DE3842090A1 - Dna mit der genetischen information von l-(alpha)-glycerophosphatoxidase und deren anwendung - Google Patents
Dna mit der genetischen information von l-(alpha)-glycerophosphatoxidase und deren anwendungInfo
- Publication number
- DE3842090A1 DE3842090A1 DE3842090A DE3842090A DE3842090A1 DE 3842090 A1 DE3842090 A1 DE 3842090A1 DE 3842090 A DE3842090 A DE 3842090A DE 3842090 A DE3842090 A DE 3842090A DE 3842090 A1 DE3842090 A1 DE 3842090A1
- Authority
- DE
- Germany
- Prior art keywords
- glycerophosphate
- dna
- amino acid
- gpo
- oxidase
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 title claims description 7
- 108010041921 Glycerolphosphate Dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 67
- 102000000587 Glycerolphosphate Dehydrogenase Human genes 0.000 claims description 67
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 56
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 33
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 26
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 26
- 108010054790 glycerol-3-phosphate oxidase Proteins 0.000 claims description 22
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims description 16
- AWUCVROLDVIAJX-VKHMYHEASA-N sn-glycerol 1-phosphate Chemical compound OC[C@H](O)COP(O)(O)=O AWUCVROLDVIAJX-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 16
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 15
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 14
- GNGACRATGGDKBX-UHFFFAOYSA-N dihydroxyacetone phosphate Chemical compound OCC(=O)COP(O)(O)=O GNGACRATGGDKBX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 14
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 14
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 13
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 12
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 11
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 11
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 claims description 10
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 10
- 239000000872 buffer Substances 0.000 claims description 10
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 9
- 230000009471 action Effects 0.000 claims description 6
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims description 5
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 claims description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 3
- AWUCVROLDVIAJX-UHFFFAOYSA-N alpha-glycerophosphate Natural products OCC(O)COP(O)(O)=O AWUCVROLDVIAJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 230000007774 longterm Effects 0.000 claims description 2
- CSRCBLMBBOJYEX-UHFFFAOYSA-M sodium;2-morpholin-4-ylethanesulfonic acid;hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+].OS(=O)(=O)CCN1CCOCC1 CSRCBLMBBOJYEX-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 6
- AWUCVROLDVIAJX-GSVOUGTGSA-N sn-glycerol 3-phosphate Chemical compound OC[C@@H](O)COP(O)(O)=O AWUCVROLDVIAJX-GSVOUGTGSA-N 0.000 claims 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 52
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 26
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 25
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 25
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 18
- 101150034348 gpo gene Proteins 0.000 description 17
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 16
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 13
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 13
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 12
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 12
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 11
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 8
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 8
- 241000194031 Enterococcus faecium Species 0.000 description 7
- 241000192001 Pediococcus Species 0.000 description 7
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 7
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 7
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 7
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M sodium hydroxide Inorganic materials [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 7
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 6
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 description 6
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 description 6
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 239000007621 bhi medium Substances 0.000 description 6
- 238000000354 decomposition reaction Methods 0.000 description 6
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 description 6
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 description 6
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 description 6
- 238000011160 research Methods 0.000 description 6
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 6
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 5
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 5
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 5
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 5
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 5
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 5
- 108020000946 Bacterial DNA Proteins 0.000 description 4
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000194032 Enterococcus faecalis Species 0.000 description 4
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000194022 Streptococcus sp. Species 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 4
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 4
- 239000000047 product Substances 0.000 description 4
- FGDZQCVHDSGLHJ-UHFFFAOYSA-M rubidium chloride Chemical compound [Cl-].[Rb+] FGDZQCVHDSGLHJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 4
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000193792 Aerococcus viridans Species 0.000 description 3
- 241000186660 Lactobacillus Species 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000191998 Pediococcus acidilactici Species 0.000 description 3
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 3
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 3
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 3
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 3
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 3
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 3
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 3
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 3
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 3
- VOAXAOULFRTTAM-UHFFFAOYSA-N chloroform phenol Chemical compound C1(=CC=CC=C1)O.C(Cl)(Cl)Cl.C1(=CC=CC=C1)O.C1(=CC=CC=C1)O VOAXAOULFRTTAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 3
- 238000003759 clinical diagnosis Methods 0.000 description 3
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 3
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 3
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 3
- 229940039696 lactobacillus Drugs 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 3
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 3
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 3
- 239000012046 mixed solvent Substances 0.000 description 3
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 3
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-SVZMEOIVSA-N (+)-Galactose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-SVZMEOIVSA-N 0.000 description 2
- AZQWKYJCGOJGHM-UHFFFAOYSA-N 1,4-benzoquinone Chemical compound O=C1C=CC(=O)C=C1 AZQWKYJCGOJGHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000193798 Aerococcus Species 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 2
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 2
- 241001452028 Escherichia coli DH1 Species 0.000 description 2
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 2
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 2
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N Indole Chemical compound C1=CC=C2NC=CC2=C1 SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical class [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 2
- QIAFMBKCNZACKA-UHFFFAOYSA-N N-benzoylglycine Chemical compound OC(=O)CNC(=O)C1=CC=CC=C1 QIAFMBKCNZACKA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 2
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- 241000529920 Pediococcus parvulus Species 0.000 description 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 2
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 2
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 2
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 2
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 2
- 101000702488 Rattus norvegicus High affinity cationic amino acid transporter 1 Proteins 0.000 description 2
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 2
- 244000057717 Streptococcus lactis Species 0.000 description 2
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 2
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Chemical compound CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008186 active pharmaceutical agent Substances 0.000 description 2
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N aldehydo-D-ribose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 2
- 150000004716 alpha keto acids Chemical class 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000005018 casein Substances 0.000 description 2
- 235000021240 caseins Nutrition 0.000 description 2
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 2
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 2
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 2
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 2
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 2
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 2
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 2
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 2
- CXKWCBBOMKCUKX-UHFFFAOYSA-M methylene blue Chemical compound [Cl-].C1=CC(N(C)C)=CC2=[S+]C3=CC(N(C)C)=CC=C3N=C21 CXKWCBBOMKCUKX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 229960000907 methylthioninium chloride Drugs 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000006916 nutrient agar Substances 0.000 description 2
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 2
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 2
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 2
- 239000000049 pigment Substances 0.000 description 2
- SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M potassium acetate Chemical compound [K+].CC([O-])=O SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 2
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 235000019333 sodium laurylsulphate Nutrition 0.000 description 2
- ATHGHQPFGPMSJY-UHFFFAOYSA-N spermidine Chemical compound NCCCCNCCCN ATHGHQPFGPMSJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 239000010414 supernatant solution Substances 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZIOHCWMCYWCOS-RXMQYKEDSA-N (2s)-2-amino-3,3-dimethylpentanedioic acid Chemical compound OC(=O)CC(C)(C)[C@H](N)C(O)=O KZIOHCWMCYWCOS-RXMQYKEDSA-N 0.000 description 1
- OIXLLKLZKCBCPS-RZVRUWJTSA-N (2s)-2-azanyl-5-[bis(azanyl)methylideneamino]pentanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N.OC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N OIXLLKLZKCBCPS-RZVRUWJTSA-N 0.000 description 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- CDAISMWEOUEBRE-LKPKBOIGSA-N 1D-chiro-inositol Chemical compound O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O CDAISMWEOUEBRE-LKPKBOIGSA-N 0.000 description 1
- IVLXQGJVBGMLRR-UHFFFAOYSA-N 2-aminoacetic acid;hydron;chloride Chemical compound Cl.NCC(O)=O IVLXQGJVBGMLRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YVOOPGWEIRIUOX-UHFFFAOYSA-N 2-azanyl-3-sulfanyl-propanoic acid Chemical compound SCC(N)C(O)=O.SCC(N)C(O)=O YVOOPGWEIRIUOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UJKDYMOBUGTJLZ-UHFFFAOYSA-N 2-azanylpentanedioic acid Chemical compound OC(=O)C(N)CCC(O)=O.OC(=O)C(N)CCC(O)=O UJKDYMOBUGTJLZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JRBJSXQPQWSCCF-UHFFFAOYSA-N 3,3'-Dimethoxybenzidine Chemical compound C1=C(N)C(OC)=CC(C=2C=C(OC)C(N)=CC=2)=C1 JRBJSXQPQWSCCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-N Adenosine triphosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 241000500353 Aerococcus urinaeequi Species 0.000 description 1
- PLXMOAALOJOTIY-FPTXNFDTSA-N Aesculin Natural products OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1Oc2cc3C=CC(=O)Oc3cc2O PLXMOAALOJOTIY-FPTXNFDTSA-N 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 101710130006 Beta-glucanase Proteins 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical class [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N Calcium cation Chemical compound [Ca+2] BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000016938 Catalase Human genes 0.000 description 1
- 108010053835 Catalase Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-CUHNMECISA-N D-Cellobiose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-CUHNMECISA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- UNXHWFMMPAWVPI-QWWZWVQMSA-N D-Threitol Natural products OC[C@@H](O)[C@H](O)CO UNXHWFMMPAWVPI-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 1
- QWIZNVHXZXRPDR-UHFFFAOYSA-N D-melezitose Natural products O1C(CO)C(O)C(O)C(O)C1OC1C(O)C(CO)OC1(CO)OC1OC(CO)C(O)C(O)C1O QWIZNVHXZXRPDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002271 DEAE-Sepharose Polymers 0.000 description 1
- ZGTMUACCHSMWAC-UHFFFAOYSA-L EDTA disodium salt (anhydrous) Chemical compound [Na+].[Na+].OC(=O)CN(CC([O-])=O)CCN(CC(O)=O)CC([O-])=O ZGTMUACCHSMWAC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- UNXHWFMMPAWVPI-UHFFFAOYSA-N Erythritol Natural products OCC(O)C(O)CO UNXHWFMMPAWVPI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 1
