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JP2014509198A - 抗原結合タンパク質 - Google Patents

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Abstract

本発明は、2つのFc部分を含む抗原結合タンパク質、それらの生産のための方法、前記抗原結合タンパク質を含有する薬学的組成物、及びそれらの使用に関する。

Description

本発明は、2つのFc部分を含む抗原結合タンパク質、それらの生産のための方法、前記抗原結合タンパク質を含有する薬学的組成物、及びそれらの使用に関する。
発明の背景
この20年間の間に、単一特異的又は多重特異的のどちらか、一価又は多価のどちらかの様々な操作型抗体の誘導体が開発され、評価されてきた(例えば、Holliger,P.,et al.,Nature Biotech.23(2005)1126−1136;Fischer,N.,and Leger O.,Pathobiology 74(2007)3−14を参照)。
米国特許第2004/0033561号は、重鎖と修飾型重鎖の共発現による単価モノボディの産生とそのDNAに関する。しかし、発現の間に、かなりの量の望まれないホモダイマーが副産物として形成され、ホモダイマーとヘテロダイマーが同一又は類似の分子量を有するため、所望のヘテロダイマー性モノボディから分離することは困難である。国際公開第2007/048037号は、米国特許出願公開第2004/0033561号のヘテロダイマー性モノボディに対応するが、分離することが困難なホモダイマー性副産物からヘテロダイマーの精製を容易にするために、重鎖に結合したタグ付き部分を有し得る一価のIgGに関する。
本発明は、
a)抗原に特異的に結合する抗体の2本の修飾型重鎖であって、各重鎖のVHは前記抗体のVLにより置換され、前記修飾型重鎖はFc部分のそのCHドメインを介してお互いに会合している前記抗体の2本の修飾型重鎖;
b)前記抗体の2本の修飾型重鎖であって、各重鎖のCH1は前記抗体のCLにより置換され、前記修飾型重鎖はFc部分のそのCHドメインを介してお互いに会合している前記抗体の2本の修飾型重鎖を含み、
かつ、a)の重鎖のVLドメインはb)の重鎖のVHドメインと会合しており、かつa)の重鎖のCH1ドメインはb)の重鎖のCLドメインと会合している、抗原結合タンパク質を含む。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインは同じアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインは同じアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgGのアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgG1のアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)配列番号1のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号2のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
a)配列番号3のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号4のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;又は
a)配列番号5のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号6のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
を含むことを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の2本の修飾型重鎖、
又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらか、
は、アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾される(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる)ことを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)配列番号1のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号2のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
ここでa)の2本の修飾型重鎖、
又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらか、
は、アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾され(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる);
a)配列番号3のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号4のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
ここでa)の2本の修飾型重鎖、
又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらか、
は、アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾され(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる);
又は
a)配列番号5のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号6のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
ここでa)の2本の修飾型重鎖、
又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらか、
は、アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾される(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる)ことを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインは異なるアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインはIgG1のアイソタイプであり;
及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインはIgAのアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)配列番号7のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号4のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖を含むことを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)配列番号3のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号8のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖を含むことを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgG1のアイソタイプであり;
及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgAのアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、a)及びb)のFc部分のCH2ドメインはIgG1のアイソタイプであり、抗原結合タンパク質は、ヒトIgG1のアイソタイプのAsn297でオリゴ糖(糖類)の総量の80%以下(好ましくは65%から5%)のフコースの量でアフコシル化されていることを特徴とする。
本発明は、
a)本発明による抗原結合タンパク質をコードする核酸分子を含むベクターを持つ宿主細胞を形質転換し
b)前記抗原結合タンパク質分子の合成を許容する条件下で宿主細胞を培養し;及び
c)前記培養物から前記抗原結合タンパク質分子を回収する
工程を含む、本発明による抗原結合タンパク質の調製のための方法を含む。
本発明は、本発明による抗原結合タンパク質をコードする核酸を更に含む。
本発明は、本発明による抗原結合タンパク質をコードする核酸を含むベクターを更に含む。
本発明は前記ベクターを含む宿主細胞を更に含む。
本発明は、組成物、好ましくは本発明による抗原結合タンパク質の薬学的又は診断用の組成物を更に含む。
本発明は、本発明による抗原結合タンパク質を含む薬学的組成物を更に含む。
本発明は、本発明による抗原結合タンパク質の治療的有効量を患者に投与することにより特徴付けられる、治療法を必要としている患者の治療のための方法を更に含む。
今や本発明による抗原結合タンパク質は、生物学的又は薬学的活性(例えば親抗体に比較して増強したADCC)など価値ある特徴を有することが見いだされている。それらは例えば癌などの疾患の治療のために使用することができる。本発明による抗原結合タンパク質は、更にその上高く価値ある薬物動態特性(例えばAUC0−inf,CmaxまたはC0など)を有する。
A)CH1−CL交差を持つ、本発明による抗原結合タンパク質の模式的な構造(MoAbダイマーと略)。B)主要副産物の模式図−CH1−CL交差を持つ一価抗体モノマー(MoAb)(MoAbと略)。 C)2本の修飾型重鎖aとbの会合:2本の異なる鎖(aとb)のヘテロ二量体化は、直接一価の抗体Bをもたらす(経路2)。2本の同じ鎖(aとa及びbとb)のホモ二量体化は、会合して「MoAb−二量体」Aを形成することができる予想中間体aa及びbbをもたらす。CH3−CH3の接触の修飾は、生成物A(MoAb−二量体)とB(MoAb)の分布に影響を与えうる。ヘテロニ量体化に有利にはたらく修飾(例えばknobs into holes)は、経路2を介して化合物Bの相対量を増加させるであろうが、同一鎖間の誘引性相互作用を維持するが異なる鎖の反発をもたらす修飾(例えば異なるアイソタイプから取られたaとbのCH3ドメイン)は、経路1を支持し、よってAの量を増加させるであろう。白:軽鎖ドメイン。破線:重鎖ドメイン。 MoAb−二量体 c−Met(5D5 MoAb−二量体(「CH3−wt」))の生化学的特徴付け(CH3−wtは、未変化の野生型CH3ドメインを指す)。(A)プロテインAで精製した抗体はスーパーデックス(Superdex)200 26/60カラムで分離された。(B)ピーク画分(1、2、3)はプールされ、非還元条件下及び還元条件下でSDS−PAGEに供された。ポリアクリルアミドゲルはクマシーブルー色素で染色した。個々のピークは、MoAb(3),MoAb−二量体(2)及び高分子量の凝集体(1)に対応する。 MoAb−二量体 IGF−1R(IGF−1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」))の生化学的特徴付け(CH3−wtは、未変化の野生型CH3ドメインを指す)。(A)プロテインAで精製した抗体はスーパーデックス(Superdex)200 26/60カラムで分離された。(B)ピーク画分(1、2)はプールされ、非還元条件下及び還元条件下でSDS−PAGEに供された。ポリアクリルアミドゲルはクマシーブルー色素で染色した。個々のピークは、MoAb(2)及びMoAb−二量体(1)に対応する。C)ピーク画分1,2の分子量は、SEC−MALLSによって調べられた。 Her3 205 MoAb−二量体(「CH3wt」)の生化学的特徴付け(CH3−wtは、未変化の野生型CH3ドメインを指す)。(A)プロテインAで精製した抗体はスーパーデックス(Superdex)200 26/60カラムで分離された。(B)ピーク画分(1、2)はプールされ、非還元条件下及び還元条件下でSDS−PAGEに供された。ポリアクリルアミドゲルはクマシーブルー色素で染色した。個々のピークは、MoAb(3),MoAb−二量体(2)及び高分子量の凝集体(1)に対応する。 IGF−1R結合親和性を分析するために適用された表面プラズモン共鳴アッセイの模式絵。抗ヒトIgG抗体(JIR109−005−098)をCM5バイオセンサーチップの表面に固定し、その後MoAb又はMoAbダイマー抗体を捕捉した。組換えIGF−1Rエクトドメインのさらなる注入で、MoAb分子及びMoAb−二量体分子中の抗原結合部位の機能を確認した。 フローサイトメトリー解析による、MoAb−二量体(IGF−1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)(B)及び親抗体Mab IGF−1R(A)のA549細胞に対する細胞性結合。A549細胞を標識した抗体の希釈系列と共にインキュベートした。結合した抗体はFc−結合二次フルオロフォア結合抗体を用いて可視化した。 IGF1R Mabの非糖鎖操作型(non−ge)及び糖鎖操作型(ge)、及び非糖鎖操作型IGF−1R MoAb−二量体(IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」))によるADCCアッセイ。ドナー由来の末梢血単核細胞(PBMC)を、非糖鎖操作型(non−ge)IGF1R Mab(1),糖鎖操作型(ge)IGF1R Mab(2)及び非糖鎖操作型(non−ge)IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)(3)の存在下で、前立腺癌細胞(DU145)と共にインキュベートした。 IGF−1Rの内部移行は、IGF−1R IgG1(Mab IGF−1R)抗体及びIGF−1R MoAb−二量体(IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」))とのインキュベーション後に、HT29細胞で評価された。グラフは、ELISAに基づくアッセイ手順で測定した、抗体露光時の総IGF−1Rレベルを示す。 IGF−1Rの自己リン酸化を、10nMのIGF−1の存在下で、IGF−1R IgG1抗体とIGF−1R MoAb−二量体(IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」))と共に3T3−IGF−1R細胞をインキュベートした後で評価した。グラフは、ELISAに基づくアッセイ手順で測定した、抗体露光時のリン酸化IGF−1Rレベルを示す。 得られたMoAb−二量体(=本発明による抗原結合タンパク質)対MoAb−単量体(=一価の副産物)のHPLCにより測定された比率の解析。野生型CH3(CH3−wt)ドメインと修飾型CH3ドメインを持つ異なる抗体が一過性に発現され、二量体対単量体の比率が決定された。 非還元条件下で脱グリコシル化後のIGF−1RのMoAb二量体(SEC分画1)のESI−MSスペクトル 脱グリコシル化及び還元後のIGF−1RのMoAb二量体(SEC分画1)のESI−MSスペクトル発明の詳細な記載
