JP7765181B2 - 改変されたil-2 fc融合タンパク質 - Google Patents
改変されたil-2 fc融合タンパク質Info
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Description
この出願は、参照によりその全体が図、凡例および特許請求の範囲に特に言及して本明細書に明示的に組み込まれる、2017年12月19日に提出された米国仮出願第62/607,850号および2018年5月22日に提出された米国仮出願第62/675,070号の利益を主張する。
本出願は、ASCIIフォーマットで電子的に提出され、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる配列表を含む。該ASCIIコピーは、2018年11月30日に作成され、067461-5217-WO_ST25.txtという名称で605,038バイトのサイズである。
125S/Q126Tの群から選択されるアミノ酸置換(複数可)を含む、組成物を提供する。
本発明は、自己免疫疾患の治療のための操作されたIL-2 Fc融合体を対象とする組成物および方法を対象とする。自己免疫疾患は、一般に「Treg細胞」または「Treg」と呼ばれる制御性T細胞を優先的に活性化するメカニズムを使用して治療できる。Tregは、免疫抑制性であり、自己抗原に対する耐性を維持して自己免疫疾患を予防することにより免疫系を調節する免疫T細胞の亜集団である。Tregは、一般的にエフェクターT細胞の増殖をダウンレギュレートする。Tregsは、CD4、FOXP3、CD25(CD25はIL-2Rαタンパク質としても知られている)などのバイオマーカーを発現する。
本出願をより完全に理解できるようにするために、いくつかの定義を以下に示す。そのような定義は、文法的同等物を包含することを意図する。
本発明は、本明細書および一般的に図19に示されるような(IL-2)-(Fcドメイン)融合タンパク質を提供する。当業者に理解されるように、本発明の融合タンパク質は、実際には、Fcドメインがホモ二量体タンパク質(図19B)またはヘテロ二量体タンパク質(図19A)のいずれかに存在するために自己集合する2つの異なるポリペプチドである。本発明のタンパク質は、一般に、3つの異なるドメインであるFcドメイン、1つ以上のドメインリンカー、およびIL-2ドメインを有する。
本発明のIL-2 Fc融合タンパク質は、変異型ヒトIL-2ドメインであるIL-2ドメインを含む。本明細書で説明するように、これらのドメインは、CD25-T細胞集団と比較して、TregなどのCD25+であるT細胞の活性化を高める特異性変異体を含むように設計されており、また、必要に応じて、IL-2変異型Fc融合タンパク質が分解されるのではなく、エンドサイトーシス経路を通じてリサイクルされるように、pH6でIL-2からIL-2Rαへの結合を増加するよう設計されたアミノ酸置換を含む。
予備的事項として、本発明のIL-2変異体は、ヒトIl-2の発現を増加させることが以前に示されているC125S変異体も含む。したがって、特に明記しない限り、本明細書に記載されているすべての変異体にはC125S変異体が含まれる。場合によっては、C125A変異体も使用できる。
したがって、本発明は、Tregを含むCD25+T細胞に対する特異性が増加したIL-2変異タンパク質を提供する。これは一般に、IL-2Rαへの結合を増加させるか、IL-2RβおよびIL-2RγまたはIL-2Rβγの界面への結合、またはその両方を減少させることによって行われる。
当技術分野で知られているように、リン酸化によるSTAT5タンパク質(STAT5aおよびSTAT5b)の活性化は、IL-2によって介在される初期のシグナル伝達事象の1つである。したがって、本発明の構築物を使用して異なるT細胞集団のSTAT5リン酸化を調べることにより、特異性を評価することができる。
さらに、本発明は、pH6(エンドソームのpH)での結合が増加する、増加したpH特異性を有するIL-2変異型タンパク質を提供する。
本発明は、本明細書に概説される野生型Fcドメインおよび変異型Fcドメインの両方を含む、単独およびFcドメインに融合された場合の両方で所望の活性を有する多くの特に有用なIL-2変異体を提供する。さらに、これらのIL-2変異体は、一価の構築物(例えば図19A)または二価の構築物(例えば図19B)で使用されてもよい。
