RU2018117360A - Сконструированные нуклеиновые кислоты, нацеленные на нуклеиновую кислоту - Google Patents
Сконструированные нуклеиновые кислоты, нацеленные на нуклеиновую кислоту Download PDFInfo
- Publication number
- RU2018117360A RU2018117360A RU2018117360A RU2018117360A RU2018117360A RU 2018117360 A RU2018117360 A RU 2018117360A RU 2018117360 A RU2018117360 A RU 2018117360A RU 2018117360 A RU2018117360 A RU 2018117360A RU 2018117360 A RU2018117360 A RU 2018117360A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- acid sequence
- repeat
- protein
- nasc
- Prior art date
Links
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims 79
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims 16
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims 16
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 59
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 claims 26
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 20
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 15
- 102000044158 nucleic acid binding protein Human genes 0.000 claims 9
- 108700020942 nucleic acid binding protein Proteins 0.000 claims 9
- 108091081062 Repeated sequence (DNA) Proteins 0.000 claims 8
- 239000012636 effector Substances 0.000 claims 7
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims 6
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims 6
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 claims 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims 5
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 5
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 claims 5
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims 4
- 238000010356 CRISPR-Cas9 genome editing Methods 0.000 claims 3
- 241000589875 Campylobacter jejuni Species 0.000 claims 2
- 102100022379 SOSS complex subunit B1 Human genes 0.000 claims 2
- 101710170912 SOSS complex subunit B1 Proteins 0.000 claims 2
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 claims 2
- 241000194020 Streptococcus thermophilus Species 0.000 claims 2
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 102000011931 Nucleoproteins Human genes 0.000 claims 1
- 108010061100 Nucleoproteins Proteins 0.000 claims 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 claims 1
- 241000193996 Streptococcus pyogenes Species 0.000 claims 1
- 101150038500 cas9 gene Proteins 0.000 claims 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
- C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
- C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/22—Ribonucleases [RNase]; Deoxyribonucleases [DNase]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/50—Physical structure
- C12N2310/51—Physical structure in polymeric form, e.g. multimers, concatemers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/50—Physical structure
- C12N2310/52—Physical structure branched
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Mycology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Claims (72)
1. Композиция двух или более сконструированных последовательностей нуклеиновой кислоты, образующих остов (nucleic acid sequences forming a scaffold, «NASC»), причем указанная композиция NASC содержит
первый компонент сконструированной нуклеиновой кислоты («NASC-PC1») содержащий в направлении от 5'- к 3'-концу
спейсерный элемент 1, содержащий последовательность 1, связывающуюся с нуклеиновой кислотой-мишенью,
элемент повтора 1, содержащий последовательность нуклеиновой кислоты 1 повтора, и
элемент связывания 1 белка, связывающего нуклеиновую кислоту, содержащий последовательность связывания 1 белка, связывающего двухцепочечную нуклеиновую кислоту,
причем указанный спейсерный элемент 1 ковалентным способом присоединен к указанному элементу повтора 1, и указанный элемент повтора 1 ковалентным способом присоединен к указанному элементу связывания 1 белка, связывающего нуклеиновую кислоту;
второй компонент сконструированной нуклеиновой кислоты («NASC-PC2»), содержащий в направлении от 5'- к 3'-концу
спейсерный элемент 2, содержащий последовательность 2, связывающуюся с нуклеиновой кислотой-мишенью,
элемент повтора 2, содержащий последовательность нуклеиновой кислоты 2 повтора, и
элемент связывания 2 белка, связывающего нуклеиновую кислоту, содержащий последовательность связывания 2 белка, связывающего двухцепочечную нуклеиновую кислоту,
причем указанный спейсерный элемент 2 ковалентным способом присоединен к указанному элементу повтора 2, и указанный элемент повтора 2 ковалентным способом присоединен к указанному элементу связывания 2 белка, связывающего нуклеиновую кислоту;
причем существует соединение между указанной последовательностью нуклеиновой кислоты 1 повтора и указанной последовательностью нуклеиновой кислоты 2 повтора посредством связанных водородной связью пар оснований, причем указанное соединение образует композицию NASC, и указанная композиция NASC способна к связыванию с первым белком, связывающим двухцепочечную нуклеиновую кислоту, и вторым белком, связывающим двухцепочечную нуклеиновую кислоту.
