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TW202124409A - 預防雙硫鍵於重組體產生多肽之過程中還原 - Google Patents

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永祥 高
麥可 Ｗ 萊德
美樂蒂 翠勒 史蜜德
瑞塔 L 汪
丹尼爾 P 希威特
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美商建南德克公司
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Abstract

本發明係關於用以預防雙硫鍵於重組體產生含雙硫鍵多肽之過程中還原之方法及手段。詳言之，本發明係關於預防雙硫鍵於自重組宿主細胞培養物收集含雙硫鍵多肽(包括抗體)過程中還原。

Description

預防雙硫鍵於重組體產生多肽之過程中還原
本發明係關於用以預防雙硫鍵於重組體產生含雙硫鍵多肽之過程中還原之方法及手段。詳言之，本發明係關於預防雙硫鍵於自重組宿主細胞培養物收集含雙硫鍵多肽(包括抗體)過程中還原。
在生物技術工業中，醫藥應用需要使用重組DNA技術所產生之各種蛋白質。一般而言，重組蛋白係藉由使用真核細胞(諸如哺乳動物細胞)或原核細胞(諸如細菌細胞)進行細胞培養而產生，該等細胞經設計以藉由插入含有編碼所要蛋白質之核酸的重組質體而產生所關注之蛋白質。為使蛋白質保持生物學活性，在其純化及分離過程中必須保持蛋白質構形(包括其三級結構)且必須保護蛋白質之多個官能基以免降解。 哺乳動物細胞已成為產生用於臨床應用之哺乳動物蛋白質之主要系統，此主要係歸因於其產生適當摺疊且組合之異源蛋白質之能力及其用於轉譯後修飾之能力。中國倉鼠卵巢(CHO)細胞及自諸如小鼠骨髓瘤(NS0)、幼倉鼠腎(BHK)、人胚腎(HEK-293)及人類視網膜細胞之各種其他哺乳動物來源獲得之細胞株已獲生產生物醫藥產品之管理機構批准。 通常，為開始產生週期，使少量轉型重組宿主細胞在培養物中生長幾天(參見，例如圖23)。一旦細胞已經歷若干輪複製，即將其轉移至使其準備進行醱酵之較大容器中。使細胞生長之培養基及在產生週期中存在之氧氣、氮氣及二氧化碳之含量可能對產生過程具有顯著影響。特別針對各細胞株確定生長參數且頻繁量測該等參數以確保最佳生長及產生條件。 當細胞生長至足夠數目時，將其轉移至大規模產生槽中且使其生長更長時段。在過程中之此時間點，可收集重組蛋白。通常，細胞經設計以分泌多肽至細胞培養基中，故純化過程之第一步為自培養基分離細胞。通常，收集包括離心及過濾以產生已收集細胞培養液(HCCF)。隨後使培養基經歷移除任何細胞碎片、多餘蛋白質、鹽、礦物質或其他不合需要之元素的若干其他純化步驟。在純化過程結束時，重組蛋白純度較高且適合於人類治療用途。 雖然此過程為過去幾十年中諸多研究及改良之主題，但重組蛋白之產生仍存在困難。因此，例如在重組體產生包含雙硫鍵之多肽、尤其包含鏈間雙硫鍵之多鏈多肽(諸如抗體)期間，在整個製造、回收及純化過程中必需保護且保留雙硫鍵以產生具有必要生物活性之適當摺疊多肽。
本發明一般而言係關於一種預防雙硫鍵於重組宿主細胞中所表現之多肽中還原之方法，其包含將硫氧還原蛋白抑制劑補充至重組宿主細胞之收集前或已收集培養液中。 在一實施例中，將硫氧還原蛋白抑制劑添加至收集前培養液中。 在另一實施例中，將硫氧還原蛋白抑制劑添加至已收集培養液中。 在另一實施例中，硫氧還原蛋白抑制劑為硫氧還原蛋白之直接抑制劑。 在所有實施例中，硫氧還原蛋白抑制劑可為(例如)烷基-2-咪唑基二硫化物或萘醌螺縮酮衍生物。 在另一實施例中，硫氧還原蛋白抑制劑為硫氧還原蛋白還原酶之特異性抑制劑。 在另一實施例中，硫氧還原蛋白抑制劑為金錯合物，其中該金錯合物可(例如)為金硫葡糖(ATG)或金硫蘋果酸鹽(ATM)。 在本發明之此態樣之另一實施例中，硫氧還原蛋白抑制劑為金屬離子，其中該金屬離子(而不限於)可係選自由Hg2+ 、Cu2+ 、Zn2+ 、Co2+ 及Mn2+ 組成之群。 在不同實施例中，硫氧還原蛋白抑制劑為G6PD之抑制劑，諸如5'-磷酸吡哆醛、1-氟-2,4-二硝基苯、去氫表雄固酮(DHEA)或表雄固酮(EA)。 在另一實施例中，硫氧還原蛋白抑制劑為己糖激酶活性之抑制劑，包括(而不限於)金屬離子之螯合劑，諸如乙二胺四乙酸(EDTA)。在其他較佳實施例中，己糖激酶活性之抑制劑係選自由山梨糖-1-磷酸鹽、聚磷酸鹽、6-去氧-6-氟葡萄糖、2-C-羥基-甲基葡萄糖、木糖及來蘇糖組成之群。 在另一實施例中，硫氧還原蛋白抑制劑為與硫氧還原蛋白還原酶特異性結合之siRNA、反義核苷酸或抗體。 在另一實施例中，硫氧還原蛋白抑制劑為間接引起硫氧還原蛋白活性抑制的手段。此實施例包括(例如)空氣噴射已收集之重組宿主細胞培養液及/或降低已收集之重組宿主細胞培養液的pH值。 在各種實施例中，用以抑制硫氧還原蛋白活性之間接手段，諸如空氣噴射及/或降低pH值可與諸如以上所列之彼等直接硫氧還原蛋白抑制劑之使用組合。 在所有實施例中，多肽可為(例如)抗體或抗體之生物功能片段。代表性抗體片段包括Fab、Fab'、F(ab')2 、scFv、(scFv)2 、dAb、互補判定區(CDR)片段、線性抗體、單鏈抗體分子、微型抗體、雙功能抗體及由抗體片段形成之多特異性抗體。 治療性抗體包括(而不限於)抗HER2抗體、抗CD20抗體；抗IL-8抗體；抗VEGF抗體；抗CD40抗體、抗CD11a抗體；抗CD18抗體；抗IgE抗體；抗Apo-2受體抗體；抗組織因子(TF)抗體；抗人類α4 β7 整合素抗體；抗EGFR抗體；抗CD3抗體；抗CD25抗體；抗CD4抗體；抗CD52抗體；抗Fc受體抗體；抗癌胚抗原(CEA)抗體；針對乳腺上皮細胞之抗體；與結腸癌瘤細胞結合之抗體；抗CD38抗體；抗CD33抗體；抗CD22抗體；抗EpCAM抗體；抗GpIIb/IIIa抗體；抗RSV抗體；抗CMV抗體；抗HIV抗體；抗肝炎抗體；抗CA 125抗體；抗αvβ3抗體；抗人類腎細胞癌抗體；抗人類17-1A抗體；抗人類結腸直腸腫瘤抗體；針對GD3神經結醣脂之抗人類黑色素瘤抗體R24；抗人類鱗狀細胞癌抗體；及抗人類白細胞抗原(HLA)抗體及抗HLA DR抗體。 在其他實施例中，治療性抗體為與HER受體、VEGF、IgE、CD20、CD11a、CD40或DR5結合之抗體。 在另一實施例中，HER受體為HER1及/或HER2，較佳為HER2。HER2抗體可(例如)包含選自由SEQ ID NO：16、17、18及19組成之群的重鏈及/或輕鏈可變域序列。 在另一實施例中，治療性抗體為與CD20結合之抗體。抗CD20抗體可(例如)包含選自由SEQ ID NOS：1至15組成之群的重鏈及/或輕鏈可變域序列。 在又一實施例中，治療性抗體為與VEGF結合之抗體。抗VEGF抗體可(例如)包含選自由SEQ ID NOS：20至25組成之群的重鏈及/或輕鏈可變域序列。 在另一實施例中，治療性抗體為結合CD11a之抗體。抗CD11a抗體可(例如)包含選自由SEQ ID NOS：26至29組成之群的重鏈及/或輕鏈可變域序列。 在另一實施例中，治療性抗體與DR5受體結合。抗DR5抗體可(例如)選自由Apomab 1.1、2.1、3.1、4.1、5.1、5.2、5.3、6.1、6.2、6.3、7.1、7.2、7.3、8.1、8.3、9.1、1.2、2.2、3.2、4.2、5.2、6.2、7.2、8.2、9.2、1.3、2.2、3.3、4.3、5.3、6.3、7.3、8.3、9.3及25.3組成之群，且較佳為Apomab 8.3或Apomab 7.3，且最佳為Apomab 7.3。 在本發明之方法之其他實施例中，重組宿主細胞中表現之多肽為治療性多肽。舉例而言，治療性多肽可係選自由以下各物組成之群：生長激素，包括人生長激素及牛生長激素；生長激素釋放因子；甲狀旁腺激素；促甲狀腺激素；脂蛋白；α-1-抗胰蛋白酶；胰島素A鏈；胰島素B鏈；胰島素元；促卵泡激素；降鈣素；促黃體生成激素；升血糖激素；凝血因子，諸如因子VIIIC、因子IX、組織因子及血管性血友病因子(von Willebrands factor)；抗凝血因子，諸如蛋白C；心房利尿鈉因子；肺界面活性劑；血纖維蛋白溶酶原活化劑，諸如尿激酶或人類尿或組織型血纖維蛋白溶酶原活化劑(t-PA)；鈴蟾素；凝血酶；造血生長因子；腫瘤壞死因子-α及腫瘤壞死因子-β；腦啡肽酶；RANTES(調節活化正常T細胞表現及分泌因子)；人類巨噬細胞發炎性蛋白(MIP-1-α)；血清白蛋白，諸如人血清白蛋白；苗勒氏抑制物質(Muellerian-inhibiting substance)；鬆弛素A-鏈；鬆弛素B-鏈；鬆弛素原；小鼠促性腺激素相關肽；微生物蛋白，諸如β-內醯胺酶；DNase；IgE；細胞毒性T-淋巴細胞相關抗原(CTLA)，諸如CTLA-4；抑制素；活化素；血管內皮生長因子(VEGF)；激素或生長因子之受體；蛋白A或D；類風濕因子；神經營養因子，諸如骨衍生之神經營養因子(BDNF)、神經營養因子-3、神經營養因子-4、神經營養因子-5或神經營養因子-6(NT-3、NT-4、NT-5或NT-6)或神經生長因子，諸如NGF-β；血小板衍生之生長因子(PDGF)；纖維母細胞生長因子，諸如aFGF及bFGF；表皮生長因子(EGF)；轉化生長因子(TGF)，諸如TGF-α及TGF-β，包括TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3、TGF-β4或TGF-β5；胰島素樣生長因子-I及胰島素樣生長因子-II(IGF-I及IGF-II)；des(1-3)-IGF-I(腦IGF-I)、胰島素樣生長因子結合蛋白；CD蛋白，諸如CD3、CD4、CD8、CD19、CD20、CD34及CD40；紅血球生成素；骨生成誘導因子；免疫毒素；骨形態發生蛋白(BMP)；干擾素，諸如干擾素-α、干擾素-β及干擾素-γ；群落刺激因子(CSF)，例如M-CSF、GM-CSF及G-CSF；介白素(IL)，例如IL-1至IL-10；過氧化物歧化酶；T細胞受體；表面膜蛋白；促衰變因子；病毒抗原，諸如一部分AIDS包膜；轉運蛋白；歸巢受體；地址素；調節蛋白；整合素，諸如CD11a、CD11b、CD11c、CD18、ICAM、VLA-4及VCAM；腫瘤相關抗原，諸如HER2、HER3或HER4受體；及該等多肽之片段。 在所有實施例中，重組宿主細胞可為真核宿主細胞，諸如哺乳動物宿主細胞，包括(例如)中國倉鼠卵巢(CHO)細胞。 在所有實施例中，重組宿主細胞亦可為原核宿主細胞，諸如細菌細胞，包括(而不限於)大腸桿菌(E.coli )細胞。
I.定義 在本發明中，一般而言在蛋白質(包括抗體)之情形下，或關於任何特定蛋白質或抗體，術語"還原"係用以指蛋白質或抗體之一或多個雙硫鍵的還原。因此，舉例而言，術語"奧克珠單抗(ocrelizumab)還原"可與術語"奧克珠單抗雙硫鍵還原"互換使用且術語"抗體(Ab)還原"可與術語"抗體(Ab)雙硫鍵還原"互換使用。 術語"還原"或"雙硫鍵還原"均以最廣意義使用且包括完全及部分還原及存在於蛋白質(諸如抗體)中之一些或所有鏈間或鏈內雙硫鍵之還原。 "蛋白質"意謂鏈長足以產生較高層級之三級及/或四級結構之胺基酸序列。此不同於不具有該結構之"肽"或其他小分子量藥物。通常，本文中之蛋白質具有至少約15-20 kD、較佳至少約20 kD之分子量。涵蓋於本文定義內之蛋白質的實例包括所有哺乳動物蛋白質，尤其治療性及診斷性蛋白質(諸如治療性及診斷性抗體)及一般而言含有一或多個雙硫鍵之蛋白質，其包括包含一或多個鏈間及/或鏈內雙硫鍵之多鏈多肽。 術語"治療性蛋白質"或"治療性多肽"係指用於治療疾病之蛋白質，不管何種適應症或作用機制。為使治療性蛋白質適用於臨床，其必須大量產生。視產生之蛋白質及需要而定，治療性蛋白質或其他蛋白質之"製造規模"產生利用約400 L至約80,000 L範圍內之細胞培養物。通常該製造規模產生利用約400 L至約25,000 L之細胞培養物量。在此範圍內，使用諸如4,000 L、約6,000 L、約8,000 L、約10,000 L、約12,000 L、約14,000 L或約16,000 L的特定細胞培養物量。 術語"治療性抗體"係指用於治療疾病之抗體。治療性抗體可具有各種作用機制。治療性抗體可結合與抗原相關之標靶且中和其正常功能。舉例而言，阻斷癌細胞存活所需之蛋白質活性之單株抗體引起細胞死亡。另一治療性單株抗體可結合與抗原相關之標靶且活化其正常功能。舉例而言，單株抗體可與細胞上之蛋白質結合且觸發細胞凋亡信號。又一單株抗體可與僅於患病組織上表現之靶抗原結合；有毒有效負載(有效藥劑)，諸如化學治療藥劑或放射性藥劑與單株抗體之結合可產生用於將有毒有效負載特異性傳遞至患病組織之藥劑，降低對健康組織之損害。治療性抗體之"生物功能片段"將展示至少一種(若非一些或所有)歸因於完整抗體之生物功能，該功能包含至少與靶抗原特異性結合。 術語"診斷性蛋白質"係指用於診斷疾病之蛋白質。 術語"診斷性抗體"係指用作疾病診斷試劑之抗體。診斷性抗體可與特別與特定疾病相關或於其中顯示表現增加之靶抗原結合。診斷性抗體可用以(例如)偵測來自患者之生物樣品中的標靶或用於使患者之疾病位點(諸如腫瘤)診斷性成像。診斷性抗體之"生物功能片段"將展示至少一種(若非一些或所有)歸因於完整抗體之生物功能，該功能包含至少與靶抗原特異性結合。 "經純化"意謂分子係以含有該分子之樣品之至少80-90重量%的濃度存在於該樣品中。 經純化之蛋白質(包括抗體)較佳為基本上純的且最好為基本上均質的(亦即不含污染性蛋白質等)。 "基本上純的"蛋白質意謂包含以組合物之總重量計至少約90重量%之蛋白質的蛋白質組合物，較佳至少約95重量%。 "基本上均質的"蛋白質意謂包含以組合物之總重量計至少約99重量%之蛋白質的蛋白質組合物。 如上所述，在某些實施例中，蛋白質為抗體。"抗體" (Ab)及"免疫球蛋白"(Ig)為具有相同結構特徵之醣蛋白。雖然抗體展示與特定抗原之結合特異性，但免疫球蛋白包括抗體與一般缺乏抗原特異性的其他抗體樣分子。後一型式之多肽(例如)由淋巴系統低量產生及由骨髓瘤高量產生。 術語"抗體"以最廣意義使用且特別涵蓋單株抗體(包括具有免疫球蛋白Fc區域之全長抗體)、具有多抗原決定基特異性之抗體組合物、雙特異性抗體、雙功能抗體及單鏈分子(諸如scFv分子)以及抗體片段(例如，Fab、F(ab')2 及Fv)。 如本文所用之術語"單株抗體"係指自基本上均質的抗體群體(亦即，除可以微量存在之可能的突變體(例如天然產生之突變體)外構成該群體之個別抗體相同)獲得之抗體。因此，修飾語"單株"指示抗體不為離散抗體之混合物的特徵。在某些實施例中，該單株抗體通常包括包含結合標靶之多肽序列的抗體，其中該標靶結合多肽序列係藉由包括自複數個多肽序列中選擇單一標靶結合多肽序列的方法獲得。舉例而言，選擇方法可為自複數個純系(諸如融合瘤純系、噬菌體純系或重組DNA純系之集合)中選擇獨特純系。應瞭解，所選標靶結合序列可經進一步改變以(例如)改良對標靶之親和力、使標靶結合序列人源化、改良其在細胞培養物中之產生、減少其活體內免疫原性、形成多特異性抗體等，且包含經改變之標靶結合序列的抗體亦為本發明之單株抗體。與通常包括針對不同決定子(抗原決定基)之不同抗體的多株抗體製劑相比，單株抗體製劑中之各單株抗體係針對抗原上之單一決定子。除特異性之外，單株抗體製劑的有利之處在於其通常未經其他免疫球蛋白污染。 修飾語"單株"指示抗體獲自基本上均質的抗體群體之特徵，且不應理解為需要由任何特定方法產生該抗體。舉例而言，有待於根據本發明使用之單株抗體可藉由各種技術製備，該等技術包括(例如)融合瘤方法(例如，Kohler等人，Nature , 256: 495 (1975)；Harlow等人，Antibodies: A Laboratory Manual , (Cold Spring Harbor Laboratory Press,第二版1988)；Hammerling等人，Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681 (Elsevier, N.Y., 1981))、重組DNA方法(參見，例如美國專利第4,816,567號)、噬菌體呈現技術(參見，例如Clackson等人，Nature , 352: 624-628 (1991)；Marks等人，J. Mol. Biol. 222: 581-597 (1992)；Sidhu等人，J. Mol. Biol. 338(2): 299-310 (2004)；Lee等人，J. Mol. Biol. 340(5): 1073-1093 (2004)；Fellouse，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101 (34): 12467-12472 (2004)；及Lee等人，J. Immunol. Methods 284(1-2): 119-132 (2004))及用於在具有部分或所有人類免疫球蛋白基因座或編碼人類免疫球蛋白序列之基因之動物體內產生人類或人類樣抗體之技術(參見，例如WO 98/24893；WO 96/34096；WO 96/33735；WO 91/10741；Jakobovits等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 2551(1993)；Jakobovits等人，Nature 362: 255-258 (1993)；Bruggemann等人，Year in Immunol. 7:33 (1993)；美國專利第5,545,807號；第5,545,806號；第5,569,825號；第5,625,126號；第5,633,425號；第5,661,016號；Marks等人，BioTechnology 10: 779-783 (1992)；Lonberg等人，Nature 368: 856-859 (1994)；Morrison，Nature 368: 812-813 (1994)；Fishwild等人，Nature Biotechnol. 14: 845-851 (1996)；Neuberger,Nature Biotechnol. 14: 826 (1996)及Lonberg及Huszar,Intern. Rev. Immunol. 13: 65-93 (1995))。 本文之單株抗體特別包括"嵌合"抗體，其中一部分重鏈及/或輕鏈與源自特定物種或屬於特定抗體種類或亞類之抗體中的相應序列相同或同源，而該(等)鏈之其餘部分與源自另一物種或屬於另一抗體種類或亞類之抗體中的相應序列相同或同源；以及該等抗體之片段，只要其展現所需生物學活性即可(美國專利第4,816,567號；及Morrison等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855 (1984))。 非人類(例如鼠)抗體之"人源化"形式為含有最少之源自非人類免疫球蛋白之序列的嵌合抗體。在一實施例中，人源化抗體為人類免疫球蛋白(受體抗體)，其中來自受體之高變區的殘基經來自具有所要特異性、親和力及/或能力之非人類物種(供體抗體)(諸如小鼠、大鼠、兔或非人類靈長類動物)之高變區的殘基置換。在一些情況下，人類免疫球蛋白之構架區(FR)殘基經相應之非人類殘基置換。此外，人源化抗體可包含受體抗體或供體抗體中未見之殘基。可進行該等修飾以進一步改進抗體效能。一般而言，人源化抗體將包含基本上所有至少一個且通常兩個可變域，其中所有或基本上所有高變環對應於非人類免疫球蛋白之高變環，且所有或基本上所有FR為人類免疫球蛋白序列之FR。人源化抗體視情況亦將包含至少一部分免疫球蛋白恆定區(Fc)，通常為人類免疫球蛋白之恆定區。其他詳情參見Jones等人，Nature 321:522-525 (1986)；Riechmann等人，Nature 332:323-329 (1988)；及Presta，Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992)。亦參見以下評論性文章及其中所引用之參考文獻：Vaswani及Hamilton,Ann. Allergy, Asthma & Immunol. 1:105-115 (1998)；Harris,Biochem. Soc. Transactions 23:1035-1038 (1995)；Hurle及Gross,Curr. Op. Biotech. 5:428-433 (1994)。人源化抗體包括PrimatizedTM 抗體，其中該抗體之抗原結合區係源自藉由用所關注抗原使獼猴免疫而產生之抗體。 "人類抗體"為具有與人類所產生之抗體之胺基酸序列相對應的胺基酸序列且/或使用本文所揭示之製備人類抗體之技術中之任一者製得的抗體。此人類抗體定義特別排除包含非人類抗原結合殘基之人源化抗體。 "親和力成熟"抗體為在其一或多個CDR/HVR中具有一或多處變化之抗體，與不具有彼等變化之親本抗體相比較，彼等變化使得抗體對抗原之親和力得以改良。較佳之親和力成熟抗體將對靶抗原具有奈莫耳或甚至皮莫耳親和力。親和力成熟抗體係藉由此項技術中已知之程序產生。Marks等人，Bio/Technology 10:779-783 (1992)描述藉由VH 及VL 域改組來進行親和力成熟。CDR/HVR及/或構架殘基之隨機突變誘發係由以下文獻描述：Barbas等人，Proc Nat. Acad. Sci. USA 91:3809-3813 (1994)；Schier 等人，Gene 169:147-155 (1995)；Yelton等人，J. Immunol. 155:1994-2004 (1995)；Jackson等人，J. Immunol. 154(7):3310-9 (1995)；及Hawkins等人，J. Mol. Biol. 226:889-896 (1992)。 抗體之"可變區"或"可變域"係指抗體之重鏈或輕鏈之胺基末端域。可將重鏈之可變域稱為"VH "。可將輕鏈之可變域稱為"VL "。該等域一般為抗體之最易變部分且含有抗原結合位點。 術語"可變"係指在各抗體之間，可變域之某些部分的序列大不相同且可用於各特定抗體對其特定抗原的結合及特異性。然而，可變性並非均勻分布於整個抗體可變域中。其集中於輕鏈與重鏈可變域中稱為互補判定區(CDR)或高變區(HVR)之三個區段。可變域之更高保守部分稱作構架區(FR)。天然重鏈及輕鏈之可變域各包含由三個CDR連接之四個FR區(主要採用β-摺疊構型)，該三個CDR形成連接該β-摺疊結構且在有些狀況中形成該β-摺疊結構之部分的環。各鏈中之CDR由FR區緊密結合在一起，且與其他鏈中之CDR一起促進抗體之抗原結合位點之形成(參見Kabat等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest ，第五版，National Institute of Health, Bethesda, MD (1991))。