JP5836961B2 - 脂肪肝疾患を処置するための方法 - Google Patents

Description

関連出願
この出願は、２００９年１１月３日に出願された仮出願第６１／２８０，５４４号の利益を主張する。上記で参照された出願の教示のすべてが、参考として本明細書に援用される。

（発明の背景）
トランスフォーミング増殖因子−β（ＴＧＦ−β）スーパーファミリーは、共通の配列エレメントおよび構造モチーフを共有する種々の増殖因子を含む。これらのタンパク質は、脊椎動物および無脊椎動物の両方における広範な種々の細胞型に対して生物学的作用を発揮することが公知である。このスーパーファミリーのメンバーは、胚発生の間に、パターン形成および組織の特異化において重要な機能を果たし、脂肪生成、筋形成、軟骨形成、心臓発生、造血、神経発生、および上皮細胞分化を含む種々の分化プロセスに影響を及ぼし得る。このファミリーは、さまざまに呼ばれるタンパク質、アクチビンおよびインヒビン、ＴＧＦ−β、増殖分化因子（Ｇｒｏｗｔｈ ａｎｄ Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ）（ＧＤＦ）および骨形成因子（ＢＭＰ）に代表される。このファミリーの他のメンバー、例えばＮｏｄａｌおよびＬｅｆｔｙなども公知である。ＴＧＦ−βファミリーのメンバーの活性を操作することによって、しばしば、生物において有意な生理的変化を引き起こすことが可能である。例えば、ウシのＰｉｅｄｍｏｎｔｅｓｅおよびＢｅｌｇｉａｎ Ｂｌｕｅ品種は、ＧＤＦ８（ミオスタチンとも呼ばれる）遺伝子に機能喪失変異を有しており、筋肉量（ｍｕｓｃｌｅ ｍａｓｓ）の顕著な増加を引き起こしている。非特許文献１。さらに、ヒトでは、ＧＤＦ８の不活性な対立遺伝子は、筋肉量の増加、および、報告によれば、異常な強度と関連している。非特許文献２。

Ｇｒｏｂｅｔら、Ｎａｔ Ｇｅｎｅｔ．１９９７、１７巻（１号）：７１〜４頁 Ｓｃｈｕｅｌｋｅら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ２００４年、３５０巻：２６８２〜８頁

筋肉、骨、脂肪、軟骨および他の組織の変化は、適切なＴＧＦ−βファミリーメンバーによって媒介されるシグナル伝達を作動させること、またはそれに拮抗することによって実現し得る。脂肪肝疾患は、しばしば、治療の選択肢がほとんどないインスリン抵抗性、糖尿病またはアルコール依存症に関連する潜在的に重篤な状態である。したがって、脂肪肝疾患を処置するための、ＴＧＦ−βスーパーファミリーのメンバーによるシグナル伝達の強力な制御因子として機能する因子が必要とされている。

特定の態様では、本開示は、ＡｃｔＲＩＩＢシグナル伝達経路のアンタゴニストを使用することによって、患者における脂肪肝疾患を処置するための方法を提供する。このようなアンタゴニストは、例えば、可溶性のＡｃｔＲＩＩＢタンパク質（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合タンパク質）、ＡｃｔＲＩＩＢに結合する、またはＡｃｔＲＩＩＢの発現を阻害するアンタゴニスト、およびＡｃｔＲＩＩＢを通じてシグナルを送り、脂肪肝疾患に関与するリガンドに結合する、またはその発現を阻害するアンタゴニストであり得る。このようなリガンドは、ミオスタチン、ＧＤＦ３、アクチビン、ＢＭＰ７、ＢＭＰ２およびＢＭＰ４を包含し得る。本明細書において実証されている通り、ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合タンパク質は、ある場合には、インスリン抵抗性の減少またはアディポネクチン生成の増加などのさらなる利益を伴って肝臓の脂肪症（ｌｉｖｅｒ ａｄｉｐｏｓｉｔｙ）を減少させるために使用され得る。したがって、特定の実施形態では、ＡｃｔＲＩＩＢシグナル伝達経路の拮抗作用は、肝臓脂肪症（ｈｅｐａｔｉｃ ｓｔｅａｔｏｓｉｓ）（脂質沈着）、低アディポネクチン血症（ｈｙｐｏａｄｉｐｏｎｅｃｔｉｎｅｍｉａ）、および／またはインスリン抵抗性（例えば、高インスリン血症を含めたインスリン抵抗性の指標）に対する有益な作用を達成するために使用され得る。

特定の態様では、本開示は、脂肪肝疾患の処置を必要とする患者に、有効量のＡｃｔＲＩＩＢ関連ポリペプチドを投与することによって脂肪肝疾患を処置するための方法を提供する。ＡｃｔＲＩＩＢ関連ポリペプチドは、ＧＤＦ３、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、ＢＭＰ７、ＧＤＦ８、ＧＤＦ１１、アクチビンＡ、アクチビンＢまたはＮｏｄａｌなどのＡｃｔＲＩＩＢリガンドに結合するＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢの細胞外ドメインまたはその部分）であり得る。任意選択で、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、ＡｃｔＲＩＩＢリガンドに、１０マイクロモル濃度未満または１マイクロモル濃度未満、１００ナノモル濃度未満、１０ナノモル濃度未満または１ナノモル濃度未満のＫｄで結合する。種々の適切なＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドが、その全てが本明細書中に参考として援用される以下の公開されたＰＣＴ特許出願に記載されている：ＷＯ００／４３７８１、ＷＯ０４／０３９９４８、ＷＯ０６／０１２６２７、ＷＯ０７／０５３７７５、ＷＯ０８／０９７５４１、およびＷＯ０８／１０９１６７。任意選択で、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、ＡｃｔＲＩＩＢリガンドによって誘発される細胞内のシグナル伝達事象などの、ＡｃｔＲＩＩＢシグナル伝達を阻害する。このような調製物に用いられる可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、配列番号１、２、５、６、１２および１４から選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチド、または配列番号：１、２、５、６、１２および１４から選択されるアミノ酸配列と少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％または９９％同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドなどの本明細書に開示されるもののいずれかであり得る。可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、天然のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの機能的フラグメント、例えば、配列番号１、２、５、６、１２および１４から選択される配列の少なくとも１０、２０もしくは３０アミノ酸を含むもの、またはＣ末端の１、２、３、４、５もしくは１０〜１５アミノ酸を欠き、Ｎ末端の１、２、３、４もしくは５アミノ酸を欠く配列番号１の配列を含み得る。任意選択で、ポリペプチドは、配列番号１と比較して、Ｎ末端の２〜５アミノ酸、およびＣ末端の３以下のアミノ酸の切断を含む。別のポリペプチドは、配列番号１２として示されているものである。可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、天然に存在するＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに対して、（例えば、リガンド結合ドメインにおいて）アミノ酸配列に１、２、３、４、５以上の変更を含み得る。アミノ酸配列の変更は、例えば哺乳動物、昆虫もしくは他の真核細胞において生成される場合にポリペプチドのグリコシル化を変更し得るか、または、天然に存在するＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに対して、ポリペプチドのタンパク質分解による切断を変更し得る。可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、１つのドメインとして、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢのリガンド結合ドメインまたはその改変体）と、所望の特性、例えば、改良された薬物動態、より容易な精製、特定の組織への標的化などを提供する１または複数のさらなるドメインとを有する融合タンパク質であり得る。例えば、融合タンパク質のドメインは、インビボ安定性、インビボ半減期、取込み／投与、組織局在化もしくは分布、タンパク質複合体の形成、融合タンパク質の多量体化、および／または精製のうちの１または複数を増強し得る。可溶性のＡｃｔＲＩＩＢ融合タンパク質は、免疫グロブリン定常ドメイン、例えばＦｃドメイン（野生型または変異体）など、または血清アルブミンを含み得る。特定の実施形態では、ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合物は、Ｆｃドメインと細胞外のＡｃｔＲＩＩＢドメインとの間に位置する比較的構造化されていないリンカーを含む。この構造化されていないリンカーは、ＡｃｔＲＩＩＢの細胞外ドメインのＣ末端の約１５アミノ酸の構造化されていない領域（「テール」）に対応することができるか、またはそれは、二次構造が比較的存在しない５〜１５、２０、３０、５０もしくはそれ以上のアミノ酸の人工配列であってもよい。リンカーは、グリシン残基およびプロリン残基が豊富であり得、そして例えば、トレオニン／セリンおよび／またはグリシンの繰り返し配列または非繰り返し配列（例えば、ＴＧ_４、ＴＧ_３、ＳＧ_４、ＳＧ_３、Ｇ_４、Ｇ_３、Ｇ_２、Ｇ）を含み得る。融合タンパク質は、エピトープタグ、ＦＬＡＧタグ、ポリヒスチジン配列、および、ＧＳＴ融合物のような精製サブ配列（ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｓｕｂｓｅｑｕｅｎｃｅ）を含み得る。任意選択で、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、グリコシル化アミノ酸、ＰＥＧ化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸、脂質部分に結合体化されたアミノ酸、および有機誘導体化因子（ｏｒｇａｎｉｃ ｄｅｒｉｖａｔｉｚｉｎｇ ａｇｅｎｔ）に結合体化されたアミノ酸から選択される１または複数の修飾されたアミノ酸残基を含む。一般に、ＡｃｔＲＩＩＢタンパク質は、患者における望ましくない免疫応答の可能性を低減するために、ＡｃｔＲＩＩＢタンパク質の天然のグリコシル化を適切に媒介する哺乳動物細胞株において発現されることが好ましい。ヒトおよびＣＨＯの細胞株は、首尾よく使用されており、そして、他の一般的な哺乳動物発現ベクターが有用であることが予想される。