本明細書で論じられるように、本発明は、任意にドメインリンカーを含む、融合されたIl-2変異体を含む少なくとも1つのFcドメインを有する2つのFcドメインを含むFc融合タンパク質を提供する。図19に示すように、本発明の二量体タンパク質は、図19Aに示すように本明細書で「一価IL-2」と呼ばれることもある1つのIL-2変異体を有するように構成でき、Fcドメインの1つはIL-2変異型タンパク質およびその他は「空」または「Fcのみ」である。この実施形態は、以下で論じられるように、ヘテロ二量体Fcドメインに依存する。あるいは、図19Bに示されるような「二価」IL-2構築物が使用され、各FcドメインはIL-2変異体に融合される。これらの実施形態は、上述のように、ホモ二量体Fcドメインを利用する。
pIアミノ酸変異に加えて、1つ以上のFcγR受容体への連結の改変、FcRn受容体への連結の改変等を含むがこれらに限定されない、様々な理由で実施することができるいくつかの有用なFcアミノ酸修飾が存在する。
FcγR受容体のうちの1つ以上への連結を改変するために実施され得るいくつかの有用なFc置換が存在する。結合の増加ならびに結合の減少をもたらす置換が有用であり得る。例えば、FcγRIIIaへの結合の増加は、一般に、ADCC(抗体依存性細胞介在性細胞傷害性、すなわち、FcγRを発現する非特異的細胞傷害性細胞が標的細胞上の結合抗体を認識し、その後、標的細胞の溶解を引き起こす細胞介在性反応)の増加をもたらすことが知られている。同様に、いくつかの状況下では、FcγRIIb(抑制性受容体)への結合の減少も有益であり得る。本発明で使用されるアミノ酸置換には、USSN11/124,620(特に図41)、USSN11/174,287、USSN11/396,495、USSN11/538,406に列挙されるものが含まれ、それらのすべてはその全体が、具体的にはそこで開示される変異体が参照により、明示的に本明細書に組み込まれる。使用される特定の変異体には、236A、239D、239E、332E、332D、239D/332E、267D、267E、328F、267E/328F、236A/332E、239D/332E/330Y、239D、332E/330L、243A、243L、264A、264V、および299Tが含まれるがこれらに限定されない。
同様に、機能性変異体の別のカテゴリーは「FcγR切除変異体」または「Fcノックアウト(FcKOまたはKO)」変異体である。これらの実施形態では、いくつかの治療用途のために、1つ以上またはすべてのFcγ受容体(例えば、FcγR1、FcγRIIa、FcγRIIb、FcγRIIIaなど)へのFcドメインの正常な結合を低減または除去して、追加の作用機序を回避することが望ましい。つまり、例えば、多くの実施形態において、特に二機能性免疫調節性タンパク質の使用において、Fcドメインのうちの1つが、1つ以上のFcγ受容体切除変異体を含むように、FCγRIIIa結合を切除してADCC活性を除去または顕著に減少させることが望ましい。これらの切除変異体は、図4に示されており、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236del/S239K、E233P/L234V/L235A/G236del/S267K、E233P/L234V/L235A/G236del/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236del/S267K/A327G、およびE233P/L234V/L235A/G236delからなる群から選択される切除変異体を用いる好ましい態様で、それぞれが独立して任意選択的に含まれるかまたは除外することができる。本明細書で言及される切除変異体は、FcγR結合を切除するが、FcRn結合を切除しないことに留意されたい。
ある実施形態では、本発明は、図19Bに一般的に示されるように、ホモ二量体Fcドメインを含む二価のホモ二量体タンパク質を提供する。この実施形態では、各単量体は同一であり、一般に、変異体-IL-2-リンカー-Fcドメインを含み、リンカーは一般にIgG1からのヒンジである。
図19Bに示されるように、ホモ二量体の二価のIL-2融合タンパク質に加えて、代替の実施形態は一価のIL-2融合タンパク質を利用し、Fcドメインの1つは「空」であり、本発明はヘテロ二量体化変異体に依存して、2つのFcドメインを一緒にする。これらの実施形態は、自己集合してヘテロ二量体Fcドメインおよびヘテロ二量体Fc融合タンパク質を形成する2つの異なる変異型Fc配列の使用に依存する。
本発明は、ヘテロ二量体形成および/またはホモ二量体からの精製を可能にするためにヘテロ二量体化変異体を利用する、様々なフォーマットのヘテロ二量体抗体を含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。多数のヘテロ二量体化のバリエーションを図2に示す。
ある実施形態において、ヘテロ二量体の形成は、立体変異体の付加によって促進され得る。すなわち、各重鎖中のアミノ酸を変えることによって、異なる重鎖が会合して同一のFcアミノ酸配列を有するホモ二量体を形成するよりもヘテロ二量体構造を形成する可能性が高い。図には、適切な立体変異体が含まれている。
