RU2003129056A - Модифицированный интерферон альфа с уменьшенной иммуногенностью - Google Patents
Модифицированный интерферон альфа с уменьшенной иммуногенностью Download PDFInfo
- Publication number
- RU2003129056A RU2003129056A RU2003129056/13A RU2003129056A RU2003129056A RU 2003129056 A RU2003129056 A RU 2003129056A RU 2003129056/13 A RU2003129056/13 A RU 2003129056/13A RU 2003129056 A RU2003129056 A RU 2003129056A RU 2003129056 A RU2003129056 A RU 2003129056A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- molecule
- amino acid
- sequence
- infα2
- modified
- Prior art date
Links
- 102000006992 Interferon-alpha Human genes 0.000 title 1
- 108010047761 Interferon-alpha Proteins 0.000 title 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 31
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims 26
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims 25
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims 15
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims 15
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims 14
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 claims 11
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 claims 11
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 11
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 claims 10
- 101000959794 Homo sapiens Interferon alpha-2 Proteins 0.000 claims 8
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims 8
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 8
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 claims 6
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims 6
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 5
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 claims 4
- 102000018713 Histocompatibility Antigens Class II Human genes 0.000 claims 3
- 108010027412 Histocompatibility Antigens Class II Proteins 0.000 claims 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 3
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 claims 3
- 238000000126 in silico method Methods 0.000 claims 3
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 claims 3
- 102220560681 ATP-binding cassette sub-family C member 8_F27S_mutation Human genes 0.000 claims 2
- 102220503597 FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1_F38E_mutation Human genes 0.000 claims 2
- 102220553419 Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 2_Y89E_mutation Human genes 0.000 claims 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 claims 2
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims 2
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims 2
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims 2
- 102220074246 rs180177268 Human genes 0.000 claims 2
- 102200109205 rs200857997 Human genes 0.000 claims 2
- 102220029460 rs398123552 Human genes 0.000 claims 2
- 102220057632 rs730882042 Human genes 0.000 claims 2
- 102220602361 DAZ-associated protein 1_F84D_mutation Human genes 0.000 claims 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 1
- 102220519967 Protein DEK_L66A_mutation Human genes 0.000 claims 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 1
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 claims 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 claims 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 1
- 102200051510 rs121913152 Human genes 0.000 claims 1
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 claims 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 claims 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/06—Linear peptides containing only normal peptide links having 5 to 11 amino acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/555—Interferons [IFN]
- C07K14/56—IFN-alpha
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Immunology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Claims (70)
1. Модифицированная молекула, которая имеет биологическую активность интерферона альфа 2 (INFα2) человека и является существенно неиммуногенной или менее иммуногенной, чем любая немодифицированная молекула, которая имеет ту же биологическую активность при использовании in vivo.
2. Молекула по п.1, в которой указанная потеря иммуногенности достигается путем удаления одного или более эпитопов Т-клеток, имеющих происхождение от исходной немодифицированной молекулы и/или путем уменьшения количества аллотипов МНС, способных связывать пептиды, имеющие происхождение от указанной молекулы.
3. Молекула по п.2, в которой один эпитоп Т-клеток удален.
4. Молекула по любому из пп.2-4, в которой указанные исходно присутствующие эпитопы Т-клеток являются лигандами МНС класса II или пептидными последовательностями, которые демонстрируют способность стимулировать или связывать Т-клетки посредством презентации на МНС класса II.
5. Молекула по п.4, в которой указанные лиганды или пептидные последовательности являются 13-мерными или 15-мерными пептидами.
6. Молекула по п.5, в которой указанные пептидные последовательности выбраны из группы, как показано на фигуре 1.
7. Молекула по любому из пп.2-6, в которой 1-9 аминокислотных остатков в любом из исходно присутствующих эпитопов Т-клеток изменены.
8. Молекула по п.7, в которой один аминокислотный остаток изменен.
9. Молекула по п.7 или 8, в которой изменение аминокислотных остатков представляет собой замену исходно присутствующего(их) аминокислотного(ых) остатка(ов) другим(ми) аминокислотным(ми) остатком(ами) в специфическом(их) положении(ях).
10. Молекула по п.9, в которой одна или более замен аминокислотных остатков выполнены так, как показано на фигуре 2.
