[go: up one dir, main page]

RU2008130089A - Улучшенная направленная замена нуклеотидов модифицированными олигонуклеотидами lna - Google Patents

Улучшенная направленная замена нуклеотидов модифицированными олигонуклеотидами lna Download PDF

Info

Publication number
RU2008130089A
RU2008130089A RU2008130089/13A RU2008130089A RU2008130089A RU 2008130089 A RU2008130089 A RU 2008130089A RU 2008130089/13 A RU2008130089/13 A RU 2008130089/13A RU 2008130089 A RU2008130089 A RU 2008130089A RU 2008130089 A RU2008130089 A RU 2008130089A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
oligonucleotide
dna sequence
nucleotides
modified
cell
Prior art date
Application number
RU2008130089/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2463350C2 (ru
Inventor
Пол БЮНДОК (NL)
Пол БЮНДОК
БОТ Михил Теодор Ян ДЕ (NL)
БОТ Михил Теодор Ян ДЕ
Рене Корнелис Йозефус ХОГЕРС (NL)
Рене Корнелис Йозефус ХОГЕРС
Людвик Кевин ВАХОВСКИЙ (NL)
Людвик Кевин ВАХОВСКИЙ
Original Assignee
Киджин Н.В. (Nl)
Киджин Н.В.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=36691461&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RU2008130089(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Киджин Н.В. (Nl), Киджин Н.В. filed Critical Киджин Н.В. (Nl)
Publication of RU2008130089A publication Critical patent/RU2008130089A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2463350C2 publication Critical patent/RU2463350C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8213—Targeted insertion of genes into the plant genome by homologous recombination
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8274—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for herbicide resistance
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8274—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for herbicide resistance
    • C12N15/8278—Sulfonylurea
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88—Lyases (4.)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6832—Enhancement of hybridisation reaction

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

1. Олигонуклеотид для направленного изменения последовательности дуплексной ДНК, содержащей первую последовательность ДНК и вторую последовательность ДНК, которая комплементарна первой последовательности ДНК, где олигонуклеотид содержит домен, способный гибридизироваться с первой последовательностью ДНК, где домен содержит по меньшей мере одно ошибочное спаривание по отношению к первой последовательности ДНК, и где олигонуклеотид содержит по меньшей мере один участок, который содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид, обладающий большей аффинностью связывания по сравнению с природными нуклеотидами A, C, T или G, причем по меньшей мере один модифицированный нуклеотид представляет собой LNA и расположен на расстоянии по меньшей мере одного нуклеотида от по меньшей мере одной точки ошибочного спаривания, и где необязательно олигонуклеотид содержит не более приблизительно 75% модифицированных нуклеотидов LNA. ! 2. Олигонуклеотид по п.1, в котором по меньшей мере 2, предпочтительно по меньшей мере 3, предпочтительнее по меньшей мере 4, еще предпочтительнее по меньшей мере 5 и наиболее предпочтительно по меньшей мере 6 нуклеотидов представляют собой LNA. ! 3. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором LNA распределены независимо на расстоянии не более 10 нуклеотидов, предпочтительно не более 8 нуклеотидов, предпочтительнее не более 6 нуклеотидов, еще предпочтительнее не более 4, 3 или 2 нуклеотидов с обеих сторон от точки ошибочного спаривания. ! 4. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором 2, предпочтительнее 3, еще предпочтительнее 4, еще предпочтительнее 5 и наиболее предпочтительно 6 нуклеотидов представляют собой LNA. ! 5.

