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JP2019511911A - Tgfベータ2抗体 - Google Patents

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Abstract

本発明は、抗トランスフォーミング増殖因子ベータ2(TGF−β2)抗体の分野に属する。特に、本発明は、ヒトTGF−β1またはTGF−β3アイソフォームより優先的にヒトTGF−β2アイソフォームに結合するヒトモノクローナル抗体を提供する。

Description

配列表
本出願は、ASCIIフォーマットで電子的に提出され、ここに参照により完全に組み込まれる配列表を含む。前記ASCIIコピーは、2017年2月13日に作製され、PAT057206−WO−PCT_SL.TXTと名付けられ、サイズは162,071バイトである。
本発明は、抗トランスフォーミング増殖因子ベータ2(TGF−β2)抗体に関する。特に、本発明は、ヒトTGF−β1またはTGF−β3アイソフォームより優先的にヒトTGF−β2アイソフォームに結合するヒトモノクローナル抗体を提供する。
トランスフォーミング増殖因子β(TGF−β)スーパーファミリーのメンバーは、様々な病的状態、例えば線維形成、瘢痕化、がん(Growth Factors. 2011 Aug;29(4):140-52)、マルファン関連状態(米国特許第8,597,646号)および表皮水疱症のような特定の状態に関連したサイトカインである。米国特許第5,571,714号は、悪性腫瘍および転移がんの処置における抗TGFβ抗体の使用を開示する。抗TGFβ抗体は多数の疾患の処置で使用されてきた、例えば:肺線維形成(S.N. Giri et al. Thorax 48, 959-966, 1993);神経性瘢痕化(A. Logan et al. Eur. J. Neurosci. 6, 355-363, 1994);動脈損傷(Y.G. Wolf, L.M. Rasmussen & E. Ruoslahti J. Clin. Invest. 93, 1172-1178, 1994);糸球体腎炎(W.A Border et al. Nature 346, 371-374, 1990);慢性関節リウマチ(Wahl et al J. Exp. Medicine 177, 225-230, 1993)および皮膚の瘢痕化(M. Shah et al. Lancet 339, 213-214 1992;M.Shah et al. J.Cell Science 107, 1137-1157, 1994;M. Shah et al. 108, 985-1002, 1995)。したがって、TGF−β活性を標的にすることは、アンチセンスオリゴヌクレオチド(Curr Pharm Biotechnol. 2011 Dec;12(12):2203-13.)、TGF−β受容体キナーゼの小分子阻害剤(例えば、TGF−β受容体I型およびII型を標的にするLY2109761(Mol Cancer Ther 2008 7; 829))、それらの天然のリガンドを捕捉する可溶性受容体外部ドメイン、およびモノクローナル抗体(Growth Factors. 2011 Aug;29(4):140-52;国際公開第9713844号で総論されている)を含む異なるアプローチを使用した研究の活動領域である。
トランスフォーミング増殖因子ベータ2(TGF−β2)は、TGF−βタンパク質ファミリーの30を超えるメンバーのうちの1メンバーである。それは、TGF−β1/3アイソフォームに緊密に関係している。全てのTGF−β前駆体タンパク質は、N末端シグナルペプチド、大きなプロペプチドセグメントおよびC末端ポリペプチドからなる。後者は二量体化して、TGF−β2と呼ばれる、活性のある成熟したTGF−β2タンパク質を形成する。成熟したTGF−β1、TGF−β2およびTGF−β3の間の相同性は比較的高い(71〜79%)が、プロペプチドセグメントは著しく保存されていない(43〜54%の相同性)。さらに、他のTGF−βファミリータンパク質へのTGF−β2の相同性はわずか33%未満であるが、ヒト、カニクイザルおよびマウスを含む様々な種からのTGF−β2の間で非常に高い相同性が観察される(95〜100%)。
最も広く記載されたTGF−βシグナル伝達経路はTGF−βII型受容体、ALK5およびSmad2/3を介したものであるが、ALK−およびSmad非依存性経路を含む多くの他の経路が立証されている。大多数の市販されているTGF−β抗体は、非ヒト種に由来するポリクローナル抗体、またはウエスタンブロット分析で使用するためのTGF−β1特異的MAB240(R&D Systems(商標)による)などのマウスモノクローナル抗体である(J Immunol Methods. 1999 May 27;225(1-2):87-93)。ヒトの臨床試験で使用するための抗体は、ツール抗体と異なる必要条件を満たさなければならない。重大な必要条件は、キメラ、ヒト化、または完全ヒト抗体の使用による潜在的免疫原性の低減である。以下を含む、これらの必要条件を満たす臨床開発途上のいくつかのTGF−βアイソフォーム抗体がある:
1.TGF−βアイソフォーム1、2および3を中和する完全ヒトモノクローナル抗体GC1008(フレソリムマブ)、
2.TGF−β1を中和する抗体LY2382770、
3.TGF−β1を中和する抗体CAT−192(メテリムマブ)、および
4.抗体CAT−152(レルデリムマブ、6B1としても知られる)は、TGF−β2に高い親和性を、およびTGF−β3と交差反応性を有する(上の全ては、Growth Factors. 2011 Aug;29(4):140-52で総論されている)。
CAT−152:CAT−152は、TGF−β2(Biacore(登録商標)システムの解離定数0.89nM)に親和性を有し、TGF−β3(Biacore(登録商標)システムの解離定数10nM)と9%交差反応性を有するが、TGF−β1への検出可能な結合を示さない、完全ヒトIgG4抗体である(J Immunol Methods. 1999 Jul 30;227(1-2):17-29;Drugs R&D 2002; 3 (2):106-108;国際公開第9713844号)。CAT−152は、線維柱帯切除術としても知られる緑内障排液手術の補助的手段として開発された(Drugs R&D 2002; 3 (2):106-108)。しかし、CAT−152は、フェーズIII治験において初回の線維柱帯切除術の後にある特定の緑内障患者で線維形成の進行を予防することができなかった(Ophthalmology. 2007 Oct; 114(10):1822-30)。
CAT−192:TGF−β1特異的組換えヒト抗体CAT−192は、初期の散在性皮膚全身性硬化症の処置を調査したフェーズI/II治験において、効力の証拠を示すことができなかった(Arthritis Rheum. 2007 Jan;56(1):323-33)。さらに、その治験でプラセボを受けた患者よりCAT−192を受けた患者でより多くの有害事象が観察された。これらの所見は、活性TGF−β1の低下したレベルが、多臓器炎症、表皮のランゲルハンス細胞の欠如および腫瘍の発達と関連することを示す、突然変異体マウスモデルで得られた結果によってさらに裏付けられる(Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Dec 2;105(48))。
3つの緊密に関連したTGF−β1/2/3アイソフォームの存在は、有害であるかまたは望ましくない事象と関連する可能性のある他の経路に対するいかなる干渉も回避するために、ヒトでそれらのタンパク質の特異的検出および中和を可能にする化合物の必要性を発生させる。より具体的には、これは、TGF−β2を効果的に中和し、TGF−β1またはTGF−β3より優先的なTGF−β2の結合および中和を示す、アイソフォーム特異的抗TGF−β2治療抗体への強力な医学的必要性を発生させる。理想的には、高い結合親和性は効力の増加およびより低い投与必要量と関連し、効能の強化、安全性およびより低い費用に寄与するので、TGF−β2抗体の特異性は高い結合親和性と組み合わされる(MAbs. 2012 May-Jun;4(3):341-8)。モノクローナル抗体は、疾患機構における非常にタイトなタンパク質間相互作用を破壊するために、非常に低い(例えば、ピコモルの)解離定数を必要とすることがしばしばある(MAbs. 2012 May-Jun;4(3):341-8)。これは、非常に低いピコモルの解離定数を示すアイソフォーム特異的TGF−β2治療抗体への強力な医学的必要性を発生させるが、それも本発明によって解決される。
本開示のある特定の実施形態は、以下の態様で記載される:
1.ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2を中和し、ヒトアイソフォームTGF−β3を中和しない、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片。
2.ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2を中和し、ヒトアイソフォームTGF−β3およびTGF−β1を中和しない、態様1による抗体またはその機能的断片。
3.中和はSmad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される、態様1または2によるヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片。
4.Smad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される場合、250pM未満の最大半減抑制濃度(IC50)でヒトTGF−β2を中和し、100nMを超える最大半減抑制濃度(IC50)でヒトTGF−β1および/またはTGF−β3を中和する、前記態様のいずれかによる抗体またはその機能的断片。
5.TGF−β1またはTGF−β3に関するその解離定数の少なくとも70分の1の解離定数で、ヒトアイソフォームTGF−β1およびTGF−β3より優先的にヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2に結合し、ヒトTGF−β2を中和する、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片。
6.1pM以下のKでヒトTGF−β2に結合する、前記態様のいずれかによる抗体またはその機能的断片。
7.配列番号1、21、41、61、81、101または4、24、44、64、84、104または124〜129からなる群から選択される配列に少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変CDR1領域;配列番号2、22、42、62、82、102または5、25、45、65、85、105からなる群から選択される配列に少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変CDR2領域;配列番号3、23、43、63、83、103または6、26、46、66、86、106からなる群から選択される配列に少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変CDR3領域;配列番号11、31、51、71、91、111または14、34、54、74、94、114からなる群から選択される配列に少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変CDR1領域;配列番号12、32、52、72、92、112または15、35、55、75、95、115からなる群から選択される配列に少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変CDR2領域;および、配列番号13、33、53、73、93、113または16、36、56、76、96、116からなる群から選択される配列に少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変CDR3領域を含む、態様1〜6のいずれかによる抗体または機能的断片。
8.配列番号7、27、47、67、87または107のうちの少なくとも1つに少なくとも95%の配列同一性を有する重鎖可変領域ポリペプチド配列を含む、態様1〜7のいずれかによる抗体または機能的断片。
9.配列番号17、37、57、77、97または117のうちの少なくとも1つに少なくとも95%の配列同一性を有する軽鎖可変領域ポリペプチド配列を含む、態様1〜8のいずれかによる抗体または機能的断片。
10.配列番号7、27、47、67、87または107のうちの少なくとも1つに少なくとも95%の配列同一性を有する重鎖可変領域ポリペプチド配列、および配列番号17、37、57、77、97または117のうちの少なくとも1つに少なくとも95%の配列同一性を有する軽鎖可変領域ポリペプチド配列を含む、態様1〜9のいずれかによる抗体または機能的断片。
11.配列番号1、21、41、61、81、101または4、24、44、64、84、104または124〜129からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR1;配列番号2、22、42、62、82、102または5、25、45、65、85、105からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR2;配列番号3、23、43、63、83、103または6、26、46、66、86、106からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR3;配列番号11、31、51、71、91、111または14、34、54、74、94、114からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR1;配列番号12、32、52、72、92、112または15、35、55、75、95、115からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR2;配列番号13、33、53、73、93、113または16、36、56、76、96、116からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR3を含む、態様1〜10のいずれかによる抗体またはその機能的断片。
12.(a)配列番号1の重鎖可変領域CDR1;配列番号2の重鎖可変領域CDR2;配列番号3の重鎖可変領域CDR3;配列番号11の軽鎖可変領域CDR1;配列番号12の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号13の軽鎖可変領域CDR3;
(b)配列番号21の重鎖可変領域CDR1;配列番号22の重鎖可変領域CDR2;配列番号23の重鎖可変領域CDR3;配列番号31の軽鎖可変領域CDR1;配列番号32の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号33の軽鎖可変領域CDR3;
(c)配列番号41の重鎖可変領域CDR1;配列番号42の重鎖可変領域CDR2;配列番号43の重鎖可変領域CDR3;配列番号51の軽鎖可変領域CDR1;配列番号52の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号53の軽鎖可変領域CDR3;
(d)配列番号61の重鎖可変領域CDR1;配列番号62の重鎖可変領域CDR2;配列番号63の重鎖可変領域CDR3;配列番号71の軽鎖可変領域CDR1;配列番号72の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号73の軽鎖可変領域CDR3;
(e)配列番号81の重鎖可変領域CDR1;配列番号82の重鎖可変領域CDR2;配列番号83の重鎖可変領域CDR3;配列番号91の軽鎖可変領域CDR1;配列番号92の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号93の軽鎖可変領域CDR3;または
(f)配列番号101の重鎖可変領域CDR1;配列番号102の重鎖可変領域CDR2;配列番号103の重鎖可変領域CDR3;配列番号111の軽鎖可変領域CDR1;配列番号112の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号113の軽鎖可変領域CDR3
を含む、態様1〜11のいずれか1つによるヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体または機能的断片。
13.配列番号9、29、49、69、89、109からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%の配列同一性を有する完全長重鎖アミノ酸配列を含む、態様1〜12のいずれかによる抗体または機能的断片。
14.配列番号19、39、59、79、99、119からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%の配列同一性を有する完全長軽鎖アミノ酸配列を含む、態様1〜13のいずれかによる抗体または機能的断片。
15.配列番号9、29、49、69、89、109からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%の配列同一性を有する完全長重鎖アミノ酸配列、および配列番号19、39、59、79、99、119からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%の配列同一性を有する完全長軽鎖アミノ酸配列を含む、態様1〜14のいずれかによる抗体または機能的断片。
16.(a)配列番号7の可変重鎖配列および配列番号17の可変軽鎖配列;
(b)配列番号27の可変重鎖配列および配列番号37の可変軽鎖配列;
(c)配列番号47の可変重鎖配列および配列番号57の可変軽鎖配列;
(d)配列番号67の可変重鎖配列および配列番号77の可変軽鎖配列;
(e)配列番号87の可変重鎖配列および配列番号97の可変軽鎖配列;または
(f)配列番号107の可変重鎖配列および配列番号117の可変軽鎖配列
を含む、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体。
17.(a)配列番号9の重鎖配列および配列番号19の軽鎖配列;
(b)配列番号29の重鎖配列および配列番号39の軽鎖配列;
(c)配列番号49の重鎖配列および配列番号59の軽鎖配列;
(d)配列番号69の重鎖配列および配列番号79の軽鎖配列;
(e)配列番号89の重鎖配列および配列番号99の軽鎖配列;または
(f)配列番号109の重鎖配列および配列番号119の軽鎖配列
を含む、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体。
18.IgG1アイソタイプである、前記態様のいずれかによる抗TGF−β2抗体。
19.Fc領域の突然変異により変更されたエフェクター機能を有する、前記態様のいずれかによるヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体。
20.前記態様のいずれかによる抗体または機能的断片をコードする、単離されたポリヌクレオチド配列。
21.配列番号8、10、18、20、28、30、38、40、48、50、58、60、68、70、78、80、88、90、98、100、108、110、118または120の1つまたは複数を含む、態様20による単離されたポリヌクレオチド配列。
22.態様20または21による1つまたは複数の単離されたポリヌクレオチド配列を含む、クローニングまたは発現ベクター。
23.少なくとも1つのCDR領域をコードする、配列番号8、10、18、20、28、30、38、40、48、50、58、60、68、70、78、80、88、90、98、100、108、110、118もしくは120、またはその断片の1つまたは複数を含む、態様22によるベクター。
24.態様22または23による1つまたは複数のベクターを含む宿主細胞。
25.態様1〜19のいずれか1つの抗体またはその機能的断片の生成のための方法であって、態様24の宿主細胞を培養することおよび前記抗体または機能的断片を単離することを含む方法。
26.態様1〜19のいずれか1つによる抗体またはその機能的断片を含む医薬組成物。
27.療法において使用するための態様12、15、16、17または26のいずれかの抗体またはその機能的断片を含む医薬組成物。
28.医薬として使用するための態様12、15、16、17または26のいずれかの抗体またはその機能的断片を含む医薬組成物。
29.薬学的に許容される希釈剤または担体をさらに含む、態様26〜28による医薬組成物。
30.1つまたは複数のさらなる活性薬剤をさらに含む、態様26〜29による医薬組成物。
31.デュピュイトラン病の処置で使用するための態様26〜30の医薬組成物。
32.ロイス−ディーツ症候群の処置で使用するための態様26〜30の医薬組成物。
33.マルファン関連状態またはマルファン病の処置で使用するための態様26〜30の医薬組成物。
34.表皮水疱症の処置で使用するための態様26〜30の医薬組成物。
35.線維柱帯切除術の処置で使用するための態様26〜30の医薬組成物。
36.皮膚全身性硬化症の処置で使用するための態様26〜30の医薬組成物。
37.筋骨格疾患または障害の処置で使用するための態様26〜30の医薬組成物。
38.前記筋骨格疾患または障害が、筋萎縮症、例えばミオパシー、例えばミオトニー、先天性ミオパシー、例えばネマリンミオパシー、多重/ミニコアミオパシーおよび管状筋(中心核)ミオパシーによって引き起こされるもの、ミトコンドリアミオパシー、家族性周期性四肢麻痺、炎症性ミオパシー、代謝ミオパシー、例えば、グリコーゲンまたは脂質貯蔵病、皮膚筋炎、多発筋炎、封入体筋肉炎、骨化性筋炎、横紋筋融解およびミオグロビン尿症によって引き起こされるもの;筋ジストロフィー、例えば、デュシェンヌ、ベッカー、筋緊張性、筋膜肩甲上腕部、エメリー−ドライフス、眼球咽頭、肩甲上腕部、四肢肢帯、フクヤマ、先天性筋ジストロフィーまたは遺伝性末梢筋障害;骨粗しょう症;骨折;低い背丈;小人症;長期ベッド療養;随意不活動性;または不随意の不活動性である、態様37の医薬組成物。
39.デュピュイトラン病を患っている患者を処置する方法であって、前記患者に態様26〜30のいずれか1つによる医薬組成物の有効用量を投与することを含む方法。
40.マルファン関連状態またはマルファン病を患っている患者を処置する方法であって、前記患者に態様26〜30のいずれか1つによる医薬組成物の有効用量を投与することを含む方法。
41.表皮水疱症を患っている患者を処置する方法であって、前記患者に態様26〜30のいずれか1つによる医薬組成物の有効用量を投与することを含む方法。
42.線維柱帯切除術を受ける患者を処置する方法であって、前記患者に態様26〜30のいずれか1つによる医薬組成物の有効用量を投与することを含む方法。
43.皮膚全身性硬化症を患っている患者を処置する方法であって、前記患者に態様26〜30のいずれか1つによる医薬組成物の有効用量を投与することを含む方法。
44.ロイス−ディーツ症候群を患っている患者を処置する方法であって、前記患者に態様26〜30のいずれか1つによる医薬組成物の有効用量を投与することを含む方法。
45.筋骨格疾患または障害を患っている患者を処置する方法であって、前記患者に態様26〜30のいずれか1つによる医薬組成物の有効用量を投与することを含む方法。
46.前記筋骨格疾患または障害が、筋萎縮症、例えばミオパシー、例えばミオトニー、先天性ミオパシー、例えばネマリンミオパシー、多重/ミニコアミオパシーおよび管状筋(中心核)ミオパシーによって引き起こされるもの、ミトコンドリアミオパシー、家族性周期性四肢麻痺、炎症性ミオパシー、代謝ミオパシー、例えば、グリコーゲンまたは脂質貯蔵病、皮膚筋炎、多発筋炎、封入体筋肉炎、骨化性筋炎、横紋筋融解およびミオグロビン尿症によって引き起こされるもの;筋ジストロフィー、例えば、デュシェンヌ、ベッカー、筋緊張性、筋膜肩甲上腕部、エメリー−ドライフス、眼球咽頭、肩甲上腕部、四肢肢帯、フクヤマ、先天性筋ジストロフィーまたは遺伝性末梢筋障害;骨粗しょう症;骨折;低い背丈;小人症;長期ベッド療養;随意不活動性;または不随意の不活動性である、態様45による方法。
47.デュピュイトラン病、マルファン関連状態もしくはマルファン病、表皮水疱症、線維柱帯切除術、ロイス−ディーツ症候群、皮膚全身性硬化症または筋骨格疾患もしくは障害の処置のための医薬の製造における、態様1〜19のいずれか1つによる抗体もしくは機能的断片、態様20もしくは21によるポリヌクレオチド配列、または態様26〜30のいずれか1つによる医薬組成物の使用。
48.前記筋骨格疾患または障害が、筋萎縮症、例えばミオパシー、例えばミオトニー、先天性ミオパシー、例えばネマリンミオパシー、多重/ミニコアミオパシーおよび管状筋(中心核)ミオパシーによって引き起こされるもの、ミトコンドリアミオパシー、家族性周期性四肢麻痺、炎症性ミオパシー、代謝ミオパシー、例えば、グリコーゲンまたは脂質貯蔵病、皮膚筋炎、多発筋炎、封入体筋肉炎、骨化性筋炎、横紋筋融解およびミオグロビン尿症によって引き起こされるもの;ジストロフィー、例えば、デュシェンヌ、ベッカー、筋緊張性、筋膜肩甲上腕部、エメリー−ドライフス、眼球咽頭、肩甲上腕部、四肢肢帯、フクヤマ、先天性筋ジストロフィーまたは遺伝性末梢筋障害;骨粗しょう症;骨折;低い背丈;小人症;長期ベッド療養;随意不活動性;または不随意の不活動性である、態様47の使用。
49.態様17の少なくとも1つの抗体によってTGFβ−2への結合を交差ブロックするかまたは交差ブロックされる、抗体またはその機能的断片。
溶液平衡滴定(SET)方法(Sector Imager 6000(MSD))を使用して得られた、ヒト組換えTGF−β2へのTGF−β2特異的AB MOR13436結合の濃度−応答曲線を示す図である。K親和性測定は、文献に記載されている通りに実施した(Friquet et al., J Immnunol Meth 77, 305-319. 1985)。SET方法の感度および精度を向上させるために、それは古典的ELISAからECLに基づくテクノロジーに変えられた(Haenel et al., Anal Biochem 339, 182-184. 2005)。 溶液平衡滴定(SET)方法(Sector Imager 6000(MSD))を使用して得られた、ヒト組換えTGF−β2およびマウス組換えTGF−β2へのTGF−β2特異的AB(A)MOR14799、(B)MOR14800、(C)MOR14797および(D)MOR14809の濃度−応答曲線を示す図である。K親和性測定は、文献に記載されている通りに実施した(Friquet et al., J Immnunol Meth 77, 305-319. 1985)。SET方法の感度および精度を向上させるために、それは古典的ELISAからECLに基づくテクノロジーに変えられた(Haenel et al., Anal Biochem 339, 182-184. 2005)。 TGF−β2特異的AB MOR13436の生物学的「中和」活性を示す図である。HEK293T/17CAGA−12(HEK293T−RGA)、リン酸化Smad−2およびSmad−3に特異的なルシフェラーゼリポーターアッセイにおける、組換えヒトTGF−β2、マウスTGF−β2、ヒトTGF−β3およびヒトTGF−β1の効果に対する抗体の濃度−応答曲線を示す図である。組換えTGF−βは、CAGA−12リポーターに結合してルシフェラーゼ遺伝子発現を引き起こす、Smad−2およびSmad−3のリン酸化を誘導する。MOR13436は、組換えヒトおよびマウスTGF−β2を中和するが、ヒトTGF−β1およびTGF−β3を中和しない。IgG抗体MOR03207は、陰性対照の役目をした。MOR03207は、ヒト生得的免疫系の一部である酵素を認識する。 TGF−β2特異的AB MOR14799、MOR14800、MOR14797およびMOR14809の生物学的「中和」活性を示す図である。HEK293T/17CAGA−12(HEK293T−RGA)、リン酸化Smad−2およびSmad−3に特異的なルシフェラーゼリポーターアッセイにおける、様々な組換えヒトTGF−βファミリータンパク質:アクチビンA、アクチビンB、アクチビンAB、GDF−11、ミオスタチン、TGF−b2およびTGF−b3の効果に対するABの濃度−応答曲線を示す。組換えTGF−βは、CAGA−12リポーターに結合してルシフェラーゼ遺伝子発現を引き起こす、Smad−2およびSmad−3のリン酸化を誘導した。全てのABは組換えヒトTGF−β2を中和するが、いかなる他のTGF−βタンパク質ファミリーメンバーも中和しない。IgG抗体MOR03207(100nMおよび33.3nMで評価した)は、陰性対照の役目をした。MOR03207は、ヒト生得的免疫系の一部である酵素を認識する。 TGF−β2特異的AB MOR13436の生物学的「中和」活性を示す図である。組換えヒトTGF−β2(●)、マウスTGF−β2(■)およびヒトTGF−β3(◆)によるヒト骨格筋細胞(skMC)分化のAB対抗阻害の濃度−応答曲線を示す。細胞を最高120時間分化させ、クレアチンキナーゼ(CK)活性、確立された骨格筋細胞分化マーカー、を測定した。全てのTGF−βはCK活性を阻害し、AbはTGF−β2に対抗するが、TGF−β3応答に対抗しない。 TGF−β2特異的AB(A)MOR14799、(B)MOR14800、(C)MOR14797および(D)MOR14809の生物学的「中和」活性を示す図である。組換えヒトTGF−β2(●)、マウスTGF−β2(■)およびヒトTGF−β3(◆)によるヒト骨格筋細胞(skMC)分化のAB対抗阻害の濃度−応答曲線を示す。細胞を最高120時間分化させ、クレアチンキナーゼ(CK)活性、確立された骨格筋細胞分化マーカー、を測定した。全てのTGF−βはCK活性を阻害し、AbはTGF−β2に対抗するが、TGF−β3応答に対抗しない。 TGF−β2特異的AB MOR14797または汎TGF−β抗体1D11と7日間培養されたデュピュイトラン患者試料中のコラーゲンIタンパク質の免疫染色を数量化した棒グラフを示す図である。患者組織をスライスし、Abの存在下で7日間培養し、その後コラーゲンIのために免疫染色した。 アイソタイプ対照(A/C)と比較してTGF−β2特異的AB MOR14797(B/D)と7日間培養された2つの異なるデュピュイトラン患者試料中のコラーゲンIタンパク質の免疫染色を示す図である。患者1からの結果はA/Bに示し、患者2からのものはC/Dに示す。患者組織をスライスし、Abの存在下で7日間培養し、その後コラーゲンIのために免疫染色した。 TGF−β2特異的AB MOR13436で処置した片側性尿道閉塞モデル(UUO)からのマウス腎臓中のコラーゲンIタンパク質のmRNA発現を数量化した棒グラフを示す図である。偽−またはUUO手術動物をAbで14日間処置し、腎臓を取り出し、mRNAを単離してqPCRによって分析した。 TGFβ−2に結合するMOR14797のエピトープ:(A)TGFβ−2ダイマーに結合する2つのMOR14797 Fabの全体的構造を示す図である。MOR14797は面で、TGFβ−2はリボンで示される。(B)MOR14797まで5Å以内の距離のTGFβ−2ダイマーの残基は、棒で示される。 TGFβ−2に結合するMOR14797のパラトープ:MOR14797 VH(A)(それぞれ配列番号67および67、登場順)およびVL(B)(それぞれ配列番号77および77、登場順)の配列を掲載した図である。CDRループ(KabatおよびChothiaの定義)は、四角で囲まれる。TGFβ−2ダイマーまで5Å以内の距離のMOR14797の残基は、灰色で陰影をつけられる。
一般定義
本発明がより容易に理解されるように、特定の用語を先ず定義する。さらなる定義は、詳細な説明全体で示される。
以下を含む:用語「含む(comprising)」は「含む(including)」を意味し、例えば、Xを「含む(comprising)」組成物は、Xのみからなっていてもよいし、または例えばX+Yのように追加のものを含んでいてもよい。
用語「ヒトTGF−βアイソフォーム」は、トランスフォーミング増殖因子β(TGF−β)スーパーファミリーのメンバー、すなわち、ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β1、TGF−β2およびTGF−β3をそれぞれ記載するために使用される。用語「ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2」、「TGF−β2アイソフォーム」、「TGFβ2」および「TGF−β2」およびTGFベータ2は、本開示全体で同義的に使用される。
本明細書で言及される用語「抗体」は、完全な抗体およびその任意の抗原結合性断片(すなわち、「抗原結合性部分」)またはその単鎖を含む。天然に存在する「抗体」は、ジスルフィド結合によって相互接続される少なくとも2つの重(H)鎖および2つの軽(L)鎖を含む糖タンパク質である。各重鎖は、重鎖可変領域(本明細書でVと略す)および重鎖定常領域で構成される。重鎖定常領域は、3つのドメイン、CH1、CH2およびCH3で構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(本明細書でVと略す)および軽鎖定常領域で構成される。軽鎖定常領域は、1つのドメイン、Cで構成される。VおよびV領域は、フレームワーク領域(FR)と呼ばれるより保存されている領域が間に散在する、相補性決定領域(CDR)と呼ばれる超可変性の領域にさらに細分化することができる。各VおよびVは、アミノ末端からカルボキシ末端まで以下の順序で配列される3つのCDRおよび4つのFRで構成される:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合性ドメインを含有する。抗体の定常領域は、免疫系の様々な細胞(例えば、エフェクター細胞)および古典的補体系の第1構成要素(C1q)を含む、宿主の組織または因子への免疫グロブリンの結合を媒介することができる。
本明細書で用いるように、「単離された抗体」は、異なる抗原特異性を有する他の抗体が実質的に含まれない抗体を指す(例えば、抗原結合性部分に特異的に結合する単離された抗体には、TGFβ−2以外の抗原に特異的に結合する抗体が実質的に含まれない)。
本明細書で用いるように、用語「K」は、K対Kの比(すなわちK/K)から得られ、モル濃度(M)で表される解離定数を指すものとする。抗体のK値は、当技術分野で十分に確立されている方法を使用して測定することができる。抗体のKを測定する方法は、表面プラズモン共鳴、例えばBiacore(登録商標)のバイオセンサーシステム、または溶液平衡滴定(SET)である(Friguet B et al. (1985) J. Immunol Methods; 77(2): 305-319、およびHanel C et al. (2005) Anal Biochem; 339(1): 182-184を参照)。用語「Kassoc」または「K」は、特定の抗体−抗原相互作用の会合速度を指すものであり、用語「Kdis」または「K」は、本明細書で用いるように特定の抗体−抗原相互作用の解離速度を指すものである。
明細書全体で、10の倍率表記に対して様々な科学的表記が使用される。10の倍率表記に代わるものとして、科学的E表記(例えば、1.1E−15)が使用される。例えば、0.000000001モルは、3.0×10−9モルとして、または3.0E−9モルとして表記できる。
本明細書で用いるように、用語「ADCC」または「抗体依存性細胞傷害」活性は、ヒトB細胞消耗活性を指す。ADCC活性は、当技術分野で公知のヒトB細胞消耗アッセイによって測定することができる。
