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JP2019514850A - プロテアーゼ活性化t細胞二重特異性分子 - Google Patents

プロテアーゼ活性化t細胞二重特異性分子 Download PDF

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Abstract

本発明は、一般に、新規のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子と、マスキング部分として作用するイデオタイプ特異的ポリペプチドとに関する。本発明はまた、このようなプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子及びイデオタイプ特異的ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと、このようなポリヌクレオチドを含むベクター及び宿主細胞とにも関する。本発明はさらに、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子及びイデオタイプ特異的ポリペプチドを生成するための方法と、これらのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子及びイデオタイプ特異的ポリペプチドを、疾患の治療において使用する方法とにも関する。
【選択図】図1A

Description

本発明は一般に、分子の抗原への結合を可逆的にマスキングする抗イデオタイプ結合部分を含む、新規のプロテアーゼ活性化型抗原結合性分子に関する。具体的には、本発明は、プロテアーゼにより切断されるまでCD3結合部分をマスキングする抗イデオタイプ結合部分を有するT細胞結合分子に関する。これは、腫瘍などの標的組織、例えば、腫瘍浸潤T細胞に近接するまで、CD3結合部分をアクセス不可能とするか、又は「マスキング」することを可能とする。加えて、本発明は、このようなプロテアーゼ活性化T細胞結合分子及びイデオタイプ特異的ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、並びにこのようなポリヌクレオチドを含むベクター及び宿主細胞に関する。本発明はさらに、本発明のプロテアーゼ活性化T細胞結合分子を生成するための方法、及びこれを、例えば、疾患の治療において使用する方法にも関する。
様々な臨床状況では、個別の標的細胞、又は特異的標的細胞型の選択的破壊が所望されることが多い。例えば、健常細胞及び健常組織をインタクトのままとし、損傷せずに、腫瘍細胞を、特異的に破壊することは、がん治療の第1の目標である。
これを達成する魅力的な様式は、免疫応答を、腫瘍に対して誘導して、ナチュラルキラー(NK)細胞又は細胞傷害性Tリンパ球(CTL)などの免疫エフェクター細胞に、腫瘍細胞を攻撃及び破壊させることである。この点で、1つの「アーム」により、標的細胞上の表面抗原に結合し、第2の「アーム」により、T細胞受容体(TCR)複合体の活性化させる不変の成分に結合するようにデザインされた二重特異性抗体が、近年、関心を集めている。このような抗体の、その両方の標的への同時的な結合は、標的細胞とT細胞との間の、一過性の相互作用を強い、任意の細胞傷害性T細胞の活性化と、その後の標的細胞の溶解とを引き起こす。よって、免疫応答は、標的細胞へと再指向し、CTLの、通常のMHC制限型活性化に関与性である、標的細胞によるペプチド抗原の提示、又はT細胞の特異性に依存しない。
この文脈では、CTLが、標的細胞と近接した、すなわち、免疫学的シナプスが模倣された場合に限り活性化することが極めて重要である。特に、効果的な標的細胞の溶解を誘発するために、リンパ球のあらかじめの条件付け又は共刺激を要請しない、T細胞活性化二重特異性分子が所望される。いくつかの二重特異性抗体フォーマットを開発し、T細胞媒介型免疫療法へのそれらの適性について探索した。これらは、BiTE(二重特異性T細胞エンゲージャー)分子(Nagorsen及びBaeuerle, Exp Cell Res 317, 1255-1260 (2011))、ダイアボディ(Holligerら, Prot Eng 9, 299-305 (1996))及びタンデムダイアボディなど、その誘導体(Kipriyanovら, J Mol Biol 293, 41-66 (1999))、DART(二重親和性再標的化)分子、(Mooreら, Blood 117, 4542-51 (2011))、並びにトリオマブ(Seimetzら, Cancer Treat Rev 36, 458-467 (2010))を含む。
治療に適する二重特異性分子を作出する課題は、有効性、毒性、適用可能性、及び生産可能性と関連する、いくつかの技術的難題であって、対処しなければならない難題をもたらす。二重特異性分子が、標的細胞、例えば、がん細胞上の抗原であって、非標的組織内でもまた発現する抗原を標的化する場合、毒性が生じうる。したがって、標的細胞の存在下では、完全なT細胞の活性化をもたらすが、正常細胞又は正常組織の存在下では、T細胞の活性化をもたらさない、効果的なT細胞活性化二重特異性分子が必要とされている。
本発明は、一般に、標的細胞の存在下で選択的に活性化する、T細胞活性化二重特異性分子に関する。
一態様では、本発明は、
(a)CD3への特異的結合が可能な第1の抗原結合部分と;
(b)標的細胞抗原への特異的結合が可能な第2の抗原結合部分と;
(c)プロテアーゼ切断型リンカーを介して、T細胞二重特異性結合性分子と共有結合しているマスキング部分であって、第1又は第2の抗原結合部分のイデオタイプへの特異的結合が可能であり、これにより、第1又は第2の抗原結合部分を、可逆的に隠蔽するマスキング部分と
を含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子に関する。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のマスキング部分は、第1の抗原結合部分と共有結合している。一実施態様では、マスキング部分は、第1の抗原結合部分の重鎖可変領域と共有結合している。一実施態様では、マスキング部分は、第1の抗原結合部分の軽鎖可変領域と共有結合している。一実施態様では、マスキング部分は、抗イデオタイプscFvである。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第2の抗原結合部分を可逆的に隠蔽する、第2のマスキング部分を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ切断型リンカーを切断することが可能なプロテアーゼを、標的細胞に発現させる。一実施態様では、第2の抗原結合部分は、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変領域又は定常領域を交換した、クロスオーバーFab分子である。一実施態様では、第2の抗原結合部分は、Fab軽鎖及びFab重鎖の定常領域を交換した、クロスオーバーFab分子である。一実施態様では、第1の抗原結合部分は、従来型のFab分子である。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、CD3への特異的結合が可能な、1つを超えない抗原結合部分を含む。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、標的細胞抗原への特異的結合が可能なFab分子である、第3の抗原結合部分を含む。特定の一実施態様では、第3の抗原結合部分は、第2の抗原結合部分と同一である。特定の一実施態様では、第3の抗原結合部分は、第2の抗原結合部分と同一ではない。一実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1又はHER1への特異的結合が可能である。一実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1、HER1、又はメソテリンへの特異的結合が可能である。一実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1、HER1、HER2、又はメソテリンへの特異的結合が可能である。
一実施態様では、第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分は、任意選択的にペプチドリンカーを介して互いに融合している。特定の一実施態様では、第2の抗原結合部分は、Fab重鎖のC末端において、第1の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させる。特定の一実施態様では、第1の抗原結合部分は、Fab重鎖のC末端において、第2の抗原結合部分のFab重鎖のN末端に融合している。特定の一実施態様では、第1の抗原結合部分のFab軽鎖及び第2の抗原結合部分のFab軽鎖は、任意選択的にペプチドリンカーを介して互いに融合している。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、加えて、安定的な会合が可能な、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインを含む。一実施態様では、Fcドメインは、IgG、具体的には、IgG又はIgGのFcドメインである。一実施態様では、Fcドメインは、ヒトFcドメインである。一実施態様では、Fcドメインは、天然IgGのFcドメインと比較した、Fc受容体への結合親和性の低減及び/又はエフェクター機能の低減を呈示する。一実施態様では、Fcドメインは、Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低減する、一又は複数のアミノ酸置換を含む。特定の一実施態様では、一又は複数のアミノ酸置換は、L234、L235、及びP329(カバット番号付け)の群から選択される、一又は複数の位置におけるものである。特定の一実施態様では、Fcドメインの各サブユニットは、活性化Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低減する、3つのアミノ酸置換であって、L234A、L235A、及びP329Gであるアミノ酸置換を含む。特定の一実施態様では、Fc受容体は、Fcγ受容体である。一実施態様では、エフェクター機能は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)である。一実施態様では、標的細胞は、ヒト細胞である。
一実施態様では、マスキング部分は、
(a)DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;及び
(c)PYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む。
一実施態様では、マスキング部分は、
(a)RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(b)YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(c)QHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む。
一実施態様では、マスキング部分は、
(a)DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;
(c)PYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
(d)RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む。
一実施態様では、マスキング部分は、
(a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;及び
(c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む。
一実施態様では、マスキング部分は、
(a)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(b)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(c)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む。
一実施態様では、マスキング部分は、
(a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;
(c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
(d)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ切断型リンカーは、少なくとも1つのプロテアーゼ認識配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ切断型リンカーは、プロテアーゼ認識配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識配列は、
(a)RQARVVNG(配列番号36);
(b)VHMPLGFLGPGRSRGSFP(配列番号37);
(c)RQARVVNGXXXXXVPLSLYSG(配列番号38);及び
(d)RQARVVNGVPLSLYSG(配列番号39)
(e)PLGLWSQ(配列番号40)
[配列中、Xは、任意のアミノ酸である]からなる群から選択される。
一実施態様では、プロテアーゼ切断型リンカーは、プロテアーゼ認識配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識配列は、
(a)RQARVVNG(配列番号36);
(b)VHMPLGFLGPGRSRGSFP(配列番号37);
(c)RQARVVNGXXXXXVPLSLYSG(配列番号38);
(d)RQARVVNGVPLSLYSG(配列番号39);
(e)PLGLWSQ(配列番号40);
(f)VHMPLGFLGPRQARVVNG(配列番号97);
(g)FVGGTG(配列番号98);
(h)KKAAPVNG(配列番号99);
(i)PMAKKVNG(配列番号100);
(j)QARAKVNG(配列番号101);
(k)VHMPLGFLGP(配列番号102);
(l)QARAK(配列番号103);
(m)VHMPLGFLGPPMAKK(配列番号104);
(n)KKAAP(配列番号105);及び
(o)PMAKK(配列番号106)
[配列中、Xは、任意のアミノ酸である]からなる群から選択される。
一実施態様では、プロテアーゼ切断型リンカーを切断することが可能なプロテアーゼは、メタロプロテイナーゼ、例えば、マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)1−28、並びにディスインテグリン及びメタロプロテイナーゼ(ADAM)2、7−12、15、17−23、28−30、及び33、セリンプロテアーゼ、例えば、ウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子及びマトリプターゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、並びにカテプシンプロテアーゼからなる群から選択される。具体的な一実施態様では、プロテアーゼは、MMP9又はMMP2である。さらなる具体的な実施態様では、プロテアーゼは、マトリプターゼである。一実施態様では、プロテアーゼ切断型リンカーは、プロテアーゼ認識配列RQARVVNG(配列番号36)を含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第1の抗原結合部分は、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第1の抗原結合部分は、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46の重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第1の抗原結合部分は、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第1の抗原結合部分は、配列番号43のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号14、配列番号15、及び配列番号16からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号151、配列番号152、及び配列番号153からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号154、配列番号155、及び配列番号156からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号14、配列番号15、及び配列番号16からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号151、配列番号152、及び配列番号153からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号154、配列番号155、及び配列番号156の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、配列番号47のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、配列番号157のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号158のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、配列番号47のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号158のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、メソテリンへの特異的結合が可能であり、配列番号107、配列番号108、及び配列番号109からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号110、配列番号111、及び配列番号112からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、メソテリンへの特異的結合が可能であり、配列番号107、配列番号108、及び配列番号109からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号110、配列番号111、及び配列番号112の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、配列番号113のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号114のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、配列番号113のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号114のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、出典明示によりその全体において本明細書に援用される、国際公開第2006/082515号において開示されている抗体のうちのいずれか1つの、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)を含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、配列番号32のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖と、配列番号33のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖とを含む。本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子についての一実施態様では、第2の抗原結合部分は、配列番号32のアミノ酸配列を含む重鎖と、配列番号33のアミノ酸配列を含む軽鎖とを含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER2への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分は、配列番号160のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号161のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、第3の抗原結合部分は、配列番号159のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号161のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号2のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と
を含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号4のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と
を含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号32のアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖と;
(b)配列番号34のアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの軽鎖と
を含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号72のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と
を含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号85のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と
を含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号73のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号74のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号77のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号82のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号78のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号81のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号76のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号77のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号78のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号79のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号132のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号136のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号81のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号133のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む。
特定の一実施態様では、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(a)配列番号137のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号139のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号81のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号138のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む。
一態様では、本発明は、分子の抗CD3抗原結合部位を可逆的に隠蔽するための、イデオタイプ特異的ポリペプチドに関する。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、抗イデオタイプscFvである。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、リンカーを介して分子と共有結合している。一実施態様では、リンカーは、ペプチドリンカーである。一実施態様では、リンカーは、プロテアーゼ切断型リンカーである。一実施態様では、ペプチドリンカーは、少なくとも1つのプロテアーゼ認識部位を含む。一実施態様では、プロテアーゼは、メタロプロテイナーゼ、例えば、マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)1−28、並びにディスインテグリン及びメタロプロテイナーゼ(ADAM)2、7−12、15、17−23、28−30、及び33、セリンプロテアーゼ、例えば、ウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子及びマトリプターゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、並びにカテプシンプロテアーゼからなる群から選択される。具体的な一実施態様では、プロテアーゼは、MMP9又はMMP2である。さらなる具体的な実施態様では、プロテアーゼは、マトリプターゼである。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、1つを超えるリンカーを介して分子と共有結合している。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、2つのリンカーを介して分子と共有結合している。
一実施態様では、抗CD3抗原結合部位を含む分子は、T細胞活性化二重特異性分子である。特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、
(a)DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;及び
(c)PYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む。
特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、
(a)RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(b)YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(c)QHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む。
特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、
(a)DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;
(c)PYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列;
を含む重鎖可変領域と;
(d)RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む。
特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、
(a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;及び
(c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む。
特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、
(a)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(b)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(c)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む。
特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、
(a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;
(c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
(d)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む。
本発明の別の態様に従い、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドが提供される。本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドも包摂する。本発明はまた、本発明の単離ポリヌクレオチドを含む発現ベクター、及び本発明の単離ポリヌクレオチド又は発現ベクターを含む宿主細胞も提供する。一部の実施態様では、宿主細胞は、真核細胞、特に、哺乳類細胞である。
別の態様では、本発明のプロテアーゼ活性化T細胞分子を生成する方法であって、a)本発明の宿主細胞を、プロテアーゼ活性化T細胞分子の発現に適する条件下で培養する工程と、b)プロテアーゼ活性化T細胞分子を回収する工程とを含む方法が提供される。本発明はまた、本発明の方法により生成されるプロテアーゼ活性化T細胞分子も包摂する。
別の態様では、本発明のイデオタイプ特異的ポリペプチドを生成する方法であって、a)本発明の宿主細胞を、プロテアーゼ活性化T細胞分子の発現に適する条件下で培養する工程と、b)イデオタイプ特異的ポリペプチドを回収する工程とを含む方法が提供される。本発明はまた、本発明の方法により生成されるイデオタイプ特異的ポリペプチドも包摂する。
本発明はまた、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子と、薬学的に許容される担体とを含む薬学的組成物も提供する。
本発明にはまた、本発明のプロテアーゼ活性化T細胞分子と、薬学的組成物とを使用する方法も包摂される。一態様では、本発明は、医薬としての使用のための、プロテアーゼ活性化T細胞分子、又は本発明の薬学的組成物を提供する。一態様では、それを必要とする個体における疾患の治療における使用のための、本発明に従うプロテアーゼ活性化T細胞分子、又は薬学的組成物が提供される。具体的な実施態様では、疾患は、がんである。
また、それを必要とする個体における疾患の治療のための医薬を製造するための、本発明のプロテアーゼ活性化T細胞分子の使用のほか、個体における疾患を治療する方法であって、前記個体へと、薬学的に許容される形態の、本発明に従うプロテアーゼ活性化T細胞分子を含む、治療的有効量の組成物を投与することを含む方法も提供される。具体的な実施態様では、疾患は、がんである。上記の実施態様のうちのいずれかでは、個体は、好ましくは、哺乳類、特に、ヒトである。
本発明はまた、標的細胞、特に、腫瘍細胞の溶解を誘導するための方法であって、T細胞、特に、細胞傷害性T細胞の存在下で、標的細胞を、本発明のプロテアーゼ活性化T細胞分子と接触させることを含む方法も提供する。
別の態様では、本発明はまた、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子と、薬学的に許容される担体とを含む組成物も提供する。
別の態様では、本発明はまた、本明細書で記載されるイデオタイプ特異的ポリペプチドと、薬学的に許容される担体とを含む組成物も提供する。
別の態様では、本発明はまた、本明細書で記載される、医薬としての使用のための、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又はイデオタイプ特異的ポリペプチド、又は本明細書で記載される組成物も提供する。一実施態様では、医薬は、がんを治療するか、若しくはその進行を遅延させ、免疫関連疾患を治療するか、若しくはその進行を遅延させ、かつ/又は個体における免疫応答若しくは免疫機能を増強若しくは刺激するためのものである。
別の態様では、本発明はまた、本明細書で記載される、それを必要とする個体における疾患の治療における使用のための、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又はイデオタイプ特異的ポリペプチドも提供する。一実施態様では、疾患は、増殖性疾患、特に、がんである。
別の態様では、本発明はまた、個体における疾患を治療する方法であって、前記個体へと、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又は組成物を含む、治療的有効量の組成物を投与することを含む方法も提供する。
別の態様では、本発明はまた、標的細胞の溶解を誘導するための方法であって、T細胞の存在下で、標的細胞を、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又は組成物と接触させることを含む方法も提供する。一実施態様では、標的細胞の溶解を誘導するための方法は、インビトロ法である。一実施態様では、標的細胞は、がん細胞である。一実施態様では、標的細胞は、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を活性化させることが可能なプロテアーゼを発現させる。
別の態様では、本発明はまた、抗CD3抗原結合分子のイデオタイプに特異的な、抗イデオタイプCD3抗体又はその抗原結合断片であって、抗CD3抗原結合分子に特異的に結合すると、抗CD3抗原結合分子の、CD3への結合をブロックする、抗イデオタイプCD3抗体又はその断片も提供する。
一実施態様では、抗イデオタイプCD3抗体又はその抗原結合断片は、プロテアーゼ認識部位を含むペプチドリンカーを介して、抗CD3抗原結合分子と可逆的に会合する。一実施態様では、CD3は、マウスCD3、サルCD3、又はヒトCD3である。
別の態様では、本発明は、T細胞活性化二重特異性分子の、インビボにおける毒性を軽減する方法であって、本明細書で記載されるイデオタイプ特異的ポリペプチドを、プロテアーゼ切断型リンカーにより、T細胞活性化二重特異性分子と結合させて、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を形成することを含み、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の、インビボにおける毒性が、T細胞活性化二重特異性分子の毒性と比較して軽減されている方法を提供する。
マスキング部分を伴う、異なるCD3結合剤についての概略を描示する図である。7859:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−MK062マトリプターゼ部位−CD3−Fcを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるCD3結合剤についての概略を描示する図である。7860:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062マトリプターゼ部位−CD3−Fcを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるCD3結合剤についての概略を描示する図である。7857:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−非切断型リンカー−CD3−Fcを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるCD3結合剤についての概略を描示する図である。7858:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−非切断型リンカー−CD3−Fcを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるCD3結合剤についての概略を描示する図である。7861:一価のCD3Fcを示す図である。 抗イデオタイプマスキング部分の、CD3結合剤(CH2527)に対する親和性をまとめる表である。 図1A及び1Bで描示した分子についての、キャピラリー電気泳動−SDS解析を示す図である。非還元条件下(図3A)及び還元条件下(図3B)における、図1Aで描示した分子についての、キャピラリー電気泳動−SDS解析を示す図である。非処理分子(I)と、処理分子(III)との比較は、37℃で48時間にわたる、rhマトリプターゼ/ST14による処理の後における、抗ID scFvの完全な切断を示す。1例の試料(II)は、非処理であったが、37℃で48時間にわたりインキュベートされた。 図1A及び1Bで描示した分子についての、キャピラリー電気泳動−SDS解析を示す図である。非還元条件下(図3C)及び還元条件下(図3D)における、図1Bで描示した分子についての、キャピラリー電気泳動−SDS解析を示す図である。非処理分子(I)と、処理分子(III)との比較は、37℃で48時間にわたる、rhマトリプターゼ/ST14による処理の後における、抗ID scFvの完全な切断を示す。1例の試料(II)は、非処理であったが、37℃で48時間にわたりインキュベートされた。 抗イデオタイプによる、CD3への結合のマスキングの効果を示す図である。抗イデオタイプCD3 scFv 4.15.64のマスキング効果を示す、Jurkat NFATレポーターアッセイの結果を描示する図(図4A)である。抗ヒトFc抗体(アッセイプレート上にコーティングした)を介して、一価のCD3 IgGを架橋してから、Jurkat NFAT(NFATプロモーターを伴う、急性リンパ性白血病のレポーター細胞株であって、ヒトCD3εを発現させるレポーター細胞株)を添加した。Jurkat−NFATレポーター細胞株(Promega)は、NFATプロモーターを伴う、ヒト急性リンパ性白血病のレポーター細胞株であって、ヒトCD3εを発現させるレポーター細胞株である。CD3結合剤が、CD3εに結合し、ルシフェラーゼを発現させる場合、これを、One−Glo基質(Promega)の添加の後の発光により測定することができる。 抗イデオタイプによる、CD3への結合のマスキングの効果を示す図である。抗イデオタイプCD3 scFv 4.32.63のマスキング効果を示す、Jurkat NFATレポーターアッセイの結果を描示する図(図4B)である。抗ヒトFc抗体(アッセイプレート上にコーティングした)を介して、一価のCD3 IgGを架橋してから、Jurkat NFAT(NFATプロモーターを伴う、急性リンパ性白血病のレポーター細胞株であって、ヒトCD3εを発現させるレポーター細胞株)を添加した。Jurkat−NFATレポーター細胞株(Promega)は、NFATプロモーターを伴う、ヒト急性リンパ性白血病のレポーター細胞株であって、ヒトCD3εを発現させるレポーター細胞株である。CD3結合剤が、CD3εに結合し、ルシフェラーゼを発現させる場合、これを、One−Glo基質(Promega)の添加の後の発光により測定することができる。 抗イデオタイプによる、CD3への結合のマスキングの効果を示す図である。マスキング一価CD3結合剤及び非マスキング一価CD3結合剤の、CD3εへの結合についてのEC50値の比較を示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。7344:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−MK062マトリプターゼ部位−CD3−16D5−Fcを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。7676:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−非切断型リンカー−CD3−16D5−Fcを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。7496:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062マトリプターゼ部位−CD3−16D5−Fcを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。7611:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−非切断型リンカー−CD3−16D5−Fcを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。6298:GA916−D−16D5−02 sf W(1):共通軽鎖を伴う、FolR1 16D5古典的2+1 TCBを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。6100:GA916−D−16D5−02 sf W(3a):共通軽鎖を伴う、FolR1 16D5逆2+1 TCBを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。6182:DP47GS TCB sf CHO W(9a):DP47逆2+1 TCBを示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。7494:抗ID CH2527 Fab 4.15.64−MK062マトリプターゼ部位−CD3−16D5−Fcを示す図である。 サイズ排除クロマトグラフィーにより、トランスフェクションのために使用される第1のプラスミド比(1(ホール):1(ノブ):3(CLC))を示す図である。 サイズ排除クロマトグラフィーにより、トランスフェクションのために使用される第2のプラスミド比(1(ホール):2(ノブ):3(CLC))を示す図である。 図5Aで描示されるTCB分子(ID:7344)(最終精製調製物)についてのCE−SDS解析:レーンA=非還元、レーンB=還元、レーンC=タンパク質標準物質を示す図である。 図5Bで描示されるTCB分子(ID:7676)(最終精製調製物)についてのCE−SDS解析:レーンA=非還元、レーンB=還元、レーンC=タンパク質標準物質を示す図である。 図5Cで描示されるTCB分子(ID:7496)(最終精製調製物)についてのCE−SDS解析:レーンA=非還元、レーンB=還元、レーンC=タンパク質標準物質を示す図である。 図5Dで描示されるTCB分子(ID:7611)(最終精製調製物)についてのCE−SDS解析:レーンA=非還元、レーンB=還元、レーンC=タンパク質標準物質を示す図である。 図5A及び5Cで描示される分子についてのキャピラリー電気泳動−SDS解析を示す図である。非還元条件下における、図5Aで描示した分子(ID:7344)である、抗ID CH2527 scFv 4.15.64−MK062−CD3−16D6−Fcについての、キャピラリー電気泳動を示す図(図12A)である。非処理分子(I)と、処理分子(III)との比較は、37℃で48時間にわたる、rhマトリプターゼ/ST14による処理の後における、抗ID scFvの完全な切断を示す。1例の試料(II)は、非処理であったが、37℃で48時間にわたりインキュベートされた。あらかじめ染色されたタンパク質マーカー(IV)であるMark12(Invitrogen)を、適正な分子量を推定するために使用した。 図5A及び5Cで描示される分子についてのキャピラリー電気泳動−SDS解析を示す図である。還元条件下における、図5Aで描示した分子(ID:7344)である、抗ID CH2527 scFv 4.15.64−MK062−CD3−16D6−Fcについての、キャピラリー電気泳動を示す図(図12B)である。非処理分子(I)と、処理分子(III)との比較は、37℃で48時間にわたる、rhマトリプターゼ/ST14による処理の後における、抗ID scFvの完全な切断を示す。1例の試料(II)は、非処理であったが、37℃で48時間にわたりインキュベートされた。あらかじめ染色されたタンパク質マーカー(IV)であるMark12(Invitrogen)を、適正な分子量を推定するために使用した。 図5A及び5Cで描示される分子についてのキャピラリー電気泳動−SDS解析を示す図である。非還元条件下における、図5Cで描示した分子(ID:7496)である、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062−CD3−16D6−Fcについての、キャピラリー電気泳動を示す図(図12C)である。非処理分子(I)と、処理分子(III)との比較は、37℃で48時間にわたる、rhマトリプターゼ/ST14による処理の後における、抗ID scFvの完全な切断を示す。1例の試料(II)は、非処理であったが、インキュベートされた。あらかじめ染色されたタンパク質マーカー(IV)であるMark12(Invitrogen)を、適正な分子量を推定するために使用した。 図5A及び5Cで描示される分子についてのキャピラリー電気泳動−SDS解析を示す図である。還元条件下における、図5Cで描示した分子(ID:7496)である、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062−CD3−16D6−Fcについての、キャピラリー電気泳動を示す図(図12D)である。非処理分子(I)と、処理分子(III)との比較は、37℃で48時間にわたる、rhマトリプターゼ/ST14による処理の後における、抗ID scFvの完全な切断を示す。1例の試料(II)は、非処理であったが、インキュベートされた。あらかじめ染色されたタンパク質マーカー(IV)であるMark12(Invitrogen)を、適正な分子量を推定するために使用した。 Qifikit(Dako)によりなされる、FolR1の発現レベルの定量化を示す図である。FolR1に対する抗体:LS−C125620−100(LifeSpan BioSciences Inc);20μg/mlで使用される;マウスIgG1アイソタイプ:型番554121(BD)。 プロテアーゼ活性化型CBによるT細胞の活性化を示す図である。48時間にわたるインキュベーションの後において、濃度を10nMとするプロテアーゼ活性化TCB分子(異なる抗イデオタイプCD3マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、精製rhマトリプターゼ/ST14で前処理された分子である)及びヒトPBMC(E:T=7:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)により誘導される、Skov3細胞の殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。 プロテアーゼ活性化TCBによるT細胞の活性化を示す図である。ヒトPBMCによるT細胞の活性化であって、インキュベーション(E:T=7:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)の48時間後のSkov3細胞上における、10nMのプロテアーゼ活性化TCB(異なる抗イデオタイプCD3マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)の結合により誘導される活性化を示す図である。T細胞の活性化マーカーである、CD25(左パネル)及びCD69(右パネル)。表示の通りの、CD4+ T細胞及びCD8+ T細胞。 プロテアーゼ活性化TCBによるT細胞の活性化を示す図である。48時間にわたるインキュベーションの後において、濃度を100nMとするプロテアーゼ活性化TCB分子(異なる抗イデオタイプCD3マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(E:T=7:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)により誘導される、Mkn−45細胞の殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。 プロテアーゼ活性化TCBによるT細胞の活性化を示す図である。ヒトPBMCによるT細胞の活性化であって、インキュベーション(E:T=7:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)の48時間後のMkn−45細胞上における、100nMのプロテアーゼ活性化TCB(異なる抗イデオタイプCD3マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)の結合により誘導される活性化を示す図である。T細胞の活性化マーカーである、CD25(左パネル)及びCD69(右パネル)。表示の通りの、CD4+ T細胞及びCD8+ T細胞。 48時間にわたるインキュベーションの後において、濃度を10nMとするプロテアーゼ活性化型TCB分子(異なる抗イデオタイプCD3マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)により誘導される、HT29細胞の殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。バーは、左から右へと、7344:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−MK062−CD3−16D6−Fc;7344:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−MK062−CD3−16D6−Fc_処理あり;7676:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−非切断型−CD3−16D6−Fc;7496:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062−CD3−16D6−Fc;7496:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062−CD3−16D6−Fc_処理あり;7611:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−非切断型リンカー−CD3−16D6−Fc;6298:GA916−D−16D5−02 sf W(1);6182:DP47GS TCB sf CHO W(9a)である。 48時間にわたるインキュベーションの後において、濃度を10nMとするプロテアーゼ活性化TCB分子(異なる抗イデオタイプCD3マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(図14Aで使用したPBMCとは異なるドナーに由来する)(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)により誘導される、Skov3細胞の殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。バーは、左から右へと、7344:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−MK062−CD3−16D6−Fc;7344:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−MK062−CD3−16D6−Fc_処理あり;7676:抗ID CH2527 scFv 4.15.64−非切断型−CD3−16D6−Fc;7496:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062−CD3−16D6−Fc;7496:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062−CD3−16D6−Fc_処理あり;7611:抗ID CH2527 scFv 4.32.63−非切断型リンカー−CD3−16D6−Fc;6298:GA916−D−16D5−02 sf W(1);6182:DP47GS TCB sf CHO W(9a)である。 プロテアーゼ活性化TCBによるT細胞の活性化を示す図である。48時間にわたるインキュベーションの後において、プロテアーゼ活性化TCB分子(抗イデオタイプCD3 4.15.64マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(バフィーコートから単離された)(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)により誘導される、HeLa細胞の、用量依存的殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。 プロテアーゼ活性化TCBによるT細胞の活性化を示す図である。ヒトPBMCによるT細胞の活性化であって、インキュベーション(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)の48時間後のHeLa細胞上における、プロテアーゼ活性化TCB(抗イデオタイプCD3 4.15.64マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)の結合により誘導される、用量依存的活性化を示す図である。T細胞の活性化マーカーである、CD25(左パネル)及びCD69(右パネル)。表示の通りの、CD4+ T細胞及びCD8+ T細胞。 プロテアーゼ活性化型TCBによるT細胞の活性化を示す図である。48時間にわたるインキュベーションの後において、プロテアーゼ活性化型TCB分子(抗イデオタイプCD3 4.32.63マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(バフィーコートから単離された)(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)により誘導される、HeLa細胞の、用量依存的殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。 プロテアーゼ活性化型TCBによるT細胞の活性化を示す図である。ヒトPBMCによるT細胞の活性化であって、インキュベーション(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)の48時間後のHeLa細胞上における、プロテアーゼ活性化型TCB(抗イデオタイプCD3 4.32.63マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)の結合により誘導される、用量依存的活性化を示す図である。T細胞の活性化マーカーである、CD25(左パネル)及びCD69(右パネル)。表示の通りの、CD4+ T細胞及びCD8+ T細胞。 プロテアーゼ活性化型TCBによるT細胞の活性化を示す図である。48時間にわたるインキュベーションの後において、プロテアーゼ活性化型TCB分子(抗イデオタイプCD3 4.15.64マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(バフィーコートから単離された)(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)により誘導される、Skov3細胞の、用量依存的殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。 プロテアーゼ活性化型TCBによるT細胞の活性化を示す図である。ヒトPBMCによるT細胞の活性化であって、インキュベーション(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)の48時間後のSkov3細胞上における、プロテアーゼ活性化型TCB(抗イデオタイプCD3 4.15.64マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)の結合により誘導される、用量依存的活性化を示す図である。T細胞の活性化マーカーである、CD25(左パネル)及びCD69(右パネル)。表示の通りの、CD4+ T細胞及びCD8+ T細胞。 プロテアーゼ活性化型TCBによるT細胞の活性化を示す図である。48時間にわたるインキュベーションの後において、プロテアーゼ活性化型TCB分子(抗イデオタイプCD3 4.32.63マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(バフィーコートから単離された)(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)により誘導される、Skov3細胞の、用量依存的殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。 プロテアーゼ活性化型TCBによるT細胞の活性化を示す図である。ヒトPBMCによるT細胞の活性化であって、インキュベーション(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)の48時間後のSkov3細胞上における、プロテアーゼ活性化型TCB(抗イデオタイプCD3 4.32.63マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)の結合により誘導される、用量依存的活性化を示す図である。T細胞の活性化マーカーである、CD25(左パネル)及びCD69(右パネル)。表示の通りの、CD4+ T細胞及びCD8+ T細胞。 プロテアーゼ活性化TCBによるT細胞の活性化を示す図である。インキュベーション(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)の48時間後のHT29細胞上における、プロテアーゼ活性化TCB(抗イデオタイプCD3 4.15.64マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)の結合により誘導した、ヒトPBMC(上記で記載した実験におけるドナーとは異なるドナー)による、T細胞の用量依存的活性化を示す。