TW201512222A

TW201512222A - 使用人類化抗－ｃｄ１９嵌合抗原受體治療癌症

Info

Publication number: TW201512222A
Application number: TW103109821A
Authority: TW
Inventors: Jennifer Brogdon; Carl H June; Andreas Loew; Marcela Maus; John Scholler
Original assignee: Novartis Ag; Univ Pennsylvania
Priority date: 2013-03-16
Filing date: 2014-03-14
Publication date: 2015-04-01
Also published as: US10221245B2; US10927184B2; EP4067382A1; RU2711975C2; HUE042803T2; TWI654206B; IL241261A0; CN115287292A; PL3539986T3; JP7439002B2; MX2015013194A; ES2734549T3; SI3539986T1; JP2019106995A; AU2014236098A8; SG11201506603PA; LT2970482T; AU2014236098B2; AU2019216689C1; LT3539986T

Abstract

本發明提供用於治療與CD19表現相關疾病的組合物及方法。本發明亦關於對CD19具有特異性的嵌合抗原受體(CAR)、編碼該受體之載體，及包含CD19 CAR的重組T細胞。本發明亦包括投與經基因修飾之T細胞的方法，該T細胞表現包含CD19結合域的CAR。

Description

使用人類化抗-CD19嵌合抗原受體治療癌症

本申請案主張2013年3月16日提申之美國第61/802,629號及2013年6月24日提申之美國第61/838,537號的優先權，該等申請案中之每一者的完整內容以引用的方式併入本文中。

序列表

本申請案含有序列表，該序列表已以ASCII格式電子提交且以全文引用的方式併入本文中。2014年3月10日生成的該ASCII複本名為N2067-7002WO_SL.txt且大小為219,793個位元組。

本發明大體係關於經工程改造以表現嵌合抗原受體(CAR)的T細胞用於治療與分化叢集19蛋白(CD19)表現相關之疾病的用途。

患有B細胞惡性疾病的許多患者用標準療法無法治癒。另外，傳統治療方案往往具有嚴重的副作用。已嘗試癌症免疫療法，然而若干障礙使得其達成臨床有效性的目標很難實現。雖然已鑑別出好幾百種所謂的腫瘤抗原，但是此等腫瘤抗原一般來源於自身且因此免疫原性不足。此外，腫瘤係利用使自身對免疫攻擊之起始及傳播變得有敵意的若干機制。

近期發展係使用經嵌合抗原受體(CAR)修飾之自體T細胞(CART)療法，該療法依賴於將T細胞再導向癌細胞(諸如B細胞惡性疾病)上的適合細胞表面分子，顯示出可駕馭免疫系統之力量來治療B細胞惡性疾病及其他癌症的前景(參見例如Sadelain等人，Cancer Discovery 3：388-398(2013))。鼠源CART19(亦即「CTL019」)的臨床結果已顯示出使罹患CLL以及幼年期ALL之患者完全緩解的前景(參見例如Kalos等人，Sci Transl Med 3：95ra73(2011),Porter等人，NEJM 365：725-733(2011),Grupp等人，NEJM 368：1509-1518(2013))。除遺傳修飾T細胞上之嵌合抗原受體能夠識別及摧毀靶細胞之外，成功的治療性T細胞療法必需能夠持久增殖及進一步監視逃逸的白血病細胞。T細胞之品質變化，不論其為能力缺失、抑止或耗竭的結果，對於CAR轉型之T細胞效能均有影響，但熟練執業者此時對影響的控制有限。為了達成有效性，CAR轉型的患者T細胞必需持久維持增殖的能力，以回應CAR抗原。已顯示ALL患者T細胞效能可用包含鼠科scFv的CART19實現(參見例如Grupp等人，NEJM 368：1509-1518(2013))。

本發明藉由提供結合分化叢集19蛋白(CD19)之經最佳化且人類化的抗體片段(例如scFv)而解決患者免疫反應之控制，該分化叢集19蛋白整合至嵌合抗原受體(CAR)構築體中，從而不會引起患者之免疫反應，可長期安全使用，且維持或具有比已知用於治療B細胞源癌症之CART療法更好的臨床有效性。本發明進一步關於經工程改造以表現結合CD19之人類化抗體片段之T細胞用於治療與CD19表現相關之血液癌症的用途(OMIM寄存號107265，Swiss Prot.寄存號P15391)。

因此，在一個態樣中，本發明係關於編碼嵌合抗原受體(CAR)的分離核酸分子，其中CAR包含抗體或抗體片段，該抗體或抗體片段包括人類化抗-CD19結合域、跨膜域及胞內信號傳導域(例如包含共刺激域及/或初級信號傳導域的胞內信號傳導域)。在一個實施例中，CAR包含抗體或抗體片段，該抗體或抗體片段包括本文所述的人類化抗- CD19結合域、本文所述的跨膜域及本文所述的胞內信號傳導域(例如包含共刺激域及/或初級信號傳導域的胞內信號傳導域)。

在一個實施例中，所編碼的人類化抗-CD19結合域包含本文所述之人類化抗-CD19結合域的一或多個(例如全部三個)輕鏈互補決定區1(LC CDR1)、輕鏈互補決定區2(LC CDR2)及輕鏈互補決定區3(LC CDR3)，及/或本文所述之人類化抗-CD19結合域的一或多個(例如全部三個)重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)，例如人類化抗-CD19結合域包含一或多個(例如全部三個)LC CDR及一或多個(例如全部三個)HC CDR。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域至少包含HC CDR2。在一個實施例中，所編碼的人類化抗-CD19結合域包含本文所述之人類化抗-CD19結合域的一或多個(例如全部三個)重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)，例如所編碼的人類化抗-CD19結合域具有兩個各包含本文所述之HC CDR1、HC CDR2及HC CDR3的重鏈可變區。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域至少包含HC CDR2。在一個實施例中，所編碼之輕鏈可變區包含VK3_L25生殖系序列之一個、兩個、三個或全部四個構架區。在一個實施例中，所編碼之輕鏈可變區具有修飾(例如取代，例如SEQ ID NO：58之輕鏈可變區之相應位置中所發現之一或多個胺基酸的取代，例如位置71及87之一或多個位置上的取代)。在一個實施例中，所編碼之重鏈可變區包含VH4_4-59生殖系序列之一個、兩個、三個或全部四個構架區。在一個實施例中，所編碼之重鏈可變區具有修飾(例如取代，例如SEQ ID NO：58之重鏈可變區之相應位置中所發現之一或多個胺基酸的取代，例如位置71、73及78之一或多個位置上的取代)。在一個實施例中，所編碼之人類化抗-CD19結合域包含本文所述的人類化輕鏈可變區(例如表3中)及/或本文所述的人類化重鏈可變區(例如表3中)。在一個實施例中，所編碼之人類化抗-CD19結合域包含本文所述的人類化重鏈可變區(例如表3中)，例如至少兩個本文所述人類化重鏈可變區(例如表3中)。在一個實施例中，所編碼之抗-CD19結合域為包含表3之胺基酸序列之輕鏈及重鏈的scFv。在一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)包含：輕鏈可變區，該輕鏈可變區包含具有表3中所提供之輕鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過30個、20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與表3之胺基酸序列95-99%一致的序列；及/或重鏈可變區，該重鏈可變區包含具有表3中所提供之重鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)，但不超過30個、20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與表3之胺基酸序列95-99%一致的序列。在一個實施例中，所編碼之人類化抗-CD19結合域包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，編碼人類化抗-CD19結合域的核酸序列包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：62、SEQ ID NO：63、SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：65、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：68、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：71及SEQ ID NO：72，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，所編碼之人類化抗-CD19結合域為scFv，且包含本文所述胺基酸序列(例如表3中)的輕鏈可變區經由連接子(例如本文所述的連接子)連接至包含本文所述胺基酸序列(例如表3中)的重鏈可變區。在一個實施例中，所編碼之人類化抗-CD19結合域包括(Gly₄-Ser)n連接子，其中n為1、2、3、4、5或6，較佳為3或4(SEQ ID NO：53)。scFv之輕鏈可變區及重鏈可變區可呈例如任一種以下取向：輕鏈可變區-連接子-重鏈可變區，或重鏈可變區-連接子-輕鏈可變區。

在一個實施例中，所編碼之跨膜域為選自由以下組成之群之蛋白質的跨膜域：T細胞受體CD27、CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137及CD154之α、β或ξ鏈。在一個實施例中，所編碼之跨膜域包含SEQ ID NO：15之序列。在一個實施例中，所編碼之跨膜域包含具有SEQ ID NO：15之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過20個、10個或5個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：15之胺基酸序列95-99%一致的序列。在一個實施例中，編碼跨膜域的核酸序列包含SEQ ID NO：56之序列，或與其95-99%一致的序列。

在一個實施例中，所編碼之抗-CD19結合域經由鉸鏈區(例如本文所述的鉸鏈區)連接至跨膜域。在一個實施例中，所編碼之鉸鏈區包含SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：45或SEQ ID NO：47，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，編碼鉸鏈區的核酸序列包含SEQ ID NO：55或SEQ ID NO：46或SEQ ID NO：48之序列，或與其95-99%一致的序列。

在一個實施例中，分離核酸分子進一步包含編碼共刺激域的序列。在一個實施例中，共刺激域為獲自選自由以下組成之群之蛋白質的功能信號傳導域：OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)及4-1BB(CD137)。在一個實施例中，所編碼之共刺激域包含SEQ ID NO：16之序列。在一個實施例中，所編碼之共刺激域包含具有SEQ ID NO：16之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過20個、10個或5個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：16之胺基酸序列95-99% 一致的序列。在一個實施例中，編碼共刺激域的核酸序列包含SEQ ID NO：60之序列，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，分離核酸分子進一步包含編碼胞內信號傳導域(例如本文所述的胞內信號傳導域)的序列。在一個實施例中，所編碼之胞內信號傳導域包含4-1BB之功能信號傳導域及/或CD3ξ之功能信號傳導域。在一個實施例中，所編碼之胞內信號傳導域包含CD27之功能信號傳導域及/或CD3ξ之功能信號傳導域。在一個實施例中，所編碼之胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含具有SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之胺基酸序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過20個、10個或5個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之胺基酸序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之胺基酸序列95-99%一致的序列。在一個實施例中，所編碼之胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之序列及SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列，其中組成胞內信號傳導域的該等序列係以單一多肽鏈形式同框表現。在一個實施例中，編碼胞內信號傳導域的核酸序列包含SEQ ID NO：60之序列，或與其95-99%一致的序列；及/或SEQ ID NO：101或SEQ ID NO：44之序列，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，編碼胞內信號傳導域的核酸序列包含SEQ ID NO：52之序列，或與其95-99%一致的序列；及/或SEQ ID NO：101或SEQ ID NO：44之序列，或與其95-99%一致的序列。

在另一個態樣中，本發明係關於編碼CAR構築體的分離核酸分子，該CAR構築體包含前導序列，例如本文所述之前導序列，例如SEQ ID NO：13之前導序列；本文所述的人類化抗-CD19結合域，例如包含本文所述LC CDR1、LC CDR2、LC CDR3、HC CDR1、HC CDR2及HC CDR3的人類化抗-CD19結合域，例如表3中所述的人類化抗-CD19結合域，或與其95-99%一致的序列；本文所述的鉸鏈區，例如SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：45之鉸鏈區；本文所述的跨膜域，例如包含SEQ ID NO：15之跨膜域；及胞內信號傳導域，例如本文所述的胞內信號傳導域。在一個實施例中，所編碼之胞內信號傳導域包含共刺激域，例如本文所述的共刺激域，例如具有SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之序列的4-1BB共刺激域；及/或初級信號傳導域，例如本文所述的初級信號傳導域，例如具有SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列的CD3ξ刺激域。在一個實施例中，編碼CAR構築體的分離核酸分子包括由SEQ ID NO：54之核酸序列或與其95-99%一致序列編碼的前導序列。在一個實施例中，編碼CAR構築體的分離核酸分子包含由SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：62、SEQ ID NO：63、SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：65、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：71及SEQ ID NO：72之核酸序列或與其95-99%一致序列編碼的人類化抗-CD19結合域序列。在一個實施例中，編碼CAR構築體的分離核酸分子包括由SEQ ID NO：56之核酸序列或與其95-99%一致序列編碼的跨膜序列。在一個實施例中，編碼CAR構築體的分離核酸分子包括由SEQ ID NO：60之核酸序列或與其95-99%一致序列編碼的胞內信號傳導域序列；及/或由SEQ ID NO：101或SEQ ID NO：44之核酸序列或與其95-99%一致序列編碼的胞內信號傳導域序列。

在一個實施例中，分離核酸分子包含(例如由以下組成)編碼以下之核酸：SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41或SEQ ID NO：42之CAR胺基酸序列，或具有SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41或SEQ ID NO：42之胺基酸序列之至少1個、2個、3個、4個、5個、10個、15個、20個或30個修飾(例如取代)、但不超過60個、50個或40個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41或SEQ ID NO：42之胺基酸序列具有85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致性的胺基酸序列。

在一個實施例中，分離核酸分子包含(例如由以下組成)：SEQ ID NO：85、SEQ ID NO：86、SEQ ID NO：87、SEQ ID NO：88、SEQ ID NO：89、SEQ ID NO：90、SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：92、SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：94、SEQ ID NO：95或SEQ ID NO：96之核酸序列，或與SEQ ID NO：85、SEQ ID NO：86、SEQ ID NO：87、SEQ ID NO：88、SEQ ID NO：89、SEQ ID NO：90、SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：92、SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：94、SEQ ID NO：95或SEQ ID NO：96之核酸序列具有85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致性的核酸序列。

在一個態樣中，本發明係關於編碼人類化抗-CD19結合域的分離核酸分子，其中抗-CD19結合域包含本文所述抗-CD19結合域之一或多個(例如全部三個)輕鏈互補決定區1(LC CDR1)、輕鏈互補決定區2(LC CDR2)及輕鏈互補決定區3(LC CDR3)，及本文所述抗-CD19結合域之一或多個(例如全部三個)重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)，例如人類化抗-CD19結合域包含一或多個(例如全部三個)LC CDR及一或多個(例如全部三個)HC CDR。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域至少包含HC CDR2。在一個實施例中，輕鏈可變區包含VK3_L25生殖系序列之一個、兩個、三個或全部四個構架區。在一個實施例中，輕鏈可變區具有修飾(例如取代，例如SEQ ID NO：58之鼠科輕鏈可變區之相應位置中所發現之一或多個胺基酸的取代，例如位置71及87之一或多個位置上的取代)。在一個實施例中，重鏈可變區包含VH4_4-59生殖系序列之一個、兩個、三個或全部四個構架區。在一個實施例中，重鏈可變區具有修飾(例如取代，例如SEQ ID NO：58之鼠科重鏈可變區之相應位置中所發現之一或多個胺基酸的取代，例如位置71、73及78之一或多個位置上的取代)。在一個實施例中，所編碼之人類化抗-CD19結合域包含本文所述的輕鏈可變區(例如SEQ ID NO：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12)及/或本文所述的重鏈可變區(例如SEQ ID NO：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12)。在一個實施例中，所編碼之人類化抗-CD19結合域為包含SEQ ID NO：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12胺基酸序列之輕鏈及重鏈的scFv。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域(例如scFv)包含：輕鏈可變區，該輕鏈可變區包含具有SEQ ID NO：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12中所提供之輕鏈可變區之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過30個、20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12之胺基酸序列具有95-99%一致性的序列；及/或重鏈可變區，該重鏈可變區包含具有SEQ ID NO：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12中所提供之重鏈可變區之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過30個、20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：1、2、3、4、5、6、7、8、9、 10、11或12之胺基酸序列具有95-99%一致性的序列。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12，與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，編碼人類化抗-CD19結合域的核酸序列包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：62、SEQ ID NO：63、SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：65、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：68、SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：71及SEQ ID NO：72，或與其95-99%一致的序列。

在另一個態樣中，本發明係關於由核酸序列編碼的分離多肽分子。在一個實施例中，分離多肽分子包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41及SEQ ID NO：42。在一個實施例中，分離多肽包含SEQ ID NO：31之序列。在一個實施例中，分離多肽包含SEQ ID NO：32之序列。在一個實施例中，分離多肽分子包含SEQ ID NO：35之序列。在一個實施例中，分離多肽分子包含SEQ ID NO：36之序列。在一個實施例中，分離多肽分子包含SEQ ID NO：37之序列。

在另一個態樣中，本發明係關於分離的嵌合抗原受體(CAR)分子，其包含人類化抗-CD19結合域(例如特異性結合至CD19的人類化抗體或抗體片段)、跨膜域及胞內信號傳導域(例如包含共刺激域及/或初級信號傳導域的胞內信號傳導域)。在一個實施例中，CAR包含抗體或抗體片段，該抗體或抗體片段包括本文所述的人類化抗-CD19結合域(例如如本文所述特異性結合至CD19的人類化抗體或抗體片段)、本文所述的跨膜域及本文所述的胞內信號傳導域(例如如本文所述包含共刺激域及/或初級信號傳導域的胞內信號傳導域)。

在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含本文所述之人類化抗-CD19結合域的一或多個(例如全部三個)輕鏈互補決定區1(LC CDR1)、輕鏈互補決定區2(LC CDR2)及輕鏈互補決定區3(LC CDR3)，及/或本文所述之人類化抗-CD19結合域的一或多個(例如全部三個)重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)，例如人類化抗-CD19結合域包含一或多個(例如全部三個)LC CDR及一或多個(例如全部三個)HC CDR。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域至少包含HC CDR2。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含本文所述之人類化抗-CD19結合域的一或多個(例如全部三個)重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)，例如人類化抗-CD19結合域具有兩個各包含本文所述之HC CDR1、HC CDR2及HC CDR3的重鏈可變區。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域至少包含HC CDR2。在一個實施例中，輕鏈可變區包含VK3_L25生殖系序列之一個、兩個、三個或全部四個構架區。在一個實施例中，輕鏈可變區具有修飾(例如取代，例如SEQ ID NO：58之鼠科輕鏈可變區之相應位置中所發現之一或多個胺基酸的取代，例如位置71及87之一或多個位置上的取代)。在一個實施例中，重鏈可變區包含VH4_4-59生殖系序列之一個、兩個、三個或全部四個構架區。在一個實施例中，重鏈可變區具有修飾(例如取代，例如SEQ ID NO：58之鼠科重鏈可變區之相應位置中所發現之一或多個胺基酸的取代，例如位置71、73及78之一或多個位置上的取代)。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含本文所述的輕鏈可變區(例如表3中)及/或本文所述的重鏈可變區(例如表3中)。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域為包含表3之胺基酸序列之輕鏈及重鏈的scFv。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域(例如scFv)包含：輕鏈可變區，該輕鏈可變區包含具有表 3中所提供之輕鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過30個、20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與表3之胺基酸序列95-99%一致的序列；及/或重鏈可變區，該重鏈可變區包含具有表3中所提供之重鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)，但不超過30個、20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與表3之胺基酸序列95-99%一致的序列。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域為scFv，且包含本文所述胺基酸序列(例如表3中)的輕鏈可變區經由連接子(例如本文所述的連接子)連接至包含本文所述胺基酸序列(例如表3中)的重鏈可變區。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包括(Gly₄-Ser)n連接子，其中n為1、2、3、4、5或6，較佳為3或4(SEQ ID NO：53)。scFv之輕鏈可變區及重鏈可變區可呈例如任一種以下取向：輕鏈可變區-連接子-重鏈可變區，或重鏈可變區-連接子-輕鏈可變區。

在一個實施例中，分離的CAR分子包含選自由以下組成之群之蛋白質的跨膜域：T細胞受體CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137及CD154之α、β或ξ鏈。在一個實施例中，跨膜域包含SEQ ID NO：15之序列。在一個實施例中，跨膜域包含具有SEQ ID NO：15之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過20個、10個或5個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：15之胺基酸序列95-99%一致的序列。

在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域經由鉸鏈區(例如本文所述的鉸鏈區)連接至跨膜域。在一個實施例中，所編碼之鉸鏈區包含SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：45，或與其95-99%一致的序列。

在一個實施例中，分離的CAR分子進一步包含編碼共刺激域(例如本文所述的共刺激域)的序列。在一個實施例中，共刺激域包含獲自選自由以下組成之群之蛋白質的功能信號傳導域：OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)及4-1BB(CD137)。在一個實施例中，共刺激域包含SEQ ID NO：16之序列。在一個實施例中，共刺激域包含SEQ ID NO：51之序列。在一個實施例中，共刺激域包含具有SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過20個、10個或5個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之胺基酸序列95-99%一致的序列。

在一個實施例中，分離的CAR分子進一步包含編碼胞內信號傳導域(例如本文所述的胞內信號傳導域)的序列。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含4-1BB之功能信號傳導域及/或CD3ξ之功能信號傳導域。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16之序列及/或SEQ ID NO：17之序列。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16之序列及/或SEQ ID NO：43之序列。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含CD27之功能信號傳導域及/或CD3ξ之功能信號傳導域。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：51之序列及/或SEQ ID NO：17之序列。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：51之序列及/或SEQ ID NO：43之序列。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含具有SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之胺基酸序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過20個、10個或5個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之胺基酸序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之胺基酸序列95-99%一致的序列。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之序列及SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列，其中組成胞內信號傳導域的該等序列係以單一多肽鏈形式同框表現。

在一個實施例中，分離的CAR分子進一步包含前導序列，例如本文所述的前導序列。在一個實施例中，前導序列包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列，或與SEQ ID NO：13之胺基酸序列95-99%一致的序列。

在另一個態樣中，本發明係關於分離的CAR分子，其包含前導序列，例如本文所述的前導序列，例如SEQ ID NO：13之前導序列，或與其具有95-99%一致性的前導序列；本文所述的人類化抗-CD19結合域，例如包含本文所述之LC CDR1、LC CDR2、LC CDR3、HC CDR1、HC CDR2及HC CDR3的人類化抗-CD19結合域，例如表3中所述的人類化抗-CD19結合域，或與其95-99%一致的序列；鉸鏈區，例如本文所述的鉸鏈區，例如SEQ ID NO：14之鉸鏈區或與其95-99%一致的鉸鏈區；跨膜域，例如本文所述的跨膜域，例如具有SEQ ID NO：15之序列或與其95-99%一致之序列的跨膜域；胞內信號傳導域，例如本文所述的胞內信號傳導域(例如包含共刺激域及/或初級信號傳導域的胞內信號傳導域)。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含共刺激域，例如本文所述的共刺激域，例如具有SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之序列或與其95-99%一致之序列的4-1BB共刺激域；及/或初級信號傳導域，例如本文所述的初級信號傳導域，例如具有SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列或與其具有95-99%一致性之序列的CD3ξ刺激域。

在一個實施例中，分離的CAR分子包含(例如由以下組成)SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41或SEQ ID NO：42之CAR胺基酸序列，或具有SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41或SEQ ID NO：42之胺基酸序列之至少1個、2個、3個、4個、5個、10個、15個、20個或30個修飾(例如取代)、但不超過60個、50個或40個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與胺基酸序列SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41或SEQ ID NO：42之胺基酸序列具有85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致性的胺基酸序列。

在一個態樣中，本發明係關於人類化抗-CD19結合域，其包含本文所述抗-CD19結合域之一或多個(例如全部三個)輕鏈互補決定區1(LC CDR1)、輕鏈互補決定區2(LC CDR2)及輕鏈互補決定區3(LC CDR3)，及本文所述抗-CD19結合域之一或多個(例如全部三個)重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)，例如人類化抗-CD19結合域包含一或多個(例如全部三個)LC CDR及一或多個(例如全部三個)HC CDR。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域至少具有HC CDR2。在一個實施例中，輕鏈可變區包含VK3_L25生殖系序列之一個、兩個、三個或全部四個構架區。在一個實施例中，輕鏈可變區具有修飾(例如取代，例如SEQ ID NO：58之鼠科輕鏈可變區之相應位置中所發現之一或多個胺基酸的取代，例如位置71及87之一或多個位置上的取代)。在一個實施例中，重鏈可變區包含VH4_4-59生殖系序列之一個、兩個、三個或全部四個構架區。在一個實施例中，重鏈可變區具有修飾(例如取代，例如SEQ ID NO：58之重鏈可變區之相應位置中所發現之一或多個胺基酸的取代，例如位置71、73及78之一或多個位置上的取代)。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含本文所述的輕鏈可變區(例如SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12)及/或本文所述的重鏈可變區(例如SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12)。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域為包含SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12之胺基酸序列之輕鏈及重鏈的scFv。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域(例如scFv)包含：輕鏈可變區，該輕鏈可變區包含具有SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12中所提供之輕鏈可變區之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過30個、20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12之胺基酸序列95-99%一致的序列；重鏈可變區，該重鏈可變區包含具有SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12中所提供之重鏈可變區之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過30個、20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12之胺基酸序列95-99%一致的序列。

在另一個態樣中，本發明係關於包含編碼CAR之核酸序列的載體。在一個實施例中，載體係選自由以下組成之群：DNA、RNA、質體、慢病毒載體、腺病毒載體或逆轉錄病毒載體。

在一個實施例中，載體為慢病毒載體。在一個實施例中，載體進一步包含啟動子。在一個實施例中，啟動子為EF-1啟動子。在一個實施例中，EF-1啟動子包含SEQ ID NO：100之序列。

在一個實施例中，載體為活體外轉錄載體，例如使本文所述核酸分子之RNA轉錄的載體。在一個實施例中，載體中之核酸序列進一步包含聚(A)尾，例如本文所述聚A尾，例如包含約150個腺苷酸鹼基的聚A尾(SEQ ID NO：104)。在一個實施例中，載體中之核酸序列進一步包含3'UTR，例如本文所述的3'UTR，例如包含來源於人類β球蛋白之3'UTR之至少一個重複序列的3'UTR。在一個實施例中，載體中之核酸序列進一步包含啟動子，例如T2A啟動子。

在另一個態樣中，本發明係關於包含載體的細胞。在一個實施例中，細胞為人類T細胞。在一個實施例中，細胞為本文所述的細胞，例如人類T細胞，例如本文所述的人類T細胞。在一個實施例中，人類T細胞為CD8+ T細胞。

在另一個實施例中，本文所述的CAR表現細胞可進一步表現另一藥劑，例如使CAR表現細胞之活性增強的藥劑。舉例而言，在一個實施例中，藥劑可為抑制抑制性分子的藥劑。抑制性分子之實例包括 PD1、PD-L1、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及TGFRβ。在一個實施例中，抑制抑制性分子的藥劑包含第一多肽(例如抑制性分子)與向細胞提供陽性信號之第二多肽(例如本文所述的胞內信號傳導域)之結合。在一個實施例中，藥劑包含第一多肽，例如抑制性分子，諸如PD1、LAG3、CTLA4、CD160、BTLA、LAIR1、TIM3、2B4及TIGIT，或其中任一者之片段(例如其中任一者之胞外域之至少一部分)；及第二多肽，該第二多肽為本文所述的胞內信號傳導域(例如包含共刺激域(例如41BB、CD27或CD28，例如如本文所述)及/或初級信號傳導域(例如本文所述的CD3ξ信號傳導域)的胞內信號傳導域)。在一個實施例中，藥劑包含作為第一多肽的PD1或其片段(例如PD1之胞外域的至少一部分)，及作為第二多肽之本文所述胞內信號傳導域(例如本文所述的CD28信號傳導域及/或本文所述的CD3ξ信號傳導域)。在一個實施例中，藥劑為SEQ ID NO：119之多肽，且編碼該藥劑的序列可為例如SEQ ID NO：120之核酸序列。

SEQ ID NO：119‧

SEQ ID NO：120‧

在另一個態樣中，本發明係關於一種製備細胞的方法，包含用含有編碼CAR(例如本文所述的CAR)之核酸的載體轉導T細胞。

本發明亦提供一種產生經RNA工程改造之細胞(例如本文所述的細胞)群的方法，例如短暫表現外源RNA的T細胞。方法包含將活體外轉錄的RNA或合成RNA引入細胞內，其中RNA包含編碼本文所述之CAR分子的核酸。

在另一個態樣中，本發明係關於一種使哺乳動物具有抗腫瘤免疫力的方法，包含向哺乳動物投與有效量之包含CAR分子的細胞，例如表現本文所述CAR分子的細胞。在一個實施例中，細胞為自體T細胞。在一個實施例中，細胞為同種異體T細胞。在一個實施例中，哺乳動物為人類。

在另一個態樣中，本發明係關於一種治療患有與CD19表現相關之疾病之哺乳動物的方法，包含向哺乳動物投與有效量之包含CAR分子(例如本文所述的CAR分子)的細胞。

在一個實施例中，與CD19表現相關的疾病係選自增生性疾病，諸如癌症或惡性疾病或癌前期病狀，諸如骨髓發育不良、骨髓發育不良症候群或白血病前期，或為與CD19表現相關之非癌相關適應症。在一個實施例中，疾病為血液癌症。在一個實施例中，血液癌症為白血病。在一個實施例中，癌症係選自由以下組成之群：一或多種急性白血病，包括(但不限於)B細胞急性淋巴細胞性白血病(「BALL」)、T細胞急性淋巴細胞性白血病(「TALL」)、急性淋巴細胞性白血病(ALL)；一或多種慢性白血病，包括(但不限於)慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴細胞性白血病(CLL)；其他血液癌症或血液病狀，包括(但不限於)B細胞前淋巴細胞性白血病、母細胞性類漿細胞樹突狀細胞贅生物、伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、毛細胞白血病、小細胞或大細胞濾泡性淋巴瘤、惡性淋巴組織增生病狀、MALT淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、邊緣區淋巴瘤、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良及骨髓發育不良症候群、非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin's lymphoma)、漿母細胞性淋巴瘤、類漿細胞樹突狀細胞贅生物、瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症(Waldenstrom macroglobulinemia)，及「白血病前期」(其為血液病狀之多樣化集合合併骨髓血液細胞之無效產生(或發育不良))；以及與CD19表現相關的疾病，包括(但不限於)表現CD19的非典型及非經典癌症、惡性疾病、癌前期病狀或增生性疾病；及其任何組合。

在一個實施例中，利用淋巴細胞輸注(例如同種異體淋巴細胞輸注)來治療癌症，其中淋巴細胞輸注包含至少一個CD19 CAR表現細胞。在一個實施例中，利用自體淋巴細胞輸注來治療癌症，其中自體淋巴細胞輸注包含至少一個CD19表現細胞。

在一個實施例中，將CD19 CAR表現細胞(例如T細胞)投與已接受先前幹細胞移植(例如自體幹細胞移植)的個體。

在一個實施例中，將CD19 CAR表現細胞(例如T細胞)投與已接受先前美法侖(melphalan)劑量的個體。

在一個實施例中，將表現CAR分子(例如本文所述的CAR分子)的細胞與增強表現CAR分子之細胞之功效的藥劑(例如本文所述的藥劑)組合投與。

在一個實施例中，將表現CAR分子(例如本文所述的CAR分子)的細胞與改善一或多種與投與表現CAR分子之細胞相關之副作用的藥劑(例如本文所述的藥劑)組合投與。

在一個實施例中，將表現CAR分子(例如本文所述的CAR分子)的細胞與治療與CD19相關之疾病的藥劑(例如本文所述的藥劑)組合投與。

在一個實施例中，表現CAR分子(例如本文所述的CAR分子)的細胞係以本文所述的劑量及/或給藥時程投與。

在一個實施例中，將CAR分子引入T細胞中，例如使用活體外轉錄將CAR分子引入T細胞中，且個體(例如人類)接受包含CAR分子之細胞之初始投與，及包含CAR分子之一或多次隨後投與，其中一或多次隨後投與係在前一次投與之後15天以內投與，例如前一次投與之後14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3或2天投與。在一個實施例中，包含CAR分子之細胞每週投與個體(例如人類)超過一次，例如包含CAR分子之細胞每週投與2、3或4次。在一個實施例中，個體(例如人類個體)接受每週超過一次之包含CAR分子之投與(例如每週投與2、3或4次)(在本文中亦稱為療程)，隨後一週停止投與包含CAR分子之細胞，且接著再向個體投與包含CAR分子之細胞一或多次(例如每週投與包含CAR分子之細胞超過一次)。在另一個實施例中，個體(例如人類個體)接受超過一個療程之包含CAR分子之細胞，且每個療程之間的時間小於10、9、8、7、6、5、4或3天。在一個實施例中，包含CAR分子的細胞每隔一天投與，每週投與3次。在一個實施例中，包含CAR分子的細胞投與至少兩週、三週、四週、五週、六週、七週、八週或八週以上。

在一個實施例中，表現CAR分子(例如本文所述的CAR分子)的細胞係作為疾病(例如癌症，例如本文所述的癌症)之第一線療法投與。在另一個實施例中，表現CAR分子(例如本文所述的CAR分子)的細胞係作為疾病(例如癌症，例如本文所述的癌症)之第二線、第三線、第四線療法投與。

在一個實施例中，投與本文所述之細胞群。

在另一個態樣中，本發明係關於編碼本發明之CAR的分離核酸分子、本發明之CAR之分離多肽分子、包含本發明之CAR的載體及包含本發明之CAR的細胞作為藥劑。

在另一個態樣中，本發明係關於編碼本發明之CAR的分離核酸分子、本發明之CAR之分離多肽分子、包含本發明之CAR的載體及包含本發明之CAR的細胞用於治療表現CD19的疾病。

在一個態樣中，本發明包括經包含編碼CD19-CAR分子(例如如本文所述)之核酸分子之載體轉染或轉導的自體細胞群。在一個實施例中，載體為逆轉錄病毒載體。在一個實施例中，載體為自不活化慢病毒載體，如本文別處所述。在一個實施例中，載體遞送(例如藉由轉染或電穿孔遞送)至細胞，例如T細胞，其中載體包含編碼如本文所述之CD19 CAR分子的核酸分子；該核酸分子以mRNA分子形式轉錄，且CD19 CAR分子係自該RNA分子轉譯而成且表現於細胞表面上。

在另一個態樣中，本發明提供CAR表現細胞(例如CART細胞)群。在一些實施例中，CAR表現細胞群包含表現不同CAR之細胞的混合物。舉例而言，在一個實施例中，CART細胞群可包括第一細胞，第一細胞表現具有本文所述抗-CD19結合域之CAR；及第二細胞，第二細胞表現具有不同抗-CD19結合域(例如與第一細胞所表現之CAR中之抗-CD19結合域不同的本文所述抗-CD19結合域)之CAR。作為另一實例，CAR表現細胞群可包括第一細胞，第一細胞表現包括抗-CD19結合域(例如如本文所述)之CAR；及第二細胞，第二細胞表現包括針對除CD19外之目標(例如CD123)之抗原結合域的CAR。在一個實施例中，CAR表現細胞群包括例如第一細胞，第一細胞表現包括初級胞內信號傳導域的CAR；及第二細胞，第二細胞表現包括次級信號傳導域的CAR。

在另一個態樣中，本發明提供細胞群，其中該群體中之至少一個細胞表現具有本文所述之抗-CD19域的CAR，且第二細胞表現另一藥劑，例如使CAR表現細胞的活性增強的藥劑。舉例而言，在一個實施例中，藥劑可為抑制抑制性分子的藥劑。抑制性分子之實例包括PD1、PD-L1、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及TGFRβ。在一個實施例中，抑制抑制性分子的藥劑包含第一多肽(例如抑制性分子)與向細胞提供陽性信號之第二多肽(例如本文所述的胞內信號傳導域)之結合。在一個實施例中，藥劑包含第一多肽，例如抑制性分子，諸如PD1、LAG3、CTLA4、CD160、BTLA、LAIR1、TIM3、2B4及TIGIT，或其中任一者之片段(例如其中任一者之胞外域之至少一部分)；及第二多肽，該第二多肽為本文所述的胞內信號傳導域(例如包含共刺激域(例如41BB、CD27或CD28，例如如本文所述)及/或初級信號傳導域(例如本文所述的CD3ξ信號傳導域)的胞內信號傳導域)。在一個實施例中，藥劑包含作為第一多肽的PD1或其片段(例如PD1之胞外域的至少一部分)，及作為第二多肽之本文所述胞內信號傳導域(例如本文所述的CD28信號傳導域及/或本文所述的CD3ξ信號傳導域)。

在一個實施例中，編碼CD19 CAR分子(例如如本文所述)的核酸分子係以mRNA分子形式表現。在一個實施例中，可藉由將編碼所要CAR(例如不含載體序列)之RNA分子轉染至或電穿孔導入細胞中來產生經基因修飾之CD19 CAR表現細胞(例如T細胞)。在一個實施例中，RNA分子一經併入，RNA分子即轉譯成CD19 CAR分子且CD19 CAR分子表現於重組細胞表面上。

圖1A、1B及1C為如分析ND317(正常供者)T細胞所得的細胞毒性之圖示，該T細胞經小鼠抗-CD19 CAR或本發明之人類化抗-CD19 CAR轉導且與以下一起培養：不表現CD19的對照K562細胞(K562cc)，如圖1A中所示；經CD19轉型的K562細胞(K562.CD19)，如圖1B中所示；或自CLL患者分離出的惡性B細胞(Pt 14 B細胞分離株)，如圖1C中所示。

圖2A及2B為顯示人類化及小鼠抗-CD19 CAR表現細胞對CD19+細胞之增殖性反應的圖，其中較高數目個活CAR+ T細胞與對初級CLL細胞顯示最大CD4+及CD8+ T細胞增殖的群體相關。

圖3為本發明之scFv之解迴旋HPLC質譜之圖示，其中頂行描繪未處理之scFv且底行描繪同源去糖基化scFv。

圖4為構形穩定性之圖示，如藉由差示掃描螢光測定法所量測。小鼠scFv之Tm為57℃(粗線)。所有人類化scFv變異體在約70℃顯示高於親本小鼠scFv的Tm。藉由人類化引入的殘基使Tm提高超過10℃。

圖5為經CD19 CAR轉導之T細胞增殖之圖示，其中CART19細胞針對：(a)對於CD19之表現呈陰性且因此用作陰性對照的慢性骨髓性白血病(「CML」)細胞株；(b)對於CD19之表現呈陽性且因此用作陽性對照的重組K562細胞；或(c)自CLL患者分離且表現細胞表面上之CD19的Pt14 B細胞。

