JP2018082715A - 標的分子を捕捉するためのデバイス及び方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、それぞれの開示全体を参照により本明細書に援用する2013年5月6日付で提出された米国仮特許出願第61/820,110号に基づく利益を主張する。
本開示は、流体試料から目的の物質(agent)を捕捉する効率が上昇したシステム、デバイス、及び方法に関する。流体試料は、いくつかの実施形態では生物学的流体試料(biological fluid sample)であり、別の実施形態では、非生物学的流体試料が用いられる。例えば、複数の実施形態で、例えばミネラル含有量、汚染レベル、化学物質又は毒素の含有量、病原体の存在等を評価するために、本明細書に開示されているデバイスに環境水試料を通過させる。
容容器の内部空洞部内の固定された位置に第1及び第2ボディーを保持する。有利には、複数の実施形態で、固定された位置は、第1ボディーの内部容積部からフィルター材料を通って受容容器の内部空洞部中へと通過した生物学的流体試料と第2ボディーの出口が接触しない位置である。
i)(a)入口、出口、及び入口と出口との間の内部容積部を有する第1ボディー;(b)入口、出口、入口と出口との間の内部容積部、第2ボディーの内部容積部内に配置されたフィルター材料を有し、前記第1ボディーと流体連通する、第2ボディー、を含み、第1ボディー及び第2ボディーが、第2ボディーの入口と第1ボディーの出口との相互作用によって可逆的に接続され、前記相互作用が、第1ボディーの出口の雌ねじ部と噛み合う第2ボディーの入口の雄ねじ部の間の相互作用を含む、小胞捕捉デバイス;(ii)内部空洞部を有する受容容器であって、受容容器の内部空洞部が、第1及び第2ボディーの両方を可逆的に囲むような並びに第1ボディーの内部容積部から、フィルター材料を通って、第2ボディーの内部空洞部を通って、第2ボディーの出口から出るように通過させた後の生物学的流体試料を受容するような寸法である受容容器、を含むシステムが提供される。
。その結果、超遠心は多くの実験室にとって非実用的又は不可能な技術であることがある。
の実施形態で、ガラス様及び非ガラス様材料の組み合わせが使用される。一実施形態では、ニトロセルロースを含む非ガラス様材料をガラス様材料と組み合わせて用いる。
loading region)から小胞捕捉材料を通じて試料受容領域中へと通過させるために、真空源に接続されている。一実施形態では、通過は、デバイスに真空圧を印加することにより達成される。複数の実施形態で、小胞捕捉デバイスは、生物学的流体を試料投入領域から小胞捕捉材料を通じて試料受容領域中へと通すために、陽圧を受け得る。一実施形態では、通過はデバイスに陽圧を印加することにより達成される。複数の実施形態で、デバイスは、生物学的流体を試料投入領域から小胞捕捉材料を通じて試料受容領域中へと通すために、遠心機中に置かれ得る。一実施形態では、通過はデバイスの低速遠心により達成される。いくつかの実施形態では、試料受容領域への生物学的流体の通過は吸上げ型(wicking−type)材料により達成される。複数の実施形態で、小胞捕捉デバイスはマルチウェルプレートフォーマットで構成される。
は、小胞捕捉材料は、所望に応じて、複数層の小胞捕捉材料を含んでよい。別の実施形態では、小胞捕捉材料は更にニトロセルロースを含む。いくつかの実施形態では、小胞捕捉材料は約50〜約100ナノメートルのサイズのエキソソームを捕捉する。
細胞外環境中では核酸分解の速度が速いため、従来の理解では、検出のための鋳型として使用できる前に核酸が分解されるので、多くの組織は診断標的として好適な核酸を提供できないことが示唆される。しかし、細胞外RNA(及び本明細書に開示されている他のバイオマーカー)はしばしば、1又は複数の異なる種類の膜粒子(サイズ50〜80nm)、エキソソーム(サイズ50〜100nm)、エキソソーム様小胞(サイズ20〜50nm)、及び微小胞(サイズ100〜1000nm)に結合している。他の小胞タイプ、