一般に、当業者には理解されるように、pI変異体には2つの一般的なカテゴリー:タンパク質のpIを増加させるもの(塩基性変化)とタンパク質のpIを減少させるもの(酸性変化)がある。本明細書中に記載されるように、これらの変異体の全ての組み合わせがなされ得る:一方の単量体は野生型、または野生型と顕著に異なるpIを示さない変異体であり得、他方がより塩基性またはより酸性のいずれかであり得る。代替的に、各単量体は、1つがより塩基性に、1つがより酸性へと変化する。
さらに、本発明の多くの実施形態は、あるIgGアイソタイプから別のIgGアイソタイプへの特定の位置でのpIアミノ酸の「移入」に依存し、したがって、変異体に望ましくない免疫原性が導入される可能性を低減または排除する。これらのうちの多数は、本明細書に参照によって組み込まれる米国特許出願公開第2014/0370013号の図21に示される。すなわち、IgG1は、高いエフェクター機能を含む様々な理由から治療用抗体の一般的なアイソタイプである。しかしながら、IgG1の重定常領域は、IgG2のそれよりも高いpIを有する(8.10対7.31)。特定の位置でIgG2残基をIgG1バックボーンに導入することによって、得られる単量体のpIは低下(または上昇)し、さらにより長い血清半減期を示す。例えば、IgG1は137位にグリシン(pI5.97)を有し、IgG2はグルタミン酸(pI3.22)を有し、グルタミン酸を移入すると、得られるタンパク質のpIに影響を与える。以下に記載されるように、変異型Fc融合タンパク質のpIに顕著な影響を与えるためには、一般にいくつかのアミノ酸置換が必要とされる。しかしながら、IgG2分子中の変化でさえも血清半減期の増加を可能にすることが以下に論じられるように留意されたい。
本明細書に概説されるように、各単量体のpIは、変異体IL-2ドメインおよびFcドメインのpIに依存することがある。したがって、ある実施形態において、pIの変化は、米国特許出願公開第2014/0370013号の図19のチャートを用いて、変異体重鎖定常ドメインに基づいて計算される。本明細書で論じるように、どの単量体を操作するかは概して、各単量体の固有のpIによって決定される。あるいは、各単量体のpIを比較することができる。
当業者には理解されるように、列挙されたヘテロ二量体化変異体(スキュー変異体および/またはpI変異体を含む)はすべて、それらの「鎖性(strandedness)」または「単量体分割」を保持する限り、任意の方法で任意選択的に独立して組み合わせることができる。さらに、これらの変異体はすべて、ヘテロ二量体化フォーマットのいずれにも組み合わせることができる。
本明細書で概説するように、本発明は、いくつかの有用な一価および二価の構築物を提供する。
ある実施形態では、本発明のIL-2-Fc融合体タンパク質は、図19Aおよび19Cに示されるものなどのヘテロ二量体一価構築物である。この実施形態では、変異型IL-2ドメインは一般に、ヒンジをドメインリンカー(一般にC220S変異体を含む)として使用するか、またはヒンジに接続された追加のリンカーを使用して、変異型ヒトIgG1 Fcドメインに融合され、他のFcドメイン(ヒンジを含む)は「空」のままである。
ある実施形態では、本発明のIL-2-Fc融合体タンパク質は、図19Bおよび19Dに示されるものなどのホモ二量体二価構築物である。この実施形態では、変異体IL-2ドメインは一般に、ヒンジをドメインリンカー(一般にC220S変異体を含む)として、またはヒンジに取り付けられた追加のリンカーを使用して、変異型ヒトIgG1 Fcドメインにそれぞれ融合される。
本発明はさらに、ホモ二量体二価IL-2-Fc融合体タンパク質およびヘテロ二量体一価IL-2融合タンパク質をコードする核酸組成物を提供する。
本発明に従って使用される抗体の製剤は、所望の純度の抗体を任意選択の薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.[1980]に一般に概説されるような)と混合することによって、保存のために、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で調製される(Remington’s Pharmaceutical Sciences 第16版,Osol,A.Ed.¥[1980]に概説されるように)。
本発明のIL-2-Fc融合体タンパク質の組成物は、例えば本発明の二量体タンパク質を使用して患者のCD25+細胞を活性化することにより、自己免疫疾患の治療に用途を見出す。