圖6A及6B為代表性CAR之示意圖。

圖7描繪經CD19轉導CAR T細胞處理後之NSG小鼠中的HALLX5447原發ALL疾病進展。在經對CD19具特異性之CAR T細胞處理後之NSG小鼠中，人類原發ALL細胞之生長顯示疾病進展受到控制。CD19⁺人類ALL細胞之平均百分比為NSG小鼠之周圍血液中之疾病負荷的指標(至腫瘤植入後第65天)。黑色圓圈：經100μl PBS尾靜脈處理的小鼠；紅色方塊：經模擬物轉導之T細胞處理的小鼠；藍色三角形：經鼠科CD19 CAR轉導之T細胞處理的小鼠；及紫色倒三角形：經人類化CD19 CAR轉導之T細胞處理的小鼠。顯著性係根據 ANOVA計算；*表示P<0.01。

圖8描繪患者腫瘤細胞中之CD19表現。CD138⁺ CD45^dim腫瘤細胞按照CD19(x軸)及CD38(y軸)染色。

定義

除非另有定義，否則本文所用的全部技術及科學術語具有與一般熟悉本發明相關技術者通常所瞭解相同的含義。

術語「一」係指文中之一個或超過一個(亦即至少一個)文法對象。舉例而言，「一元件」意謂一個元件或超過一個元件。

提及可測值(諸如量、時間長度，及其類似值)時，術語「約」意欲包涵指定值之±20%之偏差，或有時候±10%之偏差，或有時候±5%之偏差，或有時候±1%之偏差，或有時候±0.1%之偏差，因為此等偏差對於實施所揭示方法為適當的。

術語「嵌合抗原受體」或者「CAR」係指重組多肽構築體，該構築體至少包含胞外抗原結合域、跨膜域及胞質信號傳導域(本文中亦稱為「胞內信號傳導域」)，該胞質信號傳導域包含來源於如下文定義之刺激性分子的功能信號傳導域。在一個態樣中，刺激性分子為與T細胞受體複合物相關的ξ鏈。在一個態樣中，胞質信號傳導域進一步包含一或多個功能信號傳導域，該等功能信號傳導域來源於至少一個如下文定義的共刺激分子。在一個態樣中，共刺激分子係選自4-1BB(亦即CD137)、CD27及/或CD28。在一個態樣中，CAR包含嵌合融合蛋白，該融合蛋白包含胞外抗原識別域、跨膜域及胞內信號傳導域，該胞內信號傳導域包含來源於刺激性分子的功能信號傳導域。在一個態樣中，CAR包含嵌合融合蛋白，該融合蛋白包含胞外抗原識別域、跨膜域及胞內信號傳導域，該胞內信號傳導域包含來源於共刺激分子的功能信號傳導域及來源於刺激性分子的功能信號傳導域。在一個態樣中，CAR包含嵌合融合蛋白，該融合蛋白包含胞外抗原識別域、跨膜域及胞內信號傳導域，該胞內信號傳導域包含兩個來源於一或多種共刺激分子的功能信號傳導域及來源於刺激性分子的功能信號傳導域。在一個態樣中，CAR包含嵌合融合蛋白，該融合蛋白包含胞外抗原識別域、跨膜域及胞內信號傳導域，該胞內信號傳導域包含至少兩個來源於一或多種共刺激分子的功能信號傳導域及來源於刺激性分子的功能信號傳導域。在一個態樣中，CAR包含視情況存在之前導序列，該前導序列位於CAR融合蛋白之胺基末端(N-ter)。在一個態樣中，CAR進一步包含位於胞外抗原識別域之N末端的前導序列，其中該前導序列係在CAR之細胞性加工及定位至細胞膜期間，視情況自抗原識別域(例如aa scFv)分裂而得。

術語「信號傳導域」係指蛋白質之功能部分，其作用為使細胞內之資訊經由所定義之信號傳導路徑傳遞以調節細胞活性、產生第二信使或藉由回應此等信使而起效應子作用。

如本文所用，術語「CD19」係指分化叢集19蛋白，其為白血病前驅細胞上可偵測的抗原決定子。人類及鼠科胺基酸及核酸序列可見於公開的資料庫中，諸如GenBank、UniProt及Swiss-Prot。舉例而言，人類CD19之胺基酸序列可見於UniProt/Swiss-Prot寄存號P15391且編碼人類CD19的核苷酸序列可見於寄存號NM_001178098。CD19表現於大多數B譜系癌症中，包括例如急性淋巴母細胞白血病、慢性淋巴細胞白血病及非霍奇金氏淋巴瘤。表現CD19的其他細胞提供於下文「與CD19表現相關的疾病」之定義中。其亦為B細胞祖細胞之早期標記。參見例如Nicholson等人，Mol.Immun.34(16-17)：1157-1165(1997)。在一個態樣中，CART之抗原結合部分識別且結合CD19蛋白胞外域內之抗原。在一個態樣中，CD19蛋白表現於癌細胞上。

如本文所用，術語「抗體」係指來源於與抗原特異性結合之免疫球蛋白分子的蛋白質或多肽序列。抗體可為多株或單株、多鏈或單鏈、或完整免疫球蛋白，且可來源於天然來源或重組來源。抗體可為免疫球蛋白分子之四聚體。

術語「抗體片段」係指完整抗體之至少一部分，或其重組變異體，且係指抗原結合域，例如完整抗體之抗原性決定可變區，其足以使得抗體片段識別及特異性結合至目標，諸如抗原。抗體片段之實例包括(但不限於)Fab、Fab'、F(ab')₂及Fv片段、scFv抗體片段、線性抗體、單域抗體(諸如sdAb(VL或VH))、駝類VHH域，及由抗體片段形成的多特異性抗體。術語「scFv」係指一種融合蛋白，其包含至少一個含有輕鏈可變區的抗體片段及至少一個含有重鏈可變區的抗體片段，其中輕鏈可變區與重鏈可變區經由短柔性多肽連接子毗連式連接且能夠以單鏈多肽形式表現，且其中scFv保留其所來源之完整抗體的特異性。除非有說明，否則如本文所用，scFv可具有任一次序之VL及VH可變區，例如相對於多肽之N末端及C末端而言，scFv可包含VL-連接子-VH或可包含VH-連接子-VL。

包含抗體或其抗體片段之本發明CAR組合物的一部分可以多種形式存在，其中抗原結合域係作為連續多肽鏈之一部分表現，包括例如單域抗體片段(sdAb)、單鏈抗體(scFv)及人類化抗體(Harlow等人，1999，於：Using Antibodies：A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,NY中；Harlow等人，1989，於：Antibodies：A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,New York中；Houston等人，1988,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85：5879-5883；Bird等人，1988,Science 242：423-426)。在一個態樣中，本發明CAR組合物之抗原結合域包含抗體片段。在另一態樣中，CAR包含含有scFv的抗體片段。

術語「抗體重鏈」係指抗體分子中以天然存在之構形存在之兩類多肽鏈中的較大者，且其通常決定該抗體所屬之類別。

術語「抗體輕鏈」係指抗體分子中以天然存在之構形存在之兩類多肽鏈中的較小者。Kappa(κ)及lambda(λ)輕鏈係指兩種主要的抗體輕鏈同型。

術語「重組抗體」係指使用DNA重組技術產生的抗體，諸如藉由噬菌體或酵母表現系統表現的抗體。該術語亦應視為意謂一種抗體，其已藉由合成編碼該抗體之DNA分子而產生，該DNA分子表示抗體蛋白質或限定該抗體之胺基酸序列，其中該DNA或胺基酸序列已使用此項技術中可獲得且熟知的重組DNA或胺基酸序列技術獲得。

術語「抗原」或「Ag」係指引起免疫反應的分子。此免疫反應可包括抗體產生，或特定免疫勝任細胞之活化，或兩者。熟習此項技術者將瞭解，任何高分子(包括實際上所有蛋白質或肽)可充當抗原。此外，抗原可來源於重組或基因組DNA。熟習此項技術者將瞭解，包含編碼引起免疫反應之蛋白質之核苷酸序列或部分核苷酸序列的任何DNA編碼如本文中所用之該術語「抗原」。此外，熟悉此項技術者將瞭解，抗原不必僅由基因之全長核苷酸序列編碼。顯然，本發明包括(但不限於)使用超過一個基因之部分核苷酸序列，且此等核苷酸序列依各種組合加以排列以編碼引起所要免疫反應的多肽。此外，熟習此項技術者將瞭解，抗原完全不必由「基因」編碼。顯然，抗原可合成產生或可來源於生物樣品，或可為除多肽之外的巨分子。此生物樣品可包括(但不限於)具有其他生物組分的組織樣品、腫瘤樣品、細胞或流體。

術語「抗腫瘤效應」係指可根據各種方式表明的生物效應，此等方式包括(但不限於)例如腫瘤體積減小、腫瘤細胞數目降低、轉移數目減少、壽命預期延長、腫瘤細胞增殖減少、腫瘤細胞存活力減小，或與癌症病狀相關之各種生理學症狀改善。「抗腫瘤效應」亦可根據本發明之肽、聚核苷酸、細胞及抗體防止腫瘤初次發生的能力表明。

術語「自體」係指來源於同一個體、隨後再引入該個體內的任何材料。

術語「同種異體」係指來源於與材料所引入之個體相同之物種之不同動物的任何材料。當位於一或多個基因座之基因不相同時，稱兩個或兩個以上個體彼此間為同種異體。在一些態樣中，來源於相同物種之個體的同種異體材料可在基因上充分不同以在抗原性上發生相互作用。

術語「異種」係指來源於不同物種之動物的移植物。

術語「癌症」係指以異常細胞之快速且不可控生長為特徵的疾病。癌細胞可局部擴散或經由血流及淋巴系統擴散至身體之其他部分。各種癌症之實例描述於本文中且包括(但不限於)乳癌、前列腺癌、卵巢癌、子宮頸癌、皮膚癌、胰臟癌、結腸直腸癌、腎癌、肝癌、腦癌、淋巴瘤、白血病、肺癌及其類似癌症。

片語「與CD19表現相關的疾病」包括(但不限於)與CD19表現相關的疾病或與CD19表現細胞相關的病狀，包括例如增生性疾病，諸如癌症或惡性疾病或癌前期病狀，諸如骨髓發育不良、骨髓發育不良症候群或白血病前期；或與CD19表現細胞相關的非癌症相關適應症。在一個態樣中，與CD19表現相關的癌症為血液癌症。在一個態樣中，血液癌症為白血病或淋巴瘤。在一個態樣中，與CD19表現相關的癌症包括癌症及惡性疾病，包括(但不限於)例如一或多種急性白血病，包括(但不限於)例如B細胞急性淋巴細胞性白血病(「BALL」)、T細胞急性淋巴細胞性白血病(「TALL」)、急性淋巴細胞性白血病(ALL)；一或多種慢性白血病，包括(但不限於)例如慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴細胞性白血病(CLL)。與CD19表現相關的其他癌症或血液病狀包含(但不限於)例如B細胞前淋巴細胞性白血病、母細胞性類漿細胞樹突狀細胞贅生物、伯基特氏淋巴瘤、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、毛細胞白血病、小細胞或大細胞濾泡性淋巴瘤、惡性淋巴組織增生病狀、MALT淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、邊緣區淋巴瘤、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良及骨髓發育不良症候群、非霍奇金氏淋巴瘤、漿母細胞性淋巴瘤、類漿細胞樹突狀細胞贅生物、瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症，及「白血病前期」，「白血病前期」為血液病狀之多樣化集合合併骨髓血液細胞之無效產生(或發育不良)，及其類似病狀。與CD19表現相關的其他疾病包括(但不限於)例如非典型及/或非經典癌症、惡性疾病、癌前期病狀或與CD19表現相關的增生性疾病。與CD19表現相關的非癌症相關適應症包括(但不限於)例如自體免疫疾病(例如狼瘡)、炎症(過敏症及哮喘)及移植。

術語「保守型序列修飾」係指不顯著地影響或改變含有胺基酸序列之抗體或抗體片段之結合特徵的胺基酸修飾。此等保守型修飾包括胺基酸取代、添加及缺失。可藉由此項技術中已知的標準技術，諸如定點誘變及PCR介導突變誘發，將修飾引入本發明之抗體或抗體片段中。保守型胺基酸取代為其中胺基酸殘基經具有類似側鏈之胺基酸殘基置換的胺基酸取代。具有類似側鏈的胺基酸殘基家族在此項技術中已定義。此等家族包括具有以下側鏈之胺基酸：鹼性側鏈(例如離胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如天冬胺酸、麩胺酸)、不帶電的極性側鏈(例如甘胺酸、天冬醯胺酸、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸、色胺酸)、非極性側鏈(例如丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸)、β分支側鏈(例如蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)及芳族側鏈(例如酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)。因此，本發明之CAR內的一或多個胺基酸殘基可經來自相同側鏈家族之其他胺基酸殘基置換且變化之CAR可使用本文所述的功能分析法加以測試。

術語「刺激」係指刺激性分子(例如TCR/CD3複合物)與其同源配位體結合所誘導的初次反應，藉此介導信號轉導事件，諸如(但不限於)經由TCR/CD3複合物發生的信號轉導。刺激可介導某些分子之表現變化，諸如TGF-β之下調，及/或細胞骨架結構之改組，及其類似方面。

術語「刺激性分子」係指由提供初級胞質信號傳導序列之T細胞所表現的分子，在T細胞信號傳導路徑之至少一些態樣中，初級胞質信號傳導序列以刺激性方式調節TCR複合物之初次活化。在一個態樣中，初級信號係由例如TCR/CD3複合物與載有肽之MHC分子結合而引發，且從而介導T細胞反應，包括(但不限於)增殖、活化、分化及其類似方面。以刺激性方式起作用的初級胞質信號傳導序列(亦稱為「初級信號傳導域」)可含有信號傳導基元，該信號傳導基元已知為基於免疫受體酪胺酸的活化基元或ITAM。含有特定用於本發明中之初級胞質信號傳導序列之ITAM實例包括(但不限於)來源於TCRξ、FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD5、CD22、CD79a、CD79b、CD278(亦稱為「ICOS」)及CD66d。在本發明之特異性CAR中，本發明之任一或多種CAR中的胞內信號傳導域包含胞內信號傳導序列，例如CD3ξ之初級信號傳導序列。在本發明之特異性CAR中，CD3ξ之初級信號傳導序列為如SEQ ID NO：17所提供之序列，或來自非人類物種(例如小鼠、嚙齒動物、猴、猿及其類似物種)的等效殘基。在本發明之特異性CAR中，CD3ξ之初級信號傳導序列為如SEQ ID NO：43所提供之序列，或來自非人類物種(例如小鼠、嚙齒動物、猴、猿及其類似物種)的等效殘基。

術語「抗原呈遞細胞」或「APC」係指在表面上呈現與主要組織相容性複合物(MHC)複合之外來抗原的免疫系統細胞，諸如輔助細胞(例如B細胞、樹突狀細胞及其類似細胞)。T細胞可利用其T細胞受體 (TCR)識別此等複合物。APC處理抗原且將其呈遞至T細胞。

如本文所用之術語「胞內信號傳導域」係指分子之胞內部分。胞內信號傳導域產生促進含CAR細胞(例如CART細胞)之免疫效應功能的信號。免疫效應功能(例如CART細胞之免疫效應功能)之實例包括溶胞活性及輔助活性，包括細胞激素之分泌。

在一個實施例中，胞內信號傳導域可包含初級胞內信號傳導域。例示性初級胞內信號傳導域包括來源於負責初始刺激或抗原依賴性模擬之分子的彼等物。在一個實施例中，胞內信號傳導域可包含共刺激胞內域。例示性共刺激胞內信號傳導域包括來源於負責共刺激信號或抗原非依賴性刺激之分子的彼等物。舉例而言，在CART情況下，初級胞內信號傳導域可包含T細胞受體之胞質序列，且共刺激胞內信號傳導域可包含來自共受體或共刺激分子的胞質序列。

初級胞內信號傳導域可包含信號傳導基元，該信號傳導基元已知為基於免疫受體酪胺酸的活化基元或ITAM。含有初級胞質信號傳導序列之ITAM實例包括(但不限於)來源於CD3ξ、FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD5、CD22、CD79a、CD79b及CD66d DAP10及DAP12的彼等物。

術語「ξ」或者「ξ鏈」、「CD3ξ」或「TCRξ」定義為以GenBan寄存號BAG36664.1提供的蛋白質，或來自非人類物種(例如小鼠、嚙齒動物、猴、猿及其類似物種)的等效殘基，且「ξ刺激域」或者「CD3ξ刺激域」或「TCRξ刺激域」定義為足以在功能上傳遞為T細胞活化所必需的起始信號、來自ξ鏈之胞質域的胺基酸殘基。在一個態樣中，ξ之胞質域包含GenBank寄存號BAG36664.1之殘基52至164，或作為其功能直系同源物、來自非人類物種(例如小鼠、嚙齒動物、猴、猿及其類似物種)的等效殘基。在一個態樣中，「ξ刺激域」或「CD3ξ刺激域」為如SEQ ID NO：17提供的序列。在一個態樣中，「ξ刺激域」或「CD3ξ刺激域」為如SEQ ID NO：43提供的序列。

術語「共刺激分子」係指與共刺激配位體特異性結合之T細胞上的同源結合搭配物，從而藉由T細胞介導共刺激反應，諸如(但不限於)增殖。共刺激分子為除抗原受體或其配位體之外、為有效免疫反應所必需的細胞表面分子。共刺激分子包括(但不限於)MHC I類分子、BTLA及Toll配位體受體，以及OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)及4-1BB(CD137)。

共刺激胞內信號傳導域可為共刺激分子之胞內部分。共刺激分子可以如下蛋白質家族為代表：TNF受體蛋白、免疫球蛋白樣蛋白、細胞激素受體、整合素、信號傳導淋巴細胞活化分子(SLAM蛋白)，及活化NK細胞受體。此等分子之實例包括CD27、CD28、4-1BB(CD137)、OX40、GITR、CD30、CD40、ICOS、BAFFR、HVEM、淋巴細胞功能相關抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3，及與CD83特異性結合的配位體，及其類似物。

胞內信號傳導域可包含其所來源之分子的整個胞內部分，或整個原生胞內信號傳導域，或其功能片段。

術語「4-1BB」係指TNFR超家族之成員，其具有如GenBank寄存號AAA62478.2所提供的胺基酸序列或來自非人類物種(例如小鼠、嚙齒動物、猴、猿及其類似物種)的等效殘基；且「4-1BB共刺激域」定義為GenBank寄存號AAA62478.2之胺基酸殘基214至255或來自非人類物種(例如小鼠、嚙齒動物、猴、猿及其類似物種)的等效殘基。在一個態樣中，「4-1BB共刺激域」為如SEQ ID NO：16提供的序列或來自非人類物種(例如小鼠、嚙齒動物、猴、猿及其類似物種)的等效殘基。

術語「編碼」係指聚核苷酸中之特定核苷酸序列(諸如基因、 cDNA或mRNA)用作模板的固有特性，該等模板用於在生物過程中合成具有所定義之核苷酸序列(例如rRNA、tRNA及mRNA)或所定義之胺基酸序列及由其所得之生物特性的其他聚合物及巨分子。因此，若對應於一基因之mRNA轉錄及轉譯而在細胞或其他生物系統中產生一蛋白質，則該基因、cDNA或RNA編碼該蛋白質。編碼股(其核苷酸序列與mRNA序列一致且通常以序列表提供)與非編碼股(作為模板用於基因或cDNA轉錄)均可稱為該基因或cDNA編碼該蛋白質或其他產物。

除非另外說明，否則「編碼胺基酸序列的核苷酸序列」包括彼此呈簡併型式且編碼相同胺基酸序列的所有核苷酸序列。片語編碼蛋白質或RNA的核苷酸序列亦可包括內含子，包括的程度以致編碼蛋白質的核苷酸序列可呈含有內含子的一些型式。

術語「有效量」或「治療有效量」在本文中可互換使用，且係指如本文所述之化合物、調配物、材料或組合物有效達成特定生物結果的量。

術語「內源」係指來源於或在生物體、細胞、組織或系統內部產生的任何材料。

術語「外源」係指自生物體、細胞、組織或系統引入或在生物體、細胞、組織或系統外部產生的任何材料。

術語「表現」係指由啟動子驅動之特定核苷酸序列的轉錄及/或轉譯。

術語「轉移載體」係指一種組合物，其包含分離核酸且可用於將該分離核酸遞送至細胞內部。此項技術中已知多種載體，包括(但不限於)線性聚核苷酸、與離子型或兩親化合物相關的聚核苷酸、質體及病毒。因此，術語「轉移載體」包括自主複製型質體或病毒。該術語亦應視為進一步包括促進核酸轉移至細胞內的非質體及非病毒化合物，諸如聚離胺酸化合物、脂質體及其類似物。病毒轉移載體之實例包括(但不限於)腺病毒載體、腺病毒相關病毒載體、逆轉錄病毒載體、慢病毒載體及其類似物。

術語「表現載體」係指一種包含重組性聚核苷酸的載體，該重組性聚核苷酸包含可操作地連接至欲表現之核苷酸序列的表現控制序列。表現載體包含足以供表現的順式作用元件；其他表現元件可由宿主細胞或活體外表現系統供應。表現載體包括此項技術中已知的所有表現載體，包括合併重組性聚核苷酸的黏質體、質體(例如裸質體或含於脂質體中)及病毒(例如慢病毒、逆轉錄病毒、腺病毒及腺病毒相關病毒)。

術語「慢病毒」係指逆轉錄病毒科家族之屬類。慢病毒獨特之處在於逆轉錄病毒能夠感染非分裂細胞；其可將大量遺傳資訊遞送至宿主細胞之DNA內，因此其為基因遞送載體之最有效方法之一。HIV、SIV及FIV為慢病毒之所有實例。

術語「慢病毒載體」係指來源於慢病毒基因組之至少一部分的載體，尤其包括自不活化慢病毒載體，如Milone等人，Mol.Ther.17(8)：1453-1464(2009)中所提供。可用於臨床之慢病毒載體的其他實例包括(但不限於)例如Oxford BioMedica之LENTIVECTOR®基因遞送技術、Lentigen之LENTIMAX^TM載體系統及其類似物。非臨床類型的慢病毒載體亦可獲得且為熟悉此項技術者所知。

術語「同源」或「一致性」係指兩個聚合物分子之間(例如兩個核酸分子之間，諸如兩個DNA分子或兩個RNA分子，或兩個多肽分子之間)的亞單元序列一致性。當兩個分子之亞單元位置均被相同單體亞單元佔據時，例如若兩個DNA分子中之每一者的位置均被腺嘌呤佔據，則其在該位置同源或一致。兩個序列之間的同源性與匹配或同源位置之數目直接相關；例如若兩個序列之一半位置(例如長度為十個亞單元之聚合物中的五個位置)同源，則兩個序列50%同源；若90%位置(例如10分之9)匹配或同源，則兩個序列90%同源。

非人類(例如鼠科)抗體之「人類化」形式為所含來源於非人免疫球蛋白之序列最小的嵌合免疫球蛋白、免疫球蛋白鏈或其片段(諸如Fv、Fab、Fab'、F(ab')2或抗體之其他抗原結合子序列)。在很大程度上，人類化抗體及其抗體片段為人類免疫球蛋白(受者抗體或抗體片段)，其中來自受者之互補決定區(CDR)的殘基已置換為來自非人類物種(供者抗體)(諸如具有所要特異性、親和力及能力的小鼠、大鼠或兔)之CDR的殘基。有時候，人類免疫球蛋白之Fv構架區(FR)殘基經相應非人類殘基置換。此外，人類化抗體/抗體片段可包含既未在受者抗體中發現、亦未在所輸入CDR或構架序列中發現的殘基。此等修飾可進一步改進及最佳化抗體或抗體片段效能。一般而言，人類化抗體或其抗體片段包含至少一個且典型兩個可變域中之實質上全部，其中全部或實質上全部的CDR區域對應於非人類免疫球蛋白之CDR區域且FR區域之全部或大部分為人類免疫球蛋白序列之FR區域。人類化抗體或抗體片段亦可包含免疫球蛋白恆定區(Fc)(典型地為人類免疫球蛋白之恆定區)之至少一部分。欲知詳情，參見Jones等人，Nature,321：522-525,1986；Reichmann等人，Nature,332：323-329,1988；Presta,Curr.Op.Struct.Biol.,2：593-596,1992。

「完全人類」係指免疫球蛋白，諸如抗體或抗體片段，其中整個分子來源於人類或由與抗體或免疫球蛋白之人類形式一致的胺基酸序列組成。

術語「分離」意謂改變或脫離自然狀態。舉例而言，天然存在於活動物中之核酸或肽係未「分離」，但與其自然狀態之共存材料部分或完全脫離的相同核酸或肽為「分離」。分離核酸或蛋白質可以實質上純化形式存在，或可存在於非原生環境中，諸如宿主細胞。

在本發明之上下文中，通常存在之核酸鹼基使用以下縮寫。「A」係指腺苷，「C」係指胞嘧啶，「G」係指鳥苷，「T」係指胸苷，且「U」係指尿苷。

術語「可操作地連接」或「轉錄控制」係指調節序列與異源核酸序列之間的功能連接，從而使後者得到表現。舉例而言，當第一核酸序列與第二核酸序列依功能關係置放時，第一核酸序列與第二核酸序列可操作地連接。舉例而言，若啟動子影響編碼序列之轉錄或表現，則啟動子可操作地連接至編碼序列。可操作地連接之DNA序列彼此間可為毗連的，且例如在需要連接兩個蛋白質編碼區的情況下，處於同一閱讀框內。

術語「非經腸」投與免疫原性組合物包括例如皮下(s.c.)、靜脈內(i.v.)、肌肉內(i.m.)或胸骨內注射、腫瘤內、或輸注技術。

術語「核酸」或「聚核苷酸」係指呈單股或雙股形式的脫氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)及其聚合物。除非受到特別限制，否則該術語包涵含有天然核苷酸之已知類似物的核酸，其具有與參考核酸類似的結合特性且代謝的方式與天然存在之核苷酸類似。除非另外說明，否則特定核酸序列亦隱含地包涵其保守修飾型變異體(例如簡併密碼子取代)、對偶基因、直系同源物、SNP及互補序列以及明確指定之序列。特定而言，簡併密碼子取代可藉由產生其中第三位置上之一或多個所選(或所有)密碼子經混合鹼基及/或脫氧肌苷殘基取代之序列來達成(Batzer等人，Nucleic Acid Res.19：5081(1991)；Ohtsuka等人，J.Biol.Chem.260：2605-2608(1985)；及Rossolini等人，Mol.Cell.Probes 8：91-98(1994))。

術語「肽」、「多肽」與「蛋白質」可互換使用，且係指包含經肽鍵共價連接之胺基酸殘基的化合物。蛋白質或肽必須含有至少兩個胺基酸，且對可組成蛋白質或肽序列的胺基酸最大數目無限制。多肽包括包含兩個或兩個以上彼此間經肽鍵連接之胺基酸的任何肽或蛋白質。如本文所用，該術語係指短鏈，短鏈在此項技術中通常亦稱為例如肽、寡肽及寡聚物；與較長鏈，較長鏈在此項技術中一般稱為蛋白質，蛋白質存在許多類型。「多肽」尤其包括例如生物學活性片段、實質上同源多肽、寡肽、同二聚體、雜二聚體、多肽變異體、修飾型多肽、衍生物、類似物、融合蛋白。多肽包括天然肽、重組肽或其組合。

術語「啟動子」係指為啟動聚核苷酸序列之特定轉錄所必需的DNA序列，該DNA序列由細胞之合成機器識別或引入合成機器內。

術語「啟動子/調節序列」係指表現可操作地連接至啟動子/調節序列之基因產物所必需的核酸序列。有時候，此序列可為核心啟動子序列，且在其他情況下，此序列亦可包括增強子序列及為表現基因產物所必需的其他調節元件。啟動子/調節序列可為例如以組織特異性方式表現基因產物的序列。

術語「組成性」啟動子係指當與編碼或限定基因產物之聚核苷酸可操作地連接時，促使細胞在細胞之大部分或所有生理條件下產生基因產物的核苷酸序列。

術語「誘導性」啟動子係指當與編碼或限定基因產物的聚核苷酸可操作地連接時，促使細胞實質上僅在對應於啟動子之誘導物存在於細胞中時產生基因產物的核苷酸序列。

術語「組織特異性」啟動子係指與編碼或限定基因之聚核苷酸可操作地連接時，促使細胞實質上僅當細胞為與啟動子對應之組織類型的細胞時產生基因產物的核苷酸序列。

如在scFv之上下文中所用的術語「柔性多肽連接子」或「連接子」係指由單獨或組合使用的胺基酸(諸如甘胺酸及/或絲胺酸殘基)組成的肽連接子，以使重鏈可變區與輕鏈可變區連接在一起。在一個實施例中，柔性多肽連接子為Gly/Ser連接子且包含胺基酸序列(Gly-Gly-Gly-Ser)_n，其中n為等於或大於1之正整數。舉例而言，n=1，n=2，n=3，n=4，n=5且n=6，n=7，n=8，n=9且n=10(SEQ ID NO：105)。在一個實施例中，柔性多肽連接子包括(但不限於)(Gly₄Ser)₄(SEQ ID NO：106)或(Gly₄Ser)₃(SEQ ID NO：107)。在另一個實施例中，連接子包括多個重複之(Gly₂Ser)、(GlySer)或(Gly₃Ser)(SEQ ID NO：108)。本發明之範疇內亦包括WO2012/138475中所述的連接子，該案以引用的方式併入本文中。

如本文所用，5'帽(亦稱為RNA帽、RNA 7-甲基鳥苷帽或RNA m⁷G帽)為經修飾之鳥嘌呤核苷酸，其已在轉錄起始之後不久添加至真核信使RNA之「前端」或5'端。5'帽係由連接至最先轉錄之核苷酸的末端基組成。其存在為核糖體識別及防止核糖核酸酶的關鍵。加帽與轉錄聯合，且以共轉錄方式發生，使得每一者可影響另一者。轉錄起始後不久，與RNA聚合酶相關的帽合成複合物結合所合成之mRNA之5'端。此酶促複合物催化mRNA加帽所必需的化學反應。合成係以多步生化反應進行。加帽部分可經修飾以調節mRNA之功能性，諸如其轉譯穩定性或效率。

如本文所用，「活體外轉錄的RNA」係指已在活體外合成的RNA，較佳為mRNA。一般而言，活體外轉錄的RNA係利用活體外轉錄載體產生。活體外轉錄載體包含用於產生活體外轉錄之RNA的模板。

如本文所用，「聚(A)」為藉由聚腺苷酸化作用連接至mRNA的一連串腺苷。在用於短暫表現之構築體的較佳實施例中，聚A在50與5000之間(SEQ ID NO：109)，較佳大於64，更佳大於100，最佳大於300或400。聚(A)序列可經化學或酶法修飾以調節mRNA功能性，諸如定位、轉譯穩定性或效率。

如本文所用，「聚腺苷酸化作用」係指聚腺苷酸部分或其修飾型變異體與信使RNA分子之共價連接。在真核生物體中，大部分信使RNA(mRNA)分子係在3'端發生聚腺苷酸化。3'聚(A)尾為經由酶(聚腺苷酸聚合酶)之作用添加至前mRNA中的腺嘌呤核苷酸長序列(往往為幾百)。在高等真核生物中，聚(A)尾係添加至含有特定序列(聚腺苷酸化信號)的轉錄物中。聚(A)尾及結合至其的蛋白質有助於保護mRNA以防被核酸外切酶降解。聚腺苷酸化對於轉錄終止、mRNA自細胞核輸出、及轉譯亦具有重要作用。聚腺苷酸化係在DNA轉錄成RNA之後立即發生於細胞核中，但另外亦可隨後發生於細胞質中。轉錄已終止之後，mRNA鏈經由與RNA聚合酶相關之核酸內切酶複合物的作用發生分裂。分裂位點的特徵通常為分裂位點附近存在鹼基序列AAUAAA。mRNA已分裂之後，腺苷殘基添加至分裂位點之自由3'端。

如本文所用，「短暫」係指未整合之轉殖基因的表現時段為數小時、數日或數週，其中表現時段小於整合至宿主細胞之基因組中或包含於宿主細胞之穩定質體複製子中之基因的表現時段。

術語「信號轉導路徑」係指在將信號自細胞之一部分傳遞至細胞之另一部分中起作用的多種信號轉導分子之間的生物化學關係。片語「細胞表面受體」包括能夠接受信號且傳遞信號越過細胞膜的分子及分子複合物。

術語「個體」意欲包括體內可引發免疫反應的活有機體(例如哺乳動物、人類)。

術語「實質上純化」細胞係指基本上不含其他細胞類型的細胞。實質上純化細胞亦指已與在其天然存在之狀態下通常與其相關之其他細胞類型分離的細胞。有時候，實質上純化之細胞群係指均質的細胞群。在其他情況下，此術語簡單地指已與在其天然狀態下與其天然相關之細胞分離的細胞。在一些態樣中，細胞係在活體外培養。在其他態樣中，細胞未在活體外培養。

如本文所用的術語「治療」意謂療法。治療作用係藉由減少、抑止、緩和或根除疾病病況而獲得。

如本文所用的術語「預防」意謂疾病或疾病病況之預防或保護性治療。

在本發明之上下文中，「腫瘤抗原」或「增生性病症抗原」或「與增生性病症相關的抗原」係指特定增生性病症共有的抗原。在某些態樣中，本發明之增生性病症抗原來源於癌症，包括(但不限於)原發或轉移性黑色素瘤、胸腺瘤、淋巴瘤、肉瘤、肺癌、肝癌、非霍奇金氏淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、白血病、子宮癌、子宮頸癌、膀胱癌、腎癌及腺癌，諸如乳癌、前列腺癌、卵巢癌、胰臟癌及其類似癌症。

術語「轉染」或「轉型」或「轉導」係指藉以將外源核酸轉移至或引入宿主細胞內的過程。「轉染」或「轉型」或「轉導」細胞為已經外源核酸轉染、轉型或轉導的細胞。細胞包括初級個體細胞及其後代。

術語「特異性結合」係指一種抗體或配位體，其識別且結合存在於樣品中的同源結合搭配物(例如存在於T細胞上之刺激及/或共刺激分子)蛋白，但該抗體或配位體實質上不識別或結合樣品中的其他分子。

範圍：在通篇本發明中，本發明之各種態樣可以範圍格式呈現。應瞭解，呈範圍格式之說明僅為了方便及簡潔且不應視為對本發明範疇之呆板限制。因此，範圍之說明應視為已特定地揭示該範圍內之所有可能的子範圍以及個別數值。舉例而言，諸如1至6之範圍之說明應視為已特定地揭示諸如1至3、1至4、1至5、2至4、2至6、3至6等子範圍，以及該範圍內之個別數值，例如1、2、2.7、3、4、5、5.3及6。作為另一實例，諸如95-99%一致性之範圍包括95%、96%、97%、98%或99%一致性，且包括諸如96-99%、96-98%、96-97%、97-99%、97-98%及98-99%一致性之子範圍。不論範圍有多寬廣，此皆適用。

說明

本文提供使用人類化抗-CD19嵌合抗原受體(CAR)治療諸如癌症之疾病的組合物及使用方法。

在一個態樣中，本發明提供包含經工程改造而與CD19蛋白結合增強之抗體或抗體片段的多種嵌合抗原受體(CAR)。在一個態樣中，本發明提供經工程改造以表現CAR的細胞(例如T細胞)，其中CAR T細胞(「CART」)展現抗腫瘤特性。在一個態樣中，細胞係經CAR轉型且CAR表現於細胞表面上。在一些實施例中，細胞(例如T細胞)係經編碼CAR的病毒載體轉導。在一些實施例中，病毒載體為逆轉錄病毒載體。在一些實施例中，病毒載體為慢病毒載體。在一些此等實施例中，細胞可穩定地表現CAR。在另一個實施例中，細胞(例如T細胞)係經編碼CAR的核酸(例如mRNA、cDNA、DNA)轉染。在一些此等實施例中，細胞可短暫地表現CAR。

在一個態樣中，CAR之抗-CD19蛋白結合部分為scFv抗體片段。在一個態樣中，此等抗體片段的功能在於，其保持等效結合親和力，例如其與其所來源之IgG抗體結合相同抗原的功效類似。在一個態樣中，此等抗體片段的功能在於其提供生物反應，生物反應可包括(但不限於)活化免疫反應、抑制起始於其目標抗原之信號轉導、抑制激酶活性，及其類似生物反應，如熟習此項技術者所瞭解。在一個態樣中，CAR之抗-CD19抗原結合域為scFv抗體片段，與其所來源之scFv之鼠科序列相比，該scFv抗體片段經人類化。在一個態樣中，親本鼠科scFv序列為PCT公開案WO2012/079000中所提供的CAR19構築體且在本文中以SEQ ID NO：58提供。

在一些態樣中，本發明之抗體併入嵌合抗原受體(CAR)中。在一個態樣中，CAR包含PCT公開案WO2012/079000中以SEQ ID NO：12提供的多肽序列，及本文中以SEQ ID NO：58的多肽序列，其中scFv域經一或多個選自SEQ ID NO：1至12的序列取代。在一個態樣中，SEQ ID NO：1至12之scFv域為SEQ ID NO：59之scFv域之人類化變異體，其為特異性結合至人類CD19之鼠源片段。此小鼠scFv之人類化可為臨床配置所需要的，其中小鼠特異性殘基可誘導接受CART19治療(例如經CAR19構築體轉導之T細胞治療)之患者體內發生人類抗小鼠抗原(HAMA)反應。

在一個態樣中，本發明之CAR的抗-CD19結合域(例如人類化scFv)部分係由轉殖基因編碼，該轉殖基因的密碼子序列已針對在哺乳動物細胞中的表現而最佳化。在一個態樣中，本發明之整個CAR構築體係由轉殖基因編碼，該轉殖基因的整個密碼子序列已針對在哺乳動物細胞中的表現而最佳化。密碼子最佳化係指發現同義密碼子(亦即編碼相同胺基酸的密碼子)在編碼DNA中的出現頻率依物種不同而有偏移。此密碼子簡併允許相同多肽由多種核苷酸序列編碼。此項技術中已知多種密碼子最佳化方法，且包括例如至少美國專利第5,786,464號及第6,114,148號中所揭示的方法。

在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：1提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：2提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：3提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：4提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：5提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：6提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：7提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：8提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：9提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：10提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：11提供的scFv部分。在一個態樣中，人類化CAR19包含以SEQ ID NO：12提供的scFv部分。