11. Молекула по п.10, в которой дополнительно одна или более замен аминокислотных остатков выполнены так, как показано на Фигуре 3, для уменьшения количества аллотипов МНС, способных связывать пептиды, имеющие происхождение от указанной молекулы.
12. Молекула по п.9, в которой одна или более замен выполнены так, как показано на фигуре 3.
13. Молекула по п.7 или 8, в которой изменение аминокислотных остатков представляет собой делецию исходно присутствующего(их) аминокислотного(ых) остатка(ов) в специфическом(их) положении(ях).
14. Молекула по п.7 или 8, в которой изменение аминокислотных остатков представляет собой добавление аминокислот(ы) в специфическом(их) положении(ях) к тем, которые исходно присутствуют.
15. Молекула по любому из пп.7-14, в которой дополнительное дальнейшее изменение выполнено для восстановления биологической активности указанной молекулы.
16. Молекула по п.15, в которой дополнительным дальнейшим изменением является замена, добавление или деления специфической(их) аминокислот(ы).
17. Модифицированная молекула по любому из пп.7-16, в которой аминокислотное изменение выполняют в отношении гомологичной последовательности белка.
18. Модифицированная молекула по любому из пп.7-16, в которой аминокислотное изменение выполняют в соответствии со способами моделирования in silico.
19. Модифицированная молекула по любому из пп.7-16, в которой аминокислотное изменение выполняют в отношении стимулирования или связывания Т клеток пептидами, имеющими происхождение от INFα2, или INFα2 белком.
20. Модифицированная молекула, которая имеет биологическую активность интерферона альфа 2 (INFα2) человека и является существенно неиммуногенной или менее иммуногенной, чем любая немодифицированная молекула, которая имеет ту же биологическую активность при использовании in vivo, которую получают изменением одной или более аминокислот в первичной последовательности путем (i) удаления одного или более эпитопов Т-клеток, которые происходят от первоначально немодифицированной молекулы и являются лигандами МНС класса II или пептидными последовательностями, которые показывают способность стимулировать или связывать Т-клетки посредством представления на МНС класса II, и/или (ii) уменьшения количества аллотипов МНС, способных связывать пептиды, имеющие происхождение от указанной молекулы, где указанная модифицированная молекула содержит изменения, которые сделаны в одном или более положениях в пределах следующих рядов смежных аминокислотных остатков указанной первичной последовательности, имеющих происхождение от INFα2 дикого типа:
(a) ISLFSCLKDRHDFGFPQEEFGNQFQKAETIPVLH (R1),
(b)FNLFSTKDSSAAWDE (R2),
(c) KEDSILAVRKYFQRITLY (R3).
21. Молекула по п.20, в которой указанное изменение является заменой 1-9 аминокислотных остатков.
22. Молекула по п.21, в которой указанную замену выполняют в одном или более аминокислотных остатках рядов R1, R2 и R3.
23. Молекула по п.21, в которой указанную замену выполняют в одном или более аминокислотных остатках рядов R2 и R3.
24. Молекула по п.21, в которой указанную замену выполняют в одном или более аминокислотных остатках ряда R3.
25. Молекула по любому из пп.19-24, в которой дополнительно проводится одна или более замен аминокислотных остатков вне рядов последовательностей R1, R2 или R3.
26. Молекула по любому из пп.19-25, включающая замену аминокислотного остатка, сделанную в одном или более положениях молекулы дикого типа: 24, 26, 27, 38, 55, 63, 64, 66, 67, 76, 84, 85, 89, 103, 110, 111, 116, 117, 119, 122, 123, 126, 128,129,130, 153.
27. Молекула по п.25, включающая замену аминокислотного остатка, сделанную в одном или более положениях молекулы дикого типа: 26, 27, 38, 63, 85, 89, 103, 110, 111, 116, 117, 122, 123, 126, 128, 153.
28. Молекула по п.27, в которой указанную замену выполняют в одном или более положениях, выбранных из 26, 27, 38.
29. Молекула по п.27, в которой указанную замену выполняют в положении 63, 85 или 89.
30. Молекула по п.27, в которой указанную замену выполняют в одном или более положениях, выбранных из 103, 110, 111, 116, 117, 122, 123, 126, 128, 153.
31. Молекула по п.27, в которой указанную замену выполняют в одном или более положениях, выбранных из 26, 27, 38, и дополнительно в положении 63, 85 или 89.
