[go: up one dir, main page]

RU2016114509A - Мутантный кальретикулин для диагностики миелоидных новообразований - Google Patents

Мутантный кальретикулин для диагностики миелоидных новообразований Download PDF

Info

Publication number
RU2016114509A
RU2016114509A RU2016114509A RU2016114509A RU2016114509A RU 2016114509 A RU2016114509 A RU 2016114509A RU 2016114509 A RU2016114509 A RU 2016114509A RU 2016114509 A RU2016114509 A RU 2016114509A RU 2016114509 A RU2016114509 A RU 2016114509A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
protein
nucleotide sequence
seq
paragraphs
Prior art date
Application number
RU2016114509A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2668808C2 (ru
RU2016114509A3 (ru
Inventor
Роберт КРАЛОВИЧ
Торстен КЛАМПФЛ
Хайнц ГИССЛИНГЕР
Original Assignee
Цемм - Форшунгсцентрум Фюр Молекуларе Медицин Гмбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=51795161&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RU2016114509(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Цемм - Форшунгсцентрум Фюр Молекуларе Медицин Гмбх filed Critical Цемм - Форшунгсцентрум Фюр Молекуларе Медицин Гмбх
Publication of RU2016114509A publication Critical patent/RU2016114509A/ru
Publication of RU2016114509A3 publication Critical patent/RU2016114509A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2668808C2 publication Critical patent/RU2668808C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005—Vertebrate antigens
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4728—Calcium binding proteins, e.g. calmodulin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869—Methods for sequencing
    • G01N33/57505—
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70—Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/76—Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering nucleic acids [NA]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/172—Haplotypes
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
    • G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
    • G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
    • G01N2333/4701—Details
    • G01N2333/4727—Calcium binding proteins, e.g. calmodulin
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/50—Determining the risk of developing a disease

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (316)

