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JP2004298184A - ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質 - Google Patents

ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質 Download PDF

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JP2004298184A JP2004081622A JP2004081622A JP2004298184A JP 2004298184 A JP2004298184 A JP 2004298184A JP 2004081622 A JP2004081622 A JP 2004081622A JP 2004081622 A JP2004081622 A JP 2004081622A JP 2004298184 A JP2004298184 A JP 2004298184A
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Shigenori Kuramitsu
成紀 倉光
Ryoji Masui
良治 増井
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Osaka University NUC
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Abstract

【課題】 ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質を提供する。
【解決手段】 特定のアミノ酸配列からなるタンパク質は、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する。このタンパク質は、超好熱性古細菌であって、好気性thermoacidophilic crenarchaeonの1種であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)種7(JCM10545)の遺伝子配列から耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を示すと推定される遺伝子をクローニングし、これを大腸菌を用いて発現させることにより得たものである。
【選択図】 図1

Description

本発明は、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質に関する。本出願は、国の委託に係る成果の出願である。
ホスホグリセリン酸キナーゼ(EC2.7.2.3.)は、解糖系においてはATPの存在下に3−ホスホ−D−グリセリン酸に作用して、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸およびADPを生成するホスホトランスフェラーゼの1種である。このような酵素としては、多くの起源から生成され、数多く報告されている(非特許文献1、非特許文献2、非特許文献3、非特許文献4、非特許文献5など参照)。また、好熱性古細菌由来のホスホグリセリン酸キナーゼとして、メタノバクテリウム・ブリアンチイ(Methanobacteriumbryantii)由来のもの、メタノサーマス・フェルビダス(Methanothermus fervidus)由来のもの(非特許文献6参照)、パイロコッカス・ウオセイ(Pyrococcuswoesei)由来のもの(非特許文献7、非特許文献8)などが知られている。
他方、超好熱性古細菌(非特許文献9参照)についての研究があり、スルホロブス属細菌の1種であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)(非特許文献10参照)は、その遺伝子が既に解析されている(非特許文献11参照)。したがって、この超好熱古細菌が、ホスホグリセリン酸キナーゼを産生するとすれば、それは優れた耐熱性を有すると予想され、また前述の好熱性古細菌由来のものとは異なる機能および活性を有する可能性がある。
J. Biol. Chem. 204 (1953) 939-948 Biochim. Biophys. Acta (1947) 292-314 Biochim. Biophys. Acta 65 (1962) 355-357 Biochem. J. 81 (1961) 405-411 Biocheim. Biophys. Acta, 1998 Jul 28;1386(1):179-88 Gene, 91, 19-25 (1990) Gene, 172, 121,(1996) Eur. J. Biochem., 1995 Ocr 1;233(1):227-37 Advances in Protetin Chemistry, Volume 48, Enzymes and Proteins from Hyperthermophilic Microorganisms (M.Adams ed.), Academic Press (1996) Suzuki, T. et al., Extremophiles, 2002 Feb;6(1):39-44 Kawarabayashi,Y. et al., "Complete genome sequence of an aerobic thermoacidophilic crenarchaeon, Sulfolobus tokodaii strain7", DNA Res. 8 (4), 123-140 (2001)
