JP2019033740A - Method for determining sweatability - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、遺伝型を検出する工程を含む被験者の汗のかきやすさを判定する方法に関する。さらに詳しくは、被験者由来のDNA含有試料において特定の遺伝型を検出する工程を含む被験者の汗のかきやすさを判定する方法に関する。 The present invention relates to a method of determining sweatness of a subject comprising the step of detecting a genotype. More particularly, the present invention relates to a method of determining sweatiness of a subject, which comprises the step of detecting a specific genotype in a subject-containing DNA-containing sample.
汗のかきやすさはヒトによって異なり、同じ人種でも必ずしも一致するとは言えない。汗に関する疾患として、発汗の消失や低下を伴う先天性無痛無汗症（CIPA,Congenital insensitivity to pain with anhydrosis）が知られており、非特許文献１において、この疾患と遺伝子多型の関連が示唆されている。また、非特許文献２〜８において、汗に伴う臭汗症（腋臭症／わきが）の要因のひとつとして、遺伝子多型が挙げられている。
しかし、汗のかきやすさ自体に着目し、その傾向を網羅的に把握できる方法を開発しようとする試みはほとんどなされていなかった。
そこで、本発明者らは本発明において、汗のかきやすさに関与する複数の遺伝型を特定することにより、汗のかきやすさを網羅的に把握できる方法の提供を試みた。
Sweatiness varies from person to person, and people of the same race may not always agree. Congenital insensitivity to pain with anhydrosis (CIPA) with loss or loss of sweating is known as a disease related to sweat, and in Non-Patent Document 1, association of this disease with gene polymorphism is suggested It is done. Moreover, in Non-Patent Documents 2 to 8, genetic polymorphism is mentioned as one of the factors of bromhidrosis (odorosis / brows) associated with sweat.
However, almost no attempt has been made to develop a method that can be comprehensively grasped, focusing on sweat easiness itself.
Therefore, in the present invention, the present inventors attempted to provide a method capable of comprehensively grasping the perspiration of perspiration by specifying a plurality of genotypes involved in perspiration of perspiration.
それぞれの被験者について、汗のかきやすさを網羅的に把握できる方法の提供を課題とする。 The task is to provide a method that can comprehensively understand the sweatiness of each subject.
本発明者らは、前記課題を解決するために鋭意研究を行い、複数のヒトの汗のかきやすさと遺伝型との関連を調べた結果、米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデ
ータベースに登録されている表１〜５に示される群から選択される１以上の一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型のいずれか一種以上を対象として解析することにより、網羅的に被験者の汗のかきやすさを判定することができることを見出し、本発明を完成するに至った。
The present inventors have intensively studied to solve the above-mentioned problems, and as a result of examining the relationship between multiple human sweatness and genotype, they are registered in the National Center for Biotechnology Information (NCBI) SNP database. One or more single nucleotide polymorphisms selected from the group shown in Tables 1 to 5 and / or single nucleotide polymorphisms, insertion polymorphisms, deletion polymorphisms in linkage disequilibrium with the single nucleotide polymorphisms, Alternatively, it has been found that it is possible to comprehensively determine the subject's sweatiness by analyzing any one or more of base repeat polymorphisms, and the present invention has been accomplished.
さらに本発明者らは、これらの遺伝子多型を含む遺伝子か該遺伝子の近傍の遺伝子としてPLB1遺伝子、PPP1CB遺伝子、SPDYA遺伝子、LONP2遺伝子、及びABCC11遺伝子を特定するに至った。そして、これらの遺伝子の発現を制御することや、合成されたタンパク質の作用を抑制することが、汗のかきやすさの改善に有用であることを見出した。 Furthermore, the present inventors came to specify the PLB1 gene, the PPP1 CB gene, the SPDYA gene, the LONP2 gene, and the ABCC11 gene as genes including these gene polymorphisms or genes in the vicinity of the genes. Then, it was found that controlling the expression of these genes and suppressing the action of the synthesized protein are useful for the improvement of the ease of sweating.
すなわち、本発明は次の（１）〜（８）の被験者の汗のかきやすさを判定する方法等に関する。
（１）被験者由来のDNA含有試料において遺伝型を検出する工程を含む被験者の汗のかきやすさを判定する方法であって、検出する遺伝型が米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデータベースに登録されている表１〜５に示される群から選択される１以上の一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型のいずれか一種以上である、被験者の汗のかきやすさを判定する方法。
（２）被験者由来のDNA含有試料において遺伝型を検出する工程を含む被験者の汗のかき
やすさを判定する方法であって、検出の対象となる一塩基多型が、rs56089836、rs55720575、rs57183123、rs899153、rs4666113、rs10192375、rs6726829、rs7594379、rs6727225、rs55772556、rs7586405、rs11690065、rs56206649、rs1569131、rs2049691、rs56240884、rs2293553、rs17007191、rs55721532、rs4408686、rs72782280、rs55877710、rs55883854、rs34627117、rs11675572、rs61275598、rs12714240、rs11683296、rs745645、rs4665431、rs112403637、rs55836936、rs11686491、rs4531886、rs62129826、rs10865506、rs10865505、rs2045884、rs4372836、rs7598876、rs2169748、rs7562170、rs11677127、rs55835850、rs111534567、rs11690423、rs4665432、rs11688129、rs72782294、rs6710959、rs4580350、rs4640348、rs2169751、rs7589860、rs7607844、rs4549034、rs34409160、rs11127180、rs2276547、rs4666119、rs4666118、rs10180266、rs7580078、rs6728459、rs11127188、rs62129808、rs6707848、rs7579277、rs11674854、rs9309664、rs4233727、rs6547872、rs6707130、rs12614723、rs4233728、rs2061757、rs56287488、rs6547870、rs55902327、rs58717377、rs56390569、rs35244334、rs7594363、rs11127187、rs4666114、rs7565187、rs6547867、rs4666115、rs 11682523、rs4643492、rs13028787、rs899154、rs12476553、rs13025377、rs13394863、rs6547875、rs10178852、rs1534480、rs6547862、rs6704973、rs1881255、rs6547863、rs11127181、rs1534481、rs7604903、rs11679568、rs1881256、rs1534477、rs1997270、rs6760822、rs7601771、rs1534479、rs2338546、rs11127178、rs11891377、rs4666107、rs4666108、rs7557359、rs55815151、rs1534476、rs13003761、rs6500380、rs1982782、rs8052293、rs17822931、rs111915588、rs56017929、rs113311037、rs7185374、及びrs12446160からなる群から選択される１以上の一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型である、上記（１）に記載の方法。
（３）rs56089836のアレルGを保有する遺伝型、rs55720575のアレルCを保有する遺伝型、rs57183123のアレルGを保有する遺伝型、rs899153のアレルGを保有する遺伝型、rs4666113のアレルAを保有する遺伝型、rs10192375のアレルGを保有する遺伝型、rs6726829のアレルCを保有する遺伝型、rs7594379のアレルGを保有する遺伝型、rs6727225のアレルGを保有する遺伝型、rs55772556のアレルTを保有する遺伝型、rs7586405のアレルAを保有する遺伝型、rs11690065のアレルAを保有する遺伝型、rs56206649のアレルAを保有する遺伝型、rs1569131のアレルTを保有する遺伝型、rs2049691のアレルGを保有する遺伝型、rs56240884のアレルTを保有する遺伝型、rs2293553のアレルTを保有する遺伝型、rs17007191のアレルTを保有する遺伝型、rs55721532のアレルGを保有する遺伝型、rs4408686のアレルCを保有する遺伝型、rs72782280のアレルTを保有する遺伝型、rs55877710のアレルTを保有する遺伝型、rs55883854のアレルTを保有する遺伝型、rs34627117のアレルGを保有する遺伝型、rs11675572のアレルTを保有する遺伝型、rs61275598のアレルAを保有する遺伝型、rs12714240のアレルGを保有する遺伝型、rs11683296のアレルGを保有する遺伝型、rs745645のアレルTを保有する遺伝型、rs4665431のアレルCを保有する遺伝型、rs112403637のアレルGを保有する遺伝型、rs55836936のアレルCを保有する遺伝型、rs11686491のアレルTを保有する遺伝型、rs4531886のアレルCを保有する遺伝型、rs62129826のアレルTを保有する遺伝型、rs10865506のアレルCを保有する遺伝型、rs10865505のアレルAを保有する遺伝型、rs2045884のアレルCを保有する遺伝型、rs4372836のアレルTを保有する遺伝型、rs7598876のアレルTを保有する遺伝型、rs2169748のアレルAを保有する遺伝型、rs7562170のアレルCを保有する遺伝型、rs11677127のアレルCを保有する遺伝型、rs55835850のアレルCを保有する遺伝型、rs111534567のアレルGを保有する遺伝型、rs11690423のアレルCを保有する遺伝型、rs4665432のアレルAを保有する遺伝型、rs11688129のアレルCを保有する遺伝型、rs72782294のアレルGを保有する遺伝型、rs6710959のアレルCを保有する遺伝型、rs4580350のアレルTを保有する遺伝型、rs4640348のアレルTを保有する遺伝型、rs2169751のアレルGを保有する遺伝型、rs7589860のアレルAを保有する遺伝型、rs7607844のアレルTを保有する遺伝型、rs4549034のアレルCを保有する遺伝型、rs34409160のアレルTを保有する遺伝型、rs11127180のアレルCを保有する遺伝型、rs2276547のアレルGを保有する遺伝型、rs4666119のアレルCを保有する遺伝型、rs4666118のアレルGを保有する遺伝型、rs10180266のアレルAを保有する遺伝型、rs7580078のアレルGを保有する遺伝型、rs6728459のアレルAを保有する遺伝型、rs11127188のアレルGを保有する遺伝型、rs62129808のアレルGを保有する遺伝型、rs6707848のアレルTを保有する遺伝型、rs7579277のアレルGを保有する遺伝型、rs11674854のアレルCを保有する遺伝型、rs9309664のアレルGを保有する遺伝型、rs4233727のアレルTを保有する遺伝型、rs6547872のアレルCを保有する遺伝型、rs6707130のアレルAを保有する遺伝型、rs12614723のアレルCを保有する遺伝型、rs4233728のアレルAを保有する遺伝型、rs2061757のアレルAを保有する遺伝型、rs56287488のアレルAを保有する遺伝型、rs6547870のアレルGを保有する遺伝型、rs55902327のアレルAを保有する遺伝型、rs58717377のアレルAを保有する遺伝型、rs56390569のアレルGを保有する遺伝型、rs35244334のアレルCを保有する遺伝型、rs7594363のアレルCを保有する遺伝型、rs11127187のアレルGを保有する遺伝型、rs4666114のアレルGを保有する遺伝型、rs7565187のアレルCを保有する遺伝型、rs6547867のアレルCを保有する遺伝型、rs4666115のアレルTを保有する遺伝型、rs11682523のアレルTを保有する遺伝型、rs4643492のアレルTを保有する遺伝型、rs13028787のアレルCを保有する遺伝型、rs899154のアレルAを保有する遺伝型、rs12476553のアレルTを保有する遺伝型、rs13025377のアレルGを保有する遺伝型、rs13394863のアレルCを保有する遺伝型、rs6547875のアレルGを保有する遺伝型、rs10178852のアレルCを保有する遺伝型、rs1534480のアレルTを保有する遺伝型、rs6547862のアレルGを保有する遺伝型、rs6704973のアレルGを保有する遺伝型、rs1881255のアレルGを保有する遺伝型、rs6547863のアレルAを保有する遺伝型、rs11127181のアレルCを保有する遺伝型、rs1534481のアレルCを保有する遺伝型、rs7604903のアレルAを保有する遺伝型、rs11679568のアレルAを保有する遺伝型、rs1881256のアレルGを保有する遺伝型、rs1534477のアレルCを保有する遺伝型、rs1997270のアレルGを保有する遺伝型、rs6760822のアレルGを保有する遺伝型、rs7601771のアレルCを保有する遺伝型、rs1534479のアレルGを保有する遺伝型、rs2338546のアレルGを保有する遺伝型、rs11127178のアレルTを保有する遺伝型、rs11891377のアレルGを保有する遺伝型、rs4666107のアレルGを保有する遺伝型、rs4666108のアレルCを保有する遺伝型、rs7557359のアレルCを保有する遺伝型、rs55815151のアレルCを保有する遺伝型、rs1534476のアレルGを保有する遺伝型、rs13003761のアレルGを保有する遺伝型、rs6500380のアレルGを保有する遺伝型、rs1982782のアレルGを保有する遺伝型、rs8052293のアレルGを保有する遺伝型、rs17822931のアレルCを保有する遺伝型、rs111915588のアレルGを保有する遺伝型、rs56017929のアレルTを保有する遺伝型、rs113311037のアレルCを保有する遺伝型、rs7185374のアレルCを保有する遺伝型、又はrs12446160のアレルGを保有する遺伝型のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者は汗をかきやすいと判定する工程を含む、上記（２）に記載の方法。
（４）被験者由来のDNA含有試料において遺伝型を検出する工程を含む被験者の汗のかき
やすさを判定する方法であって、検出の対象となる挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型がrs531181250、rs5830086、rs200048571、rs11362755、rs146417285、rs11317076、rs142578101、rs57501094、rs60484735、rs532869892、rs72356556、rs546848712、rs150122362、rs34388621、rs61013289、rs546378722、rs11333986、rs36004805、rs4665434、rs11410668、rs34677847、rs72245314、rs35685583、rs34443149、及びrs34852150からなる群から選択される１以上の挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型である、上記（１）に記載の方法。
（５）rs531181250のアレルCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTを保有する遺伝型、rs5830086のアレルTを保有する遺伝型、rs200048571のアレルTAを保有する遺伝型、rs11362755のアレルAを保有する遺伝型、rs146417285のアレルAを保有する遺伝型、rs11317076のアレルTを保有する遺伝型、rs142578101のアレルTGを保有する遺伝型、rs57501094のアレルCAGCTCACTGCAGCTTCAACCTCCCTGGを保有する遺伝型、rs60484735のアレルTGを保有する遺伝型、rs532869892のアレルTAを保有する遺伝型、rs72356556のアレルGTを保有する遺伝型、rs546848712のアレルACを保有する遺伝型、rs150122362のアレルCTを保有する遺伝型、rs34388621のアレルAGを保有する遺伝型、rs61013289のアレルCを保有する遺伝型、rs546378722のアレルCを保有する遺伝型、rs11333986のアレルCTを保有する遺伝型、rs36004805のアレルCAを保有する遺伝型、rs4665434のアレルAを保有する遺伝型、rs11410668のアレルTを保有する遺伝型、rs34677847のアレルAを保有する遺伝型、rs72245314のアレルATを保有する遺伝型、rs35685583のアレルAGを保有する遺伝型、rs34443149のアレルAを保有する遺伝型、又はrs34852150のアレルATを保有する遺伝型のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者は、汗をかきやすいと判定する工程を含む、上記（４）に記載の方法。
（６）上記（１）〜（５）のいずれかに記載の一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型を検出するためのプローブ又はプライマーとして用いることができる、被験者の汗のかきやすさの判定用ポリヌクレオチド。
（７）上記（６）に記載のポリヌクレオチドからなるプローブ及び／又はプライマーを含む、被験者の汗のかきやすさの判定用キット。
（８）PLB1遺伝子、PPP1CB遺伝子、SPDYA遺伝子、LONP2遺伝子又はABCC11遺伝子の発現を制御し、又は該タンパク質の作用を抑制する汗のかきやすさの改善のための組成物。
That is, the present invention relates to the following methods (1) to (8) for determining the degree of perspiration of a subject.