- 241001131785 Escherichia coli HB101 Species 0.000 description 1
- 241001302584 Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 Species 0.000 description 1
- 241001524679 Escherichia virus M13 Species 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- 102000057621 Glycerol kinases Human genes 0.000 description 1
- 108700016170 Glycerol kinases Proteins 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N Guanine Natural products O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010018910 Haemolysis Diseases 0.000 description 1
- 229920001202 Inulin Polymers 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N L-rhamnopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N 0.000 description 1
- PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N L-rhamnose Natural products CC(O)C(O)C(O)C(O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000186840 Lactobacillus fermentum Species 0.000 description 1
- 241001134654 Lactobacillus leichmannii Species 0.000 description 1
- 241000218588 Lactobacillus rhamnosus Species 0.000 description 1
- 241000194034 Lactococcus lactis subsp. cremoris Species 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000192132 Leuconostoc Species 0.000 description 1
- 241000192130 Leuconostoc mesenteroides Species 0.000 description 1
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 description 1
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 description 1
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 239000007993 MOPS buffer Substances 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical class [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 229910002651 NO3 Inorganic materials 0.000 description 1
- NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N Nitrate Chemical compound [O-][N+]([O-])=O NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GBDLMECRPIKBSW-IJIOZTSFSA-N OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO.OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C(=O)CO Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO.OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C(=O)CO GBDLMECRPIKBSW-IJIOZTSFSA-N 0.000 description 1
- 241000604136 Pediococcus sp. Species 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical class [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Propanedioic acid Natural products OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N Raffinose Natural products O(C[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O[C@@]2(CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O1)[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N 0.000 description 1
- 241000158504 Rhodococcus hoagii Species 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 1
- NGFMICBWJRZIBI-JZRPKSSGSA-N Salicin Natural products O([C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O1)c1c(CO)cccc1 NGFMICBWJRZIBI-JZRPKSSGSA-N 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 235000014962 Streptococcus cremoris Nutrition 0.000 description 1
- 241000264435 Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis Species 0.000 description 1
- 241000194049 Streptococcus equinus Species 0.000 description 1
- 241000193996 Streptococcus pyogenes Species 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N Thymine Natural products CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N UNPD196149 Natural products OC1C(O)C(CO)OC1(CO)OC1C(O)C(O)C(O)C(COC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)O)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010046334 Urease Proteins 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- ROWKJAVDOGWPAT-UHFFFAOYSA-N acetyl methyl carbinol Natural products CC(O)C(C)=O ROWKJAVDOGWPAT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 238000005377 adsorption chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000005273 aeration Methods 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N alpha-hydroxysuccinic acid Natural products OC(=O)C(O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NGFMICBWJRZIBI-UHFFFAOYSA-N alpha-salicin Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1=CC=CC=C1CO NGFMICBWJRZIBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 239000001166 ammonium sulphate Substances 0.000 description 1
- 230000003698 anagen phase Effects 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229940009098 aspartate Drugs 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical group [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- DLRVVLDZNNYCBX-ZZFZYMBESA-N beta-melibiose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O1 DLRVVLDZNNYCBX-ZZFZYMBESA-N 0.000 description 1
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 1
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 1
- 229910052792 caesium Inorganic materials 0.000 description 1
- TVFDJXOCXUVLDH-UHFFFAOYSA-N caesium atom Chemical compound [Cs] TVFDJXOCXUVLDH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Chemical class 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910001424 calcium ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical group 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 150000001722 carbon compounds Chemical class 0.000 description 1
- 150000004649 carbonic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N casein, tech. Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CC(C)C)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(C(C)O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(COP(O)(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(N)CC1=CC=CC=C1 BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 1
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Natural products OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 238000004040 coloring Methods 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Natural products NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000003544 deproteinization Effects 0.000 description 1
- 238000011033 desalting Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- AIUDWMLXCFRVDR-UHFFFAOYSA-N dimethyl 2-(3-ethyl-3-methylpentyl)propanedioate Chemical class CCC(C)(CC)CCC(C(=O)OC)C(=O)OC AIUDWMLXCFRVDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CHFUHGDBYUITQJ-UHFFFAOYSA-L dipotassium;2,3-dihydroxypropyl phosphate Chemical compound [K+].[K+].OCC(O)COP([O-])([O-])=O CHFUHGDBYUITQJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- XHCADAYNFIFUHF-TVKJYDDYSA-N esculin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC(C(=C1)O)=CC2=C1OC(=O)C=C2 XHCADAYNFIFUHF-TVKJYDDYSA-N 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 1
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-GUCUJZIJSA-N galactitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-GUCUJZIJSA-N 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 230000009229 glucose formation Effects 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000008588 hemolysis Effects 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000037 hydrogen sulfide Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- GFAZHVHNLUBROE-UHFFFAOYSA-N hydroxymethyl propionaldehyde Natural products CCC(=O)CO GFAZHVHNLUBROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N indole Natural products CC1=CC=CC2=C1C=CN2 PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N indolenine Natural products C1=CC=C2CC=NC2=C1 RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 229940029339 inulin Drugs 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940012969 lactobacillus fermentum Drugs 0.000 description 1
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 description 1
- 235000019626 lipase activity Nutrition 0.000 description 1
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 230000002934 lysing effect Effects 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L manganese(2+);methyl n-[[2-(methoxycarbonylcarbamothioylamino)phenyl]carbamothioyl]carbamate;n-[2-(sulfidocarbothioylamino)ethyl]carbamodithioate Chemical class [Mn+2].[S-]C(=S)NCCNC([S-])=S.COC(=O)NC(=S)NC1=CC=CC=C1NC(=S)NC(=O)OC WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- QWIZNVHXZXRPDR-WSCXOGSTSA-N melezitose Chemical compound O([C@@]1(O[C@@H]([C@H]([C@@H]1O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)O)CO)CO)[C@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O QWIZNVHXZXRPDR-WSCXOGSTSA-N 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- HEBKCHPVOIAQTA-UHFFFAOYSA-N meso ribitol Natural products OCC(O)C(O)C(O)CO HEBKCHPVOIAQTA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 235000013379 molasses Nutrition 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910017464 nitrogen compound Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002830 nitrogen compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 229940066779 peptones Drugs 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Chemical class 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011056 potassium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011600 potassium glycerophosphate Substances 0.000 description 1
- 235000000491 potassium glycerophosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 239000013587 production medium Substances 0.000 description 1
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 1
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 1
- NGFMICBWJRZIBI-UJPOAAIJSA-N salicin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CC=CC=C1CO NGFMICBWJRZIBI-UJPOAAIJSA-N 0.000 description 1
- 229940120668 salicin Drugs 0.000 description 1
- 239000013605 shuttle vector Substances 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- HDARHUHTZKLJET-UHFFFAOYSA-M sodium;3-(n-ethyl-3,5-dimethoxyanilino)-2-hydroxypropane-1-sulfonate Chemical compound [Na+].[O-]S(=O)(=O)CC(O)CN(CC)C1=CC(OC)=CC(OC)=C1 HDARHUHTZKLJET-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 229960000268 spectinomycin Drugs 0.000 description 1
- UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N spectinomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](NC)[C@@H](O)[C@H]([C@@H]([C@H]1O1)O)NC)[C@]2(O)[C@H]1O[C@H](C)CC2=O UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N 0.000 description 1
- 229940063673 spermidine Drugs 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 150000003467 sulfuric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- UFTFJSFQGQCHQW-UHFFFAOYSA-N triformin Chemical compound O=COCC(OC=O)COC=O UFTFJSFQGQCHQW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007738 vacuum evaporation Methods 0.000 description 1
- 238000009777 vacuum freeze-drying Methods 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 1
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 1
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Description
Die Erfindung betrifft eine DNA, welche die genetische
Information für L-α -Glycerophosphatoxidase umfaßt, einen
Transformanten, der diese DNA besitzt, ein Polypeptid,
das erzeugt wird, indem man den Transformanten dazu
bringt, eine Expression der genetischen Information
der DNA durchzuführen, sowie ein Verfahren zur Herstellung
der L-α -Glycerophosphatoxidase.
L-α -Glycerophosphatoxidase ist ein Enzym, das eine enzymatische
Reaktion katalysiert, bei der aus L-α -Glycerophosphat
und 1 Mol Sauerstoff Dihydroxyacetonphosphat
und 1 Mol Wasserstoffperoxid gebildet werden, und zwar
gemäß der folgenden Reaktionsformel:
L-α -Glycerophosphat + O2 → Dihydroxyacetonphosphat + H2O2
Da es sich bei L-α -Glycerophosphatoxidase (im folgenden
als GPO abgekürzt) um eine Oxidase handelt, deren Substrat
L-α -Glycerophosphat ist, kann man, wie aus der
obigen Reaktionsformel hervorgeht, sie zur quantitativen
Bestimmung von L-α -Glycerophosphat verwenden. Darüber
hinaus ermöglicht dieses Enzym, wenn es in Kombination
mit anderen Enzymen, wie Lipase, Glycerinkinase oder
dergl., oder mit einem ATP-Reagens verwendet wird, ein
einfaches und spezifisches Bestimmungsverfahren für die
Komponenten, die bei der Reaktion involviert sind, wie
Lipaseaktivität, Triglycerid, Glycerin, ATP und dergl.
Aus diesen Gründen stellt L-α -Glycerophosphatoxidase ein
Hauptenzym für biochemische, quantitative Analyseverfahren
dar, welche die herkömmlichen, nichtspezifischen,
chemischen, quantitativen Analyseverfahren zunehmend ersetzen.
Das Enzym ist somit äußerst brauchbar auf den
Gebieten der klinischen Diagnose sowie, ganz allgemein,
auf dem Gebiet der Forschung.
Man weiß seit langem, daß GPO in der Natur vorkommt. Beispielsweise
wurde berichtet, daß das Enzym in Mikroorganismen
existiert, welche beispielsweise zu Gattungen,
wie Streptococcus, Lactobacillus, Leuconostock, Pediococcus
und Aerococcus, gehören (Archives of Biochemistry
and Biophysics, 88, 250 [1960]; JP-OS 72 892/1978 und
15 746/1980).
Die Herstellung von GPO durch diese herkömmlichen,
bekannten, GPO-erzeugenden Mikroorganismen wirft jedoch
verschiedene Probleme auf. Genauer gesagt, wird mit allen
der bekannten GPO-erzeugenden Mikroorganismen lediglich
eine niedrige GPO-Produktivität erreicht. GPO-erzeugende
Mikroorganismen, die zu dem Stamm Streptococcae
und dem Stamm Lactobacillae gehören, erfordern die Zugabe
einer Substanz, welche die Produktion von GPO induziert,
wie Glycerin, Ascorbinsäure, α -Ketosäure oder
dergl. Darüber hinaus ist die Eliminierung anderer Enzyme
und unerwünschter Nebenprodukte, welche gemeinsam
mit GPO in dem Produkt dieser Mikroorganismen existieren,
äußerst schwierig. Wegen dieser Probleme konnte bisher
ein qualitativ hochwertiges GPO lediglich zu äußerst hohen
Kosten erzeugt werden, wodurch eine breite Anwendung
von GPO als Reagens für Forschungszwecke und für klinische
Diagnose bisher verhindert wurde.