在一個態樣中，本發明之CAR為特異性抗體之抗原結合域與胞內信號傳導分子之組合。舉例而言，在一些態樣中，胞內信號傳導分子包括(但不限於)CD3ξ鏈、4-1BB及CD28信號傳導模組及其組合。在一個態樣中，抗原結合域結合至CD19。在一個態樣中，CD19 CAR包含的CAR選自以SEQ ID NO：31至42中之一或多者提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：31提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：32提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：33提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：34提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：35提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：36提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：37提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：38提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：39提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：40提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：41提供的序列。在一個態樣中，CD19 CAR包含以SEQ ID NO：42提供的序列。

此外，本發明提供CD19 CAR組合物及其作為藥劑用於治療牽涉CD19表現細胞或組織之癌症或任何惡性疾病或自體免疫疾病以及其他疾病的用途或方法。

在一個態樣中，本發明之CAR可用於根除表現CD19之正常細胞，從而適用作細胞移植之前的細胞調節療法。在一個態樣中，表現CD19之正常細胞為表現CD19之正常幹細胞且細胞移植為幹細胞移植。

在一個態樣中，本發明提供經工程改造以表現嵌合抗原受體(CAR)的細胞(例如T細胞)，其中CAR T細胞(「CART」)展現抗腫瘤特性。較佳抗原為CD19。在一個態樣中，CAR之抗原結合域包含部分人類化的抗-CD19抗體片段。在一個態樣中，CAR之抗原結合域包含含有scFv之部分人類化抗-CD19抗體片段。因此，本發明提供包含人類化抗-CD19結合域且經工程改造而產生於T細胞中的CD19-CAR及其用作接受性療法的方法。

在一個態樣中，CD19-CAR包含至少一個選自以下之群組的胞內域：CD137(4-1BB)信號傳導域、CD28信號傳導域、CD3ξ信號傳導域，及其任何組合。在一個態樣中，CD19-CAR包含至少一個胞內信號傳導域，該胞內信號傳導域來自除CD137(4-1BB)或CD28之外的一或多種共刺激分子。

嵌合抗原受體(CAR)

本發明包涵含有編碼CAR之序列的重組DNA構築體，其中CAR包含特異性結合至CD19(例如人類CD19)的人類化抗體片段，其中抗體片段之序列與編碼胞內信號傳導域之核酸序列為毗連的且處於同一閱讀框內。胞內信號傳導域可包含共刺激信號傳導域及/或初級信號傳導域，例如ξ鏈。共刺激信號傳導域係指包含共刺激分子之胞內域之至少一部分的CAR之一部分。

在特定態樣中，本發明之CAR構築體包含選自由SEQ ID NO：1至12組成之群的scFv域，其中scFv之前可為視情況存在之前導序列，諸如SEQ ID NO：13所提供之前導序列，且其後可為視情況存在之鉸鏈序列，諸如SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：45或SEQ ID NO：47或SEQ ID NO：49所提供之鉸鏈序列；跨膜區，諸如SEQ ID NO：15所提供之跨膜區；包括SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51的胞內信號傳導域及包括SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43的CD3ξ序列，其中該等域為毗連的且處於同一閱讀框內以形成單一融合蛋白。本發明亦包括核苷酸序列，該核苷酸序列編碼選自由以下組成之群之各scFv片段之多肽：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12。本發明亦包括核苷酸序列，該核苷酸序列編碼選自由SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12組成之群之各scFv片段之多肽，以及SEQ ID NO：13至17之各域；以及本發明之所編碼之CD19 CAR融合蛋白。在一個態樣中，例示性CD19 CAR構築體包含視情況存在之前導序列、胞外抗原結合域、鉸鏈、跨膜域及胞內刺激域。在一個態樣中，例示性CD19 CAR構築體包含視情況存在之前導序列、胞外抗原結合域、鉸鏈、跨膜域、胞內共刺激域及胞內刺激域。含有本發明之人類化scFv域的特異性CD19 CAR構築體係以SEQ ID NO：31至42提供。

全長CAR序列在本文中亦以SEQ ID NO：31至42提供，如表3中所示。

例示性前導序列係以SEQ ID NO：13提供。例示性鉸鏈/間隔子序列係以SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：45或SEQ ID NO：47或SEQ ID NO：49提供。例示性跨膜域序列係以SEQ ID NO：15提供。4-1BB蛋白之胞內信號傳導域的例示性序列係以SEQ ID NO：16提供。CD27之胞內信號傳導域的例示性序列係以SEQ ID NO：51提供。例示性CD3ξ域序列係以SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43提供。

在一個態樣中，本發明包涵含有編碼CAR之核酸分子的重組核酸構築體，其中核酸分子包含編碼抗-CD19結合域(例如本文所述)的核酸序列，該核酸序列與編碼胞內信號傳導域的核酸序列為毗連的且處於同一閱讀框內。在一個態樣中，抗-CD19結合域係選自SEQ ID NO：1至12中的一或多者。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：61至72中之一或多者所提供之序列中的核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：61之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：62之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：63之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：64之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：65之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：66之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：67之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：68之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：69之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：70之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：71之核苷酸殘基64至813編碼。在一個態樣中，抗-CD19結合域係由SEQ ID NO：72之核苷酸殘基64至813編碼。

在一個態樣中，本發明包涵含有編碼CAR之轉殖基因的重組核酸構築體，其中核酸分子包含編碼選自SEQ ID NO：61至72中之一或多者之抗-CD19結合域的核酸序列，其中該序列與編碼胞內信號傳導域的核酸序列為毗連的且處於同一閱讀框內。可用於CAR中的例示性胞內信號傳導域包括(但不限於)例如CD3ξ、CD28、4-1BB及其類似物中的一或多個胞內信號傳導域。有時候，CAR可包含CD3ξ、CD28、4-1BB及其類似物之任何組合。在一個態樣中，本發明之CAR構築體的核酸序列係選自SEQ ID NO：85至96中的一或多者。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：85。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：86。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：87。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：88。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：89。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：90。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：91。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：92。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：93。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：94。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：95。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：96。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：97。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：98。在一個態樣中，CAR構築體之核酸序列為SEQ ID NO：99。

編碼所要分子的核酸序列可使用標準技術、利用此項技術中已知的重組方法獲得，諸如篩選表現該基因之細胞文庫、利用已知包括該基因之載體使基因衍生化，或自含有該基因的細胞及組織直接分離。或者，可以合成方式(而非選殖)產生所感興趣的核酸。

本發明包括可直接轉導至細胞內的表現CAR之逆轉錄病毒及慢病毒載體構築體。

本發明亦包括可直接轉染至細胞內的RNA構築體。產生用於轉染之mRNA的方法包括使用特別設計之引子活體外轉錄(IVT)模板，隨後添加聚A，以產生構築體，該構築體含有3'及5'未轉譯序列(「UTR」)、5'帽及/或內部核糖體進入位點(IRES)、欲表現的核酸，及長度典型地為50至2000個鹼基的聚A尾(SEQ ID NO：118)。如此產生的RNA可有效地轉染不同種類的細胞。在一個實施例中，模板包括用於CAR之序列。在一個實施例中，RNA CAR載體藉由電穿孔而轉導至T細胞內。

抗原結合域

在一個態樣中，本發明之CAR包含目標特異性結合元件，其另外稱為抗原結合域。組成部分之選擇視限定目標細胞表面之配位體類型及數目而定。舉例而言，可選擇識別配位體的抗原結合域，該配位體充當與特定疾病病況相關之目標細胞上的細胞表面標記。因此，可充當本發明CAR中之抗原結合域之配位體的細胞表面標記之實例包括與病毒、細菌及寄生蟲感染、自體免疫疾病及癌細胞相關的彼等標記。

在一個態樣中，藉由將特異性結合所要抗原之抗原結合域工程改造成CAR，可使CAR介導之T細胞反應針對所感興趣之抗原。

在一個態樣中，包含抗原結合域之CAR的該部分包含靶向CD19的抗原結合域。在一個態樣中，抗原結合域靶向人類CD19。在一個態樣中，CAR之抗原結合域與Nicholson等人，Mol.Immun.34(16-17)：1157-1165(1997)中所述的FMC63 scFv片段具有相同或相似的結合特異性。

抗原結合域可為結合至抗原的任何域，包括(但不限於)單株抗體、多株抗體、重組抗體、人類抗體、人類化抗體及其功能片段，包括(但不限於)單域抗體，諸如重鏈可變域(VH)、輕鏈可變域(VL)及來源於駱駝科之奈米抗體可變域(VHH)；及此項技術中已知充當抗原結合域的替代支架，諸如重組纖維結合蛋白域，及其類似物。有時候，抗原結合域來源於最終將使用CAR的相同物種有利。舉例而言，用於人類時，CAR之抗原結合域包含抗體或抗體片段之抗原結合域之人類或人類化殘基可為有利的。

因此，在一個態樣中，抗原結合域包含人類化抗體或抗體片段。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含本文所述之人類化抗-CD19結合域的一或多個(例如全部三個)輕鏈互補決定區1(LC CDR1)、輕鏈互補決定區2(LC CDR2)及輕鏈互補決定區3(LC CDR3)，及/或本文所述之人類化抗-CD19結合域的一或多個(例如全部三個)重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)，例如人類化抗-CD19結合域包含一或多個(例如全部三個)LC CDR及一或多個(例如全部三個)HC CDR。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含本文所述之人類化抗-CD19結合域的一或多個(例如全部三個)重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)，例如人類化抗-CD19結合域具有兩個各包含本文所述之HC CDR1、HC CDR2及HC CDR3的重鏈可變區。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含本文所述的人類化輕鏈可變區(例如表3中)及/或本文所述的人類化重鏈可變區(例如表3中)。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含本文所述的人類化重鏈可變區(例如表3中)，例如至少兩個本文所述人類化重鏈可變區(例如表3中)。在一個實施例中，抗-CD19結合域為包含表3之胺基酸序列之輕鏈及重鏈的scFv。在一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)包含：輕鏈可變區，該輕鏈可變區包含具有表3中所提供之輕鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)、但不超過30個、20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與表3之胺基酸序列95-99%一致的序列；及/或重鏈可變區，該重鏈可變區包含具有表3中所提供之重鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾(例如取代)，但不超過30個、 20個或10個修飾(例如取代)的胺基酸序列，或與表3之胺基酸序列95-99%一致的序列。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，編碼人類化抗-CD19結合域的核酸序列包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：62、SEQ ID NO：63、SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：65、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：68、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：71及SEQ ID NO：72，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域為scFv，且包含本文所述胺基酸序列(例如表3中)的輕鏈可變區經由連接子(例如本文所述的連接子)連接至包含本文所述胺基酸序列(例如表3中)的重鏈可變區。在一個實施例中，人類化抗-CD19結合域包括(Gly₄-Ser)n連接子，其中n為1、2、3、4、5或6，較佳為3或4(SEQ ID NO：53)。scFv之輕鏈可變區及重鏈可變區可呈例如任一種以下取向：輕鏈可變區-連接子-重鏈可變區，或重鏈可變區-連接子-輕鏈可變區。

在一個態樣中，抗原結合域部分包含一或多個選自SEQ ID NO：1至12的序列。在一個態樣中，人類化CAR係選自一或多個選自SEQ ID NO：31至42的序列。在一些態樣中，非人類抗體係經人類化，其中抗體之特定序列或區域係經修飾以增強與人體中天然產生之抗體或其片段的相似性。在一個態樣中，抗原結合域係經人類化。

人類化抗體可利用此項技術中已知的多種技術產生，包括(但不限於)CDR移植(參見例如歐洲專利第EP 239,400號；國際公開案第WO 91/09967號；及美國專利第5,225,539號、第5,530,101號及第5,585,089號，各文獻以全文引用的方式併入本文中)、鑲飾 (veneering)或表面重塑(resurfacing)(參見例如歐洲專利第EP 592,106號及第EP 519,596號；Padlan,1991,Molecular Immunology,28(4/5)：489-498；Studnicka等人，1994,Protein Engineering,7(6)：805-814；及Roguska等人，1994,PNAS,91：969-973，各文獻以全文引用的方式併入本文中)、鏈改組(參見例如美國專利第5,565,332號，該專利以全文引用的方式併入本文中)，及以下文獻中所揭示的技術：例如美國專利申請公開案第US2005/0042664號、美國專利申請公開案第US2005/0048617號、美國專利第6,407,213號、美國專利第5,766,886號、國際公開案第WO 9317105號；Tan等人，J.Immunol.,169：1119-25(2002)；Caldas等人，Protein Eng.,13(5)：353-60(2000)；Morea等人，Methods,20(3)：267-79(2000)；Baca等人，J.Biol.Chem.,272(16)：10678-84(1997)；Roguska等人，Protein Eng.,9(10)：895-904(1996)；Couto等人，Cancer Res.,55(23增刊)：5973s-5977s(1995)；Couto等人，Cancer Res.,55(8)：1717-22(1995)；Sandhu J S,Gene,150(2)：409-10(1994)；及Pedersen等人，J.Mol.Biol.,235(3)：959-73(1994)，各文獻以全文引用的方式併入本文中。通常，構架區中之構架殘基將經來自CDR供者抗體之相應殘基取代，以改變(例如改良)抗原結合。此等構架取代係藉由此項技術中熟知的方法鑑別，例如對CDR與構架殘基之相互作用建立模型以鑑別對於抗原結合具有重要作用的構架殘基，及序列比較以鑑別位於特定位置的異常構架殘基。(參見例如Queen等人，美國專利第5,585,089號；及Riechmann等人，1988,Nature,332：323，該等文獻以全文引用的方式併入本文中)。

人類化抗體或抗體片段中留有一或多個具有非人類來源的胺基酸殘基。此等非人類胺基酸殘基通常稱為「輸入」殘基，其典型地得自「輸入」可變域。如本文所提供，人類化抗體或抗體片段包含一或多個來自非人類免疫球蛋白分子的CDR及其中組成構架之胺基酸殘基完全或大部分來源於人類生殖系的構架區。用於抗體或抗體片段之人類化的多種技術在此項技術中已熟知且基本上可沿用Winter及同事的方法(Jones等人，Nature,321：522-525(1986)；Riechmann等人，Nature,332：323-327(1988)；Verhoeyen等人，Science,239：1534-1536(1988))、以嚙齒動物CDR或CDR序列取代人類抗體之相應序列來進行，例如CDR移植(EP 239,400；PCT公開案第WO 91/09967號；及美國專利第4,816,567號、第6,331,415號、第5,225,539號、第5,530,101號、第5,585,089號、第6,548,640號，該等文獻之內容以全文引用的方式併入本文中)。在此等人類化抗體及抗體片段中，實質上小於完整人類可變域已經來自非人類物種的相應序列取代。人類化抗體往往為其中一些CDR殘基及可能一些構架(FR)殘基經來自嚙齒動物抗體之類似位點之殘基取代的人類抗體。抗體及抗體片段之人類化亦可藉由以下達成：鑲飾或表面重塑(EP 592,106；EP 519,596；Padlan,1991,Molecular Immunology,28(4/5)：489-498；Studnicka等人，Protein Engineering,7(6)：805-814(1994)；及Roguska等人，PNAS,91：969-973(1994))或鏈改組(美國專利第5,565,332號)，該等文獻之內容以全文引用的方式併入本文中。

選擇可用於製備人類化抗體之人類可變域(輕鏈與重鏈)將降低抗原性。根據所謂的「最佳擬合」方法，參照已知人類可變域序列之整個文庫篩選嚙齒動物抗體之可變域序列。與嚙齒動物序列最接近的人類序列接著當作人類化抗體之人類構架(FR)(Sims等人，J.Immunol.,151：2296(1993)；Chothia等人，J.Mol.Biol.,196：901(1987)，該等文獻之內容以全文引用的方式併入本文中)。另一種方法係使用來源於輕鏈或重鏈之特定亞群之所有人類抗體之共同序列的特定構架。若干種不同人類化抗體可使用相同構架(參見例如Nicholson等人，Mol.Immun.34(16-17)：1157-1165(1997)；Carter等人，Proc.Natl.Acad. Sci.USA,89：4285(1992)；Presta等人，J.Immunol.,151：2623(1993)，該等文獻之內容以全文引用的方式併入本文中)。在一些實施例中，重鏈可變區之構架區(例如全部四個構架區)來源於VH4_4-59生殖系序列。在一個實施例中，構架區可包含一個、兩個、三個、四個或五個修飾，例如取代，例如相應鼠科序列(例如SEQ ID NO：58)之胺基酸之取代。在一個實施例中，輕鏈可變區之構架區(例如全部四個構架區)來源於VK3_1.25生殖系序列。在一個實施例中，構架區可包含一個、兩個、三個、四個或五個修飾，例如取代，例如相應鼠科序列(例如SEQ ID NO：58)之胺基酸之取代。

在一些態樣中，包含抗體片段之本發明CAR組合物的一部分經人類化而對目標抗原保持高親和力及其他有利的生物特性。根據本發明之一個態樣，人類化抗體及抗體片段係藉由使用親本及人類化序列之三維模型分析親本序列及各種概念性人類化產物的方法製備。三維免疫球蛋白模型通常可獲得且為熟習此項技術者所熟知。可利用說明且顯示所選候選免疫球蛋白序列之可能三維構形結構的電腦程式。檢查此等顯示可分析殘基在候選免疫球蛋白序列之功能發揮中的可能作用，例如分析影響候選免疫球蛋白結合目標抗原之能力的殘基。以此方式，可自受者及輸入序列選擇FR殘基且加以組合，以便達成所要抗體或抗體片段的特徵，諸如對目標抗原之親和力增強。一般而言，CDR殘基直接且最實質性涉及影響抗原結合。

人類化抗體或抗體片段可保持與原始抗體相似的抗原特異性，例如在本發明中，為人類CD19的能力。在一些實施例中，人類化抗體或抗體片段可具有改良之結合至人類CD19的親和力及/或特異性。

在一個態樣中，抗-CD19結合域的特徵為抗體或抗體片段的特定功能特徵或特性。舉例而言，在一個態樣中，本發明之CAR組合物的一部分包含特異性結合人類CD19的抗原結合域。在一個態樣中，該抗原結合域與Nicholson等人，Mol.Immun.34(16-17)：1157-1165(1997)中所述的FMC63 scFv具有相同或相似的結合至人類CD19之特異性。在一個態樣中，本發明係關於包含抗原結合域的抗體或抗體片段，其中抗體結合域特異性結合至CD19蛋白或其片段，其中抗體或抗體片段包含包括胺基酸序列SEQ ID NO：1至12的可變輕鏈及/或可變重鏈。在一個態樣中，抗原結合域包含選自SEQ ID NO：1至12之scFv之胺基酸序列。在某些態樣中，scFv與前導序列為毗連的且處於同一閱讀框內。在一個態樣中，前導序列為以SEQ ID NO：13提供的多肽序列。

在一個態樣中，抗-CD19結合域為片段，例如單鏈可變片段(scFv)。在一個態樣中，抗-CD19結合域為Fv、Fab、(Fab')2，或雙功能(例如雙特異性)雜合抗體(例如Lanzavecchia等人，Eur.J.Immunol.17,105(1987))。在一個態樣中，本發明之抗體及其片段以野生型或增強之親和力結合CD19蛋白。

有時候，scFv可根據此項技術中已知的方法製備(參見例如Bird等人，(1988)Science 242：423-426及Huston等人，(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85：5879-5883)。ScFv分子可藉由使用柔性多肽連接子將VH與VL區域連接在一起而製備。scFv分子包含具有最佳化長度及/或胺基酸組成的連接子(例如Ser-Gly連接子)。連接子長度可極大地影響scFv之可變區如何摺疊及相互作用。實際上，若使用短多肽連接子(例如5至10個胺基酸之間)，則防止鏈內摺疊。亦需要鏈間摺疊以使兩個可變區一起形成功能性抗原決定基結合位點。關於連接子取向及尺寸之實例，參見例如Hollinger等人，1993 Proc Natl Acad.Sci.U.S.A.90：6444-6448；美國專利申請公開案第2005/0100543號、第2005/0175606號、第2007/0014794號及PCT公開案第WO2006/020258號及第WO2007/024715號，該等文獻以引用的方式併入本文中。

scFv在其VL與VH區域之間可包含至少1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、25個、30個、35個、40個、45個、50個或超過50個胺基酸殘基之連接子。連接子序列可包含任何天然存在之胺基酸。在一些實施例中，連接子序列包含胺基酸甘胺酸及絲胺酸。在另一個實施例中，連接子序列包含多組甘胺酸與絲胺酸重複，諸如(Gly₄Ser)n，其中n為等於或大於1之正整數(SEQ ID NO：18)。在一個實施例中，連接子可為(Gly₄Ser)₄(SEQ ID NO：106)或(Gly₄Ser)₃(SEQ ID NO：107)。連接子長度之變化可保持或增強活性，在活性研究中產生優良功效。

穩定性及突變

抗-CD19結合域(例如scFv分子(例如可溶性scFv))之穩定性可參照習知對照scFv分子或全長抗體之生物物理學特性(例如熱穩定性)加以評估。在一個實施例中，人類化scFv在所述分析中具有比對照結合分子(例如習知scFv分子)大約0.1度、約0.25度、約0.5度、約0.75度、約1度、約1.25度、約1.5度、約1.75度、約2度、約2.5度、約3度、約3.5度、約4度、約4.5度、約5度、約5.5度、約6度、約6.5度、約7度、約7.5度、約8度、約8.5度、約9度、約9.5度、約10度、約11度、約12度、約13度、約14度或約15攝氏度(degrees Celsius)的熱穩定性。

抗-CD19結合域(例如scFv)之熱穩定性改良隨後賦予整個CART19構築體，使得CART19構築體之治療特性改良。與習知抗體相比，抗-CD19結合域(例如scFv)之熱穩定性可提高至少約2℃或3℃。在一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)的熱穩定性比習知抗體提高1℃。在另一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)的熱穩定性比習知抗體提高2℃。在另一個實施例中，與習知抗體相比，scFv的熱穩定性提高4℃、5℃、6℃、7℃、8℃、9℃、10℃、11℃、12℃、13℃、 14℃、15℃。舉例而言，可在本文揭示之scFv分子與scFv VH及VL所來源之抗體之scFv分子或Fab片段之間進行比較。熱穩定性可使用此項技術中已知的方法量測。舉例而言，在一個實施例中，可量測Tm。量測Tm的方法及測定蛋白質穩定性的其他方法更詳細地描述於下文中。

scFv突變(由於可溶性scFv之人類化或直接突變誘發而產生)使scFv穩定性改變且使scFv及CART19構築體之總體穩定性提高。使用諸如Tm、溫度變性及溫度聚集之量測結果，針對鼠科scFv比較人類化scFv之穩定性。

突變型scFv之結合能力可使用實例中所述的分析法測定。

在一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)包含至少一個因人類化方法而產生的突變，使得突變型scFv將改良之穩定性賦予CART19構築體。在另一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)包含至少1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個因人類化方法而產生的突變，使得突變型scFv將改良之穩定性賦予CART19構築體。

評估蛋白質穩定性之方法

抗原結合域之穩定性可使用例如下述方法評估。此等方法可測定多個熱伸展轉移，其中最小穩定域首先伸展或限定協同伸展之多域單元的總體穩定性臨限值(例如展現單一伸展轉移之多域蛋白)。最小穩定域可以許多其他方式鑑別。可進行突變誘發以探測何域限定總體穩定性。另外，多域蛋白之蛋白酶抗性可在其中經由DSC或其他光譜法獲知最小穩定域固有地伸展的條件下進行(Fontana等人，(1997)Fold.Des.,2：R17-26；Dimasi等人，(2009)J.Mol.Biol.393：672-692)。一旦鑑別出最小穩定域，則可在該等方法中使用編碼此域的序列(或其一部分)作為測試序列。

a)熱穩定性

組合物之熱穩定性可使用此項技術中已知的許多非限制性生物物理學或生物化學技術分析。在某些實施例中，熱穩定性係藉由分析光譜學評估。

例示性分析光譜學方法為差示掃描量熱法(DSC)。DSC係使用對伴隨大多數蛋白質或蛋白域去摺疊之熱吸收靈敏的量熱計(參見例如Sanchez-Ruiz等人，Biochemistry,27：1648-52,1988)。為測定蛋白質之熱穩定性，將蛋白質樣品插入量熱計中，且提高溫度直至Fab或scFv去摺疊。蛋白質去摺疊時之溫度指示總體蛋白質穩定性。

另一種例示性分析光譜學方法為圓偏光二色性(CD)光譜學。CD光譜法係測量組合物之光學活性與提高溫度的關係。圓偏光二色性(CD)光譜學係測量因結構不對稱性而出現之左旋偏振光相對於右旋偏振光之吸光度的差值。無序或去摺疊之結構產生的CD光譜與有序或摺疊結構之CD光譜差異極大。CD光譜反映蛋白質對提高溫度之變性作用的敏感性且因此指示蛋白質熱穩定性(參見van Mierlo及Steemsma,J.Biotechnol.,79(3)：281-98,2000)。

測量熱穩定性的另一種例示性分析光譜學方法為螢光發射光譜學(參見van Mierlo及Steemsma，同上)。又一種測量熱穩定性的例示性分析光譜學方法為核磁共振(NMR)光譜學(參見例如van Mierlo及Steemsma，同上)。

組合物之熱穩定性可以生物化學測量。用於評估熱穩定性的例示性生物化學方法為熱攻擊分析法。在「熱攻擊分析法」中，使組合物在一範圍之升高溫度下經受設定的時段。舉例而言，在一個實施例中，使測試的scFv分子或包含scFv分子的分子在一範圍之增加溫度下經受例如1至1.5小時。接著利用相關的生物化學分析法分析蛋白質活性。舉例而言，若蛋白質為結合蛋白(例如scFv或含有scFv的多肽)，則可利用功能性或定量ELISA測定結合蛋白之結合活性。

此分析可以高處理量格式進行且此等揭示於使用大腸桿菌及高處理量篩選的實例中。抗-CD19結合域(例如scFv變異體)之文庫可使用此項技術中已知的方法建立。可誘導抗-CD19結合域(例如scFv)表現且可對抗-CD19結合域(例如scFv)進行熱攻擊。可分析所攻擊之測試樣品的結合性且穩定的彼等抗-CD19結合域(例如scFv)可依比例擴大且進一步表徵。

藉由使用任一種上述技術(例如分析光譜學技術)量測組合物之熔融溫度(Tm)來評估熱穩定性。熔融溫度為位於熱轉移曲線之中點的溫度，其中組合物中之50%分子呈摺疊狀態(參見例如Dimasi等人，(2009)J.Mol Biol.393：672-692)。在一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)之Tm值為約40℃、41℃、42℃、43℃、44℃、45℃、46℃、47℃、48℃、49℃、50℃、51℃、52℃、53℃、54℃、55℃、56℃、57℃、58℃、59℃、60℃、61℃、62℃、63℃、64℃、65℃、66℃、67℃、68℃、69℃、70℃、71℃、72℃、73℃、74℃、75℃、76℃、77℃、78℃、79℃、80℃、81℃、82℃、83℃、84℃、85℃、86℃、87℃、88℃、89℃、90℃、91℃、92℃、93℃、94℃、95℃、96℃、97℃、98℃、99℃、100℃。在一個實施例中，IgG之Tm值為約40℃、41℃、42℃、43℃、44℃、45℃、46℃、47℃、48℃、49℃、50℃、51℃、52℃、53℃、54℃、55℃、56℃、57℃、58℃、59℃、60℃、61℃、62℃、63℃、64℃、65℃、66℃、67℃、68℃、69℃、70℃、71℃、72℃、73℃、74℃、75℃、76℃、77℃、78℃、79℃、80℃、81℃、82℃、83℃、84℃、85℃、86℃、87℃、88℃、89℃、90℃、91℃、92℃、93℃、94℃、95℃、96℃、97℃、98℃、99℃、100℃。在一個實施例中，多價抗體之Tm值為約40℃、41℃、42℃、43℃、44℃、45℃、46℃、47℃、48℃、49℃、50℃、51℃、52℃、 53℃、54℃、55℃、56℃、57℃、58℃、59℃、60℃、61℃、62℃、63℃、64℃、65℃、66℃、67℃、68℃、69℃、70℃、71℃、72℃、73℃、74℃、75℃、76℃、77℃、78℃、79℃、80℃、81℃、82℃、83℃、84℃、85℃、86℃、87℃、88℃、89℃、90℃、91℃、92℃、93℃、94℃、95℃、96℃、97℃、98℃、99℃、100℃。

熱穩定性亦藉由使用分析量熱技術(例如DSC)量測組合物之比熱或熱容(Cp)來評估。組合物之比熱為使1mol水溫度提高1℃所必需的能量(例如kcal/mol)。較大Cp為變性或不活化蛋白質組合物之標誌。組合物之熱容變化(△Cp)係藉由在組合物發生熱轉移之前與之後測定組合物之比熱來量測。熱穩定性亦可藉由量測或測定熱力學穩定性之其他參數來評估，包括吉布斯伸展自由能(Gibbs free energy of unfolding)(△G)、伸展焓(△H)或伸展熵(△S)。利用一或多種上述生物化學分析法(例如熱攻擊分析法)測定50%組合物保持其活性(例如結合活性)時的溫度(亦即T_C值)。

另外，與未突變抗-CD19結合域(例如scFv)相比，抗-CD19結合域(例如scFv)之突變使抗-CD19結合域(例如scFv)之熱穩定性改變。當將人類化抗-CD19結合域(例如scFv)併入CART19構築體中時，抗-CD19結合域(例如人類化scFv)將熱穩定性賦予整個抗-CD19 CART構築體。在一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)包含單一突變，從而將熱穩定性賦予抗-CD19結合域(例如scFv)。在另一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)包含多個突變，從而將熱穩定性賦予抗-CD19結合域(例如scFv)。在一個實施例中，抗-CD19結合域(例如scFv)中之多個突變對抗-CD19結合域(例如scFv)之熱穩定性具有相加效應。

b)聚集%

組合物之穩定性可藉由量測其聚集傾向來測定。聚集度可利用許多非限制性生物化學或生物物理學技術量測。舉例而言，組合物之聚集度可使用層析法，例如尺寸排阻層析法(SEC)加以評估。SEC係基於尺寸來使分子分離。管柱填有聚合物凝膠之半固體珠粒，其容許離子及小分子進入其內部，但不容許大分子進入。當將蛋白質組合物施加於管柱頂部時，緊密摺疊蛋白質(亦即未聚集蛋白質)遍佈於溶劑中，此溶劑的體積大於較大蛋白質聚集物可利用的溶劑體積。因此，較大聚集物移動通過管柱的速度更快，且由此可將混合物分離或分級分離成其組分。各溶離份自凝膠溶離時，可分別定量(例如藉由光散射)各溶離份。因此，組合物之聚集%可藉由比較溶離份之濃度與施加至凝膠中之蛋白質總濃度來確定。穩定組合物基本上以單一溶離份形式自管柱溶離且在溶離曲線或層析譜中基本上呈現為單一峰。

c)結合親和力

組合物之穩定性可藉由測定其目標結合親和力來評估。此項技術中已知用於測定結合親和力的多種方法。用於測定結合親和力的例示性方法係使用表面電漿共振。表面電漿共振為一種光學現象，其允許藉由偵測生物感測基質內之蛋白質濃度變化(例如使用BIAcore系統來偵測)來分析即時生物特異性相互作用(Pharmacia Biosensor AB,Uppsala,Sweden及Piscataway,N.J.)。關於進一步描述，參見Jonsson,U.等人，(1993)Ann.Biol.Clin.51：19-26；Jonsson,U.,i(1991)Biotechniques 11：620-627；Johnsson,B.等人，(1995)J.Mol.Recognit.8：125-131；及Johnnson,B.等人，(1991)Anal.Biochem.198：268-277。

在一個態樣中，CAR之抗原結合域包含與本文所述之抗原結合域胺基酸序列同源的胺基酸序列，且該抗原結合域保持本文所述之抗-CD19抗體片段的所要功能特性。在一個特定態樣中，本發明之CAR組合物包含抗體片段。在另一個態樣中，該抗體片段包含scFv。

在各種態樣中，藉由修飾一或兩個可變區(例如VH及/或VL)內，例如一或多個CDR區域內及/或一或多個構架區內的一或多個胺基酸，而對CAR之抗原結合域進行工程改造。在一個特定態樣中，本發明之CAR組合物包含抗體片段。在另一個態樣中，該抗體片段包含scFv。

一般熟悉此項技術者將瞭解，本發明之抗體或抗體片段可經進一步修飾，以使得其在胺基酸序列上不同(例如不同於野生型)，但在所要活性上不變。舉例而言，可對蛋白質進行其他核苷酸取代，從而在「非必需」胺基酸殘基處發生胺基酸取代。舉例而言，分子中之非必需胺基酸殘基可置換為選自相同側鏈家族之另一胺基酸殘基。在另一個實施例中，一連串胺基酸可置換為在側鏈家族成員之次序及/或組成上不同的結構相似串，例如可進行保守性取代，其中胺基酸殘基置換為具有相似側鏈的胺基酸殘基。

具有相似側鏈的胺基酸殘基家族在此項技術中已有定義，包括鹼性側鏈(例如離胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如天冬胺酸、麩胺酸)、不帶電極性側鏈(例如甘胺酸、天冬醯胺酸、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸)、非極性側鏈(例如丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸、色胺酸)、β分支側鏈(例如蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)及芳族側鏈(例如酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)。

在兩個或兩個以上核酸或多肽序列之上下文中，一致性百分比係指相同的兩個或兩個以上序列。若兩個序列在比較窗或指定區域上根據最大一致性進行比較及比對時，具有指定百分比之相同胺基酸殘基或核苷酸(例如在指定區域上或未指定時則在整個序列上60%一致，視情況為70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、 98%、99%一致)，如使用以下序列比較算法之一或藉由人工比對及目測檢查所量測，則此兩個序列「實質上一致」。一致性視情況存在於長度為至少約50個核苷酸(或10個胺基酸)之區域上，或更佳存在於長度為100至500或1000或多於1000個核苷酸(或20、50、200或多於200個胺基酸)之區域上。

進行序列比較時，典型地，一個序列充當與測試序列進行比較的參考序列。使用序列比較算法時，將測試序列及參考序列輸入電腦，必要時指定子序列座標，且指定序列算法程式參數。可使用預設程式參數，或可指定替代參數。序列比較算法接著根據程式參數計算測試序列相對於參考序列之序列一致性百分比。用於比較的序列比對方法在此項技術中已熟知。用於比較之最佳序列比對可藉由以下方式進行：例如局部同源算法，Smith及Waterman,(1970)Adv.Appl.Math.2：482c；同源性比對算法，Needleman及Wunsch,(1970)J.Mol.Biol.48：443；相似性搜尋方法，Pearson及Lipman,Proc.Nat'l.Acad.Sci.USA 85：2444(1988)；此等算法之電腦化實現方式(GAP、BESTFIT、FASTA及TFASTA，Wisconsin Genetics套裝軟體，Genetics Computer Group,575 Science Dr.Madison,WI)；或人工比對及目測檢查(參見例如Brent等人，(2003)Current Protocols in Molecular Biology)。

適於測定序列一致性及序列相似性百分比的兩個算法實例為BLAST及BLAST 2.0算法，其分別描述於Altschul等人，(1977)Nuc.Acids Res.25：3389-3402；及Altschul等人，(1990)J.Mol.Biol.215：403-410中。執行BLAST分析之軟體可經由國家生物技術資訊中心(National Center for Biotechnology Information)公開獲得。

兩個胺基酸序列之間的一致性百分比亦可使用E.Meyers及W.Miller,(1988)Comput.Appl.Biosci.4：11-17之算法(該算法已併入ALIGN程式(2.0版))、使用PAM120權重殘基表、空隙長度罰分12及空隙罰分4來確定。另外，兩個胺基酸序列之間的一致性百分比可使用已併入GCG套裝軟體(可於www.gcg.com獲得)之GAP程式中的Needleman及Wunsch((1970)J.Mol.Biol.48：444-453)算法、使用Blossom 62矩陣或PAM250矩陣，以及空隙權數16、14、12、10、8、6或4及長度權數1、2、3、4、5或6來確定。

在一個態樣中，本發明涵蓋對起始抗體或片段(例如scFv)胺基酸序列的修飾，以便產生功能等效分子。舉例而言，CAR中所含之抗-CD19結合域(例如scFv)的VH或VL可經修飾而與抗-CD19結合域(例如scFv)之起始VH或VL構架區保持至少約70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%一致性。本發明涵蓋對整個CAR構築體之修飾，例如對CAR構築體之不同域之一或多個胺基酸序列的修飾，以便產生功能等效分子。CAR構築體可經修飾而與起始CAR構築體保持至少約70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%一致性。

跨膜域

就跨膜域而言，在不同實施例中，CAR可設計成包含連接至CAR胞外域的跨膜域。跨膜域可包括一或多個與跨膜區相鄰的其他胺基酸，例如一或多個與跨膜蛋白所來源之蛋白質胞外區(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10至15個胺基酸之胞外區)結合的胺基酸，及/或一或多個與跨膜蛋白所來源之蛋白質胞內區(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10至15個胺基酸之胞內區)結合的其他胺基酸。在一個態樣中，跨膜域為與所用CAR之其他域結合的跨膜域。有時候，跨膜域可經選擇或藉由胺基酸取代來修飾以避免此等域與相同或不同表面膜蛋白之跨膜域結合，例如以使與受體複合物之其他成員的相互作用最小化。在一個態樣中，跨膜域能夠與另一CAR在CART細胞表面上發生均二聚。在一個不同態樣中，跨膜域之胺基酸序列可經修飾或取代以便使與存在於同一CART中之原生結合搭配物之結合域的相互作用最小化。

跨膜域可來源於天然來源或重組來源。在來源為天然來源的情況下，跨膜域可來源於任何膜結合蛋白或跨膜蛋白。在一個態樣中，只要CAR已結合至目標，跨膜域便能夠將信號傳導至胞內域。特定用於本發明中的跨膜域可至少包括例如T細胞受體CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154之α、β或ξ鏈的跨膜區。

有時候，跨膜域可經由鉸鏈(例如來自人類蛋白質之鉸鏈)連接至CAR之胞外區，例如CAR之抗原結合域。舉例而言，在一個實施例中，鉸鏈可為人類Ig(免疫球蛋白)鉸鏈，例如IgG4鉸鏈，或CD8a鉸鏈。在一個實施例中，鉸鏈或間隔子包含(例如由以下組成)SEQ ID NO：14之胺基酸序列。在一個態樣中，跨膜域包含(例如由以下組成)SEQ ID NO：15之跨膜域。

在一個態樣中，鉸鏈或間隔子包含IgG4鉸鏈。舉例而言，在一個實施例中，鉸鏈或間隔子包含如下胺基酸序列之鉸鏈： (SEQ ID NO：45)。在一些實施例中，鉸鏈或間隔子包含由如下核苷酸序列編碼的鉸鏈： (SEQ ID NO：46)。