本発明は、
a)抗原に特異的に結合する抗体の2本の修飾型重鎖であって、各重鎖のVHは前記抗体のVLにより置換され、前記修飾型重鎖はFc部分のそのCHドメインを介してお互いに会合している前記抗体の2本の修飾型重鎖;
b)前記抗体の2本の修飾型重鎖であって、各重鎖のCH1は前記抗体のCLにより置換され、前記修飾型重鎖はFc部分のそのCHドメインを介してお互いに会合している前記抗体の2本の修飾型重鎖を含み、
かつ、a)の重鎖のVLドメインはb)の重鎖のVHドメインと会合しており、かつa)の重鎖のCH1ドメインはb)の重鎖のCLドメインと会合している、抗原結合タンパク質を含む。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインは同じアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインは同じアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgGのアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgG1のアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)配列番号1のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号2のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
a)配列番号3のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号4のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;又は
a)配列番号5のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号6のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
を含むことを特徴とする。
本発明による抗原結合タンパク質の収率を向上させるために(つまり、MoAb単量体に対するMoAb二量体の比率を向上させるために(実施例9を参照))、a)のIgG1のCH3ドメインは、a)のIgG1のCH3ドメインとb)の天然の(wt)IgG1のCH3ドメインが異なるように、変異により更に修飾されることが可能である。修飾/変異は、同一鎖間の誘引性相互作用を維持するが異なる鎖の反発をもたらすような方式で行われなければならない(図1Cを参照)。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の2本の修飾型重鎖、
又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらかは、
アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾される(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる)ことを特徴とする。
KabatのEU番号付けシステムは、Kabat,et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)に記載されている。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)配列番号1のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号2のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
ここでa)の2本の修飾型重鎖、
又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらかは、
アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾され(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる);
a)配列番号3のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号4のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
ここでa)の2本の修飾型重鎖、
又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらかは、
アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾され(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる);
又は
a)配列番号5のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号6のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
ここでa)の2本の修飾型重鎖、
又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらかは、
アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾される(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる)ことを特徴とする。
本発明による抗原結合タンパク質の収量を改善するため別の可能性として(すなわち、MoAb単量体に対するMoAb二量体の比率を向上させるために(実施例9を参照)))、a)とb)のCH3ドメインが異なるアイソタイプから取られた。従って、同一鎖間の誘引性相互作用は維持されるが、異なる鎖は反発される。
従って、一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインは異なるアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインはIgGのアイソタイプであり;
及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインはIgAのアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)配列番号7のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号4のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖を特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)配列番号3のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
b)配列番号8のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖を含むことを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、
a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgG1のアイソタイプであり;
及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgA1のアイソタイプであることを特徴とする。
一実施態様において、本発明による抗原結合タンパク質は、a)及びb)のFc部分のCH2ドメインはIgG1のアイソタイプであり、抗原結合タンパク質は、ヒトIgG1のアイソタイプのAsn297でオリゴ糖(糖)の総量の80%以下のフコースの量でアフコシル化されていることを特徴とする。
本明細書で使用される用語「抗体」は、2本の抗体重鎖と2本の抗体軽鎖からなる全長抗体を意味する(図1を参照)。全長抗体の重鎖は、N末端からC末端の方向に、抗体の重鎖可変ドメイン(VH)、抗体の定常重鎖ドメイン1(CH1)、抗体のヒンジ領域(HR)、抗体の重鎖定常ドメイン2(CH2)、及び抗体の重鎖定常ドメイン3(CH3)からなるポリペプチドで、VH−CH1−HR−CH2−CH3と略記され;及びクラスIgEの抗体の場合において任意で抗体の重鎖定常ドメイン4(CH4)を含む。好ましくは、全長抗体の重鎖は、N−末端からC−末端方向にVH、CH1、HR、CH2及びCH3からなるポリペプチドである。全長抗体の軽鎖は、N−末端からC−末端方向に、抗体の軽鎖可変ドメイン(VL)、及び抗体の軽鎖定常ドメイン(CL)からなるポリペプチドであり、VL−CLと略記する。抗体の軽鎖定常ドメイン(CL)は、κ(カッパ)またはλ(ラムダ)とすることができる。抗体鎖は、CLドメインとCH1ドメイン間(すなわち、軽鎖および重鎖の間)のポリペプチド間及び完全長抗体の重鎖のヒンジ領域の間のジスルフィド結合を介して一緒に連結されている。典型的な全長抗体の例は、IgG(例えばIgG1及びIgG2),IgM,IgA,IgD,及びIgEなどの天然抗体である。本発明による抗体は、単一種、例えばヒト由来であり得、又はそれらはキメラ化抗体或いはヒト化抗体であり得る。本発明による抗体は、各々がVHとVLの対により形成される2つの抗原結合部位を含み、その両方が同一の(第一の)抗原に特異的に結合する。
これらの全長抗体から、本発明の抗原結合タンパク質は、
a)抗原に特異的に結合する抗体の2本の重鎖を、各重鎖のVHドメインを前記抗体のVLドメインにより置換することにより修飾し;
b)前記抗体の2本の重鎖を、各重鎖のCH1ドメインを前記抗体のCLドメインにより置換することにより修飾することにより得られる。
抗体又は抗原結合タンパク質の「Fc部分」は、抗原に対する抗体の結合に直接関与していないが、a)(修飾型)抗体鎖のお互いの(例えばそれらのCH3ドメインを介した)会合、及びb)様々なエフェクター機能を担っている。「抗体のFc部分」は当業者に良く知られており、抗体のパパイン切断に基づいて定義される。重鎖の定常領域のアミノ酸配列に応じて、抗体又は免疫グロブリンは、クラス:IgA,IgD,IgE,IgG及びIgM,に分けられ、これらの幾つかはサブクラス(アイソタイプ)、例えばIgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4、IGA1、及びIgA2に更に分けられる。重鎖の定常領域に従って、免疫グロブリンの異なるクラスは、それぞれα、δ、ε、γ及びμと呼ばれる。
5つのタイプの哺乳類の抗体重鎖があり、ギリシャ文字によりα、δ、ε、γ及びμと表わされる(Janeway,C.A.,Jr.et al.,Immunobiology,第5版,Garland出版(2001))。存在する重鎖のタイプは抗体のクラスを定義し;これらの鎖は、それぞれIgA、IgD、IgE、IgG及びIgM抗体に見いだされる(Rhoades,R.A.,and Pflanzer,R.G.,Human Physiology,第4版,Thomson Learning(2002))。異なる重鎖は、大きさと組成が異なり;αとγは約450個のアミノ酸を含むが、一方μとεは約550個のアミノ酸を有している。
各重鎖は、2つの領域、定常領域及び可変領域を有する。定常領域は、同じアイソタイプの全ての抗体では同一であるが、異なるアイソタイプの抗体では異なっている。重鎖γ、α、δは、3つの定常ドメインCH1、CH2、及びCH3(一列で)から成る定常領域、及び柔軟性を追加するためのヒンジ領域を有しており(Woof,J.,and Burton,D.,Nat.Rev.Immunol.4(2004)89−99);重鎖μとεは4つの定常ドメインCH1、CH2、CH3、及びCH4から成る定常領域を有している(Janeway,C.A.,Jr.et al.,Immunobiology.,第5版,Garland出版(2001))。重鎖の可変領域は異なるB細胞により産生される抗体においては異なるが、単一のB細胞又はB細胞クローンによって産生された全ての抗体については同じである。各重鎖の可変領域は、約110アミノ酸長であり、単一の抗体ドメインからなる。
「Fc部分のCHドメイン」は、抗体の重鎖定常ドメイン2(CH2)、及び抗体の重鎖定常ドメイン3(CH3)、及びクラスIgEの抗体の場合において任意で抗体の重鎖定常ドメイン4(CH4)である。
用語「前記修飾型重鎖はFc部分のそのCHドメインを介してお互いに会合している」とは、例えば鎖間イオン性相互作用、ファンデルワールス相互作用、または水素結合を介した、2本の修飾型重鎖の互いの抗体重鎖定常ドメイン(CH)、例えば両方の鎖の互いの2つのCH3ドメインの鎖間ドメイン対形成を言う。一実施態様において、前記修飾型重鎖は、Fc部分の少なくともそのCH3ドメインを介して(そして任意で(存在する場合には)そのCH2ドメインとCH4ドメインを介して)互いに会合する。
用語「a)の重鎖のVLドメインはb)の重鎖のVHドメインと会合しており、かつa)の重鎖のCH1ドメインはb)の重鎖のCLドメインと会合している」は、例えば天然抗体(VL/VH及びCH1/CL)において見いだされるように、例えば鎖間イオン性相互作用、ファンデルワールス相互作用、または水素結合を介した、前記抗体ドメインのドメイン対形成(常にa)の一つ及びb)の一つ)を言う。(図1Aを参照)。
本発明による「抗原結合タンパク質」は、2つの抗原結合部位を含み、二価である。本明細書で使用される用語「結合部位」又は「抗原結合部位」は、リガンド(例えば抗原又はその抗原断片)が実際に結合し、抗体分子又はその断片(例えばFab断片)に由来する、本発明に係る抗原結合タンパク質の領域を意味する。本発明による抗原結合部位は、抗体の重鎖可変ドメイン(VH)、及び抗体の軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。
所望の抗原に特異的に結合する抗原結合部位(すなわちVH/VLの対合)は、a)抗原に対する既知の抗体から由来するか又はとりわけ抗原タンパク質又はその核酸又はその断片を用いたデノボ免疫法により、又はファージディスプレイにより得られた新規抗体又は抗体断片に由来することが可能である。
本発明の抗原結合タンパク質の抗原結合部位は、抗原に対する結合部位の親和性に対して様々な程度で関与する6つの相補性決定領域(CDR)領域を含む。3つの重鎖可変ドメインのCDR(CDRH1、CDRH2及びCDRH3)と3つの軽鎖可変ドメインのCDR(CDRL1、CDRL2及びCDRL3)がある。CDR及びフレームワーク領域(FR)の程度は、それらの領域がアミノ酸配列間のばらつきに応じて定義されているアミノ酸配列のコンパイルされたデータベースと比較することによって決定される。
