JP6192031B2 - 植物の貯蔵タンパク質の集積に関与する遺伝子およびその利用 - Google Patents
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[1]下記の(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、または(f)のポリヌクレオチドを機能可能に有し、貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する植物において該ポリヌクレオチドを機能不能とすることにより、貯蔵タンパク質の集積性が改変された植物を生産する方法:
(a)SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 11またはSEQ ID NO: 12に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b)SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 11またはSEQ ID NO: 12に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドと相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(c)SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 11またはSEQ ID NO: 12に記載の塩基配列と少なくとも90%の同一性を有し、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(d)SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド;
(e)SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列において1若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換、付加および/または挿入したアミノ酸配列からなり、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(f)SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列と少なくとも97%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
[2][1]に定義された(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、または(f)のポリヌクレオチドが機能不能である植物へ、[1]に定義された(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、または(f)のポリヌクレオチドを導入することにより、貯蔵タンパク質の集積性が改変された植物を生産する方法。
[3]貯蔵タンパク質が、グルテリンである、[1]または[2]に記載の生産方法。
[4][1]に定義したポリヌクレオチドを含むベクター、またはSEQ ID NO: 7またはSEQ ID NO: 9の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含むベクターを用いて形質転換された、形質転換植物またはその子孫。
[5]植物が、イネ、大豆、エンバク、カボチャ、またはシロイヌナズナである、[4]に記載の形質転換植物またはその子孫。
[6][1]〜[3]のいずれか1項に記載の生産方法により得られた植物より得られる、または[4]または[5]に記載の植物若しくはその子孫より得られる、収穫物、繁殖材料または加工品。
本発明の遺伝子は植物種子の細胞内輸送に関与する。この遺伝子の発現や機能を調節することにより、種子中の成熟型グルテリンの集積量を調節することができる。このため、本発明の遺伝子は成熟型グルテリンの量が減少したイネの品種育成に有用である。従来、イネの品種改良は(1)交雑による有望系統の選抜、(2)放射線や化学物質による突然変異誘起などによって行われてきた。これらの作業は長期間を要することや変異の程度や方向性を制御できないことなどの問題があった。本発明の遺伝子を用いるイネの品種育成は、短期間で高い確実性をもって目的の植物体を得ることができる点で、従来の方法より有利である。