本明細書で用いる用語「ヒト抗体」は、フレームワークおよびCDRの両領域がヒト起源の配列に由来する可変領域を有する抗体を含むものである。さらに、抗体が定常領域を含有する場合は、定常領域もそのようなヒト配列、例えばヒト生殖細胞系配列、またはヒト生殖細胞系配列の突然変異版、またはヒトフレームワーク配列分析から導かれるコンセンサスフレームワーク配列を含有する抗体に由来し、これは、例えば、Knappik, et al.(2000. J Mol Biol 296, 57-86)に記載されている。本発明のヒト抗体は、ヒト配列によってコードされないアミノ酸残基を含むことができる(例えば、in vitroでのランダムもしくは部位特異的突然変異誘発、またはin vivoでの体細胞突然変異によって導入される突然変異;またはヒト化抗体)。
用語「ヒトモノクローナル抗体」は、フレームワークとCDR領域の両方がヒト配列に由来する可変領域を有する、単一の結合特異性を提示する抗体を指す。一実施形態では、ヒトモノクローナル抗体は、不死化細胞と融合されている、ヒト重鎖導入遺伝子および軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有する、ヒト以外のトランスジェニック動物、例えばトランスジェニックマウスから得られるB細胞を含むハイブリドーマによって生成される。
本明細書で用いるように、用語「組換えヒト抗体」は、組換え手段によって調製、発現、作製または単離された全てのヒト抗体、例えば、ヒト免疫グロブリン遺伝子に関してトランスジェニックもしくはトランスクロモソーム型である動物(例えば、マウス)から単離された抗体、またはそれから調製されるハイブリドーマ、ヒト抗体を発現するように形質転換された宿主細胞から、例えばトランスフェクトーマから単離された抗体、組換え型のコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体、およびヒト免疫グロブリン遺伝子配列の全体または一部の他のDNA配列へのスプライシングを含む任意の他の手段によって調製、発現、作製または単離された抗体を含む。そのような組換えヒト抗体は、フレームワークおよびCDR領域がヒト生殖細胞系の免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する。しかし、ある特定の実施形態では、そのような組換えヒト抗体は、in vitro突然変異誘発(または、ヒトIg配列にトランスジェニックである動物が使用されるときはin vivo体細胞突然変異誘発)にかけることができ、したがって、組換え抗体のVおよびV領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖細胞系のVおよびV配列に由来し、関係があるが、in vivoでヒト抗体生殖細胞系レパートリーの中に本来存在することができない配列である。
本明細書で用いるように、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によって提供される抗体クラス(例えば、IgM、IgE、IgG、例えばIgG1またはIgG2)を指す。
本明細書で用いるように、用語「がん」は、組織病理タイプまたは侵襲性の段階にかかわりなく、全てのタイプのがん性の増殖または腫瘍形成過程、転移組織または悪性形質転換細胞、組織もしくは器官を含むものである。がん性障害の例には、固形腫瘍、血液がん、軟組織腫瘍および転移性病変が限定されずに含まれる。固形腫瘍の例には、様々な器官系の悪性腫瘍、例えば肉腫および癌腫(腺癌および扁平上皮細胞癌腫を含む)、例えば肝臓、肺、乳房、リンパ系、胃腸(例えば、結腸)、尿生殖器の管(例えば、腎臓、尿路上皮性細胞)、前立腺および咽頭を侵すものが含まれる。腺癌には、ほとんどの結腸がん、直腸がん、腎細胞腫、肝がん、肺の非小細胞癌、小腸のがんおよび食道のがんなどの悪性腫瘍が含まれる。扁平上皮細胞癌には、例えば、肺、食道、皮膚、頭頸部領域、口腔、肛門および頸部における悪性腫瘍が含まれる。一実施形態では、がんは、メラノーマ、例えば進行期のメラノーマである。前記のがんの転移性病変を、本発明の方法および組成物を使用して処置または予防することもできる。その増殖を本明細書に開示される抗体分子を使用して阻害することができる例示的ながんには、免疫療法に一般的に応答性であるがんが含まれる。処置が好ましいがんの非限定例には、メラノーマ(例えば、転移性悪性メラノーマ)、腎臓がん(例えば、明細胞癌)、前立腺がん(例えば、ホルモン抗療性の前立腺癌)、乳がん、結腸がんおよび肺がん(例えば、非小細胞肺がん)が含まれる。さらに、抗療性および再発性の悪性腫瘍を、本明細書に記載される抗体分子を使用して処置することができる。
処置することができる他のがんの例には、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、頭部または頸部のがん、皮膚または眼内の悪性メラノーマ、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、肛門がん、胃食道、腹部のがん、脂肪肉腫、精巣がん、子宮がん、卵管癌、子宮内膜癌、子宮頸管癌、膣癌、外陰部癌、メルケル細胞がん、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、食道がん、小腸がん、内分泌系のがん、甲状腺がん、副甲状腺がん、副腎腺のがん、軟組織の肉腫、尿道がん、ペニスのがん、慢性または急性白血病、例えば急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、急性リンパ芽球性白血病、慢性リンパ球性白血病、小児期の固形腫瘍、リンパ球性リンパ腫、膀胱がん、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、腎臓または尿管のがん、腎盤の癌腫、中枢神経系(CNS)の新生物、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管新生、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、カポジ肉腫、類表皮がん、扁平上皮細胞がん、T細胞リンパ腫、アスベストによって誘発されるものを含む環境誘発がん(例えば、中皮腫)、および前記がんの組合せが含まれる。ある特定の実施形態では、がんは、皮膚がん、例えばメルケル細胞癌またはメラノーマである。一実施形態では、がんはメルケル細胞癌である。他の実施形態では、がんはメラノーマである。他の実施形態では、がんは、乳がん、例えば三重陰性乳がん(TNBC)またはHER2陰性乳がんである。他の実施形態では、がんは、腎臓がん、例えば、腎細胞癌(例えば、明細胞腎細胞癌(CCRCC)または非明細胞腎細胞癌(nccRCC))である。他の実施形態では、がんは、甲状腺がん、例えば未分化甲状腺癌(ATC)である。他の実施形態では、がんは、神経内分泌腫瘍(NET)、例えば、非定型的肺カルチノイド腫瘍または膵臓、胃腸(GI)管もしくは肺におけるNETである。ある特定の実施形態では、がんは、肺がん、例えば非小細胞肺がん(NSCLC)(例えば、扁平上皮NSCLCまたは非扁平上皮NSCLC)である。
本明細書で用いるように、用語「プログラム死1」または「PD−1」は、例えば活性化CD4+およびCD8+T細胞、TregおよびB細胞の上で発現されるCD28/CTLA−4ファミリーメンバーに関する。それは、エフェクターT細胞のシグナル伝達および機能を負に調節する。PD−1は腫瘍浸潤性T細胞の上で誘導され、機能的消耗または機能不全をもたらすことができる(Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704;Pardoll et al. (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252-64)。PD−1は、その2つのリガンド、プログラム死−リガンド1(PD−L1)またはプログラム死−リガンド2(PD−L2)のいずれかへの結合の後に、共阻害性シグナルを送達する。PD−L1は、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、マクロファージ、樹状細胞(DC)、B細胞、上皮細胞、血管内皮細胞ならびに多くの種類の腫瘍を含む、いくつかの細胞形で発現される。マウスおよびヒト腫瘍でのPD−L1の高い発現は、様々ながんにおける不良な臨床転帰にリンクされた(Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704;Pardoll et al. (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252-64)。PD−L2は、樹状細胞、マクロファージおよび一部の腫瘍で発現される。PD−1経路の遮断は、がん免疫療法のために前臨床的および臨床的に検証された。前臨床および臨床研究は、抗PD−1遮断がエフェクターT細胞の活性を回復することができ、強健な抗腫瘍応答をもたらすことを実証した。例えば、PD−1経路の遮断は、消耗した/機能不全のエフェクターT細胞機能(例えば、増殖、IFN−γ分泌または細胞溶解機能)を回復することができ、および/またはTreg細胞機能を阻害することができる(Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704;Pardoll et al. (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252-64)。PD−1経路の遮断は、PD−1、PD−L1および/またはPD−L2の抗体、その抗原結合性断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質またはオリゴペプチドで実行することができる。PD−1、例えばヒトPD−1のアミノ酸配列は、当技術分野で公知である、例えば、Shinohara T et al. (1994) Genomics 23(3):704-6; Finger LR, et al. Gene (1997) 197(1-2):177-87。
本発明の様々な定義および態様は、以下のサブセクションでさらに詳細に提供/記載される。
発明の詳細な説明
ヒトモノクローナル抗体による異なる機能と関連するいくつかの高度に相同的な標的の1つの特異的中和は、主要な課題のままである。この課題は、他の相同的標的との交差反応性を有害なまたは望ましくない事象と関連付けることができるとき、治療場面でより明白である。相同的アイソフォームTGF−β1およびTGF−β3の存在のために、ヒトモノクローナル抗体でTGF−β2を標的にするときにこれらの問題が生じることがある。これらのTGF−βアイソフォームは、ノックアウトマウスからの実験データによると異なる機能と関連する。さらに、TGF−β1の阻害は、有害事象の高いリスクと関連することが知られている。さらに、本明細書では、発明者は、動物モデルにおいてTGF−β3およびTGF−β2の同時阻害が弁膜症、心臓弁の重大な障害と関連するとの認識されていない問題を開示する。これは、TGF−β2を特異的に中和するが、TGF−β3を、またはTGF−β3およびTGF−β1を中和しないモノクローナル治療抗体を提供する、これまで未解決の必要性を発生させる。より具体的には、臨床場面で有効になるために、非常に低いピコモルの解離定数を示す中和抗TGF−β2抗体の必要性がある。さらに、有害事象と関連する可能性のある他の経路に対する干渉を引き起こしそうにないより低い用量でそれらを投与する必要があるので、高い結合親和性を有する中和抗TGF−β2抗体は、強化された効力および安全性と関連する。さらに、モノクローナル抗TGF−β2抗体のより低い用量の投与は、より低い費用とも関連する。これらの問題は、本発明によって解決される。
TGF−ベータ1/2/3アイソフォームの中和は、Smad依存性リポーター遺伝子アッセイで測定される。用語「中和抗体」および「アンタゴニスト抗体」は同義的に使用され、Smad依存性リポーター遺伝子アッセイにおいてTGFβ−1、−2および/または−3誘導シグナル伝達活性を100nM以下のIC50で阻害する抗体を指すものである。本発明との関連で使用される、「ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2を中和し、ヒトアイソフォームTGF−β3を中和しないヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片」、または「TGF−β2を特異的に中和するが、TGF−β3またはTGF−β1(または、TGF−β3およびTGF−β1の両方)を中和しない」というフレーズは、Smad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される場合、150pM未満の最大半減抑制濃度(IC50)でTGF−β2を特異的に中和するが、ヒトTGF−β1および/またはTGF−β3を中和しないヒトモノクローナル抗体を指す(例えば、ヒトTGF−β1および/またはTGF−β3に関して100nMを超えるIC50を有する)。その結果として、本開示のヒトTGF−β2中和抗体は、Smad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される場合、例えば107pM未満の最大半減抑制濃度(IC50)でヒトTGF−β2を中和し、100nMを超える最大半減抑制濃度(IC50)でヒトTGF−β1および/またはTGF−β3を中和する。一実施形態では、本開示のヒトTGF−β2中和抗体は、例えば107pM未満の最大半減抑制濃度(IC50)でヒトTGF−β2を中和し、ヒトTGF−β1および/またはTGF−β3を中和しないが、その理由は、前記抗体がSmad依存性リポーター遺伝子アッセイにおいてこれらのタンパク質に対して事実上検出不能な結合しか示さないからである。
本明細書で用いるように、用語「保存的配列改変」は、そのアミノ酸配列を含有する抗体の結合特性に有意に影響を及ぼさないか変化させないアミノ酸改変を指すものである。そのような保存的改変には、アミノ酸の置換、付加および欠失が含まれる。部位特異的突然変異誘発およびPCR媒介突然変異誘発などの当技術分野で公知の標準技術によって、改変を本発明の抗体に導入することができる。保存的アミノ酸置換は、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置き換えられるものである。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当技術分野で規定されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、無電荷極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン、トリプトファン)、無極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン)、ベータ分枝状側鎖(例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン)、および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸が含まれる。したがって、本発明の抗体のCDR領域中の1つまたは複数のアミノ酸残基を同じ側鎖ファミリーからの他のアミノ酸残基で置き換えることができ、変更された抗体は、本明細書に記載される機能アッセイを使用して保持された機能について試験することができる。
「交差反応する」抗体は、1つを超える抗原に結合する抗体を指し、前記結合は、前記抗原の活性の操作(中和、低減または活性化)をもたらすことができるが、必ずしもそうしなければならないとは限らない。交差反応性は、Smad依存性リポーター遺伝子アッセイを使用して、および、表面プラズモン共鳴バイオセンサーシステム、例えばBiacore(登録商標)システムまたは溶液平衡滴定を使用して測定することができるKを測定することによって、測定することができる。
「ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2に結合し、ヒトアイソフォームTGF−β3もしくはTGF−β1、またはTGF−β3およびTGF−β1に結合(交差反応)しないヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片」は、約1pM以下のKでTGF−β2に、および約2×10−9M、または約5×10−9Mまたは約10×10−9Mまたはそれより高いKでTGF−β1またはTGF−β3に結合する抗体を指すものでもある。ある特定の実施形態では、TGF−β3およびTGF−β1抗原と交差反応しないそのような抗体は、実際には標準の結合アッセイにおいてこれらのタンパク質に対して事実上検出不能な結合を示す。
様々な種のTGF−β2への抗体の結合能力を評価する標準のアッセイは、例えばELISA、ウエスタンブロットおよびラジオイムノアッセイ(RIA)を含め、当技術分野で公知である。適するアッセイは、実施例のセクションにおいて詳細に記載される。抗体の結合親和性は、当技術分野で公知の標準アッセイによって、例えば表面プラズモン共鳴(例えば、Biacore(登録商標)システム分析)または溶液平衡滴定によって調査することもできる。Biacore(登録商標)システムなどの表面プラズモン共鳴に基づく技術は、結合親和性の計算を可能にする結合動態を測定することができる。TGF−β2の機能特性に及ぼす抗体の効果を評価するアッセイは、実施例のセクションにおいてさらに詳細に記載される。
本発明は、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片を提供する。より詳細には、それは、ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2(配列番号122)(UniProt ID:P61812−TGFB2_HUMAN(http://www.uniprot.org/);HUGO Gene Nomenclature Committee(HGNC)に承認された遺伝子記号=TGFB2;HGNC ID=HGNC:11768)を中和し、ヒトアイソフォームTGF−β3(配列番号123)(UniProt ID:P10600−TGFB3_HUMAN;遺伝子記号HGNC=TGFB3;HGNC ID=HGNC:11769)を中和しないヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片を提供する。特に、本発明は、ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2を中和し、ヒトアイソフォームTGF−β3およびTGF−β1(配列番号121)(UniProt ID:P01137−TGFB1_HUMAN;遺伝子記号HGNC=TGFB1;HGNC ID=HGNC:11766)を中和しない、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片を提供する。抗体またはその機能的断片によるTGF−β1、TGF−β2またはTGF−β3の中和は、実施例のセクションに記載されるSmad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される。好ましくは、本発明によって提供される抗体またはその機能的断片は、Smad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される場合、ヒトTGF−β2を150pM未満、または107pM未満、または100pM未満、または95pM未満、または80pM未満、または30pM未満、または20pM未満、または10pM未満、の最大半減抑制濃度(IC50)で中和し、ヒトTGF−β1またはTGF−β3(100nMを超えるIC50を有する)を中和しない。本開示の別の実施形態では、抗体またはその機能的断片は、Smad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される場合、ヒトTGF−β2を、約1pMから約150pMの間、または約1pMから約107pMの間、または約1pMから約95pMの間、または約1pMから約80pMの間の最大半減抑制濃度(IC50)で中和し、ヒトTGF−β1またはTGF−β3(100nMを超えるIC50を有する)を中和しない。
本発明は、ヒトアイソフォームTGF−β1および/またはTGF−β3より優先的にヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2に結合する、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片も提供する。特に、提供されるヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2に、TGF−β3に関するその解離定数の少なくとも約70分の1、約1000分の1、約2000分の1、約10000分の1、約20000分の1、約200000分の1、約300000分の1、約1000000分の1または約6000000分の1の解離定数で結合し、抗体またはその機能的断片はヒトTGF−β2を中和するがTGF−β3を中和しない。
一実施形態では、ヒトTGF−β2に関する提供される抗体の解離定数は、TGF−β1またはTGF−β3に関するその解離定数の約2000分の1から約1000000分の1である。別の実施形態では、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2に、TGF−β3に関するその解離定数の少なくとも2000分の1または少なくとも1000000分の1の解離定数で結合し、抗体はヒトTGF−β2を中和するがTGF−β3を中和しない。抗体の結合親和性は、本明細書に開示される標準アッセイによって、例えば表面プラズモン共鳴(例えば、Biacore(登録商標)システム分析)または溶液平衡滴定によって調査することもできる。ヒトアイソフォームTGF−β1およびTGF−β3より優先的にヒトTGF−β2に結合する、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、約1pM以下、または約100fM以下、または約50fM以下の解離定数(K)でTGF−β2に結合する。別の実施形態では、開示される抗体または機能的断片は、1pM以下または約1pMから約10fMの解離定数(K)でヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2に結合する。
別の実施形態では、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β3に関するその解離定数の少なくとも70分の1の解離定数で、ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β3より優先的にヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2に結合し、抗体はヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2を中和するが、ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β3を中和せず、ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2に1pM以下の解離定数(K)で結合する。
好ましい実施形態では、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、TGF−β1およびTGF−β3に関するその解離定数の少なくとも70分の1の解離定数で、ヒトTGF−β1およびTGF−β3より優先的にヒトTGF−β2に結合し、抗体はヒトTGF−β2を中和するが、TGF−β3およびTGF−β1を中和せず、ヒトTGF−β2に1pM以下の解離定数(K)で結合する。
抗TGF−β2抗体またはその抗原結合性断片は、本明細書に記載されるように、単鎖抗体、Fab断片、Fv断片、F(ab’)2断片またはscFv断片、および/またはIgGアイソタイプであってもよい。
特異性および選択性に関して、先行技術抗体のいずれも本明細書に開示される抗体、特に、抗体MOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805またはMOR14787に匹敵しない。本発明の抗体は、実施例に記載される通り、単離され、構造的に特徴付けられたヒト組換え抗体を含む。本発明の単離された抗体のVアミノ酸配列は、配列番号7、27、47、67、87および107にそれぞれ示す。本発明の単離された抗体のVアミノ酸配列は、配列番号17、37、57、77、97および117にそれぞれ示す。本発明の抗体の好ましい完全長重鎖アミノ酸配列の例は、配列番号9、29、49、69、89および109にそれぞれ示す。本発明の抗体の好ましい完全長軽鎖アミノ酸配列の例は、配列番号19、39、59、79、99および119にそれぞれ示す。本発明の他の抗体には、アミノ酸の欠失、挿入または置換によって突然変異されているが、上記の配列で表す完全長重鎖アミノ酸配列と少なくとも80、90、95、97または99パーセントの同一性をなお有する抗体が含まれる。さらに、可変重鎖ヌクレオチド配列を、配列番号8、28、48、68、88および108にそれぞれ示す。可変軽鎖ヌクレオチド配列は、配列番号18、38、58、78、98および118にそれぞれ示す。完全長軽鎖ヌクレオチド配列は、配列番号20、40、60、80、100および120にそれぞれ示す。完全長重鎖ヌクレオチド配列は、配列番号10、30、50、70、90および110に示す。本発明の他の抗体には、突然変異されているが、上記の配列と少なくとも90またはそれを超える(すなわち、91、92、93、94、95、97、99またはそれを超える)パーセントの同一性をなお有する、アミノ酸または核酸が含まれる。一部の実施形態は、上記の配列で表す可変領域と比較した場合、可変領域で1、2、3、4または5個以下のアミノ酸がアミノ酸の欠失、挿入または置換によって突然変異されている突然変異アミノ酸配列を含む。これらの抗体の各々は同じ標的に結合するので、V、V、完全長軽鎖および完全長重鎖配列(ヌクレオチド配列およびアミノ酸配列)を「ミックスおよびマッチさせて」、本発明の他の抗TGF−β2抗体を作製することができる。そのような「ミックスおよびマッチさせた」抗体のTGF−β2結合は、上記のおよび実施例の結合アッセイ(例えば、ELISA)を使用して試験することができる。これらの鎖がミックスおよびマッチされるとき、特定のV/V対合からのV配列は、構造的に類似したV配列で置き換えられると予想される。同様に、特定の完全長重鎖/完全長軽鎖対合からの完全長重鎖配列は、構造的に類似した完全長重鎖配列で置き換えられると予想される。同様に、特定のV/V対合からのV配列は、構造的に類似したV配列で置き換えられると予想される。同様に、特定の完全長重鎖/完全長軽鎖対合からの完全長軽鎖配列は、構造的に類似した完全長軽鎖配列で置き換えられると予想される。したがって、一態様では、本発明は、配列番号7、27、47、67、87および107からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;ならびに配列番号17、37、57、77、97および117からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を有する、単離された組換え抗TGF−β2抗体またはその抗原結合性領域を提供する。
本明細書で用いるように、用語「相補性決定領域」および「CDR」は、抗原特異性および結合親和性に寄与する抗体可変領域中のアミノ酸の配列を指す。一般に、各重鎖可変領域には3つのCDR(HCDR1、HCDR2、HCDR3)が、および各軽鎖可変領域には3つのCDR(LCDR1、LCDR2、LCDR3)がある。所与のCDRのアミノ酸配列境界は、Kabat et al. (1991), "Sequences of Proteins of Immunological Interest," 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MDに記載されるもの(「Kabat」番号付けスキーム)を含む、いくつかの周知のスキームのいずれかを使用して決定することができる。CDR領域を決定する代わりの方法は、Chothia(Chothia et al. 1989, Nature, 342:877-883)によって考案された方法を使用する。Chothiaの定義は、構造的ループ領域の位置に基づく。CDRを規定するための他のシステムが存在し、当業者に公知である(例えば、http://www.bioinf.org.uk/abs/を参照)。CDRは抗原の認識および結合を担い、したがって、抗原結合性領域を含有すると仮定されている。この開示との関連で、CDRはKabatおよびChothiaの番号付けシステムを使用して規定されている。Kabatシステムを使用して規定されるCDRは、「KabatのCDR」と指定される。Chothiaシステムを使用して規定されるCDRは、「ChothiaのCDR」と指定される。KabatおよびChothiaのシステムを使用して予測されるCDRは大部分重複するが、必ずしも同一であるとは限らない。したがって、抗体結合性領域は、KabatおよびChothiaのシステム(「Kabat/ChothiaのCDR」)によって予測されるCDRアミノ酸配列を併合することによって規定することもできる。抗原に実際に結合する一部のアミノ酸残基はCDRの外部にあり、その結果として、さらなる抗体結合性領域/アミノ酸またはパラトープ領域を規定するために、X線結晶学およびX線回折データを使用することもできることが知られている。
用語「抗体結合性領域」、「抗体結合部位」および「パラトープ領域」は、この文書全体で同義的に使用され、抗体の軽鎖および重鎖両方の特異抗原と相互作用する可変領域の部分を指す。パラトープは、化学的相互作用(例えば、極性、非極性、水素結合/接触または塩橋)の確立によって抗原に結合する、抗体の可変領域に含まれるひと続きのアミノ酸または単独のアミノ酸からなる。CDR(例えば、Kabat/Chothiaシステムに基づいて予測される)は、抗体のKabat/Chothiaパラトープと総称される。この開示との関連で、パラトープは、抗体/抗原の結合/合併に関与する抗体のアミノ酸残基からなり、抗原まで5Å以内の距離にあるアミノ酸が、抗体/抗原結合に関与すると考えられる。パラトープは、Kabat/Chothiaにより規定されるCDRアミノ酸、ならびに抗体/抗原の結合/合併に関与する、所与の抗体の可変軽鎖および/または重鎖領域のフレームワーク領域に含まれるアミノ酸を含むことができる。Kabat/Chothiaに基づくパラトープ予測の他に、X線結晶学/X線回折データを使用して所与の抗体の完全なパラトープを識別することができる。
抗体との関連で使用されるとき、「その機能的断片」というフレーズは、抗原結合性領域(単鎖抗体、Fab断片、Fv断片、F(ab’)2断片および/またはscFv断片)を含む、完全長抗体のタンパク質断片を指し、ここで、(i)前記断片は、抗原に特異的に結合する能力を保持するか、または、(ii)別の抗体(配列交換)または抗体様構造への前記機能的断片の移入/融合の後、抗原(例えば、TGFβ−2の一部)に特異的に結合する能力は保持される。抗体の「機能的断片」の例には、V、V、CおよびCH1ドメインからなる一価の断片であるFab断片;ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって連結される2つのFab断片を含む二価の断片であるF(ab)断片;VおよびCH1ドメインからなるFd断片;抗体の単一のアームのVおよびVドメインからなるFv断片;VドメインからなるdAb断片(Ward et al., 1989 Nature 341:544-546);ならびに単離された相補性決定領域(CDR)が含まれる。さらに、Fv断片の2つのドメイン、VおよびVは別々の遺伝子によってコードされるが、それらは、組換え方法を使用して、VおよびV領域が対になって一価の分子を形成する単一のタンパク質鎖(単鎖Fv(scFv)として知られる;例えば、Bird et al., 1988 Science 242:423-426;およびHuston et al., 1988 Proc. Natl. Acad. Sci. 85:5879-5883を参照)としてそれらが作製されることを可能にする合成リンカーによって連結することができる。そのような単鎖抗体も、抗体の「機能的断片」という用語の中に包含されるものである。これらの抗体断片は、当業者に公知である従来の技術を使用して得られ、断片は元の抗体と同様に有用性についてスクリーニングされる。
一態様では、本開示のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、KabatまたはCothiaによって、またはKabatおよびCothiaによって規定される以下の相補性決定領域(CDR)を含む
(i)配列番号1〜3、11〜13、21〜23、31〜33、41〜43、51〜53、61〜63、71〜73、81〜83、91〜93、101〜103もしくは111〜113に列挙されるKabatのCDR、または
(ii)配列番号4〜6、14〜16、24〜26、34〜36、44〜46、54〜56、64〜66、74〜76、84〜86、94〜96、104〜106もしくは114〜116に列挙されるChothiaのCDR、または、
(iii)配列番号124〜129に列挙されるKabat/ChothiaのCDR。
本開示のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、配列番号1、21、41、61、81、101または4、24、44、64、84、104または124〜129からなる群から選択される配列に少なくとも80%、90%、95%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR1;配列番号2、22、42、62、82、102または5、25、45、65、85、105からなる群から選択される配列に少なくとも70%、80%、90%、95%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR2;配列番号3、23、43、63、83、103または6、26、46、66、86、106からなる群から選択される配列に少なくとも70%、80%、90%、95%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR3;配列番号11、31、51、71、91、111または14、34、54、74、94、114からなる群から選択される配列に少なくとも70%、80%、90%、95%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR1;配列番号12、32、52、72、92、112または15、35、55、75、95、115からなる群から選択される配列に少なくとも80%、90%、95%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR2;配列番号13、33、53、73、93、113または16、36、56、76、96、116からなる群から選択される配列に少なくとも70%、80%、90%、95%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR3を含む。
本開示のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、配列番号7、27、47、67、87または107の少なくとも1つに少なくとも95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性を有するVHポリペプチド配列を含む。
本開示のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、配列番号17、37、57、77、97または117の少なくとも1つに少なくとも95%、96%、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するVLポリペプチド配列を含む。