2. Композиция NASC по п. 1, отличающаяся тем, что указанный первый белок, связывающий двухцепочечную нуклеиновую кислоту, представляет собой белок CRISPR-Cas9 Класса 2 Типа II, и указанный второй белок, связывающий двухцепочечную нуклеиновую кислоту, представляет собой белок CRISPR-Cas9 Класса 2 Типа II.
3. Композиция NASC по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанный первый белок, связывающий двухцепочечную нуклеиновую кислоту, и указанный второй белок, связывающий двухцепочечную нуклеиновую кислоту, представляют собой один и тот же белок CRISPR-Cas9 Класса 2 Типа II.
4. Композиция NASC по любому предшествующему пункту, отличающаяся тем, что
указанный спейсерный элемент 1 также содержит последовательность нуклеиновой кислоты линкерного элемента, в направлении 3'-конца относительно последовательности 1, связывающейся с нуклеиновой кислотой-мишенью, и расположенную в направлении 5'-конца от элемента повтора 1; и
указанный спейсерный элемент 2 также содержит последовательность нуклеиновой кислоты линкерного элемента, в направлении 3'-конца относительно последовательности 1, связывающейся с нуклеиновой кислотой-мишенью, и расположенную в направлении 5'-конца от элемента повтора 1.
5. Композиция NASC по п. 4, отличающаяся тем, что
указанный элемент повтора 1 также содержит в направлении от 5'- к 3'-концу последовательность нуклеиновой кислоты 1b повтора, последовательность нуклеиновой кислоты 1 линкерного элемента и последовательность нуклеиновой кислоты 1а повтора; и
указанный элемент повтора 2 также содержит в направлении от 5' - к 3'-концу последовательность нуклеиновой кислоты 1аС повтора, последовательность нуклеиновой кислоты 2 линкерного элемента и последовательность нуклеиновой кислоты 1bС повтора, последовательность нуклеиновой кислоты 1 повтора и последовательность нуклеиновой кислоты линкерного элемента;
причем указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1b повтора и указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1bС повтора соединены посредством связанных водородной связью пар оснований, и указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1а повтора и указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1аС повтора соединены посредством связанных водородной связью пар оснований.
6. Композиция NASC по п. 5, отличающаяся тем, что
указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1b повтора также содержит в направлении от 5'- к 3'-концу
последовательность нуклеиновой кислоты 1b2 повтора,
последовательность нуклеиновой кислоты 1b1 выпячивания и
последовательность нуклеиновой кислоты 1b1 повтора;
указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1а повтора также содержит в направлении от 5'- к 3'-концу
последовательность нуклеиновой кислоты 1а2 повтора,
последовательность нуклеиновой кислоты 1a1 выпячивания и
последовательность нуклеиновой кислоты 1a1 повтора;
указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1аС повтора также содержит в направлении от 5'- к 3'-концу
последовательность нуклеиновой кислоты 1a1С повтора,
последовательность нуклеиновой кислоты 2а2 выпячивания и
последовательность нуклеиновой кислоты 1а2С повтора; и
указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1bС повтора также содержит в направлении от 5'- к 3'-концу
последовательность нуклеиновой кислоты 1b1С повтора,
последовательность нуклеиновой кислоты 2b2 выпячивания и
последовательность нуклеиновой кислоты 1b2С повтора;
причем указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1a1 повтора и указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1a1С повтора соединены посредством связанных водородной связью пар оснований, указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1а2 повтора и указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1а2С повтора соединены посредством связанных водородной связью пар оснований, указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1b1 повтора и указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1b1С повтора соединены посредством связанных водородной связью пар оснований, и указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1b2 повтора и указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1b2С повтора соединены посредством связанных водородной связью пар оснований.
