M+H]+。
ステップB:2-メチルナフタレン-1,3-ジオール。エチル2-メチル-3-オキソ-4-フェニル-ブタノエート(3.60g、16.3mmol)の濃硫酸(19.9g、203mmol)中溶液を、15℃で12時間撹拌した。反応混合物を氷水(30.0mL)中に注ぎ込み、得られた固体を濾過により集め、真空下で乾燥して、2-メチルナフタレン-1,3-ジオール(1.80g、10.3mmol、63.2%収率)を赤色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.02(d,J=8.0Hz,1H),7.65-7.54(m,1H),7.41(t,J=7.2Hz,1H),7.36-7.31(m,1H),6.80(s,1H),4.29-4.20(s,2H),2.41-2.24(s,3H)。
ステップC:3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン-1-オール。2-メチルナフタレン-1,3-ジオール(1.70g、9.76mmol)を、HCl/MeOH(2M、35.0mL)に加え、得られた混合物を30℃で3日間撹拌した。反応物を真空中で濃縮し、残留物を分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 1:1)により精製して、3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン-1-オール(800mg、4.25mmol、43.5%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.02(d,J=8.4Hz,1H),7.69(d,J=8.4Hz,1H),7.44-7.38(m,1H),7.37-7.31(m,1H),6.79(s,1H),5.14(s,1H),3.94(s,3H),2.29(s,3H)。
ステップD:(3-メトキシ-2-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート。3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン-1-オール(800mg、4.25mmol)およびピリジン(504mg、6.38mmol)のDCM(10.0mL)中混合物に、無水トリフルオロ酢酸(1.44g、5.10mmol)をN2雰囲気下、0℃で滴加した。混合物を20℃に温め、さらに5時間撹拌した。真空下で溶媒を除去し、残留物を分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 1:1)により精製して、(3-メトキシ-2-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.30g、4.06mmol、95.5%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.97(d,J=7.6Hz,1H),7.79-7.74(m,1H),7.52-7.43(m,2H),7.14(s,1H),3.99(s,3H),2.42(s,3H)。
ステップE:1-ブロモ-3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン:シールドチューブに、トルエン(10.0mL)中の、(3-メトキシ-2-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(466mg、1.45mmol)、t-Bu-Brettphos(154mg、290μmol)、臭化カリウム(259mg、2.17mmol)、PEG-200(175mg)、2-ブタノン(157mg、2.17mmol)、およびPd2(dba)3(133mg、145μmol)を加え、混合物を、N2により5分間脱気した。次に、トリイソブチルアルミニウム(431mg、2.17mmol)を20℃で滴加した。混合物を100℃に24時間加熱した。反応混合物を水(30.0mL)中に注ぎ込み、水層を酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(30.0mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、真空中で濃縮して残留物を得て、これをカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル 10:1)で予備精製し、次いで、分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 10:1)により精製して、1-ブロモ-3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン(700mg、2.79mmol、64.1%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.26-8.17(m,1H),7.73-7.69(m,1H),7.47-7.40(m,2H),7.09(s,1H),3.98-3.95(m,3H),2.56(s,3H)。
ステップF:4-ブロモ-3-メチル-ナフタレン-2-オール:1-ブロモ-3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン(580mg、2.31mmol)およびテトラブチルアンモニウムヨージド(2.13g、5.78mmol)のDCM(11.0mL)中の-78℃に冷却した溶液に、BCl3(1M、5.78mL)の溶液をN2下で10分かけて滴加した。反応混合物を0℃に温め、室温で2時間撹拌した。次に、真空下で溶媒を除去し、残留物を分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 5:1)により精製して、4-ブロモ-3-メチル-ナフタレン-2-オール(500mg、2.11mmol、91.3%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.26-8.15(m,1H),7.63(dd,J=3.6,6.0Hz,1H),7.45-7.38(m,2H),7.11(s,1H),5.09(s,1H),2.60(s,3H),1.56(s,3H)。
ステップG:3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-2-メチル-ナフタレン。4-ブロモ-3-メチル-ナフタレン-2-オール(265mg、1.12mmol)およびベンジルブロミド(201mg、1.18mmol)のアセトニトリル(3.00mL)中混合物に、炭酸カリウム(310mg、2.24mmol)をN2下、20℃で1度に加えた。次に、混合物を60℃で2時間撹拌した。真空下で溶媒を除去し、残留物を分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 5:1)により精製して、3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-2-メチルナフタレン(250mg、695μmol、31.0%収率、91.0%純度)を白色固体として得た。ES+APCI MS m/z 327.0、329.0 [M+H]+。
ステップB:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。DIEA(30.1g、233mmol)のPOCl3(330g、2.15mol)中溶液に、7-ベンジル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(20.0g、77.7mmol)を加え、反応混合物を110℃で5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をDCM(400mL)に溶解し、飽和NaHCO3(200mL)中に注ぎ込み、層を分離させた。水層をDCM(2×400mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/DCM=10/1~0/1)により精製して、7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(7.70g、26.2mmol)を得た。1H NMR(300MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.28(m,5H),3.73(s,2H),3.66(br s,2H),2.84(br s,4H)。
ステップC:tert-ブチル4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(17.3g、58.8mmol)のDMSO(200mL)中溶液に、DIEA(19.0g、147mmol)およびtert-ブチルピペラジン-1-カルボキシレート(11.5g、61.7mmol)を加え、混合物を55℃で10時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(200ml)に注ぎ込み、水(3×200mL)で洗浄した。合わせた有機成分をブライン(200mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をMTBE(200mL)でトリチュレートして精製し、tert-ブチル4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(24g、52.9mmol)を得た。ES+APCI MS m/z 444.2 [M+H]+。
ステップD:tert-ブチル4-[7-ベンジル-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。3-モルホリノプロパン-1-オール(11.8g、81.1mmol)、tert-ブチル4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(18g、40.5mmol)、BINAP(5.05g、8.11mmol)、t-BuONa(9.74g、101mmol)、およびPd2(dba)3(3.71g、4.05mmol)のトルエン(300mL)中混合物に、N2により脱気およびパージを3回行い、混合物を、N2雰囲気下、110℃で3時間撹拌した。反応混合物をH2O(200mL)中に注ぎ込み、水層を酢酸エチル(3×300mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(200mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=100/1~5/1)により精製して、tert-ブチル4-[7-ベンジル-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(14g、22.5mmol)を得た。ES+APCI MS m/z 553.4 [M+H]+。
ステップE:tert-ブチル4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル4-[7-ベンジル-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(14g、25.3mmol)のMeOH(1L)中溶液に、乾燥Pd/C(3g、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に、H2により真空脱気およびパージを数回行った。混合物をH2(15psi)下、40℃で10時間撹拌した。混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1TFA)/アセトニトリル]により精製して、tert-ブチル4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(6.5g、13.9mmol)を得た。ES+APCI MS m/z 463.4 [M+H]+。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=4.35(s,2H),3.60(t,J=6.4Hz,2H),3.05(t,J=6.4Hz,2H),2.55(s,3H)。
ステップB:4-クロロ-2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(16.5g、粗製、HCl)およびTEA(20.0g、196mmol、27.3mL)のTHF(400mL)中溶液に、ベンジルカルボノクロリデート(16.7g、98.1mmol、13.9mL)を0℃で滴加した。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(80mL)で希釈し、有機層を分離した。水相をEtOAc(200mL)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 80/1~5/1)により精製して、ベンジル4-クロロ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(19.6g、50.4mmol、2ステップで86%収率、90%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(300MHz,クロロホルム-d)δ=7.37(s,5H),5.18(s,2H),4.63(s,2H),3.877(d,J=8.0,2H),2.80(br s,2H),2.54(s,3H)。
ステップC:ベンジル4-クロロ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(21.5g、55.3mmol、1.00当量)のDMF(400mL)中溶液に、DIEA(35.7g、277mmol、48.2mL、5.00当量)および2-[(2S)-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(6.92g、55.3mmol、1.00当量)を加えた。80℃で2時間撹拌した後、(Boc)2O(60.4g、277mmol、63.5mL、5.00当量)を上記混合物に加え、80℃でさらに2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(800mL)で希釈し、EtOAc(2×400mL)で抽出した。有機層をブライン(300mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 10/1~1/1)により精製して、ベンジル4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(24.3g、43.0mmol、78%収率、95%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=7.43-7.29(m,5H),5.18(s,2H),4.76-4.54(m,2H),4.46(br d,J=18.4Hz,1H),4.08-3.69(m,4H),3.53-3.35(m,1H),3.34-3.03(m,2H),3.03-2.89(m,1H),2.81-2.55(m,4H),2.50(s,3H),1.51(s,9H)。
ステップD:ベンジル4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(24.3g、45.1mmol、1当量)のEtOAc(480mL)中溶液に、m-CPBA(8.70g、42.9mmol、85%純度、0.95当量)を0℃で何度かに分けて加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(800mL)で希釈した。pHをNaHCO3でpH8に調整し、有機層を分離した。水相をEtOAc(2×400mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EtOAc/MeOH 100/1~10/1)により精製して、ベンジル4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(20.9g、36.4mmol、81%収率、96%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:555。
ステップE:ベンジル4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(20.9g、37.6mmol、1当量)および[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(8.67g、75.3mmol、8.94mL、2当量)のトルエン(400mL)中溶液に、t-BuONa(7.23g、75.3mmol、2当量)を0℃で加えた。0℃で10分間撹拌した後、混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(200mL)で希釈し、EtOAc(2×400mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]により精製した。混合物は、飽和重炭酸ナトリウム溶液によって中和されて、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×1000mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、ベンジル4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(13.5g、20.5mmol、54%収率、92%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:606。
ステップF:ベンジル4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.50g、5.78mmol、1当量)のMeOH(60.0mL)中溶液に、NH3/MeOH(60.0mL)、Pd/C(1.00g、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に、H2により真空脱気およびパージを数回行った。混合物をH2(15psi)下、25℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、触媒を濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、2.33g、4.55mmol、79%収率、92%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.33(s,2H),3.61(t,J=5.6Hz,2H),2.68-2.49(m,5H),1.50(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、171mmol、1.00当量)のDCM(500mL)中の0℃での撹拌懸濁液に、DIEA(44.3g、343mmol、59.9mL、2.00当量)を加え、続いて、窒素下でTf2O(72.6g、257mmol、42.4mL、1.50当量)を加えた。直ちに褐色の溶液が形成された。25℃で16時間撹拌後、反応物を濃縮して褐色油を得た。褐色油をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~10/1)により精製した。標記化合物であるtert-ブチル2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(46.0g、107mmol、62%収率)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:430。
ステップB:8-クロロナフタレン-1-アミン。1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン(84g、496mmol、1当量)のHCl(1.5L)中溶液に、Cu(2.10g、33.1mmol、234μL、0.0665当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。得られた混合物を水(500mL)で希釈し、85℃で30分間加熱した。得られたほぼ透明な水溶液を、濾過し、冷却し、アンモニア水で(リトマス試験紙が青色になるまで)塩基化し、溶液をエーテルアセテート(2×1000mL)で抽出した。合わせた抽出物をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=200/1~5/1)により精製した。化合物である8-クロロナフタレン-1-アミン(57g、259mmol、52%収率、81%純度)を赤色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:178。
ステップC:1-ブロモ-8-クロロ-ナフタレン。8-クロロナフタレン-1-アミン(57g、320mmol、1当量)およびTsOH・H2O(219g、1.16mol、3.6当量)のMeCN(1000mL)中溶液に、NaNO2(39.8g、577mmol、1.8当量)およびCuBr(138g、963mmol、29.3mL、3当量)のH2O(120mL)中溶液を-5℃で加え、次いで、反応混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物に飽和Na2SO3溶液(100mL)を加え、15分間撹拌し、次いで、酢酸エチル(1000mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(500mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル)により精製した。標記化合物である1-ブロモ-8-クロロ-ナフタレン(56g、229mmol、72%収率、99%純度)を白色固体として得た。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。NH3をMeOH(20mL)中に-70℃で30分間バブリングした。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(380mg、623μmol、1.0当量)の溶液に、上記溶液を加え、続いてN2下でPd/C(200mg、10%純度)を加えた。この懸濁液に、H2により真空脱気およびパージを数回行った。反応物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、触媒を濾過し、濾液を濃縮して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、459μmol、74%収率、95%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ7.11(t,J=15.6Hz,1H),6.95(d,J=8.0Hz,2H),4.63(br s,1H),4.10-3.93(m,4H),3.89(br d,J=4.8Hz,1H),3.27(dd,J=3.6Hz,J=13.6Hz,1H),3.24-3.05(m,3H),3.05-2.95(m,1H),2.89-2.67(m,4H),2.52(s,3H),2.30(s,3H),2.28(s,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、983μmol、1.0当量)、3-クロロベンゼンカルボペルオキソ酸(200mg、983μmol、1.0当量)のDCM(5.0mL)中混合物に、N2により脱気およびパージを3回行い、次いで、混合物を、N2雰囲気下、0℃で30分間撹拌した。有機溶媒を水(10.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=3:1~酢酸エチル:メタノール=10:1)により精製した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、793μmol、81%収率、93%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:525。
ステップC:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.52mmol、1.0当量)、[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(369mg、3.20mmol、380μL、2.10当量)、t-BuONa(293mg、3.05mmol、2.0当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に、N2により脱気およびパージを3回行い、次いで、混合物を、N2雰囲気下、0℃で30分間撹拌した。反応物を水(20.0mL)でクエンチした。粗製混合物を酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(80.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=5:1~ジクロロメタン:メタノール=10:1)により精製した。標記化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(740mg、1.22mmol、80%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:576。
