WO2019168154A1 - 3-ヒドロキシイソ酪酸エステルおよびメタクリル酸エステルの製造方法 - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to a method for producing 3-hydroxyisobutyric acid ester and methacrylic acid ester. More specifically, the present invention relates to a method for producing 3-hydroxyisobutyric acid ester from 3-hydroxyisobutyryl-CoA using a catalytic reaction of alcohol acyltransferase.
- Methacrylic acid esters are mainly used as raw materials for acrylic resins, and are in great demand as comonomer in fields such as paints, adhesives and resin modifiers.
- the methacrylic acid ester can be produced, for example, by dehydrating 3-hydroxyisobutyric acid ester by a chemical method.
- Alcohol acyltransferase is known as a fruity flavor synthase.
- Patent Documents 1 and 2 disclose a reaction in which methacrylyl-CoA is allowed to act on alcohol or phenol to produce a methacrylic acid ester in the presence of an alcohol acyltransferase. These reactions start with a CoA compound composed of a chain hydrocarbon. When a hydroxyl group is introduced into a chain hydrocarbon of a CoA compound, the physicochemical properties of the CoA compound are expected to change. However, a CoA compound composed of a chain hydrocarbon in which an alcohol acyltransferase is hydroxylated can also be used. It was not clear whether the esterification could be catalyzed.
- the main object of the present invention is to provide a method for producing 3-hydroxyisobutyric acid ester using a biocatalyst.
- the present invention provides the following [1] to [19].
- [1] A method for producing 3-hydroxyisobutyric acid ester, comprising the step of producing 3-hydroxyisobutyric acid ester by reacting alcohol or phenol with 3-hydroxyisobutyryl-CoA in the presence of alcohol acyltransferase .
- [2] The method for producing 3-hydroxyisobutyric acid ester according to [1], wherein the alcohol acyltransferase is derived from a plant.
- [7] The method for producing a 3-hydroxyisobutyric acid ester according to any one of [1] to [6], wherein the alcohol acyltransferase comprises any one of the following amino acid sequences (1) to (4): (1) The amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 5, or SEQ ID NO: 7. (2) An amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, inserted, substituted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 7. (3) An amino acid sequence having 80% or more sequence identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 5, or SEQ ID NO: 7.
- [10] A step of reacting 3-hydroxyisobutyryl-CoA with an alcohol or a phenol in the presence of an alcohol acyltransferase to produce 3-hydroxyisobutyric acid ester; And a step of producing a methacrylic acid ester by a dehydration reaction of 3-hydroxyisobutyric acid ester.
- the method for producing a methacrylic acid ester according to [11] wherein the plant belongs to the order of mallow, rose or eggplant.
- [16] The method for producing a methacrylic acid ester according to any one of [10] to [15], wherein the alcohol acyltransferase comprises any one of the following amino acid sequences (1) to (4): (1) The amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 5, or SEQ ID NO: 7. (2) An amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, inserted, substituted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 7. (3) An amino acid sequence having 80% or more sequence identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 5, or SEQ ID NO: 7.
- a protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
- (2) comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, inserted, substituted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and catalyze the esterification of 3-hydroxyisobutyryl-CoA A protein having alcohol acyltransferase activity.
- (3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having 80% or more sequence identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and catalyzing the esterification of 3-hydroxyisobutyryl-CoA A protein having alcohol acyltransferase activity.
- the present invention provides a method for producing 3-hydroxyisobutyric acid ester using a biocatalyst.
- the method for producing 3-hydroxyisobutyric acid ester according to the present invention includes the following “Step A”.
- the method for producing a methacrylic acid ester according to the present invention includes the following “step B”.
- Step A A step of producing 3-hydroxyisobutyric acid ester by allowing alcohol or phenol to act on 3-hydroxyisobutyryl-CoA in the presence of alcohol acyltransferase.
- Step B A step of producing a methacrylic acid ester by a dehydration reaction of 3-hydroxyisobutyric acid ester. Process A and process B are shown below.
- “methacrylic acid ester” is a compound represented by Formula 1.
- R represents a linear or branched hydrocarbon group having 1 to 20 carbon atoms.
- the hydrocarbon group may be saturated or unsaturated acyclic, and may be saturated or unsaturated cyclic.
- a straight chain or branched chain unsubstituted alkyl group having 1 to 10 carbon atoms, an aralkyl group or an aryl group is preferred.
- the “alcohol” or “phenol” used in step A is a compound represented by the following formula 2. Since the structure of the alcohol or phenol corresponds to a methacrylic ester, the structure has the same definition as R in the formula 1, and represents a linear or branched hydrocarbon group having 1 to 20 carbon atoms.
- the hydrocarbon group may be saturated or unsaturated acyclic, and may be saturated or unsaturated cyclic.
- Alcohol acyltransferase (hereinafter also referred to as “AAT”) has an activity of catalyzing a reaction in which an acyl group of acyl-CoA is transferred to an alcohol or a phenol to form an ester.
- AAT is said to be involved in the formation of esters in various fruits.
- AAT is ginger (banana), rose (strawberry, apple, pear, peach), cucumber (melon), azalea (kiwi), perilla (olive), eggplant (tomato), mugwort (lemon, mango) ) And the like are known to exist in plants.
- AAT used in Step A has an activity that catalyzes a reaction that produces a 3-hydroxyisobutyric acid ester by transferring the acyl group of 3-hydroxyisobutyryl-CoA to an alcohol or phenols (hereinafter simply referred to as “catalytic activity”). Or “AAT activity”).
- AAT is not limited as long as it has the above catalytic activity.
- AAT is preferably derived from a plant.
- AATs derived from plants belonging to the order of Aoi, Rose, and Eggplant are more preferable.
- category of a plant shall follow the APG plant classification system 3rd edition (Botanical Journal of the Linnian Society, 2009, 161, 105121).
- AAT can be easily obtained from the plant by the following method. That is, first, an appropriate part of the plant tissue is cut as necessary. A solution containing 3-hydroxyisobutyryl-CoA and alcohol or phenols is added to the cut site and shaken, and allowed to react for a certain period of time. The catalytic activity is confirmed by confirming the presence or absence of 3-hydroxyisobutyric acid ester in the reaction solution by GC (gas chromatography). Specifically, for example, leaves, flowers, persimmons, pulp or peels are cut, and a solution containing 0.01 to 10 mM 3-hydroxyisobutyryl-CoA and 2 to 50-fold molar amount of n-butanol is added. And shake at 30 ° C. for 1-10 hours. After completion of the reaction, AAT that can be used in the present invention can be obtained by confirming the presence or absence of butyl 3-hydroxyisobutyrate by GC.
- the genus Musa As belonging to the family Musaceae, the genus Musa; As belonging to Zingiberaceae, the genus Zingiber; As belonging to the family Rosaceae, the genus Stragaria (Fragaria), the genus Apple (Malus), the genus Sakura (Prunus), the genus (Pyrus), the genus Biwa (Eriobotrya), the genus Chaenomeles, the genus Rubus (Rubus) and Rose genus; As belonging to the Moraceae family, the genus Ficus; As belonging to the azalea family, the genus Vaccinium; As belonging to the family Tabata, the genus Actinidia; As belonging to the family Oysteraceae, the genus Diospyros; As belonging to the camellia family, camellia (Camellia) genus; As belonging to the Cucurbitaceae family, the genus Cucumis and the
- bananas (Musaparasidiaca), Musabasjoo, Musacoccinea and Malay acacia (Musaacuminata); As belonging to the genus Ginger, ginger (Zingiber officinale); As belonging to the Dutch strawberry genus, strawberry (Fragariaxananassa), Virginia strawberry (Fragariavirginiana), Chile strawberry (Fragariachiloensis) and Ezonosnake strawberry (Fragariavesca); Apples belonging to the genus Apple (Maluspumila, Malusdomestica, Malusbaccata), Hanakaidou (Malushalliana), Kaiduzumi (Malusfloribunda) and dog apple (Malusprunifolia); The genus Prunusum, Prunusavium, Prunuspersica, Prunusarmeniaca, Prunusdulcis, Prunusalicina and Prunusalicina As belonging to the genus Pe
- Durian AAT comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
- the base sequence corresponding to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 is shown in SEQ ID NO: 2.
- Apple AAT can comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 or the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7.
- the apple AAT comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 is wild type, and the AAT comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 is a cysteine at positions 48, 167, 270, 274 and 447 of the wild type AAT.
- Tomato AAT can comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5.
- Tomato AAT comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 is tomato (wild type) A2K type AAT in which the second amino acid of tomato (wild type) wild type AAT is substituted from alanine to lysine.
- the base sequence corresponding to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 is shown in SEQ ID NO: 6.
- AAT preferably comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, 3, 5, or 7, and more preferably comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, 5, or 7.
- AAT includes, for example, deletion, insertion, substitution and substitution of one or several amino acids in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, 3, 5, or 7, preferably in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, 5, or 7.
- a protein consisting of an added amino acid sequence can also be used.
- the protein maintains alcohol acyltransferase activity that catalyzes esterification of 3-hydroxyisobutyryl-CoA.
- “several” means 1 to 40, preferably 1 to 20, more preferably 1 to 10, particularly preferably 5 or less.
- a mutation introduction kit using site-directed mutagenesis by a known method such as Kunkel method or Gapped duplex method, for example, QuikChangeTM Site-Directed Mutagenesis Kit (Stratagene) ), GeneTailorite Site-Directed Mutagenesis System (Invitrogen), TaKaRa Site-Directed Mutagenesis System (Mutan-K, Mutan-Super Express Km, etc .: Takara Bio Inc. can be used).
