WO2019235420A1 - 複合体を検出する方法 - Google Patents
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- G01N2333/96441—Serine endopeptidases (3.4.21) with definite EC number
- G01N2333/9645—Factor IX (3.4.21.22)
Definitions
- the present invention relates to a method for detecting a complex. Furthermore, it is related with the method of measuring the quantity and / or density
- Emicizumab which is a bispecific antibody, is an example of this, and has Factor VIII alternative activity that binds to two antigens, FIXa and FX, and converts FX to FXa by bringing them into close proximity.
- Non-Patent Documents 4 and 5 On the other hand, for bispecific antibodies with neutralization as the mechanism of action, a method for measuring the antibodies and free antigens recognized by the antibodies using anti-idiotype antibodies has been reported. Compared to the measurement performed by forming a complex using two types of anti-idiotype antibodies, the measurement performed by forming a three-component complex using two types of antigens is an interference with other substances. Therefore, it has been reported that the difference becomes large and difficult because the degree of dilution of the sample becomes high and the measurement time becomes long (Patent Documents 1, 2, and 3).
- Ligand ⁇ ⁇ binding assay using antigen-antibody reaction is used as a highly sensitive protein detection method, but it is generally required even if an antibody that specifically recognizes the complex can be selected. It is very difficult to reflect the state of the complex in the solution by shifting the binding equilibrium of the complex with a long incubation time or by dissociating the complex by a washing operation.
- a method for measuring affinity between proteins with high sensitivity by measuring free antigen or free antibody under conditions in which the movement of binding equilibrium hardly occurs such as KinExA (registered trademark), is known. It has not been known that this method can be used to detect very weak affinity complexes, as well as to measure concentration and / or amount.
- the present invention uses a method capable of minimizing the influence of the migration of binding equilibrium and the dissociation of the complex while taking advantage of the high sensitivity of the Ligand binding ⁇ assay method. It aims to realize quantitative evaluation of antibody complex formation.
- the present inventors have detected a complex with low affinity and measured the concentration and / or amount of the complex under the condition that the binding equilibrium of the complex is substantially maintained. Successfully found a way. Further, the present inventors have found a method for evaluating the kinetics of a complex and a method for determining a therapeutic method using a drug based on the concentration and / or amount of the complex determined by the measurement method. Successful. Specifically, the present invention provides the following [1] to [33].
- a method for detecting a complex in a sample (1) contacting the first conjugate and a sample containing the complex to bind the first conjugate and the complex; (2) a step of binding the complex bound to the first conjugate and the second conjugate, and (3) a step of detecting the second conjugate bound to the complex, wherein the said complex comprises two or more components, one of the K D value of at least one of between the components is at 1nM or more, is conducted under conditions that binding equilibrium of the complex is substantially maintained, the Method.
- [3] The method according to [1] or [2], wherein the component is at least one selected from the group consisting of peptides, polypeptides and proteins.
- [4] The method according to any one of [1] to [3], wherein at least two of the components are an antibody and an antigen recognized by the antibody.
- [5] The method according to any one of [1] to [4], wherein at least three of the components are a bispecific antibody and two antigens recognized by the antibody.
- [6] The method according to any one of [1] to [5], wherein the second conjugate is labeled.
- the sample is a blood sample, more preferably whole blood, serum or plasma.
- A blood coagulation factor IX and / or activated blood coagulation factor IX and a bispecific antibody that recognizes blood coagulation factor X
- b blood coagulation factor IX or activated blood coagulation factor IX
- C A method for determining the concentration and / or amount of a complex in a sample, further comprising the following steps of the method according to any one of blood coagulation factor X [12] [1] to [11].
- a method for determining the concentration and / or amount of the complex in the sample, the conjugate comprises two or more components, one of the K D value of at least one of between the components be 1nM or And (1) contacting the first conjugate and the sample containing the complex to bind the first conjugate and the complex.
- step, (2) a step of binding the complex bound to the first conjugate and the second conjugate, (3) a step of detecting the second conjugate bound to the complex, (4) regression
- step preparing a complex for formula creation (5) a step of detecting the complex of step (4) by a step including steps of steps (1) to (3); and (6) step (4).
- the signal value detected in the step (5) and the simulation Calculating a regression equation from the density, and comprises a step, fitting the regression equation was the signal value detected by (8) the step (3), said method.
- [17] A method for detecting a complex in a sample, wherein the complex is a ternary complex comprising a bispecific antibody and two antigens recognized by the complex as components, (1) A step of bringing a first conjugate to be recognized into contact with a sample containing the complex to bind the first conjugate and the complex; (2) a complex bound to the first conjugate; The method comprising the steps of: binding a second conjugate that recognizes an antigen different from the antigen recognized by the conjugate; and (3) detecting the second conjugate bound to the complex. . [18] The method according to any one of [1] to [17], wherein the first conjugate is bound to a solid phase.
- [27] A method for determining a therapeutic method using a drug based on an arbitrary unit calculated based on the signal value detected by the method according to [13].
- the method according to [30], wherein the sample is a blood sample, more preferably whole blood, serum or plasma.
- [32] A method for evaluating the effect of a drug based on the concentration and / or amount of the complex determined by the method according to [13].
- [33] A method for evaluating the safety of a drug based on the concentration and / or amount of the complex determined by the method according to [13].
- the affinity is weak complex, the three-way complex formed, for example, bispecific antibodies, including the low affinity antibody of about ⁇ M order of nM order as the K D value, of the wide range
- the ternary complex itself can be detected in a biological sample or the like without labeling, and the concentration and / or amount of the ternary complex can be quantitatively determined.
- (A) shows a three-component complex measurement format in which an anti-FIX antibody (XB12) is immobilized on beads and a fluorescently labeled anti-FX antibody (SB04) is used for detection.
- (B) shows a three-component complex measurement format in which an anti-FX antibody (SB04) is immobilized on beads and a fluorescently labeled anti-FIX antibody (XB12) is used for detection.
- (A) It is a figure which shows the result of having measured the sample which added FIX, FX and the bispecific antibody by KinExA in the format shown to (A) of FIG.
- FIG. B It is a figure which shows the result of having detected the sample which added FIX, FX and the bispecific antibody by KinExA in the format shown to (B) of FIG.
- A The figure shows the relationship between the antibody concentration and the calculated ternary complex concentration when the anti-FIX / FX bispecific antibody has the same dissociation constant for FIX and FX, and each changes by 2 times. is there.
- B The anti-FIX / FX bispecific antibody dissociation constants for FIX and FX, when the FIX side is twice as large as the FX side, the antibody concentration and the three calculated when each changes by 2 times It is the figure which showed the relationship of the complex density
- (C) It is the figure which converted the tripartite complex signal value of FIG. 8 (A) into the density
- (A) Comparison of signal value transition during measurement when the three-component complex formed by anti-FIX / FX bispecific antibody Q4 // J3 antibody and Q3 // J1 antibody is detected with KinExA, respectively. is there.
- (B) Comparison of signal value transitions during measurement when anti-FIX / FX bispecific antibody Q3 // J1 antibody and ternary complex formed by Emicizumab are detected with KinExA, respectively.
- FIG. It is a figure which shows the result of having detected the sample which added Tocilizumab and hIL-6R by KinExA by the method shown in FIG.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample. In another aspect, the present invention is a method for determining the concentration and / or amount of a complex in a sample.
- the present invention relates to a method for measuring the presence and / or the amount of a complex in a sample using a Ligand binding assay that is an immunoassay.
- Ligand binding assay methods include enzyme immunoassay (ELISA), radioimmunoassay (RIA method) surface plasmon resonance (SPR), electrochemiluminescence (ECL) method, binding equilibrium exclusion method (KinExA (registered trademark): Kinetic) Exclusion Assay) (Drake et al., 2004, Analytical Biochemistry 328: 35-43) can be used.
- the method has a smaller reaction field space size, a larger specific surface area of the solid surface, and a shorter assay time than the method using a microtiter plate, such as a method using a microfluidic chip, a disk, or a bead.
- a method using KinExA (registered trademark) or Gyrolab (registered trademark) immunoassay system can be used, but is not limited thereto.
- the present invention relates to a method for measuring the presence of complex and / or the amount of complex in a sample using a Single-Molecule-array method, Alpha (Amplified-Luminescence-Proximity-Homogeneous-Assay) method, or time-resolved fluorescence method. About.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein (1) the first conjugate and the sample containing the complex are brought into contact with each other, (2) a step of binding the complex bound to the first conjugate with the second conjugate, and (3) a step of detecting the second conjugate bound to the complex.
- the said complex comprises two or more components, one of the K D value of at least one of between the components is at 1nM or more, is conducted under conditions that binding equilibrium of the complex is substantially maintained, It relates to said method.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein (1) the first conjugate and the sample containing the complex are brought into contact with each other, (2) a step of binding the complex bound to the first conjugate with the second conjugate, and (3) a step of detecting the second conjugate bound to the complex.
- the said complex comprises two or more components, at least one of the K D value of between the components is not less 1nM or more, conducted under conditions that binding equilibrium of the complex is substantially maintained, the complex None of the above components are labeled or immobilized on a solid phase.
- the present invention provides a method for detecting a complex in a sample, wherein (1) the first conjugate is contacted with a sample containing the complex, and the first conjugate and the complex are complexed. (2) the step of binding the complex bound to the first conjugate with the second conjugate, and (3) the detection of the second conjugate bound to the complex. includes the step of, said composite comprising two or more components, at least one of K D values between the component is 1nM or more, relates to the aforementioned method.
- the present invention provides a method for detecting a complex in a sample, wherein (1) the first conjugate is contacted with a sample containing the complex, and the first conjugate and the complex are complexed. (2) a step of binding the complex bound to the first conjugate with the second conjugate, and (3) detecting a second conjugate bound to the complex. And wherein the complex comprises two or more components, and none of the components of the complex are labeled or immobilized.
- the present invention provides a method for detecting a complex in a sample, wherein (1) the first conjugate is contacted with a sample containing the complex, and the first conjugate and the complex are complexed. (2) a step of binding the complex bound to the first conjugate with the second conjugate, and (3) detecting a second conjugate bound to the complex.
- the complex comprises two or more components and is conducted under conditions that substantially maintain the complex's binding equilibrium.
- the present invention provides a method for detecting a complex in a sample, wherein (1) the first conjugate is contacted with a sample containing the complex, and the first conjugate and the complex are complexed. (2) the step of binding the complex bound to the first conjugate with the second conjugate, and (3) the detection of the second conjugate bound to the complex. includes the step of, the comprises a complex of 2 or more components, one of the K D value of at least one of between the components is at 1nM or more, components of the complex are not labeled or immobilized either, It relates to said method.
- the present invention provides a method for detecting a complex in a sample, wherein (1) the first conjugate is contacted with a sample containing the complex, and the first conjugate and the complex are complexed. (2) a step of binding the complex bound to the first conjugate with the second conjugate, and (3) detecting a second conjugate bound to the complex.
- the complex includes two or more components, and is performed under conditions that substantially maintain the binding equilibrium of the complex, and none of the components of the complex is labeled or immobilized, Regarding the method.
- the first conjugate of the present invention is bound to a solid phase.
- the present invention provides a method for detecting a complex in a sample, comprising: (1) contacting a first conjugate bound to a solid phase with a sample containing the complex; A step of binding the first conjugate, (2) a step of binding the complex bound to the first conjugate bound to the solid phase and the second conjugate, and (3) a complex detecting the second conjugate bound include, the conjugate comprises two or more components, one of the K D value of at least one of between the components is not less 1nM or more, binding equilibrium of the complex The method is carried out under conditions that are substantially maintained.
- the present invention provides a method for detecting a complex in a sample, comprising: (1) (a) contacting a first conjugate with a sample containing the complex; A step of binding to the first conjugate, (1) (b) a step of binding the first conjugate bound to the complex to the solid phase, and (2) binding to the first conjugate bound to the solid phase. And (3) detecting the second conjugate bound to the complex, the complex comprising two or more components, and one K D values of at least one of between the components is at 1nM or more, is conducted under conditions that binding equilibrium of the complex is substantially maintained, relates to the aforementioned method.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, comprising (1) + (2) (a) a first conjugate, a second conjugate and a complex. Contacting the sample and binding the first conjugate and the second conjugate to the complex, respectively, (b) the first conjugate bound to the complex bound to the second conjugate on the solid phase And (3) detecting a second conjugate bound to the complex, wherein the complex includes two or more components, and at least one KD value between the components. Is greater than 1 nM and is carried out under conditions such that the binding equilibrium of the complex is substantially maintained.
- the sample containing the first conjugate, the second conjugate and the complex may be contacted at the same time. Further, the second conjugate may be contacted after the sample containing the first conjugate and the complex is brought into contact. Further, after the sample containing the second conjugate and the complex is brought into contact, the first conjugate may be brought into contact.
- the present invention may have one or more cleaning steps.
- the present invention further relates to a method for determining the concentration and / or amount of a complex in a sample, which comprises the following steps. (4) a step of preparing a complex for preparing a regression equation; (5) a step of detecting the complex of the step (4) by a step including the steps of the steps (1) to (3); (6) A step of simulating the complex concentration in the step (4), (7) a step of calculating a regression equation from the signal value detected in the step (5) and the simulation concentration, and (8) A step of applying the signal value detected in the step (3) to the regression equation.
- the present invention provides a method for determining the concentration and / or amount of the complex in the sample, the conjugate comprises two or more components, at least any one with a K D between the components The value is 1 nM or more, and is performed under the condition that the binding equilibrium of the complex is substantially maintained.
- the first conjugate and the sample containing the complex are contacted, and the first conjugate and the conjugate are A step of binding the body, (2) a step of binding the complex bound to the first conjugate and the second conjugate, and (3) a step of detecting the second conjugate bound to the complex.
- (4) a step of preparing a complex for preparing a regression equation, (5) a step of detecting the complex of the step (4) by a step including the steps of the steps (1) to (3), (6) A step of simulating the complex concentration in the step (4); (7) a signal value detected in the step (5); And (8) a step of applying the signal value detected in the step (3) to the regression equation.
- the first conjugate of the present invention is bound to a solid phase
- the present invention is a method for determining the concentration and / or amount of a complex in a sample comprising the complex comprises two or more components, one of the K D value of at least one of between the components is not less 1nM or more, conducted under conditions that binding equilibrium of the complex is substantially maintained, coupled to (1) a solid phase A step of bringing the first bound body into contact with a sample containing the complex to bind the complex to the first bound body, (2) a complex bound to the first bound body bound to the solid phase And a step of binding the second conjugate, (3) a step of detecting the second conjugate bound to the complex, (4) a step of preparing a complex for preparing a regression equation, (5) the above Detecting the complex of the step (4) by a step including the steps (1) to (3), (6) the step (4) A step of simulating the complex concentration, (7) a step of calculating a regression equation from the signal value detected in step (5) and the
- step (4) it is preferable to prepare a complex having a known KD value between components of the complex at a plurality of concentrations.
- (6) in the process simulating the complex concentration from K D values between the components of the component concentration and the complex of the complex.
- the complex refers to a complex formed of two or more components.
- the components are peptides, polypeptides, proteins, organic compounds, nucleic acids and the like.
- the complex may be formed of two or more components, may be formed of the same type of components, or may be formed of different types of components such as proteins and nucleic acids, proteins and organic compounds. Good.
- the same component may be contained in the composite.
- Polypeptides generally refer to peptides and proteins having a length of about 10 amino acids or more. Moreover, although it is normally a polypeptide derived from a living organism
- the organic compound is, for example, a low molecular compound, and preferably has a molecular weight of 1000 or less.
- the nucleic acid is, for example, an antisense molecule, siRNA molecule, RNA aptamer, or ribozyme.
- the first conjugate may bind to the complex, eg, a fusion polypeptide comprising a polypeptide, antibody, antibody fragment, antibody or antibody fragment and a non-antibody polypeptide, a fusion comprising an antibody or antibody fragment and a soluble receptor.
- a polypeptide or a fusion polypeptide comprising an antibody or antibody fragment and a peptidic binding molecule is selected.
- the first conjugate is preferably bound to the complex without dissociating the complex.
- the second conjugate may bind to the complex, for example, a fusion polypeptide comprising a polypeptide, antibody, antibody or antibody fragment and a non-antibody polypeptide, a fusion polypeptide comprising an antibody or antibody fragment and a soluble receptor, Or a fusion polypeptide comprising an antibody or antibody fragment and a peptidic binding molecule.
- the second conjugate preferably binds to the complex without dissociating the complex and / or preferably binds to the complex without inhibiting the binding between the first conjugate and the complex. .
- the first conjugate and the second conjugate each bind to different components that form a complex.
- the first conjugate when the complex includes component A and component B, it is preferable that the first conjugate binds to component A and the second conjugate binds to component B.
- the first conjugate when the complex includes component A, component B, and component C, component A binds only to component B, and component B binds only to component C, the first conjugate is Preferably, the second conjugate to component A binds to component C, or the first conjugate binds to component C and the second conjugate binds to component A.
- One particular embodiment includes a complex comprising a bispecific antibody and two antigens recognized by the antibody, in which case the first conjugate binds to one antigen and the second binding The body binds to the other antigen.
- the complex includes component A, component B, component C, and component D, component A binds only to component B, component B binds only to component A and component C, and component When C binds only to component B and component D, and component D binds only to component C, the first conjugate is component A and the second conjugate is component D, or the first conjugate is component The second conjugate to D is preferably bound to component A.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein the complex is a complex comprising an antigen and an antibody that recognizes the antigen as components, and (1) recognizes the antigen.
- the complex is a complex in which at least one of the antigen binding sites of the antibody is bound to the antigen.
- the complex is a complex in which all of the antigen binding sites of the antibody are bound to the antigen.
- the first conjugate of the present invention is bound to a solid phase
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, the complex comprising an antigen and the component as a component A complex comprising an antibody recognizing an antigen; (1) a first conjugate that recognizes the antigen bound to a solid phase is brought into contact with a sample containing the complex; A step of binding a body, (2) a step of binding a complex bound to a first conjugate bound to a solid phase and a second conjugate recognizing the antigen, and (3) a complex detecting the second conjugate bound include, one with a K D value of at least one of between the components is at 1nM or more, is conducted under conditions that binding equilibrium of the complex is substantially maintained and The method.
- the complex is a complex in which at least one of the antigen binding sites of the antibody is bound to the antigen.
- the complex is a complex in which all of the antigen binding sites of the antibody are bound to the antigen.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein the complex is a tripartite complex comprising a bispecific antibody and two antigens that it recognizes as components, (1) A step of bringing a first conjugate that recognizes the antigen into contact with a sample containing the complex to bind the first conjugate and the complex, and (2) binding to the first conjugate. A step of binding the complex to a second conjugate that recognizes an antigen different from the antigen recognized by the first conjugate, and (3) a step of detecting the second conjugate bound to the complex. , Including the method.
- the first conjugate of the invention is bound to a solid phase and the invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein the complex is bispecific as a component.
- a ternary complex comprising a sex antibody and two antigens recognized by the sex antibody, and (1) contacting a first conjugate that recognizes the antigen bound to a solid phase with a sample comprising the complex, A step of binding the complex to the first conjugate, (2) recognizing an antigen different from the antigen recognized by the first conjugate and the complex bound to the first conjugate bound to the solid phase
- the method comprising: binding a second conjugate; and (3) detecting the second conjugate bound to the complex.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein the complex is a tripartite complex comprising a bispecific antibody and two antigens that it recognizes as components.
- the single K D values of at least one of between the components is not less 1nM or more, carried out, relating to the method under the condition that binding equilibrium of the complex is substantially maintained.
- the first conjugate of the invention is bound to a solid phase and the invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein the complex is bispecific as a component.
- a ternary complex comprising a sex antibody and two antigens recognized by the sex antibody, (1) contacting a first conjugate that recognizes the antigen bound to a solid phase with a sample comprising the complex; A step of binding the complex and the first conjugate, (2) recognizing an antigen different from the antigen recognized by the first conjugate and the complex bound to the first conjugate bound to the solid phase step of coupling the second coupling member, and, (3) detecting the second conjugate bound to the complex, wherein the single K D values of at least one of between said components is 1nM or And the method is carried out under conditions in which the binding equilibrium of the complex is substantially maintained.
- the complex is a complex in which both a bispecific antibody and two antigens recognized by the antibody are bound to the antibody.