抗体の特異性は、抗原の特定のエピトープに対する抗体の選択的認識を指す。天然の抗体は、例えば、単一特異性である。二重特異性抗体は、2つの異なる抗原結合特異性を有する抗体である。本発明による抗原結合タンパク質は、少なくとも単一特異性であり、具体的にはそれぞれの抗原のエピトープに結合する。
現在の明細書内で使用される用語「価」は、抗体分子において指定された数の結合部位の存在を意味する。天然の抗体は、例えば2つの結合部位を有し2価である。また、本発明による抗原結合タンパク質は少なくとも二価である。
本明細書で使用される用語「モノクローナル抗体」又は「モノクローナル抗体組成物」は、単一アミノ酸組成物の抗体分子の調製物を意味する。
用語「キメラ抗体」は、通常は組換えDNA技術によって調製される、一つの起源又は種に由来する可変領域、即ち結合領域、及び異なる起源又は種に由来する少なくとも定常領域を含む抗体を指す。マウス可変領域及びヒト定常領域を含むキメラ抗体が好ましい。本発明に包含される「キメラ抗体」の他の好ましい形態は、特にC1qの結合及び/又はFc受容体(FcR)の結合に関して、本発明に係る特性を生成するために、定常領域が元の抗体のものから修飾または変更されたものである。そのような「キメラ」抗体はまた「クラススイッチ抗体」と称される。キメラ抗体は、免疫グロブリン可変領域をコードするDNAセグメント及び免疫グロブリン定常領域をコードするDNAセグメントを含む、発現された免疫グロブリン遺伝子の生成物である。キメラ抗体を生産するための方法は、今は当該技術分野においてよく知られている一般的な組換えDNA及び遺伝子トランスフェクション技術を含む。(例えば、Morrison,S.L.等,Proc.Natl.Acad Sci.USA 81(1984)6851−6855;米国特許第5202238号及び第5204244号を参照のこと)。
用語「ヒト化抗体」は、フレームワーク又は「相補性決定領域」(CDR)が、親免疫グロブリンのものと比較して、異なる特異性の免疫グロブリンのCDRを含むように修飾された抗体を意味する。好ましい実施態様では、マウスCDRが、「ヒト化抗体」を調製するためのヒト抗体のフレームワーク領域に移植される。例えば、Riechmann,L.,et al.,Nature 332(1988)323−327;及びNeuberger,M.S.,et al.,Nature 314(1985)268−270を参照。特に好ましいCDRは、キメラ抗体について上記のように抗原を認識する配列を表すものに対応する。本発明に包含される「ヒト化抗体」の別の形態は、特にC1qの結合及び/又はFc受容体(FcR)の結合に関して、本発明に係る特性を生成するために、定常領域が元の抗体のものから更に修飾または変更されたものである。
本明細書で使用される用語「ヒト抗体」は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列から由来する可変及び定常領域を有する抗体を含むことを意図している。ヒト抗体は従来技術でよく知られている(van Dijk,M.A.及びvan de Winkel,J.G.,Curr.Opin.Chem.Biol.5(2001)368−374)。またヒト抗体は、免疫時に、内在性免疫グロブリン産生の欠損下において、ヒト抗体の選択、又は全レパートリーを生成可能なトランスジェニック動物(例えばマウス)で産生可能である。このような生殖系列変異マウスにおける、ヒト生殖系列免疫グロブリン遺伝子アレイの移動により、抗原曝露でヒト抗体が産生される(例えば、Jakobovits,A.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90(1993)2551−2555;Jakobovits,A.,et al.,Nature 362(1993)255−258;Bruggemann,M.,et al.,Year Immunol.7(1993)33−40を参照)。ヒト抗体は、ファージディスプレイライブラリーで産生することができる(Hoogenboom,H.R.,and Winter,G.,J.Mol.Biol.227(1992)381−388;Marks,J.D.,et al.,J.Mol.Biol.222(1991)581−597)。ヒトモノクローナル抗体の調製について、ColeらとBoernerらの技術も利用可能である(Cole,et al.,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,p.77(1985);及びBoerner,P.,et al.,J.Immunol.147(1991)86−95)。本発明に係るキメラ及びヒト化抗体について既に述べたように、本発明で使用される「ヒト化抗体」はまた、とりわけC1q結合及び/又はFcR結合に関して、例えば「クラススイッチ」即ちFc部分の変化又は変異(例えばIgG1からIgG4および/またはIgG1/IgG4変異)によって、本発明に係る特性を生み出すために、定常領域で修飾された抗体を含む。
本発明で使用される場合、用語「組換えヒト抗体」は、宿主細胞に形質移入された組換え発現ベクターを使用して発現したヒト免疫グロブリン遺伝子又は抗体用にトランスジェニックである動物(例えばマウス)から、又はNS0又はCHO細胞等の宿主細胞から単離された抗体等、組換え手段により調製、発現、生成又は単離された全てのヒト抗体を含むことを意図している。このような組換えヒト抗体は、再配列された形態で、可変及び定常領域を有する。本発明の組換えヒト抗体は、インビボ体細胞突然変異を受ける。よって、組換え抗体のVH及びVL領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖系列VH及びVL配列から誘導され、関連しているが、インビボでヒト抗体生殖系列レパートリー内に天然に存在しないであろう配列である。
本明細書で使用される「可変ドメイン」(軽鎖の可変ドメイン(VL)、重鎖の可変ドメイン(VH))は、抗体を抗原に結合させることに直接関与する軽鎖及び重鎖の対のそれぞれを示す。可変軽鎖及び重鎖のドメインは、同じ一般構造を有し、各ドメインは、配列が広く保存され、3個の「高頻度可変領域」(又は相補性決定領域、CDR)によって連結される、4個のフレームワーク(FR)領域を含む。フレームワーク領域は、βシートコンフォメーションをとり、CDRは、βシート構造を連結するループを形成しうる。各鎖のCDRは、フレームワーク領域によって三次元構造に保持され、もう一方の鎖由来のCDRと共に抗原結合部位を形成する。抗体の重鎖及び軽鎖CDR3領域は、本発明に係る抗体の結合特異性/親和性に特に重要な役割を果たし、よって本発明の更なる目的を提供する。
用語「超可変領域」又は「抗体の抗原−結合部分」とは、本明細書において使用される場合、抗原結合に関与する抗体のアミノ酸残基を指す。超可変領域は「相補性決定領域」又は「CDR」からのアミノ酸残基を含んでなる。「フレームワーク」又は「FR」領域は、本明細書において定義されるように超可変領域残基以外のそれらの可変ドメイン領域である。従って、抗体の軽鎖及び重鎖は、N末端からC末端に向かって、ドメインFR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3及びFR4を含んでなる。各々の鎖上のCDRはそのようなフレームワークアミノ酸により分離される。特に、重鎖のCDR3は、ほとんど抗原結合に寄与する領域である。CDR及びFR領域は、Kabat,et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)の標準的な定義に従って決定される。
本明細書において使用される場合、用語「結合」又は「特異的に結合」とは、インビトロにおけるアッセイ、好ましくは精製した野生型抗原を用いたプラズモン共鳴アッセイ(BIAcore、GE−Healthcare Uppsala,Sweden)における抗体のエピトープへの抗原結合タンパク質の結合を指す。結合の親和性は、用語ka(抗体/抗原複合体からの抗体結合に関する速度定数)、k(解離定数)、及びK(k/ka)によって定義される。結合又は特異的に結合は、10−8mol/l以下(例えば10−Mから10−13mol/l)、好ましくは10−9Mから10−13mol/lの結合親和性(K)を意味する。従って、本発明による抗原タンパク質は、10−8mol/l以下(例えば10−Mから10−13mol/l)、好ましくは10−9Mから10−13mol/lの結合親和性(K)で、特異的である各抗原に対して特異的に結合している。
FcγRIIIへの抗体の結合は、BIAcoreアッセイ(GE−Healthcare Uppsala,Sweden)により探索され得る。結合の親和性は、用語ka(抗体/抗原複合体からの抗体結合に関する速度定数)、k(解離定数)、及びK(k/ka)によって定義される。
用語「エピトープ」とは、抗原結合タンパク質に対して特異的に結合できるいずれかのポリペプチド決定基を包含する。ある実施態様においては、エピトープ決定基は、分子、例えばアミノ酸、糖側鎖、ホスホリン又はスルホニルなどの化学的活性表面群を包含し、そしてある実施態様においては、特定の三次元構造特性及び/又は比電荷特性を有することができる。エピトープは、抗原結合タンパク質により結合される抗原の領域である。
ある実施態様においては、抗体は、それがタンパク質及び/又は高分子の複合混合物中でその標的抗原を選択的に認識する場合、抗原を特異的に結合すると言われる。
用語「定常領域」は、本明細書中で使用される場合、可変領域以外の抗体のドメインの和を意味する。定常領域は、抗原の結合に直接的にかかわらないが、様々なエフェクター機能を示す。それらの重鎖の定常領域のアミノ酸配列に依存して、抗体は以下のクラス:IgA、IgD、IgE、IgG及びIgMに分類され、そしてそのいくつか、例えばIgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4、IgA1及びIgA2などは、サブクラスに更に分類されることもできる。異なった抗体クラスに対応する重鎖定常領域は、それぞれα、δ、ε、γ、及びμと呼ばれる。全部で5つの抗体クラスで見ることができる軽鎖定常領域(CL)は、κ(カッパ)及びλ(ラムダ)と呼ばれる。
用語「ヒト起源由来の定常領域」は、本願で使用される場合、アイソタイプIgG1,IgG2,IgG3,又はIgG4のヒト抗体の定常重鎖領域及び/又は定常軽鎖カッパ又はラムダ領域を意味する。そのような定常領域は、当技術分野の現状において周知であり、例えば、Kabat,E.A.によって説明されている(例えばJohnson,G.and Wu,T.T.,Nucleic Acids Res.28(2000)214−218;Kabat,E.A.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 72(1975)2785−2788を参照のこと)。
用語「補体依存性細胞傷害性(CDC)」は、ほとんどのIgG抗体サブクラスのFc領域への補体因子C1qの結合により開始されるプロセスを示す。抗体へのC1qの結合は、いわゆる結合部位での、明確なタンパク質−タンパク質相互作用によって生じる。このようなFc部分の結合部位は最先端の技術で知られている(上記参照)。このようなFc部分の結合部位は、例えば、アミノ酸L234,L235,D270,N297,E318,K320,K322,P331,及びP329により特徴付けられている(Kabat,E.AのEU指標に従い番号付け)。通常、サブクラスIgG1、IgG2及びIgG3の抗体は、C1q及びC3結合を含む補体活性を示すが、IgG4は補体系を活性化させず、C1q及び/又はC3に結合しない。
IgG4サブクラスの抗体はFc受容体(FcγRIIIa)結合の減少を示すが、別のIgGサブクラスの抗体は強い結合を示す。しかしながら、Pro238,Asp265,Asp270,Asn297(Fc糖鎖の喪失)、Pro329,Leu234,Leu235,Gly236,Gly237,Ile253,Ser254,Lys288,Thr307,Gln311,Asn434,及びHis435は、変更される場合には、Fc受容体結合の減少も与える残基である(Shields,R.L.,et al.,J. Biol.Chem.276(2001)6591−6604;Lund,J.,et al.,FASEB J.9(1995)115−119;Morgan,A.,et al.,Immunology 86(1995)319−324;欧州特許第0307434号)。
一実施態様では、本発明の抗体は、IgG1抗体に比較してFcR結合が減少しており、その全長親抗体は、S228、L234、L235、および/またはD265に変異を有するIgG1又はIgG2サブクラス又はIgG4サブクラスのFcR結合に関連し、及び/又はPVA236変異を含む。一実施態様において、全長親抗体の変異は、S228P,L234A,L235A,L235E及び/又はPVA236である。別の実施態様において、全長親抗体の変異は、IgG4のS228PとL235E及びIgG1のL234AとL235Aにある。
抗体の定常領域は、ADCC(抗体依存性細胞媒介性細胞傷害)及びCDC(補体依存性細胞傷害)に直接関与している。補体活性(CDC)は、ほとんどのIgG抗体サブクラスの定常領域に対する補体因子C1qの結合により開始される。抗体へのC1qの結合は、いわゆる結合部位での、明確なタンパク質−タンパク質相互作用によって生じる。このような定常領域結合部位は、当技術分野において公知であり、例えばLukas,T.J.,et al.,J.Immunol.127(1981)2555−2560;Bunkhouse,R.and Cobra,J.J.,Mol.Immunol.16(1979)907−917;Burton,D.R.,et al.,Nature 288(1980)338−344;Thomason,J.E.,et al.,Mol.Immunol.37(2000)995−1004;Idiocies,E.E.,et al.,J.Immunol.164(2000)4178−4184;Hearer,M.,et al.,J.Virol.75(2001)12161−12168;Morgan,A.,et al.,Immunology 86(1995)319−324;及び欧州特許第0307434合により記載される。このような結合部位は、例えば、L234、L235、D270、N297、E318、K320、K322、P331及びP329である(Kabat,et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)に記載されるKabatのEU指標に従い番号付け)。
用語「抗体依存性細胞傷害性性(ADCC)」は、エフェクター細胞の存在下、本発明の抗体によるヒト標的細胞の溶解を意味する。ADCCは、エフェクター細胞の存在下、例えば新鮮に単離されたPBMC又はバフィーコートからの精製エフェクター細胞、例えば単球又はナチュラルキラー(NK)細胞又は永続的に増殖するNK細胞株の存在下で本発明の抗体で抗原発現細胞の調製物を処理することにより好ましくは測定される。