- the entire gene having a sequence containing a deletion or the like may be artificially synthesized.
- AAT includes, for example, 80% or more, preferably 90% or more with respect to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, 3, 5, or 7, preferably with respect to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, 5, or 7. More preferably, a protein comprising an amino acid sequence having a sequence identity of 95% or more, more preferably 99.5% or more, and particularly preferably 99.9% or more can be used.
- the protein maintains alcohol acyltransferase activity that catalyzes esterification of 3-hydroxyisobutyryl-CoA.
- sequence identity is obtained by aligning both sequences so that the residues of the two amino acid sequences to be compared match as much as possible, and dividing the number of matching residues by the total number of residues. It is expressed as a percentage.
- a gap is appropriately inserted in one or both of the two sequences to be compared as necessary.
- Such alignment of sequences can be performed using a known program such as BLAST, FASTA, CLUSTALW, and the like.
- the total number of residues is the number of residues obtained by counting one gap as one residue.
- the identity is calculated by dividing the number of matching residues by the total number of residues in the longer sequence. .
- AAT hybridizes under stringent conditions to, for example, a complementary strand of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, 4, 6, or 8, preferably a complementary strand of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, 6, or 8.
- a protein having an amino acid sequence encoded by soybean DNA can also be used.
- the protein maintains alcohol acyltransferase activity that catalyzes esterification of 3-hydroxyisobutyryl-CoA.
- a nylon membrane on which DNA is immobilized is 6 ⁇ SSC (1 ⁇ SSC is 8.76 g of sodium chloride, 4.41 g of sodium citrate dissolved in 1 liter of water), 1% Conditions for hybridization by incubation with a probe at 65 ° C. for 20 hours in a solution containing SDS, 100 ⁇ g / ml salmon sperm DNA, 0.1% bovine serum albumin, 0.1% polyvinylpyrrolidone, 0.1% ficoll
- the present invention is not limited to this.
- Those skilled in the art should set hybridization conditions by taking into account various conditions such as probe concentration, probe length, reaction time, etc. in addition to such conditions as buffer salt concentration and temperature. Can do.
- washing conditions after hybridization for example, “2 ⁇ SSC, 0.1% SDS, 42 ° C.”, “1 ⁇ SSC, 0.1% SDS, 37 ° C.”, and more stringent conditions, for example, Conditions such as “1 ⁇ SSC, 0.1% SDS, 65 ° C.” and “0.5 ⁇ SSC, 0.1% SDS, 50 ° C.” can be mentioned.
- Conditions such as “1 ⁇ SSC, 0.1% SDS, 65 ° C.” and “0.5 ⁇ SSC, 0.1% SDS, 50 ° C.” can be mentioned.
- AAT When AAT is subjected to a reaction, its form of use is not particularly limited as long as it exhibits the catalytic activity, and a living tissue containing AAT or a processed product thereof can be used as it is.
- a biological tissue an entire plant body, a plant organ (for example, fruit, leaf, petal, stem, seed, etc.), or a plant tissue (for example, fruit epidermis, pulp, etc.) can be used.
- the processed tissue include AAT crude enzyme solution or purified enzyme extracted from the living tissue.
- the method for purifying AAT is not particularly limited, it can be purified by the following method.
- the plant tissue having AAT activity is disrupted and then suspended in a buffer such as Tris-HCl buffer or phosphate buffer.
- a buffer such as Tris-HCl buffer or phosphate buffer.
- fractionation by precipitation (2) various chromatographies, (3) methods for removing low-molecular substances by dialysis, ultrafiltration and the like, which are commonly used for enzyme purification, are used alone or appropriately. Apply in combination.
- a preferred embodiment as a method for purifying AAT is as follows.
- a living tissue is frozen with liquid nitrogen or the like and ground, and then extracted with a Tris-HCl buffer containing 5 times the amount of DTT (dithiothreitol) and glycerol.
- the crude enzyme extract is subjected to ion exchange chromatography, and the non-adsorbed portion is recovered to obtain the enzyme extract.
- this method eliminates the influence of polyphenols contained in plants and can be obtained stably and efficiently.
- Enzyme protein can be efficiently purified by using the obtained enzyme extract using ion exchange chromatography, gel filtration column or the like.
- AAT-expressing genetically modified microorganism When subjecting AAT to the reaction, it is also possible to isolate the AAT gene, introduce it into a general host vector system, and use a microorganism transformed with the vector system.
- the host include Escherichia coli, Rhodococcus genus, Pseudomonas genus, Corynebacterium genus, Bacillus genus, Streptococcus genus, Streptomyces genus and the like in yeasts, and Is mentioned.
- E. coli it is particularly convenient to use E. coli, because it is simple and efficient.
- AAT gene isolation can be performed using a general molecular biological technique such as PCR using gene information published in a database. It is also possible to completely synthesize the base sequence of the AAT gene by a usual method. On the other hand, it can be isolated in the same manner as a known AAT gene by using AAT with unknown genetic information and gene sequence information estimated by molecular biological techniques based on the amino acid sequence of the purified protein. Whether the known or novel AAT has the catalytic activity of the present invention can be confirmed by the method described above.
- a culture solution obtained by culturing a recombinant microorganism can be used as it is, or a microbial cell obtained by a collection operation such as centrifugation from the culture solution or a treated product thereof can be used.
- treated cells include cells treated with acetone and toluene, freeze-dried cells, disrupted cells, cell-free extracts obtained by disrupting cells, and crude enzymes or purified enzymes obtained by extracting enzymes from these cells, etc. Is mentioned.
- 3-Hydroxyisobutyryl-CoA may be synthesized from methacrylyl-CoA in the body of a microorganism.
- Alcohol acyltransferase is reactive not only with 3-hydroxyisobutyryl-CoA but also with methacrylyl-CoA, and produces methacrylic acid esters from methacrylyl-CoA. If the alcohol acyltransferase is highly reactive to methacrylyl-CoA, the amount of alcohol acyltransferase that functions in the reaction of 3-hydroxyisobutyryl-CoA to 3-hydroxyisobutyrate is reduced. As a result, the production efficiency of the desired 3-hydroxyisobutyric acid ester is lowered.
- alcohol acyltransferase has a ratio of activity against methacrylyl-CoA and activity against 3-hydroxyisobutyryl-CoA (vs. It is preferable to use one having a higher (3-hydroxyisobutyryl-CoA activity / versus methacrylyl-CoA activity).
- durian alcohol acyltransferase can be preferably employed (see Example 4).
- 3-hydroxyisobutyric acid ester and 3-hydroxyisobutyryl-CoA used as a raw material have a highly reactive double bond at the alpha position. The toxicity is low.
- 3-hydroxyisobutyric acid ester has higher water solubility than methacrylic acid.
- the method for producing methacrylic acid ester according to the present invention using 3-hydroxyisobutyric acid ester having low toxicity and high water solubility as a raw material exhibits an advantageous effect particularly in a reaction system using microorganisms.
- step A 3-hydroxyisobutyryl CoA and alcohol or phenol are added to a solvent and dissolved or suspended. Then, AAT is brought into contact with this solution or suspension, and 3-hydroxyisobutyryl CoA and alcohol or phenol are reacted while controlling conditions such as temperature. By the above reaction, the 3-hydroxyisobutyryl group of 3-hydroxyisobutyryl CoA is transferred to alcohol or phenol to form 3-hydroxyisobutyric acid ester.
- an aqueous solvent such as a buffer is usually used.
- the osmotic pressure concentration and / or ionic strength may be controlled by an osmotic pressure adjusting agent or the like in order to allow the reaction to proceed smoothly.
- the osmotic pressure adjusting agent may be a water-soluble substance added for the purpose of adjusting to be isotonic or hypertonic with respect to the osmotic pressure of the intracellular cell fluid, and is, for example, a salt or a saccharide, preferably a salt. It is.
- the salt is preferably a metal salt, more preferably an alkali metal salt, more preferably an alkali metal halide, and examples thereof include sodium chloride and potassium chloride.
- the saccharide is preferably a monosaccharide or oligosaccharide, more preferably a monosaccharide or disaccharide, and examples thereof include glucose, sucrose, mannitol and the like.
- the osmotic pressure adjusting agent is preferably added at a concentration of 1 mM or more, and particularly preferably adjusted to be isotonic or hypertonic as compared with the intracellular cell solution used.
- organic solvent for example, linear, branched or cyclic, saturated or unsaturated aliphatic hydrocarbon, saturated or unsaturated aromatic hydrocarbon, etc. can be used alone or in admixture of two or more.
- hydrocarbon solvents eg, pentane, hexane, cyclohexane, benzene, toluene, xylene, etc.
- halogenated hydrocarbon solvents eg, methylene chloride, chloroform, etc.
- ether solvents eg, diethyl ether, Dipropyl ether, diisopropyl ether, dibutyl ether, tert-butyl methyl ether, dimethoxyethane and the like
- ester solvents for example, methyl formate, methyl acetate, ethyl acetate, butyl acetate, methyl propionate
- 3-hydroxyisobutyric acid ester may move to the organic phase and the reaction may proceed efficiently.
- the molar ratio and concentration of 3-hydroxyisobutyryl CoA, alcohol or phenol, and AAT are not particularly limited, and can be adjusted as appropriate.
- 3-hydroxyisobutyryl CoA and alcohols or phenols and AAT are preferably 100 pM to 10 mM: 10 ⁇ M to 1 M: 1 pM to 10 mM.