(a)SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 11またはSEQ ID NO: 12に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b)SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 11またはSEQ ID NO: 12に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドと相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(c)SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 11またはSEQ ID NO: 12に記載の塩基配列と少なくとも90%の同一性を有し、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(d)SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド;
(e)SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列において1若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換、付加および/または挿入したアミノ酸配列からなり、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(f)SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列と少なくとも97%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
(e')SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質;
(f')SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列において1若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換、付加および/または挿入したアミノ酸配列からなり、かつ植物種子においてグルテリンを集積させる機能を有するタンパク質;
(g')SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列と少なくとも97%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ植物種子においてグルテリンを集積させる機能を有するタンパク質。
中程度にストリンジェントな条件は、例えば、対象となるポリヌクレオチドの長さに基づき、当業者であれば容易に設計することができる。基本的な条件は、Sambrookら,Molecular Cloning: A Laboratory Manual、第3版、第6〜7章、Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001に示されている。典型的には、中程度にストリンジェントな条件は、ニトロセルロースフィルターに関し、5×SSC、0.5%SDS、1.0 mM EDTA(pH8.0)の前洗浄条件;約40〜50℃での、約50%ホルムアミド、2〜6×SSC(または、約42℃での、約50%ホルムアミド中のStark's solutionなどの他の同様のハイブリダイゼーション溶液)のハイブリダイゼーション条件;および約40℃〜60℃、0.5〜6×SSC、0.1% SDSの洗浄条件を含む。中程度にストリンジェントな条件は、好ましくは、約50℃、6×SSCのハイブリダイゼーション条件を含み、前述の洗浄条件および/または洗浄条件を含んでいてもよい。
本発明において「グルテリン」というときは、特に記載した場合を除き、純タンパク質の一つで、穀類中に含まれ、純水・中性塩類溶液およびアルコールには溶けず、稀酸・稀アルカリには溶けるタンパク質(総称)をいう。本発明で単に、「貯蔵タンパク質」または「グルテリン」というときは、成熟型のものを指す。イネにおいて、グルテリンは全タンパク質のうちの約60%を占める。グルテリンは、コムギの麩素(グルテンgluten)中のグルテニン(glutenin)を含み、αグルテリン(イネにおいては、分子量37〜40 kD)、βグルテリン(イネにおいては、分子量20〜23 kD)を含む。
本発明のポリヌクレオチドが挿入されるベクターは、植物細胞内で挿入物の機能を発揮させることが可能なものであれば特に制限はない。例えば、植物細胞内で恒常的に遺伝子を発現させるためのプロモーター(例えば、カリフラワーモザイクウイルスの35Sプロモーター)を有するベクターや、外的な刺激により誘導的に活性化されるプロモーターを有するベクターを用いることもできる。ここでいう「植物細胞」には、種々の形態の植物細胞、例えば、種子、懸濁培養細胞、プロトプラスト、葉の切片、カルスなどが含まれる。
植物材料:
材料には水稲品種「台中65号」および同品種のN-methyl-N-nitrosoureaを用いた受精卵処理によって誘発したglup6突然変異系統「EM939」、「EM1327」を用いた(Satoh et al, 2010, Ueda et al, 2010)。これらの系統の完熟種子、登熟種子を解析に用いた。遺伝子連鎖地図の構築のために、glup6突然変異系統「EM939」とインド型品種「Kasalath」との交雑F2種子を材料に用いた。
