JP2004298184A - ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】 特定のアミノ酸配列からなるタンパク質は、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する。このタンパク質は、超好熱性古細菌であって、好気性thermoacidophilic crenarchaeonの1種であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)種7(JCM10545)の遺伝子配列から耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を示すと推定される遺伝子をクローニングし、これを大腸菌を用いて発現させることにより得たものである。
【選択図】 図1
Description
J. Biol. Chem. 204 (1953) 939-948 Biochim. Biophys. Acta (1947) 292-314 Biochim. Biophys. Acta 65 (1962) 355-357 Biochem. J. 81 (1961) 405-411 Biocheim. Biophys. Acta, 1998 Jul 28;1386(1):179-88 Gene, 91, 19-25 (1990) Gene, 172, 121,(1996) Eur. J. Biochem., 1995 Ocr 1;233(1):227-37 Advances in Protetin Chemistry, Volume 48, Enzymes and Proteins from Hyperthermophilic Microorganisms (M.Adams ed.), Academic Press (1996) Suzuki, T. et al., Extremophiles, 2002 Feb;6(1):39-44 Kawarabayashi,Y. et al., "Complete genome sequence of an aerobic thermoacidophilic crenarchaeon, Sulfolobus tokodaii strain7", DNA Res. 8 (4), 123-140 (2001)
(a) 配列番号1のアミノ酸配列からなる耐熱性タンパク質。
(b) 配列番号1のアミノ酸配列において、1つ以上のアミノ酸残基が、欠失、置換、付加若しくは挿入されたアミノ酸配列からなり、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する耐熱性タンパク質。
スルフォロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii(JCM10545))をL培地中で37℃にて一晩培養して集菌したものに、SSC溶液 (0.15M NaCl, 0.015M クエン酸ナトリウム)10mL、0.5M EDTA、100mg/ml ニワトリ卵白リゾチーム 0.1mLおよび10%非イオン性界面活性剤Brij-58を0.5mL加え、0℃で30分間放置した後、プロテイナーゼK(Merck社製)5mgを10%SDS 0.2mLに溶かした溶液を加え、37℃で2、3日間放置した。この溶液に水飽和フェノール、クロロホルム、イソアミルアルコールの混合溶液を加えて、37℃で1時間放置した後、水層を分取し、そこへエタノールを加えてDNAを沈殿濃縮した。このDNAの沈殿をTE溶液(10mM Tris-HCl(pH7.5)、1mM EDTA(pH8.0))10mLに溶解し、リボヌクレアーゼ0.25mL(最終濃度0.25mg/mL)を加えて、37℃で一晩放置した後、エタノールで沈殿させた。次いで、DNAをTE溶液5mLに溶解した後、260nmの吸光度より、DNA濃度を決定した(Clarke,L.& Carbon,J.(1979) Methods Enzymol.68,396-408)。
1.発現プラスミドの構築
耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼ遺伝子の翻訳領域の後ろに制限酵素BamHI、NotIサイトを含むDNAを構築する目的で下記のDNAプライマーを合成し、このプライマーを用いたPCRで耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼ遺伝子の翻訳領域の後ろに制限酵素サイトを導入した。用いたDNAポリメラーゼはKOD-plus-(東洋紡社製)であった。
Forwadr primer(配列番号3):5'-TGATCAAAGTAGCTGACCTTAATATTCCTGTT-3'
Reverse primer(配列番号4):5'-ATATGGATCCGCGGCCGCTTATTAACTTTTTCCACTTTGCAT-3'
