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TW201437227A - 雙特異性ｔ細胞活化抗原結合分子 - Google Patents

雙特異性ｔ細胞活化抗原結合分子 Download PDF

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TW201437227A
TW201437227A TW103106320A TW103106320A TW201437227A TW 201437227 A TW201437227 A TW 201437227A TW 103106320 A TW103106320 A TW 103106320A TW 103106320 A TW103106320 A TW 103106320A TW 201437227 A TW201437227 A TW 201437227A
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Ralf Hosse
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Christian Klein
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Pablo Umana
Tina Weinzierl
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Roche Glycart Ag
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Abstract

本發明概言之係關於用於T細胞活化及重定向至特定靶細胞之新穎雙特異性抗原結合分子。此外，本發明係關於編碼該等雙特異性抗原結合分子之多核苷酸以及包括該等多核苷酸之載體及宿主細胞。本發明進一步係關於產生本發明該等雙特異性抗原結合分子之方法及使用該等雙特異性抗原結合分子治療疾病之方法。

Description

雙特異性T細胞活化抗原結合分子
本發明概言之係關於用於活化T細胞之雙特異性抗原結合分子。此外，本發明係關於編碼該等雙特異性抗原結合分子之多核苷酸以及包括該等多核苷酸之載體及宿主細胞。本發明進一步係關於產生本發明雙特異性抗原結合分子之方法及使用該等雙特異性抗原結合分子治療疾病之方法。
個別細胞或特定細胞類型之選擇性破壞通常在多種臨床環境中合意。例如，癌症療法之主要目標係特異性破壞腫瘤細胞，同時使健康細胞及組織完整並不受損壞。
達成此目標之誘人方式係藉由誘導針對腫瘤之免疫反應使免疫效應子細胞(例如自然殺手(NK)細胞或細胞毒性T淋巴球(CTL))攻擊並破壞腫瘤細胞。CTL構成免疫系統最有效的效應子細胞，然而，其無法藉由習用治療性抗體之Fc結構域介導之效應子機制來活化。
就此而言，經設計以利用一「臂」結合至靶細胞上之表面抗原且利用另一「臂」結合至T細胞受體(TCR)複合物之活化不變組份之雙特異性抗體近年來已引起業內關注。該抗體與其兩個靶之同時結合將迫使靶細胞與T細胞之間進行暫時相互作用，從而使得活化任何細胞毒性T細胞並隨後溶解靶細胞。因此，免疫反應重定向至靶細胞， 且獨立於靶細胞之肽抗原呈送或與CTL之正常MHC限制性活化相關之T細胞特異性。在此背景下，僅在靶細胞向CTL呈送雙特異性抗體(即模擬免疫突觸)時活化CTL至關重要。不需要淋巴球預處理或共刺激來誘發靶細胞之有效溶解之雙特異性抗體尤其合意。
已研發出若干雙特異性抗體格式且已研究其於T細胞介導之免疫療法之適宜性。在該等研究中，所謂的BiTE(雙特異性T細胞銜接物)分子已經極充分表徵且已在臨床中顯示有一定希望(綜述於Nagorsen及Bäuerle，Exp Cell Res 317,1255-1260(2011))。BiTE係其中兩個scFv分子藉由撓性連接體融合之串聯scFv分子。所評估用於T細胞銜接之其他雙特異性格式包含雙鏈抗體(Holliger等人，Prot Eng 9,299-305(1996))及其衍生物，例如串聯雙鏈抗體(Kipriyanov等人，J Mol Biol 293,41-66(1999))。最近發展係所謂的DART(雙親和力重靶向)分子，其係基於雙鏈抗體格式但特徵在於用於額外穩定之C末端二硫橋(Moore等人，Blood 117,4542-51(2011))。所謂的三功能單抗(triomab)係完整的雜合小鼠/大鼠IgG分子且當前亦在臨床試驗中進行評估，其代表更大大小之格式(綜述於Seimetz等人，Cancer Treat Rev 36,458-467(2010))。
所研發格式之多樣性顯示T細胞重定向及活化在免疫療法中之巨大潛能。然而，產生適用於其之雙特異性抗體之任務決非微不足道，且涉及眾多必須克服之關於抗體功效、毒性、適用性及生產能力之挑戰。
儘管小構築物(例如BiTE分子)能夠有效地交聯效應子及靶細胞，但其具有極短的血清半衰期，因此其需要藉由連續輸注來投與患者。另一方面，儘管IgG樣格式具有長半衰期之極大益處，但其具有IgG分子所固有之與天然效應子功能相關之毒性。其免疫原性潛能構成IgG樣雙特異性抗體、尤其非人類格式於成功的治療性研發方面之另一種 不利特徵。最終，雙特異性抗體之一般研發中之主要挑戰在於產生臨床上足夠量及純度之雙特異性抗體構築物，此乃因共表現後具有不同特異性之抗體重鏈及輕鏈發生錯配，此降低正確組裝構築物之產量且產生期望雙特異性抗體可能難以與其分離之眾多非功能性副產物。
鑒於與當前可用於T細胞介導之免疫療法之雙特異性抗體相關的困難及缺點，業內仍需要該等分子之新穎經改良格式。本發明提供經設計用於T細胞活化及重定向之雙特異性抗原結合分子，該等分子將良好功效及生產能力與低毒性及有利的藥物代謝動力學性質組合在一起。
在本發明之第一態樣中提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR；(ii)第二抗原結合部分，其係能夠特異性結合至靶細胞抗原之Fab分子。
在一實施例中，為能夠特異性結合至CD3之Fab分子之第一抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：32及SEQ ID NO：33；及可變輕鏈，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：7及SEQ ID NO：31。
在一實施例中，為能夠特異性結合至CD3之Fab分子之第一抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約 95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至癌胚胎抗原(CEA、CEACAM5)，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25及SEQ ID NO：26組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29及SEQ ID NO：30之群之輕鏈CDR。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至CEA，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP(CSPG4)，且包括至少一個選自由以下組成之群之重鏈互補決定區(CDR)：SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38及SEQ ID NO：40；及至少一個選自以下之群之輕鏈CDR：SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：49及SEQ ID NO：50。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至黑素瘤相關之硫酸軟骨蛋白多糖(MCSP、CSPG4)，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15及SEQ ID NO：16組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19及SEQ ID NO：20之群之輕鏈CDR。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至 MCSP，且包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：39及SEQ ID NO：41；及輕鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：47及SEQ ID NO：51。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：13至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：17至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在具體實施例中，第一抗原結合部分係其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之可變區或恆定區之交叉Fab分子。在又一具體實施例中，第一抗原結合部分係其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之恆定區之交叉Fab分子。
在一實施例中，第二抗原結合部分係習用Fab分子。
在又一具體實施例中，在T細胞活化雙特異性抗原結合分子中存在不多於一個的能夠特異性結合至CD3之抗原結合部分(即T細胞活化雙特異性抗原結合分子提供與CD3之單價結合)。
在又一實施例中，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括第三抗原結合部分，其係能夠特異性結合至靶細胞抗原之Fab分子。在一實施例中，該第三抗原結合分子係習用Fab分子。在一實施例中，該第三抗原結合分子與第二抗原結合部分相同。
在具體實施例中，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括第三抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CEA之Fab分子，且包 括至少一個選自由SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25及SEQ ID NO：26組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29及SEQ ID NO：30之群之輕鏈CDR。
在具體實施例中，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括第三抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CEA之Fab分子，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在一實施例中，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括第三抗原結合部分，其係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，且包括至少一個選自由以下組成之群之重鏈互補決定區(CDR)：SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38及SEQ ID NO：40；及至少一個選自以下之群之輕鏈CDR：SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：49及SEQ ID NO：50。
在具體實施例中，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括第三抗原結合部分，其係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15及SEQ ID NO：16組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19及SEQ ID NO：20之群之輕鏈CDR。
在一實施例中，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括第三抗原結合部分，其係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，且包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：13、 SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：39及SEQ ID NO：41；及輕鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：47及SEQ ID NO：51。
在具體實施例中，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括第三抗原結合部分，其係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：13至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：17至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在一些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之第一與第二抗原結合部分視情況經由肽連接體彼此融合。在一該實施例中，第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第一抗原結合部分Fab重鏈之N末端。在另一該實施例中，第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第二抗原結合部分Fab重鏈之N末端。在其中(i)第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第一抗原結合部分Fab重鏈之N末端或(ii)第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第二抗原結合部分Fab重鏈之N末端的實施例中，第一抗原結合部分之Fab輕鏈與第二抗原結合部分之Fab輕鏈另外可視情況經由肽連接體彼此融合。
在一實施例中，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括(iii)由能夠穩定締合之第一與第二亞單位構成之Fc結構域。
在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域第一或第二亞單位之N末端。在另一實施例中，第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一或第二亞單位的N末端。在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之第一與第二抗原結合部分係在Fab重鏈之 C末端各自融合至Fc結構域之一亞單位的N末端。
在一實施例中，第三抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一或第二亞單位的N末端。在具體實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之第二與第三抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端各自融合至Fc結構域之一亞單位的N末端，且第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第二抗原結合部分Fab重鏈的N末端。在另一具體實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之第一與第三抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端各自融合至Fc結構域之一亞單位的N末端，且第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第一抗原結合部分Fab重鏈的N末端。T細胞活化雙特異性抗原結合分子之組份可直接融合或經由適宜肽連接體融合。在一實施例中，第一及第三抗原結合部分以及Fc結構域係免疫球蛋白分子之一部分。
在具體實施例中，免疫球蛋白分子係IgG類免疫球蛋白。在又一具體實施例中，免疫球蛋白係IgG1子類免疫球蛋白。在另一實施例中，免疫球蛋白係IgG4子類免疫球蛋白。
在具體實施例中，Fc結構域係IgG Fc結構域。在特定實施例中，Fc結構域係IgG1 Fc結構域。在另一特定實施例中，Fc結構域係IgG4 Fc結構域。在甚至更特定實施例中，Fc結構域係包括胺基酸取代S228P(Kabat編號)之IgG4 Fc結構域。在具體實施例中，Fc結構域係人類Fc結構域。
在具體實施例中，Fc結構域包括促進第一與第二Fc結構域亞單位締合之修飾。在特定該實施例中，在Fc結構域第一亞單位之CH3結構域中之胺基酸殘基經具有較大側鏈體積之胺基酸殘基置換，由此在第一亞單位之CH3結構域內產生可定位於第二亞單位CH3結構域內之空腔中的凸起，且在Fc結構域之第二亞單位之CH3結構域中之胺基酸殘基經具有較小側鏈體積之胺基酸殘基置換，由此在第二亞單位之 CH3結構域內產生空腔，第一亞單位CH3結構域內之凸起可定位於該空腔內。
在具體實施例中，Fc結構域展現與天然IgG1 Fc結構域相比降低的對Fc受體之結合親和力及/或降低的效應子功能。在某些實施例中，Fc結構域經改造以具有與未經改造之Fc結構域相比，降低的對Fc受體之結合親和力及/或降低的效應子功能。在一實施例中，Fc結構域包括一或多個降低對Fc受體之結合及/或效應子功能之胺基酸取代。在一實施例中，Fc結構域中降低對Fc受體之結合及/或效應子功能之一或多個胺基酸取代位於一或多個選自L234、L235及P329(Kabat編號)之群之位置。在具體實施例中，Fc結構域之每一亞單位包括三個降低對Fc受體之結合及/或效應子功能之胺基酸取代，其中該等胺基酸取代為L234A、L235A及P329G。在一該實施例中，Fc結構域係IgG1 Fc結構域、尤其人類IgG1 Fc結構域。在其他實施例中，Fc結構域之每一亞單位包括兩個降低對Fc受體之結合及/或效應子功能之胺基酸取代，其中該等胺基酸取代為L235E及P329G。在一該實施例中，Fc結構域係IgG4 Fc結構域、尤其人類IgG4 Fc結構域。在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之Fc結構域係IgG4 Fc結構域，且包括胺基酸取代L235E及S228P(SPLE)。
在一實施例中，Fc受體係Fcγ受體。在一實施例中，Fc受體係人類Fc受體。在一實施例中，Fc受體係活化Fc受體。在特定實施例中，Fc受體係人類FcγRIIa、FcγRI及/或FcγRIIIa。在一實施例中，效應子功能係抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)。
本發明之另一態樣提供編碼本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸。本發明亦涵蓋由本發明多核苷酸編碼之多肽。本發明進一步提供包括本發明之經分離多核苷酸之表現載體及包括本發明之經分離多核苷酸或表現載體之宿主細胞。在一些實 施例中，宿主細胞係真核細胞、尤其哺乳動物細胞。
在另一態樣中提供產生本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之方法，其包括以下步驟：a)在適於表現T細胞活化雙特異性抗原結合分子之條件下培養本發明之宿主細胞，及b)回收T細胞活化雙特異性抗原結合分子。本發明亦涵蓋藉由本發明方法產生之T細胞活化雙特異性抗原結合分子。
本發明進一步提供醫藥組合物，其包括本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子及醫藥上可接受之載劑。
本發明亦涵蓋使用本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子及醫藥組合物之方法。在一態樣中，本發明提供本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或醫藥組合物用作藥劑。在一態樣中提供本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或醫藥組合物用於治療有需要之個體之疾病。在一特定實施例中，疾病係癌症。
亦提供本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之用途，其用於製造用來治療有需要之個體之疾病的藥劑；以及治療個體之疾病之方法，其包括向該個體投與治療有效量之包括呈醫藥上可接受形式之本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之組合物。在一特定實施例中，疾病係癌症。在上述實施例中之任一者中，個體較佳係哺乳動物、尤其人類。
本發明亦提供用於誘導靶細胞、尤其腫瘤細胞溶解之方法，其包括使靶細胞與本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子在T細胞、尤其細胞毒性T細胞存在下接觸。
圖1. 本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子(TCB)之實例性組態。(A)「1+1 IgG Crossfab」分子之圖解說明。(B)「2+1 IgG Crossfab」分子之圖解說明。(C)Crossfab與Fab組份具有替代順序 (「倒轉」)之「2+1 IgG Crossfab」分子之圖解說明。(D)「1+1 CrossMab」分子之圖解說明。(E)「輕鏈連接之2+1 IgG Crossfab」分子之圖解說明。(F)「輕鏈連接之1+1 IgG Crossfab」分子之圖解說明。(G)「輕鏈連接之倒轉2+1 IgG Crossfab」分子之圖解說明。(H)「輕鏈連接之倒轉1+1 IgG Crossfab」分子之圖解說明。黑點：Fc結構域中促進異源二聚化之可選修飾。
圖2. 親和力成熟之抗MCSP純系與不成熟親代純系(M4-3 ML2)之比對。
圖3. MCSP TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA)分子之示意圖。
圖4. MCSP TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA，SEQ ID NO：12、53、54及55)之CE-SDS分析。電泳圖顯示為MCSP TCB之SDS-Page：A)非還原，B)還原。
圖5. CEA TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA)分子之示意圖。
圖6. CEA TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA，SEQ ID NO：22、56、57及58)分子之CE-SDS分析。電泳圖顯示為CEA TCB之SDS-Page：A)非還原，B)還原。
圖7. MCSP TCB(SEQ ID NO：12、53、54及55)與A375細胞(MCSP+)(A)及Jurkat(CD3+細胞)(B)之結合。「未經靶向之TCB」：銜接CD3但無第二抗原之雙特異性抗體(SEQ ID NO：59、60、61及62)。
圖8. A375(高MCSP)(A)、MV-3(中等MCSP)(B)、HCT-116(低MCSP)(C)及LS180(MCSP陰性)(D)靶細胞之由MCSP TCB抗體(SEQ ID NO：12、53、54及55)誘導之T細胞殺死(E：T=10：1，效應子為人類PBMC，培育時間24h)。「未經靶向之TCB」：銜接CD3但無第二抗 原之雙特異性抗體(SEQ ID NO：59、60、61及62)。
圖9. 在MV3黑素瘤細胞之由MCSP TCB抗體(SEQ ID NO：12、53、54及55)誘導的T細胞介導之殺死(E：T=10：1，培育24h)後，人類CD8+(A、B)及CD4+(C、D)T細胞上CD25及CD69之上調。「未經靶向之TCB」：銜接CD3但無第二抗原之雙特異性抗體(SEQ ID NO：59、60、61及62)。
圖10. 在MV3黑素瘤細胞之由MCSP TCB抗體(SEQ ID NO：12、53、54及55)誘導的T細胞介導之殺死(E：T=10：1，培育24h)後，藉助人類PBMC之IL-2(A)、IFN-γ(B)、TNFα(C)、IL-4(D)、IL-10(E)及顆粒酶B(F)之分泌。「未經靶向之TCB」：銜接CD3但無第二抗原之雙特異性抗體(SEQ ID NO：59、60、61及62)。
圖11. CEA TCB(SEQ ID NO：22、56、57及58)與表現CEA之A549肺腺癌細胞(A)及表現CD3之永生人類及食蟹猴T淋巴球系(分別為Jurkat(B)及HSC-F(C))之結合。
圖12. HPAFII(高CEA)(A、E)、BxPC-3(中等CEA)(B、F)、ASPC-1(低CEA)(C、G)及HCT-116細胞(CEA陰性)(D、H)之由CEA TCB(SEQ ID NO：22、56、57及58)誘導之T細胞殺死。E：T=10：1，效應子為人類PBMC，培育時間24h(A-D)或48h(E-H)。「未經靶向之TCB」：銜接CD3但無第二抗原之雙特異性抗體(SEQ ID NO：59、60、61及62)。
圖13. 在HPAFII(高CEA)(A、E)、BxPC-3(中等CEA)(B、F)、ASPC-1(低CEA)(C、G)及HCT-116細胞(CEA陰性)(D、H)之由CEA TCB(SEQ ID NO：22、56、57及58)誘導的T細胞介導之殺死後5天時，人類CD8+及CD4+ T細胞增殖(A-D)及人類CD8+及CD4+ T細胞上CD25之上調(E-H)。「DP47 TCB」：銜接CD3但無第二抗原之雙特異性抗體(SEQ ID NO：59、60、61及62)。
圖14. 在MKN45腫瘤細胞之由CEA TCB(SEQ ID NO：22、56、57及58)誘導的T細胞介導之殺死(E：T=10：1，培育48h)後，IFN-γ(A)、TNFα(B)、顆粒酶B(C)、IL-2(D)、IL-6(E)及IL-10(F)之分泌。「未經靶向之TCB」：銜接CD3但無第二抗原之雙特異性抗體(SEQ ID NO：59、60、61及62)。
圖15. 在濃度遞增之脫落CEA(sCEA)存在下，在與CEA TCB及sCEA一起培育後24h(A)或48h(B)時檢測的表現CEA之LS180腫瘤靶細胞之由CEA TCB(SEQ ID NO：22、56、57及58)誘導的T細胞介導之殺死。
圖16. 與CEA TCB(SEQ ID NO：22、56、57及58)及作為效應子細胞之人類PBMC(A、C)或食蟹猴PBMC(B、D)一起培育21h(A、B)及40h(C、D)時評價之過表現人類CEA之A549(肺腺癌)細胞(A549-hCEA)的T細胞介導之殺死。
圖17. 表現CEA之人類結腸直腸癌細胞系之由0.8nM(A)、4nM(B)及20nM(C)之CEA TCB(SEQ ID NO：22、56、57及58)誘導的T細胞介導之殺死。(D)在20nM CEA TCB下CEA表現與特異性溶解%之間之相關性，(E)CEA表現與CEATCB之EC50之間之相關性。
圖18. CEA TCB(SEQ ID NO：22、56、57及58)在與人類PBMC共移植之LS174T-fluc2人類結腸癌(E：T比率為5：1)中之活體內抗腫瘤功效。結果顯示在不同研究組中藉助卡尺(A及C)及藉助生物發光(總通量，B及D)量測之12只小鼠腫瘤體積的平均值及SEM。(A、B)在第1天開始早期治療，(C、D)在第7天開始延遲治療。使用MCSP TCB(SEQ ID NO：12、53、54及55)作為陰性對照。
圖19. CEA TCB(SEQ ID NO：22、56、57及58)在與人類PBMC共移植之LS174T-fluc2人類結腸癌(E：T比率1：1)中之活體內抗腫瘤功效。結果顯示在不同研究組中藉助卡尺(A)及藉助生物發光(總通量， B)量測之10只小鼠腫瘤體積的平均值及SEM。使用MCSP TCB(SEQ ID NO：12、53、54及55)作為陰性對照。
圖20. 鼠源化CEA TCB在免疫活性huCD3ε/huCEA轉基因小鼠之Panco2-huCEA正位腫瘤模型中之活體內功效。
圖21. CEA TCB之熱穩定性。在以0.05℃/min之25℃-75℃之溫度斜坡中量測之動態光散射。重複以灰色顯示。
圖22. MCSP TCB之熱穩定性。在以0.05℃/min之25℃-75℃之溫度斜坡中量測之動態光散射。重複以灰色顯示。
圖23. (A)A375(高MCSP)、(B)MV-3(中等MCSP)及(C)HCT-116(低MCSP)腫瘤靶細胞之由MCSP TCB(SEQ ID NO：12、53、54及55)及MCSP 1+1 CrossMab TCB抗體誘導的T細胞介導之殺死。(D)使用LS180(MCSP陰性腫瘤細胞系)作為陰性對照。腫瘤細胞殺死係在將靶細胞與抗體及效應子細胞(人類PBMC)一起培育後24h(A-D)及48h(E-H)時來評價。
圖24. 在表現MCSP之腫瘤細胞(A375，A-D；及MV-3，E-H)之由MCSP TCB(SEQ ID NO：12、53、54及55)及MCSP 1+1 CrossMab TCB抗體介導的T細胞殺死後，CD8+及CD4+ T細胞上CD25及CD69之上調。
圖25. 作為非結合抗體之含有DP47 GS之DP47 GS TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA=「未經靶向之TCB」SEQ ID NO：59、60、61及62)及作為抗CD3抗體之人類化CH2527的CE-SDS分析。電泳圖顯示為DP47 GS TCB之SDS-PAGE：A)非還原，B)還原。
定義
除非下文另有定義，否則本文所使用之術語具有業內通用之含義。
如本文所使用，術語「抗原結合分子」在其最廣泛意義上係指特異性結合抗原決定簇之分子。抗原結合分子之實例係免疫球蛋白及其衍生物(例如片段)。
術語「雙特異性」意指抗原結合分子能夠特異性結合至至少兩個不同的抗原決定簇。通常，雙特異性抗原結合分子包括兩個抗原結合位點，其各自特異性針對不同的抗原決定簇。在某些實施例中，雙特異性抗原結合分子能夠同時結合兩個抗原決定簇、尤其兩個在兩種不同細胞上表現之抗原決定簇。
如本文所使用之術語「價」指示在抗原結合分子中存在指定數量之抗原結合位點。因此，術語「單價結合至抗原」指示在抗原結合分子中存在一個(及不多於一個)特異性針對抗原之抗原結合位點。
「抗原結合位點」係指抗原結合分子之提供與抗原相互作用之位點(即一或多個胺基酸殘基)。例如，抗體之抗原結合位點包括來自互補決定區(CDR)之胺基酸殘基。天然免疫球蛋白分子通常具有兩個抗原結合位點，Fab分子通常具有單一抗原結合位點。
如本文使所用，術語「抗原結合部分」係指特異性結合至抗原決定簇之多肽分子。在一實施例中，抗原結合部分能夠使其所附接之實體(例如第二抗原結合部分)針對靶位點(例如針對具有抗原決定簇之特定類型之腫瘤細胞或腫瘤間質)。在另一實施例中，抗原結合部分能夠藉助其靶抗原(例如T細胞受體複合抗原)來活化信號傳導。抗原結合部分包含如本文進一步定義之抗體及其片段。具體抗原結合部分包含抗體之抗原結合結構域，包括抗體重鏈可變區及抗體輕鏈可變區。在某些實施例中，抗原結合部分可包括如本文進一步定義且業內已知之抗體恆定區。有用重鏈恆定區包含5種同種型中之任一者：α、δ、ε、γ或μ。有用輕鏈恆定區包含兩種同種型中之任一者：κ及λ。
如本文所使用，術語「抗原決定簇」與「抗原」及「表位」同 義，且係指多肽大分子上抗原結合部分所結合形成抗原結合部分-抗原複合物之位點(例如胺基酸之鄰接段或由非鄰接胺基酸之不同區域構成之構象組態)。有用抗原決定簇可發現於(例如)腫瘤細胞之表面上、病毒感染細胞之表面上、其他病變細胞之表面上、游離於血清中及/或細胞外基質(ECM)中。除非另外指明，否則在本文中稱為抗原之蛋白質(例如MCSP、CEA、CD3)可係任何脊椎動物來源(包含哺乳動物，例如靈長類動物(例如人類)及齧齒類動物(例如小鼠及大鼠))之蛋白質之任何天然形式。在具體實施例中，抗原為人類抗原。當本文中提及特定蛋白質時，該術語涵蓋未經處理之「全長」蛋白質以及源自細胞處理之蛋白質之任何形式。該術語亦涵蓋蛋白質之天然變體，例如剪接變體或對偶基因變體。可用作抗原之實例性人類蛋白質包含(但不限於)：黑素瘤相關硫酸軟骨蛋白多糖(MCSP)，亦稱為硫酸軟骨蛋白多糖4(CSPG4，UniProt編號Q6UVK1(70版)，NCBI RefSeq編號NP_001888.2)；癌胚胎抗原(CEA)，亦稱為癌胚胎抗原相關細胞黏著分子5(CEACAM5，UniProt編號P06731(119版)，NCBI RefSeq編號NP_004354.2)；及CD3、尤其CD3之ε亞單位(參見UniProt編號P07766(130版)，NCBI RefSeq編號NP_000724.1，人類序列SEQ ID NO：103；或UniProt編號Q95LI5(49版)，NCBI GenBank編號BAB71849.1，食蟹猴[食蟹獼猴(Macaca fascicularis)]序列SEQ ID NO：104)。在某些實施例中，本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子結合至CD3或靶細胞抗原之在不同物種之CD3或靶抗原中保守之表位。在某些實施例中，本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子結合至CD3及CEACAM5，但並不與CEACAM1或CEACAM6結合。「特異性結合」意指結合對抗原具有選擇性且可區別於不期望或非特異性相互作用。抗原結合部分與特異性抗原決定簇結合之能力可經由酶聯免疫吸附分析(ELISA)或熟習此項技術者熟悉之其他技術(例如表 面電漿子共振(SPR)技術(在BIAcore儀器上進行分析)(Liljeblad等人，Glyco J 17,323-329(2000))及傳統結合分析(Heeley,Endocr Res 28,217-229(2002)))來量測。在一實施例中，抗原結合部分與不相關蛋白質之結合程度小於抗原結合部分與抗原結合的約10%，如藉由例如SPR所量測。在某些實施例中，結合至抗原之抗原結合部分或包括該抗原結合部分之抗原結合分子具有1μM、100nM、10nM、1nM、0.1nM、0.01nM或0.001nM(例如10-8M或更小，例如10-8M至10-13M，例如10-9M至10-13M)之解離常數(KD)。