在一個態樣中，鉸鏈或間隔子包含IgD鉸鏈。舉例而言，在一個實施例中，鉸鏈或間隔子包含如下胺基酸序列之鉸鏈： (SEQ ID NO：47)。在一些實施例中，鉸鏈或間隔子包含由如下核苷酸序列編碼的鉸鏈： (SEQ ID NO：48)。

在一個態樣中，跨膜域可為重組跨膜域，在此情況下，其主要包含疏水性殘基，諸如白胺酸及纈胺酸。在一個態樣中，可在重組跨膜域之各端發現苯丙胺酸、色胺酸及纈胺酸之三聯體。

視情況，長度為2個胺基酸與10個胺基酸之間的短寡肽或多肽連接子可在CAR之跨膜域與胞質區之間形成連接。甘胺酸-絲胺酸二聯體提供特別適合的連接子。舉例而言，在一個態樣中，連接子包含胺基酸序列GGGGSGGGGS(SEQ ID NO：49)。在一些實施例中，連接子係由如下核苷酸序列編碼：GGTGGCGGAGGTTCTGGAGGTGGAGGTTCC(SEQ ID NO：50)。

胞質域

CAR之胞質域或區包括胞內信號傳導域。胞內信號傳導域一般負責其中已引入CAR之免疫細胞之至少一種正常效應功能的活化。術語「效應功能」係指細胞之特殊化功能。舉例而言，T細胞之效應功能可為溶胞活性或輔助活性，包括細胞激素分泌。因此，術語「胞內信號傳導域」係指蛋白質之一部分，該部分轉導效應功能信號且導引細胞執行特殊化功能。雖然通常可使用整個胞內信號傳導域，但在很多情況下，不必使用整個鏈。就使用胞內信號傳導域之截斷部分而言，可使用此截斷部分替換完整鏈，只要此截斷部分轉導效應功能信號。術語胞內信號傳導域因此意欲包括足以轉導效應功能信號之胞內信號傳導域的任何截斷部分。

用於本發明之CAR中之胞內信號傳導域的實例包括T細胞受體(TCR)及共受體之胞質序列，其協同作用以在抗原受體接合之後起始信號轉導；以及具有相同功能能力之此等序列及任何重組序列的任何衍生物或變異體。

已知經由單獨TCR所產生的信號不足以使T細胞完全活化且次級及/或共刺激信號亦為必需的。因此，據稱T細胞活化可由兩類不同的胞質信號傳導序列介導：經由TCR起始抗原依賴性初級活化的胞質信號傳導序列(初級胞內信號傳導域)，及以抗原非依賴性方式起作用以提供次級或共刺激信號的胞質信號傳導序列(次級胞質域，例如共刺激域)。

初級信號傳導域以刺激性方式或以抑制性方式調節TCR複合物之初級活化。以刺激性方式起作用的初級胞內信號傳導域可含有信號傳導基元，已知為基於免疫受體酪胺酸的活化基元或ITAM。

含有特定用於本發明中之初級胞內信號傳導域的ITAM實例包括TCRξ、FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD5、CD22、CD79a、CD79b及CD66d之彼等物。在一個實施例中，本發明之CAR包含胞內信號傳導域，例如CD3ξ之初級信號傳導域。

在一個實施例中，初級信號傳導域包含經修飾之ITAM域，例如與原生ITAM域相比，活性已改變(例如增強或降低)的突變ITAM域。在一個實施例中，初級信號傳導域包含含有經修飾之ITAM的初級胞內信號傳導域，例如含有最佳化及/或截斷之ITAM的初級胞內信號傳導域。在一個實施例中，初級信號傳導域包含一個、兩個、三個、四個或四個以上ITAM基元。

CAR之胞內信號傳導域可包含單獨的CD3ξ信號傳導域或其可與適用於本發明之CAR之背景下的任何其他所要胞內信號傳導域組合。舉例而言，CAR之胞內信號傳導域可包含CD3ξ鏈部分及共刺激信號傳導域。共刺激信號傳導域係指CAR的一部分，該部分包含共刺激分子之胞內域。共刺激分子為除抗原受體或其配位體之外的細胞表面分子，其為淋巴細胞對抗原產生有效反應所必需的。此等分子之實例包括CD27、CD28、4-1BB(CD137)、OX40、CD30、CD40、PD1、ICOS、淋巴細胞功能相關抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7-H3，及與CD83特異性結合的配位體，及其類似物。舉例而言，CD27共刺激已表明可活體外增強人類CART細胞的擴增、效應功能及存活且可活體內加強人類T細胞持久存在及抗腫瘤活性(Song等人，Blood.2012；119(3)：696-706)。

本發明CAR之胞質部分內的胞內信號傳導序列彼此間可以隨機或指定次序連接。視情況，短寡肽或多肽連接子，例如長度在2個與10個胺基酸之間(例如2、3、4、5、6、7、8、9、或10個胺基酸)的短寡肽或多肽連接子，可在胞內信號傳導序列之間形成連接。在一個實施例中，可使用甘胺酸-絲胺酸二聯體作為適合連接子。在一個實施例中，可使用單一胺基酸(例如丙胺酸、甘胺酸)作為適合連接子。

在一個態樣中，胞內信號傳導域設計成包含兩個或兩個以上(例如2、3、4、5或5個以上)共刺激信號傳導域。在一個實施例中，兩個或兩個以上(例如2、3、4、5或5個以上)共刺激信號傳導域被連接子分子(例如本文所述的連接子分子)分隔。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含兩個共刺激信號傳導域。在一些實施例中，連接子分子為甘胺酸殘基。在一些實施例中，連接子為丙胺酸殘基。

在一個態樣中，胞內信號傳導域設計成包含CD3ξ之信號傳導域及CD28之信號傳導域。在一個態樣中，胞內信號傳導域設計成包含CD3ξ之信號傳導域及4-1BB之信號傳導域。在一個態樣中，4-1BB之信號傳導域為SEQ ID NO：16之信號傳導域。在一個態樣中，CD3ξ之信號傳導域為SEQ ID NO：17之信號傳導域。

在一個態樣中，胞內信號傳導域設計成包含CD3ξ之信號傳導域及CD27之信號傳導域。在一個態樣中，CD27之信號傳導域包含胺基酸序列QRRKYRSNKGESPVEPAEPCRYSCPREEEGSTIPIQEDYRKPEPACSP(SEQ ID NO：51)。在一個態樣中，CD27之信號傳導域由如下核酸序列編碼： (SEQ ID NO：52)。

在一個態樣中，本文所述之表現CAR的細胞可進一步包含第二CAR，例如包括不同抗原結合域，例如針對相同目標(CD19)或不同目標(例如CD123)的抗原結合域。在一個實施例中，當CAR表現細胞包含兩個或兩個以上不同CAR時，不同CAR之抗原結合域可使得抗原結合域彼此間不相互作用。舉例而言，表現第一及第二CAR之細胞可具有第一CAR之抗原結合域(例如片段，例如scFv)，該抗原結合域不與第二CAR之抗原結合域形成結合，例如第二CAR之抗原結合域為VHH。

在另一個態樣中，本文所述的CAR表現細胞可進一步表現另一藥劑，例如使CAR表現細胞之活性增強的藥劑。舉例而言，在一個實施例中，藥劑可為抑制抑制性分子的藥劑。在一些實施例中，抑制性分子(例如PD1)可降低CAR表現細胞建立免疫效應反應的能力。抑制性分子之實例包括PD1、PD-L1、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及TGFRβ。在一個實施例中，抑制抑制性分子的藥劑包含第一多肽(例如抑制性分子)與向細胞提供陽性信號之第二多肽(例如本文所述的胞內信號傳導域)之結合。在一個實施例中，藥劑包含第一多肽，例如抑制性分子，諸如PD1、LAG3、CTLA4、CD160、BTLA、LAIR1、TIM3、2B4及TIGIT，或其中任一者之片段(例如其中任一者之胞外域之至少一部分)；及第二多肽，該第二多肽為本文所述的胞內信號傳導域(例如包含共刺激域(例如41BB、CD27或CD28，例如如本文所述)及/或初級信號傳導域(例如本文所述的CD3ξ信號傳導域)的胞內信號傳導域)。在一個實施例中，藥劑包含作為第一多肽的PD1或其片段(例如PD1之胞外域的至少一部分)，及作為第二多肽之本文所述胞內信號傳導域(例如本文所述的CD28信號傳導域及/或本文所述的CD3ξ信號傳導域)。

在另一個態樣中，本發明提供細胞群，其中該群體中之至少一個細胞表現具有本文所述之抗-CD19域的CAR，且第二細胞表現另一藥劑，例如使CAR表現細胞的活性增強的藥劑。舉例而言，在一個實施例中，藥劑可為抑制抑制性分子的藥劑。在一些實施例中，例如抑制性分子可降低CAR表現細胞建立免疫效應反應的能力。抑制性分子之實例包括PD1、PD-L1、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及TGFRβ。在一個實施例中，抑制抑制性分子的藥劑包含第一多肽(例如抑制性分子)與向細胞提供陽性信號之第二多肽(例如本文所述的胞內信號傳導域)之結合。在一個實施例中，藥劑包含第一多肽，例如抑制性分子，諸如PD1、LAG3、CTLA4、CD160、BTLA、LAIR1、TIM3、2B4及TIGIT，或其中任一者之片段(例如其中任一者之胞外域之至少一部分)；及第二多肽，該第二多肽為本文所述的胞內信號傳導域(例如包含共刺激域(例如41BB、CD27或CD28，例如如本文所述)及/或初級信號傳導域(例如本文所述的CD3ξ信號傳導域)的胞內信號傳導域)。在一個實施例中，藥劑包含作為第一多肽的PD1或其片段(例如PD1之胞外域的至少一部分)，及作為第二多肽之本文所述胞內信號傳導域(例如本文所述的CD28信號傳導域及/或本文所述的CD3ξ信號傳導域)。

RNA轉染

本文揭示產生活體外轉錄之RNA CAR的方法。本發明亦包括可直接轉染至細胞內的CAR編碼RNA構築體。產生用於轉染之mRNA的方法可包括使用特別設計之引子活體外轉錄(IVT)模板，隨後添加聚A，以產生構築體，該構築體含有3'及5'未轉譯序列(「UTR」)、5'帽及/或內部核糖體進入位點(IRES)、欲表現的核酸，及長度典型地為50至2000個鹼基的聚A尾(SEQ ID NO：118)。如此產生的RNA可有效地轉染不同種類的細胞。在一個態樣中，模板包括用於CAR之序列。

在一個態樣中，抗-CD19 CAR係由信使RNA(mRNA)編碼。在一個態樣中，將編碼抗-CD19 CAR的mRNA引入T細胞內以產生CART細胞。

在一個實施例中，可將活體外轉錄的RNA CAR以短暫轉染的形式引入細胞內。RNA係使用聚合酶鏈反應(PCR)產生的模板、藉由活體外轉錄而產生。來自任何來源的感興趣DNA可使用適當引子及RNA聚合酶、藉由PCR直接轉化為模板用於活體外mRNA合成。DNA來源可為例如基因組DNA、質體DNA、噬菌體DNA、cDNA、合成DNA序列或任何其他適當的DNA來源。用於活體外轉錄的所要模板為本發明之CAR。舉例而言，用於RNA CAR的模板包含含有抗腫瘤抗體之單鏈可變域的胞外區、鉸鏈區、跨膜域(例如CD8a之跨膜域)；及包括胞內信號傳導域(例如包含CD3ξ之信號傳導域及4-1BB之信號傳導域的胞內信號傳導域)的胞質區。

在一個實施例中，用於PCR的DNA含有開放閱讀框。DNA可來自天然存在之DNA序列，該DNA序列來自生物體之基因組。在一個實施例中，核酸可包括一些或全部5'及/或3'未轉譯區(UTR)。核酸可包括外顯子及內含子。在一個實施例中，用於PCR的DNA為人類核酸序列。在另一個實施例中，用於PCR的DNA為包括5'及3' UTR的人類核酸序列。DNA或者可為通常不表現於天然存在之生物體中的人工DNA序列。例示性人工DNA序列為含有基因之多個部分的DNA序列，基因之該等部分連接在一起而形成編碼融合蛋白之開放閱讀框。連接在一起之DNA的該等部分可來自單一生物體或來自超過一種生物體。

PCR用於產生供活體外轉錄用於轉染之mRNA用的模板。執行PCR的方法在此項技術中已熟知。用於PCR的引子設計成具有與作為模板用於PCR之DNA區域實質上互補的區域。如本文所用，「實質上互補」係指核苷酸序列，其中引子序列中的大部分或全部鹼基為互補的，或一或多個鹼基為非互補的或錯配的。實質上互補的序列能夠與指定DNA目標在用於PCR的黏接條件下黏接或雜合。引子可設計成與DNA模板的任何部分實質上互補。舉例而言，引子可設計成擴增通常轉錄於細胞中的核酸部分(開放閱讀框)，包括5'及3' UTR。引子亦可設計成擴增編碼所感興趣之特定域的核酸部分。在一個實施例中，引子設計成擴增人類cDNA之編碼區，包括5'及3' UTR之全部或部分。適用於PCR的引子可藉由此項技術中熟知的合成方法產生。「正向引子」為含有與待擴增之DNA序列上游之DNA模板上之核苷酸實質上互補之核苷酸區域的引子。「上游」在本文中用於指待擴增之DNA序列之相對於編碼股的位置5。「反向引子」為含有與待擴增之DNA序列下游之雙股DNA模板實質上互補之核苷酸區域的引子。「下游」在本文中用於指待擴增之DNA序列之相對於編碼股的位置3'。

本文揭示的方法中可使用適用於PCR的任何DNA聚合酶。試劑及聚合酶可購自許多來源。

亦可使用能夠促進穩定性及/或轉譯效率的化學結構。RNA較佳具有5'及3' UTR。在一個實施例中，5' UTR長度介於1個核苷酸與3000個核苷酸之間。添加至編碼區中之5'及3' UTR序列的長度可藉由不同方法改變，包括(但不限於)設計可黏接至UTR之不同區域的PCR引子。一般熟悉此項技術者使用此方法可修飾5'及3' UTR長度，此等5' 及3' UTR長度為所轉錄之RNA轉染之後達成最佳轉譯效率所必需的。

5'及3' UTR可為對於所感興趣之核酸具內源性的天然存在之5'及3' UTR。或者，對於所感興趣之核酸不具內源性的UTR序列可藉由將UTR序列併入正向及反向引子中或藉由模板之任何其他修飾來添加。使用對於所感興趣之核酸不具內源性的UTR序列可適用於修改RNA之穩定性及/或轉譯效率。舉例而言，已知3' UTR序列中之富AU元件可降低mRNA穩定性。因此，根據此項技術中熟知之UTR的特性，3' UTR可經選擇或設計成增強所轉錄RNA之穩定性。

在一個實施例中，5' UTR可含有內源性核酸之Kozak序列。或者，當對於所感興趣之核酸不具內源性的5' UTR如上所述正藉由PCR添加時，可藉由添加5' UTR序列而再設計Kozak共同序列。Kozak序列可提高一些RNA轉錄物之轉譯效率，但對於能夠有效轉譯的所有RNA而言似乎並非必需的。用於許多mRNA之Kozak序列的要求在此項技術中已知。在其他實施例中，5' UTR可為RNA病毒之5' UTR，該RNA病毒的RNA基因組在細胞中為穩定的。在其他實施例中，3'或5' UTR中可使用各種核苷酸類似物以防止核酸外切酶使mRNA降解。

為了能夠利用DNA模板合成RNA而無需進行基因選殖，轉錄之啟動子應連接至待轉錄序列上游之DNA模板。當充當RNA聚合酶之啟動子的序列添加至正向引子之5'端時，RNA聚合酶啟動子併入待轉錄之開放閱讀框上游的PCR產物中。在一個較佳實施例中，啟動子為T7聚合酶啟動子，如本文別處所述。其他有用啟動子包括(但不限於)T3及SP6 RNA聚合酶啟動子。T7、T3及SP6啟動子之共同核苷酸序列在此項技術中已知。

在一個較佳實施例中，mRNA在5'端與3'聚(A)尾均有帽，此帽決定核糖體結合、轉譯起始及mRNA在細胞中的穩定性。在環狀DNA模板(例如質體DNA)上，RNA聚合酶產生不適於在真核細胞中表現的長連環體產物。在3' UTR末端線性化之質體DNA轉錄產生正常尺寸之mRNA，此mRNA不能有效進行真核轉染，即使其在轉錄之後發生聚腺苷酸化。

在線性DNA模板上，噬菌體T7 RNA聚合酶可使轉錄物之3'端延伸超越模板之最後一個鹼基(Schenborn及Mierendorf,Nuc Acids Res.,13：6223-36(1985)；Nacheva及Berzal-Herranz,Eur.J.Biochem.,270：1485-65(2003)。

聚A/T擴展段整合至DNA模板中的習知方法為分子選殖。然而，整合至質體DNA中的聚A/T序列會引起質體不穩定性，此為獲自細菌細胞之質體DNA模板往往被缺失及其他異常高度污染的原因。此使得選殖程序不僅費力費時，而且往往不可靠。此為不利用選殖而是用聚A/T 3'擴展段建構DNA模板之方法高度合乎需要的原因。

轉錄性DNA模板之聚A/T區段可在PCR期間藉由使用含有聚T尾(諸如100T尾(SEQ ID NO：110)(尺寸可為50T至5000T(SEQ ID NO：111))的反向引子產生，或在PCR之後，藉由任何其他方法(包括(但不限於)DNA連接或活體外重組)產生。聚(A)尾亦向RNA提供穩定性且減少其降解。一般而言，聚(A)尾長度與所轉錄RNA之穩定性正相關。在一個實施例中，聚(A)尾介於100個腺苷與5000個腺苷之間(SEQ ID NO：112)。

RNA之聚(A)尾可在活體外轉錄之後，利用聚(A)聚合酶(諸如大腸桿菌聚A聚合酶(E-PAP))進一步延伸。在一個實施例中，將聚(A)尾長度自100個核苷酸延長至300個與400個核苷酸之間(SEQ ID NO：113)可使RNA轉譯效率提高約兩倍。另外，不同化學基團連接至3'端可增強mRNA穩定性。此連接可含有經修飾/人工核苷酸、適體及其他化合物。舉例而言，可利用聚(A)聚合酶將ATP類似物併入聚(A)尾中。ATP類似物可進一步增強RNA穩定性。

5'加帽亦向RNA分子提供穩定性。在一個較佳實施例中，本文揭示之方法所產生的RNA包括5'帽。5'帽係使用此項技術中已知及本文所述的技術提供(Cougot等人，Trends in Biochem.Sci.,29：436-444(2001)；Stepinski等人，RNA,7：1468-95(2001)；Elango等人，Biochim.Biophys.Res.Commun.,330：958-966(2005))。

本文揭示之方法所產生的RNA亦可含有內部核糖體進入位點(IRES)序列。IRES序列可為起始帽非依賴性核糖體結合至mRNA且促進轉譯起始的任何病毒、染色體或人工設計序列。可包括適於細胞電穿孔的任何溶質，其可含有促進細胞滲透性及生存力的因子，諸如糖、肽、脂質、蛋白質、抗氧化劑及界面活性劑。

可利用許多不同方法中的任一種方法將RNA引入目標細胞中，例如市售方法，包括(但不限於)電穿孔(Amaxa Nucleofector-II(Amaxa Biosystems,Cologne,Germany))、(ECM 830(BTX)(Harvard Instruments,Boston,Mass.)或Gene Pulser II(BioRad,Denver,Colo.)、Multiporator(Eppendort,Hamburg Germany)、利用脂質轉染法進行的陽離子性脂質體介導轉染、肽介導轉染，或生物射彈粒子遞送系統，諸如「基因槍」(參見例如Nishikawa等人，Hum Gene Ther.,12(8)：861-70(2001)。

編碼CAR的核酸構築體

本發明亦提供編碼本文所述之一或多種CAR構築體的核酸分子。在一個態樣中，核酸分子係以信使RNA轉錄物形式提供。在一個態樣中，核酸分子係以DNA構築體形式提供。

因此，在一個態樣中，本發明係關於編碼嵌合抗原受體(CAR)的分離核酸分子，其中CAR包含抗-CD19結合域(例如人類化抗-CD19結合域)、跨膜域及包括刺激域(例如共刺激信號傳導域)及/或初級信號傳導域(例如ξ鏈)的胞內信號傳導域。在一個實施例中，抗-CD19結合域為本文所述的抗-CD19結合域，例如包含選自由以下組成之群之序列的抗-CD19結合域：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，跨膜域為選自由以下組成之群之蛋白質的跨膜域：T細胞受體CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137及CD154之α、β或ξ鏈。在一個實施例中，跨膜域包含SEQ ID NO：15之序列，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，抗-CD19結合域經由鉸鏈區(例如本文所述的鉸鏈區)連接至跨膜域。在一個實施例中，鉸鏈區包含SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：45或SEQ ID NO：47或SEQ ID NO：49，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，分離核酸分子進一步包含編碼共刺激域的序列。在一個實施例中，共刺激域為選自由以下組成之群之蛋白質的功能信號傳導域：OX40、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)及4-1BB(CD137)。在一個實施例中，共刺激域包含SEQ ID NO：16之序列，或與其95-99%一致的序列。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含4-1BB之功能信號傳導域及/或CD3ξ之功能信號傳導域。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：51之序列，或與其95-99%一致的序列；及SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列，或與其95-99%一致的序列，其中組成胞內信號傳導域之該等序列係以單一多肽鏈形式同框表現。

在另一個態樣中，本發明係關於一種編碼CAR構築體的分離核酸分子，該CAR構築體包含：SEQ ID NO：13之前導序列；scFv域，該scFv域具有選自由以下組成之群之序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO： 2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12(或與其95-99%一致的序列)；SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：45或SEQ ID NO：47或SEQ ID NO：49(或與其95-99%一致的序列)之鉸鏈區；具有SEQ ID NO：15之序列(或與其95-99%一致的序列)的跨膜域；具有SEQ ID NO：16之序列的4-1BB共刺激域或具有SEQ ID NO：51之序列(或與其95-99%一致的序列)的CD27共刺激域；及具有SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列(或與其95-99%一致的序列)的CD3ξ刺激域。

在另一個態樣中，本發明係關於由核酸分子編碼的分離多肽分子。在一個實施例中，分離多肽分子包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41及SEQ ID NO：42或與其95-99%一致的序列。

在另一個態樣中，本發明係關於一種編碼嵌合抗原受體(CAR)分子的核酸分子，該嵌合抗原受體(CAR)分子包含抗-CD19結合域、跨膜域及包括刺激域的胞內信號傳導域，且其中該抗-CD19結合域包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12，或與其95-99%一致的序列。

在一個實施例中，所編碼之CAR分子進一步包含編碼共刺激域的序列。在一個實施例中，共刺激域為獲自選自由以下組成之群之蛋白質的功能信號傳導域：OX40、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)及4-1BB(CD137)。在一個實施例中，共刺激域包含 SEQ ID NO：16之序列。在一個實施例中，跨膜域為選自由以下組成之群之蛋白質的跨膜域：T細胞受體CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137及CD154之α、β或ξ鏈。在一個實施例中，跨膜域包含SEQ ID NO：15之序列。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含4-1BB之功能信號傳導域及/或ξ之功能信號傳導域。在一個實施例中，胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16之序列及SEQ ID NO：17之序列，其中組成胞內信號傳導域的該等序列係以單一多肽鏈形式同框表現。在一個實施例中，抗-CD19結合域經鉸鏈區連接至跨膜域。在一個實施例中，鉸鏈區包含SEQ ID NO：14。在一個實施例中，鉸鏈區包含SEQ ID NO：45或SEQ ID NO：47或SEQ ID NO：49。

在另一個態樣中，本發明係關於所編碼之CAR分子，其包含SEQ ID NO：13之前導序列；scFv域，該scFv域具有選自由以下組成之群之序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12，或與其95-99%一致的序列；SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：45或SEQ ID NO：47或SEQ ID NO：49之鉸鏈區；具有SEQ ID NO：15之序列的跨膜域；具有SEQ ID NO：16之序列的4-1BB共刺激域或具有SEQ ID NO：51之序列的CD27共刺激域；及具有SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列的CD3ξ刺激域。在一個實施例中，所編碼之CAR分子包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41及SEQ ID NO：42，或與其95-99%一致的序列。

編碼所要分子的核酸序列可使用標準技術、利用此項技術中已知的重組方法獲得，諸如篩選表現該基因之細胞文庫、利用已知包括該基因之載體使基因衍生化，或自含有該基因的細胞及組織直接分離。或者，可以合成方式(而非選殖)產生所感興趣的基因。

本發明亦提供其中插有本發明之DNA的載體。來源於逆轉錄病毒(諸如慢病毒)的載體為適於達成長期基因轉移的工具，原因在於該等載體允許轉殖基因達成長期穩定的整合及傳承於子代細胞中。與來源於致癌性逆轉錄病毒(諸如鼠科白血病病毒)的載體相比，慢病毒載體之額外優勢在於，其可轉導非增殖細胞，諸如肝細胞。其亦具有低免疫原性之額外優勢。

在另一個實施例中，包含編碼本發明之所要CAR之核酸的載體為腺病毒載體(A5/35)。在另一個實施例中，編碼CAR之核酸之表現可利用轉座子完成，諸如睡美人(sleeping beauty)、卷髮夾(crisper)、CAS9及鋅指核酸酶。參見下文June等人，2009Nature Reviews Immunology 9.10：704-716，該文獻以引用的方式併入本文中。

簡要言之，編碼CAR之天然或合成核酸之表現典型地藉由使編碼CAR多肽或其一部分之核酸可操作地連接至啟動子且將構築體併入表現載體中來達成。載體可適於真核細胞之複製及整合。典型的選殖載體含有轉錄及轉譯終止子、起始序列，及適用於調控所要核酸序列表現之啟動子。

利用標準基因遞送方案，本發明之表現構築體亦可用於核酸免疫及基因療法。基因遞送方法在此項技術中已知。參見例如美國專利第5,399,346號、第5,580,859號、第5,589,466號，該等專利以全文引用的方式併入本文中。在另一個實施例中，本發明提供基因療法載體。

核酸可選殖入許多類型的載體中。舉例而言，核酸可選殖入包括(但不限於)以下之載體中：質體、噬菌體質體、噬菌體衍生物、動物病毒及黏質體。特別感興趣之載體包括表現載體、複製載體、探針產生載體及測序載體。

此外，表現載體可以病毒載體形式提供至細胞中。病毒載體技術在此項技術中已熟知且描述於例如Sambrook等人，2012,MOLECULAR CLONING：A LABORATORY MANUAL，第1-4卷，Cold Spring Harbor Press,NY)，及其他病毒學及分子生物學手冊中。適用作載體的病毒包括(但不限於)逆轉錄病毒、腺病毒、腺病毒相關病毒、疱疹病毒及慢病毒。一般而言，適合載體含有在至少一種生物體中起作用的複製起點、啟動子序列、適宜的限制性內切酶位點，及一或多個可選標記(例如WO 01/96584；WO 01/29058；及美國專利第6,326,193號)。

已開發出許多基於病毒的系統用於將基因轉移至哺乳動物細胞。舉例而言，逆轉錄病毒向基因遞送系統提供適宜平台。所選基因可插入載體中且利用此項技術中已知的技術封裝於逆轉錄病毒粒子中。接著可分離出重組病毒且活體內或離體遞送至個體細胞中。此項技術中已知多種逆轉錄病毒系統。在一些實施例中，使用腺病毒載體。此項技術中已知多種腺病毒載體。在一個實施例中，使用慢病毒載體。

其他啟動子元件(例如增強子)調控轉錄起始頻率。典型地，但此等元件位於起始位點上游30-110bp區域，但是多種啟動子已顯示亦可含有位於起始位點下游的功能元件。啟動子元件之間的距離通常為柔性的，使得當元件相對於彼此間逆轉或移動時，啟動子功能得以保持。在胸苷激酶(tk)啟動子中，在活性開始降低之前，啟動子元件之間的距離可增大至相距50bp。視啟動子而定，個別元件似乎可協同地或獨立地發揮活化轉錄的作用。

能夠使CAR轉殖基因在哺乳動物T細胞中受到表現的啟動子實例為EF1a啟動子。原生EF1a啟動子驅動延伸因子-1複合物之α亞單元表現，此α亞單元負責胺醯基tRNA經酶促遞送至核糖體。EF1a啟動子已廣泛用於哺乳動物表現質體中且已顯示可有效驅動選殖入慢病毒載體中之轉殖基因表現成CAR。參見例如Milone等人，Mol.Ther.17(8)：1453-1464(2009)。在一個態樣中，EF1a啟動子包含以SEQ ID NO：100提供的序列。

啟動子之另一實例為立即早期巨細胞病毒(CMV)啟動子序列。此啟動子序列為強組成性啟動子序列，其能夠驅動可操作地連接至其之任何聚核苷酸序列受到高量表現。然而，亦可使用其他組成性啟動子序列，包括(但不限於)猿猴病毒40(SV40)早期啟動子、小鼠乳腺瘤病毒(MMTV)、人類免疫缺乏性病毒(HIV)長末端重複序列(LTR)啟動子、MoMuLV啟動子、鳥禽白血病病毒啟動子、埃-巴二氏病毒(Epstein-Barr virus)立即早期啟動子、勞氏肉瘤病毒啟動子，以及人類基因啟動子，諸如(但不限於)肌動蛋白啟動子、肌球蛋白啟動子、延伸因子-1α啟動子、血紅蛋白啟動子及肌酸激酶啟動子。此外，本發明應不限於使用組成性啟動子。亦涵蓋誘導性啟動子為本發明之一部分。使用誘導性啟動子可提供分子開關，在需要可操作地連接至其之聚核苷酸序列受到表現時，此分子開關能夠打開此表現，或當不需要表現時，能夠關閉此表現。誘導性啟動子之實例包括(但不限於)金屬硫蛋白啟動子、糖皮質激素啟動子、孕酮啟動子及四環素啟動子。

為了評估CAR多肽或其一部分之表現，待引入細胞內之表現載體亦可含有可選標記基因或報導基因或兩者以有利於自設法經由病毒載體轉染或感染的細胞群中鑑別出及選出表現細胞。在其他態樣中，可選標記可採取分離的DNA碎片形式且以共轉染程序使用。可選標記與報導基因均可側接能夠在宿主細胞中達成表現的適當調控序列。適用的可選標記包括例如抗生素抗性基因，諸如neo及其類似物。

報導基因用於鑑別潛在轉染的細胞及用於評估調控序列之功能性。一般而言，報導基因為不存在於受者生物體或組織中或不由受者生物體或組織表現的基因，及所編碼之多肽之表現可依據一些可容易偵測到之特性(例如酶活性)表明的基因。報導基因之表現係在DNA已引入受者細胞中之後的適合時間加以分析。適合的報導基因可包括編碼螢光素酶、β-半乳糖苷酶、氯黴素乙醯轉移酶、分泌性鹼性磷酸酶的基因，或綠色螢光蛋白基因(例如Ui-Tei等人，2000 FEBS Letters 479：79-82)。適合的表現系統已熟知且可利用已知技術製備或市購。一般而言，具有顯示報導基因之最高表現量之最小5'側接區域的構築體鑑別為啟動子。此等啟動子區域可連接至報導基因且用於評估藥劑調節啟動子所驅動之轉錄的能力。

將基因引入且表現於細胞內的方法在此項技術中已知。在表現載體之背景下，載體容易藉由此項技術中的任何方法引入宿主細胞內，例如哺乳動物、細菌、酵母或昆蟲細胞。舉例而言，表現載體可藉由物理、化學或生物方式轉移至宿主細胞內。

將聚核苷酸引入宿主細胞內的物理方法包括磷酸鈣沈澱、脂質轉染、粒子轟擊、微注射、電穿孔及其類似方法。用於產生包含載體及/或外源核酸之細胞的方法在此項技術中已熟知。參見例如Sambrook等人，2012,MOLECULAR CLONING：A LABORATORY MANUAL，第1-4卷，Cold Spring Harbor Press,NY。將聚核苷酸引入宿主細胞內的較佳方法為磷酸鈣轉染。

將所感興趣之聚核苷酸引入宿主細胞內的生物學方法包括使用DNA及RNA載體。病毒載體，尤其是逆轉錄病毒載體，已成為用於將基因插入哺乳動物(例如人類)細胞內的最廣泛使用方法。其他病毒載體可來源於慢病毒、痘病毒、單純疱疹病毒I、腺病毒及腺病毒相關病毒，及其類似病毒。參見例如美國專利第5,350,674號及第 5,585,362號。

用於將聚核苷酸引入宿主細胞內的化學方式包括膠體分散系統，諸如巨分子複合物、奈米膠囊、微球體、珠粒，及基於脂質的系統，包括水包油乳液、微胞、混合微胞及脂質體。用作活體外及活體內遞送媒劑的例示性膠態系統為脂質體(例如人工膜微脂粒)。可利用先前技術中靶向遞送核酸的其他方法，諸如用靶向奈米粒子或其他適合的次微米尺寸化遞送系統遞送聚核苷酸。

在使用非病毒遞送系統的情況下，例示性遞送媒劑為脂質體。預期使用脂質調配物可將核酸引入(活體外、離體或活體內)宿主細胞內。在另一個態樣中，核酸可與脂質結合。與脂質結合的核酸可囊封於脂質體之水性內部；散置於脂質體之脂質雙層內；經由與脂質體和寡核苷酸均結合之連接分子連接至脂質體；截留於脂質體內；與脂質體複合；分散於含有脂質的溶液中；與脂質混合；與脂質合併；以懸浮液形式包含於脂質中；包含於微胞中或與微胞複合；或以其他方式與脂質結合。脂質、脂質/DNA或脂質/表現載體相關組合物不限於溶液中的任何特定結構。舉例而言，其可以雙層結構形式存在，如微胞，或以「塌陷」結構形式存在。其亦可簡單地散置於溶液中，從而可能形成尺寸或形狀不均一的聚集物。脂質為可天然存在之脂肪物質，或合成脂質。舉例而言，脂質包括天然存在於細胞質中的脂滴，以及含有長鏈脂族烴及其衍生物(諸如脂肪酸、醇、胺、胺基醇及醛)的一類化合物。

適於使用的脂質可獲自商業來源。舉例而言，二肉豆蔻醯磷脂醯膽鹼(「DMPC」)可獲自Sigma,St.Louis,MO；磷酸雙十六烷基酯(「DCP」)可獲自K & K Laboratories(Plainview,NY)；膽固醇(「Choi」)可獲自Calbiochem-Behring；二肉豆蔻醯磷脂醯甘油(「DMPG」)及其他脂質可獲自Avanti Polar Lipids,Inc.(Birmingham, AL.)。脂質於氯仿或氯仿/甲醇的儲備溶液可在約-20℃儲存。氯仿係作為唯一溶劑使用，原因在於其比甲醇更容易蒸發。「脂質體」為通用術語，其包涵藉由產生封閉脂質雙層或聚集物而形成的多種單一及多層脂質媒劑。脂質體的特徵可為具有微脂粒結構，此等微脂粒結構具有磷脂雙層膜及內部水性介質。多層脂質體具有多個由水性介質分隔的脂質層。當磷脂懸浮於過量水溶液中，多層脂質體自發地形成。脂質組分經歷自重排，隨後形成閉合結構且將水及所溶溶質截留於脂質雙層之間(Ghosh等人，1991 Glycobiology 5：505-10)。然而，亦包涵在溶液中具有不同於正常微脂粒結構之結構的組合物。舉例而言，脂質可呈現微胞結構或僅以脂質分子之非均一聚集物形式存在。亦涵蓋脂染胺-核酸複合物。

為了證明宿主細胞中存在重組DNA序列，可執行多種分析，不論使用何方法將外源核酸引入宿主細胞內或以其他方式將細胞暴露於本發明之抑制劑。此等分析包括例如熟習此項技術者熟知的「分子生物學」分析，諸如南方及北方墨點法、RT-PCR及PCR；「生物化學」分析，諸如偵測特定肽之存在或不存在，例如藉由免疫方式(ELISA及西方墨點法)或藉由本文所述之鑑別屬於本發明範圍內之藥劑的分析。

本發明進一步提供包含編碼CAR之核酸分子的載體。在一個態樣中，CAR載體可直接轉導至細胞中，例如T細胞。在一個態樣中，載體為選殖載體或表現載體，例如包括(但不限於)以下之載體：一或多種質體(例如表現質體、選殖載體、微環、微載體、雙微染色體)、逆轉錄病毒及慢病毒載體構築體。在一個態樣中，載體能夠使CAR構築體在哺乳動物T細胞中得到表現。在一個態樣中，哺乳動物T細胞為人類T細胞。

T細胞源

擴增及基因修飾之前，自個體獲得T細胞源。術語「個體」意欲包括體內可引發免疫反應的活有機體(例如哺乳動物)。個體實例包括人類、犬、貓、小鼠、大鼠、及其轉殖基因物種。T細胞可獲自許多來源，包括周圍血液單核細胞、骨髓、淋巴結組織、臍帶血、胸腺組織、來自感染部位之組織、腹水、胸膜積液、脾組織及腫瘤。在本發明之某些態樣中，可使用此項技術中可獲得的任何數目個T細胞株。在本發明之某些態樣中，T細胞可獲自收集血液之裝置，血液係利用熟習此項技術者已知的任何數目個技術(諸如Ficoll^TM分離術)自個體收集。在一個較佳態樣中，藉由血球分離術自個體循環血液獲得細胞。血球分離產物典型地含有淋巴細胞，包括T細胞、單核細胞、粒細胞、B細胞、其他有核白血球、紅血球及血小板。在一個態樣中，藉由血球分離術收集的細胞可經洗滌以移除血漿部分且將細胞置放於適當緩衝液或培養基中用於隨後處理步驟。在本發明之一個態樣中，細胞係用磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)洗滌。在一個替代態樣中，洗滌溶液缺少鈣且可能缺少鎂或可能缺少許多(若非全部)二價陽離子。缺少鈣時的初始活化步驟可引起活化增強。如一般熟悉此項技術者容易瞭解，洗滌步驟可藉由熟悉此項技術者已知的方法，諸如利用半自動化「順流」離心機(例如Cobe 2991細胞處理器、Baxter CytoMate，或Haemonetics Cell Saver 5)、根據製造商說明書完成。洗滌之後，可將細胞再懸浮於多種生物相容性緩衝液中，諸如無Ca無Mg之PBS、PlasmaLyte A，或具有或不具有緩衝劑的其他鹽水溶液。或者，可移除血球分離樣品中之非所需組分且將細胞直接再懸浮於培養基中。