T細胞の活性化マーカーである、CD25(左パネル)及びCD69(右パネル)。表示の通りの、CD4+ T細胞及びCD8+ T細胞。 プロテアーゼ活性化TCBによるT細胞の活性化を示す図である。インキュベーション(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)の48時間後のHT29細胞上における、プロテアーゼ活性化TCB(抗イデオタイプCD3 4.32.63マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)の結合により誘導した、ヒトPBMC(図16におけるドナーとは異なるドナー)による、T細胞の用量依存的活性化を示す。T細胞の活性化マーカーである、CD25(左パネル)及びCD69(右パネル)。表示の通りの、CD4+ T細胞及びCD8+ T細胞。 ヒトPBMC(上記で記載した実験におけるドナーとは異なるドナー)による、T細胞の用量依存的活性化を、インキュベーション(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)の48時間後のHRCEpiC細胞上における、プロテアーゼ活性化TCB(抗イデオタイプCD3 4.15.64マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)の結合により誘導したことを示す図である。T細胞の活性化マーカーである、CD25(左パネル)及びCD69(右パネル)。表示の通りの、CD4+ T細胞及びCD8+ T細胞。 48時間にわたるインキュベーションの後において、濃度を50nMとするプロテアーゼ活性化TCB分子(異なる抗イデオタイプCD3マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)により誘導される、Ovcar3細胞の殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、10分間にわたり37℃で行った(完全には切断されていない)。 48時間にわたるインキュベーションの後において、10nMのプロテアーゼ活性化TCB分子(抗イデオタイプCD3 4.15.64マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(バフィーコートから単離された)(E:T=10:1;エフェクターは、3例の異なるヒトPBMCドナーである)により誘導される、Skov3細胞の殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。 48時間にわたるインキュベーションの後において、10nMのプロテアーゼ活性化型TCB分子(抗イデオタイプCD3 4.32.63マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(バフィーコートから単離された)(E:T=10:1;エフェクターは、3例の異なるヒトPBMCドナーである)により誘導される、Skov3細胞の殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。 48時間にわたるインキュベーションの後において、100pMのプロテアーゼ活性化型TCB分子(抗イデオタイプCD3 4.32.63マスク、切断型リンカー及び非切断型リンカーを伴うTCBであり、処理分子である)及びヒトPBMC(バフィーコートから単離された)(E:T=10:1;エフェクターは、3例の異なるヒトPBMCドナーである)により誘導される、HeLa細胞の殺滅を示す図である。rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による前処理は、37℃で、24時間にわたり行った。 抗ID GA201 scFv−マトリックスメタロプロテアーゼ部位−GA201 Fc(GA201−抗GA201−scFv)についての概略を描示する図である。 抗HER1抗体である、GA201についての概略を描示する図である。 非還元条件下(図30A)及び還元条件下(図30B)における、図28で描示した分子についての、キャピラリー電気泳動−SDS解析を示す図である。図28で描示した分子は、プロテインAクロマトグラフィー及びサイズ排除クロマトグラフィーにより、均質となるまで精製し、キャピラリー電気泳動−SDS解析にかけた。 GA201−抗GA201−scFv及びGA201の、H322M細胞上で発現するHER1への結合についてのFACS解析であって、抗イデオタイプGA201 scFvのマスキング効果を確認するFACS解析を示す図である。GA201−抗GA201−scFvを、マトリックスメタロプロテアーゼMMP−2と共に、一晩にわたりインキュベートし、H322M細胞への結合を、切断されていないGA201−抗GA201−scFv、GA201及びアイソタイプIgG1コントロール抗体と比較した。H322M細胞上のHER1への結合は、F(ab’)2−ヤギ抗ヒトIgG Fc二次抗体FITCコンジュゲートにより検出し、BD FACS Canto IIを使用するFACSにより解析した。解析のために、中央値蛍光強度(MFI)を使用した。 MMP2切断の前及び後における、マスキングGA201及び非マスキングGA201の、HER1への結合についての表面プラズモン共鳴解析を示す図である。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8364:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MMP9−MK062マトリプターゼ部位を、CD3へと融合させた、古典的フォーマットの16D5 TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8363:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−カテプシンS/B部位を、CD3へと融合させた、古典的フォーマットの16D5 TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8365:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062マトリプターゼ部位を、共通軽鎖へと融合させた、逆フォーマットの16D5 TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8366:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−非切断型リンカーを、共通軽鎖へと融合させた、逆フォーマットの16D5 TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8672:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MMP9−MK062マトリプターゼ部位を、CD3×Fabへと融合させた、古典的フォーマットの抗メソテリンRG7787荷電残基TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8673:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−非切断型リンカーを、CD3×Fabへと融合させた、古典的フォーマットの抗メソテリンRG7787荷電残基TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8674:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MMP9−MK062マトリプターゼ部位を、CD3×Fabへと融合させた、逆フォーマットの抗メソテリンRG7787荷電残基TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8675:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−非切断型リンカーを、CD3×Fabへと融合させた、逆フォーマットの抗メソテリンRG7787荷電残基TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8505:逆フォーマットの、CD3×Fab抗メソテリンRG7787荷電残基TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8676:古典的フォーマットの、CD3×Fab抗メソテリンRG7787荷電残基TCB。 TCB 8365及びTCB 8366(最終精製調製物)についてのCE−SDS解析:レーンA=タンパク質標準物質、レーンB=4℃で保存されたタンパク質、レーンC=rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)により前処理されたタンパク質、レーンD=37℃で、72時間にわたりインキュベートされたタンパク質、及びレーンE=分子3を描示する図である。 図33A(ID:8364)で描示したTCBについてのCE−SDS解析を描示する図である。TCB 8364(最終精製調製物)についてのCE−SDS解析:レーンA=タンパク質標準物質、レーンB=4℃で保存されたタンパク質、レーンC=rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)により前処理されたタンパク質、レーンD=37℃で、72時間にわたりインキュベートされたタンパク質、及びレーンE=非切断型リンカーコンストラクト。 図33B(ID:8363)で描示したTCBについてのCE−SDS解析を描示する図である。TCB 8363(最終精製調製物)についてのCE−SDS解析:レーンA=タンパク質標準物質、レーンB=4℃で保存されたタンパク質、レーンC=rhカテプシンB(R&D Systems)により前処理されたタンパク質、レーンD=rhカテプシンS(R&D Systems)により前処理されたタンパク質、レーンE=37℃で、72時間にわたりインキュベートされたタンパク質、及びレーンF=非切断型リンカーコンストラクト。 HeLa細胞及びSkov−3細胞を標的細胞として使用する、Jurkat NFAT活性化アッセイを描示する図である。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。Jurkat−NFATレポーター細胞株(Promega)は、NFATプロモーターを伴う、ヒト急性リンパ性白血病のレポーター細胞株であって、ヒトCD3εを発現させるレポーター細胞株である。TCBのCD3結合剤が、腫瘍標的に結合し、CD3(架橋が必要である)が、CD3εに結合する場合、ルシフェラーゼの発現を、One−Glo基質(Promega)の添加の後の発光により測定することができる。 FolR1 TCB(黒の下向き三角)と、N末端において抗ID CD3 4.32.63 scFv及びMMP9−マトリプターゼMK062部位を融合させた、前処理プロテアーゼ活性化TCB(8364;グレーの塗りつぶし四角)とを比較した。分子を、rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)により、37℃で、約20時間にわたり処理した。マスキングTCB(GS非切断型リンカーを含有する;グレーの上向き三角)、及び非標的化TCBコントロール(白抜きの下向き三角)も同様に示す。点線は、TCBを伴わない標的細胞及びエフェクター細胞による発光を示す。 HeLa細胞を標的細胞として使用する、Jurkat NFAT活性化アッセイを示す図である。 HeLa細胞及びSkov−3細胞を標的細胞として使用する、Jurkat NFAT活性化アッセイを描示する図である。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。Jurkat−NFATレポーター細胞株(Promega)は、NFATプロモーターを伴う、ヒト急性リンパ性白血病のレポーター細胞株であって、ヒトCD3εを発現させるレポーター細胞株である。TCBのCD3結合剤が、腫瘍標的に結合し、CD3(架橋が必要である)が、CD3εに結合する場合、ルシフェラーゼの発現を、One−Glo基質(Promega)の添加の後の発光により測定することができる。 FolR1 TCB(黒の下向き三角)と、N末端において抗ID CD3 4.32.63 scFv及びMMP9−マトリプターゼMK062部位を融合させた、前処理プロテアーゼ活性化TCB(8364;グレーの塗りつぶし四角)とを比較した。分子を、rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)により、37℃で、約20時間にわたり処理した。マスキングTCB(GS非切断型リンカーを含有する;グレーの上向き三角)、及び非標的化TCBコントロール(白抜きの下向き三角)も同様に示す。点線は、TCBを伴わない標的細胞及びエフェクター細胞による発光を示す。 Skov−3細胞を標的細胞として使用する、Jurkat NFAT活性化アッセイを示す図である。 FolR1 TCB及びヒトPBMC(エフェクター:標的=10:1)に媒介される、腫瘍細胞への細胞傷害性を描示する図である。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。HeLa標的細胞への細胞傷害性。MK062マトリプターゼリンカーにより連結された、抗イデオタイプCD3 scFvをどちらも含有する、2つの異なるフォーマットのプロテアーゼ活性化TCBの比較。 FolR1 TCB及びヒトPBMC(エフェクター:標的=10:1)に媒介される、腫瘍細胞への細胞傷害性を描示する図である。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。Skov−3標的細胞への細胞傷害性。MK062マトリプターゼリンカーにより連結された、抗イデオタイプCD3 scFvをどちらも含有する、2つの異なるフォーマットのプロテアーゼ活性化TCBの比較。 FolR1 TCB及びヒトPBMC(エフェクター:標的=10:1)に媒介される、腫瘍細胞への細胞傷害性を描示する図である。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。HeLa標的細胞への細胞傷害性。抗イデオタイプCD3 scFvと、プロテアーゼ部位が異なるGSリンカーとを含有する、古典的プロテアーゼ活性化TCBの比較。MMP9−マトリプターゼMK062リンカーを含有するプロテアーゼ活性化TCB(8364;グレーの四角)、FolR1 TCB(ライトグレーの下向き三角)、マトリプターゼMK062部位のみ(ライトグレーの菱形)/カテプシン部位(グレーの丸)、又は非切断型リンカー(黒の下向き三角)を含有するプロテアーゼ活性化TCB。 FolR1 TCB及びヒトPBMC(エフェクター:標的=10:1)に媒介される、腫瘍細胞への細胞傷害性を描示する図である。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。Skov−3標的細胞への細胞傷害性。抗イデオタイプCD3 scFvと、プロテアーゼ部位が異なるGSリンカーとを含有する、古典的プロテアーゼ活性化TCBの比較。MMP9−マトリプターゼMK062リンカーを含有するプロテアーゼ活性化TCB(8364;グレーの四角)、FolR1 TCB(ライトグレーの下向き三角)、マトリプターゼMK062部位のみ(ライトグレーの菱形)/カテプシン部位(グレーの丸)、又は非切断型リンカー(黒の下向き三角)を含有するプロテアーゼ活性化TCB。 200nMの異なるTCB、及び3例の異なるヒトPBMCドナーとの、初代ヒト腎皮質上皮細胞のコインキュベーションの後における、CD8陽性細胞のCD69の定量化を描示する図である。T細胞を、48時間にわたるインキュベーションの後に染色した(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)。CD8T細胞について、T細胞の活性化マーカーであるCD69の中央値蛍光強度を示す。各点は、3例の異なるヒトPBMCドナーについての、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーに表示する。統計学的解析には、対応のないt検定を使用した。 200nMの異なるTCB、及び3例の異なるヒトPBMCドナーとの、ヒト気管支上皮細胞のコインキュベーションの後における、CD8陽性細胞のCD69の定量化を描示する図である。T細胞を、48時間にわたるインキュベーションの後に染色した(E:T=10:1;エフェクターは、ヒトPBMCである)。CD8T細胞について、T細胞の活性化マーカーであるCD69の中央値蛍光強度を示す。各点は、3例の異なるヒトPBMCドナーについての、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーに表示する。統計学的解析には、対応のないt検定を使用した。 MSLN TCB及びヒトPBMC(エフェクター:標的=10:1)に媒介される、腫瘍細胞への細胞傷害性を描示する図である。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの20時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。NCI H596標的細胞への細胞傷害性。MMP9−MK062マトリプターゼリンカーにより連結された、抗イデオタイプCD3 scFvを含有する、プロテアーゼ活性化MSLN TCB。プロテアーゼ活性化TCB(8672;ライトグレーの丸)、MSLN TCB(ダークグレーの下向き三角)、及び非切断型リンカーを含有するプロテアーゼ活性化TCB(8673;グレーの上向き三角)を比較する。 MSLN TCB及びヒトPBMC(エフェクター:標的=10:1)に媒介される、腫瘍細胞への細胞傷害性を描示する図である。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの20時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。AsPC−1標的細胞への細胞傷害性。MMP9−MK062マトリプターゼリンカーにより連結された、抗イデオタイプCD3 scFvを含有する、プロテアーゼ活性化MSLN TCB。プロテアーゼ活性化TCB(8672;ライトグレーの丸)、MSLN TCB(ダークグレーの下向き三角)、及び非切断型リンカーを含有するプロテアーゼ活性化TCB(8673;グレーの上向き三角)を比較する。 原発腫瘍試料及びプロテアーゼ活性化FolR1 TCBを伴う、Jurkat−NFAT活性化アッセイを描示する図である。Jurkat NFATレポーター細胞は、FolR1 TCB(6298)及びMMP9−マトリプターゼ切断部位(8364)を含有するプロテアーゼ活性化FolR1 TCBとのコインキュベーションの後で活性化する。プロテアーゼ活性化FolR1 TCB(8363、8408)及びコントロールのTCB(8409、7235)は、ルシフェラーゼの発現を誘導しない。点線は、腫瘍と共にコインキュベートされたJurkat NFAT細胞についての、ベースラインの発光を指し示す。 ヒト血清中のインキュベーション後における、プロテアーゼ活性化TCBについてのキャピラリー電気泳動を示す図である。分子を、加湿インキュベーター(5%のCO2)内、37℃のヒトIgG枯渇血清中、0又は14日間にわたりインキュベートした。全ての分子を、アフィニティークロマトグラフィー(プロテインA)により精製し、次いで、キャピラリー電気泳動により解析した。血清、0日目及び14日目における血清中のFolR1 TCB(6298)についてのCE−SDS解析。 ヒト血清中のインキュベーション後における、プロテアーゼ活性化TCBについてのキャピラリー電気泳動を示す図である。分子を、加湿インキュベーター(5%のCO2)内、37℃のヒトIgG枯渇血清中、0又は14日間にわたりインキュベートした。全ての分子を、アフィニティークロマトグラフィー(プロテインA)により精製し、次いで、キャピラリー電気泳動により解析した。血清、0日目及び14日目における血清中のMMP9−マトリプターゼリンカーを伴うプロテアーゼ活性化FolR1 TCB(8364)についてのCE−SDS解析。 ヒト血清中のインキュベーション後における、プロテアーゼ活性化TCBについてのキャピラリー電気泳動を示す図である。分子を、加湿インキュベーター(5%のCO2)内、37℃のヒトIgG枯渇血清中、0又は14日間にわたりインキュベートした。全ての分子を、アフィニティークロマトグラフィー(プロテインA)により精製し、次いで、キャピラリー電気泳動により解析した。血清、0日目及び14日目における血清中のマトリプターゼリンカーを伴うプロテアーゼ活性化FolR1 TCB(8408)、並びに血清中であらかじめ切断された分子についてのCE−SDS解析。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8955:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062−MMP9リンカーを、VHへと融合させた、古典的フォーマットのハーセプターグTCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8957:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−非切断型リンカーを、VHへと融合させた、古典的フォーマットのハーセプターグTCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8959:古典的フォーマットのハーセプターグTCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8997:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−MK062−MMP9リンカーを、VHへと融合させた、古典的フォーマットのFolR1 36F2 TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8998:N末端において、抗ID CH2527 scFv 4.32.63−非切断型リンカーを、VHへと融合させた、古典的フォーマットのFolR1 36F2 TCB。 マスキング部分を伴う、異なるT細胞二重特異性分子についての概略を描示する図である。8996:古典的フォーマットのFolR1 36F2 TCB。 ヒトPBMC及び100nM又は10nMのTCBに媒介される、ヒト気管支上皮細胞への細胞傷害性を描示する図である。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの20時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。 100nMのFolR1 TCB及びヒトPBMCに媒介される、FolR1陰性標的細胞(Mkn−45)への細胞傷害性を描示する図である。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの20時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。各点は、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーにより表示する。
定義
以下で別途規定がない限り、本明細書において、用語は、当該技術分野で一般に使用される通りに使用する。
本明細書で使用される「抗原結合分子」という用語は、その最も広い意味において、抗原決定基に特異的に結合する分子を指す。抗原結合分子の例は、免疫グロブリン及び誘導体、例えば、これらの断片である。
「二重特異性」という用語は、抗原結合分子が、少なくとも2つの異なる抗原決定基に特異的に結合することが可能であることを意味する。典型的に、二重特異性抗原結合分子は、それらの各々が、異なる抗原決定基に対して特異的である、2つの抗原結合部位を含む。ある特定の実施態様では、二重特異性抗原結合分子は、2つの抗原決定基、特に、2つの異なる細胞上で発現する、2つの抗原決定基に同時に結合することが可能である。
本明細書で使用される「〜価」という用語は、抗原結合分子内の、一定数の抗原結合部位の存在を表す。それ自体、「抗原への一価の結合」という用語は、抗原結合分子内の抗原に特異的な、1つの(かつ1つを超えない)抗原結合部位の存在を表す。
「抗原結合部位」とは、抗原との相互作用をもたらす、部位、すなわち、抗原結合分子の一又は複数のアミノ酸残基を指す。例えば、抗体の抗原結合部位は、相補性決定領域(CDR)に由来するアミノ酸残基を含む。天然の免疫グロブリン分子は、典型的に、2つの抗原結合部位を有し、Fab分子は典型的に、単一の抗原結合部位を有する。
本明細書で使用される「抗原結合部分」という用語は、抗原決定基に特異的に結合するポリペプチド分子を指す。一実施態様では、抗原結合部分は、それを結合させた実体(例えば、第2の抗原結合部分)を、標的部位、例えば、抗原決定基を保有する、特異的種類の腫瘍細胞又は腫瘍間質へと方向付けることが可能である。別の実施態様では、抗原結合部分は、その標的抗原、例えば、T細胞受容体複合抗原を介して、シグナル伝達を活性化させることが可能である。抗原結合部分は、本明細書でさらに規定される通り、抗体及びその断片を含む。特定の抗原結合部分は、抗体の重鎖可変領域及び抗体の軽鎖可変領域を含む、抗体の抗原結合ドメインを含む。ある特定の実施態様では、抗原結合部分は、本明細書でさらに規定され、当該技術分野で公知の抗体定常領域を含みうる。有用な重鎖定常領域は、5つのアイソタイプ:α、δ、ε、γ、又はμのうちのいずれかを含む。有用な軽鎖定常領域は、2つのアイソタイプ:κ及びλのうちのいずれかを含む。
本明細書で使用される「抗原決定基」という用語は、「抗原」及び「エピトープ」と同義であり、ポリペプチド高分子上の部位(例えば、アミノ酸の連続する連なり、又は非連続アミノ酸の異なる領域から構成されるコンフォメーショナルな立体構成)であって、抗原結合部分が結合し、抗原結合部分−抗原複合体を形成する部位を指す。有用な抗原決定基は、例えば、腫瘍細胞の表面上、ウイルス感染細胞の表面上、他の罹患細胞の表面上、免疫細胞の表面上に、血清中及び/又は細胞外マトリックス(ECM)中に遊離して見出すことができる。本明細書で抗原と称するタンパク質(例えば、FolR1、HER1、HER2、CD3、メソテリン)は、別途指示がない限り、霊長類(例えば、ヒト)及びげっ歯類(例えば、マウス及びラット)などの哺乳類を含む、任意の脊椎動物供給源に由来する、タンパク質の任意の天然形態でありうる。特定の実施態様では、抗原は、ヒトタンパク質である。本明細書で特異的タンパク質に言及する場合、用語は、プロセシングされていない「完全長」タンパク質のほか、細胞内のプロセシングから生じる、タンパク質の任意の形態を包摂する。用語はまた、タンパク質の、天然に存在する変異体、例えば、スプライスバリアント又は対立遺伝子変異体も包摂する。抗原として有用な例示的ヒトタンパク質は、FolR1、HER1、及びCD3、特に、CD3のエプシロンサブユニット(ヒト配列についての、UniProt番号:P07766(version 130)、NCBI RefSeq番号:NP_000724.1、配列番号54;又はカニクイザル[Macaca fascicularis]配列についての、UniProt番号:Q95LI5(version 49)、NCBI GenBank番号:BAB71849.1を参照されたい)を含むがこれらに限定されない。ある特定の実施態様では、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、異なる種に由来するCD3間又は標的抗原間で保存されている、CD3又は標的細胞抗原のエピトープに結合する。ある特定の実施態様では、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、CD3及びFolR1には結合するが、FolR2又はFolR3には結合しない。ある特定の実施態様では、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、CD3及びHER1に結合する。ある特定の実施態様では、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、CD3及びメソテリンに結合する。ある特定の実施態様では、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、CD3及びHER2に結合する。「特異的結合」とは、結合が、抗原について選択的であり、望ましくない相互作用又は非特異的相互作用から弁別されうることを意味する。抗原結合部分が、特異的抗原決定基に結合する能力は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、又は当業者が精通している他の技法、例えば、表面プラズモン共鳴(SPR)法(BIAcore計器上で解析される)(Liljebladら, Glyco J 17, 323-329 (2000))、及び従来の結合アッセイ(Heeley, Endocr Res 28, 217-229 (2002))を介して測定することができる。一実施態様では、抗原結合部分が、非類縁タンパク質に結合する程度は、例えば、SPRにより測定される通り、抗原結合部分の、抗原への結合の約10%未満である。ある特定の実施態様では、抗原に結合する抗原結合部分、又は抗原結合部分を含む抗原結合分子は、≦1μM、≦100nM、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM、又は≦0.001nM(例えば、10−8M又はこれ未満、例えば、10−8Mから10−13M、例えば、10−9Mから10−13M)の解離定数(K)を有する。
「親和性」とは、分子(例えば、受容体)の単一の結合部位と、その結合パートナー(例えば、リガンド)との非共有結合的相互作用の総計の強度を指す。別途指示がない限り、本明細書で使用される「結合親和性」とは、結合対のメンバーの間(例えば、抗原結合部分と抗原との間、又は受容体とそのリガンドとの間)の1:1の相互作用を反映する、固有の結合親和性を指す。分子Xの、そのパートナーYに対する親和性は一般に、解離速度定数及び会合速度定数(それぞれ、koff及びkon)の比である、解離定数(K)により表される。したがって、同等な親和性は、速度定数の比が、同じ比を維持する限り、異なる速度定数を含みうる。親和性は、当該技術分野で公知の、十分に確立された方法であって、本明細書で記載される方法を含む方法により測定することができる。親和性を測定するための特定の方法は、表面プラズモン共鳴(SPR)である。
「結合の低減」、例えば、Fc受容体への結合の低減とは、例えば、SPRにより測定される、それぞれの相互作用についての親和性の低下を指す。明確さのために述べると、用語はまた、親和性の、ゼロ(又は解析法の検出限界を下回る値)への低減、すなわち、相互作用の完全な消失も含む。逆に、「結合の増大」とは、それぞれの相互作用についての結合親和性の増大を指す。
本明細書で使用される「T細胞の活性化」とは、Tリンパ球、特に、細胞傷害性Tリンパ球の、一又は複数の細胞性応答であって、増殖、分化、サイトカイン分泌、細胞傷害性エフェクター分子の放出、細胞傷害活性、及び活性化マーカーの発現から選択される応答を指す。本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、T細胞の活性化を誘導することが可能である。当該技術分野では、T細胞の活性化を測定するのに適するアッセイが公知であり、本明細書でも記載される。
本明細書で使用される「標的細胞抗原」とは、標的細胞、例えば、がん細胞又は腫瘍間質の細胞など、腫瘍内の細胞の表面上に提示される抗原決定基を指す。
抗原結合部分に関して、本明細書で使用される「第1」及び「第2」などの用語は、1つを超える、各種の部分が存在する場合の、識別の便宜のために使用される。別途明示的な指定のない限り、これらの用語の使用は、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の、具体的な順序又は方向を付与することを意図するものではない。
「Fab分子」とは、免疫グロブリンの、重鎖のVHドメイン及びCH1ドメイン(「Fab重鎖」)、並びに軽鎖のVLドメイン及びCLドメイン(「Fab軽鎖」)からなるタンパク質を指す。
「融合させた」とは、直接、又は1若しくは複数のペプチドリンカーを介して、成分(例えば、Fab分子及びFcドメインサブユニット)を、ペプチド結合により連結することを意味する。
本明細書で使用される「単鎖」という用語は、ペプチド結合により直鎖状に連結された、アミノ酸モノマーを含む分子を指す。ある特定の実施態様では、抗原結合部分のうちの1つは、単鎖Fab分子、すなわち、Fab軽鎖と、Fab重鎖とを、単一のペプチド鎖を形成するように、ペプチドリンカーにより接続したFab分子である。特定のこのような実施態様では、Fab軽鎖のC末端を、単鎖Fab分子内のFab重鎖のN末端へと接続する。
「クロスオーバー」Fab分子(「Crossfab」ともまた称する)とは、Fab重鎖及びFab軽鎖の可変領域又は定常領域を交換したFab分子を意味する、すなわち、クロスオーバーFab分子は、軽鎖可変領域と、重鎖定常領域とから構成されたペプチド鎖、及び重鎖可変領域と軽鎖定常領域とから構成されたペプチド鎖を含む。明確さのために述べると、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変領域を交換した、クロスオーバーFab分子では、本明細書では、重鎖定常領域を含むペプチド鎖を、クロスオーバーFab分子の「重鎖」と称する。逆に、Fab軽鎖及びFab重鎖の定常領域を交換した、クロスオーバーFab分子では、本明細書では、重鎖可変領域を含むペプチド鎖を、クロスオーバーFab分子の「重鎖」と称する。
これに対し、「従来型の」Fab分子とは、その天然のフォーマットにおけるFab分子、すなわち、重鎖可変領域及び重鎖定常領域から構成される重鎖(VH−CH1)と、軽鎖可変領域及び軽鎖定常領域から構成される軽鎖(VL−CL)とを含むFab分子を意味する。
「免疫グロブリン分子」という用語は、天然に存在する抗体の構造を有するタンパク質を指す。例えば、IgGクラスの免疫グロブリンとは、ジスルフィド結合させた、2つの軽鎖と、2つの重鎖とから構成される、約150,000ドルトンの、ヘテロテトラマーの糖タンパク質である。N末端からC末端へと、各重鎖は、可変重鎖ドメイン又は重鎖可変ドメインともまた呼ばれる可変領域(VH)に続き、重鎖定常領域ともまた呼ばれる、3つの定常ドメイン(CH1、CH2、及びCH3)を有する。同様に、N末端からC末端へと、各軽鎖は、可変軽鎖ドメイン又は軽鎖可変ドメインともまた呼ばれる可変領域(VL)に続き、軽鎖定常領域ともまた呼ばれる、定常軽鎖(CL)ドメインを有する。免疫グロブリンの重鎖は、α(IgA)、δ(IgD)、ε(IgE)、γ(IgG)、又はμ(IgM)と呼ばれる5種類のうちの1つへと割り当てることができ、これらの一部は、亜型、例えば、γ(IgG)、γ(IgG)、γ(IgG)、γ(IgG)、α(IgA)、及びα(IgA)へとさらに分けることができる。免疫グロブリンの軽鎖は、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づき、カッパ(κ)及びラムダ(λ)と呼ばれる、2種類のうちの1つへと割り当てることができる。免疫グロブリンは、免疫グロブリンのヒンジ領域を介して連結された、2つのFab分子及びFcドメインから本質的になる。
本明細書では、「抗体」という用語を、最も広い意味で使用し、それらが、所望の抗原結合活性を呈示する限り、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、及び抗体断片を含むがこれらに限定されない、多様な抗体構造を包摂する。
「抗体断片」とは、インタクトな抗体以外の分子であって、インタクトな抗体が結合する抗原に結合する、インタクトな抗体の部分を含む分子を指す。抗体断片の例は、Fv、Fab、Fab’、Fab’−SH、F(ab’)、ダイアボディ、直鎖状抗体、単鎖抗体分子(例えば、scFv)、及び単一ドメイン抗体を含むがこれらに限定されない。ある特定の抗体断片の総説については、Hudsonら,Nat Med 9,129−134(2003)を参照されたい。scFv断片の総説については、例えば、Plueckthun,The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg及びMoore編,Springer−Verlag,New York,pp.269−315(1994)を参照されたい。また、国際公開第93/16185号;及び米国特許第5571894号及び同第5587458号も参照されたい。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含み、インビボにおける半減期を延長した、Fab断片及びF(ab’)断片の議論については、米国特許第5869046号を参照されたい。ダイアボディとは、二価又は二重特異性でありうる、2つの抗原結合部位を伴う抗体断片である。例えば、EP404097;国際公開第1993/01161号;Hudsonら,Nat Med 9,129−134(2003);及びHollingerら,Proc Natl Acad Sci USA 90,6444−6448(1993)を参照されたい。Hudsonら,Nat Med 9,129−134(2003)においてはまた、トリアボディ及びテトラボディも記載されている。単一ドメイン抗体とは、抗体の重鎖可変ドメインの全部若しくは一部又は軽鎖可変ドメインの全部若しくは一部を含む抗体断片である。ある特定の実施態様では、単一ドメイン抗体は、ヒト単一ドメイン抗体(Domantis,Inc.、Waltham、MA;例えば、米国特許第6248516B1号を参照されたい)である。抗体断片は、インタクトな抗体の、タンパク質分解性消化のほか、本明細書で記載される、組換え宿主細胞(例えば、大腸菌(E.coli)又はファージ)による生成を含むがこれらに限定されない、多様な技法により作製することができる。
「抗原結合ドメイン」という用語は、抗原の一部又は全部に特異的に結合し、これらと相補的な領野を含む、抗体の一部を指す。抗原結合ドメインは、例えば、一又は複数の抗体の可変ドメイン(抗体の可変領域とまた呼ばれる)によりもたらされうる。特に、抗原結合ドメインは、抗体の軽鎖可変領域(VL)及び抗体の重鎖可変領域(VH)を含む。
「可変領域」又は「可変ドメイン」という用語は、抗体の重鎖又は軽鎖のドメインであって、抗体の、抗原への結合に関与するドメインを指す。天然の抗体の重鎖及び軽鎖の可変ドメイン(それぞれ、VH及びVL)は一般に、各ドメインが、4つの保存されたフレームワーク領域(FR)と、3つの超可変領域(HVR)とを含む、類似の構造を有する。例えば、Kindtら,Kuby Immunology,6th ed.,W.H.Freeman and Co.,p91(2007)を参照されたい。単一のVH又はVLドメインは、抗原結合特異性を付与するのに十分でありうる。
本明細書で使用される「超可変領域」又は「HVR」という用語は、配列が超可変性であり、かつ/又は構造的に規定されたループ(「超可変ループ」)を形成する、抗体の可変ドメインの領域の各々を指す。一般に、天然の4本鎖抗体は、VH(H1、H2、H3)内の3つ、及びVL(L1、L2、L3)内の3つである、6つのHVRを含む。HVRは、一般に、超可変ループ及び/又は相補性決定領域(CDR)に由来するアミノ酸残基を含み、後者は、配列の可変性が最大であり、かつ/又は抗原認識に関与する。VH内のCDR1を例外として、CDRは一般に、超可変ループを形成するアミノ酸残基を含む。超可変領域(HVR)はまた、「相補性決定領域」(CDR)とも称し、本明細書では、抗原結合領域を形成する可変領域の部分に言及して、これらの用語を互換的に使用する。この特定の領域については、定義が、互いに対して比較した場合に、アミノ酸残基の重複又はサブセットを含む、Kabatら,U.S.Dept.of Health and Human Services,Sequences of Proteins of Immunological Interest(1983);及びChothiaら,J Mol Biol 196:901−917(1987)により記載されている。しかしながら、抗体又はその変異体のCDRに言及する、一方の定義の適用も、本明細書で規定及び使用される用語の範囲内にあることを意図する。上記で引用した参考文献の各々により規定されるCDRを包摂する、適切なアミノ酸残基を、比較として、下記の表1に明示する。特定のCDRを包摂する、正確な残基数は、CDRの配列及びサイズに応じて変動するであろう。当業者は、抗体の可変領域のアミノ酸配列を踏まえ、どの残基が、特定のCDRを構成するのかを、常套的に決定しうる。
Kabatらはまた、任意の抗体へと適用可能な可変領域配列のための番号づけシステムも規定した。当業者は、配列自体以外の実験データに依拠せずに、この「カバット番号付け」システムを、任意の可変領域配列へと明白に当てはめることができる。本明細書で使用される「カバット番号付け」とは、Kabatら,U.S.Dept.of Health and Human Services,“Sequence of Proteins of Immunological Interest”(1983)により明示される番号づけシステムを指す。特に断りのない限り、抗体の可変領域内の具体的なアミノ酸残基の位置についての番号付けへの言及は、カバット番号付けシステムに従う。
配列表のポリペプチド配列は、カバット番号付けシステムに従い番号付けされない。しかし、配列表の配列の番号付けを、カバット番号付けへと転換することは十分に、当業者の技術の範囲内にある。
「フレームワーク」又は「FR」とは、超可変領域(HVR)残基以外の可変ドメイン残基を指す。可変ドメインのFRは、一般に、4つのFRドメイン:FR1、FR2、FR3、及びFR4からなる。したがって、HVR配列及びFR配列は一般に、VH(又はVL)内に、以下の順序:FR1−H1(L1)−FR2−H2(L2)−FR3−H3(L3)−FR4で現れる。
抗体又は免疫グロブリンの「クラス」とは、その重鎖により保有される定常ドメイン又は定常領域の種類を指す。抗体には、5つの主要なクラス:IgA、IgD、IgE、IgG、及びIgMがあり、これらの一部は、サブクラス(アイソタイプ)、例えば、IgG、IgG、IgG、IgG、IgA、及びIgAへとさらに分けることができる。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインを、それぞれ、α、δ、ε、γ、及びμと呼ぶ。
本明細書では、「Fcドメイン」又は「Fc領域」という用語を、定常領域の少なくとも一部を含有する、免疫グロブリン重鎖のC末端領域を規定するように使用する。用語は、天然Fc領域及び変異Fc領域の配列を含む。IgG重鎖のFc領域の境界部は、若干変動しうるであろうが、ヒトIgG重鎖Fc領域は通例、Cys226又はPro230から、重鎖のカルボキシル末端へと拡がると規定される。しかし、Fc領域のC末端リジン(Lys447)は、存在する場合もあり、存在しない場合もある。本明細書では、特に断りのない限り、Fc領域内又は定常領域内のアミノ酸残基の番号付けは、Kabatら,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD,1991において記載されている、EUインデックスともまた呼ばれるEU番号付けシステムに従う。本明細書で使用される、Fcドメインの「サブユニット」とは、ダイマーのFcドメインを形成する2つのポリペプチドのうちの1つ、すなわち、安定的な自己会合が可能な、免疫グロブリン重鎖のC末端の定常領域を含むポリペプチドを指す。例えば、IgGのFcドメインのサブユニットは、IgG CH2定常ドメイン及びIgG CH3定常ドメインを含む。
「Fcドメインの、第1のサブユニットと、第2のサブユニットとの会合を促進する修飾」とは、Fcドメインサブユニットを含むポリペプチドの、同一なポリペプチドとの会合であって、ホモダイマーを形成する会合を低減するか、又は防止する、ペプチド骨格の操作、又はFcドメインサブユニットの翻訳後修飾である。本明細書で使用される、会合を促進する修飾は、特に、会合することが所望される、2つのFcドメインサブユニット(すなわち、Fcドメインの第1のサブユニット及び第2のサブユニット)の各々へと施される個別の修飾であって、2つのFcドメインサブユニットの会合を促進するように、互いに相補的な修飾を含む。例えば、会合を促進する修飾は、それらの会合を、立体的又は静電的に、それぞれ、好適とするように、Fcドメインサブユニットの一方又は両方の構造又は電荷を変更しうる。したがって、サブユニット(例えば、抗原結合部分)の各々へと融合させる、さらなる成分が同じではないという意味において、非同一でありうる、第1のFcドメインサブユニットを含むポリペプチドと、第2のFcドメインサブユニットを含むポリペプチドとの間で、(ヘテロ)二量体化が生じる。一部の実施態様では、会合を促進する修飾は、Fcドメイン内のアミノ酸突然変異、具体的には、アミノ酸置換を含む。特定の実施態様では、会合を促進する修飾は、Fcドメインの、2つのサブユニットの各々における、個別のアミノ酸突然変異、具体的には、アミノ酸置換を含む。
「エフェクター機能」という用語は、抗体のFc領域へと帰せられうる生物学的活性であって、抗体のアイソタイプと共に変動する生物学的活性を指す。抗体のエフェクター機能の例は、C1q結合及び補体依存性細胞傷害(CDC)、Fc受容体結合、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞の食作用(ADCP)、サイトカイン分泌、抗原提示細胞による、免疫複合体に媒介される抗原の取込み、細胞表面受容体(例えば、B細胞受容体)の下方調節、及びB細胞活性化を含む。
本明細書で使用される「〜を操作する(engineer)、操作された(engineered)、〜を操作すること(engineering)」という用語は、天然に存在するポリペプチド若しくは組換えポリペプチド又はこれらの断片のペプチド骨格又は翻訳後修飾の任意の操作(manipulation)を含むと考えられる。操作すること(engineering)は、個別のアミノ酸のアミノ酸配列、グリコシル化パターン、又は側鎖基の修飾のほか、これらの手法の組合せを含む。
本明細書で使用される「アミノ酸突然変異」という用語は、アミノ酸の置換、欠失、挿入、及び修飾を包摂することを意図する。最終的なコンストラクトに到達するように、最終的なコンストラクトが、所望の特性、例えば、Fc受容体への結合の低減、又は別のペプチドとの会合の増大を保有するという条件で、置換、欠失、挿入、及び修飾の任意の組合せを施すことができる。アミノ酸配列の欠失及び挿入は、アミノ酸の、アミノ末端及び/又はカルボキシ末端の、欠失及び挿入を含む。特定のアミノ酸突然変異は、アミノ酸置換である。例えば、Fc領域の結合特性を変更する目的では、非保存的アミノ酸置換、すなわち、1つのアミノ酸を、異なる構造的特性及び/又は化学的特性を有する、別のアミノ酸で置きかえることが、特に、好ましい。アミノ酸置換は、天然に存在しないアミノ酸、又は20の標準的なアミノ酸の、天然に存在するアミノ酸誘導体(例えば、4−ヒドロキシプロリン、3−メチルヒスチジン、オルニチン、ホモセリン、5−ヒドロキシリジン)による置きかえを含む。アミノ酸突然変異は、当該技術分野で周知の遺伝子法又は化学法を使用して作出することができる。遺伝子法は、部位特異的突然変異誘発、PCR、遺伝子合成などを含みうる。化学修飾など、遺伝子操作以外の方法により、アミノ酸の側鎖基を変更する方法もまた、有用でありうることが想定される。本明細書では、同じアミノ酸突然変異を指し示すのに、多様な表記を使用する場合がある。例えば、Fcドメインの329位におけるプロリンから、グリシンへの置換は、329G、G329、G329、P329G、又はPro329Glyと表示することができる。
本明細書で使用される「ポリペプチド」という用語は、アミド結合(ペプチド結合としてもまた公知である)により直鎖状に連結されたモノマー(アミノ酸)から構成される分子を指す。「ポリペプチド」という用語は、2つ又はこれを超えるアミノ酸の任意の鎖を指し、具体的な長さの産物を指すわけではない。したがって、2つ又はこれを超えるアミノ酸の鎖を指すのに使用される、ペプチド、ジペプチド、トリペプチド、オリゴペプチド、「タンパク質」、「アミノ酸鎖」、又は他の任意の用語が、「ポリペプチド」の定義内に含まれ、「ポリペプチド」という用語を、これらの用語のうちのいずれかの代わりに使用することもでき、これらと互換的に使用することもできる。「ポリペプチド」という用語はまた、限定せずに述べると、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、公知の保護(protecting/blocking)基による誘導、タンパク質分解性切断、又は天然に存在しないアミノ酸による修飾を含む、ポリペプチド発現後修飾の産物を指すことも意図する。ポリペプチドは、天然の生物学的供給源に由来する場合もあり、組換え技術により生成される場合もあるが、必ずしも、表示の核酸配列から翻訳されるわけではない。ポリペプチドは、化学合成を含む、任意の方式で作出することができる。本発明のポリペプチドは、約3若しくはこれを超える、5若しくはこれを超える、10若しくはこれを超える、20若しくはこれを超える、25若しくはこれを超える、50若しくはこれを超える、75若しくはこれを超える、100若しくはこれを超える、200若しくはこれを超える、500若しくはこれを超える、1,000若しくはこれを超える、又は2,000若しくはこれを超えるアミノ酸のサイズでありうる。ポリペプチドは、規定された三次元構造を有しうるが、必ずしも、このような構造を有するわけではない。規定された三次元構造を伴うポリペプチドを、フォールディングポリペプチドと称し、規定された三次元構造を有さず、多数の異なるコンフォメーションを取りうるポリペプチドを、アンフォールディングポリペプチドと称する。
「単離」ポリペプチド又はその変異体若しくは誘導体とは、その天然の環境にないポリペプチドであることを意図する。特定レベルの精製が要請されるわけではない。例えば、単離ポリペプチドは、その天然(native又はnatural)環境から取り出すことができる。宿主細胞内で発現させる、組換え生成によるポリペプチド及びタンパク質は、本発明の目的では、任意の適切な技法により、分離、分画、又は部分的若しくは実質的に精製された、天然又は組換えのポリペプチドと同様に、単離されていると考えられる。
参照ポリペプチド配列に照らした「アミノ酸配列の同一性パーセント(%)」は、配列をアライメントし、必要な場合は、ギャップを導入して、最大の配列同一性パーセントを達成するが、保存的置換は、配列同一性の部分として考慮せずにおいた後における、参照ポリペプチド配列内の、アミノ酸残基と同一な、候補配列内のアミノ酸残基の百分率と規定される。アミノ酸配列の同一性パーセントを決定することを目的とするアライメントは、例えば、BLASTソフトウェア、BLAST−2ソフトウェア、ALIGNソフトウェア、又はMegalign(DNASTAR)ソフトウェアなど、市販のコンピュータソフトウェアを使用して、当該技術分野の範囲内にある多様な方式で達成することができる。当業者は、配列をアライメントするのに適切なパラメータであって、比較される配列の完全長にわたり、最適のアライメントを達成するのに必要とされる、任意のアルゴリズムを含むパラメータを決定することができる。しかし、本明細書の目的では、配列比較コンピュータプログラムであるALIGN−2を使用して、アミノ酸配列の同一性%値を生成する。ALIGN−2配列比較コンピュータプログラムは、Genentech,Inc.により作製され、ソースコードが、U.S.Copyright Office、Washington D.C.、20559に、ユーザーマニュアルと共に出願され、ここで、U.S.Copyright Registration第TXU510087号として登録されている。ALIGN−2プログラムは、Genentech,Inc.、South San Francisco、Californiaから市販品を入手することもでき、ソースコードからコンパイルすることもできる。ALIGN−2プログラムは、ディジタル式UNIX V4.0Dを含む、UNIXオペレーティングシステム上での使用のためにコンパイルすべきである。全ての配列比較パラメータは、ALIGN−2プログラムにより設定され、変動させない。ALIGN−2を、アミノ酸配列比較のために援用する状況下では、所与のアミノ酸配列Aの、所与のアミノ酸配列Bに対する、これとの、又はこれに照らした、アミノ酸配列の同一性%(これを、代替的に、所与のアミノ酸配列Bに対する、これとの、又はこれに照らした、ある特定のアミノ酸配列の同一性%を有するか又は含む、所与のアミノ酸配列Aとも称しうる)は、以下:
100×割合X/Y
[式中、Xは、配列アライメントプログラムであるALIGN−2により、このプログラムによる、AとBとのアライメントにおいて、同一なマッチとしてスコア付けされたアミノ酸残基の数であり、Yは、B内のアミノ酸残基の総数である]の通りに計算される。アミノ酸配列Aの長さが、アミノ酸配列Bの長さと等しくない場合、AのBに対するアミノ酸配列の同一性%は、BのAに対するアミノ酸配列の同一性%と等しくないことが察知されるであろう。別途具体的に指定のない限り、本明細書で使用される、全てのアミノ酸配列の同一性%値は、ALIGN−2コンピュータプログラムを使用して、直前の段落で記載した通りに得られる。
「ポリヌクレオチド」という用語は、単離核酸分子又はコンストラクト、例えば、メッセンジャーRNA(mRNA)、ウイルス由来のRNA、又はプラスミドDNA(pDNA)を指す。ポリヌクレオチドは、従来型のホスホジエステル結合を含む場合もあり、非従来型の結合(例えば、ペプチド核酸(PNA)内で見出される結合などのアミド結合)を含む場合もある。「核酸分子」という用語は、ポリヌクレオチド内に存在する、任意の一又は複数の核酸セグメント、例えば、DNA断片又はRNA断片を指す。
「単離」核酸分子又は「単離」ポリヌクレオチドは、その天然の環境から取り出された核酸分子、DNA、又はRNAであることを意図する。例えば、ベクター内に含有される、ポリペプチドをコードする組換えポリヌクレオチドは、本発明の目的では、単離されていると考えられる。単離ポリヌクレオチドのさらなる例は、異種宿主細胞内で維持される組換えポリヌクレオチド、又は溶液中で(部分的に又は実質的に)精製されるポリヌクレオチドを含む。単離ポリヌクレオチドは、ポリヌクレオチド分子を通常含有する細胞内に含有されるポリヌクレオチド分子を含むが、ポリヌクレオチド分子は、染色体外にも存在し、又はその天然の染色体内の位置と異なる染色体内の位置にも存在する。単離RNA分子は、インビボ又はインビトロにおける、本発明のRNA転写物のほか、プラス鎖形態及びマイナス鎖形態、並びに二本鎖形態を含む。本発明に従う単離ポリヌクレオチド又は核酸は、合成により生成された、このような分子をさらに含む。加えて、ポリヌクレオチド又は核酸は、プロモーター、リボソーム結合部位、又は転写ターミネーターなど制御エレメントであるか、又はこれらを含みうる。
本発明の参照ヌクレオチド配列と、少なくとも、例えば、95%「同一」なヌクレオチド配列を有する核酸又はポリヌクレオチドにより、ポリヌクレオチド配列が、参照ヌクレオチド配列100ヌクレオチド当たり、最大で5つの点突然変異を含みうることを除き、ポリヌクレオチドのヌクレオチド配列は、参照配列と同一であることが意図される。言い換えれば、参照ヌクレオチド配列と、少なくとも、95%同一なヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを得るには、参照配列内のヌクレオチドのうち、最大で5%を欠失させることもでき、別のヌクレオチドで置換することもでき、参照配列内の全ヌクレオチドのうちの最大で5%という、多数のヌクレオチドを、参照配列へと挿入することもできる。これらの参照配列の変更は、参照ヌクレオチド配列の5’末端位又は3’末端位に施すこともでき、これらの末端位の間のいずれかの位置に施すこともでき、参照配列内の残基間に個別に散在させることもでき、参照配列内の、一又は複数の連続基により散在させることもできる。実際上の問題として、任意の特定のポリヌクレオチド配列が、本発明のヌクレオチド配列と、少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるのかどうかは、ポリペプチドについて上記で論じたプログラム(例えば、ALIGN−2)など、公知のコンピュータプログラムを使用して、従来の方式で決定することができる。
「発現カセット」という用語は、組換え又は合成により作出されるポリヌクレオチドであって、標的細胞内の特定の核酸の転写を可能とする、一連の、指定された核酸エレメントを伴うポリヌクレオチドを指す。組換え発現カセットは、プラスミド、染色体、ミトコンドリアDNA、プラスミドDNA、ウイルス、又は核酸断片へと組み込むことができる。典型的に、発現ベクターの組換え発現カセット部分は、他の配列の中でも、転写される核酸配列と、プロモーターとを含む。ある特定の実施態様では、本発明の発現カセットは、本発明の二重特異性抗原結合分子をコードするポリヌクレオチド配列又はその断片を含む。
「ベクター」又は「発現ベクター」という用語は、「発現コンストラクト」と同義であり、標的細胞内で作動可能に結合する特定の遺伝子を導入し、その発現を方向付けるのに使用されるDNA分子を指す。用語は、自己複製核酸構造としてのベクターのほか、それが導入される宿主細胞のゲノムへと組み込まれるベクターを含む。本発明の発現ベクターは、発現カセットを含む。発現ベクターは、大量の安定的なmRNAの転写を可能とする。発現ベクターが標的細胞内部に入ると、細胞の転写機構及び/又は翻訳機構により、遺伝子によりコードされるリボ核酸分子又はタンパク質を生成する。一実施態様では、本発明の発現ベクターは、本発明の二重特異性抗原結合分子をコードするポリヌクレオチド配列又はその断片を含む発現カセットを含む。
「宿主細胞」、「宿主細胞株」、及び「宿主細胞培養物」という用語は、互換的に使用され、外因性核酸が導入される細胞であって、このような細胞の子孫を含む細胞を指す。宿主細胞は、初代形質転換細胞と、継代数に関わりなく、これに由来する子孫とを含む、「形質転換体」及び「形質転換細胞」を含む。子孫は、核酸含有量が親細胞と完全に同一ではなく、突然変異を含有しうる。本明細書には、元の形質転換細胞についてスクリーニング又は選択された、同じ機能又は生物活性を有する、突然変異体の子孫も含まれる。宿主細胞は、本発明の二重特異性抗原結合分子を作出するのに使用しうる、任意の種類の細胞系である。宿主細胞は、ごく少数を挙げれば、培養細胞、例えば、CHO細胞、BHK細胞、NS0細胞、SP2/0細胞、YO骨髄腫細胞、P3X63マウス骨髄腫細胞、PER細胞、PER.C6細胞、又はハイブリドーマ細胞などの哺乳類培養細胞、酵母細胞、昆虫細胞、及び植物細胞を含むが、また、トランスジェニック動物、トランスジェニック植物、又は培養された植物組織若しくは動物組織の中に含まれる細胞も含む。
「活性化Fc受容体」とは、抗体のFcドメインの係合の後で、エフェクター機能を果たすように、受容体保有細胞を刺激するシグナル伝達イベントを誘発するFc受容体である。ヒト活性化Fc受容体は、FcγRIIIa(CD16a)、FcγRI(CD64)、FcγRIIa(CD32)、及びFcαRI(CD89)を含む。
抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)とは、抗体でコートされた標的細胞の、免疫エフェクター細胞による溶解をもたらす免疫機構である。標的細胞とは、一般に、Fc領域に対してN末端であるタンパク質の部分を介して、抗体又はFc領域を含むその誘導体が、特異的に結合する細胞である。本明細書で使用される「ADCCの低減」という用語は、標的細胞を取り囲む培地中の抗体の所与の濃度で、所与の時間内に、上記で規定されたADCC機構により溶解する標的細胞の数の低減、及び/又は所与の時間内に、ADCC機構により、所与の数の標的細胞の溶解を達成するのに要請される、標的細胞を取り囲む培地中の抗体の濃度の増大と規定される。ADCCの低減は、同じ標準的な作製法、精製法、製剤化法、及び保管法(当業者に公知である)を使用して、同じ種類の宿主細胞により産生され、操作されていない、同じ抗体に媒介されるADCCと比べた低減である。例えば、そのFcドメイン内に、ADCCを低減するアミノ酸置換を含む抗体に媒介される、ADCCの低減は、Fcドメイン内のこのアミノ酸置換を伴わない同じ抗体に媒介されるADCCと比べた低減である。当該技術分野では、ADCCを測定するのに適するアッセイが周知である(例えば、PCT公開番号WO2006/082515、又はPCT公開番号WO2012/130831を参照されたい)。
薬剤の「有効量」とは、それが投与される細胞内又は組織内の生理的変化を結果としてもたらすのに必要な量を指す。
薬剤、例えば、薬学的組成物の「治療的有効量」とは、必要な投与量で、必要な時間にわたり、所望の治療的結果又は予防的結果を達成するのに有効な量を指す。治療的有効量の薬剤は、例えば、疾患の有害作用を消失させるか、減殺するか、遅延させるか、最小化するか、又は予防する。
「個体」又は「対象」とは、哺乳類である。哺乳類は、馴致動物(例えば、ウシ、ヒツジ、ネコ、イヌ、及びウマ)、霊長類(例えば、ヒト、及びサルなどの非ヒト霊長類)、ウサギ、及びげっ歯類(例えば、マウス及びラット)を含むがこれらに限定されない。特に、個体又は対象は、ヒトである。
「薬学的組成物」という用語は、その中に含有される有効成分の生物活性が有効となることを可能とするが、製剤が投与される対象に対して、許容不可能な程度に毒性となる、さらなる成分は含有しないような形態にある調製物を指す。
「薬学的に許容される担体」とは、薬学的組成物中の、有効成分以外の成分であって、対象に対して非毒性である成分を指す。薬学的に許容される担体は、バッファー、賦形剤、安定剤、又は防腐剤を含むがこれらに限定されない。
本明細書で使用される「治療」(及び、「〜を治療する」又は「〜を治療すること」など、その文法的変化形)とは、個体において治療される疾患の、自然の経過を変更しようとする企図における臨床的介入を指し、予防のために実施することもでき、臨床病理の経過中に実施することもできる。所望の治療効果は、疾患の発生又は再発の予防、症候の緩和、疾患の、任意の直接的又は間接的な病理学的帰結の減殺、転移の予防、疾患進行の速度の低下、病態の改善又は緩和、及び寛解又は予後の改善を含むがこれらに限定されない。一部の実施態様では、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を使用して、疾患の発生を遅延させるか、又は疾患の進行を緩徐化させる。
「添付文書」という用語は、通例、治療用製品の市販のパッケージ内に含まれる指示書であって、適応症、使用、投与量、投与、併用療法、このような治療用製品の使用に関する禁忌及び/又は警告についての情報を含有する指示書を指すように使用される。
本明細書で使用される「イデオタイプ特異的ポリペプチド」とは、抗原結合部分、例えば、CD3に特異的な抗原結合部分のイデオタイプを認識するポリペプチドを指す。イデオタイプ特異的ポリペプチドは、抗原結合部分の可変領域に特異的に結合し、これにより、抗原結合部分の、そのコグネイト抗原への特異的結合を低減又は防止することが可能である。抗原結合部分を含む分子と会合すると、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、分子のマスキング部分として機能しうる。具体的には、本明細書では、抗CD3結合分子のイデオタイプに特異的な、抗イデオタイプ抗体又は抗イデオタイプ結合性抗体断片が開示される。
本明細書で使用される「プロテアーゼ」又は「タンパク質分解酵素」とは、認識部位において、リンカーを切断し、標的細胞が発現させる、任意のタンパク質分解酵素を指す。このようなプロテアーゼは、標的細胞により分泌される場合もあり、標的細胞との会合、例えば、標的細胞表面上の会合を維持する場合もあろう。プロテアーゼの例は、メタロプロテイナーゼ、例えば、マトリックスメタロプロテイナーゼ1−28、並びにディスインテグリン及びメタロプロテイナーゼ(ADAM)2、7−12、15、17−23、28−30、及び33、セリンプロテアーゼ、例えば、ウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子及びマトリプターゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、並びにカテプシンファミリーのメンバーを含むがこれらに限定されない。
T細胞活性化二重特異性分子に関して本明細書で使用される「プロテアーゼ活性化型」とは、CD3に結合する、T細胞活性化二重特異性分子の能力を低減するか、又は失効化させるマスキング部分のために、T細胞を活性化させる能力を低減するか又は失効化させた、T細胞活性化二重特異性分子を指す。タンパク質分解性切断、例えば、マスキング部分を、T細胞活性化二重特異性分子へと接続するリンカーの、タンパク質分解性切断により、マスキング部分が解離すると、CD3への結合が回復し、これにより、T細胞活性化二重特異性分子は活性化する。
本明細書で使用される「可逆的隠蔽」とは、抗原結合部分又は分子が、その抗原、例えば、CD3に結合することを防止するように、マスキング部分又はイデオタイプ特異的ポリペプチドが、抗原結合部分又は分子に結合することを指す。この隠蔽は、イデオタイプ特異的ポリペプチドが、例えば、プロテアーゼ切断により、抗原結合部分又は分子から放出され、これにより、抗原結合部分又は分子を、その抗原に結合するように解放しうるという点で可逆的である。
詳細な説明
一態様では、本発明は、
(a)CD3への特異的結合が可能な第1の抗原結合部分と;
(b)標的細胞抗原への特異的結合が可能な第2の抗原結合部分と;
(c)プロテアーゼ切断型リンカーを介して、T細胞二重特異性結合性分子と共有結合しているマスキング部分であって、第1又は第2の抗原結合部分のイデオタイプへの特異的結合が可能であり、これにより、第1又は第2の抗原結合部分を、可逆的に隠蔽するマスキング部分と
を含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子に関する。
CD3への特異的結合が可能な、第1の抗原結合部分は、イデオタイプを含む。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のマスキング部分は、第1の抗原結合部分と共有結合している。一実施態様では、マスキング部分は、第1の抗原結合部分の重鎖可変領域と共有結合している。一実施態様では、マスキング部分は、第1の抗原結合部分の軽鎖可変領域と共有結合している。この共有結合は、第1の抗原結合部位のイデオタイプへの、マスキング部分の、好ましくは非共有結合である、特異的結合とは別個である。第1の抗原結合部分のイデオタイプは、その可変領域を含む。一実施態様では、マスキング部分は、第1の抗原結合部分がCD3に結合するときに、CD3と接触するアミノ酸残基に結合する。好ましい実施態様では、マスキング部分は、第1の抗原結合部分のコグネイト抗原又はその断片ではない、すなわち、マスキング部分は、CD3又はその断片ではない。一実施態様では、マスキング部分は、抗イデオタイプ抗体又はその断片である。一実施態様では、マスキング部分は、抗イデオタイプscFvである。抗イデオタイプscFvであるマスキング部分と、このようなマスキング部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化分子との例示的実施態様については、実施例において、詳細に記載する。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第2の抗原結合部分を可逆的に隠蔽する、第2のマスキング部分を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含むFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)標的細胞抗原への特異的結合が可能なFab分子である、第2の抗原結合部分と
を含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、配列番号43のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号14、配列番号15、及び配列番号16からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
別の具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号47のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号151、配列番号152、及び配列番号153からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号154、配列番号155、及び配列番号156の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
別の具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号157のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号158のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
別の具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
別の具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、配列番号32のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖と、配列番号33のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖とを含む。
別の具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、配列番号115のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号116のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分は、メソテリンへの特異的結合が可能であり、配列番号107、配列番号108、及び配列番号109からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号110、配列番号111、及び配列番号112の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
別の具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分は、メソテリンへの特異的結合が可能であり、配列番号113のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号114のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含むFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)FolR1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号14、配列番号15、及び配列番号16からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含むFab分子である、第2の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)FolR1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号47のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第2の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含むFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)FolR1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号151、配列番号152、及び配列番号153からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号154、配列番号155、及び配列番号156の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含むFab分子である、第2の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)FolR1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号157のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号158のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第2の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含むFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)HER1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含むFab分子である、第2の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)HER1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号115のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号116のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第2の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変領域又は定常領域を交換した、クロスオーバーFab分子である。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含むFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)メソテリンへの特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号107、配列番号108、及び配列番号109からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号110、配列番号111、及び配列番号112の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含むFab分子である、第2の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)メソテリンへの特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号113のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号114のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第2の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、第2の抗原結合部分は、従来型のFab分子である。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、Fab軽鎖及びFab重鎖の定常領域を交換した、クロスオーバーFab分子であり、第2の抗原結合部分は、従来型のFab分子である。さらなる特定の実施態様では、第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分が、任意選択的にペプチドリンカーを介して互いに融合している。
特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、安定的な会合が可能な、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインをさらに含む。
さらなる特定の実施態様では、CD3への特異的結合が可能な、1つを超えない抗原結合部分が、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子内に存在する(すなわち、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、CD3への一価の結合をもたらす)。
プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のフォーマット
プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の成分は、様々な構成で、互いに融合させることができる。例示的構成を、図1A−1E及び5A−5Hに描示する。さらなる例示的構成を、図33A−33Kに描示する。
特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、安定的な会合が可能な、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインを含む。一部の実施態様では、第2の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第1のサブユニット又は第2のサブユニットのN末端へと融合させる。
このような一実施態様では、第1の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第2の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させる。このような具体的な実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は本質的に、第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分と、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインと、任意選択的に、一又は複数のペプチドリンカーとからなり、この場合、第1の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第2の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させ、第2の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第1のサブユニット又は第2のサブユニットのN末端へと融合させる。加えて、任意選択的に、第1の抗原結合部分のFab軽鎖及び第2の抗原結合部分のFab軽鎖を、互いに融合させることもできる。
別のこのような実施態様では、第1の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第1のサブユニット又は第2のサブユニットのN末端へと融合させる。このような具体的な実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は本質的に、第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分と、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインと、任意選択的に、一又は複数のペプチドリンカーとからなり、この場合、第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分の各々を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインのサブユニットのうちの1つのN末端へと融合させる。
他の実施態様では、第1の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第1のサブユニット又は第2のサブユニットのN末端へと融合させる。
特定のこのような実施態様では、第2の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第1の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させる。このような具体的な実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は本質的に、第1の抗原結合部分と、第2の抗原結合部分と、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインと、任意選択的に、一又は複数のペプチドリンカーとからなり、この場合、第2の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第1の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させ、第1の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第1のサブユニット又は第2のサブユニットのN末端へと融合させる。加えて、任意選択的に、第1の抗原結合部分のFab軽鎖及び第2の抗原結合部分のFab軽鎖を、互いに融合させることもできる。
抗原結合部分を、Fcドメイン又は互いに直接融合させることもでき、一又は複数のアミノ酸、典型的に、約2−20アミノ酸を含むペプチドリンカーを介して融合させることもできる。当該技術分野では、ペプチドリンカーについて公知であり、本明細書でも記載される。適切な非免疫原性ペプチドリンカーは、例えば、(GS)、(SG、(GS)、又はG(SGのペプチドリンカーを含む。「n」とは、一般に、1から10の間、典型的に、2から4の間の数である。第1の抗原結合部分のFab軽鎖及び第2の抗原結合部分のFab軽鎖を、互いに融合させるのに特に適するペプチドリンカーは、(GS)である。第1の抗原結合部分のFab重鎖と、第2の抗原結合部分のFab重鎖とを接続するのに適する、例示的なペプチドリンカーは、EPKSC(D)−(GS)(配列番号105及び106)である。加えて、リンカーは、免疫グロブリンヒンジ領域(の一部)を含みうる。特に、抗原結合部分を、FcドメインのサブユニットのN末端へと融合させる場合は、さらなるペプチドリンカーを伴うか又は伴わない、免疫グロブリンヒンジ領域又はその部分を介して、融合させることができる。
標的細胞抗原への特異的結合が可能な、単一の抗原結合部分を伴う、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、高親和性の抗原結合部分の結合の後に、標的細胞抗原の内部移行が予測される場合に、特に有用である。このような場合、標的細胞抗原に特異的な、1つを超える抗原結合部分の存在が、標的細胞抗原の内部移行を増強することが可能であり、これにより、そのアベイラビリティーを低減しうる。
しかし、多くの他の場合、例えば、標的部位への標的化を最適化するか、又は標的細胞抗原の架橋を可能とするように、標的細胞抗原に特異的な、2つ又はこれを超える抗原結合部分を含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子(図5A−5Hに示した例を参照されたい)を有することが有利であろう。
したがって、ある特定の実施態様では、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、標的細胞抗原への特異的結合が可能なFab分子である、第3の抗原結合部分をさらに含む。一実施態様では、第3の抗原結合部分は、従来型のFab分子である。一実施態様では、第3の抗原結合部分は、第2の抗原結合部分と同じ標的細胞抗原への特異的結合が可能である。特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、標的細胞抗原への特異的結合が可能である。特定の実施態様では、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、同一である(すなわち、同じアミノ酸配列を含む)。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号14、配列番号15、及び配列番号16からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含み;第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号14、配列番号15、及び配列番号16からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含み;第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号14、配列番号15、及び配列番号16からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、FolR1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号47のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含み;第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含み;第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号115のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号116のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER2への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分は、配列番号142、配列番号143、及び配列番号144からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号148、配列番号149、及び配列番号150の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含み、第3の抗原結合部分は、配列番号145、配列番号146、及び配列番号147からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号148、配列番号149、及び配列番号150の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含み;第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER2への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分は、配列番号142、配列番号143、及び配列番号144からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号148、配列番号149、及び配列番号150の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含み、第3の抗原結合部分は、配列番号145、配列番号146、及び配列番号147からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号148、配列番号149、及び配列番号150の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER2への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分は、配列番号160のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号161のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、第3の抗原結合部分は、配列番号159のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号161のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、メソテリンへの特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号107、配列番号108、及び配列番号109からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号110、配列番号111、及び配列番号112の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含み;第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、メソテリンへの特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号107、配列番号108、及び配列番号109からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号110、配列番号111、及び配列番号112の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、メソテリンへの特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号113のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号114のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61からなる群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19からなる群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含み;第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、HER1への特異的結合が可能であり、この場合、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分は、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61からなる群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、第3の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第1のサブユニット又は第2のサブユニットのN末端へと融合させる。より具体的な実施態様では、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分の各々を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインのサブユニットのうちの1つのN末端へと融合させ、第1の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第2の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させる。加えて、任意選択的に、第1の抗原結合部分のFab軽鎖及び第2の抗原結合部分のFab軽鎖を、互いに融合させることもできる。
第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分を、直接、又はペプチドリンカーを介して、Fcドメインへと融合させることができる。特定の実施態様では、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分の各々を、免疫グロブリンヒンジ領域を介して、Fcドメインへと融合させる。具体的な実施態様では、免疫グロブリンヒンジ領域は、ヒトIgGのヒンジ領域である。一実施態様では、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分並びにFcドメインは、免疫グロブリン分子の一部である。特定の実施態様では、免疫グロブリン分子は、IgGクラスの免疫グロブリンである。なおより特定の実施態様では、免疫グロブリンは、IgGサブクラスの免疫グロブリンである。別の実施態様では、免疫グロブリンは、IgGサブクラスの免疫グロブリンである。さらなる特定の実施態様では、免疫グロブリンは、ヒト免疫グロブリンである。他の実施態様では、免疫グロブリンは、キメラ免疫グロブリン又はヒト化免疫グロブリンである。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は本質的に、標的細胞抗原への特異的結合が可能な免疫グロブリン分子と、CD3への特異的結合が可能な抗原結合部分とからなり、この場合、抗原結合部分は、任意選択的に、ペプチドリンカーを介して、免疫グロブリン重鎖のうちの1つのN末端へと融合させたFab分子、特に、クロスオーバーFab分子である。
特定の実施態様では、第1の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分の各々を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインのサブユニットのうちの1つのN末端へと融合させ、第2の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第1の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させる。このような具体的な実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は本質的に、第1の抗原結合部分、第2の抗原結合部分、及び第3の抗原結合部分と、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインと、任意選択的に、一又は複数のペプチドリンカーとからなり、この場合、第2の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第1の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させ、第1の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第1のサブユニットのN末端へと融合させ、第3の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第2のサブユニットのN末端へと融合させる。加えて、任意選択的に、第1の抗原結合部分のFab軽鎖及び第2の抗原結合部分のFab軽鎖を、互いに融合させることもできる。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号45の重鎖CDR2、配列番号46の重鎖CDR3、配列番号17の軽鎖CDR1、配列番号18の軽鎖CDR2、及び配列番号19の軽鎖CDR3を含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、FolR1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号14の重鎖CDR1、配列番号15の重鎖CDR2、配列番号16の重鎖CDR3、配列番号17の軽鎖CDR1、配列番号18の軽鎖CDR2、及び配列番号19の軽鎖CDR3を含むFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、FolR1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号47のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号45の重鎖CDR2、配列番号46の重鎖CDR3、配列番号17の軽鎖CDR1、配列番号18の軽鎖CDR2、及び配列番号19の軽鎖CDR3を含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、FolR1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号151の重鎖CDR1、配列番号152の重鎖CDR2、配列番号153の重鎖CDR3、配列番号154の軽鎖CDR1、配列番号155の軽鎖CDR2、及び配列番号156の軽鎖CDR3を含むFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、FolR1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号157のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号158のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号45の重鎖CDR2、配列番号46の重鎖CDR3、配列番号17の軽鎖CDR1、配列番号18の軽鎖CDR2、及び配列番号19の軽鎖CDR3を含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、HER1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号56の重鎖CDR1、配列番号57の重鎖CDR2、配列番号58の重鎖CDR3、配列番号59の軽鎖CDR1、配列番号60の軽鎖CDR2、及び配列番号61の軽鎖CDR3を含むFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、HER1への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号115のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号116のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号45の重鎖CDR2、配列番号46の重鎖CDR3、配列番号17の軽鎖CDR1、配列番号18の軽鎖CDR2、及び配列番号19の軽鎖CDR3を含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、HER2への特異的結合が可能なFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分であって、第2の抗原結合部分が、配列番号142の重鎖CDR1、配列番号143の重鎖CDR2、配列番号144の重鎖CDR3、配列番号148の軽鎖CDR1、配列番号149の軽鎖CDR2、及び配列番号150の軽鎖CDR3を含み、第3の抗原結合部分が、配列番号145の重鎖CDR1、配列番号146の重鎖CDR2、配列番号148の重鎖CDR3、配列番号148の軽鎖CDR1、配列番号149の軽鎖CDR2、及び配列番号150の軽鎖CDR3を含む第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、HER2への特異的結合が可能なFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分であって、第2の抗原結合部分が、配列番号160のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号161のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、第3の抗原結合部分が、配列番号159のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号161のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号44の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号45の重鎖CDR2、配列番号46の重鎖CDR3、配列番号17の軽鎖CDR1、配列番号18の軽鎖CDR2、及び配列番号19の軽鎖CDR3を含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、メソテリンへの特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号107の重鎖CDR1、配列番号108の重鎖CDR2、配列番号109の重鎖CDR3、配列番号110の軽鎖CDR1、配列番号111の軽鎖CDR2、及び配列番号112の軽鎖CDR3を含むFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
一実施態様では、本発明は、
(i)CD3への特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含むFab分子である、第1の抗原結合部分であって、Fab軽鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域と、Fab重鎖の可変領域又は定常領域、特に定常領域とを交換した、クロスオーバーFab分子である、第1の抗原結合部分と;
(ii)各々が、メソテリンへの特異的結合が可能なFab分子であり、配列番号113のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号114のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含むFab分子である、第2の抗原結合部分及び第3の抗原結合部分と
を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。
上記の10の実施態様のうちのいずれかに従う、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子はさらに、(iii)安定的な会合が可能な、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインも含むことが可能であり、第2の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第1の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させ、第1の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第1のサブユニットのN末端へと融合させ、第3の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、Fcドメインの第2のサブユニットのN末端へと融合させる。
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の一部では、第1の抗原結合部分のFab軽鎖及び第2の抗原結合部分のFab軽鎖を、任意選択的にリンカーペプチドを介して互いに融合させる。第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分の構成に応じて、第1の抗原結合部分のFab軽鎖を、そのC末端において、第2の抗原結合部分のFab軽鎖のN末端へと融合させることもでき、第2の抗原結合部分のFab軽鎖を、そのC末端において、第1の抗原結合部分のFab軽鎖のN末端へと融合させることもできる。第1及び第2の抗原結合部分のFab軽鎖の融合は、マッチしないFab重鎖とFab軽鎖との誤対合をさらに低減し、また、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の一部の発現に必要とされるプラスミドの数も低減する。
ある特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第1の抗原結合部分のFab軽鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab重鎖定常領域と共有し(すなわち、第1の抗原結合部分は、重鎖可変領域を、軽鎖可変領域で置きかえたクロスオーバーFab重鎖を含む)、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、Fcドメインサブユニットと共有するポリペプチド(VL(1)−CH1(1)−CH2−CH3(−CH4))と、第2の抗原結合部分のFab重鎖が、カルボキシ末端のペプチド結合を、Fcドメインサブユニットと共有するポリペプチド(VH(2)−CH1(2)−CH2−CH3(−CH4))とを含む。一部の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第1の抗原結合部分のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab軽鎖定常領域と共有するポリペプチド(VH(1)−CL(1))と、第2の抗原結合部分のFab軽鎖ポリペプチド(VL(2)−CL(2))とをさらに含む。ある特定の実施態様では、ポリペプチドを、例えば、ジスルフィド結合により、共有結合的に連結する。
代替的な実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第1の抗原結合部分のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab軽鎖定常領域と共有し(すなわち、第1の抗原結合部分は、重鎖定常領域を、軽鎖定常領域で置きかえたクロスオーバーFab重鎖を含み)、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、Fcドメインサブユニットと共有するポリペプチド(VH(1)−CL(1)−CH2−CH3(−CH4))と、第2の抗原結合部分のFab重鎖が、カルボキシ末端のペプチド結合を、Fcドメインサブユニットと共有するポリペプチド(VH(2)−CH1(2)−CH2−CH3(−CH4))とを含む。一部の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第1の抗原結合部分のFab軽鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab重鎖定常領域と共有するポリペプチド(VL(1)−CH1(1))と、第2の抗原結合部分のFab軽鎖ポリペプチド(VL(2)−CL(2))とをさらに含む。ある特定の実施態様では、ポリペプチドを、例えば、ジスルフィド結合により、共有結合的に連結する。
一部の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第1の抗原結合部分のFab軽鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab重鎖定常領域と共有し(すなわち、第1の抗原結合部分は、重鎖可変領域を、軽鎖可変領域で置きかえたクロスオーバーFab重鎖を含み)、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第2の抗原結合部分のFab重鎖と共有し、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、Fcドメインサブユニットと共有するポリペプチド(VL(1)−CH1(1)−VH(2)−CH1(2)−CH2−CH3(−CH4))を含む。他の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第1の抗原結合部分のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab軽鎖定常領域と共有し(すなわち、第1の抗原結合部分は、重鎖定常領域を、軽鎖定常領域で置きかえたクロスオーバーFab重鎖を含み)、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第2の抗原結合部分のFab重鎖と共有し、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、Fcドメインサブユニットと共有するポリペプチド(VH(1)−CL(1)−VH(2)−CH1(2)−CH2−CH3(−CH4))を含む。さらに他の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第2の抗原結合部分のFab重鎖が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab軽鎖可変領域と共有し、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab重鎖定常領域と共有し(すなわち、第1の抗原結合部分は、重鎖可変領域を、軽鎖可変領域で置きかえたクロスオーバーFab重鎖を含み)、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、Fcドメインサブユニットと共有するポリペプチド(VH(2)−CH1(2)−VL(1)−CH1(1)−CH2−CH3(−CH4))を含む。他の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第2の抗原結合部分のFab重鎖が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab重鎖可変領域と共有し、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab軽鎖定常領域と共有し(すなわち、第1の抗原結合部分は、重鎖定常領域を、軽鎖定常領域で置きかえたクロスオーバーFab重鎖を含み)、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、Fcドメインサブユニットと共有するポリペプチド(VH(2)−CH1(2)−VH(1)−CL(1)−CH2−CH3(−CH4))を含む。
これらの実施態様のうちのあるものでは、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第1の抗原結合部分のクロスオーバーFab軽鎖ポリペプチドであって、第1の抗原結合部分のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab軽鎖定常領域と共有するクロスオーバーFab軽鎖ポリペプチド(VH(1)−CL(1))と、第2の抗原結合部分のFab軽鎖ポリペプチド(VL(2)−CL(2))とをさらに含む。これらの実施態様のうちの他のものでは、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第1の抗原結合部分のFab軽鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab重鎖定常領域と共有するクロスオーバーFab軽鎖ポリペプチド(VL(1)−CH1(1))と、第2の抗原結合部分のFab軽鎖ポリペプチド(VL(2)−CL(2))とをさらに含む。これらの実施態様のうちのさらに他のものでは、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、第1の抗原結合部分のFab軽鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab重鎖定常領域と共有し、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第2の抗原結合部分のFab軽鎖ポリペプチドと共有するポリペプチド(VL(1)−CH1(1)−VL(2)−CL(2))、第1の抗原結合部分のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab軽鎖定常領域と共有し、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第2の抗原結合部分のFab軽鎖ポリペプチドと共有するポリペプチド(VH(1)−CL(1)−VL(2)−CL(2))、第2の抗原結合部分のFab軽鎖ポリペプチドが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab軽鎖可変領域と共有し、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab重鎖定常領域と共有するポリペプチド(VL(2)−CL(2)−VL(1)−CH1(1))、又は第2の抗原結合部分のFab軽鎖ポリペプチドが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab重鎖可変領域と共有し、これが、カルボキシ末端のペプチド結合を、第1の抗原結合部分のFab軽鎖定常領域と共有するポリペプチド(VL(2)−CL(2)−VH(1)−CL(1))をさらに含む。
これらの実施態様に従うプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子はさらに、(i)Fcドメインサブユニットのポリペプチド(CH2−CH3(−CH4))、又は(ii)第3の抗原結合部分のFab重鎖が、カルボキシ末端のペプチド結合を、Fcドメインサブユニットと共有するポリペプチド(VH(3)−CH1(3)−CH2−CH3(−CH4))、及び第3の抗原結合部分のFab軽鎖ポリペプチド(VL(3)−CL(3))も含みうる。ある特定の実施態様では、ポリペプチドを、例えば、ジスルフィド結合により、共有結合的に連結する。
上記の実施態様のうちのいずれかに従い、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の成分(例えば、抗原結合部分、Fcドメイン)を、直接融合させることもでき、多様なリンカー、特に、一又は複数のアミノ酸、典型的に、本明細書で記載されているか、又は当該技術分野で公知の、約2−20アミノ酸を含むペプチドリンカーを介して融合させることもできる。適切な非免疫原性ペプチドリンカーは、例えば、(GS)、(SG、(GS)、又はG(SG[式中、nは、一般に、1から10の間、典型的に、2から4の間の数である]のペプチドリンカーを含む。
Fcドメイン
プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のFcドメインは、免疫グロブリン分子の重鎖ドメインを含むポリペプチド鎖の対からなる。例えば、免疫グロブリンG(IgG)分子のFcドメインは、その各サブユニットが、CH2 IgG重鎖定常ドメイン及びCH3 IgG重鎖定常ドメインを含むダイマーである。Fcドメインの2つのサブユニットは、互いとの安定的な会合が可能である。一実施態様では、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、1つを超えないFcドメインを含む。
本発明に従う一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のFcドメインは、IgGのFcドメインである。特定の実施態様では、Fcドメインは、IgGのFcドメインである。別の実施態様では、Fcドメインは、IgGのFcドメインである。より具体的な実施態様では、Fcドメインは、S228位(カバット番号付け)におけるアミノ酸置換、特に、アミノ酸置換S228Pを含む、IgGのFcドメインである。このアミノ酸置換は、IgG抗体の、インビボにおけるFabアームの交換を低減する(Stubenrauchら, Drug Metabolism and Disposition 38, 84-91 (2010)を参照されたい)。さらなる特定の実施態様では、Fcドメインは、ヒトFcドメインである。
ヘテロ二量体化を促進するFcドメイン修飾
本発明に従うプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、Fcドメインの、2つのサブユニットのうちの一方又は他方へと融合させた、異なる抗原結合部分を含み、したがって、Fcドメインの2つのサブユニットは、典型的に、2つの同一でないポリペプチド鎖内に含まれる。これらのポリペプチドの組換え共発現、及びその後の二量体化は、2つのポリペプチドの、いくつかの可能な組合せをもたらす。したがって、組換え生成における、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の収量及び純度を改善するためには、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のFcドメイン内に、所望のポリペプチドの会合を促進する修飾を導入することが有利であろう。
したがって、特定の実施態様では、本発明に従うプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のFcドメインは、Fcドメインの、第1のサブユニットと、第2のサブユニットとの会合を促進する修飾を含む。ヒトIgGのFcドメインの、2つのサブユニットの間の、最も広範なタンパク質間相互作用の部位は、FcドメインのCH3ドメイン内の部位である。したがって、一実施態様では、前記修飾は、FcドメインのCH3ドメイン内にある。
具体的な実施態様では、前記修飾は、いわゆる、Fcドメインの、2つのサブユニットのうちの1つにおける「ノブ」修飾と、Fcドメインの、2つのサブユニットのうちの他の1つにおける「ホール」修飾とを含む、「ノブ・イントゥー・ホール」修飾である。
ノブ・イントゥー・ホール技術については、例えば、米国特許第5731168号;米国特許第7695936号;Ridgwayら,Prot Eng 9,617−621(1996)及びCarter, J Immunol Methods 248, 7−15 (2001)において記載されている。一般に、方法は、ヘテロダイマー形成を促進し、ホモダイマー形成を妨げるよう、突出部を、空隙内に配置しうるように、第1のポリペプチドの接触面に、突出部(「ノブ」)を導入し、第2のポリペプチドの接触面に、対応する空隙(「ホール」)を導入することを伴う。第1のポリペプチドの接触面に由来する、小型のアミノ酸側鎖を、大型の側鎖(例えば、チロシン又はトリプトファン)で置きかえることにより、突出部を構築する。大型のアミノ酸側鎖を、小型のアミノ酸側鎖(例えば、アラニン又はスレオニン)で置きかえることにより、突出部と同一又は同様のサイズの代補的空隙を、第2のポリペプチドの接触面内に創出する。