1. Способ оценки того, страдает ли пациент миелоидным новообразованием или предрасположен страдать миелоидным новообразованием, где указанный способ включает:
определение присутствия одного или более мутантных аллелей гена кальретикулина в образце от указанного пациента; и
оценку того, что указанный пациент страдает миелоидным новообразованием или предрасположен страдать миелоидным новообразованием, когда присутствует указанный один или более мутантных аллелей гена кальретикулина.
2. Способ по п. 1,где указанный один или более мутантных аллелей содержит нуклеиновую кислоту, кодирующую мутантный белок кальретикулин.
3. Способ по п. 2, где указанный мутантный белок кальретикулин выбран из группы, включающей:
(а) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 1, 2 или 3;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
4. Способ по п. 2 или 3, где указанный мутантный белок кальретикулин выбран из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 1, 2, 3, 5, 6, 7, 9, 10, 11, 13, 14, 15, 17, 18, 19, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 29, 30, 31, 33, 34, 35, 37, 38, 39, 41, 42, 43, 45, 46, 47, 49, 50, 51, 53, 54, 55, 57, 58, 59, 61, 62, 63, 65, 66, 67, 69, 70, 71, 73, 74, 75, 77, 78, 79, 81, 82, 83, 85, 86, 87, 89, 90, 91, 93, 94, 95, 97, 98, 99, 101, 102, 103, 105, 106, 107, 109, 110, 111, 113, 114, 115, 117, 118, 119, 121, 122, 123, 125, 126, 127, 129, 130, 131, 133, 134, 135, 137, 138, 139, 141, 142 или 143;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
5. Способ по любому из пп. 2-4, где указанный мутантный белок кальретикулин выбран из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 291, 292, 293, 295, 296, 297, 299, 300, 301, 303, 304, 305, 307, 308, 309, 311, 312, 313, 315, 316, 317, 319, 320, 321, 323, 324, 325, 327, 328, 329, 331, 332, 333, 335, 336, 337, 339, 340, 341, 343, 344, 345, 347, 348, 349, 351, 352, 353, 355, 356, 357, 359, 360, 361, 363, 364, 365, 367, 368, 369, 371, 372, 373, 375, 376, 377, 379, 380, 381, 383, 384, 385, 387, 388, 389, 391, 392, 393, 395, 396, 397, 399, 400, 401, 403, 404, 405, 407, 408, 409, 411, 412, 413, 415, 416, 417, 419, 420, 421, 423, 424, 425, 427, 428, 429, 431, 432 или 433;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
6. Способ по любому из пп. 2-5, где указанный мутантный белок кальретикулин выбран из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 145, 146, 147, 149, 150, 151, 153, 154, 155, 157, 158, 159, 161, 162, 163, 165, 166, 167, 169, 170, 171, 173, 174, 175, 177, 178, 179, 181, 182, 183, 185, 186, 187, 189, 190, 191, 193, 194, 195, 197, 198, 199, 201, 202, 203, 205, 206, 207, 209, 210, 211, 213, 214, 215, 217, 218, 219, 221, 222, 223, 225, 226, 227, 229, 230, 231, 233, 234, 235, 237, 238, 239, 241, 242, 243, 245, 246, 247, 249, 250, 251, 253, 254, 255, 257, 258, 259, 261, 262, 263, 265, 266, 267, 269, 270, 271, 273, 274, 275, 277, 278, 279, 281, 282, 283, 285, 286 или 287;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284, или 288;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
7. Способ по любому из пп. 1-6, где указанный один или более мутантных аллелей гена кальретикулина находится в области, охватывающей экзон 9 гена кальретикулина.
8. Способ по любому из пп. 1-7, где указанный мутантный аллель содержит мутацию сдвига рамки считывания в гене кальретикулина дикого типа.
9. Способ по п. 8, где указанная мутация сдвига рамки считывания находится в экзоне 9 гена кальретикулина.
10. Способ по п. 8 или 9, где указанная мутация сдвига рамки считывания представляет делецию одного нуклеотида или добавление двух нуклеотидов.
11. Способ по п. 8 или 9, где (1+(3×n0)) нуклеотидов делецировано из гена кальретикулина.
12. Способ по любому из пп. 8, 9 и 11, где 1, 4, 19, 22, 31, 34, 46, 52 нуклеотида делецированы.
13. Способ по любому из пп. 8, 9, 11 и 12,
где 1 нуклеотид делецирован и где 6 нуклеотидов инсерцированы;
где 2 нуклеотида делецированы и где 4 нуклеотида инсерцированы;
где 3 нуклеотида делецированы и где 5 нуклеотидов инсерцированы;
где 12 нуклеотидов делецированы и где 5 нуклеотидов инсерцированы;
где 18 нуклеотидов делецированы и где 11 нуклеотидов инсерцированы;
где 18 нуклеотидов делецированы и где 14 нуклеотидов инсерцированы;
где 20 нуклеотидов делецированы и где 1 нуклеотид инсерцирован;
где 28 нуклеотидов делецированы и где 6 нуклеотидов инсерцированы;
где 35 нуклеотидов делецированы и где 1 нуклеотид инсерцирован; или
где 36 нуклеотидов делецированы и где 2 нуклеотида инсерцированы.
14. Способ по п. 8 или 9, где (2+(3×n0)) нуклеотидов инсерцированы в ген кальретикулина.
15. Способ по п. 14, где 5 нуклеотидов инсерцированы.
16. Способ по любому из пп. 1-15, где указанный ген кальретикулина содержит последовательность, выбранную из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 290;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 289;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
17. Способ по любому из пп. 10-16, где указанный нуклеотид(ы) делецирован из и/или инсерцирован в экзоне 9 гена кальретикулина.
18. Способ по любому из пп. 9-17, где указанный экзон 9 гена кальретикулина содержит последовательность, выбранную из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 436;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 435;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
19. Способ по любому из пп. 1-18, где указанный мутантный аллель содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140, 144, 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284, 288; 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 1, 5, 9, 13, 17, 21, 25, 29, 33, 37, 41, 45, 49, 53, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 85, 89, 93, 97, 101, 105, 109, 113, 117, 121, 125, 129, 133, 137, 141, 145, 149, 153, 157, 161, 165, 169, 173, 177, 181, 185, 189, 193, 197, 201, 205, 209, 213, 217, 221, 225, 229, 233, 237, 241, 245, 249, 253, 257, 261, 265, 269, 273, 277, 281, 285, 291, 295, 299, 303, 307, 311, 315, 319, 323, 327, 331, 335, 339, 343, 347, 351, 355, 359, 363, 367, 371, 375, 379, 383, 387, 391, 395, 399, 403, 407, 411, 415, 419, 423, 427 или 431;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
20. Способ по любому из пп. 1-19, где указанный мутантный аллель представляет ДНК, предпочтительно геномную ДНК.
21. Способ по п. 20, где присутствие указанной ДНК определяется секвенированием.
22. Способ оценки того, страдает ли пациент миелоидным новообразованием или предрасположен страдать миелоидным новообразованием, где указанный способ включает:
определение присутствия генного продукта одного или более мутантных аллелей гена кальретикулина в образце от указанного пациента; и
оценку того, что указанный пациент страдает миелоидным новообразованием или предрасположен страдать миелоидным новообразованием, когда присутствует указанный генный продукт.