驚くべきことに、本発明に係る抗原結合タンパク質は、その親完全抗体に比較して、特により高い抗体濃度の領域でADCCの特性の増強を示すことが見いだされている。これらの改善されたADCC効果は、糖鎖工学のようなFc部分の更なる修飾無しで達成される。
従って、一実施態様において、本発明に係る抗原結合タンパク質は、その親完全抗体と比較してADCCが増強されている(実施例4で説明されるように測定)。
哺乳類では、ラムダ(λ)とカッパ(κ)と呼ばれる軽鎖の2種類のみが存在する。軽鎖は2つの連続したドメインを有する:一つの定常ドメインCL及び一つの可変ドメインVL。軽鎖のおおよその長さは211から217アミノ酸である。好ましくは、軽鎖はカッパ(κ)軽鎖であり、定常ドメインCLは好ましくはカッパ(κ)軽鎖(定常ドメインCκ)から由来する。
モノクローナル抗体の細胞媒介性エフェクター機能は、Umana,P.,et al.,Nature Biotechnol.17(1999)176−180、及び米国特許第6,602,684号に記載されるように、例えば、それらのオリゴ糖成分を操作によって更に強化することができる。IgG1型抗体は、最も一般的に使用される治療用抗体であり、各CH2ドメインのAsn297で、保存されたN−結合型糖鎖付加部位を持つ糖タンパク質である。Asn297に付着した2つの複雑な二分岐オリゴ糖は、CH2ドメインの間に埋葬され、ポリペプチド骨格との広範な接触を形成し、そしてそれらの存在は、例えば抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)などのエフェクター機能を媒介するために抗体にとって必須である(Lifely,M.,R.,et al.,Glycobiology 5(1995)813−822;Jefferis,R.,et al.,Immunol.Rev.163(1998)59−76;Wright,A.,and Morrison,S.,L.,Trends Biotechnol.15(1997)26−32)。Umana,P.,et al.Nature Biotechnol.17(1999)176−180及び国際公開第99/54342号は、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞において、二分オリゴ糖の形成を触媒するグリコシルトランスフェラーゼであるβ(1,4)−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(「GNTIII」)の過剰発現が、抗体のインビトロADCC活性を有意に増加させることを示した。Asn297の糖鎖の変化またはその除去は、FcγRととC1qの結合にも影響を及ぼす(Umana,P.,et al.,Nature Biotechnol.17(1999)176−180;Davies,J.,et al.,Biotechnol.Bioeng.74(2001)288−294;Mimura,Y.,etal.,J.Biol.Chem.276(2001)45539−45547;Radaev,S.,et al.,J.Biol.Chem.276(2001)16478−16483;Shields,R.,L.,et al.,J.Biol.Chem.276(2001)6591−6604;Shields,R.,L.,et al.,J.Biol.Chem.277(2002)26733−26740;Simmons,L.,C.,et al.,J.Immunol.Methods263(2002)133−147)。
本発明の一実施態様では、本発明による抗原結合タンパク質は、a)とb)のFc部分のCH2ドメインはIgG1のアイソタイプであり、抗原タンパク質は、Asn297で、オリゴ糖(糖類)の総量の80%以下のフコースの量でアフコシル化されていることを特徴とする。
一実施態様において、抗原タンパク質は、Asn297で、オリゴ糖(糖類)の総量の65%から5%のフコースの量でアフコシル化されている。
用語「アフコシル化抗原タンパク質」は、Asn297でのフコース残基のレベルが減少し、Fc領域でグリコシル化のパターンが変化した、IgG1又はIgG3のアイソタイプ(好ましくは、IgG1のアイソタイプ)の抗原結合タンパク質を指す。ヒトIgG1又はIgG3のグリコシル化は、コアフコシル化された二分岐複合オリゴ糖のグリコシル化が最大2つのGal残基で終結している場合、Asn297で生じる。これらの構造は、末端Gal残基の量に応じて、G0、G1(α1,6又はα1,3)、又はG2グリカン残基と命名される(Raju,T.S.,Bioprocess Int.1(2003)44−53)。抗体のFc部分のCHO型グリコシル化は、例えば、Routier,F.H.,Glycoconjugate J.14(1997)201−207により記載されている。非糖修飾されたCHO宿主細胞で組換え的に発現している抗体は、通常、少なくとも85%の量で、Asn297でフコシル化されている。本明細書で使用される場合、用語「抗原タンパク質」は、そのグリコシル化パターンでフコースを持たない抗原タンパク質を含む。抗体における典型的なグリコシル化残基の位置は、EU番号付けシステムに従って位置297のアスパラギンであることが一般に知られている(「Asn297」)。
従って、本発明によるアフコシル化抗原結合タンパク質は、IgG1又はIgG3のアイソタイプの(好ましくはIgG1のアイソタイプの)抗原結合部分を意味し、ここでAsn297でのフコースの量はオリゴ糖(糖類)の総量の80%以下(例えば80%から1%)である(Fc領域のオリゴ糖(糖類)の少なくとも20%以上がAsn297でアフコシル化されていることを意味する)。一実施態様において、フコースの量は、Asn297でFc領域のオリゴ糖の65%以下であり(例えば65%から1%)、一実施態様では65%から5%であり、一実施態様では40%から20%である。本発明によれば、「フコースの量」は、MALDI−TOF質量分析により測定され平均値として計算される(フコースの量を決定する詳細な手順については、例えば国際公開第2008/077546号を参照)、Asn297に結合した全オリゴ糖(例えば複合体、ハイブリッド及び高マンノース構造)の総和に関連した、オリゴ糖(糖類)鎖内のAsn297での前記オリゴ糖(フコース)の量を意味する。更に、一実施態様では、Fc領域のオリゴ糖が二分されている。本発明によるアフコシル化抗原結合タンパク質は、Fc領域でオリゴ糖を部分的にフコシル化するのに十分な量で、GnTIII活性を有するポリペプチドをコードする少なくとも一の核酸を発現するために、糖修飾型宿主細胞で発現することができる。一実施態様において、GnTIII活性を有するポリペプチドは融合ポリペプチドである。あるいは、宿主細胞のα1、6−フコシルトランスフェラーゼ活性を、糖鎖修飾型宿主細胞を生成するために、米国特許第6946292号に従って減少させるか又は排除することができる。抗原結合タンパク質のフコシル化の量は、例えば、発酵条件(例えば発酵時間)によって又はフコシル化した量が異なる少なくとも二つの抗原結合タンパク質の組み合わせによっての何れかにより、予め決定することができる。アフコシル化抗原結合タンパク質を産生するためのそうした方法は、国際公開第2005/044859,国際公開第2004/065540号,国際公開第2007/031875号,Umana,P.,et al.,Nature Biotechnol.17(1999)176−180,国際公開第99/154342号,国際公開第2005/018572号,国際公開第2006/116260号,国際公開第2006/114700号,国際公開第2005/011735号,国際公開第2005/027966号,国際公開第97/028267号,米国特許出願公開第2006/0134709号,米国特許出願公開第2005/0054048号,米国特許出願公開第2005/0152894号、国際公開第2003/035835号,国際公開第2000/061739号に記載されている。本発明によれば、これらの糖鎖操作型抗原結合タンパク質は、(親抗原結合タンパク質と比較して)ADCCが増加している。本発明に係るアフコシル化抗原結合タンパク質を得る他の糖鎖工学の方法は、例えばNiwa,R..et al.,J.Immunol.Methods 306(2005)151−160;Shinkawa,T.,et al.,J.Biol.Chem,278(2003)3466−3473;国際公開第03/055993号又は米国特許出願公開第2005/0249722号に記載されている。
従って、本発明の一態様は、Asn297でのオリゴ糖(糖類)の総量の60%以下(例えば60%から1%)のフコースの量を持つ、IgG1のアイソタイプ又はIgG3のアイソタイプである(好ましくはIgG1のアイソタイプである)本発明に係るアフコシル化抗原結合タンパク質である。
従って、本発明の一態様は、癌の治療のため、Asn297でのオリゴ糖(糖類)の総量の60%以下(例えば60%から1%)のフコースの量を持つ、IgG1のアイソタイプ又はIgG3のアイソタイプである(好ましくはIgG1のアイソタイプである)本発明に係るアフコシル化抗原結合タンパク質である。
本発明の別の一態様は、癌の治療のための医薬の製造用に、Asn297でのオリゴ糖(糖類)の総量の60%以下のフコースの量を持つ、IgG1のアイソタイプ又はIgG3のアイソタイプである(好ましくはIgG1のアイソタイプである)本発明に係るアフコシル化抗原結合タンパク質である。
一実施態様において、フコースの量は、Asn297で、オリゴ糖(糖類)の総量の60%から20%の間である一実施態様において、フコースの量は、Asn297で、オリゴ糖(糖類)の総量の60%から40%の間である一実施態様において、フコースの量は、Asn297で、オリゴ糖(糖類)の総量の0%の間である。
「EU番号付けシステム」又は「EU指標」は、免疫グロブリン重鎖定常領域の残基を参照するときに通常使用される(例えばKabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版, Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)に報告されたEU指標は参照により本明細書に明示的に援用される)。
「糖鎖がCHO細胞で組換え的に発現した抗体のAsn297に結合したN−結合グリカンの特徴を示す」なる用語は、本発明の全長親抗体のAsn297の糖鎖が、フコース残基を除き、未修飾のCHO細胞で発現した同様の抗体のもの、例えば国際公開第2006/103100号で報告されているものと同様の構造及び糖残基配列を有することを示す。
この出願で使用される「NGNA」なる用語は、糖残基N−グリコシル−ノイラミン酸を示す。
ヒトIgG1又はIgG3のグリコシル化は、コアフコシル化された二分岐複合オリゴ糖のグリコシル化が最大2つのGal残基で終結している場合、Asn297で生じる。IgG1又はIgG3のサブクラスのヒト定常重鎖領域は、Kabat,E.,A.,et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD.(1991),及びBrueggemann,M.,et al.,J.Exp.Med.166(1987)1351−1361;Love,T.,W.,et al.,Methods Enzymol.178(1989)515−527により詳しく報告されている。これらの構造は、末端Gal残基の量に応じて、G0、G1(α−1,6−又はα−1,3−)、又はG2グリカン残基と命名される(Raju,T.,S.,Bioprocess Int.1(2003)44−53)。抗体のFc部分のCHO型グリコシル化は、例えば、Routier,F.H.,Glycoconjugate J.14(1997)201−207により記載されている。非糖修飾されたCHO宿主細胞で組換えにより発現している抗体は、通常、少なくとも85%の量で、Asn297でフコシル化されている。全長親抗体の修飾されたオリゴ糖は、ハイブリッド又は複合体であり得る。好ましくは二分された、還元され/フコシル化されていないオリゴ糖はハイブリッドである。別の実施態様において、還元され/フコシル化されていないオリゴ糖は複合体である。
本発明によれば、「フコースの量」は、MALDI−TOF質量分析により測定され平均値として計算される、Asn297に結合した全糖鎖構造(例えば複合体、ハイブリッド及び高マンノース構造)の総和に関連した、Asn297での前記糖の量を意味する。フコースの量は、MALDI−TOFにより、N−グリコシダーゼF処理した試料(例えば、複合体、ハイブリッド、及びオリゴ及び高マンノース構造のそれぞれ)において同定された全ての糖構造に関連したフコース含有構造の割合である。
本発明に係る抗体は、組換え手段によって生成される。従って、本発明の一態様は、本発明による抗体をコードする核酸であり、更なる態様は、本発明による抗体をコードする前記核酸を含む細胞である。組換えによる産生のための方法が広く先端技術で知られており、原核細胞および真核細胞におけるタンパク質の発現を含み、その後の抗体の単離、及び通常は薬学的に許容される純度までの精製を伴う。宿主細胞で前述のように抗体を発現するために、それぞれの修飾された軽鎖と重鎖が、標準的な方法により発現ベクターに挿入される。発現は、CHO細胞、NS0細胞、SP2/0細胞、HEK293細胞、COS細胞、PER.C6細胞、酵母、または大腸菌細胞などの適当な原核生物または真核生物宿主細胞中で行われ、抗体は細胞(上清または溶解後の細胞)から回収される。抗体の組換えによる生成のための一般的な方法は、最新技術分野において周知であり、例えば、Makrides,S.C.,Protein Expr.Purif.17(1999)183−202;Geisse,S.,et al.,Protein Expr.Purif.8(1996)271−282;Kaufman,R.J.,Mol.Biotechnol.16(2000)151−161;Werner,R.G.,Drug Res.48(1998)870−880の総説に記載されている。
本発明による抗原結合タンパク質は、従来の免疫グロブリン精製手順、例えば、プロテインA−セファロース、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析、又はアフィニティークロマトグラフィーなどによって培養培地から適切に分離される。モノクローナル抗体をコードするDNAおよびRNAは容易に単離され、従来の手順を用いて配列決定される。ハイブリドーマ細胞は、DNAとRNAの供給源として機能することができる。一度単離されると、DNAは、発現ベクターに挿入することができ、これらは次いで、本来ならば免疫グロブリンタンパク質を生成しないHEK293細胞、CHO細胞、またはミエローマ細胞などの宿主細胞中にトランスフェクトされ、宿主細胞中で組換えモノクローナル抗体の合成を得る。