上記のように、IL-2は非常に速いクリアランスに悩まされている。この急速なクリアランスは、一部にはIL-2:IL-2R複合体の内部移行によるものである。エンドソームへの内在化に続いて、IL-2、IL-2Rβ、およびγcは分解され、IL-2Rαは構成的に細胞表面にリサイクルされる。L18M/L19S変異を持つIL-2変異体2D1は、野生型IL-2よりも長い半減期を示す。Fallonらは、野生型IL-2はエンドソームpHでIL-2Rαに対する親和性が低く、IL-2とIL-2Rαの間のpH依存性結合を示唆していると報告している。このグループはさらに、2D1がエンドソームpHでWT IL-2よりもIL-2Rαに対して高い親和性を持つため、2D1の延長された半減期がIL-2Rαによるリサイクルから生じることを発見した。特に、IL-2上の残基L18およびL19は、IL-2Rβおよびγcと接触すると記載されている。対照的に、我々は、IL-2:IL-2Rαインターフェースでの残基の変更は、pH依存性結合の減衰、IL-2RαによるIL-2のリサイクルの増加、さらには半減期の増加に適していると仮定した。
IL-2およびIL-2Rαインターフェース(PDBコード2ERJ)の結晶構造を調べることにより、我々は、Arg38、Thr41、および/またはIL-2のPhe42およびIL-2RαのHis120間の相互作用からなるIL-2/IL-2Rαインターフェースでの可能な自然の「pHスイッチ」を特定した(図8を参照)。我々は、IL-2:IL-2Rαβγ複合体の内在化後のエンドソームの低pHでは、His20がプロトン化され、IL-2RαからのIL-2の放出、およびその後の残りのIL-2:IL-2Rβγ複合体のリソソーム分解が起こると仮定した。IL-2Rαは細胞表面にリサイクルされることが知られており、これらの相互作用する残基の1つ以上を置換することにより、pH6.0でIL-2とIL-2Rαとのの結合親和性を高めると、IL-2のリサイクルが改善され、半減期が延長される。Protein Design Automationテクノロジーによる計算予測(たとえば、1998年10月22日公開のWO1998/047089を参照)を使用して、我々は、これら3つの接触残基を飽和させる変異体を作製した。
次に、R38Lを従来のIL-2変異体と組み合わせて(2009年5月14日公開のWO2009/061853に記載されているQ126Tの変異体2-4)他のIL-2変異体との関連でオフレートが改善されたかどうかを調査した。
IL-2による増殖性シグナル伝達は、IL-2中間親和性受容体複合体(IL-2Rβγ)の一部として、またはIL-2高親和性受容体複合体(IL-2Rαβγ)の一部として、IL-2Rβおよびγcによって介在される。CD25は、IL-2Rαβγ複合体のIL-2への高親和性結合を付与するが、それ以外ではそれ自体がシグナル伝達を欠いている。IL-2Rαβγ複合体への高親和性結合により、IL-2はIL-2Rαを構成的に発現するTregを支持する。したがって、IL-2Rαに対するIL-2の親和性を増加させると、Treg上のIL-2Rαβγ複合体に有利に結合をさらに歪めることができると仮定された。あるいは、IL-2Rβ、γc、またはIL-2Rβγに対するIL-2の親和性を低下させると、CD25陰性T細胞およびNK細胞からの結合をゆがめる可能性がある。
IL-2の短い半減期にさらに取り組むために、我々は、生産を促進し、FcRnを介したリサイクルを促進しおよび半減期を長くすることを目的として、Fc融合体(以下、IL-2-Fc融合体と呼ぶ)としてIL-2を作製した。
IL-2をコードするプラスミドを、標準的な遺伝子合成、続いてFc融合体パートナー(例えば、図6に示す定常領域)を含むpTT5発現ベクターへのサブクローニングによって構築した。IL-2には、発現を改善するためのC125S置換と、O-グリコシル化部位を除去するためのT3A置換が含まれる場合がある。例示的なIL-2-Fc融合体フォーマットの概略図を図19に示す。選択された置換は、標準的な突然変異誘発技術によって導入された。
monovIL-2-Fc融合体フォーマットの堅牢性と有効性を調査するために、多くの先行技術のIL-2変異体がこのフォーマットで生成された。これらのIL-2-Fc融合体には、XENP24637(2012年8月16日公開のWO2012/107417に記載された変異体に基づく)、XENP24638(WO2005/007121、2005年1月27日公開に記載の変異体2-4に基づく)、XENP24639(2005年1月27日公開、WO2005/007121に記載の変異M1に基づく)、XENP24640(2009年5月14日公開、WO2009/061853に記載のQ126Tを伴う変異2-4に基づく)、XENP24642(基盤1999年11月25日に公開されたWO1999/060128に記載された変種)、XENP24728(Mitra et al.2015に記載されたH9-RETに基づく)、およびXENP24729(Mitra et al.2015に記載されたH9-RETRに基づく)が含まれる。XENP24641、XENP24730、XENP24731、およびXENP24732などの追加の変異体は、従来技術で説明されている個々の置換または置換の組み合わせに基づいていた。配列は、図20に示される。