(1) A method for determining sweatiness of a subject, including the step of detecting the genotype in a DNA-containing sample derived from the subject, wherein the genotype to be detected is registered in the National Center for Biotechnology Information (NCBI) SNP database One or more single nucleotide polymorphisms selected from the group shown in Tables 1 to 5 and / or single nucleotide polymorphisms, insertion polymorphisms, deletion polymorphisms in linkage disequilibrium with the single nucleotide polymorphisms Or a method for determining the subject's sweatiness, which is any one or more of base repeat polymorphisms.
(2) A method for determining the sweatiness of a subject, including the step of detecting the genotype in a DNA-containing sample derived from the subject, wherein the single nucleotide polymorphisms to be detected are , Rs4666113, rs10192375, rs6726829, rs7572325, rs5772525, rs75726405, rs11690065, rs56206649, rs1569131, rs1569131, rs56240884, rs17007191, rs4408686, rs72782280, rs5582 714 7 b11 714 s. ,,,,,,, rs4665431, rs112403637, rs55869366, rs45318866, rs62129826, rs10865506, rs10865505, rs1085505, rs2042884, rs7598876, rs2169748, rs7562170, rsll5l5s5l7, rs11690423, rsll5l5s7l5G, b7 7 1413 , Rs7607844, rs4549034, rs34409160, rs11127180, rs2276547, rs4666119, rs4666118, rs10180266, rs75080078, rs67 1415 714 7 b14 717 1417 rs11682523, rs4643492, rs13028787, rs12476553, rs13025377, rs13394863, rs6547875, rs10178852, rs1547480, rs6547862, rsl7041473, rsl8514763, rs7604903, rss7604407, avail. Rs11127178, rs11891377, rs4666107, rs4576108, rs7515359, rs55815151, rs1534476, rs13003761, rs6500380, rs19822382, rs8052293, rs118291531, rs151015528, rs113111037, rs7185374, and rs12446160 selected from the group consisting of 1 or more bases And / or a single nucleotide polymorphism in linkage disequilibrium with the single nucleotide polymorphism, in the above (1) Method described.
(3) A genotype possessing allele G of rs56089836, a genotype possessing allele C of rs55720575, a genotype possessing allele G of rs57183123, a genotype possessing allele G of rs899153, possess allele A of rs4666113 Genotype carrying rs10192375 allele G, carrying rs6726829 allele C, carrying rs7594379 allele G, carrying rs6727225 gene G, carrying rs55772556 allele T Genotype carrying genotype rs7586405 allele A genotype carrying rs11690065 allele A genotype carrying rs56206649 allele A carrying genotype of rs1569131 allele T carrying rs2049691 allele G Genotype: genotype carrying rs56240884 allele T: genotype carrying rs2293553 allele T: genotype carrying rs17007191 allele T: genotype carrying rs55721532 allele G: rs4408686 allele C Genotype, rs A genotype that carries allele T of 72782280, a genotype that carries allele T of rs55877710, a genotype that carries allele T of rs55883854, a genotype that carries allele G of rs34627117, a genotype that carries allele T of rs11675572, A genotype carrying rs61275598 allele A, a genotype carrying rs12714240 allele G, a genotype carrying rs11683296 allele G, a genotype carrying rs745645 allele T, a genotype carrying rs4665431 allele C, A genotype that carries allele G of rs112403637, a genotype that carries allele C of rs55836936, a genotype that carries allele T of rs11686491, a genotype that carries allele C of rs4531886, a genotype that carries allele T of rs62129826, A genotype carrying the rs10865506 allele C, a genotype carrying the rs10865505 allele A, a genotype carrying the rs2045884 allele C, a genotype carrying the rs4372836 allele T, a genotype carrying the rs7598876 allele T, rs216974 A genotype carrying 8 alleles A, a genotype carrying rs7562170 allele C, a genotype carrying rs11677127 allele C, a genotype carrying rs55835850 allele C, a genotype carrying rs111534567 allele G, A genotype carrying rs11690423 allele C, a genotype carrying rs4665432 allele A, a genotype carrying rs11688129 allele C, a genotype carrying rs72782294 allele G, a genotype carrying rs6710959 allele C, A genotype carrying the rs4580350 allele T, a genotype carrying the rs4640348 allele T, a genotype carrying the rs2169751 allele G, a genotype carrying the rs7589860 allele A, a genotype carrying the rs7607844 allele T, A genotype carrying allele C of rs4549034, a genotype carrying allele T of rs34409160, a genotype carrying allele C of rs11127180, a genotype carrying allele G of rs2276547, a genotype carrying allele C of rs4666119, Alley of rs4666118 A genotype possessing G, a genotype possessing allele A of rs10180266, a genotype possessing allele G of rs7500788, a genotype bearing allele A of rs6728459, a genotype possessing allele G of rs11127188, an allele of rs62129808 A genotype carrying G, a genotype carrying allele T of rs6707848, a genotype carrying allele G of rs7579277, a genotype carrying allele C of rs11674854, a genotype carrying allele G of rs9309664, an allele of rs4233727 A genotype that carries T, a genotype that carries allele C of rs6547872, a genotype that carries allele A of rs6707130, a genotype that carries allele C of rs12614723, a genotype that carries allele A of rs4233728, an allele of rs2061757 A-bearing genotype, a genotype with rs56287488 allele A, a genotype with rs6547870 allele G, a genotype with rs55902327 allele A, a genotype with rs58717377 allele A, the rs56390569 allele Keep G To carry, rs35244334 allele C-bearing genotype, rs7594363 allele C-bearing genotype, rs11127187 allele G-bearing genotype, rs4666114 allele G-bearing genotype, rs7565187 allele C-bearing To carry, rs6547867 allele C, rs4666115 allele T, rs11682523 allele T, rs4643492 allele T, rs13028787 allele C To carry, rs899154 allele A, rs12476553 allele T, rs13025377 allele G, rs13394863 allele C, rs6547875 allele G To carry, rs 1017 8852, allele C, rs 1534 480, allele T, rs 654 786 2, allele r, rs 6704, 73, rs Inheritance Type, a genotype carrying rs6547863 allele A, a genotype carrying rs11127181 allele C, a genotype carrying rs1534481 allele C, a genotype carrying rs7604903 allele A, a gene carrying rs11679568 allele A Type, genotype having rs1881256 allele G, genotype having rs1534477 allele C, genotype having rs1997270 allele G, genotype having rs6760822 allele G, rs7601771 allele C Rs1534479 allele G type, rs2338546 allele G type genotype, rs11127178 allele type T genotype, rs11891377 allele type G genotype, rs4666107 allele type G Type, genotype having rs4666108 allele C, genotype having rs7557359 allele C, genotype having rs55815151 allele C, genotype having rs1534476 allele G, rs13003761 allele G Type, rs650038 A genotype carrying allele G of 0, a genotype carrying allele G of rs1982782, a genotype carrying allele G of rs8052293, a genotype carrying allele C of rs17822931, a genotype carrying allele G of rs111915588, Indicates one or more genotypes of rs 56017929 allele T, rs 113311037 allele C, rs 7185 374 allele C, or rs 12446 160 allele G The method according to (2) above, including the step of determining that the subject is likely to sweat.
(4) A method for determining sweatiness of a subject, including the step of detecting a genotype in a DNA-containing sample derived from the subject, which is an insertion type polymorphism, a deletion type polymorphism, or a base to be detected Repeated polymorphisms are rs 53 11 250 250, rs 5 38 0086, rs 11 362 755, rs 14 16417 285, rs 11 13 10 76 56, rs 14 25 10 1014, rs 5 10 10 10 14 354, rs 5 2684 8952, rs 5 2 8268 559, rs 7 2456 5612, rs 3 14 2 8 8 12 The method according to (1) above, which is one or more insertion polymorphisms, deletion polymorphisms, or base repeat polymorphisms selected from the group consisting of rs34443149 and rs34852150.
(5) A genotype carrying the allele CTTTTTTTTTTTTTTTTTT of rs531181250, a genotype carrying the allele T of rs5830086, a genotype carrying the allele TA of rs2000048571, a genotype carrying the allele A of rs11362755, the allele A carrying rs146417285 Genotype carrying rs11317076 allele T gene carrying rs142578101 allele TG handing rs57501094 allele CAGCTCACTGCAGCTTCAACCTCCCTGG carrying genotype rs60484735 allele TG carrying rs532869892 allele TA Genotype carrying rs72356556 GT, rs546848812 carrying AC, rs150122362 carrying CT carrying rs34388621 allele AG, carrying rs61013289 allele C Genotype, genotype c carrying allele C of rs546378722, genotype g carrying allele CT of rs11333986, genotype g carrying allele CA of rs36004805, allele A of rs4665434 A genotype having rs11410668 allele T, a genotype having rs34677847 allele A, a genotype having rs72245314 allele AT, a genotype having rs35685583 allele AG, and rs34443149 allele A A method according to the above (4), which comprises the step of determining that a subject who exhibits any one or more genotypes of the above genotype or a genotype carrying the rs34852150 allele AT is easy to sweat.
(6) A single nucleotide polymorphism according to any one of the above (1) to (5) and / or a single nucleotide polymorphism, an insertion polymorphism, a deletion polymorphism which is in linkage disequilibrium with the single nucleotide polymorphism Or a polynucleotide for determining sweatness of a subject, which can be used as a probe or primer for detecting a base repeat polymorphism.
(7) A kit for determining the sweatiness of a subject, comprising a probe and / or a primer consisting of the polynucleotide according to (6) above.
(8) A composition for improving sweatiness which controls expression of PLB1 gene, PPP1 CB gene, SPDYA gene, LONP2 gene or ABCC11 gene or suppresses the action of the protein.
本発明の方法により、対象となるヒトそれぞれの汗のかきやすさを網羅的に把握することができる。また、判定用ポリヌクレオチドや判定用キットの使用により、汗のかきやすさを簡便に把握することも可能となる。 According to the method of the present invention, it is possible to comprehensively grasp the sweatiness of each target human being. In addition, the use of the determination polynucleotide or the determination kit makes it possible to easily grasp the ease of sweating.
本発明の「被験者の汗のかきやすさを判定する方法」とは、被験者由来のDNA含有試料において遺伝型を検出する工程を含む被験者の汗のかきやすさを判定する方法のことをいう。本発明の方法はさらに、被験者の汗のかきやすさを判定するために有用なその他の工程を含むものであっても良い。
ここで検出する一塩基多型とは、米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデータベースに登録されている表１〜５に示される群から選択される１以上の一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型のことを指す。
なお、表１〜５において“他のrs番号”とは“rs番号”で特定されるある遺伝子多型を他の番号で示したものであり、実質的に同一な遺伝子多型を示すもののことをいう。例えば遺伝子多型がrs56089836である場合、“他のrs番号”に示されるrs59581898、rs62129813及びrs112631724も同じ遺伝子多型を示すものである。
The “method for determining the subject's sweatiness” in the present invention refers to a method for determining the subject's activity, which includes the step of detecting a genotype in a DNA-containing sample derived from the subject. The method of the present invention may further include other steps useful to determine the subject's sweatiness.
The single nucleotide polymorphism detected here means one or more single nucleotide polymorphisms selected from the group shown in Tables 1 to 5 registered in the National Center for Biotechnology Information (NCBI) SNP database and / or It refers to a single nucleotide polymorphism, insertion polymorphism, deletion polymorphism, or base repeat polymorphism which is in a linkage disequilibrium with a nucleotide polymorphism.
In Tables 1 to 5, "other rs number" indicates a certain gene polymorphism specified by "rs number" by another number, and indicates substantially the same gene polymorphism. Say For example, when the gene polymorphism is rs56089836, rs59581898, rs62129813 and rs112631724 shown in "other rs number" also show the same gene polymorphism.
なお、本発明における一塩基多型(Single Nucleotide Polymorphism、SNP)とは、ヒトのゲノム配列において、国際標準配列と比較して母集団中１％以上の頻度で存在する、一つの塩基が他の塩基に置換変異したものを指す。
また、本発明において連鎖不平衡にある一塩基多型とは、rs番号で特定される本発明のいずれかの一塩基多型との間の連鎖不平衡係数(r2)が0.8以上である一塩基多型をいう。
In the present invention, single nucleotide polymorphism (SNP) refers to one nucleotide present in human genome sequence at a frequency of 1% or more in the population as compared to the international standard sequence. It refers to one that has been substituted and mutated to a base.
Furthermore, in the present invention, a single nucleotide polymorphism in linkage disequilibrium means a linkage disequilibrium coefficient (r2) between any single nucleotide polymorphism of the present invention specified by rs number is 0.8 or more. Refers to a nucleotide polymorphism.