抗原結合タンパク質のアミノ酸配列変異体(又は変異体)は、抗体のDNAに適当なヌクレオチド変化を導入することによって、またはヌクレオチド合成によって調製される。しかしながら、そのような修飾は、例えば、ごく限られた範囲で上述したように行うことができる。例えば、修飾は、例えば、IgGのアイソタイプおよび抗原結合など上述したような抗体の特性を変化させないが、組換えによる生成収率、タンパク質安定性を改善したり、精製を容易にすることができる。
本出願で使用される用語「宿主細胞」は、本発明に係る抗体を生成するように操作することができる細胞性システムの任意の種類を意味する。一実施態様において、HEK293細胞及びCHO細胞が宿主細胞として使用される。本明細書で使用される場合、「細胞」、「細胞株」及び「細胞培養物」は互換的に使用され、すべてのそのような名称は子孫を含む。よって、「形質転換体」及び「形質転換細胞」なる用語には、初代被験体細胞、及び移動の回数に関係なくそこから得られた培養物も含まれる。また、全ての子孫は、意図的なまたは不慮の突然変異により、DNA量において、厳密には同一でない可能性もあると理解される。最初に形質転換された細胞においてスクリーニングされた場合、同じ機能又は生物活性を有する変異子孫も含まれる。
NS0細胞における発現は、例えば、Barnes,L.M.,et al.,Cytotechnology 32(2000)109−123;Barnes,L.M.,et al.,Biotech.Bioeng.73(2001)261−270により説明される。一過性発現は、例えばDurocher,Y.,et al.,Nucl.Acids.Res.30(2002)E9により説明される。可変ドメインのクローニングは、Orlandi,R.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86(1989)3833−3837;Carter,P.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89(1992)4285−4289;及びNorderhaug,L.,et al.,J.Immunol.Methods 204(1997)77−87により説明される。好適な一過性発現系(HEK293)は、Schlaeger,E.−J.,and Christensen,K.,Cytotechnology 30(1999)71−83及びSchlaeger,E.−J.,J.Immunol.Methods 194(1996)191−199により説明される。
原核生物に適している制御配列は、例えば、プロモーター、必要に応じてオペレーター配列、及びリボソーム結合部位を含む。真核細胞は、プロモーター、エンハンサーおよびポリアデニル化シグナルを利用することが知られている。
核酸は、それは、他の核酸配列と機能的な関係で配置されたとき、「操作可能に連結」されている。例えば、プレ配列または分泌リーダーのDNAは、ポリペプチドの分泌に関与するタンパク質前駆体として発現される場合、ポリペプチドのDNAに操作可能に連結されている;プロモーター又はエンハンサーは、配列の転写に影響を与える場合、コード配列に操作可能に連結されている;またはリボソーム結合部位は、翻訳を促進するように配置されている場合、コード配列に操作可能に連結されている。一般に、「操作可能に連結した」とは、連結しているDNA配列は連続しており、分泌リーダーの場合には、リーディング・フレームにあり連続している。しかし、エンハンサーは連続している必要はない。連結は、好都合な制限部位での連結反応によって達成される。そのような部位が存在しない場合、合成オリゴヌクレオチドアダプター又はリンカーは、従来の慣例に従って使用される。
抗原結合タンパク質の精製は、細胞成分または他の汚染物質、例えば他の細胞の核酸又はタンパク質(例えば図1Bの副産物)を、アルカリ/SDS処理、塩化セシウムバンディング、カラムクロマトグラフィー、アガロースゲル電気泳動、及び当該技術分野で周知のその他を含む標準的な技術によって除去するために行われる(Ausubel,F.,et al.,編,Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing and Wiley Interscience,New York(1987)を参照)。タンパク質精製のために異なる方法、例えば微生物のタンパク質による親和性クロマトグラフィー(例えば、プロテインA又はプロテインG親和性クロマトグラフィー)、イオン交換クロマトグラフィー(例えば陽イオン交換(カルボキシメチル樹脂)、陰イオン交換(アミノエチル樹脂)および混合モード交換)、チオフィリック吸着(β−メルカプトエタノール及び他のSHリガンドによるなど)、疎水性相互作用又は芳香族吸着クロマトグラフィー(フェニル−セファロース、アザアレノフィリック樹脂、又はm−アミノフェニルボロン酸によるなど)、金属キレート親和性クロマトグラフィー(Ni(II)−及びCu(II)親和性材料によるなど)、サイズ排除クロマトグラフィー、及び電気泳動的方法(例えばゲル電気泳動、キャピラリー電気泳動など)が十分に確立され広範に使用されている(Vijayalakshmi,M.A.,Appl.Biochem.Biotech.75(1998)93−102)。精製の一例は、実施例1とそれの対応する図に記載されている。
本発明の一つの態様は、本発明に係る抗原結合タンパク質を含む薬学的組成物である。本発明の別の態様は、薬学的組成物の製造のための、本発明に係る抗原結合タンパク質の使用である。本発明の更なる態様は、本発明に係る抗原結合タンパク質を含む薬学的組成物の製造のための方法である。別の態様において、本発明は、例えば、薬学的担体と共に調製される本発明に係る抗原結合タンパク質を含む薬学的組成物を含む組成物を提供する。
本発明の一実施態様は、癌の治療のための、本発明に係る抗原結合タンパク質である。
本発明の別の態様は、癌の治療のための前記薬学的組成物である。
本発明の一実施態様は、癌の治療において使用のための、本発明に係る抗原結合タンパク質である。
本発明の別の態様は、癌の治療のための医薬の製造のための、本発明に係る抗原結合タンパク質の使用である。
本発明の別の態様は、治療を必要とする患者に、本発明に係る抗原結合タンパク質を投与することによる、癌に罹患している患者の治療方法である。
本明細書で使用される場合、「薬学的担体」には、任意及び全ての溶媒、分散用媒体、コーティング剤、抗菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延化剤で、生理学的に適合性であるものが含まれる。好ましくは、担体は静脈内、筋肉内、大脳内、皮下、非経口、脊髄、又は表皮投与(例えば、注射又は注入による)に適している。
本発明の薬学的組成物は、当該技術で知られているの種々の方法で投与することができる。当業者に理解されているように、投与の経路及び/又は方式は、所望する結果に応じて変えられるであろう。投与のある種の経路により、本発明の化合物を投与するため、その不活性化を防止するための物質で化合物をコーティングする、又はその不活性化を防止するための物質と化合物とを一緒に投与する必要があるかもしれない。例えば、化合物は適切な担体、例えばリポソーム、又は希釈剤において、被験者に投与されてもよい。薬学的に許容可能な希釈剤には、生理食塩水又は水性緩衝液が含まれる。薬学的担体には、滅菌水溶液又は分散液、及び無菌の注射可能な溶液又は分散液を即時調製するための滅菌パウダーが含まれる。薬学的に活性な物質のためのこうした媒体及び薬剤の使用は、当該技術で知られている。
本明細書で使用される場合、「非経口投与」及び「非経口的に投与」なる語句は、経腸及び局所投与以外の投与方式、通常は注射による投与を意味し、限定されるものではないが、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、関節包内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、クモ膜下、脊髄内、硬膜外及び胸骨内注射及び注入が含まれる。
本明細書で使用される場合、「癌」なる用語は、増殖性疾患、例えば、リンパ腫、リンパ性白血病、肺癌、非小細胞肺(NSCL)癌、気管支肺胞上皮細胞肺癌、骨癌、膵臓癌、皮膚癌、頭部又は頸部の癌、皮膚又は眼球内黒色腫、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、肛門領域の癌、胃癌、胃腸癌、結腸癌、乳癌、子宮癌、卵管癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、膣癌、外陰癌、ホジキン病、食道癌、小腸癌、内分泌系の癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟組織の肉腫、尿道癌、陰茎癌、前立腺癌、膀胱癌、腎臓又は尿管の癌、腎細胞癌、腎盂癌、中皮腫、肝細胞癌、胆道癌、中枢神経系(CNS)の腫瘍、脊椎腫瘍、脳幹神経膠腫、多形神経膠芽腫、星状細胞腫、シュワン腫、上衣腫、随芽腫、髄膜腫、扁平上皮癌、下垂体腺腫、及びユーイング肉腫を指し、上述した任意の癌の抵抗性バージョン、又は上述した癌の一又は複数の組合せを含む。
これらの組成物は、アジュバント、例えば保存料、湿潤剤、乳化剤、及び分散剤をさらに含有可能である。微生物存在の防止は、上掲の滅菌手段、及び種々の抗菌及び抗真菌剤、例えばパラベン、クロロブタノール、フェノール、スコルビン酸等により確実になる。また、等張剤、例えば糖類、塩化ナトリウムなどを、組成物に含有せしめることもまた望ましい。加えて、注射可能な薬学的形態の長時間にわたる吸収は、吸収を遅らせる薬剤、例えばモノステアリン酸アルミニウム及びゼラチンを含有せしめることによりもたらすことができる。
選択された投与経路にかかわらず、適切な水和形態、及び/又は本発明の薬学的組成物で使用される本発明の化合物は、当業者に知られている一般的な方法により、薬学的に許容可能な剤形に処方される。
本発明の薬学的組成物における活性成分の実際の投与レベルは、患者に対して毒性がなく、特定の患者に対する所望する治療的応答、組成物、及び投与方式を達成するのに効果的な活性成分の量が得られるように変えうる。選択された投与レベルは、使用される本発明の特定の組成物の活性、投与経路、投与時間、使用される特定の化合物の排出速度、処置時間、他の薬剤、使用される特定の組成物と組合せて使用される化合物及び/又は物質、年齢、性別、体重、状態、一般的健康状態、処置される患者の以前の病歴、及び医療でよく知られている要因を含む、種々の薬物動態学的要因に依存するであろう。
組成物は滅菌されていなければならず、組成物がシリンジにより送達可能である程度に、流動的でなければならない。水に加えて、担体は、好ましくは等張の緩衝生理食塩水である。
適切な流動性は、例えばレシチン等のコーティング剤を使用することにより、又は分散液の場合は必要な粒径を維持することにより、そして界面活性剤を使用することにより、維持することができる。多くの場合、等張剤、例えば糖類、多価アルコール類、例えばマンニトール又はソルビトール、及び塩化ナトリウムを、組成物に含有せしめることが好ましい。
本明細書で使用される場合、「細胞」、「細胞株」及び「細胞培養物」は互換的に使用され、すべてのそのような名称は子孫を含む。「形質転換体」及び「形質転換細胞」なる用語には、初代の被験体細胞、及び移動の回数に関係なくそこから得られた培養物も含まれる。また、全ての子孫は、意図的なまたは不慮の突然変異により、DNA量において、厳密には同一でない可能性もあると理解される。最初に形質転換された細胞においてスクリーニングされた場合、同じ機能又は生物活性を有する変異子孫も含まれる。異なる命名が意図されるところでは、文脈から明らかであろう。
本明細書で使用される場合、用語「形質転換」は、宿主細胞へのベクター/核酸の転写のプロセスを指す。手ごわい細胞壁障壁が無い細胞を宿主細胞として用いる場合には、トランスフェクションは、例えば、Graham and Van der Eh,Virology 52(1978)546により説明されるようにリン酸カルシウム沈殿法により行われる。しかし、核注入による、又はプロトプラスト融合によるなど、細胞にDNAを導入するための他の方法を用いてもよい。実質的な細胞壁構造を含む原核細胞又は細胞が使用される場合、例えばトランスフェクションの一つの方法は、Cohen,F.N,et al.,PNAS 69(1972)7110)によって記述された塩化カルシウムを用いたカルシウム処理である。
本明細書で使用される「発現」とは、核酸がmRNAに転写されるプロセス、及び/又は転写されたmRNA(これも転写産物とも呼ばれる)が、その後、ペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質に翻訳されるプロセスを指す。転写物及びコードされたポリペプチドは、遺伝子産物と総称して呼ばれる。ポリヌクレオチドがゲノムDNAに由来した場合、真核細胞における発現は、mRNAのスプライシングを含み得る。
「ベクター」は、核酸分子で、特に自己複製し、これにより、挿入された核酸分子を宿主細胞へ及び/又は宿主細胞間で転送する。その用語は、主にDNA又はRNAを細胞へ挿入するため(例えば、染色体の統合)に機能するベクター、DNA又はRNAの複製のために主に機能するベクターの複製、及びDNA又はRNAの転写及び/又は翻訳のために機能する発現ベクターを含む。また含まれるのは、説明したように一以上の機能を提供するベクターである。
「発現ベクター」は、適当な宿主細胞に導入されると、転写されてポリペプチドに翻訳することができるポリヌクレオチドである。「発現系」は、通常、所望の発現産物を生じるために機能することができる発現ベクターからなる適切な宿主細胞を指す。
以下の実施例、配列表及び図面は、本発明、添付の特許請求の範囲に記載されているの真の範囲、の理解を助けるために提供される。変更は、本発明の精神を逸脱することなく、記載された手順で行うことができることが理解される。
アミノ酸配列の記述
配列番号1 c−Met 5D5 MoAb−二量体(「CH3−wt」)−修飾型重鎖 a)VL−CH1−CH2−CH3
配列番号2 c−Met 5D5 MoAb−二量体(「CH3−wt」)−修飾型重鎖 b)VH−CL−CH2−CH3
配列番号3 IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)−修飾型重鎖 a)VL−CH1−CH2−CH3
配列番号4 IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)−修飾型重鎖 b)VH−CL−CH2−CH3
配列番号5 Her3 205 MoAb−二量体(「CH3−wt」)−修飾型重鎖 a)VL−CH1−CH2−CH3
配列番号6 Her3 205 MoAb−二量体(「CH3−wt」)−修飾型重鎖 b)VH−CL−CH2−CH3
配列番号7 IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)−修飾型重鎖 a)IgA−CH3を伴うVL−CH1−CH2−CH3