23. Способ по п. 22, где указанный один или более мутантных аллелей содержит нуклеиновую кислоту, кодирующую мутантный белок кальретикулин.
24. Способ по п. 23, где указанный мутантный белок кальретикулин выбран из группы, включающей:
(а) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 1, 2 или 3;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
25. Способ по п. 23 или 24, где указанный мутантный белок кальретикулин выбран из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 1, 2, 3, 5, 6, 7, 9, 10, 11, 13, 14, 15, 17, 18, 19, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 29, 30, 31, 33, 34, 35, 37, 38, 39, 41, 42, 43, 45, 46, 47, 49, 50, 51, 53, 54, 55, 57, 58, 59, 61, 62, 63, 65, 66, 67, 69, 70, 71, 73, 74, 75, 77, 78, 79, 81, 82, 83, 85, 86, 87, 89, 90, 91, 93, 94, 95, 97, 98, 99, 101, 102, 103, 105, 106, 107, 109, 110, 111, 113, 114, 115, 117, 118, 119, 121, 122, 123, 125, 126, 127, 129, 130, 131, 133, 134, 135, 137, 138, 139, 141, 142 или 143;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
26. Способ по любому из пп. 23-25, где указанный мутантный белок кальретикулин выбран из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 291, 292, 293, 295, 296, 297, 299, 300, 301, 303, 304, 305, 307, 308, 309, 311, 312, 313, 315, 316, 317, 319, 320, 321, 323, 324, 325, 327, 328, 329, 331, 332, 333, 335, 336, 337, 339, 340, 341, 343, 344, 345, 347, 348, 349, 351, 352, 353, 355, 356, 357, 359, 360, 361, 363, 364, 365, 367, 368, 369, 371, 372, 373, 375, 376, 377, 379, 380, 381, 383, 384, 385, 387, 388, 389, 391, 392, 393, 395, 396, 397, 399, 400, 401, 403, 404, 405, 407, 408, 409, 411, 412, 413, 415, 416, 417, 419, 420, 421, 423, 424, 425, 427, 428, 429, 431, 432 или 433;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислоты, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
27. Способ по любому из пп. 23-26, где указанный мутантный белок кальретикулин выбран из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 145, 146, 147, 149, 150, 151, 153, 154, 155, 157, 158, 159, 161, 162, 163, 165, 166, 167, 169, 170, 171, 173, 174, 175, 177, 178, 179, 181, 182, 183, 185, 186, 187, 189, 190, 191, 193, 194, 195, 197, 198, 199, 201, 202, 203, 205, 206, 207, 209, 210, 211, 213, 214, 215, 217, 218, 219, 221, 222, 223, 225, 226, 227, 229, 230, 231, 233, 234, 235, 237, 238, 239, 241, 242, 243, 245, 246, 247, 249, 250, 251, 253, 254, 255, 257, 258, 259, 261, 262, 263, 265, 266, 267, 269, 270, 271, 273, 274, 275, 277, 278, 279, 281, 282, 283, 285, 286 или 287;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284, или 288;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
28. Способ по любому из пп. 22-27, где указанный аллель содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140, 144, 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284, 288; 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 1, 5, 9, 13, 17, 21, 25, 29, 33, 37, 41, 45, 49, 53, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 85, 89, 93, 97, 101, 105, 109, 113, 117, 121, 125, 129, 133, 137, 141, 145, 149, 153, 157, 161, 165, 169, 173, 177, 181, 185, 189, 193, 197, 201, 205, 209, 213, 217, 221, 225, 229, 233, 237, 241, 245, 249, 253, 257, 261, 265, 269, 273, 277, 281, 285, 291, 295, 299, 303, 307, 311, 315, 319, 323, 327, 331, 335, 339, 343, 347, 351, 355, 359, 363, 367, 371, 375, 379, 383, 387, 391, 395, 399, 403, 407, 411, 415, 419, 423, 427 или 431;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
29. Способ по любому из пп. 22-28, где указанный генный продукт содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 3;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
30. Способ по любому из пп. 22-29, где указанный генный продукт содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 3, 7, 11, 15, 19, 23, 27, 31, 35, 39, 43, 47, 51, 55, 59, 63, 67, 71, 75, 79, 83, 87, 91, 95, 99, 103, 107, 111, 115, 119, 123, 127, 131, 135, 139 или 143;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
31. Способ по любому из пп. 22-30, где указанный генный продукт содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 ил 434;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 293, 297, 301, 305, 309, 313, 317, 321, 325, 329, 333, 337, 341, 345, 349, 353, 357, 361, 365, 369, 373, 377, 381, 385, 389, 393, 397, 401, 405, 409, 413, 417, 421, 425, 429 или 433;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
32. Способ по любому из пп. 22-31, где указанный генный продукт содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 147, 151, 155, 159, 163, 167, 171, 175, 179, 183, 187, 191, 195, 199, 203, 207, 211, 215, 219, 223, 227, 231, 235, 239, 243, 247, 251, 255, 259, 263, 267, 271, 275, 279, 283 или 287;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
33. Способ по любому из пп. 22-28, где указанный генный продукт содержит полипептид, выбранный из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 1, 2 или 3;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
34. Способ по любому из пп. 22-28 и 33, где указанный генный продукт содержит полипептид, выбранный из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 1, 2, 3, 5, 6, 7, 9, 10, 11, 13, 14, 15, 17, 18, 19, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 29, 30, 31, 33, 34, 35, 37, 38, 39, 41, 42, 43, 45, 46, 47, 49, 50, 51, 53, 54, 55, 57, 58, 59, 61, 62, 63, 65, 66, 67, 69, 70, 71, 73, 74, 75, 77, 78, 79, 81, 82, 83, 85, 86, 87, 89, 90, 91, 93, 94, 95, 97, 98, 99, 101, 102, 103, 105, 106, 107, 109, 110, 111, 113, 114, 115, 117, 118, 119, 121, 122, 123, 125, 126, 127, 129, 130, 131, 133, 134, 135, 137, 138, 139, 141, 142 или 143;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
35. Способ по любому из пп. 22-28, 33 и 34, где указанный генный продукт содержит полипептид, выбранный из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 291, 292, 293, 295, 296, 297, 299, 300, 301, 303, 304, 305, 307, 308, 309, 311, 312, 313, 315, 316, 317, 319, 320, 321, 323, 324, 325, 327, 328, 329, 331, 332, 333, 335, 336, 337, 339, 340, 341, 343, 344, 345, 347, 348, 349, 351, 352, 353, 355, 356, 357, 359, 360, 361, 363, 364, 365, 367, 368, 369, 371, 372, 373, 375, 376, 377, 379, 380, 381, 383, 384, 385, 387, 388, 389, 391, 392, 393, 395, 396, 397, 399, 400, 401, 403, 404, 405, 407, 408, 409, 411, 412, 413, 415, 416, 417, 419, 420, 421, 423, 424, 425, 427, 428, 429, 431, 432 или 433;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
36. Способ по любому из пп. 22-28 и 33-35, где указанный генный продукт содержит полипептид, выбранный из группы, включающей:
(a) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 145, 146, 147, 149, 150, 151, 153, 154, 155, 157, 158, 159, 161, 162, 163, 165, 166, 167, 169, 170, 171, 173, 174, 175, 177, 178, 179, 181, 182, 183, 185, 186, 187, 189, 190, 191, 193, 194, 195, 197, 198, 199, 201, 202, 203, 205, 206, 207, 209, 210, 211, 213, 214, 215, 217, 218, 219, 221, 222, 223, 225, 226, 227, 229, 230, 231, 233, 234, 235, 237, 238, 239, 241, 242, 243, 245, 246, 247, 249, 250, 251, 253, 254, 255, 257, 258, 259, 261, 262, 263, 265, 266, 267, 269, 270, 271, 273, 274, 275, 277, 278, 279, 281, 282, 283, 285, 286 или 287;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
37. Способ по любому из пп. 22-36, где указанный генный продукт представляет мРНК.
38. Способ по п. 37, где присутствие или количество указанной мРНК определяется ПЦР в режиме реального времени, ПЦР с обратной транскрипцией, полногеномным транскриптомным шот-ган секвенированием (секвенированием РНК), гибридизацией in situ или технологией микрочипов.
39. Способ по п. 38, где определение ПЦР в режиме реального времени и ПЦР с обратной транскрипцией дополнительно включает стадии:
(i) контактирование нуклеиновой кислоты в образце с одним или двумя олигонуклеотидами:
(ii) получение продукта амплификации, содержащего последовательность-мишень.
40. Способ по любому из пп. 22-28 и 33-36, где указанный генный продукт является белком.
41. Способ по п. 40, где присутствие или количество указанного белка определяется иммуногистохимией (IHC), иммуноанализом, методами на основе гель-электрофореза или блоттинга, IHC, масс-спектрометрией, проточной цитометрией или FACS.
42. Способ по любому из пп. 1-41, где указанный пациент является пациентом-человеком.
43. Способ по любому из пп. 1-42, где указанный образец представляет образец костного мозга.
44. Способ по любому из пп. 1-42, где указанный образец представляет образец крови.
45. Способ по п. 43 или 44, где указанный образец костного мозга получают с помощью биопсии.
46. Способ по любому из пп. 1-45, дополнительно включающий введение ингибитора мутантного кальретикулина пациенту.
47. Нуклеиновая кислота, выбранная из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 2;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
48. Нуклеиновая кислота по п. 47, где указанная нуклеиновая кислота выбрана из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 2, 6, 10, 14, 18, 22, 26, 30, 34, 38, 42, 46, 50, 54, 58, 62, 66, 70, 74, 78, 82, 86, 90, 94, 98, 102, 106, 110, 114, 118, 122, 126, 130, 134, 138 или 142;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
49. Нуклеиновая кислота по п. 47 или 48, где указанная нуклеиновая кислота выбрана из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 292, 296, 300, 304, 308, 312, 316, 320, 324, 328, 332, 336, 340, 344, 348, 352, 356, 360, 364, 368, 372, 376, 380, 384, 388, 392, 396, 400, 404, 408, 412, 416, 420, 424, 428 или 432;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
50. Нуклеиновая кислота по пп. 47-49, где указанная нуклеиновая кислота выбрана из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 146, 150, 154, 158, 162, 166, 170, 174, 178, 182, 186, 190, 194, 198, 202, 206, 210, 214, 218, 222, 226, 230, 234, 238, 242, 246, 250, 254, 258, 262, 266, 270, 274, 278, 282 или 286;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
51. Нуклеиновая кислота по любому из пп. 47-50, где указанная нуклеиновая кислота является кДНК.
52. Нуклеиновая кислота, выбранная из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 3;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
53. Нуклеиновая кислота по п. 52, где указанная нуклеиновая кислота выбрана из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 3, 7, 11, 15, 19, 23, 27, 31, 35, 39, 43, 47, 51, 55, 59, 63, 67, 71, 75, 79, 83, 87, 91, 95, 99, 103, 107, 111, 115, 119, 123, 127, 131, 135, 139 или 143;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
54. Нуклеиновая кислота по п. 52 или 53, где указанная нуклеиновая кислота выбрана из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 293, 297, 301, 305, 309, 313, 317, 321, 325, 329, 333, 337, 341, 345, 349, 353, 357, 361, 365, 369, 373, 377, 381, 385, 389, 393, 397, 401, 405, 409, 413, 417, 421, 425, 429 или 433;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
55. Нуклеиновая кислота по п. 52 или 54, где указанная нуклеиновая кислота выбрана из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 147, 151, 155, 159, 163, 167, 171, 175, 179, 183, 187, 191, 195, 199, 203, 207, 211, 215, 219, 223, 227, 231, 235, 239, 243, 247, 251, 255, 259, 263, 267, 271, 275, 279, 283 или 287;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
56. Нуклеиновая кислота по любому из пп. 52-55, где указанная нуклеиновая кислота является мРНК.
57. Нуклеиновая кислота, выбранная из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 1;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
58. Нуклеиновая кислота по п. 57, где указанная нуклеиновая кислота выбрана из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 1, 5, 9, 13, 17, 21, 25, 29, 33, 37, 41, 45, 49, 53, 57, 61, 65, 69, 73, 77, 81, 85, 89, 93, 97, 101, 105, 109, 113, 117, 121, 125, 129, 133, 137 или 141;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
59. Нуклеиновая кислота по п. 57 или 58, где указанная нуклеиновая кислота выбрана из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 291, 295, 299, 303, 307, 311, 315, 319, 323, 327, 331, 335, 339, 343, 347, 351, 355, 359, 363, 367, 371, 375, 379, 383, 387, 391, 395, 399, 403, 407, 411, 415, 419, 423, 427 или 431;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
60. Нуклеиновая кислота по п. 57 или 59, где указанная нуклеиновая кислота выбрана из группы, включающей:
(а) нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(b) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 145, 149, 153, 157, 161, 165, 169, 173, 177, 181, 185, 189, 193, 197, 201, 205, 209, 213, 217, 221, 225, 229, 233, 237, 241, 245, 249, 253, 257, 261, 265, 269, 273, 277, 281 или 285;
(c) нуклеиновую кислоту, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью нуклеиновой кислоты, определенной в п. (а) или (b);
(d) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, по меньшей мере, с 70% идентичностью с нуклеотидной последовательностью нуклеиновых кислот по любому из пп. (а)-(с); и
(e) нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты по любому из пп. (а)-(d).
61. Нуклеиновая кислота по любому из пп. 57-60, где указанная нуклеиновая кислота является геномной ДНК.
62. Белок, выбранный из группы, включающей:
(а) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 1, 2 или 3;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующуюся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
63. Белок по п. 62, где указанный белок выбран из группы, включающей:
(а) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 1, 2, 3, 5, 6, 7, 9, 10, 11, 13, 14, 15, 17, 18, 19, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 29, 30, 31, 33, 34, 35, 37, 38, 39, 41, 42, 43, 45, 46, 47, 49, 50, 51, 53, 54, 55, 57, 58, 59, 61, 62, 63, 65, 66, 67, 69, 70, 71, 73, 74, 75, 77, 78, 79, 81, 82, 83, 85, 86, 87, 89, 90, 91, 93, 94, 95, 97, 98, 99, 101, 102, 103, 105, 106, 107, 109, 110, 111, 113, 114, 115, 117, 118, 119, 121, 122, 123, 125, 126, 127, 129, 130, 131, 133, 134, 135, 137, 138, 139, 141, 142 или 143;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76, 80, 84, 88, 92, 96, 100, 104, 108, 112, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140 или 144;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
64. Белок по п. 62 или 63, где указанный белок выбран из группы, включающей:
(а) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 291, 292, 293, 295, 296, 297, 299, 300, 301, 303, 304, 305, 307, 308, 309, 311, 312, 313, 315, 316, 317, 319, 320, 321, 323, 324, 325, 327, 328, 329, 331, 332, 333, 335, 336, 337, 339, 340, 341, 343, 344, 345, 347, 348, 349, 351, 352, 353, 355, 356, 357, 359, 360, 361, 363, 364, 365, 367, 368, 369, 371, 372, 373, 375, 376, 377, 379, 380, 381, 383, 384, 385, 387, 388, 389, 391, 392, 393, 395, 396, 397, 399, 400, 401, 403, 404, 405, 407, 408, 409, 411, 412, 413, 415, 416, 417, 419, 420, 421, 423, 424, 425, 427, 428, 429, 431, 432 или 433;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 294, 298, 302, 306, 310, 314, 318, 322, 326, 330, 334, 338, 342, 346, 350, 354, 358, 362, 366, 370, 374, 378, 382, 386, 390, 394, 398, 402, 406, 410, 414, 418, 422, 426, 430 или 434;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
65. Белок по любому из пп. 62-64, где указанный белок выбран из группы, включающей:
(а) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, показанную в SEQ ID NO: 145, 146, 147, 149, 150, 151, 153, 154, 155, 157, 158, 159, 161, 162, 163, 165, 166, 167, 169, 170, 171, 173, 174, 175, 177, 178, 179, 181, 182, 183, 185, 186, 187, 189, 190, 191, 193, 194, 195, 197, 198, 199, 201, 202, 203, 205, 206, 207, 209, 210, 211, 213, 214, 215, 217, 218, 219, 221, 222, 223, 225, 226, 227, 229, 230, 231, 233, 234, 235, 237, 238, 239, 241, 242, 243, 245, 246, 247, 249, 250, 251, 253, 254, 255, 257, 258, 259, 261, 262, 263, 265, 266, 267, 269, 270, 271, 273, 274, 275, 277, 278, 279, 281, 282, 283, 285, 286 или 287;
(b) белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(c) белок по п. (а) или (b), в котором одна или более аминокислот делецированы, инсерцированы, добавлены или заменены;
(d) белок, кодированный молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, содержащий аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 216, 220, 224, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 272, 276, 280, 284 или 288;
(e) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях с комплементарной цепью молекул нуклеиновой кислоты, определенных в п. (а) или (с);
(f) белок, обладающий, по меньшей мере, 70% идентичностью с белком по любому из пп. (а)-(е); и
(g) белок, содержащий аминокислотную последовательность, кодированную нуклеиновой кислотой, которая является вырожденной в результате свойства генетического кода по отношению к нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты, определенной в пп. (а), (d) или (e).
66. Вакцина, содержащая белок по п. 62 или 63.
67. Антитело, специфически связывающееся с белком по любому из пп. 62-65.
68. siРНК, специфически направленная на нуклеиновую кислоту по любому из пп. 52-56.
69. siРНК по п. 68, где указанная siРНК состоит из молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей, по меньшей мере, десять смежных оснований.
70. siРНК по п. 68 или 69, где до 10% смежных оснований являются некомплементарными.
71. siРНК по любому из пп. 68-70, где указанная siРНК дополнительно содержит, по меньшей мере, одно основание на 5’-конце и/или, по меньшей мере, одно основание на 3’-конце.
72. Ингибитор мутантного кальретикулина для применения в лечении миелоидного новообразования.
73. Способ лечения пациента с миелоидным новообразованием, включающий введение эффективного количества ингибитора мутантного кальретикулина пациенту.
74. Ингибитор по п. 72 или способ по п. 46 или 73, где указанный мутантный кальретикулин представляет мутантный белок кальретикулин по любому из пп. 62-65.
75. Ингибитор по п. 72 или 74 или способ по любому из пп. 56, 73 или 74, где указанный ингибитор представляет антитело.
76. Ингибитор по п. 72 или 74 или способ по любому из пп. 56, 73 или 74, где указанный ингибитор выбран из группы, состоящей из внеклеточных партнеров по связыванию, небольших связывающих молекул, аптамеров и интрамеров.
77. Ингибитор по п. 72 или способ по п. 46 или 73, где указанный мутантный кальретикулин представляет нуклеиновую кислоту по любому из пп. 52-56.
78. Ингибитор по п. 72 или 77 или способ по любому из пп. 46, 73 и 77, где указанный ингибитор выбран из группы, состоящей из siРНК, miРНК, dsРНК, shРНК, stРНК и антисмысловых молекул.
79. Ингибитор по любому из пп. 72 и 74-78 или способ по любому из пп. 1-46 и 73-78, где указанное миелоидное новообразование является миелопролиферативным новообразованием.
80. Ингибитор по п. 79 или способ по п. 79, где указанное миелоидное новообразование является первичным миелофиброзом (ПМФ).
81. Ингибитор по п. 79 или способ по п. 79, где указанное миелоидное новообразование является эссенциальной тромбоцитемией (ЭТ).
82. Ингибитор по любому из пп. 72 и 74-78 или способ по любому из пп. 1-46 и 73-78, где указанное миелоидное новообразование является миелодиспластическим синдромом.
83. Ингибитор по п. 82 или способ по п. 82, где указанное миелоидное новообразование является рефрактерной анемией с кольцевыми сидеробластами и тромбоцитемией (RARS-T).
84. Ингибитор по любому из пп. 72 и 74-83 или способ по любому из пп. 73-83, где пациент, подвергающийся лечению, оценивается как страдающий миелоидным новообразованием или предрасположенный страдать миелоидным новообразованием по любому из пунктов из пп. 1-46.
85. Белок по п. 62 или 63, антитело по п. 67, siРНК по любому из пп. 68-71 или ингибитор мутантного кальретикулина по любому из пп. 72-78 для применения в качестве лекарственного средства.
86. Вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по любому из пп. 47-51 и 57-61.
87. Клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту по любому из пп. 47-51 и 57-61, или вектор по п. 86.
88. Способ получения полипептида по пп. 62-65, где указанный способ включает культивирование клеток-хозяев по п. 87 в условиях, обеспечивающих экспрессию полипептида и выделение полученного полипептида из культуры.
RU2016114509A 2013-09-16 2014-09-15 Мутантный кальретикулин для диагностики миелоидных новообразований RU2668808C2 (ru)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP13184632 2013-09-16
EP13184632.1 2013-09-16
EP13186939.8 2013-10-01
EP13186939 2013-10-01
US201361909313P 2013-11-26 2013-11-26
US61/909,313 2013-11-26
PCT/EP2014/069638 WO2015036599A1 (en) 2013-09-16 2014-09-15 Mutant calreticulin for the diagnosis of myeloid malignancies

