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TWI646099B - 作爲ｊａｋ抑制劑之三環稠合噻吩衍生物 - Google Patents

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TWI646099B TW102139641A TW102139641A TWI646099B TW I646099 B TWI646099 B TW I646099B TW 102139641 A TW102139641 A TW 102139641A TW 102139641 A TW102139641 A TW 102139641A TW I646099 B TWI646099 B TW I646099B
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Abstract

本發明提供調節Janus激酶(JAK)活性且適用於治療與JAK活性相關之疾病，包括例如發炎性病症、自體免疫性病症、癌症及其他疾病的三環稠合噻吩衍生物以及其組合物及使用方法。

Description

作為JAK抑制劑之三環稠合噻吩衍生物
本申請案主張2012年11月1日申請之美國臨時申請案第61/721,308號及2013年3月14日申請之美國臨時申請案第61/783,850號之優先權益，該等臨時申請案各自以全文引用的方式併入本文中。
本發明提供調節Janus激酶(JAK)活性且適用於治療與JAK活性相關之疾病，包括例如發炎性病症、自體免疫性病症、癌症及其他疾病的三環稠合噻吩衍生物以及其組合物及使用方法。
蛋白質激酶(PK)調控不同生物過程，尤其包括細胞生長、存活、分化、器官形成、形態發生、新血管生成、組織修復及再生。蛋白質激酶亦在許多人類疾病(包括癌症)中起特別作用。細胞激素、低分子量多肽或醣蛋白調控宿主對敗血症之發炎性反應中涉及之許多路徑。細胞激素影響細胞分化、增殖及活化，且可調節促發炎反應與消炎反應兩者以使宿主可對病原體起適當反應。廣泛範圍之細胞激素之信號傳導涉及蛋白質酪胺酸激酶之Janus激酶家族(JAK)及轉錄之信號轉導因子及活化因子(Signal Transducers and Activators of Transcription；STAT)。存在四種已知哺乳動物JAK：JAK1(Janus激酶-1)、JAK2、JAK3(亦稱為白血球Janus激酶；JAKL；及L-JAK)及TYK2(蛋白質-酪胺酸激酶2)。
細胞激素刺激之免疫及發炎性反應有助於疾病之發病機制：諸如嚴重合併性免疫缺失病(SCID)之病理學起因於免疫系統受遏制，而活性過度或不當之免疫/發炎性反應有助於自體免疫性疾病(例如哮喘、全身性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus)、甲狀腺炎、心肌炎)及諸如硬皮病及骨關節炎之疾病之病理學(Ortmann,R.A.,T.Cheng等人(2000)Arthritis Res 2(1)：16-32)。
JAK之表現不足與許多疾病病況相關。舉例而言，Jak1-/-小鼠在出生時矮小、無法照料且在週產期死亡(Rodig,S.J.,M.A.Meraz等人(1998)Cell 93(3)：373-83)。Jak2-/-小鼠胚胎貧血且由於不存在決定性之紅血球生成而在交配後約第12.5天死亡。
咸信JAK/STAT路徑且特定言之所有四種JAK在哮喘反應、慢性阻塞性肺病、支氣管炎及下呼吸道之其他相關發炎性疾病之發病機制中起作用。已發現經由JAK傳導信號之多種細胞激素與上呼吸道之發炎性疾病/病狀，諸如影響鼻及竇者(例如鼻炎及竇炎)相關聯，無論其是否為典型過敏性反應。亦已發現JAK/STAT路徑牽涉於眼部之發炎性疾病/病狀及慢性過敏性反應中。
癌症中JAK/STAT之活化可由於細胞激素刺激(例如IL-6或GM-CSF)或由於JAK信號傳導，諸如SOCS(抑制因子或細胞激素信號傳導)或PIAS(活化STAT之蛋白質抑制因子)之內源性抑制因子減少而發生(Boudny,V.及Kovarik,J.,Neoplasm.49：349-355,2002)。STAT信號傳導以及JAK下游其他路徑(例如Akt)之活化已與許多癌症類型中之不良預後相關聯(Bowman,T.等人Oncogene 19：2474-2488,2000)。經由JAK/STAT傳導信號之循環細胞激素之含量升高在惡病質(cachexia)及/或慢性疲勞中起病因性作用。因此，JAK抑制可能因延及潛在抗腫瘤活性以外之原因而有益於癌症患者。
JAK2酪胺酸激酶可有益於患有骨髓增生性病症，例如真性紅細胞增多症(polycythemia vera，PV)、原發性血小板增多症(essential thrombocythemia，ET)、伴有骨髓纖維化之骨髓化生(myeloid metaplasia with myelofibrosis，MMM)之患者(Levin等人，Cancer Cell，第7卷，2005：387-397)。抑制JAK2V617F激酶會減少造血細胞之增殖，表明JAK2為用於在患有PV、ET及MMM之患者中進行藥理學抑制之潛在目標。
抑制JAK可能有益於罹患皮膚免疫病症，諸如牛皮癬及皮膚敏化之患者。咸信除各種趨化因子及生長因子之外，牛皮癬之維持亦取決於許多發炎性細胞激素(JCI,113：1664-1675)，其中許多發炎性細胞激素經由JAK傳導信號(Adv Pharmacol.2000；47：113-74)。
因此，抑制諸如JAK之激酶之新穎或改良藥劑持續為開發旨在加強或遏制免疫及發炎路徑的新穎且更有效之醫藥(諸如用於器官移植之免疫抑制劑)所需，亦需要預防及治療自體免疫性疾病、涉及活性過度發炎性反應之疾病(例如濕疹)、過敏、癌症(例如前列腺癌、白血病、多發性骨髓瘤)及由其他治療劑引起之一些免疫反應(例如皮疹或接觸性皮炎或腹瀉)的藥劑。本文所述之本發明化合物以及其組合物及方法係針對此等需要及其他目標。
本發明尤其提供式I化合物： 及其醫藥學上可接受之鹽；其中Y、X1、X2、X3、X4、X5、R5及係在下文中加以定義。
本發明更提供包含式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之載劑之組合物。
本發明更提供調節JAK1之活性之方法，其包含使JAK1與式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽接觸。
本發明更提供藉由向患者投與治療有效量之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽來治療患者之與激酶表現或活性異常相關之疾病或病症的方法。
本發明更提供治療有需要之患者之自體免疫性疾病、癌症、骨髓增生性病症、發炎性疾病、骨再吸收疾病或器官移植排斥的方法，其包含向該患者投與治療有效量之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明亦提供如本文所述之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽，其係用於治療自體免疫性疾病、癌症、骨髓增生性病症、發炎性 疾病、骨再吸收疾病或器官移植排斥。
本發明更提供如本文所述之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽，其係用於調節JAK1。
本發明亦提供如本文所述之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽的用途，其係用於製備用於調節JAK1之方法中之藥劑。
本發明尤其提供式I化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽，其中： 環系統為芳族； 各係獨立地選自單鍵及雙鍵；Y為N或CR4；X1係選自CR1、CR1R1a、C(=O)、N、NR1、O及S；X2係選自CR2、C(=O)、N、NR2及C(=NR2a)；X3係選自CR3及NR3；X4係選自C及N；且X5為C；或X4為C；且X5係選自C及N；其限制條件為：(i)對X1、X2、X3、X4、X5及之各者之選擇應維持適當原子價；(ii)當X1為O或S時，則X2不為NR2且X2 X3不為-C(=O)-CR3-； (iii)當X1為NR1時，則X2 X3不為-NR2-NR3-；(iv)當X4為N時，則X1 X2 X3不為=N-NR2-NR3-；且(v)當X5為N時，則X1 X2不為-NR1-NR2-且X1 X2 X3不為-CR1R1a-NR2-CR3=；R1係選自H、鹵基、CN、NH2、C1-3烷基、C1-3烷氧基及C1-3鹵烷基；R1a係選自H、鹵基、CN、NH2、C1-3烷基及C1-3鹵烷基；R2a係選自CN、OH、OCH3及NO2；R2係選自H、鹵基、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、C1-6烷氧基、C1-6烷基-S-、CN、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、C(=NRe)Rb、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6烷氧基及C1-6烷基-S-各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：Cy2、鹵基、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；或者，R2係選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、R21、Cy2、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；其限制條件為當X1 X2 X3為-N=CR2-NR3-，X4為C，且X5為C；且Cy4為具有一或多個氮原子之未經取代或經取代之3-10員飽和雜伸環烷基或Cy4A為未經取代或經取代之具有一或多個氮原子之3-10員飽和雜伸環烷基時，則R2係選自H、鹵基、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、C1-6 烷氧基、C1-6烷基-S-、CN、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、C(=NRe)Rb、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6烷氧基及C1-6烷基-S-各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：Cy2、鹵基、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；各R21係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：Cy2、鹵基、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；或者，當兩個R21基團連接於同一碳原子時，該兩個R21基團連同其所連接之該碳原子一起形成3-7員環烷基環或3-7員雜環烷基環，其中該雜環烷基環之1或2個環成員係獨立地選自N、O及S；且其中該等環烷基環及雜環烷基環各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、OH、CN、C1-3烷基、C1-3烷氧基及C1-3鹵烷基；各Cy2係獨立地選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、R22、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd； 各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、CN、NO2、ORa1、SRa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；各Rb係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、CN、NO2、ORa1、SRa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；各Re係獨立地選自H、CN、OH、C1-4烷基、C1-4烷氧基、NO2、C(O)(C1-4烷基)及S(=O)2(C1-4烷基)；各R22係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：Cy3、鹵基、CN、NO2、ORa1、SRa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；各Ra1、Rc1及Rd1係獨立地選自H、C1-3烷基、C2-3烯基、C2-3炔基及C1-3鹵烷基； 各Rb1係獨立地選自C1-3烷基、C2-3烯基、C2-3炔基及C1-3鹵烷基；各Re1係獨立地選自H、CN、OH、C1-4烷基及C1-4烷氧基；各Cy3係獨立地選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、NO2、ORa1、SRa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；R3係選自Cy4、-Cy4A-Cy5、-Cy4A-Y1-Cy5、-Cy4A-Y1-Cy5A-Cy6、-Cy4A-Cy5A-Y2-Cy6、-Cy4A-Y1-Cy5A-Y2-Cy6或-Cy4A-Y3-Cy6；Cy4係選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy4A係選自C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基，其中該等C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Y1為Y11、C1-6伸烷基、C2-6伸烯基、C2-6伸炔基、C1-6伸烷基-Y11、C2-6伸烯基-Y11、C2-6伸炔基-Y11、Y11-C1-6伸烷基、Y11-C2-6伸烯基或Y11-C2-6伸炔基，其中該等伸烷基、伸烯基及伸炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、OH、C1-3烷基、C1-3烷氧基、C1-3鹵烷基及C1-3鹵烷氧基；Cy5及Cy6係各自獨立地選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團取代；Cy5A係選自C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基，其中該等C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團取代； Y2為Y21、C1-6伸烷基、C2-6伸烯基、C2-6伸炔基、C1-6伸烷基-Y21、C2-6伸烯基-Y21、C2-6伸炔基-Y21、Y21-C1-6伸烷基、Y21-C2-6伸烯基或Y21-C2-6伸炔基，其中該等伸烷基、伸烯基及伸炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、OH、C1-3烷基、C1-3烷氧基、C1-3鹵烷基及C1-3鹵烷氧基；Y3為C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基、C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基-Y31或Y31-C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基，其中該等伸烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、OH、C1-3烷基、C1-3烷氧基、C1-3鹵烷基及C1-3鹵烷氧基；各Cy7係獨立地選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立選擇之R33基團取代；Y11、Y21及Y31係各自獨立地選自O、S、C(=O)、C(=O)NRf、C(=O)O、OC(=O)、OC(=O)NRf、NRf、NRfC(=O)、NRfC(=O)O、NRfC(=O)NRf、NRfS(=O)、NRfS(=O)2、NRfS(=O)2NRf、S(=O)、S(=O)NRf、S(=O)2及S(=O)2NRf；各R31係獨立地選自Cy7、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各R32係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、鹵基、 CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各R33係獨立地選自鹵基、OH、NO2、CN、C1-3烷基、C2-3烯基、C2-3炔基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、C1-3烷氧基-C1-3烷基、C3-7環烷基、C1-3烷氧基、C1-3鹵烷氧基、胺基、C1-3烷基胺基、二(C1-3烷基)胺基、硫基、C1-3烷基硫基、C1-3烷基亞磺醯基、C1-3烷基磺醯基、胺甲醯基、C1-3烷基胺甲醯基、二(C1-3烷基)胺甲醯基、羧基、C1-3烷基羰基、C1-4烷氧基羰基、C1-3烷基羰基氧基、C1-3烷基羰基胺基、C1-3烷基磺醯基胺基、胺基磺醯基、C1-3烷基胺基磺醯基、二(C1-3烷基)胺基磺醯基、胺基磺醯基胺基、C1-3烷基胺基磺醯基胺基、二(C1-3烷基)胺基磺醯基胺基、胺基羰基胺基、C1-3烷基胺基羰基胺基及二(C1-3烷基)胺基羰基胺基；或者，當兩個R33基團連接於同一碳原子時，該兩個R33基團連同其所連接之該碳原子一起形成3-7員環烷基環或3-7員雜環烷基環，其中該雜環烷基環之1或2個環成員係獨立地選自N、O及S；且其中該等環烷基環及雜環烷基環各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、OH、CN、C1-3烷基、C1-3烷氧基及C1-3鹵烷基；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自R33之取代基取代；各Rb2係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自R33之取 代基取代；各Re2係獨立地選自H、CN、OH、C1-4烷基及C1-4烷氧基；各Rf係獨立地選自H及C1-3烷基；R4係選自H、鹵基、CN、NH2、C1-3烷基及C1-3鹵烷基；且R5係選自H、鹵基、氰基、羥基、胺基、(C1-4烷基)胺基、二(C1-4烷基)胺基、C1-4烷基、C1-4鹵烷基及C1-4烷氧基。
在一些實施例中： 環系統為芳族； 各係獨立地選自單鍵及雙鍵；Y為N或CR4；X1係選自CR1、CR1R1a、C(=O)、N、NR1、O及S；X2係選自CR2、C(=O)、N、NR2及C(=NR2a)；X3係選自CR3及NR3；X4係選自C及N；且X5為C；或X4為C；且X5係選自C及N；其限制條件為：(i)對X1、X2、X3、X4、X5及之各者之選擇應維持適當原子價；(ii)當X1為O或S時，則X2不為NR2且X2 X3不為-C(=O)-CR3-；(iii)當X1為NR1時，則X2 X3不為-NR2-NR3-；(iv)當X4為N時，則X1 X2 X3不為=N-NR2-NR3-；且(v)當X5為N時，則X1 X2不為-NR1-NR2-且X1 X2 X3不為-CR1R1a-NR2-CR3=；R1係選自H、鹵基、CN、NH2、C1-3烷基、C1-3烷氧基及C1-3鹵烷基；R1a係選自H、鹵基、CN、NH2、C1-3烷基及C1-3鹵烷基；R2a係選自CN、OH、OCH3及NO2；R2係選自H、鹵基、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、C1-6烷氧基、C1-6烷基-S-、CN、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、 NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、C(=NRe)Rb、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6烷氧基及C1-6烷基-S-各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：Cy2、鹵基、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；或者，R2係選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、R21、Cy2、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；各R21係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：Cy2、鹵基、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；或者，當兩個R21基團連接於同一碳原子時，該兩個R21基團連同其所連接之該碳原子一起形成3-7員環烷基環或3-7員雜環烷基環，其中該雜環烷基環之1或2個環成員係獨立地選自N、O及S；且其中該等環烷基環及雜環烷基環各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、OH、CN、C1-3烷基、C1-3烷氧基及C1-3鹵烷基；各Cy2係獨立地選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環 烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、R22、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、CN、NO2、ORa1、SRa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；各Rb係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、CN、NO2、ORa1、SRa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；各Re係獨立地選自H、CN、OH、C1-4烷基、C1-4烷氧基、NO2、C(O)(C1-4烷基)及S(=O)2(C1-4烷基)；各R22係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：Cy3、鹵基、CN、NO2、ORa1、SRa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、 C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；各Ra1、Rc1及Rd1係獨立地選自H、C1-3烷基、C2-3烯基、C2-3炔基及C1-3鹵烷基；各Rb1係獨立地選自C1-3烷基、C2-3烯基、C2-3炔基及C1-3鹵烷基；各Re1係獨立地選自H、CN、OH、C1-4烷基及C1-4烷氧基；各Cy3係獨立地選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立地選自以下之取代基取代：C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、NO2、ORa1、SRa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；R3為Cy4、-Cy4A-Cy5、-Cy4A-Y1-Cy5、-Cy4A-Y1-Cy5A-Cy6、-Cy4A-Cy5A-Y2-Cy6、-Cy4A-Y1-Cy5A-Y2-Cy6或-Cy4A-Y3-Cy6；Cy4係選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其中該3-10員雜環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜環烷基；Cy4A係選自C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基，其中該等C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其中該3-10員雜伸環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜伸環烷基；Y1為Y11、C1-6伸烷基、C2-6伸烯基、C2-6伸炔基、C1-6伸烷基-Y11、C2-6伸烯基-Y11、C2-6伸炔基-Y11、Y11-C1-6伸烷基、Y11-C2-6伸烯基或Y11-C2-6伸炔基，其中該等伸烷基、伸烯基及伸炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自 以下之取代基取代：鹵基、CN、OH、C1-3烷基、C1-3烷氧基、C1-3鹵烷基及C1-3鹵烷氧基；Cy5及Cy6係各自獨立地選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團取代；Cy5A係選自C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基，其中該等C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團取代；Y2為Y21、C1-6伸烷基、C2-6伸烯基、C2-6伸炔基、C1-6伸烷基-Y21、C2-6伸烯基-Y21、C2-6伸炔基-Y21、Y21-C1-6伸烷基、Y21-C2-6伸烯基或Y21-C2-6伸炔基，其中該等伸烷基、伸烯基及伸炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、OH、C1-3烷基、C1-3烷氧基、C1-3鹵烷基及C1-3鹵烷氧基；Y3為C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基、C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基-Y31或Y31-C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基，其中該等伸烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、OH、C1-3烷基、C1-3烷氧基、C1-3鹵烷基及C1-3鹵烷氧基；各Cy7係獨立地選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立選擇之R33基團取代；Y11、Y21及Y31係各自獨立地選自O、S、C(=O)、C(=O)NRf、C(=O)O、OC(=O)、OC(=O)NRf、NRf、NRfC(=O)、NRfC(=O)O、NRfC(=O)NRf、NRfS(=O)、NRfS(=O)2、NRfS(=O)2NRf、S(=O)、S(=O)NRf、S(=O)2及S(=O)2NRf；各R31係獨立地選自Cy7、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、 S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各R32係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各R33係獨立地選自鹵基、OH、NO2、CN、C1-3烷基、C2-3烯基、C2-3炔基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、C1-3烷氧基-C1-3烷基、C3-7環烷基、C1-3烷氧基、C1-3鹵烷氧基、胺基、C1-3烷基胺基、二(C1-3烷基)胺基、硫基、C1-3烷基硫基、C1-3烷基亞磺醯基、C1-3烷基磺醯基、胺甲醯基、C1-3烷基胺甲醯基、二(C1-3烷基)胺甲醯基、羧基、C1-3烷基羰基、C1-4烷氧基羰基、C1-3烷基羰基氧基、C1-3烷基羰基胺基、C1-3烷基磺醯基胺基、胺基磺醯基、C1-3烷基胺基磺醯基、二(C1-3烷基)胺基磺醯基、胺基磺醯基胺基、C1-3烷基胺基磺醯基胺基、二(C1-3烷基)胺基磺醯基胺基、胺基羰基胺基、C1-3烷基胺基羰基胺基及二(C1-3烷基)胺基羰基胺基；或者，當兩個R33基團連接於同一碳原子時，該兩個R33基團連同其所連接之該碳原子一起形成3-7員環烷基環或3-7員雜環烷基環，其中該雜環烷基 環之1或2個環成員係獨立地選自N、O及S；且其中該等環烷基環及雜環烷基環各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、OH、CN、C1-3烷基、C1-3烷氧基及C1-3鹵烷基；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自R33之取代基取代；各Rb2係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自R33之取代基取代；各Re2係獨立地選自H、CN、OH、C1-4烷基及C1-4烷氧基；各Rf係獨立地選自H及C1-3烷基；R4係選自H、鹵基、CN、NH2、C1-3烷基及C1-3鹵烷基；且R5係選自H、鹵基、氰基、羥基、胺基、(C1-4烷基)胺基、二(C1-4烷基)胺基、C1-4烷基、C1-4鹵烷基及C1-4烷氧基。
在一些實施例中：R2為H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、C1-6烷氧基、C1-6烷基-S-、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6烷氧基及C1-6烷基-S-各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其中該C1-6烷基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、 S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；且各Rb係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其中該C1-6烷基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、C1-6烷基、CN、ORa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1。
在一些實施例中：R2為C1-6烷基，其視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其中該C1-6烷基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1；各Rb係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其中該C1-6烷基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、C1-6烷基、CN、ORa1、C(=O)Rb1、C(=O)NRc1Rd1、C(=O)ORa1、OC(=O)Rb1、OC(=O)NRc1Rd1、C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1C(=NRe1)NRc1Rd1、NRc1Rd1、NRc1C(=O)Rb1、NRc1C(=O)ORa1、NRc1C(=O)NRc1Rd1、NRc1S(=O)Rb1、NRc1S(=O)2Rb1、NRc1S(=O)2NRc1Rd1、S(=O)Rb1、S(=O)NRc1Rd1、S(=O)2Rb1及S(=O)2NRc1Rd1。
在一些實施例中，R2為C1-6烷基、C1-6烷氧基及C1-6烷基-S-，其各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、OH、C1-6烷氧基、S(C1-6烷基)、C(=O)(C1-6烷基)、C(=O)NH2、C(=O)NH(C1-6烷基)、C(=O)N(C1-6烷基)2、C(=O)O(C1-6烷基)、OC(=O)(C1-6烷基)、 OC(=O)NH2、OC(=O)NH(C1-6烷基)、OC(=O)N(C1-6烷基)2、C(=NH)NH2、C(=NH)NH(C1-6烷基)、C(=NH)N(C1-6烷基)2、NHC(=NH)NH2、NHC(=NH)NH(C1-6烷基)、NHC(=NH)N(C1-6烷基)2、NH2、NH(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)2、NHC(=O)(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)C(=O)(C1-6烷基)、NHC(=O)(C1-6烷基)、NHC(=O)O(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)C(=O)O(C1-6烷基)、NHC(=O)NH2、NHC(=O)NH(C1-6烷基)、NHC(=O)N(C1-6烷基)2、NHS(=O)(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)S(=O)(C1-6烷基)、NHS(=O)2(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)S(=O)2(C1-6烷基)、NHS(=O)2NH2、NHS(=O)2NH(C1-6烷基)、NHS(=O)2N(C1-6烷基)2、S(=O)(C1-6烷基)、S(=O)NH2、S(=O)NH(C1-6烷基)、S(=O)N(C1-6烷基)2、S(=O)2(C1-6烷基)、S(=O)2NH2、S(=O)2NH(C1-6烷基)及S(=O)2N(C1-6烷基)2。
在一些實施例中，R2為C1-6烷基，其視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、OH、C1-6烷氧基、S(C1-6烷基)、C(=O)(C1-6烷基)、C(=O)NH2、C(=O)NH(C1-6烷基)、C(=O)N(C1-6烷基)2、C(=O)O(C1-6烷基)、OC(=O)(C1-6烷基)、OC(=O)NH2、OC(=O)NH(C1-6烷基)、OC(=O)N(C1-6烷基)2、C(=NH)NH2、C(=NH)NH(C1-6烷基)、C(=NH)N(C1-6烷基)2、NHC(=NH)NH2、NHC(=NH)NH(C1-6烷基)、NHC(=NH)N(C1-6烷基)2、NH2、NH(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)2、NHC(=O)(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)C(=O)(C1-6烷基)、NHC(=O)(C1-6烷基)、NHC(=O)O(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)C(=O)O(C1-6烷基)、NHC(=O)NH2、NHC(=O)NH(C1-6烷基)、NHC(=O)N(C1-6烷基)2、NHS(=O)(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)S(=O)(C1-6烷基)、NHS(=O)2(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)S(=O)2(C1-6烷基)、NHS(=O)2NH2、NHS(=O)2NH(C1-6烷基)、NHS(=O)2N(C1-6烷基)2、S(=O)(C1-6烷基)、S(=O)NH2、S(=O)NH(C1-6烷基)、S(=O)N(C1-6烷基)2、S(=O)2(C1-6烷基)、S(=O)2NH2、S(=O)2NH(C1-6烷基)及S(=O)2N(C1-6烷基)2。
在一些實施例中，R2為C1-6烷基，其視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra及Rc係獨立地選自H及C1-3烷基；且各Rb係獨立地選自C1-3烷基。
在一些實施例中，R2為H或C1-6烷基，其中該C1-6烷基視 情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa、NRcRd、NRcC(=O)Rb及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H及C1-3烷基；且各Rb係獨立地選自C1-3烷基。
在一些實施例中，R2為H、甲基、乙基、丙基或異丙基，其中該等甲基、乙基、丙基或異丙基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa、NRcRd、NRcC(=O)Rb及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、甲基及乙基；且各Rb係獨立地選自甲基及乙基。
在一些實施例中，R2為甲基或乙基，其各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra及Rc係獨立地選自H、甲基及乙基；且各Rb係獨立地選自甲基及乙基。
在一些實施例中，R2為環丙基或氮雜環丁烷環，其各自視情況經1、2或3個獨立選擇之R21基團取代。
在一些實施例中，各R21係獨立地為C1-3烷基。
在一些實施例中：R2為H、甲基、乙基、丙基或異丙基，其中該等甲基、乙基、丙基或異丙基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa、NRcRd、NRcC(=O)Rb及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、甲基及乙基；且各Rb係獨立地選自甲基及乙基；或或者，R2為環丙基或氮雜環丁烷環，其各自視情況經1、2或3個獨立選擇之R21基團取代；且各R21係獨立地為C1-3烷基。
在一些實施例中，R2為-CH2-OH、-CH(CH3)-OH或-CH2-NHSO2CH3。
在一些實施例中，R4為H。
在一些實施例中，R5為H。
在一些實施例中，R3係選自Cy4、-Cy4A-Cy5、-Cy4A-Cy5A-C6、-Cy4A-Y1-Cy5、-Cy4A-Y1-Cy5A-Cy6、-Cy4A-Cy5A-Y2-Cy6、-Cy4A-Y1-Cy5A-Y2-Cy6 及-Cy4A-Y3-Cy6。
在一些實施例中：Y1為Y11、C1-6伸烷基、C1-6伸烷基-Y11或Y11-C1-6伸烷基；Y2為Y21、C1-6伸烷基、C1-6伸烷基-Y21或Y21-C1-6伸烷基；Y3為C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基、C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基-Y31或Y31-C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基；且Y11、Y21及Y31係各自獨立地選自O及NRf。
在一些實施例中，R3為Cy4、-Cy4A-Cy5或-Cy4A-Y1-Cy5。
在一些實施例中，R3為-Cy4A-Cy5或-Cy4A-Y1-Cy5。
在一些實施例中，R3為Cy4或-Cy4A-Cy5。
在一些實施例中，R3為Cy4。
在一些實施例中，R3為-Cy4A-Cy5。
在一些實施例中，R3為-Cy4A-Cy5A-Cy6。
在一些實施例中，R3為-Cy4A-Y1-Cy5。
在一些實施例中，R3為-Cy4A-Y1-Cy5；其中Y為C1-4伸烷基或Y11-C1-4伸烷基；且Y11為C(=O)。
在一些實施例中，R3為-Cy4A-Y1-Cy5A-Cy6。
在一些實施例中，R3為-Cy4A-Cy5A-Y2-Cy6。
在一些實施例中，R3為-Cy4A-Y1-Cy5A-Y2-Cy6。
在一些實施例中，R3為-Cy4A-Y3-Cy6。
在一些實施例中，Y1為Y11、C1-6伸烷基、C1-6伸烷基-Y11或Y11-C1-6伸烷基。
在一些實施例中，Y2為Y21、C1-6伸烷基、C1-6伸烷基-Y21或Y21-C1-6伸烷基。
在一些實施例中，Y3為C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基、C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基-Y31或Y31-C1-6伸烷基-Y31-C1-6伸烷基。
在一些實施例中，Y11、Y21及Y31係各自獨立地選自O及NRf。
在一些實施例中，Cy4係選自C6-10芳基、C3-10環烷基及3-10 員雜環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜環烷基。
在一些實施例中，Cy4為苯基、環己基、四氫-2H-哌喃環、哌啶環或吡咯啶環，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代基取代。
在一些實施例中，Cy4係選自C3-10環烷基及3-10員雜環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜環烷基。
在一些實施例中，Cy4為C3-10環烷基，其視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代。
在一些實施例中，Cy4係選自C3-7環烷基，其視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代。
在一些實施例中，Cy4係選自環己基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代。
在一些實施例中，Cy4為四氫-2H-哌喃環，其視情況經1或2個獨立選擇之R31基團取代。
在一些實施例中，Cy4為環己基、四氫-2H-哌喃環或哌啶環，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代基取代。
在一些實施例中，Cy4為哌啶-4-基，其視情況經1或2個獨立選擇之R31基團取代。
在一些實施例中，Cy4A係選自C3-10伸環烷基及3-10員雜伸環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜伸環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜伸環烷基。
在一些實施例中，Cy4A係選自C3-10伸環烷基，其視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代。
在一些實施例中，Cy4A係選自C3-7伸環烷基，其視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代。
在一些實施例中，Cy4A係選自伸環丙基、伸環丁基、伸環戊基、伸環己基及伸環庚基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代。
在一些實施例中，Cy4A係選自伸環己基，其各自視情況經1或2個獨立選擇之R31基團取代。
在一些實施例中，Cy5為5-10員雜芳基，其視情況經1或2個獨立選擇之R32基團取代。
在一些實施例中，Cy5為1H-1,2,4-三唑基，其視情況經1或2個獨立選擇之R32基團取代。
在一些實施例中，Cy5為1H-1,2,4-三唑基。
在一些實施例中，Cy5為C6-10芳基或5-10員雜芳基，其各自視情況經1或2個獨立選擇之R32基團取代。
在一些實施例中，Cy5為吡啶環、吡唑環或三唑環，其各自視情況經1或2個獨立選擇之R32基團取代。
在一些實施例中，R3為Cy4，其限制條件為Cy4不為具有一或多個氮環成員之3-10員飽和雜環烷基；且R2係選自H、鹵基、環丙基、環丁基、氮雜環丁烷環、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、C1-6烷氧基、C1-6烷基-S-、CN、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、C(=NRe)Rb、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6烷氧基及C1-6烷基-S-各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、NO2、ORa、SRa、C(=O)Rb、C(=O)NRcRd、C(=O)ORa、OC(=O)Rb、OC(=O)NRcRd、C(=NRe)NRcRd、NRcC(=NRe)NRcRd、NRcRd、NRcC(=O)Rb、NRcC(=O)ORa、NRcC(=O)NRcRd、NRcS(=O)Rb、NRcS(=O)2Rb、NRcS(=O)2NRcRd、S(=O)Rb、S(=O)NRcRd、S(=O)2Rb及S(=O)2NRcRd。
在一些實施例中：各R31係獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2及NRc2Rd2； 其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基及C1-6鹵烷基；且各Rb2係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基。
在一些實施例中：各R31係獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2、C(=O)Rb2、C(=O)ORa2及NRc2Rd2；其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基及C1-6鹵烷基各自視情況經1、2或3個CN取代；且各Rb2係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其各自視情況經1、2或3個CN取代。
在一些實施例中：各R31係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-4烷基、C1-4鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、C1-3烷基羰基、C1-4烷氧基羰基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-4烷基、C1-3烷基羰基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、CN、胺甲醯基、C1-3烷基胺甲醯基、二(C1-3烷基)胺甲醯基、C1-3烷基胺基磺醯基、C1-3烷基磺醯基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基。
在一些實施例中，各R31係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基。
在一些實施例中： 各R32係獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2及NRc2Rd2；其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基及C1-6鹵烷基；且各Rb2係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基。
在一些實施例中，各R32係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基。
在一些實施例中：R2為C1-6烷基，其視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、OH、C1-6烷氧基、S(C1-6烷基)、C(=O)(C1-6烷基)、C(=O)NH2、C(=O)NH(C1-6烷基)、C(=O)N(C1-6烷基)2、C(=O)O(C1-6烷基)、OC(=O)(C1-6烷基)、OC(=O)NH2、OC(=O)NH(C1-6烷基)、OC(=O)N(C1-6烷基)2、C(=NH)NH2、C(=NH)NH(C1-6烷基)、C(=NH)N(C1-6烷基)2、NHC(=NH)NH2、NHC(=NH)NH(C1-6烷基)、NHC(=NH)N(C1-6烷基)2、NH2、NH(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)2、NHC(=O)(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)C(=O)(C1-6烷基)、NHC(=O)(C1-6烷基)、NHC(=O)O(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)C(=O)O(C1-6烷基)、NHC(=O)NH2、NHC(=O)NH(C1-6烷基)、NHC(=O)N(C1-6烷基)2、NHS(=O)(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)S(=O)(C1-6烷基)、NHS(=O)2(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)S(=O)2(C1-6烷基)、NHS(=O)2NH2、NHS(=O)2NH(C1-6烷基)、NHS(=O)2N(C1-6烷基)2、S(=O)(C1-6烷基)、S(=O)NH2、S(=O)NH(C1-6烷基)、S(=O)N(C1-6烷基)2、S(=O)2(C1-6烷基)、S(=O)2NH2、S(=O)2NH(C1-6烷基)及S(=O)2N(C1-6烷基)2；R3為Cy4或-Cy4A-Cy5；Cy4係選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其 中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy4A係選自C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy5係選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團取代；各R31係獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2及NRc2Rd2；其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各R32係獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2及NRc2Rd2；其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基及C1-6鹵烷基；各Rb2係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：R2為C1-6烷基，其視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra及Rc係獨立地選自H及C1-3烷基；且各Rb係獨立地選自C1-3烷基；R3為Cy4或-Cy4A-Cy5；Cy4係選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、 2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy4A係選自C6-10伸芳基、C3-10伸環烷基、5-10員雜伸芳基及3-10員雜伸環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy5係選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團取代；各R31係獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2及NRc2Rd2；其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各R32係獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2及NRc2Rd2；其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基及C1-6鹵烷基；各Rb2係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：R2為C1-6烷基，其視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra及Rc係獨立地選自H及C1-3烷基；且各Rb係獨立地選自C1-3烷基；R3為Cy4或-Cy4A-Cy5；Cy4係選自C3-10環烷基及3-10員雜環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜環烷基； Cy4A係選自C3-10伸環烷基及3-10員雜伸環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜伸環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜伸環烷基；Cy5係選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團取代；各R31係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基；各R32係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：R2為-CH2-OH、-CH(CH3)-OH或-CH2-NHSO2CH3；R3為Cy4或-Cy4A-Cy5；Cy4係選自C3-10環烷基及3-10員雜環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜環烷基；Cy4A係選自C3-10伸環烷基及3-10員雜伸環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜伸環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜伸環烷基；Cy5係選自5-10員雜芳基，其視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團取代；各R31係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3 烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基；各R32係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：R2為-CH2-OH、-CH(CH3)-OH或-CH2-NHSO2CH3；R3為Cy4；Cy4係選自C3-10環烷基及3-10員雜環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜環烷基；各R31係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：R2為H、甲基、乙基、丙基或異丙基，其中該等甲基、乙基、丙基或異丙基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa、NRcRd、NRcC(=O)Rb及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、甲基及乙基；且各Rb係獨立地選自甲基及乙基；或或者，R2為環丙基或氮雜環丁烷環，其各自視情況經1、2或3個獨立選擇之R21基團取代；各R21係獨立地為C1-3烷基；R3為Cy4、-Cy4A-Cy5或-Cy4A-Y1-Cy5； Y1為C1-4伸烷基或Y11-C1-4伸烷基；Y11為C(=O)；Cy4係選自C6-10芳基、C3-10環烷基及3-10員雜環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜伸環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜伸環烷基；Cy4A係選自C3-10伸環烷基及3-10員雜伸環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜伸環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜伸環烷基；Cy5為C6-10芳基或5-10員雜芳基，其各自視情況經1或2個獨立選擇之R32基團取代；各R31或R32係各自獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2、C(=O)Rb2、C(=O)ORa2及NRc2Rd2；其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基及C1-6鹵烷基各自視情況經1、2或3個CN取代；各Rb2係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其各自視情況經1、2或3個CN取代；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：R2為H、甲基、乙基、丙基或異丙基，其中該等甲基、乙基、丙基或異丙基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa、NRcRd、NRcC(=O)Rb及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、甲基及乙基；且各Rb係獨立地選自甲基及乙基；或或者，R2為環丙基或氮雜環丁烷環，其各自視情況經1、2或3個獨立選擇之R21基團取代；其限制條件為當X1 X2 X3為-N=CR2-NR3-，X4為C，且X5為C；且Cy4 為具有一或多個氮原子之未經取代或經取代之3-10員飽和雜伸環烷基或Cy4A為未經取代或經取代之具有一或多個氮原子之3-10員飽和雜伸環烷基時，則R2係選自H、甲基、乙基、丙基或異丙基，其中該等甲基、乙基、丙基或異丙基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa、NRcRd、NRcC(=O)Rb及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、甲基及乙基；且各Rb係獨立地選自甲基及乙基；各R21係獨立地為C1-3烷基；R3為Cy4、-Cy4A-Cy5或-Cy4A-Y1-Cy5；Y1為C1-4伸烷基、Y11-C1-4伸烷基或C1-6伸烷基-Y11；Y11為C(=O)或NHC(=O)O；Cy4係選自苯基、C3-7環烷基及4-6員雜環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy4A係選自C3-7伸環烷基及4-6員雜伸環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy5為苯基、4-6員雜環烷基或5-6員雜芳基，其各自視情況經1或2個獨立選擇之R32基團取代；各R31或R32係各自獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2、C(=O)Rb2、C(=O)ORa2及NRc2Rd2；其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基、C1-6鹵烷基，且其中該等C1-6烷基及C1-6鹵烷基各自視情況經1、2或3個CN取代；各Rb2係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其各自視情況經1、2或3個CN取代；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：R2為H、甲基、乙基、丙基或異丙基，其中該等甲基、乙基、丙基或異丙基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、 ORa、NRcRd、NRcC(=O)Rb及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、甲基及乙基；且各Rb係獨立地選自甲基及乙基；或或者，R2為環丙基或氮雜環丁烷環，其各自視情況經1、2或3個獨立選擇之R21基團取代；其限制條件為當X1 X2 X3為-N=CR2-NR3-，X4為C，且X5為C；且Cy4為具有一或多個氮原子之未經取代或經取代之3-10員飽和雜伸環烷基或Cy4A為未經取代或經取代之具有一或多個氮原子之3-10員飽和雜伸環烷基時，則R2係選自H、甲基、乙基、丙基或異丙基，其中該等甲基、乙基、丙基或異丙基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa、NRcRd、NRcC(=O)Rb及NRcS(=O)2Rb；其中各Ra、Rc及Rd係獨立地選自H、甲基及乙基；且各Rb係獨立地選自甲基及乙基；各R21係獨立地為C1-3烷基；R3為Cy4、-Cy4A-Cy5或-Cy4A-Y1-Cy5；Y1為C1-4伸烷基或Y11-C1-4伸烷基；Y11為C(=O)；Cy4係選自C6-10芳基、C3-10環烷基及3-10員雜環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy4A係選自C3-10伸環烷基及3-10員雜伸環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy5為C6-10芳基或5-10員雜芳基，其各自視情況經1或2個獨立選擇之R32基團取代；各R31或R32係各自獨立地選自C1-6烷基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、ORa2、C(=O)Rb2、C(=O)ORa2及NRc2Rd2；其中該C1-6烷基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、ORa2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基及C1-6鹵烷基各自視情況經1、2或3個CN取代；各Rb2係獨立地選自C1-6烷基及C1-6鹵烷基，其各自視情況經1、2或3個 CN取代；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：R2為-CH2-OH、-CH(CH3)-OH或-CH2-NHSO2CH3；R3為-Cy4A-Cy5；Cy4A係選自C3-10伸環烷基及3-10員雜伸環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜伸環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜伸環烷基；Cy5係選自5-10員雜芳基，其視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團取代；各R31係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基；各R32係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：R2為-CH2-OH、-CH(CH3)-OH或-CH2-NHSO2CH3；R3為Cy4或-Cy4A-Cy5；Cy4係選自伸環己基及2H-四氫呋喃環，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy4A係選自伸環己基及2H-四氫呋喃環，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；Cy5係選自5-10員雜芳基，其視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R32基團 取代；各R31係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基；各R32係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基；R4為H；且R5為H。