配列番号8 IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)−修飾型重鎖 b)IgA−CH3ドメインを伴うVH−CL−CH2−CH3
実験手順
A.材料と方法
組換えDNA技術
Sambrook,J.et al.,Molecular cloning:A laboratory manual;Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,New York,1989に既述されるように、標準的な方法がDNAを操作するために使用された。分子生物学的試薬を、製造元の指示に従って使用した。
DNAおよびタンパク質配列分析および配列データ管理
ヒト免疫グロブリンの軽鎖及び重鎖の塩基配列に関する一般情報については次に与えられる:Kabat,E.A.et al.,(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Ed.,NIH Publication No 91−3242.抗体鎖のアミノ酸はEU番号付けに従って番号が付けられている(Edelman,G.M.,et al.,PNAS 63(1969)78−85;Kabat,E.A.,et al.,(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,NIH Publication No 91−3242)。GCG(Genetics Computer Group,Madison,Wisconsin)ソフトウェアパッケージバージョン10.2及びInfomax’s Vector NTI Advance suiteのバージョン8.0が配列の作成、マッピング、解析、注解及び図解のために使用された。
DNA配列決定
DNA配列は、SequiServe(Vaterstetten,Germany)とGeneart AG(Regensburg,Germany)で行った二本鎖配列決定により決定した。
遺伝子合成
所望の遺伝子セグメントは、自動化された遺伝子合成による合成オリゴヌクレオチド及びPCR産物から、Geneart AG(Regensburg,Germany)により調製された。特異な制限酵素切断部位に隣接する遺伝子セグメントがpGA18(ampR)プラスミドにクローニングされた。プラスミドDNAを形質転換した細菌から精製し、UV分光法により濃度を決定した。サブクローニング遺伝子断片のDNA配列を、DNA配列決定によって確認した。2本の抗体鎖(VH−CL−CH2−CH3及びVL−CH1−CH2−CH3)をコードするDNA配列が、隣接する5’HpaI及び3’NaeI制限酵素認識部位を伴って、遺伝子合成により全体の断片として調製された。MoAb−二量体生成物並びにIgG1部分をコードする遺伝子セグメントのIgA−CH3ドメイン(例えば配列番号7)による置換を優先的にもたらす、CH3ドメインにおける点変異をコードする遺伝子セグメントが、遺伝子合成により調製された。これらのセグメントは、対応する野生型IgG1配列の置換を可能にするユニークな制限部位が配置された。全ての構築物は、真核細胞内の分泌のためにタンパク質を標的とするリーダーペプチドをコードする5’末端DNA配列を含み設計された。
発現プラスミドの構築
ロシュ発現ベクターを、すべての抗体鎖の構築のために使用した。ベクターは、以下の要素からなる:
− エプスタイン−バーウイルス(EBV)の複製起点、oriP、
− 大腸菌でこのプラスミドの複製を可能にするベクターpUC18からの複製起点
− 大腸菌においてアンピシリン耐性を付与するβ−ラクタマーゼ遺伝子、
− ヒトサイトメガロウイルス(HCMV)からの前初期エンハンサー及びプロモーター、
− ヒト免疫グロブリン1ポリアデニル化(「ポリA」)シグナル配列、及び
− 固有のHpaI,BclI,及びNaeI制限酵素部位。
VH−CL−CH2−CH3とVL−CH1−CH2−CH3の順の免疫グロブリン遺伝子並びに抗体鎖のC末端(CH3)をコードする3’領域で修飾された構築物は、遺伝子合成によって調製し、説明したようにpGA18(ampR)プラスミドにクローニングした。合成DNAセグメントとロッシュ発現ベクターを運ぶpG18(ampR)プラスミドは、HpaI及びNaeI又はBclI及びNaeIの制限酵素(Roche Molecular Biochemicals)のどちらかで消化され、アガロースゲル電気泳動に供した。次いで、精製されたDNAセグメントは、ロッシュ発現ベクターHpaI/NaeI又はBclI/NaeI断片に連結され、最終発現ベクターを生じた。最終の発現ベクターは、大腸菌細胞に形質転換され、発現プラスミドDNAを単離し(ミニプレップ)、制限酵素分析及びDNA配列決定に供した。正しいクローンを、150mlのLB−Amp培地中で増殖させ、再びプラスミドDNAを単離し(マキシプレップ)、配列の完全性をDNA配列決定によって確認した。
HEK293細胞における免疫グロブリン変異体の一過性発現
組換え免疫グロブリン変異体は、製造業者(Invitrogen,USA)の指示に従ってFreeStyleTM293発現システムを使用して、ヒト胎児腎臓293−F細胞の一過性トランスフェクションによって発現させた。簡潔には、懸濁液FreeStyleTM293−F細胞を37℃/8%COで、FreeStyle 293発現培地で培養した。細胞は、トランスフェクションの当日に1−2×10の生存細胞/mlの密度で新鮮な培地に播種した。DNA−293fectinTM複合体は、Opti−MEM(登録商標)I培地(Invitrogen,USA)中で、250mlの最終トランスフェクション容積に対して、325μlの293fectinTM(Invitrogen,Germany)と250μgの各プラスミドDNAを1:1のモル比で使用して調製した。抗体を含む細胞培養上清をトランスフェクション後7日間で30分間14000gで遠心分離して回収し、無菌フィルター(0.22μm)でろ過した。上清を精製まで−20℃で保存した。
あるいは、抗体は、HEK293−EBNA細胞において一過性トランスフェクションによって産生させた。抗体は、10%の超低(Ultra Low)IgGのFCS(ウシ胎児血清、Gibco)、2mMのL−グルタミン(Gibco)、及び250μg/mlのジェネティシン(Geneticin)(Gibco)を補充したDMEM(ダルベッコ改変イーグル培地、Gibco)中で培養された、粘着して増殖するHEK293−EBNA細胞中で、それぞれの発現プラスミドの一過性共トランスフェクションにより発現された。トランスフェクション用に、FuGENETM6トランスフェクション試薬(Roche Molecular Biochemicals)が、DNA(μg)に対するFuGENETM試薬の比率が4:1で(3:1から6:1の範囲で)使用された。タンパク質は、等モル量比のプラスミドを用いて各プラスミドから発現させた。3日目に、細胞に、L−グルタミン4mM、グルコース[Sigma]及びNAA[Gibco]が与えられた。細胞培養上清を含む免疫グロブリン変異体を、遠心分離によるトランスフェクション後5日から11日まで採取し、−80℃保存した。例えばHEK293細胞中でのヒト免疫グロブリンの組換え発現に関する一般情報についてはMeissner,P.,et al.,Biotechnol.Bioeng.75(2001)197−203に与えられる。
抗体の精製
抗体は、プロテインA−セファロースTM(GE Healthcare,Sweden)を使用する親和性クロマトグラフィー及びスーパーデックス200サイズ排除クロマトグラフィーにより細胞培養上清から精製された。簡潔には、無菌ろ過した細胞培養上清を、PBS緩衝液(10mMのNaHPO,1mMのKHPO,137mMのNaCl及び2.7mMのKCl,pH7.4)で平衡化したHiTrapプロテインAHP(5ml)カラムに適用した。非結合タンパク質は、平衡緩衝液を用いて洗浄した。抗体及び抗体変異体は、0.1Mクエン酸緩衝液、pH2.8で溶出し、タンパク質を含む画分は、0.1mlの1Mトリス、pH8.5で中和した。次いで、溶出したタンパク質画分をプールし、アミコンウルトラ遠心濾過装置(MWCO:30K,Millipore)で3mlの体積まで濃縮し、20mMのヒスチジン、140mMのNaCl、pH6.0で平衡化した、スーパーデックス200 HiLoad 120ml 16/60又は26/60ゲル濾過カラムにロードした。5%未満の高分子量凝集体を含有する精製抗体を含む画分がプールされ、−80℃で1.0mg/mlの一定分量として保存した。
精製タンパク質の分析
精製されたタンパク質サンプルのタンパク質濃度を、アミノ酸配列に基づいて計算されたモル吸光係数を用いて、280nmでの光学密度(OD)を測定することによって決定した。抗体の純度及び分子量は、還元剤(5mMの1,4−ジチオトレイトール)の存在下及び非存在下でのSDS−PAGE、及びクーマシーブリリアントブルーによる染色により分析された。NuPAGE(登録商標)Pre−Castゲルシステム(Invitrogen,USA)を、製造業者の説明に従って使用した(4−12%のトリスグリシン・ゲル)。抗体サンプルの凝集体含量は、25℃で200mMのKHPO,250mMのKCl,pH7.0のランニングバッファー中で、Superdex200分析的サイズ排除カラムを使用して高性能SECにより分析された。25μgのタンパク質が流速0.5ml/分でカラムに注入され、50分間にわたり均一濃度で溶出された。安定性分析のため、濃度が1mg/mlの精製タンパク質が、4℃及び40℃で7日間インキュベートされ、次いで高性能SEC(例えばHP SEC分析(Purified Protein))により評価された。還元された免疫グロブリン変異体の鎖のアミノ酸骨格の完全性が、ペプチド−N−グリコシダーゼF(Roche Molecular Biochemicals)による酵素処理によるN−グリカンの除去後にナノエレクトロスプレーQ−TOF質量分析法により検証された。
質量分析法
抗体の全脱グリコシル化質量を決定し、エレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI−MS)を介して確認した。簡潔には、100μgの精製抗体が、100mMのKHPO/KHPO,pH7中で、37℃で12〜24時間、最大2mg/mlのタンパク質濃度で、50mUのN−グリコシダーゼ F(PNGaseF,ProZyme)により脱グリコシル化され、続いてセファデックスG25カラム(GE Healthcare)を用いたHPLCを介して脱塩した。それぞれの抗体鎖の質量が脱グリコシル化及び還元後にESI−MSにより決定された。簡潔には、115μl中で50μgの抗体が、60μlの1MのTCEP及び50μlの8Mのグアニジン塩酸塩とインキュベートされ続いて脱塩された。全質量及び還元型抗体鎖の質量は、NanoMate供給源を装備したQ−Star Elite MSシステム上でESI−MSを介して決定された。記録された質量範囲は、サンプルの分子量に依存する。一般に、還元された抗体に対しては、質量範囲は600−2000m/zから設定され、非還元型抗体に対しては1000−3600m/zから設定された。
SEC−MALLS
SEC−MALLS(多角度レーザー光散乱によるサイズ排除クロマトグラフィー)が溶液中のタンパク質のおよその分子量を決定するために使用された。光散乱理論によれば、MALLSは、分子形状又は他の推測に関係なく、巨大分子の分子量の推定を可能にする。SEC−MALLSは、SECクロマトグラフィー、続く、濃度及び散乱光感受性検出器を介した、タンパク質の、その大きさ(流体力学半径)に従った分離に基づいている。SEC−MALLSは、SEC分離が十分であるとするならば、典型的には、単量体、二量体、三量体などの間の明白な区別を可能にする正確さで分子量を生じる。
この作業において、以下の機器を用いた:Dionex Ultimate3000HPLC;カラム:Superose6 10/300(GE Healthcare);溶出剤:1xPBS;流速:0.25mL/分;検出器:OptiLab REX(Wyatt社,Dernbach),MiniDawn Treos(Wyatt社,Dernbach).分子量は、アストラソフトウェア、バージョン5.3.2.13で計算した。50から150μgの間の量のタンパク質がカラム上にロードされ、BSA(Sigma Aldrich)が参照タンパク質として使用された。
動的光散乱(DLS)経時変化
20mMのHis/HisCl,140mMのNaCl,pH6.0中で、約1mg/mLの濃度でのサンプル(30μL)が384ウェルフィルタープレート(0.45μmの細孔サイズ)を介して384ウェル光学プレート(Corning)の中へ濾過され、20μLのパラフィンオイル(Sigma)で覆われた。動的光散乱データは、40℃の一定温度でDynaPro DLSプレートリーダー(Wyatt)により、5日間の期間中に繰り返し収集された。データはダイナミクスV6.10(Wyatt)で処理した。
表面プラズモン共鳴
抗IGF−lR抗原結合タンパク質及び抗体の結合特性はビアコア機器を使用して、表面プラズモン共鳴(SPR)技術により分析された(Biacore,GE−Healthcare,Uppsala)。このシステムは、分子相互作用の研究のために確立されている。それは、リガンド/分析物の結合を連続的リアルタイムで監視し、従って、様々なアッセイの設定において、会合速度定数(ka)、解離速度定数(kd)、及び平衡定数(kd)の決定を可能とする。SPR−技術は、金被覆バイオセンサーチップの表面に近い屈折率の測定に基づいている。屈折率の変化は、溶液中に注入された分析物と固定化されたリガンドとの相互作用により生じた表面上の質量変化を示す。分子が表面上で固定化リガンドに結合する場合、質量は増加し、解離の場合には質量は減少する。捕捉のために、抗ヒトIgG抗体は、アミン結合化学を用いてCM5バイオセンサーチップの表面上に固定化された。フローセルは、0.1MのN−ヒドロキシスクシンイミド及び0.1Mの3−(N、N−ジメチルアミノ)プロピル−N−エチルカルボジイミドの5μl/分の流速で1:1混合物により活性化した。抗ヒトIgG抗体が、酢酸ナトリウム、pH5.0に10μg/mlで注入された。参照コントロールのフローセルは同じ方式で、ただし抗体を捕捉するかわりにヒヒクル緩衝液のみで処置された。表面は、1Mのエタノールアミン/HCl pH8.5の注入によりブロックした。IGF−1R抗体はHBS−Pで希釈して注入した。全ての相互作用は25℃(標準温度)で行われた。3Mの塩化マグネシウムの再生溶液を5μl/分の流量で60秒間注入し、各結合サイクル後、非共有性で結合した任意のタンパク質を除去した。シグナルは、1秒に1回のシグナルの割合で検出された。サンプルを、濃度を増加させて注入した。図17は、適用されたアッセイフォーマットを示す。抗体を捕捉する密度及びIGF−1R抗体による低負荷密度が結合を強制するために選ばれた。
親和性測定のため、PR機器(Biacore T100)上で標準的なアミンカップリング及びブロッキング化学によって表面に結合した抗His抗体に対するHisタグ付き受容体を捕捉することにより(Penta−His,Qiagen)、ヒトFcgIIIaがCM−5センサーチップに対して固定化された。FcgRIIIa捕捉後、50nMのIGF1R抗体が5μL/分の流速で25℃で注入された。チップはその後10mMのグリシンHCl、pH2.0溶液の60秒のパルスで再生された。