Darüber hinaus gibt es bisher keine Berichte betreffend
die detaillierte Primärstruktur des GPO-Gens noch die
Primärstruktur der Aminosäuresequenz für das Protein,
welches GPO aufbaut.
Von den Erfindern wurde umfangreiche Untersuchungen mit
dem Ziel durchgeführt, die Produktivität von GPO zu steigern
und die Menge der anderen coexistierenden Enzyme
(verunreinigenden Enzyme), die in dem Produkt enthalten
sind, zu reduzieren. Dabei ist es den Erfindern gelungen,
das GPO-Gen zu separieren und dessen Primärstruktur
aufzuklären. Die Erfindung haben ferner durch die Anwendung
von Genetic Engineering-Techniken ein Verfahren entwickelt,
das geeignet ist, GPO mit hoher Produktivität
zu erzeugen, ohne irgendwelche Zusätze zur Induzierung
der GPO-Produktion in dem Produktionsmedium zu verwenden.
Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist somit die Schaffung
von DNA mit einer Basensequenz, die für eine Aminosäuresequenz
eines Polypeptids codiert, das L-α -Glycerophosphatoxidase
(GPO) aufbaut, eines Transformanten,
welcher dieser DNA aufweist, eines Polypeptids, das GPO-
Aktivität hat und durch Kultivierung des Transformanten
erzeugt wird, einer GPO mit überlegenen physiko-chemischen
Eigenschaften sowie eines Verfahrens zur Herstellung
einer derartigen GPO.
Andere Aufgaben, Merkmale und Vorteile der Erfindung werden
aus der folgenden Beschreibung noch deutlicher.
In Fig. 1 ist schematisch der Aufbau von Plasmid
pGPOS1 dargestellt.
Die DNA der vorliegenden Erfindung kann beispielsweise
nach der folgenden Verfahrensweise unter Anwendung von
Genetic Engineering-Techniken hergestellt werden. Zunächst
wird die DNA eines Mikroorganismus, der den GPO-
Gendonor darstellt und die Fähigkeit zur GPO-Produktion
aufweist, abgetrennt und gereinigt. Diese DNA wird verdaut,
wobei man Ultraschallwellen oder eine Restriktionsendonuclease
verwendet. Diese verdaute DNA und eine
Expressionsvektor-DNA, welche linear gemacht wird, werden
mit einer DNA-Ligase oder dergl. an den abgestumpften
oder kohäsiven Enden der beiden DNAs unter Bildung
eines geschlossenen Kreises verbunden. Der auf diese
Weise erhaltene, rekombinante DNA-Vektor wird in einen
reproduzierbaren Wirtsmikroorganismus eingeführt. Mikroorganismen,
welche den rekombinanten DNA-Vektor aufweisen,
werden mittels Screeningverfahren unter Verwendung
des Vektormarkers und der GPO-Aktivität als Indikatoren
ausgewählt und kultiviert. Der rekombinante DNA-Vektor
wird dann aus den kultivierten Zellen abgetrennt und
gereinigt. Die DNA, welche die genetische Information
der GPO besitzt und den Gegenstand der vorliegenden Erfindung
darstellt, wird anschließend von dem rekombinanten
DNA-Vektor abgetrennt.
Als GPO-Gen-Donatormikroorganismus für die Zwecke der
vorliegenden Erfindung können beliebige Mikroorganismen
mit der Fähigkeit zur GPO-Produktion verwendet werden.
Beispiele sind GPO-produzierende Mikroorganismen, die
zur Gattung Streptococcus gehören und beispielsweise in
den JP-OS 72 892/1978, 15 746/1980, 1 65 789/1978 und
dergl. beschrieben sind, einschließlich die Stämme
Streptococcus faecium F-24, Streptococcus faecalis 10C1,
Streptococcus faecium ATCC 12755, Streptococcus faecium
ATCC 8043, Streptococcus faecalis ATCC 19488, Streptococcus
cremoris NRRL B684 und dergl.; GPO-produzierende
Mikroorganismen, die zur Gattung Pediococcus gehören,
einschließlich die Stämme Pediococcus cerevisiae ATCC
8042, (Pediococcus acidilactici ATCC 8042), Pediococcus
cerevisiae ATCC 8081 (Pediococcus acidilactici ATCC
8081), Prediococcus cerevisiae IFO 12230 (Pediococcus
pentasaceus IFO 12230), Pediococcus acidilactici IFO
3885, Pediococcus pentasaceus IFO 12318, Pediococcus
parvulus IFO 12235 (Pediococcus parvulus IFO 19371),
Pediococcus homari IFO 12217 (Pediococcus sp. IFO 12217),
Pediococcus urinae-equi ATCC 29722 (Pediococcus urinae-
equi IFO 12173) und dergl.; GPO-produzierende Mikroorganismen,
die zur Gattung Lactobacillus gehören, einschließlich
die Stämme Lactobacillus delbruckii NRRL
B445 (Lactobacillus casei subsp.rhamnosus ATCC 10863),
L.delbruckii NRRL B445, Lactobacillus fermentum NRRL
8338, Lactobacillus leichmannii ATCC 4797 und dergl.;
CPO-produzierende Mikroorganismen, die zur Gattung
Leuconostoc gehören, einschließlich die Stämme Leuconostoc
mesenteroides und dergl.; sowie GPO-produzierende
Mikroorganismen, die zur Gattung Aerococcus gehören,
einschließlich die Stämme Aerococcus viridans IFO
12219, Aerococcus viridans IFO 12317 und dergl. Unter
diesen sind GPO-produzierende Mikroorganismen, die zur
Gattung Streptococcus gehören, besonders bevorzugt.
Von den Erfindern wurden weitere, umfangreiche Forschungen
durchgeführt, um eine GPO herzustellen, die keinen
Defekt zeigt, wie er bei allen bekannten Enzymen inhärent
ist. Im Zuge dieser Forschungen wurden entdeckt, daß
ein neuer Stamm GPOS-53, der zur Gattung Streptococcus
gehört und der aus dem Boden einer Ranch bei Yamaguchi,
Susono City, Shizuoka-Präfektur, Japan, isoliert wurde,
eine GPO mit überlegenen physiko-chemischen Eigenschaften
erzeugt. Dieser Stamm GPOS-53 stellt einen besonders
bevorzugten Mikroorganismus für die Erzeugung des GPO-
Gens dar.
Die taxonomischen Charakteristika dieses neuen Stamms
GPOS-53 sind wie folgt:
Filiformes Wachstum, jedoch ziemlich schwach, cremige
oder milchigweiße Färbung. Lösliches Pigment wird
nicht gebildet.
Kolonien sind kreisförmig, konvex geformt und cremig
oder milchigweiß gefärbt. Lösliches Pigment wird nicht
gebildet.
Gutes Zellwachstum mit trübe werdender Brühe. Die Zellen
präzipitieren anschließend, und der Überstand wird
klar.
Die Kulturbrühe wird sauer.
Die Zellen sind sphärisch oder ovoid. Man findet einzelne,
nichtverknüpfte Zellen, zweikettige Zellen und
langkettige Zellen. Die Zellen sind nicht bewegungsfähig
und bilden keine Sporen. Die Größe der Zellen ist
0,8 bis 1,0 μm.
In den folgenden Beschreibungen steht "+" für positiv,
"-" für negativ und "(+)" für schwach positiv.
| Gramanfärbung | ||
| + | ||
| KOH-Reaktion | - | |
| Säure-Schnellanfärbung | - | |
| Kapselbildung | - | |
| OF-Test (Hugh Leifson) | F | |
| Wachstum unter anaeroben Bedingungen | + | |
| Wachstumstemperatur @ | 45°C | + |
| 30°C | + | |
| 10°C | + | |
| Salzresistenz bei NaCl-Konz. @ | 0% | + |
| 5,0% | + | |
| 6,0% | - | |
| Wachstum bei pH @ | 9,5 | + |
| 8,0 | + | |
| 4,0 | + | |
| Wachstum in einem Methylenblau-Milchmedium | + | |
| Catalasebildung | - | |
| Oxidasebildung | - | |
| Ureasebildung (sowohl für SSR als auch Chris) | - | |
| Gelatine-Zersetzung | - | |
| Casein-Zersetzung | + | |
| Äsculinhydrolyse | + | |
| Hippurat-Zersetzung (API 20 STREP) | + | |
| Cellulose-Zersetzung | - | |
| Arginin-Zersetzung | + | |
| Indol-Bildung | - | |
| Hydrogensulfid-Bildung | - | |
| Acetoin-Bildung (NaCl) | + | |
| MR-Test | + | |
| Nitrat-Reduktion | - | |
| Denitrifikation | - | |
| Nutzungstest @ | Citronensäure (sowohl für Simons als auch für Chris) | - |
| Apfelsäure @ | (für Simons) | - |
| (für Chris) | + | |
| Propionsäure (für Simons) | - | |
| Malonsäure (für Chris) | + | |
| Gasbildung aus Glucose | - | |
| Bildung von Säure aus Kohlenhydrat @ | Adonit | - |
| L(+)-Arabinose | + | |
| Cellobiose | + | |
| Dulcit | - | |
| meso-Erythrit | - | |
| Fructose | + | |
| D-Galactose | + | |
| D-Glucose | + | |
| Glycerin | (+) | |
| Inosit | - | |
| Inulin | - | |
| Lactose | + | |
| Maltose | + | |
| Mannit | + | |
| Mannose | + | |
| Melibiose | + | |
| Melezitose | - | |
| Raffinose | + | |
| L(+)-Rhamnose | - | |
| D-Ribose | + | |
| Salicin | + | |
| L-Sorbose | - | |
| Sorbit | - | |
| Stärke | + | |
| Saccharose | + | |
| Xylose | - | |
| Trehalose | + | |
| Hämolyse (API 20 STREP) | - |
Aufgrund der obigen mycologischen Charakteristika kann
der neue Mikroorganismus der vorliegenden Erfindung als
grampositiver, sphärischer oder ovoider Mikroorganismus
bezeichnet werden, der einzeln, in Paaren oder langkettig
vorkommt, unfähig zur Bildung von Catalase oder
Oxidase ist, Kohlenhydrate fermentativ unter Bildung
von Säuren zersetzt, bewegungsunfähig ist, keine Sporen
bilden kann und eine Größe von 0,8 bis 1,0 μm besitzt.