在一些實施例中：X1 X2 X3為-N=CR2-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-CR1=CR2-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-CR1R1a-C(=O)-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-O-C(=O)-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為=N-CR2=CR3-，X4為N，X5為C，且Y為CR4。
在一些實施例中：X1 X2 X3為-N=CR2-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-CR1=CR2-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-CR1R1a-C(=O)-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-O-C(=O)-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為=N-CR2=CR3-，X4為N，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-N=N-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-NR1-C(=O)-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-N=CR2-CR3=，X4為C，X5為N，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-CR1=CR2-CR3=，X4為C，X5為N，且Y為CR4；或X1 X2 X3為=N-N=CR3-，X4為N，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為=CR1-N=CR3-，X4為N，X5為C，且Y為CR4；或 X1 X2 X3為=CR1-CR2=CR3-，X4為N，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-CR1=N-NR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-O-N=CR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-NR1-N=CR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-S-N=CR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-O-CR2=CR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-S-CR2=CR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為=N-NR2-CR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4；或X1 X2 X3為-C(=O)-NR2-CR3-，X4為C，X5為C，且Y為CR4。
在一些實施例中，X1 X2 X3為-CR1=CR2-NR3-，X4為C，且X5為C。
在一些實施例中，X1 X2 X3為-CR1R1a-C(=O)-NR3-，X4為C，且X5為C。
在一些實施例中，X1 X2 X3為-O-C(=O)-NR3-，X4為C，且X5為C。
在一些實施例中，X1 X2 X3為=N-CR2=CR3-，X4為N，且X5為C。
在一些實施例中，化合物為式IIa化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式IIb化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式IIc化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式IId化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式IIe化合物： IIe或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式IIf化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式IIIa化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式IIIb化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式IIIc化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為具有式IV-1至IV-18之任一者之化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為具有式IV-19至IV-28之任一者之化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式V化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式VI化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式VII化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式VIII化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式IX化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，化合物為式X化合物： 或其醫藥學上可接受之鹽。
應進一步瞭解，為明確起見在各別實施例之上下文中描述的本發明之某些特徵亦可於單一實施例中組合提供(而該等實施例意欲就如同以多個附屬形式書寫一般組合)。反之，為簡潔起見在單一實施例之上下文中描述的本發明之各種特徵亦可單獨或以任何適合次組合提供。
在本說明書中之各處，本發明化合物之取代基係以群組或範圍形式揭露。明確意欲本發明包括此等群組及範圍之成員的各個及每一個 別次組合。舉例而言，術語「C1-6烷基」明確意欲個別地揭露甲基、乙基、C3烷基、C4烷基、C5烷基及C6烷基。
在本說明書中之各處，描述連接取代基。當結構明確需要連接基團時，針對彼基團列出之馬庫西(Markush)變數應理解為連接基團。舉例而言，若結構需要連接基團且彼變數之馬庫西基團定義列出「烷基」或「芳基」，則應瞭解「烷基」或「芳基」分別代表連接伸烷基或伸芳基。
在本說明書中之各處，描述環(例如「哌啶環」)。除非另外規定，否則此等環可在原子價所允許之任何環成員處連接於分子之其餘部分。舉例而言，術語「2H-四氫哌喃環」可係指2H-四氫哌喃-2-基、2H-四氫哌喃-3-基、2H-四氫哌喃-4-基環等。
術語「n員」(其中n為整數)通常描述某一部分中之成環原子數，其中成環原子數為n。舉例而言，2H-四氫哌喃為6員雜環烷基環之一實例，1H-1,2,4-三唑為5員雜芳基環之一實例，吡啶為6員雜芳基環之一實例，且1,2,3,4-四氫-萘為10員環烷基之一實例。
對於變數出現一次以上之本發明化合物，各變數可為獨立地選自定義該變數之群組的不同部分。舉例而言，當描述結構具有同時存在於同一化合物上之兩個R基團時，該兩個R基團可表示獨立地選自定義R之群組的不同部分。在另一實例中，當以以下形式指定視情況存在之多個取代基時： 則應瞭解取代基R可在環上出現p次，且R在每次出現時可為不同部分。應瞭解各R基團可置換連接於環原子之任何氫原子，包括(CH2)n氫原子中之一或兩者。此外，在以上實例中，若定義變數Q包括氫，諸如當Q稱為CH2、NH等時，則以上實例中之任何浮動取代基(諸如R)皆可置換Q變數之氫以及環之任何其他非可變組分中之氫。
如本文所用，片語「視情況經取代」意謂未經取代或經取代。如本文所用，術語「經取代」意謂氫原子移除且置換為取代基。應瞭解在 既定原子處之取代受原子價限制。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「Cn-m烷基」係指可為直鏈或分支鏈之具有n至m個碳原子的飽和烴基團。在一些實施例中，烷基含有1至6、1至4或1至3個碳原子。烷基部分之實例包括但不限於諸如甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、第二丁基、第三丁基、正戊基、2-甲基-1-丁基、3-戊基、正己基、1,2,2-三甲基丙基及其類似基團之化學基團。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「伸烷基」係指可為分支鏈或直鏈之二價烷基連接基團，其中兩個取代基可連接在伸烷基連接基團之任何位置。伸烷基之實例包括但不限於乙-1,2-二基、丙-1,3-二基、丙-1,2-二基、丁-1,4-二基、丁-1,3-二基、丁-1,2-二基、2-甲基-丙-1,3-二基及其類似基團。
如本文所用，「Cn-m烯基」係指具有一或多個碳-碳雙鍵且具有n至m個碳之烷基。在一些實施例中，烯基部分含有2至6、2至4、或2至3個碳原子。示範性烯基包括但不限於乙烯基、正丙烯基、異丙烯基、正丁烯基、第二丁烯基及其類似基團。
如本文所用，「Cn-m炔基」係指具有一或多個碳-碳參鍵且具有n至m個碳之烷基。示範性炔基包括但不限於乙炔基、丙炔-1-基、丙炔-2-基及其類似基團。在一些實施例中，炔基部分含有2至6、2至4、或2至3個碳原子。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「伸烯基」係指可為分支鏈或直鏈之二價烯基連接基團，其中兩個取代基可連接在伸烯基連接基團之任何位置。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「伸炔基」係指可為分支鏈或直鏈之二價炔基連接基團，其中兩個取代基可連接在伸炔基連接基團之任何位置。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「C1-3烷氧基」係指式-O-烷基之基團，其中該烷基具有1至3個碳。示範性烷氧基包括甲氧基、乙氧基及丙氧基(例如正丙氧基及異丙氧基)。
如本文所用，術語「胺基」係指式-NH2之基團。
如本文所用，術語「C1-3烷基胺基」係指式-NH(烷基)之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「二(C1-3-烷基)胺基」係指式-N(烷基)2之基團，其中該兩個烷基各自獨立地具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「C1-4烷氧基羰基」係指式-C(O)O-烷基之基團，其中該烷基具有1至4個碳原子。
如本文所用，術語「C1-3烷基羰基」係指式-C(O)-烷基之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「羧基」係指式-C(O)OH之基團。
如本文所用，術語「硫基」係指式-SH之基團。
如本文所用，術語「C1-3烷基硫基」係指式-S-(C1-3烷基)之基團。
如本文所用，術語「C1-3烷基亞磺醯基」係指式-S(O)-烷基之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「C1-3烷基磺醯基」係指式-S(O)2-烷基之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「C1-3烷基羰基氧基」係指式-OC(O)-烷基之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「C1-3烷基羰基胺基」係指式-NHC(O)-烷基之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「胺基羰基胺基」係指式-NHC(O)NH2之基團。
如本文所用，術語「C1-3烷基胺基羰基胺基」係指式-NHC(O)NH(烷基)之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「二(C1-3烷基胺基羰基胺基」係指式-NHC(O)N(烷基)2之基團，其中各烷基獨立地具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「胺甲醯基」係指式-C(O)-NH2之基團。
如本文所用，術語「C1-3烷基胺甲醯基」係指式-C(O)-NH(烷 基)之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「二(C1-3-烷基)胺甲醯基」係指式-C(O)N(烷基)2之基團，其中該兩個烷基各自獨立地具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「C1-3烷基磺醯基胺基」係指式-NHS(O)2-烷基之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「胺基磺醯基」係指式-S(O)2NH2之基團。
如本文所用，術語「C1-3烷基胺基磺醯基」係指式-S(O)2NH(烷基)之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「二(C1-3烷基)胺基磺醯基」係指式-S(O)2N(烷基)2之基團，其中各烷基獨立地具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「胺基磺醯基胺基」係指式-NHS(O)2NH2之基團。
如本文所用，術語「C1-3烷基胺基磺醯基胺基」係指式-NHS(O)2NH(烷基)之基團，其中該烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「二(C1-3烷基胺基磺醯基胺基」係指式-NHS(O)2N(烷基)2之基團，其中各烷基獨立地具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「HO-Cn-m-烷基」係指式-伸烷基-OH之基團，其中該伸烷基具有n至m個碳原子。在一些實施例中，伸烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，術語「Co-p烷氧基-Cn-m-烷基」係指式-伸烷基-O-烷基之基團，其中該伸烷基具有n至m個碳原子且該烷基具有o至p個碳原子。在一些實施例中，烷基及伸烷基各自獨立地具有1至3個碳原子。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「羰基」係指-C(O)-基團。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之「鹵基」或「鹵素」包括氟基、氯基、溴基及碘基。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「Cn-m鹵烷基」係指具有多達{2(n至m)+1}個可為相同或不同之鹵素原子之Cn-m烷基。在一些實施例中，鹵素原子為氟原子。在一些實施例中，烷基具有1至6 或1至4個碳原子。示範性鹵烷基包括CF3、C2F5、CHF2、CCl3、CHCl2、C2Cl5及其類似基團。在一些實施例中，鹵烷基為氟烷基。
如本文所用，「Cn-m鹵烷氧基」係指具有n至m個碳原子之式-O-鹵烷基之基團。一示範性鹵烷氧基為OCF3。在一些實施例中，鹵烷氧基僅經氟化。在一些實施例中，烷基具有1至6或1至4個碳原子。
如本文所用，術語「氰基-Cn-m烷基」係指經氰基取代之Cn-m烷基。在一些實施例中，烷基具有1至3個碳原子。
如本文所用，在某一部分之名稱之前出現術語「單環」指示該部分具有單個環。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「環烷基」係指非芳族環烴部分，其可視情況含有一或多個伸烯基作為環結構之一部分。環烷基可包括單環或多環(例如具有2、3或4個稠環、螺環或橋環)環系統。環烷基之定義中亦包括一或多個芳族環稠合(亦即共同具有鍵)於環烷基環之部分，例如環戊烷、環戊烯、環己烷及其類似物之苯并衍生物。環烷基之一或多個成環碳原子可經氧化以形成羰基鍵聯。在一些實施例中，環烷基為3-10員單環或雙環環烷基。在一些實施例中，環烷基為3-6或3-7單環環烷基。示範性環烷基包括1,2,3,4-四氫-萘、環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基、環戊烯基、環己烯基、環己二烯基、環庚三烯基、降冰片基、降蒎烷基、降蒈烷基、金剛烷基及其類似基團。在一些實施例中，環烷基為環丙基、環丁基、環戊基或環己基。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「芳基」係指單環或多環(例如具有2、3或4個稠環)芳族烴，諸如但不限於苯基、1-萘基、2-萘基、蒽基、菲基及其類似基團。在一些實施例中，芳基為C6-10芳基。在一些實施例中，芳基為萘環或苯基環。在一些實施例中，芳基為苯基。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「雜芳基」係指具有一或多個選自氮、硫及氧之雜原子環成員之單環或多環(例如具有2、3或4個稠環)芳族烴部分。在一些實施例中，雜芳基為包含1至9個碳原子及1、2、3或4個獨立地選自氮、硫及氧之雜原子環成員的5-10員單 環或雙環雜芳基。在一些實施例中，雜芳基為包含1至5個碳原子及1、2、3或4個獨立地選自氮、硫及氧之雜原子環成員的5-6員單環或雙環雜芳基。當雜芳基含有一個以上雜原子環成員時，該等雜原子可相同或不同。示範性雜芳基包括但不限於吡啶、嘧啶、吡嗪、噠嗪、吡咯、吡唑、唑基、噁唑、噻唑、咪唑、呋喃、噻吩、喹啉、異喹啉、吲哚、苯并噻吩、苯并呋喃、苯并異噁唑、咪唑并[1,2-b]噻唑、嘌呤或其類似基團。
5員環雜芳基為具有含5個環原子之環之雜芳基，其中一或多個(例如1、2或3個)環原子獨立地選自N、O及S。示範性5員環雜芳基為噻吩基、呋喃基、吡咯基、咪唑基、噻唑基、噁唑基、吡唑基、異噻唑基、異噁唑基、1,2,3-三唑基、四唑基、1,2,3-噻二唑基、1,2,3-噁二唑基、1,2,4-三唑基、1,2,4-噻二唑基、1,2,4-噁二唑基、1,3,4-三唑基、1,3,4-噻二唑基及1,3,4-噁二唑基。
6員環雜芳基為具有含6個環原子之環之雜芳基，其中一或多個(例如1、2或3個)環原子獨立地選自N、O及S。示範性6員環雜芳基為吡啶基、吡嗪基、嘧啶基、三嗪基及噠嗪基。
如本文所用，術語「雜芳基烷基」係指式-伸烷基-雜芳基之基團。在一些實施例中，雜芳基烷基為C1-9雜芳基-C1-3烷基，其中該雜芳基部分為單環或雙環且具有1、2、3或4個獨立地選自氮、硫及氧之雜原子環成員。
如本文所用，單獨或與其他術語組合使用之術語「雜環烷基」係指非芳族環系統，其可視情況含有一或多個伸烯基或伸炔基作為環結構之一部分，且其具有至少一個獨立地選自氮、硫及氧之雜原子環成員。當雜環烷基含有一個以上雜原子時，該等雜原子可為相同或不同。雜環烷基可包括單環或多環(例如具有2、3或4個稠環、螺環或橋環)環系統。雜環烷基之定義中亦包括一或多個芳族環稠合(亦即共同具有鍵)於非芳族環之部分，例如1,2,3,4-四氫-喹啉及其類似基團。雜環烷基之環中之碳原子或雜原子可經氧化以形成羰基或磺醯基(或其他氧化鍵聯)，或氮原子可經四級銨化。在一些實施例中，雜環烷基為包含2至9個碳原子及1、2、3或4個獨立地選自氮、硫及氧之雜原子環成員的5-10員單環或雙環雜環烷基。雜 環烷基之實例包括1,2,3,4-四氫-喹啉、氮雜環丁烷、氮雜環庚烷、吡咯啶、哌啶、哌嗪、嗎啉、硫代嗎啉、哌喃及2-側氧基-1,3-噁唑啶環。
如本文所用，術語「雜環烷基烷基」係指式-伸烷基-雜環烷基之基團。在一些實施例中，雜環烷基烷基為C2-9雜環烷基-C1-3烷基，其中該雜環烷基部分為單環或雙環且具有1、2、3或4個獨立地選自氮、硫及氧之雜原子環成員。
本文所述之化合物可具有不對稱性(例如具有一或多個立體中心)。除非另外指示，否則意指所有立體異構體，諸如對映異構體及非對映異構體。含有經不對稱取代之碳原子之本發明化合物可以光學活性或外消旋形式分離。如何自非光學活性起始物質製備光學活性形式之方法在此項技術中為已知的，諸如藉由解析外消旋混合物或藉由立體選擇性合成。烯烴、C=N雙鍵及其類似物之許多幾何異構體亦可存在於本文所述之化合物中，且所有此等穩定異構體皆涵蓋在本發明中。描述本發明化合物之順式及反式幾何異構體且其可以異構體之混合物形式或以分離異構形式分離。
可藉由此項技術中已知之眾多方法中之任一者對化合物之外消旋混合物進行解析。一示範性方法包括使用為光學活性成鹽有機酸之對掌性解析酸進行分段再結晶。適用於分段再結晶方法之解析劑為例如光學活性酸，諸如D型及L型酒石酸、二乙醯基酒石酸、二苯甲醯基酒石酸、杏仁酸(mandelic acid)、蘋果酸、乳酸或各種光學活性樟腦磺酸，諸如β-樟腦磺酸。適於分段結晶方法之其他解析劑包括α-甲基苯甲基胺之立體異構純形式(例如S及R形式或非對映異構純形式)、2-苯基甘胺醇、去甲麻黃鹼(norephedrine)、麻黃鹼、N-甲基麻黃鹼、環己基乙胺、1,2-二胺基環己烷及其類似物。
亦可藉由在裝填有光學活性解析劑(例如二硝基苯甲醯基苯基甘胺酸)之管柱上溶離來對外消旋混合物進行解析。適合溶離溶劑組成可由熟習此項技術者確定。
本發明化合物亦包括互變異構形式。互變異構形式由單鍵與相鄰雙鍵交換並伴隨質子遷移所產生。互變異構形式包括質子轉移互變異 構體，其為具有相同經驗式及總電荷之異構質子化狀態。示範性質子轉移互變異構體包括酮-烯醇對、醯胺-亞胺酸對、內醯胺-內醯亞胺對、烯胺-亞胺對、及質子可佔據雜環系統之兩個或兩個以上位置之環形式，例如1H-咪唑及3H-咪唑、1H-1,2,4-三唑、2H-1,2,4-三唑及4H-1,2,4-三唑、1H-異吲哚及2H-異吲哚、及1H-吡唑及2H-吡唑。互變異構形式可處於平衡狀態或藉由適當取代在空間上鎖定為一種形式。
本發明化合物亦可包括中間物或最終化合物中存在之原子之所有同位素。同位素包括原子序數相同但質量數不同之彼等原子。舉例而言，氫之同位素包括氚及氘。在一些實施例中，式I之氮雜環丁烷環中之1、2或3個CH2基團經CHD或CD2基團置換。在一些實施例中，式I之哌啶環中之1、2或3個CH2或CH基團分別經CHD、CD2或CD基團置換。在一些實施例中，式I之哌啶環中之1、2、3、4或5個CH2或CH基團分別經CHD、CD2或CD基團置換。
如本文所用之術語「化合物」意欲包括所述結構之所有立體異構體、幾何異構體、互變異構體及同位素。
所有化合物及其醫藥學上可接受之鹽可連同諸如水及溶劑之其他物質一起獲得(例如水合物及溶劑合物)或可經分離。
在一些實施例中，本發明化合物或其鹽實質上經分離。就「實質上經分離」而言，其意謂化合物至少部分或實質上自其形成或偵測到時所處之環境分離。部分分離可包括例如富含本發明化合物之組合物。實質上分離可包括含有至少約50重量%、至少約60重量%、至少約70重量%、至少約80重量%、至少約90重量%、至少約95重量%、至少約97重量%或至少約99重量%的本發明化合物或其鹽之組合物。分離化合物及其鹽之方法在此項技術中為常規的。
片語「醫藥學上可接受」在本文中用於指在合理醫學判斷之範疇內適用於與人類及動物之組織接觸而無過度毒性、刺激、過敏反應或其他問題或併發症，與合理益處/風險比相稱的彼等化合物、物質、組合物及/或劑型。
如本文所用之表述「環境溫度」及「室溫」為此項技術中所 瞭解，且通常指溫度(例如反應溫度)大致為進行反應所處之房間之溫度，例如約20℃至約30℃之溫度。
本發明亦包括本文所述之化合物的醫藥學上可接受之鹽。如本文所用，「醫藥學上可接受之鹽」係指所揭露化合物之衍生物，其中母體化合物藉由使現有酸或鹼部分轉化成其鹽形式而經改質。醫藥學上可接受之鹽之實例包括但不限於鹼性殘基(諸如胺)之無機酸或有機酸鹽；酸性殘基(諸如羧酸)之鹼鹽或有機鹽；及其類似物。本發明之醫藥學上可接受之鹽包括例如自無毒無機酸或有機酸形成之母體化合物的無毒鹽。本發明之醫藥學上可接受之鹽可藉由習知化學方法自含有鹼性或酸性部分之母體化合物合成。一般而言，此等鹽可藉由使此等化合物之遊離酸或鹼形式與化學計算量之適當鹼或酸在水或有機溶劑或兩者之混合物中反應來製備；一般而言，如醚、乙酸乙酯、醇(例如甲醇、乙醇、異丙醇或丁醇)或乙腈(ACN)之非水性介質較佳。適合鹽之清單見於Remington's Pharmaceutical Sciences,第17版，Mack Publishing Company,Easton,Pa.,1985，第1418頁及Journal of Pharmaceutical Science,66,2(1977)中，其各自以全文引用的方式併入本文中。在一些實施例中，本文所述之化合物包括N-氧化物形式。
合成
本發明化合物(包括其鹽)可使用已知有機合成技術製備且可根據眾多可能之合成途徑(諸如以下流程中之合成途徑)之任一者合成。製備本發明化合物之反應可在可易於由熟習有機合成技術者選擇之適合溶劑中進行。適合溶劑可實質上不與起始物質(反應物)、中間物或產物在進行反應所處之溫度(例如可在溶劑之冷凍溫度至溶劑之沸騰溫度之範圍內的溫度)下反應。指定反應可在一種溶劑或一種以上溶劑之混合物中進行。視特定反應步驟而定，適於特定反應步驟之溶劑可由熟練技術人員選擇。
製備本發明化合物可涉及各種化學基團之保護及脫除保護。對保護及脫保護之需要及對適當保護基之選擇可易於由熟習此項技術者確定。保護基之化學可見於例如Wuts及Greene,Protective Groups in Organic Synthesis，第4版，John Wiley & Sons：New Jersey,(2007)中，其以全文引用的方式併入本文中。
可根據此項技術中已知之任何適合方法監測反應。舉例而言，產物形成可藉由分光手段，諸如核磁共振光譜法(例如1H或13C)、紅外光譜法、分光光度測定法(例如紫外-可見)、質譜；或藉由層析方法，諸如高效液相層析(HPLC)或薄層層析(TLC)監測。
式I化合物可藉由類似於以下流程中之程序的程序合成。當X1-X2-X3為-N=CR2-NR3-，X4為C，且X5為C時，式I化合物可如流程1中所說明加以製備。經適當取代之噻吩并吡啶1可在諸如含硝酸四丁銨及三氟乙酸酐之二氯甲烷或含硝酸之硫酸的條件下經受硝化以得到式2化合物。噻吩并吡啶醇2在加熱POCl3中或在諸如POCl3/PCl5之其他適合氯化條件下反應提供相應氯化物3。化合物3與適當R3-NH2在諸如二異丙基乙胺之適合鹼存在下偶合產生化合物4。使用採用諸如鈀或鎳之催化劑之催化氫化條件或使用鐵或其他適合還原條件還原硝基化合物4產生相應二胺5。化合物5與適當醯胺(用四氟硼酸三乙基氧鎓活化)縮合產生所要化合物6。亦可使二胺與適當酸R2CO2H在偶合條件下反應以得到醯胺中間物，其隨後可經由分子間縮合轉化成化合物6。R2及R3可進一步改質成所要基團。或者，R3可經由在化合物4及5上進行改質來進一步轉化成本發明中揭露之基團。
當X1-X2-X3為-CR1=CR2-NR3-，X4為C，且X5為C時，式I化合物可如流程2中所說明加以製備。可使經適當取代之噻吩并吡啶1與N-碘代丁二醯亞胺反應以得到化合物7。噻吩并吡啶醇7在加熱POCl3中或 在諸如POCl3/PCl5之其他適合氯化條件下反應提供相應氯化物8。碘化合物8與適當炔烴化合物之由諸如氯化雙(三苯基膦)鈀(II)及碘化銅(I)之適合鈀及銅催化劑催化的反應產生化合物9。9與R3-NH2在諸如含乙酸鈀、(9,9-二甲基-9H-口山口星-4,5-二基)雙(二苯基膦)及碳酸銫之甲苯之適合偶合條件存在下縮合產生胺偶合中間物，其用炔烴就地環化以提供式10化合物。可藉由吡咯環之鹵化、硝化或親核加成來引入取代R2。可使用熟習此項技術者已知之方法在各步中達成對R1、R2、R3、R4及R5之進一步改質。
當X1-X2-X3為-O-C(O)-NR3-，X4為C，且X5為C時，式I化合物可如流程3中所說明加以製備。可使噻吩并吡啶11與NaOCl反應以產生相應氯化化合物12。或者，11可轉化成N-氧化物，其隨後可在HCl或POCl3條件下轉化成12。使用熟習此項技術者已知之條件保護12中之羥基得到醚化合物13。13與R3NH2在諸如含乙酸鈀、(9,9-二甲基-9H-口山口星-4,5-二基)雙(二苯基膦)及碳酸銫之甲苯之偶合條件下反應可產生化合物14。用三溴化硼將14脫保護得到化合物15。用三光氣或羰基二咪唑處理15接著提供式16化合物。
流程3
當X1-X2-X3為=N-CR2=CR3-，X4為N，且X5為C時，式I化合物可如流程4中所說明加以製備。噻吩并吡嗪17與過氧化氫在乙酸中反應得到N-氧化物中間物，其在用三氯氧磷處理後提供化合物18。在布赫瓦爾德(Buchwald)條件下用Boc-NH2取代氯化物產生化合物19。藉由熟習此項技術者已知之方法用經適當取代之2-鹵甲基酮[鹵基-CH2C(O)R3]使胺基甲酸酯19烷基化得到化合物20。必要時化合物20可在標準烷基化或醛縮合條件下進一步轉化成相應經取代之化合物21。可使用諸如含三氟乙酸之二氯甲烷或含HCl之二噁烷之條件達成將21脫保護成22。可藉由熟習此項技術者已知之方法，例如用三氟乙酸酐及三氟乙酸混合物處理來使22環化成化合物23。必要時可使用熟習此項技術者已知之反應(例如Larock,R.C.Comprehensive Organic Transformation)進行R2、R3、R4、R5之進一步官能化。
或者，式23化合物可如流程5中所示加以合成。來自流程 4之化合物19可用三氟乙酸或含HCl之二噁烷處理以得到脫保護化合物24。24與α-鹵基-酮在適合鹼存在下縮合接著產生所要化合物23。
當X1-X2-X3為-N=N-NR3-，X4為C，且X5為C時，式I化合物可藉由使來自流程1之化合物5與諸如亞硝酸丁酯之重氮化試劑在溴化銅(II)存在下反應來製備，如流程6中所說明。
當X1-X2-X3為-N=CR2-CR3=，X4為C，且X5為N時，式I化合物可如流程7中所說明加以製備。三溴吡唑28可用諸如SEM之適合保護基保護以得到相應化合物29。接著用適合烷基化試劑(例如R2-鹵基)或親電子試劑(例如醛)淬滅的29與丁基鋰之鋰-鹵素交換提供化合物30。30與諸如丁基鋰之鋰試劑反應，隨後進行水性處理產生單溴-吡唑31。31與硼酸酯27(藉由在適合鈀催化劑存在下與頻哪醇硼酸酯反應而自溴化物26製備)之鈴木(Suzuki)反應可得到偶合化合物32。32之溴化可產生化合物33，其可用鐵還原以提供胺34。可使用熟習此項技術者已知之方法，諸如與三氟乙酸反應，隨後用氫氧化銨處理來達成脫除SEM保護。35與原酸酯縮合接著產生三環化合物36。三環化合物36可經受諸如鈴木偶合條件之偶合條件以提供式37化合物。必要時可藉由為熟習此項技術者所知之方法對取代 進行進一步改質。
當X1-X2-X3為=N-N=CR3-，X4為N，且X5為C時，式I化合物可如流程8中所說明加以製備。經取代之肼38可藉由使化合物18與經適當保護之肼(例如Boc-NHNH2)在布赫瓦爾德-哈特維希(Buchwald-Hartwig)胺化條件下反應來製備。可使用諸如Greene,T.W.及Wats,P.G.M.「Protective Groups in Organic Synthesis，第3版」，1999,Wiley-Interscience中所述之條件的條件將化合物38脫保護。例如當P為Boc時，化合物38可藉由用三氟乙酸或含HCl之二噁烷處理來脫保護成39。可藉由熟習此項技術者已知之多種方法，諸如標準肽偶合方法來達成自39形成醯肼40。可藉由與POCl3或在適合鹼(例如三乙胺)存在下與亞硫醯氯反應來使醯肼40環化成式41化合物。
當X1-X2-X3為=CR1-N=CR3-，X4為N，且X5為C時，式I化合物可如流程9中所說明加以製備。噻吩并吡嗪18可經由Pd介導之氰化，諸如在三氟乙酸鈀(II)及外消旋-2-(二-第三丁基膦基)-1,1’-聯萘存在下使用氰化鋅轉化成氰基化合物42。隨後使用熟知條件，諸如在HCl存在下使用鈀催化氫化還原腈42得到胺43。可在諸如HATU/二異丙基乙胺之標準醯胺偶合條件下達成胺43與酸R3CO2H偶合。可藉由轉化成相應硫醯胺(藉由與例如勞森氏試劑(Lawesson’s reagent)反應)，隨後用活化劑(諸如汞鹽、銀鹽或銅鹽)處理來達成醯胺44環化成式45三環化合物。
當X1-X2-X3為-NR1-N=CR3-，X4為C，且X5為C時，式I 化合物可如流程10中所說明加以製備。市售氯噻吩并吡啶46可經由在高溫下用碘化鈉處理來轉化成相應碘類似物47。碘噻吩并吡啶47與丁基鋰或其他金屬試劑反應，隨後用適合醛R3CHO處理提供醇48。可藉由用諸如戴斯-馬丁(Dess-Martin)高碘烷之氧化劑處理48來達成酮49之製備。酮49可接著經由與肼反應來轉化成腙50。可經由分子內布赫瓦爾德-哈特維希環化來達成腙50環化成三環化合物51。可藉由使51與諸如R1-鹵素或R1-OMs/R1-OTs之烷基化試劑在諸如DBU之鹼存在下反應來使化合物51轉化成式52化合物。或者，式53化合物(式I，此時X1-X2-X3為=N-NR2-CR3=，X4為C，且X5為C)可藉由在諸如氫化鈉之適合鹼存在下用烷基化試劑R2-離去基團(離去基團為鹵基、OTs、OMs、OTf等)處理51來製備。
當X1-X2-X3為-O=CR2=CR3-，X4為C，且X5為C時，式I化合物可如流程11中所說明加以製備。可使來自流程10之化合物49與乙醇酸酯在布赫瓦爾德-哈特維希偶合條件下反應以產生化合物54。54在諸如第三丁醇鉀之鹼性條件下環化可提供三環化合物55。必要時可使用熟習此項技術者已知之反應對55上之取代進行進一步官能化。舉例而言，酯55可水解成酸56，其可接著在諸如BOP或HATU偶合之標準偶合條件下轉化成醯胺57。醯胺57與諸如溴化甲基鎂之親核劑反應產生酮58，其可接著經還原以得到式59化合物。當X1-X2-X3為-S=CR2=CR3-，X4為C，且X5為C時，式I化合物可類似於流程11中說明之方法加以製備，其中用硫乙 醇酸酯替換乙醇酸酯。
當Y為N，X1-X2-X3為-N=CR2-NR3-，X4為C，且X5為C時，本發明之式I化合物可如流程12中所說明加以製備。可使經適當取代之氟吡啶60與諸如苯甲基硫醇之硫醇在諸如第三丁醇鈉之適合鹼存在下反應以得到式61化合物。吡啶硫醚61與磺醯氯反應，隨後用氨處理提供環化產物62。或者，化合物62可藉由使化合物60與羥胺及硫反應來合成。化合物63之硝化得到式64化合物。化合物64與適當R3-NH2在諸如二異丙基乙胺之適合鹼存在下偶合產生化合物65。使用採用諸如鈀或鎳之催化劑之催化氫化條件或使用鐵或其他適合還原條件還原硝基化合物65產生相應二胺66。化合物66與適當醯胺(用四氟硼酸三乙基氧鎓活化)縮合產生所要化合物67。亦可使二胺與適當酸R2CO2H在偶合條件下反應以得到醯胺中間物，其隨後可經由分子間縮合轉化成化合物67。R2及R3可進一步改質成所要基團。或者，R3可經由在化合物65及66上進行改質來進一步轉化成本發明中揭露之基團。
流程12
方法
本發明化合物為JAK抑制劑，且大多數本發明化合物為JAK1選擇性抑制劑。JAK1選擇性抑制劑為優先抑制JAK1活性超過對其他Janus激酶之抑制的化合物。舉例而言，本發明化合物優先抑制JAK1超過對JAK2、JAK3及TYK2中之一或多者的抑制。在一些實施例中，化合物優先抑制JAK1超過對JAK2之抑制(例如JAK1/JAK2 IC50比率>1)。在一些實施例中，化合物對JAK1之選擇性超過對JAK2之選擇性約10倍。在一些實施例中，化合物對JAK1之選擇性超過對JAK2之選擇性約3倍、約5倍、約10倍、約15倍或約20倍，如藉由在1mM ATP下量測IC50(例如參見實例A)所計算。
JAK1在當調控異常時可導致或促成疾病病況之許多細胞激素及生長因子信號傳導路徑中起主要作用。舉例而言，在類風濕性關節炎(一種已表明具有不利影響之疾病)中，IL-6含量升高(Fonesca,J.E.等人，Autoimmunity Reviews,8：538-42,2009)。因為IL-6至少部分經由JAK1進行信號傳導，所以預期經由JAK1抑制直接或間接拮抗IL-6會提供臨床益處(Guschin,D.,N.等人Embo J 14：1421,1995；Smolen,J.S.等人.Lancet 371：987,2008)。此外，在一些癌症中，JAK1突變，從而導致不合需要之組成性腫瘤細胞生長及存活(Mullighan CG, Proc Natl Acad Sci U S A.106：9414-8,2009；Flex E.等人J Exp Med.205：751-8,2008)。在其他自體免疫性疾病及癌症中，活化JAK1之發炎性細胞激素之全身性含量升高亦可促成疾病及/或相關症狀。因此，患有此等疾病之患者可受益於JAK1抑制。 JAK1之選擇性抑制劑可為有效的，同時避免抑制其他JAK激酶之不必要及可能不合需要的效應。
相對於其他JAK激酶對JAK1具有選擇性之抑制劑可具有優於選擇性較低之抑制劑的多種治療優勢。關於針對JAK2之選擇性，許多重要細胞激素及生長因子經由JAK2傳導信號，包括例如紅血球生成素(erythropoietin，Epo)及血小板生成素(thrombopoietin，Tpo)(Parganas E等人Cell.93：385-95,1998)。Epo為紅血球產生之關鍵生長因子；因此缺乏Epo依賴性信號傳導可導致紅血球數量減少及貧血(Kaushansky K,NEJM 354：2034-45,2006)。作為JAK2依賴性生長因子之另一實例，Tpo在控制巨核細胞-亦即自其產生血小板之細胞的增殖及成熟中起主要作用(Kaushansky K,NEJM 354：2034-45,2006)。因此，Tpo信號傳導降低將使巨核細胞數減少(巨核細胞減少症(megakaryocytopenia))及循環血小板計數降低(血小板減少症(thrombocytopenia))。此可導致不合需要及/或不可控制之出血。對諸如JAK3及Tyk2之其他JAK之抑制降低亦可能合乎需要，因為缺乏此等激酶之功能形式之人類已顯示罹患眾多疾病，諸如嚴重合併性免疫缺失或高免疫球蛋白E症候群(Minegishi,Y等人.Immunity 25：745-55,2006；Macchi P等人.Nature.377：65-8,1995)。因此，就涉及免疫遏制、貧血及血小板減少症之副作用減少而言，對其他JAK之親和力降低之JAK1抑制劑將具有優於選擇性較低之抑制劑的顯著優勢。
本發明之另一態樣係關於治療個體(例如患者)之JAK相關性疾病或病症之方法，其係藉由向需要此治療之該個體投與治療有效量或劑量之本發明化合物或其醫藥組合物來達成。JAK相關性疾病可包括直接或間接與JAK之表現或活性相關，包括過度表現及/或活性程度異常之任何疾病、病症或病狀。JAK相關性疾病亦可包括可藉由調節JAK活性加以預防、改善或治癒之任何疾病、病症或病狀。
JAK相關性疾病之實例包括涉及免疫系統之疾病，包括例如器官移植排斥(例如同種異體移植物排斥及移植物抗宿主疾病)。
JAK相關性疾病之實例包括自體免疫性疾病，諸如多發性硬化症、類風濕性關節炎、青少年關節炎、牛皮癬性關節炎、第I型糖尿病、 狼瘡、牛皮癬、發炎性腸病、潰瘍性結腸炎、克羅恩氏病(Crohn’s disease)、重症肌無力、免疫球蛋白腎病變、心肌炎、自體免疫性甲狀腺病症、慢性阻塞性肺病(COPD)及其類似疾病。在一些實施例中，自體免疫性疾病為自體免疫性大皰性皮膚病症，諸如尋常天皰瘡(pemphigus vulgaris，PV)或大皰性類天皰瘡(bullous pemphigoid，BP)。
JAK相關性疾病之其他實例包括過敏性病狀，諸如哮喘、食物過敏、濕疹性皮炎、接觸性皮炎、異位性皮炎(異位性濕疹)及鼻炎。JAK相關性疾病之其他實例包括病毒性疾病，諸如艾伯斯坦巴爾病毒(Epstein Barr Virus，EBV)、B型肝炎、C型肝炎、HIV、HTLV 1、水痘-帶狀皰疹病毒(Varicella-Zoster Virus，VZV)及人類乳頭狀瘤病毒(Human Papilloma Virus，HPV)。
JAK相關性疾病之其他實例包括與軟骨轉換(cartilage turnover)相關之疾病，例如痛風性關節炎、敗血性或感染性關節炎、反應性關節炎、反射交感性營養不良(reflex sympathetic dystrophy)、痛性營養不良(algodystrophy)、泰齊症候群(Tietze syndrome)、肋骨關節病變、地方性變形性骨關節炎(osteoarthritis deformans endemica)、姆塞萊尼病(Mseleni disease)、漢迪格度病(Handigodu disease)、由纖維肌痛引起之退化、全身性紅斑狼瘡、硬皮病或強直性脊柱炎。
JAK相關性疾病之其他實例包括先天性軟骨畸形，包括遺傳性軟骨溶解(hereditary chrondrolysis)、軟骨發育不全(chrondrodysplasias)及假性軟骨發育不全(pseudochrondrodysplasias)(例如小耳症(microtia)、無耳(enotia)及幹骺端軟骨發育不全(metaphyseal chrondrodysplasia))。
JAK相關性疾病或病狀之其他實例包括皮膚病症，諸如牛皮癬(例如尋常性牛皮癬(psoriasis vulgaris))、異位性皮炎、皮疹、皮膚刺激、皮膚敏化(例如接觸性皮炎或過敏性接觸性皮炎)。舉例而言，當局部施用時，包括一些醫藥劑之某些物質可引起皮膚敏化。在一些實施例中，共投與或依序投與至少一種本發明JAK抑制劑以及引起不當敏化之藥劑可有助於治療此不當敏化或皮炎。在一些實施例中，藉由局部投與至少一種本發明JAK抑制劑來治療皮膚病症。
在其他實施例中，JAK相關性疾病為癌症，包括特徵在於實體腫瘤(例如前列腺癌、腎癌、肝癌、胰臟癌、胃癌、乳癌、肺癌、頭頸癌、甲狀腺癌、膠質母細胞瘤、卡波西氏肉瘤(Kaposi’s sarcoma)、卡所門氏病(Castleman’s disease)、子宮平滑肌肉瘤、黑素瘤(melanoma)等)、血液科癌症(例如淋巴瘤、白血病(諸如急性淋巴母細胞性白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML))或多發性骨髓瘤)及皮膚癌(諸如皮膚T細胞淋巴瘤(CTCL)及皮膚B細胞淋巴瘤)之癌症。示範性CTCL包括塞紮萊症候群(Sezary syndrome)及蕈樣真菌病(mycosis fungoides)。
在一些實施例中，本文所述之JAK抑制劑或與其他JAK抑制劑(諸如美國專利申請序列第11/637,545號中所報導者，該文獻以全文引用的方式併入本文中)之組合可用於治療發炎相關性癌症。在一些實施例中，癌症與發炎性腸病相關。在一些實施例中，發炎性腸病為潰瘍性結腸炎。在一些實施例中，發炎性腸病為克羅恩氏病。在一些實施例中，發炎相關性癌症為結腸炎相關性癌症。在一些實施例中，發炎相關性癌症為結腸癌或結腸直腸癌。在一些實施例中，癌症為胃癌、胃腸類癌腫瘤、胃腸基質腫瘤(GIST)、腺癌、小腸癌或直腸癌。
JAK相關性疾病可進一步包括特徵在於表現以下之疾病：JAK2突變體，諸如在假激酶域中具有至少一個突變者(例如JAK2V617F)；在假激酶域以外具有至少一個突變之JAK2突變體；JAK1突變體；JAK3突變體；紅血球生成素受體(EPOR)突變體；或CRLF2之表現失調。
JAK相關性疾病可進一步包括骨髓增生性病症(MPD)，諸如真性紅細胞增多症(PV)、原發性血小板增多症(ET)、伴有骨髓化生之骨髓纖維化(MMM)、原發性骨髓纖維化(PMF)、慢性骨髓性白血病(CML)、慢性骨髓單核細胞性白血病(CMML)、嗜伊紅性白血球增多症候群(hypereosinophilic syndrome，HES)、全身性肥大細胞病(SMCD)及其類似疾病。在一些實施例中，骨髓增生性病症為骨髓纖維化(例如原發性骨髓纖維化(PMF)或真性紅細胞增多症/原發性血小板增多症後骨髓纖維化(PV/ET後MF))。在一些實施例中，骨髓增生性病症為原發性血小板增多症後骨髓纖維化(ET後MF)。在一些實施例中，骨髓增生性病症為真性紅細胞增多症後 骨髓纖維化(PV後MF)。
JAK相關疾病進一步包括骨髓發育不良症候群(MDS)。
本發明更提供藉由投與含有本發明化合物之局部調配物來治療牛皮癬或其他皮膚病症之方法。
在一些實施例中，本文所述之JAK抑制劑可用於治療肺動脈高血壓。
本發明更提供一種藉由投與本發明化合物來治療其他醫藥之皮膚學副作用之方法。舉例而言，眾多醫藥藥劑會導致可表現為痤瘡樣皮疹或相關皮炎之不當過敏性反應。具有此等不當副作用之示範性醫藥藥劑包括抗癌藥物，諸如吉非替尼(gefitinib)、西妥昔單抗(cetuximab)、埃羅替尼(erlotinib)及其類似物。本發明化合物可與具有不當皮膚學副作用之醫藥藥劑組合(例如同時或依序)來全身性或局部(例如定位於皮炎附近)投與。在一些實施例中，本發明化合物可連同一或多種其他醫藥劑一起局部投與，其中該等其他醫藥劑在不存在本發明化合物下局部施用時會導致接觸性皮炎、過敏性接觸敏化或類似皮膚病症。因此，本發明組合物包括含有本發明化合物及會引起皮炎、皮膚病症或相關副作用之另一醫藥藥劑之局部調配物。
其他JAK相關性疾病包括發炎及發炎性疾病。示範性發炎性疾病包括類肉瘤病、眼部發炎性疾病(例如虹膜炎、葡萄膜炎、鞏膜炎、結膜炎或相關疾病)、呼吸道發炎性疾病(例如上呼吸道(包括鼻及竇)發炎性疾病，諸如鼻炎或竇炎；或下呼吸道發炎性疾病，包括支氣管炎、慢性阻塞性肺病及其類似疾病)、發炎性肌病變(諸如心肌炎)及其他發炎性疾病。在一些實施例中，眼部發炎性疾病為瞼炎。
本文所述之JAK抑制劑可進一步用於治療缺血再灌注損傷或與發炎性缺血事件(諸如中風或心跳停止)相關之疾病或病狀。本文所述之JAK抑制劑可進一步用於治療內毒素驅動之疾病病況(例如在繞道手術之後的併發症或造成慢性心臟衰竭之慢性內毒素狀態)。本文所述之JAK抑制劑可進一步用於治療諸如由癌症引起或與癌症相關之厭食、惡病質或疲勞。本文所述之JAK抑制劑可進一步用於治療再狹窄、硬化性皮炎 (sclerodermitis)或纖維化。本文所述之JAK抑制劑可進一步用於治療與低氧或星形細胞膠質化(astrogliosis)相關之病狀，諸如糖尿病性視網膜病變、癌症或神經退化。參見例如Dudley,A.C.等人Biochem.J.2005,390(第2部分)：427-36及Sriram,K.等人J.Biol.Chem.2004,279(19)：19936-47.2004年3月2日電子出版，兩者均以全文引用的方式併入本文中。本文所述之JAK抑制劑可用於治療阿茲海默氏病(Alzheimer’s disease)。
本文所述之JAK抑制劑可進一步用於治療其他發炎性疾病，諸如全身性發炎性反應症候群(SIRS)及敗血性休克。
本文所述之JAK抑制劑可進一步用於治療痛風及歸因於例如良性前列腺肥大(benign prostatic hypertrophy/benign prostatic hyperplasia)之前列腺尺寸增加。
其他JAK相關性疾病包括骨再吸收疾病，諸如骨質疏鬆、骨關節炎。骨再吸收亦可與其他病狀，諸如激素不平衡及/或激素療法、自體免疫性疾病(例如骨類肉瘤病)或癌症(例如骨髓瘤)相關。歸因於JAK抑制劑之骨再吸收降低可為約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%或約90%。
在一些實施例中，本文所述之JAK抑制劑可進一步用於治療乾眼病症。如本文所用，「乾眼病症」意欲涵蓋乾眼症研討會(Dry Eye Workshop，DEWS)之新近官方報導中概述之疾病病況，該報導將乾眼症定義為「一種眼淚及眼表面之多因素疾病，其導致不適、視力障礙及淚膜不穩定症狀，且對眼表面具有潛在損害。其伴有淚膜之容積莫耳滲透濃度增加及眼表面發炎。」Lemp,「The Definition and Classification of Dry Eye Disease：Report of the Definition and Classification Subcommittee of the International Dry Eye Workshop」,The Ocular Surface,5(2),75-92 2007年4月，其以全文引用的方式併入本文中。在一些實施例中，乾眼病症係選自水性淚缺乏性乾眼症(ADDE)或蒸發性乾眼病症或其適當組合。在一些實施例中，乾眼病症為休格連症候群乾眼症(Sjogren syndrome dry eye，SSDE)。在一些實施例中，乾眼病症為非休格連症候群乾眼症(non-Sjogren syndrome dry eye，NSSDE)。
在另一態樣中，本發明提供一種在有需要之患者中治療結膜炎、葡萄膜炎(包括慢性葡萄膜炎)、脈絡膜炎、視網膜炎、睫狀體炎、鞏膜炎、上鞏膜炎或虹膜炎；治療與角膜移植、LASIK(雷射輔助原位屈光性角膜成形術)、光折射角膜切除術或LASEK(雷射輔助上皮下屈光性角膜成形術)相關之發炎或疼痛；抑制與角膜移植、LASIK、光折射角膜切除術或LASEK相關之視敏度降低；或抑制移植排斥之方法，其包含向該患者投與治療有效量之本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
另外，本發明化合物或與其他JAK抑制劑(諸如美國專利申請序列第11/637,545號中所報導者，該文獻以全文引用的方式併入本文中)之組合可用於治療與病毒感染相關之呼吸功能障礙或衰竭，諸如流行性感冒及SARS。
在一些實施例中，本發明提供如本文任何實施例中所述之式I化合物、其醫藥學上可接受之鹽，其係用於治療本文所述之任何疾病或病症之方法中。在一些實施例中，本發明提供如本文任何實施例中所述之式I化合物的用途，其係製備用於治療本文所述之任何疾病或病症之方法中的藥劑。
在一些實施例中，本發明提供如本文所述之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽，其係用於調節JAK1之方法中。在一些實施例中，本發明亦提供如本文所述之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽的用途，其係製備用於調節JAK1之方法中之藥劑。
如本文所用，術語「接觸」係指使指定部分在活體外系統或活體內系統中集合在一起。舉例而言，使JAK與本發明化合物「接觸」包括向具有JAK之個體或患者(諸如人類)投與本發明化合物以及例如將本發明化合物引入含有包含JAK之細胞或經純化製劑之樣品中。
如本文所用，可互換使用之術語「個體」或「患者」係指任何動物，包括哺乳動物，較佳為小鼠、大鼠、其他齧齒動物、兔、狗、貓、豬、牛、綿羊、馬或靈長類動物，且最佳為人類。
如本文所用，片語「治療有效量」係指引發由研究人員、獸醫、醫學醫生或其他臨床醫師在組織、系統、動物、個體或人類中所尋求 之生物或醫學反應之活性化合物或醫藥藥劑的量。在一些實施例中，治療有效量為約5mg至約1000mg、或約10mg至約500mg。
如本文所用，術語「治療」係指以下一或多者：(1)預防疾病；例如預防可能易患疾病、病狀或病症但尚未經歷或顯示疾病之病理學或症狀之個體的疾病、病狀或病症；(2)抑制疾病；例如抑制正經歷或顯示疾病、病狀或病症之病理學或症狀之個體的疾病、病狀或病症(亦即遏制病理學及/或症狀之進一步發展)；及(3)改善疾病；例如改善正經歷或顯示疾病、病狀或病症之病理學或症狀之個體的疾病、病狀或病症(亦即逆轉病理學及/或症狀)，諸如降低疾病之嚴重性。
組合療法
一或多種其他醫藥藥劑，諸如化學治療劑、消炎劑、類固醇、免疫抑制劑以及Bcr-Abl、Flt-3、RAF及FAK激酶抑制劑(諸如WO 2006/056399(其以全文引用的方式併入本文中)中所述者)或其他藥劑可與本文所述之化合物組合用於治療JAK相關性疾病、病症或病狀。一或多種其他醫藥藥劑可同時或依序向患者投與。
示範性化學治療劑包括蛋白酶體抑制劑(例如硼替佐米(bortezomib))、沙利度胺(thalidomide)、雷利米德(revlimid)及DNA破壞劑，諸如美法侖(melphalan)、小紅莓(doxorubicin)、環磷醯胺(cyclophosphamide)、長春新鹼(vincristine)、依託泊苷(etoposide)、卡莫司汀(carmustine)及其類似物。
示範性類固醇包括皮質類固醇，諸如地塞米松(dexamethasone)或潑尼松(prednisone)。
示範性Bcr-Abl抑制劑包括美國專利第5,521,184號、WO 04/005281及美國專利申請序列第60/578,491號中揭露之屬及種類之化合物及其醫藥學上可接受之鹽，該等文獻皆以全文引用的方式併入本文中。
示範性適合Flt-3抑制劑包括如WO 03/037347、WO 03/099771及WO 04/046120中揭露之化合物及其醫藥學上可接受之鹽，該等文獻皆以全文引用的方式併入本文中。
示範性適合RAF抑制劑包括如WO 00/09495及WO 05/028444中揭露之化合物及其醫藥學上可接受之鹽，該兩篇文獻均以全文引用的方式併入本文中。
示範性適合FAK抑制劑包括如WO 04/080980、WO 04/056786、WO 03/024967、WO 01/064655、WO 00/053595及WO 01/014402中揭露之化合物及其醫藥學上可接受之鹽，該等文獻皆以全文引用的方式併入本文中。
在一些實施例中，一或多種本發明化合物可與一或多種其他激酶抑制劑(包括伊馬替尼(imatinib))組合，特定言之用於治療對伊馬替尼或其他激酶抑制劑具有抗性之患者。
在一些實施例中，適合化學治療劑可選自抗代謝物藥劑、拓撲異構酶(topoisomerase)1抑制劑、鉑類似物、紫杉烷(taxane)、蒽環黴素(anthracycline)及EGFR抑制劑及其組合。
在一些實施例中，抗代謝物藥劑包括卡培他濱(capecitabine)、吉西他濱(gemcitabine)及氟尿嘧啶(5-FU)。
在一些實施例中，紫杉烷包括太平洋紫杉醇(paclitaxel)、Abraxane®(用於可注射懸浮液之太平洋紫杉醇蛋白質結合粒子)及Taxotere®(多西他賽(docetaxel))。
在一些實施例中，鉑類似物包括奧沙利鉑(oxaliplatin)、順鉑(cisplatin)及卡鉑(carboplatin)。
在一些實施例中，拓撲異構酶1抑制劑包括伊立替康(irinotecan)及拓撲替康(topotecan)。
在某一實施例中，蒽環黴素包括多柔比星(doxorubicin)或多柔比星之脂質體調配物。
在一些實施例中，化學治療劑為FOLFIRINOX(5-FU、甲醯四氫葉酸(lecovorin)、伊立替康及奧沙利鉑)。在一些實施例中，化學治療劑為吉西他濱及Abraxane®(用於可注射懸浮液之太平洋紫杉醇蛋白質結合粒子)。
在一些實施例中，一或多種本發明JAK抑制劑可與化學治 療劑組合用於治療癌症(諸如多發性骨髓瘤)，且相較於對單獨化學治療劑之反應，可改良治療反應而不加劇其毒性效應。用於治療多發性骨髓瘤之其他醫藥藥劑之實例例如可包括(不限於)美法侖、美法侖加潑尼松[MP]、小紅莓、地塞米松及維爾科德(Velcade)(硼替佐米)。用於治療多發性骨髓瘤之其他另外藥劑包括Bcr-Abl、Flt-3、RAF及FAK激酶抑制劑。累加或協同效應為組合本發明JAK抑制劑與另一藥劑之所要結果。此外，多發性骨髓瘤細胞對諸如地塞米松之藥劑之抗性可在用本發明JAK抑制劑治療後逆轉。藥劑可以單一或連續劑型與本發明化合物組合，或藥劑可以單獨劑型同時或依序投與。
在一些實施例中，諸如地塞米松之皮質類固醇與至少一種JAK抑制劑組合向患者投與，其中與連續相反，間歇投與地塞米松。
在一些其他實施例中，一或多種本發明JAK抑制劑與其他治療劑之組合可在骨髓移植或幹細胞移植之前、期間及/或之後向患者投與。
