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TW201008579A - Anti-Fn14 antibodies and uses thereof - Google Patents

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TW201008579A
TW201008579A TW098116062A TW98116062A TW201008579A TW 201008579 A TW201008579 A TW 201008579A TW 098116062 A TW098116062 A TW 098116062A TW 98116062 A TW98116062 A TW 98116062A TW 201008579 A TW201008579 A TW 201008579A
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TW
Taiwan
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seq
antibody
cdr
antigen
binding fragment
Prior art date
Application number
TW098116062A
Other languages
English (en)
Inventor
Ellen Garber
Linda Burkly
Jennifer Michaelson
Alexey Lugovskoy
Yen-Ming Hsu
Karl Hanf
Original Assignee
Biogen Idec Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Biogen Idec Inc filed Critical Biogen Idec Inc
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Description

201008579 六、發明說明: 【先前技術】 腫瘤壞死因子(TNF)相關細胞激素為具有一系列功能之 蛋白質的超家族,該等功能包括免疫調節及細胞凋亡調節 中所牵涉之功能。TWEAK(細胞凋亡之TNF樣弱誘導劑)為 此超家族中之一個成員。TWEAK受體FnU為減少細胞黏 著至細胞外基質且減少血清刺激性生長及遷移的生長因子 調節之即刻早期反應基因(Meighan-Mantha等人,J. Biol. 參 Chem. 274:33166-33176 (1999)) 〇 【發明内容】 本發明至少部分係基於與Fnl4結合且誘導腫瘤細胞死亡 之抗體的鑑別及表徵。該等抗體以低劑量在癌症之動物模 型中有效且在預防腫瘤生長方面具有持久作用。 在一態樣中,本發明之特徵在於一種經分離Fnl4結合蛋 白(例如,經分離抗體或其抗原結合片段),其⑴與在細胞 表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽於抗原決定基處選擇性結 ❹ 合,該抗原決定基在SEQ ID NO: 1之位置42處包括胺基酸 殘基色胺酸,及(η)活體内或活體外誘導或增強癌細胞(例 如’ WiDr結腸癌細胞)之細胞死亡。 如本文所用之「於抗原決定基處結合,該抗原決定基在 SEQ ID NO: 1之位置42處包括胺基酸殘基色胺酸」係指抗 體或其抗原結合片段與SEQ ID NO: 1之野生型人類Fn 14蛋 白選擇性結合之能力,但不能與在位置42處含有取代色胺 酸之丙胺酸的SEQ ID NO·· 1突變體顯著結合。 140330.doc 201008579 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合,且交叉阻斷單株抗體P4A8或P3G5 與SEQ ID NO: 1結合;及(ii)活體内或活體外誘導或增強 癌細胞(例如,WiDr結腸癌細胞)之細胞死亡。當Fn 14結合 蛋白與Fnl4先前結合抑制單株抗體與Fnl4在相同層面上稍 後結合(在該層面上,單株抗體與Fnl4先前結合抑制相同 單株抗體與Fnl4稍後結合)時,Fnl4結合蛋白交叉阻斷單 株抗體(例如,P4A8或P3G5)與Fnl4結合。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合,且交叉阻斷包含P4A8之VH及VL 域之單株抗體、包含P3G5之VH及VL域之單株抗體或包含 P2D3之VH及VL域之單株抗體與SEQ ID NO: 1結合;及(ii) 活體内或活體外誘導或增強癌細胞(例如,WiDr結腸癌細 胞)之細胞死亡。 亦揭示一種經分離抗體或其抗原結合片段,其⑴與在細 胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)在抗 體之恆定區中包含突變,該突變導致效應功能降低或不存 在;及(iii)活體内或活體外誘導或增強癌細胞(例如, WiDr結腸癌細胞)之細胞死亡。在一些實施例中,抗體或 其抗原結合片段與SEQ ID NO: 1多肽於抗原決定基處結 合,該抗原決定基在SEQ ID NO: 1之位置42處包括胺基酸 殘基色胺酸。 140330.doc 201008579 術語「效應功能」係指抗體之Fc區或恆定區結合免疫系 統之蛋白質及/或細胞的功能性能力。具有降低之效應功 能的抗體及對該等抗體工程化之方法在此項技術中已為熟 知(參見,例如 WO 05/18572,WO 05/03175 及 US 6,242,195) 且在本文中進一步詳細描述。典型效應功能包括結合補體 •蛋白(例如補體蛋白Clq)及/或Fc受體(FcR)(例如,FcyRI、 FcyRII、FcyRIIa、FcyRIII 及 / 或 FcyRIIIb)之能力。能夠結 合前述分子中之一或多者的功能性結果包括(但不限於)助 Φ 噬作用、吞噬作用、抗原依賴性細胞毒性(ADCC)、補體 依賴性細胞毒性(CDC)及/或效應細胞調節。效應功能降低 係指至少部分藉由Fc與其同源受體或與補體蛋白或效應細 胞結合而誘導之生物化學活性或細胞活性中之一或多者降 低,同時雖然具有降低、類似、相同或增加之結合親和 力,但仍維持抗體(或其片段)之可變區之抗原結合活性。 效應功能(例如Fc與Fc受體或補體蛋白之結合性)降低可以 「降低倍數」(例如降低1.5倍、2倍及其類似者)表示且可 基於(例如)使用此項技術中已知之結合檢定所測定之結合 活性降低百分比來計算(參見,例如WO 05/18572)。Fc介 :導之受體過度交聯亦可為增強活性之因素。 亦揭示一種經分離F η 14結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽在與單株抗體P4A8、P3G5或P2D3(或包含P4A8 之VH及VL域之單株抗體、包含P3G5之VH及VL域之單株 抗體或包含P2D3之VH及VL域之單株抗體)相同之抗原決定 140330.doc 201008579 基處選擇性結合;及(ii)活體内或活體外誘導或增強癌細 胞(例如,WiDr結腸癌細胞)之細胞死亡。 在一些實施例中,本文所述之F η 14結合蛋白(例如,經 分離抗體或其抗原結合片段)與SEQ ID NO: 1多肽之結合 阻斷或降低TWEAK與多肽之結合。可在各種基於細胞之 系統中量測TWEAK與FN14之結合。舉例而言,可用編碼 Fn 14之載體轉染細胞且可藉由使經轉染細胞與連接可偵測 標記之可溶性TWEAK蛋白接觸來量測TWEAK與該等細胞 之結合。可將F η 14結合蛋白添加至細胞中,隨後添加可溶 性TWEAK蛋白以判定Fnl4結合蛋白是否阻斷或降低 TWEAK與Fnl4之結合。 本文亦揭示一種經分離Fn 14結合蛋白(例如,經分離抗 體或其抗原結合片段),其與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合,且模擬至少一種由TWEAK與Fnl4 結合產生之生物活性,例如誘導IL-8、誘導卡斯蛋白酶 (caspase)裂解及/或誘導NFkB活性(例如,促效劑抗體)。 本文進一步揭示一種經分離F η 14結合蛋白(例如,經分 離抗體或其抗原結合片段),其與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合,且亦與獼猴、小鼠及大鼠Fnl 4 顯著(或可偵測地)結合。 本文亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗 體或其抗原結合片段),其與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合,且在與細胞表面上之Fnl4結合之 後内化至細胞中。 140330.doc 201008579 與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合且 殺死腫瘤細胞之抗體或其抗原結合片段包括具有本文所述 特徵之任何組合的抗體’該等特徵例如⑴促效劑活性或模 擬至少一些由TWEAK與Fnl4結合產生之生物效應,(Π)顯 著阻斷TWEAK與Fnl4結合,(iii)與包括W42之人類Fnl4之 抗原決定基結合,(iv)與人類、獼猴、大鼠及小鼠Fnl4顯 著結合,及(iv)至少一些效應功能之誘導缺乏或降低。舉 例而言,在一實施例中,Fnl4抗體為阻斷TWEAK與Fnl4 結合之促效劑抗體。抗體可與包涵W42之Fnl4之抗原決定 基進一步結合及/或具有效應功能降低之FC區。
在某些實施例中,與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1 多肽選擇性結合且誘導或增強細胞死亡之經分離Fnl4結合 蛋白(例如’經分離抗體或其抗原結合片段)並非此項技術 中已知之抗體’例如,如(例如)Nakayama等人,(2〇〇3) J
Immunol. 170:341,Nakayama等人,(2003) BBRC 306:819 及 Harada 等人,(2002) BBRC 299:488 中所述之 πέμ]、 ITEM-2、ITEM-3 或 ITEM-4。 在某些實施例中’抗體或其抗原結合片段具有在1〇-2至 10·6’ ’ 通常 10·2 至 l〇-5s-l,例如 1〇-2至 10-3^,諸如 ΐχΐ〇 3 至5xl〇-3s-i之範圍内的解離動力學(亦參見實例14)。在一 實施例中’抗體以與單株抗體P4A8或其經修飾形式類似 (例如’在單株抗體P4A8或其經修飾形式之五倍或十倍以 内)之親和力及/或動力學與人類Fnl4結合,其經修飾形式 為例如其嵌合形式或人類化形式(例如,本文所述之人類 140330.doc 201008579 化形式)。可(例如)使用生物感測器技術(BIACORE™)來測 試抗Fnl4抗體之親和力及結合動力學。 在某些實施例中,抗體或其抗原結合片段具有在丨〇-2至 l〇_6s_1,通常1〇·2至ίο·5〆1之範圍内的解離動力學。在一實 施例中’抗體以與單株抗體P2D3或其經修飾形式類似(例 如,在單株抗體P2D3或其經修飾形式之五倍或十倍以内) 之親和力及/或動力學與人類Fnl4結合,其經修飾形式為 例如其嵌合形式或人類化形式(例如,本文所述之人類化 形式)。 在某些實施例中,抗體或其抗原結合片段具有在1 〇-2至 10Ύ1,通常1〇·2至ιοΛ·1之範圍内的解離動力學。在一實 施例中,抗體以與單株抗體P3G5或其經修飾形式類似(例 如’在單株抗體P3G5或其經修飾形式之五倍或十倍以内) 之親和力及/或動力學與人類Fnl4結合,其經修飾形式為 例如其嵌·合形式或人類化形式(例如,本文所述之人類化 形式)。 在某些實施例中,抗體或其抗原結合片段具有在1〇5至 Η^Μ·1:,諸如 5x1〇5 至 5xl〇6M-ls_l,例如 7x1〇5 至 3χ1〇6 M ls_1之範圍内的締合動力學(參見實例14)。在某些實施例 中’抗體或其抗原結合片段具有105至ΙΟ7]^-、-1,諸如 5X105至5xl〇6M-】s-i,例如7x1〇5至3Χΐ〇6Μ·ΐ8-丨之締合常數 及1〇-2至1〇-\-1 ’諸如lxl〇-3至5x1〇-3s-i之解離常數。抗體 或其抗原結合片段可具有10-1G、10-9或10·8Μ或更低,諸如 在 ΙΟ’Μ至 1(Γ9Μ,例如 5χΗΓ1()至 5χ10·9Μ或 lxl〇-9至 5χ1〇·9Μ 140330.doc 201008579 之範圍内的親合力常數(參見實例14)。此等動力學參數可 為抗體或其抗原結合片段與可溶性Fnl4蛋白結合之特徵, 該可溶性Fnl4蛋白為諸如可溶性人類Fnl4蛋白,例如基本 上由人類Fnl4之胞外區或半胱胺酸富集區(例如,人類 Fnl4之胺基酸28-68、69、70或80附近,或胺基酸28附近 •至胺基酸68至80之胺基酸附近)組成之可溶性人類Fnl4蛋 .白。 在某些實施例中,抗體或其抗原結合片段與人類Fnl4之 〇 殘基 C49、W42、K48、D51、R58、A57、H60、R56、 L46、M5 0及R58中之一或多者相互作用。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含與SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3或SEQ ID NO: 4之胺基酸序列至少80%—致之VH 域;及(iii)活體内或活體外誘導或增強癌細胞(例如, WiDr結腸癌細胞)之細胞死亡。在一些實施例中,VH域與 SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3 或 SEQ ID NO: 4 之胺基酸序 列至少90%—致。在一些實施例中,VH域與SEQ ID NO·· : 2、SEQ ID NO: 3或SEQ ID NO: 4之胺基酸序列至少95°/〇 — 致。在一些實施例中,VH域與SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3或SEQ ID NO: 4之胺基酸序列一致。
亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含與SEQ ID NO: 5、SEQ ID 140330.doc -9- 201008579 NO: 6或SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少80%—致之VL 域;及(iii)活體内或活體外誘導或增強癌細胞(例如, WiDr結腸癌細胞)之細胞死亡。在一些實施例中,VL域與 SEQ ID N〇:5、SEQ ID NO: 6 或 SEQ ID NO: 7之胺基酸序 列至少90%—致。在一些實施例中,VL域與SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 6或SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少95%— 致。在一些實施例中,VL域與SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 6或SEQ ID NO: 7之胺基酸序列一致。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含與SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3或SEQ ID NO: 4之胺基酸序列至少80%—致之VH 域;(iii)包含與 SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 6 或 SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少80%—致之VL域;及(iv)活體内或 活體外誘導或增強癌細胞(例如,WiDr結腸癌細胞)之細胞 死亡。在一些實施例中,(i)VH域與SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3或SEQ ID NO: 4之胺基酸序列至少90%—致,及 (ii)VL域與 SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 6或 SEQ ID NO: 7 之胺基酸序列至少90%—致。在一些實施例中,(i)VH域與 SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3 或 SEQ ID NO: 4 之胺基酸序 列至少 95%—致,及(ii)VL域與 SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 6或SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少95%—致。在一些 實施例中,(i)VH域與 SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3 或 SEQ ID NO: 4之胺基酸序列一致,及(ii)VL域與SEQ ID NO: 140330.doc -10- 201008579 5、SEQ ID NO: 6或SEQ ID NO: 7之胺基酸序列一致。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少80%—致之VH域;及(iii)活體 •内或活體外誘導或增強癌細胞(例如,WiDr結腸癌細胞)之 , 細胞死亡。在一些實施例中,VH域與SEQ ID NO: 11或 SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少90%—致。在一些實施例 〇 中,VH域與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO·. 12之胺基酸序列 至少95%—致。在一些實施例中,VH域與SEQ ID NO: 11 或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列一致。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含與SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 15之胺基酸序列至少80%—致之 VL域;及(iii)活體内或活體外誘導或增強癌細胞(例如, WiDr結腸癌細胞)之細胞死亡。在一些實施例中,VL域與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或 SEQ ID NO: 15 之胺基 :酸序列至少90% —致。在一些實施例中,VL域與SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14或 SEQ ID NO: 15 之胺基酸序列至 少95%—致。在一些實施例中,VL域與SEQ ID NO: 13、 SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 15之胺基酸序列一致。
亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID 140330.doc -11 - 201008579 NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少80%—致之VH域;(iii)包含與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或 SEQ ID NO: 15 之胺基 酸序列至少80% —致之VL域;及(iv)活體内或活體外誘導 或增強癌細胞(例如,WiDr結腸癌細胞)之細胞死亡。在一 些實施例中,(i)VH域與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之 胺基酸序列至少90%—致,及(ii)VL域與SEQ ID NO: 13、 SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 15之胺基酸序列至少90% — 致。在一些實施例中,(i)VH域與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少95%—致,及域與SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或 SEQ ID NO: 15之胺基酸序列至 少95%—致。在一些實施例中,⑴VH域與seq ID NO: 11 或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列一致,及(n)vL域與SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO·· 14 或 SEQ ID NO: 15 之胺基酸序列一 致。在一些實施例中,重鏈包含SEQ ID NO: 37或SEQ ID NO: 39 且輕鏈包含 SEQ ID NO: 41、SEQ ID NO: 43 或 SEQ ID NO: 45。在一些實施例中,重鏈包含SEq id NO: 37且 輕鏈包含SEQ ID NO: 43。
亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段)’其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含vh域,該VH域包含(a)與 SEQ ID NO: 2 或SEQ ID NO: 3 之 CDR-H1 至少 90%— 致之第 一重鏈互補決定區(CDR),與SEQ ID NO: 2或SEQ ID NO: 3之CDR-H2至少90% —致之第二重鏈CDR,及與SEQ ID 140330.doc •12- 201008579 NO: 2或SEQ ID NO: 3之CDR-H3至少90%—致之第三重鏈 CDR,或(b)與 SEQ ID NO: 4 之 CDR-H1 至少 90% —致之第 一重鏈CDR,與SEQ ID NO: 4之CDR-H2至少90% —致之第 二重鏈CDR,及與SEQ ID NO: 4之CDR-H3至少90%—致之 第三重鏈CDR ;及(iii)活體内或活體外誘導或增強癌細胞 : (例如,Wi〇r結腸癌細胞)之細胞死亡。在一些實施例中, 第一重鏈CDR 與 SEQ ID NO: 2 或 SEQ ID NO: 3 之CDR-H1 一致,第二重鏈CDR 與 SEQ ID NO: 2或 SEQ ID NO: 3之 β CDR-H2—致,且第三重鍵CDR與 SEQ ID NO: 2或 SEQ ID NO: 3之CDR-H3 —致。在一些實施例中,第一重鏈CDR與 SEQ ID NO: 4 之 CDR-H1—致,第二重鍵CDR 與SEQ ID NO: 4之CDR-H2—致,且第三重鏈CDR與SEQ ID NO: 4之 CDR-H3—致。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VL域,該VL域包含(a)與 w SEQ ID NO: 5或 SEQ ID NO: 6之 CDR-L1 至少 90%— 致之第 一輕鍵 CDR,與 SEQ ID NO: 5 或 SEQ ID NO: 6 之 CDR-L2 至 :少90%—致之第二輕鏈CDR,及與SEQ ID NO: 5或SEQ ID NO: 6之CDR-L3至少90% —致之第三輕鏈CDR,或(b)與 SEQ ID NO: 7之CDR-L1至少90%—致之第一輕鏈CDR,與 SEQ ID NO: 7之CDR-L2至少90%—致之第二輕鏈CDR,及 與SEQ ID NO: 7之CDR-L3至少90% —致之第三輕鏈CDR ; 及(iii)活體内或活體外誘導或增強癌細胞(例如,WiDr結 140330.doc •13· 201008579
腸癌細胞)之細胞死亡。在一些實施例中,第一輕鍵CDR 與 SEQ ID NO: 5 或 SEQ ID NO: 6 之 CDR-L1— 致,第二輕 鏈 CDR與 SEQ ID NO: 5 或 SEQ ID NO: 6之 CDR-L2—致,且 第三輕鏈CDR與 SEQ ID NO: 5或 SEQ ID NO: 6之CDR-L3 — 致。在一些實施例中,第一輕鏈CDR與SEQ ID NO: 7之 CDR-L1— 致,第二輕鏈 CDR 與SEQ ID NO: 7 之 CDR-L2~-致,且第三輕鏈CDR與SEQ ID NO: 7之CDR-L3—致。 亦揭示一種經分離Fnl 4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH域,該VH域包含(a)與 SEQ ID NO: 2 或 SEQ ID NO: 3 之 CDR-H1 至少 90%— 致之第 一重鏈 CDR’ 與 SEQ ID NO: 2 或 SEQ ID NO: 3 之 CDR-H2 至少90%—致之第二重鏈CDR,及與SEQ ID NO: 2或SEQ ID NO: 3之CDR-H3至少90% —致之第三重鏈CDR,或(b) 與SEQ ID NO: 4之CDR-H1至少90%—致之第一重鏈CDR, 與SEQ ID NO: 4之CDR-H2至少90%—致之第二重鏈CDR, 及與SEQ ID NO: 4之CDR-H3至少90%—致之第三重鏈 CDR; (iii)包含VL域,該VL域包含(a)與SEQ ID NO: 5或 SEQ ID NO: 6之CDR-L1至少90%—致之第一輕鏈CDR,與 SEQ ID NO: 5 或 SEQ ID NO: 6 之 CDR-L2 至少 90% — 致之第 二輕鏈CDR,及與SEQ ID NO: 5或 SEQ ID NO: 6之 CDR-L3 至少90%—致之第三輕鏈CDR,或(b)與SEQ ID NO: 7之 CDR-L1至少90% —致之第一輕鏈CDR,與SEQ ID NO: 7之 CDR-L2至少90%—致之第二輕鏈CDR,及與SEQ ID NO: 7 140330.doc •14- 201008579 之CDR-L3至少90% —致之第三輕鏈CDR ;及(iv)活體内或 活體外誘導或增強癌細胞(例如,WiDr結腸癌細胞)之細胞 死亡。在一些實施例中,⑴第一重鏈CDR與SEQ ID NO: 2 之 CDR-H1 — 致’第二重鍵 CDR 與 SEQ ID NO: 2 之 CDR-H2 一致’且第三重鏈CDR與SEQ ID NO: 2之CDR-H3—致; 及(ii)第一輕鏈 CDR 與 SEQ ID NO: 5 之 CDR-L1—致,第二 輕鏈CDR與SEQ ID NO: 5之CDR-L2—致,且第三輕鏈CDR 與SEQ ID NO: 5之CDR-L3—致。在一些實施例中,⑴第 一重鏈CDR與SEQ ID NO: 3之CDR-H1—致,第二重鏈 CDR與SEQ ID NO: 3之CDR-H2—致,且第三重鏈CDR與 SEQ ID NO: 3之CDR-H3—致;及(ii)第一輕鏈CDR與 SEQ ID NO: 6之 CDR-L1— 致,第二輕鏈CDR 與 SEQ ID NO: 6之 CDR-L2—致,且第三輕鏈 CDR 與 SEQ ID NO: 6 之CDR-L3 一致。在一些實施例中,⑴第一重鏈CDR與SEQ ID NO: 4 之 CDR-H1—致,第二重鏈 CDR 與 SEQ ID NO: 4 之 CDR-H2 一致,且第三重鏈CDR與SEQ ID NO: 4之CDR-H3—致; 及(ii)第一輕鏈 CDR 與 SEQ ID NO: 7 之 CDR-L1—致,第二 輕鏈CDR與SEQ ID NO: 7之CDR-L2—致,且第三輕鏈CDR 與SEQ ID NO: 7之CDR-L3—致。在一些實施例中,VH域 包含SEQ ID NO: 8之胺基酸1 -121。在一些實施例中,VL 域包含SEQ ID NO: 9之胺基酸1-111。在一些實施例中, VH域包含SEQ ID NO: 8之胺基酸1-121且VL域包含SEQ ID NO: 9之胺基酸l-iii。在一些實施例中,重鏈包含seQ ID NO: 8且輕鏈包含SEQ ID NO: 9。在一些實施例中,重鏈 140330.doc -15- 201008579 包含SEQ ID NO: 16。在一些實施例中,重鏈包含SEQ ID NO: 16且輕鏈包含SEQ ID NO: 9。 本文所述之抗體或其抗原結合片段可視情況含有與人類 生殖系構架區總計至少90% —致(或至少95%、98%或99% 一致)之構架區。術語「總計」意謂在序列比較中將所有 構架考慮在一起,而非個別構架區。舉例而言,本文所述 之抗體或其抗原結合片段可包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之VH域構架區總計至少90%—致(或至少95%、 98%或99%—致)之VH域構架區。在另一實例中,本文所 述之抗體或其抗原結合片段可包含與SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 15之VL域構架區總計至少90%— 致(或至少95%、98%或99%—致)之VL域構架區。在一些 狀況下,本文所述之抗體或其抗原結合片段可包含⑴與 SEQ ID ΝΟ:11或SEQ ID NO: 12之VH域構架區總計至少 90%—致之 VH域構架區,及(ii)與 SEQ ID NO·· 13、SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 15之VL域構架區總計至少90%—致 之VL域構架區。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH域,該VH域包含SEQ ID NO: 11 ;及(iii)包含 VL域,該 VL域包含 SEQ ID NO: 13 °
亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID 140330.doc -16- 201008579 NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH域,該VH域包含與 SEQ ID NO: 11 之 CDR —致或與 SEQ ID NO: 11 之 CDR 之不 同之處在於至多一個、兩個、三個或四個改變(例如,取 代、缺失或插入)的CDR,其中構架區與SEQ ID NO: 11之 構架區總計至少90%、95%、97%、98%或99%—致;及 - (iii)包含VL域,該VL域包含與SEQ ID NO: 13之CDR—致 • 或與SEQ ID NO: 13之CDR之不同之處在於至多一個、兩 個、三個或四個改變(例如,取代、缺失或插入)的CDR, ❹ 其中構架區與SEQ ID NO: 13之構架區總計至少90%、 95%、97%、98%或 99%—致。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段)’其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH域,該VH域包含SEQ ID NO: 11 ;及(iii)包含 VL域,該 VL域包含 SEQ ID NO: 14 ° 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 ® 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(Π)包含vh域,該VH域包含與 : SEQ ID NO: 11 之 CDR —致或與 SEQ ID NO: 11 之 CDR 之不 同之處在於至多一個、兩個、三個或四個改變(例如,取 代、缺失或插入)的CDR,其中構架區與SEQ ID NO: 11之 構架區總計至少90%、95%、97%、98%或99%—致;及 (iii)包含VL域,該VL域包含與SEQ ID NO: 14之CDR—致 或與SEQ ID NO: I4之CDR之不同之處在於至多一個、兩 140330.doc -17· 201008579 個、三個或四個改變(例如’取代、缺失或插入)的CDR ’ 其中構架區與SEQ ID NO: 14之構架區總計至少90%、 95%、97%、98% 或 99%—致。 亦揭示一種經分離F η 14結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段)’其(i)與在細胞表面上表現之SEQ id NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH域,該VH域包含SEQ ID NO: 11 ;及(iii)包含 VL域’該 VL域包含 SEQ ID NO: 15 ° 亦揭示一種經分離Fn 14結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段)’其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH域,該VH域包含與 SEQ ID NO: 11 之 CDR —致或與 SEQ ID NO: 11 之 CDR 之不 同之處在於至多一個、兩個、三個或四個改變(例如,取 代、缺失或插入)的CDR,其中構架區與SEQ ID NO: 11之 構架區總計至少90%、95%、97%、98%或99%—致;及 (iii)包含VL域,該VL域包含與SEQ ID NO: 15之CDR—致 或與SEQ ID NO: 15之CDR之不同之處在於至多一個、兩 個、三個或四個改變(例如’取代、缺失或插入)的CDR, 其中構架區與SEQ ID NO: 1 5之構架區總計至少90%、 95%、97%、98% 或 99%—致。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(Π)包含VH域,該VH域包含SEQ ID NO: 12 ;及(iii)包含 VL域,該 VL域包含 SEQ ID NO: 140330.doc -18 201008579 13 ° 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH域,該VH域包含與 SEQ ID NO: 12 之 CDR —致或與 SEQ ID NO: 12 之 CDR 之不 同之處在於至多一個、兩個、三個或四個改變(例如,取 代、缺失或插入)的CDR,其中構架區與SEQ ID NO: 12之 構架區總計至少90%、95%、97%、98%或99%—致;及 ® (iii)包含VL域,該VL域包含與SEQ ID NO: 13之CDR—致 或與SEQ ID NO: 13之CDR之不同之處在於至多一個、兩 個、三個或四個改變(例如,取代、缺失或插入)的CDR, 其中構架區與SEQ ID NO: 13之構架區總計至少90%、 95%、97%、98% 或 99%—致。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其(i)與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH域,該VH域包含SEQ ID NO: 12 ;及(iii)包含 VL域,該 VL 域包含 SEQ ID NO: 14 〇 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH域,該VH域包含與 SEQ ID NO: 12 之 CDR —致或與 SEQ ID NO: 12 之 CDR 之不 同之處在於至多一個、兩個、三個或四個改變(例如,取 代、缺失或插入)的CDR,其中構架區與SEQ ID NO: 12之 140330.doc -19· 201008579 構架區總計至少90%、95%、97%、98%或99% —致;及 (iii)包含VL域,該VL域包含與SEQ ID NO: 14之CDR—致 或與SEQ ID NO: 14之CDR之不同之處在於至多一個、兩 個、三個或四個改變(例如,取代、缺失或插入)的CDR, 其中構架區與SEQ ID NO: 14之構架區總計至少90%、 95%、97%、98%或 99%—致。 