「親和力」係指分子之單一結合位點(例如受體)與其結合配偶體(例如配體)之間之非共價相互作用的總強度。除非另外指明，否則如本文所使用，「結合親和力」係指反映結合對之成員(例如，抗原結合部分與抗原，或受體與其配體)之間之1：1相互作用的固有結合親和力。分子X對其配偶體Y之親和力通常可由解離常數(KD)來表示，解離常數係解離速率常數與締合速率常數(分別為k解離與k締合)之比率。因此，等效親和力可包括不同的速率常數，只要速率常數之比率保持相同即可。親和力可藉由業內已知之已充分建立之方法(包含彼等本文所闡述者)來量測。用於量測親和力之具體方法係表面電漿子共振(SPR)。
「降低的結合」(例如降低的對Fc受體之結合)係指對各別相互作用之親和力減小，如藉由例如SPR所量測。為清晰起見，該術語亦包含親和力降低至0(或分析方法之檢測極限以下)，即完全消除相互作用。相反，「增加的結合」係指對各別相互作用之結合親和力增加。
如本文所使用之「T細胞活化」係指T淋巴球、尤其細胞毒性T淋巴球之一或多種選自以下各項之細胞反應：增殖、分化、細胞介素分泌、細胞毒性效應子分子釋放、細胞毒性活性及活化標記之表現。本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子能夠誘導T細胞活化。適於 量測T細胞活化之分析如本文所闡述為業內已知。
如本文所使用之「靶細胞抗原」係指在靶細胞(例如腫瘤細胞(例如癌細胞)或腫瘤間質細胞)表面上呈送之抗原決定簇。
如本文所使用，關於抗原結合部分等使用術語「第一」及「第二」以便於區分一個以上之每一類部分。除非明確說明，否則該等術語之應用並不意欲賦予T細胞活化雙特異性抗原結合分子特定順序或取向。
「Fab分子」係指由免疫球蛋白之重鏈(「Fab重鏈」)之VH及CH1結構域以及輕鏈(「Fab輕鏈」)之VL及CL結構域組成的蛋白質。
「融合」意指組份(例如Fab分子及Fc結構域亞單位)藉由肽鍵直接連接或經由一或多個肽連接體連接。
如本文所使用，術語「單鏈」係指包括藉由肽鍵線性連接之胺基酸單體之分子。在某些實施例中，一個抗原結合部分為單鏈Fab分子，即其中Fab輕鏈與Fab重鏈藉由肽連接體連接形成單一肽鏈之Fab分子。在具體該實施例中，在單鏈Fab分子中，Fab輕鏈之C末端連接至Fab重鏈之N末端。
「交叉」Fab分子(亦稱為「Crossfab」)意指其中交換Fab重鏈與輕鏈之可變區或恆定區之Fab分子，即交叉Fab分子包括由輕鏈可變區及重鏈恆定區構成之肽鏈以及由重鏈可變區及輕鏈恆定區構成之肽鏈。為清晰起見，在其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之可變區之交叉Fab分子中，包括重鏈恆定區之肽鏈在本文中稱為交叉Fab分子之「重鏈」。相反，在其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之恆定區之交叉Fab分子中，包括重鏈可變區之肽鏈在本文中稱為交叉Fab分子之「重鏈」。
與其相比，「習用」Fab分子意指呈其天然格式之Fab分子，即包括由重鏈可變及恆定區(VH-CH1)構成之重鏈以及由輕鏈可變及恆定區(VL-CL)構成之輕鏈。
術語「免疫球蛋白分子」係指具有天然抗體結構之蛋白質。例如，IgG類免疫球蛋白係約150,000道爾頓之異源四聚體糖蛋白，其係由二硫鍵鍵結之兩條輕鏈及兩條重鏈構成。自N末端至C末端，每一重鏈依次具有可變區(VH)(亦稱為可變重鏈結構域或重鏈可變結構域)及三個恆定結構域(CH1、CH2及CH3)(亦稱為重鏈恆定區)。相似地，自N末端至C末端，每一輕鏈依次具有可變區(VL)(亦稱為可變輕鏈結構域或輕鏈可變結構域)及恆定輕鏈(CL)結構域(亦稱為輕鏈恆定區)。可將免疫球蛋白之重鏈指定為5種類型中之一者，稱為α(IgA)、δ(IgD)、ε(IgE)、γ(IgG)或μ(IgM)，其中之一些可進一步分成多個亞型，例如γ1(IgG1)、γ2(IgG2)、γ3(IgG3)、γ4(IgG4)、α1(IgA1)及α2(IgA2)。基於免疫球蛋白恆定結構域之胺基酸序列，可將該免疫球蛋白之輕鏈指定為兩種類型中之一者，稱為kappa(κ)及lambda(λ)。免疫球蛋白基本上係由經由免疫球蛋白鉸鏈區連接之兩個Fab分子及Fc結構域組成。
術語「抗體」在本文中係以最廣泛意義使用且涵蓋各種抗體結構，包含(但不限於)單株抗體、多株抗體及抗體片段，只要其展現期望之抗原結合活性即可。
「抗體片段」係指除完整抗體外之分子，其包括完整抗體中結合完整抗體所結合之抗原的一部分。抗體片段之實例包含(但不限於)Fv、Fab、Fab'、Fab’-SH、F(ab')2、雙鏈抗體、直鏈抗體、單鏈抗體分子(例如scFv)及單一結構域抗體。關於某些抗體片段之綜述，參見Hudson等人Nat Med 9,129-134(2003)。關於scFv片段之綜述，參見例如Plückthun，The Pharmacology of Monoclonal Antibodies，第113卷，Rosenburg及Moore編輯，Springer-Verlag,New York，第269-315頁(1994)；亦參見WO 93/16185及美國專利第5,571,894號及第5,587,458號。關於包括補救受體結合表位殘基且具有增加的活體內半 衰期之Fab及F(ab')2片段的論述，參見美國專利第5,869,046號。雙鏈抗體係具有兩個抗原結合位點之可為二價或雙特異性之抗體片段。例如，參見EP 404,097；WO 1993/01161；Hudson等人，Nat Med 9,129-134(2003)；及Hollinger等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90,6444-6448(1993)。三鏈抗體及四鏈抗體亦闡述於Hudson等人，Nat Med 9,129-134(2003)中。單一結構域抗體係包括抗體之重鏈可變結構域之全部或一部分或輕鏈可變結構域之全部或一部分的抗體片段。在某些實施例中，單一結構域抗體係人類單一結構域抗體(Domantis公司，Waltham,MA；例如，參見美國專利第6,248,516 B1號)。抗體片段可藉由多種技術來製得，包含(但不限於)蛋白水解消化完整抗體以及藉由重組宿主細胞(例如大腸桿菌(E.coli)或噬菌體)來產生，如本文所闡述。
術語「抗原結合結構域」係指包括特異性結合至抗原之一部分或全部且與其互補之區域的抗體部分。抗原結合結構域可由(例如)一或多個抗體可變結構域(亦稱為抗體可變區)提供。具體而言，抗原結合結構域包括抗體輕鏈可變區(VL)及抗體重鏈可變區(VH)。
術語「可變區」或「可變結構域」係指抗體重鏈或輕鏈之參與抗體與抗原結合之結構域。天然抗體重鏈及輕鏈之可變結構域(分別為VH及VL)通常具有相似結構，其中每一結構域包括4個保守框架區(FR)及3個超變區(HVR)。例如，參見Kindt等人，Kuby Immunology，第6版，W.H.Freeman及Co.，第91頁(2007)。單一VH或VL結構域可足以賦予抗原結合特異性。
如本文所使用之術語「超變區」或「HVR」係指抗體可變結構域之序列具有超變性及/或形成結構上經定義之環(「超變環」)之區域中的每一者。通常，天然四鏈抗體包括六個HVR；三個位於VH中(H1、H2、H3)，且三個位於VL中(L1、L2、L3)。HVR通常包括來自 超變環及/或來自互補決定區(CDR)之胺基酸殘基，後者具有最高序列可變性及/或參與抗原識別。除VH中之CDR1外，CDR通常包括形成超變環之胺基酸殘基。超變區(HVR)亦稱為「互補決定區」(CDR)，且該等術語在本文中可互換用於提及可變區之形成抗原結合區之部分。此具體區域已由Kabat等人，U.S.Dept.of Health and Human Services,Sequences of Proteins of Immunological Interest(1983)及Chothia等人，J.Mol.Biol.196：901-917(1987)闡述，其中該等定義在彼此進行比較時包含胺基酸殘基之重疊或子集。然而，如本文所定義及使用之術語之範疇意欲涵蓋使用任一定義意指抗體或其變體之CDR。涵蓋由上文所引用參考文獻中之每一者定義之CDR的適宜胺基酸殘基以比較方式陳述於下表A中。涵蓋具體CDR之確切殘基數量可端視CDR之序列及大小而變化。給定抗體之可變區胺基酸序列，彼等熟習此項技術者可以常規方式確定包括具體CDR之殘基。
1表A中之所有CDR定義皆係根據Kabat等人所述編號規定來編號(參見下文)。
2如表A中所使用之具有小寫字母「b」之「AbM」係指如由Oxford Molecular之「AbM」抗體建模軟體定義之CDR。
Kabat等人亦定義用於可變區序列且適用於任一抗體之編號系統。熟習此項技術者在不依賴除序列本身外之任何實驗數據的情況下 即可明確地將此「Kabat編號」系統指定給任一可變區序列。如本文所使用，「Kabat編號」係指Kabat等人，美國衛生及人類服務部(U.S.Dept.of Health and Human Services)，「Sequence of Proteins of Immunological Interest」(1983)陳述之編號系統。除非另有說明，否則對抗體可變區中之特定胺基酸殘基位置進行編號之提及係根據Kabat編號系統。
序列表之多肽序列並非根據Kabat編號系統來編號。然而，熟習此項技術者熟知將序列表之序列編號轉化成Kabat編號。
「框架」或「FR」係指除超變區(HVR)殘基外之可變結構域殘基。可變結構域之FR通常係由4個FR結構域組成：FR1、FR2、FR3及FR4。因此，HVR及FR序列通常出現於VH(或VL)中之以下序列中：FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。
抗體或免疫球蛋白之「種類」係指其重鏈所具有之恆定結構域或恆定區之類型。存在5大類抗體：IgA、IgD、IgE、IgG及IgM，且該等類別中之若干者可進一步分成多個子類(同種型)，例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2。對應於不同類別之免疫球蛋白之重鏈恆定結構域分別稱為α、δ、ε、γ及μ。
術語「Fc結構域」或「Fc區」在本文中用於定義免疫球蛋白重鏈之含有恆定區之至少一部分的C末端區域。該術語包含天然序列Fc區及變體Fc區。儘管IgG重鏈之Fc區的邊界可能稍有變化，但通常將人類IgG重鏈Fc區定義為自Cys226或自Pro230延伸至該重鏈之羧基末端。然而，可存在或可不存在Fc區之C末端離胺酸(Lys447)。除非在本文中另有說明，否則Fc區或恆定區中胺基酸殘基之編號係根據EU編號系統(亦稱為EU索引)，如Kabat等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，國家衛生研究院公共衛生服務部(Public Health Service,National Institutes of Health),Bethesda,MD, 1991中所闡述。如本文所使用之Fc結構域之「亞單位」係指兩個形成二聚體Fc結構域之多肽中之一者，即能夠穩定地自我締合之包括免疫球蛋白重鏈之C末端恆定區之多肽。例如，IgG Fc結構域之亞單位包括IgG CH2及IgG CH3恆定結構域。
「促進Fc結構域之第一與第二亞單位締合之修飾」係減少或防止包括Fc結構域亞單位之多肽與相同多肽締合形成同源二聚體的肽骨架之操縱或Fc結構域亞單位之翻譯後修飾。如本文所使用之促進締合之修飾尤其包含對期望締合之兩個Fc結構域亞單位(即Fc結構域之第一及第二亞單位)中之每一者作出之單獨修飾，其中該等修飾彼此互補以促進兩個Fc結構域亞單位之締合。例如，促進締合之修飾可改變Fc結構域亞單位中之一者或兩者的結構或電荷，以使其分別以空間或靜電上有利之方式進行締合。因此，在包括第一Fc結構域亞單位之多肽與包括第二Fc結構域亞單位之多肽之間發生(異源)二聚化，該(異源)二聚化之不一致性可在於融合至每一亞單位(例如抗原結合部分)之其他組份不相同。在一些實施例中，促進締合之修飾包括Fc結構域中之胺基酸突變，尤其胺基酸取代。在具體實施例中，促進締合之修飾包括Fc結構域之兩個亞單位中每一者中之單獨胺基酸突變，尤其胺基酸取代。
術語「效應子功能」係指可歸因於抗體Fc區之生物活性之彼等，其隨抗體同種型而變化。抗體效應子功能之實例包含：C1q結合及補體依賴性細胞毒性(CDC)、Fc受體結合、抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)、抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)、細胞介素分泌、藉助抗原呈送細胞之免疫複合物介導之抗原攝取、細胞表面受體(例如B細胞受體)之下調及B細胞活化。
如本文所使用，術語「改造(engineer、engineered、engineering)」視為包含天然多肽或重組多肽或其片段之肽骨架或翻 譯後修飾的任一操縱。改造包含胺基酸序列之修飾、糖基化模式之修飾或個別胺基酸之側鏈基團之修飾以及該等方式之組合。
如本文所使用之術語「胺基酸突變」意欲涵蓋胺基酸取代、缺失、插入及修飾。在最終構築物中可獲得取代、缺失、插入及修飾之任一組合，前提係最終構築物具有期望特性，例如對Fc受體之結合減少或與另一肽之締合增加。胺基酸序列缺失及插入包含胺基酸之胺基及/或羧基末端缺失及插入。具體胺基酸突變為胺基酸取代。出於改變(例如)Fc區之結合特性之目的，非保守胺基酸取代(即使用另一具有不同結構及/或化學性質之胺基酸置換一個胺基酸)尤佳。胺基酸取代包含藉由以下胺基酸進行之置換：非天然胺基酸或20種標準胺基酸之天然胺基酸衍生物(例如4-羥基脯胺酸、3-甲基組胺酸、鳥胺酸、高絲胺酸、5-羥基離胺酸)。可使用業內熟知之遺傳或化學方法來產生胺基酸突變。遺傳方法可包含定點誘變、PCR、基因合成及諸如此類。預期亦可使用藉由除遺傳改造外之方法來改變胺基酸之側鏈基團的方法，例如化學修飾。在本文中可使用多個名稱來指示相同胺基酸突變。例如，Fc結構域之位置329之脯胺酸至甘胺酸之取代可指示為329G、G329、G329、P329G或Pro329Gly。
如本文所使用，術語「多肽」係指由醯胺鍵(亦稱為肽鍵)線性連接之單體(胺基酸)構成之分子。術語「多肽」係指兩個或更多個胺基酸之任一鏈，且並非指產物之特定長度。因此，肽、二肽、三肽、寡肽、「蛋白質」、「胺基酸鏈」或用於指兩個或更多個胺基酸之鏈之任一其他術語皆包含於「多肽」之定義內，且術語「多肽」可用於置換該等術語中之任一者或可互換使用。術語「多肽」亦欲指多肽之表現後修飾之產物，該等表現後修飾包含(但不限於)糖基化、乙醯化、磷酸化、醯胺化、藉助已知保護/封阻基團之衍生、蛋白水解裂解或藉助非天然胺基酸之修飾。多肽可衍生自天然生物來源或藉由重組技 術來產生，但未必自指定核酸序列翻譯。其可以任一方式產生，包含藉由化學合成產生。本發明多肽之大小可為約3個或更多個、5個或更多個、10個或更多個、20個或更多個、25個或更多個、50個或更多個、75個或更多個、100個或更多個、200個或更多個、500個或更多個、1,000個或更多個或2,000或更多個胺基酸。多肽可具有所定義之三維結構，但其未必具有該結構。具有所定義三維結構之多肽稱為摺疊多肽，且不具有所定義三維結構而是可採用大量不同構象之多肽稱為非摺疊多肽。
「經分離」多肽或其變體或衍生物欲指並不處於其天然環境中之多肽。並不要求具體純化程度。例如，經分離多肽可自其天然或自然環境中取出。出於本發明之目的，將於宿主細胞中表現之重組產生之多肽及蛋白質視為經分離形式，如同藉由任一適宜技術分離、分級分離或部分地或實質上純化之天然或重組多肽。
就參考多肽序列而言，「胺基酸序列一致性百分數(%)」定義為在比對序列且引入空位(若需要)以達到最大序列一致性百分數後，候選序列中與參考多肽序列中之胺基酸殘基一致之胺基酸殘基的百分比，且不將任何保守取代視為序列一致性之一部分。出於確定胺基酸序列一致性百分數之目的，比對可以熟習此項技術者所熟知之各種方式來達成，例如使用可公開獲得之電腦軟體，例如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)軟體。彼等熟習此項技術者可確定用於比對序列之適宜參數，包含在所比較序列之全長範圍內達成最大比對所需要之任何算法。然而，出於本文之目的，使用序列比較電腦程式ALIGN-2來產生胺基酸序列一致性%之值。ALIGN-2序列比較電腦程式係由Genentech公司設計，且源代碼與使用者文件已一起編入美國版權局(U.S.Copyright Office)，Washington D.C.,20559中，其中其係以美國版權註冊號TXU510087註冊。ALIGN-2程式可自 Genentech公司，South San Francisco,California公開獲得，或可自源代碼進行編譯。ALIGN-2程式應經編譯用於UNIX操作系統(包含數位UNIX V4.0D)中。所有序列比較參數皆由ALIGN-2程式設定且不改變。在採用ALIGN-2進行胺基酸序列比較之情形下，給定胺基酸序列A相對於(to)、與(with)或對(against)給定胺基酸序列B之胺基酸序列一致性%(或者可表達為相對於、與或對給定胺基酸序列B具有或包括一定胺基酸序列一致性%之給定胺基酸序列A)計算如下：100×分數X/Y
其中X係在A與B之程式比對中由序列比對程式ALIGN-2評定為一致性匹配之胺基酸殘基數，且其中Y係B中胺基酸殘基之總數。應瞭解，倘若胺基酸序列A之長度不等於胺基酸序列B之長度，則A相對於B之胺基酸序列一致性%將不等於B相對於A之胺基酸序列一致性%。除非另有明確說明，否則本文所使用之所有胺基酸序列一致性%的值皆係如前面緊接段落中所闡述使用ALIGN-2電腦程式來獲得。
術語「多核苷酸」係指經分離核酸分子或構築物，例如信使RNA(mRNA)、源自病毒之RNA或質體DNA(pDNA)。多核苷酸可包括習用磷酸二酯鍵或非習用鍵(例如醯胺鍵，例如發現於肽核酸(PNA)中者)。術語「核酸分子」係指存在於多核苷酸中之任一或多個核酸區段，例如DNA或RNA片段。
「經分離」核酸分子或多核苷酸欲指已自其天然環境取出之核酸分子、DNA或RNA。例如，出於本發明之目的，將載體中所含之編碼多肽之重組多核苷酸視為經分離形式。經分離多核苷酸之其他實例包含維持於異源宿主細胞中之重組多核苷酸或於溶液中之經純化(部分地或實質上)多核苷酸。經分離多核苷酸包含通常含有多核苷酸分子之細胞中所含的多核苷酸分子，但該多核苷酸分子存在於染色體外或存在於與其天然染色體位置不同之染色體位置。經分離RNA分子包 含本發明之活體內或活體外RNA轉錄本以及正鏈及負鏈形式及雙鏈形式。本發明之經分離多核苷酸或核酸進一步包含以合成方式產生之該等分子。此外，多核苷酸或核酸可為或可包含調控元件，例如啟動子、核糖體結合位點或轉錄終止子。
具有與本發明參考核苷酸序列至少(例如)95%「一致」之核苷酸序列的核酸或多核苷酸欲指該多核苷酸之核苷酸序列與參考序列一致，只是該多核苷酸序列可包含參考核苷酸序列之每100個核苷酸至多5處點突變。換言之，為獲得具有與參考核苷酸序列至少95%一致之核苷酸序列的多核苷酸，參考序列中至多5%的核苷酸可缺失或經另一核苷酸取代，或可將佔參考序列中總核苷酸至多5%之多個核苷酸插入參考序列中。參考序列之該等改變可發生在參考核苷酸序列之5’或3’末端位置或在彼等末端位置之間之任何位置，其係個別地散佈在參考序列殘基中之各殘基之間或在參考序列內呈一或多個鄰接基團形式。實際上，可使用已知電腦程式(例如上文針對多肽所論述者(例如ALIGN-2))按慣例確定任一具體多核苷酸分子序列與本發明核苷酸序列是否為至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致。
術語「表現盒」係指以重組或合成方式產生之具有一系列允許靶細胞中之具體核酸轉錄之指定核酸元件的多核苷酸。重組表現盒可納入質體、染色體、線粒體DNA、質體DNA、病毒或核酸片段中。通常，表現載體之重組表現盒部分較其他序列尤其包含欲轉錄核酸序列及啟動子。在某些實施例中，本發明之表現盒包括編碼本發明之雙特異性抗原結合分子或其片段之多核苷酸序列。
術語「載體」或「表現載體」與「表現構築物」同義，且係指用於引入在靶細胞中與其可操作地締合之特定基因且引導其表現之DNA分子。該術語包含呈自我複製核酸結構之載體，以及納入引入其 之宿主細胞基因組中之載體。本發明之表現載體包括表現盒。表現載體容許轉錄大量穩定mRNA。表現載體位於靶細胞內部後，藉由細胞轉錄及/或翻譯機構來產生由基因編碼之核糖核酸分子或蛋白質。在一實施例中，本發明之表現載體包括包含編碼本發明之雙特異性抗原結合分子或其片段之多核苷酸序列的表現盒。
術語「宿主細胞」、「宿主細胞系」及「宿主細胞培養物」可互換使用且係指已引入外源核酸之細胞，包含該等細胞之子代。宿主細胞包含「轉化體」及「經轉化細胞」，其包含原代經轉化細胞及源自其之子代(與傳代次數無關)。子代與親代細胞之核酸含量可能並不完全相同，但可含有突變。本文包含經篩選或選擇用於原始經轉化細胞中之具有相同功能或生物活性的突變體子代。宿主細胞係任何類型之可用於產生本發明雙特異性抗原結合分子之細胞系統。宿主細胞包含培養細胞，例如哺乳動物培養細胞，例如CHO細胞、BHK細胞、NS0細胞、SP2/0細胞、YO骨髓瘤細胞、P3X63小鼠骨髓瘤細胞、PER細胞、PER.C6細胞或雜交瘤細胞、酵母菌細胞、昆蟲細胞及植物細胞，僅舉幾個例子，且亦包含轉基因動物、轉基因植物或培養植物或動物組織內所包括之細胞。
「活化Fc受體」係在由抗體之Fc區銜接後誘發刺激具有受體之細胞實施效應子功能之信號傳導事件的Fc受體。人類活化Fc受體包含FcγRIIIa(CD16a)、FcγRI(CD64)、FcγRIIa(CD32)及FcαRI(CD89)。
抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)係藉由免疫效應子細胞使抗體包覆之靶細胞溶解之免疫機制。靶細胞係包括Fc區之抗體或其衍生物通常經由為Fc區N末端之蛋白質部分特異性結合之細胞。如本文所使用，術語「降低的ADCC」定義為在給定時間中在給定抗體濃度下在圍繞靶細胞之介質中藉由上文所定義之機制溶解的靶細胞數量之減少，及/或在圍繞靶細胞之介質中在給定時間中藉由ADCC機制達 成給定數量之靶細胞溶解所需要的抗體濃度之增加。ADCC之降低係相對於使用相同的標準產生、純化、調配及儲存方法(為彼等熟習此項技術者已知)由相同類型之宿主細胞產生之但尚未經改造之相同抗體介導的ADCC而言。例如，由在抗體Fc結構域中包括降低ADCC之胺基酸取代之抗體介導的ADCC之降低係相對於由Fc結構域中不含此胺基酸取代之相同抗體介導之ADCC而言。適於量測ADCC之分析為業內所熟知(例如，參見PCT公開案第WO 2006/082515號或PCT公開案第WO 2012/130831號)。
藥劑之「有效量」係指在投與該藥劑之細胞或組織中產生生理學變化所需要之量。
藥劑(例如醫藥組合物)之「治療有效量」係指在所需時間段內以所需劑量有效地達成期望治療或預防結果之量。例如，治療有效量之藥劑會消除、減少、延遲、最小化或防止疾病之不利效應。
「個體(individual或subject)」係哺乳動物。哺乳動物包含(但不限於)家養動物(例如，牛、綿羊、貓、狗及馬)、靈長類動物(例如，人類及非人類靈長類動物，例如猴)、兔及齧齒類動物(例如，小鼠及大鼠)。具體而言，個體係人類。
術語「醫藥調配物」係指如下製劑：其係呈允許其中所含有之活性成份之生物活性有效之形式，且不含對將投與調配物之個體具有不可接受毒性之其他組份。
「醫藥上可接受之載劑」係指醫藥組合物中除活性成份外對個體無毒之成份。醫藥上可接受之載劑包含(但不限於)緩衝液、賦形劑、穩定劑或防腐劑。
如本文所使用，「治療」(及其語法變化形式，例如「治療(treat或treating)」)係指試圖改變所治療個體之疾病之自然病程的臨床干預，且可出於預防性目的或在臨床病理學病程期間實施。治療之期望 效應包含(但不限於)預防疾病之發生或復發、減輕症狀、減弱疾病之任何直接或間接病理結果、預防轉移、降低疾病進展速率、改善或緩和疾病狀態及緩解或改良預後。在一些實施例中，使用本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子來延遲疾病之發生或減緩疾病之進展。
使用術語「包裝插頁」來指通常包含於治療產品之商業包裝內之說明書，其含有有關適應症、用法、劑量、投與、組合療法、禁忌及/或關於該等治療產品之使用之警告的資訊。
實施例之詳細描述
在本發明之第一態樣中提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR；(ii)第二抗原結合部分，其係能夠特異性結合至靶細胞抗原之Fab分子。
在一實施例中，第一抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：32及SEQ ID NO：33；及輕鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：7及SEQ ID NO：31。
在一實施例中，第一抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序 列。
在特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至CEA，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25及SEQ ID NO：26組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29及SEQ ID NO：30之群之輕鏈CDR。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至CEA，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，且包括至少一個選自由以下組成之群之重鏈互補決定區(CDR)：SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38及SEQ ID NO：40；及至少一個選自以下之群之輕鏈CDR：SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：49及SEQ ID NO：50。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15及SEQ ID NO：16組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19及SEQ ID NO：20之群之輕鏈CDR。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，且包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：39及SEQ ID NO：41；及輕鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至 少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：47及SEQ ID NO：51。
在另一特定實施例中，第二抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：13至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：17至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在一實施例中，本發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR；(ii)第二抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CEA之Fab分子，其包括至少一個選自由SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25及SEQ ID NO：26組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29及SEQ ID NO：30之群之輕鏈CDR。
在一實施例中，本發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列，(ii)第二抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CEA之Fab分 子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在一實施例中，本發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR；(ii)第二抗原結合部分，其係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，其包括至少一個選自由SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15及SEQ ID NO：16組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19及SEQ ID NO：20之群之輕鏈CDR。
在一實施例中，本發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括
(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
(ii)第二抗原結合部分，其係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：13至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：17至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在具體實施例中，第一抗原結合部分係其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之可變區或恆定區之交叉Fab分子。
在一實施例中，第二抗原結合部分係習用Fab分子。
在具體實施例中，第一抗原結合部分係其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之恆定區之交叉Fab分子，且第二抗原結合部分係習用Fab分子。在又一具體實施例中，第一與第二抗原結合部分視情況經由肽連接體彼此融合。
在具體實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括由能夠穩定締合之第一與第二亞單位構成之Fc結構域。
在又一具體實施例中，在T細胞活化雙特異性抗原結合分子中存在不多於一個的能夠特異性結合至CD3之抗原結合部分(即T細胞活化雙特異性抗原結合分子提供與CD3之單價結合)。
T細胞活化雙特異性抗原結合分子格式
T細胞活化雙特異性抗原結合分子之組份可以多種組態彼此融合。實例性組態繪示於圖1、圖3及圖5中。
在具體實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括由能夠穩定締合之第一與第二亞單位構成之Fc結構域。在一些實施例中，第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一或第二亞單位的N末端。
在一該實施例中，第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第二抗原結合部分Fab重鏈之N末端。在特定該實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子基本上係由第一及第二抗原結合部分、由第一及第二亞單位構成之Fc結構域及視情況一或多個肽連接體組成，其中第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第二抗原結合部分Fab重鏈之N末端，且第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一或第二亞單位的N末端。視情況，第一抗原結合部分 之Fab輕鏈與第二抗原結合部分之Fab輕鏈可以其他方式彼此融合。
在另一該實施例中，第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一或第二亞單位的N末端。在特定該實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子基本上係由第一及第二抗原結合部分、由第一及第二亞單位構成之Fc結構域及視情況一或多個肽連接體組成，其中第一與第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端各自融合至Fc結構域之一亞單位的N末端。
在其他實施例中，第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一或第二亞單位的N末端。
在具體該實施例中，第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第一抗原結合部分Fab重鏈之N末端。在特定該實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子基本上係由第一及第二抗原結合部分、由第一及第二亞單位構成之Fc結構域及視情況一或多個肽連接體組成，其中第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第一抗原結合部分Fab重鏈之N末端，且第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一或第二亞單位的N末端。視情況，第一抗原結合部分之Fab輕鏈與第二抗原結合部分之Fab輕鏈可以其他方式彼此融合。
抗原結合部分可直接融合或經由包括一或多個胺基酸、通常約2-20個胺基酸之肽連接體融合至Fc結構域或彼此融合。肽連接體為業內已知且闡述於本文中。適宜的非免疫原性肽連接體包含例如(G4S)n、(SG4)n、(G4S)n或G4(SG4)n肽連接體。「n」通常係介於1與10之間、通常介於2與4之間之數值。尤其適於將第一與第二抗原結合部分之Fab輕鏈彼此融合之肽連接體係(G4S)2。適於連接第一與第二抗原結合部分之Fab重鏈之實例性肽連接體係EPKSC(D)-(G4S)2(SEQ ID NO 105及106)。此外，連接體可包括免疫球蛋白鉸鏈區(之一部分)。尤其在將抗原結合部分融合至Fc結構域亞單位之N末端時，其可在具或不具 其他肽連接體的情況下經由免疫球蛋白鉸鏈區或其一部分融合。