- the complex means a ternary complex in which the bispecific antibody binds to antigen A and antigen B.
- the antigen A and the antigen B may be the same antigen or different antigens.
- the complex is blood A complex comprising coagulation factor IX (FIX) or activated blood coagulation factor IX (FIXa) and blood coagulation factor X (FX) or activated blood coagulation factor X (FXa) bound to Emicizumab.
- FIX and FIXa are sometimes used synonymously unless otherwise specified, and FIX (a) may be expressed as a concept including FIX and FIXa.
- FX and FXa are sometimes used synonymously unless otherwise specified, and FX (a) may be expressed as a concept including FX and FXa.
- Certain embodiments of the present invention provide a method for detecting a complex comprising the Emicizumab.
- an antibody that binds to FIX (a) as the first conjugate is selected, an antibody that binds to FX (a) can be selected as the second conjugate.
- an antibody that binds to FX (a) as the first conjugate is selected, an antibody that binds to FIX (a) can be selected as the second conjugate.
- the antibody that binds to FIX (a) is not particularly limited, but it preferably binds to an epitope different from the epitope in FIX (a) of Emicizumab.
- Such an antibody can be appropriately selected from, for example, A19, A25, A31, A38, A39, A40, A41, A44, A50, A69, and XB12 described in the patent document (WO 2006/109592).
- the antibody that binds to FX (a) is not particularly limited, but preferably binds to an epitope different from the epitope in FX (a) of Emicizumab.
- antibodies examples include B2, B5, B9, B10, B11, B12, B13, B14, B15, B16, B18, B19, B20, B21, B23, and B25 described in the patent literature (WO 2006/109592). , B26, B27, B31, B34-1, B34-2, B35, B36, B38, B42, SB04, SB15, SB27.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein the complex is a ternary complex comprising Emicizumab, FIX (a) and FX as components, and (1) FIX ( a) contacting a first conjugate that recognizes FX or a sample containing the complex to bind the first conjugate and the complex; (2) a complex bound to the first conjugate A body and a second conjugate recognizing FIX (a) or FX, which is an antigen different from the antigen recognized by the first conjugate, and (3) a second bound to the complex Detecting the conjugate of the method.
- the complex is a ternary complex comprising Emicizumab, FIX (a) and FX as components, and (1) FIX ( a) contacting a first conjugate that recognizes FX or a sample containing the complex to bind the first conjugate and the complex; (2) a complex bound to the first conjugate A body and a second conjugate recognizing FIX (a) or F
- the first conjugate of the present invention is bound to a solid phase
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein the complex comprises Emicizumab, FIX as a component.
- a ternary complex containing FX and (1) a first conjugate that recognizes FIX (a) or FX bound to a solid phase and a sample containing the complex are brought into contact with each other to form a complex (2) a complex bound to the first conjugate bound to the solid phase, and FIX (which is an antigen different from the antigen recognized by the first conjugate) a) binding a second conjugate that recognizes FX or (3) detecting the second conjugate bound to the complex.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein the complex is a ternary complex comprising Emicizumab, FIX (a) and FX as components, and (1) FIX ( a) contacting a first conjugate that recognizes FX or a sample containing the complex to bind the first conjugate and the complex; (2) a complex bound to the first conjugate A body and a second conjugate recognizing FIX (a) or FX, which is an antigen different from the antigen recognized by the first conjugate, and (3) a second bound to the complex Detecting the conjugate of the method, wherein the method is carried out under conditions in which the binding equilibrium of the complex is substantially maintained.
- the method is carried out under conditions in which the binding equilibrium of the complex is substantially maintained.
- the first conjugate of the present invention is bound to a solid phase
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample, wherein the complex comprises Emicizumab, FIX as a component.
- a ternary complex containing FX and (1) a first conjugate that recognizes FIX (a) or FX bound to a solid phase and a sample containing the complex are brought into contact with each other to form a complex (2) a complex bound to the first conjugate bound to the solid phase, and FIX (which is an antigen different from the antigen recognized by the first conjugate)
- the method is carried out under conditions that are maintained.
- the complex consists of a bispecific antibody, antigen A recognized by the antibody and antigen B recognized by the antibody, and the antibody is bound to antigen A and antigen B. It is preferred that the first conjugate binds to antigen A and the second conjugate binds to antigen B.
- the first conjugate in the case of a complex comprising Emicizumab, a bispecific antibody bound to FIX (a) and FX (a), the first conjugate binds to FIX (a) and the second The conjugate preferably binds to FX (a), or the first conjugate binds to FX (a) and the second conjugate preferably binds to FIX (a).
- the method of the present invention is performed without labeling or immobilizing the components of the complex to be detected.
- Labeling refers to modification with a luminescent label, chemiluminescent label, electrochemiluminescent label, fluorescent label, digoxigenin, biotin, avidin or radioactive label, but is not limited thereto.
- Immobilization means binding or fixing to a solid phase such as beads, disks, microfluidic chips, magnetic particles, or microtiter plates, whether directly or indirectly, but is not limited to these. Absent.
- the method of the present invention includes a step of newly generating a complex by adding an excess of a component that forms a complex to a sample to be measured, excluding a sample for preparing a regression line. Not included.
- the affinity (dissociation constant (K D )) between a plurality of components forming the complex is not particularly limited, but is 1 nM or more, preferably 10 nM or more, 100 nM or more, particularly preferably Is 1 ⁇ M or more.
- the method of the invention is a method for measuring the presence and / or amount of a complex with low affinity (high KD value).
- the binding site with the lowest affinity is considered to be important for the maintenance of the complex.
- Affinity can be used synonymously with the affinity of the complex.
- the affinity between the antibody and antigen A and / or antigen B and the K D values is 1nM or more showing the, preferably 10nM or more, or more than 100 nM, particularly preferably at least 1 [mu] M.
- the affinity for the antigen does not necessarily need to be as strong as that of the neutralizing antibody, and in some cases, a weak affinity is suitable.
- Emicizumab which is the bispecific antibody described above, has an affinity for FIX or FIXa, which is the antigen, and affinity for FX or FXa, both of which are about 1 ⁇ M.
- the affinity with the antigen is very weak (Kitazawa, Thromb Haemost 117 (7): 1348-1357 (2017)).
- the present invention can be used, for example, to detect a complex of the following bispecific antibody and its antigens.
- Ozoralizumab (antigens are TNF and albumin)
- RG7716 (antigens are VEGF-A and angiopoietin-2)
- RG-7990 (antigens are IL-13 and IL-17)
- Lutikizumab (antigens are IL-1 ⁇ and IL-1 ⁇ )
- the method of the present invention can detect a complex comprising an antibody having a weak affinity for an antigen and an antigen bound to the antibody. In one embodiment, the method of the present invention is a method for detecting a complex comprising a bispecific antibody having a weak affinity for at least one antigen and an antigen bound to the antibody. In one embodiment, the method of the present invention is a method for detecting a complex comprising a bispecific antibody having a weak affinity for two antigens and an antigen bound to the antibody.
- the affinity weak antibody with the antigen in the present specification is a K D values indicating the affinity of the antibody with the antigen is 1nM or more, preferably 10nM or more, or more than 100 nM, particularly preferably 1 ⁇ M or more.
- the present invention is a method for detecting a complex in a sample under a condition in which the binding equilibrium of the complex is substantially maintained.
- the condition under which the binding equilibrium of the complex is substantially maintained is, for example, a condition in which a new complex is not substantially generated on the solid phase and / or a complex is not substantially dissociated. .
- the conditions are smaller than the method using a microtiter plate, the reaction field has a smaller space size, the specific surface area of the solid phase surface is larger, and the assay time is shorter, for example, a method using a microfluidic chip, a disk, or a bead.
- a method using a microfluidic chip, a disk, or a bead can be realized, for example, by a method using KinExA (registered trademark) or Gyrolab (registered trademark) immunoassay system (Fraley et al., 2013, Bioanalysis 5: 1765-74).
- the short assay time means that the sample is brought into contact with the solid phase, for example, a sample containing an antigen is added to a column packed with beads to which an antibody capable of capturing the antigen is immobilized,
- the time that any particular antigen in the sample is in contact with any particular point in the column is 10 seconds or less, 9 seconds or less, 8 seconds or less, 7 seconds or less 6 seconds or less, 5 seconds or less, 4 seconds or less, 3 seconds or less, 2 seconds or less, 1 second or less, 0.5 seconds or less, 0.1 seconds or less, 0.05 seconds or less, 0.01 seconds or less, more preferably at least 0.001 It is preferable that it is not less than seconds and not less than 0.01 seconds.
- the present invention is a method for detecting a complex in a blood sample, wherein the complex comprises, as components, a bispecific antibody contained in the blood sample and two antigens that it recognizes.
- detecting the second conjugate bound to the complex, and comprising at least one of the components between the component bound to the complex and the second conjugate K D values is not less 1nM above, is carried out under conditions that binding equilibrium of the complex is substantially maintained, it relates to the aforementioned method.
- the first conjugate of the invention is bound to a solid phase and the invention is a method for detecting a complex in a blood sample, wherein the complex is a blood sample as a component A trispecific complex comprising a bispecific antibody contained therein and two antigens recognized by the antibody, (1) a first conjugate bound to a solid phase and a blood sample comprising said complex Contacting the complex and the first conjugate, (2) coupling the complex bound to the first conjugate bound to the solid phase and the second conjugate, and (3) detecting the second conjugate bound to the complex, wherein the single K D values of at least one of between the components is not less 1nM or more, binding equilibrium of the complex is substantially maintained
- This method is performed under the following conditions.
- conditions under which binding equilibrium is substantially maintained are substantially free of new complexes and / or substantially free of complex dissociation on the solid phase during the assay. It is a condition.
- the condition under which binding equilibrium is substantially maintained refers to a time that is so short that the binding equilibrium does not move theoretically.
- the fact that the binding equilibrium is substantially maintained means that, for example, when the measurement value is used as an index, the difference in the measurement value when measured multiple times is preferably 50% or less, 40% or less, 30% or less, 20 % Or less, 10% or less, 5% or less, 3% or less, 2% or less, 1% or less, 0.5% or less, or 0.1% or less.
- the theoretically short time that the binding equilibrium does not move is the time when the sample and the solid phase are in contact, for example, the sample containing the antigen is placed on a column packed with beads to which an antibody capable of capturing the antigen is immobilized.
- the time during which any specific antigen in the sample is in contact with any specific point in the column is preferably 10 seconds or less, 9 seconds or less, 8 seconds 7 seconds or less, 6 seconds or less, 5 seconds or less, 4 seconds or less, 3 seconds or less, 2 seconds or less, 1 second or less, 0.5 seconds or less, 0.1 seconds or less, 0.05 seconds or less, 0.01 seconds or less Although it is preferable, it is preferably at least 0.001 seconds or more and 0.01 seconds or more.
- the second conjugate may be labeled.
- the label may be a luminescent label, a chemiluminescent label, an electrochemiluminescent label, a fluorescent label, digoxigenin, biotin or a radioactive label, but is not limited thereto.
- the solid phase may be a bead, a disk, a microfluidic chip, a magnetic particle, or a microtiter plate, and is not limited thereto as long as the object of the present invention can be achieved.
- the binding of the first conjugate to the solid phase is different, if the first conjugate is a polypeptide, the N-terminal group and / or ⁇ -amino group (lysine) of the amino acid backbone of the polypeptide. It is performed by chemical conjugation via the ⁇ -amino group of lysine, the carboxy function, the sulfhydryl function, the hydroxyl function, and / or the phenol function, and / or the sugar alcohol group of the carbohydrate structure of the polypeptide.
- the first conjugate is bound to the solid phase by passive adsorption.
- Passive adsorption is described, for example, in Butler, JE, in “Solid Phases in Immunoassay” (1996) 205-225 and Diamandis, EP, and Christopoulos, TK (Editors), in “Immunoassay” (1996) Academic Press (San Diego) Is explained by.
- the first conjugate is bound to the solid phase by a specific binding pair.
- binding pair first component / second component
- such binding pair is streptavidin or avidin / biotin, antibody / antigen (e.g., Hermanson, GT, et al., Bioconjugate Techniques, Academic Press (1996)), lectins / polysaccharides, steroid / steroid binding proteins, hormones / hormone receptors, enzymes / substrates, IgG / protein A and / or protein G, and the like.
- the first conjugate is linked to biotin and conjugation takes place via avidin or streptavidin immobilized on a solid phase.
- sample refers to a biological sample obtained from, for example, a human, but is not limited thereto, and may be a biological sample obtained from other than a human.
- a liquid sample obtained from a human can be used as the biological sample.
- the “sample” may be a sample created in vitro.
- the liquid sample is, for example, a blood sample, and includes serum, plasma, or whole blood. In the present invention, it is preferable to use a plasma sample.
- Methods for obtaining blood samples from humans are well known to those skilled in the art.
- the liquid sample may be interstitial fluid, fluid obtained by grinding tissue, fluid in which tissue is solubilized, or the like, and the tissue may be fresh tissue or frozen tissue. Methods for obtaining tissue from humans are well known to those skilled in the art.
- a blood sample that has been subjected to some kind of treatment can also be included in the blood sample in the present invention.
- Detection includes quantitative or qualitative detection. For example, as qualitative detection, simply determining whether a complex is present, the complex is present in a certain amount or more. Measurement, and measurement of comparing the amount of the complex with other samples (for example, control samples, etc.). On the other hand, quantitative detection can include measurement of the concentration of the complex, measurement of the amount of the complex, and the like.
- affinity refers to the total strength of a non-covalent interaction between a binding site of a molecule (eg, an antibody) and a binding partner (eg, an antigen) of the molecule.
- affinity refers to an intrinsic binding affinity that reflects a 1: 1 interaction between members of a binding pair (eg, an antibody and an antigen).
- the affinity of a molecule X for its partner Y can generally be represented by the dissociation constant (K D ). Affinity can be measured by conventional methods known in the art, including those described herein. Specific illustrative and exemplary embodiments for measuring binding affinity are described below.
- K D values are radiolabeled antigen binding assay: measured by (radiolabeled antigen binding assay RIA).
- RIA is performed using the Fab version of the antibody of interest and its antigen.
- Fab binding affinity for antigen is determined by equilibrating the Fab with a minimal concentration of ( 125I ) -labeled antigen in the presence of increasing series of unlabeled antigen, and then coating the bound antigen with anti-Fab antibody. Measured by catching with the prepared plate. (See, eg, Chen et al., J. Mol. Biol. 293: 865-881 (1999)).
- MICROTITER® multiwell plates (Thermo Scientific) were coated overnight with 5 ⁇ g / ml capture anti-Fab antibody (Cappel Labs) in 50 mM sodium carbonate (pH 9.6), then Block with 2% (w / v) bovine serum albumin in PBS for 2-5 hours at room temperature (approximately 23 ° C.).
- a non-adsorbed plate (Nunc # 269620), 100 pM or 26 pM [ 125 I] -antigen (see, for example, the anti-VEGF antibody Fab- in Presta et al., Cancer Res. 57: 4593-4599 (1997)).
- K D values are measured using BIACORE (TM) surface plasmon resonance assay.
- TM BIACORE
- a measurement method using BIACORE (registered trademark) -2000 or BIACORE (registered trademark) -3000 (BIAcore, Inc., Piscataway, NJ) is used to measure CM5 in which an antigen of approximately 10 response units (RU) is immobilized. Performed at 25 ° C using a chip.
- a carboxymethylated dextran biosensor chip (CM5, BIACORE, Inc.) is prepared according to the supplier's instructions with N-ethyl-N ′-(3-dimethylaminopropyl) -carbodiimide hydrochloride (EDC) and N Activated with -hydroxysuccinimide (NHS).
- EDC N-ethyl-N ′-(3-dimethylaminopropyl) -carbodiimide hydrochloride
- NHS N Activated with -hydroxysuccinimide
- the antigen is brought to 5 ⁇ g / ml (approximately 0.2 ⁇ M) using 10 mM sodium acetate, pH 4.8 before being injected at a flow rate of 5 ⁇ l / min to achieve approximately 10 reaction units (RU) of protein binding. Diluted. After the injection of antigen, 1M ethanolamine is injected to block unreacted groups.
- a 2-fold serial dilution of Fab (0.78 nM) in PBS (PBST) containing 0.05% polysorbate 20 (TWEEN-20 TM) surfactant at 25 ° C. and a flow rate of approximately 25 ⁇ l / min. ⁇ 500nM) is injected.
- the association rate (k on ) and dissociation rate (k off ) can be determined by simultaneously fitting the association and dissociation sensorgrams using a simple one-to-one Langmuir association model (BIACORE® evaluation software version 3.2). Calculated.
- the equilibrium dissociation constant (K D ) is calculated as the k off / k on ratio. See, for example, Chen et al., J. Mol. Biol.
- the on-rate exceeds 10 6 M -1 s -1 by the surface plasmon resonance assay described above, the on-rate is measured using a spectrophotometer (eg, a stop flow spectrophotometer (Aviv Instruments) or a 8000 series SLM- Fluorescence emission intensity at 25 ° C.
- a spectrophotometer eg, a stop flow spectrophotometer (Aviv Instruments) or a 8000 series SLM- Fluorescence emission intensity at 25 ° C.
- antibody is used herein in the broadest sense, and is not limited to a monoclonal antibody, including but not limited to a chimeric, humanized, or human antibody, as long as it exhibits the desired antigen binding activity.
- Various antibody structures including polyclonal antibodies, multispecific antibodies (eg, bispecific antibodies) and antibody fragments.
- the antibody is a multispecific antibody, such as a bispecific antibody.
- Multispecific antibodies are monoclonal antibodies that have binding specificities for at least two different sites. In certain embodiments, one of the binding specificities is for a first antigen and the other is for a different second antigen. In certain embodiments, bispecific antibodies may bind to two different epitopes of the same antigen.
- Bispecific antibodies can be prepared as full length antibodies or antibody fragments.
- the antibody is a bispecific antibody that specifically binds to the first and second antigens.
- the bispecific antibody has i) a first binding specificity that specifically binds to a first antigen or to a first epitope on the antigen, and ii) a second antigen. Or a second binding specificity that specifically binds to a second epitope on the same antigen.
- the second epitope on the same antigen is a different epitope than the first epitope.
- Antibody fragment refers to a molecule other than a complete antibody, including a portion of the complete antibody that binds to an antigen to which the complete antibody binds.
- Examples of antibody fragments include, but are not limited to, Fv, Fab, Fab ′, Fab′-SH, F (ab ′) 2 ; diabodies; linear antibodies; single chain antibody molecules (eg, scFv And multispecific antibodies formed from antibody fragments.
- chimeric antibody is one in which a portion of the heavy and / or light chain is derived from a particular source or species, while the remaining portion of the heavy and / or light chain is derived from a different source or species. Refers to an antibody.
- the “class” of an antibody refers to the type of constant domain or constant region provided on the heavy chain of the antibody.
- the heavy chain constant domains that correspond to the different classes of immunoglobulins are called ⁇ , ⁇ , ⁇ , ⁇ , and ⁇ , respectively.
- the antibody comprises an antibody variant, for example, an antibody variant having one or more amino acid substitutions, insertions, or deletions, an antibody variant with a modified sugar chain, a water-soluble such as PEG, etc.
- An antibody derivative to which a polymer is bound is bound.
- a recombinant antibody produced using a gene recombination technique can be used as the antibody.
- Recombinant antibodies are produced by cloning DNA encoding them from hybridomas or antibody-producing cells such as sensitized lymphocytes that produce antibodies, incorporating them into vectors, and introducing them into hosts (host cells). Can be obtained.
- IgG type bispecific antibody can be secreted by hybridoma (quadroma) produced by fusing two hybridomas producing IgG antibody (Milstein Cet al. Nature 1983, 305: 537-540). Moreover, it can be secreted by co-expressing the L chain and H chain genes constituting the two kinds of target IgG, a total of four kinds of genes by introducing them into cells. Regarding the L chain, since the diversity of the L chain variable region is lower than that of the H chain variable region, it is expected that a common L chain capable of giving binding ability to both H chains can be obtained.
- the bispecific antibody may be an antibody having a common L chain.
- Bispecific antibodies can also be produced by chemically cross-linking Fab '.
- leucine zippers derived from Fos, Jun Jun and the like can be used instead of chemical crosslinking.