様々なIL-2受容体に対する上記のmonovIL-2-Fc融合体の親和性は、実施例2に一般的に記載されているようにオクテットを使用して決定された。特に、IL-2Rαの親和性を決定するために、CD25(IL-2Rα)-Fc融合体(R&D Systems、ミネアポリス、ミネソタ州)をAR2Gバイオセンサーにロードし、複数の濃度のIL-2-Fc融合体に浸した。IL-2RβおよびIL-2Rβγの親和性を決定するには、二価CD122(IL-2Rβ)-Fc-His融合体またはヘテロ二量体CD122:CD132(IL-2Rβγ)-Fc-His融合体をHIS1Kバイオセンサーにロードし、IL-2-Fc融合体の複数の濃度に浸した。得られた解離定数(KD)、会合速度(ka)、および解離速度(kd)を図21に示す。
サイトカインがその受容体に結合した後、受容体に関連するヤヌスキナーゼ(JAK)がSTATタンパク質をリン酸化し、STATタンパク質が核に移行してさらに下流のプロセスを調節する。したがって、STATタンパク質(特に、STAT5aおよびSTAT5bを含むSTAT5)のリン酸化は、IL-2が高または中親和性IL-2受容体に結合することによって引き起こされる最も初期のシグナル伝達現象の1つである((Lin and Leonard(2000);Wuest et al.(2008))。したがって、上記のmonovIL-2-Fc融合体が、CD8+およびCD4+T細胞およびTregなどの様々な細胞型においてSTAT5リン酸化を誘導する能力を調べた。
bivIL-2-Fc融合体フォーマットの堅牢性と有効性を調査するには、先行技術のIL-2変異体(1999年11月25日公開のWO1999/060128に記載)とコントロールIL-2(C125SとT3A置換を併用)はこのフォーマットで生成され、その配列は図23に示されている。
別の実験では、新鮮なPBMCを、指定の試験物質とともに指定濃度で15分間インキュベートした。インキュベーション後、PBMCを抗CD3-BUV395(UCHT1)、抗CD4-BV605(RPA-T4)、および抗CD8-Alexa700(SK1)で、室温で、30~45分間染色した。細胞を洗浄し、予め冷却した(-20℃)90%メタノールとともに20~60分間インキュベートした。メタノールインキュベーション後、細胞を再度洗浄し、抗CD25-BV510(M-A251)、抗CD45RA-PE(HI100)、抗FOXP3-Alexa488(259D)、および抗pSTAT5-Alexa647(pY694)で染色し、様々な細胞集団およびSTAT5リン酸化を標識した。CD8+T細胞、CD4+T細胞、TregでのSTAT5リン酸化の誘導を示すデータを図24に示す。
IL-2とFc領域の間にリンカーを含めることの影響を調査するために、先行技術のIL-2変異体(1999年11月25日公開のWO1999/060128および2012年8月16日公開のWO2012/107417に記載)は、Gly-SerリンカーとのmonovIL-2-Fc融合体またはbivIL-2-Fc融合体として生成された。これらのIL-2-Fc融合体の配列は図25に示されている。
別の実験では、新鮮なPBMCを、指定の試験物質とともに指定濃度で15分間インキュベートした。インキュベーション後、PBMCを抗CD3-BUV395(UCHT1)、抗CD4-BV605(RPA-T4)、および抗CD8-Alexa700(SK1)で、室温で、30~45分間染色した。細胞を洗浄し、予め冷却した(-20℃)90%メタノールとともに20~60分間インキュベートした。メタノールインキュベーション後、細胞を再度洗浄し、抗CD25-BV510(M-A251)、抗CD45RA-PE(HI100)、抗FOXP3-Alexa488(259D)、および抗pSTAT5-Alexa647(pY694)で染色し、様々な細胞集団およびSTAT5リン酸化を標識した。CD8+T細胞、CD4+T細胞、TregでのSTAT5リン酸化の誘導を示すデータを図26に示す。
実施例2で論じたように、IL-2RのIL-2Rβに対する親和性を増加させると、Treg上のIL-2Rαβγ複合体に有利に結合をさらにゆがめ、一方で、IL-2Rβ、γc、またはIL-2Rβγに対するIL-2の親和性を減少させると、CD25陰性T細胞およびNK細胞からの結合をゆがめる可能性がある。ここでは、IL-2Rα結合を増加させる置換を、Treg選択性を高める目的で、IL-2-Fc融合体との関連でIL-2Rβ結合を減少させる置換と組み合わせた。