尤其在預期於高親和力抗原結合部分結合後內化靶細胞抗原之情形下，可使用具有能夠特異性結合至靶細胞抗原之單一抗原結合部分之T細胞活化雙特異性抗原結合分子(例如如圖1A、圖1D、圖1F或圖1H中所顯示)。在該等情形下，存在一個以上的特異性針對靶細胞抗原之抗原結合部分可增強靶細胞抗原之內化，由此降低其可用度。
然而，在許多其他情形下將有利的是，具有包括兩個或更多個特異性針對靶細胞抗原之抗原結合部分之T細胞活化雙特異性抗原結合分子(參見圖1B、圖1C、圖1E或圖1G中所顯示之實例)，例如以最佳化對靶位點之靶向或容許靶細胞抗原交聯。
因此，在某些實施例中，本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括第三抗原結合部分，其係能夠特異性結合至靶細胞抗原之Fab分子。在一實施例中，第三抗原結合部分係習用Fab分子。在一實施例中，第三抗原結合部分與第二抗原結合部分能夠特異性結合至相同靶細胞抗原。在具體實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至靶細胞抗原。在具體實施例中，第二及第三抗原結合部分相同(即其包括相同胺基酸序列)。
在具體實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至CEA，其中第二及第三抗原結合部分包括至少一個選自由SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25及SEQ ID NO：26組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29及SEQ ID NO：30之群之輕鏈CDR。
在具體實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR；且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至CEA，其中第二及第三抗原結合部分包括至少一個選自由SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25及SEQ ID NO：26組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29及SEQ ID NO：30之群之輕鏈CDR。
在具體實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR；且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至CEA，其中第二及第三抗原結合部分包括至少一個選自由SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25及SEQ ID NO：26組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29及SEQ ID NO：30之群之輕鏈CDR。
在具體實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：32及SEQ ID NO：33；及輕鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：7及SEQ ID NO：31，且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至CEA，其中第二及第三抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在具體實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、 96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列，且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至CEA，其中第二及第三抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在一實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，其中第二及第三抗原結合部分包括至少一個選自由以下組成之群之重鏈互補決定區(CDR)：SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38及SEQ ID NO：40；及至少一個選自以下之群之輕鏈CDR：SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：49及SEQ ID NO：50。
在具體實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR；且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，其中第二及第三抗原結合部分包括至少一個選自由以下組成之群之重鏈互補決定區(CDR)：SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38及SEQ ID NO：40；及至少一個選自以下之群之輕鏈CDR：SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：49及SEQ ID NO：50。
在一實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR；且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，其中第二及第三抗原結合部分包括至少一個選自由SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15及SEQ ID NO：16組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19及SEQ ID NO：20之群之輕鏈CDR。
在一實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：32及SEQ ID NO：33；及輕鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：7及SEQ ID NO：31，且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，其中第二及第三抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：39及SEQ ID NO：41；及輕鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：47及SEQ ID NO：51。
在一實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、 99%或100%一致之胺基酸序列，且第二及第三抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，其中第二及第三抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：13至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：17至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在一實施例中，第三抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一或第二亞單位的N末端。在更特定實施例中，第二與第三抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端各自融合至Fc結構域之一亞單位的N末端，且第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第二抗原結合部分Fab重鏈之N末端。視情況，第一抗原結合部分之Fab輕鏈與第二抗原結合部分之Fab輕鏈可以其他方式彼此融合。
第二與第三抗原結合部分可直接融合或經由肽連接體融合至Fc結構域。在具體實施例中，第二與第三抗原結合部分經由免疫球蛋白鉸鏈區各自融合至Fc結構域。在特定實施例中，免疫球蛋白鉸鏈區係人類IgG1鉸鏈區。在一實施例中，第二及第三抗原結合部分以及Fc結構域係免疫球蛋白分子之一部分。在具體實施例中，免疫球蛋白分子係IgG類免疫球蛋白。在又一具體實施例中，免疫球蛋白係IgG1子類免疫球蛋白。在另一實施例中，免疫球蛋白係IgG4子類免疫球蛋白。在又一具體實施例中，免疫球蛋白係人類免疫球蛋白。在其他實施例中，免疫球蛋白係嵌合免疫球蛋白或人類化免疫球蛋白。在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子基本上係由能夠特異性結合至靶細胞抗原之免疫球蛋白分子及能夠特異性結合至CD3之抗原結合部分組成，其中抗原結合部分係視情況經由肽連接體融合至一條免疫球蛋白重鏈N末端之Fab分子、尤其交叉Fab分子。
在具體實施例中，第一及第三抗原結合部分係在Fab重鏈之C末 端各自融合至Fc結構域之一亞單位的N末端，且第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第一抗原結合部分Fab重鏈之N末端。在特定該實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子基本上係由第一、第二及第三抗原結合部分、由第一及第二亞單位構成之Fc結構域及視情況一或多個肽連接體組成，其中第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第一抗原結合部分Fab重鏈之N末端，且第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一亞單位的N末端，且其中第三抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第二亞單位的N末端。視情況，第一抗原結合部分之Fab輕鏈與第二抗原結合部分之Fab輕鏈可以其他方式彼此融合。
在一實施例中，本發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括SEQ ID NO：4之重鏈互補決定區(CDR)1、SEQ ID NO：5之重鏈CDR 2、SEQ ID NO：6之重鏈CDR 3、SEQ ID NO：8之輕鏈CDR 1、SEQ ID NO：9之輕鏈CDR 2及SEQ ID NO：10之輕鏈CDR 3，其中第一抗原結合部分係其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之可變區或恆定區、尤其恆定區之交叉Fab分子；(ii)第二及第三抗原結合部分，其各自係能夠特異性結合至CEA之Fab分子，其包括SEQ ID NO：24之重鏈CDR 1、SEQ ID NO：25之重鏈CDR 2、SEQ ID NO：26之重鏈CDR 3、SEQ ID NO：28之輕鏈CDR 1、SEQ ID NO：29之輕鏈CDR 2及SEQ ID NO：30之輕鏈CDR3。
在一實施例中，本發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、 96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列，其中第一抗原結合部分係其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之可變區或恆定區、尤其恆定區之交叉Fab分子；(ii)第二及第三抗原結合部分，其各自係能夠特異性結合至CEA之Fab分子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
在一實施例中，本發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括SEQ ID NO：4之重鏈互補決定區(CDR)1、SEQ ID NO：5之重鏈CDR 2、SEQ ID NO：6之重鏈CDR 3、SEQ ID NO：8之輕鏈CDR 1、SEQ ID NO：9之輕鏈CDR 2及SEQ ID NO：10之輕鏈CDR 3，其中第一抗原結合部分係其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之可變區或恆定區、尤其恆定區之交叉Fab分子；(ii)第二及第三抗原結合部分，其各自係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，其包括SEQ ID NO：14之重鏈CDR 1、SEQ ID NO：15之重鏈CDR 2、SEQ ID NO：16之重鏈CDR 3、SEQ ID NO：18之輕鏈CDR 1、SEQ ID NO：19之輕鏈CDR 2及SEQ ID NO：20之輕鏈CDR3。
在一實施例中，本發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、 96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列，其中第一抗原結合部分係其中交換Fab輕鏈與Fab重鏈之可變區或恆定區、尤其恆定區之交叉Fab分子；(ii)第二及第三抗原結合部分，其各自係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：13至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：17至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
根據上述四個實施例中任一者之T細胞活化雙特異性抗原結合分子可進一步包括(iii)由能夠穩定締合之第一與第二亞單位構成之Fc結構域，其中第二抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至第一抗原結合部分Fab重鏈之N末端，且第一抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第一亞單位的N末端，且其中第三抗原結合部分係在Fab重鏈之C末端融合至Fc結構域之第二亞單位的N末端。
在一些本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子中，第一抗原結合部分之Fab輕鏈與第二抗原結合部分之Fab輕鏈視情況經由連接體肽彼此融合。端視第一及第二抗原結合部分之組態，第一抗原結合部分可在Fab輕鏈之C末端融合至第二抗原結合部分Fab輕鏈之N末端，或第二抗原結合部分可在Fab輕鏈之C末端融合至第一抗原結合部分Fab輕鏈的N末端。第一與第二抗原結合部分之Fab輕鏈之融合進一步減少不匹配Fab重鏈與輕鏈之錯配，且亦減少為表現一些本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子所需之質體數。
在某些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括以下多肽：其中第一抗原結合部分之Fab輕鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區共享羧基末端肽鍵(即第一抗原結合部分包括交叉Fab 重鏈，其中重鏈可變區經輕鏈可變區置換)，該第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區進而與Fc結構域亞單位共享羧基末端肽鍵(VL(1)-CH1(1)-CH2-CH3(-CH4))；及其中第二抗原結合部分之Fab重鏈與Fc結構域亞單位共享羧基末端肽鍵(VH(2)-CH1(2)-CH2-CH3(-CH4))。在一些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括其中第一抗原結合部分之Fab重鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區共享羧基末端肽鍵之多肽(VH(1)-CL(1))及第二抗原結合部分之Fab輕鏈多肽(VL(2)-CL(2))。在某些實施例中，多肽係由(例如)二硫鍵共價連接。
在替代性實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括以下多肽：其中第一抗原結合部分之Fab重鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區共享羧基末端肽鍵(即第一抗原結合部分包括交叉Fab重鏈，其中重鏈恆定區經輕鏈恆定區置換)，該第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區進而與Fc結構域亞單位共享羧基末端肽鍵(VH(1)-CL(1)-CH2-CH3(-CH4))；及其中第二抗原結合部分之Fab重鏈與Fc結構域亞單位共享羧基末端肽鍵(VH(2)-CH1(2)-CH2-CH3(-CH4))。在一些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括其中第一抗原結合部分之Fab輕鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區共享羧基末端肽鍵之多肽(VL(1)-CH1(1))及第二抗原結合部分之Fab輕鏈多肽(VL(2)-CL(2))。在某些實施例中，多肽係由(例如)二硫鍵共價連接。
在一些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括以下多肽：其中第一抗原結合部分之Fab輕鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區共享羧基末端肽鍵(即第一抗原結合部分包括交叉Fab重鏈，其中重鏈可變區經輕鏈可變區置換)，該第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區進而與第二抗原結合部分之Fab重鏈共享羧基末端肽 鍵，該第二抗原結合部分之Fab重鏈進而與Fc結構域亞單位共享羧基末端肽鍵(VL(1)-CH1(1)-VH(2)-CH1(2)-CH2-CH3(-CH4))。在其他實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括以下多肽：其中第一抗原結合部分之Fab重鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區共享羧基末端肽鍵(即第一抗原結合部分包括交叉Fab重鏈，其中重鏈恆定區經輕鏈恆定區置換)，該第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區進而與第二抗原結合部分之Fab重鏈共享羧基末端肽鍵，該第二抗原結合部分之Fab重鏈進而與Fc結構域亞單位共享羧基末端肽鍵(VH(1)-CL(1)-VH(2)-CH1(2)-CH2-CH3(-CH4))。在又一些其他實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括以下多肽：其中第二抗原結合部分之Fab重鏈與第一抗原結合部分之Fab輕鏈可變區共享羧基末端肽鍵，該第一抗原結合部分之Fab輕鏈可變區進而與第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區共享羧基末端肽鍵(即第一抗原結合部分包括交叉Fab重鏈，其中重鏈可變區經輕鏈可變區置換)，該第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區進而與Fc結構域亞單位共享羧基末端肽鍵(VH(2)-CH1(2)-VL(1)-CH1(1)-CH2-CH3(-CH4))。在其他實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括以下多肽：其中第二抗原結合部分之Fab重鏈與第一抗原結合部分之Fab重鏈可變區共享羧基末端肽鍵，該第一抗原結合部分之Fab重鏈可變區進而與第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區共享羧基末端肽鍵(即第一抗原結合部分包括交叉Fab重鏈，其中重鏈恆定區經輕鏈恆定區置換)，該第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區進而與Fc結構域亞單位共享羧基末端肽鍵(VH(2)-CH1(2)-VH(1)-CL(1)-CH2-CH3(-CH4))。
在該等實施例中之一些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括第一抗原結合部分之交叉Fab輕鏈多肽，其中第一抗原結合部分之Fab重鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區共 享羧基末端肽鍵(VH(1)-CL(1))；及第二抗原結合部分之Fab輕鏈多肽(VL(2)-CL(2))。在該等實施例中之其他實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括交叉Fab輕鏈多肽，其中第一抗原結合部分之Fab輕鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區共享羧基末端肽鍵(VL(1)-CH1(1))；及第二抗原結合部分之Fab輕鏈多肽(VL(2)-CL(2))。在該等實施例中之又一些其他實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子進一步包括以下多肽：其中第一抗原結合部分之Fab輕鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區共享羧基末端肽鍵，該第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區進而與第二抗原結合部分之Fab輕鏈多肽共享羧基末端肽鍵(VL(1)-CH1(1)-VL(2)-CL(2))；其中第一抗原結合部分之Fab重鏈可變區與第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區共享羧基末端肽鍵，該第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區進而與第二抗原結合部分之Fab輕鏈多肽共享羧基末端肽鍵(VH(1)-CL(1)-VL(2)-CL(2))；其中第二抗原結合部分之Fab輕鏈多肽與第一抗原結合部分之Fab輕鏈可變區共享羧基末端肽鍵，該第一抗原結合部分之Fab輕鏈可變區進而與第一抗原結合部分之Fab重鏈恆定區共享羧基末端肽鍵(VL(2)-CL(2)-VL(1)-CH1(1))；或其中第二抗原結合部分之Fab輕鏈多肽與第一抗原結合部分之Fab重鏈可變區共享羧基末端肽鍵，該第一抗原結合部分之Fab重鏈可變區進而與第一抗原結合部分之Fab輕鏈恆定區共享羧基末端肽鍵(VL(2)-CL(2)-VH(1)-CL(1))。
根據該等實施例之T細胞活化雙特異性抗原結合分子可進一步包括(i)Fc結構域亞單位多肽(CH2-CH3(-CH4))，或(ii)其中第三抗原結合部分之Fab重鏈與Fc結構域亞單位共享羧基末端肽鍵之多肽(VH(3)-CH1(3)-CH2-CH3(-CH4))及第三抗原結合部分之Fab輕鏈多肽(VL(3)-CL(3))。在某些實施例中，多肽係由(例如)二硫鍵共價連接。
根據上述實施例中之任一者，T細胞活化雙特異性抗原結合分子 之組份(例如抗原結合部分、Fc結構域)可直接融合或經由各種連接體、尤其包括一或多個胺基酸、通常約2-20個胺基酸之肽連接體融合，該等連接體闡述於本文中或為業內已知。適宜之非免疫原性肽連接體包含(例如)(G4S)n、(SG4)n、(G4S)n或G4(SG4)n肽連接體，其中n通常係介於1與10之間、通常介於2與4之間之數值。
Fc結構域
T細胞活化雙特異性抗原結合分子之Fc結構域係由一對包括免疫球蛋白分子之重鏈結構域之多肽鏈組成。例如，免疫球蛋白G(IgG)分子之Fc結構域為二聚體，其每一亞單位包括CH2及CH3 IgG重鏈恆定結構域。Fc結構域之兩個亞單位能夠彼此穩定締合。在一實施例中，本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括不多於一個的Fc結構域。
在本發明之一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之Fc結構域係IgG Fc結構域。在具體實施例中，Fc結構域係IgG1 Fc結構域。在另一實施例中，Fc結構域係IgG4 Fc結構域。在更特定實施例中，Fc結構域係包括位置S228處之胺基酸取代(Kabat編號)、尤其胺基酸取代S228P之IgG4 Fc結構域。此胺基酸取代會減少IgG4抗體之活體內Fab臂交換(參見Stubenrauch等人，Drug Metabolism and Disposition 38,84-91(2010))。在又一具體實施例中，Fc結構域為人類Fc結構域。人類IgG1 Fc區之實例性序列以SEQ ID NO：107給出。
促進異源二聚化之Fc結構域修飾
本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括融合至Fc結構域兩個亞單位中之一者或另一者之不同抗原結合部分，因此Fc結構域之兩個亞單位通常包括在兩條不同多肽鏈中。該等多肽之重組共表現及隨後二聚化產生兩個多肽之若干可能組合。為改良T細胞活化雙特異性抗原結合分子在重組產生中之產量及純度，因此在T細胞活化雙特 異性抗原結合分子之Fc結構域中誘導促進期望多肽締合之修飾將有利。
因此，在具體實施例中，本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之Fc結構域包括促進Fc結構域之第一與第二亞單位締合之修飾。人類IgG Fc結構域之兩個亞單位之間最廣泛的蛋白質-蛋白質相互作用之位點位於Fc結構域之CH3結構域中。因此，在一實施例中，該修飾位於Fc結構域之CH3結構域中。
在特定實施例中，該修飾係所謂的「隆凸於孔洞中(knob-into-hole)」修飾，包括Fc結構域兩個亞單位中一者中之「隆凸」修飾及Fc結構域兩個亞單位中另一者中之「孔洞」修飾。
隆凸於孔洞中技術闡述於(例如)US 5,731,168；US 7,695,936；Ridgway等人，Prot Eng 9,617-621(1996)及Carter,J Immunol Meth 248,7-15(2001)中。通常，該方法涉及在第一多肽之界面處引入凸起(「隆凸」)且在第二多肽之界面處引入相應空腔(「孔洞」)，以使該凸起可位於空腔中以促進異源二聚體形成並阻礙同源二聚體形成。藉由使用較大側鏈(例如酪胺酸或色胺酸)置換來自第一多肽界面之較小胺基酸側鏈來構築凸起。藉由使用較小胺基酸側鏈(例如丙胺酸或蘇胺酸)置換較大胺基酸側鏈在第二多肽之界面處產生大小與凸起相同或相似之補償性空腔。
因此，在具體實施例中，在T細胞活化雙特異性抗原結合分子Fc結構域之第一亞單位之CH3結構域中，胺基酸殘基經具有較大側鏈體積之胺基酸殘基置換，由此在第一亞單位之CH3結構域內產生可定位於第二亞單位CH3結構域內之空腔中的凸起；且在Fc結構域第二亞單位之CH3結構域中，胺基酸殘基經具有較小側鏈體積之胺基酸殘基置換，由此在第二亞單位之CH3結構域內產生空腔，第一亞單位CH3結構域內之凸起可定位於該空腔內。
凸起及空腔可藉由改變編碼多肽之核酸(例如藉由位點特異性誘變或藉由肽合成)來製得。
在特定實施例中，在Fc結構域第一亞單位之CH3結構域中，位置366處之蘇胺酸殘基經色胺酸殘基置換(T366W)，且在Fc結構域第二亞單位之CH3結構域中，位置407處之酪胺酸殘基經纈胺酸殘基置換(Y407V)。在一實施例中，在Fc結構域之第二亞單位中，位置366處之蘇胺酸殘基另外經絲胺酸殘基置換(T366S)，且位置368處之白胺酸殘基經丙胺酸殘基置換(L368A)。
在又一實施例中，在Fc結構域之第一亞單位中，位置354處之絲胺酸殘基另外經半胱胺酸殘基置換(S354C)，且在Fc結構域之第二亞單位中，位置349處之酪胺酸殘基另外經半胱胺酸殘基置換(Y349C)。引入該兩個半胱胺酸殘基會在Fc結構域之兩個亞單位之間形成二硫橋，從而進一步穩定二聚體(Carter,J Immunol Methods 248,7-15(2001))。
在具體實施例中，將能夠結合至CD3之抗原結合部分融合(視情況經由能夠結合至靶細胞抗原之抗原結合部分)至Fc結構域之第一亞單位(包括「隆凸」修飾)。不希望受限於理論，能夠結合至CD3之抗原結合部分與Fc結構域之含隆凸亞單位的融合將(進一步)使包括兩個能夠結合至CD3之抗原結合部分之抗原結合分子之產生(兩個含隆凸多肽之空間位阻)最小化。
在替代性實施例中，促進Fc結構域之第一與第二亞單位締合之修飾包括調介靜電牽引效應之修飾，例如如PCT公開案WO 2009/089004中所闡述。通常，此方法涉及藉由帶電胺基酸殘基置換兩個Fc結構域亞單位之界面處之一或多個胺基酸殘基，以使同源二聚體形成變得靜電不利而使異源二聚化變得靜電有利。
降低Fc受體結合及/或效應子功能之Fc結構域修飾
Fc結構域賦予T細胞活化雙特異性抗原結合分子有利的藥物代謝動力學性質，包含長血清半衰期(其有助於在靶組織中良好累積)及有利的組織-血液分佈比率。然而，同時，其可導致T細胞活化雙特異性抗原結合分子對表現Fc受體之細胞而非具有較佳抗原之細胞之不期望靶向。此外，共活化Fc受體信號傳導途徑可引起細胞介素釋放，此與抗原結合分子之T細胞活化性質及長半衰期組合使得細胞介素受體過度活化且在全身性投與時引起嚴重副作用。除T細胞外之(具有Fc受體之)免疫細胞之活化甚至可因例如NK細胞對T細胞之潛在破壞而降低T細胞活化雙特異性抗原結合分子之功效。
因此，在具體實施例中，本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之Fc結構域展現與天然IgG1 Fc結構域相比降低的對Fc受體之結合親和力及/或降低的效應子功能。在一該實施例中，Fc結構域(或包括該Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)展現與天然IgG1 Fc結構域相比，小於50%、較佳小於20%、更佳小於10%且最佳小於5%的對Fc受體之結合親和力(或包括天然IgG1 Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)；及/或與天然IgG1 Fc結構域(或包括天然IgG1 Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)相比，小於50%、較佳小於20%、更佳小於10%且最佳小於5%的效應子功能。在一實施例中，Fc結構域(或包括該Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)實質上並不與Fc受體結合及/或誘導效應子功能。在具體實施例中，Fc受體係Fcγ受體。在一實施例中，Fc受體係人類Fc受體。在一實施例中，Fc受體係活化Fc受體。在特定實施例中，Fc受體係活化人類Fcγ受體，更特定係人類FcγRIIIa、FcγRI或FcγRIIa，最特定係人類FcγRIIIa。在一實施例中，效應子功能係選自以下之群之一或多者：CDC、ADCC、ADCP及細胞介素分泌。在具體實施例中，效應子功能為ADCC。在一實施例中，Fc結構域展現與天然IgG1 Fc結構域相比 實質上相似的對新生Fc受體(FcRn)之結合親和力。與FcRn實質上相似的結合係在Fc結構域(或包括該Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)展現比天然IgG1 Fc結構域(或包括天然IgG1 Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)與FcRn之結合親和力大約70%、尤其大約80%、更尤其大約90%的結合親和力時達成。
在某些實施例中，Fc結構域經改造以具有與未經改造之Fc結構域相比，降低的對Fc受體之結合親和力及/或降低的效應子功能。在具體實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之Fc結構域包括一或多個降低Fc結構域對Fc受體之結合親和力及/或效應子功能之胺基酸突變。通常，相同的一或多個胺基酸突變存在於Fc結構域之兩個亞單位中之每一者中。在一實施例中，胺基酸突變會降低Fc結構域對Fc受體之結合親和力。在一實施例中，胺基酸突變將Fc結構域對Fc受體之結合親和力降低至先前的至少1/2、至少1/5或至少1/10。在存在一個以上的降低Fc結構域對Fc受體之結合親和力之胺基酸突變的實施例中，該等胺基酸突變之組合可將Fc結構域對Fc受體之結合親和力降低至先前的至少1/10、至少1/20或甚至至少1/50。在一實施例中，與包括未經改造之Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子相比，包括經改造Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子展現小於20%、尤其小於10%、更尤其小於5%的對Fc受體之結合親和力。在具體實施例中，Fc受體係Fcγ受體。在一些實施例中，Fc受體係人類Fc受體。在一些實施例中，Fc受體係活化Fc受體。在特定實施例中，Fc受體係活化人類Fcγ受體，更特定係人類FcγRIIIa、FcγRI或FcγRIIa，最特定係人類FcγRIIIa。較佳地，降低對該等受體中每一者之結合。在一些實施例中，亦降低對補體組份之結合親和力、尤其對C1q之結合親和力。在一實施例中，並未降低對新生Fc受體(FcRn)之結合親和力。對FcRn實質上相似之結合(即保留Fc結構域對該受體之結合親和 力)係在Fc結構域(或包括該Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)展現比Fc結構域之未經改造形式(或包括Fc結構域之該未經改造形式之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)對FcRn之結合親和力大約70%之結合親和力時達成。Fc結構域或包括該Fc結構域之本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子可展現比該親和力大約80%且甚至大約90%的親和力。在某些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之Fc結構域經改造以具有與未經改造之Fc結構域相比降低的效應子功能。降低的效應子功能可包含(但不限於)以下中之一或多者：降低的補體依賴性細胞毒性(CDC)、降低的抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)、降低的抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)、降低的細胞介素分泌、降低的免疫複合物介導之藉助抗原呈送細胞之抗原攝取、降低的與NK細胞之結合、降低的與巨噬細胞之結合、降低的與單核球之結合、降低的與多形核細胞之結合、降低的誘導細胞凋亡之直接信號傳導、降低的靶結合抗體之交聯、降低的樹突細胞成熟或降低的T細胞引發。在一實施例中，降低的效應子功能係選自以下之群中之一或多者：降低的CDC、降低的ADCC、降低的ADCP及降低的細胞介素分泌。在具體實施例中，降低的效應子功能係降低的ADCC。在一實施例中，降低的ADCC小於由未經改造之Fc結構域(或包括未經改造之Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)誘導之ADCC之20%。