在一些實施例中，其他治療劑為丙酮化氟新諾龍(fluocinolone acetonide)(Retisert®)或利美索龍(rimexolone)(AL-2178、維克松(Vexol)，Alcon)。
在一些實施例中，其他治療劑為環孢靈(cyclosporine)(Restasis®)。
在一些實施例中，其他治療劑為皮質類固醇。在一些實施例中，皮質類固醇為曲安西龍(triamcinolone)、地塞米松、氟新諾龍、可的松(cortisone)、潑尼松龍(prednisolone)或氟米龍(flumetholone)。
在一些實施例中，其他治療劑係選自DehydrexTM(Holles Labs)、西瓦米德(Civamide)(Opko)、透明質酸鈉(sodium hyaluronate)(維斯姆(Vismed)，Lantibio/TRB Chemedia)、環孢靈(ST-603，Sirion Therapeutics)、ARG101(T)(睾丸酮(testosterone)，Argentis)、AGR1012(P)(Argentis)、依卡倍特鈉(ecabet sodium)(Senju-Ista)、吉法酯(gefarnate)(Santen)、15-(s)-羥基花生四烯酸(15(S)-HETE)、西維美林(cevilemine)、多西環素(doxycycline)(ALTY-0501，Alacrity)、米諾環素(minocycline)、iDestrinTM(NP50301，Nascent Pharmaceuticals)、環孢靈A(Nova22007， Novagali)、氧四環素(oxytetracycline)(耐久黴素(Duramycin)、MOLI1901，Lantibio)、CF101(2S,3S,4R,5R)-3,4-二羥基-5-[6-[(3-碘苯基)甲胺基]嘌呤-9-基]-N-甲基-氧雜環戊烷-2-胺甲醯基，Can-Fite Biopharma)、沃科寶林(voclosporin)(LX212或LX214，Lux Biosciences)、ARG103(Agentis)、RX-10045(合成利索文(resolvin)類似物，Resolvyx)、DYN15(Dyanmis Therapeutics)、利格列酮(rivoglitazone)(DE011，Daiichi Sanko)、TB4(RegeneRx)、OPH-01(Ophtalmis Monaco)、PCS101(Pericor Science)、REV1-31(Evolutec)、拉里汀(Lacritin)(Senju)、瑞巴匹特(rebamipide)(Otsuka-Novartis)、OT-551(Othera)、PAI-2(賓夕法尼亞大學(University of Pennsylvania)及坦普爾大學(Temple University))、毛果芸香鹼(pilocarpine)、他克莫司(tacrolimus)、吡美莫司(pimecrolimus)(AMS981，Novartis)、依碳酸氯替潑諾(loteprednol etabonate)、利妥昔單抗(rituximab)、地誇磷索四鈉(diquafosol tetrasodium)(INS365，Inspire)、KLS-0611(Kissei Pharmaceuticals)、去氫表雄酮(dehydroepiandrosterone)、阿那白滯素(anakinra)、依法珠單抗(efalizumab)、黴酚酸鈉(mycophenolate sodium)、依那西普(etanercept)(Embrel®)、羥氯奎(羥基chloroquine)、NGX267(TorreyPines Therapeutics)、安挺樂(actemra)、吉西他濱(gemcitabine)、奧沙利鉑(oxaliplatin)、L-天冬醯胺酶或沙利度胺。
在一些實施例中，其他治療劑為抗血管生成劑、膽鹼激導性促效劑、TRP-1受體調節劑、鈣通道阻斷劑、黏蛋白促泌素(mucin secretagogue)、MUC1刺激劑、鈣調神經磷酸酶(calcineurin)抑制劑、皮質類固醇、P2Y2受體促效劑、蕈毒鹼受體促效劑(muscarinic receptor agonist)、mTOR抑制劑、另一JAK抑制劑、Bcr-Abl激酶抑制劑、Flt-3激酶抑制劑、RAF激酶抑制劑及FAK激酶抑制劑，諸如WO 2006/056399(其以全文引用的方式併入本文中)中所述者。在一些實施例中，其他治療劑為四環素衍生物(例如米諾環素或多西環素)。在一些實施例中，其他治療劑結合FKBP12。
在一些實施例中，其他治療劑為烷化劑或DNA交聯劑；抗代謝物/去甲基劑(例如5-氟尿嘧啶(flurouracil)、卡培他濱(capecitabine)或阿紮胞苷(azacitidine))；抗激素療法(例如激素受體拮抗劑、SERM或芳香酶 (aromotase)抑制劑)；有絲分裂抑制劑(例如長春新鹼或太平洋紫杉醇(paclitaxel))；拓撲異構酶(topoisomerase)(I或II)抑制劑(例如米托蒽醌(mitoxantrone)及伊立替康(irinotecan))；細胞凋亡誘導劑(例如ABT-737)；核酸療法(例如反義物或RNAi)；核受體配位體(例如促效劑及/或拮抗劑：全反式視黃酸(all-trans retinoic acid)或蓓薩羅丁(bexarotene))；表觀遺傳靶向劑，諸如組蛋白去乙醯基酶抑制劑(例如伏立諾他(vorinostat))、低甲基化劑(例如地西他濱(decitabine))；蛋白質穩定性之調控劑，諸如Hsp90抑制劑、泛素(ubiquitin)及/或泛素樣共軛分子或去共軛分子；或EGFR抑制劑(埃羅替尼(erlotinib))。
在一些實施例中，其他治療劑為緩和滴眼劑(亦稱為「人工淚」)，其包括但不限於含有聚乙烯醇、羥丙基甲基纖維素、甘油、聚乙二醇(例如PEG400)或羧甲基纖維素之組合物。人工淚可藉由補償降低之淚膜濕潤及潤滑能力來幫助治療乾眼症。在一些實施例中，其他治療劑為可與黏蛋白相互作用且因此降低淚膜之黏度的黏液溶解藥物，諸如N-乙醯基-半胱胺酸。
在一些實施例中，其他治療劑包括抗生素、抗病毒劑、抗真菌劑、麻醉劑、消炎劑(包括類固醇及非類固醇消炎劑)及抗過敏劑。適合藥劑之實例包括胺基醣苷，諸如阿米卡星(amikacin)、健他黴素(gentamycin)、妥布黴素(tobramycin)、鏈黴素(streptomycin)、奈替黴素(netilmycin)及康黴素(kanamycin)；氟喹諾酮(氟quinolone)，諸如環丙沙星(ciprofloxacin)、諾氟沙星(norfloxacin)、氧氟沙星(ofloxacin)、曲伐沙星(trovafloxacin)、洛美沙星(lomefloxacin)、左氧氟沙星(levofloxacin)及依諾沙星(enoxacin)；萘啶；磺醯胺；多黏菌素(polymyxin)；氯胺苯醇(chloramphenicol)；新黴素(neomycin)；巴龍黴素(paramomycin)；甲磺酸黏菌素(colistimethate)；桿菌肽(bacitracin)；萬古黴素(vancomycin)；四環素；利福平(rifampin)及其衍生物(「利福平類」)；環絲胺酸；β-內醯胺；頭孢菌素(cephalosporin)；兩性黴素(amphotericin)；氟康唑(fluconazole)；氟胞嘧啶；納他黴素(natamycin)；咪康唑(miconazole)；酮康唑(ketoconazole)；皮質類固醇；雙氯芬酸(diclofenac)；氟比洛芬(flurbiprofen)；酮咯酸(ketorolac)；舒洛芬(suprofen)； 色甘酸(cromolyn)；洛度沙胺(lodoxamide)；左卡巴斯汀(levocabastin)；萘唑啉(naphazoline)；安他唑啉(antazoline)；非尼拉敏(pheniramine)；或氮雜內酯(azalide)抗生素。
醫藥調配物及劑型
當用作醫藥時，本發明化合物可以醫藥組合物形式投與。此等組合物可以醫藥技術中熟知之方式製備，且視需要局部治療抑或全身性治療及欲治療之區域而定，可藉由多種途徑投與。投藥可為局部(包括經皮、表皮、經眼及投向黏膜，包括鼻內、陰道及直腸傳遞)、經肺(例如藉由吸入或吹入散劑或氣霧劑，包括使用噴霧器；氣管內或鼻內)、經口或非經腸投藥。非經腸投藥包括靜脈內、動脈內、皮下、腹膜內或肌肉內注射或輸注；或顱內(例如鞘內或腦室內)投藥。非經腸投藥可呈單一團式劑量形式，或可例如藉由連續灌注泵達成。用於局部投藥之醫藥組合物及調配物可包括經皮貼片、軟膏劑、洗劑、乳膏劑、凝膠劑、滴劑、栓劑、噴霧劑、液體及散劑。習知醫藥載劑、水性、粉末狀或油性基質、增稠劑及其類似物可為必需或所需要的。
本發明亦包括含有作為活性成分之本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽與一或多種醫藥學上可接受之載劑(賦形劑)組合的醫藥組合物。在一些實施例中，組合物適於局部投藥。在製備本發明組合物時，活性成分通常與賦形劑混合、由賦形劑稀釋或封閉在呈例如膠囊、藥囊、紙或其他容器形式之該種載體內。當賦形劑充當稀釋劑時，其可為充當活性成分之媒劑、載劑或介質之固體、半固體或液體物質。因此，組合物可呈錠劑、丸劑、散劑、口含錠、藥囊、扁囊劑、酏劑、懸浮液、乳液、溶液、糖漿、氣霧劑(呈固體形式或於液體介質中)、含有例如多達10重量%活性化合物之軟膏劑、軟質及硬質明膠膠囊、栓劑、無菌可注射溶液及無菌包裝散劑形式。
在製備調配物時，活性化合物可在與其他成分組合之前進行研磨以提供適當粒度。若活性化合物實質上不可溶，則其可研磨成粒度小於200目。若活性化合物實質上可溶於水，則粒度可藉由研磨調整以使得 在調配物中實質上均一分佈，例如約40目。
可使用已知研磨程序(諸如濕磨)研磨本發明化合物以獲得適於形成錠劑及其他調配物類型之粒度。本發明化合物之細粉狀(奈米顆粒)製劑可藉由此項技術中已知之方法製備，例如參見國際申請案第WO 2002/000196號。
適合賦形劑之一些實例包括乳糖、右旋糖、蔗糖、山梨糖醇、甘露糖醇、澱粉、阿拉伯膠(gum acacia)、磷酸鈣、海藻酸鹽、黃蓍、明膠、矽酸鈣、微晶纖維素、聚乙烯吡咯啶酮、纖維素、水、糖漿及甲基纖維素。調配物可另外包括：潤滑劑，諸如滑石、硬脂酸鎂及礦物油；濕潤劑；乳化劑及懸浮劑；防腐劑，諸如羥基苯甲酸甲酯及羥基苯甲酸丙酯；甜味劑；及調味劑。本發明之組合物可經調配以在藉由使用此項技術中已知之程序向患者投藥之後提供活性成分之快速、持續或延遲釋放。
在一些實施例中，醫藥組合物包含矽化微晶纖維素(SMCC)及至少一種本文所述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中，矽化微晶纖維素包含約98%微晶纖維素及約2%二氧化矽(w/w)。
在一些實施例中，組合物為包含至少一種本文所述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及至少一種醫藥學上可接受之載劑的持續釋放組合物。在一些實施例中，組合物包含至少一種本文所述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及至少一種選自微晶纖維素、乳糖單水合物、羥丙基甲基纖維素及聚環氧乙烷之組分。在一些實施例中，組合物包含至少一種本文所述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及微晶纖維素、乳糖單水合物及羥丙基甲基纖維素。在一些實施例中，組合物包含至少一種本文所述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及微晶纖維素、乳糖單水合物及聚環氧乙烷。在一些實施例中，組合物進一步包含硬脂酸鎂或二氧化矽。在一些實施例中，微晶纖維素為Avicel PH102TM。在一些實施例中，乳糖單水合物為Fast-flo 316TM。在一些實施例中，羥丙基甲基纖維素為羥丙基甲基纖維素2208 K4M(例如Methocel K4 M PremierTM)及/或羥丙基甲基纖維素2208 K100LV(例如Methocel K00LVTM)。在一些實施例中，聚環氧乙烷為聚環氧乙烷WSR 1105(例如Polyox WSR 1105TM)。
在一些實施例中，使用濕式粒化方法來製造組合物。在一些實施例中，使用乾式粒化方法來製造組合物。
組合物可調配成單位劑型，各劑量含有約5至約1,000mg(1g)、更通常約100mg至約500mg活性成分。在一些實施例中，各劑量含有約10mg活性成分。在一些實施例中，各劑量含有約50mg活性成分。在一些實施例中，各劑量含有約25mg活性成分。術語「單位劑型」係指適合作為用於人類個體及其他哺乳動物之單一劑量之物理個別單元，各單元含有經計算以產生所要治療效應之預定量之活性物質以及適合醫藥賦形劑。
在一些實施例中，本發明組合物含有約5mg至約50mg活性成分。一般技藝人士應瞭解此表示化合物或組合物含有約5mg至約10mg、約10mg至約15mg、約15mg至約20mg、約20mg至約25mg、約25mg至約30mg、約30mg至約35mg、約35mg至約40mg、約40mg至約45mg、或約45mg至約50mg活性成分。
在一些實施例中，本發明之組合物含有約50mg至約500mg活性成分。一般技藝人士應瞭解此表示化合物或組合物含有約50mg至約100mg、約100mg至約150mg、約150mg至約200mg、約200mg至約250mg、約250mg至約300mg、約350mg至約400mg、或約450mg至約500mg活性成分。
在一些實施例中，本發明組合物含有約500mg至約1,000mg活性成分。一般技藝人士應瞭解此表示化合物或組合物含有約500mg至約550mg、約550mg至約600mg、約600mg至約650mg、約650mg至約700mg、約700mg至約750mg、約750mg至約800mg、約800mg至約850mg、約850mg至約900mg、約900mg至約950mg、或約950mg至約1,000mg活性成分。
活性化合物可在廣泛劑量範圍內有效且通常以醫藥有效量投與。然而，應瞭解實際投與之化合物之量將通常由醫師根據相關情形來確定，該等情形包括欲治療之病狀、所選投藥途徑、投與之實際化合物、個別患者之年齡、體重及反應、患者之症狀之嚴重性及其類似情形。
對於製備諸如錠劑之固體組合物，將主要活性成分與醫藥賦形劑混合以形成含有本發明化合物之均質混合物的固體預調配組合物。當稱此等預調配組合物為均質時，活性成分通常均勻分散在整個組合物中以使組合物可易於再分成等效單位劑型，諸如錠劑、丸劑及膠囊。此固體預調配物接著再分成含有例如約0.1至約1000mg本發明活性成分之上述類型單位劑型。
本發明之錠劑或丸劑可經包覆或以其他方式混配以提供給予作用延長之優勢之劑型。舉例而言，錠劑或丸劑可包含內部劑量組分及外部劑量組分，後者呈位於前者之上之包膜形式。兩種組分可由用於抵抗胃中之崩解且允許內部組分完整進入十二指腸或延遲釋放之腸溶層分隔開。多種物質可用於此等腸溶層或包衣，此等物質包括許多聚合酸及聚合酸與諸如蟲膠(shellac)、十六醇及乙酸纖維素之物質之混合物。
本發明之化合物及組合物可併入以用於經口或藉由注射投藥所依之液體形式包括水溶液、經適合調味之糖漿、水性或油性懸浮液、及經調味之乳液，含有可食用油(諸如棉籽油、芝麻油、椰子油或花生油)以及酏劑及類似醫藥媒劑。
用於吸入或吹入之組合物包括於醫藥學上可接受之水性或有機溶劑或其混合物中之溶液及懸浮液、及散劑。液體或固體組合物可含有如上所述之適合醫藥學上可接受之賦形劑。在一些實施例中，組合物藉由經口或經鼻呼吸途徑投與以達成局部或全身性效應。組合物可藉由使用惰性氣體進行霧化。霧化溶液可直接自霧化裝置呼吸或霧化裝置可連接於面罩(face masks tent)或間歇式正壓呼吸機。溶液、懸浮液或散劑組合物可經口或經鼻自以適當方式傳遞調配物之裝置投與。
局部調配物可含有一或多種習知載劑。在一些實施例中，軟膏劑可含有水及一或多種選自例如液體石蠟、聚氧乙烯烷基醚、丙二醇、白凡士林(white Vaseline)及其類似物之疏水性載劑。乳膏劑之載劑組成可基於水與甘油及一或多種其他組分(例如單硬脂酸甘油酯、PEG-單硬脂酸甘油酯及十六基硬脂醇)之組合。可使用異丙醇及水，適當時與其他組分(諸如甘油、羥乙基纖維素及其類似物)組合來調配凝膠劑。在一些實施例中，局部 調配物含有至少約0.1、至少約0.25、至少約0.5、至少約1、至少約2或至少約5wt%本發明化合物。局部調配物可適當地包裝於例如100g之管中，該等管視情況連同有治療所選適應症，例如牛皮癬或其他皮膚病狀之說明書。
向患者投與之化合物或組合物之量將視所投與物、投藥目的(諸如預防或治療)、患者狀態、投藥方式及其類似因素而變化。在治療應用中，組合物可以足以治癒或至少部分遏制疾病及其併發症之症狀的量向已罹患該疾病之患者投與。有效劑量將視所治療之疾病病狀而定以及根據主治臨床醫師按照諸如疾病之嚴重性、患者之年齡、體重及一般狀況及其類似因素之因素進行的判斷。
向患者投與之組合物可呈上述醫藥組合物形式。此等組合物可藉由習知滅菌技術滅菌，或可經無菌過濾。水溶液可包裝用於按原樣使用或可凍乾，其中凍乾製劑在投藥之前與無菌水性載劑組合。化合物製劑之pH值通常將介於3與11之間、更佳為5至9且最佳為7至8。應瞭解使用某些上述賦形劑、載劑或穩定劑將導致形成醫藥鹽。
本發明化合物之治療劑量可根據例如治療所欲達成之特定用途、化合物之投與方式、患者之健康及狀況、及處方醫師之判斷而變化。本發明化合物在醫藥組合物中之比例或濃度可視許多因素，包括劑量、化學特徵(例如疏水性)及投藥途徑而變化。舉例而言，本發明化合物可以含有約0.1至約10% w/v化合物之生理緩衝水溶液形式提供以用於非經腸投藥。一些典型劑量範圍為每天每公斤體重約1μg至約1g。在一些實施例中，劑量範圍為每天每公斤體重約0.01mg至約100mg。劑量可能取決於諸如疾病或病症之類型及進展程度、特定患者之總體健康狀態、所選化合物之相對生物功效、賦形劑之配方、及其投藥途徑之變數。有效劑量可自由活體外或動物模型測試系統獲得之劑量-反應曲線外推而來。
本發明組合物可進一步包括一或多種其他醫藥藥劑，諸如化學治療劑、類固醇、消炎化合物或免疫抑制劑，其實例列於上文中。
在一些實施例中，化合物或其醫藥學上可接受之鹽以眼用組合物形式投與。因此，在一些實施例中，方法包含投與化合物或其醫藥學 上可接受之鹽及眼科學上可接受之載劑。在一些實施例中，眼用組合物為液體組合物、半固體組合物、插入物、薄膜、微粒或奈米粒子。
在一些實施例中，眼用組合物為液體組合物。在一些實施例中，眼用組合物為半固體組合物。在一些實施例中，眼用組合物為局部組合物。局部組合物包括但不限於液體及半固體組合物。在一些實施例中，眼用組合物為局部組合物。在一些實施例中，局部組合物包含水溶液、水性懸浮液、軟膏劑或凝膠劑。在一些實施例中，眼用組合物局部施用於眼前方、上眼瞼下方、下眼瞼上及陷凹(cul-de-sac)中。在一些實施例中，眼用組合物經滅菌。滅菌可藉由已知技術達成，如使溶液滅菌過濾或藉由加熱於安瓿中之溶液備用。本發明之眼用組合物可進一步含有適於製備眼用調配物之醫藥賦形劑。此等賦形劑之實例為防腐劑、緩衝劑、螯合劑、抗氧化劑及調節滲透壓之鹽。
如本文所用，術語「眼科學上可接受之載劑」係指可容納及釋放化合物或其醫藥學上可接受之鹽且與眼相容之任何物質。在一些實施例中，眼科學上可接受之載劑為水或水性溶液或懸浮液，但亦包括油(諸如用於製備軟膏劑者)及聚合物基質(諸如用於眼用插入物中者)。在一些實施例中，組合物可為包含化合物或其醫藥學上可接受之鹽之水性懸浮液。液體眼用組合物(包括軟膏劑與懸浮液兩者)可具有適於所選投藥途徑之黏度。在一些實施例中，眼用組合物之黏度在約1,000至約30,000厘泊範圍內。
在一些實施例中，眼用組合物可進一步包含以下一或多者：界面活性劑、佐劑、緩衝劑、抗氧化劑、張力調整劑、防腐劑(例如EDTA、BAK(氯化苯甲烴銨)、亞氯酸鈉、過硼酸鈉、聚四級銨-1)、增稠劑或黏度調節劑(例如羧甲基纖維素、羥甲基纖維素、聚乙烯醇、聚乙二醇、二醇400、丙二醇羥甲基纖維素、羥丙基-瓜爾膠(hydrox丙基-guar)、透明質酸及羥丙基纖維素)及其類似物。調配物中之添加劑可包括但不限於氯化鈉、碳酸氫鈉、山梨酸、對羥基苯甲酸甲酯、對羥基苯甲酸丙酯、氯己定(chlorhexidine)、蓖麻油及過硼酸鈉。
水性眼用組合物(溶液或懸浮液)通常不含生理學上或眼科 學上有害之組分。在一些實施例中，組合物中使用經純化水或去離子水。可藉由添加任何生理學上及眼科學上可接受之pH值調整酸、鹼或緩衝劑來調整pH值至約5.0至8.5之範圍內。酸之眼科學上可接受之實例包括乙酸、硼酸、檸檬酸、乳酸、磷酸、鹽酸及其類似物，且鹼之實例包括氫氧化鈉、磷酸鈉、硼酸鈉、檸檬酸鈉、乙酸鈉、乳酸鈉、緩血酸胺(tromethamine)、參羥甲胺基-甲烷及其類似物。鹽及緩衝劑包括檸檬酸鹽/右旋糖、碳酸氫鈉、氯化銨及上述酸及鹼之混合物。
在一些實施例中，方法涉及形成或供應與眼之外表面接觸之治療劑的儲槽。儲槽係指不由淚或其他眼清除機制快速移除之治療劑來源。此允許藉由單次用藥使連續、持續高濃度之治療劑存在於眼之外表面上的流體中。不希望受任何理論束縛，咸信吸收及穿透可取決於溶解之藥物濃度及外部組織與含藥物流體之接觸持續時間兩者。隨著藥物藉由眼流體之清除及/或吸收至眼組織中而移除，更多藥物被自儲槽提供(例如溶解)至補充之眼流體中。因此，使用儲槽可更易於促進向眼組織裝載不可溶性更大之治療劑。在一些實施例中，儲槽可保留多達8小時或8小時以上。在一些實施例中，眼用儲槽形式包括但不限於水性聚合懸浮液、軟膏劑及固體插入物。
在一些實施例中，眼用組合物為軟膏劑或凝膠劑。在一些實施例中，眼用組合物為油基傳遞載具。在一些實施例中，組合物包含石油或羊毛脂(lanolin)基質，其中添加通常為0.1至2%之活性成分、及賦形劑。常見基質可包括但不限於礦物油、石油脂及其組合。在一些實施例中，軟膏劑以條帶形式施用於下眼瞼上。
在一些實施例中，眼用組合物為眼用插入物。在一些實施例中，眼用插入物具有生物惰性、軟質性、生物可侵蝕性、黏彈性、在暴露於治療劑之後對滅菌穩定、對來自空氣傳播細菌之感染具有抗性、生物可侵蝕性、生物相容性及/或黏彈性。在一些實施例中，插入物包含眼科學上可接受之基質，例如聚合物基質。基質通常為聚合物且治療劑通常分散於其中或鍵結於聚合物基質。在一些實施例中，治療劑可經由溶解或共價鍵水解自基質緩慢釋放。在一些實施例中，聚合物具有生物可侵蝕性(可溶性) 且其溶解速率可控制其中分散之治療劑之釋放速率。在另一形式中，聚合物基質為諸如藉由水解而分解以藉此釋放與其鍵結或其中分散之治療劑的生物可降解性聚合物。在其他實施例中，基質及治療劑可環繞有另一聚合塗層以進一步控制釋放。在一些實施例中，插入物包含生物可降解性聚合物，諸如聚己內酯(PCL)、乙烯/乙酸乙烯酯共聚物(EVA)、聚氰基丙烯酸烷酯、聚胺基甲酸酯、耐綸或聚(dl-丙交酯共乙交酯)(PLGA)或任何此等各物之共聚物。在一些實施例中，治療劑分散於基質物質中或在聚合之前分散在用於製備基質物質之單體組合物中。在一些實施例中，治療劑之量為約0.1至約50%或約2至約20%。在其他實施例中，使用生物可降解性或生物可侵蝕性聚合物基質以便用過的插入物不必移除。隨著生物可降解性或生物可侵蝕性聚合物降解或溶解，治療劑釋放。
在其他實施例中，眼用插入物包含聚合物，包括但不限於Wagh等人，「Polymers used in ocular dosage form and drug delivery systems」,Asian J.Pharm.，第12-17頁(2008年1月)中所述者，該參考文獻以全文引用的方式併入本文中。在一些實施例中，插入物包含選自以下之聚合物：聚乙烯吡咯啶酮(PVP)、丙烯酸酯或甲基丙烯酸酯聚合物或共聚物(例如來自Rohm或Degussa之Eudragit®聚合物家族)、羥甲基纖維素、聚丙烯酸、聚(醯胺基胺)樹枝狀聚合物、聚(二甲基矽氧烷)、聚環氧乙烷、聚(丙交酯共乙交酯)、聚(甲基丙烯酸2-羥乙酯)、聚(乙烯醇)或聚(反丁烯二酸伸丙酯)。在一些實施例中，插入物包含Gelfoam® R。在一些實施例中，插入物為450kDa聚丙烯酸-半胱胺酸共軛物。
在一些實施例中，眼用組合物為眼用薄膜。適於此等薄膜之聚合物包括但不限於Wagh等人(同上)中所述者。在一些實施例中，薄膜為軟隱形眼鏡，諸如由N,N-二乙基丙烯醯胺與甲基丙烯酸用乙二醇二甲基丙烯酸酯交聯之共聚物製得的軟隱形眼鏡。
在一些實施例中，眼用組合物包含微球體或奈米粒子。在一些實施例中，微球體包含明膠。在一些實施例中，微球體係注射至眼之後段、脈絡膜間隙中、鞏膜中、玻璃體內或視網膜下。在一些實施例中，微球或奈米粒子包含聚合物，包括但不限於Wagh等人(同上)中所述者，該參 考文獻以全文引用的方式併入本文中。在一些實施例中，聚合物為聚葡萄胺糖(chitosan)、聚羧酸(諸如聚丙烯酸)、白蛋白粒子、透明質酸酯、聚衣康酸(polyitaconic acid)、聚(丁基)氰基丙烯酸酯、聚己內酯、聚(異丁基)己內酯、聚(乳酸共乙醇酸)或聚(乳酸)。在一些實施例中，微球體或奈米粒子包含固體脂質粒子。
在一些實施例中，眼用組合物包含離子交換樹脂。在一些實施例中，離子交換樹脂為無機沸石(zeolite)或合成有機樹脂。在一些實施例中，離子交換樹脂包括但不限於Wagh等人(同上)中所述者，該參考文獻以全文引用的方式併入本文中。在一些實施例中，離子交換樹脂為部分中和之聚丙烯酸。
在一些實施例中，眼用組合物為水性聚合懸浮液。在一些實施例中，治療劑或聚合懸浮劑懸浮於水性介質中。在一些實施例中，可調配水性聚合懸浮液以使其在眼中保持其在向眼投與之前所具有之相同或實質上相同之黏度。在一些實施例中，其可經調配以使在與淚流體接觸後凝膠化增強。
經標記化合物及分析方法
本發明之另一態樣係關於本發明之經標記(放射性標記、螢光標記等)化合物，其將不僅適用於成像技術中而且亦適用於定位及定量組織樣品(包括人類)中之JAK及藉由抑制經標記化合物之結合來鑒別JAK配位體的活體外分析與活體內分析兩者中。因此，本發明包括含有此等經標記化合物之JAK分析。
本發明進一步包括本發明之經同位素標記化合物。「同位素」或「放射性標記」化合物為本發明化合物之一或多個原子經原子質量或質量數不同於在自然界中通常所見(亦即天然存在)之原子質量或質量數的原子置換或取代。可併入本發明化合物中之適合放射性核種包括但不限於3H(對於氚而言，亦寫作T)、11C、13C、14C、13N、15N、15O、17O、18O、18F、35S、36Cl、82Br、75Br、76Br、77Br、123I、124I、125I及131I。併入本發明放射性標記化合物中之放射性核種將視彼放射性標記化合物之特定應用而定。舉例而言，對於活體外JAK標記及競爭分析，併有3H、14C、82Br、125I、131I 或35S之化合物將通常最適用。對於放射性成像應用，11C、18F、125I、123I、124I、131I、75Br、76Br或77Br將通常最適用。
應瞭解「放射性標記」或「經標記化合物」為已併有至少一種放射性核種之化合物。在一些實施例中，放射性核種係選自由3H、14C、125I、35S及82Br組成之群。在一些實施例中，化合物併有1、2或3個氘原子。
本發明可進一步包括使放射性同位素併入本發明化合物中之合成方法。使放射性同位素併入有機化合物中之合成方法在此項技術中為熟知的且一般技藝人士將易於認識到適用於本發明化合物之方法。
在篩檢分析中可使用本發明之經標記化合物來鑒別/評估化合物。舉例而言，可藉由追蹤標記以監測經標記之新近合成或鑒別之化合物(亦即測試化合物)在與JAK接觸時之濃度變化來評估其結合JAK的能力。舉例而言，可評估測試化合物(經標記)降低已知會結合JAK之另一化合物(亦即標準化合物)之結合的能力。因此，測試化合物與標準化合物競爭結合JAK之能力直接與其結合親和力相關。反之，在一些其他篩檢分析中，對標準化合物進行標記且測試化合物未標記。因此，監測經標記標準化合物之濃度以評估標準化合物與測試化合物之間的競爭，且因此確定測試化合物之相對結合親和力。
套組
本發明亦包括適用於例如治療或預防JAK相關性疾病或病症(諸如癌症)之醫藥套組，其包括一或多個含有包含治療有效量之本發明化合物之醫藥組合物的容器。此等套組必要時可進一步包括各種習知醫藥套組組分，諸如具有一或多種醫藥學上可接受之載劑之容器、其他容器等之一或多者，如將易於為熟習此項技術者顯而易知。呈插頁或標籤形式之指示欲投與之組分之量、投藥指導方針、及/或混合組分之指導方針的說明書亦可包括在套組中。
本發明將藉助於特定實例更詳細地描述。下列實例係出於說明性目的而提供，且不欲以任何方式限制本發明。熟習此項技術者將易於認識到可進行改變或修改以產生基本上相同結果之多種非關鍵參數。已根 據至少一種本文所述之分析發現實例之化合物為JAK抑制劑。
實例 實例1. (1R)-1-{1-[(3S)-四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
步驟1. 6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-醇
在-5℃下逐滴添加溶解於二氯甲烷(100mL)中之硝酸N,N,N-三丁基丁-1-銨(來自Aldrich，9.1g，30mmol)至噻吩并[3,2-b]吡啶-7-醇(來自Aldrich，3.0g，20mmol)於二氯甲烷(100mL)中之攪拌溶液中。在維持溫度低於0℃下添加三氟乙酸酐(4.5mL，32mmol)。接著在-5℃下攪拌所得混合物30分鐘且在室溫下攪拌隔夜。濃縮反應混合物，用乙醚稀釋，過濾。收集之固體依次用水及乙醚/甲醇(MeOH)混合物(1：1)洗滌，且風乾以得到所要產物(3.3g，85%)。C7H5N2O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=197.0；實驗值：196.9。
步驟2. 7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶
將6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-醇(3.3g，17mmol)懸浮於磷醯氯(30mL，400mmol)中且在回流下加熱1小時(在45分鐘之後溶解明顯)。移除溶劑。添加甲苯至殘餘物中且在真空中移除揮發性組分。添加二氯甲烷及飽和NaHCO3溶液(注意：氣體逸出)，且分離各層。有機層用水洗滌，經MgSO4乾燥且濃縮以得到所要產物(2.7g，75%)。C7H4ClN2O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=215.0；實驗值：214.9。
步驟3. 6-硝基-N-[(3S)-四氫-2H-哌喃-3-基]噻吩井[3,2-b]吡啶-7-胺
在60℃下將7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.060g，0.28mmol)、(3S)-四氫-2H-哌喃-3-胺鹽酸鹽(來自J&W Pharmatech，0.059g，0.43mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.15mL，0.84mmol)於異丙醇(0.95mL)中之混合物加熱隔夜。濃縮所得混合物且在矽膠上純化(用含0至50%乙酸乙酯(EtOAc)之己烷溶離)以得到所要產物(30mg，38%)。C12H14N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=280.1；實驗值：280.0。
步驟4. N7-[(3S)-四氫-2H-哌喃-3-基]噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺
在回流下加熱6-硝基-N-[(3S)-四氫-2H-哌喃-3-基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(30mg，0.1mmol)、鐵(18mg，0.32mmol)及氯化銨(29mg，0.54mmol)於乙醇(0.8mL)/水(0.3mL)中之混合物4小時。過濾所得混合物。濾液用EtOAc稀釋，用飽和NaHCO3溶液洗滌，經MgSO4乾燥，且濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物。C12H16M3OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=250.1；實驗值：250.0。
步驟5. (1R)-1-{1-[(3S)-四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
在攪拌15分鐘之後，(2R)-2-羥基丙醯胺(來自Aldrich，5.4mg，0.060mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(12mg，0.062mmol)於四氫呋喃(0.1mL)中之混合物變成溶液。在又45分鐘之後，添加此溶液至N7-[(3S)-四氫-2H-哌喃-3-基]噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺(7.5mg，0.030mmol)於乙醇(0.24mL)中之混合物中且在回流下加熱所得混合物2小時。粗混合物在 RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(5.9mg，65%)。C15H18N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=304.1；實驗值：304.0。
實例2. (反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈
步驟1. {反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲醇
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.21g，0.98mmol)(實例1，步驟2)、(反-4-胺基環己基)甲醇(來自J&W Pharmatech，0.25g，2.0mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.51mL，2.9mmol)於異丙醇(3.3mL)中之混合物2小時。濃縮所得混合物且在矽膠上純化(用含0至60% EtOAc之己烷溶離)以得到所要產物(0.26g，86%)。C14H18N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=308.1；實驗值：308.0。
步驟2. 甲烷磺酸{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲酯
向{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲醇(0.26g，0.84mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.30mL，1.7mmol)於二氯甲烷(3mL)中之混合物中添加甲烷磺醯氯(0.085mL，1.1mmol)。在室溫下攪拌所 得混合物2小時。在用水稀釋之後，混合物用二氯甲烷萃取。濃縮有機層且在矽膠上純化(用含0至70% EtOAc之己烷溶離)以得到所要產物(0.2g，61%)。C15H20N3O5S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=386.1；實驗值：386.0。
步驟3. {反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈
在90℃下攪拌甲烷磺酸{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲酯(0.20g，0.52mmol)及氰化鈉(0.057g，1.2mmol)於二甲亞碸(2mL)中之混合物4小時。在用EtOAc稀釋之後，所得混合物用飽和NaHCO3溶液、水及鹽水洗滌，接著濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物。C15H17N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=317.1；實驗值：317.0。
步驟4. {反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈
在室溫下在H2氣球壓力下氫化{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(0.16g，0.50mmol)及10%鈀/碳(20mg)於甲醇(5mL)中之混合物2小時。過濾反應混合物且濃縮濾液以得到所要產物(0.124g，86%)，其直接用於下一步驟中。C15H19N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=287.1；實驗值：287.1。
步驟5. (反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈
在攪拌15分鐘之後，(2R)-2-羥基丙醯胺(0.12g，1.3mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.25g，1.3mmol)於四氫呋喃(2mL)中之混合物變成溶液。在又45分鐘之後，添加此溶液至{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(124mg，0.433mmol)於乙醇(3.4mL)中之混合物中且在回流下加熱所得混合物2小時。粗混合物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(65mg，44%)。C18H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.1。1H NMR(DMSO-d 6,400MHz)δ 8.98(1H,s),8.00(1H,d,J=5.2Hz),7.66(1H,d,J=5.2Hz),5.86(1H,d,J=6.4Hz),5.19(1H,m),4.92(1H,m),2.61(2H,d,J=6.0Hz),2.43(2H,m),2.01(5H,m),1.64(3H,d,J=6.4Hz),1.40(2H,m)ppm。
實例3. 反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己醇
步驟1. 反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己醇
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.47g，2.2mmol)(實例1，步驟2)、反-4-胺基環己醇(來自Aldrich，0.50g，4.4mmol)及N,N-二異丙基乙胺(1.1mL，6.6mmol)於異丙醇(7.4mL)中之混合物2小時。濃縮反應混合物且在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(0.266g，41%)。C13H16N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=294.1；實驗值：294.0。
步驟2. 反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己醇
在室溫下在H2氣球壓力下氫化反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己醇(50mg，0.2mmol)及10%鈀/碳(7mg)於甲醇(2mL)中之混合物2小時。過濾反應混合物。濃縮濾液以得到所要產物，其直接用於下一步驟中。C13H18N3OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=264.1；實 驗值：264.1。
步驟3. 反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己醇
在攪拌15分鐘之後，(2R)-2-羥基丙醯胺(96mg，1.1mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.20g，1.1mmol)於四氫呋喃(2mL)中之混合物變成溶液。在又45分鐘之後，添加此溶液至反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己醇(95mg，0.36mmol)於乙醇(2.9mL)中之混合物中且在回流下加熱2小時。所得混合物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(0.9mg，0.8%)。C16H20N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=318.1；實驗值：318.0。
實例4. (1R)-1-(1-{反-4-[(2,2,2-三氟乙基)胺基]環己基}-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇
步驟1. 反-N-(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)環己烷-1,4-二胺
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.21g，0.98mmol)(實例1，步驟2)、反-環己烷-1,4-二胺(來自Aldrich，0.13g，1.2mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.34mL，2.0mmol)於異丙醇(3.3mL)中之混合物2小時。移除所得混合物中之溶劑以得到所要產物，其直接用於下一步驟中。C13H17N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=293.1；實驗值：293.0。
步驟2. 反-N-(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N'-(2,2,2-三氟乙基)環己烷-1,4-二胺
向反-N-(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)環己烷-1,4-二胺(120mg，0.41mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.36mL，2.0mmol)於二氯甲烷(2mL)/N,N-二甲基甲醯胺(2mL)中之混合物中添加三氟甲烷磺酸2,2,2-三氟乙酯(0.18mL，1.2mmol)。在室溫下攪拌反應4小時。所得混合物用水稀釋， 用二氯甲烷萃取。濃縮有機層且在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(34mg，22%)。C15H18F3N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=375.1；實驗值：375.0。
步驟3. N7-{反-4-[(2,2,2-三氟乙基)胺基]環己基}噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺
在室溫下在H2氣球壓力下氫化反-N-(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N'-(2,2,2-三氟乙基)環己烷-1,4-二胺(34mg，0.091mmol)及10%鈀/碳(4mg)於甲醇(0.9mL)中之混合物2小時。過濾反應混合物且濃縮濾液以得到所要產物(27mg，86%)，其直接用於下一步驟中。C15H20F3N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=345.1；實驗值：345.0。
步驟4. (1R)-1-(1-{反-4-[(2,2,2-三氟乙基)胺基]環己基}-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇
在攪拌15分鐘之後，(2R)-2-羥基丙醯胺(21mg，0.24mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(45mg，0.24mmol)於四氫呋喃(0.3mL)中之混合物變成溶液。在又45分鐘之後，添加此溶液至N7-{反-4-[(2,2,2-三氟乙基)胺基]環己基}噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺(27mg，0.078mmol)於乙醇(0.62mL)中之混合物中且在回流下加熱2小時。所得混合物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(3.2mg，10%)。C18H22F3N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=399.1；實驗值：399.2。
實例5. (1R)-1-(1-{反-4-[2-(甲基磺醯基)乙基]環己基}-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇
步驟1. (反-4-甲醯基環己基)胺基甲酸第三丁酯
在0℃下向[反-4-(羥基甲基)環己基]胺基甲酸第三丁酯(來自Aldrich，0.61g，2.7mmol)於二氯甲烷(10mL)中之溶液中添加戴斯-馬丁高 碘烷(1.35g，3.19mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。反應用1N NaOH水溶液淬滅，用二氯甲烷萃取。合併之有機層用水及鹽水洗滌，經MgSO4乾燥，且濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(0.3g，50%)。C12H21NO3Na之LCMS計算值：(M+Na)+：m/z=250.2；實驗值：250.1。
步驟2. {反-4-[2-(甲基磺醯基)乙烯基]環己基｝胺基甲酸第三丁酯
在0℃下向1.0M第三丁醇鉀於四氫呋喃(THF)中之溶液(1.0mL，1.0mmol)中逐滴添加[(甲基磺醯基)甲基]膦酸二乙酯(0.21g，0.92mmol)且在0℃下攪拌所得混合物1小時。逐滴添加(反-4-甲醯基環己基)胺基甲酸第三丁酯(0.15g，0.66mmol)於四氫呋喃(4.6mL)中之溶液，接著移除冷卻浴且在室溫下攪拌混合物1小時。反應混合物用EtOAc稀釋，用水洗滌，濃縮且在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到呈E-異構物與Z-異構物之混合物形式之所要產物(0.14g，70%)。C14H25NO4SNa之LCMS計算值：(M+Na)+：m/z=326.2；實驗值：326.1。
步驟3. 反-4-(2-(甲基磺醯基)乙基)環己胺三氟乙酸鹽
在室溫下在H2氣球壓力下將{反-4-[2-(甲基磺醯基)乙烯基]環己基}胺基甲酸第三丁酯(140mg，0.46mmol)及10%鈀/碳(49mg)於甲醇(4mL)中之混合物氫化隔夜。過濾反應混合物且濃縮濾液以得到{反-4-[2-(甲基磺醯基)乙基]環己基}胺基甲酸第三丁酯。C9H20NO2S之LCMS計算值：(M-Boc+2H)+：m/z=206.1；實驗值：206.1。在室溫下用含三氟乙酸(0.2mL，3mmol)之二氯甲烷(0.5mL)處理Boc-中間物1小時。濃縮所得混合物以得到呈三氟乙酸(TFA)鹽形式之所要產物。C9H20NO2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=206.1；實驗值：206.1。
步驟4. N-{反-4-[2-(甲基磺醯基)乙基]環己基}-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.10g，0.46mmol)、反-4-[2-(甲基磺醯基)乙基]環己胺TFA鹽(0.12g，0.60mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.40mL，2.3mmol)於異丙醇(1.0mL)中之混合物2小時。濃縮反應混合物且在矽膠上純化(用含0至45% EtOAc之二氯甲烷溶離)以得 到所要產物。C16H22N3O4S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=384.1；實驗值：384.0。
步驟5. N7-{反-4-[2-(甲基磺醯基)乙基]環己基}噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺
在室溫下在H2氣球壓力下氫化N-{反-4-[2-(甲基磺醯基)乙基]環己基}-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(220mg，0.57mmol)及10%鈀/碳(60mg，0.06mmol)於甲醇(4mL)中之混合物2小時。過濾反應混合物且濃縮濾液以得到所要產物，其直接用於下一步驟中。C16H24N3O2S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=354.1；實驗值：354.0。
步驟6. (1R)-1-(1-{反-4-[2-(甲基磺醯基)乙基]環己基}-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇
在攪拌15分鐘之後，(2R)-2-羥基丙醯胺(52mg，0.59mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.11g，0.59mmol)於四氫呋喃(1mL)中之混合物變成溶液。在又45分鐘之後，添加此溶液至N7-{反-4-[2-(甲基磺醯基)乙基]環己基}噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺(83mg，0.23mmol)於乙醇(2mL)中之混合物中且在回流下加熱隔夜。所得混合物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.1mg，1.1%)。C19H26N3O3S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=408.1；實驗值：408.1。
實例6. (1R)-1-{1-[順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
步驟1. 反-甲烷磺酸4-[(第三丁氧基羰基)胺基]環己酯
向(反-4-羥基環己基)胺基甲酸第三丁酯(來自AstaTech，0.133g，0.618mmol)及三乙胺(0.12mL，0.86mmol)於二氯甲烷(1mL)中之 混合物中添加甲烷磺醯氯(0.057mL，0.74mmol)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。在用飽和NaHCO3水溶液稀釋之後，混合物用二氯甲烷萃取。合併之有機層用鹽水洗滌，經MgSO4乾燥且濃縮以得到所要產物(0.18g，99%)。
步驟2. 順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己胺三氟乙酸鹽
逐份添加氫化鈉(60%，0.034g，0.86mmol)至1H-1,2,4-三唑(0.064g，0.92mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(2mL)中之溶液中。在攪拌5分鐘之後，添加反-甲烷磺酸4-[(第三丁氧基羰基)胺基]環己酯(0.18g，0.61mmol)。在65℃下歷經週末攪拌所得混合物。將冷卻混合物傾入冰冷水中，用EtOAc萃取。濃縮有機層且在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之EtOAc溶離)以得到[順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己基]胺基甲酸第三丁酯(0.14g，86%)。C13H23N4O2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=267.2；實驗值：267.1。在室溫下用含三氟乙酸(0.28mL，3.7mmol)之二氯甲烷(1mL)處理此胺基甲酸酯中間物1小時且接著濃縮以得到呈TFA鹽形式之所要產物。C8H15N4之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=167.1；實驗值：167.2。
步驟3. 6-硝基-N-[順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.10g，0.46mmol)、順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己胺TFA鹽(0.10g，0.60mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.40mL，2.3mmol)於異丙醇(1.0mL)中之混合物2小時。濃縮所得混合物且在矽膠上純化(用含0至10% EtOAc之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(32mg，20%)。C15H17N6O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=345.1；實驗值：345.0。
步驟4. N7-[順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己基]噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺
在室溫下在H2氣球壓力下氫化6-硝基-N-[順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(32mg，0.093mmol)及10%鈀/碳(4mg)於甲醇(0.9mL)中之混合物2小時。過濾反應且濃縮所得濾液以得到所要產物，其直接用於下一步驟中。C15H19N6S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=315.1；實驗值：315.1。
步驟5. (1R)-1-{1-[順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
在攪拌15分鐘之後，(2R)-2-羥基丙醯胺(28mg，0.32mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(60mg，0.32mmol)於四氫呋喃(0.4mL)中之混合物變成溶液。在又45分鐘之後，添加此溶液至N7-[順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己基]噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺(25mg，0.080mmol)於乙醇(0.8mL)中之混合物中且在回流下加熱隔夜。所得混合物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.7mg，5.8%)。C18H21N6OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=369.1；實驗值：369.1。
實例7. 順-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己烷甲腈
步驟1. 反-甲烷磺酸4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己酯
向反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己醇(0.21g，0.72mmol)(實例3，步驟1)及N,N-二異丙基乙胺(0.25mL，1.4mmol)於二氯甲烷(2mL)中之混合物中添加甲烷磺醯氯(0.083mL，1.1mmol)。在室溫下攪拌反應2小時。在用飽和NaHCO3水溶液稀釋之後，所得混合物用二氯甲烷萃取。濃縮有機層且在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(0.24g，90%)。C14H18N3O5S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=372.1；實驗值：372.0。
步驟2. 順-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己烷甲腈
在90℃下攪拌反-甲烷磺酸4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己酯(0.12g，0.32mmol)及氰化鈉(0.061g，1.2mmol)於二甲亞碸(1mL)中之混合物6小時。在用EtOAc稀釋之後，所得混合物用飽和 NaHCO3溶液、水及鹽水洗滌，且接著濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(32mg)。C14H15N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=303.1；實驗值：303.0。
步驟3. 順-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己烷甲腈
在室溫下在H2氣球壓力下氫化順-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己烷甲腈(32mg，0.10mmol)及10%鈀/碳(4mg)於甲醇(1mL)中之混合物4小時。過濾混合物且濃縮濾液以得到所要產物，其直接用於下一步驟中。C14H17N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=273.1；實驗值：273.1。
步驟4. 順-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己烷甲腈
在攪拌15分鐘之後，(2R)-2-羥基丙醯胺(40mg，0.4mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(89mg，0.47mmol)於四氫呋喃(0.4mL)中之混合物變成溶液。在又45分鐘之後，添加此溶液至順-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己烷甲腈(32mg，0.12mmol)於乙醇(0.74mL)中之混合物中且在回流下加熱隔夜。所得混合物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.1mg，2.9%)。C17H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=327.1；實驗值：327.0。
實例8. 3-(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)丙腈
步驟1. {反-4-[2-氰基乙烯基]環己基}胺基甲酸第三丁酯
在0℃下向1.0M第三丁醇鉀於THF中之溶液(1.0mL，1.0mmol)中添加氰基甲基膦酸二乙酯(0.15mL，0.92mmol)且在0℃下攪拌所得混合物1小時。逐滴添加(反-4-甲醯基環己基)胺基甲酸第三丁酯(0.15g，0.66 mmol)(實例5，步驟1)於四氫呋喃(4.6mL)中之溶液，接著移除冷卻浴且在室溫下攪拌反應混合物1小時。反應用EtOAc稀釋，用水洗滌。濃縮有機層且在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到呈E-異構物與Z-異構物之混合物形式之所要產物(0.14g，70%)。C14H22N2O2Na之LCMS計算值：(M+Na)+：m/z=273.2；實驗值：273.0。
步驟2. 3-(反-4-胺基環己基)丙腈三氟乙酸鹽