したがって、特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のFcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメイン内で、アミノ酸残基を、側鎖容積のより大きなアミノ酸残基で置きかえ、これにより、第1のサブユニットのCH3ドメイン内の突出部であって、第2のサブユニットのCH3ドメイン内の空隙内に配置可能な突出部を作出し、Fcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメイン内で、アミノ酸残基を、側鎖容積のより小さなアミノ酸残基で置きかえ、これにより、第2のサブユニットのCH3ドメイン内の空隙であって、その中に、第1のサブユニットのCH3ドメイン内の突出部が配置可能な空隙を作出する。
突出部及び空隙は、ポリペプチドをコードする核酸を変更することにより、例えば、部位特異的突然変異誘発、又はペプチド合成により施すことができる。
具体的な実施態様では、Fcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメイン内で、366位におけるスレオニン残基を、トリプトファン残基で置きかえ(T366W)、Fcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメイン内で、407位におけるチロシン残基を、バリン残基で置きかえる(Y407V)。一実施態様では、加えて、Fcドメインの第2のサブユニット内で、366位におけるスレオニン残基を、セリン残基で置きかえ(T366S)、368位におけるロイシン残基を、アラニン残基で置きかえる(L368A)。
なおさらなる実施態様では、加えて、Fcドメインの第1のサブユニット内で、354位におけるセリン残基を、システイン残基で置きかえ(S354C)、加えて、Fcドメインの第2のサブユニット内で、349位におけるチロシン残基を、システイン残基で置きかえる(Y349C)。これらの2つのシステイン残基の導入は、Fcドメインの2つのサブユニットの間のジスルフィド架橋の形成を結果としてもたらし、さらに、ダイマーを安定化させる(Carter, J Immunol Methods 248, 7-15 (2001))。
特定の実施態様では、CD3への結合が可能な抗原結合部分を、(任意選択的に、標的細胞抗原への結合が可能な抗原結合部分を介して)Fcドメインの第1のサブユニット(「ノブ」修飾を含む)へと融合させる。理論に束縛されることを望まずに述べると、CD3への結合が可能な抗原結合部分の、Fcドメインの、ノブを含有するサブユニットへの融合は、CD3への結合が可能な、2つの抗原結合部分を含む抗原結合分子の作出(ノブを含有する、2つのポリペプチドの立体的衝突)を(さらに)最小化するであろう。
代替的な実施態様では、Fcドメインの、第1のサブユニットと、第2のサブユニットとの会合を促進する修飾は、静電ステアリング効果を媒介する修飾であって、例えば、PCT公開WO2009/089004において記載されている修飾を含む。一般に、この方法は、ホモダイマー形成は、静電的に不適となるが、ヘテロ二量体化は、静電的に好適となるように、2つのFcドメインサブユニットの接触面における、一又は複数のアミノ酸残基の、荷電アミノ酸残基による置きかえを伴う。
Fc受容体の結合及び/又はエフェクター機能を低減するFcドメイン修飾
Fcドメインは、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子へと、標的組織内の良好な蓄積、及び好適な組織−血液分布比に寄与する、長い血清半減期を含む、好適な薬物動態特性を付与する。しかし、Fcドメインは、同時に、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の、好ましい抗原保有細胞ではなく、Fc受容体を発現させる細胞への、所望されない標的化ももたらしうる。さらに、Fc受容体シグナル伝達経路の共活性化は、抗原結合分子の、T細胞活性化特性、及び長い半減期と組み合わされると、全身投与されると、サイトカイン受容体の過剰な活性化と、重度の副作用とを結果としてもたらす、サイトカインの放出ももたらしうる。T細胞以外の(Fc受容体を保有する)免疫細胞の活性化はなお、例えば、NK細胞による、T細胞の潜在的な破壊のために、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の有効性さえ低減しうる。
したがって、特定の実施態様では、本発明に従うプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のFcドメインは、天然IgGのFcドメインと比較した、Fc受容体への結合親和性の低減及び/又はエフェクター機能の低減を呈示する。このような一実施態様では、Fcドメイン(又は前記Fcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子)は、天然IgGのFcドメイン(又は天然IgGのFcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子)と比較した、50%未満、好ましくは20%未満、より好ましくは10%未満であり、最も好ましくは5%未満の、Fc受容体への結合親和性、及び/又は天然IgGのFcドメイン(又は天然IgGのFcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子)と比較した、50%未満、好ましくは20%未満、より好ましくは10%未満であり、最も好ましくは5%未満のエフェクター機能を呈示する。一実施態様では、Fcドメイン(又は前記Fcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子)は、実質的に、Fc受容体に結合せず、かつ/又はエフェクター機能を誘導しない。特定の実施態様では、Fc受容体は、Fcγ受容体である。一実施態様では、Fc受容体は、ヒトFc受容体である。一実施態様では、Fc受容体は、活性化Fc受容体である。具体的な実施態様では、Fc受容体は、活性化ヒトFcγ受容体、より具体的には、ヒトFcγRIIIa、FcγRI、又はFcγRIIa、最も具体的には、ヒトFcγRIIIaである。一実施態様では、エフェクター機能は、CDC、ADCC、ADCP、及びサイトカイン分泌の群から選択される一又は複数である。特定の実施態様では、エフェクター機能は、ADCCである。一実施態様では、Fcドメインは、天然IgGのFcドメインと比較して、実質的に同様の、新生児Fc受容体(FcRn)に対する結合親和性を呈示する。FcRnへの、実質的に同様の結合は、Fcドメイン(又は前記Fcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子)が、天然IgGのFcドメイン(又は天然IgGのFcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子)の、FcRnに対する結合親和性の、約70%を超える、特に、約80%を超える、より特定すると、約90%を超える結合親和性を呈示する場合に達成される。
ある特定の実施態様では、操作されていないFcドメインと比較して、Fc受容体への結合親和性を低減し、かつ/又はエフェクター機能を低減するように、Fcドメインを操作する。特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のFcドメインは、Fcドメインの、Fc受容体に対する結合親和性及び/又はエフェクター機能を低減する、一又は複数のアミノ酸突然変異を含む。典型的に、一又は複数の、同じアミノ酸突然変異は、Fcドメインの、2つのサブユニットの各々に存在する。一実施態様では、アミノ酸突然変異は、Fcドメインの、Fc受容体に対する結合親和性を低減する。一実施態様では、アミノ酸突然変異は、Fcドメインの、Fc受容体に対する結合親和性を、少なくとも2分の1、少なくとも5分の1、又は少なくとも10分の1に低減する。Fcドメインの、Fc受容体に対する結合親和性を低減する、1つを超えるアミノ酸突然変異が存在する実施態様では、これらのアミノ酸突然変異の組合せは、Fcドメインの、Fc受容体に対する結合親和性を、少なくとも10分の1、少なくとも20分の1、又は少なくとも50分の1にも低減しうる。一実施態様では、操作Fcドメインを含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、操作されていないFcドメインを含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子と比較して、20%未満、特に、10%未満、より特定すると、5%未満の、Fc受容体への結合親和性を呈示する。特定の実施態様では、Fc受容体は、Fcγ受容体である。一部の実施態様では、Fc受容体は、ヒトFc受容体である。一部の実施態様では、Fc受容体は、活性化Fc受容体である。具体的な実施態様では、Fc受容体は、活性化ヒトFcγ受容体、より具体的には、ヒトFcγRIIIa、FcγRI、又はFcγRIIa、最も具体的には、ヒトFcγRIIIaである。好ましくは、これらの受容体の各々への結合を低減する。一部の実施態様では、補体成分への結合親和性、具体的には、C1qへの結合親和性もまた低減する。一実施態様では、新生児Fc受容体(FcRn)に対する結合親和性は低減しない。FcRnへの、実質的に同様の結合、すなわち、Fcドメインの、前記受容体に対する結合親和性の保存は、Fcドメイン(又は前記Fcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子)が、操作されていないFcドメインの形態(又は前記操作されていないFcドメインの形態を含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子)の、FcRnに対する結合親和性の、約70%を超える結合親和性を呈示する場合に達成される。本発明のFcドメイン、又は前記Fcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、このような親和性の、約80%を超え、なお約90%を超える結合親和性を呈示しうる。ある特定の実施態様では、操作されていないFcドメインと比較して、エフェクター機能を低減するように、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のFcドメインを操作する。エフェクター機能の低減は、以下:補体依存性細胞傷害(CDC)の低減、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)の低減、抗体依存性細胞の食作用(ADCP)の低減、サイトカイン分泌の低減、抗原提示細胞による免疫複合体に媒介される抗原の取込みの低減、NK細胞への結合の低減、マクロファージへの結合の低減、単球への結合の低減、多形核細胞への結合の低減、アポトーシスを誘導する直接的なシグナル伝達の低減、標的に結合した抗体の架橋の低減、樹状細胞の成熟の低減、又はT細胞プライミングの低減のうちの一又は複数を含みうるがこれらに限定されない。一実施態様では、エフェクター機能の低減は、CDCの低減、ADCCの低減、ADCPの低減、及びサイトカイン分泌の低減の群から選択される一又は複数である。特定の実施態様では、エフェクター機能の低減は、ADCCの低減である。一実施態様では、ADCCの低減は、操作されていないFcドメイン(又は操作されていないFcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子)により誘導されるADCCの20%未満である。
一実施態様では、Fcドメインの、Fc受容体に対する結合親和性及び/又はエフェクター機能を低減するアミノ酸突然変異は、アミノ酸置換である。一実施態様では、Fcドメインは、E233、L234、L235、N297、P331、及びP329の群から選択される位置におけるアミノ酸置換を含む。より具体的な実施態様では、Fcドメインは、L234、L235、及びP329の群から選択される位置におけるアミノ酸置換を含む。一部の実施態様では、Fcドメインは、アミノ酸置換L234A及びL235Aを含む。このような一実施態様では、Fcドメインは、IgGのFcドメイン、特に、ヒトIgGのFcドメインである。一実施態様では、Fcドメインは、P329位におけるアミノ酸置換を含む。より具体的な実施態様では、アミノ酸置換は、P329A又はP329G、特に、P329Gである。一実施態様では、Fcドメインは、P329位におけるアミノ酸置換を含み、E233、L234、L235、N297、及びP331から選択される位置におけるアミノ酸置換をさらに含む。より具体的な実施態様では、さらなるアミノ酸置換は、E233P、L234A、L235A、L235E、N297A、N297D、又はP331Sである。特定の実施態様では、Fcドメインは、P329、L234、及びL235位におけるアミノ酸置換を含む。より特定の実施態様では、Fcドメインは、アミノ酸突然変異である、L234A、L235A、及びP329G(「P329G LALA」)を含む。このような一実施態様では、Fcドメインは、IgGのFcドメイン、特に、ヒトIgGのFcドメインである。アミノ酸置換の組合せである「P329G LALA」とは、出典明示によりその全体において本明細書に援用される、PCT公開番号WO2012/130831において記載されている通り、ヒトIgGのFcドメインの、Fcγ受容体(並びに補体)への結合を、ほぼ完全に消失させる。国際公開第2012/130831号はまた、このような突然変異体Fcドメインを調製する方法、及びFc受容体の結合又はエフェクター機能など、その特性を決定するための方法についても記載する。
IgG抗体は、IgG抗体と比較した、Fc受容体への結合親和性の低減と、エフェクター機能の低減とを呈示する。よって、一部の実施態様では、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のFcドメインは、IgGのFcドメイン、特に、ヒトIgGのFcドメインである。一実施態様では、IgGのFcドメインは、S228位におけるアミノ酸置換、具体的には、アミノ酸置換S228Pを含む。Fc受容体への、その結合親和性、及び/又はそのエフェクター機能をさらに低減するために、一実施態様では、IgGのFcドメインは、L235位におけるアミノ酸置換、具体的には、アミノ酸置換L235Eを含む。別の実施態様では、IgGのFcドメインは、P329位におけるアミノ酸置換、具体的には、アミノ酸置換P329Gを含む。特定の実施態様では、IgGのFcドメインは、S228、L235及びP329位におけるアミノ酸置換、具体的には、アミノ酸置換S228P、L235E及びP329Gを含む。このようなIgGのFcドメイン突然変異体、及びそれらのFcγ受容体結合特性については、出典明示によりその全体において本明細書に援用される、PCT公開番号WO2012/130831において記載されている。
特定の実施態様では、天然IgGのFcドメインと比較した、Fc受容体への結合親和性の低減及び/又はエフェクター機能の低減を呈示するFcドメインは、アミノ酸置換L234A、L235Aと、任意選択的に、P329Gとを含むヒトIgGのFcドメイン、又はアミノ酸置換S228P、L235Eと、任意選択的に、P329Gとを含むヒトIgGのFcドメインである。
ある特定の実施態様では、FcドメインのN−グリコシル化を、消失させている。このような一実施態様では、Fcドメインは、N297位におけるアミノ酸突然変異、特に、アスパラギンをアラニンで置きかえる(N297A)又はアスパラギン酸で置きかえる(N297D)アミノ酸置換を含む。
本明細書上記及びPCT公開番号WO2012/130831に記載されているFcドメインに加えて、Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低減したFcドメインはまた、Fcドメイン残基である、238、265、269、270、297、327、及び329のうちの一又は複数を置換したFcドメイン(米国特許第6737056号)も含む。このようなFc突然変異体は、2つ又はこれを超えるアミノ酸位置である、265、269、270、297、及び327位において置換したFc突然変異体であって、残基である、265及び297を、アラニンへと置換した、いわゆる、「DANA」Fc突然変異体を含むFc突然変異体(米国特許第7332581号)を含む。
突然変異体Fcドメインは、当該技術分野で周知の遺伝子法又は化学法を使用する、アミノ酸の欠失、置換、挿入、又は修飾により調製することができる。遺伝子法は、コードDNA配列の部位特異的突然変異誘発、PCR、遺伝子合成などを含みうる。適正なヌクレオチド変化は、例えば、シーケンシングにより検証することができる。
Fc受容体への結合は、BIAcore計器(GE Healthcare)などの標準的な計測、及び組換え発現などにより得られうるFc受容体を使用して、例えば、ELISA、又は表面プラズモン共鳴(SPR)により容易に決定することができる。本明細書では、適切なこのような結合アッセイについて記載する。代替的に、Fcドメイン、又は細胞活性化二重特異性抗原結合分子であって、Fcドメインを含む二重特異性抗原結合分子の、Fc受容体に対する結合親和性は、FcγIIIa受容体を発現させるヒトNK細胞など、特定のFc受容体を発現させることが公知の細胞株を使用して査定することができる。
Fcドメイン、又はFcドメインを含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のエフェクター機能は、当該技術分野で公知の方法により測定することができる。本明細書では、ADCCを測定するのに適するアッセイについて記載する。目的の分子のADCC活性について評価するインビトロアッセイの他の例については、米国特許第5500362号;Hellstromら,Proc Natl Acad Sci USA 83,7059−7063(1986)及びHellstromら,Proc Natl Acad Sci USA 82,1499−1502(1985);米国特許第5821337号;Bruggemannら,J Exp Med 166,1351−1361(1987)において記載されている。代替的に、非放射性アッセイ法も、援用することができる(例えば、フローサイトメトリーのためのACTI(商標)非放射性細胞傷害アッセイ(CellTechnology,Inc.、Mountain View、CA);及びCytoTox 96(登録商標)非放射性細胞傷害アッセイ(Promega、Madison、WI)を参照されたい)。このようなアッセイに有用なエフェクター細胞は、末梢血単核細胞(PBMC)及びナチュラルキラー(NK)細胞を含む。代替的に、又は加えて、目的の分子のADCC活性は、例えば、Clynesら,Proc Natl Acad Sci USA 95,652−656(1998)において開示されている動物モデルなどの動物モデルにおいて、インビボで評価することができる。
一部の実施態様では、Fcドメインの、補体成分への結合、具体的には、C1qへの結合を低減する。したがって、エフェクター機能を低減するように、Fcドメインを操作する、一部の実施態様では、前記エフェクター機能の低減は、CDCの低減を含む。C1q結合アッセイを実行して、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が、C1qに結合することが可能であり、したがって、CDC活性を有するのかどうかを決定することができる。例えば、国際公開第2006/029879号及び国際公開第2005/100402号における、C1q結合ELISA及びC3c結合ELISAを参照されたい。補体の活性化について評価するために、CDCアッセイを実施することができる(例えば、Gazzano-Santoroら, J Immunol Methods 202, 163 (1996); Craggら, Blood 101, 1045-1052 (2003); 並びにCragg及びGlennie, Blood 103, 2738-2743 (2004)を参照されたい)。
抗原結合部分
本発明の抗原結合分子は、二重特異性である、すなわち、2つの異なる抗原決定基への特異的結合が可能な、少なくとも2つの抗原結合部分を含む。本発明に従い、抗原結合部分は、Fab分子(すなわち、各々が可変領域及び定常領域を含む、重鎖及び軽鎖から構成される抗原結合ドメイン)である。一実施態様では、前記Fab分子は、ヒトFab分子である。別の実施態様では、前記Fab分子は、ヒト化Fab分子である。さらに別の実施態様では、前記Fab分子は、ヒト重鎖定常領域及びヒト軽鎖定常領域を含む。
抗原結合部分のうちの少なくとも1つは、クロスオーバーFab分子である。このような修飾は、異なるFab分子に由来する重鎖及び軽鎖の誤対合を防止し、これにより、組換え生成における、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の収量及び純度を改善する。本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子に有用な、特定のクロスオーバーFab分子では、Fab軽鎖の定常領域と、Fab重鎖の定常領域とを交換する。本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子に有用な、別のクロスオーバーFab分子では、Fab軽鎖の可変領域と、Fab重鎖の可変領域とを交換する。
本発明に従う特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、標的細胞抗原、特に、腫瘍細胞抗原、及びCD3への同時的な結合が可能である。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、標的細胞抗原及びCD3への同時的な結合により、T細胞と、標的細胞とを架橋することが可能である。なおより特定の実施態様では、このような同時的な結合は、標的細胞、特に、腫瘍細胞の溶解を結果としてもたらす。一実施態様では、このような同時的な結合は、T細胞の活性化を結果としてもたらす。他の実施態様では、このような同時的な結合は、Tリンパ球、特に、細胞傷害性Tリンパ球の細胞応答であって、増殖、分化、サイトカイン分泌、細胞傷害性エフェクター分子の放出、細胞傷害活性、及び活性化マーカーの発現の群から選択される細胞応答を結果としてもたらす。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の、CD3への、標的細胞抗原への同時的な結合を伴わない結合は、T細胞の活性化を結果としてもたらさない。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、T細胞の細胞傷害活性を、標的細胞へと再指向させることが可能である。特定の実施態様では、前記再指向は、標的細胞による、MHC媒介性のペプチド抗原の提示及び/又はT細胞の特異性に依存しない。
特に、本発明の実施態様のうちのいずれかに従うT細胞は、細胞傷害性T細胞である。一部の実施態様では、T細胞は、CD4T細胞又はCD8T細胞、特に、CD8T細胞である。
CD3結合部分
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、CD3への結合が可能な、少なくとも1つの抗原結合部分(本明細書ではまた、「CD3抗原結合部分」又は「第1の抗原結合部分」とも称する)を含む。特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、CD3への特異的結合が可能な、1つを超えない抗原結合部分を含む。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、CD3への一価の結合をもたらす。CD3抗原結合分子は、クロスオーバーFab分子、すなわち、Fab重鎖及びFab軽鎖の可変領域又は定常領域を交換したFab分子である。プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子内に、標的細胞抗原への特異的結合が可能な、1つを超える抗原結合部分が含まれる実施態様では、CD3への特異的結合が可能な抗原結合部分は、好ましくは、クロスオーバーFab分子であり、標的細胞抗原への特異的結合が可能な抗原結合部分は、従来型のFab分子である。
特定の実施態様では、CD3は、ヒトCD3又はカニクイザルCD3、最も特定すると、ヒトCD3である。特定の実施態様では、CD3抗原結合部分は、ヒトCD3及びカニクイザルCD3に対して交差反応性である(すなわち、これらに特異的に結合する)。一部の実施態様では、第1の抗原結合部分は、CD3のエプシロンサブユニットへの特異的結合が可能である。
CD3抗原結合部分は、配列番号11、配列番号12、及び配列番号13からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、CD3抗原結合部分は、配列番号11の重鎖CDR1、配列番号12の重鎖CDR2、配列番号13の重鎖CDR3、配列番号17の軽鎖CDR1、配列番号18の軽鎖CDR2、及び配列番号19の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、CD3抗原結合部分は、配列番号44の重鎖CDR1、配列番号45の重鎖CDR2、配列番号46の重鎖CDR3、配列番号17の軽鎖CDR1、配列番号18の軽鎖CDR2、及び配列番号19の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、CD3抗原結合部分は、配列番号43のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一な重鎖可変領域配列と、配列番号55のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一な軽鎖可変領域配列とを含む。
一実施態様では、CD3抗原結合部分は、配列番号43のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、CD3抗原結合部分は、配列番号43の重鎖可変領域配列と、配列番号55の軽鎖可変領域配列とを含む。
標的細胞抗原結合部分
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、標的細胞抗原への結合が可能な、少なくとも1つの抗原結合部分(本明細書ではまた、「標的細胞抗原結合部分」又は「第2の」抗原結合部分若しくは「第3の」抗原結合部分とも称する)を含む。ある特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、標的細胞抗原への結合が可能な、2つの抗原結合部分を含む。特定のこのような実施態様では、これらの抗原結合部分の各々は、同じ抗原決定基に特異的に結合する。なおより特定の実施態様では、これらの抗原結合部分の全ては、同一である。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、標的細胞抗原への特異的結合が可能な免疫グロブリン分子を含む。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、標的細胞抗原への結合が可能な、2つを超えない抗原結合部分を含む。
好ましい実施態様では、標的細胞抗原結合部分は、特異的抗原決定基に結合し、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を、標的部位、例えば、抗原決定基を保有する、特異的種類の腫瘍細胞へと方向付けることが可能なFab分子、特に、従来型のFab分子である。
ある特定の実施態様では、標的細胞抗原結合部分は、細胞表面抗原に特異的に結合する。特定の実施態様では、標的細胞抗原結合部分は、標的細胞の表面上の葉酸受容体1(FolR1)に特異的に結合する。別のこのような具体的な実施態様では、標的細胞抗原結合部分は、上皮増殖因子受容体(EGFR)、具体的には、ヒトEGFR、例えば、HER1に特異的に結合する。別のこのような具体的な実施態様では、標的細胞抗原結合部分は、HER2に特異的に結合する。別のこのような具体的な実施態様では、標的細胞抗原結合部分は、メソテリン、具体的には、ヒトメソテリンに特異的に結合する。
ある特定の実施態様では、標的細胞抗原結合部分を、腫瘍細胞上又はウイルス感染細胞上に提示される抗原など、病理学的状態と関連する抗原へと方向付ける。適切な抗原は、例えば、細胞表面受容体であるがこれらに限定されない細胞表面抗原である。特定の実施態様では、抗原は、ヒト抗原である。具体的な実施態様では、標的細胞抗原は、葉酸受容体1(FolR1)及び上皮増殖因子受容体(EGFR)、具体的には、ヒトEGFR、例えば、HER1から選択される。さらなる具体的な実施態様では、標的細胞抗原は、HER2である。さらなる具体的な実施態様では、標的細胞抗原は、メソテリンである。
一部の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む。一実施態様では、HER1に特異的な抗原結合部分は、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、HER1に特異的な抗原結合部分は、配列番号56の重鎖CDR1、配列番号57の重鎖CDR2、配列番号58の重鎖CDR3、配列番号59の軽鎖CDR1、配列番号60の軽鎖CDR2、及び配列番号61の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、HER1に特異的な抗原結合部分は、PCT出願公開番号WO2006/082515において開示されている、抗HER1抗体の重鎖CDR配列及び軽鎖CDR配列を含む。
一実施態様では、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号32と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号33と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号34と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列のうちの少なくとも1つを含む。一実施態様では、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号32のポリペプチド配列、配列番号33のポリペプチド配列、及び配列番号34のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号41又は42と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号41又は42のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号48の重鎖CDR1、配列番号49の重鎖CDR2、配列番号50の重鎖CDR3、配列番号51の軽鎖CDR1、配列番号52の軽鎖CDR2、及び配列番号53の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプHER1 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号48の重鎖CDR1、配列番号49の重鎖CDR2、配列番号50の重鎖CDR3、配列番号51の軽鎖CDR1、配列番号52の軽鎖CDR2、及び配列番号53の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号35と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むリンカーをさらに含む。
一実施態様では、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号36、37、38、39、40、97、98、99、100、101、102、103、104、105、又は106と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むプロテアーゼ認識部位を有するリンカーをさらに含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号36、37、38、39、40、97、98、99、100、101、102、103、104、105、又は106のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号36のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号97のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、HER1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号7、8、9、10、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、又は96と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むリンカーをさらに含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7、8、9、10、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、又は96のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号86のポリペプチド配列を含む。
一部の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、HER2に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む。一実施態様では、HER2に特異的な抗原結合部分は、配列番号142、配列番号143、及び配列番号144からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号148、配列番号149、及び配列番号150の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。さらなる一実施態様では、HER2に特異的な抗原結合部分は、配列番号145、配列番号146、及び配列番号147からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号148、配列番号149、及び配列番号150の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、HER2に特異的な抗原結合部分は、配列番号142の重鎖CDR1、配列番号143の重鎖CDR2、配列番号144の重鎖CDR3、配列番号148の軽鎖CDR1、配列番号149の軽鎖CDR2、及び配列番号150の軽鎖CDR3を含む。さらなる実施態様では、HER2に特異的な抗原結合部分は、配列番号145の重鎖CDR1、配列番号146の重鎖CDR2、配列番号147の重鎖CDR3、配列番号148の軽鎖CDR1、配列番号149の軽鎖CDR2、及び配列番号150の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、HER2に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、HER2に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、HER2に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号41又は42と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号41又は42のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、HER2に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号48の重鎖CDR1、配列番号49の重鎖CDR2、配列番号50の重鎖CDR3、配列番号51の軽鎖CDR1、配列番号52の軽鎖CDR2、及び配列番号53の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプHER2 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号48の重鎖CDR1、配列番号49の重鎖CDR2、配列番号50の重鎖CDR3、配列番号51の軽鎖CDR1、配列番号52の軽鎖CDR2、及び配列番号53の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、HER2に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号35と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むリンカーをさらに含む。
一実施態様では、HER2に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号36、37、38、39、40、97、98、99、100、101、102、103、104、105、又は106と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むプロテアーゼ認識部位を有するリンカーをさらに含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号36、37、38、39、40、97、98、99、100、101、102、103、104、105、又は106のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号36のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号97のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、HER2に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号7、8、9、10、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、又は96と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むリンカーをさらに含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7、8、9、10、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、又は96のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号86のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号132と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号136と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号81と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号133と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号132のポリペプチド配列、配列番号136のポリペプチド配列、配列番号81のポリペプチド配列、及び配列番号133のポリペプチド配列を含む。
特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、FolR1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む。一実施態様では、FolR1は、ヒトFolR1である。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、ヒトFolR1に特異的であり、ヒトFolR2又はヒトFolR3に結合しない、少なくとも1つの抗原結合部分を含む。一実施態様では、FolR1に特異的な抗原結合部分は、配列番号14、配列番号15、及び配列番号16からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、FolR1に特異的な抗原結合部分は、配列番号14の重鎖CDR1、配列番号15の重鎖CDR2、配列番号16の重鎖CDR3、配列番号17の軽鎖CDR1、配列番号18の軽鎖CDR2、及び配列番号19の軽鎖CDR3を含む。
さらなる実施態様では、FolR1に特異的な抗原結合部分は、配列番号47と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一な重鎖可変領域配列、及び配列番号55と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一な軽鎖可変領域配列、又は機能性を保持するこれらの変異体を含む。
一実施態様では、FolR1に特異的な抗原結合部分は、配列番号47のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、FolR1に特異的な抗原結合部分は、配列番号151、配列番号152、及び配列番号153からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号154、配列番号155、及び配列番号156の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、FolR1に特異的な抗原結合部分は、配列番号151の重鎖CDR1、配列番号152の重鎖CDR2、配列番号153の重鎖CDR3、配列番号154の軽鎖CDR1、配列番号155の軽鎖CDR2、及び配列番号156の軽鎖CDR3を含む。
さらなる実施態様では、FolR1に特異的な抗原結合部分は、配列番号157と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一な重鎖可変領域配列、及び配列番号158と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一な軽鎖可変領域配列、又は機能性を保持するこれらの変異体を含む。
一実施態様では、FolR1に特異的な抗原結合部分は、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号158のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号2と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号1と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号2のポリペプチド配列、及び配列番号1のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、FolR1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、FolR1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、FolR1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号41又は42と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号41又は42のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、FolR1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号36、37、38、39、40、97、98、99、100、101、102、103、104、105、又は106と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むプロテアーゼ認識部位を有するリンカーをさらに含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号36、37、38、39、40、97、98、99、100、101、102、103、104、105、又は106のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号36のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号97のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、ForR1に特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号7、8、9、10、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、又は96と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むリンカーをさらに含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7、8、9、10、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、又は96のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号86のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号1と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号3と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号72と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号1と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号3と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号72と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号1と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号3と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号85と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号1と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号3と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号73と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号74と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号1のポリペプチド配列、配列番号3のポリペプチド配列、及び配列番号72のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号1のポリペプチド配列、配列番号3のポリペプチド配列、及び配列番号85のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号1のポリペプチド配列、配列番号3のポリペプチド配列、配列番号73のポリペプチド配列、及び配列番号74のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号137と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号139と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号81と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号138と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号137のポリペプチド配列、配列番号139のポリペプチド配列、配列番号81のポリペプチド配列、及び配列番号138のポリペプチド配列を含む。
特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、メソテリンに特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む。一実施態様では、メソテリンは、ヒトメソテリンである。一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、ヒトメソテリンに特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む。一実施態様では、メソテリンに特異的な抗原結合部分は、配列番号107、配列番号108、及び配列番号109からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号110、配列番号111、及び配列番号112の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む。
一実施態様では、メソテリンに特異的な抗原結合部分は、配列番号107の重鎖CDR1、配列番号108の重鎖CDR2、配列番号109の重鎖CDR3、配列番号110の軽鎖CDR1、配列番号111の軽鎖CDR2、及び配列番号112の軽鎖CDR3を含む。
さらなる実施態様では、メソテリンに特異的な抗原結合部分は、配列番号113と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一な重鎖可変領域配列、及び配列番号114と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一な軽鎖可変領域配列、又は機能性を保持するこれらの変異体を含む。
一実施態様では、メソテリンに特異的な抗原結合部分は、配列番号113のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号114のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、メソテリンに特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、メソテリンに特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、メソテリンに特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号41又は42と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む抗イデオタイプCD3 scFvをさらに含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号41又は42のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、メソテリンに特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号36、37、38、39、40、97、98、99、100、101、102、103、104、105、又は106と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むプロテアーゼ認識部位を有するリンカーをさらに含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号36、37、38、39、40、97、98、99、100、101、102、103、104、105、又は106のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号36のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号97のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、メソテリンに特異的な、少なくとも1つの抗原結合部分を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号7、8、9、10、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、又は96と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含むリンカーをさらに含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7、8、9、10、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、又は96のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号86のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号77と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号78と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号81と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号82と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号76と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号77と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号78と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号79と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号77のポリペプチド配列、配列番号78のポリペプチド配列、配列番号81のポリペプチド配列、及び配列番号82のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号76のポリペプチド配列、配列番号77のポリペプチド配列、配列番号78のポリペプチド配列、及び配列番号79のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号76と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号77と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号78と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号81と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号77と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号78と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、配列番号81と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列、及び配列番号84と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号76のポリペプチド配列、配列番号77のポリペプチド配列、配列番号78のポリペプチド配列、及び配列番号81のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、T細胞活性化二重特異性分子は、配列番号77のポリペプチド配列、配列番号78のポリペプチド配列、配列番号81のポリペプチド配列、及び配列番号84のポリペプチド配列を含む。
マスキング部分
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、少なくとも1つのマスキング部分を含む。他者らは、結合部分により認識される抗原の断片で結合部分をキャッピングすることにより、抗体の結合をマスキングしようと試みてきた(例えば、国際公開第2013128194号)。この手法は、いくつかの限界を有する。例えば、抗原の使用は、結合部分の親和性の低減において、それほどの柔軟性を可能としない。これは、親和性が、抗原マスクにより信頼できる形でマスキングするのに十分な程度に大きくなければならないためである。また、解離された抗原は、インビボにおいて、そのコグネイト受容体に潜在的に結合し、これらと相互作用し、このような受容体を発現させる細胞へと、所望されないシグナルを引き起こす場合もあろう。これに対し、本明細書で記載される手法は、抗イデオタイプ抗体又はその断片を、マスクとして使用する。有効なマスキング部分をデザインするための、2つの相反する検討事項は、1.マスキングの有効性、及び2.マスキングの可逆性である。親和性が小さ過ぎれば、マスキングは、無効となろう。しかし、親和性が大き過ぎれば、マスキング工程は、たやすく可逆的とはなりえないだろう。高親和性の抗イデオタイプマスクがよりよく作用するのか、低親和性の抗イデオタイプマスクがよりよく作用するのかは、予測できなかった。本明細書で記載される通り、高親和性マスキング部分の方が、抗原結合部位のマスキングにおいて、全般的により高性能であり、同時に、分子を活性化させるために有効に除去することができた。一実施態様では、抗イデオタイプマスクは、1−8nMのKDを有する。一実施態様では、抗イデオタイプマスクは、37℃で、2nMのKDを有する。具体的な一実施態様では、マスキング部分は、CD3、例えば、ヒトCD3への特異的結合が可能な、第1の抗原結合部分のイデオタイプを認識する。具体的な一実施態様では、マスキング部分は、標的細胞抗原への結合が可能な、第2の抗原結合部分のイデオタイプを認識する。
一実施態様では、マスキング部分は、CD3結合部分をマスキングし、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む。一実施態様では、マスキング部分は、配列番号20の重鎖CDR1、配列番号21の重鎖CDR2、配列番号22の重鎖CDR3、配列番号23の軽鎖CDR1、配列番号24の軽鎖CDR2、及び配列番号25の軽鎖CDR3を含む。
