[go: up one dir, main page]

RU2019112395A - Конъюгаты аффинная молекула-олигонуклеотид и их применения - Google Patents

Конъюгаты аффинная молекула-олигонуклеотид и их применения Download PDF

Info

Publication number
RU2019112395A
RU2019112395A RU2019112395A RU2019112395A RU2019112395A RU 2019112395 A RU2019112395 A RU 2019112395A RU 2019112395 A RU2019112395 A RU 2019112395A RU 2019112395 A RU2019112395 A RU 2019112395A RU 2019112395 A RU2019112395 A RU 2019112395A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
reservoir
sequence
polynucleotide
oligonucleotide
tcr
Prior art date
Application number
RU2019112395A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2763554C2 (ru
RU2019112395A3 (ru
Inventor
Франсуа ВИНЬО
Рэнгем Эдриан БРИГГС
Стивен Дж. ГОЛДФЛЕСС
Брайан Дж. БЕЛМОНТ
Original Assignee
АБВИТРО ЭлЭлСи
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by АБВИТРО ЭлЭлСи filed Critical АБВИТРО ЭлЭлСи
Priority claimed from PCT/US2017/013274 external-priority patent/WO2018057051A1/en
Publication of RU2019112395A publication Critical patent/RU2019112395A/ru
Publication of RU2019112395A3 publication Critical patent/RU2019112395A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2763554C2 publication Critical patent/RU2763554C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869—Methods for sequencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
    • C12N15/1065—Preparation or screening of tagged libraries, e.g. tagged microorganisms by STM-mutagenesis, tagged polynucleotides, gene tags
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602—Vertebrate cells
    • C12N5/0634—Cells from the blood or the immune system
    • C12N5/0636—T lymphocytes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6881—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
    • C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
    • C40B30/00—Methods of screening libraries
    • C40B30/04—Methods of screening libraries by measuring the ability to specifically bind a target molecule, e.g. antibody-antigen binding, receptor-ligand binding
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • G01N33/56966—Animal cells
    • G01N33/56972—White blood cells
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6872—Intracellular protein regulatory factors and their receptors, e.g. including ion channels
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
    • C12Q2563/159—Microreactors, e.g. emulsion PCR or sequencing, droplet PCR, microcapsules, i.e. non-liquid containers with a range of different permeability's for different reaction components
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
    • C12Q2563/179—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties the label being a nucleic acid
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
    • C12Q2563/185—Nucleic acid dedicated to use as a hidden marker/bar code, e.g. inclusion of nucleic acids to mark art objects or animals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/705—Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • G01N2333/70503—Immunoglobulin superfamily, e.g. VCAMs, PECAM, LFA-3
    • G01N2333/7051—T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/705—Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • G01N2333/70503—Immunoglobulin superfamily, e.g. VCAMs, PECAM, LFA-3
    • G01N2333/70514—CD4
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/705—Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • G01N2333/70503—Immunoglobulin superfamily, e.g. VCAMs, PECAM, LFA-3
    • G01N2333/70517—CD8
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/705—Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • G01N2333/70503—Immunoglobulin superfamily, e.g. VCAMs, PECAM, LFA-3
    • G01N2333/70539—MHC-molecules, e.g. HLA-molecules
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2458/00—Labels used in chemical analysis of biological material
    • G01N2458/10—Oligonucleotides as tagging agents for labelling antibodies

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Solid-Sorbent Or Filter-Aiding Compositions (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Treatment Of Liquids With Adsorbents In General (AREA)

Claims (145)