本発明は、このような事情に鑑みなされたものであり、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を持つ新規耐熱性タンパク質の提供を、その目的とする。
前記目的を達成するために、超好熱性古細菌であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)のゲノム情報について調べたところ、この細菌が、ホスホグリセリン酸キナーゼを産生する可能性があることを突き止めた。この知見に基づき、さらに研究を重ねたところ、この細菌の遺伝子から、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を持つ新規タンパク質を発現させることに成功し、本発明に到達した。なお、スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)は、理化学研究所生物基盤研究部微生物系統保存施設に保存されており、第三者の要求により分譲可能である。スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)の生育温度は80℃であり、生育限界温度が87℃であるから、本発明のタンパク質は、80〜87℃の高温であっても活性がある。また、前述の好熱性古細菌が嫌気性であるのに対し、スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)は、好気性であるから、この株由来のホスホグリセリン酸キナーゼは、従来のものと異なる機能および活性を有する可能性がある。
すなわち、本発明のタンパク質は、下記の(a)または(b)のタンパク質である。
(a) 配列番号1のアミノ酸配列からなる耐熱性タンパク質。
(b) 配列番号1のアミノ酸配列において、1つ以上のアミノ酸残基が、欠失、置換、付加若しくは挿入されたアミノ酸配列からなり、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する耐熱性タンパク質。
本発明により、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質が提供できる。
前記ホスホグリセリン酸キナーゼ活性は、ATPの存在下に3−ホスホ−D−グリセリン酸に作用して、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸およびADPを生成する機能である。なお、本発明のタンパク質は、前記反応の逆反応を触媒してもよい。
前述のように、本発明の新規耐熱性タンパク質は、超好熱性古細菌由来であり、具体的には、スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii) (JCM10545)由来である。但し、本発明のタンパク質は、この菌が産生するものに限定されず、遺伝子工学的手法により、他の生物が産生するものであってもよい。
つぎに、本発明の発現ベクターは、前記本発明のタンパク質をコードするDNAまたは配列番号2に記載のDNAを含むベクターである。
つぎに、本発明の形質転換体は、前記本発明のベクターにより形質転換された形質転換体である。なお、宿主は特に制限されず、例えば、大腸菌等がある。
つぎに、本発明のタンパク質の製造方法は、前記本発明の形質転換体を培養する工程と、前記培養工程において発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む製造方法である。
つぎに、本発明の製造方法は、酵素反応により、ATPの存在下、3−ホスホ−D−グリセリン酸から、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸およびADPを製造する方法であって、前記酵素として前記本発明のタンパク質を用い、温度80〜90℃の条件で前記酵素反応を行う製造方法である。
また、本発明の別の製造方法は、酵素反応により、ADPの存在下、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸から3−ホスホ−D−グリセリン酸およびATPを製造する方法であって、前記酵素として前記本発明のタンパク質を用い、温度80〜90℃の条件で前記酵素反応を行う製造方法である。
このように、前記本発明のタンパク質を用いれば、温度80〜90℃の高温領域で酵素反応を実施でき、この結果、ホスホグリセリン酸キナーゼの工業的な用途が広がる。なお、この製造方法において、前記酵素反応のpHは、pH3〜9の範囲が好ましい。