検出の対象となる一塩基多型として、例えば、表１〜４に示されるrs56089836（rs59581898、rs62129813或いはrs112631724）、rs55720575（rs60889943或いはrs62129815）、rs57183123（rs62129811）、rs899153（rs57518271）、rs4666113、rs10192375（rs57041568）、rs6726829、rs7594379、rs6727225、rs55772556（rs56653894或いはrs62129809）、rs7586405（rs56607784或いはrs59214254）、rs11690065（rs58204780）、rs56206649、rs1569131（rs76582714）、rs2049691（rs58413317）、rs56240884、rs2293553（rs58193861）、rs17007191（rs61621522）、rs55721532（rs59787561）、rs4408686（rs61069972）、rs72782280（rs74261418）、rs55877710、rs55883854、rs34627117、rs11675572（rs58282073）、rs61275598、rs12714240、rs11683296、rs745645、rs4665431、rs112403637、rs55836936、rs11686491、rs4531886（rs17691762或いはrs58681435）、rs62129826、rs10865506（rs60221408）、rs10865505（rs58410399）、rs2045884（rs74261419）、rs4372836（rs59288070）、rs7598876（rs57613161）、rs2169748、rs7562170、rs11677127、rs55835850、rs111534567、rs11690423（rs57906003）、rs4665432（rs56730214）、rs11688129、rs72782294（rs73920351）、rs6710959（rs17254369或いはrs61388810）、rs4580350（rs4665433、rs6419695、rs10327805或いはrs56994305）、rs4640348（rs10327848或いはrs59668038）、rs2169751（rs79100049）、rs7589860、rs7607844（rs60543350）、rs4549034（rs57468504）、rs34409160、rs11127180（rs59960949）、rs2276547（rs116938845）、rs4666119、rs4666118（rs60578675）、rs10180266、rs7580078（rs61465139）、rs6728459、rs11127188（rs59311982）、rs62129808、rs6707848（rs17041256或いはrs60113633）、rs7579277（rs60992031）、rs11674854（rs57418127）、rs9309664（rs17691872、rs56415973或いはrs57130115）、rs4233727（rs57066661）、rs6547872、rs6707130（rs57581508）、rs12614723、rs4233728（rs59558037）、rs2061757、rs56287488（rs58010948或いはrs62129814）、rs6547870（rs60919232）、rs55902327（rs62129812）、rs58717377（rs62129817）、rs56390569（rs60268969或いはrs62129816）、rs35244334（rs60347309或いはrs62129810）、rs7594363、rs11127187（rs17742531、rs56489812、rs57342746或いはrs60298605）、rs4666114（rs60847247）、rs7565187（rs58133309））、rs6547867（rs61031248）、rs4666115（rs60288269）、rs11682523（rs58466405）、rs4643492、rs13028787、rs899154、rs12476553、rs13025377（rs58509600）、rs13394863（rs58146767）、rs6547875（rs17765415）、rs10178852（rs61204417或いはrs74261420）、rs1534480（rs17741924、rs56437411、rs57838999或いはrs386536127）、rs6547862（rs59296728）、rs6704973（rs56867625）、rs1881255（rs17691036或いはrs56821276）、rs6547863（rs57814903）、rs11127181（rs56431711、rs56893412或いはrs58453533）、rs1534481（rs61420251）、rs7604903（rs61130953）、rs11679568、rs1881256（rs17691012或いはrs61505939）、rs1534477（rs17690773、rs60698702或いはrs386536126）、rs1997270（rs59540154）、rs6760822（rs57342465）、rs7601771（rs12999769、rs52803712或いはrs57054163）、rs1534479（rs17741942或いはrs58604876）、rs2338546（rs57174191或いはrs76345595）、rs11127178（rs56888239）、rs11891377（rs60425837）、rs4666107（rs13019804或いはrs58457568）、rs4666108（rs57042623）、rs7557359（rs52798867或いはrs60427147）、rs55815151（rs58411837）、rs1534476（rs61195301）、rs13003761（rs57402442）、rs6500380（rs17751896或いはrs59063731）、rs1982782、rs8052293、rs17822931（rs52813591或いはrs58140753）、rs111915588、rs56017929（rs58076334）、rs113311037、rs7185374（rs59904631）、及びrs12446160（rs56568573或いはrs57947603）等が挙げられる。 As single nucleotide polymorphisms to be detected, for example, rs56089836 (rs59581898, rs62129813 or rs112631724), rs55720575 (rs60889943 or rs62129815), rs57183123 (rs62129811), rs899153 (rs57518271), rs4666113, rs192375 shown in Tables 1 to 4 rs57041 568), rss6754379, rss6727225, rss5772556 (rss56653894 or rs62129809), rs7586405 (rss56607784 or rs59214254), rs11690065 (rs58204780), rs56206649, rs1569131 (rs76582714), rs20469491s r7's carriers ), Rs55721532 (rs59787561), rs4408686 (rs61069972), rs72782280 (rs74261418), rs55877710, rs55883854, rs34627117, rs11675572 (rs58282073), rs61275498, rsl127645, rs74583, rs4165431, rsll2404407714756s , Rs62129826, rs10865506 (rs60221408), rs10865505 (rs58410399), rs2045884 (rs74261419), rs 4372836 (rs59288070), rs7598876 (rs57613161), rs2169748, rs7562170, rs11677127, rs55835850, rs111534567, rs11690423 (rs57906003), rs4665432 (rs56730214), rs11688129, rs72782294 (rs73920351), rs6710959 (rs17h75007r75007r7r7r7) rs10327805 or rs56994305), rs4640348 (rs10327848 or rs59668038), rs2169751 (rs79100049), rs7589860, rs7607844 (rs60543350), rs4549034 (rs57468504), rs34409160, rs11427180 (rs59960949), rs2276547, rs1l56l56l5 l7l7l7l7l7l5l7l7l7l7) rs75208 (rs61465139), rs6728459, rs11127188 (rs59311982), rs62129808, rs6707848 (rs17041256 or rs60111333), rs7579277 (rs60992031), rs11674854 (rs57418127), rs17691872, rs56415973 or rs57130115, rs747 l l7 l7s ), Rs12614723, rs4233728 (rs59558037), rs2061757, rs56287488 (rs58010948 or rs62147814), rs6547870 (rs60919232), rs55902327 (rs62129812), rs5871377 (rs62129817), rs56390569 (rs60268699 or rs62129816), rs35244334 (rs60347309 or rs62129810), rs7594363, rs11127187, rs17742531, rs5649878, rss7l75s rs7565187 (rs58133309)), rs6547867 (rs61031248), rs4666115 (rs60288269), rs11682523 (rs58466405), rs4643492, rs13028787, rs899154, rs12476553, rs13025377 (rs58509600), rs133944863 (rs58146767), rs7547447hs Rs1534480 (rs17742924, rs56437411, rs57838999 or rs386536127), rs6547862 (rs59296728), rs6704973 (rs56867625), rs1881255 (rs17691036 or rs56821276), rs6547863 (rs57814903), rs11127181 (rs56431711, rs568r513, or rsll 54 531l3s rs61130953), rs11679568, rs1881256 (rs17691012 or rs6150939), rs1534 Rs 1997270 (RsS), sREST 1997 (RsS); sREST 1997 (RsS); sREST 1997 (Rs); ), Rs4666107 (rs13019804 or rs58457568), rs4666108 (rs57042623), rs7557359 (rs5279888667 or rs60427147), rs55815151 (rs58411837), rs1534476 (rs61195301), rs13003761 (rs57402442), rs6500380 (rs17751896 or rssl7 57l l7 l l l l Or rs581407553), rs111915588, rs56017929 (rs58076334), rs113311037, rs7185374 (rs59904631), and rs12446160 (rs56568573 or rs57947603) etc. are mentioned.
このうち一塩基多型がrs56089836の場合ではアレルがGかCであり、ターゲットアレルがGである。従って、遺伝型がG/G＞C/G＞C/Cの順番で被験者は汗をかきやすいと判定される。また、rs55720575の場合ではアレルがCかTであり、ターゲットアレルがCである。従って、遺伝型がC/C＞T/C＞T/Tの順番で被験者は汗をかきやすいと判定される。
なお、対応するアレルがGかCまたはAかTである一塩基多型については、リスクアレルを判定するための配列情報を表６、７に示した。本発明において“rs番号”で特定される遺伝子多型で記載しているアレルのストランドはいずれもNCBI SNPデータベースのバージョンGRCh37または米国カリフォルニア大学サンタクルーズ校（UCSC）データベースのバージョンhg19のリファレンスストランドに等しい。
Among them, when the single nucleotide polymorphism is rs56089836, the allele is G or C, and the target allele is G. Therefore, it is determined that the subject is easy to sweat in the order of genotypes G / G> C / G> C / C. Also, in the case of rs55720575, the allele is C or T, and the target allele is C. Therefore, it is determined that the subject is easy to sweat in the order of genotype C / C> T / C> T / T.
For single nucleotide polymorphisms in which the corresponding allele is G or C or A or T, sequence information for determining a risk allele is shown in Tables 6 and 7. In the present invention, all of the allele strands described in the gene polymorphisms identified by “rs number” in the present invention are equal to the reference strand of version GRCh 37 of the NCBI SNP database or version hg 19 of the University of California, Santa Cruz (UCSC) database. .
即ち、本発明の検出対象が次の一塩基多型である場合、１）〜１３０）のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者であれば汗をかきやすいと判定されることになる。
１）rs56089836のアレルGを保有する遺伝型、２）rs55720575のアレルCを保有する遺伝型、３）rs57183123のアレルGを保有する遺伝型、４）rs899153のアレルGを保有する遺伝型、５）rs4666113のアレルAを保有する遺伝型、６）rs10192375のアレルGを保有する遺伝型、７）rs6726829のアレルCを保有する遺伝型、８）rs7594379のアレルGを保有する遺伝型、９）rs6727225のアレルGを保有する遺伝型、１０）rs55772556のアレルTを保有する遺伝型、１１）rs7586405のアレルAを保有する遺伝型、１２）rs11690065のアレルAを保有する遺伝型、１３）rs56206649のアレルAを保有する遺伝型、１４）rs1569131のアレルTを保有する遺伝型、１５）rs2049691のアレルGを保有する遺伝型、１６）rs56240884のアレルTを保有する遺伝型、１７）rs2293553のアレルTを保有する遺伝型、１８）rs17007191のアレルTを保有する遺伝型、１９）rs55721532のアレルGを保有する遺伝型、２０）rs4408686のアレルCを保有する遺伝型、２１）rs72782280のアレルTを保有する遺伝型、２２）rs55877710のアレルTを保有する遺伝型、２３）rs55883854のアレルTを保有する遺伝型、２４）rs34627117のアレルGを保有する遺伝型、２５）rs11675572のアレルTを保有する遺伝型、２６）rs61275598のアレルAを保有する遺伝型、２７）rs12714240のアレルGを保有する遺伝型、２８）rs11683296のアレルGを保有する遺伝型、２９）rs745645のアレルTを保有する遺伝型、３０）rs4665431のアレルCを保有する遺伝型、３１）rs112403637のアレルGを保有する遺伝型、３２）rs55836936のアレルCを保有する遺伝型、３３）rs11686491のアレルTを保有する遺伝型、３４）rs4531886のアレルCを保有する遺伝型、３５）rs62129826のアレルTを保有する遺伝型、３６）rs10865506のアレルCを保有する遺伝型、３７）rs10865505のアレルAを保有する遺伝型、３８）rs2045884のアレルCを保有する遺伝型、３９）rs4372836のアレルTを保有する遺伝型、４０）rs7598876のアレルTを保有する遺伝型、４１）rs2169748のアレルAを保有する遺伝型、４２）rs7562170のアレルCを保有する遺伝型、４３）rs11677127のアレルCを保有する遺伝型、４４）rs55835850のアレルCを保有する遺伝型、４５）rs111534567のアレルGを保有する遺伝型、４６）rs11690423のアレルCを保有する遺伝型、４７）rs4665432のアレルAを保有する遺伝型、４８）rs11688129のアレルCを保有する遺伝型、４９）rs72782294のアレルGを保有する遺伝型、５０）rs6710959のアレルCを保有する遺伝型、５１）rs4580350のアレルTを保有する遺伝型、５２）rs4640348のアレルTを保有する遺伝型、５３）rs2169751のアレルGを保有する遺伝型、５４）rs7589860のアレルAを保有する遺伝型、５５）rs7607844のアレルTを保有する遺伝型、５６）rs4549034のアレルCを保有する遺伝型、５７）rs34409160のアレルTを保有する遺伝型、５８）rs11127180のアレルCを保有する遺伝型、５９）rs2276547のアレルGを保有する遺伝型、６０）rs4666119のアレルCを保有する遺伝型、６１）rs4666118のアレルGを保有する遺伝型、６２）rs10180266のアレルAを保有する遺伝型、６３）rs7580078のアレルGを保有する遺伝型、６４）rs6728459のアレルAを保有する遺伝型、６５）rs11127188のアレルGを保有する遺伝型、６６）rs62129808のアレルGを保有する遺伝型、６７）rs6707848のアレルTを保有する遺伝型、６８）rs7579277のアレルGを保有する遺伝型、６９）rs11674854のアレルCを保有する遺伝型、７０）rs9309664のアレルGを保有する遺伝型、７１）rs4233727のアレルTを保有する遺伝型、７２）rs6547872のアレルCを保有する遺伝型、７３）rs6707130のアレルAを保有する遺伝型、７４）rs12614723のアレルCを保有する遺伝型、７５）rs4233728のアレルAを保有する遺伝型、７６）rs2061757のアレルAを保有する遺伝型、７７）rs56287488のアレルAを保有する遺伝型、７８）rs6547870のアレルGを保有する遺伝型、７９）rs55902327のアレルAを保有する遺伝型、８０）rs58717377のアレルAを保有する遺伝型、８１）rs56390569のアレルGを保有する遺伝型、８２）rs35244334のアレルCを保有する遺伝型、８３）rs7594363のアレルCを保有する遺伝型、８４）rs11127187のアレルGを保有する遺伝型、８５）rs4666114のアレルGを保有する遺伝型、８６）rs7565187のアレルCを保有する遺伝型、８７）rs6547867のアレルCを保有する遺伝型、８８）rs4666115のアレルTを保有する遺伝型、８９）rs11682523のアレルTを保有する遺伝型、９０）rs4643492のアレルTを保有する遺伝型、９１）rs13028787のアレルCを保有する遺伝型、９２）rs899154のアレルAを保有する遺伝型、９３）rs12476553のアレルTを保有する遺伝型、９４）rs13025377のアレルGを保有する遺伝型、９５）rs13394863のアレルCを保有する遺伝型、９６）rs6547875のアレルGを保有する遺伝型、９７）rs10178852のアレルCを保有する遺伝型、９８）rs1534480のアレルTを保有する遺伝型、９９）rs6547862のアレルGを保有する遺伝型、１００）rs6704973のアレルGを保有する遺伝型、１０１）rs1881255のアレルGを保有する遺伝型、１０２）rs6547863のアレルAを保有する遺伝型、１０３）rs11127181のアレルCを保有する遺伝型、１０４）rs1534481のアレルCを保有する遺伝型、１０５）rs7604903のアレルAを保有する遺伝型、１０６）rs11679568のアレルAを保有する遺伝型、１０７）rs1881256のアレルGを保有する遺伝型、１０８）rs1534477のアレルCを保有する遺伝型、１０９）rs1997270のアレルGを保有する遺伝型、１１０）rs6760822のアレルGを保有する遺伝型、１１１）rs7601771のアレルCを保有する遺伝型、１１２）rs1534479のアレルGを保有する遺伝型、１１３）rs2338546のアレルGを保有する遺伝型、１１４）rs11127178のアレルTを保有する遺伝型、１１５）rs11891377のアレルGを保有する遺伝型、１１６）rs4666107のアレルGを保有する遺伝型、１１７）rs4666108のアレルCを保有する遺伝型、１１８）rs7557359のアレルCを保有する遺伝型、１１９）rs55815151のアレルCを保有する遺伝型、１２０）rs1534476のアレルGを保有する遺伝型、１２１）rs13003761のアレルGを保有する遺伝型、１２２）rs6500380のアレルGを保有する遺伝型、１２３）rs1982782のアレルGを保有する遺伝型、１２４）rs8052293のアレルGを保有する遺伝型、１２５）rs17822931のアレルCを保有する遺伝型、１２６）rs111915588のアレルGを保有する遺伝型、１２７）rs56017929のアレルTを保有する遺伝型、１２８）rs113311037のアレルCを保有する遺伝型、１２９)rs7185374のアレルCを保有する遺伝型、又は、１３０)rs12446160のアレルGを保有する遺伝型。
That is, when the detection target of the present invention is the next single nucleotide polymorphism, if it is a subject showing a genotype of any one or more of 1) to 130), it is judged that sweat is easy to scratch.