在一個態樣中，藉由溶解紅血球及消耗單核細胞(例如藉由PERCOLLTM梯度離心或藉由逆流離心式淘析)而將T細胞與周圍血液淋巴細胞分離。T細胞之特定子群，諸如CD3+、CD28+、CD4+、CD8+、CD45RA+及CD45RO+T細胞，可藉由陽性或陰性選擇技術進一步分離。舉例而言，在一個態樣中，T細胞係藉由與抗-CD3/抗-CD28(例如3x28)結合珠粒(諸如DYNABEADS® M-450 CD3/CD28 T)一起培育足以達成陽性選出所要T細胞的時段來分離。在一個態樣中，該時段為約30分鐘。在另一態樣中，時段範圍為30分鐘至36小時或超過36小時及其間的所有整數值。在另一態樣中，該時段為至少1、2、3、4、5或6小時。在又一個較佳態樣中，該時段為10至24小時。在一個態樣中，培育時段為24小時。在T細胞比其他類型細胞少的任何情形中，可用於分離T細胞的培育時間更長，諸如自腫瘤組織或自免疫能力受損個體分離腫瘤浸潤淋巴細胞(TIL)。此外，使用較長培育時間可增強CD8+ T細胞的捕捉效率。因此，藉由簡單地縮短或延長時間，可使T細胞結合至CD3/CD28珠粒，且/或藉由提高或降低珠粒與T細胞之比率(如本文進一步描述)，可在培養起始或在處理期間的其他時間點優先選出T細胞子群。另外，藉由提高或降低珠粒或其他表面上之抗-CD3及/或抗-CD28抗體的比率，可在培養起始或在其他所要時間點優先選出T細胞子群。熟習此項技術者將認識到，在本發明之背景下亦可使用多輪選擇。在某些態樣中，可能需要執行選擇程序及在活化及擴增過程中使用「未經選擇」的細胞。亦可對「未經選擇」的細胞再進行多輪選擇。

藉由陰性選擇來富集T細胞群可利用針對表面標記之抗體組合來完成，此等表面標記為陰性選擇細胞所獨有的。一種方法為經由陰性磁性免疫黏附或流式細胞術進行的細胞分類及/或選擇，其係使用針對存在於陰性選出之細胞上之細胞表面標記之單株抗體的混合物。舉例而言，為藉由陰性選擇來富集CD4+細胞，單株抗體混合物典型地包括針對CD14、CD20、CD11b、CD16、HLA-DR及CD8的抗體。在某些態樣中，可能需要富集或陽性選出調控性T細胞，此等T細胞典型地表現CD4+、CD25+、CD62Lhi、GITR+及FoxP3+。或者，在某些態樣中，藉由抗-C25結合珠粒或其他相似的選擇方法消耗調控性T細胞。

在一個實施例中，可選擇表現以下一或多者的T細胞群：IFN-γ、TNFα、IL-17A、IL-2、IL-3、IL-4、GM-CSF、IL-10、IL-13、顆粒酶B(granzyme B)及穿孔素(perforin)，或其他適當分子，例如其他細胞激素。可確定根據細胞表現進行篩選的方法，例如PCT公開案第WO 2013/126712號中所述的方法。

根據陽性或陰性選擇來分離所要細胞群時，細胞及表面(例如粒子，諸如珠粒)之濃度可改變。在某些態樣中，可能需要顯著降低珠粒與細胞混合在一起的體積(例如提高細胞濃度)，以確保細胞與珠粒的最大接觸。舉例而言，在一個態樣中，使用每毫升20億個細胞之濃度。在一個態樣中，使用每毫升10億個細胞之濃度。在另一個態樣中，使用每毫升大於1億個細胞。在另一個態樣中，使用每毫升1千萬、1千5百萬、2千萬、2千5百萬、3千萬、3千5百萬、4千萬、4千5百萬或5千萬個細胞之細胞濃度。在又一個態樣中，使用每毫升7千5百萬、8千萬、8千5百萬、9千萬、9千5百萬或1億個細胞之細胞濃度。在其他態樣中，可使用1.25億或1.5億個細胞之濃度。使用高濃度可引起提高之細胞產量、細胞活化及細胞擴增。此外，使用高細胞濃度可更有效地捕捉對所感興趣之目標抗原表現較弱的細胞，諸如CD28陰性T細胞，或捕捉其中存在許多腫瘤細胞之樣品(例如白血病血液、腫瘤組織等)的細胞。此等細胞群可具有治療價值且需要獲得。舉例而言，使用高濃度細胞可更有效地選擇通常具有較弱CD28表現的CD8+ T細胞。

在一個相關態樣中，可能需要使用較低濃度的細胞。藉由顯著稀釋T細胞與表面(例如粒子，諸如珠粒)之混合物，使粒子與細胞之間的相互作用最小化。由此選出高量表現所要抗原之結合至粒子的細胞。舉例而言，CD4+ T細胞表現CD28的量較高且在稀釋濃度下比CD8+ T細胞更有效地被捕捉。在一個態樣中，所用細胞濃度為5X10e6/ml。在其他態樣中，所用濃度可為約1X10⁵/ml至1X10⁶/ml，及其間的任何整數值。

在其他態樣中，細胞可在2-10℃或室溫下、在旋轉器上以不同速度培育不同的時間長度。

用於刺激的T細胞亦可在洗滌步驟之後加以冷凍。希望不受理論束縛，冷凍及隨後解凍步驟藉由移除細胞群中之粒細胞及(在某種程度上)單核細胞而得到更均一產物。洗滌步驟移除血漿及血小板之後，可將細胞懸浮於冷凍溶液中。雖然多種冷凍溶液及參數在此項技術中已知且適用於此背景，但一種方法包括使用含有20% DMSO及8%人類血清白蛋白的PBS，或含有10%葡聚糖40及5%右旋糖、20%人類血清白蛋白及7.5% DMSO的培養基，或含有31.25% Plasmalyte-A、31.25%右旋糖5%、0.45% NaCl、10%葡聚精40及5%右旋糖、20%人類血清白蛋白及7.5% DMSO的培養基，或含有例如羥乙基澱粉(Hespan)及PlasmaLyte A的其他適合細胞冷凍培養基，接著將細胞以每分鐘1°之速率冷凍至-80℃且儲存於氣相液氮儲槽中。可使用其他可控冷凍方法及在-20℃或在液氮中立即冷凍的不可控冷凍方法。

在某些態樣中，如本文所述將低溫保存細胞解凍且洗滌且在室溫下擱置一小時，隨後使用本發明方法活化。

在本發明之上下文中，亦涵蓋在可能需要本文所述之擴增細胞之前的時間，自個體收集血液樣品或血球分離產物。因而，可在需要時的任何時間點收集待擴增的細胞源，且分離及冷凍所要細胞(諸如T細胞)以便隨後以T細胞療法用於多種受益於T細胞療法的疾病或病狀，諸如本文所述者。在一個態樣中，血液樣品或血球分離產物取自一般健康個體。在某些態樣中，血液樣品或血球分離產物取自具有發生疾病之風險、但尚未發生疾病的一般健康個體，且將所感興趣之細胞分離且冷凍以便隨後使用。在某些態樣中，可將T細胞擴增、冷凍且隨後使用。在某些態樣中，在如本文所述之特定疾病診斷之後不久、但在任何治療之前，自患者收集樣品。在另一個態樣中，在任何次數之相關治療方式之前，自個體血液樣品或血球分離產物中分離出細胞，此等相關治療方式包括(但不限於)用以下藥劑治療：諸如那他珠單抗(natalizumab)、依法利珠單抗(efalizumab)之藥劑、抗病毒劑、化學療法、輻射、免疫抑制劑，諸如環孢菌素(cyclosporin)、硫唑嘌呤(azathioprine)、甲胺喋呤(methotrexate)、黴酚酸酯(mycophenolate)及FK506)、抗體或其他免疫消融劑，諸如CAMPATH、抗-CD3抗體、環磷醯胺(cytoxan)、氟達拉濱(fludarabine)、環孢菌素、FK506、雷帕黴素(rapamycin)、黴酚酸(mycophenolic acid)、類固醇、FR901228及放射。

在本發明之另一態樣中，T細胞直接獲自治療後之患者，此治療使個體中產生功能性T細胞。就此而言，已觀測到在某些癌症治療之後，尤其在損害免疫系統之藥物治療之後，治療後不久在患者自治療正常恢復期間，所得T細胞之品質可為最佳或其離體擴增的能力改良。同樣，在使用本文所述方法進行離體操作之後，此等細胞可處於較佳狀態，其移植及活體內擴增均增強。因此，本發明之上下文中涵蓋在此恢復期期間收集血液細胞，包括T細胞、樹突狀細胞，或造血譜系之其他細胞。此外，在某些態樣中，可利用遷移(例如使用GM-CSF促成遷移)及調節方案在個體中建立有利於特定細胞類型重建、再循環、再生及/或擴增的條件，尤其在治療後之限定時間窗期間。說明性細胞類型包括T細胞、B細胞、樹突狀細胞，及免疫系統之其他細胞。

活化及擴增T細胞

T細胞一般可使用以下文獻中所述的方法活化及擴增：例如美國專利6,352,694、6,534,055、6,905,680、6,692,964、5,858,358、6,887,466、6,905,681、7,144,575、7,067,318、7,172,869、7,232,566、7,175,843、5,883,223、6,905,874、6,797,514、6,867,041；及美國專利申請公開案第20060121005號。

一般而言，本發明之T細胞可藉由與一表面接觸來擴增，該表面連接有刺激CD3/TCR複合物相關信號的藥劑及刺激T細胞表面上之共刺激分子的配位體。詳言之，T細胞群可如本文所述加以刺激，諸如藉由與抗-CD3抗體或其抗原結合片段接觸或與固著於表面上之抗-CD2抗體接觸，或藉由與結合鈣離子載體之蛋白激酶C活化劑(例如苔蘚蟲素(bryostatin))接觸。共刺激T細胞表面上之輔助分子時，使用結合該輔助分子的配位體。舉例而言，T細胞群可與抗-CD3抗體及抗-CD28抗體在適於刺激T細胞增殖的條件下接觸。為了刺激CD4+ T細胞或CD8+ T細胞增殖，使用抗-CD3抗體及抗-CD28抗體。抗-CD28抗體之實例包括9.3、B-T3、XR-CD28(Diaclone,Besançon,France)，亦可此項技術中通常已知的其他方法(Berg等人，Transplant Proc.30(8)：3975-3977,1998；Haanen等人，J.Exp.Med.190(9)：13191328,1999；Garland等人，J.Immunol Meth.227(1-2)：53-63,1999)。

在某些態樣中，T細胞的初級刺激信號及共刺激信號可根據不同方案提供。舉例而言，提供各信號的藥劑可溶於溶液中或偶連至表面。偶連至表面時，藥劑可偶連至同一表面(亦即呈「順式」形式)或偶連至各別表面(亦即呈「反式」形式)。或者，一種藥劑可偶連至表面且另一種藥劑溶於溶液中。在一個態樣中，提供共刺激信號的藥劑結合至細胞表面且提供初級活化信號的藥劑溶於溶液中或偶連至表面。在某些態樣中，兩種藥劑均可溶於溶液中。在一個態樣中，藥劑可呈可溶性形式，且接著與表面(諸如表現Fc受體或抗體或結合至藥劑之其他結合劑的細胞)發生交聯。就此而言，參見例如美國專利申請公開案第20040101519號及第20060034810號中關於人工抗原呈遞細胞(aAPC)的內容，預期其可在本發明中用於T細胞之活化及擴增。

在一個態樣中，兩種藥劑固著於珠粒上，固著於同一珠粒上(亦即「順式」)或固著於各別珠粒上(亦即「反式」)。舉例而言，提供初級活化信號的藥劑為抗-CD3抗體或其抗原結合片段且提供共刺激信號的藥劑為抗-CD28抗體或其抗原結合片段；且兩種藥劑均以相等分子的量共固著於同一珠粒上。在一個態樣中，使用結合至珠粒之各抗體之1：1比率用於CD4+ T細胞擴增及T細胞生長。在本發明之某些態樣中，使用結合至珠粒之抗CD3：CD28抗體比率應使得所觀測到之T細胞擴增比使用1：1比率所觀測到之擴增增加。在一個特定態樣中，與使用1：1比率所觀測到之擴增相比，觀測到約1至約3倍之增加。在一個態樣中，結合至珠粒之CD3：CD28抗體的比率係在100：1至1：100範圍內及其間的所有整數值。在本發明之一個態樣中，結合至粒子的抗-CD28抗體比抗-CD3抗體多，亦即CD3：CD28比率小於1。在本發明之某些態樣中，結合至珠粒之抗CD28抗體與抗CD3抗體的比率大於2：1。在一個特定態樣中，使用結合至珠粒之抗體之1：100 CD3：CD28比率。在一個態樣中，使用結合至珠粒之抗體之1：75 CD3：CD28比率。在另一個態樣中，使用結合至珠粒之抗體之1：50 CD3：CD28比率。在一個態樣中，使用結合至珠粒之抗體之1：30 CD3：CD28比率。在一個較佳態樣中，使用結合至珠粒之抗體之1：10 CD3：CD28比率。在一個態樣中，使用結合至珠粒之抗體之1：3 CD3：CD28比率。在又一個態樣中，使用結合至珠粒之抗體之3：1 CD3：CD28比率。

可利用1：500至500：1之粒子與細胞比率及其間的任何整數值來刺激T細胞或其他目標細胞。如一般熟習此項技術者可容易瞭解，就目標細胞而言，粒子與細胞之比率可視粒徑而定。舉例而言，小尺寸珠粒僅可結合幾個細胞，而較大珠粒可結合許多。在某些態樣中，細胞與粒子之比率係在1：100至100：1範圍內及其間的任何整數值，且在其他態樣中，亦可利用包含1：9至9：1及其間任何整數值的比率來刺激T細胞。抗-CD3偶合粒子及抗-CD28偶合粒子與T細胞之引起T細胞刺激的比率可如上文所述改變，然而某些較佳值包括1：100、1：50、1：40、1：30、1：20、1：10、1：9、1：8、1：7、1：6、1：5、1：4、1：3、1：2、1：1、2：1、3：1、4：1、5：1、6：1、7：1、8：1、9：1、10：1及15：1，其中一個較佳比率為至少1：1粒子：T細胞。在一個態樣中，使用1：1或小於1：1之粒子與細胞比率。在一個特定態樣中，較佳的粒子：細胞比率為1：5。在其他態樣中，粒子與細胞之比率可根據刺激的日子而改變。舉例而言，在一個態樣中，粒子與細胞之比率在第一天為1：1至10：1，且之後每天或每隔一天向細胞中添加其他粒子歷時長達10天，最終比率為1：1至1：10(根據添加當天的細胞計數)。在一個特定態樣中，粒子與細胞之比率在刺激第一天為1：1且在刺激第三天及第五天調整至1：5。在一個態樣中，粒子係每天或每隔一天添加，在刺激第一天的最終比率為1：1，在刺激第三天及第五天為1：5。在一個態樣中，粒子與細胞之比率在刺激第一天為2：1且在刺激第三天及第五天調整至1：10。在一個態樣中，粒子係每天或每隔一天添加，在刺激第一天的最終比率為1：1，在刺激第三天及第五天為1：10。熟習此項技術者將瞭解，多種其他比率可適用於本發明。詳言之，比率將根據粒徑及細胞尺寸及類型而改變。在一個態樣中，最典型的使用比率在第一天為約1：1、2：1及3：1。

在本發明之其他態樣中，將細胞(諸如T細胞)與塗佈藥劑之珠粒合併，隨後將珠粒與細胞分離，且接著培養細胞。在一個替代態樣中，培養之前，塗佈藥劑之珠粒與細胞不分離，而是在一起培養。在另一個態樣中，首先藉由施加力(諸如磁力)而將珠粒與細胞濃縮，從而增強細胞表面標記之連接，藉此誘導細胞刺激。

舉例而言，細胞表面蛋白可藉由允許抗-CD3及抗-CD28所連接之順磁性珠粒(3x28個珠粒)接觸T細胞來連接。在一個態樣中，將細胞(例如10⁴至10⁹個T細胞)與珠粒(例如DYNABEADS® M-450 CD3/CD28 T順磁性珠粒，1：1比率)合併於緩衝劑(例如PBS(不含二價陽離子，諸如鈣及鎂))中。又，一般熟習此項技術者可容易瞭解，可使用任何細胞濃度。舉例而言，目標細胞在樣品中可為極其稀少的且在樣品中僅佔0.01%，或整個樣品(亦即100%)可包含所感興趣之目標細胞。因此，本發明之上下文涵蓋任何細胞數目。在某些態樣中，可能需要顯著降低粒子與細胞混合在一起的體積(亦即提高細胞濃度)，以確保細胞與粒子的最大接觸。舉例而言，在一個態樣中，使用每毫升約20億個細胞之濃度。在一個態樣中，使用每毫升大於1億個細胞。在另一個態樣中，使用每毫升1千萬、1千5百萬、2千萬、2千5百萬、3千萬、3千5百萬、4千萬、4千5百萬或5千萬個細胞之細胞濃度。在又一個態樣中，使用每毫升7千5百萬、8千萬、8千5百萬、9千萬、9千5百萬或1億個細胞之細胞濃度。在其他態樣中，可使用1.25億或1.5億個細胞之濃度。使用高濃度可引起提高之細胞產量、細胞活化及細胞擴增。此外，使用高細胞濃度允許更有效地捕捉對所感興趣之目標抗原表現較弱的細胞，諸如CD28陰性T細胞。此等細胞群可具有治療價值且在某些態樣中需要獲得。舉例而言，使用高濃度細胞可更有效地選擇通常具有較弱CD28表現的CD8+ T細胞。

在本發明之一個態樣中，混合物可培養數小時(約3小時)至約14天或其間的任何以小時計之整數值。在一個態樣中，混合物可培養21天。在本發明之一個態樣中，珠粒與T細胞一起培養約八天。在一個態樣中，珠粒與T細胞一起培養2至3天。亦可能需要多輪刺激，以致T細胞之培養時間可為60天或超過60天。適於培養T細胞的條件包括適當培養基(例如最低必需培養基或RPMI培養基1640，或X-vivo 15(Lonza))，該培養基可含有為增殖及生存力所必需的因子，包括血清(例如胎牛或人類血清)、介白素-2(IL-2)、胰島素、IFN-γ、IL-4、IL-7、GM-CSF、IL-10、IL-12、IL-15、TGFβ及TNF-α，或熟習此項技術者已知用於細胞生長的任何其他添加劑。用於細胞生長的其他添加劑包括(但不限於)界面活性劑、人血漿蛋白粉(plasmanate)，及還原劑，諸如N-乙醯基-半胱胺酸及2-巰基乙醇。培養基可包括RPMI 1640、AIM-V、DMEM、MEM、α-MEM、F-12、X-Vivo 15及X-Vivo 20、Optimizer，其添加有胺基酸、丙酮酸鈉及維生素，不含血清或補充有適量血清(或血漿)或一組限定的激素，及/或足以供T細胞生長及擴增的適量細胞激素。抗生素(例如青黴素及鏈黴素)僅包括於實驗性培養物中，而不包括於待輸注至個體中的細胞培養物中。目標細胞係在支持生長所必需的條件下維持，例如適當溫度(例如37℃)及氛圍(例如空氣+5% CO₂)。

已暴露於刺激不同時間的T細胞可展現不同特徵。舉例而言，典型的血液或血球分離之周圍血液單核細胞產物具有大於細胞毒性或抑制性T細胞群(TC，CD8+)的輔助性T細胞群(TH，CD4+)。藉由刺激CD3及CD28受體而對T細胞進行離體擴增，產生的T細胞群在約8至9天之前主要由TH細胞組成，而在約8至9天之後，T細胞群包含逐漸增大的TC細胞群。因此，視治療目的而定，將主要包含TH細胞之T細胞群輸注入個體可為有利的。類似地，若已分離出TC細胞之抗原特異性亞群，則擴增此亞群更為有利。

此外，除CD4及CD8標記之外，其他表型標記顯著不同，但在細胞擴增過程中大部分可再生。因此，此再生性使得定製活化T細胞產物用於特定目的能夠實現。

CD19 CAR一經建構，則可利用各種分析法評估分子活性，諸如 (但不限於)抗原刺激之後擴增T細胞的能力、缺少再刺激時維持T細胞擴增的能力，及在適當活體外及動物模型中的抗癌活性。評估CD19 CAR作用的分析法更詳細地描述於下文中。

可利用西方墨點法分析初級T細胞中之CAR表現以偵測單體及二聚體之存在。參見例如Milone等人，Molecular Therapy 17(8)：1453-1464(2009)。簡言之，表現CAR的T細胞(CD4⁺ T細胞與CD8⁺ T細胞之1：1混合物)在活體外擴增超過10天，隨後進行溶胞且在還原條件下進行SDS-PAGE。使用針對TCR-ζ鏈的抗體、藉由西方墨點法偵測含有全長TCR-ζ胞質域及內源性TCR-ζ鏈的CAR。使用相同T細胞亞群在非還原條件下進行SDS-PAGE分析以便評估共價二聚體形成。

抗原刺激之後的CAR⁺ T細胞活體外擴增可藉由流式細胞術量測。舉例而言，用αCD3/αCD28 aAPC刺激CD4⁺ T細胞與CD8⁺ T細胞之混合物，隨後在啟動子的控制下用表現GFP的慢病毒載體轉導以便分析。例示性啟動子包括CMV IE基因、EF-1α、泛素C，或磷酸甘油激酶(PGK)啟動子。培養第6天，藉由流式細胞術評估CD4⁺及/或CD8⁺ T細胞亞群中的GFP螢光。參見例如Milone等人，Molecular Therapy 17(8)：1453-1464(2009)。或者，在第0天，用塗佈αCD3/αCD28之磁性珠粒刺激CD4⁺ T細胞與CD8⁺ T細胞之混合物，且在第1天，使用表現CAR以及eGFP的雙順反子慢病毒載體、使用2A核蛋白體的跳躍序列、用CAR轉導，洗滌之後，在抗-CD3及抗-CD28抗體(K562-BBL-3/28)存在下，用CD19⁺ K562細胞(K562-CD19)、野生型K562細胞(K562野生型)或表現hCD32及4-1BBL的K562細胞再刺激培養物。每隔一天，向培養物中添加100IU/ml的外源IL-2。藉由流式細胞術，使用基於珠粒的計數法對GFP⁺ T細胞進行計數。參見例如Milone等人，Molecular Therapy 17(8)：1453-1464(2009)。

亦可在再刺激不存在的情況下量測所維持的CAR⁺ T細胞擴增。參見例如Milone等人，Molecular Therapy 17(8)：1453-1464(2009)。簡言之，第0天用塗佈αCD3/αCD28之磁性珠粒刺激且第1天用指定CAR轉導之後，在培養第8天使用Coulter Multisizer III粒子計數器量測平均T細胞體積(fl)。

亦可使用動物模型量測CART活性。舉例而言，可使用異種移植物模型，其使用人類CD19特異性CAR⁺ T細胞治療免疫缺乏小鼠之原發人類前B ALL。參見例如Milone等人，Molecular Therapy 17(8)：1453-1464(2009)。簡言之，建立ALL之後，小鼠隨機分入處理組。將數目不同的αCD19-ζ及αCD19-BB-ζ工程改造T細胞以1：1比率共注入具有B-ALL的NOD-SCID-γ^-/-小鼠中。在注射T細胞之後的不同時間，評估小鼠脾DNA中之αCD19-ζ及αCD19-BB-ζ載體複本的數目。每隔一週評估動物白血病。量測經αCD19-ζ CAR⁺ T細胞或模擬物轉導T細胞注射之小鼠之周圍血液CD19⁺ B-ALL母細胞計數。使用對數秩檢驗法對各群組之存活曲線進行比較。另外，T細胞注射之後第4週，亦可分析NOD-SCID-γ^-/-小鼠之周圍血液中的CD4⁺及CD8⁺ T細胞絕對計數。將白血病細胞注入小鼠且3週後將T細胞注入小鼠，此等T細胞經工程改造以藉由編碼連接至eGFP之CAR的雙順反子慢病毒載體表現CAR。T細胞在注射之前藉由與模擬物轉導細胞混合而校正為45-50%輸入GFP⁺ T細胞，且藉由流式細胞術證明。每隔一週評估動物白血病。使用對數秩檢驗法對CAR⁺ T細胞組之存活曲線進行比較。

可評估劑量依賴性CAR治療反應。參見例如Milone等人，Molecular Therapy 17(8)：1453-1464(2009)。舉例而言，在小鼠中建立白血病之後，第21天注入CAR T細胞、相等數目個模擬物轉導T細胞或不注入T細胞，第35至70天獲得周圍血液。各組小鼠隨機放血以便測定周圍血液CD19⁺ ALL母細胞計數且接著在第35及49天處死。剩餘動物在第57及70天評估。

對細胞增殖及細胞激素產生之評估先前已描述於例如Milone等人，Molecular Therapy 17(8)：1453-1464(2009)。簡言之，在微量滴定盤中，藉由將經洗滌之T細胞與表現CD19(K19)或CD32及CD137(KT32-BBL)之K562細胞以2：1之最終T細胞：K562比率混合來評估CAR介導之增殖。K562細胞在使用之前用γ輻射照射。將抗-CD3(純系OKT3)及抗-CD28(純系9.3)單株抗體添加至具有KT32-BBL細胞的培養物中以用作刺激T細胞增殖的陽性對照物，原因在於此等信號證明CD8⁺ T細胞之長期離體擴增。使用CountBright^TM螢光珠粒(Invitrogen,Carlsbad,CA)及流式細胞術，如製造商所述，對培養物中的T細胞進行計數。使用經表現連有eGFP-2A之CAR之慢病毒載體工程改造的T細胞、根據GFP表現來鑑別CAR⁺ T細胞。對於不表現GFP之CAR⁺ T細胞而言，使用生物素化重組CD19蛋白及次級抗生物素蛋白-PE結合物偵測CAR⁺ T細胞。T細胞上之CD4⁺及CD8⁺表現亦同時用特異性單株抗體(BD Biosciences)偵測。使用人類TH1/TH2細胞激素細胞量測珠粒陣列套組(BD Biosciences,San Diego,CA)，根據製造商說明書，對再刺激後24小時收集的上清液進行細胞激素量測。使用FACScalibur流式細胞儀評估螢光，且根據製造商說明書分析資料。

藉由標準51Cr釋放分析來評估細胞毒性。參見例如Milone等人，Molecular Therapy 17(8)：1453-1464(2009)。簡言之，目標細胞(K562細胞株及原發前B-ALL細胞)在37℃、在頻繁攪拌下用51Cr(如NaCrO₄,New England Nuclear,Boston,MA)裝載2小時，用完全RPMI洗滌兩次且塗鋪於微量滴定盤中。在各孔中，將效應T細胞與目標細胞以效應T細胞：目標細胞之不同比率(E：T)混合於完全RPMI中。亦製備僅含有培養基(自發釋放，SR)或triton-X 100洗滌劑之1%溶液(總釋放，TR)的其他孔。在37℃培育4小時之後，收穫各孔之上清液。接著使用γ粒子計數器(Packard Instrument Co.,Waltham,MA)量測所釋放之 51Cr。各條件至少一式三份進行，且使用下式計算溶胞百分比：溶胞%=(ER-SR)/(TR-SR)，其中ER表示各實驗條件下之平均51Cr釋放。

可利用成像技術評估患腫瘤動物模型中之CAR的特異性移動及增殖。此等分析法已描述於例如Barrett等人，Human Gene Therapy 22：1575-1586(2011)。簡言之，將Nalm-6細胞IV注入NOD/SCID/γc^-/-(NSG)小鼠中，7天後將電穿孔導入CAR構築體之後4小時的T細胞注入。T細胞用慢病毒穩定轉染以表現螢火蟲螢光素酶，且對小鼠的生物發光進行成像。或者，可以下量測在Nalm-6異種移植物模型中單一注射CAR⁺ T細胞的治療功效及特異性：將經轉導以穩定表現螢火蟲螢光素酶的Nalm-6注入NSG小鼠中，接著在7天後，單一尾靜脈注射經電穿孔而導入CD19 CAR的T細胞。在注射後的不同時間點，對動物進行成像。舉例而言，可產生代表性小鼠在第5天(治療前2天)及第8天(CAR⁺ PBL後24小時)之螢火蟲螢光素酶陽性白血病的光子密度熱圖。

亦可利用其他分析法(包括本文實例章節中所述的分析法以及此項技術中已知的分析法)評估本發明之CD19 CAR構築體。

治療性應用 CD19相關疾病及/或病症

在一個態樣中，本發明提供治療與CD19表現相關之疾病的方法。在一個態樣中，本發明提供治療疾病的方法，其中腫瘤之一部分對CD19呈陰性且腫瘤之一部分對CD19呈陽性。舉例而言，本發明之CAR適用於治療因與CD19表現提高相關之疾病而已經歷治療的個體，其中因CD19含量提高而已經歷治療的個體展現與CD19含量提高相關的疾病。

在一個態樣中，本發明係關於載體，其包含可操作地連接至啟動子以便在哺乳動物T細胞中表現的CD19 CAR。在一個態樣中，本發明提供表現CD19 CAR之重組T細胞，其用於治療表現CD19之腫瘤，其中表現CD19 CAR的重組T細胞稱為CD19 CART。在一個態樣中，本發明之CD19 CART能夠使腫瘤細胞與其表面上所表現之本發明至少一種CD19 CAR接觸，以使得CART靶向腫瘤細胞且抑制腫瘤生長。

在一個態樣中，本發明係關於一種抑制表現CD19之腫瘤細胞之生長的方法，包含使腫瘤細胞與本發明之CD19 CAR T細胞接觸，以使得CART回應抗原而活化且靶向癌細胞，其中腫瘤生長受到抑制。

在一個態樣中，本發明係關於一種治療個體之癌症的方法。方法包含將本發明之CD19 CAR T細胞投與個體，以便治療個體之癌症。本發明之CD19 CAR T細胞可治療之癌症實例為與CD19表現相關之癌症。在一個態樣中，與CD19表現相關之癌症為血液癌症。在一個態樣中，血液癌症為白血病或淋巴瘤。在一個態樣中，與CD19表現相關的癌症包括癌症及惡性疾病，包括(但不限於)例如一或多種急性白血病，包括(但不限於)例如B細胞急性淋巴細胞性白血病(「BALL」)、T細胞急性淋巴細胞性白血病(「TALL」)、急性淋巴細胞性白血病(ALL)；一或多種慢性白血病，包括(但不限於)例如慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴細胞性白血病(CLL)。與CD19表現相關的其他癌症或血液病狀包括(但不限於)例如B細胞前淋巴細胞性白血病、母細胞性類漿細胞樹突狀細胞贅生物、伯基特氏淋巴瘤、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、毛細胞白血病、小細胞或大細胞濾泡性淋巴瘤、惡性淋巴組織增生病狀、MALT淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、邊緣區淋巴瘤、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良及骨髓發育不良症候群、非霍奇金氏淋巴瘤、漿母細胞性淋巴瘤、類漿細胞樹突狀細胞贅生物、瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症，及「白血病前期」，「白血病前期」為血液病狀之多樣化集合合併骨髓血液細胞之無效產生(或發育不良)，及其類似病狀。此外，與CD19表現相關的疾病包括(但不限於)例如非典型性及/或非經典癌症、惡性疾病、癌前期病狀或與CD19表現相關的增生性疾病。

在一些實施例中，可用CD19 CAR(例如本文所述)治療的癌症為多發性骨髓瘤。多發性骨髓瘤為血液癌症，其特徵為漿細胞純系積聚於骨髓中。多發性骨髓瘤之當前療法包括(但不限於)雷利度胺(lenalidomide)治療，雷利度胺為沙立度胺(thalidomide)之類似物。雷利度胺的活性包括抗腫瘤活性、血管生成抑制作用及免疫調節作用。一般而言，在流式細胞術中，骨髓瘤細胞被認為對CD19表現呈陰性。本發明包涵對很小百分比之骨髓瘤腫瘤細胞表現CD19的識別，如實例6中所表明。因此，在一些實施例中，C19 CAR(例如本文所述)可用於靶向骨髓瘤細胞。在一些實施例中，CD19 CAR療法可與一或多種其他療法(例如雷利度胺治療)組合使用。

本發明包括一種細胞療法，其中T細胞經基因修飾以表現嵌合抗原受體(CAR)且CAR T細胞注入有需要之受者。所注入之細胞能夠殺死受者體內之腫瘤細胞。與抗體療法不同，經CAR修飾之T細胞能夠活體內複製，從而長期持久存在，使得腫瘤控製得以維持。在不同態樣中，T細胞投與患者之後，投與患者的T細胞或其子代在患者體內持續存在至少四個月、五個月、六個月、七個月、八個月、九個月、十個月、十一個月、十二個月、十三個月、十四個月、十五個月、十六個月、十七個月、十八個月、十九個月、二十個月、二十一個月、二十二個月、二十三個月、兩年、三年、四年或五年。

本發明亦包括一種細胞療法，其中T細胞經修飾(例如經活體外轉錄之RNA修飾)以短暫地表現嵌合抗原受體(CAR)且CAR T細胞注入有需要之受者。所注入之細胞能夠殺死受者體內之腫瘤細胞。因此，在不同態樣中，T細胞投與患者之後，投與患者的T細胞存在少於一個月，例如三週、兩週、一週。

不希望受任何特定理論束縛，經CAR修飾之T細胞所引起的抗腫瘤免疫反應可為主動或被動免疫反應，或者可歸因於直接相對於間接的免疫反應。在一個態樣中，經CAR轉導之T細胞展現特異性促炎性細胞激素分泌及強溶胞活性作為對表現CD19之人類癌細胞的反應、抵制可溶性CD19抑制、介導旁觀者殺死作用且介導所建立之人類腫瘤消退。舉例而言，表現CD19之腫瘤之非均質區內的抗原較少腫瘤細胞容易被再導向CD19之T細胞間接摧毀，此等T細胞先前已有針對相鄰抗原陽性癌細胞的反應。

在一個態樣中，本發明之經完全人類CAR修飾之T細胞可為一種用於離體免疫之疫苗及/或哺乳動物之活體內療法。在一個態樣中，哺乳動物為人類。

就離體免疫而言，細胞投與哺乳動物之前，活體外存在以下至少一者：i)擴增細胞；ii)將編碼CAR的核酸引入細胞；或iii)低溫保存細胞。

離體程序在此項技術中已熟知且更充分地論述於下文中。簡言之，自哺乳動物(例如人類)分離出細胞且用表現本文所揭示之CAR的載體進行基因修飾(亦即活體外轉導或轉染)。經CAR修飾之細胞可投與哺乳動物受者以提供治療益處。哺乳動物受者可為人類且經CAR修飾之細胞相對於受者而言可為自體的。或者，就受者而言，細胞可為同種異體的、同源基因的或異源基因的細胞。

用於離體擴增造血幹細胞及祖細胞的程序描述於美國專利第5,199,942號中，該專利以引用的方式併入本文中，且可應用於本發明之細胞。其他適合方法在此項技術中已知，因此本發明不限於離體擴增細胞的任何特定方法。簡言之，T細胞之離體培養及擴增包含：(1)利用周圍血液收穫或骨髓外植體自哺乳動物收集CD34+造血幹細胞及祖細胞；及(2)離體擴增此等細胞。除美國專利第5,199,942號中所述的細胞生長因子之外，可利用其他因子(諸如flt3-L、IL-1、IL-3及c-kit配位體)培養及擴增細胞。

除在離體免疫方面使用基於細胞之疫苗之外，本發明亦提供用於活體內免疫的組合物及方法，以在患者體內引起針對抗原的免疫反應。

一般而言，如本文所述活化且擴增的細胞可用於治療及預防免疫能力受損之個體中出現的疾病。詳言之，本發明之經CAR修飾的T細胞係用於治療與CD19表現相關的疾病、病症及病狀。在某些態樣中，本發明之細胞用於治療處於發生與CD19表現相關之疾病、病症及病狀之風險的患者。因此，本發明提供治療或預防與CD19表現相關之疾病、病症及病狀的方法，包含向有需要之個體投與治療有效量之本發明之經CAR修飾的T細胞。

在一個態樣中，本發明之CART細胞可用於治療增生性疾病，諸如癌症或惡性疾病，或癌前期病狀，諸如骨髓發育不良、骨髓發育不良症候群或白血病前期。在一個態樣中，癌症為血液癌症。在一個態樣中，血液癌症為白血病或淋巴瘤。在一個實施例中，本發明之CART細胞可用於治療癌症及惡性疾病，諸如(但不限於)例如急性白血病，包括(但不限於)例如B細胞急性淋巴細胞性白血病(「BALL」)、T細胞急性淋巴細胞性白血病(「TALL」)、急性淋巴細胞性白血病(ALL)；一或多種慢性白血病，包括(但不限於)例如慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴細胞性白血病(CLL)；其他血液癌症或血液病狀，包括(但不限於)例如B細胞前淋巴細胞性白血病、母細胞性類漿細胞樹突狀細胞贅生物、伯基特氏淋巴瘤、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、毛細胞白血病、小細胞或大細胞濾泡性淋巴瘤、惡性淋巴組織增生病狀、MALT淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、邊緣區淋巴瘤、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良及骨髓發育不良症候群、非霍奇金氏淋巴瘤、漿母細胞性淋巴瘤\類漿細胞樹突狀細胞贅生物\瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症，及「白血病前期」，白血病前期為血液學病狀之多樣化集合合併骨髓血液細胞之無效產生(或發育不良)，及其類似病狀。此外，與CD19表現相關的疾病包括(但不限於)例如非典型性及/或非經典癌症、惡性疾病、癌前期病狀或表現CD19的增生性疾病。與CD19表現相關的非癌症相關適應症包括(但不限於)例如自體免疫疾病(例如狼瘡)、炎症(過敏症及哮喘)及移植。

本發明之經CAR修飾之T細胞可單獨投與，或以與稀釋劑及/或其他組分(諸如IL-2或其他細胞激素或細胞群)組合之醫藥組合物形式投與。

血液癌症

血液癌症病狀為影響血液、骨髓及淋巴系統的癌症類型，諸如白血病及惡性淋巴增生病狀。

白血病可分類為急性白血病及慢性白血病。急性白血病可進一步分類為急性骨髓性白血病(AML)及急性淋巴性白血病(ALL)。慢性白血病包括慢性骨髓性白血病(CML)及慢性淋巴性白血病(CLL)。其他相關病狀包括骨髓發育不良症候群(MDS，先前稱為「白血病前期」)，其為血液病狀之多樣化集合合併骨髓血液細胞之無效產生(或發育不良)及轉型為AML之風險。