1. Способ выбора T-клеточного рецептора (TCR), включающий
(а) приведение множества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид в контакт со множеством T-клеток;
(b) прикрепление меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида или его комплементарной последовательности к
(i) олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид в резервуаре из множества резервуаров и
(ii) полинуклеотиду TCR из отдельной T-клетки из множества T-клеток в резервуаре и
(c) секвенирование олигонуклеотидной части или ее комплементарной последовательности и полинуклеотида TCR или его комплементарной последовательности, таким образом получая информацию о последовательности.
2. Способ определения аффинности связывания T-клеточного рецептора (TCR), включающий
(a) приведение множества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид в контакт со множеством T-клеток;
(b) секвенирование олигонуклеотидной части или ее комплементарной последовательности, таким образом получая информацию о последовательности; и
(c) определение аффинности связывания TCR с конъюгатом pMHC-олигонуклеотид на основании информации о последовательности.
3. Способ выбора T-клеточного рецептора (TCR), включающий
(a) приведение множества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид в контакт со множеством T-клеток, при этом молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид содержат выявляемую часть;
(b) получение обогащенной популяции T-клеток из множества T-клеток из (a) на основании выявления выявляемой части;
(c) выделение отдельной T-клетки, связанной с молекулой конъюгата pMHC-олигонуклеотид, из обогащенной популяции в первый резервуар из множества резервуаров,
(d) прикрепление меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида или его комплементарной последовательности к
(i) олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид в первом резервуаре и
(ii) полинуклеотиду TCR из отдельной T-клетки в первом резервуаре и
(e) секвенирование олигонуклеотидной части или ее комплементарной последовательности и полинуклеотида TCR или его комплементарной последовательности, таким образом получая информацию о последовательности.
4. Способ выбора T-клеточного рецептора (TCR), включающий
(a) приведение множества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид в контакт со множеством T-клеток, при этом молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид содержат выявляемую часть;
(b) получение обогащенной популяции T-клеток из множества T-клеток из (a) на основании выявления выявляемой части;
(c) выделение отдельной T-клетки, связанной с молекулой конъюгата pMHC-олигонуклеотид, из обогащенной популяции в первый резервуар из множества резервуаров,
(d) секвенирование олигонуклеотидной части или ее комплементарной последовательности и полинуклеотида TCR или его комплементарной последовательности, таким образом получая информацию о последовательности; и
(e) определение аффинности связывания TCR, кодируемого полинуклеотидом TCR, с конъюгатом pMHC-олигонуклеотид на основании информации о последовательности.
5. Способ по п. 3 или 4, при этом обогащенная популяция T-клеток содержит соотношение T-клеток, связанных с молекулой конъюгата pMHC-олигонуклеотид, к общему количеству T-клеток, которое является большим, чем соотношение T-клеток, связанных с молекулой конъюгата pMHC-олигонуклеотид, к общему количеству T-клеток во множестве T-клеток после контакта.
6. Способ выбора T-клеточного рецептора (TCR), включающий
(a) приведение первого множества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид в контакт с первым множеством T-клеток при первом соотношении молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид и клеток,
(b) приведение второго множества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид в контакт со вторым множеством T-клеток при втором соотношении молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид и клеток, которое является более низким, чем первое соотношение молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид и клеток,
(c) прикрепление первого меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида или его комплементарной последовательности к
(i) олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид в первом резервуаре из множества резервуаров и
(ii) первому полинуклеотиду TCR из отдельной T-клетки из первой популяции T-клеток в первом резервуаре,
(d) прикрепление второго меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида или его комплементарной последовательности к
(i) олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид во втором резервуаре из множества резервуаров и
(ii) второму полинуклеотиду TCR из отдельной T-клетки из второй популяции T-клеток во втором резервуаре;
(e) секвенирование олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид в первом резервуаре или ее комплементарной последовательности и первого полинуклеотида TCR или его комплементарной последовательности, таким образом получая первый набор информации о последовательности,
(f) секвенирование олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид во втором резервуаре или ее комплементарной последовательности и второго полинуклеотида TCR или его комплементарной последовательности, таким образом получая второй набор информации о последовательности,
(g) определение первого сигнала от связывания TCR, кодируемого первым полинуклеотидом TCR, с конъюгатом pMHC-олигонуклеотид на основании первого набора информации о последовательности, и определение второго сигнала от связывания TCR, кодируемого вторым полинуклеотидом TCR, с конъюгатом pMHC-олигонуклеотид на основании второго набора информации о последовательности,
при этом первый полинуклеотид TCR и второй полинуклеотид TCR кодируют один и тот же TCR.
7. Способ по п. 1 или 3, дополнительно включающий определение аффинности связывания TCR, кодируемого полинуклеотидом TCR, с конъюгатом pMHC-олигонуклеотид на основании информации о последовательности.
8. Способ по п. 6, дополнительно включающий определение аффинности связывания одного и того же TCR, кодируемого первым полинуклеотидом TCR и вторым полинуклеотидом TCR, на основании первого сигнала от связывания и второго сигнала от связывания.
9. Способ по п. 6, при этом молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид из первого и второго множества содержат один и тот же пептид.
10. Способ по п. 6 или 9, при этом MHC в составе молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид из первого и второго множества относятся к одному и тому же подтипу.
11. Способ выбора T-клеточного рецептора (TCR), включающий
(a) приведение множества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид в контакт со множеством T-клеток,
(b) прикрепление
(i) первого меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида или его комплементарной последовательности к олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид в первом резервуаре из множества резервуаров,
(ii) первому полинуклеотиду TCR из первой отдельной T-клетки из популяции T-клеток в первом резервуаре,
(iii) второго меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида или его комплементарной последовательности к олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид во втором резервуаре из множества резервуаров и
(iv) полинуклеотида TCR из второй отдельной T-клетки из популяции T-клеток во втором резервуаре;
(c) секвенирование
(i) олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид в первом резервуаре или ее комплементарной последовательности и первого полинуклеотида TCR или его комплементарной последовательности, таким образом получая первый набор информации о последовательности, содержащий риды последовательности штрих-кода резервуара полинуклеотида TCR и риды последовательности штрих-кода резервуара олигонуклеотида, и
(ii) олигонуклеотидной части молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид во втором резервуаре или ее комплементарной последовательности и второго полинуклеотида TCR или его комплементарной последовательности, таким образом получая второй набор информации о последовательности, содержащий риды последовательности штрих-кода резервуара полинуклеотида TCR и риды последовательности штрих-кода резервуара олигонуклеотида;