- Various conditions such as reaction temperature or reaction time are not particularly limited and can be appropriately determined.
- the reaction temperature and reaction time are usually 20 to 1 week at 5 to 80 ° C., preferably 20 to 120 hours at 10 to 70 ° C., more preferably 20 minutes to 60 hours in the same temperature range, 20 minutes to 40 hours is more preferable.
- the pH of the reaction solution is not particularly limited, but is, for example, in the range of pH 4 to 10, preferably pH 5.0 to 9.0.
- step B 3-hydroxyisobutyric acid ester is dehydrated by a conventionally known chemical method to produce methacrylic acid ester.
- a conventionally known chemical method for example, the method described in Patent Document 3 can be employed.
- dehydration can be performed by a gas phase reaction at a normal pressure and a temperature of 200 to 500 ° C. using a solid catalyst such as silica, silica-alumina, zeolite and solid phosphoric acid. It can also be dehydrated by a liquid phase reaction using sulfuric acid, phosphoric acid or the like.
- the produced methacrylic acid ester can be detected and quantified using ordinary methods such as high performance liquid chromatography and LC-MS. Further, the methacrylic acid ester volatilized in the gas phase part (head space part) of the culture vessel or reaction vessel can be detected and quantified using a usual method such as gas chromatography.
- Isolation of the methacrylic acid ester from the reaction solution may be carried out by appropriately combining known operations such as filtration, centrifugation, vacuum concentration, ion exchange or adsorption chromatography, solvent extraction, distillation and crystallization as necessary. it can.
- the obtained methacrylic acid ester can be used as a comonomer such as a raw material for acrylic resin, a paint, an adhesive, and a resin modifier.
- Example 1 Measurement of durian AAT activity
- Ammonium sulfate was added to the crude enzyme solution, and the fraction with an added concentration of 30% to 60% was dialyzed against buffer A (20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 5 mM 2-mercaptoethanol) (dialysis fraction 1). ). The dialyzed fraction 1 was applied to a Q-Sepharose column, washed thoroughly with buffer A, and then eluted by increasing the concentration of sodium chloride. The eluate was collected and dialyzed against buffer B (20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 5 mM 2-mercaptoethanol, 30% saturated ammonium sulfate) (dialysis fraction 2).
- the dialysis fraction 2 was applied to a Resource PHE column, washed thoroughly with buffer B, and then eluted with a reduced ammonium sulfate concentration. The eluate was collected and dialyzed against buffer A (dialysis fraction 3). Further, the dialysis fraction 3 was applied to a MonoQ 10/100 column, washed thoroughly with buffer A, and then eluted by increasing the concentration of sodium chloride. The eluate was collected and dialyzed against buffer C (50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 5 mM 2-mercaptoethanol, 150 mM sodium chloride) (dialysis fraction 4).
- buffer C 50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 5 mM 2-mercaptoethanol, 150 mM sodium chloride
- dialyzed fraction 4 was applied to a Superdex 200 column equilibrated with buffer C. The eluate was collected and used as a purified enzyme solution. When the purified enzyme was subjected to SDS-PAGE, a single band of 53 kDa was confirmed.
- AAT activity of the crude enzyme solution, the dialysis fractions 1 to 4 and the purified enzyme solution was measured by the method described below. 100 ⁇ l of a reaction solution (100 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0), 40 mM n-butanol, 0.50 mM methacrylyl-CoA) was prepared. The crude enzyme solution, dialysis fractions 1 to 4 or purified enzyme solution was added and sealed, and reacted at 30 ° C. for 30 minutes. After the reaction, 10 ⁇ l of 10 mM 2-hexanone was added as an internal standard, and the solvent was extracted with 100 ⁇ l octane.
- a reaction solution 100 ⁇ l of a reaction solution (100 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0), 40 mM n-butanol, 0.50 mM methacrylyl-CoA) was prepared.
- the crude enzyme solution, dialysis fractions 1 to 4 or purified enzyme solution was added and sealed, and reacted
- Primer pairs were designed based on the base sequences stored in plant-derived AAT, and DNA fragments were amplified from cDNA. The base sequence of the obtained amplified fragment (700 bp) was determined.
- Primers were designed based on the base sequence of the amplified fragment, and 5′RACE and 3′RACE were performed using cDNA.
- the base sequence of the obtained amplified fragment (about 1.1 kbp and about 1.0 kbp) was determined, and the Dorian AAT gene sequence of SEQ ID NO: 2 was obtained.
- Example 3 Production of recombinant E. coli expressing Dorian AAT gene and purification of recombinant Dorian AAT
- AAT expression vector pET21-NHisMBPTEV-optDzibAAT
- MBP Methyl Binding Protein
- TEV protease cleavage sequence is incorporated into vector pET21a (Novagen) to obtain vector pET21-NHisMBPTEV It was.
- the codon of the Dorian AAT gene sequence of SEQ ID NO: 2 is optimized for E. coli, and the codon optimized AAT gene sequence of SEQ ID NO: 9 (including TEV protease cleavage sequence and restriction enzyme recognition sequence as an additional sequence) is commissioned and synthesized.
- the expression vector pET21-NHisMBPTEV-optDzibAAT was obtained by integrating into the vector pET21-NHisMBPTEV.
- the expression vector pET21-NHisMBPTEV-optDzibAAT was introduced into E. coli NiCo21 (DE3) (New England Biolabs) to obtain recombinant NiCo21 (DE3) / pET21-NHisMBPTEV-optDzibAAT.
- E. coli recombinant NiCo21 (DE3) / pET21-NHisMBPTEV-optDzibAAT was inoculated into 200 mL of 2 ⁇ YT liquid medium containing ampicillin and pre-cultured at 37 ° C. for 16 hours. 100 mL of the culture solution was taken, added to 20 L of the same medium, and cultured at 37 ° C. After shaking culture until the turbidity (OD) reached 1.2, IPTG (final concentration 0.5 mM) was added, the culture temperature was lowered to 20 ° C., and the shaking culture was further continued for 16 hours.
- OD turbidity
- the cells are collected from the culture broth by centrifugation and suspended in buffer D (20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 10 mM imidazole, 0.2 mM Tris (2-carboxyethyl) phosphine hydrochloride). did.
- the cell suspension was crushed with an ultrasonic crusher for 30 minutes while cooling with ice, and then centrifuged to obtain a supernatant as a cell extract.
- the cell extract was applied to a Ni-NTA column, washed thoroughly with buffer D, and then eluted by increasing the imidazole concentration. Fractions with absorbance at 280 nm were collected and subjected to SDS-PAGE.
- a band with a molecular weight consistent with the target protein fused with MBP and AAT was collected and dialyzed against buffer D at 4 ° C. for 16 hours (dialysis Fraction 1).
- 500 U of TEV protease (ProTEV Plus, Promega) was added to dialysis fraction 1 and allowed to stand at 4 ° C. for 48 hours to cleave His tag-MBP.
- Dialysis Fraction 1 is applied to a Ni-NTA column to adsorb the cleaved His-tag-MBP, and an 80% saturated ammonium sulfate solution is added to the passing fraction containing AAT so as to be 25% saturated ammonium sulfate, and an amylose column (New England Biolabs) to obtain a passing fraction.
- the flow-through fraction was applied to a TOYOPEARL Butyl-600 column (Tosoh Corp.), washed thoroughly with buffer E (20 mM Tris-HCl (pH 7.5), 1 mM EDTA, 1 mM DTT) containing 25% saturated ammonium sulfate, and then ammonium sulfate. Elution was performed with decreasing concentration.
- a fraction having an absorbance of 280 nm was collected, subjected to SDS-PAGE, a band having a molecular weight consistent with AAT was collected, and dialyzed against buffer E at 4 ° C. for 16 hours (dialysis fraction 2). Finally, the dialysis fraction 3 was applied to an SP Sepharose column (GE Healthcare), washed thoroughly with buffer E, and then eluted by increasing the concentration of sodium chloride. The obtained eluate was recovered and used as a purified enzyme solution.
- SP Sepharose column GE Healthcare
- the AAT activity of the cell extract, dialysis fractions 1 and 2 and the purified enzyme solution was measured by the method described in Example 1.
- the yield and activity of the enzyme composition in each purification stage are shown in “Table 2”.
- Three column separations yielded 16.4 U / mg AAT, which was purified 1195-fold in activity.
- Example 4 Production of butyl 3-hydroxyisobutyrate by AAT] 100 ⁇ l of a reaction solution (100 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0), 40 mM n-butanol, 0.5 mM 3-hydroxyisobutyryl-CoA) was prepared. The purified enzyme solution obtained in Example 3 was added and sealed, and reacted at 30 ° C. for 30 minutes. After the reaction, 10 ⁇ l of 10 mM 2-hexanone was added as an internal standard, and the solvent was extracted with 100 ⁇ l octane.
- a reaction solution 100 ⁇ l of a reaction solution (100 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0), 40 mM n-butanol, 0.5 mM 3-hydroxyisobutyryl-CoA) was prepared.
- the purified enzyme solution obtained in Example 3 was added and sealed, and reacted at 30 ° C. for 30 minutes. After the reaction, 10 ⁇ l of 10 mM 2-hexanone
- Example 5 Production of butyl 3-hydroxyisobutyrate by each plant AAT
- plasmid pAAT032 containing a tomato (wild type) A2K type AAT (SEQ ID NO: 5) gene in which the second amino acid of tomato (wild type) wild type AAT was substituted from alanine to lysine was commissioned and synthesized (Genscript, hereinafter). the same).