抗体依存性細胞傷害性アッセイ(ADCC)
抗IGF−IR抗体による抗体媒介性エフェクター機能の決定。免疫エフェクター機構を誘発する生成された抗体の能力を決定するために、抗体依存性細胞傷害(ADCC)の研究が行われた。ADCCにおける抗体の影響を調査するために、DU145 IGF−IR発現細胞(1×106細胞/ml)が、細胞インキュベーター中で37℃で25分間、1mlあたり1μlのBATDA溶液(Perkin Elmer)で標識された。その後、細胞は10mlのRPMI−FM/PenStrepで4回洗浄し、200×gで10分間、遠沈した。最後の遠心分離工程の前に、細胞数を測定し、その後ペレットからRPMI−FM/PenStrep培地中に1×105細胞/mlに細胞が希釈された。細胞を50μlの容量で、丸底プレートにウェル当たり5,000個が蒔かれた。HuMAb抗体が、50μlの細胞懸濁液に対して50μlの細胞培養培地の容量で、25−0.1μg/mlの範囲の最終濃度で追加された。続いて、50μlのエフェクター細胞、新鮮に単離されたPBMCがE:Tの比率が25:1で添加された。プレートを200×gで1分間遠心分離し、37℃で2時間のインキュベーション工程が続いた。インキュベーションの後、細胞は200gで10分間遠沈し、上清の20μlが回収され、Optiplate96−Fプレートに移された。ユーロピウム溶液(Perkin Elmer、室温で)200μlを添加し、プレートを加振台上で15分間インキュベートした。蛍光はPerkin ElmerからのEu−TDAプロトコルを使用して、時間分割蛍光光度計(Victor 3,Perkin Elmer)で定量化される。ADCCによる細胞溶解の規模は、それぞれの標的細胞からのTDAの自発的放出に対して補正され、界面活性剤により溶解した、標的細胞からのTDA蛍光エンハンサーの最大放出の%として表される。
IGF−1R内部移行アッセイ
本発明に係る抗体及び抗原結合タンパク質のIGF−1Rに対する結合は、受容体の内部移行と分解を生じる。この工程は、IGF−1Rを発現するHT29 CRC細胞をIGF−1R標的抗体とインキュベートし、続いてELISAにより、細胞溶解物中に残存するIGF−1Rタンパク質のレベルを定量化することにより監視することができる。
この目的のために、1,5×104細胞/ウェルでのHT29細胞が、細胞の付着を可能にするために、10%のFCSを含むRPMI中で96ウェルのMTP中で、37℃、5%COで一晩インキュベートされた。翌朝、培地を吸引し、RPMI+10%FCSで希釈されたIGF−1R抗体が、10nMから2pMの濃度で、1:3の希釈工程で添加された。細胞は37℃で18時間、抗体とインキュベートされた。その後、培地は再び除去され、120μlのMES溶解緩衝液(25mMのMES pH6.5+完全)が添加された。
ELISAのために、96ウェルのストレプトアビジンコーティングポリスチレンプレート(Nunc)が3%のBSA/PBSTで1:200に希釈された100μlのMAK<hu IGF−1Rα>hu−1a−IgG−Bi (Ch.10)をロードされ、室温で1時間、一定の攪拌下でインキュベートした。その後、ウェルの内容物を除去し、各ウェルを200μlのPBSTで3回洗浄した。細胞溶解物の溶液100μlをウェル当たりに添加し、再び加振台上で室温で1時間インキュベートし、200μlのPBSTで3回洗浄した。上清の除去後に、3%のBSA/PBSTで1:750希釈された、100μl/ウェルのPAK<ヒトIGF−1Rα>Ra−C20−IgG(Santa Cruz #sc−713)が添加され、その後上述のように同様の培養及び洗浄間隔が続いた。IGF−1Rに結合した特異的な抗体を検出するために、3%のBSA/PBSTで1:4000希釈された、ポリクローナル西洋ワサビペルオキシダーゼ結合ウサギ抗体(Cell Signaling #7074)が、100μl/ウェル添加された。それから1時間後、非結合抗体が、上述のように完全に6回洗浄することにより再び除去された。結合した抗体の定量化のため、100μl/ウェルの3,3’−5,5’−テトラメチルベンジジン(Roche,BM−Blue ID.−Nr.11484281)が添加され、室温で30分間インキュベートした。熱発生反応は、1MのH2SO4を25μl/ウェル添加することにより最終的に停止させ、光吸収が波長450nmで測定される。抗体で処理していない細胞が、0%下方制御のコントロールとして、溶解緩衝液がバックグランドコントロールとして使用される。
IGF−1Rの自己リン酸化アッセイ(IGF−1刺激)
IGF−1R抗体によるIGF−1R標的化はIGF−1R誘導性自己リン酸化の阻害をもたらす。我々は、野生型IGF−1RのMoAb二量体の自己リン酸化の阻害を、親のIGF−1RのIgG1抗体と比較して調査した。この目的のため、3T3−IGF−1R細胞、マウス線維芽細胞株を過剰発現するヒトIGF−1Rを、異なる濃度のIGF−1R抗体又はIGF−1R抗原結合タンパク質の存在下で、10nMの組換えヒトIGF−1により10分間処理した。細胞の溶解後に、リン酸化されたIGF−1Rタンパク質のレベルを、ヒトIGF−1R特異的捕捉抗体及びリン酸化チロシン特異的検出抗体を組み合わせて、リン酸化−IGF−1R特異的ELISAによって決定した。
PK特性の決定マウスにおける単回投与の速度論
方法
動物:
NMRIマウス、メス、摂食、化合物投与時での体重は23−32g。
研究プロトコール
10mg/kgの単回静脈注射投与のため、マウスは各々2〜3匹の動物を有する3つの群に割り当てられた。血液サンプルは、投薬後、群1からは0.5時間、168時間及び672時間で採取され、群2からは24時間及び336時間で採取され、群3からは48時間及び504時間で採取された。
約100μLの血液サンプルを眼球後部穿刺により得た。少なくとも40μlの血清サンプルが、室温で2.5分間の遠心分離(9300×g)により、室温で1時間後に血液から得られた。血清サンプルは遠心分離後直接凍結され、分析まで−20℃で凍結して保存した。
分析論:
マウス血清中のヒト抗体の濃度を、1%マウス血清を用いた酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)で測定した。ヒトFcγに対するビオチン化モノクローナル抗体(mAb<hFcγPAN>IgG−Bi)を、第一工程でストレプトアビジンでコーティングされたマイクロタイタープレートに結合させた。次の工程で、血清サンプル(様々な希釈で)及び参照基準がそれぞれ添加され、固定化mAb<hFcγPAN>IgG−Biに結合させた。次いで、ヒトFcγに対するジゴキシゲニン化モノクローナル抗体(mAb<hFcγPAN>IgG−Dig)が添加された。ヒト抗体は、抗Dig−西洋ワサビペルオキシダーゼ抗体コンジュゲートを介して検出された。ABTS溶液を、西洋ワサビペルオキシダーゼの基質として使用した。使用される捕捉及び検出抗体の特異性は、マウスIgGと交差反応せず、マウス血清サンプル中のヒト抗体の定量を可能にする。
結論:
薬物動態パラメーターは、薬物動態学的評価プログラムWinNonlinTM、バージョン5.2.1を使用して、非コンパートメント解析により計算された。
以下の薬物動態パラメーターが、ヒト抗体を評価するために使用された。
ボーラスIVモデルの推定初期濃度(C0)。
(Tmax)で発生する最大観察濃度(Cmax)。
最大観測濃度の時間(Tmax)。
濃度/時間の曲線下の面積AUC(0−inf)は、時間0から無限で線形台形公式(線形補間)により算出した。
見かけの終末相半減期(T1/2)は次式から誘導した。T1/2=ln2/λz.
全身クリアランス(CL)は、投与量/AUC(0−inf)として算出した。
定常状態での分布容量(Vss)は、MRT(0−inf)xCL(MRT(0−inf)として算出され、AUMC(0−inf)/AUC(0−inf)として定義される。
B.実施例:
実施例1:
MoAb−二量体抗原結合タンパク質の産生
我々は、図1Aに示される設計原理をもとにして、c−Met(配列番号1及び配列番号2),IGF−1R(配列番号3及び配列番号4)及びHER3(配列番号5及び配列番号6)に対する本発明に係る抗原結合タンパク質を設計した。ぞれぞれの構築物は上述したようにHEK293細胞において一過性に発現させ、続いてプロテインA親和性クロマトグラフィーを介して精製し、その後サイズ排除クロマトグラフィーで精製した。図2−4は、抗原結合タンパク質の三つの異なる生産物のサイズ排除クロマトグラフィーのクロマトグラム、並びに非還元および還元条件下での対応するSDS−PAGEを示している。図2のピーク3、図3のピーク2、図4のピーク3に加えて、図2のカラムピーク2,図3のカラムピーク1、図7のカラムピーク4に由来するより早期時点で溶出するタンパク質が観察された。それらの保持時間に基づいて、それらが、一価抗体(図1B,MoAb)の分子量の二倍体を呈していると算出され、図1Aに係る抗原結合タンパク質(MoAb−二量体)に対応している。
IGF−1R抗体の2つのピーク1と2の大きさはSEC−MALLSにより確認され(図3C)、実際に、ピーク1に対応するタンパク質が、一価抗体(ピーク2)の分子量のおよそ二倍の分子量を呈していることを示していた。MoAb−二量体の存在と単離されたタンパク質の同一性は次いで質量分析により確認した。それらの知見に基づいて、我々は図1Aに記載されるMoAb−二量体の構造についてのモデルを導き出した。
我々は、質量分析法、還元、プロテアーゼ消化などの実験を行い、図1Aに示される仮想的構造を確認した。
IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)の安定性は、上述のように動的光散乱により研究される。簡潔には、IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)の凝集傾向が、40℃でのDLS経時実験により評価される。
実施例2:
IGF−1R結合親和性
IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)のIGF−1R細胞外ドメイン結合を、表面プラズモン共鳴(SPR)により親の<IGF−1R>IgG1抗体の結合と比較した。図5は、親和性を決定するためのSPRアッセイの模式図を示す。分析では、IGF−1Rの結合親和性は、IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)で保持されることを示していた。
実施例3:
IGF−1Rを発現する細胞株に対する細胞結合
IGF−1RのMoAb−二量体の細胞結合が、A549細胞上で実証された。対数増殖期のA549細胞はaccutase(Sigma)で切り離され、2x10e5細胞を、個々の抗体のインキュベーションのために使用した。IGF−1R抗体及びMoAb二量体が三倍希釈系列(100−0.0003μg/mL)で追加された。結合抗体が、ヒト免疫グロブリンの定常領域に対する二次的Alexa488結合抗体(5μg/mL)結合で視覚化された。死滅した細胞を7−AAD(BD)で染色し、分析から除外した。単一細胞の蛍光強度を、FACSカント(BD Biosciences)フローサイトメーターで測定した。MoAb−二量体は、親のIGF−1R IgG1抗体に同等の、細胞に対する非常に類似した半最大結合を示した。このことは、MoAb−二量体は細胞上で2本の腕で結合することができ、結合活性作用を示している。しかし、全mfi(平均蛍光強度)は、MAb IGF−1RよりもMoAb−二量体でより高い。これは、細胞表面上において1モルのIGF−1R当たりのより多くのFc部分に起因する可能性がある。結果は図6及び以下に示される。
実施例4:
ADCC誘導
ドナー由来の末梢血単核細胞(PBMC)は、癌細胞に対する非糖鎖操作型抗体および糖鎖操作型抗体によって、エフェクター細胞の動員を測定するために使用することができる。癌細胞の溶解は、NK細胞媒介性細胞傷害と相関し、NK細胞を動員する抗体の能力に比例する。この特定の設定において、DU145前立腺癌細胞が、それぞれの抗体の欠損下又は存在下でPBMCと、1:25の比率(DU145:PBMC)でインキュベートされた。2時間後、上述のように細胞の溶解をBATDA/ユーロピウムシステムを用いて測定した。ADCCによる細胞溶解の規模は、それぞれの標的細胞からのTDAの自発的放出に対して補正され、界面活性剤により溶解した、標的細胞からのTDA蛍光エンハンサーの最大放出の%として表される。データは、非糖鎖操作型の二価のIGF−1R MoAb−二量体が、非糖鎖操作型IGF−1R抗体に比べてADCCを誘導する点において優れていることを示している。驚くべきことに、非糖鎖操作型IGF−1R MoAb−二量体は、高濃度に向かうADCCアッセイの低下を示す糖鎖操作型IGF−1R抗体に比較して、高濃度でADCCを誘導する点において更に優れている。糖鎖工学の欠損下でのMoAb−二量体による優れたADCCの誘導は、FcgRIIIaの二価性に起因する、NK細胞上でのFcgRIIIaの構築物の高い親和性(結合活性作用)により説明することができる。
非糖鎖操作型IGF1R MAb(1)、糖鎖操作型、アフコシル化IGF1R MAb (2)、及び非糖鎖操作型IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」) (3)が図7に示されており、MoAb−二量体IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)は、非糖鎖操作型IGF1R MAbに比較してADCCを改善させ、そして高濃度においては、糖鎖操作型、アフコシル化IGF1R MAb(2)に比べて、更に改善させていることを表している。
実施例5:
IGF−1R内部移行アッセイ
二価のIGF−1R抗体による、腫瘍細胞におけるIGF−1Rのターゲティングは、IGF−1Rの内部移行とリソソーム分解をもたらす。我々は、IGF−1R MoAb−二量体の内部移行特性を、親のIGF−1R親の抗体と比較して調査した。この目的のために、HT29結腸癌細胞が、異なる濃度のMoAb−二量体と親のIGF−1R抗体で18時間処置された。細胞の溶解後、IGF−1Rタンパク質の残存しているレベルがIGF−1R特異的ELISAにより決定された。
図8のデータは、MoAb−二量体によるIGF−1Rの内部移行は、二価の親のIGF−1R親の抗体と実質的に同一であることを示している。最大の内部移行は82.99 %(IgG1)対83.7%(MoAb−二量体)であって、半最大阻害に必要な濃度は0.027nM(IgG1)対0.027nM(MoAb−二量体)であった。
実施例6:
IGF−1Rの自己リン酸化(IGF−1刺激)