種子1粒または半粒を粉砕し、種子10 mgに対し200μl量の試料用緩衝液(0.125 M Tris-HCl、4%SDS、4 M尿素、および5%β-メルカプトエタノール、pH 6.8)を加え、1晩振とうさせてタンパク質を抽出した。抽出したタンパク質をSDS-PAGEにより分離した。電気泳動終了後、ゲルを50%エタノール、7%酢酸を含む0.5%クマシーブルーによって染色し、染色したゲルを25%エタノール、7%酢酸によって脱色した。
セミドライブロッティング装置を用いて、SDS-PAGE終了後のゲルからタンパク質をニトロセルロース膜に10 Vで1時間転写した。転写後のニトロセルロース膜をブロッキング用緩衝液(5%スキムミルクを含むTris buffer saline(TBS:10 mM Tris-HCl、0.15 M NaCl、pH 7.5))に浸して1時間ブロッキング処理を行った。ブロッキングの後、ニトロセルロース膜をブロッキング用緩衝液で希釈した1次抗体によって1晩反応させた後、TBST(0.05%Tween 20を含むTBS)によって10分間、3回洗浄した。洗浄後、ブロッキング用緩衝液で希釈した2次抗体によって1時間反応させた後、TBSTによって10分間、3回洗浄した。ECL試薬キット(GE healthcare, Buckinghamshire, UK)を用いてニトロセルトース膜上に目的バンドを検出した。 一次抗体には、抗α-グルテリン-ウサギ抗体および抗GEF(VPS9)-ウサギ抗体を用いた。二次抗体には、抗ウサギ IgG-ヤギ抗体および抗マウスIgG-ヤギ抗体を用いた。
「EM939」と「Kasalath」との交雑F2種子の遺伝子型を決定するために、各種子を半分に切断し、胚を含まない部位から抽出したタンパク質をSDS-PAGE解析した。SDS-PAGE解析によってグルテリン前駆体を多量に集積した種子をglup6遺伝子ホモ個体とした。glup6ホモ個体とした種子の胚を含む部位を播種し、生育した幼苗の葉からDNAを抽出し連鎖解析に用いた。
約0.2 gの新鮮葉を乾燥し、マルチビーズショッカー(安井器械(株)製)を用いて粉砕した。粉砕した葉からCTAB(cetyltrimethylammonium bromide)法(Murray and Thompson, 1980)を用いて全DNAを抽出した。
「台中65号」のゲノムDNAを鋳型として、GLUP6候補遺伝子の開始コドンより約2 kb上流領域を以下に示すプライマーを用いたPCR反応により増幅し、GLUP6候補遺伝子のプロモーターとした。
5'プライマー: 5'-ata gtcgac cagtgga cacgtagtgg cttattg-3'(SEQ ID NO: 15)
(gtcgac は制限酵素SalIによる切断配列)
3'プライマー: 5'- tatgaattcagatctccggattcggtcacgttttgtg- 3'(SEQ ID NO: 16)
(gaattcとagatctは制限酵素EcoRIおよびBgl IIによる切断配列配列)
GLUP6候補遺伝子のコード配列を得るために、cDNAクローン(J033091P13)を鋳型として、94℃-1分間(1サイクル)、94℃-30秒間→61℃-30秒間→72℃-2分間(30サイクル)、72℃-2分間(1サイクル)の条件でPCRを行った。GLUP6候補遺伝子プロモーターおよび当該遺伝子のコード配列を、それぞれSalI/EcoRI、BglII/XhoIによる制限酵素処理・ライゲーション反応により、GFPを含むエントリーベクター(EV(zeo)126)に導入した。その後、LR反応(LRclonase)により、構築したエントリーベクターをバイナリーベクター(DV9)に挿入した。
「EM939」の完熟種子を除菌した後、カルス誘導培地に播種した。播種後1か月経過したカルスを形質転換に用いた。構築したコンストラクトをアグロバクテリウム(EHA105菌株)により「EM939」のカルスに導入した。
テンプレート調製PCR: 葉から抽出したゲノムDNAを鋳型として、LA Taqポリメラーゼ(Takara社製)を用い添付のプロトコールに従いシークエンス用テンプレートを調製した。1 ngゲノムDNA(100 ng/μl)を用いてPCR反応溶液を調製し、94℃-30秒間(1サイクル)、94℃-30秒間→61℃-30秒間→72℃-2分間(30サイクル)、72℃-2分間(1サイクル)の条件でPCRを行った。その後エタノール沈殿にてPCR産物を精製し、濃縮させた。
登熟種子を約1 mmの厚さに切断し、固定液(25%グルタルアルデヒド、2%パラホルム-アルデヒドを含む50 mM Pipes、0.25 Mスクロース、pH 7.24)に浸し、4℃にて1晩細胞を固定した。固定した切片を、50 mM Pipes、0.25 Mスクロース(pH 7.24) 緩衝液を用いて10分間3回洗浄した。洗浄後、30、50、60、70、80、90、95、100%(V/V)のエタノール希釈シリーズを用いて各濃度10分間ずつ脱水を行なった。脱水後、LR-White樹脂の濃度シリーズ(LR-White樹脂:エタノール=1:3→1:2→1:1→3:1→LR-White樹脂100%×3日間)を用いて試料中に樹脂を浸透させた。樹脂浸透後、ゼラチンカプセルに試料を入れ樹脂を注いだ後、窒素を充填させた。恒温器に入れ、60℃で24時間以上加熱重合させた。
