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JP2018528161A - Ksp阻害剤との部位特異的均一複合体 - Google Patents

Ksp阻害剤との部位特異的均一複合体 Download PDF

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JP2018528161A JP2017566401A JP2017566401A JP2018528161A JP 2018528161 A JP2018528161 A JP 2018528161A JP 2017566401 A JP2017566401 A JP 2017566401A JP 2017566401 A JP2017566401 A JP 2017566401A JP 2018528161 A JP2018528161 A JP 2018528161A
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レブストック,アンヌ−ソフィ
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テッベ,ヤン
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バイエル ファーマ アクチエンゲゼルシャフト
バイエル ファーマ アクチエンゲゼルシャフト
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Abstract

本発明は、キネシン紡錘体タンパク質阻害剤の部位特異的均一バインダー薬物複合体;これら複合体の活性代謝物;これら複合体の製造方法;疾患の治療および/または予防のためのこれら複合体の使用;ならびに疾患、特には過剰増殖性障害および/または血管新生障害、例えば癌疾患の治療および/または予防のための医薬製造のためのこれら複合体の使用に関するものである。そのような治療は、単独療法として、または他の医薬もしくは別の治療手段と組み合わせて行うことができる。【選択図】なし

Description

緒言および最新技術
本発明は、キネシンスピンドルタンパク質阻害剤の部位特異的均一結合体薬剤複合体、これら複合体の活性代謝物、これら複合体の製造方法、疾患の治療および/または予防のためのこれら複合体の使用、および疾患、特に過剰増殖性および/または血管新生障害、例えば癌疾患の治療および/または予防のための医薬を製造するためのこれら複合体の使用に関する。そのような治療は、単独療法として、または他の医薬もしくはさらなる治療手段と組み合わせて行うことができる。
癌疾患は、最も多様な組織の制御されない細胞増殖の結果である。多くの場合、新たな細胞が既存の組織に侵入し(浸潤性増殖)、またはそれらは離れた臓器に転移する。癌疾患は、最も多様な臓器で生じ、多くの場合、疾患の組織特異的経過を辿る。従って、一般名称として「癌」という用語は、各種臓器、組織および細胞型の所定の疾患の大きい群を説明するものである。
早期の腫瘍は、外科手段および放射線療法手段によって摘出することができる可能性がある。転移腫瘍は基本的に、化学療法によって対症的に治療可能なだけである。この場合の目的は、生活の質の向上および寿命延長の至適な組み合わせを達成することにある。
結合体タンパク質の1以上の活性化合物分子との複合体は、特に腫瘍関連抗原に向かうインターナライジング抗体がリンカーを介して細胞毒性薬に共有結合的に結合している抗体薬物複合体(ADC)の形態で知られている。腫瘍細胞へのADCの導入と次に複合体の解離に続いて、細胞毒性薬自体またはそれから形成される細胞毒性代謝物が腫瘍細胞内で放出され、直接および選択的にそれの作用を発揮することができる。このようにして、従来の化学療法と対照的に、正常組織への損傷は、かなり狭い範囲に抑えられる[例えば、J. M. Lambert, Curr. Opin. Pharmacol. , 543−549 (2005); A. M. Wu and P. D. Senter, Nat. Biotechnol. 23, 1137−1146 (2005); P. D. Senter, Curr. Opin. Chem. Biol. 13, 235−244 (2009); L. Ducry and B. Stump, Bioconjugate Chem. 21, 5−13 (2010)参照]。従って、WO2012/171020には、複数の担毒体分子が高分子リンカーを介して抗体に結合しているADCが記載されている。可能な担毒体として、WO2012/171020には、特に、物質SB743921、SB715992(イスピネシブ)、MK−0371、AZD8477、AZ3146およびARRY−520が挙げられている。
WO2012/171020
J. M. Lambert, Curr. Opin. Pharmacol. 5, 543−549 (2005) A. M. Wu and P. D. Senter, Nat. Biotechnol. 23, 1137−1146 (2005) P. D. Senter, Curr. Opin. Chem. Biol. 13, 235−244 (2009) L. Ducry and B. Stump, Bioconjugate Chem. 21, 5−13 (2010)
最後に挙げた物質は、キネシンスピンドルタンパク質阻害剤である。キネシンスピンドルタンパク質(KSP、Eg5、HsEg5、KNSL1またはKIF11とも称される)は、双極性有糸分裂紡錘体が機能するのに必須のキネシン様モータータンパク質である。KSPの阻害によって有糸分裂停止となり、比較的長期間かけてアポトーシスに至る(Tao et al., Cancer Cell 2005 Jul 8(1), 39−59)。最初の細胞透過性KSP阻害剤であるモナストロール発見後、KSP阻害剤は新たな化学療法剤の種類として確立され(Mayer et al., Science 286:971−974, 1999)、多くの特許出願のテーマとなっている(例えばWO2006/044825;WO2006/002236;WO2005/051922;WO2006/060737;WO03/060064;WO03/040979;およびWO03/049527)。しかしながら、KSPは、有糸分裂期の比較的短期間中にのみそれの作用を発揮することから、KSP阻害剤は、これらの初期相中に十分に高い濃度で存在していなければならない。
抗体複合化方法は代表的には、リジン類またはシステイン類のそれぞれ活性化エステルもしくはマレイミド官能基との化学反応を含む。しかしながら、これらの反応は部位特異性および立体化学に関して制御が困難であり、不均一生成物を生じる(Wang et al., タンパク質 Sci. 14, 2436−2446 (2005); Hamblett et al., Clin. Cancer Res. 10, 7063−7070(2004);Sun et al., Bioconjug. Chem. 16, 1282−1290 (2005); Willner et al., Bioconjug. Chem. 4, 521−527(1993))。結果的に、不均一ADCは、非複合と過剰の両方の抗体を含む可能性がある。非複合抗体は、抗原結合について薬剤負荷化学種と競合し、それはADC療法の活性を低下させ得る。他方、高度の抗体修飾は、抗体凝集、毒性上昇、安定性低下および循環におけるADC類の半減期短縮を生じ得る(Sochaj et al., Biotechnology Advances, 33, 775−784(2015))。ADC種の不均一性が、それの薬物動態(PK)、イン・ビボ性能および安全性プロファイルに影響し得ることが報告されている(Jackson et al., PLoS One 9, e83865(2014);Junutula et al., Nat. Biotechnol. 26, 925−932 (2008); Strop et al., Chem. Biol.20161−167(2013);Boswell et al., Bioconjugate Chem. 22, 1994−2004(2011))。さらに、ADC製造におけるバッチ間一貫性は困難な課題であり、かなりの製造能力を要求するものである。従って、新たなADC承認のためには、将来的に規制要件が変わる可能性がある。
既知数のリンカー−薬物が一貫して所定部位に結合する部位特異的結合が、これらの課題を克服する一つの方途である。不均一性が低下し、ADC特性の予測がより容易となり、バッチ間の複合体製造が一貫する。薬物:抗体比(DAR)が正確に制御され、各種のリンカー−薬物に合うように調整することができる。部位特異的結合については、文献に各種方法が記載されている(Agarwal et al., Bioconjug. Chem. 26, 176−192(2015);Cal et al., Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 53, 10585−10587(2014);Behrens et al., MAbs 6, 46−53(2014);Panowski et al., MAbs 6, 34−45(2014))。部位特異的結合方法には、特には、例えばトランスグルタミナーゼ類(TGase類)、グリシルトランスフェラーゼ類またはホルミルグリシン発生酵素を用いる酵素法などがある(Sochaj et al., Biotechnology Advances, 33, 775−784 2015)。
WO2014/198817には抗TWEAKR抗体が、WO2015/189143には脱グリコシル化抗TWEAKR抗体が記載されており、それらは抗体薬物複合体(ADC類)で用いることができる。さらに、WO2015/096982には、抗体薬物複合体(ADC)が、キネシン紡錘体タンパク質(KSP)で記載されている。特には、この出願には、TWEAKR抗体とのADC類が記載されている。
本発明は、キネシン紡錘体タンパク質阻害剤が結合体のグルタミン側鎖に結合しており、ランダム結合結合体薬物複合体の前記欠点を持たない、新規なキネシン紡錘体タンパク質阻害剤の部位特異的均一結合体複合体を提供する。より具体的には本発明は、トランスグルタミナーゼ類(TGase類)を用いて、キネシン紡錘体タンパク質阻害剤が結合体のグルタミン側鎖に結合しており、ランダム結合結合体薬物複合体の前記の欠点を持たない新規なキネシン紡錘体タンパク質阻害剤の部位特異的均一結合体複合体を提供する。
この背景に対して、本発明の目的は、比較的低濃度で投与した後に、アポトーシス作用を発揮することから、癌療法において有益であり得る物質を提供することにある。
この目的を達成するため、本発明は、結合体またはそれの誘導体の1以上の活性化合物分子との部位特異的均一複合体であって、その活性化合物分子がリンカーLを介して結合体に結合している1以上のキネシン紡錘体タンパク質阻害剤(KSP阻害剤)またはそれのプロドラッグである複合体を提供する。その結合体は、好ましくは結合体タンパク質またはペプチド、特に好ましくはヒト、ヒト化もしくはキメラモノクローナル抗体またはそれの抗原結合性断片、特には抗TWEAKR抗体もしくはそれの抗原結合性断片または抗EGFR抗体もしくはそれの抗原結合性断片である。特に好ましいものは、TWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)におけるアミノ酸Dに特異的に結合する抗TWEAKR抗体、特には抗TWEAKR抗体TPP−2090、または抗Her2抗体トラスツズマブである。結合体が抗体である場合、それは優先的に定常領域にアクセプターグルタミンを含む。そのようなアクセプターグルタミンは、好適な位置のグルタミンへの突然変異(例えば突然変異N297Q、Kabat EUナンバリング)によって、または脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の形成(例えばPNGase Fによる酵素的脱グリコシルによって、またはN297Xの突然変異によって、Kabat EUナンバリング)によって導入することができる。脱グリコシルもしくは脱グリコシル化抗体のその後者の場合、グルタミンQ295(Kabat EUナンバリング)はアクセプターグルタミンとなる。非常に好ましいのは、突然変異N297AまたはN297Q(Kabat EUナンバリング)を含む抗体である。従って、概して、ここで記載の抗体は、PNGase Fの脱グリコシルによって、または重鎖のN297(抗体のKabatナンバリングシステム、Kabat et al. 、Sequences of Proteins of Immulological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD.(1991)参照)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって形成されるこれら抗体の脱グリコシル化変異体も含む。さらに、本明細書に記載の抗体には、トランスグルタミナーゼ(TGase)触媒反応のために1以上のアクセプターグルタミン残基を含むように改変されている記載の抗体の変異体などもある。
この結合の一つの方法は、トランスグルタミナーゼを用いる結合体の部位特異的結合を扱う文献記載のアプローチである。細菌トランスグルタミナーゼ(BTG)(EC2.3.2.13)などのトランスグルタミナーゼ(TGase)は、グルタミン類のγ−カルボニルアミド基とリジン類の一級アミンの間の共有結合の形成を触媒する酵素のファミリーである。一部のTGaseはアミン供与体としてリジン以外の基質も受容することから、それらを用いて、好適なアクセプターグルタミン残基で抗体を含むタンパク質を修飾している(Jeger et al., Angewandte Chemie Int. Ed. Engl 49, 9995−9997 (2010); Josten et al., J. Immunol. Methods 240, 47−54 (2000); Mindt et al., Bioconjugate Chem. 19, 271−278 (2008); Dennler et al., in Antibody Drug Conjuagtes (Ducry, L., Ed.), pp 205−215, Humana Press. (2013))。一方で、遺伝子工学によって導入されたトランスグルタミナーゼアクセプターグルタミンである遺伝的に人工のグルタミン標識を有する抗体に薬物をカップリングさせるのに、トランスグルタミナーゼが用いられている(Strop et al., Chem. Biol. 2161−167(2013))。他方で、重鎖の定常領域に位置する保存グルタミンQ295(IgG類のKabatナンバリングシステム)は、脱グリコシル化IgG1の骨格内の細菌トランスグルタミナーゼ(EC2.3.2.13)に対する単一のγ−カルボニルアミド供与体であるが、重鎖の位置N297(kabatナンバリング)でグリコシル化されているIgG1における骨格にはアクセプターグルタミンは全く存在しないことが報告されている(Jeger et al., Angewandte Chemie Int. Ed. Engl 49, 9995−9997(2010))。要約すると、細菌トランスグルタミナーゼを、リンカー/薬物のアミン基の抗体のアクセプターグルタミン残基への結合に用いることができる。そのようなアクセプターグルタミンは、突然変異による抗体の操作によって、または脱グリコシル化抗体の形成によって導入することができる。そのような脱グリコシル化抗体は、N−グリコシダーゼF(PNGaseF)を用いる脱グリコシルによって、または重鎖のグリコシル化部位のN297(Kabatナンバリング)の他のいずれかのアミノ酸への突然変異によって形成することができる。そのような脱グリコシル化抗体の酵素的結合が、突然変異N297D、N297Q(Jeger et al., Angewandte Chemie Int. Ed. Engl 49, 9995−9997(2010))、またはN297S(特許出願WO2013092998A1およびWO2013092983A2を参照する。)を有する脱グリコシル化抗体変異体について記載されている。そのような脱グリコシル化抗体のトランスグルタミナーゼを用いる酵素的結合によって、両方の重鎖が位置Q295(Kabatナンバリング)で部位特異的に官能化されている、概して2のDARを有するADCが提供される。抗体の突然変異N297Qは、各重鎖での結合のためのもう一つ別の部位を提供し、それによって例えば、両方の重鎖が位置Q295およびQ297(Kabatナンバリング)で部位特異的に官能化されている、4のDARを有するADCSが生じる。突然変異Q295NおよびN297Qを有する抗体変異体は、位置Q297に一つのアクセプターグルタミン残基を提供する(Simone Jeger, Site specific conjugation of tumour targeting antibodies using transglutaminase, Dissertation at ETH Zurich (2009))。トランスグルタミナーゼを介した脱グリコシル化抗体の部位特異的結合について記載した文献にいくつかの例がある(例えばDennler et al., Bioconjugate Chemistry 19, 569−578 (2014); Lhospice et al., Molecular Pharmaceutics 12, 1863−1871 (2015))。脱グリコシル化抗体のトランスグルタミナーゼ触媒結合を用いる戦略は、図8にまとめてある。
本発明者らは、部位特異的均一的にKSP阻害剤に結合体を結合させて、上記の目的を達成する方法を見出した。さらに、トランスグルタミナーゼが突然変異N297A(Kabatナンバリング)を有する脱グリコシル化抗体変異体への結合を効率的に触媒することが可能であることが、それらによって示された。
本発明は、結合体もしくはそれの誘導体の1以上の活性化合物分子との部位特異的均一複合体であって、前記活性化合物分子がリンカーLを介して結合体に結合したキネシン紡錘体タンパク質阻害剤(KSP阻害剤)であり、前記リンカーLが結合体、好ましくは結合体のグルタミン側鎖の特異的部位に結合している複合体を提供する。
より具体的には、本発明は、結合体もしくはそれの誘導体の1以上の活性化合物分子との部位特異的均一複合体であって、前記活性化合物分子がリンカーLを介して結合体に結合したキネシン紡錘体タンパク質阻害剤(KSP阻害剤)であり、前記リンカーLがトランスグルタミナーゼ類(TGase類)を用いて結合体のグルタミン側鎖に結合している複合体を提供する。
本発明による複合体は、下記一般式によって表すことができる。
Figure 2018528161
式中、BINDERはバインダー、好ましくは抗体を表し、Lはリンカーを表し、KSPはKSP阻害剤を表し、mは1から5の数字、好ましくは1を表し、nは2から10、好ましくは2から4、やはり好ましくは2または4を表す。ここで、mはリンカー当たりのKSP阻害剤の数であり、nはBINDER当たりのKSP阻害剤/リンカー複合体の数である。従って、複合体中に存在する全てのKSPの合計は、mとnの積である。BINDERは好ましくは、バインダーペプチドまたはタンパク質、例えば抗体である。バインダーが抗体である場合、それは優先的に定常領域にアクセプターグルタミンを含む。そのようなアクセプターグルタミン類は、好適な位置のグルタミンへの突然変異(例えば突然変異N297Q、Kabat EUナンバリング)または脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の形成(例えば、PNGase Fによる酵素的脱グリコシルによって、またはN297X、Kabat EUナンバリングの突然変異によって)によって導入することができる。その後者の脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の場合、グルタミンQ295(Kabat EUナンバリング)はアクセプターグルタミンになる。非常に好ましいものは、突然変異N297AまたはN297Q(Kabat EUナンバリング)を含む抗体である。さらに、リンカーは、バインダーペプチドまたはタンパク質もしくはそれの誘導体のグルタミン残基に結合している。特に好ましいものは、抗体のグルタミン残基への結合である。
本発明によれば、キネシン紡錘体タンパク質阻害剤は下記の下位構造I(sub)を有することができる。
Figure 2018528161
式中、
#aは、分子の残りの部分への結合を表し;
1aは、−H、−MOD、または−(CH0−3Zを表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは、−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は、Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C=O−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは、−Hまたは−OHを表し、
は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
2aは、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
4aは、H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルによって置換されていても良い−NHC(=O)−NHを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
4aは、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−の基もしくはカテプシン開裂性基または基R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−を表し、
21は、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−SO−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)または−OHで1回以上置換されていても良く;またはそれは、−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり,
vは1から10の数字であり、
22は、−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
または
2aおよびR4aが一緒に、(ピロリジン環の形成を伴う)−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は、−H、ハロゲン(好ましくは−Fまたは−Cl)、−NH、−COOH、−SOH、−SHC1−4−アルキル、ハロ−C1−4−アルキル、C1−4−アルコキシ、ヒドロキシ置換されたC1−4−アルキル、−C(=O)−O−(C1−4−アルキル)または−OHを表す。
本発明によれば、キネシン紡錘体タンパク質阻害剤は、R1a、R2a、R4aまたはR10で水素原子の置換によってリンカーを介してバインダーに結合していることができる。
このバインダーに結合しているKSP阻害剤(または非常に多くの場合、複数のKSP阻害剤がバインダーに結合していることからKSP阻害剤)は好ましくは、下記の式(Ia)の化合物ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
式(Ia):
Figure 2018528161
式中、
1aは、−H、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは、−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは、−Hまたは−OHを表し、
は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分基のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
2aは、−H、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
4aは、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
4aは、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−、またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−の基、もしくはカテプシン開裂性基または式R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−を表し、
21は、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基(それは、−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−S(=O)NH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良い。)、−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
22は、−H、−アルキル(好ましくはC12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
または
2aおよびR4aが一緒に、(ピロリジン環の形成を伴う)−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は、−H、ハロゲン(好ましくは−Fまたは−Cl)、−NH、−COOH、−SOH、−SH、C1−4−アルキル、ハロ−C1−4−アルキル、C1−4−アルコキシ、ヒドロキシ置換されたC1−4−アルキル、−C(=O)−O−(C1−4−アルキル)または−OHを表し;
3aは、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキルまたは複素環アルキル基、好ましくはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個のO−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
Zは、−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
nは0、1または2であり、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−H、−(CH0−3−CH(NHC(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
8aは、C1−10−アルキルまたは−(CH0−2−(HZ)を表し、
HZは、N、OおよびSからなる群から選択される2個以下のヘテロ原子を有する4から7員の複素環を表し;
HZは、単環式もしくは二環式複素環を表し、それはハロゲン、C1−10−アルキル基、C6−10−アリール基およびC6−10−アラルキル基からなる群から選択される1以上の置換基によって置換されていても良く、それはハロゲンによって置換されていても良く;
上記で定義の−MODは、−(NR10−(G1)−G2−G3を表し、
10は、−H;ハロゲンまたはC−C−アルキルを表し;
G1は、−NHC(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が−NHC(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10はNHを表さない。)を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−、−C(=O)−、−CR=N−O−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
いずれかの側鎖を含む前記炭化水素基は、−NHC(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
は、H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NHC(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
は、−H、C−C−アルキルまたはフェニル)を表し、
G3は、−Hまたは−COOHを表し、
−MODは好ましくは、少なくとも一つの基−COOHを有し;
前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤は、R1a、R2a、R3a、R4a、R8aもしくはR10で水素原子の置換によって、または適宜にHZの置換基のうちの一つを介して、特にはR1a、R2a、R3a、R4aまたはR10を介してリンカーに結合している。
上記で示した式中のKSP−L−は好ましくは下記式(IIa)を有するもの、ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
式(IIa):
Figure 2018528161
式中、
は、Nを表し、XはNを表し、XはCを表し;または
はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はCHもしくはCFを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し、
(XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表すのが好ましい);
はH、−L−#1、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
は−L−#1、H、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
は−L−#1、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
Zは−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
はR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−の基もしくはカテプシン開裂性基R21−(C=O)(0−1)−(P3)(1−2)−P2−を表し、
21はH、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基(それは、−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良い)、−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;複数のアミノ酸P3がある場合、P3は、上記で定義の同一もしくは異なるアミノ酸を有することができ;
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10はL−#1、−H、−NH、−SOH、−COOH、−SHまたは−OHを表し、ピロリジン環中の2級アミノ基の水素原子がR21−C(=O)−P3(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−SIG−によって置き換わっていても良く;
L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
−SIGは、−C(=O)ーSIG結合の開裂時に遊離2級アミンを与える自壊性基であり;
Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
は−L−#1、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくは−L−#1またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
nは0、1または2を表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NHC(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
は−L−#1、−H、−NH、−NO、ハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)、−CN、−CF、−OCF、−CHF、−CHF、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
およびRは互いに独立に、−H、シアノ、(フッ素化されていても良い)C1−10−アルキル、(フッ素化されていても良い)C2−10−アルケニル、(フッ素化されていても良い)C2−10−アルキニル、ヒドロキシ、−NO、−NH、−COOHまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
は(フッ素化されていても良い)C1−10−アルキル、(フッ素化されていても良い)C2−10−アルケニル、(フッ素化されていても良い)C2−10−アルキニル、(フッ素化されていても良い)C4−10−シクロアルキルまたは−(CH0−2−(HZ)を表し、
HZはN、OおよびSからなる群から選択される2個以下のヘテロ原子を有する4から7員の複素環を表し、これらの基のそれぞれは−OH、−COOHまたは−NHまたは−L−#1によって置換されていても良く;
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
上記で定義の−MODは−(NR10−(G1)−G2−G3を表し、
10はHまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が−NHC(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10は−NHを表さない。)を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−、−C(=O)−、−CR=N−O−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
いずれかの側鎖を含む炭化水素鎖は、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
は−H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
は−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
G3は−Hまたは−COOHを表し、
−MODは好ましくは、少なくとも一つの−COOH基を有する。
本発明による複合体は、化学的に不安定なリンカー、酵素的に不安定なリンカーまたは安定なリンカーを有することができる。特に好ましいものは、安定なリンカーおよびレグマインまたはカテプシンによって開裂可能なリンカーである。
本発明はさらに、本発明による部位特異的均一複合体の製造方法、さらにはその製造のための前駆体および中間体も提供する。
本発明による複合体の製造は通常、次の段階を含む。
(i)保護基を有していても良く、バインダーにカップリングし得る反応性基を有するリンカー前駆体の製造;
(ii)保護基を有していても良い低分子量KSP阻害剤の誘導体(好ましくは下位構造I(sub)を有するKSP阻害剤、特に好ましくは式(Ia)のもの、特には式(IIa)のもの;これらの式において、リンカーへの結合はまだない。)へのリンカー前駆体の結合による、保護基を有していても良い反応性のKSP阻害剤/リンカー複合体の取得;
(iii)KSP阻害剤/リンカー複合体に存在する保護基の除去、および
(iv)好ましくはトランスグルタミナーゼを用いる、KSP阻害剤/リンカー複合体へのバインダーの部位特異的結合による、本発明によるバインダー/KSP阻害剤部位特異的均一複合体の取得。
反応性基の結合は、保護されていても良いKSP阻害剤/リンカー前駆体複合体の構築後に行うこともできる。
上記で説明したように、低分子量KSP阻害剤へのリンカー前駆体の結合は、リンカーにより、下位構造I(sub)におけるR1a、R2a、R4aまたはR10で、式(Ia)におけるR1a、R2a、R3a、R4a、R8aもしくはR10で、または式(IIa)におけるR、R、R、R、R、RまたはR10で水素原子の置換によって起こり得る。複合体化前の合成段階において、存在する官能基は、保護された形で存在しても良い。複合体化段階の前に、これらの保護基はペプチド化学の公知の方法によって除去される。複合体化は、実施例における図式2から6に例示的に示されているように、各種経路によって化学的に行われる。特に、例えば置換を促進するための保護基もしくは脱離基の導入により、リンカーへの結合のために、低分子量KSP阻害剤を修飾しても良い。
特に、本発明は、バインダーに結合した低分子量KSP阻害剤を提供する。これらのバインダー複合体は、下記一般式(IIIa)を有するもの、ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
Figure 2018528161
式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;または
はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はCHもしくはCFを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し
(XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表すのが好ましい);
は−H、−L−BINDER、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−NHY、−OY、−SY、ハロゲン、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
はHまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
は−L−BINDER、H、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10はL−#1、−H、−NH、−SOH、−COOH、−SH、または−OHを表し;
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
は−L−BINDER、−H、−C(O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
はR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−、またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−、もしくはカテプシン開裂性基の基または式R21−(C=O)(0−1)−(P3)(1−2)−P2−を表し、
21は−H、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)もしくは−OHで1回以上置換されていても良いか、−Hまたは基−O−(CHCHO)−R22であり、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NHを表し;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10はL−#1、−H、−NH、−SOH、−COOH、−SH、ハロゲン、C1−4アルキル、C1−4ハロアルキル、C1−4アルコキシ、ヒドロキシル置換されたC1−4アルキル、COO(C1−4アルキル)または−OHを表し;ピロリジン環中の2級アミノ基の水素原子がR21−C(=O)−P3(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)NH)−C(=O)−SIG−によって置き換わっていても良く;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
−SIGは、−C(=O)−SIG結合の開裂時に遊離2級アミンを与える自壊性基であり;
Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
は−L−BINDER、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくは−L−BINDER、またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
nは0、1または2であり、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
「アルキル」は好ましくは、C1−10−アルキル)を表し;
は−L−BINDER、−H、−NH、−NO、ハロゲン(特にはF、Cl、Br)、−CN、−CF、−OCF、−CHF、−CHF、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し,
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
はC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキルまたは−(CH0−2−(HZ)を表し、
HZはN、OおよびSからなる群から選択される2個以下のヘテロ原子を有する4から7員の複素環(好ましくはオキセタン)を表し、これらの基のそれぞれは−OH、−COOHまたは−NHまたは−L−BINDERによって置換されていても良く;
Lはリンカーを表し、
BINDERはバインダーもしくはそれの誘導体を表し、当該バインダーは複数の活性化合物分子に結合していても良く、
、R、R、R、RおよびR10の一つの代表的なものは−L−バインダーを表し;
およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシ、−NO、−NH、−COOHまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
−MODは−(NR10−(G1)−G2−G3を表し、
10は−HまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10はNHを表さない。)を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く,Rは−H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、または−C(=O)−、−CR=N−O−を表し、Rは−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
いずれかの側鎖を含む炭化水素鎖は、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
G3は−Hまたは−COOHを表し、
−MODは好ましくは、少なくとも一つの基−COOHを有する。
図1は、各種生物種のTWEAKRシステイン豊富ドメイン(アミノ酸34から68)の配列(数字は、シグナル配列;配列番号169を含む全長構築物におけるアミノ酸位置を示す。)。
図2Aは、TWEAKR(配列番号169)の構造の模式図である。その図は、システイン豊富ドメイン(36から67)を含む細胞外ドメイン(アミノ酸28から80)(配列番号168)、膜貫通ドメイン−TM(81から101)および細胞内ドメイン(102から129)を示している。TPP−2202−完全細胞外ドメイン(28から80)は、hIgG1のFcドメインに融合している。TPP−2203−N末端およびC末端切断(34から68)のある細胞外ドメインは、hIgG1のFcドメインに融合している。ジスルフィド架橋Cys36−Cys49、Cys52−Cys67およびCys55−Cys64は、黒色棒線で示されている。N末端およびC末端のTPP−2203は、未修飾システイン豊富ドメインと比較して、それぞれアミノ酸2個およびアミノ酸1個を多く含むことで、適切な折り畳みが確保されている。TPP−1984−C末端切断を有する細胞外ドメイン(28から68)は、HIS6標識に融合している。3種類全ての構築物は、本発明による抗体およびPDL−192(TPP−1104)に対して同等の結合を示す。P4A8(TPP−1324)は、全長細胞外ドメイン(TPP−2202)にのみ結合する。
図2Bは、細胞外ドメインのアミノ酸配列であり:アミノ酸64がTWEAKリガンド結合に必須であり;およびアミノ酸47が、本明細書で確認したように本発明による抗体の結合に必須であることが公開されている。
図3は、TWEAKR細胞外ドメインの抗体および基準抗体との相互作用である。図示してあるものは、TWEAKR−Fc融合タンパク質コーティング(TPP−2202、1μg/mL)および0.08μg/mL(白抜き棒線)および0.03μ/mL(黒抜き棒線)の可溶性結合相手としてのビオチン化IgGでのELISAの結果である。検出は、ストレプトアビジン−HRPおよびAmplex Red基質を用いて行った。Yは「ELISAシグナル強度[Rfu]」であり;Xは「試験抗体構築物」であり:aは「TPP−2090」であり;bは「TPP−2084」であり;cは「PDL−192(TPP−1104)」であり;dは「P4A8(TPP−1324)」であり;eは「P3G5(TPP−2195)」であり;fは「136.1(TPP−2194)」であり;hは「ITEM1」であり;iは「ITEM4」であり;jはマイスアイソタイプ対照であり;kはヒトアイソタイプ対照である。調べた全ての抗体が80ng/mLの濃度で飽和結合を示している。
図4は、TWEAKRのシステイン豊富ドメインの本発明による抗体および基準抗体との相互作用である。示してあるものは、TWEAKR(34−68)−Fc融合タンパク質コーティング(TPP−2203、1μg/mL)および0.08μg/mL(白抜き棒線)および0.3μ/mL(黒抜き棒線)の可溶性結合相手としてのビオチン化IgGでのELISAの結果である。検出は、ストレプトアビジン−HRPおよびAmplex Red基質を用いて行った。Xは「試験抗体構築物」であり:aは「TPP−2090」であり;bは「TPP−2084」であり;cは「PDL−192(TPP−1104)」であり;dは「P4A8(TPP−1324)」であり;eは「P3G5(TPP−2195)」であり;fは「136.1(TPP−2194)」であり;hは「ITEM1」であり;iは「ITEM4」であり;jはマイスアイソタイプ対照であり;kはヒトアイソタイプ対照である。調べた全ての抗体が80ng/mLの濃度で飽和結合を示している。
図5は、TWEAKR(28−68)の本発明による抗体および基準抗体との相互作用である。示してあるものは、TWEAKR(28−68)−HISコーティング(TTP−1984、1μg/mL)および0.08μg/mL(白抜き棒線)および0.3μ/mL(黒抜き棒線)の可溶性結合相手としてのビオチン化IgGでのELISAの結果である。検出は、ストレプトアビジン−HRPおよびAmplex Red基質を用いて行った。Xは「試験抗体構築物」であり:aは「TPP−2090」であり;bは「TPP−2084」であり;cは「PDL−192(TPP−1104)」であり;dは「P4A8(TPP−1324)」であり;eは「P3G5(TPP−2195)」であり;fは「136.1(TPP−2194)」であり;hは「ITEM1」であり;iは「ITEM4」であり;jはマイスアイソタイプ対照であり;kはヒトアイソタイプ対照である。調べた全ての抗体が80ng/mLの濃度で飽和結合を示している。
図6Aは、システイン豊富ドメインのアラニンスキャンである。TWEAKR(34−68)−Fcの突然変異タンパク質を、PDL−192(TPP−1104)(X)−およびTPP−2090(Y)−結合について分析した。S37A、R38A、S40A、W42A、S43A、D45A、D47A、K48A、D51A、S54A、R56A、R58A、P59A、H60A、S61A、D62A、F63AおよびL65A突然変異タンパク質をHEK293細胞で発現させた(黒色菱形)。PFL192(TPP−1104)およびTPP−2090をコーティングし(1μg/mL)、HEK293発酵ブロスの8倍希釈上清を、TWEAKRタンパク質結合用に加えた。Xは「PDL−192/TTP−1104)相互作用のELISA強度[Rfu]」であり、Yは「TPP−2090相互作用のELISA強度[Rfu]」である。TPP−2090(Y)は、D74A−TWEAKR突然変異タンパク質の結合減少を示し(閉じた箱形)、PDL−192(TPP−1104)(X)はR56Aへの結合減少を示している(点線の箱形)。
B−Yは「野生型結合シグナルに対して正規化した%単位での結合[%]」であり、1は「TPP−2090」であり;2は「PDL−192(TPP−1104)」であり;3は「P4A8(TPP−1324)」であり(1μg/mL)、TWEAKR変異体を250ng/mLで加え、検出は抗HIS HRPによるものであった。野生型構築物と比較して、TTP−2090は5%未満の結合を示している。
図7は、Pellegriniら(FEBS280:1818−1829)が発表しているTWEAKR細胞外ドメインのNMR構造である。TWEAK結合はL46に依存し(Pellegriniら)、TTP−2090結合はに依存し、PDL−192はR56に結合する。PDL−192はTWEAKリガンド結合部位と逆に結合し、TPP−2090はTWEAKリガンド部位に直接結合する。
図8は、脱グリコシル化抗体のトランスグルタミナーゼ触媒複合体化を用いる戦略をまとめたものである。
各種生物種のTWEAKRシステイン豊富ドメイン(アミノ酸34から68)の配列(数字は、シグナル配列;配列番号169を含む全長構築物におけるアミノ酸位置を示す。)である。 TWEAKR(配列番号169)の構造の模式図である。 細胞外ドメインのアミノ酸配列である。 TWEAKR細胞外ドメインの抗体および基準抗体との相互作用である。 TWEAKRのシステイン豊富ドメインの本発明による抗体および基準抗体との相互作用である。 TWEAKR(28−68)の本発明による抗体および基準抗体との相互作用である。 システイン豊富ドメインのアラニンスキャンである。 野生型結合シグナルに対して正規化した%単位での結合[%]を示す図である。 Pellegriniら(FEBS280:1818−1829)が発表しているTWEAKR細胞外ドメインのNMR構造である。 脱グリコシル化抗体のトランスグルタミナーゼ触媒複合体化を用いる戦略をまとめたものである。
本発明は、バインダーもしくはそれの誘導体の1以上の活性化合物分子との部位特異的均一複合体であって、前記活性化合物分子がリンカーLを介してバインダーに結合したキネシン紡錘体タンパク質阻害剤(KSP阻害剤)であり、前記リンカーLがバインダー、好ましくはバインダーのグルタミン側鎖の特異的部位に結合している複合体を提供する。
より具体的には本発明は、バインダーもしくはそれの誘導体の1以上の活性化合物分子との部位特異的均一複合体であって、前記活性化合物分子がリンカーLを介してバインダーに結合したキネシン紡錘体タンパク質阻害剤(KSP阻害剤)であり、前記リンカーLがトランスグルタミナーゼ類(TGase類)を用いてバインダーのグルタミン側鎖に結合している複合体を提供する。
本発明による複合体は、下記一般式によって表すことができる。
Figure 2018528161
式中、BINDERはバインダー、好ましくは抗体を表し、Lはリンカーを表し、KSPはKSP阻害剤を表し、mは1から5の数字、好ましくは1を表し、nは2から10、好ましくは2から4、やはり好ましくは2または4を表す。ここで、mはリンカー当たりのKSP阻害剤の数であり、nはBINDER当たりのKSP阻害剤/リンカー複合体の数である。従って、複合体中に存在する全てのKSPの合計は、mとnの積である。KSP−Lは好ましくは、上記で示した式(IIa)を有する。BINDERは好ましくは、バインダーペプチドまたはタンパク質、例えば抗体である。バインダーが抗体である場合、それは優先的に定常領域にアクセプターグルタミンを含む。そのようなアクセプターグルタミン類は、好適な位置のグルタミンへの突然変異(例えば突然変異N297Q、Kabat EUナンバリング)または脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の形成(例えば、PNGase Fによる酵素的脱グリコシルによって、またはN297X、Kabat EUナンバリングの突然変異によって)によって導入することができる。その後者の脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の場合、グルタミンQ295(Kabat EUナンバリング)はアクセプターグルタミンになる。非常に好ましいものは、突然変異N297AまたはN297Q(Kabat EUナンバリング)を含む抗体である。さらに、リンカーは、バインダーペプチドまたはタンパク質もしくはそれの誘導体のグルタミン残基に結合している。特に好ましいものは、抗体のグルタミン残基への結合である。
本発明に従って使用可能なバインダー、本発明に従って使用可能なKSP阻害剤および制限なく組み合わせて使用可能な本発明に従って使用可能なリンカーについて、下記で説明する。特に、好ましいまたは特に好ましいものとして各場合で表されるバインダーを、好ましいまたは特に好ましいものとして各場合で表されるKSP阻害剤と組み合わせて、適宜に好ましいまたは特に好ましいものとして各場合で表されるリンカーと組み合わせて用いることができる。
KSP阻害剤およびそれらのバインダー複合体
低分子量KSP阻害剤が、例えばWO2006/044825;WO2006/002236;WO2005/051922;WO2006/060737;WO03/060064;WO03/040979;およびWO03/049527から知られている。
基本的に、KSP阻害剤は、下記の下位構造I(sub)を有する。
Figure 2018528161
式中、
#aは、分子の残りの部分への結合を表し;
1aは、−Hまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは、−H、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は、Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは、−Hまたは−OHを表し、
は、−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
2aは、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
4aは、H、−C(O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルによって置換されていても良い−NH−C(=O)−NHを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
4aは、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−の基もしくはカテプシン開裂性基または式R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−を表し、
21は、−H、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)または−OHで1回以上置換されていても良く;またはそれは、−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり,
vは1から20の数字であり、
22は、−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
または
2aおよびR4aが一緒に、(ピロリジン環の形成を伴う)−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は、−H、ハロゲン(好ましくは−Fまたは−Cl)、−NH、−COOH、−SOH、−SHC1−4−アルキル、ハロ−C1−4−アルキル、C1−4−アルコキシ、ヒドロキシ置換されたC1−4−アルキル、−C(=O)−O−(C1−4−アルキル)または−OHを表す。
特に高頻度であるものは、下記の下位構造II(sub)である。
Figure 2018528161
式中、
#a、R1a、R2aおよびR4aは、I(sub)におけるものと同じ意味を有し、R12aおよびR13aは−Hを表し、
または
12aおよびR13aが一緒に(ピペリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は−H、−NH、−COOH、−SOH、−SHまたは−OHを表し;
Zは−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NH、−COOHまたは−(C=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表す。
特に、多くのKSP阻害剤が、下位構造II(sub)を有し、R1a、R2a、R4a、R12aおよびR13aはHを表す。
本発明によれば、下位構造I(sub)または下位構造II(sub)のKSP阻害剤を用いることができる。本発明に従って使用されるKSP阻害剤には、例えばイスピネシブ(Cytokinetics/GSK)、MK−0731(Merck)、AZD4877(AstraZeneca)、ARRY−520(Array BioPharma)およびARQ621(ArQule)などもある。
本発明に従って好ましいKSP阻害剤は、下記の基本構造を有するもの、ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
式(Ia):
Figure 2018528161
式中、
1aは、−H、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは、−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは、−Hまたは−OHを表し、
は、−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分基のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
2aは、−H、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
4aは、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
4aは、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CH−C(=O)−NH)−C(=O)−、またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−の基、もしくはカテプシン開裂性基または式R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−を表し、
21は、−H、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基(それは、−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良い。)を表し、または−Hもしくは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
22は、−H、−アルキル(好ましくはC12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
または
2aおよびR4aが一緒に、(ピロリジン環の形成を伴う)−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は、−H、ハロゲン(好ましくは−Fまたは−Cl)、−NH、−COOH、−SOH、−SHまたは−OHを表し、ピロリジン環中の2級アミノ基の水素原子がR21−C(=O)−P3(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)NH)−C(=O)−SIG−によって置き換わっていても良く;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
−SIGは、−C(=O)−SIG結合の開裂時に遊離2級アミンを提供する自壊性基であり;
3aは、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキルまたは複素環アルキル基、好ましくはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個のO−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
Zは、−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
nは0、1または2であり、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は、−H、−(CH0−3−CH(NHC(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
8aは、C1−10−アルキルを表し、
HZは、単環式もしくは二環式複素環を表し、それはハロゲン、C1−10−アルキル基、C6−10−アリール基およびC6−10−アラルキル基からなる群から選択される1以上の置換基によって置換されていても良く、それはハロゲンによって置換されていても良く;
上記で定義の−MODは、−(NR10−(G1)−G2−G3を表し、
10は、−H;ハロゲンまたはC−C−アルキルを表し;
G1は、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が−HC(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10はNHを表さない。)を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−、−C(=O)−、−CR=N−O−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
いずれかの側鎖を含む前記炭化水素基は、−NHC(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
は、H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NHC(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
は、−H、C−C−アルキルまたはフェニル)を表し、
G3は、−Hまたは−COOHを表し、
−MODは好ましくは、少なくとも一つの基−COOHを有する。
本発明によれば、そのようなキネシン紡錘体タンパク質阻害剤は、R1a、R2a、R3a、R4a、R8aもしくはR10で水素原子の置換によって、または適宜にHZの置換基のうちの一つを介して、特にはR1a、R2a、R3a、R4aまたはR10を介してリンカーに結合していることができる。
式(Ia)の置換基は好ましくは下記の意味を有し、これらの好ましい意味が、好ましくは互いに組み合わせられる。
1aは好ましくは、Hまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、を−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジル表し;
2aおよびR4aは互いに独立に、好ましくは−H、−L−#1、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Z、を表し、またはR2aおよびR4aが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は−H、−SOH、−NH、−COOH、−SHまたは−OHを表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
は互いに独立に、−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
はHまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表す。
あるいは、R4aは、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−または式R21−(C=O)(0−1)−(P3)(1−2)−P2−のカテプシン開裂性基であることができる。別の選択肢において、ピロリジン環上の−NHの水素原子が、R21−C(=O)−P3−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−SIG−によって置き換わっている。
基R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−またはR21−C(=O)−P3−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−SIG−は、酵素レグマインによってイン・ビボで開裂すると考えられている。従って、以下において、これらの基は、「レグマイン開裂性基」と称される。レグマイン開裂性基は、式−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−または−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−を有する。本発明の複合体において、この基は好ましくは、式R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)#を有する、すなわちレグマイン開裂性基は、一端に基R21を有し、他端(−#)で、それは式Iaにおけるアミノ基相当位置R4aに結合している。
−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−(すなわち、アスパラギン)および−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−(すなわち、アスパラギン酸)は、天然のL配置で存在する。レグマイン開裂性基は、アスパラギンに加えて、1から3個の別のアミノ酸(−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−;−P3−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−;−(P3)(2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−)を含むことから、ジ−、トリ−、もしくはテトラペプチドまたはそれの誘導体である(ジペプチド:−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−;トリペプチド:−P3−P2−NH−CH(CHC(=O)NH)−C(=O)−;テトラペプチド:−(P3)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−)。レグマイン開裂性基がアスパラギン酸を含む場合も、同じことが当てはまる。
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択される、好ましくはAla、Gly、Val、Leu、Ile、Pro、Ser、Thr、シトルリンおよびAsnから選択されるアミノ酸である。P2は通常は、天然L配置で存在する。特に好ましいものは、L−Alaである。
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリン、またはそれのN−アルキル−アミノ酸類、好ましくはN−メチル−アミノ酸類から選択されるアミノ酸である。P3は好ましくは、His、Pro、Ala、Val、Leu、Ile、Gly、Ser、シトルリンおよびGlnから選択される。P3は通常は、天然L配置で存在する。特に好ましいものは、L−Alaである。
特に好ましいレグマイン開裂性基は、−L−Ala−L−Ala−L−Asn−(例えばR21−L−Ala−L−Ala−L−Asn−#)である。
21は好ましくは、−H、C1−5−アルキル、C5−10−アラルキル、C1−5−アルコキシ、C6−10−アリールオキシ、C5−10−ヘテロアルキル−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、またはC5−10−複素環アルコキシ基を表し、それらはそれぞれ、−COOH、−C(=O)−Oアルキル、−C(=O)−O−NH、−NHまたは−N(アルキル),)で1回以上置換されていても良く;または基−O−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり、
vは1から10の数字であり、
22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NHを表す。
「アルキル」はここでは、20個以下の炭素原子を有するアルキル基、好ましくはC1−12−アルキルを意味する。
カテプシン開裂性基は、式−(C=O)(0−1)−(P3)(1−2)−P2−を有する。本発明の複合体において、この基は好ましくは式R21−(C=O)(0−1)−(P3)(1−2)−P2−#を有する、すなわちカテプシン開裂性基は、一端に基R21を有し、他端(−#)で、それは式Iaにおけるアミノ基相当位置R4aに結合している。ここで、R21、P2およびP3は、レグマイン開裂性基におけるものと同じ意味を有する。特に好ましいカテプシン開裂性基は、P2がアラニン、リジンおよびシトルリンから選択され、P3がバリン、アラニンおよびフェニルアラニンから選択されるものであり、特には式R21−(C=O)(0−1)−P3−P2−のものである。
は好ましくは、置換されていても良いアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、−L−#1、−MOD、またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個のO−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
nは0、1または2であり、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(−CH0−3Z′を表し、Yは−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
「アルキル」は好ましくは、C1−10−アルキルを表す。
8aは好ましくは、C1−10−アルキルを表す。
HZは好ましくは、単環式もしくは二環式複素環を表し、それはハロゲン、C1−10−アルキル基、C6−10−アリール基およびC6−10−アラルキル基(ハロゲンによって置換されていても良い)からなる群から選択される1以上の置換基によって置換されていても良い。
本発明の文脈において(すなわち、上記式において、そして下記の式においても)C1−10−アルキルは、1から10個の炭素原子を有する直鎖もしくは分岐のアルキルを表す。好ましいものとして挙げることができる例は、メチル、エチル、n−プロピル、イソプロピル、n−ブチル、イソブチル、1−メチルプロピルおよびtert−ブチルである。
本発明の文脈においてC6−10−アリール−は、単環式または二環式芳香族同素環、例えばフェニルおよびナフチルを表す。
6−10−アラルキル基本発明の文脈においては、C1−C4−アルキル基が結合している単環式芳香族同素環、例えばフェニルを表す。C6−10−アラルキル基の1例はベンジルである。
5−10−ヘテロアリール本発明の文脈においては、合計6から10個の環原子を有する単環式もしくは二環式芳香族複素環を表し、その環はN、O、S、SOおよびSOからなる群からの1個もしくは2個の環ヘテロ原子を含み、環炭素原子または適宜に環窒素原子を介して結合している。挙げることができる例には、ピリジル、フラニル、ピリミジル、イミダゾリル、チエニル、チオフェニル、イソオキサゾイル(isoxazoyl)、イソチアゾイル(isothiazoyl)、1,2,3−オキサジアゾリル(oxadiazoyl)、フラザニル、1,2,3−トリアゾイル(triazoyl)、1,2,4−トリアゾイル(triazoyl)、ピリダジル、ピロリル、トリアジニル、インドリル、キノリニル、キナゾリニル、1,3−ベンゾジオキソール、イソインドリル、インダゾリル、1H−ピラゾロ[3,4−d]ピリミジル、ベンゾトリアゾリル、イソキノリニル、シノリニル(cinolinyl)、フタラジニル、プテリジニル、ナフチリジニル、ベンゾイミダゾリニル、ベンゾチアゾリニル、ベンゾオキサゾリニル、3,4−メチレンジオキシフェニルおよびベンゾ[6]フラニルである。
単環式または二環式複素環本発明の文脈においては、合計5から10個の環炭素原子を有する単環式もしくは二環式複素環を表し、その環はN、O、S、SOおよびSOからなる群からの1から3個の環ヘテロ原子を含み、環炭素原子または適宜に環窒素原子を介して結合している。挙げることができる例は、ピペリジル、ピロリニル、モルホリニル、3,4−メチレンジオキシフェニルおよびテトラヒドロフラニルである。
本発明の文脈においてハロゲン原子は、F、Cl、BrまたはIを表す。
本明細書で使用される場合、「ヘテロアルキル」という用語は、1以上のヘテロ原子、すなわち1以上の炭素原子に代わる炭素以外の元素(酸素、硫黄、窒素、リンなど(これらに限定されるものではない))を含む直鎖もしくは分岐のアルキル基を指す。
ある基が「置換されている」と記載されている場合は常に、その基は1以上の指定の置換基によって置換されている。置換基が全く示されていない場合、それは、示された「置換された」基がアルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、シクロアルキニル、ヘテロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアリシクリル、アラルキル、ヘテロアラルキル、(ヘテロアリシクリル)アルキル、ヒドロキシ、アルコキシ、アリールオキシ、アシル、メルカプト、アルキルチオ、アリールチオ、シアノ、ハロゲン、チオカルボニル、カルバミル、チオカルバミル、アミド、スルホンアミド、スルホンアミド、カルボキシ、イソシアナト、チオシアナト、イソチオシアナト、ニトロ、シリル、スルフェニル、スルフィニル、スルホニル、ハロアルキル、ハロアルコキシ、トリハロメタンスルホニル、トリハロメタンスルホンアミド、アミノ、モノ置換されたアミノ基およびジ置換されたアミノ基、およびこれらの保護された誘導体から個別かつ独立に選択される1以上の基で置換されていても良いことを意味する。
置換基の数が特定されていない場合(例えばハロアルキル)、1以上の置換基が存在していても良い。例えば「ハロアルキル」は、1以上の同一もしくは異なるハロゲンを含むことができる。別の例として、「C〜−C〜アルコキシフェニル」は、1個、2個もしくは3個の原子を含む1以上の同一もしくは異なるアルコキシ基を含むことができる。
下位構造I(sub)または下位構造II(sub)におけるR1a、R2a、R4aまたはR10での、または式(Ia)におけるHZでのR1a、R2a、R3a、R4a、R8aもしくはR10での水素原子の置換によって、式(Ia)の化合物は、当業者に公知の形でリンカーに結合していることができる。特に好ましくは、水素原子の置換は、R1a、R2a、R3a、R4aで、またはR2aおよびR4aによって形成されるピロリジン環で起こる。この結合は、実施例における図式2から16で例示的に示されているように、各種経路によって化学的に行うことができる。特に、例えば置換を促進するための保護基もしくは脱離基の導入によって、リンカーへの結合のために低分子量KSP阻害剤を修飾することが可能である場合がある(その反応において、水素原子ではない前記脱離基がリンカーによって置換される。)。次に、このようにして得られたKSP阻害剤−リンカー分子(そのリンカーはバインダーへの結合に関して反応性基を有する。)をバインダーと反応させることで、本発明によるバインダー複合体を得ることができる。実験の部において、この手順を、いくつかの実施例によって例示的に説明する。