32. Молекула по п.27, в которой указанную замену выполняют в одном или более положениях, выбранных из 26, 27, 38 или альтернативно из 63, 85, 89, и дополнительно в одном или более положениях, выбранных из 103, 110, 111, 116, 117, 122, 123, 126, 128, 153.
33. Молекула по п.26, в которой указанную замену выполняют в одном или более положениях, как определено на Фигуре 4.
34. Молекула по п.28, в которой указанную замену выбирают из L26P, F27S, F38E.
35. Молекула по п.29, в которой указанную замену выбирают из I63T, Y85S, Y89D, Y89E, Y89N.
36. Молекула по п.30, в которой указанную замену выбирают из V103E, L110G, М111Т, M111S, М111Е, I116S, I116Q, L117G, L117A, Y122E, Y122Q, F123H, I126A, L128A, L153S.
37. Модифицированная молекула, которая имеет биологическую активность интерферона альфа 2 (INFα2) человека и является существенно неиммуногенной или менее иммуногенной, чем любая немодифицированная молекула, которая имеет ту же биологическую активность при использовании in vivo, которую получают заменой одной или более аминокислот в первичной последовательности путем (i) удаления одного или более эпитопов Т-клеток, имеющих происхождение от первоначально немодифицированной молекулы и являющихся лигандами МНС класса II или пептидными последовательностями, которые показывают способность стимулировать или связывать Т-клетки посредством представления на МНС класса II, и/или (и) уменьшения количества аллотипов МНС, способных связывать пептиды, имеющие происхождение от указанной молекулы, где указанная замена сделана в одном или более положениях молекулы дикого типа INFα2a или INFα2b, которые соответствуют, по крайней мере, одной из групп, выбранных из:
(i) I24P, L26P, F27S, F38E, V55A,
(ii) I63T, L66A, F67D, F67E, W76H, F84D, F84E, Y85S, Y89D, Y89E, Y89N,
(iii) любое положение в пределах последовательности R3.
38. Молекула по п.37, в которой сделаны одна или более следующих замен в пределах последовательности R3:
V103E, L110G, L110S,M111T, M111S, М111Е, I116S, I116Q, L117G, L117A, V119A, Y122Q, Y122E, Y122H, F123H, I126A, L128A, Y129N, L130G, L130, L153S.
39. Молекула по п.38, в которой сделаны одна или более следующих замен:
Y122E, Y122Q, F123H, I126A, L128A.
40. Молекула по любому из пп.36-39, в которой сделаны дополнительные замены.
41. Модифицированный интерферон альфа 2 (INFα2) человека, который обладает уменьшенной иммуногенностью, состоящий из следующей последовательности:
CDLPQTHSLGSRRTLMLLAQMRX0SLFSCLKDRHDFGPPQEEFGNQFQKAETIPVLHEMIQQIFNLFSTKDSSAAWDETLLDKFYTELYQQLNDLEACVIQGVGVTETPLMKEDSILAVRKX1X2QRX3TX4YLKEKKYSPCAWEVVRAEIMRSFSLSTNLQESLRSKE,
в которой Х0 представляет собой R, К;
Х1 представляет собой Y, Е, Q;
Х2 представляет собой F, Н;
Х3 представляет собой I, А; и
Х4 представляет собой L, А;
за исключением случая, когда одновременно Х1=Y, X2=F, X3=I и X4=L.
42. Модифицированный интерферон альфа 2 (INFα2) человека, который обладает уменьшенной иммуногенностью, состоящий из следующей последовательности:
CDLPQTHSLGSRRTLMLLAQMRX°ISLFSCLKDRHDFGFPQEEFGNQFQKAETIPVLHEMIQQIFNLFSTKDSSAAWDETLLDKFYTELYQQLNDLEACVIQGVGVTETPX1X2KEDSXЗX4AVRKX5X6QRX7TX8YLKEKKYSPCAWEWRAEIMRSFSX9STNLQESLRSKE,
в которой х0 представляет собой R, К;
Х1 представляет собой L, S, G,
Х2 представляет собой М, Т, S, Е,
Х3 представляет собой I, S, Q,
Х4 представляет собой L, G,
Х5 представляет собой Y, Е, Q;
Х6 представляет собой F, Н;
Х7 представляет собой I, А;
Х8 представляет собой L, А; и,
Х9 представляет собой L, S
за исключением случая, когда одновременно Х1=L, Х2=М, Х3=I, Х4=L, Х5=Y, X6=F, X7=I, X8=L и X9=L.