ステップB:エチル2-(ジエトキシホスホリル)-2-フルオロアセテート(24.5g、101mmol、20.6mL、1.5当量)のTHF(50mL)中溶液に、n-BuLi(2.5M、32.4mL、1.2当量)を-65℃で加えた。-65℃で0.5時間撹拌後、2-メトキシアセトアルデヒド(5g、67.5mmol、1.09mL、1当量)を混合物に加えた。混合物を-65℃で30分間撹拌し、次いで、混合物を-78℃で水(10mL)でクエンチした。混合物を酢酸エチル(2×20mL)で抽出し、合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空中で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(3/1、石油エーテル/酢酸エチル)により精製して、エチル(Z)-2-フルオロ-4-メトキシブタ-2-エノエート(6g、55%)を無色油として得た。Rf=0.82(3/1、石油エーテル/酢酸エチル)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=6.28-5.97(m,1H),4.41(dd,J=3.2,6.0Hz,2H),4.34-4.28(m,2H),3.36(s,3H),1.35(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップC:エチル(Z)-2-フルオロ-4-メトキシブタ-2-エノエート(1g、6.17mmol、1当量)およびLiOH(591mg、24.7mmol、4当量)のTHF(4mL)およびH2O(1mL)中混合物を、15℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、1M HCl(水中)を加えてpHを1に調整した。混合物を酢酸エチル(2×10mL)で抽出し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空中で濃縮して、(Z)-2-フルオロ-4-メトキシブタ-2-エン酸(600mg、73%)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ6.03(td,J=5.6,20.0Hz,1H),4.75-4.57(m,2H),4.31(q,J=7.2Hz,2H),1.36(t,J=7.2Hz,3H),0.91(s,9H),0.15-0.05(m,6H)。
ステップB:エチル(Z)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-2-フルオロブタ-2-エノエート(500mg、1.91mmol、1.0当量)のTHF(3mL)およびH2O(3mL)中溶液に、25℃でLiOH・H2O(959mg、22.9mmol、12.0当量)を加え、混合物を50℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮し、得られた残留物を水(5mL)で希釈し、メチルtert-ブチルエーテル(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過した。濾液を減圧下で濃縮して、エチル(Z)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-2-フルオロブタ-2-エノエート(500mg)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく使用した。Rf=0.10(ジクロロメタン/メタノール=10/1)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.08-6.97(m,3H),6.60(dd,J=7.6,10.4Hz,1H),5.78(s,1H),5.69(d,J=0.8Hz,1H),2.25(d,J=1.6Hz,3H)。
ステップB.7-フルオロ-5-メチル-11-オキサトリシクロウンデカ-1,3,5(7),6(8)-テトラエン(550mg、3.12mmol、1.0当量)のエタノール(6.50mL)中溶液に、濃HCl(12.0M、3.50mL、13.4当量)を25℃で加えた。混合物を78℃で1時間撹拌し、続いて混合物を減圧下で45℃で濃縮した。粗生成物を逆相フラッシュクロマトグラフィー[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]により精製して、7-フルオロ-8-メチル-ナフタレン-1-オール(500mg、2.84mmol、90.9%収率)を褐色固体として得た。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.65(dd,J=5.6,8.8Hz,1H),7.44(d,J=8.0Hz,1H),7.30-7.21(m,2H),6.80(d,J=7.6Hz,1H),5.26(s,1H),2.90(d,J=2.8Hz,3H)。
ステップC.7-フルオロ-8-メチル-ナフタレン-1-オール(500mg、2.8mmol、1.0当量)、DIEA(1.1g、8.5mmol、1.48mL、3.0当量)および4Åモレキュラーシーブ(100mg)のジクロロメタン(10.0mL)中混合物を窒素雰囲気下で-40℃で20分間撹拌した。この溶液に、-40℃でTf2O(801mg、2.84mmol、468μL、1.0当量)を滴加し、混合物をこの温度で40分間撹拌した。混合物を減圧下40℃で濃縮し、得られた残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:0~100:1)により精製して、(7-フルオロ-8-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(900mg、粗製)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.11-7.07(m,2H),7.05(dd,J=4.0,8.0Hz,1H),6.74(dd,J=7.8,9.2Hz,1H),5.89(s,1H),5.75(s,1H)。
ステップB.7-クロロ-5-フルオロ-10-オキサトリシクロウンデカ-2,4(6),5(7)-テトラエン(7g、35.6mmol、1.0当量)の濃HCl(51.0g、503mmol、50mL、36%純度、14.1当量)およびEtOH(80mL)中反応混合物を、78℃で2時間加熱した。その後、反応混合物を減圧下で濃縮して、粗残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=1:0~50:1)により精製して、7gの粗生成物を得た。生成物を石油エーテル(20mL)でトリチュレートし、濾過した。濾過ケーキを真空下で乾燥し、8-クロロ-7-フルオロ-ナフタレン-1-オール(5.3g、26.6mmol、75%収率、98.8%純度)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.81(s,1H),7.65(dd,J=5.6,9.2Hz,1H),7.34-7.27(m,2H),7.23-7.17(m,1H),7.03-6.97(m,1H)。
ステップC.8-クロロ-7-フルオロ-ナフタレン-1-オール(1g、5.09mmol、1当量)およびDIEA(3.29g、25.4mmol、4.43mL、5.0当量)、4Åモレキュラーシーブ(1g)のDCM(20mL)中反応混合物を20℃で10分間撹拌した。混合物にTf2O(1.87g、6.61mmol、1.09mL、1.3当量)を-40℃で加えた。反応混合物をこの温度で10分間撹拌した。続いて、反応物を水(1mL)でクエンチし、層を分離した。水層を酢酸エチル(2×3mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=1:0~100:1)により精製して、(8-クロロ-7-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.3g、3.96mmol、78%収率)を無色油として得た。
ステップB:N-(3,4-ジフルオロベンジル)-4-メチルベンゼンスルホンアミド(7.1g、23.9mmol、1当量)のTHF(106mL)中溶液に、NaH(1.24g、31.0mmol、60%純度、1.3当量)を-5℃で30分後に加え、tert-ブチル2-ブロモ酢酸(6.99g、35.82mmol、5.29mL、1.5当量)を-5℃で加えた。反応混合物をー5℃で2時間撹拌した。混合物を飽和NH4Cl水溶液(150mL)でクエンチし、次いで、酢酸エチル(100mL×2)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1~5/1)により精製して、tert-ブチルN-(3,4-ジフルオロベンジル)-N-トシルグリシナート(9.09g、22.1mmol、93%収率、100%純度)をオフホワイト固体として得た。LCMS[M-55]:356。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.75(d,J=8.4Hz,2H),7.32(d,J=8.0Hz,2H),7.16-7.06(m,2H),7.00(ddd,J=2.0,4.0,6.4Hz,1H),4.45(s,2H),3.81(s,2H),2.44(s,3H),1.34(s,9H)。
ステップC:tert-ブチルN-(3,4-ジフルオロベンジル)-N-トシルグリシナート(10.3g、25.0mmol、1当量)のTFA(50mL)中溶液を25℃で1時間撹拌した。混合物を真空中で濃縮し、粗生成物を25℃で20分間、MTBE(10mL)でトリチュレートし、N-(3,4-ジフルオロベンジル)-N-トシルグリシン(8.6g、24.1mmol、96%収率、99.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:356。
ステップD:N-(3,4-ジフルオロベンジル)-N-トシルグリシン(4.5g、12.7mmol、1当量)の(COCl)2(32.6g、257mmol、22.5mL、20.3当量)中溶液を55℃で2時間撹拌した。次いで、混合物をTLCでモニターした。撹拌が完了したら、混合物を真空中で濃縮し、残留物をDCM(45mL)に溶解した。混合物にAlCl3(8.44g、63.3mmol、3.46mL、5.0当量)を0℃で加え、25℃で1.5時間撹拌した。0℃でHCl(1M、25mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、次いで水(150mL)で希釈し、酢酸エチル(2×200mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1~2:1)により精製して、6,7-ジフルオロ-2-トシル-2,3-ジヒドロイソキノリン-4(1H)-オン(3.2g、8.42mmol、67%収率、88.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:338。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.67(dd,J=8.0,10.0Hz,1H),7.62(d,J=8.4Hz,2H),7.27(s,2H),7.08(dd,J=7.2,9.6Hz,1H),4.49(s,2H),4.02(s,2H),2.40(s,3H)。
ステップE:6,7-ジフルオロ-2-トシル-2,3-ジヒドロイソキノリン-4(1H)-オン(5.08g、15.1mmol、1当量)のEtOH(450mL)中溶液に、NaHCO3(21.0g、250mmol、9.72mL、16.6当量)のH2O(250mL)中溶液を加え、混合物を100℃で16時間撹拌した。次いで、混合物を真空中で濃縮し、得られた残留物に水(150mL)を加えた。水層を酢酸エチル(500mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空中で濃縮して、6,7-ジフルオロイソキノリン-4-オール(3.11g)を黄色固体として得た。粗生成物をさらに精製することなく使用した。LCMS[M+1]:182。1H NMR(400MHz,CD3OD)δ=8.68(s,1H),8.00-7.87(m,3H)。ステップF:6,7-ジフルオロイソキノリン-4-オール(1.50g、8.28mmol、1当量)、Et3N(5.03g、49.7mmol、6.92mL、6当量)、および4Åモレキュラーシーブ(1.5g)のDCM(75mL)中混合物に、25℃で10分間撹拌した。次いで、混合物を-40℃に冷却し、トリフルオロメタンスルホン酸無水物(3.50g、12.4mmol、2.05mL、1.5当量)のDCM(10mL)中溶液を滴加した。混合物を-40℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(50mL)でクエンチし、有機層を分離し、次いでブライン(90mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1~10/1)により精製して、6,7-ジフルオロイソキノリン-4-イルトリフルオロメタンスルホネート(668mg、1.94mmol、23%収率、90.8%純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:314。
ステップB:7-ベンジル-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール(40g、139mmol、1.0当量)のCHCl3(500mL)中溶液に、POCl3(128g、835mmol、77.6mL、6.0当量)を加えた。反応混合物を80℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空中で濃縮した。残留物を酢酸エチル(500mL)に溶解し、NaHCO3飽和水溶液(1L)中に注ぎ込んだ。得られた混合物を分離し、水層を酢酸エチル(2×500mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(300mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空中で濃縮して、粗製物を得た。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(5:1、石油エーテル/酢酸エチル)により精製して、7-ベンジル-4-クロロ-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(28g、90.6mmol、65%収率、99%純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:306。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.38-7.27(m,5H),3.71(s,2H),3.60(s,2H),2.80(s,4H),2.53(s,3H)。
ステップC:7-ベンジル-4-クロロ-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(23g、75.2mmol、1.0当量)およびDIEA(29.2g、226mmol、39.3mL、3.0当量)のDMAc(230mL)中溶液に、(S)-2-(ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(11.3g、90.3mmol、1.2当量)を加えた。反応混合物を80℃で3時間撹拌した。この後、(Boc)2O(49.2g、226mmol、51.8mL、3.0当量)を加え、混合物を80℃で1時間撹拌した。次いで、反応混合物を氷水(800mL)中に注ぎ込み、酢酸エチル(3×300mL)で抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮して、粗製物を得、これをシリカゲルクロマトグラフィー(3:1、石油エーテル:酢酸エチル)により精製して、tert-ブチル(S)-4-(7-ベンジル-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(32.8g、65.7mmol、87%収率、99%純度)を黄色油として得た。LCMS[M+1]:495。
ステップD:(S)-4-(7-ベンジル-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(35g、70.8mmol、1.0当量)およびDIEA(27.4g、212mmol、37.0mL、3.0当量)のDCE(700mL)中溶液に、1-クロロエチルカルボノクロリデート(25.3g、177mmol、2.5当量)を0℃で加えた。0~10℃で1時間撹拌後、混合物を真空中で濃縮した。残留物をMeOH(700mL)に溶解し、70℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空中で濃縮し、ほとんどのMeOHを除去した。残留MeOH層を石油エーテル(5×30mL)で洗浄した。層を真空中で濃縮し、酢酸エチル(50mL)および水(20mL)で希釈した。混合物をNaHCO3(飽和水溶液)でpH>7に塩基化し、酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、真空下で濃縮し、粗製物を得た。粗製物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、5:1、酢酸エチル/MeOH)により精製して、tert-ブチル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(24g、57.0mmol、80%収率、96%純度)を褐色固体として得た。LCMS[M+1]:405。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.52(br s,1H),4.32-4.20(m,1H),4.05-3.84(m,4H),3.75(br d,J=12.4Hz,1H),3.30-3.01(m,4H),2.99-2.88(m,1H),2.86-2.57(m,4H),2.43(s,3H),1.43(s,9H)。
ステップE:tert-ブチル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2g、4.94mmol、1.0当量)、4ÅMS(5g、4.94mmol、1.0当量)およびCs2CO3(4.03g、12.4mmol、2.5当量)のトルエン(40mL)中反応混合物に、8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート(2.44g、7.42mmol、1.5当量)、キサントホスPd G3(469mg、494μmol、0.1当量)およびキサントホス(572mg、989μmol、0.2当量)を加えた。反応混合物を窒素雰囲気下、110℃で24時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾過ケーキを酢酸エチル(2×20mL)で洗浄した。濾液を真空中で濃縮して、粗製物を得て、これをシリカゲルクロマトグラフィー(4:1、石油/酢酸エチル)、続いて逆相カラムクロマトグラフィー[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]により精製して、tert-ブチル(S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.8g、3.07mmol、62%収率、99.6%純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:583。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.77-7.73(m,1H),7.65-7.56(m,1H),7.46-7.38(m,1H),7.35-7.27(m,2H),4.63(br s,1H),4.41(dd,J=14.0,17.6Hz,1H),4.10-3.79(m,4H),3.61-3.52(m,1H),3.41-2.54(m,8H),2.52(d,J=2.0Hz,3H),1.52(s,9H)。
ステップF:tert-ブチル(S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3.6g、6.17mmol、1.0当量)のDCM(80mL)中溶液に、m-CPBA(1.73g、8.03mmol、80%純度、1.3当量)を0℃で加えた。反応混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をNaHCO3(飽和水溶液、3×50mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(メチルスルフィニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3.7g、5.56mmol、90%収率、90%純度)を褐色固体として得た。LCMS[M+1]:599。
ステップB:ベンジル2-(メチルチオ)-4-(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(3.84g、8.29mmol、1.0当量)のDMAc(60mL)中混合物に、DIEA(2.14g、16.6mmol、2.89mL、2.0当量)およびtert-ブチル(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.68g、7.46mmol、0.9当量)を加えた。混合物を15℃で30分間撹拌した。この後、混合物を酢酸エチル(70mL)で希釈し、水(300mL)で洗浄し、分離した。水相を酢酸エチル(1×70mL)で抽出し、有機層を飽和ブライン(2×50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空中で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1)により精製して、ベンジル(S)-4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(メチルチオ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(3.93g、6.86mmol、83%収率、94.0%純度)を黄色油として得た。LCMS[M+1]:539。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.41-7.31(m,5H),5.19(s,2H),4.74-4.56(m,2H),4.46(d,J=18.8Hz,1H),4.08-3.90(m,3H),3.84-3.71(m,1H),3.52-3.11(m,3H),3.05-2.91(m,2H),2.81-2.59(m,4H),2.50(s,3H),1.51(s,9H)。
ステップC:ベンジル(S)-4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(メチルチオ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(3.90g、7.24mmol、1.0当量)のジクロロメタン(40mL)中混合物に、m-CPBA(1.56g、7.24mmol、80%純度、1.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。次いで、混合物を飽和Na2CO3(水中、2×40mL)およびブライン(1×30mL)で洗浄し、次いで、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空中で濃縮して、ベンジル4-((S)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(メチルスルフィニル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(3.58g)を白色固体として得、これをさらに精製することなく使用した。LCMS[M+1]:555。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、347μmol、1.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、TFA(3.08g、27.0mmol、2.0mL、77.8当量)を加えた。混合物を20℃で10分間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。生成物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、粗製、TFA)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、339μmol、1.0当量、TFA)のDCM(2.0mL)中溶液に、DIEA(1.11g、8.61mmol、1.50mL、25.4当量)およびDCM(2.0mL)中の2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリド(200mg、1.84mmol、5.43当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~83%、12分)で精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例1、120mg、217μmol、2ステップで62%収率、98.9%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:548。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体73、400mg、695μmol、1.0当量)のDCM(0.50mL)中溶液に、TFA(3.08g、27.0mmol、2.0mL、38.9当量)を加えた。混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濃縮し、飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、次いで、DCM(5.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(400mg、粗製)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップB:2-[(2S)-1-(2-クロロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、631μmol、1.0当量)およびDIEA(245mg、1.89mmol、330μL、3.0当量)のDCM(1.0mL)中溶液に、2-クロロプロパ-2-エノイルクロリド(236mg、1.89mmol、3.0当量)を-78℃で加えた。混合物を-78℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物に飽和NaHCO3水溶液(2.0mL)を加え、EA(10.0mL×3)で抽出した。得られた生成物を、分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:53%~83%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-クロロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例2、4.72mg、8.35μmol、2ステップで1%収率、99.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:564。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1g、1.58mmol、1当量)のMeOH(60mL)中溶液に、Pd/C(500mg、10%純度)およびNH3・MeOH(20%、50mL)をN2下で加えた。この懸濁液に、H2により真空脱気およびパージを3回行った。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(680mg、1.26mmol、80%収率、92.3%純度)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:498。