1) a genotype which carries allele G of rs56089836, 2) a genotype which carries allele C of rs55720575, a genotype which carries allele G of rs57183123, a genotype which carries allele G of rs899153, 5) The genotype that carries allele A of rs4666113 6) The genotype that carries allele G of rs10192375 7 The genotype that carries allele C of rs6726829 8) The genotype that carries allele G of rs7594379 9) rs6727225 A genotype carrying allele G, 10) A genotype carrying allele T of rs55772556, 11) A genotype carrying allele A of rs7586405, 12) a genotype carrying allele A of rs11690065, 13) allele A of rs56206649 14) rs1569131 allele T: 15 genotype rs 2049691 allele G: 16) rs 56240 884 allele T possessing genotype 17) rs 229355 allele T Genotype, 18) rs17007191 allele T 19) A genotype that carries allele G of rs55721532 20) A genotype that carries allele C of rs4408686 21) A genotype that carries allele T of rs72782280 22 that r alleles of rs55877710 Genotype 23) Genotype carrying allele T of rs55883854 24) Genotype carrying allele G of rs34627117 25) Genotype carrying allele T of rs11675572 26) Genotype carrying allele A of rs61275598 27) a genotype carrying allele G of rs12714240 28) a genotype carrying allele G of rs11683296 29) a genotype carrying allele T of rs745645 30) a genotype carrying allele C of rs4665431 31 G) genotype carrying allele G of rs112403637 genotyping carrying allele C of rs55836936 g) genotype carrying allele T of rs11686491 34 g) genotype carrying allele C of rs4531886 35) rs62129826 Allele T of 36) rs10865506 allele C-bearing genotype 37) rs10865505 allele A-bearing genotype 38) rs 2045884 allele C-bearing genotype C) 39 rs4372836 allele T Genotype 40. Genotype carrying allele T of rs7598876 41. Genotype carrying allele A of rs2169748 42. Genotype carrying allele C of rs7562170 43. Genotype carrying allele C of rs11677127. 44) a genotype that carries allele C of rs55835850, a genotype that carries allele G of rs111534567, a genotype that carries allele C of rs11690423, a genotype that carries allele A of rs4665432, 48) 51) A genotype carrying allele C of rs11688129 49 A genotype carrying allele G of rs72782294 50) A genotype carrying allele C of rs6710959 51 A genotype carrying allele T of rs4580350 52) rs4640348 Maintain the allele T of 53) rs2169751 allele G, 54) rs7589860 allele A, 55) rs7607844 allele T, 56) rs4549034 allele C Type, 57) a genotype that carries allele T of rs34409160, a genotype that carries allele C of rs11127180, a genotype that carries allele G of 59 rs2276547, a genotype that carries allele C of 60) rs4666119, 61) genotype carrying allele G of rs4666118 62) genotype carrying allele A of rs10180266 63) genotype carrying allele G of rs75080078 64) genotype carrying allele A of rs6728459 65) Genotype carrying the allele G of rs11127188, genotype having the allele G of rs62129808, genotype having the allele T of rs6707848, genotype of the gene carrying allele G of rs7579277, 69) rs11674854 Possess allele C Genotype 70. Genotype carrying allele G of rs9309664 71) Genotype carrying allele T of rs4233 72. Genotype carrying allele C of rs6547872 73. Genotype carrying allele A of rs 6707130. 74) a genotype that carries allele C of rs12614723, a genotype that carries allele A of rs4233728, a genotype that carries allele A of rs2061757, a genotype that carries allele A of rs56287488, 78 G.) Rs6547870 genotype G carrying allele G, genotyping gene carrying rs 55902327 allele A 80 g) genotyping carrying rs 587 1 377 allele A, 81) genotype g carrying allele G of rs 563 905 69, 82) rs 35 244 334 Genotypes carrying allele C, 83) genotypes carrying allele C of rs7594363, genotypes carrying allele G of rs11127187, 85 genotypes carrying allele G of rs4666114, allele of 86) rs7565187 Genetics that hold C 87) a genotype that carries allele C of rs6547867 88 a genotype that carries allele T of rs4666115 89 a genotype that carries allele T of rs11682523 90) a genotype that carries allele T of rs4643492 91 92) a genotype carrying allele A of rs 899 154 93) a genotype carrying allele T of rs 12476 553 a genotype carrying allele G of rs 130 25 377 95) rs13394863 Genotype carrying allele C, Genotype carrying allele G of rs6547875, Genotype carrying allele C of rs10178852, Genotype carrying allele T of rs1534480, and allele of 99) rs654782 G-bearing genotype, 100) rs6704973 allele G-bearing genotype, 101) rs1881255 allele G-bearing genotype, 102) rs6547863 allele A-bearing genotype, 103) rs11127181 allele C Remains owned Type, 104) a genotype having an allele C of rs1534481, a genotype having an allele A of 105 rs7604903, a genotype having an allele A of 106) rs11679568, a genotype having an allele G of 107) rs1881256, 108) A genotype carrying the allele C of rs 1534477, a genotype carrying the allele G of rs 1997 270, 110 a genotype carrying the allele G of rs 6760822, a genotype carrying the allele C of rs 7601771, 112) The genotype that carries the allele G of rs1534479, the genotype that carries the allele G of the rs2338546, the genotype that carries the allele T of the rs11127178, the genotype that carries the allele G of the rs11891377, the 116) rs4666107 A genotype carrying the allele G, 117) A genotype carrying the allele C of the rs 4666108, a genotype carrying the allele C of the rs 75 57 359, a genotype carrying the allele C of the rs 55 15 151, 120) genotype that carries allele G of rs1534476, genotype that carries allele G of rs13003761, genotype that carries allele G of rs6500380, genotype that carries allele G of rs1982782, 124) rs8052293 A genotype carrying the allele G, a genotype carrying the allele C of the rs17822931, a genotype carrying the allele G of the rs111915588, a genotype carrying the allele T of the rs56017929, an allele C of the rs113311037 Genotype possessing 129, rs7185374 allele C, or 130) genotype possessing allele G of rs12446160.
また、本発明の検出の対象には挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型も含まれる。このような多型が例えば、例えば、表５に示されるrs531181250、rs5830086（rs144590574或いはrs376740408）、rs200048571（rs368363472或いはrs370981189）、rs11362755（rs36069422、rs78253755、rs368096786或いはrs368189821）、rs146417285、rs11317076（rs56097856、rs76402921、rs142965090、rs368949582或いはrs369769629）、rs142578101（rs371760496）、rs57501094、rs60484735（rs376598253）、rs532869892、rs72356556（rs111495162或いはrs375112434）、rs546848712、rs150122362（rs151080189）、rs34388621（rs71403622、rs72026676或いはrs141651285）、rs61013289（rs144624612、rs368339141或いはrs372039314）、rs546378722、rs11333986（rs35108799、rs71749840、rs72434769或いはrs372999280）、rs36004805（rs67928480、rs76305205、rs144471198或いはrs397797564）、rs4665434、rs11410668（rs79913682或いはrs141606034）、rs34677847（rs76260741）、rs72245314（rs200948141）、rs35685583（rs60070238、rs67882308、rs369471888或いはrs371096457）、rs34443149（rs56337963、rs141848290、rs372533555或いはrs377676748）、及びrs34852150（rs35224635、rs150649475或いはrs376829531等が挙げられる。 In addition, the subject of detection of the present invention also includes insertion polymorphisms, deletion polymorphisms, or base repeat polymorphisms. Such polymorphisms are shown, for example, in Table 5: rs531181250, rs5830086 (rs144590574 or rs376740408), rs20004851 (rs368363472 or rs370981189), rs11362755 (rs36069422, rs78253755, rs368096786 or rs368189821), rss rs142965090, rs368949582 or rs369769629), rs142578101 (rs371760496), rs57501094, rs60484735 (rs376598253), rs532689892, rs72356556 (rs111495162 or rs375112434), rs546848712, rs1501082172 (rs1510801813), rs343881 717, s7l13, s7, l7s, s7, l7s, s14, s7, s7, s7, s7, s14 rs 372039314), rs 5463783722, rs 11333986 (rs 35 10 8 87 99, rs 71 749 840, rs 7 24 3 447 69 or rs 37 2 999 280), rs 36 0048 05 (rs 67 928 480, rs 76 305 205, rs 14447 1198 or rs 3 797 75 564), rs 4 665 434, rs 114 96 268 (rs 79 913 682 or rs 1416060434) rs67882308, rs36 9471 888 or rs 37 10 96 457), rs 34 443 149 (rs 56337963, rs 14184 2 890, rs 372533 555 or rs 3776 567 748), and rs 34 52 150 (rs 35 24 2 635, rs 150 649 475 or rs 3768 25 531 etc.).
このうち、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型がrs531181250の場合では、アレルがCかCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTであり、ターゲットアレルがCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTである。従って、遺伝型がCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT＞C/CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT＞C/Cの順番で被験者は汗をかきやすいと判定される。また、rs5830086の場合ではアレルがTCかTであり、ターゲットアレルがTである。従って、遺伝型がT/T＞TC/T＞TC/TCの順番で被験者は汗をかきやすいと判定することになる。 Among them, when the insertion type polymorphism, deletion type polymorphism or base repeat polymorphism is rs531181250, the allele is C or CTTTTTTTTTTTTTTTT, and the target allele is CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT. Therefore, it is judged that the subject is easy to sweat in the order of genotype CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT / CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT> C / CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT> C / C. Moreover, in the case of rs5830086, the allele is TC or T, and the target allele is T. Therefore, in the order of T / T> TC / T> TC / TC, it is determined that the subject is easy to sweat.
即ち、本発明の検出対象が次の挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型である場合、１）〜２５）のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者であれば汗をかきやすいと判定されることになる。
１）rs531181250のアレルCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTを保有する遺伝型、２）rs5830086のアレルTを保有する遺伝型、３）rs200048571のアレルTAを保有する遺伝型、４）rs11362755のアレルAを保有する遺伝型、５）rs146417285のアレルAを保有する遺伝型、６）rs11317076のアレルTを保有する遺伝型、７）rs142578101のアレルTGを保有する遺伝型、８）rs57501094のアレルCAGCTCACTGCAGCTTCAACCTCCCTGGを保有する遺伝型、９）rs60484735のアレルTGを保有する遺伝型、１０）rs532869892のアレルTAを保有する遺伝型、１１）rs72356556のアレルGTを保有する遺伝型、１２）rs546848712のアレルACを保有する遺伝型、１３）rs150122362のアレルCTを保有する遺伝型、１４）rs34388621のアレルAGを保有する遺伝型、１５）rs61013289のアレルCを保有する遺伝型、１６）rs546378722のアレルCを保有する遺伝型、１７）rs11333986のアレルCTを保有する遺伝型、１８）rs36004805のアレルCAを保有する遺伝型、１９）rs4665434のアレルAを保有する遺伝型、２０）rs11410668のアレルTを保有する遺伝型、２１）rs34677847のアレルAを保有する遺伝型、２２）rs72245314のアレルATを保有する遺伝型、２３）rs35685583のアレルAGを保有する遺伝型、２４）rs34443149のアレルAを保有する遺伝型、又は２５）rs34852150のアレルATを保有する遺伝型。
That is, when the subject to be detected according to the present invention is the following insertion polymorphism, deletion polymorphism, or base repeat polymorphism, it is a subject that exhibits a genotype of any one or more of 1) to 25) It will be determined that it is easy to
1) a genotype carrying the allele CTTTTTTTTTTTTTTTTTT of rs531181250 2) a genotype carrying the allele T of rs5830086 3 a genotype carrying the allele TA of rs2000048571 4 a genotype carrying the allele A of rs11362755 5) rs146417285 genotype A possessing allele A, 6) genotype b possessing allele T of rs11317076, 7) genotype having allele TG of rs142578101, 8) genotype having allele CAGCTCACTGCAGCTTCAACCTCCTCTGG of rs57501094, 9) rs60484735 Genotype carrying allele TG 10) Genotype carrying allele TA of rs 532869892 11) Genotype carrying allele GT of rs 72356556 12) Genotype carrying allele AC of rs 5468488 12 13) allele CT of rs 150 122 362 14) r rs 34388 621 alleles AG genotypes 15) rs 610 13 289 alleles C genotypes 16) rs 54637 8722 alleles C genotypes 17) rs 113 33 9 86 Genotype carrying allele CT, 18) Genotype carrying allele CA of rs36004805, 19) Genotype carrying allele A of rs 4665434, 20) genotype carrying allele T of rs11410668, 21) allele of rs34677847 22) rs72245314 allele AT, 23) rs35685583 allele AG, 24) rs34443149 allele A, or 25) rs34852150 allele AT Genotype to possess.
