[go: up one dir, main page]

RS64114B1 - Modulatori interakcije sestrin-gator2 i nјihova upotreba - Google Patents

Modulatori interakcije sestrin-gator2 i nјihova upotreba

Info

Publication number
RS64114B1
RS64114B1 RS20230265A RSP20230265A RS64114B1 RS 64114 B1 RS64114 B1 RS 64114B1 RS 20230265 A RS20230265 A RS 20230265A RS P20230265 A RSP20230265 A RS P20230265A RS 64114 B1 RS64114 B1 RS 64114B1
Authority
RS
Serbia
Prior art keywords
mmol
acid
compound
solution
carcinoma
Prior art date
Application number
RS20230265A
Other languages
English (en)
Inventor
Kristina Michelle Fetalvero
Sridhar Narayan
David John O'neill
Eddine Saiah
Shomit Sengupta
Original Assignee
Navitor Pharm Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Navitor Pharm Inc filed Critical Navitor Pharm Inc
Publication of RS64114B1 publication Critical patent/RS64114B1/sr

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
    • C07F7/00—Compounds containing elements of Groups 4 or 14 of the Periodic Table
    • C07F7/02—Silicon compounds
    • C07F7/08—Compounds having one or more C—Si linkages
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C229/00—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton
    • C07C229/02—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton
    • C07C229/04—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
    • C07C229/06—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton
    • C07C229/10—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton the nitrogen atom of the amino group being further bound to acyclic carbon atoms or to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings
    • C07C229/12—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton the nitrogen atom of the amino group being further bound to acyclic carbon atoms or to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings to carbon atoms of acyclic carbon skeletons
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/185—Acids; Anhydrides, halides or salts thereof, e.g. sulfur acids, imidic, hydrazonic or hydroximic acids
    • A61K31/19—Carboxylic acids, e.g. valproic acid
    • A61K31/195—Carboxylic acids, e.g. valproic acid having an amino group
    • A61K31/197—Carboxylic acids, e.g. valproic acid having an amino group the amino and the carboxyl groups being attached to the same acyclic carbon chain, e.g. gamma-aminobutyric acid [GABA], beta-alanine, epsilon-aminocaproic acid or pantothenic acid
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/185—Acids; Anhydrides, halides or salts thereof, e.g. sulfur acids, imidic, hydrazonic or hydroximic acids
    • A61K31/19—Carboxylic acids, e.g. valproic acid
    • A61K31/195—Carboxylic acids, e.g. valproic acid having an amino group
    • A61K31/197—Carboxylic acids, e.g. valproic acid having an amino group the amino and the carboxyl groups being attached to the same acyclic carbon chain, e.g. gamma-aminobutyric acid [GABA], beta-alanine, epsilon-aminocaproic acid or pantothenic acid
    • A61K31/198—Alpha-amino acids, e.g. alanine or edetic acid [EDTA]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/21—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates
    • A61K31/215—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids
    • A61K31/22—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids of acyclic acids, e.g. pravastatin
    • A61K31/221—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids of acyclic acids, e.g. pravastatin with compounds having an amino group, e.g. acetylcholine, acetylcarnitine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/21—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates
    • A61K31/215—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids
    • A61K31/22—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids of acyclic acids, e.g. pravastatin
    • A61K31/223—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids of acyclic acids, e.g. pravastatin of alpha-aminoacids
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/275—Nitriles; Isonitriles
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/335—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin
    • A61K31/34—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having five-membered rings with one oxygen as the only ring hetero atom, e.g. isosorbide
    • A61K31/341—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having five-membered rings with one oxygen as the only ring hetero atom, e.g. isosorbide not condensed with another ring, e.g. ranitidine, furosemide, bufetolol, muscarine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/41—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with two or more ring hetero atoms, at least one of which being nitrogen, e.g. tetrazole
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/695—Silicon compounds
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P21/00—Drugs for disorders of the muscular or neuromuscular system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/08—Antiepileptics; Anticonvulsants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
    • A61P3/08—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis
    • A61P3/10—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis for hyperglycaemia, e.g. antidiabetics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02—Immunomodulators
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C229/00—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton
    • C07C229/02—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton
    • C07C229/04—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
    • C07C229/06—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton
    • C07C229/10—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton the nitrogen atom of the amino group being further bound to acyclic carbon atoms or to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings
    • C07C229/14—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton the nitrogen atom of the amino group being further bound to acyclic carbon atoms or to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings to carbon atoms of carbon skeletons containing rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C229/00—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton
    • C07C229/02—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton
    • C07C229/04—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
    • C07C229/06—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton
    • C07C229/18—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton the nitrogen atom of the amino group being further bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C229/00—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton
    • C07C229/02—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton
    • C07C229/04—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
    • C07C229/20—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated the carbon skeleton being further substituted by halogen atoms or by nitro or nitroso groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C229/00—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton
    • C07C229/02—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton
    • C07C229/04—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
    • C07C229/22—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated the carbon skeleton being further substituted by oxygen atoms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C229/00—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton
    • C07C229/02—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton
    • C07C229/04—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
    • C07C229/26—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having more than one amino group bound to the carbon skeleton, e.g. lysine
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C229/00—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton
    • C07C229/02—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton
    • C07C229/28—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being saturated and containing rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C233/00—Carboxylic acid amides
    • C07C233/01—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C233/02—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having nitrogen atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to carbon atoms of unsubstituted hydrocarbon radicals
    • C07C233/04—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having nitrogen atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to carbon atoms of unsubstituted hydrocarbon radicals with carbon atoms of carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton
    • C07C233/07—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having nitrogen atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to carbon atoms of unsubstituted hydrocarbon radicals with carbon atoms of carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C233/00—Carboxylic acid amides
    • C07C233/01—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C233/34—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by amino groups
    • C07C233/35—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by amino groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom
    • C07C233/40—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by amino groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom having the carbon atom of the carboxamide group bound to an acyclic carbon atom of a carbon skeleton containing six-membered aromatic rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C233/00—Carboxylic acid amides
    • C07C233/01—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C233/45—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups
    • C07C233/46—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom
    • C07C233/47—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom having the carbon atom of the carboxamide group bound to a hydrogen atom or to a carbon atom of an acyclic saturated carbon skeleton
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C233/00—Carboxylic acid amides
    • C07C233/01—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C233/45—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups
    • C07C233/46—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom
    • C07C233/49—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom having the carbon atom of the carboxamide group bound to a carbon atom of an acyclic unsaturated carbon skeleton
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C233/00—Carboxylic acid amides
    • C07C233/01—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C233/45—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups
    • C07C233/46—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom
    • C07C233/51—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom having the carbon atom of the carboxamide group bound to an acyclic carbon atom of a carbon skeleton containing six-membered aromatic rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C233/00—Carboxylic acid amides
    • C07C233/57—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings
    • C07C233/63—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C233/00—Carboxylic acid amides
    • C07C233/64—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings
    • C07C233/81—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups
    • C07C233/82—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom
    • C07C233/83—Carboxylic acid amides having carbon atoms of carboxamide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups with the substituted hydrocarbon radical bound to the nitrogen atom of the carboxamide group by an acyclic carbon atom of an acyclic saturated carbon skeleton
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C237/00—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups
    • C07C237/02—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton
    • C07C237/04—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
    • C07C237/06—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having the nitrogen atoms of the carboxamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C237/00—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups
    • C07C237/02—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton
    • C07C237/04—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
    • C07C237/12—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having the nitrogen atom of at least one of the carboxamide groups bound to an acyclic carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C237/00—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups
    • C07C237/28—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a non-condensed six-membered aromatic ring of the carbon skeleton
    • C07C237/30—Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atom of at least one of the carboxamide groups bound to a carbon atom of a non-condensed six-membered aromatic ring of the carbon skeleton having the nitrogen atom of the carboxamide group bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C255/00—Carboxylic acid nitriles
    • C07C255/61—Carboxylic acid nitriles containing cyano groups and nitrogen atoms being part of imino groups bound to the same carbon skeleton
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C261/00—Derivatives of cyanic acid
    • C07C261/04—Cyanamides
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/01—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms
    • C07C311/02—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton
    • C07C311/03—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton having the nitrogen atoms of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms
    • C07C311/06—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an acyclic saturated carbon skeleton having the nitrogen atoms of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to acyclic carbon atoms to acyclic carbon atoms of hydrocarbon radicals substituted by carboxyl groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/01—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms
    • C07C311/10—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of a saturated carbon skeleton containing rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/01—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms
    • C07C311/12—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an unsaturated carbon skeleton containing rings
    • C07C311/13—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to acyclic carbon atoms of an unsaturated carbon skeleton containing rings the carbon skeleton containing six-membered aromatic rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/14—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/15—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings
    • C07C311/16—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings having the nitrogen atom of at least one of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to an acyclic carbon atom
    • C07C311/19—Sulfonamides having sulfur atoms of sulfonamide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings having the nitrogen atom of at least one of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to an acyclic carbon atom to an acyclic carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by carboxyl groups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
    • C07C311/50—Compounds containing any of the groups, X being a hetero atom, Y being any atom
    • C07C311/51—Y being a hydrogen or a carbon atom
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D257/00—Heterocyclic compounds containing rings having four nitrogen atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D257/02—Heterocyclic compounds containing rings having four nitrogen atoms as the only ring hetero atoms not condensed with other rings
    • C07D257/04—Five-membered rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D307/00—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having one oxygen atom as the only ring hetero atom
    • C07D307/02—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having one oxygen atom as the only ring hetero atom not condensed with other rings
    • C07D307/26—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having one oxygen atom as the only ring hetero atom not condensed with other rings having one double bond between ring members or between a ring member and a non-ring member
    • C07D307/30—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having one oxygen atom as the only ring hetero atom not condensed with other rings having one double bond between ring members or between a ring member and a non-ring member with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D307/32—Oxygen atoms
    • C07D307/33—Oxygen atoms in position 2, the oxygen atom being in its keto or unsubstituted enol form
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
    • C07F7/00—Compounds containing elements of Groups 4 or 14 of the Periodic Table
    • C07F7/02—Silicon compounds
    • C07F7/08—Compounds having one or more C—Si linkages
    • C07F7/0803—Compounds with Si-C or Si-Si linkages
    • C07F7/081—Compounds with Si-C or Si-Si linkages comprising at least one atom selected from the elements N, O, halogen, S, Se or Te
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C2601/00—Systems containing only non-condensed rings
    • C07C2601/04—Systems containing only non-condensed rings with a four-membered ring
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C2601/00—Systems containing only non-condensed rings
    • C07C2601/06—Systems containing only non-condensed rings with a five-membered ring
    • C07C2601/08—Systems containing only non-condensed rings with a five-membered ring the ring being saturated
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C2601/00—Systems containing only non-condensed rings
    • C07C2601/12—Systems containing only non-condensed rings with a six-membered ring
    • C07C2601/14—The ring being saturated

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Emergency Medicine (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Obesity (AREA)
  • Physical Education & Sports Medicine (AREA)
  • Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Optical Modulation, Optical Deflection, Nonlinear Optics, Optical Demodulation, Optical Logic Elements (AREA)
  • Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
  • Crystals, And After-Treatments Of Crystals (AREA)
  • Control Of Indicators Other Than Cathode Ray Tubes (AREA)
  • Steroid Compounds (AREA)
  • Pyridine Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Description