1aに好ましいものは、−H、−COOH、−C(=O)−NHNH、−(CH1−3NH、−C(=O)−NZ″(CH1−3−NHおよび
−C(=O)−NZ″CHCOOHであり、
Z″は−Hまたは−NHを表す。
2aおよびR4aに好ましいものはHであるか、R2aおよびR4aが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は−Hを表す。
3aに好ましいものはC1−10−アルキル−であり、それは−OH、−O−アルキル、−SH、−S−アルキル、−O−C(=O)−アルキル、−O−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、−NH−C(=O)−NH−アルキル、−S(=O)−アルキル、−S(=O)−NH−アルキル、−NH−アルキル、−N(アルキル)または−NHによって置換されていても良く、
アルキルは好ましくはC1−3−アルキルであり、
nは0、1または2である。
8aに好ましいものは、分岐のC1−5−アルキル基、好ましくはメチル、エチル、n−プロピル、イソプロピル、n−ブチル、イソブチル、1−メチルプロピルおよびtert−ブチルである。
HZに好ましいものは、単環式または二環式複素環であり、それはハロゲン、C1−10−アルキル基、C6−10−アリール基およびC6−10−アラルキル基(ハロゲンによって置換されていても良い)からなる群から選択される1以上の置換基によって置換されていても良い。
特に好ましくは、HZは、置換されたピロール、ピラゾール、イミダゾール、キナゾリンまたはジヒドロキナゾリンであり、それは置換されていても良いベンジル基によってオルト位(R1aなどと置換基に関して)で置換されている。さらに、置換されたピロール、ピラゾール、イミダゾールまたはキナゾリンは好ましくは、オキソ(ジヒドロキナゾリンの場合)または1個もしくは2個のハロゲン原子によって置換されたフェニル基によって置換されていることができる。特に好ましくは、HZは、置換されたピロールである。
好ましく用いられるKSP阻害剤はイスピネシブである。さらなる好ましいKSP阻害剤はArry−520である。
構造KSP−L−の他の特に好ましい化合物は、下記の式(IIa)または(II)を有するもの、ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
式(IIa):
Figure 2018528161
式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;または
はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はCHもしくはCFを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHもしくはCFを表し、XはNを表し、XはCを表し;
(XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表すのが好ましい);
は−H、−L−#1、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
は−H、−L−#1、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
は−H、−L−#1、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
Zは−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
はR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−の基もしくはカテプシン開裂性基R21−(C=O)(0−1)−(P3)(1−2)−P2−を表し、
21はH、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基(それは、−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良い。)、−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;複数のアミノ酸P3がある場合、P3は、上記で定義の同一もしくは異なるアミノ酸を有することができ;
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は−H、ハロゲン(好ましくは−F)、−NH、−SOH、−COOH、−SHまたは−OHを表しピロリジン環中の2級アミノ基の水素原子がR21−C(=O)−P3(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−SIG−によって置き換わっていても良く;
L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;複数のアミノ酸P3がある場合、P3は、上記で定義の同一もしくは異なるアミノ酸を有することができ;
−SIGは、−C(=O)−SIG結合の開裂時に遊離2級アミンを与える自壊性基であり;
Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
は−L−#1、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個のO−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH((CHCHO)1−20H)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
nは0、1または2を表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NHC(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
は−L−#1、H、−MOD、−NH、−NO、ハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)、−CN、−CF、−OCF、−CHF、−CHF、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシ、−NO、−NH、−COOHまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
はC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキル、−または−(CH0−2−(HZ)を表し、
HZはN、OおよびSからなる群から選択される2個以下のヘテロ原子を有する4から7員の複素環を表し、これらの基のそれぞれは−OH、−COOHまたは−NHまたは−L−#1によって置換されていても良く;
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
置換基R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つが、−L−#1を表し(またはRの場合、含む)、
は−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表し;
上記で定義の−MODは−(NR10−(G1)−G2−G3を表し、
10は−HまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10は−NHを表さない。)を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−、−C(=O)−、−CR=N−O−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
いずれかの側鎖を含む炭化水素鎖は、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
は−H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
は−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
G3は−Hまたは−COOHを表し、
−MODは好ましくは、少なくとも一つの−COOH基を有する。
式(II):
Figure 2018528161
式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;または
はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はCHもしくはCFを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し、

は−H、−MOD、−L−#1または−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し,
は−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
は−L−#1、H、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
は−L−#1、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
Zは−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
はR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−の基もしくはカテプシン開裂性基R21−(C=O)(0−1)−(P3)(1−2)−P2−を表し、
21はH、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−S(=O)NH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)もしくは−OHで1回以上置換されていても良く、または−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;複数のアミノ酸P3がある場合、P3は、上記で定義の同一もしくは異なるアミノ酸を有することができ;
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は−H、ハロゲン(好ましくは−Fまたは−Cl)、−NH、−SOH、−COOH、−SH、C1−4−アルキル、C1−4−ハロアルキル、C1−4−アルコキシ、ヒドロキシ置換されたC1−4−アルキル、−C(=O)−O−(C1−4−アルキル)または−OHを表し、ピロリジン環中の2級アミノ基の水素原子がR21−C(=O)−P3(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−SIG−によって置き換わっていても良く;
L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
−SIGは、−C(=O)−SIG結合の開裂時に遊離2級アミンを与える自壊性基であり;
Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
は−L−#1、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくは−L−#1またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
nは0、1または2を表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NHC(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−H、−NH、−NO、ハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
はC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキル、または置換されていても良いオキセタンを表し;
は−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表し;
ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマー。
当業者に公知の形でのR、R、R、R、RもしくはRでの、またはRおよびRによって形成されたピロリジン環(R10)での水素原子の置換によって、置換基R、R、R、R、R、RおよびR10のうちのいずれも−L−#1を表さない式(IIa)または(II)の化合物をリンカーに結合させることができる。これによって、置換基R、R、R、R、R、RまたはR10のうちの一つが−L−#1を表し、Lがリンカーを表し、#1がバインダーまたはそれの誘導体の結合を表す式(IIa)または(II)の複合体が得られる。そこで、式(IIa)または(II)によるKSP阻害剤がバインダーと結合している場合、置換基R、R、R、R、R、RもしくはR10のうちの一つが−L−#1を表し、Lはリンカーを表し、#1はバインダーまたはそれの誘導体への結合を表す。すなわち、その複合体の場合、置換基R、R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つが−L−#1を表し、−L−#1はバインダー、例えば抗体への結合を表す。特に好ましくは、置換基RおよびRのうちの一つが−L−#1を表す。この実施形態において、Rが、上記で定義の−H、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−を表すことが好ましい。別の好ましい実施形態において、置換基Rは−L−#1を表し、リンカーはRに結合している窒素原子で開裂可能であることで、開裂によって1級アミノ基が生じる(R=−Hに相当)。相当する開裂性基については下記で説明する。
が−Hではない場合、Rに結合している炭素原子は立体中心であり、それはLおよび/またはD配置で、好ましくはL配置で存在することができる。
がではない場合、Rに結合している炭素原子は立体中心であり、それはLおよび/またはD配置で存在することができる。
バインダーは好ましくは、ヒト、ヒト化もしくはキメラモノクローナル抗体もしくはそれの抗原結合性断片、特には抗TWEAKR抗体もしくはそれの抗原結合性断片または抗EGFR抗体もしくはそれの抗原結合性断片である。特に好ましいものは、TWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)でアミノ酸Dに特異的に結合している抗TWEAKR抗体、特には抗TWEAKR抗体TPP−2090、または抗Her2抗体トラスツズマブである。記載の抗体全てが、PNGaseFによる脱グリコシルによって、または重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって生じるこれら抗体の脱グリコシル化変異体を含む。
置換基R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つが−L−#1を表し、
がNを表し、XがNを表し、XがCを表し;
がCHもしくはCFを表し、XがCを表し、XがNを表し;
がNHを表し、XがCを表し、XがCを表し;または
がCHを表し、XがNを表し、XがCを表す式(IIa)または(II)の化合物、
特には、XがNを表し、XがNを表し、XがCを表し;またはXがCHを表し、XがCを表し、XがNを表すものが特に好ましい。特に好ましいものは、XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表す化合物である。
Aに関して、好ましいものは−C(=O)−である。
に関して好ましいものは、−L−#1、−H、−COOH、−C(=O)−NHNH、−(CH1−3NH、−C(=O)−NZ″(CH1−3NHおよび−C(=O)−NZ″CHCOOHであり、Z″は−Hまたは−NHを表す。
およびRは、−Hを表し、またはRが−Hを表し、RがR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−を表し、またはRおよびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、R10が−Hまたは−L−#1を表す。
に関して好ましいものは、−L−#1またはC1−10−アルキル−であり、それは−OH、−O−アルキル、−SH、−S−アルキル、−O−C(=O)−アルキル、−O−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、−NH−C(=O)−NH−アルキル、−S(O)−アルキル、−S(=O)−NH−アルキル、−NH−アルキル、−N(アルキル)または−NHによって置換されていても良く;アルキルは好ましくはC1−3−アルキルであり、nは0、1または2である。
について好ましいものは−L−#1、−Hまたは−Fである。
およびRについて好ましいものは、互いに独立に、−H、(フッ素化されていても良い)C1−3−アルキル、(フッ素化されていても良い)C2−4−アルケニル、(フッ素化されていても良い)C2−4−アルキニル、ヒドロキシまたはハロゲンである。
について好ましいものは、分岐のC1−5−アルキル基、特には式−C(CH−(CH0−2−Rの基であり、Rは−H、−OH、−COOH、−NHまたは−L−#1を表す。特に好ましいものは、式−C(CH−(CH)−Rの基であり、Rは−Hまたは−L−#1を表す。
について好ましいものは−Hまたは−Fである。
特に好ましいものは、
置換基R、R、R、R、R、RおよびR10のうちで−L−#1を表すものが全くないか一つであり、
がNを表し、XがNを表し、XがCを表し;
がCHもしくはCFを表し、XがCを表し、XがNを表し;
がNHを表し、XがCを表し、XがCを表し;または
がCHを表し、XがNを表し、XがCを表し
Aが−C(=O)−を表し;
が−H、−COOH、−C(=O)−NHNH、−(CH1−3NH、−C(=O)−NZ″(CH1-3−NHおよび−C(=O)−NZ″CHCOOHを表し、Z″が−Hまたは−NHを表し;
およびRが−Hを表しまたはRが−Hを表し、RがR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−(P2およびP3は上記で定義のものと同じ意味を有する。)を表し、またはRおよびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、R10がHまたは−L−#1を表し;
が、ハロゲン(特にはF)またはフッ素化されていても良いC1−3−アルキルによってモノ置換もしくは多置換されていても良いフェニル基を表すか、フッ素化されていても良いC1−10−アルキル基[それは、−OY、−SY、−O−C(=O)−Y、−O−C(=O)−NH−Y、−NH−C(=O)−Y、−NH−C(=O)−NH−Y、−S(=O)−Y(nは0、1または2を表す。)、−S(=O)−NH−Y、−NH−Yまたは−N(Yによって置換されていても良く、Yは−H、フェニル(ハロゲン(特にはF)またはフッ素化されていても良いC1−3−アルキルによってモノ置換または多置換されていても良い)、またはアルキル(アルキル基は、−OH、−COOHおよび/または−NHC(=O)−C1−3−アルキルによって置換されていても良く、アルキルは好ましくは、C1−3−アルキルを表す。)を表す。]を表し;
特に好ましくはRが、−OH、−O−アルキル、−SH、−S−アルキル、−O−C(=O)−アルキル、−O−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、−NH−C(=O)−NH−アルキル、−S(=O)−アルキル(nは0、1または2を表す。)、−S(=O)−NH−アルキル、−NH−アルキル、−N(アルキル)または−NH(アルキルは好ましくは、C1−3−アルキルを意味する。)によって置換されていても良く、
が−Hまたは−Fを表し;
およびRが互いに独立に、−H、(フッ素化されていても良い)C1−3−アルキル、(フッ素化されていても良い)C2−4−アルケニル、(フッ素化されていても良い)C2−4−アルキニル、ヒドロキシまたはハロゲンを表し;
が分岐のC1−5−アルキル基を表し;
が−Hまたは−Fを表す、式(IIa)または(II)の化合物である。
さらに、(単独でまたは組み合わせて)、
●Rが−L−#1、−COOHまたは−Hを表し、
●RおよびRが互いに独立に−L−#1または−Hを表し;またはRが−Hを表し、RがR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−(P2およびP3は上記で定義のものと同じ意味を有する。)を表し、またはRおよびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、R10が−Hまたは−L−#1を表し、
●Aが−C(=O)−を表し、
●Rが−(CH)OH、−CH(CH)OH、−CH−S−CHCH(COOH)NH−C(=O)−CH、−CH(CH)OCH、フェニル基(1から3個のハロゲン原子、1から3個のアミノ基または1から3個のアルキル基(ハロゲン化されていても良い)によって置換されていても良い。)を表し、または−L−#1を表し、
●Rが−L−#1または−Hを表し、
●RおよびRが互いに独立に−H、C1−3−アルキルまたはハロゲンを表し;特には、RおよびRが−Fを表し;
●RがC1−4−アルキル(好ましくはtert−ブチル)を表し;および/または
●Rが−Hを表し、
●置換基R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つが−L−#1を表す場合が好ましい。
さらに、本発明によれば、
●Rが−L−#1、−COOHまたは−Hを表し、
●RおよびRが互いに独立に−L−#1または−Hを表し、またはRが−Hを表し、RがR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−(P2およびP3は上記で定義のものと同じ意味を有する。)を表し、またはRおよびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、R10が−Hまたは−L−#1を表し、
●Aが−C(=O)−を表し、
●Rが−(CH)OH、−CH(CH)OH、−CH−S−CHCH(COOH)NH−C(=O)−CH、−CH(CH)OCH、フェニル基[1から3個のハロゲン原子、1から3個のアミノ基または1から3個のアルキル基(ハロゲン化されていても良い)によって置換されていても良い。]を表し、−L−#1を表し、
●Rが−L−#1または−Hを表し、
●RおよびRが互いに独立に−H、C1−3−アルキルまたはハロゲンを表し;特には、RおよびRが−Fを表し;
●RがC1−4−アルキル(好ましくはtert−ブチル)を表し;
●Rが−Hを表し、
●置換基R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つが−L−#1を表す場合が好ましい。
他の特に好ましい化合物は、下記式(IIIa)または(III)を有するもの、ならびにそれの塩、溶媒和物および溶媒和物の塩である。
式(IIIa):
Figure 2018528161
式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;または
はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はCHもしくはCFを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し、
(XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表すのが好ましい);
は−H、−L−BINDER、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−NHY、−OY、−SY、ハロゲン、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
はHまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
は−L−BINDER、−H、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
は−L−BINDER、−H、−C(O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
はR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−の基を表し、
21は−H、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良く、または−Hまたは基−O−(CHCHO)−R22であり、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NHを表し;
P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は−L−BINDER、−H、−NH、−SOH、−COOH、−SHまたは−OHを表し;
Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
は−L−BINDER、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくは−L−BINDER、またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
nは0、1または2であり、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
「アルキル」は好ましくは、C1−10−アルキル)を表し;
は−L−BINDER、−H、−NH、−NO、ハロゲン(特にはF、Cl、Br)、−CN、−CF、−OCF、−CHF、−CHF、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシ、−NO、−NH、−COOHまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
はC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、
2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキルまたは−(CH0−2−(HZ)を表し、
HZはN、OおよびSからなる群から選択される2個以下のヘテロ原子を有する4から7員の複素環(好ましくはオキセタン)を表し、これらの基のそれぞれは−OH、−COOHまたは−NHまたは−L−BINDERによって置換されていても良く;
は−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表し;
Lはリンカーを表し、
BINDERはバインダーもしくはそれの誘導体を表し、当該バインダーは複数の活性化合物分子に結合していても良く、
、R、R、RおよびRの一つの代表的なものは−L−バインダーを表し;
−MODは−(NR10−(G1)−G2−Hを表し、
10は−HまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NHC(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10はNHを表さない。)を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
は−H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、または−C(=O)−、−CR=N−O−を表し、
は−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
いずれかの側鎖を含む炭化水素鎖は、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
−MODは好ましくは、少なくとも一つの基−COOHを有する。
式(IIIa)のKSP阻害剤のバインダー複合体の場合、R、R、R、R、RおよびR10の多くとも一つの代表的なもの(上記で提供の条件のうちの一つに代えて)が、−L−BINDERを表すことができ、Lはリンカーを表し、BINDERはバインダーもしくはそれの誘導体を表し、当該バインダーは複数の活性化合物分子に結合していても良い。
式(III):
Figure 2018528161
式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し、または
はCHを表し、XはCを表し、XはNを表し、または
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し、または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し;
は−H、−L−BINDERまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−NHY、−OY、−SY、ハロゲン、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
はHまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
およびRは互いに独立に、−L−BINDER、−H、−C(O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10はL−#1、−H、−NH、−SOH、−COOH、−SH、または−OHを表し;
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
は−L−BINDERまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくは−L−BINDER、またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
nは、0、1または2であり、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
「アルキル」は好ましくは、C1−10−アルキル)を表し;
は−L−BINDER、−H、−NH、−NO、ハロゲン(特にはF、Cl、Br)、−CN、−CF、−OCF、−CHF、−CHF、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシ、またはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
はC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキルまたは置換されていても良いオキセタンを表し;
は−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表し;
−Lはリンカーを表し、
−BINDERはバインダーもしくはそれの誘導体を表し、当該バインダーは複数の活性化合物分子に結合していても良く、
、R、R、R、RおよびR10の一つの代表的なものは−L−バインダーを表し;
ならびにそれの塩、溶媒和物および溶媒和物の塩。
さらに、本発明による好ましいものは、次のKSP阻害剤の複合体である。
式(IIIb):
Figure 2018528161
式中、
、X、Xは、式(IIIa)または(III)におけるものと同じ意味を有し(好ましくはXは−CH−を表し、Xは−C−を表し、Xは−N−を表す。)、R、R、R、R、R、R、RおよびRは、式(IIIa)または(III)におけるものと同じ意味を有し、Aは−C(=O)−を表し、Bは単結合、−O−CH−または−CH−O−を表し、R20は−NH、−F、−CFまたは−CHを表し、nは0、1または2を表す。
式(IIIc):
Figure 2018528161
式中、
、X、Xは、式(IIIa)または(III)(好ましくはXは−CH−を表し、Xは−C−を表し、Xは−N−を表す。)におけるものと同じ意味を有し;
A、R、R、R、R、RおよびRは、式(IIIa)または(III)におけるものと同じ意味を有し、Aは好ましくは、−C(=O)−を表し、Rは−CHOH、−CHOCH、−CH(CH)OHまたは−CH(CH)OCHを表す。
式(IIId):
Figure 2018528161
式中、
、X、Xは、式(IIIa)または(III)におけるものと同じ意味を有し(好ましくはXは−CH−を表し、Xは−C−を表し、Xは−N−を表す。);
A、R、R、R、RおよびRは、式(IIIa)または(III)におけるものと同じ意味を有し、Aは好ましくは、−C(=O)−を表し、Rは−CH−S−(CH0−4−CHY−COOHを表し、xは0または1であり、Yは−Hまたは−NHYを表し、Yは−Hまたは−C(=O)−CHを表す。
式(IIIe):
Figure 2018528161
式中、
は−CH−を表し、Xは−C−を表し、Xは−N−を表し;
A、R、R、R、R、RおよびRは、式(IIIa)または(III)におけるものと同じ意味を有し、Rは−L−BINDERを表す。
さらに、式(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)および(IIIe)の化合物において(単独でまたは組み合わせて)、
●ZがClまたはBrを表し;
●Rが−(CH0−3Zを表し、Zが−C(=O)−NYを表し、Yが−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′を表し、Yが−H、−NHまたは−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′を表し;
●Yが−Hを表し、Yが−(CHCHO)−CHCHZ′を表し、Z′が−COOHを表し;
●Yが−Hを表し、Yが−CHCHZ′を表し、Z′が−(C(=O)−NHCHYCOOHを表し;
●Yが−Hを表し、Yが−CHCHZ′を表し、Z′が−(C(=O)−NHCHYCOOHを表し、Y基の一方がi−プロピルを表し、他方が−(CH−NH−C(=O)−NHを表し;
●YがHを表し、Yが−CHCHZ′を表し、Z′が−(C(=O)−NHCHYCOOHを表し、Y基の一方が−CHを表し、他方が−(CH−NH−C(=O)−NHを表し;
●Yが−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
●少なくとも一つのYの代表的なものが、i−プロピルおよび−CHからなる群から選択され;
●Yが−Hを表し、Yが−CHCHZ′を表し、Z′が−C(=O)−NHCHYCOOHを表し、Yが−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
●Yがアミノベンジルを表し;
●Rが−(CH0−3Zを表し、Zが−SYを表し;
●Rが−C(=O)−CHY−NHYを表し、Yが−Hを表し;
●Rが−C(=O)−CHY−NHYを表し、Yが−C(=O)−CHY−NHを表し;
●RがR21−L−Ala−L−Ala−L−Asn−#を表し;
●Yが−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表す場合が好ましい。
さらに、式(IIa)または(IIIa)におけるR、RまたはRが−MODを表す場合、特にはRが−L−#1または−L−BINDERを表す場合(特には−Lが、−N−Rまたは−N−L−#1または−L−BINDERで直接開裂する開裂性リンカーであることで、RまたはLが−Hによって置き換わる場合)が好ましい。
特に好ましくは、Rは−MODを表し、RまたはRは−L−#1または−L−BINDERを表し、
−MODは−(NR10−(G1)−G2−Hを表し、
10は−HまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10はNHを表さない。)を表し;
nは、0または1であり;
oは0または1であり;
G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
は−H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、または−C(=O)−、−CR=N−O−を表し、
は−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
いずれかの側鎖を含む炭化水素鎖は、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
−MODは好ましくは、少なくとも一つの基−COOHを有する。
特に好ましくは、基−MODは、(好ましくは末端)−COOH基を、例えばベタイン基で有する。好ましくは、基−MODは、式−CH−S−(CH0−4−CHY−COOHを有し、xは0または1であり、Yは−Hまたは−NHYを表し、Yは−Hまたは−C(=O)−CHを表す。
他の特に好ましい化合物は、下記の式(IV)を有するもの、ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
Figure 2018528161
式中、
はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;
は−H、−L−BINDERまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−NHY、−OY、−SY、ハロゲン、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し,
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′または−CH(CHW)Z′を表し、
はHまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
およびRは互いに独立に−L−BINDER、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10はL−#1、−H、−NH、−SOH、−COOH、−SH、または−OHを表し;
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
は−L−BINDERまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、または−CH−S−(CH0−4−CHY−COOHを表し、
xは0または1であり、
は−Hまたは−NHYを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHを表し、
好ましくは−L−BINDER、またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
nは、0、1または2であり、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
「アルキル」は好ましくは、C1−10−アルキル)を表し;
は−L−BINDER、−H、−NH、−NO、ハロゲン(特にはF、Cl、Br)、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
Lはリンカーを表し、
BINDERはバインダーもしくはそれの誘導体を表し、当該バインダーは複数の活性化合物分子に結合していても良く;
およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し;
はC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキルまたは置換されていても良いオキセタンを表し;
は−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表し;
ただし、R、RおよびRが同時に−Hを表すことはない。
さらに、式(IIa)、(II)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)および(IV)の化合物において(単独でまたは組み合わせて)、
●ZがClまたはBrを表し;
●Rが−(CH0−3Zを表し、Zが−C(=O)−NYを表し、Yが−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′を表し、Yが−H、−NHまたは−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′を表し;
●Yが−Hを表し、Yが−(CHCHO)−CHCHZ′を表し、Z′が−COOHを表し;
●Yが−Hを表し、Yが−CHCHZ′を表し、Z′が−(C(=O)−NHCHYCOOHを表し;
●Yが−Hを表し、Yが−CHCHZ′を表し、Z′が−(C(=O)−NHCHYCOOHを表し、一方のYの代表的なものがi−プロピルを表し、他方が−(CH−NH−C(=O)−NHを表し;
●YがHを表し、Yが−CHCHZ′を表し、Z′が−(C(=O)−NHCHYCOOHを表し、一方のYの代表的なものが−CHを表し、他方が−(CH−NH−C(=O)−NHを表し;
●Yが−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
●少なくとも一つのYの代表的なものが、i−プロピルおよび−CHからなる群から選択され;
●Yが−Hを表し、Yが−CHCHZ′を表し、Z′が−C(=O)−NHCHYCOOHを表し、Yが−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
●Yがアミノベンジルを表し;
●Rが−(CH0−3Zを表し、Zが−SYを表し;
●Rが−C(=O)−CHY−NHYを表し、Yが−Hを表し;
●Rが−C(=O)−CHY−NHYを表し、Yが−C(=O)−CHY−NHを表し;
●RがR21−L−Ala−L−Ala−L−Asn−#を表し;
●Yが−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表す場合が好ましい。
好ましいものは、さらには、
がNを表し、XがNを表し、XがCを表し;または
がNを表し、XがCを表し、XがNを表し;または
がCHもしくはCFを表し、XがCを表し、XがNを表し;または
がNHを表し、XがCを表し、XがCを表し;または
がCHもしくはCFを表し、XがNを表し、XがCを表し;
(XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表すのが好ましい);
がH、−L−#1または−L−BINDER、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
Zが−H、−NHY、−OY、−SY、ハロゲン、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYが互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
がHまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′が−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wが−Hまたは−OHを表し、
が−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
が−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zが−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYが互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
が−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′が−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
が−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
が−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
が直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
が−HまたはR21−L−Ala−L−Ala−L−Asn−を表し;
21が−H、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良く、または−Hまたは基−O−(CHCHO)−R22であり、
xが0または1であり、
vが1から20の数字であり、
22が−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NHを表し;
Aが−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
が−L−#1または−L−BINDER、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくは−L−BINDER、またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
nが、0、1または2であり、
Zが−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYが互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
が−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′が−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
「アルキル」が好ましくは、C1−10−アルキル)を表し;
が−H、−MOD、−NH、−NO、ハロゲン(特にはF、Cl、Br)、−CN、−CF、−OCF、−CHF、−CHF、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zが−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYが互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
が−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′が−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
およびRが互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシ、−NO、−NH、−COOHまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
がC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、C4−10−シクロアルキルまたはフルオロ−C4−10−シクロアルキルを表し、
置換基RおよびRのうちの一つが−L−#1または−L−BINDERを表し、
Lがリンカーを表し、
#1がバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
BINDERがバインダーを表し、
が−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表し;
−MODが−(NR10−(G1)−G2−G3を表し、
10が−HまたはC−C−アルキルを表し;
G1が−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10は−NHを表さない。)を表し;
nが、0または1であり;
oが0または1であり;
G2が、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
が−H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、または−C(=O)−、−CR=N−O−を表し、
が−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
いずれかの側鎖を含む炭化水素鎖が、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
G3が−Hまたは−COOHを表し、
−MODが好ましくは、少なくとも一つの基−COOHを有する、式(IIa)、(II)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)または(IV)の化合物ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
好ましいものはさらに、
がNを表し、XがNを表し、XがCを表し;または
がNを表し、XがCを表し、XがNを表し;または
がCHもしくはCFを表し、XがCを表し、XがNを表し;または
がNHを表し、XがCを表し、XがCを表し;または
がCHもしくはCFを表し、XがNを表し、XがCを表し;
(XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表すのが好ましい);
が−H、−L−#1または−L−BINDER、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
Zが−H、−NHY、−OY、−SY、ハロゲン、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYが互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
がHまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′が−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wが−Hまたは−OHを表し、
が−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
が−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zが−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYが互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
が−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′が−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
が−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
が−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
が直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
が−HまたはR21−L−Ala−L−Ala−L−Asn−を表し;
21が−H、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良く、または−Hまたは基−O−(CHCHO)−R22であり、
xが0または1であり、
vが1から20の数字であり、
22が−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NHを表し;
Aが−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
が−L−#1または−L−BINDER、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
nが、0、1または2であり、
Zが−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYが互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
が−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′が−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
「アルキル」が好ましくは、C1−10−アルキル)を表し;
が−MOD、−H、−NH、−NO、ハロゲン(特にはF、Cl、Br)、−CN、−CF、−OCF、−CHF、−CHF、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zが−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYが互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
が−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′が−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
およびRが互いに独立に、−Hまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
がC1−10−アルキルまたはフルオロ−C1−10−アルキルを表し、
置換基RおよびRのうちの一つが−L−#1または−L−BINDERを表し、
Lがリンカーを表し、
#1がバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
BINDERがバインダーを表し、
が−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表し;
−MODが−CH−S−(CH0−4−CHY−COOHを表し、
xが0または1であり、、
がHまたはNHYを表し、
がHまたは−C(=O)−CHを表す、式(IIa)、(II)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)または(IV)の化合物、ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
本発明による特に好ましいものは、下記の式V、VIおよびVIIの化合物(R、R、R、RおよびRは上記で言及の意味を有する(例えば式(IIa)または(IIIa)について挙げたように)。)の複合体である。
Figure 2018528161
特に好ましいものは、RおよびRが−Hまたは−L−#1を表し;RおよびRが互いに独立に−L−#1または−Hを表し、またはRおよびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、R10が−Hまたは−L−#1を表し;Rが−CHOH、−CH(CH)OHまたは−L−#1を表し、置換基R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つが−L−#1を表す式V、VI、VIIの化合物である。特別に好ましいものは、相当する式VIの化合物である。
本発明の好ましい抗体薬物複合体(ADC類)は、下記式VIIのものである。
Figure 2018528161
式中、
mは0から2の数字であり;
nは0または1であり;
Xは−C(=O)−NHまたは−COOHを表し;
は自壊性リンカーを表し;
はリンカーを表し、
は、アミノ酸Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisのうちの一つ由来の残基であり;
は、アミノ酸Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキル−アミノ酸、好ましくはN−メチル−アミノ酸のうちの一つ(P3が複数ある場合、P3は異なる意味を有することができる。)のうちの一つ由来の残基であり;
D1は、式IIまたはIIaによるKSP(すなわち、リンカーLなし)であり;
RはZ−(C=O)−を表し、
qは0または1であり、
はC1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C5−10−ヘテロアリール−アルコキシ−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−S(=O)−NH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、−OH、−Hまたは基−O−(CHCHO)−Rで1回以上置換されていても良く、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NHを表し、
ABは抗体を表し、
sは1から20、好ましくは2から8の数字であり、特に好ましくは2から4、例えば4である。
本発明の好ましい抗体プロドラッグ複合体(APDC類)は、下記式IXのものである。
Figure 2018528161
式中、
mは0、1または2であり;
nは0または1であり;
Xは−C(=O)−NHまたは−COOHを表し;
は自壊性リンカーを表し;
はリンカーを表し;
はアミノ酸Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisのうちの一つ由来の残基であり;
は、アミノ酸Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキル−アミノ酸、好ましくはN−メチル−アミノ酸のうちの一つ(P3が複数ある場合、P3は異なる意味を有することができる。)のうちの一つ由来の残基であり;
は、式IIまたはIIaによるKSP(すなわち、リンカーLなし)であり;
RはZ−(C=O)−を表し、
qは0または1であり、
はC1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C5−10−ヘテロアリール−アルコキシ−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−S(=O)−NH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OH、−Hまたは基−O−(CHCHO)−Rで1回以上置換されていても良く、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NHを表し、
ABは抗体を表し、
sは1から20、好ましくは2から8の数字、特に好ましくは2から4、例えば4である。
リンカー
文献に、部位特異的に均一的に、例えば抗体などのバインダーに有機分子を共有結合的にカップリング(結合)させるための多様な選択肢が開示されている(例えば、Sochaj et al., Biotechnology Advances、近刊の論文(2015)、Panowski et al., MAbs , 34−45(2014))参照)。本発明に従って好ましいものは、トランスグルタミナーゼを用いる抗体のアクセプターグルタミン残基を介した抗体へのKSP阻害剤の結合である。そのようなアクセプターグルタミン類は、突然変異による、または脱グリコシル化抗体の形成による抗体の操作によって導入することができる。抗体における前記アクセプターグルタミン残基の数は、好ましくは2または4である。カップリングのためには、リンカーを用いる。リンカーは、イン・ビボで開裂可能なリンカーの群およびイン・ビボで安定なリンカーの群に分類することができる(L. Ducry and B. Stump, Bioconjugate Chem. 21, 5−13(2010)参照)。イン・ビボで開裂可能なリンカーは、イン・ビボで開裂可能な基を有し、そこで、イン・ビボで化学的に開裂可能な基とイン・ビボで酵素的に開裂可能な基の間で区別することが可能である。「イン・ビボで化学的に開裂可能な」および「イン・ビボで酵素的に開裂可能な」は、リンカーまたは基が循環中では安定であり、標的細胞でもしくは標的細胞内でのみ、そこでの化学的もしくは酵素的に異なる環境(比較的低いpH;高いグルタチオン濃度;レグマイン、カテプシンもしくはプラスチンなどのリソソーム酵素、または例えば、β−グルクロニダーゼ類などのグリオシダーゼ類(glyosidases)の存在)によって開裂することで、低分子量KSP阻害剤またはそれの誘導体を放出することを意味する。イン・ビボで化学的に開裂可能な基は、特にはジスルフィド、ヒドラゾン、アセタールおよびアミナールであり;酵素的にイン・ビボで開裂可能な基は、特に2−8−オリゴペプチド基、特別にはジペプチド基またはグリコシドである。ペプチド開裂部位は、Bioconjugate Chem. 2002, 13, 855−869およびBioorganic&Medicinal Chemistry Letters 8 (1998) 3341−3346、さらにはBioconjugate Chem. 1998, 9, 618−626に開示されている。これらには、例えば、バリン−アラニン、バリン−リジン、バリン−シトルリン、アラニン−リジンおよびフェニルアラニン−リジン(適宜に、さらなるアミド基を有する)などがある。
イン・ビボで安定なリンカーは、高い安定性(血漿中24時間後に5%未満の代謝物)によって区別され、上記のようなイン・ビボで化学的または酵素的に開裂可能基を持たない。
リンカー−L−は好ましくは、
下記の基本構造(i)から(iv):
(i)−(C=O)−SG1−L1−L2−
(ii)−(C=O)−L1−SG−L1−L2−
(iii)−(C=O)−L1−L2−
(iv)−(C=O)−L1−SG−L2
のうちの一つを有し、
mは0または1であり;SGは、(化学的にまたは酵素的に)イン・ビボで開裂可能な基(特に、ジスルフィド、ヒドラゾン、アセタールおよびアミナール;またはプロテアーゼによって開裂可能な2から8オリゴペプチド基)であり、SG1はオリゴペプチド基または好ましくはジペプチド基であり、L1は互いに独立に、イン・ビボで安定な有機基を表し、L2は、バインダーに対するカップリング基を表す。
本発明に従って特に好ましいものは、特にはバインダーが抗体である場合に、基本的リンカー構造(iii)である。代謝により、基本的リンカー構造(iii)を有する本発明による複合体の投与およびトランスグルタミナーゼを用いるバインダータンパク質またはペプチドのグルタミン残基へのリンカーのカップリングによって、下記式のグルタミン誘導体が生じる。
Figure 2018528161
式中、L1は、各場合で、低分子量KSP阻害剤、例えば式式(I)、(IIa)、(II)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)または(IV)から(IX)のいずれかの化合物に結合している。
本発明によれば、L1は好ましくは、下記式によって表される。
Figure 2018528161
式中、
10は、H、−NHまたはC−C−アルキルを表し;
G1は、−NH−C(=O)−、−C−(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が、−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合はR10は好ましくはNHではない。)を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G3は、結合またはアリーレン基からの1から100個の炭素原子を有する置換されていても良い直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖および/または直鎖および/または分岐および/または環状のアルキレン基を表し、それは基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NR−C(=O)−、−C(NH)NR−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−(Rは、H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、それらはそれぞれ−NH−C(=O)−NHN、−COOH、−OH、−NH、NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良い。)、−C(=O)−、−CR=N−O−(Rは、H、C−C−アルキルまたはフェニルを表す。)および/または4個以下のN、OおよびS、−S(=O)−または−S(=O)−からなる群から選択されるヘテロ原子を有する3から10員の芳香族もしくは非芳香族複素環(好ましくは
Figure 2018528161
)の1以上によって1回もしくは複数回中断されていても良く、側鎖を含む炭化水素は、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良い。
G3は、結合またはアリーレン基からの1から100個の炭素原子を有する置換されていても良い直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖および/または直鎖および/または分岐および/または環状アルキレン基を表し、それは基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NH−、−C(=O)−、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−、−NMe−、−NHNH−、−S(=O)−NHNH−、−C(=O)−NHNH−およびN、OおよびS、または−S(=O)−からなる群から選択される4個以下のヘテロ原子を有する5から10員の芳香族または非芳香族複素環(好ましくは
Figure 2018528161
)の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、前記側鎖が存在する場合、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良い。
G3は好ましくは、結合またはアリーレン基からの1から100個の炭素原子を有する置換されていても良い直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖および/または直鎖および/または分岐および/または環状アルキレン基を表し、それは基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NH−、−C(=O)−、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−、−NMe−、−NHNH−、−S(=O)−NHNH−、−C(=O)−NHNH−、−CR=N−O−(Rは、H、C1−C3−アルキルまたはフェニルを表す。)およびN、OおよびS、−S(=O)−または−S(=O)−からなる群から選択される4個以下のヘテロ原子を有する3から10員、例えば5から10員の芳香族または非芳香族複素環(好ましくは
Figure 2018528161
または
Figure 2018528161
)の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、側鎖を含む炭化水素鎖が存在する場合、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良い。
G3におけるさらなる中断基は、好ましくは
Figure 2018528161
であり、
は、H、C−C−アルキルまたはフェニルを表す。
ここで、#はKSP阻害剤への結合であり、#はバインダーへのカップリング基への結合である(例えばL2)。
アリーレン基および/または直鎖および/または分岐および/または環状アルキレン基の直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖は通常、言及される個々の数の炭素原子を有するα,ω−二価アルキル基を含む。好ましいものとして挙げることができる例いは、メチレン、エタン−1,2−ジイル(1,2−エチレン)、プロパン−1,3−ジイル(1,3−プロピレン)、ブタン−1,4−ジイル(1,4−ブチレン)、ペンタン−1,5−ジイル(1,5−ペンチレン)、ヘキサン−1,6−ジイル(1,6−ヘキシレン)、ヘプタン−1,7−ジイル(1,7−ヘキシレン)、オクタン−1,8−ジイル(1,8−オクチレン)、ノナン−1,9−ジイル(1,9−ノニレン)、デカン−1,10−ジイル(1,10−デシレン)である。しかしながら、炭化水素鎖におけるアルキレン基は分岐であることもでき、すなわち上記で言及の直鎖アルキレン基の1以上の水素原子がC1−10−アルキル基によって置換されていることで、側鎖を形成していることができる。炭化水素鎖はさらに、環状アルキレン基(シクロアルカンジイル)、例えば1,4−シクロヘキサンジイルまたは1,3−シクロペンタンジイルを含んでいても良い。これらの環状基は不飽和であっても良い。特に、その炭化水素基には、芳香族基(アリーレン基)、例えばフェニレンが存在しても良い。そして、環状アルキレン基およびアリーレン基において、やはり、1以上の水素原子がC1−10−アルキル基によって置換されていても良い。このようにして、分岐していても良い炭化水素鎖が形成される。この炭化水素鎖は、合計0から100個の炭素原子、好ましくは1から50個、特に好ましくは2から25個の炭素原子を有する。
側鎖が存在する場合、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良い。
当該炭化水素鎖は、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NH−、−C(=O)−、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−、−NMe−、−NHNH−、−S(O)−NHNH−、−C(=O)−NHNH−ならびにN、OおよびS、−S(=O)−または−S(O)−からなる群から選択される4個以下のヘテロ原子を有する5から10員の芳香族または非芳香族複素環(好ましくは
Figure 2018528161
)の1以上によって同一でまたは異なって1回または複数回中断されていても良い。
G3におけるさらなる中断基は好ましくは、
Figure 2018528161
である。
本発明によれば、L2は好ましくは、下記式:
Figure 2018528161
によって表され、
pは0または1であり;
qは0または1であり;
G4は、置換されていても良いアルキルまたはヘテロアルキル鎖を表し、その鎖のいずれかの炭素がアルコキシ、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、−S−アルキル、チオール、−C(=O)−S−アルキル、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、アミン、−C(=O)−NHによって置換されていても良く、
は、基Lへの結合箇所を示し、
は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示す。
好ましくは、L2は、次の基のうちの一つ:
Figure 2018528161
であり、
は−H、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、−C(=O)−NH、−NHであり、
は、基Lへの結合箇所を示し、
は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示す。
好ましくはRは、−Hまたは−NH−C(=O)−Meである。
好ましくは、リンカーは、下記式に相当する。
Figure 2018528161
式中、
mは0または1であり;
§は、活性化合物分子への結合を表し、
§§は、バインダーペプチドもしくはタンパク質への結合を表し、
L1およびL2は上記で提供の意味を有する。
上記で言及したリンカーは、リンカーがRもしくはRでの水素原子の置換によってカップリングする式(I)または(II)の複合体で、またはR4での開裂可能リンカーSG1と組み合わせたものが特に好ましく、すなわちRが−L−#1を表し、またはRが−L−#1を表し、またはRが−SG1−L−#1を表し、#1がバインダーへの結合を表す。
上記の式§−(C=O)−L1−L2−§§における好ましい基L1は下記のものであり、各場合でのrは、互いに独立には、0から20、好ましくは0から15、特に好ましくは1から20、特別に好ましくは2から10の数字を表す。
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
相当するリンカーを有する複合体の例は、下記の構造を有し、X1、X2、X3、RyおよびL1は上記で提供の意味を有し、AKはバインダー、好ましくはグルタミン側鎖に結合した抗体を表し、nは2から10、好ましくは2から4、そして好ましくは2または4である。特に好ましくは、AKは、ヒト、ヒト化もしくはキメラモノクローナル抗体もしくはそれの抗原結合性断片、特には抗TWEAKR抗体もしくはそれの抗原結合性断片または抗EGFR抗体もしくはそれの抗原結合性断片である。バインダーが抗体である場合、それは優先的に定常領域にアクセプターグルタミンを含む。そのようなアクセプターグルタミン類は、好適な位置のグルタミンへの突然変異(例えば突然変異N297Q、Kabat EUナンバリング)または脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の形成(例えば、PNGase Fによる酵素的脱グリコシルによって、またはN297X、Kabat EUナンバリングの突然変異によって)によって導入することができる。その後者の脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の場合、グルタミンQ295(Kabat EUナンバリング)はアクセプターグルタミンになる。非常に好ましいものは、突然変異N297AまたはN297Q(Kabat EUナンバリング)を含む抗体である。特に好ましいものは、TWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)でアミノ酸Dに特異的に結合している抗TWEAKR抗体、特には抗TWEAKR抗体TPP−2090、または抗Her2抗体である。記載の抗体全てが、PNGaseFによる脱グリコシルによって、または重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって生じるこれら抗体の脱グリコシル化変異体を含む。
Figure 2018528161
Figure 2018528161
本発明に従って好ましいものはさらに、基本構造(i)、(ii)または(iv)であり、それらにおいて、SG1またはSGはカテプシンによって開裂可能な基を表し、L1およびL2は上記で提供の意味を有する。特に好ましいものは、下記の基である。
●−NH−Val−Ala−CONH−(これにより、アラニンのC末端アミドでのアミド結合の開裂)
●−NH−Val−Lys−CONH−(リジンのC末端アミドでのアミド結合の開裂)
●−NH−Val−Cit−CONH−(シトルリンのC末端アミドでのアミド結合の開裂)
●−NH−Phe−Lys−CONH(リジンのC末端アミドでのアミド結合の開裂)
●−NH−Ala−Lys−CONH−(リジンのC末端アミドでのアミド結合の開裂)
●−NH−Ala−Cit−CONH−(シトルリンのC末端アミドでのアミド結合の開裂)。
SG1またはSGは特に好ましくは