在一實施例中，降低Fc結構域對Fc受體之結合親和力及/或效應子功能之胺基酸突變係胺基酸取代。在一實施例中，Fc結構域包括選自以下之群之位置處的胺基酸取代：E233、L234、L235、N297、P331及P329。在更特定實施例中，Fc結構域包括選自L234、L235及P329之群之位置處的胺基酸取代。在一些實施例中，Fc結構域包括胺基酸取代L234A及L235A。在一該實施例中，Fc結構域係IgG1 Fc結構域、尤其人類IgG1 Fc結構域。在一實施例中，Fc結構域包括位置 P329處之胺基酸取代。在更特定實施例中，胺基酸取代係P329A或P329G、尤其P329G。在一實施例中，Fc結構域包括位置P329處之胺基酸取代及選自E233、L234、L235、N297及P331位置處的又一胺基酸取代。在更特定實施例中，又一胺基酸取代係E233P、L234A、L235A、L235E、N297A、N297D或P331S。在具體實施例中，Fc結構域包括P329、L234及L235位置處之胺基酸取代。在更具體實施例中，Fc結構域包括胺基酸突變L234A、L235A及P329G(「P329G LALA」)。在一該實施例中，Fc結構域係IgG1 Fc結構域、尤其人類IgG1 Fc結構域。胺基酸取代之「P329G LALA」組合幾乎完全消除了人類IgG1 Fc結構域之Fcγ受體(以及補體)結合，如PCT公開案第WO 2012/130831號中所闡述，該公開案之全文以引用方式併入本文中。WO 2012/130831亦闡述製備該等突變Fc結構域之方法及用於測定其性質(例如Fc受體結合或效應子功能)之方法。
IgG4抗體展現與IgG1抗體相比降低的對Fc受體之結合親和力及降低的效應子功能。因此，在一些實施例中，本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之Fc結構域係IgG4 Fc結構域、尤其人類IgG4 Fc結構域。在一實施例中，IgG4 Fc結構域包括位置S228處之胺基酸取代、尤其胺基酸取代S228P。為進一步降低其對Fc受體之結合親和力及/或其效應子功能，在一實施例中，IgG4 Fc結構域包括位置L235處之胺基酸取代、尤其胺基酸取代L235E。在另一實施例中，IgG4 Fc結構域包括位置P329處之胺基酸取代、尤其胺基酸取代P329G。在具體實施例中，IgG4 Fc結構域包括位置S228、L235及P329處之胺基酸取代、尤其胺基酸取代S228P、L235E及P329G。該等IgG4 Fc結構域突變體及其Fcγ受體結合性質闡述於PCT公開案第WO 2012/130831號中，該公開案之全文以引用方式併入本文中。
在具體實施例中，展現與天然IgG1 Fc結構域相比降低的對Fc受 體之結合親和力及/或降低的效應子功能之Fc結構域係包括胺基酸取代L234A、L235A及視情況P329G之人類IgG1 Fc結構域或包括胺基酸取代S228P、L235E及視情況P329G之人類IgG4 Fc結構域。
在某些實施例中，已消除Fc結構域之N-糖基化。在一該實施例中，Fc結構域包括位置N297處之胺基酸突變、尤其天冬醯胺經丙胺酸(N297A)或天冬胺酸(N297D)置換之胺基酸取代。
除上文及PCT公開案第WO 2012/130831號中所闡述之Fc結構域外，Fc受體結合及/或效應子功能降低之Fc結構域亦包含彼等在Fc結構域殘基238、265、269、270、297、327及329中之一或多者處具有取代者(美國專利第6,737,056號)。該等Fc突變體包含在胺基酸位置265、269、270、297及327中之兩者或更多者處具有取代之Fc突變體，包含殘基265及297經丙胺酸取代之所謂的「DANA」Fc突變體(美國專利第7,332,581號)。
突變Fc結構域可使用業內熟知之遺傳或化學方法藉由胺基酸缺失、取代、插入或修飾來製備。遺傳方法可包含編碼DNA序列之位點特異性誘變、PCR、基因合成及諸如此類。可藉由(例如)測序來驗證正確的核苷酸變化。
與Fc受體之結合可容易地藉由(例如)ELISA或藉由表面電漿子共振(SPR)使用標準儀器(例如BIAcore儀器(GE Healthcare))來測定，且Fc受體(例如)可藉由重組表現來獲得。適宜的該結合分析闡述於本文中。另一選擇為，Fc結構域或包括Fc結構域之細胞活化雙特異性抗原結合分子對Fc受體之結合親和力可使用已知表現具體Fc受體之細胞系(例如表現FcγIIIa受體之人類NK細胞)來評估。
Fc結構域或包括Fc結構域之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之效應子功能可藉由業內已知方法來量測。適用於量測ADCC之分析闡述於本文中。評價所關注分子ADCC活性之活體外分析之其他實例闡 述於美國專利第5,500,362號；Hellstrom等人Proc Natl Acad Sci USA 83,7059-7063(1986)及Hellstrom等人，Proc Natl Acad Sci USA 82,1499-1502(1985)；美國專利第5,821,337號；Bruggemann等人，J Exp Med 166,1351-1361(1987)中。另一選擇為，可採用非放射性分析方法(例如，參見用於流式細胞術之ACTITM非放射性細胞毒性分析(CellTechnology公司，Mountain View,CA)及CytoTox 96®非放射性細胞毒性分析(Promega,Madison,WI))。可用於該等分析之效應子細胞包含外周血單核細胞(PBMC)及自然殺手(NK)細胞。另一選擇為或此外，可例如在諸如Clynes等人，Proc Natl Acad Sci USA 95,652-656(1998)中所揭示之動物模型中在活體內評價所關注分子之ADCC活性。
在一些實施例中，降低Fc結構域對補體組份、尤其對C1q之結合。因此，在一些其中Fc結構域經改造以具有降低的效應子功能之實施例中，該降低的效應子功能包含降低的CDC。可實施C1q結合分析來測定T細胞活化雙特異性抗原結合分子是否能夠結合C1q且因此具有CDC活性。例如，參見WO 2006/029879及WO 2005/100402中之C1q及C3c結合ELISA。為評價補體活化，可實施CDC分析(例如，參見Gazzano-Santoro等人，J Immunol Methods 202,163(1996)；Cragg等人，Blood 101,1045-1052(2003)；及Cragg及Glennie，Blood 103,2738-2743(2004))。
抗原結合部分
本發明之抗原結合分子具有雙特異性，即其包括至少兩個能夠特異性結合至兩個不同抗原決定簇之抗原結合部分。根據本發明，抗原結合部分為Fab分子(即由各自包括可變區及恆定區之重鏈及輕鏈構成之抗原結合結構域)。在一實施例中，該等Fab分子係人類Fab分子。在另一實施例中，該等Fab分子係人類化Fab分子。在又一實施例 中，該等Fab分子包括人類重鏈及輕鏈恆定區。
至少一個抗原結合部分為交叉Fab分子。該修飾防止來自不同Fab分子之重鏈與輕鏈錯配，由此改良本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子在重組產生中之產量及純度。在可用於本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之具體交叉Fab分子中，交換Fab輕鏈與Fab重鏈之恆定區。在可用於本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之另一交叉Fab分子中，交換Fab輕鏈與Fab重鏈之可變區。
在本發明之具體實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子能夠同時結合至靶細胞抗原、尤其腫瘤細胞抗原及CD3。在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子能夠藉由同時結合至靶細胞抗原及CD3來交聯T細胞及靶細胞。在又一具體實施例中，該同時結合使靶細胞、尤其腫瘤細胞溶解。在一實施例中，該同時結合使T細胞活化。在其他實施例中，該同時結合使T淋巴球、尤其細胞毒性T淋巴球產生選自以下之群之細胞反應：增殖、分化、細胞介素分泌、細胞毒性效應子分子釋放、細胞毒性活性及活化標記之表現。在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子與CD3結合而不同時與靶細胞抗原結合並不使T細胞活化。
在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子能夠使T細胞之細胞毒性活性重定向至靶細胞。在具體實施例中，該重定向獨立於藉助靶細胞之MHC介導之肽抗原呈送及/或T細胞之特異性。
具體而言，根據本發明任一實施例之T細胞係細胞毒性T細胞。在一些實施例中，T細胞係CD4+或CD8+ T細胞、尤其CD8+ T細胞。
CD3結合部分
本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括至少一個能夠結合至CD3之抗原結合部分(在本文中亦稱為「CD3抗原結合部分」或「第一抗原結合部分」)。在具體實施例中，T細胞活化雙特異性抗原 結合分子包括不多於一個的能夠特異性結合至CD3之抗原結合部分。在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子提供與CD3之單價結合。CD3抗原結合分子係交叉Fab分子，即其中交換Fab重鏈與輕鏈之可變區或恆定區之Fab分子。在其中存在一個以上的包括於T細胞活化雙特異性抗原結合分子中之能夠特異性結合至靶細胞抗原之抗原結合部分的實施例中，能夠特異性結合至CD3之抗原結合部分較佳係交叉Fab分子，且能夠特異性結合至靶細胞抗原之抗原結合部分係習用Fab分子。
在具體實施例中，CD3係人類CD3(SEQ ID NO：103)或食蟹猴CD3(SEQ ID NO：104)、最尤其係人類CD3。在具體實施例中，CD3抗原結合部分對人類及食蟹猴CD3具有交叉反應性(即與其特異性結合)。在一些實施例中，第一抗原結合部分能夠特異性結合至CD3之ε亞單位。
CD3抗原結合部分包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR。
在一實施例中，CD3抗原結合部分包括SEQ ID NO：4之重鏈CDR1、SEQ ID NO：5之重鏈CDR2、SEQ ID NO：6之重鏈CDR3、SEQ ID NO：8之輕鏈CDR1、SEQ ID NO：9之輕鏈CDR2及SEQ ID NO：10之輕鏈CDR3。
在一實施例中，CD3抗原結合部分包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之重鏈可變區序列：SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：32及SEQ ID NO：33；及與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之輕鏈可變區序列：SEQ ID NO：7及SEQ ID NO：31。
在一實施例中，CD3抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括選自 以下之群之胺基酸序列：SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：32及SEQ ID NO：33；及輕鏈可變區，其包括選自以下之群之胺基酸序列：SEQ ID NO：7及SEQ ID NO：31。
在一實施例中，CD3抗原結合部分包括與SEQ ID NO：3至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之重鏈可變區序列及與SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之輕鏈可變區序列。
在一實施例中，CD3抗原結合部分包括包含胺基酸序列SEQ ID NO：3之重鏈可變區及包含胺基酸序列SEQ ID NO：7之輕鏈可變區。
在一實施例中，CD3抗原結合部分包括SEQ ID NO：3之重鏈可變區序列及SEQ ID NO：7之輕鏈可變區序列。
靶細胞抗原結合部分
本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括至少一個能夠結合至靶細胞抗原之抗原結合部分(在本文中亦稱為「靶細胞抗原結合部分」或「第二」或「第三」抗原結合部分)。在某些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括兩個能夠結合至靶細胞抗原之抗原結合部分。在具體該實施例中，該等抗原結合部分中之每一者皆特異性結合至相同抗原決定簇。在又一具體實施例中，該等抗原結合部分中之所有皆相同。在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括能夠特異性結合至靶細胞抗原之免疫球蛋白分子。在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括不多於兩個的能夠結合至靶細胞抗原之抗原結合部分。
靶細胞抗原結合部分通常係結合至特異性抗原決定簇且能夠使T細胞活化雙特異性抗原結合分子針對靶位點、例如針對具有抗原決定簇之特定類型之腫瘤細胞的Fab分子、尤其習用Fab分子。
在某些實施例中，靶細胞抗原結合部分特異性結合至細胞表面 抗原。在具體實施例中，靶細胞抗原結合部分特異性結合至細胞表面抗原之近膜區。在特定該實施例中，細胞表面抗原係癌胚胎抗原(CEA)且近膜區係CEA之B3結構域(SEQ ID NO：119之殘基208-286)。在另一特定該實施例中，細胞表面抗原係黑素瘤相關硫酸軟骨蛋白多糖(MCSP)且近膜區係MCSP之D3結構域(SEQ ID NO：118)。
在某些實施例中，靶細胞抗原結合部分係針對與病理學病況相關之抗原，例如在腫瘤細胞上或病毒感染細胞上呈送之抗原。適宜抗原係細胞表面抗原，例如(但不限於)細胞表面受體。在具體實施例中，抗原係人類抗原。在特定實施例中，靶細胞抗原係選自黑素瘤相關硫酸軟骨蛋白多糖(MCSP、CSPG4)及癌胚胎抗原(CEA、CEACAM5)。
在一些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括至少一個特異性針對黑素瘤相關硫酸軟骨蛋白多糖(MCSP)之抗原結合部分。在一實施例中，特異性針對MCSP之抗原結合部分包括至少一個選自由以下組成之群之重鏈互補決定區(CDR)：SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38及SEQ ID NO：40；及至少一個選自以下之群之輕鏈CDR：SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：49及SEQ ID NO：50。
在一實施例中，特異性針對MCSP之抗原結合部分包括至少一個選自由SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15及SEQ ID NO：16組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19及SEQ ID NO：20之群之輕鏈CDR。
在一實施例中，特異性針對MCSP之抗原結合部分包括SEQ ID NO：14之重鏈CDR1、SEQ ID NO：15之重鏈CDR2、SEQ ID NO：16之重鏈CDR3、SEQ ID NO：18之輕鏈CDR1、SEQ ID NO：19之輕鏈 CDR2及SEQ ID NO：20之輕鏈CDR3。
在又一實施例中，特異性針對MCSP之抗原結合部分包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之重鏈可變區序列：SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：39及SEQ ID NO：41；及與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之輕鏈可變區序列：SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：47及SEQ ID NO：51。
在又一實施例中，特異性針對MCSP之抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括選自以下之群之胺基酸序列：SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：39及SEQ ID NO：41；及輕鏈可變區，其包括選自以下之群之胺基酸序列：SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：47及SEQ ID NO：51。
在又一實施例中，特異性針對MCSP之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：13至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之重鏈可變區序列及與SEQ ID NO：17至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之輕鏈可變區序列或其保留功能之變體。
在一實施例中，特異性針對MCSP之抗原結合部分包括包含胺基酸序列SEQ ID NO：13之重鏈可變區及包含胺基酸序列SEQ ID NO：17之輕鏈可變區。
在一實施例中，特異性針對MCSP之抗原結合部分包括SEQ ID NO：13之重鏈可變區序列及SEQ ID NO：17之輕鏈可變區序列。
在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括與SEQ ID NO：12至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；與SEQ ID NO：53至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；與SEQ ID NO：54至少約95%、96%、97%、98%、 99%或100%一致之多肽序列；及與SEQ ID NO：55至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。
在具體實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括至少一個特異性針對癌胚胎抗原(CEA)之抗原結合部分。在一實施例中，特異性針對CEA之抗原結合部分包括至少一個選自由SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25及SEQ ID NO：26組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29及SEQ ID NO：30之群之輕鏈CDR。
在一實施例中，特異性針對CEA之抗原結合部分包括SEQ ID NO：24之重鏈CDR1、SEQ ID NO：25之重鏈CDR2、SEQ ID NO：26之重鏈CDR3、SEQ ID NO：28之輕鏈CDR1、SEQ ID NO：29之輕鏈CDR2及SEQ ID NO：30之輕鏈CDR3。
在又一實施例中，特異性針對CEA之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之重鏈可變區序列及與SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之輕鏈可變區序列或其保留功能之變體。
在一實施例中，特異性針對CEA之抗原結合部分包括包含胺基酸序列SEQ ID NO：23之重鏈可變區及包含胺基酸序列SEQ ID NO：27之輕鏈可變區。
在一實施例中，特異性針對CEA之抗原結合部分包括SEQ ID NO：23之重鏈可變區序列及SEQ ID NO：27之輕鏈可變區序列。
在一實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子包括與SEQ ID NO：22至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；與SEQ ID NO：56至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；與SEQ ID NO：57至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；及與SEQ ID NO：58至少約95%、96%、 97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。
多核苷酸
本發明進一步提供編碼如本文所闡述之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸。在一些實施例中，該片段為抗原結合片段。
本發明之多核苷酸包含彼等與以下各項中所述序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致者：SEQ ID NO 63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97及98，包含其功能片段或變體。
編碼本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之多核苷酸可表示為編碼整個T細胞活化雙特異性抗原結合分子之單一多核苷酸或多個(例如兩個或更多個)共表現之多核苷酸。由共表現之多核苷酸編碼之多肽可經由(例如)二硫鍵或其他方式進行締合以形成功能性T細胞活化雙特異性抗原結合分子。例如，抗原結合部分之輕鏈部分可由來自T細胞活化雙特異性抗原結合分子部分之單獨多核苷酸編碼，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子部分包括抗原結合部分之重鏈部分、Fc結構域亞單位及視情況另一抗原結合部分(之一部分)。在共表現時，重鏈多肽將與輕鏈多肽締合形成抗原結合部分。在另一實例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之包括兩個Fc結構域亞單位中之一者及視情況一或多個抗原結合部分(之一部分)的部分可由來自T細胞活化雙特異性抗原結合分子部分之單獨多核苷酸編碼，該T細胞活化雙特異性抗原結合分子部分包括兩個Fc結構域亞單位中之另一者及視情況抗原結合部分(之一部分)。在共表現時，Fc結構域亞單位將締合形成Fc結構域。
在一些實施例中，經分離多核苷酸編碼如本文所闡述之本發明 之整個T細胞活化雙特異性抗原結合分子。在其他實施例中，經分離多核苷酸編碼包括於如本文所闡述之本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子中之多肽。
在另一實施例中，本發明係關於編碼本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸，其中多核苷酸包括編碼如SEQ ID NO3、7、13、17、23、27、31、32、33、34、36、39、41、43、46、47或51中所顯示之可變區序列之序列。在另一實施例中，本發明係關於編碼T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸，其中多核苷酸包括編碼如SEQ ID NO 22、56、57、58、12、53、54及55中所顯示之多肽序列之序列。在另一實施例中，本發明進一步係關於編碼本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸，其中多核苷酸包括與SEQ ID NO63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97或98中所顯示之核苷酸序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之序列。在另一實施例中，本發明係關於編碼本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸，其中多核苷酸包括SEQ ID NO63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97或98中所顯示之核酸序列。在另一實施例中，本發明係關於編碼本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸，其中多核苷酸包括編碼與SEQ ID NO3、7、13、17、23、27、31、32、33、34、36、39、41、43、46、47或51中之胺基酸序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之可變區序列之序列。在另一實施例中，本發明係關於編碼T細胞活化雙特 異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸，其中多核苷酸包括編碼與SEQ ID NO 22、56、57、58、12、53、54或55中之胺基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多肽序列之序列。本發明涵蓋編碼本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸，其中多核苷酸包括編碼具有保守胺基酸取代之可變區序列SEQ ID NO 3、7、13、17、23、27、31、32、33、34、36、39、41、43、46、47或51之序列。本發明亦涵蓋編碼本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之經分離多核苷酸，其中多核苷酸包括編碼具有保守胺基酸取代之多肽序列SEQ ID NO 22、56、57、58、12、53、54或55之序列。
在某些實施例中，多核苷酸或核酸係DNA。在其他實施例中，本發明之多核苷酸係(例如)呈信使RNA(mRNA)形式之RNA。本發明之RNA可為單鏈或雙鏈。
重組方法
本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子可藉由例如固態肽合成(例如Merrifield固相合成)或重組產生來獲得。對於重組產生，將一或多個編碼例如如上文所闡述之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之多核苷酸分離且插入至一或多個載體中以在宿主細胞中進一步選殖及/或表現。可使用習用程序容易地分離該多核苷酸並測序。在一實施例中，提供包括本發明之一或多個多核苷酸之載體、較佳表現載體。可使用彼等熟習此項技術者熟知之方法來構築表現載體，該等表現載體含有T細胞活化雙特異性抗原結合分子之編碼序列以及適宜的轉錄/翻譯控制信號。該等方法包含活體外重組DNA技術、合成技術及活體內重組/遺傳重組。例如，參見闡述於以下文獻中之技術：Maniatis等人，MOLECULAR CLONING：A LABORATORY MANUAL,Cold Spring Harbor Laboratory,N.Y.(1989)；及Ausubel等人，CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY,Greene Publishing Associates and Wiley Interscience,N.Y(1989)。表現載體可為質體、病毒之一部分，或可為核酸片段。表現載體包含表現盒，將編碼T細胞活化雙特異性抗原結合分子(片段)之多核苷酸(即編碼區)經選殖至該表現盒中與啟動子及/或其他轉錄或翻譯控制元件可操作地締合。如本文所使用，「編碼區」係由翻譯成胺基酸之密碼子組成之核酸部分。儘管「終止密碼子」(TAG、TGA或TAA)並不翻譯成胺基酸，但其可視為編碼區之一部分(若存在)，但任何側接序列(例如啟動子、核糖體結合位點、轉錄終止子、內含子、5'及3'非翻譯區及諸如此類)並非編碼區之一部分。兩個或更多個編碼區可存在於單一多核苷酸構築物中(例如位於單一載體上)或單獨多核苷酸構築物中(例如位於單獨(不同)載體上)。此外，任一載體皆可含有單一編碼區，或可包括兩個或更多個編碼區，例如，本發明之載體可編碼一或多種多肽，該一或多種多肽以後翻譯或共翻譯方式經由蛋白水解性裂解分離成最終蛋白質。此外，本發明之載體、多核苷酸或核酸可編碼異源編碼區，該等異源編碼區與編碼本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子(片段)或其變體或衍生物之多核苷酸融合或不融合。異源編碼區包含(但不限於)指定元件或基序，例如分泌信號肽或異源功能結構域。可操作締合係如下情形：以使基因產物之表現處於調控序列之影響或控制下之方式使用於基因產物之編碼區(例如多肽)與一或多個調控序列締合。兩個DNA片段(例如多肽編碼區及與其相關之啟動子)在以下情形下為「可操作地締合」：誘導啟動子功能會引起編碼期望基因產物之mRNA轉錄，且兩個DNA片段間之連接之性質並不干擾表現調控序列引導基因產物表現之能力或干擾DNA模板轉錄之能力。因此，若啟動子能夠實現編碼多肽之核酸之轉錄，則啟動子區域將與該核酸可操作地締合。啟動子可為僅在預定細胞中引導DNA之實質性轉錄之細胞特 異性啟動子。除啟動子外，其他轉錄控制元件(例如增強子、操縱子、抑制子及轉錄終止子信號)可與多核苷酸可操作地締合以引導細胞特異性轉錄。適宜啟動子及其他轉錄控制區揭示於本文中。多種轉錄控制區已為彼等熟習此項技術者所知。該等轉錄控制區包含(但不限於)在脊椎動物細胞中發揮作用之轉錄控制區，例如(但不限於)來自巨細胞病毒(例如立即早期啟動子，與內含子A連結)、猿猴病毒40(例如早期啟動子)及逆轉錄病毒(例如Rous肉瘤病毒)之啟動子及增強子區段。其他轉錄控制區包含彼等衍生自脊椎動物基因者(例如肌動蛋白、熱休克蛋白、牛生長激素及兔â-球蛋白)以及能夠控制真核細胞中之基因表現之其他序列。其他適宜轉錄控制區包含組織特異性啟動子及增強子以及誘導型啟動子(例如四環素誘導型啟動子)。相似地，多種翻譯控制元件已為彼等熟習此項技術者所知。該等翻譯控制元件包含(但不限於)核糖體結合位點、翻譯起始及終止密碼子以及衍生自病毒系統之元件(尤其內部核糖體進入位點或IRES，亦稱為CITE序列)。表現盒亦可包含其他特徵，例如複製起點及/或染色體整合元件(例如逆轉錄病毒長末端重複(LTR)或腺相關病毒(AAV)反轉末端重複(ITR))。
本發明之多核苷酸及核酸編碼區可與編碼引導由本發明多核苷酸編碼之多肽分泌之分泌肽或信號肽的其他編碼區締合。例如，若T細胞活化雙特異性抗原結合分子之分泌合意，則可將編碼信號序列之DNA置於編碼本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之核酸上游。根據信號假說，由哺乳動物細胞分泌之蛋白質具有信號肽或分泌前導序列，一旦在粗糙內質網中輸出生長蛋白鏈，則該信號肽或分泌前導序列自成熟蛋白質裂解。彼等熟習此項技術者應瞭解，由脊椎動物細胞分泌之多肽通常具有融合至多肽之N末端之信號肽，該信號肽自翻譯之多肽裂解產生分泌或「成熟」形式之多肽。在某些實 施例中，使用天然信號肽(例如免疫球蛋白重鏈或輕鏈信號肽)，或該序列之保留引導與其可操作地締合之多肽分泌能力的功能性衍生物。另一選擇為，可使用異源哺乳動物信號肽或其功能衍生物。例如，野生型前導序列可經人類組織纖維蛋白溶酶原活化劑(TPA)或小鼠β-醛糖酸化合物酶之前導序列取代。分泌信號肽之實例性胺基酸及多核苷酸序列於SEQ ID NO 108-116中給出。
在編碼多核苷酸之T細胞活化雙特異性抗原結合分子(片段)之內部或末端處可包含編碼短蛋白質序列之DNA，該短蛋白質序列可用於促進後續純化(例如組胺酸標籤)或幫助標記T細胞活化雙特異性抗原結合分子。