Claims (27)

1. Олигонуклеотид для направленного изменения последовательности дуплексной ДНК, содержащей первую последовательность ДНК и вторую последовательность ДНК, которая комплементарна первой последовательности ДНК, где олигонуклеотид содержит домен, способный гибридизироваться с первой последовательностью ДНК, где домен содержит по меньшей мере одно ошибочное спаривание по отношению к первой последовательности ДНК, и где олигонуклеотид содержит по меньшей мере один участок, который содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид, обладающий большей аффинностью связывания по сравнению с природными нуклеотидами A, C, T или G, причем по меньшей мере один модифицированный нуклеотид представляет собой LNA и расположен на расстоянии по меньшей мере одного нуклеотида от по меньшей мере одной точки ошибочного спаривания, и где необязательно олигонуклеотид содержит не более приблизительно 75% модифицированных нуклеотидов LNA.
2. Олигонуклеотид по п.1, в котором по меньшей мере 2, предпочтительно по меньшей мере 3, предпочтительнее по меньшей мере 4, еще предпочтительнее по меньшей мере 5 и наиболее предпочтительно по меньшей мере 6 нуклеотидов представляют собой LNA.
3. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором LNA распределены независимо на расстоянии не более 10 нуклеотидов, предпочтительно не более 8 нуклеотидов, предпочтительнее не более 6 нуклеотидов, еще предпочтительнее не более 4, 3 или 2 нуклеотидов с обеих сторон от точки ошибочного спаривания.
4. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором 2, предпочтительнее 3, еще предпочтительнее 4, еще предпочтительнее 5 и наиболее предпочтительно 6 нуклеотидов представляют собой LNA.
5. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором не более 50% модифицированных нуклеотидов олигонуклеотида представляют собой производные LNA, предпочтительнее не более 40%, еще предпочтительнее не более 30%, еще предпочтительнее не более 20% и наиболее предпочтительно не более 10%.
6. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеотид независимо расположен с 5'- стороны и/или с 3'-стороны от точки ошибочного спаривания.
7. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором два модифицированных нуклеотида LNA расположены с одной 5'- или 3'-стороны от точки ошибочного спаривания и отделены друг от друга по меньшей мере одной, предпочтительнее по меньшей мере двумя парами оснований.
8. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором нуклеотид в положении ошибочного спаривания не модифицирован.
9. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеотид расположен не рядом с точкой ошибочного спаривания, а предпочтительно находится от точки ошибочного спаривания на расстоянии 2, 3, 4, 6, 7, 8, 9 или 10 нуклеотидов.
10. Олигонуклеотид по п.1 или 2, имеющий длину от 10 до 500 нуклеотидов.
11. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором модифицированный участок представляет собой домен.
12. Способ направленного изменения последовательности дуплексной акцепторной ДНК, включающий комбинирование последовательности дуплексной акцепторной ДНК с донорным олигонуклеотидом, в котором последовательность дуплексной акцепторной ДНК содержит первую последовательность ДНК и вторую последовательность ДНК, которая комплементарна первой последовательности ДНК, а донорный олигонуклеотид включает домен, который содержит по меньшей мере одно ошибочное спаривание по отношению к последовательности дуплексной акцепторной ДНК, подлежащей изменению, предпочтительно по отношению к первой последовательности ДНК, и в котором олигонуклеотид содержит участок, который содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид, обладающий более высокой аффинностью связывания по сравнению с природными A, C, T или G, причем модифицированный нуклеотид прочнее связывается с нуклеотидом в противоположном положении в первой последовательности ДНК по сравнению с природным нуклеотидом, комплементарным нуклеотиду в противоположном положении в первой последовательности ДНК, в присутствии белков, способных осуществлять направленную замену нуклеотидов, где модифицированный олигонуклеотид определен в пп.1-11.