- Apple AAT expression vector pAAT154 and tomato AAT expression vector pAAT032 were introduced into Escherichia coli JM109 strain to obtain a recombinant.
- the obtained bacterial cell suspension was adjusted so that OD630 was 20. Cells were disrupted by sonication and the cells and membrane fraction were removed by centrifugation. Then, it filtered using Nalgene Rapid-flow Bottle Top Filter (pore diameter 0.2micrometer, the product made from Thermo Fisher Scientific), and prepared the cell extract.
- 100 ⁇ l of the cell extract was added to 900 ⁇ l of a reaction solution containing 0.5 mM methacrylyl-CoA and 40 mM n-butanol to initiate the butyl methacrylate production reaction.
- the reaction was carried out in a 10 ml sample bottle (for GC). The sample bottle was incubated at 30 ° C. to allow the reaction to proceed for 1-5 hours. After completion of the reaction, 1 ml of acetonitrile was added to the reaction solution in the sample bottle and mixed. Thereafter, the mixture was filtered using a syringe filter DISMIC (hole diameter: 0.45 ⁇ m, manufactured by ADVANTEC) and subjected to HPLC analysis.
- a syringe filter DISMIC hole diameter: 0.45 ⁇ m, manufactured by ADVANTEC
- 3-Hydroxyisobutyrate was detected from the reaction solution to which the cell extract containing apple AAT, tomato AAT or durian AAT was added.
- the activity of apple AAT and tomato AAT against 3-hydroxyisobutyryl-CoA (3HIBA-CoA) and methacrylyl-CoA (MAA-CoA) was evaluated from the amount of butyl 3-hydroxyisobutyrate and butyl methacrylate (Table). 3).
- SEQ ID NO: 1 amino acid sequence of durian AAT
- SEQ ID NO: 2 nucleotide sequence of durian AAT gene
- SEQ ID NO: 3 amino acid sequence of apple AAT
- SEQ ID NO: 4 codon optimized apple AAT gene sequence
- SEQ ID NO: 5 amino acid sequence of tomato A2K type AAT
- SEQ ID NO: 6 Codon optimized tomato A2K type AAT gene sequence
- SEQ ID NO: 7 Amino acid sequence of mutant apple AAT SEQ ID NO: 8: Codon optimized mutant apple AAT gene sequence
- SEQ ID NO: 9 Codon optimized durian AAT gene sequence (addition) (Including TEV protease cleavage sequence and restriction enzyme recognition sequence)
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Abstract
Description
CoA化合物の鎖式炭化水素に水酸基が導入された場合、CoA化合物の物理化学的性質が変化すると予想されるが、アルコールアシルトランスフェラーゼが水酸化された鎖式炭化水素で構成されたCoA化合物についてもそのエステル化を触媒し得るかどうかは明らかでなかった。
[1] アルコールアシルトランスフェラーゼの存在下、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAにアルコールまたはフェノール類を作用させて、3-ヒドロキシイソ酪酸エステルを生成する工程を含む、3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
[2] 前記アルコールアシルトランスフェラーゼが植物由来である、[1]の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
[3] 前記植物が、アオイ目、バラ目またはナス目に属するものである、[2]の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
[4] 前記植物が、アオイ科、バラ科、またはナス科に属するものである、[2]の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
[5] 前記植物が、ドリアン属、リンゴ属、またはナス属に属するものである、[2]の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
[6] 前記植物が、ドリアン、リンゴ、またはトマトである、[2]の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
[7] 前記アルコールアシルトランスフェラーゼが、以下の(1)~(4)のいずれかのアミノ酸配列を含んでなる、[1]~[6]のいずれかの3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法、
(1)配列番号1、配列番号5、または配列番号7のアミノ酸配列。
(2)配列番号1、配列番号5、または配列番号7のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸が欠失、挿入、置換および/または付加されたアミノ酸配列。
(3)配列番号1、配列番号5、または配列番号7のアミノ酸配列に対して80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列。
(4)配列番号2、配列番号6、または配列番号8の塩基配列の相補鎖にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAにコードされるアミノ酸配列。
[8] 前記アルコールアシルトランスフェラーゼを発現する遺伝子組み換え微生物を用いる、[1]~[7]のいずれかの3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
[9] 3-ヒドロキシイソブチリル-CoAが、前記微生物の生体内でメタクリリル-CoAから合成されるものである、[8]の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの脱水反応によりメタクリル酸エステルを生成する工程と、を含むメタクリル酸エステルの製造方法。
[11] 前記アルコールアシルトランスフェラーゼが植物由来である、[10]のメタクリル酸エステルの製造方法。
[12] 前記植物が、アオイ目、バラ目またはナス目に属するものである、[11]のメタクリル酸エステルの製造方法。
[13] 前記植物が、アオイ科、バラ科、またはナス科に属するものである、[11]のメタクリル酸エステルの製造方法。
[14] 前記植物が、ドリアン属、リンゴ属、またはナス属に属するものである、[11]のメタクリル酸エステルの製造方法。
[15] 前記植物が、ドリアン、リンゴ、またはトマトである、[11]のメタクリル酸エステルの製造方法。
[16] 前記アルコールアシルトランスフェラーゼが、以下の(1)~(4)のいずれかのアミノ酸配列を含んでなる、[10]~[15]のいずれかのメタクリル酸エステルの製造方法、
(1)配列番号1、配列番号5、または配列番号7のアミノ酸配列。
(2)配列番号1、配列番号5、または配列番号7のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸が欠失、挿入、置換および/または付加されたアミノ酸配列。
(3)配列番号1、配列番号5、または配列番号7のアミノ酸配列に対して80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列。
(4)配列番号2、配列番号6、または配列番号8の塩基配列の相補鎖にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAにコードされるアミノ酸配列。
[17] 前記アルコールアシルトランスフェラーゼを発現する遺伝子組み換え微生物を用いる、[10]~[16]のいずれかのメタクリル酸エステルの製造方法。
[18] 3-ヒドロキシイソブチリル-CoAが、前記微生物の生体内でメタクリリル-CoAから合成されるものである、[17]のメタクリル酸エステルの製造方法。
(1)配列番号1のアミノ酸配列を含んでなるタンパク質。
(2)配列番号1のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸が欠失、挿入、置換および/または付加されたアミノ酸配列を含んでなり、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAのエステル化を触媒するアルコールアシルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質。
(3)配列番号1のアミノ酸配列、または配列番号1のアミノ酸配列に対して80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなり、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAのエステル化を触媒するアルコールアシルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質。