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2016114509A true RU2016114509A (ru) 2017-10-18
RU2016114509A3 RU2016114509A3 (ru) 2018-03-06
RU2668808C2 RU2668808C2 (ru) 2018-10-02

Family

ID=51795161

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016114509A RU2668808C2 (ru) 2013-09-16 2014-09-15 Мутантный кальретикулин для диагностики миелоидных новообразований

Country Status (16)

Country Link
US (5) US10344335B2 (ru)
EP (4) EP3339318A1 (ru)
JP (2) JP6745220B2 (ru)
KR (1) KR102433548B1 (ru)
CN (2) CN105916876A (ru)
AU (2) AU2014320262B2 (ru)
BR (1) BR112016005611B1 (ru)
CA (1) CA2924370C (ru)
DK (3) DK3020727T4 (ru)
ES (1) ES2577289T3 (ru)
MX (1) MX348980B (ru)
PL (2) PL2808338T3 (ru)
PT (1) PT2808338E (ru)
RU (1) RU2668808C2 (ru)
SG (1) SG11201601193TA (ru)
WO (1) WO2015036599A1 (ru)

Families Citing this family (34)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105916876A (zh) 2013-09-16 2016-08-31 分子医学研究中心责任有限公司 用于骨髓恶性肿瘤诊断的突变钙网蛋白
US10550435B2 (en) 2014-11-12 2020-02-04 Neogenomics Laboratories, Inc. Determining tumor load and biallelic mutation in patients with CALR mutation using peripheral blood plasma
EP3227341A1 (en) * 2014-12-02 2017-10-11 CeMM - Forschungszentrum für Molekulare Medizin GmbH Anti-mutant calreticulin antibodies and their use in the diagnosis and therapy of myeloid malignancies
US20180030475A1 (en) * 2015-03-30 2018-02-01 Jeffrey Thomas Loh Methods for producing modified red blood cell compositions, compositions and uses thereof
CA2983820A1 (en) 2015-04-23 2016-10-27 Quest Diagnostics Investments Incorporated Methods and compositions for the detection of calr mutations in myeloproliferative diseases
KR101953092B1 (ko) * 2015-11-11 2019-06-13 가톨릭대학교 산학협력단 Ｂｃｒ／ａｂｌ 음성 골수증식종양 관련 유전자변이 다중검출용 펩티드핵산 프로브, 이를 포함하는 유전자변이 다중검출 조성물, 다중검출 키트 및 유전자변이 다중검출방법
ITUA20162858A1 (it) * 2016-04-26 2017-10-26 Univ Degli Studi Di Torino Procedimento per la rivelazione di mutazioni di tipo 1 e 2 del gene calreticulina (calr) e relativo kit
EP3468585A2 (en) * 2016-06-10 2019-04-17 IO Biotech APS Calr and jak2 vaccine compositions
CN106566875A (zh) * 2016-09-20 2017-04-19 上海荻硕贝肯医学检验所有限公司 用于检测骨髓异常增生综合征mds基因突变的引物、试剂盒及方法
CN107164473B (zh) * 2017-05-22 2020-08-25 复旦大学附属华山医院 一种检测calr基因1型突变的引物组合物及试剂盒
CN107164474B (zh) * 2017-05-22 2020-09-04 复旦大学附属华山医院 一种检测calr基因2型突变的引物组合物及试剂盒
CN108949971A (zh) * 2017-05-23 2018-12-07 曹国君 钙网蛋白基因1型突变检测用封闭pna探针
CN107462706A (zh) * 2017-08-01 2017-12-12 广西中医药大学附属瑞康医院（广西中西医结合医院） 一种肿瘤试剂盒
EP3737692A4 (en) 2018-01-09 2021-09-29 Elstar Therapeutics, Inc. CALRETICULIN AND MODIFIED T-LYMPHOCYTES BINDING CONSTRUCTIONS FOR THE TREATMENT OF DISEASES
CN108434439B (zh) * 2018-01-23 2020-02-07 中国人民解放军总医院 钙网蛋白的医药用途
US11414698B2 (en) * 2018-03-22 2022-08-16 Chang Gung Medical Foundation Chang Gung Memorial Hospital At Chiayi Method of quantifying mutant allele burden of target gene
CN112955465A (zh) 2018-07-03 2021-06-11 马伦戈治疗公司 抗tcr抗体分子及其用途
RU2679653C1 (ru) * 2018-08-01 2019-02-12 Общество с ограниченной ответственностью "Формула гена" Набор реактивов для выявления Ph-негативных миелопролиферативных новообразований и способ диагностики на его основе
US12410185B2 (en) 2018-10-23 2025-09-09 Myelopro Diagnostics And Research Gmbh Compounds targeting mutant calreticulin
CN114127113A (zh) * 2019-02-21 2022-03-01 马伦戈治疗公司 与钙网蛋白结合的多功能分子及其用途
WO2020172605A1 (en) 2019-02-21 2020-08-27 Elstar Therapeutics, Inc. Antibody molecules that bind to nkp30 and uses thereof
CN114026122B (zh) 2019-02-21 2024-12-31 马伦戈治疗公司 结合t细胞相关癌细胞的多功能分子及其用途
KR20210134705A (ko) 2019-02-28 2021-11-10 각코우호우진 쥰텐도 절단형의 변이형 Calreticulin에 결합하는 항체, 및 골수 증식성 종양의 진단, 예방 또는 치료약
CN114302967A (zh) * 2019-08-30 2022-04-08 东洋钢钣株式会社 用于评价骨髓增殖性肿瘤相关基因突变的试剂盒
IL270306A (en) 2019-10-30 2021-05-31 Yeda Res & Dev Prevention and treatment of pre-myeloid and myeloid malignancies
CN112795647B (zh) * 2019-11-14 2022-08-16 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院) 一种肿瘤标志物及其应用
US12018289B2 (en) 2019-11-18 2024-06-25 Janssen Biotech, Inc. Vaccines based on mutant CALR and JAK2 and their uses
EP4084823A4 (en) 2020-01-03 2024-05-15 Marengo Therapeutics, Inc. ANTI-TCR ANTIBODY MOLECULES AND THEIR USES
WO2021188619A1 (en) * 2020-03-17 2021-09-23 Memorial Sloan Kettering Cancer Center Heteroclitic cancer vaccines
KR20230057351A (ko) 2020-08-27 2023-04-28 각코우호우진 쥰텐도 항절단형 변이 calr-cd3 이중특이성 항체 및 의약 조성물
JPWO2023163087A1 (ru) 2022-02-25 2023-08-31
WO2023245139A2 (en) * 2022-06-17 2023-12-21 Icahn School Of Medicine At Mount Sinai Mutant calr-peptide based vaccine
CN117003866B (zh) * 2023-08-23 2025-06-06 复旦大学附属华山医院 一种抗calr突变蛋白抗体、制备方法及检测试剂盒
WO2025207632A1 (en) * 2024-03-26 2025-10-02 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for the treatment of myeloproliferative neoplasms