限定されるものではないが、例えばナノ小胞、小胞、デキソソーム(dexosome)、ブレブ(bleb)、プロスタソーム(prostasome)、微粒子、腔内小胞(intralumenal vesicle)、エンドソーム様小胞、又はエキソサイトーシスにより放出される媒体(vehicle)も捕捉され得る。本発明において、「エキソソーム」及び「小胞」という用語は、この分野でのそれぞれの通常の意味に従って使用され、原形質膜又は内膜のいずれかに由来する任意の脱落した膜結合粒子を含むとも解釈されなければならない。疑義がないように、様々な種類の小胞を記述する用語は、特に断りのない限り、小胞又はエキソソームとして一般的に言及される。エキソソームは更に、エキソソーム内腔に含まれる分子(例えば、限定されるものではないが、腫瘍由来マイクロRNA又は細胞内タンパク質)と共に腫瘍由来タンパク質に選択的に結合する宿主循環に由来する表面結合分子等の腫瘍起源の種々の膜結合タンパク質を含む任意の細胞内膜に囲まれた小胞構造の搬出により生じる又は原形質膜の一部の脱出性膨出(herniated evagination)(例えば、ブレブ形成)分離及び封止(sealing)により生じる、脂質二重層膜によって囲まれた細胞由来構造を含み得る。エキソソームは膜フラグメントも含み得る。本明細書中、循環腫瘍由来エキソソーム(CTE)とは、腫瘍細胞から循環又は体液中に脱落したエキソソームである。CTEは通常、起始細胞(cell−of−origin)特異的エキソソーム同様、高度に特異的に体液からのそれらの単離を可能にする固有のバイオマーカーを有する。本明細書に開示されている複数の実施形態により達成されるように、そのような種類の小胞のいずれかの選択的単離は、多くの疾患の診断又は予後に有用であり得るそれらのRNA(例えば、mRNA、マイクロRNA、及びsiRNA)の単離及び分析を可能にする。したがって、エキソソーム及び微小胞(EMV)は、疾患のバイオマーカーを提供することができる(例えば、限定されるものではないが、腎疾患を評価するための尿由来小胞の単離)。本明細書に開示のデバイス及び方法を用いて抽出できる標的化合物としては、タンパク質、脂質、抗体、ビタミン、ミネラル、ステロイド、ホルモン、コレステロール、アミノ酸、小胞、エキソソーム、及び核酸が含まれる。
用に用いることができる種々の異なる特異的バイオマーカーを含み得る。
、円錐形)。いくつかの実施形態では、中間領域134のテーパーは、流体試料3による出口開口部102の通過を容易化するように構成されている。いくつかの実施形態では、第1中空ボディー1は、第1中空ボディー1の隣接部分の外側表面130を超えて延びるつば105を含む。いくつかの実施形態では、つば105は、第1中空ボディー1が保存ラック又は受容容器(図示せず)に挿入された時に第1中空ボディー1を支持するように構成されている。
実施形態では、外側表面130の少なくとも一部は、内側表面240の少なくとも一部に包囲されている。いくつかの実施形態では、外側表面230の少なくとも一部は、内側表面140の少なくとも一部に包囲されている。いくつかの実施形態では、出口直径112は入口直径211より小さい。
前にそのような阻害性材料が除去されるように前処理される。例えば、高濃度のアルブミン等のタンパク質は、小胞捕捉の捕捉効率を低下させ得る。そのような場合、例えば、アルブミンへの親和性が捕捉材料4へのアルブミンの親和性より大きな化合物(例えば、Blue Trisacryl M樹脂)を含む材料又は溶液を捕捉材料4に通過させる等の種々の技術によってアルブミンが除去され得る。混入物を除去するために用いられる技術としては、加熱、酸浴、塩基性浴、超音波洗浄等も含まれ得る。
の容積より約1000倍、約500倍、約300倍、又は約100倍大きい。捕捉材料4の材料が隙間空間(interstitial space)を含む実施形態では、「捕捉材料4の容積」という語句の意味は、これらの隙間空間の容積を含むと解釈されるべきである。複数の実施形態で、溶出容積は、約5〜約500マイクロリットル、例えば約5マイクロリットル〜約10マイクロリットル、約10マイクロリットル〜約20マイクロリットル、約20マイクロリットル〜約50マイクロリットル、約50マイクロリットル〜約100マイクロリットル、約100マイクロリットル〜約150マイクロリットル、約150マイクロリットル〜約200マイクロリットル、約200マイクロリットル〜約300マイクロリットル、約300マイクロリットル〜約400マイクロリットル、約400マイクロリットル〜約500マイクロリットル、及びこれらの間の重複する範囲である。