13. Способ по п.12, в котором изменение происходит внутри клетки, предпочтительно выбранной из группы, которая состоит из растительной клетки, клетки гриба, клетки грызуна, клетки примата, клетки человека и дрожжевой клетки.
14. Способ по п.12, в котором белки получены из клеточного экстракта.
15. Способ по п.14, в котором клеточный экстракт выбран из группы, состоящей из экстракта растительных клеток, экстракта клеток грибов, экстракта клеток грызунов, экстракта клеток приматов, экстракта клеток человека и экстракта дрожжевых клеток.
16. Способ по п.12, в котором изменение представляет собой делецию, замещение или инсерцию по меньшей мере одного нуклеотида.
17. Способ по любому из предыдущих пунктов, в котором клетка является эукариотической клеткой, растительной клеткой, нечеловеческой клеткой, клеткой млекопитающего или клеткой человека.
18. Способ по любому из пп.12-16, в котором ДНК-мишень происходит от грибов, бактерий, растений, млекопитающих или человека.
19. Способ по любому из пп.12-16, в котором дуплексная ДНК происходит из геномной ДНК, линейной ДНК, искусственных хромосом млекопитающих, бактериальных искусственных хромосом, дрожжевых искусственных хромосом, растительных искусственных хромосом, ядерной хромосомной ДНК, хромосомной ДНК органелл, эписомной ДНК.
20. Способ по любому из пп.12-16 для изменения клетки, исправления мутации с возвратом к дикому типу, индуцирования мутации, инактивирующей фермент за счет разрушения кодирующей области, модифицирования биологической активности фермента за счет изменения кодирующей области, модифицирования белка за счет разрушения кодирующей области.
21. Применение олигонуклеотида, определенного в пп.1-12, для изменения клетки, для исправления мутации с возвратом к дикому типу, для индуцирования мутации, инактивирующей фермент за счет разрушения кодирующей области, для модифицирования биологической активности фермента за счет изменения кодирующей области, для модифицирования белка за счет разрушения кодирующей области, для репарации ошибок спаривания, для направленного изменения генетического материала (растений), для включения генной мутации, направленной репарации генов и генного нокаута.
22. Применение олигонуклеотида, определенного в пп.1-12, для улучшенного направленного изменения последовательности дуплексной ДНК, где последовательность дуплексной ДНК содержит первую последовательность ДНК и вторую последовательность ДНК, которая комплементарна первой последовательности ДНК, где олигонуклеотид содержит домен, способный гибридизироваться с первой последовательностью ДНК, причем домен содержит по меньшей мере одно ошибочное спаривание по отношению к первой последовательности ДНК, и где олигонуклеотид содержит участок, который содержит модифицированные нуклеотиды, причем модифицированные нуклеотиды обладают более высокой аффинностью связывания по сравнению с природными A, C, T или G, где модифицированные нуклеотиды прочнее связываются с нуклеотидом в противоположном положении в первой последовательности ДНК по сравнению с природным нуклеотидом, комплементарным нуклеотиду в противоположном положении в первой последовательности ДНК, где модифицированный нуклеотид представляет собой LNA.
23. Применение олигонуклеотида, определенного в пп.1-11, в способе создания у растений устойчивости к гербицидам.
24. Набор, содержащий олигонуклеотид, определенный в пп.1-11.
25. Модифицированный генетический материал, полученный способом по пп.12-20.
26. Клетка, содержащая модифицированный генетический материал по п.25.
27. Растение или часть растения, полученные способом по пп.11-20 или содержащие генетический материал по п.25.
RU2008130089/10A 2005-12-22 2006-12-21 Улучшенная направленная замена нуклеотидов модифицированными олигонуклеотидами lna RU2463350C2 (ru)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
NLPCT/NL2005/000884 2005-12-22
PCT/NL2005/000884 WO2007073149A1 (en) 2005-12-22 2005-12-22 Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange
PCT/NL2006/000244 WO2007073154A1 (en) 2005-12-22 2006-05-09 Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange
NLPCT/NL2006/000244 2006-05-09