Opis
OBLAST PRONALASKA
Predmetni pronalazak se odnosi na jedinjenja i postupke korisne za modulaciju interakcije Sestrin-GATOR2 čime se indirektno selektivno moduliše aktivnost mTORC1. Pronalazak, takođe, obezbeđuje farmaceutski prihvatljive kompozicije koje sadrže jedinjenja predmetnog pronalaska i terapeutsku upotrebu navedenih farmaceutski prihvatljivih kompozicija u lečenju različitih poremećaja.
STANЈE TEHNIKE
Mehanistički cilj protein kinaze kompleksa 1 rapamicina (mTORC1) je glavni regulator rasta koji oseća različite ekološke znakove, kao što su faktori rasta, ćelijski stres i nivoi hranljivih materija i energije. Kada se aktivira, mTORC1 fosforiliše supstrate koji potenciraju anaboličke procese, kao što su translacija mRNK i sinteza lipida, i ograničava one kataboličke, kao što je autofagija. Disregulacija mTORC1 javlja se u širokom spektru bolesti, uključujući dijabetes, epilepsiju, neurodegeneraciju, imuni odgovor, potisnuti rast skeletnih mišića i rak između ostalog (Biochemical Society transactions 41, 906-912; Kim et al., (2013) Molecules and cells 35, 463-473; Laplante and Sabatini, (2012) Cell 149, 274-293).
Mnogi uzvodni ulazi, uključujući faktore rasta i nivoe energije, signaliziraju mTORC1 preko TSC kompleksa, koji reguliše Rheb, malu GTPazu koja je suštinski aktivator mTORC1 (Brugarolas et al., (2004) Genes & Development 18, 2893-2904; Garami et al., (2003) Molecular Cell 11, 1457-1466; Inoki et al., (2003) Genes & Development 17, 1829-1834; Long et al., (2005) Current Biology 15, 702-713; Sancak et al., (2008) Science (New York, NY) 320, 1496-1501; Saucedo et al., (2003) Nature cell biology 5, 566-571; Stocker et al., (2003) Nature cell biology 5, 559-565; Tee et al., (2002) Proc Natl Acad Sci U S A 99, 13571-13576). Čini se da amino-kiseline ne signaliziraju mTORC1 preko TSC-Rheb ose i umesto toga deluju preko heterodimernih Rag GTPaza, koje se sastoje od RagA ili RagB vezanog za RagC ili RagD, tim redosledom (Hirose et al., (1998) Journal of cell science 111 (Pt 1), 11-21; Kim et al., (2008) Nature cell biology 10, 935-945; Nobukuni et al., (2005) Proc Natl Acad Sci U S A 102, 14238-14243; Roccio et al., (2005) Oncogene 25, 657-664; Sancak et al., (2008) Science (New York, NY) 320, 1496-1501; Schürmann et al., (1995) The Journal of biological chemistry 270, 28982-28988; Sekiguchi et al., (2001) The Journal of biological chemistry 276, 7246-7257; Smith et al., (2005) The Journal of biological chemistry 280, 18717-18727). Rag GTPaze kontrolišu subćelijsku lokalizaciju mTORC1 i amino-kiseline promovišu njegovo regrutovanje na lizozomnu površinu, gde se takođe nalazi Rheb GTPaza (Buerger et al., (2006) Biochemical and Biophysical Research Communications 344, 869-880; Dibble et al., (2012) Molecular cell 47, 535-546; Saito et al., (2005) Journal of Biochemistry 137, 423-430; Sancak et al., (2008) Science (New York, NY) 320, 1496-1501). Identifikovano je nekoliko pozitivnih komponenti puta uzvodno od Rag GTPaze. Ragulator kompleks lokalizuje Rag GTPaze na lizozomnu površinu i, zajedno sa vakuolarnom-ATPazom, pospešuje razmenu GDP-a za GTP na RagA/B (Bar-Peled et al., (2012) Cell 150, 1196-1208; Sancak et al., (2010) Cell 141, 290-303; Zoncu et al., (2011) Science Signaling 334, 678-683). Posebni FLCN-FNIP kompleks deluje na RagC/D i stimuliše njegovu hidrolizu GTP u GDP (Tsun et al., 2013). Kada je RagA/B napunjen GTP, a RagC/D GDP, heterodimeri se vezuju i regrutuju mTORC1 na lizozomnu površinu, gde može doći u kontakt sa svojim aktivatorom Rheb GTPazom.
Nedavni rad je identifikovao GATOR1 multi-proteinski kompleks kao glavni negativni regulator puta sensiranja amino-kiselina i njegov gubitak uzrokuje da mTORC1 signalizacija bude potpuno neosetljiva na gladovanje amino-kiselina (Bar-Peled et al., (2013) Science 340, 1100-1106; Panchaud et al., (2013) Science Signaling 6, ra42). GATOR1 se sastoji od DEPDC5, Nprl2 i Nprl3 i predstavlja protein koji aktivira GTPazu (GAP) za RagA/B. Multiproteinski kompleks GATOR2, koji ima pet poznatih podjedinica (WDR24, WDR59, Mios, Sec13 i Seh1L), pozitivna je komponenta puta i uzvodno od GATOR1 ili paralelno sa njim, ali njegova molekularna funkcija je do nedavno bila nepoznata. (Bar-Peled et al., (2013) Science 340, 1100-1106; Bar-Peled, L. and Sabatini, D. M. (2014), Trends in Cell Biology 24(7): 400-406).
Nedavno su razjašnjene dodatne informacije o putu mTORC1 identifikovanjem vezivanja GATOR2 sa jednim ili više sestrina i prikazivanjem da dobijeni kompleks Sestrin-GATOR2 reguliše subćelijsku lokalizaciju i aktivnost mTORC1 (Chantranupong, L. et al., (2014), Cell Rep.
9(1):1-8). Konkretno, prisustvo kompleksa Sestrin-GATOR2 inhibira mTORC1 put i smanjuje aktivnost mTORC1 sprečavanjem translokacije mTORC1 u lizozomnu membranu. Interakciju GATOR2 sa sestrinima, a posebno sa Sestrinom1 i Sestrinom2, antagonizuju amino-kiseline, posebno leucin i, u manjoj meri, izoleucin, metionin i valin. U prisustvu leucina, GATOR2 ne reaguje sa Sestrinom1 ili Sestrinom2 i mTORC1 je u stanju da migrira do lizozomne membrane gde je aktivan. Sestrin1 i Sestrin2 direktno vezuju leucin i, u manjoj meri, izoleucin i metionin (Chantranupong et al., (2014) Cell Rep.;9(1):1-8). Vezivanje leucina pomoću Sestrina1 ili -2 je potrebno za prekid njegove interakcije sa GATOR2 i naknadnu aktivaciju mTORC1. Sestrin2 mutanti nesposobni da vežu leucin ne mogu signalizirati prisustvo leucina za mTORC1, a ćelije osiromašene od Sestrina2 i njegovih homologa čine mTORC1 neosetljivim na odsustvo leucina (Wolfson et al., (2015) Science pii: ab2674 [Epub pre štampane verzije]).
Sestrini su tri srodna proteina (Sestrin1, -2 i -3) sa slabo okarakterisanim molekularnim funkcijama (Buckbinder et al., (1994) Proc Natl Acad Sci U S A 91, 10640-10644; Budanov et al., (2002) Cell 134, 451-460; Peeters et al., (2003) Human genetics 112, 573-580). Sestrin2 inhibira mTORC1 signalizaciju i predloženo je da aktivira AMPK uzvodno od TSC, kao i da stupa u interakciju sa TSC (Budanov and Karin, (2008) Cell 134, 451-460), ali kasnije studije otkrivaju inhibiciju mTORC1 od strane Sestrina2 u odsustvu AMPK (Peng et al., (2014) Cell 159(1): 122-33) dalje naglašavajući važnu ulogu koju kompleks GATOR2 igra u modulaciji mTORC1 kao odgovor na Sestrin2.
Modulacija kompleksa Sestrin-GATOR2 predstavlja potencijalni terapeutski cilj za selektivnu modulaciju aktivnosti mTORC1 indirektno.
SUŠTINA PRONALASKA
Sada je ustanovljeno da su jedinjenja predmetnog pronalaska i njihove farmaceutski prihvatljive kompozicije efikasna kao modulatori Sestrin-GATOR2. Takva jedinjenja imaju opštu formulu I:
ili njihova farmaceutski prihvatljiva so, gde je svaka varijabla kao što je definisana i opisana ovde, naznačena time, što su jedinjenja formule I izabrana iz
Poželjno, jedinjenje formule I je I-90 ili njegova farmaceutski prihvatljiva so, poželjnije, jedinjenje formule I je I-90.
Jedinjenja predmetnog pronalaska i njihove farmaceutski prihvatljive kompozicije su korisne za lečenje raznih bolesti, poremećaja ili stanja, povezanih sa mTORC1. Takve bolesti, poremećaji ili stanja uključuju dijabetes, epilepsiju, neurodegeneraciju, imuni odgovor, potisnuti rast skeletnih mišića i poremećaje ćelijske proliferacije (npr. rak) kao što su oni ovde opisani. Poželjno, jedinjenja predmetnog pronalaska, i njihove farmaceutski prihvatljive kompozicije, su korisna za lečenje (i) raka izabranog iz: leukemija (akutna leukemija, akutna limfocitna leukemija, akutna mijelocitna leukemija, akutna mijeloblastna leukemija, akutna promijelocitna leukemija, akutna mijelomonocitna leukemija, akutna monocitna leukemija, akutna eritroleukemija, hronična leukemija, hronična mijelocitna leukemija, hronična limfocitna leukemija), policitemije vera, limfoma (Hočkinova bolest ili ne-Hočkinova bolest), Waldenstromove makroglobulinemije, multiplih mijeloma, bolesti teškog lanca i solidnih tumori kao što su sarkomi i karcinomi (fibrosarkom, miksosarkom, liposarkom, hondrosarkom, osteogeni sarkom, hordom, angiosarkom, endoteliosarkom, limfangiosarkom, limfangioendoteliosarkom, sinoviom, mezoteliom, Juingov tumor, lejomiosarkom, rabdomiosarkom, karcinom debelog creva, rak pankreasa, rak dojke, rak jajnika, rak prostate, karcinom skvamoznih ćelija, karcinom bazalnih ćelija, adenokarcinom, karcinom znojnih žlezda, karcinom lojne žlezde, papilarni karcinom, papilarni adenokarcinom, cistadenokarcinom, medularni karcinom, bronhogeni karcinom, karcinom bubrežnih ćelija, hepatom, karcinom žučnih kanala, horiokarcinom, seminom, embrionalni karcinom, Vilmov tumor, rak grlića materice, rak materice, rak testisa, karcinom pluća, mikrocelularni karcinom pluća, karcinom mokraćne bešike, epitelni karcinom, gliom, astrocitom, meduloblastom, kraniofaringiom, ependimom, pinealom, hemangioblastom, akustični neurom, oligodendrogliom, švanom, meningiom, melanom, neuroblastom i retinoblastom), (ii) proliferativne bolesti izabrane iz gojaznosti, benigne hiperplazije prostate, psorijaze, abnormalne keratinizacije, limfoproliferativnih poremećaja (poremećaj u kome postoji abnormalna proliferacija ćelija limfnog sistema), hroničnog reumatoidnog artritisa, arterioskleroze, restenoze i dijabetesne retinopatije, ili (iii) Ribosomopatije (Diamond-Blackfan anemija, 5q-sindrom, Shwachman-Diamondov sindrom, X-vezana diskeratoza, hipoplazija hrskavice i kose ili Treacher-Collinsov sindrom), kohezinopatije (Robertsov sindrom ili Cornelia de Lange sindrom), atrofija mišića, autofagija ili depresija.
Štaviše, jedinjenja predmetnog pronalaska su korisna u in vitro postupku za modulaciju interakcije Sestrin-GATOR2 čime se selektivno modulira aktivnost mTORC1 indirektno u biološkom uzorku koji obuhvata korak dovođenja u kontakt datog biološkog uzorka sa jedinjenjem iz predmetnog pronalaska.
DETALJAN OPIS ODREĐENIH REALIZACIJA
1. Opšti opis određenih realizacija pronalaska:
Jedinjenja predmetnog pronalaska i njihove kompozicije su korisna kao Sestrin-GATOR2 modulatori. Na uvid javnosti je takođe stavljeno jedinjenje formule I:
ili njegova farmaceutski prihvatljiva so, pri čemu:
R<1>je H ili C1-6alkil;
R<2>je R, -(CH2)n-fenil, -C(O)R, -SO2R, ili -C(O)N(R)2;
n je 0, 1 ili 2;
svaki R je nezavisno vodonik, -CN ili opciono supstituisana grupa izabrana iz zasićenog ili nezasićenog C1-6alifatičnog, fenilnog, 4-7-članog zasićenog ili delimično nezasićenog monocikličnog karbocikličnog prstena, 5-6-članog monocikličnog heteroarilnog prstena koji ima 1-4 heteroatoma, ili 4-8-članog zasićenog ili delimično zasićenog heterocikličnog prstena sa 1-2 heteroatoma nezavisno izabranih iz azota, kiseonika ili sumpora;
R<3>je prsten (ring) A, -C(O)R, -C(O)OR, -C(O)N(R)2, -SO3H, -SO2N(R)2, -S(O)R, -S(O) Ring A, -OR ili -B(OR)2gde su dve OR grupe na istom boru uzete zajedno sa njihovim atomima koji se nalaze između njih da bi formirali 5-8-člani monociklični zasićeni ili delimično nezasićeni prsten koji ima 0-3 heteroatoma, pored bora i dva kiseonika, nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora, ili R<3>i R<4>uzeti zajedno formiraju opciono supstituisani 5-6-člani prsten koji ima 0-1 heteroatoma izabranih iz azota, kiseonika ili sumpora;
L je kovalentna veza ili ravni ili razgranati C1-6alkilenski lanac opciono supstituisan sa 1-9 fluor grupa;
Prsten (Ring) A je opciono supstituisani prsten koji se bira između fenila ili opciono supstituisanog 5-6-članog heteroarilnog prstena koji ima 1-4 heteroatoma koji su nezavisno izabrani iz azota, kiseonika ili sumpora;
R<4>je R, -CF3, -OR, -N(R)2, - Si(R)3, ili -SR, ili R<3>i R<4>uzeti zajedno formiraju opciono supstituisani 5-6-člani prsten koji ima 0-1 heteroatoma izabranih iz azota, kiseonika ili sumpora; i
R<5>je H ili C1-4alkil,
pri čemu je, u predmetnom pronalasku, jedinjenje formule (I) izabrano iz
2. Jedinjenja i definicije:
Jedinjenja predmetnog pronalaska su definisana priloženim patentnim zahtevima. Kako se ovde koriste, sledeće definicije će se primenjivati osim ako nije drugačije naznačeno. Za potrebe predmetnog pronalaska, hemijski elementi su identifikovani u skladu sa Periodnim sistemom elemenata, CAS verzijom, Priručnikom za hemiju i fiziku, 75. izdanje. Pored toga, opšti principi organske hemije su opisani u „Organic Chemistry”, Thomas Sorrell, University Science Books, Sausalito: 1999, i „March’s Advanced Organic Chemistry”, 5th Ed., Ed.: Smith, M.B. and March, J., John Wiley & Sons, New York: 2001.
Izraz „alifatična” ili „alifatična grupa”, kako se ovde koristi, označava ravan lanac (tj., nerazgranati) ili razgranati, supstituisani ili nesupstituisani ugljovodonični lanac koji je potpuno zasićen ili koji sadrži jednu ili više jedinica nezasićenosti, ili monociklični ugljovodonik ili biciklični ugljovodonik koji je potpuno zasićen ili koji sadrži jednu ili više jedinica nezasićenosti, ali koji nije aromatičan (koji se ovde, takođe, naziva „karbocikl”, „cikloalifatični” ili „cikloalkil”), koji ima jednu tačku vezivanja za ostatak molekula. Osim ako nije drugačije naznačeno, alifatične grupe sadrže 1-6 alifatičnih atoma ugljenika. U nekim slučajevima, alifatične grupe sadrže 1-5 alifatičnih atoma ugljenika. U drugim slučajevima, alifatične grupe sadrže 1-4 alifatična atoma ugljenika. U još nekim slučajevima, alifatične grupe sadrže 1-3 alifatična atoma ugljenika, au još nekim slučajevima alifatične grupe sadrže 1-2 alifatična atoma ugljenika. U nekim slučajevima,
„cikloalifatični” (ili „karbocikl” ili „cikloalkil”) se odnosi na monociklični C3-C6ugljovodonik koji je potpuno zasićen ili koji sadrži jednu ili više jedinica nezasićenosti, ali koji nije aromatičan, koji ima jednu tačku vezivanja za ostatak molekula. Pogodne alifatične grupe uključuju, ali nisu ograničene na, linearne ili razgranate, supstituisane ili nesupstituisane alkil, alkenil, alkinil grupe i njihove hibride kao što su (cikloalkil)alkil, (cikloalkenil)alkil ili (cikloalkil)alkenil.
Izraz „heteroatom” označava jedan ili više od kiseonika, sumpora, azota, fosfora ili silicijuma (uključujući bilo koji oksidovani oblik azota, sumpora, fosfora ili silicijuma; kvaternizovani oblik bilo kog osnovnog azota ili; supstituabilni azot heterocikličnog prstena, na primer N (kao u 3,4-dihidro-2H-pirolilu), NH (kao u pirolidinilu) ili NR<+>(kao u N-supstituisanom pirolidinilu)).
Izraz „nezasićeni”, kako se ovde koristi, znači da grupa ima jednu ili više jedinica nezasićenosti.
Kako se ovde koristi, izraz „bivalentni C1-8(ili C1-6) zasićeni ili nezasićeni, ravan ili razgranati, ugljovodonični lanac”, odnosi se na dvovalentne alkilenske, alkenilenske i alkinilenske lance koji su ravni ili razgranati kako je ovde definisano.
Izraz „alkilen” se odnosi na dvovalentnu alkil grupu. „Alkilenski lanac” je polimetilenska grupa, tj. -(CH2)n-, pri čemu je n pozitivan ceo broj, poželjno od 1 do 6, od 1 do 4, od 1 do 3, od 1 do 2 ili od 2 do 3. Supstituisani alkilenski lanac je polimetilenska grupa u kojoj je jedan ili više metilenskih atoma vodonika zamenjeno supstituentom. Pogodni supstituenti uključuju one koji su dole opisani za supstituisanu alifatičnu grupu.
Izraz „alkenilen” se odnosi na dvovalentnu alkenil grupu. Supstituisani alkenilenski lanac je polimetilenska grupa koja sadrži najmanje jednu dvostruku vezu u kojoj je jedan ili više atoma vodonika zamenjeno supstituentom. Pogodni supstituenti uključuju one koji su dole opisani za supstituisanu alifatičnu grupu.
Izraz „halogen” označava F, Cl, Br ili I.
Izraz „aril” koji se koristi sam ili kao deo veće grupe kao što je „aralkil”, „aralkoksi” ili „ariloksialkil”, odnosi se na monociklične ili biciklične sisteme prstenova koji imaju ukupno pet do četrnaest članova prstena, pri čemu je najmanje jedan prsten u sistemu aromatičan i pri čemu svaki prsten u sistemu sadrži 3 do 7 članova prstena. Izraz „aril” se može koristiti naizmenično sa izrazom „arilni prsten”. U određenim slučajevima predmetnog pronalaska, „aril” se odnosi na aromatični prstenasti sistem koji uključuje, ali nije ograničen na, fenil, bifenil, naftil, antracil i slično, koji mogu da nose jedan ili više supstituenata. Takođe, uključena u obim izraza „aril”, kako se ovde koristi, je grupa u kojoj je aromatični prsten fuzionisan sa jednim ili više nearomatičnih prstenova, kao što su indanil, ftalimidil, naftimidil, fenantridinil ili tetrahidronaftil, i slično.
Izrazi „heteroaril” i „heteroar-”, koji se koriste sami ili kao deo većeg dela, npr. „heteroaralkil” ili „heteroaralkoksi”, odnose se na grupe koje imaju 5 do 10 atoma u prstenu, poželjno 5, 6 ili 9 atoma u prstenu; koji imaju 6, 10 ili 14 π elektrona podeljenih u cikličnom nizu; i imaju, pored atoma ugljenika, od jedan do pet heteroatoma. Izraz „heteroatom” se odnosi na azot, kiseonik ili sumpor, i uključuje bilo koji oksidovani oblik azota ili sumpora, i bilo koji kvaternizovani oblik osnovnog azota. Heteroarilne grupe uključuju, bez ograničenja, tienil, furanil, pirolil, imidazolil, pirazolil, triazolil, tetrazolil, oksazolil, izoksazolil, oksadiazolil, tiazolil, izotiazolil, tiadiazolil, piridil, piridil, piridazinil, pirimidinil, pirazinil, indolizinil, purinil, naftiridinil i pteridinil. Izrazi „heteroaril” i „heteroar-”, kako se ovde koriste, takođe uključuju grupe u kojima je heteroaromatični prsten fuzionisan sa jednim ili više arilnih, cikloalifatičnih ili heterociklil prstenova, gde je radikal ili tačka vezivanja na heteroaromatičnom prstenu. Neograničavajući primeri uključuju indolil, izoindolil, benzotienil, benzofuranil, dibenzofuranil, indazolil, benzimidazolil, benztiazolil, hinolil, izohinolil, kinolinil, ftalazinil, hinazolinil, hinoksalinil, 4H-hinolizinil, karbazolil, akridinil, fenazinil, fenotiazinil, fenoksazinil, tetrahidrokinolinil, tetrahidroizohinolinil i pirido[2,3-b]-oksazin-3(4H)-on. Heteroarilna grupa može biti mono- ili biciklična. Izraz „heteroaril” se može koristiti naizmenično sa izrazima „heteroarilni prsten”,
„heteroarilna grupa” ili „heteroaromatičan”, od kojih svaki izraz uključuje prstenove koji su opciono supstituisani. Izraz „heteroaralkil” se odnosi na alkilnu grupu supstituisanu heteroarilom, pri čemu su alkil i heteroaril delovi nezavisno opciono supstituisani.
Kako se ovde koriste, izrazi „heterocikl”, „heterociklil”, „heterociklični radikal” i „heterociklični prsten” se koriste naizmenično i odnose se na stabilan 5- do 7-člani monociklični ili 7-10-člani biciklični heterociklični deo koji je bilo zasićeni ili delimično nezasićeni, i koji ima, pored atoma ugljenika, jedan ili više, poželjno jedan do četiri, heteroatoma, kao što je gore definisano. Kada se koristi u odnosu na atom u prstenu heterocikla, izraz „azot” uključuje supstituisani azot. Kao primer, u zasićenom ili delimično nezasićenom prstenu koji ima 0-3 heteroatoma izabrana iz kiseonika, sumpora ili azota, azot može biti N (kao u 3,4-dihidro-2H-pirolilu), NH (kao u pirolidinilu), ili<+>NR (kao u N-supstituisanom pirolidinilu).
Heterociklični prsten može biti vezan za svoju priveznu grupu na bilo kom heteroatomu ili atomu ugljenika koji rezultira stabilnom strukturom i bilo koji od atoma prstena može biti opciono supstituisan. Primeri takvih zasićenih ili delimično nezasićenih heterocikličnih radikala uključuju, bez ograničenja, tetrahidrofuranil, tetrahidrotiofenil pirolidinil, piperidinil, pirolinil, tetrahidrohinolinil, tetrahidroizohinolinil, dekahidrohinolinil, oksazolidinil, piperazinil, dioksanil, dioksolanil, diazepinil, oksazepinil, tiazepinil, morfolinil i hinuklidinil. Izrazi „heterocikl”,
„heterociklil”, „heterociklilni prsten”, „heterociklična grupa”, „heterociklični deo” i
„heterociklični radikal” se ovde koriste naizmenično, a takođe uključuju grupe u kojima je heterociklilni prsten fuzionisan sa jednim ili više arilnih, heteroarilnih ili cikloalifatičnih prstenova, kao što su indolinil, 3H-indolil, hromanil, fenantridinil ili tetrahidrokinolinil. Heterociklilna grupa može biti mono- ili biciklična. Izraz „heterociklilalkil” se odnosi na alkilnu grupu supstituisanu heterociklilom, pri čemu su alkil i heterociklil delovi nezavisno opciono supstituisani.
Kako se ovde koristi, izraz „delimično nezasićen” se odnosi na deo prstena koji uključuje najmanje jednu dvostruku ili trostruku vezu. Izraz „delimično nezasićen” je namenjen da obuhvati prstenove koji imaju višestruka mesta nezasićenosti, ali nije namera da uključi aril ili heteroaril delove, kako je ovde definisano.
Kao što je ovde opisano, jedinjenja pronalaska mogu da sadrže „opciono supstituisane” delove. Uopšteno, izraz „supstituisan”, bez obzira da li mu prethodi izraz „opciono” ili ne, znači da su jedan ili više vodonika naznačene grupe zamenjeni odgovarajućim supstituentom. Osim ako nije drugačije naznačeno, „opciono supstituisana” grupa može imati odgovarajući supstituent na svakoj supstitabilnoj poziciji grupe, a kada više od jedne pozicije u bilo kojoj datoj strukturi može biti supstituisano sa više od jednog supstituenta izabranog iz određene grupe, supstituent može biti ili isti ili različiti na svakoj poziciji. Kombinacije supstituenata predviđenih predmetnim pronalaskom su poželjno one koje rezultiraju formiranjem stabilnih ili hemijski izvodljivih jedinjenja. Izraz
„stabilan”, kako se ovde koristi, odnosi se na jedinjenja koja nisu suštinski promenjena kada su podvrgnuta uslovima koji omogućavaju njihovu proizvodnju, otkrivanje i, u određenim slučajevima, njihovo dobijanje, prečišćavanje i upotrebu u jednu ili više namena ovde stavljenih na uvid javnosti.
Pogodni monovalentni supstituenti na supstitabilnom atomu ugljenika „opciono supstituisane” grupe su nezavisno halogen; (-(CH2)0-4R°; -(CH2)0-40R°; -O(CH2)0-4R°, -O-(CH2)0-4C(O)OR°; -(CH2)0-4CH(OR°)2; -(CH2)0-4SR°; -(CH2)0-4Ph, koji može biti supstituisan sa R°; (CH2)0-4O(CH2)0-1Ph koji može biti supstituisan sa R°; -CH=CHPh, koji može biti supstituisan sa R°; -(CH2)0-4O(CH2)0-1-piridil koji može biti supstituisan sa R°; -NO2; - CN; -N3; -(CH2)0-4N(R°)2; -(CH2)0-4N(R°)C(O)R°; -N(R°)C(S)R°; -(CH2)0-4N(R°)C(O)NR°2; -N(R°)C(S)NR°2; -(CH2)0-4N(R°)C(O)OR°; - N(R°)N(R°)C(O)R°; -N(R°)N(R°)C(O)NR°2; -N(R°)N(R°)C(O)OR°; -(CH2)0-4C(O)R°; - C(S)R°; -(CH2)0-4C(O)OR°; -(CH2)0-4C(O)SR°; -(CH2)0-4C(O)OSiR°3; -(CH2)0-4OC(O)R°; - OC(O)(CH2)0-4SR-, SC(S)SR°; -(CH2)0-4SC(O)R°; -(CH2)0-4C(O)NR°2; -C(S)NR°2; - C(S)SR°; -SC(S)SR°, -(CH2)0-4OC(O)NR°2; C(O)N(OR°)R°; -C(O)C(O)R°; - C(O)CH2C(O)R°; -C(NOR°)R°; -(CH2)0-4SSR°; -(CH2)0-4S(O)2R’; -(CH2)0-4S(O)2OR°; -(CH2)0-4OS(O)2R°; - S(O)2NR°2; -(CH2)0-4S(O)R°; -N(R°)S(O)2NR°2; -N(R°)S(O)2R°; - N(OR°)R°; -C(NH)NR°2; -P(O)2R°; -P(O)R°2; -OP(O)R°2; -OP(O)(OR°)2; -SiR°3; -(C1-4 ravan ili razgranati alkilen) O-N(R°)2; ili -(C1-4ravan ili razgranati alkilen) C(O)ON(R°)2, pri čemu svaki R° može biti supstituisan kao što je definisano u nastavku i nezavisno je vodonik, C1-6alifatični, -CH2Ph, -O(CH2)0-1Ph, -CH2-(5-6-člani heteroarilni prsten), ili 5-6-člani zasićeni, delimično nezasićeni ili arilni prsten koji ima 0-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora, ili, bez obzira na gornju definiciju, dve nezavisne pojave od R°, uzete zajedno sa njihovim posredujućim atomom(ima), formiraju 3-12-člani zasićeni, delimično nezasićeni ili arilni mono- ili biciklični prsten koji ima 0-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora, koji mogu biti zamenjen kao što je definisano u nastavku.
Pogodni monovalentni supstituenti na R° (ili prsten formiran uzimanjem dva nezavisna pojavljivanja R° zajedno sa njihovim posredujućim atomima) su nezavisno halogen, -(CH2)0-2R<●>, -(haloR<●>), -(CH2)0-2OH, -(CH2)0-2OR<●>, -(CH2)0-2CH(OR<●>)2; -O(haloR<●>), -CN, -N3, -(CH2)0-2C(O)R<●>, -(CH2)0-2C(O)OH, -(CH2)0-2C(O)OR<●>, -(CH2)0-2SR<●>, -(CH2)0-2SH, -(CH2)0-2NH2, -(CH2)0-2NHR<●>, -(CH2)0-2NR<●>2, - NO2, -SiR<●>3, -OSiR<●>3, -C(O)SR<●>, -(C1-4 ravan ili razgranati alkilen)C(O)OR', ili -SSR<●>pri čemu svaki R<●>je nesupstituisan ili gde mu prethodi
„halo” supstituisan je samo sa jednim ili više halogena, i nezavisno je izabran iz C1-4alifatičnog, -CH2Ph, -O(CH2)0-1Ph, ili 5-6-članog zasićengo, delimično nezasićenog ili arilnog prstena koji ima 0-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora. Pogodni dvovalentni supstituenti na zasićenom atomu ugljenika R° uključuju =O i =S.
Pogodni dvovalentni supstituenti na zasićenom atomu ugljenika „opciono supstituisane” grupe uključuju sledeće: =O, =S, =NNR<∗>2, =NNHC(O)R<∗>, =NNHC(O)OR<∗>, =NNHS(O)2R<∗>, =NR<∗>, =NOR<∗>, -O(C(R<∗>2))2-3O-, ili -S(C(R<∗>2))2-3S-, pri čemu svako nezavisno pojavljivanje R<∗>je izabrano iz vodonika, C1-6alifatičnog koji može biti supstituisan kao što je definisano u nastavku, ili nesupstituisanog 5-6-članog zasićenog, delimično nezasićenog ili arilnog prstena koji ima 0-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora. Pogodni dvovalentni supstituenti koji su vezani za vicinalne supstitabilne ugljenike „opciono supstituisane” grupe uključuju: O(CR<∗>2)2-3O-, pri čemu svako nezavisno pojavljivanje R<∗>je izabrano iz vodonika, C1-6alifatičnog koji može biti supstituisan kao što je definisano u nastavku, ili nesupstituisanog 5-6-članog zasićenog, delimično nezasićenog ili arilnog prsten koji ima 0-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora.
Pogodni supstituenti na alifatičkoj grupi R<∗>uključuju halogen, - R<●>, -(haloR<●>), -OH, -OR<●>, -O(haloR<●>), -CN, -C(O)OH, -C(O)OR<●>, -NH2, -NHR<●>, -NR<●>2, ili NO2, pri čemu je svaki R<●>nesupstituisan ili kad mu prethodi „halo” je supstituisan samo sa jednim ili više halogena, i nezavisno je C1-4alifatični, -CH2Ph, -O(CH2)0-1Ph, ili 5-6-člani zasićeni, delimično nezasićeni ili arilni prsten koji ima 0-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora.
Pogodni supstituenti na supstitabilnom azotu „opciono supstituisane” grupe uključuju -R<†>, -NR<†>2, -C(O)R<†>, -C(O)OR<†>, -C(O)C(O)R<†>, C(O)CH2C(0)R<†>, -S(O)2R<†+>, - S(O)2NR<†>2, -C(S)NR<†>2, -C(NH)NR<†>2, ili -N(R<†>)SO)2R<†>; pri čemu svaki R<†>je nezavisno vodonik, C1-6alifatični koji može biti supstituisan kao što je dole definisan, nesupstituisani -OPh, ili nesupstituisani 5-6-člani zasićeni, delimično nezasićeni ili arilni prsten koji ima 0-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora, ili, bez obzira na gornju definiciju, dve nezavisne pojave R<†>, uzete zajedno sa njihovim posredujućim atomom(ima) formiraju nesupstituisani 3-12-člani zasićeni, delimično nezasićeni ili arilni mono- ili biciklični prsten koji ima 0-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora.
Pogodni supstituenti na alifatičkoj grupi R<†>su nezavisno halogen, - R<●>, -(haloR<●>), -OH, -OR<●>, -O(haloR<●>), -CN, -C(O)OH, -C(O)OR<●>, -NH2, -NHR<●>, -NR<●>2, ili NO2, pri čemu svaki R<●>je nesupstituisan ili gde mu prethodi „halo” je supstituisan samo sa jednim ili više halogena, i nezavisno je C1-4alifatični, -CH2Ph, -O(CH2)0-1Ph, ili 5-6-člani zasićeni, delimično nezasićeni ili arilni prsten koji ima 0-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora.
Kako se ovde koristi, izraz „farmaceutski prihvatljiva so” odnosi se na one soli koje su, u okviru razumne medicinske procene, pogodne za upotrebu u kontaktu sa tkivima ljudi i nižih životinja bez nepotrebne toksičnosti, iritacije, alergijskog odgovora i slično, i srazmerne su razumnom odnosu koristi/rizik. Farmaceutski prihvatljive soli su dobro poznate u tehnici. Na primer, S. M.
Berge et al., detaljno opisuju farmaceutski prihvatljive soli u J. Pharmaceutical Sciences, 1977, 66, 1-19. Farmaceutski prihvatljive soli jedinjenja predmetnog pronalaska uključuju one izvedene iz pogodnih neorganskih i organskih kiselina i baza. Primeri farmaceutski prihvatljivih, netoksičnih kiselinskih adicijskih soli su soli amino grupe formirane sa neorganskim kiselinama kao što su hlorvodonična kiselina, bromovodonična kiselina, fosforna kiselina, sumporna kiselina i perhlorna kiselina ili sa organskim kiselinama kao što su sirćetna kiselina, oksalna kiselina, maleinska kiselina, vinsku kiselinu, limunsku kiselinu, sukcinsku kiselinu ili malonsku kiselinu ili korišćenjem drugih postupaka koji se koriste u tehnici kao što je jonska razmena. Ostale farmaceutski prihvatljive soli obuhvataju adipat, alginat, askorbat, aspartat, benzensulfonat, benzoat, bisulfat, borat, butirat, kamforat, kamforsulfonat, citrat, ciklopentanpropionat, diglukonat, dodecilsulfat, etansulfonat, format, fumarat, glukoheptonat, glicerofosfat, glukonat, hemisulfat, heptanoat, heksanoat, hidrojodid, 2-hidroksi-etansulfonat, laktobionat, laktat, laurat, lauril sulfat, malat, maleat, malonat, metansulfonat, 2-naftalensulfonat, nikotinat, nitrat, oleat, oksalat, palmitat, pamoat, pektinat, persulfat, 3-fenilpropionat, fosfat, pivalat, propionat, stearat, sukcinat, sulfat, tartarat, tiocijanat, p-toluensulfonat, undekanoat, valeratne soli i slično.
Soli dobijene od odgovarajućih baza uključuju alkalne metale, zemnoalkalne metale, amonijum i N(C1-4alkil)4soli. Reprezentativne soli alkalnih ili zemnoalkalnih metala uključuju natrijum, litijum, kalijum, kalcijum, magnezijum i slično. Dalje, farmaceutski prihvatljive soli uključuju, kada je prikladno, netoksični amonijum, kvaternarni amonijum i aminske katjone formirane korišćenjem kontrajona kao što su halid, hidroksid, karboksilat, sulfat, fosfat, nitrat, niži alkil sulfonat i aril sulfonat.
Osim ako nije drugačije navedeno, strukture prikazane ovde, takođe, podrazumevaju da uključuju sve izomerne (npr. enantiomerne, dijastereomerne i geometrijske (ili konformacione)) oblike strukture; na primer, R i S konfiguracije za svaki asimetrični centar, Z i E izomere dvostruke veze i Z i E konformacione izomere. Prema tome, pojedinačni stereohemijski izomeri kao i enantiomerne, dijastereomerne i geometrijske (ili konformacione) smeše ovih jedinjenja su u okviru pronalaska. Osim ako nije drugačije navedeno, svi tautomerni oblici jedinjenja pronalaska su unutar obima pronalaska. Pored toga, osim ako nije drugačije navedeno, strukture prikazane ovde takođe podrazumevaju jedinjenja koja se razlikuju samo u prisustvu jednog ili više izotopski obogaćenih atoma. Na primer, jedinjenja koja imaju predmetnu strukturu uključujući zamenu vodonika deuterijumom ili tricijumom, ili zamenu ugljenika sa<13>C- or<14>C-obogaćenim ugljenikom su u okviru predmetnog pronalaska. Takva jedinjenja su korisna, na primer, kao analitička sredstva, kao sonde u biološkim testovima, ili kao terapeutska sredstva u skladu sa predmetnim pronalaskom.
Kako se ovde koristi, izraz „leucinski mimetik ” je definisan kao jedinjenje koje smanjuje količinu Sestrina2 vezanog za GATOR2 za najmanje oko 40% na 25 µM u odnosu na leucin. U određenim slučajevima, „leucinski mimetik” smanjuje količinu Sestrina2 vezanog za GATOR2 za najmanje oko 100%, za najmanje oko 150%, ili za najmanje oko 200%.
Kako se ovde koristi, izraz „leucinski antagonist” je definisan kao jedinjenje koje povećava količinu Sestrina2 vezanog za GATOR2 za najmanje oko 40% na 25 µM u odnosu na leucin (predstavljeno kao -40% aktivnosti leucina). U određenim slučajevima, „leucinski antagonist” povećava količinu Sestrina2 vezanog za GATOR2 za najmanje oko 100%, za najmanje oko 150%, ili za najmanje oko 200%.
Izrazi „merljivi afinitet” i „merljivo inhibiranje”, kako se ovde koriste, označavaju merljivu promenu u vezivanju Sestrina2 za GATOR2 između uzorka koji sadrži jedinjenje iz predmetnog pronalaska, ili njegove kompozicije, i Sestrina2, GATOR2 i leucina, i ekvivalentnog uzorka koji sadrži Sestrin2, GATOR2 i leucin, u odsustvu datog jedinjenja, ili njegove kompozicije.
3. Opis primernih realizacija:
Takođe je stavljeno na uvid javnosti jedinjenje formule I:
ili njegova farmaceutski prihvatljiva so, pri čemu:
R<1>je H ili C1-6alkil;
R<2>je R, -(CH2)n-fenil, -C(O)R, -SO2R, ili -C(O)N(R)2;
n je 0, 1 ili 2;
svaki R je nezavisno vodonik, -CN ili opciono supstituisana grupa izabrana iz zasićenog ili nezasićenog C1-6alifatičnog, fenilnog, 4-7-članog zasićenog ili delimično nezasićenog monocikličnog karbocikličnog prstena, 5-6-članog monocikličnog heteroarilnog prstena koji ima 1-4 heteroatoma, ili 4-8-članog zasićenog ili delimično zasićenog heterocikličnog prstena sa 1-2 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora;
R<3>je prsten A, -C(O)R, -C(O)OR, -C(O)N(R)2, -SO3H, -SO2N(R)2, -S(O)R, -S(O) prsten A, -OR ili -B(OR)2gde su dve OR grupe na istom boru uzete zajedno sa svojim posredujućim atomima da bi formirali 5-8-člani monociklični zasićeni ili delimično nezasićeni prsten koji ima 0-3 heteroatoma, pored bora i dva kiseonika, nezavisno izabrana iz azota, kiseonika, ili sumpor, ili R<3>i R<4>uzeti zajedno formiraju opciono supstituisani 5-6-člani prsten koji ima 0-1 heteroatom izabran iz azota, kiseonika ili sumpora;
L je kovalentna veza ili ravni ili razgranati C1-6alkilenski lanac opciono supstituisan sa 1-9 fluor grupa;
Prsten (Ring) A je opciono supstituisani prsten izabran iz fenila ili opciono supstituisani 5-6-člani heteroarilni prsten koji ima 1-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora;
R<4>je R, -CF3, -OR, -N(R)2, -Si(R)3, ili -SR, ili R<3>i R<4>uzeti zajedno formiraju opciono supstituisani 5-6-člani prsten koji ima 0-1 heteroatom izabran iz azota, kiseonika ili sumpora; i
R<5>je H ili C1-4alkil,
pri čemu je, u predmetnom pronalasku, jedinjenje formule (I) izabrano iz
Kao što je generalno definisano za formulu I gore, R<1>je H ili C1-6alkil. U nekim slučajevima, R<1>je H. U drugim slučajevima, R<1>je C1-6alkil. U nekim slučajevima R<1>je metil. U nekim slučajevima R<1>je izobutil. U nekim slučajevima, R<1>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 1, u daljem tekstu. U nekim slučajevima, R<1>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 2, u daljem tekstu.
Kao što je generalno definisano za formulu I gore, R<2>je R, -(CH2)n-fenil, -C(O)R, -SO2R, ili -C(O)N(R)2. U nekim slučajevima, R<2>je R. U nekim slučajevima, R<2>je -(CH2)n-fenil. U nekim slučajevima, R<2>je -C(O)R. U nekim slučajevima, R<2>je -SO2R. U nekim slučajevima, R<2>je -C(O)N(R)2. U nekim slučajevima, R<2>je metil. U nekim slučajevima, R<2>je -(CH2)-fenil. U nekim slučajevima, R<2>je -C(O)CH3. U nekim slučajevima, R<2>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 1, u daljem tekstu. U nekim slučajevima, R<2>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 2, u daljem tekstu.
Kao što je generalno definisano za formulu I gore, n je 0, 1 ili 2. U nekim slučajevima, n je 0. U nekim slučajevima, n je 1. U nekim slučajevima, n je 2.
Kao što je generalno definisano za formulu I gore, R<3>je prsten A, -C(O)R, -C(O)OR, - C(O)N(R)2, -SO3H, -SO2N(R)2, -S(O)R, -S(O) Prsten A, -OR ili -B(OR)2gde su dve -OR grupe na istom boru uzete zajedno sa njihovim posredujućim atomima da formiraju 5-8-člani monociklični zasićeni ili delimično nezasićeni, prsten koji ima 0-3 heteroatoma, pored bora i dva kiseonika, nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora, ili R<3>i R<4>uzeti zajedno formiraju opciono supstituisani 5-6 člani prsten koji ima 0-1 heteroatom izabran iz azota, kiseonika ili sumpora.
U nekim slučajevima, R<3>je -C(O)OH. U nekim slučajevima, R<3>je -C(O)N(R)2. U nekim slučajevima, R<3>je -SO3H. U nekim slučajevima, R<3>je -SO2N(R)2. U nekim slučajevima, R<3>je -B(OR)2gde su dve -OR grupe na istom boru uzete zajedno sa njihovim posredujućim atomima da formiraju 5-8-člani monociklični zasićeni, delimično nezasićeni ili heterociklični prsten koji ima 0-3 heteroatoma, pored bora i dva kiseonika, nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora. U nekim slučajevima, R<3>i R<4>uzeti zajedno formiraju opciono supstituisani 5-6 člani prsten koji ima 0-1 heteroatom izabran iz azota, kiseonika ili sumpora.
U nekim slučajevima, R<3>je Prsten A. Kao što je generalno definisano gore, Prsten A je opciono supstituisani prsten izabran iz fenila ili opciono supstituisani 5-6-člani heteroarilni prsten koji ima 1-4 heteroatoma nezavisno izabranih između azota, kiseonika ili sumpora. U nekim slučajevima, prsten A je opciono supstituisani fenil. U nekim slučajevima, Prsten A je opciono supstituisani 5-člani heteroarilni prsten koji ima 1-4 heteroatoma nezavisno izabrana iz azota, kiseonika ili sumpora. U nekim slučajevima, Prsten A je opciono supstituisani 5-člani heteroarilni prsten izabran iz imidazolila, izoksazolila, 1H-pirolila (npr. maleimido), pirazolila, oksazolila, tetrazolila, tiazolila i triazolila. U nekim slučajevima, Prsten A je opciono supstituisani 6-člani heteroarilni prsten koji ima 1-2 atoma azota. U nekim slučajevima, Prsten A je opciono supstituisani 6-člani prsten izabran iz piridila i pirimidinila. U nekim slučajevima, prsten A je izabran iz onih prikazanih u tabeli 1, u daljem tekstu.
U nekim slučajevima, R<3>je (pinakolato)bor. U nekim slučajevima, R<3>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 1, u daljem tekstu. U nekim slučajevima, R<3>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 2, u daljem tekstu.
Kao što je generalno definisano za formulu I gore, L je kovalentna veza ili ravni ili razgranati C1-
6alkilenski lanac opciono supstituisan sa 1-4 fluor grupe. U nekim slučajevima, L je kovalentna veza. U nekim slučajevima, L je ravni ili razgranati C1-6alkilenski lanac opciono supstituisan sa 1-4 fluor grupe. U nekim slučajevima, L je metilen. U nekim slučajevima, L je n-butilenil. U nekim slučajevima, L je etilenil. U nekim slučajevima, L je n-propilenil. U nekim slučajevima, L je izabran iz onih prikazanih u tabeli 1, u daljem tekstu. U nekim slučajevima, L je izabran iz onih prikazanih u tabeli 2, u daljem tekstu.
U nekim slučajevima, L je razgranati C1-6alkilenski lanac opciono supstituisan sa 1-4 fluor grupe. U određenim slučajevima, L je -C(CH3)2-. U drugim slučajevima, L je -C(CH3)(CF3)-
Kao što je generalno definisano za formulu I gore, R<4>je R, -CF3, -OR, -N(R)2, -Si(R)3ili - SR, ili R<3>i R<4>uzeti zajedno formiraju opciono supstituisani 5-6 člani prsten koji ima 0-1 heteroatom izabran iz azota, kiseonika ili sumpora. U nekim slučajevima, R<4>je R. U nekim slučajevima, R<4>je -CF3. U nekim slučajevima, R<4>je -OR. U nekim slučajevima, R<4>je -N(R)2. U nekim slučajevima, R<4>je - Si(R)3. U nekim slučajevima, R<4>je -SR. U nekim slučajevima, R<4>je izopropil. U nekim slučajevima, R<4>je terc-butil. U nekim slučajevima, R<4>je ciklopropil. U nekim slučajevima, R<4>je ciklobutil. U nekim slučajevima, R<4>je sek-butil. U nekim slučajevima, R<4>je metoksil. U nekim slučajevima, R<4>je metiltioil. U nekim slučajevima, R<3>i R<4>uzeti zajedno formiraju opciono supstituisani 5-6-člani prsten koji ima 0-1 heteroatom izabran iz azota, kiseonika ili sumpora. U nekim slučajevima, R<4>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 1, u daljem tekstu. U nekim slučajevima, R<4>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 2, u daljem tekstu.
Kao što je generalno definisano za formulu I gore, R<5>je H ili C1-4alkil. U nekim slučajevima, R<5>je H. U nekim slučajevima, R<5>je C1-4alkil. U nekim slučajevima, R<5>je metil. U nekim slučajevima, R<5>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 1, u daljem tekstu. U nekim slučajevima, R<5>je izabran iz onih prikazanih u tabeli 2, u daljem tekstu.
Primeri jedinjenja formule I su izloženi u Tabeli 1, ispod, pri čemu samo jedinjenja I-63, I-90, I91, I-128, I-129, I-196, I-210, I-229, I-230, I-232, I-234, I-238, I- 251 i I-252 su jedinjenja predmetnog pronalaska.
Tabela 1. Primeri jedinjenja
* = nije deo predmetnog pronalaska ;Primeri jedinjenja formule I su navedeni u Tabeli 2, u daljem tekstu. ;Tabela 2. Primeri jedinjenja ; ; ;; * = nije deo predmetnog pronalaska
U nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje izloženo u Tabeli 1, gore, ili njegovu farmaceutski prihvatljivu so, pod uslovom da je jedinjenje izabrano iz jedinjenja I-63, I-90, I-91, I-128, I-129, I-196, I-210, I-229, I-230, I-232, I-234, I-238, I-251 i I-252.
5. Upotreba, formulacija i primena/administracija
Farmaceutski prihvatljive kompozicije
Prema drugoj realizaciji, pronalazak obezbeđuje kompoziciju koja sadrži jedinjenje predmetnog pronalaska, tj. jedinjenje formule I izabrano iz jedinjenja I-63, I-90, I-91, I-128, I-129, I-196, I-210, I-229, I-230, I-232, I-234, I-238, I-251 i I-252 ili njegov farmaceutski prihvatljiv derivat i farmaceutski prihvatljiv nosač, pomoćno sredstvo ili vehikulum. Količina jedinjenja u kompozicijama predmetnog pronalaska je takva da je efikasna da merljivo inhibira ili aktivira interakciju Sestrin-GATOR2, u biološkom uzorku ili kod pacijenta. U određenim realizacijama, količina jedinjenja u kompozicijama predmetnog pronalaska je takva da je efikasna da merljivo inhibira ili aktivira interakciju Sestrin-GATOR2, u biološkom uzorku ili kod pacijenta. U određenim realizacijama, kompozicija predmetnog pronalaska je formulisana za davanje pacijentu kome je potrebna takva kompozicija. U nekim realizacijama, kompozicija predmetnog pronalaska je formulisana za oralnu primenu kod pacijenta.
Izraz „pacijent”, kako se ovde koristi, označava životinju, poželjno sisara, a najpoželjnije čoveka.
Izraz „farmaceutski prihvatljiv nosač, pomoćno sredstvo ili vehikulum” odnosi se na netoksični nosač, pomoćno sredstvo ili vehikulum koji ne uništava farmakološku aktivnost jedinjenja sa kojim je formulisano. Farmaceutski prihvatljivi nosači, adjuvansi ili nosači koji se mogu koristiti u kompozicijama predmetnog pronalaska uključuju, ali nisu ograničeni na, jonoizmenjivače, aluminijum oksid, aluminijum stearat, lecitin, serumske proteine, kao što je albumin humanog seruma, puferske supstance kao što su fosfati, glicin, sorbinska kiselina, kalijum sorbat, delimične gliceridne smešne zasićenih biljnih masnih kiselina, vode, soli ili elektrolita, kao što su protamin sulfat, dinatrijum hidrogen fosfat, kalijum hidrogen fosfat, natrijum hlorid, soli cinka, koloidni silicijum dioksid, magnezijum-trisilikat, polivinil pirolidon, supstance na bazi celuloze, polietilen glikol, natrijum karboksimetilceluloza, poliakrilati, voskovi, polietilen-polioksipropilen blok polimeri, polietilen glikol i vunena mast.
Kompozicije predmetnog pronalaska mogu se davati oralno, parenteralno, sprejom za inhalaciju, lokalno, rektalno, nazalno, bukalno, vaginalno ili preko implantiranog rezervoara. Izraz
„parenteralni” kako se ovde koristi uključuje supkutane, intravenozne, intramuskularne, intraartikularne, intrasinovijalne, intrasternalne, intratekalne, intrahepatične, intralezijske i intrakranijalne tehnike injekcije ili infuzije. Poželjno, kompozicije se daju oralno, intraperitonealno ili intravenozno. Sterilni injekcioni oblici kompozicija predmetnog pronalaska mogu biti vodene ili uljane suspenzije. Ove suspenzije se mogu formulisati prema tehnikama poznatim u tehnici korišćenjem odgovarajućih sredstava za dispergovanje ili vlaženje i sredstava za suspendovanje. Sterilni preparat za injekcije može, takođe, biti sterilni rastvor ili suspenzija za injekcije u netoksičnom parenteralno prihvatljivom razblaživaču ili rastvaraču, na primer, kao rastvor u 1,3-butandiolu. Među prihvatljivim nosačima i rastvaračima koji se mogu koristiti su voda, Ringerov rastvor i izotonični rastvor natrijum hlorida. Pored toga, sterilna, fiksna ulja se konvencionalno koriste kao rastvarač ili medijum za suspendovanje.
U tu svrhu, može se koristiti bilo koje kombinovano fiksno ulje uključujući sintetičke mono- ili di-gliceride. Masne kiseline, kao što je oleinska kiselina i njeni derivati glicerida, korisni su u pripremi injekcija, kao i prirodna farmaceutski prihvatljiva ulja, kao što su maslinovo ulje ili ricinusovo ulje, posebno u njihovim polioksietilisanim verzijama. Ovi uljani rastvori ili suspenzije mogu, takođe, da sadrže dugolančani alkoholni razblaživač ili disperzante, kao što je karboksimetil celuloza ili slična sredstva za dispergovanje koja se obično koriste u formulaciji farmaceutski prihvatljivih oblika doziranja uključujući emulzije i suspenzije. Drugi uobičajeno korišćeni surfaktanti, kao što su Tweens, Spans i druga sredstva za emulgovanje ili pojačivači biodostupnosti koji se obično koriste u proizvodnji farmaceutski prihvatljivih čvrstih, tečnih ili drugih oblika doziranja, takođe, se mogu koristiti za svrhe formulacije.
Farmaceutski prihvatljive kompozicije predmetnog pronalaska mogu se oralno davati u bilo kom oralno prihvatljivom obliku doziranja uključujući, ali ne ograničavajući se na, kapsule, tablete, vodene suspenzije ili rastvore. U slučaju tableta za oralnu upotrebu, nosači koji se obično koriste uključuju laktozu i kukuruzni skrob. Sredstva za podmazivanje, kao što je magnezijum stearat, takođe se obično dodaju. Za oralnu primenu u obliku kapsula, korisni razblaživači uključuju laktozu i sušeni kukuruzni skrob. Kada su vodene suspenzije potrebne za oralnu upotrebu, aktivni sastojak se kombinuje sa sredstvima za emulgovanje i suspendovanje. Po želji se mogu dodati i određeni zaslađivači, arome ili boje.
Alternativno, farmaceutski prihvatljive kompozicije predmetnog pronalaska mogu se davati u obliku supozitorija za rektalnu primenu. One se mogu pripremiti mešanjem sredstva sa odgovarajućim neiritirajućim ekscipijensom koji je čvrst na sobnoj temperaturi, ali tečan na rektalnoj temperaturi i stoga će se istopiti u rektumu da bi oslobodio lek. Takvi materijali uključuju kakao puter, pčelinji vosak i polietilen glikole.
Farmaceutski prihvatljive kompozicije predmetnog pronalaska se, takođe, mogu primenjivati lokalno, posebno kada cilj lečenja uključuje oblasti ili organe koji su lako dostupni lokalnoj primeni, uključujući bolesti oka, kože ili donjeg crevnog trakta. Pogodne lokalne formulacije se lako pripremaju za svaku od ovih oblasti ili organa.
Lokalna primena za donji crevni trakt može se izvršiti u formulaciji rektalnih supozitorija (videti gore) ili u odgovarajućoj formulaciji za klistir. Mogu se koristiti i lokalni transdermalni flasteri.
Za lokalnu primenu, pod uslovom da farmaceutski prihvatljive kompozicije mogu biti formulisane u odgovarajućoj masti koja sadrži aktivnu komponentu suspendovanu ili rastvorenu u jednom ili više nosača. Nosači za lokalnu primenu jedinjenja predmetnog pronalaska uključuju, ali nisu ograničeni na, mineralno ulje, tečni vazelin, beli vazelin, propilen glikol, polioksietilen, polioksipropilensko jedinjenje, emulgujući vosak i vodu. Alternativno, obezbeđene farmaceutski prihvatljive kompozicije mogu biti formulisane u pogodnom losionu ili kremi koji sadrži aktivne komponente suspendovane ili rastvorene u jednom ili više farmaceutski prihvatljivih nosača. Pogodni nosači uključuju, ali nisu ograničeni na, mineralno ulje, sorbitan monostearat, polisorbat 60, vosak cetil estra, cetearil alkohol, 2-oktildodekanol, benzil alkohol i vodu.
Za oftalmičku upotrebu, obezbeđene farmaceutski prihvatljive kompozicije mogu biti formulisane kao mikronizovane suspenzije u izotoničnom sterilnom fiziološkom rastvoru sa podešenim pH, ili, poželjno, kao rastvori u izotoničnom, pH prilagođenom sterilnom fiziološkom rastvoru, bilo sa ili bez konzervansa kao što je benzilalkonijum hlorid. Alternativno, za oftalmološku upotrebu, farmaceutski prihvatljive kompozicije mogu biti formulisane u masti kao što je vazelin.
Farmaceutski prihvatljive kompozicije predmetnog pronalaska se, takođe, mogu davati nazalnim aerosolom ili inhalacijom. Takve kompozicije se pripremaju u skladu sa tehnikama koje su dobro poznate u oblasti farmaceutske formulacije i mogu se pripremiti kao rastvori u fiziološkom rastvoru, korišćenjem benzil alkohola ili drugih odgovarajućih konzervanasa, promotera apsorpcije za povećanje biodostupnosti, fluorugljenika i/ili drugih konvencionalnih sredstava za rastvaranje ili dispergovanje.
Najpoželjnije, farmaceutski prihvatljive kompozicije predmetnog pronalaska su formulisane za oralnu primenu. Takve formulacije se mogu davati sa ili bez hrane. U nekim realizacijama, farmaceutski prihvatljive kompozicije predmetnog pronalaska se daju bez hrane. U drugim realizacijama, farmaceutski prihvatljive kompozicije predmetnog pronalaska se daju sa hranom.
Količina jedinjenja iz predmetnog pronalaska koja se može kombinovati sa materijalima nosača da bi se proizvela kompozicija u jednom obliku doziranja će varirati u zavisnosti od domaćina koji se leči, posebnog načina primene. Poželjno, obezbeđene kompozicije treba da budu formulisane tako da se doza inhibitora između 0,01 - 100 mg/kg telesne težine/dan može primeniti pacijentu koji prima ove kompozicije.
Takođe, podrazumeva se da će specifična doza i režim lečenja za svakog određenog pacijenta zavisiti od niza faktora, uključujući aktivnost specifičnog upotrebljenog jedinjenja, starost, telesnu težinu, opšte zdravlje, pol, ishranu, vreme primene, stopu izlučivanja, kombinaciju lekova i procenu lekara koji leči i težinu određene bolesti koja se leči. Količina jedinjenja iz predmetnog pronalaska u kompoziciji će, takođe, zavisiti od određenog jedinjenja u kompoziciji.
Upotreba jedinjenja i farmaceutski prihvatljivih kompozicija
Jedinjenja i kompozicije opisane ovde su generalno korisne za inhibiciju ili aktivaciju interakcije Sestrin-GATOR2. U nekim realizacijama, obezbeđeno jedinjenje, ili njegova kompozicija, je aktivator interakcije Sestrin-GATOR2.
Aktivnost jedinjenja korišćenog u predmetnom pronalasku kao inhibitora ili aktivatora interakcije Sestrin-GATOR2, može se ispitati in vitro, in vivo ili u ćelijskoj liniji. In vitro testovi uključuju testove koji određuju inhibiciju ili aktivaciju interakcije Sestrin-GATOR2. Alternativni in vitro testovi kvantifikuju sposobnost inhibitora ili aktivatora da smanje ili povećaju vezivanje sestrina za GATOR2. Detaljni uslovi za ispitivanje jedinjenja korišćenog u predmetnom pronalasku kao inhibitora ili aktivatora interakcije Sestrin-GATOR2, navedeni su u Primerima u daljem tekstu.
Kako se ovde koriste, izrazi „lečenje (tretman)”, „lečiti (tretirati)” i „koji leči (koji tretira)” odnose se na poništavanje, ublažavanje, odlaganje početka ili inhibiranje napredovanja bolesti ili poremećaja, ili jednog ili više njihovih simptoma, kao što je ovde opisano. U nekim realizacijama, lečenje se može primeniti nakon što se razvije jedan ili više simptoma. U drugim realizacijama, lečenje se može primeniti u odsustvu simptoma. Na primer, lečenje se može primeniti na osetljivu osobu pre pojave simptoma (npr. u svetlu istorije simptoma i/ili u svetlu genetskih ili drugih faktora osetljivosti). Lečenje se, takođe, može nastaviti nakon što simptomi nestanu, na primer, da bi se sprečilo ili odložilo njihovo ponavljanje.
Obezbeđena jedinjenja su inhibitori ili aktivatori interakcije Sestrin-GATOR2 i stoga su korisna za lečenje jednog ili više poremećaja povezanih sa aktivnošću mTORC1. Prema tome, u određenim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju poremećaja posredovanog mTORC1, i obuhvata korak davanja pacijentu kome je to potrebno jedinjenja iz predmetnog pronalaska, ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
Kako se ovde koriste, izrazi „poremećaji, bolesti i/ili stanja posredovani mTORC1” kako se ovde koriste označavaju bilo koju bolest ili drugo štetno stanje u kome je poznato da mTORC1 igra ulogu. Shodno tome, druga realizacija predmetnog pronalaska se odnosi na lečenje ili umanjenje težine jedne ili više bolesti kod kojih je poznato da mTORC1 igra ulogu.
Terapeutske upotrebe ovde opisane uključuju jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju raka kod subjekta. Kako se koristi u ovom kontekstu, „lečiti” znači ublažiti ili poboljšati barem jedan simptom ili klinički parametar raka. Na primer, lečenje može dovesti do smanjenja veličine tumora ili brzine rasta. Lečenje ne mora da izleči rak ili da izazove remisiju 100% vremena, kod svih subjekata.
Kao što je ovde opisano, primena sredstava, na primer, inhibitornih nukleinskih kiselina ili malih molekula, koji aktiviraju interakciju Sestrin-GATOR2 i na taj način smanjuju aktivnost mTORC1, smanjuje proliferaciju ćelija raka i na taj način leči rak kod subjekata. Stoga, u nekim realizacijama, terapeutske upotrebe ovde opisane uključuju primenu terapeutski efikasne doze jednog ili više sredstava koja aktiviraju interakciju Sestrin-GATOR2 i time indirektno inhibiraju mTORC1 put.
Kako se ovde koristi, izraz „rak” se odnosi na ćelije koje imaju kapacitet za autonomni rast, tj. abnormalno stanje ili stanje koje karakteriše brzo proliferišući rast ćelija. Izraz podrazumeva sve vrste kancerogenih izraslina ili onkogenih procesa, metastatskih tkiva ili maligno transformisanih ćelija, tkiva ili organa, bez obzira na histopatološki tip ili stadijum invazivnosti. Izraz „tumor” kako se ovde koristi odnosi se na ćelije raka, npr. na masu ćelija raka.
Karcinomi koji se mogu lečiti ili dijagnostikovati korišćenjem terapijskih primena opisanih ovde uključuju malignitete različitih sistema organa, kao što su oni koji zahvataju pluća, dojke, štitaste žlezde, limfni sistem, gastrointestinalni i genito-urinarni trakt, kao i adenokarcinomi koji uključuju maligne bolesti kao što je većina karcinoma debelog creva, karcinom bubrežnih ćelija, rak prostate i/ili tumori testisa, nemikrocelularni karcinom pluća, rak tankog creva i rak jednjaka.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska se koristi za lečenje ili dijagnostikovanje karcinoma kod subjekta. Izraz „karcinom” je u tehnici priznat i odnosi se na maligne tumore epitelnog ili endokrinog tkiva uključujući karcinome respiratornog sistema, karcinome gastrointestinalnog sistema, karcinome genitourinarnog sistema, karcinome testisa, karcinome dojke, karcinome prostate, karcinome endokrinog sistema i melanome. U nekim realizacijama, rak je karcinom bubrega ili melanom. Primeri karcinoma uključuju one koji se formiraju iz tkiva grlića materice, pluća, prostate, dojke, glave i vrata, debelog creva i jajnika. Izraz, takođe, uključuje karcinosarkome, na primer, koji uključuju maligne tumore sastavljene od karcinomatoznog i sarkomatoznog tkiva. „Adenokarcinom” se odnosi na karcinom koji potiče iz tkiva žlezde ili u kome tumorske ćelije formiraju prepoznatljive žlezdane strukture.
Izraz „sarkom” je u tehnici priznat i odnosi se na maligne tumore mezenhimalnog porekla.
U nekim realizacijama, vrste raka koje se leče jedinjenjem ili farmaceutski prihvatljivom kompozicijom pronalaska su vrste raka koje imaju povećane nivoe mTORC1 ili povećanu ekspresiju ili aktivnost mTORC1 u odnosu na normalna tkiva ili na druge vrste raka istih tkiva; postupci poznati u tehnici i ovde opisani mogu se koristiti za identifikaciju ovih vrsta raka. U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu uključuje dobijanje uzorka koji sadrži ćelije raka, određivanje aktivnosti mTORC1 u uzorku i primenu tretmana kao što je ovde opisano (npr. modulatora interakcije Sestrin-GATOR2 ). U nekim realizacijama, rak je onaj za koji je ovde prikazano da ima povećane nivoe aktivnosti mTORC1
U nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju jednog ili više poremećaja, bolesti i/ili stanja pri čemu poremećaj, bolest ili stanje uključuje, ali nije ograničeno na, poremećaje ćelijske proliferacije.
Poremećaji ćelijske proliferacije
Predmetni pronalazak predstavlja postupke i kompozicije za dijagnozu i prognozu poremećaja ćelijske proliferacije (npr. raka) i lečenje ovih poremećaja modulacijom interakcije Sestrin-GATOR2 čime se indirektno selektivno modulira aktivnost mTORC1. Poremećaji ćelijske proliferacije koji su ovde opisani uključuju, na primer, rak, gojaznost i bolesti zavisne od proliferacije. Takvi poremećaji se mogu dijagnostikovati korišćenjem postupaka poznatih u tehnici.
Rak