恆定域並不與抗體與抗原之結合直接相關，但其展示出各種效應功能，諸如使抗體參與抗體依賴性細胞毒性。 來自任何脊椎動物物種之抗體(免疫球蛋白)之"輕鏈"可基於其恆定域之胺基酸序列歸為兩個稱為κ及λ之截然不同類型中之一者。 抗體(免疫球蛋白)可視其重鏈恆定域之胺基酸序列而歸為不同類別。存在5種主要類別之免疫球蛋白：IgA、IgD、IgE、IgG及IgM，且可將該等免疫球蛋白中之若干者進一步分為子類(同型)，例如IgG1 、IgG2 、IgG3 、IgG4 、IgA1 及IgA2 。將與不同類別之免疫球蛋白對應之重鏈恆定域分別稱為a、d、e、g及m。不同類別之免疫球蛋白之次單位結構及三維構型已熟知且一般性描述於例如，Abbas等人，Cellular andMol. Immunology ，第4版(2000)中。抗體可為由該抗體與一或多種其他蛋白質或肽共價或非共價締合所形成之較大融合分子之部分。 術語"全長抗體"、"完整抗體"及"整個抗體"在本文中可互換使用，其係指基本上完整形式的抗體而非如下所定義之抗體片段。該等術語尤其係指具有含有Fc區之重鏈的抗體。 "抗體片段"僅包含完整抗體之一部分，其中該部分保留當彼部分存在於完整抗體中時通常與其相關之功能中之至少一種功能，且多至大部分或全部功能。在一實施例中，抗體片段包含完整抗體之抗原結合位點且因此保留結合抗原之能力。在另一實施例中，抗體片段(例如包含Fc區之片段)保留當該Fc區存在於完整抗體中時通常與其相關之生物功能中之至少一種功能，諸如FcRn結合、抗體半衰期調節、ADCC功能及補體結合。在一實施例中，抗體片段為具有基本上與完整抗體類似之活體內半衰期的單價抗體。舉例而言，該抗體片段可包含連接至能夠賦予該片段活體內穩定性之Fc序列之抗原結合臂。 抗體之木瓜蛋白酶消化產生兩個稱為"Fab"片段之相同抗原結合片段，各自具有單一抗原結合位點；及殘餘"Fc"片段，其名稱反映其易於結晶之能力。胃蛋白酶處理產生具有兩個抗原結合位點且仍能夠與抗原交聯之F(ab')2 片段。 Fab片段含有重鏈及輕鏈可變域且亦含有輕鏈之恆定域及重鏈之第一恆定域(CH1)。Fab'片段因在重鏈CH1域之羧基末端添加有幾個殘基(包括一或多個來自抗體鉸鏈區之半胱胺酸)而不同於Fab片段。Fab'-SH在本文中指代恆定域之半胱胺酸殘基帶有游離硫醇基之Fab'。最初F(ab')2 抗體片段係以其間具有鉸鏈半胱胺酸之Fab'片段對的形式產生。亦已知抗體片段之其他化學偶聯。 "Fv"為含有完整抗原結合位點的最小抗體片段。在一實施例中，雙鏈Fv物質由緊密、非共價締合之一重鏈可變域與一輕鏈可變域之二聚體組成。在單鏈Fv(scFv)物質中，一重鏈可變域及一輕鏈可變域可由可撓性肽連接子共價聯結，以使得輕鏈及重鏈可締合成與雙鏈Fv物質中之結構類似之"二聚"結構。在此構型中各可變域之3個CDR相互作用以界定VH -VL 二聚物表面上之抗原結合位點。六個CDR共同賦予抗體以抗原結合特異性。然而，即使單一可變域(或僅包含三個對抗原具有特異性之CDR之半個Fv)仍具有識別及結合抗原之能力，但其親和力比整個結合位點低。 "單鏈Fv"或"scFv"抗體片段包含抗體之VH 及VL 域，其中該等域係存在於單一多肽鏈中。一般而言，scFv多肽另外包含VH 與VL 域之間使scFv能夠形成抗原結合所需結構之多肽連接子。對於scFv之評論，參見Pluckthun，The Pharmacology of Monoclonal Antibodies，第113卷，Rosenburg及Moore編，Springer-Verlag，New York，第269-315頁(1994)。 術語"雙功能抗體"係指具有兩個抗原結合位點之小抗體片段，該等片段包含與同一多肽鏈中之輕鏈可變域(VL )連接之重鏈可變域(VH )(VH -VL )。藉由使用太短以至於不能使同一鏈上的兩個域之間配對的連接子，迫使該等域與另一鏈之互補域配對且產生兩個抗原結合位點。雙功能抗體可為二價或雙特異性的。雙功能抗體更充分描述於例如EP 404,097；WO 93/1161；Hudson等人，(2003)Nat. Med. 9:129-134；及Hollinger等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 : 6444-6448 (1993)中。三功能抗體及四功能抗體亦描述於Hudson等人，(2003)Nat. Med. 9:129-134中。 抗體可與任何蛋白質結合，該等蛋白質包括(而不限於)HER受體家族中之成員，諸如HER1(EGFR)、HER2、HER3及HER4；CD蛋白，諸如CD3、CD4、CD8、CD19、CD20、CD21、CD22及CD34；細胞黏著分子，諸如LFA-1、Mol、p150,95、VLA-4、ICAM-1、VCAM及αv/β3整合素(包括其α或β次單位)(例如抗CD11a、抗CD18或抗CD11b抗體)；生長因子，諸如血管內皮生長因子(VEGF)；IgE；血型抗原；flk2/flt3受體；肥胖(OB)受體；及蛋白C。其他例示性蛋白質包括生長激素(GH)，包括人生長激素(hGH)及牛生長激素(bGH)；生長激素釋放因子；甲狀旁腺激素；促甲狀腺激素；脂蛋白；α-1-抗胰蛋白酶；胰島素A-鏈；胰島素B-鏈；胰島素原；促卵泡激素；降鈣素；促黃體生成激素；升血糖激素；凝血因子，諸如因子VIIIC、因子IX、組織因子及血管性血友病因子；抗凝血因子，諸如蛋白C；心房利尿鈉因子；肺界面活性劑；血纖維蛋白溶酶原活化劑，諸如尿激酶或組織型血纖維蛋白溶酶原活化劑(t-PA)；鈴蟾素；凝血酶；腫瘤壞死因子-α及腫瘤壞死因子-β；腦啡肽酶；RANTES(調節活化正常T細胞表現及分泌因子)；人類巨噬細胞發炎性蛋白(MIP-1-α)；血清白蛋白，諸如人血清白蛋白(HSA)；苗勒氏抑制物質；鬆弛素A-鏈；鬆弛素B-鏈；鬆弛素原；小鼠促性腺激素相關肽；DNase；抑制素；活化素；激素或生長因子之受體；整合素；蛋白A或D；類風濕因子；神經營養因子，諸如骨衍生之神經營養因子(BDNF)、神經營養因子-3、神經營養因子-4、神經營養因子-5或神經營養因子-6(NT-3、NT-4、NT-5或NT-6)或神經生長因子，諸如NGF-β；血小板衍生之生長因子(PDGF)；纖維母細胞生長因子，諸如aFGF及bFGF；表皮生長因子(EGF)；轉化生長因子(TGF)，諸如TGF-α及TGF-β，包括TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3、TGF-β4或TGF-β5；胰島素樣生長因子-I及胰島素樣生長因子-II(IGF-I及IGF-II)；des(1-3)-IGF-I(腦IGF-I)；胰島素樣生長因子結合蛋白；紅血球生成素(EPO)；血小板生成素(TPO)；骨生成誘導因子；免疫毒素；骨形態發生蛋白(BMP)；干擾素，諸如干擾素-α、干擾素-β及干擾素-γ；群落刺激因子(CSF)，例如M-CSF、GM-CSF及G-CSF；介白素(IL)，例如IL-1至IL-10；過氧化物歧化酶；T細胞受體；表面膜蛋白；促衰變因子；病毒抗原，諸如一部分AIDS包膜；轉運蛋白；歸巢受體；地址素；調節蛋白；免疫黏附素；抗體；及以上所列舉之任何多肽的生物活性片段或變異體。許多其他抗體及/或其他蛋白質可根據本發明使用且以上列舉並不意謂僅限於此。 抗體之"生物功能片段"僅包含完整抗體之一部分，其中該部分保留當彼部分存在於完整抗體中時通常與其相關之功能中之至少一種功能，且多至大部分或全部功能。在一實施例中，抗體之生物功能片段包含完整抗體之抗原結合位點且因此保留結合抗原之能力。在另一實施例中，抗體之生物功能片段(例如包含Fc區之片段)保留當該Fc區存在於完整抗體中時通常與其相關之生物功能中之至少一種功能，諸如FcRn結合、抗體半衰期調節、ADCC功能及補體結合。在一實施例中，抗體之生物功能片段為具有基本上與完整抗體類似之活體內半衰期的單價抗體。舉例而言，抗體之該生物功能片段可包含連接至能夠賦予該片段活體內穩定性之Fc序列之抗原結合臂。 術語"硫氧還原蛋白抑制劑"及"Trx抑制劑"可互換使用且包括有效抑制硫氧還原蛋白活性之所有藥劑及手段。因此，硫氧還原蛋白(Trx)抑制劑包括阻斷Trx、G6PD及/或己糖激酶系統之任何組份之所有藥劑及手段。在此情形下，"抑制"包括完全消除(阻斷)及降低硫氧還原蛋白活性且因此完全或部分消除蛋白質(諸如抗體)中之雙硫鍵還原。 "經分離"抗體為已經鑑別且與其自然環境之組份分離且/或自其回收的抗體。其自然環境之污染物組份為干擾抗體之研究、診斷性或治療性使用的物質，且可包括酶、激素及其他蛋白性溶質或非蛋白性溶質。在一些實施例中，將抗體純化(1)至如由(例如)勞力法(Lowry method)所測定大於95重量%之抗體，且在一些實施例中，大於99重量%；(2)至足以獲得使用(例如)旋杯式序列分析儀測定之N-末端或內部胺基酸序列之至少15個殘基的程度，或(3)至在還原或非還原條件下藉由SDS-PAGE使用(例如)考馬斯藍(Coomassie blue)或銀染色測定之均質性。由於抗體天然環境之至少一種組份將不存在，故經分離之抗體包括原位處於重組細胞內之抗體。然而，一般經分離抗體將由至少一個純化步驟來製備。 術語"蛋白A"及"ProA"可在本文中互換使用且涵蓋自蛋白A之天然來源回收之蛋白A、合成產生之蛋白A(例如藉由肽合成或藉由重組技術)及其保留結合蛋白質的能力，具有CH 2/CH 3區(諸如Fc區)之變異體。蛋白A可在商業上自Repligen、Pharmacia及Fermatech購得。蛋白A一般固定在固相載體材料上。術語"ProA"亦係指含有與蛋白A共價連接之層析固態載體基質之親和層析樹脂或管柱。 術語"層析"係指因在移動相之影響下混合物中之個別溶質遷移經過固定介質之速率差異或是結合及溶離過程之差異而產生之使混合物中之所關注溶質與混合物中之其他溶質分離的方法。 術語"親和層析"及"蛋白質親和層析"可在本文中互換使用且係指使所關注蛋白質或所關注抗體可逆地且特異性地結合至生物特異性配位體之蛋白質分離技術。較佳地，當溶液接觸層析固相材料時，生物特異性配位體與層析固相材料共價連接且可接近溶液中之所關注蛋白質。在層析步驟期間，所關注之蛋白質(例如，抗體、酶或受體蛋白)保留其對生物特異性配位體(例如抗原、受質、輔因子或激素)之特異性結合親和力，而混合物中之其他溶質及/或蛋白質不與配位體可觀地或特異性結合。所關注之蛋白質與固定配位體的結合使得污染性蛋白質或蛋白質雜質通過層析介質，而所關注之蛋白質仍保持與固相材料上之固定配位體特異性結合。隨後將特異性結合之所關注之蛋白質以活性形式自低pH值、高pH值、高鹽之固定配位體、競爭性配位體及其類似物移除，且隨溶離緩衝液通過層析管柱，不含早先已通過管柱之污染性蛋白質或蛋白質雜質。可將任何組份用作純化其各別特異性結合蛋白質(例如抗體)之配位體。 術語"非親和層析"及"非親和純化"係指不使用親和層析之純化方法。非親和層析包括依賴於所關注之分子(諸如蛋白質，例如抗體)與固相基質之間的非特異性相互作用之層析技術。 "陽離子交換樹脂"係指帶負電且因此具有用於與通過固相之水溶液中的陽離子交換之游離陽離子的固相。附著於固相以形成陽離子交換樹脂之帶負電配位體可為(例如)羧酸根或磺酸根。市售陽離子交換樹脂包括羧基-甲基-纖維素、固定於瓊脂糖上之磺丙基(SP)(例如Pharmacia之SP-SEPHAROSE FAST FLOWTM 或SP-SEPHAROSE HIGH PERFORMANCETM )及固定於瓊脂糖上之磺醯基(例如Pharmacia之S-SEPHAROSE FAST FLOWTM )。"混合型離子交換樹脂"係指由陽離子部分、陰離子部分及疏水性部分共價修飾之固相。市售混合型離子交換樹脂為含有弱陽離子交換基團、低濃度陰離子交換基團及疏水性配位體附著於矽膠固相載體基質之BAKERBOND ABXTM (J.T. Baker, Phillipsburg, NJ)。 本文所用之術語"陰離子交換樹脂"係指帶正電，例如附著有一或多個帶正電配位體(諸如四級胺基)之固相。市售陰離子交換樹脂包括DEAE纖維素、QAE SEPHADEXTM 及FAST Q SEPHAROSETM (Pharmacia)。 "緩衝液"為藉由溶液之酸鹼共軛組份之作用抵抗pH值變化之溶液。可視(例如)緩衝液之所要pH值而使用之各種緩衝液描述於Buffers. A Guide for the Preparation and Use of Buffers in Biological Systems ，Gueffroy, D.編，Calbiochem Corporation (1975)中。在一實施例中，緩衝液具有約2至約9，或者約3至約8，或者約4至約7，或者約5至約7範圍內之pH值。將pH值控制於此範圍內之緩衝液的非限制性實例包括MES、MOPS、MOPSO、Tris、HEPES、磷酸鹽、乙酸鹽、檸檬酸鹽、琥珀酸鹽及銨緩衝液以及該等物質之組合。 "上樣緩衝液"為用以將包含所關注之多肽分子及一或多種雜質之組合物加載於離子交換樹脂上之緩衝液。上樣緩衝液具有使所關注之多肽分子(及一般一或多種雜質)與離子交換樹脂結合或使所關注之蛋白質流經管柱而雜質與樹脂結合之傳導率及/或pH值。 "中間緩衝液"係用以在溶離所關注之多肽分子之前自離子交換樹脂溶離一或多種雜質。中間緩衝液具有使一或多種雜質而非顯著量之所關注之多肽自離子交換樹脂溶離之傳導率及/或pH值。 術語"洗滌緩衝液"在本文中使用時係指用以在溶離所關注之多肽分子之前洗滌或再平衡離子交換樹脂的緩衝液。便利地，洗滌緩衝液及上樣緩衝液可相同，但並非必需如此。 "溶離緩衝液"係用以自固相中溶離所關注之多肽。溶離緩衝液具有使所關注之多肽自離子交換樹脂溶離之傳導率及/或pH值。 "再生緩衝液"可用以使離子交換樹脂再生以使其可再使用。再生緩衝液具有自離子交換樹脂中移除基本上所有雜質及所關注之多肽所需之傳導率及/或pH值。 如本文所用之術語"基本上類似"或"基本上相同"表示兩個數值(例如，一數值與本發明之抗體關聯而另一數值與參考/比較抗體關聯)之間的類似度足夠高，以使得熟習此項技術者將認為兩值之間的差異在該等值(例如Kd值)所量測之生物學特徵之情形下具有較小或不具有生物學及/或統計顯著性。該兩個值之間的差異以參考/比較值計(例如)小於約50%、小於約40%、小於約30%、小於約20%及/或小於約10%。 如本文關於量或數值(且不提及還原之化學過程)所用之短語"基本上降低"或"基本上不同"表示兩個數值(一般一數值與分子關聯而另一數值與參考/比較分子關聯)之間的差異程度足夠高，以使得熟習此項技術者將認為兩值之間的差異在該等值(例如Kd值)所量測之生物學特徵之情形下具有統計顯著性。該兩個值之間的差異以參考/比較分子之數值計(例如)大於約10%、大於約20%、大於約30%、大於約40%及/或大於約50%。 如本文所用之術語"載體"意指一種核酸分子，其能夠傳輸已與其連接之另一核酸。一種類型之載體為"質體"，其係指可與其他DNA區段接合之環狀雙股DNA。另一類型之載體為噬菌體載體。另一類型之載體為病毒載體，其中可將其他DNA區段與病毒基因組接合。某些載體能夠在其所引入之宿主細胞中自主複製(例如，具有細菌複製起點之細菌載體及游離型哺乳動物載體)。其他載體(例如非游離型哺乳動物載體)可在引入宿主細胞之後整合至宿主細胞之基因組中，且藉此與宿主基因組一起複製。此外，某些載體能夠指導與其以可操作方式連接之基因之表現。在本文中該等載體稱為"重組表現載體"(或簡單地稱為"表現載體")。一般而言，可用於重組DNA技術中之表現載體通常為質體之形式。由於質體為載體之最常用形式，因此在本發明之說明書中，"質體"與"載體"可互換使用。 相對於參考多肽序列之"胺基酸序列一致性百分比(%)"係定義為：在對準序列且(若需要)引入空位以獲得最大序列一致性百分比之後且不將任何保守性取代視作序列一致性的部分，候選序列中與參考多肽序列中之胺基酸殘基一致之胺基酸殘基的百分比。為測定胺基酸序列一致性百分比之對準可以此項技術內熟知之多種方式獲得，例如使用公開可得之電腦軟體，諸如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)軟體。熟習此項技術者可測定對準序列之適當參數，包括為獲得在所比較之全長序列上之最大對準所需要的任何演算法。然而，為達到本文之目的，胺基酸序列一致性百分比值係使用序列比較電腦程式ALIGN-2產生。ALIGN-2序列比較電腦程式係由Genentech, Inc.創作且源編碼已隨使用者文件歸檔於美國版權局(U.S. Copyright Office)，Washington D.C., 20559中，在此其係以美國版權登記號(U.S. Copyright Registration No.) TXU510087登記。ALIGN-2程式可自Genentech, Inc., South San Francisco, California公開獲得或可自源編碼編譯。應編譯ALIGN-2程式以用於UNIX操作系統，較佳數位UNIX V4.0D。所有序列比較參數係由ALIGN-2程式設定且不改變。 在ALIGN-2用於胺基酸序列比較之情況下，給定胺基酸序列A對給定胺基酸序列B之胺基酸序列一致性百分比(其或者可表述為具有或包含對給定胺基酸序列B之某胺基酸序列一致性百分比的給定胺基酸序列A)計算如下： 100×分數X/Y， 其中X為在A及B之序列對準程式ALIGN-2之對準中由彼程式評分為一致匹配的胺基酸殘基之數目， 且其中Y為B中胺基酸殘基之總數。 應瞭解若胺基酸序列A之長度不等於胺基酸序列B之長度，則A對B之胺基酸序列一致性百分比不等於B對A之胺基酸序列一致性百分比。除非另外明確規定，否則本文所用之所有胺基酸序列一致性百分比值係如上一段中所述使用ALIGN-2電腦程式來獲得。 將"核酸序列一致性百分比(%)"定義為在對準序列且(若需要)引入空位以獲得最大序列一致性百分比之後候選序列中與參考因子D-編碼序列中之核苷酸一致之核苷酸的百分比。為測定核酸序列一致性百分比之對準可以此項技術內熟知之多種方式獲得，例如使用公開可得之電腦軟體，諸如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)軟體。熟習此項技術者可測定量測對準之適當參數，包括為獲得在所比較之全長序列上之最大對準所需要的任何演算法。隨後計算相對於較長序列之序列一致性，亦即即使較短序列顯示對較長序列之一部分的100%序列一致性，但總序列一致性將會小於100%。 "治療"係指治療性治療與預防性手段。需要治療者包括已患有病症者以及有待於預防病症者。本文中"治療"涵蓋疾病及特定疾病之病徵及症狀的緩減。 "病症"為將受益於蛋白質治療之任何病狀。此包括慢性及急性病症或疾病，包括使哺乳動物易患所述病症之彼等病理病狀。本文中待治療之病症的非限制性實例包括癌瘤及過敏症。 為達到治療之目的之"哺乳動物"係指歸類為哺乳動物之任何動物，包括人類、非人類高級靈長類動物、其他脊椎動物、家養及農場動物，及動物園、體育或寵物動物，諸如犬、馬、貓、牛等。哺乳動物較佳為人類。 "干擾RNA"或"小干擾RNA(siRNA)"為長度小於約30個核苷酸，減少靶基因之表現之雙股RNA分子。干擾RNA可使用已知方法(Shi Y.，Trends in Genetics 19(1):9-12 (2003)，WO/2003056012及WO 2003064621)鑑別及合成且siRNA庫可購得，例如自Dharmacon、Lafayette、Colorado購得。通常，可siRNA經成功設計以靶向基因之5'末端。 II.本發明之組合物及方法 除非另外指出，否則本發明之實踐將使用在此項技術之技能內的習知分子生物學技術及其類似技術。該等技術在文獻中得以充分闡述。參見，例如Molecular Cloning: A Laboratory Manual (J. Sambrook等人， Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989)；Current Protocols in Molecular Biology (F. Ausubel等人編，1987年更新)；Essential Molecular Biology (T. Brown編，IRL Press 1991)；Gene Expression Technology (Goeddel編，Academic Press 1991)；Methods for Cloning and Analysis of Eukaryotic Genes (A. Bothwell等人編， Bartlett Publ. 1990)；Gene Transfer and Expression (M. Kriegler，Stockton Press 1990)；Recombinant DNA Methodology II (R. Wu等人編，Academic Press 1995)；PCR：A Practical Approach (M. McPherson等人，IRL Press at Oxford University Press 1991)；Oligonucleotide Synthesis (M. Gait編，1984)；Cell Culture for Biochemists (R. Adams編，Elsevier Science Publishers 1990)；Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (J. Miller及M. Calos編，1987)；Mammalian Cell Biotechnology (M. Butler編，1991)；Animal Cell Culture (J. Pollard等人編，Humana Press 1990)；Culture of Animal Cells ，第2版(R. Freshney等人編，Alan R. Liss 1987)；Flow Cytometry and Sorting (M. Melamed等人編，Wiley-Liss 1990)；叢書Methods in Enzymology (Academic Press, Inc.)；Wirth M.