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段)’其(i)與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ϋ)包含VH域,該VH域包含SEQ ID NO: 12 ;及(iii)包含 VL域,該 VL域包含 SEQ ID NO: 15 ° 亦揭示一種經分離Fnl4結合蛋白(例如,經分離抗體或 其抗原結合片段),其⑴與在細胞表面上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(π)包含vh域,該VH域包含與 SEQ ID NO: 12 之 CDR — 致或與 SEQ ID NO: 12 之 CDR 之不 同之處在於至多一個、兩個、三個或四個改變(例如’取 代、缺失或插入)的CDR,其中構架區與SEQ ID NO: 12之 構架區總計至少90%、95%、97%、98%或99% —致;及 (iii)包含VL域,該VL域包含與SEQ ID NO: 15之CDR—致 或與SEQ ID NO: 15之CDR之不同之處在於至多一個、兩 個、三個或四個改變(例如,取代、缺失或插入)的CDR, 其中構架區與SEQ ID NO: 1 5之構架區總計至少90%、 95%、97%、98%或 99%—致。 在一實施例中,抗體或抗原結合片段包括全部六種來自 140330.doc •20- 201008579 P4A8之CDR或緊密相關之CDR,例如一致或具有至少一個 胺基酸改變但不多於兩個、三個或四個改變(例如,取 代、缺失或插入)的CDR,或本文所述之其他CDR。 在一實施例中,抗體或抗原結合片段包括全部六種來自 . P3G5之CDR或緊密相關之CDR,例如一致或具有至少一個 -胺基酸改變但不多於兩個、三個或四個改變(例如,取 ,代、缺失或插入)的CDR,或本文所述之其他CDR。 在一實施例中,抗體或抗原結合片段包括全部六種來自 O P2D3之CDR或緊密相關之CDR,例如一致或具有至少一個 胺基酸改變但不多於兩個、三個或四個改變(例如,取 代、缺失或插入)的CDR,或本文所述之其他CDR。 與Fnl4蛋白相互作用之抗Fnl4抗體或其抗原結合片段之 胺基酸較佳未經突變(或,若經突變,則由保守胺基酸殘 基置換)。在P4A8抗體之變體或源自P4A8之抗體的變體或 抗原結合片段(例如,包含SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 13 之抗體或抗原結合片段)之一實施例中,CDR L1之殘基S32 未經改變。在另一實施例中,CDR L1之殘基Y34未經改 "變。在另一實施例中,CDR L1之殘基Y36未經改變。在另 : 一實施例中,CDR L2之殘基Y54未經改變。在另一實施例 中,CDR L3之殘基R96未經改變。在另一實施例中,CDR H1之殘基D3 1未經改變。在另一實施例中,CDR H1之殘 基Y32未經改變。在另一實施例中,CDR H2之殘基S52未 經改變。在另一實施例中,CDR H2之殘基Y54未經改變。 在另一實施例中,CDR H2之殘基N55未經改變。在另一實 140330.doc -21 - 201008579 施例中’ CDR H2之殘基Y57未經改變。在另一實施例中, CDR H3之殘基γ 1 〇 1未經改變。在另一實施例中,CDR H3 之殘基Y105未經改變。在另一實施例中,CDR H3之殘基 Y106未經改變。 在一實施例中,抗體或抗原結合片段係如本文所述,其 限制條件為CDR中之至少一者、兩者、三者、四者、五者 或六者或可變鏈中之一或兩者並非來自已知抗體(例如, ITEM-1、ITEM-2、ΙΤΕΜ·3 或 ITEM-4)。 在一實施例中,抗體或抗原結合片段不與其他TNF及參 TNFR家族成員交叉反應。 本文所述之抗體或抗原結合片段可為(例如)人類化抗 體、完全人類抗體、單株抗體、單鏈抗體、單價抗體、多 株抗體、嵌合抗體、多特異性抗體(例如雙特異性抗體)、 多價抗體、Fab片段、F(ab,)2片段、&片段、&片段或Fv片 段。 本文所述之抗體或抗原結合片段可為「多特異性」的, 例如雙特異性、三特異性或具更高多特異性,意謂其同時Θ 識別且結合一或多個不同抗原(例如蛋白質)上所存在之兩 個或兩個以上不同抗原決定基。因此,結合分子為「單特 異性」抑或「多特異性」(例如「雙特異性」)的係指與該 結合分子反應之不同抗原決定基之數目。多特異性抗體可 對Fnl4蛋白之不同抗原決定基具特異性或可對Fni4以及 對異源抗原決定基(諸如異源多肽或固體載體材料)具特異 性。 140330.doc -22, 201008579 如本文所用之術語「價」(如「多價抗體」中所用)係指 結合分子中所存在之潛在結合域(例如抗原結合域)之數 目。各結合域與一個抗原決定基特異性結合。當結合分子 包含一個以上結合域時'各結合域可與相同抗原決定基特 .異性結合(對於具有兩個結合域之抗體而言,稱為「二價 丨單特異性」)或與不同抗原決定基特異性結合(對於具有兩 . 個結合域之抗體而言,稱為「二價雙特異性」)。抗體亦 可為雙特異性的且對各特異性而言為二價的(稱為「雙特 Ο 異性四價抗體」)。在另一實施例中,可製得四價微型抗 體或域缺失抗體。 雙特異性二價抗體及其製造方法描述於(例如)美國專利 第 5,731,168號,第 5,807,706號,第 5,821,333 號;及美國 申請公開案第2003/020734號及第2002/0155537號中,所有 該等案之揭示内容皆以引用的方式併入本文中。雙特異性 四價抗體及其製造方法描述於(例如>WO 02/096948及WO 00/44788中,該等案之揭示内容均以引用的方式併入本文 中。一般而言,參見PCT公開案WO 93/17715,WO 92/08802,WO 91/00360,WO 92/05793,WO 2007/109254 ;
Tutt 等人,J. Immunol. 147:60-69 (1991);美國專利第 4,474,893 號,第 4,714,681 號,第 4,925,648 號,第 5,573,920號,第 5,601,819號;Kostelny 等人,J. Immunol. 148:1547-1553 (1992)。 抗體之重鏈及輕鏈可為大體上全長的。蛋白質可包括至 少一個及視情況兩個完整重鏈及至少一個及視情況兩個完 140330.doc •23- 201008579 整輕鏈或可包括抗原結合片段。在其他實施例中,抗體具 有選自(例如)IgGl、IgG2、lgG3、IgG4、IgM、IgAl、
IgA2、IgD及IgE之重鏈恆定區。重鏈恆定區通常為人類恆 定區或人類恆定區之經修飾形式。在另一實施例中,抗體 具有^^"自(例如)K或λ,尤其κ(例如,人類K)之輕鍵怔定 區0 在某些實施例中,抗體或其抗原結合片段之結合使得細 胞表面上之Fnl4受體交聯或叢集。舉例而言,抗體或其抗 原結合片段可(例如)藉由與蛋白質A結合而形成多聚體, 或可為多價的。 本文所述之抗體或抗原結合片段可經修飾以增強效應功 能’例如’以增強抗體之抗原依賴性細胞介導之細胞毒性 (ADCC)及/或補體依賴性細胞毒性(CDC)或增強目標受體/ Fnl 4之交聯。此可藉由將一或多個胺基酸取代引入抗體之 Fc區中來達成。或者或另外’可將半胱胺酸殘基引入以區 中’藉此允許在此區域中形成鍵間雙硫鍵。由此產生之同 源二聚抗體可具有改良之内化能力及/或增加之補體介導 之細胞死亡及抗體依賴性細胞毒性(ADCC)。具有增強之 抗腫瘤活性的同源二聚抗體亦可使用如Wolff等人,Cancer Research 53:2560-2565 (1993)中所述之異源雙功能交聯劑 來製備。或者’可對具有雙Fc區且可藉此具有增強之補體 溶解及ADCC能力之抗體工程化。參見Stevenson等人, Anti-Cancer Drug Design 3:219-230 (1989)。 本文亦提供編碼本文所述之抗體或其抗原結合片段之核 140330.doc -24· 201008579 酸(例如DNA)。與此等核酸至少約80%、85%、90%、 95%、97%、98%或99%—致或在嚴格雜交條件下與此等核 酸雜交之核酸亦涵蓋於本文中。 亦揭示一種產生本文所述之抗體或抗原結合片段之經分 離細胞。本文亦提供包含編碼本文所述蛋白質之核酸的細 胞(例如經分離細胞)。細胞可為(例如)藉由將哺乳動物B細 胞與骨髓瘤細胞融合而獲得之融合細胞。 亦揭示一種醫藥組合物,其包含本文所述之抗體或抗原 © 結合片段及醫藥學上可接受之載劑。 在另一態樣中’本發明之特徵在於一種誘導腫瘤細胞死 亡之方法’該方法包含使表現Fnl4之腫瘤細胞與有效誘導 通瘤細胞死亡之量的本文所述抗體或抗原結合片段接觸。 亦揭示一種預防或減少腫瘤細胞生長之方法,該方法包 含向具有腫瘤之哺乳動物投與醫藥組合物,該醫藥組合物 包含有效預防或減少腫瘤細胞生長之量的本文所述抗體或 抗原結合片段。 參 亦揭示一種治療癌症之方法,該方法包含向患有癌症之 "甫乳動物投與包含治療有效量之本文所述抗體或抗原結合 片段的醫藥組合物。癌症可為(例如)結腸癌或乳癌。 根據本文所述之方法治療之哺乳動物可為(例如)人類、 小鼠、大鼠、乳牛、豬、狗、貓或猴。 應瞭解’當在本文中提及「抗體或抗原結合片段」時, 此片語可由「蛋白質」替代。因此,抗體及其抗體結合片 段之描述亦適用於蛋白質,諸如包含此等抗體或其抗體結 140330.doc -25- 201008579 合片段之蛋白質。 除非另有規定,否則本文所用之所有技術術語及科學術 語皆具有與一般熟習本發明所屬技術者通常所理解之含義 相同的含義。儘管與本文所述之方法及材料類似或等價之 方法及材料可用於本發明之實施或測試,但在下文描述例 示性方法及材料。本文提及之所有公開案、專利申請案、 專利及其他參考文獻皆以其全文引用的方式併入。在相衝 突之狀況下,本申請案(包括定義)將占支配地位。材料、 方法及實例僅為說明性的且並不意欲作限制。 本發明之其他特徵及優勢將自以下實施方式及申請專利 範圍顯而易見。 【實施方式】 P4A8、P2D3、P3G5及P3D8為與人類Fnl4特異性結合且 拮抗(agonize)Fnl4活性或模擬至少一些由TWEAK與細胞 表面上之Fnl4結合產生之活性的例示性抗體。已發現 P2D3與P3D8具有相同胺基酸序列。本文所述之抗以丨斗抗 體誘導細胞死亡,例如藉由細胞凋亡(諸如卡斯蛋白酶依 賴性細胞调亡)及/或内源TNF_a介導之細胞死亡,且可用 以治療或預防Fnl4介導之病症(諸如癌症)。 Γηΐ 4
Fnl4為FGF誘導性受體。其常常在正常組織之細胞上以 低量表現,且可在損傷或疾病中或在癌症(例如腫瘤)細胞 上上調。在不受理論束缚之情況下,咸信以^受以“配位 體(例如TWEAK)刺激可誘導腫瘤細胞死亡,且抗处14抗體 140330.doc -26· 201008579 亦將有效殺死腫瘤細胞。亦咸信Fnl4在人類腫瘤中過度表 現。抗Fnl4抗體可觸發腫瘤細胞死亡且因此在治療學上有 益於治療癌症。 人類Fnl4之序列展示為: MARGSLRRLLRLLVLGLWLALLRSVAGEQAPGTAPCSRGS SWSADLDKCMDCASCRARPHSDFCLGCAAAPPAPFRLLW PILGGALSLTFVLGLLSGFLVWRRCRRREKFTTPIEETGGE GCPAVALIQ(SEQ ID NO: 1)。 Φ 其他Fnl4蛋白序列包括.:小鼠Fnl4(例如,NCBI寄存編 號 AAF07882 或 NP_038777 或 Q9CR75 或 AAH25860)、人類 Fnl4(例如,NCBI 寄存編號 NP_057723 或 BAA94792 或 Q9NP84 或 AAH02718 或 AAF69108);大鼠 Fnl4(例如, NCBI寄存編號NP_851600 或 AAH60537);及爪蟾Fnl4(例 如,NCBI寄存編號AAR21225或NP_001083640)。可將此 等Fnl4蛋白用作(例如)製備抗Fnl4抗體之免疫原。如本文 所述,可接著篩選抗Fn 14抗體以鑑別促效劑抗體。 ❹ 抗Fnl4抗饉 本揭示案包括抗?1114促效劑抗體(諸如?4八8、?203、 P3G5及P3D8)之特定實例的序列。諸如此等之特定抗體可 (例如)藉由製備及表現編碼所述胺基酸序列之合成基因或 藉由使人類生殖系基因突變以提供編碼所述胺基酸序列之 基因而製得。此外,此等抗體及其他抗Fnl4抗體(例如, 促效劑抗體)可(例如)使用以下方法中之一或多者產生。 眾多方法可用於獲得抗體,尤其人類抗體。一種例示性 140330.doc •27- 201008579 方法包括篩選蛋白質表現庫,例如噬菌體呈現庫或核糖體 呈現庫。噬菌體呈現描述於(例如)U.S. 5,223,409 ; Smith (1985) Science 228:1315-1317 ; WO 92/18619 ; WO 91/17271 ; WO 92/20791 ; WO 92/15679 ; WO 93/01288 ; WO 92/01047 ; WO 92/09690及 WO 90/02809 中。Fab在噬 菌體上之呈現描述於(例如)美國專利第5,658,727號,第 5,667,988號及第 5,885,793號中。 除使用呈現庫以外,其他方法亦可用於獲得Fnl4結合抗 體。舉例而言,Fnl 4蛋白或其肽可用作非人類動物中之抗 原,該非人類動物為例如餐齒動物,例如小鼠、倉鼠或大 鼠。 在一實施例中,非人類動物包括人類免疫球蛋白基因之 至少一部分。舉例而言,可能以人類Ig基因座之大片段對 小鼠抗體產生不足之小鼠品系工程化。使用融合瘤技術, 可產生及選擇源自具有所要特異性之基因的抗原特異性單 株抗體。參見,例如XENOMOUSE™,Green等人,(1994) Nature Genetics 7:13-21 > U.S. 2003-0070185 > WO 96/34096 及 WO 96/33735。 在另一實施例中,自非人類動物獲得單株抗體,且接著 加以修飾,例如人類化或去免疫。Winter描述可用於製備 本文所述之人類化抗體之例示性CDR移植方法(U.S. 5,225,539)。特定人類抗體之所有或一些CDR可由非人類 抗艎之至少一部分置換。僅可有必要置換結合該等CDR或 結合該等CDR之決定子所需之CDR以得到與Fnl4結合之適 140330.doc • 28 · 201008579 用人類化抗體。 可藉由以來自人類Fv可變區之等價序列置換並不直接涉 及抗原結合之Fv可變區之序列來產生人類化抗體。產生人 類化抗體之通用方法係由Morrison,S. L. (1985) Se/ewee 229:1202-1207,Oi專人,(1986) 4:214 ;及 US 5,585,089 ; US 5,693,761 ; US 5,693,762 ; US 5,859,205 及US 6,407,213¼供。彼等方法包括分離、操縱及表現核 酸序列’該專核酸序列編碼來自重鍵或輕鍵中之至少一者 β 之所有或一部分免疫球蛋白Fv可變區。該核酸之來源為熟 習此項技術者所熟知且(例如)可自產生針對預定標乾之抗 體的融合瘤(如上所述)’自生殖系免疫球蛋白基因或自合 成構築體獲得。可接著將編碼人類化抗體之重組DNA選殖 至適當表現載體中。 人類生殖系序列揭示於(例如)T〇mlinson,I.A·等人, (1992) «/· Λ/ο/. _βίο/. 227:776-798 ; Cook,G. P·等人,(1995)
Immunol. Today 16:237-242 ; Chothia, D.等人,(1992) j
Mo/. 227:799-817 ;及 Tomlinson等人,(1995) J 14:4628-4638中。V BASE目錄提供人類免疫球蛋白可變區 序列之詳盡目錄(由Tomlinson, I.A.等人,MRC Centre for Protein Engineering, Cambridge, UK彙編)。此等序列可用 作人類序列之來源,例如用於構架區及CDR。亦可(例如) 如美國專利第6,300,064號中所述使用一致人類構架區。 非人類Fnl4結合抗體亦可由WO 98/52976及w〇 00/34317中所揭示之方法藉由人類τ細胞抗原決定基之特 140330.doc -29- 201008579 異性缺失或「去免疫」來修飾。簡言之,可針對與11類 MHC結合之肽分析抗體之重鍵及輕鏈可變區;此等狀表示 潛在T細胞抗原決定基(如WO 98/52976及WO 00/343 17中 所定義)。為偵測潛在T細胞抗原決定基,可應用稱為「狀 穿過(peptide threading)」之電腦模擬法,且另外可如w〇 98/52976及WO 00/34317中所述在人類11類^111(:結合肽之 資料庫中搜尋vH及vL序列中所存在之基元。此等基元與18 個主要II類MHC DR異型中之任一者結合,且因此構成潛 在T細胞抗原決定基。所偵測之潛在τ細胞抗原決定基可藉 由取代可變區中之少數胺基酸殘基或較佳藉由單一胺基酸 取代基來消除。儘可能進行保守性取代。常常但並非排他 地,可使用對人類生殖系抗體序列中之位置常見的胺基 酸。在鑑別去免疫變化之後,可藉由誘變或其他合成方法 (例如,重新合成、卡匣置換等)來構築編碼之核 酸。經誘變之可變序列可視情況與人類恆定區(例如人類 IgGl或κ恆定區)融合。 在一些狀況下,潛在T細胞抗原決定基將包括已知或預 測對抗體功能重要之殘基。舉例而言,潛在τ細胞抗原決 定基通常偏向於CDR。另外,潛在Τ細胞抗原決定基可存 在於對抗體結構及結合重要之構架殘基中。消除此等潛在 抗原決定基之變化在一些狀況下將需要更多精細研究,例 如藉由製造及測試有或無變化之鏈。若可能,則可藉由在 C D R外進行取代來消除與c D R重疊之潛在τ細胞抗原決定 基。在一些狀況下,CDR内之改變為唯一選擇,且因此可 140330.doc -30- 201008579 測試有或無此取代之變體。在其他狀況下,移除潛在丁細 胞抗原決定基所需之取代處於可能對抗體結合至關重要之 構架内殘基位置處。在此等狀況下,測試有或無此取代之 變體。因此,在一些狀況下,設計若干變體去免疫之重鏈 及輕鍵可變區且測試各種重鏈/輕鏈組合以鑑別最佳去免 疫抗體。可接著藉由結合去免疫程度考慮不同變體之結合 親和力’尤其保留於可變區中之潛在τ細胞抗原決定基之 數目來進行最終去免疫抗體之選擇^去免疫可用於修飾任 何抗體’例如包括非人類序列之抗體,例如合成抗體、鼠 類抗體、其他非人類單株抗體或自呈現庫分離之抗體。 亦可使用使抗體人類化之其他方法。舉例而言,其他方 法了說明抗體之二維結構、與結合決定子三維鄰近之構架 位置,及免疫原性肽序列。參見,例如WO 90/07861 ;美 國專利第 5,693,762號’第 5,693,761 號,第 5,585,089 號, 第 5,530,101 號及第 6,407,213 號;Tempest 等人,(1991) 幻;9:266-271。另一方法稱為「人體化 (humaneering)」且描述於(例如)u.S. 2005-008625 中。 抗體可包括人類Fc區,例如野生型Fc區或包括一或多個 改變之F c區。在一實施例中,怪定區經改變(例如經突變) 以調節抗體之特性(例如’增加或減小下列項中之一或多 者:F c受體結合性、抗體糖基化、半胱胺酸殘基數目、效 應細胞功能或補體功能)。舉例而言,人類IgG1恆定區可 在一或多個殘基(例如殘基234及237中之一或多者)處突 變。抗體可在重鍵之CH2區中具有突變,該等突變降低或 140330.doc •31 · 201008579 改變效應功能’例如Fc受體結合性及補體活化。舉例而 言,抗體可具有諸如美國專利第5,624,821號及第5,648,260 號中所述之突變的突變。如此項技術中所揭示(例如,
Angal等人 ’(1993) Mo/· 30:105-08),抗體亦可 具有使在免疫球蛋白之兩條重鏈之間的雙硫鍵穩定之突 變,諸如IgG4之鉸鏈區中之突變。亦參見,例如u.S. 2005-0037000 〇 親和力成熟 在一實施例中,藉由(例如)誘變來修飾抗Fnl4抗體以提 供經修飾抗體之集合。接著評估經修飾抗體以鑑別一或多 個具有改變之功能特性(改良之結合性、改良之穩定性、 減小之抗原性或增加之活體内穩定性)的抗體。在一實施 中,將呈現庫技術用於選擇或筛選經修飾抗體之集合。接 著(例如)藉由使用較高嚴格度或較具競爭性結合及洗滌條 件自第二庫鑑別較高親和力抗體。亦可使用其他篩選技 術。 在一些實施中,誘變靶向已知或可能處於結合界面處之 區域。舉例而言,若經鑑別之結合蛋白為抗體,則誘變可 針對如本文所述之重鏈或輕鏈之CDR區域。此外,誘變可 針對靠近或鄰近CDR之構架區,例如,尤其在CDR接合點 之1〇個、5個或3個胺基酸内之構架區。在抗體之狀況下, 誘變亦可限於一或數個CDR,例如以產生逐步改良。 在一實施例中,誘變用於產生與一或多個生殖系序列較 類似之抗體。一種例示性生殖系方法可包括:鑑別一或多 140330.doc -32- 201008579 個與經分離抗體之序列類似(例如,在特定資料庫中最類 似)之生殖系序列。接著可在經分離抗體中以遞增、組合 或兩者之方式產生突變(在胺基酸層面上)。舉例而言,產 生,括編碼一些或所有可能生殖系突變之序列的核酸庫。 接著-平估經犬變抗體,例如以鑑別相對於經分離抗體具有 一或多㈣^殘基且仍適用(例如’具有功能活性) 之抗體纟f施例中,將儘可能多的生殖系殘基引入經 分離抗體中。 在實施例中,誘變用於將一或多個生殖系殘基取代至 或插入CDR區中。舉例而言,生殖系咖殘基可來自與經 修飾之可變區類似(例如,最類似)之生殖系序列。誘變之 後,可評估抗體之活性(例如,結合性或其他功能活性)以 判疋生殖系殘基是否具耐受性。可在構架區中進行類似誘 變。 可以不同方式進行生殖系序列選擇。舉例而言,若生殖 系序列滿足選擇性或相似性之預定準貝q ’例如相董子於供體 非人類抗體至少某一百分比一致,例如至少75%、8〇〇/〇、 85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、 98%、99%或99.5%—致,則可選擇該生殖系序列。可使用 至少2個、3個、5個或1〇個生殖系序列進行選擇。在cdri 及CDR2之狀況下,鑑別類似生殖系序列可包括選擇一種 該序列。在CDR3之狀況下,鑑別類似生殖系序列可包括 選擇一種該序列,但可包括使用獨立貢獻於胺基末端部分 及羧基末端部分之兩個生殖系序列。在其他實施中,使用 140330.doc -33· 201008579 一個以上或兩個以上生殖系序列,例如以形成一致序列。 在其他實施例中,抗體可經修飾以具有改變之糖基化模 式(亦即,自原始或原生糖基化模式改變)。如此情形中所 用之「改變」意謂使一或多個碳水化合物部分缺失及/或 將一或多個糖基化位點添加至原始抗體中。可藉由改變胺 基酸序列以含有糖基化位點一致序列來實現糖基化位點添 加至目前所揭示之抗體中;該等技術在此項技術中已為熟 知。增加抗體上碳水化合物部分之數目的另一方式係藉由 醣苷與抗體之胺基酸殘基化學或酶促偶合。此等方法描述 於(例如)WO 87/05330及 Aplin及 Wriston (1981) CWi.
Rev·出22:259-306中。移除抗體上所存在之任何碳 水化合物部分可如此項技術中所述(Hakimuddin等人, (1987) Jrc/i.扪扪ορ/ζγ. 259:52 ; Edge等人,(1981) 118:131 ;及 Thotakura等人,(1987) A/W/z. 138:350)以化學方式或酶促方式實現。關於藉由 提供救助受體結合抗原決定基來增加活體内半衰期之修 飾’參見’例如美國專利第5,869,046號。 在一實施例中’抗體具有與p4A8、P2D3、P3G5或P3D8 之CDR序列僅有非實質性差異之CDR序列。非實質性差異 包括微小胺基酸變化,諸如取代CDR(例如,ch〇thia或 Kabat CDR)之序列中通f任何5_7個胺基酸中之一或兩 者。胺基酸通常係、由具有類似電荷、疏水性或立體化學特 徵之相關絲酸取代°該等取代將在技術者之-般技術範 圍内。與CDR中之情況不同,在不會不利影響抗體之結合 140330.doc •34. 201008579 特性的情況下可在結構構架區(FR)中產生較多實質性變 化。FR之變化包括(但不限於)使源自非人類之構架人類化 或對對抗原接觸或結合位點穩定化重要之某些構架殘基工 程化’例如改變恆定區之種類或子類,改變可能改變效應 功能(諸如F c受體結合性)之特異性胺基酸殘基(L u n d等人, (1991) J. 则147:2657-62 ; Morgan 等人,(1995) 则⑽/〇幻;86:319-24),或改變恆定區所源自之物種。
❹ 抗Fnl4抗體可呈全長抗體之形式或呈抗體片段之形式, 該等片段為例如Fab、F(ab,)2、Fd、dAb及scFv片段。其他 形式包括蛋白質,該蛋白質包括單一可變域,例如駱駝域 或路駝化域。參見,例如U.S. 2005-0079574及Davies等 人 ’(1996) /Voiek 五《发.9(6):531-7。 本文提供包含抗Fnl4抗體與其一或多種酸性變體之混合 物的組合物,例如,其中酸性變體之量小於約8〇%、 70%、60。/。、50%、40%、30%、20%、1〇%、5%或 1%。亦 提供包含抗Fnl4抗體之組合物,該抗以“抗體包含至少一 個去醯胺位點,其中組合物2pH值為約5 〇至約6 5,使得 (例如)至少約90%之抗以14抗體未經去醯胺(亦即,小於約 10%之抗體經去醯胺)。在某些實施例中,小於約、 3%、2%或1%之抗體經去醯胺。pH值可為5 〇到6 〇,諸如 5.5或6.0。在某些實施例中,組合物之阳值為55、56、 5.7 、 5.8 、 5.9 、 6.0 、 6·1 、 6.2 、 6·3 、 6 4或6 5 。 「酸性變體」為所關注之多肽的變體,其比所關注之多 肽更具酸性(例如,如陽離子交換層析所測定)。酸性變體 140330.doc -35- 201008579 之一實例為去醯胺變體。 多肽分子之「去醯胺」變體為如下多肽’其中原始多肽 之一或多個天冬醯胺殘基已轉化為天冬胺酸鹽,亦即,中 性醯胺側鏈已轉化為具有全部酸性特徵之殘基。 如本文關於包含抗Fnl4抗體之組合物所用之術語「混合 物」思謂存在所要抗Fnl4抗體與其一或多種酸性變體。酸 性變體可主要包含去醯胺抗Fnl4抗體與微量其他酸性變 體。 在一實施例中’使去醯胺位點(NG)内或去醯胺位點附近 之胺基酸突變以減少或消除抗體去醯胺。舉例而言,人類 化 P4A8 重鏈 SEQ ID NO: 11 之 CDR2 在位置 55(N; Asn)及 5 6(G ’ Gly)處含有去酿胺位點(NG)。可將至少一個胺基酸 取代引入在對應於SEQ ID NO·· 11之位置54、55或56之位 置處含有SEQ ID ΝΟ:11(或本文所述之其變體)之CDR2的 抗體之CDR2内,以減少或消除抗體去酿胺,其中:位置 54 為 Gly、Ala、Ser、Val、Thr、Leu、lie、Met、Phe、 Tyr 或 Trp ;位置 55 為 Asn、Gin、Arg、Asp、Ser、Gly 或 Ala,位置 56 為 Gly、Ala、Ser、Val、Thr、Leu、lie、 Met、Phe、Tyr或Trp ;其限制條件為當位置55為Asn時, 位置5 6不為Gly。舉例而言,在去醯胺位點ng中,N或G可 取代另一胺基酸。在一實施例中,在胺基酸位置55(N55) 處之天冬醯胺經絲胺酸取代(亦即,CDR2之N55S突變 體)。類似物之其他實例包括:位置54為Gly,位置55為 Asn ’且位置56為Val ;位置54為Gly,位置5 5為Asn,且位 140330.doc -36· 201008579 置56為Ala ;位置54為Gly,位置55為Asp,且位置56為 Gly ;位置54為Gly ’位置55為Gin,且位置56為Gly ;位置 54為Gly,位置55為Ala ’且位置56為Gly ;位置54為Gly, 位置55為Gly,且位置56為Gly ;位置54係選自由Gly、
Ala、Ser、Val、Thr、Leu、lie、Met、Phe、Tyr及 Trp組成 之群,位置55為Ala,且位置56為Gly ;且位置54係選自由
Gly、Ala、Ser、Val、Thr、Leu、lie、Met、Phe、Tyr及
Trp組成之群,位置55為Gly,且位置56為〇^(參見,例如 ❹ W02003/073982)。 在某些實施例中’經突變以消除去醯胺之抗體的結合親 和力(kd)、締合速率(on_rate)(締合Kd)及/或解離速率 rate)(解離KD)與野生型抗體之彼者類似,例如具有小於約 5 倍、2倍、1倍(100%)、5〇%、3〇%、2〇%、1〇%、、 3°/〇、2%或1 %之差異。 在某些實施例中,抗Fnl4抗體抑制血管生成。或者,抗 φ Fnl4抗體可刺激血管生成或對血管生成無作用。可在活體 外或活體内檢定中,例如在針對HUVEC細胞之内皮細胞 增殖檢定中,或在角膜囊袋檢定及此項技術中已知之其他 檢定(例如,美國專利第6,824,773號中所述)中測定對血管 生成之作用。 抗體片段 〜傳統上,抗體片段係經由完整抗體之蛋白水解消化而 付。或者’此等片段可由重組宿主細胞直接產生。㈣、 Fv及ScFv抗體片段皆可在大腸桿菌⑷,中表現且自大 140330.doc -37- 201008579 腸桿菌分泌,因此允許易於產生大量此等片段。可自抗體 噬菌體庫分離抗體片段。或者,Fab,_SH片段可自大腸桿 菌直接回收且經化學偶合以形成F(ab)2片段(Carter等人, Bio/Technology 1〇:ΐ63·167 (1992))。根據另一方法, F(ab')2片段可自重組宿主細胞培養物直接分離。包含救助 受體結合抗原決定基殘基之具有增加之活體内半衰期的 Fab及F(ab')2片段描述於美國專利第5 869 〇46號中。在其 他實施例中,所選抗體為單鏈Fv片段(scFv)。卜及^卜含 有無恆定區之完整組合位點;因此,其適合於在活體内使 用期間降低之非特異性結合。可構築8(:1^融合蛋白以得到 效應蛋白在scFv之胺基末端或羧基末端之融合。舉例而 言,如美國專利第5,641,870號中所述,抗體片段亦可為 「線抗體」。該等線抗體片段可為單特異性或雙特異性 的。 雙特異性抗體 雙特異性抗體為對至少兩種不同抗原決定基具有結合特 異性之抗體。例示性雙特異性抗體可與Fnl 4蛋白之兩種不 同抗原決定基結合。其他該等抗體可將Fnl4結合位點與另 一蛋白質之結合位點組合。或者,可將抗Fnl4臂與結合白 血球上之觸發分子(諸如T細胞受體分子(例如CD3))或IgG 之 Fc 受體(Fc_y_r)(諸如 Fc个RI(CD64)、fc_y_rh(CD32)及 Fc-Y-RIII(CD16))之臂組合,以使細胞防禦機制集中於且 定位於Fnl 4表現細胞。雙特異性抗體亦可用於將細胞毒性 劑定位於表現Fnl4之細胞。此等抗體具有Fnl4結合臂及結 140330.doc -38· 201008579 合細胞毒性劑(例如,沙泊寧(saporin)、抗干擾素·α、長春 才匕屬生物驗(vinca alkaloid)、萬麻毒素Α鍵(ricin A chain)、甲胺喋呤(meth〇trexate)或放射性同位素半抗原)之 臂。可將雙特異性抗體製備為全長抗體或抗體片段(例 如,F(ab')2雙特異性抗體)。 全長雙特異性抗體之傳統製備係基於兩條免疫球蛋白重 鏈-輕鏈對之共同表現,其中該兩條鏈具有不同特異性 (Millstein等人,Nature 305:537-539 (1983))。在一不同方 法中,使具有所要結合特異性之抗體可變域與免疫球蛋白 十亙疋域序列融合。將編瑪免疫球蛋白重鍵融合體及(必要 時)免疫球蛋白輕鏈之DNA插入獨立表現載體中且共同轉 染至合適宿主細胞令。此在調整三個多肽片段之比例方面 提供較大靈活性。然而,當至少兩條多肽鏈以等比率之表 現產生高產率時,有可能將兩條或全部三條多肽鏈之編碼 序列插入單一表現載體中。 根據美國專利第5,731,168號中所述之另一方法,可對一 對抗體分子之間的界面工程化以使自重組細胞培養物回收 之異源二聚體的百分比最大化。較佳界面包含CM域之至 少-部分。在此方法中,-或多個來自第—抗體分子之界 面的小胺基酸側鏈經較大側鏈(例如,酪胺酸或色胺酸)置 換。藉由以較小胺基酸側鏈(例如,丙胺酸或蘇胺酸)置換 大胺基酸侧鏈,在第二抗體分子之界面上產生具有與大側 鏈相同或類似之尺寸的補償「空腔此提供使異源二聚 體之產率增加超過其他不合需要之最終產物(諸如同源二 140330.doc •39· 201008579 聚體)的機制。 雙特異性抗體包括交聯或「異源結合」抗體。舉例而 言,呈異源結合物形式之抗體中之一者可與抗生物素蛋白 偶合’另一者與生物素偶合。可使用任何便利的交聯方法 製得異源結合抗體。 「微型雙功能抗體(diabody)」技術提供製造雙特異性抗 體片段之替代性機制。該等片段包含由連接子與Vl連接之 VH ’該連接子過短以致不允許同一鏈上之兩個域之間配 對。因此,迫使一個片段之Vh&Vl域與另一片段之互補 Vl及VH域配對’藉此形成兩個抗原結合位點。 多價抗體 多價抗體可比二價抗體更快地由表現抗體所結合之抗原 的細胞内化(及/或異化)。本文所述之抗體可為具有三個或 二個以上抗原結合位點之多價抗體(例如,四價抗體),其 可易於精由重組表現編碼抗體之多肽鏈的核酸來產生。多 價抗體可包含二聚化域及三個或三個以上抗原結合位點。 例示性二聚化域包含Fc區或鉸鏈區(或由Fc區或鉸鏈區組 成)。多價抗體可包含二個至約八個(例如四個)抗原結合位 點(或由三個至約八個(例如四個)抗原結合位點組成)。多 價抗體視情況包含至少一條多肽鍵(例如,至少兩條多肽 鏈),其中該(該等)多肽鏈包含兩個或兩個以上可變域。舉 例而言’多肽鏈可包含VDl-(Xl)n-VD2_(X2)n-Fc,其中 VD1為第一可變域,VD2為第二可變域,以為以區之多肽 鏈’ XI及X2表示胺基酸或肽間隔子,且η為❹或!。 140330.doc •40· 201008579 抗體產生 一些抗體(例如Fab)可在例如大腸桿菌細胞之細菌細胞 中產生。抗體亦可在真核細胞中產生。在一實施例中,抗 體(例如scFv)在諸如畢赤酵母(/^/„·α)(參見,例如p〇wers 等人,(2001) J /所則Mei/ioc/s. 251:123-35)、漢森酵母 或酵母(Sacc/zarowycei)之酵母細胞中表現。 在一較佳實施例中,抗體係於哺乳動物細胞中產生。表 現抗體之例示性哺乳動物宿主細胞包括中國倉鼠卵巢細胞 (CHO細胞)(包括 Urlaub及 Chasin (1980) Proc. #加/. Jcat/. 5Ά 77:4216-4220中所述之办介-CHO細胞,其與(例 如)如 Kaufman及 Sharp (1982) Mo/·价〇/. 159:601-621 中所 述之DHFR可選擇標記一起使用)、淋巴細胞株(例如NS0骨 趟瘤細胞及SP2細胞)、COS細胞及來自轉殖基因動物(例如 轉殖基因哺乳動物)之細胞。舉例而言,細胞為乳腺上皮 細胞。 除編碼多樣化免疫球蛋白域之核酸序列以外,重組表現 載體亦可帶有其他序列,諸如調節載體在宿主細胞中之複 製的序列(例如複製起點)及可選擇標記基因。可選擇標記 基因有助於選擇載體已引入其中之宿主細胞(參見,例如 美國專利第4,399,216號’第4,634,665號及第5,179,017 號)。舉例而言,在載體已引入其中之宿主細胞上,可選 擇才示s己基因通常賦予對諸如G418、潮黴素(hygromycin)或 甲胺喋呤之藥物的抗性。 在抗體表現之例示性系統中,藉由雄酸妈介導之轉染將 140330.doc -41 · 201008579
現載體引入CHO