在又一實施例中，提供包括本發明之一或多個多核苷酸之宿主細胞。在某些實施例中，提供包括本發明之一或多個載體之宿主細胞。多核苷酸及載體可單獨或以組合納入本文所闡述分別與多核苷酸及載體相關之任一特徵中。在一該實施例中，宿主細胞包括包含編碼本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子(之一部分)的多核苷酸之載體(例如已經其轉化或轉染)。如本文所使用，術語「宿主細胞」係指可經改造以產生本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段之任一類細胞系統。適於複製T細胞活化雙特異性抗原結合分子且支持其表現之宿主細胞已為業內所熟知。該等細胞可視需要經具體表現載體轉染或轉導，且可使大量含有載體之細胞生長用於大規模發酵罐接種以獲得足量用於臨床應用之T細胞活化雙特異性抗原結合分子。適宜宿主細胞包含原核微生物(例如大腸桿菌)或各種真核細胞(例如中國倉鼠卵巢細胞(CHO)、昆蟲細胞或諸如此類)。例如，多肽可在細菌中產生，尤其在不需要糖基化時產生。表現後，多肽可以可溶性部分形式自細菌細胞團分離且可進一步純化。除原核生物外，真核微生物(例如絲狀真菌或酵母菌)係適用於編碼多肽之載體之選殖或表現宿 主，包含糖基化途徑已經「人類化」以產生具有部分或完全人類糖基化模式之多肽之真菌及酵母菌菌株。參見Gerngross,Nat Biotech 22,1409-1414(2004)及Li等人，Nat Biotech 24,210-215(2006)。適用於多肽表現(糖基化)之宿主細胞亦衍生自多細胞有機體(無脊椎動物及脊椎動物)。無脊椎動物細胞之實例包含植物及昆蟲細胞。已鑒定多種桿狀病毒株可與昆蟲細胞聯合使用，尤其用於轉染草地貪夜蛾(Spodoptera frugiperda)細胞。亦可利用植物細胞培養物作為宿主。例如，參見美國專利第5,959,177號、第6,040,498號、第6,420,548號、第7,125,978號及第6,417,429號(闡述用於在轉基因植物中產生抗體之PLANTIBODIESTM技術)。亦可使用脊椎動物細胞作為宿主。例如，可使用適於懸浮液生長之哺乳動物細胞系。有用哺乳動物宿主細胞系之其他實例係經SV40轉化之猴腎CV1細胞系(COS-7)、人類胚腎細胞系(293或293T細胞，如(例如)Graham等人，J Gen Virol 36,59(1977)中所闡述)、幼倉鼠腎細胞(BHK)、小鼠支持細胞(TM4細胞，如(例如)Mather,Biol Reprod 23,243-251(1980)中所闡述)、猴腎細胞(CV1)、非洲綠猴腎細胞(VERO-76)、人類子宮頸上皮癌細胞(HELA)、犬腎細胞(MDCK)、布法羅大鼠(buffalo rat)肝細胞(BRL 3A)、人類肺細胞(W138)、人類肝細胞(Hep G2)、小鼠乳房腫瘤細胞(MMT 060562)、TRI細胞(如(例如)Mather等人，Annals N.Y.Acad Sci 383,44-68(1982)中所闡述)、MRC5細胞及FS4細胞。其他有用哺乳動物宿主細胞系包含中國倉鼠卵巢(CHO)細胞，包含dhfr- CHO細胞(Urlaub等人，Proc Natl Acad Sci USA 77,4216(1980))；及骨髓瘤細胞系，例如YO、NS0、P3X63及Sp2/0。關於適於蛋白質產生之某些哺乳動物宿主細胞系之綜述參見例如Yazaki及Wu，Methods in Molecular Biology，第248卷(B.K.C.Lo編輯，Humana Press,Totowa,NJ)，第255-268頁(2003)。宿主細胞包含培養細胞(僅舉幾個為例，例如哺乳 動物培養細胞、酵母菌細胞、昆蟲細胞、細菌細胞及植物細胞)，但亦包含包括於轉基因動物、轉基因植物或培養植物或動物組織內之細胞。在一實施例中，宿主細胞係真核細胞、較佳哺乳動物細胞，例如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞、人類胚胎腎(HEK)細胞或淋巴細胞(例如，Y0、NS0、Sp20細胞)。
業內已知在該等系統中表現外源基因之標準技術。表現包括抗原結合結構域(例如抗體)之重鏈或輕鏈之多肽之細胞可經改造以亦表現其他抗體鏈，以使得所表現產物係具有重鏈及輕鏈二者之抗體。
在一實施例中，提供產生本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之方法，其中該方法包括在適於表現T細胞活化雙特異性抗原結合分子之條件下培養包括編碼如本文所提供之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之多核苷酸的宿主細胞，及自宿主細胞(或宿主細胞培養基)回收T細胞活化雙特異性抗原結合分子。
將T細胞活化雙特異性抗原結合分子之組份以遺傳方式彼此融合。T細胞活化雙特異性抗原結合分子可經設計以使其組份直接彼此融合或經由連接體序列間接融合。連接體之組成及長度可根據業內熟知之方法確定且可測試其功效。T細胞活化雙特異性抗原結合分子之不同組份間之連接體序列的實例參見本文所提供之序列。若需要，亦可包含其他序列(例如內肽酶識別序列)以納入裂解位點來分離融合物之個別組份。
在某些實施例中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之一或多個抗原結合部分包括至少一個能夠結合抗原決定簇之抗體可變區。可變區可形成天然或非天然抗體及其片段之一部分且衍生自該等天然或非天然抗體及其片段。產生多株抗體及單株抗體之方法為業內所熟知(例如，參見Harlow及Lane，「Antibodies,a laboratory manual」,Cold Spring Harbor Laboratory,1988)。非天然抗體可使用固相肽合成來構 築，可以重組方式產生(例如，如美國專利第4,186,567號中所闡述)或可藉由(例如)篩選包括可變重鏈及可變輕鏈之組合文庫來獲得(例如，參見頒予McCafferty之美國專利第5,969,108號)。
在本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子中可使用抗體、抗體片段、抗原結合結構域或可變區之任何動物種類。可用於本發明中之非限制性抗體、抗體片段、抗原結合結構域或可變區可來自鼠類、靈長類動物或人類來源。若T細胞活化雙特異性抗原結合分子意欲用於人類用途，則可使用抗體之嵌合形式，其中抗體恆定區來自人類。人類化或完全人類形式之抗體亦可根據業內熟知之方法來製備(例如，參見頒予Winter之美國專利第5,565,332號)。可藉由多種方法來達成人類化，包含(但不限於)(a)將非人類(例如，供體抗體)CDR移植至保留或不保留關鍵框架殘基之人類(例如接受者抗體)框架及恆定區(例如彼等對於保留良好抗原結合親和力或抗體功能至關重要者)，(b)僅將非人類特異性決定區(SDR或a-CDR；對於抗體-抗原相互作用較為關鍵之殘基)移植至人類框架及恆定區上，或(c)移植整個非人類可變結構域，但使用人類樣部分藉由置換表面殘基將其「覆蓋」。人類化抗體及其製備方法綜述於(例如)Almagro及Fransson，Front Biosci 13,1619-1633(2008)中，且進一步闡述於(例如)以下文獻中：Riechmann等人，Nature 332,323-329(1988)；Queen等人，Proc Natl Acad Sci USA 86,10029-10033(1989)；美國專利第5,821,337號、第7,527,791號、第6,982,321號及第7,087,409號；Jones等人，Nature 321,522-525(1986)；Morrison等人，Proc Natl Acad Sci 81,6851-6855(1984)；Morrison及Oi，Adv Immunol 44,65-92(1988)；Verhoeyen等人，Science 239,1534-1536(1988)；Padlan,Molec Immun 31(3),169-217(1994)；Kashmiri等人，Methods 36,25-34(2005)(闡述SDR(a-CDR)移植)；Padlan,Mol Immunol 28,489-498 (1991)(闡述「表面重修」)；Dall’Acqua等人，Methods 36,43-60(2005)(闡述「FR穿梭」)；以及Osbourn等人，Methods 36,61-68(2005)及Klimka等人，Br J Cancer 83,252-260(2000)(闡述FR穿梭之「導向選擇」方式)。可使用業內已知之各種技術產生人類抗體及人類可變區。人類抗體概述於van Dijk及van de Winkel，Curr Opin Pharmacol 5,368-74(2001)及Lonberg,Curr Opin Immunol 20,450-459(2008)中。人類可變區可形成藉由雜交瘤方法製得之人類單株抗體之一部分且衍生自該人類單株抗體(例如，參見Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications，第51-63頁(Marcel Dekker公司，New York,1987))。亦可藉由以下方式來製備人類抗體及人類可變區：將免疫原投與已進行修飾而因應抗原激發產生具有人類可變區之完整人類抗體或完整抗體之轉基因動物(例如，參見Lonberg,Nat Biotech 23,1117-1125(2005))。亦可藉由分離選自源自人類之噬菌體展示文庫之Fv純系可變區序列來產生人類抗體及人類可變區(例如，參見Hoogenboom等人，Methods in Molecular Biology 178,1-37(O，Brien等人編輯，Human Press,Totowa,NJ,2001)；及McCafferty等人，Nature 348,552-554；Clackson等人，Nature 352,624-628(1991))。噬菌體通常展示呈單鏈Fv(scFv)片段或呈Fab片段之抗體片段。
在某些實施例中，根據(例如)美國專利申請公開案第2004/0132066號(其全部內容以引用方式併入本文中)中所揭示之方法，改造可用於本發明中之抗原結合部分以具有增強的結合親和力。本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子結合特異性抗原決定簇之能力可經由酶聯免疫吸附分析(ELISA)或熟習此項技術者熟知之其他技術(例如表面電漿子共振技術(在BIACORE T100系統上分析)(Liljeblad等人，Glyco J 17,323-329(2000))及傳統結合分析(Heeley, Endocr Res 28,217-229(2002)))來量測。可使用競爭分析來鑒定與參考抗體競爭結合具體抗原之抗體、抗體片段、抗原結合結構域或可變結構域，例如與V9抗體競爭結合CD3之抗體。在某些實施例中，該競爭抗體結合至參考抗體所結合之相同表位(例如線性或構象表位)。定位抗體所結合之表位之詳細實例性方法提供於Morris(1996)「Epitope Mapping Protocols」,Methods in Molecular Biology第66卷(Humana Press,Totowa,NJ)中。在實例性競爭分析中，將固定抗原(例如CD3)在如下溶液中培育：其包括結合至抗原之第一經標記抗體(例如V9抗體，闡述於US 6,054,297中)及第二未經標記抗體(測試其與第一抗體競爭結合抗原之能力)。第二抗體可存在於雜交瘤上清液中。作為對照，在包括第一經標記抗體但不包括第二未經標記抗體之溶液中培育固定抗原。在允許第一抗體結合至抗原之條件下培育後，去除過量未結合抗體，且量測與固定抗原締合之標記的量。若在測試樣品中與固定抗原締合之標記之量相對於對照樣品實質上有所減小，則此表明第二抗體與第一抗體競爭結合抗原。參見Harlow及Lane(1988)Antibodies：A Laboratory Manual ch.14(Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY)。
如本文所闡述製備之T細胞活化雙特異性抗原結合分子可藉由業內已知之技術來純化，例如高效液相層析、離子交換層析、凝膠電泳、親和層析、粒徑排阻層析及諸如此類。用於純化具體蛋白質之實際條件部分地端視諸如靜電荷、疏水性、親水性等因素而定，且為彼等熟習此項技術者所明瞭。對於親和層析純化而言，可使用結合T細胞活化雙特異性抗原結合分子之抗體、配體、受體或抗原。例如，對於本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之親和層析純化，可使用具有蛋白質A或蛋白質G之基質。可依序使用蛋白質A或G親和層析及粒徑排阻層析來分離基本上如實例中所闡述之T細胞活化雙特異性抗 原結合分子。可藉由各種熟知分析方法中之任一者來測定T細胞活化雙特異性抗原結合分子之純度，包含凝膠電泳、高壓液相層析及諸如此類。例如，如實例中所闡述表現之重鏈融合蛋白顯示為完整蛋白質且進行適當組裝，如藉由還原SDS-PAGE所展示(例如，參見圖4)。三條帶解析為約Mr 25,000、Mr 50,000及Mr 75,000，此對應於T細胞活化雙特異性抗原結合分子輕鏈、重鏈及重鏈/輕鏈融合蛋白之預測分子量。
分析
本文所提供之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之物理/化學性質及/或生物活性可藉由業內已知之各種分析來鑒定、篩選或表徵。
親和力分析
T細胞活化雙特異性抗原結合分子對Fc受體或靶抗原之親和力可根據實例中所述方法藉由表面電漿子共振(SPR)使用標準儀器(例如BIAcore儀器(GE Healthcare))及諸如可藉由重組表現獲得之受體或靶蛋白來測定。另一選擇為，T細胞活化雙特異性抗原結合分子對不同受體或靶抗原之結合可使用表現具體受體或靶抗原之細胞系藉由例如流式細胞術(FACS)來評估。用於量測結合親和力之特定說明性及實例性實施例闡述於下文及下列實例中。
根據一實施例，KD係在25℃下使用BIACORE® T100機器(GE Healthcare)藉由表面電漿子共振來量測。
為分析Fc部分與Fc受體之間之相互作用，藉由固定在CM5晶片上之抗五His抗體(Qiagen)捕獲His標記之重組Fc受體，且使用雙特異性構築物作為分析物。簡言之，根據供應商之說明書，使用N-乙基-N’-(3-二甲基胺基丙基)-碳化二亞胺鹽酸鹽(EDC)及N-羥基琥珀醯亞胺(NHS)來活化羧甲基化葡聚糖生物感測器晶片(CM5,GE Healthcare)。使用10mM乙酸鈉(pH 5.0)將抗五His抗體稀釋至40μg/ml，然後以5 μl/min之流速注射以達成約6500個反應單位(RU)之偶合蛋白。注射配體後，注射1M乙醇胺來封阻未反應之基團。隨後，在4nM或10nM下經60s捕獲Fc受體。對於動力學量測，在25℃下在HBS-EP(GE Healthcare，10mM HEPES、150mM NaCl、3mM EDTA、0.05%表面活性劑P20，pH 7.4)中以30μl/min之流速經120s注射雙特異性構築物之四倍連續稀釋物(範圍介於500nM與4000nM之間)。
為測定對靶抗原之親和力，藉由固定在如針對抗五His抗體所闡述之活化CM5感測器晶片表面上之抗人類Fab特定抗體(GE Healthcare)來捕獲雙特異性構築物。偶合蛋白質之最終量為約12000RU。在300nM下經90s捕獲雙特異性構築物。使靶抗原在250nM至1000nM之濃度範圍下以30μl/min之流速經180s通過流動細胞。經180s監測解離。
藉由減去對參考流動細胞獲得之反應來校正本體折射率差異。藉由Langmuir結合等溫線之非線性曲線擬合使用穩態反應來衍生出解離常數KD。使用簡單一對一Langmuir結合模型(BIACORE® T100評估軟體1.1.1版)藉由同時擬合締合與解離感測圖來計算締合速率(k締合)及解離速率(k解離)。以比率k解離/k締合之形式來計算平衡解離常數(KD).例如，參見Chen等人，J.Mol Biol 293,865-881(1999)。
活性分析
本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之生物活性可藉由多種如實例中所闡述之分析來量測。生物活性可包含例如誘導T細胞之增殖、誘導T細胞中之信號傳導、誘導活化標記在T細胞中之表現、誘導藉助T細胞之細胞介素分泌、誘導諸如腫瘤細胞等靶細胞之溶解及誘導腫瘤消退及/或改良存活率。
組合物、調配物及投與途徑
在又一態樣中，本發明提供(例如)用於以下治療方法中之任一者 之醫藥組合物，其包括本文所提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子中之任一者。在一實施例中，醫藥組合物包括本文所提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子中之任一者及醫藥上可接受之載劑。在另一實施例中，醫藥組合物包括本文所提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子中之任一者及至少一種其他治療劑(例如如下文所闡述)。
本文進一步提供產生呈適於活體內投與形式之本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之方法，該方法包括(a)獲得本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，及(b)調配T細胞活化雙特異性抗原結合分子與至少一種醫藥上可接受之載劑，其中T細胞活化雙特異性抗原結合分子之製劑經調配用於活體內投與。
本發明之醫藥組合物包括治療有效量之一或多種溶解或分散於醫藥上可接受之載劑中的T細胞活化雙特異性抗原結合分子。片語「醫藥或藥理上可接受」係指如下分子實體及組合物：在視需要投與諸如人類等動物時在所採用劑量及濃度下通常對接受者無毒、即並不產生不利、過敏或其他不適反應。彼等熟習此項技術者根據本發明已知含有至少一種T細胞活化雙特異性抗原結合分子及視情況其他活性成份之醫藥組合物之製備，如藉由Remington's Pharmaceutical Sciences，第18版，Mack Printing公司，1990(以引用方式併入本文中)所例示。此外，對於動物(例如，人類)投與而言，應理解，製劑應符合FDA Office of Biological Standards或其他國家中之相應當局所要求之無菌性、熱原性、一般安全性及純度標準。較佳組合物係凍乾調配物或水溶液。如本文所使用，術語「醫藥上可接受之載劑」包含如熟習此項技術者已知之任一及所有溶劑、緩衝液、分散介質、包衣、表面活性劑、抗氧化劑、防腐劑(例如，抗細菌劑、抗真菌劑)、等滲劑、吸收延遲劑、鹽、防腐劑、抗氧化劑、蛋白質、藥物、藥物穩定劑、聚合物、凝膠、黏合劑、賦形劑、崩解劑、潤滑劑、甜味劑、矯 味劑、染料、該等類似材料及其組合(例如，參見Remington's Pharmaceutical Sciences，第18版，Mack Printing公司，1990，第1289頁-1329頁，其以引用方式併入本文中)。除任何與活性成份不相容之習用載劑外，本發明涵蓋其於治療或醫藥組合物中之使用。
端視組合物欲以固體、液體抑或氣溶膠形式投與及組合物是否需要無菌來以注射形式用於該等投與途徑，組合物可包括不同類型之載劑。本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子(及任一其他治療劑)可以熟習此項技術者已知之以下方法投與：靜脈內、皮內、動脈內、腹膜內、病灶內、顱內、關節內、前列腺內、脾內、腎內、胸膜內、氣管內、鼻內、玻璃體內、陰道內、直腸內、瘤內、肌內、腹膜內、皮下、結膜下、胞膜內、經黏膜、心包內、臍內、眼內、經口、經局部(topically、locally)、藉由吸入(例如氣溶膠吸入)、注射、輸注、連續輸注、直接局部灌注浸浴靶細胞、經由導管、經由灌洗、乳霜、脂質組合物(例如脂質體)或藉由其他方法或上述方法之任一組合(例如，參見Remington's Pharmaceutical Sciences，第18版，Mack Printing公司，1990，其以引用方式併入本文中)。非經腸投與、尤其靜脈內注射最常用於投與諸如本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子等多肽分子。
非經腸組合物包含彼等經設計用於藉由注射投與者，例如皮下、皮內、病灶內、靜脈內、動脈內、肌內、鞘內或腹膜內注射。對於注射而言，本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子可在水溶液中進行調配，較佳在諸如漢克氏溶液(Hanks' solution)、林格氏溶液(Ringer's solution)或生理鹽水緩衝液等生理上相容之緩衝液中進行調配。該溶液可含有諸如懸浮劑、穩定劑及/或分散劑等調配劑。另一選擇為，T細胞活化雙特異性抗原結合分子可呈粉末形式，以在使用前用適宜媒劑(例如無菌無熱原水)構造。藉由將所需量之本發明T細 胞活化雙特異性抗原結合分子與(視需要)下文所列舉之各種其他成份一起納入適當溶劑中來製備無菌可注射溶液。無菌性可藉由(例如)無菌過濾膜過濾來容易地達成。通常，分散液係藉由將各種經滅菌活性成份納入含有基本分散介質及/或其他成份之無菌媒劑中來製備。在用於製備無菌可注射溶液、懸浮液或乳液之無菌粉末之情形下，較佳製備方法為真空乾燥或冷凍乾燥技術，其自先前經無菌過濾之液體介質產生活性成份及任何其他期望成份之粉末。液體介質(若需要)應經適當緩衝，且液體稀釋劑首先在注射之前使用足夠鹽水或葡萄糖調節為等滲。組合物在製造及存儲條件下必須穩定，且必須防止受到諸如細菌及真菌等微生物之污染作用。應瞭解，內毒素污染應在最小程度上保持在安全量，例如小於0.5ng/mg蛋白質。適宜的醫藥上可接受之載劑包含(但不限於)：緩衝液，例如磷酸鹽、檸檬酸鹽及其他有機酸；抗氧化劑，包含抗壞血酸及甲硫胺酸；防腐劑(例如十八烷基二甲基苄基氯化銨；氯化六甲雙銨；氯苄烷銨；氯化苯銨松寧(benzethonium chloride)；苯酚；丁醇或苄醇；對羥基苯甲酸烷基酯，例如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯；兒茶酚；間苯二酚；環己醇；3-戊醇；及間甲酚)；低分子量(少於約10個殘基)多肽；蛋白質，例如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白；親水性聚合物，例如聚乙烯吡咯啶酮；胺基酸，例如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺、組胺酸、精胺酸或離胺酸；單糖、二糖及其他碳水化合物，包含葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合劑，例如EDTA；糖，例如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨醇；鹽形成抗衡離子，例如鈉；金屬錯合物(例如Zn-蛋白質錯合物)；及/或非離子型表面活性劑，例如聚乙二醇(PEG)。水性注射懸浮液可含有增加懸浮液黏度之化合物，例如羧甲基纖維素鈉、山梨醇、葡聚糖或諸如此類。視情況，懸浮液亦可含有適宜穩定劑或增加該等化合物之溶解度的試劑，以容許製備高濃度溶液。此外，活性化 合物之懸浮液可製備成適宜的油性注射懸浮液。適宜親脂性溶劑或媒劑包含脂肪油(例如芝麻油)或合成脂肪酸酯(例如油酸乙酯或三酸甘油酯)或脂質體。
活性成份亦可分別裝入藉由(例如)凝聚技術或介面聚合製備之微膠囊(例如，羥甲基纖維素或明膠微膠囊及聚-(甲基丙烯酸甲酯)微膠囊)中、膠質藥物遞送系統(例如，脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米粒子及奈米膠囊)或粗滴乳液中。該等技術揭示於Remington's Pharmaceutical Sciences(第18版，Mack Printing公司，1990)中。亦可製備持續釋放製劑。持續釋放製劑之適宜實例包含含有多肽之固體疏水性聚合物之半透性基質，該等基質係呈成形物件形式，例如膜或微膠囊。在具體實施例中，可藉由在組合物中使用延遲吸收之藥劑(例如，單硬脂酸鋁、明膠或其組合)來延長吸收可注射組合物。
除先前所闡述之組合物外，T細胞活化雙特異性抗原結合分子亦可調配成儲積製劑。該等長效調配物可藉由植入(例如，經皮下或肌內)或藉由肌內注射投與。因此，例如，T細胞活化雙特異性抗原結合分子可使用適宜聚合或疏水性材料(例如作為於可接受油中之乳液)或離子交換樹脂來調配，或作為微溶衍生物(例如，微溶鹽)來調配。
包括本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子之醫藥組合物可藉助習用混合、溶解、乳化、囊封、包埋或凍乾製程來製造。醫藥組合物可以習用方式使用一或多種生理上可接受且幫助將蛋白質處理成可用於醫藥之製劑的載劑、稀釋劑、賦形劑或輔助劑加以調配。適宜調配物端視所選投與途徑而定。
T細胞活化雙特異性抗原結合分子可調配成呈游離酸或鹼、中性或鹽形式之組合物。醫藥上可接受之鹽係實質上保留游離酸或鹼之生物活性之鹽。該等鹽包含酸加成鹽，例如，彼等使用蛋白組合物之游離胺基形成者，或使用無機酸(例如，鹽酸或磷酸)或有機酸(例如，乙 酸、草酸、酒石酸或苦杏仁酸)形成者。使用游離羧基形成之鹽亦可衍生自諸如氫氧化鈉、氫氧化鉀、氫氧化銨、氫氧化鈣或氫氧化鐵等無機鹼或諸如異丙胺、三甲胺、組胺酸或普魯卡因(procaine)等有機鹼。醫藥鹽往往比相應游離鹼形式更易溶於水性及其他質子溶劑中。
治療方法及組合物
本文所提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子中任一者皆可用於治療性方法中。可使用本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子作為例如癌症治療中之免疫治療劑。
為用於治療方法中，以與良好醫學實踐一致之方式來調配、投用及投與本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子。在此上下文中需考慮之因素包含所治療之具體病症、所治療之具體哺乳動物、個體患者之臨床病況、病因、藥劑之遞送位點、投與方法、投與時間安排及從業醫師所知之其他因素。
在一態樣中，提供本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子用作藥劑。在其他態樣中，提供本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子用於治療疾病。在某些實施例中，提供本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子用於治療方法中。在一實施例中，本發明提供如本文所闡述之T細胞活化雙特異性抗原結合分子用於治療有需要之個體之疾病。在某些實施例中，本發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子用於治療患有疾病之個體之方法中，該方法包括向個體投與治療有效量之T細胞活化雙特異性抗原結合分子。在某些實施例中，欲治療之疾病係增殖性病症。在具體實施例中，該疾病係癌症。在某些實施例中，該方法進一步包括向個體投與治療有效量之至少一種其他治療劑(例如，若欲治療之疾病係癌症，則該其他治療劑為抗癌劑)。在其他實施例中，本發明提供如本文所闡述之T細胞活化雙特異性抗原結合分子用於誘導靶細胞、尤其腫瘤細胞溶解。在某些實施例中，本 發明提供T細胞活化雙特異性抗原結合分子用於誘導個體之靶細胞、尤其腫瘤細胞溶解之方法中，該方法包括向個體投與有效量之T細胞活化雙特異性抗原結合分子以誘導靶細胞溶解。根據上述實施例中任一者之「個體」係哺乳動物，較佳係人類。
在又一態樣中，本發明提供本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子在製造或製備藥劑中之用途。在一實施例中，藥劑用於治療有需要之個體之疾病。在又一實施例中，藥劑用於治療疾病之方法中，該方法包括向患有疾病之個體投與治療有效量之藥劑。在某些實施例中，欲治療之疾病係增殖性病症。在具體實施例中，該疾病係癌症。在一實施例中，該方法進一步包括該個體投與治療有效量之至少一種其他治療劑(例如，該欲治療之疾病係癌症，則該其他治療劑為抗癌劑)。在又一實施例中，藥劑用於誘導靶細胞、尤其腫瘤細胞溶解。在又一實施例中，藥劑用於誘導個體之靶細胞、尤其腫瘤細胞溶解之方法中，該方法包括向個體投與有效量之藥劑以誘導靶細胞溶解。根據上述實施例中任一者之「個體」係哺乳動物，較佳係人類。
在又一樣中，本發明提供治療疾病之方法。在一實施例中，該方法包括向患有該疾病之個體投與治療有效量之本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子。在一實施例中，向該個體投與組合物，該組合物包括呈醫藥上可接受形式之本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子。在某些實施例中，欲治療之疾病係增殖性病症。在具體實施例中，該疾病係癌症。在某些實施例中，該方法進一步包括向個體投與治療有效量之至少一種其他治療劑(例如，若欲治療之疾病係癌症，則該其他治療劑為抗癌劑)。根據上述實施例中任一者之「個體」係哺乳動物，較佳係人類。
在又一態樣中，本發明提供用於誘導靶細胞、尤其腫瘤細胞溶解之方法。在一實施例中，該方法包括使靶細胞與本發明之T細胞活 化雙特異性抗原結合分子在T細胞、尤其細胞毒性T細胞存在下接觸。在又一態樣中，提供誘導個體之靶細胞、尤其腫瘤細胞溶解之方法。在一該實施例中，該方法包括向個體投與有效量之T細胞活化雙特異性抗原結合分子以誘導靶細胞溶解。在一實施例中，「個體」係人類。
在某些實施例中，欲治療之疾病係增殖性病症，尤其係癌症。癌症之非限制性實例包含膀胱癌、腦癌、頭頸癌、胰臟癌、肺癌、乳癌、卵巢癌、子宮癌、子宮頸癌、子宮內膜癌、食道癌、結腸癌、結腸直腸癌、直腸癌、胃癌、前列腺癌、血癌、皮膚癌、鱗狀細胞上皮癌、骨癌及腎癌。可使用本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子治療之其他細胞增殖病症包含(但不限於)位於以下各項中之贅瘤：腹部、骨、乳腺、消化系統、肝、胰臟、腹膜、內分泌腺(腎上腺、副甲狀腺、垂體、睪丸、卵巢、胸腺、甲狀腺)、眼、頭頸、神經系統(中樞及周圍)、淋巴系統、骨盆、皮膚、軟組織、脾、胸腔區及泌尿生殖系統。亦包含癌前期病況或病灶及癌症轉移。在某些實施例中，癌症係選自由以下組成之群：腎細胞癌、皮膚癌、肺癌、結腸直腸癌、乳癌、腦癌、頭頸癌。熟習此項技術者容易地意識到，在許多情形下，T細胞活化雙特異性抗原結合分子可不提供治癒益處，而僅可提供部分益處。在一些實施例中，具有一些益處之生理學變化亦視為治療上有益的。因此，在一些實施例中，將T細胞活化雙特異性抗原結合分子之提供生理學變化之量視為「有效量」或「治療有效量」。需要治療之個體(subject、individual)或患者通常係哺乳動物，更特定係人類。
在一些實施例中，向細胞投與有效量之本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子。在其他實施例中，向個體投與治療有效量之本發明T細胞活化雙特異性抗原結合分子來治療疾病。
為預防或治療疾病，本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之適宜劑量(在單獨使用或與一或多種其他治療劑組合使用時)將端視以下因素而定：欲治療疾病之類型、投與途徑、患者之體重、T細胞活化雙特異性抗原結合分子之類型、疾病之嚴重程度及病程、投與T細胞活化雙特異性抗原結合分子係用於預防目的抑或治療目的、先前或同時之治療干預、患者之臨床病史及對於T細胞活化雙特異性抗原結合分子之反應以及主治醫師之決定。在任一情形下，負責投與之執業醫師將決定組合物中活性成份之濃度及用於各個體之適當劑量。本文涵蓋各種投藥方案，包含(但不限於)在不同時間點單次或多次投與、濃注投與及脈衝輸注。
T細胞活化雙特異性抗原結合分子係一次性或經一系列治療適宜地投與患者。端視疾病之類型及嚴重程度，無論(例如)藉由一或多次單獨投與抑或藉由連續輸注，投與患者之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之初始候選劑量為約1μg/kg至15mg/kg(例如0.1mg/kg-10mg/kg)。一種典型日劑量可介於約1μg/kg至100mg/kg範圍內或更高，此端視上文所提及因素而定。在經若干天或更長時間重複投與時，端視病況，治療通常持續至對疾病症狀之期望阻抑出現為止。T細胞活化雙特異性抗原結合分子之一實例性劑量將介於約0.005mg/kg至約10mg/kg範圍內。在其他非限制性實例中，每次投與之劑量亦可包括約1微克/kg體重、約5微克/kg體重、約10微克/kg體重、約50微克/kg體重、約100微克/kg體重、約200微克/kg體重、約350微克/kg體重、約500微克/kg體重、約1毫克/kg體重、約5毫克/kg體重、約10毫克/kg體重、約50毫克/kg體重、約100毫克/kg體重、約200毫克/kg體重、約350毫克/kg體重、約500毫克/kg體重至約1000mg/kg體重或更高及其中衍生之任一範圍。在來自本文所列示數值之衍生範圍之非限制性實例中，基於上文所闡述之數值，可投與約5mg/kg體重至約100 mg/kg體重、約5微克/kg體重至約500毫克/kg體重等之範圍。因此，可向患者投與一或多個約0.5mg/kg、2.0mg/kg、5.0mg/kg或10mg/kg(或其任一組合)之劑量。該等劑量可間歇性投與，例如每週一次或每三週一次(例如，以使患者接受約2個至約20個或例如約6個劑量之T細胞活化雙特異性抗原結合分子)。可在開始時投與較高負荷劑量，隨後投與一或多個較低劑量。然而，可使用其他劑量方案。此療法之進展可容易地藉由習用技術及分析來監測。
本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子通常將以有效達成預定目的之量來使用。為用於治療或預防病況，以治療有效量投與或施加本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其醫藥組合物。治療有效量之確定為彼等熟習此項技術者所熟知，尤其可根據本文所提供之詳細揭示內容來確定。
對於全身性投與，最初可自活體外分析(例如細胞培養分析)來估計治療有效劑量。然後可將劑量調配用於動物模型中以達成包含如在細胞培養物中測定之IC50之循環濃度範圍。該資訊可用於更準確地確定可供人類使用之劑量。
亦可自活體內數據(例如，動物模型)使用業內熟知之技術來估計初始劑量。熟習此項技術者容易地基於動物數據來最佳化在人類中之投與。
可個別地調節劑量量及間隔以提供足以維持治療效應之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之血漿濃度。用於藉由注射投與之常用患者劑量介於約0.1mg/kg/日至50mg/kg/日、通常約0.5mg/kg/日至1mg/kg/日範圍內。可藉由每天投與多個劑量來達成治療有效之血漿濃度。可藉由(例如)HPLC來量測血漿濃度。
在局部投與或選擇性攝取之情形下，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之有效局部濃度可與血漿濃度無關。熟習此項技術者能夠無需 過多實驗即最佳化治療上有效之局部劑量。