一実施態様では、マスキング部分は、CD3結合部分をマスキングし、配列番号41と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。一実施態様では、マスキング部分は、CD3結合部分をマスキングし、配列番号41のポリペプチド配列を含む。
好ましい一実施態様では、マスキング部分は、CD3結合部分をマスキングし、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む。一実施態様では、マスキング部分は、配列番号26の重鎖CDR1、配列番号27の重鎖CDR2、配列番号28の重鎖CDR3、配列番号29の軽鎖CDR1、配列番号30の軽鎖CDR2、及び配列番号31の軽鎖CDR3を含む。一実施態様では、マスキング部分は、CD3結合部分をマスキングし、配列番号42と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリペプチド配列を含む。好ましい一実施態様では、マスキング部分は、CD3結合部分をマスキングし、配列番号42のポリペプチド配列を含む。
一実施態様では、マスキング部分は、HER1結合部分をマスキングし、配列番号48の重鎖CDR1、配列番号49の重鎖CDR2、配列番号50の重鎖CDR3、配列番号51の軽鎖CDR1、配列番号52の軽鎖CDR2、及び配列番号53の軽鎖CDR3のうちの少なくとも1つを含む。一実施態様では、抗イデオタイプscFvは、配列番号48の重鎖CDR1、配列番号49の重鎖CDR2、配列番号50の重鎖CDR3、配列番号51の軽鎖CDR1、配列番号52の軽鎖CDR2、及び配列番号53の軽鎖CDR3を含む。
一態様では、本発明は、分子の抗原結合部位の、抗原への結合を可逆的に隠蔽するための、イデオタイプ特異的ポリペプチドに関する。一実施態様では、本発明は、分子の抗CD3抗原結合部位を可逆的に隠蔽するための、イデオタイプ特異的ポリペプチドに関する。抗CD3抗原結合部位を可逆的に隠蔽するための、このようなイデオタイプ特異的ポリペプチドは、抗CD3抗原結合部位のイデオタイプへの特異的結合が可能であり、これにより、抗CD3抗原結合部位の、CD3への結合を低減するか、又は失効させることが可能でなければならない。一実施態様では、本発明は、分子の抗HER1抗原結合部位を可逆的に隠蔽するための、イデオタイプ特異的ポリペプチドに関する。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、抗イデオタイプscFvである。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、リンカーを介して分子と共有結合している。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、1つを超えるリンカーを介して分子と共有結合している。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、2つのリンカーを介して分子と共有結合している。一実施態様では、リンカーは、ペプチドリンカーである。一実施態様では、リンカーは、プロテアーゼ切断型リンカーである。一実施態様では、リンカーは、配列番号7、8、9、又は10の配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7、8、9、10、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、又は96の配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号7のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、リンカーは、配列番号86のポリペプチド配列を含む。一実施態様では、ペプチドリンカーは、少なくとも1つのプロテアーゼ認識部位を含む。一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、配列番号36、37、38、39、40、97、98、99、100、101、102、103、104、105、又は106のポリペプチド配列を含む。好ましい一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、プロテアーゼ認識配列RQARVVNG(配列番号36)を含む。さらなる実施態様では、リンカーは、1つを超えるプロテアーゼ認識部位を含む。好ましい一実施態様では、プロテアーゼ認識部位は、プロテアーゼ認識配列VHMPLGFLGPRQARVVNG(配列番号97)を含む。一実施態様では、プロテアーゼは、メタロプロテイナーゼ、例えば、マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)1−28、並びにディスインテグリン及びメタロプロテイナーゼ(ADAM)2、7−12、15、17−23、28−30、及び33、セリンプロテアーゼ、例えば、ウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子及びマトリプターゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、並びにカテプシンプロテアーゼからなる群から選択される。具体的な一実施態様では、プロテアーゼは、MMP9又はMMP2である。さらなる具体的な実施態様では、プロテアーゼは、マトリプターゼである。
一実施態様では、抗CD3抗原結合部位を含む分子は、T細胞活性化二重特異性分子である。特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;及びPYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む。特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及びQHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む。特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;PYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域と;RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及びQHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;及びGITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む。特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及びQHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む。特定の一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域と;RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及びQHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、配列番号48のアミノ酸配列である、重鎖相補性決定領域(CDR H)1;配列番号49のアミノ酸配列であるCDR H2;及び配列番号50のアミノ酸配列であるCDR H3のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、配列番号51のアミノ酸配列である、軽鎖相補性決定領域(CDR L)1;配列番号52のアミノ酸配列であるCDR L2;及び配列番号53のアミノ酸配列であるCDR L3のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、配列番号48のアミノ酸配列である、重鎖相補性決定領域(CDR H)1;配列番号49のアミノ酸配列であるCDR H2;及び配列番号50のアミノ酸配列であるCDR H3を含む重鎖可変領域と、配列番号51のアミノ酸配列である、軽鎖相補性決定領域(CDR L)1;配列番号52のアミノ酸配列であるCDR L2;及び配列番号53のアミノ酸配列であるCDR L3を含む軽鎖可変領域とを含む。
ポリヌクレオチド
本発明はまた、本明細書で記載される、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。一部の実施態様では、前記断片は、抗原結合断片である。
本発明のポリヌクレオチドは、配列番号62−71又はそれらの機能的断片若しくは変異体を含む配列番号に明示された配列と、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリヌクレオチドを含む。本発明のポリヌクレオチドはさらに、それらの機能的断片又は変異体を含む配列番号117−131に明示された配列と、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリヌクレオチドも含む。本発明のポリヌクレオチドはさらに、それらの機能的断片又は変異体を含む配列番号162−170に明示された配列と、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なポリヌクレオチドも含む。
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子をコードするポリヌクレオチドは、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の全体をコードする単一のポリヌクレオチドとして発現させることもでき、共発現する複数の(例えば、2つ又はこれを超える)ポリヌクレオチドとして発現させることもできる。共発現するポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドは、機能的なプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を形成するように、例えば、ジスルフィド結合又は他の手段を介して会合しうる。例えば、抗原結合部分の軽鎖部分は、抗原結合部分の重鎖部分と、Fcドメインサブユニットと、任意選択的に、別の抗原結合部分(の一部)を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の部分に由来する、別個のポリヌクレオチドによりコードされうる。共発現させると、重鎖ポリペプチドは、軽鎖ポリペプチドと会合して、抗原結合部分を形成するであろう。別の例では、2つのFcドメインサブユニットのうちの一方と、任意選択的に、一又は複数の抗原結合部分(の一部)を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の部分は、2つのFcドメインサブユニットのうちの他方と、任意選択的に、抗原結合部分(の一部)を含む、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の部分に由来する、別個のポリヌクレオチドによりコードされうるであろう。共発現させると、Fcドメインサブユニットは、会合して、Fcドメインを形成するであろう。
一部の実施態様では、単離ポリヌクレオチドは、本明細書で記載される、本発明に従うプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の全体をコードする。他の実施態様では、単離ポリヌクレオチドは、本明細書で記載される、本発明に従うプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子に含まれるポリペプチドをコードする。
別の実施態様では、本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、可変領域配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。別の実施態様では、本発明は、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、47、又は55に示すポリペプチド配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。別の実施態様では、本発明は、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、47、55、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85に示すポリペプチド配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。別の実施態様では、本発明は、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、47、55、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、132、133、134、135、136、137、138、139、140、又は141に示すポリペプチド配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。別の実施態様では、本発明はさらに、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号62、63、64、65、66、67、68、69、70、又は71に示されるヌクレオチド配列と、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一な配列を含むポリヌクレオチドも対象とする。別の実施態様では、本発明はさらに、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、又は131に示されるヌクレオチド配列と、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一な配列を含むポリヌクレオチドも対象とする。別の実施態様では、本発明はさらに、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、162、163、164、165、166、167、168、169、又は170に示されるヌクレオチド配列と、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一な配列を含むポリヌクレオチドも対象とする。別の実施態様では、本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号62、63、64、65、66、67、68、69、70、又は71に示される核酸配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。別の実施態様では、本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、又は131に示される核酸配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。別の実施態様では、本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、162、163、164、165、166、167、168、169、又は170に示される核酸配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。別の実施態様では、本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号43、47、又は55のアミノ酸配列と、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一な可変領域配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、保存的アミノ酸置換を伴う、配列番号43、47、又は55の可変領域配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを包摂する。
別の実施態様では、本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号43、47、55、113、114、115、又は116のアミノ酸配列と、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一な可変領域配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、保存的アミノ酸置換を伴う、配列番号43、47、55、113、114、115、又は116の可変領域配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを包摂する。
別の実施態様では、本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号43、47、55、113、114、115、116、157、158、159、160、又は161のアミノ酸配列と、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一な可変領域配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを対象とする。本発明は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、保存的アミノ酸置換を伴う、配列番号43、47、55、113、114、115、116、157、158、159、160、又は161の可変領域配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドを包摂する。
ある特定の実施態様では、ポリヌクレオチド又は核酸は、DNAである。他の実施態様では、本発明のポリヌクレオチドは、例えば、メッセンジャーRNA(mRNA)の形態のRNAである。本発明のRNAは、一本鎖の場合もあり、二本鎖の場合もある。
本発明はまた、本明細書で記載されるイデオタイプ特異的ポリペプチド又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。一部の実施態様では、前記断片は、イデオタイプ結合、すなわち、抗イデオタイプ特異的抗体又はその断片である。一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、抗イデオタイプscFvである。
本発明はまた、本発明のイデオタイプ特異的ポリペプチド又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、配列番号20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、48、49、50、51、52、及び53のうちの一又は複数のポリペプチド配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドも包摂する。本発明はまた、本発明のイデオタイプ特異的ポリペプチド又はその断片をコードする単離ポリヌクレオチドであって、保存的アミノ酸置換を伴う、配列番号20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、48、49、50、51、52、及び53のうちの一又は複数のポリペプチド配列をコードする配列を含むポリヌクレオチドも包摂する。
本発明のイデオタイプ特異的ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、イデオタイプ特異的ポリペプチドの全体をコードする単一のポリヌクレオチドとして発現させることもでき、共発現する複数の(例えば、2つ又はこれを超える)ポリヌクレオチドとして発現させることもできる。共発現するポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドは、機能的なイデオタイプ特異的ポリペプチド、例えば、マスキング部分を形成するように、例えば、ジスルフィド結合又は他の手段を介して会合しうる。例えば、一実施態様では、イデオタイプ特異的ポリペプチドは、抗イデオタイプscFv(単鎖可変断片)であり、この場合、抗イデオタイプscFvの軽鎖可変部分は、抗イデオタイプscFvの重鎖可変部分を含む抗イデオタイプscFvの部分に由来する別個のポリヌクレオチドによりコードされうる。共発現すると、重鎖ポリペプチドは、軽鎖ポリペプチドと会合して、抗イデオタイプscFvを形成するであろう。一部の実施態様では、単離ポリヌクレオチドは、本明細書で記載される、本発明に従うイデオタイプ特異的ポリペプチドをコードする。
ある特定の実施態様では、ポリヌクレオチド又は核酸は、DNAである。他の実施態様では、本発明のポリヌクレオチドは、例えば、メッセンジャーRNA(mRNA)の形態のRNAである。本発明のRNAは、一本鎖の場合もあり、二本鎖の場合もある。
組換え法
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、例えば、固体相ペプチド合成(例えば、メリフィールド固体相合成)又は組換え生成により得ることができる。組換え生成のためには、例えば、上記で記載したように、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子(断片)をコードする、一又は複数のポリヌクレオチドを、宿主細胞内の、さらなるクローニング及び/又は発現のために、一又は複数のベクターへと単離及び挿入する。このようなポリヌクレオチドは、従来の手順を使用して、たやすく単離及びシーケンシングすることができる。一実施態様では、本発明のポリヌクレオチドのうちの一又は複数を含むベクター、好ましくは、発現ベクターを提供する。当業者に周知の方法を使用して、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子(断片)のコード配列を、適切な転写/翻訳制御シグナルと共に含有する発現ベクターを構築することができる。これらの方法は、インビトロ組換えDNA法、合成法、及びインビボにおける組換え/遺伝子組換えを含む。例えば、Maniatisら,MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL,Cold Spring Harbor Laboratory,N.Y.(1989);及びAusubelら,CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY,Greene Publishing Associates and Wiley Interscience,N.Y(1989)において記載されている技法を参照されたい。発現ベクターは、プラスミド、ウイルスの一部の場合もあり、核酸断片の場合もある。発現ベクターは、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子(断片)(すなわち、コード化領域)をコードするポリヌクレオチドを、プロモーター及び/又は他の転写制御エレメント若しくは翻訳制御エレメントと作動可能に関連させてクローニングした発現カセットを含む。本明細書で使用される「コード化領域」とは、アミノ酸へと翻訳されるコドンからなる、核酸の部分である。「終止コドン」(TAG、TGA、又はTAA)は、アミノ酸へと翻訳されないものの、存在する場合、コード化領域の一部であると考えられうるが、任意のフランキング配列、例えば、プロモーター、リボソーム結合部位、転写ターミネーター、イントロン、5’側非翻訳領域及び3’側非翻訳領域などは、コード化領域の一部ではない。2つ又はこれを超えるコード化領域は、単一のポリヌクレオチドコンストラクト内、例えば、単一のベクター上、又は個別のポリヌクレオチドコンストラクト内、例えば、個別の(異なる)ベクター上に存在しうる。さらに、任意のベクターは、単一のコード化領域を含有する場合もあり、2つ又はこれを超えるコード化領域を含む場合もあり、例えば、本発明のベクターは、タンパク質分解性切断を介して、翻訳後に、又は翻訳と同時に、最終的なタンパク質へと分離される、一又は複数のポリペプチドをコードしうる。加えて、本発明のベクター、ポリヌクレオチド、又は核酸は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子(断片)、又はその変異体若しくは誘導体をコードするポリヌクレオチドへと融合させているか、又は融合させていない、異種コード化領域もコードしうる。異種コード化領域は、限定せずに述べると、分泌性シグナルペプチド又は異種機能ドメインなど、特化されたエレメント又はモチーフを含む。作動可能な関連とは、遺伝子産物の発現を、調節配列の影響下又は制御下に置くような形で、遺伝子産物のコード化領域、例えば、ポリペプチドを、一又は複数の調節配列と関連させる場合の関連である。プロモーター機能の誘導が、所望の遺伝子産物をコードするmRNAの転写を結果としてもたらし、2つのDNA断片の間の連関の性質が、発現調節配列が遺伝子産物の発現を方向付ける能力に干渉しないか、又はDNA鋳型の被転写能に干渉しない、2つのDNA断片(ポリペプチドコード化領域及びこれと関連するプロモーターなど)は、「作動可能に関連」している。したがって、プロモーターが、この核酸の転写をもたらすことが可能な場合、プロモーター領域は、ポリペプチドをコードする核酸と、作動可能に関連しているであろう。プロモーターは、所定の細胞内に限り、DNAの実質的な転写を方向付ける、細胞特異的プロモーターでありうる。プロモーターのほか、他の転写制御エレメント、例えば、エンハンサー、オペレーター、リプレッサー、及び転写終結シグナルも、細胞特異的転写を方向付けるように、ポリヌクレオチドと作動可能に関連させることができる。本明細書では、適切なプロモーター及び他の転写制御領域が開示される。当業者には、様々な転写制御領域が公知である。これらは、限定せずに述べると、脊椎動物細胞内で機能する転写制御領域であって、サイトメガロウイルス(例えば、イントロンAと併せた前早期プロモーター)、シミアンウイルス40(例えば、早期プロモーター)、及びレトロウイルス(例えば、ラウス肉腫ウイルスなど)に由来するプロモーターセグメント及びエンハンサーセグメントなどであるがこれらに限定されない転写制御領域を含む。他の転写制御領域は、アクチン、熱ショックタンパク質、ウシ成長ホルモン、及びウサギa−グロビンなど、脊椎動物遺伝子に由来する転写制御領域のほか、真核細胞内の遺伝子発現を制御することが可能な他の配列を含む。さらなる適切な転写制御領域は、組織特異的プロモーター及び組織特異的エンハンサーのほか、誘導的プロモーター(例えば、プロモーター誘導性テトラサイクリン)を含む。同様に、様々な翻訳制御エレメントは、当業者に公知である。これらは、リボソーム結合部位、翻訳開始コドン及び翻訳終結コドン、並びにウイルス系に由来するエレメント(特に、CITE配列ともまた称する、内部リボソーム侵入部位又はIRES)を含むがこれらに限定されない。発現カセットはまた、複製開始点及び/又はレトロウイルス長末端反復(LTR)若しくはアデノ随伴ウイルス(AAV)逆末端反復(ITR)などの染色体組込みエレメントなど、他の特徴も含みうる。
本発明のポリヌクレオチド及び核酸のコード化領域は、本発明のポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドの分泌を方向付ける、分泌性ペプチド又はシグナルペプチドをコードする、さらなるコード化領域と関連しうる。例えば、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の分泌が所望である場合、シグナル配列をコードするDNAを、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片をコードする核酸の上流に配置することができる。シグナル仮説に従うと、哺乳類細胞により分泌されるタンパク質は、増殖するタンパク質鎖の、粗面小胞体を越える移出が開始されると、成熟タンパク質から切断される、シグナルペプチド又は分泌リーダー配列を有する。当業者は、脊椎動物細胞により分泌されるポリペプチドが一般に、ポリペプチドの分泌形態又は「成熟」形態を産生するように、翻訳されたポリペプチドから切断される、ポリペプチドのN末端へと融合させたシグナルペプチドを有することを承知している。ある特定の実施態様では、天然のシグナルペプチド、例えば、免疫グロブリンの重鎖若しくは軽鎖のシグナルペプチド、又はこれと作動可能に関連させたポリペプチドの分泌を方向付ける能力を保持する配列の機能的な誘導体を使用する。代替的に、異種哺乳類のシグナルペプチド、又はその機能的な誘導体も使用することができる。例えば、野生型リーダー配列を、ヒト組織プラスミノーゲン活性化因子(TPA)又はマウスβ−グルクロニダーゼのリーダー配列で置換することができる。
後の精製(例えば、ヒスチジンタグ)を容易とするのに使用される場合もあり、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子への標識付けの一助とするのに使用される場合もある、短いタンパク質配列をコードするDNAを、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子(断片)をコードするポリヌクレオチド内に組み入れることもでき、この末端に組み入れることもできる。
さらなる実施態様では、本発明の、一又は複数のポリヌクレオチドを含む宿主細胞が提供される。ある特定の実施態様では、本発明の、一又は複数のベクターを含む宿主細胞が提供される。ポリヌクレオチド及びベクターは、ポリヌクレオチド及びベクターのそれぞれとの関連で、本明細書で記載される特徴のうちのいずれかを、単独で、又は組合せで組み込みうる。このような一実施態様では、宿主細胞は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子(の一部)をコードするポリヌクレオチドを含むベクターを含む(例えば、これらで形質転換されているか、又はこれらをトランスフェクトされている)。本明細書で使用される「宿主細胞」という用語は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその断片を作出するように操作されうる、任意の種類の細胞系を指す。当該技術分野では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を複製し、その発現を支援するのに適する宿主細胞が周知である。このような細胞に、適切な場合、特定の発現ベクターをトランスフェクト又は形質導入することができ、臨床適用に十分な数量のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を得るように、大量のベクター含有細胞を、大スケールの発酵槽内の播種のために増殖させることができる。適切な宿主細胞は、大腸菌などの原核微生物、又はチャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、昆虫細胞など、多様な真核細胞を含む。例えば、ポリペプチドは、グリコシル化を必要としない場合は特に、細菌内で生成することができる。発現の後、ポリペプチドを、可溶型画分内の細菌細胞ペーストから単離することができ、さらに精製することができる。原核生物に加えて、糸状菌又は酵母などの真核微生物も、ポリペプチドコードベクターに適する、クローニング宿主又は発現宿主であって、それらのグリコシル化経路が「ヒト化」されている結果として、部分的又は完全なヒトグリコシル化パターンを伴うポリペプチドの生成をもたらす真菌株及び酵母株を含む宿主である。Gerngross,Nat Biotech 22,1409−1414(2004);及びLiら,Nat Biotech 24,210−215(2006)を参照されたい。(グリコシル化)ポリペプチドの発現に適する宿主細胞はまた、多細胞生物(無脊椎動物及び脊椎動物)にも由来する。無脊椎動物細胞の例は、植物細胞及び昆虫細胞を含む。昆虫細胞と併せて使用することが可能であり、特に、ヨトウガ(Spodoptera frugiperda)細胞のトランスフェクションのための、多数のバキュロウイルス株が同定されている。植物細胞培養物もまた、宿主として活用することができる。例えば、米国特許第5959177号、同第6040498号、同第6420548号、同第7125978号、及び同第6417429号(トランスジェニック植物において抗体を生成するためのPLANTIBODIES(商標)技術について記載する)を参照されたい。脊椎動物細胞もまた、宿主として使用することができる。例えば、懸濁液中で増殖するように適合させた哺乳類細胞株は、有用でありうる。有用な哺乳類宿主細胞株の他の例は、SV40で形質転換された、サル腎臓CV1株(COS−7);ヒト胎児性腎臓株(例えば、Grahamら, J Gen Virol 36, 59 (1977)において記載されている293、又は293T細胞)、ベビーハムスター腎臓細胞(BHK)、マウスセルトリ細胞(例えば、Mather, Biol Reprod 23, 243-251 (1980)において記載されているTM4細胞)、サル腎臓細胞(CV1)、アフリカミドリザル腎臓細胞(VERO−76)、ヒト子宮頸癌細胞(HELA)、イヌ腎臓細胞(MDCK)、バッファローラット肝臓細胞(BRL3A)、ヒト肺細胞(W138)、ヒト肝臓細胞(HepG2)、マウス乳房腫瘍細胞(MMT060562)、TRI細胞(例えば、Matherら, Annals N.Y. Acad Sci 383, 44-68 (1982)において記載されている)、MRC5細胞、及びFS4細胞である。他の有用な哺乳類宿主細胞株は、dhfrCHO細胞を含むチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞(Urlaubら, Proc Natl Acad Sci USA 77, 4216 (1980));並びにYO、NS0、P3X63、及びSp2/0などの骨髄腫細胞株を含む。タンパク質の生成に適する、ある特定の哺乳類宿主細胞株の総説については、例えば、Yazaki及びWu,Methods in Molecular Biology,Vol.248(B.K.C.Lo編,Humana Press,Totowa,NJ),pp.255−268(2003)を参照されたい。宿主細胞は、ごく少数を挙げれば、培養細胞、例えば、哺乳類培養細胞、酵母細胞、昆虫細胞、細菌細胞、及び植物細胞を含むが、また、トランスジェニック動物、トランスジェニック植物、又は培養された植物組織若しくは動物組織の中に含まれる細胞も含む。一実施態様では、宿主細胞は、真核細胞、好ましくは、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、ヒト胎児性腎臓(HEK)細胞、又はリンパ系細胞(例えば、Y0細胞、NS0細胞、Sp20細胞)などの哺乳類細胞である。
当該技術分野では、これらの系内で、外来遺伝子を発現させる、標準的な技術が公知である。発現産物が、重鎖及び軽鎖のいずれも有する抗体となるよう、抗体鎖の他方もまた発現させるように、抗体など、抗原結合ドメインの重鎖又は軽鎖を含むポリペプチドを発現させる細胞を操作することができる。
一実施態様では、本発明に従うプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を生成する方法であって、本明細書で提示されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子をコードするポリヌクレオチドを含む宿主細胞を、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の発現に適する条件下で培養することと、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を、宿主細胞(又は宿主細胞培地)から回収することとを含む方法が提供される。
プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の成分を、互いに遺伝子融合させる。プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、その成分を、互いに直接的に融合させることもでき、リンカー配列を介して間接的に融合させることもできるようにデザインすることができる。リンカーの組成物及び長さは、当該技術分野で周知の方法に従い決定することができ、有効性について調べることができる。異なるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の成分の間のリンカー配列の例は、本明細書で提示される配列内に見出される。所望の場合、さらなる配列、例えばエンドペプチダーゼ認識配列を、切断部位を組み込んで融合体の個別の成分を分離するために含めることができる。
ある特定の実施態様では、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の、一又は複数の抗原結合部分は、抗原決定基への結合が可能な、少なくとも1つの抗体可変領域を含む。可変領域は、天然に存在するか又は天然に存在しない、抗体及びその断片の一部を形成する場合もあり、これに由来する場合もある。当該技術分野では、ポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体を生成する方法が周知である(例えば、Harlow及びLane, "Antibodies, a laboratory manual", Cold Spring Harbor Laboratory, 1988を参照されたい)。天然に存在しない抗体は、固体相ペプチド合成を使用して構築することができ、組換えにより生成すること(例えば、米国特許第4186567号で記載されている)もでき、例えば、可変重鎖及び可変軽鎖を含むコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることにより得ることもできる(例えば、McCaffertyの米国特許第5969108号を参照されたい)。
任意の動物種の抗体、抗体断片、抗原結合ドメイン、又は可変領域を、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子内で使用することができる。本発明で有用な、非限定的な抗体、抗体断片、抗原結合ドメイン、又は可変領域は、マウス、霊長類、又はヒト由来のものでありうる。プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が、ヒトにおける使用を目的とする場合、抗体の定常領域がヒトに由来する、抗体のキメラ形態も使用することができる。当該技術分野で周知の方法に従い、抗体のヒト化形態又は完全ヒト形態もまた調製することができる(例えば、Winterによる、米国特許第5565332号を参照されたい)。ヒト化は、(a)極めて重要なフレームワーク残基(例えば、良好な抗原結合親和性又は抗体機能を保持するのに重要なフレームワーク残基)の保持を伴うか又は伴わずに、非ヒト(例えば、ドナー抗体)CDRを、ヒト(例えば、レシピエント抗体)フレームワーク及びヒト定常領域へとグラフトする方法、(b)非ヒト特異性決定領域(SDR又はa−CDR;抗体−抗原間相互作用に極めて重要な残基)のみを、ヒトフレームワーク及びヒト定常領域へとグラフトする方法、又は(c)非ヒト可変ドメインの全体を移植するが、表面残基の置きかえにより、それらをヒト様区画で「クローキングする」方法を含むがこれらに限定されない、多様な方法により達成することができる。ヒト化抗体及びそれらを作製する方法は、例えば、Almagro及びFransson,Front Biosci 13,1619−1633(2008)において総説されており、例えば、Riechmannら,Nature 332,323−329(1988);Queenら,Proc Natl Acad Sci USA 86,10029−10033(1989);米国特許第5821337号、同第7527791号、同第6982321号、及び同第7087409号;Jonesら,Nature 321,522−525(1986);Morrisonら,Proc Natl Acad Sci 81,6851−6855(1984);Morrison及びOi,Adv Immunol 44,65−92(1988);Verhoeyenら,Science 239,1534−1536(1988);Padlan,Molec Immun 31(3),169−217(1994);Kashmiriら,Methods 36,25−34(2005)(SDR(a−CDR)グラフティングについて記載する);Padlan,Mol Immunol 28,489−498(1991)(「リサーフェイシング」について記載する);Dall’Acquaら,Methods 36,43−60(2005)(「FRシャッフリング」について記載する);並びにOsbournら,Methods 36,61−68(2005)及びKlimkaら,Br J Cancer 83,252−260(2000)(FRシャッフリングのための「誘導選択」法について記載する)においてさらに記載されている。ヒト抗体及びヒト可変領域は、当該技術分野で公知の多様な技法を使用して生成することができる。ヒト抗体については、van Dijk及びvan de Winkel,Curr Opin Pharmacol 5,368−74(2001)及びLonberg,Curr Opin Immunol 20,450−459(2008)において一般的に記載されている。ヒト可変領域は、ハイブリドーマ法により作製されるヒトモノクローナル抗体の一部を形成することが可能であり、これに由来しうる(例えば、Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987)を参照されたい))。ヒト抗体及びヒト可変領域はまた、免疫原を、抗原チャレンジに応答して、インタクトなヒト抗体、又はヒト可変領域を伴うインタクトな抗体を生成するように改変されたトランスジェニック動物へと投与することにより調製することもできる(例えば、Lonberg, Nat Biotech 23, 1117-1125 (2005)を参照されたい)。ヒト抗体及びヒト可変領域はまた、ヒト由来のファージディスプレイライブラリーから選択された、Fvクローン可変領域配列を単離することにより作出することもできる(例えば、Hoogenboomら, in Methods in Molecular Biology 178, 1-37 (O'Brienら編, Human Press, Totowa, NJ, 2001);及びMcCaffertyら, Nature 348, 552-554; Clacksonら, Nature 352, 624-628 (1991)を参照されたい)。ファージは典型的に、抗体断片を、単鎖Fv(scFv)断片又はFab断片として提示する。
ある特定の実施態様では、本発明で有用な抗原結合部分を、例えば、出典明示によりその全体が本明細書に援用される、米国特許出願公開第2004/0132066号において開示されている方法に従い、結合親和性を増強するように操作する。本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が、特異的抗原決定基に結合する能力は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、又は当業者が精通している他の技法、例えば、表面プラズモン共鳴法(BIACORE T100システム上で解析する)(Liljebladら, Glyco J 17, 323-329 (2000))、及び従来の結合アッセイ(Heeley, Endocr Res 28, 217-229 (2002))を介して測定することができる。競合アッセイを使用して、特定の抗原への結合について、参照抗体と競合する、抗体、抗体断片、抗原結合ドメイン、又は可変ドメイン、例えば、CD3への結合について、V9抗体と競合する抗体を同定することができる。ある特定の実施態様では、このような競合抗体は、参照抗体が結合する同じエピトープ(例えば、直鎖状エピトープ又はコンフォメーションエピトープ)に結合する。抗体が結合するエピトープをマッピングするための、詳細な例示的方法については、Morris(1996)“Epitope Mapping Protocols,”Methods in Molecular Biology vol.66(Humana Press,Totowa,NJ)に提示されている。例示的な競合アッセイでは、固定化抗原(例えば、CD3)を、抗原に結合する、第1の標識化抗体(例えば、米国特許第6054297号に記載されているV9抗体)と、抗原への結合について、第1の抗体と競合するその能力について調べられる、第2の非標識化抗体とを含む溶液中でインキュベートする。第2の抗体は、ハイブリドーマ上清中に存在しうる。コントロールとして、固定化抗原を、第1の標識化抗体は含むが、第2の非標識化抗体は含まない溶液中でインキュベートする。第1の抗体の、抗原への結合を許容する条件下におけるインキュベーション後、過剰な非結合抗体を除去し、固定化抗原と会合した標識の量を測定する。被験試料中の、固定化抗原と会合する標識の量が、コントロール試料と比べて実質的に低減された場合は、第2の抗体が、抗原への結合について、第1の抗体と競合していることを指し示す。Harlow及びLane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual ch.14(Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY)を参照されたい。
本明細書で記載される通りに調製された、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、高速液体クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、アフィニティークロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィーなど、当該技術分野で公知の技法により精製することができる。特定のタンパク質を精製するのに使用される実際の条件は、部分的に、正味の電荷、疎水性、親水性などの因子に依存し、当業者には明らかであろう。アフィニティークロマトグラフィー精製のために、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が結合する、抗体、リガンド、受容体、又は抗原を使用することができる。例えば、アフィニティークロマトグラフィーによる、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の精製のために、プロテインA又はプロテインGを伴うマトリックスを使用することができる。逐次的な、プロテインA又はプロテインGによるアフィニティークロマトグラフィー、及びサイズ排除クロマトグラフィーを使用して、実施例で本質的に記載される、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を単離することができる。プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の純度は、周知の様々な解析法であって、ゲル電気泳動、高圧液体クロマトグラフィーなどを含む方法のうちのいずれかにより決定することができる。例えば、実施例で記載される通りに発現させた重鎖融合タンパク質は、インタクトであり、還元SDS−PAGEにより裏付けられる通り、適正にアセンブルされることが示された(例えば、図8−12を参照されたい)。3つのバンドを、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の、軽鎖、重鎖、及び重鎖/軽鎖の融合タンパク質の予測分子量に対応する、約Mr 25,000、Mr 50,000、及びMr 75,000で分解した。
アッセイ
本明細書で提示されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、当該技術分野で公知の多様なアッセイにより、それらの物理的/化学的特性及び/又は生物学的活性を、同定することもでき、それらについてスクリーニングすることもでき、それらの特徴を明らかにすることもできる。
親和性アッセイ
プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の、Fc受容体又は標的抗原に対する親和性は、実施例で明示される方法に従い、BIAcore計器(GE Healthcare)などの標準的な計測、及び組換え発現により得られうるような受容体又は標的タンパク質を使用して、表面プラズモン共鳴(SPR)により決定することができる。代替的に、異なる受容体又は標的抗原に対する、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の結合は、例えば、フローサイトメトリー(FACS)により、特定の受容体又は標的抗原を発現させる細胞株を使用して査定することができる。結合親和性を測定するための、具体的な例示的(illustrative及びexemplary)実施態様については、以下及び下記の実施例で記載する。
一実施態様に従い、Kを、25℃で、BIACORE(登録商標)T100機器(GE Healthcare)を使用する、表面プラズモン共鳴により測定する。
Fc部分とFc受容体との間の相互作用を解析するには、Hisタグ付けした組換えFc受容体を、CM5チップ上に固定化した抗ペンタHis抗体(Qiagen)により捕捉し、二重特異性コンストラクトを、被分析物として使用する。略述すると、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサーチップ(CM5;GE Healthcare)を、供給業者の指示書に従って、N−エチル−N’−(3−ジメチルアミノプロピル)−カルボジイミド塩酸塩(EDC)及びN−ヒドロキシスクシンイミド(NHS)により活性化させる。5μl/分の流速の注射の前に、抗ペンタHis抗体を、10mMの酢酸ナトリウム、pH5.0で、40μg/mlへと希釈して、約6500反応単位(RU)のカップリングタンパク質を達成する。リガンドの注射後、1Mのエタノールアミンを注射して、反応しなかった基をブロックする。その後、Fc受容体を、4又は10nMで、60秒間にわたり捕捉する。反応速度の測定のために、二重特異性コンストラクトの、4倍の段階希釈液(500nMから4000nMの間の範囲)を、HBS−EP(GE Healthcare;10mMのHEPES、150mMのNaCl、3mMのEDTA、0.05%の界面活性剤P20、pH7.4)中、25℃、30μl/分の流速で、120秒間にわたり注射する。
標的抗原に対する親和性を決定するために、二重特異性コンストラクトを、抗ペンタHis抗体について記載されている、活性化CM5センサーチップ表面上に固定化されている、抗ヒトFab特異的抗体(GE Healthcare)により捕捉する。カップリングタンパク質の最終量は、約12000RUである。二重特異性コンストラクトを、300nMで、90秒間にわたり捕捉する。標的抗原は、濃度範囲を250から1000nMとする、30μl/分の流速で、180秒間にわたり、フローセルを流過させる。解離は、180秒間にわたりモニタリングする。
参照フローセル上で得られる応答を控除することにより、バルク屈折率の差異を補正する。定常状態応答を使用して、非線形曲線の、ラングミュア結合についての等温曲線への当てはめにより、解離定数であるKを導出した。会合速度(kon)及び解離速度(koff)は、会合センサーグラム及び解離センサーグラムを同時的に当てはめることにより、単純な1対1のラングミュア結合モデル(BIACORE(登録商標)T100 Evaluation Software version 1.1.1)を使用して計算する。平衡解離定数(K)は、koff/konの比として計算する。例えば、Chenら,J Mol Biol 293,865−881(1999)を参照されたい。
活性アッセイ
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の生物活性は、実施例で記載される多様なアッセイにより測定することができる。生物学的活性は、例えば、T細胞の増殖の誘導、T細胞内のシグナル伝達の誘導、T細胞内の活性化マーカーの発現の誘導、T細胞によるサイトカイン分泌の誘導、腫瘍細胞など、標的細胞の溶解の誘導、並びに腫瘍の縮小及び/又は生存の改善の誘導を含みうる。
組成物、製剤、及び投与経路
さらなる態様では、本発明は、例えば、下記の治療法のうちのいずれかにおける使用のための、本明細書で提示されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のうちのいずれかを含む薬学的組成物を提供する。一実施態様では、薬学的組成物は、本明細書で提示されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のうちのいずれかと、薬学的に許容される担体を含む。別の実施態様では、薬学的組成物は、本明細書で提示されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のうちのいずれかと、例えば、下記で記載される、少なくとも1つのさらなる治療剤とを含む。
さらに、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を、インビボにおける投与に適する形態で生成する方法であって、(a)本発明に従うプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を得ることと、(b)プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を、少なくとも1つの薬学的に許容される担体と共に製剤化し、これにより、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の調製物を、インビボにおける投与のために製剤化することとを含む方法が提供される。
本発明の薬学的組成物は、薬学的に許容される担体中に溶解又は分散させた、治療的有効量の、一又は複数のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を含む。「薬学的な、又は薬理的に許容可能な」という語句は、援用される投与量及び濃度で、レシピエントに対して、一般に非毒性である、すなわち、適切な場合、例えば、ヒトなどの動物へと投与された場合、有害反応、アレルギー反応、又は他の望ましくない反応をもたらさない分子実体及び組成物を指す。少なくとも1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子と、任意選択的に、さらなる有効成分とを含有する薬学的組成物の調製は、出典明示により本明細書で援用される、Remington’s Pharmaceutical Sciences,18th Ed.Mack Printing Company,1990で例示される通り、本開示に照らして、当業者に公知であろう。さらに、動物(例えば、ヒト)への投与については、調製物は、FDA下の生物学的基準についての当局又は他の諸国の対応する規制機関により要請される、無菌状態、発熱性、全般的な安全性、及び純度についての基準を満たすべきであることが理解されるであろう。好ましい組成物は、凍結乾燥製剤又は水溶液である。本明細書で使用される「薬学的に許容される担体」とは、任意かつ全ての溶媒、バッファー、分散媒、コーティング、界面活性剤、抗酸化剤、防腐剤(例えば、抗菌剤、抗真菌剤)、等張剤、吸収遅延剤、塩、防腐剤、抗酸化剤、タンパク質、薬物、薬物安定剤、ポリマー、ゲル、結合剤、賦形剤、崩壊剤、潤滑剤、甘味剤、香味剤、色素、当業者に公知である同様の材料及びそれらの組合せ(例えば、出典明示により本明細書で援用される、Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed. Mack Printing Company, 1990, pp. 1289-1329を参照されたい)を含む。任意の従来の担体が、有効成分に対して不適合である場合を除き、治療的組成物中又は薬学的組成物中のその使用が想定される。
組成物は、それが、固体形態で投与されるのか、液体形態で投与されるのか、エアゾール形態で投与されるのか、及び、それが、注射のような投与経路のために、滅菌を必要とするのかどうかに応じて、異なる種類の担体を含みうる。本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子(及び任意のさらなる治療剤)は、静脈内、皮内、動脈内、腹腔内、病巣内、頭蓋内、関節内、前立腺内、脾臓内、腎臓内、胸膜内、気管内、鼻腔内、硝子体内、膣内、直腸内、腫瘍内、筋肉内、腹腔内、皮下、結膜下、小胞内、経粘膜、心膜内、臍帯内、眼内、経口、局所(topically、locally)、吸入(例えば、エアゾール吸入)、注射、点滴、連続注入、標的細胞を直接浸漬する局所灌流により、カテーテルを介して、洗浄を介して、クリームにより、脂質組成物(例えば、リポソーム)により、若しくは他の方法、又は当業者に公知である前出(例えば、出典明示により本明細書で援用される、Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed. Mack Printing Company, 1990を参照されたい)の任意の組合せにより投与することができる。非経口投与、特に、静脈内注射は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子などのポリペプチド分子を投与するために、最も一般に使用される。