43. Модифицированный интерферон альфа 2 (INFα2) человека, который обладает уменьшенной иммуногенностью, состоящий из следующей последовательности:
CDLPQTHSLGSRRTLMLLAQMRX0ISLFSCLKDRHDFGFPQEEFGNQFQKAETIPVLHEMIQQX1X2 NX3X4STKDSSAAX5DETLLDKX6X7TELX8QLNDLEACVIQGVGVTETPLMKEDSILAVRKYFQRITLYLKEKKYSPCAWEWRAEIMRSFSLSTNLQESLRSKE,
в которой X0 представляет собой R, К;
Х1 представляет собой I, Т;
Х2 представляет собой F, D, А;
Х3 представляет собой L, А;
Х4 представляет собой F, D, E;
Х5 представляет собой W, Н;
Х6 представляет собой F, D, E;
Х7 представляет собой Y, S и
Х8 представляет собой Y, D, E, N;
за исключением случая, когда одновременно Х1=I, Х2=F, Х3=L, Х4=F, Х5=W, X6=F, X7=Y и X8=Y.
44. Модифицированный интерферон альфа 2 (INFα2) человека, который обладает уменьшенной иммуногенностью, состоящий из следующей последовательности:
CDLPQTHSLGSRRTLMLLAQMRX0SLFSCLKDRHDFGFPQEEFGNQFQKAETIPVLHEMIQQX1FNLFSTKDSSAAWDETLLDKFX2TELX3QLNDLEACVIQGVGVTETPLMKEDSILAVRKYFQRITLYLKEKKYSPCAWEWRAEIMRSFSLSTNLQESLRSKE,
в которой X0 представляет собой R, К;
X1 представляет собой I, Т;
Х2 представляет собой Y, S и
Х3 представляет собой Y, D, Е, N;
за исключением случая, когда одновременно Х1=I, Х2=Y и Х3=Y.
45. Модифицированный интерферон альфа 2 (INFα2) человека, который обладает уменьшенной иммуногенностью, состоящий из следующей последовательности:
CDLPQTHSLCSPPTLMLLAQMRX0ISX1X2SCLKDRHDFGX3PQEEFGNQFQKAETIPX4LHEMIQQIFNLFSTKDSSAAWDETLLDKFYTELYQQLNDLEACVIQGVGVTETPLMKEDSILAVRKYFQRITLYLKEKKYSPCAWEWRAEIMRSFSLSTNLQESLRSKE,
в которой х0 представляет собой R, К;
Х1 представляет собой L, Р;
Х2 представляет собой F, S;
Х3 представляет собой F, Е и
Х4 представляет собой V, А
за исключением случая, когда одновременно Х1=L, X2=F, X3=F и X4=V.
46. Модифицированная последовательность INFα2 по п.41, в которой сделаны дополнительные замены.
47. Модифицированная последовательность INFα2 по п.46, дополнительно содержащая замены по п.43.
48. Модифицированная последовательность INFα2 по п.46, дополнительно содержащая замены по п.44.
49. Модифицированная последовательность INFα2 по пп.47 или 48, дополнительно содержащая замены по по п.45.
50. Модифицированная последовательность INFα2 по п.42, содержащая дополнительные замены.
51. Модифицированная последовательность INFα2 по п.50, дополнительно содержащая замены по п.43.
52. Модифицированная последовательность INFα2 по п.50, дополнительно содержащая замены по п.44.
53. Модифицированная последовательность INFα2 по пп.51 или 52, дополнительно содержащая замены по п.45.
54. Модифицированная последовательность INFα2 по п.1, в которой дополнительные замены сделаны в одном или более положениях в пределах частичной последовательности R1 и/или R2 и/или R3, где R1, R2, R3 принимают значения, указанные в п.19.
55. Последовательность ДНК, кодирующая модифицированный INFα2 по любому из пп.1-54.
56. Фармацевтическая композиция, содержащая модифицированную молекулу, которая имеет биологическую активность INFα2, как определено в любом из указанных выше пунктов, необязательно вместе с фармацевтически приемлемым носителем, разбавителем или наполнителем.