本開示のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、配列番号7、27、47、67、87または107の少なくとも1つに少なくとも95%、96%、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するVHポリペプチド配列、および配列番号17、37、57、77、97または117の少なくとも1つに少なくとも95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性を有するVLポリペプチド配列を含む。
当業者は、2つのDNAまたはタンパク質配列の同一性を評価するために使用することができる方法を知っている。2つのアミノ酸配列または2つの核酸配列のパーセント同一性を測定するために、配列を最適な比較目的のために整列させる(例えば、最適なアラインメントのために第1および第2のアミノ酸または核酸配列の一方または両方にギャップを導入することができ、非相同配列は比較目的のために無視することができる)。配列の比較および2つの配列間のパーセント同一性の測定は、数学アルゴリズムを使用して達成することができる。好ましい実施形態では、2つのアミノ酸配列間のパーセント同一性は、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comで入手可能)中のGAPプログラムに組み込まれている、NeedlemanおよびWunsch((1970) J. Mol. Biol. 48:444-453)アルゴリズムを使用して、Blossum62マトリックスまたはPAM250マトリックスのいずれか、ならびに16、14、12、10、8、6または4のギャップウェイトおよび1、2、3、4、5または6のレングスウェイトを使用して測定される。さらに別の好ましい実施形態では、2つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comで入手可能)中のGAPプログラムを使用して、NWSgapdna.CMPマトリックスおよび40、50、60、70または80のギャップウェイトおよび1、2、3、4、5または6のレングスウェイトを使用して測定される。パラメータの特に好ましいセット(特記しない限り使用されると予想されるもの)は、12のギャップペナルティ、4のギャップ伸長ペナルティおよび5のフレームシフトギャップペナルティによるBlosum62スコアリングマトリックスである。2つのアミノ酸またはヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれているE.MeyersおよびW.Miller((1989) CABIOS, 4: 11-17)のアルゴリズムを使用し、PAM120ウェイトレジデュ表、12のギャップ長ペナルティおよび4のギャップペナルティを使用して測定することができる。本明細書に記載される核酸およびタンパク質配列は、公開データベースで検索を実行するための「クエリー配列」として使用することができる。そのような検索は、Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-10のNBLASTおよびXBLASTプログラム(バージョン2.0)を使用して実行することができる。本発明の核酸(配列番号1)分子に相同的なヌクレオチド配列を得るために、BLASTヌクレオチド検索をNBLASTプログラム、スコア=100、ワードレングス=12で実行することができる。本発明のタンパク質分子に相同的なアミノ酸配列を得るために、BLASTタンパク質検索をXBLASTプログラム、スコア=50、ワードレングス=3で実行することができる。比較目的のためにギャップがあるアラインメントを得るために、Altschul et al., (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-3402に記載されているようにGapped BLASTを利用することができる。BLASTおよびGapped BLASTプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム(例えば、XBLASTおよびNBLAST)のデフォルトパラメータを使用することができる。http://www.ncbi.nlm.nih.gov.を参照。
本開示のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、配列番号1、21、41、61、81、101または4、24、44、64、84、104または124〜129からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR1;配列番号2、22、42、62、82、102または5、25、45、65、85、105からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR2;配列番号3、23、43、63、83、103または6、26、46、66、86、106からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR3;配列番号11、31、51、71、91、111または14、34、54、74、94、114からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR1;配列番号12、32、52、72、92、112または15、35、55、75、95、115からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR2;配列番号13、33、53、73、93、113または16、36、56、76、96、116からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR3を含む。
これらの抗体の各々はTGF−β2に結合することができるので、V CDR1、2および3の配列、ならびにV CDR1、2および3の配列を「ミックスおよびマッチさせる」ことができる。そのような「ミックスおよびマッチさせた」抗体のTGF−β2結合は、上記のおよび実施例の結合アッセイ(例えば、ELISA)を使用して試験することができる。V CDR配列をミックスおよびマッチさせるとき、特定のV配列からのCDR1、CDR2および/またはCDR3配列は、構造的に類似したCDR配列で置き換えると予想される。同様に、V CDR配列をミックスおよびマッチさせるとき、特定のV配列からのCDR1、CDR2および/またはCDR3配列は、構造的に類似したCDR配列で置き換えると予想される。1つまたは複数のVおよび/またはV CDR領域の配列を、本発明のモノクローナル抗体について本明細書に示すCDR配列からの構造的に類似した配列で置換することによって、新規のVおよびV配列を作製することができることは、当業技術者に容易に明白になる。
本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(A)配列番号1の重鎖可変領域CDR1;配列番号2の重鎖可変領域CDR2;配列番号3の重鎖可変領域CDR3;配列番号11の軽鎖可変領域CDR1;配列番号12の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号13の軽鎖可変領域CDR3を含む。
別の実施形態では、上記の(A)の抗体は、配列番号124の重鎖可変領域CDR1を含む。
本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(B)配列番号4の重鎖可変領域CDR1;配列番号5の重鎖可変領域CDR2;配列番号6の重鎖可変領域CDR3;配列番号14の軽鎖可変領域CDR1;配列番号15の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号16の軽鎖可変領域CDR3を含む。
別の実施形態では、上記の(B)の抗体は、配列番号124の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、(C):配列番号1、2および3のCDRを含む可変重鎖、ならびに配列番号11、12および13のCDRを含む可変軽鎖からなり、前記抗体の可変重鎖および可変軽鎖フレームワーク領域は、配列番号7の可変重鎖(VH)配列のフレームワーク領域および配列番号17の可変軽鎖(VL)配列のフレームワーク領域に少なくとも95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性をそれぞれ有する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、(D):配列番号4、5および6のCDRを含む可変重鎖、ならびに配列番号14、15および16のCDRを含む可変軽鎖からなり、前記抗体の可変重鎖および可変軽鎖フレームワーク領域は、配列番号7の可変重鎖(VH)配列のフレームワーク領域および配列番号17の可変軽鎖(VL)配列のフレームワーク領域に少なくとも95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性をそれぞれ有する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、(E):配列番号61、62および63のCDRを含む可変重鎖、ならびに配列番号71、72および73のCDRを含む可変軽鎖からなり、前記抗体の可変重鎖および可変軽鎖フレームワーク領域は、配列番号67の重鎖配列(VH)のフレームワーク領域および配列番号77の軽鎖配列(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性をそれぞれ有する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(F)配列番号61の重鎖可変領域CDR1;配列番号62の重鎖可変領域CDR2;配列番号63の重鎖可変領域CDR3;配列番号71の軽鎖可変領域CDR1;配列番号72の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号73の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(F)は、配列番号127の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(F2)配列番号61の重鎖可変ドメインCDR1;配列番号62の重鎖可変ドメインCDR2;配列番号63の重鎖可変ドメインCDR3;配列番号71の軽鎖可変ドメインCDR1;配列番号72の軽鎖可変ドメインCDR2;および配列番号73の軽鎖可変ドメインCDR3を含み、前記抗体の重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインフレームワーク領域は、配列番号67の重鎖可変ドメイン(VH)および配列番号77の軽鎖可変ドメイン(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%の配列同一性をそれぞれ有する。別の実施形態では、上記の抗体(F2)は、配列番号127の重鎖可変ドメインCDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(G):(i)配列番号61、62および63のCDR、ならびに(ii)1位のアミノ酸Qおよび99位のアミノ酸Rを含む重鎖可変ドメイン;ならびに(iii)配列番号71、72および73のCDR、ならびに(iv)49位のアミノ酸Fを含む軽鎖可変ドメインを含み、前記抗体の重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインフレームワーク領域は、配列番号67の重鎖可変ドメイン配列(VH)および配列番号77の軽鎖可変ドメイン配列(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%の配列同一性をそれぞれ有し、(ii)および(iv)に指摘されるアミノ酸の位置は、配列番号67および77の1位、99位および49位にそれぞれ対応する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(H)配列番号64の重鎖可変領域CDR1;配列番号65の重鎖可変領域CDR2;配列番号66の重鎖可変領域CDR3;配列番号74の軽鎖可変領域CDR1;配列番号75の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号76の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(H)は、配列番号127の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(H1)配列番号64の重鎖可変ドメインCDR1;配列番号65の重鎖可変ドメインCDR2;配列番号66の重鎖可変ドメインCDR3;配列番号74の軽鎖可変ドメインCDR1;配列番号75の軽鎖可変ドメインCDR2;および配列番号76の軽鎖可変ドメインCDR3を含み、前記抗体の重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインフレームワーク領域は、配列番号67の重鎖可変ドメイン(VH)および配列番号77の軽鎖可変ドメイン(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%の配列同一性をそれぞれ有する。別の実施形態では、上記の抗体(H1)は、配列番号127の重鎖可変ドメインCDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(H2):(i)配列番号64、65および66のCDR、ならびに(ii)1位のアミノ酸Qおよび99位のアミノ酸Rを含む重鎖可変ドメイン;ならびに(iii)配列番号74、75および76のCDR、ならびに(iv)49位のアミノ酸Fを含む軽鎖可変ドメインを含み、前記抗体の重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインフレームワーク領域は、配列番号67の重鎖可変ドメイン(VH)および配列番号77の軽鎖可変ドメイン(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%の配列同一性をそれぞれ有し、(ii)および(iv)に指摘されるアミノ酸の位置は、配列番号67および77の1位、99位および49位にそれぞれ対応する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(I):以下のアミノ酸:(i)1位のQ、31位のT、32位のS、34位のM、55位のW、56位のN、58位のD、99位のR、101位のF、102位および103位のY、104位のS、106位のYおよび108位のD、を含む重鎖可変ドメイン、ならびに以下のアミノ酸:(ii)32位のY、49位のF、53位のS、54位のL、55位のQ、56位のS、91位のT、92位のNおよび93位のT、を含む軽鎖可変ドメインを含み、前記抗体の重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインフレームワーク領域は、配列番号67の重鎖可変ドメイン(VH)および配列番号77の軽鎖可変ドメイン(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%の配列同一性をそれぞれ有し、(i)および(ii)で指摘するアミノ酸の位置は、配列番号67の位置1、31、32、34、55、56、58、99、101、102、103、104、106および108に、ならびに配列番号77の位置32、49、53、54、55、56、91、92および93にそれぞれ対応する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(I1):(i)TGFβ−2ダイマーに結合するとき、前記抗原まで5Å以内の距離にある位置1、31、32、34、55、56、58、99、101〜104、106および108のアミノ酸を含む重鎖可変ドメイン、ならびに(ii)TGFβ−2ダイマーに結合するとき、抗原まで5Å以内の距離にある位置32、49、53〜56および91〜93のアミノ酸を含む軽鎖可変ドメインを含み、(i)および(ii)で指摘するアミノ酸の位置は、配列番号67の位置1、31、32、34、55、56、58、99、101〜104、106および108に、ならびに配列番号77の位置32、49、53〜56、91、92および93にそれぞれ対応する。
別の実施形態では、上記の抗体(I2)またはその機能的断片は、重鎖可変ドメインの位置1、31、32、34、55、56、58、99、101〜104、106および108に、配列番号67の重鎖可変ドメインタンパク質の同じ位置にあるそれらと同じアミノ酸を含み、軽鎖可変ドメインの位置32、49、53〜56および91〜93に、配列番号77の軽鎖可変ドメインタンパク質の同じ位置にあるそれらと同じアミノ酸を含む。
別の実施形態では、上記の抗体(I3)またはその機能的断片は、重鎖可変ドメインの位置1、31、32、34、55、56、58、99、101〜104、106および108に、配列番号67の重鎖可変ドメインタンパク質の同じ位置にあるアミノ酸と類似した側鎖を有するアミノ酸を含み、重鎖可変ドメインの位置32、49、53〜56および91〜93に、配列番号77の重鎖可変ドメインタンパク質の同じ位置にあるアミノ酸と類似した側鎖を有するアミノ酸を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(I4):以下のアミノ酸:TGFβ−2ダイマーに結合するとき、抗原まで5Å以内の距離にある、1位のQ、31位のT、32位のS、34位のM、55位のW、56位のN、58位のD、99位のR、101位のF、102位および103位のY、104位のS、106位のYおよび108位のD、を含む重鎖可変ドメイン、ならびに以下のアミノ酸:TGFβ−2ダイマーに結合するとき、抗原まで5Å以内の距離にある、32位のY、49位のF、53位のS、54位のL、55位のQ、56位のS、91位のT、92位のNおよび93位のT、を含む軽鎖可変ドメインを含み、前記抗体の重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインフレームワーク領域は、配列番号67の重鎖可変ドメイン(VH)および配列番号77の軽鎖可変ドメイン(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%の配列同一性をそれぞれ有する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(J)配列番号21の重鎖可変領域CDR1;配列番号22の重鎖可変領域CDR2;配列番号23の重鎖可変領域CDR3;配列番号31の軽鎖可変領域CDR1;配列番号32の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号33の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(J)は、配列番号125の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、(K):配列番号21、22および23のCDRを含む可変重鎖、ならびに配列番号31、32および33のCDRを含む可変軽鎖からなり、前記抗体の可変重鎖および可変軽鎖フレームワーク領域は、配列番号29の重鎖配列(VH)のフレームワーク領域および配列番号39の軽鎖配列(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性をそれぞれ有する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(L)配列番号21の重鎖可変領域CDR1;配列番号22の重鎖可変領域CDR2;配列番号23の重鎖可変領域CDR3;配列番号31の軽鎖可変領域CDR1;配列番号32の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号33の軽鎖可変領域CDR3;および配列番号131および132のフレームワークパラトープ領域を含む。別の実施形態では、上記の抗体(L)は、配列番号125の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(M)配列番号24の重鎖可変領域CDR1;配列番号25の重鎖可変領域CDR2;配列番号26の重鎖可変領域CDR3;配列番号34の軽鎖可変領域CDR1;配列番号35の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号36の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(M)は、配列番号125の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(N)配列番号24の重鎖可変領域CDR1;配列番号25の重鎖可変領域CDR2;配列番号26の重鎖可変領域CDR3;配列番号34の軽鎖可変領域CDR1;配列番号35の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号36の軽鎖可変領域CDR3;および配列番号131および132のパラトープ領域を含む。別の実施形態では、上記の抗体(N)は、配列番号125の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(O)配列番号41の重鎖可変領域CDR1;配列番号42の重鎖可変領域CDR2;配列番号43の重鎖可変領域CDR3;配列番号51の軽鎖可変領域CDR1;配列番号52の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号53の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(O)は、配列番号126の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、(P):配列番号41、42および43のCDRを含む可変重鎖、ならびに配列番号51、52および53のCDRを含む可変軽鎖からなり、前記抗体の可変重鎖および可変軽鎖フレームワーク領域は、配列番号47の重鎖配列(VH)のフレームワーク領域および配列番号57の軽鎖配列(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性をそれぞれ有する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(Q)配列番号44の重鎖可変領域CDR1;配列番号45の重鎖可変領域CDR2;配列番号46の重鎖可変領域CDR3;配列番号54の軽鎖可変領域CDR1;配列番号55の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号56の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(Q)は、配列番号126の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(R)配列番号81の重鎖可変領域CDR1;配列番号82の重鎖可変領域CDR2;配列番号83の重鎖可変領域CDR3;配列番号91の軽鎖可変領域CDR1;配列番号92の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号93の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(R)は、配列番号128の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、(S):配列番号81、82および83のCDRを含む可変重鎖、ならびに配列番号91、92および93のCDRを含む可変軽鎖からなり、前記抗体の可変重鎖および可変軽鎖フレームワーク領域は、配列番号87の重鎖配列(VH)のフレームワーク領域および配列番号97の軽鎖配列(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性をそれぞれ有する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(T)配列番号84の重鎖可変領域CDR1;配列番号85の重鎖可変領域CDR2;配列番号86の重鎖可変領域CDR3;配列番号94の軽鎖可変領域CDR1;配列番号95の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号96の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(T)は、配列番号128の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(U)配列番号101の重鎖可変領域CDR1;配列番号102の重鎖可変領域CDR2;配列番号103の重鎖可変領域CDR3;配列番号111の軽鎖可変領域CDR1;配列番号112の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号113の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(U)は、配列番号129の重鎖可変領域CDR1を含む。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、(V):配列番号101、102および103のCDRを含む可変重鎖、ならびに配列番号111、112および113のCDRを含む可変軽鎖からなり、前記抗体の可変重鎖および可変軽鎖フレームワーク領域は、配列番号107の重鎖配列(VH)のフレームワーク領域および配列番号117の軽鎖配列(VL)のフレームワーク領域に少なくとも95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性をそれぞれ有する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(W)配列番号104の重鎖可変領域CDR1;配列番号105の重鎖可変領域CDR2;配列番号106の重鎖可変領域CDR3;配列番号114の軽鎖可変領域CDR1;配列番号115の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号116の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、上記の抗体(W)は、配列番号129の重鎖可変領域CDR1を含む。
別の好ましい実施形態では、上記のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体(A)〜(W)またはその機能的断片は、TGF−β1またはTGF−β3に関するその解離定数の少なくとも2000分の1の解離定数で、ヒトTGF−β1およびTGF−β3より優先的にヒトTGF−β2に結合し、抗体はヒトTGF−β2を中和するが、TGF−β3を中和せず、ヒトTGF−β2に1pM以下の解離定数(K)で結合する。別の実施形態では、本開示のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、配列番号9、29、49、69、89および109からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%、96%、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有する完全長重鎖アミノ酸配列を含む。
一実施形態では、本開示のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、配列番号19、39、59、79、99および119からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%、96%、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有する完全長軽鎖アミノ酸配列を含む。
一実施形態では、本開示のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体は、配列番号9、29、49、69、89および109からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%、96%、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有する完全長重鎖アミノ酸配列、および、配列番号19、39、59、79、99および119からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%、96%、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有する完全長軽鎖アミノ酸配列を含む。
一態様では、本発明は、
(a)配列番号7の可変重鎖配列および配列番号17の可変軽鎖配列;(b)配列番号27の可変重鎖配列および配列番号37の可変軽鎖配列;(c)配列番号47の可変重鎖配列および配列番号57の可変軽鎖配列;(d)配列番号67の可変重鎖配列および配列番号77の可変軽鎖配列;(e)配列番号87の可変重鎖配列および配列番号97の可変軽鎖配列;または(f)配列番号107の可変重鎖配列および配列番号117の可変軽鎖配列を含む、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片をさらに提供する。
別の実施形態では、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、TGF−β1またはTGF−β3に関するその解離定数の少なくとも2000分の1の解離定数で、ヒトTGF−β1およびTGF−β3より優先的にヒトTGF−β2に結合し、抗体はヒトTGF−β2を中和するが、TGF−β3を中和せず、ヒトTGF−β2に1pM以下の解離定数(K)で結合し、抗体またはその機能的断片は:(a)配列番号7の可変重鎖配列および配列番号17の可変軽鎖配列;(b)配列番号27の可変重鎖配列および配列番号37の可変軽鎖配列;(c)配列番号47の可変重鎖配列および配列番号57の可変軽鎖配列;(d)配列番号67の可変重鎖配列および配列番号77の可変軽鎖配列;(e)配列番号87の可変重鎖配列および配列番号97の可変軽鎖配列;または(f)配列番号107の可変重鎖配列および配列番号117の可変軽鎖配列を含む。
本発明は、
(a)配列番号9の重鎖配列および配列番号19の軽鎖配列;
(b)配列番号29の重鎖配列および配列番号39の軽鎖配列;
(c)配列番号49の重鎖配列および配列番号59の軽鎖配列;
(d)配列番号69の重鎖配列および配列番号79の軽鎖配列;
(e)配列番号89の重鎖配列および配列番号99の軽鎖配列;または
(f)配列番号109の重鎖配列および配列番号119の軽鎖配列
を含む、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体を提供する。
MOR14799:本明細書でMOR14799と呼ばれる本開示のモノクローナル抗体は、配列番号9の重鎖配列および配列番号19の軽鎖配列を含む。MOR14799は、配列番号7の可変重鎖配列および配列番号17の可変軽鎖配列を含む。MOR14799は、配列番号1の重鎖可変領域CDR1;配列番号2の重鎖可変領域CDR2;配列番号3の重鎖可変領域CDR3;配列番号11の軽鎖可変領域CDR1;配列番号12の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号13の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、MOR14799は、配列番号124の重鎖可変領域CDR1を含む。MOR14799の重鎖および重鎖可変領域は、配列番号10および8のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。MOR14799の軽鎖および軽鎖可変領域は、配列番号20および18のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。(i)hTGFβ−2に関する抗体MOR14799のK値は1.08E−15Mであり、(ii)TGFβ−1への検出可能な結合がなく、および(iii)hTGFβ−3に関するK値は1.99E−11Mである(表4を参照)。このことから、TGFβ2に関するMOR14799のK値は、TGFβ3に関するものの18000分の1より低いことになる。さらにそのようなアッセイの検出限界近くの極めて低いK値からもたらされる可能な測定誤差を考慮するために、100fM以下のK値について合意することによって、MOR14799のK値測定のより控え目な解釈を適用するときでさえ、TGFβ2に関するMOR14799のK値は、TGFβ3に関するもののなお200分の1である。これらのデータは、先行技術の抗体に対するMOR14799の意外な優位性を例示するが、その理由は、Thompson et al (J Immunol Methods. 1999 Jul 30;227(1-2):17-29)によって公開されたデータに基づくと、(i)hTGFβ−2に関する先行技術抗体CAT−152のK値は0.89nMであり、(ii)hTGFβ−3に関するK値は10nMであるからである。このことから、TGFβ2に関するCAT−152のK値は、TGFβ3に関するもののちょうど11分の1になる。本明細書で提供される実験データに基づいて、TGFβ2に関するCAT−152のK値は7.3E−11Mであり、hTGFβ−3に関するK値は1.18E−09Mであり、これは、TGFβ3に関するもののわずか16分の1である、TGFβ2に関するCAT−152のK値をもたらす。
本明細書で提供される実験データに基づいて、TGFβ2に関する1D11のK値は1.17E−10Mであり、hTGFβ−3に関するK値は2.0E−11Mであり、これは、TGFβ3に関するもののわずか17分の1である、TGFβ2に関する1D11のK値をもたらす。
MOR14800:本明細書でMOR14800と呼ばれる本開示のモノクローナル抗体は、配列番号29の重鎖配列および配列番号39の軽鎖配列を含む。MOR14800は、配列番号27の可変重鎖配列および配列番号37の可変軽鎖配列を含む。MOR14800は、配列番号21の重鎖可変領域CDR1、配列番号22の重鎖可変領域CDR2;配列番号23の重鎖可変領域CDR3;配列番号31の軽鎖可変領域CDR1;配列番号32の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号33の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、MOR14800は、配列番号125の重鎖可変領域CDR1を含む。MOR14800の重鎖および重鎖可変領域は、配列番号30および28のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。MOR14800の軽鎖および軽鎖可変領域は、配列番号40および38のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。(i)hTGFβ−2に関する抗体MOR14800のK値は4.34E−16Mであり、(控え目な推定100fM)、(ii)TGFβ−1への検出可能な結合がなく、および(iii)TGFβ−3への検出可能な結合がない(表4)。したがって、抗体MOR14800は、TGFβ1ともTGFβ3とも全く反応しない。これらのデータは、先行技術の抗体に対するMOR14800の意外な優位性を例示する。
