前述の一般的な説明および以下の詳細な説明はともに、例示的および説明的なものに過ぎず、特許請求される本発明を限定するものではないことを理解されたい。本明細書において、単数形の使用は、別段の指示がない限り複数を含む。本明細書で使用するとき、「または」は、別段の指示がない限り「および/または」を意味する。さらに、用語「含んでいる」、ならびに「含む」および「含まれる」等の他の形態の使用も限定的なものではない。また、「要素」または「構成要素」等の用語は、別段の指示がない限り、1つのユニットを含む要素および構成要素と、2つ以上のサブユニットを含む要素および構成要素の両方を包含する。
本明細書で使用する項目見出しは、構成的な目的のために過ぎず、説明される主題を限定すると解釈すべきではない。特許、特許出願、記事、書籍、および論文を含むがこれらに限定されない、本願に引用されるあらゆる文書または文書の一部は、本明細書で考察される文書の一部に対して、ならびにそれらの全体として、参照することによって明示的に本明細書に組み込まれる。
定義
特定の定義がなされない限り、本明細書に記載される分析化学、合成有機化学、医薬品化学および製薬化学と関連して使用される命名法、ならびにそれらの手順および技法は、当該技術分野において周知であり、一般的に使用されるものである。標準的技法を化学合成および化学分析に使用してよい。許可される場合、あらゆる特許、出願、公開出願、および他の刊行物、米国立生物工学情報センター(NCBI)等のデータベースを通して入手可能なGENBANK受託番号および関連付けられた配列情報、ならびに本明細書において開示全体を通して参照される他のデータは、本明細書で考察される文書の一部に対して、ならびにそれらの全体として、参照することによって本明細書に組み込まれる。
別段の指示がない限り、以下の用語は以下の意味を有する。
「2’−O−メトキシエチル」(2’−MOEおよび2’−O(CH2)2−OCH3ともいう)は、フラノース環の2’位のO−メトキシ−エチル修飾を指す。2’−O−メトキシエチル修飾糖は、修飾糖である。
「2’−MOEヌクレオシド」(2’−O−メトキシエチルヌクレオシドともいう)とは、2’−MOE修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
「2’−置換ヌクレオシド」とは、フラノシル環の2’位にHまたはOH以外の置換基を含むヌクレオシドを意味する。特定の実施形態では、2’置換ヌクレオシドは、二環式糖修飾を有するヌクレオシドを含む。
「3’標的部位」とは、特定のアンチセンス化合物の最も3’側のヌクレオチドに相補的な標的核酸のヌクレオチドを指す。
「5’標的部位」とは、特定のアンチセンス化合物の最も5’側のヌクレオチドに相補的な標的核酸のヌクレオチドを指す。
「5−メチルシトシン」とは、5位に結合したメチル基で修飾されたシトシンを意味する。5−メチルシトシンは修飾核酸塩基である。
「約」は、値の±7%以内を意味する。例えば、「少なくとも約70%のHBV阻害を受けた化合物」と記載されている場合、HBVレベルが63%〜77%の範囲内で阻害されることを示唆する。
「許容可能な安全性プロファイル」とは、臨床的に許容可能な限度内の副作用のパターンを意味する。
「活性医薬品」とは、個体に投与したときに治療効果をもたらす、医薬組成物中の1つまたは複数の物質を意味する。例えば、特定の実施形態では、HBVを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、活性医薬品である。
「活性標的領域」とは、1つ以上の活性アンチセンス化合物に標的とされる領域を意味する。「活性アンチセンス化合物」とは、標的核酸レベルまたはタンパク質レベルを減少させるアンチセンス化合物を意味する。
「急性B型肝炎感染」は、B型肝炎ウイルスに暴露された人がウイルス性肝炎の兆候および症状を発症し始めたときに生じる。潜伏期間と称されるこの期間は、平均90日間であるが、わずか45日間の場合もあり、または6ヶ月間におよぶ場合もある。ほとんどの場合、この感染は軽度から中程度の不快感を生じるが、身体の免疫応答がウイルスとの戦いに成功することにより自然に消失する。しかしながら、一部の人々、特に、AIDS罹患者、化学療法を受けている者、免疫抑制剤を摂取している者、またはステロイド剤を摂取している者等の免疫系に障害がある人々は、急性HBV感染の結果として極めて深刻な問題を生じ、劇症肝不全等のより重度の状態に移行する。
「併用投与される」とは、両剤の薬理効果が患者に同時に現れる、あらゆる方式の2つの薬剤の同時投与を指す。併用投与は、両剤を単一の医薬組成物で、同一剤形で、または同一投与経路で投与することを必要としない。両剤の効果が同時に現れる必要はない。これらの効果は、ある期間重複する必要があるだけであり、等しい期間である必要はない。
「投与すること」は、医薬品を個体に提供することを意味し、限定されないが、医療従事者による投与および自己投与を含む。
「薬剤」とは、動物に投与したときに治療効果をもたらすことができる活性物質を意味する。「第1の薬剤」とは、本明細書に記載の治療化合物を意味する。例えば、第1の薬剤は、HBVを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドであってもよい。「第2の薬剤」とは、本明細書に記載の第2の治療化合物(例えば、HBVを標的とする第2のアンチセンスオリゴヌクレオチド)、および/または非HBV治療化合物を意味する。
「改善」とは、状態または疾患の重症度の少なくとも1つの指標を緩和することを指す。指標の重症度は、当業者に既知の主観的または客観的尺度によって決定することができる。
「動物」は、ヒトまたは非ヒト動物を指し、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、ネコ、ブタ、ならびにサルおよびチンパンジーを含むがこれらに限定されない非ヒト霊長類を含む。
「抗体」とは、何らかの方法で抗原と特異的に反応することを特徴とする分子を指し、抗体および抗原は各々、他方の観点から定義される。抗体とは、完全抗体分子あるいはその任意の断片または領域、例えば重鎖、軽鎖、Fab領域、およびFc領域等を指し得る。
「アンチセンス活性」は、アンチセンス化合物のその標的核酸へのハイブリダイゼーションに起因する、任意の検出可能または測定可能な活性を意味する。特定の実施形態では、アンチセンス活性は、標的核酸またはかかる標的核酸によってコードされるタンパク質の量または発現の低下である。
「アンチセンス化合物」とは、水素結合を介して標的核酸にハイブリダーセーションすることが可能なオリゴマー化合物を意味する。アンチセンス化合物の例としては、1本鎖および2本鎖化合物、例えばアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、shRNA、snoRNA、miRNA、およびサテライト反復が挙げられる。
「アンチセンス阻害」とは、アンチセンス化合物の不在下における標的核酸レベルと比較した、標的核酸に相補的なアンチセンス化合物の存在下における標的核酸レベルの減少を意味する。
「アンチセンス機序」とは、標的核酸への化合物のハイブリダイゼーションに関わるあらゆる機序であって、このときハイブリダイゼーションの結果または効果は、例えば転写またはスプライシングに関与する細胞機構の付随的な停止を伴う、標的分解または標的占有のいずれかである。
「アンチセンスオリゴヌクレオチド」とは、標的核酸の対応する領域またはセグメントへのハイブリダイゼーションを許容する核酸塩基配列を有する1本鎖オリゴヌクレオチドを意味する。
「塩基相補性」とは、アンチセンスオリゴヌクレオチドの核酸塩基の標的核酸中の対応する核酸塩基との正確な塩基対合(すなわち、ハイブリダイゼーション)の能力を指し、これは対応する核酸塩基間のワトソン・クリック、フーグスティーン、または逆フーグスティーン水素結合によって仲介される。
「二環式糖」とは、2つの非ジェミナルな炭素原子の架橋によって修飾されるフラノース環を意味する。二環式糖は修飾糖である。
「体重」とは、脂肪組織を含む全ての組織を含む動物の全体重を指す。
「キャップ構造」または「末端キャップ部分」は、アンチセンス化合物のいずれかの末端に組み込まれた化学修飾を意味する。
「cEt」または「拘束エチル」とは、4’炭素と2’炭素とを接続する架橋を含む二環式糖部分を意味し、この架橋は、式:4’−CH(CH3)−O−2’を有する。
「拘束エチルヌクレオシド」(cEtヌクレオシドともいう)とは、4’−CH(CH3)−O−2’架橋を含む二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
「化学的に異なる領域」とは、同じアンチセンス化合物の別の領域と何らかの形で化学的に異なる、アンチセンス化合物の領域を指す。例えば、2’−O−メトキシエチルヌクレオチドを有する領域は、2’−O−メトキシエチル修飾を有さないヌクレオチドを有する領域と化学的に異なる。
「キメラアンチセンス化合物」とは、各位置が複数のサブユニットを有する、少なくとも2つの化学的に異なる領域を有するアンチセンス化合物を意味する。
「慢性B型肝炎感染」は、人が最初は急性感染を患ったが、その後その感染を撃退できない場合に生じる。疾患が慢性化するか完全に解消するかは、主に感染者の年齢による。出生時に感染した乳児の約90%は、慢性疾患に進行する。しかしながら、年齢が上がるにつれ慢性感染症の危険性は低下し、例えば子供では20%〜50%、年長の子供および成人では10%未満が、急性から慢性感染症へと進行する。慢性HBV感染は、本発明の実施形態の主要な治療目標であるが、本発明のASO組成物は、炎症、線維症、硬変、肝癌、血清肝炎等のHBV関連状態も治療することができる。
「同時投与」とは、2つ以上の医薬品の個人への投与を意味する。この2つ以上の医薬品は、単一医薬組成物の形態であってもよく、または別個の医薬組成物の形態であってもよい。この2つ以上の医薬品の各々は、同じまたは異なる投与経路により投与してもよい。同時投与は、並行投与および順次投与を包含する。
「相補性」は、第1の核酸および第2の核酸の核酸塩基間で対合する能力を意味する。
「順守する」とは、推奨される療法の個人による厳守を意味する。
「含む」、「含んでいる(comprises)」および「含んでいる(comprising)」とは、記載されるステップもしくは要素またはステップもしくは要素の群の包含を示唆し、いかなる他のステップもしくは要素またはステップもしくは要素の群の除外を示唆するものではないと理解される。
「連続核酸塩基」とは、相互に直接隣接する核酸塩基を意味する。
「治癒」とは、健康状態を回復する方法または過程、あるいはある疾病の所定の治療を意味する。
「デオキシリボヌクレオチド」とは、ヌクレオチドの糖部分の2’位に水素を有するヌクレオチドを意味する。デオキシリボヌクレオチドは、様々な置換基のいずれで修飾されていてもよい。
「設計する」または「〜ように設計された」とは、選択された核酸分子に特異的にハイブリダイズするオリゴマー化合物を設計する過程を指す。
「希釈剤」とは、薬理活性を有さないが、薬学的に必要または望ましい組成物中の成分を意味する。例えば、注入される薬剤では、希釈剤は液体、例えば生理食塩水であってもよい。
「投薬単位」とは、医薬品が提供される形態、例えば丸剤、錠剤、または当該分野で既知の他の投薬単位を意味する。
「用量」は、単回投与で、または指定期間に提供される、医薬品の指定量を意味する。特定の実施形態では、一用量を2つ以上のボーラス、錠剤、または注射剤として投与してもよい。例えば、皮下投与が望ましい特定の実施形態では、所望の用量は、単回注射によって容易に対応できない容量を必要とする。かかる実施形態では、2回以上の注射を用いて、所望の用量を達成してもよい。特定の実施形態では、一用量を2回以上の注射で投与して、個人における注射部位反応を最小限に抑えてもよい。別の実施形態では、長時間にわたって、または連続的に、点滴によって医薬品を投与する。用量は、1時間、1日、1週間、または1ヶ月当たりの医薬品の量として定めることができる。
「投与計画」は、1つ以上の所望の効果を達成するために策定される用量の組み合わせである。
「持続期間」とは、活性または事象が継続する期間を意味する。特定の実施形態では、治療の持続期間は、医薬品の用量が投与される期間である。
活性の調節または状態の治療もしくは防止に関連して、「有効量」とは、効果の調節に、またはその状態の治療もしくは予防もしくは改善に有効な調節、治療、または予防の必要がある対象へのその量の活性成分の単回用量でのまたは一連の投与の一部としての投与を意味する。有効量は、治療を受ける個体の健康および身体状態、治療を受ける個体の分類学的な群、組成物の剤形、医学的状態の評価、および他の関連因子に応じて異なり得る。
「有効性」とは、所望の効果を生じる能力を意味する。
「発現」には、遺伝子のコードされた情報を細胞中に存在して作用する構造に変換する全ての機能が含まれる。かかる構造としては、転写産物および翻訳産物が挙げられるが、これらに限定されない。
「完全に相補的」または「100%相補的」とは、第1の核酸の各核酸塩基が、第2の核酸に相補的核酸塩基を有することを意味する。特定の実施形態では、第1の核酸はアンチセンス化合物であり、標的核酸が第2の核酸である。
「完全修飾モチーフ」とは、本質的に各ヌクレオシドが均一修飾を有する糖修飾ヌクレオシドであるヌクレオシドの連続配列を含む、アンチセンス化合物を指す。
「ギャップマー」とは、RNaseH切断を支持する複数のヌクレオシドを有する内部領域が、1個以上のヌクレオシドを有する外部領域間に位置付けられるキメラアンチセンス化合物を意味し、この内部領域を構成するヌクレオシドは、外部領域を構成する1つまたは複数のヌクレオシドと化学的に異なる。内部領域は、「ギャップ」と称されることがあり、外部領域は、「ウィング」と称されることがある。
「ギャップ拡張」とは、修飾糖部分を有する1〜6個のヌクレオシドを有する5’および3’ウィングセグメント間に位置付けられる、12個以上の連続2’−デオキシリボヌクレオシドのギャップセグメントを有する、アンチセンス化合物を意味する。
「HBV」とは、ヒトB型肝炎ウイルスを含む哺乳動物のB型肝炎ウイルスを意味する。この用語は、B型肝炎ウイルス、特にヒトB型肝炎ウイルスの地理的遺伝子型、ならびにB型肝炎ウイルスの地理的遺伝子型の変異株を包含する。
「HBV抗原」とは、コアタンパク質、例えば「B型肝炎コア抗原」すなわち「HBcAG」、および「B型肝炎E抗原」すなわち「HBeAG」、ならびに外被タンパク質、例えば「HBV表面抗原」すなわち「HBsAg」または「HBsAG」を含む、あらゆるB型肝炎ウイルス抗原もしくはタンパク質を意味する。
「B型肝炎E抗原」すなわち「HBeAg」または「HBeAG」は、分泌型の非微粒子形態のHBVコアタンパク質である。HBV抗原HBeAgおよびHBcAgは、一次アミノ酸配列を共有しているため、T細胞レベルで交差反応性を示す。HBeAgは、ウイルスの構築または複製には必要でないが、慢性感染症の確立に必要である可能性が実験から示唆されている。新生児のHBeAgネガティブ変異体感染は、慢性HBV感染症ではなく劇症の急性感染症を引き起こすことが多いが(Terezawa et al(1991) Pediatr.Res.29:5)、若年のウッドチャックのWHeAgネガティブ変異体感染は、はるかに低い比率で慢性WHV感染症を引き起こす(Cote et al(2000) Hepatology 31:190)。HBeAgは、欠失またはクローンアネルギーによってコア特異的T細胞を不活性化することにより、トレラゲンとして機能し得る可能性がある(Milich et al(1998) J.Immunol.160:8102)。抗ウイルス療法およびHBeAgセロコンバージョンの際に、HBVウイルス量および抗原の減少と、活性化T細胞の負の調節因子である阻害受容体programmed death−1(PD−1、PDCD1としても知られている)のT細胞による発現低下との間には正の相関が存在する(Evans et al(2008) Hepatology 48:759)。
「HBV mRNA」とは、B型肝炎ウイルスによって発現されるあらゆるメッセンジャーRNAを意味する。
「HBV核酸」または「HBV DNA」とは、HBVをコードするあらゆる核酸を意味する。例えば、特定の実施形態では、HBV核酸には、限定するものではないが、HBVゲノムまたはその部分をコードする任意のウイルスDNA配列、HBVタンパク質をコードする任意のmRNA配列を含む、ウイルスDNAから転写された任意のRNA配列が含まれる。
「HBVタンパク質」とは、B型肝炎ウイルスにより分泌される任意のタンパク質を意味する。この用語は、コアタンパク質、例えば「E型肝炎抗原」、「HBeAg」または「HBeAG」、および外被タンパク質、例えば「HBV表面抗原」すなわち「HBsAg」を含む、種々のHBV抗原を包含する。
「HBV表面抗原」すなわち「HBsAg」または「HBsAG」は、感染性HBVウイルス粒子の外被タンパク質であるが、HBVウイルス粒子よりも1000倍高い血清レベルで非感染性粒子としても分泌される。感染した人間または動物におけるHBsAgの血清レベルは、1000μg/mLもの高さになり得る(Kann and Gehrlich(1998) Topley & Wilson’s Microbiology and Microbial Infections,9th ed.745)。急性HBV感染症では、血清中でのHBsAgの半減期、すなわち血清t1/2は、8.3日である(Chulanov et al(2003) J.Med.Virol.69:313)。骨髄樹状細胞によるHBsAgの内在化は、共刺激分子(すなわちB7)の上方制御を阻害し、またT細胞刺激能を阻害し(den Brouw et al(2008) Immunology 126:280)、さらに慢性的に感染した患者に由来する樹状細胞は、共刺激分子の発現、IL−12の分泌、およびHBsAg存在下でのT細胞の刺激の欠如も示す(Zheng et al(2004) J.Viral Hepatitis 11:217)。CHB患者に由来するHBsAg特異的CD8細胞は、変化した四量体結合を示す。これらのCD8細胞はアネルギーではないが、部分寛容または無視をもたらすTCRトポロジーを有する場合がある(Reignat et al(2002) J.Exp.Med.195:1089)。さらに、24週目における1logを上回る血清HBsAgの減少は、Peg−IFNα2a療法中の持続性ウイルス学的著効(SVR−治療1年後にPCRでHBV DNAが検出されないと定義される)の高い予測値(92%)を有する(Moucari et al(2009) Hepatology 49:1151)。
「B型肝炎関連状態」または「HBV関連状態」とは、B型肝炎の感染、暴露、または疾病によって悪化する、これを原因とする、これに関連する、これに付随する、またはこれに起因する、疾患、生物学的状態、医学的状態、または事象を意味する。B型肝炎関連状態という用語には、慢性HBV感染、炎症、線維症、硬変、肝癌、血清肝炎、黄疸、肝癌、肝臓炎、肝線維症、肝硬変、肝不全、びまん性肝細胞炎症性疾患、血球貪食症候群、血清肝炎、HBVウイルス血症、移植に関連する肝疾患、ならびにB型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス抗原の存在の陽性結果、またはB型肝炎ウイルス抗原に特異的な抗体の存在の陽性結果に伴って、インフルエンザ様疾病、衰弱、疼痛、頭痛、発熱、食欲不振、下痢、悪心嘔吐、身体の肝臓範囲にわたる疼痛、粘土色または灰色の便、全身のそう痒感、および濃い色の尿のうちのいずれかまたは全てを含み得る症状を有する状態が含まれる。
「ハイブリダイゼーション」とは、相補的核酸分子のアニーリングを意味する。特定の実施形態では、相補的核酸分子には、アンチセンス化合物および核酸標的が含まれるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、相補的核酸分子には、アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび核酸標的が含まれるが、これらに限定されない。
「HBV感染を有する動物を特定すること」とは、HBVを有すると診断された動物を特定すること、または慢性HBV感染、炎症、線維症、硬変、肝癌、血清肝炎、黄疸、肝癌、肝臓炎、肝線維症、肝硬変、肝不全、びまん性肝細胞炎症性疾患、血球貪食症候群、血清肝炎、HBVウイルス血症、移植に関連する肝疾患、ならびにB型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス抗原の存在の陽性結果、またはB型肝炎ウイルス抗原に特異的な抗体の存在の陽性結果に伴って、B型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス抗原の存在の陽性結果、またはB型肝炎ウイルス抗原に特異的な抗体の存在の陽性結果に伴って、インフルエンザ様疾病、衰弱、疼痛、頭痛、発熱、食欲不振、下痢、悪心嘔吐、身体の肝臓範囲にわたる疼痛、粘土色または灰色の便、全身のそう痒感、および濃い色の尿のうちのいずれかまたは全てを含み得る症状を有する状態を含むがこれらに限定されない、HBV感染の何らかの症状を有する動物を特定することを意味する。
「直接隣接する」とは、直接隣接する要素間に介在要素が存在しないことを意味する。
「個体」とは、治療または療法のために選択されるヒトまたは非ヒト動物を意味する。
「個人の順守」とは、推奨または指定される療法の個人による厳守を意味する。
「誘導する」、「阻害する」、「増強する」、「上昇させる」、「増加させる」、「低下させる」等は、一般に、2つの状態間の量的な差を表す。かかる用語は、2つの状態間の統計的有意差を指し得る。例えば、「HBVの活性または発現を阻害するのに有効な量」とは、処理された試料におけるHBVの活性または発現のレベルが、未処理細胞におけるHBVの活性または発現のレベルと量的に異なり、これが統計的に有意であり得ることを意味する。かかる用語は、例えば、発現レベルおよび活性レベルに適用される。
「HBVを阻害すること」とは、HBV mRNA、DNA、および/またはタンパク質のレベルまたは発現を減少させることを意味する。特定の実施形態では、HBVは、アンチセンスオリゴヌクレオチド等のHBVアンチセンス化合物の不在下でのHBV mRNA、DNA、および/またはタンパク質の発現レベルと比較して、HBVを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、HBVを標的とするアンチセンス化合物の存在下で阻害される。
「発現または活性を阻害すること」とは、発現または活性の減少、遮断を指し、必ずしも発現または活性の完全な排除を示すわけではない。
「注射部位反応」は、個人における注射部位の皮膚の炎症または異常な発赤を意味する。
「ヌクレオシド間連結」とは、ヌクレオシド間の化学結合を指す。
「腹腔内投与」とは、腹膜内への点滴または注射を介する投与を意味する。
「静脈内投与」とは、静脈内への投与を意味する。
「延長」アンチセンスオリゴヌクレオチドとは、本明細書で開示するアンチセンスオリゴヌクレオチドと比較して、1つ以上の付加的ヌクレオシドを有するものである。
「連結されたデオキシヌクレオシド」とは、リン酸エステルによって連結されたデオキシリボースで置換されてヌクレオチドを形成する、核酸塩基(A、G、C、T、U)を意味する。
「連結されたヌクレオシド」とは、ヌクレオシド間連結によって連結された隣接するヌクレオシドを意味する。
「ロックド核酸」または「LNA」または「LNAヌクレオシド」とは、ヌクレオシド糖単位の4’位と2’位との間の2つの炭素原子を接続する架橋を有し、それにより二環式糖を形成する、核酸モノマーを意味する。かかる二環式糖の例としては、以下に示す通りのA)α−L−メチレンオキシ(4’−CH
2−O−2’)LNA、(B)β−D−メチレンオキシ(4’−CH
2−O−2’)LNA、(C)エチレンオキシ(4’−(CH
2)
2−O−2’)LNA、(D)アミノオキシ(4’−CH
2−O−N(R)−2’)LNA、および(E)オキシアミノ(4’−CH
2−N(R)−O−2’)LNAが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書で使用するとき、LNA化合物は、糖の4’位と2’位との間に少なくとも1つの架橋を有する化合物であって、その架橋の各々が、独立して、−[C(R1)(R2)]n−、−C(R1)=C(R2)−、−C(R1)=N−、−C(=NR1)−、−C(=O)−、−C(=S)−、−O−、−Si(R1)2−、−S(=O)x−、および−N(R1)−(式中、xは、0、1、または2であり;nは、1、2、3、または4であり;各R1およびR2は、独立して、H、保護基、ヒドロキシル、C1−C12アルキル、置換C1−C12アルキル、C2−C12アルケニル、置換C2−C12アルケニル、C2−C12アルキニル、置換C2−C12アルキニル、C5−C20アリール、置換C5−C20アリール、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、C5−C7脂環式ラジカル、置換C5−C7脂環式ラジカル、ハロゲン、OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、アシル(C(=O)−H)、置換アシル、CN、スルホニル(S(=O)2−J1)、またはスルホキシル(S(=O)−J1)であり;各J1およびJ2は、独立して、H、C1−C12アルキル、置換C1−C12アルキル、C2−C12アルケニル、置換C2−C12アルケニル、C2−C12アルキニル、置換C2−C12アルキニル、C5−C20アリール、置換C5−C20アリール、アシル(C(=O)−H)、置換アシル、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、C1−C12アミノアルキル、置換C1−C12アミノアルキル、または保護基である。)から独立して選択される1個または2〜4個の連結基を含む化合物を含むが、これらに限定されない。
LNAの定義に包含される4’−2’架橋基の例としては、−[C(R1)(R2)]n−、−[C(R1)(R2)]n−O−、−C(R1R2)−N(R1)−O−、または−C(R1R2)−O−N(R1)−の式のうちの1つが挙げられるが、これらに限定されない。さらに、LNAの定義に包含される他の架橋基は、4’−CH2−2’、4’−(CH2)2−2’、4’−(CH2)3−2’、4’−CH2−O−2’、4’−(CH2)2−O−2’、4’−CH2−O−N(R1)−2’、および4’−CH2−N(R1)−O−2’−架橋であり、式中、各R1およびR2は、独立して、H、保護基、またはC1−C12アルキルである。
また、本発明によるLNAの定義には、リボシル糖環の2’−ヒドロキシル基が糖環の4’炭素原子に結合し、それによってメチレンオキシ(4’−CH2−O−2’)架橋を形成して、二環式糖部分を形成するLNAも含まれる。この架橋は、2’酸素原子と4’炭素原子とを結合するメチレン(−CH2−)基であってもよく、これにはメチレンオキシ(4’−CH2−O−2’)LNAという用語が使用される。さらに、この位置にエチレン架橋基を有する二環式糖部分の場合、エチレンオキシ(4’−CH2CH2−O−2’)LNAという用語が使用される。メチレンオキシ(4’−CH2−O−2’)LNAの異性体であるα−L−メチレンオキシ(4’−CH2−O−2’)も本発明で使用するLNAの定義に包含される。
「ミスマッチ」または「非相補的核酸塩基」とは、第1の核酸の核酸塩基が、第2の核酸または標的核酸の対応する核酸塩基と対合できない場合を指す。
「修飾ヌクレオシド間連結」とは、天然に存在するヌクレオシド間結合(すなわち、リン酸ジエステルヌクレオシド間結合)からの置換または任意の変化を指す。
「修飾核酸塩基」とは、アデニン、シトシン、グアニン、チミジン、またはウラシル以外のあらゆる核酸塩基を意味する。「非修飾核酸塩基」とは、プリン塩基であるアデニン(A)およびグアニン(G)、ならびにピリミジン塩基である、チミン(T)、シトシン(C)、およびウラシル(U)を意味する。
「修飾ヌクレオシド」とは、独立して、修飾糖部分および/または修飾核酸塩基を有するヌクレオシドを意味する。
「修飾ヌクレオチド」とは、独立して、修飾糖部分、修飾ヌクレオシド間連結、または修飾核酸塩基を有するヌクレオチドを意味する。
「修飾オリゴヌクレオチド」とは、少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間連結、修飾糖、および/または修飾核酸塩基を含むオリゴヌクレオチドを意味する。
「修飾糖」とは、天然糖部分からの置換および/または任意の変化を意味する。
「モノマー」とは、オリゴマーの単一単位を指す。モノマーには、天然に存在するか修飾されているかにかかわらず、ヌクレオシドおよびヌクレオチドが含まれるが、これらに限定されない。
「モチーフ」とは、アンチセンス化合物中の非修飾および修飾ヌクレオシドのパターンを意味する。
「天然糖部分」とは、DNA(2’−H)またはRNA(2’−OH)中に認められる糖部分を意味する。
「天然に存在するヌクレオシド間連結」とは、3’−5’リン酸ジエステル連結を意味する。
「非相補的核酸塩基」とは、互いに水素結合を形成しない、あるいはハイブリダイゼーションを支持しない核酸塩基の対を指す。
「核酸」とは、モノマーヌクレオチドからなる分子を指す。核酸には、リボ核酸(RNA)、デオキシリボ核酸(DNA)、1本鎖核酸、2本鎖核酸、低分子干渉リボ核酸(siRNA)、およびマイクロRNA(miRNA)が含まれるが、これらに限定されない。
「核酸塩基」とは、別の核酸の塩基と対合可能な複素環部分を意味する。
「核酸塩基相補性」とは、別の核酸塩基との塩基対合が可能な核酸塩基を指す。例えば、DNAでは、アデニン(A)はチミン(T)に相補的である。例えば、RNAでは、アデニン(A)はウラシル(U)に相補的である。特定の実施形態では、相補的核酸塩基とは、アンチセンス化合物の、その標的核酸の核酸塩基との塩基対合が可能な核酸塩基を指す。例えば、アンチセンス化合物の特定の位置の核酸塩基が、標的核酸の特定の位置の核酸塩基と水素結合できる場合、オリゴヌクレオチドと標的核酸との間の水素結合の位置は、その核酸塩基対において相補的であるとみなされる。
「核酸塩基配列」とは、いかなる糖、結合、および/または核酸塩基の修飾とも無関係な連続核酸塩基の順序を意味する。
「ヌクレオシド」とは、糖に結合した核酸塩基を意味する。
「ヌクレオシド模倣体」は、オリゴマー化合物の1つ以上の位置において糖または糖および塩基、ならびに必ずではないが結合を置換するために使用される構造体を含み、例えば、モルホリノ、シクロヘキセニル、シクロヘキシル、テトラヒドロピラニル、二環式または三環式糖模倣体、例えば、非フラノース糖単位を有するヌクレオシド模倣体が挙げられる。ヌクレオチド模倣体は、オリゴマー化合物の1つ以上の位置において、ヌクレオシドおよび結合を置換するために使用される構造体を含み、例えば、ペプチド核酸またはモルホリノ(−N(H)−C(=O)−O−または他の非リン酸ジエステル連結によって連結されるモルホリノ)が挙げられる。糖代用物は、やや広義ではヌクレオシド模倣体と重複するが、糖単位(フラノース環)の置換のみを示すよう意図されている。本明細書において提供するテトラヒドロピラニル環は、フラノース糖基がテトラヒドロピラニル環系で置換された糖代用物の例を示している。「模倣体」とは、糖、核酸塩基、および/またはヌクレオシド間連結を置換する基を指す。一般に、模倣体は、糖または糖−ヌクレオシド間連結の組み合わせの代わりに使用され、核酸塩基は、選択される標的に対するハイブリダイゼーションのために維持される。
「ヌクレオチド」とは、ヌクレオシドの糖部分に共有結合したリン酸基を有するヌクレオシドを意味する。
「オフターゲット効果」とは、目的とする標的核酸以外の遺伝子のRNAもしくはタンパク質発現の調節に付随する望ましくない効果または有害な生物学的効果を指す。
「オリゴマー化合物」とは、核酸分子の少なくともある領域にハイブリダイズ可能な連結したモノマーサブユニットのポリマーを意味する。
「オリゴヌクレオシド」とは、ヌクレオシド間連結がリン原子を含まないオリゴヌクレオチドを意味する。
「オリゴヌクレオチド」とは、連結されたヌクレオシドのポリマーを意味し、連結されたヌクレオシドの各々は、互いに独立して、修飾されていても非修飾でもよい。
「非経口投与」とは、注射(例えば、ボーラス注入)または点滴による投与を意味する。非経口投与には、皮下投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、腹腔内投与、または頭蓋内投与、例えば髄腔内もしくは脳室内投与が含まれる。
「ペプチド」とは、アミド結合により少なくとも2つのアミノ酸を連結することによって形成される分子を意味する。限定するものではないが、本明細書で使用するとき、「ペプチド」とは、ポリペプチドおよびタンパク質を指す。
「薬学的に許容される担体」とは、オリゴヌクレオチドの構造に干渉しない媒体または希釈剤を意味する。特定のかかる担体は、例えば、対象による経口摂取用の錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル、液剤、ゲル、シロップ剤、スラリー剤、懸濁剤、および舐剤として、医薬組成物を製剤化できるようにする。
「薬学的に許容される誘導体」は、本明細書に記載される化合物の薬学的に許容される塩、共役体、プロドラッグ、または異性体を包含する。
「薬学的に許容される塩」とは、アンチセンス化合物の生理学的および薬学的に許容される塩、すなわち親オリゴヌクレオチドの所望の生物活性を保持し、かつそれに望ましくない毒性効果を付与しない塩を意味する。
「医薬品」とは、個人に投与したときに治療効果をもたらす物質を意味する。例えば、特定の実施形態では、HBVを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは医薬品である。
「医薬組成物」とは、対象への投与に好適な物質の混合物を意味する。例えば、医薬組成物は、アンチセンスオリゴヌクレオチドと滅菌水溶液とを含んでもよい。特定の実施形態では、医薬組成物は、特定の細胞株における自由取り込みアッセイで活性を示す。
「ホスホロチオエート連結」とは、非架橋酸素原子のうちの1つを硫黄原子で置換することによりリン酸ジエステル結合が修飾された、ヌクレオシド間の連結を意味する。ホスホロチオエート連結は、修飾ヌクレオシド間連結である。
「部分」とは、核酸の規定の数の連続(すなわち、連結)核酸塩基を意味する。特定の実施形態では、部分は、標的核酸の規定の数の連続核酸塩基である。特定の実施形態では、部分は、アンチセンス化合物の規定の数の連続核酸塩基である。
「防止」または「防止すること」とは、状態または疾患の発現または発症を数時間から数日間、好ましくは数週間から数ヶ月の期間、遅延させる、または予防することを指す。
「プロドラッグ」とは、不活性形態で調製され、内因性の酵素あるいは他の化学物質または条件の作用によって、身体またはその細胞内で活性形態(すなわち、薬物)に変換される治療薬を意味する。
「予防有効量」とは、動物に予防または防止効果をもたらす医薬品の量を指す。
「推奨される療法」とは、疾患の治療、緩和、または防止のために医療専門家により推奨される治療法を意味する。
「領域」は、少なくとも1つの特定可能な構造、機能、または特徴を有する標的核酸の部分と定義される。
「リボヌクレオチド」とは、ヌクレオチドの糖部分の2’位にヒドロキシを有するヌクレオチドを意味する。リボヌクレオチドは、種々の置換基のいずれで修飾されていてもよい。
「塩」とは、アンチセンス化合物の生理学的および薬学的に許容される塩、すなわち親オリゴヌクレオチドの所望の生物活性を保持し、かつそれに望ましくない毒性効果を付与しない塩を意味する。
「セグメント」は、標的核酸内の領域のより小さい部分もしくは従属部分と定義される。
「セロコンバージョン」は、市販のELISA系の現在利用可能な検出限界で判定する際に、セロコンバージョンの決定因子としてHBeAgをモニターする場合、血清HBeAgの不在および血清HBeAbの存在と定義され、あるいはセロコンバージョンの決定因子としてHBsAgをモニターする場合、血清HBsAgの不在と定義される。
本明細書において教示されるアンチセンスオリゴヌクレオチドの「短縮」型または「切断」型は、1つ、2つ、またはそれ以上のヌクレオシドが欠失している。
「副作用」とは、治療に起因する所望の効果以外の生理学的応答を意味する。特定の実施形態では、副作用は、限定するものではないが、注射部位反応、肝機能検査異常、腎機能異常、肝毒性、腎毒性、中枢神経系の異常、およびミオパシーを含む。例えば、血清アミノトランスフェラーゼレベルの増加は、肝毒性または肝機能異常を示し得る。例えば、ビリルビンの増加は、肝毒性または肝機能異常を示し得る。
本明細書で使用する「顕著な」とは、測定可能または観測可能であること意味し、例えば、顕著な結果、例えば顕著な改善または顕著な減少とは、一般に、測定可能または観測可能な結果、例えば測定可能または観測可能な改善または減少を指す。
本明細書で使用する「部位」とは、標的核酸内の固有の核酸塩基部分と定義される。
「進行を遅らせる」とは、当該疾患の進行の低下を意味する。
「特異的にハイブリダイズ可能な」とは、特異的結合が望まれる条件下で、すなわちインビボアッセイおよび治療処置の場合には生理学的条件下で、アンチセンスオリゴヌクレオチドと標的核酸との間に、所望の効果を誘導するのに十分な程度の相補性を有する一方、非標的核酸に対してはわずかな影響を示すか、全く影響を示さないアンチセンス化合物を指す。「ストリンジェントハイブリダイゼーション条件」または「ストリンジェント条件」とは、オリゴマー化合物がその標的配列にハイブリダイズするが、他の配列にはわずかな数しかハイブリダイズしない条件を指す。
本明細書で使用する「統計的に有意な」とは、偶然生じる可能性が低い測定可能または観測可能なパラメータを意味する。
「皮下投与」とは、皮膚直下の投与を意味する。
「対象」とは、治療または療法に選択されたヒトまたは非ヒト動物を意味する。
「標的」とは、調節が所望されるタンパク質を指す。
「標的遺伝子」とは、標的をコードする遺伝子を指す。
「標的とすること」とは、標的核酸に特異的にハイブリダイズし、所望の効果を誘導するアンチセンス化合物の設計および選択の過程を意味する。
「標的核酸」、「標的RNA」、「標的RNA転写物」、および「核酸標的」は全て、アンチセンス化合物の標的とすることが可能な核酸を意味する。
「標的領域」とは、1つ以上のアンチセンス化合物が標的とする標的核酸の部分を意味する。
「標的セグメント」とは、アンチセンス化合物が標的とする標的核酸のヌクレオチドの配列を意味する。「5’標的部位」とは、標的セグメントの最も5’側のヌクレオチドを指す。「3’標的部位」とは、標的セグメントの最も3’側のヌクレオチドを指す。
「治療有効量」とは、個人に治療効果をもたらす医薬品の量を意味する。
「治療」とは、疾患または状態の変化または改善を達成するために組成物を投与することを指す。
「非修飾」核酸塩基とは、プリン塩基であるアデニン(A)およびグアニン(G)、ならびにピリミジン塩基である、チミン(T)、シトシン(C)、およびウラシル(U)を意味する。
「非修飾ヌクレオチド」とは、天然に存在する核酸塩基、糖部分、およびヌクレオシド間連結からなるヌクレオチドを意味する。特定の実施形態では、非修飾ヌクレオチドは、RNAヌクレオチド(すなわち、β−D−リボヌクレオシド)またはDNAヌクレオチド(すなわち、β−D−デオキシリボヌクレオシド)である。
「有効標的セグメント」は、活性オリゴマー化合物が標的とする標的領域の少なくとも8核酸塩基部分(すなわち、8個の連続する核酸塩基)と定義される。
「ウィングセグメント」とは、向上した阻害活性、増加した標的核酸に対する結合親和性、またはインビボヌクレアーゼによる分解に対する耐性等の特性をオリゴヌクレオチドに付与するように修飾された複数のヌクレオシドを意味する。
特定の実施形態
特定の実施形態は、HBV mRNA発現を阻害するための方法、化合物、および組成物を提供する。
特定の実施形態は、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物を提供する。特定の実施形態では、HBV核酸は、GENBANK受託番号U95551.1(配列番号1として本明細書に組み込まれる)に記載される配列である。
特定の実施形態では、本明細書で提供される化合物は、修飾オリゴヌクレオチドであるか、または修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、化合物は、修飾オリゴヌクレオチドと、本明細書に記載の共役体とを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、薬学的に許容される誘導体である。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、HBVを標的とする、10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。HBV標的は、配列番号1に記載の配列、またはその部分、またはその変異体を有してもよい。
特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または修飾オリゴヌクレオチドは、10〜30個の連結されたヌクレオシド長であり、HBVを標的とする。特定の実施形態では、HBV標的は、配列番号1に記載の配列を有する。特定の実施形態では、かかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBVの以下のヌクレオチド領域のうちの1つを標的とする:CCTGCTGGTGGCTCCAGTTC(配列番号1273)、AGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCA(配列番号1354)、CATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTT(配列番号1276)、CAAGGTATGTTGCCCGT(配列番号1277)、CCTATGGGAGTGGGCCTCAG(配列番号1279、TGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCG(配列番号1287)、TATATGGATGATGTGGT(配列番号1359)、TGCCAAGTGTTTGCTGA(配列番号1360)、TGCCGATCCATACTGCGGAACTCCT(配列番号1361)、CCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGCACGT(配列番号1352)、GGAGGCTGTAGGCATAAATTGGT(配列番号1353)、CTTTTTCACCTCTGCCTA(配列番号1362)、TTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGG(配列番号1363)、AGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGG(配列番号1274)、TGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCAT(配列番号1275)、TGTATTCCCATCCCATC(配列番号1278)、TGGCTCAGTTTACTAGTGC(配列番号1280)、GGGCTTTCCCCCACTGT(配列番号1281)、TCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACTCCT(配列番号1282)、CGCACCTCTCTTTACGCGG(配列番号1283)、GGAGTGTGGATTCGCAC(配列番号1284)、またはGAAGAAGAACTCCCTCGCCT(配列番号1285)。特定の実施形態では、かかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、9個、10個、またはそれ以上の連結されたデオキシヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、かかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、または16個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、かかるギャップセグメントは、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、または8個の連結された修飾ヌクレオシドを独立して有する2つのウィングセグメント間に存在する。特定の実施形態では、ウィングセグメント中の1つ以上の修飾ヌクレオシドは、修飾糖を有する。特定の実施形態では、修飾糖は二環式糖である。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、LNAヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−置換ヌクレオシドである。特定の実施形態では、2’置換ヌクレオシドには、二環式糖修飾を含むヌクレオシドが含まれる。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−MOEヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)ヌクレオシドである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、少なくとも8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、または30個の連続核酸塩基が、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な部分を含む核酸塩基配列であって、配列番号1に相補的な核酸塩基配列を有する、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、かかるオリゴヌクレオチドは、9個、10個、またはそれ以上の連結されたデオキシヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、かかるギャップセグメントは、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、または8個の連結された修飾ヌクレオシドを独立して有する2つのウィングセグメント間に存在する。特定の実施形態では、ウィングセグメント中の1つ以上の修飾ヌクレオシドは、修飾糖を有する。特定の実施形態では、修飾糖は二環式糖である。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、LNAヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−置換ヌクレオシドである。特定の実施形態では、2’置換ヌクレオシドには、二環式糖修飾を含むヌクレオシドが含まれる。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−MOEヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)ヌクレオシドである。特定の実施形態では、各ウィングセグメント中の各修飾ヌクレオシドは、独立して、2’−MOEヌクレオシド、または二環式糖修飾を含むヌクレオシド、例えば拘束エチル(cEt)ヌクレオシドまたはLNAヌクレオシドである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号5〜310、321〜802、804〜1272、1288〜1350、1364〜1372、1375、1376、または1379のいずれかの少なくとも8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、かかるオリゴヌクレオチドは、9個、10個、またはそれ以上の連結されたデオキシヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、かかるギャップセグメントは、1〜5個、1〜4個、1〜3個、2〜5個、2〜4個、または2〜3個の連結された修飾ヌクレオシドを独立して有する2つのウィングセグメント間に存在する。特定の実施形態では、かかるギャップセグメントは、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、または8個の連結された修飾ヌクレオシドを独立して有する2つのウィングセグメント間に存在する。特定の実施形態では、ウィングセグメント中の1つ以上の修飾ヌクレオシドは、修飾糖を有する。特定の実施形態では、修飾糖は二環式糖である。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、LNAヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−置換ヌクレオシドである。特定の実施形態では、2’置換ヌクレオシドには、二環式糖修飾を含むヌクレオシドが含まれる。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−MOEヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)ヌクレオシドである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、または4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、各糖修飾ヌクレオシドは、独立して、2’−MOEヌクレオシド、または二環式糖部分を含むヌクレオシド、例えば拘束エチル(cEt)ヌクレオシドまたはLNAヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、9個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、各糖修飾ヌクレオシドは、独立して、2’−MOEヌクレオシド、または二環式ヌクレオシド、例えば拘束エチル(cEt)ヌクレオシドまたはLNAヌクレオシドである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号5〜310、321〜802、804〜1272、1288〜1350、1364〜1372、1375、1376、または1379のうちのいずれかの少なくとも8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、かかるオリゴヌクレオチドは、10個以上の連結されたデオキシヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、かかるギャップセグメントは、1〜5個、1〜4個、1〜3個、2〜5個、2〜4個、または2〜3個の連結された修飾ヌクレオシドを独立して有する2つのウィングセグメント間に存在する。特定の実施形態では、かかるギャップセグメントは、2個、3個、4個、5個、6個、7個、または8個の連結された修飾ヌクレオシドを独立して有する2つのウィングセグメント間に存在する。特定の実施形態では、ウィングセグメント中の1つ以上の修飾ヌクレオシドは、修飾糖を有する。特定の実施形態では、修飾糖は二環式糖である。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、LNAヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−置換ヌクレオシドである。特定の実施形態では、2’置換ヌクレオシドには、二環式糖修飾を含むヌクレオシドが含まれる。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−MOEヌクレオシドである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号5、15、16、33、39〜95、123〜135、163〜175、180〜310、321〜406、413〜455、461〜802、または804〜1272のいずれかの少なくとも8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、かかるオリゴヌクレオチドは、10個以上の連結されたデオキシヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、かかるギャップセグメントは、1〜5個、1〜4個、1〜3個、2〜5個、2〜4個、または2〜3個の連結された修飾ヌクレオシドを独立して有する2つのウィングセグメント間に存在する。特定の実施形態では、ウィングセグメント中の1つ以上の修飾ヌクレオシドは、修飾糖を有する。特定の実施形態では、修飾糖は二環式糖である。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、LNAヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−置換ヌクレオシドである。特定の実施形態では、2’置換ヌクレオシドには、二環式糖修飾を含むヌクレオシドが含まれる。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−MOEヌクレオシドである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号6〜14、17〜32、34〜38、96〜122、136〜162、176〜179、407〜412、456〜462、523〜538のいずれかの少なくとも8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、かかるオリゴヌクレオチドは、10個以上の連結されたデオキシヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、かかるギャップセグメントは、1〜5個、1〜4個、1〜3個、2〜5個、2〜4個、または2〜3個の連結された修飾ヌクレオシドを独立して有する2つのウィングセグメント間に存在する。特定の実施形態では、ウィングセグメント中の1つ以上の修飾ヌクレオシドは、修飾糖を有する。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−置換ヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−MOEヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、14ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜3個、または2個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、9個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、または5個の糖修飾ヌクレオシド、例えば2’−MOEヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17ヌクレオシド長であり、9個または10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3〜4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、5個、または6個の糖修飾ヌクレオシド、例えば2’−MOEヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、18ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、3〜5個、または4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、5個、6個、7個、または8個の糖修飾ヌクレオシド、例えば2’−MOEヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、修飾オリゴヌクレオチドの塩を含む。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、薬学的に許容される担体または希釈剤をさらに含む。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、修飾オリゴヌクレオチド全体にわたって測定したとき、配列番号1に少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、または100%相補的である。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、修飾オリゴヌクレオチド全体にわたって測定したとき、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363のうちのいずれか1つに、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、または100%相補的である。
特定の実施形態では、化合物または修飾オリゴヌクレオチドは1本鎖である。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、または30個の連結されたヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、18個の連結されたヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、14個の連結されたヌクレオシドからなる。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシド間連結は、修飾ヌクレオシド間連結である。特定の実施形態では、各ヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結である。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、修飾糖を含む。特定の実施形態では、少なくとも1つの修飾糖は、2’−O−メトキシエチル基(2’−O(CH2)2−OCH3)を含む。特定の実施形態では、修飾糖は2’−O−CH3基を含む。
特定の実施形態では、少なくとも1つの修飾糖は二環式糖である。特定の実施形態では、少なくとも1つの修飾糖である二環式糖は、4’−(CH2)n−O−2’架橋を含み、式中、nは1または2である。特定の実施形態では、二環式糖は、4’−CH2−O−2’架橋を含む。特定の実施形態では、二環式糖は、4’−CH(CH3)−O−2’架橋を含む。