體重鏈及輕鏈且自培養基回收抗體。 回收抗體。標準分子生物學技術 編碼抗體重鏈與抗體輕鏈之重組表 細胞中。在重組表現載體内,抗體 自操作性地連接至強化子/啟動子; 用於製備重組表現載體’轉染宿主細胞,選擇轉化體,培 養宿主細胞,且自培養基回收抗體。舉例而言,可藉由親 和層析以蛋白質Α或蛋白質G偶合基質分離一些抗體。 對於包括Fc域之抗體而言,抗體產生系統較佳合成Fc區 經糖基化之抗體。舉例而言,IgG分子之Fe域在ch2域中 之天冬醯胺297處經糖基化。此天冬酿胺為以雙觸型寡膽 修飾之位點。已證實此糖基化為由Fey受體及補體C 1 q介導 之效應功月匕所需(Burton及 Woof (1992) Jdv. 5 1:1 · 84 ; Jefferis等人,(1998) /wwwno/· i?ev. 163:59-76)。在一 實施例中’在將對應於天冬醯胺297之殘基適當糖基化之 哺乳動物表現系統中產生Fc域。抗體之Fc域或其他區亦可 包括其他真核轉譯後修飾。 抗體亦可由轉殖基因動物產生。舉例而言,美國專利第 5,849,992號描述一種在轉殖基因哺乳動物之乳腺中表現抗 體之方法。構築包括乳特異性啟動子及編碼所關注抗體之 140330.doc -42- 201008579 核酸及供分泌用之信號序列的轉殖基因。由該等轉殖基因 哺乳動物之雌性動物產生之乳包括其中所分泌之所關注抗 體。抗體可自該乳純化,或直接用於一些應用。亦提供包 含本文所述核酸中之一或多者的動物。 表徵 抗體之結合特性可由任何標準方法量測,該標準方法為 例如以下方法中之一者:BIACORE™分析、酶聯免疫吸附 檢定(ELISA)、螢光共振能量轉移(FRET)、X射線結晶分 〇 析、序列分析及掃描誘變。抗體較佳具有統計學上顯著之 作用,其指示抗體促進Fnl4之一或多種活性(例如,促進 Fnl4信號轉導)。 表面電漿共振(SPR) 所關注之蛋白質與標靶(例如Fnl4)之結合相互作用可使 用SPR分析。在未標記相互作用物中之任一者的情況下, SPR或生物分子相互作用分析(BIA)即時偵測生物特異性相 互作用。在BIA晶片之結合表面處的質量變化(指示結合事 件)引起表面附近之光的折射率改變(表面電漿共振(SPR)之 光學現象)。折射率之變化產生可偵測信號,其經量測作 為生物分子之間即時反應之指示。使用SPR之方法描述於 (例如)美國專利第 5,641,640 號;Raether (1988) Swr/aee P/asmons Springer Verlag; Sjolander及 Urbaniczky (1991) Anal. Ckw. 63:2338-2345 ; Szabo 等人,(1995) Cwrr. Opin. Sirwci. 5/o/. 5:699-705 及由 BIAcore International AB(Uppsala,Sweden)提供之線上資源中。來自SPR之資訊 140330.doc -43- 201008579 可用於提供生物分子與標靶結合之平衡解離常數(Kd)及動 力學參數(包括反⑽及^之精確及定量量度。 亦可藉由使用BIAcore層析技術評估不同抗體彼此競爭 性地結合Fnl4(例如人類Fnl4)之能力來直接定位抗原決定 基(Pharmacia BIAtechnology Handbook, 「Epitope Mapping」,6.3_2部分,(1994年5月);亦參見johne等人, (1993) «/. J/nmwwo/· Mei/zoA,160:191-198)。例如在西方墨 點法及免疫沈殿檢定中評估抗體之其他通用導則可見於 Antibodies: A Laboratory Manual, Harlow及 Lane編,Cold Spring Harbor press (1988)中。 促效劑抗體 一旦已鑑別與Fn 14結合之抗體,即可對抗體進行檢定以 判定抗體是否為Fnl4之促效劑。可評估抗Fnl4抗體增加或 活化Fnl4信號轉導之下游效應(例如,增加或活化Fnl4由 天然配位體(例如TWEAK)接合之下游事件)或模擬由天然 配位體(例如TWEAK)與Fnl4結合引起之效應的能力。模擬 可與天然配位體之效應程度相同或比天然配位體之效應程 度更小或更大,只要引起相同類型之效應即可。 舉例而言,可評估抗體誘導或增強Fnl4表現細胞(例如 癌細胞,諸如WiDr結腸癌細胞)之細胞死亡的能力。在另 一實施例中,評估抗體誘導或增強F η 14表現細胞(例如 Α375細胞)中之IL-8分泌,誘導或增加NF-KB ρ52及/或細 胞週期抑制劑p21 Wafl/Cipl表現或蛋白質含量之能力。 具有與小鼠或人類化P4A8之活性類似之活性的抗體可 140330.doc • 44- 201008579 用於治療如本文所述之癌症,例如,其中相同量之抗體產 生小鼠或人類化P4A8所產生之作用的至少約50%、75%、 80%、90%、95%、97%、98%或99%之作用。舉例而言, 誘導P4A8所產生之IL-8量的至少約50%之量的IL-8產生之 .抗Fnl4抗體;誘導至少50%與P4A8—樣有效地殺死細胞之 抗體;及誘導NK-KB p52或p21表現至P4A8所產生之量的 . 至少約50%之量的抗體可分別用於治療癌症。 寄存物 © 產生單株抗體l.P4A8.3C7(P4A8)、單株抗體 l.P3G5.1E4(P3G5)及單株抗體 l.P2D3.3D5(P2D3)之融合瘤 已於2009年4月7日在國際承認用於專利程序的微生物寄存 之布達佩斯條約(Budapest Treaty on the International Recognition of the Deposit of Microorganisms for the Purpose of Patent Procedure)之條款下寄存於美國菌種保存 中心(American Type Culture Collection,ATCC),且具有 寄存編號 HYB-53541(P4A8)、HYB-53362(P3G5)及 HYB_ 53363(P2D3)。當因對此所頒布之專利之期限結束之前寄 存物之狀況要求時,若寄存處不能提供樣本,則申請者認 :可其有義務替換寄存物。申請者亦認可其有責任通知 ATCC該專利頒布,屆時寄存物將為公眾可用。在彼時之 前,寄存物將在37 C.F.R. § 1.14及35 U.S.C. § 112之條款 下為專利委員可用。 具有降低之效應功能的抗tt 抗體及抗體-抗原複合物與免疫系統細胞之相互作用觸 140330.doc -45 - 201008579 發多種反應,在本文中稱作效應功能。IgG抗體藉由與細 胞表面Fey受體家族之成員及與補體系統之結合來活化 免疫系統之效應路徑。由叢集之抗體連接效應蛋白觸發多 種反應,包括釋放發炎性細胞激素、調節抗原產生、細胞 攝粒作用及細胞死亡。在一些臨床應用中,此等反應對單 株抗體之功效至關重要。在其他臨床應用中,其引起不合 需要之副作用,諸如發炎及消除帶有抗原之細胞。因此, 本發明進一步係關於Fnl4結合蛋白,包括改變(例如降低) 效應功能的抗體。 可使用許多已知檢定中之一者來測定本發明之抗Fnl4抗 體之效應功能。抗Fn 14抗體之效應功能相對於第二抗Fn i 4 抗體可降低。在一些實施例中,第二抗Fnl 4抗體可為特異 性結合Fn 14之任何抗體。在一些實施例中,第二抗Fn丨4抗 體可為野生型抗體。在其他實施例中,第二Fnl4特異性抗 體可為本發明之抗體中之任一者,諸如P4A8。在其他實施 例中’若已經修飾所關注之抗Fnl4抗體以降低效應功能 時’該第二抗Fnl4抗體可為未經修飾或親本型式之抗體。 例示性效應功能包括Fc受體結合性、吞噬作用、細胞〉周 亡、促炎反應、下調細胞表面受體(例如B細胞受體; BCR),等等。其他效應功能包括抗體依賴性細胞介導之 細胞毒性(ADCC) ’藉以使抗體結合導致細胞死亡之細胞 毒性T細胞、自然殺手(natural killer,NK)細胞或巨嗔細胞 上之Fc受體;及補體依賴性細胞毒性(CDC),其係經由補 體級聯之活化而誘導細胞死亡(評論於Daeron, 乂 nnw. 140330.doc 46- 201008579
Immunol. 15:203-234 (1997) ; Ward及 Ghetie, TTierapewiic Immunol. 2:77-94 (1995);及 Ravetch及 Kinet, Annu. Rev. 9:457-492 (1991)中)。該等效應功能一般需要Fc 區與結合域(例如抗體可變域)組合,且可使用此項技術中 已知之標準檢定來評估(參見,例如WO 05/018572、WO 05/003175及 U.S. 6,242,195)。 可藉由使用缺乏Fc域之抗體片段(諸如Fab、Fab2或單鏈 Fv)來避免效應功能。一替代方案已使用IgG4亞型抗體, 〇 其與FcyRI結合但與Clq及FcyRII及RIII結合不良。IgG2亞 型亦與Fc受體之結合性降低,但保持與FcyRIIa之H131異 型及與Clq顯著結合。因此,需要Fc序列之其他變化以消 除與所有Fc受體及與Clq之結合。 包括ADCC之若干抗體效應功能係由結合抗體之Fc區的 Fc受體(FcR)介導。抗體對特定FcR之親和力及因此由該抗 體介導之效應活性可藉由改變抗體之Fc區及/或恒定區之 胺基酸序列及/或轉譯後修飾來調節。 胃 FcR係由其對免疫球蛋白同型之特異性來定義;IgG抗體 之Fc受體稱作FcYR,IgE抗體之Fc受體稱作FcsR,IgA抗體 之Fc受體稱作FcaR,等。已鑑別FcYR之三個子類: FcyRI(CD64)、FcyRII(CD32)及 FcyRIII(CD16)。FcyRII 與 FcyRIII 均具有兩種類型:FcyRIIA(CD32)與 FcyRIIB (CD32);及 FcyRIIIA(CD16a)與 FcyRIIIB(CD16b)。因為各 FcyR子類係由兩個或三個基因編碼,且替代性RNA拼接產 生多個轉錄物,所以存在FcYR同功異型物之廣泛多樣性。 140330.doc -47- 201008579 舉例而言,FcyRII(CD32)包括同功異型物Ila、Ilbl、 IIb2、IIb3 及 lie。 先前已將FcYR在人類及鼠類抗體上之結合位點寒位於由 殘基 233-239(如 Kabat 等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第 5 版 Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991) ) Woof 等人,Mo/ec. 厂 23:319-330 (1986) ; Duncan等人,
Nature 332:563 (1988) ; CanfieldA Morrison, J. Exp. Med. 173:1483-1491 (1991) ; Chappel等人,/Voc. ΛΓα". Jcac?. •SW 88:9036-9040 (1991)中之EU索引編號)組成之所謂 「較低鉸鏈區」。在殘基233-239中,P238及S239為提及可 能涉及結合之彼等者。可能涉及與FcyR結合之其他先前提 及之區域為:人類FcyRI之G316-K338(人類IgG)(僅藉由序 列比較;評估無取代突變體)(Woof等人,Mo/ec. /mmwwo/· 23:319-330 (1986));人類 FcyRIII 之 K274-R301(人類
IgG 1)(基於肽)(Sarmay 等人,Mo/ec_ Immunol. 21:43-51 (1984));及人類 FcyRIII 之 Y407-R416(人類 IgG)(基於 肽)(Gergely 等人,Biochem. Soc. Trans. \2.·Ί39-ΊA3 (1984);及 Shields 等人,·/ C/zew 276:6591-6604 (2001) ; Lazar GA^ A > Proc Natl Acad Sci 103:4005-4010 (2006))。根據對Ig-FcR複合物之晶體結構的檢查,涉及 FcR結合之胺基酸殘基之此等及其他段或區可為熟習此項 技術者顯而易見(參見,例如Sondermann等人,2〇00 Nature 406(6793):267-73 及 Sondermann 等人,2002 140330.doc -48- 201008579 <Soc TVaw-s1· 30(4):481-6)。因此,本發明之抗Fnl4 抗體包括對上述殘基中之一或多者的修飾° 降低mAb效應功能之其他已知方法包括使涉及效應結合 相互作用之在mAb表面上的胺基酸突變(Lund,J.等人, (1991) /· /wmwno/. 147(8):2657-62 ; Shields,R. L.等人, (2001) «/. 5b/. CTzem. 276(9):6591-604);及使用不同亞型 序列區段之組合(例如’ IgG2與IgG4組合)以得到與Fey受 體之結合性比單獨任一亞型降低更多(Armour等人, 〇 J. Immunol. (1999) 29:2613-1624 ; Mol. Immunol. 40 (2003) 585-593)。
對一些或所有Fc受體亞型具有改變及/或降低之親和力 (及因此具有改變及/或降低之效應功能)的眾多Fc變體在此 項技術中已知。參見,例如US 2007/0224188 ; US 2007/0148171 ; US 2007/0048300 ; US 2007/0041966 ; US
2007/0009523 ; US 2007/0036799 ; US 2006/0275283 ; US
2006/0235208 ; US 2006/0193856 ; US 2006/0160996 ; US
2006/0134105 ; US 2006/0024298 ; US 2005/0244403 ; US
2005/0233382 ; US 2005/0215768 ; US 2005/0118174 ; US 2005/0054832 ; US 2004/0228856 ; US 2004/132101 ; US 2003/158389 ;亦參見US 7,183,387 ; 6,737,056 ; 6,538,124 ; 6,528,624 ; 6,194,551 ; 5,624,821 ; 5,648,260。 在CDC中,抗體-抗原複合物結合補體,引起補體級聯 活化且產生攻膜複合物。典型補體路徑之活化係藉由補體 系統之第一組份(Clq)與結合同源抗原之抗體(適當子類之 140330.doc -49- 201008579 抗體)結合而引發;因此補體級聯之活化係部分由免疫球 蛋白與C1 q蛋白之結合親和力來調節。為活化補體級聯, 有必要使Clq與IgGl、IgG2或IgG3之至少兩個分子但僅與 連接抗原標乾之IgM之一個分子結合(Ward及Ghetie, 77^;-<3!/?它《"’<?/7«所《«〇/〇尽少 2:77-94 (1995)第80頁)。為評估補 體活化,可進行(例如)如Gazzano-Santoro等人,·/· 7"mww«o/. Mei/ioc/s 202:163 (1996)中戶斤述之 CDC 檢定。 已提出IgG分子之各種殘基涉及與Clq之結合,該等殘基 包括CH2域上之Glu318、Lys320及Lys322殘基,定位於緊 鄰同一 β股之轉角上的胺基酸殘基331,定位於較低鉸鏈區 中之Lys23 5及Gly237殘基,及定位於CH2域之Ν末端區中 之殘基231至238(參見,例如Xu等人,·/· 了所mwno/· 150:152A (摘要)(1993) ; W094/29351 ; Tao 等人,J.五jcp. Med., 1 78:661-667 (1993) ; Brekke 等人,五wr. J. Immunol. 24:2542-47 (1994) ; Burton 等人,Nature, 288:338-344 (1980) ; Duncan 及 Winter, iVaiwre 332:738-40 (1988);
Idusogie 等人,164:4178-4184 (2000) ; U.S. 5,648,260 ;及 U.S. 5,624,821)。作為 IgGl 之實例,人類 IgGl之CH2域之COOH末端區的兩個突變-K322A及P329A-並不活化CDC路徑且經顯示引起Clq結合性降低100倍以上 (US 6,242,195) ° 因此,在本發明之某些實施例中,可將此等殘基中之一 或多者加以修飾、取代或移除,或可插入一或多個胺基酸 殘基以降低本文所提供之Fnl4抗體之CDC活性。舉例而 140330.doc -50- 201008579 言,在一些實施例中,可能需要降低或消除主題抗體之效 應功能以降低或消除進一步活化免疫反應之潛力。具有降 低之效應功能的抗體亦可在接受該等抗體之個體中降低血 栓栓塞事件之風險。 在某些其他實施例中,本發明提供一種抗Fnl4抗體,其 -展現與一或多種FcR受體之結合性降低,但維持其結合補 體之能力(例如,至與原生、非變異或親本抗Fnl4抗體類 似之程度或在一些實施例中至小於原生、非變異或親本抗 ® Fnl4抗體之程度)。因此,本發明之抗Fnl4抗體可結合及 活化補體,同時展現與FcR(諸如FcyRIIa,例如在血小板 上表現之FcyRIIa)之結合性降低。與FcyRIIa(諸如在血小 板上表現之FcyRIIa)之結合性降低或無結合性但在至少一 定程度上可結合C 1 q且活化補體級聯的抗體將降低血栓栓 塞事件之風險,同時維持可能需要之效應功能。在替代性 實施例中,本發明之抗Fnl4抗體展現與一或多種FcR之結 合性降低,但維持其結合一或多種其他FcR之能力。參 見,例如 US 2007-0009523、2006-0194290、2005-' 0233382、2004-0228856 及 2004-0191244,其描述產生與 : FcRI、FcRII及/或FcRIII之結合性降低之抗體的各種胺基 酸修飾,以及引起與一種FcR之結合性增加但與另一 FcR 之結合性降低的胺基酸取代。 因此,涉及抗Fnl4抗體之恆定區的效應功能可藉由改變 恆定區及尤其Fc區之特性來調節。在某些實施例中,將具 有降低之效應功能的抗Fnl 4抗體與具有效應功能且可為非 140330.doc -51 - 201008579 變異原生或親本抗體(包含介導效應功能之原生恆定區 或Fc區)之第二抗體相比。在特定實施例中,效應功能調 卽包括/舌性被消除或完全不存在之情形。 原生序列Fc區或恆定區包含與自然界中所見之&區或恆 疋鏈區之胺基酸序列一致的胺基酸序列。用於評估相對效 應功能之對照分子較佳包含與測試抗體或變異抗體相同類 型/亞型之Fc區。藉助於至少一個胺基酸修飾(諸如轉譯後 修飾、胺基酸取代、插入或缺失),變異或改變之Fc區或 恆定區包含與原生序列重鏈區之胺基酸序列不同的胺基酸 序列。因此,變異恆定區可含有一或多個胺基酸取代、缺 失或插入,其引起轉譯後修飾改變’包括(例如)糖基化模 式改變。親本抗體或Fc區為(例如)具有正常效應功能之用 於構築具有改變(例如降低)之效應功能之恆定區(亦即, Fc)的變體。 可藉由對具有變異恆定區、Fc區或重鏈區之抗體工程化 或產生具有變異怪定區、Fc區或重鏈區之抗體來產生具有 改變(例如降低或消除)之效應功能的抗體。重組DNA技術 及/或細胞培養及表現條件可用於產生具有改變之功能及/ 或活性的抗體。舉例而言,重組DNA技術可用於在影響抗 體功能(包括效應功能)之區域(諸如Fc區或恆定區)中對一 或多個胺基酸取代、缺失或插入工程化。或者,可藉由操 縱產生抗體之宿主細胞及細胞培養及表現條件來達成轉譯 後修飾(諸如糖基化模式(參見下文))之變化。 諸如胺基酸取代之胺基酸改變可改變本發明之抗Fnl4抗 J40330.doc •52- 201008579 體之效應功能而不影響抗原結合親和力。舉例而言,上文 所述之胺基酸取代(例如,Glu3 18、Kys320、Lys332、 Lys23 5、Gly237、K332及P3 29)可用於產生具有降低之效 應功能的抗體。 在其他實施例中,可對以下胺基酸殘基中之一或多者進 •行胺基酸取代:重鏈恆定區之234、235、236、237、 297、318、320及 322(參見 US 5,624,821及仍 5,648,260) ° 該等取代可改變效應功能,同時保持抗原結合活性。如與 ® 未經修飾或非變異抗體相比,在胺基酸234、235、236及 237中之一或多者處之改變可降低Fc區對FcyRI受體之結合 親和力。胺基酸殘基234、236及/或237可經(例如)丙胺酸 取代,且胺基酸殘基235可經(例如)麩醯胺酸取代。在另一 實施例中,抗Fnl4 IgGl抗體可包含在位置234處以Ala取 代Leu,在位置235處以Glu取代Leu,及在位置237處以Ala 取代Gly。 或者或另外,可改變在318、320及322處之Fc胺基酸殘 _ 基。在小鼠及人類IgG中高度保守之此等胺基酸殘基介導 補體結合。已顯示此等胺基酸殘基之改變降低Clq結合 :性,但並不改變抗原結合性、蛋白質A結合性或Fc與小鼠 巨嗤細胞結合之能力。 在另一實施例中,本發明之抗Fnl 4抗體為包含降低或消 除效應功能之取代的IgG4免疫球蛋白。本發明之抗Fnl4抗 體之IgG4 Fc部分可包含以下取代中之一或多者:在殘基 233處以脯胺酸取代麩胺酸、在殘基234處以丙胺酸或纈胺 140330.doc -53- 201008579 酸取代苯丙胺酸及在殘基235處以丙胺酸或麩胺酸取代白 胺酸(EU編號,Kabat, Ε· A.等人,(1991),同上)。此外, 藉由在殘基297(EU編號)處以Ala取代Asn而移除IgG4 Fc區 中之N-連接糖基化位點可進一步降低效應功能且消除任何 可存在之殘餘效應活性。具有降低之效應功能的另一例示 性IgG4突變體為在重鏈恆定區中含有突變S228P及 L23 5E(PE突變)的IgG4亞型變體。此突變引起效應功能降 低。參見118 5,624,821及118 5,648,260。如本文所述,在 IgG4情形中降低效應功能之另一例示性突變為 S228P/T229A。 恆定區中之其他例示性胺基酸序列變化包括(但不限 於)Bluestone等人所述之Ala-Ala突變(參見WO 94/28027及 WO 98/47531 ;亦參見Xu等人,2000 CW/ Jmww⑽/ 200, 1 6-26)。因此,在某些實施例中,在恆定區内具有突變(包 括Ala-Ala突變)之抗Fnl4抗體可用於降低或消除效應功 能。根據此等實施例,抗Fnl4抗體之恆定區包含在位置 234處突變為丙胺酸或在位置235處突變為丙胺酸。另外, 恆定區可含有雙重突變:在位置234處突變為丙胺酸及在 位置235處二次突變為丙胺酸。 在一實施例中,抗Fnl4抗體包含IgG4構架,其中Ala-Ala突變 將描述 在位置 234 處 自苯丙 胺酸至 丙胺酸之突變 及/或在位置23 5處自白胺酸至丙胺酸之突變。在另一實施 例中,抗Fnl4抗體包含IgGl構架,其中Ala-Ala突變將描 述在位置234處自白胺酸至丙胺酸之突變及/或在位置23 5 140330.doc -54· 201008579 處自白胺酸至丙胺酸之突變。或者或另外,抗Fnl4抗體可 帶有其他突變,包括CH2域中之點突變K322A(Hezareh等 人,2001 Fz>o/. 75:12161-8)。 其他例示性胺基酸取代提供於WO 94/2935 1 (以其全文引 .用的方式併入本文中)中,其陳述在CH2域之N末端區中具 * 有突變之抗體,該等突變改變抗體與FcRI結合之能力,藉 . 此降低抗體與Clq結合之能力,繼而降低抗體固定補體之 能力。亦參見 Cole 等人(/. (1997) 159:3613- Ο 3621),其描述在IgG2中上部CH2區中之突變,該等突變使 得FcR結合性較低。 產生包含胺基酸取代之上述抗體變體中之任一者的方法 在此項技術中已為熟知。此等方法包括(但不限於)藉由編 碼抗體或至少抗體之恆定區的所製備DNA分子之定點(或 募核苷酸介導)誘變、PCR誘變及卡匣誘變來製備。 定點誘變在此項技術中已為熟知(參見,例如Carter等 k,Nucleic Acids Res. 1 3 :443 1-4443 (1985)及 Kunkel 等 人,Proc. TVai/· dead. tASJ 82:488 (1987))。 PCR誘變亦適合於製造起始多肽之胺基酸序列變體。參 見 Higuchi,PCR Protocols,第 177-183 頁(Academic Press, 1990);及 Vallette 等人,iVwc. Jcz·心及以.17:723-733 (1989)。製備序列變體之另一方法卡匣誘變係基於Wells等 人,Gene 34:315-323 (1985)所述之技術。 本發明之另一實施例係關於一種具有降低之效應功能的 抗Fnl4抗體,其中抗體之Fc區或其部分與具有天然降低之 140330.doc -55- 201008579 效應誘導活性之Fc區(或與其部分)交換。舉例而言,人類 IgG4恆定區展現補體活化降低或無補體活化。此外,不同 IgG分子在其對FcR之結合親和力方面不同,其可至少部分 歸因於IgG之鉸鏈區之長度及可撓性不同(結合親和力以
IgG3 > IgGl > IgG4 > IgG2之順序降低)。舉例而言,igG4 展現與FcyRIIa之結合性降低或無結合性。關於嵌合分子 及嵌·合怪疋區之實例’參見’例如Gillies等人(Cancer 1999,59:2159-2166)及 Mueller 等人(Mo/. 1997, 34:441-452) ° 本發明亦係關於具有降低之效應功能的抗Fn 14抗體,其 中Fc區完全不存在。該等抗體亦可稱作本發明之抗體衍生 物及抗原結合片段。該等衍生物及片段可與非抗體蛋白質 序列或非蛋白質結構融合,尤其與經設計以在投與動物 (例如人類個體)時有利於傳遞及/或生物可用性的結構融合 (參見下文)。 如上文所討論,鉸鏈區内之變化亦影響效應功能。舉例 而言,鉸鍵區之缺失可降低對Fc受體之親和力且可降低補 體活化(Klein等人,1981 PAUS t/M 78:524-528)。因此, 本揭示案亦係關於在鉸鏈區中具有改變之抗體。 在特定實施例中,本發明之抗體可經修飾以抑制補體依 賴性細胞毒性(CDC)。可藉由將一或多個胺基酸取代、插 入或缺失引入抗體之Fc區中來達成經調節之CDC活性(參 見,例如1186,194,551及1;8 6,242,195)。或者或另外,可 將半胱胺酸殘基引入Fc區中,藉此允許在此區域中形成鏈 140330.doc •56- 201008579 間雙硫鍵。由此產生之同源二聚抗體可具有改良或降低之 内化能力及/或增加或減小之補體介導性細胞死亡。參見
Caron等人,乂 Med· 176:1191-1195 (1992);及 Shopes,
B. J. Immunol. 148:2918-2922 (1992) ; WO 99/51642 ; Duncan 及 Winter Nature 322:738-40 (1988) ; US - 5,648,260 ; US 5,624,821 ;及 WO 94/29351。 應進一步瞭解’效應功能可根據抗體之結合親和力而 變。舉例而言,與具有相對較低親和力之抗體相比,具有 ® 高親和力之抗體可更有效地活化補體系統(Marzocchi-
Machado等人,1999 /wmwwo/ /«νβίί 28:89-101)。因此,可 改變抗體使得對其抗原之結合親和力降低(例如,藉由以 諸如一或多個胺基酸殘基之取代、添加或缺失的方法改變 抗體之可變區)。具有降低之結合親和力的抗體可展現效 應功能降低,包括(例如)ADCC及/或CDC降低。 具有降低之效應功能的本發明抗Fnl4抗體包括相對於親
© 本或非變異抗Fnl4抗趙對一或多種Fc受體(FcR)之結合親 和力降低的抗體。因此’具有降低之FcR結合親和力的抗 Fn 14抗體包括與親本或非變異抗Fn丨4抗體相比展現對一或 多種Fc受體之結合親和力降低丨.5倍、2倍、2.5倍、3倍、4 倍或5倍或5倍以上之抗Fnl4抗體。在一些實施例中,具有 降低之效應功能的抗Fnl4抗體相對於親本或非變異抗體以 約小10倍之親和力與FcR結合。在其他實施例中,具有降 低之效應功能的抗Fnl 4抗體相對於親本或非變異抗體以約 小15倍之親和力或以約小2〇倍之親和力與FcR結合。FcR 140330.doc •57- 201008579 受體可為 FcyRI(CD64)、FcyRII(CD32)及 FcyRIII及其同功 異型物及FcsR、FcpR、Fc5R及/或FcaR中之一或多者。在 特定實施例中,具有降低之效應功能的抗Fnl4抗體展現對 FcYRIIa之結合親和力降低1.5倍、2倍、2.5倍、3倍、4倍 或5倍或5倍以上。 因此,在某些實施例中,相對於第二抗Fnl4抗體,本發 明之抗Fnl4抗體展現與補體蛋白之結合性降低。在某些實 施例中,相對於第二抗Fnl 4抗體,本發明之抗Fnl 4抗體展 現結合性降低約1.5倍或1.5倍以上、約2倍或2倍以上、約3 倍或3倍以上、約4倍或4倍以上、約5倍或5倍以上、約6倍 或6倍以上、約7倍或7倍以上、約8倍或8倍以上、約9倍或 9倍以上、約10倍或10倍以上或約15倍或15倍以上。 本發明之某些實施例係關於一種包含一或多個選自S E Q ID NO: 2之 CDR-H1、SEQ ID NO: 2之 CDR-H2及 SEQ ID NO: 2之CDR-H3的重鏈CDR序列之抗Fnl4抗體,其中該抗 體進一步包含較之原生或親本Fc區賦予降低之效應功能的 變異Fc區。在其他實施例中,抗Fnl4抗體包含CDR中之至 少兩者,且在其他實施例中,抗體包含重鏈CDR序列中之 全部三者。 本發明之其他實施例係關於一種包含一或多個選自SEQ ID NO: 5 之 CDR-L1、SEQ ID NO: 5 之 CDR-L2及 SEQ ID NO: 5之CDR-L3的輕鏈CDR序列之抗Fnl4抗體,該抗體進 一步包含較之原生或親本Fc區賦予降低之效應功能的變異 Fc區。在其他實施例中,抗Fnl4抗體包含輕鏈CDR中之至 140330.doc •58- 201008579 少兩者’且在其他實施例中,抗體包含輕鏈CDR序列中之 全部三者。 在本發明之其他實施例中,具有降低之效應功能的抗 Fnl4抗體包含SEQ ID NO·· 5之全部三個輕鏈CDR序列且包 含SEQ ID NO: 2之全部三個重鏈CDR序列。 在其他實施例中,本發明係關於一種包含SEQ ID NO: 9 之胺基酸1-111之VL序列的抗Fnl4抗體,該抗體進一步包 含較之原生或親本Fc區賦予降低之效應功能的變異FC區。 在其他實施例中,本發明係關於一種包含SEQ ID NO: 8 之胺基酸1-121之VH序列的抗Fnl4抗體,該抗體進一步包 含較之原生或親本Fc區賦予降低之效應功能的變異fc區。 具有改變之糙基化的抗Fnl4抗髏 聚糖移除產生應極大地降低與跨物種Fc受體家族之所有 成員之結合性的結構變化。在糖基化抗體(包括抗Fnl4抗 體)中’與Fc二聚體之CH2域中之保守N-連接位點連接之聚 糖(寡醣)封閉於CH2域之間,使得糖殘基與相對CH2域上 之特異性胺基酸殘基接觸。不同糖基化模式與抗體之不同 生物特性相關(Jefferis 及 Lund, 1997, C/mw. 65:111-128 ; Wrights Morrison, 1997, Trends Biotechnol., 15: 26-32)。某些特異性糖型(glyC0form)賦予潛在有利之 生物特性。聚糖之損失改變域之間的間隔且增加其相對於 彼此之遷移率且預期對F c受體家族之所有成員的結合性皆 具有抑制作用。舉例而言,以各種糖基化抗體進行之活體 外研究已證實移除CH2聚糖改變Fc結構,使得抗體與以受 140330.doc -59· 201008579 體及補體蛋白C1Q之結合性極大地降低。降低效應功能之 另一已知方法為抑制在Fc之CH2域中位置297(EU編號)處 之N-連接聚糖產生或移除在Fc之CH2域中位置297(EU編 號)處之N-連接聚糖(Nose等人,1983尸见45 80:6632 ; Leatherbarrow 等人,1985 Mol. Immunol. 22:407 ; Tao 等 人 > 1989 J. Immunol. 143:2595 ; Lund 等人,1990 Mol. Immunol. 27:1145 ; Dorai 等人,1991 Hybridoma 10:211 ; Hand ^ A , 1992 Cancer Immunol. Immunother. 35:165 ; Leader等人,1991 72:481 ; Pound等人,1993
Mol. Immunol. 30:233 ; Boyd 等人,1995 Mol. Immunol. 32:1311)。亦已知不同糖型可顯著影響治療劑之特性,包 括藥物動力學、藥效學、受體相互作用及組織特異性靶向 (Graddis等人,2002, Cwrr P/iorw 5/oiec/zTio/· 3:285-297) 〇 詳言之,對於抗體而言,除抗體之效應功能(例如,與誘 導CDC之補體複合物C1之結合性及與負責調節ADCC路徑 之FcYR受體之結合性)以外,寡醣結構可影響與蛋白酶抗 性、由FcRn受體介導之抗體的血清半衰期、吞噬作用及抗 體反饋有關之特性(Nose及 Wigzell,1983 ; Leatherbarrow及 Dwek,1983 ; Leatherbarrow等人,1985 ; Walker 等人, 1989,· Carter等人,1992,尸iVM,89:4285-4289) ° 因此,調節抗體之效應功能的另一方式包括改變抗體恆 定區之糖基化。改變之糖基化包括(例如)糖基化殘基數目 減少或增多、糖基化殘基之模式或位置變化以及糖結構變 化。人類IgG上所見之寡醣影響人類IgG之效應功能的程度 140330.doc -60- 201008579 (Raju, T.S. BioProcess International 2003^-4,¾ 44-53);人 類IgG寡醣之微異質性可影響生物功能,諸如CDC及 ADCC、與各種Fc受體之結合性及與Clq蛋白之結合性 (Wright A及 Morrison SL. TIBTECH 1997, 15 26-32 ; Shields^ A » J Biol Chem. 2001 276(9):6591-604 ; Shields ^ K ^ J Biol Chem. 2002,277(30):26733-40 ; Shinkawa等 A » J Biol Chem. 2003 278(5):3466-73 ; Umana# A > Nat ' 化 c/zwo/· 1999年 2月,17(2):176-80)。舉例而言,IgG 結 β 合Clq且活化補體級聯之能力可取決於定位於兩個CH2域 之間的碳水化合物部分(其通常錨定於Asn297處)之存在、 不存在或修飾(Ward 及 Ghetie, 2:77-94 (1995))。 可由標準技術鑑別含Fc多肽(例如抗體,諸如IgG抗體) 中之糖基化位點。糖基化位點之鑑別可根據實驗或基於序 列分析或模擬數據。已描述一致基元,亦即,由各種糖基 轉移酶識別之胺基酸序列。舉例而言,N-連接糖基化基元 ^ 之一致基元常為NXT或NXS,其中X可為除脯胺酸以外之 任何胺基酸。亦已描述用於定位潛在糖基化基元之若干演 算法。因此,為鑑別抗體或含Fc片段内之潛在糖基化位 點,例如,藉由使用公開可用之資料庫,諸如由生物序列 分析中心(Center for Biological Sequence Analysis)提供之 網站(參見用於預測N-連接糖基化位點之NetNGlyc服務及 用於預測Ο-連接糖基化位點之NetOGlyc服務)來檢查抗體 之序列。 140330.doc -61- 201008579 活體内研究已證實去糖基抗體之效應功能降低。舉例而 言,去糖基抗CD8抗體不能耗盡小鼠中帶有CD8之細胞 (Isaacs, 1992 «/· 148:3062)且去糖基抗 CD3 抗體在 小鼠或人類中並不誘發細胞激素釋放症候群(Boyd, 1995同 上;Friend, 1999 68:1632) ° 重要地,儘管CH2域中之聚糖移除似乎對效應功能具有 顯著影響,但抗體之其他功能及物理特性保持不變。特定 言之,已顯示聚糖移除對血清半衰期及與抗原之結合性具 有極小影響至無影響(Nose,1983同上;Tao, 1989同上; Dorai, 1991 同上;Hand,1992 同上;Hobbs, 1992 Mo/. 29:949) ° 儘管去糖基方法存在活體内驗證,但存在關於去糖基 mAb之殘餘效應功能的報導(參見,例如Pound,J. D.等 A 5 (1993) Mol. Immunol. 30(3):233-41 ; Dorai, Η.等人, (1991) 10(2):211-7)。Armour 等人顯示與