7. Композиция NASC по п. 6, отличающаяся тем, что
указанная последовательность нуклеиновой кислоты линкерного элемента 1 также содержит в направлении от 5'- к 3'-концу:
последовательность нуклеиновой кислоты 1-2-2 линкерного элемента,
последовательность нуклеиновой кислоты 1-2а повтора и
последовательность нуклеиновой кислоты 1-2-1 линкерного элемента;
указанная последовательность нуклеиновой кислоты 2-2 линкерного элемента также содержит в направлении от 5'- к 3'-концу:
последовательность нуклеиновой кислоты 2-2-1 линкерного элемента
последовательность нуклеиновой кислоты 1-2аС повтора и
последовательность нуклеиновой кислоты 2-2-2 линкерного элемента; причем указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1-2а повтора и указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1-2аС повтора соединены посредством связанных водородной связью пар оснований и образуют область двухцепочечной нуклеиновой кислоты 1-2.
8. Композиция NASC по п. 7, отличающаяся тем, что
указанная область двухцепочечной нуклеиновой кислоты 1-2 дополнительно содержит сайт связывания эффекторного белка;
указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1-2а повтора дополнительно содержит последовательность нуклеиновой кислоты 1-2а сайта связывания эффекторного белка; и
указанная последовательность нуклеиновой кислоты 2 повтора дополнительно содержит последовательность нуклеиновой кислоты 1-2аС сайта связывания эффекторного белка;
причем указанный сайт связывания эффектора образован посредством образования водородных связей пар оснований между последовательностью нуклеиновой кислоты 1-2а сайта связывания эффекторного белка и последовательностью нуклеиновой кислоты 1-2аС сайта связывания эффекторного белка.
9. Композиция NASC по п. 8, отличающаяся тем, что указанный сайт связывания 1 эффекторного белка представляет собой сайт связывания белка Csy4.
10. Композиция NASC по любому из пп. 1-9, отличающаяся тем, что
указанная последовательность нуклеиновой кислоты 1 повтора дополнительно содержит аффинную метку 1; и
указанная последовательность нуклеиновой кислоты 2 повтора дополнительно содержит аффинную метку 2;
причем указанная аффинная метка 1 соединена с указанной аффинной меткой 2.
11. Композиция NASC по п. 10, отличающаяся тем, что указанная композиция NASC содержит РНК, ДНК или РНК и ДНК.
12. Композиция NASC по п. 11, отличающаяся тем, что указанный NASC-PC2 содержит РНК и ДНК.
13. Композиция нуклеиновой кислоты/белка, содержащая
композицию NASC по любому предшествующему пункту; и
первый белок Cas9 и второй белок Cas9.
14. Композиция нуклеиновой кислоты/белка по п. 13, отличающаяся тем, что указанный первый белок Cas9 является таким же, как и указанный второй белок Cas9, и указанный первый белок Cas9 и указанный второй белок Cas9 выбраны из группы, состоящей из белка Cas9 Streptococcus pyogenes, белка Cas9 Streptococcus thermophilus, белка Cas9 Staphylococcus aureus и белка Cas9 Campylobacter jejuni.
15. Композиция нуклеиновой кислоты/белка по п. 13, отличающаяся тем, что указанный первый белок Cas9 отличается от указанного второго белка Cas9, и указанный первый белок Cas9 и указанный второй белок Cas9 выбраны из группы, состоящей из белка Cas9 Streptococcus pyogenes, белка Cas9 Streptococcus thermophilus, белка Cas9 Staphylococcus aureus и белка Cas9 Campylobacter jejuni.