本文所闡述T細胞活化雙特異性抗原結合分子之治療有效劑量通常將在不引起大量毒性的情況下提供治療益處。在細胞培養物或實驗動物中，T細胞活化雙特異性抗原結合分子之毒性及治療功效可藉由標準醫藥程序來測定。可使用細胞培養分析及動物研究來測定LD50(對50%群體致死之劑量)及ED50(對50%群體治療有效之劑量)。毒性與治療效應之間之劑量比率即為治療指數，其可表示為比率LD50/ED50。展現大治療指數之T細胞活化雙特異性抗原結合分子較佳。在一實施例中，本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子展現高治療指數。自細胞培養分析及動物研究獲得之數據可用於調配適用於人類之劑量範圍。該劑量較佳地在具有極低毒性或無毒性之循環濃度(包含ED50)的範圍內。該劑量端視例如以下各種因素可在此範圍內有所變化：所採用劑型、所利用之投與途徑、個體之病況及諸如此類。實際調配物、投與途徑及劑量可由個別醫師根據患者之病況來選擇(例如，參見Fingl等人，1975，The Pharmacological Basis of Therapeutics，第1章，第1頁，其全文以引用方式併入本文中)。
經本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子治療之患者之主治醫師將知曉因毒性、器官功能障礙及諸如此類而終止、中斷或調節投與之方式及時間。反之，若臨床反應不夠(排除毒性)，則主治醫師亦應知曉將治療調節至更高程度。在所關注病症之管控中所投與劑量之數量級應隨欲治療病況之嚴重程度、投與途徑及諸如此類而變化。例如，病況之嚴重程度可部分地藉由標準預後評估方法來評估。此外，該劑量及(可能)劑量頻率亦應根據個體患者之年齡、體重及反應來變化。
其他藥劑及治療
本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子可於療法中與一或多 種其他藥劑組合投與。例如，本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子可與至少一種其他治療劑共投與。術語「治療劑」涵蓋經投與治療需要該治療之個體之症狀或疾病之任一藥劑。該其他治療劑可包括適用於所治療具體適應症之任一活性成份，較佳係具有並不對彼此造成不利影響之互補活性之彼等。在某些實施例中，其他治療劑係免疫調節劑、細胞生長抑制劑、細胞黏著抑制劑、細胞毒性劑、細胞凋亡活化劑或增加細胞對細胞凋亡誘導劑之敏感性之藥劑。在具體實施例中，其他治療劑係抗癌劑，例如微管干擾劑、抗代謝物、拓撲異構酶抑制劑、DNA嵌入劑、烷基化劑、激素療法、激酶抑制劑、受體拮抗劑、腫瘤細胞凋亡活化劑或抗血管生成劑。
該等其他藥劑適宜地以對欲達成目的有效之量以組合形式存在。該等其他藥劑之有效量端視所使用T細胞活化雙特異性抗原結合分子之量、病症或治療之類型及上文所論述之其他因素而定。T細胞活化雙特異性抗原結合分子通常以與本文所闡述相同之劑量及投與途徑、或本文所闡述劑量之約1%至99%、或以經驗/臨床上確定為適宜之任一劑量及任一途徑使用。
上述該等組合療法涵蓋組合投與(其中兩種或更多種治療劑包含於相同或單獨組合物中)及單獨投與(在該情形下，本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之投與可在投與其他治療劑及/或佐劑之前、同時及/或之後進行)。本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子亦可與放射療法組合使用。
製品
在本發明之另一態樣中，提供含有可用於治療、預防及/或診斷上文所闡述病症之材料的製品。該製品包括容器及位於該容器上或與該容器締合之標記或包裝插頁。適宜容器包含(例如)瓶子、小瓶、注射器、IV溶液袋等。該等容器可自諸如玻璃或塑膠等多種材料形成。 容器裝有自身或與另一組合物組合時可有效治療、預防及/或診斷病況之組合物，且可具有無菌存取埠(例如，該容器可為靜脈內溶液袋或具有可由皮下注射針刺穿之塞子的小瓶)。組合物中之至少一種活性劑係本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子。標記或包裝插頁指示該組合物用於治療所選病況。此外，該製品可包括(a)含有組合物之第一容器，其中該組合物包括本發明之T細胞活化雙特異性抗原結合分子；及(b)含有組合物之第二容器，其中該組合物包括又一細胞毒性劑或其他治療劑。本發明此實施例中之製品可進一步包括指示組合物可用於治療具體病況之包裝插頁。另一選擇或此外，該製品可進一步包括第二(或第三)容器，該容器包括醫藥上可接受之緩衝液，例如抑菌性注射用水(BWFI)、磷酸鹽緩衝鹽水、林格氏溶液及右旋糖溶液。其可進一步包含自商業及使用者角度來看合意之其他材料，包含其他緩衝液、稀釋劑、濾膜、針及注射器。
實例
以下係本發明方法及組合物之實例。應理解，鑒於上文所提供之一般說明可實踐各種其他實施例。
一般方法 重組DNA技術
使用標準方法來操縱DNA，如Sambrook等人，Molecular cloning：A laboratory manual；Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,New York,1989中所闡述。根據製造商說明書來使用分子生物學試劑。關於人類免疫球蛋白輕鏈及重鏈之核苷酸序列之一般資訊在以下文獻中給出：Kabat,E.A.等人，(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，NIH公開案第91-3242號。
DNA測序
藉由雙鏈測序測定DNA序列。
基因合成
所需之期望基因區段係藉由PCR使用適當模板來產生，或藉由Geneart AG(Regensburg,Germany)自合成寡核苷酸及PCR產物藉由自動基因合成來合成。在沒有精確基因序列可用之情形下，基於來自最近同源物之序列來設計寡核苷酸引子，且藉由RT-PCR自源自適當組織之RNA來分離基因。將側接有單數限制性內切酶裂解位點之基因區段選殖至標準選殖/測序載體中。自轉化細菌純化質體DNA且藉由UV光譜測定濃度。藉由DNA測序確認亞選殖基因片段之DNA序列。使用適宜限制性位點來設計基因區段以容許亞選殖至各別表現載體中。所有構築物皆經設計具有編碼前導肽之5’端DNA序列，該前導肽用於靶向在真核細胞中分泌之蛋白質。實例性前導肽及編碼其之多核苷酸序列繪示於SEQ ID NO 108-116中。
原代人類泛T細胞與PBMC之分離
藉由Histopaque密度離心自地方血庫或健康人類供體之新鮮血液獲得之富含淋巴球之製劑(血沉棕黃層)製備外周血單核細胞(PBMC)。簡言之，用無菌PBS稀釋血液且在Histopaque梯度(Sigma,H8889)上小心地分層。在室溫下在450×g(關閉制動器)下離心30分鐘後，丟棄含有PBMC之中間相上方之血漿之一部分。將PBMC轉移至新50ml Falcon管中且用PBS填充管直至50ml之總體積。在室溫下在400×g(開啟制動器)下將混合物離心10分鐘。丟棄上清液且用無菌PBS將PBMC沈澱物洗滌兩次(將離心步驟在4℃下在350×g下保持10分鐘)。對所得PBMC群進行自動計數(ViCell)且將其儲存在37℃、5% CO2下於培育器中之含有10% FCS及1% L-丙胺醯基-L-麩醯胺酸之RPMI1640培養基(Biochrom,K0302)中直至開始分析。
根據製造商之說明書使用泛T細胞分離套組II(Miltenyi Biotec編號130-091-156)自PBMC實施T細胞富集。簡言之，將細胞沈澱物稀釋 於40μl冷緩衝液/1000萬個細胞(含有0.5% BSA、2mM EDTA之PBS，經無菌過濾)中，且在4℃下與10μl生物素抗體混合物/1000萬個細胞一起培育10min。添加30μl冷緩衝液及20μl抗生物素磁珠/1000萬個細胞，並在4℃下將混合物再培育15min。藉由添加緩衝液當前體積之10-20×來洗滌細胞且隨後在300×g下將離心步驟保持10min。將至多1億個細胞重懸浮於500μl緩衝液中。根據製造商之說明書使用LS管柱(Miltenyi Biotec編號130-042-401)來實施未經標記人類泛T細胞之磁力分離。對所得T細胞群進行自動計數(ViCell)且將其儲存在37℃、5% CO2下於培育器中之AIM-V培養基中直至開始分析(不超過24h)。
原代人類原初T細胞與PBMC之分離
藉由Histopaque密度離心自地方血庫或健康人類供體之新鮮血液獲得之富含淋巴球之製劑(血沉棕黃層)製備外周血單核細胞(PBMC)。根據製造商之說明書使用來自Miltenyi Biotec之原初CD8+ T細胞分離套組(編號130-093-244)自PBMC實施T細胞富集，但省略CD8+ T細胞之最終分離步驟(亦參見用於分離原代人類泛T細胞之描述)。
鼠類泛T細胞與脾細胞之分離
根據製造商之說明書，自C57BL/6小鼠分離脾，將其轉移至含有MACS緩衝液(PBS+0.5% BSA+2mM EDTA)之GentleMACS C-管(Miltenyi Biotech編號130-093-237)中，且用GentleMACS解離器解離，以獲得單細胞懸浮液。將細胞懸浮液通過預分離過濾器以去除剩餘未解離之組織粒子。在4℃下在400×g下離心4min後，添加ACK溶解緩衝液以溶解紅血細胞(在室溫下培育5min)。用MACS緩衝液將剩餘細胞洗滌兩次，計數且用於分離鼠類泛T細胞。按照製造商之說明書使用來自Miltenyi Biotec之泛T細胞分離套組(編號130-090-861)來實施陰性(磁力)選擇。對所得T細胞群進行自動計數(ViCell)且立即用於其他分析。
原代食蟹猴PBMC與肝素化血液之分離
藉由密度離心自健康食蟹猴供體之新鮮血液如下製備外周血單核細胞(PBMC)：用無菌PBS以1：3稀釋肝素化血液，且用無菌PBS將Lymphoprep培養基(Axon Lab編號1114545)稀釋至90%。兩體積稀釋血液在一體積稀釋密度梯度上分層，且藉由在室溫下在無制動器的情況下以520×g離心30min來分離PBMC部分。將PBMC帶轉移至新鮮50ml Falcon管中且用無菌PBS藉由在4℃下在400×g下離心10min來洗滌。實施一次低速離心以去除血小板(在150×g下保持15min，4℃)，並對所得PBMC群自動計數(ViCell)且立即用於其他分析。
靶細胞
為評價靶向MCSP之雙特異性抗原結合分子，使用以下腫瘤細胞系：人類黑素瘤細胞系WM266-4(ATCC編號CRL-1676)，其衍生自惡性黑素瘤之轉移位點且表現高含量之人類MCSP；人類黑素瘤細胞系MV-3(來自Radboud University Nijmegen Medical Centre之友好饋贈)，其表現中等含量之人類MCSP；人類惡性黑素瘤(原發性腫瘤)細胞系A375(ECACC編號88113005)，其表現高含量之MCSP；人類結腸癌細胞系HCT-116(ATCC編號CCL-247)，其不表現MCSP；及人類高加索人(Caucasian)結腸腺癌細胞系LS180(ECACC編號87021202)，其不表現MCSP。
為評價靶向CEA之雙特異性抗原結合分子，使用以下腫瘤細胞系：人類胃癌細胞系MKN45(DSMZ編號ACC 409)，其表現極高含量之人類CEA；人類胰臟腺癌細胞系HPAF-II(Roche Nutley之友好饋贈)，其表現高含量之人類CEA；人類原發性胰臟腺癌細胞系BxPC-3(ECACC編號93120816)，其表現中等含量之人類CEA；人類女性高加索人結腸腺癌細胞系LS-174T(ECACC編號87060401)，其表現中等含量之人類CEA；人類胰臟腺癌細胞系ASPC-1(ECACC編號 96020930)，其表現低含量之人類CEA；人類上皮樣胰臟癌細胞系Panc-1(ATCC編號CRL-1469)，其表現(極)低含量之人類CEA；人類結腸癌細胞系HCT-116(ATCC編號CCL-247)，其不表現CEA；人類腺癌肺泡基底上皮細胞系A549-huCEA，其自身穩定轉染以表現人類CEA；及鼠類結腸癌細胞系MC38-huCEA，其自身經改造以穩定表現人類CEA。
此外，使用人類T細胞白血病細胞系Jurkat(ATCC編號TIB-152)來評價不同雙特異性構築物對細胞上人類CD3之結合。
實例1 抗MCSP抗體M4-3/ML2之親和力成熟
親和力成熟係經由寡核苷酸定向誘變程序來實施。為此，將重鏈變體M4-3及輕鏈變體ML2以與彼等Hoogenboom所闡述(Hoogenboom等人，Nucleic Acid Res.1991,19,4133-4137)相似之方式選殖至噬菌粒載體中。藉由首先經由經典同源建模產生該抗體之3D模型及隨後鑒定重鏈及輕鏈之互補決定區(CDR)之溶劑可及性殘基來鑒定欲隨機化之殘基。如表1中所顯示之基於三核苷酸合成之具有隨機化之寡核苷酸購自Ella Biotech(Munich,Germany)。經由經典PCR產生三個獨立的子文庫，且包括CDR-H1與CDR-H2一起或CDR-L1與CDR-L2一起之隨機化。CDR-L3係以單獨方式隨機化。經由限制性消化及連接將彼等文庫之DNA片段選殖至噬菌粒中，且隨後電穿孔至TG1細菌中。
文庫選擇
由此產生之抗體變體在融合至包裝於每一粒子內之M13基因III產物時，以單價形式自絲狀噬菌體粒子展示。然後針對經噬菌體展示之變體之生物活性(在此處：結合親和力)篩選經噬菌體展示之變體，且將具有一或多種經改良活性之候選者用於進一步研發中。製備噬菌體 展示文庫之方法可參見Lee等人，J.Mol.Biol.(2004)340,1073-1093。
在溶液中根據以下程序用所有親和力成熟文庫實施選擇：1.將每一親和力成熟文庫之約1012個噬菌粒粒子與100nM生物素化hu-MCSP(D3結構域)-avi-his(SEQ ID NO：118)以1ml之總體積結合0.5h，2.藉由添加5.4×107個抗生蛋白鏈菌素包覆之磁珠經10min捕獲生物素化hu-MCSP(D3結構域)-avi-his及特異性結合之噬菌體粒子，3.使用5-10×1ml PBS/Tween-20及5-10×1ml PBS洗滌珠粒，4.藉由添加1ml 100mM TEA(三乙胺)經10min溶析噬菌體粒子且藉由添加500μl 1M Tris/HCl(pH 7.4)來中和，及5.對數生長之大腸桿菌TG1細菌之再感染，使用輔助噬菌體VCSM13進行感染，且隨後對欲用於後續選擇週期中之噬菌粒粒子進行PEG/NaCl沈澱。使用恆定或遞減(自10-7M至2×10-9M)之抗原濃度實施3-5輪選擇。在第2輪中，使用中性鏈親和素(neutravidin)板代替抗生蛋白鏈菌素珠粒實施抗原-噬菌體複合物之捕獲。藉助ELISA如下鑒定特異性結合劑：將100μl 10nM生物素化hu-MCSP(D3結構域)-avi-his/孔塗覆於中性鏈親和素板上。添加含Fab之細菌上清液且經由其Flag標籤藉由使用抗Flag/HRP二級抗體來檢測結合Fab。在96孔格式中ELISA陽性純系在細菌中表現為可溶Fab片段，且使用ProteOn XPR36(BioRad)藉由SPR分析使上清液經歷動力學篩選實驗。鑒定具有最高親和力常數之表現Fab之純系且對相應噬菌粒進行測序。
圖2顯示親和力成熟抗MCSP純系與不成熟親代純系(M4-3 ML2)之比對。僅在CDR1及2中實施重鏈隨機化。在CDR1及2中且獨立地在CDR3中實施輕鏈隨機化。
在選擇期間，框架中之少數突變出現在如純系G3中之F71Y或純系E10中之Y87H中。
人類IgG 1 之產生及純化
將親和力成熟變體之重鏈及輕鏈DNA序列之可變區與預先插入各別接受者哺乳動物表現載體中之恆定重鏈或恆定輕鏈一起亞選殖至框架中。抗體表現係藉由MPSV啟動子來驅動且在CDS之3’端處載有合成聚A信號序列。此外，每一載體皆含有EBV OriP序列。
該分子係使用聚乙烯亞胺(PEI)藉由共轉染HEK293-EBNA細胞與哺乳動物表現載體來產生。使用相應表現載體以1：1比率轉染細胞。對於轉染，在於CD CHO培養基中之不含血清之懸浮液中培養 HEK293 EBNA細胞。為在500ml搖瓶中產生，在轉染前24小時時接種4億個HEK293 EBNA細胞。對於轉染，在210×g下將細胞離心5min，使用預熱之20ml CD CHO培養基更換上清液。在20ml CD CHO培養基中混合表現載體至200μg DNA之最終量。添加540μl PEI溶液後，將混合物渦旋15s，且隨後在室溫下培育10min。此後，將細胞與DNA/PEI溶液混合，轉移至500ml搖瓶，且在37℃下在具有5% CO2氣氛之培育器中培育3小時。培育時間後，添加160ml F17培養基且將細胞培養24小時。轉染後1天時，添加1mM丙戊酸及7%補料1(Lonza)。7天後，收集培養上清液，藉由在210×g下離心15min來純化，將溶液無菌過濾(0.22μm過濾器)且添加最終濃度為0.01% w/v之疊氮化鈉，並保持在4℃下。
使用蛋白質A藉由親和層析自細胞培養物上清液純化所分泌蛋白質。將上清液裝載於經40ml 20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)平衡之HiTrap蛋白質A HP管柱(CV=5mL,GE Healthcare)上。藉由使用至少10管柱體積之20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)洗滌來去除未結合之蛋白質。在經20管柱體積之自20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)至20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 2.5)梯度期間溶析靶蛋白。藉由添加1/10 0.5M磷酸鈉(pH 8)來中和蛋白質溶液。將靶蛋白濃縮且過濾，然後裝載於經20mM組胺酸、140mM氯化鈉溶液(pH 6.0)平衡之HiLoad Superdex 200管柱(GE Healthcare)上。
藉由使用基於胺基酸序列計算之莫耳消光係數量測280nm下之光學密度(OD)來測定純化蛋白質樣品之蛋白質濃度。在還原劑存在及不存在下藉由CE-SDS分析分析分子之純度及分子量。根據製造商之說明書使用Caliper LabChip GXII系統(Caliper Life Sciences)。使用2μg樣品進行分析。在25℃下使用於25mM K2HPO4、125mM NaCl、 200mM L-精胺酸單鹽酸鹽、0.02%(w/v)NaN3運行緩衝液(pH 6.7)中之TSKgel G3000 SW XL分析型粒徑排阻管柱(Tosoh)分析抗體樣品之聚集物含量。
親和力測定 ProteOn分析
在25℃下藉由表面電漿子共振使用ProteOn XPR36機器(Biorad)來量測KD，其中在CM5晶片上藉由胺偶合固定抗人類F(ab’)2片段特異性捕獲抗體(Jackson ImmunoResearch編號109-005-006)且隨後捕獲來自細菌上清液或純化Fab製劑之Fab。簡言之，根據供應商之說明書，使用N-乙基-N’-(3-二甲基胺基丙基)-碳化二亞胺鹽酸鹽(EDC)及N-羥基琥珀醯亞胺(NHS)來活化羧甲基化之葡聚糖生物感測器晶片(CM5,GE Healthcare)。用50μg/ml 10mM乙酸鈉(pH 5.0)稀釋抗人類F(ab’)2片段特異性捕獲抗體，然後以10μl/分鐘之流速注射以達成高達約10.000個反應單位(RU)之偶合捕獲抗體。注射捕獲抗體後，注射1M乙醇胺來封阻未反應之基團。對於動力學量測而言，以10μl/分鐘之流速經300s注射來自細菌上清液之Fab或經純化Fab且解離300s以達成捕獲基線穩定。捕獲級別介於100-500RU範圍內。在隨後步驟中，在25℃下以50μl/min之流速注射人類MCSP(D3結構域)-avi-his分析物，其以單一濃度或以濃度系列(端視介於100nM與250pM之間之範圍內之純系親和力而定)稀釋於HBS-EP+(GE Healthcare,10mM HEPES、150mM NaCl、3mM EDTA、0.05%表面活性劑P20(pH 7.4))中。藉由依次以90μl/min經30s注射甘胺酸(pH 1.5)及以相同流速經20s注射NaOH使感測器晶片表面再生。使用簡單一對一Langmuir結合模型(ProteOn XPR36評估軟體或Scrubber軟體(BioLogic))藉由同時擬合締合與解離感測圖來計算締合速率(k締合)及解離速率(k解離)。以k解離/k締合比率之形式來計算平衡解離常數(KD)。使用此數據來測定親和力成熟變體與親代抗體之競爭性結合親和力。表3a顯示自該等分析產生之數據。
選擇針對輕鏈之G3、E10、C5及針對重鏈之D6、A7、B7、B8、C1轉換成人類IgG1格式。由於輕鏈CDR1及2之隨機化獨立於CDR3，故所得CDR在IgG轉換期間組合。
在IgG格式中，除量測對食蟹猴同源物(SEQ ID NO：117)之親和力外，亦量測對人類MCSP抗原(SEQ ID NO：118)之親和力。
所使用之方法確切地如針對Fab片段所闡述，但使用哺乳動物產生之經純化IgG。
藉由表面電漿子共振(SPR)使用Biacore T200之親和力測定
在25℃下在Biacore T200上使用HBS-EP作為運行緩衝液(0.01M HEPES(pH 7.4)、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.005%表面活性劑 P20，Biacore,Freiburg/Germany)實施測定親和力成熟IgG之親和力及親合力之表面電漿子共振(SPR)實驗。
為分析不同抗MCSP IgG對人類及食蟹猴MCSP D3相互作用之親合力，在CM5晶片上在pH 5.0下使用標準胺偶合套組(Biacore,Freiburg/Germany)直接偶合約9,500個共振單位(RU)之抗五His抗體(Qiagen)。分別在30nM下以10μl/min經60s捕獲抗原。使IgG以0.0064-100nM之濃度及30μl/min之流速經280s通過流動細胞。經180s監測解離。藉由減去對參考流動細胞獲得之反應來校正本體折射率差異。在此處，使IgG流經具有固定抗五His抗體但其上已注射有HBS-EP而非人類MCSP D3或食蟹猴MCSP D3之表面。
對於親和力量測，在具有固定抗人類Fc之CM5感測器晶片表面上捕獲IgG。藉由在pH 5.0下使用標準胺偶合套組(Biacore,Freiburg/Germany)直接固定約9,500個共振單位(RU)將捕獲IgG偶合至感測器晶片表面。在10nM下以30μl/min經25s捕獲IgG。以2-500nM之濃度及30μl/min之流速使人類及食蟹猴MCSP D3經120s通過流動細胞。經60s監測解離。分別經1200s及600s監測166nM及500nM濃度下之締合及解離。藉由減去對參考流動細胞獲得之反應來校正本體折射率差異。在此處，使抗原流經具有固定抗人類Fc抗體但其上已注射有HBS-EP而非抗MCSP IgG之表面。
使用Biacore T200評估軟體(vAA,Biacore AB,Uppsala/Sweden)衍生出動力學常數，以藉由數值積分擬合針對1：1 Langmuir結合之速率方程。
藉由表面電漿子共振量測使用Biacore T200來確認對人類及食蟹猴MCSP D3之較高親和力。此外，親合力量測顯示二價結合增加高達3倍(表3b)。
表3b. 抗MCSP IgG對人類MCSP-D3及食蟹猴MCSP-D3之親和
實例2 作為抗MCSP抗體之含有M4-3(C1)ML2(G3)之MCSP TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA)及作為抗CD3抗體之人類化CH2527的製備
將重鏈及輕鏈DNA序列之可變區與預先插入各別接受者哺乳動物表現載體中之恆定重鏈或恆定輕鏈一起亞選殖至框架中。抗體表現係藉由MPSV啟動子來驅動且在CDS之3’端處載有合成聚A信號序列。此外，每一載體皆含有EBV OriP序列。
該分子係藉由使用聚乙烯亞胺(PEI)共轉染HEK293-EBNA細胞與哺乳動物表現載體來產生。使用相應表現載體以1：2：1：1比率(「載體重鏈Fc(孔洞)」：「載體輕鏈」：「載體輕鏈Crossfab」：「載體重鏈Fc(隆凸)-FabCrossfab」)轉染細胞。
對於轉染，在於CD CHO培養基中之不含血清之懸浮液中培養HEK293 EBNA細胞。為在500ml搖瓶中產生，在轉染前24小時時接種4億個HEK293 EBNA細胞。對於轉染，在210×g下將細胞離心5min，使用預熱之20ml CD CHO培養基更換上清液。在20ml CD CHO培養基中混合表現載體至200μg DNA之最終量。添加540μl PEI溶液後，將混合物渦旋15s，且隨後在室溫下培育10min。此後，將細胞與DNA/PEI溶液混合，轉移至500ml搖瓶，且在37℃下在具有5% CO2氣氛之培育器中培育3小時。培育時間後，添加160ml F17培養基且 將細胞培養24小時。轉染後1天時，添加1mM丙戊酸及7%補料1(Lonza)。7天後，收集培養上清液，藉由在210×g下離心15min來純化，將溶液無菌過濾(0.22μm過濾器)且添加最終濃度為0.01% w/v之疊氮化鈉，並保持在4℃下。
使用蛋白質A藉由親和層析自細胞培養物上清液純化所分泌蛋白質。將上清液裝載於經40ml 20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)平衡之HiTrap蛋白質A HP管柱(CV=5mL,GE Healthcare)上。藉由使用至少10管柱體積之20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)洗滌來去除未結合之蛋白質。在經20管柱體積之自20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)至20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 2.5)梯度期間溶析靶蛋白。藉由添加1/10 0.5M磷酸鈉(pH 8)來中和蛋白質溶液。將靶蛋白濃縮且過濾，然後裝載於經20mM組胺酸、140mM氯化鈉溶液(pH 6.0)平衡之HiLoad Superdex 200管柱(GE Healthcare)上。
藉由使用基於胺基酸序列計算之莫耳消光係數量測280nm下之光學密度(OD)來測定純化蛋白質樣品之蛋白質濃度。
在還原劑存在及不存在下藉由CE-SDS分析分析分子之純度及分子量。根據製造商之說明書使用Caliper LabChip GXII系統(Caliper lifescience)。使用2μg樣品進行分析。
在25℃下使用於25mM K2HPO4、125mM NaCl、200mM L-精胺酸單鹽酸鹽、0.02%(w/v)NaN3運行緩衝液(pH 6.7)中之TSKgel G3000 SW XL分析型粒徑排阻管柱(Tosoh)分析抗體樣品之聚集物含量。
圖3顯示MCSP TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA)分子之示意圖。
圖4及表4b顯示MCSP TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA)分子(SEQ ID NO：12、53、54及55)之CE-SDS分析。
實例3 作為抗CEA抗體之含有CH1A1A 98/99 2F1之CEA TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA)及作為抗CD3抗體之人類化CH2527的製備
將重鏈及輕鏈DNA序列之可變區與預先插入各別接受者哺乳動物表現載體中之恆定重鏈或恆定輕鏈一起亞選殖至框架中。抗體表現係藉由MPSV啟動子來驅動且在CDS之3’端處載有合成聚A信號序列。此外，每一載體皆含有EBV OriP序列。
該分子係藉由使用聚乙烯亞胺(PEI)共轉染HEK293 EBNA細胞與哺乳動物表現載體來產生。使用相應表現載體以1：2：1：1比率(「載體 重鏈Fc(孔洞)」：「載體輕鏈」：「載體輕鏈Crossfab」：「載體重鏈Fc(隆凸)-FabCrossfab」)轉染細胞。
對於轉染，在於CD CHO培養基中之不含血清之懸浮液中培養HEK293 EBNA細胞。為在500ml搖瓶中產生，在轉染前24小時時接種4億個HEK293 EBNA細胞。對於轉染，在210×g下將細胞離心5min，使用預熱之20ml CD CHO培養基更換上清液。在20ml CD CHO培養基中混合表現載體至200μg DNA之最終量。添加540μl PEI溶液後，將混合物渦旋15s，且隨後在室溫下培育10min。此後，將細胞與DNA/PEI溶液混合，轉移至500ml搖瓶，且在37℃下在具有5% CO2氣氛之培育器中培育3小時。培育時間後，添加160ml F17培養基且將細胞培養24小時。轉染後1天時，添加1mM丙戊酸及7%補料1(Lonza)。7天後，收集培養上清液，藉由在210×g下離心15min來純化，將溶液無菌過濾(0.22μm過濾器)且添加最終濃度為0.01% w/v之疊氮化鈉，並保持在4℃下。
使用蛋白質A藉由親和層析自細胞培養物上清液純化所分泌蛋白質。將上清液裝載於經40ml 20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)平衡之HiTrap蛋白質A HP管柱(CV=5mL,GE Healthcare)上。藉由使用至少10管柱體積之20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)洗滌來去除未結合之蛋白質。在經20管柱體積之自20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)至20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 2.5)梯度期間溶析靶蛋白。藉由添加1/10 0.5M磷酸鈉(pH 8)來中和蛋白質溶液。將靶蛋白濃縮且過濾，然後裝載於經20mM組胺酸、140mM氯化鈉溶液(pH 6.0)平衡之HiLoad Superdex 200管柱(GE Healthcare)上。
藉由使用基於胺基酸序列計算之莫耳消光係數量測280nm下之光學密度(OD)來測定純化蛋白質樣品之蛋白質濃度。
在還原劑存在及不存在下藉由CE-SDS分析分析分子之純度及分子量。根據製造商之說明書使用Caliper LabChip GXII系統(Caliper lifescience)。使用2μg樣品進行分析。
在25℃下使用於25mM K2HPO4、125mM NaCl、200mM L-精胺酸單鹽酸鹽、0.02%(w/v)NaN3運行緩衝液(pH 6.7)中之TSKgel G3000 SW XL分析型粒徑排阻管柱(Tosoh)分析抗體樣品之聚集物含量。
圖5顯示CEA TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA)分子之示意圖。
圖6及表6顯示CEA TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA)分子(SEQ ID NO：22、56、57及58)之CE-SDS分析。
在替代性純化方法中，CEA TCB係藉由蛋白質A親和層析(MabSelect SuRe)自所收穫且澄清的發酵上清液捕獲。然後將蛋白質A溶析物提交給陽離子交換層析(Poros 50 HS)且隨後藉助SE-HPLC及 毛細管電泳進行分級分離及分析。彙集含有產物之流份且使其在室溫下以結合-溶析模式經歷疏水相互作用層析(丁基-Sepharose 4FF)。然後藉助SE-HPLC及毛細管電泳對來自其之溶析物進行分級分離及分析。彙集含有產物之流份且隨後以流經模式實施陰離子交換層析(Q-Sepharose FF)。使用此純化方法獲得之材料具有>98%之單體含量。
實例4 MCSP TCB與表現MCSP及CD3之細胞之結合
測試MCSP TCB對表現MCSP之人類惡性黑素瘤細胞系(A375)及表現CD3之永生T淋巴球系(Jurkat)之結合。簡言之，收穫細胞，計數，檢查活力且以2×106個細胞/ml重懸浮於FACS緩衝液(100μl PBS 0.1% BSA)中。在4℃下在96孔圓底板中將100μl細胞懸浮液(含有0.2×106個細胞)與濃度遞增之MCSP TCB(2.6pM-200nM)一起培育30min，用冷PBS 0.1% BSA洗滌兩次，在4℃下與PE偶聯之AffiniPure F(ab’)2片段山羊抗人類IgG Fcγ片段特異性二級抗體(Jackson Immuno Research Lab PE編號109-116-170)再一起培育30min，用冷PBS 0.1% BSA洗滌兩次，並立即藉助FACS使用FACS CantoII(軟體FACS Diva)藉由對活細胞、DAPI陰性細胞設門來分析。使用GraphPadPrism5獲得結合曲線(圖7A，與A375細胞之結合，EC50=3381pM；圖7B，與Jurkat細胞之結合)。
實例5 由MCSP TCB抗體誘導之T細胞殺死
由MCSP TCB抗體介導之T細胞殺死係使用一組表現不同量MCSP之腫瘤細胞系(A375=高MCSP，MV-3=中等MCSP，HCT-116=低MCSP，LS180=MCSP陰性)來評價。簡言之，使用胰蛋白酶/EDTA收穫靶細胞，洗滌，且以25 000個細胞/孔之密度使用96孔平底板平鋪。使細胞黏著過夜。藉由對自健康人類供體獲得之富含淋巴球之製 劑(血沉棕黃層)進行Histopaque密度離心來製備外周血單核細胞(PBMC)。用無菌PBS稀釋新鮮血液且在Histopaque梯度(Sigma，編號H8889)上分層。離心(450×g，30分鐘，室溫)後，丟棄含有PBMC之中間相上方之血漿且將PBMC轉移至新falcon管中，隨後填充50ml PBS。將混合物離心(400×g，10分鐘，室溫)，丟棄上清液且用無菌PBS將PBMC沈澱物洗滌兩次(離心步驟350×g，10分鐘)。對所得PBMC群進行自動計數(ViCell)，且將其儲存在37℃、5% CO2下於細胞培育器中之含有10% FCS及1% L-丙胺醯基-L-麩醯胺酸之RPMI1640培養基(Biochrom,K0302)中直至進一步使用(不超過24h)。對於殺死分析，添加所指示濃度(範圍為1pM-10nM，一式三份)之抗體。將PBMC以10：1之最終效應子對靶(E：T)比率添加至靶細胞中。在37℃、5% CO2下培育24h後，藉由量化藉助凋亡/壞死細胞釋放至細胞上清液中之LDH(LDH檢測套組，Roche Applied Science，編號11 644 793 001)來評價靶細胞殺死。藉由使用1% Triton X-100培育靶細胞來達成靶細胞之最大溶解(=100%)。最小溶解(=0%)係指在不含雙特異性構築物的情況下共培育靶細胞與效應子細胞。結果顯示，MCSP TCB誘導強且靶特異性之MCSP陽性靶細胞系之殺死，且不誘導MCSP陰性細胞系之殺死(圖8，A-D)。使用GraphPadPrism5計算之與殺死分析相關之EC50值於表7中給出。
實例6 在表現MCSP之腫瘤細胞之由MCSP TCB抗體誘導的T細胞殺死後，CD8 + 及CD4 + 效應子細胞上CD25及CD69之上調
表現MCSP之MV-3腫瘤細胞之由MCSP TCB抗體介導之T細胞殺死後CD8+及CD4+ T細胞的活化係藉由FACS分析使用識別T細胞活化標記CD25(晚期活化標記)及CD69(早期活化標記)之抗體來評價。抗體及殺死分析條件基本上如上文所闡述(實例5)，使用相同抗體濃度範圍(1pM-10nM，一式三份)、E：T比率10：1及培育時間24h。