特定の態様では、本明細書に開示されている化合物は、脂肪肝疾患を処置するための薬学的調製物として処方することができる。薬学的調製物は、ＡｃｔＲＩＩＢ関連障害を処置するために使用される化合物のような１または複数のさらなる化合物も含み得る。薬学的調製物は、実質的に発熱物質を含まないことが好ましい。

特定の態様では、本開示は、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードし、完全なＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードしない核酸を提供する。単離されたポリヌクレオチドは、上述のような可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのコード配列を含み得る。例えば、単離された核酸は、ＡｃｔＲＩＩＢの細胞外ドメイン（例えば、リガンド結合ドメイン）をコードする配列およびＡｃｔＲＩＩＢの、膜貫通ドメインおよび／もしくは細胞質ドメインの一部もしくは全部をコードする配列を含み得るが、膜貫通ドメイン内もしくは細胞質ドメイン内、または、細胞外ドメインと膜貫通ドメインもしくは細胞質ドメインとの間に位置する終止コドンは除く。例えば、単離されたポリヌクレオチドは、配列番号４などの完全長ＡｃｔＲＩＩＢポリヌクレオチド配列または部分的切断バージョンを含むことができ、前記単離されたポリヌクレオチドは、３’末端の少なくとも６００ヌクレオチド前に、さもなければ、ポリヌクレオチドの翻訳が、完全長ＡｃｔＲＩＩＢの切断部分に任意選択で融合される細胞外ドメインを生成するように置かれた転写終結コドンをさらに含む。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードする他の適切な核酸は、配列番号３および１５として示されている。本明細書に開示されている核酸は、発現のためのプロモーターに作動可能に連結され得、そして、本開示は、このような組換えポリヌクレオチドで形質転換された細胞を提供する。細胞は、ＣＨＯ細胞などの哺乳動物の細胞であることが好ましい。

特定の態様では、本開示は、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを作製するための方法を提供する。このような方法は、適切な細胞、例えば、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞などにおいて、本明細書中に開示される核酸のいずれか（例えば、配列番号３または１５）を発現させることを包含し得る。このような方法は、ａ）可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの発現に適した条件下で細胞を培養するステップであって、前記細胞が、可溶性のＡｃｔＲＩＩＢ発現構築物で形質転換される、ステップと、ｂ）このようにして発現された可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを回収するステップとを包含し得る。可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、細胞培養物からタンパク質を得るための周知技術のいずれかを用いて、粗製、部分的に精製された、または高度に精製された画分として回収することができる。

特定の態様では、本明細書に記載の化合物は、種々の形態の脂肪肝疾患およびその合併症（例えば、非アルコール性脂肪性肝疾患、非アルコール性脂肪性肝炎、アルコール性脂肪肝疾患、アルコール性脂肪性肝炎、肝線維症、硬変症）ならびに関連障害、例えば、低アディポネクチン血症、インスリン抵抗性または高インスリン血症などの管理において使用され得る。驚くべきことに、本明細書で示されているように、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、脂肪肝疾患に対する正の作用を達成しながら、低アディポネクチン血症およびインスリン抵抗性の関連障害に対する正の作用も有するように使用され得る。

特定の態様では、本開示は、本明細書に記載の障害または状態を処置するための医薬を作製するための、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの使用を提供する。

特定の態様では、本開示は、脂肪肝疾患の処置を必要とする患者において脂肪肝疾患を処置するための方法を提供し、このような方法は、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド、および配列番号３の核酸とストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチドからなる群より選択される化合物を有効量で投与することを包含し得る。ポリペプチドは、異種部分を含む融合タンパク質であり得る。ポリペプチドは、二量体であり得る。ポリペプチドは、免疫グロブリンの定常ドメインと融合され得る。ポリペプチドは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４などの免疫グロブリンのＦｃ部分と融合され得る。ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９、２９〜１２８、２９〜１３１、２９〜１３４、２５〜１０９、２５〜１２８、２５〜１３１、２５〜１３４または２０〜１３４の配列と少なくとも８０％、９０％、９３％、９５％、９７％、９８％、９９％または１００％同一であるアミノ酸配列を含み得る。ポリペプチドは、配列番号５、６、１２または１４のアミノ酸の配列と少なくとも８０％、９０％、９３％、９５％、９７％、９８％、９９％または１００％同一であるアミノ酸配列を含み得る。このような化合物で処置される患者は、本明細書に記載の障害、例えば、脂肪肝疾患またはその合併症（例えば、非アルコール性脂肪性肝疾患、非アルコール性脂肪性肝炎、アルコール性脂肪肝疾患、アルコール性脂肪性肝炎、肝線維症または硬変症）、低アディポネクチン血症、インスリン抵抗性、高インスリン血症を含めた障害を有する患者であり得る。

特定の態様では、本開示は、脂肪肝疾患の処置を必要とする患者において、脂肪肝疾患を処置するための方法であって、ＡｃｔＲＩＩＢ、またはＡｃｔＲＩＩＢを通じてシグナルを送るリガンドのいずれかを標的化することによってＡｃｔＲＩＩＢシグナル伝達経路を阻害する化合物を、有効な量で投与することを包含する方法を提供する。このような化合物の例としては、ＡｃｔＲＩＩＢのアンタゴニスト；ミオスタチンのアンタゴニスト；アクチビンＡのアンタゴニスト；アクチビンＢのアンタゴニスト；ＢＭＰ２のアンタゴニスト；ＢＭＰ４のアンタゴニストおよびＧＤＦ３のアンタゴニストが挙げられる。前述のそれぞれのアンタゴニストは、このような標的に特異的に結合し、それを阻害する抗体または他のタンパク質（例えば、モノクローナル抗体などの抗体、または、ミオスタチンおよびＧＤＦ３の場合ではプロペプチド）であり得る。また、前述のアンタゴニストは、ＡｃｔＲＩＩＢまたはリガンドの発現を阻害する核酸ベースの化合物（例えば、アンチセンス核酸またはＲＮＡｉ核酸）などの化合物であり得る。このような化合物で処置される患者は、本明細書に記載の障害、例えば、脂肪肝疾患（例えば、非アルコール性脂肪性肝疾患、非アルコール性脂肪性肝炎、アルコール性脂肪肝疾患、アルコール性脂肪性肝炎、肝線維症または硬変症）、低アディポネクチン血症、インスリン抵抗性、高インスリン血症を含めた障害を有する患者であり得る。
したがって、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
脂肪肝疾患の処置を必要とする患者において脂肪肝疾患を処置するための方法であって、該方法は、以下：
ａ．配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；および
ｂ．ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で配列番号３の核酸とハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド
からなる群より選択される化合物を有効量で投与することを含む、方法。
（項目２）
上記ポリペプチドが、ＡｃｔＲＩＩＢに対して異種である部分を含む融合タンパク質である、項目１に記載の方法。
（項目３）
上記ポリペプチドが二量体である、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
上記ポリペプチドが、免疫グロブリンの定常ドメインに融合している、項目２または３に記載の方法。
（項目５）
上記ポリペプチドが、免疫グロブリンのＦｃ部分に融合している、項目２から４までのいずれか一項に記載の方法。
（項目６）
上記免疫グロブリンがヒトＩｇＧ１である、項目５に記載の方法。
（項目７）
上記ポリペプチドが、配列番号５または６の配列を含む、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目８）
上記患者がインスリン抵抗性を有する、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目９）
上記患者がインスリン抵抗性および代謝障害を有する、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１０）
上記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１１）
上記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列と少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列を含む、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１２）
上記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列と少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１３）
上記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２５〜１３１の配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１４）
上記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２５〜１３１の配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１５）
上記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２５〜１３１の配列と少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列を含む、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１６）
上記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２５〜１３１の配列と少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７）
上記化合物を投与することにより、処置される上記患者における肝臓脂肪症を阻害する、項目１から１６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８）
上記患者を、非アルコール性脂肪性肝疾患について処置する、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
脂肪肝疾患の処置を必要とする患者において脂肪肝疾患を処置するための方法であって、該方法は、以下：
ａ．ＡｃｔＲＩＩＢのアンタゴニスト；
ｂ．ミオスタチンのアンタゴニスト；
ｃ．アクチビンＡおよび／またはアクチビンＢのアンタゴニスト；ならびに
ｄ．ＧＤＦ３のアンタゴニスト
からなる群より選択される化合物を有効量で投与することを含む、方法。
（項目２０）
上記化合物がＡｃｔＲＩＩＢのアンタゴニストである、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
上記ＡｃｔＲＩＩＢのアンタゴニストが、ＡｃｔＲＩＩＢに結合する抗体およびＡｃｔＲＩＩＢをコードする核酸にハイブリダイズし、ＡｃｔＲＩＩＢの生成を阻害する核酸からなる群より選択される、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
上記化合物がミオスタチンのアンタゴニストである、項目１９に記載の方法。
（項目２３）
上記ミオスタチンのアンタゴニストが、ミオスタチンに結合する抗体、ミオスタチンをコードする核酸にハイブリダイズし、ミオスタチンの生成を阻害する核酸、およびミオスタチンのプロペプチドまたはその改変体を含むポリペプチドからなる群より選択される、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
上記化合物がアクチビンＡおよび／またはアクチビンＢのアンタゴニストである、項目１９に記載の方法。
（項目２５）
上記アクチビンＡおよび／またはアクチビンＢのアンタゴニストが、アクチビンＡおよび／またはアクチビンＢに結合する抗体、ならびにアクチビンＡおよび／またはアクチビンＢをコードする核酸とハイブリダイズし、アクチビンＡおよび／またはアクチビンＢの生成を阻害する核酸からなる群より選択される、項目２４に記載の方法。
（項目２６）
上記化合物がＧＤＦ３のアンタゴニストである、項目１９に記載の方法。
（項目２７）
上記ＧＤＦ３のアンタゴニストが、ＧＤＦ３に結合する抗体、ＧＤＦ３をコードする核酸にハイブリダイズし、ＧＤＦ３の生成を阻害する核酸、およびＧＤＦ３のプロペプチドまたはその改変体を含むポリペプチドからなる群より選択される、項目２６に記載の方法。