Rak uključuje, bez ograničenja, leukemije (npr. akutnu leukemiju, akutnu limfocitnu leukemiju, akutnu mijelocitnu leukemiju, akutna mijeloblastna leukemija, akutna promijelocitna leukemija, akutna mijelomonocitna leukemija, akutna monocitna leukemija, akutna eritroleukemija, hronična leukemija, hronična mijelocitna leukemija, hronična limfocitna leukemija), policitemiju rubra vera, limfom (npr. Hočkinova bolest ili ne-Hočkinova bolest), Waldenstromovu makroglobulinemiju, multipli mijelom, bolest teškog lanca i solidne tumore kao što su sarkomi i karcinomi (npr. fibrosarkom, miksosarkom, liposarkom, hondrosarkom, osteosarkom, hordom, angiosarkom, endoteliosarkom, limfangiosarkom, limfangioendoteliosarkom, sinoviom, mezoteliom, Juingov tumor, lejomiosarkom, rabdomiosarkom, karcinom debelog creva, rak pankreasa, rak jajnika, rak prostate, karcinom skvamoznih ćelija, karcinom bazalnih ćelija, adenokarcinom, karcinom znojnih žlezda, karcinom lojnih žlezda, papilarni karcinom, papilarni adenokarcinomi, cistadenokarcinom, medularni karcinom, bronhogeni karcinom, karcinom bubrežnih ćelija, hepatom, karcinom žučnih kanala, horiokarcinom, seminom, embrionalni karcinom, Wilmsov tumor, rak grlića materice, rak materice, rak testisa, karcinom pluća, mikrocelularni karcinom pluća, karcinom mokraćne bešike, epitelni karcinom, gliom, astrocitom, meduloblastom, kraniofaringeom, ependimom, pinealom, hemangioblastom, akustični neurom, oligodendrogliom, švanom, meningiom, melanom, neuroblastom i retinoblastom). U nekim realizacijama, rak je melanom ili rak dojke.
Druge proliferativne bolesti
Ostale proliferativne bolesti uključuju, na primer, gojaznost, benignu hiperplaziju prostate, psorijazu, abnormalnu keratinizaciju, limfoproliferativne poremećaje (npr. poremećaj u kome postoji abnormalna proliferacija ćelija limfnog sistema), hronični reumatoidni artritis, arterioskleroza, restenoza i dijabetesna retinopatija. Proliferativne bolesti uključuju one opisane u US Pat. Br.5,639,600 i 7,087,648.
Drugi poremećaji
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje ribozomopatija (npr. Diamond-Blackfan anemije, 5qsindroma, Shwachman-Diamondovog sindroma, X-vezana diskeratoza, hipoplazija hrskavice i kose, Treacher-Kolinsov sindrom). (Videti Payne et al., (2012) Blood. Sep 13;120(11):2214-24; Efeyan et al., (2012) Trends Mol Med. Sep; 18(9): 524-533). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju ribozomopatije, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije. U određenim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju ribozomopatije izabrane iz Diamond-Blackfan anemije, 5q-sindroma, Shwachman-Diamondovog sindroma, X-vezane diskeratoze, hipoplazije hrskavice i kose ili Treacher-Kolinsovog sindroma, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 aktivnosti se koristi za lečenje kohezinopatija (npr. Robertsovog sindroma i Cornelia de Lange sindroma). (Videti Xu et al., (2016) BMC Genomics 17:25). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju koheziopatije
(npr. Robertsovog sindroma i Cornelia de Lange sindroma), kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za preokretanje mišićne atrofije ili za sprečavanje atrofije mišića usled neaktivnosti usled načina života, neaktivnosti izazvane ortopedskom hirurgijom, imobilizacijom ili starosti subjekta ili bolesti ili stanja koje subjekt ima ili od kojeg pati. (Videti Cuthbertson et al., (2005) FASEB J. Mar;19(3):422-4. Epub 2004 Dec 13; Rennie, (2009) Appl. Physiol. Nutr. Metab.34: 377-381; Ham et al., (2014) Clin Nutr. Dec;33(6):937-45). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u preokretanju ili prevenciji atrofije mišića usled neaktivnosti usled načina života, neaktivnosti izazvane ortopedskom hirurgijom, imobilizacijom, ili starosti subjekta ili bolesti ili stanja koje subjekt ima ili od kojeg pati, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za preokretanje mišićne atrofije ili za sprečavanje atrofije mišića usled slomljene kosti, teške opekotine, povrede kičme, amputacije, degenerativne bolesti, stanja u kojem oporavak zahteva mirovanje subjekta u krevetu, boravak u jedinici intenzivne nege ili dugotrajnu hospitalizaciju. (Videti Gordon et al., (2013) Int J Biochem Cell Biol. Oct;45(10):2147-57; Léger et al., (2009) Muscle Nerve. Jul;40(1):69-78). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u preokretanju ili sprečavanju atrofije mišića usled slomljene kosti, teške opekotine, povrede kičme, amputacije, degenerativne bolesti, stanja u kome je za oporavak potreban odmor u krevetu za subjekta, boravak u jedinici intenzivne nege ili dugotrajna hospitalizacija, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje bolesti, stanja ili poremećaja koji rezultiraju atrofijom skeletnih mišića, kao što je sarkopenija, mišićna denervacija, mišićna distrofija, inflamatorna miopatija, spinalna mišićna atrofija (SMA), amiotrofična lateralna skleroza (ALS) ili mijastenija gravis. (Videti Kye et al., (2014) Hum Mol Genet. Dec 1; 23(23): 6318-6331; Gurpur et al., (2009) Am J Pathol. March; 174(3): 999-1008; Chauhan et al., (2013) Neurosci Res. Sep-Oct;77(1-2): 102-9); Ching et al., (2013) Hum Mol Genet. Mar 15;22(6):1167-79). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju bolesti, stanja ili poremećaja koji rezultiraju atrofijom skeletnih mišića, kao što je sarkopenija, mišićna denervacija, mišićna distrofija, inflamatorna miopatija, spinalna mišićna atrofija (SMA), amiotrofična lateralna skleroza (ALS) ili mijastenija gravis, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za sprečavanje, održavanje ili poboljšanje oporavka od gubitka mišića kod subjekta koji se priprema, učestvuje ili se nedavno vratio sa putovanja u svemir, tim redosledom. (Videti Stein et al., (1999) Am J Phisiol.;276:E1014-21). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u prevenciji, održavanju ili poboljšanju oporavka od gubitka mišića kod subjekta koji se priprema, učestvuje ili se nedavno vratio sa putovanja u svemir, tim redosledom, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za održavanje ili poboljšanje oporavka od preteranog mišićnog stresa i/ili umora kod subjekta koji se sprema, učestvuje ili se nedavno vratio iz oružanog konflikta ili sa vojne obuke. (Videti Pasiakos et al., (2011) Am J Clin Nutr. Sep;94(3):809-18). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u održavanju ili poboljšanju oporavka od prekomernog mišićnog stresa i/ili umora kod subjekta koji se priprema, učestvuje ili se nedavno vratio iz oružanog konflikta ili sa vojne obuke, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za sprečavanje autofagije kod pacijenta. U nekim realizacijama, dati pacijent ima ili pati od raka otpornog na terapiju na način koji zavisi od indukcije autofagije. (Videti Kim i Guan, (2015) J Clin Invest. Jan;125(1):25-32). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u prevenciji autofagije kod pacijenta koji ima ili pati od raka otpornog na terapiju na način koji zavisi od indukcije autofagije, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC se koristi za lečenje ili prevenciju depresije. (Videti Ignacio et al., (2015) Br J Clin Pharmacol. 27. nov). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju ili prevenciji depresije, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi da izazove brzi početak antidepresivne aktivnosti. Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u izazivanju brzog početka antidepresivne aktivnosti, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje ili prevenciju džet lega kroz ponovno smirivanje ubrzanog cirkadijalnog ritma kao odgovor na pomeranje ciklusa dan/svetlo. (Videti Cao et al., (2013) Neuron. 21. avgusta; 79(4):712-24 10.1016). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju ili prevenciji džet lega kroz ponovno smirivanje ubrzanog cirkadijalnog ritma kao odgovor na pomeranje ciklusa dan/svetlo, kod pacijenta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi da spreči ili preokrene atrofiju srčanog mišića kod subjekta. U nekim realizacijama, dati subjekt ima ili je imao bolest ili stanje izabrano iz srčanog udara, kongestivne srčane insuficijencije, transplantacije srca, popravke srčanog zaliska, ateroskleroze, druge bolesti velikih krvnih sudova i operacije bajpasa. (Videti Song et al., (2010) Am J Physiol Cell Physiol. Dec; 299(6): C1256-C1266). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u prevenciji ili preokretanju atrofije srčanog mišića kod subjekta, pri čemu dati subjekt ima ili je imao bolest ili stanje izabrano iz srčanog udara, kongestivne srčane insuficijencije, transplantacije srca, popravke srčanih zalistaka, ateroskleroze, druge bolesti velikih krvnih sudova i operacije bajpasa, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za povećanje snage i/ili povećanje mišićne mase nakon vežbanja.
U nekim realizacijama, terapeutska upotreba se sprovodi zajedno sa fizikalnom terapijom, kao deo ukupne parenteralne ishrane, ili za poboljšanje funkcionalne električne stimulacije. (Videti Nakamura et al., (2012) Geriatr Gerontol Int. Jan;12(1): 131-9). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u povećanju snage i/ili povećanju mišićne mase nakon vežbanja. U nekim realizacijama, terapeutska upotreba se sprovodi u kombinaciji sa fizikalnom terapijom, kao deo ukupne parenteralne ishrane, ili za poboljšanje funkcionalne električne stimulacije, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za smanjenje unosa hrane. (Videti Pedroso et al., (2015) Nutrients. 22. maj; 7(5): 3914-37). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u smanjenju unosa hrane, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje gojaznosti. Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju gojaznosti, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za povećanje produktivnosti u proizvodnji terapeutskih rekombinantnih proteina iz bioreaktora. (Videti McVey et al., (2016) Biotechnol Bioeng. 16. februar doi: 10.1002/bit.25951). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u povećanju produktivnosti u proizvodnji terapeutskih rekombinantnih proteina iz bioreaktora, i obuhvata korak dodavanja u datu proizvodnju obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
[0101] U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 u imunim ćelijama se koristi za poboljšanje i/ili održavanje njihove antitumorske aktivnosti. Ovo uključuje povećanje mTORC1 u imunim ćelijama in vitro pre adoptivnog transfera, kao i povećanje mTORC1 u imunim ćelijama kada se primenjuje zajedno sa drugim ciljanim strategijama imunoterapije in vivo. U nekim realizacijama, imune ćelije uključuju naivne T-ćelije, CD4+ ili CD8+ T-ćelije, Th1, Th2, TRegi Th17 ćelije, dendritske ćelije, NK ćelije i makrofage. (Videti Yang et al., (2011) Nat Immunol.;12:888-897; O’Brien et al. (2011) Eur J Immunol.;41:3361-3370; Delgoffe et al., (2009) Immunity. Jun 19;30(6):832-44; Chi, (2012) Nat Rev Immunol. Apr 20; 12(5): 325-338; Pollizzi et al., (2015) J Clin Invest.; 125(5):2090-2108; Ali et al., (2015) Front Immunol.; 6: 355; Katholnig et al., (2013) Biochem Soc Trans. Aug;41(4):927-33; Wang et al., (2013) Proc Natl Acad Sci USA. Dec 10;110(50):E4894-903; Yang i Chi, (2013) J Clin Invest. Dec;123(12):5165-78). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 u imunim ćelijama za poboljšanje i/ili održavanje njihove antitumorske aktivnosti. U nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u povećanju mTORC1 u imunim ćelijama in vitro pre adoptivnog transfera. U nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u povećanju mTORC1 u imunim ćelijama kada se primenjuje zajedno sa drugim ciljanim strategijama imunoterapije in vivo. U određenim realizacijama, imune ćelije uključuju naivne T-ćelije, CD4+ ili CD8+ T-ćelije, Th1, Th2, TRegi Th17 ćelije, dendritske ćelije, NK-ćelije i makrofage, i obuhvata korak dodavanja datim imunim ćelijama obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 u retini se koristi za lečenje retinitis pigmentosa i drugih oblika očne neurodegeneracije. (Videti Punzo et al., (2009) Nat Neurosci. Jan;12(1):44-52). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju retinitis pigmentosa i drugih oblika očne neurodegeneracije, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za povećanje centralne ili periferne regeneracije aksona. (Videti Namiko et al., (2010) J Biol Chem. 285:28034-28043). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u povećanju centralne ili periferne regeneracije aksona, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za pospešivanje ponovne mijelinizacije i neuronske aktivnosti nakon povrede ili kod bolesti koje karakteriše demijelinizacija kao što su multipla skleroza i Parkinsonova bolest. (Videti Tyler et al., (2009) J Neurosci. May 13;29(19):6367-78; Norrmen et al., (2014) Cell Rep. Oct 23;9(2):646-60; Love (2006). J Clin Pathol. Nov; 59(11): 1151-1159). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u pospešivanju remijelinizacije i neuronske aktivnosti nakon povrede ili kod bolesti koje karakteriše demijelinizacija, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjekta obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije. U nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju multiple skleroze kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjekta obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije. U nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju Parkinsonove bolesti kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjekta obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje multiple skleroze. Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju multiple skleroze ili njene varijante, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom pacijentu datog jedinjenja ili farmaceutski njegov prihvatljiv sastav. U nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju Balove koncentrične skleroze, Šilderove bolesti, akutne (Marburgov tip) multiple skleroze, inflamatorne demijelinativne poliradikuloneuropatije ili tumefaktivne multiple skleroze, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjekta obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje Devikove bolesti, akutnog diseminovanog encefalomijelitisa, akutnog hemoragičnog leukoencefalitisa, progresivne multifokalne leukoencefalopatije i Niman-Pikove bolesti (Videti Takikita et al., (2004) J Neuropathol Exp Neurol. Jun; 63(6):660-73). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju Devikove bolesti, akutnog diseminovanog encefalomijelitisa, akutnog hemoragičnog leukoencefalitisa, progresivne multifokalne leukoencefalopatije i Niman-Pikove bolesti, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje ili prevenciju oblika autizma. (Videti Novarino et al., (2012) Science 19 Oct, 338:6105, str.394-397). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju ili prevenciji oblika autizma, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje neurodegenerativnih bolesti. Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju neurodegenerativne bolesti, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje bolesti povezanih sa sinaptičkom disfunkcijom. Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju bolesti povezane sa sinaptičkom disfunkcijom, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 u centralnom nervnom sistemu se koristi za povećanje formiranja dendrita i sinaptogeneze kod neurodegenerativnih bolesti obeleženih smanjenjem dendritskih bodlji i gubitkom sinapsi kao što je Alchajmerova bolest, amiotrofična lateralna skleroza, moždani udar i glaukom. (Videti Di Polo et al., (2015) Neural Regen Res. Apr; 10(4): 559-561). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u povećanju formiranja dendrita i sinaptogeneze u neurodegenerativnoj bolesti obeleženoj smanjenjem dendritskih bodlji i gubitkom sinapsi, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije. U nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju Alchajmerove bolesti, amiotrofične lateralne skleroze, moždanog udara ili glaukoma kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
U nekim realizacijama, jedinjenje ili farmaceutski prihvatljiva kompozicija pronalaska za upotrebu u aktiviranju mTORC1 se koristi za lečenje bolesti kao što su Alchajmerova bolest, amiotrofična lateralna skleroza, šizofrenija, Retov sindrom, fragilni X sindrom (Martin-Bel sindrom), Parkinsonova bolest, Hantingtonova bolest, moždani udar i glaukom. (Videti Lin et al.,
PLoS ONE 8(4): e62572, 2013; Lee et al., (2015) Neuron. Jan 21; 85(2): 303-315; Bowling et al., (2014) Sci Signal.Jan 14; 7(308): ra4). Shodno tome, u nekim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju bolesti kao što je Alchajmerova bolest, amiotrofična lateralna skleroza, šizofrenija, Retov sindrom, fragilni X sindrom, Parkinsonova bolest, Hantingtonova bolest, moždani udar i glaukom, kod subjekta kome je to potrebno, i obuhvata korak davanja datom subjektu obezbeđenog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije.
Farmaceutski prihvatljive kompozicije predmetnog pronalaska mogu se davati ljudima i drugim životinjama oralno, rektalno, parenteralno, intracisternalno, intravaginalno, intraperitonealno, lokalno (kao u obliku prahova, masti ili kapi), bukalno, kao oralni ili nazalni sprej ili slično, u zavisnosti od težine infekcije koja se leči. U određenim realizacijama, jedinjenja pronalaska se mogu davati oralno ili parenteralno u nivoima doze od oko 0,01 mg/kg do oko 50 mg/kg i poželjno od oko 1 mg/kg do oko 25 mg/kg telesne težine subjekta po danu, jednom ili više puta dnevno, da bi se postigao željeni terapeutski efekat.
Tečni oblici doziranja za oralnu primenu uključuju, ali nisu ograničeni na, farmaceutski prihvatljive emulzije, mikroemulzije, rastvore, suspenzije, sirupe i eliksire. Pored aktivnih jedinjenja, tečni oblici doziranja mogu da sadrže inertne razblaživače koji se obično koriste u tehnici, kao što su, na primer, voda ili drugi rastvarači, sredstva za rastvaranje i emulgatore kao što su etil alkohol, izopropil alkohol, etil karbonat, etil acetat, benzil alkohol, benzil benzoat, propilen glikol, 1,3-butilen glikol, dimetilformamid, ulja (posebno, semena pamuka, kikirikija, kukuruza, klica, maslina, ricinusovo i susamovo ulje), glicerol, tetrahidrofurfuril alkohol, polietilen glikole i estre masne kiseline sorbitana i njihove smeše. Pored inertnih razblaživača, oralne kompozicije, takođe, mogu uključivati pomoćne supstance kao što su sredstva za vlaženje, sredstva za emulgovanje i suspendovanje, zaslađivači, arome i sredstva za korigovanje mirisa.
Preparati za ubrizgavanje, na primer, sterilne injektabilne vodene ili uljane suspenzije mogu se formulisati u skladu sa poznatim stanjem tehnike korišćenjem odgovarajućih sredstava za dispergovanje ili vlaženje i sredstava za suspendovanje. Sterilni preparat za injekcije može, takođe, biti sterilni rastvor za injekcije, suspenzija ili emulzija u netoksičnom parenteralno prihvatljivom razblaživaču ili rastvaraču, na primer, kao rastvor u 1,3-butandiolu. Među prihvatljivim vehikulumima i rastvaračima koji se mogu koristiti su voda, Ringerov rastvor, U.S.P. i izotonični rastvor natrijum hlorida. Pored toga, sterilna, fiksna ulja se konvencionalno koriste kao rastvarač ili medijum za suspendovanje. U tu svrhu može se koristiti bilo koje kombinovano fiksno ulje uključujući sintetičke mono- ili digliceride. Pored toga, masne kiseline kao što je oleinska kiselina se koriste u pripremi ampuliranih lekova.
Formulacije za ubrizgavanje mogu se sterilisati, na primer, filtriranjem kroz filter koji zadržava bakterije ili ugrađivanjem sredstava za sterilizaciju u obliku sterilnih čvrstih kompozicija koje se mogu rastvoriti ili dispergovati u sterilnoj vodi ili drugom sterilnom medijumu za injektiranje pre upotrebe.
Da bi se produžio efekat jedinjenja iz predmetnog pronalaska, često je poželjno da se uspori apsorpcija jedinjenja iz supkutane ili intramuskularne injekcije. Ovo se može postići upotrebom tečne suspenzije kristalnog ili amorfnog materijala sa slabom rastvorljivošću u vodi. Brzina apsorpcije jedinjenja tada zavisi od brzine rastvaranja koja, zauzvrat, može zavisiti od veličine kristala i kristalnog oblika. Alternativno, odložena apsorpcija parenteralno primenjenog oblika jedinjenja se postiže rastvaranjem ili suspendovanjem jedinjenja u uljanom nosaču. Injekcioni depo oblici se prave formiranjem mikrokapsuliranih matrica jedinjenja u biorazgradivim polimerima kao što je polilaktid-poliglikolid. U zavisnosti od odnosa jedinjenja prema polimeru i prirode određenog polimera koji se koristi, brzina oslobađanja jedinjenja se može kontrolisati. Primeri drugih biorazgradivih polimera uključuju poli(ortoestre) i poli(anhidride). Formulacije za depo injekcije se, takođe, pripremaju hvatanjem jedinjenja u lipozome ili mikroemulzije koje su kompatibilne sa telesnim tkivima.
Kompozicije za rektalnu ili vaginalnu primenu su poželjno supozitorije koje se mogu pripremiti mešanjem jedinjenja predmetnog pronalaska sa odgovarajućim neiritirajućim ekscipijensima ili nosačima kao što su kakao puter, polietilen glikol ili vosak supozitorija koji su čvrsti na sobnoj temperaturi, ali tečni na telesnoj temperaturi i stoga se rastapaju u rektumu ili vaginalnoj šupljini i oslobađaju aktivno jedinjenje.
Čvrsti oblici doziranja za oralnu primenu uključuju kapsule, tablete, pilule, prahove i granule. U takvim čvrstim oblicima doziranja, aktivno jedinjenje je pomešano sa najmanje jednim inertnim, farmaceutski prihvatljivim ekscipijensom ili nosačem kao što je natrijum citrat ili dikalcijum fosfat i/ili a) punilima ili ekstenderima kao što su skrobovi, laktoza, saharoza, glukoza, manitol i silicijumova kiselina, b) veziva kao što su, na primer, karboksimetilceluloza, alginati, želatin, polivinilpirolidinon, saharoza i arapska guma, c) sredstva za vlaženje kao što je glicerol, d) sredstva za dezintegraciju kao što je agar--agar, kalcijum karbonat, krompir ili tapioka skrob, alginska kiselina, određeni silikati i natrijum karbonat, e) sredstva za usporavanje rastvora kao što je parafin, f) akceleratori apsorpcije kao što su jedinjenja kvaternarnog amonijuma, g) sredstva za vlaženje kao što su, na primer, cetil alkohol i glicerol monostearat, h) apsorbenti kao što su kao što je kaolin i bentonit glina, i i) maziva kao što su talk, kalcijum stearat, magnezijum stearat, čvrsti polietilen glikoli, natrijum lauril sulfat i njihove smeše. U slučaju kapsula, tableta i pilula, oblik doziranja može, takođe, da sadrži puferska sredstva.
Čvrste kompozicije sličnog tipa mogu se, takođe, koristiti kao punila u mekim i tvrdo punjenim želatinskim kapsulama korišćenjem ekscipijenasa kao što su laktoza ili mlečni šećer, kao i polietilen glikoli visoke molekularne težine i slično. Čvrsti oblici doziranja tableta, dražeja, kapsula, pilula i granula mogu se pripremiti sa oblogama i školjkama kao što su enterični omotači i druge obloge dobro poznate u oblasti farmaceutske formulacije. Oni mogu opciono da sadrže sredstva za zamućenje i, takođe, mogu biti sastava da oslobađaju aktivni sastojak(e) samo, ili poželjno, u određenom delu crevnog trakta, opciono, na odloženi način. Primeri kompozicija za ugradnju koje se mogu koristiti uključuju polimerne supstance i voskove. Čvrste kompozicije sličnog tipa mogu se, takođe, koristiti kao punila u mekim i tvrdo punjenim želatinskim kapsulama korišćenjem ekscipijenasa kao što su laktoza ili mlečni šećer, kao i polietilen glikoli visoke molekularne težine i slično.
Aktivna jedinjenja, takođe, mogu biti u mikro-kapsuliranom obliku sa jednim ili više ekscipijenasa kao što je gore navedeno. Čvrsti oblici doziranja tableta, dražeja, kapsula, pilula i granula mogu se pripremiti sa oblogama i školjkama kao što su enterični omotači, obloge za kontrolu oslobađanja i druge obloge dobro poznate u oblasti farmaceutske formulacije. U takvim čvrstim oblicima doziranja aktivno jedinjenje može biti pomešano sa najmanje jednim inertnim razblaživačem kao što je saharoza, laktoza ili skrob. Takvi oblici doziranja mogu, takođe, da sadrže, kao što je uobičajena praksa, dodatne supstance osim inertnih razblaživača, na primer, maziva za tabletiranje i druga pomoćna sredstva za tabletiranje kao što je magnezijum stearat i mikrokristalna celuloza. U slučaju kapsula, tableta i pilula, oblici doziranja mogu, takođe, da sadrže puferska sredstva. Oni mogu opciono da sadrže sredstva za zamućenje i, takođe, mogu biti sastava da oslobađaju aktivni sastojak(e) samo, ili poželjno, u određenom delu crevnog trakta, opciono, na odloženi način. Primeri kompozicija za ugradnju koje se mogu koristiti uključuju polimerne supstance i voskove.
Oblici doziranja za topikalnu ili transdermalnu primenu jedinjenja predmetnog pronalaska uključuju masti, paste, kreme, losione, gelove, prahove, rastvore, sprejeve, inhalante ili flastere. Aktivna komponenta je pomešana pod sterilnim uslovima sa farmaceutski prihvatljivim nosačem i svim potrebnim konzervansima ili puferima koji mogu biti neophodni. Oftalmološka formulacija, kapi za uši i kapi za oči takođe se smatraju da su u okviru predmetnog pronalaska. Pored toga, predmetni pronalazak razmatra upotrebu transdermalnih flastera, koji imaju dodatnu prednost obezbeđivanja kontrolisane isporuke jedinjenja u telo. Takvi oblici doziranja se mogu napraviti rastvaranjem ili doziranjem jedinjenja u odgovarajućem medijumu. Pojačivači apsorpcije se, takođe, mogu koristiti za povećanje protoka jedinjenja preko kože. Brzina se može kontrolisati bilo obezbeđivanjem membrane za kontrolu brzine ili dispergovanjem jedinjenja u polimernoj matrici ili gelu.
Prema jednoj realizaciji, pronalazak se odnosi na in vitro postupak modulacije interakcije Sestrin-GATOR2 čime se selektivno modulira aktivnost mTORC1 indirektno u biološkom uzorku i obuhvata korak dovođenja u kontakt datog biološkog uzorka sa jedinjenjem predmetnog pronalaska ili kompozicijom koja sadrži dato jedinjenje.
Izraz „biološki uzorak”, kako se ovde koristi, uključuje, bez ograničenja, ćelijske kulture ili njihove ekstrakte; biopsirani materijal dobijen od sisara ili njegove ekstrakte; i krv, pljuvačku, urin, izmet, spermu, suze ili druge telesne tečnosti ili njihove ekstrakte.
Druga realizacija predmetnog pronalaska se odnosi na jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u modulaciji interakcije Sestrin-GATOR2 čime se selektivno moduliše aktivnost mTORC1 indirektno kod pacijenta i obuhvata korak davanja datom pacijentu jedinjenja iz predmetnog pronalaska, ili kompozicije koja sadrži dato jedinjenje.
Prema još jednoj realizaciji, pronalazak se odnosi na jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u modulaciji interakcije Sestrin-GATOR2 čime se selektivno modulira aktivnost mTORC1 indirektno kod pacijenta i obuhvata korak davanja datom pacijentu jedinjenja iz predmetnog pronalaska, ili kompoziciju koja sadrži dato jedinjenje. U drugim realizacijama, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinjenje ili farmaceutski prihvatljivu kompoziciju pronalaska za upotrebu u lečenju poremećaja posredovanog mTORC1 kod pacijenta kome je to potrebno, i korak davanja datom pacijentu jedinjenja prema predmetnom pronalasku ili njegove farmaceutski prihvatljive kompozicije. Ovakvi poremećaji su ovde detaljno opisani.
U zavisnosti od određenog stanja ili bolesti koje treba lečiti, dodatna terapeutska sredstva koja se normalno primenjuju za lečenje tog stanja, takođe mogu biti prisutna u kompozicijama predmetnog pronalaska. Kako se ovde koristi, dodatna terapeutska sredstva koja se normalno primenjuju za lečenje određene bolesti ili stanja, poznata su kao „prikladna za bolest ili stanje koje se leči”.
Jedinjenje predmetnog pronalaska se, takođe, može koristiti sa prednostima u kombinaciji sa drugim antiproliferativnim jedinjenjima. Takva antiproliferativna jedinjenja uključuju, ali nisu ograničena na inhibitore aromataze; antiestrogene; inhibitore topoizomeraze I; inhibitore topoizomeraze II; aktivna jedinjenja mikrotubula; alkilujuća jedinjenja; inhibitore histon deacetilaze; jedinjenja koja indukuju procese ćelijske diferencijacije; inhibitore ciklooksigenaze; MMP inhibitore; mTOR inhibitori; antineoplastične antimetabolite; jedinjenja platine; jedinjenja koja ciljaju/smanjuju aktivnost proteina ili lipid kinaze i dalja anti-angiogena jedinjenja; jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost proteina ili lipid fosfataze; agoniste gonadorelina; anti-androgene; inhibitore metionin aminopeptidaze; inhibitore matriks metaloproteinaze; bisfosfonate; modifikatore biološkog odgovora; antiproliferativna antitela; inhibitore heparanaze; inhibitore Ras onkogenih izoforma; inhibitore telomeraze; inhibitori proteazoma; jedinjenja koja se koriste u lečenju hematoloških maligniteta; jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost Flt-3; Inhibitore Hsp90 kao što su 17-AAG (17-alilaminogeldanamicin, NSC330507), 17-DMAG (17-dimetilaminoetilamino-17-demetoksi-geldanamicin, NSC707545), IPI-504, CNF1010, CNF2024, SNF1212 od Conforma Therapeutics; temozolomid (Temodal<®>); inhibitore proteina vretena kinezina, kao što su SB715992 ili SB743921 od GlaxoSmithKline, ili pentamidin/hlorpromazin od CombinatoRx; MEK inhibitore kao što su ARRY142886 iz Array BioPharma, AZD6244 od AstraZeneca-e, PD181461 od Pfizer-a i leukovorin. Izraz „inhibitor aromataze” kako se ovde koristi odnosi se na jedinjenje koje inhibira proizvodnju estrogena, na primer, konverziju supstrata androstendiona i testosterona u estron i estradiol, respektivno. Izraz uključuje, ali nije ograničen na steroide, posebno atamestan, eksemestan i formestan i, posebno, nesteroide, posebno aminoglutetimid, rogletimid, piridoglutetimid, trilostan, testolakton, ketokonazol, vorozol, fadrozol, anastrozol i letrozol. Eksemestan se prodaje pod trgovačkim imenom Aromasin<™>. Formestan se prodaje pod trgovačkim imenom Lentaron<™>. Fadrozol se prodaje pod trgovačkim imenom Afema<™>. Anastrozol se prodaje pod trgovačkim imenom Arimidex<™>. Letrozol se prodaje pod trgovačkim nazivima Femara<™>ili Femar<™>. Aminoglutetimid se prodaje pod trgovačkim imenom Orimeten<™>. Kombinacija pronalaska koja sadrži hemoterapeutsko sredstvo koje je inhibitor aromataze je posebno korisna za lečenje tumora pozitivnih na hormonske receptore, kao što su tumori dojke.
Izraz „antiestrogen” kako se ovde koristi odnosi se na jedinjenje koje antagonizuje efekat estrogena na nivou receptora estrogena. Izraz uključuje, ali nije ograničen na tamoksifen, fulvestrant, raloksifen i raloksifen hidrohlorid. Tamoksifen se prodaje pod trgovačkim imenom Nolvadex<™>. Raloksifen hidrohlorid se prodaje pod trgovačkim imenom Evista<™>. Fulvestrant se može davati pod trgovačkim imenom Faslodex<™>. Kombinacija pronalaska koja sadrži hemoterapeutsko sredstvo koje je antiestrogen je posebno korisna za lečenje tumora pozitivnih na estrogenski receptor, kao što su tumori dojke.
Izraz „anti-androgen” kako se ovde koristi odnosi se na bilo koju supstancu koja je sposobna da inhibira biološke efekte androgenih hormona i uključuje, ali nije ograničen na, bikalutamid (Casodex<™>). Izraz „agonist gonadorelina” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na abareliks, goserelin i goserelin acetat. Goserelin se može davati pod trgovačkim imenom Zoladex<™>.
Izraz „inhibitor topoizomeraze I” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na topotekan, gimatekan, irinotekan, kamptotekan i njegove analoge, 9-nitrokamptotecin i makromolekularni kamptotecin konjugat PNU-166148. Irinotekan se može primeniti, npr. u obliku kako se prodaje, npr. pod robnom markom Camptosar<™>. Topotekan se prodaje pod trgovačkim imenom Hycamptin<™>.
Izraz „inhibitor topoizomeraze II” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na antracikline kao što je doksorubicin (uključujući lipozomalnu formulaciju, kao što je Caelyx<™>), daunorubicin, epirubicin, idarubicin i nemorubicin, antrahinoni mitoksantron i losoksantron i podofilotoksini etopozid i teniposid. Etopozid se prodaje pod trgovačkim imenom Etopophos<™>. Tenipozid se prodaje pod trgovačkim imenom VM 26-Bristol. Doksorubicin se prodaje pod trgovačkim imenom Acriblastin<™>ili Adriamycin<™>. Epirubicin se prodaje pod trgovačkim imenom Farmorubicin<™>. Idarubicin se prodaje pod trgovačkim imenom Zavedos<™>. Mitoksantron se prodaje pod trgovačkim imenom Novantron.
Izraz „aktivno sredstvo za mikrotubule” odnosi se na jedinjenja koja stabilizuju mikrotubule, jedinjenja koja destabilizuju mikrotubule i inhibitore polimerizacije mikrotublina uključujući, ali ne ograničavajući se na taksane, kao što su paklitaksel i docetaksel; vinka alkaloide, kao što su vinblastin ili vinblastin sulfat, vinkristin ili vinkristin sulfat i vinorelbin; diskodermolide; kohicin i epotilone i njihove derivate. Paklitaksel se prodaje pod trgovačkim imenom Taxol<™>. Docetaksel se prodaje pod trgovačkim imenom Taxotere<™>. Vinblastin sulfat se prodaje pod trgovačkim imenom Vinblastin R.P<™>. Vinkristin sulfat se prodaje pod trgovačkim imenom Farmistin<™>.
Izraz „sredstvo za alkilovanje” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničeno na, ciklofosfamid, ifosfamid, melfalan ili nitrozoureu (BCNU ili Gliadel). Ciklofosfamid se prodaje pod trgovačkim imenom Cyclostin<™>. Ifosfamid se prodaje pod trgovačkim imenom Holoxan<™>.
Izraz „inhibitori histon deacetilaze” ili „inhibitori HDAC” odnosi se na jedinjenja koja inhibiraju histon deacetilazu i koja poseduju antiproliferativnu aktivnost. Ovo uključuje, ali nije ograničeno na, suberoilanilid hidroksaminsku kiselinu (SAHA).
Izraz „antineoplastični antimetabolit” uključuje, ali nije ograničen na, 5-fluoruracil ili 5-FU, kapecitabin, gemcitabin, jedinjenja za demetilaciju DNK, kao što su 5-azacitidin i decitabin, metotreksat i edatreksat, i antagoniste folne kiseline kao što su pemetreksed. Kapecitabin se prodaje pod trgovačkim imenom Xeloda<™>. Gemcitabin se prodaje pod trgovačkim imenom Gemzar<™>.
Izraz „jedinjenje platine” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na, karboplatin, cisplatin, cisplatinu i oksaliplatin. Karboplatin se može primenjivati, npr. u obliku u kome je na tržištu, npr. pod robnom markom Carboplat<™>. Oksaliplatin se može primenjivati, npr. u obliku u kome je na tržištu, npr. pod robnom markom Eloxatin<™>.
Izraz „jedinjenja koja ciljaju/smanjuju aktivnost proteina ili lipid kinaze; ili aktivnost proteina ili lipid fosfataze; ili dalja anti-angiogena jedinjenja” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na, protein tirozin kinazu i/ili serin i/ili inhibitore treonin kinaze ili inhibitore lipid kinaze, kao što su a) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost receptora faktora rasta izvedenih iz trombocita (PDGFR), kao što su jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost PDGFR, posebno jedinjenja koja inhibiraju PDGF receptor, kao što je derivat N-fenil-2-pirimidin-amina, kao što su imatinib, SU101, SU6668 i GFB-111; b) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost receptora faktora rasta fibroblasta (FGFR); c) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost receptora faktora rasta sličnog insulinu (IGF-IR), kao što su jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost IGF-IR, posebno jedinjenja koja inhibiraju aktivnost kinaze IGF-I receptora, ili antitela koja ciljaju na vanćelijski domen IGF-I receptora ili njegove faktore rasta; d) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost Trk porodice receptora tirozin kinaze, ili inhibitora efrina B4; e) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost Axl porodice receptora tirozin kinaze; f) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost Ret receptora tirozin kinaze; g) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost Kit/SCFR receptorske tirozin kinaze, kao što je imatinib; h) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost C-kit receptorskih tirozin kinaza, koja su deo porodice PDGFR, kao što su jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost c-Kit porodice receptora tirozin kinaze, posebno jedinjenja koji inhibiraju c-Kit receptor, kao što je imatinib; i) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost članova porodice c-Abl, njihovih proizvoda fuzije gena (npr. BCR-Abl kinaze) i mutante, kao što su jedinjenja koja ciljaju na smanjenje ili inhibiranje aktivnosti članova porodice c-Abl i proizvodi njihove fuzije gena, kao što je derivat N-fenil-2-pirimidin-amina, kao što je imatinib ili nilotinib (AMN107); PD180970; AG957; NSC 680410; PD173955 od ParkeDavis-a; ili dasatinib (BMS-354825); j) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost članova protein kinaze C (PKC) i Raf porodice serin/treonin kinaza, članova MEK, SRC, JAK/pan-JAK, FAK, PDK1, PKB/Akt, Ras/MAPK, PI3K, SYK, TYK2, BTK i TEC porodice, i/ili članovi porodice kinaze zavisne od ciklina (CDK) uključujući derivate staurosporina, kao što je midostaurin; primeri daljih jedinjenja uključuju UCN-01, safingol, BAY 43-9006, briostatin 1, perifozin; llmofozin; RO 318220 i RO 320432; GO 6976; lsis 3521; LY333531/LY379196; jedinjenja izohinolina; FTIs; PD184352 ili QAN697 (inhibitor P13K) ili AT7519 (inhibitor CDK); k) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost inhibitora protein-tirozin kinaze, kao što su jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost inhibitora protein-tirozin kinaze uključuju imatinib mezilat (Gleevec<™>) ili tirfostin kao što je tirfostin A23/RG-50810; AG 99; tirfostin AG 213; tirfostin AG 1748; tirfostin AG 490; tirfostin B44; tirfostin B44 (+) enantiomer; tirfostin AG 555; AG 494; tirfostin AG 556, AG957 i adafostin (4-{ [(2,5-dihidroksifenil)metil]amino}- benzoeve kiseline adamantil estar; NSC 680410, adafostin); 1) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost porodice epidermalnog faktora rasta receptorskih tirozin kinaza (EGFR1ErbB2, ErbB3, ErbB4 kao homo- ili heterodimeri) i njihovi mutanti, kao što su jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost porodice receptora epidermalnog faktora rasta posebno su jedinjenja, proteini ili antitela koja inhibiraju članove EGF porodice receptora tirozin kinaze, kao što su EGF receptor, ErbB2, ErbB3 i ErbB4 ili se vezuju za EGF ili EGF srodne ligande, CP 358774, ZD 1839, ZM 105180; trastuzumab (Herceptin<™>), cetuksimab (Erbitux<™>), Iressa, Tarceva, OSI-774, Cl-1033, EKB-569, GW-2016, E1.1, E2.4, E2.5, E6.2, E6.4, E2.11, E6.3 ili E7.6.3 i derivati 7H-pirolo-[2,3-d]pirimidina; m) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost c-Met receptora, kao što su jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost c-Met, posebno jedinjenja koja inhibiraju aktivnost kinaze c-Met receptora, ili antitela koja ciljaju vanćelijski domen c-Met ili se vezuju za HGF, n) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost kinaze jednog ili više članova JAK porodice (JAK1 / JAK2 / JAK3 / TYK2 i/ili pan-JAK), uključujući, ali ne ograničavajući se na, PRT-062070, SB-1578, baricitinib, pakritinib, momelotinib, VX-509, AZD-1480, TG-101348, tofacitinib i ruksolitinib; o) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost kinaze PI3 kinaze (PI3K) uključujući, ali ne ograničavajući se na, ATU-027, SF-1126, DS-7423, PBI-05204, GSK-2126458, ZSTK-474, buparlizib, piktrelizib, PF-4691502, BYL-719, daktolizib, XL-147, XL-765 i idelalizib; i q) jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju signalne efekte hedžehog proteina (Hh) ili puteva zaglađenih receptora (SMO), uključujući, ali ne ograničavajući se na, ciklopamin, vismodegib, itrakonazol, erismodegib i IPI-926 (saridegib).
Izraz „PI3K inhibitor” kako se ovde koristi uključuje, ali se ne ograničava na jedinjenja koja imaju inhibitornu aktivnost protiv jednog ili više enzima u porodici fosfatidilinozitol-3-kinaze, uključujući, ali ne ograničavajući se na PI3Kα, PI3Kγ, PI3Kδ, PI3Kβ, PI3K-C2α, PI3K-C2β, PI3K-C2γ, Vps34, p110-α, p110-β, p110-γ, p110-δ, p85-α, p85-β, p55-γ, p150, p101 i p87. Primeri PI3K inhibitora korisnih u predmetnom pronalasku uključuju, ali nisu ograničeni na ATU-027, SF-1126, DS-7423, PBI-05204, GSK-2126458, ZSTK-474, buparlizib, piktrelizib, PF-4691502, BYL-719 daktolizib, XL-147, XL-765 i idelalizib.
Izraz „inhibitor Bcl-2” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na jedinjenja koja imaju inhibitornu aktivnost protiv proteina B-ćelijskog limfoma 2 (Bcl-2), uključujući, ali ne ograničavajući se na, ABT-199, ABT-731, ABT- 737, apogosipol, Ascentine pan-Bcl-2 inhibitore, kurkumin (i njegove analoge), dvostruke inhibitore Bcl-2/Bcl-xL (Infiniti Pharmaceuticals / Novartis Pharmaceuticals), Genasense (G3139), HA14-1 (i njihove analoge; videti WO2008118802), navitoklaks (i njegove analoge, videti US7390799), NH-1 (Shenayng Pharmaceutical University), obatoklaks (i njegove analoge, videti WO2004106328), S-001 (Gloria Pharmaceuticals), serija jedinjenja TW (Univerzitet u Mičigenu), i venetoklaks. U nekim realizacijama, inhibitor Bcl-2 je terapeutik malog molekula. U nekim realizacijama inhibitor Bcl-2 je peptidomimetik.
Izraz „BTK inhibitor” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na jedinjenja koja imaju inhibitornu aktivnost protiv Brutonove tirozin kinaze (BTK), uključujući, ali ne ograničavajući se na AVL-292 i ibrutinib.
Izraz „SYK inhibitor” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na jedinjenja koja imaju inhibitornu aktivnost protiv tirozin kinaze slezine (SIK), uključujući, ali ne ograničavajući se na PRT-062070, R-343, R-333, Ekcellair, PRT-062607 i fostamatinib
Dalji primeri BTK inhibitornih jedinjenja i stanja koja se leče takvim jedinjenjima u kombinaciji sa jedinjenjima predmetnog pronalaska mogu se naći u WO2008039218 i WO2011090760.
Dalji primeri SYK inhibitornih jedinjenja i stanja koja se mogu lečiti takvim jedinjenjima u kombinaciji sa jedinjenjima predmetnog pronalaska mogu se naći u WO2003063794, WO2005007623 i WO2006078846.
Dalji primeri PI3K inhibitornih jedinjenja i stanja koja se leče takvim jedinjenjima u kombinaciji sa jedinjenjima predmetnog pronalaska mogu se naći u WO2004019973, WO2004089925, WO2007016176, US8138347, WO2002088112, WO2007084786, WO2007129161, WO2006122806, WO2005113554 i WO2007044729.
Dalji primeri JAK inhibitornih jedinjenja i stanja koja se leče takvim jedinjenjima u kombinaciji sa jedinjenjima predmetnog pronalaska mogu se naći u WO2009114512, WO2008109943, WO2007053452, WO2000142246 i WO2007070514.
Dalja anti-angiogena jedinjenja uključuju jedinjenja koja imaju drugi mehanizam za svoju aktivnost, npr. nevezano za inhibiciju proteina ili lipid kinaze, npr. talidomid (Thalomid<™>) i TNP-470.
Primeri inhibitora proteazoma korisnih za upotrebu u kombinaciji sa jedinjenjima pronalaska uključuju, ali nisu ograničeni na bortezomib, disulfiram, epigalokatehin-3-galat (EGCG), salinosporamid A, karfilzomib, ONX-0912, CEP-18770 i MLN9708.
Jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost proteina ili lipid fosfataze su npr. inhibitori fosfataze 1, fosfataze 2A ili CDC25, kao što je okadaična kiselina ili njen derivat.
Jedinjenja koja indukuju procese ćelijske diferencijacije uključuju, ali nisu ograničena na, retinoinsku kiselinu, α-γ- ili δ-tokoferol ili α-γ- ili δ-tokotrienol.
Izraz inhibitor ciklooksigenaze kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na, inhibitore Cox-2, 5-alkil supstituisanu 2-arilaminofenil sirćetnu kiselinu i derivate, kao što je celekoksib (Celebrex<™>), rofekoksib (Vioxx<™>), etorikoksib, valdekoksib ili 5-alkil-2-arilaminofenil sirćetna kiselina, kao što je 5-metil-2-(2'-hlor-6'-fluoranilino)fenil sirćetna kiselina, lumirakoksib.
Izraz „bisfosfonati” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na, etidronsku, klodronsku, tiludronsku, pamidronisku, alendronsku, ibandronsku, risedronsku i zoledronsku kiselinu. Etidronska kiselina se prodaje pod trgovačkim imenom Didronel<™>. Klodronska kiselina se prodaje pod trgovačkim imenom Bonefos<™>. Tiludronska kiselina se prodaje pod trgovačkim imenom Skelid<™>. Pamidroniska kiselina se prodaje pod trgovačkim imenom Aredia<™>. Alendronska kiselina se prodaje pod trgovačkim imenom Fosamax<™>. Ibandronska kiselina se prodaje pod trgovačkim imenom Bondranat<™>. Risedronska kiselina se prodaje pod trgovačkim imenom Actonel<™>. Zoledronska kiselina se prodaje pod trgovačkim imenom Zometa<™>. Izraz „mTOR inhibitori” odnosi se na jedinjenja koja inhibiraju cilj rapamicina kod sisara (mTOR) i koja poseduju antiproliferativnu aktivnost kao što je sirolimus (Rapamune<®>), everolimus (Certican<™>), CCI-779 i ABT578.
Izraz „inhibitor heparanaze” kako se ovde koristi odnosi se na jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju degradaciju heparin sulfata. Izraz uključuje, ali nije ograničen na, PI-88. Izraz
„modifikator biološkog odgovora” kako se ovde koristi odnosi se na limfokin ili interferone.
Izraz „inhibitor Ras onkogenih izoformi”, kao što su H-Ras, K-Ras ili N-Ras, kako se ovde koristi, odnosi se na jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju onkogenu aktivnost Ras; na primer,
„inhibitor farnezil transferaze” kao što je L-744832, DK8G557 ili R115777 (Zarnestra<™>). Izraz
„inhibitor telomeraze” kako se ovde koristi odnosi se na jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost telomeraze. Jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost telomeraze su posebno jedinjenja koja inhibiraju receptor telomeraze, kao što je telomestatin.
Izraz „inhibitor metionin aminopeptidaze” kako se ovde koristi odnosi se na jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost metionin aminopeptidaze. Jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost metionin aminopeptidaze uključuju, ali nisu ograničena na, bengamid ili njegov derivat.
Izraz „inhibitor proteazoma” kako se ovde koristi odnosi se na jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost proteazoma. Jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost proteazoma uključuju, ali nisu ograničena na, Bortezomib (Velcade<™>) i MLN 341.
Izraz „inhibitor matriks metaloproteinaza” ili (inhibitor „MMP”) kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na, kolagen peptidomimetičke i nepeptidomimetičke inhibitore, derivate tetraciklina, npr. hidroksamatni peptidomimetički inhibitor batimastat i njegov oralno bioraspoloživi analog marimastat (BB-2516), prinomastat (AG3340), metastat (NSC 683551) BMS-279251, BAY 12-9566, TAA211, MMI2790B ili AAJ996.
Izraz „jedinjenja koja se koriste u lečenju hematoloških maligniteta” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na, inhibitore tirozin kinaze slične FMS, koji su jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost receptora tirozin kinaze sličnih FMS (Flt- 3R); interferon, 1-β-D-arabinofuransilcitozin (ara-c) i bisulfan; i ALK inhibitori, koji su jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju anaplastičnu limfom kinazu.
Jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost receptora tirozin kinaze sličnih FMS (Flt-3R) su posebno jedinjenja, proteini ili antitela koja inhibiraju članove porodice Flt-3R receptor kinaze, kao što su PKC412, midostaurin, derivat staurosporina, SU11248 i MLN518.
Izraz „HSP90 inhibitori” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na, jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju intrinzičnu aktivnost ATPaze HSP90; degradiranje, ciljanje, smanjenje ili inhibiranje proteina klijenta HSP90 preko puta ubikvitin proteozoma. Jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju intrinzičnu aktivnost ATPaze HSP90 su posebno jedinjenja, proteini ili antitela koja inhibiraju aktivnost ATPaze HSP90, kao što je 17-alilamino,17demetoksigeldanamicin (17AAG), derivat geldanamicina; druga jedinjenja srodna geldanamicinu; inhibitori radicikola i HDAC.
Izraz „antiproliferativna antitela” kako se ovde koristi uključuje, ali nije ograničen na, trastuzumab (Herceptin<™>), Trastuzumab-DMl, erbituks, bevacizumab (Avastin<™>), rituksimab (Rituxan<®>), PRO64553 (anti-CD40) i 2C4 antitelo. Pod antitelima se podrazumevaju intaktna monoklonska antitela, poliklonska antitela, multispecifična antitela formirana od najmanje 2 intaktna antitela i fragmenti antitela sve dok pokazuju željenu biološku aktivnost.
Za lečenje akutne mijeloične leukemije (AML), jedinjenja predmetnog pronalaska mogu se koristiti u kombinaciji sa standardnim terapijama leukemije, posebno u kombinaciji sa terapijama koje se koriste za lečenje AML. Posebno, jedinjenja predmetnog pronalaska mogu se davati u kombinaciji sa, na primer, inhibitorima farnezil transferaze i/ili drugim lekovima korisnim za lečenje AML, kao što su daunorubicin, adriamicin, Ara-C, VP-16, tenipozid, mitoksantron, idarubicin, karboplatinum i PKC412.
Ostala antileukemijska jedinjenja uključuju, na primer, Ara-C, analog pirimidina, koji je derivat 2'-alfa-hidroksi riboze (arabinozid) deoksicitidina. Takođe je uključen purinski analog hipoksantina, 6-merkaptopurina (6-MP) i fludarabin fosfata. Jedinjenja koja ciljaju, smanjuju ili inhibiraju aktivnost inhibitora histon deacetilaze (HDAC), kao što su natrijum butirat i suberoilanilid hidroksamska kiselina (SAHA) inhibiraju aktivnost enzima poznatih kao histon deacetilaze. Specifični inhibitori HDAC uključuju MS275, SAHA, FK228 (ranije FR901228), trihostatin A i jedinjenja stavljana na uvid javnosti u US 6,552,065 uključujući, ali ne ograničavajući se na, N-hidroksi-3-[4-[[[2-(2-metil-1H-indol-3-il)-etil]-amino]metil]fenil]-2E-2-propenamid ili njegova farmaceutski prihvatljiva so i N-hidroksi-3-[4-[(2-hidroksietil){2-(lH-indol-3-il)etil]-amino]metil]fenil]-2E-2-propenamid ili njegova farmaceutski prihvatljiva so, posebno laktatna so. Antagonisti receptora somatostatina, kako se ovde koriste, odnose se na jedinjenja koja ciljaju, leče ili inhibiraju somatostatinski receptor kao što je oktreotid i SOM230. Pristupi oštećenju tumorskih ćelija odnose se na pristupe kao što je jonizujuće zračenje. Izraz
„jonizujuće zračenje” koji se pominje iznad i dalje u tekstu označava jonizujuće zračenje koje se javlja ili kao elektromagnetni zraci (kao što su rendgenski i gama zraci) ili čestice (kao što su alfa i beta čestice). Jonizujuće zračenje je obezbeđeno, ali nije ograničeno na to, u terapiji zračenjem i poznato je u tehnici. Vidite Hellman, Principles of Radiation Therapy, Cancer, in Principles and Practice of Oncology, Devita et al., Eds., 4<th>Edition, Vol.1, pp.248-275 (1993).
Uključeni su i EDG veziva i inhibitori ribonukleotid reduktaze. Izraz „EDG veziva” kako se ovde koristi odnosi se na klasu imunosupresiva koji moduliraju recirkulaciju limfocita, kao što je FTY720. Izraz „inhibitori ribonukleotid reduktaze” odnosi se na analoge pirimidinskih ili purinskih nukleozida uključujući, ali ne ograničavajući se na, fludarabin i/ili citozin arabinozid (ara-C), 6-tioguanin, 5-fluoruracil, kladribin, 6-merkaptopurin u kombinaciji (spec. sa ara-C protiv ALL) i/ili pentostatin. Inhibitori ribonukleotidne reduktaze su posebno derivati hidroksiuree ili 2-hidroksi-1H-izoindol-1,3-diona.
Takođe su uključena posebno ona jedinjenja, proteini ili monoklonska antitela VEGF-a kao što su 1-(4-hloranilino)-4-(4-piridilmetil)ftalazin ili njegova farmaceutski prihvatljiva so, 1-(4-hloranilino)-4-(4-piridilmetil)ftalazin sukcinat; Angiostatin<™>; Endostatin<™>; amidi antranilne kiseline; ZD4190; ZD6474; SU5416; SU6668; bevacizumab; ili anti-VEGF antitela ili anti-VEGF receptor antitela, kao što su rhuMAb i RHUFab, VEGF aptamer kao što je Macugon; FLT-4 inhibitori, FLT-3 inhibitori, VEGFR-2 IgGI antitelo, Angiozim (RPI 4610) i Bevacizumab (Avastin<™>).
Fotodinamička terapija kako se ovde koristi odnosi se na terapiju koja koristi određene hemikalije poznate kao fotosenzibilišuća jedinjenja za lečenje ili prevenciju raka. Primeri fotodinamičke terapije uključuju tretman jedinjenjima, kao što je Visudyne<™>i porfimer natrijum.
Angiostatski steroidi, kako se ovde koriste, odnose se na jedinjenja koja blokiraju ili inhibiraju angiogenezu, kao što su, na primer, anekortav, triamcinolon, hidrokortizon, 11-α-epihidrokotizol, korteksolon, 17α-hidroksiprogesteron, kortikosteron, dezoksikortikosteron, testosteron, estron i deksametazon.
Implantati koji sadrže kortikosteroide odnose se na jedinjenja, kao što su fluocinolon i deksametazon.
Druga hemoterapeutska jedinjenja uključuju, ali nisu ograničena na, biljne alkaloide, hormonska jedinjenja i antagoniste; modifikatore biološkog odgovora, poželjno limfokine ili interferone; antisens oligonukleotide ili derivate oligonukleotida; shRNK ili siRNK; ili razna jedinjenja ili jedinjenja sa drugim ili nepoznatim mehanizmom delovanja.
Struktura aktivnih jedinjenja identifikovanih kodnim brojevima, generičkim ili trgovačkim nazivima može biti preuzeta iz stvarnog izdanja standardnog kompendijuma „The Merck Index” ili iz baza podataka, npr. Patents International (npr. IMS World Publications).
Jedinjenje predmetnog pronalaska se, takođe, može koristiti u kombinaciji sa poznatim terapijskim procesima, na primer, primenom hormona ili zračenja. U određenim realizacijama, obezbeđeno jedinjenje se koristi kao radiosenzibilizator, posebno za lečenje tumora koji pokazuju slabu osetljivost na radioterapiju.
Jedinjenje predmetnog pronalaska se može primeniti samostalno ili u kombinaciji sa jednim ili više drugih terapeutskih jedinjenja, moguća kombinovana terapija u obliku fiksnih kombinacija ili primena jedinjenja pronalaska i jednog ili više drugih terapijskih jedinjenja koje se raspoređuju ili daju nezavisno jedan od drugog, ili kombinovano davanje fiksnih kombinacija i jednog ili više drugih terapeutskih jedinjenja. Jedinjenje predmetnog pronalaska može se pored ili dodatno davati posebno za terapiju tumora u kombinaciji sa hemoterapijom, radioterapijom, imunoterapijom, fototerapijom, hirurškom intervencijom ili njihovom kombinacijom. Dugotrajna terapija je podjednako moguća kao i adjuvansna terapija u kontekstu drugih strategija lečenja, kao što je gore opisano. Drugi mogući tretmani su terapija za održavanje statusa pacijenta nakon regresije tumora, ili čak hemopreventivna terapija, na primer, kod pacijenata sa rizikom.
Ova dodatna sredstva se mogu davati odvojeno od inventivne kompozicije koja sadrži jedinjenje, kao deo višestrukog režima doziranja. Alternativno, ta sredstva mogu biti deo jednog oblika doziranja, pomešani zajedno sa jedinjenjem predmetnog pronalaska u jednoj kompoziciji. Ako se daju kao deo višestrukog režima doziranja, dva aktivna sredstva se mogu dostaviti istovremeno, uzastopno ili u vremenskom periodu jedno od drugog, normalno u roku od pet sati jedno od drugog.
Kako se ovde koristi, izraz „kombinacija”, „kombinovan” i srodni izrazi se odnose na istovremenu ili sekvencijalnu primenu terapeutskih sredstava u skladu sa predmetnim pronalaskom. Na primer, jedinjenje iz predmetnog pronalaska može se davati sa drugim terapeutskim sredstvom istovremeno ili uzastopno u odvojenim jediničnim oblicima doziranja ili zajedno u jednom jediničnom obliku doziranja. Shodno tome, predmetni pronalazak obezbeđuje jedinični oblik doziranja koji sadrži jedinjenje predmetnog pronalaska, dodatno terapeutsko sredstvo i farmaceutski prihvatljiv nosač, pomoćno sredstvo ili vehikulum.
Količina i inventivnog jedinjenja i dodatnog terapeutskog sredstva (u onim kompozicijama koje sadrže dodatno terapeutsko sredstvo kao što je gore opisano) koji se mogu kombinovati sa materijalima nosača da bi se proizveo jedan oblik doze variraće u zavisnosti od domaćina koji se leči i određenog načina primene. Poželjno, kompozicije predmetnog pronalaska treba da budu formulisane tako da se može primeniti doza između 0,01 - 100 mg/kg telesne težine/dan inventivnog jedinjenja.
U onim kompozicijama koje sadrže dodatno terapeutsko sredstvo, to dodatno terapeutsko sredstvo i jedinjenje predmetnog pronalaska mogu delovati sinergistički. Prema tome, količina dodatnog terapeutskog sredstva u takvim kompozicijama biće manja od one koja je potrebna u monoterapiji koja koristi samo to terapeutsko sredstvo. U takvim kompozicijama može se primeniti doza između 0,01 - 1,000 µg/kg telesne težine/dan dodatnog terapeutskog sredstva.