plunger)を受容するように構成されている。いくつかの実施形態では、陰圧の印加により流体試料をデバイスに通す。例えば、いくつかの実施形態では、第2中空ボディーは、バキュームマニホールド等の真空源に可逆的に接続されるようになっており、これにより、流体試料3を捕捉デバイス100に通す陰圧を印加することができる。受容容器を用いるいくつかの実施形態では、受容容器は、捕捉デバイスに陰(又は実施形態に応じて陽)圧が印加されるように構成されており、これにより、流体試料を捕捉デバイスに通すことができる。しかし、複数の実施形態では、特別な陽又は陰圧が印加されない。例えば、複数の実施形態で、流体試料3を捕捉デバイス100に通すために遠心力が印加される。複数の実施形態では、重力流(gravitational flow)も用いられ得る。
心チューブ、バキュームマニホールド、及びマルチウェルプレートからなる群から選択されるプラスチック製部品を含む。複数の実施形態では、使用説明書も提供される。
エキソソーム捕捉の有効性に関して、生物学的試料の種々の特性の影響を評価した。4名の健康ドナーから採取した尿試料を800×gで15分間遠心し、上清を回収した。処理前に、各対象から得た4.5mLの尿上清を種々の容積の濃縮バッファー溶液と混合した。本明細書に開示されている回収デバイスで試料を処理した。簡潔に述べると、第2ボディーに接続した第1ボディーに試料を添加した。第1及び第2ボディーを50mLの円錐形遠心チューブ(受容容器)の内側に配置し、2,000×gで10分間遠心して、第2ボディー内の捕捉フィルター上にエキソソーム及び微小胞(EMV)を捕捉した。その後、第1及び第2ボディーを受容容器から取り外し、第2ボディーを第1ボディーから係合解除した。第2ボディーを、その出口部分がマルチウェルマイクロプレートのウェル中にあるように配置した。溶解バッファーで捕捉EMVを溶解(37℃、10分)した後、mRNA単離のために、ライセートをオリゴ(dT)固定化マイクロプレート(Hitachi Chemical Research Center, Inc.)に移した。ハウスキーピングmRNAを含む複数の腎臓関連遺伝子をリアルタイムRT−PCRにより定量した。プロトコールを比較するために、標準的な超遠心プロトコールを用いてエキソソームを単離した。800×g上清を100,000×gで1時間遠心し、EMVペレットを回収した。溶解バッファーでEMVを溶解した後、ライセートをオリゴ(dT)固定化マイクロプレートに移してmRNA単離及びリアルタイムRT−PCR用に処理した。
多くの一般的に用いられているプロトコール及び生物学的流体からエキソソームを単離するための超遠心を用いる。しかし、前述したように、超遠心はコストが高く(cost
intensive)なり得る。本明細書に開示されているようにエキソソーム捕捉デバイスを用いて0.1〜10mLの尿試料を処理した。尿試料を確立されている超遠心法でも処理してエキソソームを捕捉した。その後、同じmRNA単離及びPCRプロトコールを用いた。
意な低減を示している。このように、これらのデバイスを用いた遺伝子発現分析は、より高い精度を達成でき、データ変動に基づく偽陽性結果のリスクを低減することができる。
本明細書に開示のエキソソーム捕捉デバイスを用いて、2週間にわたり4回対象から採取した尿試料(12時間採取)中の遺伝子発現を評価する。図10Aはこの遺伝子発現データを示しており、特に、遺伝子発現レベル(各試験遺伝子内)が2週間の実験期間全体にわたり非常に類似している。図10Bは、3つのハウスキーピング遺伝子の経時的データを示している。これらの各遺伝子の非常に安定な遺伝子発現プロファイルが確認され、このことから、本明細書に開示のデバイスを用いてエキソソームを捕捉した場合のmRNA発現プロファイリングの精度が確認される。