特定の実施形態では、当該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含む。特定の実施形態では、修飾核酸塩基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、1本鎖修飾オリゴヌクレオチドからなる。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、a)連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。ギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは修飾糖を含む。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは3個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは3個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖および/または拘束エチル(cEt)糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。一部の態様では、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、3’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドの各々は、拘束エチル(cEt)糖である。他の態様では、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、拘束エチル(cEt)糖、および2’−O−メトキシエチル糖である。他の態様では、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖である。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖および拘束エチル(cEt)糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。一部の態様では、5’ウィングセグメントの2個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および2’−O−メトキシエチル糖である。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの2個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖および2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、8個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、8個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドの各々は、拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖および拘束エチル(cEt)糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。一部の態様では、5’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および2’−O−メトキシエチル糖である。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、および2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、8個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、8個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、7個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、および2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、7個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、6個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの6個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、7個の連結されたデオキシヌクレオシドからり、5’ウィングセグメントは、6個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントの6個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンであり、5’ウィングの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングの5個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖である。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)3個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。一部の態様では、ギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、3’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドの各々は、拘束エチル(cEt)糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。他の態様では、ギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、拘束エチル(cEt)糖、および2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。他の態様では、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖である。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)2個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。一部の態様では、ギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、5’ウィングセグメントの2個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)2個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの2個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖および2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)8個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)8個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの3個の連結されたヌクレオシドの各々は、拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)4個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖および拘束エチル(cEt)糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。一部の態様では、5’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および2’−O−メトキシエチル糖である。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)4個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、および2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)4個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)8個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)8個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)7個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの5個の連結されたヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、および2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)7個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)6個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの6個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)7個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)6個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、5’ウィングセグメントの6個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングセグメントの4個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖であり、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンであり、5’ウィングの5個の連結されたヌクレオシドは、5’から3’の方向で、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、拘束エチル(cEt)糖、2’−デオキシヌクレオシド、および拘束エチル(cEt)糖であり、3’ウィングの5個の連結されたヌクレオシドの各々は、2’−O−メトキシエチル糖である。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、8個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、8個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、7個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、7個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、6個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、6個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、18個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、6個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、6個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、5個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、3個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、4個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、14個の連結されたヌクレオシドからなり、ギャップセグメントは、10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなり、5’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、3’ウィングセグメントは、2個の連結されたヌクレオシドからなり、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシンは5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)2個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)8個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)8個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)2個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)7個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)7個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)3個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)4個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)6個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)6個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、18個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)4個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)2個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)6個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)6個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)2個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)4個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)3個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、17個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)3個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)2個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)2個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)4個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)3個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、16個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)9個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載の核酸塩基のいずれかの等長部分に相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、14個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、この核酸塩基配列は、配列番号1に相補的であり、この修飾オリゴヌクレオチドは、a)10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、b)2個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、c)2個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含む。このギャップセグメントは、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり、各シトシン残基は5−メチルシトシンである。
特定の実施形態では、提供される方法、化合物、および組成物は、HBV mRNA発現および/またはDNAレベルおよび/またはタンパク質レベルおよび/または抗原レベルを阻害する。
別の実施形態は、哺乳動物におけるHBV関連疾患、障害、および状態を治療するための方法を提供し、この方法は、HBV関連疾患、障害、および状態を治療するために、治療有効量の上述の任意の医薬組成物を、それを必要とする哺乳動物に投与することを含む。関連する実施形態では、哺乳動物はヒトであり、HBV関連疾患、障害、および状態は、ヒトB型肝炎ウイルスによるB型肝炎ウイルス感染症である。より具体的には、ヒトB型肝炎ウイルスは、ヒト地理的遺伝子型:A(北西欧、北米、中米)、B(インドネシア、中国、ベトナム)、C(東アジア、韓国、中国、日本、ポリネシア、ベトナム)、D(地中海地域、中東、インド)、E(アフリカ)、F(アメリカ先住民、ポリネシア)、G(米国、フランス)、またはH(中米)のいずれであってもよい。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1の以下のヌクレオチド領域内で相補的である:1〜20、10〜29、10〜56、13〜38、13〜35、19〜38、25〜47、25〜50、25〜56、43〜68、43〜63、55〜74、58〜73、58〜74、58〜77、58〜79、58〜80、58〜84、59〜74、59〜75、59〜80、60〜75、60〜76、60〜79、61〜76、61〜77、61〜80、62〜77、63〜84、68〜114、101〜123、98〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、158〜177、167〜186、191〜215、196〜224、196〜215、196〜218、199〜228、199〜218、199〜224、200〜224、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜264、242〜263、243〜262、244〜263、245〜274、245〜260、245〜264、246〜266、247〜266、247〜269、247〜270、245〜267、251〜267、245〜266、250〜269、251〜266、251〜268、251〜269、245〜269、245〜266、245〜261、250〜265、250〜266、250〜267、250〜268、250〜269、251〜270、252〜267、253〜268、253〜269、253〜272、253〜274、254〜269、254〜270、254〜274、255〜270、255〜271、255〜274、255〜401、255〜400、255〜274、255〜273、255〜272、255〜271、256〜271、256〜275、255〜276、256〜272、256〜276、253〜275、256〜279、257〜276、258〜273、259〜274、260〜279、262〜281、262〜321、262〜315、262〜312、265〜312、266〜288、266〜291、266〜285、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、292〜311、290〜312、293〜312、293〜315、293〜321、296〜321、302〜321、324〜343、339〜361、339〜367、348〜367、342〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜383、360〜388、360〜385、362〜381、366〜388、369〜388、366〜385、366〜392、370〜389、370〜392、380〜399、382〜401、384〜433、384〜400、384〜401、385〜401、405〜424、409〜428、405〜428、411〜426、411〜427、411〜430、411〜431、411〜437、412〜431、411〜426、411〜427、412〜428、412〜431、412〜427、413〜433、413〜432、413〜428、413〜429、413〜432、413〜433、414〜427、415〜427、414〜429、414〜430、414〜433、415〜428、415〜429、415〜430、415〜431、415〜434、416〜431、416〜432、416〜429、416〜435、417〜432、417〜433、417〜436、418〜433、418〜435、418〜434、418〜437、419〜435、419〜434、420〜435、419〜432、419〜434、421〜436、422〜437、422〜441、423〜436、425〜465、454〜473、454〜472、457〜476、457〜472、457〜473、454〜476、455〜472、457〜485、458〜485、458〜483、458〜477、458〜473、459〜485、460〜485、463〜498、463〜485、466〜485、463〜482、457〜491、458〜491、459〜491、460〜491、463〜491、466〜491、472〜491、472〜493、473〜492、475〜491、459〜494、460〜494、463〜494、466〜494、467〜498、472〜494、475〜494、457〜473、457〜472、458〜494、454〜494、457〜494、457〜473、485〜513、470〜493、476〜519、485〜519、500〜519、512〜534、512〜550、524〜546、536〜559、548〜567、548〜570、550〜570、548〜594、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、611〜645、617〜363、623〜642、617〜645、639〜754、639〜658、639〜654、641〜656、642〜657、643〜658、642〜754、653〜672、662〜685、665〜685、665〜689、668〜687、670〜754、670〜706、670〜685、670〜686、670〜689、671〜690、671〜691、671〜686、671〜687、672〜693、672〜697、672〜707、672〜687、672〜688、673〜688、674〜693、678〜693、679〜694、679〜707、679〜698、679〜701、679〜702、679〜707、680〜695、680〜699、679〜699、681〜706、681〜696、682〜697、682〜706、682〜707、682〜702、682〜701、683〜698、684〜699、685〜700、686〜701、687〜754、688〜704、689〜709、689〜710、690〜705、679〜705、679〜710、679〜706、690〜710、691〜710、690〜754、690〜706、684〜703、687〜705、687〜702、687〜703、687〜706、688〜703、688〜704、688〜705、689〜704、689〜705、689〜708、690〜705、690〜706、690〜709、691〜706、692〜711、693〜716、693〜712、695〜715、697〜716、697〜716、690〜716、724〜746、724〜752、724〜754、724〜758、733〜752、738〜754、738〜753、739〜758、739〜754、739〜775、739〜754、740〜754、742〜785、742〜773、757〜776、757〜785、790〜815、793〜812、811〜833、811〜844、814〜833、811〜906、820〜839、822〜844、822〜867、823〜842、845〜864、845〜867、854〜906、845〜909、845〜906、854〜876、863〜882、863〜885、878〜900、887〜906、899〜918、899〜933、899〜958、905〜927、905〜933、914〜933、936〜958、936〜955、945〜964、951〜970、951〜985、951〜1044、951〜1024、951〜1056、951〜997、960〜985、963〜1044、963〜1024、963〜997、972〜1015、1025〜1044、1031〜1056、1037〜1056、1046〜1083、1049〜1068、1070〜1089、1070〜1095、1082〜1101、1081〜1134、1081〜1143、1082〜1101、1088〜1107、1088〜1134、1094〜1119、1097〜1119、1112〜1134、1118〜1143、1118〜1146、1088〜1146、1121〜1140、1127〜1146、1127〜1193、1150〜1193、1156〜1187、1165〜1187、1170〜1192、1171〜1191、1172〜1191、1176〜1192、1176〜1285、1177〜1192、1176〜1191、1203〜1297、1206〜1228、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1255、1245〜1265、1251〜1280、1262〜1285、1251〜1285、1259〜1296、1259〜1290、1259〜1287、1261〜1296、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1296、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1264〜1297、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1296、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1270〜1285、1271〜1290、1271〜1296、1277〜1296、1261〜1290、1262〜1290、1268〜1290、1263〜1305、1259〜1305、1259〜1305、1266〜1305、1259〜1302、1275〜1294、1281〜1306、1281〜1324、1281〜1336、1282〜1301、1286〜1306、1290〜1324、1293〜1318、1290〜1324、1293〜1315、1296〜1315、1311〜1336、1311〜1333、1326〜1345、1353〜1381、1359〜1378、1395〜1414、1498〜1532、1498〜1523、1498〜1535、1510〜1529、1515〜1535、1515〜1563、1515〜1596、1515〜1605、1515〜1602、1515〜1540、1515〜1535、1518〜1605、1518〜1602、1518〜1537、1521〜1563、1521〜1540、1550〜1655、1550〜1563、1550〜1569、1553〜1578、1553〜1599、1553〜1590、1565〜1584、1571〜1595、1577〜1605、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1578〜1598、1571〜1598、1579〜1594、1579〜1594、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1580〜1605、1580〜1602、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1582〜1602、1553〜1655、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1586〜1652、1642〜1664、1651〜1720、1651〜1673、1655〜1679、1695〜1720、1716〜1738、1743〜1763、1743〜1768、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1796、1777〜1800、1778〜
1800、1778〜1793、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1798、1779〜1797、1779〜1796、1779〜1795、1779〜1794、1780〜1799、1780〜1796、1780〜1795、1781〜1797、1781〜1796、1781〜1796、1781〜1800、1781〜1797、1782〜1799、1782〜1797、1782〜1798、1783〜1798、1783〜1799、1784〜1800、1784〜1799、1779〜1799、1778〜1889、1778〜1794、1779〜1795、1780〜1799、1785〜1800、1794〜1813、1806〜1837、1806〜1828、1806〜1825、1809〜1828、1812〜1843、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1843、1815〜1844、1815〜1840、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1840、1821〜1844、1821〜1837、1822〜1843、1822〜1839、1822〜1837、1823〜1843、1823〜1838、1824〜1839、1827〜1846、1861〜1884、1861〜1880、1865〜1885、1866〜1881、1867〜1882、1867〜1886、1868〜1883、1869〜1885、1869〜1884、1870〜1885、1871〜1886、1872〜1887、1874〜1889、1876〜1895、1888〜1914、1888〜1908、1891〜1910、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1913〜1935、1898〜1920、1907〜1929、1913〜1935、1918〜1934、1919〜1938、1919〜1934、1921〜1934、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2368〜2393、2381〜2397、2368〜2394、2379〜2394、2381〜2396、2368〜2397、2368〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2459〜2478、2819〜2838、2818〜2838、2873〜2892、および3161〜3182。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1の以下のヌクレオチド領域を標的とする:1〜20、10〜29、10〜56、13〜38、13〜35、19〜38、25〜47、25〜50、25〜56、43〜68、43〜63、55〜74、58〜73、58〜74、58〜77、58〜79、58〜80、58〜84、59〜74、59〜75、59〜80、60〜75、60〜76、60〜79、61〜76、61〜77、61〜80、62〜77、63〜84、68〜114、101〜123、98〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、158〜177、167〜186、191〜215、196〜224、196〜215、196〜218、199〜228、199〜218、199〜224、200〜224、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜264、242〜263、243〜262、244〜263、245〜274、245〜260、245〜264、246〜266、247〜266、247〜269、247〜270、245〜267、251〜267、245〜266、250〜269、251〜266、251〜268、251〜269、245〜269、245〜266、245〜261、250〜265、250〜266、250〜267、250〜268、250〜269、251〜270、252〜267、253〜268、253〜269、253〜272、253〜274、254〜269、254〜270、254〜274、255〜270、255〜271、255〜274、255〜401、255〜400、255〜274、255〜273、255〜272、255〜271、256〜271、256〜275、255〜276、256〜272、256〜276、253〜275、256〜279、257〜276、258〜273、259〜274、260〜279、262〜281、262〜321、262〜315、262〜312、265〜312、266〜288、266〜291、266〜285、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、292〜311、290〜312、293〜312、293〜315、293〜321、296〜321、302〜321、324〜343、339〜361、339〜367、348〜367、342〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜383、360〜388、360〜385、362〜381、366〜388、369〜388、366〜385、366〜392、370〜389、370〜392、380〜399、382〜401、384〜433、384〜400、384〜401、385〜401、405〜424、409〜428、405〜428、411〜426、411〜427、411〜430、411〜431、411〜437、412〜431、411〜426、411〜427、412〜428、412〜431、412〜427、413〜433、413〜432、413〜428、413〜429、413〜432、413〜433、414〜427、415〜427、414〜429、414〜430、414〜433、415〜428、415〜429、415〜430、415〜431、415〜434、416〜431、416〜432、416〜429、416〜435、417〜432、417〜433、417〜436、418〜433、418〜435、418〜434、418〜437、419〜435、419〜434、420〜435、419〜432、419〜434、421〜436、422〜437、422〜441、423〜436、425〜465、454〜473、454〜472、457〜476、457〜472、457〜473、454〜476、455〜472、457〜485、458〜485、458〜483、458〜477、458〜473、459〜485、460〜485、463〜498、463〜485、466〜485、463〜482、457〜491、458〜491、459〜491、460〜491、463〜491、466〜491、472〜491、472〜493、473〜492、475〜491、459〜494、460〜494、463〜494、466〜494、467〜498、472〜494、475〜494、457〜473、457〜472、458〜494、454〜494、457〜494、457〜473、485〜513、470〜493、476〜519、485〜519、500〜519、512〜534、512〜550、524〜546、536〜559、548〜567、548〜570、550〜570、548〜594、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、611〜645、617〜363、623〜642、617〜645、639〜754、639〜658、639〜654、641〜656、642〜657、643〜658、642〜754、653〜672、662〜685、665〜685、665〜689、668〜687、670〜754、670〜706、670〜685、670〜686、670〜689、671〜690、671〜691、671〜686、671〜687、672〜693、672〜697、672〜707、672〜687、672〜688、673〜688、674〜693、678〜693、679〜694、679〜707、679〜698、679〜701、679〜702、679〜707、680〜695、680〜699、679〜699、681〜706、681〜696、682〜697、682〜706、682〜707、682〜702、682〜701、683〜698、684〜699、685〜700、686〜701、687〜754、688〜704、689〜709、689〜710、690〜705、679〜705、679〜710、679〜706、690〜710、691〜710、690〜754、690〜706、684〜703、687〜705、687〜702、687〜703、687〜706、688〜703、688〜704、688〜705、689〜704、689〜705、689〜708、690〜705、690〜706、690〜709、691〜706、692〜711、693〜716、693〜712、695〜715、697〜716、697〜716、690〜716、724〜746、724〜752、724〜754、724〜758、733〜752、738〜754、738〜753、739〜758、739〜754、739〜775、739〜754、740〜754、742〜785、742〜773、757〜776、757〜785、790〜815、793〜812、811〜833、811〜844、814〜833、811〜906、820〜839、822〜844、822〜867、823〜842、845〜864、845〜867、854〜906、845〜909、845〜906、854〜876、863〜882、863〜885、878〜900、887〜906、899〜918、899〜933、899〜958、905〜927、905〜933、914〜933、936〜958、936〜955、945〜964、951〜970、951〜985、951〜1044、951〜1024、951〜1056、951〜997、960〜985、963〜1044、963〜1024、963〜997、972〜1015、1025〜1044、1031〜1056、1037〜1056、1046〜1083、1049〜1068、1070〜1089、1070〜1095、1082〜1101、1081〜1134、1081〜1143、1082〜1101、1088〜1107、1088〜1134、1094〜1119、1097〜1119、1112〜1134、1118〜1143、1118〜1146、1088〜1146、1121〜1140、1127〜1146、1127〜1193、1150〜1193、1156〜1187、1165〜1187、1170〜1192、1171〜1191、1172〜1191、1176〜1192、1176〜1285、1177〜1192、1176〜1191、1203〜1297、1206〜1228、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1255、1245〜1265、1251〜1280、1262〜1285、1251〜1285、1259〜1296、1259〜1290、1259〜1287、1261〜1296、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1296、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1264〜1297、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1296、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1270〜1285、1271〜1290、1271〜1296、1277〜1296、1261〜1290、1262〜1290、1268〜1290、1263〜1305、1259〜1305、1259〜1305、1266〜1305、1259〜1302、1275〜1294、1281〜1306、1281〜1324、1281〜1336、1282〜1301、1286〜1306、1290〜1324、1293〜1318、1290〜1324、1293〜1315、1296〜1315、1311〜1336、1311〜1333、1326〜1345、1353〜1381、1359〜1378、1395〜1414、1498〜1532、1498〜1523、1498〜1535、1510〜1529、1515〜1535、1515〜1563、1515〜1596、1515〜1605、1515〜1602、1515〜1540、1515〜1535、1518〜1605、1518〜1602、1518〜1537、1521〜1563、1521〜1540、1550〜1655、1550〜1563、1550〜1569、1553〜1578、1553〜1599、1553〜1590、1565〜1584、1571〜1595、1577〜1605、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1578〜1598、1571〜1598、1579〜1594、1579〜1594、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1580〜1605、1580〜1602、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1582〜1602、1553〜1655、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1586〜1652、1642〜1664、1651〜1720、1651〜1673、1655〜1679、1695〜1720、1716〜1738、1743〜1763、1743〜1768、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1796、1777〜1800、1778〜1800、1778
〜1793、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1798、1779〜1797、1779〜1796、1779〜1795、1779〜1794、1780〜1799、1780〜1796、1780〜1795、1781〜1797、1781〜1796、1781〜1796、1781〜1800、1781〜1797、1782〜1799、1782〜1797、1782〜1798、1783〜1798、1783〜1799、1784〜1800、1784〜1799、1779〜1799、1778〜1889、1778〜1794、1779〜1795、1780〜1799、1785〜1800、1794〜1813、1806〜1837、1806〜1828、1806〜1825、1809〜1828、1812〜1843、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1843、1815〜1844、1815〜1840、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1840、1821〜1844、1821〜1837、1822〜1843、1822〜1839、1822〜1837、1823〜1843、1823〜1838、1824〜1839、1827〜1846、1861〜1884、1861〜1880、1865〜1885、1866〜1881、1867〜1882、1867〜1886、1868〜1883、1869〜1885、1869〜1884、1870〜1885、1871〜1886、1872〜1887、1874〜1889、1876〜1895、1888〜1914、1888〜1908、1891〜1910、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1913〜1935、1898〜1920、1907〜1929、1913〜1935、1918〜1934、1919〜1938、1919〜1934、1921〜1934、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2368〜2393、2381〜2397、2368〜2394、2379〜2394、2381〜2396、2368〜2397、2368〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2459〜2478、2819〜2838、2818〜2838、2873〜2892、および3161〜3182。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1のヌクレオチド領域1〜1932に対応するHBV pre−S1第2の部分遺伝子領域内で相補的である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1のヌクレオチド領域2831〜3182に対応するHBV pre−S1第1の部分遺伝子領域内で相補的である。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1のヌクレオチド領域1〜1932に対応するHBV pre−S1第2の部分遺伝子領域を標的とする。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1のヌクレオチド領域2831〜3182に対応するHBV pre−S1第1の部分遺伝子領域を標的とする。
特定の実施形態では、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とする。特定の実施形態では、HBV核酸のある領域を標的とするかかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、その領域の等長核酸塩基部分に相補的である連続核酸部分を有する。例えば、その部分は、本明細書に記載する領域の等長部分に相補的な少なくとも8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個の連続核酸塩基部分であってもよい。特定の実施形態では、かかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1の以下のヌクレオチド領域を標的とする:1〜20、10〜29、10〜56、13〜38、13〜35、19〜38、25〜47、25〜50、25〜56、43〜68、43〜63、55〜74、58〜73、58〜74、58〜77、58〜79、58〜80、58〜84、59〜74、59〜75、59〜80、60〜75、60〜76、60〜79、61〜76、61〜77、61〜80、62〜77、63〜84、68〜114、101〜123、98〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、158〜177、167〜186、191〜215、196〜224、196〜215、196〜218、199〜228、199〜218、199〜224、200〜224、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜264、242〜263、243〜262、244〜263、245〜274、245〜260、245〜264、246〜266、247〜266、247〜269、247〜270、245〜267、251〜267、245〜266、250〜269、251〜266、251〜268、251〜269、245〜269、245〜266、245〜261、250〜265、250〜266、250〜267、250〜268、250〜269、251〜270、252〜267、253〜268、253〜269、253〜272、253〜274、254〜269、254〜270、254〜274、255〜270、255〜271、255〜274、255〜401、255〜400、255〜274、255〜273、255〜272、255〜271、256〜271、256〜275、255〜276、256〜272、256〜276、253〜275、256〜279、257〜276、258〜273、259〜274、260〜279、262〜281、262〜321、262〜315、262〜312、265〜312、266〜288、266〜291、266〜285、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、292〜311、290〜312、293〜312、293〜315、293〜321、296〜321、302〜321、324〜343、339〜361、339〜367、348〜367、342〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜383、360〜388、360〜385、362〜381、366〜388、369〜388、366〜385、366〜392、370〜389、370〜392、380〜399、382〜401、384〜433、384〜400、384〜401、385〜401、405〜424、409〜428、405〜428、411〜426、411〜427、411〜430、411〜431、411〜437、412〜431、411〜426、411〜427、412〜428、412〜431、412〜427、413〜433、413〜432、413〜428、413〜429、413〜432、413〜433、414〜427、415〜427、414〜429、414〜430、414〜433、415〜428、415〜429、415〜430、415〜431、415〜434、416〜431、416〜432、416〜429、416〜435、417〜432、417〜433、417〜436、418〜433、418〜435、418〜434、418〜437、419〜435、419〜434、420〜435、419〜432、419〜434、421〜436、422〜437、422〜441、423〜436、425〜465、454〜473、454〜472、457〜476、457〜472、457〜473、454〜476、455〜472、457〜485、458〜485、458〜483、458〜477、458〜473、459〜485、460〜485、463〜498、463〜485、466〜485、463〜482、457〜491、458〜491、459〜491、460〜491、463〜491、466〜491、472〜491、472〜493、473〜492、475〜491、459〜494、460〜494、463〜494、466〜494、467〜498、472〜494、475〜494、457〜473、457〜472、458〜494、454〜494、457〜494、457〜473、485〜513、470〜493、476〜519、485〜519、500〜519、512〜534、512〜550、524〜546、536〜559、548〜567、548〜570、550〜570、548〜594、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、611〜645、617〜363、623〜642、617〜645、639〜754、639〜658、639〜654、641〜656、642〜657、643〜658、642〜754、653〜672、662〜685、665〜685、665〜689、668〜687、670〜754、670〜706、670〜685、670〜686、670〜689、671〜690、671〜691、671〜686、671〜687、672〜693、672〜697、672〜707、672〜687、672〜688、673〜688、674〜693、678〜693、679〜694、679〜707、679〜698、679〜701、679〜702、679〜707、680〜695、680〜699、679〜699、681〜706、681〜696、682〜697、682〜706、682〜707、682〜702、682〜701、683〜698、684〜699、685〜700、686〜701、687〜754、688〜704、689〜709、689〜710、690〜705、679〜705、679〜710、679〜706、690〜710、691〜710、690〜754、690〜706、684〜703、687〜705、687〜702、687〜703、687〜706、688〜703、688〜704、688〜705、689〜704、689〜705、689〜708、690〜705、690〜706、690〜709、691〜706、692〜711、693〜716、693〜712、695〜715、697〜716、697〜716、690〜716、724〜746、724〜752、724〜754、724〜758、733〜752、738〜754、738〜753、739〜758、739〜754、739〜775、739〜754、740〜754、742〜785、742〜773、757〜776、757〜785、790〜815、793〜812、811〜833、811〜844、814〜833、811〜906、820〜839、822〜844、822〜867、823〜842、845〜864、845〜867、854〜906、845〜909、845〜906、854〜876、863〜882、863〜885、878〜900、887〜906、899〜918、899〜933、899〜958、905〜927、905〜933、914〜933、936〜958、936〜955、945〜964、951〜970、951〜985、951〜1044、951〜1024、951〜1056、951〜997、960〜985、963〜1044、963〜1024、963〜997、972〜1015、1025〜1044、1031〜1056、1037〜1056、1046〜1083、1049〜1068、1070〜1089、1070〜1095、1082〜1101、1081〜1134、1081〜1143、1082〜1101、1088〜1107、1088〜1134、1094〜1119、1097〜1119、1112〜1134、1118〜1143、1118〜1146、1088〜1146、1121〜1140、1127〜1146、1127〜1193、1150〜1193、1156〜1187、1165〜1187、1170〜1192、1171〜1191、1172〜1191、1176〜1192、1176〜1285、1177〜1192、1176〜1191、1203〜1297、1206〜1228、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1255、1245〜1265、1251〜1280、1262〜1285、1251〜1285、1259〜1296、1259〜1290、1259〜1287、1261〜1296、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1296、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1264〜1297、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1296、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1270〜1285、1271〜1290、1271〜1296、1277〜1296、1261〜1290、1262〜1290、1268〜1290、1263〜1305、1259〜1305、1259〜1305、1266〜1305、1259〜1302、1275〜1294、1281〜1306、1281〜1324、1281〜1336、1282〜1301、1286〜1306、1290〜1324、1293〜1318、1290〜1324、1293〜1315、1296〜1315、1311〜1336、1311〜1333、1326〜1345、1353〜1381、1359〜1378、1395〜1414、1498〜1532、1498〜1523、1498〜1535、1510〜1529、1515〜1535、1515〜1563、1515〜1596、1515〜1605、1515〜1602、1515〜1540、1515〜1535、1518〜1605、1518〜1602、1518〜1537、1521〜1563、1521〜1540、1550〜1655、1550〜1563、1550〜1569、1553〜1578、1553〜1599、1553〜1590、1565〜1584、1571〜1595、1577〜1605、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1578〜1598、1571〜1598、1579〜1594、1579〜1594、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1580〜1605、1580〜1602、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1582〜1602、1553〜1655、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、
1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1586〜1652、1642〜1664、1651〜1720、1651〜1673、1655〜1679、1695〜1720、1716〜1738、1743〜1763、1743〜1768、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1796、1777〜1800、1778〜1800、1778〜1793、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1798、1779〜1797、1779〜1796、1779〜1795、1779〜1794、1780〜1799、1780〜1796、1780〜1795、1781〜1797、1781〜1796、1781〜1796、1781〜1800、1781〜1797、1782〜1799、1782〜1797、1782〜1798、1783〜1798、1783〜1799、1784〜1800、1784〜1799、1779〜1799、1778〜1889、1778〜1794、1779〜1795、1780〜1799、1785〜1800、1794〜1813、1806〜1837、1806〜1828、1806〜1825、1809〜1828、1812〜1843、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1843、1815〜1844、1815〜1840、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1840、1821〜1844、1821〜1837、1822〜1843、1822〜1839、1822〜1837、1823〜1843、1823〜1838、1824〜1839、1827〜1846、1861〜1884、1861〜1880、1865〜1885、1866〜1881、1867〜1882、1867〜1886、1868〜1883、1869〜1885、1869〜1884、1870〜1885、1871〜1886、1872〜1887、1874〜1889、1876〜1895、1888〜1914、1888〜1908、1891〜1910、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1913〜1935、1898〜1920、1907〜1929、1913〜1935、1918〜1934、1919〜1938、1919〜1934、1921〜1934、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2368〜2393、2381〜2397、2368〜2394、2379〜2394、2381〜2396、2368〜2397、2368〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2459〜2478、2819〜2838、2818〜2838、2873〜2892、および3161〜3182。
特定の実施形態では、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とする。特定の実施形態では、HBV核酸のある領域を標的とするかかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、その領域の等長核酸塩基部分に相補的である連続核酸部分を有する。例えば、その部分は、本明細書に記載する領域の等長部分に相補的な少なくとも8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個の連続核酸塩基部分であってもよい。特定の実施形態では、かかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1の58〜73、58〜74、58〜77、59〜74、60〜75、61〜76、62〜77、245〜274、245〜260、250〜265、251〜266、252〜267、253〜268、254〜269、255〜270、256〜271、256〜272、258〜273、259〜274、380〜399、382〜401、411〜437、411〜427、411〜426、412〜427、413〜428、413〜432、414〜429、415〜430、416〜431、417〜432、418〜433、419〜434、420〜435、421〜436、422〜437、457〜472、458〜473、639〜754、639〜658、639〜654、641〜656、642〜657、643〜658、670〜754、670〜706、670〜685、671〜686、672〜687、673〜688、678〜693、679〜694、680〜695、681〜706、681〜696、682〜697、683〜698、684〜699、685〜700、686〜701、687〜702、688〜703、689〜704、690〜705、691〜706、738〜754、738〜753、739〜754、1176〜1285、1176〜1191、1177〜1192、1261〜1285、1261〜1276、1262〜1277、1263〜1278、1264〜1279、1265〜1280、1266〜1281、1267〜1282、1268〜1283、1269〜1284、1270〜1285、1577〜1606、1577〜1592、1578〜1593、1579〜1594、1580〜1595、1581〜1596、1582〜1597、1583〜1598、1584〜1599、1585〜1600、1586〜1601、1587〜1602、1588〜1603、1589〜1604、1590〜1605、1591〜1606、1778〜1889、1778〜1800、1778〜1793、1779〜1794、1780〜1799、1780〜1796、1780〜1795、1781〜1796、1782〜1797、1783〜1798、1784〜1799、1785〜1800、1822〜1839、1822〜1837、1823〜1838、1824〜1839、1866〜1881、1867〜1882、1868〜1883、1869〜1884、1870〜1885、1871〜1886、1872〜1887、または1874〜1889のヌクレオチド領域を標的とし、この化合物または修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチルまたは拘束エチル(cEt)糖を含む。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1の以下のヌクレオチド領域内で相補的である:58〜73、58〜74、58〜77、59〜74、59〜75、60〜75、60〜76、61〜76、61〜77、62〜77、253〜272、253〜269、254〜270、255〜271、256〜272、411〜437、411〜426、411〜427、411〜430、412〜427、412〜428、412〜431、413〜428、413〜429、413〜432、414〜429、414〜430、414〜433、415〜430、415〜431、415〜434、416〜431、416〜432、416〜435、417〜432、417〜433、417〜436、418〜433、418〜434、418〜437、457〜472、457〜473、458〜473、670〜706、670〜685、670〜686、671〜686、671〜687、672〜687、672〜688、673〜688、687〜702、687〜703、687〜706、688〜703、688〜704、689〜704、689〜705、690〜705、690〜706、691〜706、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1269〜1284、1269〜1285、1270〜1285、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1579〜1594、1579〜1594、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1778〜1800、1778〜1793、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1794、1779〜1795、1779〜1798、1780〜1795、1780〜1796、1780〜1799、1781〜1796、1781〜1797、1781〜1800、1782〜1797、1782〜1798、1783〜1798、1783〜1799、1784〜1799、および1784〜1800。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1の以下のヌクレオチド領域を標的とする:58〜73、58〜74、58〜77、59〜74、59〜75、60〜75、60〜76、61〜76、61〜77、62〜77、253〜272、253〜269、254〜270、255〜271、256〜272、411〜437、411〜426、411〜427、411〜430、412〜427、412〜428、412〜431、413〜428、413〜429、413〜432、414〜429、414〜430、414〜433、415〜430、415〜431、415〜434、416〜431、416〜432、416〜435、417〜432、417〜433、417〜436、418〜433、418〜434、418〜437、457〜472、457〜473、458〜473、670〜706、670〜685、670〜686、671〜686、671〜687、672〜687、672〜688、673〜688、687〜702、687〜703、687〜706、688〜703、688〜704、689〜704、689〜705、690〜705、690〜706、691〜706、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1269〜1284、1269〜1285、1270〜1285、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1579〜1594、1579〜1594、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1778〜1800、1778〜1793、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1794、1779〜1795、1779〜1798、1780〜1795、1780〜1796、1780〜1799、1781〜1796、1781〜1797、1781〜1800、1782〜1797、1782〜1798、1783〜1798、1783〜1799、1784〜1799、および1784〜1800。