ステップC:2-[(2S)-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。4-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシブタ-2-イン酸(172mg、803μmol、2当量)およびDIEA(155mg、1.21mmol、210μL、3当量)のMeCN(5mL)中溶液に、MsCl(92.1mg、803μmol、62.2μL、2当量)を0℃で加えた。0℃で20分間撹拌した後、混合物に、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、402μmol、1当量)を加え、混合物を25℃で2時間撹拌した。次いで、反応混合物を80℃まで加熱し、10時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC((カラム:Boston Green ODS 150*30 5u;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~45%、10分)により精製し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)によりさらに精製した。標記化合物である2-[(2S)-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例3、1.43mg、2.39μmol、1%収率、96.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:580。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体73、200mg、347μmol、1.0当量)のジオキサン(2.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4.0M、2.0mL、23.0当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、EA(5.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。生成物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(160mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(160mg、336μmol、1.0当量)のDCM(6.0mL)中溶液に、Py(532mg、6.73mmol、543μL、20.0当量)およびDCM(2.0mL)中の(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(246mg、1.35mmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、0℃でMeOH(5.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、減圧下で濃縮して残留物を得た。生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、粗製)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:622。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、321μmol、1.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、K2CO3(88.8mg、642μmol、2.0当量)、KI(2.67mg、16.1μmol、0.05当量)、および3-フルオロピロリジン(403mg、3.21mmol、10.0当量、HCl塩)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を、飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、EA(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.04%NH3H2O)-ACN];B%:60%~84%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮し、次いで、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例5、123mg、193μmol、3ステップで56%収率、99.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:631。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、528μmol、1当量、HCl)のDCM(5mL)中溶液に、DIEA(1.73g、13.4mmol、2.33mL、25.4当量)およびDCM(5mL)中の2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリド(286mg、2.64mmol、5当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、ジクロロメタン/メタノール=10/1~10/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)で精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%~50%、10.5分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例7、24.1mg、36.7μmol、7%収率、99.1%純度、FA)を褐色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.04-6.89(m,1H),6.12(qd,J=2.0,16.0Hz,1H),5.14-4.94(m,2H),4.22(q,J=6.8Hz,2H),1.30(t,J=6.8Hz,3H)。
ステップB:(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸。エチル(E)-4-フルオロブタ-2-エノエート(0.10g、粗製)およびNaOH(121mg、3.03mmol)のTHF(1.00mL)およびH2O(1.00mL)中混合物を、25℃で2時間撹拌した。pH値をHCl(1N、5.00mL)により1~3に調整し、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(0.02g、192mmol、2ステップで46%)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.37-7.31(m,1H),7.15-7.01(m,1H),6.15(dd,J=1.6,16.0Hz,1H),5.22-4.96(m,2H)。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(7.32mg、70.4μmol、2当量)およびPy(8.35mg、106μmol、8.52μL、3.00当量)のアセトニトリル(1.00mL)中溶液に、MsCl(8.06mg、70.4μmol、5.45μL、2.00当量)を0℃で加えた。0℃で1時間撹拌した後、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.02g、35.2μmol、1.00当量、HCl)を混合物に加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。混合物を水(5.00mL)で希釈し、酢酸エチル(3×5.00mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)で精製した。所望の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例8、3.01mg、4.82μmol、14%収率、98.9%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:618。
ステップA:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、150mg、282μmol、1.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、Py(446mg、5.64mmol、455μL、20.0当量)およびDCM(1.0mL)中の(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(207mg、1.13mmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)を褐色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:680。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、221μmol、1.0当量)のDCM(10.0mL)中溶液に、K2CO3(366mg、2.65mmol、12.0当量)、KI(1.83mg、11.0μmol、0.05当量)、および3-フルオロピロリジン(277mg、2.21mmol、10.0当量、HCl)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、EA(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.04%NH3・H2O)-ACN];B%:60%~84%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例9、9.67mg、14.0μmol、6%収率、99.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:687。
ステップA:中間体71、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(310mg、414μmol、1.0当量)のジオキサン(4.0mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4.0M、4.0mL、39.0当量)を25℃で加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、飽和NaHCO3水溶液(20.0mL)により反応混合物をクエンチし、次いで、EA(3×40.0mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和NaCl水溶液(100.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、残留物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(250mg、粗製)を黄色固体として得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:532。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、150mg、282μmol、1.0当量、粗製)のDCM(6.0mL)中溶液に、Py(446mg、5.6mmol、455μL、20.0当量)およびDCM(1.0mL)中の(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(207mg、1.2mmol、4.0当量、粗製)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。次いで、K2CO3(779mg、5.6mmol、20.0当量)、KI(4.6mg、28.2μmol、0.1当量)、および3-フルオロアゼチジン(472mg、4.2mmol、15.0当量、HCl)を0℃で加えた。次いで、混合物を25℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10.0mMのNH4HCO3)-ACN];B%:55%~85%、10分)および凍結乾燥により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例10、10.8mg、15.7μmol、6%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:673。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.77(d,J=8.0Hz,1H),7.63(t,J=7.8Hz,1H),7.54(d,J=7.2Hz,1H),7.50-7.43(m,1H),7.35(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.21(m,1H),6.89(d,J=15.2Hz,1H),6.42(d,J=14.8Hz,1H),5.26-4.62(m,1H),5.11(t,J=5.2Hz,1H),4.80-4.37(m,2H),4.20-4.08(m,2H),3.92(br d,J=17.6Hz,1H),3.86-3.71(m,3H),3.60(s,1H),3.52-3.47(m,1H),3.45-3.33(m,1H),3.28-3.21(m,3H),3.16-3.11(m,3H),3.03(dd,J=8.4,16.8Hz,1H),2.82-2.60(m,4H),2.49(d,J=2.8Hz,3H),2.37-2.25(m,1H),2.09-2.03(m,1H),1.86-1.83(m,1H),1.78-1.76(m,3H)。
ステップA:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、188μmol、1.0当量)およびピリジン(119mg、1.50mmol、121μL、8.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(138mg、752μmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(130mg、粗製)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:678、680。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-[メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ]ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(128mg、189μmol、1.0当量)、K2CO3(130mg、943μmol、5.0当量)、およびKI(9.39mg、56.6μmol、0.30当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、2,2,2-トリフルオロ-N-メチル-エタンアミン(213mg、1.88mmol、10.0当量)を少しずつ加えた。混合物を0~25℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.04%のNH3・H2O)-ACN];B%:70%~100%、10分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-[メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ]ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例11、2.87mg、3.84μmol、2%収率、95%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:711。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=6.05-5.87(m,1H),5.86-5.72(m,1H),4.11-4.01(m,2H),2.57(dd,J=4.0,15.6Hz,1H),2.38(dd,J=9.2,15.6Hz,1H),1.21-1.17(m,3H)。
ステップ2:エチル(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノエート。エチル4,4-ジフルオロ-3-ヒドロキシ-ブタノエート(3.00g、粗製)のジクロロメタン(20.0mL)中溶液に、TEA(1.81g、17.8mmol、2.48mL)およびMsCl(3.68g、32.1mmol、2.49mL)を0℃で加えた。4時間撹拌した後、混合物に、TEA(3.61g、35.68mmol、4.97mL、2当量)を0℃で加えた。25℃まで温め、12時間撹拌した後、混合物を水(10.0mL)で希釈し、HCl(1N、1×20.0mL)およびブライン(1×20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、エチル(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノエート(1.40g、9.33mmol、2ステップで44%収率)を無色油として得、さらに精製して次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.81(m,1H),6.29(dt,J=2.8,1.6Hz,1H),6.23(dd,J=4.0,55.2Hz,1H),4.25(q,J=7.2Hz,2H),1.31(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップ3:(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エン酸。エチル(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノエート(1.30g、8.66mmol、1.00当量)およびNaOH(1.39g、34.6mmol、4.00当量)のTHF(5.00mL)およびH2O(5.00mL)中混合物を25℃で2時間撹拌した。混合物をHCl(2N、20.0mL)によりpH=1~3に酸性化し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エン酸(0.35g、2.87mmol、33%収率)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エン酸(68.8mg、564μmol、1.50当量)、EDCI(108mg、564μmol、1.50当量)、およびHOBt(50.8mg、376μmol、1.00当量)のPy(3mL)中混合物を0℃で15分間撹拌し、次いで、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、0.20g、376μmol、1.00当量)を混合物に加えた。0℃で1時間および25℃で1時間撹拌した後、混合物を水(10.0mL)で希釈し、酢酸エチル(1×10.0mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。所望の画分を集め、混合物を飽和重炭酸ナトリウム(5.00mL)で中和し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)で精製した。所望の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例13、66.9mg、104μmol、28%収率、98.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:636。
ステップ2:エチル2-(メトキシメチル)プロパ-2-エノエート。1-(2-(エトキシカルボニル)アリル)-1,4-ジアザビシクロ[2.2.2]オクタン-1-イウムブロミド(15g、49.6mmol、1当量)およびTEA(10.5g、104mmol、14.5mL、2.09当量)のMeOH(150mL)中混合物を25℃で16時間撹拌した。溶媒を真空下で留去した(25℃)。残留物をDCM(40ml)中に溶解し、次いで、5%クエン酸水溶液(1×40mL)および飽和重炭酸ナトリウム水溶液(1×40mL)で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、25℃で真空下で濃縮して、エチル2-(メトキシメチル)プロパ-2-エノエート(5.3g、36.8mmol、74%収率)を黄色の液体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップ3:2-(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸。エチル2-(メトキシメチル)プロパ-2-エノエート(5.1g、35.4mmol、1当量)のTHF(71mL)中溶液に、NaOH(5.66g、142mmol、4当量)のH2O(71mL)中溶液を5℃で加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、THFを真空下で留去した。混合物を、1MのHClでpH3に調整し、EtOAc(3×70mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、2-(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸(3.4g、26.4mmol、収率75%、90%純度)を淡黄色液体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5.4g、8.915mmol)をジクロロメタン(89.15ml、8.915mmol)に溶解し、塩酸(1,4-ジオキサン中4.0Mの溶液)(11.14ml、44.57mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。反応物をより多くのDCMおよび1MのNaOHで希釈し、層を分離した。次に有機成分をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空中で濃縮して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.364g、8.631mmol、96.82%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 506.3 [M+H]+。
ステップC:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:丸底フラスコ中で、ジオキサン(43.15ml、8.631mmol)中のベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.364g、8.631mmol)の溶液を、アルゴンにより5分間スパージした。1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼン(5.851ml、43.15mmol)、Cs2CO3(14.06g、43.15mmol)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.7348g、0.8631mmol)を、アルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で加熱した。反応物を室温まで冷却する。酢酸エチルを加え、反応物をGF/F濾紙を通して濾過し、真空中で濃縮した。濃縮物を、2%NH4OHを含有するDCM中0~15%のMeOHを溶出液として使用したCombiFlash上での順相クロマトグラフィーにより2回精製した。所望の生成物を含有する画分を集め、真空中で濃縮して、2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.411g、0.8641mmol、100.1%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 476.3 [M+H]+。
ステップD:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(200mg、0.420mmol)、4,4,4-トリフルオロクロトン酸(118mg、0.841mmol)、DIEA(367μl、2.10mmol)のDCM(4205μl、0.420mmol)中溶液に、HATU(240mg、0.631mmol)を加え、得られた混合物を室温で5時間撹拌した。反応混合物はブラインで洗浄し、水層をDCM(2×)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濃縮し、60:40のACN:H2O中に希釈し、水/0.1%TFA中の5~95%のACN/0.1%TFAにより溶出するGilson(逆分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩を用いて塩基を遊離させて、有機成分をDCMで抽出した。有機成分をNa2SO4上で乾燥し、真空中で濃縮して、標記化合物である2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例15、28mg、0.0468mmol、11.1%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 598.3 [M+H]+。