培育後，將PBMC轉移至96孔圓底板，在350×g下離心5min，且用含有0.1% BSA之PBS洗滌兩次。根據供應商之說明書，對CD8(FITC抗人類CD8，BD編號555634)、CD4(PECy7抗人類CD4，BD編號557852)、CD69(PE抗人類CD69，Biolegend編號310906)及CD25(APC抗人類CD25，BD編號555434)實施表面染色。用150μl/孔含有0.1% BSA之PBS將細胞洗滌兩次，且在4℃下使用100μl/孔固定緩衝液(BD編號554655)固定15min。離心後，將樣品重懸浮於200μl/孔含有DAPI之PBS 0.1% BSA中以排除死細胞用於FACS量測。以BD FACS Fortessa分析樣品。結果顯示，在MCSP TCB誘導殺死後CD8+ T細胞(圖9 A、B)及CD4+ T細胞(圖9C、D)上活化標記(CD25、CD69)之強且靶特異性的上調。
實例7 在表現MCSP之腫瘤細胞之由MCSP TCB抗體誘導的T細胞殺死後，藉助人類效應子細胞之細胞介素F分泌
在表現MCSP之MV-3腫瘤細胞之由MCSP TCB抗體誘導的T細胞殺死後藉助人類PBMC之細胞介素分泌係藉由殺死分析後細胞上清液之FACS分析來評價。
使用相同抗體且基本上如上文所闡述(實例5及6)使用10：1之E：T 比率及24h之培育時間來實施殺死分析。
培育時間結束後，在350×g下將板離心5min，將上清液轉移至新96孔板中且儲存在-20℃下直至隨後分析。根據製造商之說明書在FACS CantoII上使用BD CBA人類可溶性蛋白Flex Set來檢測分泌至細胞上清液中之顆粒酶B、TNFα、IFN-γ、IL-2、IL-4及IL-10。使用以下套組：BD CBA人類顆粒酶B BD CBA人類顆粒酶B Flex Set編號BD 560304；BD CBA人類TNF Flex Set編號BD 558273；BD CBA人類IFN-γ Flex Set編號BD 558269；BD CBA人類IL-2 Flex Set編號BD 558270；BD CBA人類IL-4 Flex Set編號BD 558272；BD CBA人類IL-10 Flex Set編號BD 558274。
結果顯示，在MCSP TCB誘導殺死後IL-2、IFN-γ、TNFα、顆粒酶B及IL-10(但無IL-4)之分泌(圖10，A-F)。
總而言之，該等實例顯示，MCSP CD3雙特異性抗體
˙顯示與MCSP陽性A375細胞之良好結合
˙誘導MCSP陽性靶細胞系之強且靶特異性之殺死，且不誘導MCSP陰性細胞系之殺死
˙誘導殺死後CD8+及CD4+ T細胞上活化標記(CD25、CD69)之強且靶特異性的上調
˙誘導殺死後IL-2、IFN-γ、TNFα、顆粒酶B及IL-10(無IL-4)之分泌。
實例8 CEA TCB與表現CEA及CD3之細胞之結合
測試CEA TCB對所轉染之表現CEA之肺腺癌細胞(A549-huCEA)及表現CD3之永生人類及食蟹猴T淋巴球系(分別為Jurkat及HSC-F)之結合。使用未經靶向之TCB(SEQ ID NO：59、60、61及62；參見實例24)作為對照。簡言之，收穫細胞，計數，檢查活力且以2×106個細 胞/ml重懸浮於FACS緩衝液(100μl PBS 0.1% BSA)中。在4℃下在96孔圓底板中將100μl細胞懸浮液(含有0.2×106個細胞)與濃度遞增之CEA TCB(61pM-1000nM)一起培育30min，用冷PBS 0.1% BSA洗滌兩次，在4℃下與FITC偶聯之AffiniPure F(ab’)2片段山羊抗人類IgG F(ab’)2片段特異性二級抗體(Jackson Immuno Research Lab FITC編號109-096-097)再一起培育30min，用冷PBS 0.1% BSA洗滌兩次，並立即藉助FACS使用FACS CantoII或Fortessa(軟體FACS Diva)藉由對活細胞、PI陰性細胞設門來分析。使用GraphPadPrism5獲得結合曲線(圖11A，與A549細胞之結合，EC50為6.6nM；圖11B，與Jurkat細胞之結合；圖11C，與HSC-F細胞之結合)。
實例9 表現CEA之腫瘤靶細胞之由CEA TCB抗體誘導的T細胞介導之殺死
靶細胞之由CEA TCB抗體誘導的T細胞介導之殺死係針對HPAFII(高CEA)、BxPC-3(中等CEA)及ASPC-1(低CEA)人類腫瘤細胞來評價。使用HCT-116(CEA陰性腫瘤細胞系)及未經靶向之TCB作為陰性對照。使用人類PBMC作為效應子，且檢測將其與雙特異性抗體一起培育後24h及48h時之殺死。簡言之，使用胰蛋白酶/EDTA收穫靶細胞，洗滌，且以25 000個細胞/孔之密度使用96孔平底板平鋪。使細胞黏著過夜。藉由對自健康人類供體獲得之富含淋巴球之製劑(血沉棕黃層)進行Histopaque密度離心來製備外周血單核細胞(PBMC)。用無菌PBS稀釋新鮮血液且在Histopaque梯度(Sigma，編號H8889)上分層。離心(450×g，30分鐘，室溫)後，丟棄含有PBMC之中間相上方之血漿且將PBMC轉移至新falcon管中，隨後填充50ml PBS。將混合物離心(400×g，10分鐘，室溫)，丟棄上清液且用無菌PBS將PBMC沈澱物洗滌兩次(離心步驟350×g，10分鐘)。對所得PBMC群進行自動計數(ViCell)，且將其保持在於細胞培育器(37℃、5% CO2)中之含 有10% FCS及1% L-丙胺醯基-L-麩醯胺酸之RPMI1640培養基(Biochrom,K0302)中直至進一步使用(不超過24h)。對於殺死分析，添加所指示濃度(範圍為6pM-100nM，一式三份)之抗體。將PBMC以10：1之最終E：T比率添加至靶細胞中。培育24h及48h後，藉由量化藉助凋亡/壞死細胞釋放至細胞上清液中之LDH(乳酸去氫酶，LDH檢測套組，Roche Applied Science，編號11 644 793 001)來評價靶細胞殺死。藉由使用1% Triton X-100培育靶細胞來達成靶細胞之最大溶解(=100%)。最小溶解(=0%)係指在不含雙特異性抗體的情況下共培育靶細胞與效應子細胞。結果顯示，CEA TCB誘導CEA陽性靶細胞之強且靶特異性之殺死(圖12，A-H)。使用GraphPadPrism5計算之與殺死分析相關之EC50值於表8中給出。
實例10 在表現CEA之腫瘤靶細胞之CEA TCB介導之殺死後5天時的T細胞增殖及活化
檢測在表現CEA之腫瘤靶細胞之CEA TCB介導的殺死後5天時之T細胞增殖及活化，針對HPAFII(高CEA)、BxPC-3(中等CEA)及ASPC-1(低CEA)細胞進行評價。使用HCT-116(CEA陰性腫瘤細胞系)及未經靶向之TCB作為陰性對照。用於增殖分析之實驗條件與實例9中所闡述者相似，但僅將10 000個靶細胞平鋪於96孔平底板之每孔 中。為評價T細胞增殖，使用CFSE(Sigma編號21888)標記剛分離之PBMC。簡言之，稀釋CFSE儲備溶液以獲得100μM之工作溶液。將90×106個PBMC細胞重懸浮於90ml預熱PBS中且補充90μl CFSE工作溶液。將細胞立即混合且在37℃下培育15min。將10ml預熱FCS添加至細胞中來終止反應。在400g下將細胞離心10min，重懸浮於50ml培養基中且在37℃下培育30min。培育後，用溫培養基將細胞洗滌一次，計數，重懸浮於培養基中並添加至靶細胞中用於殺死分析，且隨後量測10：1之E：T下之細胞增殖及活化。藉由量化CFSE染料稀釋物評價殺死後5天時CD4及CD8陽性T細胞之增殖。使用抗人類CD25抗體評價相同T細胞子集之CD25表現。簡言之，離心(400×g，4min)後，將細胞重懸浮，用FACS緩衝液洗滌且在4℃下與25μl經稀釋CD4/CD8/CD25抗體混合物一起培育30min(APC/Cy7抗人類CD4編號317418、APC抗人類CD8編號301014、PE/Cy7抗人類CD25編號302612)。然後將細胞洗滌三次以去除未結合之抗體，且最終重懸浮於200μl含有碘化丙啶(PI)之FACS緩衝液中以排除死細胞用於FACS量測。使用BD FACS CantoII量測螢光。結果顯示，CEA TCB誘導CD8+及CD4+ T細胞之強且靶特異性之增殖(圖13，A-D)及其如藉由CD25活化標記之上調檢測之活化(圖13，E-H)。
實例11 在表現CEA之腫瘤細胞之由CEA TCB誘導的T細胞介導之殺死後，藉助人類效應子細胞之細胞介素分泌
在表現CEA之MKN45腫瘤細胞之由CEA TCB誘導的T細胞介導之殺死後藉助人類PBMC之細胞介素分泌係藉由殺死後48h時細胞上清液之FACS分析(CBA套組)來評價。
實驗條件與實例9中所闡述者一致。培育時間結束後，在350×g下將板離心5min，將上清液轉移至新96孔板中且儲存在-20℃下直至 隨後分析。根據製造商之說明書在FACS CantoII上使用BD CBA人類可溶性蛋白Flex Set來檢測分泌至細胞上清液中之(A)IFN-γ、(B)TNFα、(C)顆粒酶B、(D)IL-2、(E)IL-6及(F)IL-10。使用以下套組：BD CBA人類IL-2 BD，Flex Set編號BD 558270；BD CBA人類顆粒酶BBD Flex Set編號BD 560304；BD CBA人類TNF Flex Set編號BD 558273；BD CBA人類IFN-γ Flex Set編號BD 558269；BD CBA人類IL-4 Flex Set編號BD 558272；BD CBA人類IL-10 Flex Set編號BD 558274。
結果顯示，CEA TCB介導之殺死(而非未經靶向之TCB對照介導之殺死)誘導IFN-γ、TNFα、顆粒酶B、IL-2、IL-6及IL-10之分泌(圖14，A-F)。
實例12 在濃度遞增之脫落CEA(sCEA)存在下靶細胞之T細胞介導之殺死
評價在濃度遞增之脫落CEA(sCEA 2.5ng/ml-5μg/ml)存在下表現CEA之腫瘤靶細胞(LS180)之由CEA TCB抗體誘導的T細胞介導之殺死。使用人類PBMC作為效應子細胞，且檢測將其與雙特異性抗體及sCEA一起培育後24h及48h時之殺死。簡言之，使用胰蛋白酶/EDTA收穫靶細胞，洗滌，且以25 000個細胞/孔之密度使用96孔平底板平鋪。使細胞黏著過夜。藉由對自健康人類供體獲得之富含淋巴球之製劑(血沉棕黃層)進行Histopaque密度離心來製備外周血單核細胞(PBMC)。用無菌PBS稀釋新鮮血液且在Histopaque梯度(Sigma，編號H8889)上分層。離心(450×g，30分鐘，室溫)後，丟棄含有PBMC之中間相上方之血漿且將PBMC轉移至新Falcon管中，隨後填充50ml PBS。將混合物離心(400×g，10分鐘，室溫)，丟棄上清液且用無菌PBS將PBMC沈澱物洗滌兩次(離心步驟350×g，10分鐘)。對所得PBMC群進行自動計數(ViCell)，且將其保持在於細胞培育器(37℃、5% CO2)中之含有10% FCS及1% L-丙胺醯基-L-麩醯胺酸之RPMI1640培養基(Biochrom,K0302)中直至進一步使用(不超過24h)。對於殺死 分析，使用1nM固定濃度之CEA TCB抗體且將sCEA以2.5ng-5μg/ml之濃度範圍摻入實驗中。將PBMC以10：1之最終E：T比率添加至靶細胞中。培育24h及48h後，藉由量化藉助凋亡/壞死細胞釋放至細胞上清液中之LDH(乳酸去氫酶，LDH檢測套組，Roche Applied Science，編號11 644 793 001)來評價靶細胞殺死。藉由使用1% Triton X-100培育靶細胞來達成靶細胞之最大溶解(=100%)。最小溶解(=0%)係指在不含雙特異性抗體的情況下共培育靶細胞與效應子細胞。將sCEA不存在下由CEA TCB介導之殺死設定為100%且針對其將在濃度遞增之sCEA存在下獲得之殺死正規化。結果顯示，sCEA對表現CEA之靶細胞之CEA TCB介導之殺死僅具有較小影響(圖15A、B)。未檢測到高達0.2μg/ml之sCEA對T細胞殺死造成影響。高於0.2μg/ml之sCEA濃度對總體殺死僅具有較小影響(10%-50%減少)。
實例13 使用人類及食蟹猴PBMC作為效應子細胞之靶細胞之T細胞介導的殺死
評價與CEA TCB抗體及作為效應子細胞之人類PBMC或食蟹猴PBMC一起培育後21h及40h時，過表現人類CEA之A549(肺腺癌)細胞(A549-hCEA)之T細胞介導的殺死。簡言之，使用胰蛋白酶/EDTA收穫靶細胞，洗滌，且以25000個細胞/孔之密度使用96孔平底板平鋪。使細胞黏著若干小時。藉由對自健康人類供體或健康食蟹猴獲得之富含淋巴球之製劑(血沉棕黃層)進行Histopaque密度離心來製備外周血單核細胞(PBMC)。此後，使用90% Histopaque-PBS密度梯度。用無菌PBS稀釋新鮮血液且在Histopaque梯度(Sigma，編號H8889)上分層。離心(對於人類PBMC為450×g，30分鐘，室溫；對於食蟹猴PBMC為520×g，30分鐘，室溫)後，丟棄含有PBMC之中間相上方之血漿且將PBMC轉移至新Falcon管中，隨後填充50ml PBS。將混合物離心(400×g，10分鐘，室溫)，丟棄上清液且用無菌PBS將PBMC沈 澱物洗滌兩次(離心步驟350×g，10分鐘)。為製備食蟹猴PBMC，在150×g下實施15min額外低速離心步驟。對所得PBMC群進行自動計數(ViCell)，且將其保持在於細胞培育器(37℃、5% CO2)中之含有10% FCS及1% L-丙胺醯基-L-麩醯胺酸之RPMI1640培養基(Biochrom,K0302)中直至進一步使用(至多4h)。對於殺死分析，添加所指示濃度(範圍為6pM-100nM，一式三份)之抗體。將PBMC以10：1之最終E：T比率添加至靶細胞中。培育21h及40h後，藉由量化藉助凋亡/壞死細胞釋放至細胞上清液中之LDH(乳酸去氫酶，LDH檢測套組，Roche Applied Science，編號11 644 793 001)來評價靶細胞殺死。藉由使用1% Triton X-100培育靶細胞來達成靶細胞之最大溶解(=100%)。最小溶解(=0%)係指在不含雙特異性抗體的情況下共培育靶細胞與效應子細胞。結果顯示，CEA TCB介導使用人類(圖16，A、C)及食蟹猴(圖16，B、D)效應子細胞(PBMC)之CEA陽性靶細胞之靶特異性殺死。對於人類PBMC，使用GraphPadPrism5計算之與40h殺死相關之EC50值為306pM，且對於食蟹猴PBMC，EC50值為102pM。
實例14 表現CEA之人類結腸直腸癌細胞系之由CEA TCB抗體誘導的T細胞介導之殺死
評價與人類PBMC及0.8nM、4nM及20nM CEA TCB抗體一起培育後48h時表現CEA之人類結腸直腸癌細胞系之T細胞介導之殺死。簡言之，自單一健康供體獲得之白血球錐分離PBMC。使用PBS稀釋細胞(1：10)且在50mL Falcon管中在Lymphoprep上分層。離心(1800rpm，25min)後，自界面抽出PBMC層且用PBS洗滌4×。對PBMC進行計數，在可控速率冷凍條件下以40×106個細胞/mL冷凍於FCS中之10% DMSO中且儲存在液氮中直至進一步使用。對於T細胞殺死分析，將腫瘤細胞自冷凍儲備溶液直接平鋪於96孔板中。將細胞快速升 溫且立即轉移至預熱培養基中，離心，並重懸浮於完全培養基(DMEM、Iscoves或RPMI-1640，其皆補充有10% FCS及1%青黴素(penicillin)/鏈黴素(streptomycin))中，且以2.5×104個細胞/孔之密度平鋪。然後在37℃下在10% CO2加濕培育器中培育板，且第二天用100μL含有1%麩醯胺酸之RPMI 2% FCS及50μL CEA TCB(最終濃度介於6.4pM至20000pM範圍內，1：5滴定步驟，對於每一條件為一式兩份孔)更換培養基。將剛解凍之PBMC用於分析(在開始分析2小時內自冷凍小瓶解凍)，且將50μL(3×105)添加至每一孔中以獲得10：1之效應子：靶(E：T)比率。將Triton X100(50μL，4%)添加至150μL靶細胞中以獲得最大釋放值。在37℃下將板培育48h，且根據製造商之說明書使用乳糖去氫酶細胞毒性檢測套組(Roche)測定殺死活性。以[樣品釋放-自發釋放]/[最大釋放-自發釋放]×100計算特異性細胞溶解百分比。圖17 A-C顯示CEA表現(使用QIFIKIT量化之受體拷貝數，參見下文)與對31種結腸直腸癌細胞系之殺死%(列示於x軸上)之間的相關性。圖17 D顯示在20nM CEA TCB下CEA表現與特異性溶解%之間之相關性(斯皮爾曼相關係數(Spearman correlation)=0.7289，p<0.0001，n=31)，此指示展示高CEA受體拷貝數(>50 000)之腫瘤細胞藉助CEA TCB有效地溶解，而展示低CEA受體拷貝數(<10 000)之細胞簇在相同實驗條件下並未被CEA TCB溶解。圖17 E顯示CEA表現與CEA TCB之EC50之間之相關性。儘管該相關性在統計學上並不顯著(斯皮爾曼相關係數=-0.3994，p=0.1006，R2=0.1358)，但該圖清晰地顯示了對表現高CEA受體拷貝數之腫瘤細胞系較佳的CEA TCB效能(即較低EC50值)之模式。
為分析癌細胞系上之CEA表面表現，使用Qifikit(DakoCytomation,Glostrup,Denmark)來校準螢光信號且測定每個細胞之結合位點數。在冰上將細胞與小鼠抗人類CEACAM5單株抗體(0.5 μg，5×105個細胞，純系：CI-P83-1,sc-23928,Santa Cruz)一起培育30min，用PBS1X-BSA 0.1%洗滌兩次，然後與Qifikit提供之多株螢光異硫氰酸鹽偶聯之山羊抗小鼠抗體一起培育45min。使用4',6-二甲脒基-2-苯基吲哚(DAPI)染色自分析排除死細胞。在CyAnTM ADP分析儀(Beckman Coulter)上分析樣品。使用Summit 4.3軟體進行數據分析後獲得所有平均螢光強度(MFI)。使用該等MFI使用自校準曲線(Qifikit校準珠粒)獲得之方程來測定細胞系上抗體結合位點之相對數(稱為基於結果之CEA拷貝數)。
用於T細胞殺死分析及CEA表面表現量化之結腸直腸癌細胞系係自冷凍小瓶接種。用於維持冷凍儲備溶液之方法係如Bracht等人(Bracht等人(2010),Br J Cancer 103,340-346)中所闡述。
實例15 CEA TCB在與人類PBMC共移植之LS174T-fluc2人類結腸癌(E：T比率5：1)中之活體內抗腫瘤功效
向NOG(NOD/Shi-scid/IL-2Rγ基因剔除)小鼠(n=12)皮下注射預混合有人類PBMC之1×106個LS174T-fluc2細胞，其總體積為於PBS中之100μl，E：T比率為5：1。LS174T-fluc2細胞已經改造以表現螢光素酶，其容許以非侵入性及高靈敏方式藉由生物發光(BLI)來監測腫瘤進展。為評價早期及延遲治療效應，在腫瘤細胞/PBMC皮下共移植後第1天(早期治療)或第7天(延遲治療)開始，每兩週向小鼠靜脈內注射一次0.5mg/kg或2.5mg/kg CEA TCB。作為對照，每兩週向一組小鼠靜脈內注射一次2.5mg/kg具有與CEA TCB相同格式之對照TCB(在此情形下MCSP TCB用作未經靶向之對照，此乃因LS174T-fluc2細胞不表現MCSP)，且在第1天開始使額外對照組僅接受PBS(媒劑)。藉由數位卡尺每週一次量測腫瘤體積。此外，每週向小鼠腹膜內注射一次D-螢光素，且使用IVIS光譜(Perkin Elmer)量測活腫瘤細胞之生物發 光。投與治療直至腫瘤細胞接種後19天時為止，此對應於研究終止時之天數。實驗結果顯示於圖18 A-D中。結果顯示在不同研究組((A、B)早期治療，(C、D)延遲治療)中藉助卡尺(A及C)及藉助生物發光(總通量，B及D)量測之12只小鼠腫瘤體積的平均值及SEM。
實例16 CEA TCB在與人類PBMC共移植之LS174T-fluc2人類結腸癌(E：T比率1：1)中之活體內抗腫瘤功效
向NOG(NOD/Shi-scid/IL-2Rγ基因剔除)小鼠(n=10)皮下注射預混合有人類PBMC之1×106個LS174T-fluc2細胞(參見實例15)，其總體積為於PBS中之100μl，E：T比率為1：1。為評價早期及延遲治療效應，在腫瘤細胞接種後第1天(早期治療)或第7天(延遲治療)開始，每兩週向小鼠靜脈內注射一次2.5mg/kg CEA TCB。作為對照，每兩週向一組小鼠靜脈內注射一次2.5mg/kg MCSP TCB(亦參見實例15)，且在第1天開始使額外對照組僅接受PBS(媒劑)。藉由數位卡尺每週一次量測腫瘤體積。此外，每週向小鼠腹膜內注射一次D-螢光素，且使用IVIS光譜(Perkin Elmer)量測活腫瘤細胞之生物發光。投與治療直至腫瘤細胞接種後23天時為止，此對應於研究終止時之天數。實驗結果顯示於圖19中。結果顯示在不同研究組(n=10)中藉助卡尺(A)以及藉助生物發光(B)量測之腫瘤體積的平均值及SEM。
實例17 鼠源化CEA TCB在免疫活性huCD3ε/huCEA轉基因小鼠之Panco2-huCEA正位腫瘤模型中之活體內功效
向huCD3ε/huCEA轉基因小鼠(n=10)胰臟內注射總體積為於PBS中之10μl之2×105個Panco2-huCEA細胞。由於鼠類細胞不表現CEA，故鼠類胰臟癌細胞系Panco2經改造以過表現人類CEA作為CEA TCB之靶抗原。每週向小鼠靜脈內注射兩次0.5mg/kg鼠源化CEA TCB 或PBS作為對照組(媒劑)且監測存活率。每天控制動物之臨床症狀且檢測不利效應。針對動物之終止標準為可見疾病：毛不整齊、弓背、呼吸困難、運動受損。以總體存活率表示之結果顯示於圖20中。結果顯示每個時間點下之存活動物百分數。使用成對Student t測試比較治療組對PBS對照組之顯著性(p=0.078)。
實例18 藉由表面電漿子共振(SPR)量測之CEA TCB對CEA及CD3之親和力
在25℃下在Biacore T100上使用HBS-EP作為運行緩衝液(0.01M HEPES(pH 7.4)、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.005%表面活性劑P20，Biacore,Freiburg/Germany)實施表面電漿子共振(SPR)實驗。
對於親和力量測，在具有固定抗人類Fab(GE Healthcare編號28-9583-25)之CM5感測器晶片表面上捕獲CEA TCB。藉由在pH 5.0下使用標準胺偶合套組(Biacore,Freiburg/Germany)直接固定約10,000個共振單位(RU)將捕獲IgG偶合至感測器晶片表面。
為分析對人類CD3ε莖-Fc(隆凸)-Avi/CD3δ-莖-Fc(孔洞)(分別為SEQ ID NO 120及121)之相互作用，在50nM下以10μl/min經30s捕獲CEA TCB。使CD3ε/CD3δ以0.68-500nM之濃度及30μl/min之流速經360s通過流動細胞。經360s監測解離。
藉由以10μl/min經40s捕獲TCB分子來測定CEA TCB與重組腫瘤靶抗原人類NABA-avi-his(含有人類CEA(CEACAM5)之B3結構域，其由人類CEACAM1之N、A1及A2結構域圍繞且具有C末端avi 6his標籤；參見SEQ ID NO：119)之間相互作用之KD值。使抗原在0.68nM至500nM之濃度範圍下以30μl/min之流速經240s流經流動細胞。經240s量測解離。
藉由減去對參考流動細胞獲得之反應來校正本體折射率差異。在此處，使抗原流經具有固定抗人類Fab抗體但其上已注射有HBS-EP 而非CEA之表面。
使用Biacore T200評估軟體(vAA,Biacore AB,Uppsala/Sweden)衍生出動力學常數，以藉由數值積分擬合針對1：1 Langmuir結合之速率方程。使用下式計算相互作用之半衰期(t1/2)：t1/2=ln2/k解離。
CEA TCB以nM級結合至腫瘤靶及CD3ε/CD3δ，且對於人類NABA KD值為62nM，且對於人類CD3ε/CD3δ KD值為75.3nM。與NABA單價結合之半衰期為5.3分鐘，與CD3ε/CD3δ結合之半衰期為5.7分鐘。動力學值概述於表9中。
實例19 藉由表面電漿子共振(SPR)量測之MCSP TCB對MCSP及CD3之親和力
在25℃下在Biacore T100上使用HBS-EP作為運行緩衝液(0.01M HEPES(pH 7.4)、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.005%表面活性劑P20，Biacore,Freiburg/Germany)實施表面電漿子共振(SPR)實驗。
對於親和力量測，在具有固定抗人類Fab(GE Healthcare編號28-9583-25)之CM5感測器晶片表面上捕獲MCSP TCB。藉由在pH 5.0下使用標準胺偶合套組(Biacore,Freiburg/Germany)直接固定約7,500個共振單位(RU)將捕獲IgG偶合至感測器晶片表面。在30nM下以10μl/min經60s捕獲MCSP TCB。使人類及食蟹猴MCSP D3(分別參見SEQ ID NO 118及117)以0.024-50nM之濃度及30μl/min之流速經90s通過流動細胞。用於人類及食蟹猴CD3ε莖-Fc(隆凸)-Avi/CD3δ-莖- Fc(孔洞)之濃度範圍為1.17-600nM。由於預期與鼠類MCSP D3(SEQ ID NO：122)之相互作用較弱，故用於此抗原之濃度範圍經選擇介於3.9nM與500nM之間。經120s監測對所有相互作用之解離。藉由減去對參考流動細胞獲得之反應來校正本體折射率差異。在此處，使抗原流經具有固定抗人類Fab抗體但其上已注射有HBS-EP而非MCSP TCB之表面。
使用Biacore T200評估軟體(vAA,Biacore AB,Uppsala/Sweden)衍生出動力學常數，以藉由數值積分擬合針對1：1 Langmuir結合之速率方程。在穩態下測定MCSP TCB與鼠類MCSP D3之相互作用。使用下式計算相互作用之半衰期(t1/2)：t1/2=ln2/k解離。
MCSP TCB以pM級結合至腫瘤靶，且對於人類抗原KD值為0.15nM，且對於食蟹猴抗原KD值為0.12nM。MCSP TCB結合重組CD3ε/CD3δ，且KD值為78nM(人類)及104nM(食蟹猴)。對於腫瘤靶，單價結合之半衰期高達260分鐘，且對於CD3e/CD3d，單價結合之半衰期為2.9分鐘。親和力成熟後，MCSP抗體獲得與重組鼠類MCSP D3一定程度的結合。此相互作用之KD值係以mM級表示(1.6mM)。動力學值概述於表10中。
實例20 CEA TCB之熱穩定性
CEA TCB之熱穩定性係藉由動態光散射(DLS)來監測。將30μg蛋白質濃度為0.5mg/ml之過濾蛋白質樣品一式兩份施加至Dynapro板讀取器(Wyatt Technology公司；USA)。將溫度以0.05℃/min自25℃斜坡式升至75℃，且收集半徑及總散射強度。
結果顯示於圖21中。CEA TCB之聚集溫度經量測為55℃。
實例21 MCSP TCB之熱穩定性
MCSP TCB之熱穩定性係藉由動態光散射(DLS)來監測。將30μg蛋白質濃度為0.5mg/ml之過濾蛋白質樣品一式兩份施加至Dynapro板讀取器(Wyatt Technology公司；USA)。將溫度以0.05℃/min自25℃斜坡式升至75℃，且收集半徑及總散射強度。
結果顯示於圖22中。MCSP TCB之聚集溫度經量測為55℃。
實例22 表現MCSP之腫瘤靶細胞之由MCSP TCB及MCSP 1+1 CrossMab抗體誘導的T細胞介導之殺死
針對A375(高MCSP)、MV-3(中等MCSP)及HCT-116(低MCSP)腫瘤靶細胞評價靶細胞之由MCSP TCB及MCSP 1+1 CrossMab TCB(T細胞活化雙特異性抗體與MCSP TCB具有相同的CD3及MCSP結合序列，且分子格式顯示於圖1D中)抗體誘導的T細胞介導之殺死。使用LS180(MCSP陰性腫瘤細胞系)作為陰性對照。評價將靶細胞與抗體及效應子細胞(人類PBMC)一起培育後24h及48h時之腫瘤細胞殺死。簡言之，使用胰蛋白酶/EDTA收穫靶細胞，洗滌，且以25 000個細胞/孔之密度使用96孔平底板平鋪。使細胞黏著過夜。藉由對自健康人類供體獲得之富含淋巴球之製劑(血沉棕黃層)進行Histopaque密度離心 來製備外周血單核細胞(PBMC)。用無菌PBS稀釋新鮮血液且在Histopaque梯度(Sigma，編號H8889)上分層。離心(450×g，30分鐘，室溫)後，丟棄含有PBMC之中間相上方之血漿且將PBMC轉移至新Falcon管中，隨後填充50ml PBS。將混合物離心(400×g，10分鐘，室溫)，丟棄上清液且用無菌PBS將PBMC沈澱物洗滌兩次(離心步驟350×g，10分鐘)。對所得PBMC群進行自動計數(ViCell)，且將其保持在細胞培育器(37℃、5% CO2)中之含有10% FCS及1% L-丙胺醯基-L-麩醯胺酸之RPMI1640培養基(Biochrom,K0302)中直至進一步使用(不超過24h)。對於殺死分析，添加所指示濃度(範圍為0.01pM-10nM，一式三份)之抗體。將PBMC以10：1之最終E：T比率添加至靶細胞中。培育24h及48h後，藉由量化藉助凋亡/壞死細胞釋放至細胞上清液中之LDH(乳酸去氫酶，LDH檢測套組，Roche Applied Science，編號11 644 793 001)來評價靶細胞殺死。藉由使用1% Triton X-100培育靶細胞來達成靶細胞之最大溶解(=100%)。最小溶解(=0%)係指在不含雙特異性抗體的情況下共培育靶細胞與效應子細胞。結果顯示，MCSP TCB抗體比MCSP 1+1 CrossMab TCB更有效，此乃因其在兩個時間點下且針對所有腫瘤靶細胞誘導較強的MCSP陽性靶細胞殺死(圖23 A-H)。使用GraphPadPrism5計算之與殺死分析相關之EC50值於表11中給出。
實例23 在表現MCSP之腫瘤細胞之由MCSP TCB及MCSP 1+1 CrossMab抗體誘導的T細胞介導之殺死後，CD8 + 及CD4 + 效應子細胞上CD25及CD69之上調
在表現MCSP之腫瘤細胞(A375及MV-3)之由MCSP TCB及MCSP 1+1 CrossMab抗體介導的T細胞殺死後CD8+及CD4+ T細胞之活化係藉由FACS分析使用識別T細胞活化標記CD25(晚期活化標記)及CD69(早期活化標記)之抗體來評價。抗體及殺死分析條件基本上如上文所闡述(實例22)，使用相同抗體濃度範圍(0.01pM-10nM，一式三份)、E：T比率10：1及48h培育時間。
培育後，將PBMC轉移至96孔圓底板，在350×g下離心5min，且用含有0.1% BSA之PBS洗滌兩次。根據供應商之說明書，對CD8(FITC抗人類CD8，BD編號555634)、CD4(PECy7抗人類CD4，BD編號557852)、CD69(PE抗人類CD69，Biolegend編號310906)及CD25(APC抗人類CD25，BD編號555434)實施表面染色。用150μl/孔含有0.1% BSA之PBS將細胞洗滌兩次，且在4℃下使用100μl/孔固定緩衝液(BD編號554655)固定15min。離心後，將樣品重懸浮於200μl/孔含有DAPI之PBS 0.1% BSA中以排除死細胞用於FACS量測。以BD FACS Fortessa分析樣品。結果顯示，在MCSP TCB誘導殺死後CD8+ T細胞(圖24 A、B(對於A375細胞)及E、F(對於MV-3細胞))以及CD4+ T細胞(圖24 C、D(對於A375細胞)及G、H(對於MV-3細胞))上活化標記(CD25、CD69)之強且靶特異性的上調。作為殺死結果，MCSP TCB對T細胞之活化強於MCSP 1+1 CrossMab對T細胞之活化。
實例24 作為非結合抗體之含有DP47 GS之DP47 GS TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA=「未經靶向之TCB」)及作為抗CD3抗體之人類化 CH2527的製備
在上述實驗中使用「未經靶向之TCB」作為對照。雙特異性抗體銜接有CD3ε但不與任何其他抗原結合，且因此無法使T細胞與任何靶細胞交聯(且隨後無法誘導任何殺死)。因此在分析中將其用作陰性對照以監測任何非特異性T細胞活化。
將重鏈及輕鏈DNA序列之可變區與預先插入各別接受者哺乳動物表現載體中之恆定重鏈或恆定輕鏈一起亞選殖至框架中。抗體表現係藉由MPSV啟動子來驅動且在CDS之3’端處載有合成聚A信號序列。此外，每一載體皆含有EBV OriP序列。
該分子係藉由使用聚乙烯亞胺(PEI)共轉染HEK293 EBNA細胞與哺乳動物表現載體來產生。使用相應表現載體以1：2：1：1比率(「載體重鏈Fc(孔洞)」：「載體輕鏈」：「載體輕鏈Crossfab」：「載體重鏈Fc(隆凸)-FabCrossfab」)轉染細胞。
對於轉染，於CD CHO培養基中之不含血清之懸浮液中培養HEK293 EBNA細胞。為在500ml搖瓶中產生，在轉染前24小時時接種4億個HEK293 EBNA細胞。對於轉染，在210×g下將細胞離心5min，使用預熱之20ml CD CHO培養基更換上清液。在20ml CD CHO培養基中混合表現載體至200μg DNA之最終量。添加540μl PEI溶液後，將混合物渦旋15s，且隨後在室溫下培育10min。此後，將細胞與DNA/PEI溶液混合，轉移至500ml搖瓶，且在37℃下在具有5% CO2氣氛之培育器中培育3小時。培育時間後，添加160ml F17培養基且將細胞培養24小時。轉染後1天時，添加1mM丙戊酸及7%補料1(Lonza)。7天後，收集培養上清液，藉由在210×g下離心15min來純化，將溶液無菌過濾(0.22μm過濾器)且添加最終濃度為0.01% w/v之疊氮化鈉，並保持在4℃下。
使用蛋白質A藉由親和層析自細胞培養物上清液純化所分泌蛋白 質。將上清液裝載於經40ml 20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)平衡之HiTrap蛋白質A HP管柱(CV=5mL,GE Healthcare)上。藉由使用至少10管柱體積之20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)洗滌來去除未結合之蛋白質。在經20管柱體積之自20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.5)至20mM檸檬酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 2.5)梯度期間溶析靶蛋白。藉由添加1/10 0.5M磷酸鈉(pH 8)來中和蛋白質溶液。將靶蛋白濃縮且過濾，然後裝載於經20mM組胺酸、140mM氯化鈉溶液(pH 6.0)平衡之HiLoad Superdex 200管柱(GE Healthcare)上。