特定の実施形態では、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とする。特定の実施形態では、HBV核酸のある領域を標的とするかかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、その領域の等長核酸塩基部分に相補的である連続核酸部分を有する。例えば、その部分は、本明細書に記載する領域の等長部分に相補的な少なくとも8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個の連続核酸塩基部分であってもよい。特定の実施形態では、かかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1の以下のヌクレオチド領域を標的とする:1〜20、10〜29、10〜56、13〜38、13〜35、19〜38、25〜47、25〜50、25〜56、43〜68、43〜63、55〜74、58〜73、58〜74、58〜77、58〜79、58〜80、58〜84、59〜74、59〜75、59〜80、60〜75、60〜76、60〜79、61〜76、61〜77、61〜80、62〜77、63〜84、68〜114、101〜123、98〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、158〜177、167〜186、191〜215、196〜224、196〜215、196〜218、199〜228、199〜218、199〜224、200〜224、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜264、242〜263、243〜262、244〜263、245〜264、246〜266、247〜266、247〜269、247〜270、245〜267、251〜267、245〜266、250〜269、251〜268、251〜269、245〜269、245〜266、245〜261、250〜266、250〜267、250〜268、250〜269、251〜270、253〜269、253〜272、253〜274、254〜270、254〜274、255〜271、255〜274、255〜401、255〜400、255〜274、255〜273、255〜272、255〜271、256〜275、255〜276、256〜272、256〜276、253〜275、256〜279、257〜276、260〜279、262〜281、262〜321、262〜315、262〜312、265〜312、266〜288、266〜291、266〜285、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、292〜311、290〜312、293〜312、293〜315、293〜321、296〜321、302〜321、324〜343、339〜361、339〜367、348〜367、342〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜383、360〜388、360〜385、362〜381、366〜388、369〜388、366〜385、366〜392、370〜389、370〜392、384〜433、384〜400、384〜401、385〜401、405〜424、409〜428、405〜428、411〜426、411〜427、411〜430、411〜431、411〜437、412〜431、411〜426、411〜427、412〜428、412〜431、412〜427、413〜433、413〜432、413〜428、413〜429、413〜432、413〜433、414〜427、415〜427、414〜429、414〜430、414〜433、415〜428、415〜429、415〜430、415〜431、415〜434、416〜431、416〜432、416〜429、416〜435、417〜432、417〜433、417〜436、418〜433、418〜435、418〜434、418〜437、419〜435、419〜434、420〜435、419〜432、419〜434、422〜441、423〜436、425〜465、454〜473、454〜472、457〜476、457〜472、457〜473、454〜476、455〜472、457〜485、458〜485、458〜483、458〜477、458〜473、459〜485、460〜485、463〜498、463〜485、466〜485、463〜482、457〜491、458〜491、459〜491、460〜491、463〜491、466〜491、472〜491、472〜493、473〜492、475〜491、459〜494、460〜494、463〜494、466〜494、467〜498、472〜494、475〜494、457〜473、457〜472、458〜494、454〜494、457〜494、457〜473、485〜513、470〜493、476〜519、485〜519、500〜519、512〜534、512〜550、524〜546、536〜559、548〜567、548〜570、550〜570、548〜594、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、611〜645、617〜363、623〜642、617〜645、642〜754、653〜672、662〜685、665〜685、665〜689、668〜687、670〜706、670〜685、670〜686、670〜689、671〜690、671〜691、671〜686、671〜687、672〜693、672〜697、672〜707、672〜687、672〜688、673〜688、674〜693、679〜707、679〜698、679〜701、679〜702、679〜707、680〜699、679〜699、682〜706、682〜707、682〜702、682〜701、687〜754、688〜704、689〜709、689〜710、690〜705、679〜705、679〜710、679〜706、690〜710、691〜710、690〜754、690〜706、684〜703、687〜705、687〜702、687〜703、687〜706、688〜703、688〜704、688〜705、689〜704、689〜705、689〜708、690〜705、690〜706、690〜709、691〜706、692〜711、693〜716、693〜712、695〜715、697〜716、697〜716、690〜716、724〜746、724〜752、724〜754、724〜758、733〜752、738〜754、739〜758、739〜754、739〜775、739〜754、740〜754、742〜785、742〜773、757〜776、757〜785、790〜815、793〜812、811〜833、811〜844、814〜833、811〜906、820〜839、822〜844、822〜867、823〜842、845〜864、845〜867、854〜906、845〜909、845〜906、854〜876、863〜882、863〜885、878〜900、887〜906、899〜918、899〜933、899〜958、905〜927、905〜933、914〜933、936〜958、936〜955、945〜964、951〜970、951〜985、951〜1044、951〜1024、951〜1056、951〜997、960〜985、963〜1044、963〜1024、963〜997、972〜1015、1025〜1044、1031〜1056、1037〜1056、1046〜1083、1049〜1068、1070〜1089、1070〜1095、1082〜1101、1081〜1134、1081〜1143、1082〜1101、1088〜1107、1088〜1134、1094〜1119、1097〜1119、1112〜1134、1118〜1143、1118〜1146、1088〜1146、1121〜1140、1127〜1146、1127〜1193、1150〜1193、1156〜1187、1165〜1187、1170〜1192、1171〜1191、1172〜1191、1176〜1192、1177〜1192、1176〜1191、1203〜1297、1206〜1228、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1255、1245〜1265、1251〜1280、1262〜1285、1251〜1285、1259〜1296、1259〜1290、1259〜1287、1261〜1296、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1296、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1264〜1297、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1296、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1270〜1285、1271〜1290、1271〜1296、1277〜1296、1261〜1290、1262〜1290、1268〜1290、1263〜1305、1259〜1305、1259〜1305、1266〜1305、1259〜1302、1275〜1294、1281〜1306、1281〜1324、1281〜1336、1282〜1301、1286〜1306、1290〜1324、1293〜1318、1290〜1324、1293〜1315、1296〜1315、1311〜1336、1311〜1333、1326〜1345、1353〜1381、1359〜1378、1395〜1414、1498〜1532、1498〜1523、1498〜1535、1510〜1529、1515〜1535、1515〜1563、1515〜1596、1515〜1605、1515〜1602、1515〜1540、1515〜1535、1518〜1605、1518〜1602、1518〜1537、1521〜1563、1521〜1540、1550〜1655、1550〜1563、1550〜1569、1553〜1578、1553〜1599、1553〜1590、1565〜1584、1571〜1595、1577〜1605、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1578〜1598、1571〜1598、1579〜1594、1579〜1594、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1580〜1605、1580〜1602、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1582〜1602、1553〜1655、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1586〜1652、1642〜1664、1651〜1720、1651〜1673、1655〜1679、1695〜1720、1716〜1738、1743〜1763、1743〜1768、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1796、1777〜1800、1778〜1800、1778〜1793、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1798、1779〜1797、1779
〜1796、1779〜1795、1779〜1794、1780〜1799、1780〜1796、1780〜1795、1781〜1797、1781〜1796、1781〜1796、1781〜1800、1781〜1797、1782〜1799、1782〜1797、1782〜1798、1783〜1798、1783〜1799、1784〜1800、1784〜1799、1779〜1799、1778〜1794、1779〜1795、1780〜1799、1794〜1813、1806〜1837、1806〜1828、1806〜1825、1809〜1828、1812〜1843、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1843、1815〜1844、1815〜1840、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1840、1821〜1844、1821〜1837、1822〜1843、1822〜1839、1823〜1843、1827〜1846、1861〜1884、1861〜1880、1865〜1885、1867〜1886、1869〜1885、1876〜1895、1888〜1914、1888〜1908、1891〜1910、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1913〜1935、1898〜1920、1907〜1929、1913〜1935、1918〜1934、1919〜1938、1919〜1934、1921〜1934、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2368〜2393、2381〜2397、2368〜2394、2379〜2394、2381〜2396、2368〜2397、2368〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2459〜2478、2819〜2838、2818〜2838、2873〜2892、および3161〜3182。
特定の実施形態では、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とする。特定の実施形態では、HBV核酸のある領域を標的とするかかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、その領域の等長核酸塩基部分に相補的である連続核酸部分を有する。例えば、その部分は、本明細書に記載する領域の等長部分に相補的な少なくとも8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個の連続核酸塩基部分であってもよい。特定の実施形態では、かかる化合物またはオリゴヌクレオチドは、配列番号1の233〜264、242〜263、243〜262、244〜263、245〜264、246〜266、247〜266、247〜269、247〜270、245〜267、251〜267、245〜266、250〜269、251〜268、251〜269、245〜269、245〜266、245〜261、250〜266、250〜267、250〜268、250〜269、251〜270、253〜272、253〜274、254〜274、255〜274、255〜401、255〜400、255〜274、255〜273、255〜272、255〜271、256〜275、255〜276、256〜276、253〜275、256〜279、257〜276、260〜279、262〜281、262〜321、262〜315、262〜312、265〜312、266〜288、266〜291、266〜285、281〜321、281〜303、405〜424、409〜428、405〜428、411〜430、411〜431、411〜431、412〜431、411〜426、411〜427、412〜428、412〜431、412〜427、413〜433、413〜432、413〜428、413〜433、411〜427、414〜427、415〜427、415〜428、415〜429、416〜432、416〜429、418〜435、418〜434、419〜435、419〜434、420〜435、419〜432、419〜434、422〜441、423〜436、425〜465、584〜606、611〜645、617〜363、623〜642、617〜645、642〜754、653〜672のヌクレオチド領域を標的とし、この化合物または修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖を含む。
特定の実施形態では、配列番号1の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドに標的とされたとき、少なくとも50%の阻害を示す:1〜20、10〜29、10〜56、13〜38、13〜35、19〜38、25〜47、25〜50、25〜56、43〜68、43〜63、55〜74、58〜77、58〜74、58〜73、58〜79、58〜80、58〜84、59〜74、59〜75、59〜80、60〜79、60〜75、60〜76、61〜80、61〜76、61〜77、62〜77、63〜84、68〜114、101〜123、98〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、158〜177、167〜186、191〜215、196〜224、196〜215、196〜218、199〜228、199〜218、199〜224、200〜224、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜264、242〜263、243〜262、244〜263、245〜264、246〜266、247〜266、247〜269、247〜270、245〜267、251〜267、245〜266、250〜269、251〜268、251〜269、245〜269、245〜266、245〜261、250〜265、250〜266、250〜267、250〜268、250〜269、251〜266、251〜270、252〜267、253〜268、253〜269、253〜272、253〜274、254〜269、254〜270、254〜274、255〜274、255〜401、255〜400、255〜274、255〜273、255〜272、255〜271、255〜270、256〜271、256〜272、256〜275、255〜276、256〜276、253〜275、256〜279、257〜276、258〜273、259〜274、260〜279、262〜281、262〜321、262〜315、262〜312、265〜312、266〜288、266〜291、266〜285、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、292〜311、290〜312、293〜312、293〜315、293〜321、296〜321、302〜321、324〜343、339〜361、339〜367、348〜367、342〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜383、360〜388、360〜385、362〜381、366〜388、369〜388、366〜385、366〜392、370〜389、370〜392、380〜399、382〜401、384〜433、384〜400、384〜401、385〜401、405〜424、409〜428、405〜428、411〜430、411〜431、411〜431、412〜431、411〜426、411〜427、411〜430、411〜437、412〜428、412〜431、412〜427、413〜432、413〜428、413〜429、413〜433、411〜427、414〜427、414〜429、414〜430、414〜433、415〜427、415〜428、415〜429、415〜430、415〜431、415〜434、416〜435、416〜432、416〜431、416〜429、417〜432、417〜433、417〜436、418〜437、418〜435、418〜434、418〜433、419〜435、419〜434、420〜435、419〜432、419〜434、421〜436、422〜441、422〜437、423〜436、425〜465、454〜473、454〜472、457〜476、454〜476、455〜472、457〜485、457〜473、457〜472、458〜485、458〜483、458〜477、458〜473、459〜485、460〜485、463〜498、463〜485、466〜485、463〜482、457〜491、458〜491、459〜491、460〜491、463〜491、466〜491、472〜491、472〜493、473〜492、475〜491、459〜494、460〜494、463〜494、466〜494、467〜498、472〜494、475〜494、457〜473、457〜472、458〜494、454〜494、457〜494、457〜473、485〜513、470〜493、476〜519、485〜519、500〜519、512〜534、512〜550、524〜546、536〜559、548〜567、548〜570、550〜570、548〜594、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、611〜645、617〜363、623〜642、617〜645、639〜654、641〜656、642〜657、642〜754、643〜658、653〜672、662〜685、665〜685、665〜689、668〜687、670〜689、670〜706、670〜685、670〜686、671〜686、671〜687、671〜690、671〜691、672〜687、672〜688、672〜693、672〜697、672〜707、673〜688、674〜693、678〜693、679〜707、679〜694、679〜698、679〜701、679〜702、679〜707、680〜699、679〜699、680〜695、681〜696、682〜706、682〜707、682〜702、682〜701、682〜697、683〜698、684〜699、685〜700、686〜701、687〜702、687〜703、687〜706、687〜754、688〜703、688〜704、689〜704、689〜705、689〜709、689〜710、690〜705、690〜706、691〜706、679〜705、679〜710、679〜706、690〜710、691〜710、690〜754、690〜706、684〜703、687〜705、687〜703、687〜706、688〜705、689〜708、690〜709、692〜711、693〜716、693〜712、695〜715、697〜716、697〜716、690〜716、724〜746、724〜752、724〜754、724〜758、733〜752、738〜753、738〜754、739〜758、739〜754、739〜775、739〜754、740〜754、742〜785、742〜773、757〜776、757〜785、790〜815、793〜812、811〜833、811〜844、814〜833、811〜906、820〜839、822〜844、822〜867、823〜842、845〜864、845〜867、854〜906、845〜909、845〜906、854〜876、854〜873、863〜882、863〜885、878〜900、878〜897、887〜906、899〜918、899〜933、899〜958、905〜927、905〜933、914〜933、936〜958、936〜955、945〜964、951〜970、951〜985、951〜1044、951〜1024、951〜1056、951〜997、960〜985、963〜1044、963〜1024、963〜997、966〜985、972〜1015、978〜997、1025〜1044、1031〜1056、1037〜1056、1046〜1083、1049〜1068、1070〜1089、1070〜1095、1082〜1101、1081〜1134、1081〜1143、1082〜1101、1088〜1107、1088〜1134、1094〜1119、1097〜1119、1112〜1134、1118〜1143、1118〜1146、1088〜1146、1121〜1140、1127〜1146、1127〜1193、1150〜1193、1156〜1187、1165〜1187、1170〜1192、1171〜1191、1172〜1191、1176〜1192、1177〜1192、1176〜1191、1203〜1297、1206〜1228、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1255、1215〜1234、1218〜1237、1221〜1240、1224〜1243、1227〜1246、1230〜1249、1233〜1252、1236〜1255、1245〜1265、1251〜1280、1251〜1285、1251〜1270、1254〜1273、1254〜1279、1257〜1276、1258〜1277、1259〜1296、1259〜1290、1259〜1287、1260〜1279、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1261〜1296、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1262〜1285、1262〜1296、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1264〜1297、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1296、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1270〜1285、1271〜1290、1271〜1296、1277〜1296、1261〜1290、1262〜1290、1268〜1290、1263〜1305、1259〜1305、1259〜1305、1266〜1305、1259〜1302、1275〜1294、1281〜1306、1281〜1324、1281〜1336、1782〜1797、1282〜1301、1286〜1306、1290〜1324、1293〜1318、1290〜1324、1293〜1315、1296〜1315、1311〜1336、1311〜1333、1326〜1345、1353〜1381、1359〜1378、1395〜1414、1498〜1532、1498〜1523、1498〜1535、1510〜1529、1515〜1535、1515〜1563、1515〜1596、1515〜1605、1515〜1602、1515〜1540、1515〜1535、1518〜1605、1518〜1602、1518〜1537、1521〜1563、1521〜1540、1550〜1655、1550〜1563、1550〜1569、1553〜1578、1553〜1599、1553〜1590、1565〜1584、1571〜1595、1577〜1606、1577〜1605、1577〜1596、1577〜1592、1577〜1593、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1578〜1598、1579〜1594、1579〜1595、1579〜1598、1571〜1598、1580〜1605、1580〜1602、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1582〜1602、1553〜1655、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1586〜1652、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1642〜1664、
1651〜1720、1651〜1673、1655〜1679、1695〜1720、1716〜1738、1743〜1763、1743〜1768、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1796、1777〜1800、1778〜1800、1778〜1793、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1798、1779〜1797、1779〜1796、1779〜1795、1779〜1794、1780〜1796、1781〜1797、1781〜1796、1781〜1800、1781〜1797、1782〜1799、1784〜1800、1779〜1799、1778〜1794、1779〜1795、1780〜1799、1794〜1813、1780〜1795、1780〜1796、1780〜1799、1781〜1796、1781〜1797、1781〜1800、1782〜1798、1783〜1799、1784〜1799、1784〜1800、1785〜1800、1806〜1837、1806〜1828、1806〜1825、1809〜1828、1812〜1843、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1843、1815〜1844、1815〜1840、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1840、1821〜1844、1821〜1837、1822〜1843、1822〜1839、1823〜1843、1827〜1846、1861〜1884、1861〜1880、1865〜1885、1867〜1886、1869〜1885、1876〜1895、1888〜1914、1888〜1908、1891〜1910、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1913〜1935、1898〜1920、1907〜1929、1913〜1935、1918〜1934、1919〜1938、1919〜1934、1921〜1934、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2278〜2297、2281〜2300、2284〜2303、2368〜2393、2381〜2397、2368〜2394、2379〜2394、2381〜2396、2368〜2397、2368〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2459〜2478、2819〜2838、2818〜2838、2873〜2892、および3161〜3182。
特定の実施形態では、配列番号1の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドに標的とされたとき、少なくとも60%の阻害を示す:1〜20、10〜29、10〜53、13〜38、25〜50、43〜68、55〜74、58〜84、58〜77、58〜74、58〜73、58〜79、59〜80、59〜74、59〜75、60〜75、60〜76、61〜77、61〜76、61〜80、62〜77、68〜114、98〜123、101〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、191〜215、196〜224、196〜215、199〜228、199〜218、200〜223、199〜218、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜263、244〜263、245〜264、247〜266、250〜265、251〜266、252〜267、253〜272、253〜269、251〜267、253〜274、254〜270、255〜276、256〜279、256〜276、256〜274、256〜272、256〜271、258〜273、259〜274、265〜388、265〜284、266〜291、266〜288、260〜279、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、293〜312、296〜315、302〜321、324〜343、339〜367、339〜361、342〜367、348〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜379、366〜392、366〜385、369〜388、370〜392、382〜401、405〜428、405〜424、409〜428、411〜436、411〜433、411〜431、411〜426、411〜430、411〜427、412〜431、412〜428、412〜427、413〜428、413〜429、413〜433、414〜433、414〜430、414〜429、414〜433、415〜430、415〜431、415〜434、415〜435、415〜436、416〜429、416〜434、416〜431、416〜432、416〜436、416〜435、417〜436、417〜433、417〜432、418〜434、418〜433、418〜437、419〜434、420〜435、421〜436、422〜437、423〜436、425〜465、454〜472、455〜472、457〜476、457〜472、457〜473、458〜485、458〜473、458〜483、463〜498、467〜498、463〜482、470〜493、472〜491、485〜519、485〜513、500〜519、512〜534、524〜546、536〜558、548〜567、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、608〜648、639〜654、640〜656、641〜656、642〜657、642〜658、643〜658、653〜672、662〜685、665〜685、670〜706、670〜689、670〜685、670〜686、671〜690、671〜686、671〜687、672〜707、672〜697、672〜693、672〜687、672〜688、673〜688、679〜707、679〜698、679〜694、680〜695、681〜696、682〜697、682〜701、683〜698、684〜699、685〜700、686〜701、687〜754、687〜702、687〜705、687〜703、687〜706、688〜704、688〜703、688〜704、688〜705、688〜707、689〜710、689〜709、689〜705、689〜704、690〜754、690〜705、690〜706、691〜706、691〜710、692〜711、697〜716、724〜758、724〜754、724〜752、724〜746、738〜754、738〜753、739〜754、742〜785、757〜785、790〜815、811〜906、811〜844、811〜833、822〜867、822〜844、823〜842、845〜867、854〜906、854〜873、878〜897、899〜958、899〜933、936〜958、945〜964、951〜1044、951〜1024、951〜985、951〜997、963〜1044、963〜1024、963〜997、966〜985、978〜997、1031〜1056、1046〜1083、1070〜1095、1081〜1143、1081〜1134、1082〜1101、1088〜1146、1088〜1134、1118〜1146、1118〜1143、1127〜1193、1170〜1189、1176〜1192、1176〜1191、1177〜1192、1203〜1297、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1234、1218〜1237、1221〜1240、1224〜1243、1227〜1246、1230〜1249、1233〜1252、1236〜1255、1251〜1270、1251〜1285、1254〜1273、1254〜1279、1257〜1276、1258〜1277、1259〜1278、1260〜1279、1261〜1276、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1281、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1297、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1287、1269〜1284、1269〜1285、1270〜1285、1281〜1336、1281〜1324、1281〜1306、1286〜1305、1290〜1324、1311〜1336、1326〜1345、1353〜1381、1395〜1414、1498〜1535、1498〜1532、1515〜1535、1515〜1534、1521〜1540、1550〜1655、1553〜1599、1553〜1590、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1579〜1594、1579〜1595、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1642〜1664、1651〜1720、1716〜1738、1743〜1763、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1800、1777〜1797、1655〜1674、1778〜1794、1778〜1800、1781〜1800、1781〜1797、1784〜1800、1779〜1799、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1795、1779〜1798、1780〜1795、1780〜1796、1780〜1799、1781〜1796、1781〜1797、1781〜1800、1782〜1797、1794〜1813、1806〜1837、1806〜1825、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1844、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1837、1822〜1838、1827〜1846、1861〜1884、1821〜1840、1866〜1885、1867〜1886、1888〜1914、1888〜1907、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1919〜1938、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2278〜2297、2281〜2300、2284〜2303、2368〜2397、2368〜2396、2368〜2394、2368〜2393、2379〜2394、2381〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2819〜2838、2873〜2892、および3161〜3182。
特定の実施形態では、配列番号1の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドに標的とされたとき、少なくとも65%の阻害を示す:1〜20、10〜29、10〜53、13〜38、25〜50、43〜68、55〜74、58〜84、58〜79、58〜74、58〜73、58〜77、59〜75、59〜80、58〜77、60〜75、60〜76、61〜77、61〜76、61〜80、62〜77、68〜114、98〜123、101〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、191〜215、196〜215、199〜228、199〜218、200〜223、199〜218、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜263、244〜263、245〜264、250〜265、251〜266、253〜269、253〜274、255〜276、256〜279、256〜276、256〜274、256〜272、256〜271、247〜266、253〜272、258〜273、266〜291、266〜288、260〜279、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、296〜315、293〜312、302〜321、324〜343、339〜367、339〜361、342〜367、348〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜379、366〜392、366〜385、369〜388、370〜392、382〜401、405〜428、405〜424、409〜428、411〜433、411〜431、411〜430、411〜427、411〜426、412〜431、412〜428、412〜427、413〜433、413〜428、413〜429、413〜432、414〜433、414〜430、414〜429、415〜430、415〜431、415〜434、415〜435、415〜436、416〜434、416〜436、416〜435、416〜432、416〜431、417〜436、417〜433、417〜432、418〜433、418〜434、418〜437、420〜435、422〜437、423〜436、425〜465、454〜472、455〜472、457〜472、458〜485、458〜483、458〜473、463〜498、467〜498、457〜476、470〜493、472〜491、485〜519、485〜513、500〜519、512〜534、524〜546、536〜558、548〜567、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、608〜648、639〜654、640〜656、641〜656、642〜657、642〜658、643〜658、653〜672、662〜685、665〜685、670〜685、670〜706、670〜689、670〜686、670〜685、671〜686、671〜687、671〜690、672〜688、672〜687、672〜707、672〜697、672〜693、673〜688、679〜698、680〜695、681〜696、682〜697、682〜701、683〜698、684〜699、685〜700、686〜701、687〜702、688〜703、688〜707、687〜754、690〜754、690〜706、690〜705、687〜705、687〜703、687〜706、687〜702、688〜705、688〜703、688〜704、689〜705、691〜706、692〜711、697〜716、724〜758、724〜754、724〜752、724〜746、738〜754、739〜754、742〜785、757〜785、790〜815、811〜906、811〜844、811〜833、822〜867、822〜844、823〜842、845〜867、854〜906、854〜873、878〜897、899〜958、899〜933、936〜958、945〜964、951〜1044、951〜1024、951〜985、951〜997、963〜1044、963〜1024、963〜997、966〜985、978〜997、1031〜1056、1046〜1083、1070〜1095、1081〜1143、1081〜1134、1082〜1101、1088〜1146、1088〜1134、1118〜1146、1118〜1143、1127〜1193、1170〜1189、1176〜1192、1177〜1192、1203〜1297、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1234、1218〜1237、1221〜1240、1224〜1243、1227〜1246、1230〜1249、1233〜1252、1236〜1255、1251〜1270、1251〜1285、1254〜1273、1254〜1279、1257〜1276、1258〜1277、1259〜1278、1260〜1279、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1281、1262〜1277、1262〜1278、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1297、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1287、1269〜1284、1269〜1285、1270〜1285、1281〜1336、1281〜1324、1281〜1306、1290〜1324、1311〜1336、1326〜1345、1353〜1381、1395〜1414、1498〜1535、1498〜1532、1515〜1535、1515〜1534、1550〜1655、1553〜1599、1553〜1590、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1579〜1594、1579〜1595、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1642〜1664、1651〜1720、1655〜1674、1716〜1738、1743〜1763、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1800、1777〜1797、1778〜1800、1778〜1797、1779〜1799、1778〜1794、1779〜1794、1779〜1795、1779〜1798、1780〜1796、1780〜1799、1780〜1795、1781〜1796、1781〜1797、1781〜1800、1782〜1797、1794〜1813、1806〜1837、1806〜1825、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1844、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1837、1822〜1838、1827〜1846、1861〜1884、1866〜1885、1867〜1886、1888〜1914、1888〜1907、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1919〜1938、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2278〜2297、2281〜2300、2284〜2303、2368〜2397、2368〜2396、2368〜2394、2368〜2393、2379〜2394、2381〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2819〜2838、2873〜2892、および3161〜3182。
特定の実施形態では、配列番号1の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドに標的とされたとき、少なくとも70%の阻害を示す:1〜20、10〜29、10〜53、13〜38、25〜50、43〜68、55〜74、58〜84、58〜79、58〜74、59〜75、59〜80、58〜77、60〜75、60〜76、61〜77、68〜114、98〜123、101〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、191〜215、199〜228、199〜218、200〜223、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜263、244〜263、245〜264、253〜269、253〜274、255〜276、256〜279、256〜276、256〜274、256〜272、247〜266、250〜265、251〜266、253〜272、256〜271、266〜291、266〜288、260〜279、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、293〜312、302〜321、324〜343、339〜367、339〜361、342〜367、348〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜379、366〜392、366〜385、370〜392、382〜401、405〜428、405〜424、409〜428、411〜433、411〜431、411〜430、411〜427、411〜426、412〜431、412〜428、412〜427、413〜428、413〜429、413〜432、414〜433、414〜430、414〜429、415〜430、414〜433、415〜434、415〜435、415〜436、416〜431、416〜434、416〜436、416〜435、416〜432、417〜436、417〜433、418〜433、418〜437、423〜436、425〜465、454〜472、455〜472、457〜472、457〜476、458〜473、458〜485、458〜483、463〜498、467〜498、457〜476、470〜493、470〜493、472〜491、485〜519、485〜513、485〜519、485〜513、500〜519、512〜534、524〜546、536〜558、548〜567、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、608〜648、639〜654、640〜656、641〜656、642〜657、642〜658、643〜658、653〜672、662〜685、665〜685、670〜706、670〜689、670〜685、670〜686、671〜690、671〜686、671〜687、672〜687、672〜688、672〜707、672〜697、672〜693、673〜688、679〜698、681〜696、682〜697、682〜701、683〜698、684〜699、686〜701、687〜702、687〜754、687〜702、688〜703、690〜754、690〜706、687〜705、687〜703、687〜706、692〜711、697〜716、724〜758、724〜754、724〜752、724〜746、738〜754、739〜754、738〜754、742〜785、757〜785、790〜815、811〜906、811〜844、811〜833、822〜867、822〜844、845〜867、854〜906、854〜873、878〜897、899〜958、899〜933、936〜958、945〜964、951〜1044、951〜1024、951〜985、951〜997、963〜1044、963〜1024、963〜997、966〜985、978〜997、1031〜1056、1046〜1083、1070〜1095、1081〜1143、1081〜1134、1082〜1101、1088〜1146、1088〜1134、1118〜1146、1118〜1143、1127〜1193、1170〜1189、1176〜1192、1177〜1192、1203〜1297、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1234、1218〜1237、1221〜1240、1224〜1243、1227〜1246、1230〜1249、1233〜1252、1236〜1255、1251〜1285、1251〜1270、1254〜1273、1254〜1279、1257〜1276、1258〜1277、1259〜1278、1260〜1279、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1281、1262〜1277、1262〜1278、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1297、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1287、1269〜1284、1269〜1285、1270〜1285、1281〜1336、1281〜1324、1281〜1306、1290〜1324、1311〜1336、1326〜1345、1353〜1381、1395〜1414、1498〜1535、1498〜1532、1515〜1535、1550〜1655、1553〜1599、1553〜1590、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1579〜1594、1579〜1595、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1642〜1664、1651〜1720、1716〜1738、1743〜1763、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1800、1777〜1797、1778〜1800、1778〜1797、1779〜1799、1778〜1794、1779〜1795、1779〜1798、1780〜1795、1780〜1796、1780〜1799、1781〜1800、1782〜1797、1794〜1813、1806〜1837、1806〜1825、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1844、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1837、1822〜1838、1827〜1846、1861〜1884、1866〜1885、1867〜1886、1888〜1914、1888〜1907、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1919〜1938、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2278〜2297、2281〜2300、2284〜2303、2368〜2397、2368〜2396、2368〜2394、2368〜2393、2379〜2394、2381〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2819〜2838、2873〜2892、および3161〜3182。
特定の実施形態では、配列番号1の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドに標的とされたとき、少なくとも75%の阻害を示す:13〜32、16〜35、19〜38、25〜44、28〜47、31〜50、43〜62、46〜65、49〜68、55〜74、58〜82、58〜74、58〜77、59〜75、60〜75、60〜76、61〜77、65〜84、98〜117、101〜120、104〜123、116〜135、119〜138、131〜150、137〜156、140〜159、143〜162、158〜177、161〜180、164〜183、167〜186、200〜219、203〜226、209〜228、218〜237、233〜252、236〜255、239〜258、242〜264、247〜266、251〜266、253〜272、255〜276、266〜285、269〜288、281〜300、284〜303、290〜313、298〜317、302〜321、324〜343、339〜358、342〜361、348〜367、358〜381、364〜383、366〜386、370〜389、373〜392、382〜401、405〜424、409〜428、411〜430、411〜426、411〜427、412〜427、412〜431、413〜428、413〜429、413〜432、414〜436、414〜430、414〜429、415〜430、416〜431、416〜432、417〜433、418〜437、422〜441、425〜444、428〜447、434〜453、440〜459、443〜462、446〜465、456〜477、458〜473、464〜483、470〜493、476〜495、479〜498、488〜507、491〜510、494〜513、500〜519、512〜531、515〜534、524〜543、527〜546、536〜555、539〜558、560〜579、566〜585、569〜588、572〜591、575〜594、584〜603、587〜606、608〜627、614〜633、617〜636、620〜639、623〜642、626〜645、629〜648、639〜654、641〜656、642〜657、643〜658、653〜672、665〜684、668〜688、670〜706、670〜686、670〜685、671〜691、671〜687、671〜686、672〜688、673〜688、679〜703、681〜696、682〜697、686〜701、686〜706、687〜702、687〜703、688〜703、689〜708、693〜712、695〜714、696〜715、697〜716、727〜746、739〜754、742〜761、748〜767、751〜770、754〜773、757〜776、760〜779、763〜782、766〜785、790〜809、793〜812、796〜815、811〜830、814〜833、817〜836、820〜839、822〜844、845〜864、854〜873、857〜876、863〜882、866〜885、872〜891、875〜894、878〜897、881〜900、884〜903、887〜906、899〜918、902〜921、905〜924、908〜927、911〜930、914〜933、936〜955、939〜958、951〜970、954〜973、957〜976、960〜979、963〜982、966〜985、969〜988、972〜991、975〜994、978〜997、996〜1015、1002〜1021、1025〜1044、1031〜1050、1034〜1053、1037〜1056、1046〜1065、1049〜1068、1052〜1071、1055〜1074、1058〜1077、1061〜1080、1064〜1083、1070〜1089、1073〜1092、1076〜1095、1082〜1101、1088〜1107、1094〜1113、1097〜1116、1100〜1119、1103〜1122、1106〜1125、1109〜1128、1112〜1131、1115〜1134、1121〜1140、1127〜1146、1153〜1172、1156〜1175、1159〜1178、1162〜1181、1165〜1184、1168〜1191、1174〜1193、1206〜1225、1209〜1228、1212〜1231、1215〜1234、1218〜1237、1221〜1240、1224〜1243、1227〜1246、1230〜1249、1233〜1252、1236〜1255、1239〜1258、1242〜1261、1245〜1264、1251〜1270、1254〜1273、1254〜1279、1257〜1283、1257〜1276、1258〜1277、1260〜1279、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1277、1262〜1278、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1287、1269〜1284、1269〜1285、1270〜1285、1272〜1291、1275〜1294、1282〜1303、1286〜1306、1290〜1309、1293〜1312、1296〜1315、1299〜1318、1305〜1324、1311〜1330、1314〜1333、1317〜1336、1353〜1381、1356〜1375、1359〜1378、1498〜1517、1501〜1520、1504〜1523、1510〜1529、1553〜1572、1556〜1575、1559〜1578、1562〜1581、1565〜1584、1571〜1590、1574〜1599、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1579〜1594、1579〜1595、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1582〜1602、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1605、1586〜1602、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1604〜1623、1607〜1626、1630〜1649、1633〜1652、1645〜1664、1651〜1670、1654〜1674、1657〜1676、1660〜1679、1663〜1682、1666〜1685、1689〜1708、1695〜1714、1698〜1717、1701〜1720、1716〜1735、1778〜1797、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1795、1779〜1798、1780〜1795、1780〜1796、1780〜1799、1781〜1800、1794〜1813、1895〜1914、1898〜1917、1901〜1920、1907〜1926、1910〜1929、1913〜1932、1916〜1935、1919〜1938、2278〜2297、2281〜2300、および2284〜2303。
特定の実施形態では、配列番号1の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドに標的とされたとき、少なくとも80%の阻害を示す:13〜32、16〜35、19〜38、25〜44、28〜47、46〜65、49〜68、58〜77、59〜80、63〜82、98〜120、116〜135、137〜159、158〜177、167〜186、203〜224、205〜224、209〜228、218〜237、233〜252、236〜263、245〜264、253〜272、256〜275、257〜276、266〜288、281〜300、290〜312、293〜312、324〜343、339〜358、348〜367、358〜378、360〜379、361〜383、366〜385、373〜392、382〜401、405〜424、411〜431、411〜426、411〜427、411〜430、413〜428、414〜433、414〜434、415〜430、415〜434、416〜431、416〜435、417〜436、418〜437、422〜441、425〜444、434〜453、456〜476、458〜473、458〜477、464〜483、471〜493、488〜507、494〜513、512〜531、524〜543、527〜546、536〜558、560〜579、566〜585、572〜591、575〜594、584〜603、587〜606、608〜627、614〜633、617〜636、620〜639、623〜642、626〜645、629〜648、639〜654、641〜656、642〜657、643〜658、665〜688、670〜687、670〜686、671〜686、671〜687、671〜691、673〜688、679〜699、682〜697、682〜706、686〜701、687〜702、687〜706、687〜703、693〜715、727〜746、742〜761、748〜767、757〜776、766〜785、790〜815、814〜833、820〜839、822〜844、845〜864、854〜873、854〜876、863〜885、872〜906、878〜897、899〜918、905〜933、936〜955、951〜979、963〜985、966〜985、972〜1015、978〜997、1002〜1021、1025〜1044、1031〜1056、1049〜1074、1061〜1083、1070〜1089、1082〜1101、1088〜11107、1094〜1119、1109〜1134、1121〜1140、1127〜1146、1159〜1187、1171〜1191、1206〜1228、1209〜1228、1215〜1255、1215〜1234、1218〜1237、1221〜1240、1224〜1243、1227〜1246、1230〜1249、1233〜1252、1236〜1255、1245〜1264、1251〜1279、1251〜1270、1254〜1273、1254〜1279、1257〜1276、1258〜1277、1259〜1278、1260〜1279、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1283、1265〜1284、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1270〜1285、1275〜1294、1282〜1301、1286〜1306、1293〜1318、1311〜1333、1326〜1345、1359〜1378、1553〜1578、1565〜1584、1571〜1590、1574〜1599、1577〜1592、1577〜1596、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1579〜1595、1579〜1598、1580〜1596、1580〜1599、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1601、1582〜1602、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1603、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1606、1588〜1603、1589〜1604、1589〜1605、1657〜1679、1780〜1795、1780〜1796、1780〜1799、1913〜1935、2278〜2297、2281〜2300、および2284〜2303。