本特許または特許出願のファイルは、カラーで製作された少なくとも１つの図面を含有する。（１または複数の）カラーの図面を伴う本特許または特許出願公開のコピーは、要請し、必要な料金を支払えば、特許庁により提供されるであろう。

図１は、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃの完全なアミノ酸配列（配列番号１４）を示す。ＴＰＡリーダー（残基１〜２２）および切断されたＡｃｔＲＩＩＢ細胞外ドメイン（天然の残基２５〜１３１）のそれぞれに下線を付す。配列決定によって成熟融合タンパク質のＮ末端アミノ酸であることが明らかになったグルタミン酸を目立たせている。 図２は、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃをコードするヌクレオチド配列（配列番号１５）を示す（上にコード鎖を示し、下に３’〜５’で相補物（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ）を示している）。ＴＰＡリーダーをコードする配列（ヌクレオチド１〜６６）およびＡｃｔＲＩＩＢ細胞外ドメインをコードする配列（ヌクレオチド７３〜３９６）に下線を付す。ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）に対応するアミノ酸配列も示されている。 図２は、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃをコードするヌクレオチド配列（配列番号１５）を示す（上にコード鎖を示し、下に３’〜５’で相補物（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ）を示している）。ＴＰＡリーダーをコードする配列（ヌクレオチド１〜６６）およびＡｃｔＲＩＩＢ細胞外ドメインをコードする配列（ヌクレオチド７３〜３９６）に下線を付す。ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）に対応するアミノ酸配列も示されている。 図３は、食餌誘導性の肥満のマウスモデルにおける、６０日間にわたるＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃ処置の、肝臓脂肪症に対する効果を示す。オイルレッドＯで染色した肝臓の切片（全て同じ拡大率で示されている）は、高脂肪食条件下で明白な脂質沈着を示すが対照条件下ではそれを示さない。矢印は、明赤色に染色された多くの密集した脂肪滴のいくつかを示すが、白黒の画像で見分けるのは難しい。ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃは、このような脂肪滴の形成を阻害し、大部分の肝組織の外観が標準食を与えたマウスの肝組織の外観まで回復した。 図４は、食餌誘導性の肥満のマウスモデルにおける、６０日間にわたるＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃ処置の、精巣上体の白色脂肪におけるアディポネクチンのｍＲＮＡのレベルに対する効果を示す。ＲＴ−ＰＣＲデータ（相対的な単位、ＲＵで）は、平均±ＳＥＭであり；群当たりｎ＝７；＊、ｐ＜０．０５である。高脂肪食を与えたマウスにおいて、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃは、アディポネクチンのｍＲＮＡのレベルを、６０％超増加させ、したがって、これらのマウスにおける循環アディポネクチン濃度の上昇に寄与している。 図５は、食餌誘導性の肥満のマウスモデルにおける、６０日間にわたるＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃ処置の、血清アディポネクチン濃度に対する効果を示す。ＥＬＩＳＡ測定により、主要なオリゴマーのアイソフォーム（全アディポネクチン）の全てが検出され、データは、平均±Ｍ；群当たりｎ＝７〜８；＊＊、ｐ＜０．０１；＊＊＊、ｐ＜０．００１である。ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃは循環アディポネクチン濃度を、高脂肪食の対照と比較して７５％超増加させ、標準食の対照において観察された濃度よりも有意に上昇させた。 図６は、食餌誘導性の肥満のマウスモデルにおける、６０日間にわたるＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃ処置の、血清インスリン濃度に対する効果を示す。データは、平均±ＳＥＭ；群当たりｎ＝７〜８；＊＊、ｐ＜０．０１である。ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃは、インスリン濃度に対する高脂肪食の作用を逆転させ、これは標的組織におけるインスリン感受性の増加を示す。 図７は、１６週間にわたるＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｍＦｃ処置の、アテローム発生のマウスモデルにおける、マイクロコンピュータ断層撮影法によって決定された肝組織の密度に対する効果を示す。データ（平均±ＳＥＭ）は、骨塩のヒドロキシアパタイト（ＨＡ）についての正の値および水についてのゼロの値に基づいて標準化した単位で表されている；したがって、脂質の値は負である；＊＊、ｐ＜０．０１。このモデルでは、ビヒクル処置と比較して、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｍＦｃは肝臓の密度を増加させ、これは肝臓脂肪症の有意な低下を示す。

１．概要
脂肪肝疾患は、一連の肝臓の状態を包含し、一般にはアルコール性または非アルコール性のいずれかに分類される。いずれの場合においても、脂肪肝疾患は、単純な肝臓脂肪症（脂質の蓄積および沈着）から、しばしば肝線維症、硬変症、およびおそらく肝細胞癌まで進行し得る脂肪性肝炎（ＡＳＨまたはＮＡＳＨ）までにわたる。アルコール性脂肪肝疾患（ＡＦＬＤ）および非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）は、組織学的に区別できない；しかし、定義によると、ＮＡＦＬＤは、アルコールをほとんど消費しない、または消費しない患者において発生する。その代わりに、ＮＡＦＬＤは、肥満、メタボリックシンドローム、および２型糖尿病の個体において頻繁に見いだされ、インスリン抵抗性と密接に関連づけられる（Ｕｔｚｓｃｈｎｅｉｄｅｒら、２００６年、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ Ｍｅｔａｂ、９１巻：４７５３〜４７６１頁）。最近、肥満およびインスリン抵抗性の有病率が劇的に増加しており、ＮＡＦＬＤは、最も一般的な慢性肝疾患としてＡＦＬＤおよびウイルス性肝炎誘導性の肝疾患を凌いでいる。肥満を有する者のおよそ７５％がＮＡＦＬＤを有し、その２０％もが、ＮＡＳＨを有する可能性があることが推定されている（Ｃｌａｒｋ、２００６年、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ ４０巻（付録１）：Ｓ５〜Ｓ１０頁；Ｌａｚｏら、２００８年、Ｓｅｍｉｎ Ｌｉｖｅｒ Ｄｉｓ ２８巻：３３９〜３５０頁）。

アディポネクチンと、両方の種類の脂肪肝疾患との間の密接な関連性の証拠が明らかになった。脂肪由来のホルモンであるアディポネクチンの濃度は、白色脂肪組織の質量と逆に変動し、標的組織において重要なインスリン感作作用を発揮する（Ｙａｍａｕｃｈｉら、２００１年、Ｎａｔ Ｍｅｄ ７巻：９４１〜９４６頁；Ｍａｅｄａら、２００２年、Ｎａｔ Ｍｅｄ ８巻：７３１〜７３７頁；Ｋａｄｏｗａｋｉら、２００５年、Ｅｎｄｏｃｒ Ｒｅｖ ２６巻：４３９〜４５１頁）。ヒトの異なる民族にわたって、低アディポネクチン血症の度合い（循環アディポネクチン濃度が低いこと）は、脂肪症よりもインスリン抵抗性とさらに密接に相関する（Ｗｅｙｅｒら、２００１年、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ Ｍｅｔａｂ ８６巻：１９３０〜１９３５頁）。さらに、肥満のｏｂ／ｏｂマウスでは、アディポネクチンを投与することにより、肝臓脂肪症および肝臓の膨大（肝腫大）が改善される（Ｘｕら、２００３年、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ １１２巻：９１〜１００頁）。最終的に、アディポネクチンのシグナル伝達のアルコール媒介性の調節不全の証拠が増大しており（Ｙｏｕら、２００９年、Ｅｘｐ Ｂｉｏｌ Ｍｅｄ ２３４巻：８５０〜８５９頁）、アディポネクチンを投与することにより、ＡＦＬＤのマウスモデルにおける肝臓脂肪症、肝肥大、および肝臓の炎症も改善される（Ｘｕら、２００３年、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ １１２巻：９１〜１００年）。