書に開示されている方法は、必ずしも記載されている順番で行われなくてもよい。本明細書に開示の方法は、実施者によりとられる特定の行為を含むが、明示的であれ暗示的であれ、任意の第3者によるそれらの行為の指示も含み得る。例えば、「血液検査を行う」等の行為は、「血液検査の実施を指示する」を含む。本明細書に開示されている範囲は更に、重複、サブ範囲、及びその組合せの全てを包含する。「最大」、「少なくとも」、「超」、「より大きい」、「未満」、「間」等の言葉は、記載されている数字を含む。「約」又は「およそ」等の用語に先行される数字は記載の数字を含む。例えば、「約3mm」は「3mm」を含む。
じ部(male thread)と噛み合う第2ボディーの入口の雌ねじ部(female thread)を含む。更なる実施形態では、第2ボディーの入口は、第1ボディーの出口の雌ねじ部と噛み合う第2ボディーの入口の雄ねじ部を含む。複数の実施形態で、接続は、第2ボディーが第1ボディーの内部容積部を通らずとも、第2ボディーを連結(couple)して、その後、第1ボディーから分離(de−couple)することが可能なように構成される。
多くの一般的に用いられているプロトコールは、生物学的流体からエキソソームを単離するために超遠心を用いる。しかし、前述したように、超遠心はコストが高く(cost
intensive)なり得る。本明細書に開示されているようにエキソソーム捕捉デバイスを用いて0.1〜10mLの尿試料を処理した。尿試料を確立されている超遠心法でも処理してエキソソームを捕捉した。その後、同じmRNA単離及びPCRプロトコールを用いた。
Claims (54)
- 対象から得た生物学的流体試料から小胞を捕捉するためのシステムであって、
(i)
(a)入口、出口、及び前記入口と前記出口との間の内部容積部を含む第1ボディー;
(b)入口、出口、前記入口と前記出口との間の内部容積部、第2ボディーの前記内部容積部内に配置されたフィルター材料を有し、前記第1ボディーと流体連通する、第2ボディー
を含み、
前記第1ボディー及び前記第2ボディーが、前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との相互作用により可逆的に接続される、
小胞捕捉デバイス;
(ii)内部空洞部を有する受容容器であって、
前記受容容器の前記内部空洞部が、前記第1及び前記第2ボディーの両方を可逆的に囲むような並びに前記第1ボディーの前記内部容積部から、前記フィルター材料を通り、前記第2ボディーの前記内部空洞部を通り、前記第2ボディーの前記出口から出るように通過させた後の前記生物学的流体試料を受容するような寸法である、受容容器
を含むシステム。 - (iii)個々の第2ボディーの出口と可逆的に相互作用するように構成された1又は複数の分析ウェルを更に含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記1又は複数の分析ウェルが、標準的な6、12、48、又は96ウェルマイクロプレートを含む、請求項2に記載のシステム。
- 前記1又は複数の分析ウェルが、標準的な96ウェルマイクロプレートを含む、請求項2に記載のシステム。
- 前記第1ボディーの前記内部容積部が約2〜約10mLである、請求項1に記載のシステム
- 前記第2ボディーの前記内部容積部が約2〜約5mLである、請求項1に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との間の前記可逆的接続が摩擦接続を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との間の前記可逆的接続がルアーロック接続を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との間の前記可逆的接続が回転接続を含み、前記第2ボディーの前記出口のピンが、前記第2ボディーの前記入口の溝部と噛み合う、請求項1に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との間の前記可逆的接続がねじ接続を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口が、前記第1ボディーの前記出口の雄ねじ部と噛み合う前記第2ボディーの前記入口の雌ねじ部を含む、請求項10に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口が、前記第1ボディーの前記出口の雌ねじ部と噛み合う前記第2ボディーの前記入口の雄ねじ部を含む、請求項10に記載のシステム。