在H2氣球壓力下歷經週末氫化{反-4-[2-氰基乙烯基]環己基}胺基甲酸第三丁酯(0.13g，0.52mmol)及10%鈀/碳(52mg)於乙醇(2mL)中之混合物。過濾混合物，且濃縮濾液以得到[反-4-(2-氰基乙基)環己基]胺基甲酸第三丁酯。C10H17N2O2之LCMS計算值：(M-tBu+H)+：m/z=197.1；實驗值：197.1。在室溫下用含三氟乙酸(0.4mL，5mmol)之二氯甲烷(1mL)處理此胺基甲酸酯中間物1小時，且接著移除溶劑以得到呈TFA鹽形式之所要產物。C9H17N2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=153.1；實驗值：153.2。
步驟3. 3-{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}丙腈
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.087g，0.41mmol)、3-(反-4-胺基環己基)丙腈(0.080g，0.52mmol)TFA鹽及N,N-二異丙基乙胺(0.35mL，2.0mmol)於異丙醇(0.89mL)中之混合物2小時。濃縮所得混合物且在矽膠上純化(用含0至20% EtOAc之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(63mg，47%)。C16H19N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=331.1；實驗值：331.0。
步驟4. 3-{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}丙腈
在室溫下在H2氣球壓力下氫化3-{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}丙腈(63mg，0.19mmol)及10%鈀/碳(20mg)於甲醇(1mL)中之混合物2小時。過濾反應混合物且濃縮濾液以得到所要產物(48mg，84%)，其直接用於下一步驟中。C16H21N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=301.1；實驗值：301.1。
步驟5. 3-(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)丙腈
向3-{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}丙 腈(0.048g，0.16mmol)及(R)-2-羥基丙酸(0.019g，0.21mmol)於二氯甲烷(0.96mL)中之混合物中添加N,N-二異丙基乙胺(60μL，0.35mmol)及六氟磷酸N,N,N',N'-四甲基-O-(7-氮雜苯并三唑-1-基)(66mg，0.17mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。混合物用水洗滌。濃縮有機層且在矽膠上純化(用含0至10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到(2R)-N-(7-{[反-4-(2-氰基乙基)環己基]胺基}噻吩并[3,2-b]吡啶-6-基)-2-羥基丙醯胺。C19H25N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=373.2；實驗值：373.0。在105℃下攪拌醯胺中間物於乙酸中之溶液(0.3mL)5小時。在真空中移除反應混合物中之溶劑，用MeOH稀釋且在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(6mg，10%)。C19H23N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=355.2；實驗值：355.1。
實例9. (1R)-1-[1-(3-氟哌啶-4-基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]乙醇
步驟1. 3-羥基-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.61g，2.8mmol)(實例1，步驟2)、4-胺基-3-羥基哌啶-1-甲酸第三丁酯(來自Aurora，0.95g，4.4mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.99mL，5.7mmol)於異丙醇(7.4mL)中之混合物2小時。所得混合物用水稀釋。藉由過濾收集沈澱，用水洗滌且風乾以得到所要產物(1g，89%)。C17H23N4O5S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=395.1；實驗值：395.0。
步驟2. 3-氟-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯
向在0℃下冷卻的3-羥基-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基) 胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯(716mg，1.82mmol)於二氯甲烷(4mL)中之溶液中緩慢添加2-甲氧基-N-(2-甲氧基乙基)-N-(三氟-λ(4)-磺醯基)乙胺(0.50mL，2.7mmol)。在室溫下攪拌反應4小時。混合物用二氯甲烷稀釋，用水洗滌，且濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含0至30% EtOAc之二氯甲烷溶離)以得到呈順式異構物與反式異構物之混合物形式之所要產物(0.32g，44%)。C17H22FN4O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=397.1；實驗值：397.1。
步驟3. 4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-3-氟哌啶-1-甲酸第三丁酯
在室溫下在H2氣球壓力下氫化3-氟-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯(0.32g，0.81mmol)及10%鈀/碳(80mg)於甲醇(8mL)中之混合物5小時。過濾反應混合物，且濃縮濾液以得到呈順式異構物與反式異構物之混合物形式之所要產物(0.23g，78%)。C17H24FN4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=367.2；實驗值：367.1。
步驟4. (1R)-1-[1-(3-氟哌啶-4-基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]乙醇
向4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-3-氟哌啶-1-甲酸第三丁酯(0.21g，0.57mmol)及(R)-2-羥基丙酸(0.059g，0.65mmol)於二氯甲烷(5mL)中之混合物中添加N,N-二異丙基乙胺(0.23mL，1.3mmol)及六氟磷酸N,N,N',N'-四甲基-O-(7-氮雜苯并三唑-1-基)(0.23g，0.60mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。反應混合物用水洗滌，濃縮且在矽膠上純化(用含0至10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到3-氟-4-[(6-{[(2R)-2-羥基丙醯基]胺基}噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯(0.155g，62%)。C20H28FN4O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=439.2；實驗值：439.1。在回流下加熱醯胺中間物於乙酸中之溶液(1mL)2小時。所得混合物在矽膠上純化(用含0-10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到3-氟-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-甲酸第三丁酯(16mg，10%)。C20H26FN4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=421.2；實驗值：421.1。在室溫下用含三氟乙酸(0.1mL，1mmol)之二氯甲烷(0.2mL)處理經Boc保護之中間物1小時。濃縮混合物且在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/ 含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到兩種所要產物。第一峰滯留時間0.253分鐘。C15H18FN4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=321.1；實驗值：321.1。第二峰滯留時間0.514分鐘。C15H18FN4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=321.1；實驗值：321.1。
實例10. (反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈HCl鹽
步驟1. 甲烷磺酸{反-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]環己基}甲酯
[反-4-(羥基甲基)環己基]胺基甲酸第三丁酯(來自Albany Molecular，1.5g，6.5mmol)於二氯甲烷(20mL)中之混合物用吡啶(2.14mL，26.5mmol)處理。冷卻混合物至0℃且歷經5分鐘逐滴添加甲烷磺醯氯(1.01mL，13.1mmol)。在室溫下攪拌反應5小時。接著濃縮所得混合物且分配於EtOAc與水之間。濃縮有機相且在矽膠上純化(用含50% EtOAc之己烷溶離)以得到所要產物(1.48g，74%)。C13H25NO5SNa之LCMS計算值：(M+Na)+：m/z=330.2；實驗值：330.0。
步驟2. (反-4-胺基環已基)乙腈三氟乙酸鹽
在90℃下攪拌甲烷磺酸{反-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]環己基}甲酯(1.48g，4.81mmol)及氰化鈉(0.46g，9.4mmol)於二甲亞碸(20mL)中之混合物4小時。在冷卻之後，將混合物分配於EtOAc與鹽水之間。有機層用水洗滌，濃縮且在矽膠上純化(用含50% EtOAc之己烷溶離)以得到[反-4-(氰基甲基)環己基]胺基甲酸第三丁酯。C13H22N2O2Na之LCMS計算值：(M+Na)+：m/z=261.2；實驗值：261.1。經Boc保護之中間物於二氯甲烷中之溶液(20mL)用三氟乙酸(3mL，40mmol)處理且在室溫下攪拌所得混合物2小時，接著濃縮以得到呈TFA鹽形式之所要產物。C8H15N2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=139.1；實驗值：139.1。
步驟3. {反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈
向7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.88g，4.1mmol)於異丙醇(14mL)中之攪拌懸浮液中添加(反-4-胺基環己基)乙腈TFA鹽(0.68g，4.9mmol)及N,N-二異丙基乙胺(3.0mL，17mmol)。在90℃下攪拌反應2小時。濃縮混合物且在矽膠上純化(用含0至60% EtOAc之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(1g，77%)。C15H17N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=317.1；實驗值：317.0。
步驟4. {反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈
在室溫下在H2氣球壓力下氫化{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(1.0g，3.2mmol)及10%鈀/碳(0.3g，0.3mmol)於甲醇(30mL)中之混合物5小時。過濾反應混合物。濃縮濾液，用二氯甲烷稀釋，經MgSO4乾燥，且濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含0至5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物。(0.63g，70%)。C15H19N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=287.1；實驗值：287.1。
步驟5. (反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(0.630g，7.07mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(1.26g，6.66mmol)於四氫呋喃(9.7mL)中之混合物2小時。移除溶劑，且將殘餘物溶解於乙醇(4.1mL)中並添加至{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(0.63g，2.2mmol)於乙醇(15mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌反應2小時。移除溶劑且將殘餘物分配於EtOAc與飽和NaHCO3溶液之間。有機相用鹽水洗滌，經MgSO4乾燥，且濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含0至10% MeOH之二氯甲烷溶離)，接著進一步在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(0.55g，73%)。C18H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.1。
步驟6. (反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并{3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈HCl鹽
將(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈(0.154g，0.451mmol)溶解於乙腈(10mL)中。在攪拌 下緩慢添加含1.0M氯化氫之水(0.480mL，0.480mmol)，隨後添加水(10mL)。在室溫下攪拌混合物直至變為均質。凍乾所得溶液以得到呈HCl鹽形式之所要產物。(0.169g，99.5%)。C18H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.1。1H NMR(DMSO-d 6,500MHz)δ 9.55(1H,s),8.47(1H,d,J=5.5Hz),8.00(1H,d,J=5.5Hz),5.32(1H,m),5.07(1H,m),2.62(2H,d,J=6.0Hz),2.43(2H,m),2.12(2H,m),2.04(3H,m),1.68(3H,d,J=6.0Hz),1.46(2H,m)ppm。
實例11. (1R)-1-{1-[反-4-(羥甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
步驟1. {反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲醇
在室溫下在H2氣球壓力下氫化{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲醇(0.080g，0.26mmol)(實例2，步驟1)及10%鈀/碳(0.03g)於甲醇(3mL)中之混合物1小時。過濾混合物。濃縮濾液，用二氯甲烷稀釋，接著經MgSO4乾燥，且濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(41mg，57%)。C14H20N3OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=278.1；實驗值：278.1。
步驟2. (1R)-1-{1-[反-4-(羥甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(42mg，0.48mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(85mg，0.45mmol)於四氫呋喃(0.65mL)中之混合物2小時。移除溶劑，且將殘餘物溶解於乙醇(0.27mL)中並添加至{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲醇(41mg，0.15mmol)於乙醇(0.99mL)中之懸浮液中。在85℃下攪拌所得混合物1小時。移除溶劑且殘餘物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(2.3mg，4.7%)。 C17H22N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=332.1；實驗值：332.1。
實例12. (1R)-1-{1-[反-4-(氟甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
步驟1. N-[反-4-(氟甲基)環己基]-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺
向在0℃下冷卻的{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲醇(0.30g，0.98mmol)於二氯甲烷(2mL)中之溶液中緩慢添加2-甲氧基-N-(2-甲氧基乙基)-N-(三氟-λ(4)-磺醯基)乙胺(0.27mL，1.5mmol)。在室溫下攪拌所得混合物4小時。混合物用二氯甲烷稀釋，用水洗滌，且濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含0-30% EtOAc之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(0.2g，70%)。C14H17FN3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=310.1；實驗值：310.0。
步驟2. N7-[反-4-(氟甲基)環己基]噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺
過濾混合物。在室溫下在H2氣球壓力下氫化N-[反-4-(氟甲基)環己基]-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(0.20g，0.65mmol)及10%鈀/碳(0.07g)於甲醇(7mL)中之混合物1小時。濃縮濾液，用二氯甲烷稀釋，且接著經MgSO4乾燥且濃縮以得到所要產物(0.11g，61%)。C14H19FN3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=280.1；實驗值：280.1。
步驟3. (1R)-1-{1-[反-4-(氟甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(0.184g，2.07mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.371g，1.95mmol)於四氫呋喃(2.8mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(1.2mL)中並添加至N7-[反-4-(氟甲基)環己基]噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺(0.18g，0.64mmol)於乙醇(4.3mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌所得混合物1小時。移除溶劑且殘餘物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速 30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(0.10g，50%)。C17H21FN3OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=334.1；實驗值：334.1
實例13. (1R)-1-(1-環己基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇
步驟1. N-環己基-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.055g，0.26mmol)(實例1，步驟2)、環己胺(59μL，0.51mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.13mL，0.77mmol)於異丙醇(0.87mL)中之混合物2小時。濃縮所得混合物以得到所要產物，其直接用於下一步驟中。C13H16N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=278.1；實驗值：278.0。
步驟2. N7-環己基噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺
在室溫下在H2氣球壓力下氫化N-環己基-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(0.065g，0.23mmol)及10%鈀/碳(0.02g)於甲醇(3mL)中之混合物1小時。過濾反應混合物。濃縮濾液，用二氯甲烷稀釋，經MgSO4乾燥，且濃縮。殘餘物在矽膠上純化(用含0至10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(42mg，72%)。C13H18N3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=248.1；實驗值：248.1。
步驟3. (1R)-1-(1-環己基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(49mg，0.55mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(98mg，0.51mmol)於四氫呋喃(0.75mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.32mL)中並添加至N7-環己基噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺(42mg，0.17mmol)於乙醇(1.1mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌反應混合物1小時。移除溶劑，且殘餘物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1mg，2%)。C16H20N3OS之LCMS計算值：(M+H)+： m/z=302.1；實驗值：302.1。
實例14. 1-(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)-N-甲基甲烷磺醯胺
步驟1. 4-甲基苯磺酸{反-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]環己基}甲酯
向[反-4-(羥基甲基)環己基]胺基甲酸第三丁酯(0.50g，2.2mmol)(供應商：Chem-Impex)於二氯甲烷(15mL)中之溶液中添加三乙胺(1.29mL，9.27mmol)、4-二甲基胺基吡啶(53mg，0.44mmol)及對甲苯磺醯氯(0.89g，4.7mmol)。在室溫下攪拌所得混合物2小時，隨後再添加對甲苯磺醯氯(0.42g，2.2mmol)。將混合物攪拌隔夜。添加水及二氯甲烷且分離各層。水層用二氯甲烷萃取。合併之有機物用水及鹽水洗滌，乾燥(MgSO4)，過濾，且濃縮。殘餘物在Biotage Isolera上純化(40g Agela濾筒，歷經15分鐘用5-50% EtOAc/己烷溶離)以得到呈白色結晶固體狀之所要產物(0.72g，86%)。C19H29NO5SNa之LCMS計算值：(M+Na)+：m/z=406.2；實驗值：406.0。
步驟2. S-({反-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]環己基}甲基)硫代乙酸酯
向4-甲基苯磺酸{反-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]環己基}甲酯(0.72g，1.9mmol)於二甲亞碸(6.0mL)中之混合物中添加硫乙酸鉀(0.242g，2.12mmol)於二甲亞碸(1.0mL)中之溶液。在55℃下攪拌所得混合物3小時。在冷卻之後，反應藉由添加飽和NaHCO3加以淬滅。在短暫攪拌之後，過濾形成之固體且用水洗滌以得到0.52g(96%)所要產物。C9H18NOS之LCMS計算值：(M+H-Boc+H)+：m/z=188.1；實驗值：188.2。
步驟3. S-[(反-4-胺基環己基)甲基]硫代乙酸酯三氟乙酸鹽
在室溫下用三氟乙酸(0.54mL，7.0mmol)處理S-({反-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]環己基}甲基)硫代乙酸酯(0.20g，0.70mmol)於二氯甲烷(1.6mL)中之混合物2小時。蒸發反應混合物至乾燥以得到所要產物(0.21 g，100%)。C9H18NOS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=188.1；實驗值：188.1。
步驟4. S-({反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲基)硫代乙酸酯
在減壓下濃縮混合物。在90℃下加熱S-[(反-4-胺基環己基)甲基]硫代乙酸酯三氟乙酸鹽(0.21g，0.70mmol)、7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.11g，0.51mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.27mL，1.5mmol)於異丙醇(1.6mL)中之混合物2小時。殘餘物用水處理以形成固體，其藉由過濾收集且用水洗滌以得到所要產物(0.12g，64%)。C16H20N3O3S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=366.1；實驗值：366.1。1H NMR(DMSO-d 6,400MHz)δ 9.07(1H,s),9.03(1H,d,J=8.8Hz),8.35(1H,d,J=5.6Hz),7.51(1H,d,J=5.6Hz),4.13(1H,m),2.83(2H,d,J=6.4Hz),2.34(3H,s),2.13(2H,m),1.83(2H,m),1.51(3H,m),1.19(2H,m)ppm。
步驟5. {反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲烷磺酸
添加過氧化氫(30%，110μL，1.1mmol)之混合物至甲酸(0.43mL)中，且攪拌所得混合物30分鐘，隨後添加S-({反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲基)硫代乙酸酯(67mg，0.18mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。反應用少量0.3M偏亞硫酸氫鈉溶液淬滅。藉由添加50% NaOH調整混合物之pH值至約5，此導致固體析出。過濾固體且用乙醚洗滌以得到所要產物(68mg)，其不經進一步純化即直接用於下一步驟中。C14H18N3O5S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=372.1；實驗值：372.1。
步驟6. N-甲基-1-{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲烷磺醯胺
向{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲烷磺酸(34mg，0.092mmol)於二氯甲烷(0.30mL)中之混合物中添加1滴DMF及亞硫醯氯(33μL，0.46mmol)。在42℃下攪拌所得混合物1小時，接著蒸發溶劑以得到粗{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲烷磺醯氯。向以上製得之粗磺醯氯中添加含2.0M甲胺之THF(0.30mL，0.60mmol)。在室溫下攪拌混合物30小時。LCMS顯示剩餘少量起始物質。再添加含2.0M甲胺之THF(0.15mL)且攪拌30分鐘以達成完全反應。蒸發溶 劑且在真空中乾燥所得殘餘物以得到粗產物，其不經進一步純化即用於下一步驟中。C15H21N4O4S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=385.1；實驗值：385.1。
步驟7. 1-{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}-N-甲基甲烷磺醯胺
在H2氛圍下攪拌N-甲基-1-{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲烷磺醯胺(35mg，0.091mmol)及10%鈀/碳(10mg)於甲醇(1.0mL)中之混合物10小時。混合物經矽藻土過濾。在減壓下濃縮濾液以得到所要產物(32mg)。C15H23N4O2S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=355.1；實驗值：355.1。
步驟8. 1-(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)-N-甲基甲烷磺醯胺
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(25.8mg，0.290mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(51.9mg，0.273mmol)於四氫呋喃(0.40mL)中之混合物1小時。在減壓下蒸發至乾燥之後，混合澄清油狀物與乙醇(0.20mL，3.4mmol)且添加至於微波小瓶中的1-{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}-N-甲基甲烷磺醯胺(32mg，0.090mmol)於乙醇(0.60mL)中之溶液中。接著在80℃下加熱混合物1小時。在減壓下濃縮混合物。使用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化所得殘餘物以得到所要產物(9.8mg，26%)。C18H25N4O3S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=409.1；實驗值：409.1。
實例15. (1R)-1-{1-[1-(2,2,2-三氟乙基)哌啶-4-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
步驟1. 4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.48g，2.2 mmol)(實例1，步驟2)、4-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯(來自Aldrich，0.67g，3.4mmol)及N,N-二異丙基乙胺(1.2mL，6.7mmol)於異丙醇(7.6rmL)中之混合物2小時。沈澱用異丙醇洗滌以得到所要產物(0.70 83%)。C17H23N4O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=379.1；實驗值：379.2。
步驟2. 4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯
在室溫下使4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯(0.70g，1.8mmol)及10%鈀/碳(0.2g)於甲醇(20mL)中之混合物經受H2氣球壓力5小時。過濾且濃縮反應混合物以得到所要產物(0.64g，100%)。C17H25N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=349.2；實驗值：349.1。
步驟3. 4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-甲酸第三丁酯
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(0.468g，5.26mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.941g，4.95mmol)於四氫呋喃(7.2mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(3.0mL)中並添加至4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯(0.57g，1.6mmol)於乙醇(11mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌混合物1小時。移除溶劑且殘餘物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(85mg，13%)。C20H27N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=403.2；實驗值：403.2。
步驟4. (1R)-1-(1-哌啶-4-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇鹽酸鹽
向4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-甲酸第三丁酯(71mg，0.18mmol)於二氯甲烷(1.2mL)中之溶液中添加含4.0M氯化氫之二噁烷(0.35mL，1.4mmol)。在室溫下攪拌反應溶液6小時。移除溶劑以得到呈白色固體狀之所要產物(60mg，100%)。C15H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=303.1；實驗值：303.1。
步驟5. (1R)-1-{1-[1-(2,2,2-三氟乙基)哌啶-4-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
向(1R)-1-(1-哌啶-4-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶 -2-基)乙醇鹽酸鹽(21.6mg，0.0637mmol)及三乙胺(40.0μL，0.287mmol)於二氯甲烷(0.78mL)中之混合物中添加三氟甲烷磺酸2,2,2-三氟乙酯(17.8mg，0.0765mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。蒸發溶劑，且粗殘餘物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到6.5mg(26%)所要產物。C17H20F3N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=385.1；實驗值：385.0。
實例16. 3-(4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)丙腈
向(1R)-1-(1-哌啶-4-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇鹽酸鹽(21.7mg，0.0640mmol)(實例15，步驟4)於乙腈(0.40mL)中之溶液中依次添加2-丙烯腈(8.4μL，0.13mmol)及1,8-二氮雜雙環[5.4.0]十一-7-烯(38μL，0.26mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。在蒸發至乾燥之後，殘餘物在RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(11mg，48%)。C18H22N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=356.2；實驗值：356.0。
實例17. {反-4-[2-(羥甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}乙腈
在120℃下攪拌{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(51.9mg，0.181mmol)(實例2，步驟4)及2-氯-1,1,1-三乙氧基乙烷(來自Aldrich，0.105mL，0.549mmol)於乙酸(0.5mL)中之混合物30分 鐘。移除溶劑且將所得殘餘物溶解於二氯甲烷中並在矽膠上純化(用含0-5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到22mg(35.5%){反-4-[2-(氯甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}乙腈。C17H18ClN4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=345.1；實驗值：345.0。亦溶離8mg(12%)乙酸{1-[反-4-(氰基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}甲酯，C19H21N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=369.1；實驗值：369.0。乙酸酯化合物用氫氧化鋰處理以在HPLC純化(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)之後得到所要產物化合物。C17H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=327.1；實驗值：327.1。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6)δ 8.96(s,1H),8.01(d,J=5.5Hz,1H),7.67(d,J=5.5Hz,1H),5.80(t,J=5.6Hz,1H),4.85(d,J=5.3Hz,2H),4.74(m,1H),2.61(d,J=6.1Hz,2H),2.42(m,2H),2.09-1.99(m,5H),1.41(m,2H)ppm。
實例18. N-({1-[反-4-(氰甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}甲基)甲烷磺醯胺
步驟1. (甲基磺醯基)胺基甲酸第三丁酯
在室溫下依序添加三乙胺(2.2mL，16mmol)、二碳酸二-第三丁酯(2.65g，12.1mmol)及4-二甲基胺基吡啶(0.096g，0.79mmol)至甲烷磺醯胺(0.75g，7.9mmol)於二氯甲烷(20mL)中之溶液中。在室溫下攪拌反應2小時且接著濃縮。添加EtOAc，且所得混合物用1N HCl水溶液洗滌，經MgSO4乾燥且濃縮以得到欲直接用於下一步驟中之所要產物(1g)。
步驟2. N-({1-[反-4-(氰甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}甲基)甲烷磺醯胺
向{反-4-[2-(氯甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}乙腈(來自實例17，22.2mg，0.0644mmol)溶解於N,N-二甲基甲醯胺(0.2mL)中之溶液中添加(甲基磺醯基)胺基甲酸第三丁酯(19mg，0.096 mmol)及碳酸鉀(18mg，0.13mmol)。將反應在50℃下攪拌隔夜。混合物用水稀釋，用EtOAc萃取。合併之有機層經MgSO4乾燥且濃縮以得到({1-[反-4-(氰基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}甲基)(甲基磺醯基)胺基甲酸第三丁酯。C23H30N5O4S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=504.2；實驗值：504.1。在室溫下用含三氟乙酸(0.1mL，1mmol)之二氯甲烷(0.1mL)處理此粗中間物30分鐘，且接著在真空中移除溶劑。接著將殘餘物溶解於MeOH中且在製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(9.5mg，36%)。C18H22N5O2S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=404.1；實驗值：404.0。
實例19. (1R)-1-{1-[(3S)-6-(羥甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
步驟1. (4S)-2,2-二甲基-4-乙烯基-1,3-噁唑啶-3-甲酸第三丁酯
向甲基三苯基溴化鏻(5.63g，15.8mmol)於四氫呋喃(140mL)中之懸浮液中添加含2.5M正丁基鋰之己烷(7.35mL，18.4mmol)。在0℃下攪拌深紅色溶液1小時。接著在0℃下逐滴添加(4R)-4-甲醯基-2,2-二甲基-1,3-噁唑啶-3-甲酸第三丁酯(來自Aldrich，3.01g，13.1mmol)於四氫呋喃(7.3mL)中之溶液。使紅色溶液升溫至室溫且攪拌12小時。以4：1(v/v)比率添加己烷至反應混合物中。懸浮液經矽藻土過濾且濃縮濾液。所得殘餘物藉由急驟層析純化(用含10%乙酸乙酯之己烷溶離)以得到呈無色油狀之所要化合物(1.92g，64%)。
步驟2. [(1S)-1-(羥基甲基)丙-2-烯-1-基]胺基甲酸第三丁酯
在0℃下向(4S)-2,2-二甲基-4-乙烯基-1,3-噁唑啶-3-甲酸第三丁酯(1.90g，8.36mmol)於甲醇(83mL)中之溶液中添加對甲苯磺酸單水合物(0.80g，4.2mmol)。使混合物緩慢升溫至室溫隔夜。反應混合物用飽和 NaHCO3溶液稀釋，濃縮，且接著用乙酸乙酯稀釋。有機層用飽和NaHCO3(2×)及鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，過濾且濃縮以得到呈無色油狀之所要產物(1.187g，76%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 5.81(1H,m),5.25(2H,m),4.90(1H,m),4.25(1H,br s),3.67(2H,m),1.45(9H,s)ppm。
步驟3. [(1S)-1-({[1-(羥基甲基)丙-2-烯-1-基]氧基}甲基)丙-2-烯-1-基]胺基甲酸第三丁酯
向燒瓶中裝以[(1S)-1-(羥基甲基)丙-2-烯-1-基]胺基甲酸第三丁酯(0.401g，2.14mmol)、參(二苯亞甲基丙酮)二鈀(0)(59mg，0.064mmol)、N,N'-(1S,2S)-環己烷-1,2-二基雙[2-(二苯基膦基)-1-萘甲醯胺](150mg，0.19mmol)及4-二甲基胺基吡啶(78mg，0.64mmol)。反應混合物用N2淨化三次，且接著依序添加二氯甲烷(21.3mL)、及含1.0M三乙基硼烷之THF(130μL，0.13mmol)。在攪拌10分鐘之後，添加2-乙烯基環氧乙烷(0.150g，2.14mmol)且將所得混合物攪拌隔夜。反應用二氯甲烷及飽和NaHCO3溶液稀釋。分離有機層且經Na2SO4乾燥，過濾且濃縮。粗殘餘物用急驟層析純化(用0-50%乙酸乙酯/己烷溶離)以得到所要產物(0.271g，49%)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 5.85(1H,m),5.67(1H,m),5.84~5.17(4H,m),4.83(1H,m),4.30(1H,br s),3.83(1H,m),3.69(1H,dd,J=4.5及6.9Hz),3.54(2H,m),3.36(1H,dd,J=4.5及6.9Hz),1.45(9H,s)ppm。
步驟4. 乙酸2-({(2S)-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]丁-3-烯-1-基}氧基)丁-3-烯-1-基酯
向[(1S)-1-({[1-(羥基甲基)丙-2-烯-1-基]氧基}甲基)丙-2-烯-1-基]胺基甲酸第三丁酯(268mg，1.04mmol)於二氯甲烷(10mL)中之混合物中添加以三乙胺(435μL，3.12mmol)。冷卻混合物至0℃，且逐滴添加乙醯氯(150μL，2.1mmol)。在室溫下攪拌反應2小時，接著用水淬滅。濃縮有機層且所得殘餘物在矽膠上純化(用20%乙酸乙酯/己烷溶離)以得到所要產物(0.26g，85%)。C10H18NO3之LCMS計算值：(M-100+H)+：m/z=200.1；實驗值：200.1。
步驟5. 乙酸{(5S)-5-[(第三丁氧基羰基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯
向500mL 2頸圓底燒瓶中添加苯亞甲基(二氯)(1,3-二草米基咪唑啶-2-亞-2-基)(三環己基正膦基)釕(38mg，0.044mmol)。在用氮氣淨化3次之後，依次添加二氯甲烷(無水，8mL)及乙酸2-({(2S)-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]丁-3-烯-1-基}氧基)丁-3-烯-1-基酯(265mg，0.885mmol)。在室溫下攪拌反應混合物15小時。在真空中濃縮混合物。殘餘物經由急驟層析純化(用己烷至含25% EtOAc之己烷溶離)以得到呈棕色油狀之所要產物(0.205g，85%)。C9H14NO5之LCMS計算值：(M+H-Bu+H)+：m/z=216.1；實驗值：216.1。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 5.94(0.17H,m),5.84(0.83H,m),5.69(1H,m),4.89(0.13H,m),4.70(0.83H,m),4.25(1H,m),4.05(4H,m),3.56(0.13H,m),3.38(0.87H,m),2.04(2.49H,s),2.03(0.51H,m),1.38(9H,s)ppm(產物為反式異構物與順式異構物之約5：1混合物)。
步驟6. 乙酸[(5S)-5-胺基-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基]甲酯
向乙酸{(5S)-5-[(第三丁氧基羰基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯(205mg，0.756mmol)於二氯甲烷(5.2mL)中之溶液中添加含4.0M氯化氫之二噁烷(1.5mL，6.0mmol)。在室溫下攪拌反應溶液6小時。在減壓下移除溶劑以得到呈白色固體狀之所要產物。C8H14NO3之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=172.1；實驗值：172.1。
步驟7. 乙酸{(5S)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯
在90℃下加熱乙酸7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(156mg，0.727mmol)、[(5S)-5-胺基-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基]甲酯(129mg，0.754mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.26mL，1.5mmol)於異丙醇(1.7mL)中之混合物2小時。濃縮反應混合物且用急驟層析純化以得到所要產物(0.21g 83%)。C15H16N3O5S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=350.1；實驗值：350.0。
步驟8. 乙酸{(5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲酯
在室溫下使乙酸{(5S)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯(210mg，0.600mmol)及10%鈀/碳(0.21g)於甲醇(4.0mL)中之混合物經受H2氣球壓力2小時。過濾混合物，且濃縮 濾液並用急驟層析純化(用含15%甲醇之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(145mg，75%)。C15H20N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=322.1；實驗值：322.0。
步驟9. (1R)-1-{1-[(3S)-6-(羥甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(131mg，1.47mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(263mg，1.38mmol)於THF(2mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.85mL)中並添加至乙酸{(5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲酯(145mg，0.451mmol)於乙醇(3.1mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌混合物1小時。冷卻反應至室溫且用水(1.0mL)稀釋，添加氫氧化鋰(32.4mg，1.35mmol)，且攪拌混合物2小時。反應混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈白色固體狀之所要產物(95mg，63%)。C16H20N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=334.1；實驗值：334.0。
實例20. ((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈
步驟1：4-甲基苯磺酸((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯及4-甲基苯磺酸((2S,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯
在0℃下向(1R)-1-{1-[(3S)-6-(羥基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇(100mg，0.300mmol)(實例19，步驟9)於二氯甲烷(3.4mL)及吡啶(0.146mL，1.80mmol)中之溶液中添加對甲苯磺醯氯(57.2mg，0.300mmol)及4-二甲基胺基吡啶(1.8mg，0.015 mmol)。使反應混合物升溫至室溫隔夜。濃縮反應混合物，用甲醇稀釋，且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到兩個峰。在分析型HPLC(Waters SunFire C18，2.1×50mm，5μM；流速3毫升/分鐘；注射體積2μL；在3分鐘內自2%至80% B之梯度下(A=含0.025% TFA之水，B=乙腈))上：第一峰(45.3mg，31%)滯留時間1.81分鐘，C23H26N3O5S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=488.1；實驗值：488.1。第二峰(8.5mg，5.8%)滯留時間1.88分鐘，C23H26N3O5S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=488.1；實驗值：488.1。
步驟2. ((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈
在50℃下攪拌4-甲基苯磺酸((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯(來自先前步驟之第1峰，27mg，0.055mmol)及氰化鈉(4.5mg，0.092mmol)於二甲亞碸(0.4mL)中之混合物4小時。在冷卻之後，混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(14.5mg，76%)。C17H19N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=343.1；實驗值：343.0。1H NMR(DMSO-d 6,500MHz)δ 9.51(1H,s),8.45(1H,d,J=5.5Hz),7.97(1H,d,J=5..5Hz),5.31(1H,m),5.20(1H,m),4.31(1H,m),4.23(1H,m),4.02(1H,m),2.96(1H,dd,J=17.0及4.5Hz),2.85(1H,dd,J=17.0及4.5Hz),2.66(1H,m),2.26(1H,m),2.09(1H,m),1.73(1H,m),1.69(3H,d,J=6.5Hz)ppm。
實例20a. ((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈水合物
自乙腈(8mL)與水(4mL)之混合物結晶來自實例20之((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四 氫-2H-哌喃-2-基)乙腈(52mg，0.15mmol)。收集之所得無色稜形晶體適於X射線晶體結構分析。
晶體資料顯示：約0.520×0.180×0.100mm，斜方晶，P212121，a=6.962(3)Å，b=11.531(4)Å，c=20.799(7)Å，體積=1669.6(10)Å3，Z=4，T=-100.℃，式量=359.42，密度=1.430g/cm3，μ(Mo)=0.22mm-1
在Bruker SMART APEX-II CCD系統上進行資料收集，MoKα輻射，標準聚焦管，陽極功率=50kV×42mA，晶體至板之距離=5.0cm，512×512像素/幀，射束中心=(256.13,253.14)，總幀數=1151，振動/幀=0.50°，暴露/幀=10.1秒/幀，SAINT積分，hkl最小/最大=(-9,9,-15,15,-27,27)，輸入shelx之資料=17025，獨特資料=3975，2θ範圍=3.92至55.72°，2θ55.72之完成率=99.80%，R(int-xl)=0.0681，應用SADABS校正。
使用XS(Shelxtl)解析結構，使用shelxtl軟體套件細化，藉由F2全矩陣最小平方達成細化，散射因子來自Int.Tab.Vol C表4.2.6.8及6.1.1.4，資料數目=3975，約束數目=0，參數數目=235，資料/參數比率=16.91，F2擬合優度=1.04，R指數[I>4σ(I)]R1=0.0505，wR2=0.1242，R指數(所有資料)R1=0.0769，wR2=0.1401，最大差異峰及孔=0.724及-0.277e/Å3，細化佛雷克(flack)參數=-0.12(13)，所有CH氫原子皆使用騎式模型細化。自差異圖得到OH氫且進行充分細化。
結果顯示不對稱單元含有如所示之一個分子及一個水，其中熱橢球體接近50%機率度。確認三個立體中心之各者處之立體化學(如以上在化合物之名稱及結構中所指示)。細化至0.28(24)之佛雷克參數指示對映異構設置正確。
實例21. ((2S,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈
此化合物係根據實例20，步驟2中所述之程序製備，使用 4-甲基苯磺酸((2S,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯(來自實例20，步驟1，第2峰)替代4-甲基苯磺酸((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯作為起始物質。C17H19N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=343.1；實驗值：343.0。
實例22. N-((1-((2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲基)甲烷磺醯胺
步驟1. N-[(2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基]-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.064g，0.30mmol)(實例1，步驟2)、雙環[2.2.1]庚-2-胺(來自Aldrich，0.050g，0.45mmol)及三乙胺(0.083mL，0.60mmol)於異丙醇(1.4mL)中之混合物2小時。濃縮混合物以得到所要產物，其不經進一步純化即用於下一步驟中。C14H16N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=290.1；實驗值：290.0。
步驟2. N7-[(2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基]噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺
在室溫下使N-[(2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基]-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(0.080g，0.28mmol)及10%鈀/碳(0.03g)於甲醇(3mL)中之混合物經受H2氣球壓力1小時。過濾混合物且濃縮濾液以得到所要產物，其不經進一步純化即直接用於下一步驟中。C14H18N3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=260.1；實驗值：260.0。
步驟3. 1-[(2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基]-2-(氯甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶
在120℃下攪拌N7-[(2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基]噻吩并[3,2-b]吡啶-6,7-二胺(0.060g，0.23mmol)及2-氯-1,1,1-三乙氧基乙烷(0.134mL，0.700mmol)於乙酸(0.2mL)中之混合物30分鐘。移除溶劑且將所得殘餘物溶解於二氯甲烷中並在矽膠上純化(用含0-5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得 到所要產物。C16H17ClN3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=318.1；實驗值：318.0。
步驟4. N-((1-((2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲基)甲烷磺醯胺
向1-[(2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基]-2-(氯甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶(0.10g，0.31mmol)溶解於N,N-二甲基甲醯胺(1mL)中之溶液中添加(甲基磺醯基)胺基甲酸第三丁酯(0.092g，0.47mmol)及碳酸鉀(0.087g，0.63mmol)。將混合物在50℃下攪拌隔夜，接著用水稀釋且用EtOAc萃取。合併之有機層經MgSO4乾燥且濃縮以得到粗({1-[(2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}甲基)(甲基磺醯基)胺基甲酸第三丁酯。C22H29N4O4S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=477.2；實驗值：477.1。在室溫下用含三氟乙酸(0.5mL，6mmol)之二氯甲烷(0.5mL)處理粗中間物30分鐘，接著在真空中移除溶劑。將殘餘物再溶解於MeOH中且在製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(30mg，25%)。C17H21N4O2S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=377.1；實驗值：377.0。
實例23. (反-4-{7-[(1R)-1-羥乙基]-8H-吡咯并[2,3-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-8-基}環己基)乙腈
步驟1. 6-碘噻吩并[3,2-b]吡啶-7-醇
將噻吩并[3,2-b]吡啶-7-醇(來自Aldrich)(0.54g，3.6mmol)及N-碘代丁二醯亞胺(0.88g，3.9mmol)於乙腈(10mL)中之混合物在回流下加熱隔夜。在減壓下濃縮混合物以得到所要產物，其不經進一步純化即用於下一步驟中。C7H5INOS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=277.9；實驗值：277.8。
步驟2. 7-氯-6-碘噻吩并[3,2-b]吡啶
在120℃下加熱粗6-碘噻吩并[3,2-b]吡啶-7-醇(0.99g，3.6mmol)於磷醯氯(20mL)中之混合物2小時。冷卻反應至室溫，在減壓下濃縮。使殘餘物與甲苯共蒸發，接著用二氯甲烷稀釋且用飽和NaHCO3溶液小心中和。濾出黑溚(black tar)且轉移濾液至分液漏斗中。濃縮有機層且在矽膠上純化(用0-35% EtOAc/己烷溶離)以得到所要產物(44%(2步))。C7H4ClINS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=295.9；實驗值：295.8。
步驟3. (2R)-4-(7-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-6-基)丁-3-炔-2-醇
7-氯-6-碘噻吩并[3,2-b]吡啶(0.46g，1.6mmol)、氯化雙(三苯基膦)鈀(II)(0.11g，0.16mmol)及碘化銅(I)(30mg，0.16mmol)之混合物用N2淨化。經由注射器添加(2R)-丁-3-炔-2-醇(0.13g，1.9mmol)及三乙胺(4.5mL，33mmol)。在回流下加熱反應混合物2小時。在減壓下濃縮混合物，且所得殘餘物在矽膠上純化(用0-85% EtOAc/己烷溶離)以得到所要產物。C11H9ClNOS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=238.0；實驗值：238.0。
步驟4. (反-4-{7-[(1R)-1-羥乙基]-8H-吡咯并[2,3-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-8-基}環己基)乙腈
(2R)-4-(7-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-6-基)丁-3-炔-2-醇(0.055g，0.23mmol)、(反-4-胺基環己基)乙腈 鹽酸鹽(0.040g，0.23mmol)、碳酸銫(0.19g，0.58mmol)、乙酸鈀(5.2mg，0.023mmol)及(9,9-二甲基-9H-口山口星-4,5-二基)雙(二苯基膦)(27mg，0.046mmol)於甲苯(1.1mL)中之混合物用N2淨化3次。在100℃下攪拌所得混合物2小時，接著在120℃下攪拌2小時。過濾混合物。在減壓下濃縮濾液，用MeOH稀釋且在製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.4mg，1.8%)。C19H22N3OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=340.1；實驗值：340.1。
實例24. (1-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈
步驟1. N-1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-基-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺
在90℃下攪拌1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-胺(來自J&W PharmLab，0.40g，2.5mmol)、7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.29g，1.4mmol)及三乙胺(0.38mL，2.7mmol)於異丙醇(4.4mL)中之混合物2小時。濃縮混合物以得到欲直接用於下一步驟中之所要產物。C15H18N3O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=336.1；實驗值：336.0。
步驟2. 4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己酮
在室溫下攪拌N-1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-基-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(0.45g，1.3mmol)及含3.0M氯化氫之水(9mL，30mmol)於丙酮(20mL)中之混合物20分鐘，且接著在60℃下攪拌1小時。在0℃下用5M NaOH水溶液鹼化混合物，接著用EtOAc萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥，濃縮且在矽膠管柱上純化(用含0-30% EtOAc之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(0.2g，51%(2步))。C13H14N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=292.1；實驗值：292.0。
步驟3. {1-羥基-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈
冷卻N,N-二異丙胺(0.19mL，1.4mmol)於四氫呋喃(3mL)中之溶液至0℃。在保持溫度低於5℃下逐滴添加含1.6M正丁基鋰之己烷(0.86mL，1.4mmol)。在完成添加之後，在0℃下攪拌混合物20分鐘。接著冷卻混合物至-78℃且在保持溫度低於-70℃下添加乙腈(0.072mL，1.4mmol)。在完成添加之後，在-78℃下攪拌混合物20分鐘且在保持溫度低於-70℃下添加4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己酮(0.20g，0.69mmol)於四氫呋喃(3mL)/六甲基磷醯胺(3mL)中之混合物。在完成添加之後，在-78℃下攪拌混合物30分鐘且接著在室溫下攪拌5小時。將混合物分配於二氯甲烷與飽和NH4Cl水溶液之間。有機相用水洗滌，經硫酸鈉乾燥， 濃縮且在矽膠管柱上純化(用含0-30% EtOAc之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(0.11g，48%)。C15H17N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=333.1；實驗值：333.0。
步驟4. {4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-1-羥基環己基}乙腈
在室溫下在H2氣球壓力下氫化{1-羥基-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(0.11g，0.33mmol)及10% Pd/C(0.050g)於甲醇(7mL)中之混合物2小時。過濾混合物，濃縮且在矽膠管柱上純化(用含0-10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到呈順式異構物與反式異構物之混合物形式之所要產物(38mg，38%)。C15H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=303.1；實驗值：303.0。
步驟5. (反-1-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(57mg，0.64mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(119mg，0.626mmol)於四氫呋喃(0.8mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.23mL)中並添加至{4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-1-羥基環己基}乙腈(38mg，0.12mmol)於乙醇(0.84mL)中之懸浮液中。在85℃下攪拌混合物2小時且接著在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到2個峰。在分析型HPLC(Waters SunFire C18，2.1×50mm，5μM；流速3毫升/分鐘；注射體積2μL；在3分鐘內自2%至80% B之梯度下(A=含0.025% TFA之水，B=乙腈))上：第一峰(5mg，10%)滯留時間0.952分鐘，C18H21N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=357.1；實驗值：357.1。1H NMR(DMSO-d 6,400MHz)δ 8.94(1H,s),8.00(1H,d,J=5.6Hz),7.60(1H,d,J=5.6Hz),5.78(1H,d,J=6.8Hz),5.22(1H,s),5.13(1H,m),4.82(1H,m),2.65(4H,m),1.86(2H,m),1.73~1.63(4H,m),1.59(1H,d,J=6.8Hz)ppm。第二峰(15mg，33%)滯留時間0.977分鐘，C18H21N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=357.1；實驗值：357.1。1H NMR(DMSO-d 6,400MHz)δ 8.93(1H,s),7.99(1H,d,J=5.6Hz),7.63(1H,d,J=5.6Hz),5.82(1H,d,J=6.8Hz),5.33(1H,s),5.15(1H,m),4.88(1H,m),3.05 (2H,m),2.23(2H,m),1.93(4H,m),1.74(2H,m),1.61(1H,d,J=6.8Hz)ppm。
實例25. {(2E)-1-[反-4-(氰甲基)環己基]-1,3-二氫-2H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-亞基}氰胺三氟乙酸鹽
在100℃下加熱{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(0.028g，0.098mmol)、氰基甲亞胺酸二苯酯(0.046g，0.20mmol)及N,N-二異丙基乙胺(0.17mL，0.98mmol)於乙腈(1mL)中之溶液2小時。汽提混合物至乾燥，用甲醇(MeOH)稀釋且接著藉由製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.05% TFA之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈TFA鹽形式之所要產物(2.5mg，7.6%)。C17H17N6S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=337.1；實驗值：337.1。
實例26. [反-4-(2-環丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈
在室溫下攪拌環丙烷甲醯胺(65.0mg，0.764mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(145mg，0.763mmol)於四氫呋喃(0.4mL)中之混合物1小時且接著濃縮。在回流下加熱{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(22mg，0.077mmol)及以上製得之試劑於乙醇(0.70mL)中之混合物2小時。混合物在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(2.5mg，9.7%)。C19H21N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=337.1；實驗值：337.0。
實例27. [反-4-(2-異丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己 基]乙腈
在室溫下攪拌2-甲基丙醯胺(80mg，0.9mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(170mg，0.89mmol)於四氫呋喃(0.4mL)中之混合物1小時且接著濃縮。在回流下加熱{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(22mg，0.077mmol)及以上製得之試劑於乙醇(0.70mL)中之混合物2小時。混合物在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(2.9mg，11%)。C19H23N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=339.2；實驗值：339.0。
實例28. [反-4-(2-氮雜環丁烷-3-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈
步驟1. 3-(胺基羰基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁酯
向1-(第三丁氧基羰基)氮雜環丁烷-3-甲酸(來自Activate Scientific.0.25g，1.2mmol)、乙酸銨(0.14g，1.9mmol)及六氟磷酸N,N,N',N'-四甲基-O-(7-氮雜苯并三唑-1-基)(0.71g，1.9mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(4mL)中之溶液中添加N,N-二異丙基乙胺(0.43mL，2.5mmol)。將混合物在室溫下攪拌隔夜。混合物用MeOH稀釋且在製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(0.156g，63%)。之LCMS計算值：C9H16N2O3Na(M+Na)+：m/z=223.1；實驗值：223.0。
步驟2. 3-{1-[反-4-(氰基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁酯
在室溫下攪拌3-(胺基羰基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁酯 (156mg，0.779mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(280mg，1.5mmol)於四氫呋喃(0.4mL)中之混合物1小時且接著濃縮。在回流下加熱{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(39mg，0.14mmol)及以上製得之試劑於乙醇(0.70mL)中之混合物2小時。冷卻混合物至室溫，用EtOAc稀釋，用飽和NaHCO3溶液洗滌，經MgSO4乾燥，濃縮且在矽膠管柱上純化(含0-5% MeOH之二氯甲烷)以得到所要產物。C24H30N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=452.2；實驗值：452.1。
步驟3. [反-4-(2-氮雜環丁烷-3-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈
在室溫下用含三氟乙酸(1mL)之二氯甲烷(1mL)處理3-{1-[反-4-(氰甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}氮雜環丁烷-1-甲酸酯(14mg，0.031mmol)1小時。汽提混合物至乾燥，用MeOH稀釋且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物。C19H22N5S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=352.2；實驗值：352.0。
實例29. {反-4-[2-(1-甲基氮雜環丁烷-3-基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}乙腈
向[反-4-(2-氮雜環丁烷-3-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈(14mg，0.038mmol)於甲醇(0.5mL)/四氫呋喃(0.5mL)/乙腈(0.5mL)中之溶液中添加37%甲醛水溶液(12μL，0.16mmol)。在室溫下攪拌所得混合物10分鐘，隨後添加三乙醯氧基硼氫化鈉(16mg，0.077mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時且接著用MeOH稀釋並藉由製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(0.8mg，6%)。C20H24N5S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=366.2；實驗值：366.1。
實例30. 3-[(順-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)胺基]丙腈
步驟1. {4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}胺基甲酸第三丁酯
在100℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(118mg，0.550mmol)、(4-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯(140mg，0.66mmol)及三乙胺(0.23mL，1.6mmol)於異丙醇(5mL)中之混合物1小時。濃縮混合物以得到欲直接用於下一步驟中之呈順式異構物與反式異構物之混合物形式的所要產物。C18H25N4O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=393.2；實驗值：393.1。
步驟2. {4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}胺基甲酸第三丁酯
在室溫下使含{4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}胺基甲酸第三丁酯(216mg，0.550mmol)及10% Pd/C(20mg)之甲醇(5mL)經受H2氣球壓力2小時。過濾混合物，濃縮且在矽膠管柱上純化(用含0-10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物。C18H27N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=363.2；實驗值：363.1。
步驟3. (4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)胺基甲酸第三丁酯
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(320mg，3.6mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.69g，3.6mmol)於四氫呋喃(3mL)中之混合物1小時且接著濃縮。在回流下加熱{4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}胺基甲酸第三丁酯(191mg，0.527mmol)及以上製得之試劑於乙醇(4.8mL)中之混合物2小時。濃縮混合物且在矽膠管柱上純化(用含0-10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物。C21H29N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=417.2；實驗值：417.0。
步驟4. (1R)-1-[1-(4-胺基環己基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]乙醇二鹽酸鹽
將(4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)胺基甲酸第三丁酯(0.22g，0.53mmol)在室溫下用含具有4.0M氯化氫之二噁烷(0.66mL，2.6mmol)之二氯甲烷(3mL)處理隔夜。濃縮混合物以得到呈HCl鹽形式之所要產物(0.22g，94%)。C16H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=317.1；實驗值：317.0。
步驟5. 3-[(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)胺基]丙腈
向(1R)-1-[1-(4-胺基環己基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]乙醇二鹽酸鹽(26mg，0.067mmol)於乙腈(0.45mL)中之溶液中依次添加1,8-二氮雜雙環[5.4.0]十一-7-烯(50μL，0.33mmol)及2-丙烯腈(8.78μL，0.134mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。在蒸發至乾燥之後，殘餘物藉由製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到2個峰。在分析型HPLC(Waters SunFire C18，2.1×50mm，5μM；流速3毫升/分鐘；注射體積2μL；在3分鐘內自2%至80% B之梯度下(A=含0.025% TFA之水，B=乙腈))上：第一峰(4.3mg，17%)滯留時間0.683分鐘，C19H24N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=370.2；實驗值：370.1。來自製備型HPLC之第二峰(4.3mg，17%)在分析型HPLC上之滯留時間為0.598分鐘，C19H24N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=370.2；實驗值：370.1。
實例31. N-乙基-2-(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙醯胺
步驟1. {反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙酸乙酯
在100℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(97mg，0.45 mmol)、(反-4-胺基環己基)乙酸乙酯鹽酸鹽(來自Activate Scientific，120mg，0.54mmol)及三乙胺(0.19mL，1.4mmol)於異丙醇(4mL)中之混合物1小時。濃縮混合物以得到欲直接用於下一步驟中之所要產物。C17H22N3O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=364.1；實驗值：364.1。
步驟2. {反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙酸乙酯
過濾混合物。在室溫下使含{反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙酸乙酯(160mg，0.44mmol)及10% Pd/C(20mg)之甲醇(4mL)經受H2氣球壓力2小時。濃縮濾液且在矽膠管柱上純化(用含0-10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物。C17H24N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=334.2；實驗值：334.1。
步驟3. (反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙酸乙酯
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(170mg，1.9mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.36g，1.9mmol)於四氫呋喃(2mL)中之混合物1小時且接著濃縮。在回流下加熱{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙酸乙酯(150mg，0.45mmol)及以上製得之試劑於乙醇(4.8mL)中之混合物2小時。濃縮混合物且在矽膠管柱上純化(用含0-5% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(0.15g，86%)。C20H26N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=388.2；實驗值：388.1。
步驟4. (反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙酸
將(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙酸乙酯(0.15g，0.39mmol)及氫氧化鋰單水合物(0.079g，1.9mmol)於水(0.7mL)/甲醇(1.7mL)/四氫呋喃(1.7mL)中之混合物在室溫下攪拌隔夜。反應用1N HCl水溶液酸化至pH=4，用二氯甲烷萃取。合併之有機層經MgSO4乾燥且濃縮以得到欲直接用於下一步驟中之所要產物(0.11g，79%)。C18H22N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=360.1；實驗值：360.1。
步驟5. N-乙基-2-(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并 [3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙醯胺
向(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙酸(11mg，0.031mmol)、含2.0M乙胺之THF(23μL，0.046mmol)及六氟磷酸苯并三唑-1-基氧基參(二甲基胺基)鏻(23mg，0.052mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(0.4mL)中之溶液中添加N,N-二異丙基乙胺(0.016mL，0.092mmol)。在室溫下攪拌混合物2小時。混合物用MeOH稀釋且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.8mg，15%)。C20H27N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=387.2；實驗值：387.1。
實例32. 3-(3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)丙腈
步驟1. [3-(羥基甲基)環己基]胺基甲酸第三丁酯
在0℃下向3-[(第三丁氧基羰基)胺基]環己烷甲酸(來自Alfa Aesar，3.3g，14mmol)及三乙胺(3.8mL，27mmol)於四氫呋喃(40mL)中之混合物中逐滴添加氯甲酸乙酯(1.9mL，20mmol)。在0℃下攪拌混合物10分鐘且接著在室溫下攪拌20分鐘。過濾混合物以移除白色固體且接著冷卻至0℃。緩慢添加四氫硼酸鈉(1.0g，27mmol)與甲醇(1mL)之混合物。在室溫下攪拌混合物1小時。混合物用1N HCl水溶液淬滅且用EtOAc萃取。濃縮萃取物且在矽膠管柱上純化(用含75% EtOAc之己烷溶離)以得到所要產物(2.88g，92%)。C13H23NO3Na之LCMS計算值：(M+Na)+：m/z=252.2；實驗值：252.1。
步驟2. (3-甲醯基環己基)胺基甲酸第三丁酯
在0℃下向[3-(羥基甲基)環己基]胺基甲酸第三丁酯(0.51g，2.2mmol)於二氯甲烷(10mL)中之溶液中添加戴斯-馬丁高碘烷(1.1g，2.7mmol)。在室溫下攪拌混合物2小時。反應用1N NaOH水溶液淬滅且用二 氯甲烷萃取。合併之有機層依次用水及鹽水洗滌，經MgSO4乾燥，濃縮，且接著在矽膠管柱上純化(用含20-50% EtOAc之己烷溶離)以得到所要產物(0.3g，59%)。C12H21NO3Na之LCMS計算值：(M+Na)+：m/z=250.2；實驗值：250.1。
步驟3. {3-[2-氰基乙烯基]環己基}胺基甲酸第三丁酯
在0℃下向含1.0M第三丁醇鉀之THF(2.0mL，2.0mmol)中逐滴添加氰基甲基膦酸二乙酯(0.30mL，1.8mmol)且在0℃下攪拌混合物1小時。逐滴添加(3-甲醯基環己基)胺基甲酸第三丁酯(0.30g，1.3mmol)於四氫呋喃(9.3mL)中之溶液，接著移除冷卻浴，且將混合物在室溫下攪拌隔夜。混合物用EtOAc稀釋，用水洗滌，濃縮且在矽膠管柱上純化(用含0-30% EtOAc之己烷溶離)以得到呈順式異構物與反式異構物之混合物形式之所要產物(0.12g，36%)。C14H22N2O2Na之LCMS計算值：(M+Na)+：m/z=273.2；實驗值：273.1。
步驟4. 3-(3-胺基環己基)丙烯腈鹽酸鹽
在室溫下用含具有4.0M氯化氫之二噁烷(1.6mL，6.6mmol)之二氯甲烷(2mL)處理{3-[2-氰基乙烯基]環己基}胺基甲酸第三丁酯2小時。汽提混合物至乾燥以得到呈順式異構物與反式異構物之混合物形式之所要產物。C9H15N2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=151.1；實驗值：151.1。
步驟5. 3-{3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}丙烯腈
在90℃下加熱3-(3-胺基環己基)丙烯腈鹽酸鹽(0.090g，0.48mmol)、7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.085g，0.40mmol)及三乙胺(0.22mL，1.6mmol)於異丙醇(0.9mL)中之混合物1小時。濃縮混合物以得到欲直接用於下一步驟中之所要產物。C16H17N4O2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=329.1；實驗值：329.1。
步驟6. 3-{3-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}丙腈
在室溫下在H2氣球壓力下歷經週末氫化3-{3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}丙烯腈(0.13g，0.40mmol)及10% Pd/C(0.05g)於甲醇(10mL)中之混合物。過濾混合物，濃縮且在矽膠管柱上純化(用含0-10% MeOH之二氯甲烷溶離)以得到所要產物。C16H21N4S之LCMS計算 值：(M+H)+：m/z=301.1；實驗值：301.0。
步驟7. 3-(3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)丙腈
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(194mg，2.18mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.41g，2.2mmol)於四氫呋喃(2mL)中之混合物1小時且接著濃縮。在回流下加熱3-{3-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}丙腈(131mg，0.436mmol)及以上製得之試劑於乙醇(4.7mL)中之混合物2小時。過濾混合物，用MeOH稀釋且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(60mg，39%)。C19H23N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=355.2；實驗值：355.0。
實例33. [4-(7-甲基咪唑并[1,2-a]噻吩并[3,2-e]吡嗪-8-基)苯基]乙腈
步驟1. 6-溴-5-氯-2-甲基咪唑并[1,2-a]吡嗪
在1頸圓底燒瓶中將N,N-二異丙胺(0.50mL，3.6mmol)溶解於四氫呋喃(4.0mL)中且在-78℃下冷卻。添加含1.6M正丁基鋰之己烷(1.9mL，3.1mmol)。在-78℃下攪拌反應30分鐘且逐滴添加含6-溴-2-甲基咪唑并[1,2-a]吡嗪(來自Ark Pharm，0.500g，2.36mmol)之四氫呋喃(6.0mL)。在-78℃下攪拌反應混合物45分鐘且添加六氯乙烷(0.72g，3.1mmol)。在-78℃下攪拌所得混合物1小時。反應用NH4Cl溶液淬滅且接著分配於EtOAc與水之間。EtOAc萃取物用鹽水洗滌，乾燥(MgSO4)，且在真空中汽提。殘餘物在矽膠上進行層析，用含40% EtOAc之己烷溶離以得到所要產物(0.25g，43%)。C7H6BrClN3之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=245.9；實驗值：245.9。1H NMR(CDCl3,400MHz)δ 8.72(1H,s),7.68(1H,s),2.56(3H,s)ppm。
步驟2. 5-氯-2-甲基-6-[(三甲基矽烷基)乙炔基]咪唑并[1,2-a]吡嗪
在45℃下在油浴中加熱6-溴-5-氯-2-甲基咪唑并[1,2-a]吡嗪(0.710g，2.88mmol)、氯化雙(三苯基膦)鈀(II)(0.1g，0.1mmol)、(三甲基矽烷基)乙炔(0.90mL，6.3mmol)、碘化銅(I)(0.04g，0.2mmol)及三乙胺(0.803mL，5.76mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(8.5mL)中之混合物且攪拌14小時。反應用水(20ml)淬滅且用乙酸乙酯(2×100ml)萃取。合併之有機萃取物用水(10ml)、飽和NaCl(10ml)洗滌，經Na2SO4乾燥且在真空中移除溶劑。產物藉由矽膠層析純化，用含10-20% EtOAc之己烷溶離以得到所要產物(0.39g，76%)。C12H15ClN3Si之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=264.1；實驗值：264.0。
步驟3. 7-甲基咪唑并[1,2-a]噻吩并[3,2-e]吡嗪
在攪拌下在100℃下在預加熱油浴中加熱5-氯-2-甲基-6-[(三甲基矽烷基)乙炔基]咪唑并[1,2-a]吡嗪(0.400g，1.52mmol)及硫化鈉單水合物(1.09g，4.55mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(6.0mL)中之混合物1小時。冷卻反應且分配於EtOAc與水之間。有機層用水、鹽水洗滌，乾燥且在真空中移除溶劑。殘餘物在矽膠上進行層析，用EtOAc及含3% MeOH之EtOAc溶離以得到所要產物(0.15g，52%)。C9H8N3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=190.0；實驗值：190.0。
步驟4. 8-碘-7-甲基咪唑并[1,2-a]噻吩并[3,2-e]吡嗪
在25℃下攪拌7-甲基咪唑并[1,2-a]噻吩并[3,2-e]吡嗪(30mg，0.16mmol)及N-碘代丁二醯亞胺(39mg，0.17mmol)於二氯甲烷(1.2mL)中之混合物16小時。產物藉由製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(15mg，30%)。C9H7IN3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=315.9；實驗值：316.0。1H NMR(CDCl3,400MHz)δ 8.89(1H,s),7.55(1H,d,J=5.6Hz),7.35(1H,d,J=5.6Hz),2.55(3H,s)ppm。
步驟5. [4-(7-甲基咪唑并[1,2-a]噻吩并[3,2-e]吡嗪-8-基)苯基]乙腈
將[4-(氰基甲基)苯基]硼酸(來自Aldrich，9.3mg，0.058mmol)、8-碘-7-甲基咪唑并[1,2-a]噻吩并[3,2-e]吡嗪(12mg，0.038mmol)及碳酸鉀(16mg，0.12mmol)於乙腈(0.6mL)及水(0.2mL)中之混合物脫氣。向 混合物中添加肆(三苯基膦)鈀(0)(2.2mg，0.0019mmol)。在微波反應器中在160℃下加熱反應混合物10分鐘。反應用甲醇稀釋，過濾。濾液藉由製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物。C17H13N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=305.1；實驗值：305.0。1H NMR(CDCl3,400MHz)δ 9.01(1H,s),7.55(4H,m),7.49(1H,d,J=6.0Hz),7.14(1H,d,J=6.0Hz),3.93(2H,s),2.48(3H,s)ppm。
實例34. [(1R,2R,4S)-2-羥基-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈三氟乙酸鹽與[(1S,2S,4R)-2-羥基-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈三氟乙酸鹽之混合物
步驟1. -2-甲氧基-4-[(三甲基矽烷基)氧基]環己-3-烯-1-甲酸甲酯
在80℃下加熱丙烯酸甲酯(5.23mL，58.0mmol)及1-甲氧基-3-(三甲基矽烷氧基)-1,3-丁二烯(來自Aldrich,10.0g，58.0mmol)於甲苯(100mL)中之混合物2天。濃縮反應溶液且在矽膠管柱上純化以得到呈反式異構物與順式異構物之混合物形式之所要產物(8.3g，55%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ 5.16(1H,m),4.97(1H,m),4.22(1H,m),4.08(1H,m),3.68(3H,s),3.67(3H,s),3.32(3H,s),3.24(3H,s),2.59(1H,m),2.51(1H,m),1.80-2.14(8H,m),0.18(18H,s)ppm。
步驟2. (1S,2R)-2-甲氧基-4-側氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)及(1S,2S)-2-甲氧基-4-側氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)
在0℃下向-2-甲氧基-4-[(三甲基矽烷基)氧基]環己-3-烯-1-甲酸甲酯(8.3g，32mmol)於甲醇(200mL)中之溶液中添加碳酸鉀(2.2g，16mmol)。在攪拌20分鐘之後，反應用飽和NH4Cl溶液及乙酸乙酯稀釋。水層用乙酸乙酯萃取。合併之有機層用鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，在真空中濃縮。粗物質用急驟層析純化(用含0至50%乙酸乙酯之己烷溶離)以得到反 式異構物(第一溶離物，1.5g，25%)及順式異構物(末個溶離物，1.35g，22%)。對於反式異構物：1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 3.89(1H,m),3.75(3H,s),3.33(3H,s),2.85(1H,m),2.78(1H,m),2.44(2H,m),2.32(1H,m),2.15(1H,m),1.96(1H,m)ppm。對於順式異構物：1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 4.18(1H,m),3.72(3H,s),3.30(3H,s),2.85(2H,m),2.46(2H,m),2.28(1H,m),2.12(1H,m)ppm。
步驟3. (1S,2R,4R)-4-羥基-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)
在-78℃下向(1S,2R)-2-甲氧基-4-側氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋，來自最後一步之順式異構物)(1.35g，7.25mmol)於甲醇(30mL)中之溶液中添加四氫硼酸鈉(270mg，7.2mmol)。在攪拌1小時之後，反應用飽和NH4Cl溶液及乙酸乙酯稀釋。水層用乙酸乙酯萃取。合併之有機層用鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，濃縮且用急驟層析純化(用含70%乙酸乙酯之己烷溶離)以得到所要產物(1.26g，92%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ 3.96(2H,m),3.72(3H,s),3.38(3H,s),2.45(1H,m),2.31(1H,m),2.11(1H,m),1.97(1H,m),1.77(1H,m),1.50(2H,m)ppm。
步驟4. (1S,2R,4R)-2-甲氧基-4-[(甲基磺醯基)氧基]環己烷甲酸甲酯(外消旋)
在0℃下用甲烷磺醯氯(0.938mL，12.1mmol)逐滴處理(1S,2R,4R)-4-羥基-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)(1.14g，6.06mmol)於二氯甲烷(30mL)中之溶液。在0℃下攪拌混合物2小時且分配於乙酸乙酯與水之間。濃縮有機相且在矽膠上純化(用含50%乙酸乙酯之己烷溶離)以得到所要產物(1.48g，93%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 4.89(1H,m),3.70(3H,s),3.62(1H,m),3.36(3H,s),3.02(3H,s),2.78(1H,m),2.42(1H,m),2.01(2H,m),1.98(1H,m),1.80(1H,m),1.62(1H,m)ppm。
步驟5. (1S,2R,4S)-4-疊氮基-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)
向(1S,2R,4R)-2-甲氧基-4-[(甲基磺醯基)氧基]環己烷甲酸甲酯(外消旋)(1.48g，5.56mmol)於DMF(19mL)中之溶液中添加疊氮化鈉(1.4g，22mmol)。攪拌反應混合物且在80℃下加熱4小時。將反應混合物傾入飽和NaHCO3溶液中且用乙酸乙酯(2×30mL)萃取。合併之萃取物用鹽水洗 滌，經Na2SO4乾燥，濃縮。粗物質藉由急驟層析純化(用含0-35%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈無色油狀之所要產物(1.02g，86%)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 3.98(1H,m),3.76(3H,s),3,58(1H,m),3.36(3H,s),2.38(2H,m),2.06(1H,m),1.90(2H,m),1.36(2H,m)ppm。
步驟6. (1S,2R,4S)-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)
向(1S,2R,4S)-4-疊氮基-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)(901mg，4.22mmol)於甲醇(26mL)中之溶液中依次添加二碳酸二-第三丁酯(1.11g，5.07mmol)及10%鈀/碳(720mg，0.68mmol)。將所得混合物在氫氣氣球壓力下攪拌隔夜。反應混合物經矽藻土墊過濾且用甲醇洗滌。移除溶劑且殘餘物用急驟層析純化(用含0-40%乙酸乙酯之己烷溶離)以得到呈無色油狀之所要產物(0.96g，79%)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 4.38(1H,m),3.92(1H,m),3.66(3H,s),3.28(3H,s),2.35(2H,m),2.07-1.76(3H,m),1.40(9H,s),1.08(2H,m)ppm。
步驟7. [(1S,3R,4R)-4-(羥基甲基)-3-甲氧基環己基]胺基甲酸第三丁酯(外消旋)
將(1S,2R,4S)-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)(0.87g，3.0mmol)溶解於乙醚(27mL)中且冷卻至0℃。添加四氫鋁酸鋰(138mg，3.63mmol)且攪拌所得反應混合物4小時。在0℃下用5mL水淬滅反應，接著在攪拌30分鐘之後用5mL 15% NaOH及15mL水稀釋。反應混合物經矽藻土墊過濾且用乙酸乙酯洗滌。水層用乙酸乙酯(2×)萃取。合併之有機層用鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，過濾且濃縮。粗物質用急驟層析純化(用含0-80%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈白色泡沫狀之所要產物。
步驟8. 甲烷磺酸{(1R,2R,4S)-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]-2-甲氧基環己基}甲酯(外消旋)
在0℃下向[(1S,3R,4R)-4-(羥基甲基)-3-甲氧基環己基]胺基甲酸第三丁酯(外消旋)(671mg，2.59mmol)於二氯甲烷(8mL)中之溶液中添加甲烷磺醯氯(0.401mL，5.18mmol)。在0℃下攪拌混合物1小時，接著濃 縮且分配於乙酸乙酯與水之間。濃縮有機相且藉由急驟層析純化(用含50%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到所要產物(0.87g，100%)。C9H16NO5S之LCMS計算值：(M+H-t-Bu-MeOH)+：m/z=250.1；實驗值：250.0。
步驟9. [(1R,2R,4S)-4-胺基-2-甲氧基環己基]乙睛三氟乙酸鹽(外消旋)
將甲烷磺酸{(1R,2R,4S)-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]-2-甲氧基環己基}甲酯(外消旋)(703mg，2.08mmol)及氰化鈉(120mg，2.5mmol)於DMSO(7mL)中之混合物在90℃下攪拌隔夜。在冷卻之後，將混合物分配於乙酸乙酯與鹽水之間。有機層用水及鹽水洗滌，且濃縮以得到經Boc保護之疊氮化物中間物。用TFA(9mL)處理中間物於二氯甲烷中之溶液(9mL)且在室溫下攪拌2小時。濃縮反應溶液以得到呈TFA鹽形式之所要產物。C9H17N2O之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=169.1；實驗值：169.2。
步驟10. {(1R,2R,4S)-2-甲氧基-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(外消旋)
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(381mg，1.78mmol)、[(1R,2R,4S)-4-胺基-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)(310mg，1.8mmol)及N,N-二異丙基乙胺(1.2mL，7.1mmol)於異丙醇(4.2mL)中之混合物2小時。濃縮粗物質且用急驟層析純化以得到所要產物(485mg，78%)。C15H19N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=347.1；實驗值：347.0。
步驟11. {(1R,2R,4S)-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-2-甲氧基環己基}乙腈(外消旋)
在室溫下使{(1R,2R,4S)-2-甲氧基-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(外消旋)(380mg，1.1mmol)及10%鈀/碳(0.38g，0.36mmol)於甲醇(7.3mL)中之混合物經受H2氣球壓力2小時。過濾混合物且濃縮濾液並用急驟層析純化(用含15%甲醇之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(310mg，89%)。C16H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=317.1；實驗值：317.1。
步驟12. [(1R,2R,4S)-2-甲氧基-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈(外消旋)
在120℃下攪拌{(1R,2R,4S)-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7- 基)胺基]-2-甲氧基環己基}乙腈(外消旋)(45mg，0.14mmol)及原乙酸三乙酯(79μL，0.43mmol)於乙酸(0.4mL，7mmol)中之混合物30分鐘。移除溶劑，且將殘餘物溶解於甲醇中並用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(28mg，58%)。C18H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.0。
步驟13. [(1R,2R,4S)-2-羥基-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈三氟乙酸鹽與[(1S,2S,4R)-2-羥基-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈三氟乙酸鹽之混合物
向裝有[(1R,2R,4S)-2-甲氧基-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈(外消旋)(28mg，0.082mmol)之微波小瓶中添加乙腈(1mL)及碘三甲基矽烷(0.60mL，4.2mmol)。在80℃下加熱反應溶液6小時。反應混合物用甲醇稀釋且用HPLC純化(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1% TFA之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)加以純化以得到呈外消旋混合物形式之所要產物。C17H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=327.1；實驗值：327.1。
實例35. [(1R,2R,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈三氟乙酸鹽與[(1S,2S,4R)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈三氟乙酸鹽之混合物
步驟1. [(1R,2S,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)
根據實例34，步驟12之程序，使用1,1,1-三乙氧基-{(1R,2R,4S)-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-2-甲氧基環己基}乙腈(外消旋)及丙烷作為起始物質製備所要化合物。C19H23N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=355.2；實驗值：355.1。
步驟2. [(1R,2R,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈三氟乙酸鹽與[(1S,2S,4R)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈三氟乙酸鹽之混合物
根據實例34，步驟13之程序，使用[(1R,2S,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)作為起始物質製備所要化合物。C18H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.1。
實例36. ((1R,2R,4S)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈及((1S,2S,4R)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈
步驟1. ((1R,2R,4S)-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}-2-甲氧基環己基)乙腈與((1R,2R,4S)-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}-2-甲氧基環己基)乙腈之混合物
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(82.2mg，0.922mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(160mg，0.87mmol)於THF(4.6mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(2.0mL)中並添加至{(1R,2R,4S)-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-2-甲氧基環己基}乙腈(外消旋)(89mg，0.28mmol)於乙醇(0.9mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌混合物1小時。反應混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈白色固體狀之所要產物(65mg，62%)。C19H23N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=371.2；實驗值：371.0。
步驟2. ((1R,2R,4S)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈及((1S,2S,4R)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈
向((1R,2R,4S)-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}-2-甲氧基環己基)乙腈(非對映異構物混合物)(40.2mg，0.108mmol)於乙腈(2.5mL)中之溶液中添加碘三甲基矽烷(772μL，5.42mmol)。在90℃下加熱所得混合物4小時。反應用甲醇淬滅且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1% TFA之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈兩種非鏡像異構物之混合物形式之所要產物。藉由對掌性管柱(Phenomenex Lux纖維素A-2，5um，21.2×250mm，15%乙醇/85%己烷，流速：18毫升/分鐘，2毫克/注射)分離外消旋混合物以得到兩個峰。異構物1(首先溶離)：C18H21N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=357.1；實驗值：357.0。異構物2(其次溶離)：C18H21N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=357.1；實驗值：357.0。
實例37. ((1R,2S,4S)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈三氟乙酸鹽及((1S,2R,4R)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈三氟乙酸鹽