特定の実施形態では、配列番号1の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドに標的とされたとき、少なくとも85%の阻害を示す:13〜32、16〜35、19〜38、25〜44、46〜65、59〜80、101〜120、140〜159、158〜177、167〜186、200〜219、205〜224、209〜228、233〜252、242〜263、253〜272、266〜285、281〜300、290〜311、293〜312、359〜379、361〜381、370〜389、382〜401、411〜426、411〜430、411〜427、413〜428、414〜433、415〜430、416〜435、417〜436、422〜441、456〜476、458〜473、470〜493、512〜531、524〜543、536〜558、566〜585、575〜594、587〜606、608〜627、614〜636、623〜645、639〜654、665〜687、671〜686、671〜687、680〜699、682〜703、687〜706、687〜703、727〜746、742〜761、757〜776、793〜812、822〜843、854〜876、854〜873、863〜885、878〜900、878〜897、887〜906、899〜918、905〜927、914〜933、936〜955、951〜985、966〜985、972〜1015、978〜997、1002〜1021、1025〜1044、1037〜1056、1049〜1074、1064〜1083、1070〜1089、1088〜1107、1094〜1119、1109〜1128、1121〜1140、1156〜1175、1162〜1187、1172〜1191、1206〜1228、1209〜1228、1215〜1255、1215〜1234、1218〜1237、1221〜1240、1224〜1243、1227〜1246、1230〜1249、1233〜1252、1236〜1255、1245〜1264、1251〜1279、1251〜1270、1254〜1273、1254〜1279、1257〜1276、1258〜1277、1259〜1278、1260〜1279、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1283、1265〜1284、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1284、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1270〜1285、1275〜1294、1282〜1301、1293〜1315、1311〜1330、1359〜1378、1574〜1593、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1577〜1606、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1579〜1598、1580〜1596、1580〜1599、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1601、1583〜1598、1583〜1602、1584〜1603、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1605、1587〜1602、1588〜1603、1780〜1799、1780〜1796、および2278〜2297、2281〜2300、および2284〜2303。
特定の実施形態では、配列番号1の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドに標的とされたとき、少なくとも90%の阻害を示す:13〜32、16〜35、60〜80、140〜159、158〜177、167〜186、242〜261、292〜311、362〜381、370〜389、382〜401、411〜427、411〜426、413〜428、415〜430、416〜435、422〜441、473〜492、617〜636、623〜642、639〜654、668〜687、680〜699、682〜701、684〜703、687〜706、727〜746、757〜776、824〜843、854〜873、854〜876、863〜882、878〜897、878〜900、887〜906、899〜918、905〜927、914〜933、936〜955、951〜970、960〜985、966〜985、972〜1015、978〜997、1025〜1044、1037〜1056、1070〜1089、1097〜1119、1109〜1128、1121〜1140、1165〜1187、1172〜1191、1206〜1228、1209〜1228、1215〜1234、1215〜1234、1215〜1255、1218〜1237、1221〜1240、1224〜1243、1227〜1246、1230〜1249、1233〜1252、1236〜1255、1245〜1264、1251〜1279、1251〜1270、1254〜1273、1254〜1279、1257〜1276、1258〜1277、1259〜1278、1260〜1279、1261〜1285、1261〜1280、1262〜1278、1261〜1276、1262〜1281、1262〜1277、1263〜1282、1263〜1278、1264〜1283、1265〜1284、1266〜1285、1268〜1284、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1296〜1315、1577〜1605、1577〜1596、1577〜1593、1577〜1592、1578〜1597、1581〜1600、1582〜1601、1583〜1602、1583〜1598、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1605、1588〜1603、1780〜1799、1780〜1796、2278〜2297、2281〜2300、および2284〜2303。
特定の実施形態では、配列番号1の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドに標的とされたとき、少なくとも95%の阻害を示す:411〜426、411〜427、413〜428、617〜636、623〜642、668〜687、680〜699、682〜701、854〜873、878〜897、887〜906、914〜933、966〜985、978〜997、1209〜1228、1215〜1234、1218〜1237、1221〜1240、1224〜1243、1227〜1246、1230〜1249、1233〜1252、1236〜1255、1245〜1264、1251〜1270、1254〜1273、1254〜1279、1257〜1276、1258〜1277、1259〜1278、1260〜1279、1261〜1285、1261〜1280、1262〜1281、1263〜1282、1263〜1278、1264〜1283、1265〜1284、1266〜1285、1268〜1284、1269〜1288、1577〜1592、1577〜1596、1577〜1601、1583〜1598、1585〜1601、1588〜1603、1780〜1799、2278〜2297、2281〜2300、および2284〜2303。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも50%の阻害をもたらす:ISIS番号510088、510089、510090、510092、510096、510097、510098、510099、510100、510101、510102、505330、509928、510104、509929、510105、509930、510106、510107、510108、510111、510115、509931、510116、510117、510118、510119、510120、510121、509932、510122、509933、510123、509934、510124、509935、510125、510126、510127、510128、510140、146779、505314、505315、505316、505317、146821、505318、509922、505319、509925、505320、509952、505321、505322、505323、505324、505325、505326、505327、505328、505329、509956、509957、509927、509958、510038、505330、509959、510039、509960、510040、509961、510041、509962、509963、505331、505332、509968、509969、510050、510052、505333、505334、505335、505336、509972、146823、509974、505338、505339、509975、505340、509978、505341、509979、510058、505342、509981、510061、505344、505345、509983、505346、509984、505347、505348、505350、505352、505353、505354、505355、505356、146786、505357、505358、505359、505360、509985、509986、509987、509988、505363、505364、505365、505366、146787、510079、524410、524411、524413、524414、524415、524416、524417、524418、524419、524420、524421、524422、524424、524425、524426、524427、524428、524429、524431、524432、524433、524434、524435、524436、524439、524440、524442、524444、524446、524447、524448、524450、524451、524452、524453、524454、524455、524456、524457、524458、524459、524460、524461、524462、524464、524466、524467、524468、524469、524470、524471、524472、524473、524474、524475、524477、524478、524479、524480、524481、524482、524483、524484、524485、524486、524487、524489、524490、524491、524492、524493、524494、524495、524496、524498、524499、524500、524501、524502、524503、524504、524506、524507、524508、524509、524510、524511、524512、524513、524514、524515、524516、524517、524518、524519、524520、524521、524522、524523、524524、524525、524526、524527、524528、524529、524530、524531、524532、524533、524534、524535、524536、524537、524538、524539、524540、524541、524543、524544、524546、524547、524548、524549、524550、524551、524552、524553、524554、524555、524556、524557、524558、524559、524560、524561、524562、524563、524564、524565、524568、524569、524570、524571、524572、524573、524574、524575、524576、524577、524578、524579、524580、524581、524582、524584、524585、524586、524587、524588、524589、524590、524591、524592、524593、524594、524595、524598、524599、524600、524601、524602、524603、524604、524605、524606、524607、524608、524609、524610、524611、524614、524615、524616、524617、524618、524619、524620、524621、524622、524623、524624、524625、524626、524627、524629、524632、524633、524634、524635、524636、524637、524638、524639、524640、524641、524642、524643、524644、524646、524647、524648、524649、524650、524651、524652、524654、524656、524657、524658、524659、524660、524661、524662、524663、524664、524665、524666、524667、524668、524669、524670、524672、524673、524675、524676、524678、524679、524680、524682、524683、524684、524685、524686、524687、524688、524689、524690、524691、524692、524693、524694、524695、524696、524697、524698、524699、524700、524701、524702、524703、524704、524705、524706、524707、524708、524709、524710、524712、524713、524714、524715、524716、524717、524718、524719、524721、524722、524723、524724、524726、524727、524728、524729、524730、524731、524732、524733、524734、524735、524736、524737、524738、524739、524740、524741、524742、524743、524744、524745、524746、524747、524748、524749、524750、524751、524752、524753、524754、524755、524756、524757、524758、524759、524760、524761、524762、524763、524764、524765、524766、524767、524768、524769、524770、524771、524772、524773、524774、524775、524776、524777、524778、524779、524780、524781、524782、524783、524784、524785、524786、524787、524788、524789、524790、524791、524792、524793、524794、524795、524796、524797、524798、524799、524800、524801、524802、524803、524804、524805、524806、524807、524808、524809、524810、524811、524812、524813、524814、524815、524816、524817、524818、524819、524820、524821、524822、524823、524824、524825、524826、524827、524828、524829、524830、524831、524632、524833、524834、524835、524842、524843、524844、524845、524847、524848、524856、524857、524861、524866、524867、524868、524869、524870、524871、524872、524873、524875、524876、524877、524878、524879、524880、524881、524882、524883、524884、524885、524886、524887、524888、524889、524890、524891、524892、524893、524894、524895、524896、524897、524898、524899、524900、524901、524902、524903、524904、524905、524906、524907、524908、524909、524910、524911、524912、524913、524914、524915、524916、524917、524918、524919、524921、524922、524923、524924、524925、524926、524927、524928、524929、524930、524931、524932、524933、524934、524935、524936、524937、524938、524939、524940、524941、524942、524943、524944、524945、524946、524947、524948、524949、524950、524951、524952、524953、524954、524955、524956、524957、524958、524959、524960、524961、524962、524964、524965、524976、524977、524978、524979、524980、524981、524982、524983、524984、524985、524986、524987、524988、524989、524991、524992、524993、524994、524997、524998、525021、525022、525037、525039、525043、525050、525052、525086、525090、525100、551909、551910、551911、551912、551913、551916、551917、551918、551919、551920、551921、551922、551923、551924、551925、551926、551927、551928、551929、551930、551932、551933、551934、551935、551936、551937、551939、551940、551941、551942、551943、551944、551945、551946、551947、551948、551949、551950、551951、551952、551953、551954、551955、551956、551957、551958、551959、551960、551962、551963、551964、551965、551966、551967、551968、551971、551972、55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特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも50%の阻害をもたらす:配列番号5、6、7、9、10、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、33、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、74、83、85、86、87、88、89、92、96、98、99、100、102、103、104、106、108、109、111、112、115、117、121、122、123、124、125、126、127、128、136、137、139、140、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、153、155、157、159、161、165、166、167、168、169、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、186、187、188、189、190、191、192、193、194、197、198、199、201、203、206、207、208、209、210、211、212、213、215、217、218、220、221、222、224、225、226、227、228、230、231、232、233、234、235、236、237、240、241、242、243、244、250、283、321、322、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、335、336、337、338、339、340、342、343、344、345、346、347、350、351、353、355、357、358、359、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、399、400、401、402、403、404、405、406、408、409、410、411、412、413、414、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、453、454、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、473、474、475、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、494、495、496、497、498、499、500、501、502、503、504、505、508、509、510、511、512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、524、525、526、527、528、529、530、531、532、533、534、535、536、537、539、542、543、544、545、546、547、548、549、550、551、552、553、554、555、556、557、558、559、560、561、562、564、566、567、568、569、570、571、572、573、574、575、576、577、578、579、580、582、583、585、586、588、589、590、592、593、594、595、596、597、598、599、600、601、602、603、604、605、606、607、608、609、610、611、612、613、614、615、616、617、618、619、620、622、623、624、625、626、627、628、629、631、632、633、634、636、637、638、639、640、641、642、643、644、645、646、647、648、649、650、651、652、653、654、655、656、657、658、659、660、661、662、663、664、665、666、667、668、669、670、671、672、673、674、675、676、677、678、679、680、681、682、683、684、685、686、687、688、689、690、691、692、693、694、695、696、697、698、699、700、701、702、703、704、705、706、707、708、709、710、711、712、713、714、715、716、717、718、719、720、721、722、723、724、725、726、727、728、729、730、731、732、733、734、735、736、737、738、739、740、741、742、743、744、745、746、747、754、755、756、757、759、760、768、769、773、777、778、779、780、781、782、783、784、786、787、788、789、790、791、792、793、794、795、796、797、798、799、800、801、802、803、804、805、806、807、808、809、810、811、812、813、814、815、816、817、818、819、820、821、822、823、824、825、826、827、828、829、830、831、833、834、835、836、837、838、839、840、841、842、843、844、845、846、847、848、849、850、851、852、853、854、855、856、857、858、859、860、861、862、863、864、865、866、867、868、869、870、871、872、873、874、876、877、888、889、890、891、892、893、894、895、896、897、898、899、900、901、903、904、905、906、909、910、933、934、949、951、955、962、964、998、1002、1013、1052、1267、1271、1272、1288、1289、1290、1291、1292、1293、1294、1295、1296、1297、1298、1299、1300、1301、1302、1303、1304、1305、1306、1307、1308、1309、1310、1311、1312、1313、1314、1315、1316、1317、1318、1319、1320、1321、1322、1323、1324、1325、1326、1327、1328、1329、1330、1331、1332、1333、1334、1335、1336、1337、1338、1339、1340、1341、1342、1343、1344、1345、1346、1347、1348、1349、1350、1364、1365、1366、1367、1368、1369、1370、1371、1372、1375、および1376。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも60%の阻害をもたらす:ISIS番号510090、510100、510102、505330、509928、510104、509929、510105、509930、510106、510107、510111、509931、510116、510117、510118、510119、510120、510121、509932、510122、509933、510123、509934、510124、509935、510125、510128、146779、505314、505315、505316、505317、146821、505318、505319、505322、505323、505324、505325、505326、505327、505328、505329、509956、509957、509958、505330、509959、510041、505332、509968、505333、505335、146823、509974、505338、505339、509975、505340、505341、509979、505342、509981、505344、505345、509983、505346、509984、505347、505348、505353、505354、505356、146786、505357、505358、505359、505360、509985、509986、505363、505366、524410、524413、524414、524415、524416、524417、524418、524419、524420、524421、524422、524424、524425、524426、524428、524431、524432、524433、524434、524435、524439、524440、524446、524447、524448、524451、524452、524453、524454、524455、524456、524457、524459、524460、524461、524464、524466、524467、524468、524469、524471、524472、524473、524474、524475、524477、524478、524479、524480、524481、524482、524485、524486、524487、524489、524490、524491、524492、524493、524494、524495、524496、524499、524500、524501、524502、524503、524504、524506、524507、524508、524509、524510、524511、524512、524513、524514、524515、524516、524517、524519、524520、524521、524523、524525、524526、524527、524528、524529、524532、524533、524534、524535、524536、524537、524538、524539、524540、524541、524543、524546、524547、524549、524550、524552、524553、524554、524555、524556、524557、524558、524559、524560、524561、524562、524563、524564、524565、524568、524569、524570、524571、524572、524573、524574、524575、524576、524577、524578、524579、524580、524581、524582、524585、524586、524587、524588、524589、524590、524591、524593、524594、524595、524598、524599、524600、524602、524603、524604、524605、524606、524607、524610、524611、524614、524615、524616、524617、524618、524619、524620、524621、524622、524623、524625、524627、524629、524632、524633、524634、524635、524636、524637、524638、524639、524640、524641、524642、524643、524644、524646、524647、524648、524649、524650、524651、524654、524656、524657、524658、524659、524661、524662、524663、524664、524665、524666、524667、524668、524669、524670、524673、524675、524676、524678、524679、524680、524683、524684、524685、524686、524687、524688、524689、524690、524691、524692、524694、524695、524696、524697、524698、524699、524700、524701、524702、524703、524704、524705、524706、524707、524708、524709、524710、524713、524714、524715、524716、524717、524718、524719、524721、524722、524724、524726、524727、524728、524729、524730、524731、524732、524733、524734、524735、524736、524737、524738、524739、524741、524742、524743、524744、524746、524747、524748、524749、524750、524751、524752、524753、524754、524755、524756、524757、524758、524759、524760、524761、524762、524763、524764、524765、524766、524767、524768、524769、524770、524771、524772、524773、524774、524775、524776、524777、524778、524779、524780、524781、524782、524783、524784、524785、524787、524788、524789、524790、524791、524792、524793、524794、524795、524796、524797、524798、524799、524800、524801、524802、524803、524804、524805、524806、524807、524808、524809、524810、524811、524812、524813、524814、524815、524816、524817、524818、524819、524820、524821、524822、524823、524824、524825、524826、524827、524828、524829、524830、524632、524833、524842、524843、524844、524845、524847、524856、524866、524867、524868、524869、524870、524871、524872、524873、524876、524878、524879、524880、524881、524882、524883、524884、524885、524886、524887、524888、524889、524890、524891、524892、524893、524894、524895、524896、524897、524898、524899、524900、524901、524902、524903、524904、524905、524906、524907、524908、524909、524910、524911、524912、524913、524914、524915、524916、524921、524922、524923、524924、524925、524926、524928、524929、524930、524931、524932、524933、524936、524937、524938、524939、524940、524941、524942、524944、524946、524947、524948、524949、524950、524952、524953、524954、524955、524961、524977、524978、524979、524980、524981、524982、524983、524984、524985、524986、524987、524988、524991、524992、524993、524994、525037、525052、551909、551911、551919、551920、551921、551922、551924、551925、551926、551927、551928、551932、551933、551934、551935、551936、551941、551943、551944、551948、551949、551950、551951、551952、551953、551954、551955、551956、551957、551958、551959、551960、551962、551963、551965、551966、551967、551968、551973、551975、551979、551981、551982、551983、551984、551985、551986、551987、551989、551990、551992、551993、551994、551995、551996、551997、551998、551999、552000、552001、552002、552003、552005、552006、552007、552009、552010、552012、552013、552014、552015、552016、552017、552018、552019、552020、552021、552022、552023、552024、552025、552026、552027、552028、552029、552030、552031、552032、552033、552034、552035、552036、552038、552039、552041、552042、552044、552045、552046、552047、552048、552049、552050、552051、552052、552053、552054、552055、552056、552057、552058、552059、552060、552061、552062、552063、552064、552065、552068、552069、552070、552071、552073、552074、552075、552076、552077、552078、552079、552080、552081、552082、552083、552084、552085、552086、552087、552088、552089、552090、552091、552092、552093、552094、552095、552096、552097、552098、552099、552100、552101、552102、552114、552115、552116、552117、552118、552119、552123、552124、552125、552126、552127、552128、552129、552131、552132、552133、552134、552135、552136、552138、552139、552140、552141、552143、552144、55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特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも60%の阻害をもたらす:配列番号7、9、10、12、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、33、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、56、83、85、86、87、88、89、92、96、98、100、102、103、112、115、117、122、123、124、125、126、127、128、136、137、139、140、142、143、145、147、149、150、151、153、155、157、159、161、166、167、168、172、174、176、177、178、179、180、181、186、187、188、189、190、191、192、193、194、198、199、201、206、207、208、209、210、211、212、213、218、220、222、224、225、226、227、228、230、231、232、233、234、240、243、321、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、335、336、337、339、342、343、344、345、346、350、351、357、358、359、362、363、364、365、366、367、368、370、371、372、375、376、377、378、379、381、382、383、384、387、388、389、390、391、392、395、396、397、399、400、401、402、403、404、405、406、409、410、411、412、413、414、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、429、430、431、433、435、436、437、438、439、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、453、456、457、459、460、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、473、474、475、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、495、496、497、498、499、500、501、503、504、505、508、509、510、512、513、514、515、516、517、520、521、524、525、526、527、528、529、530、531、532、533、535、537、539、542、543、544、545、546、547、548、549、550、551、552、553、554、555、556、557、558、559、560、561、564、566、567、568、569、571、572、573、574、575、576、577、578、579、580、583、585、586、588、589、590、593、594、595、596、597、598、599、600、601、602、604、605、606、607、608、609、610、611、612、613、614、615、616、617、618、619、620、623、624、625、626、627、628、629、631、632、634、636、637、638、639、640、641、642、643、644、645、646、647、648、649、650、652、653、654、655、657、658、659、660、661、662、663、664、665、666、667、668、669、670、671、672、673、674、675、676、677、678、679、680、681、682、683、684、685、686、687、688、689、690、691、692、693、694、695、696、698、699、700、701、702、703、704、705、706、707、708、709、710、711、712、713、714、715、716、717、718、719、720、721、722、723、724、725、726、727、728、729、730、731、732、733、734、735、736、737、738、740、741、742、744、745、754、755、756、757、759、768、777、778、779、780、781、782、783、784、787、789、790、791、792、793、794、795、796、797、798、799、800、801、802、803、804、805、806、807、808、809、810、811、812、813、814、815、816、817、818、819、820、821、822、823、824、825、826、827、828、833、834、835、836、837、838、840、841、842、843、844、845、848、849、850、851、852、853、854、856、858、859、860、861、862、864、865、866、867、873、889、890、891、892、893、894、895、896、897、898、899、900、903、904、905、906、949、964、1271、1288、1289、1290、1291、1292、1293、1294、1295、1296、1297、1298、1299、1300、1301、1302、1303、1304、1305、1306、1307、1308、1309、1310、1311、1312、1313、1314、1315、1316、1317、1318、1319、1320、1321、1322、1323、1324、1325、1326、1327、1328、1329、1330、1331、1332、1333、1334、1335、1336、1337、1338、1339、1340、1341、1342、1343、1344、1345、1346、1347、1348、1349、1350、1365、1366、1367、1368、1369、1370、1371、1372、および1376。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも70%の阻害をもたらす:ISIS番号510100、505330、509928、509929、509930、510106、509931、510116、510119、510120、510121、509932、510122、509933、510123、509934、510124、509935、146779、505317、146821、505318、505319、505323、505325、505326、505327、509957、505330、505332、505335、509974、505338、505339、509975、505342、509981、505345、505346、505347、505348、146786、505357、505358、505359、505363、524410、524413、524414、524415、524416、524418、524419、524420、524421、524424、524425、524426、524428、524431、524432、524433、524434、524435、524446、524447、524448、524452、524453、524457、524459、524460、524461、524464、524466、524467、524468、524469、524472、524473、524474、524475、524477、524478、524479、524480、524481、524482、524485、524487、524490、524491、524492、524493、524494、524495、524499、524500、524502、524503、524507、524508、524510、524511、524512、524513、524514、524515、524516、524517、524520、524525、524526、524528、524532、524533、524534、524535、524536、524537、524538、524539、524540、524541、524547、524549、524552、524553、524554、524555、524556、524557、524558、524559、524560、524561、524563、524564、524565、524568、524569、524570、524571、524572、524573、524574、524575、524577、524578、524579、524580、524582、524586、524587、524590、524591、524594、524595、524598、524600、524602、524603、524604、524605、524606、524607、524610、524611、524614、524615、524616、524617、524618、524619、524620、524621、524629、524633、524634、524635、524636、524637、524638、524641、524642、524643、524644、524646、524647、524648、524649、524650、524651、524656、524657、524659、524661、524662、524663、524664、524665、524666、524667、524668、524669、524670、524678、524679、524680、524685、524686、524687、524688、524689、524690、524691、524692、524695、524696、524698、524699、524700、524701、524702、524703、524704、524705、524706、524707、524708、524709、524713、524714、524715、524716、524717、524718、524721、524722、524724、524726、524727、524728、524729、524730、524731、524732、524733、524734、524735、524736、524737、524738、524739、524741、524742、524743、524746、524747、524748、524749、524750、524751、524752、524754、524755、524756、524758、524760、524761、524762、524763、524764、524765、524766、524767、524768、524769、524771、524773、524775、524776、524777、524778、524779、524780、524781、524782、524783、524784、524785、524787、524788、524789、524790、524791、524792、524793、524794、524795、524796、524797、524798、524799、524800、524801、524802、524803、524804、524805、524806、524807、524808、524809、524810、524811、524812、524813、524814、524815、524816、524817、524818、524819、524821、524822、524823、524824、524825、524826、524827、524828、524829、524830、524833、524842、524843、524844、524845、524856、524866、524867、524868、524869、524870、524871、524873、524879、524880、524881、524882、524883、524884、524885、524886、524887、524888、524889、524890、524891、524892、524893、524894、524895、524896、524897、524898、524899、524900、524902、524903、524905、524906、524907、524908、524909、524910、524911、524912、524913、524914、524915、524916、524921、524922、524930、524931、524932、524937、524940、524942、524948、524980、524981、524982、524983、524984、524985、524986、524987、524988、551919、551921、551922、551924、551925、551926、551933、551941、551950、551951、551952、551953、551955、551956、551957、551958、551966、551983、551984、551985、551986、551987、551989、551990、551992、551993、551994、551995、551996、551997、551998、551999、552000、552005、552006、552009、552012、552013、552014、552015、552017、552018、552019、552020、552021、552022、552023、552024、552025、552026、552027、552028、552029、552030、552031、552032、552033、552034、552038、552039、552041、552044、552046、552047、552049、552050、552051、552052、552053、552054、552055、552056、552057、552058、552059、552060、552061、552062、552063、552064、552065、552068、552069、552070、552071、552073、552074、552075、552076、552077、552078、552079、552080、552081、552082、552083、552084、552085、552086、552087、552088、552089、552090、552091、552092、552093、552094、552095、552096、552097、552098、552099、552100、552101、552115、552117、552123、552125、552127、552128、552129、552132、552133、552138、552139、552140、552141、552143、552144、552145、552146、552147、552148、552149、552150、552151、552152、552158、552159、552160、552163、552168、552179、552187、552188、552192、552193、552195、552199、552200、552201、552202、552203、552204、552205、552206、552207、552208、552210、552211、552213、552214、552222、552246、552247、552248、552253、552254、552255、552258、552294、552301、552302、552306、552307、552308、552309、552310、552312、552314、552315、552317、552318、552321、552322、552323、552325、552332、552337、552339、552347、552348、552349、552354、552355、552358、552359、552360、552361、552362、552363、552364、552365、552366、552367、552368、552369、552371、552373、552374、552375、552376、552377、552378、552379、552403、552408、552409、552411、552418、552419、552420、552424、552442、552464、552465、552466、552467、552472、552474、552475、552477、552478、552521、552522、552523、552527、552528、552529、552530、552534、552567、552578、552579、552584、552586、552587、552588、552590、552789、552803、552804、552805、552808、552816、552817、552818、552819、552820、552821、552822、552823、552824、552828、552829、552830、552833、552834、552835、552842、552843、552844、552846、552848、552849、552850、552851、552852、552853、552854、552855、552856、552857、552858、552859、552860、552861、552863、552864、552865、552872、552894、552903、552904、552907、552909、552910、552911、552913、552914、552915、552916、552917、552918、552922、552923、552925、552927、552928、552929、552930、552931、552932、552933、