- 前記第2ボディー上の固有識別子が、患者特異的RFIDタグを含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記第2ボディー上の固有識別子が、患者特異的二次元バーコードを含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記第2ボディー上の固有識別子が、患者特異的三次元バーコードを含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記第2ボディー上の固有識別子が、前記第2ボディーの前記出口が前記マイクロプレートのウェルと連通している時に前記第2ボディーの上の位置から可視及び/又は読取り可能である、請求項1に記載のシステム。
- 前記受容容器の前記内部空洞部の容積が約50mLである、請求項1に記載のシステム。
- 前記受容容器の前記内部空洞部の容積が約100mLである、請求項1に記載のシステム。
- 前記第1ボディーが、前記第1ボディーの前記入口の周辺部から延びるリップを含み、前記リップが、前記受容容器の前記入口の周辺部の上に留まり、前記リップが、前記受容容器から前記第1及び第2ボディーを取り外すことを可能にしながら前記第1及び第2ボディーを前記受容容器が囲むことを可能にする、請求項1に記載のシステム。
- 前記第1ボディー上の前記リップが、前記受容容器の前記内部空洞部内の固定された位置に前記第1及び第2ボディーを保持する、請求項19に記載のシステム。
- 前記固定された位置が、前記第1ボディーの前記内部容積部から前記フィルター材料を通って前記受容容器の前記内部空洞部へと通過した前記生物学的流体試料に前記第2ボディーの前記出口が接触しない位置である、請求項20に記載のシステム。
- 受容容器が、前記入口、前記入口の反対側の閉じた末端、及び前記内部空洞部から本質的になる、請求項1に記載のシステム。
- 前記第1ボディーの内部から前記フィルター材料を通って前記第2ボディーの前記出口を出て前記受容容器の前記内部容積部中へと前記生物学的流体試料を通過させるために遠心が用いられる、請求項1に記載のシステム。
- 前記フィルター材料が、直径が約0.6ミクロン〜約1.5ミクロンの小胞を保持するように構成された複数層の1又は複数のガラス様材料を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記システムが、前記第1ボディーの内部から前記フィルター材料を通って前記第2ボディーの前記出口を出て前記受容容器の前記内部容積部中へと前記生物学的流体試料を通過させるために陰又は陽圧を用いない、請求項1に記載のシステム。
- 対象から得た生物学的流体試料から小胞を捕捉するためのシステムであって、
(i)
(a)入口、出口、及び前記入口と前記出口との間の内部容積部をを有する第1ボディー;
(b)入口、出口、前記入口と前記出口との間の内部容積部、第2ボディーの前記内部容積部内に配置されたフィルター材料を有し、前記第1ボディーと流体連通する、第2ボディー、
を含み、
前記第1ボディー及び前記第2ボディーが、前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との相互作用により可逆的に接続され、
前記相互作用が、前記第2ボディーの前記入口への前記第1ボディーの前記出口の挿入を含み、
前記第2ボディーが、前記第2ボディーの前記入口から前記第1ボディーの前記出口を引き抜くことにより前記第1ボディーから引き離され、