Količina dodatnog terapeutskog sredstva prisutnog u kompozicijama predmetnog pronalaska neće biti veća od količine koja bi se normalno primenila u kompoziciji koja sadrži to terapeutsko sredstvo kao jedino aktivno sredstvo. Poželjno, količina dodatnog terapeutskog sredstva u ovde stavljenim na uvid kompozicijama će se kretati od oko 50% do 100% količine koja je normalno prisutna u kompoziciji koja sadrži to sredstvo kao jedino terapeutski aktivno sredstvo.
Jedinjenja predmetnog pronalaska, ili njihove farmaceutske kompozicije, takođe mogu biti ugrađene u kompozicije za oblaganje implantabilnog medicinskog uređaja, kao što su proteze, veštački zalisci, vaskularni transplanti, stentovi i kateteri. Vaskularni stentovi, na primer, korišćeni su za prevazilaženje restenoze (ponovnog sužavanja zida krvnih sudova nakon povrede). Međutim, pacijenti koji koriste stentove ili druge implantabilne uređaje rizikuju stvaranje ugrušaka ili aktivaciju trombocita. Ovi neželjeni efekti se mogu sprečiti ili ublažiti prethodnim premazivanjem uređaja farmaceutski prihvatljivom kompozicijom koja sadrži inhibitor kinaze. Uređaji za implantaciju obloženi jedinjenjem predmetnog pronalaska su još jedna realizacija predmetnog pronalaska.
PRIMERI
Kao što je prikazano u Primerima u daljem tekstu, u određenim primerima realizacija, jedinjenja se pripremaju prema sledećim opštim procedurama. Podrazumeva se da, iako opšti postupci opisuju sintezu određenih jedinjenja iz predmetnog pronalaska, sledeći opšti postupci i drugi postupci poznati prosečnom stručnjaku mogu se primeniti na sva jedinjenja i potklase i vrste svakog od ovih jedinjenja, kao što je ovde opisano. Što se tiče sledećih primera, samo jedinjenja I-63, I-90, I-91, I-128, I-129, I-196, I-210, I-229, I-230, I-232, I-234, I-238, I-251 i I-252 su jedinjenja predmetnog pronalaska. Primeri koji se odnose na jedinjenja koja nisu jedinjenja I-63, I-90, I-91, I-128, I-129, I-196, I-210, I-229, I-230, I-232, I-234, I-238, I-251 i I-252 su uporedni primeri i nisu deo pronalaska.
Spisak skraćenica korišćenih u eksperimentalnom delu.
4A MS: 4 Å molekularna sita
AcOH: sirćetna kiselina
ACN: acetonitril
Anhid: bezvodan
Aq: vodeni
Bn: benzil
Boc: terc-butoksikarbonil
CbzCl: benzil hlorformat
Cbz-OSU: N-(benziloksikarboniloksi)sukcinimid
Cu(OAc)2: bakar(II) acetat
d: dana
DAST: dietilamino sumpor trifluorid
DBU: 1,8-diazobiciklo[5.4.0]undek-7-en
DCE: 1,2-dihloretan
DCM: dihlormetan
DEA: dietilamin
DIBAL-H: diizobutilaluminijum hidrid
DIPEA: N,N-diizopropiletilamin
DMA: N,N-dimetilacetamid
DMAP: 4-dimetilaminopiridin
DMF: N,N-dimetilformamid
DMSO-dimetil sulfoksid
DPPA: difenilfosforil azid
EDC: 1-(3-dimetilaminopropil)-3-etilkarbodiimid hidrohlorid
ee: enantiomerni višak
ESI: elektrosprej jonizacija
Et3N: trietilamin
Et2O: dietil etar
EtOAc: etil acetat
EtOH: etanol
Fmoc: fluorenilmetiloksikarbonil
Fmoc-OSu: N-(9-fluorenilmetoksikarboniloksi)sukcinimid
h: sati
HATU: 1-[bis(dimetilamino)metilen]-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]piridinijum 3-oksid heksafluorfosfat
HCOONH4: amonijum format
HPLC: tečna hromatografija visokih performansi
IBX: 2-jodoksibenzoeva kiselina
IPA: izopropil alkohol
KOAc: kalijum acetat
M: molar
Me: metil
MeOH: metanol
min: minuta
mL: mililitri
mM: milimolar
mmol: milimoli
MTBE: metil terc-butil etar
NaBH3CN: natrijum cijanoborhidrid
Na2CO3: natrijum karbonat
NaHCO3: natrijum bikarbonat
NMP: N-metilpirolidin
NMR: Nuklearna magnetna rezonanca
°C: stepeni Celzijusa
PBS: fiziološki rastvor puferovan fosfatnim puferom Pd/C: Paladijum na ugljeniku
Pd(OH)2/C: Pearlmanov katalizator
PE: petrolej etar
PhNH2: anilin
PPh3: trifenilfosfin
Rel: relativan
rt: sobna temperatura
sat: zasićen
SFC: superkritična tečna hromatografija
SOCl2: tionil hlorid
TBAB: Tetra-n-butilamonijum bromid
tBuOK: kalijum terc-butoksid
TEA: trietilamin
Tf: trifluormetansulfonat
TfAA: trifluormetansulfonski anhidrid
TFA: trifluorosirćetna kiselina
SAVETI: triizopropilsilil
THF: tetrahidrofuran
TMSCN: trimetilsilil cijanid
pTSA: para-toluensulfonska kiselina
TsOH: p-toluensulfonska kiselina
Priprema reprezentativnih neograničavajućih primera datih jedinjenja je opisana u nastavku.
Primer 1: (S)-2-(dimetilamino)-4-metilpentanska kiselina [I-1] (uporedno jedinjenje):
[0181]
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-2-(dimetilamino)-4-metilpentanska kiselina:
Formaldehid (38%, 24,0 g) i Pd/C (10%, 500 mg) su dodati u rastvor (S)-2-amino-4-metilpentanske kiseline (2,0 g, 15,24 mmol) u rezultujućem rastvoru je filtriran ( 60 mL). Smeša je hidrogenizovana na sobnoj temperaturi dva dana i filtrirana da bi se uklonio katalizator. Filtrat je koncentrovan do suva i u ostatak je dodat EtOH (30 mL). Smeša je mešana 1 h i filtrirana. Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (S)-2-(dimetilamino)-4-metilpentanska kiselina (1,3 g, 8,16 mmol, 53%) kao beli prah. ESI-MS (EI+, m/z): 160.2 [M+H]+.1H-NMR (400 MHz, MeOD-d4): δ 3.47 (dd, J = 4.4 Hz, 10.0 Hz, 1H), 2.85 (S, 6H), 1.89-1.74 (m, 2H), 1.62-1.55 (m, 1H), 1.00 (dd, J = 2.8 Hz, 6.8 Hz, 6H).
Primeri 2 i 3: hidrohlorid (S)-2-amino-7,7,7-trifluorheptanske kiseline [I-2] (uporedno jedinjenje) i hidrohlorid (R)-2-amino-7,7,7-trifluorheptanske kiseline [1-3] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 1,1,1-trifluor-5-jodopentan:
U rastvor 5,5,5-trifluorpentan-1-ola (2,0 g, 14,0 mmol), imidazola (1,48 g, 21,7 mmol) i PPh3(5.5 g, 21,0 mmol) u DCM (40 mL) je dodat I2(4,45 g, 17,5 mmol) sa ledenim kupatilom. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana preko noći. U gornju smešu je dodat Et2O (50 mL), a zatim je mešana 10 min. Smeša je filtrirana, a filtrat je uparen na 65 °C da bi se uklonio rastvarač pod atmosferskim pritiskom, a ostatak je razblažen sa Et2O (30 mL), smeša je filtrirana, a filtrat je korišćen za sledeći korak.
Korak 2: (S)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-7,7,7-trifluorheptanoat i (R)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-7,7,7-trifluorheptanoat:
U rastvor terc-butil 2-(difenilmetilenamino)acetata (2,0 g, 6,78 mmol) i TBAB (109 mg, 0,339 mmol) u toluenu (35 mL) i DCM (15 mL) dodat je KOH (50%, 20 mL) na -10 °C, nakon 5 minuta, gornji rastvor 1,1,1-trifluor-5-jodopentana u Ft2O (30 mL) je dodavan kap po kap tokom 5 minuta, dobijena smeša je mešana na -10 °C do 0 °C tokom 1 h. Rastvor je razblažen vodom (200 mL) i ekstrahovan sa EA (100 mL). Organska faza je isprana vodom (100 mL × 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu, a sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat/petrolej etar =1/10), a zatim hiral-prep-HPLC [ kolona, R, R-whelk- ol 4.6<∗>250mm 5um; rastvarač, MeOH (0,2% metanol amonijak)] da se dobije (S)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-7,7,7-trifluorheptanoat (200 mg, 0,48 mmol, 7,1%) i (R)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-7,7,7-trifluorheptanoat (200 mg, 0,48 mmol, 7,1%).
(S)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-7,7,7-trifluorheptanoat (200 mg, 0,48 mmol, 7,1%). ESI-MS (EI+, m/z): 243.1 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, CDCl3): δ 8.64 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.43-7.46 (m, 3H), 7.38-7.39 (m, 1H), 7.31-7.34 (m, 2H), 7.15-7.17 (m, 2H), 3.91 (dd, J= 5.5 Hz, 7.5 Hz, 1H), 2.00-2.05 (m, 2H), 1.88-1.92 (m, 2H), 1.31-1.52 (m, 13H).
(R)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-7,7,7-trifluorheptanoat (200 mg, 0,48 mmol, 7,1%). ESI-MS (EI+, m/z): 243.1 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, CDCl3): δ 8.64 (d, J= 7.0 Hz, 2H), 7.43-7.46 (m, 3H), 7.38-7.39 (m, 1H), 7.31-7.34 (m, 2H), 7.15-7.17 (m, 2H), 3.92 (dd, J = 5.5 Hz, 7.5 Hz, 1H), 2.00-2.05 (m, 2H), 1.88-1.92 (m, 2H), 1.31-1.52 (m, 13H).
Korak 3: hidrohlorid (S)-2-amino-7,7,7-trifluorheptanske kiseline [I-2]:
Rastvor (S)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-7,7,7-trifluorheptanoata (200 mg, 0,48 mmol) u 6 M HCl (10 mL) i dioksanu (5 mL) je zagrevan na 100 °C tokom 17 sati. Rastvor je ekstrahovan sa Et2O (10 mL × 2), vodena faza je koncentrovana do suva da bi se dobio hidrohlorid (S)-2-amino-7,7,7-trifluorheptanske kiseline (1-2) kao bela čvrsta supstanca (82,7 mg, 0,35 mmol, 74%). ESI-MS (EI+, m/z): 200.1 [M+H]<+>.<1>H NMR (500 MHz, D2O) δ 3.93 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 2.10-2.15 (m, 2H), 1.83-1.90 (m, 2H), 1.40-1.56 (m, 4H).
Korak 4: (R)-2-amino-7,7,7-trifluorheptanska kiselina hidrohlorid [I-3]:
Rastvor (R)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-7,7,7-trifluorheptanoata (200 mg, 0,48 mmol) u 6 M HCl (10 mL) i dioksana (5 mL) je zagrejan na 100 °C tokom 17 sati. Rastvor je ekstrahovan sa Et2O (10 mL × 2), vodena faza je koncentrovana do suva da bi se dobio hidrohlorid (R)-2-amino-7,7,7-trifluorheptanske kiseline (I-3) kao bela čvrsta supstanca (91,6 mg, 0,39 mmol, 82%). ESI-MS (EI+, m/z): 200.1 [M+H]+.1H NMR (500 MHz, D2O) δ 3.92 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 2.09 - 2.14 (m, 2H), 1.82 - 1.89 (m, 2H), 1.39 - 1.55 (m, 4H).
Primeri 4 i 5: (S)-2-amino-4,4,4-trifluorbuterna kiselina [I-4] (uporedno jedinjenje) i (R)-2-amino-4,4,4-trifluor buterna kiselina [I-5] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-4,4,4-trifluor buterna kiselina i (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-4,4,4-trifluor buterna kiselina
N-(Benziloksikarboniloksi)sukcinimid (1,75 g, 7,01 mmol) je polako dodavan u rastvor 2-amino-4,4,4-trifluor buterne kiseline (1,0 g, 6,36 mmol) i NaHCO3(589 mg, 7,01 mmol) u acetonu (60 mL) i dobijeni rastvor je filtriran (60 mL) na 0 °C. Smeša je mešana na sobnoj temperaturi 16 sati. Reakciona smeša je ekstrahovana sa CH2Cl2(2 × 100 mL) i vodeni sloj je zakiseljen sa HCl (3 M) do oko pH 4, a zatim ekstrahovan sa EtOAc (3 × 150 mL). Organska faza je osušena preko Na2SO4i rastvarač je uparen pod vakuumom. Dobijeni sirovi proizvod je prečišćen hiral-prep-HPLC (kolona, AY-H 4.6<∗>250 mm 5um; rastvarač, EtOH) da se dobije (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-4,4,4-trifluor buterna kiselina (700 mg, 2,40 mmol, 37,8%) i (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-4,4,4-trifluor buterna kiselina (700 mg, 2,40 mmol, 37,8%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 314.0 [M+Na]+.
(S)-2-(benziloksikarbonilamino)-4,4,4-trifluor buterna kiselina. 1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): δ 13.20 (s, 1H), 7.84 (d, J = 9.0 Hz, 1H), 7.40-7.30 (m, 5H), 5.06 (s, 2H), 4.31-4.27 (m, 1H), 2.85-2.58 (m, 2H).
(R)-2-(benziloksikarbonilamino)-4,4,4-trifluor buterna kiselina. 1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): δ 13.21 (s, 1H), 7.85 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 7.38-7.30 (m, 5H), 5.06 (s, 2H), 4.31-4.27 (m, 1H), 2.83-2.59 (m, 2H).
Korak 2: (S)-2-amino-4,4,4-trifluor buterna kiselina [I-4].
Smeša (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-4,4,4-trifluor buterne kiseline (700 mg, 2,40 mmol) i Pd/C (10%) (200 mg) u MeOH (50 mL) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 2 h u atmosferi vodonika. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (20 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (S)-2-amino-4,4,4-trifluor buterna kiselina (1-4), (250 mg, 1,59 mmol, 66,3%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 158.1 [M+H]+. 1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6 1 kap TFA 1 kap D2O): δ 4.32 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 3.03-2.82 (m, 2H).
Korak 3: (R)-2-amino-4,4,4-trifluor buterna kiselina [I-5].
Smeša (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-4,4,4-trifluor buterne kiseline (700 mg, 2,40 mmol) i Pd/C (10%) (200 mg) u MeOH (50 mL) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 2 h u atmosferi vodonika. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (20 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (R)-2-amino-4,4,4-trifluor buterna kiselina (I-5), (250 mg, 1,59 mmol, 66,3%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 158.1 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6+ 1 kap TFA 1 kap D2O): δ 4.31 (t, J= 6.0 Hz, 1H), 3.03-2.83 (m, 2H).
Primeri 6 i 7: (S)-2-amino-5,5,5-trifluorpentanska kiselina [I-6] (uporedno jedinjenje) i (R)-2-amino-5,5,5-trifluorpentanska kiselina [I-7] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 4,4,4-trifluorbutanal:
U rastvor 4,4,4-trifluorbutan-1-ola (4,0 g, 31,3 mmol) u DMSO (80 mL) dodat je IBX (13,0 g, 46,9 mmol) u ledenom kupatilu. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana preko noći. Reakciona smeša je sipana u vodu (200 mL) i ekstrahovana sa Et2O (100 mL × 2), organska faza je isprana vodom (100 mL × 3) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4) i rastvor je korišćen za sledeći korak.
Korak 2: 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluorpentannitril:
U rastvor gornjeg 4,4,4-trifluorbutanala u Et2O (200 mL) dodat je benzilamin (4 mL), AcOH (3,0 mL) i zatim TMSCN (3,5 mL) u ledenom kupatilu. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana preko noći. Rastvor je razblažen vodom (200 mL) i ekstrahovan sa EtOAc (100 mL), organska faza je isprana vodom (100 mL × 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da se dobije 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluorpentannitril (6,7 g, sirovo) kao smeđa čvrsta supstanca koja je korišćena za sledeći korak. ESI-MS (EI+, m/z): 243.1 [M+H]+.
Korak 3: 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluorpentanska kiselina:
Rastvor 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluorpentannitrila (6,7 g, sirov) u konc. HCl (80 mL) i AcOH (30 mL) su zagrevani na 95 °C tokom 17 sati. Rastvor je koncentrovan do suva, razblažen dobijenim rastvorom, filtriran (100 mL) i ACN (50 mL), pH je podešen na 3-4 sa zas. NaHCO3rastvorom, smeša je filtrirana i osušena da bi se dobila 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluorpentanska kiselina (3,5 g, 13,4 mmol, 43% za 3 koraka) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 262.1 [M+H]<+>.
Korak 4: 2-amino-5,5,5-trifluorpentanska kiselina:
Smeša 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluorpentanske kiseline (3,3 g, 12,6 mmol) i Pd(OH)2/C (20%, 400 mg) u AcOH (60 mL) je mešana na 30<o>C tokom 17 sati. Smeša je filtrirana, a filtrat je koncentrovan do suva da bi se dobila 2-amino-5,5,5-trifluorpentanska kiselina (3,0 g, sirova) kao braon čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 172.2 [M+H]+.\
Korak 5: (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluorpentanska kiselina i (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluorpentanska kiselina:
U rastvor 2-amino-5,5,5-trifluorpentanske kiseline (3,0 g, sirova) u zas. NaHCO3rastvoru (100 mL) i acetonu (100 mL) je dodavan Cbz-OSu (3,45 g, 13,9 mmol) u ledenom kupatilu, posle 2 h. Smeša je podešena na pH 3 sa 6 M HCl, ekstrahovana sa EtOAc (50 mL × 2), organska faza je isprana vodom (50 mL) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), i koncentrovana u vakuumu, Sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat/petrolej etar =1/2), a zatim hiral-prep-HPLC [kolona, AY-H 4.6<∗>250mm 5um; rastvarač, MeOH (0,5% NH4OH)] da bi se dobila (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluorpentanska kiselina (1,50 g, 4,92 mmol, 28%, 2 koraka) i (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluorpentanska kiselina (1,50 g, 4,92 mmol, 28%,\ za 2 koraka) kao bele čvrste supstance.
(S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluorpentanska kiselina (1.50 g, 4,92 mmol, 28% za 2 koraka). ESIMS (EI+, m/z): 328.0 [M+Na]+.1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): δ 12.86 (s, 1H), 7.71 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.31-7.39 (m, 5H), 5.05 (s, 2H), 4.05-4.10 (m, 1H), 2.34-2.41 (m, 1H), 2.21-2.29 (m, 1H), 1.84-1.97 (m, 2H).
(R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluorpentanska kiselina (1.50 g, 4.92 mmol, 28%, 2 steps) ESI-MS (EI+, m/z): 328.0 [M+Na]+. 1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): δ 12.85 (s, 1H), 7.71 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.30-7.39 (m, 5H), 5.05 (s, 2H), 4.05-4.10 (m, 1H), 2.34-2.41 (m, 1H), 2.21-2.29 (m, 1H), 1.84-1.97 (m, 2H).
Korak 6: (S)-2-amino-5,5,5-trifluorpentanska kiselina [I-6]:
Smeša (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluorpentanske kiseline (500 mg, 1,64 mmol) i Pd/C (10%) (50 mg) u MeOH (20 mL) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 2 h pod vodonikom. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (20 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (S)-2-amino-5,5,5-trifluorpentanska kiselina (1-6), (200 mg, 1,17 mmol, 71%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 172.1 [M+H]+. 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 8.38 (s, 3H), 4.05 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 2.34-2.55 (m, 2H), 1.95-20.9 (m, 2H).
Korak 7: (R)-2-amino-5,5,5-trifluorpentanska kiselina [I-7]:
Smeša (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluorpentanske kiseline (500 mg, 1,64 mmol) i Pd/C (10%) (50 mg) u MeOH (20 mL) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 2 h pod vodonikom. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (20 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (R)-2-amino-5,5,5-trifluorpentanska kiselina (1-7), (160 mg, 0,94 mmol, 57%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 172.1 [M+H]+. 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 8.38 (s, 3H), 4.05 (d, J = 4.4 Hz, 1H), 2.34-2.55 (m, 2H), 1.95-20.9 (m, 2H).
Primeri 8 i 9: (S)-2-amino-6,6,6-trifluorheksanska kiselina [I-8] (uporedno jedinjenje) i (R)-2-amino-6,6,6-trifluorheksanska kiselina [I- 9] (uporedno jedinjenje):
Postupak i karakterizacija:
Korak 1: (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-6,6,6-trifluorheksanska kiselina i (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-6,6,6-trifluorheksanska kiselina
Benzil karbonohloridat (554 mg, 3,25 mmol) je polako dodavan u rastvor 2-amino-6,6,6-trifluorheksanske kiseline (556 mg, 2,5 mmol) i 1 M NaOH (25 mL, 25 mmol) u THF (25 mL) na 0<o>C, smeša je mešana na sobnoj temperaturi tokom 16 h. Reakciona smeša je ekstrahovana sa DCM (2 × 100 mL) i vodeni sloj je zakiseljen sa HCl (3 M) do oko pH 4 i zatim ekstrahovan sa EtOAc (3 × 50 mL). Organska faza je osušena preko Na2SO4i rastvarač je uparen pod vakuumom. Dobijeni sirovi proizvod je prečišćen hiral-prep-HPLC (kolona: AY-H (250<∗>4.6mm 5um); mobilna faza: n-heksan (0,1% DEA): EtOH (0,1% DEA) = 9010) da bi se dobila (S)-2-(benziloksikarbonil amino)-6,6,6-trifluorheksanska kiselina (232 mg, 0,73 mmol, 29 %) i (R)-2-(benziloksikarbonil amino)-6,6,6-trifluorheksanska kiselina (250 mg, 0,78 mmol, 31,3%) kao bele čvrste supstance. ESI-MS (EI+, m/z): 342.0 [M+Na]+.
(S)-2-(benziloksikarbonilamino)-6,6,6-trifluorheksanska kiselina, 1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): δ 12.68 (s, 1H), 7.66 (d, J = 7.5 Hz, 1H), 7.38-7.32 (m, 5H), 5.04 (s, 2H), 4.00-3.96 (m, 1H), 2.28-2.19 (m, 2H), 1.80-1.51 (m, 4H).
(R)-2-(benziloksikarbonilamino)-6,6,6-trifluorheksanska kiselina, 1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): δ 12.68 (s, 1H), 7.67 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 7.38-7.30 (m, 5H), 5.04 (s, 2H), 4.00-3.96 (m, 1H), 2.33-2.15 (m, 2H), 1.82-1.51 (m, 4H).
Korak 2: (S)-2-amino-6,6,6-trifluorheksanska kiselina [I-8].
Smeša (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-6,6,6-trifluorheksanske kiseline (200 mg, 0,63 mmol) i Pd/C (10%) (50 mg) u MeOH (20 mL) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 2 h u atmosferi vodonika. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (20 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (S)-2-amino-6,6,6-trifluorheksanska kiselina (I-8), (56,2 mg, 0,30 mmol, 48,2%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 186.1 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6+ 1 kap TFA 1 kap D2O): δ 3.99 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 2.32-2.30 (m, 2H), 1.91-1.83 (m, 2H), 1.70-1.57 (m, 2H).
Korak 3: (R)-2-amino-6,6,6-trifluorheksanska kiselina [I-9].
Smeša (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-6,6,6-trifluorheksanske kiseline (250 mg, 0,78 mmol) i Pd/C (10%) (50 mg) u MeOH (20 mL) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 2 h u atmosferi vodonika. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (20 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (R)-2-amino-6,6,6-trifluorheksanska kiselina (I-9), (48,8 mg, 0,26 mmol, 33,8%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 186.1 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6+ 1 kap TFA 1 kap D2O): δ 3.98 (t, J = 6.5 Hz, 1H), 3.33-2.28 (m, 2H), 1.93-1.81 (m, 2H), 1.71-1.54 (m, 2H).
Primer 11: (S)-2-(benzilamino)-4-metilpentanska kiselina [I-11] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 2-(benzilamino)-4-metilpentanoat:
U mešani rastvor L-leucin benzil estar p-toluensulfonata (800 mg, 2,0 mmol) u MeOH (30 mL) dodat je benzaldehid (0,26 g, 2,4 mmol) i kalijum acetat (0,4 g, 4,1 mmol) i smeša je mešana 30 min na sobnoj temperaturi, zatim je dodat natrijum cijanoborhidrid (0,2 g, 3,0 mmol), i smeša je mešana još 5 h na sobnoj temperaturi. Smeša je ugašena zas. NaHCO3rastvorom (50 mL), ekstrahovana sa EtOAc (50 mL × 2), isprana sa dobijenim rastvorom i filtrirana (50 mL) i slanim rastvorom (50 mL). Organska faza je koncentrovana i prečišćena prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 2-(benzilamino)-4-metilpentanoat (200 mg, 0,64 mmol, 32%) kao bezbojno ulje. MS (EI+, m/z): 312.3 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, MeOD): δ 7.41~7.49 (m, 10H), 5.34 (dd, J = 12.0 Hz, 45.0 Hz, 2H), 4.23 (q, J = 12.0 Hz, 2H), 4.07~4.09 (m, 3H), 1.68~1.85 (m, 3H), 0.94 (dd, J = 8.5 Hz, 20.5 Hz, 6H).
Korak 2: (S)-2-(benzilamino)-4-metilpentanska kiselina [1-11]:
U mešani rastvor (S)-benzil 2-(benzilamino)-4-metilpentanoata (50 mg, 0,16 mmol) u MeOH (5 mL) dodat je 1 M NaOH (0,5 mL). Reakcija je mešana 4 h na sobnoj temperaturi. Dobijeni rastvor je koncentrovan, a ostatak je prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da se dobije (S)-2-(benzilamino)-4-metilpentanska kiselina (I-11), (21 mg, 0,095 mmol, 58%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 222.2 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6) : δ 9.32 (s, 1H), 7.43~7.50 (m, 5H), 4.17 (dd, J = 13.0 Hz, 44.0 Hz, 2H), 3.82 (t, J = 6.5 Hz, 1H), 1.68~1.76 (m, 3H), 0.85~0.90 (m, 6H).
Primer 12: (S)-4-metil-2-(2-fenilacetamido)pentanska kiselina [I-12] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 4-metil-2-(2-fenilacetamido)pentanoat:
U rastvor L-leucin benzil estar p-toluensulfonata (500 mg, 1,27 mmol), 2-fenilsirćetne kiseline (260 mg, 1,91 mmol) i HATU (726 mg, 1,91 mmol) u DMF (10 mL) dodata je DIPEA (410 mg, 3,18 mmol) i rastvor je mešan tokom 2 h na sobnoj temperaturi. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 4-metil-2-(2-fenilacetamido)pentanoat (300 mg, 0,88 mmol, 70%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 340.2 [M+H]+.
Korak 2: (S)-4-metil-2-(2-fenilacetamido)pentanska kiselina [I-12]:
U mešani rastvor (S)-benzil 4-metil-2-(2-fenilacetamido)pentanoata (250 mg, 0,74 mmol) u EtOH (10 mL) dodata je katalitička količina Pd/C (10%, 20 mg). Reakcija je mešana u atmosferi vodonika tokom 3 h na 50°C. Dobijeni rastvor je filtriran i koncentrovan da bi se dobila (S)-4-metil-2-(2-fenilacetamido)pentanska kiselina (1-12), (100 mg, 0,40 mmol, 54%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 250.2 [M+H]+. 1H-NMR (500 MHz, MeOD): δ 7.24-7.32 (m, 5H), 4.44 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 3.58 (s, 2H), 1.64-1.68 (m, 3H), 0.96 (d, J = 6.0 Hz, 3H), 0.91 (d, J = 6.0 Hz, 3H).
Primer 13: (S)-2-(izopropilamino)-4-metilpentanska kiselina [I-13] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 2-(izopropilamino)-4-metilpentanoat:
U mešani rastvor L-leucin benzil estar p-toluensulfonata (1,0 g, 2,53 mmol) u MeOH (30 mL) dodat je aceton (177 mg, 3,05 mmol) i kalijum acetat (0,5 g, 5,08 mmol) i smeša je mešana 30 min na sobnoj temperaturi, zatim je dodat natrijum cijanoborhidrid (0,24 g, 3,81 mmol), smeša je mešana još 3 h na sobnoj temperaturi. Smeša je ugašena zas. NaHCO3rastvorom (50 mL), ekstrahovana sa EtOAc (50 mL x 2), isprana dobijenim rastvorom, filtrirana (50 mL) i slanim rastvorom (50 mL). Organska faza je koncentrovana i prečišćena prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 2-(izopropilamino)-4-metilpentanoat (200 mg, 0,76 mmol, 30%) kao bezbojno ulje. S (EI+, m/z): 264.3 [M+H]+. 1H-NMR (500 MHz, MeOD): δ 7.22~7.29 (m, 5H), 5.07 (dd, J = 11.5 Hz, 17.0 Hz, 2H), 3.33(dd, J = 6.5 Hz, 8.5 Hz, 1H), 2.54~2.59 (m, 1H), 1.30~1.48 (m, 3H), 0.72~0.94 (m, 12H).
Korak 2: (S)-2-(izopropilamino)-4-metilpentanska kiselina [I-13]:
U mešani rastvor (S)-benzil 2-(izopropilamino)-4-metilpentanoata (200 mg, 0,76 mmol) u MeOH (10 mL), dodata je katalitička količina Pd/C (10%, 50 mg). Reakcija je mešana u atmosferi vodonika tokom 24 h na sobnoj temperaturi. Dobijeni rastvor je filtriran i filtracija je koncentrovana da bi se dobila (S)-2-(izopropilamino)-4-metilpentanska kiselina (1-13), (100 mg, 0,57 mmol, 76%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 174.3 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, MeOD): δ 3.56 (dd, J = 6.0 Hz, 8.5 Hz, 1H), 3.33~3.40 (m, 1H), 1.75~1.86 (m, 2H), 1.53~1.58 (m, 1H), 1.31~1.36 (m, 6H), 0.96~1.02 (m, 6H).3.85 (dd, J = 5.5 Hz, 8.5 Hz, 1H), 2.87 (q, J = 6.0 Hz, 1H), 2.68 (dd, J= 7.5 Hz, 12.0 Hz, 1H), 1.92~1.99 (m, 1H), 1.65~1.78 (m, 3H), 0.88~0.96 (m, 12H).
Primer 14: (S)-2-(izobutilamino)-4-metilpentanska kiselina [I-14] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 2-(izobutilamino)-4-metilpentanoat:
U mešani rastvor L-leucin benzil estar p-toluensulfonata (1,0 g, 2,53 mmol) u MeOH (30 mL) dodat je izobutiraldehid (0,22 g, 3,05 mmol) i smeša kalijum acetata (0,5 g, 5,08 mmol), i smeša je mešana 30 min na sobnoj temperaturi, zatim je dodat natrijum cijanoborhidrid (0,24 g, 3,81 mmol). Smeša je mešana još 5 h na sobnoj temperaturi. Smeša je ugašena zas. NaHCO3rastvorom (50 mL), ekstrahovana sa EtOAc (50 mL × 2), isprana dobijenim rastvorom, filtrirana (50 mL) i rastvorom soli (50 mL). Organska faza je koncentrovana i prečišćena prep-HPLC (Boston C18 21<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 2-(izobutilamino)-4-metilpentanoat (300 mg, 1,08 mmol, 50%) kao bezbojno ulje. MS (EI+, m/z): 278.2 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6) : δ 9.16 (s, 1H), 9.14 (d, J = 17.5 Hz, 2H), 7.42-7.43 (m, 5H), 5.28 (q, J = 12.0 Hz, 2H), 4.08-4.09 (m, 1H), 2.87-2.89 (m, 1H), 2.65-2.66 (m, 1H), 1.91-1.95 (m, 1H), 1.62~1.71 (m, 3H), 0.88~0.94 (m, 12H).
Korak 2: (S)-2-(izobutilamino)-4-metilpentanska kiselina [1-14]:
U mešani rastvor (S)-benzil 2-(izobutilamino)-4-metilpentanoata (300 mg, 1,08 mmol) u MeOH (10 mL), dodata je katalitička količina Pd/C (10%, 50 mg). Reakcija je mešana u atmosferi vodonika tokom 24 h na sobnoj temperaturi. Dobijeni rastvor je filtriran i filtracija je koncentrovana da bi se dobila (S)-2-(izobutilamino)-4-metilpentanska kiselina (1-14), (150 mg, 0,8 mmol, 74%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 188.3 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): δ 8.82 (s, 2H), 3.85 (dd, J = 5.5 Hz, 8.5 Hz, 1H), 2.87 (q, J = 6.0 Hz, 1H), 2.68 (dd, J = 7.5 Hz, 12.0 Hz, 1H), 1.92~1.99 (m, 1H), 1.65~1.78 (m, 3H), 0.88~0.96 (m, 12H).
Primer 15: (S)-2-benzamido-4-metilpentanska kiselina [1-15] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 2-benzamido-4-metilpentanoat:
U rastvor L-leucin benzil estar p-toluensulfonata (500 mg, 1,27 mmol), benzoeve kiseline (223 mg, 1,91 mmol) i HATU (726 mg, 1,91 mmol) u DMF (10 mL) dodata je DIPEA (410 mg, 3,18 mmol) i rastvor je mešan tokom 2 h na sobnoj temperaturi. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 2-benzamido-4-metilpentanoat (300 mg, 0,92 mmol, 73%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 326.2 [M+H]+.
Korak 2: (S)-2-benzamido-4-metilpentanska kiselina [I-15]:
U mešani rastvor (S)-benzil 2-benzamido-4-metilpentanoata (100 mg, 0,46 mmol) u EtOH (10 mL) dodata je katalitička količina Pd/C (10%, 20 mg). Reakcija je mešana u atmosferi vodonika tokom 3 h na 50 °C. Dobijeni rastvor je filtriran i koncentrovan da bi se dobila (S)-2-benzamido-4-metilpentanska kiselina (1-15), (100 mg, 0,42 mmol, 65%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 236.2 [M+H]+.1H-NMR (400 MHz, MeOD): δ 7.87 (t, J = 6.5 Hz, 2H), 7.47-7.57 (m, 3H), 4.69 (dd, J = 4.0 Hz, 11.0 Hz, 1H), 1.75-1.84 (m, 3H), 1.01 (dd, J = 6.5 Hz, 10.5 Hz, 6H).
Primer 16: (S)-2-izobutiramido-4-metilpentanska kiselina [I-16] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 2-izobutiramido-4-metilpentanoat:
U rastvor L-leucin benzil estar p-toluensulfonata (500 mg, 1,27 mmol), izobuterne kiseline (168 mg, 1,91 mmol) i HATU (726 mg, 1,91 mmol) u DMF (10 mL) dodata je DIPEA (410 mg, 3,18 mmol) i rastvor je mešan tokom 2 h na sobnoj temperaturi. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 2-izobutiramido-4-metilpentanoat (300 mg, 1,03 mmol, 81%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 292.2 [M+H]+.
Korak 2: (S)-2-izobutiramido-4-metilpentanska kiselina [I-16]:
U mešani rastvor (S)-benzil 2-(cikloheksankarboksamido)-4-metilpentanoata (200 mg, 0,69 mmol) u EtOH (10 mL) dodata je katalitička količina Pd/C (10%, 20 mg). Reakcija je mešana u atmosferi vodonika tokom 3 h na 50 °C. Dobijeni rastvor je filtriran i koncentrovan da bi se dobila (S)-2-izobutiramido-4-metilpentanska kiselina (100 mg, 0,50 mmol, 73%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 202.2 [M+H]+. 1H-NMR (400 MHz, MeOD): δ 4.43 (t, J = 6.4 Hz, 1H), 2.49-2.56 (m, 1H), 1.60-1.74 (m, 3H), 1.12 (dd, J = 2.4 Hz, 6.8 Hz, 6H), 0.96 (dd, J = 6.4 Hz, 16.0 Hz, 6H).
Primer 17: (S)-2-(cikloheksansulfonamido)-4-metilpentanska kiselina [I-17] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 2-(cikloheksansulfonamido)-4-metilpentanoat:
Rastvor (S)-benzil 2-amino-4-metilpentanoat 4-metilbenzensulfonata (500 mg, 1,27 mmol) i Et3N (642,89 mg, 6,35 mmol) u DMF (3 mL), ohlađen u ledenom kupatilu, je dodat cikloheksansulfonil hlorid (278,53 mg, 1,52 mmol). Smeša je mešana na 25 °C tokom 2 sata. Rastvor je razblažen etil acetatom (10 mL), ispran dobijenim rastvorom, filtriran (10 mL × 3) i slanim rastvorom (10 mL), osušen anhidrovanim natrijum sulfatom, filtriran i koncentrovan in vacuo. Sirovi proizvod je prečišćen prep-HPLC (Boston C18 21<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 2-(cikloheksansulfonamido)-4-metilpentanoat (200 mg, 0,544 mmol, 98%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 368.3 [M+H]+.1H -NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 7.70 (d, J = 9.0 Hz, 1H), 7.38 (t, J = 6.5 Hz, 4H), 7.37 - 7.32 (m, 1H), 5.14 (q, J = 12.5 Hz, 2H), 3.91 (td, J = 5.0 Hz, 9.5 Hz, 1H), 2.69-2.74 (m, 1H), 2.05 (d, J = 12.5 Hz, 1H), 1.97 (d, J = 12.5 Hz, 1H), 1.74 - 1.67 (m, 2H), 1.57 - 1.51 (m, 2H), 1.50 - 1.44 (m, 1H), 1.36 - 0.99 (m, 5H), 0.87 (dt, J = 10.5 Hz, J = 20.5 Hz, 6H).
Korak 2: (S)-2-(cikloheksansulfonamido)-4-metilpentanska kiselina [I-17]:
U rastvor (S)-benzil 2-(cikloheksansulfonamido)-4-metilpentanoata (192 mg, 0,552 mmol) u EtOH (3 mL), dodat je Pd/C (20 mg, 10%). Reakciona smeša je mešana na 50 °C tokom 4 h pod vodonikom. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (10 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (S)-2-(cikloheksansulfonamido)-4-metilpentanska kiselina (1-17), (23,3 mg, 0,084 mmol, 100%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 300.2 [M+Na]+.1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.75 (s, 1H), 7.47 (d, J = 9.0 Hz, 1H), 3.76 (td, J = 5.0 Hz, 9.5 Hz, 1H), 2.82 - 2.69 (m, 1H), 2.18 - 1.97 (m, 2H), 1.82 - 1.69 (m, 3H), 1.61 (d, J= 12.5 Hz, 1H), 1.54 - 1.40 (m, 2H), 1.39 - 1.07 (m, 5H), 0.95 - 0.80 (m, 6H).
Primer 18: (S)-4-metil-2-(fenilmetilsulfonamido)pentanska kiselina [I-18] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 4-metil-2-(fenilmetilsulfonamido)pentanoat:
U rastvor (S)-benzil 2-amino-4-metilpentanoat 4-metilbenzensulfonata (500 mg, 1,27 mmol) i Et3N (642,89 mg, 6,35 mmol) u DMF (3 mL), ohlađen u ledenom kupatilu, dodat je fenilmetansulfonil hlorid (290,71 mg, 1,52 mmol). Smeša je mešana na 25 °C tokom 2 sata. Rastvor je razblažen etil acetatom (10 mL), ispran dobijenim rastvorom, filtriran (10 mL × 3) i slanim rastvorom (10 mL), osušen sa anhidrovanim natrijum sulfatom, filtriran i koncentrovan u vakuumu. Sirovi proizvod je prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 4-metil-2-(fenilmetilsulfonamido)pentanoat (149 mg, 0,396 mmol, 90%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 398.0 [M+Na]+. 1H -NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 7.81 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 7.52 -7.18 (m, 9H), 5.15 (s, 2H), 4.28 (dd, J = 13.5 Hz, 44.5 Hz, 2H), 3.87 (dd, J = 8.0 Hz, 15.0 Hz, 1H), 1.57 - 1.15 (m, 4H), 0.82 (dd, J = 4.5 Hz, 6.0 Hz, 6H).
Korak 2: (S)-4-metil-2-(fenilmetilsulfonamido)pentanska kiselina [I-18]:
U rastvor (S)-benzil 4-metil-2-(fenilmetilsulfonamido)pentanoata (121 mg, 0,322 mmol) u EtOH (3 mL), dodat je Pd/C (20 mg, 10%). Ova reakciona smeša je mešana na 50 °C tokom 4 h pod vodonikom. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (10 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (S)-4-metil-2-(fenilmetilsulfonamido)pentanska kiselina (1-18), (41,2 mg, 0,144 mmol, 100%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 308.0 [M+Na]+.1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.77 (s, 1H), 7.59 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 7.47 - 7.25 (m, 5H), 4.30 (dd, J = 13.5 Hz, 37.0 Hz, 2H), 3.75 (dd, J = 7.5 Hz, 15.5 Hz, 1H), 1.65 (dt, J = 6.5 Hz, 13.5 Hz, 1H), 1.45 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 0.85 (dd, J = 1.5 Hz, 6.5 Hz, 6H).
Primer 19: (S)-4-metil-2-(metilsulfonamido)pentanska kiselina [I-19] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 4-metil-2-(metilsulfonamido)pentanoat:
U rastvor (S)-benzil 2-amino-4-metilpentanoat 4-metilbenzensulfonata (500 mg, 1,27 mmol) i Et3N (642,89 mg, 6,35 mmol) u DMF (3 mL), ohlađen u ledenom kupatilu, dodat je metansulfonil hlorid (290,71 mg, 1,52 mmol), smeša je mešana na 25 °C tokom 2 h. Rastvor je razblažen etil acetatom (10 mL), ispran dobijenim rastvorom, filtriran (10 mL × 3) i slanim rastvorom (10 mL), osušen sa anhidrovanim natrijum sulfatom, filtriran i koncentrovan u vakuumu. Sirovi proizvod je prečišćen prep-HPLC (Boston C18 21<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da se dobije (S)-benzil 4-metil-2-(metilsulfonamido)pentanoat (192 mg, 0,641 mmol, 98%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 323.0 [M+Na]+.1H -NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 7.79 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 7.42 - 7.36 (m, 4H), 7.37 - 7.32 (m, 1H), 5.16 (s, 2H), 3.97 (td, J = 6.0 Hz, 9.0 Hz, 1H), 2.85 (s, 3H), 1.68 (dq, J= 6.5 Hz, 13.0 Hz, 1H), 1.54 - 1.46 (m, 2H), 0.91 - 0.82 (m, 6H).
Korak 2: (S)-4-metil-2-(metilsulfonamido)pentanska kiselina [1-19]:
U rastvor (S)-benzil 4-metil-2-(metilsulfonamido)pentanoata (149 mg, 0,497 mmol) u EtOH (3 mL) dodat je Pd/C (20 mg, 10%). Ova reakciona smeša je mešana na 50 °C tokom 4 h u atmosferi vodonika. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (10 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobilo (S)-4-metil-2-(metilsulfonamido)pentanska kiselina (I-19), (31,4 mg, 0,150 mmol, 100%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 232.1 [M+Na]+. 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.82 (s, 1H), 7.56 (d, J = 9.0 Hz, 1H), 3.82 (dd, J= 8.0 Hz, 15.5 Hz, 1H), 2.88 (s, 3H), 1.72 (dt, J= 6.5 Hz, 13.0 Hz, 1H), 1.48 (t, J = 7.0 Hz, 2H), 0.89 (t, J = 7.0 Hz, 6H).
Primer 20: (S)-2-amino-4-metil-N-fenilpentanamid [I-20] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 4-metil-1-okso-1-(fenilamino)pentan-2-ilkarbamat :
U rastvor (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-4-metilpentanske kiseline (1,0 g, 3,77 mmol) u DMF (20 mL) dodat je anilin (702 mg, 7,55 mmol), HATU (1,72 g, 4,52 mmol) i Et3N (1,14 g, 11,31 mmol) na sobnoj temperaturi. Posle 2 sata, rastvor je razblažen sa EtOAc (80 mL), ispran dobijenim rastvorom, filtriran (80 mL × 3) i slanim rastvorom (80 mL), osušen (Na2SO4), filtriran i koncentrovan u vakuumu. Sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat/petrolej etar = 1/3) da bi se dobio (S)-benzil 4-metil-1-okso-1-(fenilamino)pentan-2-ilkarbamat (350 mg, 1,03 mmol, 27%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 341.1 [M+H]+.
Korak 2: (S)-2-amino-4-metil-N-fenilpentanamid [I-20]:
Smeša (S)-benzil 4-metil-1-okso-1-(fenilamino)pentan-2-ilkarbamata (350 mg, 1,03 mmol) i Pd/C (10 %, 50 mg) u MeOH (10 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 2 h pod vodonikom. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (10 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobio (S)-2-amino-4-metil-N-fenilpentanamid (1-20), (100 mg, 0,49 mmol, 47%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 207.2 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, DMSOd6): δ 9.86 (s, 1H), 7.63 (dd, J= 1.0 Hz, 8.5 Hz, 2H), 7.31-7.27 (m, 2H), 7.03 (t, J= 7.5 Hz, 1H), 3.31 (dd, J= 5.0 Hz, 8.5 Hz, 1H), 1.80-1.71 (m, 1H), 1.50-1.44 (m, 1H), 1.35-1.29 (m, 1H), 0.90 (dd, J= 6.5 Hz, 14.0 Hz, 6H).
Primer 21: (S)-2-amino-N,4-dimetilpentanamid [I-21] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 4-metil-1-(metilamino)-1-oksopentan-2-ilkarbamat:
U rastvor (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-4-metilpentanske kiseline (1,0 g, 3,77 mmol) u DMF (20 mL) dodat je MeNH2□HCl (509 mg, 7,54 mmol), HATU (1,72 g, 4,52 mmol) i Et3N (1,14 g, 11,31 mmol) na 25<o>C. Posle 2 h, rastvor je razblažen sa EtOAc (80 mL), ispran dobijenim rastvorom, filtriran (80 mL × 3) i slanim rastvorom (80 mL), osušen (Na2S04), filtriran i koncentrovan u vakuumu. Sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/3) da bi se dobio (S)-benzil 4-metil-1-(metilamino)-1-oksopentan-2-ilkarbamat (550 mg, 1,98 mmol, 52%) kao bezbojno ulje. ESI-MS (EI+, m/z): 279.2 [M+H]+.
Korak 2: (S)-2-amino-N,4-dimetilpentanamid [I-21]:
Smeša (S)-benzil 4-metil-l-(metilamino)-l-oksopentan-2-ilkarbamata (300 mg, 1,08 mmol) i Pd/C (10%) (50 mg) u MeOH (10 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 2 h pod vodonikom. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (10 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobio (S)-2-amino-N,4-dimetilpentanamid (1-21), (152 mg, 1,05 mmol, 98%) kao bezbojno ulje. ESI-MS (EI+, m/z): 145.3 [M+H]+.1H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): δ 7.80 (s, 1H), 3.10 (dd, J= 5.0 Hz, 9.0 Hz, 1H), 2.57 (dd, J= 3.0 Hz, 5.0 Hz, 3H), 1.81 (s, 2H), 1.66-1.69 (m, 1H), 1.34-1.39 (m, 1H), 1.16-1.22 (m, 1H), 0.81-0.87 (m, 6H).
Primer 22: (S)-4-metil-2-(fenilamino)pentanska kiselina [I-22] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 2-(cikloheksankarboksamido)-4-metilpentanoat:
U rastvor L-leucin benzil estar p-toluensulfonata (500 mg, 1,27 mmol), cikloheksankarboksilne kiseline (244 mg, 1,91 mmol) i HATU (726 mg, 1,91 mmol) u DMF (10 mL) dodat je DIPEA (410 mL, 3,18 mmol) i rastvor je mešan tokom 2 h na sobnoj temperaturi. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C18 21<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 2-(cikloheksankarboksamido)-4-metilpentanoat (300 mg, 0,91 mmol, 71%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 332.3 [M+H]+.
Korak 2: (S)-2-(cikloheksankarboksamido)-4-metilpentanska kiselina [I-22]:
U mešani rastvor (S)-benzil 2-(cikloheksankarboksamido)-4-metilpentanoata (200 mg, 0,60 mmol) u EtOH (10 mL) dodata je katalitička količina Pd/C (10%, 20 mg). Reakcija je mešana u atmosferi vodonika tokom 3 h na 50 °C. Dobijeni rastvor je filtriran i koncentrovan da bi se dobila (S)-2-(cikloheksankarboksamido)-4-metilpentanska kiselina (I-22), (100 mg, 0,41 mmol, 69%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 242.3 [M+H]<+>.1H-NMR (500 MHz, CD3OD): δ 4.43 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 2.29 (td, J = 8.0 Hz, 11.0 Hz, 1H), 1.74-1.85 (m, 4H), 1.63-1.72 (m, 4H), 1.43-1.49 (m, 2H), 1.26-1.36 (m, 3H), 0.96 (dd, J= 6.0 Hz, 20.5 Hz, 6H).
Primer 25: (S)-4-metil-2-(fenilsulfonamido)pentanska kiselina [I-25] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 4-metil-2-(fenilsulfonamido)pentanoat:
U rastvor (S)-benzil 2-amino-4-metilpentanoat 4-metilbenzensulfonata (300 mg, 0,762 mmol) i Et3N (385,73 mg, 3,81 mmol) u DMF (3 mL), ohlađen u ledenom kupatilu, je dodat benzensulfonil hlorid (148,12 mg, 0,838 mmol). Smeša je mešana na 25 °C tokom 2 h. Rastvor je razblažen etil acetatom (10 mL), ispran dobijenim rastvorom, filtriran (10 mL x 3) i slanim rastvorom (10 mL), osušen sa anhidrovanim natrijum sulfatom, filtriran i koncentrovan u vakuumu. Sirovi proizvod (280 mg, čistoća: 85%, prinos: 74%) je direktno korišćen u sledećem koraku. ESI-MS (EI+, m/z): 384.1 [M+Na]+.
Korak 2: (S)-4-metil-2-(fenilsulfonamido)pentanska kiselina [I-25]:
U rastvor (S)-benzil 4-metil-2-(fenilsulfonamido)pentanoata (200 mg, 0,553 mmol) u EtOH (3 mL), dodat je Pd/C (20 mg, 10%). Ova reakciona smeša je mešana na 50 °C tokom 4 h u atmosferi vodonika. Smeša je filtrirana, a filter kolač je ispran sa MeOH (10 mL). Filtrat je koncentrovan da bi se dobila (S)-4-metil-2-(fenilsulfonamido)pentanska kiselina (1-25), (63.7 mg, 0,234 mmol, 100%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 294.0 [M+Na]+. 1H- NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.61 (s, 1H), 8.16 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 7.79 - 7.73 (m, 2H), 7.62 (t, J = 7.3 Hz, 1H), 7.56 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 3.63 (dd, J= 8.5 Hz, 14.5 Hz, 1H), 1.53 (td, J= 6.5 Hz, 13.5Hz, 1H), 1.41 - 1.31 (m, 2H), 0.79 (d, J= 6.6 Hz, 3H), 0.66 (d, J= 6.5 Hz, 3H).
Primer 26: (S)-4-metil-2-(fenilamino)pentanska kiselina [I-26] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 4-metil-2-(fenilamino)pentanoat:
Smeši L-leucin benzil estar p-toluensulfonat (200 mg, 0,51 mmol), fenilborne kiseline (186 mg, 1,52 mmol) i Cu(OAc)2(462 mg, 2,54 mmol) u DCM (10 mL) je dodat 4A MS (1.0 g) i Et3N (155 mg, 1,52 mmol) i smeša je mešana 18 h na sobnoj temperaturi. Smeša je ugašena dobijenim rastvorom, filtrirana (50 mL), ekstrahovana sa EtOAc (50 mL × 2), isprana dobijenim rastvorom, filtrirana (50 mL) i slanim rastvorom (50 mL). Organska faza je koncentrovana i prečišćena hromatografijom (silicijum, etil acetat / petrolej etar = 1/20) da bi se dobio (S)-benzil 4-metil-2-(fenilamino)pentanoat (100 mg, 0,34 mmol, 66%) kao bezbojno ulje. MS (EI+, m/z): 298.2 [M+H]+.
Korak 2: (S)-4-metil-2-(fenilamino)pentanska kiselina [I-26]:
U mešani rastvor (S)-benzil 4-metil-2-(fenilamino)pentanoata (100 mg, 0,34 mmol) u EtOH (10 mL) dodata je katalitička količina Pd/C (10%, 20 mg). Reakcija je mešana u atmosferi vodonika tokom 2 h na 50 °C. Dobijeni rastvor je filtriran i koncentrovan da bi se dobila (S)-4-metil-2-(fenilamino)pentanska kiselina (1-26), (30 mg, 0,15 mmol, 43%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 208.1 [M+H]+. 1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.23 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 6.83 (t, J = 7.6 Hz, 1H), 6.66 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 3.99 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 2.87 (q, J = 6.0 Hz, 1H), 1.72~1.86 (m, 2H), 1.62~1.68 (m, 1H), 0.85~1.03 (m, 6H).
Primer 36: (S)-2-acetamido-4-metilpentanska kiselina [I-36] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 2-acetamido-4-metilpentanoat:
U rastvor L-leucin benzil estar p-toluensulfonata (500 mg, 1,27 mmol), sirćetne kiseline (114 mg, 1,91 mmol) i HATU (726 mg, 1,91 mmol) u DMF (10 mL) dodat je DIPEA (410 mg, 3,18 mmol) i rastvor je mešan 2 h na sobnoj temperaturi. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio (S)-benzil 2-acetamido-4-metilpentanoat (300 mg, 1,14 mmol, 89%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 264.2 [M+H]+.
Korak 2: (S)-2-acetamido-4-metilpentanska kiselina [1-36]:
U mešani rastvor (S)-benzil 2-acetamido-4-metilpentanoata (250 mg, 0,74 mmol) u EtOH (10 mL) dodata je katalitička količina Pd/C (10%, 20 mg). Reakcija je mešana u atmosferi vodonika tokom 3 h na 50 °C. Dobijeni rastvor je filtriran i koncentrovan da bi se dobila (S)-2-acetamido-4-metilpentanska kiselina (1-36), (100 mg, 0,57 mmol, 81%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 174.2 [M+H]+. 1H-NMR (500 MHz, MeOD): δ 4.43 (dd, J = 6.0 Hz, 9.5 Hz, 1H), 2.00 (s, 3H), 1.61-1.73 (m, 3H), 0.97 (dd, J = 6.0 Hz, 17.5 Hz, 6H).
Primer 45: (S,E)-2-(4-metoksi-4-oksobut-2-enamido)-4-metilpentanska kiselina [I-45] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S,E)-2-(4-metoksi-4-oksobut-2-enamido)-4-metilpentanska kiselina [I-45] :
U rastvor (E)-4-metoksi-4-oksobut-2-enske kiseline (1,0 g, 7,69 mmol) u DCM (30 mL) dodat je SOCl2(1,83 g, 15,38 mmol), a zatim DMF (0,1 mL). Rastvor je zagrevan na 40 °C tokom 4 h. Rastvor je koncentrovan do suva da bi se dobilo ulje. Ulje je razblaženo sa DCM (10 mL). Rastvor (S)-2-amino-4-metilpentanske kiseline (1,0 g, 7,62 mmol) u acetonu (20 mL) i zas. Na2CO3(20 mL) rastvor ohlađen u ledenom kupatilu je dodat u kapima. Posle 1 h, rastvor je podešen na pH 2 sa 6 M rastvora HCl, ekstrahovan sa EtOAc (40 x 2), ispran dobijenim rastvorom, filtriran (80 mL × 3) i slanim rastvorom (80 mL), osušen (Na2SO4), filtriran i koncentrovan in vacuo. Sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, MeOH/DCM = 1/20) da se dobije (S,E)-2-(4-metoksi-4-oksobut-2-enamido)-4-metilpentanska kiselina (I-45), (1,0 g, 4,11 mmol, 53%) kao žuto ulje. ESI-MS (EI+, m/z): 244.2 [M+H]+.1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.32 (d, J= 15.2 Hz, 1H), 7.05 (d, J = 15.2 Hz, 1H), 6.85-6.89 (m, 2H), 7.30-7.46 (m, 1H), 3.82 (s, 1H), 1.63-1.78 (m, 3H), 0.97 (d, J= 4.8 Hz, 6H).
Primeri 46 i 47: (R)-2-amino-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina [I-46] (uporedno jedinjenje) i (S)-2-amino-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina [I-47] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: etil 2,2-difluor-3-metilbutanoat:
Smeša etil 3-metil-2-oksobutanoata (10 g, 0,069 mol) i DAST (16,8 g, 0,10 mol) mešana je na sobnoj temperaturi tokom 12 h. Posle provere pomoću TLC, reakciona smeša je dodavana u kapima polako u hladni, zasićeni vodeni rastvor natrijum bikarbonata. Smeša je ekstrahovana sa Et2O (300 mL × 2), a organski slojevi su isprani slanim rastvorom, osušeni i koncentrovani da bi se dobio sirovi etil 2,2-difluor-3-metilbutanoat (8,3 g) koji je direktno korišćen u sledećem koraku.
Korak 2: 2,2-difluor-3-metilbutanal:
U rastvor sirovog etil 2,2-difluor-3-metilbutanoata (8,3 g) u CH2Cl2(200 mL) dodat je u kapima rastvor DIBAL-H u heksanu (1,0 M, 69 mL, 69,0 mmol) na -78 °C pod argonom, i smeša je mešana tokom 30 min na -78 °C. Posle provere pomoću TLC, reakcija je ugašena zasićenom limunskom kiselinom i ekstrahovana sa Et2O. Ekstrakt je ispran zasićenom limunskom kiselinom, slanim rastvorom, osušen preko Na2SO4i koncentrovan pod sniženim pritiskom da bi se dobio uljasti aldehid 2,2-difluor-3-metilbutanal (4,2 g), koji je korišćen odmah u sledećem koraku bez prečišćavanja.
Korak 3: 2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentannitril:
Rastvor sirovog 2,2-difluor-3-metilbutanala (4,2 g) u 50 mL MeOH je ohlađen na 0 °C. U kapima je dodata sirćetna kiselina (glacijalna, 2,1 mL), održavajući temperaturu oko 0 °C, a zatim trimetilsilil cijanid (4,2 mL) tokom perioda od 15 minuta. Reakciona smeša je zagrejana do 25 °C i mešana preko noći. Hladni dobijeni rastvor je filtriran (200 mL), sipan je u reakcionu smešu i reakciona smeša je ekstrahovana dihlormetanom (2<∗>200 mL). Dihlormetanski sloj je ispran dobijenim rastvorom i filtriran (2<∗>100 mL), nakon čega sledi slani rastvor (2<∗>50 mL). Dihlormetanski sloj je osušen preko anhidrovanog natrijum sulfata i koncentrovan pod sniženim pritiskom da bi se dobio sirovi 2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentannitril (2,8 g) koji je korišćen odmah u sledećem koraku bez prečišćavanja. ESI-MS (EI+, m/z): 238.2 [M+H]+.
Korak 4: 2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina:
Rastvor sirovog 2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentannitrila (2,8 g) u 50 mL konc. hlorvodonične kiseline i 10 mL HOAc je mešano na 90 °C tokom 24 sata i koncentrovano. Ostatak je prečišćen prep-HPLC da bi se dobila 2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina (513 mg) kao bela čvrsta supstanca. Čisti proizvod je prečišćen pomoću hiral-HPLC da bi se dobilo (R)-2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina (80 mg) i (S)-2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina (63 mg) koje su obe bile bele čvrste supstance. ESI-MS (EI+, m/z): 258.2 [M+H]+.
Korak 5-A: (R)-2-amino-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina [I-46]:
U rastvor (R)-2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentanske kiseline (80 mg, 0,31 mmol) u 20 mL MeOH dodat je HCOONH4(98 mg, 1,56 mmol) i Pd/C (100 mg) na sobnoj temperaturi. Smeša je mešana na 60 °C tokom 2 h. Reakciona smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobio sirov proizvod koji je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila (R)-2-amino-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina (1-46), (23 mg, 44%) kao bela čvrsta supstanca; 1H-NMR (500 MHz, D2O): δ 4.27 (dd, J = 24.0, 3.5 Hz, 1 H), 2.55-2.42 (m, 1 H), 1.04 (d, J = 7.0 Hz, 3 H), 0.993 (d, J = 6.5 Hz, 3 H).
Korak 5-B: (S)-2-amino-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina [1-47]:
U rastvor (S)-2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentanske kiseline (63 mg, 0,24 mmol) u 15 mL MeOH dodat je HCOONH4(77 mg, 1,22 mmol) i Pd/C (100 mg) na sobnoj temperaturi. Smeša je mešana na 60 °C tokom 2 h. Reakciona smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobio sirov proizvod koji je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila (S)-2amino-3,3-difluor-4-metilpentanska kiselina (1-47), ( 14 mg, 34%) kao bela čvrsta supstanca; 1H-NMR (500 MHz, D2O): δ 4.27 (dd, J = 24.0, 3.5 Hz, 1 H), 2.55-2.42 (m, 1 H), 1.04 (d, J = 7.0 Hz, 3 H), 0.993 (d, J = 6.5 Hz, 3 H).
Primer 147: (S)-2-amino-4-metil-N-(metilsulfonil)pentanamid hidrohlorid [I-147] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-terc-butil 4-metil-1-(metilsulfonamido)-1-oksopentan-2-ilkarbamat:
Rastvoru (S)-2-(terc-butoksikarbonilamino)-4-metilpentanske kiseline (1,0 g, 4,32 mmol), metansulfonamida (452 mg, 4,75 mmol) i HATU (1,8 g, 4,75 mmol) u DMF (30 mL) je dodat TEA (1,3 g, 12,9 mmol) i rastvor je mešan tokom 17 h na sobnoj temperaturi. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da se dobije (S)-terc-butil 4-metil-1-(metilsulfonamido)-1-oksopentan-2-ilkarbamat (130 mg, 0,42 mmol, 8,9%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI-, m/z): 307.0 [M-H]-.
Korak 2: (S)-2-amino-4-metil-N-(metilsulfonil)pentanamid hidrohlorid [I-147]:
Rastvoru (S)-terc-butil 4-metil-1-(metilsulfonamido)-1-oksopentan-2-ilkarbamata (130 mg, 0,42 mmol) u Et2O (15 mL) je dodato 4 M HCl/dioksana (5 mL) i mešan je tokom 3 h na sobnoj temperaturi. Čvrsta supstanca je filtrirana da bi se dobilo (S)-2-amino-4-metil-N-(metilsulfonil)pentanamid hidrohlorid [I-147] kao bela čvrsta supstanca (32 mg, 0,13 mmol, 31%). ESI-MS (EI+, m/z): 209.1 [M+H]+. 1H NMR (500 MHz, CD3OD) δ 3.96 (t, J= 3.0 Hz, 1H), 3.32 (s, 3H), 1.74-1.79 (m, 3H), 1.02-1.05 (m, 6H).
Primer 193: (S)-2-amino-N,4,4-trimetil-N-(metilsulfonil)pentanamid hidrohlorid [I-193] (uporedno jedinjenje):
[0292]
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-terc-butil 4,4-dimetil-1-(N-metilmetilsulfonamido)-1-oksopentan-2-ilkarbamat:
U rastvor (S)-2-(terc-butoksikarbonilamino)-4,4-dimetilpentanske kiseline (500 mg, 1,97 mmol) u DCM (60 mL) dodat je HATU (900 mg, 2,36 mmol) i mešan je na sobnoj temperaturi tokom 2 h. Zatim Cs2CO3(1,92 g, 5,91 mmol), N-metilmetansulfonamid (322 mg, 2,95 mmol) su dodati u smešu i mešani preko noći na sobnoj temperaturi. Rastvor je razblažen vodom (200 mL) i ekstrahovan sa DCM (100 mL). Organska faza je isprana vodom (100 mL x 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu, sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/5) da bi se dobio (S)-terc-butil 4,4-dimetil-1-(N-metilmetilsulfonamido)-1-oksopentan-2-ilkarbamat (420 mg, 1,25 mmol, 63%) kao žuto ulje. ESI-MS (EI+, m/z): 359.1 [M+Na]<+>.
Korak 2: (S)-2-amino-N,4,4-trimetil-N-(metilsulfonil)pentanamid hidrohlorid [I-193]:
Rastvoru (S)-terc-butil 4,4-dimetil-1-(N-metilsulfonamido)-1-oksopentan-2-ilkarbamata (420 mg, 1,25 mmol) u Et2O (20 mL) je dodat 4 M HCl / dioksana (10 mL) i mešan je tokom 17 h na sobnoj temperaturi. Čvrsta supstanca je filtrirana da bi se dobio (S)-2-amino-N,4,4-trimetil-N-(metilsulfonil)pentanamid hidrohlorid [I-193] kao bela čvrsta supstanca (250 mg, 0,13 mmol, 71%). ESI-MS (EI+, m/z): 237.1 [M+H]+.<1>H NMR (500 MHz, DMSO) δ 8.55 (s, 3H), 4.59 (s, 1H), 3.50 (s, 3H), 3.26 (s, 3H), 1.81-1.85 (m, 1H), 1.63-1.67 (m, 1H), 0.95 (s, 9H).
Primer 192: 2-amino-4-fluor-4-metil-N-(metilsulfonil)pentanamid hidrohlorid [1-192] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: terc-butil 4-fluor-4-metil-1-(metilsulfonamido)-1-oksopentan-2-ilkarbamat:
U rastvor terc-butil 4-fluor-4-metil-1-(metilsulfonamido)-1-oksopentan-2-ilkarbamata (270 mg, 1,08 mmol) u DCM (50 mL) dodat je HATU (451 mg, 1,19 mmol) i mešan je na sobnoj temperaturi tokom 2 h. Zatim Cs2CO3(1,06 g, 3,24 mmol), metansulfonamid (206 mg, 2,17 mmol) je dodat u smešu i mešan preko noći na sobnoj temperaturi. Rastvor je razblažen vodom (200 mL) i ekstrahovan sa DCM (100 mL). Organska faza je isprana vodom (100 mL x 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu, sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/5) da bi se dobio (S)-terc-butil 4,4-dimetil-1-(N-metilmetilsulfonamido)-1-oksopentan-2-ilkarbamat (200 mg, 0,6 mmol, 55%) kao žuto ulje. ESI-MS (EI+, m/z): 344.1 [M+NH4]<+>.
Korak 2: 2-amino-4-fluor-4-metil-N-(metilsulfonil)pentanamid hidrohlorid [I-192].
Rastvoru (S)-terc-butil 4,4-dimetil-1-(N-metilmetilsulfonamido)-1-oksopentan-2- ilkarbamata (200 mg, 0,6 mmol) u Et2O (20 mL) je dodat 4 M HCl/dioksan (10 mL) i mešan je tokom 17 h na sobnoj temperaturi. Čvrsta supstanca je filtrirana da bi se dobio 2-amino-4-fluor-4-metil-N-(metilsulfonil)pentanamid hidrohlorid [1-192] kao bela čvrsta supstanca (89,8 mg, 0,34 mmol, 57%). ESI-MS (EI+, m/z): 227.1 [M+H]+.<1>H NMR (500 MHz, DMSO) δ 8.44 (s, 3H), 4.02 (s, 1H), 3.25 (s, 3H), 2.16-2.25 (m, 1H), 2.03-2.10 (m, 1H), 1.43 (s, 3H), 1.38 (s, 3H).
Primer 190: (S)-metil 2-((S)-2-amino-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat hidrohlorid [1-190] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-metil 2-((S)-2-(terc-butoksikarbonilamino)-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat:
Rastvoru (S)-2-(terc-butoksikarbonilamino)-4,4-dimetilpentanske kiseline (500 mg, 2.0 mmol) u DCM (80 mL) je dodat HATU (900 mg, 2,3 mmol) i mešan je na sobnoj temperaturi tokom 2 h. Zatim Cs2CO3(1,95 g, 6,0 mmol), (S)-metil 2-amino-4-metilpentanoat hidrohlorid (555 mg, 3,0 mmol) su dodati u smešu i mešan preko noći na sobnoj temperaturi. Rastvor je razblažen vodom (200 mL) i ekstrahovan sa DCM (100 mL). Organska faza je isprana vodom (100 mL x 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu, sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/5) da bi se dobilo (S)-metil 2-((S)-2-(terc-butoksikarbonilamino)-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat (500 mg, 1,34 mmol, 67%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 317.2 [M-56]<+>.