(4)配列番号2の塩基配列、または配列番号2の塩基配列の相補鎖にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAにコードされるアミノ酸配列を含んでなり、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAのエステル化を触媒するアルコールアシルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質。
本発明に係る3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法は、以下の「工程A」を含む。また、本発明に係るメタクリル酸エステルの製造方法は、工程Aに加えて以下の「工程B」を含む。
工程A:アルコールアシルトランスフェラーゼの存在下、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAにアルコールまたはフェノール類を作用させて、3-ヒドロキシイソ酪酸エステルを生成する工程。
工程B:3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの脱水反応によりメタクリル酸エステルを生成する工程。
工程Aおよび工程Bを以下に示す。
工程Aで用いられる「アルコール」または「フェノール類」は、以下の式2で示される化合物である。アルコールまたはフェノール類の構造は、メタクリル酸エステルに対応することから、その構造は、前記式1のRと同じ定義であり、直鎖あるいは分岐の炭素数1~20の炭化水素基を表す。炭化水素基は、飽和または不飽和の非環式であってもよく、飽和または不飽和の環式であってもよい。好ましくは直鎖あるいは分岐の炭素数1~10の無置換のアルコール、アラルキルアルコールまたはフェノール類であり、より好ましくはメタノール、エタノール、n-プロパノール、イソプロパノール、n-ブタノール、イソブタノール、sec-ブタノール、tert-ブタノール、n-ペンチルアルコール、イソペンチルアルコール、tert-ペンチルアルコール、n-ヘキシルアルコール、イソヘキシルアルコール、2-ヘキシルアルコール、ジメチルブチルアルコール、エチルブチルアルコール、ヘプチルアルコール、オクチルアルコール、2-エチルヘキシルアルコールの炭素数1~8のアルキルアルコール、ベンジルアルコールまたはフェノールである。特に好ましくは、メタノール、エタノール、n-ブタノール、イソブタノール、n-ヘキシルアルコールである。
アルコールアシルトランスフェラーゼ(以下「AAT」とも称する)は、アシル-CoAのアシル基をアルコールまたはフェノール類に転移させてエステルを生成する反応を触媒する活性を有する。AATは、種々の果物におけるエステルの生成に関与していると言われている。AATはショウガ目(バナナ)、バラ目(イチゴ、リンゴ、ナシ、モモ)、ウリ目(メロン)、ツツジ目(キウイ)、シソ目(オリーブ)、ナス目(トマト)、ムクロジ目(レモン、マンゴー)等の植物に存在することが知られている。
なお、本発明において、植物の分類はAPG植物分類体系第3版(Botanical Journal of the Linnean Society, 2009, 161, 105121)に従うものとする。
バラ目に属するものとしてはバラ科(Rosaceae)およびクワ科(Moraceae);
ツツジ目に属するものとしてはツツジ科(Ericaceae)、マタタビ科(Actinidiaceae)、カキノキ科(Ebenaceae)およびツバキ科(Theaceae);
ウリ目に属するものとしてはウリ科(Cucurbitaceae);
アブラナ目に属するものとしてはパパイア科(Caricaceae)およびアブラナ科(Brassicaceae);
クスノキ目に属するものとしてはクスノキ科(Lauraceae);
イネ目に属するものとしてはパイナップル科(Bromeliaceae)およびイネ科(Poaceae);
ヤシ目に属するものとしてはヤシ科(Arecaceae);
クサスギカズラ目に属するものとしてはラン科(Orchidaceae)およびアヤメ科(Iridaceae);
ユキノシタ目に属するものとしてはスグリ科(Grossulariaceae);
ナデシコ目に属するものとしてはナデシコ科(Caryophyllaceae);
ブドウ目に属するものとしてはブドウ科(Vitaceae);
キントラノオ目に属するものとしてはキントラノオ科(Malpighiaceae)、トケイソウ科(Passifloraceae)、トウダイグサ科(Euphorbiaceae)およびヤナギ科(Salicaceae);
カタバミ目に属するものとしてはカタバミ科(Oxalidaceae);
マメ目に属するものとしてはマメ科(Fabaceae);
ムクロジ目に属するものとしてはウルシ科(Anacardiaceae)、ビーベルステイニア科(Biebersteiniaceae)、カンラン科(Burseraceae)、キルキア科(Kirkiaceae)、センダン科(Meliaceae)、ソウダノキ科(Nitrariaceae)、ミカン科(Rutaceae)、ムクロジ科(Sapindaceae)およびニガキ科(Simaroubaceae);
アオイ目に属するものとしてはベニノキ科(Bixaceae)、ハンニチバナ科(Cistaceae)、キティヌス科(Cytinaceae)、フタバガキ科(Dipterocarpaceae)、アオイ科(Malvaceae)、ナンヨウザクラ科(Muntingiaceae)、ネウラダ科(Neuradaceae)、サルコラエナ科(Sarcolaenaceae)、スファエロセパルム科(Sphaerosepalaceae)およびジンチョウゲ科(Thymelaeaceae);
フトモモ目に属するものとしてはミソハギ科(Lythraceae)、アカバナ科(Onagraceae)およびフトモモ科(Myrtaceae);
キンポウゲ目に属するものとしてはキンポウゲ科(Ranunculaceae)およびケシ科(Papaveraceae);
ナス目に属するものとしてはナス科(Solanaceae);
シソ目に属するものとしてはキツネノマゴ科(Acanthaceae)、ノウゼンカズラ科(Bignoniaceae)、ビブリス科(Byblidaceae)、キンチャクソウ科(Calceolariaceae)、カールマニア科(Carlemanniaceae)、イワタバコ科(Gesneriaceae)、シソ科(Lamiaceae)、アゼナ科(Linderniaceae)、タヌキモ科(Lentibulariaceae)、ツノゴマ科(Martyniaceae)、モクセイ科(Oleaceae)、ハマウツボ科(Orobanchaceae)、キリ科(Paulowniaceae)、ゴマ科(Pedaliaceae)、ハエドクソウ科(Phrymaceae)、オオバコ科(Plantaginaceae)、プロコスペルマ科(Plocospermataceae、シュレーゲリア科(Schlegeliaceae)、ゴマノハグサ科(Scrophulariaceae)、スティルベ科(Stilbaceae)、テトラコンドラ科(Tetrachondraceae)、トマンデルシア科(Thomandersiaceae)およびクマツヅラ科(Verbenaceae);
リンドウ目に属するものとしてはキョウチクトウ科(Apocynaceae);
モクレン目に属するものとしてはバンレイシ科(Annonaceae)、デゲネリア科(Degeneriaceae)、エウポマティア科(Eupomatiaceae)、ヒマンタンドラ科(Himantandraceae)、モクレン科(Magnoliaceae)およびニクズク科(Myristicacea);
キク目に属するものとしてはアルセウオスミア科(Alseuosmiaceae)、アルゴフィルム科(Argophyllaceae)、キク科(Asteraceae)、カリケラ科(Calyceraceae)、キキョウ科(Campanulaceae))、クサトベラ科(Goodeniaceae)、ミツガシワ科(Menyanthaceae)、ユガミウチワ科(Pentaphragmataceae)、フェリネ科(Phellinaceae)、ロウッセア科(Rousseaceae)およびスティリディウム科(Stylidiaceae)の植物が好ましい。上記植物の近縁種も利用することができる。
これらのうち、アオイ科、バラ科、又はナス科に属する植物がより好ましい。
ショウガ科(Zingiberaceae)に属するものとしてはショウガ属(Zingiber);
バラ科に属するものとしてはオランダイチゴ(Fragaria)属、リンゴ(Malus)属、サクラ(Prunus)属、ナシ(Pyrus)属、ビワ(Eriobotrya)属、ボケ(Chaenomeles)属、キイチゴ(Rubus)属およびバラ(Rosa)属;
クワ科(Moraceae)に属するものとしてはイチジク(Ficus)属;
ツツジ科に属するものとしてはスノキ(Vaccinium)属;
マタタビ科に属するものとしてはマタタビ(Actinidia)属;
カキノキ科に属するものとしてはカキノキ(Diospyros)属;
ツバキ科に属するものとしてはツバキ(Camellia)属;
ウリ科に属するものとしてはキュウリ(Cucumis)属およびスイカ(Citrullus)属;
パパイア科に属するものとしてはパパイア(Carica)属およびヴァスコンセレア(Vasconcellea)属;
アブラナ科に属するものとしてはシロイヌナズナ(Arabidopsis)属;
クスノキ科に属するものとしてはワニナシ(Persea)属;
パイナップル科に属するものとしてはアナナス属(Ananas);
イネ科に属するものとしてはイネ(Oryza)属、コムギ(Triticum)属、オオムギ(Hordeum)属、トウモロコシ(Zea)属、モロコシ(Sorghum)属およびヤマカモジグサ(Brachypodium)属;
ヤシ科に属するものとしてはココヤシ(Cocos)属;
ラン科に属するものとしてはバンダ(Vanda)属;
アヤメ科に属するものとしてはアヤメ(Iris)属;
スグリ科に属するものとしてはスグリ(Ribes)属;
ナデシコ科に属するものとしてはカスミソウ属(Gypsophila);
ブドウ科に属するものとしてはブドウ属(Vitis)、ノブドウ属(Ampelopsis)、ヤブガラシ属(Cayratia)、セイシカズラ属(Cissus)、キフォステンマ属(Cyphostemma)、ウドノキ属(Leea)、ツタ属(Parthenocissus)およびミツバカズラ属(Tetrastigma);
キントラノオ科に属するものとしてはヒイラギトラノオ(Malpighia)属;
トケイソウ科に属するものとしてはトケイソウ(Passiflora)属;
トウダイグサ科に属するものとしてはトウゴマ(Ricinus)属;
ヤナギ科に属するものとしてはヤマナラシ(Populus)属;
カタバミ科に属するものとしてはゴレンシ(Averrhoa)属;
マメ科に属するものとしてはウマゴヤシ(Medicago)属、ハウチワマメ(Lupinus)属、ダイズ(Glycine)属およびチョウマメ(Clitoria)属;
ウルシ科に属するものとしてはマンゴー(Mangifera)属;
ミカン科に属するものとしてはミカン属(Citrus)、アエグレ属(Aegle)、サンショウ属(Zanthoxylum)、ゲッキツ属(Murraya)、ヘンルーダ属(Ruta)、コクサギ属(Orixa)、ミヤマシキミ属(Skimmia)、ゴシュユ属(Euodia)、キハダ属(Phellodendron)、ボロニア属(Boronia)、アクロニキア属(Acronychia)、ワンピ属(Clausena)、コレア属(Correa)、ハナシンボウギ属(Glycosmis)およびアワダン属(Melicope);