前記第2ボディーの前記出口が、6、12、48、又は96ウェルマイクロプレートのウェルの内径内に適合するような寸法であり、
前記第2ボディーが、前記対象のアイデンティティーに対応する固有識別子を含む、
小胞捕捉デバイス;及び
(ii)入口、前記入口の反対側の閉じた末端、及び内部空洞部を有する受容容器であって、
前記受容容器の前記内部空洞部が、前記第1及び前記第2ボディーの両方を可逆的に囲むような並びに前記第1ボディーの前記内部容積部から、前記フィルター材料を通り、前記第2ボディーの前記内部空洞部を通り、前記第2ボディーの前記出口から出るように通過させた後の前記生物学的流体試料を受容するような寸法である、受容容器
を含む、システム。 - 前記第1ボディーの前記内部容積部が約2〜約10mLである、請求項26に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記内部容積部が約2〜約5mLである、請求項26に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との間の可逆的接続が摩擦接続を含む、請求項26に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との間の前記可逆的接続が回転接続を含み、前記第2ボディーの前記出口のピンが、前記第2ボディーの前記入口の溝部と噛み合う、請求項26に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーと前記出口との間の可逆的接続がねじ接続を含む、請求項25に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口が、前記第1ボディーの前記出口の雄ねじ部と噛み合う前記第2ボディーの前記入口の雌ねじ部を含む、請求項31に記載のシステム。
- 前記第2ボディーの前記入口が、前記第1ボディーの前記出口の雌ねじ部と噛み合う前記第2ボディーの前記入口の雄ねじ部を含む、請求項31に記載のシステム。
- 前記第2ボディー上の前記固有識別子が、患者特異的RFIDタグを含む、請求項26
に記載のシステム。 - 前記第2ボディー上の前記固有識別子が、患者特異的二次元バーコードを含む、請求項26に記載のシステム。
- 前記第2ボディー上の前記固有識別子が、患者特異的三次元バーコードを含む、請求項26に記載のシステム。
- 前記第2ボディー上の前記固有識別子が、前記第2ボディーの前記出口が前記マイクロプレートのウェルと連通している時に前記第2ボディーの上の位置から可視及び/又は読取り可能である、請求項26に記載のシステム。
- 前記受容容器の前記内部空洞部の容積が約50mLである、請求項26に記載のシステム。
- 前記受容容器の前記内部空洞部の容積が約100mLである、請求項26に記載のシステム。
- 前記第1ボディーが、前記第1ボディーの前記入口の周辺部から延びるリップを含み、前記リップが、前記受容容器の前記入口の周辺部の上に留まり、前記リップが、前記受容容器から前記第1及び第2ボディーを取り外すことを可能にしながら前記第1及び第2ボディーを前記受容容器が囲むことを可能にする、請求項26に記載のシステム。
- 前記第1ボディー上の前記リップが、前記受容容器の前記内部空洞部内の固定された位置に前記第1及び第2ボディーを保持する、請求項40に記載のシステム。
- 前記固定された位置が、前記第1ボディーの前記内部容積部から前記フィルター材料を通って前記受容容器の前記内部空洞部へと通過した前記生物学的流体試料に前記第2ボディーの前記出口が接触しない位置である、請求項41に記載のシステム。
- 受容容器が、前記入口、前記入口の反対側の閉じた末端、及び前記内部空洞部から本質的になる、請求項26に記載のシステム。
- 前記第1ボディーの内部から前記フィルター材料を通って前記第2ボディーの前記出口を出て前記受容容器の前記内部容積部中へと前記生物学的流体試料を通過させるために遠心が用いられる、請求項43に記載のシステム。
- 前記フィルター材料が、直径が約0.6ミクロン〜約1.5ミクロンの小胞を保持するように構成された複数層の1又は複数のガラス様材料を含む、請求項26に記載のシステム。