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2008130089A true RU2008130089A (ru) 2010-01-27
RU2463350C2 RU2463350C2 (ru) 2012-10-10

Family

ID=36691461

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008130093/13A RU2008130093A (ru) 2005-12-22 2006-12-20 Улучшенный направленный обмен нуклеотидов с пропинил-модифицированными олигонуклеотидами
RU2008130089/10A RU2463350C2 (ru) 2005-12-22 2006-12-21 Улучшенная направленная замена нуклеотидов модифицированными олигонуклеотидами lna

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008130093/13A RU2008130093A (ru) 2005-12-22 2006-12-20 Улучшенный направленный обмен нуклеотидов с пропинил-модифицированными олигонуклеотидами

Country Status (15)

Country Link
US (3) US20090307805A1 (ru)
EP (4) EP2333115A1 (ru)
JP (3) JP5295780B2 (ru)
KR (2) KR20080092924A (ru)
CN (3) CN101346474B (ru)
AU (2) AU2006328050B2 (ru)
BR (2) BRPI0621134A2 (ru)
CA (2) CA2633741A1 (ru)
ES (2) ES2393277T3 (ru)
IL (2) IL192164A0 (ru)
MX (2) MX2008008258A (ru)
NZ (2) NZ569503A (ru)
RU (2) RU2008130093A (ru)
WO (4) WO2007073149A1 (ru)
ZA (2) ZA200805091B (ru)

Families Citing this family (39)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007073149A1 (en) * 2005-12-22 2007-06-28 Keygene N.V. Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange
KR20100051795A (ko) * 2007-06-22 2010-05-18 키진 엔.브이. 향상된 변형 올리고뉴클레오티드를 이용한 표적화 뉴클레오티드 교환
RU2515110C2 (ru) * 2007-12-21 2014-05-10 Киджин Н.В. Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты
CN103146757B (zh) * 2007-12-21 2016-05-04 凯津公司 通过聚乙二醇的介导将致诱变核碱基引入植物原生质体的改进的诱变方法
JP2012513199A (ja) * 2008-12-22 2012-06-14 キージーン・エン・フェー 植物プロトプラストにおける標的化遺伝子改変の効率を増大させるための二本鎖ｒｎａの使用
CA2951341A1 (en) 2009-12-21 2011-06-30 Keygene N.V. Improved techniques for transfecting protoplasts
AU2011337323B2 (en) * 2010-12-02 2015-11-26 Keygene N.V. Targeted alteration of DNA
ES2536640T3 (es) 2010-12-02 2015-05-27 Keygene N.V. Alteración dirigida de ADN con oligonucleótidos
US20140206850A1 (en) 2011-04-29 2014-07-24 Keygene N.V. Glyphosate resistance enhancement
WO2012174187A2 (en) * 2011-06-15 2012-12-20 Grifols Therapeutics Inc. Methods, compositions, and kits for determining human immunodeficiency virus (hiv)
EP2554045A1 (en) 2011-08-04 2013-02-06 Rijk Zwaan Zaadteelt en Zaadhandel B.V. Method for systemically influencing processes in the male meiocyte
EP2581448B1 (en) * 2011-10-13 2015-01-28 Association Institut de Myologie Tricyclo-phosphorothioate DNA
CN102827251B (zh) * 2012-09-12 2014-06-18 中国人民解放军第四军医大学 一种透膜肽介导的反义抗菌剂及其制备方法和应用
EA032843B9 (ru) 2012-09-28 2019-11-29 Nunhems Bv Растения solanum lycopersicum, имеющие нетрансгенные модификации в гене acs4
EA032773B1 (ru) 2012-11-21 2019-07-31 Нунхемс Б.В. Растения solanum lycopersicum, имеющие нетрансгенные изменения в гене acs2
AU2014211518B2 (en) 2013-01-31 2019-08-01 Nunhems B.V. Solanum lycopersicum plants having pink fruits