16. Композиция нуклеиновой кислоты/белка по п. 15, отличающаяся тем, что указанный первый белок Cas9 и указанный второй белок Cas9 выбраны из группы, состоящей из белка Саs9/белка Cas9, белка Саs9/белка dCas9, белка dСаs9/белка Cas9 и белка dCas9/бнлеп dCas9, соответственно.
17. Композиция нуклеиновой кислоты/белка по любому из пп. 13-16, отличающаяся тем, что указанная композиция NASC содержит РНК, ДНК или РНК и ДНК.
18. Набор, содержащий
композицию NASC по любому из пп. 1-12 или одну или несколько последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующих композицию NASC по любому из пп. 1-12; и
буфер.
19. Набор по п. 18, дополнительно содержащий один или несколько белков Cas9 или одну или несколько последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующих один или несколько белков Cas9.
20. Набор по п. 18, дополнительно содержащий нуклеопротеиновые комплексы, которые содержат композицию NASC и один или несколько белков Cas9.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201562263232P | 2015-12-04 | 2015-12-04 | |
| US62/263,232 | 2015-12-04 | ||
| PCT/US2016/064860 WO2017096328A1 (en) | 2015-12-04 | 2016-12-02 | Engineered nucleic-acid targeting nucleic acids |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2018117360A3 RU2018117360A3 (ru) | 2020-01-09 |
| RU2018117360A true RU2018117360A (ru) | 2020-01-09 |
Family
ID=57750577
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2018117360A RU2018117360A (ru) | 2015-12-04 | 2016-12-02 | Сконструированные нуклеиновые кислоты, нацеленные на нуклеиновую кислоту |
Country Status (17)
| Country | Link |
|---|---|
| US (4) | US9771600B2 (ru) |
| EP (2) | EP3564371B1 (ru) |
| JP (1) | JP6707133B2 (ru) |
| KR (1) | KR102093570B1 (ru) |
| CN (1) | CN108473981B (ru) |
| AU (2) | AU2016363024B2 (ru) |
| CA (1) | CA3004757C (ru) |
| DK (1) | DK3371310T3 (ru) |
| ES (1) | ES2735773T3 (ru) |
| HK (1) | HK1252755B (ru) |
| IL (1) | IL259148B (ru) |
| MX (1) | MX391311B (ru) |
| NZ (2) | NZ742040A (ru) |
| RU (1) | RU2018117360A (ru) |
| SG (1) | SG11201803593QA (ru) |
| WO (1) | WO2017096328A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA201802968B (ru) |
Families Citing this family (29)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP3564371B1 (en) | 2015-12-04 | 2020-05-27 | Caribou Biosciences, Inc. | Engineered nucleic-acid targeting nucleic acids |
| PL3604527T3 (pl) * | 2016-06-02 | 2021-09-06 | Sigma-Aldrich Co., Llc | Zastosowanie programowalnych białek wiążących dna do wzmocnienia celowanej modyfikacji genomu |
| US12286727B2 (en) | 2016-12-19 | 2025-04-29 | Editas Medicine, Inc. | Assessing nuclease cleavage |
| US11499151B2 (en) | 2017-04-28 | 2022-11-15 | Editas Medicine, Inc. | Methods and systems for analyzing guide RNA molecules |
| CN107488710B (zh) | 2017-07-14 | 2020-09-22 | 上海吐露港生物科技有限公司 | 一种Cas蛋白的用途及靶标核酸分子的检测方法和试剂盒 |
| EP3652312A1 (en) | 2017-07-14 | 2020-05-20 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for targeted integration and genome editing and detection thereof using integrated priming sites |
| US11584955B2 (en) * | 2017-07-14 | 2023-02-21 | Shanghai Tolo Biotechnology Company Limited | Application of Cas protein, method for detecting target nucleic acid molecule and kit |