FcyRIIa 及 FcyRIIb 蛋白之殘餘結合性(£1^.>/./;«防《/7〇/· (1999) 29:2613-1624 ; Mo/· 40 (2003) 585-593) ° 因此,效應功能(尤其補體活化)之進一步降低對在一些情 況下保證活性完全除去可為重要的。出於彼原因,IgG2與 IgG4及G1/G4雜交體之去糖基形式預期適用於本發明之方 法及具有降低之效應功能的本發明之抗體組合物。 可修飾或改變本發明之抗Fnl4抗體以引發效應功能降低 (與第二Fnl4特異性抗體相比)同時視情況保持Fc部分之其 他有價值屬性。 140330.doc -62- 201008579 因此,在某些實施例中,本發明係關於具有降低之效應 功能的去糖基抗Fnl4抗體,其特徵在於在抗體之Fc部分之 CH2域中保守N-連接位點處的修飾。Fc二聚體之CH2域中 保守N-連接位點之修飾可產生去糖基抗Fn 14抗體。該等修 .飾之實例包括使Fc二聚體之CH2域中保守N-連接位點突 - 變、移除與CH2域肀之N-連接位點連接之聚糖,及防止糖 基化。舉例而言,去糖基抗Fnl4抗體可藉由將重鏈CH2域 中之標準N-連接Asn位點變為Gin殘基而產生(參見,例如 Φ WO 05/03175及 US 2006-0193856)。 在本發明之一實施例中,修飾包含在重鏈糖基化位點處 之突變以防止在該位點處糖基化。因此,在本發明之一實 施例中,去糖基抗Fnl4抗體係藉由使重鏈糖基化位點突 變,亦即,N298Q(使用Kabat EU編號為N297)突變來製備 且在適當宿主細胞中表現。舉例而言,此突變可藉由遵循 關於來自 Amersham-Pharmacia Biotech®(Piscataway,NJ, US A)之獨特位點誘變套組的製造商推薦方案來實現。 W 突變抗體可在宿主細胞(例如NSO或CHO細胞)中穩定表 ' 現且接著經純化。作為一實例,可使用蛋白質A層析及凝 : 膠過滤層析來進行純化。熟習此項技術者將顯而易見,亦 可使用表現及純化之其他方法。 在本發明之另一實施例中,去糖基抗Fnl4抗體具有降低 之效應功能,其中在該抗體或抗體衍生物之Fc部分之CH2 域中保守N-連接位點處的修飾包含移除CH2域聚糖,亦 即,去糖基化。此等去糖基抗Fnl4抗體可由習知方法產生 140330.doc -63 - 201008579 且接著以酶促方式去糖基化。將抗體以酶促方式去糖基化 之方法為熟習此項技術者所熟知(Williams,1973 ; Wmkelhake及Nic〇lson,1976 j 扪〇/ 25i:i〇74 8〇)。 在本發明之另-實施例中,可藉由使產生抗體之宿主細 胞在包含諸如衣黴素(tunicamycin)之糖基化抑制劑的培養 基中生長來達成去糖基化(N〇se&wigzell,1983)。亦即, 修飾為減少或防止在該抗體之以部分之CH2域中保守N_連 接位點處之糖基化。 在本發明之其他實施例中,重組X多肽(或含有該等多肽參 之細胞或細胞膜)可用作抗原以產生可接著去糖基化之抗 Fnl4抗體或抗體衍生物。 在替代性實施例中’本發明之去糖基抗Fnl4抗體或具有 減少之糖基化的抗Fnl4抗體可由Tayl〇r等人(W〇 〇5/18572 及US 2007-0048300)中所述之方法產生。舉例而言,在一 實施例中,抗Fnl4去糖基抗體可藉由改變第一胺基酸殘基 (例如,藉由取代、插入、缺失,或藉由化學修飾)而產 生’其中改變之第一胺基酸殘基藉由位阻或電荷或兩者來 ® 抑制第二殘基之糖基化。在某些實施例中,藉由胺基酸取 代來修飾第一胺基酸殘基。在其他實施例中,胺基酸取代 基係選自由 Gly、Ala、Val、Leu、lie、Phe、Asn、Gin、
Trp、Pro、Ser、Thr、Tyr、Cys、Met、Asp、Glu、Lys、
Arg及His組成之群。在其他實施例中,胺基酸取代基為非 傳統胺基酸殘基《第二胺基酸殘基可在糖基化基元附近或 内部’例如,含有胺基酸序列NXT或NXS之N-連接糖基化 140330.doc -64· 201008579 基元附近或内部。在一例示性實施例中,根據Kab at編 號,第一胺基酸殘基為胺基酸299且第二胺基酸殘基為胺 基酸297。舉例而言,根據Kabat編號,第一胺基酸取代基 可為 T299A、T299N、T299G、T299Y、T299C、T299H、 T299E、T299D、T299K、T299R、T299G、T299I、 T299L、T299M、T299F、T299P、T299W 及 T299V。在特 定實施例中,胺基酸取代基為T299C。 亦可藉由修飾本發明之抗體使得該抗體含有阻斷部分來 Ο 降低效應功能。例示性阻斷部分包括具有足夠空間體積 (steric bulk)及/或電荷使得發生糖基化減少之部分,例 如,藉由阻斷醣苷酶將多肽糖基化之能力。或者或另外, 阻斷部分可降低效應功能,例如,藉由抑制Fc區結合受體 或補體蛋白之能力。在一些實施例中,本發明係關於一種 包含變異Fc區之Fnl4結合蛋白(例如抗Fnl4抗體),該變異 Fc區包含第一胺基酸殘基及N-糖基化位點,該第一胺基酸 殘基以側鏈化學物修飾以較之未經修飾之第一胺基酸殘基 ^ 達成空間體積增加或靜電荷增加,藉此降低N-糖基化位點 ^ 處之糖基化程度或以其他方式改變N-糖基化位點處之糖基 :化。在某些此等實施例中,變異Fc區較之對照(非變異Fc 區)賦予降低之效應功能。在其他實施例中,具有增加之 空間體積的側鏈為選自由Phe、Trp、His、Glu、Gin、 Arg、Lys、Met及Tyr組成之群之胺基酸殘基的侧鏈。在其 他實施例中,具有增加之靜電荷的側鏈化學物為選自由 Asp、Glu、Lys、Arg及His組成之群之胺基酸殘基的側 140330.doc -65- 201008579 鍵。 因此’在-實施例中,糖基化及Fe結合性可藉由以帶電 側鏈化學物(諸如D、E、K或R)取代T299來調節。歸因於 不利之靜電相互作用,所得抗體將具有減少之糖基化以及 對Fc受體降低之Fc結合親和力。 在另一實施例中,經去糖基化且能夠形成半胱胺酸加合 物之T299C變異抗體較之其去糖基化抗體制物可展現較 小效應功能(例如FqRI結合性)(參見,例如w〇 05Π8572)。因此,鄰近糖基化基元之第一胺基酸改變可抑 制抗體在第二胺基酸殘基處之糖基化;當第一胺基酸為半 胱胺酸殘斜,㈣可展現甚至進一轉低之效應功能。 另外,較之其他亞型中去糖基化之影響,抑制IgG4亞型之 抗體糖基化可對FcyRI結合性具有更顯著影響。 在其他實施例中,本發明係關於展現與一或多種FcR受 體之結合性降低且視情況亦展現與一或多種Fc受體及/或 補體之結合性增加或正常的具有改變之糖基化的抗以抖抗 體,例如,至少維持與原生、對照抗以^抗體相同或類似 之對一或多種FC受體及/或補體之結合親和力的具有改變 之糖基化的抗體。舉例而言,主要以Man5GlcNAc2N_聚糖 作為所存在之聚糖結構的抗Fnl4抗體(例如,其中 MansGlcNAc^N-聚糖結構係以比1§組合物之下一主要聚糖 結構多至少約5莫耳%之含量存在)較之Man5GlcNAc2N-聚 糖結構並非主要之抗Fn 14抗體群體可展現改變之效應功 能°主要具有此聚糖結構之抗體展現與FcyRIIa& FcyRIIb 140330.doc -66- 201008579 之結合性降低、與FcyRIIIa及FcyRIIIb之結合性增加,及 與C1複合物之Clq次單元之結合性增加(參見US 2006-0257399)。此聚糖結構當其為主要聚糖結構時賦予ADCC 增加、CDC增加、血清半衰期增加、B細胞之抗體產生增 加及經巨噬細胞之吞噬作用減少。 •一般而言,醣蛋白上之糖基化結構將視表現宿主及培養 條件而變(Raju,TS. BioProcess 2003 年 4 月 44-53)。該等差異可引起效應功能與藥物動力學變化 ❹ (Israel 等人,Immunology. 1996, 89(4):573-578 ; Newkirk 等人,P. Clin. Exp. 1996,106(2):259-64)。舉例而言,半 乳糖基化(galactosylation)可隨細胞培養條件而變,其可視 免疫球蛋白組合物之特異性半乳糖模式而致使一些免疫球 蛋白組合物具免疫原性(Patel等人’ 1992. «/· 285:839-845)。非人類哺乳動物細胞所產生之醣蛋白的寡 醣結構傾向於與人類醣蛋白之寡醣結構較緊密相關。此 外,蛋白質表現宿主系統可經工程化或選擇以表現主要Ig 糖型或替代地可天然產生具有主要聚糖結構之醣蛋白。產 生具有主要糖型之醣蛋白的工程化蛋白質表現宿主系統之 :實例包括基因剔除/突變(Shields等人,2002,J5C, 277:26733-26740)、遺傳工程化(Umana等人,1999, iWUwre 17:176-1 80)或兩者之組合。或者,某些細胞天然 表現主要糖型-例如雞、人類及乳牛(Raju等人,2000, 10:477-486)。因此,熟習此項技術者藉由選 擇許多表現宿主系統中之至少一者可獲得具有改變之糖基 140330.doc •67· 201008579 化(例如主要一種特異性聚糖結構)之抗Fnl4抗體或抗體組 合物的表現。可用於產生本發明之抗Fnl4抗體的蛋白質表 現宿主系統包括動物細胞、植物細胞、昆蟲細胞、細菌細 胞及其類似物。舉例而言,US 2007-0065909、2007-0020725及2005-0170464描述在細菌細胞中產生去糖基化 免疫球蛋白分子。作為另一實例,Wright及Morrison在糖 基化不足之CHO細胞株中產生抗體(1994 J及φ Med 180:1087-1096)且顯示在此細胞株中所產生之抗體不能進 行補體介導之細胞溶解。醣蛋白產生之技術中所見之表現 宿主系統之其他實例包括:CHO細胞:Raju WO 99/22764 及 Presta WO 03/35835 ;融合瘤細胞:Trebak等人,1999, «/· Mei/zoA,230:59-70 ;昆蟲細胞:Hsu等人, 1997,272:9062-970 ;及植物細胞:Gerngross等人, WO 04/74499。在給定細胞或提取物已引起給定基元糖基 化之程度上,技術上公認之用於判定基元是否已經糖基化 之技術為可用的,例如使用凝膠電泳及/或質譜分析。 改變抗體之糖基化位點的其他方法描述於(例如)US 6,350,861 A US 5,7 14,350、WO 05/1 8572 及 WO 05/03 175 中;此等方法可用於產生具有改變、降低之糖基化或無糖 基化之本發明之抗Fnl4抗體。 具有降低之效應功能的去糖基抗Fn 14抗體或本文所述之 其他抗體可為包含修飾或可經結合以包含功能部分之抗 體。該等部分包括阻斷部分(例如,PEG部分、半胱胺酸加 合物等)、可偵測部分(例如,螢光部分、放射性同位素部 140330.doc -68- 201008579 分、放射不透部分等,包括診斷部分)及/或治療部分(例 如,細胞毒性劑、消炎劑、免疫調節劑、抗感染劑、抗癌 劑、抗神經退化劑、放射性核種等)。
Fnl4相關病症 抗Fnl4抗體(諸如本文所述之抗體)可用於治療多種病 症,諸如Fn 14相關病症。舉例而言,抗體可用於治療患者 之癌症,例如實體腫瘤癌症。可用抗?1114抗體治療之癌症 的實例包括結腸癌及乳癌。可治療之癌症的其他實例包 括:肛門癌、膽管癌、膀胱癌、骨癌、繼發性骨癌、腸癌 (結腸直腸癌)、腦癌、繼發性腦癌、乳癌、繼發性乳癌、 子宮頸癌、兒科癌症、内分泌癌、眼癌、膽囊癌、胃腸癌 (例如胃癌)、食道癌、頭頸癌、卡波西氏肉瘤(Kap〇si,s sarcoma)、腎癌、喉癌、白血病、急性淋巴母細胞白血 病、急性骨髓白血病、慢性淋巴球性白血病、慢性骨髓白 血病、肝癌、繼發性肝癌、肺癌(例如NSCLC)、繼發性肺 癌、繼發性淋巴結癌、淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤(H〇dgkin
Lymphoma)、非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin Lymphoma)、 黑色素瘤、間皮瘤、骨髓瘤、神經内分泌癌、卵巢癌、食 道癌、胰腺癌、陰莖癌、前列腺癌、直腸癌、皮膚癌、軟 組織肉瘤、脊髓癌、胃癌、睪丸癌、胸腺癌、甲狀腺癌、 未知原發性癌症、陰道癌、陰門癌及子宮癌(子宮内膜 癌)。 可治療之腫瘤包括具有Fnl4表現之腫瘤,例如相對於在 正常成年細胞上之Fnl4表現量具有高Fnl4表現之腫瘤。 140330.doc •69- 201008579 術語「治療」係指以有效改良病狀、症狀或與病症相關 之參數或預防病症(包括由該病症引起之繼發性損”之發 展或惡化達崎學上㈣之程度或達熟習此項技術者可偵 測之程度的量、方式及/或模式投與本文所述之組合物。、 可向處於此等病症中之—者的風險中、經診斷患有此等 病症中之-者或已患有此等病症中之__者的個體以提供全 p⑺療作用之量技與抗Fn〖4抗體且歷時提供全部治療作用 之時間。抗Fnl4抗體可單獨或與其他藥劑組合投與。在組 合療法之狀況下,投與之量及時間可為提供(例如)協同治 療作用之量及時間。此外,投與抗㈣抗體(與或不與第 一藥劑起)可用作初級治療,例如一線治療;或用作二 級治療,例如,用於對先前投與之療法具有不足反應之個 體(亦即,除用抗Fn 14抗體之療法以外的療法)。在一些實 施例中,抗Fnl4抗體可與另一化學治療劑組合使用。在一 些實施例中,組合療法包括使用兩種或兩種以上抗Fni4抗 體,例如本文所述之抗Fnl 4抗體中之至少一者與另一抗
Fnl4抗體之組合,例如本文所述之抗以“抗體中之兩者或 兩者以上。 在某些實施例中,接受抗Fn丨4抗體之個體在腫瘤細胞上 具有Fnl4表現’例如相對於正常成年細胞上之以^表現量 具有南Fnl4表現。在某些實施例中,接受抗〜^抗體之個 體並非為在其腫瘤細胞之表面上不具有可偵測之Fnl4量的 個體。可藉由免疫組織化學或FACS使用(例如)本文所述之 抗艘來量測腫瘤細胞上之Fn丨4量。 140330.doc -70· 201008579 在某些實施例中,以本文所述之Fnl4抗體(例如Fnl4促 效劑抗體)治療之個體並非為患有因Fnl 4促效劑抗體或可 能因Fnl4促效劑抗體而惡化之疾病的個體。舉例而言,在 某些實施例中,以Fnl4抗體(例如促效劑抗體)治療之個體 並非為患有以下疾病之個體:自體免疫疾病、類風濕性關 : 節炎、多發性硬化症、中風、纖維化、神經退化性疾病、 阿兹海默氏病(Alzheimer's disease)、ALS、全身性紅斑性 狼瘡症,或美國專利第7,169,387號、评0 03/086311、评0 © 2006/088890或WO 2006/089095中所闡述之疾病。在某些 實施例中,接受抗Fn 14抗體之個體並非為患有或可能出現 發炎性或自體免疫疾病之個體,該發炎性或自體免疫疾病 為例如類風濕性關節炎、腸病、狼瘡、克隆氏病(Crohn's disease)、多發性硬化症、糖尿病、牛皮癬、急性移植物 抗宿主疾病(GVHD)、胰腺炎、遲發型過敏(DTH)。 在某些實施例中’接受抗Fnl4抗體之個體已接受或正接 受或將接受消炎治療。舉例而言,可在以抗Fn 14 Ab治療 ❹ 同時、之前及/或之後用消炎劑治療個體。例示性消炎劑 包括曱胺嗓吟、TNF-α阻斷劑、Tweak阻斷劑、改變病情 抗風濕藥物(DMARD)、諸如水楊酸鹽(阿司匹靈(ASpirin)) 之非類固醇消炎藥、金化合物、經氯喧(1^«11*〇\7^11〇1'(^11丨116)、 青黴胺(penicillamine)、類固醇及免疫抑制藥物。 在某些實施例中’一種方法包含測定個體之腫瘤細胞上 所表現之Fnl4的量,且接著,若該量高於正常細胞(例如 與癌細胞相同類型或譜系之正常細胞)上之量,則以抗 140330.doc •71 - 201008579
Fnl4抗體治療個體;且若該量低於正常細胞(例如與癌細 胞相同類型或譜系之正常細胞)上之量或若不存在可偵測 量之Fn 14,則不以抗Fn 14抗體治療個體。 在某些實施例中,一種方法包含判定Fnl4是否在個體之 腫瘤細胞上表現(以最低臨限量),且接著,若偵測到Fnl4 表現(以表低臨限量)’則以抗Fn 14抗體治療個體;且若未 偵測到Fnl4表現(以最低臨限量),則不以抗以14抗體治療 個體》 癌症 抗Fnl4抗體可用於治療經診斷患有癌症或處於癌症風險 中之個體,該癌症為例如結腸癌或乳癌。癌症可為原發 性、繼發性或轉移性的。 療法:抗Fnl4抗體(諸如本文所述之抗體)可單獨或與另 癌症療法(诸如護理標準療法)組合用於治療癌症或降低 癌症出現之風險。除本文所述之組合治療以外,抗Fnl4抗 體可與吉西他濱(Gemcitabine)(例如用於治療胰腺癌)、紫 杉盼(taxol)或曲妥珠單抗(trastuzumab)(例如用於治療乳 癌)、伊立替康(Irinotecan)、貝伐單抗(bevacizumab)、5· 氟尿癌啶或西妥昔單抗(cetuximab)(例如用於治療結腸癌) 或曲妥珠單抗(例如用於治療胃癌)組合使用。 其他癌症治療包括手術、化學療法、輻射療法、免疫療 法及單株抗體療法。Fnl4抗體可與此等治療方式中之任— 者組合使用。療法之選擇視腫瘤之位置及等級及疾病之階 段以及患者之一般狀態而定。 140330.doc -72- 201008579 在不#害身體其餘部分之情況下完全移除癌症為治療目 Z。有時此可藉由手術實現,但癌症傾向於藉由微觀轉移 k襲相鄰组織或擴散至遠端部位常常限制其有效性。化學 療法之有效性常常受對體内其他組織之毒性限制。輻射亦 可對正常組織造成損害。 手術.理論上,癌症若藉由手術完全移除則可治癒,但 、、非始終為可旎的。當在手術之前癌症已轉移至體内其 他部位時’完全手術切除通常為不可能的。在癌症發展之 一模型中,腫瘤局部生長,接著擴散至淋巴結,隨後至身 體其餘部分。&已引起僅局部治療之普及,諸如用於小癌 疒之手術。甚至小侷限性腫瘤亦日益被視為具有轉移潛 力。 癌症之手術程序的實例包括乳癌之乳房切除術及前列腺 癌之前列腺切除術。手術之目標可為僅移除腫瘤或移除整 個器官。單一癌細胞為肉眼不可見的但可再長成新腫瘤。 除移除原發腫瘤以外,手術常常為分期所必需,例如, 確疋疾病程度且判定其是否已轉移至區域性淋巴結。分期 為預後及需要輔助療法之主要決定因素。 手術偶爾為緩解性治療所必需,以控制諸如脊髓壓迫或 腸阻塞之症狀。 抗Fnl4抗體可在手術之前、期間及/或之後與手術組合 使用。舉例而言,抗體可在手術之部位處局部投與,例如 於腫瘤切除區域中及/或腫瘤切除區域周圍之組織上,咬 作為已經歷手術之患者復原之後的療法。 140330.doc -73- 201008579 輻射療法:輻射療法(亦稱為放射線療法、又射線療 。 放射)為使用電離輻射以殺死癌細胞且縮小腫瘤。 體外電子束放射線療法(EBRT)以外部方式或經由近接療法 以内部方式投與輻射療法。輕射療法之作用為局部的且限 於所治療之區域。輻射療法損害或破壞所治療之區域 (「目標組織」)中之細胞。輻射療法之目標為損害儘可能 多的癌細胞,同時限制對附近健康組織之傷害。因此,犯 允許許多部分之間的健康組織復原之情況下在該等部= 中給與輻射療法。 輻射療法可用於治療幾乎每—類型之實體腫瘤,包括腦 癌、乳癌、子宮頸癌、喉癌、肺癌、騰腺癌、前列腺癌、 皮膚癌、胃癌、子宮癌或軟組織肉瘤。輻射亦用於治療白 血病及淋巴瘤。對各部位之輻射劑量視許多因素而定該 等因素包括各癌症類型之輻射敏感性及附近是否存在可受 輻射損害之組織及器官。 & 抗Fnl4抗體可(例如)在輻射療法之前、期間及/或之後與 輻射療法組合使用。舉例而言,抗體可在已受輻射/正受 輻射/將受輻射之部位處局部投與。 化學療法.化學療法為以可破壞癌細胞之藥物治療癌 症。「化學療法」通常係指與靶向療法成對比,一般影響 快速分裂細胞之細胞毒性藥物。化學療法藥物以各種可能 方式干擾細胞分裂,例如干擾1)>^八複製或新形成之染色體 分離。化學療法之大多數形式把向所有快速分裂細胞且對 癌細胞不具特異性,儘管—定程度之特異性可來自許多癌 140330.doc -74- 201008579 細胞不能修復DNA損害,而正常細胞一般可以。 癌症療法中所用之化學治療劑的實例包括:安吖啶 (Amsacrine)、博萊黴素(Bleomycin)、硫酸布他卡因 (Busulfan)、卡西他濱(Capecitabine)、卡始(Carboplatin)、 卡莫司灯(Carmustine)、苯丁酸氮芬(Chlorambucil)、順翻 (Cisplatin)、克拉屈濱(Cladribine)、氯法拉濱 (Clofarabine)、左旋天冬醯胺酶(Crisantaspase) '環填醯胺 (Cyclophosphamide)、阿糖胞苦(Cytarabine)、達卡巴嗓 ® (Dacarbazine)、放線菌素 D(Dactinomycin)、道諾徽素 (Daunorubicin)、.多西他賽(Docetaxel)、小紅莓 (Doxorubicin)、表柔比星(Epirubicin)、依託泊苦 (Etoposide)、說達拉濱(Fludarabine)、5-IL 尿0密唆(5FU)、 吉西他濱、格立得植入物(Gliadel implant)、經基腺 (Hydroxycarbamide)、黃膽素(Idarubicin)、異環麟醯胺 (Ifosfamide)、伊立替康、甲醯四氫葉酸(Leucovorin)、微 脂體小紅莓(Liposomal doxorubicin)、微脂體道諾黴素 (Liposomal daunorubicin)、洛莫司汀(Lomustine)、美法命 (Melphalan)、疏基0票 °令(Mercaptopurine)、美司鈉 : (Mesna)、甲胺喋呤、絲裂黴素(Mitomycin)、米托蒽醌 (Mitoxantrone)、奥赛力翻(Oxaliplatin)、太平洋紫杉醇 (Paclitaxel)、培美曲塞(Pemetrexed)、喷司他汀 (Pentostatin)、丙卡巴肼(Procarbazine)、雷替曲赛 (Raltitrexed)、鍵腺黴素(Streptozocin)、嗔氟唆-尿嘴咬 (Tegafur-uracil)、替莫。坐胺(Temozolomide)、替尼泊武 140330.doc -75- 201008579 (Teniposide)、〇塞替派(Thiotepa)、硫鳥嗓吟(Tioguanine)、 拓朴替康(Topotecan)、曲奥舒凡(Treosulfan)、長春驗 (Vinblastine)、長春新驗(Vincristine)、長春地辛 (Vindesine)及長春瑞濱(Vinorelbine)。 因為一些藥物在一起比單獨更好地起作用,所以常常同 時給與兩種或兩種以上藥物。兩種或兩種以上化學治療劑 常常以組合化學療法使用。抗Fnl4抗體可(例如)在使用化 學治療劑之前、期間或之後與化學療法(例如,與一或多 種化學治療劑)組合使用。 靶向療法:靶向療法在於使用對癌細胞之失調蛋白質具 特異性之藥劑。小分子靶向療法藥物一般為在癌細胞内突 變、過度表現或其他方面關鍵之蛋白質上之酶促域的抑制 劑。重要實例為路胺酸激酶抑制劑伊馬替尼(imatinib)及吉 非替尼(gefitinib)。單株抗體療法為另一策略,其中治療 劑為與癌細胞表面上之蛋白質特異性結合之抗體。實例包 括抗Fnl4抗體、乳癌中通常使用之抗HER2/neu抗體曲妥珠 單抗(HERCEPTIN®)及多種B細胞惡性疾病中通常使用之 抗CD20抗體利妥昔單抗(rituximab)。 把向療法亦可涉及作為「歸位器件(homing device)」之 小肽,其可與細胞表面受體或包圍腫瘤之受感染細胞外基 質結合。若核種在細胞附近衰變,則與此等肽(例如RGD) 連接之放射性核種最終殺死癌細胞。 抗Fn 14抗體可(例如)在使用靶向療法之前、期間或之後 與另一乾向療法(例如,本文所述之乾向療法)組合使用。 140330.doc -76· 201008579 光動力療法:光動力療法(PDT)為用於癌症之三元治 療’其涉及光敏劑、組織氧及光(常使用雷射)。PDT可用 作(例如)基底細胞癌(BCC)或肺癌之治療;ρ〇τ亦可適用於 在手術移除大腫瘤之後移除微小惡性組織。 抗Fnl 4抗體可(例如)在使用光動力療法之前、期間或之 後與光動力療法組合使用。 免疫療法:癌症免疫療法係指經設計以誘導患者之自身 免疫系統對抗腫瘤之一組不同治療策略。用於產生針對腫 瘤之免疫反應的當Θ方法包括用於淺表性膀胱癌之膀胱内 BCG免疫療法’及(例如)在腎細胞癌及黑色素瘤患者中使 用干擾素(例如干擾素-γ)及其他細胞激素以誘導免疫反 應。 同種異體造血幹細胞移植可視為免疫療法之形式,此係 由於供體之免疫細胞將常常以移植物抗腫瘤效應攻擊腫 瘤。 抗Fnl4抗體可(例如)在使用其他免疫療法之前、期間或 之後與本文所述之免疫療法組合使用。 激素療法:藉由提供或阻斷某些激素可抑制一些癌症之 生長。激素敏感性腫瘤之常見實例包括某些類型之乳癌及 前列腺癌。移除或阻斷雌激素或睪固酮常常為重要的額外 治療。在某些癌症中,投與激素促效劑(諸如孕激素)可為 治療學上有益的。 抗Fnl4抗體可(例如)在使用激素療法之前、期間或之後 與本文所述之激素療法組合使用。 140330.doc -77- 201008579 結嫌癌.結腸癌為始於大腸(結腸)或直腸(結腸末端)之 癌症。該癌症有時稱作「結腸直腸癌」。最常見類型為結 腸癌。諸如淋巴瘤、類癌、黑色素瘤及肉瘤之其他類型結 腸癌為罕見的。 病因:根據美國癌症學會(American Cancer Society;), 結腸直腸癌為美國癌症相關死亡之主要病因之一。結腸癌 不存在單一病因。早期所有結腸癌皆以良性息肉之形式起 始,其緩慢發展成癌症。若患者具有··結腸直腸息肉、體 内他處之癌症、結腸癌之家族病史、潰瘍性結腸炎、克隆❹ 氏病、乳癌之個人病史,則存在較高結腸癌風險,及/或 某些遺傳症候群亦增加結腸癌出現之風險。 症狀:許多結腸癌病例無症狀。然而,以下症狀可指示 結腸癌:腹瀉、便秘或其他腸習性變化、便血、原因未明 貧血、腹痛及下腹壓痛、腸阻塞、原因未明體重減輕及大 便變細。在適當篩選下,可在症狀出現之前偵測到結腸 癌,此時其為最可治癒的。 檢查及測試:儘管可感覺到腹部腫塊,但身體檢查很少參 ’‘八4何問題。直腸檢查可揭示直腸癌而非結腸癌患者中 鬼—斷結腸直腸癌之成像測試包括:結腸鏡檢查及 乙狀結腸鏡檢查。糞便潛血測試(FOBT)可偵測大便中之少 液/、可表明結腸癌。然而’此測試在結腸癌患者中 $常為陰性的。出於此原因,通常連同結腸鏡檢查或乙狀 腸鏡檢查《進行FOBT。全企球計數可揭示低鐵含量 貧血之跡象。 140330.doc • 78· 201008579 若患者患有結勝直腸癌,則將進行其他測試分期以觀
察癌症疋否已擴散·· 0期:腸最内層上之極早期癌症;I 期:癌症處於結腸内層中;„期:癌症已擴散穿過結腸之 肌肉壁;111期:癌症已擴散至淋巴結;IV期:癌症已擴散 至其他器官。 治療:治療部分地取決於癌症階段。一般而言,治療可 包括:殺死癌細胞之化學療法藥物、移除癌細胞之手術 及/或破壞癌性組織之輻射療法。此外,本文所述之抗 F η 1 4抗體可單獨或與本文所述之另—治療組合用於治療結 腸癌可藉由常常在結腸鏡檢查期間移除癌細胞來治療〇 期、%腸癌。此外,本文所述之抗Fnl4抗體可單獨或與本文 斤述之另冶療(例如手術或化學療法)組合用於治療〇期結 腸癌對於I期、π期及ΙΠ期癌症而言,需要較廣泛手術以 =除癌性結腸部分。χ,本文所述之抗Fnl4抗體可單獨或 與本文所述之另一治療(例如手術、化學療法或放射線療 φ 法)組合用於治療1期、11期或ΠΙ期結腸癌。幾乎所有ΙΠ期 腸癌患者應在手術之後接受化學療法歷時約0-8個月。5_ 齓尿嘧啶為用於治療m期結腸癌之化學治療劑的實例。化 學療法亦用於治療IV期結腸癌患者。伊立替康、奥赛力鉑 氣尿鳴咬為二種最常用藥物。亦使用卡西他濱。此 卜本文所述之抗Fnl4抗體可單獨、與本文所述之另一治 療(例如手術、化學療法或放射線療法)組合用於治療以期 、结腸癌。對於已擴散至肝臟之IV期疾病患者而言,可使用 各種特異性地針對肝臟之治療。此可包括切去癌症、切除 140330.doc •79· 201008579 或冷柬療法。化學療法或輻射有時可直接傳遞至肝臟中。 此外’本文所述之抗Fnl4抗體可單獨或與本文所述之另一 治療(例如手術、化學療法或放射線療法)組合用於治療已 轉移至肝臟或體内其他位置之結腸癌。儘管輻射療法偶爾 用於結腸癌患者,但對於冚期直腸癌患者而言其通常與化 學療法組合使用。類似地,本文所述之抗以“抗體可(例 如)與輻射療法組合用於治療IV期結腸癌。 預後:患者之健康程度取決於許多者,包括癌症階段。 一般而言,當在早期治療時,大於9〇%之患者在其診斷之 後存活至少5年。然而,僅約39%之結腸直腸癌在早期發 現。一旦癌症已擴散,貝5年存活率顯著下降。若患者之 結腸癌在5年内不復發,則將其視為治癒。j期、π期及m 期級癌症視為潛在可治癒的。在大多數狀況下,ιν級癌症 不可治瘡。 可能性併發症:併發症包括轉移、結腸内癌瘤復發、第 二原發性結腸直腸癌出現。 預防:結腸癌可幾乎始終在其最早及最可治療階段藉由 結腸鏡檢查發覺。幾乎所有5〇歲及5〇歲以上之男性及女性 應作結腸鏡檢查。膳食及生活方式調整為重要的。一些證 據表明低脂肪及高纖維膳食可降低結腸癌風險。抗FnM抗 體可用於降低結腸癌出現之風險或預防結腸癌出現,例如 在鑑別為處於結腸癌風險中之声、者中。 乳癌:乳癌為始於乳房組織之癌症。乳癌之兩種主要類 型為乳腺管癌及小葉癌。在極少狀況下,乳癌可始於乳房 140330.doc •80- 201008579 之其他區域。許多乳癌為雌激素敏感性的(雌激素受體陽 性癌症或ER陽性癌症)^ 一些乳癌為HER2陽性的。 病因:風險因素包括: 年齡及性別-乳癌出現之風險隨年齡而增加。大多數晚 期乳癌病例在超過50歲之女性中發現。女性患乳癌之可能 性比男性大100倍。 乳癌家族病史_若近親已患有乳癌、子宮癌、卵巢癌或 結腸癌,則存在較高乳癌風險。約2〇_3〇%患有乳癌之女性 ® 具有該疾病之家族病史。 遺傳學-最常見基因缺陷見於BRCA1及BRCA2基因中。 在此等基因中之一者中具有突變之女性具有高達8〇%之機 率在其生中某時患上乳癌。其他遺傳缺陷已與乳癌相關 聯,包括ATM基因、CHEK-2基因及P53腫瘤抑制基因中所 見之遺傳缺陷,但此等遺傳缺陷為罕見的。 月經週期-經期開始較早(12歲之前)或停經期較晚(5 5歲 之後)之女性具有增加之乳癌風險。 酒精飲用-一天飲酒多於1-2杯可增加乳癌風險。 分娩-從未有過小孩或僅在30歲之後有小孩之女性具有 增加之乳癌風險。懷孕一次以上或在早年受孕降低乳癌風 險。 DES-服用乙烯雌酚(diethylstilbestrol,DES)以防止流產 之女性在40歲之後可具有增加之乳癌風險。 激素替代療法(HRT)-對於已接受激素替代療法歷時數年 或數年以上之女性而言,存在較高乳癌風險。 140330.doc -81 - 201008579 肥胖-肥胖已與乳癌相關聯,儘管此關聯為有爭論的。 輻射-兒童或青年時接受以治療胸部區域之癌症的輻射 療法增加乳癌出現之風險。 症狀:早期乳癌通常並不引起症狀。隨著癌症生長,症 狀可包括:硬的,具有不平邊緣且通常無痛之乳房腫塊或 腋窩中之腫塊;乳房或乳頭之尺寸、形狀或感覺變化例 如紅色、凹陷或起皺;乳頭溢液-可為血色、透明至黃色 或綠色,且看似膿液。在男性中,乳癌症狀包括乳房腫 塊、乳房疼痛及壓痛。 晚期乳癌之症狀可包括:骨痛、乳房疼痛或不適、皮膚 潰瘍、一個手臂(緊挨癌症乳房)腫脹及體重減輕。 檢查及測試:醫生將詢問症狀及風險因素,且進行身體 檢查,其包括兩個乳房、腋窩以及頸部及胸部區域。其他 測试可包括:乳房攝影檢查、乳房MRI、乳房超音、乳房 活組織檢查、針抽吸或乳房腫塊移除以移除所有或部分乳 房腫塊以供較精密檢查。若患者患有乳癌,則進行其他測 試(例如分期)以觀察癌症是否已擴散以幫助指導未來治 療。 乳癌階段處於〇期至IV期之範圍内。一般而言,乳癌可 為原位(非侵襲性)乳癌或侵襲性乳癌。期數愈高,癌症愈 晚期。 治療:治療係基於許多因素,包括癌症類型及階段、癌 症是否對某些激素敏感及癌症是否過度產生(過度表現)稱 為HER2/neu之基因。一般而言,癌症治療可包括:化學療 140330.doc 201008579 法、輻射療法、移除癌性組織之手術-腫塊切除術移除乳 房腫塊;乳房切除術移除所有或部分乳房及可能之附近結 構。此外,本文所述之抗Fnl4抗體可單獨或與本文所述之 另一治療組合用於治療乳癌。其他治療包括:激素療法及 把向療法。激素療法之實例為藥物他莫昔芬(tamoxifen)。 -此藥物阻斷可幫助乳癌細胞存活及生長之雌激素作用。大 .多數患有雌激素敏感性乳癌之女性得益於此藥物。已顯示 一類稱為芳香酶抑制劑之較新穎藥物(諸如依西美坦 參 (exemestane,Aromasin))在患有乳癌之停經後女性中正如 他莫昔芬一樣好地起作用或甚至比他莫昔芬更好地起作 用。靶向療法使用鑑別細胞中可導致癌症之某些變化的特 殊抗癌藥物。一種該藥物為曲妥珠單抗(HERCEPTIN®)。 對於患有IV期HER2陽性乳癌之女性而言,已顯示 HERCEPTIN®加上化學療法比單獨化學療法更好地起作 用。研究亦已顯示在患有早期HER2陽性乳癌之女性中, 此藥物加上化學療法將癌症復發之風險削減50%。本文所 述之抗Fnl4抗體可與HERCEPTIN®(單獨或與化學療法一 起)組合用於治療。 :癌症治療可為局部或全身性的。輻射及手術為局部治療 之形式。化學療法為全身性治療之類型。 大多數女性接受治療組合。對於患有I期、II期或III期乳 癌之女性而言,主要目標為治療癌症且預防其復發。對於 患有IV期癌症之女性而言,目標為改良症狀且幫助其活得 更久。在大多數狀況下,IV期乳癌不可治癒。本文所述之 140330.doc -83- 201008579 抗Fnl4抗體可單獨或與本文所述 κ另 治療組合用於治療 〇期、I期、II期、III期或IV期乳癌。 〇期-腫塊切除術加上輻射或⑽切除術為標準治療。 I期及II期-·腫塊切除術加上輕射或乳房切除術與某種淋 巴結移除為標準治療。亦可在手術之後推薦激素療法、化 學療法及生物療法。 可能繼之以化學療法、激素療法 III期-治療涉及手術 及生物療法。 W期-治療可涉及手術'輻射、化學療法、激素療法或 該等治療之組合。 乳癌經適當治療者之5年存活率如下: 〇期為100% I期為100% ΠΑ期為92% ΠΒ期為81% ΠΙΑ期為67% ΗΙΒ期為54% IV期為20% 可能性併發症:乳癌可擴散至身體其他部分。有時,癌 症甚至在移除整個腫瘤且附近淋巴結未發現癌症之後亦復 發。來自癌症治療之副作用或併發症為可能的。舉例而 σ,輻射療法可引起乳房暫時性腫脹及該區域周圍疼痛。 預防.健康膳食及生活方式稍加變化一般可降低總體癌 症機率。 140330.doc 201008579 乳癌若早期發現則較易治療且常可治癒。早期偵測涉 及··乳房自檢(BSE)、醫學專業人員所進行之臨床乳房檢 查及/或篩選性乳房攝影檢查。 醫藥组合物 可將抗Fnl4抗體(諸如本文所述之抗體)調配為醫藥組合 物以供投與個體,(例如)來治療本文所述之病症。醫藥組 合物通常包括醫藥學上可接受之載劑。如本文所用之「醫 藥學上可接受之載劑」包括任何及所有溶劑、分散介質、 〇 塗料、抗細菌劑及抗真菌劑、等張劑及吸收延遲劑及其生 理學上相容之類似物。組合物可包括醫藥學上可接受之 鹽,例如酸加成鹽或驗加成鹽(參見,例如Berge,S.M.等 人,(1977) J· 5W. 66:1-19)。 醫藥調配為公認技術且進一步描述於(例如)Gennaro (編).,Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 第 20 版,Lippincott Williams & Wilkins (2000) (ISBN: 0683306472) ; Ansel^ A > Pharmaceutical Dosage Forms Drwg jDe/z’ver;; ,第 7版,Lippincott Williams &