実施例に記載の通り、ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合タンパク質は、食餌誘導性の肥満のマウスモデルにおいて、肝臓脂肪症（脂質沈着）を阻害するため、血清アディポネクチン濃度を増加させるため、および血清インスリン濃度を正常化するために使用され得る。したがって、ＡｃｔＲＩＩＢ由来の因子およびＡｃｔＲＩＩＢシグナル伝達を阻害する他の化合物は、脂肪肝疾患を処置しながら、一部において、標的組織における循環アディポネクチン濃度を増加させ、かつ／またはインスリン抵抗性を減少させることによって正の作用も達成するために使用され得る。肝臓脂肪症、循環アディポネクチン濃度、およびインスリン抵抗性の制御に関係づけられるＡｃｔＲＩＩＢに結合するリガンドとしては、アクチビン（例えば、アクチビンＡおよびアクチビンＢ）、ミオスタチン、ＧＤＦ３、ＢＭＰ７、ＢＭＰ２およびＢＭＰ４が挙げられる。特定の態様では、本発明は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに関する。本明細書で使用される、用語「ＡｃｔＲＩＩＢ」は、任意の種に由来する、アクチビンＩＩＢ型受容体（ＡｃｔＲＩＩＢ）タンパク質およびＡｃｔＲＩＩＢ関連タンパク質のファミリーを指す。ＡｃｔＲＩＩＢファミリーのメンバーは、一般に、全てが、システインリッチ領域を有するリガンド結合細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、および予測セリン／トレオニンキナーゼ特異性を持つ細胞質ドメインから構成される膜貫通タンパク質である。ヒトのＡｃｔＲＩＩＢ前駆体は以下のアミノ酸配列を有し、シグナルペプチドに下線を付し、細胞外ドメインを太字で示し、潜在的なＮ−連結グリコシル化部位を枠で囲った（配列番号２）（ＮＭ＿００１１０６、５１２アミノ酸）。

天然のリーダーを含めた上記の野生型配列を、本開示全体を通して、ＡｃｔＲＩＩＢの種々の切断、成熟型および改変体のいずれかのアミノ酸を番号付けするための塩基配列として使用する。用語「ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド」は、ＡｃｔＲＩＩＢファミリーのメンバーの任意の天然に存在するポリペプチド、ならびに、有用な活性を保持するその任意の改変体（変異体、フラグメント、融合物、およびペプチド模倣形態（ｐｅｐｔｉｄｏｍｉｍｅｔｉｃ ｆｏｒｍ）を含む）を含むポリペプチドを指すために使用される。例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの配列と少なくとも約８０％同一である配列、および、好ましくは少なくとも８５％、９０％、９５％、９７％、９９％またはそれより高い同一性を持つ配列を有する、任意の公知のＡｃｔＲＩＩＢの配列から誘導されたポリペプチドを包含する。

特定の実施形態では、本発明は、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに関する。本明細書に記載の通り、用語「可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド」は、一般的にＡｃｔＲＩＩＢタンパク質の細胞外ドメインを含むポリペプチドを指す。本明細書中で使用される場合、用語「可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド」は、任意の天然に存在するＡｃｔＲＩＩＢタンパク質の細胞外ドメイン、ならびに、有用な活性を保持するその任意の改変体（変異体、フラグメントおよびペプチド模倣形態を含む）を包含する。例えば、ＡｃｔＲＩＩＢタンパク質の細胞外ドメインは、リガンドに結合し、また、一般に可溶性である。以下は、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの例である（配列番号１）（１１６アミノ酸）。

可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの他の例は、ＡｃｔＲＩＩＢタンパク質の細胞外ドメインに加えて、シグナル配列を含む（実施例１を参照されたい）。シグナル配列は、ＡｃｔＲＩＩＢの天然のシグナル配列、または組織プラスミノーゲン活性化因子（ＴＰＡ）のシグナル配列またはミツバチメリチン（ＨＢＭ）のシグナル配列などの、別のタンパク質由来のシグナル配列であり得る。

２つの関連するＩＩ型受容体であるＡｃｔＲＩＩＡおよびＡｃｔＲＩＩＢが、アクチビンならびに種々の他のＢＭＰおよびＧＤＦに対するＩＩ型受容体として同定されている（ＭａｔｈｅｗｓおよびＶａｌｅ、１９９１年、Ｃｅｌｌ ６５巻：９７３〜９８２頁；Ａｔｔｉｓａｎｏら、１９９２年、Ｃｅｌｌ ６８巻：９７〜１０８頁）。ＡｃｔＲＩＩＡおよびＡｃｔＲＩＩＢは、アクチビンに加えて、ＢＭＰ７、Ｎｏｄａｌ、ＧＤＦ８およびＧＤＦ１１を含むいくつかの他のＴＧＦ−βファミリータンパク質と生化学的に相互作用し得る（Ｙａｍａｓｈｉｔａら、１９９５年、Ｊ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．１３０巻：２１７〜２２６頁；ＬｅｅおよびＭｃＰｈｅｒｒｏｎ、２００１年、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９８巻：９３０６〜９３１１頁；ＹｅｏおよびＷｈｉｔｍａｎ、２００１年、Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ ７巻：９４９〜９５７頁；Ｏｈら、２００２年、Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ．１６巻：２７４９〜５４頁）。特定の実施形態では、本発明は、本主題のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド（例えば、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）でＡｃｔＲＩＩＢ受容体のリガンド（ＡｃｔＲＩＩＢリガンドとも称される）に拮抗することに関する。したがって、本発明の組成物および方法は、１または複数のＡｃｔＲＩＩＢ受容体のリガンドの異常な活性に関連する障害を処置するために有用である。例示的なＡｃｔＲＩＩＢ受容体のリガンドとしては、アクチビンＡ、アクチビンＢ、ＧＤＦ３、Ｎｏｄａｌ、ＧＤＦ８およびＧＤＦ１１などのいくつかのＴＧＦ−βファミリーのメンバーが挙げられる。

アクチビンは、二量体ポリペプチド増殖因子であり、そしてＴＧＦ−βスーパーファミリーに属する。３種のアクチビン（Ａ、ＢおよびＡＢ）が存在し、これらは、２つの密接に関連するβサブユニットのホモ二量体／ヘテロ二量体（β_Ａβ_Ａ、β_Ｂβ_Ｂおよびβ_Ａβ_Ｂ）である。ＴＧＦ−βスーパーファミリーにおいて、アクチビンは、卵巣および胎盤の細胞におけるホルモン生成を刺激し得、ニューロン細胞（ｎｅｕｒｏｎａｌ ｃｅｌｌ）の生存を支援し得、細胞周期の進行に対して細胞型に依存して正もしくは負に影響を及ぼし得、そして、少なくとも両生類の胚において中胚葉分化を誘導し得る、独特かつ多機能の因子である（ＤｅＰａｏｌｏら、１９９１年、Ｐｒｏｃ Ｓｏｃ Ｅｐ Ｂｉｏｌ Ｍｅｄ．１９８巻：５００〜５１２頁；Ｄｙｓｏｎら、１９９７年、Ｃｕｒｒ Ｂｉｏｌ．７巻：８１〜８４頁；Ｗｏｏｄｒｕｆｆ、１９９８年、Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．５５巻：９５３〜９６３頁）。さらに、刺激されたヒト単球性白血病細胞から単離された赤血球分化因子（ＥＤＦ）は、アクチビンＡと同一であることが分かった（Ｍｕｒａｔａら、１９８８年、ＰＮＡＳ、８５巻：２４３４頁）。アクチビンＡは、骨髄における赤血球生成の天然の制御因子として作用することが示唆された。いくつかの組織では、アクチビンのシグナル伝達は、その関連するヘテロ二量体であるインヒビンによって拮抗される。例えば、下垂体からの卵胞刺激ホルモン（ＦＳＨ）の放出の間に、アクチビンは、ＦＳＨの分泌および合成を促進するが、インヒビンは、ＦＳＨの分泌および合成を抑制する。アクチビンの生活性を調節し得、そして／または、アクチビンに結合し得る他のタンパク質としては、フォリスタチン（ＦＳ）、フォリスタチン関連タンパク質（ＦＳＲＰ）、α_２−マクログロブリン、ケルベロス（ｃｅｒｂｅｒｕｓ）、およびエンドグリン（ｅｎｄｏｇｌｉｎ）（これらは以下に記載される）が挙げられる。