(d) сравнение аффинности связывания TCR, кодируемого первым полинуклеотидом TCR, и аффинности связывания TCR, кодируемого вторым полинуклеотидом TCR, при этом аффинность связывания TCR, кодируемого первым полинуклеотидом TCR, определяют на основании первого набора информации о последовательности, и при этом определение аффинности связывания TCR, кодируемого вторым полинуклеотидом TCR, осуществляют на основании второго набора информации о последовательности; и
(e) выбор TCR, кодируемого первым полинуклеотидом TCR, на основании сравнения, при этом выбранный TCR, кодируемый первым полинуклеотидом TCR, характеризуется более сильной аффинностью связывания, чем TCR, кодируемый вторым полинуклеотидом TCR.
12. Способ по п. 11, при этом первая отдельная T-клетка происходит из пациента с заболеванием или состоянием.
13. Способ по п. 12, при этом вторая отдельная T-клетка происходит из пациента без заболевания или состояния.
14. Способ по любому из пп. 1, 6-13, при этом молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид содержат выявляемую часть.
15. Способ по п. 14, при этом получение обогащенной популяции T-клеток основывается на выявлении выявляемой части.
16. Способ по п. 14 или 15, при этом выявляемая часть содержит флуорофор.
17. Способ по любому из пп. 1-16, при этом последовательность штрих-кода резервуара в меченом штрих-кодом резервуара полинуклеотиде или его комплементарной последовательности в первом резервуаре отличается от последовательности штрих-кода резервуара в меченом штрих-кодом резервуара полинуклеотиде или его ампликоне во втором резервуаре из множества резервуаров.
18. Способ по любому из пп. 1-17, при этом информация о последовательности содержит риды последовательности штрих-кода резервуара полинуклеотида TCR и риды последовательности штрих-кода резервуара олигонуклеотида.
19. Способ по любому из пп. 1, 6-18, при этом способ дополнительно включает после контакта получение обогащенной популяции T-клеток, содержащей более высокий процент T-клеток, связанных с молекулой конъюгата pMHC-олигонуклеотид, чем процент T-клеток, связанных с молекулой конъюгата pMHC-олигонуклеотид, во множестве T-клеток после контакта.
20. Способ по любому из пп. 1-19, при этом способ дополнительно включает определение количества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид, связанных с отдельной клеткой.
21. Способ по любому из пп. 1-20, при этом олигонуклеотидная часть конъюгата pMHC-олигонуклеотид содержит последовательность молекулярного штрих-кода тетрамера (TMB), которая является уникальной для отдельной молекулы конъюгата pMHC-олигонуклеотид из множества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид.
22. Способ по п. 21, при этом информация о последовательности содержит риды последовательности молекулярного штрих-кода тетрамера.
23. Способ по п. 21 или 22, при этом количество молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид, связанных с одной T-клеткой, определяют из информации о последовательности.
24. Способ по любому из пп. 21-23, при этом количество молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид, связанных с отдельной T-клеткой, определяют из ридов последовательности молекулярного штрих-кода тетрамера.
25. Способ по любому из пп. 21-24, при этом каждая молекула конъюгата pMHC-олигонуклеотид из множества молекул конъюгата pMHC-олигонуклеотид содержит уникальную последовательность TMB.
26. Способ по любому из пп. 1-25, при этом pMHC часть конъюгата pMHC-олигонуклеотид содержит мультимер pMHC, необязательно, тетрамер pMHC.
27. Способ по любому из пп. 1-26, при этом MHC присутствует в растворимой форме.
28. Способ по любому из пп. 1-27, при этом пептид в составе pMHC части конъюгата pMHC-олигонуклеотид содержит синтетический пептид.
29. Способ по любому из пп. 1-28, при этом pMHC часть связывается с T-клеточным рецептором (TCR) отдельной T-клетки.
30. Способ по любому из пп. 1-29, при этом олигонуклеотидная часть содержит идентификационную последовательность тетрамера (TID).
31. Способ по п. 30, при этом TID выступает в качестве штрих-кода для пептида или pMHC части конъюгата pMHC-олигонуклеотид.
32. Способ по любому из пп. 1-31, при этом меченый штрих-кодом резервуара полинуклеотид происходит из матричного меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида в резервуаре.
33. Способ по любому из пп. 1-32, при этом способ дополнительно включает определение характеристики отдельной T-клетки в резервуаре на основании информации о последовательности.
34. Способ по п. 33, при этом информация о последовательности содержит идентификационную последовательность тетрамера (TID) или ее комплементарную последовательность и/или содержит количество копий молекул, имеющих последовательность TID.
35. Способ по любому из пп. 1-34, при этом способ дополнительно включает отмывку множества T-клеток после контакта.
36. Способ по любому из пп. 1, 6-35, при этом способ дополнительно включает выделение отдельной T-клетки в резервуаре.
37. Способ по п. 36, при этом отдельная T-клетка связывается с конъюгатом pMHC-олигонуклеотид до выделения.
38. Способ по любому из пп. 1-37, при этом способ дополнительно включает лизис отдельной T-клетки.
39. Способ по п. 38, при этом лизис осуществляют после выделения отдельной T-клетки в резервуаре.
40. Способ по любому из пп. 1-39, при этом множество T-клеток представляет собой множество несортированных T-клеток.
41. Способ по любому из пп. 1-40, при этом последовательность штрих-кода резервуара в меченом штрих-кодом резервуара полинуклеотиде или его комплементарной последовательности в первом резервуаре из множества резервуаров отличается от последовательности штрих-кода резервуара в меченом штрих-кодом резервуара полинуклеотиде или его комплементарной последовательности во втором резервуаре из множества резервуаров.
42. Способ по любому из пп. 1-41, при этом последовательность штрих-кода резервуара в каждом меченом штрих-кодом резервуара полинуклеотиде или его комплементарной последовательности в отдельном резервуаре из множества резервуаров содержит одинаковую последовательность штрих-кода резервуара.
43. Способ по любому из пп. 1-42, при этом последовательность штрих-кода резервуара в каждом меченом штрих-кодом резервуара полинуклеотиде или его комплементарной последовательности в любом отдельном резервуаре из множества резервуаров является уникальной для последовательности штрих-кода резервуара в каждом меченом штрих-кодом резервуара полинуклеотиде или его комплементарной последовательности в любом другом отдельном резервуаре из множества резервуаров.
44. Способ по любому из пп. 1-43, при этом прикрепление меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида к олигонуклеотидной части и прикрепление меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида к полинуклеотиду TCR из отдельной T-клетки осуществляют одновременно.
45. Способ по любому из пп. 1-44, при этом способ дополнительно включает амплификацию олигонуклеотида или его комплементарной последовательности.
46. Способ по любому из пп. 1-45, при этом способ дополнительно включает амплификацию клеточного полинуклеотида TCR или его комплементарной последовательности.
47. Способ по п. 46, при этом амплификацию олигонуклеотида или его комплементарной последовательности и амплификацию полинуклеотида TCR или его комплементарной последовательности осуществляют одновременно.
48. Способ по любому из пп. 44-47, при этом последовательность штрих-кода резервуара в клеточном полинуклеотиде и последовательность штрих-кода резервуара в олигонуклеотиде является одинаковой.
49. Способ по любому из пп. 1-48, при этом способ дополнительно включает объединение олигонуклеотидов, их амплифицированных продуктов или их комплементарных последовательностей из двух или более резервуаров из множества резервуаров.
50. Способ по п. 49, при этом способ дополнительно включает объединение олигонуклеотидов, их амплифицированных продуктов или их комплементарных последовательностей и полинуклеотидов TCR или их комплементарных последовательностей из двух или более резервуаров из множества резервуаров.
51. Способ по п. 49 или 50, при этом объединение осуществляют до секвенирования.
52. Способ по любому из пп. 1-51, при этом конъюгат pMHC-олигонуклеотид содержит множество отличающихся конъюгатов pMHC-олигонуклеотид.