ステップB:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:THF(30mL)中のベンジル(S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.17g、0.255mmol)の溶液を、N2によりパージし、続いて、Pd/C(0.0272g、0.255mmol)を加えた。反応物を真空で排気し、H2で3回充填し、混合物を室温で3日間撹拌した。反応物をN2により再びパージし、続いて、セライトを通して濾過し、濾液を真空中で濃縮した。物質を粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 532.2 [M+H]+。
ステップC:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.055g、0.10mmol)のDCM(20mL)中溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.040g、0.31mmol)、(E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エン酸(0.017g、0.12mmol)、および1-プロパンホスホン酸環状無水物(0.033g、0.10mmol)を加え、反応物を室温で30分間撹拌した。次に、TEP3および酸(0.24mmol)を加え、反応物をさらに1時間。次に、有機成分を1N NaOH、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、真空中で濃縮した。物質を、順相シリカ(1~10%(MeOH+2%NH4OH)/DCM)上で2回クロマトグラフ処理し、続いて、0.1%のTFAを添加剤として含有する5~95%ACN/水を使用したgilson逆分取HPLCにより精製した。純粋な画分を、塩基性水中に注ぎ込み、EtOAc中に抽出した。有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、真空中で濃縮して、標記化合物である2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例19、0.0094g、0.014mmol、14%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 654.2 [M+H]+。
ステップB:(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エン酸:エチル(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エノエート(382mg、2.23mmol)をメタノール(8mL)で希釈し、続いて、NaOH(4463μl、8.93mmol)を加えた。4時間撹拌後、反応物を2N HCl(4.5mL)で希釈し、酢酸エチルで抽出した。酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エン酸を得た。
ステップC:(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-N,N-ジメチル-4-オキソブタ-2-エナミド:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(30mg、0.05863mmol)をDMFで希釈し、続いて、(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エン酸(10.07mg、0.07036mmol)、DIEA(20.48μl、0.1173mmol)、および1-プロピルホスホン酸環状無水物(52.35μl、0.08795mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-N,N-ジメチル-4-オキソブタ-2-エナミド(実施例28、3.7mg、0.005810mmol、9.910%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 637.3 [M+H]+。
ステップB:(E)-4-アミノ-4-オキソブタ-2-エン酸:エチル(E)-3-シアノアクリレート(300mg、2.40mmol)をHCl(3996μl、24.0mmol)で希釈した。反応物を窒素下に置き、100℃まで4時間加熱した。反応物を放冷し、次いで、濃縮して、(E)-4-アミノ-4-オキソブタ-2-エン酸(214mg、1.86mmol、77.6%収率)を得た。
ステップC:(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エナミド:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(20mg、0.039mmol)、HATU(30mg、0.078mmol)、および(E)-4-アミノ-4-オキソブタ-2-エン酸(9.0mg、0.078mmol)をDMF(400μL)で希釈し、続いて、DIEA(14μl、0.078mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エナミド(実施例29、2.9mg、0.0048mmol、12%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 609.3 [M+H]+。
ステップB:(E)-3-シアノアクリル酸:エチル(E)-3-シアノアクリレート(10mg、0.080mmol)をHCl(133μl、0.80mmol)で希釈し、窒素下に置き、100℃まで加熱した。15分間撹拌後、反応物を濃縮して、(E)-3-シアノアクリル酸(7.5mg、0.077mmol、97%収率)を得た。
ステップC:(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(20mg、0.03909mmol)および(E)-3-シアノアクリル酸(5.312mg、0.05472mmol)をDMF(400μL)で希釈し、続いて、DIEA(13.65μl、0.07817mmol)および1-プロピルホスホン酸環状無水物(34.90μl、0.05863mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル(実施例30、3.5mg、0.005925mmol、15.16%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 591.3 [M+H]+。
ステップB:(Z)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(20mg、0.03909mmol)および(Z)-3-シアノアクリル酸(6.071mg、0.06254mmol)をDMF(400μL)で希釈し、続いて、DIEA(13.65μl、0.07817mmol)および1-プロピルホスホン酸環状無水物(39.56μl、0.06645mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である(Z)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル(実施例31、2.1mg、0.003555mmol、9.095%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 591.3 [M+H]+。
ステップA:tert-ブチルN-[(E)-4-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-3-フルオロ-4-オキソ-ブタ-2-エニル]-N-メチル-カルバメート。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、300mg、564μmol、1当量)、(E)-4-[tert-ブトキシカルボニル(メチル)アミノ]-2-フルオロ-ブタ-2-エン酸(600mg、2.57mmol、4.56当量)、およびDIEA(729mg、5.64mmol、982μL、10当量)のDCM(10mL)中溶液に、HATU(643mg、1.69mmol、3当量)を0℃で加えた。反応混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(3mL)でクエンチし、DCM(3×8mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆フラッシュクロマトグラフィー(FA条件:水中の60%MeCN(0.1%FA))により精製して、tert-ブチルN-[(E)-4-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-3-フルオロ-4-オキソ-ブタ-2-エニル]-N-メチル-カルバメート(330mg、404μmol、72%収率、91.5%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:747。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-2-フルオロ-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチルN-[(E)-4-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-3-フルオロ-4-オキソ-ブタ-2-エニル]-N-メチル-カルバメート(300mg、401μmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(915mg、8.03mmol、594μL、20当量)を加えた。反応混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をDCM(10mL)により希釈し、飽和NaHCO3(8mL)により塩基化した。混合物をDCM(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-2-フルオロ-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(240mg、356μmol、89%収率、95.9%純度)を褐色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:647。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)-2-フルオロ-ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-2-フルオロ-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、185μmol、1当量)、およびパラホルムアルデヒド(83.5mg、927μmol、5当量)、HCOOH(26.7mg、556μmol、3当量)のMeOH(5mL)中溶液に、NaBH3CN(35.0mg、556μmol、3当量)を加えた。この反応混合物を25℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(0.5mL)でクエンチし、濾過した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EA:MeOH:NH3・H2O=50:1:0~10:1:0.1)、次いで、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:50%~100%、10分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)-2-フルオロ-ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例32、26.7mg、40.2μmol、22%収率、99.5%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:661。
ステップB:2-((S)-1-((E)-4-(1H-ピラゾール-1-イル)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(42.37mg、0.08281mmol)、(E)-4-(1H-ピラゾール-1-イル)ブタ-2-エン酸(12.6mg、0.08281mmol)、およびN,N-ジメチルホルムアミド(1mL、12.79mmol)の撹拌混合物を撹拌しながら氷塩浴上で冷却し、トリエチルアミン(0.03463mL、0.2484mmol)を1度に加え、続いて、EtOAc(0.07395mL、0.1242mmol)中50%の2,4,6-トリプロピル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリホスフィナン2,4,6-三酸化物を加えた。反応混合物を5分にわたって室温まで温め、室温で一晩撹拌した。反応混合物を0.5MのNa2CO3(5mL)とEtOAc(10mL)との間で分配し、有機成分を分離し、有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空中で留去した。生成物を、DCM中の5%MeOH+0.5%NH4OHを使用したシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、標記化合物を無色固体として得た(実施例38、11.46mg、23%)。ESI+APCI MS m/z 646.3 [M+H]+。
ステップB:2-((S)-1-((E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(100mg、0.1954mmol)、(2E)-4-ヒドロキシブタ-2-エン酸(39.90mg、0.3909mmol)、およびN-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.06809ml、0.3909mmol)のDCM(5mL)中撹拌溶液に、O-(7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(111.5mg、0.2932mmol)を1度に加え、反応混合物を室温で4時間撹拌した。水(1mL)を加え、反応混合物を5分間撹拌し、EtOAc(10mL)と飽和NaHCO3(5mL)との間で分配した。有機層を分離し、NaHCO3、ブライン(各5mL)で洗浄し、K2CO3上で乾燥し、真空中で留去した。残留物を、5%MeOH+0.5%NH4OHでシリカゲルクロマトグラフィーにかけた。無色固体としての標記化合物(実施例39、29mg、25%)。ESI+APCI MS m/z 596.3 [M+H]+。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.81(s,3H),3.28(s,6H),1.52(s,3H)。
ステップB:メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート。メチル2,2-ジメトキシプロパノエート(2.00g、13.5mmol、1.00当量)のDMF(20.0mL)中溶液に、P2O5(1.05g、7.42mmol、458μL、0.55当量)を少しずつ加えた。100℃に1時間加熱した後、混合物を飽和重炭酸ナトリウム(20.0mL)で希釈し、イソプロピルエーテル(3×30.0mL)で抽出し、ブライン(3×40.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を油ポンプ下で蒸留して、メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート(0.65g、5.60mmol、41%収率)を無色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
ステップC:2-メトキシプロパ-2-エン酸。メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート(0.60g、5.17mmol、1.00当量)およびNaOH(827mg、20.7mmol、4.00当量)のH2O(5.00mL)およびTHF(5.00mL)中混合物を、60℃で1時間撹拌した。濃HCl(10.0mL)により混合物をpH<3に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-メトキシプロパ-2-エン酸(0.40g、1.96mmol、38%収率、50%純度)を淡紅色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.63(br s,1H),5.52(d,J=2.8Hz,1H),4.75(d,J=2.8Hz,1H),3.70(s,3H)。
ステップD:2-[(2S)-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.14g、274μmol、1.00当量)、2-メトキシプロパ-2-エン酸(112mg、1.09mmol、4.00当量)、およびDIEA(141mg、1.09mmol、191μL、4.00当量)のジクロロメタン(5.00mL)中溶液に、HATU(208mg、547μmol、2.00当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌後、混合物を水(3.00mL)で希釈した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.10%)/アセトニトリル]および分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~90%、12分)により精製した。所望の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例41、10.27mg、17.22μmol、6.3%収率、99.9%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:596。
ステップ2:(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノエート。エチル(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノエート(900mg、粗製)、[クロロ(ジフェニル)メチル]ベンゼン(2.89g、10.4mmol)、DMAP(84.5mg、692μmol)、TEA(1.4g、13.8mmol、1.9mL)のDCM(5.0mL)中混合物に、N2により脱気およびパージを3回行い、次いで、混合物を、N2雰囲気下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、H2O(10.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20:1~15:1)により精製した。化合物であるエチル(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノエート(340mg、913μmol、13%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.38-7.35(m,6H),7.26-7.22(m,6H),7.18-7.15(m,3H),6.88(dt,J=15.6,3.6Hz,1H),6.29(dt,J=15.6,2.2Hz,1H),4.16(q,J=7.1Hz,2H),3.72(dd,J=2.4,2.0Hz,2H),1.25(t,J=7.0Hz,3H)。
ステップ3:(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エン酸。エチル(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノエート(170mg、456μmol、1.0当量)のMeOH(1.0mL)中溶液に、NaOH(54.5mg、1.37mmol、3.0当量)のH2O(0.5mL)中溶液を加え、次いで、混合物を、N2雰囲気下、40℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、0℃で1MのHClをpH=5まで加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(8.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3:1~1:1)により精製した。化合物である(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エン酸(113mg、328μmol、72%収率)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.38-7.36(m,6H),7.26-7.24(m,5H),7.20-7.16(m,4H),7.0(dt,J=15.6,3.6Hz,1H),6.32(dt,J=15.6,2.0Hz,1H),3.76(dd,J=3.2,2.4Hz,2H)。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、60.0mg、113μmol、1.0当量)、(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エン酸(77.8mg、226μmol、2.0当量)、およびDIEA(73.0mg、564μmol、98μL、5.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、HATU(64mg、169μmol、1.5当量)を、N2下、0℃で1度に加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、H2O(8.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)を黄色固体として得、粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:858。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)のDCM(1.0mL)中溶液に、TFA(1.0ml、13.5mmol)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、0℃でNaHCO3水溶液をpH=8まで加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:48%~72%、10分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例42、8.21mg、13.3μmol、7.6%収率、99.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.68(d,J=8.0Hz,1H),7.70-7.33(m,1H),7.49(dd,J=6.8,0.8Hz,1H),7.37(dt,J=11.98,7.82Hz,1H),7.26(t,J=11.8Hz,1H),7.19-7.11(m,1H),6.99(dt,J=14.8,3.4Hz,1H),6.56(br s,1H),5.02-4.57(m,1H),4.39-4.29(m,4H),4.12-4.06(m,1H),4.03-3.99(m,2H),3.85-3.72(m,2H),3.67-3.36(m,3H),3.24-3.09(m,2H),3.03-2.89(m,3H),2.73(br s,1H),2.63-2.61(m,1H),2.50(br s,1H),2.41(s,3H),2.25-2.19(m,1H),2.03-1.92(m,1H),1.70-1.60(m,3H)。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.81(s,3H),3.28(s,6H),1.52(s,3H)。
ステップ2:メチル2-メトキシプロパ-2-エノエート。メチル2,2-ジメトキシプロパノエート(2.00g、13.5mmol、1.00当量)のDMF(20.0mL)中溶液に、P2O5(1.05g、7.42mmol、458μL、0.55当量)を少しずつ加えた。100℃で1時間撹拌後、混合物を飽和重炭酸ナトリウム(20.0mL)で希釈し、イソプロピルエーテル(3×30.0mL)で抽出した。抽出物をブライン(3×40.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を真空下で蒸留して、メチル2-メトキシプロパ-2-エノエート(0.65g、5.60mmol、41%収率)を無色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=5.36(d,J=2.8Hz,1H),4.63(d,J=2.8Hz,1H),3.81(s,3H),3.66(s,3H)。