57. Способ производства модифицированной молекулы, которая имеет биологическую активность INFα2, как определено в любом из указанных выше пунктов, и который включает следующие стадии:
(i) определение аминокислотной последовательности полипептида или его части;
(ii) идентификацию одного или более потенциальных эпитопов Т-клеток в пределах аминокислотной последовательности белка любым способом,
включающим определение связывания пептидов с молекулами МНС при использовании способов in vitro или in silica или биологических анализов;
(iii) моделирование новых вариантов последовательности с одной или более аминокислотами в пределах идентифицированных потенциальных эпитопов Т-клеток, модифицированных таким образом для существенного уменьшения или устранения активности эпитопов Т-клеток, как определено путем связывания пептидов с молекулами МНС при использовании способов in vitro или in silico или биологическими анализами; (iv) конструирование таких вариантов последовательности с помощью техники рекомбинантных ДНК и тестирование указанных вариантов для того, чтобы идентифицировать один или более вариантов с желаемыми свойствами; и
(v) необязательное повторение этапов (ii)-(iv).
58. Способ по п.57, в котором стадию (iii) выполняют путем замены, добавления или делеции 1-9 аминокислотных остатков в любых исходно присутствующих эпитопах Т-клеток.
59. Способ по п.57, в котором изменение сделано в отношении гомологичной последовательности белка и/или в соответствии со способами моделирования in silico.
60. Способ по любому из пп.57-59, в котором стадию (ii) выполняют посредством следующих стадий: (а) выбора участка пептида, который имеет известную последовательность аминокислотных остатков; (b) последовательного выбора аминокислотных сегментов перекрывающихся участков аминокислотных остатков с предварительно определенным одинаковым размером и состоящих, по крайней мере, из трех аминокислотных остатков выбранного участка; (с) подсчета значения связывания молекулы МНС класса II для каждого выборочного сегмента путем суммирования определенных значений для каждой гидрофобной аминокислотной боковой цепи, которая присутствует в каждом выборочном сегменте аминокислотного остатка; и (d) идентификации, по крайней мере, одного из указанных сегментов, подходящих для модификации, основываясь на подсчитанной величине связывания молекулы МНС класса II этого сегмента для изменения общего значения связывания МНС класса II для пептида без существенного уменьшения терапевтической полезности пептида.
61. Способ по п.60, в котором стадию (с) выполняют при использовании функции подсчета Bohm, модифицированной таким образом, чтобы учесть вклад энергии 12-6 ван-дер-ваальсового отталкивания белок-лиганд и вклад конформационной энергии лиганда, посредством (1) обеспечения первой базы данных модели молекулы МНС класса II; (2) обеспечения второй базы данных возможного пептидного скелета для моделей молекул указанного МНС класса II; (3) отбора модели из указанной первой базы данных; (4) отбора возможного пептидного скелета из второй базы данных; (5) идентификации боковых цепей аминокислотных остатков, которые присутствуют в каждом выборочном сегменте; (6) определения значения связывающего сродства ко всем боковым цепям, которые присутствуют в каждом выборочном сегменте; и повторения стадий от (1) до (5) для каждой указанной модели и каждого указанного скелета.
62. Молекула пептида, состоящая из 13 последовательных аминокислотных остатков, имеющая потенциальную активность связывания МНС класса II и созданная из первичной последовательности немодифицированного INFα2, выбранная из группы как показано на Фигуре 1, Фигуре 6а, 6b, 6с.
63. Молекула пептида, состоящая из 15 последовательных аминокислотных остатков, имеющая потенциальную активность связывания МНС класса II и созданная из первичной последовательности немодифицированного INFα2, выбранная из любой из групп частичных последовательностей R1, R2, R3, как указано в п.19.
64. Молекула пептида по п.63, выбранная из фигуры 7.
65. Пептидная последовательность, состоящая, по крайней мере, из 9 последовательных аминокислотных остатков, выбранная из пептидов эпитопов Т-клеток, как указано в пп.62-64.
66. Молекула пептида, состоящая из 9-15 последовательных аминокислотных остатков, имеющих потенциальную активность связывания МНС класса II и созданная из первичной последовательности немодифицированного INFα2, где указанная молекула имеет показатель стимулирования по крайней мере 1,8 в биологическом анализе клеточной пролиферации, где указанный показатель взят в значении клеточной пролиферации, вычисленной после стимулирования пептидом, и разделен на значение клеточной пролиферации, вычисленной в контрольных клетках, не получивших пептид, и где клеточная пролиферация измерена любыми подходящими средствами согласно стандартных способов.
67. Молекула пептида по п.66, состоящая из последовательности, как.определено на Фигуре 6 или 7.