Gemäß der Beschreibung in Bergey's Mannual of Determinative
Bacteriology (8. Auflage) wird dieser Mikroorganismus
der Gattung Streptococcus zugehörig beurteilt.
Mikroorganismen, die zur Gattung Streptococcus gehören
(im folgenden auch einfach mit "S." bezeichnet) können
in Gruppen eingeteilt werden gemäß ihrer Fähigkeit, bei
10°C und 45°C zu wachsen, in einem 0,1% Methylenblau-
Milchmedium zu wachsen, Gelatine zu zersetzen, Salzresistenz
zu zeigen und dergl. Ein Vergleich der Hauptstämme
der Gattung Streptococcus und des Mikroorganismus
der vorliegenden Erfindung im Hinblick auf diese
Charakteristika ist in der nachfolgenden Tabelle zusammengestellt.
Die folgenden Mikroorganismen wurden für
den Vergleich verwendet:
(1) S. pyogenes
(2) S. equisimilis
(3) S. equi
(4) S. pneumoniae
(5) S. salivaris
(6) S. bovis
(7) S. faecalis
(8) S. faecium
(9) S. lactis
(10) erfindungsgem. Mikroorganismus
(2) S. equisimilis
(3) S. equi
(4) S. pneumoniae
(5) S. salivaris
(6) S. bovis
(7) S. faecalis
(8) S. faecium
(9) S. lactis
(10) erfindungsgem. Mikroorganismus
Aufgrund des obigen Vergleichs wird der erfindungsgemäße
Mikroorganismus dahingehend beurteilt, daß es sich
um einen Stamm handelt, der ähnlich ist wie S. faecalis,
S. faecium und S. lactis. Diese drei Stämme und der erfindungsgemäße
Mikroorganismus werden in der nachfolgenden
Tabelle noch genauer verglichen.
Gemäß dem obigen Vergleich ist der erfindungsgemäße
Mikroorganismus dem S. faecium sehr ähnlich. Er unterscheidet
sich jedoch von S. faecium hinsichtlich der
Hippurat-Zersetzungsfähigkeit und der Salzresistenz
(6,5%), Merkmale, die für einen Mikroorganismus indikativ
sind, der zur Gattung Streptococcus gehört. Dieser
Mikroorganismus wurde daher als zur Gattung Streptococcus
gehörender Mikroorganismus identifiziert und als
Streptococcus sp. GPOS-53 bezeichnet. Der Mikroorganismus
wurde bei Fermentation Research Institute, Agency
of Industrial Science and Technology hinterlegt (Hinterlegungs-
Nr. 2120, FERM BP-2120).
Im folgenden wird die Methode erläutert, mit der DNA-
induziert durch den Genspender-Mikroorganismus, erhalten
wird. Zunächst wird irgendein beliebiges der oben
erwähnten Gen-spendenden Mikroorganismen in einem flüssigen
Kulturmedium unter Belüftung 1 bis 3 Tage kultiviert.
Die Kulturbrühe wird zentrifugiert, um die Zellen
zu sammeln. Anschließend werden die Zellen lysiert, um
ein Bakteriolyseprodukt, enthaltend GPO-Gen, zu erzeugen.
Für die Bakteriolyse wird eine Behandlung mit einem
Zellwand-lysierenden Enzym, wie Lysozym oder β -Glucanase,
gegebenenfalls in Kombination mit anderen Enzymen,
wie Protease, oder einem oberflächenaktiven Mittel, wie
Natriumlaurylsulfat, verwendet. Zusätzlich kann eine
physikalische Verdauung der Zellwände durch Einfrieren-
Auftauen oder mittels einer französischen Presse angewendet
werden zusammen mit dem Lysat.
Herkömmliche Reinigungsverfahren einschließlich beispielsweise
Deproteinisierung durch Phenolextraktion,
Proteasebehandlung, Ribonucleasebehandlung, Alkohol-
Fällung und Zentrifugieren können angewendet werden,
und zwar unabhängig oder in Kombination, um die DNA
aus dem Bakteriolyseprodukt abzutrennen und zu reinigen.
Die Verdauung der auf diese Weise abgetrennten und gereinigten
DNA des Mikroorganismus kann durchgeführt werden
mittels einer Behandlung mit Ultraschallwellen oder
Restriktionsendonucleasen. Um zu gewährleisten, daß eine
leichte Vereinigung der DNA-Fragmente und der Vektor-
DNA stattfindet, ist jedoch die Verwendung von Restriktionsendonucleasen
bevorzugt, speziell die Verwendung
von Typ II Endonucleasen, welche auf eine spezifische
Nucleotid-Sequenz wirkt, wie EcoR I, Hind III, BamH I
oder BamH II.
Besonders geeignete Vektoren, die für den Einsatz in
Frage kommen, sind solche, welche durch künstliche Behandlung
eines Phagen die Verwendung als genetische
Rekombinanten-DNA rekonstruiert wurden, oder eine
Plasmid-DNA, welche in der Lage ist, in einer Wirts-
Bakterienzelle autonom zu wachsen.
Bei Verwendung von Escherichia coli als Wirts-Mikroorganismus
kann man beispielsweise λ gt. λC, λ gt. λ B oder
dergl. als Phagen-Vektor verwenden.
Als Plasmid kann man pBR322, pBR325, pACYC184, pUC12,
pUC13, pUC18, pUC19 oder dergl. verwenden, falls
Escherichia coli als Wirts-Mikroorganismus dient, während
pUB110, pC194 oder dergl. in Frage kommt, falls
Bacillus subtilis der Wirts-Mikroorganismus ist. Zusätzlich
kann man Shuttlevektoren einsetzen, welche entweder
in grampositiven oder gramnegativen Mikroorganismen-
Wirtsbakterienzellen autonom wachsen, z. B. in einem oder
in beiden von Escherichia coli und Saccharomyces cerevisiae.
Diese Vektoren werden vorteilhafterweise unter
Verwendung der gleichen Restriktionsendonuclease verdaut,
wie sie zum Aufbrechen der oben erwähnten GPO-
Gen-Spendermikroorganismus-DNA verwendet wurde.
Eine herkömmliche Ligationsmethode unter Verwendung einer
DNA-Ligase kann eingesetzt werden, um die bakterielle
DNA und das Vektorfragment zu verbinden. Beispielsweise
werden das kohäsive Ende der bakteriellen DNA und
das des Vektorfragments zunächst getempert und nachfolgend
kann rekombinante DNA aus der bakteriellen DNA und
dem Vektorfragment hergestellt werden unter der Einwirkung
einer zweckentsprechenden DNA-Ligase. Falls erforderlich,
wird das getemperte, bakterielle DNA-Vektorfragment
in den Wirts-Mikroorganismus eingeführt, um
die rekombinante DNA mit Hilfe einer in vivo-DNA-Ligase
zu erzeugen.
Beliebige Mikroorganismen, welche ein autonomes und stabiles
Wachstum der rekombinanten DNA erlauben und zur
Expression der Beschaffenheit der Fremd-DNA in der Lage
sind, können als Wirts-Bakterium verwendet werden. Beispiele
derartige Mikroorganismen umfassen Escherichia
coli DH1, Escherichia coli HB101, Escherichia coli
W3110, Escherichia coli C600 und dergl., falls Escherichia
coli als Wirts-Bakterium eingesetzt wird.
Die Einführung der rekombinanten DNA in den Wirts-
Mikroorganismus kann durchgeführt werden in Gegenwart
von Calciumionen, falls der Wirts-Mikroorganismus ein
Bakterium ist, das zur Gattung Escherichia gehört.
Falls ein Bakterium als Wirts-Mikroorganismus verwendet
wird, das zur Gattung Bacillus gehört, kann man zur
Einführung der Ribosom-Rekombinant-DNA in einen Protoplast-
Wirts-Mikroorganismus eine Kompetent-Zellmethode
oder eine elektrische Fusions-Einführungsmethode verwenden.
Eine Mikroinjektions-Methode kann ebenfalls
angewendet werden.
Die Einführung der gewünschten DNA in den Wirts-Mikroorganismus
kann man mittels Screeningverfahren ermitteln,
und zwar unter Verwendung eines Drogen-Resistenzmarkers
des Vektors und gleichzeitiger Bestimmung der
GPO-Aktivität. Auf diese Weise können beispielsweise
solche Bakterien ausgewählt werden, welche auf einem selektiven
Kulturmedium, basierend auf dem Drogen-Resistenzmarker,
wachsen und GPO produzieren.
Rekombinante DNA, welche das GPO-Gen besitzt und auf
die beschriebene Weise einmal ausgewählt wurde, kann
leicht aus dem Transformanten für die Einführung in
ein anderes Wirts-Bakterium extrahiert werden. Alternativ
kann man eine GPO-Gen-DNA unter Verwendung einer
Restriktions-Endonuclease oder dergl. aus einer rekombinanten
DNA, welche ein GPO-Gen besitzt, verdauen und
mit einem Ende eines linearisierten Vektors vereinigen,
der auf ähnliche Weise erhalten wurde. Auf diese Weise
wird ein rekombinantes DNA-Molekül mit neuen Eigenschaften
erzeugt. Dieses kann anschließend in einen
weiteren Wirts-Mikroorganismus eingeführt werden.