非経口組成物は、注射、例えば、皮下注射、皮内注射、病巣内注射、静脈内注射、動脈内注射、筋肉内注射、髄腔内注射、又は腹腔内注射による投与のためにデザインされた組成物を含む。注射のために、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を、水溶液中、好ましくは、ハンクス液、リンゲル液、又は生理的生理食塩水によるバッファーなど、生理学的に適合するバッファー中で製剤化することができる。溶液は、懸濁剤、安定化剤、及び/又は分散剤などの調合剤を含有しうる。代替的に、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、使用の前における、適切なビヒクル、例えば、滅菌発熱物質非含有水による再構成のための粉末形態でもありうる。滅菌注射用溶液は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を、要請に応じて、下記で列挙される、他の多様な成分を伴う適切な溶媒中に、要求量で組み込むことにより調製する。無菌状態は、例えば、滅菌濾過膜を介する濾過により、たやすく達することができる。一般に、分散体は、多様な滅菌有効成分を、基本分散媒及び/又は他の成分を含有する滅菌ビヒクルへと組み込むことにより調製する。滅菌注射用溶液、懸濁液、又はエマルジョンを調製するための滅菌粉末の場合、好ましい調製法は、有効成分に加えた、既に滅菌濾過されたその液体媒体に由来する、任意のさらなる所望の成分の粉末をもたらす、真空乾燥法又は凍結乾燥法である。液体媒体は、必要な場合、適切な形で緩衝すべきであり、液体希釈剤は、十分な生理食塩水又はグルコースを伴う注射の前に、まず、等張性とすべきである。組成物は、製造及び保管の条件下で、安定でなければならず、細菌及び真菌など、微生物の汚染作用に対して保存されなければならない。エンドトキシン汚染は、例えば、タンパク質1mg当たり0.5ng未満の安全なレベルで、最小限に保つべきことが察知されるであろう。適切な、薬学的に許容される担体は、リン酸塩、リン酸エステル、リン酸塩又はリン酸エステル、クエン酸塩、クエン酸エステル、及び他の有機酸などのバッファー;アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤;防腐剤(オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド;ヘキサメトニウムクロライド;ベンザルコニウムクロライド;ベンゼトニウムクロライド;フェノール、ブチルアルコール、又はベンジルアルコール;メチルパラベン又はプロピルパラベンなどのアルキルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3−ペンタノール;及びm−クレゾールなど);低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、又は免疫グロブリンなどのタンパク質;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、又はリジンなどのアミノ酸;グルコース、マンノース、又はデキストリンを含む、単糖類、二糖類、及び他の炭水化物;EDTAなどのキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロース、又はソルビトールなどの糖類;ナトリウムなどの塩形成対イオン;金属錯体(例えば、Zn−タンパク質複合体);及び/又はポリエチレングリコール(PEG)などの非イオン性界面活性剤を含むがこれらに限定されない。水性注射用懸濁液は、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトール、デキストランなど、懸濁液の粘性を増大させる化合物を含有しうる。任意選択的に、懸濁液はまた、高濃度の溶液の調製を可能とする化合物の溶解度を増大させる、適切な安定剤又は薬剤も含有しうる。加えて、活性の化合物の懸濁液は、適切な油性注射用懸濁液としても調製することができる。適切な親油性溶媒又はビヒクルは、ゴマ油などの脂肪油、又はオレイン酸エチル若しくはトリグリセリドなどの合成脂肪酸エステル、又はリポソームを含む。
有効成分は、コロイド状薬物送達系(例えば、リポソーム、アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子、及びナノカプセル)内、又はマクロエマルジョン中の、例えば、コアセルベーション法又は界面重合により調製されたマイクロカプセル、例えば、ヒドロキシメチルセルロース、又はゼラチンマイクロカプセル及びポリ(メタクリル酸メチル)マイクロカプセル内にそれぞれ取り込むことができる。このような技法は、Remington’s Pharmaceutical Sciences(18th Ed.Mack Printing Company,1990)において開示されている。徐放性調製物を調製することができる。徐放性調製物の適切な例は、ポリペプチドを含有する、固体の疎水性ポリマーによる半透性マトリックスであって、成形品、例えば、フィルム又はマイクロカプセルの形態にあるマトリックスを含む。特定の実施態様では、注射用組成物の持続吸収は、例えば、モノステアリン酸アルミニウム、ゼラチン、又はこれらの組合せなど、吸収を遅延させる薬剤の、組成物中の使用によりもたらすことができる。
前出で記載した組成物に加えて、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子はまた、持効性製剤としても製剤化することができる。このような長時間作用型製剤は、植込みにより(例えば、皮下又は筋肉内)投与することもでき、筋肉内注射により投与することもできる。したがって、例えば、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、適切なポリマー材料若しくは疎水性材料(例えば、許容可能な油中のエマルジョンとしての)又はイオン交換樹脂と共に製剤化することもでき、難溶型誘導体として、例えば、難溶型塩として製剤化することもできる。
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を含む薬学的組成物は、従来の混合工程、溶解工程、乳化工程、封入工程、取込み工程、又は凍結乾燥工程により製造することができる。薬学的組成物を、タンパク質の、薬学的に使用しうる調製物への加工を容易とする、一又は複数の生理的に許容可能な担体、希釈剤、賦形剤、又は補助剤を使用して、従来の方式で製剤化することができる。適正な製剤は、選び出される投与経路に依存する。
プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を、遊離酸形態又は遊離塩基形態、中性形態又は塩形態の組成物へと製剤化することができる。薬学的に許容される塩とは、遊離酸又は遊離塩基の生物活性を実質的に保持する塩である。これらは、酸付加塩、例えば、タンパク質性組成物の遊離アミノ基により形成される酸付加塩、又は例えば、塩酸若しくはリン酸などの無機酸、又は酢酸、シュウ酸、酒石酸、若しくはマンデル酸などの有機酸により形成される酸付加塩を含む。遊離カルボキシル基と共に形成される塩はまた、例えば、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、水酸化カルシウム、若しくは水酸化鉄などの無機塩基;又はイソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、若しくはプロカインなどの有機塩基にも由来しうる。薬学的塩は、水性溶媒中、及び対応する遊離塩基形態以外のプロトン性溶媒中で、可溶性が大きくなる傾向がある。
治療法及び組成物
本明細書で提示されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子のいずれも、治療法において使用することができる。本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、例えば、がんの治療における免疫療法剤として使用することができる。
治療法における使用のために、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、医学行動規範と一致した様式で、製剤化し、用量設定し、投与する。この文脈における検討のための因子は、治療される特定の障害、治療される特定の哺乳類、個々の患者の臨床状態、障害の原因、薬剤の送達部位、投与法、投与スケジュール、及び医療施術者に公知の他の因子を含む。
一態様では、医薬としての使用のための、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が提供される。さらなる態様では、疾患の治療における使用のための、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が提供される。ある特定の実施態様では、治療法における使用のための、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が提供される。一実施態様では、本発明は、それを必要とする個体における疾患の治療における使用のための、本明細書で記載される、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。ある特定の実施態様では、本発明は、疾患を有する個体を治療する方法であって、個体へと、治療的有効量のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を投与することを含む方法における使用のための、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。ある特定の実施態様では、治療される疾患は、増殖性疾患である。特定の実施態様では、疾患は、がんである。ある特定の実施態様では、方法は、個体へと、治療的有効量の少なくとも1つのさらなる治療剤、例えば、治療される疾患ががんである場合の抗がん剤を投与することをさらに含む。さらなる実施態様では、本発明は、本明細書で記載される、標的細胞、特に、腫瘍細胞の溶解の誘導における使用のための、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。ある特定の実施態様では、本発明は、個体における標的細胞、特に、腫瘍細胞の溶解を誘導する方法であって、個体へと、有効量のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を投与して、標的細胞の溶解を誘導することを含む方法における使用のための、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を提供する。上記の実施態様のうちのいずれかに従う「個体」とは、哺乳類、好ましくはヒトである。
さらなる態様では、本発明は、医薬の製造又は調製における、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の使用を提供する。一実施態様では、医薬は、それを必要とする個体における疾患の治療のためのものである。さらなる実施態様では、医薬は、疾患を治療する方法であって、疾患を有する個体へと、治療的有効量の医薬を投与することを含む方法における使用のためのものである。ある特定の実施態様では、治療される疾患は、増殖性疾患である。特定の実施態様では、疾患は、がんである。一実施態様では、方法は、個体へと、治療的有効量の少なくとも1つのさらなる治療剤、例えば、治療される疾患ががんである場合の抗がん剤を投与することをさらに含む。さらなる実施態様では、医薬は、標的細胞、特に、腫瘍細胞の溶解の誘導のためのものである。なおさらなる実施態様では、医薬は、個体における標的細胞、特に、腫瘍細胞の溶解を誘導する方法であって、個体へと、有効量の医薬を投与して、標的細胞の溶解を誘導することを含む方法における使用のためのものである。上記の実施態様のうちのいずれかに従う「個体」とは、哺乳類、好ましくはヒトでありうる。
さらなる態様では、本発明は、疾患を治療するための方法を提供する。一実施態様では、方法は、このような疾患を有する個体へと、治療的有効量の、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を投与することを含む。一実施態様では、薬学的に許容される形態にある、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を含む組成物を、前記個体へと投与する。ある特定の実施態様では、治療される疾患は、増殖性疾患である。特定の実施態様では、疾患は、がんである。ある特定の実施態様では、方法は、個体へと、治療的有効量の少なくとも1つのさらなる治療剤、例えば、治療される疾患ががんである場合の抗がん剤を投与することをさらに含む。上記の実施態様のうちのいずれかに従う「個体」とは、哺乳類、好ましくはヒトでありうる。
さらなる態様では、本発明は、標的細胞、特に、腫瘍細胞の溶解を誘導するための方法を提供する。一実施態様では、方法は、T細胞、特に、細胞傷害性T細胞の存在下で、標的細胞を、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子と接触させることを含む。さらなる態様では、個体における標的細胞、特に、腫瘍細胞の溶解を誘導するための方法が提供される。このような一実施態様では、方法は、個体へと、有効量のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を投与して、標的細胞の溶解を誘導することを含む。一実施態様では、「個体」とは、ヒトである。
ある特定の実施態様では、治療される疾患は、増殖性疾患、特に、がんである。がんの非限定的な例は、膀胱がん、脳がん、頭頸部がん、膵臓がん、肺がん、乳がん、卵巣がん、子宮がん、子宮頸がん、子宮内膜がん、食道がん、結腸がん、結腸直腸がん、直腸がん、胃がん、前立腺がん、血液がん、皮膚がん、扁平上皮癌、骨がん、及び腎臓がんを含む。本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を使用して治療されうる、他の細胞増殖障害は、腹部、骨、乳、消化器系、肝臓、膵臓、腹膜、内分泌腺(副腎、副甲状腺、下垂体、睾丸、卵巣、胸腺、甲状腺)、眼、頭頸部、神経系(中枢及び末梢)、リンパ系、骨盤、皮膚、軟組織、脾臓、胸部領域、及び泌尿生殖器系に位置する腫瘍を含むがこれらに限定されない。また、前がん性状態又は前がん性病変及びがん転移も含まれる。ある特定の実施態様では、がんは、腎細胞がん、皮膚がん、肺がん、結腸直腸がん、乳がん、脳がん、頭頸部がんからなる群から選択される。当業者は、多くの場合、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、治癒をもたらすことはできず、部分的な利益のみをもたらしうることをたやすく認識する。一部の実施態様では、一部の利益を有する生理的変化もまた、治療的に有益であると考える。したがって、一部の実施態様では、生理的変化をもたらす、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の量は、「有効量」又は「治療的有効量」と考えられる。治療を必要とする対象、患者、又は個体は、典型的に、哺乳類、より具体的には、ヒトである。
一部の実施態様では、有効量の本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を、細胞へと投与する。他の実施態様では、治療的有効量の本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を、疾患の治療のために、個体へと投与する。
疾患を予防又は治療するために、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の適切な投与量(単独で、又は1若しくは複数の他のさらなる治療剤と組み合わせて使用する場合の)は、治療される疾患の種類、投与経路、患者の体重、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の種類、疾患の重症度及び経過、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子を、予防目的で投与するのか、治療目的で投与するのか、既往の治療的介入又は併用される治療的介入、患者の病歴及びプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子への応答、並びに主治医の裁量に依存するであろう。いずれにせよ、投与担当の施術者が、組成物中の有効成分の濃度と、個々の対象に適切な用量とを決定することになる。本明細書では、単回又は多様な時点にわたる複数回の投与、ボーラス投与、及びパルス注入を含むがこれらに限定されない、多様な投与スケジュールが想定される。
プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、患者へと、単回、又は一連の治療にわたって、適切な形で投与する。疾患の種類及び重症度に応じて、約1μg/kgから15mg/kg(例えば、0.1mg/kg−10mg/kg)のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が、例えば、一又は複数にわたる個別の投与によるのであれ、連続的注入によるのであれ、患者への初回の候補投与量でありうる。典型的な毎日1回の投与量は、上記で言及した因子に応じて、約1μg/kgから100mg/kg又はこれを超える範囲でありうる。数日間又はこれを超える期間にわたる反復投与には、状態に応じて、治療は一般に、所望される病徴の抑制が生じるまで持続する。T細胞二重特異性抗原結合分子の、1つの例示的な投与量は、約0.005mg/kgから約10mg/kgの範囲であろう。他の非限定的な例では、用量はまた、投与1回体重1kg当たり約1マイクログラム、体重1kg当たり約5マイクログラム、体重1kg当たり約10マイクログラム、体重1kg当たり約50マイクログラム、体重1kg当たり約100マイクログラム、体重1kg当たり約200マイクログラム、体重1kg当たり約350マイクログラム、体重1kg当たり約500マイクログラム、体重1kg当たり約1ミリグラム、体重1kg当たり約5ミリグラム、体重1kg当たり約10ミリグラム、体重1kg当たり約50ミリグラム、体重1kg当たり約100ミリグラム、体重1kg当たり約200ミリグラム、体重1kg当たり約350ミリグラム、体重1kg当たり約500ミリグラムから、体重1kg当たり約1000mg、又はこれを超える用量、及びこの中の導出可能な任意の範囲も含みうる。本明細書で列挙される数から導出可能な範囲の非限定的な例では、上記で記載した数に基づき、体重1kg当たり約5mgから体重1kg当たり約100mg、体重1kg当たり約5マイクログラムから体重1kg当たり約500ミリグラムなどの範囲を投与することができる。したがって、一又は複数にわたる、約0.5mg/kg、2.0mg/kg、5.0mg/kg、又は10mg/kgの用量(又はこれらの任意の組合せ)を、患者へと投与することができる。このような用量は、間欠的に、例えば、毎週又は3週間ごとに(例えば、患者が、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の投与約2から約20回、又は、例えば、約6回を施されように)投与することができる。初回の高負荷用量に続き、一又は複数にわたる低用量を投与することができる。しかし、他の投与量レジメンも有用でありうる。この治療の進行は、従来の技法及びアッセイにより容易にモニタリングされる。
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は一般に、意図される目的を達成するのに有効な量で使用する。疾患状態を治療又は予防する使用のために、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子又はその薬学的組成物を、治療的有効量で投与又は適用する。治療的有効量の決定は、とりわけ、本明細書で提示される詳細な開示に照らして、十分に当業者の能力の範囲内にある。
全身投与のために、治療的有効用量を、まず、細胞培養アッセイなどのインビトロアッセイから推定することができる。次いで、用量を、動物モデルにおいて製剤化して、細胞培養物中で決定されたIC50を含む、循環濃度範囲を達成することができる。このような情報を使用して、ヒトにおいて有用な用量を、より正確に決定することができる。
初回投与量はまた、当該技術分野で周知の技法を使用して、インビボデータ、例えば、動物モデルから推定することもできる。当業者であれば、動物データに基づき、ヒトへの投与を、たやすく最適化しうるであろう。
治療効果を維持するのに十分な、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の血漿レベルを個別にもたらすように、投与量及び投与間隔を調整することができる。注射による投与のための、通例の患者投与量は、約0.1から50mg/kg/日、典型的に、約0.5から1mg/kg/日の範囲である。治療的有効血漿レベルは、各日複数回の投与を実施することにより達成することができる。血漿中のレベルは、例えば、HPLCにより測定することができる。
局所投与又は選択的取込みの場合、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の有効局所濃度は、血漿濃度と関連する。当業者は、不要な実験を伴わずに、治療的有効局所投与量を、最適化することが可能であろう。
治療的有効用量の、本明細書で記載されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は一般に、実質的な毒性を引き起こさずに、治療的利益をもたらすであろう。プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の毒性及び治療的有効性は、細胞培養物又は実験動物における標準的な薬学的手順により決定することができる。細胞培養アッセイ及び動物研究を使用して、LD50(集団のうちの50%に対して致死性である用量)及びED50(集団のうちの50%において、治療的に有効な用量)を決定することができる。毒性と治療的効果との用量比は、LD50/ED50の比として表しうる治療指数である。大きな治療指数を呈示するプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が好ましい。一実施態様では、本発明に従うプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、大きな治療指数を呈示する。細胞培養アッセイ及び動物研究から得られるデータは、ヒトにおける使用に適する投与量の範囲を製剤化するのに使用することができる。投与量は、毒性をほとんど又は全く伴わずに、ED50を含む循環濃度の範囲内にあることが好ましい。投与量は、様々な因子、例えば、援用される剤形、活用される投与経路、対象の状態などに応じて、この範囲内で変動しうる。正確な製剤化、投与経路、及び投与量は、患者の状態を念頭に、個々の医師により選ばれうる(例えば、出典明示によりその全体において本明細書に援用される、Finglら, 1975,The Pharmacological Basis of Therapeutics, Ch. 1, p. 1を参照されたい)。
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子に治療される患者の主治医は、毒性、臓器不全などのために、投与を、いかにして、いつ、終了させるのか、中断するのか、又は調整するのかについて承知しているであろう。逆に、主治医はまた、臨床応答が不十分(毒性を除き)であった場合、治療を高レベルへと調整することについても承知しているであろう。目的の障害を管理するときに投与される用量の大きさは、治療される状態の重症度、投与経路などと共に変動するであろう。状態の重症度は、例えば、標準的な予後査定法により、部分的に査定することができる。さらに、投与及びおそらくは投与頻度もまた、個々の患者の年齢、体重、及び応答に従い変動するであろう。
他の薬剤及び治療
本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、治療において、一又は複数の他の薬剤と組み合わせて投与することができる。例えば、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は、少なくとも1つのさらなる治療剤と共に共投与することができる。「治療剤」という用語は、このような治療を必要とする個体における症候又は疾患を治療するのに投与される、任意の薬剤を包摂する。このようなさらなる治療剤は、治療される特定の適応に適する、任意の有効成分、好ましくは、互いに有害な影響を及ぼし合わない、相補的活性を伴う有効成分を含みうる。ある特定の実施態様では、さらなる治療剤は、免疫調節剤、細胞増殖抑制剤、細胞接着の阻害剤、細胞傷害剤、細胞アポトーシスの活性化因子、又は細胞の、アポトーシス誘導因子への感受性を増大させる薬剤である。特定の実施態様では、さらなる治療剤は、抗がん剤、例えば、微小管破壊剤、代謝拮抗剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレーター、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化因子、又は抗血管新生剤である。
このような他の薬剤は、意図される目的に有効な量の組合せで存在することが適する。このような他の薬剤の有効量は、使用されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の量、障害又は治療の種類、及び上記で論じた他の因子に依存する。プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子は一般に、本明細書で記載される同じ投与量及び投与経路で、若しくは本明細書で記載される投与量の約1から99%で、又は任意の投与量で、適切であることが経験的/臨床的に決定されている任意の経路により使用する。
上記で言及した、このような併用療法は、混合投与(この場合、2つ又はこれを超える治療剤を、同じ組成物中又は個別の組成物中に組み入れる)と、その場合、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の投与を、さらなる治療剤及び/又はアジュバントの投与の前に、これと同時に、かつ/又はこの後で行いうる個別投与とを包摂する。本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子はまた、放射線療法と組み合わせて使用することもできる。
製造品
本発明の別の態様では、上記で記載した障害の治療、予防、及び/又は診断に有用な材料を含有する製造品が提供される。製造品は、容器と、容器上のラベル又は容器に添付された添付文書とを含む。適切な容器は、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、IV溶液バッグなどを含む。容器は、ガラス又はプラスチックなど、様々な材料から形成することができる。容器は、単独の、又は状態を治療、予防、及び/又は診断するために有効な別の組成物と混合された組成物を保持し、滅菌のアクセスポートを有しうる(例えば、容器は、静脈内溶液バッグの場合もあり、皮下注射針により穿刺可能な止栓を有するバイアルの場合もある)。組成物中の、少なくとも1つの活性薬剤は、本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子である。標識又は添付文書は、組成物を、えり抜きの状態を治療するために使用することを指し示す。さらに、製造品は、(a)本発明のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を含む組成物をその中に含有した第1の容器と;(b)細胞傷害性治療剤又はそれ以外の治療剤をさらに含む組成物をその中に含有した第2の容器とを含みうる。本発明のこの実施態様における製造品はさらに、組成物を使用して、特定の状態を治療しうることを指し示す添付文書も含みうる。代替的に、又は加えて、製造品はさらに、静菌性の注射用水(BWFI)、リン酸緩衝生理食塩水、リンゲル液、及びデキストローズ溶液など、薬学的に許容可能なバッファーを含む、第2の(又は第3の)容器も含みうる。製造品はさらに、商業的視点及び使用者的視点から所望される他の材料であって、他のバッファー、希釈剤、フィルター、注射針、及びシリンジを含む材料も含みうる。
例示的実施態様
1. (a)CD3への特異的結合が可能な第1の抗原結合部分と;
(b)標的細胞抗原への特異的結合が可能な第2の抗原結合部分と;
(c)プロテアーゼ切断型リンカーを介して、T細胞二重特異性結合性分子と共有結合しているマスキング部分であって、第1又は第2の抗原結合部分のイデオタイプへの特異的結合が可能であり、これにより、第1又は第2の抗原結合部分を、可逆的に隠蔽するマスキング部分と
を含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
2. マスキング部分が、第1の抗原結合部分と共有結合しており、第1の抗原結合部分を可逆的に隠蔽する、実施態様1のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
3. マスキング部分が、第1の抗原結合部分の重鎖可変領域と共有結合している、実施態様1又は2のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
4. マスキング部分が、第1の抗原結合部分の軽鎖可変領域と共有結合している、実施態様1又は2のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
5. マスキング部分が、抗イデオタイプscFvである、実施態様1から4のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
6. プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子が、第2の抗原結合部分を可逆的に隠蔽する、第2のマスキング部分を含む、実施態様2から5のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
7. プロテアーゼを、標的細胞に発現させる、実施態様1から6のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
8. 第2の抗原結合部分が、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変領域又は定常領域を交換した、クロスオーバーFab分子である、実施態様1から7のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
9. 第2の抗原結合部分が、Fab軽鎖及びFab重鎖の定常領域を交換した、クロスオーバーFab分子である、実施態様1から8のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
10. 第1の抗原結合部分が、従来型のFab分子である、実施態様1から9のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
11. CD3への特異的結合が可能な、1つを超えない抗原結合部分を含む、実施態様1から10のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
12. 標的細胞抗原への特異的結合が可能なFab分子である、第3の抗原結合部分を含む、実施態様1から11のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
13. 第3の抗原結合部分が、第2の抗原結合部分と同一である、実施態様12のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
14. 第2の抗原結合部分が、FolR1又はHER1への特異的結合が可能である、実施態様1から13のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
15. 第2の抗原結合部分が、FolR1、HER1、及びメソテリンからなる群から選択される標的細胞抗原への特異的結合が可能である、実施態様1から13のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
16. 第2の抗原結合部分が、FolR1、HER1、HER2、及びメソテリンからなる群から選択される標的細胞抗原への特異的結合が可能である、実施態様1から13のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
17. 第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分が、任意選択的にペプチドリンカーを介して互いに融合している、実施態様1から16のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
18. 第2の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第1の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させた、実施態様1から17のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
19. 第1の抗原結合部分を、Fab重鎖のC末端において、第2の抗原結合部分のFab重鎖のN末端へと融合させた、実施態様1から17のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
20. 第1の抗原結合部分のFab軽鎖及び第2の抗原結合部分のFab軽鎖が、任意選択的にペプチドリンカーを介して互いに融合している、実施態様1から19のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
21. 安定的な会合が可能な、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインを加えて含む、実施態様1から20のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
22. Fcドメインが、IgG、具体的には、IgG又はIgGのFcドメインである、実施態様21のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
23. Fcドメインが、ヒトFcドメインである、実施態様21又は22のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
24. Fcドメインが、天然IgGのFcドメインと比較した、Fc受容体への結合親和性の低減及び/又はエフェクター機能の低減を呈示する、実施態様21から23のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
25. Fcドメインが、Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低減する、一又は複数のアミノ酸置換を含む、実施態様24のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
26. 前記一又は複数のアミノ酸置換が、L234、L235、及びP329(カバット番号付け)の群から選択される、一又は複数の位置におけるものである、実施態様25のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
27. Fcドメインの各サブユニットが、活性化Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低減する、3つのアミノ酸置換であって、L234A、L235A、及びP329Gであるアミノ酸置換を含む、実施態様26のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
28. Fc受容体が、Fcγ受容体である、実施態様24から27のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
29. エフェクター機能が、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)である、実施態様24から28のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
30. マスキング部分が、
(a)DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;及び
(c)PYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む、実施態様1から29のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
31. マスキング部分が、
(d)RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む、実施態様1から30のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
32. マスキング部分が、
(a)DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;
(c)PYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
(d)RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む、実施態様1から31のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
33. マスキング部分が、
(a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;及び
(c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む、実施態様1から29のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
34. マスキング部分が、
(d)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む、実施態様1から29及び33のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
35. マスキング部分が、
(a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;
(c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
(d)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む、実施態様1から29及び33から34のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
36. マスキング部分が、
(a)DYYIN(配列番号48)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)VINPDSGGTDYNQNFKG(配列番号49)のCDR H2アミノ酸配列;及び
(c)RDSYGFDY(配列番号50)のCDR H3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む、実施態様1から35のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
37. マスキング部分が、
(a)KASLSVTNDVA(配列番号51)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(b)YASNRNA(配列番号52)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(c)QQDYTSPPT(配列番号53)のCDR L3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む、実施態様1から36のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
38. マスキング部分が、
a)DYYIN(配列番号48)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
b)VINPDSGGTDYNQNFKG(配列番号49)のCDR H2アミノ酸配列;及び
c)RDSYGFDY(配列番号50)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
d)KASLSVTNDVA(配列番号51)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
e)YASNRNA(配列番号52)のCDR L2アミノ酸配列;及び
f)QQDYTSPPT(配列番号53)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む、実施態様1から37のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
39. プロテアーゼ切断型リンカーが、少なくとも1つのプロテアーゼ認識配列を含む、実施態様1から38のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
40. プロテアーゼ切断型リンカーが、プロテアーゼ認識配列を含む、実施態様39のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
41. プロテアーゼ認識配列が、
(a)RQARVVNG(配列番号36);
(b)VHMPLGFLGPGRSRGSFP(配列番号37);
(c)RQARVVNGXXXXXVPLSLYSG(配列番号38);及び
(d)RQARVVNGVPLSLYSG(配列番号39)
(e)PLGLWSQ(配列番号40)
[配列中、Xは、任意のアミノ酸である]
からなる群から選択される、実施態様40のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
42. プロテアーゼ認識配列が、
(a)RQARVVNG(配列番号36);
(b)VHMPLGFLGPGRSRGSFP(配列番号37);
(c)RQARVVNGXXXXXVPLSLYSG(配列番号38);
(d)RQARVVNGVPLSLYSG(配列番号39);
(e)PLGLWSQ(配列番号40);
(f)VHMPLGFLGPRQARVVNG(配列番号97);
(g)FVGGTG(配列番号98);
(h)KKAAPVNG(配列番号99);
(i)PMAKKVNG(配列番号100);
(j)QARAKVNG(配列番号101);
(k)VHMPLGFLGP(配列番号102);
(l)QARAK(配列番号103);
(m)VHMPLGFLGPPMAKK(配列番号104);
(n)KKAAP(配列番号105);及び
(o)PMAKK(配列番号106)
[配列中、Xは、任意のアミノ酸である]
からなる群から選択される、実施態様40のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
43. プロテアーゼ切断型リンカーが、プロテアーゼ認識配列RQARVVNG(配列番号36)を含む、実施態様39又は40のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
44. プロテアーゼ切断型リンカーが、プロテアーゼ認識配列VHMPLGFLGPRQARVVNG(配列番号97)を含む、実施態様39又は40のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
45. プロテアーゼ切断型リンカーが、プロテアーゼ認識配列RQARVVNG(配列番号36)、又はプロテアーゼ認識配列VHMPLGFLGPRQARVVNG(配列番号97)を含む、実施態様39又は40のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
46. プロテアーゼが、メタロプロテイナーゼ、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、及びカテプシンプロテアーゼからなる群から選択される、実施態様1から45のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
47. メタロプロテイナーゼが、マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)、好ましくは、MMP9又はMMP2である、実施態様46のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
48. セリンプロテアーゼが、マトリプターゼである、実施態様46のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
49. 第1の抗原結合部分が、配列番号44、配列番号45、及び配列番号46からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
50. 第1の抗原結合部分が、CD3への特異的結合が可能であり、
a)TYAMN(配列番号44)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
b)RIRSKYNNYATYYADSVKG(配列番号45)のCDR H2アミノ酸配列;及び
c)HGNFGNSYVSWFAY(配列番号46)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
d)GSSTGAVTTSNYAN(配列番号17)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
e)GTNKRAP(配列番号18)のCDR L2アミノ酸配列;及び
f)ALWYSNLWV(配列番号19)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む、実施態様1から49のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
51. 第1の抗原結合部分が、配列番号43のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様1から50のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
52. 第1の抗原結合部分が、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号43のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様1から50のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
53. 第2の抗原結合部分が、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号14、配列番号15、及び配列番号16からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号17、配列番号18、及び配列番号19の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む、実施態様1から52のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
54. 第2の抗原結合部分が、FolR1への特異的結合が可能であり、
a)NAWMS(配列番号14)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
b)RIKSKTDGGTTDYAAPVKG(配列番号15)のCDR H2アミノ酸配列;及び
c)PWEWSWYDY(配列番号16)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
d)GSSTGAVTTSNYAN(配列番号17)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
e)GTNKRAP(配列番号18)のCDR L2アミノ酸配列;及び
f)ALWYSNLWV(配列番号19)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む、実施態様1から53のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
55. 第2の抗原結合部分が、配列番号47のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様1から54のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
56. 第2の抗原結合部分が、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号47のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様1から54のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
57. 第2の抗原結合部分が、FolR1への特異的結合が可能であり、配列番号151、配列番号152、及び配列番号153からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号154、配列番号155、及び配列番号156の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む、実施態様1から52のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
58. 第2の抗原結合部分が、FolR1への特異的結合が可能であり、
a)SYYMH(配列番号151)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
b)IINPSGGSTSYAQKFQG(配列番号152)のCDR H2アミノ酸配列;及び
c)SFFTGFHLDY(配列番号153)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
d)RASQSVSSSYLA(配列番号154)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
e)GASSRAT(配列番号155)のCDR L2アミノ酸配列;及び
f)QQYTNEHYYT(配列番号156)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む、実施態様1から52又は57のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
59. 第2の抗原結合部分が、配列番号157のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号158のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様1から52、57又は58のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
60. 第2の抗原結合部分が、ForR1への特異的結合が可能であり、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号158のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様1から52又は57から59のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
61. 第2の抗原結合部分が、メソテリンへの特異的結合が可能であり、配列番号107、配列番号108、及び配列番号109からなる群から選択される、少なくとも1つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号110、配列番号111、及び配列番号112の群から選択される、少なくとも1つの軽鎖CDRとを含む、実施態様1から52のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
62. 第2の抗原結合部分が、メソテリンへの特異的結合が可能であり、
a)GYTMN(配列番号107)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
b)LITPYNGASSYNQKFRG(配列番号108)のCDR H2アミノ酸配列;
c)GGYDGRGFDY(配列番号109)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
d)SASSSVSYMH(配列番号110)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
e)DTSKLAS(配列番号111)のCDR L2アミノ酸配列;及び
f)QQWSKHPLT(配列番号112)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む、実施態様1から52又は61のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
63. 第2の抗原結合部分が、配列番号113のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号114のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様1から52、61、又は62のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
64. 第2の抗原結合部分が、メソテリンへの特異的結合が可能であり、配列番号113のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号114のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様1から52又は61から63のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
65. 第2の抗原結合部分が、配列番号32のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む重鎖と、配列番号33のアミノ酸配列と、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一なアミノ酸配列を含む軽鎖とを含む、実施態様1から52のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
66. 第2の抗原結合部分が、HER1への特異的結合が可能であり、配列番号115のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号116のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様1から52又は65のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
67. (a)配列番号2のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
68. (a)配列番号4のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
69. a)配列番号32のアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの重鎖と;
b)配列番号34のアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
70. (a)配列番号72のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
71. (a)配列番号85のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
72. (a)配列番号73のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号1のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号74のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
73. (a)配列番号77のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号82のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号78のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号81のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
74. (a)配列番号76のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号77のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号78のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号79のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
75. (a)配列番号132のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号136のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号81のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号133のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
76. (a)配列番号137のアミノ酸配列を含む、第1の重鎖と;
(b)配列番号139のアミノ酸配列を含む、第2の重鎖と;
(c)配列番号81のアミノ酸配列を含む、第1の軽鎖と;
(d)配列番号138のアミノ酸配列を含む、第2の軽鎖と
を含む、実施態様1から48のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
77. 分子の抗CD3抗原結合部位を可逆的に隠蔽するための、イデオタイプ特異的ポリペプチド。
78. 抗イデオタイプscFvである、実施態様77のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
79. リンカーを介して分子と共有結合している、実施態様77又は78のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
80. リンカーが、ペプチドリンカーである、実施態様79のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
81. リンカーが、プロテアーゼ切断型リンカーである、実施態様79又は80のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
82. ペプチドリンカーが、少なくとも1つのプロテアーゼ認識部位を含む、実施態様79から81のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド。
83. プロテアーゼが、メタロプロテイナーゼ、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、及びカテプシンプロテアーゼからなる群から選択される、実施態様82のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
84. メタロプロテイナーゼが、マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)、好ましくは、MMP9又はMMP2である、実施態様83のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