68. Молекула пептида по п.66, включающая, по крайней мере, 9 последовательных аминокислотных остатков из любых INFα2 частичных последовательностей R1, R2, R3, как определено в п.19.
69. Применение пептида по любому из пп.62-68, для изготовления модифицированной молекулы INFα2, которая является существенно неиммуногенной или менее иммуногенной, чем любая немодифицированная молекула, которая имеет ту же или приемлемо сниженную биологическую активность при использовании in vivo.
70. Фармацевтическая композиция, состоящая из синтетической последовательности пептида, как определено в любом из пп.62-68, необязательно вместе с фармацевтически приемлемым носителем, разбавителем или наполнителем.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP01105088.7 | 2001-03-02 | ||
| EP01105088 | 2001-03-02 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2003129056A true RU2003129056A (ru) | 2005-04-20 |
Family
ID=8176646
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2003129056/13A RU2003129056A (ru) | 2001-03-02 | 2002-03-01 | Модифицированный интерферон альфа с уменьшенной иммуногенностью |
Country Status (13)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20060062761A1 (ru) |
| EP (1) | EP1379555A2 (ru) |
| JP (1) | JP2004535173A (ru) |
| KR (1) | KR20030081479A (ru) |
| CN (1) | CN1529714A (ru) |
| BR (1) | BR0207704A (ru) |
| CA (1) | CA2439690A1 (ru) |
| HU (1) | HUP0303309A2 (ru) |
| MX (1) | MXPA03007838A (ru) |
| PL (1) | PL363181A1 (ru) |
| RU (1) | RU2003129056A (ru) |
| WO (1) | WO2002085941A2 (ru) |
| ZA (1) | ZA200307677B (ru) |
Families Citing this family (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP1539960B1 (en) | 2002-09-09 | 2010-04-28 | Hanall Pharmaceutical Co., Ltd. | Protease-resistant modified interferon alpha polypeptides |
| AU2003277088A1 (en) * | 2002-10-01 | 2004-04-23 | Xencor, Inc | Interferon variants with improved properties |
| KR20050107435A (ko) * | 2003-02-18 | 2005-11-11 | 메르크 파텐트 게엠베하 | 개선된 특성의 인터페론 알파 뮤테인의 융합 단백질 |
| US20080260820A1 (en) * | 2007-04-19 | 2008-10-23 | Gilles Borrelly | Oral dosage formulations of protease-resistant polypeptides |
| US20090010966A1 (en) * | 2007-06-21 | 2009-01-08 | Angelica Therapeutics, Inc. | Modified diphtheria toxins |
| WO2009110944A1 (en) * | 2008-02-29 | 2009-09-11 | Angelica Therapeutics, Inc. | Modified toxins |
| WO2010030671A1 (en) * | 2008-09-09 | 2010-03-18 | University Of Medicine And Dentistry Of New Jersey | Type i interferon antagonists |
| JP2016519651A (ja) | 2013-03-15 | 2016-07-07 | アンジェリカ セラピューティックス,インク. | 改質された毒素 |
| CN105200017A (zh) * | 2015-10-16 | 2015-12-30 | 西安医学院 | 一种去除a47l降低痘苗病毒免疫优势的方法及病毒 |
| CN105255840A (zh) * | 2015-10-16 | 2016-01-20 | 西安医学院 | 通过去除显性表位b8r重组痘苗病毒的方法及其病毒 |
| EP4400175A3 (en) | 2017-04-28 | 2024-09-25 | The Regents of the University of Colorado, a body corporate | Methods of treating rheumatoid arthritis using rna-guided genome editing of hla gene |
| AR117715A1 (es) | 2019-12-17 | 2021-08-25 | Univ Nacional Del Litoral Unl | Interferón hiperglicosilado con inmunogenicidad reducida |
| JP2024517476A (ja) * | 2021-05-10 | 2024-04-22 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ コロラド,ア ボディー コーポレイト | 自己免疫を治療するためのhla対立遺伝子のポケット操作 |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1997033998A1 (en) * | 1996-03-14 | 1997-09-18 | The Immune Response Corporation | Targeted delivery of genes encoding interferon |
-
2002
- 2002-03-01 WO PCT/EP2002/002218 patent/WO2002085941A2/en not_active Ceased
- 2002-03-01 RU RU2003129056/13A patent/RU2003129056A/ru not_active Application Discontinuation
- 2002-03-01 CA CA002439690A patent/CA2439690A1/en not_active Abandoned
- 2002-03-01 MX MXPA03007838A patent/MXPA03007838A/es unknown
- 2002-03-01 BR BR0207704-3A patent/BR0207704A/pt not_active IP Right Cessation
- 2002-03-01 JP JP2002583467A patent/JP2004535173A/ja active Pending