- sc (Fv) 2 such as IgG-scFv (Protein Eng Des Sel. 2010 Apr; 23 (4): 221-8) and BiTE (Drug Discov Today. 2005 Sep 15; 10 (18): 1237-44. ), DVD-Ig (Nat Biotechnol. 2007 Nov; 25 (11): 1290-7. Epub 2007 Oct 14., MAbs. 2009 Jul; 1 (4): 339-47. Epub 2009 Jul 10.) (IDrugs 2010, 13: 698-700), two-in-one antibody (Science. 2009 Mar 20; 323 (5921): 1610-4., Immunotherapy.
- Bispecific antibodies such as Tri-Fab, tandem scFv, and diabody are also known (MAbs. 2009 November; 1 (6): 539-547.). Furthermore, even when molecular forms such as scFv-Fc and scaffold-Fc are used, by secreting heterogeneous Fc preferentially (Ridgway JB et al. Protein Engineering 1996, 9: 617-621, Merchant AM et al Nature Biotechnology 1998, 16: 677-681, WO2006 / 106905, Davis JH et al. Protein Eng Des Sel. 2010, 4: 195-202.), Bispecific antibodies can be made efficiently.
- Bispecific antibodies can also be produced in diabodies.
- a bispecific diabody is a heterodimer of two cross-over scFv fragments.
- the detection of the tripartite complex can be performed as follows.
- an example of the bispecific antibody Emicizumab that recognizes FIX (a) and FX (a) is shown.
- the tripartite complex to be measured is composed of FIX (a), FX (a) and Emicizumab.
- a bispecific antibody that recognizes FIX (a) and FX (a) for preparing regression equations is prepared.
- the affinity of the bispecific antibody for preparing the regression equation is not necessarily high (low KD value), but higher affinity is preferable.
- the bispecific antibody for creating a regression equation for example, Q4 // J3 antibody (K D value for hFIX is 17.7 nm, K D values for hFX is 11.5 nm), Q3 // J1 antibodies (K against hFIX D value 1.20MyuM, although K D values may be used 58.3NM) for HFX, this example assumes use of Q4 // J3.
- FIX (a) antibody whose epitope for FIX (a) is different from that of Emicizumab and an FX (a) antibody whose epitope for FX (a) is different from that of Emicizumab.
- Examples of XB12 as an anti-FIX (a) antibody and SB04 as an anti-FX antibody are shown below, but the anti-FIX (a) antibody is not limited to XB12, and the anti-FX antibody is not limited to SB04.
- Ligand binding assay methods include enzyme immunoassay (ELISA), radioimmunoassay (RIA method) surface plasmon resonance (SPR), electrochemiluminescence (ECL) method, binding equilibrium exclusion method (KinExA (registered trademark): Kinetic) Exclusion Assay) (Drake et al., 2004, Analytical Biochemistry 328: 35-43) and the like can be used.
- ELISA enzyme immunoassay
- RIA method radioimmunoassay
- SPR surface plasmon resonance
- ECL electrochemiluminescence
- KinExA registered trademark
- Kinetic Kinetic Exclusion Assay
- the method has a smaller reaction field space size, a larger specific surface area of the solid surface, and a shorter assay time than the method using a microtiter plate, such as a method using a microfluidic chip, a disk, or a bead.
- a method using KinExA (registered trademark) or Gyrolab (registered trademark) immunoassay system can be used, but is not limited thereto.
- KinExA® 3200 (Sapidyne) can be used as a measuring instrument for KinExA (registered trademark)
- Gyrolab® xP (Gyros® Protein® Technologies) can be used for a Gyrolab® (registered trademark) immunoassay system.
- Gyrolab is a fully automated ligand binding assay system that uses a dedicated Bioaffy® CD for measurement. There is an affinity bead column in the channel on the CD, and the sample in the sample is specifically captured by the antibody solid-phased on the beads by passing the sample through the channel in a short time through the channel. The captured analyte is further detected using a fluorescent label of a specific antibody.
- KinExA® Stepidyne
- KinExA and Gyrolab have similar measurement principles and are used to calculate the dissociation constant of the antigen-antibody reaction in solution by measuring free antibody in the sample (Anal Biochem. 2012 Jul 15; 426 (2): 134-41).
- SB04 fluorescently labeled (Lightning-Link® Rapid Dylight® 650, prepared according to the manufacturer's protocol using Innova Biosciences) can be used as the detection antibody.
- the detection antibody solution containing the fluorescently labeled antibody is, for example, a fluorescently labeled anti-FX antibody (prepared according to the manufacturer's protocol using Lightning-Link (registered trademark) Rapid Dylight (registered trademark) 650, Innova Biosciences).
- Samples that spike only hFIX and hFX and do not spike anti-FIX / FX bispecific antibodies are blank samples.
- the concentration of hFIX and hFX is set as a physiological concentration (plasma concentration). After sample preparation, incubate at room temperature for 1 hour until measurement, so that complex formation reaches equilibrium.
- the measurement is performed according to the protocol recommended by the vendor. For example, the following methods are mentioned.
- One prepared suspension of beads is transferred to a bead bottle (Sapidyne) filled with 25 mL of running buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , pH 7.4).
- the protocol to control the device is created by KinExA Pro software (Sapidyne).
- the protocol is created so that an appropriate reagent is sampled at an appropriate timing by specifying an appropriate reagent / sample position for each measurement process.
- beads in which XB12 is immobilized are packed into a column in a flow cell.
- the amount of bead suspension to be applied is monitored and optimized with a camera so that the beads are reproducibly filled to the appropriate height.
- the released hFIX, hFIX and bispecific antibody bipartite complex, or the bispecific antibody bound to both hFIX and hFX are bound to the bead. Capture.
- the fluorescently labeled SB04 solution is passed through and the fluorescently labeled SB04 is passed.
- the antibody is bound to hFX in the captured ternary complex.
- the KinExA signal is detected as the fluorescence intensity increased from the baseline at the start of measurement. Sample, running buffer (+) in the first wash step, detection antibody solution, running buffer (+) in the second wash step, and running buffer (+) volume, time, and flow rate in the third wash step The signal value to noise ratio is measured under sufficient conditions.
- Sample 135 ⁇ L, 32.4 s, 0.25 mL / min
- Running buffer (+) in the first washing step 125 ⁇ L, 30 s, 0.25 mL / min
- Detection antibody solution 800 ⁇ L, 192 s, 0.25 mL / min
- Running buffer (+) in the second washing step 125 ⁇ L, 30 s, 0.25 mL / min
- Running buffer (+) in the third washing step 1500 ⁇ L, 90 s, 1.00 mL / min.
- FIX concentration, FX concentration, bispecific antibody concentration, and the bispecific antibodies of FIX it is necessary to define each respective K D values for FX, the concentration of FIX and FX are physiological Concentrations (plasma concentrations) were set constant at 5, 8 ⁇ g / mL (89.3, 136 nM), respectively, and the anti-FIX / FX bispecific antibody concentration was 0.0122-1600 ⁇ g / mL (0.0814-10667 nM). Change by 2 times in the range.
- the K D values for FIX and FX of bispecific antibodies can be carried out under conditions for example both equal conditions or K D values are for FIX, twice the K D values for FX.
- the ternary complex concentration under each condition is simulated, the ternary complex concentration is plotted on the Y axis, and the bispecific antibody concentration is plotted on the X axis, and each value is plotted.
- examples of Q4 // J antibodies are shown as bispecific antibodies.
- the average (Mean) and standard deviation (SD) of the signal value of the blank sample can be calculated, and for example, Mean + 3.29 ⁇ SD can be set as the detection limit.
- Calculation of the mean (Mean) and standard deviation (SD) of signal values can be performed using, for example, Microsoft Excel 2013.
- the three-component complex signal value is calculated by subtracting the Mean of the signal value of the blank sample for the sample that is above the detection limit. Plot the measured values with the tripartite complex signal value on the Y-axis and the bispecific antibody concentration on the X-axis.
- Gyrolab xP (Gyros Protein Technologies) can be used as a measurement instrument, and Bioaffy 200 CD can be used as a measurement CD.
- Bioaffy 200 CD can be used as a measurement CD.
- XB12 or SB04 can be used for acquisition, an example using XB12 is shown here. Since Gyrolab CD has streptavidin beads set, XB12 used for capture is biotinylated with Sulfo-NHS-LC-Biotin (Thermo Scientific) (biotin-XB12). The protocol refers to the product protocol. After the biotinylation treatment, treatment with Zeba Spin Desalting Columns (Thermo Scientific) is performed to remove the free biotin reagent.
- hFIX and hFX are fixed at 5, 8 ⁇ g / mL (89.3, 136 nM), respectively, and Q4 // J3 antibody is 0.195-50 ⁇ g / mL (1.30-333 nM) with a common ratio of 4 at a total of 5 concentrations
- Samples spiked with each are prepared in assay buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl 2 , 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4).
- Samples that spike only hFIX and hFX and do not spike anti-FIX / FX bispecific antibodies are blank samples.
- the concentration of hFIX and hFX is set as a physiological concentration (plasma concentration). After sample preparation, incubate at room temperature for 1 hour until measurement, so that complex formation reaches equilibrium.
- the measurement is performed according to the protocol recommended by the vendor. For example, the following methods are mentioned. Gyrolab xP workstation (Gyros Protein Technologies) is used as a measuring instrument, and Bioaffy 200 is used as a CD for measurement. All processes in the measurement are performed automatically by Gyrolab.
- the 200-3W-001 Wizard method in the Gyrolab Control software (Gyros Protein Technologies) is used as the protocol for controlling the instrument, and the operation proceeds in the order of capture antibody, sample, and detection antibody. To enter. The concentration of the capture antibody and the detection antibody is set as a condition where the signal value to noise ratio is high.
- assay buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl 2 , 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4) is used.
- capture antibody solution, sample, detection antibody solution, washing assay buffer are added to a dedicated PCR plate, and the plate is set in the instrument before measurement.
- the biotin-XB12 solution is captured by the streptavidin beads through the flow path.
- free hFIX, hFIX and bispecific antibody complex in the sample, and hFIX, hFX and bispecific antibody complex are captured by biotin-XB12 on the beads.
- the fluorescence-labeled SB04 solution is passed, and the fluorescence-labeled SB04 antibody is bound to hFX in the captured ternary complex.
- Detection is performed at three fixed values of the amplification level of the response by a photomultiplier tube (PMT), for example, 1, 5, and 25%, and the measured value at each setting is recorded.
- PMT photomultiplier tube
- ⁇ analysis ⁇ It is preferable to use a value obtained under the PMT condition indicating a value at which the detected response is sufficiently large and the detector is not saturated in the analysis.
- Calculation of the mean (Mean) and standard deviation (SD) of signal values can be performed using, for example, Microsoft Excel 2013. Of the signal values of the other samples, the three-component complex response is calculated by subtracting the Mean of the response of the blank sample for the sample that is above the detection limit.
- human plasma when used as a sample, for example, it can be performed as follows.
- KinExA 3200 Sonic Acid tesque
- 1M HEPES buffer solution pH 7.1-7.5, nacalai tesque
- 10000 unit / 10 mL Heparin Sodium is added to a final concentration of 10 unit / mL.
- the 1M HEPES buffer solution added here is, for example, 1/100 equivalent to 1/2 equivalent.
- 1/99 equivalent, 1/49 equivalent, 1/19 equivalent, 1/9 equivalent, 1/4 equivalent, and 1/2 equivalent when plasma is diluted and measured in the same manner as in a normal ELISA, the complex is dissociated by dilution, and therefore the purpose of measuring the complex in plasma cannot be achieved.
- the buffer action by HEPES buffer solution is used in order to suppress this. Heparin sodium is added to further suppress the coagulation reaction.
- the plasma thus prepared is hereinafter referred to as FVIIId (++) plasma.
- Whole blood and serum can be prepared in the same manner as described above.
- At least one of the components constituting the complex contained in the sample is a drug that can be used for treatment, and the treatment method is determined based on the concentration and / or amount of the complex in the sample.
- a method is provided.
- the therapeutic determination is the determination of the dose of the drug, the determination of the administration frequency.
- At least one of the components constituting the complex contained in the sample is a drug that can be used for treatment, and the determination of the treatment method is performed by detecting the complex.
- the therapeutic decision is made based on the signal value obtained by detecting the complex.
- the therapeutic method is determined based on a standardized signal value calculated based on a signal value obtained by detecting the complex.
- the therapeutic method is determined based on an arbitrary unit calculated based on the signal value obtained by detecting the complex.
- Emicizumab is a bispecific antibody that recognizes FIX (a) and FX and is used to treat hemophilia A.
- Emicizumab When Emicizumab is administered to a patient, it binds to FIX (a) or / and FX in the blood, and a bipartite complex of Emicizumab and FIX (a), a bipartite complex of Emicizumab and FX, Emicizumab, FIX ( Form a ternary complex with a) and FX.
- Emicizumab binds to FIX (a) and FX, and FIXa promotes the reaction of converting FX to FXa by physically bringing FIX (a) and FX close together. Therefore, it is necessary for Emicizumab to form the ternary complex in order to exert its medicinal effects, and detecting the ternary complex and determining the concentration and amount is a therapeutic decision. This is particularly important in determining dose setting and dosing frequency.
- the amount of the tripartite complex can potentially increase. An increase can occur. In order to evaluate the increase in its pharmacological action, measurement of a tripartite complex may be useful.
- treatment decisions can be made based on the concentration or amount of the tripartite complex.
- a plasma containing a known concentration of FIX and FX is spiked with a known concentration of a bispecific antibody, and the signal value obtained by measuring the tripartite complex and regression from the simulated concentration. Calculate the formula.
- plasma is prepared by centrifugation, and the concentration converted from the regression equation is obtained from the signal value obtained by detecting the tripartite complex.
- the concentration transition of the tripartite complex can be obtained by measuring the sample over time after administration of the bispecific antibody.
- the simulation concentration is a three-component complex concentration in an equilibrium state calculated on the assumption that the antibody concentration, the FIX concentration, the FX concentration, and the dissociation constants for FIX / FX, respectively, bind independently.
- examples of the calculation method of the regression equation include a linear regression method and a nonlinear regression method, but are not particularly limited thereto.
- the therapeutic method can be determined by evaluating the amount of the tripartite complex based on the signal value obtained by detecting the complex. From a blood sample collected after bispecific antibody administration, plasma is prepared by centrifugation, and a signal value obtained by measuring the tripartite complex is obtained. The time course of the signal value of the tripartite complex can be obtained by measuring the sample over time after administration of the bispecific antibody.
- the therapeutic method can be determined by evaluating the amount of the tripartite complex based on the standardized signal value.
- a standardization sample for example, a signal value obtained by measuring a tripartite complex by spiked a bispecific antibody with a known concentration in pooled plasma can be used as a standardization signal value.
- It is standardized by preparing plasma by centrifugation from a blood sample collected after bispecific antibody administration, and dividing the signal value obtained by measuring the tripartite complex by the signal value for standardization. Signal value obtained.
- a time course of the standardized signal value of the tripartite complex can be obtained by measuring the sample over time after administration of the bispecific antibody.
- pooled plasma is, for example, plasma obtained by mixing, dispensing, and freezing human plasma derived from multiple persons, or by dispensing and freezing human plasma spiked with a known concentration of a bispecific antibody. .
- the therapeutic method can be determined by evaluating the amount of the tripartite complex based on an arbitrary unit. First, the correspondence between the standardized signal value obtained by the above method and the unit (A.U.) of an arbitrary three-component complex amount is determined. Plasma was prepared from a blood sample collected after bispecific antibody administration by centrifugation, and the signal value obtained by measuring the tripartite complex was divided by the signal value for standardization. Get the signal value. The standardized signal value is then converted to A.U. A time course of the A.U. of the tripartite complex can be obtained by measuring the sample over time after administration of the bispecific antibody.
- At least one of the components constituting the complex contained in the sample is a drug that can be used for treatment, and the kinetics of the drug is evaluated based on the concentration and / or amount of the complex in the sample.
- a method is provided.
- a method for assessing the pharmacokinetics of a complex comprising a bispecific antibody is provided.
- the pharmacokinetic properties of a bispecific antibody are as follows: when the antibody is alone, it binds to one antigen and forms a bipartite complex, or when it binds to two antigens and forms a ternary complex, It may be potentially different due to the nature of the antigen itself, structural changes when forming a complex, physicochemical changes, and the like. Therefore, by measuring the tripartite complex, it is possible to evaluate the antigen-dependent pharmacokinetic characteristics of the bispecific antibody, and to perform pharmacokinetic prediction using modeling and simulation with high accuracy.
- At least one of the components constituting the complex contained in the sample is a drug that can be used for treatment. Based on the concentration and / or amount of the complex in the sample, the effect and safety of the drug are determined. A method for assessing sex is provided. In a specific embodiment, the evaluation of the effect and safety of the drug is performed by the same method as the determination of the treatment method.
- the tripartite complex in solution is considered to be in an equilibrium state of binding and dissociation. Therefore, when a sample is incubated with a solid phase for a long time such as 1 hour, as in normal ELISA, the equilibrium is obtained. It was considered that the state of the complex in the solution could not be correctly reflected. In addition, since the affinity between the antigen and antibody of the complex is not sufficiently high, the complex is not obtained by a long incubation with the detection antibody solution or multiple washings with a large amount of buffer as in normal ELISA. Since it easily dissociates, it was considered difficult to detect the complex with sufficient sensitivity and reproducibility.
- KinExA (Sapidyne) was employed as a measuring instrument because the reaction time between the sample and the antibody on the solid phase was sufficiently short, and the washing could be carried out in a short time with a small amount of buffer.
- Gyrolab which was considered to be able to achieve measurement under the same conditions, was also employed as a measuring instrument.
- Example 2 Selection of anti-FIX antibody and anti-FX antibody
- the bispecific antibody is immobilized on a bead.
- Anti-FIX antibody in-house preparation: XB12
- anti-FX antibody in-house preparation: in-house preparation: Lightning-Link (registered trademark) Rapid Dylight (registered trademark) 650, prepared according to the manufacturer's protocol using Innova Biosciences)
- assay buffer 0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05%
- Surfactant P20 1.2 mM CaCl 2 , 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4
- the preparation process in order to remove the aggregate of the fluorescent label, first, it was prepared to 5 ⁇ g / mL, then centrifuged at 18,000 g for 10 minutes, and the supernatant was further diluted to 0.5 ⁇ g / mL.
- hFIX Enzyme Research Laboratories
- hFIXa Enzyme Research Laboratories
- hFIXa Enzyme Research Laboratories
- hFIXa is assay buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 12.5, 6.25, 3.13, 1.56, 0 ⁇ g / mL (272, 136,
- KinExA 3200 (Sapidyne) was used as a measuring instrument. Two prepared suspensions of beads were transferred to a bead bottle (Sapidyne) filled with 24 mL of running buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , pH 7.4). A bead bottle, a sample, and a detection antibody solution were set at each position on the KinExA 3200 autosampler. All processes in the measurement were performed automatically by KinExA 3200 and autosampler. The protocol for controlling the instrument was created with KinExA Pro software (Sapidyne).
- the protocol was created so that an appropriate reagent was sampled at an appropriate timing by specifying an appropriate reagent / sample position for each measurement process (the same applies to the following examples).
- the beads were packed into a column in a flow cell.
- the amount of bead suspension to be applied was optimized by monitoring with a camera so that the beads were reproducibly filled to the appropriate height.
- the hFIX (hFIXa) was captured by the antibody on the beads by passing a dilution series sample of hFIX (hFIXa) through the column.
- the solution is passed through a fluorescence-labeled anti-FIX antibody solution and fluorescent.
- the labeled anti-FIX antibody was bound to the captured hFIX (hFIXa) (FIG. 2 (A)).
- the KinExA signal was detected as the fluorescence intensity increased from the baseline at the start of measurement.
- the hFX (hFXa) was captured by the antibody on the beads by passing a sample containing hFX (hFXa) through the column.
- running buffer (+) (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN 3 , pH 7.4)
- the solution is passed through a fluorescence-labeled anti-FX antibody solution and fluorescent.
- a labeled anti-FX antibody was bound to the captured hFX (hFXa) (FIG. 2 (B)).
- the KinExA signal was detected as the fluorescence intensity increased from the baseline at the start of measurement.