本發明提供治療癌症的組合物及方法。在一個態樣中，癌症為血液癌症，包括(但不限於)作為白血病或淋巴瘤的血液癌症。在一個實施例中，本發明之CART細胞可用於治療癌症及惡性疾病，諸如(但不限於)例如急性白血病，包括(但不限於)例如B細胞急性淋巴細胞性白血病(「BALL」)、T細胞急性淋巴細胞性白血病(「TALL」)、急性淋巴細胞性白血病(ALL)；一或多種慢性白血病，包括(但不限於)例如慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴細胞性白血病(CLL)；其他血液癌症或血液病狀，包括(但不限於)例如B細胞前淋巴細胞性白血病、母細胞性類漿細胞樹突狀細胞贅生物、伯基特氏淋巴瘤、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、毛細胞白血病、小細胞或大細胞濾泡性淋巴瘤、惡性淋巴組織增生病狀、MALT淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、邊緣區淋巴瘤、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良及骨髓發育不良症候群、非霍奇金氏淋巴瘤、漿母細胞性淋巴瘤\類漿細胞樹突狀細胞贅生物\瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症，及「白血病前期」，白血病前期為血液學病狀之多樣化集合合併骨髓血液細胞之無效產生(或發育不良)，及其類似病狀。此外，與CD19表現相關的疾病包括(但不限於)例如非典型性及/或非經典癌症、惡性疾病、癌前期病狀或表現CD19的增生性疾病。

本發明亦提供抑制CD19表現細胞群之增殖或減少CD19表現細胞群的方法，方法包含使包含CD19表現細胞的細胞群與本發明之結合至CD19表現細胞的抗CD19 CART細胞接觸。在一個特定態樣中，本發明提供抑制CD19表現癌細胞群之增殖或減少CD19表現癌細胞群的方法，方法包含使CD19表現癌細胞群與本發明之結合至CD19表現細胞的抗-CD19 CART細胞接觸。在一個態樣中，本發明提供抑制CD19表現癌細胞群之增殖或減少CD19表現癌細胞群的方法，方法包含使CD19表現癌細胞群與本發明之結合至CD19表現細胞的抗-CD19 CART細胞接觸。在某些態樣中，相對於陰性對照物，本發明之抗-CD19 CART細胞使患有骨髓白血病或與CD19表現細胞相關之另一種癌症之個體或動物模型中的細胞及/或癌細胞之數量、數目、量或百分比降低至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少65%、至少75%、至少85%、至少95%或至少99%。在一個態樣中，個體為人類。

本發明亦提供預防、治療及/或管理與CD19表現細胞相關之疾病(例如表現CD19之血液癌症或非典型癌症)的方法，方法包含向有需要之個體投與本發明之結合至CD19表現細胞的抗-CD19 CART細胞。在一個態樣中，個體為人類。與CD19表現細胞相關之病症的非限制性實例包括自體免疫病症(諸如狼瘡)、炎症(諸如過敏症及哮喘)及癌症(諸如表現CD19的血液癌症或非典型癌症)。

本發明亦提供預防、治療及/或管理與CD19表現細胞相關之疾病的方法，方法包含向有需要之個體投與本發明之結合至CD19表現細胞的抗-CD19 CART細胞。在一個態樣中，個體為人類。

本發明提供預防與CD19表現細胞相關之癌症復發的方法，方法包含向有需要之個體投與本發明之結合至CD19表現細胞的抗-CD19 CART細胞。在一個態樣中，方法包含向有需要之個體投與有效量之結合至CD19表現細胞之本文所述抗-CD19 CART細胞與有效量之另一療法之組合。

組合療法

本文所述的CAR表現細胞可與其他已知藥劑及療法組合使用。如本文所用，「組合」投與意謂在個體罹患病症的過程中，將兩種(或超過兩種)不同療法遞送至個體，例如在個體已診斷出患有該病症之後且在該病症已治癒或消除之前或因其他理由停止治療之前，遞送兩種或超過兩種療法。在一些實施例中，一種療法之遞送在第二療法開始遞送時仍存在，以致就投與而言存在重疊。在本文中此有時稱為「同時遞送」或「並行遞送」。在其他實施例中，一種療法之遞送在另一療法遞送開始之前結束。在任一情況之一些實施例中，療法因組合投與而更有效。舉例而言，第二療法更有效，例如第二療法較少時見到等效作用，或第二療法減輕症狀的程度大於第一療法不存在時投與第二療法所見的程度，或用第一療法時見到類似情形。在一些實施例中，遞送使得症狀或與病症相關之其他參數之降幅大於使用一種療法遞送而另一療法不存在時所觀測到之降幅。兩種療法之作用可為部分相加的、完全相加的或大於相加作用。遞送可使得當遞送第二療法時，所遞送之第一療法的作用仍可偵測到。

本文所述的CAR表現細胞及至少一種其他治療劑可在相同組合物中或在各別組合物中同時投與，或依序投與。依序投與時，本文所述的CAR表現細胞可首先投與，且另一種藥劑可第二個投與，或可顛倒投與次序。

在其他態樣中，本文所述的CAR表現細胞在治療方案中可與以下組合使用：手術、化學療法、輻射；免疫抑制劑，諸如環孢菌素、硫唑嘌呤、甲胺喋呤、黴酚酸酯及FK506；抗體或其他免疫消融劑，諸如CAMPATH、抗-CD3抗體或其他抗體療法、細胞毒素、氟達拉濱、環孢菌素、FK506、雷帕黴素、黴酚酸、類固醇、FR901228、細胞激素及放射；肽疫苗，諸如Izumoto等人，2008 J Neurosurg 108：963-971中所述。

在一個實施例中，本文所述的CAR表現細胞可與化學治療劑組合使用。例示性化學治療劑包括蒽環黴素(anthracycline)(例如阿黴素(doxorubicin)(例如脂質體阿黴素)、長春花生物鹼(例如長春鹼(vinblastine)、長春新鹼(vincristine)、長春地辛(vindesine)、長春瑞賓(vinorelbine))、烷基化劑(例如環磷醯胺(cyclophosphamide)、達卡巴嗪(decarbazine)、美法侖、異環磷醯胺(ifosfamide)、替莫唑胺(temozolomide))、免疫細胞抗體(例如阿侖單抗(alemtuzamab)、吉妥單抗(gemtuzumab)、利妥昔單抗(rituximab)、托西莫單抗(tositumomab))、抗代謝物(包括例如葉酸拮抗劑、嘧啶類似物、嘌呤類似物及腺苷脫胺酶抑制劑(例如氟達拉濱))、mTOR抑制劑、TNFR糖皮質激素誘導TNFR相關蛋白質(GITR)促效劑、蛋白酶體抑制劑(例如阿克拉黴素A(aclacinomycin A)、黴膠毒素(gliotoxin)或硼替佐米(bortezomib))、免疫調節劑(諸如沙立度胺(thalidomide)或沙立度胺衍生物(例如雷利度胺(lenalidomide)))。

考慮供組合療法中使用的一般化學治療劑包括阿那曲唑(anastrozole)(Arimidex®)、比卡魯胺(bicalutamide)(Casodex®)、博萊黴素硫酸鹽(Blenoxane®)、白消安(busulfan)(Myleran®)、白消安注射劑(Busulfex®)、卡培他濱(capecitabine)(Xeloda®)、N4-戊氧基羰基-5-脫氧-5-氟胞苷、卡鉑(carboplatin)(Paraplatin®)、卡莫司汀(carmustine)(BiCNU®)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)(Leukeran®)、順鉑(cisplatin)(Platinol®)、克拉屈濱(cladribine)(Leustatin®)、環磷醯胺(Cytoxan®或Neosar®)、阿糖胞苷(cytarabine/cytosine arabinoside)(Cytosar-U®)、阿糖胞苷脂質體注射劑(DepoCyt®)、達卡巴嗪(dacarbazine)(DTIC-Dome®)、放線菌素D(dactinomycin/Actinomycin D，Cosmegan)、道諾黴素鹽酸鹽(Cerubidine®)、道諾黴素檸檬酸鹽脂質體注射劑(DaunoXome®)、地塞米松(dexamethasone)、多西他賽(docetaxel)(Taxotere®)、阿黴素鹽酸鹽(Adriamycin®，Rubex®)、依託泊苷(etoposide)(Vepesid®)、氟達拉賓磷酸鹽(fludarabine phosphate)(Fludara®)、5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil)(Adrucil®，Efudex®)、氟他胺(flutamide)(Eulexin®)、替紮他濱(tezacitibine)、吉西他賓(Gemcitabine)(二氟脫氧胞苷)、羥脲(hydroxyurea)(Hydrea®)、伊達比星(Idarubicin)(Idamycin®)、異環磷醯胺(IFEX®)、伊立替康(irinotecan)(Camptosar®)、左天冬醯胺酶(ELSPAR®)、亞葉酸鈣、美法侖(Alkeran®)、6-巰基嘌呤(Purinethol®)、甲胺喋呤(Folex®)、米托蒽醌(mitoxantrone)(Novantrone®)、麥羅塔(mylotarg)、太平洋紫杉醇(paclitaxel)(Taxol®)、殊品(phoenix)(釔90/MX-DTPA)、噴司他丁 (pentostatin)、聚苯丙生20/卡莫司汀植入物(polifeprosan 20 with carmustine implant)(Gliadel®)、檸檬酸它莫西芬(tamoxifen citrate)(Nolvadex®)、替尼泊苷(teniposide)(Vumon®)、6-硫鳥嘌呤、噻替派(thiotepa)、替拉紮明(tirapazamine)(Tirazone®)、用於注射之拓撲替康鹽酸鹽(topotecan hydrochloride for injection)(Hycamptin®)、長春鹼(Velban®)、長春新鹼(Oncovin®)及長春瑞賓(Navelbine®)。

例示性烷基化劑包括(不限於)氮芥類、伸乙亞胺衍生物、烷基磺酸鹽、亞硝基脲及三氮烯：尿嘧啶氮芥(Aminouracil Mustard®，Chlorethaminacil®，Demethyldopan®，Desmethyldopan®，Haemanthamine®，Nordopan®，Uracil nitrogen mustard®，Uracillost®，Uracilmostaza®，Uramustin®，Uramustine®)、甲川氯(chlormethine)(Mustargen®)、環磷醯胺(Cytoxan®，Neosar®，Clafen®，Endoxan®，Procytox®，RevimmuneTM)、異環磷醯胺(Mitoxana®)、美法侖(Alkeran®)、苯丁酸氮芥(Leukeran®)、哌泊溴烷(pipobroman)(Amedel®，Vercyte®)、曲他胺(triethylenemelamine)(Hemel®，Hexalen®，Hexastat®)、三伸乙基硫代磷醯胺、替莫唑胺(Temozolomide)(Temodar®)、噻替派(Thioplex®)、白消安(Busilvex®，Myleran®)、卡莫司汀(carmustine)(BiCNU®)、洛莫司汀(lomustine)(CeeNU®)、鏈佐星(streptozocin)(Zanosar®)及達卡巴嗪(DTIC-Dome®)。其他例示性烷基化劑包括(不限於)奧沙利鉑(Oxaliplatin)(Eloxatin®)；替莫唑胺(Temozolomide)(Temodar®及Temodal®)；放線菌素D(亦稱為放線菌素-D，Cosmegen®)；美法侖(亦稱為L-PAM，L-沙可來新，及苯丙胺酸氮芥，Alkeran®)；六甲密胺(Altretamine)(亦稱為六甲三聚氰胺(HMM)，Hexalen®)；卡莫司汀(Carmustine)(BiCNU®)；苯達莫司汀(Bendamustine)(Treanda®)；白消安(Busulfex®及Myleran®)；卡鉑(Carboplatin)(Paraplatin®)；洛莫司汀(Lomustine)(亦稱為CCNU，CeeNU®)；順鉑(Cisplatin)(亦稱為CDDP，Platinol®及Platinol®-AQ)；苯丁酸氮芥(Leukeran®)；環磷醯胺(Cytoxan®及Neosar®)；達卡巴嗪(亦稱為DTIC，DIC及咪唑甲醯胺，DTIC-Dome®)；六甲密胺(亦稱為六甲三聚氰胺(HMM)，Hexalen®)；異環磷醯胺(Ifex®)；潑尼莫司汀(Prednumustine)；丙卡巴肼(Procarbazine)(Matulane®)；二氯甲二乙胺(Mechlorethamine)(亦稱為氮芥及二氯甲二乙胺鹽酸鹽，Mustargen®)；鏈佐星(Zanosar®)；噻替派(亦稱為硫代磷醯胺，TESPA及TSPA，Thioplex®)；環磷醯胺(Endoxan®，Cytoxan®，Neosar®，Procytox®，Revimmune®)；及苯達莫司汀HCl(Treanda®)。

例示性mTOR抑制劑包括例如替西莫司(temsirolimus)；理達莫司(ridaforolimus)(正式稱為德福莫司(deferolimus)，二甲基亞膦酸(1R,2R,4S)-4-[(2R)-2[(1R,9S,12S,15R,16E,18R,19R,21R,23S,24E,26E,28Z,30S,32S,35R)-1,18-二羥基-19,30-二甲氧基-15,17,21,23,29,35-六甲基-2,3,10,14,20-五側氧基-11,36-二氧雜-4-氮雜三環[30.3.1.0^4,9]三十六碳-16,24,26,28-四烯-12-基]丙基]-2-甲氧基環己基酯，亦稱為AP23573及MK8669，且描述於PCT公開案第WO 03/064383號中)；依維莫司(everolimus)(Afinitor®或RAD001)；雷帕黴素(rapamycin)(AY22989，Sirolimus®)；塞馬莫德(simapimod)(CAS 164301-51-3)；恩希羅莫司(emsirolimus)(5-{2,4-雙[(3S)-3-甲基嗎啉-4-基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-基}-2-甲氧基苯基)甲醇(AZD8055)；2-胺基-8-[反-4-(2-羥基乙氧基)環己基]-6-(6-甲氧基-3-吡啶基)-4-甲基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(PF04691502，CAS 1013101-36-4)；及N ²-[1,4-二側氧基-4-[[4-(4-側氧基-8-苯基-4H-1-苯并哌喃-2-基)嗎啉鎓-4-基]甲氧基]丁基]-L-精胺醯基甘胺醯基-L-α-天冬胺醯基L-絲胺酸-，內鹽(SF1126，CAS 936487-67-1)，及XL765。

例示性免疫調節劑包括例如阿托珠單抗(afutuzumab)(購自Roche®)；乙二醇化非格司亭(pegfilgrastim)(Neulasta®)；雷利度胺(CC-5013，Revlimid®)；沙立度胺(Thalomid®)、艾科替米(actimid)(CC4047)；及IRX-2(人類細胞激素之混合物，包括介白素1、介白素2及干擾素γ，CAS 951209-71-5，購自IRX Therapeutics)。

例示性蒽環黴素包括例如阿黴素(Adriamycin®及Rubex®)；博萊黴素(lenoxane®)；道諾黴素(道諾黴素鹽酸鹽，柔紅黴素(daunomycin)及柔紅黴素鹽酸鹽，Cerubidine®)；脂質體道諾黴素(道諾黴素檸檬酸鹽脂質體，DaunoXome®)；米托蒽醌(mitoxantrone)(DHAD，Novantrone®)；表柔比星(epirubicin)(Ellence®)；伊達比星(idarubicin)(Idamycin®，Idamycin PFS®)；絲裂黴素C(Mutamycin®)；格爾德黴素(geldanamycin)；除莠黴素(herbimycin)；近灰黴素(ravidomycin)；及去乙醯近灰黴素(desacetylravidomycin)。

例示性長春花生物鹼包括例如長春瑞賓酒石酸鹽(Navelbine®)、長春新鹼(Oncovin®)及長春地辛(Eldisine^TM))；長春鹼(亦稱為硫酸長春鹼、長春花鹼及VLB，Alkaban-AQ®及Velban®)；及長春瑞賓(Navelbine®)。

例示性蛋白酶體抑制劑包括硼替佐米(bortezomib)(Velcade®)；卡非佐米(carfilzomib)(PX-171-007，(S)-4-甲基-N-((S)-1-(((S)-4-甲基-1-((R)-2-甲基氧雜環丙-2-基)-1-側氧基戊-2-基)胺基)-1-側氧基-3-苯基丙-2-基)-2-((S)-2-(2-嗎啉基乙醯胺基)-4-苯基丁醯胺基)-戊醯胺)；嗎力佐米(marizomib)(NPI-0052)；艾紮佐米檸檬酸鹽(ixazomib citrate)(MLN-9708)；戴蘭佐米(delanzomib)(CEP-18770)；及O-甲基-N-[(2-甲基-5-噻唑基)羰基]-L-絲胺醯基-O-甲基-N-[(1S)-2-[(2R)-2-甲基-2-氧雜環丙烷基]-2-側氧基-1-(苯基甲基)乙基]-L-絲胺醯胺(ONX-0912)。

例示性GITR促效劑包括例如GITR融合蛋白及抗-GITR抗體(例如二價抗-GITR抗體)，諸如GITR融合蛋白，其描述於美國專利第6,111,090號、歐洲專利第090505B1號、美國專利第8,586,023號、PCT公開案第WO 2010/003118號及第2011/090754號中；或抗-GITR抗體，其描述於例如美國專利第7,025,962號、歐洲專利第1947183B1號、美國專利第7,812,135號、美國專利第8,388,967號、美國專利第8,591,886號、歐洲專利第EP 1866339號、PCT公開案第WO 2011/028683號、PCT公開案第WO 2013/039954號、PCT公開案第WO2005/007190號、PCT公開案第WO 2007/133822號、PCT公開案第WO2005/055808號、PCT公開案第WO 99/40196號、PCT公開案第WO 2001/03720號、PCT公開案第WO99/20758號、PCT公開案第WO2006/083289號、PCT公開案第WO 2005/115451號、美國專利第7,618,632號及PCT公開案第WO 2011/051726號中。

在一個實施例中，本文所述的CAR表現細胞係與mTOR抑制劑(例如本文所述的mTOR抑制劑，例如雷帕黴素類似物(rapalog)，諸如依維莫司)組合投與個體。在一個實施例中，mTOR抑制劑係在CAR表現細胞之前投與。舉例而言，在一個實施例中，mTOR抑制劑可在對細胞進行血球分離之前投與。在一個實施例中，個體患有CLL。

在一個實施例中，本文所述的CAR表現細胞係與GITR促效劑(例如本文所述的GITR促效劑)組合投與個體。在一個實施例中，GITR促效劑係在CAR表現細胞之前投與。舉例而言，在一個實施例中，GITR促效劑在對細胞進行血球分離之前投與。在一個實施例中，個體患有CLL。

亦可使用抑制鈣依賴性磷酸酶鈣調神經磷酸酶的藥物(環孢素及FK506)或抑制對生長因子誘導信號傳導具有重要作用之p70S6激酶的藥物(雷帕黴素)(Liu等人，Cell 66：807-815,1991；Henderson等人，Immun.73：316-321,1991；Bierer等人，Curr.Opin.Immun.5：763-773, 1993)。在另一態樣中，本發明之細胞組合物可聯合(例如之前、同時或之後)以下投與患者：骨髓移植、使用化學治療劑(諸如氟達拉濱)之T細胞消融療法、外束輻射療法(XRT)、環磷醯胺及/或抗體，諸如OKT3或CAMPATH。在一個態樣中，本發明之細胞組合物係在B細胞消融療法(諸如與CD20反應的藥劑，例如利妥昔單抗(Rituxan))之後投與。舉例而言，在一個實施例中，個體可經歷高劑量化學療法標準治療，隨後經歷周圍血液幹細胞移植。在某些實施例中，移植之後，個體接受本發明之經擴增免疫細胞之輸注。在另一實施例中，經擴增之細胞係在手術之前或之後投與。

在一個實施例中，可向個體投與減少或改善與投與CAR表現細胞相關之副作用的藥劑。與投與CAR表現細胞相關的副作用包括(但不限於)CRS，及噬血細胞性淋巴組織細胞增多症(HLH)，亦稱為巨噬細胞活化症候群(MAS)。CRS症狀包括高熱、噁心、短暫低血壓、低氧及其類似症狀。因此，本文所述的方法可包含將本文所述的CAR表現細胞投與個體及進一步投與可管理可溶性因子含量提高的藥劑，此可溶性因子含量提高係因CAR表現細胞治療所引起。在一個實施例中，個體體內提高的可溶性因子為IFN-γ、TNFα、IL-2及IL-6中的一或多者。因此，為治療此副作用而投與的藥劑可為中和一或多種此等可溶性因子的藥劑。此等藥劑包括(但不限於)類固醇、TNFα抑制劑及IL-6抑制劑。TNFα抑制劑之實例為依那西普(entanercept)。IL-6抑制劑之實例為妥希珠單抗(Tocilizumab)(toc)。

在一個實施例中，可向個體投與使CAR表現細胞活性增強的藥劑。舉例而言，在一個實施例中，藥劑可為抑制抑制性分子的藥劑。在一些實施例中，抑制性分子(例如程式化死亡因子1(PD1))可降低CAR表現細胞建立免疫效應反應的能力。抑制性分子之實例包括PD1、PD-L1、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、 LAIR1、CD160、2B4及TGFRβ。抑制抑制性分子，例如在DNA、RNA或蛋白質層面進行抑制，可最佳化CAR表現細胞效能。在實施例中，抑制性核酸，例如抑制性核酸，例如dsRNA，例如siRNA或shRNA，可用於抑制CAR表現細胞表現抑制性分子。在一個實施例中，抑制劑為shRNA。在一個實施例中，抑制性分子在CAR表現細胞內受到抑制。在此等實施例中，抑制抑制性分子表現的dsRNA分子連接至編碼CAR之組分(例如所有組分)的核酸。在一個實施例中，抑制性信號之抑制劑可為例如結合至抑制性分子的抗體或抗體片段。舉例而言，藥劑可為結合至PD1、PD-L1、PD-L2或CTLA4的抗體或抗體片段(例如艾匹木單抗(ipilimumab)(亦稱為MDX-010及MDX-101，且以Yervoy®(Bristol-Myers Squibb)市購；曲美木單抗(Tremelimumab)(購自Pfizer的IgG2單株抗體，先前稱為替西木單抗(ticilimumab)，CP-675,206))。在一個實施例中，藥劑為結合至TIM3的抗體或抗體片段。在一個實施例中，藥劑為結合至LAG3的抗體或抗體片段。

PD1為CD28受體家族的抑制性成員，CD28受體家族亦包括CD28、CTLA-4、ICOS及BTLA。PD1表現於活化B細胞、T細胞及骨髓細胞上(Agata等人，1996 Int.Immunol 8：765-75)。PD1、PD-L1及PD-L2之兩種配位體已顯示在結合至PD1時可下調T細胞活化(Freeman等人，2000 J Exp Med 192：1027-34；Latchman等人，2001 Nat Immunol 2：261-8；Carter等人，2002 Eur J Immunol 32：634-43)。PD-L1富含於人類癌症中(Dong等人，2003 J Mol Med 81：281-7；Blank等人，2005 Cancer Immunol.Immunother 54：307-314；Konishi等人，2004 Clin Cancer Res 10：5094)。免疫抑制可藉由抑制PD1與PD-L1之局部相互作用逆轉。PD1、PD-L1及PD-L2之抗體、抗體片段及其他抑制劑在此項技術中可獲得，且可與本文所述的CD19 CAR組合使用。舉例而言，尼沃單抗(nivolumab)(亦稱為BMS-936558或MDX1106；Bristol- Myers Squibb)為特異性阻斷PD1的完全人類IgG4單株抗體。尼沃單抗(純系5C4)及特異性結合至PD1的其他人類單株抗體揭示於美國8,008,449及WO2006/121168中。匹迪單抗(Pidilizumab)(CT-011；Cure Tech)為結合至PD1的人類化IgG1k單株抗體。匹迪單抗及其他人類化抗-PD1單株抗體揭示於WO2009/101611中。蘭博單抗(Lambrolizumab)(亦稱為MK03475；Merck)為結合至PD1的人類化IgG4單株抗體。蘭博單抗及其他人類化抗-PD1抗體揭示於US 8,354,509及WO2009/114335中。MDPL3280A(Genentech/Roche)為結合至PD-L1的人類Fc最佳化IgG1單株抗體。MDPL3280A及針對PD-L1的其他人類單株抗體揭示於美國專利第7,943,743號及美國公開案第20120039906號中。其他抗-PD-L1結合劑包括YW243.55.S70(在WO2010/077634中，重鏈及輕鏈可變區顯示於SEQ ID NOs 20及21中)及MDX-1 105(亦稱為BMS-936559，及例如WO2007/005874中所揭示的抗-PD-L1結合劑)。AMP-224(B7-DCIg；Amplimmune；例如WO2010/027827及WO2011/066342中所揭示)為阻斷PD1與B7-H1之間相互作用的PD-L2 Fc融合可溶性受體。其他抗-PD1抗體包括AMP 514(Amplimmune)，其他例如US 8,609,089、US 2010028330及/或US 20120114649中所揭示的抗-PD1抗體。

在一些實施例中，使CAR表現細胞之活性增強的藥劑可為例如包含第一域及第二域的融合蛋白，其中第一域為抑制性分子或其片段，且第二域為與陽性信號相關的多肽，例如包含如本文所述之胞內信號傳導域的多肽。在一些實施例中，與陽性信號相關的多肽可包括CD28、CD27、ICOS之共刺激域；CD28、CD27及/或ICOS之例如胞內信號傳導域；及/或本文所述之例如CD3ξ之例如初級信號傳導域。在一個實施例中，融合蛋白係由表現CAR的相同細胞表現。在另一個實施例中，融合蛋白係由細胞(例如不表現抗-CD19 CAR的T細胞)表現。

在一個實施例中，使本文所述之CAR表現細胞之活性增強的藥劑為miR-17-92。

醫藥組合物及治療

本發明之醫藥組合物可包含如本文所述的CAR表現細胞，例如複數個CAR表現細胞，與一或多種醫藥學上或生理學上可接受之載劑、稀釋劑或賦形劑之組合。此等組合物可包含緩衝液，諸如中性緩衝鹽水、磷酸鹽緩衝鹽水及其類似物；碳水化合物，諸如葡萄糖、甘露糖、蔗糖或葡聚糖、甘露糖醇；蛋白質；多肽或胺基酸，諸如甘胺酸；抗氧化劑；螯合劑，諸如EDTA或麩胱甘肽；佐劑(例如氫氧化鋁)；及防腐劑。本發明之組合物在一個態樣中經調配用於靜脈內投與。

本發明之醫藥組合物可以適合於治療(或預防)疾病的方式投與。投藥量及頻率將根據諸如以下因素來確定：患者之狀況，及患者疾病之類型及嚴重程度，但適當劑量可根據臨床試驗來確定。

在一個實施例中，醫藥組合物實質上不含污染物，例如不存在可偵測含量的污染物，例如選自由以下組成之群的污染物：內毒素、黴漿菌、複製勝任型慢病毒(RCL)、p24、VSV-G核酸、HIV gag、殘餘抗-CD3/抗-CD28塗佈珠粒、小鼠抗體、混合之人類血清、牛血清白蛋白、牛血清、培養基組分、載體包裝細胞或質體組分、細菌及真菌。在一個實施例中，細菌為選自由以下組成之群的至少一者：糞產鹼菌(Alcaligenes faecalis)、白色念珠菌(Candida albicans)、大腸桿菌(Escherichia coli)、流感嗜血桿菌(Haemophilus influenza)、腦膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitides)、綠膿假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、肺炎鏈球菌(Streptococcus pneumonia)及A群化膿鏈球菌(Streptococcus pyogenes group A)。

當指明「免疫有效量」、「抗腫瘤有效量」、「腫瘤抑制有效量」或「治療量」時，投與本發明組合物之準確量可由醫師考慮個體在年齡、體重、腫瘤大小、感染或轉移程度及患者(個體)狀況方面之個別差異來確定。一般可陳述為，包含本文所述之T細胞的醫藥組合物可以每公斤體重10⁴至10⁹個細胞之劑量，有時候每公斤體重10⁵至10⁶個細胞之劑量(包括彼等範圍內之全部整數值)投與。T細胞組合物亦可以此等劑量投與多次。可藉由使用免疫療法中通常已知的輸注技術投與細胞(參見例如Rosenberg等人，New Eng.J.of Med.319：1676,1988)。

在某些態樣中，可能需要將活化T細胞投與個體且隨後接著再抽血(或進行血球分離術)，根據本發明活化其T細胞，及將活化且擴增的此等T細胞再輸注至患者中。此方法可每幾週進行多次。在某些態樣中，可抽取10cc至400cc血液進行T細胞活化。在某些態樣中，抽取20cc、30cc、40cc、50cc、60cc、70cc、80cc、90cc或100cc血液進行T細胞活化。

本發明組合物之投與可以任何適宜方式進行，包括氣溶膠吸入、注射、攝入、輸液、植入或移植。本文所述的組合物可經動脈、皮下、皮內、瘤內、淋巴結內、髓內、肌內、靜脈內(i.v.)注射或腹膜內投與患者。在一個態樣中，本發明之T細胞組合物藉由皮內或皮下注射投與患者。在一個態樣中，本發明之T細胞組合物藉由靜脈內注射投與。T細胞組合物可直接注入腫瘤、淋巴結或感染部位內。

在一個特定例示性態樣中，個體可經歷白血球分離術，其中對白血球進行收集、富集或離體消耗，以選擇及/或分離出所感興趣之細胞，例如T細胞。此等T細胞分離株可藉由此項技術中已知的方法擴增且處理，以便可引入本發明之一或多個CAR構築體，從而產生本發明之CAR T細胞。有需要之個體隨後可經歷高劑量化學療法標準治療，隨後經歷周圍血液幹細胞移植。在某些態樣中，在移植之後或同時，個體接受本發明之經擴增CAR T細胞之輸注。在另一態樣中，經擴增之細胞係在手術之前或之後投與。

投與患者之上述治療劑量將根據所治療病狀之準確性質及治療之接受者而變。投與人類之劑量可根據此項技術可接受之實務進行調整。舉例而言，CAMPATH劑量對於成年患者而言，一般在1mg至約100mg範圍內，通常每天投與歷時1天至30天。較佳日劑量為每天1mg至10mg，但是有時候可使用每天高達40mg之較大劑量(描述於美國專利第6,120,766號中)。

在一個實施例中，將CAR分子引入T細胞中，例如使用活體外轉錄將CAR分子引入T細胞中，且個體(例如人類)接受本發明之CAR T細胞之初始投與，及本發明之CAR T細胞之一或多次隨後投與，其中一或多次隨後投與係在前一次投與之後15天以內投與，例如前一次投與之後14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3或2天投與。在一個實施例中，本發明之CAR T細胞每週投與個體(例如人類)超過一次，例如本發明之CAR T細胞每週投與2次、3次或4次。在一個實施例中，個體(例如人類個體)接受CAR T細胞之每週超過一次投與(例如每週投與2次、3次或4次)(本文中亦稱為療程)，隨後一週停止CAR T細胞投與，接著向個體再投與CAR T細胞一或多次(例如每週投與CAR T細胞超過一次)。在另一個實施例中，個體(例如人類個體)接受超過一個療程之CAR T細胞，且每個療程之間的時間小於10、9、8、7、6、5、4或3天。在一個實施例中，CAR T細胞每隔一天投與，每週投與3次。在一個實施例中，本發明之CAR T細胞投與至少兩週、三週、四週、五週、六週、七週、八週或八週以上。

在一個態樣中，CD19 CART係使用慢病毒病毒載體(諸如慢病毒) 產生。以此方式產生的CART將具有穩定的CAR表現。

在一個態樣中，轉導之後，CART短暫表現CAR載體4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15天。CAR之短暫表現可藉由RNA CAR載體遞送達成。在一個態樣中，CAR RNA係藉由電穿孔轉導至T細胞中。

使用短暫表現CAR T細胞(特別是使用具有鼠科scFv之CART)治療患者時出現的潛在問題為多次治療之後的過敏反應。

不希望受此理論束縛，咸信此過敏反應可能歸因於患者出現體液型抗-CAR反應，亦即抗-CAR抗體具有抗-IgE同型。據信，當存在十天至十四天暴露於抗原的間歇期時，患者的抗體產生細胞經歷自IgG同型(不引起過敏反應)至IgE同型的類別轉變。

若患者在短暫CAR療法過程中處於產生抗-CAR抗體反應的高風險(諸如因RNA轉導而產生的抗-CAR抗體反應)，CART輸注間歇期不應持續超過十至十四天。

實例

本發明參考以下實驗性實例進一步詳細描述。此等實例僅為說明目的而提供，且不希望具限制性，除非另有說明。因此，本發明決不應解釋為限於以下實例，而是應解釋為包涵作為本文所提供之教示內容之結果而變得顯而易見的任何及所有變化形式。

無需進一步描述，咸信一般熟悉此項技術者可利用前述說明及以下說明性實例製備及使用本發明化合物及實施所主張之方法。以下操作實例特別地指出本發明之不同態樣，且不應解釋為以任何方式限制本發明之其餘內容。

實例1：鼠科抗-CD19抗體之人類化

臨床配置需要對鼠科CD19抗體進行人類化，其中小鼠特異性殘基可在接受CART19治療(亦即經CAR19構築體轉導之T細胞治療)的患者體內誘導人類抗小鼠抗原(HAMA)反應。融合瘤源鼠科CD19抗體之VH及VL序列引自公開文獻(Nicholson等人，1997，同上)。藉由將來自鼠科CD19抗體之CDR區域移植至人類生殖系受體構架VH4_4-59及VK3_L25(vBASE資料庫)上來完成人類化。除CDR區域之外，保留來自鼠科序列的五個構架殘基(亦即VH #71、#73、#78及VL #71、#87)，此被認為可證明CDR區域之結構完整性。此外，重鏈及輕鏈分別使用人類J元件JH4及JK2。人類化抗體之所得胺基酸序列分別指定為FMC63_VL_hz及FMC63_VH_hz1，且顯示於下表1中。殘基編號依循Kabat(Kabat E.A.等人，1991，同上)。Kabat與Chothia等人(1987，同上)均可用於CDR定義。來自小鼠CD19之殘基係以粗體/斜體顯示。加方框的位置#60/61/62指示CDR H2(亦稱為HCDR2)中之潛在轉譯後修飾(PTM)位點。

此等人類化CD19 IgG用於產生供測試表現的可溶性scFv，及用於完全CART CD19構築體的scFv(參見下文實例)。感興趣的是，在人類化期間，CDRH2區域中之位置62較佳為絲胺酸殘基，而非存在於鼠科CDRH2中的丙胺酸。鼠科序列缺少轉譯後修飾(PTM)，且在 CDRH2中之位置60/61/62分別具有天冬醯胺酸-絲胺酸-丙胺酸。在人類化過程中，此產生潛在PTM基元(在CDRH2中以加方框的位點指示)。測試在人類化過程中所產生之PTM位點是否實際上為「真實」PTM位點，或僅為理論PTM位點。假設胺基酸基元天冬醯胺酸及其後之絲胺酸(NS)容易發生轉譯後脫醯胺，而非顯而易見的某些東西。亦假設天冬醯胺酸及其後之除脯胺酸外的任何胺基酸及接著其後之絲胺酸(NxS，x≠P)容易發生轉譯後N糖基化。為檢驗此假設，產生兩種IgG變異體，其中位置60之天冬醯胺酸(已知為糖基化位點)突變為絲胺酸或麩醯胺酸，且分別指定為FMC63_VH_hz2(N60S)及FMC63_VH_hz2(N60Q)。產生此等構築體以便排除潛在的轉譯後修飾位點(PTM)且測試所保持之活性(參見下文實例2)。

選殖：

獲得編碼小鼠及人類化VL及VH域的DNA序列，且構築體之密碼子係針對在智人細胞中之表現而經最佳化。

編碼VL及VH域的序列自選殖載體次選殖入適於在哺乳動物細胞中分泌的表現載體中。重鏈及輕鏈選殖入個別表現載體中以允許共轉染。表現載體之元件包括啟動子(巨細胞病毒(CMV)增強子-啟動子)、促進分泌的信號序列、聚腺苷酸化信號及轉錄終止子(牛生長激素(BGH)基因)、允許在原核生物中進行游離型複製及複製的元件(例如SV40起點及ColE1或此項技術中已知的其他元件)及允許選擇的元件(胺苄西林抗性基因(ampicillin resistance gene)及芥森標記(zeocin marker))。

表現：

嵌合及人類化IgG候選物表現於1ml規模的HEK293F哺乳動物細胞中。澄清的上清液用於FACS結合研究。更確切而言，HEK293F細胞於補充有Pen/Strep之FreeStyle培養基中稀釋至每毫升5E5個細胞且轉移1ml至圓底24深孔盤中。0.5μg輕鏈及0.5μg重鏈哺乳動物表現質體與4μl FuGENE HD(Roche REF 04709705001)一起在同一培養基中稀釋。室溫培育15分鐘之後，將DNA/Fugene混合物逐滴添加至細胞中且在37℃、5% CO₂恆溫箱中以250rpm置放五天。接著藉由離心將上清液與細胞分離。為了量測IgG含量，取200μL等分樣品置放於96孔微量滴定盤之孔中。所有樣品及標準物均使用蛋白A浸液及閱讀生物感測器(Fortebio目錄號18-5010)雙重複量測。將盤置放於Octet儀器(ForteBio)中且允許在恆溫室中平衡至27℃。使用Octet User軟體3.0版自動處理資料且藉由與IgG標準曲線比較來測定濃度。

藉由FACS進行結合分析：

使用細胞株300.19-hsCD19FL，利用流式細胞術結合分析法評估人類化及嵌合抗體。此細胞株係藉由用編碼全長人類CD19編碼序列及天然啟動子以及芥森抗性基因的載體(hCD19 FL/pEF4-myc-His A)轉染小鼠preB細胞株300.19來產生。簡言之，將300.19細胞電穿孔而導入線性化質體且接著使用結合APC之抗人類CD19 Ab(純系HIB19，得自BD 555415)鑑別高量表現hsCD19的細胞且使用FACS Aria流式細胞儀進行分類。培養所分類之hsCD19+細胞且驗證其穩定地高量表現hsCD19。