及Hauser H. (1993)；Immunochemistry in Practice ，第3版，A. Johnstone及R. Thorpe，Blackwell Science, Cambridge, MA, 1996；Techniques in Immunocytochemistry , (G. Bullock及P. Petrusz編，Academic Press 1982、1983、1985、1989)；Handbook of Experimental Immunology, (D. Weir及C. Blackwell編)；Current Protocols in Immunology (J. Coligan等人編，1991)；Immunoassay (E. P. Diamandis及T.K. Christopoulos編，Academic Press, Inc., 1996)；Goding (1986)Monoclonal Antibodies: Principles and Practice (第2版) Academic Press, New York；Ed Harlow及David Lane，Antibodies A laboratory Manual , Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, 1988；Antibody Engineering ，第2版(C. Borrebaeck編，Oxford University Press, 1995)；及叢書Annual Review of Immunology ；叢書Advances in Immunology 。 1. 雙硫鍵還原之預防 本發明係關預防蛋白質之雙硫鍵於重組體產生過程中還原之方法。詳言之，本發明係關於預防重組蛋白之雙硫鍵於醱酵之後的加工處理過程中還原之方法。本發明之方法對於含雙硫鍵之蛋白質的大規模產生，諸如製造規模的產生尤其重要。在一實施例中，本發明之方法適用於大於5,000 L之規模的大規模蛋白質產生。 已經由實驗發現雙硫鍵還原發生在製造含有雙硫鍵之重組蛋白期間所產生之已收集細胞培養液(HCCF)的處理過程中。通常，此還原在細胞溶解之後，尤其收集操作期間之機械細胞溶解之後，當細胞溶解達到某一臨限值，諸如總細胞溶解之約30%至約70%，或約40%至約60%，或約50%至約60%時觀察到。此臨限值將視所產生之蛋白質(例如抗體)的性質、重組宿主、產生系統、所用產生參數及其類似因素而變化且可易於經由實驗來確定。 理論上，該還原可能由製造過程中的多種因素及條件產生且可由多種還原劑引起。本發明(至少部分)係基於對此還原之根本原因為HCCF中之活化硫氧還原蛋白(Trx)系統的認知。 由Trx、硫氧還原蛋白還原酶(TrxR)及NADPH組成之Trx酶系統為使蛋白質中之雙硫鍵還原之氫供體系統。Trx為具有CXXC活性位點基元之小單體蛋白，該蛋白質經由硫醇-雙硫鍵交換催化許多氧化還原反應。氧化之Trx可由NADPH經由TrxR還原。隨後還原之Trx可催化蛋白質中雙硫鍵之還原。硫氧還原蛋白系統所需之NADPH係經由磷酸戊糖途徑及糖酵解中之反應來提供。本文所提出之結果證實Trx系統活性所需之NADPH係由6-磷酸葡萄糖脫氫酶(G6PD)活性提供，後者由葡萄糖及ATP經由己糖激酶產生NADPH(參見圖4)。細胞溶解後該等細胞酶(Trx系統、G6PD及己糖激酶)以及其受質一起被釋放至CCF中，從而使還原發生。因此，雙硫鍵還原可由Trx酶系統或為活化Trx系統提供組份(諸如G6PD及己糖激酶活性)之上游酶系統之抑制劑來預防。 對於該等酶系統之其他詳情或關於蛋白質產生之其他詳情，參見(例如)：Babson, A.L.及Babson, S.R. (1973) Kinetic Colorimetric Measurement of Serum Lactate Dehydrogenase Activity.Clin. Chem. 19: 766-769；Michael W. Laird等人，"Optimization of BLyS Production and Purification from Eschericia coli"，Protein Expression and Purification 39:237-246 (2005)；John C. Joly等人，"Overexpression of Eschericia coli Oxidoreductases Increases Recombinant Insulin-like Growth Factor-I Accumulation"，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:2773-2777 (1998年3月)；Dana C. Andersen等人，"Production Technologies for Monoclonal Antibodies and Their Fragments"，Current Opinion in Biotechnology 15:456-462 (2004)；Yariv Mazor等人，"Isolation of Engineered, Full-length Antibodies from Libraries Expressed inEscherichia coli "Nature Biotech. 25, 563-565 (2007年6月1日)；Laura C. Simmons等人，"Expression of Full-length Immunoglobulins inEscherichia coli: Rapid and Efficient Production of Aglycosylated Antibodies"，Journal of Immunological Methods 263:133-147 (2002)；Paul H. 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方法1 目的
添加EDTA、EGTA或檸檬酸鹽 抑制己糖激酶
添加山梨糖-1-磷酸鹽、聚磷酸鹽、6-去氧-6-氟葡萄糖、2-C-羥基-甲基葡萄糖、木糖及來蘇糖 抑制己糖激酶
添加表雄固酮或去氫表雄固酮(DHEA) 抑制G6PD
添加5'-磷酸吡哆醛或1-氟-2,4-二硝基苯 抑制G6PD
添加金屬離子，諸如Cu2+ 、Zn2+ 、Hg2+ 、Co2+ 或Mn2+ 抑制Trx系統
添加烷基-2-咪唑基二硫化物及相關化合物(例如，1-甲基丙基-2-咪唑基二硫化物2 )或或萘醌螺縮酮衍生物(例如，帕馬黴素(palmarumycin)CP1 2 ) 抑制Trx
添加金硫葡糖(ATG)或金硫蘋果酸鹽(ATM) 抑制TrxR
空氣噴射 消耗G6P及NADPH
pH值調節至6.0以下 降低硫醇-雙硫鍵交換率及Trx系統活性
1 在收集之前應用於CCF或收集之後立即應用於HCCF。2 當前不可購得。 用於本發明之方法的"Trx抑制劑"包括(而不限於)：(1)Trx之直接抑制劑，諸如烷基-2-咪唑基二硫化物及相關化合物(例如，1-甲基丙基-2-咪唑基二硫化物)(Kirkpatrick等人，1998及1999，上述)及萘醌螺縮酮衍生物(例如，帕馬黴素CP1 )(Wipf等人，2001，上述)；(2) TrxR之特異性抑制劑，包括金錯合物，諸如金硫葡糖(ATG)及金硫蘋果酸鹽(ATM)(參見，例如Gromer等人，2004之評論)，其為TrxR之不可逆抑制劑之實例；(3)金屬離子，諸如Hg2+ 、Cu2+ 、Zn2+ 、Co2+ 及Mn2+ ，其可易於與硫醇及硒醇形成錯合物，且因此可於本發明之實施例中用作TrxR或Trx之抑制劑；(4) G6PD之抑制劑，諸如5'-磷酸吡哆醛及1-氟-2,4-二硝基苯(Milhausen及Levy 1975，上述)、某些類固醇，諸如去氫表雄固酮(DHEA)及表雄固酮(EA)(Gordon等人，1995，上述)；且(4)己糖激酶活性之抑制劑(及藉此產生用於G6PD之G6P)，包括金屬離子(例如Mg2+ )之螯合劑，諸如EDTA；及與SH基團、山梨糖-1-磷酸鹽、聚磷酸鹽、6-去氧-6-氟葡萄糖、2-C-羥基-甲基葡萄糖、木糖及來蘇糖反應之化合物(Sols等人，1958，上述；McDonald，1955，上述)；其他己糖激酶抑制劑揭示於標題為"Hexokinase Inhibitors"之美國專利第5,854,067號中。應瞭解該等抑制劑僅係出於說明之目的而列出。其他Trx抑制劑存在且可單獨或以各種組合用於本發明之方法中。 用於本發明之方法的"Trx抑制劑"亦包括用以使得重組產生之抗體或蛋白質之還原可藉由在產生週期中之各點降低Trx系統、戊糖磷酸途徑或己糖激酶之酶含量而減少或預防的試劑。在一些實施例中，此酶含量減少可藉由使用靶向siRNA、反義核苷酸或抗體來完成。為設計針對如見於CHO細胞中之基因的靶向siRNA或反義核苷酸，該等基因序列可自公開可得資料庫獲得以選擇用於靶向不同生物體中之酶之序列。關於大腸桿菌及小鼠Trx系統之基因實例參見以下實例9。 除使用上述抑制劑外，在本發明之在某些實施例中亦可藉由用空氣噴射HCCF以保持HCCF中之氧化性氧化還原電位來預防待純化之重組蛋白還原。此為可藉由連續氧化還原形式之Trx及TrxR來消耗葡萄糖、G6P及NADPH的非直接手段。HCCF槽之空氣噴射可(例如)以每分鐘約100公升至約200公升，諸如150公升之氣流進行。可進行空氣噴射以達到終點飽和百分比；例如可持續空氣噴射直至HCCF為約100%空氣飽和，或其可持續直至HCCR為約30%空氣飽和，或直至約100%空氣飽和至約30%空氣飽和之間。 在本發明之其他實施例中，可用以阻斷重組蛋白還原之另一非直接方法為降低HCCF之pH值。此實施例利用在較低pH值下尤其緩慢之硫醇-雙硫鍵交換(Whitesides等人，1977，上述；Pleasants等人，1989，上述)。因此，在6以下之pH值下，Trx系統之活性顯著較低，且因此可抑制諸如奧克珠單抗之重組蛋白之還原。 非直接方法亦可彼此組合及/或與使用一或多種Trx抑制劑組合。 雙硫鍵還原可藉由使用一或多種Trx抑制劑及/或在完成細胞培養過程之後，將非直接方法較佳在收集之前應用於CCF或收集之後立即應用於HCCF中來抑制(亦即，部分或完全阻斷)。最佳之應用時間及方式及有效量視待純化之蛋白質的性質、重組宿主細胞及所用特定產生方法而定。最佳參數之確定完全在一般熟習此項技術者之技能範圍內。 舉例而言，在哺乳動物細胞培養過程中，諸如在本文實例中所述之CHO抗體產生過程中，若將硫酸銅(五水合物形式或無水形式之CuSO4 )用作Trx抑制劑，則其可以約5 μM至約100 μM，諸如約10 μM至約80 μM、較佳約15 μM至約50 μM之濃度範圍添加以補充CCF或HCCF。因為一些細胞培養物已含有銅(例如本文實例中所用之CHO細胞培養物之約0.04 μM CuSO4 )，故此量係除已存在於細胞培養物中之銅(若存在)以外。只要溶解度不存在問題，即可使用任何銅(II)鹽替代CuSO4 。舉例而言，可使用均可溶於水之乙酸銅及氯化銅替代CuSO4 。 視細胞溶解之程度、所用重組宿主細胞及產生過程之其他參數而定，EDTA可以寬濃度範圍使用。舉例而言，當使用CHO或其他哺乳動物宿主細胞時，視細胞溶解之程度而定，EDTA通常可以約5 mM至約60 mM之間，諸如約10 mM至約50 mM，或約20 mM至約40 mM的濃度添加。對於較低程度之細胞溶解，較低濃度之EDTA便足夠，而對於約75%-100%之細胞溶解，所需EDTA濃度較高，諸如約20 mM至約40 mM。 作為Trx抑制劑之DHEA通常在較低濃度下有效，例如在約0.05 mM至約5 mM，較佳約0.1 mM至約2.5 mM之濃度範圍內有效。 其他Trx抑制劑，諸如金硫葡糖(ATG)及金硫蘋果酸鹽(ATM)在μM濃度範圍內抑制雙硫鍵之還原。因此，例如ATG或ATM可以約0.1 mM至約1 mM之間的濃度添加。 在一較佳實施例中，製造過程中所用之哺乳動物宿主細胞為中國倉鼠卵巢(CHO)細胞(Urlaub等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216(1980))。其他哺乳動物宿主細胞包括(而不限於)由SV40轉型之猴子腎CV1細胞株(COS-7，ATCC CRL 1651)；人胚腎細胞株(次選殖以在懸浮培養物中生長之293或293細胞)，Graham等人，J. Gen Virol 36:59 (1977))；幼倉鼠腎細胞(BHK，ATCC CCL 10)；小鼠足細胞(TM4，Mather,Biol. Reprod. 23:243-251 (1980))；猴腎細胞(CV1 ATCC CCL 70)；非洲綠猴腎細胞(VERO-76，ATCC CRL-1587)；人類宮頸癌細胞(HELA，ATCC CCL 2)；犬科動物腎細胞(MDCK，ATCC CCL 34)；布法羅大鼠(buffalo rat)肝細胞(BRL 3A，ATCC CRL 1442)；人類肺細胞(W138, ATCC CCL 75)；人類肝細胞(Hep G2，HB 8065)；小鼠乳腺腫瘤(MMT 060562，ATCC CCL 51)；TRI細胞(Mather等人，Annals N. Y. Acad. Sci . 383:44-68 (1982))；MRC 5細胞；FS4細胞；人類肝癌細胞株(Hep G2)；及骨髓瘤或淋巴瘤細胞(例如Y0、J558L、P3及NS0細胞)(參見美國專利第5,807,715號)。 用於產生本文之多肽的較佳宿主細胞為CHO細胞系DP12(CHO K1 dhfr- )。此為廣泛用於實驗室實踐之最佳的已知CHO細胞株之一(參見，例如1989年3月15日公開之EP 0,307,247)。此外，已知其他CHO-K1(dhfr- )細胞株且其可用於本發明之方法中。 用以產生肽、多肽及蛋白質之哺乳動物宿主細胞可在多種培養基中培養。市售培養基，諸如罕姆氏(Ham's)F10(Sigma)、最低必需培養基((MEM)，Sigma)、RPMI-1640(Sigma)及達爾伯克氏改良伊格爾氏培養基(Dulbecco's Modified Eagle's Medium)((DMEM)，Sigma)適合於培養宿主細胞。此外，以下文獻中描述之任何培養基可用作宿主細胞之培養基：Ham及Wallace(1979), Meth. in Enz. 58:44；Barnes及Sato(1980), Anal. Biochem. 102:255；美國專利第4,767,704號；第4,657,866號；第4,927,762號；或第4,560,655號；WO 90/03430；WO 87/00195；美國專利第Re. 30,985號；或美國專利第5,122,469號，所有該等文獻之揭示內容均以引用的方式併入本文中。任何該等培養基可視需要補充有激素及/或其他生長因子(諸如胰島素、鐵傳遞蛋白或表皮生長因子)、鹽(諸如氯化鈉、鈣鹽、鎂鹽及磷酸鹽)、緩衝液(諸如HEPES)、核苷(諸如腺苷及胸苷)、抗生素(諸如GentamycinTM 藥物)、痕量元素(定義為通常以微莫耳範圍內之最終濃度存在的無機化合物)及葡萄糖或均等能量源。亦可包括熟習此項技術者已知之合適濃度的任何其他必需補充物。諸如溫度、pH值及其類條件之培養條件為先前選擇以表現之宿主細胞所使用之彼等條件且將為熟習此項技術者顯而易見。 在哺乳動物(諸如CHO)細胞中產生、回收及純化重組抗體之方案可包括以下步驟： 可將細胞在經攪拌槽式生物反應器系統中培養且使用饋料分批培養程序。在較佳饋料分批培養中，最初將哺乳動物宿主細胞及培養基提供至培養容器中且在培養過程中在終止培養之前進行或不進行週期性細胞及/或產物收集之情況下將其他培養養分連續或以不連續增量饋入培養物中。饋料分批培養可包括(例如)半連續饋料分批培養，其中定期將整個培養物(包括細胞及培養基)移除且用新鮮培養基更換。饋料分批培養不同於在培養過程開始時將用於細胞培養之所有組份(包括細胞及所有培養養分)提供至培養容器中之簡單分批培養。饋料分批培養可進一步不同於灌注培養，不同之處在於在過程中不自培養容器移除上清液(在灌注培養中，藉由(例如)過濾、封裝、錨定至微載體等將細胞約束於培養物中且連續或間歇地引入培養基且自培養容器中移除培養基)。 另外，培養物之細胞可根據適合於所涵蓋之特定宿主細胞及特定產生計劃之任何流程或程式繁殖。因此，可使用單步或多步培養程序。在單步培養中，將宿主細胞接種至培養環境中且在細胞培養之單一產生階段中使用該等方法。或者，可使用多步培養。在多步培養中，細胞可以多個步驟或階段培養。舉例而言，可在第一步或生長階段培養中使細胞生長，其中將可自儲存裝置中移除之細胞接種至適合於促進生長及高生命力之培養基中。可藉由添加新鮮培養基至宿主細胞培養物中來使細胞在生長階段維持合適時段。 在某些實施例中，可設計饋料分批或連續細胞培養條件以增強在細胞培養之生長階段哺乳動物細胞之生長。在生長階段中，使細胞在一定條件下生長且歷時最長之生長時段。諸如溫度、pH值、溶氧量(dO2 )及其類似條件之培養條件為特定宿主所使用之彼等條件且將為熟習此項技術者顯而易見。一般而言，使用酸(例如，CO2 )或鹼(例如，Na2 CO3 或NaOH)將pH值調節至約6.5與7.5之間的水準。培養哺乳動物細胞(諸如CHO細胞)之合適溫度範圍在約30℃與38℃之間，且合適dO2 在5-90%空氣飽和度之間。 在特定階段，可使用細胞來接種細胞培養之產生階段或步驟。或者，如上所述產生階段或步驟可與接種或生長階段或步驟相連。 在細胞培養之產生階段中，通常控制細胞培養環境。因此，若產生醣蛋白，則可控制影響哺乳動物宿主細胞之細胞比生產率之因素以便在所得醣蛋白中獲得所要唾液酸含量。在一較佳態樣中，細胞培養過程之產生階段之前為細胞培養之過渡階段，其中細胞培養之產生階段的參數得以吻合。此過程之其他詳情可見於美國專利第5,721,121號及Chaderjian等人，Biotechnol. Prog. 21(2):550-3 (2005)中，該等文獻之全部揭示內容以引用的方式明確併入本文中。 醱酵之後純化蛋白質。由細胞碎片純化蛋白質之程序最初視蛋白質之表現位點而定。可使一些蛋白質自細胞直接分泌至周圍生長培養基中；其他蛋白質則於細胞內製備。對於後者蛋白質而言，純化過程之第一步包括可藉由多種方法進行之溶解細胞，該等方法包括機械剪切、滲透壓衝擊或酶處理。該破碎將細胞之全部內含物釋放至勻漿中且此外產生亞細胞片段，該等亞細胞片段由於其尺寸小而難以移除。該等亞細胞片段一般藉由差速離心或過濾移除。關於直接分泌之蛋白質，由於在蛋白質產生運作之過程中細胞之自然死亡及細胞內宿主細胞蛋白質及組份之釋放，其亦出現同一問題，但程度較小。 一旦已獲得含有所關注蛋白質的澄清溶液，通常即使用不同層析技術之組合試圖使其與由細胞產生之其他蛋白質分離。該等技術基於蛋白質之電荷、疏水程度或尺寸而分離蛋白質之混合物。該等技術各自可使用若干不同層析樹脂，從而精確定製適於所涉及之特定蛋白質的純化流程。該等分離方法各自的本質為可使蛋白質以不同速率沿長管柱向下移動，從而達成當其進一步向下通過管柱時增加之物理分離，或者使蛋白質選擇性黏附至分離基質上，隨後用不同溶劑有差別地進行溶離。在一些情況下，其係在雜質特異性黏附於管柱而所關注之蛋白質未黏附(亦即所關注之蛋白質存在於"流出液"中)時，使所要蛋白質與雜質分離。因此，自哺乳動物宿主細胞之細胞培養物中純化重組蛋白可包括一或多個親和(例如蛋白A)及/或離子交換層析步驟。 離子交換層析法為常用於蛋白質純化之層析技術。在離子交換層析法中，溶質表面上之帶電碎片受附著於層析基質之相反電荷吸引，條件為周圍緩衝液之離子強度低。溶離一般係藉由增加緩衝液之離子強度(亦即傳導率)以與離子交換基質之帶電位點之溶質競爭而達成。改變pH值且藉此改變溶質之電荷為達成溶質溶離之另一方法。傳導率或pH值之改變可為逐漸的(梯度溶離)或逐步的(步驟溶離)。過去，該等改變為累進的；亦即，pH值或傳導率在單一方向上增加或減少。 對於治療性抗體之工業純化之其他詳情，參見(例如)Fahrner等人，Biotechnol. Genet. Eng. Rev. 18:301-27 (2001)，其全部揭示內容明確以引用的方式併入本文中。 除哺乳動物宿主細胞外，其他真核生物可用作表現重組蛋白之宿主細胞。對於在諸如常用麵包酵母或釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae )之酵母宿主細胞中表現，合適載體包括基於2-微米質體之游離複製型載體、整合載體及酵母人工合成染色體(YAC)載體。適於重組體產生異源蛋白之其他酵母包括粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe )(Beach及Nurse, Nature，290: 140 (1981)；1985年5月2日公開之EP 139,383)；克魯維酵母(Kluyveromyces )宿主(美國專利第4,943,529號；Fleer等人，Bio/Technology，2: 968 975 (1991))，諸如乳酸克魯維酵母(K. lactis ) (MW98-8C, CBS683, CBS4574；Louvencourt等人，J Bacterid., 737(1983))、脆壁克魯維酵母(K. fragilis )(ATCC 12,424)、保加利亞克魯維酵母(K. bulgaricus )(ATCC 16,045)、魏氏克魯維酵母(K. wickeramii )(ATCC 24,178)、沃特克魯維酵母(K. waltii )(ATCC 56,500)、果蠅克魯維酵母(K. drosophilarum )(ATCC 36,906；Van den Berg等人，Bio/Technology，8: 135 (1990))、耐熱克魯維酵母(K.thermotolerans )及馬克斯克魯維酵母(K. marxianus )；耶氏酵母(yarrowia )(EP 402,226)；畢赤酵母(Pichia pastoris ) (EP 183,070；Sreekrishna等人，J. Basic Microbiol., 28 : 265 278 (1988))；假絲酵母(Candida )；裏氏木黴(Trichoderma reesia )(EP 244,234)；粗糙脈孢菌(Neurospora crassa )(Case等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 76 : 5259 5263 (1979))；許旺酵母(Schwanniomyces )，諸如西方許旺酵母(Schwanniomyces occidentalis )(1990年10月31日公開之EP 394,538)；及絲狀真菌(filamentous fungi )，諸如脈孢菌(Neurospora )、青黴菌(Penicillium )、彎頸黴菌(Tolypocladium )(1991年1月10日公開之WO 91/00357)及麯黴(Aspergillus )宿主，諸如構巢麯黴(A.nidulans )(Ballance等人，Biochem. Biophys. Res. Commun.