IGF−1R抗体によるIGF−1R標的化はIGF−1R誘導性自己リン酸化の阻害をもたらす。我々は、MoAb二量体IGF−1R抗体の自己リン酸化の阻害を、親のIGF−1RのIgG1抗体と比較して調査した。この目的のため、3T3−IGF−1R細胞、マウス線維芽細胞株を過剰発現するヒトIGF−1Rを、異なる濃度のIGF−1R抗体及び抗原結合タンパク質の存在下で、10nMの組換えヒトIGF−1により10分間処理した。細胞の溶解後に、リン酸化されたIGF−1Rタンパク質のレベルを、ヒトIGF−1R特異的捕捉抗体及びリン酸化チロシン特異的検出抗体を組み合わせて、リン酸化−IGF−1R特異的ELISAによって決定した。
図9のデータは、IGF−1R MoAb−二量体は、IGF−1R IgG1の親の分子と比べて同様に又はわずかに良好に、IGF−1誘導性自己リン酸化を阻害することができることを示している。半最大阻害に必要な濃度は、1.44nM(親のIGF−1R IgG1)対3.52nM(MoAb−二量体),であって、観察された最大阻害は80.3%(親のIGF−1R IgG1)対89.1%(MoAb−二量体)であった。
実施例7:
PK特性の決定
本発明による抗原結合タンパク質の薬物動態学的特性を、NMRIマウス、メス、摂食、単回投与PK試験において化合物投与時での体重が23−32gのマウスで(方法のセクションで)上述のように測定した。
PK特性は続く表で与えられ、抗原結合タンパク質IGF1R AK18 MoAb−二量体(「CH3−wt」)は、親の<IGF−1R>IgG1抗体と比較して高く価値ある特性(例えばAUC0−inf,Cmax又はC0など)を持っていることを示している。
実施例8:
IGF−1R MoAb−二量体のESI−MS実験
IGF−1R MoAb−二量体(IGF1R AK18 MoAb(「CH3−wt」))(配列番号3及び配列番号4)は一過性に発現され、プロテインA親和性クロマトグラフィー及びサイズ排除クロマトグラフィーを介して精製された。調製用SECの後で(図3A参照)、抗体は、2つの別々のピーク内に溶出され、それを回収した。最初のピーク(画分1)からの分析用SECは、約200kDaの見かけの分子量を示し、一方第2ピーク(画分2)は100kDaの分子量に対応している。異なる分子量が、副産物として区別された単量体(画分2)と所望の二量体(画分1)にそれぞれ割り当てることができた。SEC−MALSは初期のSEC結果を追認し、画分2(単量体)について99.5kDaの分子量及び画分1(ニ量体)について193.8kDaの分子量を示した。
変性条件および還元条件下で2つの画分のSDS−PAGE分析(図3B参照)は、50−60kDaの見かけの分子量の一つの主要なバンドを示す。非還元条件下で画分2は分子量が100kDa近傍に主要なバンドを示し、画分1は、約100−200kDaの範囲の非常に広いバンドを示している。
画分1=165mL
画分2=190mL
これらの初期のデータは、二量体形成を示している。
画分1からの脱グリコシル化MoAb−二量体及び画分2のMoAb単量体のESI−MSスペクトル(60μlの1M TCEP及び50μlの8Mグアニジン塩酸塩でインキュベートされたサンプル)は相違を示している。画分2は、質量が98151Daの単量体に対応する唯一のピーク系列を示すが、画分1は98155Daの質量(単量体)に対応する2つの主要なピーク系列及び196319Daの質量(二量体)を持つ第二系列を含む2つの異なるエンベロープを示す。
画分1における単量体の存在は、インキュベーションの条件(60μlの1MのTCEP及び50μlの8Mグアニジン塩酸塩とともにインキュベートされる)、及び可能性のあるCH1−Ck間の開いたS−Sブリッジにより説明され得る。この場合、MS用にサンプル調製の最中に水性から酸性の有機溶媒への移行は、二量体の2つの単量体への解離を生じる場合がある。
これは、CE−SDS(BioAnalyzer)分析からの結果に一致している。画分1は非還元条件下で71%の二量体と16%の単量体を含有する。SDSの使用は、非共有結合した鎖を分離する。画分2は非還元条件下で唯一の単量体シグナル(98%)を示す。
画分1と画分2の非還元条件下でのMS測定は、構築物の正確な配列と発現を示す。画分1からのMSデータは、分子量が47960Da及び50208Daの2本の異なる重鎖をほぼ等しい量で示している。これら2本の重鎖はまた、同様の強度を有する画分2で発見された。
実施例9:
CH3野生型及びCH3−修飾型IGF1R AK18 MoAb−二量体抗原結合タンパク質におけるMoAb−二量体対一価単量体の比率の分析
抗体鎖のCH3ドメインの修飾は、MoAb−二量体及びMoAb−単量体の比率を変えることができる。典型的には、異なる重鎖修飾は、未修飾の重鎖と一緒に又は組み合わせて、一過性にHEK293F細胞で発現される。比較のために、抗体を含む未修飾の重鎖を平行して一過性にトランスフェクトした。抗体を含有する上清をトランスフェクション後に第7日で回収した。抗体はプロテインAセファロースを用いて沈殿させ、標準的なpHショックプロトコールでビーズから溶出した。得られた溶出液をG3000SW(TSKGel)カラムを使用してHPLC分析にかけた。抗体比は定量化され、各ピーク下の面積を計算した。用語「CH3−wt」は、天然配列を持つIgG1 CH3ドメインを指す(野生型=wt)。
実施例10:
糖鎖操作抗体の作製
糖鎖操作型MoAb抗原結合タンパク質の生成のため、HHEK−EBNA細胞を、4つのプラスミドにより、リン酸カルシウム法を用いて、トランスフェクトした。2つは抗体鎖をコードし、一つは融合GnTIIIポリペプチド発現用(GnT−III発現ベクター)、及び一つはマンノシダーゼII発現用(ゴルジマンノシダーゼII発現ベクター)で、それぞれ4:4:1:1の比で。細胞を、10%のFCSを補填したDMEM培養培地を使用してTフラスコ中で付着単層培養として増殖させ、それらが50及び80%集密になったときに形質移入した。T150フラスコの形質移入では、FCS(最終10%V/Vで)を補填した25mlのDMEM培養培地に形質移入の24時間前に1500万細胞を播種し、細胞を5%CO大気のインキュベーターに37℃で一晩配した。形質移入される各T150フラスコに対して、DNA、CaCl及び水の溶液を、軽鎖及び重鎖発現ベクター間で均等に分割された94μgの全プラスミドベクターDNA、469μlの最終容量までの水及び469μlの1MのCaCl溶液を混合することによって調製した。この溶液に、938μlの50mMのHEPES、280mMのNaCl、1.5mMのNaHPO溶液(pH7.05)を加え、直ぐに10秒間混合し、室温で20秒間静置した。懸濁液を、2%のFCSを補填した10mlのDMEMで希釈し、既存の培地の代わりにT150に加えた。ついで、更なる13mlの形質移入培地を加えた。細胞を約17から20時間、37℃、5%COでインキュベートし、ついで培地を25mlのDMEM、10%FCSに置換した。条件培養培地を210×gでの15分の遠心分離によって形質移入から7日後に収集し、溶液を滅菌濾過(0.22μmフィルター)し、0.01%w/vの最終濃度のアジ化ナトリウムを加え、4℃に維持した。

Claims (21)

  1. a)抗原に特異的に結合する抗体の2本の修飾型重鎖であって、各重鎖のVHは前記抗体のVLにより置換され、前記修飾型重鎖はFc部分のそのCHドメインを介してお互いに会合している前記抗体の2本の修飾型重鎖;
    b)前記抗体の2本の修飾型重鎖であって、各重鎖のCH1は前記抗体のCLにより置換され、前記修飾型重鎖はFc部分のそのCH3ドメインを介してお互いに会合している前記抗体の2本の修飾型重鎖を含み、
    かつ、a)の重鎖のVLドメインはb)の重鎖のVHドメインと会合しており、かつa)の重鎖のCH1ドメインはb)の重鎖のCLドメインと会合している、抗原結合タンパク質。
  2. a)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインは同じアイソタイプであることを特徴とする、請求項1に記載の抗原結合タンパク質。
  3. a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインは同じアイソタイプであることを特徴とする、請求項2に記載の抗原結合タンパク質。
  4. a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgGのアイソタイプであることを特徴とする、請求項3に記載の抗原結合タンパク質。
  5. a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgG1のアイソタイプであることを特徴とする、請求項4に記載の抗原結合タンパク質。
  6. a)配列番号1のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
    b)配列番号2のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
    a)配列番号3のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
    b)配列番号4のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;又は
    a)配列番号5のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
    b)配列番号6のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;
    を含むことを特徴とする、請求項1に記載の抗原結合タンパク質。
  7. a)の2本の修飾型重鎖、
    又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらかは、
    アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾される(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる)ことを特徴とする、請求項5に記載の抗原結合タンパク質。
  8. a)配列番号1のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
    b)配列番号2のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖を含み、
    ここでa)の2本の修飾型重鎖、
    又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらかは、
    アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾され(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる);
    a)配列番号3のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
    b)配列番号4のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖を含み
    ここでa)の2本の修飾型重鎖、
    又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらかは、
    アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾され(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる);
    又は
    a)配列番号5のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
    b)配列番号6のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖を含み、
    ここでa)の2本の修飾型重鎖、
    又はb)の2本の修飾型重鎖のどちらかは、
    アミノ酸置換、S364G,L368F,D399K及びK409Dにより更に修飾される(ここでアミノ酸の位置はKabatのEUインデックスに従って番号付けられる)ことを特徴とする、請求項1に記載の抗原結合タンパク質。
  9. a)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメイン及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインは異なるアイソタイプであることを特徴とする、請求項1に記載の抗原結合タンパク質。
  10. a)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインはIgG1のアイソタイプであり;
    及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH3ドメインはIgAのアイソタイプであることを特徴とする、請求項9に記載の抗原結合タンパク質。
  11. a)配列番号7のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖;及び
    b)配列番号4のアミノ酸配列を含む2本の修飾型重鎖を含むことを特徴とする、請求項10に記載の抗原結合タンパク質。
  12. a)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgG1のアイソタイプであり;
    及びb)の修飾型重鎖のFc部分のCH2とCH3ドメインはIgAのアイソタイプであることを特徴とする、請求項10に記載の抗原結合タンパク質。
  13. a)及びb)のFc部分のCH2ドメインはIgG1のアイソタイプであり、抗原結合タンパク質は、ヒトIgG1のアイソタイプのAsn297でオリゴ糖(糖)の総量の80%以下のフコースの量でアフコシル化されていることを特徴とする、請求項1から11に記載の一価抗原結合タンパク質。
  14. 請求項1から13に記載の抗原結合タンパク質を含む、薬学的組成物。
  15. 癌の治療において使用のための、請求項1から13に記載の抗原結合タンパク質。
  16. 癌の治療のための医薬の製造のための、請求項1から13に記載の抗原結合タンパク質の使用。
  17. 請求項1から13に記載の抗原結合タンパク質の治療的有効量を患者に投与することにより特徴付けられる、治療法を必要としている患者の治療のための方法。
  18. a)請求項1から13に記載の抗原結合タンパク質をコードする核酸分子を含むベクターで宿主細胞を形質転換し、
    b)前記抗原結合タンパク質分子の合成を許容する条件下で宿主細胞を培養し;及び
    c)前記培養物から前記抗原結合タンパク質分子を回収する工程を含む、請求項1から13に記載の抗原結合タンパク質の調製のための方法。
  19. 請求項1から13に記載の抗原結合タンパク質をコードする核酸。
  20. 請求項19に記載の核酸を含むベクター。
  21. 請求項20に記載のベクターを含む宿主細胞。
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