ステップ3:2-メトキシプロパ-2-エン酸。メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート(0.60g、5.17mmol、1.00当量)およびNaOH(827mg、20.7mmol、4.00当量)のH2O(5.00mL)およびTHF(5.00mL)中混合物を、60℃で1時間撹拌した。濃HCl(10.0mL)により混合物をpH<3に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-メトキシプロパ-2-エン酸(0.40g、1.96mmol、38%収率、50%純度)を淡紅色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.63(br s,1H),5.52(d,J=2.8Hz,1H),4.75(d,J=2.8Hz,1H),3.70(s,3H)。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.20g、376μmol、1.00当量)、2-メトキシプロパ-2-エン酸(153mg、1.50mmol、4.00当量)、およびDIEA(194mg、1.50mmol、262μL、4.00当量)のジクロロメタン(5.00mL)中溶液に、HATU(286mg、752μmol、2.00当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌した後、反応物を逆相フラッシュ[水(FA、0.1%)/アセトニトリル]、分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5u;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~45%。7.8分)、およびさらなる分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~79%、10分)により精製した。所望の画分を集め、凍結乾燥し、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例43、30.1mg、48.9μmol、13%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、228μmol、1.0当量)およびK2CO3(315mg、2.28mmol、10.0当量)のアセトニトリル(2.0mL)中溶液に、3-フルオロアゼチジン(152mg、1.37mmol、6.0当量、HCl)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物に水(5.0mL)を加え、酢酸エチル(5.0mL×4)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~90%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例44、45.0mg、66μmol、29%収率、96%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:653。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.46-7.31(m,5H),5.23(s,2H),4.74-4.49(m,2H),4.43-4.27(m,2H),4.21-3.70(m,5H),3.42-3.17(m,3H),3.09(t,J=7.6Hz,1H),2.98(td,J=3.6,12.4Hz,1H),2.86-2.74(m,1H),2.74-2.54(m,4H),2.47(s,3H),2.35-2.21(m,1H),2.05-1.97(m,1H),1.90-1.74(m,3H),1.49(s,9H)。
ステップB:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.7g、6.11mmol、1当量)のジオキサン(20mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、22.9mL、15当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。液体をデカントし、固体を集めた。固体残留物を水(50mL)およびジクロロメタン(100mL)で希釈し、混合物を飽和Na2CO3水溶液でpH約8に塩基化し、ジクロロメタン(100mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.6g、4.89mmol、80%収率、95%純度)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:506。
ステップC:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.3g、4.55mmol、1当量)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(中間体69、1.31g、5.91mmol、1.3当量)、Cs2CO3(3.71g、11.4mmol、2.5当量)、Pd2(dba)3(833mg、909μmol、0.2当量)、およびキサントホス(1.05g、1.82mmol、0.4当量)のトルエン(50mL)中混合物に、N2により脱気およびパージを3回行い、次いで、混合物を、N2雰囲気下、90℃で6時間撹拌した。反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1~10/1)により精製した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.6g、2.48mmol、54%収率)を黄色固体として得た。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.60g、2.48mmol、1.00当量)のMeOH(20.0mL)およびNH3(MeOH中20%w/w、7mL)中混合物を、H2(4.99mg、2.48mmol、1.00当量、15psi)下、25℃で触媒としてのPd/C(100mg、2.48mmol、10%純度、1.00当量)により3時間水素添加した。触媒をセライトパッドを通して濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮した。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.20g、2.35mmol、95%収率)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップE:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(140mg、274μmol、1.00当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(73.9mg、821μmol、3.00当量)のジクロロメタン(3.00mL)中混合物に、DIEA(212mg、1.64mmol、286μL、6.00当量)、HATU(312mg、821μmol、3.00当量)を、N2下、0℃で1度に加えた。0℃で30分間撹拌後、反応混合物を水(10.0mL)で希釈し、ジクロロメタン(2×10.0mL)で抽出した。合わせた有機層を水(1×10.0mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:55%~85%、10分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例45、48.7mg、82.1μmol、30%収率、98.4%純度)を白色固体として得た。
SFC条件:「カラム:Chiralcel OJ-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.62(m,2H),7.45-7.31(m,2H),7.27-7.17(m,2H),5.53-5.34(m,1H),5.26(dd,J=3.6,17.2Hz,1H),4.88(br s,1H),4.41-4.32(m,1H),4.31-4.22(m,1H),4.21-4.10(m,2H),4.10-4.02(m,1H),3.89(br d,J=18.0Hz,1H),3.78(d,J=18.4Hz,1H),3.59-3.40(m,2H),3.27-3.15(m,2H),3.14-3.04(m,2H),3.03-2.90(m,4H),2.90-2.73(m,2H),2.72-2.56(m,2H),2.47(d,J=4.8Hz,3H),2.33-2.23(m,1H),2.11-1.98(m,1H),1.90-1.74(m,3H)。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80mg、95.5μmol、1当量)のジクロロメタン(200μL)中溶液に、TFA(218mg、1.91mmol、141μL、20当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を水(5mL)で希釈して、NaHCO3水溶液(2mL)でpH約8に塩基化した。混合物をジクロロメタン(5mL×3)で抽出した。合わせた有機層を、ブライン(3mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製した。混合物を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例46、10.2mg、16.8μmol、18%収率、98.5%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:596。
SFC条件:カラム:Chiralcel OD-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2中の40%メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.61(m,2H),7.46-7.30(m,2H),7.27-7.16(m,2H),7.06(d,J=14.8Hz,1H),6.62(br d,J=13.6Hz,1H),5.25-4.53(m,1H),4.48-4.32(m,3H),4.30-3.95(m,4H),3.93-3.82(m,1H),3.81-3.61(m,1H),3.59-3.39(m,2H),3.30-2.96(m,5H),2.92(s,3H),2.87-2.53(m,4H),2.47(d,J=4.0Hz,3H),2.34-2.21(m,1H),2.13-1.99(m,1H),1.98-1.82(m,3H)。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ5.30-5.10(m,1H),4.58-4.37(m,1H),3.94-3.76(m,1H),3.75(s,3H),3.72-3.55(m,1H),2.54-2.23(m,2H),1.52-1.40(m,9H)。
ステップ2:[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール:O1-tert-ブチルO2-メチル(2R,4R)-4-フルオロピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(300mg、1.21mmol、1.0当量)のTHF(3.0mL)中溶液に、LiAlH4(138mg、3.64mmol、3.0当量)を-40℃で加えた。混合物をこの温度で1時間撹拌し、次いで、70℃に加熱し、70℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2SO4水溶液(0.30mL)でクエンチし、次いで、濾過した。母液を集め、真空下で濃縮して、生成物である[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(130mg、976μmol、80%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ5.18-4.98(m,1H),3.76-3.70(m,1H),3.54-3.43(m,1H),3.38-3.28(m,1H),2.51-2.44(m,1H),2.42-2.37(m,1H),2.35(s,3H),2.34-2.26(m,1H),2.21-2.09(m,1H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(103mg、773μmol、2.0当量)およびt-BuONa(55.8mg、580μmol、1.50当量)のトルエン(2.0mL)中溶液に、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、387μmol、1.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物に水(10.0mL)を加え、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュHPLC(C18、水中0.1%FA、0~60%MeCN)により精製して、生成物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、316μmol、82%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:664。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.70(br d,J=8.4Hz,1H),7.65(t,J=8.6Hz,1H),7.45-7.32(m,7H),7.26-7.17(m,2H),5.24-5.02(m,3H),4.73-4.61(m,1H),4.53-4.42(m,1H),4.30-4.18(m,2H),4.11-3.96(m,2H),3.94-3.81(m,1H),3.81-3.67(m,1H),3.58-3.47(m,1H),3.46-3.29(m,2H),3.24-3.06(m,3H),3.05-2.96(m,1H),2.92(s,3H),2.82-2.71(m,2H),2.70-2.51(m,2H),2.50-2.47(m,4H),2.45-2.35(m,1H),2.12-2.05(m,1H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、301μmol、1.0当量)およびNH3・MeOH(2.0mL、20%純度)のメタノール(4.0mL)中溶液に、Pd/C(80mg、10%純度)を加えた。混合物を、N2により3回パージし、次いで、H2(15Psi)雰囲気下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトを通して濾過した。母液を真空下で濃縮して、生成物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(140mg、264μmol、88%収率)を黄色油として得た。生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:664。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、226μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(61.2mg、680μmol、3.0当量)、およびDIEA(176mg、1.36mmol、238μL、6.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、HATU(258.44mg、679.69μmol、3当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物に水(5.0mL)を加え、酢酸エチル(5.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例47、37.9mg、60.1μmol、27%収率、96%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:602。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.70(br d,J=8.0Hz,1H),7.65(t,J=8.2Hz,1H),7.45-7.37(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.18(m,2H),5.53-5.32(m,1H),5.30-5.22(m,1H),5.21-5.03(m,1H),4.97-4.68(m,1H),4.52-4.42(m,1H),4.29-4.20(m,2H),4.18-4.03(m,2H),3.95-3.68(m,2H),3.60-3.41(m,2H),3.39-3.30(m,1H),3.26-3.15(m,2H),3.15-2.95(m,2H),2.92(s,3H),2.90-2.54(m,4H),2.53-2.46(m,4H),2.45-2.35(m,1H),2.13-1.97(m,1H)。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.45-4.26(m,1H),3.96-3.89(m,1H),3.72(s,3H),3.68-3.55(m,1H),3.54-3.43(m,1H),3.27(s,3H),2.38-2.17(m,2H),1.51-1.37(m,9H)。
ステップ2:[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール。O1-tert-ブチルO2-メチル(2R,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(2.98g、11.5mmol、1当量)のTHF(60mL)中溶液に、LiAlH4(872mg、23.0mmol、2当量)を0℃で加え、混合物を0℃で1時間撹拌した。次いで、反応混合物を80℃まで加熱し、2時間撹拌した。混合物を飽和Na2SO4水溶液(3mL)でクエンチし、次いで、濾過し、濾過ケーキをTHF(3×20mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(1.53g、10.0mmol、87%収率、95.0%純度)を褐色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.82-3.76(m,1H),3.69(dd,J=3.2,11.2Hz,1H),3.45(dd,J=1.6,10.8Hz,1H),3.29(s,3H),3.18(d,J=10.4Hz,1H),2.62(br s,1H),2.42(tdd,J=2.8,6.4,9.2Hz,1H),2.38-2.33(m,1H),2.32(s,3H),2.16(ddd,J=6.8,8.8,14.0Hz,1H),1.92(tdd,J=1.6,6.8,14.0Hz,1H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(1.37g、9.42mmol、2.8当量)のトルエン(40mL)中溶液に、t-BuONa(970mg、10.1mmol、3当量)を0℃で加え、次いで、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2g、3.36mmol、1当量)を0℃で加え、反応混合物を0℃で0.5時間撹拌した。水(20mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=57%)により精製して、(ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.8g、2.53mmol、75%収率、95.0%純度))を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:676。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.60(m,2H),7.47-7.31(m,7H),7.27-7.16(m,2H),5.21(s,2H),4.67(br s,1H),4.45(br dd,J=4.4,10.0Hz,1H),4.24-4.16(m,2H),4.10-3.96(m,2H),3.96-3.65(m,3H),3.59-3.40(m,2H),3.29(d,J=1.6Hz,3H),3.25-3.06(m,4H),3.00(dt,J=3.6,12.4Hz,1H),2.91(s,3H),2.81-2.55(m,4H),2.45(d,J=6.0Hz,3H),2.42-2.29(m,2H),1.88-1.68(m,2H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2g、2.96mmol、1当量)およびNH3・MeOH(20mL、20%純度)のMeOH(40mL)中溶液に、Pd/C(1g、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に、H2により真空脱気およびパージを数回行った。混合物をH2(15psi)下、20℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.29g、2.26mmol、76%収率、95%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:542。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、277μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(74.8mg、831μmol、3当量)、およびTEA(336mg、1.66mmol、462μL、50%純度、6当量)のEtOAc(3mL)中溶液に、T3P(264mg、831μmol、247μL、3当量)を0℃で加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。水(4mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(3×8mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=32%)により精製した。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例48、59.5mg、97.0μmol、35%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:614。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(br d,J=8.4Hz,1H),7.65(t,J=8.0Hz,1H),7.45-7.38(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),5.53-5.33(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.88(br s,1H),4.50-4.41(m,1H),4.30-3.99(m,4H),3.96-3.71(m,3H),3.59-3.40(m,2H),3.30(s,3H),3.25-3.15(m,3H),3.14-2.94(m,2H),2.92(s,3H),2.90-2.74(m,2H),2.73-2.55(m,2H),2.45(d,J=5.6Hz,3H),2.42-2.29(m,2H),1.81(br dd,J=7.2,14.4Hz,1H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(650mg、953μmol、1.0当量)、およびPd/C(200mg、10%純度)を、MeOH(8.0mL)およびNH3・MeOH(8.0mL、20%純度)中に加え、次いで、混合物に、H2により脱気およびパージを3回行い、次いで、混合物を、H2(15psi)雰囲気下、20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、粗製混合物をセライトパッドで濾過した。ケーキをMeOH(50.0mL)で洗浄し、濾液を高真空下で乾燥した。化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(420mg、736μmol、77.2%収率、96%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:548。
ステップC:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(420mg、822μmol、1.0当量)およびピリジン(520mg、6.57mmol、531μL、8.0当量)のDCM(6.0mL)中溶液に、(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(603mg、3.29mmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(500mg、粗製)を黄色油として得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:695。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(500mg、720μmol、1.0当量)およびK2CO3(995mg、7.20mmol、10.0当量)のMeCN(12.0mL)中溶液に、3-フルオロアゼチジン(482mg、4.32mmol、6.0当量、HCl)を0℃で加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を水(10.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル:酢酸エチル=3:1~酢酸エチル:メタノール=100:1)により精製し、次いで、粗生成物を濃縮し、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150×25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~79%、10分];B%:45%~75%、12分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例49、45.8mg、66.5μmol、9.24%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:689。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.74-7.63(m,2H),7.47-7.32(m,2H),7.27-7.18(m,2H),6.88(br d,J=15.3Hz,1H),6.42(br d,J=15.4Hz,1H),5.27-5.05(m,1H),4.64(br s,1H),4.48-4.41(m,1H),4.31-4.18(m,2H),4.16-3.95(m,2H),3.94-3.84(m,1H),3.82-3.66(m,3H),3.54(br d,J=7.6Hz,1H),3.50-3.36(m,2H),3.34(br d,J=3.8Hz,2H),3.30-3.24(m,1H),3.24-3.08(m,4H),3.07-2.95(m,2H),2.92(s,3H),2.86-2.76(m,1H),2.76-2.57(m,3H),2.57-2.47(m,1H),2.46(d,J=4.5Hz,3H),2.34-2.17(m,1H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(500mg、粗製)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(61.1mg、679μmol)、およびTEA(294mg、2.91mmol、405μL)のDMF(10mL)中溶液に、T3P(926mg、1.45mmol、865μL、EtOAc中50%純度)を-40℃で加えた。次いで、混合物を-40℃で0.5時間および0℃でさらに0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(20mL)で希釈し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]により精製した。所望の画分を集め、飽和NaHCO3水溶液により中和し、EtOAc(2×70mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:10%~40%、12分)により精製した。所望の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例50、52.5mg、79.8μmol、2ステップ15%収率、96.4%純度、FA)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:588。