步驟1. (1S,2S,4R)-4-羥基-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)
在-78℃下向(1S,2S)-2-甲氧基-4-側氧基環己烷甲酸甲酯(來自實例34步驟2之反式異構物，第一溶離物，外消旋)(1.5g，8.0mmol)於THF(20mL)中之溶液中添加含1.0M L-三第二丁基硼氫化鋰之THF(12mL)。在相同溫度下攪拌2小時之後，反應用飽和NaHCO3溶液及乙酸乙酯稀釋。水層用乙酸乙酯(3×)萃取。合併之有機層用鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，過濾且濃縮。粗物質用急驟層析純化(用含0-65%乙酸乙酯之己烷溶離)以得到呈無色油狀之所要產物(1.5g，100%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 4.18(1H,m),3.82(1H,m),3.70(3H,s),3.32(3H,s),2.43(1H,m),2.10(1H,m),1.96(1H,m),1.76(1H,m),1.71-1.48(2H,m),1.40(1H,m)ppm。
步驟2. (1R,2R,4S)-2-甲氧基-4-[(甲基磺醯基)氧基]環己烷甲酸甲酯(外消旋)
在0℃下用甲烷磺醯氯(1.23mL，15.9mmol)逐滴處理(1R,2R,4S)-4-羥基-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)(1.50g，7.97mmol)於二氯甲烷(40mL)中之溶液。在0℃下攪拌混合物2小時且分配於乙酸乙酯與水之間。濃縮有機相且在矽膠上純化(用含50%乙酸乙酯之己烷溶離)以得到所要產物(2.12g，91%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 4.62(1H,m),3.71(3H,s),3.48(1H,m),3.33(3H,s),3.02(3H,s),2.64(1H,m),2.32(1H,m),2.19(1H,m),2.00(1H,m),1.60-1.42(3H,m)ppm。
步驟3. (1R,2R,4R)-4-疊氮基-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)
向(1R,2R,4S)-2-甲氧基-4-[(甲基磺醯基)氧基]環己烷甲酸甲酯(外消旋)(1.92g，7.21mmol)於DMF(24mL)中之溶液中添加疊氮化鈉(1.9g，29mmol)。攪拌反應混合物且在80℃下加熱4小時。將反應混合物傾入飽和NaHCO3溶液中且用乙酸乙酯(2×30mL)萃取。合併之萃取物用鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，濃縮。粗物質藉由急驟層析純化(用含0-35%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈無色油狀之所要產物(1.22g，79%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ 3.70(3H,s),3,44(1H,m),3.32(3H,s),3.30(1H,m),2.48(1H,m),2.32(1H,m),2.00(2H,m),1.48(1H,m),1.28(2H,m)ppm。
步驟4. (1S,2S,4S)-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)
向(1S,2S,4S)-4-疊氮基-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)(1.2g，5.6mmol)於甲醇(34mL)中之溶液中依次添加二碳酸二-第三丁酯(1.47g，6.75mmol)及10%鈀/碳(960mg)。將所得混合物在H2氣球下攪拌隔夜。反應混合物經矽藻土墊過濾且用甲醇洗滌。移除溶劑且殘餘物用急驟層析純化(用含0-40%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈無色油狀之所要產物(1.02g，63%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 4.54(1H,m),3.68(3H,s),3.48(1H,m),3.32(3H,s),2.43(1H,m),2.31(1H,m),1.94(2H,m),1.54(1H,m),1.43(9H,s),1.08(2H,m)ppm。
步驟5. [(1S,3S,4R)-4-(羥基甲基)-3-甲氧基環己基]胺基甲酸第三丁酯 (外消旋)
將(1S,2S,4S)-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]-2-甲氧基環己烷甲酸甲酯(外消旋)(1.02g，3.55mmol)溶解於乙醚(32mL)中且冷卻至0℃。添加四氫鋁酸鋰(162mg，4.26mmol)且攪拌所得混合物4小時。在0℃下用5mL水淬滅反應，接著在攪拌30分鐘之後用5mL 15% NaOH及15mL水稀釋。反應混合物經矽藻土墊過濾且用乙酸乙酯洗滌。水層用乙酸乙酯(2×)萃取。合併之有機層用鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，過濾且濃縮。粗物質用急驟層析純化(用含0-80%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈白色泡沫狀之所要產物。C8H18NO2之LCMS計算值：(M+H-Boc)+：m/z=160.1；實驗值：160.2。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 4.46(1H,brs),3.71-3.40(3H,m),3.37(3H,s),3.12(2H,m),2.48(1H,m),1.94(1H,m),1.71-1.50(3H,m),1.41(9H,s),1.05(2H,m)ppm。
步驟6. 甲烷磺酸{(1R,2S,4S)-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]-2-甲氧基環己基}甲酯
在0℃下向[(1S,3S,4R)-4-(羥基甲基)-3-甲氧基環己基]胺基甲酸第三丁酯(外消旋)(720mg，2.8mmol)於二氯甲烷(9mL)中之溶液中添加甲烷磺醯氯(0.430mL，5.56mmol)。在0℃下攪拌混合物1小時。接著濃縮混合物且分配於乙酸乙酯與水之間。濃縮有機相且藉由急驟層析純化(用含50%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到所要產物(0.859g，92%)。C9H20NO4S之LCMS計算值：(M+H-Boc)+：m/z=238.1；實驗值：238.o。
步驟7. [(1R,2S,4S)-4-胺基-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)
將甲烷磺酸{(1R,2S,4S)-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]-2-甲氧基環己基}甲酯(661mg，1.96mmol)及氰化鈉(115mg，2.35mmol)於DMSO(6mL)中之混合物在90℃下攪拌隔夜。在冷卻至室溫之後，將混合物分配於乙酸乙酯與鹽水之間。有機層用水及鹽水洗滌，且濃縮以得到經Boc保護之疊氮化物：LCMS[M+Na]261.1。用TFA(9mL)處理中間物於二氯甲烷中之溶液(9mL)且在室溫下攪拌2小時。濃縮反應溶液以得到呈TFA鹽形式之所要產物。C9H17N2O之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=169.1；實驗值：169.1。
步驟8. {(1R,2S,4S)-2-甲氧基-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(外消旋)
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(381mg，1.78mmol)、[(1R,2S,4S)-4-胺基-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)(310mg，1.8mmol)及N,N-二異丙基乙胺(1.2mL，7.1mmol)於異丙醇(4.2mL)中之混合物2小時。濃縮粗物質且用急驟層析純化以得到所要產物(469mg，76%)。C15H19N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=347.1；實驗值：347.0。
步驟9. {(1R,2S,4S)-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-2-甲氧基環己基}乙腈(外消旋)
在室溫下使{(1R,2S,4S)-2-甲氧基-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(外消旋)(401mg，1.16mmol)及10%鈀/碳(0.20g)於甲醇(7.7mL)中之混合物經受H2氣球壓力2小時。過濾混合物且濃縮濾液並用急驟層析純化(用含15%甲醇之二氯甲烷溶離)以得到所要產物(342mg，93%)。C16H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=317.1；實驗值：317.1。
步驟10. ((1R,2S,4S)-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}-2-甲氧基環己基)乙腈及((1S,2R,4R)-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}-2-甲氧基環己基)乙腈
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(40.6mg，0.456mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(82mg，0.43mmol)於THF(2.3mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.45mL)中並添加至{(1R,2S,4S)-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-2-甲氧基環己基}乙腈(外消旋)(44mg，0.14mmol)於乙醇(0.45mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌所得混合物1小時。反應混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈白色固體狀之所要產物(26mg，50%)。C19H23N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=371.2；實驗值：371.0。
步驟11. ((1R,2S,4S)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈三氟乙酸鹽及((1S,2R,4R)-2-羥基 -4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈三氟乙酸鹽
向((1R,2S,4S)-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}-2-甲氧基環己基)乙腈(非對映異構物混合物)(23.0mg，0.0621mmol)於乙腈(0.9mL)中之溶液中添加碘三甲基矽烷(0.45mL，3.2mmol)。在80℃下攪拌6小時之後，反應混合物用甲醇及水稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1% TFA之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到兩個峰(異構物1，2.1mg，9.5%；異構物2，2.5mg，11%)。異構物1(首先溶離)：C18H21N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=357.1；實驗值：357.0。異構物2(其次溶離)：C18H21N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=357.1；實驗值：357.0。
實例38. [(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
步驟1. {(2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲醇
在室溫下使乙酸{(5S)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯(366mg，1.05mmol)及10%鈀/碳(0.18g)於甲醇(7.0mL)中之混合物經受H2氣球壓力2小時。過濾混合物且用1M NaOH(1mL)處理1小時。混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈5：1比率之兩個峰。主峰為標題化合物(154mg，58%)。C13H18N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=280.1；實驗值：280.1。
步驟2. [(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇
向{(2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫 -2H-哌喃-2-基}甲醇(131mg，0.469mmol)於乙酸(1.3mL)中之溶液中添加原乙酸三乙酯(275μL，1.50mmol)。在120℃下攪拌混合物30分鐘。在冷卻至室溫之後，混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈白色固體狀之所要產物(60mg，42%)。C15H18N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=304.1；實驗值：304.1。
步驟3：4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯
在0℃下向[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇(60.1mg，0.198mmol)於二氯甲烷(2.3mL)及吡啶(51μL，0.62mmol)中之溶液中添加對甲苯磺醯氯(38.7mg，0.203mmol)及4-二甲基胺基吡啶(1.2mg，0.010mmol)。使反應混合物升溫至室溫隔夜。濃縮反應混合物，用甲醇稀釋，且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(50mg，55%)。C22H24N3O4S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=458.1；實驗值：458.1。
步驟4. [(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
向4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯(50.2mg，0.110mmol)及氰化鈉(9.1mg，0.19mmol)於DMF(1.1mL)中之混合物中添加含1.0M硫酸之DMF(9μL，0.009mmol)。將反應溶液在50℃下攪拌隔夜。在冷卻之後，混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(15.2mg，44%)。C16H17N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=313.1；實驗值：313.0。
實例39. [(2R,5S)-5-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
步驟1. [(2R,5S)-5-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇
向{(2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲醇(115mg，0.412mmol)於乙酸(1.1mL)中之溶液中添加1,1,1-三乙氧基-丙烷(265μL，1.32mmol)。在120℃下攪拌所得混合物30分鐘。在冷卻至室溫之後，混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈白色固體狀之所要產物(74.8mg，57%)。C16H20N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=318.1；實驗值：318.1。
步驟2：4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯
此化合物係根據實例38，步驟3中所述之程序製備，使用[(2R,5S)-5-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇替代[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇作為起始物質。C23H26N3O4S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=472.1；實驗值：472.0。
步驟3. [(2R,5S)-5-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
此化合物係根據實例38，步驟4中所述之程序製備，使用4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯替代4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯作為起始物質。C17H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=327.1；實驗值：327.0。1H NMR(DMSO-d 6,300MHz)δ 8.88(1H,s),7.95(1H,d,J=5.5Hz),7.61(1H,d,J=5.5Hz),4.64(1H,m),4.21(1H,m),4.09(1H,m),3.93(1H,m),3.04(2H,m), 2.83(2H,m),2.53(1H,m),2.13(1H,m),1.97(1H,m),1.67(1H,m),1.31(3H,t,J=7.4Hz)ppm。
實例40. [(1R,2S,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈及[(1S,2R,4R)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈
步驟1. [(1R,2S,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)
根據實例34，步驟12之程序，使用{(1R,2S,4S)-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-2-甲氧基環己基}乙腈(外消旋)及1,1,1-三乙氧基-丙烷作為起始物質製備此化合物。C19H23N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=355.2；實驗值：355.1。
步驟2. [(1R,2S,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈及[(1S,2R,4R)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈
在微波小瓶中，添加碘三甲基矽烷(0.20mL，1.4mmol)至[(1R,2S,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)(10mg，0.03mmol)於乙腈(0.3mL)中之溶液中。封蓋小瓶，且將混合物在80℃下加熱隔夜。反應用幾滴水淬滅。接著進一步稀釋混合物且使用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈外消旋混合物形式之所要產物。藉由對掌性管柱(Chiralcel AD-H，5uM，20×250mm，80% EtOH/己烷，流速：18毫升/分鐘)分離外消旋混合物以得到兩個峰。異構物1(首先溶離)：C18H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.1。異構物2(其次溶離)：C18H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.1。
實例41. [(1R,2S,4S)-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈及[(1S,2R,4R)-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈
步驟1. [(1R,2S,4S)-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)
根據實例34，步驟12之程序，使用{(1R,2S,4S)-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-2-甲氧基環己基}乙腈(外消旋)及原乙酸三乙酯作為起始物質製備此化合物。C18H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.1。
步驟2. [(1R,2S,4S)-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈及[(1S,2R,4R)-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基--2-羥基環己基]乙腈
此化合物係根據實例40，步驟2中所述之程序製備，使用[(1R,2S,4S)-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)替代[(1R,2S,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈(外消旋)作為起始物質。藉由對掌性管柱(Chiralcel AD-H，5uM，20×250mm，80% EtOH/己烷，流速：18毫升/分鐘)分離外消旋混合物以得到兩個峰。異構物1(首先溶離)：C17H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=327.1；實驗值：327.0。異構物2(其次溶離)：C17H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=327.1；實驗值：327.0。
實例42. [(2R,5S)-5-(2-異丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
步驟1：[(2R,5S)-5-(2-異丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇
在室溫下攪拌2-甲基丙醯胺(71.4mg，0.820mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(154mg，0.812mmol)於THF(2mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.5mL)中並添加至{(2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲醇(69.2mg，0.248mmol)於乙醇(1.7mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌混合物1小時。冷卻反應混合物至室溫，用甲醇稀釋，且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物。C17H22N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=332.1；實驗值：332.1。
步驟2 4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-異丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯
此化合物係根據實例38，步驟3中所述之程序製備，使用[(2R,5S)-5-(2-異丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇替代[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇作為起始物質。C24H28N3O4S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=486.1；實驗值：486.0。
步驟3. [(2R,5S)-5-(2-異丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
此化合物係根據實例38，步驟4中所述之程序製備，使用4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-異丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯替代4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯作為起始物質。1H NMR(CDCl3,300MHz)δ 9.06(1H,s),7.64(1H,d,J=5.5Hz),7.54(1H,d,J=5.5Hz),4.59(2H,m),4.04(2H,m),3.28(1H,m),2.85(1H,m),2.64(2H,m),2.13(2H,m),1.81(1H,m),1.44(6H,m)ppm。C18H21N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.0。
實例43. [(2R,5S)-5-(2-環丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
步驟1：[(2R,5S)-5-(2-環丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇
在室溫下攪拌環丙烷甲醯胺(72.6mg，0.853mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.161g，0.845mmol)於THF(2mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.48mL)中並添加至{(2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲醇(72.0mg，0.258mmol)於乙醇(1.8mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌混合物1小時。冷卻反應混合物至室溫，用甲醇稀釋，且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物。C17H20N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=330.1；實驗值：330.0。
步驟2 4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-環丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯
此化合物係根據實例38，步驟3中所述之程序製備，使用[(2R,5S)-5-(2-環丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇替代[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲醇作為起始物質。C24H26N3O4S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=484.1；實驗值：484.0。
步驟3. [(2R,5S)-5-(2-環丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并]3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
此化合物係根據實例38，步驟4中所述之程序製備，使用4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-環丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯替代4-甲基苯磺酸[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]甲酯作為起始物質。C18H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=339.1；實驗值：339.0。
實例44. ((2S,5R)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b] 吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈
步驟1：[(1R)-1-(羥基甲基)丙-2-烯-1-基]胺基甲酸第三丁酯
向(2R)-2-胺基丁-3-烯-1-醇鹽酸鹽(0.94g，7.6mmol)(來自Astatech公司)於乙醇(30mL)中之溶液中添加三乙胺(1.27mL，9.13mmol)及二碳酸二-第三丁酯(1.99g，9.13mmol)。將反應溶液在室溫下攪拌隔夜，接著濃縮且用急驟層析純化(用含0-50%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈無色油狀之所要產物。
步驟2：[(1R)-1-({[1-(羥基甲基)丙-2-烯-1-基]氧基}甲基)丙-2-烯-1-基]胺基甲酸第三丁酯
裝有[(1R)-1-(羥基甲基)丙-2-烯-1-基]胺基甲酸第三丁酯(1.88g，10.0mmol)、參(二苯亞甲基丙酮)二鈀(0)(134mg，0.146mmol)、N,N'-(1R,2R)-環己烷-1,2-二基雙[2-(二苯基膦基)-1-萘甲醯胺](350mg，0.44mmol)、4-二甲基胺基吡啶(370mg，3.0mmol)之燒瓶用N2三次淨化，且接著用二氯甲烷(100mL)填充，隨後添加含1.0M三乙基硼烷之THF(0.294mL，0.294mmol)。在攪拌10分鐘之後，添加2-乙烯基環氧乙烷(0.704g，10.0mmol)，且將所得混合物攪拌隔夜。反應用二氯甲烷及飽和NaHCO3溶液稀釋。分離有機層且經Na2SO4乾燥，過濾且濃縮。粗殘餘物用急驟層析純化(用0-50%乙酸乙酯/己烷溶離)以得到所要產物(0.271g，49%)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 5.85(1H,m),5.67(1H,m),5.84~5.17(4H,m),4.83(1H,m),4.30(1H,br s),3.83(1H,m),3.69(1H,dd,J=4.5及6.9Hz),3.54(2H,m),3.36(1H,dd,J=4.5及6.9Hz),1.45(9H,s)ppm。
步驟3：乙酸2-({(2R)-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]丁-3-烯-1-基}氧基)丁-3-烯-1-基酯
此化合物係根據實例19，步驟4中所述之程序製備，使用[(1R)-1-({[1-(羥基甲基)丙-2-烯-1-基]氧基}甲基)丙-2-烯-1-基]胺基甲酸第三 丁酯替代[(1S)-1-({[1-(羥基甲基)丙-2-烯-1-基]氧基}甲基)丙-2-烯-1-基]胺基甲酸第三丁酯作為起始物質。
步驟4. 乙酸{(5S)-5-[(第三丁氧基羰基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯
此化合物係根據實例19，步驟5中所述之程序製備，使用乙酸2-({(2R)-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]丁-3-烯-1-基}氧基)丁-3-烯-1-基酯替代乙酸2-({(2S)-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]丁-3-烯-1-基}氧基)丁-3-烯-1-基酯作為起始物質。
步驟5. 乙酸[(5R)-5-胺基-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基]甲酯
此化合物係根據實例19，步驟6中所述之程序製備，使用乙酸{(5R)-5-[(第三丁氧基羰基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯替代乙酸{(5S)-5-[(第三丁氧基羰基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯作為起始物質。C8H14NO3之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=172.1；實驗值：172.1。
步驟6. 乙酸{(5R)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯
此化合物係根據實例19，步驟7中所述之程序製備，使用乙酸[(5R)-5-胺基-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基]甲酯替代乙酸[(5S)-5-胺基-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基]甲酯作為起始物質。C15H16N3O5S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=350.1；實驗值：350.0。
步驟7. 乙酸{(5R)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲酯
此化合物係根據實例19，步驟8中所述之程序製備，使用乙酸{(5R)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯替代乙酸{(5S)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯作為起始物質。C15H20N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=322.1；實驗值：322.0。
步驟8. (1R)-1-{1-[(3R)-6-(羥甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
此化合物係根據實例19，步驟9中所述之程序製備，使用 乙酸{(5R)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲酯替代乙酸{(5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲酯作為起始物質。C16H20N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=334.1；實驗值：334.0。
步驟9：4-甲基苯磺酸((2S,5R)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯及4-甲基苯磺酸((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯
此化合物係根據實例20，步驟1中所述之程序製備，使用(1R)-1-{1-[(3R)-6-(羥基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇替代(1R)-1-{1-[(3S)-6-(羥基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇作為起始物質。C23H26N3O5S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=488.1；實驗值：488.1。
步驟10：((2S,5R)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈
此化合物係根據實例20，步驟2中所述之程序製備，使用4-甲基苯磺酸((2S,5R)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯替代4-甲基苯磺酸((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯作為起始物質。C17H19N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=343.1；實驗值：343.0。
實例45：((2R,5S)-5-{2-[(1S)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈
步驟1：(1S)-1-{1-[(3S,6R)-6-(羥甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
在室溫下攪拌(2S)-2-羥基丙醯胺(86.6mg，0.972mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(185mg，0.972mmol)於THF(2mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.50mL)中並添加至{(2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲醇(65.0mg，0.233mmol)於乙醇(1.8mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌混合物1小時。冷卻混合物至室溫，用甲醇稀釋，且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈白色固體狀之所要產物(45mg，58%)。C16H20N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=334.1；實驗值：334。
步驟2：4-甲基苯磺酸((2R,5S)-5-{2-[(1S)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯
向(1S)-1-{1-[(3S,6R)-6-(羥基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇(48.0mg，0.144mmol)於二氯甲烷(2.09mL)及吡啶(70.4μL，0.871mmol)中之溶液中添加對甲苯磺醯氯(35.0mg，0.184mmol)及4-二甲基胺基吡啶(1.1mg，0.0092mmol)。在室溫下將反應混合物攪拌隔夜。濃縮反應混合物，用甲醇稀釋，且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈白色固體狀之所要產物(42mg，60%)。C23H26N3O5S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=488.1；實驗值：488.1。
步驟3. ((2R,5S)-5-{2-[(1S)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈
此化合物係根據實例20，步驟2中所述之程序製備，使用4-甲基苯磺酸((2R,5S)-5-{2-[(1S)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯替代4-甲基苯磺酸((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯作為起始物質。C17H19N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=343.1；實驗值：343.0。
實例46：[4-(8-甲基吡唑并[1,5-c]噻吩并[2,3-e]嘧啶-9-基)苯基]乙腈
步驟1：3-溴-5-甲基-1-{[2-(三甲基矽烷基)乙氧基]甲基}-1H-吡唑
在0℃下向3-溴-5-甲基-1H-吡唑(來自Ark Pharm,6.4g，40mmol)於四氫呋喃(263mL)中之溶液中添加氫化鈉(3.2g，80mmol)。在攪拌30分鐘之後，添加[β-(三甲基矽烷基)乙氧基]甲基氯化物(8.4mL，48mmol)且使反應混合物歷經2小時升溫至室溫。反應混合物用乙酸乙酯及水稀釋。水層用乙酸乙酯萃取。合併之有機層用鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，過濾且濃縮。粗物質用急驟層析純化(用含0-15%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈無色油狀之所要產物(12g，100%)。C10H20BrN2OSi之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=291.1；實驗值：291.0。
步驟2：(2-溴-3-噻吩基)胺基甲酸第三丁酯
向3-噻吩基胺基甲酸第三丁酯(來自Ark Pharm,3.97g，19.9mmol)於二氯甲烷(190mL)中之溶液中逐份添加N-溴丁二醯亞胺(3.54g，19.9mmol)。在40℃下加熱所得混合物20分鐘。濃縮反應溶液並過濾沈澱且濾液用急驟層析純化(用含0-10%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈白色固體狀之所要產物。C5H5BrNO2S之LCMS計算值：(M+H-t-Bu)+：m/z=221.9；實驗值：221.8。
步驟3：[2-(三甲基錫烷基)-3-噻吩基]胺基甲酸第三丁酯
在-78℃下向(2-溴-3-噻吩基)胺基甲酸第三丁酯(4.81g，17.3mmol)於THF(42mL)中之溶液中添加含2.5M正丁基鋰之己烷(15.2mL，38.0mmol)。在攪拌45分鐘之後，添加含1.0M氯三甲基錫烷之THF(19.0mL，19.0mmol)。使所得混合物升溫至室溫。反應用鹽水(70mL)淬滅且用乙酸乙酯(2×)萃取。合併之有機層用鹽水洗滌，經MgSO4乾燥，過濾且濃縮以得到所要產物。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 7.49(1H,d,J=4.8Hz),7.13(1H,d,J=4.8Hz),6.39(1H,brs),1.50(9H,s),0.36(9H,s)ppm。
步驟4：[2-(5-甲基-1-{[2-(三甲基矽烷基)乙氧基]甲基}-1H-吡唑-3-基)-3- 噻吩基]胺基甲酸第三丁酯
裝有3-溴-5-甲基-1-{[2-(三甲基矽烷基)乙氧基]甲基}-1H-吡唑(2.99g，10.3mmol)、[2-(三甲基錫烷基)-3-噻吩基]胺基甲酸第三丁酯(4.40g，11.3mmol)、氟化銫(3.4g，23mmol)及預研磨乙酸鈀及二環己基(2',4',6'-三異丙基聯苯-2-基)膦(190mg，0.20mmol)之微波小瓶用氮氣淨化三次。添加1,2-二甲氧基乙烷(10mL)且將所得懸浮液在80℃下加熱隔夜。在冷卻至室溫之後，混合物用乙酸乙酯稀釋且經矽膠墊過濾。矽膠墊用乙酸乙酯洗滌。在真空中移除溶劑且殘餘物用急驟層析純化(用含0-20%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到所要產物。C19H32N3O3SSi之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=410.2；實驗值：410.2。
步驟5：8-甲基吡唑并[1,5-c]噻吩并[2,3-e]嘧啶
向[2-(5-甲基-1-{[2-(三甲基矽烷基)乙氧基]甲基}-1H-吡唑-3-基)-3-噻吩基]胺基甲酸第三丁酯(3.2g，7.8mmol)於二氯甲烷(23mL)中之溶液中添加三氟乙酸(23mL)。在室溫下攪拌5小時之後，移除溶劑。將殘餘物溶解於THF(40mL)中且用1,1-二甲氧基-N,N-二甲基甲胺(1.56mL，11.7mmol)處理。在80℃下加熱所得溶液1小時。在減壓下移除溶劑。粗物質用急驟層析純化(用含0-20%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈白色固體狀之所要產物。1H NMR(300MHz,CD3OD)δ 9.09(1H,s),7.81(1H,d,J=5.3Hz),7.45(1H,d,J=5.3Hz),6.60(1H,s),2.49(3H,s)ppm。C9H8N3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=190.0；實驗值：190.0。
步驟6：9-溴-8-甲基吡唑并[1,5-c]噻吩并[2,3-e]嘧啶
向8-甲基吡唑并[1,5-c]噻吩并[2,3-e]嘧啶(1.01g，5.34mmol)於二氯甲烷(30mL)中之溶液中添加N-溴丁二醯亞胺(0.959g，5.39mmol)。在攪拌1小時之後，濃縮反應溶液，且所得殘餘物用急驟層析純化(用含0-20%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到呈白色固體狀之所要產物。1H NMR(300MHz,CD3OD)δ 9.11(1H,s),7.94(1H,d,J=5.3Hz),7.52(1H,d,J=5.3Hz),2.48(3H,s)ppm。C9H7BrN3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=268.0；實驗值：267.9。
步驟7：[4-(8-甲基吡唑并[1,5-c]噻吩并[2,3-e]嘧啶-9-基)苯基]乙腈
裝有9-溴-8-甲基吡唑并[1,5-c]噻吩并[2,3-e]嘧啶(48.0mg，0.179mmol)、[4-(氰基甲基)苯基]硼酸(來自Aldrich，51.9mg，0.322mmol)、碳酸鈉(47.4mg，0.448mmol)、[1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II)與二氯甲烷之錯合物(1：1)(15mg，0.018mmol)、DMF(1.3mL)及水(0.13mL)之微波小瓶用N2淨化且接著在95℃下攪拌10小時。反應用乙酸乙酯及水稀釋。有機層用鹽水洗滌，經MgSO4乾燥，過濾且濃縮。粗物質用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(35mg，64%)。C17H13N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=305.1；實驗值：305.0。
實例47：[反-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈
在120℃下攪拌{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(20.1mg，0.0702mmol)及1,1,1-三乙氧基丙烷(0.0428mL，0.213mmol)於乙酸(0.2mL)中之混合物30分鐘。混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(13mg，57%)。C18H21N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=325.1；實驗值：325.1。
實例48：[反-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈
此化合物係根據實例47中所述之程序製備，使用原乙酸三乙酯替代1,1,1-三乙氧基-丙烷作為起始物質。C17H19N4之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=311.1；實驗值：311.1。
實例49. ((1R,3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環戊基)乙腈三氟乙酸鹽
步驟1. (1R,3S)-3-胺基環戊烷甲酸乙酯三氟乙酸鹽
向(1R,3S)-3-[(第三丁氧基羰基)胺基]環戊烷甲酸(來自Acros，0.46g，2.0mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(4.6mL)中之溶液中添加碳酸氫鈉(0.34g，4.0mmol)及碘乙烷(0.64mL，8.0mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。混合物用乙酸乙酯稀釋，接著用飽和碳酸氫鈉、水(2×)及鹽水洗滌。乾燥(Na2SO4)有機物，過濾，且濃縮以得到粗酯。向粗酯中添加二氯甲烷(3.0mL)及三氟乙酸(1.0mL，13mmol)。攪拌所得溶液1小時，接著濃縮且在真空中乾燥以得到0.25g(46%)標題化合物。C8H16NO2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=158.1；實驗值：158.1。
步驟2. (1R,3S)-3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環戊烷甲酸乙酯
向7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(0.18g，0.84mmol)及(1R,3S)-3-胺基環戊烷甲酸乙酯三氟乙酸鹽(0.25g，0.92mmol)於異丙醇(2.3mL)中之攪拌混合物中添加N,N-二異丙基乙胺(0.73mL，4.2mmol)。在90℃下攪拌所得混合物100分鐘，且接著蒸發溶劑。粗殘餘物在矽膠上純化，用含10-60% EtOAc之己烷溶離以得到0.15g(55%)所要產物。C15H18N3O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=336.1；實驗值：336.0。
步驟3. {(1R,3S)-3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環戊基}甲醇
在攪拌下在約0℃下添加四氫鋁酸鋰(20.4mg，0.537mmol)至(1R,3S)-3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環戊烷甲酸乙酯(0.15g，0.45mmol)於四氫呋喃(4.0mL)中之溶液中。保持所得混合物冷卻且攪拌40分鐘。進行Fieser處理，隨後經矽藻土過濾且濃縮。使用矽膠純化粗物質，用含40-100% EtOAc之己烷溶離以得到70mg(50%)所要產物。C13H16N3O3S 之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=294.1；實驗值：294.0
步驟4. {(1R,3S)-3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環戊基}乙腈
在攪拌下在約0℃下添加甲烷磺醯氯(24.0μL，0.310mmol)至{(1R,3S)-3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環戊基}甲醇(70mg，0.2mmol)及三乙胺(66.5μL，0.477mmol)於二氯甲烷(2.1mL)中之溶液中。使所得混合物升溫至室溫且攪拌隔夜。混合物用二氯甲烷稀釋，接著用水及鹽水洗滌。乾燥(MgSO4)有機物，過濾，且濃縮以得到亮黃色膠狀物。向粗甲磺酸酯中添加二甲亞碸(2.0mL)及氰化鈉(22mg，0.45mmol)。在室溫下攪拌所得混合物。在2小時之後，使溫度增加至80℃且攪拌3小時。在冷卻之後，添加EtOAc及鹽水。分離各層且有機物用水(2×)洗滌，乾燥(Na2SO4)，過濾且濃縮。粗物質在矽膠上純化，用含10-70% EtOAc之己烷溶離以得到8mg(10%)所要產物。C14H15N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=303.1；實驗值：303.0。
步驟5. {(1R,3S)-3-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環戊基}乙腈
將{(1R,3S)-3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環戊基}乙腈(8mg，0.03mmol)及10%鈀/碳(4mg)於甲醇(0.3mL)中之混合物在H2(氣球)氛圍下攪拌隔夜。過濾混合物且濃縮以得到7mg所要產物。C14H17N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=273.1；實驗值：273.0。
步驟6. ((1R,3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環戊基)乙腈三氟乙酸鹽
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(7.4mg，0.083mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(14.7mg，0.0776mmol)於四氫呋喃(0.15mL)中之混合物50分鐘，接著濃縮。將殘餘物溶解於乙醇(0.1mL)中，且接著添加此溶液至於小瓶中的{(1R,3S)-3-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環戊基}乙腈(7.0mg，0.026mmol)於乙醇(0.1mL)中之溶液中。在80℃下攪拌所得混合物1小時。在冷卻之後，使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.05% TFA之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化混合物以得到3.6mg(32%)呈TFA鹽形式之所要產物。C17H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=327.1；實驗值：327.0。
實例50. (3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-甲酸乙酯
步驟1. (3S)-3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯
在90℃下攪拌7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(166mg，0.774mmol)、(3S)-3-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯(來自Aldrich，186mg，0.929mmol)及三乙胺(0.32mL，2.3mmol)於異丙醇(1.8mL)中之混合物2小時。在冷卻至室溫之後，觀測到固體。添加水，此導致形成更多固體。過濾黃色固體，用水洗滌，且乾燥以得到0.26g所要產物。C17H23N4O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=379.1；實驗值：379.0。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 9.40(s,1H),9.29(s,1H),7.84(d,J=5.5Hz,1H),7.49(d,J=5.5Hz,1H),4.42(m,1H),3.83(m,1H),3.46(m,3H),2.12(m,1H),1.83(m,3H),1.41(s,9H)ppm。
步驟2. (3S)-3-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯
將(3S)-3-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯(0.26g，0.69mmol)及10%鈀/碳(80mg)於甲醇(5.0mL)中之混合物在H2(氣球)氛圍下攪拌隔夜。混合物經矽藻土墊過濾且濃縮以得到0.24g所要產物。C17H25N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=349.2；實驗值：349.0。
步驟3. (3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-甲酸第三丁酯
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(197mg，2.21mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(395mg，2.08mmol)於四氫呋喃(4.0mL)中之混合物75分鐘，接著濃縮。將殘餘物溶解於乙醇(1.5mL)中且接著添加此溶液至於小瓶中的(3S)-3-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]哌啶-1-甲酸第三丁酯(0.24 g，0.69mmol)於乙醇(3.5mL)中之溶液中。在80℃下攪拌所得混合物2小時。蒸發溶劑且粗物質在矽膠上純化，用含0-10% MeOH之二氯甲烷溶離以得到250mg(86%)所要產物。C20H27N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=403.2；實驗值：403.1。
步驟4. (1R)-1-{1-[(3S)-哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽
向(3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-甲酸第三丁酯(0.25g，0.62mmol)於二氯甲烷(3.5mL)中之溶液中添加含4.0M氯化氫之1,4-二噁烷(1.2mL，5.0mmol)。即刻形成沈澱。在室溫下攪拌反應2小時。蒸發溶劑且在真空中乾燥固體以得到0.21g呈HCl鹽形式之產物。C15H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=303.1；實驗值：303.0。
步驟5. (3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-甲酸乙酯