ムクロジ科に属するものとしてはレイシ(Litchi)属;
アオイ科に属するものとしてはドリアン属(Durio)、カカオ属(Theobroma)、イチビ属(Abutilon)、トロロアオイ属(Abelmoschus)、ワタ属(Gossypium)、ヤノネボンテンカ属(Pavonia)、フヨウ属(Hibiscus)、キンゴジカ属(Sida)およびアオイ属(Malva);
ミソハギ科に属するものとしてはザクロ(Punica)属、アカバナ科に属するものとしてはサンジソウ(Clarkia)属;
フトモモ科に属するものとしてはバンジロウ(Psidium)属;
キンポウゲ科に属するものとしてはルイヨウショウマ(Actaea)属、ケシ科に属するものとしてはケシ(Papaver)属;
ナス科に属するものとしてはナス(Solanum)属、トウガラシ(Capsicum)属、タバコ(Nicotiana)属およびツクバネアサガオ(Petunia)属;
モクセイ科に属するものとしてはモクセイ属(Osmanthus)およびオリーブ属(Olea)、ソケイ属(Jasminum)、レンギョウ属(Forsythia)、ハシドイ属(Syringa)、ヒトツバタゴ属(Chionanthus)トネリコ属(Fraxinus)およびイボタノキ属(Ligustrum);
シソ科に属するものとしてはアキギリ(Salvia)属;
クマツヅラ科に属するものとしてはグランデュラリア(Glandularia)属;
キョウチクトウ科に属するものとしてはラウオルフィア(Rauvolfia)属およびニチニチソウ(Catharanthus)属;
モクレン科に属するものとしてはモクレン属(Magnolia);
キク科に属するものとしてはカミツレ属(Chamaemelum)、ノコギリソウ属(Achillea)、ムラサキバレンギク属(Echinacea)、シカギク属(Matricaria)、ヨモギギク属(Tanacetum)、タンポポ属(Taraxacum)、ヨモギ属(Artemisia)、フキ属(Petasites)、ムギワラギク属(Helichrysum)、ワタスギギク属(Santolina)、チョウセンアザミ属(Cynara)、オオアザミ属(Silybum)、キンセンカ属(Calendula)、キクニガナ属(Cichorium)、ベニバナ属(Carthamus)およびキク属(Chrysanthemum)の植物が好ましい。
これらのうち、ドリアン属、リンゴ属、またはナス属に属する植物がより好ましい。
ショウガ属に属するものとしてはショウガ(Zingiberofficinale);
オランダイチゴ属に属するものとしてはイチゴ(Fragariaxananassa)、バージニアイチゴ(Fragariavirginiana)、チリイチゴ(Fragariachiloensis)およびエゾノヘビイチゴ(Fragariavesca);
リンゴ属に属するものとしてはリンゴ(Maluspumila、Malusdomestica、Malusbaccata)、ハナカイドウ(Malushalliana)、カイドウズミ(Malusfloribunda)およびイヌリンゴ(Malusprunifolia);
サクラ属に属するものとしてはウメ(Prunusmume)、セイヨウミザクラ(Prunusavium)、モモ(Prunuspersica)、アンズ(Prunusarmeniaca)、アーモンド(Prunusdulcis)、スモモ(Prunussalicina)およびセイヨウスモモ(Prunusdomestica);
ナシ属に属するものとしてはセイヨウナシ(Pyruscommunis)、ナシ(Pyruspyrifolia)、マメナシ(Pyruscalleryana)およびヤセイセイヨウナシ(Pyruspyraster);
ビワ属に属するものとしてはビワ(Eriobotryajaponica);
ボケ属に属するものとしてはカリン(Chaenomelessinensis);
キイチゴ属に属するものとしてはラズベリー(Rubusidaeus)およびブラックラズベリー(Rubusfruticosus);
バラ属に属するものとしてはハマナス(Rosarugosa);
イチジク属に属するものとしてはイチジク(Ficuscarica);
スノキ属に属するものとしてはブリーベリー(Vacciniumcorymbosum、Vacciniumangustifolium)、ビルベリー(Vacciniummyrtillus)、コケモモ(Vacciniumvitis-idaea)およびツルコケモモ(Vacciniumoxycoccos);
マタタビ属に属するものとしてはキウイ(Actinidiachinensis、Actinidiadeliciosa)、サルナシ(Actinidiaarguta)、シマサルナシ(Actinidiarufa)およびマタタビ(Actinidiapolygama);
カキノキ属に属するものとしてはカキ(Diospyroskaki);
ツバキ属に属するものとしてはチャノキ(Camelliasinensis);
キュウリ属に属するものとしてはキュウリ(Cucumissativus)、メロン(Cucumismelo)、ニシインドコキュウリ(Cucumisanguria)およびツノニガウリ(Cucumismetulifer);
スイカ属に属するものとしてはスイカ(Citrulluslanatus);
パパイア属に属するものとしてはパパイア(Caricapapaya);
ヴァスコンセレア属に属するものとしてはマウンテンパパイア(Vasconcelleacundinamarcensis);
シロイヌナズナ属に属するものとしてはシロイヌナズナ(Arabidopsisthaliana)およびミヤマハタザオ(Arabidopsislyrata);
ワニナシ属に属するものとしてはアボカド(Perseaamericana);
アナナス属に属するものとしてはパイナップル(Ananascomosus);
イネ属に属するものとしてはイネ(Oryzasativa);
コムギ属に属するものとしてはコムギ(Triticumaestivum);
オオムギ属に属するものとしてはオオムギ(Hordeumvulgare);
トウモロコシ属に属するものとしてはトウモロコシ(Zeamays);
モロコシ属に属するものとしてはモロコシ(Sorghumbicolor);
ヤマカモジグサ属に属するものとしてはセイヨウヤマカモジ(Brachypodiumdistachyon);
ココヤシ属に属するものとしてはココナッツ(Cocosnucifera);
バンダ属に属するものとしてはバンダ(Vandahybridcultivar);
アヤメ属に属するものとしてはオランダアヤメ(Irisxhollandica);
スグリ属に属するものとしてはクロスグリ(カシス)(Ribesnigrum);
カスミソウ属に属するものとしてはカスミソウ(Gypsophilapaniculata、Gypsophilaelegans);
ブドウ属に属するものとしてはブドウ(Vitisvinifera、Vitislabrusca)、サマーグレープ(Vitisaestivalis)、ヤマブドウ(Vitiscoignetiae)およびエビヅル(Vitisficifolia);
ヒイラギトラノオ属に属するものとしてはアセロラ(Malpighiaglabra);
トケイソウ属に属するものとしてはパッションフルーツ(Passifloraedulis);
トウゴマ属に属するものとしてはトウゴマ(Ricinuscommunis);
ヤマナラシ属に属するものとしてはコットンウッド(Populustrichocarpa);
ゴレンシ属に属するものとしてはスターフルーツ(Averrhoacarambola);
ウマゴヤシ属に属するものとしてはタルウマゴヤシ(Medicagotruncatula);
ハウチワマメ属に属するものとしてはルピナス(シロバナハウチワマメ)(Lupinusalbus);
ダイズ属に属するものとしてはダイズ(Glycinemax);
チョウマメ属に属するものとしてはチョウマメ(Clitoriaternatea);
マンゴー属に属するものとしてはマンゴー(Mangiferaindica);
ドリアン属に属するものとしてはドリアン(Duriozibethinus、Duriotestudinarius、Duriokutejensis、Duriooxleyanus、Duriograveolens、Duriodulcis);
ミカン属に属するものとしてはレモン(Citruslimon)、スダチ(Citrussudachi)、カボス(Citrussphaerocarpa)、グレープフルーツ(Citrusxparadisi)、ユズ(Citrusjunos)ライム(Citrusaurantifolia)、ウンシュウミカン(Citrusunshiu)およびオレンジ(Citrussinensis);
アエグレ属に属するものとしてはアエグレ・マルメロス(Aeglemarmelos);
レイシ属に属するものとしてはライチ(Litchichinensis);
カカオ属に属するものとしてはカカオ(Theobromacacao);
ザクロ属に属するものとしてはザクロ(Punicagranatum);
サンジソウ属に属するものとしてはフェアリーファンズ(fairyfans)(Clarkiabreweri)およびレッドリボンズ(Redribbons)(Clarkiaconcinna);
バンジロウ属に属するものとしてはグァバ(Psidiumguajava);
ルイヨウショウマ属に属するものとしてはアメリカショウマ(Actaearacemosa);
ケシ属に属するものとしてはケシ(Papaversomniferum)、オニゲシ(Papaverorientale)およびハカマオニゲシ(Papaverbracteatum);
ナス属に属するものとしてはトマト(Solanumlycopersicum);
トウガラシ属に属するものとしてはピーマン(Capsicumannuum)およびハバネロ(Capsicumchinense);
タバコ属に属するものとしてはタバコ(Nicotianatabacum、Nicotianaattenuata);
ツクバネアサガオ属に属するものとしてはペチュニア(Petuniaxhybrida);
モクセイ属に属するものとしてはモクセイ(ギンモクセイ、キンモクセイ、ウスギモクセイ、シロモクセイ)(Osmanthusfragrans)、ヒイラギ(Osmanthusheterophyllus)、リュウキュウモクセイ(Osmanthusmarginatus)、ヒイラギモクセイ(Osmanthus×fortunei)およびシマモクセイ(Osmanthusinsularis);
オリーブ属に属するものとしてはオリーブ(Oleaeuropaea);
アキギリ属に属するものとしてはサルビア(Salviasplendens);
グランデュラリア属に属するものとしてはビジョザクラ(Glandulariaxhybrida);
ラウオルフィア属に属するものとしてはインドジャボク(Rauvolfiaserpentina);
ニチニチソウ属に属するものとしてはニチニチソウ(Catharanthusroseus);
モクレン属に属するものとしてはカラタネオガタマ(Magnoliafigo)、オガタマノキ(Magnoliacompressa)、キンコウボク(Magnoliachampaca)、モクレン(Magnolialiliiflora)、コブシ(Magnoliakobus)、ホオノキ(MagnoliaobovataおよびMagnolialaevifolia);
カミツレ属に属するものとしてはローマンカモミール(ChamaemelumnobileおよびChamaemelumfuscatum)が好ましい。