増殖分化因子３（ＧＤＦ３）は、Ｖｇ１関連２（Ｖｇ１−ｒｅｌａｔｅｄ ２）としても公知であり、胚発生において重要な役割を果たし、成人期の間の脂肪生成にも関係づけられている。簡単に述べると、白色脂肪組織におけるＧＤＦ３の発現は、体重または肥満と相関し（Ｗｅｉｓｂｅｒｇら、２００３年、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ １１２巻：１７９６〜１８０８年）、アデノウイルス媒介性のＧＤＦ３の過剰発現は、野生型マウスにおいて高脂肪食条件下で観察される脂肪症の増加を悪化させる（Ｗａｎｇら、２００４年、Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ ３２１巻：１０２４〜１０３１頁）。重要なことに、ＧＤＦ３を遺伝的除去したマウスは、標準食で維持すると健康であり、基本的に正常であるが肥満から保護され、高脂肪食で維持すると基礎代謝率の増加を示す（Ｓｈｅｎら、２００９年、Ｍｏｌ Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ ２３巻：１１３〜１２３頁）。総合すると、これらの発見は、特に食餌誘導性の肥満において、およびより一般的には脂肪症の制御においてＧＤＦ３に関係づけられる。

Ｎｏｄａｌタンパク質は、中胚葉および内胚葉の誘導および形成、ならびに初期胚形成における心臓および胃などの軸構造物の以降の組織化において機能を果たす。発生中の脊椎動物の胚の背側組織は脊索および前索板の軸構造物に主に寄与し、同時に、それは周辺細胞を動員して非軸性の胚性構造物を形成することが実証されている。Ｎｏｄａｌは、Ｉ型およびＩＩ型の両受容体ならびにＳｍａｄタンパク質として公知の細胞内のエフェクターを通してシグナル伝達するようである。最近の研究は、ＡｃｔＲＩＩＡおよびＡｃｔＲＩＩＢがＮｏｄａｌのためのＩＩ型受容体の役目を果たすという考えを支持している（Ｓａｋｕｍａら、Ｇｅｎｅｓ Ｃｅｌｌｓ．２００２年、７巻：４０１〜１２頁）。Ｎｏｄａｌリガンドは、それらの補助因子（例えば、ｃｒｉｐｔｏ）と相互作用して、Ｓｍａｄ２をリン酸化するアクチビンＩ型およびＩＩ型受容体を活性化させることが示唆されている。Ｎｏｄａｌタンパク質は、中胚葉形成、前方パターニングおよび左右軸の特異化を含む、初期の脊椎動物の胚に重要な多くの事象との関係が示唆されている。実験上の証拠は、Ｎｏｄａｌシグナル伝達が、アクチビンおよびＴＧＦ−βに特異的に反応することが前に示されたルシフェラーゼレポーターである、ｐＡＲ３−Ｌｕｘを活性化することを実証している。しかし、Ｎｏｄａｌは、骨形態発生タンパク質に特異的に反応性であるレポーターであるｐＴｌｘ２−Ｌｕｘを誘導することができない。最新結果は、Ｎｏｄａｌシグナル伝達がアクチビン−ＴＧＦ−β経路ＳｍａｄのＳｍａｄ２およびＳｍａｄ３の両方によって媒介されることの直接の生化学的証拠を提供する。さらなる証拠は、細胞外のｃｒｉｐｔｏタンパク質がＮｏｄａｌシグナル伝達のために必要とされることを示し、このことは、Ｎｏｄａｌシグナル伝達をアクチビンまたはＴＧＦ−βのシグナル伝達から差別化する。

増殖分化因子８（ＧＤＦ８）は、ミオスタチンとしても公知である。ＧＤＦ８は、骨格筋量の負の調節因子である。ＧＤＦ８は、発生中および成体の骨格筋で高く発現される。トランスジェニックマウスでのＧＤＦ８ヌル変異は、骨格筋の著しい肥大および過形成を特徴とする（ＭｃＰｈｅｒｒｏｎら、Ｎａｔｕｒｅ、１９９７年、３８７巻：８３〜９０頁）。骨格筋量の類似した増加は、ウシ（Ａｓｈｍｏｒｅら、１９７４年、Ｇｒｏｗｔｈ、３８巻：５０１〜５０７頁；ＳｗａｔｌａｎｄおよびＫｉｅｆｆｅｒ、Ｊ． Ａｎｉｍ． Ｓｃｉ．、１９９４年、３８巻：７５２〜７５７頁；ＭｃＰｈｅｒｒｏｎおよびＬｅｅ、Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ、１９９７年、９４巻：１２４５７〜１２４６１頁およびＫａｍｂａｄｕｒら、Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ．、１９９７年、７巻：９１０〜９１５頁）、および驚くべきことにヒト（Ｓｃｈｕｅｌｋｅら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ、２００４年、３５０巻：２６８２〜８頁）のＧＤＦ８の天然に存在する変異において明白である。研究は、ヒトのＨＩＶ感染に関連する筋肉消耗には、ＧＤＦ８タンパク質発現の増加が付随することも示している（Ｇｏｎｚａｌｅｚ−Ｃａｄａｖｉｄら、ＰＮＡＳ、１９９８年、９５巻：１４９３８〜４３頁）。さらに、ＧＤＦ８は筋肉特異的酵素（例えば、クレアチンキナーゼ）の生成を調節すること、および筋芽細胞増殖を調節することができる（国際公開第００／４３７８１号）。ＧＤＦ８プロペプチドは、成熟したＧＤＦ８ドメイン二量体に非共有結合的に結合し、その生物学的な活性を不活性化することができる（Ｍｉｙａｚｏｎｏら、（１９８８年）Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ．、２６３巻：６４０７〜６４１５頁；Ｗａｋｅｆｉｅｌｄら（１９８８年）Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ．、２６３巻：７６４６〜７６５４頁およびＢｒｏｗｎら（１９９０年）Ｇｒｏｗｔｈ Ｆａｃｔｏｒｓ、３巻：３５〜４３頁）。ＧＤＦ８または構造的に関連するタンパク質に結合して、それらの生物学的な活性を阻害する他のタンパク質には、フォリスタチン、および潜在的に、フォリスタチン関連のタンパク質が含まれる（Ｇａｍｅｒら（１９９９年）Ｄｅｖ． Ｂｉｏｌ．、２０８巻：２２２〜２３２頁）。

ＢＭＰ１１としても公知の増殖分化因子１１（ＧＤＦ１１）は、分泌タンパク質である（ＭｃＰｈｅｒｒｏｎら、１９９９年、Ｎａｔ． Ｇｅｎｅｔ．２２巻：２６０〜２６４頁）。ＧＤＦ１１は、マウスの発生中、尾芽、肢芽、上顎および下顎弓、ならびに後根神経節で発現される（Ｎａｋａｓｈｉｍａら、１９９９年、Ｍｅｃｈ． Ｄｅｖ．８０巻：１８５〜１８９頁）。ＧＤＦ１１は、中胚葉および神経の両組織をパターン化することにおいて、特異な役割を演ずる（Ｇａｍｅｒら、１９９９年、Ｄｅｖ Ｂｉｏｌ．、２０８巻：２２２〜３２頁）。ＧＤＦ１１は、発生中のニワトリの肢における軟骨形成および筋発生の負の調節因子であることが示された（Ｇａｍｅｒら、２００１年、Ｄｅｖ Ｂｉｏｌ．２２９巻：４０７〜２０頁）。筋肉でのＧＤＦ１１の発現はまた、ＧＤＦ８に類似した方法で筋成長を調節することにおけるその役割を示唆する。さらに、脳でのＧＤＦ１１の発現は、ＧＤＦ１１が神経系の機能に関する活性を有することもできることを示唆する。興味深いことに、ＧＤＦ１１は嗅上皮で神経発生を阻害することが見出された（Ｗｕら、２００３年、Ｎｅｕｒｏｎ．３７巻：１９７〜２０７頁）。したがって、ＧＤＦ１１は、筋肉疾患および神経変性疾患（例えば、筋萎縮性側索硬化症）などの疾患の処置において、インビトロおよびインビボでの適用を有することができる。

特定の態様では、本発明は、一般に、ＡｃｔＲＩＩＢ活性に関連する任意のプロセスにおいて、ＡｃｔＲＩＩＢリガンドのシグナル伝達に拮抗するための、特定のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド（例えば、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）の使用に関する。任意選択で、本発明のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、アクチビンＡ、アクチビンＢ、ＧＤＦ３、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、ＢＭＰ７、Ｎｏｄａｌ、ＧＤＦ８およびＧＤＦ１１などの１または複数のＡｃｔＲＩＩＢ受容体のリガンドに拮抗し得、したがって、さらなる障害の処置において有用であり得る。