Figure 2018528161
であり、
Xは、−HまたはC1−10−アルキル基を表し、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、NH、−NH−CNNHまたはスルホン酸によって置換されていても良い。
下記の表は、リンカー部分−SG1−L1−または−L1−SG−L1−の例を提供するものであり、SG1およびSGは、カテプシンによって開裂し得る基である。L1基が四角で強調されている。しかしながら、これらの基L1は、上記の式§−(C=O)−L1−L2−§§について提供される基L1のうちの一つによって置き換わっていることができる。
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
構造(i)を有する複合体の例は、下記の構造を有し、X1、X2、X3、R1およびRyは上記で提供の意味を有し、AKはバインダー、好ましくはグルタミン側鎖に結合した抗体を表し、nは2から10、好ましくは2から4、そして好ましくは2または4である。特に好ましいものは、TWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)でアミノ酸Dに特異的に結合している抗TWEAKR抗体、特には抗TWEAKR抗体TPP−2090である。記載の抗体全てが、PNGaseFによる脱グリコシルによって、または重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって生じるこれら抗体の脱グリコシル化変異体を含む。
Figure 2018528161
KSP阻害剤−リンカー−中間体および複合体の製造
本発明による複合体は、最初に低分子量KSP阻害剤にリンカーを提供することによって製造される。次に、このようにして得られた中間体をトランスグルタミナーゼを用いてバインダー(好ましくは抗体)と反応させる。好ましくは、グルタミン側鎖への部位特異的カップリングのため、下記の化合物のうちの一つを、トランスグルタミナーゼを用いて、抗体などのアクセプターグルタミン含有バインダーと反応させる。
Figure 2018528161
Figure 2018528161
式中、X、X、X、SG、L1、R1およびRyは、上記と同じ意味を有する。上記の式においては、遊離アミノ基(−NH)に代えて、基R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CH−C(=O)−NH)−C(=O)−NH−が存在しても良い(R21、P2およびP3は、例えば式(IIa)に関して上記で定義のものと同じ意味を有する。)。
バインダーが抗体である場合、それは優先的に定常領域にアクセプターグルタミンを含む。そのようなアクセプターグルタミン類は、好適な位置のグルタミンへの突然変異(例えば突然変異N297Q、Kabat EUナンバリング)または脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の形成(例えば、PNGase Fによる酵素的脱グリコシルによって、またはN297X、Kabat EUナンバリングの突然変異によって)によって導入することができる。その後者の脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の場合、グルタミンQ295(Kabat EUナンバリング)はアクセプターグルタミンになる。非常に好ましいものは、突然変異N297AまたはN297Q(Kabat EUナンバリング)を含む抗体である。
当該化合物は、例えばそれのトリフルオロ酢酸塩の形態で用いることができる。例えば抗体との反応に関しては、当該化合物は、バインダーに関して、2から100倍モル過剰で、より好ましくは10から100倍モル過剰で、さらにより好ましくは50から100倍モル過剰で用いる。
グルタミン側鎖への中間体カップリングについては、反応は次のように示すことができる。
他の中間体および他の抗体は、それに応じて反応させることができる。
Figure 2018528161
本発明によれば、これは次の複合体を提供する。
Figure 2018528161
上記式において、X、X、XおよびR1は、式(II)におけるものと同じ意味を有し、SG、RおよびL1は上記のものと同じ意味を有する。AKはグルタミン側鎖にカップリングした抗体である。特に好ましくは、AK1は、抗TWEAKR抗体、特にはTWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)でアミノ酸Dに特異的に結合している抗体、特には抗TWEAKR抗体TPP−2090である。記載の抗体全てが、PNGaseFによる脱グリコシルによって、または重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって生じるこれら抗体の脱グリコシル化変異体を含む。
特に好ましいKSP−阻害剤−複合体
特に好ましいものは、次の複合体であり、AK3a、AK3b、AK3d、AK3eはバインダー、好ましくは抗体を表し、nは2から10、好ましくは2から4、やはり好ましくは2または4を表す。好ましい抗体は、セクション「BINDER類」で下記に記載のもの、特には抗体TPP−2090−HC−N297A(特にはAK3aとして)、抗体TPP−2090−HC−N297Q(特にはAK3bとして)、トラスツズマブ(TPP−7510)(トラスツズマブ−HC−N297Aに等しい)(特にはAK3dとして)、およびトラスツズマブ(TPP−7511)(トラスツズマブ−HC−N297Qに等しい)(特にはAK3eとして)である。
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
置換基の定義
アルキル
アルキルは、1から10、好ましくは1から6(C−C−アルキル)、より好ましくは1から4(C−C−アルキル)、特に好ましくは1から3(C−C−アルキル)個の炭素原子を有する直鎖もしくは分岐の飽和一価炭化水素基を表す。
好ましいものとして挙げることができる例には、メチル−、エチル−、プロピル−、ブチル−、ペンチル−、ヘキシル−、イソプロピル−、イソブチル−、sec−ブチル、tert−ブチル−、イソペンチル−、2−メチルブチル−、1−メチルブチル−、1−エチルプロピル−、1,2−ジメチルプロピル、ネオペンチル−、1,1−ジメチルプロピル−、4−メチルペンチル−、3−メチルペンチル−、2−メチルペンチル−、1−メチルペンチル−、2−エチルブチル−、1−エチルブチル−、3,3−ジメチルブチル−、2,2−ジメチルブチル−、1,1−ジメチルブチル−、2,3−ジメチルブチル−、1,3−ジメチルブチル−、1,2−ジメチルブチル−がある。特に好ましいものは、メチル、エチル、プロピル、イソプロピルまたはtert−ブチル基である。
ヘテロアルキル
ヘテロアルキルは、上記の「アルキル」下に定義のアルキルを表し、−O−、−S−、−NH−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−によって中断されているものである。
シクロアルキル
シクロアルキルは、3から10(C−C10−シクロアルキル)、好ましくは3から8(C−C−シクロアルキル)、特に好ましくは3から7(C−C−シクロアルキル)個の炭素原子を有する単環式飽和一価炭化水素基を表す。
好ましいものとして挙げることができる単環式シクロアルキル基の例には、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシルおよびシクロヘプチルがある。
特に好ましいものは、シクロプロピル、シクロペンチルまたはシクロヘキシル基である。
アラルキル
アリール−C−C−アルキル−は、置換されていても良いアリール基およびC−C−アルキル基から構成され、C−C−アルキル基を介して分子の残りの部分に結合している基を意味するものと理解される。ここで、そのアルキル基は、アルキル下で上記にて提供の意味を有する。
挙げることができる例には、ベンジル、フェニルエチル、フェニルプロピル、フェニルペンチルなどがあり、ベンジルが好ましい。
アルコキシ
アルコキシは、1から6(C−C−アルコキシ)、好ましくは1から4(C−C−アルコキシ)、特に好ましくは1から3(C−C−アルコキシ)個の炭素原子を有する式−O−アルキルの直鎖もしくは分岐の飽和アルキルエーテル基を表す。
好ましいものとして挙げることができる例には、メトキシ、エトキシ、n−プロポキシ、イソプロポキシ、tert−ブトキシ、n−ペンチルオキシおよびn−ヘキシルオキシがある。
アラルコキシ
アラルコキシは、置換されていても良いアリール基およびC−C−アルコキシ基から構成され、C−C−アルコキシ基を介して分子の残りの部分に結合している基を意味するものと理解される。ここで、アルコキシ基は、上記で定義の意味を有する。
挙げることができる例には、ベンジルオキシ、フェニルエチルオキシ、フェニルプロピルオキシ、フェニルペンチルオキシなどがあり、ベンジルオキシが好ましい。
アルコキシアルキル
アルコキシアルキルは、アルコキシによって置換されたアルキル基を表し、例えばC−C−アルコキシ−C−C−アルキル−またはC−C−アルコキシ−C−C−アルキル−である。
ここで、C−C−アルコキシ−C−C−アルキル−は、アルコキシアルキル基が分子の残りの部分にアルキル部分を介して結合していることを意味する。
ヘテロ原子
ヘテロ原子は、酸素、窒素または硫黄原子を意味するものと理解される。
アリール
アリールは炭素原子からなる一価の単環式もしくは二環式芳香環系を表す。例には、ナフチル−およびフェニル−などがあり、好ましいものはフェニル−またはフェニル基である。
ヘテロアリール
ヘテロアリールは、同一であっても異なっていても良い1、2、3もしくは4個のヘテロ原子を有する1価の単環式もしくは二環式芳香環系を表す。ヘテロ原子は窒素原子、酸素原子または硫黄原子であることができる。結合価は、芳香族炭素原子または窒素原子でのものであることができる。
本発明による単環式ヘテロアリール基は、5個もしくは6個の環原子を有する。
好ましいモノは、1個もしくは2個のヘテロ原子を有するヘテロアリール基である。ここで、特に好ましいものは、1個もしくは2個の窒素原子である。
5個の環原子を有するヘテロアリール基には、例えば、次の環:
チエニル、チアゾリル、フリル、ピロリル、オキサゾリル、イミダゾリル、ピラゾリル、イソオキサゾリル、イソチアゾリル、オキサジアゾリル、トリアゾリル、テトラゾリルおよびチアジアゾリルなどがある。
6個の環原子を有するヘテロアリール基には、例えば、次の環:
ピリジニル、ピリダジニル、ピリミジニル、ピラジニルおよびトリアジニルなどがある。
本発明による二環式ヘテロアリール基は、9個または10個の環原子を有する。
9個の環原子を有するヘテロアリール基には、例えば、次の環:
フタリジル、チオフタリジル、インドリル、イソインドリル、インダゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾフリル、ベンゾチエニル、ベンゾイミダゾリル、ベンゾオキサゾリル、アゾシニル、インドリジニル、プリニル、インドリニルなどがある。
10個の環原子を有するヘテロアリール基には、例えば、下記の環:
イソキノリニル、キノリニル、キノリジニル、キナゾリニル、キノキザリニル、シンノリニル、フタラジニル、1,7−および1,8−ナフチリジニル、プテリジニル、クロマニルなどがある。
ヘテロアリールはさらに、部分飽和二環式アリールおよび部分飽和二環式ヘテロアリールの意味を有する。
部分飽和二環式アリールおよび部分飽和二環式ヘテロアリール
部分飽和二環式アリール基またはヘテロアリール基は、各場合で2個の直接隣接する環原子を介して、4から7個の環原子を有し、同一もしくは異なっていても良い1個もしくは2個のヘテロ原子を含んでいても良い脂肪族環状基に縮合しているフェニル基または単環式5員もしくは6員のヘテロアリール基からなる二環式基を表す。そのヘテロ原子は、窒素原子、酸素原子または硫黄原子であることができる。
部分飽和二環式アリール基には、例えば、下記の基:
テトラヒドロナフチル、2,3−ジヒドロ−1,4−ベンゾジオキシニル、2,3−ジヒドロ−1−ベンゾフラニルおよび1,3−ベンゾジオキソリルなどがある。
部分飽和二環式ヘテロアリール基には、例えば、下記の基:
5,6,7,8−テトラヒドロキノリニル−および5,6,7,8−テトラヒドロイソキノリニル−などがある。
複素環アルキル
複素環アルキルは、単環式複素環、ヘテロスピロシクロアルキルおよび架橋複素環アルキルを意味する。
単環式複素環
単環式複素環は、同一でも異なっていても良い1、2または3個のヘテロ原子を有する非芳香族単環式環系を意味する。ヘテロ原子は、窒素原子、酸素原子または硫黄原子であることができる。
本発明による単環式複素環環は、3から8個、好ましくは4から7個、特に好ましくは5個もしくは6個の環原子を有することができる。
例えば好ましくは、次のもの:アジリジニル−が、3個の環原子を有する単環式複素環基について挙げられる。
例えば好ましくは、次のもの:アゼチジニル−、オキセタニル−が、4個の環原子を有する単環式複素環基について挙げられる。
例えば好ましくは、次のもの:ピロリジニル−、イミダゾリジニル−、ピラゾリジニル−、ピロリニル−、ジオキソラニル−およびテトラヒドロフラニル−が、5個の環原子を有する単環式複素環基について挙げられる。
例えば好ましくは、次のもの:ピペリジニル−、ピペラジニル−、モルホリニル−、ジオキサニル−、テトラヒドロピラニル−およびチオモルホリニル−が、6個の環原子を有する単環式複素環基について挙げられる。
例えば好ましくは、次のもの:アゼパニル−、オキセパニル−、1,3−ジアゼパニル−、1,4−ジアゼパニル−が、7個の環原子を有する単環式複素環基について挙げられる。
例えば好ましくは、次のもの:オキソカニル−、アゾカニル−が、8個の環原子を有する単環式複素環基について挙げられる。
単環式複素環基の中からは、O、NおよびSからなる群からの2個以下のヘテロ原子を有する4から7員の飽和複素環基が好ましい。
特に好ましいものは、モルホリニル−、ピペリジニル−およびピロリジニル−である。
スピロシクロアルキルおよびヘテロスピロシクロアルキル
いずれかの組み合わせで1個、2個、3個もしくは4個の炭素原子が上記で定義のヘテロ原子によって置き換わっているC−C12−スピロシクロアルキルまたはC−C12−ヘテロスピロシクロアルキルは、1個の共通の原子を共有する二つの飽和環系の縮合を意味するものと理解される。例には、スピロ[2.2]ペンチル、スピロ[2.3]ヘキシル、アザスピロ[2.3]ヘキシル、スピロ[3.3]ヘプチル、アザスピロ[3.3]ヘプチル、オキサアザスピロ[3.3]ヘプチル、チアアザスピロ[3.3]ヘプチル、オキサスピロ[3.3]ヘプチル、オキサザスピロ[3.5]ノニル、オキサザスピロ[3.4]オクチル、オキサザスピロ[5.5]ウンデシル、ジアザスピロ[3.3]ヘプチル、チアザスピロ[3.3]ヘプチル、チアザスピロ[3.4]オクチル、アザスピロ[5.5]デシル、および定義に従ってヘテロ原子によって修飾された変形形態を含むさらなる同族のスピロ[3.4]、スピロ[4.4]、スピロ[5.5]、スピロ[6.6]、スピロ[2.4]、スピロ[2.5]、スピロ[2.6]、スピロ[3.5]、スピロ[3.6]、スピロ[4.5]、スピロ[4.6]およびスピロ[5.6]系がある。好ましいものは、C−C10−ヘテロスピロシクロアルキル−であり、例えば特に好ましいものは2−アザスピロ[3.3]ヘプチル−、1−チア−6−アザスピロ[3.3]ヘプチル−、2−チア−6−アザスピロ[3.3]ヘプチル−、2−オキサ−6−アザスピロ[3.3]ヘプチル−、2,6−ジアザスピロ[3.3]ヘプチル−、2−オキサ−6−アザスピロ[3.4]オクチル−、2−オキサ−6−アザスピロ[3.5]ノニル−、2−オキサ−7−アザスピロ[3.5]ノニル−、8−アザスピロ[4.5]デシル−、2,8−ジアザスピロ[4.5]デシル−、3−オキサ−1,8−ジアザスピロ[4.5]デシル−である。
ビシクロアルキルおよびヘテロビシクロアルキル
いずれかの組み合わせで上記のように定義のヘテロ原子によって1個、2個、3個もしくは4個の炭素原子が置き換わっているC−C12−ビシクロアルキルまたはC−C12−ヘテロビシクロアルキルは、2個の直接隣接する原子を共有する二つの飽和環系の縮合体を意味するものと理解される。例には、ビシクロ[2.2.0]ヘキシル−、ビシクロ[3.3.0]オクチル−、ビシクロ[4.4.0]デシル−、ビシクロ[5.4.0]ウンデシル−、ビシクロ[3.2.0]ヘプチル−、ビシクロ[4.2.0]オクチル−、ビシクロ[5.2.0]ノニル−、ビシクロ[6.2.0]デシル−、ビシクロ[4.3.0]ノニル−、ビシクロ[5.3.0]デシル−、ビシクロ[6.3.0]ウンデシル−およびビシクロ[5.4.0]ウンデシル−であり、ヘテロ原子によって修飾された変形形態、例えばアザビシクロ[3.3.0]オクチル−、アザビシクロ[4.3.0]ノニル−、ジアザビシクロ[4.3.0]ノニル−、オキサザビシクロ[4.3.0]ノニル−、チアザビシクロ[4.3.0]ノニル−もしくはアザビシクロ[4.4.0]デシル−、ならびに定義によるさらなる可能な組み合わせから誘導される基である。好ましいものは、C−C10−ヘテロビシクロアルキルであり、例えば特に好ましいものは、パーヒドロシクロペンタ[c]ピロリル−、パーヒドロフロ[3,2−c]ピリジニル−、パーヒドロピロロ[1,2−a]ピラジニル−、パーヒドロピロロ[3,4−c]ピロリル−である。
−C12−ビシクロアルキル−の好ましい例は、パーヒドロナフタレニル−(デカリニル−)、パーヒドロベンゾアンヌレニル−、パーヒドロアズレニル−、パーヒドロインダニル−、パーヒドロペンタレニル−である。
架橋シクロアルキルおよび架橋複素環アルキル
架橋C−C12−シクロアルキル−または架橋C−C12−複素環アルキル−などの架橋C−C12環系は、互いに直接隣接しない2個の原子を共有する少なくとも二つの飽和環の縮合を意味するものと理解される。これによって、架橋炭素環(架橋シクロアルキル−)またはいずれかの組み合わせで上記で定義のヘテロ原子によって1個、2個、3個もしくは4個の炭素原子が置き換わっている架橋複素環(架橋複素環アルキル−)が生じ得る。例には、ビシクロ[2.2.1]ヘプチル−、アザビシクロ[2.2.1]ヘプチル−、オキサザビシクロ[2.2.1]ヘプチル−、チアザビシクロ[2.2.1]ヘプチル−、ジアザビシクロ[2.2.1]ヘプチル−、ビシクロ[2.2.2]オクチル−、アザビシクロ[2.2.2]オクチル−、ジアザビシクロ[2.2.2]オクチル−、オキサザビシクロ[2.2.2]オクチル−、チアザビシクロ[2.2.2]オクチル−、ビシクロ[3.2.1]オクチル−、アザビシクロ[3.2.1]オクチル−、ジアザビシクロ[3.2.1]オクチル−、オキサザビシクロ[3.2.1]オクチル−、チアザビシクロ[3.2.1]オクチル−、ビシクロ[3.3.1]ノニル−、アザビシクロ[3.3.1]ノニル−、ジアザビシクロ[3.3.1]ノニル−オキサザビシクロ[3.3.1]ノニル−、チアザビシクロ[3.3.1]ノニル−、ビシクロ[4.2.1]ノニル−、アザビシクロ[4.2.1]ノニル−、ジアザビシクロ[4.2.1]ノニル−、オキサザビシクロ[4.2.1]ノニル−、チアザビシクロ[4.2.1]ノニル−、ビシクロ[3.3.2]デシル−、アザビシクロ[3.3.2]デシル−、ジアザビシクロ[3.3.2]デシル−、オキサザビシクロ[3.3.2]デシル−、チアザビシクロ[3.3.2]デシル−またはアザビシクロ[4.2.2]デシル−および定義によるさらなる可能な組み合わせがある。好ましいものは架橋C−C10−複素環アルキル−であり、例えば特に好ましくは、2−アザビシクロ[2.2.1]ヘプチル−、2,5−ジアザビシクロ[2.2.1]ヘプチル−、2−オキサ−5−アザビシクロ[2.2.1]ヘプチル−,8−アザビシクロ[3.2.1]オクチル−、8−オキサ−3−アザビシクロ[3.2.1]オクチル−、3,9−ジアザビシクロ[4.2.1]ノニル−である。
ハロゲン化アルキル基
ハロゲン化アルキル基は、少なくとも1個のハロゲン置換基を有するアルキル基である。ハロ−C−C−アルキル基は、1から6個の炭素原子および少なくとも1個のハロゲン置換基を有するアルキル基である。複数のハロゲン置換基が存在する場合、これらは互いに異なっていても良い。好ましいものは、フルオロ−C−C−アルキル、フルオロ−C−C−アルキルおよびフルオロ−C−C−アルキル基である。同様に好ましいものとして挙げることができる例は、トリフルオロメチル、2,2,2−トリフルオロエチル、ペンタフルオロエチル、4,4,5,5,5−ペンタフルオロペンチルまたは3,3,4,4,5,5,5−ヘプタフルオロペンチル基である。
好ましいものは、トリフルオロメチルまたはペンタフルオロエチルなどのパーフルオロアルキル基である。
さらなる定義
「TGase」または「TG」と互換的に用いられる「トランスグルタミナーゼ」という用語は、ペプチド結合グルタミンのγ−カルボキサミド基とリジンもしくは構造的に関連のある1級アミン、例えばアミノペンチル基、例えばペプチド結合リジンのε−アミノ基との間のアシル転位反応によるタンパク質を架橋して8−(y−グルタミル)リジンイソペプチド結合を形成することができる酵素を指す。TGase類には、特には、細菌トランスグルタミナーゼ(BTG)、例えばEC参照番号EC2.3.2.13を有する酵素(タンパク質−グルタミン−y−グルタミルトランスフェラーゼ)などがある。
抗体のアミノ酸残基を指す場合の「アクセプターグルタミン」という用語は、好適な条件下でTGaseによって認識され、グルタミンとリジンもしくは構造的に関連する1級アミン、例えばアミノペンチル基との間の反応によりTGaseによって架橋され得るグルタミン残基を意味する。適宜に、アクセプターグルタミンは、表面露出グルタミンである。
本明細書において「アミノ酸修飾」または「突然変異」は、ポリペプチド配列におけるアミノ酸置換、挿入および/または欠失を意味する。本明細書における好ましいアミノ酸修飾は置換である。本明細書における「アミノ酸置換」または「置換」は、タンパク質配列における所定位置での別のアミノ酸によるアミノ酸の置き換えを意味する。例えば、置換Y50Wは、位置50でのチロシンがトリプトファンによって置き換わっている親ポリペプチドの変異体を指す。ポリペプチドの「変異体」は、基準ポリペプチド、代表的には天然もしくは「親」ポリペプチドと実質的に同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドを指す。ポリペプチド変異体は、天然アミノ酸配列内の一定の位置での1以上のアミノ酸置換、欠失および/または挿入を有することができる。
「部位特異的複合体」という用語は、バインダー、好ましくは抗体、および部分の複合体、好ましくはリンカー−薬物−部分を指し、そのバインダーは、バインダーの1以上の所定の位置、好ましくはグルタミン残基で官能化されている。細菌トランスグルタミナーゼ(BTG)(EC2.3.2.13)などのトランスグルタミナーゼ類(TGase)は、グルタミンタンパク質基質の認識において厳密な特異性を示し、「部位特異的複合体化」を触媒することができる。
「均一複合体」または「均一ADC」という用語は、バインダーの少なくとも60、70、80または90%がバインダー当たり同数の複合体化部分を有する部位特異的複合体の組成を指す。抗体の場合、抗体当たりの複合体化部分の数は、偶数、優先的には2または4になるものと考えられる。
バインダー
最も広い意味で、「バインダー」という用語は、バインダー/活性化合物複合体によって処理されるある種の標的細胞群で存在する標的分子に結合する分子を意味するものと理解される。バインダーという用語は、それの最も広い意味で理解されるべきであり、例えば、レクチン類、ある種の糖鎖に結合することができるタンパク質、およびリン脂質結合タンパク質も含む。そのようなバインダーには、例えば、高分子量タンパク質(結合タンパク質)、ポリペプチド類またはペプチド類(結合ペプチド)、非ペプチド(例えば、Keefe AD., et al., Nat. Rev. Drug Discov. 2010;9:537−550による総覧があるアプタマー類(US5,270,163))、またはビタミン類)および全ての他の細胞結合性の分子もしくは物質などがある。結合タンパク質は、例えば、脱グリコシル化変異体を含む抗体、および抗体断片または抗体模倣体、例えばアフィボディ類、アドネクチン類、アンチカリン類、DARPin類、アビメール類、ナノボディ類である(Gebauer M. et al., Curr. Opinion in Chem. Biol.2009;13:245−255;Nuttall S.D. et al., Curr. Opinion in Pharmacology 2008;8:608−617による総覧)。結合ペプチドは、例えば、リガンド/受容体対のリガンド、例えばリガンド/受容体対VEGF/KDRのVEGF、例えばリガンド/受容体対トランスフェリン/トランスフェリン受容体のトランスフェリンまたはサイトカイン/サイトカイン受容体、例えばリガンド/受容体対TNFα/TNFα受容体のTNFαである。
「バインダー」は、細菌トランスグルタミナーゼ(BTG)(EC2.3.2.13)などのトランスグルタミナーゼ(TGase)によって官能化することができるアクセプターグルタミン残基を含む。このアクセプターグルタミンは、バインダーの変化のない天然のものであるか、発生されたものである。アクセプターグルタミンは、好適な位置でのグルタミン残基の挿入(例えば、アクセプターグルタミンを含む標識への融合を介して)、好適な位置のグルタミン残基への突然変異、アミノ酸残基の突然変異(その突然変異は、以前にはTGaseによって認識されなかった天然グルタミン残基がアクセプターグルタミンとなる効果を有する。)、または翻訳後修飾(例えばグリコシル化)の変化(その変化は、以前にはTGaseによって認識されなかった天然グルタミン残基がアクセプターグルタミンとなる効果を有する。)によって形成されるものと考えられる。バインダーが抗体である場合、それは優先的に定常領域にアクセプターグルタミンを含む。そのようなアクセプターグルタミン類は、好適な位置のグルタミンへの突然変異(例えば突然変異N297Q、Kabat EUナンバリング)または脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の形成(例えば、PNGase Fによる酵素的脱グリコシルによって、またはN297X、Kabat EUナンバリングの突然変異によって)によって導入することができる。その後者の脱グリコシルまたは脱グリコシル化抗体の場合、グルタミンQ295(Kabat EUナンバリング)はアクセプターグルタミンになる。非常に好ましいものは、突然変異N297AまたはN297Q(Kabat EUナンバリング)を含む抗体である。
本明細書における「脱グリコシル抗体」または「脱グリコシル化抗体」または「脱グリコシル抗体」という用語は、Fc領域のCH2ドメインにおける保存N連結部位に結合したグリカンを持たないFc領域を含む抗体または抗体誘導体を定義するのに用いられる。脱グリコシル抗体は、例えば、N297(Kabat EUナンバリングを使用)の重鎖グリコシル化部位の突然変異によって、またはグリコシル化がない発現系での抗体の発現によって製造することができる。抗体の酵素的脱グリコシル方法は、当業界で公知である(例えば、Winkelhake & Nicolson (1976), J Biol Chem. 251(4):1074−80)。脱グリコシル化抗体は、例えばPNGaseFを用いる酵素的脱グリコシルによって製造することができる。本発明の1実施形態において、脱グリコシル抗体は、原核生物宿主での抗体発現によって製造することができる。好適な原核生物宿主には、大腸菌(E. coli)、枯草菌(Bacillus subtilis)、ネズミチフス菌(Salmonella typhimurium)ならびにシュードモナス属、ストレプトミセス属およびスタフィロコッカス属の各種生物種などがあるが、これらに限定されるものではない。本発明の別の実施形態において、脱グリコシル抗体は、グリコシル化阻害剤ツニカマイシンとともに哺乳動物発現系を用いることで達成することができる(Nose & Wigzell (1983), Proc Natl Acad Sci USA, 80(21):6632−6)。すなわち、その修飾は、前記抗体のFc部分のCH2ドメインにおける保存N連結部位でのグリコシル化の防止である。
文献には、有機分子の抗体への均一部位特異的共有結合カップリング(複合体化)の各種選択肢も開示されている。本発明による好ましいものは、抗体の二つもしくは四つのアクセプターグルタミン残基を介した抗体への担毒体の結合である。
最も広い意味での「標的分子」は、標的細胞群に存在し、タンパク質(例えば、増殖因子の受容体)または非ペプチド分子(例えば、糖またはリン脂質)であることができる分子を意味するものと理解される。それは好ましくは、受容体または抗原である。
「細胞外」標的分子という用語は、細胞外にあって細胞に結合した標的分子、または細胞外にある標的分子の一部を説明するものである。すなわちバインダーは、無傷細胞上で、それの細胞外標的分子に結合することができる。細胞外標的分子は、細胞膜に固定されることができるか、細胞膜の構成成分であることができる。当業者であれば、細胞外標的分子を識別する方法については知っている。タンパク質の場合、それは、膜貫通ドメインおよび膜におけるタンパク質の配向を確認することで行い得る。これらのデータは通常、タンパク質データベースに寄託される(例えばSwissProt)。
「癌標的分子」という用語は、同じ組織型の非癌細胞上より1以上の癌細胞種上で豊富に存在する標的分子を説明するものである。好ましくは、癌標的分子は、同じ組織型の非癌細胞と比較して1以上の癌細胞種上に選択的に存在し、「選択的に」とは、同じ組織型の非癌細胞と比較して癌細胞上で少なくとも2倍豊富であることを説明するものである(「選択的癌標的分子」)。癌標的分子を用いることで、本発明による複合体を用いる癌細胞の選択的療法が可能となる。
バインダーは、結合を介してリンカーに結合していることができる。バインダーの結合は、グルタミン側鎖のカルボニル官能基を介したものであることができる。好ましくは、そのようなグルタミン残基は、細菌トランスグルタミナーゼによって基質として認識される。本発明によるグルタミン残基は、天然バインダー中に存在し得るか、分子生物学の方法によって、例えばPNGaseFによる抗体の脱グリコシルもしくは突然変異の導入によって導入することができる。本発明によれば、担毒体へのバインダーの結合は、標的分子に関してバインダーの結合活性に対するごくわずかな効果しか持たない。好ましい実施形態において、その結合は、標的分子に関してバインダーの結合アフィニティおよび特異性に対して全く効果を持たない。
本発明によれば、「抗体」という用語は、それの最も広い意味で理解すべきであり、免疫グロブリン分子、例えば無傷もしくは修飾モノクローナル抗体、脱グリコシル化抗体、ポリクローナル抗体または多特異的抗体(例えば二重特異抗体)を含む。免疫グロブリン分子は好ましくは、代表的にはジスルフィド架橋によって連結される四つのポリペプチド鎖、二つの重鎖(H鎖)および二つの軽鎖(L鎖)を有する分子を含む。各重鎖は、重鎖の可変ドメイン(略称VH)および重鎖の定常ドメインを含む。重鎖の定常ドメインは、例えば、三つのドメインCH1、CHおよびCH3を含むことができる。各軽鎖は、可変ドメイン(略称VL)および定常ドメインを含む。軽鎖の定常ドメインは、ドメイン(略称CL)を含む。VHおよびVLドメインは、超可変性を有する領域[相補性決定領域(略称CDR)とも称される]および低い配列可変性を有する領域(フレームワーク領域、略称FR)にさらに細分することができる。代表的には、各VHおよびVL領域は、三つのCDRおよび四つ以下のFRからなる。例えば、アミノ末端からカルボキシ末端に次の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4である。抗体は、いずれか好適な生物種、例えばウサギ、ラマ、ラクダ、マウスまたはラットから得ることができる。1実施形態において、抗体は、ヒトまたはマウス起源のものである。抗体は、例えばヒト、ヒト化またはキメラであることができる。
「モノクローナル」抗体という用語は、実質的に均一な抗体の群から得られる抗体を指し、すなわち、その群の個々の抗体は、数が少ない可能性がある自然突然変異を除いて同一である。モノクローナル抗体は、高い特異性を有する単一抗原性結合部位を認識する。モノクローナル抗体という用語は、特定の製造プロセスを指さない。
「無傷」抗体という用語は、軽鎖および重鎖の抗原結合ドメインおよび定常ドメインの両方を含む抗体を指す。定常ドメインは、多くの修飾アミノ酸位置を有する天然ドメインまたはそれの変異体であることができ、脱グリコシル化されていることもできる。
「修飾無傷」抗体という用語は、抗体起源ではないさらなるポリペプチドもしくはタンパク質との共有結合(例えば、ペプチド結合)によってアミノ末端またはカルボキシ末端を介して融合した無傷抗体を指す。さらに、抗体を修飾して、定義の位置で、反応性システインを導入して、担毒体へのカップリングを促進するようにすることができる(Junutula et al. Nat Biotechnol. 2008, Aug., 26(8):925−32参照)。
「ヒト」抗体という用語は、ヒトから得ることができるか、合成ヒト抗体である抗体を指す。「合成」ヒト抗体は、ヒト抗体配列の分析に基づいて合成配列からイン・シリコで部分的または完全に得ることができる抗体である。ヒト抗体は、例えば、ヒト起源の抗体配列のライブラリから単離された核酸によってコードされ得る。そのような抗体の例が、Soderlind et al., Nature Biotech. 2000, 18:853−856にある。そのような「ヒト「」および「合成」抗体には、PNGaseFによる脱グリコシルによって、または重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって形成される脱グリコシル化変異体も含まれる。
「ヒト化」または「キメラ」抗体という用語は、配列の非ヒトおよびヒト部分からなる抗体を説明するものである。これらの抗体において、ヒト免疫グロブリン(受容体)の配列の一部が、非ヒト免疫グロブリン(供与体)の配列部分によって置き換わっている。多くの場合で、供与体はマウス免疫グロブリンである。ヒト化抗体の場合、受容体のCDRのアミノ酸が、供与体のアミノ酸によって置き換わっている。場合により、フレームワークのアミノ酸も、供与体の相当するアミノ酸によって置き換わっている。場合により、ヒト化抗体は、抗体の至適化時に導入された、受容体にも供与体にも存在しないアミノ酸を含む。キメラ抗体の場合、供与体免疫グロブリンの可変ドメインが、ヒト抗体の定常領域と融合している。そのような「ヒト化」および「キメラ」抗体には、PNGaseFによる脱グリコシルによって、または重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって形成される脱グリコシル化変異体も含まれる。
本明細書で使用される相補性決定領域(CDR)という用語は、抗原への結合に必要な可変抗体ドメインのアミノ酸を指す。代表的には、各可変領域は、CDR1、CDR2およびCDR3と称される三つのCDR領域を有する。各CDR領域は、カバットの定義によるアミノ酸および/またはコチアに従って定義される超可変ループのアミノ酸を包含することができる。カバットによる定義は、例えば、可変軽鎖のほぼアミノ酸位置24から34(CDR1)、50から56(CDR2)および89から97(CDR3)、そして可変重鎖の31から35(CDR1)、50から65(CDR2)および95から102(CDR3)からの領域を含む(Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD.(1991))。コチアによる定義は、例えば、可変軽鎖のほぼアミノ酸位置26から32(CDR1)、50から52(CDR2)および91から96(CDR3)そして可変重鎖の26から32(CDR1)、53から55(CDR2)および96から101(CDR3)の領域を含む(Chothia and Lesk; J Mol Biol 196:901−917(1987))。場合により、CDRは、カバットおよびコチアに従って定義されるCDR領域からのアミノ酸を含むことができる。
重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、抗体は異なる群に分けることができる。無傷抗体の主要な5群:IgA、IgD、IgE、IgGおよびIgMがあり、これらのうちのいくつかは、さらなる下位群(アイソタイプ)、例えばIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1およびIgA2に分けることができる。異なる群に相当する重鎖の定常ドメインは、[アルファ/α]、[デルタ/δ]、[イプシロン/ε]、[ガンマ/γ]および[ミュー(my)/μ]と称される。抗体の三次元構造およびサブユニット構造の両方が公知である。
抗体/免疫グロブリンの「機能性断片」または「抗原結合性抗体断片」という用語は、やはり抗体/免疫グロブリンの抗原結合性ドメインを含む抗体/免疫グロブリンの断片(例えば、IgGの可変ドメイン)と定義される。抗体の「抗原結合性ドメイン」は代表的には、抗体の1以上の超可変領域、例えばCDR、CDR2および/またはCDR3領域を含む。しかしながら、抗体の「フレームワーク」または「骨格」領域は、抗原に対する抗体の結合時に関与し得る。そのフレームワーク領域は、CDRの骨格を形成する。好ましくは、抗原結合性ドメインは、少なくとも可変軽鎖のアミノ酸4から103および可変重鎖のアミノ酸5から109、より好ましくは可変軽鎖のアミノ酸3から107および可変重鎖の4から111、特に好ましくは完全な可変軽および重鎖、すなわちVLのアミノ酸1から109およびVHの1から113(WO97/08320による番号付け)を含む。
本発明の「機能性断片」または「抗原結合性抗体断片」は、Fab、Fab′、F(ab′)2およびFv断片、二重特異抗体、単一ドメイン抗体(DAbs)、線状抗体、抗体の個々の鎖(単鎖Fv、略称scFv);および多特異的抗体、例えば二重特異抗体および三重特異抗体、例えば抗体断片から形成されるものを包含するが、これらに限定されるものではない(C. A. K Borrebaeck, editor (1995) Antibody Engineering (Breakthroughs in Molecular Biology), Oxford University Press; R. Kontermann&S. Duebel, editors (2001) Antibody Engineering(Springer Laboratory Manual), Springer Verlag)。「多特異的」または「多機能性」抗体以外の抗体は、同一の結合部位を有するものである。多特異的抗体は、抗原の異なるエピトープに特異的であることができるか、複数の抗原のエピトープに特異的であることができる(例えば、WO93/17715;WO92/08802;WO91/00360;WO92/05793;Tutt, et al., 1991, J. Immunol. 147:60 69;米国特許第4,474,893号;同4,714,681号;同4,925,648号;同5,573,920号;同5,601,819号;またはKostelny et al., 1992, J. Immunol. 148:15471553参照)。F(ab′)またはFab分子は、Ch1ドメインとCLドメインの間で起こる分子間ジスルフィド相互作用の作用を低減または完全に防止することができるように構築することができる。
「エピトープ」は、免疫グロブリンまたはT細胞受容体に特異的に結合する能力を有するタンパク質決定基を指す。エピトープ決定基は通常、アミノ酸もしくは糖側鎖またはそれらの組み合わせなどの分子の化学的に活性な表面基からなり、通常は特異な三次元構造特性を有し、特異な電荷特性も有する。
「機能性断片」または「抗原結合性抗体断片」は、それのアミノ末端またはカルボキシル末端を介して、共有結合(例えばペプチド連結)によって、抗体を起源としない別のポリペプチドまたはタンパク質と融合していることができる。さらに、抗体および抗原結合性断片を、規定の場所で反応性システインを導入することで修飾して、担毒体へのカップリングを促進することができる(Junutula et al. Nat Biotechnol. 2008 Aug;26(8):925−32参照)。
ポリクローナル抗体は、当業者に公知の方法によって作ることができる。モノクローナル抗体は、当業者に公知の方法によって作ることができる(Koehler and Milstein, Nature, 256, 495−497, 1975)。ヒトおよびヒト化モノクローナル抗体は、当業者に公知の方法によって作ることができる(Olsson et al., Meth Enzymol. 92, 3−16またはCabilly et al US 4,816,567またはBoss et al US4,816,397)。
当業者は、例えば、トランスジェニックマウス(N Lonberg and D Huszar, Int Rev Immunol. 1995; 13(1):65−93)またはファージ提示技術(Clackson et al., Nature. 1991 Aug 15;352(6336):624−8)によってヒト抗体およびそれの断片を作る多様な方法を知っている。本発明の抗体は、例えば非常に多数の健常志願者から集めた非常に多数の抗体のアミノ酸配列からなる組換え抗体ライブラリーから得ることができる。抗体は、公知の組換えDNA技術によって作ることも可能である。抗体の核酸配列は、通常の配列決定によって得ることができるか、公開でアクセス可能なデータベースから入手することができる。
「単離」抗体またはバインダーは、精製されて細胞の他の構成要素が除去されたものである。診断的使用または治療的使用を妨害し得る細胞の汚染構成要素は、例えば、酵素類、ホルモン類、または細胞の他のペプチドもしくは非ペプチド構成要素である。好ましい抗体またはバインダーは、抗体またはバインダーに対して95重量%強の範囲(例えばローリー法、UV−Visスペクトル分析またはSDSキャピラリーゲル電気泳動によって測定)まで精製されているものである。さらに、アミノ末端もしくは内部アミノ酸配列の少なくとも15個のアミノ酸を決定することができる程度まで精製されている抗体、または均一となるまで精製された(均一性は還元条件もしくは非還元条件下のSDS−PAGEによって決定される(検出は、クマシー・ブルー(Coomassie Blau)染色または好ましくは銀着色によって決定することができる。)。)抗体である。しかしながら、抗体は通常は、1以上の精製段階によって得られる。
「特異的結合」または「特異的に結合する」という用語は、所定の抗原/標的分子に結合する抗体またはバインダーを指す。抗体またはバインダーの特異的結合は代表的には、少なくとも10−7Mのアフィニティを有する抗体またはバインダーを説明するものであり(Kd値として;すなわち好ましくは10 −7 Mより小さいKd値を有するもの)、その抗体またはバインダーは所定の抗原/標的分子でも非常に関連の深い抗原/標的分子でもない非特異的抗原/標的分子(例えばウシ血清アルブミンまたはカゼイン)に対してより、所定の抗原/標的分子に対して少なくとも2倍高いアフィニティを有する。その抗体は好ましくは、少なくとも10−7M(Kd値として;すなわち、好ましくは10−7Mより小さいKd値を有するもの)、好ましくは少なくとも10−8M、より好ましくは10−9Mから10−11Mの範囲のアフィニティを有する。Kd値は、例えば表面プラズモン共鳴分光法によって測定することができる。
本発明の抗体−薬物複合体は同様に、これらの範囲のアフィニティを示す。そのアフィニティは、好ましくは薬物の結合によってほとんど影響を受けない(概して、そのアフィニティは一桁未満低下し、すなわち、例えば、多くとも10−8Mから10−7Mである。)。
本発明に従って使用される抗体は、好ましくは高い選択性についても注目すべきものである。高い選択性が存在するのは、本発明の抗体が、独立の他の抗原、例えばヒト血清アルブミンに対してより少なくとも2倍、好ましくは5倍、またはより好ましくは10倍良好な標的タンパク質に対するアフィニティを示す場合である(アフィニティは、例えば表面プラズモン共鳴分光法によって測定することができる。)。
さらに、使用される本発明の抗体は、好ましくは交差反応性である。前臨床試験、例えば毒性試験または活性試験(例えば、異種移植マウスでの試験)を容易にし、より良好に解釈できるようにするために、本発明に従って使用される抗体がヒト標的タンパク質に結合するだけでなく、試験に用いられる生物における生物標的タンパク質にも結合する場合が有利である。1実施形態において、本発明に従って使用される抗体は、ヒト標的タンパク質に加えて、少なくとも一つの別の生物種の標的タンパク質に対して交差反応性である。毒性試験および活性試験に関しては、齧歯類、イヌおよび非ヒト霊長類の科の生物を用いることが好ましい。好ましい齧歯類種は、マウスおよびラットである。好ましい非ヒト霊長類は、アカゲザル、チンパンジーおよびカニクイザルである。
1実施形態において、本発明に従って用いられる抗体は、ヒト標的タンパク質に加えて、マウス、ラットおよびカニクイザル(Macaca fascicularis)からなる生物種の群から選択される少なくとも一つの別の生物種の標的タンパク質に対して交差反応性である。特別に好ましいものは、ヒト標的タンパク質に加えて、少なくともマウス標的タンパク質に対して交差反応性である本発明に従って用いられる抗体である。好ましいものは、前記別の非ヒト生物種の標的タンパク質に対するアフィニティがヒト標的タンパク質に対するアフィニティと50倍まで、詳細には10倍まで異なる交差反応性抗体である。
癌標的分子に対する抗体
バインダー、例えば抗体またはそれの抗原結合性断片が向かう標的分子は、好ましくは癌標的分子である。「癌標的分子」という用語は、同じ組織型の非癌細胞上より1以上の癌細胞種上で豊富に存在する標的分子を説明するものである。好ましくは、癌標的分子は、同じ組織型の非癌細胞と比較して1以上の癌細胞種上に選択的に存在し、「選択的に」とは、同じ組織型の非癌細胞と比較して癌細胞上で少なくとも2倍豊富であることを説明するものである(「選択的癌標的分子」)。癌標的分子を用いることで、本発明による複合体を用いる癌細胞の選択的療法が可能となる。
抗原、例えば癌細胞抗原に対して特異的である抗体は、当業者が熟知している方法(例えば、組み換え発現)、または市販の方法(例えば、Merck KGaA, Germanyから)によって、当業者が製造することができる。癌療法における公知の市販抗体の例には、Erbitux(登録商標)(セツキシマブ、Merck KGaA)、Avastin(登録商標)(ベバシズマブ、Roche)およびHerceptin(登録商標)(トラスツズマブ、Genentech)である。トラスツズマブは、細胞に基づくアッセイで(Kd=5nM)、ヒト表皮成受容体の細胞外ドメインに高アフィニティで結合するIgG1κ型の組み換えヒト化モノクローナル抗体である。その抗体は、CHO細胞で組み換え的に産生される。これらの抗体はいずれも、PNGaseFによる脱グリコシルによって、または重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって形成されるこれら抗体の脱グリコシル化変異体としても製造され得る。
好ましい実施形態において、標的分子は選択的癌標的分子である。
特に好ましい実施形態において、標的分子はタンパク質である。
1実施形態において、標的分子は細胞外標的分子である。好ましい実施形態において、細胞外標的分子はタンパク質である。
癌標的分子は当業者には公知である。これらの例を以下に列記する。
癌標的分子の例は次のものである。
(1)EGF受容体(NCBI参照配列NP_005219.2)、配列番号213(1210アミノ酸):
>gi|29725609|ref|NP_005219.2|EGFR受容体前駆体[ホモ・サピエンス]
MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEVVLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALAVLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVVALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADEYLIPQQGFFSSPSTSRTPLLSSLSATSNNSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTEDSIDDTFLPVPEYINQSVPKRPAGSVQNPVYHNQPLNPAPSRDPHYQDPHSTAVGNPEYLNTVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGSTAENAEYLRVAPQSSEFIGA
細胞外ドメインは下線によって印を付けている。
(2)メソテリン(SwissProt参照番号Q13421−3)、配列番号214(622アミノ酸):
>sp|Q13421−3|MSLN_HUMANメソテリンOS=ホモ・サピエンスGN=MSLNのアイソフォーム2
MALPTARPLLGSCGTPALGSLLFLLFSLGWVQPSRTLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISS
LSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPL
DLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEA
DVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTW
SVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKT
ACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELY
PQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVK
GRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKA
RLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQ
KLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEALSGT
PCLLGPGPVLTVLALLLASTLA
メソテリンは、アミノ酸296から598によってコードされる。アミノ酸37−286は、巨核球強化因子をコードしている。メソテリンは、GPIアンカーを介して細胞膜に固定されており、細胞外で局在している。
(3)炭酸脱水酵素IX(SwissProt参照番号Q16790)、配列番号215(459アミノ酸):
>sp|Q16790|CAH9_HUMAN炭酸脱水酵素9OS=ホモ・サピエンスGN=CA9PE=1SV=2
MAPLCPSPWLPLLIPAPAPGLTVQLLLSLLLLVPVHPQRLPRMQEDSPLGGGSSGEDDPL
GEEDLPSEEDSPREEDPPGEEDLPGEEDLPGEEDLPEVKPKSEEEGSLKLEDLPTVEAPG
DPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFCPALRPL
ELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHT
VEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIA
EEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLS
DTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSPRAAEPVQLNSCLAAGDILALVF
GLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAEVAETGA
細胞外ドメインは、下線によって印を付けている。
(4)C4.4a(NCBI参照配列NP_055215.2;同義語LYPD3)、配列番号216(346アミノ酸):
>gi|93004088|ref|NP_055215.2|ly6/PLAURドメイン含有タンパク質3−前駆体[ホモ・サピエンス]
MDPARKAGAQAMIWTAGWLLLLLLRGGAQALECYSCVQKADDGCSPNKMKTVKCAPGVDVCTEAVGAVETIHGQFSLAVRGCGSGLPGKNDRGLDLHGLLAFIQLQQCAQDRCNAKLNLTSRALDPAGNESAYPPNGVECYSCVGLSREACQGTSPPVVSCYNASDHVYKGCFDGNVTLTAANVTVSLPVRGCVQDEFCTRDGVTGPGFTLSGSCCQGSRCNSDLRNKTYFSPRIPPLVRLPPPEPTTVASTTSVTTSTSAPVRPTSTTKPMPAPTSQTPRQGVEHEASRDEEPRLTGGAAGHQDRSNSGQYPAKGGPQQPHNKGCVAPTAGLAALLLAVAAGVLL
成熟細胞外ドメインは、下線によって印を付けている。
(5)CD52(NCBI参照配列NP_001794.2)、配列番号217
>gi|68342030|ref|NP_001794.2|CAMPATH−1抗原−前駆体[ホモ・サピエンス]
MKRFLFLLLTISLLVMVQIQTGLSGQNDTSQTSSPSASSNISGGIFLFFVANAIIHLFCFS
(6)Her2(NCBI参照配列NP_004439.2)、配列番号218
>gi|54792096|ref|NP_004439.2|受容体チロシン−タンパク質キナーゼerbB−2アイソフォームa[ホモ・サピエンス]
MELAALCRWGLLLALLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIISAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLEPSEEEAPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPTAENPEYLGLDVPV
(7)CD20(NCBI参照配列NP_068769.2)、配列番号219
>gi|23110987|ref|NP_068769.2|B−リンパ球抗原CD20[ホモ・サピエンス]
MTTPRNSVNGTFPAEPMKGPIAMQSGPKPLFRRMSSLVGPTQSFFMRESKTLGAVQIMNGLFHIALGGLLMIPAGIYAPICVTVWYPLWGGIMYIISGSLLAATEKNSRKCLVKGKMIMNSLSLFAAISGMILSIMDILNIKISHFLKMESLNFIRAHTPYINIYNCEPANPSEKNSPSTQYCYSIQSLFLGILSVMLIFAFFQELVIAGIVENEWKRTCSRPKSNIVLLSAEEKKEQTIEIKEEVVGLTETSSQPKNEEDIEIIPIQEEEEEETETNFPEPPQDQESSPIENDSSP
(8)リンパ球活性化抗原CD30(SwissProt ID P28908)、配列番号220
>gi|68348711|ref|NP_001234.2|腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー8アイソフォーム1−前駆体[ホモ・サピエンス]
MRVLLAALGLLFLGALRAFPQDRPFEDTCHGNPSHYYDKAVRRCCYRCPMGLFPTQQCPQRPTDCRKQCEPDYYLDEADRCTACVTCSRDDLVEKTPCAWNSSRVCECRPGMFCSTSAVNSCARCFFHSVCPAGMIVKFPGTAQKNTVCEPASPGVSPACASPENCKEPSSGTIPQAKPTPVSPATSSASTMPVRGGTRLAQEAASKLTRAPDSPSSVGRPSSDPGLSPTQPCPEGSGDCRKQCEPDYYLDEAGRCTACVSCSRDDLVEKTPCAWNSSRTCECRPGMICATSATNSRARCVPYPICAAETVTKPQDMAEKDTTFEAPPLGTQPDCNPTPENGEAPASTSPTQSLLVDSQASKTLPIPTSAPVALSSTGKPVLDAGPVLFWVILVLVVVVGSSAFLLCHRRACRKRIRQKLHLCYPVQTSQPKLELVDSRPRRSSTQLRSGASVTEPVAEERGLMSQPLMETCHSVGAAYLESLPLQDASPAGGPSSPRDLPEPRVSTEHTNNKIEKIYIMKADTVIVGTVKAELPEGRGLAGPAEPELEEELEADHTPHYPEQETEPPLGSCSDVMLSVEEEGKEDPLPTAASGK
(9)リンパ球接着分子CD22(SwissProt ID P20273)、配列番号221
>gi|157168355|ref|NP_001762.2|B細胞受容体CD22アイソフォーム1−前駆体[ホモ・サピエンス]
MHLLGPWLLLLVLEYLAFSDSSKWVFEHPETLYAWEGACVWIPCTYRALDGDLESFILFHNPEYNKNTSKFDGTRLYESTKDGKVPSEQKRVQFLGDKNKNCTLSIHPVHLNDSGQLGLRMESKTEKWMERIHLNVSERPFPPHIQLPPEIQESQEVTLTCLLNFSCYGYPIQLQWLLEGVPMRQAAVTSTSLTIKSVFTRSELKFSPQWSHHGKIVTCQLQDADGKFLSNDTVQLNVKHTPKLEIKVTPSDAIVREGDSVTMTCEVSSSNPEYTTVSWLKDGTSLKKQNTFTLNLREVTKDQSGKYCCQVSNDVGPGRSEEVFLQVQYAPEPSTVQILHSPAVEGSQVEFLCMSLANPLPTNYTWYHNGKEMQGRTEEKVHIPKILPWHAGTYSCVAENILGTGQRGPGAELDVQYPPKKVTTVIQNPMPIREGDTVTLSCNYNSSNPSVTRYEWKPHGAWEEPSLGVLKIQNVGWDNTTIACAACNSWCSWASPVALNVQYAPRDVRVRKIKPLSEIHSGNSVSLQCDFSSSHPKEVQFFWEKNGRLLGKESQLNFDSISPEDAGSYSCWVNNSIGQTASKAWTLEVLYAPRRLRVSMSPGDQVMEGKSATLTCESDANPPVSHYTWFDWNNQSLPYHSQKLRLEPVKVQHSGAYWCQGTNSVGKGRSPLSTLTVYYSPETIGRRVAVGLGSCLAILILAICGLKLQRRWKRTQSQQGLQENSSGQSFFVRNKKVRRAPLSEGPHSLGCYNPMMEDGISYTTLRFPEMNIPRTGDAESSEMQRPPPDCDDTVTYSALHKRQVGDYENVIPDFPEDEGIHYSELIQFGVGERPQAQENVDYVILKH
(10)骨髄(myloid)細胞表面抗原CD33(SwissProt ID P20138)、配列番号222
>gi|130979981|ref|NP_001763.3|骨髄細胞表面抗原CD33アイソフォーム1−前駆体[ホモ・サピエンス]
MPLLLLLPLLWAGALAMDPNFWLQVQESVTVQEGLCVLVPCTFFHPIPYYDKNSPVHGYWFREGAIISRDSPVATNKLDQEVQEETQGRFRLLGDPSRNNCSLSIVDARRRDNGSYFFRMERGSTKYSYKSPQLSVHVTDLTHRPKILIPGTLEPGHSKNLTCSVSWACEQGTPPIFSWLSAAPTSLGPRTTHSSVLIITPRPQDHGTNLTCQVKFAGAGVTTERTIQLNVTYVPQNPTTGIFPGDGSGKQETRAGVVHGAIGGAGVTALLALCLCLIFFIVKTHRRKAARTAVGRNDTHPTTGSASPKHQKKSKLHGPTETSSCSGAAPTVEMDEELHYASLNFHGMNPSKDTSTEYSEVRTQ
(11)膜貫通糖タンパク質NMB(SwissProt ID Q14956)、配列番号223
>gi|52694752|ref|NP_001005340.1|膜貫通糖タンパク質NMBアイソフォームa−前駆体[ホモ・サピエンス]
MECLYYFLGFLLLAARLPLDAAKRFHDVLGNERPSAYMREHNQLNGWSSDENDWNEKLYPVWKRGDMRWKNSWKGGRVQAVLTSDSPALVGSNITFAVNLIFPRCQKEDANGNIVYEKNCRNEAGLSADPYVYNWTAWSEDSDGENGTGQSHHNVFPDGKPFPHHPGWRRWNFIYVFHTLGQYFQKLGRCSVRVSVNTANVTLGPQLMEVTVYRRHGRAYVPIAQVKDVYVVTDQIPVFVTMFQKNDRNSSDETFLKDLPIMFDVLIHDPSHFLNYSTINYKWSFGDNTGLFVSTNHTVNHTYVLNGTFSLNLTVKAAAPGPCPPPPPPPRPSKPTPSLATTLKSYDSNTPGPAGDNPLELSRIPDENCQINRYGHFQATITIVEGILEVNIIQMTDVLMPVPWPESSLIDFVVTCQGSIPTEVCTIISDPTCEITQNTVCSPVDVDEMCLLTVRRTFNGSGTYCVNLTLGDDTSLALTSTLISVPDRDPASPLRMANSALISVGCLAIFVTVISLLVYKKHKEYNPIENSPGNVVRSKGLSVFLNRAKAVFFPGNQEKDPLLKNQEFKGVS
(12)接着分子CD56(SwissProt ID P13591)、配列番号224
>gi|94420689|ref|NP_000606.3|神経細胞接着分子1アイソフォーム1[ホモ・サピエンス]
MLQTKDLIWTLFFLGTAVSLQVDIVPSQGEISVGESKFFLCQVAGDAKDKDISWFSPNGEKLTPNQQRISVVWNDDSSSTLTIYNANIDDAGIYKCVVTGEDGSESEATVNVKIFQKLMFKNAPTPQEFREGEDAVIVCDVVSSLPPTIIWKHKGRDVILKKDVRFIVLSNNYLQIRGIKKTDEGTYRCEGRILARGEINFKDIQVIVNVPPTIQARQNIVNATANLGQSVTLVCDAEGFPEPTMSWTKDGEQIEQEEDDEKYIFSDDSSQLTIKKVDKNDEAEYICIAENKAGEQDATIHLKVFAKPKITYVENQTAMELEEQVTLTCEASGDPIPSITWRTSTRNISSEEKTLDGHMVVRSHARVSSLTLKSIQYTDAGEYICTASNTIGQDSQSMYLEVQYAPKLQGPVAVYTWEGN
QVNITCEVFAYPSATISWFRDGQLLPSSNYSNIKIYNTPSASYLEVTPDSENDFGNYNCTAVNRIGQESLEFILVQADTPSSPSIDQVEPYSSTAQVQFDEPEATGGVPILKYKAEWRAVGEEVWHSKWYDAKEASMEGIVTIVGLKPETTYAVRLAALNGKGLGEISAASEFKTQPVQGEPSAPKLEGQMGEDGNSIKVNLIKQDDGGSPIRHYLVRYRALSSEWKPEIRLPSGSDHVMLKSLDWNAEYEVYVVAENQQGKSKAAHFVFRTSAQPTAIPANGSPTSGLSTGAIVGILIVIFVLLLVVVDITCYFLNKCGLFMCIAVNLCGKAGPGAKGKDMEEGKAAFSKDESKEPIVEVRTEEERTPNHDGGKHTEPNETTPLTEPEKGPVEAKPECQETETKPAPAEVKTVPNDATQTKENESKA
(13)表面分子CD70(SwissProt ID P32970)、配列番号225
>gi|4507605|ref|NP_001243.1|CD70抗原[ホモ・サピエンス]
MPEEGSGCSVRRRPYGCVLRAALVPLVAGLVICLVVCIQRFAQAQQQLPLESLGWDVAELQLNHTGPQQDPRLYWQGGPALGRSFLHGPELDKGQLRIHRDGIYMVHIQVTLAICSSTTASRHHPTTLAVGICSPASRSISLLRLSFHQGCTIASQRLTPLARGDTLCTNLTGTLLPSRNTDETFFGVQWVRP
(14)表面分子CD74(SwissProt ID P04233)、配列番号226
>gi|10835071|ref|NP_004346.1|HLAクラスII組織適合性抗原γ鎖アイソフォームb[ホモ・サピエンス]
MHRRRSRSCREDQKPVMDDQRDLISNNEQLPMLGRRPGAPESKCSRGALYTGFSILVTLLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTVTSQNLQLENLRMKLPKPPKPVSKMRMATPLLMQALPMGALPQGPMQNATKYGNMTEDHVMHLLQNADPLKVYPPLKGSFPENLRHLKNTMETIDWKVFESWMHHWLLFEMSRHSLEQKPTDAPPKESLELEDPSSGLGVTKQDLGPVPM
(15)B−リンパ球抗原CD19(SwissProt ID P15391)、配列番号227
>gi|296010921|ref|NP_001171569.1|B−リンパ球抗原CD19アイソフォーム1−前駆体[ホモ・サピエンス]
MPPPRLLFFLLFLTPMEVRPEEPLVVKVEEGDNAVLQCLKGTSDGPTQQLTWSRESPLKPFLKLSLGLPGLGIHMRPLAIWLFIFNVSQQMGGFYLCQPGPPSEKAWQPGWTVNVEGSGELFRWNVSDLGGLGCGLKNRSSEGPSSPSGKLMSPKLYVWAKDRPEIWEGEPPCLPPRDSLNQSLSQDLTMAPGSTLWLSCGVPPDSVSRGPLSWTHVHPKGPKSLLSLELKDDRPARDMWVMETGLLLPRATAQDAGKYYCHRGNLTMSFHLEITARPVLWHWLLRTGGWKVSAVTLAYLIFCLCSLVGILHLQRALVLRRKRKRMTDPTRRFFKVTPPPGSGPQNQYGNVLSLPTPTSGLGRAQRWAAGLGGTAPSYGNPSSDVQADGALGSRSPPGVGPEEEEGEGYEEPDSEEDSEFYENDSNLGQDQLSQDGSGYENPEDEPLGPEDEDSFSNAESYENEDEELTQPVARTMDFLSPHGSAWDPSREATSLAGSQSYEDMRGILYAAPQLRSIRGQPGPNHEEDADSYENMDNPDGPDPAWGGGGRMGTWSTR
(16)表面タンパク質ムチン−1(SwissProt ID P15941)、配列番号228
>gi|65301117|ref|NP_002447.4|ムチン−1アイソフォーム1−前駆体[ホモ・サピエンス]
MTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNALSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAATSANL
(17)表面タンパク質CD138(SwissProt ID P18827)、配列番号229
>gi|29568086|ref|NP_002988.3|シンデカン−1−前駆体[ホモ・サピエンス]
MRRAALWLWLCALALSLQPALPQIVATNLPPEDQDGSGDDSDNFSGSGAGALQDITLSQQTPSTWKDTQLLTAIPTSPEPTGLEATAASTSTLPAGEGPKEGEAVVLPEVEPGLTAREQEATPRPRETTQLPTTHQASTTTATTAQEPATSHPHRDMQPGHHETSTPAGPSQADLHTPHTEDGGPSATERAAEDGASSQLPAAEGSGEQDFTFETSGENTAVVAVEPDRRNQSPVDQGATGASQGLLDRKEVLGGVIAGGLVGLIFAVCLVGFMLYRMKKKDEGSYSLEEPKQANGGAYQKPTKQEEFYA
(18)インテグリンαV(Genbank受託番号:NP_002201.1)、配列番号230
>gi|4504763|ref|NP_002201.1|インテグリンα−Vアイソフォーム1−前駆体[ホモ・サピエンス]
MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSASSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQEREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
(19)奇形癌由来増殖因子1タンパク質TDGF1(Genbank受託番号:NP_003203.1)、配列番号231
>gi|4507425|ref|NP_003203.1|奇形癌由来増殖因子1アイソフォーム1−前駆体[ホモ・サピエンス]
MDCRKMARFSYSVIWIMAISKVFELGLVAGLGHQEFARPSRGYLAFRDDSIWPQEEPAIRPRSSQRVPPMGIQHSKELNRTCCLNGGTCMLGSFCACPPSFYGRNCEHDVRKENCGSVPHDTWLPKKCSLCKCWHGQLRCFPQAFLPGCDGLVMDEHLVASRTPELPPSARTTTFMLVGICLSIQSYY
(20)前立腺特異的膜抗原PSMA(Swiss Prot ID:Q04609)、配列番号232
>gi|4758398|ref|NP_004467.1|グルタミン酸カルボキシペプチダーゼ2アイソフォーム1[ホモ・サピエンス]
MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSNPIVLRMMNDQLMFLERAFIDPLGLPDRPFYRHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
(21)チロシンタンパク質キナーゼEPHA2(Swiss Prot ID:P29317)、配列番号233
>gi|32967311|ref|NP_004422.2|エフリンA型受容体2−前駆体[ホモ・サピエンス]
MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMNDMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDIVYSVTCEQCWPESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSGLVTSRSFRTASVSINQTEPPKVRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQSRVWKYEVTYRKKGDSNSYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLSPEGSGNLAVIGGVAVGVVLLLVLAGVGFFIHRRRKNQRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
(22)表面タンパク質SLC44A4(Genbank受託番号:NP_001171515)、配列番号234
>gi|295849282|ref|NP_001171515.1|コリントランスポーター様タンパク質4アイソフォーム2[ホモ・サピエンス]
MGGKQRDEDDEAYGKPVKYDPSFRGPIKNRSCTDVICCVLFLLFILGYIVVGIVAWLYGDPRQVLYPRNSTGAYCGMGENKDKPYLLYFNIFSCILSSNIISVAENGLQCPTPQTVITSLQQELCPSFLLPSAPALGRCFPWTNVTPPALPGITNDTTIQQGISGLIDSLNARDISVKIFEDFAQSWYWILVALGVALVLSLLFILLLRLVAGPLVLVLILGVLGVLAYGIYYCWEEYRVLRDKGASISQLGFTTNLSAYQSVQETWLAALIVLAVLEAILLLMLIFLRQRIRIAIALLKEASKAVGQMMSTMFYPLVTFVLLLICIAYWAMTALYLATSGQPQYVLWASNISSPGCEKVPINTSCNPTAHLVNSSCPGLMCVFQGYSSKGLIQRSVFNLQIYGVLGLFWTLNWVLALGQCVLAGAFASFYWAFHKPQDIPTFPLISAFIRTLRYHTGSLAFGALILTLVQIARVILEYIDHKLRGVQNPVARCIMCCFKCCLWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGKNFCVSAKNAFMLLMRNIVRVVVLDKVTDLLLFFGKLLVVGGVGVLSFFFFSGRIPGLGKDFKSPHLNYYWLPIMTSILGAYVIASGFFSVFGMCVDTLFLCFLEDLERNNGSLDRPYYMSKSLLKILGKKNEAPPDNKKRKK
(23)表面タンパク質BMPR1B(SwissProt:O00238)
(24)輸送タンパク質SLC7A5(SwissProt:Q01650)
(25)表皮前立腺抗原STEAP1(SwissProt:Q9UHE8)
(26)卵巣癌抗原MUC16(SwissProt:Q8WXI7)
(27)輸送タンパク質SLC34A2(SwissProt:O95436)
(28)表面タンパク質SEMA5b(SwissProt:Q9P283)
(29)表面タンパク質LYPD1(SwissProt:Q8N2G4)
(30)エンドセリン受容体B型EDNRB(SwissProt:P24530)
(31)薬指タンパク質RNF43(SwissProt:Q68DV7)
(32)前立腺癌関連タンパク質STEAP2(SwissProt:Q8NFT2)
(33)カチオンチャンネルTRPM4(SwissProt:Q8TD43)
(34)補体受容体CD21(SwissProt:P20023)
(35)B細胞抗原受容体複合体関連タンパク質CD79b(SwissProt:P40259)
(36)細胞接着抗原CEACAM6(SwissProt:P40199)
(37)ジペプチダーゼDPEP1(SwissProt:P16444)
(38)インターロイキン受容体IL20Rα(SwissProt:Q9UHF4)
(39)プロテオグリカンBCAN(SwissProt:Q96GW7)
(40)エフリン受容体EPHB2(SwissProt:P29323)
(41)前立腺幹細胞関連タンパク質PSCA(Genbank受託番号:NP_005663.2)
(42)表面タンパク質LHFPL3(SwissProt:Q86UP9)
(43)受容体タンパク質TNFRSF13C(SwissProt:Q96RJ3)
(44)B細胞抗原受容体複合体関連タンパク質CD79a(SwissProt:P11912)
(45)受容体タンパク質CXCR5(SwissProt:P32302)
(46)イオンチャンネルP2X5(SwissProt:Q93086)
(47)リンパ球抗原CD180(SwissProt:Q99467)
(48)受容体タンパク質FCRL1(SwissProt:Q96LA6)
(49)受容体タンパク質FCRL5(SwissProt:Q96RD9)
(50)MHCクラスII分子Ia抗原HLA−DOB(Genbank受託番号:NP_002111.1)
(51)T細胞タンパク質VTCN1(SwissProt:Q7Z7D3)
(52)TWEAKR(配列番号169(タンパク質);配列番号170(DNA)
(53)リンパ球抗原CD37(SwissProt:P11049)
(54)FGF受容体2;FGFR2(Gene ID:2263;公式記号:FGFR2).FGFR2受容体は、各種スプライス変異体(α、β、IIIb、IIIc)で生じる。全てのスプライス変異体が標的分子として働き得る。
(55)膜貫通糖タンパク質B7H3(CD276;Gene ID:80381.