結合分析可使用含有所表現IgG的無血清培養基直接進行。所評估的全部IgG校正為相同濃度(85nM)，隨後藉由3倍連續稀釋度稀釋至1.4pM。接著，在96孔盤中，將5×10⁵個細胞/孔之等分樣品與所稀釋之IgG一起在4℃培育30分鐘。細胞用FACS緩衝液(含有0.5% BSA之PBS)洗滌兩次，隨後添加1：1000在FACS緩衝液中稀釋的偵測抗體：結合APC之山羊抗hu IgG特異性Fc片段(Dianova #109-136-098)。細胞在4℃再培育30分鐘，接著在FACS緩衝液中洗滌兩次且使用FACS Calibur(BD Bioscience)分析。使用GraphPad PrismTM 3.0軟體、利用非線性回歸分析S形劑量反應(可變斜率)來對結合曲線作圖(中值螢光強度相對於IgG濃度)及測定EC₅₀。

FACS分析顯示，對所評估之全部IgG的表觀結合可廣泛不同，其中一些構築體對於IgG的EC₅₀展現5至10倍轉變(相對於scFv)。根據EC₅₀值，選擇結合親和力在嵌合參考物之2倍或超過2倍之範圍內的主要候選物。

實例2：表徵來源於人類化CD19 IgG抗體之抗-CD19可溶性scFv片段

使用標準分子生物學技術，自實例1中所述之人類化CD19 IgG產生可溶性scFv片段。此等可溶性scFv在表徵研究中用於檢查scFv之穩定性、細胞表面表現及結合特性。另外，亦進行實驗以研究在人類化過程中所引入之潛在PTM的影響。

scFv表現及純化

各scFv構築體轉染時，使用PEI作為轉染試劑，使用100μg質體，以3：1比率(PEI：DNA)轉染約3e8個293F細胞。細胞於100ml EXPi293表現培養基(Invitrogen)中，在振盪瓶中，在37℃、125rpm、8% CO₂下生長。六天後收穫培養物且用於蛋白質純化。

藉由3500g離心20分鐘來收穫293F細胞。收集上清液且經由VacuCap90 PF過濾裝置(w/0.8/0.2μm超級膜，PALL)過濾。向上清液中添加約400μl Ni-NTA瓊脂糖珠粒(Qiagen)。混合物在4℃旋轉且培育4小時。將其裝載至純化塔中且用含有20mM組胺酸的洗滌緩衝液洗滌。蛋白質用含有300mM組胺酸的500μl溶離緩衝液溶離。樣品在4℃相對於PBS緩衝液透析隔夜。使用nanodrop 2000c定量蛋白質樣品。

scFv構形及膠體穩定性分析

藉由DSF測定scFv之熱穩定性：將10-20μl蛋白質樣品與染料Sypro Orange(Invitrogen目錄號S6650)以25μl總體積、以1：1000之最終稀釋度混合於PBS中，在BioRad CFX1000上運作(25℃運作2分鐘，接著按30秒0.5℃遞增，25℃至95℃)。

對於分析性SEC實驗而言，將含有約15-20μg之scFv蛋白樣品的20μl PBS以0.3ml/min流速注射至Agilent 1100系列之TSKgel Super SW2000上。

藉由FACS結合所得之EC ₅₀

小鼠細胞株300.CD19在具有0.5mg/mL芥森的RPMI 1640中生長。將每孔約5e5個細胞轉移至BD Falcon 96孔盤中。細胞以900rpm離心(Sorval Legend XT離心機)3分鐘。移除上清液。抗-CD19 scFv蛋白樣品在含有5% FBS的DPBS中稀釋。向孔中添加樣品，與細胞充分混合且培育1小時。細胞在含有5% FBS的DPBS中洗滌兩次。細胞與抗poly His PE(R & D)一起培育1小時，洗滌兩次，隨後進行FACS分析(LSRII，得自BD Biosciences)。

藉由Proteon進行動力學分析

使用Bio-Rad Proteon測定動力學。使用偶合至GLC感測晶片上的標準胺進行固著。scFv樣品在乙酸鹽pH 4.5中稀釋至0.03mg/mL且以30μL/min之流速塗覆至晶片300秒。CD19配位體接著在PBS-Tween中連續稀釋且以50μL/min之流速注射120秒，解離時間為480秒。晶片表面用甘胺酸pH 2.5再生。使用1：1朗繆爾模型(Langmuir model)擬合資料。

CART19構築體之表面表現及藉由FACS染色

轉染後2天收穫經不同抗hCD19 CART短暫轉染的HEK293F懸浮細胞。將約1e6個細胞置放於V形96孔盤(Greiner Bio-One,Germany)之各孔中且用0.2ml FACS緩衝液(1XPBS，含有4%牛血清白蛋白(BSA)(BSA溶離份V，Roche Diagnostics,Indianapolis,IN))洗滌三次。將細胞再懸浮於含有0.2μg生物素化蛋白L(GenScript,Piscataway,NJ)或 100nM hCD19(AA 1-291)-hIgG1 Fc(在NIBRI產生)的0.2ml FCAS緩衝液中，且在4℃培育30分鐘。細胞接著用0.2ml FACS緩衝液洗滌三次，且對於含有蛋白L的樣品而言，與1μl抗生蛋白鏈菌素Alexa Fluor 488(Life Technologies,Grand Island,NY)一起在0.2ml FACS緩衝液中培育，或對於含有hCD19-hIgG1 Fc的樣品而言，與2μl PE抗人類Fcγ(Jackson ImmunoResearch Laboratories,West Grove,PA)一起在0.2ml FACS緩衝液中、在4℃、在黑暗中培育30分鐘。用0.2ml FACS緩衝液洗滌三次後，在LSRII(BD Biosciences,San Jose,CA)機器上使用FACSDiva軟體(BD Biosciences,San Jose,CA)分析細胞。免疫螢光染色係作為活細胞之相對螢光對數值加以分析，且量測Alexa Fluor 488陽性或PE陽性細胞之百分比。

在人類化過程中所產生之潛在PMT的分析

感興趣的是，在人類化期間，CDRH2區域中之位置62較佳為絲胺酸殘基，而非如實例1中所述存在於鼠科CDRH2中的丙胺酸。測試在人類化過程中所產生之PTM位點是否實際上為「真實」PTM位點，或僅為理論PTM位點。產生兩種IgG變異體，其中位置60之天冬醯胺酸(已知為糖基化位點)突變為絲胺酸或麩醯胺酸，且分別指定為FMC63_VH_hz2(N60S)及FMC63_VH_hz2(N60Q)。產生此等構築體以便排除潛在的轉譯後修飾位點(PTM)且測試所保持之活性。

結果

抗-CD19人類化scFv及小鼠scFv表現於293F細胞中且經由His標記純化。所有人類化scFv之表現及產量比原始小鼠scFv高得多(資料未顯示)。

為確認身分及評估完整性，在與N-聚糖酶F(PNGaseF)一起培育或不培育的情況下分析scFV構築體，隨後進行高效液相層析-質譜分析(HPLC-MS)(參見圖3)與SDS-PAGE(資料未顯示)。PNGaseF為特定用於自共同序列N-X-S/T/C中移除N連接聚糖結構的酶，其中X為除脯胺酸外的任何胺基酸。簡言之，樣品於水中稀釋至0.1μg/μl，且不加以處理或與PNGaseF一起以1：2(w/w)PNGaseF：scFV比率在37℃培育3小時。

使用NuPAGE 4-12% Bis-Tris凝膠(得自Novex)進行SDS-PAGE分析。將約2μg scFV裝載入各泳道中且在200V恆定電壓下進行電泳40分鐘。電泳之後，使用PhastGel Blue R 250染色劑(Amersham Pharmacia)將凝膠染色且用10%乙酸、30%甲醇脫色。

在與Xevo-Tof質譜儀耦合的Water之Acquity UPLC系統上進行HPLC-MS分析。將約1μg各樣品以0.5mL/min之流速裝載至設定為60℃的R 1/10 2.1x100mm 10μm POROS管柱(Applied Biosciences)上。移動相由0.1%甲酸(A)及0.1%甲酸、75%異丙醇、25%乙腈(B)組成。利用25%至90% B之逆相梯度、在12分鐘內自管柱溶離蛋白質。使用電噴霧正掃描來進行獲取，m/z範圍為600-4000Da，源錐電壓斜線上升為20-50V。使用MaxEnt1對所得波譜進行解迴旋。

糖基化位點係在人類化過程中引入。非PTM變異體(VH：N60S或N60Q)無此其他形式。構築體為HC CDR2中具有共同N連接糖基化位點的唯一構築體。在SDS-PAGE分析中，未處理樣品係以單帶形式遷移，此等單帶與除103101-WT(S/N)外之所有構築體之序列之近似分子量一致，對於103101-WT(S/N)，觀測到雙重態。此構築體為H-CDR2中具有共同N連接糖基化位點的唯一構築體。經PNGaseF處理時，雙重態之較高分子量帶不再存在，表明該位點被部分佔據。類似地，根據解迴旋質譜所觀測到之分子量與根據胺基酸序列預測之分子量一致。然而，雖然其他構築體顯示單一初級分子物種，但103101-WT(S/N)亦具有比根據該序列所預測之分子量高1217道爾頓的群體，該序列經PNGaseF處理後不再存在。此與單一主要N連接糖基化形式 (根據質量，可能為寡甘露糖5)之存在一致。糖基化形式之存在係利用MS分析加以確認，如圖3中所示。

構形穩定性係利用差示掃描螢光測定法(DSF)量測。如圖4中所示，小鼠scFv之Tm為57℃，但人類變異體顯示約70℃之更高Tm。所有人類化scFv之Tm比鼠科scFv高得多，清楚顯示所有人類化scFv比鼠科scFv更穩定。此穩定性可能轉譯為CART19構築體，可能引起治療特性改善。

純化scFv之活性係根據結合至hCD19表現細胞以及結合至hCD19抗原、使用基於SPR的偵測方法加以量測。使用小鼠細胞株300測定scFv之結合。小鼠scFv對於hCD19之EC₅₀為約0.6-1.6nM。人類化變異體顯示其EC₅₀在較低或次nM EC₅₀範圍內。

實例3：CD19 CAR構築體

用於最終CAR構築體中的ScFv來源於實例1中所述的人類化IgG。VL及VH域在scFv中出現的次序不同(亦即VL-VH，或VH-VL取向)，且其中「G4S」(SEQ ID NO：18)亞單元之三個或四個複本(其中各亞單元包含序列GGGGS(SEQ ID NO：18)(例如(G4S)₃(SEQ ID NO：107)或(G4S)₄(SEQ ID NO：106))連接可變域而產生完整scFv域，如表2中所示。

人類化scFv片段之序列(SEQ ID NO：1至12)提供於下表3中。全長CAR構築體係使用使用SEQ ID NO：1至12及下文所示的其他序列SEQ ID NO：13至17產生，以產生具有SEQ ID NO：31至42的全長CAR構築體。

˙前導(胺基酸序列)(SEQ ID NO：13)MALPVTALLLPLALLLHAARP

˙前導(核酸序列)(SEQ ID NO：54)ATGGCCCTGCCTGTGACAGCCCTGCTGCTGCCTCTGGCTCTGCTGCTGCATGCCGCTAGACCC

˙CD8鉸鏈(胺基酸序列)(SEQ ID NO：14)TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD

˙CD8鉸鏈(核酸序列)(SEQ ID NO：55)

˙CD8跨膜(胺基酸序列)(SEQ ID NO：15)IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC

˙跨膜(核酸序列)(SEQ ID NO：56)ATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGC

˙4-1BB胞內域(胺基酸序列)(SEQ ID NO：16)KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL

˙4-1BB胞內域(核酸序列)(SEQ ID NO：60)

˙CD3ξ域(胺基酸序列)(SEQ ID NO：17)

˙CD3ξ(核酸序列)(SEQ ID NO：101)

˙CD3ξ域(胺基酸序列；NCBI參考序列NM_000734.3)(SEQ ID NO：43)

˙CD3ξ(核酸序列；NCBI參考序列(NM_000734.3)；(SEQ ID NO：44)

IgG4鉸鏈(胺基酸序列)(SEQ ID NO：102)

IgG4鉸鏈(核苷酸序列)(SEQ ID NO：103)

此等純系在來源於4-1BB之共刺激域之信號域中皆含有Q/K殘基變化。

scFv域之人類化CDR序列之序列對於重鏈可變域而言顯示於表4中且對於輕鏈可變域而言顯示於表5中。「ID」代表各CDR之各別SEQ ID NO。

表6為檢索表，其使CD19構築體編號名稱與scFv輕鏈及重鏈之特定取向、使重鏈與輕鏈分隔之連接單元的數目(亦即(G4S)₃(SEQ ID NO：107)或(G4S)₄(SEQ ID NO：106))，及重鏈CDR2中之特徵胺基酸序列相關聯。

接著將CAR scFv片段選殖入慢病毒載體中以在單一編碼框中產生全長CAR構築體，且使用用於表現的EF1α啟動子(SEQ ID NO：100)。

EF1α啟動子

(SEQ ID NO：100)

如實例4中所述對人類化CAR構築體進行分析。

實例4：分析CART中之人類化CD19構築體

為了經由CAR技術評估靶向CD19的可行性，將抗-CD19抗體之單鏈可變片段選殖入慢病毒CAR表現載體中，其中CD3ξ鏈與4-1BB共刺激分子具有四種不同組態，且根據經CD19 CAR轉導之T細胞(「CART19」或「CART19T細胞」)回應CD19+目標之效應T細胞反應的量及品質來選擇最佳構築體。效應T細胞反應包括(但不限於)細胞擴增、增殖、倍增、細胞激素產生及目標細胞殺死或溶胞活性(去粒)。

材料及方法 產生再導向之人類化CART19 T細胞

使用人類化CART19慢病毒轉移載體產生包裝於VSVg假型慢病毒粒子中的基因組材料。將慢病毒轉移載體DNA與VSVg之三種包裝組分(gag/pol及rev)以及脂染胺試劑混合，以將其一起轉染至293T細胞中。24小時及48小時之後，收集培養基，過濾且藉由超離心法濃縮。所得病毒製劑在-80℃儲存。轉導單元數目係藉由對SupT1細胞滴定來測定。再導向之CART19 T細胞如下產生：藉由與CD3x28珠粒接合24小時來活化新鮮的未處理T細胞且接著添加適當數目個轉導單元以獲得所要百分比之轉導T細胞。允許此等經修飾之T細胞擴增直至其休止且尺寸下降，此時將其低溫保存以便隨後分析。使用coulter multisizer III量測細胞數目及尺寸。低溫保存之前，在LSRII上藉由流式細胞分析測定所轉導細胞(在細胞表面上表現CART19)之百分比及其對應於此表現之相對螢光強度。在直方圖中，可藉由對所轉導之百分比與其相對螢光強度進行比較來檢查CAR之相對表現量。

評估人類化CART19再導向T細胞之溶胞活性、增殖能力及細胞激素分泌

為評估人類化CAR19 T細胞殺死、增殖及分泌細胞激素的功能能力，將細胞解凍且允許恢復隔夜。除人類化CART19之外，鼠科CART19用於比較目的，而SS1-BBz作為非靶向之所表現CAR用於CAR/T細胞背景效應。所有分析中皆使用最高標準物(Gold standard,GS)「對照」CART19來比較分析偏差。重要的是，GS CART19為在研究級(亦即非臨床級)製造條件下產生的細胞且包括向生長培養物中添加IL-2。此可能會影響此等細胞之整體存活力及功能性且不應以與其他所轉導T細胞群之研究級產生進行直接比較來評估。T細胞殺死作用係針對K562(一種表現或不表現CD19的慢性骨髓性白血病細胞株)或Pt14(自CLL患者分離出的B細胞)。在此基於流動之細胞毒性分析中，目標細胞用CSFE染色以定量其存在。目標細胞係針對CD19表現而經染色以證明目標抗原含量相似。CAR19 T細胞之溶胞活性係在效應細胞：目標細胞之10：1、3：1、1：1、0.3：1及0：1滴定比率下量測，其中效應細胞定義為表現抗-CD19嵌合受體的T細胞。藉由將適當數目個T細胞與恆定數目個目標細胞混合來起始分析。16個小時之後，移除總體積之各混合物且洗滌各孔，適當合併。T細胞係針對CD2加以染色且所有細胞經染色而皆含有活/死標記7AAD。最終洗滌後，將離心塊狀細胞再懸浮於具有預定數目個計數珠粒的特定體積中。藉由LSRII流式細胞術收集細胞染色資料且使用珠粒、利用FloJo軟體加以分析，以定量結果。

量測人類化CAR19 T細胞之細胞增殖及細胞激素產生時，將細胞解凍且允許恢復隔夜。除人類化CART19之外，鼠科CART19用於比較目的，而SS1-BBz作為非靶向之所表現CAR用於CAR/T細胞背景效應。所有分析中皆使用最高標準物「對照」CART19來比較分析偏差。T細胞係針對K562(一種表現或不表現CD19的慢性骨髓性白血病細胞株)或Pt14(自CLL患者分離出的B細胞)。另外，使用CD3x28珠粒評估T細胞回應內源性免疫信號的潛力。為了分析增殖，T細胞用CSFE染色。增殖使得CSFE染色被稀釋，反映親本標記現分離進入兩個子代細胞中。此分析僅測試1：1及1：0之效應：目標細胞比率，其中效應細胞定義為表現抗-CD19嵌合受體的T細胞。雙重複進行分析，且在細胞混合後24小時，移除/置換50%培養基以便使用偵測人類細胞激素的Luminex 10-plex panel進行細胞激素分析。5天後，T細胞針對CAR表現而經染色，表型分型為CD4或CD8細胞且針對活/死7AAD而經染色。最終洗滌後，將離心塊狀細胞再懸浮於具有預定數目個BD計數珠粒的特定體積中。藉由LSRII流式細胞術收集細胞染色資料且使用珠粒、利用FloJo軟體加以分析，以定量結果。總細胞計數係根據相對於特定珠粒數目所計數之細胞數目乘以尚有待計數之珠粒的分率來確定。

為了評估與當前成功的鼠科CART19具有相似作用之人類化CART19細胞的潛力，意欲評估其活體外殺死目標細胞、回應目標抗原而增殖及顯示持久信號的能力。藉由對SupT1細胞上的各人類化CART19慢病毒構築體進行包裝及滴定，能夠測定依約50%轉導率校正的病毒量。由此允許自每個細胞的相似平均整合位點數開始，對活性進行更直接的比較。

治療性CAR19 T細胞的產生始於正常血球分離供者的血液，其未處理T細胞係藉由對T細胞、CD4+及CD8+淋巴細胞進行陰性選擇來獲得。此等細胞在37℃、5% CO₂中、在10% RPMI中經CD3x28珠粒活化。

24小時後，T細胞快速擴增且添加校正量之病毒。T細胞開始分裂而進入對數生長模式，藉由量測每毫升之細胞計數及細胞尺寸來監測。當T細胞開始休止時，對數生長減弱且細胞尺寸縮小。減緩生長速率與T細胞尺寸(達到約300fl)之組合決定待低溫保存或再刺激之T細胞之狀態。

如根據尺寸所見，存在T細胞休止的非常相似傾向。具有當前鼠科CART19之人類化CART細胞與UTD群體之間的幾乎重疊模式指示人類化CAR19對活化之後的正常T細胞擴增無異常影響。作為對照，使用SS1-BBz定義非所需的抗原非依賴性CAR活性。總細胞數之擴增概況顯示個別擴增中之實際數目差異可能主要歸因於起始細胞數目不同。藉由校正起始T細胞數目，瞭解所有CART19細胞之緊密叢集。另外，在下方及遠離群組跑膠的細胞株中偵測到抗原非依賴性CAR活化之非所需影響。

測定此等CAR19表現細胞中之每一者的表面表現量。針對轉導校正的滴定病毒顯示與轉導效率(轉導細胞百分比)相關的類似表現量。一些CAR的效價係根據早先包裝進行外推，且雖然其轉導百分比較低，但其MFI如所預期亦降低。結果指示，與UTD及鼠科CAR19 T細胞相比，人類化CAR19對細胞正常擴增能力不存在可偵測的不利影響。

分析人類化CART19細胞選擇性識別細胞上所表現之細胞表面特異性抗原決定基且摧毀其的能力。野生型K562細胞不表現CD19，但經轉導可表現CD19。比較此等殺死曲線，滴定效應細胞之量顯示表現CD19的彼等細胞被摧毀。來自同一供者且經人類化CART19細胞或當前臨床鼠科CART19細胞修飾的再導向T細胞在其殺死能力方面無差異。殺死曲線顯示在靶向來自患者14之CD19+ CLL細胞的人類化CART19細胞當中發現非常相似的殺死能力。有趣的是，整體溶胞活性，特別是GS CART19，存在著減小，表明此等細胞可具有特異性抑制特性。目標細胞上所表現之CD19含量相似指示表現量並非細胞殺死能力差異的原因。

在對照CD3x28珠粒及表現CD19之目標刺激之後，在所有構築體中均發現人類化CART19細胞在尋見目標細胞後增殖的必需特性。靶向Pt14 CLL細胞似乎指示稍微較大的增殖速率，其中當具有3x GGGGS或4x GGGGS連接(分別為SEQ ID NO：107及106)時，輕鏈至重鏈取向無偏置。增殖結果反映在5天期間聚集的細胞總數，指示人類化CART19(2146、2144、2136、2141及2137)驅動更具增殖性的信號至T細胞。令人印象深刻的是，此在靶向Pt14 CLL細胞的人類化CART19細胞中偵測到。

總而言之，人類化CART19構築體在針對抗原特異性目標的溶胞活性、增殖反應及細胞激素分泌方面展現與當前鼠科CART19非常相似的特徵。人類化CART19細胞(2146、2144、2136、2141及2137)在目標活化時驅動更具增殖性的信號至T細胞的潛力似乎為此等新穎構築體潛在增強治療反應的額外益處。

結果

使用去粒與細胞激素產生分析，均表明經工程改造的CART19 T細胞特異性地靶向CD19+細胞。

分析經本發明之人類化CD19CAR構築體(亦稱為「huCART19」)轉導的ND317細胞。CD3x28活化且用人類化CART19候選物轉導之後，T細胞在其擴增期間的尺寸相對於鼠科CART19及未修飾(UTD)之T細胞而言存在緊密的相似性。

實驗顯示，CD3x28活化且用不同的人類化CART19候選物轉導之後，T細胞在其擴增期間累積的數目相對於鼠科CART19及未修飾(UTD)之T細胞而言存在很小的差異。

人類化CART19之細胞表面表現為類似的且其表現量與鼠科CART19非常相似。直方圖之重疊部分繪製出經人類化CART19轉導之各T細胞的細胞表面表現染色圖案且由此等概況計算出的平均螢光強度(MFI)與所轉導細胞之百分比非常相關。

此外，人類化CART19在靶向表現CD19之目標細胞上具有相似的特異性細胞毒性活性且可與鼠科CART19類似。使用滴定效應與目標細胞(E：T)比率，根據基於16小時流動的殺死分析作圖，其中人類化CART19效應細胞靶向CSFE標記K562cc(圖1A，不表現CD19對照)、K562.CD19(圖1B，經轉導而表現CD19的K562細胞)或Pt14(圖1C，CLL患者之B細胞)。所有人類化CART19細胞之溶胞活性相似且與鼠科CART19類似。不同目標之間在溶胞活性上的差異相似且可比，指示鼠科CART19活性在CART19之人類化形式中得以保存。

經CFSE標記之人類化CART19細胞與目標細胞混合後6天的直方圖重疊顯示其增殖能力(圖5)。CAR19所遞送之增殖反應為與目標細胞接合且殺死目標細胞之後的必需反應，以產生陽性臨床反應。SS1-BBz CSFE染色之稀釋(子代細胞分裂而稀釋親本細胞染色的指標)為未休止T細胞依靶向非依賴性機制維持分裂的結果。

使用模擬TCR與共刺激物CD28內源性接合的CD3x28珠粒評估細胞群整體增殖能力。資料指示各細胞群具有類似的增殖潛力。所有人類化及鼠科CART19細胞在與表現CD19之K562細胞接合時強烈且類似地增殖。人類化CART19細胞對獲自CLL患者的B細胞亦有良好的反應，然而有些反應稍微較小。如圖2A及2B中所示，可見到人類化CART19細胞2136、2137、2140、2141、2144及2146具有稍微更強的增殖，如CSFE染色之較大稀釋所證明。此等構築體皆具有相同的輕鏈至重鏈可變鏈取向，指示此取向為所選取向。仔細觀察重鏈CDR2位點之胺基酸變化(表1)揭示，尋見目標之後似乎具有更強增殖作用的構築體均代表三種變異YSSSL、YQSSL及YNSSL(分別為SEQ ID NO：28、29及30)中之每一者。另外，此等所觀測構築體具有含有3個亞單元複本(3G4S)(SEQ ID NO：107)的G4S連接子與含有4個亞單元複本(4G4S)(SEQ ID NO：106)的G4S連接子，指示連接子尺寸不影響功能。

根據上述增殖性擴增，測定腫瘤接合後5天之後的總細胞數。細胞數目與初始所見相比降低，指示維持存活必需活化。分析內源性活化對照，其顯示在6天結束時的總細胞計數相似。人類化CART19細胞靶向表現CD19之K562細胞顯示，兩種鼠科CART19細胞均最後得到較高細胞數目，其中2146稍微高於具有相似值的其他構築體。暴露於患者14之B細胞(pt14)後6天亦分析總細胞數，且有趣地顯示，先前選出之人類化CART19構築體2146、2144、2136、2141、及2137得到較高總細胞數(高於鼠科CART19)，所有此等構築體皆具有輕鏈至重鏈取向且代表三種胺基酸變異YSSSL、YQSSL及YNSSL(分別為SEQ ID NO：28、29及30)。不同人類化抗CD19CAR純系之間的此意外區別可解釋為經此等構築體轉導之CART細胞具有較佳臨床功效。

分析由人類化CART19細胞暴露於不表現CD19之對照K562細胞後產生之細胞激素的背景含量。使用luminex 30-plex panel分析24小時上清液。內源性免疫系統經CD3x28珠粒刺激所得的潛在細胞激素概況指示各細胞群具有類似的細胞激素概況。

資料亦顯示，人類化CART19與鼠科CART19回應於相同目標時產生相似含量、相似概況的細胞激素。靶向Pt14目標細胞時，細胞激素概況較低，但相似。

實例5：人類化CD19 CAR T細胞在活體內ALL模型中之治療

原發人類ALL細胞可在免疫受損小鼠中生長而無須將其在活體外培養。此等小鼠可用於測試嵌合抗原受體(CAR)T細胞在代表將在臨床中發現之患者群體之模型中的功效。此處所用之模型HALLX5447在NOD.Cg-Prkdc ^scid Il2rg ^tm1Wjl/SzJ(NSG)中繼代兩次，隨後在測試CAR T細胞之功效的研究中使用。

鼠科CD19 CAR T細胞先前已顯示可靶向且殺死原發人類ALL之NSG小鼠模型中的白血病細胞。CD19 scFv(單鏈Fc可變片段)已經人類化且該實例係對表現人類化CD19 CAR(CAR 2)之T細胞活體內清除ALL腫瘤細胞的能力與鼠科CD19 CAR T細胞的此能力進行比較。此處，已直接比較此等細胞在建立有原發人類ALL之小鼠中的功效，如藉由人類CD19⁺細胞之周圍血液FACS分析加以分析。1.5x10⁶個原發ALL細胞靜脈內植入之後，腫瘤植入後2週達成血液中2.5-4% CD19⁺人類細胞之疾病負荷。此CD19百分比為小鼠血液中總細胞百分比。經CAR T細胞治療之前的小鼠中之人類細胞100%為腫瘤細胞。周圍血液中之CD19⁺人類細胞百分比超過2%視為此模型中建立人類ALL疾病。一旦白血病建立於小鼠中(腫瘤植入之後約兩至三週)，即用CAR T細胞治療患有白血病之小鼠。各組小鼠均用5x10⁶個總人類T細胞治療。表現CAR之慢病毒對供者人類T細胞之轉導效率在40%至60%之間。用T細胞治療之後，將小鼠每週放血一次，用於分析血液中CD19⁺人類細胞之百分比作為疾病進展之生物標記。

材料及方法：

原發人類ALL細胞： 初級細胞在植入之前不在活體外培養。此等細胞自患有ALL之患者收穫且轉移至小鼠中用於建立及擴增。腫瘤細胞在小鼠中擴增之後，收穫骨髓及脾細胞且以各別分批進行活冷凍以便再植入。細胞於90% DMSO及10% FBS中以每毫升5x10⁶個細胞之最低濃度冷凍。再植入時，將冷凍的ALL細胞解凍且接著靜脈內注入NSG小鼠中，以便產生患有ALL的小鼠，其將用於比較人類化CD19 CAR T細胞與鼠科CD19 CAR T細胞之抗腫瘤功效。

小鼠： 6週齡NSG(NOD.Cg-Prkdc ^scid Il2rg ^tm1Wjl/SzJ)小鼠獲自Jackson Laboratory(系群編號005557)。實驗之前，允許動物對Novartis NIBRI動物設施適應至少3天。根據Novartis ACUC規則及準則處置動物。

腫瘤植入： 活體內連續繼代之原發人類ALL細胞(模型HALLX5447)在37℃水浴中解凍。細胞接著轉移至15ml錐形管中且用無菌冷PBS洗滌兩次。接著對原發ALL細胞計數且以每毫升15x10⁶個細胞之濃度再懸浮於PBS中。將細胞置放於冰上且立即(在一小時內)植入小鼠體內。以靜脈內方式，經由尾靜脈注射100μl體積之ALL細胞，每隻小鼠注射總共1.5x10⁶個細胞。

給與CAR T細胞： 腫瘤植入之後16天，將5x10⁶個T細胞投與小鼠。細胞在37攝氏度水浴中部分解凍且接著藉由添加1ml無菌冷PBS至含有細胞之管中而完全解凍。解凍的細胞轉移至15ml錐形離心管(falcon tube)中且用PBS調節至10ml之最終體積。細胞在1000rpm洗滌兩次，每次10分鐘，且接著用血球計計數。T細胞接著以每毫升50x10⁶個細胞之濃度再懸浮於冷PBS中且在冰上保持直至給與小鼠。以靜脈內方式將100μl CAR T細胞經由尾靜脈注入小鼠中，劑量為每隻小鼠5x10⁶個T細胞。每組五隻小鼠用100μl單獨PBS(PBS)、未轉導之T細胞(模擬物)、鼠科CD19 CAR T細胞(muCTL019)或人類化CD19 CAR T細胞(huCTL019)治療。未轉導之T細胞、muCTL019 T細胞及huCTL019 T細胞皆自同一人類供者並行製備。

動物監測： 每天監測小鼠健康狀態，包括每週兩次量測體重。體重變化百分比如下計算：(BW_當前-BW_初始)/(BW_初始)x 100%。每週利用周圍血液FACS分析對腫瘤負荷進行監測。小鼠每週經由尾靜脈放血置於塗佈EDTA之管中，在冰上保持。將10-20μl血液自管塗鋪於冰上之96孔盤中。紅血球用ACK紅血球溶解緩衝液(Life Technologies，目錄號A10492-01)溶解且接著用冷PBS洗滌兩次。細胞與人類及小鼠Fc阻斷物(Miltenyi Biotec，目錄號130-059-901及130-092-575)之Fc阻斷混合物一起培育30分鐘且接著與抗人類CD19抗體一起培育30分鐘。細胞用2%三聚甲醛溶液固定20分鐘，洗滌且在PBS+2% FBS中儲存隔夜，隨後用BD Canto或Fortessa分析，隨後使用FlowJo FACS分析軟體進一步分析。分析細胞以測定患有人類HALLX5447 ALL腫瘤之NSG小鼠之血液中的人類CD19⁺細胞百分比。血液中之CD19百分比係以平均值+標準平均誤差(SEM)報導。

治療/控制(T/C)百分比值使用下式計算：若△T0，則% T/C=100 x △T/△C；若△T<0，則消退%=100 x △T/T_初始；其中T=藥物治療組在研究最後一天的平均周圍血液CD19百分比；T_初始=藥物治療組在初始給藥日的周圍血液CD19百分比；△T=藥物治療組在研究最後一天的平均周圍血液CD19百分比-藥物治療組在初始給藥日的平均周圍血液CD19百分比；C=對照組在研究最後一天的平均周圍血液CD19百分比；且△C=對照組在研究最後一天的平均周圍血液CD19百分比-對照組在初始給藥日的平均周圍血液CD19百分比。

T/C值在100%至42%範圍內解釋為不具有或具有最小的抗腫瘤活性；T/C值<42%且>10%解釋為具有抗腫瘤活性或腫瘤生長抑制。T/C值<10%或消退值>-10%解釋為腫瘤停滯。消退值<-10%報導為消退。

結果：

評估鼠科及人類化CD19 CAR T細胞之抗腫瘤活性且以原發人類ALL模型進行比較。第0天植入腫瘤之後，將小鼠隨機分入療組且在第16天用5x10⁶個T細胞靜脈內治療。監測ALL疾病負荷及動物健康狀況直至動物達成終點。所有群組之小鼠在腫瘤植入後第65天無痛處死，此時對照組之疾病負荷為周圍血液中之人類CD19⁺細胞高於80%。

自腫瘤植入之後24天直至第65天研究結束時，對照組與鼠科或人類化CD19 CAR T細胞治療組之間在疾病負荷上見到明顯差異(P<0.01)鼠科與人類CD19 CAR T細胞表明在NSG小鼠中控制人類HALLX5447 ALL腫瘤細胞生長的能力相似。兩組在HALLX5447植入後第21天均顯示12-15%人類CD19⁺細胞之峰值周圍血液疾病含量。腫瘤細胞植入之後42天，huCTL019組中偵測不到人類CD19⁺細胞，而muCTL019組中之人類CD19⁺細胞百分比降至約1%。鼠科與人類化CD19 CAR T細胞在此模型中控制原發人類ALL細胞擴增的能力類似(P>0.05)。經模擬物轉導之T細胞組之% T/C值為94.40%，表明經模擬物轉導之T細胞不具有抗腫瘤活性。muCTL019組之消退百分比為-89.75%且huCTL019組之消退百分比為-90.46%，表明此兩組治療均能夠引起HALLX5447腫瘤模型之消退。作為此等小鼠中之疾病負荷之量度的周圍血液人類CD19⁺細胞百分比顯示於圖7中。不接受任何T細胞的PBS治療組顯示，在靜脈內植入之NSG小鼠中存在基線原發ALL腫瘤生長動力學。模擬物治療組接受未轉導之T細胞，其經歷的活體外擴增過程與CAR T細胞相同。此等細胞充當對照T細胞以在此腫瘤模型顯示T細胞之非特異性反應。PBS與模擬物轉導T細胞治療組均顯示腫瘤在整個實驗中連續進展。在5x10⁶個T細胞注射一週內，鼠科與人類化CD19 CAR T細胞均控制疾病進展，且在此65天研究過程中顯示相似的維持疾病控制之能力。

在功效研究中，評估鼠科與人類化CD19 CAR轉導T細胞在具有原發人類ALL模型(HALLX5447)之NSG小鼠中的抗腫瘤活性。此研究表明，鼠科與人類化CD19 CAR T細胞(muCTL019與huCTL019)均能夠在原發人類ALL模型中建立抗腫瘤反應。另外，如依據周圍血液疾病負荷所分析，此反應與muCTL019及huCTL019細胞相同。在給與小鼠T細胞一週之內，鼠科與人類化CD19 CAR T細胞均控制原發ALL生長。治療後，疾病負荷初始連續增大，隨後降低至實質上偵測不到的水準。鼠科或人類化CAR T細胞之一療法在65天期間，針對對照治療小鼠之疾病進展產生持續之抗腫瘤反應。人類化CD19 CAR T細胞顯示建立有效抗-CD19腫瘤反應及控制ALL疾病負荷的能力，此能力與鼠科CD19 CAR T細胞的能力相似。

實例6：CD19 CAR T細胞用於治療多發性骨髓瘤。

即使使用化學療法、靶向療法及自體幹細胞移植之當前療法，骨髓瘤亦視為不治之症。該實例描述用針對CD19與嵌合抗原受體(慢病毒/CD19：4-1BB：CD3ξ；亦稱為「CART19」或CTL019)的自體T細胞治療多發性骨髓瘤(MM)。此實例表明，針對CD19的CAR療法基於靶向骨髓瘤幹細胞及/或CD19表現量極低(大部分方法偵測不到)的腫瘤細胞而具有建立長期持久性深度緩解作用的潛力。

治療患有侵襲性繼發漿細胞性白血病的患者時，發現在補救自體幹細胞移植後兩天投與CART19可使漿細胞性白血病快速清除且在經由多線化學療法已進展的患者中產生很好的部分反應。此患者在治療前之數月具有輸液依賴性；在治療後兩個月，其血液計數恢復(血小板計數及白血球計數在正常範圍內)且不需要輸液，因為其已出院而脫離治療。

由於骨髓瘤細胞並非天然地表現CD19，因此CART19療法對此腫瘤誘導快速且顯著之抗腫瘤反應的發現令人吃驚。不希望受特定理論束縛，據推測，CART19可用於治療骨髓瘤的原因在於：(1)雖然傳統上根據流式細胞術認為，骨髓瘤細胞對於CD19表現呈陰性，但存在的資料表明骨髓瘤細胞可以極低量表現CD19，以致表現可依據RNA偵測到，但流式細胞術或免疫組織化學卻偵測不到；及(2)靶向純系型B細胞的概念，純系型B細胞被認為是引起多發性骨髓瘤的癌症幹細胞，且對化學療法特別有抗性。B細胞與骨髓瘤腫瘤細胞之間存在純系關係，但傳統骨髓瘤療法係針對惡性漿細胞，而非B細胞。治療骨髓瘤之CART19因此靶向與大部分骨髓瘤療法不同的細胞群。

在單一患者經歷中，該患者具有循環漿細胞，且吾人能夠對其表現CD19之腫瘤細胞進行測試。其腫瘤細胞中約1-2%表現CD19抗原(圖8)。因此，據推測，CART19對其很小的腫瘤細胞群可具有直接作用；此為很好的部分反應，但基於僅靶向很小的CD19+腫瘤細胞群尚不能預測。

在此情況下，高劑量美法侖之後，進行自體幹細胞移植援救，隨後投與CART19。雖然此為骨髓瘤之標準療法，但卻無法治癒。此外，此患者先前已經歷串聯式自體幹細胞移植且移植之後較早(<6個月)復發。不希望受特定理論束縛，如該實例中所述的CART19細胞當與補救自體幹細胞移植組合用於治療骨髓瘤時，可具有不重疊的機制。