Wilkins Publishers (1999) (ISBN: 0683305727);及 Kibbe (編),Handbook of Pharmaceutical Excipients American 尸第 3版(2000) (ISBN: 091733096X) 中ο 醫藥組合物可呈多種形式。此等形式包括(例如)液體、 半固體及固體劑型,諸如液體溶液(例如,可注射及可輸 注溶液)、分散液或懸浮液、錠劑、丸劑、散劑、脂質體 140330.doc -85- 201008579 及栓劑。較佳形式可視預期投藥模式及治 :所述之藥劑的"合物通常呈可注射或可輸注溶液二 式0 在 存於2-8°C下 一實施例巾’將抗Fnl4抗體與諸如氣化鈉七水合碟 酸虱納、錢二氫納之賦形劑物質及歡劑—起調配。抗 Fnl4抗體可(例如)在緩衝溶液中以合適之濃度提供且· 該等組合物可由非經腸模式(例如,靜脈内、皮下、腹 膜内或肌肉内注射)投與。如本文所用之片語「非經腸投 樂」及「非經腸投與」意謂除腸内及局部投與以外之通常 藉由注射而投藥之模式’且包括(但不限於)靜脈内、肌肉 内、動脈内、勒内、囊内、眶内、心内、皮内、腹膜内、 經氣管、皮下、角質層下、關節内、囊下、蛛網膜下、脊 柱内、硬膜外及胸骨内注射及輸注。 可將組合物調配為溶液、微乳液、分散液、脂質體或適 合於以高濃度穩定儲存之其他有序結構。可藉由將本文所 述之藥劑以所需量併入具有上文列舉之成份中之一者或其 組合的適當溶劑中,必要時繼之以過濾殺菌來製備無菌可 注射溶液。一般而言,藉由將本文所述之藥劑併入含有鹼 性分散介質及來自上文列舉之彼等者之所需其他成份的無 菌媒劑中來製備分散液。在用於製備無菌可注射溶液之無 菌散劑的狀況下,較佳製備方法為真空乾燥及冷凍乾燥, 其自先前無菌過濾溶液得到本文所述之藥劑加上任何其他 所要成份之散劑。可(例如)藉由使用諸如卵磷脂之塗料, 140330.doc • 86 - 201008579 在分散液之狀況下藉由維持所需粒度及藉由使用界面活性 劑來維持溶液之適當流動性。可藉由在組合物中包括延遲 吸收之試劑(例如,單硬脂酸鹽及明膠)來達成可注射組合 物之持久吸收。 在某些實施例中,抗Fnl4抗體可與載劑—起製備,該載 劑將保護化合物免於快速釋放,諸如受控釋放調配物包 括植入物及微囊封傳遞系統。可使用生物可降解、生物相 容性聚合物,諸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、 ❹ 冑原蛋白、聚原酸酯及聚乳酸。製備該等調配物之許多方 法已取得專利或一般已知。參見,例如““
Controlled Release Drug Delivery Systems, J.R. Robinson 編 ’ Marcel Dekker,lnc·,New York (1978) 〇 抗Fnl4抗體可(例如)用使其在循環中(例如在血液、血清 或其他組織中)之穩定性及/或滞留改良(例如)至少15倍、2 倍、5倍、1〇倍或5〇倍之部分來修飾。 參舉例而言,抗Fnl4抗體可與聚合物締合(例如結合),該 聚合物為例如大體上不具抗原性之聚合物,諸如聚氧化烯 或聚氧化乙烯。合適之聚合物以重量計將大體上變化。可 使用數量平均分子量處於約200至約35,000道爾頓 (Dalton)(或約1,〇〇〇至約15 〇〇〇及2 〇〇〇至約範圍内 之聚合物。 舉例而言,抗Fnl4抗體可與水溶性聚合物結合,該水溶 性聚合物為例如親水性聚乙烯聚合物,例如聚乙烯醇或聚 乙烯比咯啶酮。該等聚合物之實例包括聚氧化烯均聚物, 140330.doc •87· 201008579 諸如聚乙二醇(PEG)或聚丙二醇、聚氧乙烯化多元醇、其 共聚物及其嵌段共聚物,其限制條件為維持嵌段共聚物之 水溶性。其他適用之聚合物包括聚氧化烯,諸如聚氧化乙 烯、聚氧化丙烯,及聚氧化乙烯與聚氧化丙烯之嵌段共聚 物;聚曱基丙烯酸酯;卡波姆(carbomer);及分枝或未分 枝多糖。 在一些實施中,抗Fnl4抗體亦可與標記或其他藥劑偶合 或以其他方式締合,該藥劑為例如另一治療劑,諸如細胞 毒性劑或細胞生長抑制劑’但在許多實施例中,此組態並 非必要。細胞毒性劑及化學治療劑之實例包括紫杉酚、細 胞遲緩素B(Cyt〇chalasin B)、短桿菌素D(gramicidin D)、 長春驗、小紅莓、道諾黴素、類美登素(maytansin〇id)(例 如美登素醇(maytansinol)或DM1類美登素·美登素 (maytansine)之含硫氫基衍生物)、米托蒽醌、光神黴素 (mithramycin)、放線菌素 D(actinomycin D)、1-去氫睪固 酮、糖皮質激素、普魯卡因(procaine)、紫杉烧(taxane)、 丁卡因(tetracaine)、利多卡因(Hdocaine)、普萘洛爾 (propranolol)及嘌呤黴素(puromycin)及其類似物或同系 物。 當抗Fn 14抗體與第二藥劑(例如化學治療劑)組合使用 時,兩種藥劑可獨立調配或一起調配。藥劑可以協同有效 量調配或以其他方式使用。亦可能以小於單一療法將使用 之量使用該等藥劑中之一或兩者。舉例而言,可(例如)在 臨投與之前將各別醫藥組合物混合且一起投與或可(例如) 140330.doc -88· 201008579 同時或在不同時間獨立投與。 亦可能使用其他Fnl4結合劑或促效劑藥劑。藥劑可為任 何類型之可投與個體之化合物(例如,小有機分子或:2 機分子、核酸、蛋白質或肽模擬劑)。在一實施例中,藥 劑為生物劑,例如分子量介於5_3〇〇 kDa之間的蛋白質。 舉例而言,Fnl4促效劑藥劑可活化Fnl4接合之下游事件。 除與Fnl4結合之促效劑抗體以外,例示性FnU促效劑藥劑 亦包括TWEAK及可溶形式之TWEAK(參見,例如美國專利 第7,1〇9,298號)。該等藥劑可作為與本文所述之一或多種 抗體的組合療法之-部分來投與。本文所述之其他治療劑 亦可以醫藥組合物之形式(例如)由標準方法或本文所述之 方法提供。 投藥 可由多種方法將抗Fnl4抗體投與個體,例如有需要之個 體,例如人類個體。對於許多應用而言,投藥途徑為靜脈 〇 内注射或輸注(IV)、皮下注射(SC)、腹膜内(IP)或肌肉内 注射中之一者。亦可能使用關節内傳遞。亦可使用非經腸 才又藥之其他模式。该等模式之實例包括:動脈内、鞘内、 囊内、眶内、心内、皮内、經氣管、角質層下、關節内、 囊下、蛛網膜下、脊柱内及硬膜外及胸骨内注射。在一些 狀況下,投藥可直接至癌症部位,例如至腫瘤中及/或鄰 近腫瘤。 亦可針對個別狀況調整抗體之投藥途徑及/或模式,例 如藉由(例如)使用斷層攝影成像監測個體(例如)來顯現腫 140330.doc •89- 201008579 瘤。 抗體可以固定劑量或以mg/kg劑量投與。亦可選擇劑量 以減少或避免針對抗Fnl4抗體之抗體產生。調整給藥方案 以提供所要反應,例如治療反應或組合治療作用。—般% 言,可使用抗Fnl4抗體(及視情況第二藥劑)之劑量以向個 體提供生物可用量之藥劑。舉例而言,可投與在〇1_1〇〇 mg/kg、0.5-100 mg/kg、1 mg/kg-100 mg/kg ' 0.5-20 mg/kg、0.1-10 mg/kg或1-10 mg/kg之範圍内的劑量。亦可 使用其他劑量。 組合物可包含約10至100 mg/m丨或約50至1〇〇 mg/ml或約 100至 150 mg/ml或約 1〇〇至 200 mg/ml之抗體。 在某些實施例中,組合物中之抗Fn 14抗體主要呈單體形 式,例如,至少約 90°/。、92%、94%、96%、98%、98.5% 或99%呈單體形式◊如(例如)藉由uv在A28〇 nm下偵測, 某些抗Fnl 4抗體組合物可包含小於約5〇/。、4%、3%、2%、 1%、0.5%、0.3%或〇.1%之聚集體。如(例如)藉由11¥在 A280 nm下偵測,某些抗以“抗體組合物包含小於約5%、 4%、3%、2%、1%、〇.5〇/0、0.3%、〇 2%或 〇 1%之片段。 如本文所用之單位劑型或「固定劑量」係指適於作為單 次劑量用於待治療之個體的實體離散單位;各單位含有預 定篁之活性化合物,該量經計算以與所需醫藥載劑相結合 及視情況與其他藥劑相結合產生所要治療作用。可給與單 人或多次劑量。或者或另外,可經由連續輸注來投與抗 體。 140330.doc 201008579 可(例如)以週期性時間間隔經足以包涵至少2劑、3劑、 5劑、10劑或1〇劑以上之時段(療程)投與抗FnU抗體劑 量例如,母日一或兩次,或每週約一至四次,或較佳每 週认、母兩週一次、每三週一次、每月一次,例如歷時 約1週至12週之間,較佳2週至8週之間,更佳約3週至了週 之間且甚至更佳歷時約4週、5週或ό週。可影響有效治 療個體所需之劑量及時序的因素包括(例如)疾病或病症之 嚴重度、調配物、傳遞途徑、先前治療、個體之一般健康 ® 狀况及/或年齡,及所存在之其他疾病。此外,以治療有 效量之化合物治療個體可包括單次治療或較佳可包括一系 列治療。亦可將動物模型用於確定適用劑量,例如初始劑 量或方案。 若個體處於癌症或本文所述之其他病症出現之風險中, 可在癌症或病症完全發作之前投與抗體,例如作為預防性 措施。該預防性治療之持續時間可為抗體之單次劑量或治 φ 療可持續(例如,多次劑量)。舉例而言’可用抗體治療處 於病症風險中或具有患病傾向之個體歷時數天、數週、數 月或甚至數年以預防病症出現或暴發。 醫藥組合物可包括「治療有效量」之本文所述藥劑。可 基於所投與藥劑之作用或藥劑之組合作用(若使用一種以 上藥劑)來確定該等有效量。藥劑之治療有效量亦可根據 以下因素而變:諸如個體之疾病病況、年齡、性別及體 重,及化合物在個體中引發所要反應之能力,例如改善至 少一個病症參數或改善至少一種病症症狀。治療有效量亦 140330.doc •91- 201008579 為其中治療右m 乍用超過組合物之任何毒性作用或有害作 用的量。 療法用之器件及套組 I *療器件投與包括抗Fnl4抗體之醫藥組合物。該器 2可^ 4有諸如可攜性、室溫儲存及使用簡易之特徵,使 :,、可(例如)由未經培訓之個體或由在此領域中之應急人 員:醫醫療a又施及其他醫療設備移除用於緊急情況。該器 牛p c括(例如)一或多個用於儲存包括抗抗體之醫藥 二劑的:殼’且可經組態以傳遞抗體之一或多個單位劑 1。,器件可經進"'步組態以作為亦包括抗Fnl4抗體之單 -醫樂組合物或作為兩種獨立醫藥組合物投與第二藥劑, 例如化學治療劑。 可用/主射ϋ投與醫藥組合物。亦可用無針皮下注射器件 投與醫藥組合物’該器件為諸如為us 5,399,H 5,383,851 ; 5,312,335 ; 5,064,413 ; 4,941,880 ; 4,790,824 或4,596,556中所揭示之器件。熟知植人物及模組之實例包 括:US 4,487,603,其揭示一種用於以受控速率分配藥物 之可植人微輸注泵;US 4,486,194,其揭示—種用於經由 皮膚投與藥劑之治療器件;us 4,447,233,其揭示一種用 於以精確輸注速率傳遞藥物之藥物輸注泵;uS 4,447,224,其揭示一種用於連續藥物傳遞之可變流動可植 入輸注裝置;US 4,439,196,其揭示一種具有多腔室區室 之滲透藥物傳遞系統;及US 4,475,196,其揭示一種滲透 藥物傳遞系統。許多其他器件、植入物、傳遞系統及模組 140330.doc •92· 201008579 亦為已知的。 括址中提供抗Fnl4抗體。在一實施例中該套組包 二包括抗^14抗體之組合物的容器,及視情況⑻ 關枓。該資訊材料可為描述性、指導性、銷售性材料 =於本文所述之方法及/或使用藥劑用於達成治療效益 的其他材料。 在一實施例中’套組亦包括用於治療本文所述之病症的
第-樂劑’例如化學治療劑。舉例而t,套組包括:含有 包括抗Fnl4抗體之組合物的第—容器及包括第二藥劑 二容器。 套組之資訊材料的形式不受限制。在—實施例中,資訊 材料可包括關於化合物生產、化合物分子量、濃度、失效 日期、批次之資訊或產地資訊等。在一實施例中,資訊材 料係關於投與抗Fnl4抗體之方法(例如以合適之劑量、劑 型)或投藥模式(例如,本文所述之投藥劑量、劑型或模 式)’以治療已患有癌症或本文所述之其他病症或處於癌 症或本文所述之其他病症之風險中的個體。可以多種格式 提供資訊,包括印刷文本、電腦可讀材料、視訊記錄或音 訊記錄,或提供實質性材料之鏈路或位址的資訊(例如在 網際網路上)。 除抗體以外,套紐中之組合物亦可包括其他成份,諸如 溶劑或緩衝液、穩定劑或防腐劑。抗體可以任何形式,例 如液體、乾燥或凍乾形式,較佳以大體上純的及/或無菌 形式提供。當在液體溶液中提供藥劑時,液體溶液較佳為 140330.doc •93· 201008579 水溶液。當以乾無形式坦极滅 式如供樂劑時,一般藉由添加合適之 溶劑來進行復水。可視愔汐. 祝it况在套組中提供例如無菌水 衝液之溶劑。 & 套組可包括-或多個用於含有藥劑之組合物的容器 一些實施例中,套組令古 各有用於組合物及資訊材料之獨立 器、分隔器或區室。舉例而言,瓶、小瓶或注射器中可含 有組合物,且塑膠套筒或封包中可含有資訊材料。在其他 實施例中,单一未分 平木刀隔各器内含有套組之獨立元件。舉 而言,在附著呈標籤形式夕咨 戰I式之貝讯材料的瓶、小瓶或注射器 中含有組合物。在一4b管·絲也丨由 Δ >£, 1 —貫鉍例中,套組包括複數個( 一盒)個別容器,其各自合右越麻丨 八合目3有樂劑之一或多個單位劑型 如,本文所述之劑型)。纟器可包括組合單位劑量 如,包括(例如)所要比率之抗Fnl4抗體與第二藥劑的 位。舉例而言,套組包括複數個注射器、安瓶、荡封勺 發泡包裝或醫療器件,例如,其各自含有單次组合單:劑 量:套組之容器可為氣密的、防水的(例如對水分變化 或瘵發為不透的)及/或不透光的。 套組視情況包括適合於投與組合物之器件,例如注射器 或其他合適之傳遞器件。器件可經提供預負载有藥劑令之 一或兩者或可為空的,但適合於負載。 靶向Fnl4表現細胞 本文所述之抗Fnl4抗體可用於使有效負載靶向以14表現 細胞或靶向與Fnl4相關之組織或其他結構。舉例而^ ^ 體可與可傳遞外源基因(例如,對於基因 抗 激沃而g )之病毒 140330.doc •94· 201008579 或類病毒粒子或與脂質體(例如’囊封治療劑或外源基因 之脂質體)連接。使用抗體以靶向病毒之例示性方法描述 於 Roux 等人,(1989) Proc Natl Acad Sci USA (1989) 86:9079-9083 中。亦參見,例如 Cwrr Gene 772er. (2005) 5:63-70及i/wm 77zer. (2004) 15:1034-1044。 本發明之抗Fnl4抗體亦可與含有諸如化學治療劑之治療 劑的脂質體連接。抗體與脂質體之連接可由任何已知之交 聯劑實現,該交聯劑為諸如已廣泛用於使毒素或化學治療 劑與抗體偶合以供乾向傳遞之異源雙功能交聯劑。舉例而 言,可使用碳水化合物引導之交聯試劑4-(4-順丁烯二醯亞 胺基苯基)丁酸醯肼(MPBH)來實現與脂質體之結合 (Duzgunes等人 ’(1992) j· ce//. Abst.增刊 ι6Ε 77)。亦可由熟知之方法來製備含有抗體之脂質體(參見, 例如 DE 3,218,121 ; Epstein等人,(1985) w"·众 μ t/以,82:3688-92 ; Hwang等人,(1980) #如/.
Id· *SW. t/以,77:4030_34 ; u_S. 4,485,045及4,544,545)。 診斯用途 抗Fn 14抗體可在診斷方法中用於活體外(例如生物樣 本,諸如組織、活組織)或活體内(例如,個體中之活體内 成像)偵測Fn 14的存在。舉例而言,可將人類或有效人類 抗Fn 14抗體投與個體以偵測個體内之Fn丨4。舉例而言可 (例如)用MRI可偵測標記或放射性標記來標記抗體。可使 用用於债測可谓測標記之方式來評估個體。舉例而言,可 對個體掃描以評估抗體在個體内之定位。舉例而言,(例 140330.doc •95· 201008579 如)由NMR或其他斷層攝影成像方式使個體成像。 適用於—斷性成像之標記的實例包括放射性標記 123 1 - In、3、99mTc、32p、33p、125ι、沱、γ 及 Rh,螢光標記,諸如螢光素(fluorescein)及若丹明 32ι n 111- ,“ 吨斯 (rhodamine);核磁共振活性標記;可由正電子發射斷層攝 影(「PET」)掃描儀债測之正電子發射同位素;化學發光 劑,諸如蟲螢光素(luciferin);及酶促標記,諸如過氧化 酶或磷酸酶。亦可採用短程輻射發射體,諸如可由短程偵 測探針偵測之同位素。可使用已知技術以該等試劑標記蛋 白質配位體。舉例而言,參見Wensel及Meares (1983) Radioimmunoimaging and Radioimmunotherapy, Elsevier
New York(關於抗體之放射性標記的技術)及c〇lcher等人, (1986) Mei/z. 121:802-816。 可使用諸如放射性核掃描之已知技術使用(例如)γ相機或 發射斷層攝影術使個體活體内r成像」◊參見,例如A R.
Bradwell 等人,「Developments in Antibody Imaging」,
Monoclonal Antibodies for Cancer Detection and Therapy R.W. Baldwin 等人(編),第 65-85 頁(Academic Press 1985)。或者’可使用諸如位於布魯克赫文國家研究所 (Brookhaven National Laboratory)之指定 Pet VI的正電子發 射橫軸斷層攝影掃描儀,其中放射性標記發射正電子(例 如,、18F、15〇及 13N)。 MRI對比媢:磁共振成像(MRI)使用NMR來顯現活個體 之内部特徵,且適用於預後、診斷、治療及手術。MRI可 140330.doc -96- 201008579 在無放射性示蹤化合物之情況下使用以達成明顯效益。一 些mRI技術概括於EP0 502 814 A中。一般而言與不同環 境中水質子之弛豫時間常數T1及丁2有關之差異用於產生影 像。然而,此等差異可能不足以提供清晰高解析度影像。 此等弛豫時間常數之差異可由對比劑增強。該等對比劑 之實例包括許多磁性試劑、順磁性試劑(其主要改變τι)及 鐵磁性或超順磁性試劑(其主要改變Τ2反應)。螯合劑(例如 EDTA、DTPA及ΝΤΑ螯合劑)可用於連接一些順磁性物質 β (例* ’ Fe3+、Mn2+、Gd3+)(且降低其毒性)。其他試劑可呈 (例如)直徑小於1〇 μιη至約10 nm之粒子的形式。粒子可具 有鐵磁性、反鐵磁性或超順磁性特性。粒子可包括(例如) 磁鐵礦(FhO4)、Y-Fe2〇3、肥粒鐵(ferrhe)及過渡元素之其 他磁性礦物化合物。磁性粒子可包括一或多種有或無非磁 性材料之磁性晶體。非磁性材料可包括合成或天然聚合物 (諸如瓊脂糖、葡聚糖、糊精、澱粉及其類似物)。 參抗Fnl4抗體亦可以含活性原子或複數個該等 原子之指示基團標記’此係由於⑴大體上所有天然豐富之 氟原子為19f同位素且因此大體上所有含氟化合物具nmr 活性;(ii)許多化學活性多氟化化合物(諸如三氟乙酸酐)以 相對較低的價格市售可得;及(iii)已發現醫學上可接受用 於人類之許多氟化化合物,諸如用於載運氧作為血色素替 代品之全氟化聚醚。在允許該培育時間之後,使用諸如
Pykett (1982) Wewiz/k ⑺七㈣,246:78-88所述之裝置中 之一者的裝置進行全身MRI以定位Fnl4分布且使Fnl4分布 140330.doc •97- 201008579 成像。 在另一態樣中,本揭示案提供一種活體外偵測樣本(例 如,生物樣本,諸如血清、血漿、組織、活組織)中Fni4 之存在的方法。主題方法可用於診斷病症,例如癌症。該 方法包括:⑴使樣本或對照樣本與抗以^抗體接觸;及 (H)(例如)藉由偵測抗Fn 14抗體與Fn 14之間的複合物形成或 藉由彳貞測抗體或F η 14之存在來針對F η 14的存在評估樣本。 舉例而言,可將抗體固定於(例如)支撐物上,且偵測抗原 在支撐物上之滯留,及/或將抗原固定於(例如)支撐物上, 且偵測抗體在支撐物上之滯留。可包括對照樣本。相對於 對照樣本’在樣本中形成複合物之統計學上顯著變化可指 示樣本中Fnl4的存在。一般而言,抗Fnl4抗體可用於包括 螢光偏振、顯微法、ELISA、離心、層析及細胞分選(例 如,螢光活化細胞分選)之應用。 以下為實施本發明之實例。該等實例不應視為以任何方 式限制本發明之範疇。 實例 實例1 :抗Fnl4抗艟 藉由投與表現人類表面Fnl4之CHO細胞在FnM不足小鼠 中產生抗Fnl4抗體P4A8、P3G5、P2D3及P3D8,且用 Fnl4-myc-His蛋白加強免疫。此作為較早免疫策略似乎必 需之免疫策略並不成功。抗體於活體外結合人類Fnl4蛋白 與獼猴Fnl4蛋白。人類Fnl4蛋白(上部)與獼猴Fnl4蛋白(下 部)之比對如下: 140330.doc • 98 ~ 201008579 1 ΜΑΚσβΙΛΚΙΟΛΙ^νΐ^νίΙΑΙΛΙ^νΑαΕΟΑΡΟΤΑΙ^Ι^βν^Αηΐ^ΚΟΜ 50 ΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΜΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΜΙΙΙΙΙΜΙΙ ΙΜΙΙΜΙΙΙΜ 1 ΜΑΙ^υΚΙΪϋΚϋνΐ/^ίίΙΑΙ^υ^νΑσΕΟΑΡαΤΑΙ^ΙΚ^Ι^ΑΟΙΛΚαΊ 50 51 ΒεΑ3α?ΑΗΡΗ3ϋΡα^ΑΑΑΡΡΑΡΡϋϋνίΡΙΙίσ〇ΑΙ^ΙιΤΡνΐ^Ι^Ρ[ν 100 ΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΜΙΙ-ΙΙΙΙΜΙΙ!ΙΙΙΙΙΙΙΜΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙΙ!ΙΙ 51 ϋΟΑΒΟΙΑΗΡΗΒΟΡα^ΒΑΑΡΡΑΡΡΙΙΙίΙΛίΡΙΙ^ΑΙ^ΤΡνίαίιΙ^αΡΙίν 100 101 WRRCRRREKFTTPIEETGGEGCPAVALIQ 129 (SEQ ID ΝΟ:1) ΙΙΙΜΙΙΙΜΙΙΙΙΙΙΙΝΜΙΙΙΙΙΙΙΙ 101 WRRCRRREKFTTPIEETGGEGCPAVALIQ 129 (SEQ ID NO:10) @ 下文進一步描述之P4A8之特性包括以下:約1.6 nM或2 nM之單價結合親和力;觸發腫瘤細胞凋亡之活體外功效 的EC5〇為170 pM ;與人類、獼猴、大鼠及小鼠Fnl4之物種 交叉反應性;誘導活體外腫瘤細胞死亡之能力;在活體内 腫瘤異種移植模型中有效;活體外及活體内誘導NF-kB信 號轉導及誘導卡斯蛋白酶-3/7 ;於小鼠中2天之半衰期;於 大鼠中>5天之半衰期;及不與其他TNF家族成員受體結 合。 © 實例2 :抗Fnl4抗艟於活«外殺死臚瘤細胞 以漸增濃度之抗Fnl4抗體(P2D3、P4A8、P3G5或 P3D8)、陽性對照促效劑(Fc-TWEAK)或陰性對照 (MOPC21)各自與IFN-γ組合來處理Widr結腸癌細胞。藉由 如MTT檢定所評定之生存力降低程度來量測細胞死亡。抗 體P2D3、P4A8、P3G5及P3D8以及Fc-TWEAK能夠殺死腫 瘤細胞(圖1)。WiDr MTT檢定中之P4A8之EC50為約30 ng/ml。在MTT檢定中以人類化P4A8IgGl(hP4A8IgGl ;下 140330.doc -99- 201008579 述)獲得類似結果。另外,用多聚體型式之hP4A8IgGl(藉 由使hP4A8IgGl與蛋白質A結合而產生)處理顯示增強之作 用(圖15)。 由TUNEL檢定來量測P4A8抗體活體外殺死WiDr結腸癌 細胞之能力。以P4A8抗體或陽性對照(Fc-TWEAK)各自與 IFN-γ組合來處理WiDr細胞,或保留不處理。P4A8抗體與 Fc-TWEAK均能夠殺死腫瘤細胞(圖2A及圖2B)。 測試抗Fnl4抗體活體外殺死MDA-MB231乳癌細胞之能 力。以漸增濃度之抗體P2D3、P4A8、P3G5或P3D8或陽性 對照促效劑(Fc-TWEAK)各自與IFN-γ組合來處理癌細胞。 藉由如MTT檢定所評定之生存力降低程度來量測細胞死 亡。MDA-MB231細胞於活體外對抗Fnl4抗體具有抗性(圖 3)。 .使P4A8快速内化至所測試之所有細胞中。内部顆粒之 外觀自小而多(WiDr)變至大而少(MDA-MB231)。另外,以 P4A8處理細胞誘導或穩定Fnl4本身。此現象並非由Fnl4 mRNA增加而造成。 實例3 :誘導介白素-8分泌 測試P2D3、P4A8、P3G5及P3D8抗體以評估其活體外誘 導介白素-8(IL-8)分泌之能力。以漸增濃度之MOPC21陰性 對照、hFcTWEAK陽性對照或P2D3、P4A8、P3G5 或 P3D8 抗體處理A375細胞。量測在各濃度下分泌至培養基中之 IL-8的含量。抗體中之每一者誘導IL·8分泌且因此能夠充 當Fnl4促效劑(圖4)。 140330.doc •100· 201008579 實例4 :活髏内治療臌瘤 為測試抗Fnl4抗體活體内治療癌症之能力,將WiDr結 腸癌細胞異種移植物植入小鼠中。在腫瘤植入之後,以抗 Fnl4 抗體(P2D3、P4A8、P3G5 或 P3D8)、陰性對照(PBS、 MOPC21或P1.17)或陽性對照(Fc-TWEAK)治療動物。所用 劑量、投藥途徑及投藥頻率展示於圖5中。由腫瘤體積 (mm3,上部畫面)或腫瘤重量(公克,下部晝面)量測腫瘤 生長。Fnl4抗體於活體内有效治療腫瘤(圖5)。 ® 亦測試抗Fn 14抗體及對照之毒性。如動物重量(圖6)所 量測,甚至在重複給藥之後對該等治療中之任一者亦未觀 測到明顯毒性。 實例5 :治療大臚瘤 在大腫瘤中測試抗Fnl4抗體活體内治療癌症之能力。將 Widr結腸癌細胞異種移植物植入小鼠中。在腫瘤植入之 後,以抗Fnl4抗體(P4A8 ; 100 pg)或陰性對照(pBS或 _ MOPC21)治療動物。每週一次投與抗體且在整個研究中持 續,或在第16天開始給藥且較早(第37天)結束,或較晚(第 37天)開始給藥且貫穿至研究結束。由腫瘤體積來量 測腫瘤生長。甚至當治療較晚開始或較早終止時,抗以“ 抗體亦於活體内有效治療腫瘤(圖7)。 實例6 :劑量反應 檢查WiDr細胞異種移植物之劑量反應。測試各種劑量之 P4A8抗Fnl4抗體及PBS陰性對照(隨時間(天數)之腫瘤體積 (mm3))。功效隨抗體之劑量增加而增加(圖8)。 140330.doc • 101 · 201008579 亦以測試/對照之百分比(% Τ/C)來分析劑量反應。如圖9 所示’功效隨抗體之劑量增加而增加。亦測試各種劑量之 抗體及對照的毒性。如體重變化百分比(圖1 〇)所量測,甚 至在重複給藥之後對該等治療中之任一者亦未觀測到明顯 毒性。 實例7:活«内治療乳癌細胞贐瘌 為測试Ρη144/ι>體活體内治療癌症之能力,將MDA· ΜΒ23 1乳癌細胞異種移植物植入小鼠中。在腫瘤植入之 後,以抗Fnl4抗體(P2D3或Ρ4Α8)或陰性對照(PBS或 MOPC21)治療動物。所用劑量、投藥途徑及投藥頻率展示 於圖11中。由腫瘤體積(mm3)來量測腫瘤生長^ Fn 14抗體 於活體内有效治療腫瘤(圖11)。 實例8 :抗艟交又反應性 抗Fnl4抗體P4A8及P2D3與來自多個物種之Fnl4交叉反 應。如圖12所示,如流式細胞儀所測定(平均螢光值, MFI) ’兩種抗體均與人類、獼猴及鼠類Fnl4反應。EC50值 亦提供於圖中。P4A8亦與大鼠Fnl4交又反應。選殖怪河 猴F η 14且測定其與人類F η 14 —致。因此,抗體與悝河猴 Fnl4之結合特徵與抗體與人類Fnl4之結合特徵相同。 對編碼人類(NM_016639)、獼猴(參見實例1)、小鼠 (NM_013749)、大鼠(NM_181086)及爪蟾(NM 001090171) Fnl4之全長Fnl4 cDNA工程化以移除外來5,及3,UTR且添 加一致最優化Kozak序列,接著次選殖至pNEOOl(源自 Invitrogen表現載體pCEP4之完全序列經證實之基於pUC之 140330.doc -102- 201008579
EBV表現載體)中,其中異源基因表現係由CMV-ΙΕ啟動子 及SV40聚腺苷酸化信號控制,但缺乏EBNA基因及潮黴素 抗性基因。將Fnl4表現載體(人類:pEAG2121,獼猴: pEAG2120,小鼠:pEAG2126,大鼠:pEAG2275 且爪 蟾:PEAG2237)與帶有EGFP報導體之EBV表現載體以1:1 莫耳比共同轉染至293E細胞中。轉染後2天將細胞用於 FACS中,以所關注之單株抗體染色(以稀釋滴定)且在綠色 EGFP陽性活細胞上設門(gating)。此類型之檢定取決於 Fnl4之細胞表面密度且因此反映給定轉染之表觀EC5〇值: 此直接結合檢定並不測定真實Kd值。 以下展示人類、獼猴、大鼠及小鼠之全長Fnl4推導蛋白 質序列之比對:
人類 獼播 小鼠 大鼠 一致序列 人類 mm 小鼠 大鼠 一致序列 1 MARGslRRLl MARGslRRLl MAsawpRsLp MApGwpRpLp MARG--RRL-
51 DCASCrARPH DCASCrARPH DCASCpARPH DCASCpARPH DCASC-ARPH rLLVLGlwLa rLLVLGlwLa qiLVLGfgLv qLLVLGfgLv -LLVLG — L-
SDFCLGCAAA SDFCLGCsAA SDFCLGCAAA SDFCLGCAAA SDFCLGCAAA
LLRsVAGEQA LLRsVAGEQA LmRaciAGEQA LiRatAGEQA LLR-VAGEQA
PPApFRLLWP PPApFRLLWP PPAhFRLLWP PPAhFRmLWP PPA-FRLLWP
PGTAPCSrGS PGTAPCShGS PGTsPCSSGS PGnAPCSSGS PGTAPCSSGS ILGGALSLTf ILGGALSLTf ILGGALSLvl ILGGALSLal ILGGALSLT-
50 SWSADLDKCM SWSADLDKCM SWSADLDKCM SWSADLDKCM SWSADLDKCM
100 VLgLISGFLV VLgLlSGFLV VLaLvSsFLV VLaLvSGFLV VL-L-SGFLV 人類 獼猴 小鼠 大鼠 一致序列 與huFnl4之一致性 100.0 (SEQ ID NO:l) 98.5 (SEQ ID NO:10) 81.5 (SEQ ID NO:28) 83.1 (SEQ ID NO:29) {SEQ ID NO:30)
101 WRRCRRREKF WRRCRRREKF WRRCRRREKF WRRCRRREKF WRRCRRREKF
TTPIEETGGE TTPIEETGGE TTPIEETGGE TTPIEETGGE TTPIEETGGE 130 GCPaVALIQ* GCPaVALIQ* GCPgVALIQ* GCPgVALIQ* GCP-VALIQ* 與一致序列一致之位置為大寫字母,而與一致序列不同 之位置為小寫字母。預測信號序列自殘基1延伸至殘基27 且預測跨膜域自殘基79延伸至殘基101。上文指示與人類 -103- 140330.doc 201008579 F η 14之總體一致性百分比。 圖 16展示抗 huFnl4 mAb P2D3、P3D8、P3G5及 P4A8之 組與人類及獼猴表面Fnl 4之直接結合FACS檢定:所有皆 以類似EC50值結合。圖17展示抗huFnl4 mAb P2D3、 P3D8、P3G5及P4A8之組與鼠類表面Fnl4之直接結合FACS 檢定:所有皆以與靈長類動物Fnl4結合之表觀EC5Q值類似 之類似表觀EC5〇值結合。人類化P4A8(Hl/Ll)(huP4A8)(下 述)以與真實鼠類P4A8 mAb之親和力等價之親和力與人類 Fnl4結合。圖18A及圖18B分別展示具有不同重鏈效應功 能之huP4A8變體對人類或大鼠Fnl4之直接結合FACS數 據:對huP4A8與人類及大鼠Fnl4之結合觀測到類似表觀 EC50。 圖19A展示儘管P4A8與人類、獼猴及小鼠表面Fnl4結合 良好,但可偵測到未與爪蟾Fnl4結合。圖19B及圖19C展 示Fc-huTWEAK融合蛋白與muFc-muTWEAK融合蛋白均與 人類、獼猴、小鼠及爪蟾表面Fnl4結合良好,指示P4A8 不能與爪蟾Fnl 4結合並非由於其Fnl4之表面呈現的缺陷。 以下展示在人類(上部)與爪蟾(下部)Fnl4之間的間隙比 對,其共有48.3%之相似性且僅共有40.8%之一致性: 1 MARGSLRRLLRLLVLGLWLALLRSVAGEQAPGTAPCSRGSSWSADLDKCM 50
.Mil I Μ -I Μ = 丨丨.:丨 II III 1 ,..MTPRNLLRTFV.PLLLLVLSSAASQ.....GECPEGRAYSQDLGKCM 41 51 DCASCRARPHSDFCLGCAAAPPAP.FRLLWPILGGAIjSLTFVLGLLSGFL 99 :I· 1: 1111 I · I I : I I I ·:::丨 1 · 42 ECSVCKNSEKSDFCQNCPSKTEQPDFPWIWVIGFSAGGVFLIIVILSLTV 91 100 VWRRCRRREKFTTPIEETGGEGCPAVALIQ* 130 (SEQ ID NO:l) III·· II MMIIII I- II i 92 YLTHCRRKSKFTTPIEETGSHSAEAL.LIH* 121 (SEQ ID NO :31) 140330.doc •104· 201008579 此等結果表明P4A8結合位點為類似的,但與Fnl4上之 TWEAK結合位點微有不同。 亦已顯示P4A8不與其他TNF家族受體結合,且就此而 言,其對F η 14具選擇性。 實例9 :使Ρ4Α8抗原決定基定位於Fnl4殘基W42(P4A8對 W42A突變之敏感性) 以編碼具有W42A突變之野生型人類、獼猴、大鼠、小 鼠及人類Fnl4之核酸轉染293E細胞。由FACS測定P4A8與 Φ 此等細胞之結合。結果展示於圖13中。如直方圖所指示, P4A8與具有W42A突變之人類Fnl4蛋白的結合相對於野生 型人類Fnl4蛋白顯著較差。類似地,P3G5抗體與具有 W42A突變之人類Fnl4蛋白之結合亦顯著較差(未圖示)。 圖20為Fnl4胞外域之間隙比對(人類Fnl4中之殘基E28至 P80)。使用Stratagene之QuikChange II套組遵循製造商之 推薦方案,藉由定點誘變在全長人類、獼猴及小鼠Fnl4 cDNA之EBV表現載體中構築W42A突變體。藉由對所引入 ❹
之限制性位點變化進行篩選來鑑別突變質體。藉由W42A 突變體表現載體中之DNA定序來證實所得質體中之Fnl4 : cDNA序列:人類Fnl4 W42A指定 pEAG2251,鼠類 W42A 指定pEAG2250,且獼猴W42A指定PEAG2249。在293E細 胞中瞬間過度表現人類、獼猴及鼠類Fnl4中之野生型 huFnl4及W42A突變體且如先前所述在FACS檢定中檢定 Fc-TWEAK或P4A8 mAb之結合性。圖21八展示?〇丁^\^八1(: 與所有W42A突變體結合,而圖21B展示P4A8結合性在所 140330.doc -105- 201008579 檢查之所有物種中因突變至W42A而消除。吾人對huFnl4 表現質體PEAG2121進行定點誘變以產生其他點突變體以 供其他抗原決定基定位研究。圖22展示當殘基W42突變至 大疏水性殘基W42F或W42Y(分別pYL373及pYL374)時, P4A8結合性恢復正常。 一組huFnl4點突變體係藉由在pEAG2121模板(huFnl4之 EBV表現載體)上進行定點誘變將爪蟾殘基在許多位置處 取代至人類序列中而製得:pYL391 T33Q、pYL392 S40R、pYL393 L65Q、pYL396 M50A、pYL397 R56K、 pYL398 R56P(比爪蟾變化更強之取代)及pYL399 H60K。 直接結合FACS檢定顯示整個突變體組結合Fc-TWEAK(圖 23A)。在直接結合FACS檢定中對人類、獼猴、大鼠及小 鼠Fnl4且對整個huFnl4突變體組(W42A、T33Q、S40R、 L65Q、M50A、R56K、R56P 及 H60K)測試 Nakayama 等人 (2003,J. Immunol. 170:341)所述之促效劑抗 Fnl4 mAb(P4A8、P3G5、P2D3 及 P3D8)及 ITEM-1、ITEM-2、 ITEM-3及ITEM-4促效劑mAb。P4A8與突變體組之結合展 示於圖23B中,P3G5結果展示於圖23C中,P2D3結果展示 於圖23D中,ITEM-1結果展示於圖23E中,ITEM-4結果展 示於圖23F,ITEM-2結果展示於圖23G中,且ITEM-3結果 展示於圖23H中。該等結果指示P3G5及P4A8對Fnl4 W42A 取代敏感’但P2D3(及P3D8)及四種ITEM抗Fnl4 mAb對 W42A變化不敏感。所測試之所有抗體皆與人類、獼猴、 大鼠及小鼠Fnl4結合。 140330.doc 201008579 實例ι〇:免疫組織化學 測試抗Fnl4抗體P4A8作為免疫組織化學(IHC)試劑以偵 測石堪組織切片之切片中之Fn 14的用途。獲得正常胰腺組 織及胰腺腫瘤組織之石蠟切片。P4A8能夠將石蠟切片中之 - Fnl4染色且結果證實與正常組織相比,Fnl4在胰腺腫瘤中 : 過度表現。 . P4A8亦用於量測正常組織中之Fnl4含量。將人類組織 晶片(冷凍及石蠟)以P4A8染色。結果顯示上皮細胞、内皮 〇 及肌肉之主要輕度染色,但偶爾最低或中度染色,及細胞 質分布(不突出膜)。 實例11 :抗Fnl4抗髏之序列