SFC条件:カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.03(s,1H),7.15(s,1H),5.53-5.34(m,1H),5.25(br dd,J=3.2,16.8Hz,1H),5.02-4.61(m,3H),4.43(dd,J=4.8,11.6Hz,1H),4.27(s,2H),4.19(br d,J=13.2Hz,1H),4.01(br d,J=12.4Hz,1H),3.68-3.56(m,1H),3.55-3.50(m,2H),3.49-3.21(m,3H),3.14(br s,1H),2.98(br s,1H),2.91-2.61(m,7H),2.41(s,3H),2.34(s,3H),2.23(qd,J=8.4,12.4Hz,1H),2.14-1.95(m,3H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(290mg、339μmol、1.0当量)のジクロロメタン(1.5mL)中溶液に、TFA(2.31g、20.3mmol、1.5mL、59.8当量)を加え、混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、次いで、ジクロロメタン(10.0mL)を加え、有機層を飽和NaHCO3水溶液(2×10.0mL)で洗浄し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=3/1~酢酸エチル:メタノール=20:1)により精製した。次いで、粗生成物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例51、61.3mg、99.9μmol、29%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:614。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.73-7.61(m,2H),7.46-7.31(m,2H),7.27-7.18(m,2H),7.06(br d,J=14.8Hz,1H),6.62(br d,J=14.8Hz,1H),5.27-4.97(m,1H),4.74-4.55(m,1H),4.52-4.34(m,3H),4.31-4.16(m,2H),4.15-3.96(m,2H),3.94-3.58(m,3H),3.56-3.48(m,1H),3.46-3.41(m,1H),3.36-3.29(m,1H),3.26-3.07(m,3H),3.04-2.97(m,1H),2.92(s,3H),2.85-2.57(m,4H),2.49(d,J=4.8Hz,3H),2.45-2.34(m,1H),2.29-1.91(m,2H)。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、265μmol、1当量)のDCM(2.3mL)中溶液に、TFA(3.54g、31.1mmol、2.3mL、117当量)を加え、混合物を15℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3(30mL)によりPH=7~8に塩基化し、次いで、DCM(2×15mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=32%)により精製した。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:37%~67%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例52、41.7mg、66.6μmol、25%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:626。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(br d,J=8.4Hz,1H),7.65(t,J=8.0Hz,1H),7.45-7.38(m,1H),7.37-7.31(m,1H),7.27-7.17(m,2H),7.07(br d,J=14.8Hz,1H),6.62(br d,J=14.0Hz,1H),5.07(br s,1H),4.85-4.55(m,1H),4.51-4.37(m,3H),4.30-3.97(m,4H),3.94-3.65(m,2H),3.58-3.40(m,2H),3.29(d,J=1.6Hz,3H),3.25-2.96(m,5H),2.92(s,3H),2.86-2.54(m,4H),2.45(d,J=4.8Hz,3H),2.42-2.28(m,2H),1.81(br dd,J=8.9,13.6Hz、1H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、848μmol、1当量)、4-ブロモ-6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール(431mg、1.19mmol、1.4当量)、Pd2(dba)3(155mg、170μmol、0.2当量)、RuPhos(158mg、339μmol、0.4当量)、およびCs2CO3(691mg、2.12mmol、2.5当量)のトルエン(20mL)中混合物に、N2により脱気およびパージを3回行い、次いで、混合物を、N2雰囲気下、100℃で16時間撹拌した。混合物に、H2O(20mL×1)および酢酸エチル(20mL×1)を加えた。有機相を分離し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(酢酸エチル/メタノール=50/1~2/1)により精製した。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、535μmol、32%収率、80.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[MSI,M+1]:754。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(470mg、503μmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(2.29g、20.1mmol、1.49mL、40当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物にジクロロメタン(5mL)を加え、飽和NaHCO3水溶液によりpH=8~9に塩基化した。有機相を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(420mg、453μmol、90%収率、61.4%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[MSI,M+1]:570。
ステップC:2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(380mg、410μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(18.4mg、205μmol、0.5当量)、およびTEA(124mg、1.23mmol、171μL、3当量)のDMF(8mL)中溶液に、T3P(391mg、614μmol、365μL、DMF中50%純度、1.5当量)を-40℃で加えた。次いで、混合物を-40℃で0.5時間および0℃でさらに0.5時間撹拌した。2-フルオロプロパ-2-エン酸(11mg)およびT3P(100μL)を加え、混合物を-40℃でさらに0.5時間撹拌した。混合物を水(15mL)で希釈し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5u;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:22%~42%、7.8分)および(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:50%~68%、12分)により精製した。所望の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例56)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.72-7.61(m,2H),7.45-7.31(m,2H),7.27-7.17(m,2H),6.99(br d,J=14.8Hz,1H),6.55(br d,J=15.2Hz,1H),5.07(br s,1H),4.51-4.40(m,1H),4.31-4.04(m,5H),3.95-3.68(m,3H),3.63-3.47(m,2H),3.44(s,3H),3.42-3.35(m,1H),3.30(d,J=1.2Hz,3H),3.24-2.96(m,5H),2.92(s,3H),2.76(br dd,J=8.0,16.8Hz,1H),2.72-2.52(m,3H),2.45(d,J=5.2Hz,3H),2.41-2.27(m,2H),1.81(br dd,J=7.2,14.0Hz,1H)。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.23-4.15(m,1H),3.70(s,3H),3.44-3.38(m,2H),3.37(s,3H),3.04(br s,1H),2.51(d,J=6.4Hz,2H)。
ステップB:メチル(E)-4-メトキシブタ-2-エノエート。メチル3-ヒドロキシ-4-メトキシ-ブタノエート(7.5g、粗製)のDCM(50.0mL)中溶液に、TEA(5.12g、50.6mmol、7.05mL)およびMsCl(8.70g、75.9mmol、5.88mL)を0℃で加えた。4時間撹拌した後、混合物にTEA(10.2g、101mmol、14.1mL)を0℃で加えた。混合物を20℃まで温め、12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(50.0mL)で希釈し、HCl(1N、15.0mL)およびブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~50:1)により精製して、メチル(E)-4-メトキシブタ-2-エノエート(1.7g、11.8mmol、2ステップで8.6%収率、90%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.93(td,J=4.3,15.8Hz,1H),6.04(td,J=2.0,15.8Hz,1H),4.06(dd,J=2.0,4.3Hz,2H),3.72(s,3H),3.36(s,3H)。
ステップC:(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸。メチル(E)-4-メトキシブタ-2-エノエート(300mg、2.31mmol、1.0当量)およびKOH(517mg、9.22mmol、4.0当量)のMeOH(2.0mL)およびH2O(2.0mL)中混合物を、20℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をHCl(2N、5.0mL)によりpH=1~3に酸性化し、酢酸エチル(2×20mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(200mg、1.55mmol、67.3%収率、90%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=11.13(br s,1H),7.06(td,J=4.1,15.7Hz,1H),6.08(td,J=2.0,15.7Hz,1H),4.12(dd,J=2.0,4.1Hz,2H),3.40(s,3H)。
ステップD:2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、391μmol、1当量)、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(113mg、977μmol、2.5当量)、TEA(395mg、3.91mmol、544μL、10当量)のDMF(4mL)中溶液に、T3P(746mg、1.17mmol、697μL、50%純度、3当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.3時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈し、水(10mL×3)で洗浄した。有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=100/1~10:1)により精製し、分取HPLC(カラム:Boston pH-lex 150*25 10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:35%~59%、8分)によりさらに精製した。混合物を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例73、37.5mg、60.4μmol、15%収率、98.2%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:610。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.77-7.57(m,2H),7.46-7.37(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),6.99(br d,J=14.4Hz,1H),6.55(br d,J=14.8Hz,1H),5.24-4.49(m,1H),4.46-4.32(m,1H),4.32-3.74(m,7H),3.73-3.25(m,6H),3.25-2.94(m,5H),2.92(s,3H),2.86-2.54(m,4H),2.49(d,J=5.6Hz,3H),2.38-2.23(m,1H),2.11-2.00(m,1H),1.93-1.65(m,3H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-4-(2-((1-(tert-ブチル)アゼチジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(50.0mg、78.2μmol、1.00当量)のMeCN(1.00mL)中混合物に、HCl/ジオキサン(4M、1.50mL、76.8当量)を加え、混合物を25℃で30分間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮し、残留物を得た。残留物を酢酸エチル(5.00mL)および飽和NaHCO3溶液で希釈した。水層を分離し、酢酸エチル(5.00mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3.00mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150×25 5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3-ACN];B%:42%~72%、10分)により精製して、2-((2S)-4-(2-((1-(tert-ブチル)アゼチジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(10.4mg、19.0μmol、24%収率、99.2%純度)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:540。
SFC条件:カラム:Chiralpak IC-3 50×4.6mm I.D.、3μm移動相:CO2の場合はフェーズA、IPA+CAN(0.05%DEA)の場合はフェーズB、グラジエント溶出:CO2中の50%IPA+ACN(0.05%DEA)流速:3mL/分、波長:220nm カラム温度:35℃、背圧:100バール。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ=7.72-7.68(m,1H),7.67-7.62(m,1H),7.44-7.37(m,1H),7.37-7.31(m,1H),7.27-7.19(m,2H),4.50-4.39(m,1H),4.30-4.16(m,2H),4.04-3.72(m,4H),3.52-3.45(m,1H),3.37-3.28(m,1H),3.25-3.07(m,6H),3.06-2.96(m,2H),2.95-2.92(m,3H),2.61-2.49(m,3H),2.15-1.94(m,2H),1.06-0.96(m,9H)。
ステップC:2-((2S)-4-(2-((1-(tert-ブチル)アゼチジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(80.0mg、148μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(40.1mg、445μmol、3.0当量)の酢酸エチル(3.00mL)中混合物に、TEA(120mg、1.19mmol、165μL、8.0当量)およびT3P(283mg、445μmol、264μL、50%純度、3.0当量)を窒素下、0℃で少しずつ加えた。混合物を25℃30分間撹拌した。反応混合物を0℃で水(2.00mL)を加えることによってクエンチし、次いで、酢酸エチル(5.00mL×3)で希釈した。合わせた有機層をブライン(3.00mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150×25 5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3-ACN];B%:45%~75%、10分)により精製して、2-((2S)-4-(2-((1-(tert-ブチル)アゼチジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(21.8mg、35.4μmol、24%収率、99.2%純度)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:612。
SFC条件:カラム:Chiralcel OJ-3 50×4.6mm I.D.、3μm移動相:CO2の場合はフェーズA、MeOH(0.05%DEA)の場合はフェーズB、グラジエント溶出:CO2中のMeOH(0.05%DEA)5%~40%流速:3mL/分、波長:220nm カラム温度:20℃、背圧:100バール。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ=7.73-7.67(m,1H),7.67-7.62(m,1H),7.46-7.38(m,1H),7.38-7.32(m,1H),7.27-7.17(m,2H),5.53-5.33(m,1H),5.31-5.16(m,1H),5.03-4.64(m,1H),4.53-4.37(m,1H),4.33-4.21(m,2H),4.20-3.99(m,3H),3.94-3.73(m,3H),3.60-3.40(m,2H),3.27-3.03(m,6H),2.95-2.89(m,3H),2.86-2.76(m,1H),2.68-2.54(m,1H),2.19-1.91(m,2H),1.06-0.92(m,9H)。
ステップB:ベンジル(S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-((1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ピペリジン-4-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(118mg、160μmol、1.0当量)および4Åモレキュラーシーブ(50mg)のアセトニトリル(2mL)中混合物に、NaI(384mg、2.56mmol、16当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌し、続いて0℃でTMSCl(261mg、2.40mmol、305μL、15当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌し、続いてアルミナプラグ(Al2O3、酢酸エチル/メタノール=10/1~0/1)に直接ロードした。この物質を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]により精製して、(S)-2-(4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-((1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ピペリジン-4-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(62.0mg、94.7μmol、59%収率、91.9%純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:602。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.67(ddd,J=2.0,6.0,8.4Hz,1H),7.60(t,J=8.4Hz,1H),7.41-7.31(m,1H),7.27-7.18(m,2H),4.68-4.55(m,1H),4.44-4.33(m,1H),4.31-4.15(m,2H),4.09-3.73(m,4H),3.60-3.48(m,1H),3.40-3.29(m,1H),3.22-2.90(m,5H),2.84(d,J=3.2Hz,3H),2.80-2.56(m,4H),2.48(d,J=3.6Hz,3H),2.34-2.24(m,1H),2.05-1.99(m,1H),1.86-1.70(m,3H),1.52(s,9H)。
tert-ブチル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(7-フルオロ-8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(50.0mg、79.4μmol、1.0当量)のアセトニトリル(2.0mL)中溶液に、ジオキサン(4M、2.0mL、101当量)中のHClを0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌し、次いで40℃で減圧下で濃縮した。残留物に飽和Na2CO3水溶液(10mL)を加え、水層を酢酸エチル(5mL×3)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4で乾燥し、濾過した。濾液を40℃で減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(基本条件;カラム:Waters Xbridge 150*50 10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニアv/v-ACN];B%:50%~77%、10分)および凍結乾燥により精製して、2-((S)-4-(7-(7-フルオロ-8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(14mg、26.4μmol、33.3%収率、99.9%純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:530。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.67(dd,J=6.0,8.8Hz,1H),7.63-7.58(m,1H),7.36(dt,J=4.4,7.6Hz,1H),7.23(t,J=8.8Hz,2H),4.39(ddd,J=4.8,10.8,11.6Hz,1H),4.23(dd,J=6.4,18.0Hz,1H),4.14(td,J=7.2,10.4Hz,1H),4.08-3.90(m,1H),3.90-3.71(m,2H),3.59-3.44(m,1H),3.39-3.21(m,1H),3.21-2.88(m,7H),2.88-2.83(m,3H),2.73-2.62(m,1H),2.61-2.51(m,3H),2.47(d,J=2.8Hz,3H),2.33-2.23(m,1H),2.11-2.00(m,1H),1.90-1.75(m,3H)。