(56)B細胞受容体BAFFR(CD268;Gene ID:115650)
(57)受容体タンパク質ROR1(Gene ID:4919)
(58)表面受容体IL3RA(CD123;Gene ID:3561)
(59)CXCケモカイン受容体CXCR5(CD185;Gene ID643)
(60)受容体タンパク質シンシチン(Gene ID30816)。
本発明の好ましい主題において、癌標的分子は、癌標的分子(1)から(60)、特には(1)、(6)および(52)からなる群から選択される。
本発明のさらなる特に好ましい主題において、バインダーは、癌標的分子(1)から(60)、特には(1)、(6)および(52)からなる群から選択される細胞外癌標的分子に結合する。
本発明のさらなる特に好ましい主題において、バインダーは、癌標的分子(1)から(60)、特には(1)、(6)および(52)からなる群から選択される細胞外癌標的分子に特異的に結合する。好ましい実施形態において、バインダーは、標的細胞上のそれの細胞外標的分子への結合後に、その結合の結果として標的細胞によって内在化される。これによって、免疫複合体またはADCであることができるバインダー/活性化合物複合体が、標的細胞によって取り込まれることになる。次に、バインダーが、好ましくは細胞内で、好ましくはリソソームで処理される。
1実施形態において、バインダーは、結合タンパク質である。好ましい実施形態において、バインダーは、抗体、脱グリコシル化抗体、抗原結合抗体断片、多特異的抗体または抗体模倣体である。
好ましい抗体模倣体は、アフィボディ類、アドネクチン類、アンチカリン類、DARPin類、アビメール類、またはナノボディ類である。好ましい多特異的抗体は、二重特異性および三重特異性抗体である。
好ましい実施形態において、バインダーは、抗体または抗原結合抗体断片、より好ましくは単離抗体または単離抗原結合抗体断片である。
好ましい抗原結合抗体断片は、Fab、Fab′、F(ab′)2およびFv断片、二重特異性抗体、DAbs、直鎖抗体およびscFvである。特に好ましいのは、Fab、二重特異性抗体およびscFvである。
特に好ましい実施形態において、バインダーは抗体である。特に好ましいのは、モノクローナル抗体またはそれの抗原結合抗体断片である。さらなる特に好ましいものは、ヒト、ヒト化もしくはキメラ抗体またはそれの抗原結合抗体断片である。
癌標的分子に結合する抗体または抗原結合抗体断片は、例えば化学合成または組換え発現などの公知の方法を用いて当業者が作ることができる。癌標的分子についてのバインダーは、商業的に入手できるか、例えば化学合成または組換え発現などの公知の方法を用いて当業者が作ることができる。抗体または抗原結合性抗体断片を作るさらなる方法については、WO2007/070538に記載されている(22頁「抗体」参照)。当業者であれば、ファージ提示ライブラリー(例えばMorphosys HuCAL Gold)などのプロセスを収集および使用して抗体または抗原結合性抗体断片を発見する方法については知っている(WO2007/070538、24頁以降および70頁のAK実施例1、72頁のAK実施例2参照)。B細胞からのDNAライブラリーを用いるさらなる抗体取得方法が、例えば26頁(WO2007/070538)に記載されている。ヒト化抗体についてのプロセスは、WO2007070538の30−32頁に記載されており、Queen、et al., Pros. Natl. Acad. Sci. USA 86:10029−10033, 1989またはWO90/0786に詳細に記載されている。さらに、タンパク質一般および特に抗体の組換え発現方法は当業者には公知である(例えば、Berger and Kimrnel (Guide to Molecular Cloning Techniques, Methods in Enzymology, Vo1. 152, Academic Press, Inc.); Sambrook, et al., (Molecular Cloning: A Laboratory Manual, (Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press; Cold Spring Harbor, N.Y.; 1989) Vol. 1−3); Current Protocols in Molecular Biology, (F. M. Ausabel et al. [Eds.], Current Protocols, Green Publishing Associates, Inc. / John Wiley & Sons, Inc.); Harlow et al., (Monoclonal Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (19881, Paul [Ed.]); Fundamental Immunology, (Lippincott Williams & Wilkins (1998)); and Harlow, et al., (Using Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1998)参照)。当業者であれば、タンパク質/抗体の発現に必要な相当するベクター、プロモーターおよびシグナルペプチドは知っている。通常プロセスが、WO2007/070538の41−45頁にも記載されている。IgG1抗体の取得方法が、例えばWO2007/070538の74頁以降の実施例6に記載されている。抗原への結合後の抗体の内在化の決定を可能とするプロセスが当業者には公知であり、例えばWO2007/070538の80頁に記載されている。当業者は、異なる標的分子特異性を有する抗体の作製と同様にして炭酸脱水酵素IX(Mn)抗体を作るのに用いられているWO2007/070538に記載の方法を用いることができる。
抗EGFR抗体
癌標的分子EGFRに結合する抗体の例は、セツキシマブ(INN番号7906)、パニツムマブ(INN番号8499)およびニモツズマブ(INN番号8545).セツキシマブ(Drug Bank受託番号DB00002)は、SP2/0マウス骨髄腫細胞で産生され、ImClone Systems Inc/Merck KgaA/Bristol−Myers Squibb Co.によって販売されているキメラ抗EGFR1抗体である。セツキシマブは、野生型K−Ras遺伝子を有する転移性でEGFR発現性の結腸直腸癌の治療に適応される。それは、10−10Mのアフィニティを有する。
配列:
セツキシマブ軽鎖(κ)、配列番号235:
DILLTQSPVILSVSPGERVSFSCRASQSIGTNIHWYQQRTNGSPRLLIKYASESISGIPSRFSGSGSGTDFTLSINSVESEDIADYYCQQNNNWPTTFGAGTKLELKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
セツキシマブ重鎖、配列番号236:
QVQLKQSGPGLVQPSQSLSITCTVSGFSLTNYGVHWVRQSPGKGLEWLGVIWSGGNTDYNTPFTSRLSINKDNSKSQVFFKMNSLQSNDTAIYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSAASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
パニツムマブ(INN番号8499)(Drug Bank受託番号DB01269)は、Abgenix/Amgenによって販売されているヒトEGF受容体1に特異的に結合する組み換えモノクローナルヒトIgG2抗体である。パニツムマブは、トランスジェニックマウス(XenoMouse)の免疫化が起源である。これらのマウスは、ヒト免疫グロブリン(軽および重鎖)を産生することができる。EGFRに対する抗体を産生する特異的B細胞クローンが選択されており、このクローンはCHO細胞によって不死化されている(チャイニーズハムスター卵巣細胞)。これらの細胞は現在、100%ヒト抗体の産生に用いられている。パニツムマブは、フルオロピリミジン、オキサリプラチンおよびイリノテカンによる化学療法に抵抗性であるEGFR発現性の転移性結腸直腸癌の治療に適応される。それは、10−11Mのアフィニティを有する。
配列:
パニツムマブ軽鎖(κ)、配列番号237:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYDASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYFCQHFDHLPLAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
パニツムマブ重鎖、配列番号238:
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSVSSGDYYWTWIRQSPGKGLEWIGHIYYSGNTNYNPSLKSRLTISIDTSKTQFSLKLSSVTAADTAIYYCVRDRVTGAFDIWGQGTMVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTVERKCCVECPPCPAPPVAGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTFRVVSVLTVVHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPAPIEKTISKTKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
ニモツズマブ(INN番号8545)(EP00586002、EP00712863)は、ヒトEGF受容体1に特異的に結合し、YM BioScienecs Inc. (Mississauga Canada)によって販売されているヒト化モノクローナルIgG1抗体である。それは、非分泌性NSO細胞(哺乳動物細胞系)で産生される。ニモツズマブは、頭頸部腫瘍、極めて悪性の星状細胞腫および多形性膠芽腫(EUおよびUSでは未承認)および膵臓癌(オーファンドラッグ、EMA)の治療用に承認されている。それは、10−8Mのアフィニティを有する。
ニモツズマブ軽鎖、配列番号239:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQNIVHSNGNTYLDWYQQTPGKAPKLLIYKVSNRFSGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCFQYSHVPWTFGQGTKLQITRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
ニモツズマブ重鎖、配列番号240:
QVQLQQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTNYYIYWVRQAPGQGLEWIGGINPTSGGSNFNEKFKTRVTITADESSTTAYMELSSLRSEDTAFYFCTRQGLWFDSDGRGFDFWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK。
EGFR抗体のさらなる実施形態は、次の通りである。
●ザルツムマブ/2F8/HuMax−EGFr、Genmab A/Sから(WO02/100348、WO2004/056847、INN番号8605)
●ネシツムマブ/11F8、ImClone/IMC−11F8、ImClone Systems Inc.[Eli Lilly & Co]から(WO2005/090407(EP01735348−A1、US2007/0264253−A1、US7,598,350、WO2005/090407−A1)、INN番号9083)
●マツズマブ/抗EGFRMAb、Merck KGaA/抗EGFR MAb、Takeda/EMD72000/EMD−6200/EMD−72000およびEMD−55900/MAb425/モノクローナル抗体425、Merck KGaA/Takedaから(WO92/15683、INN番号8103(マツズマブ))
●RG−7160/GA−201/GA201/R−7160/R7160/RG7160/RO−4858696/RO−5083945/RO4858696/RO5083945、Glycart Biotechnology AG(Roche Holding AG)から(WO2010/112413−A1、WO2010/115554)
●GT−MAB5.2−GEX/CetuGEX、Glycotope GMBH(WO2008/028686−A2から(EP01900750−A1、EP01911766−A1、EP02073842−A2、US2010/0028947−A1)
●ISU−101、Isu Abxis Inc(ISU Chemical Co Ltd)/Scancellから(WO2008/004834−A1)
●ABT−806/mAb−806/ch−806/抗EGFRモノクローナル抗体806、Ludwig Institute for Cancer Research/Abbott/Life Science Pharmaceuticalsから(WO02/092771、WO2005/081854およびWO2009/023265)
●SYM−004(二つのキメラIgG1抗体(992および1024)からなる)、Symphogen A/Sから(WO2010/022736−A2)
●MR1−1/MR1−1KDEL、IVAX Corp(Teva Pharmaceutical Industries Ltd)から(Duke University)、(特許:WO2001/062931−A2)
●欠失変異体に対する抗体、EGFRvIII、Amgen/Abgenixから(WO2005/010151、US7,628,986)
●SC−100、Scancell Ltdから(WO01/088138−A1)
●MDX−447/EMD82633/BAB−447/H447/MAb、EGFR、Medarex/Merck KgaA、Bristol−Myers Squibb(US)/Merck KGaA(DE)/Takeda(JP)から、(WO91/05871、WO92/15683)
●抗EGFR−Mab、Xencorから(WO2005/056606)
●DXL−1218/抗EGFRモノクローナル抗体(癌)、InNexus、InNexus Biotechnology Incから、Pharmaprojects PH048638。
好ましい実施形態において、抗EGFR抗体は、セツキシマブ、パニツムマブ、ニモツズマブ、ザルツムマブ、ネシツムマブ、マツズマブ、RG−716、GT−MAB5.2−GEX、ISU−101、ABT−806、SYM−004、MR1−1、SC−100、MDX−447およびDXL−1218からなる群から選択される。
特に好ましい実施形態において、抗EGFR抗体は、セツキシマブ、パニツムマブ、ニモツズマブ、ザルツムマブ、ネシツムマブおよびマツズマブからなる群から選択される。
当業者であれば、配列変化によって上記の抗体のCDR領域からさらなる抗体を製造するのに用いることができる方法については知っており、これらのさらなる抗体は、標的分子についての同様もしくはより良好なアフィニティおよび/または特異性を有する。さらに、当業者であれば、配列変化によって上記抗体のCDR領域からさらなる抗体を製造するのに用いることができる方法を知っており、これらのさらなる抗体は脱グリコシル化されており、および/またはトランスグルタミナーゼ(TGase)触媒反応用に1以上のアクセプターグルタミン残基を含むように改変されている。
さらなる実施形態において、抗EGFR抗体または抗原結合抗体断片は、次の抗体:セツキシマブ、パニツムマブ、ニモツズマブ、ザルツムマブ、ネシツムマブ、マツズマブ、RG−716、GT−MAB5.2−GEX、ISU−101、ABT−806、SYM−004、MR1−1、SC−100、MDX−447およびDXL−1218のうちの一つの軽鎖の3つのCDR領域および重鎖の3つのCDR領域を含む抗体または抗原結合抗体断片からなる群から選択される。
さらなる実施形態において、抗EGFR抗体または抗原結合抗体断片は、次の抗体:セツキシマブ、パニツムマブ、ニモツズマブ、ザルツムマブ、ネシツムマブ、マツズマブのうちの一つの軽鎖の3つのCDR領域および重鎖の3つのCDR領域を含む抗体または抗原結合抗体断片からなる群から選択される。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらを本発明の文脈で用いることができる。
抗炭酸脱水酵素IX抗体
癌標的分子炭酸脱水酵素IXに結合する抗体の例が、WO2007/070538−A2(例えば、請求項1から16)に記載されている。
好ましい実施形態において、抗炭酸脱水酵素IX抗体または抗原結合抗体断片は、抗炭酸脱水酵素IX抗体または抗原結合抗体断片3ee9(WO2007/070538−A2の請求項4(a))、3ef2(WO2007/070538−A2の請求項4(b))、1e4(WO2007/070538−A2の請求項4(c))、3a4(WO2007/070538−A2の請求項4(d))、3ab4(WO2007/070538−A2の請求項4(e))、3ah10(WO2007/070538−A2の請求項4(f))、3bb2(WO2007/070538−A2の請求項4(g))、1aa1(WO2007/070538−A2の請求項4(h))、5a6(WO2007/070538−A2の請求項4(i))および5aa3(WO2007/070538−A2の請求項4(j))からなる群から選択される。
抗C4.4a抗体:
本発明によれば、C4.4a抗体を用いることができる。
C4.4a抗体および抗原結合性断片の例は、WO2012/143499A2に記載されている。参照によって、WO2012/143499A2の全ての抗体は本明細書に組み込まれ、それらを本発明で用いることができる。その抗体の配列がWO2012/143499A2の表1にあり、その表中で各列は、第1欄に挙げられた抗体の可変軽鎖または可変重鎖の個々のCDRアミノ酸配列を示している。
1実施形態において、抗C4.4a抗体またはそれの抗原結合抗体断片は、C4.4aを発現する細胞に結合した後に、その細胞によって内在化される。
さらなる実施形態において、抗C4.4a抗体または抗原結合抗体断片は、WO2012/143499A2の表1またはWO2012/143499A2の表2に挙げた抗体の少なくとも一つ、二つまたは三つのCDRアミノ酸配列を含む。そのような抗体の好ましい実施形態も同様に、WO2012/143499A2に列記されており、参照によって本明細書に組み込まれる。
抗HER2抗体:
癌標的分子Her2に結合する抗体の例には、トラスツズマブ(Genentech)がある。トラスツズマブは、特に乳癌治療に用いられるヒト化抗体である。
HER2に結合する抗体のさらなる例は、トラスツズマブ(INN7637、CAS番号:RN:180288−69−1)およびペルツズマブ(CAS番号380610−27−5)に加えて、WO2009/123894−A2、WO200/8140603−A2またはWO2011/044368−A2に開示の抗体である。抗HER2複合体の例は、トラスツズマブ−エムタンシン(INN番号9295)である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗CD20抗体:
癌標的分子CD20に結合する抗体の例は、リツキシマブ(Genentech)である。リツキシマブ(CAS番号:174722−31−7)は、非ホジキンリンパ腫の治療に使用されるキメラ抗体である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗CD52抗体:
癌標的分子CD52に結合する抗体の例は、アレムツズマブ(Genzyme)である。アレムツズマブ(CAS番号:216503−57−0)は、慢性リンパ性白血病の治療に用いられるヒト化抗体である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗メソテリン抗体:
抗メソテリン抗体の例が、例えばWO2009/068204に記載されている。参照によって、WO2009/068204に記載の全ての抗体が、本記載に組み込まれることで、これら抗体を、本明細書に開示の本発明の文脈で用いることができる。
本発明に従って用いられる抗メソテリン抗体は、好ましくはメソテリンに結合する不変異体においても注目すべきものである。不変異体結合は、例えば、本発明に従って使用される抗体が、さらなる細胞外タンパク質によってマスクできないメソテリンのエピトープに結合することを特徴とする。そのようなさらなる細胞外タンパク質は、例えば、タンパク質卵巣癌抗原125(CA125)である。好ましく使用される抗体は、それのメソテリンへの結合がCA125によってブロックされないことを特徴とする。
抗CD30抗体
癌標的分子CD30に結合し、癌、例えばホジキンリンパ腫の治療に用いることができる抗体の例は、ブレンツキシマブ、イラツムマブ(iratumumab)およびWO2008/092117、WO2008/036688またはWO2006/089232に開示の抗体である。抗CD30複合体の例は、ブレンツキシマブベドチン(INN番号9144)である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗CD22抗体
癌標的分子CD22に結合し、癌、例えばリンパ腫の治療に用いることができる抗体の例は、イノツズマブおよびエプラツズマブである。抗CD22複合体の例は、イノツズマブオザガマイシン(ozagamycin)(INN番号8574)または抗CD22−MMAEおよび抗CD22−MC−MMAE(それぞれCASRN:139504−50−0および474645−27−7)である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗CD33抗体
癌標的分子CD33に結合し、癌、例えば白血病の治療に用いることができる抗体の例は、ゲムツヅマブおよびリンツズマブ(INN7580)である。抗CD33複合体の例は、ゲムツヅマブ−オザガマイシン(ozagamycin)である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗NMB抗体
癌標的分子NMBに結合し、癌、例えばメラノーマまたは乳癌の治療に用いることができる抗体の例はグレンバツムマブ(INN9199)である。抗NMB複合体の例は、グレンバツムマブベドチン(CASRN:474645−27−7)である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗CD56抗体
癌標的分子CD56に結合し、癌、例えば多発性骨髄種、小細胞肺癌、MCCまたは卵巣癌の治療に用いることができる抗体の例は、ロルボツズマブである。抗CD56複合体の例は、ロルボツズマブメルタンシン(CASRN:139504−50−0)である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗CD70抗体
癌標的分子CD70に結合し、癌、例えば非ホジキンリンパ腫または腎細胞癌の治療に用いることができる抗体の例が、WO2007/038637−A2およびWO2008/070593−A2に開示されている。抗CD70複合体の例は、SGN−75(CD70MMAF)である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗CD74抗体
癌標的分子CD74に結合し、癌、例えば多発性骨髄種の治療に用いることができる抗体の例は、ミラツズマブである。抗CD74複合体の例は、ミラツズマブ−ドキソルビシン(CASRN:23214−92−8)である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗CD19抗体
癌標的分子CD19に結合し、癌、例えば非ホジキンリンパ腫の治療に用いることができる抗体の例が、WO2008/031056−A2に開示されている。さらなる抗体および抗CD19複合体(SAR3419)の例が、WO2008/047242−A2に開示されている。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗ムチン抗体
癌標的分子ムチン−1に結合し、癌、例えば非ホジキンリンパ腫の治療に用いることができる抗体の例は、クリバツズマブおよびWO2003/106495−A2、WO2008/028686−A2に開示の抗体である。抗ムチン複合体の例は、WO2005/009369−A2で開示されている。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗CD138抗体
癌標的分子CD138およびそれの複合体に結合し、癌、例えば多発性骨髄種の治療に用いることができる抗体の例が、WO2009/080829−A1、WO2009/080830−A1で開示されている。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗インテグリン−αV抗体
癌標的分子インテグリンαVに結合し、癌、例えばメラノーマ、肉腫または癌腫の治療に用いることができる抗体の例は、インテツムマブ(CASRN:725735−28−4)、アブシキシマブ(CASRN:143653−53−6)、エタラシズマブ(CASRN:892553−42−3)およびUS7,465,449、EP719859−A1、WO2002/012501−A1およびWO2006/062779−A2に開示の抗体である。抗インテグリンαV複合体の例は、インテツムマブ−DM4およびWO2007/024536−A2で開示の他のADC類である。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗TDGF1抗体
癌標的分子TDGF1に結合し、癌の治療に用いることができる抗体の例は、WO02/077033−A1、US7,318,924、WO2003/083041−A2およびWO2002/088170−A2に開示の抗体である。抗TDGF1複合体の例が、WO2002/088170−A2に開示されている。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗PSMA抗体
癌標的分子PSMAに結合し、癌、例えば前立腺癌の治療に用いることができる抗体の例は、WO97/35616−A1、WO99/47554−A1、WO01/009192−A1およびWO2003/034903に開示の抗体である。抗PSMA複合体の例が、WO2009/026274−A1およびWO2007/002222で開示されている。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗EPHA2抗体
癌標的分子EPHA2に結合し、複合体の製造および癌の治療に用いることができる抗体の例が、WO2004/091375−A2で開示されている。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗SLC44A4抗体
癌標的分子SLC44A4に結合し、複合体の製造および癌、例えば膵臓癌または前立腺癌の治療に用いることができる抗体の例が、WO2009/033094−A2およびUS2009/0175796−A1で開示されている。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗HLA−DOB抗体
癌標的分子HLA−DOBに結合する抗体の例は、癌、例えば非ホジキンリンパ腫の治療に用いることができる抗体Lym−1(CASRN:301344−99−0)である。抗HLA−DOB複合体の例が、例えば、WO2005/081711−A2に開示されている。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗VTCN1抗体
癌標的分子VTCN1に結合し、複合体の製造および癌、例えば卵巣癌、膵臓癌、肺癌または乳癌の治療に用いることができる抗体の例が、WO2006/074418−A2で開示されている。参照によって、これらの抗体およびそれの抗原結合性断片は本明細書に組み込まれ、それらは本発明の文脈で使用することができる。
抗FGFR2抗体
本発明によれば、抗FGFR2抗体を用いることができる。
抗FGFR2抗体および抗原結合性断片の例がWO2013076186に記載されている。参照によって、WO2013076186の全ての抗体が、本発明の説明に組み込まれ、それらを本発明で用いることができる。抗体の配列が、WO2013076186の表9および表10に示されている。好ましいものは、M048−D01およびM047−D08と称される抗体、抗原結合性断片およびその抗体由来の抗体の変異体である。好ましい抗FGFR2は、FGFR2と称される各種スプライス変異体に結合する。
1実施形態において、抗FGFR2抗体またはそれの抗原結合抗体断片は、FGFR2を発現する細胞に結合した後、その細胞によって内在化される。
さらなる実施形態において、抗FGFR2抗体または抗原結合抗体断片は、WO2013076186の表9または表10に挙げた抗体の少なくとも一つ、二つまたは三つのCDRアミノ酸配列を含む。そのような抗体の好ましい実施形態も同様に、WO2013076186に列記されており、参照によって本明細書に組み込まれる。
抗TWEAKR抗体
好ましい実施形態において、抗TWEAKR抗体またはそれの抗原結合性断片を本発明による方法で用いる場合、この抗体または断片は、下記のものから選択される。さらに、TWEAKRに結合する抗体は当業者に知られており、例えば、WO2015/189143(A1)、WO2014/198817(A1)、WO2009/020933(A2)またはWO2009140177(A2)を参照する。さらに、PNGaseFによる脱グリコシルによって、または重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって形成された記載の抗TWEAKR抗体の脱グリコシル化変異体を、本発明による方法で用いる。さらに、これら抗体の変異体を、トランスグルタミナーゼ(TGase)触媒反応のための1以上のアクセプターグルタミン残基を含むように改変した。
本発明は特に、TWEAKR(配列番号169(タンパク質);配列番号170(DNA))の強い活性化を生じることでTWEAKRを過剰発現する各種癌細胞におけるアポトーシスを強く誘発する抗体またはそれの抗原結合性抗体断片またはそれらの変異体との複合体に関するものである。
アポトーシス誘発および既述の抗TWEAKR抗体(例えばPDL−192)の増殖の阻害に関係するTWEAKRのアゴニスト活性が制限され、内因性リガンドTWEAKの効力に達しない。これらの抗体は、内因性リガンドTWEAKと比較して、同様の範囲であるアフィニティでTWEAKRで結合し(Michaelson JS et al., MAbs. 2011 Jul−Aug;3(4):362−75;Culp PA et al., Clin Cancer Res. 2010 Jan 15;16(2):497−508)、そして、より高い結合アフィニティを有する抗体でさえ、必ずしもより効果的なシグナル伝達活性を示すとは限らない(Culp PA, et al., Clin Cancer Res. 2010 Jan 15;16(2):497−508)ことから、このアゴニスト活性の欠如はアフィニティ低下に基づくものではない。さらに、既述の抗体の抗腫瘍活性はFcエフェクター機能によって決まることが明らかになり、ADCCがマウスモデルでのイン・ビボ効力において重要な役割を果たすことが明らかになっている。
抗TWEAKR抗体の形成
完全ヒト抗体ファージライブラリー(Hoet RM et al., Nat Biotechnol 2005;23(3):344−8)を用いて、固定化標的としてヒトおよびマウス−TWEAKRの二量体Fc融合細胞外ドメインを用いるタンパク質パニング(Hoogenboom H.R., Nat Biotechnol 2005;23(3):1105−16)によって、本発明のTWEAKR特異ヒトモノクローナル抗体を単離した。11種類の異なるFabファージを同定し、可溶性FAbのないCH2−CH3ドメインを提供する哺乳動物EgG発現ベクターで、相当する抗体をクローニングした。好ましい抗体を同定した後、これらを全長IgGとして発現した。個々の抗体の重鎖において突然変異N297AまたはN297Qを導入することで、記載の抗体の脱グリコシル化変異体を形成した。その構築物を、例えば、Tom et al., Chapter12, Methods Express: Expression Systems, 編者Michael R. Dyson and Yves Durocher、Scion Publishing Ltd, 2007 (AK実施例1参照)によって記載の方法に従って、哺乳動物細胞で一時的に発現させた。それらの抗体をタンパク質Aクロマトグラフィーによって精製し、AK実施例2に記載の方法に従って、ELISAおよびBIAcore分析を用いる可溶性モノマーTWEAKRに対する結合アフィニティによってさらに特性決定した。抗TWEAKR抗体の細胞結合特性を確認するため、多くの細胞系(HT29、HS68、HS578)に関して、結合をフローサイトメトリーによって調べた。NFκBレポーター遺伝子アッセイを行って、同定した11種類全ての抗体(ヒトIgG1)のアゴニスト活性を調べた。最も高いイン・ビトロ活性を有する抗体(TPP−883)を、さらなる活性およびアフィニティ成熟に関して選択した(詳細については、AK実施例1参照)。改善されたアゴニスト活性を有する単一の置換変異体:CDR−H3のG102Tが検出された。結局、最良の単一置換変異体G102Tと比較しての高いアフィニティに基づいて、7種類の変異体を選択した。それの相当するDNAを、哺乳動物IgG発現ベクターにクローニングし、上記のNF−κBレポーター遺伝子アッセイでの機能活性について調べた。結局、得られた配列をヒト生殖系列配列と比較し、アフィニティおよび効力に対してほとんど効果のない逸脱を調整した。抗体ライブラリースクリーニングにより、そしてアフィニティおよび/または活性成熟によって、次の抗体:「TPP−2090」、「TPP−2149」、「TPP−2093」、「TPP−2148」、「TPP−2084」、「TPP−2077」、「TPP−1538」、「TPP−883」、「TPP−1854」、「TPP−1853」、「TPP−1857」、および「TPP−1858」を得た。
本発明の抗体は、抗体ファージ提示スクリーニングなどの当業界で公知の方法(例えば、Hoet RM et al., Nat Biotechnol 2005;23(3):344−8参照)、確立されたハイブリドーマ技術(例えば、Koehler and Milstein Nature. 1975 Aug 7;256(5517):495−7参照)、またはマウスの免疫化、特にはhMAbマウスの免疫化(例えばVeloc免疫マウス(登録商標))によってさらに得ることができる。
抗TWEAKR抗体の特定の実施形態
本発明の1実施形態は、1以上のTWEAKR発現細胞系においてカスパーゼ3/7の強い誘発を示す抗体またはそれの抗原結合性抗体断片またはそれらの変異体を提供することである(WO2015/189143A1およびWO2014/198817A1も参照)。好ましい実施形態において、1以上のTWEAKR発現細胞系が、WiDr、A253、NCI−H322、HT29および786−Oからなる群に存在する。本明細書に記載の方法などの当業界で公知の一般的な方法によって、「カスパーゼ3/7の誘発」を測定することができる。1実施形態において、「カスパーゼ3/7の誘発」を、本発明に従って、カスパーゼ3/7溶液(Promega、#G8093)を用いた活性測定およびVICTOR V(Perkin Elmer)での発光の読取値を用いて求める。インキュベーション時間が終了した後、カスパーゼ3/7活性を求め、カスパーゼ3/7の誘発係数を、未処理細胞との比較で求めた。抗体は、誘発係数が1.2より大きい、好ましくは1.5より大きい、さらにより好ましくは1.8より大きい、さらにより好ましくは2.1より大きい、さらにより好ましくは2.5より大きい場合に、カスパーゼ3/7の「強い誘発」を示すものと言われる。既述のアゴニスト抗体[例えばPDL−192(TPP−1104)、P4A8(TPP−1324)、136.1(TPP−2194)]と比較して、さらには300ng/mLの組換えヒトTWEAKと比較して、HT29細胞でのカスパーゼ3/7誘発がより強い抗TWEAKR抗体が提供される。癌細胞でのカスパーゼ3/7誘発におけるこの強い活性は、WiDr、A253、NIC−H322および786−O細胞でも認められ、その場合に、ほとんどの実験で、調べた本発明の抗体が、参考抗体[PDL−192(TPP−1104)、P4A8(TPP−1324)]および300ng/mLのTWEAKと比べて高い変動係数を誘発した。本発明の一部の抗体は、中等度のアフィニティ(>10nM)でのみTWEAKRに結合し、それは内因性リガンドTWEAKのアフィニティより明らかに小さく、他の既知のアゴニスト抗体の場合より小さかった。この特性は、例えば、腫瘍への浸透がより深くなる可能性などのさらなる可能な利点を提供するものである。
これに関して、本発明の1実施形態は、TWEAKR(配列番号169;図1も参照)の位置47(D47)でアスパラギン酸(D)に選択的に結合することを特徴とする、新たなエピトープでTWEAKRに特異的に結合する抗体またはそれの抗原結合性抗体断片を提供することにある。抗体相互作用についてのある種のTWEAKRアミノ酸について確認された依存性は、これらの抗体において測定されたアゴニスト活性と相関するものである。自然リガンドTWEAKは、TWEAKRの効果的活性化を示し、TWEAKRのシステイン豊富ドメインにおいてロイシン46に応じて結合する(Pellegrini et al., FEBS 280:1818−1829)。P4A8は非常に低いアゴニスト活性を示し、TWEAKRのシステイン豊富ドメインの外のドメインと少なくとも部分的に相互作用する。PLD−192は、中等度のアゴニスト活性を示し、R56に応じてシステイン豊富ドメインに結合するが、TWEAKリガンド部位と反対である。本発明の抗体(例えばTPP−2090)はD47に応じて結合し、TWEAKはL46に応じて結合する。従って、TWEAKは、同様であるが異なる結合部位に結合する(図7)。従って、強いアゴニスト活性を示す本発明の抗体は、非常に高いアゴニスト活性に関連する抗体についての新規なエピトープに結合する(D47依存性)。
TWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)のアミノ酸は、本発明による抗体の結合に必須であると考えられ、それはAK実施例2および図6に記載のように、この残基をアラニンに変えることによって、抗体がそれのELISAシグナルの20%強、あるいは30%強、あるいは40%強、あるいは50%強、あるいは60%強、あるいは70%強、あるいは80%強、あるいは90%強、あるいは100%を失ったら、抗体がTWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)におけるDに特異的に結合することを意味する。あるいは、抗体がTPP−2203と比較してTPP−2614へのそれのELISAシグナルの20%強、あるいは30%強、あるいは40%強、あるいは50%強、あるいは60%強、あるいは70%強、あるいは80%強、あるいは90%強、あるいは100%を失うと、抗体はTWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)におけるDに特異的に結合する。好ましくは、抗体がTPP−2203と比較してTPP−2614へのそれのELISAシグナルの80%強を失うと、抗体はTWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)におけるDに特異的に結合する。
本願では、下記の表で示したように、次の本発明の好ましい抗体:「TPP−2090」、「TPP−2149」、「TPP−2093」、「TPP−2148」、「TPP−2084」、「TPP−2077」、「TPP−1538」、「TPP−883」、「TPP−1854」、「TPP−1853」、「TPP−1857」、「TPP−1858」を挙げている。
表:抗体のタンパク質配列
Figure 2018528161
TPP−2090は、配列番号2に相当する重鎖の領域および配列番号1に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−2658は、配列番号241に相当する重鎖の領域および配列番号1に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−5442は、配列番号242に相当する重鎖の領域および配列番号1に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−8825は、配列番号243に相当する重鎖の領域および配列番号1に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−2149は、配列番号12に相当する重鎖の領域および配列番号11に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−2093は、配列番号22に相当する重鎖の領域および配列番号21に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−2148は、配列番号32に相当する重鎖の領域および配列番号31に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−2084は、配列番号42に相当する重鎖の領域および配列番号41に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−2077は、配列番号52に相当する重鎖の領域および配列番号51に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−1538は、配列番号62に相当する重鎖の領域および配列番号61に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−883は、配列番号72に相当する重鎖の領域および配列番号71に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−1854は、番号82に相当する重鎖の領域配列および配列番号81に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−1853は、配列番号92に相当する重鎖の領域および配列番号91に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−1857は、配列番号102に相当する重鎖の領域および配列番号101に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−1858は、番号112に相当する重鎖の領域配列および配列番号111に相当する軽鎖の領域を含む抗体である。
TPP−2090は、配列番号10に相当する重鎖の可変領域および配列番号9に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−2149は、配列番号20に相当する重鎖の可変領域および配列番号19に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−2093は、配列番号30に相当する重鎖の可変領域および配列番号29に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−2148は、配列番号40に相当する重鎖の可変領域および配列番号39に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−2084は、配列番号50に相当する重鎖の可変領域および配列番号49に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−2077は、配列番号60に相当する重鎖の可変領域および配列番号59に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−1538は、配列番号70に相当する重鎖の可変領域および配列番号69に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−883は、配列番号80に相当する重鎖の可変領域および配列番号79に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−1854は、配列番号90に相当する重鎖の可変領域および配列番号89に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−1853は、配列番号100に相当する重鎖の可変領域および配列番号99に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−1857は、配列番号110に相当する重鎖の可変領域および配列番号109に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
TPP−1858は、配列番号120に相当する重鎖の可変領域および配列番号119に相当する軽鎖の可変領域を含む抗体である。
表:本発明による抗体のDNA配列
Figure 2018528161
Figure 2018528161
抗TWEAKR抗体の好ましい実施形態は、下記のものである。
1.TWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)でDに特異的に結合する抗TWEAKR抗体、脱グリコシル化変異体、またはそれの抗原結合性断片。
2.抗体がアゴニスト抗体である実施形態1による抗体またはそれの抗原結合性断片。
3.
(a)式PYPMX(XはIまたはMである。)を含むアミノ酸配列(配列番号171)によってコードされた重鎖のCDR1;
(b)式YISPSGGXTHYADSVKG(XはSまたはKである。)を含むアミノ酸配列(配列番号172)によってコードされた重鎖のCDR2;および
(c)式GGDTYFDYFDYを含むアミノ酸配列(配列番号173)によってコードされた重鎖のCDR3
を含む可変重鎖
および
(a)式RASQSISXYLN(XはGまたはSである。)を含むアミノ酸配列(配列番号174)によってコードされた軽鎖のCDR1;
(b)式XASSLQS(XはQ、AまたはNである。)を含むアミノ酸配列(配列番号175)によってコードされた軽鎖のCDR2;および
(c)式QQSYXXPXIT(位置5でのXはTまたはSであり、位置6でのXはTまたはSであり、位置8でのXはGまたはFである。)を含むアミノ酸配列(配列番号176)によってコードされた軽鎖のCDR3
を含む可変軽鎖
を含む実施形態1または2による抗体またはそれの抗原結合性断片。
4.
a.配列番号6に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号7に示した重鎖の可変CDR2配列および配列番号8に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号3に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号4に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号5に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
b.配列番号16に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号17に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号18に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号13に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号14に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号15に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
c.配列番号26に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号27に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号28に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号23に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号24に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号25に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
d.配列番号36に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号37に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号38に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号33に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号34に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号35に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
e.配列番号46に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号47に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号48に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号43に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号44に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号45に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
f.配列番号56に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号57に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号58に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号53に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号54に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号55に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
g.配列番号66に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号67に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号68に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号63に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号64に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号65に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
h.配列番号76に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号77に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号78に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号73に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号74に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号75に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
i.配列番号86に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号87に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号88に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号83に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号84に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号85に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
j.配列番号96に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号97に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号98に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号93に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号94に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号95に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
k.配列番号106に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号107に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号108に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号103に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号104に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号105に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖または
l.配列番号116に示した重鎖の可変CDR1配列、配列番号117に示した重鎖の可変CDR2配列、配列番号118に示した重鎖の可変CDR3配列を含む可変重鎖、そしてさらに
配列番号113に示した軽鎖の可変CDR1配列、配列番号114に示した軽鎖の可変CDR2配列および配列番号115に示した軽鎖の可変CDR3配列を含む可変軽鎖
を含む前出の実施形態のいずれかによる抗体またはそれの抗原結合性断片。
5.
a.配列番号10に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号9に示した軽鎖の可変性配列、または
b.配列番号20に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号19に示した軽鎖の可変性配列、または
c.配列番号30に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号29に示した軽鎖の可変性配列、または
d.配列番号40に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号39に示した軽鎖の可変性配列、または
e.配列配列番号50に示した重鎖の可変性、そしてさらに配列番号49に示した軽鎖の可変性配列、または
f.配列番号60に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号59に示した軽鎖の可変性配列、または
g.配列番号70に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号69に示した軽鎖の可変性配列、または
h.配列番号80に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号79に示した軽鎖の可変性配列、または
i.配列番号90に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号89に示した軽鎖の可変性配列、または
j.配列番号100に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号99に示した軽鎖の可変性配列、または
k.配列番号110に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号109に示した軽鎖の可変性配列、または
l.配列番号120に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号119に示した軽鎖の可変性配列
を含む前出の実施形態のいずれかによる抗体またはそれの抗原結合性断片。
6.IgG抗体である前出の実施形態のいずれかによる抗体。
7.
a.配列番号2に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号1に示した軽鎖の配列、または
b.配列番号12に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号11に示した軽鎖の配列、または
c.配列番号22に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号21に示した軽鎖の配列、または
d.配列番号32に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号31に示した軽鎖の配列、または
e.配列番号42に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号41に示した軽鎖の配列、または
f.配列番号52に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号51に示した軽鎖の配列、または
g.配列番号62に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号61に示した軽鎖の配列、または
h.配列番号72に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号71に示した軽鎖の配列、または
i.配列番号82に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号81に示した軽鎖の配列、または
j.配列番号92に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号91に示した軽鎖の配列、または
k.配列番号102に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号101に示した軽鎖の配列、または
l.配列番号112に示した重鎖の配列、そしてさらに配列番号111に示した軽鎖の配列
を含む前出の実施形態のいずれかによる抗体。
8.scFv、Fab、Fab′断片またはF(ab′)2断片である前出の実施形態のいずれかによる抗原結合性断片または前出の実施形態のいずれかによる抗体の抗原結合性断片。
9.モノクローナル抗体またはそれの抗原結合性断片である、前出の実施形態のいずれかによる抗体またはそれの抗原結合性断片。
10.ヒト、ヒト化もしくはキメラ抗体または抗原結合性断片である前出の実施形態のいずれかによる抗体またはそれの抗原結合性断片。
特に好ましいものは、抗TWEAKR抗体TPP−2090である。
本発明の1実施形態は、キネシン紡錘体タンパク質阻害剤のトランスグルタミナーゼ(TGase)介在複合体化に好適な抗体を提供するものである。
ヒトアイソタイプの野生型全長IgG抗体は、TGaseの存在下にアクセス可能で反応性である重鎖の残基295(Kabat EUナンバリング)に保存アクセプターグルタミンを有することで、抗体が非グリコシル化型である場合に、抗体および好適な化合物から複合体を形成する。そのような「脱グリコシル」または「脱グリコシル化抗体」または「脱グリコシル抗体」は、Fc領域のCH2ドメインにおける保存N連結部位に結合したグリカンを持たないFc領域を含む。
脱グリコシル抗体は、例えばグリコシル化を持たない発現系で抗体を発現させることで発生させることができる。脱グリコシル抗体は、原核生物宿主での抗体の発現によって製造することができる。好適な原核生物宿主には、大腸菌(E. coli)、枯草菌(Bacillus subtilis)、ネズミチフス菌(Salmonella typhimurium)ならびにシュードモナス属、ストレプトミセス属およびスタフィロコッカス属の各種生物種などがあるが、これらに限定されるものではない。本発明の別の実施形態において、脱グリコシル抗体は、グリコシル化阻害剤ツニカマイシンとともに哺乳動物発現系を用いて達成することができる(Nose & Wigzell (1983), Proc Natl Acad Sci USA, 80(21):6632−6)。すなわち、その修飾は、前記抗体のFc部分のCH2ドメインにおける保存N連結部位でのグリコシル化の防止である。本発明の別の実施形態において、Fc領域抗体のCH2ドメインにおける保存N連結部位に結合したグリカンを除去し、それは、抗体が脱グリコシルであることを意味する。抗体の酵素的脱グリコシル方法は、当業界で公知である(例えば、Winkelhake & Nicolson (1976), J Biol Chem. 251(4):1074−80)。脱グリコシル化抗体は、例えばPNGaseFを用いる酵素的脱グリコシルによって製造することができる。
本発明の別の実施形態において、脱グリコシル化抗体は、N297(Kabat EUナンバリングを使用)の重鎖グリコシル化部位の突然変異によって製造される。そのような改変脱グリコシル化抗体の酵素的複合体化が、突然変異N297D、N297Q(Jeger et al., Angewandte Chemie Int. Ed. Engl 49, 9995−9997(2010))、またはN297S(特許出願WO2013092998A1およびWO2013092983A2を参照)を有する脱グリコシル化抗体変異体について記載されている。さらに、本発明は、トランスグルタミナーゼが突然変異N297A(Kabat EUナンバリング)を有する脱グリコシル化抗体変異体への複合体化を効率的に触媒する可能性のあることを示すものである。
TGase存在下で反応性のさらなる部位または別の部位を、抗体の操作によって作ることができる。本発明の化合物は、野生型または親抗体の1以上のアミノ酸がグルタミンアミノ酸で置き換わっているか(それによって置換)、グルタミン残基が、適宜に他のアミノ酸残基(例えばアクセプターグルタミン残基を含む標識)とともに、野生型または親に導入または付加されるグルタミン改変抗体を含む。
TGaseにアクセス可能なグルタミンを提供する単一部位突然変異は、抗体が複数の改変鎖を含む場合に複合体化し得る複数の改変グルタミン残基を生じ得る。例えば、単一部位突然変異は、IgG抗体の二量体性のために、IgGに二つの改変グルタミン残基を生じる。
好適な条件下でTGaseの存在下に反応性である抗体のグルタミンアミノ酸残基が、重鎖、代表的には定常領域において重鎖にあり得る。1実施形態において、アミノ酸位置297(Kabat EUナンバリング)のアスパラギンが、グルタミンと異なる残基で置き換わっている。好ましいものはN297D、N297Q、N297SまたはN297Aであり、非常に好ましいものはN297Aである。その抗体は、N297X置換のある定常領域を有する。従って、N297X置換および残基295(Kabat EUナンバリング)でグルタミンを有する抗体は、一つのアクセプターグルタミン、従って、重鎖当たり一つの結合部位を有することになる。従って、完全IgG型は、抗体当たり二つの複合体を有することになる。
好適な条件下でTGaseの存在下に反応性である抗体のグルタミンアミノ酸残基が、重鎖、代表的には定常領域において重鎖にあり得る。1実施形態において、アミノ酸位置297(Kabat EUナンバリング)のアスパラギンが、グルタミン残基で置き換わっている。その抗体は、N297Q置換のある定常領域を有する。従って、N297Q置換および残基295(Kabat EUナンバリング)でグルタミンを有する抗体は、二つのアクセプターグルタミン、従って、重鎖当たり二つの結合部位を有することになる。従って、完全IgG型は、抗体当たり四つの複合体を有することになる。
好適な条件下でTGaseの存在下に反応性である抗体のグルタミンアミノ酸残基が、重鎖、代表的には定常領域において重鎖にあり得る。1実施形態において、アミノ酸位置297(Kabat EUナンバリング)のアスパラギンが、グルタミン残基で置換されており、位置295(Kabat EUナンバリング)で、グルタミンが置き換わっている。その抗体は、N297QおよびQ295X置換のある定常領域を有することになる。好ましいのはQ295N置換である。従って、N297Q置換を有し、残基295(EUナンバリング)でグルタミンを持たない抗体は、一つのアクセプターグルタミン、従って重鎖当たり一つの結合部位を有することになる。従って、完全IgG型は、抗体当たり二つの複合体を有することになる。
トランスグルタミナーゼ(TGase)介在複合体化に好適な好ましい抗体は、
i.Xがアスパラギン以外のアミノ酸であるN297X置換(さらにより好ましいものは、N297D、N297Q、N297SまたはN297A、非常に好ましいものはN297AおよびN297Qである。)
ii.Xがグルタミン以外のアミノ酸であるN297Q置換およびQ295X置換(好ましいものはQ295Nである。)
を含む。
従って、複合体化抗体製造の有利な手法には、原料としてN297連結グリコシル化を持たない抗体を提供することが関与する(そのようなN連結グリコシル化は、TGaseカップリングを妨害する。)。
同位体、塩、溶媒和物、同位体変異体
本発明はまた、本発明による化合物の全ての好適な同位体形態を包含する。本発明による化合物の同位体形態は本明細書において、本発明による化合物内の少なくとも一つの原子が同じ原子番号であるが、自然界において通常もしくは支配的にある原子質量とは異なる原子質量を有する別の原子に交換されている化合物を意味するものと理解される。本発明による化合物に組み込むことができる同位体の例には、水素、炭素、窒素、酸素、リン、硫黄、フッ素、塩素、臭素およびヨウ素の同位体があり、例えばH(重水素)、H(三重水素)、13C、14C、15N、17O、18O、32P、33P、33S、34S、35S、36S、18F、36Cl、82Br、123I、124I、129Iおよび131Iである。本発明による化合物の特定の同位体型、特別には1以上の放射性同位体が組み込まれているものは、例えば、作用機序または身体中での活性化合物分布の試験に有用となり得る。製造および検出が比較的容易であることから、特には、Hまたは14C同位体で標識された化合物がその目的には好適である。さらに、同位体、例えば重水素を組み込むことにより、化合物の代謝安定性が高くなることで特に治療上有益となり得るものであり、例えば身体中での半減期が長くなり、または必要な活性成分用量が減る。従って、本発明による化合物のそのような修飾も、場合により、本発明の好ましい実施形態を構成し得る。本発明による化合物の同位体型は、当業者に公知の方法によって、例えば下記に記載の方法および実施例に記載の手順によって、個々の試薬および/または出発化合物の相当する同位体修飾を用いることで製造することができる。
本発明の文脈において好ましいは、本発明による化合物の生理的に許容される塩である。自体は医薬用途には適さないが、例えば本発明による化合物の単離または精製には用いることができる塩も包含される。
本発明による化合物の生理的に許容される塩には、鉱酸、カルボン酸およびスルホン酸の酸付加塩、例えば塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、トルエンスルホン酸、ナフタレンジスルホン酸、酢酸、トリフルオロ酢酸、プロピオン酸、乳酸、酒石酸、リンゴ酸、クエン酸、フマル酸、マレイン酸および安息香酸の塩などがある。
本発明の化合物の生理的に許容される塩にはさらに、通常の塩基の塩、例えば好ましくは、アルカリ金属塩(例えばナトリウムおよびカリウム塩)、アルカリ土類金属塩(例えばカルシウムおよびマグネシウム塩)およびアンモニアもしくは1から16個の炭素原子を有する有機アミン、例えば好ましくはエチルアミン、ジエチルアミン、トリエチルアミン、エチルジイソプロピルアミン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、トリエタノールアミン、ジシクロヘキシルアミン、ジメチルアミノエタノール、プロカイン、ジベンジルアミン、N−メチルピペリジン、N−メチルモルホリン、アルギニン、リジンおよび1,2−エチレンジアミンから誘導されるアンモニウム塩などがある。
本発明の文脈で溶媒和物は、溶媒分子による配位によって固体または液体での錯体を形成している本発明による化合物の形態と記述される。水和物は、配位が水によるものである溶媒和物の特定の形態である。本発明の文脈で好ましい溶媒和物は水和物である。
さらに、本発明は、本発明による化合物のプロドラッグも包含する。ここでの「プロドラッグ」という用語は、自体は生理的に活性または不活性であり得るが、身体に存在中に本発明の化合物に変換される(例えば、代謝的または加水分解的に)化合物を指す。
特定の実施形態
次の実施形態が特に好ましい。
実施形態A:
下記式のADC(またはAPDC)。
Figure 2018528161
[式中、KSP−L−は式(II)、(IIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)、(IV)から(IX)のいずれか、または下記式(IIf)の化合物であり、バインダーは、アクセプターグルタミン残基(特に好ましくは、TWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)でアミノ酸Dに特異的に結合する抗TWEAKR抗体またはそれの変異体、特別には抗TWEAKR抗体TPP−2090)、PNGaseFによる脱グリコシルによってまたは重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって形成されるこれら抗体の脱グリコシル化変異体、および細菌トランスグルタミナーゼの基質である溶媒アクセス可能グルタミン残基を含むように改変された前記記載の抗体の変異体を含む抗TWEAKR抗体であり、
nは2または4であり、
式(IIf):
Figure 2018528161
式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;
はCHを表し、XはCを表し、XはNを表し;
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し;
AはC(=O)を表し;
は−L−#1、−H、−COOH、−C(=O)−NHNH、−(CH1−3NH、−C(=O)−NZ″(CH1−3NHおよび−C(=O)−NZ″CHCOOHを表し、Z″は−Hまたは−NHを表し;
およびRは−Hまたは−L−#1を表し、またはRは−Hを表し、RはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−(P2およびPeは、例えば式(IIa)に関して示したように上記で定義のものと同じ意味を有する。)を表し、またはRおよびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、R10は−Hまたは−L−#1を表し;
は−L−#1またはC1−10−アルキル−を表し、それは−OH、−O−アルキル、−SH、−S−アルキル、−O−C(O)−アルキル、−O−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、−NH−C(=O)−NH−アルキル、−S(=O)−アルキル、−S(=O)−NH−アルキル、−NH−アルキル、−N(アルキル)または−NHによって置換されていても良く(アルキルは好ましくは、C1−3−アルキルである。);
は−L−#1、HまたはFを表し;
およびRは互いに独立に、−H、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
は分岐のC1−5−アルキル基を表し、それは−L−#1によって置換されていても良く;
はHまたはFを表し、
置換基R、R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つが−L−#1を表し、
−L−はリンカーを表しおよび#1は抗体への結合を表す。]
ならびにそのADCの塩、溶媒和物および溶媒和物の塩。
リンカーは好ましくは、下記のリンカーである。
Figure 2018528161
式中、
mは0または1であり;
§はKSPへの結合を表し、
§§は抗体への結合を表し、
L2は
−(NH)−(C=O)−G4−NH−#または#−(NH)−(C=O)−G4−O−NH−#
を表し、
pは0または1であり;
qは0または1であり;
G4は置換されていても良いアルキルまたはヘテロアルキル鎖を表し、適宜に、当該鎖のいずれかの炭素がアルコキシ、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、−S−アルキル、チオール、−C(=O)−S−アルキル、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、アミン、−C(=O)−NHで置換されており、
は、基Lへの結合箇所を示し、
は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示し,
L1は、下記式:
Figure 2018528161
によって表され、
式中、
10は−H、−NHまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G3は結合またはアリーレン基および/または直鎖および/または分岐および/または環状アルキレン基からの1から100個の炭素原子を有する置換されていても良い直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖を表し、それは基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)、−NH−、−C(=O)−、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−、−NMe−、−NHNH−、−S(=O)−NHNH−、−C(=O)−NHNH−およびN、OおよびSまたは−S(=O)−(好ましくは
Figure 2018528161
または
Figure 2018528161
)からなる群から選択される4個以下のヘテロ原子を有する3から10員の芳香族もしくは非芳香族複素環のうちの1以上によって1回または複数回中断されていても良く、側鎖が存在する場合、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良い。
ここで、#はKSP阻害剤への結合であり、#はバインダー(例えばL2)へのカップリング基への結合である。
実施形態B:
下記式のADC:
Figure 2018528161
[式中、
KSP−L−は、式(II)、(IIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)、(IIf)、(IV)から(IX)のいずれかまたは下記の式(IIg)の化合物であり、バインダーはアクアセプターグルタミン残基を含む抗体であり、nは2または4であり、
式(IIg):
Figure 2018528161
式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;
はCHを表し、XはCを表し、XはNを表し;
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し;
Aは−C(=O)−を表し;
は−L−#1、−H、−COOH、−C(=O)−NHNH、−(CH1−3NH、−C(=O)−NZ″(CH1−3NHおよび−C(=O)−NZ″CHCOOHを表し、Z″は−Hまたは−NHを表し;
およびRは、−Hまたは−L−#1を表し、またはRは−Hを表し、RはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−(P2およびPeは、例えば式(IIa)に関して示したように上記で定義のものと同じ意味を有する。)を表し、またはRおよびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、R10は−Hまたは−L−#1を表し;
は−L−#1またはC1−10−アルキル−を表し、それは−OH、−O−アルキル、−SH、−S−アルキル、−O−C(=O)−アルキル、−O−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、−NH−C(=O)−NH−アルキル、−S(=O)−アルキル、−S(=O)−NH−アルキル、−NH−アルキル、−N(アルキル)または−NHによって置換されていても良く(アルキルは好ましくは、C1−3−アルキルである。);
は−L−#1、HまたはFを表し;
およびRは互いに独立に、−H、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
は分岐のC1−5−アルキル基を表し;
はHまたはFを表し、
置換基R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つが−L−#1を表し、
−L−はリンカーを表し、#1は抗体への結合を表し、
−L−は、
Figure 2018528161
によって表され、
式中、
mは0または1であり;
§はKSPへの結合を表し、
§§は抗体への結合を表し、
L2は
−(NH)−(C=O)−G4−NH−#または#−(NH)−(C=O)−G4−O−NH−#
を表し、
pは0または1であり;
qは0または1であり;
G4は置換されていても良いアルキルまたはヘテロアルキル鎖を表し、適宜に、前記鎖のいずれかの炭素がアルコキシ、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、−S−アルキル、チオール、−C(=O)−S−アルキル、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、アミン、−C(=O)−NHで置換されており、
は、基Lへの結合箇所を示し、
は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示し、
L1は、下記式:
Figure 2018528161
によって表され、
10は−H、−NHまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表し、