53. Способ по п. 52, при этом каждый конъюгат pMHC-олигонуклеотид из множества конъюгатов pMHC-олигонуклеотид содержит уникальную идентификационную последовательность тетрамера (TID).
54. Способ по любому из пп. 1-53, при этом олигонуклеотид содержит последовательность для слияния, и прикрепление включает прикрепление меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида к последовательности для слияния.
55. Способ по любому из пп. 1-54, при этом олигонуклеотид содержит последовательность для связывания праймера.
56. Способ по любому из пп. 1-55, при этом олигонуклеотид содержит константную последовательность.
57. Способ по любому из пп. 1-56, при этом способ дополнительно включает анализ последовательностей штрих-кода резервуара в ридах последовательности олигонуклеотида.
58. Способ по любому из пп. 1-57, при этом способ дополнительно включает анализ идентификационных последовательностей тетрамера (TID) в ридах последовательности олигонуклеотида.
59. Способ по любому из пп. 1-58, при этом способ дополнительно включает анализ последовательностей молекулярного штрих-кода тетрамера (TMB) в ридах последовательности олигонуклеотида.
60. Способ по п. 59, при этом анализ включает определение частоты одной или нескольких последовательностей штрих-кода резервуара, одной или нескольких последовательностей TID, одной или нескольких последовательностей молекулярного штрих-кода тетрамера (TMB) или их комбинации.
61. Способ по п. 59 или 60, при этом анализ включает сравнение.
62. Способ по любому из пп. 57-61, при этом способ дополнительно включает сравнение идентификационных последовательностей тетрамера (TID) в ридах последовательности олигонуклеотида с последовательностями молекулярного штрих-кода тетрамера (TMB) в ридах последовательности олигонуклеотида.
63. Способ по любому из пп. 44-62, при этом способ дополнительно включает секвенирование полинуклеотида TCR, его комплементарных последовательностей, его амплифицированных продуктов или их комбинации, таким образом получая риды последовательности полинуклеотида TCR.
64. Способ по п. 63, при этом способ дополнительно включает сравнение ридов последовательности олигонуклеотида с ридами последовательности полинуклеотида TCR.
65. Способ по п. 63 или 64, при этом способ дополнительно включает сравнение последовательностей штрих-кода резервуара в ридах последовательности олигонуклеотида с последовательностями штрих-кода резервуара в ридах последовательности полинуклеотида TCR.
66. Способ по любому из пп. 63-65, при этом способ дополнительно включает сравнение ридов последовательности полинуклеотида TCR.
67. Способ по любому из пп. 63-66, при этом способ дополнительно включает анализ последовательностей штрих-кода резервуара в ридах последовательности полинуклеотида TCR.
68. Способ по любому из пп. 63-67, при этом способ дополнительно включает анализ последовательностей молекулярного штрих-кода в ридах последовательности полинуклеотида TCR.
69. Способ по любому из пп. 63-68, при этом способ дополнительно включает определение характеристики клетки на основании анализа или сравнения.
70. Способ по любому из пп. 57-69, при этом способ дополнительно включает выбор TCR на основании ридов последовательности олигонуклеотида.
71. Способ по любому из пп. 63-70, при этом способ включает выбор TCR на основании ридов последовательности полинуклеотида TCR.
72. Способ по любому из пп. 1-71, при этом меченый штрих-кодом резервуара полинуклеотид, прикрепленный к олигонуклеотиду, и меченый штрих-кодом резервуара полинуклеотид, прикрепленный к полинуклеотиду TCR, происходят из одного и того же матричного меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида в резервуаре.
73. Способ по любому из пп. 1-72, при этом меченый штрих-кодом резервуара полинуклеотид, прикрепленный к олигонуклеотиду, представляет собой продукт амплификации матричного меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида.
74. Способ по п. 72 или 73, при этом меченый штрих-кодом резервуара полинуклеотид, прикрепленный к полинуклеотиду TCR, представляет собой продукт амплификации матричного меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида.
75. Способ по любому из пп. 1-74, при этом резервуар содержит твердую подложку.
76. Способ по любому из пп. 1-74, при этом резервуар не содержит твердую подложку.
77. Способ по любому из пп. 1-76, при этом каждый резервуар из множества резервуаров содержит отдельную клетку.
78. Способ по любому из пп. 1-77, при этом резервуар представляет собой лунку, эмульсию или каплю.
79. Способ по любому из пп. 1-78, при этом матричный меченый штрих-кодом резервуара полинуклеотид не связан с твердой подложкой.
80. Способ по любому из пп. 1-78, при этом матричный меченый штрих-кодом резервуара полинуклеотид связан с твердой подложкой.
81. Способ по любому из пп. 1-80, при этом способ дополнительно включает прикрепление последовательности молекулярного штрих-кода в меченом молекулярным штрих-кодом полинуклеотиде из множества меченых молекулярным штрих-кодом полинуклеотидов к полинуклеотиду TCR, при этом последовательность молекулярного штрих-кода выступает в качестве штрих-кода для отдельной молекулы полинуклеотида TCR и ее амплифицированных продуктов.
82. Способ по любому из пп. 1-81, при этом прикрепление включает лигирование меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида или его комплементарной последовательности с олигонуклеотидом.
83. Способ по любому из пп. 1-82, при этом прикрепление включает прикрепление меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида или его комплементарной последовательности к олигонуклеотиду с помощью фермента.
84. Способ по любому из пп. 1-83, при этом прикрепление включает гибридизацию меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида или его комплементарной последовательности с олигонуклеотидом.
85. Способ по п. 84, при этом прикрепление дополнительно включает достройку олигонуклеотида.
86. Способ по любому из пп. 1-85, при этом прикрепление включает амплификацию матричного меченого штрих-кодом резервуара полинуклеотида.
87. Способ по любому из пп. 1-86, при этом олигонуклеотид является двухцепочечным.
88. Способ по любому из пп. 1-86, при этом олигонуклеотид является одноцепочечным.
89. Способ по любому из пп. 1-88, при этом олигонуклеотид представляет собой ДНК.
90. Способ по любому из пп. 1-88, при этом олигонуклеотид представляет собой РНК.
91. Способ по любому из пп. 1-90, при этом клеточный полинуклеотид содержит последовательность вариабельного участка.
92. Способ по любому из пп. 1-91, при этом способ дополнительно включает спаривание последовательностей нативных цепей TCR, содержащих последовательность вариабельного участка.
93. Способ по любому из пп. 1-92, при этом полинуклеотид TCR представляет собой ДНК.
94. Способ по любому из пп. 1-93, при этом полинуклеотид TCR представляет собой РНК.
95. Способ по п. 94, при этом РНК представляет собой мРНК.
96. Композиция, содержащая множество резервуаров, при этом резервуар из множества резервуаров содержит
(a) отдельную T-клетку из образца, содержащего множество T-клеток, и
(b) меченый штрих-кодом резервуара полинуклеотид, содержащий последовательность штрих-кода резервуара,
при этом резервуар дополнительно содержит конъюгат pMHC-олигонуклеотид, который связывается с TCR отдельной T-клетки.
97. Композиция, содержащая множество резервуаров, при этом резервуар из множества резервуаров содержит
(a) отдельную лизированную T-клетку из образца, содержащего множество T-клеток, и (b) конъюгат pMHC-олигонуклеотид, содержащий pMHC часть, которая связывается с TCR отдельной лизированной T-клетки;
при этом олигонуклеотидная часть конъюгата pMHC-олигонуклеотид содержит последовательность штрих-кода резервуара, и при этом полинуклеотид TCR из отдельной лизированной T-клетки содержит одинаковую последовательность штрих-кода резервуара.
RU2019112395A 2015-09-24 2017-01-12 Конъюгаты аффинная молекула-олигонуклеотид и их применения RU2763554C2 (ru)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562232209P 2015-09-24 2015-09-24
PCT/US2016/053598 WO2017053905A1 (en) 2015-09-24 2016-09-24 Affinity-oligonucleotide conjugates and uses thereof
USPCT/US2016/053598 2016-09-24
PCT/US2017/013274 WO2018057051A1 (en) 2016-09-24 2017-01-12 Affinity-oligonucleotide conjugates and uses thereof