- 生物学的流体試料から小胞を単離する方法であって、方法が、
請求項1に記載のシステムを得る工程;
前記第1ボディーの前記入口を介して前記第1ボディーの内部容積部に或る量の(a
volume of)生物学的流体試料を配置する工程であって、
前記第1ボディーが前記第2ボディーに可逆的に接続され、工程;
前記第1及び第2ボディーを前記受容容器の前記内部空洞部中に配置する工程;
前記受容容器に重力又は遠心力の1又は複数を印加することにより、前記第1ボディーの前記内部容積部から前記第2ボディーの前記フィルター材料を通って前記第2ボディーの前記出口から出て前記受容容器の前記内部空洞部中へと前記生物学的試料を通過させ
る工程;
を含み、前記フィルターが前記生物学的試料から小胞を捕捉することにより、前記生物学的流体試料から小胞が単離される、方法。 - 生物学的流体試料から目的遺伝子の発現を検出する方法であって、
請求項46に記載の方法に従って前記生物学的流体試料から小胞を単離する工程;
前記受容容器から前記第1及び第2ボディーを引き抜く工程;
前記第1及び第2ボディーを互いから引き離す工程;
前記第2ボディーの前記出口を96ウェルマイクロプレートのウェルと連通するように配置する工程;
溶出バッファーを前記第2ボディーの前記入口に導入する工程であって、前記溶出バッファーが、前記第2ボディーの前記フィルター上に捕捉された前記小胞を溶解するバッファーを含み、これにより前記小胞からRNAを放出させる工程;
前記放出されたRNAを前記フィルターから前記96ウェルマイクロプレートの対応するウェルに移す工程;並びに
(i)前記RNAを逆転写酵素と接触させて相補的DNA(cDNA)を生成する工程及び
(ii)前記cDNAを、前記目的遺伝子に特異的なセンス及びアンチセンスプライマー並びにDNAポリメラーゼと接触させて増幅DNAを生成することにより前記目的遺伝子の発現を検出する工程
を含む方法によって前記目的遺伝子の発現を検出する工程
を含む方法。 - 対象から得た生物学的流体試料から小胞を捕捉するためのシステムであって、
(i)
(a)入口、出口、及び前記入口と前記出口との間の内部容積部を有する第1ボディー;
(b)入口、出口、前記入口と前記出口との間の内部容積部、第2ボディーの前記内部容積部内に配置されたフィルター材料を有し、患者特異的RFIDタグを含む固有識別子を有し、前記第1ボディーと流体連通する、第2ボディー、
を含み
前記第1ボディー及び前記第2ボディーが、前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との相互作用により可逆的に接続される、
小胞捕捉デバイス;及び
(ii)内部空洞部を有する受容容器であって、
前記受容容器の前記内部空洞部が、前記第1及び前記第2ボディーの両方を可逆的に囲むような並びに前記第1ボディーの前記内部容積部から、前記フィルター材料を通り、前記第2ボディーの前記内部空洞部を通り、前記第2ボディーの前記出口から出るように通過させた後の前記生物学的流体試料を受容するような寸法である、受容容器、
を含むシステム。 - 対象から得た生物学的流体試料から小胞を捕捉するためのシステムであって、
(i)
(a)入口、出口、及び前記入口と前記出口との間の内部容積部を有する第1ボディー;
(b)入口、出口、前記入口と前記出口との間の内部容積部、前記第2ボディーの前記内部容積部内に配置されたフィルター材料を有し、患者特異的二次元バーコードを含む固有識別子を有し、前記第1ボディーと流体連通する、第2ボディー、
を含み
前記第1ボディー及び前記第2ボディーが、前記第2ボディーの前記入口と前記第
1ボディーの前記出口との相互作用によって可逆的に接続される、
小胞捕捉デバイス;
(ii)内部空洞部を有する受容容器であって、
前記受容容器の前記内部空洞部が、前記第1及び前記第2ボディーの両方を可逆的に囲むような並びに前記第1ボディーの前記内部容積部から、前記フィルター材料を通り、前記第2ボディーの前記内部空洞部を通り、前記第2ボディーの前記出口から出るように通過させた後の前記生物学的流体試料を受容するような寸法である、受容容器