US12331303B2 (en) 2013-03-15 2025-06-17 Cibus Us Llc Methods and compositions for increasing efficiency of targeted gene modification using oligonucleotide-mediated gene repair
PL3527068T3 (pl) 2013-03-15 2022-10-10 Cibus Us Llc Sposoby i kompozycje do zwiększania skuteczności ukierunkowanej modyfikacji genu z użyciem naprawy genu, w której pośredniczy oligonukleotyd
US9957515B2 (en) 2013-03-15 2018-05-01 Cibus Us Llc Methods and compositions for targeted gene modification
JP2013247961A (ja) * 2013-08-21 2013-12-12 Keygene Nv 植物細胞プロトプラストにおける二本鎖アクセプタｄｎａ配列の標的化改変の方法
EA201691581A1 (ru) 2014-03-14 2017-02-28 Кибус Юс Ллс Способы и композиции для повышения эффективности направленной модификации генов с применением опосредованной олигонуклеотидами репарации генов
EP4372091A3 (en) * 2014-12-12 2024-07-31 Tod M. Woolf Compositions and methods for editing nucleic acids in cells utilizing oligonucleotides
WO2016105185A1 (en) 2014-12-22 2016-06-30 Keygene N.V. Plant callus populations
AU2016264193B2 (en) 2015-05-19 2022-04-07 The National Centre For Biological Sciences Methods and composition for determining pH
EP3402745B1 (en) * 2015-12-23 2023-07-26 The Regents of the University of California Nano-sensors for nucleic acid detection and discrimination
KR20250117482A (ko) 2016-02-09 2025-08-04 시버스 유에스 엘엘씨 올리고뉴클레오타이드 매개된 유전자 보수를 사용한 표적화된 유전자 변형의 효율을 증가시키기 위한 방법 및 조성물
EP3257944A1 (en) 2016-06-14 2017-12-20 Nunhems B.V. Tomato plants having alterations in the dmr6 gene
WO2018115389A1 (en) 2016-12-22 2018-06-28 Keygene N.V. Methods of targeted genetic alteration in plant cells
AU2019207703B2 (en) 2018-01-09 2024-11-14 Cibus Europe B.V. Shatterproof genes and mutations
CA3095047A1 (en) 2018-04-04 2019-10-10 Cibus Us Llc Fad2 genes and mutations
NL2020823B1 (en) 2018-04-25 2019-11-05 Univ Delft Tech NAD+ dependent 7ß-hydroxysteroid dehydrogenase
EP3363751B1 (de) 2018-06-05 2020-04-22 B&R Industrial Automation GmbH Verfahren zur übergabe einer transporteinheit eines langstatorlinearmotors an einer übergabeposition
WO2020011985A1 (en) 2018-07-12 2020-01-16 Keygene N.V. Type v crispr/nuclease-system for genome editing in plant cells
US20220010321A1 (en) 2018-11-01 2022-01-13 Keygene N.V. Dual guide rna for crispr/cas genome editing in plants cells
CN114262735B (zh) * 2021-12-15 2025-09-16 成都齐碳科技有限公司 用于表征多核苷酸的衔接体及其用途
WO2023168273A2 (en) * 2022-03-01 2023-09-07 Colorado State University Research Foundation Targeted control of weeds and invasive plants by delivery of fana antisense oligonucleotides
US20250215424A1 (en) * 2022-03-30 2025-07-03 National Institute Of Advanced Industrial Science And Technology Single-strand form polynucleotide and use thereof in genome editing
JP7660960B2 (ja) * 2023-04-26 2025-04-14 Ｅｕｒｕｓ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ株式会社 標的ヌクレオチド配列の改変のための非天然型ポリヌクレオチド
WO2025110249A1 (ja) * 2023-11-24 2025-05-30 国立大学法人 広島大学 塩基配列編集用組成物およびそれを使用する塩基配列編集方法