Korak 2: (S)-metil 2-((S)-2-amino-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat hidrohlorid [I-190].
Rastvoru (S)-metil 2-((S)-2-(terc-butoksikarbonilamino)-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoata (500 mg, 1,34 mmol) u Et2O (20 mL) je dodat 4 M HCl/dioksan (10 mL) i mešan je tokom 17 h na sobnoj temperaturi. Čvrsta supstanca je filtrirana da bi se dobio (S)-metil 2-(S)-2-amino-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat hidrohlorid [I-190] kao bela čvrsta supstanca (300 mg, 0,97 mmol, 73%). ESI-MS (EI+, m/z): 273.2 [M+H]<+>.1H NMR (500 MHz, DMSO) δ 9.07-9.09 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 8.42 (s, 3H), 4.29-4.34 (m, 1H), 3.82 (m, 1H), 3.60 (s, 3H), 1.72-1.83 (m, 2H), 1.50-1.62 (m, 3H), 0.86-0.91 (m, 15H).
Primer 122: (S)-metil 2-amino-4,4-dimetilpentanoat hidrohlorid [I-122] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-metil 2-amino-4,4-dimetilpentanoat hidrohlorid [1-122]:
Rastvoru (S)-2-amino-4,4-dimetilpentanske kiseline (100 mg, 0,69 mmol) u MeOH (10 mL) je dodato 4 M HCl/dioksana (10 mL) i mešano na 80 °C tokom 24 h. Smeša je koncentrovana i ostatak je razmućen sa Et2O da bi se dobio (S)-metil 2-amino-4,4-dimetilpentanoat hidrohlorid [1-122] kao bela čvrsta supstanca (23,6 mg, 0,12 mmol, 20%). ESI-MS (EI+, m/z): 160.1 [M+H]<+>.
1H-NMR (500 MHz, CD3OD): δ 4.02-4.04 (m, 1H), 3.86 (s, 3H), 1.97-2.02 (m, 1H), 1.64-1.68 (m, 1H), 1.03-1.05 (d, 9H).
Primer 123: (R)-metil 2-amino-4,4-dimetilpentanoat hidrohlorid [I-123] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (R)-metil 2-amino-4,4-dimetilpentanoat hidrohlorid [I-123]:
Smeši (R)-2-amino-4,4-dimetilpentanske kiseline (50 mg, 0,34 mmol) u suvom MeOH (10 mL) je dodat SOCl2(0.5 mL) i mešano je na sobnoj temperaturi tokom 17 h. Smeša je koncentrovana i ostatak je razmućen sa Et2O da bi se dobio (R)-metil 2-amino-4,4-dimetilpentanoat hidrohlorid [I-123] kao bela čvrsta supstanca (34,2 mg, 0,17 mmol, 50%). ESI-MS (EI+, m/z): 160.1 [M+H]+.
1H-NMR (500 MHz, CD3OD): δ 4.02-4.04 (m, 1H), 3.86 (s, 3H), 1.97-2.02 (m, 1H), 1.64-1.68 (m, 1H), 1.03 (s, 9H).
Primer 205: 2-amino-N-cijano-5,5,5-trifluor-4-metilpentanamid hidrohlorid [1-205] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanska kiselina:
Smeša 2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline (250 mg, 1,35 mmol), Boc2O (353 mg, 1,62 mmol), NaOH (80 mg, 2,0 mmol) rastvorena je u dioksanu (10 mL) i H2O (2 mL). Smeša je mešana na sobnoj temperaturi tokom 3 h. Rastvor je razblažen vodom (200 mL) i ekstrahovan sa DCM (50 mL). Organska faza je isprana vodom (20 mL × 2) i slanim rastvorom (10 mL), osušena (Na2SO4), filtriran i koncentrovan da bi se dobila sirova 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanska kiselina (385 mg) kao bezbojno ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 307.9 [M+Na]<+>.
Korak 2: 2,5-dioksopirolidin-1-il 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanoat:
Smeša 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline (385 mg, 1,35 mmol), 1-hidroksipirolidin-2,5-diona (197 mg, 1,71 mmol), DCC (353 mg, 1,71 mmol) rastvoreno je u DCM (15 mL). Smeša je mešana na sobnoj temperaturi tokom 17 h. Filtrirana je i filtrat je ispran slanim rastvorom (20 mL), osušen (Na2SO4), filtriran i koncentrovan da bi se dobio sirov 2,5-dioksopirolidin-1-il 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanoat (400 mg) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 282.9 [M-100]<+>.
Korak 3: terc-butil 1-cijanamido-5,5,5-trifluor-4-metil-1-oksopentan-2-ilkarbamat:
Smeša 2,5-dioksopirolidin-1-il 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanoata (300 mg, 0,78 mmol), cijanamida (66 mg, 1,57 mmol), NaOH (156 mg, 3,9 mmol) rastvorena je u THF (16 mL). Smeša je mešana na 0°C tokom 0,5 h i na sobnoj temperaturi tokom 17 h. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio terc-butil 1-cijanamido-5,5,5-trifluor-4-metil-1-oksopentan-2-ilkarbamat (45 mg, 0,14 mmol) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 310.3 [M+H]<+>.
Korak 4: 2-amino-N-cijano-5,5,5-trifluor-4-metilpentanamid hidrohlorid [I-205]:
Rastvoru terc-butil 1-cijanamido-5,5,5-trifluor-4-metil-1-oksopentan-2-ilkarbamata (45 mg, 0,14 mmol) u Et2O (20 mL) je dodat 4 M HCl/dioksan (10 mL) i mešan je 24 h na sobnoj temperaturi. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C18 21<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobio 2-amino-N-cijano-5,5,5-trifluor-4-metilpentanamid hidrohlorid [I-205] (12,3 mg, 0,05 mmol, 27%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 210,1 [M+H]<+>.1H NMR (500 MHz, CD3OD) 84.06-4.09 (m, 1H), 2.43-2.65 (m, 1H), 1.67-1.85 (m, 2H), 1.18-1.22 (m, 3H).
Primer 206: 2-amino-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina [I-206] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: N-metoksi-N,1-dimetilciklobutankarboksamid:
U rastvor 1-metilciklobutankarboksilne kiseline (11,6 g, 0,1 mol), N, O-dimetilhidroksilamin hidrohlorid (19,5 g, 0,2 mol) i HATU (42 g, 0,11 mol) u DMF (300 mL) je dodat TEA (30,3 g, 0,3 mol) i rastvor je mešan 17 h na sobnoj temperaturi. Rastvor je razblažen vodom (600 mL) i ekstrahovan sa EtOAc (400 mL x 2). Organska faza je isprana sa 1 N HCl, zas. NaHCO3i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobio N-metoksi-N,1-dimetilciklobutankarboksamid (12,2 g, 0,07 mol, 75%) kao bezbojno ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 158.2 [M+H]<+>.
Korak 2: 1-metilciklobutankarbaldehid:
Rastvoru N-metoksi-N,1-dimetilciklobutankarboksamida (2,0 g, 12,7 mmol) u suvom THF (20 mL) je dodat 1 M LiAlH4(19 mL, 19 mmol) kap po kap na 0°C pod N2. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana 2 sata. Rastvor je ugašen sa zas. Rošelovom solju polako i ekstrahovan sa Et2O (100 mL), organska faza je isprana vodom (100 mL x 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i korišćena za sledeći korak.
Korak 3: (Z)-tert-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)akrilat:
U rastvor Vitigovog reagensa (2,15 g, 5,86 mmol) u suvom THF (80 mL) je dodat t-BuONa (844 mg, 8,79 mmol) na 0 °C i mešan 1 h. Zatim je dodat rastvor 1-metilciklobutankarbaldehida i mešan na sobnoj temperaturi tokom 17 sati. Rastvor je ekstrahovan sa EtOAc (100 mL x 2). Organska faza je isprana slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu. Sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/30) da bi se dobio (Z)-terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)akrilat (700 mg, 2,2 mmol) kao bezbojno ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 200.2 [M-56<∗>2]<+>.
4. korak: terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)propanoat:
Smeša (Z)-terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)akrilata (700 mg, 2,2 mmol) i Pd/C (10%, 100 mg) u MeOH (100 mL) je mešana na 30°C tokom 17 sati. Smeša je filtrirana, a filtrat je koncentrovan do suva da bi se dobio terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)propanoat (600 mg, sirov) kao bezbojno ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 158.2 [M-156]<+>.
Korak 5: 2-amino-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina [I-206]:
Rastvoru terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)propanoata (600 mg, sirov) u Et2O (20 mL) je dodato 4 M HCl/dioksana (10 mL) i mešan je tokom 17 h na sobnoj temperaturi. Rastvor je koncentrovan da bi se dobila 2-amino-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina. MS (EI<+>, m/z): 158.0 [M+H]<+>.
<1>H NMR (500 MHz, D2O) δ 3.91 (t, J = 7,5 Hz, IH), 2.06-2.02 (m, IH), 1.88-1.64 (m, 7H), 1.15 (s, 3H).
Primeri 93: S-2-amino-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina [I-93] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
[0325]
Procedure i karakterizacija:
Postupak za 2-amino-3-(1-metilciklobutil)propansku kiselinu bio je isti kao u primeru 8
Korak 6: 2-(benziloksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina:
Smeša 2-amino-3-(1-metilciklobutil)propanske kiseline (300 mg, sirova), CbzOSu (714 mg, 2,8 mmol) u acetonu (10 mL) i zas. NaHCO3(3 mL) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 5 h. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C18 21<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobila 2-(benziloksikarbonilamino)-3-(1metilciklobutil)propanska kiselina (160 mg, 0,54 mmol) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 292.0 [M+H]<+>.
Korak 7: (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina:
2-(benziloksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina (160 mg, 0,54 mmol) je prečišćena hiralnom HPLC da bi se dobila (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina (50 mg, 0,17 mmol) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 292.0 [M+H]<+>.
Korak 8: (S)-2-amino-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina [I-93]:
Smeša (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina (50 mg, 0,17 mmol) i Pd/C (10%, 10 mg) u MeOH (10 mL) je mešana na sobnoj temperaturi 1 h. Rastvor je prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da se dobije (S)-2-amino-3-(1-metilciklobutil)propanska kiselina [I-93] (2 mg, 0,01 mmol) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 292.0 [M+H]<+>.1H NMR (500 MHz, D2O) δ 3.76-3.79 (t, 1H), 1.96-2.00 (m, 1H), 1.61-1.86 (m, 7H), 1.11 (s, 3H).
Primer 204: hidrohlorid 2-amino-3-(trimetilsilil)propanske kiseline [I-204] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-3-(trimetilsilil)propanoat:
Rastvor terc-butil 2-(difenilmetilenamino)acetata (2,5 g, 8,47 mmol) u THF (20 mL) je ohlađen na -78°C, zatim je dodat LiHMDS (8,47 mL, 8,47 mmol) u kapima pod N2. Rastvor je mešan na -78°C tokom 1 h. (jodmetil)trimetilsilan (1,8 g, 8,47 mmol) je dodat u kapima. Rastvor je mešan na -78°C ~ sobnoj temperaturi preko noći. Rastvor je ispran slanim rastvorom (25 mL<∗>2), osušen (Na2SO4), koncentrovan i prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/30) da bi se dobio terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-3-(trimetilsilil)propanoat (2,3 g, 6,04 mmol, 71%) kao žuta čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 382.3 [M+H]<+>.
Korak 2: hidrohlorid 2-amino-3-(trimetilsilil)propanske kiseline [I-204]:
Rastvor terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-3-(trimetilsilil)propanoata (500 mg, 1,31 mmol) u 4 M HCl/dioksanu (6 mL) je mešan 17 h na sobnoj temperaturi. Dodat je DCM (80 mL). Čvrsta supstanca je filtrirana da bi se dobio hidrohlorid 2-amino-3-(trimetilsilil)propanske kiseline [I-204] kao bela čvrsta supstanca (113 mg, 0,57 mmol, 44 %). ESI-MS (EI+, m/z): 162.2 [M+H]<+>.
<1>H NMR (500 MHz, CD3OD) δ 13.78 (br, 1H), 8.33 (br, 1H), 3.75 (m, 1H), 1.00-1.14 (m, 2H), 0.06 (s, 9H).
Primer 201: hidrohlorid (S)-2-amino-3-(trimetilsilil)propanske kiseline [I-201] (uporedno jedinjenje).
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: hidrohlorid (S)-2-amino-3-(trimetilsilil)propanske kiseline [I-201]:
Rastvor (S)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-3-(trimetilsilil)propanoata (300 mg, 0,79 mmol) u 4 M HCl/dioksanu (3 mL) je mešan 17 h na sobnoj temperaturi. Dodat je DCM (40 mL). Čvrsta supstanca je filtrirana da bi se dobio hidrohlorid (S)-2-amino-3-(trimetilsilil)propanske kiseline [I-201] kao bela čvrsta supstanca (92 mg, 0,47 mmol, 62 %). ESI-MS (EI+, m/z): 162.2 [M+H]<+>.
1H NMR (500 MHz, CD3OD) δ 13.76 (br, 1H), 8.38 (br, 1H), 3.76 (m, 1H), 1.02-1.16 (m, 2H), 0.06 (s, 9H).
Primer 200: hidrohlorid (R)-2-amino-3-(trimetilsilil)propanske kiseline [I-200] (uporedno jedinjenje).
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: hidrohlorid (R)-2-amino-3-(trimetilsilil)propanske kiseline [I-200]:
Rastvor (R)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-3-(trimetilsilil)propanoata (300 mg, 0,79 mmol) u 4 M HCl/dioksanu (3 mL) je mešan 17 h na sobnoj temperaturi. Dodat je DCM (40 mL). Čvrsta supstanca je filtrirana da bi se dobio hidrohlorid (R)-2-amino-3-(trimetilsilil)propanske kiseline [1-200] kao bela čvrsta supstanca (80 mg, 0,41 mmol, 52 %). ESI-MS (EI+, m/z): 162.2 [M+H]<+>.
1H NMR (500 MHz, CD3OD) δ 13.77 (br, 1H), 8.33 (br, 1H), 3.76 (m, 1H), 1.02-1.14 (m, 2H), 0.06 (s, 9H).
Primer 194: (S)-2-amino-4-fluor-4-metilpentanska kiselina [1-194] (uporedno jedinjenje).
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-2-amino-4-fluor-4-metilpentanska kiselina [I-194]:
Smeša (S)-etil 2-amino-4-fluor-4-metilpentanoat hidrohlorida (65 mg, 0,31 mmol), LiOH.H2O (29 mg, 0,69 mmol) u H2O (2 mL) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 2,5 h. Zatim je dodat IN HCl da se podesi pH=3. Smeša je prečišćena direktno pomoću reverzne HPLC (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobila (S)-2-amino-4-fluor-4-metilpentanska kiselina [I-194] (40 mg, 0,27 mmol, 87 %) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 150.3 [M+H]<+>.1H NMR (500 MHz, CD3OD) δ 8.10 (br, 2H), 3.79 (m, 1H), 2.19-2.26 (m, 1H), 1.97-2.05 (m, 1H), 1.42 (d, Jz=3.5 Hz, 3H), 1.37 (d, Jz=4.0 Hz, 3H).
Primer 94: (S)-3,3-dimetil-1-(2H-tetrazol-5-il)butan-1-amin [1-94] (uporedno jedinjenje).
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-terc-butil 1-cijano-3,3-dimetilbutilkarbamat:
U rastvor (S)-terc-butil 1-amino-4,4-dimetil-1-oksopentan-2-ilkarbamata (500 mg, 2,1 mmol) u DMF (10 mL) dodat je cijanurinski hlorid (450 mg, 2,5 mmol) i mešan je na sobnoj temperaturi tokom 2 h. Zatim je smeša razblažena slanim rastvorom (100 mL), ekstrahovana etil acetatom (50 mL), osušena (Na2SO4) i koncentrovana da bi se dobio sirovi (S)-terc-butil 1-cijano-3,3-dimetilbutilkarbamat (500 mg) kao žuti dop rastvor. ESI-MS (EI+, m/z): 249.2 [M+Na]<+>.
Korak 2: (S)-terc-butil 3,3-dimetil-1-(2H-tetrazol-5-il)butilkarbamat:
Smeša (S)-terc-butil 1-cijano-3,3-dimetilbutilkarbamata (sirov 500 mg), ZnBr2(900 mg, 4,0 mmol), NaN3(260 mg, 4,0 mmol) u DMF (20 mL) je mešano tokom 17 h na 100°C. Smeša je zatim razblažena slanim rastvorom (200 mL), ekstrahovana etil acetatom (60 mL), osušena (Na2SO4) i koncentrovana da bi se dobio sirovi (S)-terc-butil 3,3-dimetil-1-(2H-tetrazol-5-il)butilkarbamat (400 mg) kao žuti dop rastvor. ESI-MS (EI+, m/z): 214.3 [M+H-56]<+>.
Korak 3: ((S)-3,3-dimetil-1-(2H-tetrazol-5-il)butan-1-amin [I-94]:
Rastvor (S)-terc-butil 3,3-dimetil-1-(2H-tetrazol-5-il)butilkarbamata (sirovog 300 mg) u 4 M HCl/dioksanu (3,5 mL) je mešan 17 h na sobnoj temperaturi. Zatim je rastvor koncentrovan i prečišćen direktno pomoću HPLC reverzne faze (Boston C1821<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobila so (S)-3,3-dimetil-1-(2H-tetrazol-5-il)butan-1-amin 2,2,2-trifluorosirćetne kiseline [1-94] (30 mg, 0,11 mmol, 9 % za 3 koraka) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 170.2 [M+H]<+>. 1H NMR (500 MHz, CD3OD) δ 8.18 (br, 3H), 4.48 (m, 1H), 2.14 (m, 1H), 1.73 (dd, Jz=3.5, 16.5 Hz 1H), 0.72 (s, 9H).
Primer 175: Sinteza 2-amino-5,5,5-trifluor-4-metoksipentanske kiseline [I-175] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-benzil 4-metil-2-(fenilmetilsulfonamido)pentanoat:
U rastvor 3-(benziloksi) propan-1-ola (10,0 g, 60,24 mmol) u DMSO (100 mL) je dodat IBX (20,2 g, 72,29 mmol) u ledenom kupatilu. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana na ovoj temperaturi 17 sati. Reakciona smeša je sipana u vodu (300 mL) i ekstrahovana sa EA (200 mL x 2), organska faza je isprana vodom (200 mL × 3) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), i rastvor je koncentrovan i sirovi proizvod je prečišćen pomoću SGC da bi se dobila svetlo žuta tečnost (8,0 g, 81%).
<1>H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 9.77 (s, 1H), 7.36-7.26 (m, 5H), 4.53 (s, 2 H), 3.8-3.83 (m, 2H), 2.71-2.68 (m, 2H).
Korak 2: (4-(benziloksi)-1,1,1-trifluorbutan-2-iloksi)trimetilsilan:
U rastvor 3-(benziloksi)propanala (4,0 g, 24,4 mmol) u THF (50 mL) dodat je trimetil(trifluormetil)silan (10,4 g, 73,2 mmol) na sobnoj temperaturi, nakon čega je dodat CsF (0,37 g, 2,44 mmol). Dobijeni rastvor je mešan na sobnoj temperaturi 2 sata. Zatim je ugašen vodom (100 ml) i ekstrahovan sa EA (100 ml × 2), organska faza je isprana vodom (100 ml × 2) i slanim rastvorom (100 ml), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana. Sirovi materijal je prečišćen pomoću ISCO biotaža da bi se dobio (4-(benziloksi)-1,1,1-trifluorbutan-2-iloksi)trimetilsilan kao bezbojna tečnost. (4,5 g, 60%)
1H NMR (500 MHz, CDC13) δ 7.38-7.29 (m, 5H), 4.51 (t, J= 12 Hz, 2 H), 4.23-4.19 (m, 1H), 3.59-3.57 (m, 2H), 2.04-2.01 (m, 1H), 1.78-1.73 (m, 1H), 0.13 (s, 9H).
Korak 3: 4-(benziloksi)-1,1,1-trifluorbutan-2-ol:
Rastvor 4-(benziloksi)-1,1,1-trifluorbutan-2-ola (4,5 g, 14,7 mmol) u rastvoru HCl (3 M u MeOH, 50 ml) je mešan na sobnoj temperaturi 2 sata. Zatim je koncentrovan i prečišćen pomoću ISCO biotaža da bi se dobio 4-(benziloksi)-1,1,1-trifluorbutan-2-ol (2,75 g, 80%) kao bezbojna tečnost.
Korak 4: ((4,4,4-trifluor-3-metoksibutoksi)metil)benzen:
U rastvor 4-(benziloksi)-1,1,1-trifluorbutan-2-ola (2,75 g, 11,75 mmol) u THF (100 ml) dodat je t-BuOK (1,58 g, 14,1 mmol) na 0 °C i mešan je na ovoj temperaturi 30 min. Zatim je dodat Mel (2,17 g, 15,28 mmol) i mešan na sobnoj temperaturi još 1 sat. Reakcija je ugašena vodom (100 ml) i ekstrahovana sa EA (100 ml × 2), organska faza je isprana vodom (100 ml × 2) i slanim rastvorom (100 ml), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana. Sirovi proizvod je prečišćen pomoću ISCO biotaža da bi se dobio ((4,4,4-trifluor-3-metoksibutoksi)metil) benzen (2,04 g, 70%) kao bezbojna tečnost.
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.38-7.29 (m, 5H), 4.53 (t, J= 12 Hz, 2 H), 3.78-3.74 (m, 1H), 3.66-3.57 (m, 2H), 3.5 (s, 3H), 2.03-1.96 (m, 1H), 1.78-1.57 (m, 1H).
Korak 5: 4, 4, 4-trifluor-3-metoksibutan-1-ol:
Rastvor ((4,4,4-trifluor-3-metoksibutoksi)metil)benzena (2,04 g, 8,23 mmol) i Pd/C (0,5 g) u MeOH (30 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 2 sata, zatim filtriran i koncentrovan da bi se dobio 4,4,4-trifluor-3-metoksibutan-1-ol kao bezbojna tečnost. Ovaj sirovi proizvod je bio direktno sledeći korak.
Korak 6: 4, 4, 4-trifluor-3-metoksibutanal:
U rastvor 4,4,4-trifluor-3-metoksibutan-1-ola (1,3 g sirovog iz poslednjeg koraka) u DMSO (20 mL) je dodat IBX (2,76 g, 9,88 mmol) u ledenom kupatilu. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana na ovoj temperaturi 17 sati. Reakciona smeša je sipana u vodu (80 mL) i ekstrahovana sa Et2O (80 mL × 2), organska faza je isprana vodom (80 mL × 3) i slanim rastvorom (80 mL), a rastvor je korišćen direktno u sledećem koraku.
Korak 7: 2-(benzilamino)-5, 5, 5-trifluor-4-metoksipentannitril:
U gornji rastvor 4,4,4-trifluor-3-metoksibutanala u Et2O (160 mL) je dodat benzilamin (2 mL), AcOH (2,0 mL) i zatim TMSCN (3 mL) sa ledenim kupatilom. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana na ovoj temperaturi 17 sati. Rastvor je razblažen vodom (200 mL) i ekstrahovan sa EA (100 mL), organska faza je isprana vodom (100 mL × 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobio 2-(benzilamino)5,5,5-trifluor-4-metoksipentannitril (2,0 g, sirovo) kao smeđe gusto ulje koje je korišćeno za sledeći korak. ESI-MS (EI<+>, m/z):
Korak 8: 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-metoksipentanska kiselina:
Rastvor 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-metoksipentannitrila (2,0 g, sirov) u konc. HCl (30 mL) i AcOH (10 mL) su zagrevani na 100 °C tokom 17 sati. Rastvor je koncentrovan do suva, razblažen sa H2O (100 mL) i ACN (50 mL), podešen je pH na 3-4 sa zas. NaHCO3rastvorom, smeša je filtrirana i osušena da bi se dobila 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-metoksipentanska kiselina (0,8 g, 35% za 4 koraka) kao braon čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): [M+H]<+>.
Korak 9: 2-amino-5,5,5-trifluor-4-metoksipentanska kiselina [I-175]:
Rastvor 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-metoksipentanske kiseline (300 mg, 1,03 mmol) i HCOONH4(650 mg, 10,3 mmol) u MeOH (10 ml) je mešan na 60 °C tokom 2 sata, zatim filtriran i koncentrovan. Sirovi materijal je prečišćen biotažom reverzne faze da bi se dobila 2-amino-5,5,5-trifluor-4-metoksipentanska kiselina [I-175] kao bela čvrsta supstanca.
1H NMR (500 MHz, metanol-d4) 4.23-4.19 (m, 1H), 3.96-3.88 (m, 1H), 3.64-3.6 (m, 3H), 2.29-2.22 (m, 1H), 2.04-1.97 (m, 1H).
Primer 176: 2-amino-4,4,5-trimetilheksanska kiselina [I-176] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: dietil 2-(2,3-dimetilbutan-2-il)malonat:
Rastvor dietil 2-(propan-2-iliden)malonata (2 g, 10,0 mmol) u THF (60 mL) je ohlađen na 0 °C, a zatim je dodat bakar(I) jodid (2,9 g, 15,0 mmol). Smeša je mešana na 0 °C tokom 0,5 h. Zatim je izopropilmagnezijum bromid (1 mol/L, 30,0 mL, 30,0 mmol) dodat u kapima u gornju smešu na 0 °C. Smeša je mešana na 0 °C tokom 2 h. Smeša je ugašena sa HCl (1 mol/L), ekstrahovana sa EtOAc (60 mL<∗>2). Organska faza je odvojena, isprana vodom (100 mL × 2) i slanim rastvorom (130 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobio dietil 2-(2,3-dimetilbutan-2-il)malonat (2,4 g, 10,0 mmol, 98%) kao žuta čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 245.3 [M+H]<+>.
Korak 2: 2-(2,3-dimetilbutan-2-il)malonska kiselina:
Smeša dietil 2-(2,3-dimetilbutan-2-il)malonat acetamida (2,4 g, 10,0 mmol) i hidrata litijum hidroksida (2,1 g, 50,0 mmol) u DMSO (50 mL) i vode (10 mL) je zagrevana na 98 °C i držana 20 h. Smeša je ohlađena, zakiseljena sa HCl (1 mol/L) i podeljena između EtOAc (30 mL) i vode (30 mL). Organska faza je odvojena, isprana vodom (50 mL × 2) i slanim rastvorom (50 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobila 2-(2,3-dimetilbutan-2-il)malonska kiselina (1,8 g, 10,0 mmol, 95%) kao žuto ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 212.2 [M+H]<+>.
Korak 3: 3, 3, 4-trimetilpentanska kiselina:
Rastvor 2-(2, 3-dimetilbutan-2-il)malonske kiseline (1,8 g, 10,0 mmol) u DMSO (30 mL) je zagrejan na 120 °C i držan 12 sati. Smeša je ohlađena i podeljena između EtOAc (50 mL) i vode (60 mL). Organska faza je odvojena, isprana vodom (60 mL × 2) i slanim rastvorom (60 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobila 3,3,4-trimetilpentanska kiselina (1,4 g, 10,0 mmol, 95 %) kao žuto ulje. ESI-MS (EI-, m/z): 143.2 [M-H]<+>.
Korak 4: N-metoksi-N, 3, 3, 4-tetrametilpentanamid:
U rastvor 3,3,4-trimetilpentanske kiseline (1,4 g, 10,0 mmol) u 30 mL DMF dodat je N, O-dimetilhidroksilamin hidrohlorid (1,2 g, 12,0 mmol) na 20 °C, a zatim DIEA (3,8 g, 30,0 mmol). Zatim je dodat HATU (5,8 g, 15,0 mmol). Smeša je zagrejana na 25 °C uz mešanje i držana 18 h. Reakciona smeša je ugašena vodom, a zatim metil terc-butil etrom (50 mL<∗>2). Odvajanjem faza, organski sloj je ispran slanim rastvorom (80 mL<∗>3), osušen preko Na2SO4, filtriran i koncentrovan u vakuumu da bi se dobio N-metoksi-N,3,3,4-tetrametilpentanamid (1,5 g, 90 %) kao smeđe ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 188.2 [M+H]<+>.
Korak 4: 3, 3, 4-trimetilpentanal:
U rastvor N-metoksi-N, 3, 3, 4-tetrametilpentanamida (1,9 g, 0,01 mol) u 30 mL THF dodat je LiAlH4(1 g, 0,03 mol) na 0 °C. Smeša je mešana na 0 °C tokom 1 h. Reakciona smeša je ugašena vodom, a zatim metil terc-butil etrom (50 mL<∗>2). Odvajanjem faza, organski sloj je ispran slanim rastvorom (80 mL<∗>3), osušen preko Na2SO4i filtriran. Filtrat je sadržao 3,3,4-trimetilpentanal (1,3 g, 95%) kao bezbojni rastvor, koji je direktno korišćen u sledećem koraku.
Korak 5: 2-(benzilamino)-4,4,5-trimetilheksannitril:
U gornji rastvor 3,3,4-trimetilpentanala u metil terc-butil etru (120 mL) dodat je benzilamin (1,6 mL), AcOH (1,0 mL) i zatim TMSCN (1,8 mL) sa ledenim kupatilom. Smeša je zagrejana na 25 °C i mešana preko noći. Rastvor je razblažen vodom (60 mL) i ekstrahovan sa EtOAc (30 mL), organska faza je isprana vodom (50 mL × 2) i slanim rastvorom (50 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobio 2-(benzilamino)-4,4,5-trimetilheksannitril (2 g, sirovo) kao smeđe ulje koje je korišćeno za sledeći korak. ESI-MS (EI+, m/z): 245.4 [M+H]<+>.
Korak 6: 2-(benzilamino)-4,4,5-trimetilheksanska kiselina:
Rastvor 2-(benzilamino)-4,4,5-trimetilheksannitrila (2 g, sirov) u konc. HCl (60 mL) i AcOH (10 mL) je zagrevan na 95 °C tokom 18 sati. Rastvor je ohlađen na 15 °C, pH je podešen na 3-4 sa zas. NaHCO3rastvorom, smeša je filtrirana i osušena da bi se dobila 2-(benzilamino)-4,4, 5-trimetilheksanska kiselina (0,6 g, 2,3 mmol, 30% za 3 koraka) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 264.4 [M+H]<+>.
2-amino-4,4,5-trimetilheksanska kiselina [1-176]:
U rastvor 2-(benzilamino)-4,4,5-trimetilheksanske kiseline (78 mg, 0,3 mmol) u 8 mL MeOH dodat je HCOONH4(0,13 g, 2,0 mmol) i Pd/C (30 mg) na sobnoj temperaturi. Smeša je mešana na 60 °C tokom 2 h. Reakciona smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobio sirov proizvod koji je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila 2-amino-6,6,6-trifluor-4-metilheksanska kiselina [I-176] (40 mg, 90 %) kao bela čvrsta supstanca; ESI-MS (EI<+>, m/z): 174.3 [M+H]<+>; 1H NMR (500 MHz, MeOD) δ 3.56 (dd, J = 7.2, 4.9 Hz, 1H), 2.12 (dd, J = 14.7, 4.9 Hz, 1H), 1.66 - 1.51 (m, 2H), 0.97 (d, J = 14.9 Hz, 6H), 0.92 (dd, J = 6.8, 3.6 Hz, 6H).
Primer 178: 2-amino-4,4-dimetilheptanska kiselina [1-178] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Postupak je bio isti kao u primeru 176.
2-amino-4,4-dimetilheptanska kiselina [I-178]:<1>H NMR (500 MHz, MeOD-d4) δ 3.77 (t, J = 6 Hz, 1H), 2.09-2.05 (m, 1H), 1.6-1.56 (m, 1H), 1.37-1.26 (m, 4H), 1.01-0.92 (m, 9 H).
Primer 195: 2-amino-4,4-dimetilheksanska kiselina [I-195] (uporedno jedinjenje), (S)-2-amino-4,4-dimetilheksanska kiselina [I-120] (uporedno jedinjenje), (R)-2-amino-4,4-dimetilheksanska kiselina [I-191] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Postupak je bio isti kao u primeru 176.
2-amino-4,4-dimetilheptanska kiselina [1-195]:<1>H NMR (500 MHz, D2O) δ 3.87 (t, J= 6.0 Hz, 1H), 1.93 (dd, J= 15.0 Hz, J= 5.5 Hz, 1H), 1.57 (dd, J= 15.0 Hz, J= 6.5 Hz, 1H), 1.22-1.26 (m, 2H), 0.86 (d, (dd, J= 2.0 Hz, 6H), 0.76 (t, J= 7.5 Hz, 3H).
(S)-2-amino-4,4-dimetilheksanska kiselina [I-120]:<1>H NMR (500 MHz, MeOD-d4) δ 3.43 (dd, J = 7.0 Hz, J = 5.0 Hz, 1H), 1.95 (dd, J = 15.0 Hz, J = 5.0 Hz, 1H), 1.42 (dd, J = 15.0 Hz, J= 7.0 Hz, 1H), 1.23-1.28 (m, 2H), 0.87 (d, (dd, J= 4.5 Hz, 6H), 0.80 (t, J= 7.5 Hz, 3H).
(R)-2-amino-4,4-dimetilheksanska kiselina [I-191]:<1>H NMR (500 MHz, MeOD-d4) δ 3.43 (dd, J = 7.0 Hz, J = 5.0 Hz, 1H), 1.95 (dd, J = 15.0 Hz, J = 5.0 Hz, 1H), 1.42 (dd, J = 15.0 Hz, J= 7.0 Hz, 1H), 1.23-1.28 (m, 2H), 0.87 (d, (dd, J= 4.5 Hz, 6H), 0.80 (t, J= 7.5 Hz, 3H).
Primer 177: 2-amino-6,6,6-trifluor-4-metilheksanska kiselina [1-177] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: N-metoksi-N-metil-2-(trifenil-15-fosfaniliden)acetamid:
Smeša (2-hlor-N-metoksi-N-metilacetamida (13,7 g, 0,1 mol) i trifenilfosfana (26,2 g, 0,1 mol) u acetonitrilu (200 mL) je zagrejana do 80 °C i držana tokom 20 h. Smeša je ohlađena i koncentrovana da bi se rastvarač uklonio ispod 40 °C. Ostatak je rastvoren u dihlormetanu (200 mL), a zatim u 2 N KOH (100 mL). Dobijena smeša je mešana na 20 °C tokom 1 h. Odvajanje faza, organski sloj je ispran slanim rastvorom (200 mL<∗>3), osušen preko Na2SO4i filtriran. Filtrat je koncentrovan u vakuumu da bi se dobio N-metoksi-N-metil-2-(trifenil-15-fosfaniliden) acetamid (36 g, 0,1 mol, 98%) kao žuta čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 364.4 [M+H]<+>.
Korak 2: (E)-5,5,5-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilpent-2-enamid:
Smeša N-metoksi-N-metil-2-(trifenil-15-fosfaniliden) acetamida (36,3 g, 0,1 mol) i 4,4,4-trifluorbutan-2-ona (25,2 g, 0,2 mol) u tetrahidrofuranu (500 mL) je zagrejano na 70 ° C i držano 7 dana. Smeša je ohlađena i koncentrovana da bi se uklonio rastvarač ispod 40 °C u vakuumu. Ostatak je prečišćen kolonom silika gela (200 g, 200 ~ 300 mesh, UV 254 nm) eluiranjem etil acetatom u petrolej etru od 0 do 35 % da bi se dobio (E)-5,5,5-trifluor-N-metoksi -N,3-dimetilpent-2-enamid (6 g, 0,03 mol, 28%) kao žuto ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 212.2 [M+H]<+>.
Korak 3: 5, 5, 5-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilpentanamid:
Smeša (E)-5,5,5-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilpent-2-enamida (6 g, 0,03 mol) i Pd/C (10 %, 400 mg) u THF (100 mL) je mešana na 30 °C tokom 18 sati. Smeša je filtrirana, a filtrat je koncentrovan u vakuumu do suva da bi se dobio 5,5,5-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilpentanamid (6 g, 0,03 mol, 98 %) kao žuto ulje. ESI-MS (EI+, m/z): 214.2 [M+H]<+>.
Korak 4: 5, 5, 5-trifluor-3-metilpentanal:
U rastvor 5,5,5-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilpentanamida (6 g, 0,03 mol) u 100 mL THF dodat je LiAlH4(1 g, 0,03 mol) na 0 °C. Smeša je mešana na 0 °C tokom 1 h. Reakciona smeša je ugašena vodom, a zatim metil terc-butil etrom (60 mL<∗>2). Odvajanjem faza, organski sloj je ispran slanim rastvorom (80 mL<∗>3), osušen preko Na2SO4i filtriran. Filtrat je zadržan da bi se dobio 5,5,5-trifluor-3-metilpentanal (4,5 g, 95%) kao bezbojni rastvor, koji je direktno korišćen u sledećem koraku.
Korak 5: 2-(benzilamino)-6,6,6-trifluor-4-metilheksannitril:
U gornji rastvor 5,5,5-trifluor-3-metilpentanala u metil terc-butil etru (200 mL) dodat je benzilamin (5 mL), AcOH (4,0 mL), a zatim TMSCN (5 mL) sa ledenim kupatilom. Smeša je zagrejana na 20 °C i mešana preko noći. Rastvor je razblažen vodom (100 mL) i ekstrahovan sa EtOAc (100 mL), organska faza je isprana vodom (100 mL × 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobio 2-(benzilamino)-6,6,6-trifluor-4-metilheksannitril (6 g, sirovo) kao smeđe ulje koje je korišćeno za sledeći korak. ESI-MS (EI+, m/z): 271.3 [M+H]<+>.
Korak 6: 2-(benzilamino)-6,6,6-trifluor-4-metilheksanska kiselina:
Rastvor 2-(benzilamino)-6,6,6-trifluor-4-metilheksanitrila (3 g, sirov) u konc. HCl (100 mL) i AcOH (20 mL) je zagrevan na 100 °C tokom 17 sati. Rastvor je ohlađen na 15 °C, pH je podešen na 3-4 sa zas. NaHCO3rastvorom, smeša je filtrirana i osušena da bi se dobila 2-(benzilamino)-6,6,6-trifluor-4-metilheksanska kiselina (1 g, 13,4 mmol, 33% za 3 koraka) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 290.3 [M+H]<+>.
2-amino-6,6,6-trifluor-4-metilheksanska kiselina [I-177]:
U rastvor 2-(benzilamino)-6,6,6-trifluor-4-metilheksanske kiseline (88 mg, 0,31 mmol) u 8 mL MeOH dodat je HCOONH4(0,13 g, 2,0 mmol) i Pd/C (30 mg) na sobnoj temperaturi. Smeša je mešana na 60 °C tokom 2 h. Reakciona smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobio sirov proizvod koji je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila 2-amino-6,6,6-trifluor-4-metilheksanska kiselina [I-177] (45 mg, 84 %) kao bela čvrsta supstanca; ESI-MS (EI<+>, m/z): 200.2 [M+H]<+>; 1H NMR (500 MHz, DMSO) δ 3.15 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 2.39 - 2.24 (m, 1H), 2.19 - 1.96 (m, 2H), 1.82 - 1.66 (m, 1H), 1.63 - 1.35 (m, 1H), 0.98 (dd, J = 16.5, 6.2 Hz, 3H).
Primer 179: (S)-2-amino-5-fluor-4-(fluormetil)pentanska kiselina [I-179] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 5-(benziloksimetil)-2,2-dimetil-1,3-dioksan:
U rastvor (2,2-dimetil-1,3-dioksan-5-il)metanola (0,29 g, 2,0 mmol) u DMF (10 mL) dodat je NaH (60% u ulju, 0,12 g, 3,0 mmol) na 0 °C. Smeša je mešana na 0 °C tokom 0,2 sata. Zatim je dodat (bromometil) benzen (0,45 g, 2,6 mmol). Smeša je zagrejana na 10 °C tokom 3 h i držana 18 h. Reakciona smeša je ugašena sa ledenom vodom, a zatim sa EtOAc (60 mL). Odvajanjem faza, organski sloj je ispran slanim rastvorom (60 mL<∗>3), osušen preko Na2SO4i filtriran. Filtrat je koncentrovan i ostatak je prečišćen kolonom silika gela (20 g, UV 254 nm eluiranjem sa EtOAc u PE od 10% do 50%) da bi se dobio 5-(benziloksimetil)-2,2-dimetil-1,3- dioksan (1), (0,46 g, 0,2 mol, 95 %) kao bezbojno ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 237.3 [M+H]<+>.
Korak 2: 2-(benziloksimetil)propan-1,3-diol:
U rastvor 5-(benziloksimetil)-2,2-dimetil-1,3-dioksana (930 mg, 3,94 mmol) u MeOH (20 mL) dodat je 3N vodeni rastvor HCl (2 mL). Smeša je mešana na 50 °C tokom 2 sata. Reakciona smeša je koncentrovana i razblažena sa DCM (20 mL), isprana slanim rastvorom (15 mL), osušena i uparena da bi se dobilo sirovo bezbojno ulje (780 mg, 100%). ESI-MS (EI<+>, m/z): 197 [M+H]<+>.
Korak 3: ((3-fluor-2-(fluormetil)propoksi)metil)benzen:
U prethodno ohlađeni rastvor 2-(benziloksimetil)propan-1,3-diola (780 mg, 3,94 mmol) u DCM (20 mL) dodat je DAST (1,9 g, 11,8 mmol) kap po kap na -78 °C. Smeša je mešana na 20°C tokom 24 sata. Reakciona smeša je ugašena zas. NaHCO3vodenim rastvorom (10 mL) na -78 °C. DCM faza je odvojena i isprana slanim rastvorom, osušena sa MgSO4, filtrirana kroz kratku podlogu od silika gela i zatim koncentrovana da bi se dobilo sirovo bezbojno ulje (800 mg, 100%). ESI-MS (EI+, m/z): 223 [M+Na]<+>.<1>H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.37 - 7.28 (m, 5H), 4.65 - 4.57 (m, 2H), 4.55 - 4.48 (m, 4H), 3.57 (d, J = 6.2 Hz, 2H), 2.50 - 2.34 (m, 1H).
Korak 4: 3-fluor-2-(fluormetil)propan-1-ol:
U prethodno ohlađeni rastvor ((3-fluor-2-(fluormetil)propoksi)metil)benzena (800 mg, 3,94 mmol) u DCM (20 mL) dodat je BCl3/toluen (1M, 6 mL, 6,0 mmol) kap po kap na -78 °C. Smeša je mešana na -78~0 °C tokom 2 sata. Reakciona smeša je ugašena pomoću H2O (0,5 mL) na -78 °C. DCM faza je osušena sa MgSO4, filtrirana i rastvor (oko 20 mL) je direktno korišćen za sledeći korak.
Korak 5: 3-fluor-2-(fluormetil)propil trifluormetansulfonat:
U prethodno ohlađeni rastvor 3-fluor-2-(fluormetil)propan-1-ola (8 mL rastvora iz koraka 4, 1,6 mmol) dodat je py (380 mg, 4,8 mmol) zatim Tf2O (1,36 g, 4,8 mmol) kap po kap na -40 °C. Smeša je mešana na -30 °C 1 sat. Reakciona smeša je ugašena slanim rastvorom (20 mL) na -40 °C. DCM faza je odvojena i osušena sa MgSO4, filtrirana i zatim koncentrovana da bi se dobilo sirovo žuto ulje (200 mg, 51%) koje je direktno korišćeno za sledeći korak.
Korak 6: terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-5-fluor-4-(fluormetil)pentanoat:
U prethodno ohlađeni rastvor terc-butil 2-(difenilmetilenamino)acetata (944 mg, 3,2 mmol) u THF (20 mL) je dodat LDA (2,5 M u THF/toluen/heksan, 1,28 mL, 3,2 mmol) na - 78 °C za 25 min. Smeša je mešana na ovoj temperaturi 10 min. U kapima je dodat rastvor 3-fluor-2-(fluormetil)propil trifluormetansulfonata (200 mg, 0,82 mmol) u THF (2 mL) na -78 °C. Reakciona smeša je postavljena neposredno iznad kupatila za hlađenje i mešana još 1 h. Reakciona smeša je ugašena zas. NH4Cl vodenim rastvorom (20 mL), ekstrahovana sa MTBE (30 mL<∗>2), isprana sa H2O, slani rastvor (50 mL svaki), osušena i koncentrovan ada bi se dobila sirova supstanca koja je prečišćena hromatografijom (silika gel, PE do 5% EA/PE) dva puta da bi se dobio željeni proizvod (22 mg, 6,9%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 388 [M+H]<+>.<1>H NMR (500 MHz, DMSO) δ 7.56 - 7.45 (m, 6H), 7.41 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 7.18 (d, J = 6.3 Hz, 2H), 4.50 - 4.17 (m, 4H), 3.91 (dd, J = 7.7, 5.5 Hz, 1H), 2.11 - 1.97 (m, 1H), 1.87 (dd, J = 12.7, 5.5 Hz, 2H), 1.38 (s, 9H).
Korak 7: hidrohlorid (S)-2-amino-5-fluor-4-(fluormetil)pentanske kiseline:
[0393] Rastvor terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-5-fluor-4-(fluormetil)pentanoata (55 mg, 0,14 mmol) u 3N HCl/MeOH (2 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 20 sati. Reakciona smeša je koncentrovana i isprana sa Et2O da bi se dobila sirova čvrsta supstanca koja je rastvorena u DCM/TFA (1:1, 2 mL) i mešana na sobnoj temperaturi 20 sati. Reakciona smeša je uparena i isprana sa Et2O da bi se dobila sirova čvrsta supstanca koja je rastvorena u 6NHCl (1 mL) i mešana na 80 °C tokom 2 h. Reakciona smeša je uparena i liofilizovana da bi se dobio sirovi proizvod koji je prečišćen RP-biotažom koristeći 3mM HCl/H2O da bi se dobio željeni proizvod (8,3 mg, 29%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 168 [M+H]<+>.<1>H NMR (500 MHz, DMSO) δ 7.85 (bs, 3H), 4.48 (dd, J = 48.3, 14.2 Hz, 4H), 3.46 - 3.36 (m, 1H), 2.47 - 2.26 (m, 1H), 1.78 (dt, J = 14.3, 7.3 Hz, 1H), 1.63 - 1.53 (m, 1H).
Primer 187: (S)-3-amino-5,5-dimetil-dihidrofuran-2(3H)-on [1-187] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-3-amino-5,5-dimetil-dihidrofuran-2(3H)-on [I-187]:
U balon sa okruglim dnom koji sadrži (S)-2-amino-4-metilpent-4-ensku kiselinu (100 mg) dodata je konc. HCl (1 mL) i SOCl2(0.2 mL). Smeša je mešana na sobnoj temperaturi 4 sata. Reakciona smeša je koncentrovana i isprana sa Et2O da bi se dobila sirova čvrsta supstanca koja je prečišćena RP-biotažom upotrebom 0,025% TFA/H2O/MeCN da bi se dobio željeni proizvod (20,2 mg, 11,4%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 130.1 [M+H]<+>.<1>H NMR (500 MHz, DMSO) δ 8.80 (bs, 3H), 4.58 (dd, J = 11.2, 9.3 Hz, 1H), 2.53 - 2.48 (m, 1H), 2.13 (t, J= 11.7 Hz, 1H), 1.45 (s, 3H), 1.40 (s, 3H).
Primer 90: Sinteza (S)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanske kiseline [I-90]:
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: Dietil 2-(1,1,1-trifluorpropan-2-iliden)malonat:
TiCl4(65.8 mL, 600 mmol) je dodat u kapima u THF (1 L) sa ledenim kupatilom tokom 20 minuta, CCl4(30 mL) je dodat. U smešu je dodat dietil malonat (48,0 g, 300 mmol) i 1,1-difluorpropan-2-on (56,4 g, 600 mmol). Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana preko noći. Piridin (200 mL) je dodavan u kapima tokom 20 minuta sa ledenim kupatilom. Reakciona smeša je sipana u vodu (2 L), filtrirana, a filtrat je ekstrahovan sa EtOAc (500 mL × 2), organska faza je isprana sa vodom (600 mL), 1 M HCl (600 mL × 2), vodom (600 mL), zas. NaHCO3(600 mL) i rastvorom soli (600 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu i prečišćena hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar od 0% do 5%) da bi se dobio dietil 2(1,1-difluorpropan-2-iliden)malonat (60,9 g, 258 mmol, 86%) kao bezbojna tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 237.0 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, CDCl3): δ 6.97 (t, J = 55.5 Hz, 1H), 4.25-4.33 (m, 4H), 2.03 (s, 3H), 1.29-1.34 (m, 6H).
Korak 2: Dietil 2-(1,1-difluor-2-metilpropan-2-il)malonat:
U smešu dietil 2-(1,1-difluorpropan-2-iliden)malonata (10,0 g, 42,3 mmol) i CuI (12,1 g, 63,5 mmol) u DCM (100 mL) i THF (25 mL) dodat je kap po kap MeMgI (42,3 mL, 130,5 mmol) na -20 °C tokom 1 h. Rastvor je sipan u ledenu vodu (200 mL) i tretiran sa zas. NH4Cl rastvorom (100 mL), smeša je mešana 30 minuta i filtrirana, filtrat je ekstrahovan sa DCM (100 mL), organska faza je isprana vodom (100 mL × 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobio dietil 2-(1,1-difluor-2-metilpropan-2-il)malonat (10,1 g, 40,2 mmol, 95%) kao smeđa tečnost koja je korišćena za sledeći korak. ESI-MS (EI<+>, m/z): 253.1 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, CDCl3): δ 6.05 (t, J = 57.5 Hz, 1H), 4.17-4.23 (m, 4H), 3.49 (s, 1H), 1.22-1.28 (m, 6H) , 1.20 (s, 6H).
Korak 3: 4,4-difluor-3,3-dimetilbuterna kiselina:
Smeša dietil 2-(1,1-difluor-2-metilpropan-2-il)malonata (6,1 g, 24,2 mmol) i LiOH.H2O (5,1 g, 121 mmol) u DMSO (50 mL) i H2O (0,5 mL) je zagrevana na 90 °C tokom 17 sati. Smeša je razblažena vodom (200 mL), ekstrahovana sa DCM (100 mL), pH vodene faze je podešen na 3-4 sa 6 M rastvora HCl, ekstrahovana sa DCM (100 mL × 2), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobila 4,4-difluor-3,3-dimetilbuterna kiselina (3,6 g, sirova) kao smeđa tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 151.1 [M-H]-.
Korak 4: 4,4-difluor-N-metoksi-N,3,3-trimetilbutanamid:
U rastvor 4,4-difluor-3,3-dimetilbuterne kiseline (3,6 g, sirova), N, O-dimetilhidroksilamin hidrohlorida (4,6 g, 47,4 mmol) i HATU (10,8 g, 28,4 mmol) u DMF (50 mL) je dodat Et3N (7,18 g, 71,1 mmol), nakon mešanja na sobnoj temperaturi tokom 17 sati. Smeša je filtrirana, a filtrat je razblažen vodom (200 mL), ekstrahovan sa Et2O (100 mL × 2), ispran vodom (100 mL), 1 M HCl (100 mL) i slanim rastvorom (100 mL), osušen (Na2SO4), filtriran i koncentrovan u vakuumu da bi se dobio 4,4-difluor-N-metoksi-N,3,3-trimetilbutanamid (3,1 g, 15,9 mmol, 66%, 2 koraka) kao smeđa tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 196.0 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, CDCl3): δ 5.95 (t, J = 57.5 Hz, 1H), 3.69 (s, 3H), 3.17 (s, 3H), 2.51 (s, 2H) , 1.12 (s, 6H).
Korak 5: 4,4-difluor-3,3-dimetilbutanal:
U rastvor 4,4-difluor-N-metoksi-N,3,3-trimetilbutanamida (3,1 g, 15,9 mmol) u THF (80 mL) je dodat u kapima LiAlH4(24 mL, 24 mmol) sa ledenim kupatilom. Posle 1 h, smeša je ugašena rastvorom limunske kiseline (100 mL), rastvor je ekstrahovan sa Et2O (100 mL × 2), organska faza je isprana slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), a rastvor je korišćen za sledeći korak.
Korak 6: 2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentannitril:
U gornji rastvor 4,4-difluor-3,3-dimetilbutanala u Et2O (200 mL) je dodat benzilamin (3 mL), AcOH (3 mL) i zatim TMSCN (3 mL) sa ledenim kupatilom, rastvor je mešan na 0 ~ sobne temperature tokom 17 sati, a zatim razblažen sa EtOAc (100 mL). Rastvor je ispran sa H2O (100 mL × 2) i zatim koncentrovan da bi se dobio 2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentannitril (3,2 g, sirov) kao smeđa tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 253.0 [M+H]<+>.
Korak 7: 2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanska kiselina:
Rastvor 2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentannitrila (1,8 g, sirov) u konc. HCl (50 mL) i AcOH (10 mL) je zagrevan na 100 °C tokom 64 sata. Smeša je koncentrovana da bi se uklonio rastvarač, pH je podešen na 12 sa 1 M rastvora NaOH, ekstrahovana je sa PE (100 mL), pH vodene faze je podešen na 5-6 sa 6 M HCl. Formirana je bela čvrsta supstanca, filtrirana, a filter kolač je ispran vodom (50 mL), osušen u vakuumu da bi se dobila 2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanska kiselina (1,3 g, 4,80 mmol , 54%, 3 koraka) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 272.0
Korak 8: 2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanska kiselina:
Smeša 2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanske kiseline (1,3 g, 4,80 mmol), HCOONH4(1,51 g, 24 mmol) i Pd/C (10%, 200 mg) u MeOH (50 mL) je zagrevana na 60 °C tokom 1 h. Smeša je filtrirana, a filtrat je koncentrovan da bi se dobila 2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanska kiselina (1,0 g, sirova) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 182.0 Korak 9: 2-(benziloksikarbonilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanska kiselina
U rastvor 2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanske kiseline (1,0 g, sirova) i NaHCO3(1,27 g, 14,4 mmol) u acetonu (30 mL) i H2O (30 mL) je dodat CbzOSu (2,39 g, 9,6 mmol) sa ledenim kupatilom. Posle mešanja tokom 17 sati, pH smeše je podešen na 3-4 sa 1M rastvora HCl, i rastvor je ekstrahovan sa EtOAc (50 mL × 2), ispran slanim rastvorom (50 mL), osušen (Na2SO4), filtriran i koncentrovan u vakuumu, sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu i zatim hiralno-prep-HPLC [kolona, CC44.6<∗>250mm 5um; rastvarač, MeOH (0,2% metanol amonijak)] da se dobije (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanska kiselina (400 mg, 1,27 mmol, 26%, 2 koraka) i (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanska kiselina (380 mg, 1,21 mmol, 25%, 2 koraka) kao dva bezbojna ulja. ESI-MS (EI<+>, m/z): 316.0
Korak 10: (S)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanska kiselina:
Rastvor (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanske kiseline (400 mg, 1,27 mmol) i Pd/C (10%, 50 mg) u MeOH (30 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 2 sata pod vodonikom, smeša je filtrirana i koncentrovana u vakuumu i prečišćena hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila (S)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanska kiselina (115,7 mg, 0,64 mmol, 50%). ESI-MS (EI<+>, m/z): 182.0<1>H-NMR (500 MHz, MeOD-d4): δ 5.60 (t, J = 56.5 Hz, 1H), 3.97 (t, J= 6.0 Hz, 1H), 2.07 (dd, J = 15.5 Hz, J = 5.5 Hz, 1H), 1.77 (dd, J = 15.5 Hz, J = 6.5 Hz, 1H), 0.96 (d, J = 9.5 Hz, 6H).
Primer 88: Sinteza (S)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanske kiseline [I-88] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: (S)-2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamid:
U rastvor 2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentannitrila (1,2 g, 4,76 mmol) u DCM (20 mL) dodata je kap po kap do konc. H2SO4(10 mL) sa ledenim kupatilom tokom 5 minuta, smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana 6 sati. Smeša je sipana u ledenu vodu (100 mL), pH rastvora je podešen na 8 ~ 9 sa 10% rastvorom NaOH, a zatim ekstrahovan sa EtOAc (100 mL × 2), organska faza je isprana vodom (100 mL ), i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu i prečišćena hromatografijom (MeOH/DCM od 0% do 5%), a zatim hiralno-prep-HPLC [kolona, CC4 4.6<∗>250mm 5um; rastvarač, MeOH (0,2% metanol amonijak)] da bi se dobio (S)-2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamid (400 mg, 1,48 mmol, 31%) i (R)-2- (benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamid (380 mg, 1,41 mmol, 30%) kao dve bezbojne tečnosti. ESI-MS (EI<+>, m/z): 253.0 [M+H]<+>.
Korak 2: (S)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamid:
Smeša (S)-2-(benzilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamida (200 mg, 0,74 mmol), HCOONH4(233 mg, 3,7 mmol) i Pd/C (10%, 40 mg) u MeOH (15 mL) je zagrevana na 60 °C tokom 1 h. Smeša je filtrirana, a filtrat je koncentrovan i prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila (S)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamid trifluorosirćetna kiselina (128 mg, 0,44 mmol, 59%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 181.0 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, MeOD-d4): δ 5.66 (t, J = 56.5 Hz, 1H), 3.95 (dd, J = 8.0 Hz, J = 5.0 Hz, 1H), 2.14 (dd, J = 10.0 Hz, J = 8.0 Hz, 1H), 1.83 (dd, J = 14.5 Hz, J = 5.5 Hz, 1H), 1.12 (d, J = 15.0 Hz, 6H).
Primer 185: Sinteza (S)-metil 2-((S)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoata [1-185] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Procedura za 2-(benziloksikarbonilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentansku kiselinu bila je ista kao u primeru 90
Korak 1: (S)-metil 2-((S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat:
Rastvor (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanske kiseline (150 mg, 0,476 mmol), HATU (199 mg, 0,524 mmol), (S)-metil 2-amino -4-metilpentanoat hidrohlorida (104 mg, 0,571 mmol) i DIPEA (123 mg, 0,952 mmol) je mešan na sobnoj temperaturi 1 sat, zatim ugašen ledenom vodom (20 ml), ekstrahovan sa EA (2×30 ml), osušen, filtriran i koncentrovan. Sirovi materijal je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobio (S)-metil 2-((S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat (95 mg, 45%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 443.0
Korak 2: (S)-metil 2-((S)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat:
Rastvor (S)-metil 2-((S)-2-(benziloksikarbonilamino)- 5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)- 4-metilpentanoata (95 mg, 0,215 mmol) i Pd/C (30 mg) u THF (5 ml) je mešan na sobnoj temperaturi 2 sata, zatim filtriran, koncentrovan. Sirovi materijal je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobio (S)-metil 2-((S)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat (45 mg , 69%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 309.0<1>H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): 9.11 (d, J = 7 Hz, 1H), 8.41 (s, 3H), 5.81 (t, J = 56.5 Hz, 1H), 4.34-4.31 (m, 1H), 3.89-3.81 (m, 1H), 3.62 (s, 3H), 1.98-1.93 (m, 1H), 1.76-1.73 (m, 1H), 1.65-1.54 (m, 3H), 0.93-0.81 (m, 12H).
Primer 184: Sinteza (S)-metil 2-((R)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoata [1-184] (uporedno jedinjenje):
Postupak je bio isti kao u Primeru 90, 185.
(S)-metil 2-((R)-2-amino-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat: ESI-MS (EI<+>, m/z): 309.0<1>H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): 9.18 (d, J = 7 Hz, 1H), 8.38 (s, 3H), 5.79 (t, J= 56.5 Hz, 1H), 4.37-4.32 (m, 1H), 3.85-3.78 (m, 1H), 3.58 (s, 3H), 1.97-1.92 (m, 1H), 1.77-1.72 (m, 1H), 1.61-1.51 (m, 3H), 0.94-0.82 (m, 12H).
Primer 145: Sinteza (2S,4R)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline, (2R,4S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline, (2R,4R)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline i (2S,4S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline: [3d; 1-145] (uporedno jedinjenje); [3c; 1-146] (uporedno jedinjenje); [3a; I-167] (uporedno jedinjenje); [3b; 1-250] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: Sinteza (2S,4R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline, (2R,4S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor- 4-metilpentanske kiselinae, (2R,4R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanska kiselina i (2S,4S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor- 4-metilpentanske kiseline:
U rastvor 2-amino-5,5, 5-trifluor-4-metilpentanske kiseline (600 mg, 3,2 mmol) u acetonu (10 mL) i NaHCO3zasićenog vodenog rastvora (10 mL) dodat je CbzOSu (970 mg, 3,9 mmol). Smeša je mešana na sobnoj temperaturi 3 sata. Zatim je dodat EtOAc (20 mL) i H2O (20 mL), vodeni sloj je odvojen i dalje ekstrahovan sa EtOAc (2<∗>20 mL), kombinovani su ekstrakti i isprani rastvorom soli (20 mL), osušeni anhidrovanim Na2SO4, filtrirani i koncentrovani, ostatak je prečišćen pre-HPLC da bi se dobila 2-(benziloksikarbonilamino)-5,5, 5-trifluor-4-metilpentanska kiselina (750 mg) kao bela čvrsta supstanca. Čisti proizvod je prečišćen hiralnom HPLC da bi se dobila četiri izomera: (2S,4R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4- metilpentanska kiselina (150 mg, 15%), (2R, 4S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4- metilpentanska kiselina (40 mg, 3,9%), (2R,4R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4- metilpentanska kiselina (50 mg, 4,9%) i (2S,4S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4- metilpentanska kiselina (80 mg, 7,8%), koje su obe bile bele čvrste supstance. ESI-MS (EI<+>, m/z): 342.0 [M+Na]+.
Korak 2-A: Sinteza (2S,4R)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline:
Rastvor (2S,4R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4- metilpentanske kiseline (150 mg, 0,47 mmol) i Pd/C (75 mg) u MeOH (15 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 3 sata. Reakciona smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobila (2S,4R)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanska kiselina (51,7 mg, 59%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 186.2 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, MeOD): δ 3.64-3.60 (m, 1H), 2.77-2.71 (br, 1H), 2.24-2.18 (m, 1H),1.76-1.69 (m, 1H),1.25 (d, J= 7.0 Hz, 3 H).
Korak 2-B: Sinteza (2R,4S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline:
Rastvor (2R,4S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline (40 mg, 0,12 mmol) i Pd/C (20 mg) u MeOH (4 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 3 sata. Reakciona smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobila (2R,4S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanska kiselina (13,3 mg, 60%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 186.2 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, MeOD): δ 3.51-3.47 (m, 1H), 2.64-2.58 (br, 1H), 2.12-2.06 (m, 1H),1.63-1.57 (m, 1H), 1.13 (d, J= 7.0 Hz, 3 H).
Korak 2-C: Sinteza (2R,4R)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline:
Rastvor (2R,4R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanska kiseline (50 mg, 0,16 mmol) i Pd/C (25 mg) u MeOH (5 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 3 sata. Reakciona smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobila (2R,4R)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanska kiselina (18,0 mg, 61%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 186.1 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, MeOD): δ 3.51-3.47 (m, 1H), 2.46-2.44 (br, 1H), 1.95-1.87 (m, 2H), 1.11 (d, J = 7.0 Hz, 3 H).
Korak 2-D: Sinteza (2S,4S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline:
Rastvor (2S,4S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentanske kiseline (80 mg, 0,25 mmol) i Pd/C (40 mg) u MeOH (8 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 3 sata. Reakciona smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobila (2S,4S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-metilpentanska kiselina (38,1 mg, 82%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 186.2 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, MeOD): δ 3.51-3.47 (m, 1H), 2.46-2.44 (br, 1H), 1.95-1.87 (m, 2H), 1.11 (d, J = 7.0 Hz, 3 H).
Primer 128: (S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4,4-dimetilpentanska kiselina (1-128):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korišćena procedura je ista kao u primeru 187.
(S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4,4-dimetilpentanska kiselina: ESI-MS (EI<+>, m/z): 200.1<1>H-NMR (500 MHz, D2O): δ 3.94 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 2.23 (dd, J= 15.5 Hz, J= 5.5 Hz, 1H), 1.90 (dd, J = 15.5 Hz, J = 6.0 Hz, 1H), 1.13 (d, J = 8.5 Hz, 6H).
Primer 188: (S)-metil 2-((R)-2-amino-5,5,5-trifluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat [I-188] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Postupak za 2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4,4-dimetilpentansku kiselinu bio je isti kao u primeru 90
Korak 1: (S)-metil 2-((R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat:
Rastvor (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-difluor-4,4-dimetilpentanske kiseline (150 mg, 0,45 mmol), HATU (188 mg, 0,495 mmol), (S)-metil 2 -amino-4-metilpentanoat hidrohlorid (123 mg, 0,675 mmol) i DIPEA (175 mg, 1,35 mmol) je mešan na sobnoj temperaturi 1 sat, zatim ugašen ledenom vodom (20 ml), ekstrahovan sa EA (2k30 ml), osušen, filtriran i koncentrovan. Sirovi materijal je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobio (S)-metil 2-((S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat (120 mg, 58%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 461.0
Korak 2: (S)-metil 2-((R)-2-amino-5,5,5-trifluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat:
Rastvor (S)-metil 2-((S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-difluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoata (120 mg, 0,26 mmol) i Pd/C (30 mg) u THF (10 ml) je mešan na sobnoj temperaturi 2 sata, zatim filtriran, koncentrovan. Sirovi proizvod je prečišćen biotažom hromatografije na silika gelu sa reverznom fazom da bi se dobio (S)-metil 2-((S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat ( 49 mg, 57%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 326.0<1>H-NMR (500 MHz, MeOD-d4): 4.47 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 3.99-3.97 (m, 1H), 3.77 (s, 3H), 2.33-2.28 (m, 1H), 1.95-1.91 (m, 1H), 1.69-1.68 (m, 3H), 1.24-1.17 (m, 6H), 1.00-0.94 (m, 6H).
Primer 189: (S)-metil 2-((S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat [1-189] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Korišćena procedura je ista kao u primeru 188.
Procedure i karakterizacija:
Primer 189: (S)-metil 2-((S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4,4-dimetilpentanamido)-4-metilpentanoat [I-189] (uporedno jedinjenje):<1>H-NMR (500 MHz, MeOD-d4): 4.52 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 4.02-3.99 (m, 1H), 3.73 (s, 3H), 2.35-2.30 (m, 1H), 1.95-1.91 (m, 1H), 1.78-1.67 (m, 3H), 1.25 (s, 3H), 1.17 (s, 3H), 1.01-0.97 (m, 6H).