552934、552935、552936、552937、552938、552939、552940、552941、552942、552943、552944、552945、552946、552957、552961、552966、552969、552971、552972、552974、552976、552979、552980、552981、552983、552984、552988、552989、552990、552991、552995、552996、552998、552999、553001、553002、553003、553004、553006、553008、553009、553010、553011、553012、566828、566829、566830、566831、566832、577120、577121、577122、577123、577124、577125、577126、577127、577128、577129、577130、577131、577132、577133、577134、577135、577136、および582666。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも70%の阻害をもたらす:配列番号12、17、18、20、21、22、24、25、26、27、28、29、39、40、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、83、89、92、96、98、100、103、112、123、125、126、127、136、137、139、140、142、143、145、147、149、151、153、166、167、168、174、176、177、178、179、181、186、187、188、190、198、201、207、209、210、211、212、213、224、225、226、227、232、234、240、321、324、325、326、327、329、330、331、332、335、336、337、339、342、343、344、345、346、357、358、359、363、364、368、370、371、372、375、376、377、378、379、382、383、384、387、388、389、390、391、392、395、397、400、401、402、403、404、405、409、410、412、413、417、418、420、421、422、423、424、425、426、427、430、435、436、438、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、457、459、462、463、464、465、466、467、468、469、470、473、474、475、478、479、480、481、482、483、484、485、487、488、489、490、492、496、497、500、501、504、505、508、510、512、513、514、515、516、517、520、521、524、525、526、527、528、529、530、531、539、543、544、545、546、547、548、551、552、553、554、555、556、557、558、559、560、561、566、567、569、571、572、573、574、575、576、577、578、579、580、588、589、590、595、596、597、598、599、600、601、602、605、606、608、609、610、611、612、613、614、615、616、617、618、619、623、624、625、626、627、628、631、632、634、636、637、638、639、640、641、642、643、644、645、646、647、648、649、650、652、653、654、657、658、659、660、661、662、663、665、666、667、669、671、672、673、674、675、676、677、678、679、680、682、684、686、687、688、689、690、691、692、693、694、695、696、698、699、700、701、702、703、704、705、706、707、708、709、710、711、712、713、714、715、716、717、718、719、720、721、722、723、724、725、726、727、728、729、730、731、733、734、735、736、737、738、740、741、742、745、754、755、756、757、768、777、778、779、780、781、782、784、790、791、792、793、794、795、796、797、798、799、800、801、802、803、804、805、806、807、808、809、810、811、812、814、815、817、818、819、820、821、822、823、824、825、826、827、828、833、834、842、843、844、849、852、854、860、892、893、894、895、896、897、898、899、900、1288、1289、1290、1291、1292、1293、1294、1295、1296、1297、1298、1299、1300、1301、1302、1303、1304、1305、1306、1307、1308、1309、1310、1311、1312、1313、1314、1315、1316、1317、1320、1322、1323、1324、1325、1326、1327、1329、1330、1331、1332、1333、1334、1335、1336、1337、1338、1340、1341、1342、1343、1344、1345、1346、1347、1348、1349、および1350、1367、1368、1369、1370、1372、および1376。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも80%の阻害をもたらす:ISIS番号510100、509931、510116、505317、505319、505323、505326、505327、505330、505339、505346、505347、505358、509934、146786、524414、524415、524416、524418、524419、524425、524426、524431、524432、524434、524446、524447、524452、524459、524460、524466、524469、524475、524477、524478、524479、524482、524485、524490、524491、524492、524493、524494、524495、524499、524502、524503、524507、524510、524511、524512、524520、524525、524528、524532、524533、524534、524535、524536、524540、524541、524547、524552、524553、524556、524561、524564、524565、524568、524570、524571、524572、524573、524578、524580、524586、524590、524591、524594、524595、524602、524604、524606、524607、524610、524611、524614、524616、524617、524618、524619、524620、524621、524633、524634、524635、524636、524637、524641、524643、524644、524646、524649、524650、524651、524657、524662、524664、524667、524670、524678、524679、524680、524686、524688、524690、524691、524692、524695、524698、524699、524701、524702、524704、524705、524706、524707、524708、524709、524713、524715、524716、524717、524718、524721、524726、524727、524728、524729、524730、524731、524733、524734、524735、524737、524739、524741、524742、524743、524747、524748、524749、524751、524752、524754、524758、524760、524762、524763、524764、524767、524768、524769、524771、524773、524777、524778、524779、524780、524781、524783、524784、524788、524789、524791、524792、524793、524794、524795、524796、524797、524798、524801、524803、524804、524805、524806、524807、524808、524809、524810、524811、524813、524816、524819、524822、524823、524824、524827、524828、524829、524833、524842、524844、524880、524881、524882、524884、524886、524887、524888、524889、524890、524891、524893、524907、524908、524980、524986、524987、551921、551924、551925、551953、551956、551957、551984、551986、551987、551989、551990、551993、551994、551995、551996、551997、551998、551999、552000、552005、552006、552018、552019、552020、552021、552022、552023、552024、552025、552026、552027、552028、552029、552030、552031、552032、552033、552034、552039、552044、552046、552050、552051、552052、552053、552054、552055、552056、552057、552058、552059、552060、552061、552062、552063、552064、552065、552073、552077、552078、552079、552080、552082、552083、552084、552085、552086、552087、552088、552089、552090、552091、552092、552093、552094、552095、552096、552097、552098、552138、552139、552145、552146、552147、552149、552192、552193、552199、552200、552201、552207、552246、552247、552253、552301、552307、552308、552310、552317、552347、552348、552354、552355、552360、552361、552362、552363、552364、552365、552366、552367、552371、552375、552464、552465、552521、552808、552816、552817、552818、552819、552820、552822、552824、552834、552844、552849、552850、552851、552852、552853、552854、552916、552922、552923、552925、552930、552931、552932、552933、552936、552937、552938、552939、552942、552943、552944、552980、552988、552989、552996、552998、553002、553003、566828、566829、566830、566831、566832、577120、577121、577122、577123、577124、577125、577126、577127、577128、577130、577131、577132、577133、577134、577135、577136、および582666。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも80%の阻害をもたらす:配列番号17、20、22、24、26、28、39、40、50、51、83、89、103、123、126、127、136、137、143、147、149、168、176、177、178、179、187、188、210、211、212、224、225、226、227、232、325、326、327、329、330、336、337、342、343、345、357、358、363、370、371、376、379、387、388、389、392、395、400、401、402、403、404、405、409、412、413、417、420、421、422、430、435、438、442、443、444、445、446、450、451、457、462、463、466、474、475、478、480、481、482、483、488、490、496、500、501、504、505、512、514、516、517、520、521、524、526、527、528、529、530、531、543、544、545、546、547、551、553、554、555、559、560、561、567、572、574、577、580、588、589、590、596、598、600、601、602、605、608、609、611、612、614、615、616、617、618、619、623、625、626、627、628、631、636、637、638、639、640、641、643、644、645、646、648、650、652、653、654、658、659、660、662、663、665、669、671、673、674、675、678、679、680、682、684、688、689、690、691、692、694、695、699、700、702、703、704、705、706、707、708、709、712、714、715、716、717、718、719、720、721、722、723、725、728、731、734、735、736、740、741、745、756、791、792、793、795、797、798、799、800、801、802、804、805、806、807、819、820、892、898、899、1292、1293、1295、1296、1301、1302、1303、1304、1305、1306、1307、1308、1310、1312、1316、1322、1324、1325、1326、1327、1330、1331、1332、1333、1334、1335、1338、1339、1340、1341、1344、1345、1349、1350、1368、1372、および1376。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも90%の阻害をもたらす:ISIS番号524414、524415、524432、524460、524466、524469、524475、524477、524493、524512、524535、524540、524552、524561、524572、524617、524619、524634、524641、524644、524657、524667、524691、524698、524699、524701、524706、524707、524709、524713、524715、524716、524718、524721、524726、524729、524730、524731、524733、524734、524735、524739、524743、524754、524763、524764、524767、524771、524780、524781、524784、524788、524789、524791、524792、524793、524794、524795、524796、524797、524798、524801、524803、524804、524805、524806、524807、524808、524809、524810、524811、524822、524827、524842、551986、551987、551989、552005、552018、552019、552020、552021、552022、552023、552025、552046、552050、552051、552052、552053、552054、552055、552057、552082、552083、552084、552085、552086、552087、552088、552089、552092、552093、552096、552097、552307、552317、552355、552361、552362、552363、552817、552851、552922、552923、566828、566829、566830、566831、566832、577120、577121、577122、577123、577124、577125、577126、577127、577128、577130、577131、577132、577134、577135、577136、および582666。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも90%の阻害をもたらす:配列番号17、24、50、51、137、143、147、176、211、212、224、226、227、325、326、343、371、376、379、403、422、445、450、462、482、527、529、544、551、554、567、577、601、608、609、611、616、617、619、623、625、626、628、631、636、639、640、641、643、644、645、646、650、654、665、674、675、678、682、691、692、695、699、700、702、703、704、705、706、707、708、709、712、714、715、716、717、718、719、720、721、722、723、735、801、804、805、807、1296、1302、1303、1304、1312、1325、1326、1332、1334、1340、1345、1349、および1376。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも95%の阻害をもたらす:ISIS番号524619、524634、524641、505339、524698、524709、524718、524731、524734、524789、524791、524792、524793、524794、524795、524796、524797、524798、524801、524803、524804、524805、524806、505346、146785、524807、505347、524808、524809、524810、524811、146786、525101、525102、525103、525107、525108、525109、525110、525111、525112、525113、525114、525115、525116、525117、525118、525119、525120、552018、552050、552019、552051、552020、552052、551987、552021、552053、552005、552022、552054、551989、552023、552055、552084、552085、552086、552087、552088、552361、552317、566831、577123、577124、566830、566828、566829、577127、577135、577132、577136、566832、および577122。
特定の実施形態では、以下のアンチセンス化合物またはオリゴヌクレオチドは、HBV核酸のある領域を標的とし、HBV mRNAの少なくとも95%の阻害をもたらす:配列番号17、50、137、143、187、210、212、224、529、544、551、608、619、628、641、645、700、702、703、704、705、706、707、708、709、712、715、716、717、718、719、720、721、722、723、1014、1015、1016、1020、1021、1022、1023、1024、1025、1026、1027、1028、1029、1030、1031、1032、1033、1236、1302、1312、1334、1340、1345、1349。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物をそれを必要とする動物に投与することを含む、動物におけるHBV関連疾患、障害、または状態を治療する方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号5〜310、321〜802、804〜1272、1288〜1350、1364〜1372、1375、1376、および1379の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾オリゴヌクレオチドを含む。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物をそれを必要とする動物に投与することを含む、動物におけるHBV関連疾患、障害、または状態を治療する方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号17、51、86、93、95、98、100、102、104、106、109、112、115、117、137、140、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、167、168、176、177〜179、181、188、190〜192、194、199、201、208、209、211、226、230〜237、244、245、247、252、254、256、258、260、262、264、266、271、1318〜1347、1364〜1372、1375、1376、および1379の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含み、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖および/または拘束エチル(cEt)糖を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に2個、3個、または4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV発現を減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号5〜310、321〜802、804〜1272、1288〜1350、1364〜1372、1375、1376、および1379の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を含む、HBVを標的とする10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV発現を減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号17、51、86、93、95、98、100、102、104、106、109、112、115、117、137、140、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、167、168、176、177〜179、181、188、190〜192、194、199、201、208、209、211、226、230〜237、244、245、247、252、254、256、258、260、262、264、266、271、1318〜1347、1364〜1372、1375、および1376の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、HBVを標的とする10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含み、この修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖および/または拘束エチル(cEt)糖を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、9個または10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV関連疾患、障害、または状態を防止、改善、または治療する方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号17、51、86、93、95、98、100、102、104、106、109、112、115、117、137、140、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、167、168、176、177〜179、181、188、190〜192、194、199、201、208、209、211、226、230〜237、244、245、247、252、254、256、258、260、262、264、266、271、1318〜1347、1364〜1372、1375、および1376の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、HBVを標的とする10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含み、この修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖および/または拘束エチル(cEt)糖を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、9個または10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物をそれを必要とする動物に投与することを含む、動物におけるHBV関連疾患、障害、または状態を治療する方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号5、15、16、33、39〜95、123〜135、163〜175、180〜310、321〜406、413〜455、461〜802、または804〜1272の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾オリゴヌクレオチドを含む。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物をそれを必要とする動物に投与することを含む、動物におけるHBV関連疾患、障害、または状態を治療する方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号6〜14、17〜32、34〜38、96〜122、136〜162、176〜179、407〜412、456〜462、523〜538の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾オリゴヌクレオチドを含み、この修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖を含む。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、14ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜3個、または2個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、9個または10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17ヌクレオシド長であり、9個または10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3〜4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、5個、または6個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、18ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、3〜5個、または4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、5個、6個、7個、または8個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV発現を減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号5〜310、321〜802、804〜1272、または1288〜1350の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、HBVを標的とする10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV発現を減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号5、15、16、33、39〜95、123〜135、163〜175、180〜310、321〜406、413〜455、461〜802、または804〜1272の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、HBVを標的とする10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV発現を減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号6〜14、17〜32、34〜38、96〜122、136〜162、176〜179、407〜412、456〜462、523〜538の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、HBVを標的とする10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含み、この修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖を含む。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、14ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜3個、または2個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、9個または10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17ヌクレオシド長であり、9個または10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、5個、または6個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3〜4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、18ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、3〜5個、または4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、5個、6個、7個、または8個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV関連疾患、障害、または状態を防止、改善、または治療する方法を提供する。特定の実施形態では、この化合物または組成物は、HBVを標的とする、10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、化合物または組成物は、配列番号5〜310、321〜802、804〜1272、または1288〜1350の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、HBVを標的とする10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含み、この修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号5〜310、321〜802、または804〜1272の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号5、15、16、33、39〜95、123〜135、163〜175、180〜310、321〜406、413〜455、461〜802、または804〜1272の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号6〜14、17〜32、34〜38、96〜122、136〜162、176〜179、407〜412、456〜462、523〜538の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有し、この修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、14ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜3個、または2個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、9個または10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17ヌクレオシド長であり、9個または10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、2個、3個、4個、5個、または6個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3〜4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、18ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、3〜5個、または4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3末端に、2個、3個、4個、5個、6個、7個、または8個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
HBV関連疾患、障害、または状態の例としては、慢性HBV感染、黄疸、肝癌、肝臓炎、肝線維症、肝硬変、肝不全、びまん性肝細胞炎症性疾患、血球貪食症候群、血清肝炎、HBVウイルス血症、ならびにB型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス抗原の存在の陽性結果、またはB型肝炎ウイルス抗原に特異的な抗体の存在の陽性結果に伴って、インフルエンザ様疾病、衰弱、疼痛、頭痛、発熱、食欲不振、下痢、悪心嘔吐、身体の肝臓範囲にわたる疼痛、粘土色または灰色の便、全身のそう痒感、および濃い色の尿のうちのいずれかまたは全てを含み得る症状を有する状態が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV mRNA発現を減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、この化合物または組成物は、HBVを標的とする、10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、動物におけるHBV mRNA発現の減少は、HBV関連疾患、障害、または状態を防止、改善、または治療する。特定の実施形態では、動物におけるHBV mRNA発現の減少は、肝疾患を防止、改善、または治療する。特定の実施形態では、HBV mRNA発現は、少なくとも5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または100%減少される。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBVタンパク質レベルを減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、この化合物または組成物は、HBVを標的とする、10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、動物におけるHBVタンパク質レベルの減少は、HBV関連疾患、障害、または状態を防止、改善、または治療する。特定の実施形態では、動物におけるHBVタンパク質レベルの減少は、肝疾患を防止、改善、または治療する。特定の実施形態では、HBVタンパク質レベルは、少なくとも5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または100%減少される。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV DNAレベルを減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、この化合物または組成物は、HBVを標的とする、10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、動物におけるHBV DNAレベルの減少は、HBV関連疾患、障害、または状態を防止、改善、または治療する。特定の実施形態では、哺乳動物はヒトであってもよく、B型肝炎ウイルスはヒトB型肝炎ウイルスであってもよい。より具体的には、ヒトB型肝炎ウイルスは、ヒト地理的遺伝子型:A(北西欧、北米、中米)、B(インドネシア、中国、ベトナム)、C(東アジア、韓国、中国、日本、ポリネシア、ベトナム)、D(地中海地域、中東、インド)、E(アフリカ)、F(アメリカ先住民、ポリネシア)、G(米国、フランス)、またはH(中米)のいずれであってもよい。特定の実施形態では、動物におけるHBV DNAレベルの減少は、肝疾患を防止、改善、または治療する。特定の実施形態では、HBV DNAレベルは、少なくとも5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または100%減少される。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、動物におけるHBV抗原レベルを減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、この化合物または組成物は、HBVを標的とする、10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、抗原は、HBsAGまたはHBeAGである。特定の実施形態では、動物におけるHBV抗原レベルの減少は、HBV関連疾患、障害、または状態を防止、改善、または治療する。特定の実施形態では、動物におけるHBV抗原レベルの減少は、肝疾患を防止、改善、または治療する。特定の実施形態では、HBV抗原レベルは、少なくとも5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または100%減少される。
特定の実施形態は、本明細書に記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、B型肝炎ウイルスに感染した動物においてHBV DNAおよびHBV抗原を減少させる方法を提供する。特定の実施形態では、この化合物または組成物は、HBVを標的とする、10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、抗原は、HBsAGまたはHBeAGである。特定の実施形態では、市販のELISA系の現在利用可能な検出限界で判定する際に、セロコンバージョンの決定因子としてHBeAgをモニターする場合、血清HBeAgの不在および血清HBeAbの存在と定義され、またはセロコンバージョンの決定因子としてHBsAgをモニターする場合、血清HBsAgの不在として定義される、セロコンバージョンを生じるのに十分な程度、HBV抗原の量を減少させてもよい。
特定の実施形態は、HBV関連疾患、障害、または状態を有する動物を治療するための方法を提供し、この方法は、a)HBV関連疾患、障害、または状態を有する当該動物を特定することと、b)14〜20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドであって、当該修飾オリゴヌクレオチド全体にわたって測定したとき、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363のいずれかに少なくとも90%相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む、治療有効量の化合物または組成物を当該動物に投与することと、を含む。特定の実施形態では、動物に投与される治療有効量の化合物または組成物は、動物におけるHBV関連疾患、障害、もしくは状態、またはその症状を治療または軽減する。特定の実施形態では、HBV関連疾患、障害、または状態は、肝疾患である。特定の実施形態では、この関連疾患、障害、または状態は、慢性HBV感染、黄疸、肝癌、肝臓炎、肝線維症、肝硬変、肝不全、びまん性肝細胞炎症性疾患、血球貪食症候群、血清肝炎、HBVウイルス血症、または移植に関連する肝疾患である。
特定の実施形態は、HBV関連疾患、障害、または状態を有する動物を治療するための方法を提供し、この方法は、a)HBV関連疾患、障害、または状態を有する当該動物を特定することと、b)14〜20個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドであって、当該修飾オリゴヌクレオチド全体にわたって測定したとき、配列番号1に少なくとも90%相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む、治療有効量の化合物または組成物を当該動物に投与することと、を含む。特定の実施形態では、動物に投与される治療有効量の化合物または組成物は、動物において、HBV関連疾患、障害、もしくは状態、またはその症状を治療または軽減する。特定の実施形態では、HBV関連疾患、障害、または状態は、肝疾患である。特定の実施形態では、この関連疾患、障害、または状態は、慢性HBV感染、黄疸、肝癌、肝臓炎、肝線維症、肝硬変、肝不全、びまん性肝細胞炎症性疾患、血球貪食症候群、血清肝炎、HBVウイルス血症、または移植に関連する肝疾患である。
特定の実施形態では、HBVは、GENBANK受託番号U95551.1(配列番号1として本明細書に組み込まれる)に記載される配列、またはその任意の変異体または断片を有する。特定の実施形態では、HBVは、配列番号1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363に記載のヒト配列の切断部分を有する。
特定の実施形態では、動物は、ヒトである。
特定の実施形態では、化合物または組成物は、第1の薬剤として指定される。特定の実施形態では、方法は、第1の薬剤と1つ以上の第2の薬剤とを投与することを含む。特定の実施形態では、方法は、第1の薬剤と1つ以上の第2の薬剤とを投与することを含む。特定の実施形態では、第1の薬剤と1つ以上の第2の薬剤とは同時投与される。特定の実施形態では、第1の薬剤と1つ以上の第2の薬剤とは、順次的にまたは併用的に同時投与される。
特定の実施形態では、1つ以上の第2の薬剤も本明細書に記載の化合物または組成物である。特定の実施形態では、1つ以上の第2の薬剤は、本明細書に記載の化合物または組成物とは異なる。1つ以上の第2の薬剤の例としては、抗炎症剤、化学療法剤、または抗感染剤が挙げられるが、これらに限定されない。
他の関連する実施形態では、付加的な治療薬は、HBV薬剤、HCV薬剤、化学療法剤、抗生物質、鎮痛剤、非ステロイド性抗炎症(NSAID)剤、抗真菌剤、抗寄生虫剤、制嘔吐剤、止痢薬、または免疫抑制剤であってよい。
特定の実施形態では、1つ以上の第2の薬剤はHBV薬剤である。特定の実施形態では、HBV薬剤としては、インターフェロンアルファ−2b、インターフェロンアルファ−2a、およびインターフェロンアルファコン−1(ペグ化または非ペグ化)、リバビリン;HBV RNA複製阻害剤;第2のアンチセンスオリゴマー;HBV治療ワクチン;HBV予防ワクチン;ラミブジン(3TC);エンテカビル(ETV);フマル酸テノホビルジソプロキシル(TDF);テルビブジン(LdT);アデホビル;またはHBV抗体治療薬(モノクローナルまたはポリクローナル)が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態では、1つ以上の第2の薬剤はHCV薬剤である。特定の実施形態では、HBV薬剤としては、インターフェロンアルファ−2b、インターフェロンアルファ−2a、およびインターフェロンアルファコン−1(ペグ化または非ペグ化);リバビリン;HCV RNA複製阻害剤(例えば、ViroPharma社のVP50406シリーズ);HCVアンチセンス薬剤;HCV治療ワクチン;HCVプロテアーゼ阻害剤;HCVヘリカーゼ阻害剤;またはHCVモノクローナルもしくはポリクローナル抗体治療薬が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態では、1つ以上の第2の薬剤は、抗炎症剤(すなわち、炎症軽減療法)である。特定の実施形態では、炎症軽減療法としては、治療的な生活様式の変更、ステロイド剤、NSAID、またはDMARDが挙げられるが、これらに限定されない。ステロイド剤は、副腎皮質ステロイド剤であってもよい。NSAIDは、アスピリン、アセトアミノフェン、イブプロフェン、ナプロキセン、COX阻害剤、インドメタシン等であってもよい。DMARDは、TNF阻害剤、プリン合成阻害剤、カルシニューリン阻害剤、ピリミジン合成阻害剤、スルファサラジン、メトトレキサート等であってもよい。
特定の実施形態では、1つ以上の第2の薬剤は、化学療法剤(すなわち、癌治療剤)である。化学療法剤としては、ダウノルビシン、ダウノマイシン、ダクチノマイシン、ドキソルビシン、エピルビシン、イダルビシン、エソルビシン、ブレオマイシン、マホスファミド、イホスファミド、シトシンアラビノシド、ビス-クロロエチルニトロソウレア、ブスルファン、マイトマイシンC、アクチノマイシンD、ミトラマイシン、プレドニゾン、ヒドロキシプロゲステロン、テストステロン、タモキシフェン、ダカルバジン、プロカルバジン、ヘキサメチルメラミン、ペンタメチルメラミン、ミトキサントロン、アムサクリン、クロラムブシル、メチルシクロヘキシルニトロソウレア、ナイトロジェンマスタード、メルファラン、シクロホスファミド、6−メルカプトプリン、6−チオグアニン、シタラビン(CA)、5−アザシチジン、ヒドロキシウレア、デオキシコホルマイシン、4−ヒドロキシペルオキシシクロホスホラミド、5−フルオロウラシル(5−FU)、5−フルオロデオキシウリジン(5−FUdR)、メトトレキサート(MTX)、コルヒチン、タクソール、ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド、トリメトレキサート、テニポシド、シスプラチン、ゲムシタビン、およびジエチルスチルベストロール(DES)が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態では、1つ以上の第2の薬剤は抗感染剤である。抗感染剤の例としては、抗生物質、抗真菌剤、および抗ウイルス剤が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態では、投与は非経口投与を含む。
特定の実施形態は、B型肝炎ウイルスに感染した哺乳動物中のHBV mRNA、DNA、タンパク質の量、および/またはHBV抗原の量を減少させるための方法であって、治療前の哺乳動物中のHBV mRNA、タンパク質の量およびHBV抗原の量と比較して、B型肝炎ウイルス感染およびB型肝炎抗原を減少させるために、治療有効量の上述の医薬組成物をそれを必要とする哺乳動物に投与することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトであってもよく、B型肝炎ウイルスはヒトB型肝炎ウイルスであってもよい。より具体的には、ヒトB型肝炎ウイルスは、ヒト地理的遺伝子型:A(北西欧、北米、中米)、B(インドネシア、中国、ベトナム)、C(東アジア、韓国、中国、日本、ポリネシア、ベトナム)、D(地中海地域、中東、インド)、E(アフリカ)、F(アメリカ先住民、ポリネシア)、G(米国、フランス)、またはH(中米)のいずれであってもよい。
特定の実施形態では、B型肝炎ウイルスに感染した哺乳動物中のHBV mRNA、DNA、タンパク質の量、および/またはHBV抗原の量を減少させるための方法であって、治療前の哺乳動物中のHBV mRNA、タンパク質の量およびHBV抗原の量と比較して、B型肝炎ウイルス感染およびB型肝炎抗原を減少させるために、治療有効量の上述の医薬組成物をそれを必要とする哺乳動物に投与することを含む、mRNAの量が、修飾アンチセンスオリゴヌクレオチド投与前の量と比較して少なくとも70%減少する方法を提供する。特定の実施形態では、B型肝炎ウイルスに感染した哺乳動物中のHBV mRNA、DNA、タンパク質の量、および/またはHBV抗原の量を減少させるための方法であって、治療前の哺乳動物中のHBV mRNA、タンパク質の量およびHBV抗原の量と比較して、B型肝炎ウイルス感染およびB型肝炎抗原を減少させるために、治療有効量の上述の医薬組成物をそれを必要とする哺乳動物に投与することを含む、mRNAの量が、修飾アンチセンスオリゴヌクレオチド投与前の量と比較して少なくとも75%減少する方法を提供する。特定の実施形態では、B型肝炎ウイルスに感染した哺乳動物中のHBV mRNA、DNA、タンパク質の量、および/またはHBV抗原の量を減少させるための方法であって、治療前の哺乳動物中のHBV mRNA、タンパク質の量およびHBV抗原の量と比較して、B型肝炎ウイルス感染およびB型肝炎抗原を減少させるために、治療有効量の上述の医薬組成物をそれを必要とする哺乳動物に投与することを含む、mRNAの量が、修飾アンチセンスオリゴヌクレオチド投与前の量と比較して少なくとも80%減少する方法を提供する。特定の実施形態では、B型肝炎ウイルスに感染した哺乳動物中のHBV mRNA、DNA、タンパク質の量、および/またはHBV抗原の量を減少させるための方法であって、治療前の哺乳動物中のHBV mRNA、タンパク質の量およびHBV抗原の量と比較して、B型肝炎ウイルス感染およびB型肝炎抗原を減少させるために、治療有効量の上述の医薬組成物をそれを必要とする哺乳動物に投与することを含む、mRNAの量が、修飾アンチセンスオリゴヌクレオチド投与前の量と比較して少なくとも85%減少する方法を提供する。特定の実施形態では、B型肝炎ウイルスに感染した哺乳動物中のHBV mRNA、DNA、タンパク質の量、および/またはHBV抗原の量を減少させるための方法であって、治療前の哺乳動物中のHBV mRNA、タンパク質の量およびHBV抗原の量と比較して、B型肝炎ウイルス感染およびB型肝炎抗原を減少させるために、治療有効量の上述の医薬組成物をそれを必要とする哺乳動物に投与することを含む、mRNAの量が、修飾アンチセンスオリゴヌクレオチド投与前の量と比較して少なくとも90%減少する方法を提供する。特定の実施形態では、B型肝炎ウイルスに感染した哺乳動物中のHBV mRNA、DNA、タンパク質の量、および/またはHBV抗原の量を減少させるための方法であって、治療前の哺乳動物中のHBV mRNA、タンパク質の量およびHBV抗原の量と比較して、B型肝炎ウイルス感染およびB型肝炎抗原を減少させるために、治療有効量の上述の医薬組成物をそれを必要とする哺乳動物に投与することを含む、mRNAの量が、修飾アンチセンスオリゴヌクレオチド投与前の量と比較して少なくとも95%減少する方法を提供する。関連する方法では、HBV抗原はHBsAgまたはHBeAgであってもよく、より具体的には、市販のELISA系の現在利用可能な検出限界で判定する際に、セロコンバージョンの決定因子としてHBeAgをモニターする場合、血清HBeAgの不在および血清HBeAbの存在と定義され、セロコンバージョンの決定因子としてHBsAgをモニターする場合、血清HBsAgの不在として定義される、セロコンバージョンを生じるのに十分な程度、HBV抗原の量を減少させてもよい。
特定の実施形態は、HBVに感染した哺乳動物においてB型肝炎ウイルスのセロコンバージョンを促進するための方法であって、治療有効量の上述の医薬組成物をB型肝炎に感染した哺乳動物に投与することと、哺乳動物の血清試料中のHBeAgおよびHBeAbの存在をモニターすること、または哺乳動物の血清試料中のHBsAgの存在をモニターすることとを含み、市販のELISA系の現在の検出限界で判定した際に、セロコンバージョンの決定因子としてHBeAgをモニターする場合、血清試料中のHBeAgの不在およびHBeAbの存在、またはセロコンバージョンの決定因子としてHBsAgをモニターする場合、血清試料中のHBsAgの不在が、その哺乳動物におけるセロコンバージョンの指標である方法を提供する。
特定の実施形態は、動物における肝疾患またはその症状を防止、改善、または治療するための本明細書に記載の化合物または組成物の使用を提供する。特定の実施形態では、この化合物または組成物は、HBVを標的とする、10〜30個の連結されたヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号17、51、86、93、95、98、100、102、104、106、109、112、115、117、137、140、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、167、168、176、177〜179、181、188、190〜192、194、199、201、208、209、211、226、230〜237、244、245、247、252、254、256、258、260、262、264、266、271、1318〜1347、1364〜1372、1375、1376、および1379の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも10個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物または組成物は、HepG2.2.1細胞に送達したときに、250nM未満、200nM未満、150nM未満、100nM未満、90nM未満、80nM未満、70nM未満、65nM未満、60nM未満、55nM未満、50nM未満、49nM未満、47nM未満、46nM未満のインビトロIC50のうち少なくとも1つを有するため、効果的である。特定の実施形態では、阻害は、本明細書に記載のプライマープローブセットRTS3370を用いて測定される。
特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物または組成物は、HepG2.2.1細胞に送達したときに、250nM未満、200nM未満、100nM未満、90nM未満、80nM未満、70nM未満、60nM未満、50nM未満、40nM未満、35nM未満、34nM未満、33nM未満、32nM未満、31nM未満のインビトロIC50のうち少なくとも1つを有するため、効果的である。特定の実施形態では、阻害は、本明細書に記載のプライマープローブセットRTS3371を用いて測定される。
特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物または組成物は、本明細書に記載のHepG2.2.1細胞に送達したときに、20μM未満、10μM未満、9.5μM未満、9.0μM未満、8.5μM未満、8.0μM未満、7.5μM未満、7.0μM未満、6.5μM未満、6.0μM未満、5.5μM未満、5.0μM未満、4.5μM未満、4.0μM未満、3.5μM未満、3.0μM未満、2.5μM未満のインビトロIC50のうち少なくとも1つを有するため、効果的である。
特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物または組成物は、生理食塩水で処置した動物の4倍、3倍、または2倍以下のALT値またはAST値の増加、あるいは30%、20%、15%、12%、10%、5%、または2%以下の肝臓、脾臓、または腎臓の重量増加のうち少なくとも1つを有することによって示されるように、忍容性が高い。特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物または組成物は、ALTまたはASTが生理食塩水で処置した動物よりも増加していないことによって示されるように、忍容性が高い。特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物または組成物は、肝臓、脾臓、または腎臓の重量が生理食塩水で処置した動物よりも増加していないことによって示されるように、忍容性が高い。特定の実施形態では、これらの化合物または組成物は、ISIS 146779、ISIS 146786、ISIS 505317、ISIS 505329、ISIS 505332、ISIS 505346、ISIS 505347、ISIS 505358、ISIS 509926、ISIS 509927、ISIS 509932、ISIS 509934、ISIS 509960、ISIS 509974、ISIS 510038、ISIS 510039、ISIS 510040、ISIS 510041、ISIS 510050ISIS 509975、ISIS 510100、ISIS 510106、およびISIS 510116を含む。特定の実施形態では、かかる化合物または組成物は、配列番号5〜310、321〜802、または804〜1272のいずれか1つの核酸塩基配列を含む化合物を含む。特定の実施形態では、かかる化合物または組成物は、配列番号5、15、16、33、39〜95、123〜135、163〜175、180〜310、321〜406、413〜455、461〜802、または804〜1272のいずれか1つの核酸塩基配列を含む化合物を含む。特定の実施形態では、かかる化合物または組成物は、配列番号6〜14、17〜32、34〜38、96〜122、136〜162、176〜179、407〜412、456〜462、523〜538(配列番号を更新する)のいずれか1つの核酸塩基配列を含む化合物を含み、この修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、14ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜3個、または2個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、16ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、2〜4個、または3〜4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、18ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、3〜5個、または4個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、20ヌクレオシド長であり、10個の連結されたヌクレオシドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップの5’末端および3’末端に、1〜5個、または5個の糖修飾ヌクレオシドを各々独立して有するウィングセグメントを有する。
特定の実施形態は、動物におけるHBV関連疾患、障害、または状態の治療、改善、遅延、または防止のための薬剤の製造における、本明細書に記載の化合物または組成物の使用を提供する。
特定の実施形態は、動物における肝疾患の治療、改善、遅延、または防止のための薬剤の製造における、本明細書に記載の化合物または組成物の使用を提供する。
特定の実施形態は、本明細書に記載のHBV関連疾患、障害、または状態、あるいはその症状を治療、防止、または改善するためのキットを提供し、このキットは、a)本明細書に記載の化合物または組成物と、場合により、b)本明細書に記載の付加的な薬剤または治療薬とを含む。キットは、HBV関連疾患、障害、または状態を治療、防止、または改善するためにこのキットを使用するための使用説明書またはラベルをさらに含んでもよい。
アンチセンス化合物
オリゴマー化合物としては、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、オリゴヌクレオチド類似体、オリゴヌクレオチド模倣体、アンチセンス化合物、アンチセンスオリゴヌクレオチド、およびsiRNAが挙げられるが、これらに限定されない。オリゴマー化合物は、標的核酸に対する「アンチセンス」であってもよく、これはそれが水素結合によって標的核酸にハイブリダイゼーションすることができることを意味する。
特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、5’から3’の方向で記載したときに、それが標的とする標的核酸の標的セグメントの逆相補体を含む核酸塩基配列を有する。特定のかかる実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、5’から3’の方向で記載したときに、それが標的とする標的核酸の標的セグメントの逆相補体を含む核酸塩基配列を有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、10〜30サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、12〜30サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、12〜22サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、14〜30サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、14〜20サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、15〜30サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、15〜20サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、16〜30サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、16〜20サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、17〜30サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、17〜20サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、18〜30サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、18〜21サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、18〜20サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、20〜30サブユニット長である。言い換えると、かかるアンチセンス化合物はそれぞれ、12〜30個の連結されたサブユニット、14〜30個の連結されたサブユニット、14〜20個のサブユニット、15〜30個のサブユニット、15〜20個のサブユニット、16〜30個のサブユニット、16〜20個のサブユニット、17〜30個のサブユニット、17〜20個のサブユニット、18〜30個のサブユニット、18〜20個のサブユニット、18〜21個のサブユニット、20〜30個のサブユニット、または12〜22個の連結されたサブユニットである。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、14サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、16サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、17サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、18サブユニット長である。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、20サブユニット長である。他の実施形態では、アンチセンス化合物は、8〜80個、12〜50個、13〜30個、13〜50個、14〜30個、14〜50個、15〜30個、15〜50個、16〜30個、16〜50個、17〜30個、17〜50個、18〜22個、18〜24個、18〜30個、18〜50個、19〜22個、19〜30個、19〜50個、または20〜30個の連結されたサブユニットである。特定のかかる実施形態では、アンチセンス化合物は、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、30個、31個、32個、33個、34個、35個、36個、37個、38個、39個、40個、41個、42個、43個、44個、45個、46個、47個、48個、49個、50個、51個、52個、53個、54個、55個、56個、57個、58個、59個、60個、61個、62個、63個、64個、65個、66個、67個、68個、69個、70個、71個、72個、73個、74個、75個、76個、77個、78個、79個、または80個の連結されたサブユニット長、または上記の値のうちのいずれか2つによって画定される範囲である。一部の実施形態では、アンチセンス化合物は、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、連結されたサブユニットは、ヌクレオチドである。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、短縮または切断されていてもよい。例えば、単一のサブユニットを5’末端から欠失させても(5’切断)、あるいは3’末端から欠失させてもよい(3’切断)。HBV核酸を標的とする短縮または切断されたアンチセンス化合物は、2つのサブユニットが、アンチセンス化合物の5’末端から欠失していても、あるいはアンチセンス化合物の3’末端から欠失していてもよい。あるいは、この欠失されるヌクレオシドはアンチセンス化合物全体に分散させてもよく、例えば、アンチセンス化合物中で、5’末端から1個のヌクレオシドが欠失し、3’末端から1個のヌクレオシドが欠失していてもよい。
延長されたアンチセンス化合物中に単一の付加サブユニットが存在するとき、その付加サブユニットは、アンチセンス化合物の5’または3’末端に位置してよい。2つ以上の付加サブユニットが存在するとき、付加されたサブユニットは、互いに隣接していてもよく、例えば、アンチセンス化合物中で、2つのサブユニットが、アンチセンス化合物の5’末端に付加されていても(5’付加)、あるいはアンチセンス化合物の3’末端に付加されてもよい(3’付加)。あるいは、付加されるサブユニットはアンチセンス化合物全体に分散させてもよく、例えば、あるアンチセンス化合物中で、1つのサブユニットが5’末端に付加され、1つのサブユニットが3’末端に付加されていてもよい。
活性を失うことなく、アンチセンスオリゴヌクレオチド等のアンチセンス化合物の長さを増加もしくは減少させること、および/またはミスマッチ塩基を導入することが可能である。例えば、Woolf et al.(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:7305−7309,1992)において、卵母細胞注入モデルで標的RNAの切断を誘導する能力について、13〜25核酸塩基長の一連のアンチセンスオリゴヌクレオチドを試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドの末端付近に8個または11個のミスマッチ塩基を含む、25核酸塩基長のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ミスマッチを含まないアンチセンスオリゴヌクレオチドよりも程度は低かったものの、標的mRNAの特異的切断を導くことができた。同様に、標的特異的切断は、1個または3個のミスマッチを有するものを含む、13核酸塩基アンチセンスオリゴヌクレオチドを用いて達成された。
Gautschi et al.(J.Natl.Cancer Inst.93:463−471,March 2001)は、bcl−2 mRNAに対して100%相補性を有し、bcl−xL mRNAに対して3個のミスマッチを有するオリゴヌクレオチドのbcl−2およびbcl−xL両者の発現をインビトロおよびインビボで減少させる能力を証明した。さらに、このオリゴヌクレオチドは、インビボでの強力な抗腫瘍活性を示した。
Maher and Dolnick(Nuc.Acid.Res.16:3341−3358,1988)は、ウサギ網状赤血球アッセイにおいてヒトDHFRの翻訳を停止させる能力について、一連のタンデム14核酸塩基アンチセンスオリゴヌクレオチドと、これらタンデムアンチセンスオリゴヌクレオチドのうちの2個または3個の配列で構成されるそれぞれ28および42核酸塩基アンチセンスオリゴヌクレオチドを試験した。3つの14核酸塩基アンチセンスオリゴヌクレオチドの各々は、28または42核酸塩基アンチセンスオリゴヌクレオチドよりも軽度なレベルではあるが、単独で翻訳を阻害することができた。
アンチセンス化合物モチーフ
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、向上した阻害活性、増加した標的核酸に対する結合親和性、またはインビボヌクレアーゼによる分解に対する耐性等の特性をアンチセンス化合物に付与する、パターンまたはモチーフに配置された化学修飾サブユニットを有する。
キメラアンチセンス化合物は、典型的には、ヌクレアーゼ分解に対する耐性の増加、細胞取り込みの増加、標的核酸に対する結合親和性の増加、および/または阻害活性の増加を付与するように修飾された、少なくとも1つの領域を含有する。キメラアンチセンス化合物の第2の領域は、場合により、RNA:DNA二重鎖のRNA鎖を切断する細胞性エンドヌクレアーゼであるRNaseHの基質としての役割を果たし得る。
ギャップマーモチーフを有するアンチセンス化合物は、キメラアンチセンス化合物とみなされる。ギャップマーでは、RNaseH切断を支持する複数のヌクレオチドを有する内部領域が、内部領域のヌクレオシドとは化学的に異なる複数のヌクレオチドを有する外部領域間に位置する。ギャップマーモチーフを有するアンチセンスオリゴヌクレオチドの場合、ウィングセグメントが修飾ヌクレオシドを含む一方、ギャップセグメントは、一般にエンドヌクレアーゼ切断の基質としての役割を果たす。特定の実施形態では、ギャップマーの領域は、各々異なる領域を含む糖部分の種類によって区別される。ギャップマーの領域を区別するために使用される糖部分の種類として、一部の実施形態では、β−D−リボヌクレオシド、β−D−デオキシリボヌクレオシド、2’−修飾ヌクレオシド(かかる2’−修飾ヌクレオシドは、とりわけ2’−MOE、および2’−O−CH3を含み得る)、および二環式糖修飾ヌクレオシド(かかる二環式糖修飾ヌクレオシドは、拘束エチルを有するものを含み得る)を挙げることができる。特定の実施形態では、ウィング中のヌクレオシドは、例えば、2’−MOE、および拘束エチルまたはLNA等の二環式糖部分を含む、いくつかの修飾糖部分を含んでもよい。特定の実施形態では、ウィングは、いくつかの修飾および非修飾糖部分を含んでもよい。特定の実施形態では、ウィングは、2’−MOEヌクレオシド、拘束エチルヌクレオシドまたはLNAヌクレオシド等の二環式糖部分、および2’−デオキシヌクレオシドの種々の組み合わせを含んでもよい。