Family Cites Families (29)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US645249A (en) * 1899-06-10 1900-03-13 Us Fire And Police Telegraph Company Bell-striker.
US5849482A (en) * 1988-09-28 1998-12-15 Epoch Pharmaceuticals, Inc. Crosslinking oligonucleotides
DK51092D0 (da) 1991-05-24 1992-04-15 Ole Buchardt Oligonucleotid-analoge betegnet pna, monomere synthoner og fremgangsmaade til fremstilling deraf samt anvendelser deraf
US5539082A (en) 1993-04-26 1996-07-23 Nielsen; Peter E. Peptide nucleic acids
MX9207334A (es) 1991-12-18 1993-08-01 Glaxo Inc Acidos nucleicos peptidicos y formulacion farma- ceutica que los contiene
US5731181A (en) 1996-06-17 1998-03-24 Thomas Jefferson University Chimeric mutational vectors having non-natural nucleotides
ES2192672T3 (es) 1996-11-18 2003-10-16 Takeshi Imanishi Nuevos analogos de nucleotidos.
JP3756313B2 (ja) 1997-03-07 2006-03-15 武 今西 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
WO1999013108A1 (en) * 1997-09-10 1999-03-18 University Of Maryland, Baltimore Method of amplifying dna and rna mismatch cleavage products
AU9063398A (en) 1997-09-12 1999-04-05 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US6010907A (en) * 1998-05-12 2000-01-04 Kimeragen, Inc. Eukaryotic use of non-chimeric mutational vectors
DE69932346T2 (de) * 1998-10-26 2007-07-05 Avi Biopharma, Inc., Portland Auf Morpholin basierendes p53-Antisense- Oligonucleotid und dessen Verwendungen
WO2000056748A1 (en) 1999-03-18 2000-09-28 Exiqon A/S Xylo-lna analogues
DK1178999T3 (da) 1999-05-04 2007-08-06 Santaris Pharma As L-RIBO-LNA-analoger
ES2261270T3 (es) * 1999-12-30 2006-11-16 K.U. LEUVEN RESEARCH & DEVELOPMENT Acidos nucleicos que contienen ciclohexeno.
US6936467B2 (en) 2000-03-27 2005-08-30 University Of Delaware Targeted chromosomal genomic alterations with modified single stranded oligonucleotides
AP2002002638A0 (en) * 2000-03-27 2002-09-30 Univ Delaware Targeted chromosomal genomic alternations with modified single stranded oligonucleotides.
EP1152058A1 (en) * 2000-05-03 2001-11-07 Institut Curie Methods and compositions for effecting homologous recombination
EP1284985A2 (en) 2000-05-17 2003-02-26 University Of Delaware Plant gene targeting using oligonucleotides
HUP0301833A3 (en) * 2000-07-19 2005-12-28 Bristol Myers Squibb Pharma Co Crf2 ligands in combination therapy
NZ524366A (en) 2000-07-27 2005-12-23 Univ Delaware Methods for enhancing targeted gene alteration using oligonucleotides
WO2002026967A2 (en) * 2000-09-25 2002-04-04 Thomas Jefferson University Targeted gene correction by single-stranded oligodeoxynucleotides
US20050148530A1 (en) * 2002-02-20 2005-07-07 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of vascular endothelial growth factor and vascular endothelial growth factor receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
AU2002341905A2 (en) 2001-09-27 2003-04-07 University Of Delaware Composition and methods for enhancing oligonucleotide-directed nucleic acid sequence alteration
DK2264172T3 (da) * 2002-04-05 2017-11-27 Roche Innovation Ct Copenhagen As Oligomerforbindelser til modulering af HIF-1á-ekspression
AU2003251986A1 (en) * 2002-07-17 2004-02-02 U.S.Genomics, Inc. Methods and compositions for analyzing polymers using chimeric tags
DK1633767T3 (en) * 2003-06-02 2019-03-25 Univ Massachusetts METHODS AND COMPOSITIONS FOR MANAGING THE EFFECT OF RNA SILENCING
US20050267059A1 (en) * 2003-11-14 2005-12-01 Diana Beardsley Syk-targeted nucleic acid interference
WO2007073149A1 (en) * 2005-12-22 2007-06-28 Keygene N.V. Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange

Also Published As

Publication number Publication date
CN101346465B (zh) 2013-06-12
AU2006328054A1 (en) 2007-06-28
AU2006328050A1 (en) 2007-06-28
EP2002001B1 (en) 2013-03-13
JP5295780B2 (ja) 2013-09-18
ZA200805141B (en) 2009-09-30
KR20080083179A (ko) 2008-09-16
EP1974053A1 (en) 2008-10-01
CN101346474A (zh) 2009-01-14
JP5340742B2 (ja) 2013-11-13
JP2009520498A (ja) 2009-05-28
NZ569503A (en) 2011-12-22
US20100186124A1 (en) 2010-07-22
AU2006328050B2 (en) 2012-12-06
BRPI0621133A2 (pt) 2011-11-29
MX2008008261A (es) 2008-09-24
EP2002001A1 (en) 2008-12-17
EP1963505B1 (en) 2012-08-22
RU2008130093A (ru) 2010-01-27
KR20080092924A (ko) 2008-10-16
CN101346466B (zh) 2013-06-12
JP2009520499A (ja) 2009-05-28
JP2009520495A (ja) 2009-05-28
US20100055780A1 (en) 2010-03-04
JP5405121B2 (ja) 2014-02-05
IL192164A0 (en) 2008-12-29
ZA200805091B (en) 2009-06-24
ES2393277T3 (es) 2012-12-20
NZ569502A (en) 2011-12-22
ES2407679T3 (es) 2013-06-13
CN101346474B (zh) 2013-06-26
AU2006328054B2 (en) 2012-12-13
RU2463350C2 (ru) 2012-10-10
US20090307805A1 (en) 2009-12-10
CA2633741A1 (en) 2007-06-28
CN101346466A (zh) 2009-01-14
BRPI0621134A2 (pt) 2011-11-29
EP1963505A1 (en) 2008-09-03
WO2007073154A1 (en) 2007-06-28
IL192165A0 (en) 2008-12-29
MX2008008258A (es) 2008-09-24
CN101346465A (zh) 2009-01-14
CA2633640A1 (en) 2007-06-28
WO2007073166A1 (en) 2007-06-28
WO2007073170A1 (en) 2007-06-28
EP2333115A1 (en) 2011-06-15
WO2007073149A1 (en) 2007-06-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2008130089A (ru) Улучшенная направленная замена нуклеотидов модифицированными олигонуклеотидами lna
Sabir et al. Evolutionary and biotechnology implications of plastid genome variation in the inverted‐repeat‐lacking clade of legumes
Rushworth et al. Boechera, a model system for ecological genomics
Lusser et al. New plant breeding techniques. State-of-the-art and prospects for commercial development
RU2010101882A (ru) Направленная нуклеотидная замена при применении улучшенных модифицированных олигонуклеотидов
BR112020010451A2 (pt) métodos e composições para tolerância a herbicida de ppo
ES2562497T3 (es) Trigo y cebada con mayor tolerancia a la salinidad
ATE506438T1 (de) Herbizidresistenz verleihende gene
EP2078754A3 (en) GRG23 and GRG51 genes conferring herbicide resistance
Mengistu et al. A psbA mutation in Kochia scoparia (L) Schrad from railroad rights‐of‐way with resistance to diuron, tebuthiuron and metribuzin
Gianoglio et al. The genome-wide identification and transcriptional levels of DNA methyltransferases and demethylases in globe artichoke
BRPI0519683A2 (pt) genes que conferem resistÊncia ao herbicida
Greg Non-transgenic trait development in crop plants using oligo-directed mutagenesis: Cibus’ rapid trait development system
Van Straalen et al. Micro-evolution of toxicant tolerance: from single genes to the genome’s tangled bank
Ribeiro et al. Multiple Origins or Widespread Gene Flow in Agricultural Fields? Regional Population Genomics of Herbicide Resistance in Bromus tectorum
Asiegbu et al. Biotechnology Applications in Forestry: Forest Microbiology Volume 4
Kim et al. Evolutionary dynamics and lateral gene transfer in raphidophyceae plastid genomes
Shahiba et al. Modern Approaches in Plant Breeding Enhancing Crop Genetics
GLAZKO et al. Domestication is the proprietary case of evolution: about the universality of principles and elements
Palumbo et al. First genomic insights into the Mandevilla genus
Tomáška et al. Co-evolution in the jungle: From leafcutter ant colonies to chromosomal ends
Stranger et al. Nucleotide variation at the myrosinase‐encoding locus, TGG1, and quantitative myrosinase enzyme activity variation in Arabidopsis thaliana
Smith et al. Maize breeding
Epstein Unlocking the Genetic Diversity of Maize: Meiotic Recombination as a Driver of Evolution and Breeding Potential
Lujan Toro Genome Assembly of Camelina microcarpa Andrz. Ex DC, A step towards understanding genome evolution in Camelina

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20131222