| WO2019041296A1 (zh) * | 2017-09-01 | 2019-03-07 | 上海科技大学 | 一种碱基编辑系统及方法 |
| AU2018329745A1 (en) * | 2017-09-11 | 2020-04-16 | The Regents Of The University Of California | Antibody-mediated delivery of Cas9 to mammalian cells |
| WO2019152941A1 (en) | 2018-02-05 | 2019-08-08 | Caribou Biosciences, Inc. | Engineered gut microbes for reduction of reactivation of detoxified drugs |
| CA3087715A1 (en) | 2018-02-08 | 2019-08-15 | Zymergen Inc. | Genome editing using crispr in corynebacterium |
| JP2021523745A (ja) | 2018-05-16 | 2021-09-09 | シンテゴ コーポレイション | ガイドｒｎａ設計および使用のための方法およびシステム |
| CA3104856A1 (en) | 2018-06-29 | 2020-01-02 | Editas Medicine, Inc. | Synthetic guide molecules, compositions and methods relating thereto |
| AU2019319377A1 (en) * | 2018-08-09 | 2021-03-11 | G+Flas Life Sciences | Novel CRISPR-associated protein and use thereof |
| CN109517722B (zh) * | 2018-09-28 | 2022-04-01 | 德拜至臻医学科技(杭州)有限公司 | 一种捕获特定微量细胞的装置及其制作和使用方法 |
| WO2020077265A1 (en) | 2018-10-12 | 2020-04-16 | Theradaptive, Inc. | Polypeptides including a beta-tricalcium phosphate-binding sequence and uses thereof |
| US20220290120A1 (en) | 2019-02-25 | 2022-09-15 | Novome Biotechnologies, Inc. | Plasmids for gene editing |
| AU2020369599A1 (en) | 2019-10-23 | 2022-05-12 | Monsanto Technology Llc | Compositions and methods for RNA-templated editing in plants |
| MX2022005328A (es) * | 2019-11-05 | 2022-07-21 | Pairwise Plants Services Inc | Composiciones y metodos para el reemplazo de alelos con adn codificado por arn. |
| US20230203115A1 (en) * | 2020-03-06 | 2023-06-29 | Theradaptive, Inc. | Therapeutic compositions comprising graft materials and beta-tcp binding peptides and uses thereof |
| US11453907B2 (en) * | 2020-03-23 | 2022-09-27 | The Broad Institute, Inc. | Crispr effector system based coronavirus diagnostics |
| EP4135750A4 (en) | 2020-04-15 | 2024-08-21 | Theradaptive, Inc. | COMPOSITIONS AND METHODS FOR TARGETED THERAPEUTIC RELEASE IN BONE |
| BR112023024985A2 (pt) | 2021-06-01 | 2024-02-20 | Arbor Biotechnologies Inc | Sistemas de edição de genes compreendendo uma crispr nuclease e usos dos mesmos |
| CN114540325B (zh) * | 2022-01-17 | 2022-12-09 | 广州医科大学 | 靶向dna去甲基化的方法、融合蛋白及其应用 |
| CN116377104B (zh) * | 2022-11-14 | 2024-01-12 | 海南省农业科学院蔬菜研究所 | 一种快菜高温胁迫内参基因及其引物及应用 |
| TW202440938A (zh) | 2023-02-15 | 2024-10-16 | 美商喬木生物技術公司 | 用於抑制微管解聚蛋白2(stmn2)轉錄物中異常剪接的基因編輯方法 |
| WO2025171210A1 (en) | 2024-02-09 | 2025-08-14 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Compositions and methods for gene editing via homology-mediated end joining |
| WO2026015829A2 (en) | 2024-07-12 | 2026-01-15 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Small reverse transcriptases and gene editing systems comprising such |
| WO2026015832A2 (en) | 2024-07-12 | 2026-01-15 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Reverse transcriptases and gene editing systems comprising such |
Family Cites Families (21)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US10087431B2 (en) | 2010-03-10 | 2018-10-02 | The Regents Of The University Of California | Methods of generating nucleic acid fragments |