本発明の方法の判定対象となる被験者はヒトであれば良く、アジア人種、特に東アジア人、さらには日本人であることが好ましく、性別は問わない。
また「被験者由来のDNA試料」とは、ゲノムDNA、cDNA、又はmRNAのいずれであっても良く、汗のかきやすさを判定する対象の被験者から得られるものであれば良く、例えば、唾液、唾、髪の毛、血液、リンパ液、骨髄液、精液、腹腔液、尿等の体液、髪の毛等を由来として調製される試料等が挙げられる。
The subject to be determined by the method of the present invention may be a human, preferably an Asian race, particularly an East Asian, and further preferably a Japanese, regardless of gender.
The "subject-derived DNA sample" may be any of genomic DNA, cDNA, or mRNA, as long as it can be obtained from a subject whose sweat sensitivity is to be determined; for example, saliva or saliva And samples prepared from body fluids such as hair, blood, lymph, bone marrow fluid, semen, peritoneal fluid, urine and the like, hair and the like.
本発明の一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型の検出にあたり、従来知られているいずれの方法を用いても良く、例えばTaqMan（登録商標）PCR、LAMP法等のPCRによってこれらの遺伝子多型を含む断片を増幅する方法やDNAシーケンサー等で塩基配列を直接決定し、これらの遺伝子多型を検出する方法等が挙げられる。また、DNAチップやGeneチップ等のマイクロアレイによる検出方法を使用しても良い。 For detecting single nucleotide polymorphisms of the present invention and / or single nucleotide polymorphisms, insertion polymorphisms, deletion polymorphisms, or base repeat polymorphisms in linkage disequilibrium with the single nucleotide polymorphisms For example, TaqMan (registered trademark) PCR, LAMP method and the like are used to amplify a fragment containing these gene polymorphisms by PCR, DNA sequencing, etc. Methods for detecting gene polymorphisms can be mentioned. Alternatively, a detection method using a microarray such as a DNA chip or a Gene chip may be used.
本発明の「被験者の汗のかきやすさの判定用ポリヌクレオチド」とは、本発明の検出対象として特定されている一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型の塩基配列を含み得るポリヌクレオチドを指す。
例えば検出対象となる遺伝子多型が一塩基多型であるrs56089836の場合は、G/G、C/G、C/Cのいずれに該当するか検出するために、その箇所の塩基配列を含むポリヌクレオチドとなる。このポリヌクレオチドは検出対象となる一塩基多型及びこれに連続する少なくとも15〜30塩基対からなる塩基配列であることが好ましく、これに相補的な塩基配列も本発明の「被験者の汗のかきやすさの判定用ポリヌクレオチド」に該当し得る。
そして、この「被験者の汗のかきやすさの判定用ポリヌクレオチド」は、一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型を検出するためのプローブ又はプライマーとして用いることができる。
The “polynucleotide for determination of the subject's sweatiness” according to the present invention refers to a single nucleotide polymorphism specified as a detection target of the present invention and / or a single nucleotide polymorphism in linkage disequilibrium with the single nucleotide polymorphism. It refers to a polynucleotide which may contain a base sequence of type, insertion type polymorphism, deletion type polymorphism or base repeat type polymorphism.
For example, when the gene polymorphism to be detected is rs56089836, which is a single nucleotide polymorphism, to detect which of G / G, C / G, and C / C corresponds to, a poly containing the nucleotide sequence of that portion It becomes a nucleotide. The polynucleotide is preferably a single nucleotide polymorphism to be detected and a base sequence consisting of at least 15 to 30 base pairs contiguous thereto, and a base sequence complementary thereto is also preferred for the subject of the present invention. It may correspond to "polynucleotide for determination of
And this "polynucleotide for determination of subject's sweatiness" is used as a probe or primer for detecting a single nucleotide polymorphism and / or a single nucleotide polymorphism in linkage disequilibrium with the single nucleotide polymorphism. be able to.
本発明の「被験者の汗のかきやすさの判定用キット」とは、「被験者の汗のかきやすさの判定用ポリヌクレオチド」からなるプローブ及び／又はプライマーを少なくとも含むキットのことをいう。このキットはさらに、一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型を検出する各方法に適した試薬等を含むものであってもよく、支持体に固定化されたマイクロアレイ等としてキットに含まれてもよい。 The “kit for determining the subject's sweatiness” according to the present invention refers to a kit at least including a probe and / or a primer consisting of “a polynucleotide for determining the subject's sweatiness”. The kit further comprises a method for detecting a single nucleotide polymorphism and / or a single nucleotide polymorphism, an insertion polymorphism, a deletion polymorphism, or a base repeat polymorphism in linkage disequilibrium with the single nucleotide polymorphism. It may contain a suitable reagent or the like, and may be included in the kit as a microarray or the like immobilized on a support.
本発明の「汗のかきやすさの改善のための組成物」とは、汗のかきやすさを改善するための組成物のことをいう。この組成物はPLB1遺伝子、PPP1CB遺伝子、SPDYA遺伝子、LONP2遺伝子、又はABCC11遺伝子の発現を制御することでこのタンパク質の合成を抑制したり、合成されたタンパク質の作用を抑制したりすることができる。
このような組成物は、汗のかきやすさの改善のための医薬品、化粧品等の有効成分とすることができ、この医薬品等は全身又は局所的に投与することが可能である。
The "composition for improving the sweatiness of sweat" of the present invention refers to a composition for improving the sweatiness of sweat. This composition can suppress the synthesis of this protein or suppress the action of the synthesized protein by controlling the expression of PLB1 gene, PPP1CB gene, SPDYA gene, LONP2 gene or ABCC11 gene.
Such a composition can be used as an active ingredient for medicines, cosmetics and the like for improving sweat fragility, and these medicines and the like can be administered systemically or locally.
以下、実施例をあげて本発明をさらに詳細に説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。 Hereinafter, the present invention will be described in more detail by way of examples, but the present invention is not limited thereto.
１．DNAサンプル
株式会社エムティーアイの女性のヘルスケアに関するウェブサイト及びアプリの使用者であり、かつ、任意に募集した汗のかきやすさ（形質）に関するアンケートに回答した者をDNAサンプル提供の対象者とした。募集では14407名が集まった。
このうち、eメールアドレス、個人情報等によるスクリーニングを経て、9321名がサンプル提供の対象者となった。
なお、汗のかきやすさに関するアンケートはSurvey Monkey（http://www.surveymonkey.com）によって作成され、オンラインにより対象者から回答を受けた。
1. DNA sample People who are the users of websites and apps on women's health care of MTI, and who answered the questionnaire on sweat easiness (traits) randomly recruited, were the subjects of DNA sample provision. The recruitment attracted 14407 people.
Among these, 9321 persons were targeted for sample provision after screening by e-mail address, personal information, etc.
The questionnaire on sweat easiness was prepared by Survey Monkey (http://www.surveymonkey.com), and responses were received from target persons online.
DNAサンプルは、唾液採取キット（OraGene(登録商標） DNA；DNA Genotek社）により2015年9月から2016年4月の間に集められた（n=5783）。
本発明にあたり、同意書、アンケート項目、及び遺伝型判定について、つくば国際臨床薬理クリニックの倫理審査委員会によって承認を受けた。同意書のサインにて同意を受けたサンプル提供者よりサンプル収集を行い、遺伝型判定、汗のかきやすさについてのアンケート、及びゲノムワイド関連解析による形質分析を行った。
The DNA sample was collected between September 2015 and April 2016 (n = 5783) with a saliva collection kit (OraGene® DNA; DNA Genotek).
In the present invention, the written consent form, the questionnaire items, and the genotyping were approved by the ethics review board of the Tsukuba International Clinical Pharmacology Clinic. Samples were collected from sample providers who agreed with the signature of the consent form, and genotyping, questionnaires on sweatiness, and trait analysis by genome-wide association analysis were performed.
２．遺伝型の決定
サンプル提供の対象者から得た唾液サンプルはタカラバイオ株式会社によって処理された。
サンプルはそれぞれ、エバージーン株式会社によって東アジア人を対象とするようにカスタムされたAxiom（登録商標）アレイ（EverGen1）によって遺伝型の決定が行われた。
このEverGen1チップは合計610093の多型を含む。そのうち569104多型は1000 Genomesプロジェクトの日本人系統サンプルにおいてMAF≧0.01を有したAxiom CHB-1チップのSNPから選ばれ、疾患上又は表現型上の既知の関連性を有する40989多型を追加したものである。
遺伝型データは、Affymetrix（登録商標） Analysis Suite 1.1.0616によって得た。
2. Determination of Genotype Saliva samples obtained from subjects who provided samples were processed by Takara Bio Inc.
Each sample was genotyped by Axiom® Array (EverGen 1) customized by Evagene Inc. to target East Asians.
The EverGen1 chip contains a total of 61,003 polymorphisms. Among them, 569104 polymorphisms were selected from SNPs of Axiom CHB-1 chip with MAF 0.01 0.01 in Japanese lineage samples of 1000 Genomes project, and added 40989 polymorphisms with known disease or phenotypic association It is a thing.
Genotype data were obtained by Affymetrix® Analysis Suite 1.1.0616.
３．IBD解析によるサンプルQC
解析対象として適したサンプルを選択するため、遺伝型データを利用して同一個体及び近縁関係にある2個体を抽出した。PLINK2 ver.1.90p（2016年8月16日リリース）｛Purcell et al.、2007、#42652｝を利用して、総当りの2個体のPIHAT値を算出し、個体Call Rate値の悪い個体を解析対象から除外した。
3. Sample QC by IBD analysis
In order to select a sample suitable for analysis, genotype data were used to extract two individuals that are identical and closely related. Using PILINK2 ver. 1. 90p (August 16, 2016 release) {Purcell et al., 2007, # 42652}, PIHAT values of 2 individuals per round are calculated and individuals with bad individual Call Rate values It was excluded from analysis.
４．PCA解析によるサンプルQC
PCA解析を利用して解析対象から日本人由来の個体を選択した。
1000 GenomesプロジェクトのPhase 3サンプル集団から2504個体のサンプルの遺伝型データ（ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/release/20130502/）をダウンロードし、人種の教師データとした。
教師データと解析対象集団、更にPCA解析の精度を上げるために別時期に募集した集団
を加え、PCA解析を行なった。PCA解析に利用したSNPは121595座位で、これらはPLINK2 v1.90pにより連鎖不平衡の低いSNPとして選択した。選択基準はr2<0.2とした{Purcell et al.、2007、#42652; Chang et al.、2015、#66208}。
第1主成分得点、第２主成分得点をそれぞれ横軸、縦軸にとった散布図を描画し、日本
人教師データの近傍にある個体を解析対象として選択した{Yamaguchi-Kabata et al.、2008、#51107; Tian et al.、2008、#28781}。
汗のかきやすさに関するアンケートデータと遺伝型データの両方を有するサンプルで、IBD解析及びPCA解析により解析対象として選択した個体数は5628個体であった。
4. Sample QC by PCA analysis
Individuals of Japanese origin were selected from analysis targets using PCA analysis.
Download genotypic data (ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/release/22013052) of 2504 individual samples from the Phase 3 sample population of the 1000 Genomes project, and race teacher data And
PCA analysis was performed by adding teacher data and analysis target groups, and further groups recruited at different times to improve the accuracy of PCA analysis. The SNPs used for PCA analysis were 121,595 loci, which were selected as low linkage disequilibrium SNPs by PLINK2 v1.90 p. Selection criteria were r2 <0.2 {Purcell et al., 2007, # 42652; Chang et al., 2015, # 66208}.
A scattergram with the first principal component score and the second principal component score plotted on the horizontal axis and the vertical axis, respectively, was selected, and individuals in the vicinity of Japanese teacher data were selected as analysis targets {Yamaguchi-Kabata et al., 2008, # 51107; Tian et al., 2008, # 28781}.
The number of individuals selected for analysis by IBD analysis and PCA analysis was 5628 for the sample having both the questionnaire data on sweat fragility and genotype data.
５．SNPのQC
解析対象SNPの選択基準は、1)SNPコールレート≧99%以上、2)MAF≧0.01、3)HWE P値≧1x10-6とした。
さらに、別時期に募集した集団との重複個体（329個体）について、それぞれで決定さ
れたSNPの遺伝型の一致率を算出し、一致率が90%以上のSNPを解析対象とした。
その結果、536506個のSNPが解析対象として選択された。そのうち2417個は挿入-欠失多型（INDEL）であった。
5. SNP QC
The selection criteria for the SNPs to be analyzed were 1) SNP call rate 99 99% or more, 2) MAF 0.01 0.01, 3) H W P P value 1 1 × 10 −6 .
Furthermore, for the overlapping individuals (329 individuals) with the population recruited at different times, the concordance rate of the genotype of the SNP determined in each was calculated, and SNPs having a concordance rate of 90% or more were analyzed.