したがって、本開示は、脂肪肝疾患に関連する疾患または状態の処置または予防において、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド、およびＡｃｔＲＩＩＢまたはＡｃｔＲＩＩＢリガンドのアンタゴニストを使用することを企図する。ＡｃｔＲＩＩＢまたはＡｃｔＲＩＩＢリガンドは、多くの重大な生物学的プロセスの制御に関与する。このような脂肪肝疾患に関連する代謝的な障害または状態の例としては、非アルコール性脂肪性肝疾患、非アルコール性脂肪性肝炎、アルコール性脂肪肝疾患、アルコール性脂肪性肝炎、肝線維症、硬変症、低アディポネクチン血症、インスリン抵抗性、および高インスリン血症が挙げられるが、これらに限定されない。これらの障害および状態は、以下に「例示的な治療的用途」の下で考察されている。

本明細書中で使用される用語は、一般に、本発明の文脈の範囲内で、かつ、各々の用語が使用される特定の文脈において、当該分野におけるその通常の意味を有する。本発明の組成物および方法、ならびに、これらの作製方法および使用方法の記載において、専門家にさらなる案内を提供するために、特定の用語が以下または本明細書中の他の場所で論じられている。用語の任意の使用の範囲または意味は、その用語が使用される特定の文脈から明らかである。

「約」および「およそ」は、一般に、測定の性質または正確さが既知の測定された量についての誤差の容認可能な程度を意味するものとする。代表的には、例示的な誤差の程度は、所与の値または値の範囲の、２０パーセント（％）以内、好ましくは１０パーセント（％）以内、そしてより好ましくは５％以内である。

あるいは、そして、特に生物学的な系において、用語「約」および「およそ」は、所与の値の１桁以内、好ましくは、５倍以内、そしてより好ましくは２倍以内の値を意味し得る。本明細書中に与えられる数量は、特に明記しない限り近似値であり、明白に記述されない場合には、用語「約」または「およそ」が、推量され得ることを意味する。

本発明の方法は、配列を互いに比較する工程を包含し得、この比較には、野生型配列の１または複数の変異体（配列改変体）に対する比較を含む。このような比較は代表的には、例えば、当該分野で周知の配列アラインメントのプログラムおよび／またはアルゴリズム（例えば、少数の名を挙げれば、ＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＡおよびＭＥＧＡＬＩＧＮ）を用いた、ポリマー配列のアラインメントを含む。当業者は、変異が残基の挿入または欠失を含む場合のこのようなアラインメントにおいて、配列のアラインメントは、挿入もしくは欠失された残基を含まないポリマー配列中に「ギャップ」（代表的には、ダッシュまたは「Ａ」で表される）を導入することを容易に理解し得る。

用語「糖尿病」は、本明細書中で使用される場合、インスリン非依存性糖尿病（ＮＩＤＤＭ、２型糖尿病としても公知である）を指す。１型糖尿病またはインスリン依存性糖尿病（ＩＤＤＭ）は、グルコースの利用を制御するホルモンであるインスリンが絶対的に欠乏したことの結果である。２型糖尿病またはインスリン依存性糖尿病（すなわち、インスリン非依存性糖尿病）は、インスリンのレベルが正常である、または上昇してさえいるにもかかわらず度々起こり、組織がインスリンに適切に応答できないことの結果だと思われる。ほとんどの２型糖尿病患者は、肥満でもある。

「相同」は、そのあらゆる文法的な形態および語の綴りのバリエーションにおいて「共通する進化的起源」を有する２つのタンパク質間の関係を指し、同じ生物種のスーパーファミリーからのタンパク質ならびに異なる生物種からの相同タンパク質を含む。このようなタンパク質（およびこれをコードする核酸）は、％同一性の観点であれ、特定の残基もしくはモチーフおよび保存された位置の存在によるものであれ、その配列類似性によって反映されるように、配列の相同性を有する。

用語「配列類似性」は、そのあらゆる文法的な形態において、共通する進化の起源を共有している場合も共有していない場合もある、核酸もしくはアミノ酸配列間の同一性もしくは対応性の程度をいう。

しかし、一般的な用法およびこの出願において、用語「相同」は、「高度に」のような副詞で修飾されるとき、配列の類似性を指す場合があり、そして、共通する進化の起源に関連していてもしていなくてもよい。

２．ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド
特定の態様では、本発明は、ＡｃｔＲＩＩＢ改変体ポリペプチド（例えば、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）に関する。任意選択で、フラグメント、機能的改変体、および修飾された形態は、それらの対応する野生型ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドと同様または同一の生物学的な活性を有する。例えば、本発明のＡｃｔＲＩＩＢ改変体は、ＡｃｔＲＩＩＢリガンド（例えば、アクチビンＡ、アクチビンＡＢ、アクチビンＢ、アクチビンＣ、アクチビンＥ、ＧＤＦ３、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、ＢＭＰ７、Ｎｏｄａｌ、ＧＤＦ８、またはＧＤＦ１１）に結合し、その機能を阻害し得る。任意選択で、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、脂肪、筋肉、骨、または軟骨などの組織の成長を調節する。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの例としては、ヒトのＡｃｔＲＩＩＢ前駆体ポリペプチド（配列番号２）、および可溶性のヒトＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド（例えば、配列番号１、５、６、１２および１４）が挙げられる。

本開示は、ＡｃｔＲＩＩＢの機能的に活性な部分および改変体を同定する。出願人は、配列番号２のアミノ酸６４に対応する位置にアラニンを有する（Ａ６４）、Ｈｉｌｄｅｎら（Ｂｌｏｏｄ．１９９４年４月１５日；８３巻（８号）：２１６３〜７０頁）によって開示されている配列を有するＦｃ融合タンパク質が、アクチビンおよびＧＤＦ−１１に対して比較的低い親和性を有することを確認した。対照的に、６４位にアルギニンを持つ（Ｒ６４）同じＦｃ融合タンパク質は、アクチビンおよびＧＤＦ−１１に対して、低ナノモル濃度から高ピコモル濃度までの範囲で親和性を有する。したがって、Ｒ６４を持つ配列は、本開示では、ヒトＡｃｔＲＩＩＢの野生型参照配列として使用される。

Ａｔｔｉｓａｎｏら（Ｃｅｌｌ．１９９２年１月１０日；６８巻（１号）９７〜１０８頁）は、ＡｃｔＲＩＩＢの細胞外ドメインのＣ末端におけるプロリンノットの欠失により、アクチビンに対する受容体の親和性が減少することを示した。配列番号２のアミノ酸２０〜１１９を含有するＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合タンパク質、「ＡｃｔＲＩＩＢ（２０〜１１９）−Ｆｃ」は、プロリンノット領域および完全な膜近傍ドメインを含むＡｃｔＲＩＩＢ（２０〜１３４）−Ｆｃと比較してＧＤＦ−１１およびアクチビンへの結合が減少している。しかし、ＡｃｔＲＩＩＢ（２０〜１２９）−Ｆｃタンパク質は、プロリンノット領域が破壊されているにもかかわらず、野生型と比較して同様だがいくらか減少した活性を保持する。したがって、アミノ酸１３４、１３３、１３２、１３１、１３０および１２９で終止するＡｃｔＲＩＩＢ細胞外ドメインは全て活性であると予想されるが、１３４または１３３で終止する構築物が最も活性であり得る。同様に、残基１２９〜１３４のいずれかにおける変異によってリガンドの結合親和性が大幅に変更されるとは予想されない。この裏付けとして、Ｐ１２９およびＰ１３０の変異によってリガンドの結合は実質的に低下しない。したがって、ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合タンパク質は、早ければアミノ酸１０９（最後のシステイン）で終了し得るが、１０９〜１１９で終わる形態は、リガンドの結合が減少していると予想される。アミノ酸１１９は、不完全に保存されているので、容易に変更または切断される。１２８以後で終わる形態はリガンドの結合活性を保持している。１１９〜１２７で終わる形態は、中間の結合能を有する。これらの形態はいずれも、臨床的または実験的な設定に応じて使用することが望ましい場合がある。

ＡｃｔＲＩＩＢのＮ末端において、アミノ酸２９以前で始まるタンパク質は、リガンドの結合活性を保持していると予想される。アミノ酸２９は開始システインを表す。２４位におけるアラニンからアスパラギンへの変異により、リガンドの結合に実質的に影響を及ぼすことなくＮ−連結グリコシル化配列が導入される。これにより、アミノ酸２０〜２９に対応する、シグナル切断ペプチドとシステイン架橋領域との間の領域における変異が良好に許容されることが確認される。具体的には、２０位、２１位、２２位、２３位および２４位から始まる構築物は活性を保持し、２５位、２６位、２７位、２８位および２９位から始まる構築物も活性を保持すると予想される。