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2019112395A true RU2019112395A (ru) 2020-10-26
RU2019112395A3 RU2019112395A3 (ru) 2020-11-30
RU2763554C2 RU2763554C2 (ru) 2021-12-30

Family

ID=57121536

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019112395A RU2763554C2 (ru) 2015-09-24 2017-01-12 Конъюгаты аффинная молекула-олигонуклеотид и их применения

Country Status (17)

Country Link
US (4) US11156611B2 (ru)
EP (3) EP3933047A1 (ru)
JP (2) JP6869233B2 (ru)
KR (2) KR20180085717A (ru)
CN (2) CN108291257B (ru)
AU (1) AU2016326737B2 (ru)
BR (1) BR112018005937A2 (ru)
CA (2) CA2999888C (ru)
ES (1) ES2928681T3 (ru)
IL (1) IL258248B (ru)
MX (3) MX2018003532A (ru)
MY (2) MY193806A (ru)
PH (2) PH12018500647A1 (ru)
RU (1) RU2763554C2 (ru)
SA (1) SA518391159B1 (ru)
SG (1) SG10201912906RA (ru)
WO (1) WO2017053905A1 (ru)

Families Citing this family (113)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8835358B2 (en) 2009-12-15 2014-09-16 Cellular Research, Inc. Digital counting of individual molecules by stochastic attachment of diverse labels
WO2013130674A1 (en) 2012-02-27 2013-09-06 Cellular Research, Inc. Compositions and kits for molecular counting
US10221442B2 (en) 2012-08-14 2019-03-05 10X Genomics, Inc. Compositions and methods for sample processing
US10273541B2 (en) 2012-08-14 2019-04-30 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
US10323279B2 (en) 2012-08-14 2019-06-18 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
US10752949B2 (en) 2012-08-14 2020-08-25 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
EP4397767A3 (en) 2012-08-14 2024-07-31 10X Genomics, Inc. Microcapsule compositions and methods
US9701998B2 (en) 2012-12-14 2017-07-11 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
US9951386B2 (en) 2014-06-26 2018-04-24 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
US11591637B2 (en) 2012-08-14 2023-02-28 10X Genomics, Inc. Compositions and methods for sample processing
US10400280B2 (en) 2012-08-14 2019-09-03 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
WO2014093676A1 (en) 2012-12-14 2014-06-19 10X Technologies, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
US10533221B2 (en) 2012-12-14 2020-01-14 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
WO2014124336A2 (en) 2013-02-08 2014-08-14 10X Technologies, Inc. Partitioning and processing of analytes and other species
US9567645B2 (en) 2013-08-28 2017-02-14 Cellular Research, Inc. Massively parallel single cell analysis
JP6726659B2 (ja) 2014-04-10 2020-07-22 １０エックス ジェノミクス， インコーポレイテッド 試薬をカプセル化およびパーティション化するための流体デバイス、システム、および方法、ならびにそれらの応用
EP3155426B1 (en) 2014-06-13 2023-07-19 Immudex ApS General detection and isolation of specific cells by binding of labeled molecules
US12312640B2 (en) 2014-06-26 2025-05-27 10X Genomics, Inc. Analysis of nucleic acid sequences
AU2015279617A1 (en) 2014-06-26 2017-01-12 10X Genomics, Inc. Analysis of nucleic acid sequences
MX2016016902A (es) 2014-06-26 2017-03-27 10X Genomics Inc Metodos para analizar acidos nucleicos de celulas individuales o poblaciones de celulas.
CA2964472A1 (en) 2014-10-29 2016-05-06 10X Genomics, Inc. Methods and compositions for targeted nucleic acid sequencing
US9975122B2 (en) 2014-11-05 2018-05-22 10X Genomics, Inc. Instrument systems for integrated sample processing
WO2016114970A1 (en) 2015-01-12 2016-07-21 10X Genomics, Inc. Processes and systems for preparing nucleic acid sequencing libraries and libraries prepared using same
EP4286516A3 (en) 2015-02-24 2024-03-06 10X Genomics, Inc. Partition processing methods and systems
JP2018505688A (ja) 2015-02-24 2018-03-01 １０エックス ゲノミクス，インコーポレイテッド 標的化核酸配列包括度（ｃｏｖｅｒａｇｅ）のための方法
US9727810B2 (en) 2015-02-27 2017-08-08 Cellular Research, Inc. Spatially addressable molecular barcoding
CN107406888A (zh) 2015-03-30 2017-11-28 赛卢拉研究公司 用于组合条形编码的方法和组合物
EP3286326B1 (en) 2015-04-23 2025-01-22 Becton, Dickinson and Company Method for whole transcriptome amplification
KR102395450B1 (ko) 2015-09-11 2022-05-09 셀룰러 리서치, 인크. 핵산 라이브러리 정규화를 위한 방법 및 조성물
KR20180083313A (ko) 2015-09-24 2018-07-20 에이비비트로, 엘엘씨 Hiv 항체 조성물 및 사용 방법
EP3933047A1 (en) 2015-09-24 2022-01-05 AbVitro LLC Affinity-oligonucleotide conjugates and uses thereof
JP6954899B2 (ja) 2015-12-04 2021-10-27 １０エックス ゲノミクス，インコーポレイテッド 核酸の解析のための方法及び組成物
WO2017197343A2 (en) 2016-05-12 2017-11-16 10X Genomics, Inc. Microfluidic on-chip filters
WO2017197338A1 (en) 2016-05-13 2017-11-16 10X Genomics, Inc. Microfluidic systems and methods of use
US10301677B2 (en) 2016-05-25 2019-05-28 Cellular Research, Inc. Normalization of nucleic acid libraries
US10640763B2 (en) 2016-05-31 2020-05-05 Cellular Research, Inc. Molecular indexing of internal sequences
US10202641B2 (en) 2016-05-31 2019-02-12 Cellular Research, Inc. Error correction in amplification of samples
AU2017331459B2 (en) * 2016-09-26 2023-04-13 Becton, Dickinson And Company Measurement of protein expression using reagents with barcoded oligonucleotide sequences
US10550429B2 (en) 2016-12-22 2020-02-04 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
US10011872B1 (en) 2016-12-22 2018-07-03 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
US10815525B2 (en) 2016-12-22 2020-10-27 10X Genomics, Inc. Methods and systems for processing polynucleotides
GB201622222D0 (en) * 2016-12-23 2017-02-08 Cs Genetics Ltd Reagents and methods for molecular barcoding of nucleic acids of single cells
WO2018132392A2 (en) * 2017-01-10 2018-07-19 President And Fellows Of Harvard College Multiplexed signal amplification
EP4628582A3 (en) 2017-01-30 2025-12-24 10X Genomics, Inc. Methods and systems for droplet-based single cell barcoding
US12264411B2 (en) 2017-01-30 2025-04-01 10X Genomics, Inc. Methods and systems for analysis
EP3577232A1 (en) 2017-02-01 2019-12-11 Cellular Research, Inc. Selective amplification using blocking oligonucleotides
EP3601605B1 (en) * 2017-03-24 2023-11-22 National University of Singapore Methods for multiplex detection of molecules
EP3620529A4 (en) * 2017-05-02 2021-02-24 The University of Tokyo METHOD FOR MONITORING DYNAMIC CHANGES IN CELLS OR SUBSTANCES DERIVED FROM CELLS AND METHODS FOR CLASSIFYING THE CELL THEREOF
JP6846832B2 (ja) * 2017-05-02 2021-03-24 国立大学法人 東京大学 一細胞の非破壊的計測情報とゲノム関連情報とを一体的に検出する方法
EP3445876B1 (en) 2017-05-26 2023-07-05 10X Genomics, Inc. Single cell analysis of transposase accessible chromatin
US20180340169A1 (en) 2017-05-26 2018-11-29 10X Genomics, Inc. Single cell analysis of transposase accessible chromatin
AU2018273999A1 (en) * 2017-05-26 2019-12-05 Abvitro Llc High-throughput polynucleotide library sequencing and transcriptome analysis
US10676779B2 (en) * 2017-06-05 2020-06-09 Becton, Dickinson And Company Sample indexing for single cells
MA50079A (fr) 2017-09-07 2020-07-15 Juno Therapeutics Inc Procédés d'identification de caractéristiques cellulaires relatives à des réponses associées à une thérapie cellulaire
EP3954782A1 (en) 2017-11-15 2022-02-16 10X Genomics, Inc. Functionalized gel beads