As a result, 536,506 SNPs were selected for analysis. Among them, 2417 were insertion-deletion polymorphism (INDEL).
６．表現型データの処理
汗のかきやすさの形質についてのアンケート項目は、「以下のそれぞれの事柄について、あなたご自身はAとBのどちらに近いですか？ご自身の主観でお答えください。」という質問に対して、「A:汗をかきやすい」を選択した場合を“汗をかきやすい”ケースとし、「B:汗をかきにくい」を選択した場合をコントロールとした。
6. Processing of phenotypic data Questionnaire items about the traits of sweatiness are as follows: “Are you closer to A or B for each of the following matters? Please answer with your own subjectivity.” On the other hand, when "A: easy to sweat" is selected, the "easy to sweat" case is selected, and "B: difficult to sweat" is selected as control.
７．統計解析及び遺伝型予測
マイナーアレルに傾向性様式を仮定し、関連性の有無をロジスティック回帰分析法を用いて評価した。ソフトウェアはPLINK2 v1.90pを利用し、有意水準を5x10-8 とした。
7. Statistical analysis and genotypic prediction Assuming a tendency to minor alleles, the presence or absence of association was assessed using logistic regression analysis. The software used PLINK2 v1.90p, and the significance level was 5x10 -8 .
８．ゲノムインピュテーションによる評価
探索解析と検証解析によって関連候補遺伝子多型を決定し、その周辺の未観測遺伝子多型の遺伝型を擬似的に推定した。先ずBEAGLE 4.1{Browning and Browning、2007、#74753}を用いて遺伝型判定データセットをプレフェージング（pre-phasing）し、次にBEAGLE 4.1を用い、1000Genomes Phase 3の参照ハプロタイプを用いて遺伝型をインピュテーションした{Browning and Browning、2016、#55674}。
ゲノムインピュテーションにより擬似的に推定された遺伝型を用いて関連解析を行った。マイナーアレルに傾向性様式を仮定し、関連性の有無をロジスティック回帰分析法で評価した。ソフトウェアはPLINK2 v1.90pを利用し、有意水準を5x10-8として評価した。
8. Evaluation by genome imputation The candidate gene polymorphism was determined by search analysis and verification analysis, and the genotypes of unobserved gene polymorphisms around it were pseudo-predicted. First pre-phasing the genotyping dataset using BEAGLE 4.1 {Browning and Browning, 2007, # 74753}, then use GEAGLE 4.1 to genotyping using the 1000 Genomes Phase 3 reference haplotype Imputed {Browning and Browning, 2016, # 55674}.
Association analysis was performed using genotypes pseudo-estimated by genome imputation. The minor alleles were assumed to have a tendency pattern, and the presence or absence of association was evaluated by logistic regression analysis. The software used PLINK2 v1.90p and was evaluated as a significance level of 5 × 10 -8 .
９．機能解析(In Silico)
HaploReg 4.1{Ward and Kellis、2012、#42668}を用いて多型のアノテーション付けを行った。これは、転写因子結合部位（TFBS）についての制御系アノテーション、DNase高感受性部位（DHS）、DNAメチル化、進化的な保存度のスコア（GERP）、遺伝子オーバーラップ、及びeQTL アノテーションを含むものであった。
9. Functional analysis (In Silico)
Polymorphic annotation was performed using HaploReg 4.1 {Ward and Kellis, 2012, # 42668}. This includes regulatory annotations for transcription factor binding sites (TFBS), DNase hypersensitive sites (DHS), DNA methylation, evolutionary conservation score (GERP), gene overlap, and eQTL annotations. there were.
１０．結果
上記１．〜９．の解析の結果、ヒトの汗のかきやすさを判定するために有用な遺伝子多型として、米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデータベースに登録されている表１〜４に示される一塩基多型を特定した。また、表５に示される挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型を特定した。そして、これらの遺伝子多型を含む遺伝子、又は該遺伝子の近傍の遺伝子としてPLB1遺伝子、PPP1CB遺伝子、SPDYA遺伝子、LONP2遺伝子、及びABCC11遺伝子を見出した。
10. Result 1 above. ~ 9. As a result of analysis of the result, single nucleotide polymorphisms shown in Tables 1 to 4 registered in the US Biotechnology Information Center (NCBI) SNP database are listed as useful polymorphisms for determining the ease of human sweatness. Identified. In addition, insertion polymorphisms, deletion polymorphisms or base repeat polymorphisms shown in Table 5 were identified. Then, PLB1 gene, PPP1 CB gene, SPDYA gene, LONP2 gene, and ABCC11 gene were found as genes including these gene polymorphisms or genes in the vicinity of the gene.
表１〜４に示される一塩基多型及び表５に示される挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型において、ターゲットアレルを含む遺伝型ほど“汗をかきやすい”と判定され得た。即ち、一塩基多型であれば次の１）〜１３０）に示される遺伝型である場合に“汗をかきやすい”と判定され得た。また、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型であれば次の１）〜２５）に示される遺伝型である場合に“汗をかきやすい”と判定され得た。さらにPLB1遺伝子、PPP1CB遺伝子、SPDYA遺伝子、LONP2遺伝子、又はABCC11遺伝子は汗のかきやすさに関連し得る遺伝子と推定された。 In single nucleotide polymorphisms shown in Tables 1 to 4 and insertion type polymorphisms, deletion type polymorphisms, or base repeat polymorphisms shown in Table 5, it is determined that the genotype that includes the target allele is "prone to sweat" It was done. That is, if it is the genotype shown by following 1)-130) if it is a single nucleotide polymorphism, it could be judged as "it is easy to sweat". In addition, in the case of insertion polymorphisms, deletion polymorphisms, or base repeat polymorphisms, if it is a genotype shown in the following 1) to 25), it could be judged as "prone to sweat". Furthermore, the PLB1 gene, the PPP1 CB gene, the SPDYA gene, the LONP2 gene, or the ABCC11 gene was presumed to be a gene that can be related to sweatiness.
＜一塩基多型＞
１）rs56089836のアレルGを保有する遺伝型、２）rs55720575のアレルCを保有する遺伝型、３）rs57183123のアレルGを保有する遺伝型、４）rs899153のアレルGを保有する遺伝型、５）rs4666113のアレルAを保有する遺伝型、６）rs10192375のアレルGを保有する遺伝型、７）rs6726829のアレルCを保有する遺伝型、８）rs7594379のアレルGを保有する遺伝型、９）rs6727225のアレルGを保有する遺伝型、１０）rs55772556のアレルTを保有する遺伝型、１１）rs7586405のアレルAを保有する遺伝型、１２）rs11690065のアレルAを保有する遺伝型、１３）rs56206649のアレルAを保有する遺伝型、１４）rs1569131のアレルTを保有する遺伝型、１５）rs2049691のアレルGを保有する遺伝型、１６）rs56240884のアレルTを保有する遺伝型、１７）rs2293553のアレルTを保有する遺伝型、１８）rs17007191のアレルTを保有する遺伝型、１９）rs55721532のアレルGを保有する遺伝型、２０）rs4408686のアレルCを保有する遺伝型、２１）rs72782280のアレルTを保有する遺伝型、２２）rs55877710のアレルTを保有する遺伝型、２３）rs55883854のアレルTを保有する遺伝型、２４）rs34627117のアレルGを保有する遺伝型、２５）rs11675572のアレルTを保有する遺伝型、２６）rs61275598のアレルAを保有する遺伝型、２７）rs12714240のアレルGを保有する遺伝型、２８）rs11683296のアレルGを保有する遺伝型、２９）rs745645のアレルTを保有する遺伝型、３０）rs4665431のアレルCを保有する遺伝型、３１）rs112403637のアレルGを保有する遺伝型、３２）rs55836936のアレルCを保有する遺伝型、３３）rs11686491のアレルTを保有する遺伝型、３４）rs4531886のアレルCを保有する遺伝型、３５）rs62129826のアレルTを保有する遺伝型、３６）rs10865506のアレルCを保有する遺伝型、３７）rs10865505のアレルAを保有する遺伝型、３８）rs2045884のアレルCを保有する遺伝型、３９）rs4372836のアレルTを保有する遺伝型、４０）rs7598876のアレルTを保有する遺伝型、４１）rs2169748のアレルAを保有する遺伝型、４２）rs7562170のアレルCを保有する遺伝型、４３）rs11677127のアレルCを保有する遺伝型、４４）rs55835850のアレルCを保有する遺伝型、４５）rs111534567のアレルGを保有する遺伝型、４６）rs11690423のアレルCを保有する遺伝型、４７）rs4665432のアレルAを保有する遺伝型、４８）rs11688129のアレルCを保有する遺伝型、４９）rs72782294のアレルGを保有する遺伝型、５０）rs6710959のアレルCを保有する遺伝型、５１）rs4580350のアレルTを保有する遺伝型、５２）rs4640348のアレルTを保有する遺伝型、５３）rs2169751のアレルGを保有する遺伝型、５４）rs7589860のアレルAを保有する遺伝型、５５）rs7607844のアレルTを保有する遺伝型、５６）rs4549034のアレルCを保有する遺伝型、５７）rs34409160のアレルTを保有する遺伝型、５８）rs11127180のアレルCを保有する遺伝型、５９）rs2276547のアレルGを保有する遺伝型、６０）rs4666119のアレルCを保有する遺伝型、６１）rs4666118のアレルGを保有する遺伝型、６２）rs10180266のアレルAを保有する遺伝型、６３）rs7580078のアレルGを保有する遺伝型、６４）rs6728459のアレルAを保有する遺伝型、６５）rs11127188のアレルGを保有する遺伝型、６６）rs62129808のアレルGを保有する遺伝型、６７）rs6707848のアレルTを保有する遺伝型、６８）rs7579277のアレルGを保有する遺伝型、６９）rs11674854のアレルCを保有する遺伝型、７０）rs9309664のアレルGを保有する遺伝型、７１）rs4233727のアレルTを保有する遺伝型、７２）rs6547872のアレルCを保有する遺伝型、７３）rs6707130のアレルAを保有する遺伝型、７４）rs12614723のアレルCを保有する遺伝型、７５）rs4233728のアレルAを保有する遺伝型、７６）rs2061757のアレルAを保有する遺伝型、７７）rs56287488のアレルAを保有する遺伝型、７８）rs6547870のアレルGを保有する遺伝型、７９）rs55902327のアレルAを保有する遺伝型、８０）rs58717377のアレルAを保有する遺伝型、８１）rs56390569のアレルGを保有する遺伝型、８２）rs35244334のアレルCを保有する遺伝型、８３）rs7594363のアレルCを保有する遺伝型、８４）rs11127187のアレルGを保有する遺伝型、８５）rs4666114のアレルGを保有する遺伝型、８６）rs7565187のアレルCを保有する遺伝型、８７）rs6547867のアレルCを保有する遺伝型、８８）rs4666115のアレルTを保有する遺伝型、８９）rs11682523のアレルTを保有する遺伝型、９０）rs4643492のアレルTを保有する遺伝型、９１）rs13028787のアレルCを保有する遺伝型、９２）rs899154のアレルAを保有する遺伝型、９３）rs12476553のアレルTを保有する遺伝型、９４）rs13025377のアレルGを保有する遺伝型、９５）rs13394863のアレルCを保有する遺伝型、９６）rs6547875のアレルGを保有する遺伝型、９７）rs10178852のアレルCを保有する遺伝型、９８）rs1534480のアレルTを保有する遺伝型、９９）rs6547862のアレルGを保有する遺伝型、１００）rs6704973のアレルGを保有する遺伝型、１０１）rs1881255のアレルGを保有する遺伝型、１０２）rs6547863のアレルAを保有する遺伝型、１０３）rs11127181のアレルCを保有する遺伝型、１０４）rs1534481のアレルCを保有する遺伝型、１０５）rs7604903のアレルAを保有する遺伝型、１０６）rs11679568のアレルAを保有する遺伝型、１０７）rs1881256のアレルGを保有する遺伝型、１０８）rs1534477のアレルCを保有する遺伝型、１０９）rs1997270のアレルGを保有する遺伝型、１１０）rs6760822のアレルGを保有する遺伝型、１１１）rs7601771のアレルCを保有する遺伝型、１１２）rs1534479のアレルGを保有する遺伝型、１１３）rs2338546のアレルGを保有する遺伝型、１１４）rs11127178のアレルTを保有する遺伝型、１１５）rs11891377のアレルGを保有する遺伝型、１１６）rs4666107のアレルGを保有する遺伝型、１１７）rs4666108のアレルCを保有する遺伝型、１１８）rs7557359のアレルCを保有する遺伝型、１１９）rs55815151のアレルCを保有する遺伝型、１２０）rs1534476のアレルGを保有する遺伝型、１２１）rs13003761のアレルGを保有する遺伝型、１２２）rs6500380のアレルGを保有する遺伝型、１２３）rs1982782のアレルGを保有する遺伝型、１２４）rs8052293のアレルGを保有する遺伝型、１２５）rs17822931のアレルCを保有する遺伝型、１２６）rs111915588のアレルGを保有する遺伝型、１２７）rs56017929のアレルTを保有する遺伝型、１２８）rs113311037のアレルCを保有する遺伝型、１２９)rs7185374のアレルCを保有する遺伝型、１３０)rs12446160のアレルGを保有する遺伝型
<Single nucleotide polymorphism>
1) a genotype which carries allele G of rs56089836, 2) a genotype which carries allele C of rs55720575, a genotype which carries allele G of rs57183123, a genotype which carries allele G of rs899153, 5) The genotype that carries allele A of rs4666113 6) The genotype that carries allele G of rs10192375 7 The genotype that carries allele C of rs6726829 8) The genotype that carries allele G of rs7594379 9) rs6727225 A genotype carrying allele G, 10) A genotype carrying allele T of rs55772556, 11) A genotype carrying allele A of rs7586405, 12) a genotype carrying allele A of rs11690065, 13) allele A of rs56206649 14) rs1569131 allele T: 15 genotype rs 2049691 allele G: 16) rs 56240 884 allele T possessing genotype 17) rs 229355 allele T Genotype, 18) rs17007191 allele T 19) A genotype that carries allele G of rs55721532 20) A genotype that carries allele C of rs4408686 21) A genotype that carries allele T of rs72782280 22 that r alleles of rs55877710 Genotype 23) Genotype carrying allele T of rs55883854 24) Genotype carrying allele G of rs34627117 25) Genotype carrying allele T of rs11675572 26) Genotype carrying allele A of rs61275598 27) a genotype carrying allele G of rs12714240 28) a genotype carrying allele G of rs11683296 29) a genotype carrying allele T of rs745645 30) a genotype carrying allele C of rs4665431 31 G) genotype carrying allele G of rs112403637 genotyping carrying allele C of rs55836936 g) genotype carrying allele T of rs11686491 34 g) genotype carrying allele C of rs4531886 35) rs62129826 Allele T of 36) rs10865506 allele C-bearing genotype 37) rs10865505 allele A-bearing genotype 38) rs 2045884 allele C-bearing genotype C) 39 rs4372836 allele T Genotype 40. Genotype carrying allele T of rs7598876 41. Genotype carrying allele A of rs2169748 42. Genotype carrying allele C of rs7562170 43. Genotype carrying allele C of rs11677127. 