RU2019110035A - Свиньи, содержащие модифицированный белок cd163, и связанные с этим способы - Google Patents
Свиньи, содержащие модифицированный белок cd163, и связанные с этим способы Download PDFInfo
- Publication number
- RU2019110035A RU2019110035A RU2019110035A RU2019110035A RU2019110035A RU 2019110035 A RU2019110035 A RU 2019110035A RU 2019110035 A RU2019110035 A RU 2019110035A RU 2019110035 A RU2019110035 A RU 2019110035A RU 2019110035 A RU2019110035 A RU 2019110035A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- site
- edited
- pig
- genome
- cell
- Prior art date
Links
- 108010009992 CD163 antigen Proteins 0.000 title claims 21
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims 20
- 241000282887 Suidae Species 0.000 title claims 3
- 102000035118 modified proteins Human genes 0.000 title 1
- 108091005573 modified proteins Proteins 0.000 title 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 20
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 claims 17
- 101150087379 CD163 gene Proteins 0.000 claims 14
- 108020005067 RNA Splice Sites Proteins 0.000 claims 11
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims 9
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims 6
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims 6
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 claims 6
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 6
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 6
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 claims 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 3
- 241001135989 Porcine reproductive and respiratory syndrome virus Species 0.000 claims 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims 3
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 claims 3
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 claims 2
- 108010017070 Zinc Finger Nucleases Proteins 0.000 claims 2
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 claims 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims 1
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 claims 1
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 claims 1
- 108091027974 Mature messenger RNA Proteins 0.000 claims 1
- 210000001132 alveolar macrophage Anatomy 0.000 claims 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 claims 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 claims 1
- 210000000973 gametocyte Anatomy 0.000 claims 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims 1
- 238000010362 genome editing Methods 0.000 claims 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 claims 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 1
- 210000004980 monocyte derived macrophage Anatomy 0.000 claims 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 claims 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 claims 1
- 210000001778 pluripotent stem cell Anatomy 0.000 claims 1
- 230000002685 pulmonary effect Effects 0.000 claims 1
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 claims 1
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 claims 1
- 210000003014 totipotent stem cell Anatomy 0.000 claims 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K67/00—Rearing or breeding animals, not otherwise provided for; New or modified breeds of animals
- A01K67/027—New or modified breeds of vertebrates
- A01K67/0275—Genetically modified vertebrates, e.g. transgenic
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70596—Molecules with a "CD"-designation not provided for elsewhere
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/8509—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
- C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
- C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
- C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
- C12N5/0602—Vertebrate cells
- C12N5/0634—Cells from the blood or the immune system
- C12N5/0645—Macrophages, e.g. Kuepfer cells in the liver; Monocytes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2217/00—Genetically modified animals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2217/00—Genetically modified animals
- A01K2217/05—Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2227/00—Animals characterised by species
- A01K2227/10—Mammal
- A01K2227/108—Swine
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2267/00—Animals characterised by purpose
- A01K2267/02—Animal zootechnically ameliorated
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2510/00—Genetically modified cells
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Environmental Sciences (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Biodiversity & Conservation Biology (AREA)
- Animal Husbandry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Claims (58)
1. Генетически отредактированная свинья, где эта свинья содержит отредактированный геном, где это редактирование приводит к удалению домена SRCR5 из белка CD163, продуцируемого свиньей.
2. Генетически отредактированная свинья по п. 1, где эта свинья содержит отредактированный геном, где это редактирование приводит к удалению SRCR5 из белка CD163, продуцируемого животным, и где присутствуют все другие домены белка CD163, и их аминокислотные последовательности не изменены.
3. Генетически отредактированная свинья по п. 1 или 2, где белок CD163, продуцируемый генетически отредактированной свиньей, остается в значительной степени функциональным.
4. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где белок CD163 не имеет следующей аминокислотной последовательности:
HRKPRLVGGDIPCSGRVEV QHGDTWGTVCDSDFSL EAASVLCRELQCG TVVSLLGGAHFGEG SGQIWAEEFQCEG HESHLSLCPVAPR PDGTCSHSRDVGVVCS (SEQ ID NO: 2).
5. Генетически отредактированная свинья по п. 4, где белок CD163, продуцируемый генетически отредактированной свиньей, не имеет других изменений в аминокислотной последовательности дикого типа.
6. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, которая является гомозиготной или биаллельной для редактирования генома, что приводит к удалению домена SRCR5 из белка CD163, продуцируемого животным.
7. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где все клетки животного содержат отредактированный геном.
8. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где геном свиньи отредактирован таким образом, что последовательность, которая кодирует SRCR5, отсутствует в зрелой мРНК, полученной из отредактированного гена CD163.
9. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где свинья содержит отредактированный геном, в котором был удален экзон 7 гена CD163.
10. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где акцепторный сайт сплайсинга, расположенный на 5'-конце экзона 7 гена CD163, является инактивированным.
11. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где экзоны 1-6 и 8-16 гена CD163 не изменены по сравнению с последовательностью дикого типа.
12. Генетически отредактированная свинья по п. 11, где экзон 7 и части интронов 6 и 7, которые фланкируют экзон 7, удалены из гена CD163, но отсутствуют другие изменения в остальных областях гена CD163.
13. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где отредактированный геном отредактирован так, что последовательность донорного сайта сплайсинга в интроне 6 и акцепторный сайт сплайсинга в интроне 7 не изменяются и остаются функциональными.
14. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где геном отредактирован таким образом, что, по меньшей мере, часть области гена CD163, расположенной от положения 10466 до 23782 в нуклеотидной последовательности, приведенной в SEQ ID NO: 1, удаляется.
15. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где геном отредактирован таким образом, что области от положения 1 до положения 10465 и от положения 23783 или 23754 до положения 32908 в нуклеотидной последовательности, приведенной в SEQ ID NO: 1, не подвергаются изменениям.
16. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где геном отредактирован таким образом, что экзон 7 удаляется вместе с участком протяженностью до 5000 оснований, предпочтительно до 2000 оснований, предпочтительно до 1000 оснований, предпочтительно до 500 оснований, предпочтительно до 300 оснований или предпочтительно до 100 оснований, находящимся на 5'-конце экзона 7.
17. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где геном отредактирован таким образом, что экзон 7 удаляется вместе с участком протяженностью до 75 оснований, находящимся на 3'-конце экзона 7.
18. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где геном отредактирован таким образом, что отредактированный геном содержит делецию области, расположенной от:
а) приблизительно положения 23060 до приблизительно положения 23760, например, от положения 23065 до положения 23753, в нуклеотидной последовательности, приведенной в SEQ ID NO: 1;
b) приблизительно положения 23260 до приблизительно положения 23760, например, от положения 23268 до положения 23753, в нуклеотидной последовательности, приведенной в SEQ ID NO: 1; или
c) приблизительно положения 23370 до приблизительно положения 23760, например, от положения 23374 до положения 23753, в нуклеотидной последовательности, приведенной в SEQ ID NO: 1.
19. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где отредактированный геном содержит вставленную последовательность.
20. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где геном отредактирован таким образом, что область, расположенная от положения 23378 до положения 23416 в нуклеотидной последовательности, приведенной в SEQ ID NO: 1, отредактирована так, что акцепторный сплайсинга сайт в интроне 6 инактивируется.
21. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где акцепторный сайт сплайсинга в интроне 6 частично или полностью удален или его последовательность изменена любым другим подходящим способом, так что он больше не функционирует.
22. Генетически отредактированная свинья по п. 20 или п. 21, где акцепторный сайт сплайсинга редактируют для изменения последовательности от AATGCTATTTTTCAG CCCACAGGAAACCCAGG (SEQ ID NO: 3) до AATGCTATTTTTCgG CCatggGGAAACCCAGG (SEQ ID NO: 4), где изменения последовательности показаны строчными буквами.
23. Генетически отредактированная свинья по любому из предшествующих пунктов, где генетически отредактированная свинья имеет повышенную толерантность или устойчивость к инфекции PRRSV по сравнению со свиньями дикого типа, предпочтительно, где животное устойчиво к инфекции РРСС.
24. Генетически отредактированная клетка или эмбрион свиньи, где редактирование приводит к удалению домена SRCR5 из белка CD163, продуцируемого клеткой или эмбрионом свиньи.
25. Способ получения генетически отредактированной свиньи, включающий в себя этапы:
a) получения свиной клетки;
b) редактирования генома клетки для создания модификации генома, которая приводит к удалению домена SRCR5 из белка CD163; иc) создания животного из указанной клетки.