EP3710594B1 (en) * 2017-11-16 2023-07-19 The Regents of The University of Colorado, A Body Corporate Methods to measure functional heterogeneity among single cells
US10829815B2 (en) 2017-11-17 2020-11-10 10X Genomics, Inc. Methods and systems for associating physical and genetic properties of biological particles
GB201801481D0 (en) * 2018-01-30 2018-03-14 Immunovia Ab Methods, conjugates and systems
SG11202007686VA (en) * 2018-02-12 2020-09-29 10X Genomics Inc Methods characterizing multiple analytes from individual cells or cell populations
JP2021516049A (ja) * 2018-03-01 2021-07-01 ザ ユニバーシティ オブ カンザス 組換えｔ細胞受容体遺伝子を用いて細胞ベースの治療薬を製造するための技法
EP3775271B1 (en) 2018-04-06 2025-03-12 10X Genomics, Inc. Systems and methods for quality control in single cell processing
JP7407128B2 (ja) 2018-05-03 2023-12-28 ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー ハイスループットマルチオミクスサンプル解析
JP7358388B2 (ja) 2018-05-03 2023-10-10 ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー 反対側の転写物末端における分子バーコーディング
WO2019217758A1 (en) 2018-05-10 2019-11-14 10X Genomics, Inc. Methods and systems for molecular library generation
WO2019226631A1 (en) * 2018-05-21 2019-11-28 The Regents Of The University Of California Single cell mapping and transcriptome analysis
WO2019236571A1 (en) * 2018-06-04 2019-12-12 Chan Zuckerberg Biohub, Inc. Compositions and methods involving non-natural aptamer libraries
WO2019236548A1 (en) 2018-06-04 2019-12-12 Chan Zuckerberg Biohub, Inc. Compositions and methods for screening aptamers
CN118853827A (zh) 2018-10-01 2024-10-29 贝克顿迪金森公司 确定5’转录物序列
US11932849B2 (en) 2018-11-08 2024-03-19 Becton, Dickinson And Company Whole transcriptome analysis of single cells using random priming
EP3876956A4 (en) 2018-11-08 2022-12-28 The Regents of The University of California SYSTEMS AND METHODS FOR TARGETING CANCER CELLS
WO2020102287A1 (en) * 2018-11-14 2020-05-22 University Of Hawaii Compositions and methods for the synthesis and identification of covalent aptamers
WO2020123384A1 (en) 2018-12-13 2020-06-18 Cellular Research, Inc. Selective extension in single cell whole transcriptome analysis
EP3899538A4 (en) * 2018-12-18 2022-11-30 MBL International Corp. COMPOSITIONS OF PMHC OCCUPANCY STREPTAVIDIN OLIGO CONJUGATES
BR112021013206A2 (pt) * 2019-01-04 2021-11-23 Repertoire Immune Medicines Inc Bibliotecas de peptídeos e respectivos métodos de uso
US11661631B2 (en) 2019-01-23 2023-05-30 Becton, Dickinson And Company Oligonucleotides associated with antibodies
CN113423720A (zh) * 2019-02-04 2021-09-21 国立大学法人爱媛大学 CAR文库和scFv的制造方法
CN120099139A (zh) 2019-02-14 2025-06-06 贝克顿迪金森公司 杂合体靶向和全转录物组扩增
CN109979528B (zh) * 2019-03-28 2021-06-25 广州基迪奥生物科技有限公司 一种单细胞免疫组库测序数据的分析方法
AU2020253479A1 (en) * 2019-04-02 2021-11-11 Mission Bio, Inc. Methods and systems for Proteomic profiling and characterization
US11365441B2 (en) 2019-05-22 2022-06-21 Mission Bio, Inc. Method and apparatus for simultaneous targeted sequencing of DNA, RNA and protein
CN114051534B (zh) 2019-07-22 2025-02-21 贝克顿迪金森公司 单细胞染色质免疫沉淀测序测定
WO2021030447A1 (en) * 2019-08-12 2021-02-18 Mission Bio, Inc. Method, system and apparatus for multi-omic simultaneous detection of protein expression, single nucleotide variations, and copy number variations in the same single cells
IL291859A (en) * 2019-10-03 2022-06-01 Regeneron Pharma A high-throughput method for screening t-cell cognate and epitope reactivity in primary human cells
JP2022550596A (ja) * 2019-10-05 2022-12-02 ミッション バイオ インコーポレイテッド シングルセルで同時に検出されるコピー数変動及び単一ヌクレオチド変動のための方法、システム、及び装置
EP4048313A4 (en) * 2019-10-25 2023-05-31 Phitonex, Inc. POLYNUCLEOTIDE-LINKED BIOCONJUGATES AND METHODS OF PREPARING AND USING
ES2987640T3 (es) 2019-11-08 2024-11-15 Becton Dickinson Co Uso de cebado aleatorio para obtener información de V(D)J de longitud completa para la secuenciación del repertorio inmunitario
CN111223532B (zh) * 2019-11-14 2023-06-20 腾讯科技（深圳）有限公司 确定目标化合物的反应物的方法、设备、装置、介质
WO2021113290A1 (en) 2019-12-03 2021-06-10 Alamar Biosciences, Inc. Nucleic acid linked immune-sandwich assay (nulisa)
WO2021146207A1 (en) 2020-01-13 2021-07-22 Becton, Dickinson And Company Methods and compositions for quantitation of proteins and rna
ES2993319T3 (en) 2020-01-29 2024-12-27 Becton Dickinson Co Barcoded wells for spatial mapping of single cells through sequencing
US12449419B1 (en) 2020-02-12 2025-10-21 10X Genomics, Inc. Methods for detecting binding of peptide-MHC monomers to T cells
US12153043B2 (en) 2020-02-25 2024-11-26 Becton, Dickinson And Company Bi-specific probes to enable the use of single-cell samples as single color compensation control
KR20220155349A (ko) * 2020-03-18 2022-11-22 찬 주커버그 바이오허브, 인크. 단일-세포 조합 인덱싱된 세포 분석 시퀀싱
CN115605614A (zh) 2020-05-14 2023-01-13 贝克顿迪金森公司（Us） 用于免疫组库谱分析的引物
EP4407030B1 (en) 2020-06-02 2025-12-17 Becton, Dickinson and Company Oligonucleotides and beads for 5 prime gene expression assay
JPWO2022009642A1 (ru) * 2020-07-06 2022-01-13
US11932901B2 (en) 2020-07-13 2024-03-19 Becton, Dickinson And Company Target enrichment using nucleic acid probes for scRNAseq
WO2022026909A1 (en) 2020-07-31 2022-02-03 Becton, Dickinson And Company Single cell assay for transposase-accessible chromatin
WO2022032195A2 (en) * 2020-08-06 2022-02-10 Singular Genomics Systems, Inc. Spatial sequencing
WO2022076914A1 (en) * 2020-10-09 2022-04-14 10X Genomics, Inc. Methods and compositions for profiling immune repertoire
US11739443B2 (en) 2020-11-20 2023-08-29 Becton, Dickinson And Company Profiling of highly expressed and lowly expressed proteins
EP4263859A1 (en) 2020-12-15 2023-10-25 Becton, Dickinson and Company Single cell secretome analysis
CN117178061A (zh) * 2021-02-23 2023-12-05 10X基因组学有限公司 单细胞聚糖谱分析
WO2022190733A1 (ja) * 2021-03-10 2022-09-15 ソニーグループ株式会社 生体粒子分析方法及び生体粒子分析用試薬キット
CA3210998A1 (en) * 2021-03-19 2022-09-22 Paris Sciences Et Lettres Methods for the selective analysis of cells or organelles
CN118176298A (zh) * 2021-08-12 2024-06-11 香港大学 综合定义适应性免疫应答的材料和方法
US11753677B2 (en) * 2021-11-10 2023-09-12 Encodia, Inc. Methods for barcoding macromolecules in individual cells
US20250003973A1 (en) * 2021-12-07 2025-01-02 Fred Hutchinson Cancer Center Synthetic constructs and methods for processing antigen-specific cells
WO2023225201A1 (en) * 2022-05-20 2023-11-23 10X Genomics, Inc. Compositions and methods for characterizing t cell, or t cell-like, receptors from single cells
WO2024015378A1 (en) * 2022-07-13 2024-01-18 10X Genomics, Inc. Methods and systems for characterizing antigen-binding molecules expressed by immune cells
EP4680269A1 (en) 2023-03-13 2026-01-21 H. Lee Moffitt Cancer Center And Research Institute, Inc. Composition of selected tumor infiltrating lymphocytes and related methods of producing and using the same
WO2025080865A1 (en) 2023-10-11 2025-04-17 Turnstone Biologics Corp. Combination of tumor infiltrating lymphocytes (til) and low dose radiation
WO2025096638A2 (en) 2023-10-30 2025-05-08 Turnstone Biologics Corp. Genetically modified tumor infilitrating lymphocytes and methods of producing and using the same