- 2002-03-01 CN CNA028058658A patent/CN1529714A/zh active Pending
- 2002-03-01 PL PL02363181A patent/PL363181A1/xx unknown
- 2002-03-01 EP EP02727340A patent/EP1379555A2/en not_active Withdrawn
- 2002-03-01 KR KR10-2003-7011451A patent/KR20030081479A/ko not_active Withdrawn
- 2002-03-01 US US10/469,679 patent/US20060062761A1/en not_active Abandoned
- 2002-03-01 HU HU0303309A patent/HUP0303309A2/hu unknown
-
2003
- 2003-10-01 ZA ZA200307677A patent/ZA200307677B/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| KR20030081479A (ko) | 2003-10-17 |
| EP1379555A2 (en) | 2004-01-14 |
| HUP0303309A2 (hu) | 2003-12-29 |
| BR0207704A (pt) | 2004-07-06 |
| WO2002085941A2 (en) | 2002-10-31 |
| MXPA03007838A (es) | 2003-12-08 |
| WO2002085941A3 (en) | 2003-10-30 |
| US20060062761A1 (en) | 2006-03-23 |
| CA2439690A1 (en) | 2002-10-31 |
| CN1529714A (zh) | 2004-09-15 |
| JP2004535173A (ja) | 2004-11-25 |
| PL363181A1 (en) | 2004-11-15 |
| ZA200307677B (en) | 2004-07-13 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2004110239A (ru) | Модифицированный фактор ix | |
| RU2003129072A (ru) | Модифицированный интерферон бета с уменьшенной иммуногенностью | |
| Ponder et al. | Tertiary templates for proteins: use of packing criteria in the enumeration of allowed sequences for different structural classes | |
| RU2003125637A (ru) | Модифицированный нейтрофический фактор выделенный из мозга человека (bdnf) с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003129056A (ru) | Модифицированный интерферон альфа с уменьшенной иммуногенностью | |
| Pardi et al. | Solution structures of the rabbit neutrophil defensin NP-5 | |
| Baldwin et al. | Crystal structure of interleukin 8: symbiosis of NMR and crystallography. | |
| Sternberg et al. | On the conformation of proteins: The handedness of the β-strand-α-helix-β-strand unit | |
| Hommel et al. | Human epidermal growth factor: high resolution solution structure and comparison with human transforming growth factor α | |
| Stawikowski et al. | Introduction to peptide synthesis | |
| Kochoyan et al. | Alternating zinc fingers in the human male associated protein ZFY: 2D NMR structure of an even finger and implications for jumping-linker DNA recognition | |
| Perczel et al. | Deconvolution of the circular dichroism spectra of proteins: The circular dichroism spectra of the antiparallel β‐sheet in proteins | |
| Darby et al. | Dissecting the disulphide-coupled folding pathway of bovine pancreatic trypsin inhibitor: forming the first disulphide bonds in analogues of the reduced protein | |
| RU2003125640A (ru) | Модифицированный антагонист рецептора интерлейкина 1 (1l-1ra) с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003125654A (ru) | Модифицированный эритропоэтин (еро) с уменьшенной иммуногенностью | |
| Fischer et al. | A 3D sequence-independent representation of the protein data bank | |
| RU2003125638A (ru) | Модифицированный лептин с уменьшенной иммуногенностью | |
| Haefliger et al. | Amphibian albumins as members of the albumin, alpha-fetoprotein, vitamin D-binding protein multigene family | |
| Francart et al. | Solution structure of R-elafin, a specific inhibitor of elastase | |
| RU2003129062A (ru) | Модифицированный протамин с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003129069A (ru) | Модифицированный цилиарный нейротрофический фактор (cntf) с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2005106841A (ru) | Эпитопы т-клеток в эритропоэтине | |
| RU2003129058A (ru) | Модифицированный колониестимулирующий гранулоцитарно-макрофагальный фактор (gm-csf) с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2004110238A (ru) | Модифицированный человеческий гормон роста | |
| RU2005108044A (ru) | Эпитопы т-клеток в стафилококковом энтеротоксине в |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20060510 |