26. Способ по п. 25, где модификацией генома, которая приводит к удалению домена SRCR5 из белка CD163, является делеция экзона 7 из гена CD163 или инактивация акцепторного сайта сплайсинга в интроне 6 гена CD163.
27. Способ по п. 25 или 26, где на этапе a) клетка свиньи является соматической клеткой, гаметой, зародышевой клеткой, гаметоцитом, стволовой клеткой (например, тотипотентной стволовой клеткой или плюрипотентной стволовой клеткой) или зиготой.
28. Способ по любому из пп. 25-27, где на этапе a) клетка свиньи представляет собой одноклеточную зиготу, и этап b) способа, по меньшей мере, инициируют и предпочтительно завершают в зиготе на стадии одной клетки.
29. Способ по любому из пп. 25-28, где этап b) включает в себя:
введение сайт-специфичной нуклеазы в клетку, сайт-специфичная нуклеаза, нацелена на подходящую последовательность-мишень в гене CD163;
инкубацию указанной клетки в подходящих условиях для того, чтобы указанная сайт-специфичная нуклеаза воздействовала на ДНК в указанной последовательности-мишени или рядом с ней; и
тем самым индуцирование события редактирования в гене CD163, которое приводит к удалению домена SRCR5 из белка CD163.
30. Способ по п. 29, где событие редактирования, которое приводит к удалению домена SRCR5 из белка CD163, может представлять собой делецию экзона 7 из гена CD163 или инактивацию акцепторного сайта сплайсинга в интроне 6 гена CD163.
31. Способ по п. 29 или 30, где этап b) включает в себя введение в клетку сайт-специфичных нуклеаз, которые нацелены на сайты-мишени, фланкирующие экзон 7 гена CD163, чтобы индуцировать двухцепочечные разрезы ДНК на каждой стороне экзона 7 и тем самым вызывать его делецию.
32. Способ по п. 31, где один сайт-мишень находится интроне 6, и сайт рестрикции находится на 3'-конце донорного сайта сплайсинга на 3'-конце экзона 6, и где другой сайт-мишень находится в интроне 7, и сайт рестрикции находится на 5'-конце акцепторного сайта сплайсинга на 5'-конце экзона 8.
33. Способ по любому из пп. 25-31, где этап b) включает в себя введение в клетку апстрим сайт-специфичной нуклеазы, где эта апстрим сайт-специфичная нуклеаза нацелена на сайт-мишень перед экзоном 7 CD163, и введение в клетку даунстрим сайт-специфичной нуклеазы, где эта даунстрим сайт-специфичная нуклеаза нацелена на сайт-мишень после экзона 7 CD163.
34. Способ по любому из пп. 29 или 30, где этап b) включает в себя введение сайт-специфичной нуклеазы, которая нацелена на акцепторный сайт сплайсинга в интроне 6.
35. Способ по п. 34, где сайт-специфичная нуклеаза, которая нацелена на акцепторный сайт сплайсинга в интроне 6, создает один двухцепочечный разрез в желаемом сайте рестрикции, чтобы инактивировать акцепторный сайт сплайсинга, связанный с экзоном 7, негомологичным соединением концов (NHEJ) или гомологичной репарацией (HDR).
36. Способ по п. 35, включающий в себя предоставление матрицы HDR, предпочтительно матрицы HDR, имеющей следующую последовательность: GAAGGAAAATAT GGAATCATATTCT CCCTCACCGAAATGC TATTTTTCgGC CatggGGAAACCCAGG CTGGTTGGAGGGG ACATTCCCTGCTCTGGTC (SEQ ID NO: 16), где строчные буквы показывают изменения, сделанные по сравнению с неизмененной последовательностью.
37. Способ по любому из пп. 25-36, где сайт-специфичная нуклеаза включает в себя, по меньшей мере, одну из следующих нуклеаз: нуклеаза цинкового пальца (ZFN), эффекторная нуклеаза, подобная активаторам транскрипции (TALEN), направляемая РНК нуклеаза CRISPR, (CRISPR/Cas9) или мегануклеаза.