- Example 3 Affinity evaluation of anti-FIX / FX bispecific antibody Kinetic analysis of anti-FIX / FX bispecific antibodies
- Q4 // J3 antibody and Q3 // J1 antibody binding to antigen was performed using Biacore T200 (GE Healthcare) (buffer: 10 mM HEPES, 150 mM NaCl, 0.05% Surfactant P20, 2.5 mM CaCl 2 , pH 7.4).
- Emicizumab Reference values were used for the affinity of Emicizumab for FIX and FX (Kitazawa, Thromb Haemost 117 (7): 1348-1357 (2017)).
- Q4 // J3 antibody, Q3 // J1 antibody, and Emicizumab are antibodies obtained according to the methods described in WO2005 / 035756, WO2006 / 109592, and WO2012 / 067176.
- Example 4 Verification of specificity of complex measurement Anti-FIX antibody (XB12) and anti-FX antibody (SB04) that recognize epitope different from anti-FIX / FX bispecific antibody selected in Example 2 Can be used for capture on beads (Capture), detection with fluorescent label (Detection), or vice versa, in two measurements Format 1 and 2, respectively. It was verified whether it could be detected specifically (Fig. 4 (A, B)).
- Anti-FIX antibody in-house preparation: XB12
- anti-FX antibody in-house preparation: in-house preparation: Lightning-Link (registered trademark) Rapid Dylight (registered trademark) 650, prepared according to the manufacturer's protocol using Innova Biosciences)
- Each solution of SB04 was prepared according to Example 2.
- sample preparation Samples spiked with hFIX, hFX and bispecific antibody (Q4 // J3) at concentrations of 5, 8, 12.5 ⁇ g / mL (89.3, 136, 83.3 nM), respectively.
- Assay buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl 2 , 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH) 7.4).
- Sample spiked with all three Sample spiked with all three (Sample No.1), sample spiked with bispecific antibody and hFIX (Sample No.2), sample spiked with bispecific antibody and hFX (Sample No.3), Sample spiked with hFIX and hFX (Sample No.
- sample spiked with bispecific antibody only (Sample No. 5), sample spiked with hFIX only (Sample No. 6), sample spiked with hFX only (Sample No. 5) .7) and a blank sample (Sample No. 8) were prepared (Table 2).
- concentration of hFIX and hFX was set as a physiological concentration (plasma concentration). After sample preparation, incubation was continued for 1 hour at room temperature until measurement, so that complex formation reached equilibrium.
- KinExA 3200 (Sapidyne) was used as a measuring instrument.
- One prepared suspension of beads was transferred to a bead bottle (Sapidyne) filled with 25 mL of running buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , pH 7.4).
- a bead bottle, a sample, and a detection antibody solution were set at each position on the KinExA 3200 autosampler.
- Format 1 first, beads in which XB12 was immobilized were packed in a column in a flow cell. The amount of bead suspension to be applied was optimized by monitoring with a camera so that the beads were reproducibly filled to the appropriate height.
- the released hFIX, hFIX and bispecific antibody bipartite complex, and the bispecific antibody bound to both hFIX and hFX are removed. Captured on beads.
- running buffer (+) (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN 3 , pH 7.4)
- the fluorescently labeled SB04 solution is passed through and the fluorescently labeled SB04 is passed.
- the antibody was bound to hFX in the captured ternary complex.
- the KinExA signal was detected as the fluorescence intensity increased from the baseline at the start of measurement (FIG. 5 (A)).
- Format 2 first, beads in which SB04 was immobilized were packed in a column in a flow cell. The amount of bead suspension to be applied was optimized by monitoring with a camera so that the beads were reproducibly filled to the appropriate height. Next, by passing the sample through the column, the released hFX, hFX and bispecific antibody bipartite complex, or the bispecific antibody bound to both hFIX and hFX, are bound to the beads. Captured.
- the fluorescently labeled XB12 solution was passed through to bind the fluorescently labeled XB12 antibody to hFIX in the captured ternary complex.
- the KinExA signal was detected as the fluorescence intensity increased from the baseline at the start of measurement (FIG. 5 (B)).
- Sample, running buffer (+) in the first wash step, detection antibody solution, running buffer (+) in the second wash step, and running buffer (+) volume, time, and flow rate in the third wash step The signal value to noise ratio was measured under sufficient conditions. Each condition in this measurement is shown below.
- FIX concentration, FX concentration, bispecific antibody concentration, and the bispecific antibodies of FIX it is necessary to define each respective K D values for FX, the concentration of FIX and FX are physiological Concentrations (plasma concentrations) were set constant at 5, 8 ⁇ g / mL (89.3, 136 nM), respectively, and the anti-FIX / FX bispecific antibody concentration was 0.0122-1600 ⁇ g / mL (0.0814-10667 nM). The range was changed by 2 times.
- the K D values for FIX and FX of the bispecific antibody and both are equal conditions, the conditions K D values are twice the K D values for FX for FIX, K D values for FIX 5-2560 It was changed by 2 times within the range of nM.
- the ternary complex concentration under each condition was simulated, the ternary complex concentration was plotted on the Y axis, and the bispecific antibody concentration was plotted on the X axis, and each value was plotted.
- Example 6 Comparison of actual measurement value and simulation value From the simulation result of Example 5, the bispecific antibody having a relatively high affinity (small KD value) is a three-component compound due to a change in KD value. The effect on body concentration was small. Therefore, for bispecific antibodies with high affinity, even if there is a measurement error in the KD value, it does not significantly affect the simulation of the tripartite complex concentration, so the measured value and the simulated value are likely to match. It was. Therefore, using the Q4 // J3 antibody having a relatively high affinity, the measured tripartite complex signal value was compared with the simulation value.
- hFIX and hFX are fixed at 5, 8 ⁇ g / mL (89.3, 136 nM), respectively, and Q4 // J3 antibody is 0.195-200 ⁇ g / mL (1.30-1333 nM) with a common ratio of 2 for a total of 11 concentrations
- Samples spiked with were prepared in assay buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl 2 , 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA pH 7.4). Samples spiked only with hFIX and hFX and not spiked with Q4 // J3 antibody were used as blank samples.
- the concentrations of hFIX and hFX were set as physiological concentrations (plasma concentrations). After sample preparation, incubation was continued for 1 hour at room temperature until measurement, so that complex formation reached equilibrium.
- KinExA 3200 (Sapidyne) was used as a measuring instrument.
- One prepared suspension of beads was transferred to a bead bottle (Sapidyne) filled with 25 mL of running buffer (0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , pH 7.4).
- a bead bottle, a sample, and a detection antibody solution were set at each position on the KinExA 3200 autosampler.
- beads in which XB12 was immobilized were packed in a column in a flow cell.
- the amount of bead suspension to be applied was optimized by monitoring with a camera so that the beads were reproducibly filled to the appropriate height.
- the released hFIX, hFIX and bispecific antibody bipartite complex, or the bispecific antibody bound to both hFIX and hFX are bound to the bead. Captured.
- running buffer (+) (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN 3 , pH 7.4)
- the fluorescently labeled SB04 solution is passed through and the fluorescently labeled SB04 is passed.
- the antibody was bound to hFX in the captured ternary complex.
- the KinExA signal was detected as the fluorescence intensity increased from the baseline at the start of measurement.
- Sample, running buffer (+) in the first wash step, detection antibody solution, running buffer (+) in the second wash step, and running buffer (+) volume, time, and flow rate in the third wash step The signal value to noise ratio was measured under sufficient conditions. Each condition in this measurement is shown below.
- Example 7 Evaluation of ternary complex with antibodies having different affinity For three anti-FIX / FX bispecific antibodies (Q4 // J3, Q3 // J1, Emicizumab) having different affinity, We compared the concentrations of the tripartite complex formed.
- hFIX and hFX are fixed at 5, 8 ⁇ g / mL (89.3, 136 nM), respectively, and Q4 // J3 antibody is 0.0488-50 ⁇ g / mL (0.326-333 nM) with a common ratio of 4 in total, Q3 // J1 antibody with a common ratio of 2 between 1.38-354 ⁇ g / mL (9.20-2360 nM) and Emicuzumab with a common ratio of 2 between 6.25-400 ⁇ g / mL (41.7-2667 nM) Samples spiked at 7 concentrations were prepared with assay buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl 2 , 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4).
- hFIX and hFX Samples spiked only with hFIX and hFX and not spiked with anti-FIX / FX bispecific antibody were used as blank samples.
- concentrations of hFIX and hFX were set as physiological concentrations (plasma concentrations). After sample preparation, incubation was continued for 1 hour at room temperature until measurement, so that complex formation reached equilibrium.
- KinExA 3200 (Sapidyne) was used as a measuring instrument.
- One prepared suspension of beads was transferred to a bead bottle (Sapidyne) filled with 25 mL of running buffer (0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , pH 7.4).
- a bead bottle, a sample, and a detection antibody solution were set at each position on the KinExA 3200 autosampler.
- beads in which XB12 was immobilized were packed in a column in a flow cell.
- the amount of bead suspension to be applied was optimized by monitoring with a camera so that the beads were reproducibly filled to the appropriate height.
- the released hFIX, hFIX and bispecific antibody bipartite complex, or the bispecific antibody bound to both hFIX and hFX are bound to the bead. Captured.
- running buffer (+) (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN 3 , pH 7.4)
- the fluorescently labeled SB04 solution is passed through and the fluorescently labeled SB04 is passed.
- the antibody was bound to hFX in the captured ternary complex.
- the KinExA signal was detected as the fluorescence intensity increased from the baseline at the start of measurement.
- Sample, running buffer (+) in the first wash step, detection antibody solution, running buffer (+) in the second wash step, and running buffer (+) volume, time, and flow rate in the third wash step The signal value to noise ratio was measured under sufficient conditions. Each condition in this measurement is shown below.
- the concentration of the ternary complex formed by Emicizumab was 10.4 nM when the antibody concentration was 100 ⁇ g / mL (667 nM) (FIG. 8 (C)).
- 1.56%, 11.6%, and 7.65% of the antibody, hFIX, and hFX in the sample form a ternary complex, respectively. Therefore, in both antibodies, it was confirmed that the formation rate of the ternary complex was low for any component.
- Example 8 Examination of influence of dissociation of complex in assay In the step of measuring a tripartite complex formed by anti-FIX / FX bispecific antibodies having different affinities, the complex was captured by beads. The degree of dissociation of the tripartite complex at the time of subsequent washing may vary depending on the affinity. Therefore, we examined the effect of dissociation of the tripartite complex on the signal value by examining whether the behavior of the signal value during washing differs between anti-FIX / FX bispecific antibodies with different affinities.
- the Q4 // J3 antibody was spiked at 3.13 ⁇ g / mL (20.8 nM), the Q3 // J1 antibody at 11.1 ⁇ g / mL (74.0 nM), and Emicizumab at 100 ⁇ g / mL (667 nM) spike. Since the three-component complex signal values were the same in each sample, it was considered that the three-component complexes having different affinity were captured and detected on the beads in these sample measurements. Therefore, the behavior of the signal value during washing in these sample measurements was compared, and the degree of dissociation of the tripartite complex was compared.
- the signal value during the measurement process of each sample was output from the KinExA Pro software, and plotted in a diagram with the signal value on the Y axis and the time on the X axis. Differences between the three types of samples were simultaneously obtained and plotted in the same manner (FIG. 9 (AC)).
- FIG. 9 since the beads filling, sample capturing and washing steps continue for about 250 seconds from the start of the measurement, the signal value of KinExA takes a constant value. After that, since the fluorescently labeled detection antibody passes through the column, the signal value greatly increases, and then the washing process is started, so the signal value decreases, and finally, the portion that has increased from the baseline becomes the signal value. can get.
- the detection antibody released in the washing step of the detection antibody is washed, and at the same time, the dissociation of the complex captured on the beads is reduced as the signal value. May be observed. Therefore, if there is a difference in dissociation between complexes with different affinity, it should be observed as a time-dependent change in the difference in signal value between samples.
- Example 9 Measurement of time-dependent complex formation
- the complex is captured in a bead in the sample.
- Q3 // J1 antibody and Emicizumab (see Example 7) were used.
- sample preparation First, hFIX and hFX were added to assay buffers (0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 1.2 mM CaCl 2 , 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4) at 5, 8 ⁇ g / mL (89.3, 136 nM) Added samples were prepared. The Q3 // J1 antibody was added and mixed immediately before the measurement so that the final concentration was 5.54 ⁇ g / mL (36.9 nM). Similarly, Emicizumab was added and mixed immediately before the measurement so that the final concentration was 100 ⁇ g / mL (667 nM). Samples spiked only with hFIX and hFX and not spiked with anti-FIX / FX bispecific antibody were used as blank samples.
- KinExA 3200 (Sapidyne) was used as a measuring instrument.
- One prepared suspension of beads was transferred to a bead bottle (Sapidyne) filled with 25 mL of running buffer (0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , pH 7.4).
- a bead bottle, a sample, and a detection antibody solution were set at each position on the KinExA 3200 autosampler.
- beads in which XB12 was immobilized were packed in a column in a flow cell.
- the amount of bead suspension to be applied was optimized by monitoring with a camera so that the beads were reproducibly filled to the appropriate height.
- the released hFIX, hFIX and bispecific antibody bipartite complex, or the bispecific antibody bound to both hFIX and hFX are bound to the bead. Captured.
- running buffer (+) (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN 3 , pH 7.4)
- the fluorescently labeled SB04 solution is passed through and the fluorescently labeled SB04 is passed.
- the antibody was bound to hFX in the captured ternary complex.
- the KinExA signal was detected as the fluorescence intensity increased from the baseline at the start of measurement.
- Sample, running buffer (+) in the first wash step, detection antibody solution, running buffer (+) in the second wash step, and running buffer (+) volume, time, and flow rate in the third wash step The signal value to noise ratio was measured under sufficient conditions. Each condition in this measurement is shown below.
- the tripartite complex signal value was calculated by subtracting the average value of the blank sample signal value from each KinExA signal value.
- the elapsed time from antibody addition / mixing to measurement was plotted on the Y axis, and the tripartite complex signal value was plotted on the X axis, and the measured values were plotted (FIG. 10).
- Gyrolab is a fully automated ligand binding assay system that performs measurements using a dedicated Bioaffy CD. There is an affinity bead column in the channel on the CD, and the analyte in the sample is specifically captured by the antibody immobilized on the beads by passing the sample through the column in a short time through the channel. The captured analyte is further detected using a specific antibody fluorescent label.
- Gyrolab is similar to KinExA in that it captures analytes in the sample in a short time and the amount and time of the washing process are automatically controlled. This was selected as a measuring instrument. In fact, since the measurement principles of KinExA and Gyrolab are similar, they are used to calculate the dissociation constant of the antigen-antibody reaction in solution by measuring the free antibody in the sample (Anal Biochem. 15; 426 (2): 134-41, 2012).
- Anti-FX antibody in-house preparation: SB04
- fluorescently labeled Alexa Fluor 647 Antibody Labeling Kit, prepared according to the manufacturer's protocol using Thermo Scientific
- assay buffer 0.01M
- HEPES 0.15M NaCl, 1.2 mM CaCl 2 , 0.05%
- Surfactant P20 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4
- hFIX and hFX are fixed at 5, 8 ⁇ g / mL (89.3, 136 nM), respectively, and Q4 // J3 antibody is 0.195-50 ⁇ g / mL (1.30-333 nM) with a common ratio of 4 at a total of 5 concentrations
- Samples spiked with each were prepared with assay buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl 2 , 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4). Samples spiked only with hFIX and hFX and not spiked with anti-FIX / FX bispecific antibody were used as blank samples.
- the concentrations of hFIX and hFX were set as physiological concentrations (plasma concentrations). After sample preparation, incubation was continued for 1 hour at room temperature until measurement, so that complex formation reached equilibrium.
- Gyrolab xP workstation (Gyros Protein Technologies) was used as a measuring instrument, and Bioaffy 200 was used as a CD for measurement. All processes in the measurement were performed automatically by Gyrolab.
- the 200-3W-001 Wizard method in the Gyrolab Control software (Gyros Protein Technologies) is used as the protocol for controlling the instrument, and the operation proceeds in the order of capture antibody, sample, and detection antibody. I tried to enter.
- the concentration of the capture antibody and the detection antibody was set as a condition where the signal value to noise ratio was high.
- assay buffer (0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl 2 , 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4) was used.
- the capture antibody solution, sample, detection antibody solution, and assay buffer for washing were added to a dedicated PCR plate according to the plate design generated from the prepared protocol, and the plate was set in the instrument before measurement.
- the biotin-XB12 solution is captured by the streptavidin beads through the flow path.
- Example 11 Evaluation of ternary complex with antibodies having different affinity in human plasma Three anti-FIX / FX bispecific antibodies (Q4 // J3, Q3 // J1, Emicizumab having different affinity) ) was compared with the concentration of ternary complex formed in each of the congenital Factor VIII deficient human plasma using KinExA 3200 (Sapidyne) as a measuring instrument.
- KinExA 3200 (Sapidyne) was used as a measuring instrument.
- One prepared suspension of beads was transferred to a bead bottle (Sapidyne) filled with 25 mL of running buffer (0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN 3 , pH 7.4).
- a bead bottle, a sample, and a detection antibody solution were set at each position on the KinExA 3200 autosampler. All processes in the measurement were performed automatically by KinExA 3200 and autosampler.
- the protocol for controlling the instrument was created with KinExA Pro software (Sapidyne).
- the protocol was created so that an appropriate reagent was sampled at an appropriate timing by specifying an appropriate reagent / sample position for each measurement process.
- beads in which XB12 was immobilized were packed in a column in a flow cell.
- the amount of bead suspension to be applied was optimized by monitoring with a camera so that the beads were reproducibly filled to the appropriate height.
- the released hFIX, hFIX and bispecific antibody bipartite complex, or the bispecific antibody bound to both hFIX and hFX are bound to the bead. Captured.
- the fluorescently labeled SB04 solution is passed through and the fluorescently labeled SB04 is passed.
- the antibody was bound to hFX in the captured ternary complex.
- the KinExA signal was detected as the fluorescence intensity increased from the baseline at the start of measurement. Sample, running buffer (+) in the first wash step, detection antibody solution, running buffer (+) in the second wash step, and running buffer (+) volume, time, and flow rate in the third wash step The signal value to noise ratio was measured under sufficient conditions.
- the tripartite complex signal value of the sample spiked with the Q3 // J1 antibody and Emicizumab was converted to a concentration from the regression equation of FIG.
- the converted concentration was plotted on the Y axis and the anti-FIX / FX bispecific antibody concentration was plotted on the X axis (FIG. 12 (C)).
- the intensity of the ternary complex signal value varies, and the higher the affinity (smaller the KD value), the lower the antibody concentration, the more the signal value is observed. It was.
- saturation of the signal value was observed in the concentration range of the prepared sample.
- the signal value is saturated at an antibody concentration of 12.5-50 ⁇ g / mL (83.3-333 nM).
- the Q3 // J1 antibody the antibody concentration is 177-354 ⁇ g / mL (1180- The signal value saturated at 2360 nM).
- Emicizumab the signal value did not saturate until the antibody concentration was 400 ⁇ g / mL (2667 nM).
- Example 12 Verification of specificity of measurement of complex formed by anti-IL-6R antibody and soluble IL-6R Two-component complex formed by anti-IL-6R antibody (Tocilizumab) and soluble hIL-6R In order to detect this, we devised an anti-IL-6R antibody that recognizes an epitope different from that recognized by Tocilizumab and a method that specifically recognizes the complex using an anti-hIgG Fc antibody (Fig. 13). This specificity was verified.
- a solution of an anti-hIgG Fc antibody fluorescently labeled (Alexa Fluor TM 647 Antibody Labeling Kit, prepared according to the manufacturer's protocol using Thermo Fisher Scientific) was prepared in the same manner as in Example 2.
- Sample preparation Samples spiked with Tocilizumab and IL-6R at a concentration of 1, 0.1 ⁇ g / mL, or samples spiked only on one side and blank samples were assay buffer (0.01 M phosphate buffered saline, 0.138 M NaCl, 0.0027 M KCl, 0.05 % Tween 20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4) (Table 3). The concentration of hIL-6R was set as a physiological concentration. After sample preparation, it was incubated at room temperature for 3 hours until measurement so that complex formation reached equilibrium.
- KinExA 3200 (Sapidyne) with a short contact time of less than 0.5 seconds between the sample and the solid phase antibody was used as a measuring instrument.