DNA, welche für ein GPO-Mutein codiert, welches wesentliche
GPO-Aktivität besitzt, ist im Sinne der vorliegenden
Erfindung eine mutierte DNA, welche durch eine
Genetic Engineering-Technik aus einem GPO-Gen der vorliegenden
Erfindung erzeugt wurde. Diese Mutation kann
in das Gen eingeführt werden unter Verwendung verschiedener
Genetic Engineering-Techniken, einschließlich
eine ortsspezifische Mutagenese-Methode und eine Methode
zur Substitution eines spezifischen DNA-Fragments des
Ziel-Gens mit einem mutierten DNA-Fragment. Unter den
auf diese Weise hergestellten Muteinen können solche
GPO-Mutein-DNAs, welche speziell gewünschte Eigenschaften
aufweisen, mit einem Vektor vereinigt werden,
um eine rekombinante DNA zu erzeugen, welche anschließend
in einen Wirts-Mikroorganismus zur Herstellung
eines GPO-Muteins eingeführt wird.
Die Basensequenz der DNA der vorliegenden Erfindung,
welche nach dem oben beschriebenen Verfahren hergestellt
wurde, kann durch das Didesoxy-Verfahren bestimmt
werden (Science, 214, 1205-1210 [1981]). Beispielsweise
kann man die Basensequenz eines GPO-Gen in einem Plasmid,
das hergestellte wurde unter Verwendung des Stamms
Streptococcus sp. GPOS-53, welcher zu einem GPO-Gen-
Spender-Mikroorganismus gehört, und Escherichia coli
als Wirts-Bakterium, durch die folgende Formel (I) darstellen:
wobei X für ein Codon steht, das nicht TAA, TAG oder
TGA ist, oder für eine 5′-Endgruppe und Y ein Codon
oder eine 3′-Endgruppe bedeutet.
In der obigen Formel (I) kann es sich bei dem durch X
ausgedrückten Codon um ein beliebiges Codon handeln,
solange dasselbe nur für eine Aminosäure codiert. Zusätzlich
kann X an seinem 5′-Ende ein oder mehrere
Codons besitzen, die für eine Aminosäure codieren. Bevorzugte
Beispiele von X sind ATG oder eine Polydesoxyribonucleinsäure,
die einem Signal-Peptid entspricht.
Das durch Y dargestellte Codon kann ein beliebiges
Codon sein, ausgewählt aus Translations-Stoppcodons
und Codons, die für eine Aminosäure codieren. Y kann an
seinem 3′-Ende ein oder mehrere Codons aufweisen, die
für eine Aminosäure codieren, wobei es jedoch in diesem
Fall wünschenswert ist, daß ein Translations-Stoppcodon
am 3′-Ende dieser Codons vorgesehen ist.
Die Aminosäuresequenz des Polypeptids, das durch die
Expression der DNA der vorliegenden Erfindung erzeugt
wird, kann aus der Basensequenz der DNA vorausgesagt
werden. Die Aminosäuresequenz des Abschnitts, welcher
das N-Ende des Polypeptids darstellt, kann durch die
Methode bestimmt werden, die unten erläutert wird. Ein
GPO-Spender-Mikroorganismus mit der Fähigkeit zur Bildung
von GPO wird zunächst in einem Nährstoffmedium kultiviert,
um GPO in den Zellen zu erzeugen und anzureichern.
Die kultivierten Zellen werden aus der Brühe
durch Filtration, Zentrifugieren oder ähnliche Maßnahmen
gesammelt. Die gesammelten Zellen werden dann zerstört,
und zwar entweder auf mechanische Weise oder auf
enzymatische Weise unter Verwendung von Lysozym oder
dergl. Zu dem Lysat gibt man EDTA und/oder ein geeignetes
oberflächenaktives Mittel, falls erforderlich, um
GPO zu solubilisieren und als wäßrige Lösung abzutrennen.
Diese wäßrige Lösung von GPO wird dann kondensiert
oder, ohne daß man sie kondensiert, einer Ammoniumsulfat-
Fraktionierung, Gelfiltration, Adsorptionschromatographie
oder Ionenaustauschchromatographie unterworfen,
worfen, um hochreine GPO zu erhalten. Die Aminosäuresequenz
des Abschnitts, welcher das N-Ende des GPO-Peptids
darstellt, wird aus dieser hochreinen GPO unter
Verwendung eines Flüssigphasen-Proteinsequenzers (Beckman-
System 890ME, hergestellt von Beckman, Inc.) bestimmt.
Auf diese Weise wird festgestellt, daß die Aminosäuresequenz
dieses Abschnitts identisch ist mit der
Aminosäuresequenz des N-Endes von GPO, die mittels einer
Genetic Engineering-Technik erhalten wurde. Die auf diesem
Wege aus der obigen Basensequenz bestimmte Aminosäuresequenz
wird durch die folgende Formel (II) dargestellt:
Dabei steht A für einen Aminosäurerest oder ein Wasserstoffatom
und B bedeutet einen Aminosäurerest oder eine
-OH-Gruppe. In der durch die Formel (II) ausgedrückten
Aminosäuresequenz kann es sich bei dem durch A dargestellten
Aminosäurerest um eine oder um mehrere Aminosäuren
handeln. Bevorzugte Beispiele für A sind ein
Wasserstoffatom, ein Met oder ein Signal-Polypeptid. Die
durch B dargestellte Gruppe kann entweder ein Säureamid
sein oder ein oder mehrere Aminosäurereste.
Der auf diese Weise erhaltene Transformant kann, wenn er
in einem Nährstoffmedium kultiviert wird, große Mengen
GPO in stabiler Weise erzeugen.
Die Kultivierung des Transformanten wird unter den Bedingungen
durchgeführt, bei denen der Nährstoffbedarf
und die physiologischen Eigenschaften des Wirts-Mikroorganismus
in Betracht gezogen werden. In den meisten
Fällen wird eine Flüssigkultivierung durchgeführt. Für
die Herstellung in industriellem Maßstab ist jedoch
eine Kultivierung unter tiefen, aeroben Rührbedingungen
vorteilhafter. Eine große Vielfalt von Nährstoffen, wie
sie herkömmlicherweise für Bakterienkulturen verwendet
werden, kann zur Kultivierung der Wirts-Mikroorganismen
eingesetzt werden. Speziell können beliebige, nutzbare
Kohlenstoffverbindungen als Kohlenstoffquellen verwendet
werden. Diese umfassen beispielsweise Glucose, Saccharose,
Lactose, Maltose, Fructose, Melassen und dergl. Als
Stickstoffquellen kann man beliebige, zur Verfügung stehende
Stickstoffverbindungen einsetzen einschließlich
Peptone, Fleischextrakte, Hefeextrakte, Caseinhydrolysate
und dergl. Andere Bestandteile einschließlich Salze,
wie Phosphate, Carbonate und Sulfate, sowie Salze von
Magnesium, Calcium, Kalium, Eisen, Mangan, Zink und
dergl. sowie bestimmte Typen von Aminosäuren oder Vitaminen
können verwendet werden, sofern dies zweckmäßig
ist. Das Verfahren erfordert nicht den Einsatz von GPO-
induzierenden Substanzen, wie Glycerin, Ascorbinsäure,
α -Ketosäure und dergl., d. h. Substanzen, die bei dem
herkömmlichen Verfahren zur Herstellung von GPO von wesentlicher
Bedeutung sind.
Die Kultivierungstemperatur kann in einem Bereich variiert
werden, in dem die Bakterien wachsen und GPO produzieren.
Ein bevorzugter Temperaturbereich ist 20 bis
42°C für Escherichia coli. Die Kultivierungszeit kann in
einem gewissen Grad, je nach den Kultivierungsbedingungen,
variiert werden. Grundsätzlich wird die Kultivierung
zu einem Zeitpunkt beendet, wenn die Ausbeute an
GPO das Maximum erreicht. Bei der gewöhnlichen Praxis
sind dazu etwa 12 bis 48 Stunden erforderlich. Es ist
möglich, den pH des Kulturmediums innerhalb des Bereiches
zu ändern, in dem die Bakterien wachsen und GPO
produzieren können. Der speziell bevorzugte pH-Bereich
ist etwa 6 bis 8.
GPO kann für die Verwendung in Form einer Kulturbrühe
mit einem Gehalt der Bakterien zur Verfügung gestellt
werden. Das in der Kulturbrühe enthaltene GPO wird im
allgemeinen jedoch verwendet, nachdem die Zellen durch
Filtration, Zentrifugieren oder ähnliche Maßnahmen abgetrennt
wurden. Falls GPO innerhalb der Zellen enthalten
ist, werden die Zellen zunächst mittels Filtration oder
Zentrifugieren abgetrennt. Die gesammelten Zellen werden
anschließend verdaut, und zwar entweder durch mechanische
Mittel oder durch enzymatische Mittel unter Verwendung
von Lysozym oder dergl. Zu den verdauten Bakterien
wird ein Chelatisierungsmittel, wie EDTA und/oder ein geeignetes
Surfaktans zugegeben, sofern dies erforderlich
ist, um GPO zu solubilisieren und eine Sammlung der GPO
als wäßrige Lösung zu ermöglichen.
Die so erhaltenen Lösungen mit einem Gehalt an GPO werden
dann durch Eindampfen im Vakuum oder unter Verwendung
eines Filters kondensiert und einer Aussalzbehandlung
mit Ammoniumsulfat, Natriumsulfat oder dergl. unterworfen
oder einer fraktionierten Fällung unterzogen unter
Verwendung eines hydrophilen, organischen Lösungsmittels,
wie Methanol, Ethanol, Aceton oder dergl. Das Präzipitat
wird in Wasser aufgelöst und die Lösung wird durch eine
semi-permeable Membran dialysiert, um niedermolekulargewichtige
Verunreinigungen zu eliminieren. Als Alternative
kann man das Präzipitat durch Gelfiltration, Chromatographie,
Ionenaustausch-Chromatographie oder dergl.
reinigen und raffinieren. Gereinigte GPO wird aus den
GPO enthaltenden Lösungen, die unter Verwendung der
obigen verschiedenen Maßnahmen erhalten wurde, durch
Vakuumeindampfung, Gefriertrocknung oder dergl. gewonnen.
Die Aktivität der so hergestellten GPO wird gemäß dem
folgenden Verfahren bestimmt:
Reaktionsgemisch:
200 mM PIPES-NaOH-Puffer (pH 6,5)
300 mM L-a -Glycerophosphat
5 E/ml Peroxidase
1,5 mM 4-Aminoantipirin
0,05% Triton X-100
1,0 mM DAOS [3,5-Dimethoxy-N-ethyl-N-(2-hydroxy-3-sulfopropyl)- anilin-natriumsalz].