大腸菌 Rosetta-gami(DE3)(Novagen社製)のコンピテントセルを融解して、ファルコンチューブに0.1mL移した。その中に上記1.の精製発現プラスミドの溶液0.002mLを加え氷中に20分間放置した後、42℃でヒートショックを90秒間行い、氷中に1分間放置した後、クロラムフェニコールとアンピシリンを含むLB寒天プレートに適量まき、37℃で一晩培養し、形質転換体を得た。得られた形質転換体をアンピシリンを含むLB培地(5mL)で18時間培養し、耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼ遺伝子を発現した。培養後、遠心分離(13,000G、10分)で集菌した。
実施例2と同様にして調製したプラスミドDNA(pET−11aベクター) を用いて、大腸菌DH5α株を常法に従い形質転換した。形質転換された大腸菌DH5αからアルカリSDS法を用いてプラスミドDNAを抽出した。このプラスミドDNAを用いて、大腸菌ロゼッタ・ガミ(Rosetta-Gami)(DE3)株を形質転換した。プレート上に生えてきたコロニーを3白金耳量とり、5mLのLBL培地(1%ペプトン、0.5%酵母抽出液、0.5%NaCl、0.1%ラクトース、50μg/mLアンピシリン、40μg/mLクロラムフェニコール)に植菌して、培養開始直前まで約6時間、37℃で前培養した。この前培養液を全量、3Lの4×LBL培地(4%ペプトン、2%酵母抽出液、 2%NaCl、50μg/mLアンピシリン)に加え、高密度培養槽(ABLE社製)にて37℃、pH7.2、圧力0.02Paでコンピュータプログラム制御し、培養した。pHは、オートクレーブ済みの2M HCl(和光純薬社製)および2M NaOH(和光純薬社製)で調整した。集菌約23時間前にオートクレーブ済みの300mL発現誘導液(10%ラクトース、20%グリセロール)を加えた。大腸菌の生育度が定常期に入ったところ(培養開始50時間後)で大型遠心分離機(Beckman社製 AvantiHP-30I)を用い集菌した。回収した菌体は、−30℃で保存した。この時、菌体を少量、別に取り、150mM NaCl、20mM Tris−HCl(pH8)、5mM β-メルカプトエタノール(和光純薬社製)に溶解・懸濁し、超音波破砕装置(TOMY社製 UD-201)で破砕した。この溶液を2等分し、一方を9100G 、4℃で10分間、遠心分離し、上清と沈殿に分け、他方を75℃に設定した恒温槽(TAITEC社製DryThermounit DTU-1C)で10分間、加熱した後、9100G 、4℃で10分間、遠心分離し、上清と沈殿に分けた。これら4種の上清および沈殿(沈殿は、菌体破砕液にて再縣濁)に変性剤(62.5mM Tris−HCl(pH6.8)、10%グリセロール、2%SDS、2.4%β−メルカプトエタノール、0.005% ブロムフェノールブルー(和光純薬社製))を加え、95℃で5分間加熱し、変性させた。これらの変性させたタンパク質溶液を12.5%または15%(発現させるタンパク質の分子量により異なる)ポリアクリルアミドゲルに加え、SDS−PAGEにて電気泳動を行った。染色液(Quick-CBB、和光純薬社製)を用い、電気泳動後のゲルを染色・脱色し、目的タンパク質の発現を確認した。
実施例3において、−30℃で保存してあった菌体を、150mM NaCl、20mM Tris−HCl(pH8)、5mM β−メルカプトエタノールに溶解・懸濁し、超音波破砕装置(TOMY社製 UD-201)で破砕し、75℃に設定した恒温槽(TAITEC社製、DryThermoUnit DTU-1C)で、10分間、加熱した後、すばやく冷却した。次に、この破砕菌体液を大型遠心分離機(Beckman社製 Avanti HP-30I)を用いて、100,000Gで1時間、遠心分離し、上清を回収した。
1.測定方法
実施例4において精製したタンパク質は、ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)であり、PGKは、生体内では、基質ADPと1,3−ビスホスホグリセリン酸からATPと3−ホスホグリセリン酸を生成する反応を触媒するが、この例では、3−ホスホグリセリン酸(PGA)を用い、下記の種々条件で、逆反応(3−ホスホグリセリン酸+ATP→1,3−ビスホスホグリセリン酸+ADP)の活性測定を行った。すなわち、30mMのNaClと、50mMのMgCl2と、20mMのATP(オリエンタル酵母社製)と、20mMのPGA(Sigma−Aldrich社製)とを含む反応溶液を後述の各測定温度で1分間保持した後、実施例4において精製したタンパク質を最終濃度が10nMになるように加え、5分間保持した(すなわち、反応時間5分)。その後、反応溶液と等量の0.1MのH3PO4を加え、反応を止めた。測定は、HPLC(Amersham Biosciences社製AKTA explorer)を用いて陽イオン交換カラム(東ソー社製TSKgel DEAE 2SW)で行い、濾過により除タンパクした反応溶液を15μL採取し、リン酸濃度勾配(50mM〜500mM)により溶出させた。溶出してきたATP、ADPを256nmの波長で検出し、ピークを得た。得られたATPとADPのクロマトグラフィーのピーク面積の和とADPのピーク面積との比から生成物(ADP)の濃度を求めた。
30、40、50、60、70、80、90、95℃の各温度において、前記測定を行い、比活性を求めた。各温度での比活性は、80℃での測定値を基準(100%)として計算した。測定結果を、表1および図2のグラフに示す。図示のとおり、至適温度が90℃であることが分かった。