各々の異なる領域は、均一の糖部分、変異体、または交互の糖部分を含んでもよい。ウィング−ギャップ−ウィングモチーフは、しばしば「X−Y−Z」と記載され、式中、「X」は、5’ウィングの長さを表し、「Y」は、ギャップの長さを表し、「Z」は、3’ウィングの長さを表す。「X」および「Z」は、均一、変異型、または交互の糖部分を含んでもよい。特定の実施形態では、「X」および「Y」は、1つ以上の2’−デオキシヌクレオシドを含んでもよい。「Y」は、2’−デオキシヌクレオシドを含んでもよい。本明細書で使用する際、「X−Y−Z」として記載されるギャップマーは、ギャップが5’ウィングおよび3’ウィングの各々に直接隣接して位置付けられるような立体配置を有する。したがって、5’ウィングとギャップ、またはギャップと3’ウィングとの間に、介在ヌクレオチドは存在しない。本明細書に記載のいずれのアンチセンス化合物もギャップマーモチーフを有してよい。特定の実施形態では、「X」および「Z」は同一であり、他の実施形態では、これらは異なる。特定の実施形態では、「Y」は、8〜15個のヌクレオシドである。X、Y、またはZは、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、25個、30個、またはそれ以上のヌクレオシドのいずれであってもよい。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、1−9−1のモチーフを有する、11−merである。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、1−9−2、2−9−1、または1−10−1のモチーフを有する、12−merである。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、1−9−3、2−9−2、3−9−1、1−10−2、または2−10−1のモチーフを有する、13−merである。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、1−9−4、2−9−3、3−9−2、4−9−1、1−10−3、2−10−2、または3−10−1のモチーフを有する、14−merである。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、1−9−5、2−9−4、3−9−3、4−9−2、5−9−1、1−10−4、2−10−3、3−10−2、または4−10−1のモチーフを有する、15−merである。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、4−8−4、2−9−5、3−9−4、4−9−3、5−9−2、1−10−5、2−10−4、3−10−3、4−10−2、3−8−5、または5−10−1のモチーフを有する、16−merである。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、3−9−5、3−10−4、4−9−4、5−9−3、2−10−5、3−10−4、4−10−3、5−10−2、2−9−6、5−8−4、5−7−5、6−7−4、または6−9−2のモチーフを有する、17−merである。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、4−9−5、5−9−4、3−10−5、4−10−4、または5−10−3のモチーフを有する、18−merである。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、5−9−5、4−10−5、または5−10−4のモチーフを有する、19−merである。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるギャップマーは、例えば、5−10−5、2−10−8、8−10−2、3−10−7、7−10−3、4−10−6、または6−10−4のモチーフを有する、20−merである。
特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、ウィング−ギャップまたはギャップ−ウィング立体配置、すなわち、ギャップマー立体配置について上述したようなX−YまたはY−Z立体配置を有する「ウィングマー」モチーフを有する。したがって、本明細書において提供されるウィングマー立体配置としては、例えば、5−10、8−4、4−12、12−4、3−14、16−2、18−1、10−3、2−10、1−10、8−2、2−13、5−13、5−8、または6−8が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、2−10−2ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、3−10−3ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、4−10−4ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、5−10−5ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、3−10−4ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、2−10−4ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、2−10−8ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、8−10−2ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、3−10−7ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、7−10−3ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、4−10−6ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、6−10−4ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、2−9−6ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、6−9−2ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、4−9−4ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、5−9−3ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、3−9−5ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、5−9−2ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、2−9−5ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、4−9−3ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、3−9−4ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、ギャップ拡張モチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、ギャップが6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、または16個の連結されたヌクレオシドからなる、ギャップマーモチーフを有する。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、以下の糖モチーフのいずれかを有し:
k−d(10)−k
e−d(10)−k
k−d(10)−e
k−k−d(10)−k−k
k−k−d(10)−e−e
e−e−d(10)−k−k
k−k−k−d(10)−k−k−k
e−e−e−d(10)−k−k−k
k−k−k−d(10)−e−e−e
k−k−k−d(10)−k−k−k
e−k−k−d(10)−k−k−e
e−e−k−d(10)−k−k−e
e−d−k−d(10)−k−k−e
e−k−d(10)−k−e−k−e
k−d(10)−k−e−k−e−e
e−e−k−d(10)−k−e−k−e
e−d−d−k−d(9)−k−k−e
e−e−e−e−d(9)−k−k−e
e−e−e−e−e−d(10)−e−e−e−e−e
k−d−k−d−k−d(9)−e−e
e−e−k−k−d(9)−e−k−e−e
k−d−k−d−k−d(10)−e−e−e−e−e
k−e−k−d(10)−k−e−k
e−e−e−k−k−d(8)−e−e−e−e
e−e−e−k−k−d(7)−k−k−e−e−e
e−e−e−k−d(9)−k−e−e−e
e−e−e−k−k−d(7)−k−k−e−e−e
e−e−e−e−k−k−d(7)−e−e−e−e
e−k−e−k−d(9)−e−e−e−e
e−k−e−k−d−k−d(7)−e−e−e−e
e−e−e−k−k−d(7)−k−k−e−e−e
k−d−k−d−k−d(8)−e−e−e−e−e
式中、kは、拘束エチルヌクレオシドであり、eは、2’−MOE置換ヌクレオシドであり、dは、2’−デオキシヌクレオシドである。
特定の実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下の式Aによって記載される糖モチーフを有する:(J)m−(B)n−(J)p−(B)r−(A)t−(D)g−(A)v−(B)w−(J)x−(B)y−(J)z
式中、
各Aは、独立して、2’−置換ヌクレオシドであり、
各Bは、独立して、二環式ヌクレオシドであり、
各Jは、独立して、2’−置換ヌクレオシドまたは2’−デオキシヌクレオシドのいずれかであり、
各Dは、2’−デオキシヌクレオシドであり、
mは0〜4であり、nは0〜2であり、pは0〜2であり、rは0〜2であり、tは0〜2であり、vは0〜2であり、wは0〜4であり、xは0〜2であり、yは0〜2であり、zは0〜4であり、gは6〜14であり、
ただし、
m、n、およびrのうち少なくとも1つは、0以外であり、
wおよびyのうち少なくとも1つは、0以外であり、
m、n、p、r、およびtの合計は、2〜5であり、
v、w、x、y、およびzの合計は、2〜5である。
標的核酸、標的領域、およびヌクレオチド配列
HBVをコードするヌクレオチド配列には、限定するものではないが、GENBANK受託番号U95551.1(配列番号1として本明細書に組み込まれる)が含まれる。
本明細書に含まれる実施例において、各配列番号に記載される配列は、糖部分、ヌクレオシド間結合、または核酸塩基に対するいかなる修飾とも無関係であると理解されたい。したがって、配列番号によって定義されるアンチセンス化合物は、糖部分、ヌクレオシド間結合、または核酸塩基に対する1つ以上の修飾を独立して含んでもよい。Isis番号(IsisN o)によって記載されるアンチセンス化合物は、核酸塩基配列およびモチーフの組み合わせを示す。
特定の実施形態では、標的領域は、標的核酸の構造的に規定される領域である。例えば、標的領域は、3’UTR、5’UTR、エクソン、イントロン、エクソン/イントロン接合部、コード領域、翻訳開始領域、翻訳終結領域、または他の規定される核酸領域を包含し得る。HBVの構造的に規定される領域は、NCBI等の配列データベースから受託番号によって入手可能であり、かかる情報は参照することによって本明細書に組み込まれる。特定の実施形態では、標的領域は、標的領域内の1つの標的セグメントの5’標的部位から、同じ標的領域内の別の標的セグメントの3’標的部位までの配列を包含し得る。
標的とすることには、所望の効果を生じるようにアンチセンス化合物がハイブリダイズする、少なくとも1つの標的セグメントの決定を含む。特定の実施形態では、所望の効果は、mRNA標的核酸レベルの減少である。特定の実施形態では、所望の効果は、標的核酸によってコードされるタンパク質のレベルの低下、または標的核酸に関連する表現型の変化である。
標的領域は、1つ以上の標的セグメントを含んでもよい。標的領域内の複数の標的セグメントは、重複していてもよい。あるいは、これらは重複していなくてもよい。特定の実施形態では、標的領域内の標的セグメントは、約300個以下のヌクレオチドによって分離されている。特定の実施形態では、標的領域内の標的セグメントは、標的核酸上の多数のヌクレオチドによって分離されており、この数は、(約)250個、200個、150個、100個、90個、80個、70個、60個、50個、40個、30個、20個、または10個(以下)、あるいは前述の値のうちのいずれか2つによって画定される範囲である。特定の実施形態では、標的領域内の標的セグメントは、標的核酸上の5個以下または約5個以下のヌクレオチドによって分離されている。特定の実施形態では、標的セグメントは連続的である。本明細書に記載する5’標的部位または3’標的部位のいずれかである、開始核酸を有する範囲によって画定される標的領域が企図されている。
好適な標的セグメントは、5’UTR、コード領域、3’UTR、イントロン、エクソン、またはエクソン/イントロン接合部内に認めることができる。開始コドンまたは終止コドンを含有する標的セグメントも、好適な標的セグメントである。好適な標的セグメントは、特定の構造的に規定される領域、例えば開始コドンまたは終止コドンを特異的に除外してもよい。
好適な標的セグメントの決定は、標的核酸の配列を他の配列とゲノム全体で比較することを含み得る。例えば、BLASTアルゴリズムを使用して、異なる核酸間の類似領域を特定することができる。この比較により、選択される標的核酸以外の配列(すなわち、非標的またはオフターゲット配列)に非特異的にハイブリダイズする可能性があるアンチセンス化合物配列の選択を防ぐことができる。
アンチセンス化合物の活性(例えば、標的核酸レベルの減少率によって定義される)は、活性標的領域内で変動し得る。特定の実施形態では、HBV mRNAレベルの減少がHBV発現の阻害を示す。また、HBVタンパク質レベルの減少も標的mRNA発現の阻害を示す。さらに、表現型の変化は、HBV発現の阻害を示す。特定の実施形態では、疲労の軽減、インフルエンザ様症状の軽減、食欲増加、悪心の軽減、関節痛の軽減、黄疸の軽減、腹部痛の軽減、衰弱の軽減、体重減少の軽減、男性の乳房肥大の軽減、手のひらの発疹の軽減、血液凝固困難の軽減、硬変の軽減、皮膚のクモ状血管の軽減、ビタミンAおよびDの吸収増加、腫瘍成長の低下、腫瘍体積の減少、頭痛の軽減、発熱の軽減、下痢の軽減、身体の肝臓範囲にわたる疼痛の軽減、粘土色または灰色の便の軽減、そう痒の軽減、濃い色の尿の軽減、および悪心嘔吐の軽減は、HBV発現の阻害を示し得、特定の実施形態では、HBV関連状態、疾患、および障害に付随する症状の改善は、HBV発現の阻害を示し得る。特定の実施形態では、硬変の軽減がHBV発現の阻害を示す。特定の実施形態では、肝癌マーカーの減少がHBV発現の阻害を示し得る。
ハイブリダイゼーション
一部の実施形態では、ハイブリダイゼーションは、本明細書に記載されるアンチセンス化合物とHBV核酸との間で生じる。最も一般的なハイブリダイゼーションの機序は、核酸分子の相補的核酸塩基間での水素結合(例えば、ワトソン・クリック、フーグスティーン、または逆フーグスティーン水素結合)を含む。
ハイブリダイゼーションは、様々な条件下で生じ得る。ストリンジェント条件は、配列依存的であり、ハイブリダイズされる核酸分子の性質および組成によって決定される。
ある配列が標的核酸に特異的にハイブリダイズ可能であるかどうかを決定する方法は、当該技術分野において周知である。特定の実施形態では、本明細書において提供されるアンチセンス化合物は、HBV核酸に特異的にハイブリダイズ可能である。
相補性
十分な数のアンチセンス化合物の核酸塩基が標的核酸の対応する核酸塩基と水素結合することができるとき、アンチセンス化合物と標的核酸とは互いに相補的であり、所望の効果が生じることになる(例えば、HBV核酸等の標的核酸のアンチセンス阻害)。
アンチセンス化合物とHBV核酸との間の非相補的核酸塩基は、アンチセンス化合物が標的核酸に依然として特異的にハイブリダイズすることができるのであれば、容認することができる。さらに、アンチセンス化合物は、介在セグメントまたは隣接セグメント(例えば、ループ構造、ミスマッチ、またはヘアピン構造)がハイブリダイゼーション事象に関与しないように、HBV核酸1つ以上のセグメントにわたってハイブリダイズしてもよい。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるアンチセンス化合物、またはその特定の部分は、HBV核酸、その標的領域、標的セグメント、または特定の部分に、少なくとも、70%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%相補的である。アンチセンス化合物の標的核酸との相補性パーセントは、常法を使用して決定することができる。
例えば、アンチセンス化合物の20個の核酸塩基中18個が標的領域に相補的であり、したがって特異的にハイブリダイズすることになるアンチセンス化合物は、90%の相補性を表すことになる。本例では、残りの非相補的核酸塩基は、相補的核酸塩基とクラスターを形成しても、相補的核酸塩基が散在していてもよく、互いまたは相補的核酸塩基と隣接している必要はない。したがって、標的核酸との完全な相補性を有する2つの領域が隣接する4つの非相補的核酸塩基を有する、18核酸塩基長のアンチセンス化合物は、標的核酸と77.8%の全体相補性を有することになり、したがって本発明の範囲に含まれることになる。標的核酸のある領域とアンチセンス化合物の相補性パーセントは、当該技術分野において既知のBLASTプログラム(基本ローカルアラインメント検索ツール)およびPowerBLASTプログラム(Altschul et al.,J.Mol.Biol.,1990,215,403 410、Zhang and Madden,Genome Res.,1997,7,649 656)を使用して、常法により定量化することができる。相同性パーセント、配列同一性または相補性は、例えば、SmithおよびWatermanのアルゴリズム(Adv.Appl.Math.,1981,2,482 489)を用いたデフォルト設定を使用するGapプログラム(Wisconsin Sequence Analysis Package,Version 8 for Unix,Genetics Computer Group,University Research Park,Madison Wis.)によって決定することができる。
特定の実施形態では、本明細書において提供されるアンチセンス化合物またはその特定の部分は、標的核酸またはその特定の部分に完全に相補的(すなわち、100%相補的)である。例えば、アンチセンス化合物は、HBV核酸、またはその標的領域、または標的セグメント、または標的配列に完全に相補的であり得る。本明細書で使用する際、「完全に相補的」とは、アンチセンス化合物の各核酸塩基が、標的核酸の対応する核酸塩基と正確に塩基対合することが可能であることを意味する。例えば、20核酸塩基アンチセンス化合物は、このアンチセンス化合物に完全に相補的である標的核酸の対応する20核酸塩基部分が存在する限り、400核酸塩基長の標的配列に完全に相補的である。完全に相補的はまた、第1および/または第2の核酸の特定の部分に関連して使用することもできる。例えば、30核酸塩基アンチセンス化合物の20核酸塩基部分は、400核酸塩基長の標的配列に「完全に相補的」であり得る。この30核酸塩基オリゴヌクレオチドの20核酸塩基部分は、標的配列が対応する20核酸塩基部分を有し、各核酸塩基がアンチセンス化合物の20核酸塩基部分に相補的である場合、標的配列に完全に相補的である。同時に、30核酸塩基アンチセンス化合物全体は、そのアンチセンス化合物の残りの10核酸塩基も標的配列に相補的であるかどうかに応じて、標的配列に完全に相補的であり得るか、またはあり得ない。
非相補的核酸塩基の位置は、アンチセンス化合物の5’末端または3’末端であってよい。あるいは、1つまたは複数の非相補的核酸塩基は、アンチセンス化合物の内部位置にあってよい。2つ以上の非相補的核酸塩基が存在するとき、これらは連続的(すなわち、連結された)であっても、または非連続的であってもよい。一実施形態では、非相補的核酸塩基は、ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチドのウィングセグメント内に位置する。
特定の実施形態では、11、12、13、14、15、16、17、18、19、もしくは20核酸塩基長、または最大11、12、13、14、15、16、17、18、19、もしくは20核酸塩基長のアンチセンス化合物は、HBV核酸等の標的核酸またはその特定の部分に対して、4個以下、3個以下、2個以下、または1個以下の非相補的核酸塩基を含む。
特定の実施形態では、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、もしくは30核酸塩基長、または最大11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、もしくは30核酸塩基長のアンチセンス化合物は、HBV核酸等の標的核酸またはその特定の部分に対して、6個以下、5個以下、4個以下、3個以下、2個以下、または1個以下の非相補的核酸塩基を含む。
提供されるアンチセンス化合物には、標的核酸の部分に相補的なものも含まれる。本明細書で使用する際、「部分」とは、標的核酸の領域またはセグメント内の規定の数の連続(すなわち、連結)核酸塩基を指す。「部分」はまた、アンチセンス化合物の規定の数の連続核酸塩基も指し得る。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも8核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも9核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも10核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも11核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも12核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも13核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも14核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも15核酸塩基部分に相補的である。また、標的セグメントの少なくとも9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、またはそれ以上、あるいはこれらの値のうちのいずれか2つによって画定される範囲の核酸塩基部分に相補的なアンチセンス化合物も企図されている。
同一性
本明細書において提供されるアンチセンス化合物は、特定のヌクレオチド配列、配列番号、または特定のIsis番号で表される化合物、あるいはそれらの部分に対して、規定の同一性パーセントを有し得る。本明細書で使用する際、アンチセンス化合物は、同じ核酸塩基対合能力を有する場合、本明細書に開示される配列と同一である。例えば、開示されるDNA配列中のチミジンの代わりにウラシルを含有するRNAは、ウラシルおよびチミジンの両者がアデニンと対合することから、そのDNA配列と同一であるとみなされることになる。本明細書に記載のアンチセンス化合物の短縮型または延長型、ならびに本明細書において提供するアンチセンス化合物に対して非同一塩基を有する化合物も企図される。この非同一塩基は、互いに隣接していても、またはアンチセンス化合物全体に分散していてもよい。アンチセンス化合物の同一性パーセントは、比較される配列に対する、同一塩基対合を有する塩基の数に従って計算される。
特定の実施形態では、アンチセンス化合物またはその部分は、本明細書に開示されるアンチセンス化合物または配列番号、あるいはそれらの部分のうちの1つ以上に対して、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である。
特定の実施形態では、アンチセンス化合物の部分は、標的核酸の等長部分と比較される。特定の実施形態では、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25核酸塩基部分が、標的核酸の等長部分と比較される。
特定の実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドの部分は、標的核酸の等長部分と比較される。特定の実施形態では、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25核酸塩基部分が、標的核酸の等長部分と比較される。
修飾
ヌクレオシドは、塩基−糖の組み合わせである。ヌクレオシドの核酸塩基(塩基としても知られる)部分は、通常は、複素環式塩基部分である。ヌクレオチドは、ヌクレオシドの糖部分に共有結合したリン酸基をさらに含むヌクレオシドである。ペントフラノシル糖を含むヌクレオシドでは、リン酸基は、糖の2’、3’、または5’ヒドロキシル部分に連結可能である。オリゴヌクレオチドは、互いに隣接するヌクレオシドの共有結合によって形成され、直鎖ポリマーオリゴヌクレオチドを形成する。オリゴヌクレオチド構造の内部で、リン酸基は、一般に、オリゴヌクレオチドのヌクレオシド間連結を形成するとみなされている。
アンチセンス化合物に対する修飾には、ヌクレオシド間連結、糖部分、または核酸塩基に対する置換あるいは変更が含まれる。修飾アンチセンス化合物は、多くの場合、例えば、細胞取り込みの強化、核酸標的への親和性の強化、ヌクレアーゼ存在下での安定性の増加、または阻害活性の増加等の望ましい特性により、天然型よりも好ましい。
化学修飾ヌクレオシドはまた、短縮または切断されたアンチセンスオリゴヌクレオチドのその標的核酸に対する結合親和性を増加させるために利用することもできる。結果として、かかる化学修飾ヌクレオシドを有するより短いアンチセンス化合物を用いて、多くの場合、同等の結果を得ることができる。
修飾ヌクレオシド間連結
RNAおよびDNAの天然に存在するヌクレオシド間連結は、3’−5’リン酸ジエステル連結である。1つ以上の修飾された、すなわち非天然のヌクレオシド間結合を有するアンチセンス化合物は、多くの場合、例えば、細胞取り込みの強化、核酸標的に対する親和性の強化、およびヌクレアーゼ存在下での安定性の増加等の望ましい特性により、天然に存在するヌクレオシド間連結を有するアンチセンス化合物よりも選択される。
修飾ヌクレオシド間連結を有するオリゴヌクレオチドには、リン原子を保持するヌクレオシド間連結、ならびにリン原子を有さないヌクレオシド間連結が含まれる。代表的なリン含有ヌクレオシド間連結としては、ホスホジエステル、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホロアミデート、およびホスホロチオエートが挙げられるが、これらに限定されない。リン含有および非リン含有連結の調製方法は周知である。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、1つ以上の修飾ヌクレオシド間連結を含む。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物の各ヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結である。
修飾糖部分
本明細書において提供されるアンチセンス化合物は、場合により、糖基が修飾されている1つ以上のヌクレオシドを含んでもよい。かかる糖修飾ヌクレオシドは、ヌクレアーゼ安定性の強化、結合親和性の増加、または他の何らかの有益な生物学的特性をアンチセンス化合物に付与し得る。特定の実施形態では、ヌクレオシドは、化学修飾リボフラノース環部分を含む。化学修飾リボフラノース環の例としては、限定するものではないが、置換基(5’および2’置換基を含む)の付加、非ジェミナル環原子の架橋形成による二環式核酸(BNA)の形成、リボシル環酸素原子のS、N(R)、またはC(R1)(R)2(R=H、C1−C12アルキル、または保護基)での置換、およびそれらの組み合わせが挙げられる。化学修飾糖の例として、2’−F−5’−メチル置換ヌクレオシド(他の開示されている5’,2’−ビス置換ヌクレオシドについては、2008年8月21日公開のPCT国際出願第2008/101157号を参照)、リボシル環酸素原子のSでの置換と2’位でのさらなる置換(2005年6月16日公開の公開米国特許出願第2005/0130923号を参照)、または代替として、BNAの5’置換(LNAが、例えば5’−メチル基または5’−ビニル基で置換される、2007年11月22日公開のPCT国際出願第2007/134181号を参照)が挙げられる。
修飾糖部分を有するヌクレオシドの例としては、限定するものではないが、5’−ビニル、5’−メチル(RまたはS)、4’−S、2’−F、2’−OCH3、および2’−O(CH2)2OCH3置換基を含む、ヌクレオシドが挙げられる。2’位の置換基はまた、アリル、アミノ、アジド、チオ、O−アリル、O−C1−C10アルキル、OCF3、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2−O−N(Rm)(Rn)、およびO−CH2−C(=O)−N(Rm)(Rn)から選択することができ、各RmおよびRnは、独立して、Hまたは置換または非置換C1−C10アルキルである。
本明細書で使用する際、「二環式ヌクレオシド」は、二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを指す。二環式ヌクレオシドの例としては、限定するものではないが、4’リボシル環原子と2’リボシル環原子との間に架橋を含むヌクレオシドが挙げられる。特定の実施形態では、本明細書において提供されるアンチセンス化合物は、1つ以上の二環式ヌクレオシドを含み、この架橋は、4’−2’二環式ヌクレオシドを含む。かかる4’−2’二環式ヌクレオシドの例としては、次の式のうちの1つが挙げられるが、これらに限定されない:4’−(CH2)−O−2’(LNA);4’−(CH2)−S−2’;4’−(CH2)2−O−2’(ENA);4’−CH(CH3)−O−2’(cEt)および4’−CH(CH2OCH3)−O−2’、ならびにそれらの類似体(2008年7月15日発行の米国特許第7,399,845号を参照);4’−C(CH3)(CH3)−O−2’およびその類似体(2009年1月8日公開の公開PCT国際出願第2009/006478号を参照);4’−CH2−N(OCH3)−2’およびその類似体(2008年12月11日公開の公開PCT国際出願第2008/150729号を参照);4’−CH2−O−N(CH3)−2’(2004年9月2日公開の公開米国特許出願第2004/0171570号を参照);4’−CH2−N(R)−O−2’(式中、Rは、H、C1−C12アルキル、または保護基である)(2008年9月23日発行の米国特許第7,427,672号を参照);4’−CH2−C(H)(CH3)−2’(Chattopadhyaya,et al.,J.Org.Chem.,2009,74,118−134を参照);ならびに4’−CH2−C(=CH2)−2’およびその類似体(2008年12月8日公開の公開PCT国際出願第2008/154401号を参照)。また、例えば:Singh et al.,Chem.Commun.,1998,4,455−456、Koshkin et al.,Tetrahedron,1998,54,3607−3630、Wahlestedt et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,2000,97,5633−5638、Kumar et al.,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1998,8,2219−2222、Singh et al.,J.Org.Chem.,1998,63,10035−10039、Srivastava et al.,J.Am.Chem.Soc.,129(26)8362−8379(Jul.4,2007)、Elayadi et al.,Curr.Opinion Invens.Drugs,2001,2,558−561、Braasch et al.,Chem.Biol.,2001,8,1−7、Orum et al.,Curr.Opinion Mol.Ther.,2001,3,239−243、米国特許第6,670,461号、第7,053,207号、第6,268,490号、第6,770,748号、第6,794,499号、第7,034,133号、第6,525,191号、第7,399,845号、公開PCT国際出願第2004/106356号、第94/14226号、第2005/021570号、および第2007/134181号、米国特許出願第2004/0171570号、第2007/0287831号、および第2008/0039618号、ならびに米国特許第12/129,154号、第60/989,574号、第61/026,995号、第61/026,998号、第61/056,564号、第61/086,231号、第61/097,787号、および第61/099,844号、ならびにPCT国際出願第PCT/US2008/064591号、第PCT/US2008/066154号、および第PCT/US2008/068922号を参照されたい。前述の二環式ヌクレオシドの各々は、例えば、α−L−リボフラノースおよびβ−D−リボフラノースを含む、1つ以上の立体化学的な糖立体配置を有するように調製することができる(国際公開第99/14226号として1999年3月25日に公開されたPCT国際出願第PCT/DK98/00393号を参照)。
特定の実施形態では、BNAヌクレオシドの二環式糖部分としては、ペントフラノシル糖部分の4’位と2’位との間に少なくとも1つの架橋を有する化合物であって、かかる架橋が、独立して、[C(Ra)(Rb)]n−、−C(Ra)=C(Rb)−、−C(Ra)=N−、−C(=NRa)−、−C(=O)−、−C(=S)−、−O−、−Si(Ra)2−、−S(=O)x−、および−N(Ra)−
(式中、
xは、0、1、または2であり、
nは、1、2、3、または4であり、
各RaおよびRbは、独立して、H、保護基、ヒドロキシル、C1−C12アルキル、置換C1−C12アルキル、C2−C12アルケニル、置換C2−C12アルケニル、C2−C12アルキニル、置換C2−C12アルキニル、C5−C20アリール、置換C5−C20アリール、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、C5−C7脂環式ラジカル、置換C5−C7脂環式ラジカル、ハロゲン、OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、アシル(C(=O)−H)、置換アシル、CN、スルホニル(S(=O)2−J1)、またはスルホキシル(S(=O)−J1)であり、
各J1およびJ2は、独立して、H、C1−C12アルキル、置換C1−C12アルキル、C2−C12アルケニル、置換C2−C12アルケニル、C2−C12アルキニル、置換C2−C12アルキニル、C5−C20アリール、置換C5−C20アリール、アシル(C(=O)−H)、置換アシル、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、C1−C12アミノアルキル、置換C1−C12アミノアルキル、または保護基である)から独立して選択される1個または2〜4個の連結基を含む化合物が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態では、二環式糖部分の架橋は、−[C(Ra)(Rb)]n−、−[C(Ra)(Rb)]n−O−、−C(RaRb)−N(R)−O−、または-C(RaRb)−O−N(R)−である。特定の実施形態では、この架橋は、4’−CH2−2’、4’−(CH2)2−2’、4’−(CH2)3−2’、4’−CH2−O−2’、4’−(CH2)2−O−2’、4’−CH2−O−N(R)−2’、および4’−CH2−N(R)−O−2’−であり、式中、各Rは、独立して、H、保護基、またはC1−C12アルキルである。
特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは、異性体立体配置によってさらに定義される。例えば、4’−2’メチレン−オキシ架橋を含むヌクレオシドは、α−L立体配置またはβ−D立体配置であってもよい。以前は、α−L−メチレンオキシ(4’−CH2−O−2’)BNAは、アンチセンス活性を示すアンチセンスオリゴヌクレオチド中に組み込まれていた(Frieden et al.,Nucleic Acids Research,2003,21,6365−6372)。
特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドとしては、以下に示すような、(A)α−L−メチレンオキシ(4’−CH
2−O−2’)BNA、(B)β−D−メチレンオキシ(4’−CH
2−O−2’)BNA、(C)エチレンオキシ(4’−(CH
2)
2−O−2’)BNA、(D)アミノオキシ(4’−CH
2−O−N(R)−2’)BNA、(E)オキシアミノ(4’−CH
2−N(R)−O−2’)BNA、(F)メチル(メチレンオキシ)(4’−CH(CH
3)−O−2’)BNA、(G)メチレン−チオ(4’−CH
2−S−2’)BNA、(H)メチレン−アミノ(4’−CH2−N(R)−2’)BNA、(I)メチル炭素環式(4’−CH
2−CH(CH
3)−2’)BNA、および(J)プロピレン炭素環式(4’−(CH
2)
3−2’)BNAが挙げられるが、これらに限定されない。
(式中、Bxは、塩基部分であり、Rは独立して、H、保護基、またはC
1−C
12アルキルである)。
特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは、式I:
を有し、
式中、
Bxは、複素環式塩基部分であり、
−Q
a−Q
b−Q
c−は、−CH
2−N(R
c)−CH
2−、−C(=O)−N(R
c)−CH
2−、−CH
2−O−N(R
c)−、−CH
2−N(R
c)−O−、または−N(R
c)−O−CH
2であり、
R
cは、C
1−C
12アルキルまたはアミノ保護基であり、
T
aおよびT
bは各々、独立して、H、ヒドロキシル保護基、共役基、反応性リン基、リン部分、または支持体との共有結合である。
特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは、式II:
を有し、
式中、
Bxは、複素環式塩基部分であり、
T
aおよびT
bは各々、独立して、H、ヒドロキシル保護基、共役基、反応性リン基、リン部分、または支持体との共有結合であり、
Z
aは、C
1−C
6アルキル、C
2−C
6アルケニル、C
2−C
6アルキニル、置換C
1−C
6アルキル、置換C
2−C
6アルケニル、置換C
2−C
6アルキニル、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオである。
一実施形態では、置換される基は各々、独立して、ハロゲン、オキソ、ヒドロキシル、OJc、NJcJd、SJc、N3、OC(=X)Jc、およびNJeC(=X)NJcJdから独立して選択される置換基で一置換または多置換され、式中、各Jc、JdおよびJeは、独立して、H、C1−C6アルキル、または置換C1−C6アルキルであり、Xは、OまたはNJcである。
特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは、式III:
を有し、
式中、
Bxは、複素環式塩基部分であり、
T
aおよびT
bは各々、独立して、H、ヒドロキシル保護基、共役基、反応性リン基、リン部分、または支持体との共有結合であり、
Z
bは、C
1−C
6アルキル、C
2−C
6アルケニル、C
2−C
6アルキニル、置換C
1−C
6アルキル、置換C
2−C
6アルケニル、置換C
2−C
6アルキニル、または置換アシル(C(=O)−)である。
特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは、式IV:
を有し、
式中、
Bxは、複素環式塩基部分であり、
T
aおよびT
bは各々、独立して、H、ヒドロキシル保護基、共役基、反応性リン基、リン部分、または支持体との共有結合であり、
R
dは、C
1−C
6アルキル、置換C
1−C
6アルキル、C
2−C
6アルケニル、置換C
2−C
6アルケニル、C
2−C
6アルキニル、または置換C
2−C
6アルキニルであり、
各q
a、q
b、q
c、およびq
dは、独立して、H、ハロゲン、C
1−C
6アルキル、置換C
1−C
6アルキル、C
2−C
6アルケニル、置換C
2−C
6アルケニル、C
2−C
6アルキニル、または置換C
2−C
6アルキニル、C
1−C
6アルコキシル、置換C
1−C
6アルコキシル、アシル、置換アシル、C
1−C
6アミノアルキル、または置換C
1−C
6アミノアルキルである。
特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは、式V:
を有し、
式中、
Bxは、複素環式塩基部分であり、
T
aおよびT
bは各々、独立して、H、ヒドロキシル保護基、共役基、反応性リン基、リン部分、または支持体との共有結合であり、
q
a、q
b、q
e、およびq
fは各々、独立して、水素、ハロゲン、C
1−C
12アルキル、置換C
1−C
12アルキル、C
2−C
12アルケニル、置換C
2−C
12アルケニル、C
2−C
12アルキニル、置換C
2−C
12アルキニル、C
1−C
12アルコキシ、置換C
1−C
12アルコキシ、OJ
j、SJ
j、SOJ
j、SO
2J
j、NJ
jJ
k、N
3、CN、C(=O)OJ
j、C(=O)NJ
jJ
k、C(=O)J
j、O−C(=O)NJ
jJ
k、N(H)C(=NH)NJ
jJ
k、N(H)C(=O)NJ
jJ
k、またはN(H)C(=S)NJ
jJ
kであり、
あるいはq
eおよびq
fは、一緒になって=C(q
g)(q
h)であり、
q
gおよびq
hは各々、独立して、H、ハロゲン、C
1−C
12アルキル、または置換C
1−C
12アルキルである。
メチレンオキシ(4’−CH2−O−2’)BNAモノマーである、アデニン、シトシン、グアニン、5−メチル−シトシン、チミン、およびウラシルの合成および調製、ならびにそれらのオリゴマー化および核酸認識特性について記載されている(例えば、Koshkin et al.,Tetrahedron,1998,54,3607−3630を参照)。BNAおよびその調製は、国際公開第98/39352号および第99/14226号にも記載されている。
メチレンオキシ(4’−CH2−O−2’)BNAの類似体、メチレンオキシ(4’−CH2−O−2’)BNA、および2’−チオ−BNAも調製されている(例えば、Kumar et al.,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1998,8,2219−2222を参照)。核酸ポリメラーゼの基質としてオリゴデオキシリボヌクレオチド二重鎖を含むロックドヌクレオシド類似体の調製についても記載されている(例えば、Wengel et al.,国際公開第99/14226号を参照)。さらに、新規の立体配置制限された高親和性オリゴヌクレオチド類似体である2’−アミノ−BNAの合成について、当該技術分野で記載されている(例えば、Singh et al.,J.Org.Chem.,1998,63,10035−10039)。さらに、2’−アミノ−BNAおよび2’−メチルアミノ−BNAが調製されており、相補的RNA鎖およびDNA鎖を含むその二重鎖の熱安定性がすでに報告されている。
特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは、式VI:
を有し、
式中、
Bxは、複素環式塩基部分であり、
T
aおよびT
bは各々、独立して、H、ヒドロキシル保護基、共役基、反応性リン基、リン部分、または支持体との共有結合であり、
各q
i、q
j、q
k、およびq
lは、独立して、H、ハロゲン、C
1−C
12アルキル、置換C
1−C
12アルキル、C
2−C
12アルケニル、置換C
2−C
12アルケニル、C
2−C
12アルキニル、置換C
2−C
12アルキニル、C
1−C
12アルコキシ、置換C
1−C
12アルコキシ、OJ
j、SJ
j、SOJ
j、SO
2J
j、NJ
jJ
k、N
3、CN、C(=O)OJ
j、C(=O)NJ
jJ
k、C(=O)J
j、O−C(=O)NJ
jJ
k、N(H)C(=NH)NJ
jJ
k、N(H)C(=O)NJ
jJ
k、またはN(H)C(=S)NJ
jJ
kであり、
q
iおよびq
j、またはq
lおよびq
kは、一緒になって=C(q
g)(q
h)であり、q
gおよびq
hは各々、独立して、H、ハロゲン、C
1−C
12アルキル、または置換C
1−C
12アルキルである。
4’−(CH2)3−2’架橋を有する1つの炭素環式二環式ヌクレオシドおよび架橋4’−CH=CH−CH2−2’であるアルケニル類似体が記載されている(例えば、Freier et al.,Nucleic Acids Research,1997,25(22),4429−4443、およびAlbaek et al.,J.Org.Chem.,2006,71,7731−7740を参照)。炭素環式二環式ヌクレオシドの合成および調製、ならびにそれらのオリゴマー化および生化学的研究についても記載されている(例えば、Srivastava et al.,J.Am.Chem.Soc.2007,129(26),8362−8379を参照)。
本明細書で使用する際、「二環式ヌクレオシド」とは、糖環の2つの炭素原子を接続する架橋を含み、それにより二環式糖部分を形成するヌクレオシドを指す。特定の実施形態では、この架橋は、糖環の2’炭素と別の炭素とを接続する。
本明細書で使用する際、「4’−2’二環式ヌクレオシド」または「4’〜2’二環式ヌクレオシド」とは、2’炭素原子と4’炭素原子とを接続する架橋を含むフラノース環を含む二環式ヌクレオシドを指す。
本明細書で使用する際、「単環式ヌクレオシド」とは、二環式糖部分ではない修飾糖部分を含むヌクレオシドを指す。特定の実施形態では、ヌクレオシドの糖部分、または糖部分類似体は、任意の位置において修飾または置換されてもよい。
本明細書で使用する際、「2’−修飾糖」とは、2’位で修飾されたフラノシル糖を意味する。特定の実施形態では、かかる修飾は、置換および非置換アルコキシ、置換および非置換チオアルキル、置換および非置換アミノアルキル、置換および非置換アルキル、置換および非置換アリル、ならびに置換および非置換アルキニルを含むが、これらに限定されないハロゲン化物から選択される置換基を含む。特定の実施形態では、2’修飾は、O[(CH2)nO]mCH3、O(CH2)nNH2、O(CH2)nCH3、O(CH2)nONH2、OCH2C(=O)N(H)CH3、およびO(CH2)nON[(CH2)nCH3]2を含むが、これらに限定されない置換基から選択され、式中、nおよびmは、1〜約10である。また、他の2’−置換基は、C1−C12アルキル、置換アルキル、アルケニル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O−アルカリルもしくはO−アラルキル、SH、SCH3、OCN、Cl、Br、CN、CF3、OCF3、SOCH3、SO2CH3、ONO2、NO2、N3、NH2、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリル、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ、置換シリル、RNA切断基、レポーター基、インターカレータ、薬物動態特性を改善するための基、およびアンチセンス化合物の薬力学的特性を改善するための基、ならびに同様の特性を有する他の置換基から選択してもよい。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2’−MOE側鎖を含む(例えば、Baker et al.,J.Biol.Chem.,1997,272,11944−12000を参照)。かかる2’−MOE置換は、非修飾ヌクレオシド、および他の修飾ヌクレオシド、例えば2’−O−メチル、O−プロピル、およびO−アミノプロピルと比較して、改善された結合親和性を有するとされている。また、2’−MOE置換基を有するオリゴヌクレオチドは、インビボ使用のための有望な特徴を有する、遺伝子発現のアンチセンス阻害物質であることも示されている(例えば、Martin,P.,Helv.Chim.Acta,1995,78,486−504、Altmann et al.,Chimia,1996,50,168−176、Altmann et al.,Biochem.Soc.Trans.,1996,24,630−637、およびAltmann et al.,Nucleosides Nucleotides,1997,16,917−926を参照)。
本明細書で使用する際、「修飾テトラヒドロピランヌクレオシド」または「修飾THPヌクレオシド」とは、通常のヌクレオシド中のペントフラノシル残基の代わりに挿入された6員テトラヒドロピラン「糖」(糖代用物)を有するヌクレオシドを意味する。修飾THPヌクレオシドとしては、当該技術分野でヘキシトール核酸(HNA)、アニトール(anitol)核酸(ANA)、マニトール(manitol)核酸(MNA)(Leumann,CJ.Bioorg.& Med.Chem.(2002) 10:841−854を参照)、フルオロHNA(F−HNA)と称されるもの、または式X:
式X:
(式中、式Xの当該少なくとも1つのテトラヒドロピランヌクレオシド類似体の各々について、独立して、
Bxは、複素環式塩基部分であり、
T
3およびT
4は各々、独立して、テトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物に連結させるヌクレオシド間連結基であるか、あるいはT
3およびT
4の一方が、テトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物に連結させるヌクレオシド間連結基であり、T
3およびT
4の他方が、H、ヒドロキシル保護基、連結共役基、または5’もしくは3’−末端基であり、
q
1、q
2、q
3、q
4、q
5、q
6、およびq
7は各々、独立して、H、C
1−C
6アルキル、置換C
1−C
6アルキル、C
2−C
6アルケニル、置換C
2−C
6アルケニル、C
2−C
6アルキニル、または置換C
2−C
6アルキニルであり、
R
1およびR
2の一方は水素であり、他方はハロゲン、置換または非置換アルコキシ、NJ
1J
2、SJ
1、N
3、OC(=X)J
1、OC(=X)NJ
1J
2、NJ
3C(=X)NJ
1J
2、およびCNから選択され、式中、Xは、O、S、またはNJ
1であり、各J
1、J
2、およびJ
3は、独立して、HまたはC
1−C
6アルキルである)を有する化合物が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態では、qm、qn、qp、qr、qs、qt、およびquが各々Hである、式Xの修飾THPヌクレオシドが提供される。特定の実施形態では、qm、qn、qp、qr、qs、qt、およびquの少なくとも1つはH以外である。特定の実施形態では、qm、qn、qp、qr、qs、qt、およびquの少なくとも1つはメチルである。特定の実施形態では、R1およびR2の1つがFである、式XのTHPヌクレオシドが提供される。特定の実施形態では、R1はフルオロであり、かつR2はHであり、R1はメトキシであり、かつR2はHであり、ならびにR1はメトキシエトキシであり、かつR2はHである。
本明細書で使用する際、「2’−修飾ヌクレオシド」または「2’−置換ヌクレオシド」とは、HまたはOH以外のフラノース環の2’位に置換基を含む糖を含むヌクレオシドを指す。2’−修飾ヌクレオシドとしては、糖環の2つの炭素原子を接続する架橋が糖環の2’炭素と別の炭素とを接続する二環式ヌクレオシド、ならびにアリル、アミノ、アジド、チオ、O−アリル、O−C1−C10アルキル、−OCF3、O−(CH2)2−O−CH3、2’−O(CH2)2SCH3、O−(CH2)2−O−N(Rm)(Rn)、またはO−CH2−C(=O)−N(Rm)(Rn)(式中、各RmおよびRnは、独立して、H、または置換もしくは非置換C1−C10アルキルである)等の非架橋2’置換基を含むヌクレオシドが挙げられるが、これらに限定されない。2’修飾ヌクレオシドはさらに、例えば、糖の他の位置におけるおよび/または核酸塩基における、他の修飾を含んでもよい。
本明細書で使用する際、「2’−F」とは、2’位にフルオロ基を含む糖を指す。
本明細書で使用する際、「2’−OMe」または「2’−OCH3」または「2’−O−メチル」は各々、糖環の2’位に−OCH3基を含む糖を含むヌクレオシドを指す。
本明細書で使用する際、「オリゴヌクレオチド」とは、複数の連結されたヌクレオシドを含む化合物を指す。特定の実施形態では、複数のヌクレオシドのうちの1つ以上が修飾されている。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、1つ以上のリボヌクレオシド(RNA)および/またはデオキシリボヌクレオシド(DNA)を含む。
アンチセンス化合物に取り込むためのヌクレオシドを修飾するために使用できる、多くの他の二環式および三環式糖代用環系も当該技術分野で既知である(例えば、総説:Leumann,J.C,Bioorganic & Medicinal Chemistry,2002,10,841−854を参照)。かかる環系に様々な付加的な置換を行って活性を向上させてもよい。
修飾糖の調製のための方法は、当業者に周知である。
修飾糖部分を有するヌクレオチドにおいて、核酸塩基部分(天然、修飾、またはそれらの組み合わせ)は、適切な核酸標的とのハイブリダイゼーションのために維持される。
特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、修飾糖部分を有する1つ以上のヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、修飾糖部分は2’−MOEである。特定の実施形態では、2’−MOE修飾ヌクレオチドは、ギャップマーモチーフに配置される。特定の実施形態では、修飾糖部分はcEtである。特定の実施形態では、cEt修飾ヌクレオチドは、ギャップマーモチーフのウィング全体に配置される。
組成物および医薬組成物を製剤化するための方法
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、医薬組成物または製剤の調製のために、薬学的に許容される活性または不活性物質と混合してもよい。組成物および医薬組成物の製剤化のための方法は、投与経路、疾患の程度、または投与すべき用量を含むがこれらに限定されない、いくつかの基準によって決まる。
HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物は、アンチセンス化合物を好適な薬学的に許容される希釈剤または担体と組み合わせることによって、医薬組成物に利用することができる。薬学的に許容される希釈剤としては、リン酸緩衝食塩水(PBS)が挙げられる。PBSは、非経口的に送達される組成物での使用に好適な希釈剤である。したがって、一実施形態において、本明細書に記載される方法で使用されるのは、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物と、薬学的に許容される希釈剤とを含む医薬組成物である。特定の実施形態では、薬学的に許容される希釈剤はPBSである。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、アンチセンスオリゴヌクレオチドである。
アンチセンス化合物を含む医薬組成物は、任意の薬学的に許容される塩、エステル、またはかかるエステルの塩、あるいは任意の他のオリゴヌクレオチドが含まれ、これらはヒトを含む動物への投与時に、生物活性代謝産物またはその残留物を(直接または間接的に)提供することができる。したがって、例えば、本開示はまた、アンチセンス化合物の薬学的に許容される塩、プロドラッグ、かかるプロドラッグの薬学的に許容される塩、および他の生物学的同等物に引用される。好適な薬学的に許容される塩として、ナトリウム塩とカリウム塩が挙げられるが、それらに限定されない。
プロドラッグは、アンチセンス化合物の一端または両端への付加的なヌクレオシドの組み込みを含んでもよく、これは身体内で内因性ヌクレアーゼによって切断されて、活性アンチセンス化合物を形成する。
共役アンチセンス化合物
アンチセンス化合物は、結果として生じるアンチセンスオリゴヌクレオチドの活性、細胞分布、または細胞取り込みを強化する1つ以上の部分または共役体と共有結合されてもよい。典型的な共役基としては、コレステロール部分および脂質部分が挙げられる。さらなる共役基としては、炭水化物、リン脂質、ビオチン、フェナジン、葉酸、フェナントリジン、アントラキノン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、および色素が挙げられる。
アンチセンス化合物また、例えば、一般にアンチセンス化合物の一末端または両末端に結合される1つ以上の安定化基を有するように修飾して、ヌクレアーゼ安定性等の特性を向上させることができる。安定化基に含まれるのは、キャップ構造である。これらの末端修飾は、末端核酸を有するアンチセンス化合物をエクソヌクレアーゼ分解から保護し、送達および/または細胞内局在化を支援し得る。キャップは、5’−末端(5’−キャップ)または3’−末端(3’−キャップ)に存在してもよく、あるいは両末端に存在してもよい。キャップ構造は、当該技術分野において周知であり、例えば、逆位デオキシ脱塩基キャップが挙げられる。さらに、アンチセンス化合物の一端または両端をキャップしてヌクレアーゼ安定性を付与するために使用可能なさらなる3’および5’−安定化基としては、2003年1月16日公開の国際公開第03/004602号に開示されているものが挙げられる。
細胞培養とアンチセンス化合物処理
HBV核酸のレベル、活性、または発現に対するアンチセンス化合物の効果は、様々な細胞型でインビトロで試験することができる。かかる分析に使用する細胞型は、市販業者(例えば、American Type Culture Collection,Manassus,VA、Zen−Bio,Inc.,Research Triangle Park,NC、Clonetics Corporation,Walkersville,MD)から入手可能であり、市販の試薬(例えば、Invitrogen Life Technologies,Carlsbad,CA)を用いて、業者の指示に従って培養される。例示的な細胞型としては、HuVEC細胞、b.END細胞、HepG2細胞、Hep3B細胞、および初代肝細胞が挙げられるが、これらに限定されない。
アンチセンスオリゴヌクレオチドのインビトロ試験
アンチセンスオリゴヌクレオチドで細胞を処理するための方法が本明細書に記載され、これは他のアンチセンス化合物での処理のために適切に修正することができる。
培養細胞がおよそ60〜80%の集密度に達したときに、細胞をアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理してもよい。
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞に導入するために一般に使用される1つの試薬には、カチオン性脂質トランスフェクション試薬LIPOFECTIN(Invitrogen,Carlsbad,CA)がある。アンチセンスオリゴヌクレオチドをOPTI−MEM1(Invitrogen,Carlsbad,CA)中のLIPOFECTINと混合して、アンチセンスオリゴヌクレオチドの所望の最終濃度と、アンチセンスオリゴヌクレオチド100nM当たり2〜12μg/mLの範囲であってよいLIPOFECTIN濃度を達成し得る。
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞に導入するために使用される別の試薬には、LIPOFECTAMINE(Invitrogen,Carlsbad,CA)がある。アンチセンスオリゴヌクレオチドをOPTI−MEM1低濃度血清培地(Invitrogen,Carlsbad,CA)中のLIPOFECTAMINEと混合して、アンチセンスオリゴヌクレオチドの所望の濃度と、アンチセンスオリゴヌクレオチド100nM当たり2〜12μg/mLの範囲であってよいLIPOFECTAMINE濃度を達成する。
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞へ導入するために使用される別の技法としては、エレクトロポレーションが挙げられる。
常法によって、細胞をアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理する。アンチセンスオリゴヌクレオチド処理後16〜24時間で細胞を採取し、この時点で、当該技術分野において既知であり、本明細書に記載される方法によって、標的核酸のRNAまたはタンパク質レベルを測定する。一般に、処理を複数回実施するとき、データは、その反復処理の平均として提示する。
使用するアンチセンスオリゴヌクレオチドの濃度は、細胞株間で異なる。特定の細胞株に最適なアンチセンスオリゴヌクレオチド濃度を決定する方法は、当該技術分野において周知である。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、典型的には、LIPOFECTAMINEでトランスフェクトする場合、1nM〜300nMの範囲の濃度で使用される。エレクトロポレーションを用いてトランスフェクトする場合には、625〜20,000nMの範囲のより高い濃度でアンチセンスオリゴヌクレオチドを使用する。
RNA単離
RNA分析は、全細胞RNAまたはポリ(A)+mRNAで実施することができる。RNA単離方法は、当該技術分野で周知である。RNAは、当該技術分野で周知の方法を用いて、例えば、製造業者の推奨プロトコルに従ってTRIZOL Reagent(Invitrogen,Carlsbad,CA)を使用して、調製される。
標的レベルまたは発現の阻害の分析
HBV核酸のレベルまたは発現の阻害は、当該技術分野において既知の様々な方法でアッセイすることができる。例えば、標的核酸レベルは、例えばノーザンブロット分析、競合的ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、または定量的リアルタイムPCRによって定量化することができる。RNA分析は、全細胞RNAまたはポリ(A)+mRNAに実施することができる。RNA単離方法は、当該技術分野で周知である。ノーザンブロット分析も、当該技術分野では常法である。定量的リアルタイムPCRは、好都合なことに、市販のABI PRISM 7600、7700、または7900 Sequence Detection System(PE−Applied Biosystems(Foster City,CA)から入手可能であり、製造業者の指示に従って使用される)を使用して達成することができる。
標的RNAレベルの定量的リアルタイムPCR分析
標的RNAレベルの定量化は、ABI PRISM 7600、7700、または7900 Sequence Detection System(PE−Applied Biosystems,Foster City,CA)を製造業者の指示に従って使用する、定量的リアルタイムPCRによって達成することができる。定量的リアルタイムPCRの方法は、当該技術分野において周知である。
リアルタイムPCRに先立って、単離したRNAを逆転写酵素(RT)反応に供し、これにより相補的DNA(cDNA)を産生し、その後これをリアルタイムPCR増幅の基質として使用する。RT反応とリアルタイムPCR反応とは、同じ試料ウェルで順次実施する。RTおよびリアルタイムPCRの試薬は、Invitrogen(Carlsbad,CA)から入手できる。RTリアルタイム−PCR反応は、当業者に周知の方法によって行う。