200 mM PIPES-NaOH-Puffer (pH 6,5)
300 mM L-a -Glycerophosphat
5 E/ml Peroxidase
1,5 mM 4-Aminoantipirin
0,05% Triton X-100
1,0 mM DAOS [3,5-Dimethoxy-N-ethyl-N-(2-hydroxy-3-sulfopropyl)- anilin-natriumsalz].
Gibt 1,0 ml der Reaktionsmischung in ein Reagenzglas und
stelle die Temperatur auf 37°C ein. Gibt 0,02 ml Enzymlösung
zu und inkubiere 5 min bei 37°C. Beende die Reaktion
durch Zusatz von 2,0 ml 0,5% SDS und bestimme
die Absorption bei 600 nm (As). Wiederhole das Verfahren
unter Verwendung von Verdünnungswasser anstelle der
Enzymlösung (Ab). Die Aktivität der Substanz zur Erzeugung
von 1 μMol Wasserstoffperoxid/min wird als 1 Einheit
(E) gemäß der folgenden Gleichung ausgedrückt:
Dabei bedeutet Δ A = As - Ab, 16,6 ist der molekulare
Extinktionskoeffizient für den Chinon-Farbstoff (cm2/
μMol) und X bedeutet die Konzentration von GPO in der
Enzymlösung (mg/ml).
In der vorliegenden Anmeldung werden Aminosäuren, Peptide,
Nucleinsäuren und Nucleinsäure-verwandte Verbindungen
nach den herkömmlichen Standards abgekürzt. Einige
Beispiele für die benutzten Abkürzungen sind nachstehend
aufgeführt. Alle Bezeichnungen der Aminosäuren
beziehen sich auf die L-Isomeren.
DNA - Desoxyribonucleinsäure
RNA - Ribonucleinsäure
A - Adenin
T - Thymin
G - Guanin
C - Cytosin
Ala - Alanin
Arg - Arginin
Asn - Asparagin
Asp - Aspartat
Cys - Cystein
Gln - Glutamin
Glu - Glutamat
Gly - Glycin
His - Histidin
Ile - Isoleucin
Leu - Leucin
Lys - Lysin
Met - Methionin
Phe - Phenylalanin
Pro - Prolin
Ser - Serin
Thr - Threonin
Trp - Trpyophan
Typ - Tyrosin
Val - Valin
RNA - Ribonucleinsäure
A - Adenin
T - Thymin
G - Guanin
C - Cytosin
Ala - Alanin
Arg - Arginin
Asn - Asparagin
Asp - Aspartat
Cys - Cystein
Gln - Glutamin
Glu - Glutamat
Gly - Glycin
His - Histidin
Ile - Isoleucin
Leu - Leucin
Lys - Lysin
Met - Methionin
Phe - Phenylalanin
Pro - Prolin
Ser - Serin
Thr - Threonin
Trp - Trpyophan
Typ - Tyrosin
Val - Valin
Im folgenden wird die Erfindung anhand von beispielhaften
Ausführungsformen näher erläutert, ohne daß damit
eine Beschränkung der Erfindung beabsichtigt ist.
Eine chromosomale DNA wird hergestellt aus dem Stamm
Streptococcus sp. GPOS-53 (FERM BP-2120) unter Anwendung
des folgenden Verfahrens. Der Stamm wird unter
Schütteln über Nacht bei 37°C in 150 ml Hirn-Herz-Infusionsmedium
(hergestellt von Difco Co.; im folgenden als
BHI-Medium abgekürzt) kultiviert. Die kultivierte Brühe
wird 10 min bei 3000 U/min zentrifugiert, um die Zellen
zu sammeln. Die Zellen werden in 5 ml einer Lösung suspendiert,
enthaltend 10% Saccharose, 50 mM Tris-Chlorwasserstoffsäure
(pH 8,0) und 50 mM EDTA. Zu der Suspension
gibt man 1 ml Lysozymlösung (10 mg/ml) und inkubiert
das Gemisch 15 min bei 37°C. Dann erfolgt die Zugabe
von 1 ml 10% SDS (Natriumdodecylsulfat). Zu der
erhaltenen Suspension gibt man ein gleiches Volumen eines
gemischten Lösungsmittels von Chloroform und Phenol
(1/1). Das Gemisch wird gerührt und 3 min bei 10 000 U/
min zentrifugiert, um das Wasser und die Lösungsmittelschichten
zu trennen. Zu der abgetrennten Wasserschicht
gibt man langsam ein zweifaches Volumen Ethanol und
rührt das Gemisch langsam mit einem Glasstab, um auf diese
Weise zu bewirken, daß sich die DNA um den Stab wickelt.
Die auf diese Weise abgetrennte DNA wird in 10 ml
einer Lösung aufgelöst, enthaltend 10 mM Tris-Chlorwasserstoffsäure
(pH 8,0) und 1 mM EDTA (eine solche Lösung
wird im folgenden als TE bezeichnet). Die Lösung
wird mit einem gleichen Volumen des Chloroform-Phenol-
Mischlösungsmittels behandelt, und es wird erneut zentrifugiert,
um die Wasserschicht abzutrennen. Zu dieser
Lösung wird wiederum ein zweifaches Volumen Ethanol
zugesetzt, und die DNA wird erneut aus dem Gemisch
auf die oben beschriebene Weise abgetrennt. Diese DNA
wird dann in 2 ml TE glöst.
Escherichia coli pM191, welches pACYC 184 trägt [J.
Bacteriol, 134, 1141 [1981]; ATCC 37033), wird kultiviert
durch Schütteln in 1 l BHI-Medium (Difco Co.). Sobald
die Trübung der Brühe einen Wert von OD660 = 1,0
erreicht, wird Spectinomycin zugesetzt bis zu einer Endkonzentration
von 300 μg/ml. Das Schütteln der Brühe
wird mindestens 16 h bei 37°C fortgesetzt. Nach Beendigung
der Schüttelkultivierung wird die Brühe 10 min bei
3000 U/min zentrifugiert, um die Zellen zu sammeln. Die
Plasmid-DNA, die aus den Zellen gesammelt wurde, wird
gemäß dem Lysozym-SDS-Verfahren und der Cäsiumchlorid-
Äthidiumbromid-Methode (Maniatis et al., Molecular
Cloning, 86-94, Cold Spring Harbor [1982]) hergestellt.
(1) 2 μl (etwa 0,5 μg) Streptococcus sp. chromosomaler
DNA, die in Beispiel 1 hergestellt wurde, 1 μl einer
10fachen Konzentration an M-Puffer (Maniatis et al.,
Molecular Cloning, 104, Cold Spring Harbor [1982]),
1 μl Hind III (1,0 E/μl; Takara Shuzo Co., Ltd.) und
6 μl Wasser werden vermischt und 1 h bei 37°C inkubiert,
um die Verdauung durchzuführen. Plasmid pACYC
184-DNA (etwa 0,3 μg) wird gesondert verdaut unter Verwendung
von Hind III, wobei ein ähnliches Verfahren angewendet
wird. Dazu gibt man 0,6 Einheiten alkalische
Phosphatase (Takara Shuzo Co., Ltd.; im folgenden als
BAP abgekürzt). Das Gemisch wird 1 h bei 65°C inkubiert.
Die beiden DNA-Lösungen, die auf die beschriebene
Weise mit Hind III verdaut sind, werden zusammengemischt.
Zu dieser gemischten DNA-Lösung gibt man
0,1 Volumen 3M Natriumacetat. Anschließend wird die
Lösung mit einem gleichen Volumen eines Chloroform-
Phenol-Mischlösungsmittels behandelt und zur Abtrennung
der Wasserschicht zentrifugiert. Dazu gibt man eine
2fache Menge Ethanol, und die DNA wird mittels Zentrifugieren
gefällt und im Vakuum getrocknet. Die getrocknete
DNA wird in 89 μl Wasser gelöst. Dazu gibt man
10 μl einer 10fachen Konzentration Ligationspuffer
(0,5 M Tris-Chlorwasserstoffsäure [pH 7,6], 0,1 M
MgCl2, 0,1 M Dithiothreit, 10 mM Spermidin, 10 mM ATP)
und 1 μl T4-DNA-Ligase (350 Einheiten; Takara Shuzo Co,
Ltd.) und mischt das Ganze. Das Gemisch wird über Nacht
bei 4°C stehengelassen. Diese DNA-Lösung wird mit einem
Chloroform-Phenol-Gemisch behandelt, und die DNA wird
mit Ethanol gefällt, im Vakuum getrocknet und in 10 μl
TE aufgelöst.
(2) Escherichia coli DH 1 (J. Molecular Biology, 557,
[1983]; von Genetic Stock Center, Yale University Medical
Department) wird in 100 ml BHI-Medium kultiviert, während
der logarithmischen Wachstumsphase durch Zentrifugieren
gesammelt (10 000 U/min, 2 min) und in 40 ml einer
eisgekühlten Lösung suspendiert, die 30 mM Kaliumacetat,
100 mM RbCl, 10 mM CaCl2, 50 mM MnCl2 und 15%
Glycerin (pH 5,8) enthält. Die Suspension wird 5 min
bei 0°C stehengelassen und die Suspension wird zentrifugiert,
um den Überstand zu entfernen. Die Zellen werden
in 4 ml einer Lösung suspendiert, die 10 mM MOPS-
Puffer (Dotite Co.), 75 mM CaCl2, 10 mM RbCl und 15%
Glycerin (pH 6,5) enthält. Die Suspension wird 5 min
bei 0°C belassen, um Kompetentzellen zu erhalten.
(3) Zu 200 μl der Zellsuspension gibt man 10 μl
der in Stufe (1) hergestellten DNA-Lösung. Nachdem das
Gemisch 30 min bei 0°C gestanden hat, gibt man 1 ml BHI-
Medium zu und bewahrt das Gemisch 90 min bei 37°C auf.
Ein Aliquot der Mischung (0,1 ml) wird auf einer BHI-
Agarplatte ausgebreitet, welche 25 μg/ml Chloramphenicol
enthält. Man kultiviert über Nacht bei 37°C, um
Transformanten zu erzeugen. Die Transformanten werden
auf einer GPOS-Mediumplatte repliziert (Zusammensetzung:
5 g Pepton, 2 g Fleischextrakt, 5 g Hefeextrakt, 1 g
NaCl, 1 g K2HPO4, 0,56 MgSO4, 500 IE Peroxidase, 0,1 g
Dianisidin, 15 g Kalium-glycerophosphat, 15 g Agar,
1 l destilliertes Wasser; pH 7,0) und über Nacht bei
37°C kultiviert.