本開示の別の実施形態では、モノクローナル抗体MOR14800は、配列番号21の重鎖可変領域CDR1、配列番号22の重鎖可変領域CDR2;配列番号23の重鎖可変領域CDR3;配列番号31の軽鎖可変領域CDR1;配列番号32の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号33の軽鎖可変領域CDR3;ならびに配列番号131および132のフレームワークパラトープ領域を含む。別の実施形態では、上記の抗体MOR14800は、配列番号125の重鎖可変領域CDR1を含む。
MOR14809:本明細書でMOR14809と呼ばれる本開示のモノクローナル抗体は、配列番号49の重鎖配列および配列番号59の軽鎖配列を含む。MOR14809は、配列番号47の可変重鎖配列および配列番号57の可変軽鎖配列を含む。MOR14809は、配列番号41の重鎖可変領域CDR1;配列番号42の重鎖可変領域CDR2;配列番号43の重鎖可変領域CDR3;配列番号51の軽鎖可変領域CDR1;配列番号52の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号53の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、抗体MOR14809は、配列番号126の重鎖可変領域CDR1を含む。MOR14809の重鎖および重鎖可変領域は、配列番号50および48のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。MOR14809の軽鎖および軽鎖可変領域は、配列番号60および58のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。(i)hTGFβ−2に関する抗体MOR14809のK値は5.24E−14Mであり(控え目な推定100fM)、(ii)TGFβ−1への検出可能な結合がなく、および(iii)TGFβ−3への検出可能な結合がない(表4を参照)。したがって、抗体MOR14809は、TGFβ−1ともTGFβ−3とも全く反応しない。これらのデータは、先行技術の抗体に対するMOR14809の意外な優位性を例示する。
MOR14797:本明細書でMOR14797と呼ばれる本開示のモノクローナル抗体は、配列番号69の重鎖配列および配列番号79の軽鎖配列を含む。MOR14797は、配列番号67の可変重鎖配列および配列番号77の可変軽鎖配列を含む。MOR14797は、配列番号61の重鎖可変領域CDR1;配列番号62の重鎖可変領域CDR2;配列番号63の重鎖可変領域CDR3;配列番号71の軽鎖可変領域CDR1;配列番号72の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号73の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、抗体MOR14797は、配列番号127の重鎖可変領域CDR1を含む。MOR14797の重鎖および重鎖可変領域は、配列番号70および68のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。MOR14797の軽鎖および軽鎖可変領域は、配列番号80および78のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。(i)hTGFβ−2に関する抗体MOR14797のK値は4.46E−15Mであり、(ii)TGFβ−1への検出可能な結合がなく、および(iii)hTGFβ−3に関するK値は2.74E−08Mである(表4)。このことから、TGFβ−2に関するMOR14797のK値は、TGFβ−3に関するものの600万分の1であることになる。さらにそのようなアッセイの検出限界近くの極めて低いK値からもたらされる可能な測定誤差を考慮するために、100fM以下のK値について合意することによって、MOR14799のK値測定のより控え目な解釈を適用するときでさえ、TGFβ2に関するMOR14797のK値は、TGFβ−3に関するもののなお270000分の1と予想される。これらのデータは、先行技術の抗体に対するMOR14797の意外な優位性を例示する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(i)配列番号61、62および63のCDRならびに(ii)1位のアミノ酸Qおよび99位のアミノ酸Rを含む重鎖可変ドメイン;ならびに(iii)配列番号71、72および73のCDRならびに(iv)49位のアミノ酸Fを含む軽鎖可変ドメインを含み、前記抗体の重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインフレームワーク領域は、配列番号67の重鎖可変ドメイン配列(VH)および配列番号77の軽鎖可変ドメイン配列(VL)のフレームワーク領域に少なくとも98%の配列同一性をそれぞれ有し、(ii)および(iv)に指摘されるアミノ酸の位置は、配列番号67および77の1位、99位および49位にそれぞれ対応する。
一実施形態では、本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、(i)配列番号64、65および66のCDRならびに(ii)1位のアミノ酸Qおよび99位のアミノ酸Rを含む重鎖可変ドメイン;ならびに(iii)配列番号74、75および76のCDRならびに(iv)49位のアミノ酸Fを含む軽鎖可変ドメインを含み、前記抗体の重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインフレームワーク領域は、配列番号67の重鎖可変ドメイン(VH)および配列番号77の軽鎖可変ドメイン(VL)のフレームワーク領域に少なくとも98%の配列同一性をそれぞれ有し、(ii)および(iv)に指摘されるアミノ酸の位置は、配列番号67および77の1位、99位および49位にそれぞれ対応する。
MOR14805:本明細書でMOR14805と呼ばれる本開示のモノクローナル抗体は、配列番号89の重鎖配列および配列番号99の軽鎖配列を含む。MOR14805は、配列番号87の可変重鎖配列および配列番号97の可変軽鎖配列を含む。MOR14805は、配列番号81の重鎖可変領域CDR1;配列番号82の重鎖可変領域CDR2;配列番号83の重鎖可変領域CDR3;配列番号91の軽鎖可変領域CDR1;配列番号92の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号93の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、抗体MOR14805は、配列番号128の重鎖可変領域CDR1を含む。MOR14805の重鎖および重鎖可変領域は、配列番号90および88のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。MOR14805の軽鎖および軽鎖可変領域は、配列番号100および98のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。(i)hTGFβ−2に関する抗体MOR14805のK値は9.70E−13Mであり、(ii)TGFβ−1への検出可能な結合がなく、および(iii)hTGFβ−3に関するK値は7.05E−11Mである(表4を参照)。このことから、TGFβ−2に関するMOR14805のK値は、TGFβ−3に関するものの73分の1であることになる。これらのデータは、先行技術の抗体に対するMOR14805の意外な優位性を例示する。
MOR14787:本明細書でMOR14787と呼ばれる本開示のモノクローナル抗体は、配列番号109の重鎖配列および配列番号119の軽鎖配列を含む。MOR14787は、配列番号107の可変重鎖配列および配列番号117の可変軽鎖配列を含む。MOR14787は、配列番号101の重鎖可変領域CDR1;配列番号102の重鎖可変領域CDR2;配列番号103の重鎖可変領域CDR3;配列番号111の軽鎖可変領域CDR1;配列番号112の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号113の軽鎖可変領域CDR3を含む。別の実施形態では、抗体MOR14787は、配列番号129の重鎖可変領域CDR1を含む。MOR14787の重鎖および重鎖可変領域は、配列番号110および108のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。MOR14787の軽鎖および軽鎖可変領域は、配列番号120および118のポリヌクレオチド配列によってそれぞれコードされる。(i)hTGFβ−2に関する抗体MOR14787のK値は7.38E−16Mであり、(ii)TGFβ−1への検出可能な結合がなく、および(iii)TGFβ−3への検出可能な結合がない(表4を参照)。したがって、抗体MOR14787は、TGFβ−1ともTGFβ−3とも全く反応しない。これらのデータは、先行技術の抗体に対するMOR14787の意外な優位性を例示する。
高い結合親和性/選択性で抗TGF−β2抗体を中和することは、有害事象と関連する可能性のある他の経路に対する干渉をより引き起こしそうにない。本発明の抗体は、TGFβアイソフォーム1および3に結合および/または中和しない。さらに、本発明の抗体は、同じかまたは関連した代謝経路において活性である他のタンパク質に結合しない。特に、本発明の抗体は、ヒトタンパク質GDF−11、GDF−8、アクチビンA、アクチビンBおよびアクチビンA/B(「反標的」)に結合しない。したがって、一実施形態では、本発明は本明細書に開示される抗体MOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805またはMOR14787に関し、前記抗体は、100nMのIgG抗体まで反標的GDF−11、GDF−8、アクチビンA、アクチビンBおよびアクチビンA/Bを中和しない。
ある特定の実施形態では、本発明の抗体は、CDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変領域ならびにCDR1、CDR2、CDR3配列を含む軽鎖可変領域を有し、これらの配列の1つまたは複数は、本明細書に記載される抗体またはその保存的改変に基づく指定されたアミノ酸配列を有し、抗体は本発明の抗TGFβ−2抗体の所望の機能特性を保持する。したがって、本発明は、(a)配列番号1〜3、11〜13、21〜23、31〜33、41〜43、51〜53、61〜63、71〜73、81〜83、91〜93、101〜103、111〜113および124〜129もしくはその保存的改変からなる群から選択される、またはb)配列番号4〜6、14〜16、24〜26、34〜36、44〜46、54〜56、64〜66、74〜76、84〜86、94〜96、104〜106、114〜116および124〜129もしくはその保存的改変からなる群から選択される、CDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変領域ならびにCDR1、CDR2、CDR3を含む軽鎖可変領域、からなる単離された組換え抗TGFβ−2抗体またはその機能的断片を提供する。好ましくは、そのような抗体は、以下の機能特性の少なくとも1つを示す:(i)ヒトTGF−β2を150pM未満、または107pM未満、または100pM未満、または80pM未満、または30pM未満、または20pM未満、または10pM未満の最大半減抑制濃度(IC50)で中和し、およびSmad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される場合、100nMを超える最大半減抑制濃度(IC50)でヒトTGF−β1またはTGF−β3を中和する、または(ii)ヒトTGF−β2を、約1pMから約150pMの間、または約1pMから約107pMの間、または約1pMから約80pMの間の最大半減抑制濃度(IC50)で中和し、およびSmad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される場合、100nMを超える最大半減抑制濃度(IC50)でヒトTGF−β1またはTGF−β3を中和する。そのような抗体は、例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体であってもよい。
他の実施形態では、哺乳動物細胞での発現のために最適化される本発明の抗体は、完全長重鎖配列および完全長軽鎖配列を有し、これらの配列の1つまたは複数は、本明細書に記載される抗体またはその保存的改変に基づく指定されたアミノ酸配列を有し、抗体は本発明の抗TGFβ−2抗体の所望の機能特性を保持する。したがって、本発明は、配列番号9、29、49、69、89および109の完全長重鎖配列、ならびに配列番号19、39、59、79、99または119の完全長軽鎖配列からなる、哺乳動物細胞での発現のために最適化される単離されたモノクローナル抗TGFβ−2抗体を提供し、ここで、前記配列に保存的改変が導入されている。様々な実施形態では、抗体は、上記の機能特性の一方または両方を提示することができる。そのような抗体は、例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体であってもよい。
本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片は、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgE、IgMまたはIgDアイソタイプであってよく、特に、例えばIgG1、IgG2、IgG3およびIgG4アイソタイプのヒト重鎖定常領域から選択される。本明細書で用いるように、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によって提供される抗体クラス(例えば、IgM、IgE、IgG、例えばIgG1またはIgG2)を指す。
本発明のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体または機能的断片は、Fc領域の突然変異により変更されたエフェクター機能を有することができる。さらなる実施形態では、本発明の抗体はIgG1アイソタイプであり、Fc領域の突然変異により変更されたエフェクター機能を有する。一実施形態では、前記変更されたエフェクター機能は、低減された抗体依存性細胞傷害(ADCC)および補体依存性細胞傷害(CDC)活性である。一実施形態では、前記変更されたエフェクター機能は、抑制されたADCCおよびCDC活性である。FcRγ結合を抑止し、エフェクター機能を減弱するために、234位および235位のロイシンがアラニンに突然変異されたサイレントIgG1LALAフォーマットに、抗体を変換することもできる。抗体定常領域を変更する方法は、当技術分野で公知である。変更された機能、例えばエフェクターリガンド、例えば細胞上のFcR、または補体のC1構成成分への親和性の変更を有する抗体は、抗体の定常部分の少なくとも1つのアミノ酸残基を異なる残基で置き換えることによって生成することができる(例えば、欧州特許第388151号;米国特許第5,624,821号を参照)。マウスまたは他の種の免疫グロブリンに適用される場合、これらの機能を低下または消失させるだろう、類似の種類の変更が記載されるかもしれない。
本発明の抗TGF−β2抗体と同じエピトープに結合する抗体
別の実施形態では、本発明は、本明細書に記載される本発明の様々な特異的抗TGF−β2抗体と同じエピトープに結合する抗体を提供する。したがって、本発明は、配列番号67の重鎖可変ドメインおよび配列番号77の軽鎖可変ドメインを含む抗体によって認識されるエピトープに結合する、抗体またはその機能的断片を提供する。したがって、本発明は、抗体MOR14797によって認識されるエピトープに結合する抗体またはその機能的断片を提供する。結晶化および構造決定の後、本発明の好ましい抗体の結合性領域がより明らかに規定された。したがって、本発明は、ヒトTGFβ−2タンパク質の鎖Aのアミノ酸LEU304、ASN316、PRO351、TYR352、LEU353、TRP354、SER355、SER356、GLN359、ARG362、VAL363、LEU366、THR369およびILE370ならびにヒトTGFβ−2タンパク質の鎖BのLYS327、GLY331、TRP332、LYS333、TRP334、TYR392、ILE394、LYS399、GLU401およびLEU403を含むヒトTGFβ−2タンパク質のエピトープに結合する抗体を提供する。
したがって、本発明は、配列番号27の重鎖可変ドメインおよび配列番号37の軽鎖可変ドメインを含む抗体によって認識されるエピトープに結合する、抗体またはその機能的断片を提供する。したがって、本発明は、抗体MOR14800によって認識されるエピトープに結合する抗体またはその機能的断片を提供する。したがって、本発明は、ヒトTGFβ−2タンパク質の鎖Aのアミノ酸GLY29、TRP30、LYS31、TRP32、TYR90、TYR91、ILE92、GLU99、LEU101およびMET104、ならびにヒトTGFβ−2タンパク質の鎖BのALA1、LEU2、ASP3、ALA5、TYR6、ASN10、ASN14、PRO49、TYR50、LEU51、TRP52、SER53、SER54、ASP55、GLN57、ARG60、VAL61、LEU64、GLN81、LYS110を含むヒトTGFβ−2タンパク質のエピトープに結合する抗体を提供する。
工学操作および改変された抗体
本発明の抗体は、改変された抗体を工学的に操作するための出発材料として、本明細書に示すVおよび/またはV配列の1つまたは複数を有する抗体を使用してさらに調製することができ、この改変された抗体は、出発抗体から変更された特性を有することができる。一方または両方の可変領域(すなわちVおよび/またはV)の中の、例えば、1つまたは複数のCDR領域の中および/または1つまたは複数のフレームワーク領域の中の1つまたは複数の残基を改変することによって、抗体を工学的に操作することができる。さらに、または代わりに、例えば抗体のエフェクター機能を変更するために、定常領域の中の残基を改変することによって、抗体を工学的に操作することができる。実行することができる可変領域工学操作の1つのタイプは、抗体結合性領域/パラトープまたはCDR移植である。パラトープ配列は抗体抗原相互作用の役割を担うので、異なる特性を有する異なる抗体からのフレームワーク配列の上に接がれた特異的な天然に存在する抗体からのCDR/パラトープ配列を含む発現ベクターを構築することによって、特異的な天然に存在する抗体の特性を模倣した組換え抗体を発現させることが可能である(例えば、Riechmann, L. et al., 1998 Nature 332:323-327;Jones, P. et al., 1986 Nature 321:522-525;Queen, C. et al., 1989 Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86:10029-10033;Winterへの米国特許第5,225,539号、および米国特許第5,530,101号;第5,585,089号;Queenらへの第5,693,762号および第6,180,370号を参照)。
したがって、本発明の別の実施形態は、(a)配列番号1〜3、11〜13、21〜23、31〜33、41〜43、51〜53、61〜63、71〜73、81〜83、91〜93、101〜103、111〜113および124〜129、またはb)配列番号4〜6、14〜16、24〜26、34〜36、44〜46、54〜56、64〜66、74〜76、84〜86、94〜96、104〜106、114〜116および124〜129に列挙される配列の群から選択される相補性決定領域配列の混合を含む、単離されたモノクローナル抗TGFβ−2抗体またはその機能的断片に関する。したがって、そのような抗体は、開示される抗体のVおよびV CDR配列を含有するが、これらの抗体と異なるフレームワーク配列を含有することができる。そのようなフレームワーク配列は、生殖系列抗体遺伝子配列を含む公開DNAデータベースまたは公開された参照から得ることができる。例えば、ヒト重鎖および軽鎖可変領域遺伝子の生殖系列DNA配列は、「VBase」ヒト生殖系列配列データベース(インターネットのwww.mrc-cpe.cam.ac.uk/vbaseで利用可能)、ならびにKabat, E. A.ら[上記];Tomlinson, I. M., et al., 1992 J. fol. Biol. 227:776-798;およびCox, J. P. L. et al., 1994 Eur. J Immunol. 24:827-836で見出すことができる。
本発明の抗体で使用するためのフレームワーク配列の例は、本発明の選択される抗体によって使用されるフレームワーク配列に構造的に類似したもの、例えば、本発明のモノクローナル抗体によって使用されるコンセンサス配列および/またはフレームワーク配列である。V CDR1、2および3配列、ならびにV CDR1、2および3配列は、そのフレームワーク配列が由来する生殖系列免疫グロブリン遺伝子に見出されるものと同一の配列を有するフレームワーク領域に移植することができるか、または、生殖系列配列と比較して1つまたは複数の突然変異を含有するフレームワーク領域にCDR配列を移植することができる。例えば、ある特定の場合には、抗体の抗原結合能力を維持または強化するために、フレームワーク領域の中の残基を突然変異させることが有益であることが見出されている(例えば、米国特許第5,530,101号;米国特許第5,585,089号;米国特許第5,693,762号および米国特許第6,180,370号を参照)。別のタイプの可変領域改変は、Vおよび/またはV CDR1、CDR2および/またはCDR3領域の中のアミノ酸残基を突然変異させ、それによって「親和性成熟」として知られる目的の抗体の1つまたは複数の結合特性(例えば、親和性)を改善することである。突然変異を導入するために、部位特異的突然変異誘発またはPCR媒介突然変異誘発を実行することができ、抗体結合性または目的の他の機能特性に及ぼす影響は、本明細書に記載され、実施例に提供されるin vitroまたはin vivoアッセイで評価することができる。保存的改変(本明細書で議論される)を導入することができる。突然変異は、アミノ酸の置換、付加または欠失であってよい。さらに、一般的にCDR領域の中の1つ、2つ、3つ、4つまたは5つ以下の残基が変更される。
代わりのフレームワークまたは足場への抗原結合性ドメインの移植
結果として生じるポリペプチドがTGFβ−2に特異的に結合する少なくとも1つの結合性領域を含む限り、多種多様の抗体/免疫グロブリンフレームワークまたは足場を用いることができる。そのようなフレームワークまたは足場には、ヒト免疫グロブリンの5つの主なイディオタイプまたはその断片(本明細書の他の場所で開示されるものなど)が含まれ、ヒト化態様を好ましくは有する、他の動物種の免疫グロブリンが含まれる。この点に関しては、ラクダ科の動物で同定されたものなどの単一重鎖抗体が特に興味がある。当業者によって、新規のフレームワーク、足場および断片が継続して発見され、開発されている。
ラクダ科の動物の抗体
ラマ種(ラマ・パッコス(Lama paccos)、ラマ・グラマ(Lama glama)およびラマ・ビキューナ(Lama vicugna))などの新世界の種を含むラクダおよびヒトコブラクダ科のメンバー(カメルス・バクトリアヌス(Camelus bactrianus)およびカメルス・ドロマデリウス(Camelus dromaderius))から得た抗体タンパク質が、サイズ、構造的複雑性およびヒト対象への抗原性に関して特徴付けられている。天然に見出されるこの科の哺乳動物からのある特定のIgG抗体は軽鎖を欠き、したがって、2つの重鎖および2つの軽鎖を有する、他の動物からの抗体の一般的な4つの鎖の四次構造と構造的に異なる(国際公開第94/04678を参照)。VHHと同定された小さい単一の可変ドメインであるラクダ科の動物の抗体の領域を遺伝子操作によって得、標的に高い親和性を有する小さいタンパク質を生成し、「ラクダ科の動物のナノボディ」として知られる低分子量抗体誘導タンパク質をもたらすことができる(米国特許第5,759,808号;Stijlemans, B. et al., 2004 J Biol Chem 279: 1256-1261;Dumoulin, M. et al., 2003 Nature 424: 783-788;Pleschberger, M. et al. 2003 Bioconjugate Chem 14: 440-448;Cortez-Retamozo, V. et al. 2002 Int J Cancer 89: 456-62;およびLauwereys, M. et al. 1998 EMBO J 17: 3512-3520を参照)。ラクダ科の動物の抗体および抗体断片の工学操作ライブラリーは、例えば、Ablynx、Ghent、Belgiumから市販されている。非ヒト起源の他の抗体と同様に、ラクダ科の動物の抗体のアミノ酸配列を組換えで変更してヒト配列により緊密に類似する配列を得ることができ、すなわち、ナノボディを「ヒト化」することができる。したがって、ヒトに対するラクダ科の動物の抗体の天然の低い抗原性は、さらに低減させることができる。ラクダ科の動物のナノボディは、ヒトIgG分子のそれの概ね1/10の分子量を有し、このタンパク質はわずか数ナノメートルの物理的直径を有する。小さいサイズの1つの結果は、より大きな抗体タンパク質に機能的に不可視である抗原性部位に結合するラクダ科の動物のナノボディの能力であり、すなわち、ラクダ科の動物のナノボディは、さもなければ古典的な免疫学的技術を用いると潜在性である抗原を検出する試薬として、および可能性がある治療剤として有益である。したがって、小さいサイズのさらに別の結果は、ラクダ科の動物のナノボディが、標的タンパク質の溝または狭い裂け目の中の特異的部位に結合する結果として阻害することができ、したがって、古典的な抗体のそれより古典的な低分子量薬物の機能により緊密に類似する能力で役目を果たすことができるということである。低分子量およびコンパクトなサイズは、極めて耐熱性で、極端なpHおよびタンパク分解に安定であり、抗原性に劣るラクダ科の動物のナノボディをさらにもたらす。別の結果は、ラクダ科の動物のナノボディが循環系から組織に容易に移動し、さらに脳血液関門を通過して、神経組織に影響する障害を処置することができるということである。ナノボディは脳血液関門を越える薬物輸送をさらに促進することができる(米国特許出願公開第2004/0161738号を参照)。ヒトへの低い抗原性と組み合わさったこれらの特徴は、大きな治療的潜在能力を示す。さらに、これらの分子は大腸菌(E. coli)などの原核細胞で完全に発現させることができ、バクテリオファージとの融合タンパク質として発現され、機能的である。したがって、本発明の特徴は、例えば国際公開第94/04678号に記載されるように、本発明のヒト抗体の重鎖または軽鎖のCDR配列をナノボディまたは単一ドメイン抗体フレームワーク配列に移植することによって得られる、ラクダ科の動物の抗体である。
非抗体足場
公知の非免疫グロブリンフレームワークまたは足場には、アドネクチン(フィブロネクチン)(Compound Therapeutics,Inc.、Waltham、MA)、アンキリン(Molecular Partners AG、Zurich、Switzerland)、ドメイン抗体(Domantis,Ltd(Cambridge、MA)およびAblynx nv(Zwijnaarde、Belgium))、リポカリン(アンチカリン)(Pieris Proteolab AG、Freising、Germany)、小モジュール式の免疫医薬(Trubion Pharmaceuticals Inc.、Seattle、WA)、マキシボディ(Avidia,Inc.(Mountain View、CA))、プロテインA(Affibody AG、Sweden)およびアフィリン(ガンマ−クリスタリンまたはユビキチン)(Scil Proteins GmbH、Halle、Germany)、タンパク質エピトープ模倣体(Polyphor Ltd、Allschwil、Switzerland)が限定されずに含まれる。
(i)フィブロネクチン足場
フィブロネクチン足場は、好ましくはフィブロネクチンタイプIIIドメイン(例えば、フィブロネクチンタイプIIIの第10モジュール(10Fn3ドメイン))に基づく。フィブロネクチンタイプIIIドメインは、それ自身互いに対してパックされてタンパク質のコアを形成し、β鎖を互いと接続して、溶媒に曝露されるループ(CDRに類似している)をさらに含有している、2つのβシートの間に分配される7つまたは8つのβ鎖を有する。ベータシートサンドイッチの各エッジに少なくとも3つのそのようなループがあり、そこでは、エッジはベータ鎖の方向に直角であるタンパク質の境界である(米国特許第6,818,418号)。これらのフィブロネクチンをベースとした足場は免疫グロブリンでないが、全体の折重なりは、ラクダおよびラマのIgGでの全体の抗原認識単位を含む最も小さな機能的抗体断片、重鎖の可変領域のそれに緊密に関係する。この構造のため、非免疫グロブリン抗体は、性質および親和性が抗体のそれらに類似する抗原結合特性を模倣する。これらの足場は、in vivoでの抗体の親和性成熟の過程に類似する、in vitroでのループランダム化およびシャフリング戦略で使用することができる。これらのフィブロネクチンをベースとした分子は足場として使用することができ、そこでは、標準のクローニング技術を使用して分子のループ領域を本発明のCDRで置き換えることができる。
フレームワークまたはFcの工学操作
本発明の工学操作抗体には、例えば抗体の特性を改善するために、Vおよび/またはVの中のフレームワーク残基に改変が加えられたものが含まれる。一般的に、そのようなフレームワーク改変は、抗体の免疫原性を減少させるために加えられる。例えば、1つのアプローチは、1つまたは複数のフレームワーク残基を対応する生殖細胞系配列に「復帰突然変異」させることである。より具体的には、体細胞突然変異を経た抗体は、その抗体が由来する生殖細胞系配列と異なるフレームワーク残基を含有することができる。抗体のフレームワーク配列を抗体が由来する生殖細胞系配列と比較することによって、そのような残基を同定することができる。それらの生殖細胞系構成にフレームワーク領域配列を戻すために、体細胞突然変異を、例えば部位特異的突然変異誘発またはPCR媒介突然変異誘発によって生殖細胞系配列に「復帰突然変異」させることができる。そのような「復帰突然変異」した抗体も、本発明に包含されるものである。フレームワーク改変の別のタイプは、T細胞エピトープを除去し、それによって抗体の潜在的な免疫原性を低減するために、フレームワーク領域の中で、または1つもしくは複数のCDR領域の中でさえも1つまたは複数の残基を突然変異させることを含む。このアプローチは「脱免疫化」とも呼ばれ、米国特許出願公開第2003/0153043号にさらに詳細に記載されている。フレームワークまたはCDR領域に加えられる改変に加えて、またはその代替で、抗体の1つまたは複数の機能的特性、例えば血清中半減期、補体結合、Fc受容体結合および/または抗原依存性細胞傷害活性を一般的に変化させるために、本発明の抗体は、Fc領域中の改変を含むように工学操作することができる。さらに、同じく抗体の1つまたは複数の機能的特性を変化させるために、本発明の抗体は、化学的に改変する(例えば、1つまたは複数の化学部分を抗体に付着することができる)か、またはそのグリコシル化を変化させるように改変することができる。一実施形態では、CH1のヒンジ領域は、ヒンジ領域のシステイン残基の数が変化するように、例えば増加または減少するように改変される。このアプローチは、米国特許第5,677,425号においてさらに記載される。CH1のヒンジ領域のシステイン残基の数は、例えば軽鎖および重鎖のアセンブリーを促進するか、または抗体の安定性を増減するために変更される。別の実施形態では、抗体は、その生物学的半減期を増加させるために改変される。様々なアプローチが可能である。例えば、米国特許第6,277,375号に記載されているように、以下の突然変異の1つまたは複数を導入することができる:T252L、T254S、T256F。あるいは、生物学的半減期を増加させるために、米国特許第5,869,046号および米国特許第6,121,022号に記載の通り、IgGのFc領域のCH2ドメインの2つのループからとられるサルベージ受容体結合性エピトープを含有するように、抗体をCH1またはCL領域の中で変化させることができる。さらに他の実施形態では、抗体のエフェクター機能を変化させるために、少なくとも1つのアミノ酸残基を異なるアミノ酸残基で置き換えることによって、Fc領域を変化させる。例えば、抗体がエフェクターリガンドに対して変化した親和性を有するが、親抗体の抗原結合能力を保持するように、1つまたは複数のアミノ酸を異なるアミノ酸残基で置き換えることができる。それに対する親和性が変化させられるエフェクターリガンドは、例えば、Fc受容体または補体のC1成分であってもよい。このアプローチは、両方ともWinterらによる、米国特許第5,624,821号および米国特許第5,648,260号にさらに詳細に記載される。特に、残基234および235を突然変異させることができる。特に、これらの突然変異は、アラニンへのものであってよい。したがって、一実施形態では、本発明の抗体は、Fc領域中のアミノ酸234および235の一方または両方の突然変異を有する。別の実施形態では、アミノ酸234および235の一方または両方をアラニンに置換することができる。アラニンへのアミノ酸234および235の両方の置換は、低下したADCC活性をもたらす。さらに別の実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸を改変することによって抗体依存性細胞傷害(ADCC)を媒介する抗体の能力を増加させるために、および/またはFcγ受容体への抗体の親和性を増加させるために、Fc領域を改変する。このアプローチは、国際公開第00/42072号においてさらに記載される。さらに、FcγRl、FcγRII、FcγRIIIおよびFcRnに関するヒトIgG1の上の結合部位がマッピングされ、向上した結合を有する変異体が記載された(Shields, R.L. et al., 2001 J. Biol. Chen. 276:6591-6604を参照)。さらに別の実施形態では、抗体のグリコシル化が改変される。例えば、無グリコシル化抗体を作製することができる(すなわち、抗体はグリコシル化を欠く)。例えば抗原への抗体の親和性を増加させるために、グリコシル化を変化させることができる。そのような炭水化物改変は、例えば、抗体配列内のグリコシル化の1つまたは複数の部位を変化させることによって達成することができる。例えば、1つまたは複数の可変領域フレームワークグリコシル化部位の消去をもたらし、それによってその部位のグリコシル化を消去する、1つまたは複数のアミノ酸置換を加えることができる。そのような無グリコシル化は、抗原への抗体の親和性を増加させることができる。そのようなアプローチは、Coらによる米国特許第5,714,350号および第6,350,861号にさらに詳細に記載される。さらに、または代わりに、変化したタイプのグリコシル化を有する抗体、例えば低減された量のフコシル残基を有する低フコシル化抗体、または増加した二分GlcNac構造を有する抗体を作製することができる。そのような変化したグリコシル化パターンは、抗体のADCC能力を増加させることが実証されている。そのような炭水化物改変は、例えば変化したグリコシル化機構を有する宿主細胞で抗体を発現させることによって達成することができる。変化したグリコシル化機構を有する細胞は当技術分野で記載されており、本発明の組換え抗体を発現させ、それによって変化したグリコシル化を有する抗体を生成するための宿主細胞として使用することができる。例えば、Hangらによる欧州特許第1,176,195号は、そのような細胞系で発現される抗体が低フコシル化を示すように、機能的に破壊された、フコシル転移酵素をコードするFUT8遺伝子を有する細胞系を記載する。したがって、一実施形態では、本発明の抗体は低フコシル化パターンを示す細胞系、例えばフコシル基転移酵素をコードするFUT8遺伝子の欠損発現を有する哺乳動物細胞系での組換え発現によって生成される。国際公開第03/035835号は、フコースをAsn(297)連結炭水化物に付着させる能力が低下し、その宿主細胞で発現される抗体の低フコシル化をももたらす変異体CHO細胞系、Lecl3細胞を記載する(Shields, R.L. et al., 2002 J. Biol. Chem. 277:26733-26740も参照する)。国際公開第99/54342号は、工学操作された細胞系で発現される抗体が、抗体のADCC活性の増加をもたらす二分化GlcNac構造の増加を示すように、糖タンパク質改変グリコシルトランスフェラーゼ(例えば、ベータ(1,4)−Nアセチルグルコサミン転移酵素III(GnTIII))を発現するように工学操作された細胞系を記載する(Umana et al., 1999 Nat. Biotech. 17:176-180も参照する)。あるいは、本発明の抗体は、哺乳動物様グリコシル化パターンのために操作され、グリコシル化パターンとしてフコースを欠く抗体を生成することが可能である、酵母または糸状菌で生成することができる(例えば、欧州特許第1297172号明細書を参照)。