ステップB:2-((S)-4-(7-(7-フルオロ-8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(80.0mg、151μmol、1.0当量)、4Åモレキュラーシーブ(50.0mg)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(40.8mg、453μmol、3.0当量)の酢酸エチル(3.0mL)中混合物を、0℃で10分間撹拌した。この混合物に、TEA(61.1mg、604μmol、84.1μL、4.0当量)およびT3P(384mg、604μmol、359μL、EtOAc中の50%純度、4.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で20分間撹拌し、その後、混合物を飽和水溶液NH4Cl水溶液(100mL)でクエンチした。水層を酢酸エチル(60mL×3)で抽出し、合わせた有機層を無水Na2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を分取HPLC(基本条件;カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニアv/v-ACN];B%:57%~87%、10分)および凍結乾燥により精製して、2-((S)-4-(7-(7-フルオロ-8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(31mg、51.2μmol、33.9%収率、99.4%純度)をオフホワイト固体として得た。LCMS[M+1]:602。
SFC条件:カラム:Chiralcel OJ-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.67(dd,J=6.4,8.8Hz,1H),7.61(t,J=8.0Hz,1H),7.41-7.31(m,1H),7.27-7.18(m,2H),5.53-5.33(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.09-4.52(m,1H),4.42-4.33(m,1H),4.31-4.20(m,1H),4.19-4.10(m,2H),4.10-3.87(m,2H),3.87-3.72(m,1H),3.71-3.23(m,3H),3.23-2.94(m,5H),2.93-2.86(m,1H),2.85-2.82(m,3H),2.72-2.56(m,2H),2.47(d,J=3.2Hz,3H),2.34-2.22(m,1H),2.10-1.99(m,1H),1.88-1.74(m,3H)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.43-7.30(m,5H),5.18(s,2H),4.69(br d,J=19.2Hz,1H),4.58(br s,1H),4.45(d,J=18.8Hz,1H),4.09-3.74(m,6H),3.49-3.36(m,1H),3.31-3.04(m,4H),3.03-2.90(m,1H),2.81-2.55(m,6H),2.07(br s,1H),2.01(br s,1H),1.90-1.81(m,4H),1.69-1.62(m,2H),1.51(s,9H),1.27(t,J=7.2Hz,1H)。
ステップB:ベンジル(S)-4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1.90g、3.01mmol、1.0当量)のMeOH(84mL)中混合物に、Pd/C(190mg、10%純度)およびNH3・MeOH(12mL、メタノール中の40%純度)を加えた。混合物をH2の15psi下、30℃で2間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトパッドを通して濾過し、真空中で濃縮し、tert-ブチル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.42g、2.85mmol、95%収率、>99.5%純度)を黄色固体として得、さらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[M+1]:498。
ステップC:tert-ブチル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.25g、2.51mmol、1.0当量)、8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート(1.24g、3.77mmol、1.5当量)、4Åモレキュラーシーブ(600mg)、RuPhos(234mg、502μmol、0.2当量)およびCs2CO3(2.46g、7.54mmol、3当量)のトルエン(25mL)中混合物に、Pd2(DBA)3(230mg、251μmol、0.1当量)をN2下で加えた。混合物を脱気し、次いで、N2下、95℃に6時間加熱した。撹拌が完了したら、混合物を濾過した。次いで、混合物を酢酸エチル(10mL)および水(25mL)で希釈し、分離した。水相を酢酸エチル(1×15mL)で抽出した。次いで、有機層を飽和ブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/1)および逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]により精製して、tert-ブチル(S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.95g、1.40mmol、56%収率、99.6%純度)を褐色固体として得た。LCMS[M+1,M/2+1]:676、339。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.77-7.71(m,1H),7.60(t,J=8.0Hz,1H),7.46-7.36(m,1H),7.35-7.28(m,1H),7.23(d,J=7.6Hz,1H),4.61(br s,1H),4.46-4.33(m,1H),4.03(br s,4H),3.99-3.80(m,2H),3.59-3.49(m,1H),3.35(br dd,J=3.6,14.0Hz,1H),3.27-2.50(m,11H),2.16-2.06(m,2H),1.88(br d,J=5.2Hz,4H),1.72-1.63(m,2H),1.52(s,9H)。
tert-ブチル(S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(50.0mg、73.9μmol、1.0当量)のアセトニトリル(0.5mL)中混合物に、HCl(ジオキサン中4M、1.00mL、54当量)を加えた。混合物を15℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。次いで、飽和Na2CO3溶液(1mL)でpH値を9に調整し、混合物をメタノール(2×5mL)で洗浄し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:30%~60%、10分)により精製して、(S)-2-(4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(21.3mg、36.9μmol、49.96%収率、>99.5%)をオフホワイト固体として得た。LCMS[M+1,M/2+1]:576、289。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.78-7.71(m,1H),7.63-7.57(m,1H),7.42(q,J=6.8Hz,1H),7.35-7.28(m,1H),7.24(br s,1H),4.39(br dd,J=6.4,17.8Hz,1H),4.10-4.00(m,2H),3.95-3.81(m,2H),3.79-3.27(m,2H),3.25-3.01(m,7H),2.99-2.82(m,2H),2.69-2.44(m,5H),2.15-2.02(m,2H),1.89-1.81(m,4H),1.69-1.59(m,2H)。
ステップD:(S)-2-(4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(534mg、927μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(167mg、1.85mmol、2.0当量)、DIEA(4.80g、3.71mmol、646μL、4.0当量)および4Åモレキュラーシーブ(250mg)のジクロロメタン(10mL)中混合物に、HATU(705mg、1.85mmol、2.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過した。次いで、混合物をジクロロメタン(5mL)および水(10mL)で希釈し、分離した。水相をジクロロメタン(2×10mL)で抽出した。次いで、有機層を飽和ブライン(15mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:WelchXtimate C18 100*25mm*3μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O)-ACN];B%:30%~60%、11分)により精製し、(S)-2-(4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(272mg、414.20μmol、45%収率、98.7%純度)を褐色固体として得た。LCMS[M+1,M/2+1]:648、325。
SFC条件:Chiralcel OD-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2の場合はフェーズA、MeOH+ACN(0.05%DEA)の場合はフェーズB、グラジエント溶出:CO2中の50%MeOH+ACN(0.05%DEA),流速:3mL/分、波長:220nm カラム温度:35℃、背圧:100バール。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.74-7.68(m,1H),7.59-7.53(m,1H),7.43-7.35(m,1H),7.29(s,1H),7.26-7.21(m,1H),5.42-5.15(m,2H),4.98-4.60(m,1H),4.43-4.17(m,4H),4.16-3.91(m,2H),3.84(br t,J=17.7Hz,1H),3.53-3.35(m,4H),3.26-3.00(m,4H),2.97-2.75(m,4H),2.63-2.49(m,1H),2.25-2.10(m,2H),1.99-1.96(m,4H),1.86-1.74(m,2H)。
ステップB:4-((S)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-((1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(390mg、629μmol、1.0当量)のメタノール(8.0mL)中溶液に、乾燥Pd/C(50mg、10%純度)およびNH3・MeOH(4.0mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に、H2により真空脱気およびパージを数回行った。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。懸濁液をセライトパッドに通して濾過し、パッドをエタノール(3×15mL)で洗浄した。合わせた濾液を濃縮して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(220mg、70%収率、96.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:486。
ステップC:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、412μmol、1.0当量)、(8-クロロ-7-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(203mg、618μmol、1.5当量)、4Åモレキュラーシーブ(100mg)、RuPhos(38.4mg、82.4μmol、0.2当量)およびCs2CO3(402mg、1.24mmol、3.0当量)のトルエン(4.0mL)中混合物に、Pd2(dba)3(37.7mg、41.2μmol、0.1当量)をN2下で加えた。混合物を脱気し、次いで、N2下、95℃に6時間加熱した。反応混合物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~20/1)により精製した。残留物を逆相フラッシュカラムクロマトグラフィー[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]により精製して、tert-ブチル(2S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、36%収率、81.8%純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:664。
tert-ブチル(2S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(60mg、90.3μmol、1.0当量)のアセトニトリル(1.0mL)中溶液に、HCl(ジオキサン中4M、2.0mL)を0℃で加え、混合物を0℃で30分間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters X bridge 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:48%~68%、10分)により精製した。所望の画分を集め、真空下で濃縮した。混合物を凍結乾燥して、2-((2S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(9.88mg、19%収率)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:564。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.75(dd,J=5.6,8.8Hz,1H),7.60(d,J=8.0Hz,1H),7.42(td,J=1.9,7.8Hz,1H),7.35-7.28(m,1H),7.27-7.24(m,1H),4.39(br d,J=17.6Hz,1H),4.31-4.00(m,2H),3.97-3.80(m,2H),3.80-3.69(m,1H),3.58-3.46(m,1H),3.40-2.84(m,8H),2.79-2.64(m,1H),2.61-2.48(m,3H),2.44(br s,3H),2.14-1.98(m,1H),1.94-1.79(m,3H),1.17(s,3H)。
ステップD:2-((2S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(60mg、106μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(28.7mg、319μmol、3.0当量)の酢酸エチル(1.0mL)中溶液に、4Åモレキュラーシーブ(50mg)、Et3N(86.1mg、851μmol、118μL、8.0当量)、T3P(203mg、319μmol、190μL、酢酸エチル中の50%純度、3.0当量)を加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。反応混合物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters X bridge 150*25mm*5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:42%~72%、10分)により精製した。所望の画分を集め、真空下で濃縮した。次いで、混合物を凍結乾燥して、2-((2S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(33.6mg、47%収率)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:636。
SFC条件:カラム:Chiralpak IC-3 50×4.6mm I.D.、3μm。移動相:CO2の場合はフェーズA、MeOH+ACN(0.05%DEA)の場合はフェーズB、グラジエント溶出:CO2中の60%MeOH+ACN(0.05%DEA)。流速:3mL/分、波長:220nm。カラム温度:35℃、背圧:100バール。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.75-7.73(m,1H),7.61(t,J=6.8Hz,1H),7.48-7.38(m,1H),7.36-7.28(m,1H),7.26-7.23(m,1H),5.53-5.32(m,1H),5.31-5.19(m,1H),5.10-4.57(m,1H),4.48-4.34(m,1H),4.23-3.80(m,6H),3.64-3.36(m,2H),3.31-2.74(m,7H),2.72-2.52(m,2H),2.43-2.34(m,3H),2.10-1.98(m,1H),1.87-1.65(m,3H),1.19-1.11(m,3H)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.69-7.65(m,1H),7.53(t,J=8.8Hz,1H),7.35(td,J=7.6,17.6Hz,1H),7.28-7.20(m,2H),4.61-4.48(m,1H),4.38-4.25(m,1H),4.23-4.15(m,1H),4.02-3.70(m,5H),3.54-3.42(m,1H),3.34-2.78(m,9H),2.70-2.58(m,1H),2.54-2.36(m,2H),1.85-1.65(m,4H),1.45(s,9H),1.07(d,J=6.4Hz,3H),0.99(d,J=6.4Hz,3H)。
ステップB:tert-ブチル(S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレートのMeCN(0.2mL)中溶液に、HCl(ジオキサン中4M、184μL、10当量)を25℃で加えた。反応混合物を25℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2CO3水溶液でpH>8まで塩基性化し、酢酸エチル(3×5mL)で抽出し、合わせた有機層を真空下で濃縮し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、粗製物を得、これを分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150×25mm×5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:40%~70%、10分)により精製し、続いて凍結乾燥し、2-((S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(15.8mg、37%収率)を得た。白色固体、LCMS[M+1]:578。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.77-7.73(m,1H),7.65-7.58(m,1H),7.43(dt,J=5.2,7.6Hz,1H),7.36-7.27(m,2H),4.37(dd,J=4.8,17.6Hz,1H),4.28(ddd,J=4.0,10.4,16.4Hz,1H),4.06-3.70(m,4H),3.58-3.47(m,1H),3.36-2.87(m,10H),2.60-2.45(m,4H),1.98-1.73(m,4H),1.15(dd,J=2.4,6.4Hz,3H),1.07(d,J=6.4Hz,3H)。
ステップC:2-((S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(124mg、214μmol、1.0当量)、4ÅMS(120mg)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(38.6mg、429μmol、2.0当量)の酢酸エチル(4mL)中反応混合物を、25℃で10分間撹拌した。この混合物に、TEA(407mg、4.03mmol、560μL、18.8当量)およびT3P(546mg、858μmol、510μL、50%純度、4.0当量)を0℃で加えた。反応混合物を25℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(4mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×6mL)で抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、粗製物質を得、これを分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150×25mm×5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:47%~77%、10分)により精製し、2-((S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(45.9mg、32%収率)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:650。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.77-7.73(m,1H),7.65-7.58(m,1H),7.43(dt,J=5.2,7.6Hz,1H),7.36-7.27(m,2H),4.37(dd,J=4.8,17.6Hz,1H),4.28(ddd,J=4.0,10.4,16.4Hz,1H),4.06-3.70(m,4H),3.58-3.47(m,1H),3.36-2.87(m,10H),2.60-2.45(m,4H),1.98-1.73(m,4H),1.15(dd,J=2.4,6.4Hz,3H),1.07(d,J=6.4Hz,3H)。
SFC条件:Chiralcel OJ-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2の場合はフェーズA、MeOH(0.05%DEA)の場合はフェーズB、グラジエント溶出:CO2中のMeOH(0.05%DEA)5%~40% 流速:3mL/分、波長:220nm カラム温度:35℃、背圧:100バール。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.77-7.73(m,1H),7.65-7.58(m,1H),7.46-7.38(m,1H),7.35-7.27(m,2H),5.53-5.33(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.03-4.71(m,1H),4.46-4.33(m,1H),4.32-4.24(m,1H),4.15-3.81(m,5H),3.63-3.50(m,1H),3.48-3.37(m,1H),3.31-2.75(m,9H),2.65-2.47(m,2H),1.94-1.73(m,4H),1.14(d,J=6.4Hz,3H),1.07(d,J=6.4Hz,3H)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.79-7.72(m,1H),7.61(t,J=7.2Hz,1H),7.43(td,J=8.0,14.0Hz,1H),7.36-7.28(m,2H),4.62(br d,J=1.6Hz,1H),4.45-4.33(m,3H),4.11-3.77(m,4H),3.56(br dd,J=4.8,11.2Hz,1H),3.37(br dd,J=3.6,13.6Hz,1H),3.30-2.87(m,9H),2.82-2.67(m,2H),2.56(d,J=2.4Hz,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル(S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(2-(メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、332μmol、1.0当量)のMeCN(5mL)中溶液に、HCl(ジオキサン中4M、5mL、60当量)を15℃で加えた。反応混合物を15℃で30分間撹拌し、次いで、減圧下で濃縮した。残留物を酢酸エチル(15mL)およびNaHCO3水溶液(10mL)で希釈し、次いで分離した。水層を酢酸エチル(15mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニアv/v)-ACN];B%:48%~75%、10分)により精製し、次いで凍結乾燥し、(S)-2-(4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(2-(メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(51.7mg、93%収率、98.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:592。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.75(dd,J=5.6,8.8Hz,1H),7.64-7.57(m,1H),7.43(dt,J=3.2,8.0Hz,1H),7.35-7.27(m,2H),4.46-4.33(m,3H),4.13-3.71(m,3H),3.56-3.48(m,1H),3.39-3.07(m,8H),3.03(t,J=6.0Hz,2H),2.98-2.82(m,2H),2.55(s,3H),2.55-2.48(m,2H)。