藉由使用基於胺基酸序列計算之莫耳消光係數量測280nm下之光學密度(OD)來測定純化蛋白質樣品之蛋白質濃度。
在還原劑存在及不存在下藉由CE-SDS分析分析分子之純度及分子量。根據製造商之說明書使用Caliper LabChip GXII系統(Caliper lifescience)。使用2μg樣品進行分析。
在25℃下使用於25mM K2HPO4、125mM NaCl、200mM L-精胺酸單鹽酸鹽、0.02%(w/v)NaN3運行緩衝液(pH 6.7)中之TSKgel G3000 SW XL分析型粒徑排阻管柱(Tosoh)分析抗體樣品之聚集物含量。
圖25及表13顯示作為非結合抗體之含有DP47 GS之DP47 GS TCB(倒轉2+1 Crossfab-IgG P329G LALA)及作為抗CD3抗體之人類化CH2527(SEQ ID NO：59、60、61及62)的CE-SDS分析。
儘管已出於清晰理解之目的藉助說明及實例相當詳細地闡述了上述發明，但描述及實例不應解釋為限制本發明之範疇。本文所引用之所有專利及科學文獻之揭示內容之全文皆以引用方式明確併入本文中。
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<223> VL CD3 CH2527(VL_7-46(13))
<400> 69
<210> 70
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LCDR1 CD3 CH2527(VL_7-46(13))
<400> 70
<210> 71
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LCDR2 CD3 CH2527(VL_7-46(13))
<400> 71
<210> 72
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LCDR3 CD3 CH2527(VL_7-46(13))
<400> 72
<210> 73
<211> 1326
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> HC MCSP M4-3(C1)
<400> 73
<210> 74
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LC MCSP ML2(G3)
<400> 74
<210> 75
<211> 336
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> VH MCSP M4-3(C1)
<400> 75
<210> 76
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> HCDR1 MCSP M4-3(C1)
<400> 76
<210> 77
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> HCDR2 MCSP M4-3(C1)
<400> 77
<210> 78
<211> 9
<212> DNA
<413> 人工序列
<220>
<223> HCDR3 MCSP M4-3(C1)
<400> 78
<210> 79
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> VL MCSP ML2(G3)
<400> 79
<210> 80
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LCDR1 MCSP ML2(G3)
<400> 80
<210> 81
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LCDR2 MCSP ML2(G3)
<400> 81
<210> 82
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LCDR3 MCSP ML2(G3)
<400> 82
<210> 83
<211> 1353
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> HC CEA CH1A1A 98-99
<400> 83
<210> 84
<211> 645
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LC CEA 2F1
<400> 84
<210> 85
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> VH CEA CH1A1A 98-99
<400> 85
<210> 86
<211> 15
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> HCDR1 CEA CH1A1A 98-99
<400> 86
<210> 87
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> HCDR2 CEA CH1A1A 98-99
<400> 87
<210> 88
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> HCDR3 CEA CH1A1A 98-99
<400> 88
<210> 89
<211> 324
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> VL CEA 2F1
<400> 89
<210> 90
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LCDR1 CEA 2F1
<400> 90
<210> 91
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LCDR2 CEA 2F1
<400> 91
<210> 92
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LCDR3 CEA 2F1
<400> 92
<210> 93
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LC CD3 CH2527(Crossfab,VL-CH1)
<400> 93
<210> 94
<211> 2055
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> MCSP M4-3(C1)(VH-CH1)-CD3 CH2527(Crossfab VH-Ck)-Fc(隆凸) P329GLALA
<400> 94
<210> 95
<211> 1326
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> MCSP M4-3(C1)(VH-CH1)-Fc(孔洞)P329GLALA
<400> 95
<210> 96
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> DC CD3 CH2527(Crossfab,VL-CH1)
<400> 96
<210> 97
<211> 2082
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> CEA CH1A1A 98/99-CD3 CH2527(Crossfab VH-Ck)-Fc(隆凸)P329GLALA
<400> 97
<210> 98
<211> 1353
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> CEA CH1A1A 98/99(VH-CH1)-Fc(孔洞)P329GLALA
<400> 98
<210> 99
<211> 645
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LC DP47 GS
<400> 99
<210> 100
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> LC CD3 CH2527(Crossfab,VL-CH1)
<400> 100
<210> 101
<211> 2064
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> DP47 GS(VH-CH1)CD3 CH2527(Crossfab VH-Ck)-Fc(隆凸)P329GLALA
<400> 101
<210> 102
<211> 1335
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> DP47 GS(VH-CH1)-Fc(孔洞)P329GLALA
<400> 102
<210> 103
<211> 207
<212> PRT
<213> 智人
<400> 103
<210> 104
<211> 198
<212> PRT
<213> 食蟹獼猴
<400> 104
<210> 105
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 連接體
<400> 105
<210> 106
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 連接體
<400> 106
<210> 107
<211> 227
<212> PRT
<213> 智人
<400> 107
<210> 108
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導肽
<400> 108
<210> 109
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導肽
<400> 109
<210> 110
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導肽
<400> 110
<210> 111
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導肽
<400> 111
<210> 112
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導肽
<400> 112
<210> 113
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導肽
<400> 113
<210> 114
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導肽
<400> 114
<210> 115
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導肽
<400> 115
<210> 116
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導肽
<400> 116
<210> 117
<211> 643
<212> PRT
<213> 食蟹獼猴
<400> 117
<210> 118
<211> 643
<212> PRT
<213> 智人
<400> 118
<210> 119
<211> 428
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NABA-avi-his
<400> 119
<210> 120
<211> 360
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> CD3e莖-Fc(隆凸)-Avi
<400> 120
<210> 121
<211> 325
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> CD3d莖-Fc(孔洞)
<400> 121
<210> 122
<211> 658
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 122

Claims (69)

  1. 一種T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括至少一個選自由SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5及SEQ ID NO：6組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9及SEQ ID NO：10之群之輕鏈CDR；(ii)第二抗原結合部分，其係能夠特異性結合至靶細胞抗原之Fab分子。
  2. 如請求項1之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：32及SEQ ID NO：33；及輕鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：7及SEQ ID NO：31。
  3. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與該胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與該胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
  4. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二抗原結合部分能夠特異性結合至癌胚胎抗原(CEA)，且包括至少一個選自由SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25及SEQ ID NO：26組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29及SEQ ID NO：30之群之輕鏈CDR。
  5. 如請求項4之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與該胺基酸序列SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與該胺基酸序列SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
  6. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二抗原結合部分能夠特異性結合至黑素瘤相關硫酸軟骨蛋白多糖(MCSP)，且包括至少一個選自由以下組成之群之重鏈互補決定區(CDR)：SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38及SEQ ID NO：40；及至少一個選自以下之群之輕鏈CDR：SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：49及SEQ ID NO：50。
  7. 如請求項6之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二抗原結合部分包括至少一個選自由SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15及SEQ ID NO：16組成之群之重鏈互補決定區(CDR)及至少一個選自SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19及SEQ ID NO：20之群之輕鏈CDR。
  8. 如請求項6之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二抗原結合部分能夠特異性結合至MCSP，且包括重鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：39及SEQ ID NO：41；及輕鏈可變區，其包括與選自以下之群之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列：SEQ ID NO： 17、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：47及SEQ ID NO：51。
  9. 如請求項6之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二抗原結合部分包括重鏈可變區，其包括與該胺基酸序列SEQ ID NO：13至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與該胺基酸序列SEQ ID NO：17至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
  10. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一抗原結合部分係其中交換該Fab輕鏈與該Fab重鏈之該等可變區或該等恆定區之交叉Fab分子。
  11. 如請求項10之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一抗原結合部分係其中交換該Fab輕鏈與該Fab重鏈之該等恆定區之交叉Fab分子。
  12. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二抗原結合部分係習用Fab分子。
  13. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括不多於一個的能夠特異性結合至CD3之抗原結合部分。
  14. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括第三抗原結合部分，該第三抗原結合部分係能夠特異性結合至靶細胞抗原之Fab分子。
  15. 如請求項14之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第三抗原結合部分係習用Fab分子。
  16. 如請求項14之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第三抗原結合部分與該第二抗原結合部分相同。
  17. 如請求項16之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第三抗 原結合部分係如請求項4或5中定義之能夠特異性結合至CEA之抗原結合部分。
  18. 如請求項16之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第三抗原結合部分係如請求項6至9中任一項中定義之能夠特異性結合至MCSP之抗原結合部分。
  19. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一與該第二抗原結合部分視情況經由肽連接體彼此融合。
  20. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二抗原結合部分係在該Fab重鏈之C末端融合至該第一抗原結合部分之該Fab重鏈之N末端。
  21. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一抗原結合部分係在該Fab重鏈之C末端融合至該第二抗原結合部分的該Fab重鏈之N末端。
  22. 如請求項20之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一抗原結合部分之該Fab輕鏈與該第二抗原結合部分之該Fab輕鏈視情況經由肽連接體彼此融合。
  23. 如請求項21之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一抗原結合部分之該Fab輕鏈與該第二抗原結合部分之該Fab輕鏈視情況經由肽連接體彼此融合。
  24. 如請求項1或2之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其另外包括(iii)Fc結構域，其係由能夠穩定締合之第一與第二亞單位構成。
  25. 如請求項24之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二抗原結合部分係在該Fab重鏈之該C末端融合至該Fc結構域的該第一或該第二亞單位之N末端。
  26. 如請求項24之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一抗 原結合部分係在該Fab重鏈之該C末端融合至該Fc結構域的該第一或第二亞單位之該N末端。
  27. 如請求項24之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一與該第二抗原結合部分係在該Fab重鏈之該C末端各自融合至該Fc結構域的該等亞單位中一者之該N末端。
  28. 如請求項24之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中第三抗原結合部分係在該Fab重鏈之C末端融合至該Fc結構域的該第一或第二亞單位之該N末端。
  29. 如請求項28之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第二與該第三抗原結合部分係在該Fab重鏈之該C末端各自融合至該Fc結構域的該等亞單位中一者之該N末端，且該第一抗原結合部分係在該Fab重鏈之該C末端融合至該第二抗原結合部分的該Fab重鏈之該N末端。
  30. 如請求項28之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一與該第三抗原結合部分係在該Fab重鏈之該C末端各自融合至該Fc結構域的該等亞單位中一者之該N末端，且該第二抗原結合部分係在該Fab重鏈之該C末端融合至該第一抗原結合部分的該Fab重鏈之該N末端。
  31. 如請求項30之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該第一及該第三抗原結合部分以及該Fc結構域係免疫球蛋白分子、尤其IgG類免疫球蛋白之一部分。
  32. 如請求項24之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域係IgG、尤其IgG1或IgG4之Fc結構域。
  33. 如請求項24之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域係人類Fc結構域。
  34. 如請求項24之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構 域包括促進該Fc結構域之該第一與該第二亞單位締合之修飾。
  35. 如請求項34之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中在該Fc結構域之該第一亞單位之CH3結構域中，胺基酸殘基經具有較大側鏈體積之胺基酸殘基置換，由此在該第一亞單位之該CH3結構域內產生可定位於該第二亞單位之CH3結構域內之空腔中的凸起，且在該Fc結構域之該第二亞單位之該CH3結構域中，胺基酸殘基經具有較小側鏈體積之胺基酸殘基置換，由此在該第二亞單位之該CH3結構域內產生空腔，該第一亞單位之該CH3結構域內之該凸起可定位於該空腔內。
  36. 如請求項24之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域展現與天然IgG1 Fc結構域相比降低的對Fc受體之結合親和力及/或降低的效應子功能。
  37. 如請求項24之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域包括一或多個降低與Fc受體之結合及/或效應子功能之胺基酸取代。
  38. 如請求項37之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該一或多個胺基酸取代位於一或多個選自L234、L235及P329(Kabat編號)之群之位置。
  39. 如請求項38之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域之每一亞單位包括三個降低與活化Fc受體之結合及/或效應子功能之胺基酸取代，其中該等胺基酸取代為L234A、L235A及P329G。
  40. 如請求項36之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc受體係Fcγ受體。
  41. 如請求項36之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該效應子功能係抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)。
  42. 一種T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括SEQ ID NO：4之重鏈互補決定區(CDR)1、SEQ ID NO：5之重鏈CDR 2、SEQ ID NO：6之重鏈CDR 3、SEQ ID NO：8之輕鏈CDR 1、SEQ ID NO：9之輕鏈CDR 2及SEQ ID NO：10之輕鏈CDR 3，其中該第一抗原結合部分係其中交換該Fab輕鏈與該Fab重鏈之該等可變區或該等恆定區、尤其該等恆定區之交叉Fab分子；(ii)第二及第三抗原結合部分，其各自係能夠特異性結合至CEA之Fab分子，且包括SEQ ID NO：24之重鏈CDR 1、SEQ ID NO：25之重鏈CDR 2、SEQ ID NO：26之重鏈CDR 3、SEQ ID NO：28之輕鏈CDR 1、SEQ ID NO：29之輕鏈CDR 2及SEQ ID NO：30之輕鏈CDR3。
  43. 如請求項42之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列，其中該第一抗原結合部分係其中交換該Fab輕鏈與該Fab重鏈之該等可變區或該等恆定區、尤其該等恆定區之交叉Fab分子；(ii)第二及第三抗原結合部分，其各自係能夠特異性結合至CEA之Fab分子，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：23至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：27至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序 列。
  44. 一種T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，且包括SEQ ID NO：4之重鏈互補決定區(CDR)1、SEQ ID NO：5之重鏈CDR 2、SEQ ID NO：6之重鏈CDR 3、SEQ ID NO：8之輕鏈CDR 1、SEQ ID NO：9之輕鏈CDR 2及SEQ ID NO：10之輕鏈CDR 3，其中該第一抗原結合部分係其中交換該Fab輕鏈與該Fab重鏈之該等可變區或該等恆定區、尤其該等恆定區之交叉Fab分子；(ii)第二及第三抗原結合部分，其各自係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，且包括SEQ ID NO：14之重鏈CDR 1、SEQ ID NO：15之重鏈CDR 2、SEQ ID NO：16之重鏈CDR 3、SEQ ID NO：18之輕鏈CDR 1、SEQ ID NO：19之輕鏈CDR 2及SEQ ID NO：20之輕鏈CDR3。
  45. 如請求項44之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其包括(i)第一抗原結合部分，其係能夠特異性結合至CD3之Fab分子，其包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：3至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：7至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列，其中該第一抗原結合部分係其中交換該Fab輕鏈與該Fab重鏈之該等可變區或該等恆定區、尤其該等恆定區之交叉Fab分子；(ii)第二及第三抗原結合部分，其各自係能夠特異性結合至MCSP之Fab分子，且包括重鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：13至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列；及輕鏈可變區，其包括與胺基酸序列SEQ ID NO：17 至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列。
  46. 如請求項42至45中任一項之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其進一步包括(iii)Fc結構域，其係由能夠穩定締合之第一與第二亞單位構成，其中將第二抗原結合部分係在該Fab重鏈之C末端融合至該第一抗原結合部分的該Fab重鏈之N末端，且該第一抗原結合部分係在該Fab重鏈之C末端融合至該Fc結構域的該第一亞單位之N末端，且其中該第三抗原結合部分係在該Fab重鏈之C末端融合至該Fc結構域的該第二亞單位之N末端。
  47. 如請求項46之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域係IgG、尤其IgG1或IgG4之Fc結構域。
  48. 如請求項46之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域係人類Fc結構域。
  49. 如請求項46之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域包括促進該Fc結構域之該第一與該第二亞單位締合之修飾。
  50. 如請求項49之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中在該Fc結構域之該第一亞單位之CH3結構域中，胺基酸殘基經具有較大側鏈體積之胺基酸殘基置換，由此在該第一亞單位之該CH3結構域內產生可定位於該第二亞單位之CH3結構域內之空腔中的凸起，且在該Fc結構域之該第二亞單位之該CH3結構域中，胺基酸殘基經具有較小側鏈體積之胺基酸殘基置換，由此在該第二亞單位之該CH3結構域內產生空腔，該第一亞單位之該CH3結構域內之該凸起可定位於該空腔內。
  51. 如請求項46之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構 域展現與天然IgG1 Fc結構域相比降低的對Fc受體之結合親和力及/或降低的效應子功能。
  52. 如請求項46之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域包括一或多個降低與Fc受體之結合及/或效應子功能之胺基酸取代。
  53. 如請求項52之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該一或多個胺基酸取代位於一或多個選自L234、L235及P329(Kabat編號)之群之位置。
  54. 如請求項53之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc結構域之每一亞單位包括三個降低與活化Fc受體之結合及/或效應子功能之胺基酸取代，其中該等胺基酸取代為L234A、L235A及P329G。
  55. 如請求項51之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該Fc受體係Fcγ受體。
  56. 如請求項51之T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其中該效應子功能係抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)。
  57. 一種經分離多核苷酸，其編碼如請求項1至56中任一項之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或其片段。
  58. 一種多肽，其係由如請求項57之多核苷酸編碼。
  59. 一種載體、尤其表現載體，其包括如請求項57之多核苷酸。
  60. 一種宿主細胞，其包括如請求項57之多核苷酸或如請求項59之載體。
  61. 一種產生能夠特異性結合至CD3及靶細胞抗原之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之方法，其包括以下步驟：a)在適於表現該T細胞活化雙特異性抗原結合分子之條件下培養如請求項60之宿主細胞，及b)回收該T細胞活化雙特異性抗原結合分子。
  62. 一種T細胞活化雙特異性抗原結合分子，其係藉由如請求項61之方法產生。
  63. 一種醫藥組合物，其包括如請求項1至56或62中任一項之T細胞活化雙特異性抗原結合分子及醫藥上可接受之載劑。
  64. 如請求項1、2、42至45及62中任一項之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或如請求項63之醫藥組合物，其用作藥劑。
  65. 如請求項1、2、42至45及62中任一項之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或如請求項63之醫藥組合物，其用於治療有需要之個體之疾病。
  66. 如請求項65之T細胞活化雙特異性抗原結合分子或醫藥組合物，其中該疾病係癌症。
  67. 一種如請求項1至56或62中任一項之T細胞活化雙特異性抗原結合分子之用途，其用於製造用來治療有需要之個體之疾病的藥劑。
  68. 如請求項67之用途，其中該疾病係癌症。
  69. 一種誘導靶細胞溶解之活體外方法，其包括使靶細胞與如請求項1至56或62中任一項之T細胞活化雙特異性抗原結合分子在T細胞存在下接觸。
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