44) a genotype that carries allele C of rs55835850, a genotype that carries allele G of rs111534567, a genotype that carries allele C of rs11690423, a genotype that carries allele A of rs4665432, 48) 51) A genotype carrying allele C of rs11688129 49 A genotype carrying allele G of rs72782294 50) A genotype carrying allele C of rs6710959 51 A genotype carrying allele T of rs4580350 52) rs4640348 Maintain the allele T of 53) rs2169751 allele G, 54) rs7589860 allele A, 55) rs7607844 allele T, 56) rs4549034 allele C Type, 57) a genotype that carries allele T of rs34409160, a genotype that carries allele C of rs11127180, a genotype that carries allele G of 59 rs2276547, a genotype that carries allele C of 60) rs4666119, 61) genotype carrying allele G of rs4666118 62) genotype carrying allele A of rs10180266 63) genotype carrying allele G of rs75080078 64) genotype carrying allele A of rs6728459 65) Genotype carrying the allele G of rs11127188, genotype having the allele G of rs62129808, genotype having the allele T of rs6707848, genotype of the gene carrying allele G of rs7579277, 69) rs11674854 Possess allele C Genotype 70. Genotype carrying allele G of rs9309664 71) Genotype carrying allele T of rs4233 72. Genotype carrying allele C of rs6547872 73. Genotype carrying allele A of rs 6707130. 74) a genotype that carries allele C of rs12614723, a genotype that carries allele A of rs4233728, a genotype that carries allele A of rs2061757, a genotype that carries allele A of rs56287488, 78 G.) Rs6547870 genotype G carrying allele G, genotyping gene carrying rs 55902327 allele A 80 g) genotyping carrying rs 587 1 377 allele A, 81) genotype g carrying allele G of rs 563 905 69, 82) rs 35 244 334 Genotypes carrying allele C, 83) genotypes carrying allele C of rs7594363, genotypes carrying allele G of rs11127187, 85 genotypes carrying allele G of rs4666114, allele of 86) rs7565187 Genetics that hold C 87) a genotype that carries allele C of rs6547867 88 a genotype that carries allele T of rs4666115 89 a genotype that carries allele T of rs11682523 90) a genotype that carries allele T of rs4643492 91 92) a genotype carrying allele A of rs 899 154 93) a genotype carrying allele T of rs 12476 553 a genotype carrying allele G of rs 130 25 377 95) rs13394863 Genotype carrying allele C, Genotype carrying allele G of rs6547875, Genotype carrying allele C of rs10178852, Genotype carrying allele T of rs1534480, and allele of 99) rs654782 G-bearing genotype, 100) rs6704973 allele G-bearing genotype, 101) rs1881255 allele G-bearing genotype, 102) rs6547863 allele A-bearing genotype, 103) rs11127181 allele C Remains owned Type, 104) a genotype having an allele C of rs1534481, a genotype having an allele A of 105 rs7604903, a genotype having an allele A of 106) rs11679568, a genotype having an allele G of 107) rs1881256, 108) A genotype carrying the allele C of rs 1534477, a genotype carrying the allele G of rs 1997 270, 110 a genotype carrying the allele G of rs 6760822, a genotype carrying the allele C of rs 7601771, 112) The genotype that carries the allele G of rs1534479, the genotype that carries the allele G of the rs2338546, the genotype that carries the allele T of the rs11127178, the genotype that carries the allele G of the rs11891377, the 116) rs4666107 A genotype carrying the allele G, 117) A genotype carrying the allele C of the rs 4666108, a genotype carrying the allele C of the rs 75 57 359, a genotype carrying the allele C of the rs 55 15 151, 120) genotype that carries allele G of rs1534476, genotype that carries allele G of rs13003761, genotype that carries allele G of rs6500380, genotype that carries allele G of rs1982782, 124) rs8052293 A genotype carrying the allele G, a genotype carrying the allele C of the rs17822931, a genotype carrying the allele G of the rs111915588, a genotype carrying the allele T of the rs56017929, an allele C of the rs113311037 Genotype carrying 129, rs7185374 allele C, genotype 130) carrying rs 12446 160 allele G
＜挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型＞
１）rs531181250のアレルCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTを保有する遺伝型、２）rs5830086のアレルTを保有する遺伝型、３）rs200048571のアレルTAを保有する遺伝型、４）rs11362755のアレルAを保有する遺伝型、５）rs146417285のアレルAを保有する遺伝型、６）rs11317076のアレルTを保有する遺伝型、７）rs142578101のアレルTGを保有する遺伝型、８）rs57501094のアレルCAGCTCACTGCAGCTTCAACCTCCCTGGを保有する遺伝型、９）rs60484735のアレルTGを保有する遺伝型、１０）rs532869892のアレルTAを保有する遺伝型、１１）rs72356556のアレルGTを保有する遺伝型、１２）rs546848712のアレルACを保有する遺伝型、１３）rs150122362のアレルCTを保有する遺伝型、１４）rs34388621のアレルAGを保有する遺伝型、１５）rs61013289のアレルCを保有する遺伝型、１６）rs546378722のアレルCを保有する遺伝型、１７）rs11333986のアレルCTを保有する遺伝型、１８）rs36004805のアレルCAを保有する遺伝型、１９）rs4665434のアレルAを保有する遺伝型、２０）rs11410668のアレルTを保有する遺伝型、２１）rs34677847のアレルAを保有する遺伝型、２２）rs72245314のアレルATを保有する遺伝型、２３）rs35685583のアレルAGを保有する遺伝型、２４）rs34443149のアレルAを保有する遺伝型、２５）rs34852150のアレルATを保有する遺伝型
<Insertion polymorphism, deletion polymorphism, or base repeat polymorphism>
1) a genotype carrying the allele CTTTTTTTTTTTTTTTTTT of rs531181250 2) a genotype carrying the allele T of rs5830086 3 a genotype carrying the allele TA of rs2000048571 4 a genotype carrying the allele A of rs11362755 5) rs146417285 genotype A possessing allele A, 6) genotype b possessing allele T of rs11317076, 7) genotype having allele TG of rs142578101, 8) genotype having allele CAGCTCACTGCAGCTTCAACCTCCTCTGG of rs57501094, 9) rs60484735 Genotype carrying allele TG 10) Genotype carrying allele TA of rs 532869892 11) Genotype carrying allele GT of rs 72356556 12) Genotype carrying allele AC of rs 5468488 12 13) allele CT of rs 150 122 362 14) r rs 34388 621 alleles AG genotypes 15) rs 610 13 289 alleles C genotypes 16) rs 54637 8722 alleles C genotypes 17) rs 113 33 9 86 Genotype carrying allele CT, 18) Genotype carrying allele CA of rs36004805, 19) Genotype carrying allele A of rs 4665434, 20) genotype carrying allele T of rs11410668, 21) allele of rs34677847 22) rs72245314 allele AT, 23) rs35685583 allele AG, 24) rs34443149 allele A, 25) rs34852150 allele AT Genetic type
本発明の方法により、対象となるヒトそれぞれの汗のかきやすさを網羅的に把握することができる。また、判定用ポリヌクレオチドや判定用キットの使用により、汗のかきやすさを簡便に把握することも可能となる。
さらに、本発明により汗のかきやすさに関連する遺伝子の発現等を制御することで汗の
かきやすさの改善のための組成物を提供することも可能となる。
According to the method of the present invention, it is possible to comprehensively grasp the sweatiness of each target human being. In addition, the use of the determination polynucleotide or the determination kit makes it possible to easily grasp the ease of sweating.
Furthermore, according to the present invention, it is also possible to provide a composition for improvement in sweatiness by controlling expression of a gene related to sweatiness.
Claims (8)
を判定する方法であって、検出の対象となる一塩基多型がrs56089836、rs55720575、rs57183123、rs899153、rs4666113、rs10192375、rs6726829、rs7594379、rs6727225、rs55772556、rs7586405、rs11690065、rs56206649、rs1569131、rs2049691、rs56240884、rs2293553、rs17007191、rs55721532、rs4408686、rs72782280、rs55877710、rs55883854、rs34627117、rs11675572、rs61275598、rs12714240、rs11683296、rs745645、rs4665431、rs112403637、rs55836936、rs11686491、rs4531886、rs62129826、rs10865506、rs10865505、rs2045884、rs4372836、rs7598876、rs2169748、rs7562170、rs11677127、rs55835850、rs111534567、rs11690423、rs4665432、rs11688129、rs72782294、rs6710959、rs4580350、rs4640348、rs2169751、rs7589860、rs7607844、rs4549034、rs34409160、rs11127180、rs2276547、rs4666119、rs4666118、rs10180266、rs7580078、rs6728459、rs11127188、rs62129808、rs6707848、rs7579277、rs11674854、rs9309664、rs4233727、rs6547872、rs6707130、rs12614723、rs4233728、rs2061757、rs56287488、rs6547870、rs55902327、rs58717377、rs56390569、rs35244334、rs7594363、rs11127187、rs4666114、rs7565187、rs6547867、rs4666115、rs11682523、rs4643492、rs13028787、rs899154、rs12476553、rs13025377、rs13394863、rs6547875、rs10178852、rs1534480、rs6547862、rs6704973、rs1881255、rs6547863、rs11127181、rs1534481、rs7604903、rs11679568、rs1881256、rs1534477、rs1997270、rs6760822、rs7601771、rs1534479、rs2338546、rs11127178、rs11891377、rs4666107、rs4666108、rs7557359、rs55815151、rs1534476、rs13003761、rs6500380、rs1982782、rs8052293、rs17822931、rs111915588、rs56017929、rs113311037、rs7185374、及びrs12446160からなる群から選択される１以上の一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型である、請求項１に記載の方法。 A method for determining the sweatiness of a subject, comprising the step of detecting a genotype in a DNA-containing sample derived from the subject, wherein the single nucleotide polymorphism to be detected is rs56089836, rs55720575, rs57183123, rs899153, rs4666113, rs10192375. , Rs6726829, rs7594379, rs6772225, rs55772556, rs7569405, rs11690065, rs56206649, rs1569131, rs2049691, rs56240884, rs2729553, rs17007191, rs5722008, rss57182280, rs55883854, rs54681714sll747s ,,,,,,,,,,,,,,,, Or , Rs34409160, rs11127180, rs2276547, rs4666119, rs4666118, rs10180266, rs750078, rs6728459, rs11 127,188, rs62129808, rs6707848, rs7516,277, rs11674854, rs9309664, rs4236727, rs6547272, rs6707130, rs42314728, rs4231725, rs20641757, rs55472870, rs5517870, rs541790569, rs352443347147s rs4643492, rs13028787, rs899454, rs12365553, rs13035763, rs15347863, rs5147875, rs15178452, rs1534480, rs654972, rs181255, rs15127481, rs11524941, rs1760754, rs11679 568s, 717s one or more single nucleotide polymorphisms selected from the group consisting of rs11891377, rs4666107, rs4576108, rs55815151, rs1534476, rs13003761, rs6500380, rs1982782, rs8052293, rs11722931, rs111925588, rs56017929, rs113311037, rs7185374, and rs12446160; The method according to claim 1, wherein the single nucleotide polymorphism is in a linkage disequilibrium with the single nucleotide polymorphism.