，112: 284 289 (1983)；Tilburn等人，Gene, 26: 205 221 (1983)；Yelton等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA，81: 1470 1474 (1984))及黑麯黴(A.niger )(Kelly及Hynes，EMBO J. 4: 475 479 (1985))。甲醇酵母適於本文且包括(但不限於)能夠在甲醇上生長之選自由以下各者組成之屬的酵母：漢遜酵母(Hansenula )、假絲酵母、克勒克酵母(Kloeckera )、畢赤酵母、酵母菌屬(Saccharomyces )、球擬酵母(Torulopsis )及紅酵母(Rhodotorula )。此類酵母之例示性特定物種之清單可見於C. Anthony，The Biochemistry of Methylotrophs，269 (1982)。所列酵母及其他酵母之表現系統在此項技術中熟知且/或可購得。 對於在諸如Sf9細胞之昆蟲宿主細胞中表現而言，合適載體包括桿狀病毒載體。對於在植物宿主細胞、尤其雙子葉植物宿主(諸如煙草)中表現而言，合適表現載體包括來源於根癌土壤桿菌(Agrobacterium tumefaciens )之Ti質體之載體。 本發明之方法亦擴展至原核宿主細胞之培養物。適於表現抗體及其他有待於藉助於本發明保護之蛋白質的原核宿主細胞包括古細菌(Archaebacteria )及真細菌(Eubacteria )，諸如革蘭氏陰性或格蘭氏陽性生物體。適用細菌之實例包括埃希氏桿菌屬(Escherichia )(例如大腸桿菌)、桿菌屬(Bacilli )(例如枯草芽孢桿菌(B. subtilis ))、腸細菌(Enterobacteria )、假單胞菌屬(Pseudomonas )物種(例如銅綠假單胞菌(P. aeruginosa )、鼠傷寒沙門氏桿菌(Salmonella typhimurium )、黏質沙雷菌(Serratia marcescans) 、克雷伯氏菌屬(Klebsiella )、變形菌屬(Proteus )、志賀氏菌屬(Shigella )、根瘤菌屬(Rhizobia )、透明顫菌(Vitreoscilla )或副球菌屬(Paracoccus )。在一實施例中，使用革蘭氏陰性細胞。大腸桿菌菌株之實例包括菌株W3110 (Bachmann，Cellular and Molecular Biology，第2卷(Washington, D.C.：美國微生物學會(American Society for Microbiology)，1987)，第1190-1219頁；ATCC寄存編號27,325)及其衍生物，包括具有基因型W3110 ΔfhuA (ΔtonA) ptr3 lac Iq lacL8 ΔompTΔ(nmpc-fepE)degP41 kanR之菌株33D3(美國專利第5,639,635號)。其他菌株及其衍生物(諸如大腸桿菌294(ATCC 31,446)、大腸桿菌B、大腸桿菌X 1776(ATCC 31,537)及大腸桿菌RV308(ATCC 31,608))亦為適用的。該等實例為說明性的而非限制性的。具有確定基因型之上述任一種細菌之衍生物的建構方法在此項技術中已知且描述於例如，Bass等人，Proteins, 8:309-314 (1990)中。一般需要考慮複製子在細菌細胞中之可複製性來選擇適當之細菌。舉例而言，當使用熟知之質體(諸如pBR322、pBR325、pACYC177或pKN410)提供複製子時，大腸桿菌、沙雷氏菌(Serratia )或沙門氏菌(Salmonella )物種可適用作宿主。通常，宿主細胞應分泌最低量蛋白水解酶，且可需要將額外蛋白酶抑制劑併入細胞培養物中。 此項技術中亦熟知用於自非哺乳動物宿主細胞培養物產生、回收及純化重組蛋白之方法。若多肽係在非哺乳動物細胞產生，例如在微生物(諸如真菌或大腸桿菌)中產生，則多肽將在細胞內或在細胞周質空間中回收(Kipriyanov及Little，Molecular Biotechnology ，12: 173 201 (1999)；Skerra及Pluckthun，Science ，240: 1038 1040 (1988))。因此，需要藉由萃取(諸如細胞溶解)自細胞釋放蛋白質至細胞外培養基中。該破碎釋放全部細胞內含物至勻漿中，且此外產生由於尺寸小而難以移除之亞細胞片段。該等片段通常藉由差速離心或藉由過濾移除。 細胞溶解通常使用機械破碎技術，諸如均質化或頭部研磨來完成。儘管所關注之蛋白質通常得以有效釋放，但該等技術具有若干缺點(Engler，Protein Purification Process Engineering ，Harrison編，37 55 (1994))。通常在處理期間發生之溫度升高可使蛋白質失活。此外，所得懸浮液含有廣泛範圍之污染性蛋白質、核酸及多醣。核酸及多醣增加溶液黏度，從而可能使隨後藉由離心、交叉流過濾或層析進行之處理複雜化。該等污染物與所關注之蛋白質之複合締合可使純化過程複雜化且產生不可接受之低產量。自微生物醱酵肉湯或勻漿純化異源多肽之改良方法描述於(例如)美國專利第7,169,908號中，其全部揭示內容明確以引用的方式併入本文中。 強調本文所述之醱酵、回收及純化方法僅係出於說明之目的。本發明之方法可與開發用於產生、回收及純化重組蛋白之任何製造過程組合。 2. 抗體 在一較佳實施例中，使用本發明之方法來預防抗體(包括治療性及診斷性抗體)之鏈間雙硫鍵及/或鏈內雙硫鍵之還原。本發明範疇內之抗體包括(但不限於)：抗HER2抗體，其包括曲妥珠單抗(Trastuzumab)(HERCEPTIN®) (Carter等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA ，89:4285-4289 (1992)，美國專利第5,725,856號)；抗CD20抗體，諸如美國專利第5,736,137號中之嵌合抗CD20 "C2B8" (RITUXAN®)、美國專利第5,721,108B1號中之2H7抗體之嵌合或人源化變異體或托西莫單抗(Tositumomab) (BEXXAR®)；抗IL-8(St John等人，Chest , 103:932 (1993)及國際公開案第WO 95/23865號)；抗VEGF抗體，包括人源化及/或親和力成熟抗VEGF抗體，諸如人源化抗VEGF抗體huA4.6.1 AVASTIN®(Kim等人，Growth Factors ，7:53-64 (1992)、國際公開案第WO 96/30046號及1998年10月15日公開之第WO 98/45331號)；抗PSCA抗體(WO 01/40309)；抗CD40抗體，包括S2C6及其人源化變異體(WO 00/75348)；抗CD11a(美國專利第5,622,700號；WO 98/23761；Steppe等人，Transplant Intl. 4:3-7 (1991)及Hourmant等人，Transplantation 58:377-380 (1994))；抗IgE(Presta等人，J. Immunol. 151:2623-2632 (1993)及國際公開案第WO 95/19181號)；抗CD18(1997年4月22日頒布之美國專利第5,622,700號或如1997年7月31日公開之WO 97/26912中)；抗IgE(包括E25、E26及E27；1998年2月3日頒布之美國專利第5,714,338號或1992年2月25日頒布之美國專利第5,091,313號，1993年3月4日公開之WO 93/04173或1998年6月30日申請之國際申請案第PCT/US98/13410號，美國專利第5,714,338號)；抗Apo-2受體抗體(1998年11月19日公開之WO 98/51793)；抗TNF-α抗體，包括cA2 (REMICADE®)、CDP571及MAK-195(參見，1997年9月30日頒布之美國專利第5,672,347號；Lorenz等人，J. Immunol. 156(4):1646-1653 (1996)及Dhainaut等人，Crit. Care Med. (9):1461-1469 (1995))；抗組織因子(TF)(1994年11月9日頒布之歐洲專利第0 420 937 B1號)；抗人類α4 β7 整合素(1998年2月19日公開之WO 98/06248)；抗EGFR(如1996年12月19日公開之WO 96/40210中之嵌合或人源化225抗體)；抗CD3抗體，諸如OKT3(1985年5月7日頒布之美國專利第4,515,893號)；抗CD25或抗tac抗體，諸如CHI-621(SIMULECT®)及(ZENAPAX®)(參見1997年12月2日頒布之美國專利第5,693,762號)；抗CD4抗體，諸如cM-7412抗體(Choy等人，Arthritis Rheum 39(1):52-56(1996)；抗CD52抗體，諸如CAMPATH-1H(Riechmann等人，Nature 332:323-337 (1988))；抗Fc受體抗體，諸如Graziano等人，J. Immunol. 155(10):4996-5002 (1995)中之針對FcγRI之M22抗體；抗胚性癌抗原(CEA)抗體，諸如hMN-14(Sharkey等人，Cancer Res. 55(23增刊):5935s-5945s (1995)；針對乳腺上皮細胞之抗體，包括huBrE-3、hu-Mc 3及CHL6(Ceriani等人，Cancer Res. 55(23):5852s-5856s (1995)；及Richman等人，Cancer Res. 55(23增刊): 5916s-5920s (1995))；與結腸癌細胞結合之抗體，諸如C242 (Litton等人，Eur J. Immunol. 26(1):1-9 (1996))；抗CD38抗體，例如AT 13/5(Ellis等人，J. Immunol . 155(2):925-937 (1995))；抗CD33抗體，諸如Hu M195(Jurcic等人，Cancer Res 55(23增刊):5908s-5910s (1995))及CMA-676或CDP771；抗CD22抗體，諸如LL2或LymphoCide(Juweid等人，Cancer Res 55 (23增刊):5899s-5907s (1995))；抗EpCAM抗體，諸如17-1A (PANOREX®)；抗GpIIb/IIIa抗體，諸如阿昔單抗(abciximab)或c7E3 Fab (REOPRO®)；抗RSV抗體，諸如MEDI-493 (SYNAGIS®)；抗CMV抗體，諸如PROTOVIR®；抗HIV抗體，諸如PRO542；抗肝炎抗體，諸如抗Hep B抗體OSTAVIR®；抗CA 125抗體OvaRex；抗遺傳型GD3抗原決定基抗體BEC2；抗αvβ3抗體VITAXIN®；抗人類腎細胞癌抗體，諸如ch-G250；ING-1；抗人類17-1A抗體(3622W94)；抗人類結腸直腸瘤抗體(A33)；針對GD3神經節苷脂之抗人類黑色素瘤抗體R24；抗人類鱗狀細胞癌抗體(SF-25)；及抗人類白血球抗原(HLA)抗體，諸如Smart ID 10及抗HLA DR抗體昂可寧(Oncolym)(Lym-1)。本文中抗體之較佳靶抗原為：HER2受體、VEGF、IgE、CD20、CD11a及CD40。 該等抗體中有許多廣泛用於臨床實踐以治療各種疾病，包括癌症。 在某些特定實施例中，本發明之方法用於產生以下抗體及重組蛋白。 抗 CD20 抗體 利妥昔單抗(Rituximab)(RITUXAN®)為針對CD20抗原之遺傳工程化嵌合鼠/人類單株抗體。利妥昔單抗為在1998年4月7日頒布之美國專利第5,736,137號(Anderson等人)中稱為"C2B8"之抗體。利妥昔單抗指定用於治療患有復發或難治之低級或卵泡CD20-陽性B細胞非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin's lymphoma)之患者。活體外作用機制研究已證明利妥昔單抗結合人類補體且經由補體依賴性細胞毒性(CDC)溶解淋巴B細胞株(Reff等人，Blood 83(2):435-445 (1994))。另外，其在抗體依賴性細胞毒性(ADCC)之檢定中具有顯著活性。近年來，已顯示利妥昔單抗在氚化胸苷併入檢定中具有抗增殖效應且直接誘導細胞凋亡，而其他抗CD19及CD20抗體則不然(Maloney等人，Blood 88 (10):637a (1996))。亦已經由實驗觀察到利妥昔單抗與化學療法及毒素之間的協同作用。詳言之，利妥昔單抗使抗藥性人類B細胞淋巴瘤細胞株對阿黴素(doxorubicin)、CDDP、VP-1 6、白喉毒素及篦麻毒素之細胞毒素效應敏感(Demidem等人，Cancer Chemotherapy & Radiopharmaceuticals 12(3):177-186 (1997))。活體內臨床前研究已顯示利妥昔單抗可能經由補體及細胞介導過程消耗來自獼猴之周邊血液、淋巴結及骨髓之B細胞(Reff等人，Blood 83(2):435-445 (1994))。 關於CD20抗體之專利及專利公開案包括美國專利第5,776,456號、第5,736,137號、第6,399,061號及第5,843,439號，以及美國專利申請案第US 2002/0197255A1號、第US 2003/0021781A1號、第US 2003/0082172 A1號、第US 2003/0095963 A1號、第US 2003/0147885 A1號(Anderson等人)；美國專利第6,455,043B1號及WO 00/09160(Grillo-Lopez, A.)；WO 00/27428(Grillo-Lopez及White)；WO00/27433(Grillo-Lopez及Leonard)；WO 00/44788(Braslawsky等人)；WO 01/10462(Rastetter, W.)；WO 01/10461(Rastetter及White)；WO 01/10460(White及Grillo-Lopez)；美國申請案第US 2002/0006404號及WO 02/04021(Hanna及Hariharan)；美國申請案第US 2002/0012665 A1號及WO 01/74388(Hanna, N.)；美國申請案第US 2002/0058029 A1號(Hanna, N.)；美國申請案第US 2003/0103971 A1號(Hariharan及Hanna)；美國申請案第US 2002/0009444A1號及WO 01/80884(Grillo-Lopez, A.)；WO 01/97858(White, C.)；美國申請案第US 2002/0128488A1號及WO 02/34790(Reff, M.)；WO 02/060955(Braslawsky等人)；WO2/096948(Braslawsky等人)；WO 02/079255(Reff及Davies)；美國專利第6,171,586B1號及WO 98/56418(Lam等人)；WO 98/58964(Raju, S.)；WO 99/22764(Raju, S.)；WO 99/51642、美國專利第6,194,551B1號、美國專利第6,242,195B1號、美國專利第6,528,624B1號及美國專利第6,538,124號(Idusogie等人)；WO 00/42072(Presta, L.)；WO 00/67796(Curd等人)；WO 01/03734(Grillo-Lopez等人)；美國申請案第US 2002/0004587 A1號及WO 01/77342(Miller及Presta)；美國申請案第US 2002/0197256號(Grewal, I.)；美國申請案第US 2003/0157108 A1號(Presta, L.)；美國專利第6,090,365B1號、第6,287,537B1號、第6,015,542號、第5,843,398號及第5,595,721號(Kaminski等人)；美國專利第5,500,362號、第5,677,180號、第5,721,108號及第6,120,767號(Robinson等人)；美國專利第6,410,391B1號(Raubitschek等人)；美國專利第6,224,866B1號及WO 00/20864(Barbera-Guillem, E.)；WO 01/13945(Barbera-Guillem, E.)WO 00/67795(Goldenberg)；美國申請案第US 2003/01339301 A1號及WO 00/74718(Goldenberg及Hansen)；WO 00/76542(Golay等人)；WO 01/72333(Wolin及Rosenblatt)；美國專利第6,368,596B1號(Ghetie等人)；美國申請案第US 2002/0041847 A1號(Goldenberg, D.)；美國申請案第US 2003/0026801A1號(Weiner及Hartmann)；WO 02/102312(Engleman, E.)；美國專利申請案第2003/ 0068664號(Albitar等人)；WO 03/002607(Leung, S.)；WO 03/049694及US 2003/0185796 A1(Wolin等人)；WO 03/061694(Sing及Siegall)；US 2003/0219818 A1(Bohen等人)；US 2003/0219433 A1及WO 03/068821(Hansen等人)，該等文獻均明確以引用的方式併入本文中。亦參見美國專利第5,849,898號及歐洲申請案第330,191號(Seed等人)；美國專利第4,861,579號及EP332,865A2(Meyer及Weiss)；美國專利第4,861,579號(Meyer等人)及WO 95/03770(Bhat等人)。 關於利妥昔單抗療法之公開案包括：Perotta及Abuel "Response of chronic relapsing ITP of 10 years duration to Rituximab"，文摘號3360Blood 10 (1)(第1-2部分)：第88B頁(1998)；Stashi等人"Rituximab chimeric anti-CD20 monoclonal antibody treatment for adults with chronic idopathic thrombocytopenic purpura"，Blood 98(4):952-957 (2001)；Matthews, R，"Medical Heretics"，New Scientist (2001年4月7日)；Leandro等人，"Clinical outcome in 22 patients with rheumatoid arthritis treated with B lymphocyte depletion"，Ann Rheum Dis 61:833-888 (2002)；Leandro等人，"Lymphocyte depletion in rheumatoid arthritis: early evidence for safety, efficacy and dose response"，Arthritis & Rheumatism 44(9): S370 (2001)；Leandro等人，"An open study of B lymphocyte depletion in systemic lupus erythematosus"，Arthritis & Rheumatism 46(l):2673-2677 (2002)；Edwards及Cambridge，"Sustained improvement in rheumatoid arthritis following a protocol designed to deplete B lymphocytes"，Rheumatology 40:205-211 (2001)；Edwards等人，"B-lymphocyte depletion therapy in rheumatoid arthritis and other autoimmune disorders"，Biochem. Soc. Trans. 30(4):824-828 (2002)；Edwards等人，"Efficacy and safety of Rituximab, a B-cell targeted chimeric monoclonal antibody: A randomized, placebo controlled trial in patients with rheumatoid arthritis"，Arthritis & Rheumatism 46(9): S197 (2002)；Levine及Pestronk，"IgM antibody-related polyneuropathies: B-cell depletion chemotherapy using Rituximab"，Neurology 52: 1701-1704 (1999)；DeVita等人，"Efficacy of selective B cell blockade in the treatment of rheumatoid arthritis"，Arthritis & Rheumatism 46:2029-2033 (2002)；Hidashida等人，"Treatment of DMARD-Refractory rheumatoid arthritis with rituximab"，美國風濕病學會之年度學術會議(the Annual Scientific Meeting of the American College of Rheumatology)；10月24日-10月29日；New Orleans, La. 2002上提出；Tuscano, J，"Successful treatment of Infliximab-refractory rheumatoid arthritis with rituximab"，美國風濕病學會之年度學術會議；10月24日-10月29日；New Orleans, La. 2002上提出。Sarwal等人，N. Eng. J. Med. 349(2):125-138(2003年7月10日)報導藉由DNA微陣列譜分析鑑別之急性腎同種異體移植排斥反應中之分子異質性。 在各種實施例中，本發明提供包含人源化2H7抗CD20抗體之醫藥組合物。在特定實施例中，人源化2H7抗體為表2中所列之抗體。
表 2- 人源化抗 CD20 抗體及其變體
2H7 變異體 VL SEQ ID NO. VH SEQ ID NO. 全長輕鏈 SEQ ID NO. 全長重鏈 SEQ ID NO.