本発明の抗体をコードする核酸分子
用語「核酸」または「ポリヌクレオチド」は、一本鎖または二本鎖の形のデオキシリボ核酸(DNA)またはリボ核酸(RNA)およびそのポリマーを指す。特に限定されない限り、この用語は、参照核酸に類似した結合特性を有し、天然に存在するヌクレオチドに類似の方法で代謝される、天然ヌクレオチドの公知の類似体を含有する核酸を包含する。具体的には、変性コドン置換は、1つまたは複数の選択される(または全ての)コドンの第3位が混合基および/またはデオキシイノシン残基で置換される配列を生成することによって達成することができる(Batzer et al., Nucleic Acid Res. 19:5081 (1991);Ohtsuka et al., J. Biol. Chem. 260:2605-2608 (1985);およびRossolini et al., Mol. Cell. Probes 8:91-98 (1994))。本発明の別の態様は、本発明の抗体をコードする核酸分子に関する。完全長軽鎖ヌクレオチド配列の例は、配列番号20、40、60、80、100または120に示す。完全長重鎖ヌクレオチド配列の例は、配列番号10、30、50、70、90または110に示す。核酸は、完全細胞、細胞溶解物に存在することができるか、または部分的に精製されたか実質的に純粋な形の核酸であってもよい。アルカリ/SDS処理、CsClバンディング、カラムクロマトグラフィー、アガロースゲル電気泳動および当技術分野で周知である他を含む標準の技術によって、他の細胞構成成分または他の汚染物質、例えば他の細胞性核酸またはタンパク質から精製されるとき、核酸は「単離される」または「実質的に純粋にされる」。F. Ausubel, et al., ed. 1987 Current Protocols in Molecular Biology, Greene Publishing and Wiley Interscience, New Yorkを参照。本発明の核酸は、例えばDNAまたはRNAであってもよく、イントロン配列を含有しても含有しなくてもよい。一実施形態では、核酸はcDNA分子である。核酸は、ファージディスプレイベクターまたは組換えプラスミドベクターなどのベクターに存在してもよい。本発明の核酸は、標準の分子生物学技術を用いて得ることができる。ハイブリドーマ(例えば、さらに下で記載されるヒト免疫グロブリン遺伝子を運ぶトランスジェニックマウスから調製されるハイブリドーマ)によって発現される抗体については、ハイブリドーマによって作製される抗体の軽鎖および重鎖をコードするcDNAは、標準のPCR増幅またはcDNAクローニング技術によって得ることができる。免疫グロブリン遺伝子ライブラリーから(例えば、ファージディスプレイ技術を使用して)得られる抗体については、抗体をコードする核酸は、ライブラリーのメンバーである様々なファージクローンから回収することができる。1つまたは複数の欠失、付加または置換を含む変異核酸配列も、本発明の範囲内に含まれる。一実施形態では、本発明は、配列番号8、10、18、20、28、30、38、40、48、50、58、60、68、70、78、80、88、90、98、100、108、110、118または120の1つまたは複数を含む。遺伝子コードの同義性のために、アミノ酸は、1つより多いコドンによってコードすることができる。したがって、翻訳されるアミノ酸配列が同じままで、ヌクレオチド配列を修正することが可能である。
およびVセグメントをコードするDNA断片が得られると、例えば可変領域遺伝子を完全長抗体鎖遺伝子、Fab断片遺伝子またはscFv遺伝子に変換するために、標準の組換えDNA技術によってこれらのDNA断片をさらに操作することができる。これらの操作では、VまたはVをコードするDNA断片を、別のDNA分子、または別のタンパク質、例えば抗体定常領域もしくはフレキシブルリンカーをコードする断片に作動可能に連結される。この文脈で使用するように、用語「作動可能に連結される」は、例えば、2つのDNA断片によってコードされるアミノ酸配列がインフレームのままであるように、またはタンパク質が所望のプロモーターの制御下で発現されるように、2つのDNA断片が機能的に連結されることを意味するものである。V領域をコードする単離されたDNAは、重鎖定常領域(CH1、CH2およびCH3)をコードする別のDNA分子にVをコードするDNAを作動可能に連結することによって、完全長重鎖遺伝子に変換することができる。ヒト重鎖定常領域遺伝子の配列は当技術分野で公知であり(例えば、Kabat, E. A., et al.[上記]を参照)、これらの領域を包含するDNA断片は標準のPCR増幅によって得ることができる。重鎖定常領域は、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgE、IgMまたはIgD定常領域であってよい。一部の実施形態では、重鎖定常領域は、IgG1アイソタイプの中から選択される。Fab断片重鎖遺伝子については、VをコードするDNAを、重鎖CH1定常領域だけをコードする別のDNA分子に作動可能に連結することができる。V領域をコードする単離されたDNAは、軽鎖定常領域CLをコードする別のDNA分子にVをコードするDNAを作動可能に連結することによって、完全長軽鎖遺伝子(ならびにFab軽鎖遺伝子)に変換することができる。ヒト軽鎖定常領域遺伝子の配列は当技術分野で公知であり(例えば、Kabat, E. A., et al.[上記]を参照)、これらの領域を包含するDNA断片は標準のPCR増幅によって得ることができる。軽鎖定常領域は、カッパまたはラムダ定常領域であってよい。scFv遺伝子を作製するために、VおよびV領域がフレキシブルリンカーによって連結された、連続した単鎖タンパク質としてVおよびV配列を発現させることができるように、VおよびVをコードするDNA断片は、フレキシブルリンカーをコードする、例えばアミノ酸配列(Gly4−Ser)をコードする別の断片に作動可能に連結される(例えば、Bird et al., 1988 Science 242:423-426;Huston et al., 1988 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883;McCafferty et al., 1990 Nature 348:552-554を参照)。
本発明のモノクローナル抗体の生成
モノクローナル抗体(mAb)は、従来のモノクローナル抗体方法論、例えばKohler and Milstein (1975 Nature 256: 495)の標準体細胞ハイブリダイゼーション技術を含む、様々な技術によって生成することができる。モノクローナル抗体を生成するための多くの技術、例えばBリンパ球のウイルス性または腫瘍形成性の形質転換を用いることができる。ハイブリドーマを調製するための動物系は、マウス系である。マウスにおけるハイブリドーマ生成は、確立された手順である。融合のための免疫化脾細胞の単離のための免疫化プロトコールおよび技術は、当技術分野で公知である。融合パートナー(例えば、マウス骨髄腫細胞)および融合手順も公知である。
ヒトモノクローナル抗体を生成するハイブリドーマの生成
本発明のヒトモノクローナル抗体を生成するハイブリドーマを生成するために、免疫化されたマウスから脾細胞および/またはリンパ節細胞を単離して、マウス骨髄腫細胞系などの適当な不死化細胞系に融合することができる。結果として生じるハイブリドーマは、抗原特異的抗体の生成についてスクリーニングすることができる。例えば、免疫化されたマウスからの脾臓リンパ球の単一細胞懸濁液を、50%PEGでP3X63−Ag8.653非分泌性マウス骨髄腫細胞(ATCC、CRL 1580)の数の1/6に融合することができる。平底マイクロタイタープレートに細胞を概ね2×145で平板培養し、続いて、20%胎児クローン血清、18%「653」馴化培地、5%オリゲン(IGEN)、4mMのL−グルタミン、1mMのピルビン酸ナトリウム、5mMのHEPES、0:055mMの2−メルカプトエタノール、50単位/mlのペニシリン、50mg/mlのストレプトマイシン、50mg/mlのゲンタマイシン、および1×HAT(Sigma;HATは、融合の24時間後に加えられる)を含有する選択培地に2週間インキュベートする。概ね2週後、HATがHTで置き換えられた培地で細胞を培養することができる。次に、ヒトモノクローナルIgMおよびIgG抗体について個々のウェルをELISAでスクリーニングすることができる。広範なハイブリドーマ増殖が起こると、通常10〜14日後に培地を観察することができる。抗体分泌ハイブリドーマを再び平板培養し、再びスクリーニングし、ヒトIgGに関してなお陽性であるならば、限界希釈によってモノクローナル抗体を少なくとも2回サブクローニングすることができる。次に特徴付けのために組織培養培地で少量の抗体を生成するために、安定したサブクローンをin vitroで培養することができる。ヒトモノクローナル抗体を精製するために、モノクローナル抗体精製のための2リットルのスピナーフラスコにおいて選択されたハイブリドーマを増殖させることができる。上清を濾過、濃縮してから、プロテインA−セファロース(Pharmacia)で親和性クロマトグラフィーを行うことができる。純度を確認するために、溶出したIgGをゲル電気泳動および高速液体クロマトグラフィーによって検査することができる。緩衝溶液をPBSに交換して、1.43の吸光係数を使用してOD280によって濃度を測定することができる。モノクローナル抗体を小分けして、−80℃で保存することができる。
モノクローナル抗体を生成するトランスフェクトーマの生成
本発明の抗体は、例えば当技術分野で周知である(例えば、Morrison, S. (1985) Science 229:1202)組換えDNA技術および遺伝子トランスフェクション方法の組合せを使用して、宿主細胞トランスフェクトーマで生成することもできる。例えば、抗体またはその抗体断片を発現させるには、標準の分子生物学技術(例えば、目的の抗体を発現するハイブリドーマを使用するPCR増幅またはcDNAクローニング)によって、部分的または完全長の軽鎖および重鎖をコードするDNAを得ることができ、遺伝子が転写および翻訳制御配列に作動可能に連結されるように、このDNAを発現ベクターに挿入することができる。この関係で、用語「作動可能に連結する」は、ベクターの中の転写および翻訳制御配列が抗体遺伝子の転写および翻訳を調節するそれらの意図された機能を果たすように、抗体遺伝子がベクターの中にライゲーションされることを意味するものである。発現ベクターおよび発現制御配列は、使用する発現宿主細胞に適合するように選択される。抗体軽鎖遺伝子および抗体重鎖遺伝子を別々のベクターに挿入することができるか、より一般的には、両方の遺伝子は同じ発現ベクターに挿入される。抗体遺伝子は、標準の方法によって発現ベクターに挿入される(例えば、抗体遺伝子断片の上の相補的制限部位およびベクターのライゲーション、または制限部位が存在しない場合は平滑末端ライゲーション)。本明細書に記載される抗体の軽鎖および重鎖可変領域は、Vセグメントがベクター中のCHセグメントに作動可能に連結され、Vセグメントがベクター中のCLセグメントに作動可能に連結されるように、所望のアイソタイプの重鎖定常領域および軽鎖定常領域を既にコードしている発現ベクターにそれらを挿入することによって、任意の抗体アイソタイプの完全長抗体遺伝子を作製するために使用することができる。さらに、または代わりに、組換え発現ベクターは、宿主細胞からの抗体鎖の分泌を促進するシグナルペプチドをコードすることができる。シグナルペプチドが抗体鎖遺伝子のアミノ末端にインフレームで連結されるように、抗体鎖遺伝子をベクターにクローニングすることができる。シグナルペプチドは、免疫グロブリンシグナルペプチドであってもよく、または異種シグナルペプチド(すなわち、免疫グロブリン以外のタンパク質からのシグナルペプチド)であってもよい。抗体鎖遺伝子に加えて、本発明の組換え発現ベクターは、宿主細胞で抗体鎖遺伝子の発現を制御する調節配列を運ぶ。用語「調節配列」は、抗体鎖遺伝子の転写または翻訳を制御するプロモーター、エンハンサーおよび他の発現制御エレメント(例えば、ポリアデニル化シグナル)を含むものである。そのような調節配列は、例えば、Goeddel(Gene Expression Technology. Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA 1990)に記載されている。調節配列の選択を含む発現ベクターの設計は、形質転換する宿主細胞の選択、所望のタンパク質の発現レベル等の因子によって決めることができることは、当業者に理解される。哺乳動物宿主細胞での発現のための調節配列には、哺乳動物細胞での高レベルのタンパク質発現を誘導するウイルスエレメント、例えばサイトメガロウイルス(CMV)、シミアンウイルス40(SV40)、アデノウイルス(例えば、アデノウイルス主後期プロモーター(AdMLP))およびポリオーマに由来するプロモーターおよび/またはエンハンサーが含まれる。あるいは、ユビキチンプロモーターまたはP−グロビンプロモーターなどの、非ウイルス調節配列を使用することができる。さらに、調節エレメントは、SV40初期プロモーターからの配列および1型ヒトT細胞白血病ウイルスの長い末端反復配列を含有するSRaプロモーター系などの、異なる供給源からの配列で構成された(Takebe, Y. et al., 1988 Mol. Cell. Biol. 8:466-472)。抗体鎖遺伝子および調節配列に加えて、本発明の組換え発現ベクターは、宿主細胞でのベクターの複製を調節する配列(例えば、複製開始点)および選択マーカー遺伝子などの、追加の配列を運ぶことができる。選択マーカー遺伝子は、ベクターが導入された宿主細胞の選択を容易にする(例えば、米国特許第4,399,216号、第4,634,665号および第5,179,017号を参照)。例えば、一般的に、選択マーカー遺伝子は、ベクターが導入された宿主細胞に、G418、ハイグロマイシンまたはメトトレキセートなどの薬物への耐性を付与する。選択マーカー遺伝子には、ジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)遺伝子(dhfr−宿主細胞でメトトレキセート選択/増幅で使用するため)およびネオ遺伝子(G418選択のため)が含まれる。したがって、別の実施形態では、本発明は、少なくとも1つのCDR領域をコードする、配列番号8、10、18、20、28、30、38、40、48、50、58、60、68、70、78、80、88、90、98、100、108、110、118もしくは120、またはその断片の1つまたは複数を含む、上記のクローニングまたは発現ベクターに関する。軽鎖および重鎖の発現のために、重鎖および軽鎖をコードする発現ベクターが、標準の技術によって宿主細胞にトランスフェクトされる。用語「トランスフェクション」の様々な形態は、原核生物または真核生物の宿主細胞への外因性DNAの導入のために一般的に使用される各種の技術、例えば、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム沈殿、DEAE−デキストラントランスフェクションなどを包含するものである。原核生物または真核生物の宿主細胞で本発明の抗体を発現させることは、理論的に可能である。真核生物の細胞、特に哺乳動物の宿主細胞での抗体の発現が議論されるが、その理由は、そのような真核生物の細胞、特に哺乳動物細胞は、適切に折り畳まれて免疫学的に活性な抗体を組み立て、分泌する可能性が原核細胞より高いからである。原核生物による抗体遺伝子の発現は、活性抗体の高収率生成のために有効でないことが報告されている(Boss, M. A. and Wood, C. R., 1985 Immunology Today 6:12-13)。本発明の組換え抗体を発現させるための哺乳動物宿主細胞には、チャイニーズハムスター卵巣(CHO細胞)(DH FR選択マーカー、例えばR.J. Kaufman and P.A. Sharp, 1982 Mol. Biol. 159:601-621に記載されているものと一緒に使用された、Urlaub and Chasin, 1980 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216-4220に記載されているdhfr−CHO細胞を含む)、NSO骨髄腫細胞、COS細胞およびSP2細胞が含まれる。一実施形態では、宿主細胞は、CHO K1PD細胞である。特に、NSO骨髄腫細胞での使用のために、別の発現システムは、国際公開第87/04462号、国際公開第89/01036号および欧州特許第338,841号に示されるGS遺伝子発現システムである。一実施形態では、本発明の組換え抗体を発現させるための哺乳動物宿主細胞には、FUT8遺伝子発現が欠損した哺乳動物細胞系、例えば米国特許第6,946,292号に記載のものが含まれる。したがって、一態様では、本発明は、上記のまたは本明細書に開示されるベクターの1つまたは複数を含む宿主細胞を提供する。
抗体遺伝子をコードする組換え発現ベクターが哺乳動物宿主細胞に導入されるとき、宿主細胞での抗体の発現を可能にするかまたは宿主細胞を増殖させる培地への抗体の分泌を可能にするのに十分な時間、宿主細胞を培養することによって抗体が生成される。抗体は、標準のタンパク質精製方法を用いて培地から回収することができる。したがって、本発明は、本発明のTGFβ−2抗体またはその機能的断片の生成のための方法であって、上記の宿主細胞を培養すること、および抗体またはその機能的断片を単離することを含む方法を提供する。
医薬組成物
別の態様では、本発明は、本開示のTGFβ−2抗体またはその機能的断片を含有する組成物、例えば医薬組成物を提供する。一実施形態では、組成物は、薬学的に許容される担体と一緒に製剤化される。本発明の医薬組成物は、併用療法で投与すること、すなわち他の薬剤と組み合わせることもできる。例えば、TGFβ−2抗体またはその機能的断片は、少なくとも1つの筋肉質量/力増強剤、例えばIGF−1もしくはIGF−1の変異体、抗ミオスタチン抗体、抗アクチビン抗体、ミオスタチンプロペプチド、ActRIIBに結合するがそれを活性化しないミオスタチンデコイタンパク質、ActRIIBデコイ受容体、β2アゴニスト、グレリンアゴニスト、SARM、GHアゴニスト/模倣体またはフォリスタチンと組み合わせることができる。本発明のTGFβ−2抗体またはその機能的断片による処置は、コルチコステロイド、免疫抑制剤、抗サイトカイン剤、抗がん薬;増殖因子、例えばエリスロポイエチン、G−CSF、GM−CSFまたは他;糖尿病の処置のために使用される薬物(インスリンおよび経口血糖降下剤を含む)、抗結核薬および抗生物質と組み合わせることができる。組合せは、小分子および生体分子の薬剤を含むことができる。
本発明の医薬組成物は単独の活性薬剤として、または、ActRIIB抗体、ActRIIA抗体またはActRIIAおよびActRIIB汎特異的抗体と併用して投与することができる。例えば、本発明の薬物は、国際公開第2010125003号に開示されるActRIIB抗体と併用することができる。用語「薬学的に許容される」は、連邦もしくは州政府の規制機関に承認されたこと、または、動物、より詳細にはヒトでの使用のために米国薬局方もしくは他の公認の薬局方に掲載されていることを意味する。用語「担体」は、治療薬が一緒に投与される、希釈剤、アジュバント、賦形剤またはビヒクルを指す。そのような医薬担体は、無菌の液体、例えば水および油、例えば、石油、動物、植物または合成起源のもの、例えば落花生油、大豆油、鉱油、ゴマ油などであってもよい。適する医薬用の賦形剤には、デンプン、グルコース、ラクトース、ショ糖、ゼラチン、モルト、米、小麦粉、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、グリセロールモノステアレート、タルク、塩化ナトリウム、乾燥スキムミルク、グリセロール、プロピレングリコール、水、エタノールなどが含まれる。組成物は、所望により、少量の湿潤もしくは乳化剤、またはpH緩衝剤を含有することもできる。これらの組成物は、溶液、懸濁液、乳濁液、錠剤、丸剤、カプセル剤、散剤、徐放性製剤などの形態をとることができる。組成物は、伝統的な結合剤および担体、例えばトリグリセリドで、坐薬として製剤化することができる。経口製剤は、標準の担体、例えば、医薬グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウム等を含むことができる。適する医薬担体の例は、E. W. Martinによる「Remington's Pharmaceutical Sciences」に記載されている。好ましい実施形態では、組成物は、ルーチンの手順に従ってヒトへの静脈内投与に適合させた医薬組成物として製剤化される。必要な場合、組成物は、可溶化剤および局所麻酔薬、例えばリドカインを、注射部位の疼痛を軽減するために含むこともできる。組成物を注入により投与する場合は、無菌の医薬グレードの水または食塩水を含有する注入ボトルにより注入することができる。組成物を注射により投与する場合は、成分を投与前に混合することができるように、無菌の注射用水または食塩水のアンプルが提供されてもよい。薬学的に許容される担体には、生理的に適合する任意の全ての溶媒、分散媒体、コーティング、抗細菌および抗真菌剤、等張性および吸収遅延剤などが含まれる。担体は、静脈内、筋肉内、皮下、非経口、脊髄または表皮の投与(例えば、注射または注入による)に適するものと予想される。投与経路に従い、活性化合物、すなわち抗体、イムノコンジュゲートまたは二重特異的分子は、化合物を酸の作用および化合物を不活性化するかもしれない他の天然の条件から保護する材料でコーティングしてもよい。本発明の医薬組成物は、薬学的に許容される抗酸化剤を含むこともできる。薬学的に許容される抗酸化剤の例には、以下のものが含まれる:水溶性抗酸化剤、例えばアスコルビン酸、塩酸システイン、重硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、亜硫酸ナトリウムなど;油溶性抗酸化剤、例えばパルミチン酸アスコルビル、ブチルヒドロキシアニソール(BHA)、ブチルヒドロキシトルエン(BHT)、レシチン、没食子酸プロピル、アルファトコフェロールなど;および金属キレート化剤、例えばクエン酸、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ソルビトール、酒石酸、リン酸など。
本発明の医薬組成物で用いることができる、適する水性および非水性担体の例には、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど)および適するそれらの混合物、植物油、例えばオリーブ油、ならびに注射可能な有機エステル、例えばオレイン酸エチルが含まれる。例えばレシチンなどのコーティング材の使用によって、分散液の場合は所望の粒径の維持によって、および界面活性剤の使用によって、適切な流動性を維持することができる。
これらの組成物は、保存剤、湿潤剤、乳化剤および分散剤などのアジュバントを含有することもできる。微生物の存在の防止は、上記の滅菌手順と様々な抗細菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、ソルビン酸フェノールなどの含有の両方によって確実なものにすることができる。組成物中に糖、塩化ナトリウムなどの等張剤を含めることも望ましいであろう。さらに、吸収を遅らせる薬剤、例えばモノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンの含有によって、注射用の医薬剤形の長期吸収をもたらすことができる。薬学的に許容される担体には、無菌の水性溶液または分散液、および無菌の注射用溶液または分散液の即座の調製のための無菌の粉末が含まれる。薬理学的に活性な物質に関するそのような媒体および薬剤の使用は、当技術分野で公知である。いずれかの従来の媒体または薬剤が活性化合物と相容れない場合以外は、本発明の医薬組成物でのその使用が企図される。補助活性化合物を、組成物に組み込むこともできる。治療組成物は、製造および保存の条件下で一般的に無菌および安定でなければならない。組成物は、溶液、マイクロエマルジョン、リポソーム、または高い薬物濃度に適する他の注文構造に製剤化することができる。担体は、例えば水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコールおよび液体ポリエチレングリコールなど)、および適するその混合物を含有する溶媒または分散媒体であってもよい。例えばレシチンなどのコーティング材の使用によって、分散液の場合は所望の粒径の維持によって、および界面活性剤の使用によって、適切な流動性を維持することができる。多くの場合には、等張剤、例えば糖、多価アルコール、例えばマンニトール、ソルビトール、または塩化ナトリウムを組成物中に含めることができる。吸収を遅らせる薬剤、例えばモノステアリン酸塩およびゼラチンを組成物中に含ませることによって、注射可能な組成物の長期吸収をもたらすことができる。無菌の注射可能な溶液は、必要に応じて上に列挙された薬剤の1つまたは組合せと一緒に、適当な溶媒に必要な量で活性化合物を組み込み、続いて精密濾過滅菌を行うことによって調製することができる。一般に、分散液は、基礎的分散媒体および上に列挙されるものからの必要とされる他の薬剤を含有する無菌のビヒクルに活性化合物を組み込むことによって調製される。無菌の注射可能な溶液の調製のための無菌粉末の場合は、調製法は、活性薬剤と前もって濾過滅菌したその溶液からの任意の追加の所望の薬剤の粉末を与える、真空乾燥およびフリーズドライ(凍結乾燥)である。したがって、本発明は、本開示のTGFβ−2抗体またはその機能的断片を含み、薬学的に許容される希釈剤または担体をさらに含む、医薬組成物を提供した。
単一の剤形を生成するために担体材料と組み合わせることができる活性薬剤の量は、処置する対象および特定の投与様式によって異なる。単一の剤形を生成するために担体材料と組み合わせることができる活性薬剤の量は、治療効果を生成する組成物の量に一般的になる。一般的に、薬学的に許容される担体と組み合わせた場合、100パーセントのうち、この量は、約0.0001パーセントから約15パーセントの活性薬剤、約0.01パーセントから約10パーセント、または約0.1パーセントから約5パーセントの範囲の活性薬剤である。投薬レジメンは、最適な所望の応答(例えば、治療応答)を提供するように調整される。例えば、単一のボーラスを投与することができるか、いくつかの分割用量を経時的に投与することができるか、または治療状況の緊急性によって指示される場合、用量をそれ相応に低減もしくは増加することができる。投与の容易さおよび投薬量の均一性のために、投薬単位剤形で非経口組成物を製剤化することが特に有利である。本明細書で用いられる投薬単位剤形は、処置対象のための単回投薬量として適している物理的に別個の単位を指し、各単位は、必要な薬用担体と共同して所望の治療効果を生むように計算された活性化合物の所定量を含有する。本発明の投薬単位剤形の明細は、活性化合物の特異な特徴および達成すべき特定の治療効果、およびそのような活性化合物を個体の感受性の処置のために配合する技術に固有の限界によって決定づけられ、それに直接的に依存する。本開示のTGFβ−2抗体もしくはその機能的断片または前記TGFβ−2抗体もしくはその機能的断片を含む組成物の治療的有効量は、宿主の体重あたり約0.001から150mg/kg、または0.01から30mg/kg、より普通には0.1から10mg/kgの範囲内にある。当業者は適する有効用量を特定することを知っており、それは投与の経路(例えば、静脈内または皮下)によって異なる。例示的な処置療法は、1日につき1回、毎週1回、2週おきに1回、3週おきに1回、4週おきに1回または1カ月に1回の投与を必要とする。そのような投与は、静脈内または皮下で実行することができる。本開示のTGFβ−2抗体またはその機能的断片のための投薬レジメンは、静脈内投与による0.01mg/kg体重または0.1mg/kg体重または0.5mg/kg体重または1mg/kg体重または3mg/kg体重または10mg/kg体重を含む。あるいは、組成物は持続放出製剤であってよく、その場合には、より低い頻度の投与が必要とされる。投薬量および頻度は、患者での抗体の半減期次第で異なる。投与の投薬量および頻度は、処置が予防的であるかまたは治療的であるかによって異なってもよい。予防的適用では、長期間にわたって比較的低い頻度の間隔で比較的低い投薬量が投与される。一部の患者は、残りの存命期間中、処置を受け続ける。治療的適用では、疾患の進行が低減もしくは終了するまで、または疾患の症状の部分的もしくは完全な改善を患者が示すまで、比較的短い間隔の比較的高い投薬量が時には必要とされる。その後、患者に予防的療法を投与することができる。本発明の医薬組成物中の活性薬剤の実際の投薬量レベルは、患者に毒性でなく、特定の患者、組成物および投与様式のために所望の治療応答を達成するのに有効である活性薬剤の量を得るように変更することができる。選択される投薬量レベルは、用いられる本発明の特定の組成物、またはそのエステル、塩もしくはアミドの活性、投与経路、投与時間、用いられる特定の化合物の排泄速度、処置の持続時間、用いられる特定の組成物と併用される他の薬物、化合物および/または材料、処置患者の年齢、性別、体重、状態、健康状態および以前の病歴ならびに医療技術で周知の類似の因子を含む、様々な薬物動態学的因子による。例示的な処置療法は、毎週1回、2週おきに1回、3週おきに1回、4週おきに1回、1カ月に1回、3カ月に1回または3〜6カ月に1回の投与を必要とする。あるいは、抗体は、1年に約1回、または1回だけ投与することができる。そのような投与は、静脈内または皮下で実行することができる。本発明の抗TGFβ−2抗体のための投薬レジメンは、静脈内投与による0.1mg/kg体重または1mg/kg体重または3mg/kg体重を含むことができ、抗体は以下の例示される投与スケジュールの1つを使用して与えられる:4週おきに6回の投薬、その後3カ月おき;3週おき;3mg/kg体重を1回、続いて1mg/kg体重を3週おき。本発明の組成物に含まれる本開示のTGFβ−2抗体またはその機能的断片の治療的有効用量の投与は、疾患症状の重症度の低下、疾患無症状期間の頻度および持続時間の増加、または、デュピュイトラン病患者における微細な動作能力を恒久的に阻害する、疾患苦痛による障害もしくは能力障害の予防、すなわち手のひらと指の間の強い線維組織の低減をもたらすことができる。患者は、ポリペプチド有効成分の有効量、すなわち問題の疾患または障害を検出、処置、寛解または予防するのに十分な量を受ける。治療効果は、身体症状の低減を含むこともできる。任意の特定の対象のための治療的タンパク質の最適な有効量および濃度は、患者の年齢、サイズ、健康状態および/または性別、状態の性質および程度、特定の治療的タンパク質の活性、体によるそのクリアランスの速度、さらに治療的タンパク質と組み合わせて投与される任意の可能なさらなる治療薬を含む様々な因子による。所与の状況のために送達される有効量は、ルーチンの実験によって決定することができ、臨床医の判断の範囲内である。投薬は、単回投与スケジュールまたは多回投与スケジュールによるものであってよい。
本発明の組成物は、当技術分野で公知の様々な方法の1つまたは複数を用いて1つまたは複数の投与経路を介して投与することができる。当業者が理解するように、投与の経路および/または様式は、所望の結果によって異なる。本発明の治療的タンパク質のための投与経路には、例えば注射または注入による、静脈内、筋肉内、皮内、腹腔内、皮下、脊髄または他の非経口投与経路が含まれる。本明細書で用いるように「非経口投与」という語句は、通常注射による、腸内および局所投与以外の投与様式を意味し、限定されずに、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、包内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、クモ膜下、脊椎内、硬膜外および胸骨内の注射および注入が含まれる。一実施形態では、組成物を含む抗体は、静脈内投与される。別の実施形態では、抗体は、皮下に投与される。あるいは、本発明の組成物に含まれる本開示のTGFβ−2抗体またはその機能的断片は、非非経口経路、例えば、局所、表皮または粘膜投与経路、例えば、鼻腔内、経口、経膣、直腸、舌下または局所によって投与することができる。
活性化合物は、インプラント、経皮パッチおよびマイクロカプセル送達系を含む制御放出製剤などの、急速な放出から化合物を保護する担体で調製することができる。生分解性、生体適合性のポリマー、例えばエチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステルおよびポリ乳酸を使用することができる。そのような製剤の調製のための多くの方法は、特許を受けているか、または当業者に周知である。例えば、Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, J.R. Robinson, ed., Marcel Dekker, Inc., New York, 1978を参照する。治療組成物は、当技術分野で公知の医療器具で投与することができる。例えば、一実施形態では、本発明の治療組成物は、無針皮下注射器具、例えば米国特許第5,399,163号;5,383,851号;5,312,335号;5,064,413号;4,941,880号;4,790,824号;または4,596,556号に示される器具で投与することができる。本発明において有益な周知のインプラントおよびモジュールの例には、以下のものが含まれる:制御された速度で医薬品を小出しするための植込み型マイクロ注入ポンプを開示する米国特許第4,487,603号;皮膚を介して医薬を投与するための治療器具を示す米国特許第4,486,194号;正確な注入速度で医薬品を送達するための医薬品注入ポンプを示す米国特許第4,447,233号;連続的薬物送達のための可変流量植込み型注入機器を示す米国特許第4,447,224号;マルチチャンバーコンパートメントを有する浸透圧薬物送達系を示す米国特許第4,439,196号;および、浸透圧薬物送達系を示す米国特許第4,475,196号。他の多くのそのようなインプラント、送達系およびモジュールが当業者に公知であり、例には、MicroCHIPSTM(Bedford、MA)によって作製されたものが含まれる。