前記2つの本発明の製造方法において、一定時間酵素反応を行った後、キレート剤により前記酵素反応を停止させることもできる。前記キレート剤としては、エチレンジアミン4酢酸(EDTA)が好ましい。
以下、本発明について、さらに詳細に説明する。
本発明者らは、海洋底から採取された超好熱性古細菌であって、好気性thermoacidophilic crenarchaeonの1種であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)種7(JCM10545)の遺伝子配列からシスタチオニン−γ−シンターゼ活性を示すと推定される遺伝子(配列番号2)をクローニングし、これを大腸菌を用いて発現させることにより、本発明の新規耐熱性タンパク質を得るに至った。遺伝子のクローニング方法は、後記した実施例1に記載した通り実施した。クローニングされた遺伝子の塩基配列は配列番号2に示す通りであり、また、その推定アミノ酸配列は配列番号1に示す通りである。なお、本発明の耐熱性タンパク質は、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有していれば、配列番号1のアミノ酸配列において、一つ以上若しくは数個のアミノ酸残基が、欠質、置換、付加若しくは挿入されていてもよい。このアミノ酸配列における「アミノ酸の欠失、置換、付加若しくは挿入」は、当業者に公知の方法(例えば、突然変異誘発法)に従って実施することができる。
本発明のタンパク質は、前述の本発明のタンパク質の製造方法により製造可能であるが、これに限定されず、他の製造方法で製造されてもよい。例えば配列番号1に示すように、そのアミノ酸配列が決定されているタンパク質については、その配列を元に当業者に公知の手法、例えば、個々のアミノ酸を化学的に重合してタンパク質を合成する方法に従って調製することができる。
本発明のタンパク質をコードする遺伝子の一例としては、配列番号2に示す遺伝子がある。前記遺伝子は、例えば、後記する実施例2に示すように超好熱性古細菌スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)のゲノムから、例えば配列番号2で示される塩基配列の一部をプライマーとして用いるPCR法あるいは該DNA断片をプローブとして用いるハイブリダイゼーション法により調製することができる。また、その塩基配列をもとに、当業者に公知である核酸化学合成法等に従って前記遺伝子を得ることもできるが、これらに限定されない。
本発明の発現ベクターは、前記遺伝子もしくは配列番号2のDNAを適当なベクターに挿入することによって得ることができる。本発明の遺伝子を挿入するためのベクターは、宿主中で複製可能なものであれば、特に制限されるものではなく、例えば、プラスミドDNA、ファージDNA、AcMNPVなどのバキュロウイルスなどが挙げられる。プラスミドDNAは、大腸菌やアグロバクテリウムからアルカリ抽出法またはその変法などにより調製することができる。また、市販プラスミドとして、例えばpET-11a(Novagen社製)あるいはバチルス属の宿主を用いて分泌型のプラスミドなどを用いてもよい。これらのプラスミドは、アンピシリン耐性遺伝子、カナマイシン耐性遺伝子、クロラムフェニコール耐性遺伝子などが含まれていてもよい。
ベクターへの遺伝子等の挿入は、例えば、精製された遺伝子の塩基配列を適当な制限酵素で切断し、適当なベクターDNAの制限酵素部位またはマルチクローニングサイトに挿入してベクターに連結する方法などを用いることができるが、これらに限定されない。また、本発明の遺伝子の機能が発揮されるように、本発明の発現ベクターには本発明の遺伝子のほか、プロモーター、ターミネーター、リボソーム結合配列などを組み込んでいてもよい。さらに、本発明の遺伝子も他のタンパク質のコードする配列を融合したものを挿入してもよい。
前記発現ベクターで宿主生物を形質転換すれば、本発明の形質転換体が得られる。宿主生物としては、本発明の遺伝子を発現できるものであれば、特に制限されるものではなく、例えば、大腸菌などの原核生物細胞などが挙げられるが、これらに限定されない。形質転換法としては、既に公知である塩化カルシウム法などを使用することができるが、これらの方法に限定されない。
本発明のタンパク質の製造方法は、前記形質転換体を培養する工程と、前記培養工程において発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む製造方法である。前記培養する方法は、宿主細胞の培養に用いられる通常の方法に従って行われる。大腸菌等の微生物を宿主とした形質転換体を培養する培地としては、微生物が資化し得る炭素源、窒素源、無機塩類などを含有し、形質転換体の培養を効率的に行えるものであれば、天然培地、合成培地などのいずれを用いてもよい。本発明のタンパク質の回収は、特に制限されない。前記タンパク質が菌体内または細胞内に生産される場合には、菌体または細胞を破砕することによって前記タンパク質を回収する。また、本発明の前記タンパク質が菌体外または細胞外に生産される場合には、培養液をそのまま使用するか、遠心分離などにより菌体または細胞を除去した後、タンパク質の単離精製に用いられる一般的な生化学的方法、例えば、硫酸アンモニウム沈殿、ゲルクロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィーなどを単独でまたは適宜組み合わせて用いることにより、培養物中から本発明のタンパク質を単離精製することができる。なお、培養液をそのまま使用する場合、熱処理をすることにより、本発明のタンパク質以外のタンパク質が失活するので、実質上、本発明のタンパク質のみの酵素液として使用できる。