Family Cites Families (93)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5242794A (en) 1984-12-13 1993-09-07 Applied Biosystems, Inc. Detection of specific sequences in nucleic acids
US5019384A (en) 1986-06-30 1991-05-28 Massachusetts Institute Of Technology Immunonodulating compositions and their use
US4988617A (en) 1988-03-25 1991-01-29 California Institute Of Technology Method of detecting a nucleotide change in nucleic acids
WO1989012624A2 (en) 1988-06-14 1989-12-28 Cetus Corporation Coupling agents and sterically hindered disulfide linked conjugates prepared therefrom
US5168038A (en) 1988-06-17 1992-12-01 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University In situ transcription in cells and tissues
US5242974A (en) 1991-11-22 1993-09-07 Affymax Technologies N.V. Polymer reversal on solid surfaces
US5424186A (en) 1989-06-07 1995-06-13 Affymax Technologies N.V. Very large scale immobilized polymer synthesis
US5744101A (en) 1989-06-07 1998-04-28 Affymax Technologies N.V. Photolabile nucleoside protecting groups
US5143854A (en) 1989-06-07 1992-09-01 Affymax Technologies N.V. Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof
US5527681A (en) 1989-06-07 1996-06-18 Affymax Technologies N.V. Immobilized molecular synthesis of systematically substituted compounds
DE3920358A1 (de) 1989-06-22 1991-01-17 Behringwerke Ag Bispezifische und oligospezifische, mono- und oligovalente antikoerperkonstrukte, ihre herstellung und verwendung
US5252743A (en) 1989-11-13 1993-10-12 Affymax Technologies N.V. Spatially-addressable immobilization of anti-ligands on surfaces
US5494810A (en) 1990-05-03 1996-02-27 Cornell Research Foundation, Inc. Thermostable ligase-mediated DNA amplifications system for the detection of genetic disease
US5210015A (en) 1990-08-06 1993-05-11 Hoffman-La Roche Inc. Homogeneous assay system using the nuclease activity of a nucleic acid polymerase
US5733523A (en) 1990-12-10 1998-03-31 Akzo Nobel N.V. Targeted delivery of a therapeutic entity using complementary oligonucleotides
JP3266311B2 (ja) 1991-05-02 2002-03-18 生化学工業株式会社 新規ポリペプチドおよびこれを用いる抗ｈｉｖ剤
EP1086742B2 (en) 1991-11-22 2007-03-14 Affymetrix, Inc. (a Delaware Corporation) Combinatorial strategies for polymer synthesis
US5324633A (en) 1991-11-22 1994-06-28 Affymax Technologies N.V. Method and apparatus for measuring binding affinity
US5550215A (en) 1991-11-22 1996-08-27 Holmes; Christopher P. Polymer reversal on solid surfaces
US5384261A (en) 1991-11-22 1995-01-24 Affymax Technologies N.V. Very large scale immobilized polymer synthesis using mechanically directed flow paths
WO1993011161A1 (en) 1991-11-25 1993-06-10 Enzon, Inc. Multivalent antigen-binding proteins
EP0746609A4 (en) 1991-12-17 1997-12-17 Genpharm Int NON-HUMAN TRANSGENIC ANIMALS CAPABLE OF PRODUCING HETEROLOGOUS ANTIBODIES
US5491074A (en) 1993-04-01 1996-02-13 Affymax Technologies Nv Association peptides
US5837832A (en) 1993-06-25 1998-11-17 Affymetrix, Inc. Arrays of nucleic acid probes on biological chips
US5858659A (en) 1995-11-29 1999-01-12 Affymetrix, Inc. Polymorphism detection
US5925517A (en) 1993-11-12 1999-07-20 The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. Detectably labeled dual conformation oligonucleotide probes, assays and kits
US6090555A (en) 1997-12-11 2000-07-18 Affymetrix, Inc. Scanned image alignment systems and methods
US5578832A (en) 1994-09-02 1996-11-26 Affymetrix, Inc. Method and apparatus for imaging a sample on a device
US5631734A (en) 1994-02-10 1997-05-20 Affymetrix, Inc. Method and apparatus for detection of fluorescently labeled materials
WO1995030774A1 (en) 1994-05-05 1995-11-16 Beckman Instruments, Inc. Oligonucleotide repeat arrays
US5571639A (en) 1994-05-24 1996-11-05 Affymax Technologies N.V. Computer-aided engineering system for design of sequence arrays and lithographic masks
US5795716A (en) 1994-10-21 1998-08-18 Chee; Mark S. Computer-aided visualization and analysis system for sequence evaluation
US5599695A (en) 1995-02-27 1997-02-04 Affymetrix, Inc. Printing molecular library arrays using deprotection agents solely in the vapor phase
US5635363A (en) 1995-02-28 1997-06-03 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Compositions and methods for the detection, quantitation and purification of antigen-specific T cells
US5750341A (en) 1995-04-17 1998-05-12 Lynx Therapeutics, Inc. DNA sequencing by parallel oligonucleotide extensions
US5624711A (en) 1995-04-27 1997-04-29 Affymax Technologies, N.V. Derivatization of solid supports and methods for oligomer synthesis
SE504798C2 (sv) 1995-06-16 1997-04-28 Ulf Landegren Immunanalys och testkit med två reagens som kan tvärbindas om de adsorberats till analyten
US5968740A (en) 1995-07-24 1999-10-19 Affymetrix, Inc. Method of Identifying a Base in a Nucleic Acid
EP0862656B1 (en) 1995-11-21 2001-03-07 Yale University Unimolecular segment amplification and detection
US6852487B1 (en) 1996-02-09 2005-02-08 Cornell Research Foundation, Inc. Detection of nucleic acid sequence differences using the ligase detection reaction with addressable arrays
EP0902885A4 (en) 1996-05-16 2006-09-27 Affymetrix Inc SYSTEMS AND METHODS FOR DETECTION OF BRANDED PRODUCTS
EP1736554B1 (en) 1996-05-29 2013-10-09 Cornell Research Foundation, Inc. Detection of nucleic acid sequence differences using coupled ligase detection and polymerase chain reactions
DE69739357D1 (de) 1996-06-04 2009-05-28 Univ Utah Res Found Überwachung der hybridisierung während pcr
GB9703369D0 (en) 1997-02-18 1997-04-09 Lindqvist Bjorn H Process
US6620587B1 (en) 1997-05-28 2003-09-16 Discerna Limited Ribosome complexes as selection particles for in vitro display and evolution of proteins
US6033860A (en) 1997-10-31 2000-03-07 Affymetrix, Inc. Expression profiles in adult and fetal organs
US6428752B1 (en) 1998-05-14 2002-08-06 Affymetrix, Inc. Cleaning deposit devices that form microarrays and the like
US6269846B1 (en) 1998-01-13 2001-08-07 Genetic Microsystems, Inc. Depositing fluid specimens on substrates, resulting ordered arrays, techniques for deposition of arrays
US6054276A (en) 1998-02-23 2000-04-25 Macevicz; Stephen C. DNA restriction site mapping
US5936324A (en) 1998-03-30 1999-08-10 Genetic Microsystems Inc. Moving magnet scanner
US6780591B2 (en) 1998-05-01 2004-08-24 Arizona Board Of Regents Method of determining the nucleotide sequence of oligonucleotides and DNA molecules
EP1082458A1 (en) 1998-05-01 2001-03-14 Arizona Board Of Regents Method of determining the nucleotide sequence of oligonucleotides and dna molecules
CA2336582C (en) 1998-07-10 2006-06-06 Meija Seika Kaisha Ltd. Novel x-ray intercepting metal complexes of chlorin derivatives
US6787308B2 (en) 1998-07-30 2004-09-07 Solexa Ltd. Arrayed biomolecules and their use in sequencing
EP1165839A2 (en) 1999-03-26 2002-01-02 Whitehead Institute For Biomedical Research Universal arrays
US6582938B1 (en) 2001-05-11 2003-06-24 Affymetrix, Inc. Amplification of nucleic acids
US7306904B2 (en) 2000-02-18 2007-12-11 Olink Ab Methods and kits for proximity probing
US6686184B1 (en) 2000-05-25 2004-02-03 President And Fellows Of Harvard College Patterning of surfaces utilizing microfluidic stamps including three-dimensionally arrayed channel networks
US7902121B2 (en) 2001-07-02 2011-03-08 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University MHC-antigen arrays for detection and characterization of immune responses
IL160359A0 (en) 2001-08-31 2004-07-25 Avidex Ltd Soluble t cell receptor
GB0127564D0 (en) 2001-11-16 2002-01-09 Medical Res Council Emulsion compositions
JP2006507921A (ja) 2002-06-28 2006-03-09 プレジデント・アンド・フェロウズ・オブ・ハーバード・カレッジ 流体分散のための方法および装置
CA2501870C (en) 2002-10-09 2013-07-02 Avidex Limited Single chain recombinant t cell receptors
US20060078893A1 (en) 2004-10-12 2006-04-13 Medical Research Council Compartmentalised combinatorial chemistry by microfluidic control
WO2004091763A2 (en) 2003-04-10 2004-10-28 President And Fellows Of Harvard College Formation and control of fluidic species
EP2662135A3 (en) 2003-08-27 2013-12-25 President and Fellows of Harvard College Method for mixing droplets in a microchannel
US7169560B2 (en) 2003-11-12 2007-01-30 Helicos Biosciences Corporation Short cycle methods for sequencing polynucleotides
US20050221339A1 (en) 2004-03-31 2005-10-06 Medical Research Council Harvard University Compartmentalised screening by microfluidic control
US7643818B2 (en) 2004-11-22 2010-01-05 Seven Networks, Inc. E-mail messaging to/from a mobile terminal
CA2599683A1 (en) 2005-03-04 2006-09-14 President And Fellows Of Harvard College Method and apparatus for forming multiple emulsions
EP2485052B1 (en) 2005-09-13 2015-05-06 Affymetrix, Inc. Encoded microparticles
US20100137163A1 (en) 2006-01-11 2010-06-03 Link Darren R Microfluidic Devices and Methods of Use in The Formation and Control of Nanoreactors
GB0600927D0 (en) * 2006-01-17 2006-02-22 Glaxosmithkline Biolog Sa Assay and materials therefor
EP2263787A3 (en) 2006-01-27 2012-02-22 President and Fellows of Harvard College Fluidic droplet coalescence
GB0605584D0 (en) 2006-03-20 2006-04-26 Olink Ab Method for analyte detection using proximity probes
ATE540750T1 (de) 2006-05-11 2012-01-15 Raindance Technologies Inc Mikrofluidische vorrichtung und verfahren
WO2009014848A2 (en) 2007-06-25 2009-01-29 Affymetrix, Inc. Patterned microcodes
EP2644709B1 (en) 2008-04-30 2014-12-17 Integrated Dna Technologies, Inc. RNase-H-based assays utilizing modified RNA monomers
US8911948B2 (en) 2008-04-30 2014-12-16 Integrated Dna Technologies, Inc. RNase H-based assays utilizing modified RNA monomers
JP2012503773A (ja) 2008-09-23 2012-02-09 クァンタライフ・インコーポレーテッド 液滴ベースの分析システム
CA2777053A1 (en) 2009-10-06 2011-04-14 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois Human single-chain t cell receptors
GB2497912B (en) * 2010-10-08 2014-06-04 Harvard College High-throughput single cell barcoding
DK2625295T3 (da) * 2010-10-08 2019-06-11 Harvard College High-throughput-immunsekvensering
WO2014144495A1 (en) * 2013-03-15 2014-09-18 Abvitro, Inc. Single cell bar-coding for antibody discovery
CA2907050C (en) 2013-03-15 2023-09-26 Prognosys Biosciences, Inc. Methods for detecting peptide/mhc/tcr binding
WO2015006379A2 (en) * 2013-07-08 2015-01-15 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Selection of cells for elimination
JP6608368B2 (ja) * 2013-12-30 2019-11-20 アトレカ インコーポレイテッド 核酸バーコードを用いた単一細胞と関連づけられた核酸の分析方法
US10066265B2 (en) 2014-04-01 2018-09-04 Adaptive Biotechnologies Corp. Determining antigen-specific t-cells
ES2770634T3 (es) 2014-06-06 2020-07-02 Herlev Hospital Determinación del reconocimiento de antígenos a través de la codificación de barras de multímeros de MHC
EP3155426B1 (en) * 2014-06-13 2023-07-19 Immudex ApS General detection and isolation of specific cells by binding of labeled molecules
CN107002076B (zh) * 2014-09-15 2021-11-23 阿布维特罗有限责任公司 高通量核苷酸文库测序
ES3049406T3 (en) 2014-12-19 2025-12-16 Broad Inst Inc Methods for profiling the t-cell-receptor repertoire
EP3933047A1 (en) * 2015-09-24 2022-01-05 AbVitro LLC Affinity-oligonucleotide conjugates and uses thereof