- a bead bottle (Sapidyne) filled with 25 mL of running buffer (0.01 M phosphate buffered saline, 0.138 M NaCl, 0.0027 M KCl, 0.05% Tween 20, 0.02% NaN 3 , pH 7.4) Moved to the company).
- a bead bottle, a sample, and a detection antibody solution were set at each position on the KinExA 3200 autosampler.
- sample value running buffer in the first wash step
- detection antibody solution running buffer in the second wash step
- running buffer volume, time, and flow rate in the third wash step are each changed.
- the measurement was performed under sufficient conditions. Each condition in this measurement is shown below.
- running buffer in the first washing step 125 ⁇ L, 30 s, 0.25 mL / min
- detection antibody solution 500 ⁇ L, 120 s, 0.25 mL / min
- second Running buffer in the next washing step 125 ⁇ L, 30 s, 0.25 mL / min
- running buffer in the third washing step 1500 ⁇ L, 90 s, 1.00 mL / min.
- n 1.
- Example 13 Comparison of measured value and simulation value in measurement of complex formed between anti-IL-6R antibody and soluble IL-6R As in Example 6, anti-IL-6R antibody and soluble IL-6R Also in the measurement of the complex formed by, the measured value was compared with the simulation value. Thus, in this measurement, in accordance with the K D value complex is formed, and it was confirmed that the binding equilibrium is measured without largely shifted.
- IL-6R is constant at 0.103 ⁇ g / mL (2 nM), and Tocilizumab is 0, 0.003, 0.009, 0.03, 0.09, 0.3, 0.9, 3 ⁇ g / mL (0, 0.04, 0.12, 0.4, 1.2, 4, 12, 40 nM) and samples spiked at a total of 8 concentrations were assay buffer (0.01 M phosphate buffered saline, 0.138 M NaCl, 0.0027 M KCl, 0.05% Tween 20, 0.02% NaN 3 , 0.1% BSA, pH 7.4) It was prepared with. Samples without spikes were used as blank samples. The concentration of hIL-6R was set as a physiological concentration. After sample preparation, it was incubated at room temperature for 3 hours until measurement so that complex formation reached equilibrium.
- KinExA 3200 (Sapidyne) was used as a measuring instrument, and the measurement was performed in the same procedure as in Example 12. The sample value, running buffer in the first wash step, detection antibody solution, running buffer in the second wash step, and running buffer volume, time, and flow rate in the third wash step are each changed. The measurement was performed under sufficient conditions. Each condition in this measurement is shown below.
- the concentration of Tocilizumab molecule multiplied by 2 was treated as the binding site concentration.
- the concentration was calculated assuming that the binding state of one binding site and hIL-6R was a binary complex. That is, there is no distinction between a state in which 1 molecule of Tocilizumab is bound to 2 molecules of hIL-6R and a state in which 2 molecules of Tocilizumab are bound to 1 molecule of hIL-6R.
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Abstract
Description
また、本発明者らは、前記測定方法により決定した複合体の濃度および/または量を基に、複合体の動態を評価する方法、および薬剤を用いた治療法を決定する方法を見出すことに成功した。
本発明は、具体的には下記〔1〕~〔33〕を提供するものである。
〔1〕試料中の複合体を検出する方法であって、
(1)第一の結合体と複合体を含む試料とを接触させ、第一の結合体と複合体とを結合させる工程、
(2)第一の結合体に結合した複合体と、第二の結合体とを結合させる工程、および
(3)複合体と結合した第二の結合体を検出する工程、
を含み、前記複合体は2以上の成分を含み、前記成分間の少なくともいずれか一つのKD値が1nM以上であり、複合体の結合平衡が実質的に維持される条件で行われる、前記方法。
〔2〕複合体の成分は、標識化あるいは固相に固定化されていない、〔1〕に記載の方法。
〔3〕前記成分はペプチド、ポリペプチドおよびタンパク質からなる群から少なくとも一つ選択される、〔1〕または〔2〕に記載の方法。
〔4〕前記成分の少なくとも2つは、抗体および当該抗体が認識する抗原である、〔1〕~〔3〕のいずれかに記載の方法。
〔5〕前記成分の少なくとも3つは、二重特異性抗体および前記抗体が認識する2つの抗原である、〔1〕~〔4〕のいずれかに記載の方法。
〔6〕第二の結合体が標識されている、〔1〕~〔5〕のいずれかに記載の方法。
〔7〕試料は血液試料であり、さらに好ましくは全血、血清または血漿である、〔1〕~〔6〕のいずれかに記載の方法。
〔8〕第一の結合体は固相に結合している、〔1〕~〔7〕のいずれかに記載の方法。
〔9〕固相は、チップ、マイクロ流体チップ、ディスクまたはビーズである、〔8〕に記載の方法。
〔10〕KinExAまたはGyrolabにより測定される、〔1〕~〔9〕のいずれかに記載の方法。
〔11〕二重特異性抗体は下記の(a)、2つの抗原は下記の(b)および(c)である、〔5〕~〔10〕のいずれかに記載の方法。
(a)血液凝固第IX因子および/または活性化血液凝固第IX因子、ならびに、血液凝固第X因子を認識する二重特異性抗体
(b)血液凝固第IX因子または活性化血液凝固第IX因子
(c)血液凝固第X因子
〔12〕〔1〕~〔11〕のいずれかに記載の方法にさらに以下の工程を行う、試料中の複合体の濃度および/または量を決定する方法。
(4)回帰式作成用の複合体を準備する工程、
(5)前記工程(4)の複合体を前記工程(1)~(3)の工程を含む工程により検出する工程、
(6)前記工程(4)の複合体濃度をシミュレーションする工程、
(7)前記工程(5)で検出したシグナル値とシミュレーション濃度より回帰式を算出する工程、及び、(8)前記工程(3)により検出したシグナル値を前記回帰式に当てはめる工程。
〔13〕少なくとも一つの成分が薬剤である、〔12〕に記載の方法。
〔14〕〔13〕に記載の方法により決定した複合体の濃度および/または量を基に、薬剤を用いた治療法を決定する方法。
〔15〕〔12〕~〔14〕のいずれかに記載の方法により決定した複合体の濃度および/または量を基に、複合体の動態を評価する方法。
〔16〕試料中の複合体の濃度および/または量を決定する方法であって、前記複合体は2以上の成分を含み、前記成分間の少なくともいずれか一つのKD値が1nM以上であり、前記複合体の結合平衡が実質的に維持される条件で行われ、(1)第一の結合体と複合体を含む試料とを接触させ、第一の結合体と複合体とを結合させる工程、(2)第一の結合体に結合した複合体と、第二の結合体とを結合させる工程、(3)複合体と結合した第二の結合体を検出する工程、(4)回帰式作成用の複合体を準備する工程、(5)前記工程(4)の複合体を前記工程(1)~(3)の工程を含む工程により検出する工程、(6)前記工程(4)の複合体濃度をシミュレーションする工程、(7)前記工程(5)で検出したシグナル値とシミュレーション濃度より回帰式を算出する工程、および、(8)前記工程(3)により検出したシグナル値を前記回帰式に当てはめる工程、を含む、前記方法。
〔17〕試料中の複合体を検出する方法であって、前記複合体は成分として二重特異性抗体及びそれが認識する2つの抗原を含む3者複合体であり、(1)前記抗原を認識する第一の結合体と前記複合体を含む試料とを接触させ、第一の結合体と複合体とを結合させる工程、(2)第一の結合体に結合した複合体と、第一の結合体が認識する抗原とは異なる抗原を認識する第二の結合体とを結合させる工程、および、(3)複合体と結合した第二の結合体を検出する工程、を含む、前記方法。
〔18〕第一の結合体は固相に結合している、〔1〕~〔17〕のいずれかに記載の方法。
〔19〕前記方法を、固相上で新たな複合体を実質的に生じず、かつ/または、複合体の解離が実質的に生じない条件で行う、〔18〕に記載の方法。
〔20〕前記方法を、理論的に結合平衡が移動しないほど短い時間である条件で行う、〔1〕~〔19〕のいずれかに記載の方法。
〔21〕前記方法を、試料と固相との接触時間が10秒以下の条件で行う、〔18〕~〔20〕のいずれかに記載の方法。
〔22〕固相に結合した第一の結合体に複合体を結合させる工程から、第二の結合体を検出する工程の直前までの工程が、10分以内で行われる、〔18〕~〔21〕のいずれかに記載の方法。
〔23〕標識は発光標識、化学発光標識、電気化学発光標識、蛍光標識、または放射性標識である、〔2〕または〔6〕に記載の方法。
〔24〕治療法の決定は、薬剤の用量の決定または投与頻度の決定である、〔14〕に記載の方法。
〔25〕〔13〕に記載の方法により検出したシグナル値を基に、薬剤を用いた治療法を決定する方法。
〔26〕〔13〕に記載の方法により検出したシグナル値を基に算出する標準化シグナル値を基に、薬剤を用いた治療法を決定する方法。
〔27〕〔13〕に記載の方法により検出したシグナル値を基に算出する任意の単位を基に、薬剤を用いた治療法を決定する方法。
〔28〕洗浄工程をさらに含む、〔1〕~〔26〕のいずれかに記載の方法。
〔29〕血液試料、さらに好ましくは全血、血清または血漿は、100分の1当量~2分の1当量の1M HEPES溶液の添加により調製される、〔7〕に記載の方法。
〔30〕試料の調製方法あるいは製造方法であって、試料の100分の1当量~2分の1当量の1M HEPES溶液を添加する、方法。
〔31〕試料は血液試料であり、さらに好ましくは全血、血清または血漿である〔30〕に記載の方法。
〔32〕〔13〕に記載の方法により決定した複合体の濃度および/または量を基に、薬剤の効果を評価する方法。
〔33〕〔13〕に記載の方法により決定した複合体の濃度および/または量を基に、薬剤の安全性を評価する方法。
Ligand binding assay法としては、酵素免疫測定法(ELISA)、放射免疫測定法(RIA法)表面プラズモン共鳴(SPR)、電気化学発光(ECL)法、結合平衡除外法(KinExA(登録商標):Kinetic Exclusion Assay)(Drakeら、2004、Analytical Biochemistry 328:35~43頁)などを用いることができる。
(4)回帰式作成用の複合体を準備する工程、
(5)前記工程(4)の複合体を前記工程(1)~(3)の工程を含む工程により検出する工程、
(6)前記工程(4)の複合体濃度をシミュレーションする工程、
(7)前記工程(5)で検出したシグナル値とシミュレーション濃度より回帰式を算出する工程、および、
(8)前記工程(3)により検出したシグナル値を前記回帰式に当てはめる工程。
標識化とは、発光標識、化学発光標識、電気化学発光標識、蛍光標識、ジゴキシゲニン、ビオチン、アビジン又は放射性標識で修飾することをいうが、これらに限定されない。
固定化とは、直接または間接を問わず、ビーズ、ディスク、マイクロ流体チップ、磁性粒子、またはマイクロタイタープレートなどの固相に結合させる、あるいは固定することをいうが、これらに限定されるものではない。
Ozoralizumab(抗原はTNFおよびアルブミン)
RG7716(抗原はVEGF-Aおよびangiopoietin-2)
RG-7990(抗原はIL-13およびIL-17)
Lutikizumab(抗原はIL-1αおよびIL-1β)
1つの態様において、本発明の方法は、少なくとも一つの抗原との親和性が弱い二重特異性抗体とその抗体に結合した抗原とを含む複合体を検出する方法である。
1つの態様において、本発明の方法は、二つの抗原との親和性がいずれも弱い二重特異性抗体とその抗体に結合した抗原とを含む複合体を検出する方法である。
別の1つの態様において、結合平衡が実質的に維持される条件とは、理論的に結合平衡が移動しないほど短い時間をいう。
結合平衡が実質的に維持されるとは、例えば測定値を指標にした場合、複数回測定した際の測定値の相違が50%以下であることが好ましく、40%以下、30%以下、20%以下、10%以下、5%以下、3%以下、2%以下、1%以下、0.5%以下、0.1%以下であることがさらに好ましい。理論的に結合平衡が移動しないほど短い時間とは、試料と固相とが接触する時間、例えば抗原を含有する試料を、抗原を捕捉可能な抗体が固定されているビーズで充填されたカラムに加え、試料中の抗体を捕捉する場合、試料中の任意の特定の抗原がカラム内の任意の特定点と接触している時間が、10秒以下であることが好ましく、9秒以下、8秒以下、7秒以下、6秒以下、5秒以下、4秒以下、3秒以下、2秒以下、1秒以下、0.5秒以下、0.1秒以下、0.05秒以下、0.01秒以下であることがさらに好ましいが、少なくとも0.001秒以上、0.01秒以上であることが好ましい。
1つの態様において、固相への第一の結合体の結合は、第一の結合体がポリペプチドの場合、ポリペプチドのアミノ酸骨格のN末端基および/もしくはε-アミノ基(リジン)、異なるリジンのε-アミノ基、カルボキシ官能基、スルフヒドリル官能基、ヒドロキシル官能基、および/もしくはフェノール官能基、ならびに/またはポリペプチドの炭水化物構造の糖アルコール基を介した化学的結合によって実施される。
エピトープが異なるか否かは、例えば競合アッセイによって確認することができ、比較する一方の抗体が他方の抗体の抗原への結合を50%以上阻止することをいう。
一定の態様において、抗体は、多重特異性抗体、例えば二重特異性抗体である。多重特異性抗体は、少なくとも2つの異なる部位に対する結合特異性を有するモノクローナル抗体である。一定の態様において、結合特異性の内の一方は、第1の抗原に対するものであり、他方は、異なる第2の抗原に対するものである。一定の態様において、二重特異性抗体は、同じ抗原の2つの異なるエピトープに結合してよい。二重特異性抗体は、完全長抗体または抗体断片として調製することができる。1つの態様において、抗体は、第1の抗原および第2の抗原に特異的に結合する二重特異性抗体である。1つの態様において、二重特異性抗体は、i)第1の抗原にまたは抗原上の第1のエピトープに特異的に結合する第1の結合特異性を有し、かつii)第2の抗原にまたは同じ抗原上の第2のエピトープに特異的に結合する第2の結合特異性を有する。1つの態様において、同じ抗原上の第2のエピトープは、第一のエピトープとは異なるエピトープである。
1つの態様において、抗体は抗体変異体を含み、例えば、1つまたは複数のアミノ酸の置換、挿入、または欠失を有する抗体変異体、糖鎖が改変された抗体変異体、PEGなどの水溶性ポリマーが結合した抗体誘導体である。
〔ビーズの調製〕
20 μg/mLのXB12溶液またはSB04溶液を、リン酸緩衝生理食塩水(Phosphate buffered saline pH7.4, Sigma Aldrich社)で調製した。調製した溶液を、PMMAビーズ(Sapidyne社)1本に対して1 mL加え、室温で2時間インキュベートすることで、抗体をビーズに固相化し、低速で数秒遠心して上清を除いた後、ブロッキングバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 1% BSA, pH 7.4)を加え、室温で1時間インキュベートすることでビーズをブロッキングする。XB12を固相化したビーズ、またはSB04を固相化したビーズのいずれも用いることができるが、以下ではXB12を固相化したビーズを用いた例を示す。
〔検出抗体溶液の調製〕
XB12を固相化したビーズを用いるため、以下はSB04の蛍光標識の例を示す。 蛍光標識(Lightning-Link(登録商標) Rapid Dylight(登録商標) 650, Innova Biosciences社を用いて製造元のプロトコル通り調製)したSB04を検出抗体として使用することができる。
蛍光標識した抗体を含む検出抗体溶液は、例えば、蛍光標識(Lightning-Link(登録商標) Rapid Dylight(登録商標) 650, Innova Biosciences社を用いて製造元のプロトコル通り調製)した抗FX抗体(社内調製品:SB04)を、0.5 μg/mL となるようにアッセイバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製する。調製過程において、蛍光標識体の凝集物を除くために、まず5 μg/mLとなるように調製後、18,000 gで 10分間遠心し、上清をさらに希釈して0.5 μg/mLとしてもよい。なお、蛍光標識はこれに限られない。
〔サンプルの調製〕
ここでは二重特異性抗体Q4//J3抗体、Q3//J1抗体及びEmicizumabを測定する例を示す。hFIXとhFXをそれぞれ5, 8 μg/mL(89.3, 136 nM)一定とし、Q4//J3抗体を0.0488-50 μg/mL (0.326-333 nM)の間で公比4の計6点、Q3//J1抗体を1.38-354 μg/mL(9.20-2360 nM)の間で公比2の計9点、Emicuzumabを6.25-400 μg/mL(41.7-2667 nM)の間で公比2の計7点の濃度でそれぞれスパイクしたサンプルをアッセイバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製する。hFIXとhFX のみスパイクし、抗FIX/FX二重特異性抗体をスパイクしないサンプルをブランクサンプルとする。hFIX、hFXの濃度については、生理学的な濃度(血漿中濃度)として設定する。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで1時間室温でインキュベートする。
測定は、ベンダー推奨のプロトコルに従って行う。例えば以下の方法が挙げられる。調製したビーズの懸濁液一本分を、ランニングバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, pH 7.4)を25 mL充填したビーズボトル(Sapidyne社)に移す。KinExA 3200のオートサンプラーにおける各位置に、ビーズボトル、サンプル、検出抗体溶液をセットする。測定における全てのプロセスは、KinExA 3200とオートサンプラーによって自動で実施される。機器をコントロールするプロトコルはKinExA Proソフトウェア(Sapidyne社)で作成される。プロトコルは、測定の各プロセスに対して、適切な試薬・サンプル位置を指定することで、適切なタイミングで、適切な試薬がサンプリングされるように作成される。
まずXB12を固相化したビーズをフローセル中のカラムに充填する。アプライするビーズの懸濁液の量は、ビーズが再現良く適切な高さまで充填されるようカメラでモニターし、最適化する。次に、カラムにサンプルを通過させることで、遊離したhFIX、hFIXと二重特異性抗体の2者複合体、また二重特異性抗体がhFIX、hFX両方と結合した3者複合体をビーズに捕捉させる。ランニングバッファー(+)(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN3, pH 7.4)による第一次洗浄工程後、蛍光標識SB04溶液を通過させ、蛍光標識SB04抗体を捕捉された3者複合体中のhFXに結合させる。ランニングバッファー(+)による第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出される。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)の体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定する。例えば以下のような条件で行うことができる。
サンプル:135 μL, 32.4 s, 0.25 mL/min、
第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、
検出抗体溶液:800 μL, 192 s, 0.25 mL/min、
第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、
第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。
例えばブランクサンプルをn=5、その他のサンプルをn=1で測定する。
FIX、FXと、抗FIX/FX二重特異性抗体が形成する3者複合体が、二重特異性抗体のFIXおよびFXに対する親和性を変化させた場合にどのように形成されるかを、解離定数KDを用いたシミュレーションする。
3者複合体の濃度のシミュレーションは文献で用いられている方法を使用する(Thromb Haemost, 117(7), 1348-1357, 2017.)。計算にはMicrosoft Excel 2013を用いる。このシミュレーションにおいて、FIX濃度、FX濃度、二重特異性抗体濃度、および二重特異性抗体のFIX、FXに対する各KD値をそれぞれ規定する必要があるため、FIXとFXの濃度は生理学的な濃度(血漿中濃度)として、それぞれ5, 8 μg/mL (89.3, 136 nM)一定と設定し、抗FIX/FX二重特異性抗体濃度を0.0122-1600 μg/mL (0.0814-10667 nM)の範囲で2倍ずつ変化させる。二重特異性抗体のFIXおよびFXに対するKD値については、例えば双方が等しい条件、またはFIXに対するKD値がFXに対するKD値の2倍となる条件で行うことができる。各条件における3者複合体濃度をシミュレーションし、Y軸に3者複合体濃度、X軸に二重特異性抗体濃度をとり、各値をプロットする。以下では二重特異性抗体としてQ4//J抗体の例を示す。
〔解析〕