以下に実施例により本発明をさらに詳細に説明するが、本発明はこれらにより限定されない。
染色体DNAの調製
スルフォロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii(JCM10545))をL培地中で37℃にて一晩培養して集菌したものに、SSC溶液 (0.15M NaCl, 0.015M クエン酸ナトリウム)10mL、0.5M EDTA、100mg/ml ニワトリ卵白リゾチーム 0.1mLおよび10%非イオン性界面活性剤Brij-58を0.5mL加え、0℃で30分間放置した後、プロテイナーゼK(Merck社製)5mgを10%SDS 0.2mLに溶かした溶液を加え、37℃で2、3日間放置した。この溶液に水飽和フェノール、クロロホルム、イソアミルアルコールの混合溶液を加えて、37℃で1時間放置した後、水層を分取し、そこへエタノールを加えてDNAを沈殿濃縮した。このDNAの沈殿をTE溶液(10mM Tris-HCl(pH7.5)、1mM EDTA(pH8.0))10mLに溶解し、リボヌクレアーゼ0.25mL(最終濃度0.25mg/mL)を加えて、37℃で一晩放置した後、エタノールで沈殿させた。次いで、DNAをTE溶液5mLに溶解した後、260nmの吸光度より、DNA濃度を決定した(Clarke,L.& Carbon,J.(1979) Methods Enzymol.68,396-408)。
発現プラスミドの構築と遺伝子発現
1.発現プラスミドの構築
耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼ遺伝子の翻訳領域の後ろに制限酵素BamHI、NotIサイトを含むDNAを構築する目的で下記のDNAプライマーを合成し、このプライマーを用いたPCRで耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼ遺伝子の翻訳領域の後ろに制限酵素サイトを導入した。用いたDNAポリメラーゼはKOD-plus-(東洋紡社製)であった。
Forwadr primer(配列番号3):5'-TGATCAAAGTAGCTGACCTTAATATTCCTGTT-3'
Reverse primer(配列番号4):5'-ATATGGATCCGCGGCCGCTTATTAACTTTTTCCACTTTGCAT-3'
PCR反応後、増幅断片を制限酵素BamHIで切断し、その遺伝子断片を精製した。pET-11a(Novagen社製)を制限酵素NdeIで切断し、Klenow fragmentで末端を平滑化した後,制限酵素BamHIでさらに切断したものを精製し、上記の構造遺伝子とT4リガーゼで15℃、30分間反応させ連結した。連結したDNAの一部を大腸菌DH5αのコンピテントセルに導入し、アンピシリンを含むLB寒天プレートに適量まき、37℃で一晩培養し、形質転換体のコロニーを得た。得られた形質転換体をアンピシリンを含むLB培地(18mL)で24時間培養し、その培養液から発現プラスミドを改変アルカリSDS法で精製した。精製プラスミドのインサートの塩基配列は、BigDye Terminator kit(登録商標:Applied Biosystems社製)とABI PRISM 3700 DNA Analyzer(登録商標:Applied Biosystems社製)を用いて決定し、インサートの塩基配列が、耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼ遺伝子の正しい配列であることを確認した。
2.組換え遺伝子の発現
大腸菌 Rosetta-gami(DE3)(Novagen社製)のコンピテントセルを融解して、ファルコンチューブに0.1mL移した。その中に上記1.の精製発現プラスミドの溶液0.002mLを加え氷中に20分間放置した後、42℃でヒートショックを90秒間行い、氷中に1分間放置した後、クロラムフェニコールとアンピシリンを含むLB寒天プレートに適量まき、37℃で一晩培養し、形質転換体を得た。得られた形質転換体をアンピシリンを含むLB培地(5mL)で18時間培養し、耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼ遺伝子を発現した。培養後、遠心分離(13,000G、10分)で集菌した。