総合すると、ＡｃｔＲＩＩＢの活性部分は配列番号２のアミノ酸２９〜１０９を含み、構築物は、例えば、アミノ酸２０〜２９に対応する残基から始まり、アミノ酸１０９〜１３４に対応する位置で終わり得る。他の例としては、２０〜２９または２１〜２９からの１つの位置から始まり、１１９〜１３４、１１９〜１３３、または１２９〜１３４、１２９〜１３３からの１つの位置で終わる構築物が挙げられる。他の例としては、２０〜２４（もしくは２１〜２４、もしくは２２〜２５）からの１つの位置から始まり、１０９〜１３４（もしくは１０９〜１３３）、１１９〜１３４（もしくは１１９〜１３３）または１２９〜１３４（もしくは１２９〜１３３）からの１つの位置で終わる構築物が挙げられる。これらの範囲内の改変体、特に、配列番号２の対応する部分に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％または９９％の同一性を有する改変体も企図される。

本開示は、合成ＡｃｔＲＩＩＢ構造の分析結果を含み、これは、リガンド結合ポケットが残基Ｙ３１、Ｎ３３、Ｎ３５、Ｌ３８〜Ｔ４１、Ｅ４７、Ｅ５０、Ｑ５３〜Ｋ５５、Ｌ５７、Ｈ５８、Ｙ６０、Ｓ６２、Ｋ７４、Ｗ７８〜Ｎ８３、Ｙ８５、Ｒ８７、Ａ９２、およびＥ９４〜Ｆ１０１によって規定されることを実証している。これらの位置において、保存的変異は許容されると予想されるが、Ｋ７４Ａ変異は、Ｒ４０Ａ、Ｋ５５Ａ、Ｆ８２Ａ、およびＬ７９位における変異と同様に良好に許容される。Ｒ４０はツメガエルにおいてＫであり、この位置の塩基性アミノ酸が許容されることを示している。Ｑ５３は、ウシのＡｃｔＲＩＩＢではＲであり、ツメガエルのＡｃｔＲＩＩＢではＫであり、したがって、Ｒ、Ｋ、Ｑ、ＮおよびＨを含めたアミノ酸がこの位置で許容される。したがって、活性なＡｃｔＲＩＩＢ改変体タンパク質の一般式は、アミノ酸２９〜１０９を含むものであるが、任意選択で、２０〜２４または２２〜２５の範囲の１つの位置から始まり、１２９〜１３４の範囲の１つの位置で終わり、リガンド結合ポケットにおいて１、２、５、１０または１５以下の保存的なアミノ酸の変化を含み、リガンド結合ポケットの４０位、５３位、５５位、７４位、７９位および／または８２位において０、１またはそれ以上の非保存的な変更を含む。このようなタンパク質は、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列に対して８０％、９０％、９５％または９９％を超える配列同一性を保持し得る。可変性が特に良好に許容され得る結合ポケットの外側の部位は、細胞外ドメインのアミノ末端およびカルボキシ末端（上述のように）、および４２〜４６位および６５〜７３位を含む。６５位におけるアスパラギンからアラニンへの変更（Ｎ６５Ａ）は、Ａ６４バックグラウンドにおけるリガンドの結合を実際に改善し、したがって、Ｒ６４バックグラウンドにおいてリガンドの結合に対する好ましくない影響を有さないと予想される。この変化により、Ａ６４バックグラウンドにおけるＮ６５のグリコシル化が排除される可能性があり、したがって、この領域における著しい変化が許容される可能性があることが実証されている。Ｒ６４Ａ変化は許容性が乏しいが、Ｒ６４Ｋは良好に許容され、したがって、Ｈなどの別の塩基性残基が６４位において許容され得る。

ＡｃｔＲＩＩＢは、完全に保存された細胞外ドメインの大きなストレッチ（ｓｔｒｅｔｃｈ）を持ち、ほぼ全ての脊椎動物にわたって良好に保存されている。ＡｃｔＲＩＩＢに結合するリガンドの多くも高度に保存されている。したがって、種々の脊椎動物の生物体からのＡｃｔＲＩＩＢ配列を比較することにより、変更され得る残基への洞察がもたらされる。したがって、活性なヒトＡｃｔＲＩＩＢ改変体は、別の脊椎動物のＡｃｔＲＩＩＢの配列からの対応する位置の１つまたは複数のアミノ酸を含み得、または、ヒトまたは他の脊椎動物の配列中の残基と同様の残基を含み得る。以下の例は、活性なＡｃｔＲＩＩＢ改変体を定義するためのこのアプローチを例示している。Ｌ４６は、ツメガエルのＡｃｔＲＩＩＢではバリンであるので、この位置は変更され得、任意選択で、Ｖ、ＩまたはＦなどの別の疎水性残基、またはＡなどの非極性残基に変更され得る。Ｅ５２は、ツメガエルではＫであり、これは、この部位で、Ｅ、Ｄ、Ｋ、Ｒ、Ｈ、Ｓ、Ｔ、Ｐ、Ｇ、ＹおよびおそらくＡなどの極性残基を含めた多種多様の変化が許容され得ることを示している。Ｔ９３は、ツメガエルではＫであり、これは、この位置において幅広い構造的差異が許容されることを示しており、Ｓ、Ｋ、Ｒ、Ｅ、Ｄ、Ｈ、Ｇ、Ｐ、ＧおよびＹなどの極性残基が好ましい。Ｆ１０８は、ツメガエルではＹであり、したがって、Ｙまたは他の疎水性群、例えばＩ、ＶまたはＬが許容されるはずである。Ｅ１１１は、ツメガエルではＫであり、これは、この位置において、Ｄ、Ｒ、ＫおよびＨ、ならびにＱおよびＮを含めた、荷電残基が許容されることを示している。Ｒ１１２は、ツメガエルではＫであり、これは、この位置において、ＲおよびＨを含めた塩基性残基が許容されることを示している。１１９位のＡは比較的不完全に保存されており、げっ歯類ではＰとして、ツメガエルではＶとして現れ、したがって、この位置では本質的にいかなるアミノ酸も許容されるはずである。

本開示は、さらなるＮ−連結グリコシル化部位（Ｎ−Ｘ−Ｓ／Ｔ）を加えることにより、ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合タンパク質の血清半減期がＡｃｔＲＩＩＢ（Ｒ６４）−Ｆｃ形態と比較して増加することを実証する。２４位にアスパラギンを導入することにより（Ａ２４Ｎ構築物）、より長い半減期を与えるＮＸＴ配列が作製される。他のＮＸ（Ｔ／Ｓ）配列は、４２〜４４（ＮＱＳ）および６５〜６７（ＮＳＳ）において見出されるが、後者は６４位のＲで効率的にグリコシル化されないことがあり得る。Ｎ−Ｘ−Ｓ／Ｔ配列は、一般に、リガンド結合ポケットの外側の位置に導入され得る。非内因性Ｎ−Ｘ−Ｓ／Ｔ配列の導入に特に適した部位としては、アミノ酸２０〜２９、２０〜２４、２２〜２５、１０９〜１３４、１２０〜１３４または１２９〜１３４が挙げられる。Ｎ−Ｘ−Ｓ／Ｔ配列は、ＡｃｔＲＩＩＢ配列とＦｃまたは他の融合成分との間のリンカーにも導入され得る。このような部位は、以前から存在しているＳまたはＴに対して正しい位置にＮを導入することによって、または、以前から存在しているＮに対応する位置にＳまたはＴを導入することによって、最小の労力で導入され得る。したがって、Ｎ−連結グリコシル化部位を生じる望ましい変更は、Ａ２４Ｎ、Ｒ６４Ｎ、Ｓ６７Ｎ（できるかぎりＮ６５Ａの変更と組み合わせる）、Ｅ１０６Ｎ、Ｒ１１２Ｎ、Ｇ１２０Ｎ、Ｅ１２３Ｎ、Ｐ１２９Ｎ、Ａ１３２Ｎ、Ｒ１１２ＳおよびＲ１１２Ｔである。グリコシル化されることが予測されるＳはどれも、グリコシル化によってもたらされる保護のために、免疫原性部位を生じることなくＴに変更され得る。同様に、グリコシル化されることが予測されるＴはどれも、Ｓに変更され得る。したがって、Ｓ６７ＴおよびＳ４４Ｔの変更が企図される。同様に、Ａ２４Ｎ改変体では、Ｓ２６Ｔの変更が使用され得る。したがって、ＡｃｔＲＩＩＢ改変体は、１つまたは複数の、追加の非内因性Ｎ−連結グリコシル化コンセンサス配列を有し得る。

Ｌ７９位は、変更されたアクチビン−ミオスタチン（ＧＤＦ−１１）結合特性を与えるために変更され得る。Ｌ７９ＡまたはＬ７９Ｐにより、ＧＤＦ−１１の結合が、アクチビンの結合よりも大きな程度で減少する。Ｌ７９ＥまたはＬ７９ＤはＧＤＦ−１１の結合を保持する。著しいことに、Ｌ７９ＥおよびＬ７９Ｄ改変体は、アクチビンの結合が大幅に減少した。インビボでの実験は、これらの非アクチビン受容体が筋肉量を増加させる著しい能力を保持し、他の組織に対する作用の減少を示すことを示す。これらのデータは、アクチビンに対する作用が減少したポリペプチドを得ることについての望ましさおよび実行可能性を実証する。