ブランクサンプルのシグナル値の平均(Mean)、標準偏差(SD)を算出し、例えばMean+3.29×SDを検出限界として設定することができる。シグナル値の平均(Mean)、標準偏差(SD)の計算は例えばMicrosoft Excel 2013を用いて行うことができる。その他のサンプルのシグナル値のうち、検出限界以上のサンプルについて、ブランクサンプルのシグナル値のMeanを差し引くことで、3者複合体シグナル値を算出する。3者複合体シグナル値をY軸に、二重特異性抗体濃度をX軸にとり、測定値をプロットする。
〔捕捉抗体溶液の調製〕
XB12またはSB04を捕捉に使用できるが、ここではXB12を用いる例を示す。GyrolabのCDはストレプトアビジンビーズがセットされているため、捕捉に使用するXB12は、Sulfo-NHS-LC-Biotin(Thermo Scientific社)によりビオチン化する(biotin-XB12)。プロトコルは製品プロトコルを参照する。ビオチン化処理後、フリーのビオチン試薬を除くため、Zeba Spin Desalting Columns(Thermo Scientific社)で処理する。100 μg/mL の溶液となるようにバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, pH 7.4)で調製する。凝集物を除くために、18,000 gで10分間遠心し、上清を使用する。
〔検出抗体溶液の調製〕
蛍光標識(Alexa Fluor 647 Antibody Labeling Kit, Thermo Scientific社を用いて製造元のプロトコル通り調製)した抗FX抗体(社内調製品:SB04)を、3 μg/mL の溶液となるようにアッセイバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製する。蛍光標識体の凝集物を除くために、18,000 gで10分間遠心し、上清を使用する。
〔サンプルの調製〕
hFIXとhFXをそれぞれ5, 8 μg/mL(89.3, 136 nM)一定とし、Q4//J3抗体を0.195-50 μg/mL (1.30-333 nM)の間で公比4の計5点の濃度でそれぞれスパイクしたサンプルをアッセイバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製する。hFIXとhFX のみスパイクし、抗FIX/FX二重特異性抗体をスパイクしないサンプルをブランクサンプルとする。hFIX、hFXの濃度については、生理学的な濃度(血漿中濃度)として設定する。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで1時間室温でインキュベートする。
測定は、ベンダー推奨のプロトコルに従って行う。例えば以下の方法が挙げられる。Gyrolab xP workstation(Gyros Protein Technologies社)を測定機器として、Bioaffy 200を測定用のCDとして使用する。測定における全てのプロセスは、Gyrolabによって自動で実施される。機器をコントロールするプロトコルはGyrolab Controlソフトウェア(Gyros Protein Technologies社)内の200-3W-001 Wizard methodを使用し、捕捉抗体、サンプル、検出抗体の順に操作が進行し、各ステップの間で洗浄工程が入るようにする。捕捉抗体、検出抗体濃度は、シグナル値対ノイズ比が高かった条件として設定する。洗浄工程では、アッセイバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)を用いる。作成したプロトコルから生成されるプレートデザインに従って、専用のPCRプレートに捕捉抗体溶液、サンプル、検出抗体溶液、洗浄用のアッセイバッファーを加え、測定前にプレートを機器にセットする。測定の工程において、まず、biotin-XB12溶液が流路を通じて、ストレプトアビジンビーズに捕捉される。洗浄工程後、サンプル中の遊離したhFIX、hFIXと二重特異性抗体の2者複合体、またhFIX、hFXと二重特異性抗体の3者複合体が、ビーズ上のbiotin-XB12により捕捉され、洗浄工程後、蛍光標識SB04溶液を通過させ、蛍光標識SB04抗体を捕捉された3者複合体中のhFXに結合させる。検出は、光電子増倍管(PMT)によるレスポンスの増幅レベルの設定3種類の固定値、例えば1, 5, 25%で実施され、各設定での測定値が記録される。調製したサンプルのうち、ブランクサンプルをn=5、Q4//J3抗体をスパイクしたサンプルをn=3で測定する。
検出されるレスポンスが、十分大きく、検出器の飽和が起きていない値を示すPMTの条件で得られた値を解析に用いるのが好ましい。n=5で測定したブランクサンプルのシグナル値の平均(Mean)、標準偏差(SD)を算出し、例えばMean+3.29×SDを検出限界として設定することができる。シグナル値の平均(Mean)、標準偏差(SD)の計算は例えばMicrosoft Excel 2013を用いて行うことができる。その他のサンプルのシグナル値のうち、検出限界以上のサンプルについて、ブランクサンプルのレスポンスのMeanを差し引くことで、3者複合体レスポンスを算出する。
〔緩衝作用、抗凝固作用を持たせた血漿の調製〕
例えば以下のように調製できるが、これに限られない。
先天的Factor VIII欠損ヒト血漿(George King Bio-Medical社)に、例えば9分の1当量の1M HEPES buffer solution(pH 7.1-7.5, nacalai tesque社)を加え、さらに10000 unit/ 10 mL Heparin Sodium(Mochida Pharmaceutical社)を終濃度10 unit/mLとなるように添加する。ここで加える1M HEPES buffer solutionは例えば100分の1当量~2分の1当量である。より具体的には例えば、99分の1当量、49分の1当量、19分の1当量、9分の1当量、4分の1当量、2分の1当量である。ここで、通常のELISA同様に血漿を希釈して測定すると、希釈による複合体の解離が起きるため、血漿中の複合体を測定する目的を果たすことはできない。しかしながら、血漿をそのまま使用すると、血漿中炭酸イオン濃度変化によるpH変化が起こり、生理的な状況を反映できない。そのため、これを抑える目的で、HEPES buffer solutionによる緩衝作用を用いる。また、凝固反応をより抑えるためにHeparin Sodiumを添加する。このように調製した血漿を、以下ではFVIIId(++)血漿とする。
全血及び血清も上記と同じ方法で調製できる。ビーズの調製、検出抗体溶液の調製はすでに記載した方法により行う。
〔サンプルの調製〕
Q4//J3抗体を0.0488-50 μg/mL (0.326-333 nM)の間で公比4の計6点、Q3//J1抗体を1.38-354 μg/mL(9.20-2360 nM)の間で公比2の計9点、Emicuzumabを6.25-400 μg/mL(41.7-2667 nM)の間で公比2の計7点の濃度でそれぞれスパイクしたFVIIId(++)血漿サンプルを調製する。抗FIX/FX二重特異性抗体をスパイクしないFVIIId(++)血漿をブランクサンプルとする。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで1時間室温でインキュベートする。
測定、シミュレーション及び解析はすでに記載した方法により行う。
特定の態様において、治療法の決定とは、薬剤の用量の決定、投与頻度の決定である。
別の態様において、治療法の決定は複合体を検出して得られたシグナル値を基に行う。
別の態様において、治療法の決定は複合体を検出して得られたシグナル値を基に算出する標準化シグナル値を基に行う。
別の態様において、治療法の決定は複合体を検出して得られたシグナル値を基に算出する任意の単位を基に行う。
特定の態様において、薬剤の効果や安全性の評価は前記治療法の決定と同様の方法で行う。
抗FIX/FX二重特異性抗体がFIXおよびFXと結合して形成される3者複合体を特異的に検出するためには、抗体とFIX、抗体とFXが形成する2者複合体や、複合体を形成していない(遊離)抗体、遊離FIX、遊離FXとは区別して3者複合体のみを認識する必要がある(図1)。そこで、当該二重特異性抗体とは別のエピトープを認識する抗FIX抗体および抗FX抗体のうち、片方は固相化し、もう片方の抗体は蛍光標識したものを用いて、3者複合体をサンドイッチすることにより、当該3者複合体を特異的に検出する方法を考案した(図4(A, B))。この測定を実現するにあたり、溶液中における3者複合体は、結合・解離の平衡状態にあると考えられるため、通常のELISAのように、サンプルを固相と1時間といった長い時間インキュベーションすると、平衡が移動してしまい、溶液中の複合体の状態を正しく反映できないと考えられた。また、複合体の抗原抗体間の親和性が十分に高くないため、通常のELISAのように、検出抗体溶液との長いインキュベーションや、多量のバッファーで複数回洗浄するような洗浄では、複合体は容易に解離してしまうため、複合体を再現良く十分な感度で検出するのは困難であると考えられた。そこで、サンプルと固相上の抗体との反応時間が十分に短く、洗浄を少量のバッファーで、かつ短時間で実施できるKinExA(Sapidyne社)を測定機器として採用した。実施例11では、同様の条件での測定を達成できると考えられたGyrolabも測定機器として採用した。
<実施例2>抗FIX抗体、抗FX抗体の選定
本実施例においては、測定法の実現に適した抗FIX抗体および抗FX抗体を選定するため、当該二重特異性抗体をビーズに固相化し、候補となる抗FIX抗体、抗FX抗体を蛍光標識して検出抗体として用いるサンドイッチ法でhFIX、hFXが濃度依存的に検出できるかをKinExA 3200(Sapidyne社)を用いて確認した。また、各凝固因子の活性化体であるhFIXa、hFXaについても同様に検出できるかを検討した。
20 μg/mLの抗FIX/FX二重特異性抗体(Q4//J3)溶液を、リン酸緩衝生理食塩水(Phosphate buffered saline pH7.4, Sigma Aldrich社)で調製した。調製した溶液を、PMMAビーズ(Sapidyne社)1本に対して1 mL加え、室温で2時間インキュベートすることで、抗体をビーズに固相化し、低速で数秒遠心して上清を除いた後、ブロッキングバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 1% BSA, pH 7.4)を加え、室温で1時間インキュベートすることでビーズをブロッキングした。
蛍光標識(Lightning-Link(登録商標) Rapid Dylight(登録商標) 650, Innova Biosciences社を用いて製造元のプロトコル通り調製)した抗FIX抗体(社内調製品:XB12)、抗FX抗体(社内調製品:SB04)の溶液それぞれを、0.5 μg/mL となるようにアッセイバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2mM CaCl2, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製した。調製過程において、蛍光標識体の凝集物を除くために、まず5 μg/mLとなるように調製後、18,000 gで10分間遠心し、上清をさらに希釈して0.5 μg/mLとした。
次にhFIX、hFIXa、hFX、およびhFXaの希釈系列サンプルをそれぞれ調製した。hFIX(Enzyme Research Laboratories社)は10, 5, 2.5, 1.25, 0 μg/mL(179, 89.3, 44.6, 22.3, 0 nM)、hFIXa(Enzyme Research Laboratories社)は8, 4, 2, 1, 0 μg/mL(178, 88.9, 44.4, 22.2, 0 nM)、hFX(Enzyme Research Laboratories社)は16, 8, 4, 2, 0 μg/mL(272, 136, 68.0, 34.0, 0 nM)、hFXa(Enzyme Research Laboratories社)は12.5, 6.25, 3.13, 1.56, 0 μg/mL(272, 136, 68.0, 34.0, 0 nM)になるようアッセイバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2mM CaCl2, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製した。
KinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として使用した。調製したビーズの懸濁液二本分を、ランニングバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, pH 7.4)を24mL充填したビーズボトル(Sapidyne社)に移した。KinExA 3200のオートサンプラーにおける各位置に、ビーズボトル、サンプル、検出抗体溶液をセットした。
測定における全てのプロセスは、KinExA 3200とオートサンプラーによって自動で実施された。機器をコントロールするプロトコルはKinExA Proソフトウェア(Sapidyne社)で作成された。プロトコルは、測定の各プロセスに対して、適切な試薬・サンプル位置を指定することで、適切なタイミングで、適切な試薬がサンプリングされるように作成された(以降の実施例において同様)。
まずビーズをフローセル中のカラムに充填した。アプライするビーズの懸濁液の量は、ビーズが再現良く適切な高さまで充填されるようカメラでモニターし、最適化した。次に、カラムにhFIX(hFIXa)の希釈系列サンプルを通過させることで、hFIX(hFIXa)をビーズ上の抗体に捕捉させた。ランニングバッファー(+)(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN3, pH 7.4)による第一次洗浄工程後、蛍光標識抗FIX抗体溶液を通過させ、蛍光標識抗FIX抗体を捕捉されたhFIX(hFIXa)に結合させた(図2 (A))。ランニングバッファー(+)による第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出された。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)の体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定した。本測定における各条件を以下に示す。サンプル:20 μL, 4.8 s, 0.25 mL/min、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、検出抗体溶液:800 μL, 192 s, 0.25 mL/min、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。各サンプルをn=1で測定した。
KinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として使用した。調製したビーズの懸濁液二本分を、ランニングバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3)を24mL充填したビーズボトル(Sapidyne社)に移した。KinExA 3200のオートサンプラーにおける各位置に、ビーズボトル、サンプル、検出抗体溶液をセットした。
まずビーズをフローセル中のカラムに充填した。アプライするビーズの懸濁液の量は、ビーズが再現良く適切な高さまで充填されるようカメラでモニターし、最適化した。次に、カラムにhFX(hFXa)を含むサンプルを通過させることで、hFX(hFXa)をビーズ上の抗体に捕捉させた。ランニングバッファー(+)(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN3, pH 7.4)による第一次洗浄工程後、蛍光標識抗FX抗体溶液を通過させ、蛍光標識抗FX抗体を捕捉されたhFX(hFXa)に結合させた(図2 (B))。ランニングバッファー(+)による第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出された。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)の体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定した。本測定における各条件を以下に示す。サンプル:10 μL, 2.4 s, 0.25 mL/min、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、検出抗体溶液:400 μL, 96 s, 0.25 mL/min、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。各サンプルをn=1で測定した。
なお、抗FIX抗体(XB12)、抗FX抗体(SB04)は特許文献(WO 2005/35756)を参照して作製した。
FIX(FIXa)の測定では、hFIX濃度依存的にシグナル値が得られたことから、XB12は抗FIX/FX二重特異性抗体と別エピトープを認識する抗FIX抗体と考えられたため、本発明の複合体測定法用に選択した(図3 (A))。同様にFX(FXa)の測定では、hFX濃度依存的にシグナル値が得られたことから、抗FX抗体としてSB04を選択した(図3 (B))。また、XB12により、hFIXとhFIXaが同程度のシグナル値で検出できたことから、両者への結合性は大きく変わらないことが示唆された。一方で、SB04により、hFXaの濃度依存的なシグナル値は見られなかった。したがって、これらの抗体を使用することにより、検出可能な3者複合体は、FIXもしくはFIXa、抗FIX/FX二重特異性抗体、そしてFXにより形成されるものであると考えられた。
抗FIX/FX二重特異性抗体であるQ4//J3抗体およびQ3//J1抗体について抗原との結合に関する速度論的解析を、Biacore T200(GE Healthcare)を用いて実施した(バッファーは10 mM HEPES,150 mM NaCl,0.05% Surfactant P20, 2.5 mM CaCl2, pH 7.4)。アミンカップリング法によりsure Protein A(GE Healthcare)を固定化したSeries S Sensor Chip CM4(GE healthcare)上にQ4//J3抗体またはQ3//J1抗体を捕捉させた。捕捉させたQ4//J3抗体に対して、アナライトとして8-128 nMの濃度に調製したヒトFIX(Enzyme Research Laboratories)、または10-160 nMの濃度に調製したヒトFX(Enzyme Research Laboratories)を注入した。Q3//J1抗体に対しては、80-1280 nMのヒトFIX、または10-160 nMのヒトFXを注入した。測定は全て25℃で実施した。Biacore Evaluation Softwareを用い、1:1 binding model fittingを行うことで結合速度定数ka (1/Ms)、解離速度定数kd(1/s)を算出し、その値から解離定数KD (M) を算出した(表1)。
実施例2で選定した、抗FIX/FX二重特異性抗体とは別のエピトープを認識する抗FIX抗体(XB12)および抗FX抗体(SB04)を、ビーズ上での捕捉(Capture)、蛍光標識体での検出(Detection)に使用する、もしくは、反対にDetection、Captureにそれぞれ使用する、2つの測定Format 1および2において、3者複合体が特異的に検出できるかを検証した(図4(A、B))。
実施例2に記載の方法でXB12とSB04をそれぞれPMMAビーズ(Sapidyne社)に固相化し、ブロッキングした。
蛍光標識(Lightning-Link(登録商標) Rapid Dylight(登録商標) 650, Innova Biosciences社を用いて製造元のプロトコル通り調製)した抗FIX抗体(社内調製品:XB12)、抗FX抗体(社内調製品:SB04)の溶液それぞれを実施例2に従って調製した。
hFIX、hFXと、二重特異性抗体(Q4//J3)の三者を、それぞれ5, 8, 12.5 μg/mL(89.3, 136, 83.3 nM)の濃度でスパイクしたサンプル、また、三者のうち一者を欠いたサンプル、二者を欠いたサンプルの全ての組み合わせについてアッセイバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製した。三者全てをスパイクしたサンプル(Sample No.1)、二重特異性抗体とhFIXをスパイクしたサンプル(Sample No.2)、二重特異性抗体とhFXをスパイクしたサンプル(Sample No.3)、hFIXとhFXをスパイクしたサンプル(Sample No.4)、二重特異性抗体のみスパイクしたサンプル(Sample No.5)、hFIXのみスパイクしたサンプル(Sample No.6)、hFXのみスパイクしたサンプル(Sample No.7)およびブランクサンプル(Sample No.8)を調製した(表2)。hFIXおよびhFXの濃度については、生理学的な濃度(血漿中濃度)として設定した。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで1時間室温でインキュベートした。
KinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として使用した。調製したビーズの懸濁液一本分を、ランニングバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, pH 7.4)を25mL充填したビーズボトル(Sapidyne社)に移した。KinExA 3200のオートサンプラーにおける各位置に、ビーズボトル、サンプル、検出抗体溶液をセットした。Format 1では、まずXB12を固相化したビーズをフローセル中のカラムに充填した。アプライするビーズの懸濁液の量は、ビーズが再現良く適切な高さまで充填されるようカメラでモニターし、最適化した。次に、カラムに調製したサンプルを通過させることで、遊離したhFIX、hFIXと二重特異性抗体の2者複合体、また二重特異性抗体がhFIX、hFX両方と結合した3者複合体をビーズに捕捉させた。ランニングバッファー(+)(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN3, pH 7.4)による第一次洗浄工程後、蛍光標識SB04溶液を通過させ、蛍光標識SB04抗体を捕捉された3者複合体中のhFXに結合させた。ランニングバッファー(+)による第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出された(図5 (A))。一方、Format 2では、まずSB04を固相化したビーズをフローセル中のカラムに充填した。アプライするビーズの懸濁液の量は、ビーズが再現良く適切な高さまで充填されるようカメラでモニターし、最適化した。次に、カラムにサンプルを通過させることで、遊離したhFX、hFXと二重特異性抗体の2者複合体、また二重特異性抗体がhFIX、hFX両方と結合した3者複合体をビーズに捕捉させた。ランニングバッファー(+)による第一次洗浄工程後、蛍光標識XB12溶液を通過させ、蛍光標識XB12抗体を捕捉された3者複合体中のhFIXに結合させた。ランニングバッファー(+)による第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出された(図5 (B))。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)の体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定した。本測定における各条件を以下に示す。サンプル:50 μL, 12 s, 0.25 mL/min、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、検出抗体溶液:800 μL, 192 s, 0.25 mL/min、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。各サンプルをn=1で測定した。