ある特定の実施形態では、本開示のTGFβ−2抗体またはその機能的断片を含む組成物は、in vivoで適切な分布を確実なものにするために製剤化することができる。例えば、脳血液関門(BBB)は多くの高親水性化合物を排除する。本発明の治療化合物がBBBを通過することを(所望により)確実なものにするために;それらは、例えば、リポソームに製剤化することができる。リポソームの製造方法については、例えば、米国特許第4,522,811号;第5,374,548号;および第5,399,331号を参照する。リポソームは、特異的細胞または器官に選択的に輸送され、したがって、標的化薬物送達を強化する1つまたは複数の部分を含むことができる(例えば、V.V. Ranade, 1989 J. Clin Pharmacol. 29:685を参照)。例示的な標的化部分には、葉酸またはビオチン(例えば、米国特許第5,416,016号を参照);マンノシド(Umezawa et al., 1988 Biochem. Biophys. Res. Commun. 153:1038);抗体(P.G. Bloeman et al., 1995 FEBS Lett. 357:140;M. Owais et al., 1995 Antimicrob. Agents Chernother. 39:180);界面活性剤プロテインA受容体(Briscoe et al., 1995 Am. J. Physiol.1233:134);p120(Schreier et al., 1994 J. Biol. Chem. 269:9090);が含まれるが、K. Keinanen;M.L. Laukkanen, 1994 FEBSLett. 346:123;J.J. Killion; I.J. Fidler, 1994 Imrnunomethods 4:273も参照する。
患者群
提案された処置から恩恵を受けることができる患者には、集中治療または長期入院(1週を超える)を必要とする急性または重大な病気から回復している患者;サルコペニアを有する虚弱な高齢患者;重度の外傷、例えば自動車事故、重度のやけど、戦闘負傷および他の外傷性損傷から回復している若年成人;上記のような、悪液質を引き起こすことが知られている慢性疾患を有する患者;ならびに、上記のような筋肉疾患を有する患者が含まれる。筋肉の損耗は、重度または長期にわたるほとんどの病気に一般的な合併症であるので、筋肉消耗からの復帰が、この損耗の根源に関係なく筋肉損耗を経験する患者の機能の回復および復活を速くすることが予期される。さらに、病的状態、例えば、デュピュイトラン病(手のひらと指の間で強い線維組織を形成し、微細な動作能力を恒久的に阻害する、細胞外マトリックス(ECM)タンパク質の過剰な生成によって特徴付けられる、手の良性線維増殖性疾患)線維形成、瘢痕化、がん、特定の状態、例えば、マルファン関連の状態、表皮水疱症、特に栄養障害型表皮水疱症または接合部表皮水疱症、線維柱帯切除術および皮膚の全身性硬化症を有する患者は、提案された処置の恩恵を受けることができる。
さらに、緑内障、加齢性黄斑変性症、糖尿病性網膜症およびフックスジストロフィーの患者は、提案された処置の恩恵を受けることができる。さらに、過剰増殖性障害、例えば、レダーホース病、ペイロニ病、指関節背結節症、五十肩、手の背の線維腫症、手根管圧迫症候群、結節性筋膜炎、攻撃的な線維腫症、振戦、白蝋病、ムービングフィンガー(手腕振動症候群(HAVS)としても知られる)、足底線維腫症およびギャロッドパッドの患者は、提案された処置の恩恵を受けることができる。線維症は、一般的に炎症または傷害の結果として体の多くの組織で起こることができ、例には以下が含まれる:肺、肝臓、心臓、膝、肩、他の関節。したがって、変性および線維性疾患、例えば、強皮症、肥大性瘢痕化およびケロイド、特発性肺線維症、心臓線維症(線維性心筋炎も)、心房性線維症、心内膜心筋線維症、肝臓線維症(例えば、NASH)、肺線維症、腎臓線維症(例えば、アルポート症候群)、嚢胞性線維症、全身性硬化症、原発性骨髄線維症、関節線維症、アテローム硬化症および縦隔線維症を有する患者は、提案された処置の恩恵を受けることができる。
本発明の使用および方法
本発明の抗体は、治療的有用性を有する。例えば、これらの分子は、対象に投与することができ、疾患の処置、予防で、および疾患症状の開始を遅延させるために使用することができる。本発明は、療法において使用するための、または医薬としての、本発明のポリペプチド、核酸または医薬組成物を提供する。本発明は、病的障害の処置で使用するための、本発明のポリペプチド、核酸または医薬組成物をさらに提供する。本発明は、病的障害の処置のための医薬の製造における、本発明のポリペプチド、核酸または医薬組成物の使用をさらに提供する。本発明は、病的障害を患っている患者を処置する方法であって、前記患者に本発明のポリペプチド、核酸または医薬組成物の治療的有効量を投与することを含む方法をさらに提供する。本明細書で用いるように、用語「対象」は、哺乳動物、例えば霊長類、好ましくはより高等な霊長類、例えばヒト(例えば、本明細書に記載される障害を有するまたはその危険がある患者)であってよい。一実施形態では、対象は、ヒト対象、例えば、異常なTGFβ−2機能によって特徴付けられる障害または状態を有するヒト患者である。本発明は、病的障害を患っている患者を処置する方法であって、本開示のTGFβ−2抗体またはその機能的断片の治療的有効量を投与することを含む方法を提供する。したがって、本発明は、病的障害を患っている患者を処置する方法であって、抗体MOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805またはMOR14787の治療的有効量を投与することを含む方法を提供する。本発明は、療法において使用するための、本開示のTGFβ−2抗体またはその機能的断片も提供する。したがって、本発明は、療法において使用するための、抗体MOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805またはMOR14787を提供する。本明細書で用いるように、「病的障害」には、限定されずに、筋骨格疾患または障害、筋萎縮症、筋ジストロフィー、デュピュイトラン病、サルコペニア、外傷性損傷、悪液質を引き起こすことが知られている慢性疾患(例えば、がん)、病的状態、例えば線維症、マルファン関連の状態、表皮水疱症、特に栄養障害型表皮水疱症または接合部表皮水疱症、線維柱帯切除術、ロイス−ディーツ症候群、皮膚全身性硬化症、過剰増殖性障害、例えば、レダーホース病、ペイロニ病、指関節背結節症、五十肩、手の背の線維腫症、手根管圧迫症候群、結節性筋膜炎、攻撃的な線維腫症、振戦、白蝋病、ムービングフィンガー、足底線維腫症およびギャロッドパッドは提案された治療の恩恵を受けることができる、変性および線維性疾患、例えば、強皮症、肥大性瘢痕化およびケロイド、特発性肺線維症、心臓線維症(線維性心筋炎も)、肝臓線維症(例えば、NASH)、肺線維症、腎臓線維症(例えば、アルポート)、嚢胞性線維症、全身性硬化症、原発性骨髄線維症、アテローム硬化症、緑内障、加齢性黄斑変性症、糖尿病性網膜症およびフックスジストロフィーが含まれる。表皮水疱症は表皮水疱症の任意の形態を指すが、特に栄養障害型表皮水疱症および接合部表皮水疱症を指す。
糖質コルチコイド、例えばコルチゾール、デキサメタゾン、ベタメタゾン、プレドニゾン、メチルプレドニゾロンまたはプレドニゾロンによる処置の結果を含む、筋萎縮症の多くの原因がある。筋萎縮症は、神経外傷による除神経の結果、または変性、代謝性もしくは炎症性神経障害(例えば、ギランバレー症候群、末梢神経障害または環境毒素もしくは薬物への曝露)の結果であってもよい。さらに、筋萎縮症は、ミオパシー、例えばミオトニー;ネマリンミオパシー、多重/ミニコアミオパシーおよび筋細管性(中心核)ミオパシーを含む先天性ミオパシー;ミトコンドリアのミオパシー;家族性周期性四肢麻痺;炎症性ミオパシー;例えばグリコーゲンまたは脂質貯蔵病によって引き起こされる代謝ミオパシー;皮膚筋炎;多発筋炎;封入体筋肉炎;骨化性筋炎;横紋筋融解およびミオグロビン尿症の結果であってよい。ミオパシーは、筋ジストロフィー症候群、例えば、デュシェンヌ、ベッカー、筋緊張性、筋膜肩甲上腕部、エメリー−ドライフス、眼球咽頭、肩甲上腕部、四肢肢帯、フクヤマ、先天性筋ジストロフィーまたは遺伝性末梢筋障害が引き起こすことができる。さらに、筋萎縮症は、成人の運動ニューロン疾患、例えば、筋萎縮性側索硬化症;乳児脊髄筋萎縮、若年性の脊髄筋萎縮、多病巣性伝導体ブロックによる自己免疫性運動神経障害、脳卒中または脊髄損傷による麻痺、外傷による骨格の固定化、長期ベッド療養、随意の不活動性、不随意の不活動性、代謝ストレスまたは栄養不足、がん、AIDS、絶食、甲状腺または副腎または下垂体障害、糖尿病、良性先天性緊張低下、筋中心軸病、肝疾患(線維症、肝硬変などの例)、敗血症、腎不全、うっ血性心不全、加齢、宇宙旅行または無重力環境で費やした時間、の結果であってもよい。本開示の別の実施形態では、本発明の医薬組成物は、上記の病的障害の処置のために使用することができる。したがって、本発明の医薬組成物は、デュピュイトラン病の処置のために使用することができるか、筋ジストロフィーの処置のために使用することができるか、サルコペニアの処置のために使用することができるか、線維性状態の処置のために使用することができるか、マルファン関連の状態の処置のために使用することができるか、表皮水疱症、特に栄養障害型表皮水疱症または接合部表皮水疱症、ロイス−ディーツ症候群の処置のために使用することができるか、線維柱帯切除術の処置のために使用することができるか、皮膚全身性硬化症の処置のために使用することができる。一実施形態では、本発明は、デュピュイトラン病の処置、または筋ジストロフィーの処置、またはサルコペニアの処置、または線維性状態の処置、またはマルファン関連の状態の処置、または表皮水疱症、特に栄養障害型表皮水疱症もしくは接合部表皮水疱症の処置、または線維柱帯切除術の処置、または皮膚全身性硬化症の処置、またはロイス−ディーツ症候群の処置で使用するための、抗体MOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805またはMOR14787を提供する。特定の実施形態では、MOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805およびMOR14787からなる群から選択される抗体を含む本発明の医薬組成物は、デュピュイトラン病の処置またはロイス−ディーツ症候群の処置のために使用することができる。本開示の別の特定の実施形態では、MOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805およびMOR14787からなる群から選択される抗体を含む本発明の医薬組成物は、筋ジストロフィーの処置のために使用することができる。さらなる状態には、悪液質、慢性関節リウマチと関連した悪液質およびがんと関連した悪液質が含まれる。別の実施形態では、本開示は筋肉障害を処置する方法であって、上記のように本発明の抗体またはその機能的断片の治療的有効量を投与することを含む方法に関する。したがって、本開示は筋肉障害を処置する方法であって、MOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805およびMOR14787からなる群から選択される抗体の治療的有効量を投与することを含む方法に関する。筋肉質量を増加させるための開示されるポリペプチドまたはそれらを含む組成物による処置の必要性は、上述の状態の1つから、特に筋萎縮症などの筋骨格疾患または障害の結果として生じることができ、ここで、筋肉障害は、肥満関連のサルコペニア、サルコペニアおよび糖尿病関連の筋萎縮症からなる群から選択される筋萎縮症である。
さらに、本発明は、デュピュイトラン病、マルファン関連の状態またはマルファン病、表皮水疱症、線維柱帯切除術、ロイス−ディーツ症候群、皮膚全身性硬化症または筋骨格疾患または障害の処置のための医薬の製造のための、本発明の抗体またはその機能的断片、特にMOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805およびMOR14787からなる群から選択される抗体の使用に関する。
TGF−βは、例えば、骨形成タンパク質(BMP)、増殖および分化因子、アクチビンおよびインヒビンを含む、構造的に関係したサイトカインの大きなファミリーに属する。
正常状態の下で、TGF−βはホメオスタシスを維持し、例えば、増殖抑制およびアポトーシスの応答の誘導を介して、上皮、内皮、ニューロンおよび造血細胞系統の増殖を制限する。正規のおよび非正規のシグナル伝達経路が、TGF−βに対する細胞性応答に関与する。TGF−β/Smadの正規経路の活性化は、TGF−βの増殖抑制効果を媒介することができる。非正規のTGF−β経路は、さらなる細胞内経路、例えば、分裂促進因子活性化プロテインキナーゼ(MAPK)、ホスファチジルイノシトール3キナーゼ/プロテインキナーゼB、Rho様GTPアーゼを活性化することができ(Tian et al. Cell Signal. 2011; 23(6):951-62;Blobe et al. N Engl J Med. 2000; 342(18):1350-8)、したがって、上皮−間充織転移(EMT)および/または細胞運動性をモジュレートする。
TGF−βシグナル伝達経路の変化は、ヒト疾患、例えば、がん、心血管疾患、線維症、生殖障害および創傷治癒と関連する。理論に束縛されることを望むことなく、がんにおけるTGF−βの役割は、疾患状況(例えば、腫瘍段階および遺伝子の変化)および/または細胞環境に依存すると考えられている。例えば、がんの後期では、TGF−βは、がん関連の過程を、例えば、腫瘍増殖を促進する(例えば、EMTを誘導する)か、抗腫瘍免疫応答をブロックするか、腫瘍関連の線維症を増加させるか、血管新生を強化することによってモジュレートすることができる(Wakefield and Hill Nat Rev Cancer. 2013; 13(5):328-41)。
前臨床証拠は、TGF−βが免疫調節において重要な役割を演ずることを示す(Wojtowicz-Praga Invest New Drugs. 2003; 21(1):21-32;Yang et al. Trends Immunol. 2010; 31(6):220-7)。TGF−βは、いくつかの機構、例えば、Th2免疫表現型の方へのヘルパーT平衡のシフト;抗腫瘍Th1タイプ応答およびM1タイプマクロファージの阻害;細胞傷害性CD8+Tリンパ球(CTL)、NKリンパ球および樹状細胞機能の抑制、CD4+CD25+T調節細胞の生成;または、免疫抑制サイトカイン(例えば、IL10またはVEGF)、炎症誘発性サイトカイン(例えば、IL6、TNFαまたはIL1)の分泌によって媒介される腫瘍誘発活性を有するM2タイプマクロファージの促進、および遺伝毒性活性を有する反応性酸素種(ROS)の生成を介して、宿主免疫応答を下方制御することができる(Yang et al. Trends Immunol. 2010; 31(6):220-7;Truty and Urrutia Pancreatology. 2007; 7(5-6):423-35;Achyut et al Gastroenterology. 2011; 141(4):1167-78)。
理論に束縛されることを望むことなく、PD−1免疫療法への抵抗性は、例えば、TGF−βシグナル伝達およびTGF−β依存性の過程、例えば創傷治癒または血管新生に連結された遺伝子を含む、転写サインの存在に関連していると考えられている(Hugo et al. Cell. 2016; 165(1):35-44)。TGF−β遮断は、PD−1/PD−L1軸を阻害する療法の治療ウィンドウを拡張する。TGF−β阻害剤は、例えば、腫瘍微小環境、例えば脈管形成、線維形成またはエフェクターT細胞の動員に影響する因子をモジュレートすることによって、PD−1免疫療法の臨床有益性に影響することができる(Yang et al. Trends Immunol. 2010; 31(6):220-7; Wakefield and Hill Nat Rev Cancer. 2013; 13(5):328-41; Truty and Urrutia Pancreatology. 2007; 7(5-6):423-35)。
理論に束縛されることを望むことなく、抗腫瘍免疫サイクルのいくつかのエレメントがPD−1およびTGF−β受容体の両方を発現し、PD−1およびTGF−β受容体はおそらく非冗長細胞性シグナルを増殖させるとも考えられている。例えば、自所性前立腺がんのマウスモデルでは、TGFBRIIの優性ネガティブ形の使用、またはT細胞でのTGF−β生成の抑止は、腫瘍増殖を遅延させる(Donkor et al. Immunity. 2011; 35(1):123-34;Diener et al. Lab Invest. 2009; 89(2):142-51)。マウス前立腺トランスジェニック腺癌(TRAMP)マウスにおける研究は、養子移転T細胞でのTGF−βシグナル伝達のブロッキングは、それらの持続性および抗腫瘍活性を増加させることを示した(Chou et al. J Immunol. 2012; 189(8):3936-46)。一部、腫瘍浸潤性リンパ球におけるPD−1の上方制御のために、移転されたT細胞の抗腫瘍活性は経時的に減少する可能性があり、本明細書に記載されるようにPD−1およびTGF−β阻害の組合せを支持する。それらのPD−1の高い発現レベルおよびTGF−β刺激に対するそれらの応答性を考慮すると、PD−1またはTGF−βに対する中和抗体の使用は、調節T細胞(Treg)に影響することもでき(Riella et al. Am J Transplant. 2012; 12(10):2575-87)、例えばTregの分化および機能のモジュレーションを強化することによってがんを処置するための、PD−1およびTGF−β阻害の組合せを支持する。
理論に束縛されることを望むことなく、腫瘍増殖および転移性進行を促進するために免疫監視を逃避するために、がんはTGF−βを使用することができると考えられている。例えば、ある特定の進行したがんでは、高レベルのTGF−βは腫瘍攻撃性および不良な予後と関連し、TGF−β経路は、がん細胞運動性、浸潤、EMTまたは幹細胞表現型のうちの1つまたは複数を促進することができる。がん細胞および白血球集団によって媒介される(例えば、様々な細胞によって発現または分泌される分子、例えばIL−10またはTGF−βを介して)免疫調節は、ある特定の患者において単独療法としてのチェックポイント阻害剤への応答を制限することができる。ある特定の実施形態では、チェックポイント阻害剤(例えば、抗PD−1)単独療法に応答しないか十分に応答しないがん、例えば、膵臓がんまたは結腸直腸がん(例えば、マイクロサテライト安定結腸直腸がん(MSS−CRC))を処置するために、チェックポイント阻害剤(例えば、PD−1の阻害剤)によるTGF−βの組合せ阻害が使用される。他の実施形態では、高レベルのエフェクターT細胞浸潤を示すがん、例えば、肺がん(例えば、非小細胞肺がん)、乳がん(例えば、三重陰性乳がん)、肝がん(例えば、肝細胞癌)、前立腺がんまたは腎臓がん(例えば、明細胞腎細胞癌)を処置するために、チェックポイント阻害剤(例えば、PD−1の阻害剤)によるTGF−βの組合せ阻害が使用される。一実施形態では、本開示は、対象でがんを処置する方法であって、対象にTGF−β−2抗体とPD−1の阻害剤(例えば、抗PD−1抗体)の組合せを投与することを含む方法に関する。一実施形態では、本組合せは、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片およびPD−1阻害剤(例えば、抗PD−1抗体)を含む。一実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、0.1mg/kgから15mg/kgの間(例えば、0.3mg/kgから12mg/kgの間、または1mg/kgから6mgの間、例えば、約0.1mg/kg、0.3mg/kg、1mg/kg、3mg/kg、6mg/kg、12mg/kgまたは15mg/kg)の用量で、例えば静脈内に、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、50mgから500mgの間の用量(例えば、100mgから400mgの間、例えば、約100mg、200mg、300mgまたは400mgの用量)で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回または4週おきに1回投与される。一部の実施形態では、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、100mgから300mgの間の用量(例えば、約100mg、200mgまたは300mgの用量)で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、約0.1mg/kgまたは0.3mg/kgの用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、約100mgの用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、約0.3mg/kgの用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、約100mgまたは300mgの用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、約1mg/kg、3mg/kg、6mg/kg、12mg/kgまたは15mg/kgの用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、約300mgの用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、0.1mgから0.2mgの間の用量(例えば、約0.1mg/kg)で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、50mgから200mgの間(例えば、約100mg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、0.2mgから0.5mgの間(例えば、約0.3mg/kg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、50mgから200mgの間(例えば、約100mg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、0.2mgから0.5mgの間(例えば、約0.3mg/kg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、200mgから400mgの間(例えば、約300mg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、0.5mgから2mgの間(例えば、約1mg/kg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、200mgから400mgの間(例えば、約300mg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、2mgから5mgの間(例えば、約3mg/kg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、200mgから400mgの間(例えば、約300mg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、5mgから10mgの間(例えば、約6mg/kg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、200mgから400mgの間(例えば、約300mg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、10mgから15mgの間(例えば、約12mg/kg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、200mgから400mgの間(例えば、約300mg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、10mgから20mgの間(例えば、約15mg/kg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与され、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、200mgから400mgの間(例えば、約300mg)の用量で、例えば静脈内注入により、例えば3週おきに1回投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、PD−1の阻害剤(例えば、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体)が投与される前に投与される。他の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、PD−1の阻害剤(例えば、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体)が投与される後に投与される。ある特定の実施形態では、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片、およびPD−1の阻害剤(例えば、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体)は、2つの投与の間に少なくとも30分(例えば、少なくとも1、1.5または2時間)の中断を入れて別々に投与される。
一実施形態では、膵臓がん、結腸直腸がん(例えば、マイクロサテライト安定結腸直腸がん(MSS−CRC))、肺がん(例えば、非小細胞肺がん)、乳がん(例えば、三重陰性乳がん)、肝がん(例えば、肝細胞癌)、前立腺がんまたは腎臓がん(例えば、明細胞腎細胞癌)を処置するために、本明細書に開示されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体と併用投与される。
一実施形態では、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体と併用投与されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、抗体MOR14799、MOR14800、MOR14809、MOR14797、MOR14805またはMOR14787である。一実施形態では、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体と併用投与されるTGF−β−2抗体またはその機能的断片は、抗体MOR14797である。
がんは、例えば、本明細書に記載されるがん、例えば、肺がん(扁平上皮)、肺がん(腺癌)、頭頸部がん、子宮頸がん(扁平上皮)、胃がん、甲状腺がん、皮膚がん、メラノーマ、鼻咽頭がん(例えば、分化したまたは未分化の転移性または局所再発性の上咽頭癌)、腎臓がん、神経内分泌腫瘍(NET)、卵巣がん、卵管がん、結腸直腸がんまたは乳がんであってよい。ある特定の実施形態では、がんは、皮膚がん、例えばメルケル細胞癌またはメラノーマである。一実施形態では、がんはメルケル細胞癌である。他の実施形態では、がんはメラノーマである。他の実施形態では、がんは、乳がん、例えば三重陰性乳がん(TNBC)またはHER2陰性乳がんである。他の実施形態では、がんは、腎臓がん、例えば、腎細胞癌(例えば、明細胞腎細胞癌(CCRCC)または非明細胞腎細胞癌(nccRCC))である。他の実施形態では、がんは、甲状腺がん、例えば未分化甲状腺癌(ATC)である。他の実施形態では、がんは、神経内分泌腫瘍(NET)、例えば、非定型的肺カルチノイド腫瘍、または膵臓、胃腸(GI)管もしくは肺におけるNETである。ある特定の実施形態では、がんは、肺がん、例えば非小細胞肺がん(NSCLC)(例えば、扁平上皮NSCLCまたは非扁平上皮NSCLC)である。ある特定の実施形態では、がんは卵巣がんである。ある特定の実施形態では、がんは卵管がんである。ある特定の実施形態では、がんは結腸直腸がん(CRC)(例えば、高マイクロサテライト不安定性結腸直腸がん(高MSI CRC)またはマイクロサテライト安定結腸直腸がん(MSS CRC))である。
別の態様では、対象を処置する、例えば、対象で過剰増殖性状態または障害(例えば、がん)、例えば固形腫瘍、血液がん、軟組織腫瘍または転移性病変を低減または改善する方法が提供される。本方法は、対象に本明細書に開示されるTGF−β−2抗体/PD−1阻害剤組合せの1つまたは複数を投与することを含む。
本開示のある特定の実施形態は、以下の態様に記載される:
50.それを必要とする対象に、
(a)配列番号7の可変重鎖配列および配列番号17の可変軽鎖配列;
(b)配列番号27の可変重鎖配列および配列番号37の可変軽鎖配列;
(c)配列番号47の可変重鎖配列および配列番号57の可変軽鎖配列;
(d)配列番号67の可変重鎖配列および配列番号77の可変軽鎖配列;
(e)配列番号87の可変重鎖配列および配列番号97の可変軽鎖配列;または
(f)配列番号107の可変重鎖配列および配列番号117の可変軽鎖配列を含む、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体、
ならびに、がんを処置するのに有効な量のヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体分子を投与することを含み、抗体分子は、配列番号153のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号154のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号155のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および、配列番号163のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号164のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号165のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む、がんを処置する方法。
51.ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む、態様50の方法。
52.ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、配列番号161のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号171のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、態様50または51の方法。
53.ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、配列番号159のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号149のアミノ酸配列を含むVLを含む、態様50の方法。
54.ヒトプログラム死−1(PD−1)タンパク質に結合することが可能な抗体は、配列番号161のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号151のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、態様50または53の方法。
例示的なPD−1阻害剤
一実施形態では、PD−1阻害剤は、抗PD−1抗体分子である。一実施形態では、PD−1阻害剤は、参照により完全に組み込まれている、2015年7月30日に公開された「Antibody Molecules to PD−1 and Uses Thereof」という表題の米国特許出願公開第2015/0210769号に記載される抗PD−1抗体分子である。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列表に示されるアミノ酸配列を含む、または配列表に示されるヌクレオチド配列によってコードされる、重鎖および軽鎖可変領域からの(例えば、配列表に開示されるBAP049−クローン−EまたはBAP049−クローン−Bの重鎖および軽鎖可変領域配列からの)少なくとも1、2、3、4、5または6つの相補性決定領域(CDR)(または、一括してCDRの全て)を含む。一部の実施形態では、CDRはKabatの定義による(例えば、配列表に示される通りである)。一部の実施形態では、CDRはChothiaの定義による(例えば、配列表に示される通りである)。一部の実施形態では、CDRは、KabatとChothiaの両方の合わせたCDR定義による(例えば、配列表に示される通りである)。一実施形態では、VH CDR1のKabatおよびChothiaのCDRの組合せは、アミノ酸配列GYTFTTYWMH(配列番号203)を含む。一実施形態では、CDRの1つまたは複数(または、一括してCDRの全て)は、配列表に示されるアミノ酸配列と比較して、1、2、3、4、5、6またはそれより多くの変化、例えばアミノ酸置換(例えば、保存的アミノ酸置換)もしくは欠失を有するか、または配列表に示されるヌクレオチド配列によってコードされる。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号153のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号154のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号155のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);ならびに、配列番号163のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号164のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号165のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含み、各々は、配列表に開示されている。
一実施形態では、抗体分子は、配列番号173のヌクレオチド配列によってコードされるVHCDR1、配列番号174のヌクレオチド配列によってコードされるVHCDR2、および配列番号175のヌクレオチド配列によってコードされるVHCDR3を含むVH;ならびに、配列番号179のヌクレオチド配列によってコードされるVLCDR1、配列番号180のヌクレオチド配列によってコードされるVLCDR2、および配列番号181のヌクレオチド配列によってコードされるVLCDR3を含むVLを含み、各々は、配列表に開示されている。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号139のアミノ酸配列または配列番号139に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号169のアミノ酸配列または配列番号169に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号149のアミノ酸配列または配列番号149に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号139のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号169のアミノ酸配列を含むVLを含む。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号139のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号149のアミノ酸配列を含むVLを含む。