集菌した菌体に,破砕液(20mM Tris-HCl、100mM KCl、pH7.5)を0.2mL加え,超音波発生器で細胞を破砕し,その懸濁液を0.1mLずつ2本のサンプルチューブに分けた。一方のサンプルチューブは遠心分離(13,000G、10分)して上清と沈殿に分け,沈殿は破砕液 0.1mLで懸濁した。もう一方のサンプルチューブは,熱処理(70℃,10分)を施した後,遠心分離(13,000G、10分)して上清と沈殿に分け,沈殿は破砕液0.1mLで懸濁した。これらの試料の一部をSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)で分析し,発現を確認できた。この結果を図1のSDS−PAGE写真に示す。
耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼの発現が見られた試料についてSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動を行った後,エレクトロブロッティングによってPVDF膜に転写し,染色によって可視化された目的組換えタンパク質である耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼのバンドを切り出し,プロテインシーケンサーModel492Procise(Applied Biosystems社製)を用いて,アミノ末端配列を解析した結果、配列番号5に示すように6残基のアミノ末端配列を決定できた。この配列より,発現タンパク質が耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼであることを確認できた。この発現タンパク質は、415アミノ酸残基より構成されており、その推定分子量は45.4kDであり、図1の結果とほぼ一致した。
組換え大腸菌の大量培養
実施例2と同様にして調製したプラスミドDNA(pET−11aベクター) を用いて、大腸菌DH5α株を常法に従い形質転換した。形質転換された大腸菌DH5αからアルカリSDS法を用いてプラスミドDNAを抽出した。このプラスミドDNAを用いて、大腸菌ロゼッタ・ガミ(Rosetta-Gami)(DE3)株を形質転換した。プレート上に生えてきたコロニーを3白金耳量とり、5mLのLBL培地(1%ペプトン、0.5%酵母抽出液、0.5%NaCl、0.1%ラクトース、50μg/mLアンピシリン、40μg/mLクロラムフェニコール)に植菌して、培養開始直前まで約6時間、37℃で前培養した。この前培養液を全量、3Lの4×LBL培地(4%ペプトン、2%酵母抽出液、 2%NaCl、50μg/mLアンピシリン)に加え、高密度培養槽(ABLE社製)にて37℃、pH7.2、圧力0.02Paでコンピュータプログラム制御し、培養した。pHは、オートクレーブ済みの2M HCl(和光純薬社製)および2M NaOH(和光純薬社製)で調整した。集菌約23時間前にオートクレーブ済みの300mL発現誘導液(10%ラクトース、20%グリセロール)を加えた。大腸菌の生育度が定常期に入ったところ(培養開始50時間後)で大型遠心分離機(Beckman社製 AvantiHP-30I)を用い集菌した。回収した菌体は、−30℃で保存した。この時、菌体を少量、別に取り、150mM NaCl、20mM Tris−HCl(pH8)、5mM β-メルカプトエタノール(和光純薬社製)に溶解・懸濁し、超音波破砕装置(TOMY社製 UD-201)で破砕した。この溶液を2等分し、一方を9100G 、4℃で10分間、遠心分離し、上清と沈殿に分け、他方を75℃に設定した恒温槽(TAITEC社製DryThermounit DTU-1C)で10分間、加熱した後、9100G 、4℃で10分間、遠心分離し、上清と沈殿に分けた。これら4種の上清および沈殿(沈殿は、菌体破砕液にて再縣濁)に変性剤(62.5mM Tris−HCl(pH6.8)、10%グリセロール、2%SDS、2.4%β−メルカプトエタノール、0.005% ブロムフェノールブルー(和光純薬社製))を加え、95℃で5分間加熱し、変性させた。これらの変性させたタンパク質溶液を12.5%または15%(発現させるタンパク質の分子量により異なる)ポリアクリルアミドゲルに加え、SDS−PAGEにて電気泳動を行った。染色液(Quick-CBB、和光純薬社製)を用い、電気泳動後のゲルを染色・脱色し、目的タンパク質の発現を確認した。
組換えタンパク質の精製
実施例3において、−30℃で保存してあった菌体を、150mM NaCl、20mM Tris−HCl(pH8)、5mM β−メルカプトエタノールに溶解・懸濁し、超音波破砕装置(TOMY社製 UD-201)で破砕し、75℃に設定した恒温槽(TAITEC社製、DryThermoUnit DTU-1C)で、10分間、加熱した後、すばやく冷却した。次に、この破砕菌体液を大型遠心分離機(Beckman社製 Avanti HP-30I)を用いて、100,000Gで1時間、遠心分離し、上清を回収した。
次に、この上清をタンパク質精製装置(Amersham Biosciences社製、AKTA explorer)を用いて、1.05M 硫安、20mM Tris−HCl(pH8.0)、5mM β-メルカプトエタノールの緩衝溶液に置換した後、疎水交換カラム(Amersham Biosciences 社製, RESOURCETMPhe 6ml)に通した。1.05M→0の硫安濃度勾配で溶出させ、各画分をSDS-PAGEにて確認し、目的タンパク質の画分を回収した。