二つのFormatにおいて、三者が揃ったサンプル(Sample No.1)のみで高いシグナル値が得られ一者でも欠けたサンプルでは、これに比べて低かった。したがって、両Formatにより、3者複合体が検出されることが示された。一方で、Sample No.1以外のサンプルについて、Format 2では、二重特異性抗体とhFIXをスパイクしたサンプル(Sample No.2)、hFIXとhFXをスパイクしたサンプル(Sample No.4)、およびhFIXのみをスパイクしたサンプル(Sample No.6)で高い傾向があったことから、hFIXにより、シグナルが検出されてしまっている可能性があると考えられた。Format 1では、Sample No.1を除くと、hFIXとhFXをスパイクしたサンプル(Sample No.4)で、ブランクサンプル(Sample No.8)よりもシグナル値が高い傾向があった。(図5 (A, B))。そこで以降の検討においては、Format 1を用いて、三者が含まれるサンプルのシグナル値と、FIXとFXのみを含むサンプルのシグナル値の差分を、3者複合体由来のシグナル値と捉えるのが妥当であると考えられた。
FIX、FXと、抗FIX/FX二重特異性抗体が形成する3者複合体が、二重特異性抗体のFIXおよびFXに対する親和性を変化させた場合にどのように形成されるかを、解離定数KDを用いたシミュレーションにより考察した。
3者複合体の濃度のシミュレーションは文献で用いられている方法を使用した(Thromb Haemost, 117(7), 1348-1357, 2017.)。計算にはMicrosoft Excel 2013を用いた。このシミュレーションにおいて、FIX濃度、FX濃度、二重特異性抗体濃度、および二重特異性抗体のFIX、FXに対する各KD値をそれぞれ規定する必要があるため、FIXとFXの濃度は生理学的な濃度(血漿中濃度)として、それぞれ5, 8 μg/mL (89.3, 136 nM)一定と設定し、抗FIX/FX二重特異性抗体濃度を0.0122-1600 μg/mL (0.0814-10667 nM)の範囲で2倍ずつ変化させた。二重特異性抗体のFIXおよびFXに対するKD値については、双方が等しい条件と、FIXに対するKD値がFXに対するKD値の2倍となる条件で、FIXに対するKD値を5-2560 nMの範囲で2倍ずつ変化させた。各条件における3者複合体濃度をシミュレーションし、Y軸に3者複合体濃度、X軸に二重特異性抗体濃度をとり、各値をプロットした。
FIX、FXに対するKD値が等しい場合のシミュレーションにおいて、二重特異性抗体濃度と3者複合体濃度のシミュレーション値の関係性は、ベルシェイプの形態をとり、その形状はKD値に従って変化した。3者複合体濃度がピークとなる二重特異性抗体濃度は、FIX、FXに対するKD値が低くなるほど低濃度側にシフトするが、KD値が5-40 nMの範囲では、ピークとなる二重特異性抗体濃度は83.3-167 nMで変わらなかった。また、二重特異性抗体濃度を一定として、KD値が変化した際の3者複合体濃度は、KD値が小さくなるほど上昇するが、KD値が小さい領域ほど、その上昇の割合は小さくなることが示された(図6(A))。FIXに対するKD値がFXに対するKD値の2倍となる場合のシミュレーションにおいても、上記の傾向は同様に見られた(図6(B))。
実施例5のシミュレーション結果より、比較的高い親和性をもつ(KD値が小さい)二重特異性抗体では、KD値の変化による3者複合体濃度への影響は小さかった。したがって、親和性の高い二重特異性抗体では、KD値に測定誤差があったとしても、3者複合体濃度のシミュレーションに大きく影響しないため、測定値とシミュレーション値が合致しやすいと考えられた。そこで、比較的親和性の高いQ4//J3抗体を用いて、測定された3者複合体シグナル値と、シミュレーション値との比較を行った。
実施例2に記載の方法でXB12をPMMAビーズ(Sapidyne社)に固相化し、ブロッキングした。
蛍光標識(Lightning-Link(登録商標) Rapid Dylight(登録商標) 650, Innova Biosciences社を用いて製造元のプロトコル通り調製)した抗FX抗体(社内調製品:SB04)を、実施例2に従って調製した。
hFIXとhFXをそれぞれ5, 8 μg/mL(89.3, 136 nM)一定とし、Q4//J3抗体を0.195-200 μg/mL(1.30-1333 nM)の間で公比2の計11点の濃度でスパイクしたサンプルをアッセイバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA pH 7.4)で調製した。hFIXとhFXのみスパイクし、Q4//J3抗体をスパイクしないサンプルをブランクサンプルとした。hFIX、hFXの濃度については、生理学的な濃度(血漿中濃度)として設定した。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで1時間室温でインキュベートした。
KinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として使用した。調製したビーズの懸濁液一本分を、ランニングバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, pH 7.4)を25 mL充填したビーズボトル(Sapidyne社)に移した。KinExA 3200のオートサンプラーにおける各位置に、ビーズボトル、サンプル、検出抗体溶液をセットした。まずXB12を固相化したビーズをフローセル中のカラムに充填した。アプライするビーズの懸濁液の量は、ビーズが再現良く適切な高さまで充填されるようカメラでモニターし、最適化した。次に、カラムにサンプルを通過させることで、遊離したhFIX、hFIXと二重特異性抗体の2者複合体、また二重特異性抗体がhFIX、hFX両方と結合した3者複合体をビーズに捕捉させた。ランニングバッファー(+)(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN3, pH 7.4)による第一次洗浄工程後、蛍光標識SB04溶液を通過させ、蛍光標識SB04抗体を捕捉された3者複合体中のhFXに結合させた。ランニングバッファー(+)による第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出された。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)の体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定した。本測定における各条件を以下に示す。サンプル:50 μL, 12 s, 0.25 mL/min、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、検出抗体溶液:800 μL, 192 s, 0.25 mL/min、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。ブランクサンプルをn=5、その他のサンプルをn=1で測定した。
n=5で測定したブランクサンプルのシグナル値の平均(Mean)、標準偏差(SD)を算出し(Microsoft Excel 2013)、Mean+3.29×SDを検出限界として設定した。その他のサンプルのシグナル値のうち、検出限界以上のサンプルについて、ブランクサンプルのシグナル値のMeanを差し引くことで、3者複合体シグナル値を算出した。同時に、調製したサンプル中のhFIX, hFX, およびQ4//J3抗体濃度とKD値(実施例3参照)から、各サンプル中の3者複合体濃度をシミュレーションした(実施例5参照)。得られた3者複合体シグナル値と、シミュレーション値を比較するため、これらを左右のY軸(シグナル値は黒丸、シミュレーション値は点線)に、またQ4//J3抗体濃度をX軸にとり、プロットを作成した(図7 (A))。加えて、Y軸を3者複合体シグナル値、X軸をシミュレーション値として、得られた結果をプロットし、Microsoft Excel 2013を用いて相関解析を行った。相関解析では、線形近似曲線を引き、R2値を算出した(図7 (B))。
Q4//J3抗体の添加濃度に従って、3者複合体シグナル値はベルシェイプの形状を取り、これはシミュレーションから推測された形状と一致していた。また、X軸をシミュレーション値、Y軸を3者複合体シグナル値としてプロットした図7 (B)において、直線関係が得られた。これらのことから、Q4//J3抗体が形成する3者複合体の実測値は、シミュレーションによって説明できることが示された。そこで、シミュレーションが正しいという仮定のもと、Q4//J3抗体の濃度を変えて調製した3点以上のサンプルの3者複合体シグナル値とシミュレーション値との対応を得ることにより、未知の濃度の二重特異性抗体を含むサンプルを測定した際に、得られた3者複合体シグナル値から、回帰により3者複合体濃度を算出できると考えられた。
親和性の異なる3種の抗FIX/FX二重特異性抗体(Q4//J3、Q3//J1、Emicizumab)について、それぞれが形成する3者複合体濃度の比較を行った。
実施例6に記載の方法で調製した。
蛍光標識(Lightning-Link(登録商標) Rapid Dylight(登録商標) 650, Innova Biosciences社を用いて製造元のプロトコル通り調製)した抗FX抗体(社内調製品:SB04)を、実施例2に従って調製した。
hFIXとhFXをそれぞれ5, 8 μg/mL(89.3, 136 nM)一定とし、Q4//J3抗体を0.0488-50 μg/mL (0.326-333 nM)の間で公比4の計6点、Q3//J1抗体を1.38-354 μg/mL(9.20-2360 nM)の間で公比2の計9点、Emicuzumabを6.25-400 μg/mL(41.7-2667 nM)の間で公比2の計7点の濃度でそれぞれスパイクしたサンプルをアッセイバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製した。hFIXとhFX のみスパイクし、抗FIX/FX二重特異性抗体をスパイクしないサンプルをブランクサンプルとした。hFIX、hFXの濃度については、生理学的な濃度(血漿中濃度)として設定した。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで1時間室温でインキュベートした。
KinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として使用した。調製したビーズの懸濁液一本分を、ランニングバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, pH 7.4)を25 mL充填したビーズボトル(Sapidyne社)に移した。KinExA 3200のオートサンプラーにおける各位置に、ビーズボトル、サンプル、検出抗体溶液をセットした。まずXB12を固相化したビーズをフローセル中のカラムに充填した。アプライするビーズの懸濁液の量は、ビーズが再現良く適切な高さまで充填されるようカメラでモニターし、最適化した。次に、カラムにサンプルを通過させることで、遊離したhFIX、hFIXと二重特異性抗体の2者複合体、また二重特異性抗体がhFIX、hFX両方と結合した3者複合体をビーズに捕捉させた。ランニングバッファー(+)(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN3, pH 7.4)による第一次洗浄工程後、蛍光標識SB04溶液を通過させ、蛍光標識SB04抗体を捕捉された3者複合体中のhFXに結合させた。ランニングバッファー(+)による第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出された。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)の体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定した。本測定における各条件を以下に示す。サンプル:135 μL, 32.4 s, 0.25 mL/min、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、検出抗体溶液:800 μL, 192 s, 0.25 mL/min、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。ブランクサンプルをn=5、その他のサンプルをn=1で測定した。
n=5で測定したブランクサンプルのシグナル値の平均(Mean)、標準偏差(SD)を算出し(Microsoft Excel 2013)、Mean+3.29×SDを検出限界として設定した。その他のサンプルのシグナル値うち、検出限界以上のサンプルについて、ブランクサンプルのシグナル値のMeanを差し引くことで、3者複合体シグナル値を算出した。3者複合体シグナル値をY軸に、抗FIX/FX二重特異性抗体濃度をX軸にとり、測定値をプロットした(図8 (A))。同時に、Q4//J3抗体をスパイクしたサンプル中の3者複合体濃度をシミュレーションし(実施例6参照)、Y軸をQ4//J3抗体をスパイクしたサンプルの3者複合体シグナル値、X軸をシミュレーション値として、得られた結果をプロットし、Microsoft Excel 2013を用いて直線に回帰を行い、回帰式およびR2値を算出した(図8 (B))。続いてQ3//J1抗体、Emicizumabをスパイクしたサンプルの3者複合体シグナル値を回帰式より、濃度に換算した。換算した濃度をY軸、抗FIX/FX二重特異性抗体濃度をX軸にとり、プロットした(図8 (C))。
3者複合体シグナル値と抗FIX/FX二重特異性抗体濃度の関係は、親和性の異なる3種類のどの抗体においても、ある濃度でシグナル値が極大を示すベルシェイプ型の形状を示した。また、抗体の親和性に依存して、3者複合体シグナル値の強度が異なっており、親和性が高い(KD値が小さい)ほど低い抗体濃度でシグナル値が観察され、また最大となるシグナル値の強度も高かった。Q3//J1抗体が形成する3者複合体濃度は、抗体濃度が44.3 μg/mL(295 nM)の時、最大となり、20.4 nMであった(図8 (C))。この時サンプル中の抗体、hFIX、hFXのうち、それぞれ6.90%、22.8%、15.0%が3者複合体を形成していることになる。また、Emicizumabが形成する3者複合体濃度は、抗体濃度が100 μg/mL(667 nM)の時、最大となり、10.4 nMであった(図8 (C))。この時サンプル中の抗体、hFIX、hFXのうち、それぞれ1.56%、11.6%、7.65%が3者複合体を形成していることになる。したがって、両抗体において、3者複合体の形成割合は、どの成分に対しても、低いことが確かめられた。
親和性の異なる抗FIX/FX二重特異性抗体が形成する3者複合体を測定する工程において、複合体がビーズに捕捉された後の洗浄時における3者複合体の解離の程度が、親和性によって異なる可能性が考えられる。そこで、親和性の異なる抗FIX/FX二重特異性抗体間で、洗浄時のシグナル値の挙動が異なるかを検討することにより、3者複合体の解離がシグナル値へ与える影響を評価した。
実施例7で行った測定において、Q4//J3抗体を3.13 μg/mL(20.8 nM)、Q3//J1抗体を11.1 μg/mL(74.0 nM)、Emicizumabを100 μg/mL(667 nM)スパイクした各サンプルにおいて、3者複合体シグナル値が同程度であったことから、これらのサンプル測定において、ビーズ上に親和性の異なる3者複合体が同程度捕捉され、検出されたと考えられる。そこで、これらのサンプル測定における、洗浄時のシグナル値の挙動を比較し、3者複合体の解離の程度を比較した。洗浄時のシグナル値の挙動を比較するために、KinExA Proソフトウェアより、各サンプルの測定工程中のシグナル値を出力し、Y軸にシグナル値、X軸に時間をとった図にプロットした。3種類のサンプルの各サンプル間の差分を同時に求め、同様にプロットした(図9 (A-C))。図9において、測定開始から約250秒間はビーズの充填、サンプルの捕捉と洗浄工程が続くため、KinExAのシグナル値は一定値を取る。その後、蛍光標識された検出抗体がカラムを通過するため、大きくシグナル値は上昇し、その後、洗浄工程に入るため、シグナル値は低下し、最終的に、ベースラインから上昇した部分がシグナル値として得られる。洗浄工程において、3者複合体の解離が存在する場合、検出抗体の洗浄工程において、遊離した検出抗体が洗浄されるのと同時に、ビーズ上に捕捉された複合体の解離がシグナル値の低下として観察される可能性がある。そのため、親和性の異なる複合体間で解離に差があれば、サンプル間のシグナル値の差分の時間依存的な変化として観察されるはずである。
いずれのサンプル間の比較においても、同様のシグナル値推移を示し、検出抗体の洗浄工程におけるサンプル間のシグナル値の差分(Difference)は変動しなかった。これらのことから、親和性が異なる抗FIX/FX二重特異性抗体間において、測定中の3者複合体の解離の程度は、シグナル値に影響を与えるほどの差は無いと考えられた。
抗FIX/FX二重特異性抗体が形成する3者複合体を測定する際に、複合体をビーズに捕捉する工程で、サンプル中では複合体を形成していなかったFIX、FX、抗FIX/FX二重特異性抗体が、ビーズ上で新たな複合体を形成する可能性が考えられる。そこで、hFIX、hFXを添加したサンプルに対して、抗FIX/FX二重特異性抗体を添加し、混和した後の複数の時点で経時的に3者複合体シグナル値を検出することで、時間依存的なシグナル値変化を評価した。混和後の時間経過に従ってシグナル値が上昇すれば、溶液中で起きた複合体形成がシグナル値に反映されていることを確かめることができる。また、3者複合体シグナル値が一定となる時点を知ることにより、平衡に達するまでの時間を知ることができる。Q3//J1抗体とEmicizumab(実施例7参照)を使用した。
実施例6に記載の方法で調製した。
蛍光標識(Lightning-Link(登録商標) Rapid Dylight(登録商標) 650, Innova Biosciences社を用いて製造元のプロトコル通り調製)した抗FX抗体(社内調製品:SB04)を、実施例2に従って調製した。
まず、hFIXとhFXをアッセイバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)にそれぞれ5, 8 μg/mL(89.3, 136 nM)添加したサンプルを調製した。ここに、Q3//J1抗体を終濃度5.54 μg/mL(36.9 nM)となるように、測定直前に添加し混和した。同様にEmicizumabを終濃度100 μg/mL(667 nM)となるように、測定直前に添加し混和した。hFIXとhFX のみスパイクし、抗FIX/FX二重特異性抗体をスパイクしないサンプルをブランクサンプルとした。
KinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として使用した。調製したビーズの懸濁液一本分を、ランニングバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, pH 7.4)を25 mL充填したビーズボトル(Sapidyne社)に移した。KinExA 3200のオートサンプラーにおける各位置に、ビーズボトル、サンプル、検出抗体溶液をセットした。まずXB12を固相化したビーズをフローセル中のカラムに充填した。アプライするビーズの懸濁液の量は、ビーズが再現良く適切な高さまで充填されるようカメラでモニターし、最適化した。次に、カラムにサンプルを通過させることで、遊離したhFIX、hFIXと二重特異性抗体の2者複合体、また二重特異性抗体がhFIX、hFX両方と結合した3者複合体をビーズに捕捉させた。ランニングバッファー(+)(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN3, pH 7.4)による第一次洗浄工程後、蛍光標識SB04溶液を通過させ、蛍光標識SB04抗体を捕捉された3者複合体中のhFXに結合させた。ランニングバッファー(+)による第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出された。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)の体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定した。本測定における各条件を以下に示す。サンプル:135 μL, 32.4 s, 0.25 mL/min、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、検出抗体溶液:800 μL, 192 s, 0.25 mL/min、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。
調製したサンプルのうち、測定直前にQ3//J1抗体を添加して混和したサンプルを一つのランで測定し、Emicizumabを添加して混和したサンプルは、別のランで測定した。KinExA Proソフトウェア(Sapidyne社)に組み込まれているKineticsモードを使用することで、混和後のサンプルを経時的に繰り返し測定し、各時点について、KinExAシグナルと混和から測定までの経過時間を記録した。繰り返し測定は約12分間隔で行われ、計10点のデータを得た。また、ブランクサンプルをn=5で測定した。
各KinExAシグナル値から、ブランクサンプルのシグナル値の平均値を差し引くことで、3者複合体シグナル値を算出した。Y軸に抗体添加・混和から測定までの経過時間、X軸に3者複合体シグナル値をとり、測定値をプロットした(図10)。
Q3//J1抗体、Emicizumabともに、時間依存的にシグナル値は増大し、混和後60分程度でシグナル値ほぼ一定になることが確認されたため、この時点で平衡状態に達していると考えられた。また、サンプルがビーズを通過する際に、ビーズ上でFIXと二重特異性抗体の結合、二重特異性抗体とFXの結合が新たに生じ、新たに3者複合体が形成される寄与があり得るが、その場合、混和後0分でも複合体シグナル値が得られることが考えられる。測定機器の性質上、混和後0分の時点のシグナル値を得ることはできないため、最初の測定時点である約0.5分におけるシグナル値が平衡達成時の約3割程度であること、シグナル値の上昇は、混和直後が最も大きいことから考察すると、ビーズ上での複合体形成の寄与は低いと考えられる。したがって、測定された3者複合体シグナル値の大部分は、本測定において興味の対象としている、溶液中で形成された複合体由来であると考えられた。
他の実施例でKinExA(Sapidyne社)を用いて実施した3者複合体測定を、同様に、Gyrolab(Gyros Protein Technologies社)を用いて行った。Gyrolabは全自動リガンドバインディングアッセイシステムであり、専用のBioaffy CDを用いて、測定を行う。CD上の流路にアフィニティビーズカラムがあり、流路を通じて、カラム内にサンプルを短時間で通すことにより、ビーズに固相した抗体により、サンプル中の分析物は特異的に捕捉される。捕捉した分析物はさらに特異的な抗体の蛍光標識体を用いて検出される。これらの測定フローにより、特に短時間でサンプル中の分析物を捕捉することと、洗浄工程の洗浄量・時間が自動で制御されているという点において、GyrolabはKinExA と似た性質を持つことから、これを測定機器として選定した。実際に、KinExAとGyrolabの測定原理が類似していることから、これらはサンプル中の遊離抗体を測定することによる溶液中の抗原抗体反応の解離定数算出に用いられている(Anal Biochem. 15;426(2):134-41, 2012)。
GyrolabのCDはストレプトアビジンビーズがセットされているため、捕捉に使用するXB12は、Sulfo-NHS-LC-Biotin(Thermo Scientific社)によりビオチン化した(biotin-XB12)。プロトコルは製品プロトコルを参照した。ビオチン化処理後、フリーのビオチン試薬を除くため、Zeba Spin Desalting Columns(Thermo Scientific社)で処理した。100 μg/mL の溶液となるようにバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, pH 7.4)で調製した。凝集物を除くために、18,000 gで10分間遠心し、上清を使用した。
蛍光標識(Alexa Fluor 647 Antibody Labeling Kit, Thermo Scientific社を用いて製造元のプロトコル通り調製)した抗FX抗体(社内調製品:SB04)を、3 μg/mL の溶液となるようにアッセイバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製した。蛍光標識体の凝集物を除くために、18,000 gで10分間遠心し、上清を使用した。
hFIXとhFXをそれぞれ5, 8 μg/mL(89.3, 136 nM)一定とし、Q4//J3抗体を0.195-50 μg/mL (1.30-333 nM)の間で公比4の計5点の濃度でそれぞれスパイクしたサンプルをアッセイバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製した。hFIXとhFX のみスパイクし、抗FIX/FX二重特異性抗体をスパイクしないサンプルをブランクサンプルとした。hFIX、hFXの濃度については、生理学的な濃度(血漿中濃度)として設定した。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで1時間室温でインキュベートした。