一実施形態では、抗体分子は、配列番号140のヌクレオチド配列または配列番号140に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるヌクレオチド配列によってコードされるVHを含む。一実施形態では、抗体分子は、配列番号170もしくは150のヌクレオチド配列または配列番号170もしくは150に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるヌクレオチド配列によってコードされるVLを含む。一実施形態では、抗体分子は、配列番号140のヌクレオチド配列によってコードされるVHおよび配列番号170または150のヌクレオチド配列によってコードされるVLを含む。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号141のアミノ酸配列または配列番号141に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号171のアミノ酸配列または配列番号171に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号151のアミノ酸配列または配列番号151に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号141のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号171のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列番号141のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号151のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
一実施形態では、抗体分子は、配列番号162のヌクレオチド配列または配列番号162に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるヌクレオチド配列によってコードされる重鎖を含む。一実施形態では、抗体分子は、配列番号172もしくは152のヌクレオチド配列または配列番号172もしくは152に少なくとも85%、90%、95%もしくは99%もしくはそれより高く同一であるヌクレオチド配列によってコードされる軽鎖を含む。一実施形態では、抗体分子は、配列番号142のヌクレオチド配列によってコードされる重鎖および配列番号172または152のヌクレオチド配列によってコードされる軽鎖を含む。
一般的に、特記されない限り、抗PD−1抗体分子は、例えば本明細書に含まれる配列表に記載される、1つまたは複数のKabat CDRおよび/またはChothia CDRの任意の組合せを含むことができる。全ての定義の下で、各VHおよびVLは、アミノ末端からカルボキシ末端にかけて以下の順序で配列される3つのCDRおよび4つのフレームワーク(FR)を一般的に含む:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。
他の例示的なPD−1阻害剤
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、ニボルマブ(Bristol−Myers Squibb)、別名MDX−1106、MDX−1106−04、ONO−4538、BMS−936558またはOPDIVO(登録商標)である。ニボルマブ(クローン5C4)および他の抗PD−1抗体は、参照により完全に組み込まれる、米国特許第8,008,449号および国際出願2006/121168に開示される。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列表に開示されるニボルマブのCDR配列の1つもしくは複数(または、一括してCDR配列の全て)、重鎖もしくは軽鎖可変領域配列、または重鎖もしくは軽鎖配列を含む。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、ペムブロリズマブ(Merck&Co)、別名ラムブロリズマブ、MK−3475、MK03475、SCH−900475またはKEYTRUDA(登録商標)である。ペムブロリズマブおよび他の抗PD−1抗体は、参照により完全に組み込まれる、Hamid, O. et al. (2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44、米国特許第8,354,509号および国際出願2009/114335に開示される。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列表に開示されるペムブロリズマブのCDR配列の1つもしくは複数(または、一括してCDR配列の全て)、重鎖もしくは軽鎖可変領域配列、または重鎖もしくは軽鎖配列を含む。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子はピジリズマブ(CureTech)であり、CT−011としても知られる。ピジリズマブおよび他の抗PD−1抗体は、参照により完全に組み込まれる、Rosenblatt, J. et al. (2011) J Immunotherapy 34(5): 409-18、米国特許第7,695,715号、米国特許第7,332,582号および米国特許第8,686,119号に開示される。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、配列表に開示されるピジリズマブのCDR配列の1つもしくは複数(または、一括してCDR配列の全て)、重鎖もしくは軽鎖可変領域配列、または重鎖もしくは軽鎖配列を含む。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子はMEDI0680(Medimmune)であり、AMP−514としても知られる。MEDI0680および他の抗PD−1抗体は、参照により完全に組み込まれる、米国特許第9,205,148号および国際出願2012/145493に開示される。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、MEDI0680のCDR配列の1つもしくは複数(または、一括してCDR配列の全て)、重鎖もしくは軽鎖可変領域配列、または重鎖もしくは軽鎖配列を含む。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、REGN2810(Regeneron)である。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、REGN2810のCDR配列の1つもしくは複数(または、一括してCDR配列の全て)、重鎖もしくは軽鎖可変領域配列、または重鎖もしくは軽鎖配列を含む。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、PF−06801591(Pfizer)である。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、PF−06801591のCDR配列の1つもしくは複数(または、一括してCDR配列の全て)、重鎖もしくは軽鎖可変領域配列、または重鎖もしくは軽鎖配列を含む。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、BGB−A317またはBGB−108(Beigene)である。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、BGB−A317またはBGB−108のCDR配列の1つもしくは複数(または、一括してCDR配列の全て)、重鎖もしくは軽鎖可変領域配列、または重鎖もしくは軽鎖配列を含む。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子はINCSHR1210(Incyte)であり、別名、INCSHR01210またはSHR−1210である。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、INCSHR1210のCDR配列の1つもしくは複数(または、一括してCDR配列の全て)、重鎖もしくは軽鎖可変領域配列、または重鎖もしくは軽鎖配列を含む。
一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、TSR−042(Tesaro)であり、ANB011としても知られる。一実施形態では、抗PD−1抗体分子は、TSR−042のCDR配列の1つもしくは複数(または、一括してCDR配列の全て)、重鎖もしくは軽鎖可変領域配列、または重鎖もしくは軽鎖配列を含む。
さらなる公知の抗PD−1抗体には、例えば、参照により完全に組み込まれる、国際出願2015/112800、国際出願2016/092419、国際出願2015/085847、国際出願2014/179664、国際出願2014/194302、国際出願2014/209804、国際出願2015/200119、米国特許第8,735,553号、米国特許第7,488,802号、米国特許第8,927,697号、米国特許第8,993,731号および米国特許第9,102,727号に記載されるものが含まれる。一実施形態では、抗PD−1抗体は、本明細書に記載される抗PD−1抗体の1つと同じ、PD−1上のエピトープとの結合で競合し、および/またはそれに結合する抗体である。一実施形態では、PD−1阻害剤は、例えば、参照により完全に組み込まれる米国特許第8,907,053号に記載されるように、PD−1シグナル伝達経路を阻害するペプチドである。一実施形態では、PD−1阻害剤は、イムノアドヘシンである(例えば、定常領域(例えば、免疫グロブリン配列のFc領域)に融合したPD−L1またはPD−L2の細胞外またはPD−1結合性部分を含むイムノアドヘシン)。一実施形態では、PD−1阻害剤は、AMP−224(B7−DCIg(Amplimmune)、例えば、参照により完全に組み込まれる国際出願2010/027827および国際出願2011/066342に開示されるもの)である。
上述により、本発明はさらに他の態様で以下を規定する:
本発明の抗体が別の活性薬剤と併用投与される場合、共投与される組合せ化合物の投薬量は、用いられる共薬物のタイプ、用いられる特定薬物、処置される状態などによって当然ながら異なる。本発明のヒト抗体を含む組成物および使用説明書からなるキットも、本発明の範囲内である。キットは、少なくとも1つのさらなる試薬、または本発明の1つまたは複数のさらなる抗体をさらに含有することができる。キットは、キットの内容物の使用目的を示す表示を一般的に含む。用語表示は、キットの上にまたはそれと一緒に提供される、さもなければキットに付随する任意の書面、または記録資料を含む。キットは、患者が抗TGFβ−2抗体処置に応答する群に属するかどうかについて診断するためのツールをさらに含むことができる。そのようなキットは、凍結乾燥形の本発明の抗体、希釈剤および使用説明書を含むことができる。本発明を完全に記載したが、本発明は以下の実施例および請求項によってさらに説明され、それらは例示的であり、さらに制限するものではない。
本発明を実行するための様式
HuCAL PLATINUM(登録商標)パニング
ファージミドライブラリーは、HuCAL(登録商標)概念(Knappik et al., J Mol Biol 296, 57-86. 2000)に基づき、ファージ表面でFabを提示するためにCysDisplay(商標)技術を用いる(国際公開第01/05950号)。
TGF−β2に対するビーズベースのパニング
ビーズベースのパニングの前に、抗原をカルボキシビーズ(Dynabeads(登録商標)M−270カルボン酸、Invitrogen)に固定化しなければならなかった。ファージプールにつき、1×10個の抗原コートビーズを、等量のPBS/0.1%Tween20/5%ミルク粉末でブロックした。並行して、各パニングのために、HuCAL PLATINUM(登録商標)ファージ−抗体を、等量のPBS/0.05%Tween20/5%ミルク粉末/5%BSAでブロックした。ビーズ結合性ファージの除去のために、各々0.5〜1.0×10個のBSAコートビーズを使用して、ブロックされたファージ粒子の前吸着を2回実行した。次に、ブロックされた抗原コートビーズを前吸着およびブロックされたファージ粒子に加え、ローテータの上でRT(室温)において1〜2時間インキュベートした。抗原コートビーズに結合したファージ粒子を、磁気分離器で採集した。PBS/0.05%Tween20およびPBSを使用したいくつかの洗浄ステップによって、非特異的に結合したファージを洗い落とし、特異的に結合したファージは、DDTを使用して抗原コートビーズから溶出させた。DTT溶出液は次に大腸菌(E. coli)TG1に移し、ファージ感染のために37℃の水浴で45分間インキュベートした。細菌ペレットを2xYT培地に再懸濁させ、LB/Cam寒天プレートの上で平板培養し、o/nでインキュベートした。コロニーをプレートから削り取り、ファージ奪還、選択されたクローンのポリクローナル増幅およびファージ生成のために使用した。精製されたファージで、次の回のパニングを開始した。第2および第3回のビーズベースのパニングは、よりストリンジェントな洗浄条件が適用されたこと以外は、1回目のプロトコールに従って実行した。
TGF−β2に対する溶液パニング
溶液パニングの必要条件は、抗原のビオチン化およびビオチン化抗原の保持された活性の確認であった。溶液パニングの間、Fab提示ファージおよびビオチン化抗原は、ファージによる抗原のアクセス性を促進した溶液にインキュベートした。
ストレプトアビジン結合磁気ビーズによる溶液パニングプロトコール
ファージプールにつき、4mgのストレプトアビジンビーズ(Dynabeads(登録商標)M−280ストレプトアビジン、Invitrogen)を、1×Chemiblocker中でブロックした。並行して、各パニングのために、HuCAL PLATINUM(登録商標)ファージ−抗体を、Chemiblocker/0.1%Tween20でブロックした。その後、ストレプトアビジンまたはビーズ結合性ファージの除去のために、各々ストレプトアビジンビーズを使用して、ブロックされたファージ粒子の前吸着を2回実行した。次に、100nMのビオチン化抗原TGF−β2を前吸着およびブロックされたファージ粒子に加え、ローテータの上で室温において1〜2時間インキュベートした。ファージ−抗原複合体は2mgのブロックされたストレプトアビジンビーズを使用して捕捉し、ストレプトアビジンビーズに結合したファージ粒子は磁気分離器で採取した。PBS/0.05%Tween20およびPBSを使用したいくつかの洗浄ステップによって、非特異的に結合したファージを洗い落とした。特異的に結合したファージは、DDTを使用してストレプトアビジンビーズから溶出させた。DTT溶出液は次に大腸菌(E. coli)TG1に移し、TG1およびDTT溶出液の混合液をファージ感染のためにインキュベートした。細菌ペレットを2xYT培地に再懸濁させ、LB/Cam寒天プレートの上で平板培養し、o/nでインキュベートした。コロニーをプレートから削り取り、ファージ奪還、選択されたクローンのポリクローナル増幅およびファージ生成のために使用した。精製されたファージで、次の回のパニングを開始した。第2および第3回の溶液パニングは、低減された抗原の量およびよりストリンジェントな洗浄条件以外は、1回目のプロトコールに従って実行した。
RapMAT(登録商標)パニング
増加した親和性を有する特異的抗体を得るために、RapMAT(登録商標)パニングを実行した(Prassler et al., Immunotherapy 1, 571-583. 2009)。この目的のために、2回のビーズベースのまたは溶液パニングを上記の抗原TGF−β2で実行した。
a)LCDR3 RapMAT(登録商標)のために:第2回のパニングの後、ファージ由来のpMORPH30(登録商標)ベクターDNAのFabコード断片を酵素的に消化し、TRIM(商標)LCDR3成熟カセットを酵素的ライゲーション(Virnekas et al., 1994)によって挿入し、LCDR3を多様化した。
b)HCDR2 RapMAT(登録商標)のために:第2回のパニングの後、ファージ由来のpMORPH(登録商標)30ベクターDNAのFabコード断片を酵素的に消化し、TRIM(商標)HCDR2成熟カセット(Virnekas et al., Nucleic Acids Res 22, 5600-5607. 1994)を酵素的ライゲーションによって挿入し、HCDR2を多様化した。
ライゲーション混合物は、大腸菌(E. coli)TOP10F’細胞でエレクトロポレーションさせ、>5×10個の独立したコロニーを与えた。生成されたライブラリーを増幅し、第3回および第4回の溶液パニングのために5nMおよび0.5nMの抗原濃度をそれぞれ使用して、増加したストリンジェンシーによるさらなる2回のパニングに付した。
選択されたFab断片のサブクローニングおよびスクリーニングスケールの発現
可溶性Fabの迅速な発現を促進するために、選択されたHuCAL PLATINUM(登録商標)ファージのFabコード挿入断片を、pMORPH(登録商標)30ディスプレイベクターからpMORPH(登録商標)x11発現ベクターpMORPH(登録商標)x11_Fab_FHにサブクローニングした。大腸菌(E. coli)TG1−F’の形質転換の後、HuCAL(登録商標)−Fab断片を含有するペリプラズム抽出物の単一クローン発現および調製を、以前に記載される通りに実行した(Rauchenberger et al., J Biol Chem 278, 38194-38205. 2003)。
マスタープレートの生成
2xYT−CG(34μg/mlクロラムフェニコール(Cam);0.1%グルコース)培地を予充填した無菌の384ウェルマイクロタイタープレートのウェルに、クロラムフェニコール耐性単独クローンを選んで入れ、37℃でo/nで増殖させた。翌朝、グリセロールを含有する無菌の2xYT培地を、マスタープレートの各ウェルに加え、プレートをアルミ箔で密封し、−80℃で保存した。以下の2つの章は、それぞれ384および96ウェルフォーマットにおけるFab発現大腸菌(E. coli)からの溶菌液の調製を記載する。これらの発現プレートは、スクリーニングアプローチのために後に使用される。
ELISAおよびFMATスクリーニングのためのFab含有細菌溶菌液の調製
各o/n培養の5μlを、ウェルにつき40μlの2xYT−CG培地(34μg/mlクロラムフェニコール(Cam);0.1%グルコース)を予充填した無菌の384ウェルマイクロタイタープレートに移した。培養がわずかに濁るまで、プレートを37℃でインキュベートし、CamおよびIPTGを含有する2xYT培地を各ウェルに加えた。一晩のインキュベーションの後、BEL緩衝液(2.5mg/mlリゾチーム、4mM EDTA、10U/μlベンゾナーゼ)を加え、プレートを1時間インキュベートした。
pSMAD3 SureFire(登録商標)アッセイのためのFab含有細菌溶菌液の調製
各o/n培養の5μlを、ウェルにつき100μlの2xYT−CG培地(34μg/mlのCam;0.1%グルコース)を予充填した無菌の96ウェルマイクロタイタープレートに移した。培養がわずかに濁るまで、プレートを22℃でインキュベートし、CAMおよびIPTGを含有する2xYT培地を各ウェルに加えた。翌朝、遠心分離によって細菌を遠沈させ、上清を破棄し、BEL緩衝液(2.5mg/mlリゾチーム、完全(w/o EDTA;Roche)、20U/mlベンゾナーゼ)を各ウェルに加えた。プレートを2ハンド(hand)間インキュベートし、BEL−溶菌液(BEL緩衝液を使用して生成した溶菌液)を遠心分離して細菌細胞デブリを遠沈させた。Fab含有上清は、スクリーニング目的(例えば、pSMAD3 SureFire(登録商標)アッセイ)のために使用した。
Fab含有生細菌溶菌液のスクリーニング
ELISAスクリーニング
ELISAスクリーニングを使用して、標的抗原ヒトTGF−β2タンパク質への結合に関するパニングアウトプットから単一のFabクローンが同定される。上記のFab含有粗大腸菌(E. coli)溶菌液を使用して、Fabを試験する。
直接コート抗原でのELISAスクリーニング
このアプローチは、SETの前に一部のRapMAT(登録商標)パニングのスクリーニングのために使用された。Maxisorp(商標)384ウェルプレートを、PBSにそれぞれ5μg/mlまたは1μg/mlの濃度のマウスTGF−β2でコーティングした。PBS中の5%スキムミルクによるプレートのブロッキングの後、Fab含有大腸菌(E. coli)溶菌液を加えた。Attophos蛍光基質(Roche、#11681982001)を使用して、アルカリ性ホスファターゼ(Jackson Immuno Research、#109−055−097)(1:5000に希釈)にコンジュゲートしたF(ab)特異的ヤギ抗ヒトIgGによって、Fabの結合性を検出した。535nmの蛍光発光を、430nmでの励起で記録した。
ビオチン化抗原のELISAスクリーニング(Fab捕捉ELISA)
ヒトTGF−β2およびマウスTGF−β2に対する抗TGF−β2 Fab抗体の特異性ならびにラットTGF−β3、ヒトTGF−β1への交差反応性をELISAのセッティングで評価した。
これのために、特記されない限り、Maxisorp(商標)384ウェルプレートを、PBSに1:1000で希釈したFd断片特異的ヒツジ抗ヒトIgG(結合部位、#PC075)でコーティングした。PBS中の5%スキムミルクパウダーによるブロッキングの後、Fab含有大腸菌(E. coli)溶菌液を加えた。その後、捕捉されたHuCAL(登録商標)Fab断片をビオチン化抗原に結合させた。ビオチン化抗原の以下の濃度をスクリーニングのために使用した:
・標準のパニングのFab捕捉ELISAベースのスクリーニングのための1μg/mlのビオチン化ヒトTGF−β2/ビオチン化トランスフェリン(無関係なビオチン化タンパク質でのカウンタースクリーニングのため);
・SETの前の一部のRapMAT(登録商標)パニングのFab捕捉ELISAベースのスクリーニングのための0.01μg/mlのビオチン化ヒトTGF−β2;
抗TGF−β2 Fab抗体結合ビオチン化抗原は、アルカリ性ホスファターゼ(ホスファターゼ(Invitrogen(Zymed)、#43−4322))にコンジュゲートしたストレプトアビジンとのインキュベーションと、続くAttoPhos蛍光基質(Roche、#11681982001)の添加によって検出した。535nmの蛍光発光を、430nmでの励起で記録した。
FMATスクリーニング
FMAT(蛍光定量的微量アッセイテクノロジー)スクリーニングを使用して、ビーズに固定化された標的抗原への結合に関するパニングアウトプットから単一のFabクローンを同定する(上記のように、カルボキシビーズの上に抗原またはBSAが固定化された)。Fab含有粗大腸菌(E. coli)溶菌液(上記のように調製された)を使用して、Fabを試験する。
Fab含有溶菌液およびビーズを、PBS/0.1%Tween20/3%BSAでブロックした。ブロックされた溶菌液、ブロックされたビーズおよびCy(商標)5コンジュゲートAffiniPure F(ab’)断片ヤギ抗ヒトIgG(Jackson ImmunoResearch、#109−176−097)を、FMATプレートに移した。プレートは、暗所において室温で約3時間の間インキュベートした。8200細胞検出システム(Applied Biosystems)を製造業者の説明書に従って使用して、FMAT読取りをとった。
SETスクリーニング
親和性のランク付けは、原則として上記の通りに実行した。(Haenel et al., Anal Biochem 339, 182-184 2005)に記載される原理に基づく溶液平衡滴定による成熟結合剤のランク付けのために、一定量の希釈されたBEL抽出物(BEL緩衝液:2.5mg/mlリゾチーム、4mM EDTA、10U/μlベンゾナーゼを使用して生成された溶菌液)を、抗原の異なる濃度で一晩平衡させた。
次に、以前に抗原でコーティングしたMSDプレートに混合物を移し、インキュベーションおよび洗浄の後に、適するMSD−スルホ−タグ標識検出抗体を加えた。その後、Sector Imager6000(Meso Scale Discovery、Gaithersburg、MD、USA)を使用したECL検出を介して、未結合のFabの濃度を数量化した。親和性を推定し、こうして成熟によって最も向上したクローンを同定するために、対応するフィットモデル(下を参照)を適用して、XLfit(IDBS)ソフトウェアを使用して結果を処理した。
HuCAL(登録商標)Fab断片の発現および精製
大腸菌(E. coli)におけるHisタグ付きHuCAL(登録商標)Fab断片の微発現および微精製
0.1%グルコース、34μg/mlクロラムフェニコールおよび0.1mM IPTG(イソプロピル−β−D−チオガラクト−ピラノシド)を加えた25mlの2xYT培地を使用して、大腸菌(E. coli)TG1 F’細胞におけるpMORPH(登録商標)x11_Fab_FHによってコードされるFab断片の発現を、50mlファルコンにおいて実行した。培養は、30℃で18時間振盪させた。細胞を収集し、リゾチームおよびバグバスタータンパク質抽出試薬(Novagen、Germany)の組合せを使用して破壊した。Hisタグ付きFab断片(配列番号204として開示される「His」)を、IMAC(Qiagen、Germany)によって単離した。D−Tube96(商標)透析器(MWCO 6〜8kDa、Novagen、Germany)を使用して、1×ダルベッコのPBS(pH7.2)への緩衝液交換を実行した。紫外分光光度法によって、タンパク質濃度を測定した。代表として選択された試料の純度を、変性、還元性15%SDS−PAGEで分析した。
大腸菌(E. coli)におけるHisタグ付きHuCAL(登録商標)Fab断片の発現および精製
0.1%グルコースおよび34μg/mlクロラムフェニコールを加えた500mlの2xYT培地を使用して、大腸菌(E. coli)TG1 F’細胞におけるpMORPH(登録商標)x11_Fab_FHによってコードされるFab断片の発現を、振盪フラスコ培養において実行した。OD600が0.5の値に到達するまで、培養を30℃で振盪した。0.75mMの最終濃度でIPTG(イソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシド)を加え、さらに30℃で20時間の培養によってFab発現を誘導した。細胞を収集し、リゾチームを使用して破壊した。Hisタグ付きFab断片(配列番号204として開示される「His」)を、IMAC(Bio−Rad、Germany)によって単離し、イミダゾールを使用して溶出した。PD10カラム(GE Healthcare、Germany)を使用して、1×ダルベッコのPBS(pH7.2)への緩衝液交換を実行した。試料を滅菌濾過した(0.2μm)。紫外分光光度法によって、タンパク質濃度を測定した。試料の純度は、変性、還元性15%SDS−PAGEで分析した。較正標準によるサイズ排除クロマトグラフィー(HP−SEC)によって、Fab調製物の均一性を自然状態で測定した。
機能的バイオアッセイ
リポーター遺伝子アッセイ(RGA)
HEK293T/17細胞系の培養
10%FBS(ウシ胎児血清)、2mM L−グルタミン、ペニシリン(50IE/ml)およびストレプトマイシン(50μg/ml)を含有するDMEM(ダルベッコの改変イーグル培地)で、HEK293T/17細胞を維持した。細胞を37℃および5%COのインキュベーター内で増殖させ、3〜4日おきに継代培養した。Accutase(商標)を使用して細胞を切り離し、新鮮培地を含有する新しいフラスコに次に移した。CAGA−12 lucで安定してトランスフェクトさせたHEK293T/17細胞を、親のHEK293T/17細胞のために上に記載の通りに培養したが、細胞増殖培地には、FBS、ペニシリンおよびストレプトマイシンに加えて4mMのL−グルタミンおよび3μg/mlのブラストサイジンを加えた。
TGF−βタンパク質誘導ルシフェラーゼリポーター遺伝子アッセイ
TGF−β2誘導シグナル伝達および他のTGF−β1、TGF−β3、ミオスタチン、アクチビンおよびGDF−11に対する特異性を阻害する抗TGF−β2抗体の能力を測定するために、安定したリポーター細胞系HEK293T/17 CAGA−12 lucを使用したリポーター遺伝子アッセイを実行した。CAGA−12ルシフェラーゼリポーター構築物は、最小限のプロモーターの下流のルシフェラーゼ遺伝子ならびにリン酸化Smad−2およびSmad−3に特異的である複数のCAGAボックスを有する。精製された組換えTGF−β2(さらに、TGF−β3、TGF−β1、ミオスタチン、GDF−11およびアクチビン)の追加は、Smad−2およびSmad−3のリン酸化を、したがってCAGA−12リポーターへの結合性を誘導し、ルシフェラーゼ遺伝子発現につながる。HEK293T/17 CAGA−12 luc細胞の90%の集密度で、accutaseを使用して細胞を切り離し、細胞数2.5×105/mlの濃度までアッセイ培地(2%FBSおよび2mM Lグルタミンを加えたDMEM)で希釈した。その後、ウェルにつき100μlの細胞を白色平底96ウェルプレート(BD Falcon、#353296)に播種し、37℃および5%COで一晩インキュベートした。翌日、所望の濃度のTGF−β2抗体(FabまたはIgG)およびTGF−βタンパク質をPBS中で混合した。混合物中の抗原の最終濃度は、このアッセイにおけるそれらのそれぞれの約EC80濃度に対応し、以下の通りである:TGF−β1/2/3タンパク質−12pM(活性ダイマー)、アクチビンA、GDF−8、GDF−11−1nM(活性ダイマー)およびアクチビンΒ、アクチビンAB−100pM(活性ダイマー)。抗原および抗体は、室温で30分の間インキュベートした。アッセイ培地を細胞から除去し、播種した細胞に混合物を加えた。一晩のインキュベーションの後、アッセイ培地を除去し、70μlのPBSを(CaCl2およびMgCl2と一緒に)各ウェルに加えた。室温に適応させた後、50μlの新たに調製したBriteLite Plus試薬(PerkinElmer、#6016761)を各ウェルに加えた。5分間のインキュベーション時間の後、発光を照度計(GeniosPro、Tecan)で読み取った。それぞれの抗体の完全滴定の後、プリズムソフトウェア(GraphPad Software)を使用して最大半減抑制濃度(IC50値)を計算した。
受容体/リガンド相互作用Elisa
阻害性FabがヒトTGF−βRIII/FcのTGF−β2結合部位をブロックすることにより作用するかどうかについて評価するために、TGF−β受容体−TGF−β相互作用ELISAを実行した。
TGF−β2−TGF−βRIII相互作用アッセイ
これのために、Maxisorp(商標)384ウェルプレートを、2μg/ml(約22nM)のTGF−βRIII(R&D Systems、#LF1309051)により、4℃で一晩コーティングした。1.25μg/ml(約100nM)のビオチン化ヒトTGF−β2を、異なるFab/IgG濃度と30分間インキュベートし、次にChemiblockerでブロックしたコーティングされたウェルに加えた。結合したビオチン化ヒトTGF−β2は、アルカリ性ホスファターゼ(Invitrogen(Zymed)、#43−4322)にコンジュゲートしたストレプトアビジンとのインキュベーションと、続くAttoPhos蛍光基質(Roche、#11681982001)の添加によって検出した。535nmの蛍光発光を、430nmでの励起で記録した。
pSMAD3 SureFire(登録商標)アッセイ
この機能性スクリーニングのために、特製のFab含有細菌溶菌液(BEL緩衝液)を使用して、ホスホSMAD3(Ser423/425)キット(PerkinElmer#TGRSM3S10K)およびAlphaScreen(登録商標)IgG(ProteinA)検出キット(#6760617C)のためのAlphaScreen(登録商標)SureFire(登録商標)によりHEK293T細胞におけるTGF−β誘導Smad3リン酸化を測定した。BEL溶菌液(BEL緩衝液を使用することにより生成した溶菌液)のTGF−β2/3の中和能力を測定するために、各ウェルにつきリポーター細胞系HEK293T(CAGA−12ルシフェラーゼ)からの8,000個の細胞を、アッセイ培地(2%FBSおよび2mM L−グルタミンを追加したDMEM)中のコラーゲンコートproxiplate(商標)に播種し、37℃および5%COで一晩培養した。その翌日、0.3ng/mlのTGF−β2または3をそれぞれ加えた、25μlのBEL溶菌液および75μlの無血清アッセイ培地を含有するマスタープレートを調製した。ペーパータオルの上でプレートを払い落とし、タブをつけること(tabbing)によって、アッセイ培地を細胞から除去した。次に、マスタープレートから15μlをHEK293T細胞に移し、37℃および5%COで1時間刺激した。培地を除去し、4μlの1×溶解緩衝液を各ウェルに加えた。分析まで、プレートを−80℃で保存した。分析のために、5μlの「アクセプタービーズミックス」を2時間加え、その後2μlの「ドナービーズミックス」を追加し、さらに2時間の間インキュベートした。AlphaScreenセッティングを使用して、AlphaScreenプレートリーダーでプレートを読み取った。
骨格筋細胞分化アッセイ(クレアチンキナーゼ(CK)アッセイ)
20%FCS(PAA)を加えた骨格筋基礎培地(skBM;Lonza)からなる増殖培地(GM)を使用して、96ウェルプレートでヒト骨格筋細胞(HsKMC;Lonza)を培養した(7500個の細胞/ウェル)。skBMからなる無血清分化培地(DM)に変更することによって、播種の24〜48時間後に分化が開始された。分化の開始時に0.3ng/mlのTGF−β2およびそれぞれのIgG1を7つの異なる濃度(最高3μg/ml)で加え、細胞を最高120時間管状筋細胞に分化させることによって、HuSKMCs分化に及ぼす効果を評価した。細胞をPBSで3回洗浄し、次にリポーター溶解緩衝液(Promega)で溶解し、測定まで−80℃で保存した。CK活性は、CK(IFCC)試薬(Thermo Electron)を使用して測定した。CK試薬は、製造業者の指示に従って調製した。室温(RT)への調整のために、測定の少なくとも90分前にアッセイプレートを−80℃のフリーザーから取り出した。75μlのCK試薬を各ウェルに加えた後に(プレート設計を参照)、アッセイプレートをELISAリーダーに直ちに移し、1分間の読取り間隔で吸光度を340nmで20分間読み取った。CK活性を計算するために、ウサギの筋肉からのCK(#10127566001;Roche Diagnostics)を使用して、リポーター溶解緩衝液で標準曲線(0.02〜40μg/ml)を新たに作成した。
タンパク含有量は、ビシンコニン酸(BCA)試薬(#BCA−1;シグマ)を使用して測定した。BCA試薬は、製造業者の指示に従って調製した。200μlのBCA試薬を各ウェルに加えた後に、アッセイプレートを37℃で30分間インキュベートし、次に吸光度を562nmで読み取った。タンパク含有量を計算するために、タンパク質標準曲線(リポーター溶解緩衝液に0.25〜1mg/ml)を作成した。CK活性は、以下の通りに計算した(Florini et al. 1989も参照する)。記録した21時点の各々での吸光度の値を平均して、プロットした。これらのプロットの線形部分から、線形回帰(SigmaPlotソフトウェアを使用する)によって最大勾配を測定し、CK標準曲線の助けを借りてCK活性(mUnit)に変換した。値は対応するタンパク含有量で次に正規化し、CK活性はmUnit/mgタンパク質または対照の百分率(CK活性)で表した。可能ならば、EC50値(最大半減効果を引き起こす濃度)およびEmax(最大効果)を与えるS字曲線のあてはめ(XLfitソフトウェアを使用する)によって、濃度−応答データを評価した。
親和性測定
表面プラズモン共鳴(Biacore)を使用した親和性測定
直接抗原固定化のために、標準のEDC−NHSアミンカップリング化学を使用した。CM5チップ(Biacore、Sweden)を、10mM酢酸緩衝液pH4.5中の適当な共鳴単位(RU)のヒト−またはマウス−TGFβ−2/Fc(抗原の活性による)でコーティングした。参照フローセルのために、HSAのそれぞれの量を使用した。5μlの10mMグリシン/HCl緩衝液pH1.5で、再生を実行した。あるいは、抗原を直接的に固定化せずに、抗ヒトFc抗体で改変した(Fc捕捉キット、GE Healthcare/Biacore)CM5チップの上に捕捉した。参照フローセルの上では、捕捉抗体は固定化されたが、抗原は捕捉されなかった。再生は、5μLの3M MgClの2回の注射を使用して達成された。動態測定は、Fab試料の段階希釈列を使用して、ダルベッコのPBSにおいて20μl/分の流量で実行した。Fab濃度は、15.6から500nMの範囲内だった。各濃度の注射時間は、1分であった。解離時間は、少なくとも2分(または、測定された親和性によってそれより長く)に設定した。二重参照のために、ランニングバッファーのブランク注射を使用した。BIA評価ソフトウェア3.2(Biacore、Sweden)を使用して、全てのセンサーグラムを全般的にあてはめた。