rs55720575のアレルCを保有する遺伝型、
rs57183123のアレルGを保有する遺伝型、
rs899153のアレルGを保有する遺伝型、
rs4666113のアレルAを保有する遺伝型、
rs10192375のアレルGを保有する遺伝型、
rs6726829のアレルCを保有する遺伝型、
rs7594379のアレルGを保有する遺伝型、
rs6727225のアレルGを保有する遺伝型、
rs55772556のアレルTを保有する遺伝型、
rs7586405のアレルAを保有する遺伝型、
rs11690065のアレルAを保有する遺伝型、
rs56206649のアレルAを保有する遺伝型、
rs1569131のアレルTを保有する遺伝型、
rs2049691のアレルGを保有する遺伝型、
rs56240884のアレルTを保有する遺伝型、
rs2293553のアレルTを保有する遺伝型、
rs17007191のアレルTを保有する遺伝型、
rs55721532のアレルGを保有する遺伝型、
rs4408686のアレルCを保有する遺伝型、
rs72782280のアレルTを保有する遺伝型、
rs55877710のアレルTを保有する遺伝型、
rs55883854のアレルTを保有する遺伝型、
rs34627117のアレルGを保有する遺伝型、
rs11675572のアレルTを保有する遺伝型、
rs61275598のアレルAを保有する遺伝型、
rs12714240のアレルGを保有する遺伝型、
rs11683296のアレルGを保有する遺伝型、
rs745645のアレルTを保有する遺伝型、
rs4665431のアレルCを保有する遺伝型、
rs112403637のアレルGを保有する遺伝型、
rs55836936のアレルCを保有する遺伝型、
rs11686491のアレルTを保有する遺伝型、
rs4531886のアレルCを保有する遺伝型、
rs62129826のアレルTを保有する遺伝型、
rs10865506のアレルCを保有する遺伝型、
rs10865505のアレルAを保有する遺伝型、
rs2045884のアレルCを保有する遺伝型、
rs4372836のアレルTを保有する遺伝型、
rs7598876のアレルTを保有する遺伝型、
rs2169748のアレルAを保有する遺伝型、
rs7562170のアレルCを保有する遺伝型、
rs11677127のアレルCを保有する遺伝型、
rs55835850のアレルCを保有する遺伝型、
rs111534567のアレルGを保有する遺伝型、
rs11690423のアレルCを保有する遺伝型、
rs4665432のアレルAを保有する遺伝型、
rs11688129のアレルCを保有する遺伝型、
rs72782294のアレルGを保有する遺伝型、
rs6710959のアレルCを保有する遺伝型、
rs4580350のアレルTを保有する遺伝型、
rs4640348のアレルTを保有する遺伝型、
rs2169751のアレルGを保有する遺伝型、
rs7589860のアレルAを保有する遺伝型、
rs7607844のアレルTを保有する遺伝型、
rs4549034のアレルCを保有する遺伝型、
rs34409160のアレルTを保有する遺伝型、
rs11127180のアレルCを保有する遺伝型、
rs2276547のアレルGを保有する遺伝型、
rs4666119のアレルCを保有する遺伝型、
rs4666118のアレルGを保有する遺伝型、
rs10180266のアレルAを保有する遺伝型、
rs7580078のアレルGを保有する遺伝型、
rs6728459のアレルAを保有する遺伝型、
rs11127188のアレルGを保有する遺伝型、
rs62129808のアレルGを保有する遺伝型、
rs6707848のアレルTを保有する遺伝型、
rs7579277のアレルGを保有する遺伝型、
rs11674854のアレルCを保有する遺伝型、
rs9309664のアレルGを保有する遺伝型、
rs4233727のアレルTを保有する遺伝型、
rs6547872のアレルCを保有する遺伝型、
rs6707130のアレルAを保有する遺伝型、
rs12614723のアレルCを保有する遺伝型、
rs4233728のアレルAを保有する遺伝型、
rs2061757のアレルAを保有する遺伝型、
rs56287488のアレルAを保有する遺伝型、
rs6547870のアレルGを保有する遺伝型、
rs55902327のアレルAを保有する遺伝型、
rs58717377のアレルAを保有する遺伝型、
rs56390569のアレルGを保有する遺伝型、
rs35244334のアレルCを保有する遺伝型、
rs7594363のアレルCを保有する遺伝型、
rs11127187のアレルGを保有する遺伝型、
rs4666114のアレルGを保有する遺伝型、
rs7565187のアレルCを保有する遺伝型、
rs6547867のアレルCを保有する遺伝型、
rs4666115のアレルTを保有する遺伝型、
rs11682523のアレルTを保有する遺伝型、
rs4643492のアレルTを保有する遺伝型、
rs13028787のアレルCを保有する遺伝型、
rs899154のアレルAを保有する遺伝型、
rs12476553のアレルTを保有する遺伝型、
rs13025377のアレルGを保有する遺伝型、
rs13394863のアレルCを保有する遺伝型、
rs6547875のアレルGを保有する遺伝型、
rs10178852のアレルCを保有する遺伝型、
rs1534480のアレルTを保有する遺伝型、
rs6547862のアレルGを保有する遺伝型、
rs6704973のアレルGを保有する遺伝型、
rs1881255のアレルGを保有する遺伝型、
rs6547863のアレルAを保有する遺伝型、
rs11127181のアレルCを保有する遺伝型、
rs1534481のアレルCを保有する遺伝型、
rs7604903のアレルAを保有する遺伝型、
rs11679568のアレルAを保有する遺伝型、
rs1881256のアレルGを保有する遺伝型、
rs1534477のアレルCを保有する遺伝型、
rs1997270のアレルGを保有する遺伝型、
rs6760822のアレルGを保有する遺伝型、
rs7601771のアレルCを保有する遺伝型、
rs1534479のアレルGを保有する遺伝型、
rs2338546のアレルGを保有する遺伝型、
rs11127178のアレルTを保有する遺伝型、
rs11891377のアレルGを保有する遺伝型、
rs4666107のアレルGを保有する遺伝型、
rs4666108のアレルCを保有する遺伝型、
rs7557359のアレルCを保有する遺伝型、
rs55815151のアレルCを保有する遺伝型、
rs1534476のアレルGを保有する遺伝型、
rs13003761のアレルGを保有する遺伝型、
rs6500380のアレルGを保有する遺伝型、
rs1982782のアレルGを保有する遺伝型、
rs8052293のアレルGを保有する遺伝型、
rs17822931のアレルCを保有する遺伝型、
rs111915588のアレルGを保有する遺伝型、
rs56017929のアレルTを保有する遺伝型、
rs113311037のアレルCを保有する遺伝型、
rs7185374のアレルCを保有する遺伝型、
又はrs12446160のアレルGを保有する遺伝型のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者は汗をかきやすいと判定する工程を含む、請求項２に記載の方法。 Genotype carrying allele G of rs56089836,
Genotype carrying allele C of rs55720575,
Genotype carrying allele G of rs57183123,
Genotype carrying allele G of rs 899 153,
Genotype carrying allele A of rs4666113,
Genotype carrying allele G of rs10192375,
Genotype carrying allele C of rs6726829,
Genotype carrying allele G of rs7594379,
Genotype carrying allele G of rs6727225,
Genotype carrying allele T of rs55772556,
Genotype carrying allele A of rs7586405,
genotype carrying allele A of rs11690065,
Genotype carrying allele A of rs56206649,
Genotype carrying allele T of rs1569131,
Genotype carrying allele G of rs 2049691,
Genotype carrying allele T of rs56240884,
Genotype carrying allele T of rs2293553
Genotype carrying allele T of rs17007191,
Genotype carrying allele G of rs55721532,
Genotype carrying allele C of rs4408686,
Genotype carrying allele T of rs72782280,
Genotype carrying allele T of rs55877710,
Genotype carrying allele T of rs55883854,
Genotype carrying allele G of rs34627117,
Genotype carrying allele T of rs11675572,
Genotype carrying allele A of rs61275598,
Genotype carrying allele G of rs12714240,
Genotype carrying allele G of rs11683296,
Genotype carrying allele T of rs745645,
Genotype carrying allele C of rs4665431,
Genotype carrying allele G of rs112403637,
A genotype that carries allele C of rs55836936,
Genotype carrying allele T of rs11686491,
Genotype carrying allele C of rs4531886,
Genotype carrying allele T of rs62129826,
Genotype carrying allele C of rs10865506,
Genotype carrying allele A of rs10865505,
Genotype carrying allele C of rs2045884,
Genotype carrying allele T of rs4372836,
Genotype carrying allele T of rs7598876,
Genotype carrying allele A of rs2169748,
Genotype carrying allele C of rs7562170,
Genotype carrying allele C of rs11677127,
Genotype carrying allele C of rs55835850,
Genotype carrying allele G of rs111534567,
Genotype carrying allele C of rs11690423,
Genotype carrying allele A of rs4665432,
Genotype carrying allele C of rs11688129,
Genotype carrying allele G of rs72782294,
Genotype carrying allele C of rs6710959,
Genotype carrying allele T of rs4580350,
Genotype carrying allele T of rs4640348,
Genotype carrying allele G of rs2169751,
Genotype carrying allele A of rs7589860,
Genotype carrying allele T of rs7607844,
Genotype carrying allele C of rs4549034,
Genotype carrying allele T of rs34409160,
Genotype carrying allele C of rs11127180,
Genotype carrying allele G of rs2276547,
Genotype carrying allele C of rs4666119,
Genotype carrying allele G of rs4666118,
Genotype carrying allele A of rs10180266,
Genotype carrying allele G of rs7580078,
Genotype carrying allele A of rs6728459,
Genotype carrying allele G of rs11127188,
Genotype carrying allele G of rs62129808,
Genotype carrying allele T of rs6707848,
Genotype carrying allele G of rs7579277,
Genotype carrying allele C of rs11674854,
Genotype carrying allele G of rs9309664,
Genotype carrying allele T of rs4233727,
Genotype carrying allele C of rs6547872,
Genotype carrying allele A of rs6707130,
Genotype carrying allele C of rs12614723,
Genotype carrying allele A of rs4233728,
genotype carrying allele A of rs 2061757,
Genotype carrying allele A of rs56287488,
Genotype carrying allele G of rs6547870,
Genotype carrying allele A of rs 55902327,
Genotype carrying allele A of rs58717377,
Genotype carrying allele G of rs56390569,
Genotype carrying allele C of rs35244334,
Genotype carrying allele C of rs7594363,
Genotype carrying allele G of rs11127187,
Genotype carrying allele G of rs4666114,
Genotype carrying allele C of rs7565187,
Genotype carrying allele C of rs6547867,
Genotype carrying allele T of rs4666115,
Genotype carrying allele T of rs11682523,
Genotype carrying allele T of rs4643492,
Genotype carrying allele C of rs13028787,
Genotype carrying allele A of rs 899 154,
Genotype carrying allele T of rs12476553,
Genotype carrying allele G of rs13025377,
Genotype carrying allele C of rs13394863,
Genotype carrying allele G of rs6547875,
Genotype carrying allele C of rs10178852,
Genotype carrying allele T of rs1534480,
Genotype carrying allele G of rs6547862,
Genotype carrying allele G of rs6704973
Genotype carrying allele G of rs1881255,
Genotype carrying allele A of rs6547863,
Genotype carrying allele C of rs11127181,
Genotype carrying allele C of rs1534481,
Genotype carrying allele A of rs7604903,
Genotype carrying allele A of rs11679568,
Genotype carrying allele G of rs1881256,
Genotype carrying allele C of rs1534477,
Genotype carrying allele G of rs1997270,
Genotype carrying allele G of rs6760822,
genotype carrying allele C of rs 7601771;
Genotype carrying allele G of rs1534479,
Genotype carrying allele G of rs2338546,
Genotype carrying allele T of rs11127178,
Genotype carrying allele G of rs11891377,
Genotype carrying allele G of rs4666107,
Genotype carrying allele C of rs4666108,
Genotype carrying allele C of rs7557359,
Genotype carrying allele C of rs55815151,
Genotype carrying allele G of rs1534476,
genotype carrying allele G of rs13003761,
Genotype carrying allele G of rs6500380,
Genotype carrying allele G of rs1982782,
Genotype carrying allele G of rs8052293,
Genotype carrying allele C of rs17822931,
Genotype carrying allele G of rs111915588,
Genotype carrying allele T of rs56017929,
genotype carrying allele C of rs113311037,
genotype carrying allele C of rs7185374;
The method according to claim 2, further comprising the step of determining that a subject who exhibits any one or more genotypes of the genotype that carries allele G of rs12446160 is likely to sweat.
rs5830086のアレルTを保有する遺伝型、
rs200048571のアレルTAを保有する遺伝型、
rs11362755のアレルAを保有する遺伝型、
rs146417285のアレルAを保有する遺伝型、
rs11317076のアレルTを保有する遺伝型、
rs142578101のアレルTGを保有する遺伝型、
rs57501094のアレルCAGCTCACTGCAGCTTCAACCTCCCTGGを保有する遺伝型、
rs60484735のアレルTGを保有する遺伝型、
rs532869892のアレルTAを保有する遺伝型、
rs72356556のアレルGTを保有する遺伝型、
rs546848712のアレルACを保有する遺伝型、
rs150122362のアレルCTを保有する遺伝型、
rs34388621のアレルAGを保有する遺伝型、
rs61013289のアレルCを保有する遺伝型、
rs546378722のアレルCを保有する遺伝型、
rs11333986のアレルCTを保有する遺伝型、
rs36004805のアレルCAを保有する遺伝型、
rs4665434のアレルAを保有する遺伝型、
rs11410668のアレルTを保有する遺伝型、
rs34677847のアレルAを保有する遺伝型、
rs72245314のアレルATを保有する遺伝型、
rs35685583のアレルAGを保有する遺伝型、
rs34443149のアレルAを保有する遺伝型、
又はrs34852150のアレルATを保有する遺伝型のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者は、汗をかきやすいと判定する工程を含む、請求項４に記載の方法。 Genotype carrying the allele CTTTTTTTTTTTTTTTTTT of rs531181250,
Genotype carrying allele T of rs5830086,
Genotype carrying allele TA of rs200048571,
Genotype carrying allele A of rs11362755,
Genotype carrying allele A of rs146417285,
Genotype carrying allele T of rs11317076,
Genotype carrying allele TG of rs142578101,
A genotype carrying the rs57501094 allele CAGCTCACTGCAGCTTCAACCTCCCTGG,
Genotype carrying allele TG of rs60484735,
Genotype which carries allele TA of rs532869892,
Genotype carrying the allelic GT of rs72356556,
Genotype carrying rs546848712 allele AC,
Genotype carrying allele CT of rs150122362,
Genotype carrying allele AG of rs 34388621,
Genotype carrying allele C of rs61013289,
Genotype carrying allele C of rs546378722,
Genotype carrying allele CT of rs11333986,
Genotype carrying the allele CA of rs36004805,
Genotype carrying allele A of rs4665434,
Genotype carrying allele T of rs11410668,
Genotype carrying allele A of rs34677847,
Genotype carrying allele AT of rs72245314,
Genotype which carries allele AG of rs35685583,
Genotype carrying allele A of rs34443149,
5. The method according to claim 4, further comprising the step of determining that a subject who exhibits any one or more genotypes of the genotype that carries the allele AT of rs34852150 is easy to sweat.
A composition for improving sweatiness which controls expression of PLB1 gene, PPP1 CB gene, SPDYA gene, LONP2 gene or ABCC11 gene or suppresses the action of the protein.
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| JP2017155362 | 2017-08-10 | ||
| JP2017155362 | 2017-08-10 |
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Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2020174813A1 (en) | 2019-02-27 | 2020-09-03 | 株式会社Ｊｖｃケンウッド | Recording/reproducing device, recording/reproducing method, and program |
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2018
- 2018-07-05 JP JP2018128010A patent/JP2019033740A/en active Pending
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