これらのうち、ドリアン、リンゴ、またはトマトがより好ましい。
トマトAATは、配列番号5のアミノ酸配列を含んでなるものとできる。配列番号5のアミノ酸配列を含んでなるトマトAATは、トマト(野生種)野生型AATの2番目のアミノ酸がアラニンからリジンに置換されたトマト(野生種)A2K型AATである。配列番号5のアミノ酸配列に対応する塩基配列を配列番号6に示す。
AATは、配列番号1,3,5、または7のアミノ酸配列を含んでなるものであることが好ましく、配列番号1,5,または7のアミノ酸配列を含んでなるものであることがより好ましい。
ここで、「数個」とは、1~40個、好ましくは1~20個、より好ましくは1~10個、特に好ましくは5個以下をいう。アミノ酸配列に欠失等を導入するには、Kunkel法やGapped duplex法等の公知手法により、部位特異的突然変異誘発法を利用した変異導入用キット、例えばQuikChangeTM Site-Directed Mutagenesis Kit(ストラタジーン社)、GeneTailorTM Site-Directed Mutagenesis System(インビトロジェン社)、TaKaRa Site-Directed Mutagenesis System(Mutan-K、Mutan-Super Express Km等:タカラバイオ社)等を用いることができる。あるいは、欠失等を含む配列を有する遺伝子全体を人工合成してもよい。
ここで、「配列同一性」とは、比較すべき2つのアミノ酸配列の残基ができるだけ多く一致するように両配列を整列させ、一致した残基数を、全残基数で除したものを百分率で表したものである。上記整列の際には、必要に応じ、比較する2つの配列の一方または双方に適宜ギャップを挿入する。このような配列の整列化は、例えばBLAST、FASTA、CLUSTALW等の周知のプログラムを用いて行なうことができる。ギャップが挿入される場合、上記全残基数は、1つのギャップを1つの残基として数えた残基数となる。このようにして数えた全残基数が比較する2つの配列間で異なる場合には、長い方の配列の全残基数で一致した残基数を除して同一性(%)を算出する。
ストリンジェントな条件としては、例えば、DNAを固定したナイロン膜を、6×SSC(1×SSCは塩化ナトリウム8.76g、クエン酸ナトリウム4.41gを1リットルの水に溶かしたもの)、1%SDS、100μg/mlサケ精子DNA、0.1%ウシ血清アルブミン、0.1%ポリビニルピロリドン、0.1%フィコールを含む溶液中で65℃にて20時間プローブとともに保温してハイブリダイゼーションを行う条件を挙げることができるが、これに限定されるわけではない。当業者であれば、このようなバッファーの塩濃度、温度等の条件に加えて、その他のプローブ濃度、プローブの長さ、反応時間等の諸条件を加味し、ハイブリダイゼーションの条件を設定することができる。ハイブリダイゼーション後の洗浄条件として、例えば、「2×SSC、0.1%SDS、42℃」、「1×SSC、0.1%SDS、37℃」、よりストリンジェントな条件としては、例えば、「1×SSC、0.1%SDS、65℃」、「0.5×SSC、0.1%SDS、50℃」等の条件を挙げることができる。
ハイブリダイゼーション法の詳細な手順については、Molecular Cloning, A Laboratory Manual 2nd ed.(Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)))、Current Protocols in Molecular Biology(John Wiley & Sons(1987-1997))等を参照することができる。
AATを反応に供するに際しては、AAT遺伝子を単離し、一般的な宿主ベクター系に導入し、該ベクター系で形質転換した微生物を利用することも可能である。宿主としては、細菌では大腸菌、Rhodococcus属、Pseudomonas属、Corynebacterium属、Bacillus属、Streptococcus属、Streptomyces属などが挙げられ、酵母ではSaccharomyces属、Candida属、Shizosaccharomyces属、Pichia属、糸状菌ではAspergillus属などが挙げられる。これらの中で、特に大腸菌を用いることが簡便であり、効率もよく好ましい。
アルコールアシルトランスフェラーゼは、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAのみならずメタクリリル-CoAに対しても反応性を有し、メタクリリル-CoAからメタクリル酸エステルを生成させる。アルコールアシルトランスフェラーゼが、メタクリリル-CoAに対して高い反応性を有すると、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAから3-ヒドロキシイソ酪酸エステルへの反応に機能するアルコールアシルトランスフェラーゼの量が減少する。この結果、目的とする3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの生成効率が低下することとなる。
したがって、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAから3-ヒドロキシイソ酪酸エステルを効率よく生成させるため、アルコールアシルトランスフェラーゼには、メタクリリル-CoAに対する活性と3-ヒドロキシイソブチリル-CoAに対する活性の比(対3-ヒドロキシイソブチリル-CoA活性/対メタクリリル-CoA活性)がより高いものを用いることが好ましい。このようなアルコールアシルトランスフェラーゼとして、ドリアンのアルコールアシルトランスフェラーゼが好適に採用できる(実施例4参照)。
菌体を用いる場合、反応を円滑に進行させるために、浸透圧調整剤等によりモル浸透圧濃度および/またはイオン強度を制御してもよい。浸透圧調整剤としては、菌体内細胞液の浸透圧に対して等張または高張になるように調節する目的で加えられる水溶性物質であればよく、例えば、塩または糖類であり、好ましくは塩である。塩は、好ましくは金属塩、より好ましくはアルカリ金属塩、より好ましくはハロゲン化アルカリ金属であり、例えば、塩化ナトリウムや塩化カリウムが挙げられる。糖類は、好ましくは単糖類またはオリゴ糖類、より好ましくは単糖類または二糖類であり、例えば、グルコース、スクロース、マンニトール等が挙げられる。浸透圧調整剤は1mM以上の濃度で添加することが好ましく、使用する菌体内細胞液と比して等張または高張になるように調節することが特に好ましい。
工程Bでは、従来公知の化学的手法によって3-ヒドロキシイソ酪酸エステルを脱水し、メタクリル酸エステルを生成させる。
化学的手法として、例えば、特許文献3に記載の方法を採用できる。具体的には、シリカ、シリカ-アルミナ、ゼオライトおよび固体リン酸等の固体触媒を用いた、常圧、温度200~500℃での気相反応によって脱水できる。また、硫酸およびリン酸等を用いた液相反応により脱水することもできる。
1.ドリアンAATの精製
ドリアン(Durio zibethinus)の果実を液体窒素中で粉末状にすりつぶし、緩衝液(200mM Tris-HCl(pH8.0), 5mM 2-メルカプトエタノール)に懸濁し、ガーゼを用いて濾過した。濾液を遠心分離して上清を分離した。上清にヘキサンを加え混和した後、遠心分離により油層と水層を分離し、水層を粗酵素液として得た。後述する方法により、粗酵素液のAAT活性を測定した。
透析画分1をQ-セファロースカラムに供し、緩衝液Aで十分洗浄した後、塩化ナトリウムの濃度を上昇させて溶出を行った。溶出液を回収し緩衝液B(20mM Tris-HCl(pH8.0), 5mM 2-メルカプトエタノール, 30%飽和硫安)に対して透析した(透析画分2)。
次に、透析画分2をResource PHEカラムに供し、緩衝液Bで十分洗浄した後、硫安濃度を減少させて溶出を行った。溶出液を回収し緩衝液Aに対して透析した(透析画分3)。
さらに、透析画分3をMonoQ 10/100カラムに供し、緩衝液Aで十分洗浄した後、塩化ナトリウムの濃度を上昇させて溶出を行った。溶出液を回収し緩衝液C(50mM Tris-HCl(pH8.0), 5mM 2-メルカプトエタノール, 150 mM 塩化ナトリウム)に対して透析した(透析画分4)。
最後に、透析画分4を緩衝液Cで平衡化したSuperdex 200カラムに供した。溶出液を回収し、精製酵素液とした。精製酵素をSDS-PAGEに供したところ、53kDaの単一バンドが確認された。
以下に記載する方法により、粗酵素液、透析画分1~4および精製酵素液のAAT活性を測定した。
反応液(100mM リン酸ナトリウムバッファー(pH7.0)、40mM n-ブタノール、0.50mM メタクリリル-CoA)を100μl調製した。粗酵素液、透析画分1~4または精製酵素液を添加して密閉し、30℃で30分間反応させた。反応後、内部標準として10mM 2-ヘキサノンを10μl加え、100μlオクタンを用いて溶媒抽出した。遠心分離による分液8μlをガスクロマトグラフィー(GC)にインジェクションし、酵素反応により生成したメタクリル酸ブチル量を測定した。メタクリル酸エステル量は、内部標準法による検量線を作成して算出した。
カラム:DB-WAX(内径0.25mm×60m、0.5μm、Agilent Technologies)
カラム温度:100℃・5min、その後40℃/minで昇温し、200℃・2min
キャリアガス:ヘリウム
検出:FID
Inject温度:230℃
Detect温度:250℃
ドリアンの種皮、子房室および種子から市販のキット(PureLink Plant RNA Reagent、サーモフィッシャーサイエンティフィック社)を用いてトータルRNAを抽出した。トータルRNAから市販のキット(SMART RACE cDNA Amplification Kit、タカラバイオ社もしくはGeneRacer Kit、サーモフィッシャーサイエンティフィック社)を用いてcDNAを合成した。
1.AAT発現ベクター(pET21-NHisMBPTEV-optDzibAAT)の作成
His-tag配列、MBP(Maltose Binding Protein)配列およびTEVプロテアーゼ切断配列を含むDNA断片をベクターpET21a(ノバジェン社)に組み込んで、ベクターpET21-NHisMBPTEVを得た。
発現ベクターpET21-NHisMBPTEV-optDzibAATを大腸菌NiCo21(DE3)(ニューイングランドバイオラボ社)に導入し、組換え体NiCo21(DE3)/pET21-NHisMBPTEV-optDzibAATを得た。
大腸菌組換え体NiCo21(DE3)/pET21-NHisMBPTEV-optDzibAATを、アンピシリンを含む2×YT液体培地200mLに植菌し、37℃にて16時間前培養を行った。培養液を100mL取り、20Lの同培地に添加し、37℃にて培養した。濁度(OD)が1.2になるまで振盪培養した後、IPTG(終濃度0.5mM)を添加し、培養温度を20℃に下げ、さらに16時間振盪培養した。得られた培養液から遠心分離により菌体を回収し、緩衝液D(20 mM Tris-HCl(pH8.0), 300mM NaCl, 10mMイミダゾール, 0.2mM Tris(2-carboxyethyl)phosphine Hydrochloride)に懸濁
した。菌体懸濁液を氷冷しながら超音波破砕機を用いて30分間破砕した後、遠心分離を行って細胞抽出液として上清を得た。