様々なIL-2受容体に対する上記の変異体IL-2-Fc融合体の親和性は、実施例3B(a)に一般的に記載されているようにオクテットを使用して決定された。特に、IL-2Rαの親和性を決定するために、CD25(IL-2Rα)-Fc融合体(R&D Systems、ミネアポリス、ミネソタ州)をAR2Gバイオセンサーにロードし、複数の濃度のIL-2-Fc融合体に浸した。IL-2RβおよびIL-2Rβγの親和性を決定するには、二価CD122(IL-2Rβ)-Fc-His融合体またはヘテロ二量体CD122:CD132(IL-2Rβγ)-Fc-His融合体をHIS1Kバイオセンサーにロードし、IL-2-Fc融合体の複数の濃度に浸した。得られた解離定数(KD)、会合速度(ka)、および解離速度(kd)を図33に示す。
別の実験では、新鮮なPBMCを、指定の試験物質とともに指定濃度で15分間インキュベートした。インキュベーション後、PBMCを抗CD3-BV396(UCHT1)、抗CD4-BV605(RPA-T4)、および抗CD8-Alexa700(SK1)で、室温で、30~45分間染色した。細胞を洗浄し、予め冷却した(-20℃)90%メタノールとともに20~60分間インキュベートした。メタノールインキュベーション後、細胞を再度洗浄し、抗CD25-BV421(M-A251)、抗CD45RA-PE(HI100)、抗FOXP3-Alexa488(259D)、および抗pSTAT5-Alexa647(pY687)で染色し、様々な細胞集団およびSTAT5リン酸化を標識した。様々な細胞集団におけるSTAT5リン酸化の誘導を示すデータは、図28~29に示されている。
価数、ドメインリンカー、pHスイッチ、Treg選択性など、前の例で説明した特性を組み合わせて、追加のIL-2-Fc融合体を設計し、例2で一般的に説明したように作製した。例示的な配列が、図30に示される。さらに、WO2014/153111に記載されているように非制御性T細胞に対するTregの比率を高めるように設計されたFc-IL-2(V91K/C125A)融合体は、コンパレータ(ここではXENP27193と呼ばれる。配列は図34に示される)として生成された。
別の実験では、新鮮なPBMCを、指定のIL-2-Fc試験物質とともに指定濃度で37℃で15分間インキュベートした。インキュベーション後、PBMCはまず抗CD3-BUV395(UCHT1)、抗CD4-BV605(RPA-T4)、抗CD8-AF700(SK1)、および抗CD56-PE抗体で染色された。最初の染色後、PerFix EXPOSE(Beckman Coulter、インディアナポリス、インディアナ州)を使用して細胞を透過処理した。透過処理後、細胞は抗CD25-BV421(M-A251)、抗CD45RA-BV510(HI100)、抗FoxP3-AF488(259D)、および抗pSTAT5-AF647(47/Stat5(pY694))抗体で染色された。第2の染色後、細胞をフローサイトメトリーで分析して、様々なリンパ球集団のSTAT5リン酸化を調べた。IL-2受容体を介したIL-2-Fc融合体によるシグナル伝達を示す、様々なリンパ球集団のpSTAT5 MFIを示すデータを図35に示す。
様々なIL-2-Fc試験物品によるSTAT5リン酸化の誘導を、実施例5Aに記載されているように調査した。TregとCD4+メモリーT細胞(CD45RA-)でpSTAT5 MFIを示すデータは、IL-2受容体を介してIL-2-Fc融合体によるシグナル伝達を示し、図36~42に示されている。
1.Xtend Fcの組み込み
上記のIL-2-Fc融合体は、FcRnへの結合が強化されたXtend Fc(M428L/N434S)で設計され、融合のFcRnを介したリサイクルを促進し、その後循環半減期を延長した。Xtend Fcとの例示的な二価IL-2-Fc融合体の配列を図43に示し、Xtend Fcとの例示的な一価IL-2-Fc融合体の配列を図44に示す。
我々は、また、効力の低いIL-2-Fc融合体は抗原シンクを減少させ、それにより循環中の半減期を増加させると推論した。実施例5Bのデータを考慮して、二価のIL-2-Fc融合体およびドメインリンカーを有するIL-2-Fc融合体が効力を増強したことを示して、我々はドメインリンカーを欠く一価のIL-2-Fc融合体に特に興味があった。したがって、選択性と効力の最適なバランスでIL-2-Fc融合体を特定するために、我々は、XENP24635(C125S変異を伴う一価のIL-2-Fc融合体)を伴う、一価のIL-2融合体(それぞれD20N/T37RおよびD20N/N71K変異体を含むXENP26105およびXENP26109)、ならびにXENP25908およびXENP27193(自己免疫疾患の治療に適応されるコンパレータIL-2-Fc融合体)のインビトロ効力(様々なリンパ球集団に対するSTAT5リン酸化の誘導によって示される)をSTAT5リン酸化アッセイで比較した。データは図45に示されている。