十位其他多發性骨髓瘤患者在I期試驗中用CART19治療。

劑量原理及風險/益處

此方案選用經由靜脈內投藥途徑進行的單一劑量給藥。此方案之主要目標為測試將CART-19細胞投與多發性骨髓瘤患者的安全性及可行性。預期的主要毒性為(1)當CAR遇到惡性或正常B細胞上的其替代者CD 19抗原時，細胞激素釋放；(2)正常B細胞消耗，類似於利妥昔單抗療法；(3)對類固醇有反應的皮膚及胃腸症候群，類似於移植物抗宿主疾病，如先前當擴增/共刺激自體T細胞已與ASCT聯合用於MM時所見。理論上的擔憂為CART-19 T細胞是否會回應高量CD 19而發生轉型或不可控增殖。在本申請案中，此擔憂弱於對CLL患者之另一研究，因為MM中純系型B細胞之負荷預期遠遠低於彼研究中所治療之難治性CLL患者中惡性B細胞的負荷。

劑量原理

對於前3位患者，已在1.4x10⁷至1.1x10⁹個CART-19細胞之劑量下觀測到臨床活性。此觀測結果表明，至少在所治療之前3位患者中不存在明顯的劑量反應關係。在以log2倍劑量差異投與的患者中觀測到完全反應。因此，不同於發生代謝的標準藥物，CAR T細胞的劑量反應範圍可較寬。此很可能由於CAR T細胞能夠在患者中廣泛增殖。因此將用於輸注的劑量範圍設定為1-5x10⁸個CART-19細胞。在此基於酌情使用而提供的單一患者研究中，向患者提供多達5x10⁸個CART19細胞，無劑量下限。在十位患者試驗中，將向患者提供1-5x10⁷個CART-19細胞。

一般設計

此為基於酌情使用而提供的單一患者研究；其仿效I期研究以判定輸注經轉導以表現CART-19的自體T細胞是否為安全的。研究之主要目的為判定CART-19 T細胞在患者中的安全性、耐受性及移植潛力，該等患者在首次ASCT之後較早復發，隨後經歷補救ASCT。方案由開放標記先導研究組成。

首先，個體將經歷骨髓活組織檢查及對其MM之常規實驗及成像評估。合格的個體將經歷穩態的血球分離術，以獲得大量的周圍血液單核細胞(PBMC)用於製造CART-19。自PBMC純化T細胞，用TCRζ/4-1BB慢病毒載體轉導，活體外擴增且接著冷凍供將來投與。記錄與T細胞被成功製造的患者數目相比，T細胞收集、擴增或製造不足的患者數目；預期產物製造之可行性在此患者群體中不會有問題。

個體一般須具有足夠的周圍血液幹細胞，從而經遷移/收集而儲存，為其進行首次ASCT、再進行兩次ASCT作準備。不具有足夠周圍血液幹細胞的個體在其穩態血球分離術之前或之後，將依據符合治療醫師偏好的方案經歷第二遷移/收集程序。初始白血球分離術之後約兩週，個體將住院且接受高劑量美法侖(第-2天)，接著兩天後輸注自體幹細胞(第0天)，且四天後，所有個體將接受CART-19細胞之輸注(第+2天)。募集多達10位患者。

所有個體每隔一定時間接受血液測試直至研究第4週，以評估CART-19細胞的安全性及移植性及持久性。第+42天及第+100天，個體將經歷骨髓抽吸/活檢，以評估骨髓漿細胞負荷及CART-19細胞至骨髓之遷移量。第100天，根據國際骨髓瘤研究小組(International Myeloma Working Group，IMWG)準則136進行正式反應評估，且根據常規臨床實務監測TTP。此研究中所量測的主要功效結果為患者初始ASCT後之TTP與此研究中ASCT後之TTP的比較。

由於此研究之主要終點為輸注CART-19細胞聯合ASCT的安全性及可行性，因此研究將使用早期中止法則。簡言之，若在所治療之前五位個體當中發生的意外嚴重不利事件少於2個，則研究中再增加五位個體以達成募集10位之目標。輸注CART-19後觀測所治療個體40天(亦即，直至第42天的首次正式反應評估)，隨後募集後續個體直至已募集到五位個體且如此觀測。治療第二組五位患者時，個體之間無需等候期。

密集隨訪6個月之後，至少每個季度根據病史、身體檢查及血液測試評估個體，歷時兩年。此評估之後，個體將進入利用電話及問卷之年度隨訪的循環研究長達另外十三年，以根據長期健康問題之診斷(諸如出現新惡性疾病)進行評估。

主要研究終點

此先導試驗設計成測試經CD19 TCRζ/4-1BB轉導之自體T細胞在患者中的安全性及可行性，該等患者在首次ASCT後較早復發，隨後經歷針對MM之補救ASCT。

主要的安全性及可行性終點包括：在自輸注直至第24週之任何時間發生研究相關不利事件，定義為NCJ CTC 2：3級信號/症狀，實驗室毒性及臨床事件，其可能、大概或明確與研究治療相關。此將包括輸注毒性及與CART-19細胞可能相關的任何毒性，包括(但不限於)：

a.發燒

b.皮疹

c.嗜中性球減少症、血小板減少症、貧血、骨髓發育不良

d.肝功能失常

e.肺浸潤或其他肺毒性

f.感染胃腸道或皮膚的GVHD樣症候群。

利用患者血球分離產物製造CART-19細胞的可行性。測定在載體轉導效率、T細胞純度、存活力、無菌性及腫瘤污染方面不滿足放行準則的製造產物之數目。

對聯合CART19進行自體幹細胞移植之後的反應深度及持續時間與各患者在標準自體幹細胞移植後初始達成的反應深度及持續時間進行比較。

個體選擇及退出 包涵準則

個體須已經歷先前針對MM之ASCT且在幹細胞輸注365天內已進展。已經歷兩次先前ASCT作為計劃串聯式ASCT鞏固療法之一部分的個體為合格的。進展將根據關於進行性疾病的IMWG準則或根據患者在初始ASCT後獲得CR或sCR(CR復發的準則)加以定義(Durie等人，Leukemia 2006；20(9)：1467-1473)。注意：不要求患者必須在先前ASCT 365天內募集，且患者在此研究募集之前，在先前ASCT之後復發/進展後，可用其他藥劑治療，包括實驗性藥劑。

個體必須已簽訂書面知情同意書。

個體必須具有足以接受高劑量美法侖的生命器官功能，如根據以下準則(在美法侖輸注日前之12週量測)所定義：a.血清肌酸酐2.5或肌酐清除率估算值30mL/min且不依賴於透析；b. SGOT3×正常值上限且總膽紅素2.0mg/dl(除因吉爾伯特氏症候群(Gilbert's syndrome)所致之高膽紅素血症患者外)；c.左心室射血分數(LVEF)45%，或若LVEF為<45%，心臟病學家之正式評估鑑別心血管功能在臨床上無顯著的損害。LVEF評估必須已在募集六週內進行；d.足夠的肺功能，其中FEV1、FVC、TLC、DLCO(根據肺容量及血紅蛋白濃度適當調整之後)預測值40%。肺功能測試必須已在募集六週內進行。

個體必須具有0至2之ECOG表現狀態，除非較高表現狀態僅歸因於骨骼疼痛。

排除準則 個體不可：具有任何活動性且不可控制的感染。

具有活動性B型肝炎、C型肝炎，或HIV感染。

如所概述阻礙參與的任何不可控醫學病症。

治療方案 復發/進行性多發性骨髓瘤之療法

募集之前，患者可根據其治療醫師之偏好接受針對復發/進行性多發性骨髓瘤之療法。募集時，療法可連續進行。

血球分離術之前，患者必須停止所有療法兩週，且在高劑量美法侖之前停止兩週。若血球分離術與高劑量美法侖之間的時間預期超過兩週，則患者可在血球分離術之後，根據其治療醫師之判別來恢復療法。

高劑量美法侖(第-2天)

患者在第-3天或第-2天住院且經歷主治醫師及常規實驗室測試之檢查，包括監測腫瘤溶解症候群之參數，隨後開始執行治療方案。若在住院7天內尚未抽血進行監測MM之實驗室測試(SPEP，定量免疫球蛋白，及無血清輕鏈分析)，則在療法開始之前，抽血進行此等測試。

高劑量療法將由以下組成：第-2天以200mg/m²之劑量靜脈內投與美法侖約20分鐘。對於>70歲患者或根據治療醫師之判別可能不耐受200mg/m²劑量之任何年齡的患者而言，美法侖劑量將降低至140mg/m²。所有患者將接受標準抗嘔吐預防(可包括地塞米松)及標準抗生素預防。

幹細胞再輸注(第0天)

幹細胞輸注將在第0天，高劑量美法侖投與之後至少18小時進行。在根據標準機構實務進行前驅給藥之後，靜脈內輸注幹細胞約20至60分鐘。每公斤體重應輸注至少2x10⁶個CD34+祖細胞。另外，每公斤體重至少1x10⁶個CD34+祖細胞應以備用幹細胞產物形式獲得，以便在延遲之移植或較遲之移植失敗時輸注。G-CSF應在第+5天SQ開始時投與，所投與之劑量係根據標準機構實務。根據標準機構準則執行其他支撐性照護措施，諸如輸液支架。

CART19細胞輸注(第+2天)

經CART-19轉導之T細胞的單次給與劑量係由多達5x10⁷個CART-19細胞組成。在此單一患者方案中，經CD19 TCRζ4-1BB載體轉導之細胞輸注不存在最小的可接受劑量。幹細胞輸注之後第+2天，藉由靜脈內快速輸注給與單次劑量的CART-19細胞。

維持性雷利度胺

首次ASCT之後接受且耐受維持性雷利度胺的個體在約第+ 100天將再開始接受雷利度胺維持療法，假定治療醫師判斷不存在禁忌症。

製備及投與研究藥物

CART-19 T細胞在CVPF中製備且在滿足FDA批准之關於所輸注細胞之放行準則(例如細胞劑量、細胞純度、無菌性、載體/細胞之平均複本數等)後，CVPF才予以放行。一經放行，細胞即帶至床側投與。

細胞解凍。冷凍的細胞在乾冰中運輸至個體床側。細胞在床側使用維持在36℃至38℃的水浴解凍。將袋輕輕地按摩直至細胞剛好解凍。容器中應無冷凍團塊。若CART-19細胞產物似乎受到損傷或袋滲漏，或在其他方面似乎受到損害，則其不應輸注且應返送回至CVPF，如下文所說明。

前驅給藥。T細胞輸注之後的副作用包括短暫發燒、寒戰及/或噁心；欲回顧，參見Cruz等人(Cytotherapy 2010；12(6)：743-749)。在CART-19細胞輸注之前，建議使用乙醯胺苯酚(acetaminophen)及鹽酸苯海拉明(diphenhydramine hydrochloride)對個體進行前驅給藥。需要時，此等給藥可每六個小時重複進行。若患者持續發燒且不能用乙醯胺苯酚緩解，則可遵醫囑執行非類固醇消炎給藥過程。建議患者在任何時間均不接受全身性皮質類固醇，諸如氫化可的松(hydrocortisone)、潑尼松(prednisone)、甲潑尼龍(methylprednisolone)或地塞米松，但在危急生命的緊急情況下除外，因為其對T細胞可能具有不利影響。若因急性輸注反應而必需皮質類固醇，則建議首次劑量為100mg氫化可的松。

發熱反應。在個體經CAR T細胞輸注之後出現敗血症或全身性菌血症的不太可能事件中，應啟動適當培養及醫學管理。若懷疑CART-19 T細胞產物被污染，則使用在CVPF儲存的歸檔樣品對產物的無菌性進行再測試。

投藥。輸注將在Rhoads之隔離室中、使用針對免疫抑制患者之預防措施進行。經轉導之T細胞經由具有3通活栓的18號無乳膠Y形輸血裝置、以每分鐘約10mL至20mL之流速、藉由快速靜脈內輸注投與。輸注持續時間為約2至20分鐘。每個輸注袋附有含有以下之標記：「僅供自體使用」。另外，標記將具有至少兩個獨特標識符，諸如個體姓名首字母、出生日期及研究編號。輸注之前，兩個個體將在該個體存在下獨立地檢驗所有此資訊且如此確認該資訊與參與者正確匹配。

在輸注期間，在個體具有過敏反應或嚴重低血壓危象或對輸注之任何其他反應的情況下，可利用緊急醫療設備(亦即緊急手推車)。輸注之前及之後，量測生活徵象(溫度、呼吸率、脈搏及血壓)，接著在至少一個小時期間每15分鐘進行量測直至此等信號令人滿意且穩定。要求個體在醫師認為他或她安全而可離開時時才可離開。

包裝

輸注將包含1-5x10⁸個CA T19轉導細胞之單次劑量，其中輸注可接受之最小劑量為1x10⁷個CART-19細胞。每個袋將包含含有以下輸注級試劑(% v/v)的防凍介質等分試樣(體積取決於劑量)：31.25% plasmalyte-A、31.25%右旋糖(5%)、0.45% NaCl、至多7.5% DMSO、1%葡聚糖40、5%人類血清白蛋白。

血球分離術

在血球分離中心進行大體積(12-15公升或4-6個血液體積)血球分離程序。在此程序期間，獲得PBMC用於CART-19。利用單一白血球分離術，意欲收穫至少50x10⁹個白血球以製造CART-19 T細胞。亦獲得符合FDA復審要求及用於研究的基線血液白血球且低溫保存。預期細胞產物可在約2至4週後備妥放行。流式細胞術淋巴細胞亞群定量，包括CD19及CD20 B細胞測定。對人類抗-VSV-G及抗鼠科抗體(HAMA)進行基線評估。若個體先前已在臨床細胞及疫苗生產機構(Clinical Cell and Vaccine Production Facility)根據當前優良藥品製造規範(Good Manufacturing Practices)儲存有足夠的血球分離收集細胞，則此等細胞可用作製造CART-19之細胞源。使用所儲存的血球分離產物將避免個體再經歷血球分離收集的費用、時間及風險。

細胞減滅式化學療法

淋巴消耗式化學療法為如本文所述的高劑量美法侖。

CART-19輸注

幹細胞再輸注之後，第+2天開始輸注。

第+2天，在首次輸注之前，患者將作全血細胞計數伴差異比較(CBC with differential)，及CD3、CD4及CD8計數之評估，因為化學療法經部分地給與可誘發淋巴細胞減少症。

首次劑量將使用單次劑量投與。細胞在患者床側解凍。解凍的細胞將以可耐受的快速輸注速率給與，使得輸注持續時間為約10至15分鐘。為了促進混合，細胞將使用Y形轉接器同時投與。個體如本文所述進行輸注及前驅給藥。個體生命徵象將在給藥之前、輸注結束時及之後1小時期間每15分鐘加以評估及脈搏血氧測定，直至此等生命徵象穩定且令人滿意。用於測定基線CART-19含量的血液樣品係在首次輸注之前的任何時間及每次輸注之後20分鐘至4小時獲得(且送至TCSL)。

經歷與高劑量美法侖相關之毒性的患者將延遲其輸注時程直至此等毒性消除。作為延遲T細胞輸注之依據的特定毒性包括：1)肺：需要補充氧以使飽和度大於95%或胸部x射線之放射照相存在進行性異常；2)心臟：醫學管理不能控制的新心律不整；3)需要血管加壓藥支持的低血壓；4)主動感染：T細胞輸注48小時內，血液培養物對於細菌、真菌或病毒呈陽性。

毒性管理

不可控的T細胞增殖。與同種異體或自體T細胞輸注相關的毒性已用藥理學免疫抑制過程管理。作為對全身性皮質類固醇之反應的T細胞相關身體毒性已有報導。若發生不可控的T細胞增殖(與CART-19細胞相關的3級或4級毒性)，則個體可用皮質類固醇治療。個體將用脈衝甲潑尼龍(2mg/kg i.v.，分次給藥，q8 hr x 2天)，隨後快速遞減。

另外，根據另一方案所治療之個體的觀測結果，對巨噬細胞活化症候群(MAS)存在一些擔憂，然而預期骨髓瘤患者中的CD 19+腫瘤負荷比CLL患者低得多。此毒性之治療及治療時機將由患者的醫師及研究調查者決定。所建議的管理可包括：若個體發燒大於101℉，持續超過2個連續日且無感染證據(陰性血液培養物，CXR或其他來源)，則可考慮4mg/kg妥希珠單抗。在醫師判別下可考慮添加皮質類固醇及抗-TNF療法。

B細胞消耗。B細胞消耗與低γ球蛋白血症均有可能發生。此為抗 -CD20導向療法之共同之處。若發生臨床上嚴重的低γ球蛋白血症(亦即全身感染)，則將靜脈內免疫球蛋白(IVIG)根據所確立之臨床給藥準則給與個體，以使血清免疫球蛋白含量恢復至正常水準，如使用利妥昔單抗所達成。

初次移植失敗。與首次ASCT相比，初次移植失敗(亦即未植入)可為第二次ASCT後的更共同之處。合格準則規定，若發生初次移植失敗，則必須在治療醫師的判別下利用足夠的幹細胞進行援救性再輸注。

等效物

本文中所列之每一個專利、專利申請案及公開案的揭示內容以全文引用的方式特此併入本文中。雖然本發明已參考特定態樣加以揭示，但熟悉此項技術者顯然可在不悖離本發明之真實精神及範疇的情況下想出本發明之其他態樣及變化形式。隨附申請專利範圍意欲解釋為包括所有此等態樣及等效變化形式。

<110> 瑞士商諾華公司

<120> 使用人類化抗-CD19嵌合抗原受體治療癌症

<150> 61/838,537

<151> 2013-06-24

<150> 61/802,629

<151> 2013-03-16

<160> 118

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 242

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 1

<210> 2

<211> 242

<212> PRT

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<223> 人工序列之描述：合成多肽

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<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 6

<210> 7

<211> 247

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 7

<210> 8

<211> 247

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 8

<210> 9

<211> 247

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 9

<210> 10

<211> 247

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 10

<210> 11

<211> 242

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 11

<210> 12

<211> 242

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 12

<210> 13

<211> 21

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 13

<210> 14

<211> 45

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 14

<210> 15

<211> 24

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 15

<210> 16

<211> 42

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 16

<210> 17

<211> 112

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 17

<210> 18

<211> 5

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 18

<210> 19

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 19

<210> 20

<211> 16

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 20

<210> 21

<211> 16

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 21

<210> 22

<211> 16

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 22

<210> 23

<211> 16

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 23

<210> 24

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 24

<210> 25

<211> 11

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 25

<210> 26

<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 26

<210> 27

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 27

<210> 28

<211> 5

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 28

<210> 29

<211> 5

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 29

<210> 30

<211> 5

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 30

<210> 31

<211> 486

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 31

<210> 32

<211> 486

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 32

<210> 33

<211> 486

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 33

<210> 34

<211> 486

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 34

<210> 35

<211> 491

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 35

<210> 36

<211> 491

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 36

<210> 37

<211> 491

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 37

<210> 38

<211> 491

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 38

<210> 39

<211> 491

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 39

<210> 40

<211> 491

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 40

<210> 41

<211> 491

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 41

<210> 42

<211> 486

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 42

<210> 43

<211> 112

<212> PRT

<213> 智人

<400> 43

<210> 44

<211> 336

<212> DNA

<213> 智人

<400> 44

<210> 45

<211> 230

<212> PRT

<213> 智人

<400> 45

<210> 46

<211> 690

<212> DNA

<213> 智人

<400> 46

<210> 47

<211> 282

<212> PRT

<213> 智人

<400> 47

<210> 48

<211> 847

<212> DNA

<213> 智人

<400> 48

<210> 49

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 49

<210> 50

<211> 30

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 50

<210> 51

<211> 48

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 51

<210> 52

<211> 123

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 52

<210> 53

<211> 30

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(30)

<223> 此序列可包涵1至6個「Gly Gly Gly Gly Ser」重複單元

<220>

<223> 關於取代及較佳實施例之詳細說明，參見所提申之說明書

<400> 53

<210> 54

<211> 63

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成寡核苷酸

<400> 54

<210> 55

<211> 135

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 55

<210> 56

<211> 72

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成寡核苷酸

<400> 56

<210> 57

<211> 5

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 57

<210> 58

<211> 486

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 58

<210> 59

<211> 242

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 59

<210> 60

<211> 126

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 60

<210> 61

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 61

<210> 62

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 62

<210> 63

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 63

<210> 64

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 64

<210> 65

<211> 828

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 65

<210> 66

<211> 828

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 66

<210> 67

<211> 828

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 67

<210> 68

<211> 828

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 68

<210> 69

<211> 828

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 69

<210> 70

<211> 828

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 70

<210> 71

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 71

<210> 72

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 72

<210> 73

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 73

<210> 74

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 74

<210> 75

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 75

<210> 76

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 76

<210> 77

<211> 276

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 77

<210> 78

<211> 276

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 78

<210> 79

<211> 276

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 79

<210> 80

<211> 276

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 80

<210> 81

<211> 276

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 81

<210> 82

<211> 276

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 82

<210> 83

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 83

<210> 84

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 84

<210> 85

<211> 1458

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 85

<210> 86

<211> 1458

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 86

<210> 87

<211> 1458

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 87

<210> 88

<211> 1458

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 88

<210> 89

<211> 1473

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 89

<210> 90

<211> 1473

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 90

<210> 91

<211> 1473

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 91

<210> 92

<211> 1473

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 92

<210> 93

<211> 1473

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 93

<210> 94

<211> 1473

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 94

<210> 95

<211> 1473

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 95

<210> 96

<211> 1458

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 96

<210> 97

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 97

<210> 98

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 98

<210> 99

<211> 1458

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 99

<210> 100

<211> 1184

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 100

<210> 101

<211> 336

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 101

<210> 102

<211> 230

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 102

<210> 103

<211> 690

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 103

<210> 104

<211> 150

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 104

<210> 105

<211> 40

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(40)

<223> 此序列可包含1至10個「Gly Gly Gly Ser」重複單元

<400> 105

<210> 106

<211> 20

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 106

<210> 107

<211> 15

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 107

<210> 108

<211> 4

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成肽

<400> 108

<210> 109

<211> 5000

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(5000)

<223> 此序列可包含50至5000個腺苷鹼基

<400> 109

<210> 110

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<400> 110

<210> 111

<211> 5000

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(5000)

<223> 此序列可包含50至5000個胸苷鹼基

<400> 111

<210> 112

<211> 5000

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(5000)

<223> 此序列可包含100至5000個腺苷鹼基

<400> 112

<210> 113

<211> 400

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(400)

<223> 此序列可包含100至400個腺苷鹼基

<220>

<400> 113

<210> 114

<211> 120

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 114

<210> 115

<211> 120

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 115

<210> 116

<211> 120

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 116

<210> 117

<211> 107

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成多肽

<400> 117

<210> 118

<211> 2000

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列之描述：合成聚核苷酸

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(2000)

<223> 此序列可包含50至2000個腺苷鹼基

<400> 118

<210> 119

<211> 373

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成多肽

<400> 1

<210> 120

<211> 1182

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成聚核苷酸

<400> 2

Claims

一種編碼嵌合抗原受體(CAR)的分離核酸分子，其中該CAR包含抗體或抗體片段，該抗體或抗體片段包括人類化抗-CD19結合域、跨膜域、及包含刺激域之胞內信號傳導域，且其中該抗-CD19結合域包含表3中所列之任何抗-CD19輕鏈結合域胺基酸序列之輕鏈互補決定區1(LC CDR1)、輕鏈互補決定區2(LC CDR2)及輕鏈互補決定區3(LC CDR3)中的一或多者，以及表3中所列之任何抗-CD19重鏈結合域胺基酸序列之重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)中的一或多者。
如請求項1之分離核酸分子，其包含表3中所列之任何抗-CD19輕鏈結合域胺基酸序列的LC CDR1、LC CDR2及LC CDR3。
如請求項1之分離核酸分子，其包含表3中所列之任何抗-CD19輕鏈結合域胺基酸序列的HC CDR1、HC CDR2及HC CDR3。
如請求項1之分離核酸分子，其包含表3中所列之任何抗-CD19輕鏈結合域胺基酸序列的LC CDR1、LC CDR2及LC CDR3，以及表3中所列之任何抗-CD19重鏈結合域胺基酸序列的HC CDR1、HC CDR2及HC CDR3。
如請求項1之分離核酸分子，其包含表3中所列之任何輕鏈可變區。
如請求項1之分離核酸分子，其包含表3中所列之任何重鏈可變區。
如請求項1之分離核酸分子，其包含表3中所列之任何輕鏈可變區及表3中所列之任何重鏈可變區。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中該CD19結合域為 scFv。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中該輕鏈可變區包含胺基酸序列具有表3中所提供之輕鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過30個、20個或10個修飾，或與表3中所提供之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中該重鏈可變區包含胺基酸序列具有表3中所提供之重鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過30個、20個或10個修飾，或與表3中所提供之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中該抗-CD19結合域包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12，或與其95-99%一致的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中編碼該抗-CD19結合域的核酸序列包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：62、SEQ ID NO：63、SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：65、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：68、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：71及SEQ ID NO：72，或與其95-99%一致的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中所編碼之CAR包括跨膜域，包含選自由以下組成之群之蛋白質的跨膜域：T細胞受體CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137及CD154之α、β或ξ鏈。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中所編碼之跨膜域包含SEQ ID NO：15之序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中所編碼之跨膜域包含胺基酸序列含有SEQ ID NO：15之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過20個、10個或5個修飾，或與SEQ ID NO：15之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中編碼該跨膜域的核酸序列包含SEQ ID NO：56之序列，或與其95-99%一致的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中所編碼之抗-CD19結合域藉由鉸鏈區連接至該跨膜域。
如請求項17之分離核酸分子，其中所編碼之鉸鏈區包含SEQ ID NO：14，或與其95-99%一致的序列。
如請求項17之分離核酸分子，其中編碼該鉸鏈區的核酸序列包含SEQ ID NO：55之序列，或與其95-99%一致的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其進一步包含編碼共刺激域的序列。
如請求項20之分離核酸分子，其中該共刺激域為獲自選自由以下組成之群之蛋白質的功能信號傳導域：OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)，及4-1BB(CD137)。
如請求項20或21之分離核酸分子，其中所編碼之共刺激域包含SEQ ID NO：16之序列。
如請求項20或請求項21之分離核酸分子，其中所編碼之共刺激域包含胺基酸序列具有SEQ ID NO：16之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過20個、10個或5個修飾，或與 SEQ ID NO：16之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如請求項20或21之分離核酸分子，其中編碼該共刺激域的核酸序列包含SEQ ID NO：60之序列，或與其95-99%一致的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其進一步包含編碼胞內信號傳導域的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中所編碼之胞內信號傳導域包含4-1BB之功能信號傳導域及/或CD3ξ之功能信號傳導域。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中所編碼之胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16之序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中該胞內信號傳導域包含胺基酸序列具有SEQ ID NO：16之胺基酸序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過20個、10個或5個修飾，或與SEQ ID NO：16之胺基酸序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中所編碼之胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16之序列及SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列，其中該胞內信號傳導域包含的序列係以同框且單一多肽鏈表現。
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其中編碼該胞內信號傳導域的核酸序列包含SEQ ID NO：60之序列，或與其95-99%一致的序列；及/或SEQ ID NO：101或SEQ ID NO：44之序列，或與其95-99%一致的序列
如前述請求項中任一項之分離核酸分子，其進一步包含前導序列。
如請求項31之分離核酸分子，其中該前導序列包含SEQ ID NO：13。
一種由如請求項1至32中任一項之核酸分子編碼的分離多肽分子。
如請求項33之分離多肽，包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41及SEQ ID NO：42。
如請求項34之分離多肽，包含SEQ ID NO：31之序列。
如請求項34之分離多肽，包含SEQ ID NO：32之序列。
如請求項34之分離多肽，包含SEQ ID NO：35之序列。
如請求項34之分離多肽，包含SEQ ID NO：36之序列。
如請求項34之分離多肽，包含SEQ ID NO：37之序列。
一種分離的嵌合抗原受體(CAR)分子，其包含人類化抗-CD19結合域、跨膜域及胞內信號傳導域。
如請求項40之分離CAR分子，其包含抗體或抗體片段，包括人類化抗-CD19結合域、跨膜域及胞內信號傳導域。
如請求項40或41之分離CAR分子，其中該人類化抗-CD19結合域包含表3中所列之任何人類化抗-CD19結合域之輕鏈互補決定區1(LC CDR1)、輕鏈互補決定區2(LC CDR2)及輕鏈互補決定區3(LC CDR3)中的一或多者，以及表3中所列之任何人類化抗-CD19結合域之重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)中的一或多者。
如請求項40至42中任一項之分離CAR分子，包含表3中所列之任何抗-CD19輕鏈結合域胺基酸序列的LC CDR1、LC CDR2及LC CDR3。
如請求項40至43中任一項之分離CAR分子，包含表3中所列之任何抗-CD19重鏈結合域胺基酸序列的HC CDR1、HC CDR2及HC CDR3。
如請求項40至44中任一項之分離CAR分子，包含表3中所列之任何抗-CD19輕鏈結合域胺基酸序列的LC CDR1、LC CDR2及LC CDR3；以及表3中所列之任何抗-CD19重鏈結合域胺基酸序列的HC CDR1、HC CDR2及HC CDR3。
如請求項40至45中任一項之分離CAR分子，其中該抗-CD19結合域為scFv。
如請求項40至46中任一項之分離CAR分子，其中該抗-CD19結合域包含表3中所列之胺基酸序列的輕鏈及重鏈。
如請求項40至47中任一項之分離CAR分子，其中該抗-CD19結合域包含輕鏈可變區，該輕鏈可變區包含胺基酸序列具有表3中所提供之輕鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過30個、20個或10個修飾，或與表3中所提供之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如請求項40至48中任一項之分離CAR分子，其中該抗-CD19結合域包含重鏈可變區，該重鏈可變區包含胺基酸序列具有表3中所提供之重鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過30個、20個或10個修飾，或與表3中所提供之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如請求項40至49中任一項之分離CAR分子，其中該抗-CD19結合域包含選自由以下組成之群的序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12，或與其95-99%一致的序列。
如請求項40至50中任一項之分離CAR分子，其進一步包含選自由以下組成之群之蛋白質的跨膜域：T細胞受體CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137及CD154之α、β或ξ鏈。
如請求項51之分離CAR分子，其中該跨膜域包含SEQ ID NO：15之序列。
如請求項51或52之分離CAR分子，其中該跨膜域包含胺基酸序列具有SEQ ID NO：15之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過20個、10個或5個修飾，或與SEQ ID NO：15之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如請求項40至53中任一項之分離CAR分子，其中該人類化抗-CD19結合域藉由鉸鏈區連接至該跨膜域。
如請求項54之分離CAR分子，其中所編碼之鉸鏈區包含SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：102，或與其95-99%一致的序列。
如請求項40至55中任一項之分離CAR分子，其進一步包含編碼共刺激域的序列。
如請求項56之分離CAR分子，其中該共刺激域包含選自由以下組成之群之蛋白質的功能信號傳導域：OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)及4-1BB(CD137)。
如請求項56或57之分離CAR分子，其中該共刺激域包含SEQ ID NO：16之序列。
如請求項56或57之分離CAR分子，其中該共刺激域包含胺基酸序列具有SEQ ID NO：16之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過20個、10個或5個修飾，或與SEQ ID NO：16之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如請求項40至59中任一項之分離CAR分子，其進一步包含編碼胞內信號傳導域的序列。
如請求項60之分離CAR分子，其中該胞內信號傳導域包含4-1BB之功能信號傳導域及/或CD3ξ之功能信號傳導域。
如請求項60或61之分離CAR分子，其中該胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16之序列及/或SEQ ID NO：17之序列。
如請求項60或61之分離CAR分子，其中該胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16之序列及/或SEQ ID NO：43之序列。
如請求項60至63中任一項之分離CAR分子，其中該胞內信號傳導域包含胺基酸序列具有SEQ ID NO：16之胺基酸序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過20個、10個或5個修飾，或與SEQ ID NO：16之胺基酸序列及/或SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之胺基酸序列95-99%一致的序列。
如請求項60至65中任一項之分離CAR分子，其中該胞內信號傳導域包含SEQ ID NO：16之序列及SEQ ID NO：17或SEQ ID NO：43之序列，其中該胞內信號傳導域包含的序列係以同框且單一多肽鏈表現。
如請求項40至66中任一項之分離CAR分子，其進一步包含前導序列。
如請求項67之分離CAR分子，其中該前導序列包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列，或與SEQ ID NO：13之胺基酸序列95-99%一致的序列。
一種人類化抗-CD19結合域，其包含SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12中任何抗-CD19結合域之輕鏈互補決定區1(LC CDR1)、輕鏈互補決定區2(LC CDR2)及輕鏈互補決定區3(LC CDR3)中的一或多者；以及SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12中任何人類化抗-CD19結合域之重鏈互補決定區1(HC CDR1)、重鏈互補決定區2(HC CDR2)及重鏈互補決定區3(HC CDR3)中的一或多者。
如請求項69之人類化抗-CD19結合域，其中該人類化抗-CD19結合域為scFv，該scFv包含SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11或SEQ ID NO：12之胺基酸序列的輕鏈及重鏈。
如請求項69或70之人類化抗-CD19結合域，其中該人類化抗-CD19結合域包含：輕鏈可變區，該輕鏈可變區包含胺基酸序列具有SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12所提供之輕鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過30個、20個或10個修飾，或與SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12之胺基酸序列 95-99%一致的序列；及/或重鏈可變區，該重鏈可變區包含胺基酸序列具有SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12所提供之重鏈可變區胺基酸序列之至少一個、兩個或三個修飾、但不超過30個、20個或10個修飾，或與SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11及SEQ ID NO：12之胺基酸序列95-99%一致的序列。
一種載體，其包含編碼如前述請求項中任一項之CAR的核酸分子。
如請求項72之載體，其中該載體係選自由以下組成之群：DNA、RNA、質體、慢病毒載體、腺病毒載體或逆轉錄病毒載體。
如請求項72或73之載體，其進一步包含啟動子。
如請求項74之載體，其中該啟動子為EF-1啟動子。
如請求項75之載體，其中該EF-1啟動子包含SEQ ID NO：100之序列。
如請求項72至76中任一項之載體，其中該載體為活體外轉錄載體。
如請求項72至77中任一項之載體，其中該載體中之該核酸序列進一步包含聚(A)尾。
如請求項72至78中任一項之載體，其中該載體中之該核酸序列進一步包含3'UTR。
一種細胞，其包含如請求項72至79中任一項之載體。
如請求項80之細胞，其中該細胞為人類T細胞。
如請求項81之細胞，其中該T細胞為CD8+ T細胞。
一種製造細胞的方法，其包含用如請求項72至79中任一項之載體轉導T細胞。
一種產生經RNA工程改造之細胞群的方法，其包含將活體外轉錄之RNA或合成之RNA引入細胞中，其中該RNA包含編碼如前述請求項中任一項之CAR分子的核酸。
一種提供哺乳動物抗腫瘤免疫力的方法，包含向該哺乳動物投與有效量之表現如前述請求項中任一項之CAR分子的細胞。
如請求項85之方法，其中該細胞為自體T細胞。
如請求項85或86之方法，其中該細胞為同種異體T細胞。
如請求項85至87中任一項之方法，其中該哺乳動物為人類。
一種治療患有與CD19表現相關疾病之哺乳動物的方法，包含向該哺乳動物投與有效量之包含如前述請求項中任一項之CAR分子的細胞。
如請求項89之方法，其中與CD19表現相關的疾病係選自增生性疾病，諸如癌症或惡性疾病或癌前期病狀，諸如骨髓發育不良、骨髓發育不良症候群或白血病前期，或為與CD19表現相關的非癌症相關適應症。
如請求項89或90之方法，其中該疾病為選自由以下組成之群的血液癌症：一或多種急性白血病，包括(但不限於)B細胞急性淋巴性白血病(「BALL」)、T細胞急性淋巴性白血病(「TALL」)、急性淋巴性白血病(ALL)；一或多種慢性白血病，包括(但不限於)慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴細胞性白血病(CLL)；其他血液癌症或血液病狀，包括(但不限於)B細胞前淋巴細胞性白血病、母細胞性類漿細胞樹突狀細胞贅生物、伯基特氏淋巴瘤 (Burkitt's lymphoma)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、毛細胞白血病、小細胞或大細胞濾泡性淋巴瘤、惡性淋巴組織增生病狀、MALT淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、邊緣區淋巴瘤、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良及骨髓發育不良症候群、非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin's lymphoma)、漿母細胞性淋巴瘤、類漿細胞樹突狀細胞贅生物、瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症(Waldenstrom macroglobulinemia)，及「白血病前期」，白血病前期為血液病狀之多樣化集合合併骨髓血液細胞之無效產生(或發育不良)；以及與CD19表現相關的疾病，包括(但不限於)表現CD19的非典型及/或非經典癌症、惡性疾病、癌前期病狀或增生性疾病；及其組合。
如請求項89至91中任一項之方法，其中表現CAR分子的細胞係與使表現CAR分子之細胞功效增強的藥劑組合投與。
如請求項89至92中任一項之方法，其中表現CAR分子的細胞係與改善一或多種與投與表現CAR分子之細胞相關之副作用的藥劑組合投與。
如請求項89至93中任一項之方法，其中表現CAR分子的細胞係與治療與CD19相關疾病的藥劑組合投與。
如請求項1至32中任一項之分離核酸分子，如請求項33至39中任一項之分離多肽分子，如請求項40至68中任一項之分離CAR，如請求項69至71中任一項之抗-CD19結合域，如請求項72至79中任一項之載體，或如請求項80至82中任一項之細胞，係用作藥劑。
如請求項1至32中任一項之分離核酸分子，如請求項33至39中任一項之分離多肽分子，如請求項40至68中任一項之分離CAR，如請求項69至71中任一項之抗-CD19結合域，如請求項72至79中任一項之載體，或如請求項80至82中任一項之細胞，係用於治療表現CD19之疾病。
如請求項80至82中任一項之細胞，其進一步表現抑制性分子，該抑制性分子包含含有抑制性分子之至少一部分的第一多肽與包含來自胞內信號傳導域之陽性信號之第二多肽結合。
如請求項97之細胞，其中該抑制性分子包含含有PD1之至少一部分的第一多肽及含有共刺激域與初級信號傳導域的第二多肽。