| JP5926242B2 (ja) | 2010-05-10 | 2016-05-25 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | エンドリボヌクレアーゼ組成物およびその使用方法 |
| AU2012302195A1 (en) * | 2011-09-01 | 2014-01-23 | Hip Innovation Technology Llc | Lined femoral cup |
| US9637739B2 (en) * | 2012-03-20 | 2017-05-02 | Vilnius University | RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex |
| US20160046961A1 (en) | 2012-05-25 | 2016-02-18 | Emmanuelle Charpentier | Methods and Compositions for RNA-Directed Target DNA Modification and For RNA-Directed Modulation of Transcription |
| WO2013188638A2 (en) | 2012-06-15 | 2013-12-19 | The Regents Of The University Of California | Endoribonucleases and methods of use thereof |
| EP2880171B1 (en) | 2012-08-03 | 2018-10-03 | The Regents of The University of California | Methods and compositions for controlling gene expression by rna processing |
| EP2912175B1 (en) | 2012-10-23 | 2018-08-22 | Toolgen Incorporated | Composition for cleaving a target dna comprising a guide rna specific for the target dna and cas protein-encoding nucleic acid or cas protein, and use thereof |
| US20140189896A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-07-03 | Feng Zhang | Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation |
| ES2536353T3 (es) | 2012-12-12 | 2015-05-22 | The Broad Institute, Inc. | Ingeniería de sistemas, métodos y composiciones de guía optimizadas para manipulación de secuencias |
| DK2898075T3 (en) | 2012-12-12 | 2016-06-27 | Broad Inst Inc | CONSTRUCTION AND OPTIMIZATION OF IMPROVED SYSTEMS, PROCEDURES AND ENZYME COMPOSITIONS FOR SEQUENCE MANIPULATION |
| WO2014093694A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-cas nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation in eukaryotes |
| US8697359B1 (en) | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
| ES2576128T3 (es) | 2012-12-12 | 2016-07-05 | The Broad Institute, Inc. | Modificación por tecnología genética y optimización de sistemas, métodos y composiciones para la manipulación de secuencias con dominios funcionales |
| GB2527450A (en) | 2013-03-14 | 2015-12-23 | Caribou Biosciences Inc | Compositions and methods of nucleic acid-targeting nucleic acids |
| WO2015071474A2 (en) | 2013-11-18 | 2015-05-21 | Crispr Therapeutics Ag | Crispr-cas system materials and methods |
| WO2015089364A1 (en) * | 2013-12-12 | 2015-06-18 | The Broad Institute Inc. | Crystal structure of a crispr-cas system, and uses thereof |
| US20150376586A1 (en) | 2014-06-25 | 2015-12-31 | Caribou Biosciences, Inc. | RNA Modification to Engineer Cas9 Activity |
| CA3060508C (en) * | 2015-01-28 | 2023-08-29 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Crispr hybrid dna/rna polynucleotides and methods of use |
| US9580727B1 (en) * | 2015-08-07 | 2017-02-28 | Caribou Biosciences, Inc. | Compositions and methods of engineered CRISPR-Cas9 systems using split-nexus Cas9-associated polynucleotides |
| EP3564371B1 (en) * | 2015-12-04 | 2020-05-27 | Caribou Biosciences, Inc. | Engineered nucleic-acid targeting nucleic acids |
-
2016
- 2016-12-02 EP EP19171356.9A patent/EP3564371B1/en active Active
- 2016-12-02 EP EP16822804.7A patent/EP3371310B1/en active Active