リアルタイムPCRによって得られる遺伝子(またはRNA)標的の量は、シクロフィリンA等、その発現が一定である遺伝子の発現レベルを使用して、またはRIBOGREEN(Invitrogen,Inc.Carlsbad,CA)を使用して全RNAを定量化することによって正規化する。シクロフィリンAの発現は、標的と同時に、多重化して、または別個に実行することによって、リアルタイムPCRにより定量化する。全RNAは、RIBOGREEN RNA定量化試薬(Invetrogen,Inc.Eugene,OR)を使用して定量化する。RIBOGREENによるRNA定量化の方法は、Jones,L.J.,et al,(Analytical Biochemistry,1998,265,368−374)に教示されている。CYTOFLUOR 4000機器(PE Applied Biosystems)を使用して、RIBOGREEN蛍光を測定する。
HBV核酸にハイブリダイズするようにプローブおよびプライマーを設計する。リアルタイムPCRプローブおよびプライマーを設計するための方法は、当該技術分野で周知であり、PRIMER EXPRESS Software(Applied Biosystems,Foster City,CA)等のソフトウェアの使用を含んでもよい。
標的DNAレベルの定量的リアルタイムPCR分析
標的DNAレベルの定量化は、ABI PRISM 7600、7700、または7900 Sequence Detection System(PE−Applied Biosystems,Foster City,CA)を製造業者の指示に従って使用する、定量的リアルタイムPCRによって達成することができる。定量的リアルタイムPCRの方法は、当該技術分野において周知である。
リアルタイムPCRによって得られる遺伝子(またはDNA)標的の量は、シクロフィリンAのような、その発現が一定である遺伝子の発現レベルを使用して、またはRIBOGREEN(Invitrogen,Inc.Carlsbad,CA)を使用して全DNAを定量化することによって、正規化する。シクロフィリンAの発現は、標的と同時に、多重化して、または別個に実行することによって、リアルタイムPCRにより定量化する。全DNAは、RIBOGREEN RNA定量化試薬(Invetrogen,Inc.Eugene,OR)を使用して定量化する。RIBOGREENによるDNA定量化の方法は、Jones,L.J.,et al,(Analytical Biochemistry,1998,265,368−374)に教示されている。CYTOFLUOR 4000機器(PE Applied Biosystems)を使用して、RIBOGREEN蛍光を測定する。
HBV核酸にハイブリダイズするようにプローブおよびプライマーを設計する。リアルタイムPCRプローブおよびプライマーを設計するための方法は、当該技術分野で周知であり、PRIMER EXPRESS Software(Applied Biosystems,Foster City,CA)等のソフトウェアの使用を含んでもよい。
タンパク質レベルの分析
HBV核酸のアンチセンス阻害は、HBVタンパク質レベルを測定することによって判定することができる。HBVのタンパク質レベルは、免疫沈降、ウエスタンブロット分析(免疫ブロット法)、酵素結合免疫測定法(ELISA)、定量的タンパク質アッセイ、タンパク質活性アッセイ(例えば、カスパーゼ活性アッセイ)、免疫組織化学、免疫細胞化学、または蛍光標識細胞分取(FACS)等、当該技術分野で周知の様々な方法で評価または定量化することができる。標的を対象とする抗体は、MSRS抗体カタログ(Aerie Corporation,Birmingham,MI)等の多様な供給源から特定および入手することができ、あるいは当該技術分野で周知の従来のモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体作製法により製造することができる。
アンチセンス化合物のインビボ試験
アンチセンス化合物、例えばアンチセンスオリゴヌクレオチドを動物で試験して、HBVの発現を阻害し、表現型の変化をもたらすその能力を判定する。試験は、正常な動物または実験用疾患モデルで実施することができる。動物に投与するために、アンチセンスオリゴヌクレオチドを薬学的に許容される希釈剤、例えばリン酸緩衝食塩水に配合した。投与には、非経口投与経路、例えば、腹腔内、静脈内、皮下、髄腔内、および脳室内が含まれる。アンチセンスオリゴヌクレオチド投薬量および投与頻度の計算は、当業者の能力の範囲内であり、投与経路および動物の体重等の因子に依存する。アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処置期間後、肝組織からRNAを単離し、HBV核酸発現の変化を測定する。HBV DNAレベルの変化も測定する。HBVタンパク質レベルの変化も測定する。HBV HBeAGレベルの変化も測定する。HBV HBsAGレベルの変化も測定する。
特定の適応症
特定の実施形態では、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物を投与することを含む、個人を治療する方法、化合物、および組成物が本明細書において提供される。特定の実施形態では、個人はHBV関連状態を有する。特定の実施形態では、慢性HBV感染、炎症、線維症、硬変、肝癌、血清肝炎、黄疸、肝癌、肝臓炎、肝線維症、肝硬変、肝不全、びまん性肝細胞炎症性疾患、血球貪食症候群、血清肝炎、およびHBVウイルス血症。特定の実施形態では、HBV関連状態は、B型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス抗原の存在の陽性結果、またはB型肝炎ウイルス抗原に特異的な抗体の存在の陽性結果に伴って、インフルエンザ様疾病、衰弱、疼痛、頭痛、発熱、食欲不振、下痢、黄疸、悪心嘔吐、身体の肝臓範囲にわたる疼痛、粘土色または灰色の便、全身のそう痒感、および濃い色の尿のうちのいずれかまたは全てを含み得るものを有してもよい。特定の実施形態では、個人はHBV関連状態の危険性がある。これには、B型肝炎ウイルスに感染した個人への性的暴露、B型肝炎ウイルス終生感染症を有する個人と同じ家での生活、B型肝炎ウイルスに感染したヒト血液への暴露、違法薬物の注射、血友病患者であること、およびB型肝炎が一般的な地域の訪問を含む、HBV関連状態を発症する1つ以上の危険因子を有する個人が含まれる。特定の実施形態では、個人は、HBV関連状態の治療の必要があると特定されている。特定の実施形態では、個人においてHBV発現を予防的に減少させる方法が本明細書において提供される。特定の実施形態には、HBV核酸を標的とする治療有効量のアンチセンス化合物を個人に投与することによって、それを必要とする個人を治療することを含む。
重複する伝染経路により、多くの人々がB型肝炎ウイルス(HBV)とC型肝炎ウイルス(HCV)との双方に暴露され、これより低い割合の人々が両方のウイルスに慢性的に感染しているが、これは特にHBVが風土病であるアジア等の地域で生じる。推定によると、HCVを有する人々の最大10%がHBVも有する可能性があり、一方HBVを有する人々の恐らく20%がHCVにも同時感染していることが示唆される。しかしながら、HBV−HCV同時感染した個人におけるB型肝炎の治療またはB型肝炎についてはそれほど研究されていない。HCVおよびHBVが互いの複製を阻害すると考えられ(全ての研究でこの相互作用が観察されたわけではないが)、これが治療を困難にしている。したがって、完全にHBVを阻害する治療は、HCVを再発生させる可能性があり、逆もまた同様である。したがって、本明細書に記載の化合物および組成物は、HBVおよびHCVの双方に感染している患者を治療するために有利に使用することができる。C型肝炎(HCV)の代表的な治療選択肢としては、インターフェロン、例えば、インターフェロンアルファ−2b、インターフェロンアルファ−2a、およびインターフェロンアルファコン−1が挙げられる。ペグ化インターフェロン(その薬物動態プロファイルを改善するポリエチレングリコール部分に結合したインターフェロン)を使用して、より低頻度のインターフェロン投与を達成することも可能である。インターフェロンアルファ−2b(ペグ化および非ペグ化)とリバビリンとの併用療法も、一部の患者集団に対して効果的であることが示されている。現在開発されている他の薬剤としては、HCV RNA複製阻害剤(例えば、ViroPharma社のVP50406シリーズ)、HCVアンチセンス薬剤、HCV治療ワクチン、HCVプロテアーゼ阻害剤、HCVヘリカーゼ阻害剤、およびHCV抗体治療薬(モノクローナルまたはポリクローナル)が挙げられる。
特定の実施形態では、本明細書に記載の方法、化合物、および組成物による治療は、B型肝炎ウイルスの存在に付随するHBV関連状態を防止するために有用である。特定の実施形態では、本明細書に記載の方法、化合物、および組成物による治療は、HBV関連状態を防止するために有用である。
一実施形態では、HBV核酸を標的とする治療有効量のアンチセンス化合物の投与と同時に、個人の血清中のHBV mRNAレベルをモニターし、アンチセンス化合物の投与に対する個人の応答を判定する。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とする治療有効量のアンチセンス化合物の投与と同時に、個人の血清中のHBV DNAレベルをモニターし、アンチセンス化合物の投与に対する個人の応答を判定する。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とする治療有効量のアンチセンス化合物の投与と同時に、個人の血清中のHBVタンパク質レベルをモニターし、アンチセンス化合物の投与に対する個人の応答を判定する。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とする治療有効量のアンチセンス化合物の投与と同時に、個人の血清中のHBV S抗原(HBsAg)レベルをモニターし、アンチセンス化合物の投与に対する個人の応答を判定する。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とする治療有効量のアンチセンス化合物の投与と同時に、個人の血清中のHBV E抗原(HBeAg)レベルをモニターし、アンチセンス化合物の投与に対する個人の応答を判定する。アンチセンス化合物の投与に対する個人の応答は、治療介入の量および期間を決定するために、医師により使用される。
特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物の投与は、少なくとも15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または99%、あるいはこれらの値のうちのいずれか2つにより画定される範囲のHBV発現の減少をもたらす。特定の実施形態では、HBV核酸を標的とするアンチセンス化合物の投与は、HBV関連状態に付随する症状の軽減、および血液中のHBV関連マーカーの減少をもたらす。特定の実施形態では、HBVアンチセンス化合物の投与は、HBV RNAレベル、HBV DNAレベル、HBVタンパク質レベル、HBsAgレベル、またはHBeAgレベルを少なくとも15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または99%、あるいはこれらの値のうちのいずれか2つにより画定される範囲で低下させる。
特定の実施形態では、HBVを標的とするアンチセンス化合物を含む医薬組成物は、HBV関連状態を患っている、またはこれを起こしやすい患者を治療するための薬剤の調製に使用される。
特定の併用療法
特定の実施形態では、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物は、1つ以上の他の医薬品と同時投与される。特定の実施形態では、かかる1つ以上の他の医薬品は、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物と同じ疾患、障害、または状態を治療することを目的としている。特定の実施形態では、かかる1つ以上の他の医薬品は、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物とは異なる疾患、障害、または状態を治療することを目的としている。特定の実施形態では、かかる1つ以上の他の医薬品は、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物の望ましくない副作用を治療することを目的としている。特定の実施形態では、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物は、他の医薬品の望ましくない効果を治療するために、別の医薬品と同時投与される。特定の実施形態では、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物は、併用効果を引き起こすために、別の医薬品と同時投与される。特定の実施形態では、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物は、相乗効果を引き起こすために、別の医薬品と同時投与される。
特定の実施形態では、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物と1つ以上の他の医薬品とは、同時に投与される。特定の実施形態では、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物と1つ以上の他の医薬品とは、異なる時間に投与される。特定の実施形態では、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物と1つ以上の他の医薬品とは、一緒に単一製剤に調製される。特定の実施形態では、本明細書において提供される1つ以上の医薬組成物と1つ以上の他の医薬品とは、別個に調製される。特定の実施形態では、開示されるアンチセンスオリゴヌクレオチドは、HCV薬剤と組み合わせて投与される。さらなる実施形態では、HCV化合物はアンチセンス化合物と同時に投与され、他の実施形態では、HCV薬剤およびアンチセンス化合物の各々の用量がやがて患者の体内で重複するように、HCV化合物は別個に投与される。関連する実施形態では、HCV薬剤は、インターフェロンアルファ−2b、インターフェロンアルファ−2a、およびインターフェロンアルファコン−1(ペグ化または非ペグ化);リバビリン;HCV RNA複製阻害剤(例えば、ViroPharma社のVP50406シリーズ);HCVアンチセンス薬剤;HCV治療ワクチン;HCVプロテアーゼ阻害剤;HCVヘリカーゼ阻害剤;およびHCV抗体治療薬(モノクローナルまたはポリクローナル)から選択することができる。
他の実施形態では、本発明のHBVアンチセンス化合物は、1つ以上のHBV治療薬と組み合わせて、HBV感染患者に投与してもよく、この1つ以上のHBV治療薬は、HBV ASO化合物と同じ製剤として投与してもよく、または別個の製剤として投与してもよい。1つ以上のHBV治療薬は、ASO HBV化合物と同時に投与してもよく、またはHBV ASO化合物およびHBV治療薬の各々の用量がやがて患者の体内で重複するように、別個に投与してもよい。関連する実施形態では、1つ以上のHBV治療薬は、インターフェロンアルファ−2b、インターフェロンアルファ−2a、およびインターフェロンアルファコン−1(ペグ化または非ペグ化)、リバビリン;HBV RNA複製阻害剤;第2のHBVアンチセンス化合物;HBV治療ワクチン;HBV予防ワクチン;ラミブジン(3TC);エンテカビル;テノホビル;テルビブジン(LdT);アデホビル;およびHBV抗体治療薬(モノクローナルまたはポリクローナル)から選択することができる。
ある態様において、本発明は以下であってもよい。
[態様1]10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号5〜310、321〜802、804〜1272、または1288〜1350、1364〜1372、1375、1376、および1379の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも8個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む、化合物。
[態様2]10〜30個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾オリゴヌクレオチドが配列番号1に相補的である、化合物。
[態様3]前記修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号1に少なくとも96%相補的である、態様1または2に記載の化合物。
[態様4]前記修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号1に少なくとも97%相補的である、態様1または2に記載の化合物。
[態様5]前記修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号1に少なくとも98%相補的である、態様1または2に記載の化合物。
[態様6]前記修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号1に少なくとも99%相補的である、態様1または2に記載の化合物。
[態様7]前記修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号1に100%相補的である、態様1または2に記載の化合物。
[態様8]1本鎖修飾オリゴヌクレオチドからなる、態様1または2に記載の化合物。
[態様9]少なくとも1つのヌクレオシド間連結が修飾ヌクレオシド間連結である、態様1または2に記載の化合物。
[態様10]各ヌクレオシド間連結がホスホロチオエートヌクレオシド間連結である、態様9に記載の化合物。
[態様11]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドが修飾糖を含む、態様1または2に記載の化合物。
[態様12]前記少なくとも1つの修飾糖が二環式糖である、態様11に記載の化合物。
[態様13]少なくとも1つの修飾糖が2’−O−メトキシエチル基を含む、態様11に記載の化合物。
[態様14]前記修飾糖が2’−O(CH2)2−OCH3基を含む、態様11に記載の化合物。
[態様15]前記修飾糖が4’−CH(CH3)−O−2’基を含む、態様11に記載の化合物。
[態様16]少なくとも1つのヌクレオシドが修飾核酸塩基を含む、態様1または2に記載の化合物。
[態様17]前記修飾核酸塩基が5−メチルシトシンである、態様16に記載の化合物。
[態様18]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが修飾糖を含む、態様1または2に記載の化合物。
[態様19]前記ギャップセグメントが、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、または16個の連結されたヌクレオシドからなる、態様18に記載の化合物。
[態様20]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
2〜3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
3〜4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが2’−O−メトキシエチル糖または拘束エチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結がホスホロチオエート連結である、態様18に記載の化合物。
[態様21]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
3個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが2’−O−メトキシエチル糖または拘束エチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結がホスホロチオエート連結である、態様20に記載の化合物。
[態様22]前記5’ウィングセグメントの前記3個の連結されたヌクレオシドの各々が、2’−O−メトキシエチル糖を含み、前記3’ウィングセグメントの前記3個の連結されたヌクレオシドの各々が、拘束エチル糖を含む、態様21に記載の化合物。
[態様23]前記5’ウィングセグメントの前記3個の連結されたヌクレオシドが、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル糖、および拘束エチル糖を含み、前記3’ウィングセグメントの前記3個の連結されたヌクレオシドが、5’から3’の方向で、拘束エチル糖、拘束エチル糖、および2’−O−メトキシエチル糖を含む、態様21に記載の化合物。
[態様24]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
2個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが2’−O−メトキシエチル糖または拘束エチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結がホスホロチオエート連結である、態様20に記載の化合物。
[態様25]前記5’ウィングセグメントの前記2個の連結されたヌクレオシドが、5’から3’の方向で、2’−O−メトキシエチル糖および拘束エチル糖を含み、前記3’ウィングセグメントの前記4個の連結されたヌクレオシドが、5’から3’の方向で、拘束エチル糖、2’−O−メトキシエチル糖、拘束エチル糖、および2’−O−メトキシエチル糖を含む、態様24に記載の化合物。
[態様26]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが修飾糖を含む、態様18に記載の化合物。
[態様27]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
4個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが修飾糖を含む、態様18に記載の化合物。
[態様28]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
3個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが修飾糖を含む、態様18に記載の化合物。
[態様29]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
2個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
2個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが修飾糖を含む、態様18に記載の化合物。
[態様30]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
3個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
4個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが修飾糖を含む、態様18に記載の化合物。
[態様31]前記修飾オリゴヌクレオチドが、
10個の連結されたデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメントと、
1〜5個の連結されたヌクレオシドからなる5’ウィングセグメントと、
1〜5個の連結されたヌクレオシドからなる3’ウィングセグメントと、を含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に位置付けられ、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが2’−O−メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間連結がホスホロチオエート連結である、態様18に記載の化合物。
[態様32]前記修飾オリゴヌクレオチドが20個の連結されたヌクレオシドからなる、態様1または2に記載の化合物。
[態様33]前記修飾オリゴヌクレオチドが16個の連結されたヌクレオシドからなる、態様1または2に記載の化合物。
[態様34]前記修飾オリゴヌクレオチドが15〜30個の連結されたヌクレオシドからなる、態様1または2に記載の化合物。
[態様35]前記修飾オリゴヌクレオチドが18〜22個の連結されたヌクレオシドからなる、態様1または2に記載の化合物。
[態様36]前記修飾オリゴヌクレオチドが20〜30個の連結されたヌクレオシドからなる、態様1または2に記載の化合物。
[態様37]配列番号1のヌクレオチド1〜20、10〜29、10〜56、13〜38、13〜35、19〜38、25〜47、25〜50、25〜56、43〜68、43〜63、55〜74、58〜73、58〜74、58〜77、58〜79、58〜80、58〜84、59〜74、59〜75、59〜80、60〜75、60〜76、60〜79、61〜76、61〜77、61〜80、62〜77、63〜84、68〜114、101〜123、98〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、158〜177、167〜186、191〜215、196〜224、196〜215、196〜218、199〜228、199〜218、199〜224、200〜224、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜264、242〜263、243〜262、244〜263、245〜274、245〜260、245〜264、246〜266、247〜266、247〜269、247〜270、245〜267、251〜267、245〜266、250〜269、251〜266、251〜268、251〜269、245〜269、245〜266、245〜261、250〜265、250〜266、250〜267、250〜268、250〜269、251〜270、252〜267、253〜268、253〜269、253〜272、253〜274、254〜269、254〜270、254〜274、255〜270、255〜271、255〜274、255〜401、255〜400、255〜274、255〜273、255〜272、255〜271、256〜271、256〜275、255〜276、256〜272、256〜276、253〜275、256〜279、257〜276、258〜273、259〜274、260〜279、262〜281、262〜321、262〜315、262〜312、265〜312、266〜288、266〜291、266〜285、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、292〜311、290〜312、293〜312、293〜315、293〜321、296〜321、302〜321、324〜343、339〜361、339〜367、348〜367、342〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜383、360〜388、360〜385、362〜381、366〜388、369〜388、366〜385、366〜392、370〜389、370〜392、380〜399、382〜401、384〜433、384〜400、384〜401、385〜401、405〜424、409〜428、405〜428、411〜426、411〜427、411〜430、411〜431、411〜437、412〜431、411〜426、411〜427、412〜428、412〜431、412〜427、413〜433、413〜432、413〜428、413〜429、413〜432、413〜433、414〜427、415〜427、414〜429、414〜430、414〜433、415〜428、415〜429、415〜430、415〜431、415〜434、416〜431、416〜432、416〜429、416〜435、417〜432、417〜433、417〜436、418〜433、418〜435、418〜434、418〜437、419〜435、419〜434、420〜435、419〜432、419〜434、421〜436、422〜437、422〜441、423〜436、425〜465、454〜473、454〜472、457〜476、457〜472、457〜473、454〜476、455〜472、457〜485、458〜485、458〜483、458〜477、458〜473、459〜485、460〜485、463〜498、463〜485、466〜485、463〜482、457〜491、458〜491、459〜491、460〜491、463〜491、466〜491、472〜491、472〜493、473〜492、475〜491、459〜494、460〜494、463〜494、466〜494、467〜498、472〜494、475〜494、457〜473、457〜472、458〜494、454〜494、457〜494、457〜473、485〜513、470〜493、476〜519、485〜519、500〜519、512〜534、512〜550、524〜546、536〜559、548〜567、548〜570、550〜570、548〜594、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、611〜645、617〜363、623〜642、617〜645、639〜754、639〜658、639〜654、641〜656、642〜657、643〜658、642〜754、653〜672、662〜685、665〜685、665〜689、668〜687、670〜754、670〜706、670〜685、670〜686、670〜689、671〜690、671〜691、671〜686、671〜687、672〜693、672〜697、672〜707、672〜687、672〜688、673〜688、674〜693、678〜693、679〜694、679〜707、679〜698、679〜701、679〜702、679〜707、680〜695、680〜699、679〜699、681〜706、681〜696、682〜697、682〜706、682〜707、682〜702、682〜701、683〜698、684〜699、685〜700、686〜701、687〜754、688〜704、689〜709、689〜710、690〜705、679〜705、679〜710、679〜706、690〜710、691〜710、690〜754、690〜706、684〜703、687〜705、687〜702、687〜703、687〜706、688〜703、688〜704、688〜705、689〜704、689〜705、689〜708、690〜705、690〜706、690〜709、691〜706、692〜711、693〜716、693〜712、695〜715、697〜716、697〜716、690〜716、724〜746、724〜752、724〜754、724〜758、733〜752、738〜754、738〜753、739〜758、739〜754、739〜775、739〜754、740〜754、742〜785、742〜773、757〜776、757〜785、790〜815、793〜812、811〜833、811〜844、814〜833、811〜906、820〜839、822〜844、822〜867、823〜842、845〜864、845〜867、854〜906、845〜909、845〜906、854〜876、863〜882、863〜885、878〜900、887〜906、899〜918、899〜933、899〜958、905〜927、905〜933、914〜933、936〜958、936〜955、945〜964、951〜970、951〜985、951〜1044、951〜1024、951〜1056、951〜997、960〜985、963〜1044、963〜1024、963〜997、972〜1015、1025〜1044、1031〜1056、1037〜1056、1046〜1083、1049〜1068、1070〜1089、1070〜1095、1082〜1101、1081〜1134、1081〜1143、1082〜1101、1088〜1107、1088〜1134、1094〜1119、1097〜1119、1112〜1134、1118〜1143、1118〜1146、1088〜1146、1121〜1140、1127〜1146、1127〜1193、1150〜1193、1156〜1187、1165〜1187、1170〜1192、1171〜1191、1172〜1191、1176〜1192、1176〜1285、1177〜1192、1176〜1191、1203〜1297、1206〜1228、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1255、1245〜1265、1251〜1280、1262〜1285、1251〜1285、1259〜1296、1259〜1290、1259〜1287、1261〜1296、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1296、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1264〜1297、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1296、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1270〜1285、1271〜1290、1271〜1296、1277〜1296、1261〜1290、1262〜1290、1268〜1290、1263〜1305、1259〜1305、1259〜1305、1266〜1305、1259〜1302、1275〜1294、1281〜1306、1281〜1324、1281〜1336、1282〜1301、1286〜1306、1290〜1324、1293〜1318、1290〜1324、1293〜1315、1296〜1315、1311〜1336、1311〜1333、1326〜1345、1353〜1381、1359〜1378、1395〜1414、1498〜1532、1498〜1523、1498〜1535、1510〜1529、1515〜1535、1515〜1563、1515〜1596、1515〜1605、1515〜1602、1515〜1540、1515〜1535、1518〜1605、1518〜1602、1518〜1537、1521〜1563、1521〜1540、1550〜1655、1550〜1563、1550〜1569、1553〜1578、1553〜1599、1553〜1590、1565〜1584、1571〜1595、1577〜1605、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1578〜1598、1571〜1598、1579〜1594、1579〜1594、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1580〜1605、1580〜1602、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1582〜1602、1553〜1655、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1586〜1652、1642〜1664、1651〜1720、1651〜1673、1655〜1679、1695〜1720、1716〜1738、1743〜1763、1743〜1768、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1796、1777〜1800、1778〜1800、1778〜1793、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1798、1779〜1797、1779〜1796、
1779〜1795、1779〜1794、1780〜1799、1780〜1796、1780〜1795、1781〜1797、1781〜1796、1781〜1796、1781〜1800、1781〜1797、1782〜1799、1782〜1797、1782〜1798、1783〜1798、1783〜1799、1784〜1800、1784〜1799、1779〜1799、1778〜1889、1778〜1794、1779〜1795、1780〜1799、1785〜1800、1794〜1813、1806〜1837、1806〜1828、1806〜1825、1809〜1828、1812〜1843、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1843、1815〜1844、1815〜1840、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1840、1821〜1844、1821〜1837、1822〜1843、1822〜1839、1822〜1837、1823〜1843、1823〜1838、1824〜1839、1827〜1846、1861〜1884、1861〜1880、1865〜1885、1866〜1881、1867〜1882、1867〜1886、1868〜1883、1869〜1885、1869〜1884、1870〜1885、1871〜1886、1872〜1887、1874〜1889、1876〜1895、1888〜1914、1888〜1908、1891〜1910、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1913〜1935、1898〜1920、1907〜1929、1913〜1935、1918〜1934、1919〜1938、1919〜1934、1921〜1934、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2368〜2393、2381〜2397、2368〜2394、2379〜2394、2381〜2396、2368〜2397、2368〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2459〜2478、2819〜2838、2818〜2838、2873〜2892、または3161〜3182内で相補的な10〜30個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号1に少なくとも90%相補的である、化合物。
[態様38]核酸塩基1〜20、10〜29、10〜56、13〜38、13〜35、19〜38、25〜47、25〜50、25〜56、43〜68、43〜63、55〜74、58〜73、58〜74、58〜77、58〜79、58〜80、58〜84、59〜74、59〜75、59〜80、60〜75、60〜76、60〜79、61〜76、61〜77、61〜80、62〜77、63〜84、68〜114、101〜123、98〜123、113〜138、116〜138、131〜150、137〜162、152〜186、158〜177、167〜186、191〜215、196〜224、196〜215、196〜218、199〜228、199〜218、199〜224、200〜224、205〜224、206〜228、218〜237、224〜243、233〜264、242〜263、243〜262、244〜263、245〜274、245〜260、245〜264、246〜266、247〜266、247〜269、247〜270、245〜267、251〜267、245〜266、250〜269、251〜266、251〜268、251〜269、245〜269、245〜266、245〜261、250〜265、250〜266、250〜267、250〜268、250〜269、251〜270、252〜267、253〜268、253〜269、253〜272、253〜274、254〜269、254〜270、254〜274、255〜270、255〜271、255〜274、255〜401、255〜400、255〜274、255〜273、255〜272、255〜271、256〜271、256〜275、255〜276、256〜272、256〜276、253〜275、256〜279、257〜276、258〜273、259〜274、260〜279、262〜281、262〜321、262〜315、262〜312、265〜312、266〜288、266〜291、266〜285、281〜321、281〜303、290〜321、290〜312、292〜311、290〜312、293〜312、293〜315、293〜321、296〜321、302〜321、324〜343、339〜361、339〜367、348〜367、342〜367、358〜392、358〜378、360〜392、360〜383、360〜388、360〜385、362〜381、366〜388、369〜388、366〜385、366〜392、370〜389、370〜392、380〜399、382〜401、384〜433、384〜400、384〜401、385〜401、405〜424、409〜428、405〜428、411〜426、411〜427、411〜430、411〜431、411〜437、412〜431、411〜426、411〜427、412〜428、412〜431、412〜427、413〜433、413〜432、413〜428、413〜429、413〜432、413〜433、414〜427、415〜427、414〜429、414〜430、414〜433、415〜428、415〜429、415〜430、415〜431、415〜434、416〜431、416〜432、416〜429、416〜435、417〜432、417〜433、417〜436、418〜433、418〜435、418〜434、418〜437、419〜435、419〜434、420〜435、419〜432、419〜434、421〜436、422〜437、422〜441、423〜436、425〜465、454〜473、454〜472、457〜476、457〜472、457〜473、454〜476、455〜472、457〜485、458〜485、458〜483、458〜477、458〜473、459〜485、460〜485、463〜498、463〜485、466〜485、463〜482、457〜491、458〜491、459〜491、460〜491、463〜491、466〜491、472〜491、472〜493、473〜492、475〜491、459〜494、460〜494、463〜494、466〜494、467〜498、472〜494、475〜494、457〜473、457〜472、458〜494、454〜494、457〜494、457〜473、485〜513、470〜493、476〜519、485〜519、500〜519、512〜534、512〜550、524〜546、536〜559、548〜567、548〜570、550〜570、548〜594、554〜573、548〜576、560〜594、584〜606、611〜645、617〜363、623〜642、617〜645、639〜754、639〜658、639〜654、641〜656、642〜657、643〜658、642〜754、653〜672、662〜685、665〜685、665〜689、668〜687、670〜754、670〜706、670〜685、670〜686、670〜689、671〜690、671〜691、671〜686、671〜687、672〜693、672〜697、672〜707、672〜687、672〜688、673〜688、674〜693、678〜693、679〜694、679〜707、679〜698、679〜701、679〜702、679〜707、680〜695、680〜699、679〜699、681〜706、681〜696、682〜697、682〜706、682〜707、682〜702、682〜701、683〜698、684〜699、685〜700、686〜701、687〜754、688〜704、689〜709、689〜710、690〜705、679〜705、679〜710、679〜706、690〜710、691〜710、690〜754、690〜706、684〜703、687〜705、687〜702、687〜703、687〜706、688〜703、688〜704、688〜705、689〜704、689〜705、689〜708、690〜705、690〜706、690〜709、691〜706、692〜711、693〜716、693〜712、695〜715、697〜716、697〜716、690〜716、724〜746、724〜752、724〜754、724〜758、733〜752、738〜754、738〜753、739〜758、739〜754、739〜775、739〜754、740〜754、742〜785、742〜773、757〜776、757〜785、790〜815、793〜812、811〜833、811〜844、814〜833、811〜906、820〜839、822〜844、822〜867、823〜842、845〜864、845〜867、854〜906、845〜909、845〜906、854〜876、863〜882、863〜885、878〜900、887〜906、899〜918、899〜933、899〜958、905〜927、905〜933、914〜933、936〜958、936〜955、945〜964、951〜970、951〜985、951〜1044、951〜1024、951〜1056、951〜997、960〜985、963〜1044、963〜1024、963〜997、972〜1015、1025〜1044、1031〜1056、1037〜1056、1046〜1083、1049〜1068、1070〜1089、1070〜1095、1082〜1101、1081〜1134、1081〜1143、1082〜1101、1088〜1107、1088〜1134、1094〜1119、1097〜1119、1112〜1134、1118〜1143、1118〜1146、1088〜1146、1121〜1140、1127〜1146、1127〜1193、1150〜1193、1156〜1187、1165〜1187、1170〜1192、1171〜1191、1172〜1191、1176〜1192、1176〜1285、1177〜1192、1176〜1191、1203〜1297、1206〜1228、1206〜1255、1209〜1228、1215〜1255、1245〜1265、1251〜1280、1262〜1285、1251〜1285、1259〜1296、1259〜1290、1259〜1287、1261〜1296、1261〜1285、1261〜1276、1261〜1277、1261〜1280、1262〜1296、1262〜1277、1262〜1278、1262〜1281、1263〜1278、1263〜1279、1263〜1282、1264〜1279、1264〜1280、1264〜1283、1264〜1297、1265〜1280、1265〜1281、1265〜1284、1266〜1281、1266〜1282、1266〜1285、1267〜1282、1267〜1283、1268〜1283、1268〜1284、1268〜1296、1269〜1284、1269〜1285、1269〜1288、1270〜1285、1271〜1290、1271〜1296、1277〜1296、1261〜1290、1262〜1290、1268〜1290、1263〜1305、1259〜1305、1259〜1305、1266〜1305、1259〜1302、1275〜1294、1281〜1306、1281〜1324、1281〜1336、1282〜1301、1286〜1306、1290〜1324、1293〜1318、1290〜1324、1293〜1315、1296〜1315、1311〜1336、1311〜1333、1326〜1345、1353〜1381、1359〜1378、1395〜1414、1498〜1532、1498〜1523、1498〜1535、1510〜1529、1515〜1535、1515〜1563、1515〜1596、1515〜1605、1515〜1602、1515〜1540、1515〜1535、1518〜1605、1518〜1602、1518〜1537、1521〜1563、1521〜1540、1550〜1655、1550〜1563、1550〜1569、1553〜1578、1553〜1599、1553〜1590、1565〜1584、1571〜1595、1577〜1605、1577〜1606、1577〜1592、1577〜1593、1577〜1596、1578〜1593、1578〜1594、1578〜1597、1578〜1598、1571〜1598、1579〜1594、1579〜1594、1579〜1598、1580〜1595、1580〜1596、1580〜1599、1580〜1605、1580〜1602、1581〜1596、1581〜1597、1581〜1600、1582〜1597、1582〜1598、1582〜1601、1582〜1602、1553〜1655、1583〜1598、1583〜1599、1583〜1602、1584〜1599、1584〜1600、1584〜1603、1585〜1600、1585〜1601、1585〜1604、1586〜1601、1586〜1602、1586〜1605、1587〜1602、1587〜1603、1587〜1606、1588〜1603、1588〜1604、1589〜1604、1589〜1605、1590〜1605、1590〜1606、1591〜1606、1586〜1652、1642〜1664、1651〜1720、1651〜1673、1655〜1679、1695〜1720、1716〜1738、1743〜1763、1743〜1768、1764〜1783、1773〜1792、1777〜1796、1777〜1800、1778〜1800、1778〜1793、1778〜1794、1778〜1797、1779〜1798、1779〜1797、1779〜1796、1779〜179
5、1779〜1794、1780〜1799、1780〜1796、1780〜1795、1781〜1797、1781〜1796、1781〜1796、1781〜1800、1781〜1797、1782〜1799、1782〜1797、1782〜1798、1783〜1798、1783〜1799、1784〜1800、1784〜1799、1779〜1799、1778〜1889、1778〜1794、1779〜1795、1780〜1799、1785〜1800、1794〜1813、1806〜1837、1806〜1828、1806〜1825、1809〜1828、1812〜1843、1812〜1837、1812〜1831、1815〜1843、1815〜1844、1815〜1840、1815〜1834、1818〜1837、1821〜1840、1821〜1844、1821〜1837、1822〜1843、1822〜1839、1822〜1837、1823〜1843、1823〜1838、1824〜1839、1827〜1846、1861〜1884、1861〜1880、1865〜1885、1866〜1881、1867〜1882、1867〜1886、1868〜1883、1869〜1885、1869〜1884、1870〜1885、1871〜1886、1872〜1887、1874〜1889、1876〜1895、1888〜1914、1888〜1908、1891〜1910、1891〜1914、1895〜1938、1895〜1935、1913〜1935、1898〜1920、1907〜1929、1913〜1935、1918〜1934、1919〜1938、1919〜1934、1921〜1934、1928〜1956、1957〜1976、2035〜2057、2083〜2141、2230〜2261、2368〜2393、2381〜2397、2368〜2394、2379〜2394、2381〜2396、2368〜2397、2368〜2396、2420〜2439、2458〜2476、2459〜2478、2819〜2838、2818〜2838、2873〜2892、または3161〜3182の等長部分に100%相補的な少なくとも8個の連続核酸塩基の部分を含む核酸塩基配列を有する、10〜30個の連結されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が配列番号1に相補的である、化合物。
[態様39]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドが、少なくとも1つの2’−O−メトキシエチル糖または拘束エチル糖を含む、態様36に記載の化合物。
[態様40]10〜30個の連結されたヌクレオシドからなり、配列番号1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285、1287、1352、1353、1354、1359、1360、1361、1362、および1363の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも8個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む、化合物。
[態様41]態様1〜40のいずれかに記載の化合物またはその塩と、薬学的に許容される担体または希釈剤のうちの少なくとも1つとを含む、組成物。
[態様42]態様1〜41のいずれかに記載の化合物または組成物を動物に投与することを含む、方法。
[態様43]前記動物がヒトである、態様42に記載の方法。
[態様44]前記化合物の投与が、HBV関連疾患、障害、または状態を防止、治療、改善する、またはその進行を遅延させる、態様43に記載の方法。
[態様45]前記疾患、障害、または状態が肝疾患である、態様44に記載の方法。
[態様46]前記疾患、障害、または状態が、黄疸、肝臓炎、肝線維症、炎症、肝硬変、肝不全、びまん性肝細胞炎症性疾患、血球貪食症候群、血清肝炎、HBVウイルス血症、または肝疾患に関連する移植である、態様44に記載の方法。
[態様47]前記疾患または状態が過剰増殖状態である、態様44に記載の方法。
[態様48]前記過剰増殖状態が肝癌である、態様47に記載の方法。
[態様49]動物において抗原レベルを減少させる方法であって、態様1〜41のいずれかに記載の化合物または組成物を前記動物に投与することを含む方法。
[態様50]HBsAGレベルが減少される、態様49に記載の方法。
[態様51]HBeAGレベルが減少される、態様49に記載の方法。
[態様52]前記動物がヒトである、態様49に記載の方法。
[態様53]前記化合物または組成物と第2の薬剤とを同時投与することを含む、態様49に記載の方法。
[態様54]前記化合物または組成物と前記第2の薬剤とが併用投与される、態様53に記載の方法。
本明細書に記載の特定の化合物、組成物、および方法を特定の実施形態に従って特異的に説明したが、以下の実施例は、本明細書に記載の化合物を説明するために過ぎず、これを限定するものではない。本出願に列挙される参考文献は各々、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
実施例1
HepG2.2.15細胞におけるMOEギャップマーによるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
HBVウイルス核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、インビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果を試験した。エレクトロポレーションを用いて、1ウェル当たり25,000細胞の密度の培養HepG2.2.15細胞を15,000nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370(本明細書において配列番号2に指定する、順方向配列CTTGGTCATGGGCCATCAG、本明細書において配列番号3に指定する、逆方向配列CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA、本明細書において配列番号4に指定する、プローブ配列TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC)を使用してmRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
新たに設計された表1のキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、5−10−5MOEギャップマーまたは3−10−4MOEギャップマーのいずれかとして設計した。5−10−5MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、5個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。3−10−4MOEギャップマーは、17ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、3個および4個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。5’ウィングセグメントの各ヌクレオシドおよび3’ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、MOE糖修飾を有する。中央ギャップセグメントの各ヌクレオシドは、デオキシ糖修飾を有する。各ギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート(P=S)連結である。各ギャップマー全体のシトシン残基は全て、5−メチルシトシンである。
「ウイルス標的開始部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も5’側のヌクレオチドを示す。「ウイルス標的終結部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も3’側のヌクレオチドを示す。「モチーフ」欄は、各ギャップマーのギャップ・ウィング構造を示す。表1に記載の各ギャップマーは、本明細書において配列番号1(GENBANK受託番号U95551.1)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。
実施例2
HepG2.2.15細胞におけるMOEギャップマーによるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
HBVウイルス核酸を標的とするさらなるアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、インビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果を試験した。エレクトロポレーションを用いて、1ウェル当たり25,000細胞の密度の培養HepG2.2.15細胞を15,000nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370を使用して、mRNAレベルを測定した。RTS3370は、全長mRNA、ならびにpre−S1、pre−S2、およびpre−C mRNA転写物の第2の部分を検出する。ギャップマーは、さらなるプライマープローブセットでも検査した。ウイルスプライマープローブセットRTS3371(本明細書において配列番号311に指定する、順方向配列CCAAACCTTCGGACGGAAA、本明細書において配列番号312に指定する、逆方向配列TGAGGCCCACTCCCATAGG、本明細書において313に指定する、プローブ配列CCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAAT)もmRNAレベルを測定するために使用した。RTS3371は、RTS3370と同様であるが異なる領域で、全長mRNA、ならびにpre−S1、pre−S2、およびpre−C mRNA転写物の第2の部分を検出する。ウイルスプライマープローブセットRTS3372(本明細書において配列番号314に指定する、順方向配列ATCCTATCAACACTTCCGGAAACT、本明細書において配列番号315に指定する、逆方向配列CGACGCGGCGATTGAG、本明細書において配列番号316に指定する、プローブ配列AAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG)を使用して、mRNAレベルを測定した。RTS3372は、全長ゲノム配列を検出する。ウイルスプライマープローブセットRTS3373MGB(本明細書において配列番号317に指定する、順方向配列CCGACCTTGAGGCATACTTCA、本明細書において配列番号318に指定する、逆方向配列AATTTATGCCTACAGCCTCCTAGTACA、本明細書において配列番号319に指定する、プローブ配列TTAAAGACTGGGAGGAGTTG)を使用して、mRNAレベルを測定した。RTS3373MGBは、全長mRNA、ならびにpre−S1、pre−S2、pre−C、およびpre−X mRNA転写物の第2の部分を検出する。
HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
新たに設計された表2のキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、5−10−5MOEギャップマー、3−10−3MOEギャップマー、または2−10−2MOEギャップマーのいずれかとして設計した。5−10−5MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、5個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。3−10−3MOEギャップマーは、16ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、3個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。2−10−2MOEギャップマーは、14ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、2個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。5’ウィングセグメントの各ヌクレオシドおよび3’ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、MOE糖修飾を有する。中央ギャップセグメントの各ヌクレオシドは、デオキシ糖修飾を有する。各ギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート(P=S)連結である。各ギャップマー全体のシトシン残基は全て、5−メチルシトシンである。
「開始部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も5’側のヌクレオチドを示す。「終結部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も3’側のヌクレオチドを示す。「モチーフ」欄は、各ギャップマーのギャップ・ウィング構造を示す。表2に記載の各ギャップマーは、本明細書において配列番号1(GENBANK受託番号U95551.1)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。
実施例3
HepAD38(Tet−HBV)細胞におけるMOEギャップマーによるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
実施例2に記載した研究から選択された特定のアンチセンスオリゴヌクレオチドを別の細胞株であるヒト肝癌HepAD38細胞におけるHBV mRNAに対するそれらの効果について試験し、このときHBV産生をテトラサイクリン調節プロモーターの制御下においた。エレクトロポレーションを用いて、1ウェル当たり45,000細胞の密度の培養HepAD38(Tet−HBV)細胞を15,000nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3372およびRTS3373MGBを個別に使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として表3に提示する。