ステップC:(S)-2-(4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(2-(メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(100mg、169μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(45.6mg、507μmol、3.0当量)の酢酸エチル(5mL)中溶液に、4Åモレキュラーシーブ(100mg)を15℃で加えた。反応混合物を15℃で0.5時間撹拌した。この後、反応物を-40℃に冷却し、TEA(154mg、1.52mmol、211μL、9.0当量)、続いてT3P(430mg、676μmol、402μL、50%純度、4.0当量)を混合物に加えた。混合物を-40℃で30分間撹拌し、次いで、0℃で水(3mL)でクエンチし、酢酸エチル(5mL×2)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮し、濃縮乾固した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニアv/v)-ACN];B%:55%~80%、10分)により精製し、次いで凍結乾燥し、(S)-2-(4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(2-(メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(13.5mg、12%収率、98.2%純度)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:664。
SFC条件:Cellucoat 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2の場合はフェーズA、MeOH(0.05%DEA)の場合はフェーズB、グラジエント溶出:CO2中の40%MeOH(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm カラム温度:35℃、背圧:100バール。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.75(ddd,J=1.6,5.6,9.2Hz,1H),7.61(t,J=6.8Hz,1H),7.43(td,J=7.6,12.0Hz,1H),7.35-7.27(m,2H),5.53-5.32(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.05-4.60(m,1H),4.47-4.33(m,3H),4.22-3.99(m,2H),3.95-3.77(m,2H),3.63-3.39(m,2H),3.32-2.99(m,8H),2.98-2.70(m,2H),2.66-2.58(m,1H),2.55(s,3H)。
ステップB:(S,Z)-2-(1-(4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-2-フルオロブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(190mg、240μmol、1.0当量)のTHF(2.0mL)中溶液に、TBAF(1M、479μL、2.0当量)を加え、混合物を25℃で30分間撹拌した。次いで、混合物を酢酸エチル/エタノール(3/1、100mL)を含むAl2O3のパッドを通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮し、粗生成物を逆相フラッシュクロマトグラフィー[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]により精製して、(S,Z)-2-(4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロ-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(80.0mg、49%収率)を黄色固体として得た。Rf=0.60(ジクロロメタン/メタノール=5/1)。LCMS[M+1]:678。
ステップC:(S,Z)-2-(4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロ-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(80.0mg、118μmol、1.0当量)のジクロロメタン(1mL)中溶液に、DAST(57.0mg、354μmol、46.8μL、3.0当量)を0℃で加え、混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、0℃で飽和NaHCO3(水溶液、10mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、水(5mL)で希釈した後、酢酸エチル(3×15mL)で抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過した。濾液を濃縮乾固し、残留物を分取TLC(SiO2、ジクロロメタン/メタノール=10/1)により精製した。所望の画分を減圧下で濃縮し、残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3-ACN];B%:35%~65%、10分)によりさらに精製して、(S,Z)-2-(4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-((テトラヒドロ-1H-ピロリジン-7a(5H)-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2,4-ジフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(3.48mg、4%収率、92.7%純度)を白色固体として得た。Rf=0.20(ジクロロメタン/メタノール=10/1)。LCMS[M+1]:680.7。
SFC条件:Chiralpak IC-3カラム(50×4.6mm I.D.、3μm)、CO2中の60%MeOH+ACN(0.05%DEA)、3mL/分、220nm;tR:0.626分(メジャー)、0.816分(マイナー)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.75(ddd,J=1.6,5.6,8.8Hz,1H),7.61(t,J=7.2Hz,1H),7.42(td,J=7.6,13.2Hz,1H),7.35-7.28(m,2H),6.17-5.72(m,1H),5.29-5.02(m,2H),4.48(br s,1H),4.45-4.34(m,1H),4.17-4.01(m,3H),3.99-3.63(m,3H),3.60-3.50(m,1H),3.49-3.33(m,1H),3.30-3.00(m,6H),2.98-2.77(m,2H),2.71-2.52(m,3H),2.09(br dd,J=6.0,12.4Hz,2H),1.87(br d,J=5.6Hz,4H),1.72-1.69(m,2H)。
ステップB:tert-ブチル(S)-4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4,4-ジフルオロピリミジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(60mg、66.0μmol、1.0当量)のMeCN(1mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4.0M、2mL)を加え、混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2CO3水溶液(6mL)で希釈し、酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:36%~66%、10分)により精製し、凍結乾燥して、2-((S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-4,4-ジフルオロピリミジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(8.25mg、22%収率)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.76(dd,J=5.6,9.2Hz,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.46-7.40(m,1H),7.36-7.27(m,2H),4.42-4.29(m,3H),4.15-3.72(m,4H),3.59-3.49(m,1H),3.41-3.06(m,7H),3.05-2.82(m,2H),2.59-2.48(m,3H),2.47-2.34(m,1H),2.24-2.04(m,1H)。LCMS[M+1]:572。
ステップC:2-((S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-4,4-ジフルオロピリミジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(130mg、227μmol、1.0当量)およびDIEA(88.1mg、682μmol、119μL、3.0当量)のDCM(2mL)中溶液に、(Boc)2O(44.6mg、204μmol、47.0、0.9当量)を加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物に水(5mL)を加え、酢酸エチル(3×5mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラムクロマトグラフィー[C18カラム、水中0.1%ギ酸、0~80%MeCN]により精製して、tert-ブチル(S)-2-(((7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-4-((S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4,4-ジフルオロピロリジン-1-カルボキシレート(50mg、30%収率、92.4%純度)を得た。黄色固体、LCMS[M+1]:672。
ステップD:tert-ブチル(S)-2-(((7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-4-((S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4,4-ジフルオロピロリジン-1-カルボキシレート(50mg、74.4μmol、1.0当量)の酢酸エチル(2mL)中溶液に、TEA(45.2mg、446μmol、62.1μL、6.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(13.4mg、149μmol、2.0当量)およびT3P(189mg、298μmol、177μL、50%純度、4.0当量)を0℃で加えた。得られた混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をH2O(10mL)で希釈し、酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和ブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、tert-ブチル(S)-2-(((7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-4-((S)-3-(シアノメチル)-4-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4,4-ジフルオロピロリジン-1-カルボキシレート(50mg、78%収率、86.6%純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:744。
ステップE:(S)-2-(((7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-4-((S)-3-(シアノメチル)-4-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4,4-ジフルオロピロリジン-1-カルボキシレート(50mg、58.4μmol、1.0当量)のMeCN(1mL)中溶液に、HCl(ジオキサン中4.0M、2mL)を加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2CO3水溶液(3mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×5mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(15mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:46%~76%、10分)により精製し、凍結乾燥して、2-((S)-4-(7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-4,4-ジフルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(14.4mg、38%収率)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:644。
SFC条件:カラム:Chiralcel OD-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2の場合はフェーズA、MeOH(0.05%DEA)の場合はフェーズB、グラジエント溶出:CO2中の40%MeOH(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm カラム温度:35℃、背圧:100バール。
1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.78-7.73(m、1H)、7.65-7.60(m、1H)、7.47-7.40(m、1H)、7.36-7.24(m、2H)、5.54-5.34(m、1H)、5.26(dd、J=3.6、16.8Hz、1H)、5.05-4.63(m、1H)、4.46-4.31(m、3H)、4.27-3.71(m、5H)、3.62-3.53(m、1H)、3.50-2.74(m、9H)、2.65-2.55(m、1H)、2.48-2.35(m、1H)、2.24-2.06(m、1H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-4-(2-(2-(1H-イミダゾール-1-イル)シクロブトキシ)-7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、446μmol、1当量)のDCM(3mL)中溶液に、TFA(3mL)を加えた。混合物を20℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を飽和NaHCO3をpH約8.0に加えることによりクエンチし、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、粗生成物(150mg)を白色固体として得た。100mgの粗生成物を精製することなく次のステップに使用した。さらに50mgの粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:35%~65%、8分)により精製して、2-((2S)-4-(2-(2-(1H-イミダゾール-1-イル)シクロブトキシ)-7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(5.66mg、9.85μmol、6.6%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.75(dd,J=5.6,9.2Hz,1H),7.64-7.58(m,2H),7.47-7.40(m,1H),7.33(dt,J=2.0,8.8Hz,1H),7.26(br s,1H),7.09-6.99(m,2H),5.52-5.37(m,1H),4.73-4.63(m,1H),4.34-4.22(m,1H),4.05-3.56(m,3H),3.55-3.44(m,1H),3.24-2.98(m,5H),2.96-2.67(m,2H),2.66-2.39(m,5H),2.12-1.94(m,2H)。LCMS[M+1]:573。
ステップC:2-((2S)-4-(2-(2-(1H-イミダゾール-1-イル)シクロブトキシ)-7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(100mg、174μmol、1当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(31.4mg、349μmol、2.0当量)の酢酸エチル(2mL)中溶液に、トリエチルアミン(35.3mg、349μmol、48.6μL、2当量)を加え、次いで、0℃に冷却し、続いてT3P(222mg、349μmol、207μL、50%純度、2当量)を加えた。反応物を飽和NaHCO3を加えることによりクエンチし、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*30mm*10μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:45%~65%、10分)により精製し、2-((2S)-4-(2-(2-(1H-イミダゾール-1-イル)シクロブトキシ)-7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(23.0mg、35.0μmol、20%収率)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:645。
SFC条件:カラム:CD-PH 150×4.6mm I.D.、5μm 移動相A:0.375%TFAを含む水 B:0.1875%A/B=65/35ヲ含むアセトニトリル、流速:1.0mL/分 波長:220nm。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.80-7.71(m,1H),7.66-7.52(m,2H),7.48-7.39(m,1H),7.36-7.29(m,1H),7.27-7.21(m,1H),7.10-6.84(m,2H),5.62-5.32(m,2H),5.30-5.20(m,1H),5.06-4.58(m,2H),4.38-4.19(m,1H),4.14-3.86(m,2H),3.85-3.67(m,1H),3.65-3.46(m,2H),3.44-2.94(m,5H),2.92-2.74(m,2H),2.66-2.42(m,3H),2.23-1.95(m,2H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-4-(2-(2-(アゼチジン-1-イル)シクロブトキシ)-7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、302μmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(1mL)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を飽和NaHCO3を加えることによりクエンチし、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和NaCl(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、粗生成物(150mg)を黄色固体として得た。100mgの粗生成物を精製することなく次のステップに使用した。さらに50mgの粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:40%~65%、8分)により精製して、2-((2S)-4-(2-(2-(アゼチジン-1-イル)シクロブトキシ)-7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(7.6mg、13.5μmol、15%収率)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:562。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.75(dd,J=5.6,9.2Hz,1H),7.60(d,J=8.0Hz,1H),7.46-7.39(m,1H),7.35-7.27(m,2H),5.09-4.99(m,1H),4.37(br d,J=17.6Hz,1H),4.13-3.89(m,1H),3.89-3.69(m,2H),3.58-3.47(m,1H),3.41-2.78(m,12H),2.58-2.44(m,4H),2.37-2.26(m,1H),2.10-1.98(m,2H),1.72-1.53(m,2H)。
ステップC:2-((2S)-4-(2-(2-(アゼチジン-1-イル)シクロブトキシ)-7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(100mg、178μmol、1当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(32.0mg、356μmol、2当量)の酢酸エチル(2mL)溶液中に、TEA(36.0mg、356μmol、49.5μL、2当量)を加え、-40℃に冷却し、次いで、T3P(226mg、356μmol、212μL、50%純度、2当量)を-40℃で加え、1時間撹拌した。反応物を飽和NaHCO3を加えることによりクエンチし、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和NaCl(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、粗生成物(150mg)を得た。粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:45%~70%、8分)により精製して、生成物2-((2S)-4-(2-(2-(アゼチジン-1-イル)シクロブトキシ)-7-(8-クロロ-7-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(19.4mg、17%収率)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:634。
SFC条件:カラム:CD-PH 150×4.6mm I.D.、5μm 移動相A:0.375%TFAを含む水 B:0.1875%A/B=65/35ヲ含むアセトニトリル、流速:1.0mL/分 波長:220nm。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.80-7.72(m,1H),7.61(t,J=7.6Hz,1H),7.43(td,J=7.6,12.0Hz,1H),7.36-7.27(m,2H),5.53-5.33(m,1H),5.26(br dd,J=3.2,16.8Hz,1H),5.11-4.74(m,2H),4.45-4.34(m,1H),4.20-4.00(m,2H),3.95-3.76(m,2H),3.63-3.52(m,1H),3.49-3.38(m,1H),3.34-3.04(m,9H),2.95-2.73(m,2H),2.65-2.44(m,2H),2.38-2.27(m,1H),2.11-1.98(m,2H),1.67-1.57(m,2H)。
KRas G12C修飾アッセイ
この実施例は、例示的な本発明の化合物がKRas G12Cに共有結合することを、その例示的な化合物とKRas G12Cとの共有結合付加物を検出するためのLCMSアッセイを使用して示す。
KRas G12C依存性細胞増殖の阻害
この実施例は、例示的な本発明の化合物がKRas G12Cを発現する腫瘍細胞株の増殖を阻害することを示す。
Claims (11)
- 治療有効量の請求項1に記載の化合物および薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
- 請求項1に記載の化合物を含む、細胞におけるKRas G12C活性を阻害するための方法に使用するための医薬組成物であって、前記方法は、KRas G12C活性の阻害が所望される前記細胞を、有効量の前記化合物と接触させることを含む、医薬組成物。
- 請求項1に記載の化合物を含む、癌を治療するための方法に使用するための医薬組成物であって、前記方法は、治療有効量の前記化合物を癌を有する患者に投与することを含む、医薬組成物。
- 前記方法は、1日当たり0.01~100mg/kgの前記化合物を投与することを含む、請求項4に記載の医薬組成物。
- 前記方法は、1日当たり0.1~50mg/kgの前記化合物を投与することを含む、請求項5に記載の医薬組成物。
- 前記癌が、心臓癌、肺癌、消化管癌、尿生殖路癌、肝臓癌、胆管癌、骨癌、神経系癌、婦人科癌、血液癌、皮膚癌、および副腎癌からなる群から選択される、請求項4に記載の医薬組成物。
- 前記癌が、KRas G12Cに関連する癌である、請求項5に記載の医薬組成物。
- 前記癌が、非小細胞肺癌である、請求項8に記載の医薬組成物。
- 請求項1に記載の化合物を含む、癌の治療を必要とする患者において癌を治療するための方法に使用するための医薬組成物であって、前記方法は、(a)前記癌がKRas G12C変異に関連することを決定することと、(b)治療有効量の前記化合物を前記患者に投与することと、を含む、医薬組成物。
- 前記癌が、KRas G12Cに関連する癌である、請求項10に記載の医薬組成物。
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