Also Published As

Publication number Publication date
US11061030B2 (en) 2021-07-13
US20190025304A1 (en) 2019-01-24
AU2016326737B2 (en) 2023-01-12
EP3516069A1 (en) 2019-07-31
KR20190052084A (ko) 2019-05-15
CA2999888C (en) 2024-04-09
CA2999888A1 (en) 2017-03-30
EP3933047A1 (en) 2022-01-05
MY193806A (en) 2022-10-27
BR112018005937A2 (pt) 2019-05-21
SG10201912906RA (en) 2020-02-27
JP2021118704A (ja) 2021-08-12
US20200088725A1 (en) 2020-03-19
US11156611B2 (en) 2021-10-26
CN108291257A (zh) 2018-07-17
US20220065856A1 (en) 2022-03-03
JP6869233B2 (ja) 2021-05-12
ES2928681T3 (es) 2022-11-21
AU2016326737A1 (en) 2018-04-12
EP3353326A1 (en) 2018-08-01
MX2019003272A (es) 2019-09-13
JP2018535652A (ja) 2018-12-06
IL258248A (en) 2018-05-31
JP7282121B2 (ja) 2023-05-26
RU2763554C2 (ru) 2021-12-30
MX2022012937A (es) 2022-11-08
SA518391159B1 (ar) 2022-02-22
CA3037845A1 (en) 2018-03-29
PH12018500647A1 (en) 2018-09-24
US10393743B2 (en) 2019-08-27
IL258248B (en) 2022-07-01
US20170268056A1 (en) 2017-09-21
CN108291257B (zh) 2023-12-29
WO2017053905A1 (en) 2017-03-30
EP3516069B1 (en) 2023-10-11
RU2019112395A3 (ru) 2020-11-30
CN109996889A (zh) 2019-07-09
MY191035A (en) 2022-05-30
KR20180085717A (ko) 2018-07-27
MX2018003532A (es) 2019-04-25
EP3353326B1 (en) 2022-08-24
RU2018115247A (ru) 2019-10-24
PH12019500627A1 (en) 2019-08-05
RU2018115247A3 (ru) 2020-02-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2019112395A (ru) Конъюгаты аффинная молекула-олигонуклеотид и их применения
US12371729B2 (en) Sample indexing for single cells
Martin et al. Termination factor-mediated DNA loop between termination and initiation sites drives mitochondrial rRNA synthesis
WO2023034739A1 (en) Template switch oligonucleotide (tso) for mrna 5' analysis
Ali et al. RAD capture (Rapture): flexible and efficient sequence-based genotyping
JP2018535652A5 (ru)
CN109661474A (zh) 单细胞转录物测序
DK3180433T3 (en) Method for providing tumor-specific T cells
JP2017537645A5 (ru)
US7676328B2 (en) Method for identifying cell-specific proteins
CN113308526B (zh) 融合引物直扩法人类线粒体全基因组高通量测序试剂盒
CN112334776B (zh) 杂交全lna寡核苷酸
WO2023150763A1 (en) Preparing nucleic acid for further analysis of their sequence
CA2611198C (en) Methods for the selection of aptamers
CA3132029A1 (en) Methods and systems for proteomic profiling and characterization
CN104088019A (zh) 一种基于双分子荧光互补技术的肽适配子文库构建方法
FI4077713T3 (fi) Menetelmä ja kitti kokogenomiamplifikaatioon ja biologisessa näytteessä olevien kohdemolekyylien analysointiin
CN102277433A (zh) 一种检测微量蛋白样品的方法
US20220025430A1 (en) Sequence based imaging
US7824853B2 (en) Complex comprising at least two biospecific elements separated by a nucleic acid linker e.g. for identification of drug delivery candidates combinatorial library of such complexes
US20240376543A1 (en) Method for providing tumour-specific t cells
Prasad et al. Chemically programmable bacterial probes for the recognition of cell surface proteins
CN119432577B (zh) 同时检测单细胞表面蛋白、胞质蛋白及核蛋白的多组学方法以及用于单细胞多组学检测的装置
US20240376523A1 (en) Full length single cell rna sequencing
KR101603755B1 (ko) 대한민국 연안 미세조류인 헤테로시그마 아카쉬요의 종 판별 방법과 이에 따른 헤테로시그마 아카쉬요의 종 판별용 폴리뉴클레오티드 프로브, ｄｎａ 칩 및 키트