Primer 108: (S)-2-amino-6-fluorheksanska kiselina [I-108] (uporedno jedinjenje):
Primer 109: (R)-2-amino-6-fluorheksanska kiselina [I-109] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-6-fluorheksanoat:
Smeša 1-fluor-4-jodbutana (2,0 g, 9,90 mmol), terc-butil 2-(difenilmetilenamino)acetata (2,43 g, 8,25 mmol), TBAB (266 mg, 0,83 mmol) i KOH (50% vod. ) (10 mL) u DCM (10 mL) i toluenu (25 mL) je mešana 16 h na 50°C. Rastvor je prečišćen pomoću SGC (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/5) da bi se dobio (terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-6-fluorheksanoat (0,91 g, 2,47 mmol, 30%) kao bezbojno ulje. MS ( EI<+>, m/z): 370.2 [M+H]<+>.
Korak 2: (S)-2-amino-6-fluorheksanska kiselina [I-108]:
Rastvor (S)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-6-fluorheksanoata (360 mg, 0,97 mmol) u dioksanu (10 mL) i HCl (vod. 6M) je mešan 16 h na sobnoj temperaturi. Smeša je ekstrahovana etrom i vodom. Vodeni sloj je ekstrahovan sa EA nakon podešavanja pH na 3-4. Organski sloj je koncentrovan da bi se dobila (S)-2-amino-6-fluorheksanska kiselina [I-108] kao bela čvrsta supstanca (125 mg, 0,84 mmol, 86%). ESI-MS (EI+, m/z): 150.3 [M+H]<+>. 1H NMR (500 MHz, D2O) δ 4.469 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 4.351 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 3.950 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 1.904-1.820 (m, 2H), 1.690-1.588 (m, 2H), 1.456-1.388 (m, 2H).
Korak 2: (R)-2-amino-6-fluorheksanska kiselina [I-109]:
Rastvor (R)-terc-butil 2-(difenilmetilenamino)-6-fluorheksanoata (300 mg, 0,81 mmol) u dioksanu (10 mL) i HCl (vod. 6M) je mešan 16 h na sobnoj temperaturi. Smeša je ekstrahovana etrom i vodom. Vodeni sloj je ekstrahovan sa EA nakon podešavanja pH na 3-4. Organski sloj je prečišćen pomoću HPLC da bi se dobila (R)-2-amino-6-fluorheksanska kiselina [I-109] kao bela čvrsta supstanca (35 mg, 0,23 mmol, 29%). ESI-MS (EI+, m/z): 150.2 [M+H]<+>. 1H NMR (500 MHz, D2O) 4.505 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 4.410 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 3.823 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 1.906-1.827 (m, 2H), 1.722-1.639 (m, 2H, 1.485-1.399 (m, 2H).
Primer 198: Metil-2-amino-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanoat (I-198) (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 4,4,4-trifluor-N-metoksi-N-metil-3-(trifluormetil)but-2-enamid:
U mešani rastvor heksafluoraceton trihidrata (30 g, 136 mmol) dodat je H2SO4(100 ml, konc.) polako kap po kap tokom 1 h, a gasoviti heksafluoraceton je uveden u rastvor N-metoksi-N-metil-2-(trifenilfosforaniliden)-acetamida (10 g, 27,5 mmol) u THF (200 mL). Smeša je mešana na sobnoj temperaturi 16 sati. Zatim je dodat petrolej etar (200 mL), beli talog je odfiltriran. Filtrat je koncentrovan, ostatak je prečišćen hromatografijom na silika gelu (petrolej etar / etil acetat = 5/1~3/1) da bi se dobio 4,4,4-trifluor-N-metoksi-N-metil-3-(trifluormetil)but-2-enamid (6,2 g, 24,7 mmol, 90%) kao slabo ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 252.1 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, CDCl3): δ 7.15 (s, 1H), 3.67 (s, 3H), 3.26 (s, 3H).
Korak 2: 4,4,4-trifluor-N-metoksi-N-metil-3-(trifluormetil)butanamid:
Smeša 4,4,4-trifluor-N-metoksi-N-metil-3-(trifluormetil)but-2-enamida (4,5 g, 17,9 mmol), Pd(OH)2/C (620 mg) u MeOH (100 mL) je mešana na sobnoj temperaturi u atmosferi vodonika tokom 16 sati. Zatim je filtrirana i koncentrovana da bi se dobio 4,4,4-trifluor-N-metoksi-N-metil-3-(trifluormetil)butanamid (1,8 g, 7,1 mmol, 40 %) u vidu slabog ulja. ESI-MS (EI<+>, m/z): 254.1 [M+H]<+>.
Korak 3: 4,4,4-trifluor-3-(trifluormetil)butanal:
U rastvor 4,4,4-trifluor-N-metoksi-N-metil-3-(trifluormetil)butanamida (1,8 g, 7,1 mmol) u THF (50 mL) dodat je u kapima LiAlH4(8,5 mL, 8,5 mmol) sa ledenim kupatilom, posle 1 h, smeša je ugašena rastvorom limunske kiseline (100 mL), rastvor je ekstrahovan sa Et2O (100 mL × 2), organska faza je isprana slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), a rastvor korišćen za sledeći korak.
Korak 4: 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentannitril:
Na gornji rastvor 4,4,4-trifluor-3-(trifluormetil)butanala u Et2O (200 mL) je dodat benzilamin (2 mL), AcOH (2 mL) i zatim TMSCN (2 mL) sa ledenim kupatilom, rastvor je mešan na 0 ~ sobne temperature tokom 17 sati, a zatim razblažen sa EtOAc (100 mL). Rastvor je ispran sa H2O (100 mL × 2) i zatim koncentrovan da bi se dobio 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentannitril (2,1 g, sirov) kao smeđa tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 311.2 [M+H]<+>.
Korak 5: 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina:
Rastvor 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentannitrila (2,1 g, sirov) u konc. HCl (50 mL) i AcOH (10 mL) je zagrevan na 100 °C tokom 40 sati. Smeša je koncentrovana da bi se uklonio rastvarač, pH je podešen na 12 sa 1 M rastvora NaOH, ekstrahovana sa PE (100 mL), pH vodene faze je podešen na 5-6 sa 6 M HCl, bela čvrsta supstanca je formirana, filtrirana, a filter kolač je ispran vodom (50 mL), osušen u vakuumu da bi se dobila 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina (1,0 g, 3,0 mmol, 42%, 3 koraka) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 272.0
Korak 6: Metil 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanoat:
Rastvor 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanske kiseline (800 mg, 2,4 mmol) u HCl/MeOH (50 mL, 2M) je zagrevan na 75 °C tokom 17 sati. Rastvor je koncentrovan i prečišćen prep-HPLC (Boston C1821<∗>250mm 10 µm Mobilna faza: A: 0,1 % TFA; B: ACN) da bi se dobio metil 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanoat (120 mg, 0,35 mmol, 15%) kao bezbojno ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 344.1 [M+H]<+>.
Korak 7: Metil 2-amino-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanoat trifluorosirćetna kiselina: Smeša metil 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanoata (100 mg, 0,30 mmol), HCOONH4(92 mg, 1,5 mmol) i Pd/C (10%, 20 mg) u MeOH (10 mL) je zagrevana na 65 °C tokom 1 h. Smeša je filtrirana, a filtrat je koncentrovan i prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila metil 2-amino-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanoat trifluorosirćetna kiselina (76 mg, 0,21 mmol, 70%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 254.1 [M+H]<+>.<1>H NMR (500 MHz, MeOD-d4) δ 4.26 (dd, J = 7.5 Hz, J = 6.0 Hz, 1H), 3.91 (m, 4H), 2.49 (dd, J = 8.5 Hz, J = 5.0 Hz, 1H), 2.33-2.37 (m, 1H).
Primer 164: (S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina (I-164) (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 2-amino-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina:
Rastvor 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanske kiseline (480 mg, 1,46 mmol) i Pd(OH)2/C (20%, 100 mg) u AcOH (15 mL) je mešan na 35°C tokom 17 sati pod vodonikom. Smeša je filtrirana i filtrat je koncentrovan u vakuumu da bi se dobila 2-amino-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina (460 mg, sirova) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 240.2 [M+H]<+>.
Korak 2: (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina:
U rastvor 2-amino-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanske kiseline (460 mg, sirova) i NaHCO3(368 mg, 4,38 mmol) u acetonu (30 mL) i H2O (30 mL) je dodat CbzOSu (727 mg, 2,92 mmol) sa ledenim kupatilom. Posle 17 sati, pH reakcione smeše je podešen na 3-4 sa 1 M rastvora HCl, i rastvor je ekstrahovan sa EtOAc (50 mL × 2), ispran slanim rastvorom (50 mL), osušen (Na2SO4), filtriran i koncentrovan u vakuumu, sirovi proizvod je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu i zatim hiralno-prep-HPLC [ kolona, CC44.6<∗>250mm 5um; rastvarač, MeOH (0,2% metanol amonijak)] da se dobije (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina (27 mg, 0,072 mmol, 5%, 2 koraka) i (R)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina (22 mg, 0,059 mmol, 4%, 2 koraka) kao dva bezbojna ulja. ESI-MS (E<I+>, m/z): 396.0 [M+Na]<+>.
Korak 3: (S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina:
Smeša (S)-2-(benziloksikarbonilamino)-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanske kiseline (27 mg, 0,072 mmol) i Pd/C (10%, 5 mg) u MeOH (10 mL) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 1 h. Rastvor je filtriran i prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila (S)-2-amino-5,5,5-trifluor-4-(trifluormetil)pentanska kiselina [I-164] (8,5 mg, 0,036 mmol, 49%) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI<+>, m/z): 240.2 [M+H]<+>.<1>H NMR (500 MHz, D2O) δ 3.74-3.80 (m, 2H), 2.88-2.31 (m, 1H), 1.91-2.20 (m, 1H).
Primer 203: 2-amino-4-ciklopentilbuterna kiselina [I-203] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 2-Ciklopentilacetaldehid:
U rastvor 3-ciklopentilpropan-1-ola (2,0 g, 17,5 mmol) u DMSO (40 mL) je dodat IBX (7,35 g, 26,3 mmol) u ledenom kupatilu. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana preko noći. Reakciona smeša je sipana u vodu (200 mL) i ekstrahovana sa Et2O (100 mL × 2), organska faza je isprana vodom (100 mL × 3) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), a rastvor je korišćen za sledeći korak.
Korak 2: (Z)-terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-4-ciklopentilbut-2-enoat:
U rastvor Vitigovog reagensa (2,5 g, 6,8 mmol) u THF (50 mL) dodat je NaOt-Bu (785 mg, 8,2 mmol) sa ledenim kupatilom. Posle 1 h, gornji rastvor 2-ciklopentilacetaldehida u Et2O (200 mL) je dodat. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana preko noći. Rastvor je razblažen vodom (200 mL) i ekstrahovan sa EA (100 mL × 2), organska faza je isprana vodom (100 mL × 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu i prečišćena hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/20) da bi se dobio (Z)-terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-4-ciklopentilbut-2-enoat (1,0 g, 3,1 mmol, 45%, 2 koraka) kao bezbojna tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 326.2 [M+H]<+>.
Korak 3: terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-4-ciklopentilbutanoat:
Smeša (Z)-terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-4-ciklopentilbut-2-enoata (240 mg, 0,74 mmol) HCOONH4(233 mg, 3,7 mmol) i Pd/C (10%, 30 mg) u MeOH (15 mL) je zagrevana do refluksa tokom 4 sata. Smeša je filtrirana i koncentrovana, razblažena sa Et2O (50 mL), isprana vodom (50 mL) i slanim rastvorom (50 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da se dobije terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-4-ciklopentilbutanoat (224 mg, 0,69 mmol, 93%) kao bezbojna tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 328.2 [M+H]<+>.
Korak 4: 2-amino-4-ciklopentilbuterna kiselina:
Rastvor za terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-4-ciklopentilbutanoata (224 mg, 0,69 mmol) u 6 M HCl (20 mL) i dioksanu (10 mL) je zagrevan na 70 °C tokom 2 sata. Smeša je koncentrovana u vakuumu, razblažena vodom (30 mL), ekstrahovana sa Et2O (20 mL × 2), a filtrat je koncentrovan do suva da bi se dobila 2-amino-4-ciklopentilbuterna kiselina (114,9 mg, 0,52 mmol, 81%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 172.3 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, D2O): δ 3.91 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 1.82-1.89 (m, 2H), 1.66-1.72 (m, 3H), 1.28-1.52 (m, 6H), 1.00-1.01 (m, 2H).
Primer 202: 2-amino-5-ciklopentilpentanska kiselina [1-202] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 3-ciklopentilpropanal:
U rastvor 3-ciklopentilpropan-1-ola (1,0 g, 7,8 mmol) u DMSO (20 mL) je dodat IBX (3,28 g, 11,7 mmol) u ledenom kupatilu. Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana preko noći. Reakciona smeša je sipana u vodu (100 mL) i ekstrahovana sa Et2O (60 mL × 2), organska faza je isprana vodom (100 mL × 3) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), a rastvor je korišćen za sledeći korak.
Korak 2: (E)-terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-ciklopentilpent-2-enoat:
Rastvoru Vitigovog reagensa (500 mg, 1,36 mmol) u THF (15 mL) dodat je NaOt-Bu (157 mg, 1,63 mmol) sa ledenim kupatilom. Posle 1 h, gornji rastvor 3-ciklopentilpropanala je dodat u Et2O (100 mL). Smeša je zagrejana do sobne temperature i mešana preko noći. Rastvor je razblažen vodom (200 mL) i ekstrahovan sa EtOAc (100 mL), organska faza je isprana vodom (100 mL × 2) i slanim rastvorom (100 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu i prečišćena hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/20) da bi se dobio (E)-terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-ciklopentilpent-2-enoat (250 mg, 0,74 mmol, 9,5%, 2 koraka) kao bezbojna tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 340.2 [M+H]<+>.
Korak 3: terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-ciklopentilpentanoat:
Smeša 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-ciklopentilpent-2-enoata (250 mg, 0,74 mmol) i Pd/C (10%, 30 mg) u MeOH (15 mL) je mešana na sobnoj temperaturi 17 sati pod vodonikom. Smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobio terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-ciklopentilpentanoat (250 mg, 0,73 mmol, 99%) kao bezbojna tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 342.2 [M+H]<+>.
Korak 4: 2-amino-5-ciklopentilpentanska kiselina:
Rastvor 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-ciklopentilpentanoata (250 mg, 0,73 mmol) u 6 M HCl (20 mL) i dioksanu (10 mL) je zagrevan na 80 °C tokom 5 sati. Smeša je koncentrovana u vakuumu, razblažena vodom (30 mL), ekstrahovana sa Et2O (20 mL × 2), a filtrat je koncentrovan do suva da bi se dobila 2-amino-5-ciklopentilpentanska kiselina (115 mg, 0,52 mmol, 71%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 186.2 [M+H]<+>.<1>H-NMR (400 MHz, D2O): δ 3.84 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 1.79-1.84 (m, 2H), 1.61-1.67 (m, 3H), 1.25-1.49 (m, 8H), 0.95-0.99 (m, 2H).
Primer 197: Sinteza 2-amino-N-ciklopentil-3,3-difluor-N,4-dimetilpentanamida [I-197] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 2-(benzilamino)-N-ciklopentil-3,3-difluor-N,4-dimetilpentanamid:
Smeša 2-(benzilamino)-3,3-difluor-4-metilpentanske kiseline (80 mg, 0,31 mmol), N-metilciklopentanamina (62 mg, 0,62 mmol), HATU (141 mg, 0,37 mmol) i Et3N (94 mg, 0,93) u DMF (2 mL) je mešana na sobnoj temperaturi 3 sata. Smeša je prečišćena prep-HPLC (Boston C18 21<∗>250mm 10 µm Mobilna faza: A: 0,1 % TFA; B: ACN) da bi se dobio 2-(benzilamino)-N-ciklopentil-3,3-difluor-N,4-dimetilpentanamid (45 mg, 0,13 mmol, 43%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 339.0
Korak 2: 2-amino-N-ciklopentil-3,3-difluor-N,4-dimetilpentanamid:
Smeša 2-(benzilamino)-N-ciklopentil-3,3-difluor-N,4-dimetilpentanamida (45 mg, 0,13 mmol), HCOONH4(41 mg, 0,65 mmol) i Pd/C (10%, 10 mg) u MeOH (5 mL) je zagrevana na 60°C tokom 1 h. Smeša je filtrirana, a filtrat je koncentrovan i prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobio 2-amino-N-ciklopentil-3,3-difluor-N,4-dimetilpentanamid (16,3 mg, 0,066 mmol, 49% ) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 249.21H NMR (500 MHz, MeOD-d4) δ 5.26 (dd, J = 15.5 Hz, J = 6.0 Hz, 0.5H), 5.08 (dd, J = 16.5 Hz, J = 5.0 Hz, 1H), 4.28-4.31 (m, 0.5H), 2.97 (d, J = 48.5 Hz, 3H), 2.38 (m, 1H), 1.65-1.99 (m, 8H), 11.16 (dt, J = 6.5 Hz, J = 3.0 Hz, 6H).
Primer 196: 2-amino-5-fluor-4,4-dimetilpentanska kiselina [I-196].
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: 3-Hidroksi-N-metoksi-N,2,2-trimetilpropanamid:
Smeša 3-hidroksi-2,2-dimetilpropanske kiseline (10 g, 84,7 mmol), N,O-dimetilhidroksilamin hidrohlorida (16,4 g, 101,7 mmol), EDCI (24,4 g, 127,1 mmol), HOBT (17,2 g, 127,1 mmol) i DIPEA (28 mL, 169,5 mmol) u DMF (200 mL na 1 sat) je mešana na sobnoj temperaturi tokom 16 sati. Reakciona smeša je ekstrahovana sa EtOAc (200 mL × 3) i vodom (100 mL), kombinovani organski slojevi su isprani sa 1 N HCl (30 mL<∗>2) , 1 N NaHCO3(30 mL × 2) i rastvorom soli (50 mL), osušeni, koncentrovani da bi se dobio ostatak koji je prečišćen hromatografijom (silicijum, etil acetat / petrolej etar = 1/2) da bi se dobio 3-hidroksi-N-metoksi-N,2,2 -trimetilpropanamid (6,9 g, 50%) kao ulje bez boje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 162.2 [M+H]<+>.
Korak 2: 3-fluor-N-metoksi-N,2,2-trimetilpropanamid:
Smeši 3-hidroksi-N-metoksi-N,2,2-trimetilpropanamida (4,5 g, 27,9 mmol) u DCM (40 mL), ohlađenoj na -78 °C, dodat je DAST (7,4 mL, 55,9 mmol) u kapima. Zatim je mešana na sobnoj temperaturi 1-2 h, ponovo ohlađena na -78 °C, DAST (4 mL, 27,9 mmol) je dodat u kapima. Reakciona smeša je mešana na sobnoj temperaturi još 1 h. Reakciona smeša je ohlađena na -78 °C, zas. NH4Cl (15 mL) je polako dodavan, dodat je DCM (50 mL), odvojen je organski sloj, ispran zas. NH4Cl (30 mL), slanim rastvorom (30 mL × 2), osušen, koncentrovan da bi se dobio ostatak koji je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/4) da bi se dobio 3-fluor-N-metoksi-N,2,2-trimetilpropanamid (1,9 g, 28%) kao ulje bez boje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 164.2 [M+H]<+>.
Korak 3: 3-fluor-2,2-dimetilpropanal:
U smešu 3-fluor-N-metoksi-N,2,2-trimetilpropanamida (1,0 g, 61,3 mmol) u THF (10 mL), ohlađenu na 0 °C dodat je LiAlH4(6,1 mL, 61,3 mmol, 1 M u THF) kap po kap. Zatim je mešano na ovoj temperaturi 0,5-1 h. Zas. NH4Cl (10 mL) polako je dodat, ekstrahovan sa Et2O (20 mL × 3), ispran vodom (15 mL × 2) i slanim rastvorom (15 mL), osušen, korišćen direktno za sledeći korak. ESI-MS (EI<+>, m/z): nema MS.
Korak 4: (Z)-terc-Butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-fluor-4,4-dimetilpent-2-enoat
Smeša 3-fluor-2,2-dimetilpropanala (oko 630 mg, 6,1 mmol, Et2O rastvor iz gornjeg koraka), tercbutil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-2-dietoksifosforilacetat (2,25 g, 6,1 mmol) i t-BuONa (1,2 g, 12.3 mmol) u THF (15 mL) je mešana na sobnoj temperaturi 16 sati. Dodat je zas. NH4Cl (15 mL), ekstrahovan sa EA (30 mL × 3), kombinovan sa organskim slojevima, ispran vodom (15 mL) i slanim rastvorom (15 mL), osušen, koncentrovan da bi se dobio ostatak koji je prečišćen hromatografijom (silicijum dioksid, petrolej etar u DCM) da bi se dobio (Z)-terc-butil 2-(tercbutoksikarbonilamino)-5-fluor-4,4-dimetilpent-2-enoat (190 mg, 0,60 mmol, 8%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI+, m/z): 206 [M-111]<+>.
Korak 5: terc-Butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-fluor-4,4-dimetilpentanoat:
Smeša (Z)-terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-fluor-4,4-dimetilpent-2-enoata (190 mg, 0,60 mmol) i Pd/C (10%, 30 mg) u IPA (15 mL) je mešana na sobnoj temperaturi 17 sati pod vodonikom. Smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobio terc-butil 2-(tercbutoksikarbonilamino)-5-fluor-4,4-dimetilpentanoat (200 mg, sirov) kao bezbojna tečnost. ESI-MS (EI<+>, m/z): 342.2 [M+Na]<+>.
Korak 6: 2-amino-5-fluor-4,4-dimetilpentanska kiselina trifluorosirćetna kiselina:
Rastvor terc-butil 2-(terc-butoksikarbonilamino)-5-fluor-4,4-dimetilpentanoata (200 mg, sirov) u 6 M HCl (20 mL) i dioksana (10 mL) je zagrevan na 50 °C tokom 17 sati. Smeša je koncentrovana u vakuumu, razblažena vodom (30 mL), ekstrahovana sa Et2O (20 mL x 2), a filtrat je koncentrovan u vakuumu i prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila 2-amino-5-ciklopentilpentanska kiselina trifluorosirćetna kiselina (31,7 mg, 0,11 mmol, 19%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 164.2 [M+H]<+>.<1>H-NMR (500 MHz, D2O): δ 4.16 (d, J = 47.5 Hz, 1H), 3.97 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 2.03 (dd, J = 15.5 Hz, J = 5.5 Hz, 1H), 1.71 (dd, J = 15.5 Hz, J = 6.0 Hz, 1H), 0.91 (dd, J = 15.0 Hz, J = 2.0 Hz, 6H).
Primer 186: Sinteza 2,4-diamino-4-metilpentanske kiseline [I-186] (uporedno jedinjenje):
Sintetička šema:
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: terc-Butil 4-(metoksi(metil)amino)-2-metil-4-oksobutan-2-ilkarbamat:
Rastvoru 3-(terc-butoksikarbonilamino)-3-metilbuterne kiseline (1 g, 4,61 mmol), N,O-dimetilhidroksilamin hidrohlorida (536 mg, 5,53 mmol), HATU (2,26 g, 5,99 mmol), u DMF (15 mL) je dodat DIPEA (1.49 g, 11.53 mmol). Rastvor je mešan na sobnoj temperaturi 2 sata, zatim je smeša razblažena slanim rastvorom (100 mL), ekstrahovana sa EtOAc (50 mL × 2). Kombinovani organski slojevi, koncentrovani i prečišćeni hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/3) da bi se dobio terc-butil 4-(metoksi(metil)amino)-2-metil-4-oksobutan-2-ilkarbamat (1,0 g, 3,8 mmol, 82 %) kao bezbojno ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 261.2 [M+H]<+>.
Korak 2: terc-butil 2-metil-4-oksobutan-2-ilkarbamat:
Rastvoru terc-butil 4-(metoksi(metil)amino)-2-metil-4-oksobutan-2-ilkarbamata (3,8 g, 14,6 mmol) u THF (50 mL) je dodat LiAlH4(16 ml, 1 M u THF) na sobnoj temperaturi. Rastvor je mešan na sobnoj temperaturi 2 sata, ugašen sa Na2SO4.10H2O, filtriran i ispran THF-om da bi se dobio terc-butil 2-metil-4-oksobutan-2-ilkarbamat kao žuti rastvor (oko 14 mmol u 110 mL THF). MS (EI<+>, m/z): 146.3 [M+H-56]<+>.
Korak 3: terc-butil 4-(benzilamino)-4-cijano-2-metilbutan-2-ilkarbamat:
Rastvoru terc-butil 2-metil-4-oksobutan-2-ilkarbamata (sirov oko 14 mmol u 110 mL THF) je dodat BnNH2(2,2 mL) i AcOH (2,2 mL). Rastvor je mešan na sobnoj temperaturi 10 min. Dodat je TMSCN (2,2 mL). Smeša je mešana na sobnoj temperaturi 17 sati. Zatim je reakciona smeša koncentrovana i hromatografijom (silicijum dioksid, etil acetat / petrolej etar = 1/4) da bi se dobio terc-butil 4-(benzilamino)-4-cijano-2-metilbutan-2-ilkarbamat (670 mg, 2,11 mmol, 15 %) kao žuti dop rastvor. MS (EI<+>, m/z): 318.3 [M+H]<+>.
Korak 4: terc-Butil 5-amino-4-(benzilamino)-2-metil-5-oksopentan-2-ilkarbamat:
Smeši terc-butil 4-(benzilamino)-4-cijano-2-metilbutan-2-ilkarbamata (640 mg, 2,00 mmol), K2CO3(550 mg, 3,98 mmol) u DMSO (16 mL) je dodat 30% H2O2(0,64 mL, 5,67 mmol) i mešana je 17 sati na sobnoj temperaturi. Zatim je reakciona smeša razblažena sa H2O (200 mL), ekstrahovana sa EtOAc (100 mL × 2). Kombinovani organski slojevi su koncentrovani da bi se dobila 2-(benzilamino)-4-(terc-butoksikarbonilamino)-4-metilpentanska kiselina (sirova 890 mg) kao žuti dop rastvor. MS (EI+, m/z): 336,0 [M+H]<+>.
Korak 5: 2-(benzilamino)-4-(terc-butoksikarbonilamino)-4-metilpentanska kiselina:
Smeša terc-butil 5-amino-4-(benzilamino)-2-metil-5-oksopentan-2-ilkarbamata (sirov 890 mg, oko 2,0 mmol), KOH (406 mg, 7,25 mmol) u etan-1,2-diolu ( 9 mL) i H2O (9 mL) je mešana 5 sati na 100 °C. Zatim je reakciona smeša razblažena slanim rastvorom (200 mL), ekstrahovana sa THF/EA=2:1 (90 mL × 5), kombinovani organski slojevi, koncentrovani i prečišćeni reverznom HPLC (Boston C18 21<∗>250 mm 10 µm, Mobilna faza: A: 0,1 % trifluorosirćetna kiselina; B: acetonitril) da bi se dobila 2-(benzilamino)-4-(terc-butoksikarbonilamino)-4-metilpentanska kiselina (120 mg, 0,36 mmol, 18 %) kao bela čvrsta supstanca. MS (EI+, m/z): 337.3 [M+H]<+>.
Korak 6: 2-amino-4-(terc-butoksikarbonilamino)-4-metilpentanska kiselina:
Smeša 2-(benzilamino)-4-(terc-butoksikarbonilamino)-4-metilpentanske kiseline (140 mg, 0,42 mmol), HCOONH4(132 mg, 2,1 mmol) i Pd/C (10%, 20 mg) u MeOH (15 mL) je zagrevana na 60°C tokom 1 h. Smeša je filtrirana, a filtrat je koncentrovan i prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila 2-amino-4-(terc-butoksikarbonilamino)-4-metilpentanska kiselina (60 mg, 0,24 mmol, 58%) kao bela čvrsta materija. ESI-MS (EI<+>, m/z): 247.2
Korak 7: 2,4-diamino-4-metilpentanska kiselina:
Rastvor 2-amino-4-(terc-butoksikarbonilamino)-4-metilpentanske kiseline (60 mg, 0,24 mmol) u 6 M HCl (10 mL) i dioksanu (0 mL) je mešan na sobnoj temperaturi 17 sati. Rastvor je koncentrovan u vakuumu da bi se dobila 2,4-diamino-4-metilpentanska kiselina (51,8 mg, 0,236 mmol, 97%) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 147.11H NMR (500 MHz, D2O) δ 4.04 (dd, J = 9.5 Hz, J = 3.5 Hz, 1H), 2.32 (dd, J = 15.0 Hz, J = 9.5 Hz, 1H),1.94 (dd, J = 15.0 Hz, J = 3.0 Hz, 1H), 1.38 (dd, J = 9.5 Hz, J = 5.0 Hz, 6H).
Primer 199: Sinteza 4,4,4-trifluor-3-metil-1-(2H-tetrazol-5-il)butan-1-amina [I-199] (uporedno jedinjenje):
Procedure i karakterizacija:
Korak 1: N-metoksi-N-metil-2-(trifenil-15-fosfaniliden)acetamid:
Smeša 2-hlor-N-metoksi-N-metilacetamida (13,7 g, 0,1 mol) i trifenilfosfana (26,2 g, 0,1 mol) u acetonitrilu (200 mL) je zagrejana na 80 °C i držana tokom 20 sati. Smeša je ohlađena i koncentrovana da bi se uklonio rastvarač ispod 40 °C. Ostatak je rastvoren u dihlormetanu (200 mL), a zatim 2 N KOH (100 mL). Dobijena smeša je mešana na 20 °C tokom 1 h. Organski sloj je ispran slanim rastvorom (200 mL × 3), osušen preko Na2SO4i filtriran. Filtrat je koncentrovan u vakuumu da bi se dobio N-metoksi-N-metil-2-(trifenil-15-fosfaniliden) acetamid (36 g, 0,1 mol, 98%) kao žuta čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 364.4 [M+H]<+>.
Korak 2: (E)-4,4,4-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilbut-2-enamid:
Smeša od N-metoksi-N-metil-2-(trifenil-15-fosfaniliden) acetamida (36,3 g, 0,1 mol) i 1,1,1-trifluorpropan-2-ona (22,4 g, 0,2 mol) u tetrahidrofuranu (500 mL) zagrevana je na 20 °C i držana 20 sati. Smeša je ohlađena i koncentrovana da bi se uklonio rastvarač ispod 40 °C u vakuumu. Ostatak je prečišćen kolonom silika gela (200 g, 200 ~ 300 mesh, UV 254 nm) eluiranjem etil acetatom u petrolej etru od 0 do 25 % da bi se dobio (E)-4,4,4-trifluor-N-metoksi -N,3-dimetilbut-2-enamid (19,5 g, 0,1 mol, 98%) kao žuto ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 198.2 [M+H]<+>.
Korak 3: 4,4,4-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilbutanamid:
Smeša (E)-4,4,4-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilbut-2-enamida (2 g, 0,01 mol) i Pd/C (10 %, 200 mg) u THF (50 mL) je mešan na 26 °C tokom 18 sati. Smeša je filtrirana, a filtrat je koncentrovan u vakuumu do suva da bi se dobio 4,4,4-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilbutanamid (2 g, 0,01 mol, 98 %) kao žuto ulje. ESI-MS (EI<+>, m/z): 200,2 [M+H]<+>.
Korak 4: 4,4,4-trifluor-3-metilbutanal:
U rastvor 4,4,4-trifluor-N-metoksi-N,3-dimetilbutanamida (2 g, 0,01 mol) u 40 mL THF je dodat LiAlH4(0,4 g, 0,01 mol) na 0 °C. Smeša je mešana na 0 °C tokom 1 h. Reakciona smeša je ugašena vodom, a zatim metil terc-butil etrom (30 mL × 2). Organski sloj je ispran slanim rastvorom (50 mL × 3), osušen preko Na2SO4i filtriran. Filtrat je zadržan da bi se dobio 4,4,4-trifluor-3-metilbutanal (1,4 g, sirov) kao bezbojni rastvor, koji je direktno korišćen u sledećem koraku.
Korak 5: 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentannitril:
U rastvor gornjeg 4,4,4-trifluor-3-metilbutanala u metil terc-butil etru (100 mL) dodat je benzilamin (1,5 mL), AcOH (1,0 mL), a zatim TMSCN (1,5 mL) sa ledenim kupatilom. Smeša je zagrejana na 20 °C i mešana preko noći. Rastvor je razblažen vodom (30 mL) i ekstrahovan sa EtOAc (30 mL). Organska faza je isprana vodom (30 mL × 2) i slanim rastvorom (50 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobio 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4metil pentannitril (2,6 g, sirovo) kao smeđe ulje koje je korišćeno za sledeći korak. ESI-MS (EI<+>, m/z): 257.3 [M+H]<+>.
Korak 6: N-benzil-4,4,4-trifluor-3-metil-1-(2H-tetrazol-5-il)butan-1-amin:
U rastvor 2-(benzilamino)-5,5,5-trifluor-4-metilpentannitrila (0,3 g, sirov) u DMF (10 mL) dodat je NH4Cl (0,15 g, 0,003 mol) i NaN3(0.21 g, 0,003 mol) i zagrevan je na 95 °C tokom 18 sati. Rastvor je ohlađen na 15 °C i ekstrahovan sa EtOAc (20 mL), organska faza je isprana vodom (20 mL × 2) i slanim rastvorom (20 mL), osušena (Na2SO4), filtrirana i koncentrovana u vakuumu da bi se dobio N-benzil-4,4,4-trifluor-3-metil-1-(2H-tetrazol-5-il)butan-1-amin (0,1 g, 0,5 mmol, 33% za 3 koraka) kao bela čvrsta supstanca. ESI-MS (EI<+>, m/z): 300.3 [M+H]<+>.
4,4,4-trifluor-3-metil-1-(2H-tetrazol-5-il)butan-1-amin trifluorosirćetna kiselina:
Rastvoru N-benzil-4,4,4-trifluor-3-metil-1-(2H-tetrazol-5-il)butan-1-amina (160 mg, 0,54 mmol) u MeOH (15 mL) je dodat HCOONH4(0,17 g, 2,7 mmol) i Pd/C (30 mg) na sobnoj temperaturi. Smeša je mešana na 60 °C tokom 2 sata. Reakciona smeša je filtrirana i koncentrovana da bi se dobio sirov proizvod koji je prečišćen hromatografijom reverzne faze na silika gelu da bi se dobila 4,4,4-trifluor-3-metil-1-(2H-tetrazol-5-il)butan- 1-amin trifluorosirćetna kiselina (72,8 mg, 0,23 mmol, 42%) kao bela čvrsta supstanca; ESI-MS (EI<+>, m/z): 210.2 [M+H]<+>; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 4.67-4.93 (m, 1H), 2.31 - 2.41 (m, 1H), 2.00-2.12 (m, 2H), 0.99 (dd, J = 16.8, J = 6.4 Hz, 6H).
Primer 210: Western blot test
Ovaj skrining test meri aktivnost test jedinjenja in vitro na GATOR2/Sestrin2 kompleksima prečišćenim imunoprecipitacijom stabilno eksprimovanog FLAG-WDR24 iz HEK293T ćelija. HEK293T ćelije (293Ts) su konstruisane da stabilno eksprimuju N-terminalno označen FLAG-WDR24 transdukcijom pomoću lentivirusa. Lentivirusi su proizvedeni ko-transfekcijom vektora za prenos lentivirusa pLJM60 sa ΔVPR omotačem i CMV VSV-G pakovanjem plazmida u ćelije HEK-293T korišćenjem XTremeGene 9 transfekcionog reagensa (Roche Diagnostics). Medijum je promenjen 24 sata nakon transfekcije u Dulbecco-ov modifikovani Eagleov medijum (DMEM) sa dodatkom 30% inaktiviranog fetalnog seruma. Supernatanti koji sadrže virus su sakupljeni 48 i 72 sata nakon transfekcije i propušteni kroz filter od 0,45 µm da bi se eliminisale ćelije. Ciljne ćelije u pločama za kulturu tkiva sa 6 ležišta su inficirane u medijumu koji sadrži 8 µg/mL polibrena i spin infekcije su izvedene centrifugiranjem na 2.200 rpm tokom 1 sata. Dvadeset četiri sata nakon infekcije, virus je uklonjen, a ćelije izabrane izgovarajućim antibiotikom. Ćelije su zatim uzgajane u DMEM-u sa dodatkom 10% fetalnog goveđeg seruma i antibiotika.
Za skrining na leucin mimetička jedinjenja, 2.000.000 FLAG-WDR24 eksprimujućih 293T ćelija je postavljeno u ploču za kulturu tkiva od 10 cm. Sedamdeset dva sata kasnije, ćelije su stavljene u standardni RPMI medijum formulisan bez amino-kiselina i dopunjen sa 5 mM glukoze (-AA RPMI, US Biological Life Sciences) tokom 1 sata, a zatim su lizirane u puferu za lizu (40 mM HEPES, 1% Triton, 10 mM natrijum β-glicerofosfat, 10 mM natrijum pirofosfat, 2,5 mM MgCl2 i inhibitori proteaze). Da bi se izolovao kompleks FLAG-WDR24/endogeni-Sestrin2, sirovi lizat (ekvivalentno 2-4mg ukupnog proteina) u zapremini od 1 ml je podvrgnut imunoprecipitaciji sa 30µl anti-flag smole (SIGMA) tokom 2 sata na 4°C , ispran dva puta u hladnom puferu za lizu plus 0,5 M NaCl i resuspendovan u 1 ml hladnog citosolnog pufera (40 mM HEPES pH 7.4, 140 mM KCl, 10 mM NaCl, 2,5 mM MgCl2, 0,1% TritonX-100). Test jedinjenja ili kontrole (dobijeni rastvor je filtriran ili leucin) su zatim dodati svakom uzorku imunoprecipitacije u različitim koncentracijama i inkubirani uz rotaciju na 4°C tokom 60 minuta. Posle perioda inkubacije, uzorci su centrifugirani da bi se peletirao FLAG-WDR24/endogeni-Sestrin2 kompleks vezan za anti-flag smolu, supernatant je potpuno uklonjen i smola je resuspendovana u SDS-PAGE puferu za uzorke i kuvana 5 minuta. Uzorci su zatim obrađeni pomoću SDS-PAGE i vestern blotovi su izvedeni sa anti-FLAG (SIGMA) i anti-Sestrin2 (Cell Signaling Technology) antitelima kao što je opisano u L. Chantranupong, et al., Cell Reports 9:1-8 (2014).
Dobijeni vestern blotovi su skenirani i intenziteti traka koji odgovaraju Sestrin2 i FLAG-WDR24 su kvantifikovani pomoću LI-COR<®>platforme za snimanje. Da bi se odredila količina Sestrina2 vezanog za GATOR2 za svako stanje, intenzitet trake za Sestrin2 je normalizovan na intenzitet trake FLAG-WDR24. Za svaku seriju testiranih jedinjenja, takođe je urađena negativna kontrola (dobijeni rastvor je filtriran) i pozitivna kontrola (leucin, 25 µM, SIGMA). Smanjenje vezanog endogenog Sestrina2 za FLAG-WDR24 leucinom je normalizovano da predstavlja 100% aktivnosti. Jedinjenja su analizirana u duplikatu i aktivnost svakog jedinjenja je kvantifikovana kao procenat aktivnosti leucina i usrednjena. Ponovljeni pokušaji proba rezultirali su standardnom devijacijom od 20% u prosečnoj aktivnosti leucina u poređenju sa vodom; stoga, testirana jedinjenja koja smanjuju količinu Sestrina2 vezanog za GATOR2 za najmanje 40% na 25 µM u duplikatu su smatrana statistički značajnim i okarakterisana su kao leucinski mimetici. Neka jedinjenja su povećala količinu Sestrina2 vezanog za FLAG-WDR24. Jedinjenja koja su povećala količinu Sestrina2 vezanog za GATOR2 za više od 40% (predstavljeno kao manje od -40% aktivnosti leucina) okarakterisana su kao antagonisti leucina.
Primer 211: Postupak identifikacije jedinjenja koja oponašaju ili antagonizuju aktivnost leucina na Sestrin2 i interakciju Sestrin2/GATOR2.
Uvod
Sestrin1 i Sestrin2 komuniciraju sa GATOR2 preko GATOR2 komponenti WDR24 i Seh1L pod nedovoljnim nivoima leucina. Pod uslovima dovoljne količine leucina, leucin se direktno vezuje za Sestrin2 izazivajući disocijaciju Sestrina2 od GATOR2. Cilj sledećih postupaka je da identifikuju jedinjenja koja oponašaju efekat leucina u vezivanju za Sestrin2 i ometaju Sestrin2/GATOR2. Pored toga, postupci identifikuju jedinjenja koja antagonizuju vezivanje leucina za Sestrin2 i sprečavaju odvajanje sestrina2 od GATOR2 kao odgovor na leucin.
Postupak 1 (in vitro PPI test)
[0504] Ovaj skrining test meri aktivnost jedinjenja in vitro na kompleksima GATOR2/Sestrin2 prečišćenim imunoprecipitacijom stabilno eksprimovanog FLAG-WDR24 iz ćelija HEK293T. HEK293T ćelije (293Ts) su konstruisane da stabilno eksprimuju N-terminalno obeležen FLAG-WDR24 transdukcijom pomoću lentivirusa. Lentivirusi su proizvedeni ko-transfekcijom vektora za prenos lentivirusa pLJM60 sa ΔVPR omotačem i CMV VSV-G pakovanjem plazmida u HEK-293T ćelije korišćenjem XTremeGene 9 reagensa za transfekciju. Medijum je zamenjen 24 sata nakon transfekcije u Dulbecco-ov modifikovani Eagleov medijum (DMEM) sa dodatkom 30% inaktiviranog fetalnog seruma. Supernatanti koji sadrže virus su sakupljeni 48 i 72 sata nakon transfekcije i propušteni kroz filter od 0,45 µm da bi se eliminisale ćelije. Ciljne ćelije u pločama za kulturu tkiva sa 6 ležišta su inficirane u medijumu koji sadrži 8 µg/mL polibrena i spin infekcije su izvedene centrifugiranjem na 2.200 rpm tokom 1 sata.24 sata nakon infekcije, virus je uklonjen, a ćelije izabrane izgovarajućim antibiotikom. Ćelije se zatim uzgajaju u DMEM-u sa dodatkom 10% fetalnog goveđeg seruma i antibiotika.
Za skrining na leucin mimetička jedinjenja, 2.000.000 FLAG-WDR24 koji eksprimiraju 293T se stavlja u ploču za kulturu tkiva od 10 cm.72 sata kasnije, ćelije su stavljene u standardni RPMI medijum formulisan bez amino-kiselina i dopunjen sa 5 mM glukoze (-AA RPMI, USBiological Life Sciences) tokom 1 sata, a zatim su lizirane u puferu za lizu (40 mM HEPES, 1% Triton, 10 mM natrijum Beta-Glicerofosfata, 10mM natrijum pirofosfata, 2,5mM MgCl2i inhibitori proteaze). Kompleks FLAG-WDR24/endogeni-Sestrin2 je izolovan na sledeći način: sirovi lizat (ekvivalentno 2-4mg ukupnog proteina) u zapremini od 1 ml je podvrgnut imunoprecipitaciji (IP) sa 30µl anti-flag smole (SIGMA) tokom 2 sati na 4°C, ispran dva puta u hladnom puferu za lizu plus 0,5 M NaCl i resuspendovan u 1 ml hladnog citosolnog pufera (40 mM HEPES pH 7.4, 140 mM KCl, 10 mM NaCl, 2,5 mM MgCl2, 0,1% TritonX-100). Jedinjenja su zatim dodata u svaki uzorak u datoj koncentraciji od 25 µM i inkubirana uz rotaciju na 4°C tokom 30 minuta. Nakon perioda inkubacije, uzorci su centrifugirani da bi se peletirao FLAG-WDR24/endogeni-Sestrin2 kompleks vezan za anti-flag smolu, supernatant je potpuno uklonjen i smola je resuspendovana u puferu za uzorke elektroforeze natrijum dodecil sulfat-poliakrilamidnog gela (SDS-PAGE) i kuvana 5 minuta. Uzorci su zatim obrađeni pomoću SDS-PAGE i vestern blotovi su izvedeni sa anti-Flag (SIGMA) i anti-Sestrin2 (Cell Signaling Technology) antitelima kao što je opisano u L. Chantranupong, et al., Cell Reports 9:1-8 (2014).
Dobijeni vestern blotovi su skenirani i intenziteti traka koji odgovaraju Sestrin2 i FLAG-WDR24 su kvantifikovani pomoću LI-COR<®>platforme za snimanje. Da bi se odredila količina Sestrina2 vezanog za GATOR2 za svako stanje, intenzitet trake za Sestrin2 je normalizovan na intenzitet trake FLAG-WDR24. Za svaku seriju testiranih jedinjenja, takođe je urađena negativna kontrola (voda) i pozitivna kontrola (leucin, 25 µM, SIGMA). Smanjenje vezanog endogenog sestrina2 za FLAG-WDR24 leucinom je normalizovano da predstavlja 100% aktivnosti. Jedinjenja se ispituju u duplikatu i aktivnost svakog jedinjenja se kvantifikuje kao procenat aktivnosti leucina i usrednjuje. Tabela u kojoj su navedeni kvantifikovani podaci iz testiranih jedinjenja predstavljena je u Tabeli 3. Ponovljeni pokušaji proba rezultirali su standardnom devijacijom od 20% u prosečnoj aktivnosti leucina u poređenju sa vodom; stoga, jedinjenja u kojima oba duplikata smanjuju količinu Sestrina2 vezanog za GATOR2 za najmanje 40% na 25 µM smatrana su statistički značajnim i nazivana su leucinski mimetici. Neka jedinjenja su povećala količinu Sestrina2 vezanog za FLAG-WDR24 (prikazano kao negativan procenat aktivnosti leucina u Tabeli 3). Jedinjenja koja su pokazala manje od -40% aktivnosti leucina su, takođe, smatrana hitovima i nazivana su antagonistima leucina.
Postupak 2 (aktivacija mTORC1 zasnovana na ćeliji)
Da bi se demonstrirala efikasnost jedinjenja identifikovanih kao leucinski mimetici u intaktnim ćelijama, mTORC1 signalizacija kao odgovor na tretman jedinjenjem nakon leucinskog gladovanja merena je Western blot testovima. Nakon leucinskog gladovanja, dodavanje egzogenog leucina aktivira mTORC1 kada se signalizacija meri 10 do 90 minuta nakon dodavanja leucina, kao što je opisano u Wang, S., Tsun, Z., et al. Science 347(6218): 188-194 (2015). Stoga je sličan test dizajniran da testira da li jedinjenja identifikovana kao leucinski mimetici aktiviraju mTORC1 na sličan način. Ukratko, 800.000 HEK293T ćelija je postavljeno u svako ležište ploče sa 6 ležišta u DMEM-u sa dodatkom 10% fetalnog goveđeg seruma i antibiotika. Sledećeg dana, ćelije su smeštene u modifikovani DMEM bez leucina (Thermo Scientific) ili seruma u trajanju od 1 sata, nakon čega je dodavan leucinski mimetik (n=3) u datoj koncentraciji tokom nekog vremenskog perioda dužeg od 10 minuta. Ćelije su zatim lizirane, obrađene za SDS-PAGE i vestern blot test je izveden sa antitelima usmerenim protiv mTORC1 supstrata fosforilisane S6 kinaze (Thr389) i fosforilisanog 4EBP1 (Thr37/46) (Cell Signaling Technology) i kontrola punjenja (beta-actin, Santa Cruz Biotechnology) kako je opisano u Kang, S.A., et al. Science 341(6144): 364-374 (2013). Intenzitet traka koje odgovaraju fosforilisanim supstratima je zatim normalizovan na aktinsku traku pomoću LI-COR<®>platforme za snimanje. Jedinjenja koja su značajno povećala mTORC1 signalizaciju u odnosu na ćelije bez leucina tretirane bez jedinjenja (studentski t-test, p<0,05) smatrana su aktivnim u ćelijama. Kao pozitivna kontrola, leucin je dodat u količini od 100 µM ćelijama koje su bile leucinski izgladnjivane tokom 60 minuta.
Postupak 3 (aktivacija mTORC1 zasnovana na ćeliji)
Da bi se demonstrirala efikasnost jedinjenja identifikovanih kao antagonisti leucina ili da bi se utvrdilo da li slabi leucinski mimetici povećavaju aktivnost leucina u netaknutim ćelijama, ponovljena je ista paradigma kao gore, ali sa sledećim promenama: ćelije su smeštene u leucin minus DMEM medijum (kao što je opisano u Postupku 3) tokom 60 minuta, a zatim u jedinjenje (n=3) tokom nekog vremenskog perioda koji je veći ili jednak 60 minuta. Posle tretmana jedinjenjem, ćelije su stimulisane sa 30 i 100 µM leucina tokom 60 minuta. mTORC1 signalizacija je merena putem vestern blot testa kao što je opisano u Postupku 2. Jedinjenja koja su smanjila nivoe aktin-normalizovanih fosforilisanih supstrata mTORC1 kao odgovor na leucin na ili 30 µM ili 100 µM na statistički značajan način (studentski t-test, p<0,05) bila su smatrana aktivnim u ćelijama. Jedinjenja koja su povećala nivoe aktin-normalizovanih fosforilisanih supstrata mTORC1 kao odgovor na leucin na 30 µM ili 100 µM na statistički značajan način (studentski ttest, p<0,05) smatrana su pojačivačima leucina u ćelijama. Kao kontrola, ćelije leucinski izgladnjene su prethodno tretirane vodom pre dodavanja leucina. Alternativno, potencijalni antagonisti leucina su analizirani u ćelijama HEK293T na isti način opisan gore, ali bez gladovanja i stimulacije leucinom. Vestern blotovi su izvedeni da bi se utvrdilo da li je osnovna signalizacija mTORC1 oslabljena nakon tretmana jedinjenjem u uslovima punog kultivisanja.
Postupak 4
Sposobnost jedinjenja da modulišu interakciju između Sestrina2 i GATOR2 u ćelijama merena je ponavljanjem testa opisanog u Postupcima 2 i 3, ali u ćelijama HEK293T projektovanim da stabilno eksprimuju FLAG-WDR24 postavljene u posude za kulturu tkiva od 10 cm. Interakcija između endogenog Sestrina 2 i FLAG-WDR24 je merena iz lizata dobijenog iz ćelija nakon tretmana jedinjenjem (n=3) kako je opisano u Postupku 1. Ukratko, da bi se izmerila količina endogenog Sestrina2 vezanog za FLAG-WDR24 nakon tretmana ćelija, imunoprecipitacija je izvedena sa anti-flag smolom i dobijeni uzorci su obrađeni za SDS-PAGE i vestern blot testovima da bi se izmerile količine endogenog sestrina 2 vezanog za FLAG-WDR24. Jedinjenja koja su modulisala količinu Sestrina2 vezanog za GATOR2 na statistički značajan način (student t-test, p<0,05) smatrana su pogocima.
Postupak 5 (ALPHALisa test na ćelijama)
Da bi se demonstrirala efikasnost jedinjenja identifikovanih kao leucinski mimetici u intaktnim ćelijama u formatu zasnovanom na ploči, mTORC1 signalizacija kao odgovor na tretman jedinjenjem nakon gladovanja leucinom merena je preko AlphaLISA. Ukratko, 1.000.000 HEK293T ćelija je stavljeno na ploče u boce za kulturu ćelija T-75 u DMEM sa dodatkom 10% fetalnog goveđeg seruma. Nakon što su ćelije dostigle konfluentnost, stavljene su u modifikovani DMEM bez leucina (Thermo Scientific) sa 10% dijalizovanim fetalnim goveđim serumom tokom 1 sata. Ćelije su zatim tripsinizovane i zamenjene u pločicama sa 96 ležišta sa crnim providnim dnom na 50.000 ćelija/ležištu u DMEM bez leucina sa 10% dijalizovanim fetalnim goveđim serumom. Ćelije su ostavljene da prianjaju na ploču 2 sata, nakon čega je usledilo dodavanje jedinjenja (n=4) u datoj koncentraciji tokom nekog vremenskog perioda dužeg od 1 sata. Nakon što je dostignuta vremenska tačka, ćelije su lizirane i analizirane pomoću p-p70 S6K (Thr389) SureFire Ultra AlphaLISA kompleta prema uputstvima proizvođača (http://www.perkinelmer.com/CMSResources/Images/
44-176283MAN_SureFire_TGR70S_p70_pT389.pdf). Jedinjenja koja su značajno povećala mTORC1 signalizaciju u odnosu na ćelije bez leucina tretirane bez jedinjenja (studentski t-test, p<0,05) smatrana su mTORC1 aktivatorima. Jedinjenja koja su značajno smanjila mTORC1 signalizaciju u odnosu na ćelije leucinski izgladnjivane tretirane bez jedinjenja (studentski t-test, p<0,05) smatrana su inhibitorima u ćelijama. Kao pozitivna kontrola, leucin je dodat u količini od 100 uM ćelijama koje su leucinski izgladnjivane tokom vremenskog perioda koji je jednak tretmanu jedinjenjem.
Postupak 6, Protokol termalnog pomaka (Tm shift):
Humani Sestrin2 pune dužine, optimizovan kodonom, N-terminalno je fuzionisan sa His-MBP oznakom i kloniran u pMAL6H-C5XT bakterijski ekspresioni vektor. Ovaj vektor je transformisan u ćelije Escherichia coli LOBSTR (DE3) (Kerafast). Ćelije su uzgajane na 37 °C do 0,6 OD, a zatim je indukovana proizvodnja proteina sa 0,2 mM IPTG na 18 °C tokom 12-14 h. Ćelije su sakupljene centrifugiranjem na 6,000 g, resuspendovane u puferu za lizu (50 mM kalijumfosfat, pH 8.0, 500 mM NaCl, 30 mM imidazola, 1 mM DTT, 10 µg/ml benzonaze i 1 mM PMSF) i lizirane sinikacijom. Lizat je očišćen centrifugiranjem na 10.000 g tokom 20 min. Protein Sestrin2 je izolovan iz rastvorljive frakcije do skoro 100% čistoće kroz afinitetno hvatanje His oznake praćeno izmenom jona i hromatografijom isključivanja veličine. Za test termičkog pomeranja, protein Sestrin2 je razblažen do 2 mg/ml u puferu za razblaživanje (10 mM Tris HCl pH 7.4, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 0,1 mM EDTA). Pre izvođenja testa termičkog pomeranja, 2 µl proteina Sestrin2 je kombinovano sa 8 µl ROX boje (Thermo Fisher), 1 µL vehikuluma ili jedinjenja i 14 µL pufera za razblaživanje po ležištu ploče sa 96 ležišta, i inkubirano na ledu 1 sat da bi se omogućilo vezivanje spojeva. Test termičkog pomeranja je zatim izveden na Agilent MX3005p i svako jedinjenje je analizirano u tri primerka na 10 µM, 100 µM i 1000 µM. Inkubacija sa leucinom je pomerila temperaturu topljenja Sestrina2 za 2,16 do 11,61 stepeni Celzijusa na način koji zavisi od doze. Pozitivan pomak od 2 stepena ili više se smatra statistički značajnim na osnovu CV% varijabilnosti ponovljenih merenja termičkog pomeranja Sestrina2 inkubiranih sa vehikulom.
Postupak 7, Indirektni test vezivanja liganda (ILBA)
[0512] Vezivanje Sestrina2 za leucin ili drugi ligand je otkriveno ili u intaktnim ćelijama, in vitro ili sa prečišćenim proteinom putem imunološke detekcije sa zečjim monoklonskim anti-Sestrin2 antitelom iz Cell Signaling Technology (CST, Cat # 8487). Vezivanje CST antitela za nativni (nedenaturisani) Sestrin2 je modulisano vezivanjem leucina na takav način da se afinitet antitela smanjuje nakon vezivanja leucina. Slično, afinitet CST antitela za nativni Sestrin2 se smanjio kada se jedinjenja vezuju za nativni na način sličan leucinu. Suprotno tome, jedinjenja koja su destabilizovala Sestrin2 kao što je mereno testom termičkog pomeranja povećala su afinitet CST antitela za nedenaturisani Sestrin2. Kao rezultat, razvijeni su višestruki formati ovog indirektnog testa vezivanja liganda (ILBA) koji meri afinitet CST anti-Sestrin2 antitela nakon vezivanja leucina ili jedinjenja. U jednoj verziji, test je izveden sa sirovim lizatom generisanim iz humane ćelijske linije nakon 1-časovnog perioda amino-kiselinskog gladovanja (ćelije su lizirane u 1% Triton, 10 mM beta-glicerol fosfatu, 10 mM natrijum pirofosfatu, 40 mM HEPES [pH 7.4], 150 mM NaCl i 2,5 mM MgCl2). Lizat je zatim inkubiran sa leucinom ili drugim jedinjenjem 1 sat na ledu ili na sobnoj temperaturi. Nakon inkubacije jedinjenja, uzorci su podvrgnuti imunoprecipitaciji sa CST anti-Sestrin2 antitelom tokom 1,5 sata, nakon čega je usledila 30-minutna inkubacija sa protein-A sefarozom kao što je opisano u L. Chantranupong, et al., Cell Reports 9:1-8 (2014). Kompleks antitelo-protein konjugovan sa sefarozom je istaložen centrifugiranjem, a protok je podvrgnut drugom krugu imunoprecipitacije sa zečjim poliklonalnim anti-Sestrin2 antitelom (Protein Tech, #10795-1-AP) da bi se odredilo da li su ukupni nivoi proteina Sestrin2 između uzoraka bili su jednaki. SDS-PAGE je izveden sa uzorcima imunoprecipitacije, nakon čega je usledio vestern-blot sa mišjim monoklonskim anti-Sestrin2 antitelom iz SIGMA (kat. br. WH0083667M3). Vezivanje leucina izazvalo je značajno smanjenje intenziteta trake koja odgovara Sestrin2 za 50% ili više na imunoblotu sa uzorcima imunoprecipitiranim sa anti-Sestrin2 antitelom iz CST, ali nije dovelo do promene u Sestrin2 traci na imunoblotu sa uzorcima imunoprecipitiranim sa Protein Tech antitelom. Ova verzija testa je, takođe, merila povećanu nestabilnost Sestrina2 izazvanu inkubacijom sa jedinjenjima. Test je izveden na isti način, ali jedinjenja koja su destabilizovala Sestrin2 (kako je mereno testom termičkog pomeranja) su rezultirala povećanjem intenziteta imunoblot trake koji odgovara Sestrinu2 imunoprecipitiranom korišćenjem CST antitela.
Ovaj test je takođe izveden u kultivisanim humanim ćelijama koje prekomerno eksprimuju Sestrin2 N-terminalno spojen sa Flag oznakom. U ovoj verziji testa, postupak je ostao isti, ali je imunoblotiranje izvršeno sa mišjim anti-Flag antitelom (#F3165, SIGMA). Smanjenje afiniteta CST antitela nakon vezivanja leucina ili γ-metilleucina nije primećeno kada je ILBA izvedena sa tačkastim mutantnim oblikom Sestrina2 koji nije u stanju da veže leucin.
U drugoj verziji testa, kultivisane humane ćelije su bile podvrgnute nekoj kombinaciji aminokiselinskog gladovanja tokom 1 sata nakon čega je usledila stimulacija leucinom ili jedinjenjima. Jedan sat nakon stimulacije, ćelije su lizirane i obrađene kao što je gore opisano sa izuzetkom 1-časovnog koraka vezivanja liganda.
Test indirektnog vezivanja liganda je, takođe, izveden u formatu sa više ležišta korišćenjem ALPHAlisa tehnologije (Perkin Elmer). Ova verzija testa zahtevala je biotinilovano anti-Sestrin2 antitelo, Streptavidin donor perle (Perkin Elmer) u kombinaciji sa ili anti-Flag akceptor perlama (Perkin Elmer) za detekciju prekomerno eksprimiranih Flag-Sestrin2, ili u kombinaciji sa mišjim anti-Sestrin2 antitelom (SIGMA) i antimišjim akceptorskim perlama (Perkin Elmer) za detekciju endogenog Sestrina2.
Test je izveden kao što je gore opisano, ali sa sledećim modifikacijama: za deo testa koji se tiče vezivanja za leucin ili jedinjenje, sirovi lizat generisan iz ćelija koje prolazno ili stabilno prekomerno eksprimuju humani Flag-Sestrin2 nakon 1 sata amino-kiselinskog gladovanja je razblažen do 0,8 mg /ml ukupnog proteina u puferu za lizu i poređan u ploču sa više ležišta kao što je ploča sa 96 ležišta. Za detekciju endogenog Sestrina2, sirovi lizat je razblažen do 4 mg/ml ukupnog proteina u puferu za lizu. Leucin ili jedinjenje je dodat u svako ležište i ploča je inkubirana na ledu ili na sobnoj temperaturi 1 sat uz lagano mešanje. Tokom koraka vezivanja liganda, biotinilovano anti-Sestrin2 antitelo (CST) je razblaženo do 5nM u ALPHAlisa puferu za imunološki test (Perkin Elmer), a 5nM mišjeg anti-Sestrin2 antitela (SIGMA) je kombinovano sa 4X zalihama antimišjih akceptorskim perlama (40 µg/ml) za testove koji detektuju endogeni Sestrin2. Za detekciju Flag-Sestrina2, pripremljena je 4X zaliha anti-Flag akceptorskih perli (40 µg/ml) u puferu za imunoprobe. Posle koraka vezivanja liganda, 5 µL lizata je pripremljeno kombinovano sa 10 µL biotinilovanog anti-Sestrin2 antitela, 12,5 µL mešavine mišjeg Sestrin2 antitela/antimiših akceptorskih perli ili perli anti-Flag akceptora i 10 µL ALPHAlisa pufera za imunoprobu i inkubirano je na sobnoj temperaturi 1 sat. Dodato je 12,5 µL donorskih perli streptavidina (160 µg/ml u puferu za imunoprobe) još jedan sat u mraku pre očitavanja ploče na Envision čitaču ploča.
ALPHAlisa test je takođe izveden kako je opisano, ali sa prečišćenim proteinom Sestrin2 u konačnoj reakcionoj koncentraciji od 3 ng/ml razblaženim u puferu za imunoprobe.
Konačno, ALPHAlisa je izvedena sa lizatom iz ćelija tretiranih leucinom ili jedinjenjem u uslovima bez amino-kiselina pre lize. Tretman zasnovan na ćelijama je izveden u ploči sa više ležišta, a 15 µL lizata (1 mg/ml ukupnog proteina) je korišćeno po ALPHAlisa reakciji u kombinaciji sa 10 µL biotinilovanog antitela, 125 µL mešavine antitelo/akceptor i 125 µL mešavine smeša donorskih perli streptavidina.
Test indirektnog vezivanja liganda je, takođe, izveden postupkom zasnovanim na hvatanju kao što je ELISA sendvič kao što je izvedeno u tehnici. U jednoj verziji testa, ILBA je izvedena korišćenjem MULTI-ARRAI<®>tehnologije koju je razvio Meso-Scale Discovery (MSD). MSD sistem je zasnovan na elektrohemiluminiscentnoj detekciji vezivanja antitela za analit. ILBA je izvedena sa sirovim lizatom koji eksprimuje endogeni Sestrin2 ili prekomerno eksprimirani Flag-Sestrin2, a tretman leucinom je obavljen ili in vitro ili u ćelijama pre lize. Za in vitro ILBA sa endogenim Sestrinom2, pripremljen je sirovi lizat (0,8 mg/ml ukupnog proteina) i vezivanje leucina je izvedeno na isti način opisan za ALPHAlisa ILBA. Nakon što je vezivanje liganda završeno, biotinilovano anti-Sestrin2 antitelo iz CST je dodato u svako ležište do konačne koncentracije od 0,25 µg/ml i inkubirano je uz lagano mešanje 1 sat na 4°C. Hvatanje svakog uzorka u ležište ploče sa 96 ležišta je postignuto na jedan od sledećih načina: MSD ploče obložene streptavidinom ili gole MSD ploče obložene mišjim anti-Sestrin2 antitelom iz SIGMA. Za hvatanje je bilo potrebno 25 µL uzorka po ležištu, nakon čega sledi 1-časovna inkubacija uz mućkanje na 350 rpm. Nakon hvatanja uzorka, ležišta su tri puta isprana Tris puferiranim fiziološkim rastvorom sa 0,1% Tween-a (TBS-T). Ako su uzorci uhvaćeni na ploču obloženu streptavidinom, mišje monoklonsko anti-Sestrin2 antitelo (SIGMA) je zatim dodato do konačne koncentracije od 1 µg/ml tokom 1 sata uz mućkanje na 350 rpm. Ležišta su ponovo isprana u TBS-T i dodato je anti-mišje sekundarno SULFO-TAG antitelo u konačnoj koncentraciji od 1 µg/ml (MSD) tokom jednog sata uz mućkanje na 350 rpm. Na kraju, ležišta su isprana tri puta sa TBS-T i dodat je 2X pufer za očitavanje (MSD) i ploča je odmah očitana na MSD instrumentu. Ako su uzorci uhvaćeni golim pločama obloženim mišjim anti-Sestrin2 antitelom, nakon pranja, dodato je sekundarno streptavidin SULFO-TAG antitelo (MSD) u konačnoj koncentraciji od 1 µg/ml tokom 1 sata uz mućkanje praćeno ispiranjem i inkubacijom sa puferom za očitavanje pre analize.
U drugoj verziji ovog testa, sirovi lizat sa prekomernom ekspresijom Flag-Sestrina2 je analiziran i uhvaćen ili detektovan mišjim monoklonskim anti-Flag antitelom (SIGMA) korišćenjem istog protokola zasnovanog na MSD kao što je gore opisano.
Za sve testove, jedinjenja koja su značajno smanjila signal koji odgovara imunoreaktivnosti Sestrina2 smatrana su leucinskim mimeticima, dok su jedinjenja koja su povećala signal na značajan način smatrana potencijalnim antagonistima leucina.
Tabela 3 pokazuje aktivnost odabranih jedinjenja. Brojevi jedinjenja odgovaraju brojevima jedinjenja u Tabelama 1 i 2. Jedinjenja koja imaju aktivnost označenu kao „A” daju % aktivnosti u odnosu na leucin od ≥40%, jedinjenja koja imaju aktivnost označenu kao „B” obezbeđuju % aktivnosti u odnosu na leucin od ≤-40%; jedinjenja koja imaju aktivnost označenu kao „C” obezbeđuju % aktivnosti u odnosu na leucin između -40 i 40%. Jedinjenja koja imaju aktivnost označenu kao „D” obezbeđuju pomak u odnosu na DMSO kontrolu od 0,5 do 2 puta, jedinjenja koja imaju aktivnost označenu kao „E” obezbeđuju pomak u odnosu na DMSO od 2,1-5 puta, jedinjenja koja imaju aktivnost označenu kao „ F” obezbeđuju pomak u odnosu na DMSO od 5,1-10 puta, a jedinjenja koja imaju aktivnost označenu kao „G” obezbeđuju pomak u odnosu na DMSO od 10,1 do 14 puta, pri naznačenim koncentracijama.
[0523] Aktivnost za procenat aktivnosti u odnosu na leucinski test određena je korišćenjem postupka 1. Aktivnost za test aktivacije mTORC1 zasnovane na ćelijama je određena korišćenjem analize postupka 2.
Tabela 3. Podaci o ispitivanju za primerna jedinjenja
[0524] Tabela 4 prikazuje odabrana jedinjenja koja su aktivna u testu na bazi ćelija ALPHALisa (Postupak 5). Brojevi jedinjenja odgovaraju brojevima jedinjenja u Tabelama 1 i 2. Jedinjenja navedena u Tabeli 4 su mTORC1 aktivatori i imaju aktivnost >2 puta u odnosu na pozitivnu kontrolu leucina.
Tabela 4. Primeri jedinjenja aktivnih u ALPHALisa testu na bazi ćelija
[0525] Tabela 5 prikazuje odabrana jedinjenja aktivna u testu Termičkog pomeranja (Postupak 6). Brojevi jedinjenja odgovaraju brojevima jedinjenja u Tabelama 1 i 2. Jedinjenja navedena u Tabeli 5 pokazala su pozitivan pomak od 2 stepena ili više.
Tabela 5. Primeri jedinjenja aktivnih u testu termičkog pomeranja