Etwa 5000 der auf diese Weise hergestellten Transformanten
werden untersucht, wobei man 4 Kolonien mit schwarzgefärbten
(charcoal-colored)-Peripherien ermittelt. Einer
dieser vier Stämme wird als Escherichia coli DHI
pGPOS1 bezeichnet (hinterlegt bei Fermentation Research
Institute, Agency of Industrial Science and Technology;
Hinterlegungs-Nr. 9493, FERM-BP-2133).
Dieser Stamm
wird nach Reinigung in BHI-Medium über Nacht bei 37°C
kultiviert, um dessen GPO-Produktivität gemäß dem oben
beschriebenen Meßverfahren zur Bestimmung der GPO-Aktivität
zu messen. Man findet eine GPO-Aktivität von
0,5 E/ml.
Die in dem Stamm enthaltene Plasmid-DNA wird nach dem
gleichen Verfahren wie in Beispiel 2 abgetrennt. Das
Plasmid, welches das GPO-Gen enthält und das pACYC 184-
Gen, wird als pGPOS1 bezeichnet.
pGPOS1-Plasmid DNA wird aus dem Escherichia coli DHI
pGPOS1-Stamm auf gleiche Weise hergestellt, wie sie für
die Herstellung von pACYC184 angewendet wurde, Ein
Schnittplan der so erhaltenen pGPOS1-Plasmid-DNA wird
hergestellt unter Verwendung der Endonucleasen BamH I,
Bgl II, Cta I, EcoR I, Pst I, Sal I und Xho I (alle
von Takara Shuzo Co., Ltd.). Die Ergebnisse sind in
Fig. 1 aufgeführt. Die Basensequenz der das GPO-Gen aufweisenden
DNA wird mittels der Didesoxy-Methode
(Science, 214, 1205-1210 [1981]) unter Verwendung eines
M13-Phagen bestimmt. Die Basensequenz des GPO-Gens ist
derart, daß in der Formel (I) ATG für X und TAA für Y
steht. Die aus der Basensequenz bestimmte Aminosäuresequenz
ist derart, daß in der Formel (II) Met für A
und -OH für B steht.
Escherichia coli DHI pGPOS1 wird in 20 l BHI-Medium unter
Verwendung eines Flaschenfermenters 18 h bei 37°C
kultiviert. Die so erzeugten Zellen werden durch Zentrifugieren
bei 5000 U/min während 10 min gesammelt, mit
2 l physiologischer Salzlösung gewaschen und in 2 l eines
10 mM Phosphatpuffers (pH 7,0) suspendiert. Zu dieser
Suspension gibt man Lysozym, EDTA-2Na und Triton
X-100 in solchen Mengen zu, daß die jeweiligen Konzentrationen
in der Mischung 1 mg/ml, 2 mM bzw. 0,1 betragen.
Nach 30minütiger Inkubation bei 37°C wird das
Gemisch 10 min bei 5000 U/min zentrifugiert, um die
überstehende Lösung abzutrennen.
Die überstehende Lösung (1,9 l) wird einer Aussalzbehandlung
mit Ammoniumsulfat (40-60%) unterworfen. Das
Präzipitat wird gesammelt. Dieses Präzipitat wird in
200 ml 10 mM Phosphatpuffer (pH 7,0, enthaltend 10 mM
FAD), gelöst. Die Lösung wird einer Entsalzungsbehandlung
über Sephadex G-25 unterzogen. Aktive Fraktionen
werden mittels Ionenaustausch-Chromatographie unter Verwendung
von DEAE-Sepharose CL-6B gesammelt, entsalzt und
gefriergetrocknet. Man erhält 0,395 g L-α -Glycerophosphatoxidase
in Pulverform (40 E/mg, Ausbeute 27%).
Die physikochemischen Eigenschaften der so erhaltenen
L-α -Glycerophosphatoxidase sind wie folgt:
- (a) Wirkung: katalysiert die folgende Reaktion L-α -Glycerophosphat + O2 → Dihydroxyacetonphosphat + H2O2.
- (b) Substratspezifität: zeigt Substratspezifität für L-α -Glycerophosphat.
- (c) Optimaler pH: GOP wird bei jedem der folgenden pH-Bereiche umgesetzt: Glycin-Chlorwasserstoffsäure- Puffer (pH 2,0-5,0); Essigsäure-Puffer (pH 4,0-6,0); 3,3-Dimethylglutaminsäure-NaOH-Puffer (pH 5,0-7,0); Phosphat-Puffer (pH 6,0-8,0) und Tris-Chlorwasserstoffsäure- Puffer (pH 7,0-9,0). Man stellt fest, daß der optimale pH im Bereich von 5,5 bis 7,5 liegt.
- (d) pH-Stabilität: Die Enzymlösungen (5,0 E/ml) werden hergestellt unter Verwendung von 100 mM Essigsäure- (pH 4,0-6,0), 100 mM 3,3-Dimethylglutaminsäure- NaOH-(pH 5,0-7,0), 100 mM Phosphat-(pH 6,0-8,0) und 100 mM Tris-Chlorwasserstoffsäure-Puffer (pH 7,0-9,0), alle bei 100 mM. Jede Lösung wird 5 min bei 50°C inkubiert, um die Restaktivität des Enzyms zu bestimmen. Man findet, daß das Enzym bei einem pH von 6,0 bis 8,0 stabil ist.
- (e) Km-Wert: 5,5 ±0,5 mM (für L-α -Glycerophosphat).
- (f) Isoelektrischer Punkt: 4,0 ±0,5 (bestimmt durch eine fokussierende Elektrophorese unter Verwendung eines Ampholin-Trägers).
- (g) Thermische Stabilität: Die unter Verwendung von 0,1 M Phosphatpuffer (pH 6,5) hergestellten Enzymlösungen (5,0 E/ml) werden 5 min bei verschiedenen Temperaturen inkubiert. Die Restaktivität jeder Lösung wird bestimmt. Man findet, daß das Enzym bis zu 40°C 100% Aktivität zeigt.
- (i) Langzeit-Enzymstabilität: Enzymlösungen (5,0 E/ml) werden unter Verwendung von 0,1 M MES-NaOH- Puffer (pH 6,5) hergestellt und bei 37°C während unterschiedlicher Zeitspannen inkubiert. Bei der Messung der Restaktivität stellt man fest, daß das Enzym nach 24 h mindestens 90% Aktivität aufweist. Diese Stabilität in Lösung repräsentiert die Stabilität des Enzyms unter Bedingungen, wie sie bei der tatsächlichen klinischen Diagnose auftreten, und zeigt, daß das Enzym äußerst brauchbar ist.
Die Verwendung der DNA und des erfindungsgemäßen Transformanten
gewährleistet eine effiziente Produktion von
L-α -Glycerophosphatoxidase, ohne daß es erforderlich
ist, GPO-induzierende Substanzen, wie Glycerin, Ascorbinsäure
oder dergl., zuzusetzen. Darüber hinaus hat
die Erfindung zur Aufklärung der Merkmale des GPO-Gens
geführt.
Claims (16)
1. DNA mit einer Basensequenz, die für eine Aminosäuresequenz
eines Polypeptids codiert, das L-α -Glycerophosphatoxidase
aufbaut.
2. DNA gemäß Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß die L-α -Glycerophosphatoxidase die folgenden physiko-
chemischen Eigenschaften aufweist:
- (a) Wirkung: katalysiert die folgende Reaktion L-α -Glycerophosphat + O2 → Dihydroxyacetonphosphat + H2O2;
- (b) Substratspezifität: zeigt Substratspezifität für L-α -Glycerophosphat;
- (c) optimaler pH. 5,5 bis 7,5;
- (d) pH-Stabilität: stabil bei pH 6,0 bis 8,0.
3. DNA gemäß Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß die Aminosäuresequenz des Polypeptids, welches
die L-α -Glycerophosphatoxidase aufbaut, beginnend
von dem N-Ende, wie folgt ist:
wobei A für einen Aminosäurerest oder ein Wasserstoffatom
steht und B einen Aminosäurerest oder eine -OH-
Gruppe
bedeutet.
4. DNA gemäß Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß die Basensequenz der DNA, beginnend von dem 5′-Ende,
wie folgt ist:
wobei X für ein Codon steht, das nicht TAA, TAG oder
TGA ist, oder für eine 5′-Endgruppe und Y ein Codon oder
eine 3′-Endgruppe wiedergibt.
5. Transformant mit einer DNA, welche in bezug auf
den Wirts-Mikroorganismus fremd ist und eine Basensequenz
umfaßt, welche für eine Aminosäuresequenz eines
Polypeptids codiert, welches L-α -Glycerophosphatoxidase
aufbaut.
6. Transformant gemäß Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet,
daß die L-α -Glycerophosphatoxidase die folgenden
physiko-chemischen Eigenschaften aufweist:
- (a) Wirkung: katalysiert die folgende Reaktion L-α -Glycerophosphat + O2 → Dihydroxyacetonphosphat + H2O2;
- (b) Substrat-Spezifität: zeigt Substratspezifität für L-α -Glycerophosphat;
- (c) optimaler pH 5,5 bis 7,5;
- (d) pH-Stabilität: stabil bei pH 6,0 bis 8,0.
7. Transformant gemäß Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet,
daß die Aminosäuresequenz des Polypeptids,
welches die L-α -Glycerophosphatoxidase aufbaut, beginnend
vom N-Ende, wie folgt ist:
wobei A für einen Aminosäurerest oder ein Wasserstoffatom
steht und B einen Aminosäurerest oder eine -OH-
Gruppe bedeutet.
8. Transformant gemäß Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet,
daß die Basensequenz der DNA, beginnend vom
5′-Ende, wie folgt ist:
wobei X für ein Codon mit Ausnahme von TAA, TAG oder
TGA oder eine 5′-Endgruppe steht und Y ein Codon oder
eine 3′-Endgruppe bedeutet.
9. Transformant gemäß Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet,
daß er zur Gattung Escherichia coli gehört.