1.CD25選択的IL-2-Fc融合体で処理されたTreg培養物は、より優れたCD25発現を示す
ラパマイシンは、インビトロでCD4+CD25+FOXP3+Tregの増殖を促進し、その結果生じる拡大したTregはCD4+およびCD8+T細胞の増殖を抑制することが以前に報告されている(例えば、Battaglia et al.(2006)Rapamycin promotes expansion of functional CD4+CD25+FOXP3+regulatory T cells of both healthy subjects and type 1 diabetic patients.J Immunol. 177(12)8338-8347、およびStrauss et al.(2007)Selective survival of naturally occurring human CD4+CD25+Foxp3+regulatory T cells cultured with rapamycin.J Immunol.178(1)320-329)。
実施例7Aに記載されるようにIL-2またはXENP27564のいずれかでさらに培養されたラパマイシンTregは、15日目にそれらの抑制機能について評価された。1x105のCFSE標識PBMCを、示された数のTag-itバイオレット標識Tregと4日間インキュベートし、CD8+レスポンダーとCD4+レスポンダーの拡大をCFSE希釈で測定した。リンパ球集団は次のように染色された:抗CD8-PerCp-By5.5(SK1)、抗CD3-PE-Cy7(OKT3)、抗CD127-APC(A019D5)、抗CD25-APC-Fire750(M-A251)、抗CD45RO-Alexa700(UCHL1)、抗CD16-BV605(3G6)、抗CD56-BV605(HCD56)、抗CD45RA-BV785(HI100)、抗CD4-BUV395(SK3)、およびゾンビアクア(BV510)。特に、図49に示されているデータは、Treg選択的IL-2-Fc融合体によって拡張されたTregが抑制機能を強化している可能性があることを示す。
抑制アッセイでは、CFSE標識PBMCおよびTag-it Violet標識ラパマイシンTregを、指示された濃度の指示された被験物質とともに、100ng/mlのプレート結合抗CD3(OKT3)とともに4日間インキュベートした。リンパ球集団は次のように染色された:抗CD8-PerCp-Cy5.5(SK1)、抗CD3-PE-Cy7(OKT3)、抗CD25-APC-Cy7(M-A251)、抗CD45RO-Alexa700(UCHL1)、抗CD16-BV605(3G6)、抗CD56-BV605(HCD56)、抗CD45RA-BV785(HI100)、抗CD4-BUV395(SK3)、およびゾンビアクア(BV510)。試験品での処理後の様々なリンパ球集団の増殖(CFSEまたはTag-itバイオレット希釈で測定、ゾンビ色素は死細胞を除外するために使用)を図52に示す。データは、CD25選択的IL-2-Fc融合体XENP27563とXENP27564が、XENP24635(C125SのみのIL-2-Fc)、組換えIL-2、および組換えIL-15と比較して、Tregを選択的に拡大したことを示す。実際、図53および54に示されているデータは、CD25選択的IL-2-Fc融合体が、XENP24635、組換えIL-2、および組換えIL-15と比べて、CD8+およびCD4+T細胞の増殖を誘導する効果を実質的に減少させたことを示している。
XENP27563およびXENP27564の臨床的可能性を調査するために、カニクイザルにおけるそれらの活動を調査した。動物に投薬する前に、カニクイザルのリンパ球に対するIL-2-Fc融合体の活性を確認した。以下のように、2つのアッセイを実施した。
カニクイザルの最初の研究では、動物(n=2)に3倍量のXENP27563または3倍量のXENP27564を0日目と15日目に静脈内投与した。血液を経時的に収集して、様々なリンパ球集団の拡大を調査し、被験物質の血清濃度を調査した。動物の血清アルブミン濃度と血圧も、試験品の耐容性を調査するために採取された。
カニクイザルの最初の研究では、動物(n=3)に1X、3X、または10Xのいずれかの用量でXENP27564を静脈内投与した。様々なリンパ球集団の拡大、ならびに血清アルブミンとC反応性タンパク質(CRP)の濃度を調査するために、時間の経過とともに血液が収集された。