を含むシステム。 - 対象から得た生物学的流体試料から小胞を捕捉するためのシステムであって、
(i)
(a)入口、出口、及び前記入口と前記出口との間の内部容積部を有する第1ボディー;
(b)入口、出口、前記入口と前記出口との間の内部容積部、前記第2ボディーの前記内部容積部内に配置されたフィルター材料を有し、患者特異的三次元バーコードを含む固有識別子を有し、前記第1ボディーと流体連通する、第2ボディー、
を含み、
前記第1ボディー及び前記第2ボディーが、前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との相互作用によって可逆的に接続される、
小胞捕捉デバイス;
(ii)内部空洞部を有する受容容器であって、
前記受容容器の前記内部空洞部が、前記第1及び前記第2ボディーの両方を可逆的に囲むような並びに前記第1ボディーの前記内部容積部から、前記フィルター材料を通り、前記第2ボディーの前記内部空洞部を通り、前記第2ボディーの前記出口から出るように通過させた後の前記生物学的流体試料を受容するような寸法である、受容容器
を含むシステム。 - 対象から得た生物学的流体試料から小胞を捕捉するためのシステムであって、
(i)
(a)入口、出口、及び前記入口と前記出口との間の内部容積部を有する第1ボディー;
(b)入口、出口、前記入口と前記出口との間の内部容積部、第2ボディーの前記内部容積部内に配置されたフィルター材料を有し、前記第1ボディーと流体連通する、第2ボディー、
を含み、
前記第1ボディー及び前記第2ボディーが、前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との相互作用によって可逆的に接続され、前記相互作用が、前記第1ボディーの前記出口の雄ねじ部と噛み合う前記第2ボディーの前記入口の雌ねじ部の間の相互作用を含む、
小胞捕捉デバイス
(ii)内部空洞部を有する受容容器であって、
前記受容容器の前記内部空洞部が、前記第1及び前記第2ボディーの両方を可逆的に囲むような並びに前記第1ボディーの前記内部容積部から、前記フィルター材料を通り、前記第2ボディーの前記内部空洞部を通り、前記第2ボディーの前記出口から出るように通過させた後の前記生物学的流体試料を受容するような寸法である、受容容器
を含むシステム。 - 対象から得た生物学的流体試料から小胞を捕捉するためのシステムであって、
(i)
(a)入口、出口、及び前記入口と前記出口との間の内部容積部を含む第1ボディ
ー;
(b)入口、出口、前記入口と前記出口との間の内部容積部、第2ボディーの前記内部容積部内に配置されたフィルター材料を有し、前記第1ボディーと流体連通する、第2ボディー、
を含み、
前記第1ボディー及び前記第2ボディーが、前記第2ボディーの前記入口と前記第1ボディーの前記出口との相互作用によって可逆的に接続されており、前記相互作用が、前記第1ボディーの前記出口の雌ねじ部と噛み合う前記第2ボディーの前記入口の雄ねじ部の間の相互作用を含む、
小胞捕捉デバイス;
(ii)内部空洞部を有する受容容器であって、
前記受容容器の前記内部空洞部が、前記第1及び前記第2ボディーの両方を可逆的に囲むような並びに前記第1ボディーの前記内部容積部から、前記フィルター材料を通り、前記第2ボディーの前記内部空洞部を通り、前記第2ボディーの前記出口から出るように通過させた後の前記生物学的流体試料を受容するような寸法である、受容容器
を含むシステム。 - 前記第1及び第2ボディー間の前記可逆的接続が、前記第2ボディーに前記第1ボディーの前記内部容積部を通過させることなく前記第1ボディーから前記第2ボディーを引き離せるように構成されている、請求項51〜52のいずれか一項に記載のシステム。
- 前記システムが、(iii)個々の第2ボディーの前記出口と可逆的に相互作用するように構成された1又は複数の分析ウェルを更に含む、請求項48〜53のいずれか一項に記載のシステム。
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