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G3は結合またはアリーレン基および/または直鎖および/または分岐および/または環状アルキレン基からの1から100個の炭素原子を有する置換されていても良い直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖を表し、それは基−O−、−S−、−S(=O)−、
−S(=O)、−NH−、−C(=O)−、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−、−NMe−、−NHNH−、−S(=O)−NHNH−、−C(=O)−NHNH−およびからなる群から選択される4個以下のヘテロ原子を有する3から10員の芳香族もしくは非芳香族複素環N、OおよびSまたは−S(=O)−(好ましくは
Figure 2018528161
または
Figure 2018528161
)のうちの1以上によって1回または複数回中断されていても良く、側鎖が存在する場合、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
はKSP阻害剤への結合であり、#は、抗体(例えばL2)に対するカップリング基への結合である。]
ならびにそのADCの塩、溶媒和物および溶媒和物の塩。
実施形態C:
下記式のADC:
Figure 2018528161
[式中、KSP−L−は下記の下位構造I(sub)の化合物であり、バインダーは、アクセプターグルタミン残基(特に好ましくは、トラスツズマブまたはTWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)でアミノ酸Dに特異的に結合する抗TWEAKR抗体、特別には抗TWEAKR抗体TPP−2090)、抗HER2抗体または抗EGRF抗体(好ましくはニモツズマブ)、PNGaseFによる脱グリコシルによってまたは重鎖のN297(Kabatナンバリング)のいずれかのアミノ酸への突然変異によって形成されるこれら抗体の脱グリコシル化変異体、およびトランスグルタミナーゼ(TGase)触媒反応のために1以上のアクセプターグルタミン残基を含むように改変された前記の抗体の変異体であり、nは2または4であり;
Figure 2018528161
式中、
#aは分子の残りの部分への結合を表し;
1aは−L−#1、−Hまたは−(CH0−3Zを表し、Zは−H、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOHを表し、
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
2aおよびR4aは互いに独立に、−L−#1、H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
2aは−Hを表し、
4aはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−を表し、
P2およびP3は、例えば式(IIa)に関して示したように上記で定義のものと同じ意味を有し、
21はH、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−S(=O)NH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良く、または、−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
または
2aおよびR4aが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は−H、−L−#1、−NH、−SOH、−COOH、−SH、−SOHまたは−OHを表し、
置換基R1a、R2a、R4aまたはR10のうちの一つが−L−#1を表し、
−L−はリンカーを表し、#1は抗体への結合を表し、
−L−は、
Figure 2018528161
によって表され;
式中、
mは0または1であり;
§はKSPへの結合を表し、
§§は抗体への結合を表し、
L2は
Figure 2018528161
を表し、
pは0または1であり;
qは0または1であり;
G4は置換されていても良いアルキルまたはヘテロアルキル鎖を表し、適宜に、前記鎖のいずれかの炭素がアルコキシ、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、−S−アルキル、チオール、−C(=O)−S−アルキル、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、アミン、−C(=O)−NHで置換されており、
は、基Lへの結合箇所を示し、
は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示し,
L1は、下記式:
Figure 2018528161
によって表され;
式中、
10は−H、−NHまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G3は結合またはアリーレン基および/または直鎖および/または分岐および/または環状アルキレン基からの1から100個の炭素原子を有する置換されていても良い直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖を表し、それは基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)、−NH−、−C(=O)−、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−、−NMe−、−NHNH−、−S(=O)−NHNH−、−C(=O)−NHNH−およびN、OおよびSまたは−S(=O)−からなる群から選択される4個以下のヘテロ原子を有する3から10員の芳香族もしくは非芳香族複素環(好ましくは
Figure 2018528161
または
Figure 2018528161
)のうちの1以上によって1回または複数回中断されていても良く、側鎖が存在する場合、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良い。
ここで、#はKSP阻害剤への結合であり、#はバインダー(例えばL2)へのカップリング基への結合である。]
ならびにそのADCの塩、溶媒和物および溶媒和物の塩。
実施形態D:
下記式のADC:
Figure 2018528161
[式中、KSP−L−は、式(II)、(IIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIe)、(IIf)、(IIg),(III)から(IX)のいずれか、または下記の式(IIh)の化合物であり、バインダーはアクアセプターグルタミン残基を含む抗体であり、nは2または4の数字であり;
Figure 2018528161
式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;
はCHを表し、XはCを表し、XはNを表し;
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し;
Aは−C(=O)−を表し;
は−L−#1を表し;
およびRは、−Hを表し、
または
は−Hを表し、
はR21−C(=O)−P3(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−を表し、
P2およびP3は、例えば式(IIa)に関して示したように上記で定義のものと同じ意味を有し、
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、R10はHを表し;
はC1−10−アルキルを表し、それは1から3個の−OH基、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基または1から3個の−NH基によって置換されていても良く、
アルキルは好ましくは、C1−3−アルキルまたは−MODであり、
−MODは−(NR10−(G1)−G2−Hを表し、
10は−HまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10はNHを表さない。)を表し;
nは、0または1であり;
oは0または1であり;
G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く,
は−H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、または−C(=O)−、−CR=N−O−を表し、
は−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
いずれかの側鎖を含む炭化水素鎖は、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
−MODは好ましくは、少なくとも一つの基−COOHを有し;
はHまたはFを表し;
およびRは互いに独立に、−H、C1−3−アルキル、フルオロ−C1−3−アルキル、C2−4−アルケニル、フルオロ−C2−4−アルケニル、C2−4−アルキニル、フルオロ−C2−4−アルキニル、ヒドロキシまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
は分岐のC1−5−アルキル基を表し;
はHまたはFを表し、
−L−はリンカーを表し、#1は抗体への結合を表し,
−L−は、
Figure 2018528161
によって表され、
mは0または1であり;
§はKSPへの結合を表し、
§§は抗体への結合を表し、
L2は
Figure 2018528161
を表し、
式中、
pは0または1であり;
qは0または1であり;
G4は置換されていても良いアルキルまたはヘテロアルキル鎖を表し、適宜に、前記鎖のいずれかの炭素がアルコキシ、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、−S−アルキル、チオール、−C(=O)−S−アルキル、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、アミン、−C(=O)−NHで置換されており
は、基Lへの結合箇所を示し、
は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示し,
L1は、下記式:
Figure 2018528161
によって表され;
式中、
10は−H、−NHまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G3は結合またはアリーレン基および/または直鎖および/または分岐および/または環状アルキレン基からの1から100個の炭素原子を有する置換されていても良い直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖を表し、それは基−O−、−S−、−S(=O)−、
−S(=O)、−NH−、−C(=O)−、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−、−NMe−、−NHNH−、−S(=O)−NHNH−、−C(=O)−NHNH−およびN、OおよびSまたは−S(=O)−からなる群から選択される4個以下のヘテロ原子を有する3から10員の芳香族もしくは非芳香族複素環(好ましくは
Figure 2018528161
または
Figure 2018528161
)のうちの1以上によって1回または複数回中断されていても良く、側鎖を含む炭化水素鎖が存在する場合、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
はKSP阻害剤への結合であり、#は、抗体(例えばL2)に対するカップリング基への結合である。]
ならびにADCの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマー。
実施形態E:
下記式の部位特異的および均一ADC:
Figure 2018528161
[式中、KSP−L−は、式(II)、(IIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIe)、(IIf)、(IIg)、または(III)から(IX)のいずれか、または式(IIh)の化合物である。]ならびにADCの塩、溶媒和物および溶媒和物の塩。
本発明の1実施形態は、バインダーもしくはそれの誘導体の1以上の活性化合物分子との複合体であって、その活性化合物分子がリンカーLを介してバインダーに結合したキネシン紡錘体タンパク質阻害剤であり、そのリンカーLがバインダーのグルタミン側鎖に結合しており、1から5個のキネシン紡錘体タンパク質阻害剤がリンカーLに結合しており、前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤が下記式(IIa):
Figure 2018528161
[式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;または
はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はCHもしくはCFを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し(XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表すのが好ましい);
は−H、−MOD、−L−#1または−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
は−L−#1、H、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは、上記で定義のように表され、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
は−L−#1、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
Zは−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10はL−#1、−H、−NH、−SOH、−COOH、−SHまたは−OHを表し、
Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
は−L−#1、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくは−L−#1またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
nは0、1または2を表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NHC(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−H、−NH、−NO、ハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシ、−NO、−NH、−COOHまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
はC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキルまたは−(CH0−2−(HZ)を表し、
HZはN、OおよびSからなる群から選択される2個以下のヘテロ原子を有する4から7員の複素環(好ましくはオキセタン)を表し、これらの基のそれぞれは−OH、−COOH、−NHまたは
−L−#1によって置換されていても良く;
置換基R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つまたはゼロ個が−L−#1を表し、または(Rの場合)それを含み、
Lはリンカーを表し、
#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
−MODは−(NR10−(G1)−G2−Hを表し、
10は−HまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
Figure 2018528161
(G1が、−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表す場合、R10はNHを表さない。)を表し;
nは、0または1であり;
oは0または1であり;
G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
は−H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、または−C(=O)−、−CR=N−O−を表し、
は−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
いずれかの側鎖を含む炭化水素鎖は、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
G3は−Hまたは−COOHを表し、
−MODは好ましくは、少なくとも一つの基−COOHを有する。]
を有する複合体ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
本発明の別の実施形態は、XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表す上記の複合体である。
本発明の別の実施形態は、置換基Rが−L−#1を表す上記の複合体である。
本発明の別の実施形態は、バインダーもしくはそれの誘導体のリンカーLを介してバインダーに結合したキネシン紡錘体タンパク質阻害剤である活性化合物分子との複合体であって、そのリンカーLがバインダーのグルタミン側鎖に結合しており、前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤が、下記の下位構造:
Figure 2018528161
[式中、
#aは分子の残りの部分への結合を表し;
1aはHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
2aおよびR4aは互いに独立に、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は−H、−NH、−SOH、−COOH、−SH、または−OHを表し;
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤は、R1a、R2a、R4aでまたはR2aおよびR4aによって形成されたピロリジン環で水素原子の置換によってリンカーに結合している。]
を有する複合体ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
本発明の別の実施形態は、前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤が下記一般式(I):
Figure 2018528161
[式中、
1aは−Hまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−NHY、−OY、−SY、ハロゲン、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′または−CH(CHW)Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
2aおよびR4aは互いに独立に、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
または
2aおよびR4aが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10は−H、−NH、−SOH、−COOH、−SH、または−OHを表し;
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
3aは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくは−L−バインダー、またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
nは、0、1または2であり、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
「アルキル」は好ましくは、C1−10−アルキル)を表し;
8aはC1−10−アルキルを表し;
HZは、単環式もしくは二環式複素環を表し、それはハロゲン、C1−10−アルキル基、C6−10−アリール基およびC6−10−アラルキル基からなる群から選択される1以上の置換基によって置換されていても良く、それはハロゲンによって置換されていても良く;
前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤は、R1a、R2a、R3a、R4a、R8aでまたはR2aおよびR4aによって形成されたピロリジン環で水素原子の置換によってリンカーに結合している。]
によって表される上記の複合体ならびにそれの塩、溶媒和物および溶媒和物の塩である。
本発明の別の実施形態は、リンカーLがバインダーのグルタミン側鎖に結合しており、1から5個のキネシン紡錘体タンパク質阻害剤がリンカーLに結合しており、前記活性化合物分子リンカーが、一般式(II):
Figure 2018528161
[式中、
はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;または
はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はCHを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し;
は−H、−L−#1または−(CH0−3Zを表し、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wは−Hまたは−OHを表し、
は−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
およびRは互いに独立に、−L−#1、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
は−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
または
は−Hを表し、
は、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−の基を表し、
21はH、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−S(=O)NH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、
−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良く、または−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
xは0または1であり、
vは1から20の数字であり、
22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
P2およびP3は、例えば式(IIa)に関して示したように上記で定義のものと同じ意味を有し、
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
10はL−#1、−H、−NH、−SOH、−COOH、−SHまたは−OHを表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
は−L−#1または置換されていても良いアルキル、アリール、ヘテロアリール、または複素環アルキル基、好ましくは−L−#1またはC1−10−アルキル、C6−10−アリール、C6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
−L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
nは0、1または2を表し、
Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−H、−(CH0−3−CH(NHC(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
は−L−#1、−H、−F、−NH、−NO、ハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
、R、R、RおよびRのうちの一つ置換基が−L−#1を表し、
Lはリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
はC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキル、または置換されていても良いオキセタンを表し;
は−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表す。]
によって表される上記で定義の複合体ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
本発明の別の実施形態は、
が−H、−L−#1または−(CH0−3Zを表し、
−L−#1がリンカーを表し、#1がバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
Zが−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
およびYが互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′または−CH(CHW)Z′を表し、
が−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
Z′が−H、−NH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
Wが−Hまたは−OHを表し、
が−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
およびRが互いに独立に、−L−#1、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHYを表し、
または
およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−を表し、R10が−H、−L−#1、−NH、−COOH、−SH、−OHまたは−SOHを表し、
が−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
が−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
が直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
Aが−C(=O)−を表し、
が−(CH)OHまたは−L−#1を表し、
が−L−#1または−Hを表し、
置換基R、R、R、RおよびRのうちの一つが−L−#1を表す。]
によって表される上記の複合体ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマーである。
本発明の別の実施形態は、RおよびRが互いに独立に、−H、C1−3−アルキルまたはハロゲンを表す上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、RがC1−4−アルキル(好ましくはtert−ブチル)を表す上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、Rが−Hを表す上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、RおよびRが−Fを表す上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーまたはそれの誘導体が、バインダーペプチドもしくはタンパク質またはバインダーペプチドもしくはタンパク質の誘導体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記複合体がバインダー当たり二つの結合部位を有する上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記複合体がバインダー当たり四つの結合部位を有する上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質がトランスグルタミナーゼによって認識され得るアクセプターグルタミン側鎖を含むバインダーペプチドまたはタンパク質の抗体または誘導体を表す、上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、トランスグルタミナーゼ介在複合体化によって産生される上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、スタフィロミセス・モバラエンシス(Streptomyces Mobaraensis)由来のトランスグルタミナーゼを用いて製造される上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーが癌標的分子に結合する上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーが細胞外標的分子に結合する上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーが、細胞外標的分子に結合した後、標的分子を発現する細胞によって細胞内で(好ましくは、リソソーム的に)内在化および処理される上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、ヒト、ヒト化もしくはキメラモノクローナル抗体またはそれの抗原結合性断片である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、適宜にCH2ドメイン内の重鎖でアクセプターグルタミン残基を有する抗体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、位置295(Kabatナンバリングシステム)で重鎖にアクセプターグルタミン残基を有する抗体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、N297X置換(Xはアスパラギン以外のアミノ酸である。)、さらにより好ましくはN297D、N297Q、N297SまたはN297A、非常に好ましくはN297AおよびN297Qを含む抗体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、N297Q置換およびQ295X置換(Xはグルタミン以外のアミノ酸である。)、好ましくはQ295Nを含む抗体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、実質的にN連結グリコシル化を持たない残基297でアスパラギンを含む抗体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、アミノ酸残基N297でN連結グリコシル化を持たない抗体を産生する宿主細胞で産生される抗体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質が抗HER2抗体、抗EGFR抗体、抗TWEAKR抗体またはそれの抗原結合性断片である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記抗TWEAKR抗体が、TWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)におけるアミノ酸Dに特異的に結合し、好ましくは抗TWEAKR抗体TPP2090およびそれの脱グリコシル化変異体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記抗TWEAKR抗体が、TWEAKR(配列番号169)の位置47(D47)におけるアミノ酸Dに特異的に結合し、好ましくは抗TWEAKR抗体TPP−2090−HC−N297AまたはTPP−2090−HC−N297Qである上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記リンカーLがバインダーのグルタミン側鎖に結合し、1から5個のキネシン紡錘体タンパク質阻害剤がリンカーLに結合しており、前記リンカーLが下記の基本構造(i)から(iv):
(i)−(C=O)−SG1−L1−L2−
(ii)−(C=O)−L1−SG−L1−L2−
(iii)−(C=O)−L1−L2−
(iv)−(C=O)−L1−SG−L2
のうちの一つを有し、
mが0または1であり、SGおよびSG1がイン・ビボ開裂性基であり、L1が互いに独立にイン・ビボで非開裂性の有機基を表し、L2がバインダーへのカップリング基を表す、上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記リンカーLがバインダーのグルタミン側鎖に結合し、1から5個のキネシン紡錘体タンパク質阻害剤がリンカーLに結合しており、前記イン・ビボ開裂性基SGが2から8オリゴペプチド基、好ましくはジペプチド基またはジスルフィド、ヒドラゾン、アセタールもしくはアミナールであり、SG1が2から8オリゴペプチド基、好ましくはジペプチド基である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、上記で定義の複合体である。前記リンカーがグルタミン側鎖に結合し、下記式を有する。
Figure 2018528161
式中、
mは0または1であり;
§は、活性化合物分子への結合を表し、
§§は、バインダーペプチドまたはタンパク質への結合を表し、
L1は−(NR10−(G1)−G3−を表し、
10は−H、−HまたはC−C−アルキルを表し;
G1は−NH−C(=O)−または
Figure 2018528161
を表し;
nは0または1であり;
oは0または1であり;
G3は結合またはアリーレン基および/または直鎖および/または分岐および/または環状アルキレン基からの1から100個の炭素原子を有する置換されていても良い直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖を表し、それは基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)、−NH−、−C(=O)−、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−、−NMe−、−NHNH−、−S(=O)−NHNH−、−C(=O)−NHNH−およびN、OおよびSまたは−S(=O)−からなる群から選択される4個以下のヘテロ原子を有する3から10員の芳香族もしくは非芳香族複素環(好ましくは
Figure 2018528161
または
Figure 2018528161
)のうちの1以上によって1回または複数回中断されていても良く、側鎖を含む炭化水素鎖が存在する場合、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
または下記の基:
Figure 2018528161
のうちの一つを表し、
Rxは−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
L2は#−(NH)−(C=O)−G4−NH−#または#−(NH)−(C=O)−G4−O−NH−#を表し、
pは0または1であり;
qは0または1であり;
G4は置換されていても良いアルキルまたはヘテロアルキル鎖を表し、適宜に、前記鎖のいずれかの炭素がアルコキシ、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、−S−アルキル、チオール、−C(=O)−S−アルキル、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、アミン、−C(=O)−NHで置換されており、
は、基Lへの結合箇所を示し、
は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示す。
本発明の別の実施形態は、前記炭化水素鎖が、下記の基のうちの一つによって中断されている上記で定義の複合体である。
Figure 2018528161
Figure 2018528161
式中、Xは−HまたはC1−10−アルキル基を表し、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CN−NH、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良い。
本発明の別の実施形態は、上記で定義の複合体である。L2が下記の基のうちの一つであり;
L2が、
Figure 2018528161
(Rは−H、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、−C(=O)−NH、または−NHである。)であり、
は、基Lへの結合箇所を示し、
は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示す。
本発明の別の実施形態は、RがHまたはNHCOMeである上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、RまたはRが−L−#1を表す上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記抗TWEAKR抗体がアゴニスト抗体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、
a.式PYPMX(配列番号171)(XはIまたはMである。)を含むアミノ酸配列によってコードされる重鎖のCDR1;
b.式YISPSGGXTHYADSVKG(配列番号172)(XはSまたはKである。)を含むアミノ酸配列によってコードされる重鎖のCDR2;および
c.式GGDTYFDYFDY(配列番号173)を含むアミノ酸配列によってコードされる重鎖のCDR3;
を含む可変重鎖:
ならびに
d.式RASQSISXYLN(配列番号174)(XはGまたはSであwる。)を含むアミノ酸配列によってコードされる軽鎖のCDR1;
e.式XASSLQS(配列番号175)(XはQ、AまたはNである。)を含むアミノ酸配列によってコードされる軽鎖のCDR2;および
f.式QQSYXXPXIT(配列番号176)(位置5でのXはTまたはSであり、位置6でのXはTまたはSであり、位置8でのXはGまたはFである。)を含むアミノ酸配列によってコードされる軽鎖のCDR3;
を含む可変軽鎖
を含む上記の複合体である。
本発明の別の実施形態は、
a.配列番号10に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号9に示した軽鎖の可変性配列、または
b.配列番号20に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号19に示した軽鎖の可変性配列、または
c.配列番号30に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号29に示した軽鎖の可変性配列、または
d.配列番号40に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号39に示した軽鎖の可変性配列、または
e.配列番号50に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号49に示した軽鎖の可変性配列、または
f.配列番号60に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号59に示した軽鎖の可変性配列、または
g.配列番号70に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号69に示した軽鎖の可変性配列、または
h.配列番号80に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号79に示した軽鎖の可変性配列、または
i.配列番号90に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号89に示した軽鎖の可変性配列、または
j.配列番号100に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号99に示した軽鎖の可変性配列、または
k.配列番号110に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号109に示した軽鎖の可変性配列、または
l.配列番号120に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号119に示した軽鎖の可変性配列
を含む上記の複合体である。
本発明の別の実施形態は、前記抗体がIgG抗体である上記で定義の複合体である。
本発明の別の実施形態は、好ましくはトリフルオロ酢酸塩の形態での下記式のうちの一つの化合物を、トランスグルタミナーゼを用いてバインダーペプチドまたはタンパク質の残基に結合させ、前記化合物を好ましくはバインダーペプチドまたはタンパク質に関して2から100倍モル過剰で用いる、上記で定義の複合体の製造方法である。
Figure 2018528161
Figure 2018528161
[式中、X、X、X、SG、L1、R1は、上記、例えば式(IIa)におけるものと同じ意味を有し、Rは−H、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、−C(=O)−NH、または−NHである。]
Figure 2018528161
Figure 2018528161
[式中、X、X、X、SG、L1、R1およびRxは上記で定義のものと同じ意味を有する。]
本発明の別の実施形態は、前記バインダーペプチドまたはタンパク質が抗体または下記式によるバインダーペプチドまたはタンパク質の誘導体を表す、上記で定義の複合体である。
Figure 2018528161
本発明の別の実施形態は、上記で定義の複合体または上記で定義の化合物を不活性で無毒性の医薬として好適な補助剤と組み合わせて含む医薬組成物である。
本発明の別の実施形態は、疾患の治療および/または予防方法で使用される上記で定義の複合体または上記で定義の化合物である。
本発明の別の実施形態は、過剰増殖性および/または血管新生傷害の治療方法で使用される上記で定義の複合体または上記で定義の化合物である。
本発明の別の実施形態は、有効量の少なくとも一つの上記で定義の複合体または上記で定義の化合物を用いる、ヒトおよび動物での過剰増殖性および/または血管新生傷害の治療および/または予防方法である。
特に好ましい実施形態は、下記式のうちの一つによる複合体であり、Ak3a、Ak3b、AD3d、Ak3eは、バインダー、好ましくは抗体を表し、nは2から10、好ましくは2から4、そしてさらに好ましくは2または4を表す。
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
Figure 2018528161
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Figure 2018528161
治療用途
治療するのに本発明による化合物を用いることができる過増殖性疾患には、特には癌および腫瘍疾患の群などがある。本発明の文脈において、これらは、特には次の疾患(ただし、これらに限定されるものではない):乳癌および乳房腫瘍(腺管癌および小葉型などの乳癌、イン・サイツも)、気道の腫瘍(小細胞肺癌および非小細胞癌、気管支癌)、脳腫瘍(例えば、脳幹の腫瘍および視床下部の腫瘍、星細胞腫、上衣細胞腫、神経膠芽腫、神経膠腫、髄芽腫、髄膜腫ならびに神経外胚葉性(neuro−ectormal)腫瘍および松果体腫瘍)、消化器の腫瘍(食道、胃、胆嚢、小腸、大腸、直腸および肛門の癌)、肝臓腫瘍(特に、肝細胞癌、胆管癌および混合型肝細胞胆管癌)、頭部および頸部領域の腫瘍(喉頭、下咽頭、鼻咽頭、口咽頭癌、口唇および口腔癌、口腔メラノーマ)、皮膚腫瘍(基底細胞腫、棘細胞癌、扁平上皮癌、カポジ肉腫、悪性メラノーマ、非メラノーマ皮膚癌、メルケル細胞皮膚癌、肥満細胞腫瘍)、軟組織の腫瘍(特に、軟組織の肉腫、骨肉腫、悪性線維性組織球腫、軟骨肉腫、線維肉腫、血管肉腫、平滑筋肉腫、脂肪肉腫、リンパ肉腫および横紋筋肉腫)、眼球の腫瘍(特に、眼球内メラノーマおよび網膜芽細胞腫)、内分泌腺および外分泌腺の腫瘍(例えば甲状腺および副甲状腺、膵臓および唾液腺の癌、腺癌)、尿路の腫瘍(膀胱、陰茎、腎臓、腎盂および尿管の腫瘍)および生殖器の腫瘍(女性における子宮内膜、子宮頸部、卵巣、膣、外陰部および子宮の癌、および男性における前立腺および睾丸の癌)を意味するものと理解される。これらには、固形型または循環細胞としての血液、リンパ系および脊髄の増殖性疾患などもあり、例えば白血病、リンパ腫および骨髄増殖性疾患、例えば急性骨髄性、急性リンパ芽球性、慢性リンパ性、慢性骨髄性およびヘアリー細胞性の白血病、およびAIDS関連リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、皮膚T細胞性リンパ腫、バーキットリンパ腫および中枢神経系でのリンパ腫である。
ヒトでのこれらの十分に特徴付けられている疾患は、他の哺乳動物でも同等の病因によって生じ得るものであり、本発明の化合物によって同様に治療可能である。
本発明による化合物による上記で言及の癌疾患の治療は、固体腫瘍の治療およびそれの転移型および循環型の治療の両方を含むものである。
本発明の文脈において、「治療」または「治療する」という用語は、従来の意味で用いられ、疾患または健康上の異常と戦い、軽減し、弱化し、または改善すること、ならびに例えば癌の場合でのように、この疾患によって障害される生活条件を改善することを目的として、患者の世話を行い、ケアを行い、看病することを意味する。
従って、本発明はさらに、障害の、特には上記障害の治療および/または予防のための本発明による化合物の使用を提供する。
本発明はさらに、障害の、特には上記障害の治療および/または予防のための医薬品を製造するための本発明による化合物の使用を提供する。
本発明はさらに、障害の、特には上記障害の治療および/または予防方法での本発明による化合物の使用を提供する。
本発明はさらに、有効量の少なくとも1種類の本発明による化合物を用いて、障害、特には上記障害を治療および/または予防する方法を提供する。
本発明による化合物は、単独で、または必要に応じて、1以上の他の薬理活性物質と組み合わせて用いることができ、ただしその組み合わせは望ましくないおよび許容できない副作用を生じるものではない。従って、本発明はさらに、特には上記障害の治療および/または予防のための、少なくとも1種類の本発明による化合物および1以上のさらなる活性化合物を含む医薬品を提供する。
例えば、本発明の化合物は、癌疾患治療のための既知の抗過剰増殖性、細胞増殖抑制性または細胞毒性物質と組み合わせることができる。好適な組み合わせ活性化合物の例には、下記のものなどがある。
131I−chTNT、アバレリックス、アビラテロン、アクラルビシン、アドゥ−トラスツズマブエムタンシン、アファチニブ、アフリベルセプト、アルデスロイキン、アレムツズマブ、アレンドロン酸、アリトレチノイン、アルトレタミン、アミホスチン、アミノグルテチミド、ヘキシルアミノレブリネート、アムルビシン、アムサクリン、アナストロゾール、アンセスチム、アネトールジチオレチオン、アンギオテンシンII、アンチトロンビンIII、アプレピタント、アルシツモマブ、アルグラビン、三酸化ヒ素、アスパラギナーゼ、アキシチニブ、アザシチジン、バシリキシマブ、ベロテカン、ベンダムスチン、ベリノスタット、ベバシズマブ、ベキサロテン、ビカルタミド、ビサントレン、ブレオマイシン、ボルテゾミブ、ブセレリン、ボスチニブ、ブレンツキシマブ・ベドチン、ブスルファン、カバジタキセル、カボザンチニブ、カルシウムホリナート、カルシウムレボホリナート、カペシタビン、カプロマブ、カルボプラチン、カルフィルゾミブ、カルモフール、カルムスチン、カツマキソマブ、セレコキシブ、セルモロイキン、セリチニブ、セツキシマブ、クロラムブシル、クロルマジノン、クロルメチン、シドフォビル、シナカルセト、シスプラチン、クラドリビン、クロドロン酸、クロファラビン、コパンリシブ、クリサンタスパーゼ、シクロホスファミド、シプロテロン、シタラビン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダルベポエチンアルファ、ダブラフェニブ、ダサチニブ、ダウノルビシン、デシタビン、デガレリクス、デニロイキンジフチトクス、デノスマブ、デプレオチド、デスロレリン、デクスラゾキサン、塩化ジブロスピジウム、ジアンヒドロガラクチトール、ジクロフェナク、ジヌツキシマブ、ドセタキセル、ドラセトロン、ドキシフルリジン、ドキソルビシン、ドキソルビシン+エストロン、ドロナビノール、エクリズマブ、エドレコロマブ、酢酸エリプチニウム、エルトロンボパグ、エンドスタチン、エノシタビン、エンザルタミド、エピルビシン、エピチオスタノール、エポエチンアルファ、エポエチンベータ、エポエチンゼータ、エプタプラチン、エリブリン、エルロチニブ、エソメプラゾール、エストラジオール、エストラムスチン、エトポシド、エベロリムス、エキセメスタン、ファドロゾール、フェンタニル、フィルグラスチム、フルオキシメステロン、フロクスウリジン、フルダラビン、フルオロウラシル、フルタミド、フォリン酸、フォルメスタン、ホスアプレピタント、フォテムスチン、フルベストラント、ガドブトロール、ガドテリドール、ガドテル酸メグルミン、ガドベルセタミド、ガドキセト酸、硝酸ガリウム、ガニレリクス、ゲフィチニブ、ゲムシタビン、ゲムツズマブ、グルカルピダーゼ、グルトキシム(glutoxim)、GM−CSF、ゴセレリン、グラニセトロン、顆粒球コロニー刺激因子、ヒスタミン二塩酸塩、ヒストレリン、ヒドロキシカルバミド、I−125シード、ランソプラゾール、イバンドロン酸、イブリツモマブ チウキセタン、イブルチニブ、イダルビシン、イホスファミド、イマチニブ、イミキモド、インプロスルファン、インジセトロン、インカドロン酸、インゲノールメブテート、インターフェロンアルファ、インターフェロンベータ、インターフェロンガンマ、イオビトリドール、イオベングアン(123I)、イオメプロール、イピリムマブ、イリノテカン、イトラコナゾール、イキサベピロン、ランレオチド、ラパチニブ、ラソコリン、レナリドマイド、レノグラスチム、レンチナン、レトロゾール、リュープロレリン、レバミソール、レボノルゲストレル、レボチロキシンナトリウム、リスリド、ロバプラチン、ロムスチン、ロニダミン、マソプロコール、メドロキシプロゲステロン、メゲストロール、メラルソプロール、メルファラン、メピチオスタン、メルカプトプリン、メスナ、メタドン、メトトレキサート、メトキサレン、アミノレブリン酸メチル、メチルプレドニゾロン、メチルテストステロン、メチロシン、ミファムルチド、ミルテホシン、ミリプラチン、ミトブロニトール、ミトグアゾン、ミトラクトール、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、モガムリズマブ、モルグラモスチム、モピダモール、モルヒネ塩酸塩、モルヒネ硫酸塩、ナビロン、ナビキシモルス、ナファレリン、ナロキソン+ペンタゾシン、ナルトレキソン、ナルトグラスチム、ネダプラチン、ネララビン、ネリドロン酸、ニボルマブペンテトレオチド(nivolumabpentetreotide)、ニロチニブ、ニルタミド、ニモラゾール、ニモツズマブ、ニムスチン、ニトラクリン、ニボルマブ、オビヌツズマブ、オクトレオチド、オファツムマブ、オマセタキシン−メペサクシネート、オメプラゾール、オンダンセトロン、オプレルベキン、オルゴテイン、オリロチモド、オキサリプラチン、オキシコドン、オキシメトロン、オゾガマイシン、p53遺伝子治療、パクリタキセル、パリフェルミン、パラジウム−103シード、パロノセトロン、パミドロン酸、パニツムマブ、パントプラゾール、パゾパニブ、ペグアスパルガーゼ、PEG−エポエチンベータ(メトキシPEG−エポエチンベータ)、ペンブロリズマブ、ペグフィルグラスチム、ペグインターフェロンアルファ−2b、ペメトレキセド、ペンタゾシン、ペントスタチン、ペプロマイシン、ペルフルブタン、ペルホスファミド、ペルツズマブ、ピシバニール、ピロカルピン、ピラルビシン、ピクサントロン、プレリキサホル、プリカマイシン、ポリグルサム、リン酸ポリエストラジオール、ポリビニルピロリドン+ヒアルロン酸ナトリウム、ポリサッカライド−K、ポマリドミド、ポナチニブ、ポルフィマーナトリウム、プララトレキセート、プレドニムスチン、プレドニゾン、プロカルバジン、プロコダゾール、プロプラノロール、キナゴリド、ラベプラゾール、ラコツモマブ、塩化ラジウム−223、ラドチニブ、ラロキシフェン、ラルチトレキセド、ラモセトロン、ラムシルマブ、ラニムスチン、ラスブリカーゼ、ラゾキサン、レファメチニブ、レゴラフェニブ、リセドロン酸、エチドロン酸レニウム−186、リツキシマブ、ロミデプシン、ロミプロスチム、ロムルチド、ロニシクリブ、サマリウム(153Sm)レキシドロナム、サルグラモスチム、サツモマブ、セクレチン、シプロイセル−T、シゾフィラン、ソブゾキサン、グリシジダゾールナトリウム、ソラフェニブ、スタノゾロール、ストレプトゾシン、スニチニブ、タラポルフィン、タミバロテン、タモキシフェン、タペンタドール、タソネルミン、テセロイキン、テクネチウム(99mTc)ノフェツモマブ(nofetumomab)メルペンタン、99mTc−HYNIC−[Tyr3]−オクトレオチド、テガフール、テガフール+ギメラシル+オテラシル、テモポルフィン、テモゾロミド、テムシロリムス、テニポシド、テストステロン、テトロホスミン、サリドマイド、チオテパ、チマルファシン、チオグアニン、トシリズマブ、トポテカン、トレミフェン、トシツモマブ、トラベクテジン、トラマドール、トラスツズマブ、トラスツズマブ・エムタンシン、トレオスルファン、トレチノイン、トリフルリジン+チピラシル、トリロスタン、トリプトレリン、トラメチニブ、トロホスファミド、トロンボポエチン、トリプトファン、ウベニメクス、ヴァラチニブ、バルルビシン、バンデタニブ、バプレオチド、ベムラフェニブ、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、ビンフルニン、ビノレルビン、ビスモデギブ、ボリノスタット、ボロゾール、イットリウム−90ガラス微小球、ジノスタチン、ジノスタチンスチマラマー、ゾレドロン酸、ゾルビシン。
さらに、本発明の化合物は、例えば、例として次の標的:OX−40、CD137/4−1BB、DR3、IDO1/IDO2、LAG−3、CD40に結合し得るバインダーと組み合わせることができる。
さらに、本発明による化合物は、放射線療法および/または外科的介入と組み合わせて用いることもできる。
概して、本発明の化合物と他の細胞増殖抑制的にまたは細胞毒性的に活性な薬剤との組み合わせで、次の目的を追求することができる。
●個々の活性化合物による治療と比較して、腫瘍増殖の遅延、それの大きさの低減、またはさらにそれの完全な除去における効力の改善;
●単独療法の場合より低い用量で使用される化学療法剤使用の可能性;
●個々の投与と比較して副作用少なく、より耐容性のある治療法の可能性;
●より広いスペクトラムの腫瘍疾患の治療の可能性;
●療法に対するより高い応答速度の達成;
●現代の標準療法と比較して長い患者の生存時間。
さらに、本発明による化合物は、放射線療法および/または外科的介入と組み合わせて用いることもできる。
本発明はさらに、代表的には1以上の不活性で無毒性の医薬として好適な賦形剤とともに少なくとも一つの本発明による化合物を含む医薬、および上記目的のためのそれの使用を提供する。
本発明による化合物は、全身的および/または局所的に作用し得る。これに関して、それは好適な形で、例えば非経口的に、可能な場合に吸入によって、またはインプラントもしくはステントとして投与することができる。
本発明による化合物は、これらの投与経路に好適な投与形態で投与することができる。
非経口投与は、吸収段階(例えば、静脈、動脈、心臓内、髄腔内または腰椎内で)を回避することができ、または吸収(例えば、筋肉、皮下、皮内、経皮または腹腔内で)を含むことができる。非経口投与の好適な投与形態には、液剤、懸濁液、乳濁液または凍結乾燥物の形態での注射および注入用製剤などがある。好ましいものは、非経口投与、特別には静脈投与である。
概して、非経口投与の場合、約0.001から1mg/kg、好ましくは約0.01から0.5mg/kgの量を投与して、効果的な結果を得ることが有利であることが認められている。
そうではあっても、適切な場合、具体的に体重、投与経路、活性化合物に対する個体の応答、製剤の種類、および投与を行う時刻もしくは間隔に応じて、指定量から逸脱する必要であることもあり得る。従って、場合により、上記最小量より少ない量で十分である可能性があるが、他の場合には、言及した上限を超えなければならない。より大きい量の投与の場合、それらを1日かけて、いくつかの個々の用量に分けることが得策である可能性がある。
実施例
下記の実施例は、本発明を説明するものである。本発明は実施例に限定されるものではない。
別段の断りがない限り、下記の試験および実施例におけるパーセントは重量パーセントであり、部は重量部である。液体/液体溶液における溶媒比、希釈比および濃度データは、各場合で体積基準である。
合成経路:
作業例の例として、下記の図式は、作業例に至る例示的合成経路を示すものである。
図式1:グルタミン連結ADCの合成
Figure 2018528161
nは2または4である。
図式2
Figure 2018528161
a.HATU、DIPEA、DMF、rt;b.ACN、緩衝液pH8、室温;c.HCl4M、ジオキサン、室温。
図式3:グルタミン連結ADCの合成
Figure 2018528161
nは2または4である。
図式4
Figure 2018528161
[a):例えばベンジルブロマイド、CsCO、DMF、RT;b)例えばPd(dppf)Cl、DMF、NaCO、85℃;c)例えばLiAlH、THF、0℃;MnO、DCM、RT;d)例えばTi(iOPr)、THF、RT;e)例えばtBuLi、THF、−78℃;MeOH、NHCl;f)例えばHCl/1,4−ジオキサン]
図式5
Figure 2018528161
a.HATU、DIPEA、DMF、rt;b)Pd/C10%、MeOH;c)HATU、DIPEA、DMF、rt、d)Pd/C10%、MeOH
図式6
Figure 2018528161
[a):例えば水素化ホウ素トリアセトキシナトリウム、酢酸、DCM、RT;b)例えばアセトキシアセチルクロライド、NEt、DCM、RT;c)例えばLiOH、THF/水、RT;d)例えばH、Pd−C、EtOH、RT;e)例えばTeoc−OSu、NEt、ジオキサン、RT;f)例えばFmoc−Cl、ジイソプロピルエチルアミン、ジオキサン/水2:1、RT]
図式7:
Figure 2018528161
[a)HATU、DMF、ジイソプロピルエチルアミン、RT;b)TFA、DCM、RT;c)HATU、DMF、ジイソプロピルエチルアミン、RT;d)塩化亜鉛、トリフルオロエタノール、50℃;e)H、Pd/C、THF/水、RT]
図式8
Figure 2018528161
[a)HATU、DMF、ジイソプロピルエチルアミン、RT;b)H、Pd/C、THF/水、RT;c)塩化亜鉛、トリフルオロエタノール、50℃]
図式9:グルタミン連結ADCの合成
Figure 2018528161
nは2または4である。
図式10:
Figure 2018528161
[a):水素化ホウ素トリアセトキシナトリウム、酢酸、DCM、RT;b)アセトキシアセチルクロライド、トリエチルアミン、DCM、RT;c)L−システイン、NaHCO、DBU、イソプロパノール/水、RT;d)Boc−6−アミノカプロン酸、HATU、DMF、ジイソプロピルエチルアミン、RT;e)塩化亜鉛、トリフルオロエタノール、50℃、EDTA。]
A.実施例
略称および頭字語:
A431NS:ヒト腫瘍細胞系
A549:ヒト腫瘍細胞系
ABCB1:ATP結合カセットサブファミリーBメンバー1(P−gpおよびMDR1と同義語)
abs.:純粋
Ac:アセチル
ACN:アセトニトリル
aq.:水系、水溶液
ATP:アデノシン三リン酸
BCRP:乳癌耐性タンパク質、排出輸送体
BEP:2−ブロモ−1−エチルピリジニウムテトラフルオロボレート
Boc:tert−ブトキシカルボニル
br.:広い(NMRで)
Ex.:実施例
CI:化学イオン化(MSで)
D:二重線(NMRで)
D:日
TLC:薄層クロマトグラフィー
DCI:直接化学イオン化(MSで)
Dd:二重線の二重線(NMRで)
DMAP:4−N,N−ジメチルアミノピリジン
DME:1,2−ジメトキシエタン
DMEM:ダルベッコ改変イーグル培地(細胞培養のための標準培養液)
DMF:N,N−ジメチルホルムアミド
DMSO:ジメチルスルホキシド
DPBS、D−PBS、PBS:ダルベッコのリン酸緩衝塩溶液
PBS=DPBS=D−PBS、pH7.4、Sigmaから、No D8537
組成:
KCl 0.2g
KHPO(無水物)0.2g
NaCl 8.0g
NaHPO(無水物)1.15g
Oで1リットルとする
Dt:三重線の二重線(NMRで)
DTT:DL−ジチオスレイトール
EDC:N′−(3−ジメチルアミノプロピル)−N−エチルカルボジイミド塩酸塩
EGFR:上皮増殖因子受容体
EI:電子衝撃イオン化(MSで)
ELISA:酵素結合免疫吸着検定法
eq.:当量
ESI:電気スプレーイオン化(MSで)
ESI−MicroTofq:ESI−MicroTofq(Tof=飛行時間およびq=四重極を用いる質量分析装置の名称)
FCS:ウシ胎仔血清
Fmoc:(9H−フルオレン−9−イルメトキシ)カルボニル
GTP:グアノシン5′三リン酸
H:時間
HATU:O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−N,N,N′,N′−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート
HCT−116:ヒト腫瘍細胞系
HEPES:4−(2−ヒドロキシエチル)ピペラジン−1−エタンスルホン酸
HOAc:酢酸
HOAt:1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール
HOBt:1−ヒドロキシ−1H−ベンゾトリアゾール水和物
HOSu:N−ヒドロキシコハク酸イミド
HPLC:高圧高速液体クロマトグラフィー
HT29:ヒト腫瘍細胞系
IC50:半最大阻害濃度
i.m.:筋肉的に、筋肉への投与
i.v.:静脈的に、静脈への投与
conc.:濃厚
LC−MS:液体クロマトグラフィー結合質量分析
LLC−PK1細胞:ルイス肺癌ブタ(pork)腎臓細胞系
L−MDR:ヒトMDR1トランスフェクトLLC−PK1細胞
M:多重線(NMRで)
MDR1:多剤耐性タンパク質1
MeCN:アセトニトリル
Me:メチル
Min:分
MS:質量分析
MTT:3−(4,5−ジメチルチアゾール−2−イル)−2,5−ジフェニル−2H−テトラゾリウムブロマイド3
NCI−H292:ヒト腫瘍細胞系
NCI−H520:ヒト腫瘍細胞系
NMM:N−メチルモルホリン
NMP:N−メチル−2−ピロリジノン
NMR:核磁気共鳴スペクトル測定
NMRI:Naval Medical Research Institute(NMRI)由来のマウス系統
NSCLC:非小細胞肺癌
PBS:リン酸緩衝塩溶液
Pd/C:パラジウム/活性炭
P−pg:P−糖タンパク質(gycoprotein)、輸送体タンパク質
PNGaseF:糖を開裂させる酵素
quant.:定量的(収率で)
Quart:四重線(NMRで)
Quint:五重線(NMRで)
:保持指数(TLCで)
RT:室温
:保持時間(HPLCで)
S:一重線(NMRで)
s.c.:皮下的に、皮下への投与
SCC−4:ヒト腫瘍細胞系
SCC−9:ヒト腫瘍細胞系
SCIDマウス:重度の複合免疫不全を有する試験マウス
t:三重線(NMRで)
TBAF:フッ化テトラ−n−ブチルアンモニウム
TEMPO:(2,2,6,6−テトラメチルピペリジン−1−イル)オキシル
tert:ターシャリー
TFA:トリフルオロ酢酸
THF:テトラヒドロフラン
T3P(登録商標):2,4,6−トリプロピル−1,3,5,2,4,6−トリオキサトリホスフィナン2,4,6−トリオキサイド
UV:紫外線スペクトル測定
v/v:体積比(溶液のもの)
Z:ベンジルオキシカルボニル。
アミノ酸略称
Ala=アラニン
Arg=アルギニン
Asn=アスパラギン
Asp=アスパラギン酸
Cys=システイン
Glu=グルタミン酸
Gln=グルタミン
Gly=グリシン
His=ヒスチジン
Ile=イソロイシン
Leu=ロイシン
Lys=リジン
Met=メチオニン
Nva=ノルバリン
Phe=フェニルアラニン
Pro=プロリン
Ser=セリン
Thr=トレオニン
Trp=トリプトファン
Tyr=チロシン
Val=バリン。
本開示の文脈で、反応の記述において温度が全く与えられていない場合、常に室温を仮定すべきである。
HPLC法およびLC−MS法:
方法1(LC−MS)
装置:Waters ACQUITY SQD UPLCシステム;カラム:Waters Acquity UPLC HSS T3 1.8μ 50×1mm;移動相A:水1リットル+99%強度ギ酸0.25mL、移動相B:アセトニトリル1リットル+99%強度ギ酸0.25mL;勾配:0.0分90%A→1.2分5%A→2.0分5%Aオーブン:50℃;流量:0.40mL/分;UV検出:208−400nm。
方法2(LC−MS):
MS装置型:Waters Synapt G2S;UPLC装置型:Waters Acquity I−CLASS;カラム:Waters、BEH300、2.1×150mm、C18 1.7μm;移動相A:水1リットル+0.01%ギ酸;移動相B:アセトニトリル1リットル+0.01%ギ酸;勾配:0.0分2%B→1.5分2%B→8.5分95%B→10.0分95%B;オーブン:50℃;流量:0.50mL/分;UV検出:220nm。
方法3(LC−MS):
MS装置:Waters (Micromass)QM;HPLC装置:Agilent 1100シリーズ;カラム:Agilent ZORBAX Extend−C18 3.0×50mm 3.5ミクロン;移動相A:水1リットル+0.01molの炭酸アンモニウム、移動相B:アセトニトリル1リットル;勾配:0.0分98%A→0.2分98%A→3.0分5%A→4.5分5%A;オーブン:40℃;流量:1.75mL/分;UV検出:210nm。
方法4(LC−MS)
MS装置型:Waters Synapt G2S;UPLC装置型:Waters Acquity I−CLASS;カラム:Waters、HSST3、2.1×50mm、C18 1.8μm;移動相A:水1リットル+0.01%ギ酸;移動相B:アセトニトリル1リットル+0.01%ギ酸;勾配:0.0分10%B→0.3分10%B→1.7分95%B→2.5分95%B;オーブン:50℃;流量:1.20mL/分;UV検出:210nm。
方法5(LC−MS):
装置:Waters ACQUITY SQD UPLCシステム;カラム:Waters Acquity UPLC HSS T3 1.8μ 50×1mm;移動相A:水1リットル+99%強度ギ酸0.25mL、移動相B:アセトニトリル1リットル+99%強度ギ酸0.25mL;勾配:0.0分95%A→6.0分5%A→7.5分5%Aオーブン:50℃;流量:0.35mL/分;UV検出:210−400nm。
方法6(LC−MS)
装置:Waters UPLC Acquity搭載Micromass Quattro Premier;カラム:Thermo Hypersil GOLD1.9μ50×1mm;移動相A:水1リットル+50%強度ギ酸0.5mL、移動相B:アセトニトリル1リットル+50%強度ギ酸0.5mL;勾配:0.0分97%A→0.5分97%A→3.2分5%A→4.0分5%Aオーブン:50℃;流量:0.3mL/分;UV検出:210nm。
方法7(LC−MS):
装置:Agilent MS Quad 6150;HPLC:Agilent 1290;カラム:Waters Acquity UPLC HSS T3 1.8μ 50×2.1mm;移動相A:水1リットル+99%強度ギ酸0.25mL、移動相B:アセトニトリル1リットル+99%強度ギ酸0.25mL;勾配:0.0分90%A→0.3分90%A→1.7分5%A→3.0分5%Aオーブン:50℃;流量:1.20mL/分;UV検出:205−305nm。
方法8(LC−MS)
MS装置型:Waters Synapt G2S;UPLC装置型:Waters Acquity I−CLASS;カラム:Waters、HSST3、2.1×50mm、C18 1.8μm;移動相A:水1リットル+0.01%ギ酸;移動相B:アセトニトリル1リットル+0.01%ギ酸;勾配:0.0分2%B→2.0分2%B→13.0分90%B→15.0分90%B;オーブン:50℃;流量:1.20mL/分;UV検出:210nm。
方法9:実施例181から191についてのLC−MS−Prep精製法(方法LIND−LC−MS−Prep)
MS装置:Waters、HPLC装置:Waters(カラムWaters X−Bridge C18、19mm×50mm、5μm、移動相A:水+0.05%アンモニア、移動相B:アセトニトリル(ULC)勾配;流量:40mL/分;UV検出:DAD;210−400nm)。
または
MS装置:Waters、HPLC装置:Waters (カラムPhenomenex Luna 5μ C18(2)100A、AXIA Tech. 50×21.2mm、移動相A:水+0.05%ギ酸、移動相B:アセトニトリル(ULC)勾配;流量:40mL/分;UV検出:DAD;210−400nm)。
方法10:実施例181から191についてのLC−MS分析法(LIND_SQD_SB_AQ)
MS装置:Waters SQD;HPLC装置:Waters UPLC;カラム:Zortex SB−Aq(Agilent)、50mm×2.1mm、1.8μm;移動相A:水+0.025%ギ酸、移動相B:アセトニトリル(ULC)+0.025%ギ酸;勾配:0.0分98%A−0.9分25%A−1.0分5%A−1.4分5%A−1.41分98%A−1.5分98%A;オーブン:40℃;流量:0.600mL/分;UV検出:DAD;210nm。
方法11(HPLC):
装置:HP1100シリーズ
カラム:Merck Chromolith SpeedROD RP−18e、50−4.6mm、カタログ番号1.51450.0001、プレカラムChromolith Guardカートリッジキット、RP−18e、5−4.6mm、カタログ番号1.51470.0001
勾配:流量5mL/分
注入容量5μL
溶媒A:HClO(70%強度)/水(4mL/L)
溶媒B:アセトニトリル
開始20%B
0.50分20%B
3.00分90%B
3.50分90%B
3.51分20%B
4.00分20%B
カラム温度:40℃
波長:210nm。
以下において製造が明瞭に記載されていない全ての反応物または試薬は、一般に利用可能な提供元から商業的に購入したものである。製造が同様に以下において記載されておらず、商業的に入手できなかったか、通常は使えない供給元から得た他の全ての反応物または試薬については、それらの製造が記載されている刊行文献を挙げてある。
方法12(LC−MS)
装置MS:Thermo Scientific FT−MS;装置UHPLC+:Thermo Scientific UltiMate 3000;カラム:Waters、HSST3、2.1×75mm、C18 1.8μm;溶離液A:水1リットル+0.01%ギ酸;溶離液B:アセトニトリル1リットル+0.01%ギ酸;勾配:0.0分10%B→2.5分95%B→3.5分95%B;オーブン:50℃;流量:0.90mL/分;UV検出:210nm/最適積分経路210−300nm。
方法13:(LC−MS)
装置MS:Waters (Micromass) Quattro Micro;装置Waters UPLC Acquity;カラム:Waters BEHC18 1.7μ 50×2.1mm;溶離液A:水1リットル+0.01molギ酸アンモニウム、溶離液B:アセトニトリル1リットル;勾配:0.0分95%A→0.1分95%A→2.0分15%A→2.5分15%A→2.51分10%A→3.0分10%A;オーブン:40℃;流量:0.5mL/分;UV検出:210nm。
方法14:(LC−MS):
原料および中間体:
中間体C1
トリフルオロ酢酸−(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロパン−1−アミン(1:1)
Figure 2018528161
WO2006/002326に記載の方法に従って、標題化合物を製造した。
中間体C2
tert−ブチル−(2S)−4−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)−2−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]ブタノエート
Figure 2018528161
tert−ブチルN−(tert−ブトキシカルボニル)−L−ホモセリネート4.22g(14.5mmol)をジクロロメタン180mLに溶かし、ピリジン3.5mLおよび1,1,1−トリアセトキシ−1λ,2−ベンゾヨードキソール−3(1H)−オン9.2g(21.7mmol)を加えた。反応液を室温で1時間撹拌し、次にジクロロメタン500mLで希釈し、10%強度チオ硫酸ナトリウム溶液で2回抽出し、5%強度クエン酸で2回および10%強度重炭酸ナトリウム溶液で2回その順で抽出した。有機相を分離し、硫酸マグネシウムで脱水し、真空乾燥した。残留物をジエチルエーテルに取り、HCl(ジエチルエーテル中溶液)を加えた。沈殿を濾去し、濾液を濃縮し、アセトニトリル/水から凍結乾燥した。これによって、tert−ブチル(2S)−2−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]−4−オキソブタノエート3.7g(93%)を得て、それをそれ以上精製せずに次の段階に用いた(R:0.5(DCM/メタノール95/5))。
中間体C1 3.5g(9.85mmol)をDCM 160mLに溶かし、水素化ホウ素トリアセトキシナトリウム3.13g(14.77mmol)および酢酸0.7mLを加えた。室温で5分間撹拌後、tert−ブチル(2S)−2−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]−4−オキソブタノエート3.23g(11.85mmol)を加え、反応液を室温でさらに30分間撹拌した。減圧下に溶媒留去し、残留物をアセトニトリル/水に取った。沈殿固体を濾過し、乾燥させて、標題化合物5.46g(84%)を得た。
HPLC(方法11):R=2.5分;
LC−MS(方法1):R=1.13分;MS(ESIpos):m/z=613(M+H)
中間体C3
(2S)−4−[(アセトキシアセチル){(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ]−2−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]ブタン酸
Figure 2018528161
中間体C2 5.46g(8.24mmol)をDCM 160mLに溶かし、トリエチルアミン4.8mLおよびアセトキシアセチルクロライド2.2mL(20.6mmol)を加えた。反応液を室温で終夜撹拌し、減圧下に濃縮した。残留物を酢酸エチルに取り、飽和重炭酸ナトリウム溶液で3回と次に飽和塩化ナトリウム溶液で抽出した。有機相を硫酸ナトリウムで脱水し、濃縮した。残留物を、移動相シクロヘキサン/酢酸エチル2:1を用いるBiotage/Isolera(SNAP 340g)でのカラムクロマトグラフィーによって精製した。これによって、アシル化中間体4.57g(75%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.49分;MS(ESIpos):m/z=713(M+H)
この中間体1g(1.36mmol)をDCM 20mLに溶かし、TFA 20mLを加えた。室温で5時間撹拌後、混合物を濃縮し、残留物をn−ペンタンで2回磨砕した。各場合で、n−ペンタンを傾斜法で除去し、残った固体を高真空乾燥した。これによって、(2S)−4−[(アセトキシアセチル){(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ]−2−アミノブタン酸/トリフルオロ酢酸(1:1)1.1gを得た。LC−MS(方法1):R=0.93分;MS(ESIpos):m/z=557(M+H)
この中間体0.91g(1.57mmol)をDCM 70mLに溶かし、ジ−tert−ブチルジカーボネート3.43g(15.7mmol)およびN,N−ジイソプロピルエチルアミン4.1mLを加えた。室温で30分間撹拌後、反応液をDCMで希釈し、5%強度クエン酸で抽出した。有機相を硫酸ナトリウムで脱水し、濃縮した。残留物をn−ペンタンで2回磨砕し、各場合でn−ペンタンを傾斜法で除去した。残った固体をアセトニトリル/水1:1から凍結乾燥して、標題化合物1.11gを得た。
HPLC(方法11):R=2.55分;
LC−MS(方法1):R=1.3分;MS(ESIpos):m/z=657(M+H)
中間体C4
(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタン酸/トリフルオロ酢酸(1:1)
Figure 2018528161
中間体C2 5.46g(8.24mmol)をDCM 160mLに溶かし、トリエチルアミン4.8mLおよびアセトキシアセチルクロライド2.2mL(20.6mmol)を加えた。反応液を室温で終夜撹拌し、減圧下に濃縮した。残留物を酢酸エチルに取り、飽和重炭酸ナトリウム溶液で3回、次に飽和塩化ナトリウム溶液で抽出した。有機相を硫酸ナトリウムで脱水し、濃縮した。残留物を、移動相シクロヘキサン/酢酸エチル2:1を用いるBiotage/Isolera(SNAP 340g)でのカラムクロマトグラフィーによって精製した。これによって、アシル化中間体4.57g(75%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.49分;MS(ESIpos):m/z=713(M+H)
この中間体1.5g(2.035mmol)をエタノール50mLに取り、40%強度メタンアミン水溶液5.8mLを加えた。反応液を50℃で4時間撹拌し、濃縮した。残留物をDCMに取り、水で2回洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、濃縮した。
残留物を高真空乾燥した。これによって、この中間体1.235mgを得て、それをそれ以上精製せずにさらに反応させた。
この中間体1.235mg(1.5mmol)をDCM 15mLに溶かし、TFA 15mLを加えた。室温で4時間撹拌後、混合物を濃縮した。残留物を分取HPLCによって精製した。適切な分画を濃縮し、残留物をアセトニトリルから凍結乾燥した。これによって、標題化合物1.04g(定量的)を得た。
HPLC(方法11):R=1.9分;
LC−MS(方法1):R=0.89分;MS(ESIpos):m/z=515(M+H)
中間体C5
(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−2−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]ブタン酸
Figure 2018528161