B6マウスの脾細胞をIL-2-Fc融合体および組換えヒトIL-2と15分間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を抗CD4-PE(GK1.5)、抗CD25-BV605(PC61)、および抗CD44-BV510(IM7)で染色した。次に、細胞をPerFix EXPOSE(Beckman Coulter、インディアナポリス、インディアナ州)を使用して透過処理した。透過処理後、細胞を抗CD3-AF700(2C11)、抗CD8-AF488(53-6.7)、抗FoxP3-eF450(FJK-16S)、および抗pSTAT5(pY694)で染色し、STAT5のフローサイトメトリーで分析した様々なリンパ球集団のリン酸化。データは図77に示されている。データは、操作されたIL-2-Fc融合体がマウスのTregに対して等しく選択的かつ強力であることを示し、前臨床マウスモデルを使用して自己免疫疾患を調査するのに適している。
Claims (18)
- 変異型ヒトIL-2タンパク質を含むポリペプチド組成物であって、前記変異型ヒトIL-2タンパク質は、制御性T細胞を優先的に活性化し、かつ、配列番号2と比較してT3A/D20N/T37RおよびT3A/D20N/N71Kの群から選択されるアミノ酸置換を含む、ポリペプチド組成物。
- 前記変異型ヒトIL-2タンパク質がC125Sアミノ酸置換をさらに含む、請求項1に記載のポリペプチド組成物。
- 前記変異型ヒトIL-2タンパク質がC125Aアミノ酸置換をさらに含む、請求項1に記載のポリペプチド組成物。
- 前記ポリペプチド組成物が、ホモ二量体タンパク質複合体であり、各タンパク質単量体が、Fcドメインに共有結合した前記変異型ヒトIL-2タンパク質を含む、請求項1、2または3に記載のポリペプチド組成物。
- 前記Fcドメインのそれぞれが変異型Fcドメインである、請求項4に記載のポリペプチド組成物。
- 前記ポリペプチド組成物が、第1の変異型Fcドメインに共有結合している前記変異型ヒトIL-2タンパク質を含む第1のタンパク質単量体と、第2の変異型Fcドメインを含む第2のタンパク質単量体とを含むヘテロ二量体タンパク質複合体である、請求項1、2または3に記載のポリペプチド組成物。
- 前記変異型Fcドメインが、アミノ酸置換M428L/N434Sを含む変異型ヒトIgG1 Fcドメインである、請求項5または6に記載のポリペプチド組成物。
- 前記変異型Fcドメインが、アミノ酸置換E233P/L234V/L235A/G236del/S267Kを含む変異型ヒトIgG1 Fcドメインである、請求項5または6に記載のポリペプチド組成物。
- 前記第1および第2の変異型Fcドメインが、
からなる群から選択されるヘテロ二量化変異体のセットを含む、請求項6、7または8に記載のポリペプチド組成物。 - 前記ヘテロ二量化変異体のセットが、L368D/K370S:S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E:D401K;およびT366S/L368A/Y407V:T366Wからなる群から選択される、請求項9に記載のポリペプチド組成物。
- 前記変異型Fcドメインの1つが、
からなる群から選択されるpI変異体のセットを含む、請求項6、7、8、9または10に記載のポリペプチド組成物。 - 前記pI変異体セットが、Q295E/N384D/Q418E/N421Dである、請求項11に記載のポリペプチド組成物。
- 前記ポリペプチド組成物が、XENP27564(配列番号297および298)、XENP27563(配列番号295および296)、XENP26105(配列番号245および246)、およびXENP26109(配列番号249および250)からなる群から選択される、請求項6に記載のポリペプチド組成物。
- 請求項1に記載の変異型ヒトIL-2タンパク質をコードする核酸を含む核酸組成物。
- 核酸組成物であって、
a)請求項6~13のいずれか1項に記載の第1のタンパク質単量体をコードする第1の核酸と、
b)請求項6~13のいずれか1項に記載の第2のタンパク質単量体をコードする第2の核酸と、をそれぞれ含む、核酸組成物。 - 発現ベクター組成物であって、
a)請求項15に記載の第1の核酸を含む第1の発現ベクターと、
b)請求項15に記載の第2の核酸を含む第2の発現ベクターと、を含む、発現ベクター組成物。 - 請求項16に記載の発現ベクター組成物を含む、宿主細胞。
- ポリペプチド組成物の製造方法であって、前記組成物を製造する条件下で請求項17に記載の宿主細胞を培養することと、前記組成物を回収することとを含む、製造方法。
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