85. セリンプロテアーゼが、マトリプターゼである、実施態様83のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
86. プロテアーゼ切断型リンカーが、プロテアーゼ認識配列RQARVVNG(配列番号36)、又はプロテアーゼ認識配列VHMPLGFLGPRQARVVNG(配列番号97)を含む、実施態様82のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
87. 分子が、T細胞活性化二重特異性分子である、実施態様の77から86のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド。
88. (a)DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;及び
(c)PYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む、実施態様77から87のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド。
89. (d)RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む、実施態様77から88のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド。
90. (a)DYSIH(配列番号20)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)WINTETGEPAYADDFKG(配列番号21)のCDR H2アミノ酸配列;
(c)PYDYDVLDY(配列番号22)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
(d)RASKSVSTSNYSYIH(配列番号23)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)YVSYLES(配列番号24)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHSREFPWT(配列番号25)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む、実施態様77から87のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド。
91. (a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;及び
(c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む、実施態様77から87のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド。
92. (d)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
のうちの少なくとも1つを含む軽鎖可変領域を含む、実施態様77から87及び91のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド。
93. (a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
(b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;
(c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
を含む重鎖可変領域と;
(d)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
(e)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
(f)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域と
を含む、実施態様77から87のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド。
94. 抗CD3抗原結合部位が、配列番号43のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、実施態様77から93のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
95. 実施態様1から76のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性抗原結合分子、又は実施態様77から94のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチド。
96. 実施態様95のポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド。
97. ベクター、特に、実施態様95のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
98. 実施態様95のポリヌクレオチド、又は実施態様97のベクターを含む宿主細胞。
99. プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を生成する方法であって、a)実施態様98の宿主細胞を、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の発現に適する条件下で培養する工程と、b)プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を回収する工程とを含む方法。
100. 実施態様99の方法により生成されるプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
101. イデオタイプ特異的ポリペプチドを生成する方法であって、a)実施態様98の宿主細胞を、イデオタイプ特異的ポリペプチドの発現に適する条件下で培養する工程と、b)イデオタイプ特異的ポリペプチドを回収する工程とを含む方法。
102. 実施態様101の方法により生成されるイデオタイプ特異的ポリペプチド。
103. 実施態様1から76のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子と、薬学的に許容される担体とを含む薬学的組成物。
104. 実施態様77から94のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチドと、薬学的に許容される担体とを含む薬学的組成物。
105. 医薬としての使用のための、実施態様1から76のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、実施態様77から94のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド、又は実施態様103の組成物。
106. 医薬が、がんを治療するか、若しくはその進行を遅延させるか、免疫関連疾患を治療するか、若しくはその進行を遅延させるか、又は個体における免疫応答若しくは免疫機能を増強若しくは刺激するためのものである、実施態様105に従う使用のためのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
107. それを必要とする個体における疾患の治療における使用のための、実施態様1から76のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又は実施態様77から94のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチド。
108. 疾患が、がんである、実施態様107に記載の、それを必要とする個体における疾患の治療における使用のための、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又はイデオタイプ特異的ポリペプチド。
109. 医薬を製造するための、実施態様1から76のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又は実施態様77から94のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチドの使用。
110. 疾患が、がんである、実施態様109に記載の使用。
111. 個体における疾患を治療する方法であって、前記個体へと、実施態様1から76のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又は実施態様103の組成物を含む、治療的有効量の組成物を投与することを含む方法。
112. 標的細胞の溶解を誘導するための方法であって、T細胞の存在下で、標的細胞を、実施態様1から76のいずれか1つのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又は実施態様103の組成物と接触させることを含む方法。
113. 標的細胞が、がん細胞である、実施態様112の方法。
114. 標的細胞が、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を活性化させることが可能なプロテアーゼを発現させる、実施態様112又は113の方法。
115. 抗CD3抗原結合分子のイデオタイプに特異的な、抗イデオタイプCD3抗体又はその抗原結合断片であって、抗CD3抗原結合分子に特異的に結合すると、抗CD3抗原結合分子の、CD3への結合をブロックする、抗イデオタイプCD3抗体又はその断片。
116. プロテアーゼ認識部位を含むペプチドリンカーを介して、抗CD3抗原結合分子と可逆的に会合する、実施態様115の抗イデオタイプCD3抗体又はその抗原結合断片。
117. CD3が、マウスCD3、サルCD3、又はヒトCD3である、実施態様115又は116の抗イデオタイプCD3抗体又はその抗原結合断片。
118. T細胞活性化二重特異性分子の、インビボにおける毒性を軽減する方法であって、実施態様77から94のいずれか1つのイデオタイプ特異的ポリペプチドを、プロテアーゼ切断型リンカーにより、T細胞活性化二重特異性分子と結合させて、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を形成することを含み、プロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子の、インビボにおける毒性を、T細胞活性化二重特異性分子の毒性と比較して軽減する方法。
119. 本明細書で記載した前出の通りの本発明。
以下は、本発明の方法及び組成物の例である。上記で提示した一般的な記載を踏まえ、他の多様な実施態様も実施しうることが理解される。
実施例1
抗イデオタイプscFvを伴う、一価の抗CD3 IgG分子の合成
本明細書では、N末端において連結された抗イデオタイプCD3 scFvによりマスキングされるCD3結合剤について記載する。これらのコンストラクトは、腫瘍特異的プロテアーゼにより認識されるプロテアーゼ認識部位を含む。プロテアーゼ発現腫瘍細胞の存在下で、マスキング部分を接続するリンカーが切断され、これにより、CD3結合剤によるCD3への結合が回復する。多様な抗イデオタイプscFvを伴う、いくつかの一価の抗CD3 IgG分子を生成したが、図1A−1Eに、それらのそれぞれのID番号と共に、概略的に描示する。以下の分子:
識別番号7859:N末端において、抗CD3 scFv 4.15.64及びプロテアーゼ切断型リンカーを融合させた、一価のCD3 IgG(抗イデオタイプscFv 4.15.64−MK062マトリプターゼ部位−CD3−N末端におけるCD3 Fabへの融合−不活性Fc);
識別番号7860:N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びプロテアーゼ切断型リンカーを融合させた、一価のCD3 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−MK062マトリプターゼ部位−CD3−N末端におけるCD3 Fabへの融合−不活性Fc);
識別番号7857:N末端において、抗CD3 scFv 4.15.64及びプロテアーゼ切断型リンカーを融合させた、一価のCD3 IgG(抗イデオタイプscFv 4.15.64−非切断型リンカー−CD3−N末端におけるCD3 Fabへの融合−不活性Fc);
識別番号7858:N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びプロテアーゼ切断型リンカーを融合させた、一価のCD3 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−非切断型リンカー−CD3−N末端におけるCD3 Fabへの融合−不活性Fc);
識別番号7861:N末端において、抗CD3 scFv 4.15.64/4.32.63及びプロテアーゼリンカーを融合させた、一価のCD3 IgG(CD3 Fab−不活性Fc)
を調製した。
抗イデオタイプ(ID)結合剤の配列は、ハイブリドーマ細胞のRNAから、RACE−PCR(rapid amplification of cDNA end)により得た。ハイブリドーマ細胞は、CH2527(VL_7−46(13)/VH_3−23(12))Fab断片を伴うマウスの免疫化により得た。クローニングに必要な制限部位を含む単鎖Fv(ScFv)配列の合成は、Invitrogenに依頼した。6つの異なる抗イデオタイプCH2527結合剤を、それらの親和性について比較し(図2;Biacore−Analytics(AG M.Schraeml)による、25℃/37℃(Analyt:MAK<CEA/CD3>rH)における結果)、それらのうちの2つを、CD3 Fab−Fcの重鎖におけるN末端融合体としてクローニングした。
抗ID単鎖Fv DNA配列を、それぞれのレシピエントの哺乳類発現ベクターへとあらかじめ挿入されたCD3 VH鎖とインフレームで、サブクローニングした。タンパク質の発現は、MPSVプロモーターにより駆動され、合成polyAシグナル配列は、CDSの3’末端に存在する。加えて、各ベクターは、EBV OriP配列を含有する。
ポリエチレンイミン(PEI)を使用して、懸濁液中で増殖するHEK293−EBNA細胞を、哺乳類発現ベクターと共にコトランスフェクトすることにより、分子を生成した。細胞に、対応する発現ベクターを、1:1:2の比(「Fcホール(CH2−CH3)」:「共通軽鎖(CLC)」:「ベクター重鎖ノブ(scFv−VH−CH1−CH2−CH3)」)でトランスフェクトした。
トランスフェクションのために、HEK293 EBNA細胞を、6mMのL−グルタミン及び250mg/lのG418を含有する、無血清ExCell培地中で培養した。600mlのチューブスピンフラスコ(最大の作業容積を400mLとする)内の生成のために、8億個のHEK293 EBNA細胞を、G418を伴わないトランスフェクションの24時間前に播種した。トランスフェクションのために、8億個の細胞を、210×gで、5分間にわたり遠心分離し、上清を、6mMのL−グルタミンを含有する、あらかじめ温めておいた40mlのCD CHO培地で置きかえた。発現ベクターを、6mMのL−グルタミンを含有する、40mlのCD CHO培地と共に、総量400μgのDNAへと混合した。PEI溶液(2.7μg/ml)1080μlを添加した後で、混合物を、15秒間にわたり、ボルテックスし、その後、室温で10分間にわたりインキュベートした。その後、細胞を、DNA/PEI溶液と混合し、600mlのチューブスピンフラスコへと移し、5%のCO雰囲気を伴うインキュベーター内、37℃で、3時間にわたりインキュベートした。インキュベーション後、320mlのExCell+6mMのL−グルタミン+5g/LのPepsoy+1.0mMのVPA+3g/lのグルコース培地を添加し、細胞を、24時間にわたり培養してから、7%のFeed 7でフィードした。6−7日間にわたる培養の後、上清を、210×g(Sigma 8K遠心分離機)で、20−30分間にわたる遠心分離による精製のために回収した。溶液を滅菌濾過(0.22μmのフィルター)し、最終濃度を0.01%w/vとするアジ化ナトリウムを添加した。精製まで、溶液を4℃に保った。分泌タンパク質は、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用するアフィニティークロマトグラフィーに続く、1から2回にわたるサイズ除外クロマトグラフィー工程により、細胞培養物上清から精製した。
アフィニティークロマトグラフィーのために、上清を、25mlの20mMのリン酸ナトリウム、20mMのクエン酸ナトリウム、0.5Mの塩化ナトリウム、0.01%のTween−20 pH7.5で平衡化したHiTrap Protein A FFカラム(CV=5mL;GE Healthcare)上にロードした。20mMのリン酸ナトリウム、20mMのクエン酸ナトリウム、0.5Mの塩化ナトリウム、0.01%のTween−20 pH7.5の少なくとも10カラム容積で洗浄することにより、結合しなかったタンパク質を除去し、標的タンパク質を、20mMのクエン酸ナトリウム、0.5Mの塩化ナトリウム、0.01%のTween−20 pH2.5の20カラム容積(0%−100%の勾配)中に溶出させた。タンパク質溶液は、2MのトリスpH 10.5の1/10を添加することにより中和した。標的タンパク質は、20mMのヒスチジン、140mMの塩化ナトリウム、pH6.0、0.01%のTween20で平衡化されたHiLoad Superdex 200カラム(GE Healthcare)上にロードする前に、Amicon(登録商標)Ultra−15 Ultracel 30K(Merck Millipore Ltd.)で、最大で4mlの容積へと濃縮した。
サイズ排除クロマトグラフィーの後における解析法のために、単一画分中の分子の純度及び分子量は、還元剤の非存在下におけるSDS−PAGE及びクーマシー(InstantBlue(商標)、Expedeon)による染色により解析した。製造元の指示書に従い、NuPAGE(登録商標)Pre−Castゲル系(4−12%のビス−トリス;Invitrogen又は3−8%のトリス酢酸塩;Invitrogen)を使用した。
精製タンパク質試料のタンパク質濃度は、280nmにおける光学濃度(OD)を測定し、アミノ酸配列に基づき計算されるモル減衰係数で除することにより決定した。
最終的な精製工程の後における、分子の純度及び分子量は、還元剤の存在下及び非存在下におけるCE−SDS解析により解析した。製造元の指示書に従い、Caliper LabChip GXIIシステム(Caliper Lifescience)を使用した。分子の凝集物含有量は、25mMのK2HPO4、125mMのNaCl、200mMのL−アルギニン一塩酸塩、0.02%(w/v)のNaN3、pH6.7のランニングバッファー中、25℃で、TSKgel G3000 SW XL解析用サイズ除外カラム(Tosoh)を使用して解析した。全ての分子の最終品質は、良好であり、モノマー含有量は、≧92%であった。
実施例2
プロテアーゼ活性化IgGの切断及び安定性
プロテアーゼ活性化IgG分子についてのキャピラリー電気泳動:非処理試料と、処理試料との比較は、SDS PAGE解析におけるサイズのシフトにより指し示される(図3)通り、抗ID scFvが、rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)による処理の後で、完全に切断されることを示した。37℃で48時間にわたりインキュベートされた試料についての解析は、製剤バッファー中の分子の安定性を確認した(図3A−3D)。
実施例3
CD3 IgGに対する、抗イデオタイプscFvのマスキング効果
N末端における、抗イデオタイプCD3 scFvの融合により、CD3結合剤をマスキングする効能を、Jurkat−NFATレポーターアッセイにより示した。Jurkat−NFATレポーター細胞(NFATプロモーターにより調節されたルシフェラーゼの発現を伴う、ヒト急性リンパ性白血病のレポーター細胞株;GloResponse Jurkat NFAT−RE−luc2P、Promega:型番CS176501)は、CD3εの結合により、NFATプロモーターが活性化すると、活性のホタルルシフェラーゼを発現させる。ルシフェラーゼ基質を添加したときの発光シグナルの強度は、CD3の活性化及びシグナル伝達の強度に比例する。完全に非マスキングの一価CD3分子を、ポジティブコントロールとして用いた。処理は、rhマトリプターゼ/ST14(R&D Systems)により、37℃で48時間にわたり行った。並行して、壁面が白色の96ウェル透明底(平底)プレート(Greiner Bio−One)を、ウェル1つ当たり0.025ulのPBS中に、8ug/mlの抗ヒトFc抗体(BioLegends)により、4℃で48時間にわたりコーティングした。ピペッティングにより、PBSを除去してから、一価のIgGを、200nM−2.56pMである、表示の濃度範囲で添加した。プレートを、4℃で約30分間にわたりインキュベートした。その後、Jurkat−NFATレポーター細胞を採取し、生存率は、ViCellを使用して評価した。細胞を、ハイグロマイシンを伴わないJurkat培地(RPMI1640、2g/lのグルコース、2g/lのNaHCO3、10%のFCS、25mMのHEPES、2mMのL−グルタミン、1×NEAA、1×ピルビン酸ナトリウム)中に再懸濁させ、ウェル1つ当たり100μl(ウェル1つ当たりの細胞25,000個)を、一価の架橋CD3 IgGへと添加した。細胞を、加湿インキュベーター内、37℃で3時間にわたりインキュベートした。プレートを、約10分間にわたり、インキュベーターから取り出して、室温へと適応させてから、発光の読取りを行った。ウェル1つ当たり100μlのONE−Glo溶液(ウェル1つ当たり、1:1のONE−Glo及びアッセイ培地容積)を、ウェルへと添加し、暗所内、室温で10分間にわたりインキュベートした。発光を、WALLAC Victor3 ELISAリーダー(PerkinElmer2030)と、検出時間としての、ウェル1つ当たり1秒間とを使用して検出した。7857(非切断型リンカーを伴う4.15.64マスク)及び7859(非処理)は、非マスキング(7861)及び前処理分子(処理ありの7859)と比較して、著明に低減されたCD3εの結合を示す(図4A)。7760を、N末端の連結が、CD3の結合自体をブロックするわけではないことを示すコントロールとして組み入れた。7858(非切断型リンカーを伴う4.32.63マスク)及び7860(非処理)は、非マスキング(7861)及び前処理分子(処理ありの7860)と比較して、著明に低減されたCD3εの結合を示す(図4B)。4.32.63マスクが、4.15.64より、はるかに効果的であることは、抗イデオタイプCD3結合剤の親和性と符合する。EC50値(図4C)の点では、4.32.63は、CD3結合剤の結合を、非マスキングのCD3結合剤である7861の54分の1にマスキングした。4.15.64マスクについては、CD3結合剤の結合のマスキングは、7861の16分の1にとどまる。腫瘍標的及び標的結合剤に応じて、最良のマスクを査定することができる。
実施例4
抗CD3 scFvを伴う抗FolR1/抗CD3 T細胞二重特異性(TCB)分子の調製物
多様な抗イデオタイプscFvを伴う、いくつかのT細胞二重特異性(TCB)分子を生成したが、図5A−5Hに、それらのそれぞれのID番号と共に、概略的に描示する。以下の分子:
ID7344:N末端において、抗CD3 scFv 4.15.64及びプロテアーゼリンカーを融合させた、古典的フォーマットのFolR1 16D5 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.15.64−MK062マトリプターゼ部位−CD3−N末端におけるFolR1 VHへの融合−不活性Fc)(図5A;配列番号1、2、及び3);
ID7496:N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びプロテアーゼリンカーを融合させた、古典的フォーマットのFolR1 16D5 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−MK062マトリプターゼ部位−CD3−N末端におけるFolR1 VHへの融合−不活性Fc)(図5C;配列番号1、3、及び4);
ID7676:N末端において、抗CD3 scFv 4.15.64及びプロテアーゼリンカーを融合させた、古典的フォーマットのFolR1 16D5 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.15.64−非切断型GSリンカー−CD3−N末端におけるFolR1 VHへの融合−不活性Fc)(図5B;配列番号1、3、及び6);
ID7611:N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びプロテアーゼリンカーを融合させた、古典的フォーマットのFolR1 16D5 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−非切断型GSリンカー−CD3−N末端におけるFolR1 VHへの融合−不活性Fc)(図5D;配列番号1、3、及び5)
を調製した。
抗イデオタイプ(ID)結合剤の配列は、ハイブリドーマ細胞のRNAから、RACE−PCR(rapid amplification of cDNA end)により得た。ハイブリドーマ細胞は、マウスの免疫化により得た。クローニングに必要な制限部位を含む単鎖Fv(ScFv)配列の合成は、Invitrogenに依頼した。6つの異なる抗イデオタイプCH2527結合剤を、それらの親和性について比較し(図2;Biacore−Analytics(AG M.Schraeml)による、25℃/37℃(Analyt:MAK<CEA/CD3>rH)における結果)、それらのうちの4つを、CD3−FolR1 16D5 TCBのHCにおけるN末端融合体としてクローニングした。
抗ID単鎖Fv DNA配列を、それぞれのレシピエントの哺乳類発現ベクターへとあらかじめ挿入されたCD3 VH鎖とインフレームで、サブクローニングした。タンパク質の発現は、MPSVプロモーターにより駆動され、合成polyAシグナル配列は、コード配列(CDS)の3’末端に存在する。加えて、各ベクターは、EBV OriP配列を含有する。
ポリエチレンイミン(PEI)を使用して、懸濁液中で増殖するHEK293−EBNA細胞を、哺乳類発現ベクターと共にコトランスフェクトすることにより、分子を生成した。細胞に、対応する発現ベクターを、1:3:2の比(「ベクター重鎖ホール(VH−CH1−CH2−CH3)」:「共通軽鎖(CLC)」:「ベクター重鎖ノブ(scFv−VH−CH1−VH−CH1−CH2−CH3)」)でトランスフェクトした。
トランスフェクションのために、HEK293 EBNA細胞を、6mMのL−グルタミン及び250mg/lのG418を含有する、無血清ExCell培地中で培養した。600mlのチューブスピンフラスコ(最大の作業容積を400mLとする)内の生成のために、8億個のHEK293 EBNA細胞を、G418を伴わないトランスフェクションの24時間前に播種した。トランスフェクションのために、8億個の細胞を、210×gで、5分間にわたり遠心分離し、上清を、6mMのL−グルタミンを含有する、40mlのあらかじめ温めておいたCD CHO培地で置きかえた。発現ベクターを、6mMのL−グルタミンを含有する、40mlのCD CHO培地と共に、総量400μgのDNAへと混合した。PEI溶液(2.7μg/ml)1080μlを添加した後で、混合物を、15秒間にわたり、ボルテックスし、その後、室温で10分間にわたりインキュベートした。その後、細胞を、DNA/PEI溶液と混合し、600mlのチューブスピンフラスコへと移し、5%のCO2雰囲気を伴うインキュベーター内、37℃で、3時間にわたりインキュベートした。インキュベーション後、320mlのExCell+6mMのL−グルタミン+5g/LのPepsoy+1.0mMのVPA+3g/lのグルコース培地を添加し、細胞を、24時間にわたり培養してから、7%のFeed 7でフィードした。6−7日間にわたる培養の後、上清を、210×g(Sigma 8K遠心分離機)で、20−30分間にわたる遠心分離による精製のために回収した。溶液を滅菌濾過(0.22μmのフィルター)し、最終濃度を0.01%w/vとするアジ化ナトリウムを添加した。精製まで、溶液を4℃に保った。分泌タンパク質は、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用するアフィニティークロマトグラフィーに続く、1から2回にわたるサイズ除外クロマトグラフィー工程により、細胞培養物上清から精製した。
アフィニティークロマトグラフィーのために、上清を、25mlの20mMのリン酸ナトリウム、20mMのクエン酸ナトリウム、0.5Mの塩化ナトリウム、0.01%のTween−20 pH7.5で平衡化したHiTrap Protein A FFカラム(CV=5mL;GE Healthcare)上にロードした。20mMのリン酸ナトリウム、20mMのクエン酸ナトリウム、0.5Mの塩化ナトリウム、0.01%のTween−20 pH7.5の少なくとも10カラム容積で洗浄することにより、結合しなかったタンパク質を除去し、標的タンパク質を、20mMのクエン酸ナトリウム、0.5Mの塩化ナトリウム、0.01%のTween−20 pH2.5の20カラム容積(0%−100%の勾配)中に溶出させた。タンパク質溶液は、2MのトリスpH 10.5の1/10を添加することにより中和した。標的タンパク質は、20mMのヒスチジン、140mMの塩化ナトリウム、pH6.0、0.01%のTween20で平衡化されたHiLoad Superdex 200カラム(GE Healthcare)上にロードする前に、Amicon(登録商標)Ultra−15 Ultracel 30K(Merck Millipore Ltd.)で、4mlの最大容積へと濃縮した。
サイズ排除クロマトグラフィーの後における解析法のために、単一画分中の分子の純度及び分子量は、還元剤の非存在下におけるSDS−PAGE及びクーマシー(InstantBlue(商標)、Expedeon)による染色により解析した。製造元の指示書に従い、NuPAGE(登録商標)Pre−Castゲル系(4−12%のビス−トリス;Invitrogen又は3−8%のトリス酢酸塩;Invitrogen)を使用した。
精製タンパク質試料のタンパク質濃度は、280nmにおける光学濃度(OD)を測定し、アミノ酸配列に基づき計算されるモル減衰係数で除することにより決定した。
最終的な精製工程の後における、分子の純度及び分子量は、還元剤の存在下及び非存在下におけるCE−SDS解析により解析した。製造元の指示書に従い、Caliper LabChip GXIIシステム(Caliper Lifescience)を使用した。
分子の凝集物含有量は、25mMのK2HPO4、125mMのNaCl、200mMのL−アルギニンモノハイドロクロライド、0.02%(w/v)のNaN3、pH6.7のランニングバッファー中、25℃で、TSKgel G3000 SW XL解析用サイズ除外カラム(Tosoh)を使用して解析した。全ての分子の最終品質は、良好であり、モノマー含有量は、≧92%であった。
実施例5
プロテアーゼ活性化TCBの一過性発現
ノブ鎖は、ホール鎖及び軽鎖と比較して、低レベルで発現することが疑われるので、トランスフェクションのために使用される、異なるプラスミド比を、サイズ除外クロマトグラフィーにより比較した。図6及び7に示す通り、1(ホール):1(ノブ):3(CLC)(図6)ではなく、1(ホール):2(ノブ):3(CLC)(図7)のプラスミド比を使用したところ、適正な分子(左ピーク)の収量が増大し、ホール−ホールホモダイマー(右ピーク)の量が減少した。
実施例6
プロテアーゼ活性化TCBの切断及び安定性
プロテアーゼ活性化TCBを、キャピラリー電気泳動により解析した。非処理試料と、処理試料との比較は、抗イデオタイプscFc部分が、rhマトリプターゼ/ST14による処理の後で、完全に切断されることを示した。37℃で48時間にわたりインキュベートされた試料についての解析は、製剤バッファー中の分子の安定性を確認した(図12A−12D)。
実施例7
異なるレベルのFolR1を発現させる標的細胞株を使用する細胞殺滅
異なるレベルのFolR1を発現させる標的細胞株を使用して、プロテアーゼ活性化TCB分子により誘導される、T細胞媒介性の細胞の殺滅を評価した(図13)。ヒトPBMCを、エフェクター細胞として使用し、細胞の殺滅を、プロテアーゼ活性化TCB分子を伴う48時間にわたるインキュベーションの後に検出した。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を、採取したばかりの血液、又は健常ヒトドナーから得られたバフィーコートから単離した。新鮮な血液には、50mlのLeucosepチューブ(GreinerBioOne)を、調製のために使用した。リンパ球調製物(バフィーコート)を濃縮するために、Histopaque−1077密度調製法を使用した。血液/バフィーコートを、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(450×g、30分間、中断なし、室温)の後、PBMCを含有する界面相の上方の血漿を廃棄し、PBMCを、未使用のファルコンチューブに移し、その後、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2−3分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、さらなる使用まで、37℃、5%COの細胞インキュベーター内、2%のFCSと、1×GlutaMaxとを含有するRPMI1640培地中にPBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。略述すると、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について点検し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中、1ml当たりの細胞0.4×10個で再懸濁させた。標的細胞は、丸底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種した。殺滅アッセイのために、分子を、表示の濃度、3重で添加した。FolR1 16D5 TCBを、ポジティブコントロールとして組み入れ、標的化されていないTCB分子(CD3に結合するが、標的細胞抗原には結合しない)を、ネガティブコントロールとして組み入れた。PBMCを、最終E:T比を、10:1として、標的細胞へと添加した。標的細胞の殺滅は、37℃、5%CO、48時間にわたるインキュベーションの後、アポトーシス/壊死細胞による、細胞上清へのLDH放出の定量化(LDH検出キット;Roche Applied Science;型番11644793001)により評価した。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの1時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。
結果(図14A、15A、16、17、18A、19A、及び20A)は、N末端において、非切断型リンカーにより、抗イデオタイプCD3 scFv部分を連結されたプロテアーゼ活性化TCB(7676及び7611;それぞれ、図5B及び5D)が、Skov3細胞上及びHT29細胞上の細胞溶解を著明に低減することが可能であったことを示す。7611(図5D)が、HeLa細胞上の殺滅の低減をもたらしたのに対し、7676における抗イデオタイプCD3 scFv 4.15.64(図5B)は、細胞溶解の低減にそれほど効果的ではなかった。これは、抗イデオタイプCD3 scFvのN部分の親和性と符合する。高親和性のscFv部分は、より効果的にマスキングする。
処理TCBの力価と、非処理TCBの力価とが同等であることは、Hela細胞及びSkov3細胞によるマトリプターゼの発現を示唆する。マトリプターゼの発現は、HT29細胞内で、より低度であると考えられる。FolR1陰性細胞株である、Mkn−45の処理は、本明細書で使用される全ての分子による、弱い殺滅を示すに過ぎない(図15A)。
実施例8
腫瘍細胞株の、ヒトPBMCとのコインキュベーションの後におけるT細胞の活性化
プロテアーゼ活性化TCB分子により媒介されるT細胞の活性化を、Hela細胞上、Skov3細胞上、及びHT29細胞上で評価した。ヒトPBMCを、エフェクター細胞として使用し、T細胞の活性化を、標的細胞及び抗体を伴う48時間にわたるインキュベーションの後に検出した。標的細胞は、丸底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種した。分子を、表示の濃度、3重で添加した。FolR1 16D5 TCBを、ポジティブコントロールとして組み入れ、標的化されていないTCB分子(CD3に結合するが、標的細胞抗原には結合しない)を、ネガティブコントロールとして組み入れた。PBMCを、最終E:T比を、10:1として、標的細胞へと添加した。T細胞の活性化は、37℃、5%CO、48時間にわたるインキュベーションの後、CD4陽性T細胞上及びCD8陽性T細胞上の、CD25及びCD69の定量化により評価した。T細胞の活性化の結果は、標的細胞の殺滅について評価する前出の実施例で観察した結果と符合する(実施例7)。
実施例9
プロテアーゼ活性化TCBと、低レベルの抗原を発現させる標的細胞株とにより媒介されるT細胞の活性化
プロテアーゼ活性化TCB分子により媒介されるT細胞の活性化を、ごく低レベルのFolR1を発現させるHT29細胞上で評価した(図13)。バフィーコートから単離されたヒトPBMCを、エフェクター細胞として使用した。リンパ球調製物(バフィーコート)を濃縮するために、Histopaque−1077密度調製法を使用した。バフィーコートを、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(450×g、30分間、中断なし、室温)の後、PBMCを含有する界面相の上方の血漿を廃棄し、PBMCを、未使用のファルコンチューブに移し、その後、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2−3分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、さらなる使用まで、37℃、5%CO2の細胞インキュベーター内、2%のFCSと、1×GlutaMaxとを含有するRPMI1640培地中にPBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。略述すると、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について評価し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中、1ml当たりの細胞0.4×10個で再懸濁させた。標的細胞は、丸底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種した。分子を、表示の濃度、3重で添加した。FolR1 16D5 TCBを、ポジティブコントロールとして組み入れ、標的化されていないTCB分子(CD3に結合するが、標的細胞抗原には結合しない)を、ネガティブコントロールとして組み入れた。PBMCを、最終E:T比を、10:1として、標的細胞へと添加した。T細胞の活性化は、37℃、5%CO2、48時間にわたるインキュベーションの後、CD4陽性T細胞上及びCD8陽性T細胞上の、CD25及びCD69の定量化により評価した。処理されたプロテアーゼ活性化TCBの力価は、16D5 TCB(6298)と同等である。16D5 TCB(逆フォーマット)は、古典的フォーマットより高力価を示す。非切断型リンカーを伴うか、又はマトリプターゼによる前処理を伴わないマスキングされたTCBは、この細胞株上のT細胞の活性化を誘導しない。FolR1の発現レベルが低度又は中程度の細胞株では、いずれの抗イデオタイプscFvも、CD3 Fabをマスキングするのに十分である(図22A及び22B)。
実施例10
初代細胞株HRCEpiCを伴うプロテアーゼ活性化TCBにより媒介されるT細胞の活性化
プロテアーゼ活性化TCB分子により媒介されるT細胞の活性化を、極めて少量のFolR1のみを発現させる、初代ヒト腎皮質上皮細胞(ScienceCell)細胞上で評価した(図13)。バフィーコートから単離されたヒトPBMCを、エフェクター細胞として使用した。リンパ球調製物(バフィーコート)を濃縮するために、Histopaque−1077密度調製法を使用した。バフィーコートを、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(室温で、450×g、30分間、中断なし)の後、PBMCを含有する界面相の上方の血漿を廃棄し、PBMCを、未使用のファルコンチューブに移し、その後、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2−3分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、さらなる使用まで、37℃、5%COの細胞インキュベーター内、2%のFCSと、1×GlutaMaxとを含有するRPMI1640培地中にPBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。略述すると、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について点検し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中、1ml当たりの細胞0.4×10個で再懸濁させた。標的細胞は、丸底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種した。プロテアーゼ活性化型TCB分子を、表示の濃度、3重で添加した。FolR1 16D5 TCBを、ポジティブコントロールとして組み入れ、標的化されていないTCB分子(CD3に結合するが、標的細胞抗原には結合しない)を、ネガティブコントロールとして組み入れた。PBMCを、最終E:T比を、10:1として、標的細胞へと添加した。T細胞の活性化は、37℃、5%CO、48時間にわたるインキュベーションの後、CD4陽性T細胞上及びCD8陽性T細胞上の、CD25及びCD69の定量化により評価した。マスキングされた16D5 TCBは、TCB濃度が最高の10.000pMで、低レベルのFolR1の発現にもかかわらず、初代ヒト腎皮質上皮細胞と共にインキュベーションしても、T細胞の活性化を誘導しないことから、抗イデオタイプマスキング部分の有効性が裏付けられる。16D5 TCB(逆フォーマット及び古典的フォーマット)については、T細胞の活性化を、ほとんど観察することができない(図23)。
実施例11
16D5 TCBのCD3結合剤をマスキングする抗ID CD3 Fab。Ovcar3細胞上の殺滅。
プロテアーゼ活性化TCB分子により媒介される、T細胞媒介性の標的細胞の殺滅は、OVCAR3細胞上で評価した(図24)。ヒトPBMCを、エフェクター細胞として使用し、細胞の殺滅を、分子を伴う48時間にわたるインキュベーションの後に検出した。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を、健常ドナーの採取したばかりの血液から単離した。50mlのLeucosepチューブ(GreinerBioOne)を、調製のために使用した。血液を、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(450×g、30分間、中断なし、室温)の後、PBMCを含有する界面相の上方の血漿を廃棄し、PBMCを、未使用のファルコンチューブに移し、その後、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2−3分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、さらなる使用まで、37℃、5%CO2の細胞インキュベーター内、2%のFCSと、1×GlutaMaxとを含有するRPMI1640培地中にPBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。略述すると、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について点検し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中、1ml当たりの細胞0.4×10個で再懸濁させた。標的細胞は、丸底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種した。殺滅アッセイのために、分子を、表示の濃度、3重で添加した。FolR1 16D5 TCBを、ポジティブコントロールとして組み入れ、標的化されていないTCB分子(CD3に結合するが、標的細胞抗原には結合しない)を、ネガティブコントロールとして組み入れた。PBMCを、最終E:T比を、10:1として、標的細胞へと添加した。標的細胞の殺滅は、37℃、5%CO2、48時間にわたるインキュベーションの後、アポトーシス/壊死細胞による、細胞上清へのLDH放出の定量化(LDH検出キット;Roche Applied Science;型番11644793001)により評価した。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの1時間前における、標的細胞及びPBMCの、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。結果(図24)は、N末端において、非切断型リンカーにより、抗イデオタイプCD3 4.15.64交差Fabを連結されたプロテアーゼ活性化TCBが、CD3結合剤を、それほどマスキングしないことを示す。さらに、非処理分子もまた、これらの細胞の殺滅を誘導するため、Ovcar3細胞は、マトリプターゼを発現させると考えられる。
実施例12
3例の異なるヒトPBMCドナーによる、Skov3細胞上及びHeLa細胞上の殺滅
プロテアーゼ活性化TCB分子により媒介される、T細胞による殺滅は、異なるレベルのFolR1を発現させる、2つの異なる細胞株上で評価した(図25−27)。ヒトPBMCを、エフェクター細胞として使用し、細胞の殺滅を、分子を伴う48時間にわたるインキュベーションの後に検出した。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を、健常ヒトドナーから得られたバフィーコートから単離した。リンパ球調製物(バフィーコート)を濃縮するために、Histopaque−1077密度調製法を使用した。血液/バフィーコートを、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(450×g、30分間、中断なし、室温)の後、PBMCを含有する界面相の上方の血漿を廃棄し、PBMCを、未使用のファルコンチューブに移し、その後、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2−3分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、10%のFCSと、1×GlutaMaxとを含有するRPMI1640培地中にPBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。PBMCを、10%のFCS、1×GlutaMax、及び10%のDMSOを含有するRPMI1640培地中に再懸濁させた。PBMCを、Cool Cellボックス内、−80℃で、一晩にわたり凍結させてから、液体窒素へと移した。アッセイ開始の24時間前、PBMCを融解させ、37℃、5%CO2の細胞インキュベーター内、10%のFCSと、1×GlutaMaxとを含有するRPMI1640培地中で保った。アッセイ開始の前日、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について点検し、適切な培地中、1ml当たりの細胞0.4×10個で再懸濁させた。標的細胞は、平底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種した。アッセイの開始日に、PBMCをカウントし、生存率について点検した。PBMCを、350gで5分間にわたり遠心分離し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中に再懸濁させた。標的細胞の培地を除去し、希釈された抗体を、表示の濃度、3重で添加する前に、PBMCを、標的細胞へと添加した。FolR1 16D5 TCBを、ポジティブコントロールとして組み入れ、標的化されていないTCB分子(CD3に結合するが、標的細胞抗原には結合しない)を、ネガティブコントロールとして組み入れた。PBMCを、E:T比を、10:1として、標的細胞へと添加した。標的細胞の殺滅は、37℃、5%CO2、48時間にわたるインキュベーションの後、アポトーシス/壊死細胞による、細胞上清へのLDH放出の定量化(LDH検出キット;Roche Applied Science;型番11644793001)により評価した。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの2時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。
結果(図25−27)は、N末端において、非切断型リンカーにより、scFv 4.32.63を連結されたFolR1 TCB(図5D)が、100pMの濃度における、HeLa細胞上、及び10nMの濃度における、Skov3細胞上の殺滅の低減を誘導したことを示す。N末端において、非切断型リンカーにより、scFv 4.15.64を連結されたFolR1 TCB(図5B)は、10nMの濃度における、Skov3細胞上の殺滅の低減にそれほど効果的ではなかった。親和性の大きな抗イデオタイプscFv 4.32.63を意味する、より強力なマスキングは、CD3結合剤のマスキングにおいて、弱い抗イデオタイプscFv 4.15.64より効果的である。処理TCBの力価と、非処理TCBの力価とが同等であることは、Hela細胞及びSkov3細胞による、プロテアーゼ、例えば、マトリプターゼの発現を示唆する。
実施例13
抗イデオタイプGA201 scFvでマスキングされた、HER1結合抗体であるGA201の調製
本実施例では、以下の分子:
1:N末端において、抗イデオタイプGA201 scFv及びグリシンセリンリンカー内のマトリックスメタロプロテアーゼ部位(配列番号32及び34)を融合させたGA201 IgG1抗体と;
2:HER1結合IgG1抗体であるGA201(配列番号32及び33)と
を調製した。
その概略的例示を、図28及び29に示す。GA201抗イデオタイプ(ID)結合剤の配列は、可変軽鎖及び可変重鎖のそれぞれの末端への縮重プライマーの結合を使用して、ハイブリドーマ細胞のRNAからのRT−PCR(逆転写)により得た。ハイブリドーマ細胞は、マウスの免疫化により得た。フランキングの単一の制限エンドヌクレアーゼ部位を伴う、単鎖Fv(scFv)DNA配列の合成は、Geneartに依頼され、GA201軽鎖におけるN末端の融合体としてクローニングされた。
重鎖scFv及び軽鎖scFvの全ての融合タンパク質をコードする発現プラスミドの構築には、Roche発現ベクターを使用した。ベクターは、以下のエレメント:
・選択マーカーとしての、ハイグロマイシン耐性遺伝子;
・エプスタイン−バーウイルス(EBV)の複製開始点である、oriP;
・ベクターであるpUC18に由来する複製開始点であって、大腸菌内のこのプラスミドの複製を可能とする複製開始点;
・大腸菌内でアンピシリン耐性を付与する、ベータ−ラクタマーゼ遺伝子;
・ヒトサイトメガロウイルス(HCMV)に由来する前早期エンハンサー及び前早期プロモーター;
・ヒト免疫グロブリン1ポリアデニル化(「ポリA」)シグナル配列;及び
・固有のBamHI制限部位及びXbaI制限部位
から構成される。
製造元(Invitrogen、USA)の指示書に従い、FreeStyle(商標)293 Expression Systemを使用して、懸濁液中で増殖するヒト胎児性腎臓293−F細胞を、哺乳類発現ベクターと共にコトランスフェクトすることにより、分子を生成した。略述すると、懸濁液である、FreeStyle(商標)293−F細胞を、37℃/8%CO、FreeStyle(商標)293 Expression培地中で培養し、細胞を、トランスフェクション日に、新鮮な培地中、1ml当たりの生細胞1−2×10個の密度で播種した。Opti−MEM I培地(Invitrogen、USA)中で、250mlの最終的なトランスフェクション容積に対して、325μlの293fectin(商標)(Invitrogen、Germany)と、250μgの重鎖(「GA201重鎖」)及び軽鎖(「抗GA201 VH−VL scFv−MMP切断型リンカーG4S−GA201軽鎖」又は「GA201軽鎖」)のプラスミドDNAとを、1:1のモル比で使用して、DNA−293fectin(商標)複合体を調製した。トランスフェクションの7日後に、抗体を含有する細胞培養物上清を、14000gで、30分間にわたる遠心分離により採取し、滅菌フィルター(0.22μm)を通して濾過した。上清は、精製まで、−20℃で保存した。
分泌タンパク質は、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用するアフィニティークロマトグラフィーに続いて、サイズ排除クロマトグラフィーにより、細胞培養物上清から精製した。略述すると、滅菌濾過した細胞培養物上清を、PBSバッファー(10mMのNa2HPO4、1mMのKH2PO4、137mMのNaCl、及び2.7mMのKCl、pH7.4)で平衡化させたHiTrap ProteinA HP(5ml)カラムへと適用した。結合しなかったタンパク質は、平衡化バッファーで洗い落とした。抗体及び抗体変異体を、0.1Mのクエン酸バッファー、pH2.8で溶出させ、タンパク質含有画分を、0.1mlの1Mのトリス、pH8.5で中和させた。次いで、溶出させたタンパク質画分をプールし、Amicon Ultra遠心分離フィルターデバイス(MWCO:30K、Millipore)により、3mlの容積へと濃縮し、20mMのヒスチジン、140mMのNaCl、pH6.0で平衡化させた、Superdex200 HiLoad 120ml 16/60ゲル濾過カラム(GE Healthcare、Sweden)上にロードした。精製GA201−抗GA201−scFv又は高分子量凝集物を5%未満とするGA201を含有する画分をプールし、1.0mg/mlのアリコートとして、−80℃で保存した。
サイズ排除クロマトグラフィーの後におけるタンパク質解析法のために、単一画分中の分子の純度及び分子量は、還元剤の非存在下におけるSDS−PAGE及びクーマシー(InstantBlue(商標)、Expedeon)による染色により解析した。製造元の指示書に従い、NuPAGE(登録商標)Pre−Castゲル系(4−12%のビス−トリス;Invitrogen又は3−8%のトリス酢酸塩;Invitrogen)を使用した。
精製タンパク質試料のタンパク質濃度は、280nmにおける光学濃度(OD)を測定し、アミノ酸配列に基づき計算されるモル減衰係数で除することにより決定した。最終的な精製工程の後における、分子の純度及び分子量は、還元剤の存在下及び非存在下におけるCE−SDS解析により解析した。製造元の指示書に従い、Caliper LabChip GXIIシステム(Caliper Lifescience)を使用した。
分子の凝集物含有量は、200mMのKH2PO4、250mMのKCl、pH7.0のランニングバッファー中、25℃で、Superdex 200解析用サイズ除外カラム(GE Healthcare、Sweden)を使用する高速SECにより解析した。25μgのタンパク質を、カラム上に、0.5ml/分の流速で注入し、50分間にわたり、アイソクラティック溶出させた。
全ての分子の最終純度は、高速SECにより検出される通り、≧95%のモノマー含有量であった。抗イデオタイプscFvマスキングGA201の分子量は、CE−SDS解析により、非還元条件下で、216.3kDaとして決定し(図1A)、還元条件下で、それぞれ、GA201重鎖については、58.3kDaと決定し、scFv連結GA201軽鎖については、60.3kDaと決定した(図30B)。アミノ酸配列に基づく分子量を、重鎖については、49.2kDaと計算し、scFv融合GA201軽鎖については、51.9kDaと計算したが、これらは、HEK293細胞内の両方の鎖のグリコシル化を指し示す。
実施例14
GA201 IgGに対する、抗イデオタイプscFvのマスキング効果
抗イデオタイプGA201 scFvの、N末端における融合により、GA201の、HER1への結合をマスキングする効能を、HER1を発現させるH322M細胞についてのFACS解析と、HER1コーティングチップ表面上の表面プラズモン共鳴(SPR)解析とにより示した。GA201−抗GA201−scFvのタンパク質分解性切断のために、組換え活性ヒトMMP2(Calbiochem)を使用した。MMP切断部位を含有するグリシンセリンリンカーにより、GA201へと融合させた、1mgのGA201抗イデオタイプscFvを、37℃で一晩にわたり、PBS中に1.2μgのMMP2と共にインキュベートした。
切断されたGA201−抗GA201−scFv及び切断されていないGA201−抗GA201−scFvの、HER1への結合についてのFACS解析のために、非小細胞肺がん細胞株であるH322Mを使用した。細胞を、1ml当たり1×10個へと調整し、96ウェル丸底プレートへと分配した。分子を添加し、氷上で30分間にわたりインキュベートした。細胞を、FACSバッファー(PBS+2%のFCS+0.1%のアジ化ナトリウム)で、1回洗浄し、F(ab’)2−ヤギ抗ヒトIgG Fc二次抗体FITCコンジュゲート(ThermoFisher Scientific)と共に再懸濁させた。氷上におけるさらなる20分後、細胞を、2回にわたり洗浄し、FACSバッファー中に再懸濁させ、BD FACS Canto IIにより解析した。細胞10000個について測定し、蛍光シグナルの中央値を、解析のために使用した。GA201−抗GA201−scFvの、MMP−2による切断の前には、H322M細胞上のHER1への結合は測定不能であったことから、GA201結合ドメインの、抗イデオタイプscFvによる完全なマスキングが指し示される(図31)。切断されなかったGA201−抗GA201−scFvの結合は、非特異的アイソタイプIgGコントロール抗体と同等であった(図31)。これに対し、抗イデオタイプscFvの、MMPによる切断は、GA201の活性化をもたらし、H322M細胞上のHER1への結合は、非マスキング親抗体GA201と同様のレベルへと回復した(図31)。