Family Cites Families (36)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20493A (en) * 1858-06-08 Bebtch-plaite
US3773919A (en) 1969-10-23 1973-11-20 Du Pont Polylactide-drug mixtures
US4263428A (en) 1978-03-24 1981-04-21 The Regents Of The University Of California Bis-anthracycline nucleic acid function inhibitors and improved method for administering the same
ATE12348T1 (de) 1980-11-10 1985-04-15 Gersonde Klaus Prof Dr Verfahren zur herstellung von lipid-vesikeln durch ultraschallbehandlung, anwendung des verfahrens und vorrichtung zur durchfuehrung des verfahrens.
IE52535B1 (en) 1981-02-16 1987-12-09 Ici Plc Continuous release pharmaceutical compositions
US4711955A (en) 1981-04-17 1987-12-08 Yale University Modified nucleotides and methods of preparing and using same
US4485045A (en) 1981-07-06 1984-11-27 Research Corporation Synthetic phosphatidyl cholines useful in forming liposomes
JPS58118008A (ja) 1982-01-06 1983-07-13 Nec Corp デ−タ処理装置
EP0088046B1 (de) 1982-02-17 1987-12-09 Ciba-Geigy Ag Lipide in wässriger Phase
DE3218121A1 (de) 1982-05-14 1983-11-17 Leskovar, Peter, Dr.-Ing., 8000 München Arzneimittel zur tumorbehandlung
CA1223831A (en) 1982-06-23 1987-07-07 Dean Engelhardt Modified nucleotides, methods of preparing and utilizing and compositions containing the same
EP0102324A3 (de) 1982-07-29 1984-11-07 Ciba-Geigy Ag Lipide und Tenside in wässriger Phase
US4544545A (en) 1983-06-20 1985-10-01 Trustees University Of Massachusetts Liposomes containing modified cholesterol for organ targeting
HUT35524A (en) 1983-08-02 1985-07-29 Hoechst Ag Process for preparing pharmaceutical compositions containing regulatory /regulative/ peptides providing for the retarded release of the active substance
ATE159858T1 (de) 1983-09-26 1997-11-15 Ehrenfeld Udo Mittel und erzeugnis für die diagnose und therapie von tumoren sowie zur behandlung von schwächen der zelligen und humoralen immunabwehr
EP0143949B1 (en) 1983-11-01 1988-10-12 TERUMO KABUSHIKI KAISHA trading as TERUMO CORPORATION Pharmaceutical composition containing urokinase
US5703055A (en) 1989-03-21 1997-12-30 Wisconsin Alumni Research Foundation Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery
GB9304200D0 (en) 1993-03-02 1993-04-21 Sandoz Ltd Improvements in or relating to organic compounds
US5792608A (en) 1991-12-12 1998-08-11 Gilead Sciences, Inc. Nuclease stable and binding competent oligomers and methods for their use
WO1994029469A2 (en) 1993-06-07 1994-12-22 Vical Incorporated Plasmids suitable for gene therapy
US5525711A (en) 1994-05-18 1996-06-11 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Pteridine nucleotide analogs as fluorescent DNA probes
AU723325B2 (en) 1995-06-23 2000-08-24 President And Fellows Of Harvard College Transcriptional regulation of genes encoding vascular endothelial growth factor receptors
US5846727A (en) * 1996-06-06 1998-12-08 Board Of Supervisors Of Louisiana State University And Agricultural & Mechanical College Microsystem for rapid DNA sequencing
AU7022898A (en) 1997-04-23 1998-11-13 Ontario Cancer Treatment & Research Foundation Calreticulin-deficient cells
NZ521769A (en) * 2000-04-05 2004-12-24 Genome Therapeutics Corp The high bone mass gene of 11q13.3
US7205146B1 (en) 2000-06-14 2007-04-17 Oscient Pharmaceuticals Corporation Nucleotide and amino acid sequences relating to respiratory diseases and obesity
US6426220B1 (en) * 2000-10-30 2002-07-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of calreticulin expression
US20020147165A1 (en) * 2001-02-22 2002-10-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of calreticulin expression
GB0113266D0 (en) * 2001-05-31 2001-07-25 Bayer Ag Genes and proteins for prevention prediction diagnosis prognosis and treatment of chronic lung disease
EP1846026A4 (en) 2005-01-26 2008-07-02 Univ Johns Hopkins ANTIBODY DNA VACCINE WITH PLASMIDES FOR CODING A MUTATED ONCOPROTEIN ANTIGEN AND CALRETICULIN
JP4616237B2 (ja) 2006-11-07 2011-01-19 日本電信電話株式会社 シリコン化合物薄膜の形成方法
CN101616029B (zh) † 2009-07-28 2011-10-26 中兴通讯股份有限公司 一种实现网络拓扑发现的方法及系统
US8841074B2 (en) * 2009-12-04 2014-09-23 Quest Diagnostics Investments Incorporated MPL mutations in JAK2 V617F negative patients with myeloproliferative disease
WO2012088309A1 (en) * 2010-12-21 2012-06-28 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Therapeutic and diagnostic methods for manipulating phagocytosis through calreticulin and low density lipoprotein-related receptor
CN103091499B (zh) 2013-01-23 2015-07-08 三峡大学 一种肿瘤标志物钙网蛋白检测试剂盒的制备及应用
CN105916876A (zh) 2013-09-16 2016-08-31 分子医学研究中心责任有限公司 用于骨髓恶性肿瘤诊断的突变钙网蛋白