A 1 2 6 7
B 1 2 6 8
C 3 4 9 10
D 3 4 9 11
F 3 4 9 12
G 3 4 9 13
H 3 5 9 14
I 1 2 6 15
表2之抗體變異體A、B及I各自包含輕鏈可變序列(VL )：
Figure 02_image001
重鏈可變序列(VH )：
Figure 02_image003
表2之抗體變異體C、D、F及G各自包含輕鏈可變序列(VL )：
Figure 02_image005
重鏈可變序列(VH )：
Figure 02_image007
表2之抗體變異體H包含SEQ ID NO:3(以上)之輕鏈可變序列(VL )及重鏈可變序列(VH )：
Figure 02_image009
表2之抗體變異體A、B及I各自包含全長輕鏈序列：
Figure 02_image011
表2之變異體A包含全長重鏈序列：
Figure 02_image013
表2之變異體B包含全長重鏈序列：
Figure 02_image015
表2之變異體I包含全長重鏈序列：
Figure 02_image017
表2之抗體變異體C、D、F、G及H各自包含全長輕鏈序列：
Figure 02_image019
表2之變異體C包含全長重鏈序列：
Figure 02_image021
表2之變異體D包含全長重鏈序列：
Figure 02_image023
表2之變異體F包含全長重鏈序列：
Figure 02_image025
表2之變異體G包含全長重鏈序列：
Figure 02_image027
表2之變異體H包含全長重鏈序列：
Figure 02_image029
在某些實施例中，本發明之人源化2H7抗體進一步包含IgG Fc中之胺基酸變化且展示對人類FcRn之結合親和力相對於具有野生型IgG Fc之抗體增加至少60倍、至少70倍、至少80倍、更佳至少100倍、較佳至少125倍、甚至更佳至少150倍至約170倍。 IgG中之N-糖基化位點位於CH 2結構域之Asn297處。本發明之人源化2H7抗體組合物包括任何前述具有Fc區之人源化2H7抗體之組合物，其中在組合物中約80-100%(且較佳約90-99%)之抗體包含缺乏海藻糖並與醣蛋白之Fc區連接之成熟核心碳水化合物結構。本文證明該等組合物展示在與FcγRIIIA(F158)結合上令人驚奇的改良，FcγRIIIA (F158)在與人類IgG相互作用上並非如FcγRIIIA(V158)般有效。在正常、健康的非洲籍美洲人及白種人中FcγRIIIA (F158)比FcγRIIIA(V158)更常見。參見Lehrnbecher等人，Blood 94:4220 (1999)。歷史上，中國倉鼠卵巢細胞(CHO)(最常用之工業宿主之一)中所產生之抗體在群體中含有約2至6%非海藻糖基化。然而，YB2/0及Lec13可產生具有78至98%非海藻糖基化物質之抗體。Shinkawa等人，J Bio. Chem . 278 (5), 3466-347 (2003)報導YB2/0及Lec13細胞中所產生之具有較弱FUT8活性之抗體顯示顯著增加之活體外ADCC活性。海藻糖含量降低之抗體的產生亦描述於以下文獻中：例如Li等人，(GlycoFi) "Optimization of humanized IgGs in glycoengineeredPichia pastoris "，於2006年1月22日之Nature Biology在線出版物中；Niwa R.等人，Cancer Res. 64(6):2127-2133 (2004)；US 2003/ 0157108(Presta)；US 6,602,684及US 2003/0175884 (Glycart Biotechnology)；US 2004/0093621、US 2004/ 0110704、US 2004/0132140(均為Kyowa Hakko Kogyo)。 雙特異性人源化2H7抗體涵蓋抗體之一臂至少具有本發明之人源化2H7抗體之H鏈及/或L鏈的抗原結合區，且另一臂具有對第二抗原之V區結合特異性之抗體。在特定實施例中，第二抗原係選自由CD3、CD64、CD32A、CD16、NKG2D或其他NK活化配位體組成之群。 抗 HER2 抗體 在已接受廣泛先前抗癌療法之患有HER2-過度表現轉移性乳腺癌之患者中重組人源化型式之鼠HER2抗體4D5(huMAb4D5-8、rhuMAb HER2、曲妥珠單抗或HERCEPTIN® ；美國專利第5,821,337號)具臨床活性(Baselga等人，J. Clin. Oncol 14:737-744 (1996))。曲妥珠單抗於1998年9月25日獲得食品與藥物管理局(FDA)之上市批准用以治療具有轉移性乳腺癌之患者(其腫瘤過度表現HER2蛋白)。在2006年11月，FDA批准赫賽汀(Herceptin)作為含有阿黴素、環磷醯胺(cyclophosphamide)及紫杉醇(paclitaxel)之治療方案之一部分用以輔助治療患有HER2-陽性、淋巴結陽性乳腺癌之患者。 在一實施例中，抗HER2抗體包含以下VL 及VH 域序列： 人源化2C4型式574抗體VL (SEQ ID NO: 16)
Figure 02_image031
及人源化2C4型式574抗體VH (SEQ ID NO: 17)
Figure 02_image033
在另一實施例中，抗HER2抗體包含分別如圖21及圖22所示之曲妥珠單抗之VL (SEQ ID NO: 18)及VH (SEQ ID NO: 19)結構域序列。 其他具有不同性質之HER2抗體已描述於以下文獻中：Tagliabue等人，Int. J. Cancer 47:933-937 (1991)；McKenzie等人，Oncogene 4:543-548 (1989)；Maier等人，Cancer Res. 51:5361-5369 (1991)；Bacus等人，Molecular Carcinogenesis 3:350-362 (1990)；Stancovski等人，PNAS (USA) 88:8691-8695 (1991)；Bacus等人，Cancer Research 52:2580-2589 (1992)；Xu等人，Int. J. Cancer 53:401-408 (1993)；WO 94/00136；Kasprzyk等人，Cancer Research 52:2771-2776 (1992)；Hancock等人，Cancer Res. 51:4575-4580 (1991)；Shawver等人，Cancer Res. 54:1367-1373 (1994)；Arteaga等人，Cancer Res. 54:3758-3765 (1994)；Harwerth等人，J. Biol. Chem. 267:15160-15167 (1992)；美國專利第5,783,186號；及Klapper等人，Oncogene 14:2099-2109 (1997)。 抗 VEGF 抗體 抗VEGF抗體可(例如)包含以下序列： 在一實施例中，抗VEGF抗體包含以下VL 序列(SEQ ID NO:20)：
Figure 02_image035
以下VH 序列(SEQ ID NO:21)：
Figure 02_image037
在另一實施例中，抗VEGF抗體包含以下VL 序列(SEQ ID NO:22)：
Figure 02_image039
以下VH 序列(SEQ ID NO:23)：
Figure 02_image041
在一第三實施例中，抗VEGF抗體包含以下VL 序列(SEQ ID NO:24)：
Figure 02_image043
以下VH 序列(SEQ ID NO:25)：
Figure 02_image045
抗 CD11a 抗體 人源化抗CD11a抗體依法利珠(efalizumab)或Raptiva® (美國專利第6,037,454號)於2003年10月27日獲得食品與藥物管理局之上市批准用於治療牛皮癬。一實施例提供包含以下HuMHM24之VL 及VH 序列之抗人類CD11a抗體： VL (SEQ ID NO:26)：
Figure 02_image047
VH (SEQ ID NO:27)：
Figure 02_image049
抗人類CD11a抗體可包含SEQ ID NO:27之VH 及具有以下序列之HuMHM24的全長輕鏈：
Figure 02_image051
以上輕鏈以及具有以下序列之重鏈：
Figure 02_image053
亦可根據本發明產生針對DR5受體之抗體(抗DR5抗體)。該等抗DR5抗體特別包括PCT公開案第WO 2006/083971號中所揭示之所有抗體變異體，諸如稱為Apomab 1.1、2.1、3.1、4.1、5.1、5.2、5.3、6.1、6.2、6.3、7.1、7.2、7.3、8.1、8.3、9.1、1.2、2.2、3.2、4.2、5.2、6.2、7.2、8.2、9.2、1.3、2.2、3.3、4.3、5.3、6.3、7.3、8.3、9.3及25.3、尤其Apomab 8.3及Apomab 7.3、較佳Apomab 7.3之抗DR5抗體。因此WO 2006/083971之全部內容明確以引用的方法併入本文中。 3. 其他含雙硫鍵之蛋白質 除抗體外，本發明之方法適用於製造其他包括二硫鍵之多肽。該等多肽之代表性實例包括(而不限於)以下治療性蛋白質：組織血纖維蛋白溶酶原活化劑(t-PAs)，諸如人類組織血纖維蛋白溶酶原活化劑(htPA，阿替普酶(alteplase)，ACTIVASE® )，用於治療心肌梗塞之溶血栓劑；TNKaseTM ，用以單次團式投與之具有延長半衰期及纖維蛋白特異性之ht-PA變異體；用於治療兒童及成年人生長激素缺乏之重組人生長激素(rhGH，健高靈(somatropin)，NUTROPIN® ，PROTROPIN® )；及用於治療囊腫性纖維化(CF)之重組人去氧核糖核酸酶I(DNase I)。 含雙硫鍵之生物學上重要之蛋白質的實例包括生長激素，包括人生長激素及牛生長素；生長激素釋放因子；甲狀旁腺激素；促甲狀腺激素；脂蛋白；α-1-抗胰蛋白酶；胰島素A-鏈；胰島素B-鏈；胰島素原；促卵泡激素；降血鈣素；促黃體生成激素；升血糖激素；凝血因子，諸如因子VIIIC、因子IX、組織因子及血管性血友病因子；抗凝血因子，諸如蛋白C；心房利尿鈉因子；肺界面活性劑；血纖維蛋白溶酶原活化劑，諸如尿激酶或人尿或組織型血纖維蛋白溶酶原活化劑(t-PA)；鈴蟾素；凝血酶；造血生長因子；腫瘤壞死因子-α及腫瘤壞死因子-β；腦啡肽酶；RANTES(調節活化正常T細胞表現及分泌因子)；人類巨噬細胞發炎性蛋白(MIP-1-α)；血清白蛋白，諸如人血清白蛋白(HSA)；苗勒氏抑制物質；鬆弛素A-鏈；鬆弛素B-鏈；鬆弛素原；小鼠促性腺激素相關肽；微生物蛋白，諸如β-內醯胺酶；DNase；IgE；細胞毒性T-淋巴細胞相關抗原(CTLA)，諸如CTLA-4；抑制素；活化素；血管內皮生長因子(VEGF)；激素或生長因子之受體；蛋白A或D；類風濕因子；神經營養因子，諸如骨衍生之神經營養因子(BDNF)、神經營養因子-3、神經營養因子-4、神經營養因子-5或神經營養因子-6(NT-3、NT-4、NT-5或NT-6)或神經生長因子，諸如NGF-β；血小板衍生之生長因子(PDGF)；纖維母細胞生長因子，諸如aFGF及bFGF；表皮生長因子(EGF)；轉化生長因子(TGF)，諸如TGF-α及TGF-β，包括TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3、TGF-β4或TGF-β5；胰島素樣生長因子-I及胰島素樣生長因子-II(IGF-I及IGF-II)；des(1-3)-IGF-I(腦IGF-I)、胰島素樣生長因子結合蛋白；CD蛋白，諸如CD3、CD4、CD8、CD19、CD20、CD34及CD40；紅血球生成素；骨生成誘導因子；免疫毒素；骨形態發生蛋白(BMP)；干擾素，諸如干擾素-α、干擾素-β及干擾素-γ；群落刺激因子(CSF)，例如M-CSF、GM-CSF及G-CSF；介白素(IL)，例如IL-1至IL-10；過氧化物歧化酶；T細胞受體；表面膜蛋白；促衰變因子；病毒抗原，諸如一部分AIDS包膜；轉運蛋白；歸巢受體；地址素；調節蛋白；整合素，諸如CD11a、CD11b、CD11c、CD18、ICAM、VLA-4及VCAM；腫瘤相關抗原，諸如HER2、HER3或HER4受體；及以上所列舉之任何多肽之片段。 4. 重組體產生抗體之一般方法 在本文中抗體及其他重組蛋白可藉由重組DNA技術之熟知技術產生。因此，除以上特別鑑別之抗體外，熟習此項技術者可例如使用如下所述之技術產生針對所關注之抗原的抗體。抗原選擇及製備 本文之抗體係針對所關注之抗原。較佳地，抗原為生物學上重要之多肽且向罹患疾病或病症之哺乳動物投與抗體可對彼哺乳動物產生治療效益。然而，亦涵蓋針對非多肽抗原(諸如腫瘤相關糖脂抗原；參見美國專利5,091,178)之抗體。當抗原為多肽時，其可為跨膜分子(例如受體)或配位體，諸如生長因子。例示性抗原包括以下部分(3)中所描述之蛋白質。本發明所涵蓋之抗體之例示性分子標靶包括CD蛋白，諸如CD3、CD4、CD8、CD19、CD20、CD22、CD34、CD40；ErbB受體家族之成員，諸如EGF受體、HER2、HER3或HER4受體；細胞黏著分子，諸如LFA-1、Mac1、p150,95、VLA-4、ICAM-1、VCAM及av/β3整合素(包括其α或β次單位)(例如抗CD11a、抗CD18或抗CD11b抗體)；生長因子，諸如VEGF；IgE；血型抗原；flk2/flt3受體；肥胖(OB)受體；mpl受體；CTLA-4；蛋白C或本文所提及之任何其他抗原。與以上所列之抗體結合的抗原特別包括於本文之範疇內。 視情況與其他分子結合之可溶抗原或其片段可用作產生抗體之免疫原。對於跨膜分子(諸如受體)而言，其片段(例如受體之細胞外域)可用作免疫原。或者，表現跨膜分子之細胞可用作免疫原。該等細胞可源自天然來源(例如癌細胞株)或可為已藉由重組技術轉化以表現跨膜分子之細胞。 適用於製備抗體之其他抗原及其形式將為熟習此項技術者顯而易見。多株抗體 多株抗體較佳藉由多次皮下(sc)或腹膜內(ip)注射相關抗原及佐劑而在動物體內產生。其可適用於使用以下雙功能劑或衍生劑使抗原結合至對於待免疫物種具有免疫原性之蛋白質(例如匙孔螺血氰蛋白、血清白蛋白、牛甲狀腺球蛋白或大豆胰蛋白酶抑制劑)：例如馬來醯亞胺苯甲醯磺酸琥珀醯亞胺酯(經由半胱胺酸殘基結合)、N-羥基琥珀醯亞胺(經由離胺酸殘基)、戊二醛、琥珀酸酐、SOCl2 或R1 N=C=NR，其中R及R1 為不同烷基。 藉由將例如100 μg或5 μg之蛋白質或結合物(分別對兔或小鼠)與3體積之弗氏完全佐劑(Freund's complete adjuvant)組合並在多個位點皮內注射該溶液來使動物對抗原、免疫原性結合物或衍生物免疫。一個月後，以1/5至1/10原始量之弗氏完全佐劑中之抗原或結合物藉由在多個位點皮下注射來對動物加強免疫。7至14天後對動物進行採血且分析血清之抗體力價。對動物加強免疫直至力價平穩。較佳地，用相同抗原但與不同蛋白質及/或經由不同交聯試劑結合之結合物對動物加強免疫。結合物亦可在重組細胞培養物中以蛋白質融合體形式製得。再者，諸如礬之凝集劑適用於增強免疫反應。單株抗體 單株抗體可使用首次由Kohler等人，Nature , 256:495 (1975)所述之融合瘤方法製得，或可藉由重組DNA法(美國專利第4,816,567號)製得。 在融合瘤方法中，如上文所述使小鼠或諸如倉鼠或獼猴之其他適當宿主動物免疫以引出產生或能夠產生將與用於免疫之蛋白質特異性結合之抗體的淋巴細胞。或者，可活體外免疫淋巴細胞。接著使用合適融合劑(諸如聚乙二醇)使淋巴細胞與骨髓瘤細胞融合以形成融合瘤細胞(Goding,Monoclonal Antibodies:Principles and Practice ， 第59-103頁(Academic Press, 1986))。 對由此製備之融合瘤接種，並使其在較佳含有一或多種抑制未融合之親本骨髓瘤細胞生長或存活之物質的合適培養基中生長。舉例而言，若親本骨髓瘤細胞缺乏酶次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖基轉移酶(HGPRT或HPRT)，則融合瘤之培養基中通常將包括次黃嘌呤、胺基蝶呤及胸苷(HAT培養基)，該等物質阻止HGPRT缺乏細胞之生長。 較佳骨髓瘤細胞為有效融合，支持所選抗體產生細胞穩定高量產生抗體且對諸如HAT培養基之培養基敏感的骨髓瘤細胞。其中，較佳骨髓瘤細胞株為鼠骨髓瘤細胞株，諸如源自可購自Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, California USA之MOPC-21及MPC-11小鼠腫瘤及可購自美國菌種保存中心(American Type Culture Collection)，Rockville, Maryland USA之SP-2或X63-Ag8-653細胞獲得之細胞株。亦已描述產生人類單株抗體之人類骨髓瘤及小鼠-人類種間骨髓瘤細胞株(Kozbor,J. Immunol, 133:3001 (1984)；Brodeur等人，Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications ，第51-63頁(Marcel Dekker, Inc.，New York，1987))。 就針對抗原之單株抗體的產生來對用於使融合瘤細胞生長之培養基進行檢定。較佳地，藉由免疫沈澱法或活體外結合檢定(諸如放射免疫檢定(RIA)或酶聯免疫吸附檢定(ELISA))來測定由融合瘤細胞產生之單株抗體的結合特異性。 在鑑別產生具有所要特異性、親和力及/或活性之抗體的融合瘤細胞後，可藉由限制稀釋程序次選殖純系並藉由標準方法使其生長(Goding,Monoclonal Antibodies: Principles and Practice ， 第59-103頁(Academic Press, 1986))。適用於此目的之培養基包括(例如)D-MEM或RPMI-1640培養基。此外，可使融合瘤細胞於活體內作為動物體內之腹水腫瘤生長。 藉由習知免疫球蛋白純化程序自培養基、腹水或血清適當分離由次純系分泌之單株抗體，該等純化程序諸如蛋白A-瓊脂糖、羥磷灰石層析、凝膠電泳、透析或親和層析。較佳使用本文所述之蛋白A層析程序。 使用習知程序(例如，藉由使用能夠特異性結合編碼單株抗體之重鏈及輕鏈之基因的寡核苷酸探針)易於分離編碼單株抗體之DNA並對其測序。融合瘤細胞用作該DNA之較佳來源。一旦DNA經分離，即可將其置於表現載體中，接著將該等表現載體轉染至否則不產生免疫球蛋白之宿主細胞(諸如大腸桿菌細胞、猿COS細胞、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞或骨髓瘤細胞)中以獲得重組宿主細胞內之單株抗體的合成。 DNA亦可(例如)藉由用人類重鏈及輕鏈恆定域的編碼序列取代同源鼠序列(美國專利第4,816,567號；Morrison等人，Proc. Natl Acad. Sci. USA , 81:6851 (1984))或藉由將非免疫球蛋白多肽之編碼序列的全部或部分與免疫球蛋白編碼序列共價連接來修飾。 