中間体C4 0.9g(1.24mmol)をDCM 60mLに溶かし、ジ−tert−ブチルジカーボネート2.7g(12.5mmol)およびN,N−ジイソプロピルエチルアミン3.3mLを加えた。室温で45分間撹拌後、反応液を濃縮し、残留物をジエチルエーテルに取り、混合物が濁り始めるまでn−ペンタンを加えた。反応液を冷却して0℃とし、傾斜法で液を除去した。再度、n−ペンタンを残留物に加え、混合物を傾斜法で液を除去した。残った固体をアセトニトリル/水1:1から凍結乾燥して、標題化合物0.95g(定量的)を得た。
HPLC(方法11):R=2.5分;
LC−MS(方法1):R=1.27分;MS(ESIpos):m/z=615(M+H)
中間体C52
(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロパン−1−アミン
Figure 2018528161
最初に、4−ブロモ−1H−ピロール−2−カルボン酸メチル10.00g(49.01mmol)をDMF 100.0mLに入れ、炭酸セシウム20.76g(63.72mmol)およびベンジルブロマイド9.22g(53.91mmol)を加えた。反応混合物を室温で終夜撹拌した。反応混合物を、水と酢酸エチルとの間で分配し、水相を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒を減圧下に留去した。反応を4−ブロモ−1H−ピロール−2−カルボン酸メチル90.0gで繰り返した。
二つの合わせた反応取得物を、分取RP−HPLC(カラム:Daiso 300×100;10μ、流量:250mL/分、MeCN/水)によって精製した。溶媒を減圧下に留去し、残留物を高真空下に乾燥した。これによって、化合物1−ベンジル−4−ブロモ−1H−ピロール−2−カルボン酸メチル125.15g(理論値の87%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.18分;MS(ESIpos):m/z=295[M+H]
最初に、アルゴン下に、1−ベンジル−4−ブロモ−1H−ピロール−2−カルボン酸メチル4.80g(16.32mmol)をDMFに入れ、(2,5−ジフルオロフェニル)ボロン酸3.61g(22.85mmol)、飽和炭酸ナトリウム19.20mL溶液および[1,1′−ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン]−ジクロロパラジウム(II):ジクロロメタン1.33g(1.63mmol)を加えた。反応混合物を85℃で終夜撹拌した。反応混合物をセライトで濾過し、フィルターケーキを酢酸エチルで洗浄した。有機相を水で抽出し、飽和NaCl溶液で洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒を減圧下に留去した。残留物をシリカゲル(移動相:シクロヘキサン/酢酸エチル100:3)で精製した。溶媒を減圧下に留去し、残留物を高真空下に乾燥した。これによって、化合物1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−カルボン酸メチル3.60g(理論値の67%)を得た。
LC−MS(方法7):R=1.59分;MS(ESIpos):m/z=328[M+H]
最初に1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−カルボン酸メチル3.60g(11.00mmol)を、THF 90.0mLに入れ、水素化リチウムアルミニウム1.04g(27.50mmol)(2.4M THF中溶液)を0℃で加えた。反応混合物を0℃で30分間撹拌した。0℃で、飽和酒石酸カリウムナトリウム溶液を加え、酢酸エチルを反応混合物に加えた。有機相を飽和酒石酸カリウムナトリウム溶液で3回抽出した。有機相を飽和NaCl溶液で1回洗浄し、硫酸マグネシウムで脱水した。溶媒を減圧下に留去し、残留物をジクロロメタン30.0mLに溶解させた。酸化マンガン(IV)3.38g(32.99mmol)を加え、混合物を室温で48時間撹拌した。追加の酸化マンガン(IV)2.20g(21.47mmol)を加え、混合物を室温で終夜撹拌した。反応混合物をセライトで濾過し、フィルターケーキをジクロロメタンで洗浄した。溶媒を減圧下に留去し、残留物(1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−カルボアルデヒド)2.80gを、それ以上精製せずに次の合成段階で用いた。
LC−MS(方法7):R=1.48分;MS(ESIpos):m/z=298[M+H]
最初に1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−カルボアルデヒド28.21g(94.88mmol)と(R)−2−メチルプロパン−2−スルフィンアミド23.00g(189.77mmol)を、純粋THF 403.0mLに入れ、チタン(IV)イソプロポキシド7.42g(237.21mmol)を加え、混合物を室温で終夜撹拌した。飽和NaCl溶液500.0mLおよび酢酸エチル1000.0mLを加え、混合物を室温で1時間撹拌した。混合物を珪藻土で濾過し、濾液を飽和NaCl溶液で2回洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒を減圧下に留去し、残留物を、Biotage Isolera(シリカゲル、カラム1500+340gSNAP、流量200mL/分、酢酸エチル/シクロヘキサン1:10)を用いて精製した。
LC−MS(方法7):R=1.63分;MS(ESIpos):m/z=401[M+H]
最初に(R)−N−{(E/Z)−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]メチレン}−2−メチルプロパン−2−スルフィンアミド25.00g(62.42mmol)を、アルゴン下に純粋THFに入れ、冷却して−78℃とした。tert−ブチルリチウム(1.7Mペンタン中溶液)12.00g(187.27mmol)を−78℃で加え、混合物をこの温度で3時間撹拌した。−78℃で、メタノール71.4mLおよび飽和塩化アンモニウム溶液214.3mLをその順で加え、反応混合物を昇温させて室温とし、室温で1時間撹拌した。混合物を酢酸エチルで希釈し、水で洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒を減圧下に留去した。残留物(R)−N−{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}−2−メチルプロパン−2−スルフィンアミドを、それ以上精製せずに次の合成段階で用いた。
LC−MS(方法6):R=2.97分;MS(ESIpos):m/z=459[M+H]
最初に(R)−N−{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}−2−メチルプロパン−2−スルフィンアミド28.00g(61.05mmol)を、1,4−ジオキサン186.7mLに入れ、HCl/1,4−ジオキサン溶液(4.0M)45.8mLを加えた。反応混合物を室温で2時間撹拌し、溶媒を減圧下に留去した。残留物を分取RP−HPLC(カラム:Kinetix100×30;流量:60mL/分、MeCN/水)によって精製した。アセトニトリルを減圧下に留去し、ジクロロメタンを水系残留物に加えた。有機相を重炭酸ナトリウム溶液で洗浄し、硫酸マグネシウムで脱水した。溶媒を減圧下に留去し、残留物を高真空下に乾燥した。これによって、標題化合物16.2g(理論値の75%)を得た。
LC−MS(方法6):R=2.10分;MS(ESIpos):m/z=338[M−NH、709[2M+H]
H−NMR(400MHz、DMSO−d):δ[ppm]=0.87(s、9H)、1.53(s、2H)、3.59(s、1H)、5.24(d、2H)、6.56(s、1H)、6.94(m、1H)、7.10(d、2H)、7.20(m、1H)、7.26(m、2H)、7.34(m、2H)、7.46(m、1H)。
中間体C53
(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−2−{[(9H−フルオレン−9−イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ブタン酸
Figure 2018528161
最初に、C2と同様にして、中間体C52を、ベンジル(2S)−2−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}−4−オキソブタノエートで還元的にアルキル化した。2級アミノ基を2−クロロ−2−オキソ酢酸エチルでアシル化し、次に二つのエステル基を2M水酸化リチウム溶液/メタノールで加水分解した。このようにして得られた中間体をエタノールに溶解させ、パラジウム/炭素(10%)を加え、混合物を、室温で標準気圧下に水素で1時間水素化した。脱保護化合物をジオキサン/水2:1に取り、最後の段階で、9H−フルオレン−9−イルメチルクロロカーボネートの存在下にN,N−ジイソプロピルエチルアミンを用いてFmoc保護基を導入した。
LC−MS(方法1):R=1.37分;MS(ESIpos):m/z=734(M−H)
中間体C58
(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−2−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}アミノ)ブタン酸
Figure 2018528161
最初に、中間体C2と同様にして、中間体C52を、ベンジル(2S)−2−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}−4−オキソブタノエートで還元的にアルキル化した。最初に、C2と同様にして、中間体C52を、ベンジル(2S)−2−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}−4−オキソブタノエートで還元的にアルキル化した。中間体C27について記載の方法に従って2級アミノ基を2−クロロ−2−オキソ酢酸エチルでアシル化し、二つのエステル基を2M水酸化リチウム溶液/メタノールで加水分解した。このようにして得られた中間体をエタノールに溶解させ、パラジウム/炭素(10%)を加え、混合物を室温で水素によって標準気圧下に1時間水素化した。
この完全に脱保護された中間体500mg(0.886mmol)をジオキサン60mLに取り、1−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}オキシ)ピロリジン−2,5−ジオン253mg(0.975mmol)およびトリエチルアミン198μLを加えた。室温で24時間撹拌後、反応液を濃縮し、残留物を分取HPLCによって精製した。適切な分画を合わせ、減圧下に濃縮し、真空乾燥することで、標題化合物312mg(理論値の50%)を得た。
LC−MS(方法5):R=4.61分;MS(ESIpos):m/z=658(M+H)
中間体C61
N−[(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−2−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}アミノ)ブタノイル]−β−アラニン
Figure 2018528161
中間体C58 60mg(0.091mmol)をβ−アラニネートメチルとカップリングさせ、次に2M水酸化リチウム溶液でエステル開裂することで、標題化合物を製造した。これによって、2段階で標題化合物67mg(理論値の61%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.29分;MS(ESIpos):m/z=729(M+H)
中間体C69
11−{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}−2,2−ジメチル−6,12−ジオキソ−5−オキサ−14−チア−7,11−ジアザ−2−シラヘプタデカン−17−オン酸
Figure 2018528161
最初に(2−(トリメチルシリル)エチル{3−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(クロロアセチル)アミノ]プロピル}カーバメート(中間体C70)117.0mg(0.19mmol)および3−スルファニルプロパン酸21.6mg(0.20mmol)を、メタノール3.0mLに入れ、炭酸カリウム89.5mg(0.65mmol)を加え、混合物を50℃で4時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで希釈し、有機相を水および飽和NaCl溶液で洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒を減圧下に留去し、残留物を高真空下に乾燥した。残留物を、それ以上精製せずに次の合成段階で用いた。これによって、標題化合物106.1mg(理論値の73%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.42分;MS(ESIneg):m/z=700(M−H)
中間体C70
(2−(トリメチルシリル)エチル{3−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(クロロアセチル)アミノ]プロピル}カーバメート
Figure 2018528161
最初に(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロパン−1−アミン(中間体C52)990.0mg(2.79mmol)を、ジクロロメタン15.0mLに入れ、水素化ホウ素トリアセトキシナトリウム828.8mg(3.91mmol)および酢酸129.9mg(3.21mmol)を加え、混合物を室温で5分間撹拌した。ジクロロメタン15.0mLに溶かした2−(トリメチルシリル)エチル(3−オキソプロピル)カーバメート(中間体L15)698.1mg(3.21mmol)を加え、反応混合物を室温で終夜撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで希釈し、有機相を各場合で、飽和炭酸ナトリウム溶液で2回および飽和NaCl溶液で洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、減圧下に溶媒を留去した。残留物をシリカゲル(移動相:ジクロロメタン/メタノール=100:2)を用いて精製した。溶媒を減圧下に留去し、残留物を高真空下に乾燥した。これによって、化合物2−(トリメチルシリル)エチル[3−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)プロピル]カーバメート1.25g(理論値の73%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.09分;MS(ESIpos):m/z=556(M+H)
最初に2−(トリメチルシリル)エチル[3−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)プロピル]カーバメート908.1mg(1.63mmol)およびトリエチルアミン545.6mg(5.39mmol)を、ジクロロメタン10.0mLに入れ、混合物を冷却して0℃とした。この温度で、クロロアセチルクロライド590.5mg(5.23mmol)を加え、混合物を室温で終夜撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで希釈し、有機相を各場合で、飽和重炭酸ナトリウム溶液および飽和塩化アンモニウム溶液で3回洗浄した。有機相を飽和NaCl溶液で洗浄し、硫酸マグネシウムで脱水した。残留物を分取RP−HPLC(カラム:Reprosil 250×30;10μ、流量:50mL/分、MeCN/水、0.1%TFA)によって精製した。溶媒を減圧下に留去し、残留物を高真空下に乾燥した。これによって、標題化合物673.8mg(理論値の65%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.53分;MS(ESIneg):m/z=676(M+HCOO
中間体C71
S−(11−{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}−2,2−ジメチル−6,12−ジオキソ−5−オキサ−7,11−ジアザ−2−シラトリデカン−13−イル)−L−システイン/トリフルオロ酢酸(1:1)
Figure 2018528161
L−システイン536.6mg(4.43mmol)を、水2.5mLと重炭酸ナトリウム531.5mg(6.33mmol)に懸濁させた。イソプロパノール25.0mLに溶かした2−(トリメチルシリル)エチル{3−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(クロロアセチル)アミノ]プロピル}カーバメート(中間体C70)400.0mg(0.63mmol)および1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ−7−エン1.16g(7.59mmol)を加えた。反応混合物を50℃で1.5時間撹拌した。酢酸エチルを反応混合物に加え、有機相を飽和重炭酸ナトリウム溶液で繰り返し洗浄し、飽和NaCl溶液で1回洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒を減圧下に留去し、残留物を高真空下に乾燥した。残留物を分取RP−HPLC(カラム:Reprosil 250×30;10μ、流量:50mL/分、MeCN/水、0.1%TFA)によって精製した。溶媒を減圧下に留去し、残留物を高真空下に乾燥した。これによって、標題化合物449.5mg(理論値の86%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.20分;MS(ESIpos):m/z=717(M+H)
中間体C74
2−(トリメチルシリル)エチル3−アミノ−N−[(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−2−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}アミノ)ブタノイル]−D−アラニネートトリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
中間体C58 75mg(0.114mmol)をDMF 12.5mLに溶かし、HATU 65mg(0.11mmol)およびN,N−ジイソプロピルエチルアミン79μLの存在下に中間体L6 78mg(0.171mmol)とカップリングさせた。分取HPLCによる精製後、残留物をエタノール20mLに溶かし、10%Pd/Cの存在下に室温で大気圧下に1時間水素化した。触媒の濾過後、溶媒を減圧下に留去した。残留物を分取HPLCで精製し、凍結乾燥して標題化合物63mg(2段階で64%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.16分;MS(EIpos):m/z=844[M+H]
中間体C75
メチル(2S)−4−[(アセトキシアセチル){(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ]−2−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}アミノ)ブタノエート
Figure 2018528161
中間体C52 4.3g(12.2mmol)のDCM(525mL)中溶液に、水素化ホウ素トリアセトキシナトリウム3.63g(17.12mmol)および酢酸8.4mLを加えた。混合物を室温で5分間撹拌後、メチル−(2S)−4−オキソ−2−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}アミノ)ブタノエート(古典的方法を用い、(3S)−3−アミノ−4−メトキシ−4−オキソブタン酸から製造)3.23g(11.85mmol)のDCM(175mL)中溶液を加え、反応混合物を室温で45分間撹拌した。粗混合物をDCMで希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム溶液100mLで2回、次にブラインで洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒留去した。残留物を分取HPLCで精製して、メチル(2S)−4−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)−2−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}アミノ)ブタノエート4.6g(61%)を得た。
LC−MS(方法12):R=1.97分;MS(ESIpos):m/z=614.32(M+H)
メチル(2S)−4−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)−2−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}アミノ)ブタノエート200mg(0.33mmol)のDCM(10mL)中溶液に、トリエチルアミン105μLおよびアセトキシアセチルクロライド77μL(0.717mmol)を加えた。反応混合物を室温で終夜撹拌し、酢酸エチルで希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム溶液で2回、次にブラインで洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒留去して標題化合物213mg(75%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.46分;MS(ESIpos):m/z=714(M+H)
中間体C88
tert−ブチル(3R)−3−[({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)メチル]ピロリジン−1−カルボキシレートトリフルオロアセテート(1:1)
(立体異性体の混合物)
Figure 2018528161
tert−ブチル(3R)−3−[({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)メチル]ピロリジン−1−カルボキシレートトリフルオロアセテート(1:1)(中間体C52)2.04mg(5.75mmol)のジクロロメタン(51mL)中溶液に、水素化ホウ素トリアセトキシナトリウム1.71g(8.05mmol)および酢酸0.40g(6.61mmol)を加え、反応混合物を室温で5分間撹拌した。3−ホルミルピロリジン−1−カルボン酸tert−ブチル1.32g(6.61mmol)のジクロロメタン(20mL)中溶液を加え、混合物を室温で終夜撹拌した。酢酸エチルを加え、有機相を飽和炭酸ナトリウム溶液およびブラインで洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、減圧下に溶媒留去し、残留物を高真空乾燥した。残留物を、それ以上精製せずに次の合成段階で用いた。これによって、標題化合物1.86g(理論値の50%)を得た。
LC−MS(方法1):R=0.99分;MS(ESIpos):m/z=538(M+H−CFCOH)
中間体C89
tert−ブチル(3R)−3−{[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(クロロアセチル)アミノ]メチル}ピロリジン−1−カルボキシレート
Figure 2018528161
4Åモレキュラーシーブスを入れたtert−ブチル(3R)−3−[({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)メチル]ピロリジン−1−カルボキシレート(中間体C88)2.89g(4.19mmol、純度80%)のジクロロメタン(42mL)中溶液に、トリエチルアミン1.36g(13.42mmol)およびクロロアセチルクロライド2.13g(18.87mmol)を加えた。反応混合物を室温で5時間撹拌し、溶媒を留去した。残留物を分取HPLCで精製して、標題化合物の異性体1 449mg(理論値の17%)および異性体2 442mg(理論値の17%)を得た。
異性体1 LC−MS(方法1):R=2.74分;MS(ESIpos):m/z=614(M+H)
異性体2 LC−MS(方法1):R=2.78分;MS(ESIpos):m/z=614(M+H)
中間体C90
S−[2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}{[(3R)−1−(tert−ブトキシカルボニル)ピロリジン−3−イル]メチル}アミノ)−2−オキソエチル]−L−システイン(異性体1)
Figure 2018528161
L−システイン493mg(4.07mmol)の水(2.3mL)中溶液に、炭酸水素ナトリウム489mg(5.82mmol)と、次にtert−ブチル(3R)−3−{[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(クロロアセチル)アミノ]メチル}ピロリジン−1−カルボキシレート(中間体C89、異性体1)357mg(0.58mmol)のイソプロパノール(23.0mL)中溶液および1,8−ジアザビシクロ(5.4.0)ウンデカ−7−エン1.06g(6.98mmol)を加えた。反応混合物を50℃で3時間撹拌した。酢酸エチルを加え、有機相を飽和炭酸ナトリウム溶液およびブラインで洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、減圧下に溶媒留去し、残留物を高真空乾燥した。残留物を、それ以上精製せずに次の合成段階で用いた。これによって、標題化合物255mg(理論値の62%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.09分;MS(ESIpos):m/z=699(M+H)
中間体C95
3−{[2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}{[(3R)−1−(tert−ブトキシカルボニル)ピロリジン−3−イル]メチル}アミノ)−2−オキソエチル]スルファニル}プロパン酸(異性体1)
Figure 2018528161
tert−ブチル(3R)−3−{[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(クロロアセチル)アミノ]メチル}ピロリジン−1−カルボキシレート(中間体C89、異性体1)384.0mg(0.62mmol)および3−スルファニルプロパン酸73.0mg(0.69mmol)のメタノール(14mL)および水1滴中混合物に、炭酸カリウム302.5mg(2.19mmol)を加えた。反応混合物を50℃で2.5時間撹拌した。酢酸エチルを加え、有機相を水およびブラインで洗浄し、硫酸マグネシウムで脱水し、減圧下に溶媒留去した。残留物を高真空乾燥し、それ以上精製せずに次の合成段階で用いた。これによって、標題化合物358.0mg(理論値の84%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.33分;MS(ESIpos):m/z=684(M+H)
中間体C101
N−(3−アミノプロピル)−N−{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}−2−ヒドロキシアセトアミド
Figure 2018528161
(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロパン−1−アミン(中間体C52)150.0mg(0.42mmol)を最初に、ジクロロメタン2.0mLに入れ、HOAc 29.2mg(0.49mmol)および水素化ホウ素トリアセトキシナトリウム125.6mg(0.59mmol)を加え、混合物を室温で5分間撹拌した。3−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−2H−イソインドール−2−イル)プロパナール98.9mg(0.49mmol)を加えた。反応混合物を室温で終夜撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで希釈し、有機相を飽和炭酸ナトリウム溶液で2回および飽和NaCl溶液で1回洗浄した。硫酸マグネシウムで脱水後、減圧下に溶媒留去し、残留物を、シリカゲルを用いて精製した(移動相:ジクロロメタン/メタノール100:1)。減圧下に溶媒留去し、残留物を高真空乾燥した。これによって、化合物2−[3−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)プロピル]−1H−イソインドール−1,3(2H)−ジオン188.6mg(74%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.00分;MS(ESIpos):m/z=541[M+H]
最初に、2−[3−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)プロピル]−1H−イソインドール−1,3(2H)−ジオン171.2mg(0.32mmol)を、ジクロロメタン5.0mLに入れ、トリエチルアミン73.6mg(0.73mmol)を加えた。0℃で、アセトキシアセチルクロライド94.9mg(0.70mmol)を加え、反応混合物を室温で終夜撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで希釈し、有機相を飽和重炭酸ナトリウム溶液で2回および飽和NaCl溶液で1回洗浄した。硫酸マグネシウムで脱水後、減圧下に溶媒留去し、残留物を、BiotageIsolera(シリカゲル、カラム10gSNAP、流量12mL/分、酢酸エチル/シクロヘキサン1:3)を用いて精製した。減圧下に溶媒留去し、残留物を高真空乾燥した。これによって、化合物2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}[3−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−2H−イソインドール−2−イル)プロピル]アミノ)−2−オキソ酢酸エチル159.0mg(77%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.35分;MS(ESIpos):m/z=642[M+H]
最初に、2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}[3−(1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロ−2H−イソインドール−2−イル)プロピル]アミノ)−2−オキソ酢酸エチル147.2mg(0.23mmol)を、エタノール4.0mLに入れ、メタンアミン(40%水溶液)356.2mg(4.59mmol)を加えた。反応混合物を50℃で終夜撹拌した。減圧下に溶媒留去し、残留物を、トルエンと3回共蒸留した。残留物を、シリカゲルを用いて精製した(移動相:ジクロロメタン/メタノール10:1)。減圧下に溶媒留去し、残留物を高真空乾燥した。これによって、標題化合物67.4mg(63%)を得た。
LC−MS(方法1):R=0.91分;MS(ESIpos):m/z=470[M+H]
中間体C102
tert−ブチル{(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−[(2−{[(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)アセチル]アミノ}エチル)アミノ]−1−オキソブタン−2−イル}カーバメート
Figure 2018528161
(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−2−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]ブタン酸(中間体C5)20.0mg(32.54μmol)、N−(2−アミノエチル)−2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)アセトアミドトリフルオロアセテート(1:1)(中間体L1)10.1mg(32.54μmol)およびHATU 18.6mg(48.81μmol)をDMF 2.5mLに溶かした。N,N−ジイソプロピルエチルアミン16.8mg(23μL、130.15μmol)を加え、混合物を室温で1時間撹拌した。混合物を、分取HPLC(溶離液:アセトニトリル/水+0.1%TFA、勾配35:65→95:5)によって直接精製し、次に凍結乾燥して、標的化合物15mg(58%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.23分;MS(EIpos):m/z=794[M+H]
中間体C103
tert−ブチル[(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−({2−[({3−[(2,2−ジメチル−4,12−ジオキソ−3,15,18,21,24−ペンタオキサ−5,11−ジアザヘキサコサン−26−イル)スルファニル]−2,5−ジオキソピロリジン−1−イル}アセチル)アミノ]エチル}アミノ)−1−オキソブタン−2−イル]カーバメート
Figure 2018528161
tert−ブチル{(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−[(2−{[(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)アセチル]アミノ}エチル)アミノ]−1−オキソブタン−2−イル}カーバメート(中間体C102)15mg(18.90μmol)をアセトニトリル500μLに溶かした。リン酸緩衝生理食塩水(pH=7)275μLに溶かしたtert−ブチル(7−オキソ−21−スルファニル−10,13,16,19−テトラオキサ−6−アザヘニコス−1−イル)カーバメート(中間体L2)12.3mg(26.45μmol)を混合物に加えた。1N水酸化ナトリウム溶液数滴を加えることで、溶液のpHをpH=8に調節した。混合物を室温で30分間撹拌した。混合物を、分取HPLC(溶離液:アセトニトリル/水+0.1%TFA、勾配35:65→95:5)によって精製し、次に凍結乾燥して、標的化合物20mg(84%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.26分;MS(EIpos):m/z=1261[M+H]
中間体C104
(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−2−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}ブタン酸
Figure 2018528161
中間体C52を、中間体C2と同様にしてベンジル−(2S)−2−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}−4−オキソブタノエートで還元的にアルキル化した。次に、2級アミノ基を2−クロロ−2−オキソエチルアセテートでアシル化した。最終段階で、二つのエステル基を、2M水酸化リチウムのメタノール中溶液を用いて開裂させた。
LC−MS(方法1):R=1.31分;MS(ESIpos):m/z=646(M−H)
中間体C105
ベンジルN−{(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}−β−アラニネート・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
中間体C58 200mgを、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下にDMF中でベンジルβ−アラニネートとカップリングさせ、次にTeoc保護基を、50℃で加熱下に40分間にわたり4当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いて開裂させた。4当量のEDTAを加えた後、生成物を、HPLCによって精製した。
LC−MS(方法12):R=1.7分;MS(ESIpos):m/z=675(M+H)
中間体C106
2−(トリメチルシリル)エチルN−[2−({(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}アミノ)エチル]−N2−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}−L−グルタミネート
Figure 2018528161
中間体C104 151mg(0.23mmol)を、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下に、DMF中で中間体L9 128mg(0.234mmol)とカップリングさせた。次に、Z−保護基を常圧下で10%パラジウム/活性炭での水素化によって開裂させた。
収率:2段階で理論値の30%。
LC−MS(方法1):R=1.14分;MS(ESIpos):m/z=929(M+H)
中間体C108
2−(トリメチルシリル)エチルN−(N−{(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}−β−アラニル)−N−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}−L−リジネート
Figure 2018528161
中間体C104 103mg(0.16mmol)を、EDC、HOBTおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下に、DMF中、2−(トリメチルシリル)エチルN−β−アラニル−N−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}−L−リジネート(中間体L11)110mg(0.175mmol)とカップリングさせた。次に、Z−保護基を、常圧下で10%パラジウム/活性炭でのDCM−メタノール1:1中における水素化によって開裂させた。標題化合物を、収量113mg(2段階で75%)で得た。
LC−MS(方法1):R=1.17分;MS(ESIpos):m/z=957(M+H)
中間体C109
ジベンジルN−{(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}−β−アラニル−L−グルタメート
Figure 2018528161
HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下でのDMF中における中間体C61のジベンジルL−グルタメートとのカップリングおよびその後のトリフルオロエタノール中、50℃で1時間加熱下での10当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いるTeoc保護基の除去によって、標題化合物を得た。
LC−MS(方法1):R=1.09分;MS(ESIpos):m/z=894(M+H)
中間体C110
N2−アセチル−N−[2−({(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}アミノ)エチル]−N6−(tert−ブトキシカルボニル)−L−リジンアミド
Figure 2018528161
HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下でのDMF中における中間体C104の中間体L13とのカップリングおよびその後の常圧下で10%パラジウム/活性炭でのDCM−メタノール1:1中における水素化によるZ−保護の除去によって、標題化合物を得た。
LC−MS(方法1):R=0.96分;MS(ESIpos):m/z=826(M+H)
中間体C111
2−(トリメチルシリル)エチル(3R,4R)−3−[({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)メチル]−4−フルオロピロリジン−1−カルボキシレート・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロパン−1−アミン(108mg、304μmol)(中間体C52)のDCM(56.0mL)中溶液およびモレキュラーシーブス4Åに、水素化ホウ素トリアセトキシナトリウム(90.2mg、426μmol)を加えた。混合物を室温で15分間撹拌し、2−(トリメチルシリル)エチル(3R,4S)−3−フルオロ−4−ホルミルピロリジン−1−カルボキシレート(97.3mg、純度98%、365μmol)(参考:WO2014/151030A1)を加えた。反応混合物を室温で3.5時間撹拌し、次にDCMで希釈した。有機層を飽和炭酸水素ナトリウムおよび水で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで脱水し、溶媒留去した。残留物を分取RP−HPLCによって精製して、標題化合物1.39g(理論値の24%)を得た。
LC−MS(方法1):R=1.15分;MS(ESIpos):m/z=600(M+H)
中間体C112
2−(トリメチルシリル)エチル(3R,4R)−3−{[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(クロロアセチル)アミノ]メチル}−4−フルオロピロリジン−1−カルボキシレート
Figure 2018528161
2−(トリメチルシリル)エチル(3R,4R)−3−[({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ)メチル]−4−フルオロピロリジン−1−カルボキシレートトリフルオロアセテート(1:1)(中間体C111)692.8mg(0.88mmol)のDCM(8.7mL)中溶液とモレキュラーシーブス4Åに、トリエチルアミン295.0mg(2.91mmol)およびクロロアセチルクロライド418.9mg(3.71mmol)を加えた。反応混合物を室温で2.5時間撹拌し、DCMで希釈した。有機層を飽和炭酸水素ナトリウムおよび飽和塩化アンモニウムで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで脱水し、溶媒留去した。残留物をDCM 8.7mLで希釈し、モレキュラーシーブス4Å、トリエチルアミン295.0mg(2.91mmol)およびクロロアセチルクロライド418.9mg(3.71mmol)を加えた。反応混合物を室温で3時間撹拌し、DCMで希釈した。有機層を飽和炭酸水素ナトリウムおよび飽和塩化アンモニウムで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで脱水し、溶媒留去して標題化合物691mg(理論値の74%)を得て、それをそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
LC−MS(方法1):R=1.78分;MS(ESIpos):m/z=676(M+H)
中間体C113
S−[2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}{[(3R,4R)−4−フルオロ−1−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}ピロリジン−3−イル]メチル}アミノ)−2−オキソエチル]−L−システイン
Figure 2018528161
L−システイン203.6mg(1.68mmol)および炭酸水素ナトリウム201.7mg(2.40mmol)の水(0.95mL)中懸濁液に、2−(トリメチルシリル)エチル(3R,4R)−3−{[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(クロロアセチル)アミノ]メチル}−4−フルオロピロリジン−1−カルボキシレート(中間体C112)170.0mg(0.24mmol)のイソプロパノール(9.5mL)中溶液および1,8−ジアザビシクロ(5.4.0)ウンデカ−7−エン438.5mg(2.40mmol)を加えた。反応混合物を50℃で3時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで希釈し、有機層を飽和炭酸水素ナトリウムおよびブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで脱水し、溶媒を留去して、標題化合物152mg(理論値の83%)を得て、それをそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
LC−MS(方法1):R=1.26分;MS(ESIpos):m/z=762(M+H)
中間体L1
トリフルオロ酢酸/N−(2−アミノエチル)−2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)アセトアミド(1:1)
Figure 2018528161
市販の(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)酢酸およびtert−ブチル(2−アミノエチル)カーバメートから出発してペプチド化学の古典的方法によって、標題化合物を製造した。
HPLC(方法11):R=0.19分;
LC−MS(方法1):R=0.17分;MS(ESIpos):m/z=198(M+H)
中間体L2
tert−ブチル(7−オキソ−21−スルファニル−10,13,16,19−テトラオキサ−6−アザヘニコス−1−イル)カーバメート
Figure 2018528161
tert−ブチル(5−アミノペンチル)カーバメート356mg(1.757mmol)、1−スルファニル−3,6,9,12−テトラオキサペンタデカン−15−酸496mg(1.757mmol)およびHATU 801mg(2.108mmol)をDMF 5.95mLに溶かした。反応混合物を氷浴で冷却し、N,N−ジイソプロピルエチルアミン681mg(920μL、5.272mmol)を加えた。混合物を室温で4時間撹拌し、4℃の冷蔵庫で終夜保存した。混合物を、分取HPLC(溶離液:アセトニトリル/水+0.1%TFA、勾配20:80→80:20)によって直接精製し、次に凍結乾燥して、標的化合物255mg(29%)を得た。
LC−MS(方法1):R=0.87分;MS(EIpos):m/z=467[M+H]
中間体L3
−アセチル−N−[(ベンジルオキシ)カルボニル]−L−リジン
Figure 2018528161
ベンジルカルボノクロリデートをN−アセチル−L−リジンと反応させることで、この中間体を得た。
LC−MS(方法1):R=0.71分;MS(ESIpos):m/z=323(M+H)
中間体L4
−アセチル−N−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}−L−リジン
Figure 2018528161
1−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}オキシ)ピロリジン−2,5−ジオンをN2−アセチル−L−リジンと反応させることで、この中間体を得た。
LC−MS(方法1):R=0.87分;MS(ESIpos):m/z=333(M+H)
中間体L5
9H−フルオレン−9−イルメチル{(5S)−5−アセトアミド−6−[(2−アミノエチル)アミノ]−6−オキソヘキシル}カーバメートトリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
市販のN−アセチル−N−[(9H−フルオレン−9−イルメトキシ)カルボニル]−L−リジンをtert−ブチル(2−アミノエチル)カーバメートと反応させ、次にBoc基をトリフルオロ酢酸で除去することで、この中間体を得た。
LC−MS(方法13):R=0.87分;MS(ESIpos):m/z=453(M+H)
中間体L6
2−(トリメチルシリル)エチル3−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}−D−アラニネートトリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
古典的なペプチド化学法を用い、3−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}−N−(tert−ブトキシカルボニル)−D−アラニンから出発して、標題化合物を製造した。EDC/DMAPを用いる2−(トリメチルシリル)エタノールによるエステル化と、次にTFAによるBoc基の脱保護によって、標題化合物405mg(2段階で58%)を得た。
LC−MS(方法1):R=0.75分;MS(ESIpos):m/z=339(M+H)
中間体L7
−アセチル−N−[(ベンジルオキシ)カルボニル]−L−リジル−L−アラニル−L−アラニル−L−アスパラギン
Figure 2018528161
標題化合物の合成を、DMF中HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下でのN−[(ベンジルオキシ)カルボニル]−L−アラニル−L−アラニンおよびtert−ブチルL−アスパラギネートのカップリングから出発し、次にメタノール中10%パラジウム/活性炭を用いる水素化によってZ−保護基を除去した。得られた中間体をHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下にDMF中にて中間体L3とカップリングさせ、最終段階で、tert−ブチルエステル基をトリフルオロ酢酸/DCMで開裂させた。
LC−MS(方法1):R=0.59分;MS(ESIpos):m/z=579(M+H)
中間体L8
−アセチル−N−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}−L−リジル−L−アラニル−L−アラニル−L−アスパラギン
Figure 2018528161
標題化合物の合成を、DMF中HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下でのN−[(ベンジルオキシ)カルボニル]−L−アラニル−L−アラニンおよびtert−ブチルL−アスパラギネートのカップリングから出発し、次に常圧下で10%パラジウム/活性炭でのメタノール中にての水素化によってZ−保護基を除去した。得られた中間体を、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下にDMF中にて中間体L4とカップリングさせ、次に両方の保護基を7.5%トリフルオロ酢酸/DCM中で1時間撹拌下で除去した。最終段階で、アミノ基を、DMF中N,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下に1−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}オキシ)ピロリジン−2,5−ジオンを用いて再度保護した。
LC−MS(方法1):R=0.71分;MS(ESIpos):m/z=589(M+H)
中間体L9
2,2−ジメチルプロパン酸−−2−(トリメチルシリル)エチル−N−(2−アミノエチル)−N−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}−L−グルタミネート(1:1)
Figure 2018528161
最初に、(4S)−5−tert−ブトキシ−4−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]−5−オキソペンタン酸を、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下にベンジル−(2−アミノエチル)カーバメートとカップリングさせた。次に、Boc基およびtert−ブチルエステル基の両方を、トリフルオロ酢酸を用いて開裂させた。次に、最初に、N,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下にDMF/水中でトリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}オキシ)ピロリジン−2,5−ジオンと反応させることでアミノ基を再度保護し、次にEDC/DMAPを用い、DCM中にて2−(トリメチルシリル)エタノールでカルボキシ基をエステル化した。最終段階で、常圧下で10%パラジウム/活性炭での水素化によってZ−保護基を除去し、標題化合物を得て、HPLCによって精製した。
LC−MS(方法1):R=0.82分;MS(ESIpos):m/z=434(M+H)
中間体L10
tert−ブチルN−[(ベンジルオキシ)カルボニル]−L−アラニル−L−アラニル−L−アスパラギネート
Figure 2018528161
HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下でのDMF中でのN−[(ベンジルオキシ)カルボニル]−L−アラニル−L−アラニンのtert−ブチルL−アスパラギネートとのカップリングと、次にDCM中でのトリフルオロ酢酸によるtert−ブチルエステル基の除去によって、標題化合物を得た。
LC−MS(方法1):R=0.5分;MS(ESIpos):m/z=409(M+H)
中間体L11
2−(トリメチルシリル)エチルN−β−アラニル−N−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}−L−リジネート
Figure 2018528161
ペプチド化学の古典的方法によって、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンを用いるN−(tert−ブトキシカルボニル)−β−アラニンの2−(トリメチルシリル)エチルN−[(ベンジルオキシ)カルボニル]−L−リジネートとのカップリングから出発し、常圧下での10%パラジウム/活性炭での水素化によるZ−保護基の除去、1−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}オキシ)ピロリジン−2,5−ジオンによるトリメチルシリル−エチルオキシカルボニル(Teoc)−保護基の導入、最後に7.5%トリフルオロ酢酸のジクロロメタン中溶液中での45分間の撹拌によるBoc−保護基の温和な除去により標題化合物を合成した。
LC−MS(方法1):R=0.83分;MS(ESIpos):m/z=462(M+H)
中間体L12
ベンジル(2S)−5−({(5S)−5−アセトアミド−6−[(2−アミノエチル)アミノ]−6−オキソヘキシル}アミノ)−2−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}−5−オキソペンタノエート・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
ペプチド化学の古典的方法により、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンを用いるtert−ブチル(2−アミノエチル)カーバメートの中間体L3とのカップリングから出発して、常圧下での10%パラジウム/活性炭でのDCM/メタノール1:1中での水素化によるZ−保護基の除去、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンを用いる得られた中間体の(4S)−5−(ベンジルオキシ)−4−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}−5−オキソペンタン酸とのカップリング、最後に25%トリフルオロ酢酸のジクロロエタン中溶液中での1時間の撹拌によるBoc−保護基の除去によって、標題化合物を合成した。
LC−MS(方法1):R=0.66分;MS(ESIpos):m/z=584(M+H)
中間体L13
ベンジル(2S)−5−({(5S)−5−アセトアミド−6−[(2−アミノエチル)アミノ]−6−オキソヘキシル}アミノ)−2−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}−5−オキソペンタノエート・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
ペプチド化学の古典的方法により、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンを用いるN2−アセチル−N6−(tert−ブトキシカルボニル)−L−リジンのベンジル(2−アミノエチル)カーバメート塩酸塩(1:1)とのカップリングから出発して、次に、常圧下での10%パラジウム/活性炭でのDCM/メタノール1:1中での水素化によるZ−保護基の除去によって、標題化合物を合成した。LC−MS(方法1):R=0.43分;MS(ESIpos):m/z=331(M+H)
中間体L14
N−(ピリジン−4−イルアセチル)−L−アラニル−L−アラニル−L−アスパラギントリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
ペプチド化学の古典的方法を用い、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンを用いるピリジン−4−イル酢酸塩酸塩(1:1)の市販のtert−ブチルL−アラニル−L−アラニネート塩酸塩(1:1)とのカップリングから出発し、次に、DCM中にてトリフルオロ酢酸でtert−ブチルエステルを除去することで、標題化合物を合成した。得られた中間体を、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下にtert−ブチルL−アスパラギネートとカップリングさせ、最後に、tert−ブチルエステルをトリフルオロ酢酸/DCMで開裂させた。
LC−MS(方法1):R=0.15分;MS(ESIpos):m/z=394(M+H)
中間体L15
2−(トリメチルシリル)エチル(3−オキソプロピル)カーバメート
Figure 2018528161
3−アミノ−1−プロパノール434.4mg(5.78mmol)および2−(トリメチルシリル)エチル2,5−ジオキソピロリジン−1−カルボキシレート1.50g(5.78mmol)をジクロロメタン10.0mLに溶かし、トリエチルアミン585.3mg(5.78mmol)を加え、混合物を室温で終夜撹拌した。反応混合物をジクロロメタンで希釈し、有機相を水および飽和重炭酸ナトリウム溶液で洗浄し、硫酸マグネシウムで脱水した。溶媒を減圧下に留去した。残留物2−(トリメチルシリル)エチル(3−ヒドロキシプロピル)カーバメート(996.4mg、理論値の79%)を高真空乾燥し、それ以上精製せずに次の合成段階で用いた。
最初に、2−(トリメチルシリル)エチル(3−ヒドロキシプロピル)カーバメート807.0mg(3.68mmol)をクロロホルム15.0mLおよび0.05N炭酸カリウム/0.05N重炭酸ナトリウム溶液(1:1)15.0mLに入れた。テトラ−n−ブチル塩化アンモニウム102.2mg(0.37mmol)、N−クロロコハク酸イミド736.9mg(5.52mmol)およびTEMPO 57.5mg(0.37mmol)を加え、反応混合物を室温で終夜高撹拌した。反応混合物をジクロロメタンで希釈し、有機相を水および飽和NaCl溶液で洗浄した。有機相を硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒を減圧下に留去した。残留物を高真空乾燥し、それ以上精製せずに、次の合成段階で用いた(890.3mg)。
中間体L16
2,2−ジメチル−4,11−ジオキソ−3,15,18,21,24−ペンタオキサ−5,12−ジアザヘプタコサン−27−酸
Figure 2018528161
HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミン存在下でのDMF中でのメチル1−アミノ−3,6,9,12−テトラオキサペンタデカン−15−オエートの6−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]ヘキサン酸とのカップリングと、次にTHF:水(1:1)中室温で1時間にわたる5当量の水酸化リチウムを用いるエステル基のケン化によって、標題化合物を得た。
LC−MS(方法12):R=1.25分;MS(ESIpos):m/z=479[M+H]
中間体L17
2−(トリメチルシリル)エチル3−{[N−アセチル−N−(tert−ブトキシカルボニル)−L−リジル]アミノ}−D−アラニネート
Figure 2018528161
N,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下でのDMF中にての3−アミノ−N−[(ベンジルオキシ)カルボニル]−D−アラニンおよび2,5−ジオキソピロリジン−1−イルN−アセチル−N−(tert−ブトキシカルボニル)−L−リジネートのカップリングと、次にピリジンおよび1,3−ジシクロヘキシルカルボジイミドの存在下でのアセトニトリル中にてのカルボン酸基の2−(トリメチルシリル)エタノールとののカップリング、次に、室温で2時間にわたる10%Pd/Cの存在下でのメタノール中の水素化によるベンジルオキシカルボニル基の脱保護によって、標題化合物を得た。
LC−MS(方法1):R=0.70分;MS(ESIpos):m/z=475(M+H)
中間体L81
ベンジル{2−[(2−アミノエチル)スルホニル]エチル}カーバメートトリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
DMF中、N,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下に、2,2′−スルホニルジエタンアミン250mg(1.11mmol)を1−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]オキシ}ピロリジン−2,5−ジオン92.3mg(0.37mmol)とカップリングさせた。HPLC精製後、標題化合物70mg(理論値の47%)を得た。
LC−MS(方法12):R=0.64分;MS(ESIpos):m/z=257.11(M+H)
中間体L108
−アセチル−N−(2−アミノエチル)−N−(tert−ブトキシカルボニル)−L−リジンアミド
Figure 2018528161
HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下でのDMF中でのN−アセチル−N−(tert−ブトキシカルボニル)−L−リジンおよびベンジル(2−アミノエチル)カーバメート塩酸塩(1:1)のカップリング、次に室温で1時間にわたる10%Pd/Cの存在下でのジクロロメタン/メタノール1:1中における水素化によるベンジルオキシカルボニル基の脱保護によって、標題化合物を得た。
LC−MS(方法1):R=0.43分;MS(ESIpos):m/z=331(M+H)
中間体F1
1−{[1−(2−{[2−({(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}アミノ)エチル]アミノ}−2−オキソエチル)−2,5−ジオキソピロリジン−3−イル]スルファニル}−N−(5−アミノペンチル)−3,6,9,12−テトラオキサペンタデカン−15−アミド・2塩酸塩
Figure 2018528161
tert−ブチル[(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−({2−[({3−[(2,2−ジメチル−4,12−ジオキソ−3,15,18,21,24−ペンタオキサ−5,11−ジアザヘキサコサン−26−イル)スルファニル]−2,5−ジオキソピロリジン−1−イル}アセチル)アミノ]エチル}アミノ)−1−オキソブタン−2−イル]カーバメート(中間体C103)19mg(15.07μmol)をDCM 300μLに溶かした。4M塩化水素のジオキサン中溶液113μLを加え、混合物を室温で1時間撹拌した。追加の4M塩化水素のジオキサン中溶液100μLを加え、混合物を再度1時間撹拌した。
溶媒を留去し、アセトニトリルおよび水の混合物からの凍結乾燥によって残留物を固化させて、標的化合物11mg(64%)を得た。
LC−MS(方法4):R=5.86分;MS(EIpos):m/z=1060[M+H]
中間体F2
−アセチル−L−リジル−L−バリル−N−{(1S)−3−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−カルボキシプロピル}−L−アラニンアミド・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
ペプチド合成で公知の古典的方法を用い、メチル−(2S)−4−[(アセトキシアセチル){(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ]−2−({[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}アミノ)ブタノエート(中間体C75)から出発して、標題化合物を製造した。最初に、Teoc基を、トリフルオロエタノール中、50℃で2時間加熱下に、6当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いて開裂させた。次に、DMF中、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下に、脱保護された中間体をN−[(ベンジルオキシ)カルボニル]−L−バリル−L−アラニンと反応させた。次の段階で、Z−保護基を、常圧下で10%パラジウム/活性炭での水素化によって除去した。得られた中間体を、DMF中HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下に中間体L3と反応させた。次に、2M水酸化リチウムの水/THF2:1中溶液でのエステル開裂および常圧下で10%パラジウム/活性炭での水素化によるZ−保護基の最終除去によって、標題化合物を得た。
LC−MS(方法1):R=0.9分;MS(ESIpos):m/z=854(M+H)
中間体F3
−アセチル−L−リジル−L−バリル−N−{3−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]プロピル}−L−アラニンアミド・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
ペプチド合成において公知の古典的方法を用い、DMF中HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下にベンジルオキシ)カルボニル]−L−バリル−L−アラニンとのカップリングによって、N−(3−アミノプロピル)−N−{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}−2−ヒドロキシアセトアミド(中間体C101)から出発して標題化合物を合成した。次の段階で、常圧下で10%パラジウム/活性炭での水素化によってZ−保護基を除去した。得られた中間体を、DMF中HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下に中間体L3と反応させた。最後に、常圧下で10%パラジウム/活性炭での水素化によって標題化合物を得た。
LC−MS(方法1):R=0.90分;MS(ESIpos):m/z=810(M+H)
中間体F4
3−[(N−アセチル−L−リジル)アミノ]−N−{(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}−D−アラニントリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
中間体C74 25mg(0.026mmol)をDMF 3.75mLに溶かし、HATU 12mg(0.031mmol)および3当量のN、Nジイソプロピルエチルアミンの存在下に、市販のN2−アセチル−N6−[(9H−フルオレン−9−イルメトキシ)カルボニル]−L−リジン13mg(0.031mmol)とカップリングさせた。第2段階で、Fmoc保護基をDMF 5mL中にて100当量のDABCOで開裂させた。最後に、Teoc保護基を、トリフルオロエタノール中、50℃で2時間加熱下に6当量の塩化亜鉛で開裂させた。HPLC精製後、標題化合物4.5mg(20%)を得た。
LC−MS(方法1):R=0.76分;MS(ESIpos):m/z=770(M+H)
中間体F5
−アセチル−N−[2−({(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}アミノ)エチル]−L−リジンアミド・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−2−{[(9H−フルオレン−9−イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ブタン酸(中間体C53)の中間体L5とのカップリングと、次にDMF中100当量のDABCOによってFmoc保護基を除去することによって、標題化合物を得た。
LC−MS(方法12):R=1.11分;MS(EIpos):m/z=724.40[M+H]
中間体F6
3−({15−[(N−アセチル−L−リジル)アミノ]−4,7,10,13−テトラオキサペンタデカン−1−オイル}アミノ)−N−{(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}−D−アラニントリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
最初の段階で、中間体C74を、DMF中N、Nジイソプロピルエチルアミンの存在下に市販の9H−フルオレン−9−イルメチル{15−[(2,5−ジオキソピロリジン−1−イル)オキシ]−15−オキソ−3,6,9,12−テトラオキサペンタデカ−1−イル}カーバメートとカップリングさせた。次に、Fmoc保護基をDMF中100当量のDABCOで開裂させ、得られた中間体をDMF中1.1当量のHATUおよび3当量のN、Nジイソプロピルエチルアミンの存在下にL4とカップリングさせた。最後に、Teoc保護基およびトリメチルシリルエチルエステルを、トリフルオロエタノール中にて50℃で1時間加熱下に、12当量の塩化亜鉛で開裂させた。HPLC精製後、標題化合物2.3mgを得た。
LC−MS(方法1):R=0.72分;MS(EIpos):m/z=1017[M+H]
中間体F7
−アセチル−L−リジル−L−アラニル−L−アラニル−N−{(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−[(2−カルボキシエチル)アミノ]−1−オキソブタン−2−イル}−L−アスパルタミド
Figure 2018528161
DMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体C105の中間体L7とのカップリング、次に10%パラジウム/活性炭を用いるDCM−メタノール1:1中での水素化によるZ−保護基およびベンジルエステルの同時除去およびHPLC精製によって、標題化合物を得た。
LC−MS(方法1):R=0.82分;MS(ESIpos):m/z=1011(M+H)
中間体F8
−アセチル−L−リジル−L−アラニル−L−アラニル−N−[(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−{[2−(L−γ−グルタミルアミノ)エチル]アミノ}−1−オキソブタン−2−イル]−L−アスパルタミド・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
DMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体C106の中間体L8とのカップリング、次に50℃で6時間加熱下に10当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いる全ての保護基の同時除去によって、標題化合物を得た。6当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法1):R=0.72分;MS(ESIpos):m/z=1111(M+H)
中間体F9
−アセチル−L−リジル−L−アラニル−L−アラニル−N−{(2S)−1−[(3−{[(5S)−5−アミノ−5−カルボキシペンチル]アミノ}−3−オキソプロピル)アミノ]−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−オキソブタン−2−イル}−L−アスパルタミド・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
DMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体C108の中間体L10とのカップリング、次に常圧下での10%パラジウム/活性炭でのDCM/メタノール1:1中での水素化によるZ−保護基の除去、次にDMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体L4とのカップリング、最後に50℃で2時間加熱下に12当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いる全ての保護基の同時除去によって、標題化合物を得た。12当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法12):R=11.7分;MS(ESIneg):m/z=1137(M−H)
中間体F10
−アセチル−L−リジル−L−アラニル−L−アラニル−N−{(2S)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−[(3−{[(1S)−1,3−ジカルボキシプロピル]アミノ}−3−オキソプロピル)アミノ]−1−オキソブタン−2−イル}−L−アスパルタミド・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
DMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体C109の中間体L8とのカップリング、次に常圧下で10%パラジウム/活性炭でのメタノール中の水素化によるベンジルエステル保護基の除去、最後に50℃で6時間加熱下に6当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノール下でのTeoc保護基の除去によって、標題化合物を得た。6当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法12):R=1.31分;MS(ESIpos):m/z=1140(M+H)
中間体F11
−アセチル−L−リジル−S−{2−[(3−アミノプロピル){(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ]−2−オキソエチル}−L−システイントリフルオロアセテート(1:2)
Figure 2018528161
S−(11−{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}−2,2−ジメチル−6,12−ジオキソ−5−オキサ−7,11−ジアザ−2−シラトリデカン−13−イル)−L−システイントリフルオロアセテート(1:1)(20.0mg、24.1μmol)(中間体C71)およびN−アセチル−N−(tert−ブトキシカルボニル)−L−リジン(9.02mg、31.3μmol)のアセトニトリル(2.0mL)中溶液に、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(34μL、190μmol)および2,4,6−トリプロピル−1,3,5,2,4,6−トリオキサトリホスフィナン2,4,6−トリオキサイド(19μL、純度50%、31μmol)を加えた。混合物を室温で終夜撹拌し、分取RP−HPLC(カラム:Reprosil 250×30;10μ、流量:50mL/分、MeCN/水、0.1%TFA)によって精製した。減圧下に溶媒留去し、残留物を高真空乾燥した。これによって、N−アセチル−N−(tert−ブトキシカルボニル)−L−リジル−S−(11−{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}−2,2−ジメチル−6,12−ジオキソ−5−オキサ−7,11−ジアザ−2−シラトリデカン−13−イル)−L−システイン5.2mg(理論値の22%)を得た。得られた生成物は、それのエピマーを約15%含んでいた。
−アセチル−N−(tert−ブトキシカルボニル)−L−リジル−S−(11−{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}−2,2−ジメチル−6,12−ジオキソ−5−オキサ−7,11−ジアザ−2−シラトリデカン−13−イル)−L−システイン(61.6mg、62.4μmol)の2,2,2−トリフルオロエタノール(6.0mL)中溶液に塩化亜鉛(51.0mg、374μmol)を加え、混合物を50℃で1時間撹拌した。塩化亜鉛(51.0mg、374μmol)を加え、混合物を50℃で1時間撹拌した。混合物をEDTA(218mg、748μmol)とともに5分間撹拌し、分取RP−HPLC(カラム:Reprosil 250×30;10μ、流量:50mL/分、MeCN/水、0.1%TFA)によって精製した。減圧下に溶媒留去し、残留物を凍結乾燥した。これによって、標題化合物41.6mg(理論値の69%)を得た。
LC−MS(方法12):R=1.32分;MS(ESIneg):m/z=741[M−H]
中間体F12
N−(6−アミノヘキサノイル)−S−[2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}{[(3S,4R)−4−フルオロピロリジン−3−イル]メチル}アミノ)−2−オキソエチル]−L−システイントリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
6−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]ヘキサン酸(29.2mg、126μmol)のDMF(1.4mL)中溶液に、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(21μL、120μmol)およびHATU(46.2mg、122μmol)を加えた。反応混合物を室温で10分間撹拌し、S−[2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}{[(3R,4R)−4−フルオロ−1−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}ピロリジン−3−イル]メチル}アミノ)−2−オキソエチル]−L−システイン(37.0mg、48.6μmol)(中間体C107)のDMF(1.4mL)中溶液を加えた。反応混合物を室温で終夜撹拌した。水およびDCMを加え、有機相を分離し、水でさらに洗浄し、硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒留去してS−[2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}{[(3R,4R)−4−フルオロ−1−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}ピロリジン−3−イル]メチル}アミノ)−2−オキソエチル]−N−{6−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]ヘキサノイル}−L−システイン49.7mg(理論値の85%)を得て、それをそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