38. Способ по п. 25, включающий в себя этапы:
получения зиготы свиней;
введения сайт-специфичной нуклеазы в зиготу, где эта сайт-специфичная нуклеаза, нацелена на подходящую последовательность-мишень в гене CD163;
инкубации указанной зиготы в подходящих условиях для того, чтобы указанная сайт-специфичная нуклеаза воздействовала на ДНК в указанной последовательности-мишени или рядом с ней и тем самым индуцировала событие редактирования в гене CD163, которое приводит к удалению домена SRCR5 из белка CD163; и получения животного из указанной генетически отредактированной зиготы.
39. Способ по любому из пп. 25-38, включающий в себя характеристику произошедшего события генетического редактирования.
40. Способ получения генетически отредактированной клетки или эмбриона свиньи, этот способ включает в себя этапы:
получения клетки или эмбриона свиньи;
редактирования генома клетки или клеток внутри эмбриона для получения геномного редактирования, которое приводит к удалению домена SRCR5 белка CD163.
41. Способ модификации свиньи для повышения ее устойчивости или толерантности к PRRSV, включающий в себя редактирование генома клеток свиньи для создания модификации, которая приводит к удалению домена SRCR5 из белка CD163.
42. Животное, клетка или эмбрион, полученные способом по любому из пп. 25-41, или животное, которое является потомком животного, полученного по любому из пп. 25-39 или 41.
43. Свинья или клетка свиньи, которая несет или экспрессирует белок CD163, в котором удален домен SRCR5.
44. Клетка по п. 43, которая представляет собой макрофаг, происходящий из моноцитов периферической крови (ММПК) или легочный альвеолярный макрофаг (ЛАМ).
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GB1617559.8 | 2016-10-17 | ||
| GBGB1617559.8A GB201617559D0 (en) | 2016-10-17 | 2016-10-17 | Swine comprising modified cd163 and associated methods |
| PCT/EP2017/076460 WO2018073237A1 (en) | 2016-10-17 | 2017-10-17 | Swine comprising modified cd163 and associated methods |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2019110035A true RU2019110035A (ru) | 2020-10-05 |
Family
ID=57680765
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2019110035A RU2019110035A (ru) | 2016-10-17 | 2017-10-17 | Свиньи, содержащие модифицированный белок cd163, и связанные с этим способы |
Country Status (12)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20200045945A1 (ru) |
| EP (1) | EP3525581A1 (ru) |
| JP (1) | JP2019533445A (ru) |
| KR (1) | KR20190067212A (ru) |
| CN (1) | CN109862786A (ru) |
| AU (1) | AU2017344936A1 (ru) |
| CA (1) | CA3037451A1 (ru) |
| GB (1) | GB201617559D0 (ru) |
| MX (1) | MX2019004464A (ru) |
| PH (1) | PH12019500624A1 (ru) |
| RU (1) | RU2019110035A (ru) |
| WO (1) | WO2018073237A1 (ru) |
Families Citing this family (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN108753832A (zh) * | 2018-04-20 | 2018-11-06 | 中山大学 | 一种利用CRISPR/Cas9编辑大白猪CD163基因的方法 |
| CN108823248A (zh) * | 2018-04-20 | 2018-11-16 | 中山大学 | 一种利用CRISPR/Cas9编辑陆川猪CD163基因的方法 |
| WO2020198541A1 (en) * | 2019-03-27 | 2020-10-01 | Recombinetics, Inc. | Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (prrsv) resistant swine |
| US11240997B2 (en) * | 2019-04-09 | 2022-02-08 | Shandong Landsee Genetics Co., Ltd. | Method for preparing porcine fibroblasts with both CD163 gene and CD13 gene being knocked-out |
| CN110438155A (zh) * | 2019-08-15 | 2019-11-12 | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 | 修饰cd163基因第561位氨基酸的组合物、应用、细胞及基因编辑猪的制备方法 |
| US11208659B2 (en) * | 2020-05-05 | 2021-12-28 | Genus Plc | Pig with a genetically modified CD163 gene resistant to PRRSv |