細胞抽出液をNi-NTAカラムに供し、緩衝液Dで十分洗浄した後、イミダゾール濃度を上昇させて溶出を行った。280nmの吸光がある画分を回収し、SDS-PAGEに供し、MBPとAATが融合した目的タンパク質と一致する分子量のバンドを回収し、緩衝液Dに対して4℃で16時間透析した(透析画分1)。
次に、透析画分1に500UのTEVプロテアーゼ(ProTEV Plus、プロメガ社)を添加し、4℃で48時間放置しHisタグ-MBPを切断した。透析画分1をNi-NTAカラムに供し切断されたHisタグ-MBPを吸着させ、AATを含む通過画分に25%飽和硫安になるように80%飽和硫安溶液を加え、アミロースカラム(ニューイングランドバイオラボ社)に供して通過画分を得た。通過画分をTOYOPEARL Butyl-600カラム(東ソー社)に供し、25%飽和硫安を含む緩衝液E(20mM Tris-HCl(pH7.5), 1 mM EDTA, 1mM DTT)で十分洗浄した後、硫安濃度を減少させて溶出を行った。280nmの吸光がある画分を回収し、SDS-PAGEに供し、AATと一致する分子量のバンドを回収し、緩衝液Eに対して4℃で16時間透析した(透析画分2)。
最後に、透析画分3をSP Sepharoseカラム(GEヘルスケア社)に供し、緩衝液Eで十分洗浄した後、塩化ナトリウムの濃度を上昇させて溶出を行った。得られた溶出液を回収して精製酵素液とした。
反応液(100mM リン酸ナトリウムバッファー(pH7.0)、40mM n-ブタノール、0.5mM 3-ヒドロキシイソブチリル-CoA)を100μl調製した。実施例3で得られた精製酵素液を添加して密閉し、30℃で30分間反応させた。反応後、内部標準として10mM 2-ヘキサノンを10μl加え、100μlオクタンを用いて溶媒抽出した。遠心分離による分液8μlをガスクロマトグラフィー(GC)にインジェクションし、酵素反応により生成した3-ヒドロキシイソ酪酸ブチルを測定した。3-ヒドロキシイソ酪酸エステル量は、内部標準法による検量線を作成して算出した。
GC分析条件
カラム:DB-WAX(内径0.25mm×60m、0.5μm、Agilent Technologies)
カラム温度:100℃・5min、その後40℃/minで昇温し、240℃・2min
キャリアガス:ヘリウム
検出:FID
Inject温度:300℃
Detect温度:300℃
ドリアンAATの3-ヒドロキシイソブチリル-CoAに対する活性とメタクリリル-CoAに対する活性との比(対3-ヒドロキシイソブチリル-CoA活性/対メタクリリル-CoA活性)は37%(6.1/16.4)であった。この値は、後述するリンゴAAT及びトマトAATの値と比べて顕著に高く、ドリアンAATがイソブチリル-CoAに対して高い反応性を有していることが明らかとなった。
1.リンゴAAT遺伝子発現組み換え大腸菌及びトマトAAT遺伝子発現組み換え大腸菌
野生型リンゴAAT(配列番号3)の48位、167位、270位、274位及び447位のシステインが全てアラニンに置換され、150位のシステインがアルギニンに置換され、かつA64V、K117Q、V248A及びQ363Kの4重変異を有する変異型AAT(配列番号7)遺伝子を含むプラスミドpAAT154を文献(特願2017-538070号)記載の方法により作成した。
また、トマト(野生種)野生型AATの2番目のアミノ酸がアラニンからリジンに置換されたトマト(野生種)A2K型AAT(配列番号5)遺伝子を含むプラスミドpAAT032を委託合成した(Genscript社、以下同じ)。
アンピシリンを含むLB(1%バクトトリプトン、0.5%バクトイーストエキス、1%NaCl)培地に大腸菌形質転換体を植菌し、37℃にて7時間前培養を行った。
培養液を200μl取り、100mlの同培地(1mMIPTG含有)に加え、37℃にて15時間振盪培養した。
培養液から菌体を回収し、50mMリン酸-ナトリウム緩衝液(pH7.0)で洗浄した後、同緩衝液に懸濁した。
超音波処理により細胞を破砕し、遠心分離により菌体及び膜画分を除いた。その後、Nalgene Rapid-flow Bottle Top Filter(孔径0.2μm、サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)を用いて濾過し、細胞抽出液を調製した。
得られた細胞抽出液を14,400gの遠心力にて30分遠心分離し上清を分離した。上清を分画分子量1,000,000の限外濾過膜Vivaspin(Sartorius社製)に供し、通過画分を得、それを分画分子量30,000の限外濾過膜Amicon Ultra(メルク社製)に供し1/10から1/20の液量になるまで濃縮した。
3-ヒドロキシイソブチリル-CoA 0.5mMとn-ブタノール 40mMを含む反応液180μlに20μlの細胞抽出液を添加し、3-ヒドロキシイソ酪酸ブチルの生成反応を開始した。反応は、2ml容量のバイアル中で行った。バイアルを30℃でインキュベートして、15~35時間反応を進行させた。反応終了後、バイアル中の反応液に0.8mlの酢酸エチルを添加し混和し、静置後の酢酸エチル層を分取し、GC分析に供した。
装置:GC-2010(島津製作所)
カラム:DB-1 30m×0.25mmID 0.25μm
カラム流量:He 1.0mL/min
昇温条件:50℃、その後10℃/minで150℃まで昇温し、さらに20℃/minで300℃まで昇温
検出:FID
Inject温度:220℃
Detect温度:300℃
スプリット比:1/20
GC注入量:1.0μL
装置:Waters 2695
カラム:Shiseido CAPCELL PAK C18 UG120 5μm
移動相:65%MeOH、0.2%リン酸
流量:0.25ml/min
カラム温度:35℃
検出:UV210nm
注入量:10μL
3-ヒドロキシイソ酪酸ブチル及びメタクリル酸ブチルの生成量から、リンゴAAT及びトマトAATの3-ヒドロキシイソブチリル-CoA(3HIBA-CoA)及びメタクリリル-CoA(MAA-CoA)に対する活性を評価した(表3参照)。
配列番号2:ドリアンAAT遺伝子の塩基配列
配列番号3:リンゴAATのアミノ酸配列
配列番号4:コドン最適化リンゴAAT遺伝子配列
配列番号5:トマトA2K型AATのアミノ酸配列
配列番号6:コドン最適化トマトA2K型AAT遺伝子配列
配列番号7:変異型リンゴAATのアミノ酸配列
配列番号8:コドン最適化変異型リンゴAAT遺伝子配列
配列番号9:コドン最適化ドリアンAAT遺伝子配列(付加配列としてTEVプロテアーゼ切断配列及び制限酵素認識配列を含む)
Claims (11)
- アルコールアシルトランスフェラーゼの存在下、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAにアルコールまたはフェノール類を作用させて、3-ヒドロキシイソ酪酸エステルを生成する工程を含む、3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
- 前記アルコールアシルトランスフェラーゼが植物由来である、請求項1記載の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
- 前記植物が、アオイ目、バラ目またはナス目に属するものである、請求項2記載の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
- 前記植物が、アオイ科、バラ科、またはナス科に属するものである、請求項2記載の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
- 前記植物が、ドリアン属、リンゴ属、またはナス属に属するものである、請求項2記載の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
- 前記植物が、ドリアン、リンゴ、またはトマトである、請求項2記載の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
- 前記アルコールアシルトランスフェラーゼが、以下の(1)~(4)のいずれかのアミノ酸配列を含んでなる、請求項1~6のいずれか一項に記載の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法、
(1)配列番号1、配列番号5、または配列番号7のアミノ酸配列。
(2)配列番号1、配列番号5、または配列番号7のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸が欠失、挿入、置換および/または付加されたアミノ酸配列。
(3)配列番号1、配列番号5、または配列番号7のアミノ酸配列に対して80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列。
(4)配列番号2、配列番号6、または配列番号8の塩基配列の相補鎖にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAにコードされるアミノ酸配列。 - 前記アルコールアシルトランスフェラーゼを発現する遺伝子組み換え微生物を用いる、請求項1~7のいずれか一項に記載の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
- 3-ヒドロキシイソブチリル-CoAが、前記微生物の生体内でメタクリリル-CoAから合成されるものである、請求項8記載の3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの製造方法。
- アルコールアシルトランスフェラーゼの存在下、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAにアルコールまたはフェノール類を作用させて、3-ヒドロキシイソ酪酸エステルを生成する工程と、
3-ヒドロキシイソ酪酸エステルの脱水反応によりメタクリル酸エステルを生成する工程と、を含むメタクリル酸エステルの製造方法。 - 以下の(1)~(4)のいずれかのタンパク質。
(1)配列番号1のアミノ酸配列を含んでなるタンパク質。
(2)配列番号1のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸が欠失、挿入、置換および/または付加されたアミノ酸配列を含んでなり、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAのエステル化を触媒するアルコールアシルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質。
(3)配列番号1のアミノ酸配列、または配列番号1のアミノ酸配列に対して80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなり、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAのエステル化を触媒するアルコールアシルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質。
(4)配列番号2の塩基配列、または配列番号2の塩基配列の相補鎖にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAにコードされるアミノ酸配列を含んでなり、3-ヒドロキシイソブチリル-CoAのエステル化を触媒するアルコールアシルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質。
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