P4A8抗體之VH域的胺基酸序列為: v QVOLQOSGPEVVRPGVSVKISCKGSGYTFTDYGMHWVKO SHAKSLEWIGVISTYNGYTNYNOKFKGKATMTVDKSSSTA YMELARLTSEDSAIYYCARAYYGNLYYAMDYWGOGTSVT VSS(SEQ ID NO: 2)。編碼P4A8之VH域的 DNA序列(SEQ Ο ID NO: 17)描繪於圖14Α中。 ' P3G5抗體之VH域的胺基酸序列為:
• OVOLOOSGPEVVRPGVSVKISCKGSGYTFTDYGIHWVKOS HAKSLEWIGVISTYNGYTNYNOKFKGKATMTVDKSSSTAY MELARLTSEDSAIYYCARAYYGNLYYAMDYWGOGTSVTV SS(SEQ ID NO: 3)。編碼 P3G5 之 VH 域的 DNA 序列(SEQ ID NO: 18)描繪於圖14B中。 P2D3抗體之VH域的胺基酸序列為: 140330.doc -107- 201008579 OVSLKESGPGILOPSOTLSLTCSFSGFSLSTSGMGVSWIRQP SGKGLEWLAHIYWDDDKRYNPSLKSRLTISKDTSRNQVFL KITSVDTADTATYYCARRGPDYYGYYPMDYWGOGTSVTV SS(SEQ ID NO: 4)。編碼 P2D3 之 VH 域的 DNA 序歹丨J(SEQ ID NO: 19)描繪於圖14C中。 P4A8抗體之VL域的胺基酸序列為: DIVLTQSPASLAVSLGORATISCRASKSVSTSSYSYMHWYO QKPGQPPKLLIKYASNLESGVPARFSGSGSGTDFILNIHPVE EEDAATYYCOHSRELPFTFGSGTKLEIK(SEO ID NO: 5)。 編碼P4A8之VL域的DNA序列(SEQ ID NO: 20)描繪於圖 14D 中。 P3G5抗體之VL域的胺基酸序列為: DIVLTOSPASLAVSLGORATISCRANKSVSTSSYSYMHWYO OKPGOPPKLLIKYASNLESGVPARFSGSGSGTDFILNIHPVE EEDAATYYCQHSRELPFTFGSGTKLEIK(SEO ID NO: 6)。 編碼P3G5之VL域的DNA序列(SEQ ID NO: 21)描繪於圖 14E 中。 P2D3抗體之VL域的胺基酸序列為: DIVLTOSPASLAVSLGORATISCRASKSVSTSSYSYMHWYO QKPGQPPKLLIKYTSNLESGVPARFSGSGSGTDFILNIHPVE EEDAATYYCOHSRELPWTFGGGTKLEIK(SEQ ID NO: 7)。 編碼P2D3之VL域的DNA序列(SEQ ID NO: 22)描繪於圖14F 中〇 上文所描繪之可變域序列中之每一者的CDR(CDR- 140330.doc 108· 201008579 H1/CDR-H2/CDR-H3 及 CDR-L1/CDR-L2/CDR-L3)加下劃 線。 P3D8具有與P2D3之VH及VL域一致的VH及VL域。 抗Fnl4抗體鼠類重鏈亞群11(A)可變域之比對如下: P4A8 1 OVOLOOSGPEWRPGVSVKISCKGSGYTFTDYGMHWVKOSHAKSLEWIGV 50
Mill mill MIIMMM NM ΜΜΜΙΜΜΜΜΙΙΜΜΜΙ P3G5 1 OVOLQQSGPEWRPGVSVKISCKGSGYTFTDYGIHWVKOSHAKSLEWIGV 50 P4A8 51 ISTYNGYTNYNOKFKGKATMTVDKSSSTAYMELARLTSEDSAIYYCARAY 100 ❹ P3G5 51 ISTYNGYTNYNQKFKGKATMTVDKSSSTAYMELARLTSEDSAIYYCARAY 100 P4A8 101 YQNLYYAMDYWGQGTSVTV5S 121 (SEQ ID NO :2) IIIMIIIIIIimilllll P3G5 101 YGNLYYAMDYWGOGTSVTVSS 121 (SEQ ID NO: 3) P4A8及P3G5中之每一者之重鏈的CDR-H1(左)、CDR-H2(中)及CDR-H3(右)加下劃線。 抗Fnl4抗體鼠類重鏈P3G5(IIA)與P2D3(IB)之比對如 下: P3G5 1 QVQLQQSGPEWRPGVSVKISCKGSGYTF . .TDYGIHWVKQSHAKSLEWI 48 ||:..丨:丨::| I ill: P2D3 1 QVSLKESGPGILQPSQTLSLTCSFSGFSLSTSGMGVSWIROPSGKGLEWL 50 P3G5 4 9 GVISTYNGYTNYNOKFKGKATMTVDKSSSTAYMELARLTSEDSAIYYCAR 98 I :. II | : |.. | i . ::.: . M mil P2D3 51 AHI. YWDDDKRYNPSLKSRLTISKDTSRNOVFLKITSVDTADTATYYCAR 99 P3G5 99 A. . . YYGNLYYAMDYWGQGTSVTVSS 121 (SEQ ID NO: 3)
II) II MIIMIMMMI P2D3 100 RGPDYYG. . YYPMDYWGOGTSVTVSS 123 (SEQ ID NO: 4) P4A8及P2D3中之每一者之重鏈的CDR-H1(左)、CDR· -109· 140330.doc 201008579 H2(中)及CDR-H3(右)加下劃線。 抗Fnl4抗體鼠類κ亞群III輕鏈可變域之比對如下: P4A8 1 DIVLTOSPASLAVSLGORATISCRASKSVSTSSYSYMHWYOOKPGOPPKL 50
IIIIIIIIIIIIIIIMMIIIIIMIIIIIIIIIIIIIIIIIMIMI P3G5 1 DIVLTOSPASLAVSLGORATISCRANKSVSTSSYSYMHWYOOKPGOPPKL 50
MMIIIIIIIIIIMIIMMIIMIIIMMIIIIIIMMMIIII P2D3 1 DIVLTOSPASLAVSLGORATISCRASKSVSTSSYSYMHWYOOKPGOPPKL 50 P4A8 51 LXKYASNLESGVPARFSGSGSGTDFILNIHPVEEEDAATYYCOHSRELPF 100 ΜΙΜΜΜΙΙΜΜΜ mill MMMMMI III ΙΜΜΜΜΜΝ P3G5 51 LIKYASNLESGVPARFSGSGSGTDFILNIHPVEEEDAATYYCOHSRELPF 100 MM IMIIIIIIIIIIIIIIIIMMIIIIMIIIIIIIIIIIMM· P2D3 51 LIKYTSNLESGVPARFSGSGSGTDFILNIHPVEEEDAATYYCOHSRELPW 100 P4A8 101 TFGSGTKLEIK 111 (SEQ ID NO:5)
IIIIMIIIII P3G5 101 TFGSGTKLEIK 111 (SEQ ID NO:6) III Mlllll P2D3 101 TFGGGTKLEIK 111 (SEQ ID NO:7) P4A8、P3G5及P2D3中之每一者之輕鏈的CDR-L1 (左)、 CDR-L2(中)及CDR-L3(右)加下劃線。 實例12 :嵌合抗體 編碼重鏈及輕鏈之鼠類P4 A8可變區的cDNA用於構築表 現鼠類-人類嵌合體(chP4A8)之載體,其中muP4A8可變區 與人類IgGl及κ恆定區連接。以下展示嵌合P4A8-huIgGl重 鏈cDNA插入物之序列(自信號序列之引發子ATG至終止子 TGA): -110- 140330.doc 201008579
1 ATGGGATGCA GCTGGGTCAT GCTCTTTCTG GTAGCAACAG CTACAGGTGT 51 GCACTCCCAG GTCCAGCTGC AGCAGTCTGG GCCTGAGGTG GTGAGGCCTG 101 GGGTCTCAGT GAAGATTTCC TGCAAGGGTT CCGGCTACAC ATTCACTGAT 151 TATGGTATGC ACTGGGTGAA GCAGAGTCAT GCAAAGAGTC TAGAGTGGAT 201 TGGAGTTATT AGTACTTACA ATGGTTATAC AAACTACAAC CAGAAGTTTA 251 AGGGCAAGGC CACAATGACT GTAGACAAAT CCTCCAGCAC AGCCTATATG 301 GAACTTGCCA GATTGACATC TGAGGATTCT GCCATCTATT ACTGTGCAAG 351 AGCCTACTAT GGTAACCTTT ACTATGCTAT GGACTACTGG GGTCAAGGAA 401 CCTCAGTCAC CGTCTCCTCA GCCTCAACGA AGGGCCCATC GGTCTTCCCC 451 CTGGCACCCT CCTCCAAGAG CACCTCTGGG GGCACAGCGG CCCTGGGCTG 501 CCTGGTCAAG GACTACTTCC CCGAACCGGT GACGGTGTCG TGGAACTCAG 551 GCGCCCTGAC CAGCGGCGTG CACACCTTCC CGGCTGTCCT ACAGTCCTCA 601 GGACTCTACT CCCTCAGCAG CGTGGTGACC GTGCCCTCCA GCAGCTTGGG 651 CACCCAGACC TACATCTGCA ACGTGAATCA CAAGCCCAGC AACACCAAGG ® 701 TGGACAAGAA AGTTGAGCCC AAATCTTGTG ACAAGACTCA CACATGCCCA 751 CCGTGCCCAG CACCTGAACT CCTGGGGGGA CCGTCAGTCT TCCTCTTCCC 801 CCCAAAACCC AAGGACACCC TCATGATCTC CCGGACCCCT GAGGTCACAT 851 GCGTGGTGGT GGACGTGAGC CACGAAGACC CTGAGGTCAA GTTCAACTGG 901 TACGTGGACG GCGTGGAGGT GCATAATGCC AAGACAAAGC CGCGGGAGGA 951 GCAGTACAAC AGCACGTACC GTGTGGTCAG CGTCCTCACC GTCCTGCACC 1001 AGGACTGGCT GAATGGCAAG GAGTACAAGT GCAAGGTCTC CAACAAAGCC 140330.doc -Ill - 201008579 1051 CTCCCAGCCC CCATCGAGAA AACCATCTCC AAAGCCAAAG GGCAGCCCCG 1101 AGAACCACAG GTGTACACCC TGCCCCCATC CCGGGATGAG CTGACCAAGA 1151 ACCAGGTCAG CCTGACCTGC CTGGTCAAAG GCTTCTATCC CAGCGACATC 1201 GCCGTGGAGT GGGAGAGCAA TGGGCAGCCG GAGAACAACT ACAAGACCAC 1251 GCCTCCCGTG TTGGACTCCG ACGGCTCCTT CTTCCTCTAC AGCAAGCTCA 1301 CCGTGGACAA GAGCAGGTGG CAGCAGGGGA ACGTCTTCTC ATGCTCCGTG 1351 ATGCATGAGG CTCTGCACAA CCACTACACG CAGAAGAGCC TCTCCCTGTC 1401 TCCCGGTTGA (SEQ ID NO :32) ❹ 以下展示推導成熟chP4A8重鏈蛋白質序列: 1 QVQLQQSGPE WRPGVSVKI SCKGSGYTFT DYGMHWVKQS HAKSLEWIGV 51 ISTYNGYTNY NQKFKGKATM TVDKSSSTAY MELARLTSED SAIYYCARAY 101 YGNLYYAMDY WGQGTSVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV 151 KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSW TVPSSSLGTQ 201 TYICNWHKP SNTKVDKKVE PKSCDKTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK 251 PKDTLMISRT PEVTCVWDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY ❹ 301 NSTYRWSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP 351 QVYTLPPSRD ELTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP 401 VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG (SEQ ID NO:33) 以下展示嵌合P4A8輕鏈cDNA插入物之序列(自信號序列 之引發子ATG至終止子TAG): -112- 140330.doc 201008579 1 ATGGAGACAG ACACACTCCT GCTATGGGTA CTGCTGCTCT GGGTTCCAGG 51 TTCCACTGGT GACATTGTGC TGACACAGTC TCCTGCTTCC TTAGCTGTAT 101 CTCTGGGGCA GAGGGCCACC ATCTCATGCA GGGCCAGCAA AAGTGTCAGT 151 ACATCTAGCT ATAGTTATAT GCACTGGTAC CAACAGAAAC CAGGACAGCC 201 ACCCAAACTC CTCATCAAGT ATGCATCCAA CCTAGAATCT GGGGTCCCTG 251 CCAGGTTCAG TGGCAGTGGG TCTGGGACAG ACTTCATCCT CAACATCCAT 301 CCAGTGGAGG AGGAGGATGC TGCAACCTAT TACTGTCAGC ACAGTAGGGA 351 GCTTCCATTC ACGTTCGGCT CGGGGACAAA GTTGGAAATA AAACGTACGG 401 TGGCTGCACC ATCTGTCTTC ATCTTCCCGC CATCTGATGA GCAGTTGAAA 451 TCTGGAACTG CCTCTGTTGT GTGCCTGCTG AATAACTTCT ATCCCAGAGA 501 GGCCAAAGTA CAGTGGAAGG TGGATAACGC CCTCCAATCG GGTAACTCCC 551 AGGAGAGTGT CACAGAGCAG GACAGCAAGG ACAGCACCTA CAGCCTCAGC 601 AGCACCCTGA CGCTGAGCAA AGCAGACTAC GAGAAACACA AAGTCTACGC 651 CTGCGAAGTC ACCCATCAGG GCCTGAGCTC GCCCGTCACA AAGAGCTTCA 701 ACAGGGGAGA GTGTTAG (SEQ ID NO :34) 以下展示推導成熟chP4A8-人類κ輕鏈蛋白質序列: 1 DIVLTQSPAS LAVSLGQRAT ISCRASKSVS TSSYSYMHWY QQKPGQPPKL 51 LIKYASNLES GVPARFSGSG SGTDFILNIH PVEEEDAATY YCQHSRELPF 101 TFGSGTKLEI KRTVAAPSVF IFPPSDEQLK SGTASWCLL NNFYPREAKV 151 QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS STLTLSKADY EKHKVYACEV 201 THQGLSSPVT KSFNRGEC (SEQ ID NO :35) -113 - 140330.doc 201008579 將表現載體(chP4A8重鏈載體pXW362及chP4A8輕鏈載 體pXW364)共同轉染至293-EBNA細胞中且針對抗體分泌 及特異性來測試經轉染細胞(經空載體及分子上選殖之不 相關mAb載體轉染之細胞充當對照)。改良性培養基之西 方墨點分析(以抗人類重鏈及輕鏈抗體顯色)指示經chP4A8 轉染之細胞合成且有效分泌重鏈及輕鏈。與人類Fnl 4之直 接FACS結合證實chP4A8之特異性。 構築在CHO細胞中穩定表現chP4A8之表現載體。藉由與 編碼輕鍵及重鍵之載體共同轉染得到分泌chP4A8-huIgGl κ mAb之穩定CHO細胞株。據稀釋滴定FACS檢定,藉由與 經表面表現之人類Fnl4直接結合,證實chP4A8之結合親和 力與鼠類P4A8 mAb之結合親和力等價。 實例13 :人類化抗艟 以下描繪兩個人類化P4A8(huP4A8)重鏈(生殖系huVHl-18構架/一致HUMVH1 FR4/P4A8H CDR)之實例(各自展示 胺基酸及DNA序列;CDR加下劃線且回復突變以粗體展 示): 型式H1 QVQLVOSGAEVKKPGASVKVSCKGSGYTFTDYGMHWVROAPGQ GLEWMGVISTYNGYTNYNOKFKGRVTMTVDKSTSTAYMELRSLRSD DTAVYYCARAYYGNLYYAMDYWGOGTLVTVSS (SEQIDNO:ll)
CAGGTCCAGCTGGTGCAGTCTGGGGCTGAGGTGAAGAAGCCTG
GGGCCTCAGTGAAGGTTTCCTGCAAGGGTTCCGGCTACACATTCAC
TGATTATGGCATGCACTGGGTGCGGCAGGCCCCTGGACAAGGGCT 140330.doc •114- 201008579
AGAGTGGATGGGAGTTATTAGTACTTACAATGGTTATACAAACTA
CAACCAGAAGTTTAAGGGCAGAGTCACAATGACTGTAGACAAATC
CACGAGCACAGCCTATATGGAACTTCGGAGCTTGAGATCTGACGA
TACGGCCGTGTATTACTGTGCAAGAGCCTACTATGGCAACCTTTAC
TATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCCTGGTCACCGTCTCCT CA(SEQIDNO:23) 型式H2
OVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKGSGYTFTDYGMHWVROAPGO β GLEWIGVISTYNGYTNYNQKFKGRAlMrVDKSTSTAYMELRSLRSD DTAVYYCARAYYGNLYYAMDYWGOGTLVTVSS (SEQIDNO:12) CAGGTCCAGCTGGTGCAGTCTGGGGCTGAGGTGAAGAAGCCTG GGGCCTCAGTGAAGGTTTCCTGCAAGGGTTCCGGCTACACATTCAC TGATTATGGCATGCACTGGGTGCGGCAGGGCCCTGGACAAGGGCT CGAGTGGATCGGAGTTATTAGTACTTACAATGGTTATACAAACTAC AACCAGAAGTTTAAGGGAAGAGCCACAATGACTGTAGACAAATCC ACGAGCACAGCCTATATGGAACTTCGGAGCTTGAGATCTGACGAT 鲁 ACGGCCGTGTATTACTGTGCAAGAGCCTACTATGGCAACCTTTACT ATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCCTGGTCACCGTCTCCTC : A (SEQ ID NO:24) 以下描繪三個人類化P4A8(huP4A8)輕鏈(K037659構架/ P4A8L CDR)之實例(各自展示胺基酸及DNA序列;CDR加 下劃線且回復突變以粗體展示): 型式L1
DIVLTOSPASLAVSLGORATISCRASKSVSTSSYSYMHWYOOKPGO 140330.doc -115- 201008579 PPKLLIKYASNLESGVPARFSGSGSGTDFSLNIHPMEEDDTAMYFCOH SRELPFTFGGGTKLEIK (SEQ ID NO:13) GACATTGTGCTGACACAGTCTCCTGCTTCCCTGGCTGTATCTCTG GGGCAGAGGGCCACCATCTCATGCAGGGCCAGCAAAAGTGTCAGT ACATCTAGCTATAGTTATATGCACTGGTACCAACAGAAACCAGGA CAGCCACCCAAACTCCTCATCAAATATGCATCCAACCTAGAATCTG GGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCTC CCTCAACATCCATCCCATGGAGGAGGACGATACCGCAATGTATTTC TGTCAGCACAGTAGGGAGCTTCCATTCACGTTCGGCGGAGGGACA AAGTTGGAAATAAAA (SEQ ID NO:25) 型式L2 DIVLTOSPASLAVSLGORATISCRASKSVSTSSYSYMHWYOOKPGO PPKLLIKYASNLESGVPARFSGSGSGTDFILNIHPMEEDDTAMYFCQH SRELPFTFGGGTKLEIK (SEQ ID NO: 14) GACATTGTGCTGACACAGTCTCCTGCTTCCCTGGCTGTATCTCTG GGGCAGAGGGCCACCATCTCATGCAGGGCCAGCAAAAGTGTCAGT ACATCTAGCTATAGTTATATGCACTGGTACCAACAGAAACCAGGA CAGCCACCCAAACTCCTCATCAAATATGCATCCAACCTAGAATCTG GGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCA TCCTCAACATCCATCCAATGGAGGAGGACGATACCGCAATGTATTT CTGTCAGCACAGTAGGGAGCTTCCATTCACGTTCGGCGGAGGGAC AAAGTTGGAAATAAAA (SEQ ID NO:26) 型式L3 140330.doc -116- 201008579 DIVLTOSPASLAVSLGORATISCRASKSVSTSSYSYMHWYOOKPGQ PPKLLIKYASNLESGVPARFSGSGSGTDFILNIHPMEEDDTATYYCOHS RELPFTFGGGTKLEIK (SEQIDNO:15) GACATTGTGCTGACACAGTCTCCTGCTTCCCTGGCTGTATCTCTG GGGCAGAGGGCCACCATCTCATGCAGGGCCAGCAAAAGTGTCAGT ACATCTAGCTATAGTTATATGCACTGGTACCAACAGAAACCAGGA CAGCCACCCAAACTCCTCATCAAATATGCATCCAACCTAGAATCTG GGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCA ® TCCTCAACATCCATCCAATGGAGGAGGACGATACCGCAACCTATT ACTGTCAACACAGTAGGGAGCTTCCATTCACGTTCGGCGGAGGGA CAAAGTTGGAAATAAAA (SEQ ID NO:27) 構築HI huP4A8-huIgGl重鏈之穩定CHO表現載體 pYL310。以下展示pYL310 之 HI huP4A8-huIgGl 重鏈 cDNA 插入物之序列(自信號序列之引發子ATG至終止子TGA):
1 ATGGGATGCA GCTGGGTCAT GCTCTTTCTG GTAGCAACAG CTACAGGCGT _ 51 GCACTCCCAG GTCCAGCTGG TGCAGTCTGG GGCTGAGGTG AAGAAGCCTG 馨
101 GGGCCTCAGT GAAGGTTTCC TGCAAGGGTT CCGGCTACAC ATTCACTGAT 151 TATGGCATGC ACTGGGTGCG GCAGGCCCCT GGACAAGGGC TAGAGTGGAT 201 GGGAGTTATT AGTACTTACA ATGGTTATAC AAACTACAAC CAGAAGTTTA 251 AGGGCAGAGT CACAATGACT GTAGACAAAT CCACGAGCAC AGCCTATATG 301 GAACTTCGGA GCTTGAGATC TGACGATACG GCCGTGTATT ACTGTGCAAG 351 AGCCTACTAT GGCAACCTTT ACTATGCTAT GGACTACTGG GGTCAAGGAA 401 CCCTGGTCAC CGTCTCCTCA GCCTCCACCA AGGGCCCATC GGTCTTCCCC 140330.doc -117 - 201008579 451 CTGGCACCCT CCTCCAAGAG CACCTCTGGG GGCACAGCGG CCCTGGGCTG 501 CCTGGTCAAG GACTACTTCC CCGAACCGGT GACGGTGTCG TGGAACTCAG 551 GCGCCCTGAC CAGCGGCGTG CACACCTTCC CGGCTGTCCT ACAGTCCTCA 601 GGACTCTACT CCCTCAGCAG CGTGGTGACC GTGCCCTCCA GCAGCTTGGG 651 CACCCAGACC TACATCTGCA ACGTGAATCA CAAGCCCAGC AACACCAAGG 701 TGGACAAGAA AGTTGAGCCC AAATCTTGTG ACAAGACTCA CACATGCCCA 751 CCGTGCCCAG CACCTGAACT CCTGGGGGGA CCGTCAGTCT TCCTCTTCCC 801 CCCAAAACCC AAGGACACCC TCATGATCTC CCGGACCCCT GAGGTCACAT 851 GCGTGGTGGT GGACGTGAGC CACGAAGACC CTGAGGTCAA GTTCAACTGG 901 TACGTGGACG GCGTGGAGGT GCATAATGCC AAGACAAAGC CGCGGGAGGA 951 GCAGTACAAC AGCACGTACC GTGTGGTCAG CGTCCTCACC GTCCTGCACC 1001 AGGACTGGCT GAATGGCAAG GAGTACAAGT GCAAGGTCTC CAACAAAGCC 1051 CTCCCAGCCC CCATCGAGAA AACCATCTCC AAAGCCAAAG GGCAGCCCCG 1101 AGAACCACAG GTGTACACCC TGCCCCCATC CCGGGATGAG CTGACCAAGA 1151 ACCAGGTCAG CCTGACCTGC CTGGTCAAAG GCTTCTATCC CAGCGACATC 1201 GCCGTGGAGT GGGAGAGCAA TGGGCAGCCG GAGAACAACT ACAAGACCAC 1251 GCCTCCCGTG TTGGACTCCG ACGGCTCCTT CTTCCTCTAC AGCAAGCTCA 1301 CCGTGGACAA GAGCAGGTGG CAGCAGGGGA ACGTCTTCTC ATGCTCCGTG 1351 ATGCATGAGG CTCTGCACAA CCACTACACG CAGAAGAGCC TCTCCCTGTC 1401 TCCCGGTTGA (SEQ ID NO :36) 以下展示由pYL310編碼之推導成熟huP4A8-IgGl HI重 •118·
❹ 140330.doc 201008579 鏈蛋白質序列:
1 QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKGSGYTFT DYGMHWVRQA PGQGLEWMGV 51 ISTYNGYTNY NQKFKGRVTM TVDKSTSTAY MELRSLRSDD TAVYYCARAY 101 YGNLYYAMDY WGQGTLVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV 151 KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSW TVPSSSLGTQ 201 TYICNVNHKP SNTKVDKKVE PKSCDKTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK 251 PKDTLMISRT PEVTCVWDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY ❹ 301 NSTYRWSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP 351 QVYTLPPSRD ELTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP 401 VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG (SEQ ID NO:37) 構築H2 huP4A8-huIgGl重鏈之穩定CHO表現載體 pYL320。以下展示 pYL320 之 H2 huP4A8-huIgGl 重鏈 cDNA 插入物之序列(自信號序列之引發子ATG至終止子TGA):
m 1 ATGGGATGCA GCTGGGTCAT GCTCTTTCTG GTAGCAACAG CTACAGGCGT 51 GCACTCCCAG GTCCAGCTGG TGCAGTCTGG GGCTGAGGTG AAGAAGCCTG 101 GGGCCTCAGT GAAGGTTTCC TGCAAGGGTT CCGGCTACAC ATTCACTGAT 151 TATGGCATGC ACTGGGTGCG GCAGGCCCCT GGACAAGGGC TCGAGTGGAT * 201 CGGAGTTATT AGTACTTACA ATGGTTATAC AAACTACAAC CAGAAGTTTA 251 AGGGAAGAGC CACAATGACT GTAGACAAAT CCACGAGCAC AGCCTATATG 301 GAACTTCGGA GCTTGAGATC TGACGATACG GCCGTGTATT ACTGTGCAAG 351 AGCCTACTAT GGCAACCTTT ACTATGCTAT GGACTACTGG GGTCAAGGAA -119- 140330.doc 201008579 401 CCCTGGTCAC CGTCTCCTCA GCCTCCACCA AGGGCCCATC GGTCTTCCCC 451 CTGGCACCCT CCTCCAAGAG CACCTCTGGG GGCACAGCGG CCCTGGGCTG 501 CCTGGTCAAG GACTACTTCC CCGAACCGGT GACGGTGTCG TGGAACTCAG 551 GCGCCCTGAC C7VGCGGCGTG CACACCTTCC CGGCTGTCCT ACAGTCCTCA 601 GGACTCTACT CCCTCAGCAG CGTGGTGACC GTGCCCTCCA GCAGCTTGGG 651 CACCCAGACC TACATCTGCA ACGTGAATCA CAAGCCCAGC AACACCAAGG 701 TGGACAAGAA AGTTGAGCCC AAATCTTGTG ACAAGACTCA CACATGCCCA 751 CCGTGCCCAG CACCTGAACT CCTGGGGGGA CCGTCAGTCT TCCTCTTCCC 801 CCCAAAACCC AAGGACACCC TCATGATCTC CCGGACCCCT GAGGTCACAT 851 GCGTGGTGGT GGACGTGAGC CACGAAGACC CTGAGGTCAA GTTCAACTGG 901 TACGTGGACG GCGTGGAGGT GCATAATGCC AAGACAAAGC CGCGGGAGGA 951 GCAGTACAAC AGCACGTACC GTGTGGTCAG CGTCCTCACC GTCCTGCACC 1001 AGGACTGGCT GAATGGCAAG GAGTACAAGT GCAAGGTCTC CAACAAAGCC 1051 CTCCCAGCCC CCATCGAGAA AACCATCTCC AAAGCCAAAG GGCAGCCCCG 1101 AGAACCACAG GTGTACACCC TGCCCCCATC CCGGGATGAG CTGACCAAGA 1151 ACCAGGTCAG CCTGACCTGC CTGGTCAAAG GCTTCTATCC CAGCGACATC 1201 GCCGTGGAGT GGGAGAGCAA TGGGCAGCCG GAGAACAACT ACAAGACCAC 1251 GCCTCCCGTG TTGGACTCCG ACGGCTCCTT CTTCCTCTAC AGCAAGCTCA 1301 CCGTGGACAA GAGCAGGTGG CAGCAGGGGA ACGTCTTCTC ATGCTCCGTG 1351 ATGCATGAGG CTCTGCACAA CCACTACACG CAGAAGAGCC TCTCCCTGTC 1401 TCCCGGTTGA (SEQ ID NO:38) -120-
140330.doc 201008579 以下展示由pYL320編碼之推導成熟huP4A8-IgGl H2重 鏈蛋白質序列:
1 QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKGSGYTFT DYGMHWVRQA PGQGLEWIGV 51 ISTYNGYTNY NQKFKGRATM TVDKSTSTAY MELRSLRSDD TAVYYCARAY 101 YGNLYYAMDY WGQGTLVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV 151 KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSW TVPSSSLGTQ 201 TYICNVNHKP SNTKVDKKVE PKSCDKTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK 251 PKDTLMISRT PEVTCVWDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY 301 NSTYRWSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP 351 QVYTLPPSRD ELTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP 401 VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG
(SEQ ID NO:39) 亦構築全長型式L2 huP4A8-K輕鏈之穩定CHO表現載體 pYL317 cDNA。以下展示pYL317之huP4A8 L2 κ輕鏈cDNA 插入物之序列(自信號序列之引發子ATG至終止子TAG):
1 ATGGAGACAG ACACACTCCT GCTATGGGTA CTGCTGCTCT GGGTTCCTGG 51 TTCCACTGGT GACATTGTGC TGACACAGTC TCCTGCTTCC CTGGCTGTAT
101 CTCTGGGGCA GAGGGCCACC ATCTCATGCA GGGCCAGCAA AAGTGTCAGT 151 ACATCTAGCT ATAGTTATAT GCACTGGTAC CAACAGAAAC CAGGACAGCC 201 ACCCAAACTC CTCATCAAAT ATGCATCCAA CCTAGAATCT GGGGTCCCTG 251 CCAGGTTCAG TGGCAGTGGG TCTGGGACAG ACTTCATCCT CAACATCCAT 301 CCAATGGAGG AGGACGATAC CGCAATGTAT TTCTGTCAGC ACAGTAGGGA -121 - 140330.doc 201008579 351 GCTTCCATTC ACGTTCGGCG GAGGGACAAA GTTGGAAATA AAACGTACGG 401 TGGCTGCACC ATCTGTCTTC ATCTTCCCGC CATCTGATGA GCAGTTGAAA 451 TCTGGAACTG CCTCTGTTGT GTGCCTGCTG AATAACTTCT ATCCCAGAGA 501 GGCCAAAGTA CAGTGGAAGG TGGATAACGC CCTCCAATCG GGTAACTCCC 551 AGGAGAGTGT CACAGAGCAG GACAGCAAGG ACAGCACCTA CAGCCTCAGC 601 AGCACCCTGA CGCTGAGCAA AGCAGACTAC GAGAAACACA AAGTCTACGC 651 CTGCGAAGTC ACCCATCAGG GCCTGAGCTC GCCCGTCACA AAGAGCTTCA 701 ACAGGGGAGA GTGTTAG (SEQ 工ϋ NO:40> 以下展示由pYL317編碼之推導成熟huP4A8 L2 κ輕鏈蛋 白質序列: 1 DIVLTQSPAS LAVSLGQRAT ISCRASKSVS TSSYSYMHWY QQKPGQPPKL 51 LIKYASNLES GVPARFSGSG SGTDFILNIH PMEEDDTAMY FCQHSRELPF 101 TFGGGTKLEI KRTVAAPSVF IFPPSDEQLK SGTASWCLL NNFYPREAKV 151 QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS STLTLSKADY EKHKVYACEV 201 THQGLSSPVT KSFNRGEC (SEQ ID NO:41) 亦構築全長型式LI huP4A8-K輕鏈cDNA變體之穩定CHO 表現載體PYL321。以下展示pYL321之huP4A8 L1 κ輕鏈 cDNA插入物之序列(自信號序列之引發子ATG至終止子
TAG) : 1 ATGGAGACAG ACACACTCCT GCTATGGGTA CTGCTGCTCT GGGTTCCTGG 51 TTCCACTGGT GACATTGTGC TGACACAGTC TCCTGCTTCC CTGGCTGTAT
101 CTCTGGGGCA GAGGGCCACC ATCTCATGCA GGGCCAGCAA AAGTGTCAGT 151 ACATCTAGCT ATAGTTATAT GCACTGGTAC CAACAGAAAC CAGGACAGCC • 122- 140330.doc 201008579 201 ACCCAAACTC CTCATCAAAT ATGCATCCAA CCTAGAATCT GGGGTCCCTG 251 CCAGGTTCAG TGGCAGTGGG TCTGGGACAG ACTTCTCCCT CAACATCCAT 301 CCCATGGAGG AGGACGATAC CGCAATGTAT TTCTGTCAGC ACAGTAGGGA 351 GCTTCCATTC ACGTTCGGCG GAGGGACAAA GTTGGAAATA AAACGTACGG 401 TGGCTGCACC ATCTGTCTTC ATCTTCCCGC CATCTGATGA GCAGTTGAAA 451 TCTGGAACTG CCTCTGTTGT GTGCCTGCTG AATAACTTCT ATCCCAGAGA 501 GGCCAAAGTA CAGTGGAAGG TGGATAACGC CCTCCAATCG GGTAACTCCC 551 AGGAGAGTGT CACAGAGCAG GACAGCAAGG ACAGCACCTA CAGCCTCAGC 601 AGCACCCTGA CGCTGAGCAA AGCAGACTAC GAGAAACACA AAGTCTACGC 651 CTGCGAAGTC ACCCATCAGG GCCTGAGCTC GCCCGTCACA AAGAGCTTCA 701 ACAGGGGAGA GTGTTAG | (SEQ ID NO:42) 以下展示由pYL321編碼之推導成熟huP4A8 L1 κ輕鏈蛋 白質序列:
1 DIVLTQSPAS LAVSIjGQRAT ISCRASKSVS TSSYSYMHWY QQKPGQPPKL 51 LIKYASNLES GVPARFSGSG SGTDFSLNIH PMEEDDTAMY FCQHSRELPF 101 TFGGGTKLEI KRTVAAPSVF IFPPSDEQLK SGTASWCLL NWFYPREAKV 151 QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS STLTLSKADY EKHKVYACEV 201 THQGLSSPVT KSFNRGEC (SEQ ID NO:43> 構築全長型式L3 huP4A8-K輕鏈cDNA變體之穩定CHO表 現載體PYL322。以下展示pYL322之huP4A8 L3 κ輕鏈 cDNA插入物之序列(自信號序列之引發子ATG至終止子 TAG): -123· 140330.doc 201008579
1 ATGGAGACAG ACACACTCCT GCTATGGGTA CTGCTGCTCT GGGTTCCTGG 51 TTCCACTGGT GACATTGTGC TGACACAGTC TCCTGCTTCC CTGGCTGTAT 101 CTCTGGGGCA GAGGGCCACC ATCTCATGCA GGGCCAGCAA AAGTGTCAGT 151 ACATCTAGCT ATAGTTATAT GCACTGGTAC CAACAGAAAC CAGGACAGCC 201 ACCCAAACTC CTCATCAAAT ATGCATCCAA CCTAGAATCT GGGGTCCCTG 251 CCAGGTTCAG TGGCAGTGGG TCTGGGACAG ACTTCATCCT CAACATCCAT 301 CCAATGGAGG AGGACGATAC CGCAACCTAT TACTGTCAAC ACAGTAGGGA 351 GCTTCCATTC ACGTTCGGCG GAGGGACAAA GTTGGAAATA AAACGTACGG 401 TGGCTGCACC ATCTGTCTTC ATCTTCCCGC CATCTGATGA GCAGTTGAAA 451 TCTGGAACTG CCTCTGTTGT GTGCCTGCTG AATAACTTCT ATCCCAGAGA 501 GGCCAAAGTA CAGTGGAAGG TGGATAACGC CCTCCAATCG GGTAACTCCC 551 AGGAGAGTGT CACAGAGCAG GACAGCAAGG ACAGCACCTA CAGCCTCAGC 601 AGCACCCTGA CGCTGAGCAA AGCAGACTAC GAGAAACACA AAGTCTACGC 651 CTGCGAAGTC ACCCATCAGG GCCTGAGCTC GCCCGTCACA AAGAGCTTCA 701 ACAGGGGAGA GTGTTAG (SEQ ID NO:44> 以下展示由pYL322編碼之推導成熟huP4A8 L3 κ輕鏈蛋 白質序列:
1 DIVLTQSPAS LAVSLGQRAT ISCRASKSVS TSSYSYMHWY QQKPGQPPKL
51 LIKYASNLES GVPARFSGSG SGTDFILNIH PMEEDDTATY YCQHSRELPF 101 TFGGGTKLEI KRTVAAPSVF IFPPSDEQLK SGTASWCLL· NNFYPREAKV 151 QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS STLTLSKADY EKHKVYACEV 201 THQGLSSPVT KSFNRGEC (SEQ ID NO:45) -124- 140330.doc 201008579 藉由共同轉染重鏈質體與輕鏈質體在293E細胞中瞬間表 現所有六種型式之huP4A8。組裝所有型式之huP4A8且使 其以類似效價分泌(由ELISA定量來自瞬間轉染細胞之於改 良性培養基中之效價且正規化以供結合檢定)。圖24展示 . 如與在293E細胞中瞬間過度表現之表面人類Fnl4直接結合 - 之FACS稀釋滴定所檢定,所有型式之瞬間表現huP4A8皆 具有與chP4A8等價之生物活性。圖25展示如競爭 ELISA(與塗布於96孔盤之孔上的huFnl4-huFc融合蛋白結 Φ 合,由恆定量之經生物素標記鼠類P4A8競爭性地結合)所 檢定,所有六種型式之huP4A8皆保持與chP4A8基本上等 價之Fnl4結合親和力。藉由以pYL310與pYL321共同轉 染,得到分泌huP4A8-huIgGl K(Hl/Ll)mAb之穩定CHO細 胞株。此抗體在重鏈之成熟序列中於Asn301(IgGl之CH2 域中之天然糖基化位點)處具有糖基化。Asn301對應於以 Kabat EU編號機制之Asn297(參見Kabat等人,1991 「Sequences of proteins of immunological interest」NIH公 開案第91-3242號)。
’ 構築含有上述H1/L1組合且具有去糖基化S228P/T299A : huIgG4重鏈(huP4A8-aglyG4P重鏈)的人類化型式之P4A8。 產生IgG4重鏈S228P變化以消除半抗體且產生T299A變化 以消除CH2之N-連接聚糖且藉此削弱效應功能。就抗體依 賴性細胞毒性(ADCC)與補體介導之細胞毒性(CMC)而言, 去糖基化抗體展現降低之效應功能。以下描繪重鏈(SEQ ID NO: 8)之成熟序列,殘基S228P及T299A加下劃線且呈 140330.doc •125- 201008579 粗體(VH域對應於殘基1-121 ; IgG4恆定域對應於殘基122 447):
1 QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKGSGYTFT DYGMHWVRQA PGQGLEWMGV 51 ISTYNGYTNY NQKFKGRVTM TVDKSTSTAY MELRSLRSDD TAVYYCARAY 101 YGNLYYAMDY WGQGTLVTVS SASTKGPSVF PLAPCSRSTS ESTAALGCLV 151 KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSW TVPSSSLGTK 201 TYTCNVDHKP SNTKVDKRVE SKYGPPCPPC PAPEFLGGPS VFLFPPKPKD 251 TLMISRTPEV TCVWDVSQE DPEVQFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQFNSA 301 YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKGLP SSIEKTISKA KGQPREPQVY 351 TLPPSQEEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD 401 SDGSFFLYSR LTVDKSRWQE GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSLG (SEQ ID N〇:8) 此蛋白質係由以下核苷酸序列編碼:
1 51 ATGGGATGCA GCTGGGTCAT GCTCTTTCTG GTAGCAACAG CTACAGGCGT GCACTCCCAG GTCCAGCTGG TGCAGTCTGG GGCTGAGGTG AAGAAGCCTG 101 GGGCCTCAGT GAAGGTTTCC TGCAAGGGTT CCGGCTACAC ATTCACTGAT 151 TATGGCATGC ACTGGGTGCG GCAGGCCCCT GGACAAGGGC TAGAGTGGAT 201 GGGAGTTATT AGTACTTACA ATGGTTATAC AAACTACAAC CAGAAGTTTA 251 AGGGCAGAGT CACAATGACT GTAGACAAAT CCACGAGCAC AGCCTATATG 301 GAACTTCGGA GCTTGAGATC TGACGATACG GCCGTGTATT ACTGTGCAAG 351 AGCCTACTAT GGCAACCTTT ACTATGCTAT GGACTACTGG GGTCAAGGAA 401 CCCTGGTCAC CGTCTCCTCA GCCTCCACCA AGGGCCCATC CGTCTTCCCC -126- 140330.doc 201008579
451 CTGGCGCCCT GCTCCAGATC TACCTCCGAG AGCACAGCCG CCCTGGGCTG 501 CCTGGTCAAG GACTACTTCC CCGAACCGGT GACGGTGTCG TGGAACTCAG 551 GCGCCCTGAC CAGCGGCGTG CACACCTTCC CGGCTGTCCT ACAGTCCTCA 601 GGACTCTACT CCCTCAGCAG CGTGGTGACC GTGCCCTCCA GCAGCTTGGG 651 CACGAAGACC TACACCTGCA ACGTAGATCA CAAGCCCAGC AACACCAAGG 701 TGGACAAGAG AGTTGAGTCC AAATATGGTC CCCCATGCCC ACCGTGCCCA 751 GCACCTGAGT TCCTGGGGGG ACCATCAGTC TTCCTGTTCC CCCCAAAACC 801 CAAGGACACT CTCATGATCT CCCGGACCCC TGAGGTCACG TGCGTGGTGG 851 TGGACGTGAG CCAGGAAGAC CCCGAGGTCC AGTTCAACTG GTACGTGGAT 901 GGCGTGGAGG TGCATAATGC CAAGACAAAG CCGCGGGAGG AGCAGTTCAA 951 CAGCGCGTAC CGTGTGGTCA GCGTCCTCAC CGTCCTGCAC CAGGACTGGC 1001 TGAACGGCAA GGAGTACAAG TGCAAGGTCT CCAACAAAGG CCTCCCGTCC 1051 TCCATCGAGA AAACCATCTC CAAAGCCAAA GGGCAGCCCC GAGAGCCACA 1101 AGTGTACACC CTGCCCCCAT CCCAGGAGGA GATGACCAAG AACCAGGTCA 1151 GCCTGACCTG CCTGGTCAAA GGCTTCTACC CCAGCGACAT CGCCGTGGAG 1201 TGGGAGAGCA ATGGGCAGCC GGAGAACAAC TACAAGACCA CGCCTCCCGT 1251 CCTCGATTCC GACGGCTCCT TCTTCCTCTA CAGCAGGCTA ACCGTGGACA 1301 AGAGCAGGTG GCAGGAGGGG AATGTCTTCT CATGCTCCGT GATGCATGAG 1351 GCTCTGCACA ACCACTACAC ACAGAAGAGC CTCTCCCTGT CTCTGGGTTG 1401 A (SEQ ID NO:46) 抗體之huP4A8 κ輕鏈(SEQ ID NO: 9)之成熟序列如下 -127· 140330.doc 201008579 (VL域對應於殘基1-111): 1 DIVLTQSPAS LAVSLGQRAT ISCRASKSVS TSSYSYMHWY QQKPGQPPKL 51 LIKYASNLES GVPARFSGSG SGTDFSLNIH PMEEDDTAMY FCQHSRELPF 101 TFGGGTKLEI KRTVAAPSVF IFPPSDEQLK SGTASVVCLL NNFYPREAKV 151 QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS STLTLSKADY EKHKVYACEV 201 THQGLSSPVT KSFNRGEC (SEQ ID NO:9) 除上述去糖基化huIgG4重鏈以外,T299A去糖基化 huP4A8-huIgGl重鏈亦可與SEQ ID NO: 9之輕鏈組合使 用。以下描繪T299A去糖基化huP4A8-huIgGl重鏈(SEQ ID NO: 16)之成熟序列,殘基T299A加下劃線且呈粗體(VH域 對應於殘基1-121):
1 QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKGSGYTFT DYGMHWVRQA PGQGLEWMGV
51 ISTYNGYTNY NQKFKGRVTM TVDKSTSTAY MELRSLRSDD TAVYYCARAY
101 YGNLYYAMDY WGQGTLVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV
151 KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSVV TVPSSSLGTQ
201 TYICNVNHKP SNTKVDKKVE PKSCDKTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK
251 PKDTLMISRT PEVTCVVVDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY
301 NSAYRWSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP
351 QVYTLPPSRD ELTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP 401 VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG (SEQ ID NO:16) 此蛋白質係由以下核苷酸序列編碼: -128- 140330.doc 201008579
1 ATGGGATGCA GCTGGGTCAT GCTCTTTCTG GTAGCAACAG CTACAGGCGT 51 GCACTCCCAG GTCCAGCTGG TGCAGTCTGG GGCTGAGGTG AAGAAGCCTG 101 GGGCCTCAGT GAAGGTTTCC TGCAAGGGTT CCGGCTACAC ATTCACTGAT 151 TATGGCATGC ACTGGGTGCG GCAGGCCCCT GGACAAGGGC TAGAGTGGAT 201 GGGAGTTATT AGTACTTACA ATGGTTATAC AAACTACAAC CAGAAGTTTA 251 AGGGCAGAGT CACAATGACT GTAGACAAAT CCACGAGCAC AGCCTATATG 301 GAACTTCGGA GCTTGAGATC TGACGATACG GCCGTGTATT ACTGTGCAAG 351 AGCCTACTAT GGCAACCTTT ACTATGCTAT GGACTACTGG GGTCAAGGAA 401 CCCTGGTCAC CGTCTCCTCA GCCTCCACCA AGGGCCCATC GGTCTTCCCC 451 CTGGCACCCT CCTCCAAGAG CACCTCTGGG GGCACAGCGG CCCTGGGCTG 501 CCTGGTCAAG GACTACTTCC CCGAACCGGT GACGGTGTCG TGGAACTCAG 551 GCGCCCTGAC CAGCGGCGTG CACACCTTCC CGGCTGTCCT ACAGTCCTCA 601 GGACTCTACT CCCTCAGCAG CGTGGTGACC GTGCCCTCCA GCAGCTTGGG 651 CACCCAGACC TACATCTGCA ACGTGAATCA CAAGCCCAGC AACACCAAGG 701 馨 TGGACAAGAA AGTTGAGCCC AAATCTTGTG ACAAGACTCA CACATGCCCA 751 CCGTGCCCAG CACCTGAACT CCTGGGGGGA CCGTCAGTCT TCCTCTTCCC 801 CCCAAAACCC AAGGACACCC TCATGATCTC CCGGACCCCT GAGGTCACAT 851 GCGTGGTGGT GGACGTGAGC CACGAAGACC CTGAGGTCAA GTTCAACTGG 901 TACGTGGACG GCGTGGAGGT GCATAATGCC AAGACAAAGC CGCGGGAGGA 951 GCAGTACAAC AGCGCGTACC GTGTGGTCAG CGTCCTCACC GTCCTGCACC 1001 AGGACTGGCT GAATGGCAAG GAGTACAAGT GCAAGGTCTC CAACAAAGCC 1051 CTCCCAGCCC CCATCGAGAA AACCATCTCC AAAGCCAAAG GGCAGCCCCG •129- 140330.doc 201008579 1101 AGAACCACAG GTGTACACCC TGCCCCCATC CCGGGATGAG CTGACCAAGA 1151 ACCAGGTCAG CCTGACCTGC CTGGTCAAAG GCTTCTATCC CAGCGACATC 1201 GCCGTGGAGT GGGAGAGCAA TGGGCAGCCG GAGAACAACT ACAAGACCAC 1251 GCCTCCCGTG TTGGACTCCG ACGGCTCCTT CTTCCTCTAC AGCAAGCTCA 1301 CCGTGGACAA GAGCAGGTGG CAGCAGGGGA ACGTCTTCTC ATGCTCCGTG 1351 ATGCATGAGG CTCTGCACAA CCACTACACG CAGAAGAGCC TCTCCCTGTC 1401 TCCCGGTTGA (SEQ ID NO:47) 以下展示由pEAG2228編碼之推導成熟huP4A8-agly IgGl 重鏈蛋白質序列:
1 QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKGSGYTFT DYGMHWVRQA PGQGLEWMGV 51 ISTYNGYTNY NQKFKGRVTM TVDKSTSTAY MELRSLRSDD TAVYYCARAY 101 YGNLYYAMDY WGQGTLVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV 151 KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSW TVPSSSLGTQ 201 TYICNVNHKP SNTKVDKKVE PKSCDKTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK 251 PKDTLMISRT PEVTCVWDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY 301 NSAYRWSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP 351 QVYTLPPSRD ELTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP 401 VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG (SEQ ID NO:48) 人類化P4A8 IgGl之特徵包括:溶解度超過12 mg/ml ; pi(計算值)為8·1 ; pI(IEF)為9.1-9.2 ;活體外細胞毒性之 EC5〇為30 ng/ml(WiDr細胞MTT檢定);視動物模型而定, -130- 140330.doc 201008579 活體内異種移植物之EC5〇為3.2 mg/kg或6.4 mg/kg(如本文 進一步展示);據FACS,與WiDr細胞結合之EC5〇為0.12 nM。 實例14 :結合親和力 使用ELISA直接結合檢定來評估hP4A8_IgGl對Fnl4之 : EC50。在4°C下用碳酸鈉(pH 9.5)中之2 gg/mi小鼠Fnl4-小 鼠Fc塗布96孔ELIS A盤隔夜。在室溫下以PBS中之3% BS A 將盤阻斷1小時。將hP4A8.IgGl之濃度自2 pg/ml滴定至11 © pg/ml且在室溫下培育時間為1小時。由HRP山羊抗人IgG 偵測經結合之hP4A8.IgGl。在此£1^18八條件下11?4八8.1§01 之EC5〇為約 6.79 ng/ml。 在另一實驗中’根據製造商之說明書,使用Biacore胺偶 合套組將鼠類或人類化P4A8之各種同功異型物固定於CM5 感應晶片上。簡言之,在1〇 mM乙酸鹽(pH 5.0)中將蛋白 質稀釋至30 pg/ml且將10 μΐ注射於已用1:1 N-經基丁二醢 亞胺(NHS):1-乙基-3(3·二甲基胺基丙基)-碳化二亞胺鹽酸 鹽(EDC)之10 μΐ注射液活化之晶片表面上。另外,使各實 驗中之一個流槽保持未衍生化(underivitized)以作為背景對 '· 照。接著以1 Μ乙醇胺之50 μΐ注射液將過量游離胺基封 端。典型固定量為約1200 RU。 在 1 號Biacore 缓衝液(10 mM HEPES pH 7.0 + 150 mM NaCl + 3.4 mM EDTA+0.005% P-20清潔劑+0.05% BSA)中製 備處於0.3 nM至30 nM範圍内之濃度系列的人類Fnl4。此 等實驗中所用之可溶Fnl4蛋白之胺基酸序列為 140330.doc -131 - 201008579 EQAPGTAPCSRGSSWSADLDKCMDCASCRARPHSDFCLG CAAAPPAPFRLLWPEQKLISEEDLHHHHHH。使樣本以非 連續順序以50 μΐ/min之流動速率在抗體及對照表面上流過 歷時5分鐘’接著在1號Biacore緩衝液中解離15分鐘。在各 週期之後,以15 mM NaOH使晶片再生。 對於各濃度系列而言藉由將γ軸上之注射前反應設為零 且將X轴上之注射起點設為零,使原始數據正規化。藉由 將活性表面上之反應滅去未衍生化表面上之反應且接著將 活性表面上之結合數據減去相同表面上之唯緩衝液反應參 (buffer only asp⑽Se)(所謂數據之「雙重參考」),從而使 彰:據進一步正規化。雉著對於各濃度系列而言藉由使用 Biaevaluation軟體内斜對1:1結合之馬誇特-李文柏格演算 法(MarqUardt-LeVenbe4 aigorithm)擬合數據,來測定整體 締合及解離速率常數。自速率常數之比率計算親合力常數 (KD=kd/ka) °以大於95%純度之單體可溶性人類以“進行 結合檢定。 在結合檢定之刖進行人類Fnl4之吸光度掃描。使用由_ Pace等人之方法自胺基酸序列計算之消光係數(pace,CN, Vajdos’ F·,Fee, L·,Grimsley,G 及 Gray,τ (1995)「H〇w to measure and predict the m〇lar abs〇rpti〇n coefficient of a protein」Pr—4:2411·23)。 在結合檢定之則進行吸光度掃描。因為mAb在此等實驗 中為固^物質’所以對於測定精確速率常數而言不需要精 確知曉質1、濃度或分子量,因此15〇 kDa之近似分子量 140330.doc -132- 201008579 及1.5之近似質量消光係數用於自280 nm下之吸光度評估 抗體之濃度。 表1:自速率常數之比率計算親合力常數(KD=kd/ka) P4A8同功異型物 kaiM-'s·1) kdCs'1) Kd(M) 親本mAbi)^) 8.2±2.3χ105 1.6±0.5xl0·3 2.0±0.6xl0'9 鼠類 IgGl(n=4) 2·7±1_1χ106 2.6±0.3xl0'3 l.l±0.6xl0_9 鼠類 IgG2a(n=6) 2.4±2.4xl06 3.4±2.6xl〇·3 1.5±1.5xl0'9 喪合(n=2) 5.5±2.4xl05 1·5±0·3χ10-3 3.5±2xl0'9 鼠類 IgGl-agly(n=2) 5.6±3><105 1.5±0.4χ10'3 3·0±1.3χ10·9 人類化IgGl(n=5) 1.7±0.9xl06 2.9±0.9xl0'3 2·6±2.1χ10-9 人類化 IgGl-RRS(n=3) 1.8±0·3χ106 3±0.1xl0'3 1.7±0.3xl〇·9 人類化IgG4(P) agly(n=5) 2.0±1.6xl06 2.9±〇.7xl〇'3 3.4±3.1xl〇·9 人類化IgG4(P) agly RRS(n=3) 2.9±2xl06 4.7±2xl〇·3 2.2±1.3xl〇·9 人類化P4A8與可溶性單體人類Fnl4之單價結合親和力 (或「固有親和力」)係在約1 nM至4 nM或5 nM之範圍内。 P4A8全抗體與固定Fnl4(二價Fnl4-Fc)之二價結合親和 力(親和力分量)為約50 pM。 實例15 :卡斯蛋白酶檢定 卡斯蛋白酶檢定量測裂解之卡斯蛋白酶3及7之量。回應 hP4A8處理來量測卡斯蛋白酶裂解之誘導。卡斯蛋白酶3及 7視為「執行者」卡斯蛋白酶(與誘導細胞凋亡最為接近), 且因此此檢定與hP4A8之建議MOA有關。 將WiDr腫瘤細胞接種於96孔盤中且在80 U/ml hIFNg存 在下暴露於一系列濃度(1 pg/ml,以1:3稀釋滴定)之 hP4A8 〇在培養物中3天後,使用Promega卡斯蛋白酶_Glo 3/7檢定試劑以量測裂解之卡斯蛋白酶3及7的存在。以與 未經處理之細胞相比的倍數變化來呈現數據。 結果顯示在WiDr細胞中卡斯蛋白酶3/7回應hP4A8刺激 140330.doc -133- 201008579 而誘導,甚至當在甚至最低濃度下測試時回應多聚體型式 之hP4A8(hP4A8多聚體)亦觀測到最大作用(圖26)。當測試 漸增濃度之單體形式之P4A8時觀測到劑量反應。在離體腫 瘤中獲得類似結果。 實例16 : NFkB誘導檢定 NF-kB檢定量測標準(p50、p65)及非標準(p52、 RelB)NF-kB路徑之誘導。已公認TWEAK/Fnl4路徑經NF-kB發送信號,因此此為用於證實hP4A8之促效劑活性的相 關檢定。 .使WiDr腫瘤細胞在6孔培養皿中生長且暴露於1 pg/ml P4A8(在此檢定中,使用鼠類型式之P4A8)或100 ng/ml hFc-TWEAK以供比較。在處理後不同時間點(處於1分鐘至 24小時之範圍内),自培養物製備核提取物。接著由ELISA 套組(活性基元-TransAM NFkB家族轉錄因子檢定套組)對 核提取物進行分析以量測個別NF-kB次單元(p50、p65、 p52、RelB、c-Rel)。所有值皆相對於未受刺激之細胞而正 規化。 結果顯示在WiDr細胞中NFkB次單元ρ50、ρ52、p65、 RelB回應P4A8而誘導,指示標準NF-kB路徑與非標準NF-kB路徑均受刺激(圖27)。在離體腫瘤中獲得類似結果。 實例17 :效應功能 活體外評估hP4A8之ADCC活性。在WiDr及MDA-MB231 腫瘤細胞株中量測活性。將hP4A8.IgGl(亦即,具有與人 類IgGl連接之VH1及VL1序列的人類化P4A8)與Fc殘缺型 140330.doc •134- 201008579 式之P4A8(hP4A8-IgGlagly及hP4A8.IgG4Pagly)相比 ° 在IL-2存在下將自供體PBMC分離之NK細胞培育隔夜。 以51Cr標記WiDr及MDA-MB-231靶細胞。將經培養之NK細 胞與經標記之靶細胞以5 :1比率在不同濃度之抗體存在下 於37°C下一起培育4小時(亦以2:1之比率進行,數據未展 示)。檢定中包括自發釋放對照(無NK細胞)及最大釋放對 照(經Triton-Χ-ΙΟ處理之靶細胞)。在培育期之後量測上清 液之Cpm。溶解%計算如下: (樣本 cpm-自發 cpm)xl00 溶解% =- (最大cpm -自發cpm) 在WiDr實驗與MDA-MB231實驗中,對hlgGl觀測到顯著 ADCC 活性,但對 Fc 殘缺(hP4A8-IgGlagly 及 hP4A8IgG4Pagly)P4A8抗體未觀測到顯著ADCC活性。陽 性對照顯示一定活性,但不如hP4A8.IgGl —樣穩固(圖 28)。此等研究證實,如抗體在活體外檢定中誘導ADCC之 能力所量測,hP4A8.IgGl具有ADCC能力。 亦測定糖基化對活性之影響。在WiDr細胞中使用MTT檢 定(上述)以測試糖基化對活體外活性是否具有影響。在此 檢定中比較hP4A8.IgGl(完全效應功能)與hP4A8.IgG4Pagly (無效應功能)。在此檢定中測試研究參考標準物質。結果 顯示與活體外hP4A8.IgG4Pagly相比,hP4A8.IgGl之活性 略微增強且可再現。 亦已顯示hP4A8.IgGl之Fc效應功能在上述WiDr檢定與 140330.doc -135- 201008579 MDA-MB231檢定中於活體内均促進P4A8活性。將6.4 mg/kg P4A8 hlgGl投與任一動物模型比投與相同劑量之 P4A8hIgG4Pagly更為有效(圖 29)。 實例18:人類化P4A8.IgGl之活髏内短期及長期功效 在帶有WiDr人類結腸腫瘤之無胸腺裸小鼠中評估以每週 一次時程(qw)腹膜内(i.p.)投與6週之劑量處於0.9 mg/kg至 25.6 mg/kg範圍内的以單劑形式投與之P4A8.hIgGl Fnl4抗 體之功效。在腫瘤細胞接種後第12天當平均腫瘤體積為約 200 mm3時開始以QW時程(如箭頭所指示)用12.8 mg/kg之 IDEC 151(陰性對照)及 12.8 mg/kg、6.4 mg/kg、3.2 mg/kg、1.8 mg/kg 及0.9 mg/kg 之 P4A8.hlgGl腹膜内治療小 鼠。