向(1R)-1-{1-[(3S)-哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽(15mg，0.044mmol)及三乙胺(18.5μL，0.133mmol)於二氯甲烷(0.3mL)中之混合物中添加氯甲酸乙酯(5.1μL，0.0531mmol)。攪拌所得混合物直至完成，接著蒸發溶劑。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化粗殘餘物以得到5.6mg(34%)所要產物。C18H23N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=375.1；實驗值：375.0。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 9.08(d,J=1.3Hz,1H),7.69(dd,J=5.5及1.3Hz,1H),7.62(d,J=5.5Hz,1H),5.21(d,J=6.7Hz,1H),4.83-4.68(m,1H),4.43-4.23(m,2H),4.15(q,J=6.9Hz,2H),3.93-3.66(m,1H),3.18-3.01(m,1H),2.76-2.60(m,1H),2.20-2.10(m,1H),2.00(d,J=13.8Hz,1H),1.79(d,J=6.4Hz,3H),1.70-1.61(m,2H),1.30-1.16 (m,3H)ppm。
實例51. 3-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)-3-側氧基丙腈三氟乙酸鹽
向(1R)-1-{1-[(3S)-哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽(15mg，0.044mmol)(實例50，步驟4)、氰基乙酸(4.5mg，0.053mmol)及三乙胺(18.5μL，0.133mmol)於二氯甲烷(0.3mL)中之混合物中添加六氟磷酸N,N,N',N'-四甲基-O-(7-氮雜苯并三唑-1-基)(25.2mg，0.0664mmol)。在室溫下攪拌所得混合物。在2小時之後，進行第二次添加氰基乙酸(4.5mg，0.053mmol)且攪拌隔夜。蒸發溶劑且使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.05% TFA之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化殘餘物以得到3.4mg(16%)所要產物。C18H20N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=370.1；實驗值：370.0。
實例52. (1R)-1-{1-[(3S)-1-(4,4,4-三氟丁醯基)哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
使用與實例51之程序類似之程序製備此化合物，其中用4,4,4-三氟丁酸替代氰基乙酸且不進行第二次添加。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化粗物質以得到9.5mg(50%)所要產物。C19H22F3N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=427.1；實驗值：427.0。
實例53. (1R)-1-(1-{(3S)-1-[3-(1H-吡唑-4-基)丙醯基]哌啶-3-基}-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇
使用與實例52之程序類似之程序製備此化合物，其中用3-(1H-吡唑-4-基)丙酸(7.9mg，0.0567mmol)替代4,4,4-三氟丁酸。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化粗物質以得到6.5mg(32%)所要產物。C21H25N6O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=425.2；實驗值：425.1。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 9.04(s,1H),7.64(dd,J=11.8及6.2Hz,1H),7.57(d,J=5.6Hz,1H),7.44(s,1H),7.27(s,1H),5.26(d,J=7.1Hz,1H),4.82(d,J=8.5Hz,2H),4.07-3.86(m,2H),3.58-3.45(m,1H),3.36-3.24(m,1H),2.96-2.56(m,6H),2.22-1.89(m,2H),1.78(d,J=6.4Hz,4H)ppm。
實例54. (1R)-1-{1-[(3S)-1-(3-吡啶-3-基丙醯基)哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
使用與實例52之程序類似之程序製備此化合物，其中用3-吡啶-3-基丙酸(8.5mg，0.057mmol)替代4,4,4-三氟丁酸。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化粗物質以得到6.8mg(33%)所要產物。C23H26N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=436.2；實驗值：436.0。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 9.09(s,1H),8.52(s,1H),8.45(d,J=4.7Hz,1H),8.30(s,1H),7.70-7.56(m,2H),7.29-7.25(m,1H),5.28(s,1H),4.92-4.61(m,2H),4.06-3.81(m,0H),3.56(s,1H),3.20-3.09(m,1H),3.00-2.88(m,2H),2.78-2.60(m,5H),2.20-2.00(m,1H),1.86(d,J=6.2Hz,3H),1.80-1.65(m,2H)ppm。
實例55. (1R)-1-{1-[(3S)-1-(3-苯基丁醯基)哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d] 噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
使用與實例52之程序類似之程序製備此化合物，其中用3-苯基丁酸(9.3mg，0.057mmol)替代4,4,4-三氟丁酸。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化粗物質以得到8.3mg(39%)所要產物。C25H29N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=449.2；實驗值：449.0。
實例56. 3-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)丙腈
向(1R)-1-{1-[(3S)-哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽(15.0mg，0.0443mmol)(實例50，步驟4)於乙腈(0.3mL)中之溶液中添加依次添加1,8-二氮雜雙環[5.4.0]十一-7-烯(26μL，0.18mmol)及2-丙烯腈(5.8μL，0.089mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。蒸發溶劑且殘餘物藉由RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到5.3mg(34%)所要產物。C18H22N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=356.2；實驗值：356.1。
實例57. 1R)-1-{1-[(3S)-1-(3-苯基丙醯基)哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
向(1R)-1-{1-[(3S)-哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽(15mg，0.044mmol)(實例50，步驟4)及三乙胺(24.7μL，0.177mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(0.3mL)中之混合物中添加苯丙醯氯(8.6μL，0.058mmol)。在室溫下攪拌所得混合物90分鐘。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化混合物以得到6.5mg(34%)所要產物。C24H27N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=435.2；實驗值：435.1。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 9.07(s,1H),7.71-7.66(m,1H),7.65-7.57(m,1H),7.34-7.27(m,2H),7.26-7.16(m,2H),7.12(d,J=6.9Hz,1H),5.21(s,1H),4.83(d,J=13.1Hz,2H),4.78-4.64(m,1H),4.04-3.87(m,1H),3.61-3.23(m,3H),3.04-2.85(m,2H),2.77-2.60(m,2H),2.15(s,1H),1.97(d,J=14.4Hz,1H),1.81(d,J=6.5Hz,2H),1.50(d,J=13.1Hz,2H)ppm。
實例58. 4-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)-4-側氧基丁腈
步驟1. 4-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)-4-側氧基丁酸
向(1R)-1-{1-[(3S)-哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽(30.0mg，0.0885mmol)(實例50，步驟4)及三乙胺(37.0μL，0.266mmol)於二氯甲烷(0.5mL)中之溶液中添加3-(甲氧甲醯基)丙醯氯(12.0μL，0.0974mmol)。在室溫下攪拌所得混合物2小時。添加水及二氯甲烷且分離各層。濃縮有機物。將粗殘餘物溶解於甲醇(0.5mL)、四氫呋喃(50μL)及水(40μL)中。添加氫氧化鋰單水合物(18mg，0.44mmol)且在室溫下攪拌混合物3小時。藉由添加1N HCl使得混合物呈略微酸性，接著濃縮。將混合物溶解於二氯甲烷中，攪拌，過濾且濃縮以得到37mg澄清粗酸。C19H23N4O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=403.1；實驗值： 403.2。
步驟2. 4-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)-4-側氧基丁醯胺
向4-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)-4-側氧基丁酸(35mg，0.087mmol)、碳酸銨(42mg，0.43mmol)及三乙胺(18.2μL，0.130mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(0.6mL)中之混合物中添加六氟磷酸苯并三唑-1-基氧基參(二甲基胺基)鏻(76.9mg，0.174mmol)。在室溫下攪拌所得混合物2.5小時。混合物用乙酸乙酯稀釋，接著用飽和NaHCO3、水及鹽水洗滌。LCMS顯示大部分所要產物保持在水層中。濃縮水層以得到白色固體。在約1：1 MeOH/二氯甲烷中攪拌固體且接著過濾以得到40mg粗產物。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化粗物質以得到6mg所要產物。C19H24N5O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=402.2；實驗值：402.0。
步驟3. 4-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)-4-側氧基丁腈
在攪拌下在約0℃下向4-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)-4-側氧基丁醯胺(5.5mg，0.014mmol)及三乙胺(9.6μL，0.069mmol)於四氫呋喃(0.2mL)中之混合物中添加三氟乙酸酐(4.8μL，0.034mmol)。保持所得混合物冷卻且攪拌2小時。濃縮混合物，接著使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到3mg(57%)所要產物。C19H22N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=384.1；實驗值：384.2。
實例59. 5-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}哌啶-1-基)-5-側氧基戊腈
使用與實例58之程序類似之程序製備此化合物，其中用3-甲氧甲醯基丁醯氯替代3-(甲氧甲醯基)丙醯氯。分離1.7mg(31%)所要化合物。C20H24N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=398.2；實驗值：398.2。
實例60. (1R)-1-{1-[1-(4,4,4-三氟丁基)哌啶-4-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
步驟1. (1R)-1-(1-哌啶-4-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇
使用與實例50，步驟4之程序類似之程序製備此化合物，其中用4-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯(來自Aldrich)替代(3S)-3-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯。C15H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=303.1；實驗值：303.1。
步驟2. (1R)-1-{1-[1-(4,4,4-三氟丁基)哌啶-4-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
向(1R)-1-(1-哌啶-4-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇(15.0mg，0.0496mmol)及4,4,4-三氟丁醛(9.4mg，0.0744mmol)於二氯甲烷(0.3mL)及N,N-二甲基甲醯胺(0.2mL)中之混合物中添加三乙醯氧基硼氫化四甲銨(48.4mg，0.0992mmol)之樹脂。將所得混合物攪拌隔夜。過濾混合物且濃縮，接著使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到7mg(34%)所要產物。C19H24F3N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=413.2；實驗值：413.1。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 9.06(s,1H),7.71-7.60(m,2H),5.21(s,1H),4.72-4.58(m,1H),3.70-3.57(m,6H),3.13(d,J=9.8Hz,2H),2.89-2.66(m,1H),2.49(t,J=6.9Hz,2H),2.34-2.18(m,2H),1.96(s,1H),1.86-1.74(m,2H),1.67(s,2H)ppm。
實例61. (4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基} 哌啶-1-基)乙腈三氟乙酸鹽
在室溫下攪拌(1R)-1-(1-哌啶-4-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇(15mg，0.050mmol)(實例60，步驟1)、溴乙腈(4.2μL，0.060mmol)及三乙胺(20.7μL，0.149mmol)於乙腈(0.3mL)中之混合物4小時。稀釋混合物且使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.05% TFA之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到4.2mg(18%)所要產物。C17H20N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=342.1；實驗值：342.0。
實例62. 3-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}吡咯啶-1-基)丙腈
步驟1. (1R)-1-{1-[(3S)-吡咯啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽
使用與實例50，步驟4之程序類似之程序製備此化合物，其中用(3S)-3-胺基吡咯啶-1-甲酸第三丁酯(來自Aldrich)替代(3S)-3-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯。C14H17N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=289.1；實驗值：289.0。1H NMR(300MHz,CD3OD)δ 9.39(s,1H),8.48(d,J=5.7Hz,1H),7.91(d,J=5.7Hz,1H),6.10-5.97(m,1H),5.35(q,J=6.4Hz,1H),4.11-3.91(m,3H),3.68(dt,1H),3.42(s,1H),2.99-2.77(m,2H),1.84(d,J=6.4Hz,2H),1.60(s,1H),1.32(dd,J=6.0及3.2Hz,2H)ppm。
步驟2. 3-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}吡咯啶-1-基)丙腈
在室溫下攪拌所得混合物3小時。向(1R)-1-{1-[(3S)-吡咯啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽(15mg，0.046 mmol)於乙腈(0.3mL)中之溶液中依次添加1,8-二氮雜雙環[5.4.0]十一-7-烯(28μL，0.18mmol)及2-丙烯腈(6.1μL，0.092mmol)。進一步稀釋混合物且使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到5.7mg(36%)所要產物。C17H20N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=342.1；實驗值：342.1。
實例63. 3-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}吡咯啶-1-基)-3-側氧基丙腈
使用與實例51之程序類似之程序製備此化合物，其中用(1R)-1-{1-[(3S)-吡咯啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽(實例62，步驟1)替代(1R)-1-{1-[(3S)-哌啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化粗產物以得到7mg(43%)所要產物。C17H18N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=356.1；實驗值：356.0。
實例64. (1R)-1-{1-[(3S)-1-(4,4,4-三氟丁基)吡咯啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
使用與實例60，步驟2之程序類似之程序製備此化合物，其中用(1R)-1-{1-[(3S)-吡咯啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽(實例62，步驟1)替代(1R)-1-(1-哌啶-4-基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇。C18H22F3N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=399.1；實驗值：399.1。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 9.08(s,1H),7.68(d,J =5.5Hz,1H),7.61(d,J=5.5Hz,1H),5.59(dd,J=8.2及3.6Hz,1H),5.27(q,J=6.4Hz,1H),3.49-3.30(m,2H),2.83(dd,J=10.5及8.2Hz,1H),2.74-2.52(m,5H),2.26-2.09(m,2H),1.81(t,J=7.0Hz,6H)ppm。
實例65. 4-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}吡咯啶-1-基)丁腈
向(1R)-1-{1-[(3S)-吡咯啶-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇鹽酸鹽(15mg，0.046mmol)及N,N-二異丙基乙胺(24μL，0.14mmol)於乙腈(0.2mL)中之混合物中添加4-溴-丁腈(5.1μL，0.051mmol)。在室溫下攪拌所得混合物4小時。稀釋混合物且使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到6.3mg(38%)所要產物。C18H22N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=356.2；實驗值：356.0。
實例66. 5-((3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}吡咯啶-1-基)戊腈
使用與實例65之程序類似之程序製備此化合物，其中用5-溴戊腈替代4-溴-丁腈。C19H24N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=370.2；實驗值：370.1。1H NMR(300MHz,DMSO-d 6)δ 8.98(s,1H),8.02(d,J=5.5Hz,1H),7.67(d,J=5.5Hz,1H),5.91(s,1H),5.67-5.57(m,1H),5.29(s,1H),3.26-3.10(m,2H),3.04(t,J=9.1Hz,1H),2.80(d,J=8.4Hz,1H),2.70-2.30(m,7H)(與溶劑重疊),1.72-1.56(m,6H)ppm。
實例67. ((1R,2R,4S)-2-胺基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈
步驟1. (1S,6R)-6-{[(苯甲基氧基)羰基]胺基}環己-3-烯-1-甲酸甲酯
在攪拌下在N2下向(1R,6S)-6-(甲氧基羰基)環己-3-烯-1-甲酸(5.0g，27mmol)(來自Alfa Aesar)於甲苯(50.0mL)中之溶液中依次添加三乙胺(9.1mL，65mmol)及二苯基膦酸疊氮化物(5.85mL，27.1mmol)。將所得混合物在85℃下攪拌隔夜(18小時)。添加苯甲醇(2.81mL，27.1mmol)且加熱混合物至回流(135℃)並攪拌隔夜。在冷卻之後，混合物用EtOAc稀釋且接著用飽和NaHCO3(2×)、水及鹽水洗滌。乾燥(Na2SO4)有機層，過濾，且濃縮。在真空中乾燥殘餘物以得到7.8g黃色油狀物。C16H20NO4之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=290.1；實驗值：290.0。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 7.38-7.27(m,5H),5.62(q,J=10.1Hz,2H),5.39(d,J=8.9Hz,1H),5.07(s,2H),4.28-4.19(m,1H),3.66(s,3H),2.81(d,J=3.2Hz,1H),2.56-2.12(m,4H)ppm。
步驟2. (1R,3S,4R,6S)-4-{[(苯甲基氧基)羰基]胺基}-7-氧雜雙環[4.1.0]庚烷-3-甲酸甲酯
在攪拌下在約0℃下添加間氯過氧苯甲酸(5.56g，32.2mmol)至(1S,6R)-6-{[(苯甲基氧基)羰基]胺基}環己-3-烯-1-甲酸甲酯(7.8g，27mmol)於二氯甲烷(150mL)中之溶液中。使混合物緩慢升溫至室溫且攪拌隔夜。混合物用二氯甲烷稀釋，接著用飽和NaHCO3(3×)洗滌。乾燥(MgSO4)有機層，過濾，且濃縮。粗物質在矽膠上純化，用含0-50% EtOAc之己烷溶離以得到4.7g(57%)呈白色固體狀之所要產物。C16H20NO5之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=306.1；實驗值：306.0。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 7.37-7.29(m,5H),5.75(d,J=9.9Hz,1H),5.04(s,2H),4.09(dtd,J=14.0,6.8,6.0及3.2Hz,1H),3.65(s,3H),3.18(d,J=5.9Hz,2H),2.60(dd,J=15.5及7.3Hz,1H),2.48(td,J=7.3,6.6及3.2Hz,1H),2.23-2.01(m,3H)ppm。
步驟3. (1S,2R,4R)-2-{[(苯甲基氧基)羰基]胺基}-4-羥基環己烷甲酸甲酯
向(1R,3S,4R,6S)-4-{[(苯甲基氧基)羰基]胺基}-7-氧雜雙環[4.1.0]庚烷-3-甲酸甲酯(1.9g，6.2mmol)於乙醇(30.0mL)中之混合物中添加四氫硼酸鈉(0.471g，12.4mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜(22小時)。反應用飽和NH4Cl淬滅，接著蒸發大部分溶劑。將殘餘物溶解於EtOAc中且用水洗滌，乾燥(Na2SO4)，過濾且濃縮。粗物質在矽膠上純化，用含40-100% EtOAc之己烷溶離以得到0.75g(39%)所要產物。C16H22NO5之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=308.1；實驗值：308.0。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 7.36-7.28(m,5H),6.02(d,J=9.0Hz,1H),5.05(s,2H),4.03(s,1H),3.87(s,1H),3.64(s,3H),2.68(s,1H),2.22-2.11(m,1H),1.97-1.67(m,5H),1.42(s,1H)ppm。
步驟4. (1S,2R,4R)-2-{[(苯甲基氧基)羰基]胺基}-4[(甲基磺醯基)氧基]環己烷甲酸酯
在攪拌下在約0℃下添加甲烷磺醯氯(79.6μL，1.03mmol)至(1S,2R,4R)-2-{[(苯甲基氧基)羰基]胺基}-4-羥基環己烷甲酸甲酯(243mg，0.791mmol)及三乙胺(0.22mL，1.6mmol)於二氯甲烷(4.0mL)中之混合物中。保持所得混合物冷卻且攪拌2小時。混合物用二氯甲烷稀釋，接著用水及鹽水洗滌。乾燥(MgSO4)有機層，過濾，且濃縮以得到白色固體。C17H24NO7S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=386.1；實驗值：386.0。
步驟5. (1S,2R,4S)-4-疊氮基-2-{[(苯甲基氧基)羰基]胺基}環己烷甲酸甲酯
向(1S,2R,4R)-2-{[(苯甲基氧基)羰基]胺基}-4-[(甲基磺醯基)氧基]環己烷甲酸甲酯(0.30g，0.78mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(2.6mL)中之溶液中添加疊氮化鈉(0.20g，3.1mmol)。加熱反應至80℃且攪拌2.5小時。在冷卻之後，將反應混合物傾入飽和NaHCO3/水中且用EtOAc(3×)萃取。合併之萃取物用鹽水洗滌，乾燥(Na2SO4)，且濃縮。粗物質在矽膠上純化，用含0-40% EtOAc之己烷溶離以得到187mg(72%)呈澄清膠狀之所要產物。C16H21N2O4之LCMS計算值：(M+H-28)+：m/z=305.2；實驗值：305.1。
步驟6. [(1R,2R,5S)-5-胺基-2-(氰基甲基)環己基]胺基甲酸苯甲酯
向[(1R,2R,5S)-5-疊氮基-2-(氰基甲基)環己基]胺基甲酸苯甲 酯(45mg，0.14mmol)於四氫呋喃(1.5mL)中之混合物中添加水(13μL，0.73mmol)及三苯基膦(150mg，0.29mmol)之樹脂。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。過濾混合物且在真空中乾燥以得到32mg粗產物。C16H22N3O2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=288.2；實驗值：288.0。粗物質不經進一步純化即使用。
步驟7. {(1R,2R,5S)-2-(氰基甲基)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}胺基甲酸苯甲酯
在90℃下攪拌7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(22.0mg，0.102mmol)、[(1R,2R,5S)-5-胺基-2-(氰基甲基)環己基]胺基甲酸苯甲酯(32mg，0.11mmol)及三乙胺(35.7μL，0.256mmol)於異丙醇(0.4mL)中之混合物2小時。冷卻混合物且在矽膠上純化，用含10-90% EtOAc之己烷溶離以得到28mg(59%)所要產物。C23H24N5O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=466.2；實驗值：466.1。
步驟8. [(1R,2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-2-(氰基甲基)環己基]胺基甲酸苯甲酯
在H2(氣球)氛圍下攪拌{(1R,2R,5S)-2-(氰基甲基)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}胺基甲酸苯甲酯(28mg，0.060mmol)及10%鈀/碳(7.0mg)於甲醇(0.44mL)中之混合物3小時。過濾混合物且濃縮以得到26mg所要產物。C23H26N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=436.2；實驗值：436.0。
步驟9. ((1R,2R,5S)-2-(氰基甲基)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)胺基甲酸苯甲酯
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(17.1mg，0.192mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(34.2mg，0.180mmol)於四氫呋喃(0.36mL)中之混合物75分鐘且接著濃縮。將殘餘物溶解於乙醇(0.14mL)中，且接著添加此溶液至於小瓶中的[(1R,2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-2-(氰基甲基)環己基]胺基甲酸苯甲酯(26mg，0.060mmol)於乙醇(0.36mL)中之溶液中。將所得混合物在80℃下攪拌隔夜。在冷卻之後，濃縮混合物且在矽膠上純化，用含0-10% MeOH之二氯甲烷溶離以得到18mg所要產物。 C26H28N5O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=490.2；實驗值：490.0。
步驟10. ((1R,2R,4S)-2-胺基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈
將((1R,2R,5S)-2-(氰基甲基)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)胺基甲酸苯甲酯(18mg，0.037mmol)及10%鈀/碳(24mg)於甲醇(0.27mL)中之混合物在H2(氣球)氛圍下攪拌隔夜。過濾混合物且濃縮。使用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化粗物質以得到3.2mg所要產物。C18H22N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=356.2；實驗值：356.1。
實例68. {(2R,5S)-5-[2-(1-胺基乙基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈三氟乙酸鹽
步驟1. [(2R,5S)-5-(2-乙醯基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
向((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈(154mg，0.450mmol)於二氯甲烷(2.0mL)中之溶液中依次添加碳酸氫鈉(110mg，1.31mmol)及戴斯-馬丁高碘烷(219mg，0.517mmol)。在室溫下攪拌所得混合物3小時。混合物用二氯甲烷稀釋，過濾且濃縮。粗物質在矽膠上純化，用含0-10% MeOH之二氯甲烷溶離以得到250mg呈白色膠狀之粗產物。C17H17N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=341.1；實驗值：341.0(M+H)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 9.23(s,1H),7.77(s,2H),4.52(t,J=11.1Hz,1H),4.07(dd,J=10.1及4.4Hz,2H),2.92-2.81(m,3H),2.70-2.64(m,2H),2.21-2.09(m,2H),1.83(qd,J=13.4及4.7Hz,1H),1.62(s,2H)ppm。
步驟2. {(2R,5S)-5-[2-(1-胺基乙基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶 -1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈三氟乙酸鹽
將[(2R,5S)-5-(2-乙醯基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈(0.10g，0.18mmol)、乙酸銨(136mg，1.76mmol)及氰基硼氫化鈉(28mg，0.44mmol)於甲醇(0.4mL)/乙腈(0.4mL)中之混合物在65℃下加熱隔夜。冷卻混合物且使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.05% TFA之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到27mg(46%)所要產物。C17H20N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=342.1；實驗值：342.0。
實例69. N-(1-{1-[(3S,6R)-6-(氰甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙基)乙醯胺
向{(2R,5S)-5-[2-(1-胺基乙基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈三氟乙酸鹽(8.0mg，0.018mmol)(實例68)及三乙胺(12μL，0.088mmol)於二氯甲烷(0.15mL)中之混合物中添加乙醯氯(2.0μL，0.028mmol)。在室溫下攪拌所得混合物3小時且接著濃縮。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化殘餘物以得到3.5mg(52%)所要產物。C19H22N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=384.1；實驗值：384.2。
實例70. ((2R,5S)-5-{2-[1-(甲基胺基)乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈
向{(2R,5S)-5-[2-(1-羥乙基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈(10.1mg，0.0295mmol)及三乙胺(12μL，0.088mmol)於二氯甲烷(0.18mL)中之冷卻混合物中添加甲烷磺醯氯(2.7μL，0.035mmol)。使所得混合物升溫至室溫且攪拌隔夜。混合物用二氯甲烷稀釋且用水(2×)洗滌。分離各層且濃縮有機物。向濃縮物中添加二氯甲烷(0.2mL)、三乙胺(18μL)及甲基氯化銨(6.0mg，0.088mmol)。在室溫下歷經週末(64小時)攪拌所得混合物，接著加熱至40℃持續3小時。濃縮混合物，接著使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到2mg(19%)所要產物。C18H22N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=356.2；實驗值：356.1。
實例71. {(2R,5S)-5-[2-(1-氟乙基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈
向{(2R,5S)-5-[2-(1-羥乙基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈(8.0mg，0.023mmol)於二氯甲烷(0.2mL)中之冷卻混合物中添加2-甲氧基-N-(2-甲氧基乙基)-N-(三氟-λ(4)-磺醯基)乙胺(4.7μL，0.026mmol)(Deoxo-Fluor)。使所得混合物升溫至室溫且攪拌隔夜。再添加Deoxo-Fluor(5μL)。在6小時之後，反應用幾滴水淬滅，接著濃縮。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化殘餘物以得到1.6mg(20%)所要產物。C17H18FN4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=345.1；實驗值：345.0。
實例72. [4-(羥甲基)-4-(1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈
步驟1. (8-胺基-1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-基)甲醇
在攪拌下在約0℃下分數份添加四氫鋁酸鋰(189mg，4.97mmol)至8-胺基-1,4-二氧雜螺[4.5]癸烷-8-甲酸(來自Aldrich，0.50g，2.5mmol)於四氫呋喃(20mL)中之溶液中。使所得混合物緩慢升溫至室溫且攪拌隔夜。進行Fieser處理(0.2mL H2O，0.2mL 10% NaOH，0.6mL H2O)，隨後經矽藻土過濾且濃縮以得到0.41g欲不經進一步純化即使用之所要產物。C9H18NO3之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=188.1；實驗值：188.0。
步驟2. {8-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-基}甲醇
將7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(229mg，1.07mmol)、(8-胺基-1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-基)甲醇(240mg，1.28mmol)及三乙胺(300μL，2mmol)於異丙醇(3.5mL)中之混合物在90℃下攪拌隔夜。在冷卻至室溫之後，添加水，此導致形成更多固體。過濾固體，用水洗滌，且乾燥以得到219mg(56%)所要產物。C16H20N3O5S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=366.1；實驗值：366.1。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 8.93(s,1H),7.78-7.75(m,2H),4.17(s,2H),4.02-3.84(m,4H),2.52(d,J=13.3Hz,2H),2.12-1.82(m,4H),1.78-1.44(m,4H)ppm。
步驟3. {8-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-基}甲醇
向{8-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-基}甲醇(219mg，0.599mmol)於甲醇(4.5mL)中之混合物中添加10%鈀/碳(76mg)。在H2(氣球)氛圍下攪拌混合物2天。混合物經矽藻土過濾且濃縮以得到0.20g粗產物，其不經進一步純化即直接用於下一步驟中。C16H22N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=336.1；實驗值：336.2。
步驟4. [8-(1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-1,4-二氧雜螺[4.5] 癸-8-基]甲醇
將{8-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]-1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-基}甲醇(90.0mg，0.268mmol)、原甲酸乙酯(112μL，0.671mmol)及對甲苯磺酸單水合物(5.1mg，0.027mmol)於甲苯(3.0mL)中之混合物在85℃下攪拌隔夜。混合物用EtOAc稀釋，接著用飽和碳酸氫鈉及鹽水洗滌。乾燥(Na2SO4)有機層，過濾且濃縮以得到50mg(50%)所要產物。C17H20N3O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=346.1；實驗值：346.0。
步驟5. 4-(羥甲基)-4-(1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己酮
在室溫下攪拌[8-(1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-1,4-二氧雜螺[4.5]癸-8-基]甲醇(0.13g，0.38mmol)及含3.0M氯化氫之水(2.0mL，6.0mmol)於丙酮(5mL)中之混合物5小時且接著在60℃下攪拌1小時。在冷卻之後，藉由添加2.0N NaOH使混合物呈略微鹼性。混合物用EtOAc(3×)萃取。乾燥(Na2SO4)合併之萃取物，過濾，且濃縮。粗物質在矽膠上純化，用含0-15% MeOH之二氯甲烷溶離以得到56mg(49%)所要產物。C15H16N3O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=302.1；實驗值：302.1。
步驟6. [4-(羥甲基)-4-(1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己亞基]乙腈
在攪拌下在約0℃下向氰基甲基膦酸二乙酯(38.6mg，0.218mmol)於四氫呋喃(0.5mL)中之溶液中添加氫化鈉(10.5mg，0.262mmol)。向此中添加4-(羥基甲基)-4-(1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己酮(56mg，0.18mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(0.45mL)中之溶液。使混合物升溫至室溫且攪拌隔夜。反應用水淬滅，從而導致形成固體。過濾固體以得到18mg純淨所要產物。濾液用EtOAc稀釋，用水洗滌，且濃縮以得到額外39mg粗產物。C17H17N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=325.1；實驗值：325.0。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 8.37(s,1H),8.15(s,1H),7.47(d,J=5.6Hz,1H),7.18(d,J=5.6Hz,1H),5.20(s,1H),4.34(s,2H),2.80(d,J=4.0Hz,3H),2.59-2.29(m,4H),1.26(d,J=15.3Hz,2H)ppm。
步驟7. [4-(羥甲基)-4-(1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈
在H2(氣球)氛圍下攪拌[4-(羥基甲基)-4-(1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己亞基]乙腈(18mg，0.055mmol)及10%鈀/碳(5.9mg)於甲醇(0.6mL)中之混合物4.5小時。混合物經矽藻土墊過濾且濃縮。使用RP-HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化粗殘餘物以得到兩種異構物。在分析型HPLC(Waters SunFire C18，2.1×50mm，5μM；流速3毫升/分鐘；注射體積2μL；在3分鐘內自2%至80% B之梯度下(A=含0.025% TFA之水，B=乙腈))上：第一峰滯留時間1.05分鐘，C17H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=327.1；實驗值：327.0。第二峰滯留時間1.13分鐘，C17H19N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=327.1；實驗值：327.0。
實例73. {(2R,5S)-5-[2-(氰甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈
步驟1. [(3S)-6-(羥基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]胺基甲酸第三丁酯
在室溫下在H2氣球下攪拌含乙酸{(5S)-5-[(第三丁氧基羰基)胺基]-5,6-二氫-2H-哌喃-2-基}甲酯(來自實例19，步驟5)(3.47g，12.8mmol)及10%鈀/碳(1.4g)之甲醇(60mL)2小時。過濾反應混合物且濾液用含1.0M氫氧化鈉之水(12mL)處理。在攪拌4小時之後，濃縮反應溶液且用乙酸乙酯稀釋。分離有機層且用鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，且濃縮。用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化殘餘物以得到所要產物(0.77g，26%)。C6H14NO2之LCMS計算值：(M-100+H)+：m/z=132.1；實驗值：132.1。
步驟2. 甲烷磺酸{(5S)-5-[(第三丁氧基羰基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲酯
在0℃下用甲烷磺醯氯(0.222mL，2.87mmol)處理含[(3S)-6-(羥基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]胺基甲酸第三丁酯(331mg，1.43 mmol)之二氯甲烷(5mL)。在0℃下攪拌混合物1小時，接著濃縮且分配於乙酸乙酯與水之間。濃縮有機相且在矽膠上純化(用含0至50%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到所要產物(0.38g，86%)。C8H16NO6S之LCMS計算值：(M-t-Bu+H)+：m/z=254.1；實驗值：254.0。
步驟3. [(5S)-5-胺基四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈
將甲烷磺酸{(5S)-5-[(第三丁氧基羰基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}甲酯(308mg，0.996mmol)及氰化鈉(58mg，1.2mmol)於DMSO(3mL)中之混合物在90℃下攪拌隔夜。在冷卻至室溫之後，將混合物分配於乙酸乙酯與鹽水之間。有機層用水及鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，且濃縮以得到氰基中間物。中間物於二氯甲烷(4mL)中之溶液用含4M HCl之二噁烷(2mL)處理且在室溫下攪拌混合物2小時，接著濃縮以得到呈HCl鹽形式之所要產物。(42mg，30%)。C7H13N2O之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=141.1；實驗值：141.1。
步驟4. {(2R,5S)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈及{(2S,5S)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈
將含7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(1.18g，5.52mmol)、[(5S)-5-胺基四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈鹽酸鹽(1.01g，5.72mmol)及N,N-二異丙基乙胺(2.0mL，12mmol)之異丙醇(13mL)在50℃下加熱隔夜。移除溶劑且將固體溶解於二氯甲烷中且用急驟層析純化(20-90%乙酸乙酯/己烷)以得到兩種溶離份。在分析型HPLC(Waters SunFire C18，2.1×50mm，5uM，注射體積2uL且流速3毫升/分鐘，在3分鐘內自2%至80% B之梯度下(A=含0.025% TFA之水，B=乙腈))上：第一溶離份滯留時間1.715分鐘，C14H15N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=319.1；實驗值：319.1；第二溶離份滯留時間1.561分鐘，C14H15N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=319.1；實驗值：319.1。
步驟5. {(2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈
在室溫下使含{(2R,5S)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺 基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈(712mg，2.24mmol)(來自上一步驟之第一溶離份)及10%鈀/碳(360mg)之甲醇(15mL)經受H2氣球壓力2小時。過濾反應混合物並濃縮且用急驟層析純化(15%甲醇/二氯甲烷)以得到所要產物(604mg，94%)。C14H17N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=289.1；實驗值：289.0。
步驟6. {(2R,5S)-5-[2-(氰甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈
在室溫下攪拌2-氰基乙醯胺(80.8mg，0.960mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(181mg，0.952mmol)於THF(2mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.6mL)中並添加至{(2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈(85.0mg，0.295mmol)於乙醇(2mL)中之懸浮液中。將所得混合物在55℃下攪拌隔夜。冷卻反應至室溫且過濾固體。濾液用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.05%TFA之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到呈TFA鹽形式之所要產物。C17H16N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=338.1；實驗值：338.3。1H NMR(DMSO-d 6,500MHz)δ 9.24(s,1H),8.22(d,J=5.5Hz,1H),7.77(d,J=5.5Hz,1H),4.89(s,2H),4.67(br s,1H),4.20(m,2H),4.00(s,1H),2.96(dd,J=17.0,4.3Hz,1H),2.84(dd,J=17.0,6.6Hz,1H),2.49(m,1H),2.29(m,1H),2.06(m,1H),1.72(m,1H)ppm。
實例74. {(2S,5S)-5-[2-(氰甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈
步驟1. {(2S,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈
此化合物係根據實例73，步驟5中所述之程序製備，使用{(2S,5S)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈 (溶離份2，來自實例73，步驟4)替代{(2R,5S)-5-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈作為起始物質。C14H17N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=289.1；實驗值：289.0。
步驟2. {(2S,5S)-5-[2-(氰甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈
此化合物係根據實例73，步驟6中所述之程序製備，使用{(2S,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈替代{(2R,5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈作為起始物質。C17H16N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=338.1；實驗值：338.3。
實例75. N-[((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲基]甲烷磺醯胺
步驟1. (1R)-1-{1-[(3S,6R)-6-(疊氮基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
將4-甲基苯磺酸((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲酯(25mg，0.052mmol)及疊氮化鈉(5.0mg，0.077mmol)於DMF(0.5mL)中之混合物在60℃下攪拌隔夜。在冷卻至室溫之後，混合物用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(12mg，65%)。C16H19N6O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=359.1；實驗值：359.0。
步驟2. (1R)-1-{1-[(3S,6R)-6-(胺基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇
向(1R)-1-{1-[(3S,6R)-6-(疊氮基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇(12mg，0.034mmol)於甲 醇(0.2mL)中之溶液中添加10%鈀/碳(5.7mg)。將所得混合物在H2氣球下攪拌隔夜。反應混合物經矽藻土墊過濾且用甲醇洗滌。在減壓下移除溶劑以得到所要產物(11mg，99%)。C16H21N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=333.1；實驗值：333.1。
步驟3. N-[((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲基]甲烷磺醯胺
向(1R)-1-{1-[(3S,6R)-6-(胺基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇(11mg，0.033mmol)於甲醇(0.5mL)中之溶液中添加N,N-二異丙基乙胺(17μL，0.099mmol)及甲烷磺醯氯(2.8μL，0.036mmol)。在攪拌0.5小時之後，再添加等量甲烷磺醯氯。在攪拌20分鐘之後，反應溶液用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)純化以得到所要產物(5mg，37%)。C17H23N4O4S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=411.1；實驗值：411.1。
實例76. [((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)甲基]胺基甲酸異丙酯
向(1R)-1-{1-[(3S,6R)-6-(胺基甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇(11mg，0.032mmol)及三乙胺(22μL，0.16mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加含1.0M氯甲酸異丙酯之甲苯(39μL)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速30毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(0.9mg，7%)。C20H27N4O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=419.2；實驗值：419.0。
實例77. [反-4-(8-甲基吡唑并[1,5-c]噻吩并[2,3-e]嘧啶-9-基)環己基]乙腈
步驟1. 4-(羥甲基)環己醇