作業はすべて湿室、常温で行なった。切片にPBS(10 mM Na2HPO4、10 mM NaH2PO4、150 mM NaCl、pH 7.4)を滴下し10分間静置後、ブロッキング用緩衝液(0.8% BSA、0.1%ゼラチン、2 mM NaN3 を含むPBS、pH 7.4)で10分間反応させた。ブロッキング反応後、ブロッキング用緩衝液で希釈した一次抗体溶液を2時間反応させた。反応後、切片をPBSによって10分間、5回の洗浄を行った後、ブロッキング用緩衝液によって10分間 反応させた。ブロッキング用緩衝液で希釈した二次抗体溶液によって1時間遮光して反応させた。反応後、切片をPBSによって10分間、5回洗浄した後、蒸留水によって1分間、3回洗浄した。乾燥後、切片に退色防止剤を滴下し、カバーガラスを被せマニキュアで封入した。一次抗体には、抗β-グルテリン-マウス抗体、抗α-グルテリン-ウサギ抗体、抗14プロラミン-ウサギ抗体および抗β-グルカン-マウス抗体を用いた。二次抗体には、FITC標識抗ウサギIgG-ヤギ抗体、ローダミン標識抗マウスIgG-ヤギ抗体、FITC標識抗マウスIgG-ヤギ抗体、ローダミン標識抗ウサギIgG-ヤギ抗体を用いた。
glup6(glutelin precursor 6)突然変異体は野生型と比べてグルテリン前駆体を多く集積し、成熟型グルテリンの蓄積量が減少するので、グルテリン前駆体の貯蔵型液胞への輸送に関与する因子であることが予想される。すでにGLUP6遺伝子は染色体3に座乗することが明らかとなっている(Sato et al. Rice Genet. Newslet., 20: 43-45, 2003)。そこで、染色体3のマーカーを用いた連鎖解析によってGLUP6遺伝子近傍の遺伝子連鎖地図の構築を行った。GLUP6遺伝子連鎖地図をSTS、CAPSマーカーを用いて作成した。glup6突然変異系統EM939とインド型品種Kasalathとの交雑F2種子から、SDS-PAGE解析によってグルテリン前駆体を多量に集積するglup6遺伝子ホモ個体を選抜し連鎖解析に用いた。
GLUP6候補遺伝子がglup6変異体の原因遺伝子であることを明らかにするために、「glup6変異体」の植物体にGLUP6候補遺伝子を導入する形質転換実験を行い、相補性検定結果を行った。農業生物資源研究所イネゲノムリソースセンターより当該遺伝子に対するcDNAクローンJO33091P13の分譲を受けた。同クローンの塩基配列を解析した結果、コーディング領域の配列は日本晴の塩基配列と完全に一致したものの(図3)、第4エクソンの3'端の618Gと第5エクソンの5'端の619Gとの間に924 bpのイントロンを含んでおり、この配列も「日本晴」のゲノム塩基配列と完全に一致した(データ省略)。cDNAクローンJO33091P13(SEQ ID NO: 3、図5)を鋳型としてPCRによって同候補遺伝子の配列を増幅した。さらに、GLUP6候補遺伝子のプロモーターを「台中65号」のゲノムDNAからサブクローニングした。GFPを含むエントリーベクターに同候補遺伝子の配列とプロモーターを導入した。構築したエントリーベクターをDV9バイナリーベクターに導入し、アグロバクテリウム(EHA105菌株)を介して「EM939」に導入した。
作出した形質転換体の種子に着生した6粒の自殖種子から抽出したタンパク質をSDS-PAGE解析した結果、6粒中、グルテリン前駆体含量が原品種とほぼ同等を示す種子3粒と、前駆体を多量に集積する種子3粒とが分離した(図7A)。同じ種子のタンパク質のGFP抗体を用いたウエスタンブロット解析の結果、グルテリン前駆体含量が原品種とほぼ同等を示す3粒の種子ではGFPバンドが検出されたが、前駆体を多量に集積する残り3粒の種子では同バンドは検出されなかった(図7B)。これらの結果は同候補遺伝子の導入によってglup6変異体が野生型に復帰したこと、すなわち、glup6変異体がGEF遺伝子によって相補されたこと、を示している。同遺伝子はシロイヌナズナのGEF(VPS9: At3g19770)とアミノ酸配列において53%の相同性が認められることから、GLUP6遺伝子はGEFをコードしていることが明らかとなった。以下当該遺伝子をGLUP6-GEF遺伝子、当該タンパク質をGLUP6-GEFと称する。
GLUP6-GEF欠損変異体glup6の胚乳細胞組織におけるグルテリンの局在を蛍光顕微鏡解析により調査した。蛍光顕微鏡を用いたglup6変異体の胚乳細胞組織の観察結果を示す図を図9に示す。図9において、AおよびB:野生型(台中65号)、CおよびD:EM939(glup6変異体)、EおよびF:EM1327(glup6変異体)を示す。緑で標識された部位はグルテリン抗体、赤で標識された部位はプロラミン抗体によって標識された。上段(A、CおよびE)は、登熟初期(開花後1週目)の胚乳組織を、下段(B,DおよびF)は、登熟後期(開花後3週目)の胚乳組織を示す。