LC−MS(方法1):R=1.47分;MS(ESIpos):m/z=974[M+H]
S−[2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}{[(3R,4R)−4−フルオロ−1−{[2−(トリメチルシリル)エトキシ]カルボニル}ピロリジン−3−イル]メチル}アミノ)−2−オキソエチル]−N−{6−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]ヘキサノイル}−L−システイン(49.7mg、純度81%、41.4μmol)のトリフルオロエタノール(3.5mL)中溶液に、(45.2mg、332μmol)を加え、反応混合物を50℃で2時間撹拌した。EDTA(96.9mg、332μmol)を加え、得られた混合物を室温で15分間撹拌した。酢酸エチルを加え、有機相を水およびブラインで洗浄し、硫酸マグネシウムで脱水し、溶媒留去した。残留物を分取RP−HPLC(MeCN/水、0.1%TFA)によって精製して、標題化合物4.5mg(理論値の13%)を得た。
LC−MS(方法1):R=0.79分;MS(ESIpos):m/z=730[M+H]
中間体F13
N−(ピリジン−4−イルアセチル)−L−アラニル−L−アラニル−N−{(2S)−1−({2−[(N−アセチル−L−リジル)アミノ]エチル}アミノ)−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]−1−オキソブタン−2−イル}−L−アスパルタミド・トリフルオロアセテート(1:1)
Figure 2018528161
DMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体C110の中間体L14とのカップリング、次に50℃で0.5時間加熱下に6当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いるBoc基の除去によって、標題化合物を得た。6当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法1):R=0.76分;MS(ESIpos):m/z=1101(M+H)
中間体F14
−アセチル−N−(2−{[2−({(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}アミノ)エチル]スルホニル}エチル)−L−リジンアミド・トリフルオロアセテート(1:2)
Figure 2018528161
最初に、中間体L81をHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下に中間体C58とカップリングさせた。次に、常圧下での10%パラジウム/活性炭でのDCM/メタノール1:1中での水素化によってZ保護基を除去した。得られた中間体を、HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下に中間体L4とカップリングさせた。
最後に、Teoc保護基を、50℃で2時間加熱下に6当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いて開裂させた。6当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法12):R=0.7分;MS(ESIpos):m/z=818(M+H)
中間体F15
−アセチル−N−{2−[(3−{[2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}[ピロリジン−3−イルメチル]アミノ)−2−オキソエチル]スルファニル}プロパノイル)アミノ]エチル}−L−リジンアミド・トリフルオロアセテート(1:2)(異性体1)
Figure 2018528161
HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下でのDMF中での中間体C95の中間体L108とのカップリング、次に50℃で1時間加熱下に6当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いるBoc基の除去によって、標題化合物を得た。6当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法1):R=0.74分;MS(ESIpos):m/z=796(M+H)
中間体F16
N−(15−アミノ−4,7,10,13−テトラオキサペンタデカン−1−オイル)−S−[2−({(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}[ピロリジン−3−イルメチル]アミノ)−2−オキソエチル]システイン・トリフルオロアセテート(1:2)(異性体1)
Figure 2018528161
DMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体C90の2,2−ジメチル−4−オキソ−3,8,11,14,17−ペンタオキサ−5−アザエイコサン−20−酸とのカップリング、次に50℃で3時間加熱下での6当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いるBoc基の除去によって、標題化合物を得た。6当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法1):R=0.80分;MS(ESIpos):m/z=846(M+H)
中間体F17
N−(22−アミノ−17−オキソ−4,7,10,13−テトラオキサ−16−アザドコサン−1−オイル)−S−{2−[(3−アミノプロピル){(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ]−2−オキソエチル}−L−システイントリフルオロアセテート(1:2)
Figure 2018528161
DMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体C71の中間体L16とのカップリング、次に、50℃で1時間加熱下に6当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いる保護基の除去によって、標題化合物を得た。6当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法1):R=0.78分;MS(ESIpos):m/z=933(M+H)
中間体F18
3−[(N−アセチル−L−リジル)アミノ]−N−[3−({2−[(3−アミノプロピル){(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ]−2−オキソエチル}スルファニル)プロパノイル]−D−アラニントリフルオロアセテート(1:2)
Figure 2018528161
DMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体C69の中間体L17とのカップリングと、次に50℃で1時間加熱下に6当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いる保護基の除去によって、標題化合物を得た。6当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法1):R=0.76分;MS(ESIpos):m/z=814(M+H)
中間体F19
−アセチル−N−(2−{[3−({2−[(3−アミノプロピル){(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}アミノ]−2−オキソエチル}スルファニル)プロパノイル]アミノ}エチル)−L−リジンアミドトリフルオロアセテート(1:2)
Figure 2018528161
DMF中でのHATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下での中間体C69の中間体L108とのカップリングと、次に50℃で1時間加熱下に6当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いる保護基の除去によって、標題化合物を得た。6当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。
LC−MS(方法1):R=0.79分;MS(ESIpos):m/z=770(M+H)
B:抗体/活性化合物複合体(ADC)の製造
B−1.抗TWEAKR抗体の一般的形成方法
例えば、組み換えヒトTWEAKR配列番号138およびマウスTWEAKR配列番号137についてのファージディスプレイライブラリのスクリーニングによって抗TWEAKR抗体を形成した。特に、抗体TPP−2090は重要な例である。このようにして得られた抗体を、ヒトIgG1フォーマットに再フォーマットした。脱グリコシル化変異体TPP−2090−HC−N297Aを、TPP−2090(免疫グロブリン類のKabatナンバリングシステム)の重鎖に突然変異N297Aを導入することで形成した。脱グリコシル化変異体TPP−2090−HC−N297Qを、TPP−2090(免疫グロブリン類のKabatナンバリングシステム)の重鎖に突然変異N297Qを導入することによって形成した。これら二つの抗体を、本明細書に記載の作業例に用いた(WO2015/189143A1およびWO2014/198817A1も参照)。さらに、TWEAKRに結合する抗体は当業者に公知であり、例えば、WO2009/020933(A2)またはWO2009140177(A2)を参照する。
配列番号138(ポリペプチド):
EQAPGTAPCSRGSSWSADLDKCMDCASCRARPHSDFCLGCAAAPPAPFRLLWPRSDKTHT
CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVH
NAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPRE
PQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFF
LYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号137(ポリペプチド):
EQAPGTSPCSSGSSWSADLDKCMDCASCPARPHSDFCLGCAAAPPAHFRLLWPRSDKTHT
CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVH
NAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPRE
PQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFF
LYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
B−2.哺乳動物細胞での抗TWEAKR抗体の一般的発現方法
抗体、例えばTPP−2090および脱グリコシル化変異体TPP−2090−HC−N297A、TPP−2090−HC−N297Q、トラスツズマブ−HC−N297A(TPP−7510に等しい)、トラスツズマブ−HC−N297Q(TPP−7511に等しい)を、Tom et al., Chapter 12 in Methods Express: Expression Systems, ed. Micheal R. Dyson and Yves Durocher, Scion Publishing Ltd, 2007に記載の方法に従って一時哺乳動物細胞培養液で製造した(AK−実施例1参照)。
B−3.細胞上清からの抗体の一般的精製方法
抗体、例えばTPP−2090および脱グリコシル化変異体TPP−2090−HC−N297A、TPP−2090−HC−N297Q、トラスツズマブ−HC−N297A(TPP−7510に等しい)、トラスツズマブ−HC−N297Q(TPP−7511に等しい)を細胞培養上清から得た。細胞上清を、細胞の遠心によって清澄化した。次に、細胞上清を、MabSelect Sure(GE Healthcare)クロマトグラフィーカラムでのアフィニティクロマトグラフィーによって精製した。そのために、カラムをDPBSpH7.4(Sigma/Aldrich)で平衡とし、細胞上清を乗せ、カラムを約10カラム体積のDPBSpH7.4+500mM塩化ナトリウムで洗浄した。抗体を50mM酢酸ナトリウムpH3.5+500mM塩化ナトリウムで溶離し、次にDPBSpH7.4中Superdex 200カラム(GE Healthcare)でのゲル濾過クロマトグラフィーによってさらに精製した。
市販の抗体セツキシマブ(商標名エルビタックス)を、標準的クロマトグラフィー法(タンパク質A、分取SEC)によって市販品から精製した。
市販の抗体トラスツズマブ(商標名ハーセプチン)を、標準的クロマトグラフィー法(タンパク質A、分取SEC)によって市販品から精製した。
トラスツズマブ−HC−N297A(TPP−7510に等しい)は、配列番号244によって表される重鎖を含む。軽鎖は、トラスツズマブのものと同一である。
トラスツズマブ−HC−N297Q(TPP−7511に等しい)は、配列番号245によって表される重鎖を含む。軽鎖は、トラスツズマブのものと同一である。
市販品(商標名CIMAher)から、抗体ニモツズマブを、標準的クロマトグラフィー法(タンパク質A、分取SEC)によって市販品から精製した。
市販品(商標名ベクティビックス)から、抗体パニツムマブを、標準的クロマトグラフィー法(タンパク質A、分取SEC)によって市販品から精製した。
B−4.グルタミンへの一般的カップリング方法
最大DAR2を得るために下記実施例で用いられるトランスグルタミナーゼの一般的カップリング手順:
ADC作業例の反応のため、次の抗体を用いた(次の名称:抗体−HC−N297Zは、抗体の両方の重鎖においてアミノ酸ZによるN297(Kabatナンバリング)の置き換えを有する抗体を意味し、名称TPP−XXXX−HC−Q295N−HC−N297Qは、抗体の両方の重鎖でのアミノ酸Nによるアミノ酸Q295(Kabatナンバリング)の置き換えおよび抗体の両方の重鎖においてアミノ酸Q(Kabatナンバリング)によるアミノ酸N297(Kabatナンバリング)の置き換えを有するTPP−XXXXとの抗体を意味する。抗体の名称は、名前(例えばトラスツズマブ)またはTPP−XXXX(TPP−番号XXXXを有する抗体)と称される。
AK3a:TPP−2090−HC−N297A(抗TWEAKR抗体TPP−2658に等しい)
AK3c:TPP−2090−HC−Q295N−HC−N297Q(抗TWEAKR抗体TPP−8825に等しい)
AK3d:トラスツズマブ−HC−N297A(TPP−7510に等しい)。
個々の抗体の脱グリコシル(aglyco)変異体(HC−N297AまたはHC−Q295N−HC−N297Q)5mgのDPBSpH7.4中溶液(c約5から15mg/mL)に、個々の前駆体中間体Fの溶液(10mM DMSO中溶液)20μL(6当量)を加えた。37℃で5分間インキュベーションした後、組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの水溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germanyから)(25U/mL)50μL(1.25U)を加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートし、次にDPBSpH7.4で希釈して体積2.5mLとした。そのADC溶液を、DPBS−Puffer pH7.4(これは溶離にも用いた)で平衡としたPD10−カラム(Sephadex(登録商標)G−25、GE Healthcare)でのゲル濾過によって精製した。次に、ADC溶液を、Amicon Ultracel−30K遠心装置(Millipore)を用いて濃縮し、再希釈して体積約2.5mLとした。最後に、DPBS 12.5μL中のb−トランスグルタミナーゼブロッカーZedira C100 0.00625μmolを加えた。得られたADC溶液について、タンパク質濃度を、個々の実施例での方法で求めた。チャプターB5に記載の方法によって、薬物負荷量を求めた。実施例で指摘の方法に従って、ADCバッチの特性決定を行った。
最大DAR4を達成するために下記の実施例で用いたトランスグルタミナーゼカップリングの一般手順B:
ADC作業例の反応のため、次の抗体を用いた(次の名称は、上記で用いた通りである。):
AK3b:TPP−2090−HC−N297Q(抗TWEAKR抗体TPP−5442に等しい)
AK3e:トラスツズマブ−HC−N297Q(TPP−7511に等しい)
個々の抗体の脱グリコシル(aglyco)変異体(HC−N297Q)5mgのDPBSpH7.4中溶液(c約5から15mg/mL)に、16から24当量の個々の前駆体中間体Fの溶液(10mM DMSO中溶液)を加えた。37℃で5分間インキュベーションした後、組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの水溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germanyから)(25U/mL)400μL(10U)を加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートし、次にDPBSpH7.4で希釈して体積2.5mLとした。そのADC溶液を、DPBS−Puffer pH7.4(これは溶離にも用いた)で平衡としたPD10−カラム(Sephadex(登録商標)G−25、GE Healthcare)でのゲル濾過によって精製した。次に、ADC溶液を、Amicon Ultracel−30K遠心装置(Millipore)を用いて濃縮し、再希釈して体積約2.5mLとした。最後に、DPBS 200μL中のb−トランスグルタミナーゼブロッカーZedira C100 0.1μmolを加えた。得られたADC溶液について、タンパク質濃度を、個々の実施例での方法で求めた。チャプターB7に記載の方法によって、薬物負荷量を求めた。実施例で指摘の方法に従って、ADCバッチの特性決定を行った。
最大DAR2を達成するために下記実施例で用いたより大きい規模でのトランスグルタミナーゼカップリングの一般手順:
個々の抗体の脱グリコシル(aglyco)変異体(HC−N297AまたはHC−Q295N−HC−N297Q)30mgのDPBSpH7.4中溶液(c約5から15mg/mL)に、6当量の個々の前駆体中間体Fの溶液(10mM DMSO中溶液)を加えた。37℃で5分間インキュベーションした後、組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの水溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germanyから)(25U/mL)200μL(7.5U)を加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートした。ADCを、DPBS 7.4でSuperdex200カラム(GE Healthcare)でのゲル濾過クロマトグラフィーによって精製して、ADCから小分子およびトランスグルタミナーゼを除去し、最後にAmicon Ultracel−30K遠心装置(Millipore)を用いて濃縮して最終濃度を5から25mg/mLとした。その溶液を滅菌濾過した。
ADC溶液の作業例で記載の個々のタンパク質濃度を求めた。チャプターB5に記載の方法によって、薬物負荷量を求めた。実施例で指摘の方法に従って、ADCバッチの特性決定を行った。
最大DAR4を達成するために下記実施例で用いたより大きい規模でのトランスグルタミナーゼカップリングの一般手順:
個々の抗体の脱グリコシル(aglyco)変異体(HC−N297Q)30mgのDPBSpH7.4中溶液(c約5から15mg/mL)に、16から24当量の個々の前駆体中間体Fの溶液(10mM DMSO中溶液)を加えた。37℃で5分間インキュベーションした後、組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの水溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germanyから)(25U/mL)2400μL(60U)を加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートした。ADCを、DPBS 7.4でSuperdex200カラム(GE Healthcare)でのゲル濾過クロマトグラフィーによって精製して、ADCから小分子およびトランスグルタミナーゼを除去し、最後にAmicon Ultracel−30K遠心装置(Millipore)を用いて濃縮して最終濃度を5から25mg/mLとした。その溶液を滅菌濾過した。
ADC溶液の作業例で記載の個々のタンパク質濃度を求めた。チャプターB5に記載の方法によって、薬物負荷量を求めた。実施例で指摘の方法に従って、ADCバッチの特性決定を行った。
B−5.抗体、担毒体負荷量の測定および結合部位の測定
脱グリコシル化および/または変性後の分子量測定に加えてタンパク質同定のため、トリプシン消化を行い、それは、変性、還元および誘導体化後に、トリプシンペプチドを介してタンパク質のアイデンティティーを確認するものである。
作業例に記載の複合体の得られたPBS緩衝液溶液の担毒体負荷量を、下記のように求めた。さらに、このアプローチを、複合体化トリプシンペプチドの検出によるカップリング部位の確認に用いることができると考えられる。
グルタミン連結ADCの担毒体負荷量の測定を、個々の複合体種の分子量の質量分析測定によって行った。ここで、サンプルを酸性とし、短C4カラム(GromSil 300 Butyl−1 ST、5μm、5mm×500μm)でのHPLC分離/脱塩後に、ESI−MicroTofQシステム(Bruker Daltonik)を用いる質量分析によって分析した。TIC(全イオンクロマトグラム)におけるシグナルでの全てのスペクトラムを加え、異なる複合体種の分子量をMaxEntデコンボリューションに基づいて計算した。次に、異なる種のシグナル積分後に、担毒体数加重カップリング種の合計を各化学種の単一加重積分結果の合計によって割ることでDAR(=薬物/抗体比)を計算した。
さらに、化学種分布に基づいて、bTGカップリング法の均一性(DAR2について、D2のパーセント>85%)は、例として、下記の表中の実施例5Aの四つの異なる製造を比較することで示すことができると考えられる。
表:実施例5Aの四つの異なる製造の分布比較(DAR2)
Figure 2018528161
他のbTGカップリング担毒体−リンカー構築物で、匹敵する均一分布を得ることができる。これは、例として、下記の表中の四つの異なるADC化合物で示された。
表:四つの異なるADC例の分布(DAR2)
Figure 2018528161
抗体内のN297Q置換に基づいて、DAR4の結果とのbTGに基づく組み合わせが可能である。このADCの均一性(D4のパーセント>70%)および異なる抗体上での移動性が、例として、下記の表中の三つの異なるADC化合物で示された。
表:二つの異なるADC例の分布(DAR4)
Figure 2018528161
あるいは、還元および変性ADCの逆相クロマトグラフィーによって、グルタミン連結複合体の担毒体負荷量を求めた。グアニジニウム塩酸塩(GuHCl)(28.6mg)およびDL−ジチオスレイトール(DTT)の溶液(500mM、3μL)をADC溶液(1mg/mL、50μL)に加えた。混合物を55℃で1時間インキュベートし、HPLCによって分析した。
HPLC分析を、220nmで検出を行うAgilent 1260HPLCシステムで行った。Polymer Laboratories PLRP−Sポリマー逆相カラム(カタログ番号PL1912−3802)(2.1×150mm、粒径8μm、1000Å)を、次の勾配:0分、31%B;1分、31%B;14分、38%B;16分、95%Bで流量1mL/分で用いた。移動相Aは、0.05%トリフルオロ酢酸(TFA)/水からなり、移動相Bは0.05%トリフルオロ酢酸/アセトニトリルからなるものであった。
非複合体化抗体の軽鎖(L0)および重鎖(H0)との保持時間比較によって、検出されたピークの割り当てを行った。専ら複合体化サンプルで検出されたピークを、1個または2個の担毒体(H1、H2)を有する重鎖に割り当てた。
担毒体を有する抗体の平均負荷量を、HC負荷量およびLC負荷量の合計の倍として積分することで求められるピーク面積から計算し、その場合に、HC負荷量は、全重鎖(HC)ピークの担毒体数加重積分結果の合計をHCピークの単一加重積分結果の合計で割った値であり、LC負荷量は、軽鎖(LC)ピークの担毒体数加重積分結果の合計を全LCピークの単一加重積分結果の合計で割った値である。
B−6.ADC類の抗原結合のチェック
バインダーの標的分子への結合能力を、カップリングが起こった後に調べた。当業者であれば、この目的に用いられる多種多様の方法については熟知しており、例えば、複合体のアフィニティは、ELISA技術または表面プラズモン共鳴分析(BIAcore(商標名)測定)を用いて調べることができる。複合体濃度は、例えばタンパク質による抗体複合体についての一般的な方法を用いて当業者が測定することができる(Doronina et al.; Nature Biotechnol. 2003;21:778−784およびPolson et al., Blood 2007;1102:616−623も参照)。
作業例ADC類
トランスグルタミナーゼカップリングの一般手順C(チャプターB−4参照)に従って、下記の実施例を合成した。
実施例1A
Figure 2018528161
ここでは、DPBS pH7.4 2250μL、中間体F1の溶液200μL(10mM DMSO中溶液)、および組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germany)(100U/mL)50μLを、抗体TPP−2090−HC−N297Aの溶液(2mg/mL)2500μLに加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートした。DPBS pH7.4中のSuperdex200カラム(GE Healthcare)でのゲル濾過クロマトグラフィーによってADCを精製して、ADCから小分子およびトランスグルタミナーゼを除去し、最後にAmicon Ultracel−30K遠心装置(Millipore)を用いて濃縮した。
タンパク質濃度:1.65mg/mL
薬物/mAb比:1.9。
実施例1A4
Figure 2018528161
ここでは、DPBS pH7.4 450μL、中間体F1の溶液(10mM DMSO中溶液)40μL、および組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germany)(100U/mL)10μLを、抗体TPP−2090−HC−N297Qの溶液(2mg/mL)500μLに加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートし、その後、それ以上精製せずに薬物抗体比について直接分析した。
反応混合物中のタンパク質濃度:1mg/mL
薬物/mAb比:3.5。
実施例2A
Figure 2018528161
DPBS pH7.4 50μL、中間体F2の溶液(10mM DMSO中溶液)40μL、および組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germany)(100U/mL)10μLを、抗体TPP−2090−HC−N297Aの溶液(2mg/mL)500μLに加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートした。ADCを、DPBS pH7.4中のSuperdex200カラム(GE Healthcare)でのゲル濾過クロマトグラフィーによって精製して、ADCから小分子およびトランスグルタミナーゼを除去し、最後にAmicon Ultracel−30K遠心装置(Millipore)を用いて濃縮した。
タンパク質濃度:1.26mg/mL
薬物/mAb比:1.6。
実施例3A
Figure 2018528161
ここでは、DPBS pH7.4 450μL、中間体F3の溶液(10mM DMSO中溶液)40μL、および組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germany)(100U/mL)10μLを、抗体TPP−2090−HC−N297Aの溶液(2mg/mL)500μLに加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートした。ADCを、DPBS pH7.4中のSuperdex200カラム(GE Healthcare)でのゲル濾過クロマトグラフィーによって精製して、ADCから小分子およびトランスグルタミナーゼを除去し、最後にAmicon Ultracel−30K遠心装置(Millipore)を用いて濃縮した。
タンパク質濃度:1.06mg/mL
薬物/mAb比:2.0。
実施例4A
Figure 2018528161
ここでは、DPBS pH7.4 900μL、中間体F4の溶液(10mM DMSO中溶液)80μL、および組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germany)(100U/mL)20μLを、抗体TPP−2090−HC−N297Aの溶液(2mg/mL)1000μLに加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートした。ADCを、DPBS pH7.4中のSuperdex200カラム(GE Healthcare)でのゲル濾過クロマトグラフィーによって精製して、ADCから小分子およびトランスグルタミナーゼを除去し、最後にAmicon Ultracel−30K遠心装置(Millipore)を用いて濃縮した。
タンパク質濃度:2.18mg/mL
薬物/mAb比:1.7。
実施例5A
Figure 2018528161
ここでは、DPBS pH7.4 900μL、中間体F5の溶液(10mM DMSO中溶液)80μL、および組み換え微生物(細菌)トランスグルタミナーゼの溶液(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germany)(100U/mL)20μLを、抗体TPP−2090−HC−N297Aの溶液(2mg/mL)1000μLに加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートした。ADCを、DPBS pH7.4中のSuperdex200カラム(GE Healthcare)でのゲル濾過クロマトグラフィーによって精製して、ADCから小分子およびトランスグルタミナーゼを除去し、最後にAmicon Ultracel−30K遠心装置(Millipore)を用いて濃縮した。
タンパク質濃度:2.24mg/mL
薬物/mAb比:1.9。
実施例6A
Figure 2018528161
ここでは、DPBS pH7.4 900μL、中間体F6の溶液(10mM DMSO中溶液)80μL、および組み換え微生物の溶液(細菌)トランスグルタミナーゼ(製品番号T001、Zedira GmbH, Darmstadt, Germany)(100U/mL)20μLを、抗体TPP−2090−HC−N297Aの溶液(2/mg/mL)1000μLに加えた。反応混合物を37℃で24時間インキュベートし、その後に、それ以上精製せずに、薬物抗体比について直接分析した。
反応混合物中のタンパク質濃度:2.22mg/mL
薬物/mAb比:2.0。
5mg規模でのトランスグルタミナーゼカップリングの一般手順AもしくはBに従い、そしてより大きい規模での手順CもしくはD(チャプターB−4参照)に従って、下記実施例を合成した。
実施例2A
Figure 2018528161
前駆体:F2、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.66mg/mL
薬物/mAb比:1.7。
実施例3A
Figure 2018528161
前駆体:F3、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.71mg/mL
薬物/mAb比:1.8。
実施例4A
Figure 2018528161
前駆体:F4、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.71mg/mL
薬物/mAb比:1.8。
実施例4A4
Figure 2018528161
前駆体:F4、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:1.49mg/mL
薬物/mAb比:3.4。
実施例5A
Figure 2018528161
前駆体:F5、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.35mg/mL
薬物/mAb比:2.0。
このADCのカップリングを、チャプターB4における一般手順Cに従って30mg規模でも行った。
タンパク質濃度:11.2mg/mL
薬物/mAb比:2.0。
実施例5A4
Figure 2018528161
前駆体:F5、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:0.83mg/mL
薬物/mAb比:3.6。
このADCのカップリングを、チャプターB4における一般手順Dに従って30mg規模でも行った。
タンパク質濃度:10.0mg/mL
薬物/mAb比:3.8。
実施例5E
Figure 2018528161
前駆体:F5、一般手順A、トラスツズマブ−HC−N297A(TPP−7510に等しい)
タンパク質濃度:2.44mg/mL
薬物/mAb比:1.6。
実施例5E4
Figure 2018528161
前駆体:F5、一般手順B、トラスツズマブ−HC−N297Q(TPP−7511に等しい)
タンパク質濃度:2.85mg/mL
薬物/mAb比:3.6。
実施例6A
Figure 2018528161
前駆体:F6、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.63mg/mL
薬物/mAb比:1.8。
このADCのカップリングを、チャプターB4における一般手順Cに従って30mg規模でも行った。
タンパク質濃度:13.2mg/mL
薬物/mAb比:1.9
実施例6A4
Figure 2018528161
前駆体:F6、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:1.63mg/mL
薬物/mAb比:4.1。
このADCのカップリングを、チャプターB4における一般手順Dに従って30mg規模でも行った。
タンパク質濃度:11.8mg/mL
薬物/mAb比:3.7。
実施例7A
Figure 2018528161
前駆体:F7、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.66mg/mL
薬物/mAb比:1.9。
実施例8A
Figure 2018528161
前駆体:F8、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.68mg/mL
薬物/mAb比:1.9。
実施例9A
Figure 2018528161
前駆体:F9、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.8mg/mL
薬物/mAb比:2.0。
実施例10A
Figure 2018528161
前駆体:F10、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.73mg/mL
薬物/mAb比:1.8。
実施例10A4
Figure 2018528161
前駆体:F10、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:1.76mg/mL
薬物/mAb比:3.9。
実施例10E4
Figure 2018528161
前駆体:F10、一般手順B、トラスツズマブ−HC−N297Q(TPP−7511に等しい)
タンパク質濃度:1.56mg/mL
薬物/mAb比:3.9。
実施例11A
Figure 2018528161
前駆体:F11、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.82mg/mL
薬物/mAb比:1.9。
実施例11A4
Figure 2018528161
前駆体:F11、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:1.1mg/mL
薬物/mAb比:3.6。
実施例11E4
Figure 2018528161
前駆体:F11、一般手順B、トラスツズマブ−HC−N297Q(TPP−7511に等しい)。
タンパク質濃度:1.75mg/mL
薬物/mAb比:3.8。
実施例12A
Figure 2018528161
前駆体:F12、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.77mg/mL
薬物/mAb比:1.8。
実施例13A
Figure 2018528161
前駆体:F13、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:2.11mg/mL
薬物/mAb比:1.8。
このADCのカップリングを、チャプターB4における一般手順Cに従って30mg規模でも行った。
タンパク質濃度:11.88mg/mL
薬物/mAb比:2.0。
実施例13A4
Figure 2018528161
前駆体:F13、一般手順D、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)。
このADCのカップリングを、チャプターB4における一般手順Cに従って30mg規模でも行った。
タンパク質濃度:12.0mg/mL
薬物/mAb比:3.8。
実施例14A
Figure 2018528161
前駆体:F14、一般手順A、抗TWEAKR抗体TPP−2658(TPP−2090−HC−N297Aに等しい)
タンパク質濃度:1.58mg/mL
薬物/mAb比:1.7。
実施例15A4
Figure 2018528161
前駆体:F15、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:1.05mg/mL
薬物/mAb比:3.6。
実施例16A4
Figure 2018528161
前駆体:F16、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:1.78mg/mL
薬物/mAb比:3.8。
実施例16E4
Figure 2018528161
前駆体:F16、一般手順B、トラスツズマブ−HC−N297Q(TPP−7511に等しい)
タンパク質濃度:1.82mg/mL
薬物/mAb比:3.8。
実施例17A4
Figure 2018528161
前駆体:F17、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:1.71mg/mL
薬物/mAb比:3.8。
実施例17E4
Figure 2018528161
前駆体:F17、一般手順B、トラスツズマブ−HC−N297Q(TPP−7511に等しい)
タンパク質濃度:1.90mg/mL
薬物/mAb比:3.8。
実施例18A4
Figure 2018528161
前駆体:F18、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:1.07mg/mL
薬物/mAb比:3.7。
実施例19A4
Figure 2018528161
前駆体:F19、一般手順B、抗TWEAKR抗体TPP−5442(TPP−2090−HC−N297Qに等しい)
タンパク質濃度:0.92mg/mL
薬物/mAb比:3.3。
代謝物例M100
−L−γ−グルタミル−N−アセチル−N−[2−({(2S)−2−アミノ−4−[{(1R)−1−[1−ベンジル−4−(2,5−ジフルオロフェニル)−1H−ピロール−2−イル]−2,2−ジメチルプロピル}(グリコロイル)アミノ]ブタノイル}アミノ)エチル]−L−リジンアミドトリフルオロ
アセテート(1:1)
Figure 2018528161
最初に、中間体C58を、DMF中HATUおよびN,N−ジイソプロピルエチルアミンの存在下で中間体L12とカップリングさせ、次に、Teoc−保護基を、50℃で2時間加熱下に4当量の塩化亜鉛/2,2,2トリフルオロエタノールを用いて開裂させ、4当量のEDTAを加えた後、生成物をHPLCによって精製した。最後に、Z保護基およびベンジルエステルを、常圧下で10%パラジウム/活性炭でのメタノール中の水素化によって開裂させた。
LC−MS(方法1):R=0.74分;MS(ESIpos):m/z=855(M+H)
C:生物学的効力の評価
本発明による化合物の生理活性を、下記の評価で示すことができる。
a.C−1a:TWEAKRに対するADCの細胞毒性効果の測定
抗TWEAKR−ADCの細胞毒性効果の分析を、各種細胞系を用いて行った。
NCI−H292:ヒト粘液性類表皮肺癌細胞、ATCC−CRL−1848、標準培地:RPMI1640(Biochrom;#FG1215、安定グルタミン)+10%FCS(Biochrom;#S0415)、TWEAKR−陽性、EGFR−陽性。
SK−HEP−1:ヒト肝臓癌細胞、ATCC番号HTB−52、標準培地:アール塩+Glutamax I(Invitrogen41090)+10%熱失活FCS(Fa.gibco.番号10500−064)含有MEM;EGFR−陽性、TWEAKR陽性。
LoVo:ヒト結腸直腸癌細胞、ATCC番号CCL−229、標準培地:カイン(Kaighn′s)+L−グルタミン(Invitrogen21127)+10%熱失活FCS(Fa.gibco.番号10500−064)、TWEAKR−陽性。
BxPC3:ヒト膵臓癌細胞、ATCC−CRL−1687、標準培地:RPMI1640(Biochrom;#FG1215、安定グルタミン)+10%FCS(Biochrom;#S0415)、TWEAKR−陽性.
KPL4:ヒト乳癌細胞、標準培地:RPMI1640+GlutaMAXI+10%FBS、cell bank、Bayer Pharma AG(DSMZで2012年7月19日に同一性をチェックおよび確認)、ベルリン、ERBB2−陽性。
個々の細胞系についてAmerican Tissue Culture Collection(ATCC)に示された標準的方法によって、細胞を培養した。
MTTアッセイ
本試験は、AccutaseのPBS中溶液(BiochromAG#L2143)による細胞の分離、ペレット化、培地での再懸濁、カウンティングおよび白色底の96ウェル培養プレートへの細胞播種によって行った(Costar#3610、LoVo:1000細胞/ウェル、SK−HEP−1:1200細胞/ウェル、NCI H292:総体積100μL中1500細胞/ウェル)。次に、細胞を、インキュベータにおいて37℃および5%二酸化炭素でインキュベートした。48時間後、抗体薬物複合体を、濃度10−5Mから10−13Mで培地10μLに加え(三連で)、インキュベータにおいて37℃および5%二酸化炭素でインキュベートした。96時間後、MTTアッセイ(ATCC、Manassas, Virginia, USA、カタログ番号30−1010K)を用いて増殖を測定した。選択されたインキュベーション時間終了後、MTT試薬を加え、細胞とともに4時間インキュベートし、次に界面活性剤を加えることで、細胞を終夜溶解させた。生成した色素を、570nmで検出した(Infinite M1000pro, Fa.Tecan)。測定データに基づいて、DRC(用量応答曲線)からIC50値を求めた。試験物質で処理しなかったが、それ以外は同様に処理した細胞の増殖を、100%値と定義した。選択された例由来のデータを、表1にまとめてある。
表1
Figure 2018528161
表2
Figure 2018528161
C−1b:キネシンスピンドルタンパク質KSP/Eg5の阻害の測定
ヒトキネシンスピンドルタンパク質KSP/Eg5(tebu−bio/Cytoskeleton Incから、No.027EG01−XL)のモータードメインを、15mM PIPES、pH6.8(5mM MgClおよび10mM DTT、Sigmaから)中室温で5分間、50μg/mLタキソール(Sigmaから、No.T7191−5MG)安定化した微小管(microtubuli)(ウシまたはブタ、tebu−bio/Cytoskeleton Incから)とともに濃度10nMでインキュベートする。調製したばかりの混合物を384ウェルMTPに小分けした。濃度1.0×10−6Mから1.0×10−13Mの調べる阻害剤およびATP(最終濃度500μM、Sigmaから)を加えた。インキュベーションを室温で2時間行った。マラカイトグリーン(Biomolから)を用いて形成された無機ホスフェートを検出することで、ATPase活性を検出した。試薬を加えた後、アッセイ液を室温で50分間インキュベートしてから、波長620nmでの吸収を検出した。モナストロール(Fa. Sigma、M8515−1mg)およびイスピネシブ(Adooqから、A10486)を陽性対照として使用した。用量−活性曲線の個々のデータは、8倍測定である。IC50値は、三つの独立の実験の平均である。100%対照は、阻害剤で処理されなかったサンプルであった。
下記の表2に、記載のアッセイおよび相当する細胞毒性データからの誘導された代表的な例のIC50値をまとめてある(MTTアッセイ)。
表2
Figure 2018528161
C−2:内在化アッセイ
内在化は、抗体薬物複合体(ADC)を介した抗原発現性癌細胞における細胞毒性ペイロードの特異的かつ効率的提供を可能とする重要なプロセスである。このプロセスは、特異的TWEAKR抗体およびアイソタイプ対照抗体の蛍光標識を介してモニタリングされる。最初に、蛍光色素を抗体のリジンに結合させる。結合は、pH8.3の2倍モル過剰のCypHer 5EモノNHSエステル(バッチ357392, GE Healthcare)を用いて行う。カップリング後、反応混合物をゲルクロマトグラフィー(Zeba Spin Desalting Columns、40K、Fa. Thermo Scientific、No.87768;溶離緩衝液:ダルベッコPBS、Fa. Sigma−Aldrich、No.D8537)を用いて精製して、過剰の色素を除去し、pHを調節した。得られたタンパク質溶液を濃縮した(VIVASPIN500、Sartorius stedim biotecから)。抗体の色素負荷量の測定を、分光光度分析(NanoDrop)および次に計算(D:P=Adyeεprotein:(A280−0.16Adye)εdye)によって行った。ここで調べたTWEAKR抗体およびアイソタイプ対照の色素負荷量は、同等の次数のものであった。細胞結合アッセイにおいて、前記結合が抗体のアフィニティにおける変化をもたらさないことが確認された。
その標識抗体を、内在化アッセイで用いた。この処理開始前に、96ウェルMTP(肉厚、黒色、透明底No4308776、Applied Biosystemsから)における培地100μLに、細胞(2×10/ウェル)を播いた。37℃/5%COで18時間インキュベートした後、培地を代え、標識TWEAKR抗体を異なる濃度で加えた(10、5、2.5、1、0.1μg/mL)。標識されたアイソタイプ対照(陰性対照)について、同じ処理プロトコールを用いた。選択されたインキュベーション時間は、0時間、0.25時間、0.5時間、1時間、1.5時間、2時間、3時間、6時間および24時間である。InCellanalyzer 1000(GE Healthcareから)を用いて、蛍光測定を行った。次に、パラメータである顆粒カウント/細胞および総顆粒強度/細胞の測定によって、動力学的評価を行った。
TWEAKRへの結合後、TWEAKR抗体について、内在化能力を調べた。そのために、異なるTWEAKR発現レベルを有する細胞を選択した。標的介在特異的内在化がTWEAKR抗体の観察されたが、アイソタイプ対照は内在化を全く示さなかった。
市販の抗体(セツキシマブ、ニモツズマブ、ハーセプチン)を同様に処理し、個々の標的発現細胞を用いて上記のように内在化を行った。全ての抗体について、標的依存性内在化を認めることができたが、アイソタイプ対照は内在化を全く示さなかった。
C−3:細胞透過性を求めるためのイン・ビトロ試験
Caco−2細胞を用いるフラックスアッセイでのイン・ビトロ試験によって、基質の細胞透過性を調べることができる[M. D. Troutman and D. R. Thakker, Pharm. Res. 20 (8), 1210−1224(2003)]。これに関して、24ウェルフィルタープレート上で、細胞15から16日間培養した。透過を求めるため、個々の作業例を、HEPES緩衝液溶液で、頂部で(apically)(A)または基底部で(basally)(B)細胞に付与し、2時間インキュベートした。0時間後および2時間後に、シスおよびトランスコンパートメントからサンプルを取った。それらのサンプルを、逆相カラムを用いるHPLC(Agilent 1200、Boeblingen, Germany)によって分離した。HPLCシステムを、Turbo Ion Spray Interfaceを介して三連四重極質量分析計API4000(Applied Biosystems Applera, Darmstadt, Germany)に連結した。Schwabらが公開した式を用いて計算されたPapp値に基づいて透過性を評価した[D. Schwab et al., J. Med. Chem. 46, 1716−1725(2003)]。Papp(B−A)/Papp(A−B)の比(排出比)が>2または<0.5であった場合に、物質は能動的に輸送されると分類された。
細胞内で放出される担毒体について非常に重要なものは、BからAへの透過性[Papp(B−A)]およびPapp(B−A):Papp(A−B)の比(排出比)であり、この浸透率が低いほど、Caco−2細胞の単層を通る物質の能動輸送および受動輸送が遅くなる。さらに、排出比が能動輸送を示さない場合、その物質は、細胞内放出後に、細胞内でより長く留まることができる。従って、生化学的標的(この場合、キネシンスピンドルタンパク質、KSP/Eg5)との相互作用に使える時間も長くなる。
表3
Figure 2018528161
C−4:P−糖タンパク質(P−gp)についての基質特性を求めるためのイン・ビトロ試験
多くの腫瘍細胞が、薬物のための輸送タンパク質を発現し、これは非常に多くの場合、細胞増殖抑制剤に対する抵抗性の発達を伴う。従って、そのような輸送タンパク質、例えばP−糖タンパク質(P−gp)またはBCRPの基質ではない物質は、例えば、改善された活性プロファイルを示し得ると考えられる。
P−gp(ABCB1)用の物質の基質特性を、P−gpを過剰発現するLLC−PK1細胞(L−MDR1細胞)を用いるフラックスアッセイによって求めた[A.H. Schinkel et al., J. Clin. Invest. 96, 1698−1705 (1995)]。このために、LLC−PK1細胞またはL−MDR1細胞を、3から4日間、96ウェルフィルタープレートで培養した。透過性を測定するため、個々の試験物質を、単独でまたは阻害剤(例えば、イベルメクチンまたはベラパミル)の存在下に、HEPES緩衝液溶液で、頂部で(apically)(A)または基底部で(basally)(B)細胞に付与し、2時間インキュベートした。0時間後および2時間後に、シスおよびトランスコンパートメントからサンプルを取った。それらのサンプルを、逆相カラムを用いるHPLCによって分離した。HPLCシステムを、Turbo Ion Spray Interfaceを介して三連四重極質量分析計API3000(Applied Biosystems Applera, Darmstadt, Germany)に連結した。Schwabらが公開した式を用いて計算されたPapp値に基づいて透過性を評価した[D. Schwab et al., J. Med. Chem. 46, 1716−1725(2003)]。Papp(B−A)/Papp(A−B)の排出比が>2であった場合に、物質はP−gp基質であると分類された。
P−gp基質特性の評価のためのさらなる基準として、L−MDR1細胞およびLLC−PK1細胞における排出比または阻害剤存在下もしくは非存在下での排出比を比較することができる。これらの値が2より大きい係数だけ異なる場合、対象の物質はP−gp基質である。
C−5:薬物動態
C5a:イン・ビトロでの内在化後のADC代謝物の確認
方法の説明:
免疫複合体を用いる内在化試験を行って、細胞内的に形成された代謝物を分析する。このために、ヒト肺腫瘍細胞NCI H292(3×10/ウェル)を6ウェルプレートに播き、終夜インキュベートする(37℃、5%CO)。その細胞を10μg/mLの被験ADCで処理する。内在化を、37℃および5%COで行う。各種時間点で(0、4、24、48、72時間)、さらなる分析用に細胞サンプルと取る。最初に、上清(約5mL)を回収し、遠心(2分、室温、1000rpm Heraeus Variofuge 3.0R)後に、−80℃で保存する。細胞をPBSで洗浄し、Accutaseを用いて分離し、細胞数を測定する。さらに洗浄した後、所定数の細胞(2×10)を溶解緩衝液(哺乳動物細胞溶解キット(Sigma MCL1)100μLで処理し、Protein LoBind管(eppendorfカタログ番号0030108.116)中、連続振盪しながら(Thermomixer、15分、4℃、650rpm)インキュベートする。インキュベーション後、溶解物を遠心し(10分、4℃、12000g、Eppendorf 5415R)、上清を回収する。得られた上清を−80℃で保存する。そして、全てのサンプルを下記のように分析する。
培養上清または細胞溶解物中の化合物の測定を、メタノールまたはアセトニトリルでタンパク質を沈殿させた後に、三連四重極質量分析計(MS)に連結された高速液体クロマトグラフィー(HPLC)によって行う。
培養上清/細胞溶解物50μLの後処理のため、沈殿試薬(一般にはアセトニトリル)150μLを加え、混合物を10秒間振盪する。沈殿試薬は、好適な濃度で(通常は、20から100ng/mLの範囲)内部標準(ISTD)を含んでいる。16000gで3分間遠心した後、上清をオートサンプラーバイアルに移し、移動相に適した緩衝液500μLを加え、再度振盪する。
次に、AB SCIEX Deutschland GmbHからのHPLC連結三連四重極質量分析計API6500を用いて、その二つのマトリックスサンプルの測定を行う。
較正のため、0.5から2000μg/Lの濃縮液を血漿サンプルに加える。検出限界(LOQ)は約2μg/Lである。直線範囲は、2から1000μg/Lの幅である。
腫瘍サンプルの較正のため、0.5から200μg/Lの濃縮液を、未処理腫瘍の上清に加える。検出限界は4μg/Lである。直線範囲は、4から200μg/Lの幅である。
妥当性を調べるための品質対照は、5および50μg/Lを含んでいる。
C5b:イン・ビボでのADC代謝物の確認
3から30mg/kgの異なるADCを静脈投与した後、ADCおよび生じる全ての代謝物の血漿濃度および腫瘍濃度を測定することができ、クリアランス(CL)、曲線下面積(AUC)および半減期(t1/2)などの薬物動態パラメータを計算することができる。同様に、血漿、腫瘍および組織におけるADCの生じ得る代謝物濃度を測定することができる。
生じる代謝物の定量分析
メタノールまたはアセトニトリルによるタンパク質の沈殿後に、三連四重極質量分析計(MS)に連結された高速液体クロマトグラフィー(HPLC)により、血漿および腫瘍中の化合物の測定を行う。
血漿50μLの後処理のため、沈殿試薬(一般にアセトニトリル)250μLを加え、混合物を10秒間振盪する。沈殿試薬は、好適な濃度で(通常は、20から100ng/mLの範囲)内部標準(ISTD)を含んでいる。16000gで3分間遠心した後、上清をオートサンプラーバイアルに移し、移動相に適した緩衝液500μLを加え、再度振盪する。
腫瘍の後処理中、後者を3倍量の抽出緩衝液で処理する。その抽出緩衝液は、組織タンパク質抽出試薬(Pierce, Rockford, IL)50mL、完全−プロテアーゼ−阻害剤−カクテルのペレット2個(Roche Diagnostics GMBH, Mannheim, Germany)および最終濃度1mMでフェニルメチルスルホニルフルオリド(Sigma、St. Louis, MO)を含んでいる。最大ストローク数でTissuelyser II(Qiagen)で、サンプルを20分間2回ホモジナイズする。ホモジネート50μLをオートサンプラーバイアルに移し入れ、ISTDを含むメタノール150μLを加える。16000gで3分間遠心後、上清10μLに移動相に適した緩衝液180μLを加え、再度振盪する。そして、腫瘍サンプルは測定準備が整った状態である。
次に、AB SCIEX Deutschland GmbHからのHPLC連結三連四重極質量分析計API6500を用いて、二つのマトリクスサンプルを測定する。
較正のため、0.5から2000μg/Lの濃縮液を血漿サンプルに加える。検出限界(LOQ)は約2μg/Lである。直線範囲は、2から1000μg/Lの幅である。
腫瘍サンプルの較正のため、0.5から200μg/Lの濃縮液を、未処理腫瘍の上清に加える。検出限界は5μg/Lである。直線範囲は、5から200μg/Lの幅である。
妥当性を調べるための品質対照は、5および50μg/Lを含み、血漿ではさらに500μg/Lである。
使用した抗体の定量分析
ADCの抗体部分を、リガンド結合アッセイ(ELISA)を用いて、血漿サンプルおよび腫瘍溶解物中の総IgG濃度として測定した。ここでは、サンドイッチELISA方式を用いた。このELISAは、血漿および腫瘍サンプルでの測定に関して適格性判定し、バリデーションしたものであった。ELISAプレートを、抗ヒト−ヤギIgG−Fc抗体でコーティングした。サンプルとともにインキュベーションした後、プレートを洗浄し、サル抗ヒトIgG(H+L)抗体および西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)の検出器(detector)複合体とともにインキュベートした。さらなる洗浄段階後、HRP基質をOPDに加え、490nmでの吸収を介して、発色をモニタリングした。既知IgG濃度を有する標準サンプルを、4パラメータ式を用いて適合させた。定量下限(LLOQ)および定量上限(ULOQ)の範囲内で、未知濃度を内挿によって求めた。
C−6:イン・ビボ活性試験
本発明による複合体の活性を、例えば異種移植モデルを用いて調べた。当業者であれば、本発明による化合物の活性を調べることができる先行技術の方法については熟知している(例えば、WO2005/081711;Polson et al., Cancer Res. 2009 Mar 15;69(6):2358−64参照)。このために、例えば、バインダーの標的分子を発現する腫瘍細胞系を、齧歯類(例えばマウス)に移植した。次に、本発明による複合体、アイソタイプ対照複合体、対照抗体または等張性生理食塩水をインプラント動物に投与した。投与は、1回または複数回行った。数日のインキュベーション時間後、複合体処理動物および対照群を比較することで、腫瘍の大きさを測定した。複合体処理動物は、相対的に小さい腫瘍サイズを示した。
マウスでの増殖阻害/実験腫瘍の退行
抗体薬物複合体に対する抗原を発現するヒト腫瘍細胞を、免疫抑制マウス、例えばNMRiヌードまたはSCIDマウスの側部に皮下接種する。100から1000万個の細胞を細胞培養液から除去し、遠心し、培地または培地/マトリゲルに再懸濁させる。細胞懸濁液をマウスの皮下に注射する。
数日以内に腫瘍が増殖する。腫瘍サイズ約40mmで腫瘍が確立された後に、処置を開始する。比較的大きい腫瘍に対する効果を調べるため、腫瘍サイズが50から100mmでのみ処置を開始することも可能である。
ADCによる処置は、マウスの尾静脈に静脈経路で行う。ADCは5mL/kgの体積で投与する。
処置プロトコールは、抗体の薬物動態によって決まる。標準として、処置は、4日ごとに3連続回行う。迅速な評価のために、単回処置を行うプロトコールを用いることができる。しかしながら、治療をさらに続けることも可能であるか、後の時点で、3処置日の第2サイクルを行うことができる。
標準として、処置群当たり動物8匹を用いる。活性物質を投与される群に加えて、同じプロトコールに従って、一つの群を緩衝液のみで対照群として処理する。
実験中、腫瘍面積を、定期的にカリパスを用いて2次元(長さ/幅)で測定する。その腫瘍面積は、長さ×幅として求める。処置群の対照群との平均腫瘍面積の比を、T/C面積と記述する。
処置終了後、実験の全ての群を同時に屠殺する場合、腫瘍を摘出し、秤量することができる。処置群の対照群との平均腫瘍重量の比を、T/C重量と記述する。
D.医薬組成物の作業例
本発明による化合物は、下記のような医薬製剤に変換することができる。
静注液剤:
本発明による化合物を、生理的に許容される溶媒(例えば、等張性生理食塩水溶液、D−PBS、またはポリソルベート80を加えたクエン酸緩衝液中のグリシンおよび塩化ナトリウムを含む製剤)中、飽和溶解度以下の濃度で溶かす。その溶液について無菌濾過を行い、無菌で発熱物質を含まない注射容器に分配する。
静注液剤:
本発明による化合物を、言及の投与形態に変換することができる。これは、自体公知の方法で、不活性で無毒性の医薬として好適な賦形剤(例えば緩衝物質、安定剤、可溶化剤、保存剤)「との混和」または「への溶解」によって行うことができる。例えば、次のもの:アミノ酸(グリシン、ヒスチジン、メチオニン、アルギニン、リジン、ロイシン、イソロイシン、トレオニン、グルタミン酸、フェニルアラニンおよびその他)、糖類および関連化合物(グルコース、サッカロース、マンニトール、トレハロース、ショ糖、マンノース、乳糖、ソルビトール)、グリセリン、ナトリウム塩、カリウム、アンモニウム塩およびカルシウム塩(例えば塩化ナトリウム、塩化カリウムまたはリン酸水素二ナトリウムおよび多くの他のもの)、酢酸塩/酢酸緩衝系、リン酸緩衝液、クエン酸およびクエン酸塩緩衝系、トロメタモール(TRISおよびTRIS塩)、ポリソルベート類(例えばポリソルベート80およびポリソルベート20)、ポロキサマー類(例えばポロキサマー188およびポロキサマー171)、マクロゴール類(PEG誘導体、例えば3350)、Triton X−100、EDTA塩、グルタチオン、アルブミン類(例えばヒト)、尿素、ベンジルアルコール、フェノール、クロロクレゾール、メタクレゾール、塩化ベンザルコニウムおよび多くの他のものが存在していても良い。
後の静注、皮下注射または筋注液剤への変換のための凍結乾燥物:
あるいは、本発明の化合物は、安定な凍結乾燥物(恐らくは、上記賦形剤の助けを得て)に変換し、投与に先だって、好適な溶媒(例えば、注射用水、等張性生理食塩水溶液)で再生し、投与することができる。
抗TWEAKR抗体の作業例
本明細書において詳細に記載されていない限り、全ての実施例は、当業者に公知の標準的方法を用いて実施した。下記の実施例の分子生物学の通常の方法を、Sambrook et al., Molecular Cloning: a Laboratory Manual, 2. Edition; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N. Y., 1989などの標準的な実験書に記載の方法に従って行うことができる。
AK実施例1:抗体ライブラリーを用いる抗体製造
完全Aヒトファージディスプレイライブラリー(Hoet RM et al, Nat Biotechnol 2005;23(3):344−8)を用いて、ヒトおよびマウスTWEAKRの二量体Fc融合細胞外ドメインを標的として固定化するタンパク質パンニング(Hoogenboom H.R., Nat Biotechnol 2005;23(3):1105−16)により、本発明のTWEAKR特異的ヒトモノクローナル抗体を単離した。
表AK−1:抗体選択に使用される組み換え抗原のリスト
Figure 2018528161
製造者の説明書に従い約2倍モル過剰のビオチン−LC−NHS(Pierce;カタログ番号21347)を用いて抗原をビオチン化し、Zeba脱塩カラム(Pierce;カタログ番号89889)を用いて脱塩した。洗浄磁気ビーズ(DynaBeads)を200nMビオチン化抗原とともに4℃で終夜インキュベートし、ブロッキング緩衝液(3%BSA、0.05%Tween−20含有PBS)とともに4℃で1時間ブロックした。ブロックFabファージライブラリーをブロックTWEAKRビーズ(DynaBeadsストレプトアビジン−M280−Invitrogen 112−06D)に加え、室温で30分間インキュベートした。ストリンジェント洗浄(ブロッキング緩衝液で3回および0.05%Tween−20を含むPBS(150mM NaCl;8mM NaHPO;1.5mM KHPO;pH=7.4から7.6に調節)で9回)後、ビオチン化TWEAKRビーズ(DynaBeadsストレプトアビジン−M280−Invitrogen 112−06D)に特異的に結合するFabファージをPBSに再懸濁させ、増幅のため、大腸菌(Escherichia coli)株TG1感染に直接用いた。第2の選択ラウンドで、二つのマウスTWEAKR(200nM)を用いて、交差反応性バインダーについての選択を行い、第3の選択ラウンドで、ヒトTWEAKRの濃度を低下させて(100nM)、高アフィニティバインダーへの選択圧力を高めた。
11種類の異なるFabファージを同定し、相当する抗体を、哺乳動物IgG発現ベクターにクローニングし、それによって、可溶性Fabに存在しない欠けたCH2−CH3ドメインが得られた。Tom et al., Chapter 12 in Methods Express:Expression Systems ed. by Micheal R. Dyson and Yves Durocher, Scion Publishing Ltd, 2007に記載の方法に従って、得られたIgGを哺乳動物細胞で一時的に発現させた。すなわち、CMVプロモーターに基づく発現プラスミドをHEK293−6E細胞にトランスフェクションし、フェルンバッハ瓶またはウェーブ(Wave)バッグでインキュベートした。発現を、F17培地(Invitrogen)において37℃で5から6日間行った。トランスフェクションから24時間後、1%Ultra−Low IgG FCS(Invitrogen)および0.5mMバルプロ酸(Sigma)を補充として加えた。抗体をタンパク質−Aクロマトグラフィーによって精製し、AK−実施例2に記載のELISAおよびBIAcore分析を用いて可溶性モノマーTWEAKRへの結合アフィニティによってさらに特性決定した。
表AK−2:アフィニティ測定に使用される組み換え抗原のリスト
Figure 2018528161
抗TWEAKR抗体の細胞結合特性を求めるため、多くの細胞系(HT29、HS68、HS578)への結合を、フローサイトメトリーによって調べた。その細胞を、抗体(5μg/mL)のFACS緩衝液中希釈液に懸濁させ、氷上で1時間インキュベートした。第2の抗体(PEヤギ−抗ヒトIgG、Dianova#109−115−098)を加えた。氷上で1時間インキュベーションした後、細胞を、FACSアレー(BD Biosciences)を用いるフロサイトメトリーによって分析した。
NF−κBレポーター遺伝子アッセイを行って、同定した11種類全ての抗体(ヒトIgG1)のアゴニスト活性を評価した。HEK293細胞を、製造者の説明書に従って293fectinを用いて、NF−κBレポーター構築物(BioCat、カタログ番号LR−0051−PA)で一時的にトランスフェクションした。トランスフェクション細胞を、37℃、5%COで、白色のポリリジンコーティングした384ウェルプレート(BD)のF17培地(血清を含まない;Invitrogen)中に播いた。翌日、細胞を、各種濃度の精製抗体で6時間刺激してから、標準的な方法を用いてルシフェラーゼアッセイを行った。
抗TWEAKR抗体の蛍光標識(CypHer 5EモノNHSエステル;GE Healthcare)を介して、内在化をモニタリングした。処理に先だって、HT29細胞を、96ウェルMTPプレート(肉厚、黒色、透明底、No.4308776、Applied Biosystems)の培地100μLに播いた(2×10/ウェル)。37℃/5%COで18時間のインキュベーション後、培地を入れ換え、標識抗TWEAKR抗体を、異なる濃度(10、5、2.5、1、0.1μg/mL)で加えた。選択したインキュベーション時間は、0、0.25、0.5、1、1,5、2、3、6および24時間であった。蛍光測定を、InCell−アナライザー1000(GE Healthcare)で行った。
最も高いイン・ビトロ活性を有する抗体(TPP−883)を、さらなる活性およびアフィニティ成熟のために選択した。
TPP−883
配列番号71
AQDIQMTQSPATLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGV
PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSSPGITFGPGTKVEIKRTVAAPSVFI
FPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSS
TLTLSKADYEKHKLYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号72
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMMWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGKTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDGYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREE
MTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−883の軽鎖(配列番号71)および重鎖(配列番号72)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施している。
第一の突然変異収集ラウンドで成熟化を行い、次にアフィニティおよび活性が最も上昇したアミノ酸の組み換えを行った。突然変異NNK(N=AGCT、K=GまたはT)を収集するため、NNKコドン多様化を含む合成オリゴヌクレオチド(連続アミノ酸命名法)を用いる部位指向性変異誘発によって次の個々のアミノ酸位置:CDR−L1でのS35、S36、Y37およびN39;CDR−L2でのA51、S53、S54、Q56およびS57;CDR−L3でのS92、Y93、S94、S95、G97およびI98;CDR−H1でのP31、Y32、P33、M34およびM35;CDR−H2でのY50、S52、P53、S54、G56、K57およびH59;CDR−H3でのG99、G100、D101、G102、Y103、F104、D105およびY106で無作為化を行った。全ての個々のNNK飽和変異誘発ライブラリーのDNAを、活性成熟のために哺乳動物IgG発現ベクターに、またはアフィニティ成熟のためにファージミドベクターにクローニングした。アフィニティ成熟をファージパニングによって行った。洗浄磁気ビーズ(DynaBeads)を、10nM、1nM、100pMまたは10pMビオチン化抗原とともに4℃で終夜インキュベートし、4℃で1時間にわたりブロッキング緩衝液(3%BSA、0.05%Tween−20含有PBS)でブロックした。ブロックFabファージライブラリーを、理論的ライブラリー複雑度と比較して10000倍、1000倍または100倍過剰で、ブロックTWEAKR−DynaBeadsに加え、室温で30分間インキュベートした。それは、合計で12の戦略を次に行ったことを意味する(4抗原濃度×3Fabファージ力価測定)。ストリンジェント洗浄(ブロッキング緩衝液で3回および0.05%Tween−20含有PBSで9回)後、ビオチン化TWEAKR DynaBeads(DynaBeads ストレプトアビジン−M280−Invitrogen112−06D)に対して特異的に結合するFabファージをPBSに再懸濁させ、増幅のため、大腸菌(Escherichia coli)株TG1の感染に直接用いた。選択ラウンド2において、ヒトTWEAKR−Fcの濃度を下げ(1nM、100pM、10pMおよび1pM)、同じFabファージ力価測定を、12の戦略全てについて用いた(4.4×1011)。可溶性Fabの発現のため、ファージミドベクターをMluIで消化させて、ファージ上でのFabディスプレイに必要な遺伝子−III膜アンカー配列を除去し、ベクターを再結合させた。12の選択プールそれぞれの96の変異体を可溶性Fabとして発現させ、ELISAフォーマットで調べた。このために、2.5nMビオチン化TWEAKR−Fcを抗原コーティングし、可溶性Fabの結合を、抗c−Myc抗体(Abcam ab62928)を用いて示した。TWEAKR−Fc(配列番号138)に対する改善された結合を有する7種類の単一置換変異体(連続アミノ酸命名法)が示され、CDR−L1のS36G、CDR−L2のA51QおよびS57K、CDR−L3のS94TおよびG97F、CDR−H1のM35IおよびCDR−H3のG102Tであった。活性成熟のため、HEK293細胞をNF−κBレポーター(BioCat、カタログ番号LR−0051−PA)でトランスフェクションした。トランスフェクション細胞を、白色のポリリジンコーティングした384ウェルプレート(BD)のF17培地(血清を含まない;Invitrogen)中に播き、NNK多様化位置抗体(ヒトIgG1)ライブラリーの個々の変異体を哺乳動物細胞で一時的に発現させた。翌日、NF−κBレポーター細胞を、発現した個々のNNK抗体変異体で6時間刺激してから、標準的な方法を用いてルシフェラーゼアッセイを行った。改善されたアゴニスト活性を有する1種類の単一置換変異体が検出され、それはCDR−H3のG102Tであった。この変異体は、アフィニティ成熟によっても得られ、やはりそれも、最も高いアフィニティ促進を示した。アフィニティおよび活性スクリーニングによる突然変異収集後、7種類全ての好ましい個々の置換(ライブラリー複雑度:128変異体)を組み換えライブラリーに組み換えた。このために、オリゴヌクレオチドを合成して、各選択された位置に選択された突然変異または相当する野生型アミノ酸を導入した。オーバーラップエクステンション(overlap extension)PCRの連続ラウンドを用いて、ライブラリーを確立した。最終PCR産物を、細菌可溶性Fab発現ベクターに結合させ、上記のような可溶性Fabによる平衡ELISAスクリーニング用に無作為に528個の変異体を選択した(取ったサンプルの約4倍過剰)。最後に、最良の単一置換変異体G102Tと比較したアフィニティ上昇に基づいて、7個の変異体を選択した。これらの相当するDNAを哺乳動物IgG発現ベクターにクローニングし、上記NF−κBレポーター細胞アッセイで機能活性について調べた。最後に、得られた配列をヒト生殖細胞系配列と比較し、アフィニティおよび効力に対して有意な効果がない逸脱を適合させた。下記の配列を有する抗体が、抗体ライブラリースクリーニングおよびアフィニティおよび/または活性成熟によって得られた。
TPP−2090

配列番号1:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISGYLNWYQQKPGKAPKLLIYQASSLQSGVPS
RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPFITFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFP
PSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTL
TLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号2:
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMIWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGSTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−2090の軽鎖(配列番号1)および重鎖(配列番号2)のアミノ酸配列;
重鎖および軽鎖の両方のCDRには下線を施している。TPP−2090の配列に基づき、脱グリコシル化抗体TPP−2090−HC−N297A(重鎖N297A(Kabat、EUナンバリング)に突然変異を含む)およびTPP−2090−HC−N−297Q(重鎖N297Q(Kabat、EUナンバリング)に突然変異を含む)が、部位指向性突然変異誘発によって形成された。
TPP−2090−HC−N297A
軽鎖:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISGYLNWYQQKPGKAPKLLIYQASSLQSGVPS
RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPFITFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFP
PSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTL
TLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
重鎖:
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMIWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGSTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYA
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−2090−HC−N297Q
軽鎖:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISGYLNWYQQKPGKAPKLLIYQASSLQSGVPS
RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPFITFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFP
PSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTL
TLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
重鎖:
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMIWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGSTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYQ
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−2149
配列番号11
DIQMTQSPATLSASVGDRVTITCRASQSISGYLNWYQQKPGKAPKLLIYQASSLQSGVPS
RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPFITFGPGTKVEIKRTVAAPSVFIFP
PSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTL
TLSKADYEKHKLYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号12
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMIWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGKTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−2149の軽鎖(配列番号11)および重鎖(配列番号12)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
TPP−2093
配列番号21
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYQASSLQSGVPS
RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPFITFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFP
PSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTL
TLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号22
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMMWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGSTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−2093の軽鎖(配列番号21)および重鎖(配列番号22)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
TPP−2148
配列番号31
DIQMTQSPATLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYQASSLQSGVPS
RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPFITFGPGTKVEIKRTVAAPSVFIFP
PSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTL
TLSKADYEKHKLYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号32
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMMWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGKTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−2148の軽鎖(配列番号31)および重鎖(配列番号32)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
TPP−2084
配列番号41
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPS
RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPGITFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFP
PSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTL
TLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号42
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMMWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGSTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−2084の軽鎖(配列番号41)および重鎖(配列番号42)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
TPP−2077
配列番号51
DIQMTQSPATLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPS
RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSSPGITFGPGTKVEIKRTVAAPSVFIFP
PSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTL
TLSKADYEKHKLYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号52
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMMWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGKTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−2077の軽鎖(配列番号51)および重鎖(配列番号52)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
TPP−1538
配列番号61
AQDIQMTQSPATLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGV
PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSSPGITFGPGTKVEIKRTVAAPSVFI
FPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSS
TLTLSKADYEKHKLYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号62
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMMWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGKTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−1538の軽鎖(配列番号61)および重鎖(配列番号62)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
TPP−1854
配列番号81
AQDIQMTQSPATLSASVGDRVTITCRASQSISGYLNWYQQKPGKAPKLLIYNASSLQSGV
PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPFITFGPGTKVEIKRTVAAPSVFI
FPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSS
TLTLSKADYEKHKLYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号82
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMIWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGKTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−1854の軽鎖(配列番号81)および重鎖(配列番号82)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
TPP−1853
配列番号91
AQDIQMTQSPATLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYNASSLQSGV
PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPGITFGPGTKVEIKRTVAAPSVFI
FPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSS
TLTLSKADYEKHKLYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号92
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMMWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGKTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−1853の軽鎖(配列番号91)および重鎖(配列番号92)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
TPP−1857
配列番号101
AQDIQMTQSPATLSASVGDRVTITCRASQSISGYLNWYQQKPGKAPKLLIYNASSLQSGV
PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPGITFGPGTKVEIKRTVAAPSVFI
FPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSS
TLTLSKADYEKHKLYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号102
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMMWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGKTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−1857の軽鎖(配列番号101)および重鎖(配列番号102)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
TPP−1858
配列番号111
AQDIQMTQSPATLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYNASSLQSGV
PSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYTSPFITFGPGTKVEIKRTVAAPSVFI
FPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSS
TLTLSKADYEKHKLYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
配列番号112
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSPYPMMWVRQAPGKGLEWVSYISPSGGKTHY
ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGDTYFDYFDYWGQGTLVTVSS
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS
GLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG
PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN
STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDE
LTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRW
QQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
TPP−1858の軽鎖(配列番号111)および重鎖(配列番号112)のアミノ酸配列;重鎖および軽鎖の両方のCDRに下線を施してある。
実施例2:抗体の生化学的特徴
Biacore分析による結合アフィニティの測定:
抗TWEAKR抗体の結合アフィニティを、Biacore T100装置(GE Healthcare Biacore, Inc.)での表面プラズモン共鳴分析を用いて調べた。抗体を、間接捕捉試薬、抗ヒトIgG(Fc)を用いてCM5センサーチップ上に固定した。「ヒト抗体捕捉キット」(BR−1008−39、GE Healthcare Biacore, Inc.)の試薬を、製造者に説明に従って用いた。抗TWEAKR抗体を、10μL/分で10秒間、濃度10μg/mLで注射した。
表AK−3:アフィニティ測定に用いられる組み換え抗原(TWEAKR)のリスト
Figure 2018528161
表AK−4:アフィニティ測定に用いられる抗体のリスト
Figure 2018528161
表AK−5:アフィニティ測定に用いられる市販の抗体のリスト
Figure 2018528161
HEPES−EP緩衝液(GE Healthcare Biacore、Inc.)中の各種濃度(200nM、100nM、50nM、25nM、12.5nM、6.25nM、3.12nM、1.56nM)の精製組み換えヒトTWEAKRタンパク質(TPP−2305、配列番号168)を、3分間にわたり流量60μL/分で固定化抗TWEAKR抗体上に注入し、解離時間は5分であった。インライン基準細胞補正と、次に緩衝液サンプルの減算後に、センサーグラムを得た。1:1一次結合モデルを用いてセンサーグラムを適合させることで得られた会合(kon)定数および解離(koff)定数の比に基づいて、解離定数(K)を計算した。
表AK−6:TWEAKRタンパク質(TPP−2305(配列番号168))を用い、Biocoreを用いて測定された抗TWEAKR抗体の一価K
Figure 2018528161
Figure 2018528161
本発明の抗体は中等度の(morate)アフィニティ(K10から200nM)でTWEAKRに結合するが、いくつかの比較抗体(例えばPDL−192(TPP−1104)、136.1(TPP−2194)、18.3.3(TPP−2193)、P4A8(TPP−1324)、P3G5(TPP−2195)、P2D3(TPP−2196)、ITEM−1、ITEM−4)は高いアフィニティ結合(0.7から3.7nM)を示すことが確認された。抗体PDL−192、136.1、18.3.3、P4A8、P3G5およびP2D3の可変ドメインの配列を、特許文献WO2009/020933およびWO2009/140177から得て、ヒトIgG1およびマウスIgG2の定常領域をコードする配列を加えて、全長IgGであるPDL−192(TPP−1104)、136.1(TPP−2194)、18.3.3(TPP−2193)、P4A8(TPP−1324)、P3G5(TPP−2195)、P2D3(TPP−2196)を得た。この試験で測定されたアフィニティの範囲は、公開データと良好に一致しており;PDL−192、18.3.3および136.1に関しては、KD値5.5、0.2および0.7nMが公開されおり(WO2009/020933);P4A8については2.6nMである(WO2009/140177)。比較のため、天然リガンドTWEAKは、K値0.8から2.4nMでTWEAKRに結合する(Immunity. 2001 Nov;15(5):837−46; Biochem J. 2006 Jul 15;397(2):297−304; Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2003 Apr 1;23(4):594−600)。
結果的に、本発明の抗体(TPP−883、TPP−1538、TPP−2077、TPP−2084、TPP−2148、TPP−2093、TPP−2149およびTPP−2090)が、中等度(morate)のアフィニティ(K10から200nM)でTWEAKRに結合すると記録することができる。
TWEAKR細胞外ドメインのN末端およびC末端切断変異体を用いるTPP−2090の結合エピトープの特性決定:
異なる生物種のTWEAKR(アミノ酸34から68)のシステイン豊富ドメインの配置(図1−配置)は、それが分析した6種類の生物種で良好に保存されていることを示している。PDL−192はR56に依存して結合することから(WO2009/020933:図2B)、ラット、ブタおよびマウスTWEAKRには結合しない。TPP−2090は保存アミノ酸D47に依存して結合することから、示した全ての生物種に結合する。
上記抗体の結合エピトープの特性決定を行う最初のアプローチにおいて、TWEAKR細胞外ドメインのN末端およびC末端切断変異体を形成し、それが各種抗TWEAKR抗体に結合する能力を調べた。アミノ酸28から33がN末端で欠失され、アミノ酸69から80がC末端で欠失されていたことで、Cys36−Cys49、Cys52−Cys67およびCys55−Cys64の間でジスルフィド架橋を有するシステイン豊富ドメインが無傷で残った(図2を比較)。両方の構築物、N末端およびC末端を含む全細胞外ドメイン28から80および切断細胞外ドメイン34から68が発現され、それぞれFc融合タンパク質TPP−2202およびTPP−2203として精製した。
その結合を分析するため、1μg/mLの相当する二量体TWEAKR Fc構築物をコートし、0.3μg/mLおよび0.08μg/mLのビオチン化IgGを可溶性結合相手として用いた。ストレプトアビジン−HRPおよびAmplex Red基質を用いて検出を行った。IgGを、製造者の説明書に従って約2倍モル過剰のビオチン−LC−NHS(Pierce;カタログ番号21347)を用いてビオチン化し、Zeba脱塩カラム(Pierce;カタログ番号89889)を用いて脱塩した。可溶性リガンドの用いた全ての濃度で、本発明の抗体は両方の構築物に対する飽和結合を示したが、抗体P4A8(TPP−1324)、P3G5(TPP−2195)およびItem−4は全長細胞外ドメインに対してのみ飽和結合を示し、N末端およびC末端切断構築物に対する結合は悪化を示した(図3および図4)。これは、本発明の抗体の結合エピトープが、アミノ酸34から68の間のシステイン豊富ドメインに一していることを示している。P4A8(TPP−1324)およびP3G5(TPP−2195)結合にはTWEAKR細胞外ドメインのN末端またはC末端のいずれが必要であるかを分析するため、アミノ酸69から80のC末端欠失を有するモノマー細胞外ドメインを形成した。C末端切断TWEAKR細胞外ドメインへのP4A8(TPP−1324)およびP3G5(TPP−2195)の結合も同様に悪化しているが、本発明の抗体は飽和結合を示している(図5)。
表AK−9:エピトーププロファイリングのためのELISA分析で使用される組み換え抗原のリスト
Figure 2018528161
表AK−10:エピトーププロファイリングのためのELISA分析で使用される抗体のリスト
Figure 2018528161
Figure 2018528161
従って、システイン豊富ドメインにおけるTPP−2090、TPP−2084、PDL−192(TPP−1104)および136.1(TPP−2194)の結合エピトープおよびP4A8(TPP−1324)およびP3G5(TPP−2195)の結合エピトープは、少なくとも部分的に、システイン豊富ドメインの外にある。
抗体アフィニティに対するTWEAKR−Fc突然変異タンパク質の効果
本発明の抗体の結合特性をより詳細に調べるため、公知のアゴニスト抗体(WO2009/140177)の活性について関連性があることが示唆されているTWEAKRのある種の突然変異タンパク質について調べた。このために、次の個々のアミノ酸置換:T33Q;S40R;W42A;M50A;R56P;H60K;L65Qを有する全長細胞外ドメイン(アミノ酸28から80)を発現させ、Fc融合タンパク質として精製した。
表AK−11:突然変異タンパク質結合についてのELISA分析で使用される組み換えタンパク質のリスト
Figure 2018528161
用量−反応データを得るため、各種TWEAKR−Fc突然変異タンパク質を低濃度(62ng/mL)で384ウェルMaxisorb ELISAプレートにコーティングし、濃度100nMから出発するビオチン化IgGの一連の2倍希釈液を可溶性結合相手として用いた。ストレプトアビジン−HRPおよびAmplex Redを用いて検出を行った。調べたIgGは、本発明のTPP−2090およびTPP−2084;WO2009/020933のPDL−192、136.1および18.3.3;WO2009/140177のP4A8およびP3G5;ならびにNakayama et al [Biochem Biophys Res Com 306: 819−825]のITEM−1およびITEM−4であった。
表AK−12:突然変異タンパク質結合についてのELISA分析で使用される抗体のリスト
Figure 2018528161
Figure 2018528161
表AK−13:突然変異タンパク質結合についてのELISAで使用される市販の抗体のリスト
Figure 2018528161
IgGを、製造者の説明書に従って約2倍モル過剰のビオチン−LC−NHS(Pierce;カタログ番号21347)を用いてビオチン化し、Zeba脱塩カラム(Pierce;カタログ番号89889)を用いて脱塩した。用量−反応データを適合させ、IC50を求めた。結果を示すため、作表を行い、「−」は50nMを超えるIC50を示し、「+」は1から150pMの範囲のIC50を示す。
表AK−14:抗体結合に対する突然変異タンパク質の効果
Figure 2018528161
既報のように、ITEM−4は、H60K突然変異タンパク質[WO2009/140177:図23F]に対する結合悪化を示し、PDL−192はR56P突然変異タンパク質に対する結合の悪化を示す[WO2009/020933:図22B]。公開されたデータとは対照的に、ITEM−1はR56Pに対する結合悪化を示し、全ての抗体はW42Aに対する悪化を示す[WO2009/140177:図23E、図23F]。これらの差は選択された方法によって説明することができる。
ITEM−1、ITEM−4、PDL−192、136.1および18.3.3とは対照的に、本発明の抗体は、W42A以外の全ての置換から独立に結合する。
システイン豊富ドメインのアラニンスキャン:
システイン豊富ドメイン(アミノ酸34から68)のアラニンスキャンを行って、本発明の抗体の結合部位の位置を決定した。図6は、TWEAKRの全長細胞外ドメインのN末端およびC末端切断変異体が、本発明の抗体の結合を悪化させないことを示している。従って、結合エピトープは、システイン豊富ドメインにある。次の置換:S37A、R38A、S40A、S41A、W42A、S43A、D45A、D47A、K48A、D51A、S54A、R56A、R58A、P59A、H60A、S61A、D62A、F63AおよびL65Aが、TWEAKR(34−68)Fc構築物に導入された。
表AK−15:システイン豊富ドメインのアラニンスキャンのためのTWEAKR突然変異タンパク質構築物のリスト
Figure 2018528161
これらのTWEAKR(34−68)Fc突然変異タンパク質を、HEK293細胞で発現させた。用量−反応データを得るため、IgGを、384ウェルMaxisorp ELISAプレート上に濃度1μg/mLでコーティングし、TWEAKR突然変異タンパク質を含む上清の連続2倍希釈液を、可溶性結合相手として用いた。抗HIS−HRPおよびAmplex Redを用いて検出を行った。調べたIgGは、本発明のTPP−2090、WO2009/020933のPDL−192およびWO2009/140177のP4A8であった。
表AK−16:システイン豊富ドメインのアラニンスキャンに用いられる抗体のリスト
Figure 2018528161
各種IgGに対する結合についてのTWEAKR突然変異タンパク質の関連性を評価するため、ある突然変異タンパク質濃度での相関ブロットを作った。例を挙げると、図6にはTWEAKR発現ブロスの8倍希釈上清についての相関ブロットを示してあり、PDL−192(TPP−1104)がX軸であり、TPP−2090がY軸である。そのブロットは、TPP−2090の結合が置換D47Aによって悪化し、PDL−192(TPP−1104)の結合が置換R56Aによって悪化したことを示している。P4A8(TPP−1324)への結合は、どの構築物についても示されず、それは上記で得られた結果と一致している(図6)。従って、P4A8エピトープは、少なくとも部分的に、システイン豊富ドメインの外にある。抗体相互作用に関してある種のTWEAKRアミノ酸において確認された依存性は、これらの抗体について測定されたアゴニスト活性と相関している。天然リガンドTWEAKは、TWEAKRの効果的活性化を示し、TWEAKRのシステイン豊富ドメインにおけるロイシン46に依存して結合する(Pellegrini et al, FEBS280:1818−1829)。P4A8は、非常に低いアゴニスト活性を示し、少なくとも部分的に、TWEAKRのシステイン豊富ドメインの外のドメインと相互作用する。PDL−192は、中等度の(morate)アゴニスト活性を示し、R56に依存してシステイン豊富ドメインに結合するが、TWEAKリガンド部位は逆である。TPP−2090およびTWEAK結合は、それぞれD47およびL46に依存することから、それらは同様の結合部位に結合する(図7)。
本発明の抗体(例えばTPP−2090)はD47に依存する形でTWEAKRに結合すると結論付けることができる。
抗体相互作用に関してある種のTWEAKRアミノ酸において確認された依存性は、これらの抗体について測定されたアゴニスト活性と相関している。天然リガンドTWEAKは、TWEAKRの効果的活性化を示し、TWEAKRのシステイン豊富ドメインにおけるロイシン46に依存して結合する(Pellegrini et al, FEBS280:1818−1829)。P4A8は、非常に低いアゴニスト活性を示し、少なくとも部分的に、TWEAKRのシステイン豊富ドメインの外のドメインと相互作用する。PDL−192は、中等度の(morate)アゴニスト活性を示し、R56に依存してシステイン豊富ドメインに結合するが、TWEAKリガンド部位は逆である。本発明の抗体(実施例TPP−2090)は、D47に依存する形で結合し、TWEAKはD46に依存する形で結合し、そして同様の(しかし異なる)結合部位に結合する(図7)。従って、強いアゴニスト活性を示す本発明の抗体は、非常に高いアゴニスト活性を伴う抗体についての新規なエピトープ(D47依存性)に結合する。留意すべき興味深い点として、ミカエルソン(Michaelson)ら(Michaelson JS et al, MAbs. 2011 Jul−Aug;3(4):362−75の369頁左欄を参照)が、彼らが調べた全てのアゴニスト抗体が天然リガンドTWEAKより弱いアゴニスト活性を有するという事実の説明を提供している。彼らは、効力低下は、抗体のTWEAKRとの二量体結合相互作用の関数である可能性があり、TWEAKが恐らくは三量体相互作用に入ると結論付けている。従って、驚くべき結果として、本発明の抗体は、TWEAKRとのそれの二量体相互作用にも拘わらず、かなり高いアゴニスト活性を有する。この驚くべき活性は、本発明の抗体の特異的結合特性、すなわちTWEAKRのD47への特異的結合に関連している。

Claims (49)

  1. バインダーもしくはそれの誘導体の1以上の活性化合物分子との複合体であって、前記活性化合物分子がリンカーLを介して前記バインダーに結合したキネシン紡錘体タンパク質阻害剤であり、前記リンカーLが前記バインダーのグルタミン側鎖に結合しており、1から5個のキネシン紡錘体タンパク質阻害剤が前記リンカーLに結合しており、前記リンカーLに結合した前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤が下記式(IIa)を有する複合体、ならびに該複合体の塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマー。
    Figure 2018528161
    [式中、
    は、Nを表し、XはNを表し、XはCを表し;または
    はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
    はCHもしくはCFを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
    はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
    はCHまたはCFを表し、XはNを表し、XはCを表し、
    (XがCHを表し、XがCを表し、XがNを表すのが好ましい);
    は−H、−L−#1、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
    −L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    −MODは、上記で定義のように表され、
    Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
    は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
    Wは−Hまたは−OHを表し、
    は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
    は、−H、−L−#1、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
    −L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    −MODは、上記で定義のように表され、
    Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
    は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
    は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
    は−H、−L−#1、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
    −L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    Zは−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    は−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
    は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
    は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
    または
    はR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−の基もしくはカテプシン開裂性基R21−(C=O)(0−1)−(P3)(1−2)−P2−を表し、
    21はH、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基(それは、−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)、または−OHで1回以上置換されていても良い)、−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
    xは0または1であり、
    vは1から20の数字であり、
    22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
    P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
    P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;複数のアミノ酸P3がある場合、P3は、上記で定義の同一もしくは異なるアミノ酸を有することができ;
    または
    およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
    10は−H、ハロゲン(好ましくは−Fまたは−Cl)、−NH、−SOH、−COOH、−SH、C1−4−アルキル、ハロ−C1−4−アルキル、C1−4−アルコキシ、ヒドロキシ置換されたC1−4−アルキル、−C(=O)−O−(C1−4−アルキル)または−OHを表し、ピロリジン環中の2級アミノ基の水素原子がR21−C(=O)−P3(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−SIG−によって置き換わっていても良く;
    L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
    P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;複数のアミノ酸P3がある場合、P3は、上記で定義の同一もしくは異なるアミノ酸を有することができ;
    −SIGは、−C(=O)ーSIG結合の開裂時に遊離2級アミンを与える自壊性基であり;
    Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
    は−L−#1、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個のO−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH((CHCHO)1−20H)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
    −L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    −MODは、上記で定義のように表され、
    nは0、1または2を表し、
    Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
    は−L−#1、H、−MOD、−NH、−NO、ハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)、−CN、−CF、−OCF、−CHF、−CHF、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
    Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシ、−NO、−NH、−COOHまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
    は、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキル、−または−(CH0−2−(HZ)を表し、
    HZはN、OおよびSからなる群から選択される2個以下のヘテロ原子を有する4から7員の複素環を表し、これらの基のそれぞれは−OH、−COOHまたは−NHまたは−L−#1によって置換されていても良く;
    −L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    置換基R、R、R、R、RおよびR10のうちの一つが−L−#1を表し(またはRの場合、それを含み)、
    は−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表し;
    上記で定義の−MODは−(NR10−(G1)−G2−G3を表し、
    10はHまたはC−C−アルキルを表し;
    G1は−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
    Figure 2018528161
    (G1が−NH−C(=O)−または
    Figure 2018528161
    を表す場合、R10は−NHを表さない。)を表し;
    nは0または1であり;
    oは0または1であり;
    G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−、−C(=O)−、−CR=N−O−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
    いずれかの側鎖を含む炭化水素鎖は、−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
    は−H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
    は−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
    G3は−Hまたは−COOHを表し、
    −MODは好ましくは、少なくとも一つの−COOH基を有する。]
  2. がCHを表し、XがCを表し、XがNを表す請求項1に記載の複合体。
  3. 前記置換基Rまたは置換基Rが−L−#1を表す請求項1または2に記載の複合体。
  4. リンカーLを介してバインダーに結合したキネシン紡錘体タンパク質阻害剤である活性化合物分子とバインダーもしくはそれの誘導体の複合体であって、前記リンカーLが前記バインダーのグルタミン側鎖に結合しており、前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤が下記の下位構造を有する複合体、ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマー。
    Figure 2018528161
    [式中、
    #aは、分子の残りの部分への結合を表し;
    1aは、−H、−MOD、または−(CH0−3Zを表し、
    −MODは、上記で定義のように表され、
    Zは、−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
    は、Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は、−H、−SOH、−NH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C=O−NH−CHY1−3COOHを表し、
    Wは、−Hまたは−OHを表し、
    は、−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
    2aは、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
    Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    は、−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
    は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
    は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
    4aは、H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
    Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルによって置換されていても良い−NHC(=O)−NHを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
    は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
    は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
    または
    4aは、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−の基もしくはカテプシン開裂性基または基R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−を表し、
    21は、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−SO−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)または−OHで1回以上置換されていても良く;またはそれは、−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
    xは0または1であり,
    vは1から10の数字であり、
    22は、−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
    P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
    P3は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
    または
    2aおよびR4aが一緒に、(ピロリジン環の形成を伴う)−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
    10は、−H、ハロゲン(好ましくは−F)、−NH、−COOH、−SOH、−SHまたは−OHを表し;
    前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤は、R1a、R2a、R4aで、またはR2aおよびR4aによって形成されたピロリジン環で、水素原子の置換によってリンカーに結合している。]
  5. 前記キネシン紡錘体タンパク質阻害剤が、一般式(Ia)によって表される請求項4に記載の複合体ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマー。
    Figure 2018528161
    [式中、
    1aは、−H、−MODまたは−(CH0−3Zを表し、
    Zは、−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
    は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は、−H、−SOH、−NH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
    Wは、−Hまたは−OHを表し、
    は、−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分基のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
    2aは、−H、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
    Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
    は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
    は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
    4aは、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
    Zは、−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は、−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    は、−NHC(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
    は、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
    は、直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
    または
    4aは、R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC−(C=O)−NH)−C(=O)−、またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−の基、もしくはカテプシン開裂性基または式R21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−を表し、
    21は、−H、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、−N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−SONH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)もしくは−OHで1回以上置換されていても良く;または−Hもしくは基−O−(CHCHO)−R22を表し、
    xは0または1であり、
    vは1から20の数字であり、
    22は、−H、−アルキル(好ましくはC12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
    P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
    P3は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
    または
    2aおよびR4aが一緒に、(ピロリジン環の形成を伴う)−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
    10は、H、ハロゲン(好ましくはF)、−NH、−COOH、−SOH、−SHまたは−OHを表し、ピロリジン環中の2級アミノ基の水素原子がR21−C(=O)−P3(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)NH)−C(=O)−SIG−によって置き換わっていても良く;
    P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
    P3は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
    −SIGは、−C(=O)−SIG結合の開裂時に遊離2級アミンを提供する自壊性基であり;
    3aは、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキルまたは複素環アルキル基、好ましくはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個のO−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
    Zは、−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    −MODは、上記で定義のように表され、
    nは0、1または2であり、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は、−H、−(CH0−3−CH(NH−C(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は、−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し、
    8aは、C1−10−アルキルを表し、
    HZは、単環式もしくは二環式複素環を表し、それはハロゲン、C1−10−アルキル基、C6−10−アリール基およびC6−10−アラルキル基からなる群から選択される1以上の置換基によって置換されていても良く、それはハロゲンによって置換されていても良く;
    上記で定義の−MODは、−(NR10−(G1)−G2−G3を表し、
    10は、−H;ハロゲンまたはC−C−アルキルを表し;
    G1は、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−または
    Figure 2018528161
    (G1が−NHC(=O)−または
    Figure 2018528161
    を表す場合、R10はNHを表さない。)を表し;
    nは0または1であり;
    oは0または1であり;
    G2は、直鎖および/または分岐の炭化水素基を表し、それは1から10個の炭素原子を有し、基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NR−、−NRC(=O)−、−C(=O)−NR−、−NRNR−、−S(=O)−NRNR−、−C(=O)−NRNR−、−C(=O)−、−CR=N−O−の1以上によって1回または複数回中断されていても良く、
    いずれかの側鎖を含む前記炭化水素基は、−NHC(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CNNH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
    は、H、フェニル、C−C10−アルキル、C−C10−アルケニルまたはC−C10−アルキニルを表し、そのそれぞれは−NHC(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
    は、−H、C−C−アルキルまたはフェニル)を表し、
    G3は、−Hまたは−COOHを表し、
    −MODは好ましくは、少なくとも一つの基−COOHを有する。]
  6. 前記リンカーLが前記バインダーのグルタミン側鎖に結合し、1から5個のキネシン紡錘体タンパク質阻害剤が前記リンカーLに結合しており、前記活性化合物分子リンカーが、一般式(II)によって表される前記請求項のうちの1以上に記載の複合体、ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマー。
    Figure 2018528161
    [式中、
    はNを表し、XはNを表し、XはCを表し;または
    はNを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
    はCHもしくはCFを表し、XはCを表し、XはNを表し;または
    はNHを表し、XはCを表し、XはCを表し;または
    はCHを表し、XはNを表し、XはCを表し、

    は−H、−MOD、−L−#1または−(CH0−3Zを表し、
    −L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    −MODは、上記で定義のように表され、
    Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′(例えば−(CH0−3Z′)または−CH(CHW)Z′を表し、
    は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−NH、−SOH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
    Wは−Hまたは−OHを表し,
    は−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
    は−L−#1、H、−MOD、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
    −L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    −MODは、上記で定義のように表され、
    Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    は−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
    は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
    は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
    は−L−#1、−H、−C(=O)−CHY−NHYまたは−(CH0−3Zを表し、
    −L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    Zは−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    は−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
    は−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
    は直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し、
    または
    はR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−またはR21−(C=O)(0−1)−(P3)(0−2)−P2−NH−CH(CHCOOH)−C(=O)−の基もしくはカテプシン開裂性基R21−(C=O)(0−1)−(P3)(1−2)−P2−を表し、
    21は−H、C1−10−アルキル−、C5−10−アリール−またはC6−10−アラルキル−、C5−10−ヘテロアルキル−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリール−、C5−10−複素環アルキル−、ヘテロアリール−、ヘテロアリール−アルキル−、C1−10−アルコキシ−、C6−10−アリールオキシ−またはC6−10−アラルコキシ−、C5−10−ヘテロアルコキシ−、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールオキシ−、C5−10−複素環アルコキシ基を表し、それは−NH、−NH−アルキル、−N(アルキル)、−NH−C(=O)−アルキル、N(アルキル)−C(=O)−アルキル、−SOH、−S(=O)NH、−S(=O)−N(アルキル)、−COOH、−C(=O)−NH、−C(=O)−N(アルキル)もしくは−OHで1回以上置換されていても良く、または−Hまたは基−(O)−(CHCHO)−R22を表し、
    xは0または1であり、
    vは1から20の数字であり、
    22は−H、−アルキル(好ましくはC1−12−アルキル)、−CH−COOH、−CH−CH−COOH、または−CH−CH−NH)を表し;
    P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
    P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;複数のアミノ酸P3がある場合、P3は、上記で定義の同一もしくは異なるアミノ酸を有することができ;
    または
    およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−または−CHR10−CH−を表し、
    10は−H、ハロゲン(好ましくは−F)、−NH、−SOH、−COOH、−SHまたは−OHを表し、ピロリジン環中の2級アミノ基の水素原子がR21−C(=O)−P3(0−2)−P2−NH−CH(CHC(=O)−NH)−C(=O)−SIG−によって置き換わっていても良く;
    L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    P2は、Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisから選択されるアミノ酸であり;
    P3は、独立にGly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、シトルリンおよびHisまたは相当するN−アルキルアミノ酸、好ましくはN−メチルアミノ酸のうちの一つから選択されるアミノ酸であり;
    −SIGは、−C(=O)−SIG結合の開裂時に遊離2級アミンを与える自壊性基であり;
    Aは−C(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−、−S(=O)−NH−または−C(=N−NH)−を表し;
    は−L−#1、−MODまたは置換されていても良いアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロアルキル、複素環アルキル基、好ましくは−L−#1またはC1−10−アルキル、C6−10−アリールまたはC6−10−アラルキル、C5−10−ヘテロアルキル、C1−10−アルキル−O−C6−10−アリールまたはC5−10−複素環アルキル基を表し、それは1から3個の−OH基、1から3個のハロゲン原子、1から3個のハロゲン化アルキル基(それぞれ1から3個のハロゲン原子を有する)、1から3個の−O−アルキル基、1から3個の−SH基、1から3個の−S−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−アルキル基、1から3個の−O−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−アルキル基、1から3個の−NH−C(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−S(=O)−アルキル基、1から3個の−S(=O)−NH−アルキル基、1から3個の−NH−アルキル基、1から3個の−N(アルキル)基、1から3個の−NH基または1から3個の−(CH0−3Z基によって置換されていても良く、
    −L−#1はリンカーを表し、#1はバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    −MODは、上記で定義のように表され、
    nは0、1または2を表し、
    Zは−H、ハロゲン、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は−H、−(CH0−3−CH(NHC(=O)−CH)Z′、−(CH0−3−CH(NH)Z′または−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    は−H、−NH、−NO、ハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)、−SHまたは−(CH0−3Zを表し、
    Zは−H、−OY、−SY、ハロゲン、−NHY、−C(O)−NYまたは−C(O)−OYを表し、
    およびYは互いに独立に、−H、−NHまたは−(CH0−3Z′を表し、
    は−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′は−H、−SOH、−NHまたは−COOHを表し;
    およびRは互いに独立に、−H、シアノ、C1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C2−10−アルケニル、フルオロ−C2−10−アルケニル、C2−10−アルキニル、フルオロ−C2−10−アルキニル、ヒドロキシまたはハロゲン(特には−F、−Cl、−Br)を表し、
    はC1−10−アルキル、フルオロ−C1−10−アルキル、C4−10−シクロアルキル、フルオロ−C4−10−シクロアルキル、または置換されていても良いオキセタンを表し;
    は−H、−F、−CH、−CF、−CHFまたは−CHFを表す。]
  7. が−H、−L−#1または−(CH0−3Zを表し、
    −L−#1がリンカーを表し、#1がバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し;
    Zが−H、−OY、−SY、−NHY、−C(=O)−NYまたは−C(=O)−OYを表し、
    およびYが互いに独立に、−H、−NH、−(CHCHO)0−3−(CH0−3Z′または−CH(CHW)Z′を表し、
    が−Hまたは−(CH0−3Z′を表し、
    Z′が−H、−NH、−COOH、−NH−C(=O)−CH−CH−CH(NH)COOHまたは−(C(=O)−NH−CHY1−3COOHを表し、
    Wが−Hまたは−OHを表し、
    が−NH−C(=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し;
    およびRが互いに独立に、−L−#1、−Hまたは−C(=O)−CHY−NHYを表し、
    −L−#1がリンカーを表し、#1がバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    が−NH−(C=O)−NHによって置換されていても良い直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表すか、−NHによって置換されていても良いアリールもしくはベンジルを表し、
    が−Hまたは−C(=O)−CHY−NHを表し、
    が直鎖もしくは分岐のC1−6−アルキルを表し;
    または
    およびRが一緒に(ピロリジン環を形成)、−CH−CHR10−を表し、
    10が−L−#1、−H、−NH、−SOH、−COOH、
    −SHまたは−OHを表し、
    L−#1がリンカーを表し、#1がバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    Aが−C(=O)を表し;
    が−(CH)OHまたは−L−#1を表し、
    −L−#1がリンカーを表し、#1がバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    が−L−#1または−Hを表し、
    −L−#1がリンカーを表し、#1がバインダーもしくはそれの誘導体への結合を表し、
    置換基R、R、R、RおよびRのうちの一つが−L−#1を表す、請求項6に記載の複合体、ならびにそれの塩、溶媒和物、溶媒和物の塩およびエピマー。
  8. およびRが互いに独立に、H、C1−3−アルキルまたはハロゲンを表す、請求項6に記載の複合体。
  9. がC1−4−アルキル(好ましくはtert−ブチル)を表す、請求項6に記載の複合体。
  10. がHを表す請求項6に記載の複合体。
  11. およびRがFを表す請求項6に記載の複合体。
  12. 前記バインダーまたはそれの誘導体がバインダーペプチドもしくはタンパク質またはバインダーペプチドもしくはタンパク質の誘導体である前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  13. 前記複合体が、バインダー当たり二つの結合部位を有する前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  14. 前記複合体が、バインダー当たり四つの結合部位を有する前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  15. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、トランスグルタミナーゼによって認識され得るアクセプターグルタミン側鎖を含む抗体またはバインダーペプチドもしくはタンパク質の誘導体を表す請求項12から14のうちの1以上に記載の複合体。
  16. トランスグルタミナーゼ介在結合によって製造される請求項12から15のうちの1以上に記載の複合体。
  17. ストレプトミセス・モバラエンシス(Streptomyces Mobaraensis)からトランスグルタミナーゼを用いて製造される請求項12から16のうちの1以上に記載の複合体。
  18. 前記バインダーが癌標的分子に結合する前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  19. 前記バインダーが細胞外標的分子に結合する請求項18に記載の複合体。
  20. 前記バインダーが、細胞外標的分子への結合後に、内在化され、標的分子を発現する細胞により、細胞内で(好ましくはリソソームで)処理される請求項19に記載の複合体。
  21. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質がヒト、ヒト化もしくはキメラモノクローナル抗体またはそれの抗原結合性断片である請求項12から20のうちの1以上に記載の複合体。
  22. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、適宜にCH2ドメイン内で、それの重鎖にアクセプターグルタミン残基を有する抗体である前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  23. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、位置295(Kabatナンバリングシステム)でそれの重鎖にアクセプターグルタミン残基を有する抗体である請求項22に記載の複合体。
  24. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、N297X置換(Xはアスパラギン以外のアミノ酸である。);さらにより好ましくはN297D、N297Q、N297SまたはN297A、非常に好ましくはN297AおよびN297Qを含む抗体である請求項22に記載の複合体。
  25. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、N297Q置換およびQ295X置換(Xはアスパラギン以外のアミノ酸である。)、好ましくはQ295Nを含む抗体である請求項22に記載の複合体。
  26. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、実質的にN連結グリコシル化を持たない残基297でアスパラギンを含む抗体である前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  27. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、アミノ酸残基N297でN連結グリコシル化を持たない抗体を産生する宿主細胞で産生される抗体である請求項26に記載の複合体。
  28. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が抗HER2抗体、抗EGFR抗体、抗TWEAKR抗体またはそれの抗原結合断片である前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  29. 前記抗TWEAKR抗体が、TWEAKR(配列番号169)、好ましくは抗TWEAKR抗体TPP2090およびそれの脱グリコシル化変異体の位置47(D47)におけるアミノ酸Dに特異的に結合する請求項28に記載の複合体。
  30. 前記抗TWEAKR抗体が、TWEAKR(配列番号169)、好ましくは抗TWEAKR抗体TPP−2090−HC−N297AまたはTPP−2090−HC−N297Qの位置47(D47)におけるアミノ酸Dに特異的に結合する請求項28および29に記載の複合体。
  31. 前記リンカーLが前記バインダーのグルタミン側鎖に結合しており、1から5個のキネシン紡錘体タンパク質阻害剤が前記リンカーLに結合しており、前記リンカーLが下記の基本構造(i)から(iv):
    (i)−(C=O)−SG1−L1−L2−
    (ii)−(C=O)−L1−SG−L1−L2−
    (iii)−(C=O)−L1−L2−
    (iv)−(C=O)−L1−SG−L2
    (式中、mは0または1であり、SGおよびSG1はイン・ビボ開裂性基であり、L1は互いに独立に、イン・ビボで開裂しない有機基を表し、L2はバインダーへのカップリング基を表す。)のうちの一つを有する前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  32. 前記リンカーLが前記バインダーのグルタミン側鎖に結合しており、1から5個のキネシン紡錘体タンパク質阻害剤が前記リンカーLに結合しており、前記イン・ビボ開裂性基SGが2から8オリゴペプチド基、好ましくはジペプチド基またはジスルフィド、ヒドラゾン、アセタールもしくはアミナールであり、SG1が2から8オリゴペプチド基、好ましくはジペプチド基である請求項31に記載の複合体。
  33. 前記リンカーがグルタミン側鎖に結合しており、下記式を有する請求項31に記載の複合体。
    Figure 2018528161
    [式中、
    mは0または1であり;
    §は、活性化合物分子への結合を表し、
    §§は前記バインダーペプチドまたはタンパク質への結合を表し、
    L1は−(NR10−(G1)−G3−を表し、
    10は−H、−NHまたはC−C−アルキルを表し;
    G1は−NH−C(=O)−または
    Figure 2018528161
    を表し;
    nは0または1であり;
    oは0または1であり;
    G3は結合またはアリーレン基および/または直鎖および/または分岐および/または環状アルキレン基からの1から100個の炭素原子を有する置換されていても良い直鎖もしくは分岐の炭化水素鎖を表し、それは基−O−、−S−、−S(=O)−、−S(=O)−、−NH−、−C(=O)−、−NMe−、−NHNH−、−S(=O)−NHNH−、−NH−C(=O)−、−C(=O)−NH−、−C(=O)−NHNH−および−N−、−O−および−S−、−S(=O)−または−S(=O)−(好ましくは
    Figure 2018528161
    )からなる群から選択される4個以下のヘテロ原子を有する5から10員の芳香族もしくは非芳香族複素環のうちの1以上によって1回または複数回中断されていても良く、側鎖が存在する場合、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CN−NH、スルホンアミド、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良く、
    または、下記の基:
    Figure 2018528161
    のうちの一つを表し、
    Rxは−H、C−C−アルキルまたはフェニルを表し、
    L2は#−(NH)−(C=O)−G4−NH−#または#−(NH)−(C=O)−G4−O−NH−#を表し、
    pは0または1であり;
    qは0または1であり;
    G4は置換されていても良いアルキルまたはヘテロアルキル鎖を表し、適宜に、前記鎖のいずれかの炭素がアルコキシ、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、−S−アルキル、−チオール、−C(=O)−S−アルキル、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、アミン、−C(=O)−NHで置換されており、
    は、基Lへの結合箇所を示し、
    は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示す。]
  34. 前記炭化水素鎖が下記の基のうちの一つによって中断されている請求項33に記載の複合体。
    Figure 2018528161
    [式中、XはHまたはC1−10−アルキル基を表し、それは−NH−C(=O)−NH、−COOH、−OH、−NH、−NH−CN−NH、スルホン、スルホキシドまたはスルホン酸によって置換されていても良い。]
  35. L2が下記の基のうちの一つである請求項31から34のうちの1以上に記載の複合体。
    Figure 2018528161
    [式中、
    は−H、−C(=O)−NH−アルキル、−NH−C(=O)−アルキル、−C(=O)−NH、−NHであり、
    は、基Lへの結合箇所を示し、
    は、バインダーのグルタミン残基への結合箇所を示す。]
  36. が−Hまたは−NH−C(=O)−CHである請求項35に記載の複合体。
  37. またはRが−L−#1を表す請求項35または36に記載の複合体。
  38. 前記抗TWEAKR抗体がアゴニスト抗体である前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  39. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、
    a.式PYPMX(配列番号171)(XはIまたはMである。)を含むアミノ酸配列によってコードされる重鎖のCDR1;
    b.式YISPSGGXTHYADSVKG(配列番号172)(XはSまたはKである。)を含むアミノ酸配列によってコードされる重鎖のCDR2;および
    c.式GGDTYFDYFDY(配列番号173)を含むアミノ酸配列によってコードされる重鎖のCDR3;
    を含む可変重鎖
    および
    d.式RASQSISXYLN(配列番号174)(XはGまたはSである。)を含むアミノ酸配列によってコードされる軽鎖のCDR1;
    e.式XASSLQS(配列番号175)(XはQ、AまたはNである。)を含むアミノ酸配列によってコードされる軽鎖のCDR2;および
    f.式QQSYXXPXIT(配列番号176)(位置5のXはTまたはSであり、位置6のXはTまたはSであり、位置8のXはGまたはFである。)を含むアミノ酸配列によってコードされる軽鎖のCDR3
    を含む可変軽鎖
    を含む抗体である前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  40. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、
    a.配列番号10に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号9に示した軽鎖の可変性配列、または
    b.配列番号20に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号19に示した軽鎖の可変性配列、または
    c.配列番号30に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号29に示した軽鎖の可変性配列、または
    d.配列番号40に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号39に示した軽鎖の可変性配列、または
    e.配列番号50に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号49に示した軽鎖の可変性配列、または
    f.配列番号60に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号59に示した軽鎖の可変性配列、または
    g.配列番号70に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号69に示した軽鎖の可変性配列、または
    h.配列番号80に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号79に示した軽鎖の可変性配列、または
    i.配列番号90に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号89に示した軽鎖の可変性配列、または
    j.配列番号100に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号99に示した軽鎖の可変性配列、または
    k.配列番号110に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号109に示した軽鎖の可変性配列、または
    l.配列番号120に示した重鎖の可変性配列、そしてさらに配列番号119に示した軽鎖の可変性配列
    を含む抗体である前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  41. 前記抗体がIgG抗体である前記請求項のうちの1以上に記載の複合体。
  42. 好ましくはトリフルオロ酢酸塩の形態での下記式のうちの一つの化合物を、トランスグルタミナーゼを用いてバインダーペプチドまたはタンパク質の残基に結合させ、前記化合物が好ましくはバインダーペプチドまたはタンパク質に関して2から100倍モル過剰で用いられる、前記請求項のうちの1以上に記載の複合体の製造方法。
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    [式中、X、X、X、SG、L1、L3、R1、R4、R10およびRは、請求項1から41におけるものと同じ意味を有する。]
  43. 下記式のうちの一つの化合物。
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    [式中、X、X、X、SG、L1、L3、R1、R4、R10およびRは、請求項1から41におけるものと同じ意味を有する。]
  44. 下記式のうちの一つによる複合体[式中、Ak3a、Ak3b、AD3d、Ak3eは、バインダー、好ましくは抗体を表し、nは2から10、好ましくは2から4、そしてさらに好ましくは2または4を表す。]
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
    Figure 2018528161
  45. 前記バインダーペプチドまたはタンパク質が、抗体または下記式によるバインダーペプチドまたはタンパク質の誘導体を表す請求項1から44のうちの1以上に記載の複合体。
    Figure 2018528161
  46. 不活性で無毒性の医薬として好適な補助剤と組み合わせて請求項1から43に記載の複合体または請求項44もしくは45に記載の化合物を含む医薬組成物。
  47. 疾患の治療および/または予防方法で使用される請求項1から43のうちの1以上に記載の複合体または請求項44もしくは45に記載の化合物。
  48. 過剰増殖性障害および/または血管新生障害の治療方法で使用される請求項1から43のうちの1以上に記載の複合体または請求項44もしくは45に記載の化合物。
  49. 有効量の少なくとも一つの請求項1から43のうちの1以上に記載の複合体または請求項44もしくは45に記載の化合物を用いる、ヒトおよび動物での過剰増殖性障害および/または血管新生障害の治療および/または予防方法。
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