1)さらに5mM MgCl2を加えて前記測定を行った場合の活性を基準(100%)として、2)さらに0.2M EDTAを加えて前記測定を行った場合、3)さらに20mM ZnCl2を加えて前記測定を行った場合の活性を比較することで、金属イオンおよびキレート剤が活性に及ぼす影響を調べた。反応温度は、80℃とした。測定結果を、表2および図3のグラフに示す。図示のとおり、0.2M EDTAを加えて行った場合には、活性が見られず、キレート剤が反応の阻害に有効であることが分かった。また、20mM ZnCl2を加えて行った場合には、活性の残留は見られたものの明らかに低下しており、Zn2+が反応の阻害に有効であることが分かった。
緩衝溶液を、測定温度70℃で目的のpHになるようにしたものに変更し、前記測定を行い、比活性を求めた。測定に用いた緩衝溶液と目的のpHの関係を表3に示す。
前記測定に先立ち、1mMの実施例4において精製したタンパク質溶液(20mM Tris−HCl、5mM β−Me)を、80℃で、30、60、120分間前処理した。前記前処理物を用いて前記測定を行い、比活性を求めた。実施例4において精製したタンパク質の最終濃度は、10nMに代えて100nMとし、反応温度は、80℃とした。なお、前処理時間0時間は、前処理を行っていないものであり、これを基準(100%)として各前処理時間での相対活性を求めた。測定結果を、表5および図5のグラフに示す。図示のとおり、活性に大きな変化は見られず、この範囲での実施例4において精製したタンパク質の完全失活はないことが分かった。
配列番号2:耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼの塩基配列
配列番号3:耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼの構造遺伝子の末端に制限酵素部位BamHIおよびNotIを導入するための順方向プライマーを示す。
配列番号4:耐熱性ホスホグリセリン酸キナーゼの構造遺伝子の末端に制限酵素部位BamHIおよびNotIを導入するための逆方向プライマーを示す。
配列番号5:N末端アミノ酸配列
Claims (12)
- 下記の(a)または(b)の耐熱性タンパク質。
(a) 配列番号1のアミノ酸配列からなるタンパク質。
(b) 配列番号1のアミノ酸配列において、1つ以上のアミノ酸残基が、欠失、置換、付加若しくは挿入されたアミノ酸配列からなり、ホスホグリセリン酸キナーゼ活性を有する耐熱性タンパク質。 - 前記ホスホグリセリン酸キナーゼ活性が、ATPの存在下に3−ホスホ−D−グリセリン酸に作用して、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸およびADPを生成する機能である請求項1記載のタンパク質。
- 超好熱性古細菌由来である請求項1または2記載のタンパク質。
- 超好熱性古細菌が、スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii) (JCM10545)である請求項3記載のタンパク質。
- 請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質をコードするDNAまたは配列番号2に記載のDNAを含むベクター。
- 請求項5記載のベクターにより形質転換された形質転換体。
- 請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質の製造方法であって、請求項6記載の形質転換体を培養する工程と、前記培養工程において発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む製造方法。
- 酵素反応により、ATPの存在下、3−ホスホ−D−グリセリン酸から、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸およびADPを製造する方法であって、前記酵素として請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質を用い、温度80〜90℃の条件で前記酵素反応を行う製造方法。
- 酵素反応により、ADPの存在下、D−1,3−ビスホスホグリセリン酸から3−ホスホ−D−グリセリン酸およびATPを製造する方法であって、前記酵素として請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質を用い、温度80〜90℃の条件で前記酵素反応を行う製造方法。
- 前記酵素反応のpHが、pH3〜9の範囲である請求項8または9記載の製造方法。
- 一定時間酵素反応を行った後、キレート剤により前記酵素反応を停止させる請求項8から10のいずれかに記載の製造方法。
- 前記キレート剤が、エチレンジアミン4酢酸(EDTA)である請求項11記載の製造方法。
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2004
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