| EP4157277A4 (en) * | 2020-05-29 | 2024-05-22 | University of Connecticut | PORCINE REPRODUCTIVE AND RESPIRATORY SYNDROME VIRUS INHIBITORS |
| CN113512534B (zh) * | 2020-09-23 | 2024-04-23 | 杭州启函生物科技有限公司 | 用于遗传修饰和靶向的组合物和方法 |
| CN112094866B (zh) * | 2020-11-10 | 2021-05-11 | 北京首农未来生物科技有限公司 | 一种利用SpRY-Cas9系统制备CD163基因编辑猪的方法 |
| CN112877362A (zh) * | 2021-02-22 | 2021-06-01 | 杭州合欣源生物科技有限公司 | 构建高繁殖力、抗蓝耳病和系列腹泻病的优质猪核移植供体细胞的基因编辑系统及其应用 |
| CN114774468B (zh) * | 2022-04-20 | 2022-12-20 | 温氏食品集团股份有限公司 | 一种等位基因分子标记及抗蓝耳病猪群体组建方法 |
| CN119979720B (zh) * | 2025-02-26 | 2025-09-23 | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 | 猪精液品质相关的分子标记鉴定及其应用 |
Family Cites Families (48)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4873191A (en) | 1981-06-12 | 1989-10-10 | Ohio University | Genetic transformation of zygotes |
| GB9710809D0 (en) | 1997-05-23 | 1997-07-23 | Medical Res Council | Nucleic acid binding proteins |
| EP1060261B1 (en) | 1998-03-02 | 2010-05-05 | Massachusetts Institute of Technology | Poly zinc finger proteins with improved linkers |
| US7013219B2 (en) | 1999-01-12 | 2006-03-14 | Sangamo Biosciences, Inc. | Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins |
| US6534261B1 (en) | 1999-01-12 | 2003-03-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins |
| US20030104526A1 (en) | 1999-03-24 | 2003-06-05 | Qiang Liu | Position dependent recognition of GNN nucleotide triplets by zinc fingers |
| US6794136B1 (en) | 2000-11-20 | 2004-09-21 | Sangamo Biosciences, Inc. | Iterative optimization in the design of binding proteins |
| US7030215B2 (en) | 1999-03-24 | 2006-04-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Position dependent recognition of GNN nucleotide triplets by zinc fingers |
| BRPI0307383B1 (pt) | 2002-01-23 | 2019-12-31 | The Univ Of Utah Research Foundation | método de recombinação genética direcionada em célula de planta hospedeira |
| AU2003218382B2 (en) | 2002-03-21 | 2007-12-13 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for using zinc finger endonucleases to enhance homologous recombination |
| BRPI0508928B1 (pt) | 2004-04-23 | 2015-10-06 | Pah P & U Llc | Processo de falicitação da infecção de uma célula de vertebrado por PRRSV e para medir a propensão de uma linhagem de células teste à referida infecção |
| CA2700170A1 (en) | 2007-09-27 | 2009-04-02 | Sangamo Biosciences, Inc. | Genomic editing in zebrafish using zinc finger nucleases |
| US8309791B2 (en) | 2008-07-16 | 2012-11-13 | Recombinectics, Inc. | Method for producing a transgenic pig using a hyper-methylated transposon |
| US8546553B2 (en) | 2008-07-25 | 2013-10-01 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Prokaryotic RNAi-like system and methods of use |
| US20100076057A1 (en) | 2008-09-23 | 2010-03-25 | Northwestern University | TARGET DNA INTERFERENCE WITH crRNA |
| US20110239315A1 (en) | 2009-01-12 | 2011-09-29 | Ulla Bonas | Modular dna-binding domains and methods of use |
| EP2206723A1 (en) | 2009-01-12 | 2010-07-14 | Bonas, Ulla | Modular DNA-binding domains |
| CA2770312A1 (en) | 2009-08-11 | 2011-02-17 | Sangamo Biosciences, Inc. | Organisms homozygous for targeted modification |
| US8586526B2 (en) | 2010-05-17 | 2013-11-19 | Sangamo Biosciences, Inc. | DNA-binding proteins and uses thereof |
| US8586363B2 (en) | 2009-12-10 | 2013-11-19 | Regents Of The University Of Minnesota | TAL effector-mediated DNA modification |
| EP2615106B1 (en) | 2010-02-08 | 2018-04-25 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Engineered cleavage half-domains |
| KR20140046408A (ko) | 2011-02-25 | 2014-04-18 | 리컴비네틱스 인코포레이티드 | 유전자 변형 동물 및 이의 생산방법 |
| US20140201857A1 (en) | 2013-01-14 | 2014-07-17 | Recombinetics, Inc. | Hornless livestock |