10. Transformant gemäß Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet,
daß es sich um den Stamm Escherichia coli
DHI pGPOS1 (FERM BP-2133) handelt.
11. Polypeptid, welches L-α -Glycerophosphatoxidase
aufbaut, das durch eine Aminosäuresequenz ausgedrückt
wird, welche, beginnend vom N-Ende, wie folgt ist:
wobei A für einen Aminosäurerest oder ein Wasserstoffatom
steht und B einen Aminosäurerest oder eine -OH-
Gruppe wiedergibt.
12. L-α -Glycerophosphatoxidase mit den folgenden
physiko-chemischen Eigenschaften:
- (a) Wirkung: katalysiert die folgende Reaktion L-α -Glycerophosphat + O2 → Dihydroxyacetonphosphat + H2O2;
- (b) Substratspezifität: zeigt Substratspezifität für L-α -Glycerophosphat;
- (c) optimaler pH: 5,5 bis 7,5;
- (d) pH-Stabilität: stabil bei pH 6,0 bis 8,0;
- (e) Km-Wert: 5,5 ±0,5 mM (für L-α -Glycerophosphat);
- (f) isoelektrischer Punkt: pH 4,0 ±0,5;
- (g) Molekulargewicht: 195 000 ±10 000 (basierend auf der Gelfiltrationsmethode);
- (h) Wärmestabilität: stabil bei Temperaturen unter 40°C;
- (i) Langzeit-Enzymstabilität: behält eine Restaktivität von 90% oder mehr während 24 Stunden bei, wenn die Substanz in MES-NaOH-Puffer (pH 6,5) bei 37°C belassen wird.
13. Verfahren zur Herstellung von L-α -Glycerophosphatoxidase,
umfassend
die Kultivierung des Transformanten, wie er in
Anspruch 5 definiert ist, um zu bewirken, daß der
Transformant die genetische Information der DNA, wie
sie in Anspruch 1 definiert ist, weitergibt, und
Sammlung des Polypeptids, welches einen Bestandteil
der L-α -Glycerophosphatoxidase darstellt.
14. Verfahren gemäß Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet,
daß die L-α -Glycerophosphatoxidase die folgenden
physiko-chemischen Eigenschaften aufweist:
- (a) Wirkung: katalysiert die folgende Reaktion L-α -Glycerophosphat + O2 → Dihydroxyacetonphosphat + H2O2;
- (b) Substratspezifität: zeigt eine Substratspezifität für L-α -Glycerophosphat;
- (c) optimaler pH: 5,5 bis 7,5;
- (d) pH-Stabilität: stabil bei pH 6,0 bis 8,0.
15. Verfahren gemäß Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet,
daß die DNA, welche eine Basensequenz umfaßt, die
für die Aminosäuresequenz eines Polypeptids codiert, das
L-a -Glycerophosphatoxidase aufbaut, eine DNA ist, die
aus einem L-α -Glycerophosphatoxidase erzeugenden Mikroorganismus
stammt, der zur Gattung Streptococcus gehört.
16. Verfahren gemäß Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet,
daß das Wirts-Bakterium ein Mikroorganismus der
Gattung Escherichia coli ist.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP31712987 | 1987-12-15 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| DE3842090A1 true DE3842090A1 (de) | 1989-07-13 |
| DE3842090C2 DE3842090C2 (de) | 1995-12-07 |
Family
ID=18084761
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| DE3842090A Expired - Fee Related DE3842090C2 (de) | 1987-12-15 | 1988-12-14 | DNA mit der genetischen Information von L-alpha-Glycerophosphatoxidase und deren Anwendung |
Country Status (5)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US4960877A (de) |
| DE (1) | DE3842090C2 (de) |
| FR (1) | FR2624523B1 (de) |
| GB (1) | GB2213822B (de) |
| IT (1) | IT1235167B (de) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP1138769A1 (de) * | 1998-09-30 | 2001-10-04 | Amano Pharmaceutical Co., Ltd. | Rekombinante L-alpha-Glycerophosphat-Oxydase Gene,und Verfahren zu deren Herstellung |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2000069976A (ja) * | 1998-09-02 | 2000-03-07 | Ajinomoto Co Inc | メタノール脱水素酵素の新規活性促進因子及びその遺伝子 |
| US7687039B2 (en) * | 1998-10-28 | 2010-03-30 | Covaris, Inc. | Methods and systems for modulating acoustic energy delivery |
| EP1925359A1 (de) | 2006-11-22 | 2008-05-28 | Covaris, Inc. | Verfahren und Vorrichtungen zur Behandlung von Proben mit akustischer Energie zur Bildung von Partikeln |
Family Cites Families (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4166005A (en) * | 1976-12-10 | 1979-08-28 | Eastman Kodak Company | Process for the production of α-glycerophosphate oxidase |
| CA1095447A (en) * | 1976-12-10 | 1981-02-10 | Prakash S. Masurekar | Process for the production of a-glycero-phosphate oxidase |
| JPS6022915B2 (ja) * | 1978-07-20 | 1985-06-04 | 東洋醸造株式会社 | L−α−グリセロリン酸オキシダ−ゼの製造法 |
| JPS58165789A (ja) * | 1982-03-25 | 1983-09-30 | Toyobo Co Ltd | α−グリセロリン酸オキシダ−ゼの製造法 |
| US4463095A (en) * | 1982-11-26 | 1984-07-31 | Toyo Boseki Kabushiki Kaisha | Process for producing α-glycerophosphate oxidase |
-
1988
- 1988-12-01 GB GB8828024A patent/GB2213822B/en not_active Expired - Fee Related
- 1988-12-12 US US07/283,463 patent/US4960877A/en not_active Expired - Lifetime
- 1988-12-13 IT IT8848639A patent/IT1235167B/it active
- 1988-12-14 FR FR8816486A patent/FR2624523B1/fr not_active Expired - Lifetime
- 1988-12-14 DE DE3842090A patent/DE3842090C2/de not_active Expired - Fee Related
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| Arch. Biochem. Biophys. 88, S. 250-255, 1960 * |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP1138769A1 (de) * | 1998-09-30 | 2001-10-04 | Amano Pharmaceutical Co., Ltd. | Rekombinante L-alpha-Glycerophosphat-Oxydase Gene,und Verfahren zu deren Herstellung |
| US6303357B1 (en) | 1998-09-30 | 2001-10-16 | Amano Pharmaceutical Co., Ltd. | L-α-glycerophosphate oxidase gene, recombinant DNA, and method for producing modified L-α-glycerophosphate oxidase gene |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| IT8848639A0 (it) | 1988-12-13 |
| US4960877A (en) | 1990-10-02 |
| IT1235167B (it) | 1992-06-22 |
| GB8828024D0 (en) | 1989-01-05 |
| GB2213822A (en) | 1989-08-23 |
| GB2213822B (en) | 1991-12-18 |
| DE3842090C2 (de) | 1995-12-07 |
| FR2624523B1 (fr) | 1994-12-02 |
| FR2624523A1 (fr) | 1989-06-16 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| DE60128824T2 (de) | Neue glucosedehydrogenase und verfahren zur herstellung der dehydrogenase | |
| DE69838434T2 (de) | Luziferase und verfahren zur bestimmung von intrazellulärem atp unter verwendung derselben | |
| DE19610984A1 (de) | Alkohol-Dehydrogenase und deren Verwendung zur enzymatischen Herstellung chiraler Hydroxyverbindungen | |
| DE3686597T2 (de) | Uricase und verfahren zu deren herstellung. | |
| DE69431464T2 (de) | Milchsäurebakterien und Sauermilchprodukt | |
| DE3942129C2 (de) | Glucose-6-phosphat-dehydrogenase-Gen | |
| DE2911481C2 (de) | Verfahren zur Herstellung einer Pyruvatoxidase | |
| DE68924761T2 (de) | Neue coenzym unabhängige l-sorbosone dehydrogenase. | |
| DE69110386T2 (de) | Glukose Dehydrogenase und Verfahren zu deren Herstellung. | |
| DE3931716C2 (de) | Rekombinante DNA, eine sie enthaltende Transformante und ein Verfahren zur Herstellung von wärmestabiler Glucosedehydrogenase und ihre Verwendung | |
| DE69636649T2 (de) | Für einen Endoglycoceramidase-Aktivator kodierendes Gen | |
| DE3603257A1 (de) | Thermostabile bilirubin-oxidase und verfahren zur herstellung derselben | |
| DE60316424T2 (de) | Beta-untereinheit von glucosedehydrogenase und diese kodierende dna | |
| DE3842090C2 (de) | DNA mit der genetischen Information von L-alpha-Glycerophosphatoxidase und deren Anwendung | |
| DE69329164T2 (de) | Protein mit Alpha-Glukosidase-Aktivität, DNS mit dessen genetischer Information und Herstellung von Alpha-Glukosidase | |
| DE3600563C2 (de) | ||
| CH645668A5 (de) | Verfahren zur herstellung von sarcosinoxidase. | |
| DE4445084B4 (de) | Neue Kreatinamidinohydrolase und Verfahren zu ihrer Herstellung | |
| DE3024915C2 (de) | ||
| DE3931399A1 (de) | N-acetylhexosamin-dehydrogenase, verfahren zu deren herstellung, verfahren zur quantitativen analyse von n-acetylglucosamin oder n-acetylgalactosamin unter verwendung derselben, sowie kit fuer die quantitative analyse | |
| DE69014549T2 (de) | Enzyme aus dem bacillus pabuli zum abbau der zellwand. | |
| DE4032287C2 (de) | ||
| DE68916926T2 (de) | DNS mit Lactat-Oxydase genetischer Information. | |
| DE3888989T2 (de) | Stamm des Genus Thermus, neue Beta-galaktosidase und Verfahren zu dessen Herstellung. | |
| DE69920470T2 (de) | Neuartiges gen und transformant, welcher dieses beinhaltet |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| 8110 | Request for examination paragraph 44 | ||
| 8125 | Change of the main classification |
Ipc: C12N 15/53 |
|
| 8127 | New person/name/address of the applicant |
Owner name: ASAHI KASEI KOGYO K.K., OSAKA, JP |
|
| D2 | Grant after examination | ||
| 8364 | No opposition during term of opposition | ||
| 8339 | Ceased/non-payment of the annual fee |