溶液平衡滴定(SET)方法(Sector Imager 6000(MSD)を使用した選択された抗ヒトTGF−β2 FabおよびIgGの親和性測定
KD測定のために、抗体タンパク質のモノマー分画を使用した(少なくとも90%のモノマー含有量、Fabのためには分析的SEC;Superdex75(Amersham Pharmacia)によって、またはIgGのためにはTosoh G3000SWXL(Tosoh Bioscience)によってそれぞれ分析した)。溶液での親和性測定は、基本的には文献に記載されている通りに実施した(Friquet et al., J Immnunol Meth 77, 305-319. 1985)。SET方法の感度および精度を向上させるために、それは古典的ELISAからECLに基づくテクノロジーに変えられた(Haenel et al., Anal Biochem 339, 182-184. 2005)。1mg/mlのヤギ抗ヒト(Fab)2断片特異的抗体(Dianova)を、製造業者の指示に従ってMSD−Sulfo−TAG(商標)NHS−エステル(Meso Scale Discovery、Gaithersburg、MD、USA)で標識した。ポリプロピレンマイクロタイタープレートおよびアッセイ緩衝液として0.5%BSAおよび0.02%Tween−20を含有するPBS pH7.4で実験を実行した。予想されるKDより少なくとも10倍高い濃度から出発して、非標識の抗原を2n系列で希釈した。Bmax値を測定するために、抗原なしのウェルを使用し、バックグラウンドを測定するために、アッセイ緩衝剤だけを含むウェルを使用した。適当な量の結合剤(予想されるKDに類似のまたはそれ未満の抗体濃度、60μlの最終量)の添加の後、混合物を室温で一晩インキュベートした。MSDプレートを、抗原(1ウェルにつき30μl)でコーティングした。0.02%Tween−20を含むPBSでプレートを洗浄した後に、平衡させた試料をそれらのプレートに移し(1ウェルにつき30μl)、20分の間インキュベートした。洗浄の後、1ウェルにつき30μlのMSD−Silfo−Tag標識検出抗体(抗ヒト(Fab)2、最終希釈は一般的に1:2,000)をMSDプレートに加え、エッペンドルフ振盪機(700rpm)の上において室温で30分間インキュベートした。MSDプレートを洗浄して、界面活性剤と一緒に30μl/ウェルのMSD Read Buffer Tを加えた後、Sector Imager 6000(Meso Scale Discovery、Gaithersburg、MD、USA)を使用して電気化学発光シグナルを検出した。
カスタマイズしたフィッティングモデルを適用して、XLfit(IDBS)ソフトウェアでデータを評価した。Fab分子のKD測定のために、以下のフィットモデルを使用した((Abraham et al., J Mol Recognit. 9, 456-461.1996)によって改変された、(Haenel et al., Anal Biochem 339, 182-184.2005)による):
[Fab]t:適用された全体のFab濃度
x:適用された全体の可溶性抗原濃度(結合部位)
Bmax:抗原なしのFabの最大シグナル
KD:親和性
Fabの親和性測定
抗TGF−β2 FabのKD測定は、基本的に以下の通りに実行した:全ての希釈溶液のために、ヒトTGF−β2を4mMのHClで100μg/mLまで前希釈した。コーティングのために、抗原をPBSで0.05μg/ml(TGF−β2)までさらに希釈し、標準のMSDプレートの上で4℃においてo/nでコーティングした。その後、PBS中の3%BSAにより、MSDプレートを室温で1時間ブロックした。
TGF−β1/3および反標的への結合
TGF−β1、TGF−β3および反標的(ミオスタチン、GDF−11、アクチビンA、アクチビンBおよびアクチビンAB)への結合のSETをベースとした分析のために、特異抗原、それぞれヒトTGF−β1またはTGF−β3を記載の通りコーティングした。試験するタンパク質を滴定のために使用し、2系列で希釈した。出発濃度は、それぞれ、TGF−β1の場合2μM、TGF−β3の場合0.05μg/ml、または全ての反標的の場合100nMであった。
エピトープビニング
PBSに希釈した2.5μg/mlのTGF−β2特異的Fabにより、Maxisorp(商標)384ウェルプレートを4℃で一晩コーティングした。ビオチン化TGF−β2タンパク質を0.1μg/ml(約8nM)の定常TGF−β2濃度の溶液中のFabと室温で1時間インキュベートし、Fabの滴定はTGF−β2タンパク質と比較して12.5モル過剰のFab(5μg/ml(100nM))から開始された。Fab−TGF−β2複合体を、BSAで30分間ブロックされたFabをコートしたウェルに次に加えた。結合したビオチン化TGF−β2は、アルカリ性ホスファターゼ(Invitrogen(Zymed)、#43−4322)にコンジュゲートしたストレプトアビジンとのインキュベーションと、続くAttoPhos蛍光基質(Roche、#11681982001)の添加によって検出した。535nmの蛍光発光を、430nmでの励起で記録した。
IgGへの変換
完全長IgGを発現させるために、重鎖(VH)および軽鎖(VL)の可変ドメイン断片を、Fab発現ベクターからヒトIgG1f_LALAのためのpMorph(登録商標)4_hIg1f_LALA_カッパまたはpMorph(登録商標)4_hIg1f_LALA_ラムダベクターにサブクローニングした。
HuCAL(登録商標)免疫グロブリンの生成
pMORPH(登録商標)4ベクター系を使用したヒトIgGの一過性の試験的発現および精製。IgGの重鎖および軽鎖の両方をコードするpMORPH(登録商標)4発現ベクターDNAにより、真核生物のHKB11細胞をトランスフェクトした。トランスフェクションから3日または7日目に細胞培養上清を収集し、標準のプロテインA親和性クロマトグラフィー(MabSelect SURE、GE Healthcare)に付した。特記されない限り、1×ダルベッコのPBS(pH7.2、Invitrogen)への緩衝液交換を実行し、試料を濾過滅菌(0.2μmの孔径)した。IgGの純度は、Labchipシステム(Caliper Life Sciences、USAまたはAgilent、USA)を使用した変性、還元性および非還元性条件の下で、またはSDS−PAGEで分析した。タンパク質濃度を紫外分光光度法によって測定し、自然状態のIgG調製物を分析するためにHP−SECを実行した。
パニング、抗体の同定および特徴付け
抗体変異体タンパク質の供与源として市販されているファージディスプレイライブラリー、MorphoSys HuCAL PLATINUM(登録商標)ライブラリーを使用して、高い結合親和性を有するクローンの選択によって、抗原TGF−β2タンパク質の生物学的活性を中和する治療的抗体を生成した。HuCAL PLATINUM(登録商標)ファージミドライブラリーは、HuCAL(登録商標)概念(Knappik et al., J Mol Biol 296, 57-86, 2000)に基づき、ファージ表面でFabを提示するためにCysDisplay(登録商標)テクノロジーを用いる(国際公開第01/05950号)。
5つのパニング戦略、3つはビーズベースのものおよび2つは溶液パニング、を実行した。第2回の標準パニングのアウトプットを使用して、RapMAT(登録商標)パニングを実行した。高度に多様なHuCAL(登録商標)抗体を選択する確率を高くするために、ライブラリープールを主に別個に保った。高親和性抗体を生成する確率を高くするために、標準パニングの2回目のアウトプットを使用してRapMAT(登録商標)を実行した。H−CDR2およびL−CDR3を、別々に多様化した。標準パニングのアウトプットを、ヒトTGF−β2への結合についてスクリーニングした。スクリーニング方法は、パニング戦略に基づいて選択した:ビーズパニングはFMATアプローチを使用してスクリーニングし、溶液パニングはFab捕捉ELISAアプローチを使用してスクリーニングした。TGF−β1に対するカウンタースクリーニングは、FMATを使用して実行した。rh TGF−β2に対するパニングのために、pSmad3 SureFire(登録商標)をベースとしたスクリーニングを実行した。SETアプローチを使用して、主に最もアフィンなヒットについてRapMAT(登録商標)パニングアウトプットをスクリーニングした。標準対RapMAT(登録商標)パニングの一部として、rh TGF−β2に対するパニングのために、pSmad3 SureFire(登録商標)をベースとしたスクリーニングを実行した。これらの方法を使用して、hTGF−β2の阻害を分析した。hTGF−β2およびTGF−β3陰性クローンを選択する、ストリンジェントなELISAスクリーニングを適用した。さらに、高アフィン(TGF−β1へのK<25nM)TGF−β1結合体を排除するために、SETスクリーニングはTGF−β1に対するカウンタースクリーニングを含んだ。標準パニングの一次スクリーニングにおいて同定された一次ヒットのうち、pSmad3 SureFire(登録商標)をベースとしたスクリーニングで同定された27個のモノクローナルTGF−β2阻害抗体が固定された。その後、10/27個の特異な強固になったクローンを試験的スケールで発現させ、精製した。これらの精製されたFabタンパク質も、その後RGAで分析した。RapMAT(登録商標)パニングの一次スクリーニングで同定された一次ヒットは、Fab−FHフォーマットで微量発現させ、微量精製し、その後、RGAでhTGF−β2、mTGF−β2、TGF−β3およびTGF−β1の阻害について分析した。pSmad3 SureFire(登録商標)スクリーニングアプローチにおいて同定されたmTGF−β2阻害性ヒットと合わせて、38個の特異な固定された抗体は、次にFab−FHフォーマットにより試験的スケールで発現させ、RGAで分析もした。ELISAおよび配列決定における異なるTGF−βアイソフォームへの結合の分析を含んだ固定ステップのために、最も有力な二次ヒットを選択した。全てのパニングおよびスクリーニング戦略から、合計で190個の特異なFabを固定することができた。190個の特異な固定された抗体の配列分析は、以下を示した:
− 90個のHCDR3ファミリー;
− 89個のカッパおよび101個のラムダ抗体。
190個の固定されたFabを大腸菌(E. coli)で発現させ、精製した。169/190個の発現させたFabは品質管理に合格し、ヒトTGF−β2、マウスTGF−β2、ヒトTGF−β3およびヒトTGF−β1の阻害についてRGAにおいて特徴付けられた。この特徴付けの結果に基づいて、最も見込みがある116個の抗体を、RapCLONE(登録商標)を介したhIgG1f_LALAフォーマットへの変換のために選択した。
選択−発展性評価(s−DAS)を含むIgG特徴付け
116個のIgGを真核生物のHKB11細胞で発現させ、精製した。90/116個の発現させたIgGは品質管理に合格し、ヒトTGF−β2、マウスTGF−β2、ヒトTGF−β3およびヒトTGF−β1の阻害についてRGAにおいて特徴付けられた。高い割合の抗体が、凝集傾向のために高いか中等度の発展性リスクを有することが見出された。延長されたs−DAS分析の中で、疎水性分析も実行した。結果は、高い割合の、非常に疎水性の抗体を明らかにした。高い疎水性は、抗体の凝集傾向と相関することが見出された。低い発展性リスクを有すると明記された抗体と比較して高いか中等度の発展性リスクを有すると明記された抗体の間で、より高い割合の高/中等度の疎水性を有する抗体が見出された。
候補の特徴付け(生殖系列化およびPTM除去の前)
s−DASに合格した56個の抗体は、RGAにおいて親和性および効力を示した。RGAおよびCKアッセイおよび延長されたs−DASデータ(s−DAS+疎水性評価)における活性に基づく。in vivo特徴付けおよびPTM除去/生殖系列化のために、6つの抗TGF−β2抗体を選択した。これらの6つの選択された抗体(MOR12773、MOR13436、MOR13438、MOR12413、MOR13416、MOR13426)を、下に要約される様々なアッセイで特徴付けた。
親和性測定
抗体抗原相互作用のK値は、上記の原理および条件に従ってSETを使用して測定した。TGF−β2特異的Ab MOR13436、および選択されたTGF−β2抗体に関するK値は、表1に要約する。このプロジェクトのK成功基準は、ヒトTGF−β2については200pM未満に設定した。全ての選択されたTGF−β2特異的抗体候補は、この基準を満たした。TGF−β2特異的は、好ましくは5倍の緩い基準でマウスTGF−β2に結合すると予想される。6つの選択されたTGF−β2特異的抗体のうちの4つは、この基準を満たした。
反標的への交差反応性
TGF−β1および5つの反標的(ミオスタチン、GDF−11、アクチビンA、アクチビンBおよびアクチビンAB)への最終抗体の結合(PTM除去および生殖系列化の前)を、上記の原理および条件に従ってSETを使用して分析した。全ての選択されたTGF−β2特異的Abは、成功基準を満たした。
RGAにおける活性
最終抗体の活性(PTM除去および生殖系列化の前)を、上記の条件を使用したRGAにおいてhTGF−β2、mTGF−β2、TGF−β3およびTGF−β1の阻害について分析した。MOR13436に関するRGA活性データの一つの例を、図3に示す。このプロジェクトのRGA成功基準のIC50は、ヒトTGF−β2については200pM未満に設定した。全ての選択されたTGF−β2特異的抗体候補は、この基準を満たした。
CKアッセイにおける活性
最終抗体の活性(PTM除去および生殖系列化の前)を、上記の条件を使用したCKアッセイで分析した。CKアッセイデータはRGAデータとよく相関したが、CKアッセイで一般的により低い効力であった。このプロジェクトのCKアッセイ成功基準のIC50は、ヒトTGF−β2およびTGF−β3抗体のそれぞれについて1000pM未満に設定した。MOR13436の濃度−応答曲線の例を、図5に提供する。
受容体−リガンド相互作用アッセイ
TGF−β2−TGFβRIII結合を阻害する最終抗体の能力(PTM除去および生殖系列化の前)を、上記の条件を使用した受容体−リガンド相互作用アッセイで分析した。
最終候補の生殖系列化/工学操作
PTM除去および生殖系列化の後に、合計で23個の誘導体をpM4_hIgG1f_LALA_カッパまたはpM4_hIgG1f_LALA_ラムダにおいて生成した。表は、PTM除去および生殖系列化の後の抗体誘導体の概要を提供する。
RGAにおける活性
最終抗体の活性(PTM除去および生殖系列化の後)を、上記の条件を使用したRGAにおいてhTGF−β2、mTGF−β2、TGF−β3およびTGF−β1の阻害について分析した。データは、表4に要約する。
CKアッセイにおける活性
最終抗体の活性(PTM除去および生殖系列化の後)を、上記の条件を使用したCKアッセイで分析した。CKアッセイデータは、表4に要約する。
反標的への交差反応性(RGA)
TGF−β3および5つの反標的(ミオスタチン、GDF−11、アクチビンA、アクチビンBおよびアクチビンAB)への最終抗体の交差反応性(PTM除去および生殖系列化の後)を、上記の条件を使用したRGAで分析し、図4に示す。
要約すると、TGF−β3および5つの反標的の濃度依存性阻害は、試験した抗体のいずれについても検出できなかった。最終抗体は、TGF−β1の阻害についても試験した。抗体のいずれも、100nM IgGまでTGF−β1の濃度依存性阻害を示さなかった。
統計分析
結果は、平均+/−SEMで表す。統計分析は、一元配置分散分析法に従って、ダネットの多重比較検定を使用して実行した。確率値が<0.05であったとき、処置(抗TGF−β2抗体MOR14797、MOR14799、MOR14800、MOR14805、MOR14809およびMOR14787を対照抗体との差について試験した)および差は有意であると考えた::P<0.05、**:P<0.01、NS:IgG対照に対して有意性なし。統計分析は、GraphPad Prismバージョン5.0(GraphPad Software,Inc)によって実行した。0日目の体重を引き算することによって体重を計算し、筋肉重は0日目の体重(初期体重)によって正規化した。
デュピュイトラン病を患っている患者からの組織における抗TGF−β2抗体のex vivo試験
免疫組織化学およびmRNAによって線維症マーカーを測定する、その抗線維症活性を測定するためのデュピュイトランの拘縮疾患の最近記載された三次元ex vivo培養システム(Karkampouna et al. 2014, Molecular Therapy - Nucleic Acids, (2014) 3, e142)で、TGF−β2特異的Ab MOR14797を試験し、汎TGF−βAb 1D11と比較した。結果は、図7および8に示す。ex vivoモデルは、Karkampouna et al. 2014に記載されている通りに実行した。患者組織をスライスし、3μg/mlの抗体の存在下で7日間、ニトロセルラー膜の上で培養した。7日目に、組織スライスをmRNA単離のために収集したか、または免疫組織化学分析のために使用されるならば、低温包埋のために固定し、処理した。
免疫組織化学のために、5μmの切片を切り出し、コラーゲン1およびα−平滑筋アクチンに対する抗体で染色した。核色素DAPIを使用して、核を評価した。標識された検体の共焦点顕微鏡で切片につき3つの画像を取得し、画像化分析によって数量化した。RNA分析のために、全RNAを単離し、定量的PCR(qPCR)を実行した。結果は、ハウスキーピング遺伝子の発現に正規化したmRNA発現で表す。3人の異なる患者からの培養で、3μg/mlのMOR14797は、免疫組織化学によって測定したとき線維症マーカーコラーゲン1およびα−平滑筋アクチン(SMA;図7を参照)を効果的に低減した。MOR14797は、汎TGF−βAB 1D11より効果的だった。2人のさらなる患者からの培養で、線維症マーカーコラーゲン1およびα−平滑筋アクチンの用量依存的(0.03〜3μg/ml)低減が示された。TGF−β2特異的Ab MOR14797のコラーゲン1免疫染色阻害の例を、図8に示す。MOR14797は、mRNAレベルの様々な線維症マーカーの発現も低減した。
片側性尿管閉塞(UUO)マウス腎臓線維症モデルにおけるin vivo試験
mRNAによって線維症マーカーを測定する、その抗線維症活性を測定するための、片側性尿管閉塞(UUO)マウス腎臓線維症モデルにおけるTGF−β2特異的Ab MOR13436。結果を、図9に示す。ex vivoモデルは、Kitamoto et al. 2009(J Pharmacol Sci, 111, 285-292)に記載されている通りに実行した。簡潔には、左尿管の完全なライゲーションによってUUOを実行し、5mg/kgのTGF−β2特異的AB MOR14346で14日間処置した。mRNA単離のために、腎臓を回収した。RNA分析のために、全RNAを単離し、定量的PCR(qPCR)を実行した。結果は、ハウスキーピング遺伝子の発現に正規化したmRNA発現で表す。
ヒトTGFβ−2/MOR14797 Fab複合体のX線結晶構造
MOR14797のFab断片(配列番号69(部分配列)および79、表5)に結合したヒトTGFβ−2(残基303〜414、配列番号122)の結晶構造を測定した。下で詳述されるように、複合体の個々の構成成分は、別個の発現系を使用して生成され、精製された複合体を生成するために組み合わせた。MOR14797 Fabに結合したTGFβ−2に関する回折データを生成するために、X線結晶学を次に用い、抗原結合部位を解明した。
タンパク質生成
IgGのパパイン切断からのFab生成:MOR14797 Fabは、固定化されたパパイン(Thermo Scientific Pierce)による完全長MOR14797 IgGの切断によって生成された。20mMリン酸ナトリウム(pH7.0)、10mM EDTA中の20mg/mlのMOR14797 IgGを、80:1の重量比で固定化されたパパインと混合し、混合物は、37℃で一晩、回転プラットホームの上でインキュベートした。次に、重力流動カラムを使用して、FabおよびFc断片を固定化されたパパインから分離した。次に、あらゆるFc断片を除去するために、収集したフロースルーをHiTrap MabSelect SUREカラム(GE Healthcare Life Sciences)に加えた。Fab含有フロースルーを次に濃縮し、20mM HEPES(pH7.5)、150mM NaClで平衡させたHiLoad 16/600 Superdex200カラム(GE Healthcare Life Sciences)に加えた。ピーク分画はSDS−PAGEによる分析にかけ、組み合わせた分画はTGFβ−2と複合体を形成するために次に使用した。
TGFβ−2−MOR14797 Fab複合体のin vitro再構成:1:10(v/v)の1Mクエン酸三ナトリウム(pH3.5)を加えることによって、1mg/mlの濃度のFabを酸性化した。次に、精製されたTGFβ−2を、1:1.5のモル比(濃度はOD A280によって測定した)でMOR14797 Fabと混合した。複合体を1:5(v/v)の1Mトリス−HCl(pH8.5)で中和し、次に濃縮し、その後20mM HEPES(pH7.5)、150mM NaClで平衡させたHiLoad 16/600 Superdex200カラム(GE Healthcare Life Sciences)に加えた。ピーク分画はSDS−PAGEによる分析にかけ、選択された分画を結晶化試験のために組み合わせた。
結晶化および構造決定
TGFβ−2−MOR14797複合体を20mg/mlに濃縮し、その後、結晶化スクリーニングを実施する前に20,000×gで10分間遠心分離した。シッティングドロップ蒸気拡散セットアップを使用して、結晶を20℃で成長させた。TGFβ−2−MOR14797複合体の0.1μlを、0.1MのHEPES(pH7.5)および70%(v/v)のMPDを含有するレザバー溶液の0.1μlと混合し、液滴を、45μlのレザバー溶液に対して平衡させた。液体窒素の中で結晶を直接的に瞬間冷却し、光線17−IDでの回折データの収集のために、Advanced Photon Source(Argonne National Laboratory、USA)に送った。データセットは、autoPROC(バージョン1.1.6、Global Phasing Ltd.)を使用して、格子サイズa=77.2Å、b=122.1Å、c=130.1Å、α=90°、β=90°およびγ=90°の空間群P2において2.4Åの解像度まで処理した。複合体の構造はPhaser(バージョン2.5.5、McCoy et al., J. Appl. Cryst. 40, 658-674, 2007)を使用して分子交換によって解決し、最終モデルはCOOT(バージョン0.8.7、Emsley et al., Acta Cryst. D66, 486-501, 2010)において構築され、Phenix(バージョン1.11.1、Afonine et al., Acta Cryst. D66, 213-221, 2010)を使用して精密化された。RworkおよびRfree値は、それぞれ17.5%および23.0%である。結合の長さおよび角度のRMSD値は、0.008Åおよび1.054°であった。
エピトープは、MOR14797 Fabの任意の原子から5Å以内の原子を含有するTGFβ−2の残基と規定され、PyMOL(バージョン1.8、Schrodinger、LLC.)を使用して同定され、表6に掲載される。非対称単位(結晶中の最小の特異な単位)中に2コピーのTGFβ−2/MOR14797 Fab複合体があり、両方のコピーに共通する抗体接触残基だけがエピトープ残基として掲載される。
TGFβ−2に結合するMOR14797のエピトープおよびパラトープ
TGFβ−2に結合するMOR14797のエピトープおよびパラトープを同定するために、TGFβ−2−MOR14797 Fab複合体の結晶構造を使用した。表6に詳述されるように、MOR14797 Fabと相互作用するTGFβ−2の表面は、いくつかの非連続配列によって形成される。これらの残基は、MOR14797 Fabによって認識される三次元立体配置エピトープを形成する(図1)。表6に詳述されるように、TGFβ−2と相互作用するMOR14797の表面は、いくつかの非連続配列によって形成される。これらの残基は、TGFβ−2に結合するMOR14797の三次元パラトープを形成する(図11)。
TGFβ−2に結合するMOR14800のエピトープ

Claims (28)

  1. ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2を中和し、ヒトアイソフォームTGF−β3を中和しない、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片。
  2. ヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2を中和し、ヒトアイソフォームTGF−β3およびTGF−β1を中和しない、請求項1に記載の抗体またはその機能的断片。
  3. 中和が、Smad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される、請求項1または2に記載のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片。
  4. Smad依存性リポーター遺伝子アッセイによって測定される場合、250pM未満の最大半減抑制濃度(IC50)でヒトTGF−β2を中和し、100nMを超える最大半減抑制濃度(IC50)でヒトTGF−β1またはTGF−β3を中和する、前記請求項のいずれか一項に記載の抗体またはその機能的断片。
  5. TGF−β1またはTGF−β3に関するその解離定数の少なくとも70倍小さい解離定数で、ヒトアイソフォームTGF−β1およびTGF−β3より優先的にヒトTGF−βアイソフォームTGF−β2に結合する、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体またはその機能的断片であって、前記抗体がヒトTGF−β2を中和する、前記抗体またはその機能的断片。
  6. 1pM以下のKでヒトTGF−β2に結合する、前記請求項のいずれか一項に記載の抗体またはその機能的断片。
  7. 配列番号7、27、47、67、87または107のうちの少なくとも1つに少なくとも95%の配列同一性を有するVHポリペプチド配列、および配列番号17、37、57、77、97または117のうちの少なくとも1つに少なくとも95%の配列同一性を有するVLポリペプチド配列を含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載の抗体または機能的断片。
  8. 配列番号1、21、41、61、81、101または4、24、44、64、84、104または124〜129からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR1;配列番号2、22、42、62、82、102または5、25、45、65、85、105からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR2;配列番号3、23、43、63、83、103または6、26、46、66、86、106からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR3;配列番号11、31、51、71、91、111または14、34、54、74、94、114からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR1;配列番号12、32、52、72、92、112または15、35、55、75、95、115からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR2;配列番号13、33、53、73、93、113または16、36、56、76、96、116からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR3を含む、請求項1〜7のいずれか一項に記載の抗体または機能的断片。
  9. (a)配列番号1の重鎖可変領域CDR1;配列番号2の重鎖可変領域CDR2;配列番号3の重鎖可変領域CDR3;配列番号11の軽鎖可変領域CDR1;配列番号12の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号13の軽鎖可変領域CDR3;
    (b)配列番号21の重鎖可変領域CDR1;配列番号22の重鎖可変領域CDR2;配列番号23の重鎖可変領域CDR3;配列番号31の軽鎖可変領域CDR1;配列番号32の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号33の軽鎖可変領域CDR3;
    (c)配列番号41の重鎖可変領域CDR1;配列番号42の重鎖可変領域CDR2;配列番号43の重鎖可変領域CDR3;配列番号51の軽鎖可変領域CDR1;配列番号52の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号53の軽鎖可変領域CDR3;
    (d)配列番号61の重鎖可変領域CDR1;配列番号62の重鎖可変領域CDR2;配列番号63の重鎖可変領域CDR3;配列番号71の軽鎖可変領域CDR1;配列番号72の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号73の軽鎖可変領域CDR3;
    (e)配列番号81の重鎖可変領域CDR1;配列番号82の重鎖可変領域CDR2;配列番号83の重鎖可変領域CDR3;配列番号91の軽鎖可変領域CDR1;配列番号92の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号93の軽鎖可変領域CDR3;または
    (f)配列番号101の重鎖可変領域CDR1;配列番号102の重鎖可変領域CDR2;配列番号103の重鎖可変領域CDR3;配列番号111の軽鎖可変領域CDR1;配列番号112の軽鎖可変領域CDR2;および配列番号113の軽鎖可変領域CDR3
    を含む、請求項1〜8のいずれか一項に記載のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体または機能的断片。
  10. 配列番号9、29、49、69、89、109からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%の配列同一性を有する完全長重鎖アミノ酸配列、および配列番号19、39、59、79、99、119からなる群から選択される少なくとも1つの配列に少なくとも95%の配列同一性を有する完全長軽鎖アミノ酸配列を含む、請求項1〜9のいずれか一項に記載の抗体または機能的断片。
  11. (a)配列番号7の可変重鎖配列および配列番号17の可変軽鎖配列;
    (b)配列番号27の可変重鎖配列および配列番号37の可変軽鎖配列;
    (c)配列番号47の可変重鎖配列および配列番号57の可変軽鎖配列;
    (d)配列番号67の可変重鎖配列および配列番号77の可変軽鎖配列;
    (e)配列番号87の可変重鎖配列および配列番号97の可変軽鎖配列;または
    (f)配列番号107の可変重鎖配列および配列番号117の可変軽鎖配列
    を含む、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体。
  12. (a)配列番号9の重鎖配列および配列番号19の軽鎖配列;
    (b)配列番号29の重鎖配列および配列番号39の軽鎖配列;
    (c)配列番号49の重鎖配列および配列番号59の軽鎖配列;
    (d)配列番号69の重鎖配列および配列番号79の軽鎖配列;
    (e)配列番号89の重鎖配列および配列番号99の軽鎖配列;または
    (f)配列番号109の重鎖配列および配列番号119の軽鎖配列
    を含む、ヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体。
  13. IgG1アイソタイプのものである、前記請求項のいずれか一項に記載の抗TGF−β2抗体。
  14. Fc領域の突然変異により変更されたエフェクター機能を有する、前記請求項のいずれか一項に記載のヒトモノクローナル抗TGF−β2抗体。
  15. 前記請求項のいずれか一項に記載の抗体または機能的断片をコードする、単離されたポリヌクレオチド配列。
  16. 配列番号8、10、18、20、28、30、38、40、48、50、58、60、68、70、78、80、88、90、98、100、108、110、118または120の1つまたは複数を含む、請求項15に記載の単離されたポリヌクレオチド配列。
  17. 請求項15または16に記載の1つまたは複数の単離されたポリヌクレオチド配列を含む、クローニングまたは発現ベクター。
  18. 少なくとも1つのCDR領域をコードする、配列番号8、10、18、20、28、30、38、40、48、50、58、60、68、70、78、80、88、90、98、100、108、110、118もしくは120、またはその断片の1つまたは複数を含む、請求項17に記載のベクター。
  19. 請求項17または18に記載の1つまたは複数のベクターを含む宿主細胞。
  20. 請求項1〜14のいずれか一項に記載の抗体または機能的断片の生成のための方法であって、請求項24の宿主細胞を培養し、前記抗体または機能的断片を単離することを含む方法。
  21. 請求項1〜14のいずれか一項に記載の抗体またはその機能的断片を含む医薬組成物。
  22. 療法において、または医薬として使用するための、請求項9〜14のいずれか一項に記載の抗体またはその機能的断片を含む医薬組成物。
  23. 薬学的に許容される希釈剤または担体をさらに含む、請求項21または22に記載の医薬組成物。
  24. 1つまたは複数のさらなる活性薬剤をさらに含む、請求項21〜23のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  25. デュピュイトラン病、マルファン関連の状態またはマルファン病、表皮水疱症、線維柱帯切除術、ロイス−ディーツ症候群、皮膚全身性硬化症および筋骨格疾患または障害からなる群から選択される疾患または病的状態の処置に使用するための、請求項21〜24のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  26. デュピュイトラン病、マルファン関連の状態またはマルファン病、表皮水疱症、線維柱帯切除術、ロイス−ディーツ症候群、皮膚全身性硬化症および筋骨格疾患または障害からなる群から選択される疾患または病的状態を患っている患者を処置する方法であって、前記患者に請求項21〜24のいずれか一項に記載の医薬組成物の有効用量を投与することを含む方法。
  27. デュピュイトラン病、マルファン関連の状態またはマルファン病、表皮水疱症、線維柱帯切除術、ロイス−ディーツ症候群、皮膚全身性硬化症または筋骨格疾患または障害の処置のための医薬の製造における、請求項1〜14のいずれか一項に記載の抗体もしくは機能的断片、請求項15もしくは請求項16に記載のポリヌクレオチド配列または請求項21〜24のいずれか一項に記載の医薬組成物の使用。
  28. 請求項12の少なくとも1つの抗体によってTGFβ−2への結合を交差ブロックするかまたは交差ブロックされる、抗体またはその機能的断片。
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