數據為每一治療組1 〇隻小鼠之平均值土SEM。*對所有 給藥組而言,自20至60天與IDEC 151陰性對照相比,P < 0.001 ° 與同型匹配陰性對照抗體相比,P4A8hIgGl在0.9-25.6 mg/kg範圍内之劑量下顯示統計學上顯著(P < 0.001)之功效 (圖 30、圖 31 及圖 3 2)。跨越 0.9 mg/kg、1.8 mg/kg、3 ·2 mg/kg及6.4 mg/kg劑量組觀測到劑量依賴性功效。在6·4 mg/kg劑量以上,跨越6.4 mg/kg、12.8 mg/kg 及25·6 mg/kg 劑量組未觀測到劑量依賴性(圖30及圖3 1)。跨越所測試之 劑量範圍,以qw><6之時程’在此模型中以單劑形式投與之 P4A8hIgGl的最低有效劑量似乎為〇·9 mg/kg(圖30及圖 3 1)。以相同給藥時程,最高有效劑量為6.4 mg/kg。如圖 32所示,在終止給藥之後P4A8.hIgGl抗體維持功效50天以 140330.doc •136· 201008579 上。如無體重減輕所指示,以qw><6之時程充分耐受所有處 於0.9 mg/kg至25.6 mg/kg範圍内之劑量(η=ι〇隻小鼠/治療 組)。 除每週給藥時程以外,亦發現當每隔一週或每三週一次 投與時’投與P4A8hIgGl對帶有WiDr人類結腸腫瘤之無胸 : 腺裸小鼠有效(圖37)。當腫瘤相對較大(約5〇〇 mm3)且仍觀 • 測到腫瘤鬱積時在此研究中開始治療。儘管該抗體之半衰 期係在抗體之正常至較低範圍内(在帶有腫瘤之小鼠中小 ® 於2·5天),但抗體即使不頻繁投與亦令人驚對地活體内有 效。 在帶有MDA-MB-231乳癌腫瘤之SCID小鼠中評估以每週 一次時程(qw)腹膜内(i.p)投與6週之劑量處於6.4 mg/kgi 25.6 mg/kg範圍内的以單劑形式投與之P4A8 hIg(H以14抗 體之功效。在腫瘤細胞接種後第16天當平均腫瘤體積為約 200 mm3時開始以QW時程(如箭頭所指示)用25 6 ^&之 ❹ IDEC 151(陰性對照)及 25·6 mg/kg、12.8 mg/kg&6.4 mg/kg 之P4A8hIgGl腹膜内治療帶有MDA-MB-23 1人類乳房腫瘤 之小乳。數據為每一治療組9隻個小鼠之平均值土。* :自23至63天與IDEC 151陰性對照相比,p < 〇 〇〇1。 • 與同型匹配陰性對照抗體相比,1>4八8.1118(51在6.4_25,6 mg/kg範圍内之劑量下顯示統計學上顯著(p < 〇 〇〇1)之功效 (圖3 3)。以平均陰性對照之百分比表示之測試組平均腫瘤 尺寸的比較呈現於圖34中,虛線表示國家癌症研究所 (National Cancer Institute)關於活性之準則(42%)。 140330.doc -137- 201008579 對此模型尚未測定P4A8.hIgGl以單劑形式投與時之最低 有效劑量。跨越 6.4 mg/kg、12.8 mg/kg 及 25.6 mg/kg 劑量 組未觀測到劑量依賴性。如無顯著體重減輕所指示,充分 而才受此等劑量。 出乎意料地,P4A8.hIgGl在MDA-MB-231人類乳房腫瘤 檢定中展現大於親本抗體P4A8之功效。兩種抗體在WiDr 人類結腸腫瘤檢定中展現類似功效。 實例19 : P4A8.hIgGl之多聚化增強活性 P4A8.hIgGl與蛋白質A之多聚化在MTT檢定中增強WiDr 細胞死亡以及WiDr細胞中之卡斯蛋白酶活化(圖1 5及圖 26)。 實例20:人類化P4A8IgGl在胃癌中之功效 顯示人類化P4A8 IgGl抗體在Hs746T胃癌異種移植模型 中以所測試之各種測試展現抗腫瘤作用(圖35及圖36A)。 另外,藉由在N87胃異種移植模型中以每週一次給藥用3.2 mg/kg、6.4 mg/kg 及 12.8 mg/kg人類化 P4A8IgGl治療顯示 單劑功效(腫瘤尺寸減小70-80%)(圖36B)。 因此,P4A8有效殺死活體内動物模型中之腫瘤細胞且 具有持久作用。 實例21 :在P4A8 Fnl4界面4之胺基酸殘基相互作用 由蒸氣擴散法使鼠類P4A8 Fab/人類Fnl4胞外域之複合 物結晶且將其置於20°C之溫度下。具有繞射品質之板狀晶 體在10-14天内於含有30% PEG 8000、100 mM乙酸鈉(pH 5)、0.2 Μ硫酸鋰之結晶溶液中生長。按原樣收集晶體 140330.doc -138- 201008579 (0.2 χ〇·2χ〇.01 mm3)且在液氮中急驟冷凍。在國家同步加 速器光源(National Synchrotron Light Source)(Upton,NY) 之光束線X25下收集達3.5 A解析度之繞射數據。使用 HKL2000程式(HKL Research, Charlottesville,VA,USA)之 數據處理揭示晶體屬於P21空間群且近似晶胞尺寸為 a=61.1 A,b=103.3 A,c=76.1 A且 β=97·20,其與每個不對 稱單元2個Ρ4Α8 Fab-Fnl4複合物一致。利用人類化Ρ4Α8之 同源模型及内部Fnl4 NMR結構以MOLREP(Vagin及 Teplyakov,1997, 30:1022-1025)進行分 子置換使P4A8 Fab及Fnl4分子得以置放,所得R因子為 46%。在電子密度圖中僅可說明Fnl4之半胱胺酸富集域的 殘基50-67。密度圖中缺少H3 CDR及Fnl4胞外域之N末端 殘基。藉由使huFnl4胞外域之最新NMR結構(He及Dang, Proiek 2009,18:650-656)與 P4A8 Fab/Fnl4 晶體結 構之NMR結構重疊來產生界面之更完整模型。接著,以軟 體 ROSETTA(Das 及 Baker, Annu. Rev. Biochem.,2008, 77:363-82)模擬H3 CDR且進行總體複合物之限制性最優化 精化。表2突出在P4A8/Fnl4界面處之胺基酸相互作用。 表2 :在P4A8/Fnl4界面之胺基酸相互作用。 CDRL1 CDRL2 CDRL3 RASKSVSTSSYSYMH YASNLES SRELPFT S32 (P4A8) *C49 (Fnl4) Y54 (P4A8) *K48 (Fnl4) R96 (P4A8) D51 (Fnl4) Y34 (P4A8) W42 (Fnl4) Y36 (P4A8) K48 (Fnl4) 140330.doc •139- 201008579 CDRH1 CDRH2 CDRH3 GYTFTDYGMH VISTYNGYTNYNQKFKG AYYGNLYYAMDY D31 (P4A8) S52 (P4A8) ΥΙΟΙ (P4A8) *R58 (Fnl4) *A57 (Fnl4) L46 (Fnl4) Y32 (P4A8) Y54 (P4A8) Y105 (P4A8) R58 (Fnl4) H60 (Fnl4) M50 (Fnl4) N55 (P4A8) Y106 (P4A8) *A57 (Fnl4) R58(Fnl4) Y57 (P4A8) R56 (Fnl4) N59 (P4A8) *R56 (Fnl4) 具有界面殘基之P4A8 CDR以粗體突出/加下劃線。 *表示Η鍵相互作用。 實例22 :鈿胞株對Ρ4Α8、Ρ4Α8多聚髏及TWEAK之敏戚性 在FACS緩衝液(pbs,1% BSA,0.1%疊氮化鈉)中藉由 將細胞與曲線劑量之P4A8混合,以10 pg/ml起始,接著以 1:2連續稀釋來進行細胞株之FACS分析。以相同方式製備 mAb IDEC 151作為對照且接著在4°C下將各抗體與細胞一 起培育30 min。以FACS緩衝液洗滌2次之後,在4°C下將細 胞與經PE標記之抗hu IgG Fc特異性抗體(Jackson Labs West Grove,PA)—起培育30 min。洗滌2次之後,將細胞固 定於 2%三聚甲搭中且在 Caliber Facscan(Becton Dickinson, San Jose,CA)上獲取。使用 Flow Jo 軟體(Tree Star Inc. Ashland,OR)分析數據且測定MFI(平均螢光強度)。細胞株 之表現量(參見表3)係由以下準則根據其在1.25 pg/ml P4A8 之濃度下的MFI來評定:
負 <10 MFI 低 10-29 MFI 中 30-59 MFI 140330.doc -140- 201008579
高 60+MFI
藉由一式三份以9 pg/ml起始將細胞塗於含有80 U/ml人 類 INFg連同 Tweak-Fc、Hu P4A8、Hu P4A8-PA或 IDEC 15 1 對照mAb之1:3連續稀釋液的培養基中來設置MTT檢定。將 細胞培育3-4天且使用單溶液細胞效價MTT檢定(One Solution Cell Titer MTT assay)(prornega Madison WI)來顯 色。對各個別樣本而言’藉由使用下式來測定存活百分 比:存活%=(經處理孔之OD/未經處理孔之平均〇d)X 100。 針對各處理條件計算平均值且接著相對於抑制劑濃度繪製 存活%。 MTT檢定之結果(參見表3)係使用以下準則由其在9 pg/ml下抑制增殖之能力來評定: 無活性 -(負) > 80%存活 + /- 約80%存活 + 約60%存活 + + 約40%存活 + + + < 20%存活 + + + + 表3 :對P4A8 、P4A8多聚體及TWEAK之細胞株敏感性 膣瘤類型 株 表現(FACS) MTT敏感性 P4A8 P4A8多聚馥 TWEAK 結膦 WiDr 中 +++ ++++ ++++ HT-29 中 +-H- ND ++++ HCT-15 中 +/ ND +/- HCT-116 中 + + + SW-620 中 • +/- + Geo 中 + -hh 140330.doc •141· 201008579
Dld-1 中 - - - Lovo 低 ND ++ Km-12 低 - - + Colo-205 負 - - 乳房 NCI-ADR 極南 +/- +/- + MDA-MB231 中 +/- + ++ SUM-159 中 ND - Mxl 中 + ++ ++ DU4475 低 - ND - BT-549 負 - ND - ZR-75-1 負 _ - MCF-7 ND +/- ND ++ 胰腺 BxPc-3 中 +/- + +++ CFPAC-l 中 - ND - Su86.86 中 - - + Panc-1 低/中 +/- + SW1990 中 - +/_ +/- AsPC-1 低 + + + HCC1806 Λ +/_ + + 胃 Hs746T 中 - ++ ++ NCI-N87 中 - ++ ++ 卵巢 ES-2 高 +/- +/- +/_ SKOV-3 中 + ++ +++ NSCL HOP62 中/高 +/- + -Η- A549 中 +/- +/ +/- NCI-H23 低 +/_ + + 黑色素癌 MDA-MB435 中 - ND - SK-MEL-2 中 +/- ++ ++ ND=未進行 實例23:抗艟交又阻斷 如下評估抗體交叉阻斷。將可溶性人類Fnl4固定於表面 上。接著使表面與未經標記之第一抗體接觸。隨後,添加 經生物素標記之第二抗體且量測第二抗體與表面之結合 性。第二抗體結合性之消除指示第一抗體交叉阻斷第二抗 體與Fnl4結合。 一組抗體交叉阻斷所選抗Fn 14抗體結合之能力描繪於圖 140330.doc -142- 201008579 3 8八(?203為經生物素標記之第二抗體)、圖383(卩305為經 生物素標記之第二抗體)、圖38C(P4A8為經生物素標記之 第二抗體)、圖38D(ITEM-4為經生物素標記之第二抗體)及 圖38E(ITEM-3為經生物素標記之第二抗體)中。在此等實 驗中,P1B12及P1C12用作無關對照抗體。*表示未使用未 經標記之第一抗體的情況。 其他實施例 儘管本發明已結合其實施方式加以描述,但前述描述意 β 欲說明且不限制隨附申請專利範圍之範疇所界定的本發明 範疇。其他態樣、優勢及修改係在以下申請專利範圍之範 内。 【圖式簡單說明】 圖1為展示如ΜΤΤ檢定所量測,抗Fnl4單株抗體P2D3、 P4A8、P3G5及P3D8可活體外殺死WiDr結腸癌細胞之圖; 圖2A及圖2B為展示如TUNEL檢定所量測,抗Fnl4單株 抗體(P4A8)可活體外殺死Widr結腸癌細胞之線形圖(圖2A) 及條形圖(圖2B)。 圖3為展示如MTT檢定所量測,活體外對Fnl4單株抗體 P2D3、P4A8及P3G5具抗性之Fnl4+乳房腫瘤株(MDA-MB231)之實例的圖; 圖4為展示如在各種抗體濃度上由ng/ml IL-8所量測, Fnl4單株抗體P4A8、P2D3、P3G5及P3D8在IL-8誘導檢定 中為促效劑之圖; 圖5為展示如由在腫瘤接種後之天數上腫瘤體積 140330.doc -143- 201008579 (mm3)(上部)或由第45天腫瘤重量(公克)所量測,抗Fnl4單 株抗體P2D3、P3G5及P4A8活體内有效治療Widr細胞結腸 腫瘤之線形圖(上部)及條形圖(下部); 圖6為展示如由在腫瘤植入後之天數上重量(g)所量測, 在以抗Fnl4單株抗體P2D3、P3G5及P4A8治療之動物中無 明顯毒性之圖; 圖7為展示如由在腫瘤接種後之天數上腫瘤體積(mrn3)所 量測’抗Fnl4單株抗體P4A8之各種劑量及給藥時序對治 療大Widr腫瘤之功效的圖; 圖8為展示如由在腫瘤接種後之天數上腫瘤體積(mm3)所 量測,Widr腫瘤對P4A8抗Fnl4單株抗體之劑量反應的 ISI · 圏, 圖9為展示如由在腫瘤接種後之天數上測試/對照百分比 所量測’ Widr腫瘤對P4A8抗Fnl4單株抗體之劑量反應的 圖;
圖10為展示如由在腫瘤植入後之天數上體重變化百分比 所量測,在以各種劑量之抗Fnl4單株抗體P4A8治療之動 物中無明顯毒性之圖; 圖11為展示如由在腫瘤接種後之天數上腫瘤體積(mm3) 所量測’抗Fnl4單株抗體P2D3及P4A8活體内有效治療 MDA-MB231乳房細胞腫瘤之圖; 圖12為展示抗Fnl4單株抗體P4A8及P2D3與來自多個物 種(人類(hu)、鼠類(mu)及獼猴(cyno))i Fnl4交叉反應之 IS1 · 圃, 140330.doc -144- 201008579 圖13為展示P4A8與具有W42A突變之人類Fnl4的結合相 對於野生型Fnl4顯著較差之直方圖; 圖14A-14F為P4A8抗體之VH域(圖14A)、P3G5抗體之VH 域(圖14B)、P2D3抗體之VH域(圖14C)、P4A8抗體之VL域 (圖14D)、P3G5抗體之VL域(圖14E)及P2D3抗體之VL域(圖 - 14F)的DNA序列; 圖15為展示如MTT檢定所量測,hP4A8IgGl及多聚體型 式之hP4A8IgGl活體外殺死WiDr結腸癌細胞之圖; ® 圖16為展示抗Fnl4單株抗體P2D3、P3D8、P3G5及P4A8 以類似EC5〇值與人類及獼猴表面Fnl4結合之圖; 圖17為展示抗Fnl4單株抗體P2D3、P3D8、P3G5及P4A8 以類似EC5〇值與鼠類表面Fnl4結合之圖; 圖18A及圖18B為展示具有不同重鍵效應功能之huP4A8 變體以類似EC5〇值與人類(圖18A)及大鼠(圖18B)Fnl4結合 之圖; 圖19A為展示P4A8與人類、獼猴及小鼠表面Fnl4結合而 ❹ 不與爪蟾Fnl4結合之直方圖; 圖19B為展示Fc-huTWEAK融合蛋白與人類、獼猴、小 : 鼠及爪蟾表面Fnl4結合之直方圖; 圖19C為展示muFc-muTWEAK融合蛋白與人類、獼猴、 小鼠及爪蟾表面Fnl4結合之直方圖; 圖20為Fnl4胞外域之間隙比對; 圖21A為展示Fc-TWEAK與所有Fnl4 W42A突變體結合 之直方圖; 140330.doc -145 - 201008579 圖21B為展示P4A8與Fnl4之結合性因突變至W42A而消 除之直方圖; 圖22為展示當殘基W42突變至大疏水性殘基W42F或 W42Y時P4A8與Fnl4之結合性恢復正常之直方圖; 圖23A為展示Fc-TWEAK與一組人類Fnl4點突變體結合 之直方圖; 圖23B為展示P4A8與一組人類Fnl4點突變體結合之直方 圖, 圖23C為展示P3G5與一組人類Fnl4點突變體結合之直方 圖; 圖23D為展示P2D3與一組人類Fnl4點突變體結合之直方 圖; 圖23E為展示ITEM-1與一組人類Fnl4點突變體結合之直 方圖; 圖23F為展示ITEM-4與一組人類Fnl4點突變體結合之直 方圖; 圖23G為展示ITEM-2與一組人類Fnl4點突變體結合之直 方圖; 圖23H為展示ITEM-3與一組人類Fnl4點突變體結合之直 方圖; 圖24為展示如與在293E細胞中瞬間過度表現之表面人類 Fnl4直接結合之FACS稀釋滴定所檢定,不同型式之 huP4A8具有與chP4A8等價之生物活性的圖; 圖25為展示如競爭ELISA所檢定,不同型式之huP4A8保 140330.doc -146- 201008579 持與chP4A8基本上等價之Fnl4結合親和力之圖; 圖26為展示在WiDr細胞中卡斯蛋白酶3/7回應hP4A8及 多聚體型式之hP4A8(hP4A8多聚體)之刺激而活化之圖; 圖27為展示在WiDr細胞中NFkB次單元回應P4A8而誘導 之圖; :圖28為展示hP4A8.IgGl及Fc殘缺型式之P4A8(hP4A8-IgGlagly 及 hP4A8.IgG4Pagly)之 ADCC活性的圖; 圖29為展示在WiDr及MDA-MB23 1檢定中活體内投與 〇 P4A8hIgGl 及 P4A8hIgG4Pagly 之結果的圖; 圖30、圖31及圖32為展示以各種劑量投與帶有WiDr人類 結腸腫瘤之無胸腺裸小鼠之P4A8.hIgGl抗體之活體内功效 的圖; 圖33及圖34為展示以各種劑量投與帶有MDA-MB-231乳 癌腫瘤之SCID小鼠之P4A8.hIgGl抗體之活體内功效的 圖; 圖35為展示人類化P4A8IgGl在Hs746T胃癌異種移植模 參 型中之功效的圖; 圖3 6A及圖36B為展示人類化P4A8IgGl在Hs746T(圖36A) :犮N87(圖36B)胃癌異種移植模型中之功效的圖; 圖37為展示以各種給藥時程投與帶有WiDr人類結腸腫瘤 之無胸腺裸小鼠之P4A8.hIgGl抗體之活體内功效的圖; 圖38A為描繪一組抗體交叉阻斷抗體P2D3與人類Fnl4結 合之能力的圖; 圖38B為描繪一組抗體交叉阻斷抗體P3G5與人類Fnl4結 140330.doc -147- 201008579 合之能力的圖; 圖38C為描繪一組抗體交叉阻斷抗體P4A8與人類Fnl4結 合之能力的圖; 圖3 8D為描繪一組抗體交叉阻斷抗體ITEM-4與人類Fnl4 結合之能力的圖;及 圖38E為描繪一組抗體交又阻斷抗體ITEM-3與人類Fnl4 結合之能力的圖。 140330.doc 148-

Claims (1)

  1. 201008579 七、申請專利範圍: 1. 一種經分離抗體或其抗原結合片段,其⑴與在細胞表面 上表現之SEQ ID NO: 1多肽於抗原決定基處選擇性結 合,該抗原決定基在SEQ ID NO: 1之位置42處包括胺基 酸殘基色胺酸;及(ii)於活體内或活體外誘導或增強癌細 胞之細胞死亡。 2. —種經分離抗體或其抗原結合片段,其⑴與在細胞表面 上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合,且交叉阻斷單 〇 株抗體P4A8或P3G5與SEQ ID NO: 1結合;及(ii)於活體 内或活體外誘導或增強癌細胞之細胞死亡。 3. —種經分離抗體或其抗原結合片段,其⑴與在細胞表面 上表現之SEQ ID NO: 1多肽在與單株抗體P4A8、P3G5或 P2D3相同之抗原決定基處選擇性結合;及(ii)於活體内 或活體外誘導或增強癌細胞之細胞死亡。 4. 如請求項1至3中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中 該抗體或其抗原結合片段與該SEQ ID NO: 1多肽之結合 ® 阻斷TWEAK與該多肽結合。 5. —種經分離抗體或其抗原結合片段,其⑴與在細胞表面 上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少80%—致 之VH域;及(iii)於活體内或活體外誘導或增強癌細胞之 細胞死亡。 6. 如請求項5之抗體或其抗原結合片段,其中該VH域與 SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少90% 140330.doc 201008579 一致。 7. 如請求項6之抗體或其抗原結合片段,其中該VH域與 SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少95% 一致。 8. 如請求項5之抗體或其抗原結合片段,其中該VH域與 SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列一致。 9. 一種經分離抗體或其抗原結合片段,其⑴與在細胞表面 上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含與SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或 SEQ ID NO: 15 之胺基酸序 列至少80%—致之VL域;及(iii)於活體内或活體外誘導 或增強癌細胞之細胞死亡。 10. 如請求項9之抗體或其抗原結合片段,其中該VL域與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或 SEQ ID NO: 15 之胺基 酸序列至少90%—致。 11. 如請求項9之抗體或其抗原結合片段,其中該VL域與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或 SEQ ID NO: 15 之胺基 酸序列至少95%—致。 12. 如請求項9之抗體或其抗原結合片段,其中該VL域與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或 SEQ ID NO: 15 之胺基 酸序列一致。 13. —種經分離抗體或其抗原結合片段,其⑴與在細胞表面 上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少80%—致 之 VH 域;(iii)包含與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或 140330.doc 201008579 SEQ ID NCh 15之胺基酸序列至少80%—致之VL域;及 (iv)於活體内或活體外誘導或增強癌細胞之細胞死亡。 14.如請求項13之抗體或其抗原結合片段,其中⑴該VH域與 SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少90% 一致;及(ii)該 VL 域與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 •或SEQ ID NO: 15之胺基酸序列至少90%—致。 _ 15.如請求項13之抗體或其抗原結合片段,其中(i)該VH域與 SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列至少95% © 一致;及(ii)該 VL域與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或SEQ ID NO: 15之胺基酸序列至少95%—致。 16. 如請求項13之抗體或其抗原結合片段,其中(i)該VH域與 SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之胺基酸序列一致;及 (ii)該 VL 域與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14 或 SEQ ID NO: 1 5之胺基酸序列一致。 17. 如請求項13之抗體或其抗原結合片段,其中重鏈包含 SEQ ID NO: 37 或 SEQ ID NO: 39 且輕鏈包含 SEQ ID NO: 41、SEQ ID NO: 43 或 SEQ ID NO: 45。 18. 如請求項13之抗體或其抗原結合片段,其中重鏈包含 : SEQ ID NO: 37且輕鏈包含 SEQ ID NO: 43。 19. 一種經分離抗體或其抗原結合片段,其(i)與在細胞表面 上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VH 域,該VH域包含(a)與SEQ ID NO: 2或SEQ ID NO: 3之 CDR-H1至少90%—致之第一重鏈互補決定區(CDR),與 SEQ ID NO: 2或 SEQ ID NO: 3之 CDR-H2至少 90%—致之 140330.doc 201008579 第二重鏈 CDR,及與 SEQ ID NO: 2 或 SEQ ID NO: 3 之 CDR-H3至少90% —致之第三重鏈CDR,或(b)與SEQ ID NO: 4之CDR-H1至少90%—致之第一重鏈CDR,與SEQ ID NO: 4之CDR-H2至少90% —致之第二重鏈CDR,及與 SEQ ID NO: 4之CDR-H3至少90%—致之第三重鏈CDR ; 及(iii)於活體内或活體外誘導或增強癌細胞之細胞死 亡0 20. 如請求項19之抗體或其抗原結合片段,其中該第一重鏈 CDR與 SEQ ID NO: 2 或 SEQ ID NO: 3 之 CDR-H1— 致,該 第二重鏈CDR 與 SEQ ID NO: 2或SEQ ID NO: 3之CDR-H2 一致,且該第三重鏈CDR與SEQ ID NO: 2或SEQ ID NO: 3 之 CDR-H3—致。 21. 如請求項19之抗體或其抗原結合片段,其中該第一重鏈 CDR與SEQ ID NO: 4之CDR-H1—致,該第二重鏈CDR與 SEQ ID NO: 4之CDR-H2—致,且該第三重鏈CDR與SEQ ID NO: 4之 CDR-H3—致。 22. —種經分離抗體或其抗原結合片段,其⑴與在細胞表面 上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(ii)包含VL 域,該VL域包含(a)與SEQ ID NO: 5或SEQ ID NO: 6之 CDR-L1至少90%—致之第一輕鏈CDR,與SEQ ID NO: 5 或SEQ ID NO: 6之CDR-L2至少90%—致之第二輕鏈 CDR,及與 SEQ ID NO: 5 或 SEQ ID NO: 6 之 CDR-L3 至少 90%—致之第三輕鏈CDR,或(b)與SEQ ID NO: 7之CDR-L1至少90%—致之第一輕鏈CDR,與SEQ ID NO: 7之 140330.doc 201008579 CDR-L2至少90%—致之第二輕鍵CDR,及與SEQ ID NO: 7之CDR-L3至少90%—致之第三輕鏈CDR ;及(iii)於活體 内或活體外誘導或增強癌細胞之細胞死亡。 23. ❹24. 25. 9 如请求項22之抗體或其抗原結合片段,其中該第一輕鏈 CDR 與 SEQ ID NO: 5 或 SEQ ID NO: 6 之 CDR-L1—致,該 第二輕鏈CDR 與 SEQ ID NO: 5 或 SEQ ID NO: 6之 CDR-L2 一致’且該第三輕鍵CDR與SEQ ID NO: 5或SEQ ID NO: 6之 CDR-L3 —致。 如請求項22之抗體或其抗原結合片段,其中該第一輕鏈 CDR與SEQ ID NO: 7之CDR-L1—致,該第二輕鏈CDR與 SEQ ID NO: 7之CDR-L2—致’且該第三輕鏈CDR與SEQ ID NO: 7之CDR-L3—致。 一種經分離抗體或其抗原結合片段,其⑴與在細胞表面 上表現之SEQ ID NO: 1多肽選擇性結合;(Π)包含VH 域,該VH域包含(a)與SEQ ID NO: 2或SEQ ID NO: 3之 CDR-H1至少90%—致之第一重鏈CDR,與SEQ ID NO: 2 或SEQ ID NO: 3之CDR-H2至少90%—致之第二重鏈 CDR,及與SEQ ID NO: 2或 SEQ ID NO: 3之CDR-H3至少 90% —致之第三重鏈CDR,或(b)與SEQ ID NO: 4之CDR-H1至少90%—致之第一重鏈CDR,與SEQ ID NO: 4之 CDR-H2至少90%—致之第二重鏈CDR,及與SEQ ID NO: 4之CDR-H3至少90%—致之第三重鏈CDR ; (iii)包含VL 域,該VL域包含(a)與SEQ ID NO: 5或SEQ ID NO: 6之 CDR-L1至少90%—致之第一輕鏈CDR,與SEQ ID NO: 5 140330.doc 201008579 或SEQ ID NO·· 6之CDR-L2至少90% —致之第二輕鏈 CDR,及與 SEQ ID NO: 5 或 SEQ ID NO: 6 之 CDR-L3 至少 90% —致之第三輕鏈CDR,或(b)與SEQ ID NO: 7之CDR-L1至少90%—致之第一輕鏈CDR,與SEQ ID NO: 7之 CDR-L2至少90%—致之第二輕鏈CDR,及與SEQ ID NO: 7之CDR-L3至少90%—致之第三輕鏈CDR ;及(iv)於活體 内或活禮外誘導或增強癌細胞之細胞死亡。 26. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中⑴該第一重 鏈CDR與SEQ ID NO: 2之CDR-H1—致,該第二重鏈CDR 與SEQ ID NO: 2之CDR-H2—致,且該第三重鏈CDR與 SEQ ID NO: 2 之 CDR-H3—致;及(ii)該第一輕鏈 CDR 與 SEQ ID NO: 5 之 CDR-L1— 致,該第二輕鏈 CDR 與SEQ ID NO: 5之CDR-L2—致,且該第三輕鏈CDR與SEQ ID NO: 5之 CDR-L3—致。 27. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中⑴該第一重 鏈CDR與SEQ ID NO: 3之CDR-H1—致,該第二重鏈CDr 與SEQ ID NO·· 3之CDR-H2—致,且該第三重鏈CDR與 SEQ ID NO: 3 之 CDR-H3 —致;及(ii)該第一輕鍵 CDR 與 SEQ ID NO: 6之 CDR-L1 — 致’該第二輕鍵 CDR與 SEQ ID NO: 6之CDR-L2 —致’且該第三輕鍵CDR與SEQ ID NO: 6之 CDR-L3—致。 28. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中(丨)該第一重 鏈 CDR 與 SEQ ID NO: 4 之 CDR-H1— 致,該第二重鍵(:1)11 與SEQ ID NO: 4之CDR-H2—致,且該第三重鍵CDR與 140330.doc -6 - 201008579 SEQ ID NO: 4 之 CDR-H3—致;及(ii)該第一輕鏈CDR 與 SEQ ID NO: 7 之 CDR-L1— 致,該第二輕鏈 CDR 與 SEQ ID NO: 7之CDR-L2—致,且該第三輕鏈CDR與SEQ ID NO: 7之CDR-L3—致。 29. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其 : 抗原結合片段包含與人類生殖系構架區總計至少90% — . 致之構架區。 30. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其 ® 抗原結合片段包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12之 VH域的構架區總計至少90%—致之VH域構架區。 31. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其 抗原結合片段包含與SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14或 SEQ ID NO·· 15之VL域的構架區總計至少90%—致之VL 域構架區。 32. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其 抗原結合片段包含⑴與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 12 參 之VH域的構架區總計至少90%—致之VH域構架區,及 ' (ii)與 SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14或 SEQ ID NO: 15 :之VL域的構架區總計至少90%—致之VL域構架區。 33. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中該VH域包含 SEQ ID NO: 8之胺基酸 1-121。 34. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中該VL域包含 SEQ ID NO: 9之胺基酸 1-111。 35. 如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中該VH域包含 140330.doc 201008579 SEQ ID NO: 8之胺基酸M21且該VL域包含SEQ ID NO: 9之胺基酸1-111。 36.如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中該重鏈包含 SEQ ID NO: 8且該輕鏈包含 SEQ ID NO: 9。 37·如請求項25之抗體或其抗原結合片段,其中該重鏈包含 SEQ ID NO: 16且該輕鏈包含 SEq ID no: 9。 3 8.如請求項1至37中任一項之抗體或其抗原結合片段,其 中該抗體或其抗原結合片段誘導或增強WiDr結腸癌細胞 之細胞死亡。 39. 如請求項1至38中任一項之抗體或其抗原結合片段,其 中該抗體為人類化抗體。 40. 如請求項1至38中任一項之抗體或其抗原結合片段,其 中該抗體為完全人類抗體。 41. 如請求項1至38中任一項之抗體或其抗原結合片段,其 中該抗體為單株抗體。 42. 如請求項1至38中任一項之抗體或其抗原結合片段,其 中該抗體為單鏈抗體。 43. 如請求項1至38中任一項之抗體或其抗原結合片段,其 中該抗體或其抗原結合片段為多株抗體、嵌合抗體、〜 片段、F(ab,)2片段、Fab.片段、Fsc片段或^片段。 44·如請求項1至38中任一項之抗體或其抗原結合片段,其 中該抗體或其抗原結合片段為多特異性抗體。 45.如請求項44之抗體或其抗原結合片段其中該多特異性 抗體為雙特異性抗體。 140330.doc 201008579 46. 如請求们錢中任一項之抗體或其抗原結合片段其 中該抗體或其抗原結合片段為多價抗體。 47. -種經分離細胞,其產生如請求項ijL46t^ —項之抗 體或其抗原結合片段。 伙如請求項47之細胞,其中該細胞為藉由使哺乳動物⑽ 胞與骨髓瘤細胞融合而獲得之融合細胞。 49. -種醫藥組合物’其包含如請求項α46中任—項之抗 體或其抗原結合片段及醫藥學上可接受之載劑。 ® 50. —種誘導腫瘤細胞死亡 ^ 忑万法包含使表現Fnl4 之趙瘤細胞與有效誘導該腫瘤細胞死亡之量的如請求項 1至46中任一項之抗體或其抗原結合片段接觸。 51. -種預防或減少腫瘤細胞生長之方&,該方法包含向具 有腫瘤之哺乳動物投與醫藥組合物,該醫藥組合物包含 有效預防或減少腫瘤細胞生長之量的如請求項【至邨中 任一項之抗體或其抗原結合片段。 ❹52. -種治療癌症之方&,該方法包含向患有癌,症之哺乳動 物投與包含治療有效量之如請求項1至46中任一項之抗 體或其抗原結合片段的醫藥組合物。 53_如叫求項52之方法,其中該癌症為結腸癌或乳癌。 54.如請求項51至53中任一項之方法,其中該哺乳動物為人 類。 140330.doc
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