通常用該等非免疫球蛋白多肽取代抗體之恆定域，或用其取代抗體之一抗原結合位點之可變域，以產生包含一對抗原具有特異性之抗原結合位點及另一對不同抗原具有特異性之抗原結合位點的嵌合二價抗體。 在另一實施例中，單株抗體可自使用McCafferty等人，Nature ，348:552-554(1990)中所述之技術產生之抗體噬菌體庫分離。Clackson等人，Nature ，352:624-628(1991)及Marks等人，J. Mol. Biol ，222:581-597(1991)分別描述使用噬菌體庫分離鼠及人類抗體。隨後之出版物描述藉由鏈改組(Marks等人，Bio/Technology , 10:779-783 (1992))，以及作為構建極大噬菌體庫之策略的組合感染及活體內重組(Waterhouse等人，Nuc. Acids. Res., 21:2265-2266 (1993))來產生高親和力(nM範圍)人類抗體。因此，該等技術為用於分離單株抗體之傳統融合瘤技術之可行替代性方法。人源化及人類抗體 人源化抗體具有一或多個自非人類來源引入其中之胺基酸殘基。該等非人類胺基酸殘基通常稱為"引入"殘基，其通常取自"引入"可變域。可基本上按照Winter及同事之方法(Jones等人，Nature , 321:522-525 (1986)；Riechmann等人，Nature , 332:323-327 (1988)；Verhoeyen等人，Science , 239:1534-1536 (1988))藉由用齧齒動物CDR或CDR序列取代人類抗體之相應序列來進行人源化。因此，該等"人源化"抗體為嵌合抗體(美國專利第4,816,567號)，其中基本上不甚完整之人類可變域已經源自非人類物種的相應序列取代。實際上，人源化抗體通常為一些CDR殘基及可能一些FR殘基經來自齧齒動物抗體中的類似位點之殘基取代之人類抗體。 待用於製備人源化抗體之人類可變域(輕鏈與重鏈)之選擇對降低抗原性極其重要。根據所謂"最佳擬合"法，針對整個已知人類可變域序列庫篩選齧齒動物抗體之可變域序列。隨後將最接近齧齒動物序列之人類序列視為人源化抗體之人類FR(Sims等人，J. Immunol，151:2296 (1993))。另一方法使用源自特定輕鏈或重鏈子群之所有人類抗體之一致序列的特定構架。相同構架可用於若干不同人源化抗體(Carter等人，Proc. Natl Acad. Sci. USA ，89:4285 (1992)；Presta等人，J. Immnol , 151:2623 (1993))。 更重要的為使抗體人源化且保留對抗原之高親和力及其他有利生物特性。為實現此目標，根據一較佳方法，人源化抗體係藉由使用親本及人源化序列之三維模型分析親本序列及各種概念性人源化產物的方法來製備。三維免疫球蛋白模型一般可獲得且為熟習此項技術者所熟識。可獲得說明且呈現所選候選免疫球蛋白序列之大概三維構形結構之電腦程式。對該等呈現之檢視可分析殘基在候選免疫球蛋白序列發揮功能中之可能作用(亦即分析影響候選免疫球蛋白結合其抗原之能力的殘基)。以此方式，FR殘基可自受體及引入序列選擇且組合以便獲得所要抗體特徵，諸如對目靶抗原之親和力增加。一般而言，CDR殘基與影響抗原結合直接並最實質性相關。 或者，目前可產生經免疫後能夠在不產生內源性免疫球蛋白的情況下產生全套人類抗體譜之轉殖基因動物(例如小鼠)。舉例而言，已描述嵌合及生殖系突變小鼠體內抗體重鏈連接區(JH )基因的純合子缺失引起對內源性抗體產生之完全抑制。該等生殖系突變小鼠體內人類生殖系免疫球蛋白基因陣列之轉移將引起抗原激發後產生人類抗體。參見，例如Jakobovits等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:2551 (1993)；Jakobovits等人，Nature, 362:255-258 (1993);；Bruggermann等人，Year in Immuno., 7:33 (1993)；及Duchosal等人，Nature 355:258 (1992)。人類抗體亦可源自噬菌體呈現庫(Hoogenboom等人，J. Mol. Biol. , 227:381(1991)；Marks等人，J. Mol Biol., 222:581-597 (1991)；Vaughan等人，Nature Biotech 14:309 (1996))。抗體片段 已開發各種技術用於產生抗體片段。傳統上，該等片段可經由完整抗體之蛋白水解消化而獲得(參見，例如Morimoto等人，Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117 (1992)；及Brennan等人，Science , 229:81 (1985))。然而，該等片段現在可由重組宿主細胞直接產生。舉例而言，抗體片段可自以上所討論之抗體噬菌體庫分離。或者，Fab'-SH片段可直接自大腸桿菌回收且化學偶合以形成F(ab')2 片段(Carter等人，Bio/Technology 10:163-167 (1992))。根據另一方法，F(ab')2 片段可直接自重組宿主細胞培養物分離。產生抗體片段之其他技術將為熟習此項技術者顯而易見。在其他實施例中，所選抗體為單鏈Fv片段(scFv)(參見WO 93/16185)。多特異性抗體 多特異性抗體對至少兩種不同抗原具有結合特異性。儘管該等分子通常僅結合兩種抗原(亦即雙特異性抗體，BsAbs)，但此表述在本文中使用時涵蓋具有其他特異性之抗體(諸如三特異性抗體)。 在此項技術中已知用於製備雙特異性抗體之方法。全長雙特異性抗體之傳統產生係基於兩個免疫球蛋白重鏈-輕鏈對之共表現，其中兩條鏈具有不同特異性(Millstein等人，Nature ，305:537-539 (1983))。由於免疫球蛋白重鏈及輕鏈之隨機分配，該等融合瘤(四源雜交瘤)產生10種不同抗體分子之潛在混合物，其中僅一種具有正確雙特異性結構。通常藉由親和層析法步驟進行之正確分子之純化相當麻煩且產物產率低。類似程序揭示於WO 93/08829及Traunecker等人，EMBO J. , 10:3655-3659(1991)中。 根據WO96/27011中所述之另一方法，一對抗體分子間之界面可經工程化以使自重組細胞培養物回收的異源二聚體之百分比最大。較佳界面包含抗體恆定域CH 3結構域之至少一部分。在此方法中，來自第一抗體分子界面之一或多條小胺基酸側鏈經較大側鏈(例如，酪胺酸或色胺酸)置換。藉由將大胺基酸側鏈置換為較小胺基酸側鏈(例如丙胺酸或蘇胺酸)從而於第二抗體分子界面上形成尺寸與大側鏈相同或類似之互補"腔"。由此提供一種使異源二聚體之產率增加超過其他非吾人所要之終產物(諸如同源二聚體)的機制。 雙特異性抗體包括交聯抗體或"異源結合"抗體。舉例而言，異源結合物中之一抗體可與抗生物素蛋白偶合，另一抗體與生物素偶合。例如已提出該等抗體可使免疫系統細胞靶向非吾人所要之細胞(美國專利第4,676,980號)且用於治療HIV感染(WO 91/00360、WO 92/200373及EP 03089)。異源結合抗體可使用任何便利之交聯方法製得。合適交聯劑以及大量交聯技術在此項技術中為熟知的，且揭示於美國專利第4,676,980號中。 自抗體片段產生雙特異性抗體之技術亦已描述於文獻中。舉例而言，可使用化學鍵聯製備雙特異性抗體。Brennan等人，Science , 229:81 (1985)描述使完整抗體蛋白質裂解以產生F(ab')2 片段的程序。使該等片段在二硫醇錯合劑亞砷酸鈉存在下還原以穩定鄰近二硫醇且防止分子間雙硫鍵形成。隨後將所產生之Fab'片段轉化為硫代硝基苯甲酸酯(TNB)衍生物。隨後藉由用巰基乙胺還原將一Fab'-TNB衍生物轉化為Fab'-硫醇，且將其與等莫耳量之另一Fab'-TNB衍生物混合以形成雙特異性抗體。所產生之雙特異性抗體可用作選擇性固定酶之試劑。 近期之發展已促進自大腸桿菌直接回收Fab'-SH片段，該等片段可經化學偶合而形成雙特異性抗體。Shalaby等人，J. Exp. Med. , 175:217-225 (1992)描述完全人源化雙特異性抗體F(ab')2 分子之產生。每一Fab'片段係自大腸桿菌單獨分泌且進行活體外定向化學偶合以形成雙特異性抗體。由此形成之雙特異性抗體能夠與過度表現ErbB2受體之細胞及正常人類T細胞結合，且激發人類細胞毒素性淋巴細胞對人類乳腺腫瘤標靶之溶解活性。 亦已描述直接由重組細胞培養物製備並分離雙特異性抗體片段之各種技術。舉例而言，已使用白胺酸拉鏈產生雙特異性抗體。Kostelny等人，J. Immunol, 148(5): 1547-1553 (1992)。藉由基因融合使來自Fos及Jun蛋白之白胺酸拉鏈肽與兩種不同抗體之Fab'部分連接。使抗體同源二聚體在鉸鏈區還原以形成單體，且隨後使其氧化以形成抗體異源二聚體。此方法亦可用於產生抗體同源二聚體。Hollinger等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 90:6444-6448 (1993)所述之"雙功能抗體"技術為製備雙特異性抗體片段提供替代機制。該等片段包含經連接子連接至輕鏈可變域(VL )之重鏈可變域(VH )，該連接子太短以至於不能使同一鏈上之兩個結構域之間配對。因此，迫使一片段之VH 及VL 結構域與另一片段之互補VL 及VH 結構域配對，藉此形成兩個抗原結合位點。亦已報導另一種藉由使用單鏈Fv(sFv)二聚體來製備雙特異性抗體片段之策略。參見Gruber等人，J. Immunol, 152:5368 (1994)。或者，抗體可為如Zapata等人，Protein Eng. 8(10):1057-1062(1995)中所述之"線性抗體"。簡言之，該等抗體包含一對串聯Fd片段(VH -CH 1-VH -CH 1)，其形成一對抗原結合區。線性抗體可為雙特異性或單特異性抗體。 涵蓋具有兩價以上之抗體。舉例而言，可製備三特異性抗體。Tutt等人，J. Immunol 147: 60 (1991)。免疫黏附素 最簡單且最直接之免疫黏附素設計將黏附素之結合域(例如受體之細胞外域(ECD))與免疫球蛋白重鏈之鉸鏈及Fc區組合。通常，當製備本發明之免疫黏附素時，編碼黏附素之結合域的核酸將以C-末端與編碼免疫球蛋白恆定域序列之N-末端的核酸融合，然而N-末端融合亦可能發生。 通常，在該等融合中，經編碼之嵌合多肽將至少保留免疫球蛋白重鏈之功能活性鉸鏈，恆定區之CH 2及CH 3結構域。亦形成與恆定域之Fc部分之C-末端的融合，或緊鄰重鏈之CH 1或輕鏈之相應區之N-末端的融合。形成融合之精確位點並不關鍵；特定位點已熟知且可經選擇以使免疫黏附素之生物活性、分泌或結合特徵最佳化。 在一較佳實施例中，使黏附素序列與免疫球蛋白G1 (IgG1 )之Fc結構域的N-末端融合。可使整個重鏈恆定區與黏附素序列融合。然而，更佳地，融合中使用在恰好處於化學上界定IgG Fc之木瓜蛋白酶裂解位點(亦即殘基216，將重鏈恆定區之第一殘基視為114)或其他免疫球蛋白之類似位點上游之鉸鏈區中起始的序列。在一尤其較佳實施例中，黏附素胺基酸序列與IgG重鏈之(a)鉸鏈區及CH 2及CH 3或(b)CH 1、鉸鏈、CH 2及CH 3結構域融合。 對於雙特異性免疫黏附素而言，免疫黏附素以多聚體，且尤其以異源二聚體或異源四聚體形式裝配。一般而言，該等裝配之免疫球蛋白將具有已知單元結構。基本四鏈結構單元為存在IgG、IgD及IgE之形式。在較高分子量免疫球蛋白中重複四鏈單元；IgM一般以由雙硫鍵結合在一起之四個基本單元之五聚體形式存在。IgA球蛋白及偶而IgG球蛋白亦可以多聚體形式存在於血清中。在多聚體之情況下，四個單元中之每一者可相同或不同。 以下示意性圖示本文範疇內之各種例示性裝配之免疫黏附素： ACL -ACL ； ACH -(ACH 、ACL -ACH 、ACL -VH CH 或VL CL -ACH )； ACL -ACH -(ACL -ACH 、ACL -VH CH 、VL CL -ACH 或VL CL -VH CH ) ACL -VH CH -(ACH 或ACL -VH CH 或VL CL -ACH )； VL CL -ACH -(ACL -VH CH 或VL CL -ACH )；及 (A-Y)n -(VL CL -VH CH )2 ， 其中每一A表示相同或不同之黏附素胺基酸序列； VL 為免疫球蛋白輕鏈可變域； VH 為免疫球蛋白重鏈可變域； CL 為免疫球蛋白輕鏈恆定域； CH 為免疫球蛋白重鏈恆定域； n為大於1之整數； Y表示共價交聯劑之殘基。 出於簡短起見，上述結構僅顯示關鍵特徵；其並未指示免疫球蛋白之連接(J)或其他域，亦未顯示雙硫鍵。然而，若該等區域為結合活性所需，則應建構該等區域以使其存在於其在免疫球蛋白分子中所佔據之一般位置處。 或者，可將黏附素序列插入免疫球蛋白重鏈序列與輕鏈序列之間，以便獲得包含嵌合重鏈之免疫球蛋白。在此實施例中，黏附素序列係與免疫球蛋白之每一臂中之免疫球蛋白重鏈之3'末端，在鉸鏈與CH 2結構域之間或在CH 2與CH 3結構域之間融合。類似構造已由Hoogenboom等人，Mol. Immunol. 28:1027-1037 (1991)報導。 儘管在本發明之免疫黏附素中不需要存在免疫球蛋白輕鏈，但免疫球蛋白輕鏈可以與黏附素-免疫球蛋白重鏈融合多肽共價締合的方式存在或以與黏附素直接融合的方式存在。在前一種情況下，編碼免疫球蛋白輕鏈之DNA通常與編碼黏附素-免疫球蛋白重鏈融合蛋白之DNA共同表現。分泌後，雜合重鏈及輕鏈將共價締合以提供包含兩個雙硫鍵連接之免疫球蛋白重鏈-輕鏈對之免疫球蛋白樣結構。適合於製備該等結構之方法(例如)揭示於1989年3月28日頒布之美國專利第4,816,567號中。 免疫黏附素係最為便利地藉由使編碼黏附素部分之cDNA序列與免疫球蛋白cDNA序列同框融合而建構。然而，亦可使用與基因組免疫球蛋白片段之融合(參見，例如Aruffo等人，Cell 61:1303-1313 (1990)；及Stamenkovic等人，Cell 66:1133-1144 (1991))。後一類型之融合需要存在用於表達之Ig調節序列。編碼IgG重鏈恆定區之cDNA可基於公開序列藉由雜交或藉由聚合酶鏈反應(PCR)技術自源自脾臟或外周血淋巴細胞之cDNA庫分離。將編碼"黏附素"之cDNA及免疫黏附素之免疫球蛋白部分以串聯形式插入指導所選宿主細胞中之有效表達的質體載體中。 以下實例僅為說明性目的而提供，且不意欲以任何方式限制本發明之範疇。 本發明說明書中所引用之所有專利及參考文獻均以全文引用的方式併入本文中。實例 除非另外指出，否則實例中所涉及之市售試劑係根據製造商之說明書使用。以下實例中及在整個說明書中以ATCC寄存登記號鑑別之彼等細胞的來源為美國菌種保存中心(Manassas, Virginia)。實例 1 材料及方法之描述 以下材料及方法用於以下實例2-8中。 材料 實驗性實例中所述之實驗所用的材料及裝置包括：不鏽鋼小瓶(小槽，Flow Components, Dublin, CA；短(50 cc)且高(55 cc))；透析管(Spectra/Por，6-8000 MWCO，目錄號132645)、0.22 μm過濾器(Millipore Millipak Gamma Gold，目錄號MPGL04GH2)；磷酸鹽緩衝生理食鹽水(PBS，EMD，目錄號6506)；乙二胺四乙酸(EDTA，Sigma，目錄號E4884)；α-菸鹼醯胺腺嘌呤二核苷酸磷酸酯(NADPH，Calbiochem，目錄號481973)；去氫表雄固酮(DHEA，TCI，目錄號D0044)；硫酸銅(Sigma，目錄號C8027)，6-磷酸葡萄糖(G6P，Calbiochem，目錄號346764)；金硫葡糖(ATG，USP，目錄號1045508)；金硫蘋果酸鹽(ATM，Alfa Aesar，目錄號39740)；還原之谷胱甘肽(GSH，J.T. Baker，目錄號M770-01)；單溴雙滿(monobromobimane)(mBB，Fluka，目錄號69898)；組胺酸(J.T. Baker，目錄號2080-05)；硫酸鈉(J.T. Baker，目錄號3897-05)；Trx(Sigma，目錄號T8690)；TrxR(Sigma，目錄號T9698)。所有化學製品及試劑未經進一步純化以原樣使用。製備以下儲備溶液用於小槽時程研究：EDTA(250 mM，pH 7.5)、CuSO4 (10 mM)、ATG(30 mM)、ATM(30 mM)、NADPH(75 mM)、G6P(300 mM)。 細胞培養液 (CCF) 之產生 為產生用於各種還原研究之奧克珠單抗CCF，類似於先前所述之方法(Chaderjian等人，2005)使用代表性小規模醱酵方法。簡言之，對於奧克珠單抗培養基組份之接種體培養及產生培養物，使用配備有斜葉葉輪之3公升玻璃攪拌槽Applikon®生物反應器。生物反應器配備有經校準之溶氧量(DO)、pH值及溫度探針。使用數位控制單元將DO、pH值、溫度及攪動速率控制為奧克珠單抗製造過程之規定參數。接種體培養及產生培養物之工作體積均為1.5 L。每日在NOVA Bioprofile血液氣體分析儀上分析樣品以確保pH值及溶氧量之即時值的準確度並監測培養物中之葡萄糖、乳酸鹽、銨、麩胺醯胺、麩胺酸酯及鈉濃度。亦每日分析樣品以監測細胞生長、生存力及力價。藉由使用ViCell進行活細胞計數且以血球容積比(PCV)為基礎量測細胞生長。藉由在ViCell儀器上進行之錐蟲藍排除測試來測定培養物生存力。藉由基於HPLC之方法檢定上清液樣品以量測奧克珠單抗力價值。 已收集之細胞培養液 (HCCF) 製劑 藉由高壓均質化使用Microfluidics HC-8000均質機來實現CCF之完全溶解。將儀器之調壓器設定為4,000-8,000 psi，且引入CCF使其穿過均質機以在單次通過之後獲得完全細胞溶解(膜破損)。一旦水經由該系統淨化，即收集CCF勻漿。將勻漿轉移至離心瓶中且在Sorval RC-3B轉子離心機中在4,500 rpm下在20℃下離心30分鐘。將離心液傾析且隨後深度過濾，接著使用蠕動泵以矽管進行0.22 mm無菌過濾，以自均質化CCF(100%細胞溶解)產生最終HCCF。或者，將CCF直接自醱酵罐離心而不經任何均質化且隨後將離心液用無菌0.22 mm過濾器過濾以產生HCCF。 小槽操作 在操作所有小槽過程中使用層流操作櫥且將HCCF培育實驗中使用之所有材料高壓滅菌或使用70%異丙醇沖洗以使細菌污染最小。 乳酸脫氫酶檢定 對於乳酸脫氫酶檢定而言，參見Babson及Babson(1973)及Legrand等人(1992)，該等文獻以引用的方式併入本文中。 透析實驗 進行透析實驗以判定使奧克珠單抗還原之組份為小分子或大分子(亦即酶)。使3 mL經純化且調配之奧克珠單抗之樣品(30.2 mg/mL)對1 L磷酸鹽緩衝生理食鹽水(PBS，10 mM pH 7.2)透析24小時且在8小時之後更換PBS。隨後使用280 nm下之吸光度將奧克珠單抗樣品之濃度調節至1 mg/mL。使用之前將等分試樣儲存在-70℃下。使透析管在0.05%疊氮化物溶液中水合隔夜且在使用之前用無菌水沖洗。將由來自3-L醱酵罐之CCF之均質化獲得的HCCF解凍且經由0.22 μm Millipak過濾器使用蠕動泵過濾。將6個短小槽各自用30 mL HCCF填充。將於密封透析管中之500 μL奧克珠單抗樣品添加至每一小槽中。