MMPによる切断の後における、マスキングされたGA201の結合についてのFACS結合データを確認するため、本発明者らはまた、Biacore T100測定器(GE Healthcare Biosciences AB、Uppsala、Sweden)を使用する第2の解析法として、SPR実験も実施した。標準的なアミンカップリング化学反応を使用して、HER1を、CM5バイオセンサーチップの表面上に固定化した。HER1細胞外ドメインを、酢酸ナトリウム、pH5.0中に、1μg/mlで注入した。参照のコントロールフローセルも、同じ方式で処理したが、ビヒクルバッファーのみを伴った。一晩にわたる、MMPによる切断の前及び後における、GA201−抗GA201−scFvと、GA201とを、1×PBS pH7.4、0.05%のTween20(Roche Diagnostics GmbH)中で希釈し、3.125及び50nMの間の漸増濃度、30μl/分の流速で注入した。会合期は、3分間であり、解離時間は、10分間であった。HER1の結合は、5μl/分の流速で、30秒間にわたる、0.85%のリン酸の注入により再生させた。反応速度定数及び平衡解離定数は、Biaevaluationソフトウェア内の1:1ラングミュア結合モデルを使用することにより計算した。GA201親非マスキング抗体には、HER1の結合についての、1nMのK値を決定した(図32)。GA201−抗GA201−scFvの、MMP−2を伴う、一晩にわたるインキュベーションの後、会合及び解離についての、非マスキングコントロール抗体と同様のk速度定数及びk速度定数により、2nMのK値が測定されたことから、プロテアーゼ切断による、HER1への結合の完全な回復が指し示される(図32)。切断されていないGA201−抗GA201−scFvは、SPR解析において、HER1への結合を全く示さなかった(図32)。まとめると、本発明者らは、抗イデオタイプscFvの、IgG1抗体GA201のN末端への融合による、HER1への結合の完全な喪失を、2つの独立の解析法により裏付けた。さらに、HER1への結合は、scFvの除去により、グリシンセリンリンカー内のMMP切断部位における、プロテアーゼによる切断を介して、完全に回復した。
実施例15
抗CD3 scFvを伴う、抗FolR1/抗CD3及び抗メソテリン/抗CD3T細胞二重特異性(TCB)分子の調製物
多様な抗イデオタイプscFvを伴う、いくつかのT細胞二重特異性(TCB)分子を生成したが、図33A−33Jに、それらのそれぞれのID番号と共に、概略的に描示する。以下の分子:
ID 8364:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びMMP9−MK062プロテアーゼリンカーを融合させた、古典的フォーマットのFolR1 16D5 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−MMP9−MK062マトリプターゼ部位−CD3−N末端におけるFolR1 VHへの融合−不活性Fc)」(図33A;配列番号1、3、及び72);
ID 8363:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びカテプシンS/Bプロテアーゼリンカーを融合させた、古典的フォーマットのFolR1 16D5 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−カテプシンS/B部位−CD3−N末端におけるFolR1 VHへの融合−不活性Fc)」(図33B;配列番号1、3、及び85);
ID 8365:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びMK062マトリプターゼリンカーを融合させた、逆フォーマットのFolR1 16D5 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−MK062マトリプターゼリンカー−CD3−N末端におけるCD3 VLへの融合−不活性Fc)」(図33C;配列番号1、3、73、及び74);
ID 8366:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及び非切断型GSリンカーを融合させた、逆フォーマットのFolR1 16D5 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−非切断型GSリンカー−CD3−N末端におけるCD3 VLへの融合−不活性Fc)」(図33D);
ID 8672:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びMMP9−MK062マトリプターゼを融合させた、古典的フォーマット、MSLN荷電変異体、CD3交差型の抗メソテリン 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−MMP9−MK062マトリプターゼ−CD3−N末端における抗メソテリンVHへの融合−不活性Fc)」(図33E;配列番号77、78、81、82);
ID 8673:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及び非切断型GSリンカーを融合させた、古典的フォーマット、MSLN荷電変異体、CD3交差型の抗メソテリン 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−非切断型GSリンカー−CD3−N末端における抗メソテリンVHへの融合−不活性Fc)」(図33F);
ID 8674:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びMMP9−MK062マトリプターゼを融合させた、逆フォーマット、MSLN荷電変異体、CD3交差型の抗メソテリン 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−MMP9−MK062マトリプターゼ−CD3−N末端におけるCD3 VHへの融合−不活性Fc)」(図33G;配列番号76、77、78、79);
ID 8675:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及び非切断型GSリンカーを融合させた、逆フォーマット、MSLN荷電変異体、CD3交差型の抗メソテリン 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−非切断型GSリンカー−CD3−N末端におけるCD3 VHへの融合−不活性Fc)」(図33H);
ID 8505:「逆フォーマット、MSLN荷電変異体、CD3交差型の抗メソテリン 2+1 IgG(N末端において、CD3 VL−不活性Fcへと融合させた抗メソテリンHC)」(図33I);
ID 8676:「古典的フォーマット、MSLN荷電変異体、CD3交差型の抗メソテリン 2+1 IgG(CD3−N末端における抗メソテリンVHへの融合−不活性Fcを伴う抗メソテリンIgG)」(図33J)
を調製した。
可変ドメインを、それぞれのレシピエントの哺乳類発現ベクターへとあらかじめ挿入されたドメインとインフレームで、サブクローニングした。タンパク質の発現は、MPSVプロモーターにより駆動され、合成polyAシグナル配列は、CDSの3’末端に存在する。加えて、各ベクターは、EBV OriP配列を含有する。
ポリエチレンイミン(PEI)を使用して、懸濁液中で増殖するHEK293−EBNA細胞を、哺乳類発現ベクターと共にコトランスフェクトすることにより、分子(8505を除く;この分子は、懸濁液中で増殖するCHO細胞を、哺乳類発現ベクターと共にコトランスフェクトすることにより生成した。一過性のトランスフェクションは、Evitria AG(Switzerland)において行った)を生成した。トランスフェクションのために、HEK293 EBNA細胞を、6mMのL−グルタミン及び250mg/lのG418を含有する、無血清ExCell培地中で培養した。600mlのチューブスピンフラスコ(最大の作業容積を400mlとする)内の生成のために、8億個のHEK293 EBNA細胞を、G418を伴わないトランスフェクションの24時間前に播種した。トランスフェクションのために、8億個の細胞を、210×gで、5分間にわたり遠心分離し、上清を、6mMのL−グルタミンを含有する、40mlのあらかじめ温めておいたCD CHO培地で置きかえた。発現ベクターを、6mMのL−グルタミンを含有する、40mlのCD CHO培地と共に、総量400μgのDNAへと混合した。PEI溶液(2.7μg/ml)1080μlを添加した後で、混合物を、15秒間にわたり、ボルテックスし、その後、室温で10分間にわたりインキュベートした。その後、細胞を、DNA/PEI溶液と混合し、600mlのチューブスピンフラスコへと移し、5%のCO2雰囲気を伴うインキュベーター内、37℃で、3時間にわたりインキュベートした。インキュベーション後、320mlのExCell+6mMのL−グルタミン+5g/LのPepsoy+1.0mMのVPA+3g/lのグルコース培地を添加し、細胞を、24時間にわたり培養してから、7%のFeed 7でフィードした。6−7日間にわたる培養の後、上清を、210×g(Sigma 8K遠心分離機)で、20−30分間にわたる遠心分離による精製のために回収した。溶液を滅菌濾過(0.22μmのフィルター)し、最終濃度を0.01%w/vとするアジ化ナトリウムを添加した。精製まで、溶液を4℃に保った。分泌タンパク質は、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用するアフィニティークロマトグラフィーに続く、1から2回にわたるサイズ除外クロマトグラフィー工程により、細胞培養物上清から精製した。
アフィニティークロマトグラフィーのために、上清を、20mMのクエン酸ナトリウム、20mMのリン酸ナトリウム、pH7.5で平衡化したProtein A MabSelectSure(CV=5mL;GE Healthcare)上にロードした。20mMのクエン酸ナトリウム、20mMのリン酸ナトリウム、pH7.5の少なくとも10カラム容積で洗浄することにより、結合しなかったタンパク質を除去し、標的タンパク質を、20mMのクエン酸ナトリウム、100mMの塩化ナトリウム、100mMのグリシン、pH3.0、20カラム容積(0%−100%の勾配)中に溶出させた。タンパク質溶液は、0.5MのNa2HPO4 pH8.0の1/10を添加することにより中和した。標的タンパク質は、20mMのヒスチジン、140mMのNaCl、0.01%のTween pH6.0で平衡化されたHiLoad Superdex 200カラム(GE Healthcare)上にロードする前に、Amicon(登録商標)Ultra−15 Ultracel 30K(Merck Millipore Ltd.)で、最大で4mlの容積へと濃縮した。
精製タンパク質試料のタンパク質濃度は、280nmにおける光学濃度(OD)を測定し、アミノ酸配列に基づき計算されるモル減衰係数で除することにより決定した。
最終的な精製工程の後における、分子の純度及び分子量は、還元剤の存在下及び非存在下におけるCE−SDS解析により解析した。製造元の指示書に従い、Caliper LabChip GXIIシステム(Caliper Lifescience)を使用した。
分子の凝集物含有量は、25mMのK2HPO4、125mMのNaCl、200mMのL−アルギニンモノハイドロクロライド、0.02%(w/v)のNaN3、pH6.7のランニングバッファー中、25℃で、TSKgel G3000 SW XL解析用サイズ除外カラム(Tosoh)を使用して解析した。全ての分子の最終品質は、良好であり、モノマー含有量は、≧95%であった。
実施例16
品質管理及び安定性−異なるTCB分子についての、キャピラリー電気泳動によるSDS解析
最終的な精製工程の後における、分子の純度及び分子量を、還元剤の存在下及び非存在下におけるCE−SDS解析により解析した。製造元の指示書に従い、Caliper LabChip GXIIシステム(Caliper Lifescience)を使用した。非処理分子(4℃で保存した)、処理分子(適切な組換えプロテアーゼ(R&D Systems)により、37℃で24時間にわたり処理された)、及び37℃で72時間にわたりインキュベートされた分子についての比較を行った(図34、35A、及び35B)。
非処理分子と、処理分子との比較は、MK062マトリプターゼリンカーを含有する逆フォーマットについて、rhマトリプターゼ/ST14による処理の後における、抗ID scFvの完全な切断に対して、MMP9−MK062マトリプターゼリンカーの不完全な切断を示す。rhカテプシンBによる処理及びrhカテプシンSによる処理も同様に、不完全である。酵素の精製についての条件は、最適となっていない。
37℃で72時間にわたりインキュベートされた分子が、純粋な分子と同じ高度で泳動することから、インビトロアッセイの持続時間にわたり、分子が37℃で安定であることが示唆される。適正な分子量を推定するために、あらかじめ染色されたタンパク質マーカーである、Mark12(Invitrogen)を使用した。
実施例17
プロテアーゼ活性化FolR1 TCBの異なるリンカー及びフォーマットの比較
Jurkat NFAT活性化アッセイ:プロテアーゼ活性化TCBの異なるフォーマット及びリンカーを比較するためのJurkat NFAT活性化アッセイである。Jurkat−NFATレポーター細胞株(Promega)は、NFATプロモーターを伴う、ヒト急性リンパ性白血病のレポーター細胞株であって、ヒトCD3εを発現させるレポーター細胞株である。TCBが、腫瘍標的に結合し、CD3結合剤が、CD3εに結合する(架橋形成)場合に、ルシフェラーゼの発現を、One−Glo基質(Promega)の添加の後の発光により測定することができる。20,000個の標的細胞を、壁面が白色の96ウェル透明底プレート(Greiner BioOne)内、ハイグロマイシンを伴わない、ウェル1つ当たり50ulのJurkat培地(RPMI1640、2g/lのグルコース、2g/lのNaHCO3、10%のFCS、25mMのHEPES、2mMのL−グルタミン、1×NEAA、1×ピルビン酸ナトリウム)中に播種した。プレートを、37℃で約20時間にわたりインキュベートした。Jurkat−NFATレポーター細胞を採取し、生存率は、ViCellを使用して評価した。細胞を、ハイグロマイシンを伴わないJurkat培地中で再懸濁させ、ウェル1つ当たり50μl(ウェル1つ当たりの細胞50,000個)を添加した。E:T比は、2.5:1(播種した細胞数に基づく)であった。抗体を、ハイグロマイシンを伴わないJurkat培地中で希釈し、ウェル1つ当たり50ulを添加した。細胞を、加湿インキュベーター内、37℃で6時間にわたりインキュベートしてから、それらを、約10分間にわたり、インキュベーターから取り出して、室温へと適応させてから、発光の読取りを行った。ウェル1つ当たり50μlのONE−Glo溶液を、ウェルへと添加し、暗所内、室温で10分間にわたりインキュベートした。発光を、WALLAC Victor3 ELISAリーダー(PerkinElmer2030)と、検出時間としての、ウェル1つ当たり1秒間とを使用して検出した。前処理プロテアーゼ活性化TCB(8364;グレーの塗りつぶし四角)と、FolR1 TCB(黒の下向き三角)との比較は、切断後に力価が完全に回復することを示した。この濃度範囲では、マスキングTCB(GS非切断型リンカーを含有する;グレーの上向き三角)及び非標的化TCBコントロール(白抜きの下向き三角)でインキュベートされた、いずれの細胞株についても、発光は検出不能であった。点線は、TCBを伴わない標的細胞及びエフェクター細胞による発光を示す(図36A及び36B)。
実施例18
異なるフォーマットのプロテアーゼ活性化TCBにより媒介される腫瘍細胞への細胞傷害性
プロテアーゼ活性化TCB分子により媒介される、T細胞による殺滅を、異なるレベルのFolR1を発現させる細胞株上で評価した。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を、健常ヒトドナーから得られたバフィーコートから単離した。バフィーコートを、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(450×g、30分間、中断なし、室温)の後、PBMCを含有する界面相を、未使用のファルコンチューブに移し、その後、これを、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2−3分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、10%のFCS、1×GlutaMax、及び10%のDMSOを含有するRPMI1640培地中に、PBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。PBMCを、CoolCell(登録商標)Cell Freezing Container(BioCision)内、−80℃で、ゆっくりと凍結させ、次いで、液体窒素へと移した。アッセイ開始の1日前、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について点検し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中に再懸濁させた。標的細胞は、平底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種し、加湿インキュベーター内、37℃で約20時間にわたりインキュベートした。アッセイ開始の約20時間前、PBMCを、RPMI1640培地(10%のFCS、1×GlutaMax)中で融解させた。PBMCを、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、新鮮な培地(RPMI1640、10%のFCS、1×GlutaMax)中に再懸濁させ、加湿インキュベーター内、37℃、最長で24時間にわたりインキュベートした。アッセイの開始日に、PBMCを採取し、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、アッセイ培地中に再懸濁させ、ウェル1つ当たり100ul中に、20万個のPBMC(E:Tを10:1とする;播種した標的細胞の数に基づく)を、標的細胞へと添加した。分子を、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中で希釈し、ウェル1つ当たり50ulを、表示の濃度、3重で添加してから、プレートを、加湿インキュベーター内、37℃で約48時間にわたりインキュベートした。標的細胞の殺滅は、37℃、5%CO2で、48時間にわたるインキュベーションの後、アポトーシス/壊死細胞による、細胞上清へのLDH放出の定量化(LDH検出キット;Roche Applied Science;型番11644793001)により評価した。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの20時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。
結果(図37A及び37B)は、いずれもがMK062マトリプターゼリンカーで連結された、抗イデオタイプCD3 scFv 4.32.63を含有する、2つの異なるフォーマットのプロテアーゼ活性化TCBの比較を示す。プロテアーゼ活性化TCBの逆フォーマット(8365;グレーの丸)は、殺滅(HeLa標的細胞及びSkov−3標的細胞)において、プロテアーゼ活性化TCBの古典的フォーマット(8408;ダークグレーの上向き三角)より力価が大きいと考えられる。しかし、非切断型リンカーを含有する逆分子(8366;ライトグレーの四角)は、マスキングにおいて、古典的分子(8409;ダークグレーの下向き三角)ほど効果的ではない。
図37C:HeLa標的細胞への細胞傷害性:抗イデオタイプCD3 scFv 4.32.63と、プロテアーゼ部位が異なるGSリンカーとを含有する古典的なプロテアーゼ活性化TCBの比較である。MMP9−マトリプターゼMK062リンカーを含有するプロテアーゼ活性化TCB(8364;グレーの四角)が、FolR1 TCB(ライトグレーの下向き三角)の力価に達するのに対し、マトリプターゼMK062のみを含有するプロテアーゼ活性化TCB(ライトグレーの菱形)は、HeLa細胞の殺滅における力価が小さい。カテプシン部位を含有する分子(グレーの丸)又は非切断型リンカーを含有する分子(黒の下向き三角)は、同等である。
図37D:Skov−3標的細胞への細胞傷害性:抗イデオタイプCD3 scFv 4.32.63と、プロテアーゼ部位が異なるGSリンカーとを含有する古典的なプロテアーゼ活性化TCBの比較である。MMP9−マトリプターゼMK062リンカーを含有するプロテアーゼ活性化TCB(8364;グレーの四角)がほぼ、FolR1 TCB(ライトグレーの下向き三角)の力価に達するのに対し、マトリプターゼMK062のみを含有するプロテアーゼ活性化TCB(ライトグレーの菱形)は、Skov−3細胞の殺滅における力価がより小さい。カテプシン部位を含有する分子(グレーの丸)は、マトリプターゼMK062部位のみを含有する分子より力価が小さく、非切断型リンカーを含有する分子(黒の下向き三角)は、Skov−3細胞について、表示の濃度範囲内において10%を下回る殺滅を誘導するにとどまる。
実施例19
ヒト腎皮質上皮細胞又はヒト気管支上皮細胞の、TCB及びヒトPBMCとのコインキュベーション後における、T細胞の活性化
プロテアーゼ活性化TCB分子により媒介されるT細胞の活性化を、ごく少量のFolR1を発現させる、HRCEpi(ヒト腎皮質上皮細胞)及びHBEpiC(ヒト気管支上皮細胞)について評価した。ヒトPBMCを、エフェクター細胞として使用し、T細胞の活性化マーカーを、分子及び細胞を伴う48時間にわたるインキュベーションの後に染色した。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を、健常ヒトドナーから得られたバフィーコートから単離した。バフィーコートを、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(450×g、30分間、中断なし、室温)の後、PBMCを含有する界面相を、未使用のファルコンチューブに移し、その後、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、10%のFCS、1×GlutaMax、及び10%のDMSOを含有するRPMI1640培地中に、PBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。PBMCを、CoolCell(登録商標)Cell Freezing Containers(BioCision)内、−80℃で、ゆっくりと凍結させ、次いで、液体窒素へと移した。アッセイを開始する1日前に、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について点検し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中で再懸濁させた。標的細胞は、平底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種し、加湿インキュベーター内、37℃で約20時間にわたりインキュベートした。アッセイ開始の約20時間前、PBMCを、RPMI1640培地(10%のFCS、1×GlutaMax)中で融解させた。PBMCを、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、新鮮な培地(RPMI1640、10%のFCS、1×GlutaMax)中に再懸濁させ、加湿インキュベーター内、37℃、最長で24時間にわたりインキュベートした。アッセイの開始日に、PBMCを採取し、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、アッセイ培地中に再懸濁させ、ウェル1つ当たり100ul中に、20万個のPBMC(E:Tを10:1とする;播種した標的細胞の数に基づく)を、標的細胞へと添加した。分子を、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中で希釈し、表示の濃度、3重で添加してから、プレートを、加湿インキュベーター内、37℃で約48時間にわたりインキュベートした。
T細胞の活性化は、37℃、5%CO2における48時間にわたるインキュベーションの後に、CD4陽性T細胞/CD8陽性T細胞上の、CD25及びCD69の定量化により評価した。FolR1 16D5 TCB(6298)及び非標的化TCB(CD3には結合するが、標的細胞抗原には結合しない;7235)を、コントロールとして組み入れる。各点は、3例の異なるヒトPBMCドナーについての、3重の平均値を表す。標準偏差は、誤差バーに表示する。統計学的解析には、対応のないt検定を使用した。結果は、FolR1 TCBについて、CD8陽性細胞のCD69の増大であって、プロテアーゼ活性化TCBについての中央値蛍光強度より著明に高度な増大を示す(図38A及び38B)。
実施例20
異なるフォーマットのプロテアーゼ活性化メソテリン(MSLN)TCBにより媒介される、腫瘍細胞への細胞傷害性
プロテアーゼ活性化TCB分子により媒介される、T細胞による殺滅を、異なるレベルのメソテリン(MSLN)を発現させる細胞株上で評価した。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を、健常ヒトドナーから得られたバフィーコートから単離した。バフィーコートを、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(450×g、30分間、中断なし、室温)の後、PBMCを含有する界面相を、未使用のファルコンチューブに移し、その後、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、10%のFCS、1×GlutaMax、及び10%のDMSOを含有するRPMI1640培地中に、PBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。PBMCを、CoolCell(登録商標)Cell Freezing Containers(BioCision)内、−80℃で、ゆっくりと凍結させ、次いで、液体窒素へと移した。アッセイを開始する1日前に、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について点検し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中で再懸濁させた。標的細胞は、平底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種し、加湿インキュベーター内、37℃で約20時間にわたりインキュベートした。アッセイ開始の約20時間前、PBMCを、RPMI1640培地(10%のFCS、1×GlutaMax)中で融解させた。PBMCを、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、新鮮な培地(RPMI1640、10%のFCS、1×GlutaMax)中に再懸濁させ、加湿インキュベーター内、37℃、最長で24時間にわたりインキュベートした。アッセイの開始日に、PBMCを採取し、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、アッセイ培地中に再懸濁させ、ウェル1つ当たり100ul中に、20万個のPBMC(E:Tを10:1とする;播種した標的細胞の数に基づく)を、標的細胞へと添加した。分子を、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中で希釈し、表示の濃度、3重で添加してから、プレートを、加湿インキュベーター内、37℃で約48時間にわたりインキュベートした。標的細胞の殺滅は、37℃、5%CO2で、48時間にわたるインキュベーションの後、アポトーシス/壊死細胞による、細胞上清へのLDH放出の定量化(LDH検出キット;Roche Applied Science;型番11644793001)により評価した。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの20時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。
結果(図39A及び39B)は、プロテアーゼ活性化MSLN TCB(8672)により媒介される標的細胞の殺滅を、NCI H596細胞株及びAsPC−1細胞株について示す。プロテアーゼ活性化TCBはほぼ、NCI H596及びAsPC−1に対する、MSLN TCB(8676)の力価に達する。非切断型GSリンカー(8673)を含有する分子は、いずれの細胞株に対しても、表示の濃度範囲内で、殺滅を誘導しない。
実施例21
原発腫瘍試料中の、標的の発現(FOLR1 TCB)及びプロテアーゼ活性(プロテアーゼ活性化FOLR1 TCB)をモニタリングする、Jurkat−NFATレポーターアッセイ
このアッセイの意図は、ヒト腫瘍試料中の、腫瘍標的抗原(FolR1)の発現と、MMP9、マトリプターゼ、又はカテプシンなど、腫瘍特異的プロテアーゼの活性とを示すことであった。
Jurkat−NFATレポーター細胞株(Promega)は、NFATプロモーターを伴う、ヒト急性リンパ性白血病のレポーター細胞株であって、ヒトCD3εを発現させるレポーター細胞株である。T細胞二重特異性分子が、腫瘍標的及びCD3εに結合する(架橋形成)場合に、ルシフェラーゼの発現を測定することができる。発光を、One−Glo基質(Promega)の添加の後で測定する。
原発腫瘍試料は、Indivumed GmbH、Germanyから受領した。試料は、輸送培地中、一晩にわたり発送された。手術の約24時間後、試料を小片に切り分けた。18ulの低温マトリゲル(734−1101、Corning/VWR)を添加することにより、壁面が白色の96ウェル平底(透明底)プレートを調製した。プレートを、37℃で、2分間にわたりインキュベートしてから、腫瘍小片を添加した(3重)。ウェル1つ当たり33ulの低温マトリゲルを添加し、プレートを、37℃で、2分間にわたり、再度インキュベートした。ウェル1つ当たり50ulの抗体希釈液(ハイグロマイシンを伴わないが、2×ペニシリン/ストレプトマイシンを含有するJurkat培地中の)を添加し、プレートを、37℃、5%のCOで約48時間にわたりインキュベートした。
Jurkat−NFATレポーター細胞を採取し、生存率は、ViCellを使用して評価した。細胞を、350×gで、7分間にわたり遠心分離してから、ハイグロマイシンを伴わないJurkat培地中で再懸濁させ、ウェル1つ当たり50μl(ウェル1つ当たりの細胞50.000個)を添加した。プレートを、加湿インキュベーター内、37℃で5時間にわたりインキュベートしてから、それを、発光の読取りのために取り出した。80ulの各ウェルを、壁面が白色の96ウェルプレートへと移した。ウェル1つ当たり27μlのONE−Glo溶液を、各ウェルへと添加し、暗所内、室温で10分間にわたりインキュベートした。発光を、WALLAC Victor3 ELISAリーダー(PerkinElmer2030)と、検出時間としての、ウェル1つ当たり1秒間とを使用して検出した。
Jurkat NFATレポーター細胞は、FolR1 TCB(6298)及びMMP9−マトリプターゼ切断部位を含有するプロテアーゼ活性化FolR1 TCB(8364)とのコインキュベーションの後で活性化する。プロテアーゼ活性化FolR1 TCB(8363、8408)及びコントロールのTCB(8409、7235)は、ルシフェラーゼの発現を誘導しない。点線は、腫瘍と共にコインキュベートされたJurkat NFAT細胞についての、ベースラインの発光を指し示す(図40)。
実施例22
プロテアーゼ活性化TCBの、血清中の安定性
ヒト血清中のインキュベーション後における、プロテアーゼ活性化TCBについてのキャピラリー電気泳動。分子を、加湿インキュベーター(5%のCO2)内、37℃のヒトIgG枯渇血清中、0又は14日間にわたりインキュベートした。全ての分子を、アフィニティークロマトグラフィー(プロテインA)により精製し、次いで、キャピラリー電気泳動により解析した。
各分子100ugずつを、バッファー(0.01%のTween−20を伴うヒスチジンバッファー(Bichsel))又はヒト血清(IgG枯渇させた、SP1839、TL−15216、16FSP63814)に添加した。分子の濃度は、2mg/mlより高濃度であり、最終濃度は、0.5mg/mlであった。1つの分子(8408)のための前処理は、rhマトリプターゼ(R&D Systems)により、加湿インキュベーター内、37℃、5%CO2で24時間にわたり行った(そうでなければ、血清のpHを変化させうるであろう)。0日目のための試料は、液体窒素中で直接凍結させ、解析まで、−80℃で保存した。14日目のための試料は、これらもまた、瞬時凍結させるまで、加湿インキュベーター内、37℃、5%CO2で14日間にわたりインキュベートした。
HPLCアフィニティークロマトグラフィー(Agilent technologies 1200series;カラム:Upchurch scientific C−130B;パッケージング材料:Applied Biosystems POROS 20A 60μl;バッファー:10mMのトリス、50mMのグリシン、500mMのNaCl pH 8.0及びpH 2.0;注射容積:流量1ml/分で100μl;コレクション:ピークベース;中和:0.5Mのリン酸Na pH8.0 10%容積)を介して、CE−SDS解析の前に、全ての試料を精製した。プロテアーゼ活性化TCBは、ヒトIgG枯渇血清中で、最短で14日間にわたり、安定的である(図41A−41C)。
実施例23
抗CD3 scFvを伴う、抗Her2/抗CD3及び抗FolR1/抗CD3 T細胞二重特異性(TCB)分子のデザイン
いくつかのT細胞二重特異性(TCB)分子をデザインしたが、図42A−42Fに、それらのそれぞれのID番号と共に、概略的に描示する。以下の分子:
ID 8955:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びMMP9−MK062マトリプターゼを融合させた、古典的フォーマット、ハーセプターグ荷電変異体、CD3交差型のハーセプターグ 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−MMP9−MK062マトリプターゼ−CD3−N末端におけるハーセプターグ VHへの融合−不活性Fc)」(図42A;配列番号81、132、133、及び136);
ID 8957:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及び非切断型GSリンカーを融合させた、古典的フォーマット、ハーセプターグ荷電変異体、CD3交差型のハーセプターグ 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−非切断型GSリンカー−CD3−N末端におけるハーセプターグ VHへの融合−不活性Fc)」(図42B;配列番号81、132、133、及び135);
ID 8959:「古典的フォーマット、ハーセプターグ荷電変異体、CD3交差型のハーセプターグ 2+1 IgG(CD3−N末端におけるハーセプターグ VHへの融合−不活性Fcを伴う、ハーセプターグIgG)」(図42C;配列番号81、132、133、及び134);
ID 8997:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及びMMP9−MK062マトリプターゼを融合させた、古典的フォーマット、FolR1 36F2荷電変異体、CD3交差型のFolR1 36F2 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−MMP9−MK062マトリプターゼ−CD3−N末端におけるFolR1 36F2 VHへの融合−不活性Fc)」(図42D;配列番号81、137、138、及び139);
ID 8998:「N末端において、抗CD3 scFv 4.32.63及び非切断型GSリンカーを融合させた、古典的フォーマット、FolR1 36F2荷電変異体、CD3交差型のFolR1 36F2 2+1 IgG(抗イデオタイプscFv 4.32.63−非切断型GSリンカー−CD3−N末端におけるFolR1 36F2 VHへの融合−不活性Fc)」(図42E;配列番号81、137、138、及び140);
ID 8996:「古典的フォーマット、FolR1 36F2荷電変異体、CD3交差型のFolR1 36F2 2+1 IgG(CD3−N末端におけるFolR1 36F2 VHへの融合−不活性Fcを伴う、FolR1 36F2 IgG)」(図42F;配列番号81、137、138、及び141)
をデザインした。
可変ドメインを、それぞれのレシピエントの哺乳類発現ベクターへとあらかじめ挿入されたドメインとインフレームで、サブクローニングした。タンパク質の発現は、MPSVプロモーター又はCMV(ハーセプターグ用)プロモーターにより駆動され、合成polyAシグナル配列は、CDSの3’末端に存在する。加えて、各ベクターは、EBV OriP配列を含有する。
実施例24
プロテアーゼ活性化FolR1 TCBにより媒介される、初代細胞への細胞傷害性
プロテアーゼ活性化FolR1 TCB分子により媒介される、T細胞による殺滅を、低レベルのFolR1を発現させる初代細胞株上で評価した(図43)。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を、健常ヒトドナーから得られたバフィーコートから単離した。バフィーコートを、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(450×g、30分間、中断なし、室温)の後、PBMCを含有する界面相を、未使用のファルコンチューブに移し、その後、これを、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2−3分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、10%のFCS、1×GlutaMax、及び10%のDMSOを含有するRPMI1640培地中に、PBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。PBMCを、CoolCell(登録商標)Cell Freezing Containers(BioCision)内、−80℃で、ゆっくりと凍結させ、次いで、液体窒素へと移した。アッセイ開始の1日前、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について点検し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中に再懸濁させた。標的細胞は、平底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種し、加湿インキュベーター内、37℃で約20時間にわたりインキュベートした。アッセイ開始の約20時間前、PBMCを、RPMI1640培地(10%のFCS、1×GlutaMax)中で融解させた。PBMCを、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、新鮮な培地(RPMI1640、10%のFCS、1×GlutaMax)中に再懸濁させ、加湿インキュベーター内、37℃、最長で24時間にわたりインキュベートした。アッセイの開始日に、PBMCを採取し、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、アッセイ培地中に再懸濁させ、ウェル1つ当たり100ul中に、20万個のPBMC(E:Tを10:1とする;播種した標的細胞の数に基づく)を、標的細胞へと添加した。分子を、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中で希釈し、ウェル1つ当たり50ulを、表示の濃度、3重で添加してから、プレートを、加湿インキュベーター内、37℃で約48時間、72時間、又は96時間にわたりインキュベートした。標的細胞の殺滅は、37℃、5%CO2で、48時間、72時間、及び96時間にわたるインキュベーションの後、アポトーシス/壊死細胞による、細胞上清へのLDH放出の定量化(LDH検出キット;Roche Applied Science;型番11644793001)により評価した。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの20時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。
ヒトPBMC及び100nM又は10nMのFolR1 TCBにより媒介されるヒト気管支上皮細胞への傷害性は、プロテアーゼ活性化TCBと比較してより高度である。
実施例25
プロテアーゼ活性化FolR1 TCBにより媒介されるFolR1陰性標的細胞への細胞傷害性
プロテアーゼ活性化FolR1 TCB分子により媒介される、T細胞による殺滅は、FolR1陰性Mkn−45細胞株上で評価した(図44)。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を、健常ヒトドナーから得られたバフィーコートから単離した。バフィーコートを、滅菌PBSで、1:1に希釈し、Histopaque勾配にわたり層状化させた(Sigma、型番H8889)。遠心分離(450×g、30分間、中断なし、室温)の後、PBMCを含有する界面相を、未使用のファルコンチューブに移し、その後、これを、50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離し(400×g、10分間、室温)、上清を廃棄し、赤血球を溶解させるために、PBMCペレットを、2mlのACKバッファー中に再懸濁させた。37℃で約2−3分間にわたるインキュベーションの後、チューブに、滅菌PBSを、50mlまで満たし、350×gで10分間にわたり遠心分離した。この洗浄工程を、10%のFCS、1×GlutaMax、及び10%のDMSOを含有するRPMI1640培地中に、PBMCを再懸濁させる前に、1回繰り返した。PBMCを、CoolCell(登録商標)Cell Freezing Containers(BioCision)内、−80℃で、ゆっくりと凍結させ、次いで、液体窒素へと移した。アッセイ開始の1日前、接着性の標的細胞を、トリプシン/EDTAにより採取し、カウントし、生存率について点検し、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中に再懸濁させた。標的細胞は、平底96ウェルプレートを使用して、ウェル1つ当たりの細胞20000個の密度で播種し、加湿インキュベーター内、37℃で約20時間にわたりインキュベートした。アッセイ開始の約20時間前、PBMCを、RPMI1640培地(10%のFCS、1×GlutaMax)中で融解させた。PBMCを、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、新鮮な培地(RPMI1640、10%のFCS、1×GlutaMax)中に再懸濁させ、加湿インキュベーター内、37℃、最長で24時間にわたりインキュベートした。アッセイの開始日に、PBMCを採取し、350gで、7分間にわたり遠心分離した。ペレットを、アッセイ培地中に再懸濁させ、ウェル1つ当たり100ul中に、20万個のPBMC(E:Tを10:1とする;播種した標的細胞の数に基づく)を、標的細胞へと添加した。分子を、アッセイ培地(RPMI1640、2%のFCS、1×GlutaMax)中で希釈し、ウェル1つ当たり50ulを、表示の濃度、3重で添加してから、プレートを、加湿インキュベーター内、37℃で約48時間及び72時間にわたりインキュベートした。標的細胞の殺滅は、37℃、5%CO2で、48時間、72時間、及び96時間にわたるインキュベーションの後、アポトーシス/壊死細胞による、細胞上清へのLDH放出の定量化(LDH検出キット;Roche Applied Science;型番11644793001)により評価した。最大の標的細胞の溶解(=100%)は、LDH読み出しの20時間前における、標的細胞の、1%のTriton X−100を伴うインキュベーションにより達成した。最小の溶解(=0%)とは、エフェクター細胞を伴うが、TCBを伴わずにコインキュベートされた標的細胞を指す。プロテアーゼ活性化TCBは、100nMで、標的細胞の殺滅を誘導しなかった。
前出の本発明を、理解の明確さを目的とする例(illustration及びexample)として、ある程度詳細に記載してきたが、記載及び例は、本発明の範囲を限定するものとして解釈すべきではない。本明細書で引用される、全ての特許及び学術文献の開示は、出典明示によりそれらの全体において明示的に援用される。

Claims (39)

  1. (a)CD3への特異的結合が可能な第1の抗原結合部分と;
    (b)標的細胞抗原への特異的結合が可能な第2の抗原結合部分と;
    (c)プロテアーゼ切断型リンカーを介して、T細胞二重特異性結合性分子と共有結合しているマスキング部分であって、第1又は第2の抗原結合部分のイデオタイプへの特異的結合が可能であり、これにより、第1又は第2の抗原結合部分を可逆的に隠蔽するマスキング部分と
    を含むプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  2. マスキング部分が、第1の抗原結合部分と共有結合しており、第1の抗原結合部分を可逆的に隠蔽する、請求項1に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  3. マスキング部分が、第1の抗原結合部分の重鎖可変領域と共有結合している、請求項1又は2に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  4. マスキング部分が、抗イデオタイプscFvである、請求項1から3のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  5. 第2の抗原結合部分が、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変領域又は定常領域を交換した、クロスオーバーFab分子である、請求項1から4のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  6. 第1の抗原結合部分が、従来型のFab分子である、請求項1から5のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  7. CD3への特異的結合が可能な、1つを超えない抗原結合部分を含む、請求項1から6のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  8. 標的細胞抗原への特異的結合が可能なFab分子である、第3の抗原結合部分を含む、請求項1から7のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  9. 第3の抗原結合部分が、第2の抗原結合部分と同一である、請求項8に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  10. 第2の抗原結合部分が、FolR1、HER1、HER2、及びメソテリンからなる群から選択される標的細胞抗原への特異的結合が可能である、請求項1から9のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  11. 第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分が、任意選択的にペプチドリンカーを介して互いに融合している、請求項1から10のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  12. 第2の抗原結合部分が、Fab重鎖のC末端において、第1の抗原結合部分のFab重鎖のN末端に融合している、請求項1から11のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  13. 第1の抗原結合部分が、Fab重鎖のC末端において、第2の抗原結合部分のFab重鎖のN末端に融合している、請求項1から12のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  14. 安定的な会合が可能な、第1のサブユニット及び第2のサブユニットから構成されるFcドメインを加えて含む、請求項1から13のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  15. Fcドメインが、IgG、具体的には、IgG又はIgGのFcドメインである、請求項14に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  16. Fcドメインが、天然IgGのFcドメインと比較した、Fc受容体への結合親和性の低減及び/又はエフェクター機能の低減を呈示する、請求項14又は15に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  17. マスキング部分が、
    (a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
    (b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;
    (c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
    を含む重鎖可変領域と;
    (d)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
    (e)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
    (f)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
    を含む軽鎖可変領域と
    を含む、請求項1から16のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  18. プロテアーゼ切断型リンカーが、少なくとも1つのプロテアーゼ認識配列を含む、請求項1から17のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  19. プロテアーゼ切断型リンカーが、プロテアーゼ認識配列RQARVVNG(配列番号36)を含む、請求項18に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  20. 第1の抗原結合部分が、CD3への特異的結合が可能であり、
    a)TYAMN(配列番号44)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
    b)RIRSKYNNYATYYADSVKG(配列番号45)のCDR H2アミノ酸配列;及び
    c)HGNFGNSYVSWFAY(配列番号46)のCDR H3アミノ酸配列
    を含む重鎖可変領域と;
    d)GSSTGAVTTSNYAN(配列番号17)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
    e)GTNKRAP(配列番号18)のCDR L2アミノ酸配列;及び
    f)ALWYSNLWV(配列番号19)のCDR L3アミノ酸配列
    を含む軽鎖可変領域と
    を含む、請求項1から19のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  21. 第1の抗原結合部分が、CD3への特異的結合が可能であり、配列番号43のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号55のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、請求項1から20のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  22. 第2の抗原結合部分が、FolR1への特異的結合が可能であり、
    a)NAWMS(配列番号14)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
    b)RIKSKTDGGTTDYAAPVKG(配列番号15)のCDR H2アミノ酸配列;及び
    c)PWEWSWYDY(配列番号16)のCDR H3アミノ酸配列
    を含む重鎖可変領域と;
    d)GSSTGAVTTSNYAN(配列番号17)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
    e)GTNKRAP(配列番号18)のCDR L2アミノ酸配列;及び
    f)ALWYSNLWV(配列番号19)のCDR L3アミノ酸配列
    を含む軽鎖可変領域と
    を含む、請求項1から21のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  23. 第2の抗原結合部分が、メソテリンへの特異的結合が可能であり、
    a)GYTMN(配列番号107)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
    b)LITPYNGASSYNQKFRG(配列番号108)のCDR H2アミノ酸配列;及び
    c)GGYDGRGFDY(配列番号109)のCDR H3アミノ酸配列
    を含む重鎖可変領域と;
    d)SASSSVSYMH(配列番号110)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
    e)DTSKLAS(配列番号111)のCDR L2アミノ酸配列;及び
    f)QQWSKHPLT(配列番号112)のCDR L3アミノ酸配列
    を含む軽鎖可変領域と
    を含む、請求項1から21のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  24. 分子の抗CD3抗原結合部位を可逆的に隠蔽するための、イデオタイプ特異的ポリペプチド。
  25. 抗イデオタイプscFvである、請求項24に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
  26. リンカーを介して分子と共有結合している、請求項24又は25に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
  27. リンカーが、ペプチドリンカーである、請求項26に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
  28. リンカーが、プロテアーゼ切断型リンカーである、請求項26又は27に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
  29. ペプチドリンカーが、少なくとも1つのプロテアーゼ認識部位を含む、請求項26から28のいずれか一項に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
  30. プロテアーゼ切断型リンカーが、プロテアーゼ認識配列RQARVVNG(配列番号36)を含む、請求項29に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
  31. 分子が、T細胞活性化二重特異性分子である、請求項29又は30に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
  32. (a)SYGVS(配列番号26)の重鎖相補性決定領域(CDR H)1アミノ酸配列;
    (b)IIWGDGSTNYHSALIS(配列番号27)のCDR H2アミノ酸配列;
    (c)GITTVVDDYYAMDY(配列番号28)のCDR H3アミノ酸配列
    を含む重鎖可変領域と;
    (d)RASENIDSYLA(配列番号29)の軽鎖相補性決定領域(CDR L)1アミノ酸配列;
    (e)AATFLAD(配列番号30)のCDR L2アミノ酸配列;及び
    (f)QHYYSTPYT(配列番号31)のCDR L3アミノ酸配列
    を含む軽鎖可変領域と
    を含む、請求項24から31のいずれか一項に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチド。
  33. 請求項1から23のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又は請求項24から32のいずれか一項に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチドと、薬学的に許容される担体とを含む薬学的組成物。
  34. 医薬としての使用のための、請求項1から23のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、請求項24から32のいずれか一項に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチド、又は請求項33に記載の薬学的組成物。
  35. 医薬が、がんを治療するか、若しくはその進行を遅延させるか、免疫関連疾患を治療するか、若しくはその進行を遅延させるか、又は個体における免疫応答若しくは免疫機能を増強若しくは刺激するためのものである、請求項34に記載の使用のためのプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子。
  36. 医薬を製造するための、請求項1から23のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子、又は請求項24から32のいずれか一項に記載のイデオタイプ特異的ポリペプチドの使用。
  37. 疾患が、がんである、請求項36に記載の使用。
  38. 個体における疾患を治療する方法であって、前記個体へと、請求項1から23のいずれか一項に記載のプロテアーゼ活性化型T細胞活性化二重特異性分子を含む、治療的有効量の組成物を投与することを含む方法。
  39. がんを治療するか、若しくはその進行を遅延させるか、免疫関連疾患を治療するか、若しくはその進行を遅延させるか、又は個体における免疫応答若しくは免疫機能を増強若しくは刺激するための、請求項38に記載の方法。
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