次に、回収した画分を20mM Tris−HCl(pH8.0)、5mM β−メルカプトエタノールの緩衝溶液に置換した後、陰イオン交換カラム(Amersham Biosciences社製、RESOURCETMQ 6ml)に通した。塩化ナトリウムで溶出を行い、溶出してきた各画分をSDS−PAGEにて確認し、目的タンパク質の画分を回収した。
次に、回収した画分を10mM リン酸緩衝溶液 (pH7.0)、0.5mM β−メルカプトエタノールに置換した後、遠心濃縮チューブ(ミリポア社製VIVASPIN10000)を用いて遠心分離して濃縮し、活性測定に供した。
活性測定
1.測定方法
実施例4において精製したタンパク質は、ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)であり、PGKは、生体内では、基質ADPと1,3−ビスホスホグリセリン酸からATPと3−ホスホグリセリン酸を生成する反応を触媒するが、この例では、3−ホスホグリセリン酸(PGA)を用い、下記の種々条件で、逆反応(3−ホスホグリセリン酸+ATP→1,3−ビスホスホグリセリン酸+ADP)の活性測定を行った。すなわち、30mMのNaClと、50mMのMgClと、20mMのATP(オリエンタル酵母社製)と、20mMのPGA(Sigma−Aldrich社製)とを含む反応溶液を後述の各測定温度で1分間保持した後、実施例4において精製したタンパク質を最終濃度が10nMになるように加え、5分間保持した(すなわち、反応時間5分)。その後、反応溶液と等量の0.1MのHPOを加え、反応を止めた。測定は、HPLC(Amersham Biosciences社製AKTA explorer)を用いて陽イオン交換カラム(東ソー社製TSKgel DEAE 2SW)で行い、濾過により除タンパクした反応溶液を15μL採取し、リン酸濃度勾配(50mM〜500mM)により溶出させた。溶出してきたATP、ADPを256nmの波長で検出し、ピークを得た。得られたATPとADPのクロマトグラフィーのピーク面積の和とADPのピーク面積との比から生成物(ADP)の濃度を求めた。
2.至適温度
30、40、50、60、70、80、90、95℃の各温度において、前記測定を行い、比活性を求めた。各温度での比活性は、80℃での測定値を基準(100%)として計算した。測定結果を、表1および図2のグラフに示す。図示のとおり、至適温度が90℃であることが分かった。
Figure 2004298184
3.金属イオンおよびキレート剤が活性に及ぼす影響
1)さらに5mM MgClを加えて前記測定を行った場合の活性を基準(100%)として、2)さらに0.2M EDTAを加えて前記測定を行った場合、3)さらに20mM ZnClを加えて前記測定を行った場合の活性を比較することで、金属イオンおよびキレート剤が活性に及ぼす影響を調べた。反応温度は、80℃とした。測定結果を、表2および図3のグラフに示す。図示のとおり、0.2M EDTAを加えて行った場合には、活性が見られず、キレート剤が反応の阻害に有効であることが分かった。また、20mM ZnClを加えて行った場合には、活性の残留は見られたものの明らかに低下しており、Zn2+が反応の阻害に有効であることが分かった。
Figure 2004298184
4.至適pH
緩衝溶液を、測定温度70℃で目的のpHになるようにしたものに変更し、前記測定を行い、比活性を求めた。測定に用いた緩衝溶液と目的のpHの関係を表3に示す。
Figure 2004298184
各pHでの比活性は、最も活性の高かったpH6.0での測定値を基準(100%)として計算した。測定結果を表4および図4のグラフに示す。図示のとおり、すべてのpHで、最も活性の高かったpH6.0の65%以上の活性を有していた。なお、pH7.0での活性の落ち込みは、等電点近傍であるため、等電点沈殿の影響を受けたものと思われる。したがって、この酵素は、pH3〜9の領域において、等電点付近を除き、均一な活性を有するといえる。
Figure 2004298184
5.熱安定性
前記測定に先立ち、1mMの実施例4において精製したタンパク質溶液(20mM Tris−HCl、5mM β−Me)を、80℃で、30、60、120分間前処理した。前記前処理物を用いて前記測定を行い、比活性を求めた。実施例4において精製したタンパク質の最終濃度は、10nMに代えて100nMとし、反応温度は、80℃とした。なお、前処理時間0時間は、前処理を行っていないものであり、これを基準(100%)として各前処理時間での相対活性を求めた。測定結果を、表5および図5のグラフに示す。図示のとおり、活性に大きな変化は見られず、この範囲での実施例4において精製したタンパク質の完全失活はないことが分かった。
Figure 2004298184
本発明により、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質が提供できる。本発明のタンパク質は、高温下で使用することが可能であり、工業的用途が広がると共に、基質濃度の増加、反応効率の向上、混入微生物の除去、保存期間および耐用期間の延長などの多くの利点がもたらされる。