β-グルカンの高蓄積が、米粉の製パン特性および米粉パンの食味にどのように影響するのかを調べるために、三洋電機の新商品GOPAN(製パン機、登録商標)を使用して、glup6変異体(EM939)と野生型(台中65号)の米粉を用いて、精米220 gとコムギグルテン50 gを主な材料として用いてパンを作り、両者を比較した(図12)。
SEQ ID NO: 2:SEQ ID NO: 1に対応するアミノ酸配列
SEQ ID NO: 3:GLUP6-GEF遺伝子に対するcDNAクローンJO33091P13の塩基配列(イントロン部分を含む。)
SEQ ID NO: 4:SEQ ID NO: 3に対応するアミノ酸配列
SEQ ID NO: 5:台中65号の種子から抽出したmRNAを逆転写した1本鎖cDNAを鋳型として、GLUP6-GEF特異的プライマーによって増幅したcDNAの塩基配列
SEQ ID NO: 6:SEQ ID NO: 5に対応するアミノ酸配列
SEQ ID NO: 7:EM939の当該遺伝子のゲノムDNAの内のコーディング配列
SEQ ID NO: 8:SEQ ID NO: 7に対応するアミノ酸配列
SEQ ID NO: 9:EM1327の当該遺伝子のゲノムDNAの内のコーディング配列
SEQ ID NO: 10:SEQ ID NO: 9に対応するアミノ酸配列
SEQ ID NO: 11:日本晴のゲノムDNAの配列
SEQ ID NO: 12:台中65号のゲノムDNAの配列
SEQ ID NO: 13:EM939 のゲノムDNAの配列
SEQ ID NO: 14:EM1327のゲノムDNAの配列
SEQ ID NO: 15:PCRプライマー
SEQ ID NO: 16:PCRプライマー
Claims (6)
- 下記の(a)、(b)、(c)、(d)、または(e)のポリヌクレオチドを機能可能に有し、貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する植物において、該ポリヌクレオチドを機能不能とすることにより、貯蔵タンパク質の集積性が改変された植物を生産する方法:
(a)SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 11またはSEQ ID NO: 12に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b)SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 11またはSEQ ID NO: 12に記載の塩基配列と少なくとも90%の同一性を有し、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(c)SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド;
(d)SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列において1〜9個のアミノ酸が欠失、置換、付加および/または挿入したアミノ酸配列からなり、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(e)SEQ ID NO: 2またはSEQ ID NO: 6に記載のアミノ酸配列と少なくとも97%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ貯蔵タンパク質を貯蔵型液胞に集積する機能を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド。 - 請求項1に定義された(a)、(b)、(c)、(d)、または(e)のポリヌクレオチドが機能不能である植物へ、請求項1に定義された(a)、(b)、(c)、(d)、または(e)のポリヌクレオチドを導入することにより、貯蔵タンパク質の集積性が改変された植物を生産する方法。
- 貯蔵タンパク質が、グルテリンである、請求項1または2に記載の生産方法。
- 請求項1に定義したポリヌクレオチドを含むベクター、またはSEQ ID NO: 7またはSEQ ID NO: 9の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含むベクターを用いて形質転換された、形質転換植物であって、但し、台中65号および日本晴と称する品種のイネは除く、前記形質転換植物。
- 植物が、イネ、大豆、エンバク、またはカボチャである、請求項4に記載の形質転換植物。
- 請求項1〜3のいずれか1項に記載の生産方法により得られた植物より得られる、または請求項4または5に記載の植物より得られる、収穫物、繁殖材料または加工品。
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