將小槽密封且載入在35 rpm及周圍溫度下操作之台式混合器(Barnstead Lab-Line MAX Q 4000)中。對於每一時間點而言，自混合器移除一個小槽且取HCCF(於小槽中)及奧克珠單抗樣品(於透析袋中)之等分試樣且將其儲存在-70℃下直至用游離硫醇檢定及生物分析儀(Bioanalyzer)檢定(如下所述)分析。 測試還原抑制劑 用27 mL HCCF填充高小槽。視實驗設計而定，添加各種試劑(NADPH、G6P、G6PD或TrxR之抑制劑)至所要濃度，且用PBS(10 mM，pH 7.2)使小槽中之最終體積達到30 mL。將小槽密封且載入在35 rpm及周圍溫度下操作之台式混合器中。在每一取樣時間點，將小槽之外部用70% IPA滅菌且在層流操作櫥中打開以移除等分試樣。隨後將小槽再密封且重新載入台式混合器中。將所有等分試樣在    -70℃下儲存直至用游離硫醇檢定及生物分析儀檢定(如下所述)分析。 活體外 Trx/TrxR 還原酶研究 將市售TrxR(大鼠肝臟)溶液(4 μM)用水稀釋以產生2.86 μM溶液。將凍乾Trx(人類)用PBS(10 mM，pH 7.2)重新組構，從而產生500 μM溶液。在水中製備20 mM NADPH之溶液及10 mM ATG及ATM溶液。 在黑色聚丙烯1.5 mL微量離心管中，將437 μL PBS、25 μL NADPH、16 μL經調配之奧克珠單抗溶液(30.2 mg/mL)及5 μL Trx輕輕混合。藉由添加17.5 μL TrxR啟始反應。將反應物在室溫下培育24小時。在每一取樣時間點取20 μL之等分試樣且將其儲存於-70℃下直至藉由生物分析儀檢定(參見下文)分析。藉由在反應混合物中用等量PBS取代Trx及/或TrxR來進行對照實驗以判定當省去酶時酶途徑是否具有活性。 使用以上所述之相同反應條件在添加5 μL ATG或ATM之情況下證實Trx系統之抑制。為證實Cu2+ 對Trx系統之抑制，將2.5 μL CuSO4 (10 mM)添加至反應混合物中，該反應混合物使用相同酶而不同緩衝液(10 mM組胺酸，10 mM Na2 SO4 ，137 mM NaCl，2.5 mM KCl，pH 7.0)以預防不溶性Cu3 (PO4 )2 之形成。 游離硫醇檢定 在PBS(10 mM，pH 6.0±0.05)中產生使用GSH之標準曲線。由110 mM GSH溶液，經由連續稀釋製備0、5.5、11、22、44、55、110及550 μM之濃度之標準溶液。由mBB之乙腈儲備溶液(在-20℃下儲存之10 mM)，在PBS(10 mM，pH 10.0±0.05)中製備mBB之100 μM溶液且將其避光儲存。 在黑色平底96孔板中，將100 μL mBB分配至每一孔中。對於標準曲線而言，添加10 μL標準GSH溶液以產生8.0±0.2之工作pH值。對於樣品，將10 μL樣品添加至孔中。所有孔係以一式三份製備。將板在室溫下在黑暗中培育1小時，隨後使用螢光板讀取器(Molecular Devices SpectraMax® Gemini XS)以390 nm之激發波長及490 nm之發射波長讀取。使用三個標準孔之平均結果對GSH濃度繪圖產生線性標準曲線。樣品中之游離硫醇含量係由標準曲線之線性方程使用三個樣品孔之平均值來計算。 生物分析儀檢定 使用Agilent 2100生物分析儀獲得毛細管電泳量測。樣品製備係如Agilent蛋白230檢定方案(手冊件號(manual part number)G2938-90052)中所述在略作改動下進行。對於HCCF樣品而言，製備之前對樣品進行1:4稀釋。在變性步驟，除提供2 μL變性溶液外添加24 μL 50 mM碘乙醯胺(IAM)、0.5% SDS溶液。使用Agilent 2100 Expert軟體產生數位凝膠狀影像。 用於 HCCF 保持時間研究之儲備溶液 實驗室規模HCCF保持時間研究中使用三種獨立儲備溶液：(1)使用EDTA二鈉二水合物(Mallinckrodt，目錄號7727-06或Sigma，目錄號E-5134)及EDTA四鈉二水合物(Sigma，目錄號E-6511)製備之250 mM EDTA儲備溶液(pH 7.4)，(2)50 mM五水合硫酸銅(CuSO4 ，Sigma目錄號C-8027)之儲備溶液及(3)1 M乙酸溶液(Mallinckrodt，目錄號V193) 抑制劑添加及細胞培養液 (CCF) 摻合 將250 mM EDTA或50 mM CuSO4 之儲備溶液添加至CCF中，之後進行均質化以評估預防抗體雙硫鍵還原之最終濃度的範圍。一旦自均質化CCF產生最終HCCF，則隨後將該等溶液與由非均質化CCF產生之HCCF(亦含有EDTA或CuSO4 )混合以使總細胞溶解程度減弱或降低至100%最大值以下。或者，將1 M乙酸之儲備溶液添加至最終摻合之HCCF溶液(均質化CCF及非均質化CCF)中以降低溶液之pH值從而預防抗體雙硫鍵還原。 將約30-40 mL之每一HCCF溶液(含有EDTA、CuSO4 、乙酸或未添加以作對照)盛裝於50 mL 316L不鏽鋼小瓶中。將小瓶用夾子密封且使溶液不通氣或攪動。將小瓶儲存在室溫(18-22℃)下。在預定時間點，將溶液移除且經實驗室規模蛋白A親和樹脂純化。 空氣噴射 為評估空氣噴射由均質化CCF產生之HCCF對抗體雙硫鍵還原之預防，使用10 L中試規模不鏽鋼容器。將約2-5 L之HCCF 0.22 mm無菌過濾至每一經滅菌之容器中。使實驗條件維持在2℃及50 rpm攪動下而不控制pH值。將溶液用空氣噴射以增加溶解氧含量至空氣飽和或用氮氣(對照)噴射以移除溶液中之任何溶解氧。至每一容器之氣流恆定為40-60 mL/min之通氣速率。在預定時間點，將50 mL樣品自兩容器中移除且在分析之前經實驗室規模蛋白A親和樹脂純化。 蛋白 A 處理 可使用特異性親和層析樹脂捕捉且純化已收集之細胞培養液樣品中之抗體。選擇蛋白A樹脂(Millipore，Prosep-vA High Capacity)作為用於抗體純化之親和樹脂。將樹脂填入床高為14 cm且內徑為0.66 cm之玻璃管柱(Omnifit®)中得到4.8 mL最終管柱容積。使用AKTA Explorer 100層析系統(GE Healthcare)進行層析。 使樹脂暴露於350-560 cm/hr之間的線性流速之緩衝液及HCCF中。用25 mM Tris、25 mM NaCl、5 mM EDTA(pH 7.1)平衡樹脂。對於每一次純化而言，將樹脂以每毫升樹脂5-15毫克之間的抗體上樣。使用固定蛋白A HPLC管柱(Applied Biosystems，POROS A)測定HCCF中之抗體濃度。上樣之後，將樹脂用25 mM Tris、25 mM NaCl、5 mM EDTA、0.5 M TMAC(pH 7.1)洗滌，且隨後使用0.1 M乙酸(pH 2.9)將抗體溶離。基於在流出管柱之後線內量測之280 nm下的UV吸光度將溶離液混合。使用1 M Sodium HEPES將經純化之溶離混合物之pH值調節至pH 5.0-5.5。用0.1 M磷酸使樹脂再生之後，將相同或類似之填充樹脂用於隨後純化其他HCCF溶液。 使用UV光譜測定法在280 nm下量測經純化之蛋白A混合物中之抗體濃度。藉由生物分析儀檢定分析經純化之蛋白A溶離混合物以測定150 kDa分子量之完整抗體之百分比。實例 2 透析實驗 設計並進行透析實驗以判定奧克珠單抗之還原係歸因於小還原性分子或大分子(例如酶)。在此透析實驗中，將經純化之完整奧克珠單抗置於截留分子量(MWCO)為7000之透析袋中且將該透析袋在含奧克珠單抗之HCCF中在不鏽鋼小槽中培育。如圖1及圖2所示，培育期之後該袋內之奧克珠單抗未被還原(圖1)，而培育起始之後不久袋外HCCF中之奧克珠單抗即明顯被還原。此係由完整奧克珠單抗(約150 kDa)之損失及奧克珠單抗片段(重鏈及輕鏈之不同組合)之形成證明(圖2)。來自還原製造運作之蛋白A溶離混合物中之奧克珠單抗的質譜分析指示彼等所觀察到之片段係由僅鏈間雙硫鍵之還原而形成。 游離硫醇量測顯示在培育開始時透析袋內不存在游離硫醇；然而在培育起始之後不到5小時，透析袋內及透析袋外之游離硫醇之含量變得相當，其指示HCCF中之小分子組份在透析袋內及透析袋外完全平衡(圖3)。因為僅在具有7000 Da之MWCO的透析袋外部而非內部觀察到還原，故還原分子之分子量必須大於7000 Da。因此，酶促反應引起奧克珠單抗還原。實例 3 活體外奧克珠單抗經 Trx/TrxR 還原 藉由將完整奧克珠單抗與Trx、TrxR及NADPH一起培育來測試Trx系統活體外還原奧克珠單抗之能力。生物分析儀結果指示奧克珠單抗經Trx系統活體外還原(圖5)。此活體外系統中之還原速率似乎比於HCCF中之還原速率慢(例如當與圖2中所示之還原相比時)。此可能係歸因於該活體外反應中所用之較低酶(Trx及Trx-R)濃度及/或緩衝系統，因為Trx系統之反應速率視酶濃度與緩衝系統而定。實例 4 Trx 系統之抑制劑 (i) 硫酸銅對重組抗體還原的抑制 已知硫酸銅能夠提供氧化性氧化還原電位且其已用於細胞培養過程中以使重組抗體分子中之游離硫醇(亦即，不成對半胱胺酸)含量最小(Chaderjian等人，2005，上述)。測試硫酸銅活體外抑制Trx系統及隨後之奧克珠單抗還原之功效。在此活體外還原實驗中，緩衝系統由PBS變為組胺酸硫酸鹽以避免形成不溶性Cu3 (PO4 )2 。圖8顯示奧克珠單抗在組胺酸硫酸鹽緩衝液中易於經Trx系統還原(甚至比於PBS緩衝液中快)。添加CuSO4 至此反應物中明顯抑制奧克珠單抗還原(圖9)。(ii)ATG 及 ATM 對 HCCF 中重組抗體還原之抑制 測試兩種市售特異性TrxR抑制劑(金硫葡糖(ATG)及金硫蘋果酸鹽(ATM))活體外抑制Trx系統及奧克珠單抗還原之能力。在以上所述之檢定中ATG與ATM均可有效抑制奧克珠單抗之還原(參見圖6及圖7)。以1 mM之濃度將金硫葡糖或金硫蘋果酸鹽添加至與圖5之說明中所述相同之反應混合物中如生物分析儀分析之數位凝膠狀影像中所示有效抑制奧克珠單抗還原。 若Trx系統在HCCF中具有活性且如產生經還原之抗體分子之製造運作中或實驗室規模實驗中所觀察到使奧克珠單抗還原，則兩種金化合物(ATG及ATM)應能夠抑制奧克珠單抗在HCCF中還原。圖10顯示培育一段時期之後奧克珠單抗在來自由3-L醱酵罐產生之均質化CCT之HCCF中易於還原。然而，當將1 mM ATG或ATM添加至HCCF中時奧克珠單抗還原得以完全抑制(圖11及12)。該等結果證實Trx系統在HCCF中具有活性且直接引起奧克珠單抗還原。實例 5 Trx 系統活性之 NADPH 來源及 G6P 及葡萄糖於還原機制中之作用 雙硫鍵經Trx系統還原需要來自NADPH之還原性等效物(圖4)。為所有還原生物合成反應提供NADPH之主要細胞代謝途徑為磷酸戊糖途徑。為使抗體還原發生，此途徑中之酶必須在HCCF中仍具有活性以維持Trx系統具有活性。至少，磷酸戊糖途徑之第一步(由G6PD催化)必須具有活性以將NADP+ 還原為NADPH，同時將G6P轉化為6-磷酸葡糖酸內酯。此外，G6P極有可能係由葡萄糖及腺苷5'-三磷酸鹽(ATP)藉由HCCF中之己糖激酶活性產生。奧克珠單抗還原之總體機制概述於圖4中。 HCCF中之還原活性在有些情況下似乎為短暫的且可在某些儲存條件下隨時間得以抑制或在多個冷凍/解凍循環之後得以抑制。已完全喪失還原活性之HCCF提供探究NADPH及G6P在奧克珠單抗經Trx系統還原過程中之作用的機會。 使來自大規模製造運作("β"運作)之HCCF經歷若干冷凍/解凍循環且用於經設計以量測還原之實驗；未觀察到奧克珠單抗還原(圖13)，儘管先前在來自此相同醱酵之新解凍HCCF中觀察到其能夠引起抗體還原。將NADPH以5 mM之濃度添加至此非還原性HCCF中且還原恢復(圖14)。因此，在不再發生還原之HCCF中Trx系統仍為完整的且具有活性，且若提供輔因子則能夠使蛋白質及/或抗體還原。另外，還原活性隨時間喪失，此係因為NADPH來源消耗(大概係由於爭奪NADPH之所有還原反應使NADPH氧化)，而非因為Trx系統降解或失活。 此係由另一實驗來驗證。將10 mM G6P添加至來自β運作之經反覆冷凍-解凍之HCCF中。此G6P添加再活化Trx系統，該系統隨後在HCCF培育實驗中使奧克珠單抗還原(圖15)。此證實奧克珠單抗在HCCF中之還原係歸因於Trx系統及G6PD之活性。此外，在β運作之經反覆冷凍/解凍之HCCF中G6PD仍具有活性；在此β運作之經反覆冷凍/解凍之HCCF中還原活性之喪失似乎係歸因於G6P之消耗，其因此消除NADP+ 至NADPH之轉化。 在吾人之研究中，觀察到在HCCF培育實驗中EDTA可有效抑制奧克珠單抗還原。如圖16所示，將來自12,000 L規模奧克珠單抗製造運作之HCCF(未經反覆冷凍/解凍且未喪失還原活性)在周圍溫度下培育超過19小時之後奧克珠單抗還原。然而，當將20 mM EDTA添加至12 kL Run 9 HCCF中且盛裝於獨立不鏽鋼小槽中時還原得以完全抑制(圖17)。在糖酵解之第一步中，己糖激酶催化磷酸基由Mg2+ -ATP轉移至葡萄糖，即需要Mg2+ 與ATP錯合之反應(Hammes及Kochavi，1962a及1962b，上述)。因為EDTA為金屬離子(尤其Mg2+ )螯合劑，故其可為己糖激酶之有效抑制劑。觀察到過量EDTA可有效阻斷還原，由此指示己糖激酶與奧克珠單抗還原機制有關(亦即提供G6P)。不希望受此或任何其他理論束縛，EDTA藉由消除己糖激酶活性且藉此降低可用於G6PD之G6P含量，且隨後降低可用於Trx系統之NADPH含量來阻斷奧克珠單抗還原。 儘管EDTA極其有效阻斷奧克珠單抗於新鮮HCCF中之還原，但其不能預防奧克珠單抗在Trx系統活性喪失隨後藉由添加G6P而再活化之β運作HCCF中的還原。舉例而言，將5 mM G6P及20 mM EDTA(最終濃度)添加至已完全喪失還原活性之β運作HCCF中，在HCCF培育實驗中觀察到奧克珠單抗之還原。然而，在未添加G6P及EDTA之對照培育實驗中未觀察到還原(圖18)。不希望受此或任何其他理論束縛，以此方式使用之EDTA可能因此既不抑制Trx系統亦不抑制G6PD，且可用作產生G6P用於G6PD之己糖激酶之抑制劑。在無G6P之情況下，不會向Trx系統提供活性所必需之NADPH。實例 6 DHEA 對重組抗體還原的抑制 去氫表雄固酮(DHEA)以及其他類似G6PD抑制劑有效阻斷G6PD活性(Gordon等人，1995，上述)。G6PD抑制劑亦藉由阻斷NADPH產生預防HCCF中抗體(例如奧克珠單抗)還原。在HCCF培育實驗中證實DHEA能夠抑制奧克珠單抗還原。添加DHEA至HCCF中預防抗體還原。 DHEA通常以約0.05 mM至約5 mM範圍內之濃度使用。DHEA亦通常以約0.1 mM至約2.5 mM範圍內之濃度使用。實例 7 藉由添加 (i)EDTA 、 (ii) 硫酸銅及 (iii) 乙酸抑制重組抗體之還原 將4種不同HCCF儲存且盛裝於不鏽鋼小瓶中。該等溶液之細胞溶解量類似，該細胞溶解係藉由用來自非均質化CCF之HCCF稀釋來自均質化CCF之HCCF而產生。舉例而言，將150 mL第一溶解溶液與50 mL第二溶液分別混合。在此研究中評估之4種HCCF混合物含有以下各者中之任一者：(1)20 mM EDTA、(2)30 mM CuSO4 、(3)15 mM乙酸(pH 5.5)及(4)對於對照溶液而言未添加化學抑制劑。立刻(t=0 hr)使用蛋白A層析法自4種混合物純化奧克珠單抗抗體，且隨後在不鏽鋼小瓶中儲存20 hr及40 hr之後再次純化。藉由生物分析儀檢定分析經純化之蛋白A溶離混合物以測定完整抗體(150 kDa)之百分比。結果顯示在初始時間點在所有4種混合物中存在大於90%之完整抗體(圖19)。然而，在20 hr時間點，在對照混合物(未作任何添加)中未偵測到完整抗體，其指示抗體雙硫鍵還原。在其他三種混合物中，在20 hr與40 hr時間點均仍偵測到90%以上之完整抗體，其證實所有三種測試抑制劑預防雙硫鍵還原。實例 8 藉由空氣噴射 HCCF 來抑制重組抗體還原 將一種由均質化CCF產生之HCCF混合物儲存且盛裝於兩個獨立10 L不鏽鋼醱酵罐中。一個容器用空氣噴射，而另一容器用氮氣噴射。立刻(t=0 hr)使用蛋白A層析法自初始混合物純化奧克珠單抗抗體。在選定時間點，自每一容器移除50 mL樣品且使用蛋白A層析法將抗體純化。隨後藉由生物分析儀檢定分析經純化之蛋白A溶離混合物以測定完整抗體(150 kDa)之百分比。結果顯示在初始溶液中存在約85%完整抗體(圖20)，其指示抗體雙硫鍵早在暴露於氧氣(亦即醱酵罐中噴射空氣)之前產生些許還原。一旦將混合物用空氣噴射兩小時，在36 hr研究之剩餘時間內量測到大於90%完整抗體。相反，當將混合物用氮氣噴射時，抗體還原持續，如在2 hr(28% 150 kDa峰值)及6 hr(5% 150 kDa峰值)所測量。該等結果證實當使由均質化CCF產生之HCCF混合物暴露於氧氣中時預防抗體中雙硫鍵還原。實例 9 設計靶向 siRNA 或反義核苷酸 Trx 抑制劑 可藉由使用公開可得序列進行針對如見於CHO細胞中之基因的靶向siRNA或反義核苷酸之設計，該等序列諸如大腸桿菌硫氧還原蛋白TrxA序列(SEQ ID NO:30)、大腸桿菌硫氧還原蛋白還原酶TrxB序列(SEQ ID NO:31)；小鼠硫氧還原蛋白1序列(SEQ ID NO:32)、小鼠硫氧還原蛋白2序列(SEQ ID NO:33)、小鼠硫氧還原蛋白還原酶1序列(SEQ ID NO:34)及小鼠硫氧還原蛋白還原酶2序列(SEQ ID NO:35)。一般熟習此項技術者可使用該等序列來選擇用以設計靶向不同生物體及/或細胞(諸如CHO細胞)中之酶之Trx抑制劑的序列。 大腸桿菌硫氧還原蛋白TrxA之序列為：
Figure 02_image055
大腸桿菌硫氧還原蛋白TrxB之序列為：
Figure 02_image057
Figure 02_image059
小鼠硫氧還原蛋白1之序列為：
Figure 02_image061
小鼠硫氧還原蛋白2之序列為：
Figure 02_image063
小鼠硫氧還原蛋白還原酶1之序列為：
Figure 02_image065
Figure 02_image067
小鼠硫氧還原蛋白還原酶2之序列為：
Figure 02_image069
Figure 02_image071