図1は、本発明の一実施例における組換えタンパク質のSDS-PAGE写真である。 図2は、本発明の一実施例における温度と比活性の関係を示すグラフである。 図3は、本発明の一実施例における金属イオンおよびキレート剤が、精製タンパク質の活性に及ぼす影響を示すグラフである。 図4は、本発明の一実施例におけるpHと比活性の関係を示すグラフである。 図5は、本発明の一実施例における80℃での熱処理時間と比活性の関係を示すグラフである。
配列番号1:耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼのアミノ酸配列
配列番号2:耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼの塩基配列
配列番号3:耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼの構造遺伝子の末端に制限酵素部位BamHIおよびNotIを導入するための順方向プライマーを示す。
配列番号4:耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼの構造遺伝子の末端に制限酵素部位BamHIおよびNotIを導入するための逆方向プライマーを示す。
配列番号5:N末端アミノ酸配列

Claims (12)

  1. 下記の(a)または(b)の耐熱性タンパク質。
    (a) 配列番号1のアミノ酸配列からなるタンパク質。
    (b) 配列番号1のアミノ酸配列において、1つ以上のアミノ酸残基が、欠失、置換、付加若しくは挿入されたアミノ酸配列からなり、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する耐熱性タンパク質。
  2. 前記ホスホグリセリン酸キナーゼ活性が、ATPの存在下に3−ホスホ−D−グリセリン酸に作用して、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸およびADPを生成する機能である請求項1記載のタンパク質。
  3. 超好熱性古細菌由来である請求項1または2記載のタンパク質。
  4. 超好熱性古細菌が、スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii) (JCM10545)である請求項3記載のタンパク質。
  5. 請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質をコードするDNAまたは配列番号2に記載のDNAを含むベクター。
  6. 請求項5記載のベクターにより形質転換された形質転換体。
  7. 請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質の製造方法であって、請求項6記載の形質転換体を培養する工程と、前記培養工程において発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む製造方法。
  8. 酵素反応により、ATPの存在下、3−ホスホ−D−グリセリン酸から、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸およびADPを製造する方法であって、前記酵素として請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質を用い、温度80〜90℃の条件で前記酵素反応を行う製造方法。
  9. 酵素反応により、ADPの存在下、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸から3−ホスホ−D−グリセリン酸およびATPを製造する方法であって、前記酵素として請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質を用い、温度80〜90℃の条件で前記酵素反応を行う製造方法。
  10. 前記酵素反応のpHが、pH3〜9の範囲である請求項8または9記載の製造方法。
  11. 一定時間酵素反応を行った後、キレート剤により前記酵素反応を停止させる請求項8から10のいずれかに記載の製造方法。
  12. 前記キレート剤が、エチレンジアミン4酢酸(EDTA)である請求項11記載の製造方法。


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* Cited by examiner, † Cited by third party
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CN113186185A (zh) * 2020-01-14 2021-07-30 东北林业大学 一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主dna的方法
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