Gyrolab xP workstation(Gyros Protein Technologies社)を測定機器として、Bioaffy 200を測定用のCDとして使用した。測定における全てのプロセスは、Gyrolabによって自動で実施された。機器をコントロールするプロトコルはGyrolab Controlソフトウェア(Gyros Protein Technologies社)内の200-3W-001 Wizard methodを使用し、捕捉抗体、サンプル、検出抗体の順に操作が進行し、各ステップの間で洗浄工程が入るようにした。捕捉抗体、検出抗体濃度は、シグナル値対ノイズ比が高かった条件として設定した。洗浄工程では、アッセイバッファー(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 1.2 mM CaCl2, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)を用いた。作成したプロトコルから生成されるプレートデザインに従って、専用のPCRプレートに捕捉抗体溶液、サンプル、検出抗体溶液、洗浄用のアッセイバッファーを加え、測定前にプレートを機器にセットした。測定の工程において、まず、biotin-XB12溶液が流路を通じて、ストレプトアビジンビーズに捕捉される。洗浄工程後、サンプル中の遊離したhFIX、hFIXと二重特異性抗体の2者複合体、またhFIX、hFXと二重特異性抗体の3者複合体が、ビーズ上のbiotin-XB12により捕捉され、洗浄工程後、蛍光標識SB04溶液を通過させ、蛍光標識SB04抗体を捕捉された3者複合体中のhFXに結合させた。検出は、光電子増倍管(PMT)によるレスポンスの増幅レベルの設定3種類の固定値(1, 5, 25%)で実施され、各設定での測定値が記録された。調製したサンプルのうち、ブランクサンプルをn=5、Q4//J3抗体をスパイクしたサンプルをn=3で測定した。
PMT1%の条件で検出されたレスポンスが、十分大きく、検出器の飽和が起きていない値であったため、これを解析に使用した。n=5で測定したブランクサンプルのレスポンスの平均(Mean)、標準偏差(SD)を算出し(Microsoft Excel 2013)、Mean+3.29×SDを検出限界として設定した。その他のサンプルのレスポンスのうち、検出限界以上のサンプルについて、ブランクサンプルのレスポンスのMeanを差し引くことで、3者複合体レスポンスを算出した。3者複合体レスポンスをY軸に、抗FIX/FX二重特異性抗体濃度をX軸にとり、測定値をプロットした(図11 (A))。同時に、Q4//J3抗体をスパイクしたサンプル中の3者複合体濃度をシミュレーションし(実施例6参照)、Y軸をQ4//J3抗体をスパイクしたサンプルの3者複合体シグナル値、X軸をシミュレーション値として、得られた結果をプロットし、Microsoft Excel 2013を用いて直線に回帰を行い、回帰式およびR2値を算出した(図11 (B))。
3者複合体レスポンスとQ4//J3抗体濃度の関係は、Q4//J3抗体濃度が83.3 nMでレスポンスが極大を示すベルシェイプ型の形状を示した(図11(A))。また、X軸をシミュレーション値、Y軸を3者複合体レスポンスとしてプロットした図において、直線関係が得られた(図11(B))。この結果は、実施例6、7においてKinExAで測定した結果と同等のものであったことから、Gyrolabにおいても、KinExAと同様に3者複合体測定が可能であると考えられた。
親和性の異なる3種の抗FIX/FX二重特異性抗体(Q4//J3、Q3//J1、Emicizumab)について、先天的Factor VIII欠損ヒト血漿中で、それぞれが形成する3者複合体濃度の比較をKinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として用いて行った。
実施例6に記載の方法で調製した
蛍光標識(Lightning-Link(登録商標) Rapid Dylight(登録商標) 650, Innova Biosciences社を用いて製造元のプロトコル通り調製)した抗FX抗体(社内調製品:SB04)を、実施例2に従って調製した。
先天的Factor VIII欠損ヒト血漿(George King Bio-Medical社)に、9分の1当量の1M HEPES buffer solution(pH 7.1-7.5, nacalai tesque社)を加え、さらに10000 unit/ 10 mL Heparin Sodium(Mochida Pharmaceutical社)を終濃度10 unit/mLとなるように添加した。本実験において、通常のELISA同様に血漿を希釈して測定してしまうと、希釈による複合体の解離が起きるため、血漿中の複合体を測定する目的を果たすことはできない。しかしながら、血漿をそのまま使用すると、血漿中炭酸イオン濃度変化によるpH変化が起こり、生理的な状況を反映できない。そのため、これを抑える目的で、HEPES buffer solutionによる緩衝作用を用いている。また、凝固反応をより抑えるためにHeparin Sodiumを添加している。このように調製した血漿を、以下ではFVIIId(++)血漿とする。
Q4//J3抗体を0.0488-50 μg/mL (0.326-333 nM)の間で公比4の計6点、Q3//J1抗体を1.38-354 μg/mL(9.20-2360 nM)の間で公比2の計9点、Emicuzumabを6.25-400 μg/mL(41.7-2667 nM)の間で公比2の計7点の濃度でそれぞれスパイクしたFVIIId(++)血漿サンプルを調製した。抗FIX/FX二重特異性抗体をスパイクしないFVIIId(++)血漿をブランクサンプルとした。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで1時間室温でインキュベートした。
KinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として使用した。調製したビーズの懸濁液一本分を、ランニングバッファー(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 0.02% NaN3, pH 7.4)を25 mL充填したビーズボトル(Sapidyne社)に移した。KinExA 3200のオートサンプラーにおける各位置に、ビーズボトル、サンプル、検出抗体溶液をセットした。測定における全てのプロセスは、KinExA 3200とオートサンプラーによって自動で実施された。機器をコントロールするプロトコルはKinExA Proソフトウェア(Sapidyne社)で作成された。プロトコルは、測定の各プロセスに対して、適切な試薬・サンプル位置を指定することで、適切なタイミングで、適切な試薬がサンプリングされるように作成された。まずXB12を固相化したビーズをフローセル中のカラムに充填した。アプライするビーズの懸濁液の量は、ビーズが再現良く適切な高さまで充填されるようカメラでモニターし、最適化した。次に、カラムにサンプルを通過させることで、遊離したhFIX、hFIXと二重特異性抗体の2者複合体、また二重特異性抗体がhFIX、hFX両方と結合した3者複合体をビーズに捕捉させた。ランニングバッファー(+)(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 0.05% Surfactant P20, 1.2 mM CaCl2, 0.02% NaN3, pH 7.4)による第一次洗浄工程後、蛍光標識SB04溶液を通過させ、蛍光標識SB04抗体を捕捉された3者複合体中のhFXに結合させた。ランニングバッファー(+)による第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出された。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+)の体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定した。本測定における各条件を以下に示す。サンプル:135 μL, 32.4 s, 0.25 mL/min、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、検出抗体溶液:800 μL, 192 s, 0.25 mL/min、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、第三次洗浄工程におけるランニングバッファー(+):1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。ブランクサンプルをn=5、その他のサンプルをn=1で測定した。
解析には、Microsoft Excel 2013およびGraphPad Prism(GraphPad Software社)を用いた。n=5で測定したブランクサンプルのシグナル値の平均(Mean)、標準偏差(SD)を算出し、Mean+3.29×SDを検出限界として設定した。その他のサンプルのシグナル値のうち、検出限界以上のサンプルについて、ブランクサンプルのシグナル値のMeanを差し引くことで、3者複合体シグナル値を算出した。3者複合体シグナル値をY軸に、抗FIX/FX二重特異性抗体濃度をX軸にとり、測定値をプロットした(図12(A))。同時に、Q4//J3抗体をスパイクしたサンプル中の3者複合体濃度をシミュレーションした(実施例6参照)。この時、FIXとFXの濃度は生理学的な濃度として、それぞれ5, 8 μg/mL(89.3, 136 nM)と仮定した。続いて、Y軸を3者複合体シグナル値、X軸をシミュレーション値として得られた結果をプロットした。スパイクした抗体濃度として0.0488-12.5 μg/mL (0.326-83.3 nM) の範囲においてy=a(x/(x+b))の関係が観察されたため、この範囲でのプロットに対して非線形回帰を行い、回帰式およびR2値を算出した(図12(B))。Q3//J1抗体、Emicizumabをスパイクしたサンプルの3者複合体シグナル値を図12(B)の回帰式より、濃度に換算した。換算した濃度をY軸、抗FIX/FX二重特異性抗体濃度をX軸にとり、プロットした(図12(C))。
抗FIX/FX二重特異性抗体の親和性に依存して、3者複合体シグナル値の強度が異なっており、親和性が高い(KD値が小さい)ほど低い抗体濃度でシグナル値が観察された。Q4//J3抗体と、Q3//J1抗体においては、調製したサンプルの濃度域でシグナル値の飽和が見られた。Q4//J3抗体においては、抗体濃度が12.5-50 μg/mL(83.3-333 nM)でシグナル値が飽和し、Q3//J1抗体においては、抗体濃度が177-354 μg/mL(1180-2360 nM)でシグナル値が飽和する傾向を示した。Emicizumabにおいては、抗体濃度が400 μg/mL (2667 nM)までシグナル値が飽和しなかった。
抗IL-6R抗体(Tocilizumab)と可溶型hIL-6Rが形成する2者複合体を検出するために、Tocilizumabが認識するものとは別のエピトープを認識する抗IL-6R抗体、および、抗hIgG Fc抗体を用いて複合体を特異的に認識する方法(図13)を考案し、この特異性を検証した。
実施例2に記載の方法と同様に、Tocilizumabが認識するものとは別のエピトープを認識する抗IL-6R抗体(Clone # 17506, R&D Systems社)をPMMAビーズ(Sapidyne社)に固相化し、ブロッキングした。
蛍光標識(Alexa FluorTM 647 Antibody Labeling Kit, Thermo Fisher Scientific社を用いて製造元のプロトコルに沿って調製)した抗hIgG Fc抗体の溶液を実施例2と同様に調製した。
TocilizumabとIL-6Rを、それぞれ1, 0.1 μg/mLの濃度でスパイクしたサンプル、また、片方のみスパイクしたサンプル、ブランクサンプルについてアッセイバッファー(0.01 M phosphate buffered saline, 0.138M NaCl, 0.0027M KCl, 0.05% Tween 20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製した(表3)。hIL-6Rの濃度については、生理学的な濃度として設定した。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで3時間室温でインキュベートした。
2者複合体の結合平衡の移動を最小限にするため、サンプルと固相抗体の接触時間が0.5秒未満と短いKinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として使用した。調製したビーズの懸濁液一本分を、ランニングバッファー(0.01 M phosphate buffered saline, 0.138M NaCl, 0.0027M KCl, 0.05% Tween 20, 0.02% NaN3, pH 7.4)を25mL充填したビーズボトル(Sapidyne社)に移した。KinExA 3200のオートサンプラーにおける各位置に、ビーズボトル、サンプル、検出抗体溶液をセットした。測定において、まずTocilizumabが認識するものとは別のエピトープを認識する抗IL-6R抗体を固相化したビーズをフローセル中のカラムに充填し、次に、カラムに調製したサンプルを通過させることで、遊離したhIL-6Rと、hIL-6RとTocilizumabの2者複合体をビーズに捕捉させた。ランニングバッファーによる第一次洗浄工程後、蛍光標識抗hIgG Fc抗体溶液を通過させ、ビーズ上に捕捉された2者複合体中のTocilizumabに結合させた。ランニングバッファーによる第二次洗浄、第三次洗浄工程後、測定開始時のベースラインから上昇した蛍光強度としてKinExAシグナルが検出された(図14)。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファーの体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定した。本測定における各条件を以下に示す。サンプル:50 μL, 12 s, 0.25 mL/min、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー:125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、検出抗体溶液:500 μL, 120 s, 0.25 mL/min、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー:125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、第三次洗浄工程におけるランニングバッファー:1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。各サンプルをn=1で測定した。
二者が揃ったサンプル(Sample No.1)のみで高いシグナル値が得られ、一者のみスパイクしたサンプル(Sample No.2, 3)では、スパイクしていないブランクサンプル(Sample No.4)と同程度であった。したがって、本測定法により、2者複合体を特異的に検出することができることが確かめられた。また、二者が含まれるサンプルのシグナル値と、ブランクサンプルのシグナル値の差分を、2者複合体由来のシグナル値と捉えるのが妥当であると考えられた。
実施例6と同様に、抗IL-6R抗体と可溶型IL-6Rが形成する複合体の測定においても、測定値とシミュレーション値との比較を行った。これにより、本測定において、KD値にしたがって複合体が形成され、かつ、結合平衡が大きくシフトせずに測定されることを確認した。
実施例12と同様に実施した。
実施例12と同様に実施した。
IL-6Rを0.103 μg/mL(2 nM)一定とし、Tocilizumabを0, 0.003, 0.009, 0.03, 0.09, 0.3, 0.9, 3 μg/mL(0, 0.04, 0.12, 0.4, 1.2, 4, 12, 40 nM)と振った計8点の濃度でスパイクしたサンプルをアッセイバッファー(0.01 M phosphate buffered saline, 0.138M NaCl, 0.0027M KCl, 0.05% Tween 20, 0.02% NaN3, 0.1% BSA, pH 7.4)で調製した。スパイクしないサンプルをブランクサンプルとした。hIL-6Rの濃度については、生理学的な濃度として設定した。サンプル調製後、複合体の形成が平衡状態に達するように、測定するまで3時間室温でインキュベートした。
KinExA 3200(Sapidyne社)を測定機器として使用し、実施例12と同様の手順で測定を実施した。サンプル、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー、検出抗体溶液、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー、また第三次洗浄工程におけるランニングバッファーの体積、時間、流速をそれぞれ変化させ、シグナル値対ノイズ比が十分な条件で測定した。本測定における各条件を以下に示す。サンプル:150 μL, 36 s, 0.25 mL/min、第一次洗浄工程におけるランニングバッファー:125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、検出抗体溶液:500 μL, 120 s, 0.25 mL/min、第二次洗浄工程におけるランニングバッファー:125 μL, 30 s, 0.25 mL/min、第三次洗浄工程におけるランニングバッファー:1500 μL, 90 s, 1.00 mL/min。各サンプルをn=1、ブランクサンプルはn=5で測定した。
n=5で測定したブランクサンプルのシグナル値の平均(Mean)、標準偏差(SD)を算出し(Microsoft Excel 2013)、Mean+3.29×SDを検出限界として設定した。その他のサンプルのシグナル値のうち、検出限界以上のサンプルについて、ブランクサンプルのシグナル値のMeanを差し引くことで、2者複合体のシグナル値を算出した。同時に、調製したサンプル中のTocilizumab、IL-6R濃度とKD値(0.11 μg/mL、J Pharmacokinet Pharmacodyn. 2012 Feb;39(1):5-16.)から、各サンプル中の2者複合体濃度をシミュレーションした。シミュレーションでは、Tocilizumabが2価で結合することから、Tocilizumab分子の濃度に2を乗じた値を、結合サイトの濃度として扱った。また、一つの結合サイトとhIL-6Rが結合した状態を2者複合体として、濃度を計算した。すなわち、Tocilizumab 1分子と、hIL-6R 2分子が結合した状態と、Tocilizumab 2分子が、それぞれ1分子のhIL-6Rと結合した状態を区別していない。得られた2者複合体シグナル値と、シミュレーション値を比較するため、これらを左右のY軸(シグナル値は黒丸、シミュレーション値は点線)に、またTocilizumabの結合サイト濃度をX軸にとり、プロットを作成した(図15A)。加えて、Y軸を2者複合体シグナル値、X軸をシミュレーション値として、得られた結果をプロットし、Microsoft Excel 2013を用いて相関解析を行った。相関解析では、線形近似曲線を引き、R2値を算出した(図15B)。
TocilizumabとhIL-6をスパイクしたサンプルは、全て検出限界を上回るシグナルを示した。Tocilizumabの添加濃度に従って、2者複合体シグナル値はシグモイドの形状を取り、これはシミュレーションから推測された形状と一致していた。また、X軸をシミュレーション値、Y軸を2者複合体シグナル値としてプロットした図15Bにおいて、直線関係が得られた。これらのことから、得られているKD値にしたがって複合体が形成され、結合平衡が大きくシフトせずに測定されていると考えられた。さらに、このような関係性を得ることで、シミュレーション値が正しいという仮定の元、未知の濃度のTocilizumabとhIL-6Rを含むサンプルを測定した際に、得られた2者複合体シグナル値から、回帰により2者複合体濃度を算出できると考えられた。
Claims (17)
- 試料中の複合体を検出する方法であって、
(1)第一の結合体と複合体を含む試料とを接触させ、第一の結合体と複合体とを結合させる工程、
(2)第一の結合体に結合した複合体と、第二の結合体とを結合させる工程、および
(3)複合体と結合した第二の結合体を検出する工程、
を含み、前記複合体は2以上の成分を含み、前記成分間の少なくともいずれか一つのKD値が1nM以上であり、複合体の結合平衡が実質的に維持される条件で行われる、前記方法。 - 複合体の成分は、標識化あるいは固相に固定化されていない、請求項1に記載の方法。
- 前記成分はペプチド、ポリペプチドおよびタンパク質からなる群から少なくとも一つ選択される、請求項1または2に記載の方法。
- 前記成分の少なくとも2つは、抗体および当該抗体が認識する抗原である、請求項1~3のいずれかに記載の方法。
- 前記成分の少なくとも3つは、二重特異性抗体および前記抗体が認識する2つの抗原である、請求項1~4のいずれかに記載の方法。
- 第二の結合体が標識されている、請求項1~5のいずれかに記載の方法。
- 試料は血液試料であり、さらに好ましくは全血、血清または血漿である、請求項1~6のいずれかに記載の方法。
- 第一の結合体は固相に結合している、請求項1~7のいずれかに記載の方法。
- 固相は、チップ、マイクロ流体チップ、ディスクまたはビーズである、請求項8に記載の方法。
- KinExAまたはGyrolabにより測定される、請求項1~9のいずれかに記載の方法。
- 二重特異性抗体は下記の(a)、2つの抗原は下記の(b)および(c)である、請求項5~10のいずれかに記載の方法。
(a)血液凝固第IX因子および/または活性化血液凝固第IX因子、ならびに、血液凝固第X因子を認識する二重特異性抗体
(b)血液凝固第IX因子または活性化血液凝固第IX因子
(c)血液凝固第X因子 - 請求項1~11のいずれかに記載の方法にさらに以下の工程を行う、試料中の複合体の濃度および/または量を決定する方法。
(4)回帰式作成用の複合体を準備する工程、
(5)前記工程(4)の複合体を前記工程(1)~(3)の工程を含む工程により検出する工程、
(6)前記工程(4)の複合体濃度をシミュレーションする工程、
(7)前記工程(5)で検出したシグナル値とシミュレーション濃度より回帰式を算出する工程、及び、
(8)前記工程(3)により検出したシグナル値を前記回帰式に当てはめる工程。 - 少なくとも一つの成分が薬剤である、請求項12に記載の方法。
- 請求項13に記載の方法により決定した複合体の濃度および/または量を基に、薬剤を用いた治療法を決定する方法。
- 請求項12~14のいずれかに記載の方法により決定した複合体の濃度および/または量を基に、複合体の動態を評価する方法。
- 試料中の複合体の濃度および/または量を決定する方法であって、
前記複合体は2以上の成分を含み、前記成分間の少なくともいずれか一つのKD値が1nM以上であり、前記複合体の結合平衡が実質的に維持される条件で行われ、
(1)第一の結合体と複合体を含む試料とを接触させ、第一の結合体と複合体とを結合させる工程、
(2)第一の結合体に結合した複合体と、第二の結合体とを結合させる工程、
(3)複合体と結合した第二の結合体を検出する工程、
(4)回帰式作成用の複合体を準備する工程、
(5)前記工程(4)の複合体を前記工程(1)~(3)の工程を含む工程により検出する工程、
(6)前記工程(4)の複合体濃度をシミュレーションする工程、
(7)前記工程(5)で検出したシグナル値とシミュレーション濃度より回帰式を算出する工程、および、
(8)前記工程(3)により検出したシグナル値を前記回帰式に当てはめる工程、
を含む、前記方法。 - 試料中の複合体を検出する方法であって、
前記複合体は成分として二重特異性抗体及びそれが認識する2つの抗原を含む3者複合体であり、
(1)前記抗原を認識する第一の結合体と前記複合体を含む試料とを接触させ、第一の結合体と複合体とを結合させる工程、
(2)第一の結合体に結合した複合体と、第一の結合体が認識する抗原とは異なる抗原を認識する第二の結合体とを結合させる工程、および、
(3)複合体と結合した第二の結合体を検出する工程、
を含む、前記方法。
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