Claims (11)

  1. Patentni zahtevi 1. Jedinjenje izabrano iz:
  2. ili njegova farmaceutski prihvatljiva so. 2. Jedinjenje prema zahtevu 1, pri čemu je dato jedinjenje:
  3. ili njegova farmaceutski prihvatljiva so. 3. Jedinjenje prema zahtevu 1, pri čemu je dato jedinjenje:
  4. 4. Farmaceutski prihvatljiva kompozicija koja sadrži jedinjenje prema zahtevu 1, zahtevu 2 ili zahtevu 3 i farmaceutski prihvatljiv nosač, pomoćno sredstvo ili vehikulum; opciono u kombinaciji sa dodatnim terapeutskim sredstvom; opciono pri čemu je dodatno terapeutsko sredstvo antiproliferativno jedinjenje.
  5. 5. In vitro postupak za modulaciju interakcije Sestrin-GATOR2 čime se selektivno modulira aktivnost mTORC1 indirektno u biološkom uzorku koji obuhvata korak dovođenja u kontakt datog biološkog uzorka sa jedinjenjem prema zahtevu 1, zahtevu 2 ili zahtevu 3.
  6. 6. Kompozicija prema zahtevu 4 za upotrebu u modulaciji interakcije Sestrin-GATOR2 čime se indirektno selektivno moduliše aktivnost mTORC1, za upotrebu u lečenju: (I) Raka izabranog iz leukemija, izabranih iz akutne leukemije, akutne limfocitne leukemije, akutne mijelocitne leukemije, akutne mijeloblastne leukemije, akutne promijelocitne leukemije, akutne mijelomonocitne leukemije, akutne monocitne leukemije, akutne eritroleukemije, hronične leukemije, hronične mijelocitne leukemije, hronične limfocitne leukemije, policitemije vera, limfoma, izabranog iz Hočkinove bolesti ili ne-Hočkinove bolesti, Waldenstromove makroglobulinemije, multiplog mijeloma, bolesti teškog lanca i solidnih tumora kao što su sarkomi i karcinomi, izabrani iz fibrosarkoma, miksosarkoma, liposarkoma, hondrosarkoma, osteogenog sarkoma, hordoma, angiosarkoma, endoteliosarkoma, limfangiosarkoma, limfangioendoteliosarkoma, sinovioma, mezotelioma, Juingovog tumora, lejomiosarkoma, rabdomiosarkoma, karcinoma debelog creva, raka pankreasa, raka dojke, raka jajnika, karcinoma prostate, karcinoma skvamoznih ćelija, karcinoma bazalnih ćelija, adenokarcinoma, karcinoma znojnih žlezda, karcinoma lojnih žlezda, papilarnih karcinoma, papilarnih adenokarcinoma, cistadenokarcinoma, medularnih karcinoma, bronhogenih karcinoma, karcinoma bubrežnih ćelija, hepatoma, karcinoma žučnih kanala, horiokarcinoma, seminoma, embrionalnog karcinoma, Vilmovog tumora, raka grlića materice, raka materice, raka testisa, raka pluća, mikrocelularnog karcinoma pluća, karcinoma mokraćne bešike, epitelnog karcinoma, glioma, astrocitoma, meduloblastoma, kraniofaringioma, ependimoma, pinealoma, hemangioblastoma, akustičnog neuroma, oligodendroglioma, švanoma, meningioma, melanoma, neuroblastoma i retinoblastoma, (II) proliferativne bolesti izabrane iz gojaznosti, benigne hiperplazije prostate, psorijaze, abnormalne keratinizacije, limfoproliferativnih poremećaja, pri čemu je dati poremećaj poremećaj u kome postoji abnormalna proliferacija ćelija limfnog sistema, hronični reumatoidni artritis, arterioskleroza, restenoza i dijabetesna retinopatija, ili (III) Ribozomopatije, izabrane iz Diamond-Blackfan anemije, 5q-sindroma, Shwachman-Diamondovog sindroma, X-vezane diskeratoze, hipoplazije kose i hrskavice ili Treacher-Collinsovog sindroma, kohezinopatija, izabranih iz sindroma Robertsovog ili Cornelia de Lange sindroma, atrofije mišića, autofagije ili depresija.
  7. 7. Kompozicija za upotrebu prema zahtevu 6, pri čemu je kompozicija za upotrebu u lečenju depresije.
  8. 8. Kompozicija prema zahtevu 4 za upotrebu u lečenju poremećaja posredovanog mTORC1, pri čemu je poremećaj posredovan mTORC1: (I) Rak izabran iz leukemija, izabranih iz akutne leukemije, akutne limfocitne leukemije, akutne mijelocitne leukemije, akutne mijeloblastne leukemije, akutne promijelocitne leukemije, akutne mijelomonocitne leukemije, akutne monocitne leukemije, akutne eritroleukemije, hronične leukemije, hronične mijelocitne leukemije, hronične limfocitne leukemije, policitemije vera, limfoma, izabranog iz Hočkinove bolesti ili ne-Hočkinove bolesti, Waldenstromove makroglobulinemije, multiplog mijeloma, bolesti teškog lanca i solidnih tumora kao što su sarkomi i karcinomi, izabrani iz fibrosarkoma, miksosarkoma, liposarkoma, hondrosarkoma, osteogenog sarkoma, hordoma, angiosarkoma, endoteliosarkoma, limfangiosarkoma, limfangioendoteliosarkoma, sinovioma, mezotelioma, Juingovog tumora, lejomiosarkoma, rabdomiosarkoma, karcinoma debelog creva, raka pankreasa, raka dojke, raka jajnika, karcinoma prostate, karcinoma skvamoznih ćelija, karcinoma bazalnih ćelija, adenokarcinoma, karcinoma znojnih žlezda, karcinoma lojnih žlezda, papilarnih karcinoma, papilarnih adenokarcinoma, cistadenokarcinoma, medularnih karcinoma, bronhogenih karcinoma, karcinoma bubrežnih ćelija, hepatoma, karcinoma žučnih kanala, horiokarcinoma, seminoma, embrionalnog karcinoma, Vilmovog tumora, raka grlića materice, raka materice, raka testisa, raka pluća, mikrocelularnog karcinoma pluća, karcinoma mokraćne bešike, epitelnog karcinoma, glioma, astrocitoma, meduloblastoma, kraniofaringioma, ependimoma, pinealoma, hemangioblastoma, akustičnog neuroma, oligodendroglioma, švanoma, meningioma, melanoma, neuroblastoma i retinoblastoma, (II) proliferativne bolesti izabrane iz gojaznosti, benigne hiperplazije prostate, psorijaze, abnormalne keratinizacije, limfoproliferativnih poremećaja, pri čemu je dati poremećaj poremećaj u kome postoji abnormalna proliferacija ćelija limfnog sistema, hronični reumatoidni artritis, arterioskleroza, restenoza i dijabetesna retinopatija, ili (III) Ribozomopatije, izabrane iz Diamond-Blackfan anemije, 5q-sindroma, Shwachman-Diamondovog sindroma, X-vezane diskeratoze, hipoplazije kose i hrskavice ili Treacher-Collinsovog sindroma, kohezinopatija, izabranih iz sindroma Robertsovog ili Cornelia de Lange sindroma, atrofije mišića, autofagije ili depresija.
  9. 9. Kompozicija za upotrebu prema zahtevu 8, pri čemu je poremećaj depresija.
  10. 10. Kompozicija za upotrebu prema zahtevu 7, pri čemu je dato jedinjenje:
  11. 11. Kompozicija za upotrebu prema zahtevu 9, pri čemu je dato jedinjenje:
    Izdaje i štampa: Zavod za intelektualnu svojinu, Beograd, Kneginje Ljubice 5
RS20230265A 2015-10-23 2016-10-21 Modulatori interakcije sestrin-gator2 i nјihova upotreba RS64114B1 (sr)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562245553P 2015-10-23 2015-10-23
US201662336219P 2016-05-13 2016-05-13
EP16858326.8A EP3364958B1 (en) 2015-10-23 2016-10-21 Modulators of sestrin-gator2 interaction and uses thereof
PCT/US2016/058188 WO2017070518A1 (en) 2015-10-23 2016-10-21 Modulators of sestrin-gator2 interaction and uses thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RS64114B1 true RS64114B1 (sr) 2023-04-28