可在不存在本文未明確揭示之任何要素、限制下適當地實踐本文所說明性描述之本發明。因此，舉例而言，應廣泛且非限制性地理解術語"包含"、"包括"、"含有"等。另外，本文所用之術語及表述已用作描述性而非限制性術語，且在使用該等術語及表述時並不意欲排除所示本發明或其部分之任何等效物，而應瞭解各種修改在所主張之本發明的範疇內係可能的。因此，應瞭解儘管本發明已用較佳實施例及可選特徵明確揭示，但熟習此項技術者可易於作出所揭示之本文所涵蓋的發明之修改及變化，且將該等修改及變化視為在本文所揭示之發明的範疇內。本文已廣泛且一般性描述本發明。一般揭示內容範圍內之較窄種類及亞類組群各自亦形成該等發明之一部分。此包括在各項發明之一般描述內自該屬類移除任何標的物之限制性條款或負性限制，不論待移除之物質是否明確敍述。此外，若依據馬庫西群組(Markush group)描述本發明之特徵及態樣，則熟習此項技術者將認識到亦藉此依據馬庫西群組成員之任何個別成員或子群描述本發明。另外，當提及本發明之一態樣列舉一系列個別成員(例如'SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:100，包括SEQ ID NO:1及SEQ ID NO:100')時，其意欲等效於個別地列舉該清單的每一成員，且另外應瞭解可將每一個別成員個別地排除在申請專利範圍外或包括在申請專利範圍內。 本文之方法中所述及/或所用之步驟可以與所述及/或所規定不同之次序進行。該等步驟僅為該等步驟可能進行之次序的例示。該等步驟可以所要以便仍達成所主張之本發明之目標的任何次序進行。 自本文中本發明之描述，表明可在不背離本發明之範疇下使用各種等效物以實施本發明之概念。此外，儘管已特定參照某些實施例來描述本發明，但一般熟習此項技術者應瞭解可在不背離本發明之精神及範疇下進行形式及細節上之改變。認為所述實施例在所有方面均為說明性的而非限制性的。亦應瞭解本發明不限於本文所述之特定實施例，而能夠在不背離本發明之範疇下進行許多等效、重排、修改及取代。因此，其他實施例係在本發明之範疇內且在以下申請專利範圍內。 本文所提及之所有美國專利及申請案；外國專利及申請案；科學論文；書籍；及公開案均以全文引用的方式併入本文中，該引用程度就如同已特定地及個別地將各個專利或公開案以全文引用(包括任何圖式、圖及表)的方式併入本文中一般。
圖 1 ；透析實驗： 自生物分析儀分析獲得之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)證實在培育期內透析袋內之奧克珠單抗(rhuMAb 2H7)保持完整。圖 2 ；透析實驗： 自生物分析儀分析獲得之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)顯示在培育期內透析袋外之奧克珠單抗被還原。此係由圖中所述之完整抗體(約150 kDa)之損失及抗體片段的形成而證明。在48小時時間點(色帶7)，經還原之抗體似乎經再氧化，此可能係由於在已收集細胞培養液(HCCF)中喪失還原活性。恰好出現在28 kDa標記上方之頻帶係由抗體之輕鏈產生。在培育開始之前，HCCF中已存在大量游離輕鏈。HCCF中存在過量游離輕鏈及輕鏈二聚體為產生奧克珠單抗之細胞株的典型特徵。圖 3 ；得自透析實驗之游離硫醇含量： 磷酸鹽緩衝生理食鹽水(PBS)中之經純化之奧克珠單抗在透析袋內而含有奧克珠單抗之HCCF在袋外。透析袋內之游離硫醇(方框)及透析袋外之游離硫醇(菱形)在幾小時內達到相當含量，指示在透析袋內與透析袋外HCCF中之小分子組份之間的良好交換。圖 4 ；與抗體還原有關之硫氧還原蛋白系統及其他反應： 包含硫氧還原蛋白(Trx)、硫氧還原蛋白還原酶(TrxR)及NADPH之硫氧還原蛋白系統用作使蛋白質中之雙硫鍵還原之氫供體系統。Trx為具有CXXC活性位點基元之小單體蛋白，其經由硫醇-雙硫鍵交換催化許多氧化還原反應。經氧化之Trx可由NADPH經由TrxR還原。隨後經還原之Trx可催化蛋白質中雙硫鍵之還原。硫氧還原蛋白系統所需之NADPH係經由磷酸戊糖途徑及糖酵解中之反應來提供。圖 5 ；硫氧還原蛋白系統之活體外活性： 來自生物分析儀分析之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)證實將完整奧克珠單抗(1 mg/mL)與0.1 mM TrxR(大鼠肝臟)、5 mM Trx(人類)及1 mM NADPH一起於PBS中培育使奧克珠單抗完全還原；該奧克珠單抗在不到21小時內完全還原。圖 6 ；金硫葡糖抑制之硫氧還原蛋白系統之活體外活性： 將金硫葡糖(ATG)添加至與以上圖5之說明中所述相同之反應混合物中有效抑制奧克珠單抗還原。此係由來自生物分析儀分析之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)觀察到。圖 7 ；金硫蘋果酸鹽抑制之硫氧還原蛋白系統之活體外活性： 將金硫蘋果酸鹽(ATM)以1 mM之濃度添加至與以上圖5之說明中所述相同之反應混合物中有效抑制奧克珠單抗還原。此係由來自生物分析儀分析之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)觀察到。圖 8 ；硫氧還原蛋白系統之活體外活性： 來自生物分析儀分析之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)顯示將完整奧克珠單抗(1 mg/mL)與0.1 mM TrxR(大鼠肝臟)、5 mM Trx(人類)及1 mM NADPH一起於10 mM組胺酸硫酸鹽緩衝液中培育使奧克珠單抗在不到1小時內還原。圖 9 ； CuSO4 抑制之硫氧還原蛋白系統之活體外活性： 將CuSO4 以50 mM之濃度添加至與圖8之說明中所述相同之反應混合物中如生物分析儀分析之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)中所示有效抑制奧克珠單抗還原。圖 10 ；奧克珠單抗還原： 來自生物分析儀分析之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)顯示在使用來自由3-L醱酵罐產生之均質化CCF之HCCF的培育實驗中奧克珠單抗被還原。圖 11 ；金硫葡糖對 HCCF 中奧克珠單抗還原的抑制： 來自生物分析儀分析之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)顯示將1 mM金硫葡糖添加至與用於圖10中所示之培育實驗相同之HCCF中抑制奧克珠單抗還原。圖 12 ；金硫蘋果酸鹽對 HCCF 中奧克珠單抗還原的抑制： 來自生物分析儀分析之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)指示將1 mM金硫蘋果酸鹽添加至與用於圖10中所示之培育實驗相同之HCCF中抑制奧克珠單抗還原。圖 13 ； HCCF 中還原活性喪失： 來自奧克珠單抗之大規模製造運作("β"運作)之經歷若干冷凍/解凍循環的HCCF顯示當用於培育實驗時奧克珠單抗未還原。此係藉由生物分析儀分析(每一色帶表示一時間點)顯示且可與先前在來自相同醱酵批次之新近解凍之HCCF中所觀察到的抗體還原對比。圖 14 ；藉由添加 NADPH 恢復 HCCF 中喪失之還原活性： 在將NADPH以5 mM之濃度添加至還原活性已在以上圖13中所述條件下消除之HCCF中之後，在生物分析儀檢定(每一色帶表示一時間點)中再次觀察到奧克珠單抗之還原。圖 15 ；藉由添加 6- 磷酸葡萄糖恢復 HCCF 中喪失之還原活性： 在將G6P以10 mM之濃度添加至還原活性已由於以上圖13中所述之處理而消除之HCCF中之後，在生物分析儀檢定(每一色帶表示一時間點)中再次觀察到奧克珠單抗之還原。圖 16 ；奧克珠單抗還原： 來自生物分析儀分析之數位凝膠狀影像顯示在使用來自大規模製造運作("α"運作)之HCCF的培育實驗中奧克珠單抗被還原。圖 17 ； EDTA 抑制奧克珠單抗還原： 來自生物分析儀分析之數位凝膠狀影像(每一色帶表示一時間點)顯示將EDTA以20 mM之濃度添加至還原活性已於圖16中得以證實之HCCF中，在使用來自α運作之HCCF的培育實驗中奧克珠單抗之還原得以抑制。圖 18 ；藉由添加 6- 磷酸葡萄糖恢復 " β運作 " 中喪失之還原活性，而 EDTA 並不抑制還原： 在將G6P以5 mM之濃度及20 mM之EDTA添加至還原活性已喪失(參見圖13)之HCCF中之後，在生物分析儀檢定(每一色帶表示一時間點)中觀察到奧克珠單抗之還原。與圖17中所示之結果相比，EDTA之存在不阻斷奧克珠單抗還原。圖 19 ；藉由 (i) 添加 EDTA 、 (ii) 添加 CuSO4 或 (iii) 調節 pH 值至 5.5 抑制奧克珠單抗還原。 所有三種不同方法，(1)添加EDTA、(2)添加CuSO4 及(3)調節pH值至5.5(獨立使用)均有效抑制奧克珠單抗還原。此係由所述定量生物分析儀結果證實，該等結果顯示幾乎100%完整(150 kDa)抗體保留於蛋白A溶離混合物中。相反，在對照HCCF中在20小時HCCF保持時間之後奧克珠單抗完全還原。圖 20 ；藉由空氣噴射抑制奧克珠單抗還原： 用空氣噴射HCCF有效抑制奧克珠單抗雙硫鍵還原。此係由定量生物分析儀結果證實，該等結果顯示幾乎100%完整(150 kDa)抗體保留於蛋白A溶離混合物中。相反，在對照HCCF中在用氮氣噴射5小時之後奧克珠單抗幾乎完全還原。圖 21 顯示抗Her2抗體(曲妥珠單抗)之VL (SEQ ID NO. 24)胺基酸序列。圖 22 顯示抗Her2抗體(曲妥珠單抗)之VH (SEQ ID NO. 25)胺基酸序列。圖 23;/ 為顯示典型大規模製造過程之一些步驟的示意圖。
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Figure 12_A0101_SEQ_0028
Figure 12_A0101_SEQ_0029
Figure 12_A0101_SEQ_0030
Figure 12_A0101_SEQ_0031

Claims (48)

  1. 一種用於預防重組宿主細胞中所表現之多肽中之雙硫鍵還原的方法，其包含將硫氧還原蛋白抑制劑補充至該重組宿主細胞之收集前或已收集培養液中。
  2. 如請求項1之方法，其中將該硫氧還原蛋白抑制劑添加至該收集前培養液中。
  3. 如請求項1之方法，其中將該硫氧還原蛋白抑制劑添加至該已收集培養液中。
  4. 如請求項1之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為硫氧還原蛋白之直接抑制劑。
  5. 如請求項4之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為烷基-2-咪唑基二硫化物或萘醌螺縮酮衍生物。
  6. 如請求項1之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為硫氧還原蛋白還原酶之特異性抑制劑。
  7. 如請求項6之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為金錯合物。
  8. 如請求項7之方法，其中該金錯合物為金硫葡糖(ATG)或金硫蘋果酸鹽(ATM)。
  9. 如請求項1之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為金屬離子。
  10. 如請求項9之方法，其中該金屬離子係選自由Hg2+ 、Cu2+ 、Zn2+ 、Co2+ 及Mn2+ 組成之群。
  11. 如請求項1之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為G6PD之抑制劑。
  12. 如請求項11之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑係選自由5'-磷酸吡哆醛、1-氟-2,4-二硝基苯、去氫表雄固酮(DHEA)及表雄固酮(EA)組成之群。
  13. 如請求項1之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為己糖激酶活性之抑制劑。
  14. 如請求項13之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為金屬離子之螯合劑。
  15. 如請求項14之方法，其中該金屬離子之螯合劑為乙二胺四乙酸(EDTA)。
  16. 如請求項13之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑係選自由山梨糖-1-磷酸鹽、聚磷酸鹽、6-去氧-6-氟葡萄糖、2-C-羥基-甲基葡萄糖、木糖及來蘇糖組成之群。
  17. 如請求項1之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為與硫氧還原蛋白還原酶特異性結合之siRNA、反義核苷酸或抗體。
  18. 如請求項1之方法，其中該硫氧還原蛋白抑制劑為間接引起硫氧還原蛋白活性抑制之手段。
  19. 如請求項18之方法，其中該手段為空氣噴射該重組宿主細胞之已收集培養液。
  20. 如請求項18之方法，其中該手段為降低該重組宿主細胞之已收集培養液的pH值。
  21. 如請求項1至17中任一項之方法，其另外包含空氣噴射該重組宿主細胞之已收集培養液的步驟。
  22. 如請求項1至17中任一項之方法，其另外包含降低該重組宿主細胞之已收集培養液的pH值之步驟。
  23. 如請求項1之方法，其中該多肽為抗體或抗體之生物功能片段。
  24. 如請求項23之方法，其中該抗體片段係選自由Fab、Fab'、F(ab')2 、scFv、(scFv)2 、dAb、互補判定區(CDR)片段、線性抗體、單鏈抗體分子、微型抗體、雙功能抗體及由抗體片段形成之多特異性抗體組成之群。
  25. 如請求項23之方法，其中該抗體或抗體片段為治療性抗體或其生物功能片段。
  26. 如請求項25之方法，其中該治療性抗體係選自由以下各抗體組成之群：抗HER2抗體、抗CD20抗體；抗IL-8抗體；抗VEGF抗體；抗CD40抗體、抗CD11a抗體；抗CD18抗體；抗IgE抗體；抗Apo-2受體抗體；抗組織因子(TF)抗體；抗人類α4 β7 整合素抗體；抗EGFR抗體；抗CD3抗體；抗CD25抗體；抗CD4抗體；抗CD52抗體；抗Fc受體抗體；抗癌胚抗原(CEA)抗體；針對乳腺上皮細胞之抗體；與結腸癌瘤細胞結合之抗體；抗CD38抗體；抗CD33抗體；抗CD22抗體；抗EpCAM抗體；抗GpIIb/IIIa抗體；抗RSV抗體；抗CMV抗體；抗HIV抗體；抗肝炎抗體；抗CA 125抗體；抗αvβ3抗體；抗人類腎細胞癌抗體；抗人類17-1A抗體；抗人類結腸直腸腫瘤抗體；針對GD3神經結醣脂之抗人類黑色素瘤抗體R24；抗人類鱗狀細胞癌抗體；及抗人類白細胞抗原(HLA)抗體及抗HLA DR抗體。
  27. 如請求項25之方法，其中該治療性抗體為與HER受體、VEGF、IgE、CD20、CD11a、CD40或DR5結合之抗體。
  28. 如請求項27之方法，其中該HER受體為HER1及/或HER2。
  29. 如請求項28之方法，其中該HER受體為HER2。
  30. 如請求項29之方法，其中該治療性抗體包含選自由SEQ ID NOS：16、17、18及19組成之群的重鏈及/或輕鏈可變域序列。
  31. 如請求項27之方法，其中該治療性抗體為與CD20結合之抗體。
  32. 如請求項31之方法，其中該治療性抗體包含選自由SEQ ID NOS：1至15組成之群的重鏈及/或輕鏈可變域序列。
  33. 如請求項27之方法，其中該治療性抗體為與VEGF結合之抗體。
  34. 如請求項33之方法，其中該治療性抗體包含選自由SEQ ID NOS：20至25組成之群的重鏈及/或輕鏈可變域序列。
  35. 如請求項27之方法，其中該治療性抗體為與CD11a結合之抗體。
  36. 如請求項35之方法，其中該治療性抗體包含選自由SEQ ID NOS：26至29組成之群的重鏈及/或輕鏈可變域序列。
  37. 如請求項27之方法，其中該治療性抗體與DR5受體結合。
  38. 如請求項37之方法，其中該治療性抗體係選自由以下各抗體組成之群：Apomab 1.1、2.1、3.1、4.1、5.1、5.2、5.3、6.1、6.2、6.3、7.1、7.2、7.3、8.1、8.3、9.1、1.2、2.2、3.2、4.2、5.2、6.2、7.2、8.2、9.2、1.3、2.2、3.3、4.3、5.3、6.3、7.3、8.3、9.3及25.3。
  39. 如請求項37之方法，其中該治療性抗體為Apomab 8.3或Apomab 7.3。
  40. 如請求項39之方法，其中該治療性抗體為Apomab 7.3。
  41. 如請求項1之方法，其中該多肽為治療性多肽。
  42. 如請求項41之方法，其中該治療性多肽係選自由以下各物組成之群：生長激素，包括人生長激素及牛生長激素；生長激素釋放因子；甲狀旁腺激素；促甲狀腺激素；脂蛋白；α-1-抗胰蛋白酶；胰島素A-鏈；胰島素B-鏈；胰島素原；促卵泡激素；降鈣素；促黃體生成激素；升血糖激素；凝血因子，諸如因子VIIIC、因子IX、組織因子及血管性血友病因子(von Willebrands factor)；抗凝血因子，諸如蛋白C；心房利尿鈉因子；肺界面活性劑；血漿素原活化劑，諸如尿激酶或人類尿或組織型血纖維蛋白溶酶原活化劑(t-PA)；鈴蟾素；凝血酶；造血生長因子；腫瘤壞死因子-α及腫瘤壞死因子-β；腦啡肽酶；RANTES(調節活化正常T細胞表現及分泌因子)；人類巨噬細胞發炎性蛋白(MIP-1-α)；血清白蛋白，諸如人血清白蛋白；苗勒氏抑制物質(Muellerian-inhibiting substance)；鬆弛素A-鏈；鬆弛素B-鏈；鬆弛素原；小鼠促性腺激素相關肽；微生物蛋白，諸如β-內醯胺酶；DNase；IgE；細胞毒性T-淋巴細胞相關抗原(CTLA)，諸如CTLA-4；抑制素；活化素；血管內皮生長因子(VEGF)；激素或生長因子之受體；蛋白A或D；類風濕因子；神經營養因子，諸如骨衍生之神經營養因子(BDNF)、神經營養因子-3、-4、-5或-6(NT-3、NT-4、NT-5或NT-6)或神經生長因子，諸如NGF-β；血小板衍生之生長因子(PDGF)；纖維母細胞生長因子，諸如aFGF及bFGF；表皮生長因子(EGF)；轉化生長因子(TGF)，諸如TGF-α及TGF-β，包括TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3、TGF-β4或TGF-β5；胰島素樣生長因子-I及胰島素樣生長因子-II(IGF-I及IGF-II)；des(1-3)-IGF-I(腦IGF-I)、胰島素樣生長因子結合蛋白；CD蛋白，諸如CD3、CD4、CD8、CD19、CD20、CD34及CD40；紅血球生成素；骨生成誘導因子；免疫毒素；骨形態發生蛋白(BMP)；干擾素，諸如干擾素-α、干擾素-β及干擾素-γ；群落刺激因子(CSF)，例如M-CSF、GM-CSF及G-CSF；介白素(IL)，例如IL-1至IL-10；過氧化物歧化酶；T細胞受體；表面膜蛋白；促衰變因子；病毒抗原，諸如一部分AIDS包膜；轉運蛋白；歸巢受體；地址素；調節蛋白；整合素，諸如CD11a、CD11b、CD11c、CD18、ICAM、VLA-4及VCAM；腫瘤相關抗原，諸如HER2、HER3或HER4受體；及該等多肽之片段。
  43. 如請求項1之方法，其中該重組宿主細胞為真核宿主細胞。
  44. 如請求項43之方法，其中該真核宿主細胞為哺乳動物宿主細胞。
  45. 如請求項44之方法，其中該哺乳動物宿主細胞為中國倉鼠卵巢(CHO)細胞。
  46. 如請求項1之方法，其中該重組宿主細胞為原核宿主細胞。
  47. 如請求項46之方法，其中該原核宿主細胞為細菌細胞。
  48. 如請求項47之方法，其中該細菌細胞為大腸桿菌細胞。
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