Also Published As

Publication number Publication date
MX348980B (es) 2017-07-05
DK3020727T4 (da) 2021-04-19
JP2023024989A (ja) 2023-02-21
US10344335B2 (en) 2019-07-09
PL3494985T3 (pl) 2021-08-02
EP3020727B2 (en) 2021-02-24
PL2808338T3 (pl) 2016-09-30
AU2019229353A1 (en) 2019-10-03
EP2808338A1 (en) 2014-12-03
CA2924370A1 (en) 2015-03-19
US11274350B2 (en) 2022-03-15
US20180251852A1 (en) 2018-09-06
EP3020727B1 (en) 2018-04-04
EP3494985A1 (en) 2019-06-12
KR102433548B1 (ko) 2022-08-18
JP2016537012A (ja) 2016-12-01
CN105916876A (zh) 2016-08-31
MX2016003245A (es) 2016-09-13
PT2808338E (pt) 2016-06-15
AU2019229353B2 (en) 2021-03-18
BR112016005611B1 (pt) 2024-01-16
AU2014320262B2 (en) 2019-06-13
ES2577289T3 (es) 2016-07-14
US9371570B2 (en) 2016-06-21
SG11201601193TA (en) 2016-04-28
CN113564254A (zh) 2021-10-29
CA2924370C (en) 2024-01-23
EP3494985B1 (en) 2021-02-24
EP2808338B1 (en) 2016-03-30
RU2668808C2 (ru) 2018-10-02
US20200040399A1 (en) 2020-02-06
WO2015036599A1 (en) 2015-03-19
DK3494985T3 (da) 2021-04-19
JP7646221B2 (ja) 2025-03-17
US20150079091A1 (en) 2015-03-19
AU2014320262A1 (en) 2016-03-10
EP3020727A1 (en) 2016-05-18
US20160251723A1 (en) 2016-09-01
DK3020727T3 (en) 2018-07-02
US20220251666A1 (en) 2022-08-11
EP3339318A1 (en) 2018-06-27
JP6745220B2 (ja) 2020-08-26
BR112016005611A2 (pt) 2017-09-12
KR20160068754A (ko) 2016-06-15
DK2808338T3 (da) 2016-06-06
RU2016114509A3 (ru) 2018-03-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2016114509A (ru) Мутантный кальретикулин для диагностики миелоидных новообразований
Ma et al. Single cell and spatial sequencing define processes by which keratinocytes and fibroblasts amplify inflammatory responses in psoriasis
Dong et al. The loss of RNA N6-adenosine methyltransferase Mettl14 in tumor-associated macrophages promotes CD8+ T cell dysfunction and tumor growth
JP2016537012A5 (ru)
JP2018512878A (ja) 次世代シークエンシングの感度を高めるための方法
Buess et al. Tumor-Endothelial interaction links the CD44+/CD24-phenotype with poor prognosis in early-stage breast cancer
Yang et al. Differential transcription profiles of long non-coding RNAs in primary human brain microvascular endothelial cells in response to meningitic Escherichia coli
Speransky et al. A novel RNA aptamer identifies plasma membrane ATP synthase beta subunit as an early marker and therapeutic target in aggressive cancer
Ning et al. Characterization of the Merkel cell carcinoma miRNome
RU2016137179A (ru) Гибридные белки fgfr
CN110418850A (zh) 鉴定和使用小rna预测因子的方法
Huang et al. Inhibition of ZEB1 by miR-200 characterizes Helicobacter pylori-positive gastric diffuse large B-cell lymphoma with a less aggressive behavior
CN109072312A (zh) 癌症表观遗传谱分析
JP6202659B2 (ja) 癌組織の不均一性マーカー及びその使用
Du et al. SMARCA2 is regulated by NORFA–miR-29c, a novel pathway that controls granulosa cell apoptosis and is related to female fertility
Juzenas et al. inDrops-2: a flexible, versatile and cost-efficient droplet microfluidic approach for high-throughput scRNA-seq of fresh and preserved clinical samples
CN107904311A (zh) 一种前列腺癌标志物及其用途
CN108085399B (zh) lncRNA及其反式调控基因WNT11的新用途
Chen et al. Effects and mechanism of lncRNA‐27785.1 that regulates TGF‐β1 of Sika deer on antler cell proliferation
CN118222717B (zh) 一种绵羊生育能力相关的lncRNA及应用
CN116640734B (zh) 关键基因在体外调控卵母细胞gvbd的用途及干扰片段
KR101577007B1 (ko) 지방유래줄기세포의 분화능력 탐지 마커 및 이의 용도
Hu et al. PUS1 promotes hepatocellular carcinoma via mRNA pseudouridylation to enhance the translation of oncogenic mRNAs
JP6793037B2 (ja) Ｅｇｆ又はｂｆｇｆを含む培地で培養した脂肪由来幹細胞の増殖及び治療能力を検出するマーカー並びにその用途
JP2013051909A (ja) サイトカイン遺伝子を利用したマルチプレックスｒｔ−ｐｃｒによる魚類健康診断法