実施例4
HepAD38(Tet−HBV)細胞におけるMOEギャップマーによるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
実施例1および2に記載の研究からの特定のアンチセンスオリゴヌクレオチドをインビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果について試験した。エレクトロポレーションを用いて、1ウェル当たり45,000細胞の密度の培養HepAD38(Tet−HBV)細胞を15,000nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3372を使用して、mRNAレベルを測定した。mRNAレベルはまた、RTS3373MGBプライマープローブセットも使用して測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として表4に提示する。
実施例5
HepG2.2.15細胞におけるMOEギャップマーによるウイルスHBV RNAの用量依存的阻害
実施例3および4に記載の研究からの特定のギャップマーをヒトHepG2.2.15細胞において様々な用量で試験した。1ウェル当たり25,000細胞の密度で細胞を蒔き、エレクトロポレーションを用いて、表5で指定するように、2.5μM、5.0μM、10.0μM、および20.0μMの濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ16時間の処理時間終了後、RNAを細胞から単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370を使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
各オリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度(IC
50)も表5に提示する。表5に示すように、HBV mRNAレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞で用量依存的に著しく減少した。
実施例6
HepG2.2.15細胞におけるMOEギャップマーによるウイルスHBV RNAの用量依存的阻害
実施例3および4に記載の研究からのさらなるギャップマーをヒトHepG2.2.15細胞において様々な用量でさらに試験した。1ウェル当たり28,000細胞の密度で細胞を蒔き、LipofectAMINE 2000(登録商標)試薬を用いて、表6で指定するように、15.625nM、31.25nM、62.5nM、125.0nM、および250.0nMの濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ16時間の処理時間終了後、RNAを細胞から単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370を使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
各オリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度(IC
50)も表6に提示する。表6に示すように、HBV mRNAレベルは、一部のアンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞で用量依存的に著しく減少した。
mRNAレベルもまた、プライマープローブセットRTS3371で測定した。結果は表7に提示する。
実施例7
HBVを標的とするMOEギャップマーのBALB/cマウスにおける忍容性
BALB/cマウス(Charles River,MA)は、安全性および有効性試験にしばしば利用される汎用マウスモデルである。これらのマウスを上述の研究から選択されたISISアンチセンスオリゴヌクレオチドで処置し、種々の代謝マーカーのレベルの変化を評価した。
研究1
各々BALB/cマウス4匹からなる群に、50mg/kgのISIS 146779、ISIS 146786、ISIS 505317、ISIS 505319、ISIS 505330、ISIS 505332、ISIS 505339、ISIS 505346、ISIS 505347、ISIS 505358、ISIS 509929、ISIS 509931、ISIS 509932、ISIS 509934、ISIS 509957、ISIS 510100、ISIS 510106、ISIS 510116、およびISIS 510140を週2回3週間にわたり皮下注射した。BALB/cマウス4匹からなる1つの群に、50mg/kgのISIS 141923(CCTTCCCTGAAGGTTCCTCC(配列番号320))(いかなるヒトまたはマウス遺伝子配列とも既知の相同性を有さない5−10−5MOEギャップマー)を週2回3週間にわたり皮下注射した。BALB/cマウス4匹からなる別の群に、PBSを週2回3週間にわたり皮下注射した。このマウス群は、対照群としての役割を果たした。最終投与の3日後の各時点に、体重を測定し、マウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血漿を採取した。
体重および臓器重量
投与前および各処置期間の最後にマウスの体重を測定した。体重は表8に示され、処置開始前に測定した体重からの変化率として表記される。肝臓、脾臓、および腎臓の重量を研究の最後に測定し、PBS対照のそれぞれの臓器重量とのパーセント差として表9に示す。この結果は、ほとんどのISISオリゴヌクレオチドが、体重または臓器重量に対して有害影響を全く引き起こさなかったことを示している。
肝機能
肝機能に対するISISオリゴヌクレオチドの効果を評価するために、自動臨床化学分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)を用いて、トランスアミナーゼの血漿濃度を測定した。ALT(アラニントランスアミナーゼ)およびAST(アスパラギン酸トランスアミナーゼ)の血漿濃度を測定し、IU/Lで表した結果を表10に示す。また、コレステロールおよびトリグリセリドの血漿レベルも同じ臨床化学分析器を用いて測定し、その結果も表10に示す。
腎機能
腎機能に対するISISオリゴヌクレオチドの効果を評価するために、血中尿素窒素(BUN)の血漿濃度を、自動臨床化学分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)を用いて測定した。結果をmg/dL表示で表11に示す。
研究2
各々BALB/cマウス4匹からなる群に、50mg/kgのISIS 505329、ISIS 509926、ISIS 509927、ISIS 509958、ISIS 509959、ISIS 509960、ISIS 509974、ISIS 509975、ISIS 510038、ISIS 510039、ISIS 510040、ISIS 510041、およびISIS 510050を週2回3週間にわたり皮下注射した。BALB/cマウス4匹からなる1つの群に、PBSを週2回3週間にわたり皮下注射した。このマウス群は、対照群としての役割を果たした。最終投与の3日後の各時点に、体重を測定し、マウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血漿を採取した。
臓器重量
肝臓、脾臓、および腎臓の重量を研究の最後に測定し、PBS対照のそれぞれの臓器重量についての変化率として表12に示す。
肝機能
肝機能に対するISISオリゴヌクレオチドの効果を評価するために、自動臨床化学分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)を用いて、トランスアミナーゼの血漿濃度を測定した。ALT(アラニントランスアミナーゼ)およびAST(アスパラギン酸トランスアミナーゼ)の血漿濃度を測定し、IU/Lで表した結果を表13に示す。
腎機能
腎機能に対するISISオリゴヌクレオチドの効果を評価するために、血中尿素窒素(BUN)の血漿濃度を、自動臨床化学分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)を用いて測定した。結果をmg/dL表示で表14に示す。
実施例8
HepG2.2.15細胞におけるHBVを標的とするMOEギャップマーの用量反応確認
実施例7および8に記載の研究で測定した配列保存、活性、および忍容性に基づいてギャップマーを選択し、HepG2.2.15細胞において様々な用量で試験した。1ウェル当たり28,000細胞の密度で細胞を蒔き、LipofectAMINE 2000試薬を用いて、15.625nM、31.25nM、62.5nM、125.0nM、および250.0nMの濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。トランスフェクション2日後に、培地を新鮮培地と交換した。トランスフェクション4日後に試料を回収した。上清中のDNA、RNA、HBsAg、およびHBeAGレベルを測定した。
HBV mRNAレベルは、定量的リアルタイムPCRで測定した。HBVプライマープローブセットRTS3370を使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。表15に示すように、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞のほとんどで、HBV mRNAレベルが用量依存的に減少された。
上清中のHBV抗原は、ELISA法によって検出した。HBs抗原(HBsAg)レベルは、ELISA(Abazyme LLC,MA)によって検出した。表16に示すように、ISISオリゴヌクレオチド146779、146786、505329、505330、505339、505347、505358、509927、509934、509958、509959、509960、509974、5100038、510039、510040、510041、510100、510106、および510116での処理は、HBsAgレベルの顕著な減少をもたらした。HBe抗原(HBeAg)レベルは、ELISA(International Immuno−diagnostics,CA)によって検出した。表17に示すように、ISISオリゴヌクレオチド146779、146786、505329、505330、505339、505347、505358、509927、509934、509958、509959、509960、509974、5100038、510039、510040、510041、510100、510106、および510116での処理は、HBeAgレベルの顕著な減少をもたらした。HBV DNAレベルは、プライマープローブセットRTS3370を用いて測定した。表18に示すように、ISIS オリゴヌクレオチド146779、146786、505329、505330、505339、505347、505358、509927、509934、509958、509959、509960、509974、5100038、510039、510040、510041、510100、510106、および510116での処理は、HBV DNAレベルの顕著な減少をもたらした。上清中の総タンパク質は、表19に示すように、DCタンパク質アッセイ(BioRad)によって測定した。
実施例9
HBVトランスジェニックマウスにおけるMOEギャップマーによるHBV mRNAのインビボ阻害
ともにHBV mRNAの顕著な阻害を示す、5−10−5MOEギャップマーであるISIS 146786および3−10−4MOEギャップマーであるISIS 510100をHBV遺伝子(Chisari 1.3.32株)を含むトランスジェニックマウスで試験し(Guidotti,L.G.et al.,J.Virol.1995,69,6158−6169)、ギャップマーの有効性を評価した。
処置
各々雄雌10〜11匹のHBVトランスジェニックマウスからなる2群に、25mg/kgのISIS 146786またはISIS 510100を週2回4週間にわたり皮下投与した。雌雄14匹のHBVトランスジェニックマウスからなる別の群に、B型肝炎感染症の治療に使用される経口抗ウイルス剤であるエンテカビルを1日1mg/kgで2週間にわたり投与した。雌雄10匹のHBVトランスジェニック雌マウスからなる別の群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。PBSを注射したマウスは、対照群としての役割を果たした。肝臓HBV mRNAおよびDNAレベル、血漿ALT、ならびに体重および臓器重量を測定した。
RNA分析
プライマープローブセットRTS3370、RTS3371、およびRTS3372を用いたHBVのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。結果は、PBS対照と比較したHBV mRNA阻害率として提示する。表20に示すように、ISISアンチセンスオリゴヌクレオチドでの処置は、測定に使用したプライマープローブセットに関係なく、PBS対照と比較してHBV mRNAの顕著な減少をもたらした。エンテカビルは、HBV mRNA発現を低下させなかった。
DNA分析
プライマープローブセットRTS3370およびRTS3371を用いたHBVのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からDNAを抽出した。レベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。結果は、PBS対照と比較したHBV DNA阻害率として提示する。表21に示すように、ISISアンチセンスオリゴヌクレオチドでの処置は、測定に使用したプライマープローブセットに関係なく、PBS対照と比較してHBV DNAの顕著な減少をもたらした。エンテカビルでの処置も予想通りDNAレベルを減少させた。
肝機能
肝機能に対するISISオリゴヌクレオチドの効果を評価するために、手動臨床化学分析器(Teco Diagnostics,Anaheim,CA)を用いて、トランスアミナーゼの血漿濃度を測定した。ALT(アラニントランスアミナーゼ)の血漿濃度を測定し、IU/Lで表した結果を表22に示す。この結果は、HBVのアンチセンス阻害が、マウスの肝機能に有害影響を与えなかったことを示している。
本研究からのデータは、ISIS 146786およびISIS 510100の両者が、肝臓HBV RNAおよびDNAの強力な減少をもたらし、これらのオリゴヌクレオチドでの処置がトランスジェニックマウスにおいて良好な忍容性を示したことを示唆している。
実施例10
MOEギャップマーによるHepG2.2.15細胞におけるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
HBVウイルス核酸を標的とするさらなるアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、インビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果について試験した。上述の研究からのアンチセンスオリゴヌクレオチドのいくつかもこのアッセイに含めた。LipofectAMINE 2000(登録商標)試薬を用いて、1ウェル当たり28,000細胞の密度の培養HepG2.2.15細胞を100nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370を使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
新たに設計された表23のキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、5−10−5MOEギャップマーとして設計した。このギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、5個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。5’ウィングセグメントの各ヌクレオシドおよび3’ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、MOE糖修飾を有する。中央ギャップセグメントの各ヌクレオシドは、デオキシ糖修飾を有する。各ギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート(P=S)連結である。各ギャップマー全体のシトシン残基は全て、5−メチルシトシンである。
「ウイルス標的開始部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も5’側のヌクレオチドを示す。「ウイルス標的終結部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も3’側のヌクレオチドを示す。表23に記載の各ギャップマーは、本明細書において配列番号1(GENBANK受託番号U95551.1)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。
実施例11
MOEギャップマーによるHepG2.2.15細胞におけるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
HBVウイルス核酸を標的とするさらなるアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、インビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果について試験した。上述の研究からのアンチセンスオリゴヌクレオチドのいくつかもこのアッセイに含めた。LipofectAMINE 2000(登録商標)試薬を用いて、1ウェル当たり28,000細胞の密度の培養HepG2.2.15細胞を70nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370を使用して、mRNAレベルを測定した。これらのギャップマーのうちの一部のmRNAレベルもRTS3372を使用して測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
新たに設計された表24および25のキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、5−10−5MOEギャップマーとして設計した。このギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、5個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。5’ウィングセグメントの各ヌクレオシドおよび3’ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、MOE糖修飾を有する。中央ギャップセグメントの各ヌクレオシドは、デオキシ糖修飾を有する。各ギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート(P=S)連結である。各ギャップマー全体のシトシン残基は全て、5−メチルシトシンである。
「ウイルス標的開始部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も5’側のヌクレオチドを示す。「ウイルス標的終結部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も3’側のヌクレオチドを示す。表24に記載の各ギャップマーは、本明細書において配列番号1(GENBANK受託番号U95551.1)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。表25に記載の各ギャップマーは、本明細書において配列番号1286(GENBANK受託番号U95551.1の配列変更型)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。「データなし」は、その特定のギャップマーの阻害データが、その特定のプライマープローブセットで測定されていないことを示す。
実施例12
MOEギャップマーによるHepG2.2.15細胞におけるウイルスHBV RNAの用量依存的阻害
実施例11および12に記載の研究からの特定のギャップマーをヒトHepG2.2.15細胞において様々な用量で試験した。1ウェル当たり28,000細胞の密度で細胞を蒔き、LipofectAMINE 2000(登録商標)試薬を用いて、表26で指定するように、5.56nM、16.67nM、50.0nM、および150.0nMの濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ16時間の処理時間終了後、RNAを細胞から単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370を使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
各オリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度(IC
50)も表26に提示する。表26に示すように、HBV mRNAレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞で用量依存的に減少した。
ISIS−オリゴヌクレオチドの一部もプライマープローブセットTS3372を用いて試験した。結果は表27に提示する。
実施例13
MOEギャップマーによるHepG2.2.15細胞におけるウイルスHBV RNAの用量依存的阻害
上述の研究からの特定のギャップマーをヒトHepG2.2.15細胞において様々な用量で試験した。1ウェル当たり30,000細胞の密度で細胞を蒔き、LipofectAMINE 2000(登録商標)試薬を用いて、表28で指定するように、7.8125nM、15.625nM、31.25nM、62.5nM、125.0nM、および250.0nMの濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ16時間の処理時間終了後、RNAを細胞から単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370を使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
各オリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度(IC
50)も表28に提示する。表28に示すように、HBV mRNAレベルは、いくつかのアンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞で用量依存的に減少した。
実施例14
MOEギャップマーによるHepG2細胞におけるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
HBVウイルス核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、インビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果を試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドを同様の培養条件を有する一連の実験で試験した。各実験の結果を別々の表に示す。上述の試験からのISIS 146786、509934、ISIS 509959、およびISIS 510100も含めた。LipofectAMINE2000(登録商標)を用いて、1ウェル当たり28,000細胞の密度の培養HepG2細胞を70nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370(本明細書において配列番号2に指定する、順方向配列CTTGGTCATGGGCCATCAG、本明細書において配列番号3に指定する、逆方向配列CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA、本明細書において配列番号4に指定する、プローブ配列TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC)を使用して、mRNAレベルを測定した。レベルは、プライマープローブセットRTS3371(本明細書において配列番号311に指定する、順方向配列CCAAACCTTCGGACGGAAA、本明細書において配列番号312に指定する、逆方向配列TGAGGCCCACTCCCATAGG、本明細書において313に指定する、プローブ配列CCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAAT)も使用して測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。表32、35、42、45、および46に示すアッセイの一部では、ISIS 146786の効力を単一プレートの2つのウェルで測定した。そのような場合、両ウェルの阻害レベルの値を示している。
下表の新たに設計されたキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、2−9−5MOEギャップマー、2−9−6MOEギャップマー、2−10−8MOEギャップマー、3−9−4MOEギャップマー、3−9−5MOEギャップマー、3−10−3MOEギャップマー、3−10−4MOEギャップマー、3−10−7MOEギャップマー、4−9−3MOEギャップマー、4−9−4MOEギャップマー、4−10−6MOEギャップマー、5−9−2MOEギャップマー、5−9−3MOEギャップマー、5−10−5MOEギャップマー、6−9−2MOEギャップマー、6−10−4MOEギャップマー、7−10−3MOEギャップマー、または8−10−2MOEギャップマーのいずれかとして設計した。2−9−5MOEギャップマーは、16ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、9個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、2個および5個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。2−9−6MOEギャップマーは、17ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、9個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、2個および6個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。2−10−8MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、2個および8個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。3−9−4MOEギャップマーは、16ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、9個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、3個および4個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。3−9−5MOEギャップマーは、17ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、9個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、3個および5個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。3−10−3MOEギャップマーは、16ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、3個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。3−10−4MOEギャップマーは、17ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、3個および4個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。3−10−7MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、3個および7個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。4−9−3MOEギャップマーは、16ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、9個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、4個および3個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。4−9−4MOEギャップマーは、17ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、9個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、4個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。4−10−6MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、4個および6個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。5−9−2MOEギャップマーは、16ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、9個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、5個および2個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。5−9−3MOEギャップマーは、17ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、9個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、5個および3個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。5−10−5MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、5個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。6−9−2MOEギャップマーは、17ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、9個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、6個および2個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。6−10−4MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、6個および4個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。7−10−3MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、7個および3個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。8−10−2MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、8個および2個のヌクレオシドをそれぞれ含むウィングが隣接する。5’ウィングセグメントの各ヌクレオシドおよび3’ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、MOE糖修飾を有する。「モチーフ」欄は、各々のオリゴヌクレオチドのウィングセグメントおよびギャップセグメント内のヌクレオシド数でモチーフを示す。各ギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート(P=S)連結である。各オリゴヌクレオチド全体のシトシン残基は全て、5−メチルシトシンである。
「ウイルス標的開始部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も5’側のヌクレオチドを示す。「ウイルス標的終結部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も3’側のヌクレオチドを示す。「モチーフ」欄は、各々のギャップマーのギャップ・ウィング構造を示す。これらの表に記載の各ギャップマーは、本明細書において配列番号1(GENBANK受託番号U95551.1)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。新たに設計されたオリゴヌクレオチドの効力をISIS 146786、509934、ISIS 509959、およびISIS 510100と比較し、その情報を各表の最上部に示した。
実施例15
デオキシ、MOE、および(S)−cEtギャップマーによるHepG2細胞におけるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
HBVウイルス核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、インビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果を試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドを同様の培養条件を有する一連の実験で試験した。各実験の結果を下記の別々の表に示す。先願(2011年4月21日出願の米国特許仮出願第61/478,040号)に記載されているISIS 146786およびISIS 509934も比較のためにこれらの研究に含めた。LipofectAMINE2000(登録商標)を用いて、1ウェル当たり28,000細胞の密度の培養HepG2細胞を70nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370(本明細書において配列番号1に指定する、順方向配列CTTGGTCATGGGCCATCAG、本明細書において配列番号2に指定する、逆方向配列CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA、本明細書において配列番号3に指定する、プローブ配列TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC)を使用して、mRNAレベルを測定した。レベルは、プライマープローブセットRTS3371(本明細書において配列番号311に指定する、順方向配列CCAAACCTTCGGACGGAAA、本明細書において配列番号312に指定する、逆方向配列TGAGGCCCACTCCCATAGG、本明細書において313に指定する、プローブ配列CCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAAT)も使用して測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
下表の新たに設計されたキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、デオキシ、MOE、および(S)−cEtギャップマーとして設計した。ギャップマーは、16ヌクレオシド長であり、ヌクレオシドは、MOE糖修飾、(S)−cEt糖修飾、またはデオキシ修飾のいずれかを有する。「化学」欄は、各オリゴヌクレオチドの糖修飾を記載している。「k」は(S)−cEt糖修飾を示し、数字はデオキシヌクレオシドの数を示し、「e」はMOE修飾を示す。各ギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート(P=S)連結である。各オリゴヌクレオチド全体のシトシン残基は全て、5−メチルシトシンである。
「ウイルス標的開始部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も5’側のヌクレオチドを示す。「ウイルス標的終結部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も3’側のヌクレオチドを示す。これらの表に記載の各ギャップマーは、本明細書において配列番号1(GENBANK受託番号U95551.1)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。新たに設計されたオリゴヌクレオチドの効力をISIS 146786、509934、ISIS 509959、およびISIS 510100と比較した。
実施例16
MOEギャップマーによるHepG2細胞におけるHBV mRNAの用量依存的アンチセンス阻害
HBV mRNAのインビトロ阻害を示すアンチセンスオリゴヌクレオチドを実施例14に記載の研究から選択し、HepG2細胞において様々な用量で試験した。1ウェル当たり28,000細胞の密度で細胞を蒔き、LipofectAMINE2000(登録商標)を用いて、表53で指定するように、9.26nM、27.78nM、83.33nM、および250.00nMの濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ16時間の処理時間終了後、RNAを細胞から単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。HBVプライマープローブセットRTS3371を使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
表53に示すように、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞で、HBV mRNAレベルが用量依存的に減少された。「データなし」は、その投薬量のデータが利用できないことを示す。
実施例17
デオキシ、MOE、および(S)−cEtギャップマーによるHepG2細胞におけるHBV mRNAの用量依存的アンチセンス阻害
HBV mRNAのインビトロ阻害を示すアンチセンスオリゴヌクレオチドを実施例15に記載の研究から選択し、HepG2細胞において様々な用量で試験した。1ウェル当たり28,000細胞の密度で細胞を蒔き、LipofectAMINE2000(登録商標)を用いて、表54で指定するように、9.26nM、27.78nM、83.33nM、および250.00nMの濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ16時間の処理時間終了後、RNAを細胞から単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。HBVプライマープローブセットRTS3371を使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
表54に示すように、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞で、HBV mRNAレベルが用量依存的に減少された。
実施例18
デオキシ、MOE、および(S)−cEtギャップマーによるHepG2細胞におけるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
HBVウイルス核酸を標的とするさらなるアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、インビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果について試験した。米国特許第5985662号において開示されているISIS 5808およびISIS 9591、ならびにISIS 146781、ISIS 146786、524518、ISIS 552859、およびISIS 552870も比較のためにこれらの研究に含め、これらに星印を付して区別する。LipofectAMINE2000(登録商標)を用いて、1ウェル当たり28,000細胞の密度の培養HepG2細胞を100nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3370およびRTS3371を使用して、mRNAレベルを別個に測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
下表の新たに設計されたキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、MOEギャップマー、またはデオキシ、MOE、および(S)−cEtギャップマーとして設計した。5−10−5MOEギャップマーは、20ヌクレオシド長であり、中央ギャップセグメントは、10個の2’−デオキシヌクレオシドからなり、両側(5’方向および3’方向)に、5個のヌクレオシドを各々含むウィングが隣接する。デオキシ、MOE、および(S)−cEtギャップマーは、16ヌクレオシド長であり、ヌクレオシドは、MOE糖修飾、(S)−cEt糖修飾、またはデオキシ修飾のいずれかを有する。「化学」欄は、各オリゴヌクレオチドの糖修飾を記載している。「k」は(S)−cEt糖修飾を示し、数字はデオキシヌクレオシドの数を示し、あるいは「d」はデオキシヌクレオシドを示し、「e」はMOE修飾を示す。各ギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート(P=S)連結である。各オリゴヌクレオチド全体のシトシン残基は全て、5−メチルシトシンである。
「ウイルス標的開始部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も5’側のヌクレオチドを示す。「ウイルス標的終結部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も3’側のヌクレオチドを示す。表55に記載の各ギャップマーは、本明細書において配列番号1(GENBANK受託番号U95551.1)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。
実施例19
トランスジェニックマウスにおけるHBVを標的とするギャップマーの有効性
複数の研究において、ISISアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスジェニックマウスを処置して、ギャップマーの有効性を評価した。HBV DNAレベルおよびRNAレベルを判定した。
研究1
各々マウス12匹からなる群に、50mg/kgのISIS 510106、ISIS 510116、ISIS 505347、またはISIS 509934を週2回4週間にわたり皮下注射した。マウス12匹からなる対照群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために肝臓を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3370、RTS3371、およびRTS3372を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3370およびRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。対照群と比較した阻害率として示されるデータを表56に提示する。表56に示すように、アンチセンスオリゴヌクレオチドのほとんどは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。化学欄は、各ギャップマーのギャップ・ウィングモチーフを示す。
研究2
各々マウス6匹からなる群に、50mg/kgのISIS 146779、ISIS 505358、ISIS 146786、ISIS 509974、ISIS 509958、またはISIS 509959を週2回4週間にわたり皮下注射した。マウス10匹からなる対照群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために肝臓を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3370を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3370でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。対照群と比較した阻害率として示されるデータを表57に提示する。表57に示すように、アンチセンスオリゴヌクレオチドのほとんどは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。化学欄は、各ギャップマーのギャップ・ウィングモチーフを示す。
研究3
各々マウス6匹からなる群に、50mg/kgのISIS 509960、ISIS 505329、ISIS 146786、ISIS 505339、またはISIS 509927を週2回4週間にわたり皮下注射した。マウス6匹からなる別の群に、B型肝炎感染症の治療に使用される経口抗ウイルス剤であるエンテカビルを1日1mg/kgで2週間にわたり投与した。マウス10匹からなる対照群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために肝臓を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3371を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。対照群と比較した阻害率として示されるデータを表58に提示する。表58に示すように、アンチセンスオリゴヌクレオチドのほとんどは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。化学欄は、各ギャップマーのギャップ・ウィングモチーフを示す。
研究4
各々マウス6匹からなる群に、25mg/kgのISIS 146786、ISIS 552176、およびISIS 552073を週2回4週間にわたり皮下注射した。マウス10匹からなる1つの群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血漿を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3371を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。データを表59に提示する。表59に示すように、これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。化学欄は、各ギャップマーのギャップ・ウィングモチーフを示す。
肝機能
肝機能に対するISISオリゴヌクレオチドの効果を評価するために、自動臨床化学分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)を用いて、ALTの血漿濃度を測定した(Nyblom,H.et al.,Alcohol&Alcoholism 39:336−339,2004、Tietz NW(Ed):Clinical Guide to Laboratory Tests,3rd ed.W.B.Saunders,Philadelphia,PA,1995)。IU/Lで表した結果を表60に示す。両ISISオリゴヌクレオチドは、それらの肝臓トランスアミナーゼプロファイルにより示されるように、マウスにおいて忍容性があるとみなされた。
研究5
各々マウス6匹からなる群に、25mg/kgのISIS 146786、ISIS 552056、ISIS 552088、およびISIS 552309を週2回4週間にわたり皮下注射した。マウス10匹からなる1つの群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血漿を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3371を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。表61に示すように、これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。化学欄は、各ギャップマーのギャップ・ウィングモチーフを示す。
研究6
各々マウス6匹からなる群に、25mg/kgのISIS 146786、ISIS 505330、ISIS 509932、ISIS 552032、ISIS 552057、ISIS 552075、ISIS 552092、およびISIS 552255を週2回4週間にわたり皮下注射した。マウス10匹からなる1つの群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血漿を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3371を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。表62に示すように、これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。化学欄は、各ギャップマーのギャップ・ウィングモチーフを示す。
研究7
各々マウス6匹からなる群に、20mg/kgのISIS 552859、ISIS 577121、ISIS 577122、ISIS 577123、ISIS 577132、ISIS 577133、およびISIS 577134を週2回4週間にわたり皮下注射した。これらのギャップマーは、デオキシ、MOE、および(S)−cEt化学を有する。マウス10匹からなる1つの群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血漿を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3371を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。表63に示すように、これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。「化学」欄は、各オリゴヌクレオチドの糖修飾を記載している。「k」は(S)−cEt糖修飾を示し、数字はデオキシヌクレオシドの数を示し、あるいは「d」はデオキシヌクレオシドを示し、「e」はMOE修飾を示す。
研究8
マウス6匹からなる群に、25mg/kgのISIS 146786(5−10−5MOEギャップマー)を週2回4週間にわたり皮下注射した。マウス6匹からなる1つの群に、10mg/kgのISIS 552803、ISIS 552903、ISIS 552817、ISIS 552822、およびISIS 552907を週2回4週間にわたり皮下注射した。これらのギャップマーは全て、デオキシ、MOE、および(S)−cEt化学を有した。マウス10匹からなる1つの群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血漿を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3371を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。データを表64に提示する。表64に示すように、これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。「化学」欄は、各オリゴヌクレオチドの糖修飾を記載している。「k」は(S)−cEt糖修飾を示し、数字はデオキシヌクレオシドの数を示し、あるいは「d」はデオキシヌクレオシドを示し、「e」はMOE修飾を示し、MOEギャップマーの場合、化学欄はギャップ・ウィング構造を定義する。
研究9
マウス6匹からなる1つの群に、25mg/kgのISIS 146786を週2回4週間にわたり皮下注射した。各々マウス6匹からなる群に、10mg/kgのISIS 552853、ISIS 552854、ISIS 552932、およびISIS 552938を週2回4週間にわたり皮下注射した。マウス10匹からなる1つの群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血漿を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3371を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。表65に示すように、これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。「化学」欄は、各オリゴヌクレオチドの糖修飾を記載している。「k」は(S)−cEt糖修飾を示し、数字はデオキシヌクレオシドの数を示し、あるいは「d」はデオキシヌクレオシドを示し、「e」はMOE修飾を示し、MOEギャップマーの場合、化学欄はギャップ・ウィング構造を定義する。
研究10
マウス6匹からなる1つの群に、25mg/kgのISIS 146786を週2回4週間にわたり皮下注射した。各々マウス6匹からなる群に、10mg/kgのISIS 552922、ISIS 552923、ISIS 552942、ISIS 552872、ISIS 552925、ISIS 552937、およびISIS 552939を週2回4週間にわたり皮下注射した。マウス10匹からなる1つの群に、PBSを週2回4週間にわたり皮下注射した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血漿を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3371を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために、肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。表66に示すように、これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。「化学」欄は、各オリゴヌクレオチドの糖修飾を記載している。「k」は(S)−cEt糖修飾を示し、数字はデオキシヌクレオシドの数を示し、あるいは「d」はデオキシヌクレオシドを示し、「e」はMOE修飾を示し、MOEギャップマーの場合、化学欄はギャップ・ウィング構造を定義する。
実施例20
トランスジェニックマウスにおけるHBVを標的とするギャップマーの有効性
HBV遺伝子断片を含むマウス(Guidotti,L.G.et al.,J.Virol.1995,69,6158−6169)を使用した。マウスを上述の実験から選択したISISアンチセンスオリゴヌクレオチドで処置し、このモデルにおけるそれらの有効性を評価した。HBV DNA、RNA、および抗原レベルを判定した。
各々マウス10匹からなる群に、最初の週は50mg/kgで週2回、その後3週間にわたり25mg/kgで週2回、ISIS 146786またはISIS 510100を皮下注射した。各々マウス10匹からなる対照群をISIS 141923(CCTTCCCTGAAGGTTCCTCC、配列番号320;既知のマウス標的を有さない5−10−5MOEギャップマー)、またはISIS 459024(CGGTCCTTGGAGGATGC、配列番号1351;既知のマウス標的を有さない3−10−4MOEギャップマー)で同様に処置した。最終投与48時間後にマウスを安楽死させ、さらなる分析のために臓器および血清を採取した。
DNAおよびRNA分析
プライマープローブセットRTS3370、RTS3371、またはRTS3372(配列番号314に指定する、順方向配列ATCCTATCAACACTTCCGGAAACT、配列番号315に指定する、逆方向配列CGACGCGGCGATTGAG、配列番号316に指定する、プローブ配列AAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG)を用いたHBV DNAのリアルタイムPCR分析のために肝組織からRNAを抽出した。DNAレベルをpicogreenに対して正規化した。RT−PCR分析後、HBV RNA試料もプライマープローブセットRTS3370およびRTS3371でアッセイした。mRNAレベルをRIBOGREEN(登録商標)に対して正規化した。データを表67に提示する。研究期間終了後、血清DNA試料を分析した。対照群で測定されたレベルと比較して表されるデータを表68に提示する。表67および68に示すように、これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、PBS対照に優るHBV DNAおよびRNAの減少を達成した。結果は、対照と比較したHBV mRNAまたはDNAの阻害率として提示する。化学欄は、各ギャップマーのギャップ・ウィング構造を定義する。
HBV抗原分析
上清中のHBV抗原をELISA法によって検出した。HBs抗原(HBsAg)レベルをELISA(Abazyme LLC,MA)によって検出した。表57に示すように、ISISオリゴヌクレオチド146786または510100での処置は、HBsAGレベルの減少をもたらした。HBe抗原(HBeAg)レベルをELISA(International Immuno−diagnostics,CA)によって検出した。表69に示すように、ISISオリゴヌクレオチド146786または510100での処置は、HBeAgレベルの減少をもたらした。
実施例21
デオキシ、MOE、および(S)−cEtギャップマーによるHepG2細胞におけるHBVウイルスmRNAのアンチセンス阻害
HBVウイルス核酸を標的とするさらなるアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、インビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果について試験した。2011年4月21日出願の米国特許仮出願第61/478,040号において開示される、ISIS 146786、ISIS 505358、ISIS 509932、およびISIS 510100、2012年2月8日出願の米国特許仮出願第61/596692号において開示されるISIS 552859、ならびに上述の研究において開示されるISIS 577121、ISIS 577122、ISIS 577123、ISIS 577132、ISIS 577133、およびISIS 577134もこのアッセイに含めた。Cytofectinを用いて、1ウェル当たり28,000細胞の密度の培養HepG2細胞を9.375nM、18.75nM、37.50nM、75.00nM、150.00nM、または300.00nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3371を使用して、mRNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。結果は、未処理対照細胞と比較したHBV阻害率として提示する。
下表の新たに設計されたキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、デデオキシ、MOE、および(S)−cEtギャップマーとして設計した。デオキシ、MOE、および(S)−cEtギャップマーは、16、17、または18ヌクレオシド長であり、ヌクレオシドは、MOE糖修飾、(S)−cEt糖修飾、またはデオキシ修飾のいずれかを有する。「化学」欄は、各オリゴヌクレオチドの糖修飾を記載している。「k」は(S)−cEt糖修飾を示し、数字はデオキシヌクレオシドの数を示し、あるいは「d」はデオキシヌクレオシドを示し、「e」はMOE修飾を示す。各ギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート(P=S)連結である。各オリゴヌクレオチド全体のシトシン残基は全て、5−メチルシトシンである。
「ウイルス標的開始部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も5’側のヌクレオチドを示す。「ウイルス標的終結部位」は、ギャップマーが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も3’側のヌクレオチドを示す。表70に記載の各ギャップマーは、本明細書において配列番号1(GENBANK受託番号U95551.1)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。
実施例22
HepG2細胞における均一なデオキシオリゴヌクレオチドのHBV mRNA阻害効力の分析
さらなるアンチセンスオリゴヌクレオチドをインビトロでのHBV mRNAに対するそれらの効果について試験した。米国特許第5985662号において開示されるISIS 5808およびISIS 9591もこのアッセイに含めた。ISIS 146786をベンチマークとしてこのアッセイに含めた。LipofectAMINE2000(登録商標)を用いて、1ウェル当たり28,000細胞の密度の培養HepG2細胞を18.75nM、37.50nM、75.00nM、150.00nM、または300.00nMのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。およそ24時間の処理時間終了後、細胞からRNAを単離し、定量的リアルタイムPCRでHBV mRNAレベルを測定した。ウイルスプライマープローブセットRTS3371を使用して、mRNAレベルおよびDNAレベルを測定した。HBV mRNAレベルは、RIBOGREEN(登録商標)で測定した全RNA含有量によって調節した。S抗原レベルおよびE抗原レベルもELISAにより測定した。結果は、未処理対照細胞と比較した阻害率として提示する。
試験したアンチセンスオリゴヌクレオチドISIS 582699、ISIS 582700、およびISIS 582701は、Korba and Gerin,Antiviral Research,1995,Vol.28,225−242において開示される配列および化学によって設計したものであり、当該参考文献中でのこれらのオリゴヌクレオチドに対応する名称は、それぞれS1、C1、およびL2cである。下表のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヌクレオシドがデオキシ修飾を有する、16または21ヌクレオシド長の均一なデオキシオリゴヌクレオチドとして設計された。「ウイルス標的開始部位」は、オリゴヌクレオチドが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も5’側のヌクレオチドを示す。「ウイルス標的終結部位」は、オリゴヌクレオチドが標的とするウイルス遺伝子配列中の最も3’側のヌクレオチドを示す。表73に記載の各オリゴヌクレオチドは、本明細書において配列番号1(GENBANK受託番号U95551.1)として指定するウイルスゲノム配列を標的とする。結果は、デオキシオリゴヌクレオチドが、HBV mRNA発現レベル、DNAレベル、およびHBV抗原レベルにごくわずかな影響を与えたことを示している。