| KR20140034229A (ko) | 2011-05-16 | 2014-03-19 | 더 큐레이터스 오브 더 유니버시티 오브 미주리 | 돼지 생식기 호흡기 증후군 바이러스 내성 동물 |
| WO2013141680A1 (en) | 2012-03-20 | 2013-09-26 | Vilnius University | RNA-DIRECTED DNA CLEAVAGE BY THE Cas9-crRNA COMPLEX |
| US9637739B2 (en) | 2012-03-20 | 2017-05-02 | Vilnius University | RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex |
| US20160046961A1 (en) | 2012-05-25 | 2016-02-18 | Emmanuelle Charpentier | Methods and Compositions for RNA-Directed Target DNA Modification and For RNA-Directed Modulation of Transcription |
| KR20150023670A (ko) | 2012-06-12 | 2015-03-05 | 제넨테크, 인크. | 조건적 녹아웃 대립유전자의 생성 방법 및 이를 위한 조성물 |
| WO2013188638A2 (en) | 2012-06-15 | 2013-12-19 | The Regents Of The University Of California | Endoribonucleases and methods of use thereof |
| AR091482A1 (es) | 2012-06-21 | 2015-02-04 | Recombinetics Inc | Celulas modificadas geneticamente y metodos par su obtencion |
| US10058078B2 (en) | 2012-07-31 | 2018-08-28 | Recombinetics, Inc. | Production of FMDV-resistant livestock by allele substitution |
| KR20150100651A (ko) | 2012-10-30 | 2015-09-02 | 리컴비네틱스 인코포레이티드 | 동물의 성적 성숙 조절 |
| CN108913676B (zh) | 2012-12-06 | 2023-11-03 | 西格马-奥尔德里奇有限责任公司 | 基于crispr的基因组修饰和调控 |
| WO2014093479A1 (en) | 2012-12-11 | 2014-06-19 | Montana State University | Crispr (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) rna-guided control of gene regulation |
| EP2931892B1 (en) | 2012-12-12 | 2018-09-12 | The Broad Institute, Inc. | Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
| KR20150105956A (ko) | 2012-12-12 | 2015-09-18 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 서열 조작 및 치료적 적용을 위한 시스템, 방법 및 조성물의 전달, 유전자 조작 및 최적화 |
| ES2536353T3 (es) | 2012-12-12 | 2015-05-22 | The Broad Institute, Inc. | Ingeniería de sistemas, métodos y composiciones de guía optimizadas para manipulación de secuencias |
| US8697359B1 (en) | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
| WO2014093694A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-cas nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation in eukaryotes |
| ES2576128T3 (es) | 2012-12-12 | 2016-07-05 | The Broad Institute, Inc. | Modificación por tecnología genética y optimización de sistemas, métodos y composiciones para la manipulación de secuencias con dominios funcionales |
| US20140186843A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-07-03 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
| DK2898075T3 (en) | 2012-12-12 | 2016-06-27 | Broad Inst Inc | CONSTRUCTION AND OPTIMIZATION OF IMPROVED SYSTEMS, PROCEDURES AND ENZYME COMPOSITIONS FOR SEQUENCE MANIPULATION |
| US20140189896A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-07-03 | Feng Zhang | Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation |
| EP2931899A1 (en) | 2012-12-12 | 2015-10-21 | The Broad Institute, Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, knock out libraries and applications thereof |
| GB201313235D0 (en) * | 2013-07-24 | 2013-09-04 | Univ Edinburgh | Antiviral Compositions Methods and Animals |
| CN104593422A (zh) * | 2015-01-08 | 2015-05-06 | 中国农业大学 | 一种抗蓝耳病克隆猪的制备方法 |
| SI3331355T1 (sl) * | 2015-08-06 | 2024-10-30 | The Curators Of The University Of Missouri | Prašič, odporen na virus prašičjegaa reproduktivnega in respiratornega sindroma (PRRSV) in celice s spremenjenimi geni CD163 |
| AU2015404563B2 (en) * | 2015-08-06 | 2022-11-17 | The Curators Of The University Of Missouri | Pathogen-resistant animals having modified CD163 genes |
-
2016
- 2016-10-17 GB GBGB1617559.8A patent/GB201617559D0/en not_active Ceased
-
2017