Family

ID=58557891

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RS20230265A RS64114B1 (sr) 2015-10-23 2016-10-21 Modulatori interakcije sestrin-gator2 i nјihova upotreba

Country Status (23)

Country Link
US (5) US10100066B2 (sr)
EP (2) EP3364958B1 (sr)
JP (4) JP6800968B2 (sr)
KR (2) KR20240144424A (sr)
CN (2) CN108289866B (sr)
AU (4) AU2016342027B2 (sr)
BR (1) BR122021005850B1 (sr)
CA (2) CA3001703C (sr)
CO (1) CO2018005315A2 (sr)
DK (1) DK3364958T3 (sr)
ES (1) ES2941969T3 (sr)
FI (1) FI3364958T3 (sr)
HR (1) HRP20230331T1 (sr)
HU (1) HUE061437T2 (sr)
IL (1) IL258779B (sr)
LT (1) LT3364958T (sr)
MX (2) MX389001B (sr)
PL (1) PL3364958T3 (sr)
PT (1) PT3364958T (sr)
RS (1) RS64114B1 (sr)
SG (1) SG11201803099SA (sr)
SI (1) SI3364958T1 (sr)
WO (1) WO2017070518A1 (sr)

Families Citing this family (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20160145344A1 (en) * 2014-10-20 2016-05-26 University Of Southern California Murine and human innate lymphoid cells and lung inflammation
ES2941969T3 (es) 2015-10-23 2023-05-29 Navitor Pharm Inc Moduladores de la interacción de Sestrina-GATOR2 y sus usos
JP7179015B2 (ja) * 2017-04-26 2022-11-28 ナビター ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド Ｓｅｓｔｒｉｎ－ＧＡＴＯＲ２相互座用のモジュレーターおよびその使用
US11345654B2 (en) 2018-10-24 2022-05-31 Navitor Pharmaceuticals, Inc. Polymorphic compounds and uses thereof
EP3873897B1 (en) 2018-10-30 2024-08-14 Gilead Sciences, Inc. N-benzoyl-phenylalanine derivatives as alpha4beta7 integrin inhibitors for treating inflammatory diseases
PL3873900T3 (pl) 2018-10-30 2025-06-02 Gilead Sciences, Inc. Imidazo[1,2-a]pirydynowe pochodne jako inhibitory integryny alpha4beta7 do leczenia chorób zapalnych
LT3873884T (lt) 2018-10-30 2025-03-10 Gilead Sciences, Inc. 3-(chinolin-8-il)-1,4-dihidropirido[3,4-d]pirimidin-2,4-diono dariniai kaip alfa4beta7 integrino inhibitoriai, skirti uždegiminių ligų gydymui
KR102659859B1 (ko) 2018-10-30 2024-04-25 길리애드 사이언시즈, 인코포레이티드 알파4β7 인테그린의 억제를 위한 화합물
CN111689993B (zh) * 2019-03-11 2023-04-14 凯特立斯（深圳）科技有限公司 一种新的含硼类佐米药物关键中间体手性α-氨基硼酸酯的制备方法
EP4013499A1 (en) 2019-08-14 2022-06-22 Gilead Sciences, Inc. Compounds for inhibition of alpha 4 beta 7 integrin
IL292612A (en) * 2019-11-01 2022-07-01 Navitor Pharm Inc Treatment methods using mtorc1 modulator
CN112699498B (zh) * 2021-03-23 2021-05-25 中国空气动力研究与发展中心计算空气动力研究所 基于归一化物理量间断特征的喷流模拟激波快速判别方法
EP4234014A1 (en) * 2022-02-28 2023-08-30 Insusense ApS Amino acid based carbamates and/or ureas for the treatment of sortilin dependent diseases
KR102777583B1 (ko) 2024-05-24 2025-03-07 충남대학교산학협력단 세스트린2를 포함하는 전립선 질환 예방 또는 치료용 조성물

Family Cites Families (83)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3452015A (en) * 1967-07-12 1969-06-24 Lilly Co Eli Synthesis of beta,beta-alkyl pyrrolidines
US3567726A (en) * 1968-12-18 1971-03-02 Lilly Co Eli Synthesis of beta,beta-di-alkyl pyrrolidines
US4110368A (en) 1972-07-24 1978-08-29 American Cyanamid Company Hydro substituted prostanoic acids and esters
US4179574A (en) * 1973-04-27 1979-12-18 American Cyanamid Company Novel 2-substituted-3,4-epoxycyclopentan-1-ones, 2-substituted-3,4-epoxycyclopentan-1-ols, and various 2-substituted-cyclo-pentenones
US4346110A (en) 1981-06-01 1982-08-24 Merrell Toraude Et Compagnie Method for treating depression
JPS61149964A (ja) 1984-12-25 1986-07-08 Canon Inc 電子写真感光体
US4670196A (en) 1985-09-05 1987-06-02 Norton Company Tower packing element
ES2029799T3 (es) 1986-01-24 1992-10-01 Toray Industries, Inc. Derivados de 2,5,6,7 tetranor-4,8-inter-m-fenilen pg12.
GB8827885D0 (en) 1988-11-30 1989-01-05 Wellcome Found Novel heterocyclic pesticidal compounds
US5639600A (en) 1994-08-05 1997-06-17 The Regents Of The University Of California Diagnosis and treatment of cell proliferative disease having clonal macrophage involvement
DE19623142A1 (de) 1996-06-10 1997-12-11 Huels Chemische Werke Ag Enantiomerenangereicherte, durch einen tertiären Kohlenwasserstoffrest substituierte Malonsäuremonoester sowie deren Herstellung
KR20000035925A (ko) 1996-08-28 2000-06-26 데이비드 엠 모이어 매트릭스 메탈로프로테아제 저해제인 포스핀산 아미드
US7087648B1 (en) 1997-10-27 2006-08-08 The Regents Of The University Of California Methods for modulating macrophage proliferation using polyamine analogs
AU3459999A (en) * 1998-04-27 1999-11-16 Warner-Lambert Company Substituted diarylalkyl amides as calcium channel antagonists
DE69918662T2 (de) * 1998-11-04 2005-08-11 Basell Poliolefine Italia S.P.A. Bestandteile und katalysatoren für die olefinpolymerisation
US6329546B1 (en) 1999-01-12 2001-12-11 Laboratory Of Molecular Biophotonics Caged amino acids
US20030203900A1 (en) * 1999-05-18 2003-10-30 Martin Quibell Cysteine protease inhibitors
EE200100672A (et) * 1999-06-10 2003-02-17 Warner-Lambert Company Mono- ja diasendatud 3-propüül-gamma-aminovõihapped
DE60037345T2 (de) 1999-12-10 2008-11-13 Pfizer Products Inc., Groton Pyrrolo(2,3-d)pyrimidin-Verbindungen
US7300775B2 (en) * 1999-12-29 2007-11-27 Verenium Corporation Methods for producing α-substituted carboxylic acids using nitrilases and strecker reagents
PE20020354A1 (es) 2000-09-01 2002-06-12 Novartis Ag Compuestos de hidroxamato como inhibidores de histona-desacetilasa (hda)
JP5076257B2 (ja) * 2001-02-01 2012-11-21 旭硝子株式会社 撥水性組成物、表面処理された基材、その製造方法および輸送機器用物品
ES2280530T3 (es) 2001-04-27 2007-09-16 Zenyaku Kogyo Kabushiki Kaisha Compuesto heterociclico y agente antitumoral que contiene el mismo como principio activo.
TWI329105B (en) 2002-02-01 2010-08-21 Rigel Pharmaceuticals Inc 2,4-pyrimidinediamine compounds and their uses
ES2319894T3 (es) 2002-08-14 2009-05-14 Silence Therapeutics Aktiengesellschaft Uso de la proteina quinasa-n-beta.
US6787664B2 (en) * 2002-09-17 2004-09-07 Warner-Lambert Company Llc Process for preparing single enantiomers of 5,5,5,5′,5′,5′-hexafluoroleucine and protected analogs
AU2002953255A0 (en) 2002-12-11 2003-01-02 Cytopia Research Pty Ltd Protein kinase inhibitors
JP2006523237A (ja) 2003-04-03 2006-10-12 セマフォア ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド Ｐｉ−３キナーゼインヒビタープロドラッグ
EP1644363B1 (en) 2003-05-30 2012-02-22 Gemin X Pharmaceuticals Canada Inc. Triheterocyclic compounds, compositions, and methods for treating cancer
EP2371835A1 (en) 2003-07-03 2011-10-05 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Inhibition of syk kinase expression
LT2612862T (lt) 2004-05-13 2017-01-25 Icos Corporation Chinazolinonai kaip žmogaus fosfatidilinozitol-3-kinazės delta inhibitoriai
US20070212428A1 (en) 2004-06-04 2007-09-13 Mood Management Sciences, Inc. Methods and compositions for treating mood disorder
DE102004053407A1 (de) * 2004-11-05 2006-05-11 Bayer Healthcare Ag Acylierte Nonadepsipeptide II
US7449458B2 (en) 2005-01-19 2008-11-11 Rigel Pharmaceuticals, Inc. Prodrugs of 2,4-pyrimidinediamine compounds and their uses
MX2007009985A (es) * 2005-02-18 2008-03-11 Innodia Inc Diastereoisomeros de 4-hidroxiisoleucina y usos de los mismos.
DK1888550T3 (da) 2005-05-12 2014-09-29 Abbvie Bahamas Ltd Apoptosepromotorer
GB0510390D0 (en) 2005-05-20 2005-06-29 Novartis Ag Organic compounds
US7402325B2 (en) 2005-07-28 2008-07-22 Phoenix Biotechnology, Inc. Supercritical carbon dioxide extract of pharmacologically active components from Nerium oleander
NZ594630A (en) 2005-10-07 2013-04-26 Exelixis Inc N-(3-amino-quinoxalin-2-yl)-sulfonamide derivatives and their use as phosphatidylinositol 3-kinase inhibitors
AU2006309013B2 (en) 2005-11-01 2012-06-28 Impact Biomedicines, Inc. Bi-aryl meta-pyrimidine inhibitors of kinases
HUE025173T2 (hu) 2005-12-13 2016-01-28 Incyte Corp Heteroaril-szubsztituált pirrollo[2,3-b]piridinek és pirrolo[2,3-b]pirimidinek mint Janus-kináz inhibitorok
JO2660B1 (en) * 2006-01-20 2012-06-17 نوفارتيس ايه جي Pi-3 inhibitors and methods of use
PT2024372E (pt) 2006-04-26 2010-09-16 Hoffmann La Roche Derivado de tieno[3,2-d]pirimidina útil como inibidor de pi3k
WO2008024371A2 (en) 2006-08-21 2008-02-28 Prexa Pharmaceuticals, Inc. Multimediator transporter inhibitors for use in treatment of central nervous system disorders
EP2526934B1 (en) 2006-09-22 2015-12-09 Pharmacyclics LLC Inhibitors of bruton's tyrosine kinase
US8288416B2 (en) 2006-09-25 2012-10-16 Wockhardt Ltd. Substituted piperidinophenyl oxazolidinones
TWI397418B (zh) 2006-10-10 2013-06-01 Otsuka Pharma Co Ltd 抗憂鬱劑
EP2091937A2 (en) 2006-10-20 2009-08-26 Merck & Co., Inc. Substituted imidazoles as bombesin receptor subtype-3 modulators
KR101737753B1 (ko) 2007-03-12 2017-05-18 와이엠 바이오사이언시즈 오스트레일리아 피티와이 엘티디 페닐 아미노 피리미딘 화합물 및 이의 용도
US8394794B2 (en) 2007-03-23 2013-03-12 Regents Of The University Of Minnesota Therapeutic compounds
TW200902019A (en) 2007-04-26 2009-01-16 Ono Pharmaceutical Co Dicyclic heterocyclic compound
PE20090717A1 (es) 2007-05-18 2009-07-18 Smithkline Beecham Corp Derivados de quinolina como inhibidores de la pi3 quinasa
US8431608B2 (en) 2007-08-17 2013-04-30 Icagen Inc. Heterocycles as potassium channel modulators
EP2193119B1 (en) * 2007-08-27 2014-01-01 Abbvie Deutschland GmbH & Co. KG 4-(4-pyridinyl)-benzamides and their use as rock activity modulators
HUE029767T2 (en) 2008-03-11 2017-04-28 Incyte Holdings Corp JAK inhibitor azetidine and cyclobutane derivatives
US8613951B2 (en) 2008-06-16 2013-12-24 Bind Therapeutics, Inc. Therapeutic polymeric nanoparticles with mTor inhibitors and methods of making and using same
US8338439B2 (en) 2008-06-27 2012-12-25 Celgene Avilomics Research, Inc. 2,4-disubstituted pyrimidines useful as kinase inhibitors
WO2010044885A2 (en) 2008-10-17 2010-04-22 Whitehead Institute For Biomedical Research Soluble mtor complexes and modulators thereof
BRPI1010147A2 (pt) * 2009-06-19 2019-09-24 Lek Pharmaceuticals processo para preparar um composto, uso de um processo e uso de um catalisador de irídio
EP2459182B1 (en) 2009-07-30 2017-09-06 University of Zürich Injectable formulation for treatment and protection of patients having an inflammatory reaction or an ischemia-reperfusion event
BR112012018865A2 (pt) * 2010-01-29 2016-04-12 Boehringer Ingelheim Int naftiridinas substituídas e seu uso como inibidores de quinase syk
NZ603837A (en) 2010-06-30 2014-01-31 Fujifilm Corp Novel nicotinamide derivative or salt thereof
CN102464701B (zh) * 2010-11-08 2015-10-21 上海医药工业研究院 一类新型化合物、其制备方法及用途
US8828987B2 (en) * 2010-12-10 2014-09-09 Rottapharm Biotech S.R.L. Pyridine amide derivatives as EP4 receptor antagonists
EP2678037B1 (en) 2011-02-25 2014-12-03 Lonza Ltd Branched linker for protein drug conjugates
US9321727B2 (en) 2011-06-10 2016-04-26 Hoffmann-La Roche Inc. Pyridine derivatives as agonists of the CB2 receptor
EP2763975B1 (en) 2011-10-05 2016-04-06 Merck Sharp & Dohme Corp. 3-pyridyl carboxamide-containing spleen tyrosine kinase (syk) inhibitors
EP2589383A1 (en) 2011-11-06 2013-05-08 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Berlin FKBP subtype-specific rapamycin analogue for use in treatment of diseases
WO2013142229A1 (en) * 2012-03-19 2013-09-26 President And Fellows Of Harvard College Designing novel peptides for inducing fibronectin matrix assembly
KR102124392B1 (ko) 2012-08-06 2020-06-19 피트니 파마슈티컬스 피티와이 리미티드 mTOR 경로 관련 질병 치료를 위한 화합물
US20160002159A1 (en) * 2013-02-13 2016-01-07 Neal ZONDLO Perfluoro-tert-butyl hydroxyproline
WO2014145852A2 (en) 2013-03-15 2014-09-18 Knopp Biosciences Llc Imidazo(4,5-b) pyridin-2-yl amides as kv7 channel activators
WO2014201111A1 (en) 2013-06-14 2014-12-18 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Treatment of mtor hyperactive related diseases and disorders
US10168338B2 (en) 2014-09-12 2019-01-01 Whitehead Institute For Biomedical Research Methods of identifying modulators of sestrin-gator-2 interaction for modulating mTORC1 activity
ES2941969T3 (es) 2015-10-23 2023-05-29 Navitor Pharm Inc Moduladores de la interacción de Sestrina-GATOR2 y sus usos
US20180327364A1 (en) 2015-11-13 2018-11-15 Brandeis University Mtor inhibitors and methods of use thereof
AU2017252563B2 (en) 2016-04-21 2022-07-21 Baylor College Of Medicine Compositions and methods for the treatment of lysosomal storage disorders and disorders characterized by lysosomal dysfunction
JP7179015B2 (ja) 2017-04-26 2022-11-28 ナビター ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド Ｓｅｓｔｒｉｎ－ＧＡＴＯＲ２相互座用のモジュレーターおよびその使用
CN112261938A (zh) 2018-02-08 2021-01-22 奥维德医疗公司 (1s,3s)-3-氨基-4-(二氟亚甲基)环戊烷-1-甲酸和(s)-3-氨基-4-(二氟亚甲基)环戊-1-烯-1-甲酸在治疗耳鸣、急性感音神经性听力损失、梅尼埃病、图雷特氏综合征、注意缺陷多动障碍和成瘾中的用途
US11345654B2 (en) 2018-10-24 2022-05-31 Navitor Pharmaceuticals, Inc. Polymorphic compounds and uses thereof
US10926803B2 (en) 2019-07-17 2021-02-23 GM Global Technology Operations LLC Four rail front crush structure with load dissemination into eight element support structure
JP6689441B1 (ja) 2019-11-01 2020-04-28 エヌ・ティ・ティ・コミュニケーションズ株式会社 電子マネー管理システムおよび電子マネー管理方法
IL292612A (en) 2019-11-01 2022-07-01 Navitor Pharm Inc Treatment methods using mtorc1 modulator

Also Published As

Publication number Publication date
HUE061437T2 (hu) 2023-06-28
US20170114080A1 (en) 2017-04-27
CA3001703C (en) 2024-05-21
US10752644B2 (en) 2020-08-25
AU2025252521A1 (en) 2025-10-30
CN121102186A (zh) 2025-12-12
BR112018007954A2 (pt) 2018-10-30
PL3364958T3 (pl) 2023-05-02
AU2016342027B2 (en) 2021-05-13
US20220340604A1 (en) 2022-10-27
PT3364958T (pt) 2023-04-10
JP2024073492A (ja) 2024-05-29
IL258779B (en) 2022-03-01
EP3364958B1 (en) 2023-01-04
CA3001703A1 (en) 2017-04-27
LT3364958T (lt) 2023-06-12
SG11201803099SA (en) 2018-05-30
JP2018538248A (ja) 2018-12-27
EP4112611A3 (en) 2023-03-22
ES2941969T3 (es) 2023-05-29
MX389001B (es) 2025-03-20
US10414782B2 (en) 2019-09-17
IL258779A (en) 2018-06-28
KR20180072704A (ko) 2018-06-29
US20210047347A1 (en) 2021-02-18
SI3364958T1 (sl) 2023-05-31
AU2016342027A1 (en) 2018-05-10
US10100066B2 (en) 2018-10-16
AU2023282205A1 (en) 2024-01-04
EP3364958A4 (en) 2019-08-28
US20190048029A1 (en) 2019-02-14
MX2022000053A (es) 2022-03-11
JP7449843B2 (ja) 2024-03-14
US11325924B2 (en) 2022-05-10
US12378263B2 (en) 2025-08-05
MX2018004674A (es) 2018-09-11
DK3364958T3 (da) 2023-04-11
NZ741566A (en) 2024-07-05
CO2018005315A2 (es) 2018-08-10
JP2021050208A (ja) 2021-04-01
WO2017070518A1 (en) 2017-04-27
CN108289866A (zh) 2018-07-17
AU2021215177B2 (en) 2023-09-14
CA3234750A1 (en) 2017-04-27
AU2021215177A1 (en) 2021-09-02
US20200079800A1 (en) 2020-03-12
EP4112611A2 (en) 2023-01-04
EP3364958A1 (en) 2018-08-29
JP2025176049A (ja) 2025-12-03
FI3364958T3 (fi) 2023-04-06
BR122021005850B1 (pt) 2023-12-26
KR102708250B1 (ko) 2024-09-23
HRP20230331T1 (hr) 2023-07-07
CN108289866B (zh) 2025-10-28
KR20240144424A (ko) 2024-10-02
HK1251486A1 (en) 2019-02-01
JP6800968B2 (ja) 2020-12-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7449843B2 (ja) セストリン－ｇａｔｏｒ２相互作用のモジュレーターおよびその使用
US10683308B2 (en) Rapamycin analogs and uses thereof
WO2017023894A1 (en) Mthfd2 inhibitors and uses thereof
CN111655261A (zh) 非环状cxcr4抑制剂和其用途
HK40086108A (en) Modulators of sestrin-gator2 interaction and uses thereof
HK1251486B (en) Modulators of sestrin-gator2 interaction and uses thereof
BR112018007954B1 (pt) Compostos, composições moduladoras da interação sestrina-gator2 e usos destes
HK40006048A (en) Cxcr4 inhibitors and uses thereof