在0℃下向四氫鋁酸鋰(3.11g，81.9mmol)於THF(158mL)中之懸浮液中添加4-羥基環己烷甲酸乙酯(9.40g，54.6mmol)於THF(20mL)中之溶液。在相同溫度下攪拌30分鐘之後，反應用水(10mL)逐滴淬滅，接著用15% NaOH溶液(10mL)及水(30mL)淬滅。在攪拌10分鐘之後，反應混合物經矽藻土墊過濾，有機層用鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，過濾且在真空中濃縮。殘餘物藉由急驟層析純化(0-100%乙酸乙酯/己烷)以得到呈白色固體狀之所要產物(6.9g，97%)。
步驟2. 4-甲基苯磺酸(順-4-羥基環己基)甲酯及4-甲基苯磺酸(反-4-羥基環己基)甲酯
向4-(羥基甲基)環己醇(6.80g，52.2mmol)於二氯甲烷(400mL)及吡啶(10.6mL，130mmol)中之溶液中添加對甲苯磺醯氯(11.0g，57.4mmol)及4-二甲基胺基吡啶(410mg，3.3mmol)。在室溫下將反應混合物攪拌隔夜。反應混合物用1N HCl溶液稀釋且用二氯甲烷萃取。合併之有機物經Na2SO4乾燥，過濾且濃縮。粗物質用急驟層析純化(用含0-50%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到兩種溶離份。在分析型HPLC(Waters SunFire C18，2.1×50mm，5μM，注射體積2μL且流速3毫升/分鐘，在3分鐘內自2%至80% B之梯度下(A=含0.025% TFA之水，B=乙腈))上：第一溶離份滯留時間2.319分鐘，C14H21O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=285.1；實驗值：285.0；1H NMR1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 7.77(d,J=8.3Hz,1H),7.33(d,J=8.1Hz,1H),3.97(br s,1H),3.83(d,J=6.8Hz,2H),2.44(s,3H),1.76-1.58(m,6H),1.48(m,3H)ppm。
第二溶離份滯留時間2.222分鐘，C14H21O4S之LCMS計算 值：(M+H)+：m/z=285.1；實驗值：285.0。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 7.77(d,J=8.3Hz,2H),7.45(d,J=8.3Hz,2H),3.82(d,J=6.4Hz,2H),3.51(m,1H),2.50(d,J=8.0Hz,0H),2.44(s,3H),2.14-1.90(m,2H),1.80-1.52(m,3H),1.45-1.09(m,2H),1.09-0.87(m,2H)ppm。
步驟3. (順-4-羥基環己基)乙腈
在80℃下攪拌4-甲基苯磺酸(順-4-羥基環己基)甲酯(6.9g，24mmol)(來自上一步驟之第一溶離份)、氰化鈉(1.43g，29.1mmol)及DMF(86mL)之混合物1小時。在冷卻至室溫之後，混合物用乙酸乙酯及水稀釋。水層用乙酸乙酯萃取一次。合併之有機層經Na2SO4乾燥且濃縮。粗物質用急驟層析純化(用含0-50%乙酸乙酯之己烷之梯度溶離)以得到所要產物(2.5g，74%)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ 3.58(m,1H),2.27(d,J=6.3Hz,2H),2.02(m,2H),1.88(m,2H),1.78-1.45(m,2H),1.42-1.07(m,4H)ppm。
步驟4. (反-4-碘環己基)乙腈
在0℃下向(順-4-羥基環己基)乙腈(2.50g，18.0mmol)於二氯甲烷(80mL)中之溶液中添加1H-咪唑(1.47g，21.6mmol)、三苯基膦(5.65g，21.6mmol)，且隨後歷經45分鐘之時期分數份添加碘(5.47g，21.6mmol)。使所得懸浮液逐漸升溫至室溫。在室溫下攪拌隔夜之後，將混合物分配於Et2O(100mL)與水(100mL)之間。有機層用飽和Na2SO3溶液及鹽水洗滌，經MgSO4乾燥，過濾且濃縮。殘餘物藉由急驟層析純化(0-20%乙酸乙酯/己烷)以得到呈白色固體狀之所要產物(1.0g，22%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 4.04(m,1H),2.50-2.38(m,2H),2.24(d,J=6.1Hz,2H),1.99(m,2H),1.77(m,3H),1.22(m,2H)ppm。
步驟5. [反-4-(8-甲基吡唑并[1,5-c]噻吩并[2,3-e]嘧啶-9-基)環己基]乙腈
配備有磁性攪拌棒及橡膠隔板之微波管以氯化鋰(44.9mg，1.06mmol)裝料。在140℃下在高真空下加熱小瓶10分鐘且在冷卻至室溫之後用氮氣回填。添加鋅(69.3mg，1.06mmol)且在140℃下在高真空下加熱小瓶10分鐘並用氮氣回填。在冷卻至室溫之後，經由注射器添加THF(0.6mL)及1,2-二溴乙烷(3.4μL，0.040mmol)。在60℃下加熱混合物 10分鐘且接著冷卻至室溫。添加含氯三甲基矽烷(0.99μL，0.0078mmol)及碘(1.0mg，0.0039mmol)之THF(0.2mL)且在60℃下攪拌10分鐘並冷卻至室溫。接著添加含(反-4-碘環己基)乙腈(132mg，0.53mmol)之THF(0.2mL)，且將混合物在50℃下攪拌隔夜。添加含9-溴-8-甲基吡唑并[1,5-c]噻吩并[2,3-e]嘧啶(80.2mg，0.299mmol)、2-(二環己基膦基)-2’,6’-二甲氧基-1,1’-聯苯(29mg，0.072mmol)之甲苯(0.2mL)至微波小瓶中。在高真空下抽空小瓶且用氮氣回填。冷卻混合物至0℃且經由注射器緩慢添加鋅試劑。在添加之後，加熱反應至60℃隔夜且分配於EtOAc與飽和NH4Cl溶液之間。分離各層且水層進一步用乙酸乙酯(2×)萃取。合併之有機物用水及鹽水洗滌，經MgSO4乾燥，且濃縮。將殘餘物溶解於甲醇中且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到無色固體(5.3mg，5.7%)。C17H19N4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=311.1；實驗值：311.1。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ 8.96(s,1H),7.59(m,1H),7.49(m,1H),2.90(m,1H),2.51(s,3H),2.36(d,J=6.5Hz,2H),2.06(m,2H),1.97-1.88(m,5H),1.37(m,2H).ppm。
實例78. [(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]胺基甲酸甲酯
步驟1. ({反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲基)胺基甲酸第三丁酯
在90℃下加熱7-氯-6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶(220mg，1.0mmol)、[(反-4-胺基環己基)甲基]胺基甲酸第三丁酯(250mg，1.1mmol)及三乙胺(0.43mL，3.1mmol)於異丙醇(8mL)中之混合物2小時。移除溶劑且所得殘餘物藉由急驟層析純化(0-80% EtOAc/己烷)以得到所要產物(0.32g，77%)。C19H27N4O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=407.2；實驗值：407.0。
步驟2. ({反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲基)胺基甲酸第三丁酯
在室溫下在氫氣氣球壓力下氫化({反-4-[(6-硝基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲基)胺基甲酸第三丁酯(0.32g，0.79mmol)及10%鈀/碳(0.01g)於甲醇(3mL)中之混合物2小時。過濾混合物且濃縮以得到欲直接用於下一步驟中之所要產物(0.3g，100%)。C19H29N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=377.2；實驗值：377.1。
步驟3. [(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]胺基甲酸第三丁酯
在室溫下攪拌(2R)-2-羥基丙醯胺(0.29g，3.3mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(0.61g，3.2mmol)於THF(5.6mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(2.4mL)中並添加至({反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲基)胺基甲酸第三丁酯(0.30g，0.80mmol)於乙醇(8.6mL)中之懸浮液中。在85℃下攪拌混合物2小時。濃縮混合物且用急驟層析純化(0-10%甲醇/二氯甲烷)以得到所要產物(0.21g，61%)。C22H31N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=431.2；實驗值：431.1。
步驟4. (1R)-1-{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇雙(三氟乙酸)(鹽)
在室溫下用含三氟乙酸(0.7mL，9mmol)之二氯甲烷(2mL)處理[(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]胺基甲酸酯(0.21g，0.49mmol)1小時。汽提混合物至乾燥以得到呈TFA鹽形式之所要產物(0.35g，79%)。C17H23N4OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=331.1；實驗值：331.0。
步驟5. [(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]胺基甲酸甲酯
向(1R)-1-{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇雙(三氟乙酸鹽)(16mg，0.029mmol)及三乙胺(20μL，0.14mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加氯甲酸甲酯(2.6μL，0.034mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型 HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.4mg，13%)。C19H25N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=389.2；實驗值：389.0。1H NMR(DMSO-d 6,500MHZ)：δ 8.98(1H,s),8.02(1H,d,J=5.5Hz),7.66(1H,d,J=5.5Hz),7.24(1H,m),5.80(1H,br s),5.18(1H,m),4.90(1H,br s),3.54(3H,s),2.96(2H,m),2.38(2H,m),2.00-1.93(4H,m),1.76(1H,m),1.65(3H,d,J=6.5Hz),1.21(2H,m)ppm。
實例79. N-[(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]乙醯胺
向(1R)-1-{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇雙(三氟乙酸鹽)(16mg，0.029mmol)及三乙胺(20.μL，0.14mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加乙酸酐(4.0μL，0.043mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.4mg，13%)。C19H25N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=373.2；實驗值：373.1。
實例80. N-[(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]甲烷磺醯胺
向(1R)-1-{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇雙(三氟乙酸鹽)(16mg，0.029mmol)及三乙胺(20.μL，0.14mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加甲烷磺醯氯(2.7μL，0.034 mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.05% TFA之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到呈TFA鹽形式之所要化合物(1.9mg，16%)。C18H25N4O3S2之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=409.1；實驗值：409.1。
實例81. N'-[(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]-N,N-二甲基脲
向(1R)-1-{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇雙(三氟乙酸鹽)(16mg，0.029mmol)及三乙胺(20μL，0.14mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加N,N-二甲基胺甲醯氯(3.2μL，0.034mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.05% TFA之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到呈TFA鹽形式之所要化合物(3.4mg，30%)。C20H28N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=402.2；實驗值：402.2。
實例82. [(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]胺基甲酸乙酯
向(1R)-1-{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇雙(三氟乙酸鹽)(18mg，0.032mmol)及三乙胺(22μL,0.16mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加氯甲酸乙酯(3.7μL，0.039mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型 HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(0.9mg，7%)。C20H27N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=403.2；實驗值：402.9。
實例83. [(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]胺基甲酸丙酯
向(1R)-1-{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇雙(三氟乙酸鹽)(18mg，0.032mmol)及三乙胺(22μL，0.16mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加氯甲酸丙酯(4.3μL，0.039mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(0.9mg，7%)。C21H29N4O3S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=417.2；實驗值：417.0。
實例84. [(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]胺基甲酸異丙酯
向(1R)-1-{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇雙(三氟乙酸鹽)(18mg，0.032mmol)及三乙胺(22μL，0.16mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加含1.0M氯甲酸異丙酯之甲苯(39μL)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(0.9mg，7%)。C21H29N4O3S之 LCMS計算值：(M+H)+：m/z=417.2；實驗值：417.1。
實例85. [(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)甲基]胺基甲酸四氫呋喃-3-基酯
向(1R)-1-{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇雙(三氟乙酸鹽)(18mg，0.032mmol)及三乙胺(22μL，0.16mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加碳酸4-硝基苯基四氫呋喃-3-基酯(9.8mg，0.039mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.8mg，12%)。C22H29N4O4S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=445.2；實驗值：445.0。
實例86. ({反-4-[2-(氰基甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}甲基)胺基甲酸甲酯
步驟1. ({反-4-[2-(氰基甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}甲基)胺基甲酸第三丁酯
在室溫下攪拌2-氰基乙醯胺(120mg，1.5mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(270mg，1.4mmol)於THF(1.1mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.5mL)中並添加至({反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}甲基)胺基甲酸第三丁酯(150mg，0.40mmol)於乙醇(1.7mL)中之懸浮液中。在85℃下攪拌混合物2小時。過濾固體且濃縮濾液 並在急驟層析上純化(0-10%甲醇/二氯甲烷)以得到所要產物(0.12g，71%)。C22H28N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=426.2；實驗值：426.0。
步驟2. {1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙腈雙(HCl)
在室溫下用含具有4.0M氯化氫之二噁烷(0.5mL)之二氯甲烷(0.5mL)處理({反-4-[2-(氰甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}甲基)胺基甲酸酯(0.12g，0.28mmol)1小時。過濾固體，用DCM及甲醇洗滌，且風乾以得到所要產物(0.10g，77%)。C17H20N5S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=326.1；實驗值：326.0。
步驟3. ({反-4-[2-(氰基甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}甲基)胺基甲酸甲酯
向{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙腈(9.5mg，0.029mmol)及三乙胺(20μL，0.14mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加氯甲酸甲酯(2.7μL，0.035mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.4mg，12%)。C19H22N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=384.1；實驗值：384.0。
實例87. ({反-4-[2-(氰基甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}甲基)胺基甲酸乙酯
向{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙腈(9.5mg，0.029mmol)及三乙胺(20.μL，0.14mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加氯甲酸乙酯(3.3μL，0.035mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純 化以得到所要產物(1.9mg，16%)。C20H24N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=398.2；實驗值：397.8。
實例88. ({反-4-[2-(氰基甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}甲基)胺基甲酸異丙酯
向{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙腈(9.5mg，0.029mmol)及三乙胺(20.μL，0.14mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加含1.0M氯甲酸異丙酯之甲苯(35μL)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.5mg，12%)。C21H26N5O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=412.2；實驗值：412.1。
實例89. N-({反-4-[2-(氰甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}甲基)丙醯胺
向{1-[反-4-(胺基甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙腈(9.5mg，0.029mmol)及三乙胺(20.μL，0.14mmol)於二氯甲烷(1mL)中之溶液中添加丙醯氯(3.0μL，0.035mmol)。在室溫下攪拌混合物1小時，接著汽提至乾燥且在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化以得到所要產物(1.1mg，9.9%)。C20H24N5OS之LCMS計算值：(M+H)+：m/z= 382.2；實驗值：382.1。
實例90. {1-[反-4-(氰甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙腈
在室溫下攪拌2-氰基乙醯胺(11mg，0.13mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(21mg，0.11mmol)於THF(0.13mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(55μL)中並添加至{反-4-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]環己基}乙腈(8.9mg，0.031mmol)於乙醇(0.20mL)中之懸浮液中。在85℃下攪拌混合物2小時。在製備型HPLC(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.05% TFA之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)上純化混合物以得到呈TFA鹽形式之所要產物(2.7mg，26%)。C18H18N5S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=336.1；實驗值：336.0。
實例91. {(2R,5S)-5-[2-(羥甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈
在室溫下攪拌2-羥基乙醯胺(93.3mg，1.24mmol)及四氟硼酸三乙基氧鎓(234mg，1.23mmol)於THF(2mL)中之混合物2小時。移除溶劑且將殘餘物溶解於乙醇(0.7mL)中並添加至{(5S)-5-[(6-胺基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)胺基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈(101mg，0.350mmol)於乙醇(2.6mL)中之懸浮液中。在80℃下攪拌反應混合物1小時，且接著冷卻至室溫。濾出固體。濾液用甲醇稀釋且用製備型LCMS(XBridge C18管柱，用乙腈/含有0.1%氫氧化銨之水之梯度在流速60毫升/分鐘下溶離)純化以得到 所要產物(40mg，35%)。C16H17N4O2S之LCMS計算值：(M+H)+：m/z=329.1；實驗值：329.1。1H NMR(DMSO-d 6,500MHz)δ 8.98(s,1H),8.04(d,J=5.5Hz,1H),7.69(d,J=5.5Hz,1H),5.89(s,1H),4.92(m,1H),4.87(s,2H),4.28(m,1H),4.18-4.11(m,1H),3.98(m,1H),2.95(dd,J=17.0,4.3Hz,1H),2.83(dd,J=17.0,6.6Hz,1H),2.64(m,1H),2.49(m,1H),2.22(m,1H),2.06(m,1H)ppm。
實例A：活體外JAK激酶分析
根據Park等人，Analytical Biochemistry 1999,269,94-104中所述之以下活體外分析測試本文化合物對JAK目標之抑制活性。使用桿狀病毒在昆蟲細胞中表現人類JAK1(a.a.837-1142)、JAK2(a.a.828-1132)及JAK3(a.a.781-1124)之催化域且加以純化。藉由量測生物素化肽之磷酸化來分析JAK1、JAK2或JAK3之催化活性。藉由均質時間解析螢光(homogenous time resolved fluorescence；HTRF)偵測磷酸化肽。在含有於具有100mM NaCl、5mM DTT及0.1mg/mL(0.01%)BSA之50mM Tris(pH 7.8)緩衝液中之酶、ATP及500nM肽的40μL反應中量測化合物針對各激酶之IC50。對於1mM IC50量測，反應中之ATP濃度為1mM。在室溫下進行反應1小時且接著用20μL含45mM EDTA、300nM SA-APC、6nM Eu-Py20之分析緩衝液(Perkin Elmer,Boston,MA)終止。與銪標記抗體之結合進行40分鐘且在PHERA star盤讀取器(BMG,Cary,NC)上量測HTRF信號。實例化合物各自在實例A分析中加以測試(對於實例之化合物之如藉由實例A之分析在1mM ATP下測試的資料，參見表1)。
+指示IC50 100nM
++指示IC50 1000nM
+++指示IC50 2000nM
++++指示IC50>2000nM
+++++指示IC50大於最高測試濃度
實例B：細胞分析
生長依賴於細胞激素且因此依賴於JAK/STAT信號轉導之癌細胞株可於RPMI 1640、10% FBS及1nG/mL適當細胞激素中以每孔(96孔盤格式)6000個細胞塗鋪。化合物可於DMSO/培養基(最終濃度0.2% DMSO)中添加至細胞中且在37℃、5% CO2下培育72小時。使用CellTiter-Glo發光細胞活力分析(Promega)，隨後進行TopCount(Perkin Elmer,Boston,MA)定量來評估化合物對細胞活力之影響。使用分析讀數相同之非JAK驅動之細胞株並行量測化合物之潛在脫靶(off-target)效應。所有實驗通常皆一式兩份進行。
以上細胞株亦可用於檢查化合物對JAK激酶或潛在下游受質(諸如STAT蛋白質、Akt、Shp2或Erk)之磷酸化之影響。此等實驗可在細胞激素饑餓隔夜，隨後與化合物一起短暫預培育(2小時或2小時以下)且細胞激素刺激約1小時或1小時以下之後進行。接著自細胞萃取蛋白質且藉由此項技術中之經訓練者所熟知之技術進行分析，該等技術包括使用可區分磷酸化蛋白質與總蛋白質之抗體進行西方墨點分析(Western blotting)或ELISA。此等實驗可利用正常細胞或癌細胞來研究化合物對腫瘤細胞存活生物學或對發炎性疾病之介體的活性。舉例而言，對於後者而言，可使用諸如IL-6、IL-12、IL-23或IFN之細胞激素來刺激JAK活化，從而導致STAT蛋白質磷酸化且可能導致轉錄概況變化(藉由陣列或qPCR技術評估)或產生及/或分泌諸如IL-17之蛋白質。可使用為此項技術中之經訓練者所共有之技術量測化合物抑制此等細胞激素介導之效應的能力。為評估化合物對JAK2之效應，初級細胞或細胞株可用諸如GM-CSF或Tpo之JAK2依賴性生長因子刺激，自細胞提取蛋白質且藉由為此項技術中之經訓練者所熟知之技術加以分析，該等技術包括使用可區分磷酸化蛋白質與總蛋白質之抗體之西方墨點術或ELISA。
亦可在設計用來評估本文化合物針對突變型JAK(例如骨髓增生性病症中所發現之JAK2V617F突變)之效能及活性之細胞模型中測試本文化合物。此等實驗常利用血液譜系之其中異位表現野生型或突變JAK激酶的細胞激素依賴性細胞(例如BaF/3)(James,C.等人.Nature 434：1144-1148；Staerk,J.等人.JBC 280：41893-41899)。終點包括化合物對細胞存活、增殖及磷酸化JAK、STAT、Akt或Erk蛋白質之影響。
可評估本文某些化合物抑制T細胞增殖之活性。該種分析可視為第二細胞激素(亦即JAK)驅動之增殖分析以及對免疫活化之免疫遏 制或抑制的簡化分析。以下為可如何進行此等實驗之簡要概述。使用菲科爾希帕克(Ficoll Hypaque)分離方法自人類全血樣品製備周邊血液單核細胞(PBMC)且可藉由淘選自PBMC獲得T細胞(2000部分)。新鮮分離之人類T細胞可在37℃下以密度2×106個細胞/毫升維持在培養基(補充有10%胎牛血清、100U/ml青黴素、100μg/ml鏈黴素之RPMI 1640)中至多2天。對於IL-2刺激之細胞增殖分析，T細胞首先用最終濃度為10μg/mL之植物血球凝集素(Phytohemagglutinin，PHA)處理72小時。在用PBS洗滌一次之後，於96孔盤中每孔塗鋪6000個細胞且以於培養基中不同濃度之化合物在100U/mL人類IL-2(ProSpec-Tany TechnoGene；Rehovot,Israel)存在下處理。各盤在37℃下培育72小時且遵循製造商建議之方案使用CellTiter-Glo發光試劑(Promega；Madison,WI)評估增殖指數。
實例C：活體內抗腫瘤功效
可在免疫受損小鼠中之人類腫瘤異種移植模型中評估本文化合物。舉例而言，INA-6漿細胞瘤細胞株之致腫瘤變異體可用於皮下接種SCID小鼠(Burger,R.等人.Hematol J.2：42-53,2001)。攜帶腫瘤之動物可接著隨機分成藥物或媒劑治療組且可藉由許多常用途徑投與不同劑量之化合物，包括經口、腹膜內或使用可植入泵進行連續輸注投與。使用測徑規追蹤腫瘤隨時間之生長。此外，可在治療起始後之任何時間收集腫瘤樣品以供如上(實例B)所述進行分析來評估化合物對JAK活性及下游信號傳導路徑之影響。此外，可使用由其他已知激酶(例如Bcr-Abl)驅動之異種移植腫瘤模型，諸如K562腫瘤模型評估化合物之選擇性。
實例D：鼠類皮膚接觸遲發性過敏反應測試
亦可測試本文化合物在T細胞驅動之鼠類遲發性過敏測試模型中之功效(抑制JAK目標之功效)。鼠類皮膚接觸遲髮型過敏(DTH)反應被視為臨床接觸性皮炎及其他T淋巴細胞介導之免疫皮膚病症(諸如牛皮癬)之有效模型(Immunol Today.1998年1月；19(1)：37-44)。鼠類DTH與牛皮癬共有多種特徵，包括免疫浸潤、伴有發炎性細胞激素增加及角化細胞過度增殖。此外，在臨床中有效治療牛皮癬之許多類別之藥劑亦為小鼠中之DTH反應的有效抑制劑(Agents Actions.1993年1月；38(1-2)：116-21)。
在第0及1天，用抗原2,4，二硝基-氟苯(DNFB)對Balb/c小鼠之剃過毛的腹部局部施用來使其敏化。在第5天，使用工程師用測微器量測耳之厚度。記錄此量測結果且用作基線。動物之雙耳接著均藉由局部施用總計20μL(10μL在內耳廓上且10μL在外耳廓上)濃度為0.2%之DNFB進行攻擊。在攻擊後24至72小時，再次量測耳。在整個敏化及攻擊階段期間(第-1天至第7天)或在攻擊階段之前及整個攻擊階段期間(通常在第4天下午至第7天)給與測試化合物治療。全身性或局部(向耳局部施用治療)投與測試化合物(以不同濃度)之治療。測試化合物之功效由相較於未治療情形之耳腫脹減輕指示。引起減輕20%或20%以上之化合物視為有效。在一些實驗中，小鼠受到攻擊但未敏化(陰性對照)。
測試化合物之抑制效應(抑制JAK-STAT路徑之活化)可藉由免疫組織化學分析進行確認。JAK-STAT路徑之活化會導致功能性轉錄因子之形成及易位。此外，免疫細胞之流入及角化細胞之增殖增加亦應提供耳中可進行研究及定量之獨特表現概況變化。使用與磷酸化STAT3特異性相互作用之抗體(純系58E12，Cell Signaling Technologies)，對經福馬林固定且經石蠟包封之耳切片(在DTH模型中於攻擊階段之後收集)進行免疫組織化學分析。小鼠耳用測試化合物、媒劑或地塞米松(dexamethasone)(一種用於牛皮癬之臨床有效治療劑)處理，或在DTH模型中不經任何處理以供比較。測試化合物及地塞米松在定性與定量兩者上均可產生類似轉錄變化，且測試化合物與地塞米松兩者均可降低浸潤細胞數。全身性投與測試化合物與局部投與測試化合物兩者均可產生抑制效應，亦即降低浸潤細胞數及抑制轉錄變化。
實例E：活體內消炎活性
可在設計用來重複單一或複雜發炎反應之齧齒動物或非齧齒動物模型中評估本文化合物。舉例而言，可使用齧齒動物關節炎模型來評估預防性或治療性給與之化合物的治療潛力。此等模型包括但不限於小鼠或大鼠膠原蛋白誘發之關節炎、大鼠佐劑誘發之關節炎及膠原蛋白抗體誘發之關節炎。包括但不限於多發性硬化症、第I型糖尿病、葡萄膜視網膜炎、甲狀腺炎、重症肌無力、免疫球蛋白腎病變、心肌炎、氣道敏化(哮喘)、 狼瘡或結腸炎在內之自體免疫性疾病亦可用於評估本文化合物之治療潛力。此等模型在研究團體中已充分確立且為此項技術中之經訓練者所熟知(Current Protocols in Immunology，第3卷，Coligan,J.E.等人，Wiley Press.；Methods in Molecular Biology：第225卷，Inflammation Protocols.,Winyard,P.G.及Willoughby,D.A.,Humana Press,2003.)。
實例F：關於乾眼症、葡萄膜炎及結膜炎治療之動物模型
可在此項技術中之經訓練者已知之一或多個臨床前乾眼症模型中評估藥劑，該等模型包括但不限於兔伴刀豆凝集素A(concanavalin A，ConA)淚腺模型、莨菪鹼(scopolamine)小鼠模型(皮下或經皮)、肉毒桿菌(Botulinumn)小鼠淚腺模型，或導致眼腺功能障礙之許多自發性齧齒動物自體免疫模型(例如NOD-SCID、MRL/lpr或NZB/NZW)中之任一者(Barabino等人，Experimental Eye Research 2004,79,613-621及Schrader等人，Developmental Opthalmology,Karger 2008,41,298-312，其各自以全文引用的方式併入本文中)。此等模型中之終點可包括眼腺及眼(角膜等)之組織病變及可能包括量測淚產生之經典斯戈默(Schirmer)測試或其改進形式(Barabino等人)。可藉由可在可量測疾病存在之前或之後開始的經由多種投藥途徑(例如全身性或局部)給藥來評估活性。
可在此項技術中之經訓練者已知之一或多個臨床前葡萄膜炎模型中評估藥劑。此等包括但不限於實驗自體免疫葡萄膜炎(EAU)及內毒素誘發之葡萄膜炎(EIU)模型。EAU實驗可在兔、大鼠或小鼠中進行且可涉及被動或主動免疫。舉例而言，可使用許多視網膜抗原中之任一者使動物對相關免疫原敏感，此後可用相同抗原對動物進行經眼攻擊。EIU模型更急性且涉及以低於致死劑量局部或全身性投與脂多醣。EIU模型與EAU模型兩者之終點均可尤其包括眼底鏡檢查、組織病理學。此等模型由Smith等人(Immunology and Cell Biology 1998,76,497-512，其以全文引用的方式併入本文中)評述。藉由可在可量測疾病存在之前或之後開始的經由多種投藥途徑(例如全身性或局部)給藥來評估活性。以上所列之一些模型亦可能發展鞏膜炎/上鞏膜炎、脈絡膜炎、睫狀體炎或虹膜炎且因此適用於研究化合物治療性治療此等疾病之潛在活性。
亦可在此項技術中之經訓練者已知之一或多個臨床前結膜炎模型中評估藥劑。此等包括但不限於利用天竺鼠、大鼠或小鼠之齧齒動物模型。天竺鼠模型包括利用以諸如卵清蛋白(ovalbumin)或豬草(ragweed)之抗原進行之主動或被動免疫及/或免疫攻擊方案的模型(評述於Groneberg,D.A.等人，Allergy 2003,58,1101-1113中，其以全文引用的方式併入本文中)。大鼠及小鼠模型在整體設計方面類似於天竺鼠中之模型(亦由Groneberg評述)。可藉由可在可量測疾病存在之前或之後開始的經由多種投藥途徑(例如全身性或局部)給藥來評估活性。此等研究之終點可包括例如對諸如結膜之眼組織進行之組織學、免疫學、生物化學或分子分析。
實例G：骨之活體內保護
可在骨量減少、骨質疏鬆或骨再吸收之為此項技術中之經訓練者所知的各種臨床前模型中評估化合物。舉例而言，切除卵巢之齧齒動物可用於評估化合物影響骨再成型及/或骨密度之徵象及標記的能力(W.S.S.Jee及W.Yao,J Musculoskel.Nueron.Interact.,2001,1(3),193-207，其以全文引用的方式併入本文中)。或者，可在療法(例如糖皮質激素)誘發之骨量減少模型中在對照或化合物治療之齧齒動物中評估骨密度及結構(Yao等人Arthritis and Rheumatism,2008,58(6),3485-3497；及同上58(11),1674-1686，其兩者均以全文引用的方式併入本文中)。此外，可評估化合物在以上(實例E)論述之齧齒動物關節炎模型中對骨再吸收及密度之效應。所有此等模型之終點皆可變化但常包括組織學及放射學評估以及骨重塑之免疫組織學及適當生物化學標記。
除本文所述之修改之外，對於熟習此項技術者而言，本發明之各種修改亦將根據以上描述而顯而易知。此等修改亦意欲屬於隨附申請專利範圍之範疇。本申請案中引用之各參照文獻，包括所有專利、專利申請案及公開案皆以全文引用的方式併入本文中。

Claims (36)

  1. 一種式IIIa之化合物，
    Figure TWI646099B_C0001
    或其醫藥學上可接受之鹽，其中：R2係C1-6烷基，該C1-6烷基視情況經1、2或3個獨立地選自鹵基、CN、ORa及NRcS(=O)2Rb之取代基取代；其中各Ra及Rc係獨立地選自H及C1-3烷基；且各Rb係獨立地選自C1-3烷基；Cy4係選自C3-10環烷基及3-10員雜環烷基，其各者視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；其限制條件為該3-10員雜環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜環烷基基團；各R31係獨立地選自Cy7、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-6鹵烷基、鹵基、CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、CN、NO2、ORa2、SRa2、C(=O)Rb2、C(=O)NRc2Rd2、C(=O)ORa2、OC(=O)Rb2、OC(=O)NRc2Rd2、C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2C(=NRe2)NRc2Rd2、NRc2Rd2、NRc2C(=O)Rb2、NRc2C(=O)ORa2、NRc2C(=O)NRc2Rd2、NRc2S(=O)Rb2、NRc2S(=O)2Rb2、NRc2S(=O)2NRc2Rd2、S(=O)Rb2、S(=O)NRc2Rd2、S(=O)2Rb2及S(=O)2NRc2Rd2；各Cy7係獨立地選自C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基，其中該等C6-10芳基、C3-10環烷基、5-10員雜芳基及3-10員雜環烷基各自視情況經1、2、3、4或5個獨立選擇之R33基團取代；各R33係獨立地選自鹵基、OH、NO2、CN、C1-3烷基、C2-3烯基、C2-3炔基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、C1-3烷氧基-C1-3烷基、C3-7環烷基、C1-3烷氧基、C1-3鹵烷氧基、胺基、C1-3烷基胺基、二(C1-3烷基)胺基、硫基、C1-3烷基硫基、C1-3烷基亞磺醯基、C1-3烷基磺醯基、胺甲醯基、C1-3烷基胺甲醯基、二(C1-3烷基)胺甲醯基、羧基、C1-3烷基羰基、C1-4烷氧基羰基、C1-3烷基羰基氧基、C1-3烷基羰基胺基、C1-3烷基磺醯基胺基、胺基磺醯基、C1-3烷基胺基磺醯基、二(C1-3烷基)胺基磺醯基、胺基磺醯基胺基、C1-3烷基胺基磺醯基胺基、二(C1-3烷基)胺基磺醯基胺基、胺基羰基胺基、C1-3烷基胺基羰基胺基及二(C1-3烷基)胺基羰基胺基；或者，當兩個R33基團連接於同一碳原子時，該兩個R33基團連同其所連接之該碳原子一起形成3-7員環烷基環或3-7員雜環烷基環，其中該雜環烷基環之1或2個環成員係獨立地選自N、O及S；且其中該等環烷基環及雜環烷基環各自視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：鹵基、OH、CN、C1-3烷基、C1-3烷氧基及C1-3鹵烷基；各Ra2、Rc2及Rd2係獨立地選自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自R33之取代基取代；各Rb2係獨立地選自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基及C1-6鹵烷基，其中該等C1-6烷基、C2-6烯基及C2-6炔基各自視情況經1、2或3個獨立地選自R33之取代基取代；且各Re2係獨立地選自H、CN、OH、C1-4烷基及C1-4烷氧基。
  2. 如申請專利範圍第1項之化合物，或其醫藥學上可接受之鹽，其中R2為-CH2-OH、-CH(CH3)-OH或-CH2-NHSO2CH3。
  3. 如申請專利範圍第1項之化合物，或其醫藥學上可接受之鹽，其中Cy4係環己基，其視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代。
  4. 如申請專利範圍第1項之化合物，或其醫藥學上可接受之鹽，其中Cy4為四氫-2H-哌喃環，其視情況經1或2個獨立選擇之R31基團取代。
  5. 如申請專利範圍第1項之化合物，或其醫藥學上可接受之鹽，其中Cy4A係選自伸環丙基、伸環丁基、伸環戊基、伸環己基及伸環庚基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代。
  6. 如申請專利範圍第1項之化合物，或其醫藥學上可接受之鹽，其中Cy4A係伸環己基，其視情況經1或2個獨立選擇之R31基團取代。
  7. 如申請專利範圍第1項之化合物，或其醫藥學上可接受之鹽，其中該化合物具有式IIIa；R2為-CH2-OH、-CH(CH3)-OH或-CH2-NHSO2CH3；Cy4係選自C3-10環烷基及3-10員雜環烷基，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代，其限制條件為該3-10員雜環烷基不為具有一或多個氮環成員之飽和雜環烷基；且各R31係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基。
  8. 如申請專利範圍第1項之化合物，或其醫藥學上可接受之鹽，其中：R2為-CH2-OH、-CH(CH3)-OH或-CH2-NHSO2CH3；Cy4係選自環己基及2H-四氫呋喃環，其各自視情況經1、2、3或4個獨立選擇之R31基團取代；且各R31係獨立地選自CN、OH、F、Cl、C1-3烷基、C1-3鹵烷基、氰基-C1-3烷基、HO-C1-3烷基、胺基、C1-3烷基胺基及二(C1-3烷基)胺基，其中該等C1-3烷基及二(C1-3烷基)胺基視情況經1、2或3個獨立地選自以下之取代基取代：F、Cl、C1-3烷基胺基磺醯基及C1-3烷基磺醯基。
  9. 如申請專利範圍第1項之化合物，其係選自：(1R)-1-{1-[(3S)-四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇；(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈；反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己醇；(1R)-1-(1-{反-4-[(2,2,2-三氟乙基)胺基]環己基}-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇；(1R)-1-(1-{反-4-[2-(甲基磺醯基)乙基]環己基}-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇；(1R)-1-{1-[順-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇；順-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己烷甲腈；3-(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)丙腈；(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈；(1R)-1-{1-[反-4-(羥甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇；(1R)-1-{1-[反-4-(氟甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇；(1R)-1-(1-環己基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙醇；1-(反-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)-N-甲基甲烷磺醯胺；{反-4-[2-(羥甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]環己基}乙腈；N-({1-[反-4-(氰甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}甲基)甲烷磺醯胺；(1R)-1-{1-[(3S)-6-(羥甲基)四氫-2H-哌喃-3-基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙醇；((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈；((2S,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈；及N-((1-((2S)-雙環[2.2.1]庚-2-基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲基)甲烷磺醯胺；或其醫藥學上可接受之鹽。
  10. 如申請專利範圍第1項之化合物，其係選自：(1-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈；3-(3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)丙腈[(1R,2R,4S)-2-羥基-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈；[(1S,2S,4R)-2-羥基-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈；[(1R,2R,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈；[(1S,2S,4R)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-甲氧基環己基]乙腈；((1R,2R,4S)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈；((1S,2S,4R)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈；((1R,2S,4S)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈；((1S,2R,4R)-2-羥基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈；[(2R,5S)-5-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈；[(2R,5S)-5-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈；[(1R,2S,4S)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈；[(1S,2R,4R)-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈；[(1R,2S,4S)-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈；[(1S,2R,4R)-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)-2-羥基環己基]乙腈；[(2R,5S)-5-(2-異丙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)四氫-2H-哌喃-2-基]乙腈；((2S,5R)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈；((2R,5S)-5-{2-[(1S)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈；[反-4-(2-乙基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈；[反-4-(2-甲基-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基)環己基]乙腈；((1R,3S)-3-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環戊基)乙腈；((1R,2R,4S)-2-胺基-4-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}環己基)乙腈；及{(2R,5S)-5-[2-(1-氟乙基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈或其醫藥學上可接受之鹽。
  11. 如申請專利範圍第1項之化合物，其係選自：{(2R,5S)-5-[2-(氰甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈；{(2S,5S)-5-[2-(氰甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈；{1-[反-4-(氰甲基)環己基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基}乙腈；及{(2R,5S)-5-[2-(羥甲基)-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基]四氫-2H-哌喃-2-基}乙腈；或其醫藥學上可接受之鹽。
  12. 一種化合物，其係((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈，或其醫藥學上可接受之鹽。
  13. 一種化合物，其係((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈。
  14. 一種化合物，其係((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈單水合物。
  15. 一種組合物，其包含如申請專利範圍第1至14項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之載劑。
  16. 一種如申請專利範圍第1至14項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途，其用於製備抑制JAK1之活性之藥劑。
  17. 如申請專利範圍第16項之用途，其中該化合物或其醫藥學上可接受之鹽對JAK1之選擇性超過對JAK2之選擇性。
  18. 一種如申請專利範圍第1至14項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途，其用於製備治療自體免疫性疾病、癌症、骨髓增生性病症、發炎性疾病、骨再吸收疾病、器官移植排斥、由癌症引起或與癌症相關之惡病質或疲勞、過敏性病狀或與軟骨轉換(cartilage turnover)相關之疾病的藥劑。
  19. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該自體免疫性疾病為皮膚病症、多發性硬化症、類風濕性關節炎、牛皮癬性關節炎、青少年關節炎、第I型糖尿病、狼瘡、發炎性腸病、克羅恩氏病(Crohn's disease)、重症肌無力、免疫球蛋白腎病變、心肌炎、自體免疫性甲狀腺病症或潰瘍性結腸炎。
  20. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該自體免疫性疾病為類風濕性關節炎。
  21. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該自體免疫性疾病為皮膚病症。
  22. 如申請專利範圍第21項之用途，其中該皮膚病症為異位性皮炎、牛皮癬、皮膚敏化、皮膚刺激、皮疹、接觸性皮炎、過敏性接觸敏化或尋常天皰瘡(pemphigus vulgaris)。
  23. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該癌症為實體腫瘤。
  24. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該癌症為前列腺癌、腎癌、肝癌、乳癌、肺癌、甲狀腺癌、卡波西氏肉瘤(Kaposi’s sarcoma)、卡所門氏病(Castleman’s disease)、胰臟癌、結腸癌或結腸直腸癌。
  25. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該癌症為淋巴瘤、白血病、多發性骨髓瘤、急性淋巴母細胞性白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、皮膚T細胞淋巴瘤(CTCL)或蕈樣真菌病(mycosis fungoides)。
  26. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該骨髓增生性病症為真性紅細胞增多症(polycythemia vera，PV)、原發性血小板增多症(essential thrombocythemia，ET)、原發性骨髓纖維化(PMF)、慢性骨髓性白血病(CML)、慢性骨髓單核細胞性白血病(CMML)、嗜伊紅性白血球增多症候群(hypereosinophilic syndrome，HES)、特發性骨髓纖維化(IMF)或全身性肥大細胞病(SMCD)。
  27. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該骨髓增生性病症為骨髓纖維化。
  28. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該骨髓增生性病症為原發性骨髓纖維化(PMF)。
  29. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該骨髓增生性病症為真性紅細胞增多症後骨髓纖維化(PV後MF)。
  30. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該骨髓增生性病症為原發性血小板增多症後骨髓纖維化(ET後MF)。
  31. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該骨再吸收疾病為骨質疏鬆、骨關節炎、與激素不平衡相關之骨再吸收、與激素療法相關之骨再吸收、與自體免疫性疾病相關之骨再吸收或與癌症相關之骨再吸收。
  32. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該器官移植排斥為同種異體移植物排斥或移植物抗宿主疾病。
  33. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該過敏性病狀為哮喘或痤瘡樣皮疹。
  34. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該與軟骨轉換相關之疾病為全身性紅斑狼瘡、硬皮病或強直性脊柱炎。
  35. 一種如申請專利範圍第1至14項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途，其用於製備治療類肉瘤病(sarcoidosis)、鼻炎、竇炎、慢性阻塞性肺病、發炎性肌病變、瞼炎、全身性發炎性反應症候群(SIRS)、敗血性休克、結膜炎、葡萄膜炎、鞏膜炎或虹膜炎的藥劑。
  36. 一種如申請專利範圍第1至14項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途，其用於製備治療骨髓發育不良症候群的藥劑。
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