- 2017-10-17 EP EP17793863.6A patent/EP3525581A1/en not_active Withdrawn
- 2017-10-17 CA CA3037451A patent/CA3037451A1/en not_active Abandoned
- 2017-10-17 AU AU2017344936A patent/AU2017344936A1/en not_active Abandoned
- 2017-10-17 CN CN201780064104.0A patent/CN109862786A/zh active Pending
- 2017-10-17 US US16/342,650 patent/US20200045945A1/en not_active Abandoned
- 2017-10-17 JP JP2019520520A patent/JP2019533445A/ja active Pending
- 2017-10-17 WO PCT/EP2017/076460 patent/WO2018073237A1/en not_active Ceased
- 2017-10-17 KR KR1020197013373A patent/KR20190067212A/ko not_active Withdrawn
- 2017-10-17 MX MX2019004464A patent/MX2019004464A/es unknown
- 2017-10-17 RU RU2019110035A patent/RU2019110035A/ru not_active Application Discontinuation
-
2019
- 2019-03-22 PH PH12019500624A patent/PH12019500624A1/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2018073237A1 (en) | 2018-04-26 |
| CN109862786A (zh) | 2019-06-07 |
| MX2019004464A (es) | 2019-09-26 |
| AU2017344936A1 (en) | 2019-04-04 |
| PH12019500624A1 (en) | 2019-08-19 |
| EP3525581A1 (en) | 2019-08-21 |
| KR20190067212A (ko) | 2019-06-14 |
| JP2019533445A (ja) | 2019-11-21 |
| GB201617559D0 (en) | 2016-11-30 |
| CA3037451A1 (en) | 2018-04-26 |
| US20200045945A1 (en) | 2020-02-13 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2019110035A (ru) | Свиньи, содержащие модифицированный белок cd163, и связанные с этим способы | |
| US10959414B2 (en) | Efficient non-meiotic allele introgression | |
| EP2493288B1 (en) | Homologous recombination in the oocyte | |
| Zhou et al. | Generation of gene-edited sheep with a defined Booroola fecundity gene (FecBB) mutation in bone morphogenetic protein receptor type 1B (BMPR1B) via clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/CRISPR-associated (Cas) 9 | |
| Yasue et al. | Highly efficient targeted mutagenesis in one-cell mouse embryos mediated by the TALEN and CRISPR/Cas systems | |
| JP2018525000A5 (ru) | ||
| Li et al. | One-step efficient generation of dual-function conditional knockout and geno-tagging alleles in zebrafish | |
| Liu et al. | A highly effective TALEN-mediated approach for targeted gene disruption in Xenopus tropicalis and zebrafish | |
| Tanihara et al. | Current status of the application of gene editing in pigs | |
| HK1209276A1 (en) | Methods and compositions for generating conditional knock-out alleles | |
| JP2016525890A (ja) | 遺伝的不妊性動物 | |
| JP6958917B2 (ja) | 遺伝子ノックイン細胞の作製方法 | |
| Lee et al. | Conditional targeting of Ispd using paired Cas9 nickase and a single DNA template in mice | |
| Ayabe et al. | Off-and on-target effects of genome editing in mouse embryos | |
| Hara et al. | Microinjection-based generation of mutant mice with a double mutation and a 0.5 Mb deletion in their genome by the CRISPR/Cas9 system | |
| JP2025168433A (ja) | 高頻度標的化動物遺伝子導入 | |
| Zinovieva et al. | Genome editing: current state of research and application to animal husbandry | |
| WO2021186163A1 (en) | Optimised methods for cleavage of target sequences | |
| JP7007734B2 (ja) | 条件付きノックアウト動物の製造方法 | |
| US20180271068A1 (en) | Genetically-Edited Swine | |
| Owen et al. | Improved rate of targeted gene knock-in of in-vitro fertilized bovine embryos. | |
| WO2025186557A1 (en) | Virus resilient genetically engineered animals | |
| CN115868449A (zh) | 精子发生障碍动物模型的构建方法 | |
| De Cian et al. | Efficient gene targeting by homology-directed repair in rat zygotes using TALE nucleases | |
| Brandl et al. | Creation of targeted genomic deletions using TALEN or CRISPR/Cas |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA93 | Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination) |
Effective date: 20201019 |