- 2016-12-02 KR KR1020187019090A patent/KR102093570B1/ko active Active
- 2016-12-02 HK HK18112080.6A patent/HK1252755B/en unknown
- 2016-12-02 NZ NZ742040A patent/NZ742040A/en unknown
- 2016-12-02 NZ NZ756843A patent/NZ756843A/en unknown
- 2016-12-02 MX MX2018005392A patent/MX391311B/es unknown
- 2016-12-02 JP JP2018528798A patent/JP6707133B2/ja active Active
- 2016-12-02 WO PCT/US2016/064860 patent/WO2017096328A1/en not_active Ceased
- 2016-12-02 CN CN201680071016.9A patent/CN108473981B/zh active Active
- 2016-12-02 AU AU2016363024A patent/AU2016363024B2/en active Active
- 2016-12-02 SG SG11201803593QA patent/SG11201803593QA/en unknown
- 2016-12-02 US US15/368,570 patent/US9771600B2/en active Active
- 2016-12-02 ES ES16822804T patent/ES2735773T3/es active Active
- 2016-12-02 RU RU2018117360A patent/RU2018117360A/ru not_active Application Discontinuation
- 2016-12-02 CA CA3004757A patent/CA3004757C/en active Active
- 2016-12-02 DK DK16822804.7T patent/DK3371310T3/da active
-
2017
- 2017-09-14 US US15/703,992 patent/US9970029B1/en active Active
-
2018
- 2018-05-03 IL IL259148A patent/IL259148B/en unknown
- 2018-05-04 US US15/971,863 patent/US10100333B2/en active Active
- 2018-05-07 ZA ZA2018/02968A patent/ZA201802968B/en unknown
- 2018-10-04 US US16/152,337 patent/US11505808B2/en active Active
-
2019
- 2019-10-07 AU AU2019240724A patent/AU2019240724B2/en active Active
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2018117360A (ru) | Сконструированные нуклеиновые кислоты, нацеленные на нуклеиновую кислоту | |
| JP2021112211A5 (ru) | ||
| JP2018518163A5 (ru) | ||
| CY1119878T1 (el) | Μια μεθοδος για απομονωση πυρηνικων οξεων και ενα kit εξ' αυτης | |
| MX2022005777A (es) | Etiquetado utilizando transposomas inmovilizados con ligadores. | |
| JP2017515469A5 (ru) | ||
| CN115943162A (zh) | 抗Claudin18.2抗体以及其用途 | |
| WO2016160844A3 (en) | Methods and compositions for combinatorial barcoding | |
| JP2017048194A5 (ru) | ||
| HRP20171163T1 (hr) | Postupci i sastavi za rnk-usmjerenu modifikaciju ciljane dnk i rnk-usmjerene modulacije transkripcije | |
| CN114502591A (zh) | 靶向bcma的抗体、双特异性抗体及其用途 | |
| MX384075B (es) | Nuevas proteínas específicas para la angiogénesis. | |
| HK1216894A1 (zh) | 多價結合蛋白組合物 | |
| WO2008052173A8 (en) | Novel h5 proteins, nucleic acid molecules and vectors encoding for those, and their medicinal use | |
| JP2010503413A5 (ru) | ||
| EP2912175A4 (en) | COMPOSITION FOR CUTTING A TARGET DNA WITH A LEAD DNA SPECIFIC TO THE TARGET DNA AND FOR CAS PROTEIN-CODING NUCLEIC ACID OR CAS PROTEIN AND USE THEREOF | |
| WO2008043822A3 (en) | Amino acid sequences that bind to a desired molecule in a conditional manner | |
| JP2012505657A5 (ru) | ||
| JP2016502843A5 (ru) | ||
| WO2010027497A3 (en) | Preparations, compositions, and methods for nucleic acid sequencing | |
| MX375049B (es) | Proteinas especificas novedosas para pioverdina y pioquelina. | |
| WO2017123758A8 (en) | Compositions and methods for sequencing nucleic acids | |
| WO2008033375A3 (en) | Long lasting drug formulations | |
| JP2017536846A5 (ru) | ||
| WO2009034190A3 (en) | Affinity tag |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20200421 |