記載される差異は、種々の方法に組み合わせられ得る。さらに、本明細書中に記載される変異誘発プログラムの結果は、保存が多くの場合有益であるアミノ酸位がＡｃｔＲＩＩｂにあることを示す。これらとしては、６４位（塩基性アミノ酸）、８０位（酸性または疎水性アミノ酸）、７８位（疎水性、そして特にトリプトファン）、３７位（酸性、そして特にアスパラギン酸またはグルタミン酸）、５６位（塩基性アミノ酸）、６０位（疎水性アミノ酸、特にフェニルアラニンまたはチロシン）が挙げられる。したがって、本明細書中に開示される改変体それぞれにおいて、本開示は保存され得るアミノ酸のフレームワークを提供する。保存が望ましいと考えられる他の位置は以下の通りである：５２位（酸性アミノ酸）、５５位（塩基性アミノ酸）、８１位（酸性）、９８位（極性または荷電、特にＥ、Ｄ、ＲまたはＫ）。

特定の実施形態では、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの単離されたフラグメントは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードする核酸（例えば、配列番号３、４および１５）の対応するフラグメントから組換えにより生成されるポリペプチドをスクリーニングすることによって得られ得る。さらに、フラグメントは、従来のメリフィールド固相ｆ−Ｍｏｃもしくはｔ−Ｂｏｃ化学のような当該分野で公知の技術を用いて化学的に合成され得る。フラグメントは、（組換えにより、または、化学合成により）生成され得、そして、例えば、ＡｃｔＲＩＩＢタンパク質またはＡｃｔＲＩＩＢリガンドのアンタゴニスト（インヒビター）またはアゴニスト（活性化因子）として機能し得るペプチジルフラグメントを同定するために試験され得る。

特定の実施形態では、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの機能的改変体は、配列番号３、４および１０から選択されるアミノ酸配列と少なくとも７５％同一であるアミノ酸配列を有する。ある場合では、機能的改変体は、配列番号１、２、５、６、１２および１４から選択されるアミノ酸配列と少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％または１００％同一であるアミノ酸配列を有する。

特定の実施形態では、本発明は、治療上の効力または安定性（例えば、エクスビボ貯蔵寿命およびインビボでのタンパク質分解に対する抵抗性）の増強のような目的のために、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの構造を修飾することによって機能的改変体を作製することを企図する。修飾されたＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドはまた、例えば、アミノ酸の置換、欠失または付加によって生成され得る。例えば、ロイシンのイソロイシンもしくはバリンでの単発的な置換、アスパラギン酸のグルタミン酸での単発的な置換、スレオニンのセリンでの単発的な置換、または、あるアミノ酸の、構造的に関連したアミノ酸での同様の置換（例えば、保存的変異）は、結果として生じる分子の生物学的活性に対して大きな影響を及ぼさないと予想するのは理にかなっている。保存的置換は、その側鎖が関連しているアミノ酸のファミリー内で行われる置換である。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのアミノ酸配列の変化によって機能的ホモログがもたらされているかどうかは、改変体ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの、野生型ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドと同様に細胞における反応を生じる能力、または、１または複数のリガンド、例えば、アクチビン、ＢＭＰ７、ＧＤＦ３、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、ＧＤＦ−１１またはミオスタチンなどに野生型と同様に結合する能力を評価することにより容易に決定され得る。

特定の実施形態では、本発明は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのグリコシル化を変更するように、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの特異的な変異を企図する。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのグリコシル化部位の例は、配列番号２に例示される。このような変異は、１または複数のグリコシル化部位（例えば、Ｏ−連結もしくはＮ−連結のグリコシル化部位）を導入もしくは排除するように選択され得る。アスパラギン連結グリコシル化認識部位は、一般に、トリペプチド配列、アスパラギン−Ｘ−スレオニン／セリン（ここで、「Ｘ」は任意のアミノ酸である）を含み、この配列は、適切な細胞のグリコシル化酵素によって特異的に認識される。変化はまた、（Ｏ−連結グリコシル化部位については）野生型ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの配列への、１または複数のセリンもしくはスレオニン残基の付加、または、１または複数のセリンもしくはスレオニン残基による置換によってなされ得る。グリコシル化認識部位の第１位もしくは第３位のアミノ酸の一方もしくは両方における種々のアミノ酸置換もしくは欠失（および／または、第２位におけるアミノ酸の欠失）は、修飾されたトリペプチド配列において非グリコシル化をもたらす。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドにおける糖質部分の数を増加させる別の手段は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドへのグリコシドの化学的もしくは酵素的なカップリングによるものである。使用されるカップリング様式に依存して、糖は、（ａ）アルギニンおよびヒスチジン；（ｂ）遊離カルボキシル基；（ｃ）遊離スルフヒドリル基（例えば、システインのもの）；（ｄ）遊離ヒドロキシル基（例えば、セリン、スレオニンまたはヒドロキシプロリンのもの）；（ｅ）芳香族残基（例えば、フェニルアラニン、チロシンまたはトリプトファンのもの）；または（ｆ）グルタミンのアミド基に付加され得る。これらの方法は、本明細書中に参考として援用される１９８７年９月１１日に公開されたＷＯ ８７／０５３３０ならびにＡｐｌｉｎおよびＷｒｉｓｔｏｎ（１９８１年）ＣＲＣ Ｃｒｉｔ． Ｒｅｖ． Ｂｉｏｃｈｅｍ．、２５９〜３０６頁に記載されている。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド上に存在する１または複数の糖質部分の除去は、化学的および／または酵素的に達成され得る。化学的な脱グリコシル化は、例えば、化合物トリフルオロメタンスルホン酸または等価な化合物へのＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの曝露を含み得る。この処理は、アミノ酸配列をインタクトなままにしつつ、連結糖（Ｎ−アセチルグルコサミンまたはＮ−アセチルガラクトサミン）を除くほとんどもしくは全ての糖の切断を生じる。化学的な脱グリコシル化は、さらに、Ｈａｋｉｍｕｄｄｉｎら（１９８７年）Ａｒｃｈ． Ｂｉｏｃｈｅｍ． Ｂｉｏｐｈｙｓ．２５９巻：５２頁、およびＥｄｇｅら（１９８１年）Ａｎａｌ． Ｂｉｏｃｈｅｍ．１１８巻：１３１頁によって記載されている。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド上の糖質部分の酵素的切断は、Ｔｈｏｔａｋｕｒａら（１９８７年）Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１３８巻：３５０頁に記載されるように、種々のエンドグリコシダーゼもしくはエキソグリコシダーゼの使用により達成され得る。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの配列は、適切なように、使用される発現系のタイプに応じて調節され得る。というのも、哺乳動物、酵母、昆虫および植物の細胞は全て、ペプチドのアミノ酸配列によって影響され得る異なるグリコシル化パターンを導入し得る。一般に、ヒトにおいて使用するためのＡｃｔＲＩＩＢタンパク質は、適切なグリコシル化を提供する哺乳動物細胞株（例えば、ＨＥＫ２９３細胞株またはＣＨＯ細胞株）において発現されるが、他の哺乳動物発現細胞株も同様に有用であることと期待される。

本開示はさらに、改変体、特に、任意選択で切断型改変体を含むＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの組み合わせ改変体のセットを作製する方法を企図する；組み合わせ変異体のプールは、機能的改変体の配列を同定するために特に有用である。このような組み合わせライブラリーをスクリーニングする目的は、例えば、変更された特性（例えば、変更された薬物動態または変更されたリガンド結合）を有するＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド改変体を作製するため、であり得る。種々のスクリーニングアッセイが以下に提供され、そして、このようなアッセイは、改変体を評価するために使用され得る。例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド改変体は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに結合する能力、ＡｃｔＲＩＩＢリガンドのＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドへの結合を妨害する能力についてスクリーニングされ得る。

ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはその改変体の活性はまた、細胞ベースのアッセイまたはインビボアッセイにおいて試験され得る。例えば、脂肪細胞の分化または機能に関与する遺伝子の発現に対するＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド改変体の作用が評価され得る（例えば、アディポネクチン）。これは、必要な場合、１または複数の組換えＡｃｔＲＩＩＢリガンドタンパク質の存在下で行われ得、そして、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドおよび／またはその改変体、そして任意選択でＡｃｔＲＩＩＢリガンドを生成するように細胞がトランスフェクトされ得る。同様に、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、マウスまたは他の動物に投与され得、そして、肝細胞または脂肪細胞の１または複数の特性（アディポネクチン遺伝子発現など）が評価され得る。同様に、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはその改変体の活性は、脂肪細胞、筋肉細胞、骨細胞、およびニューロン細胞において、これらの細胞の成長に対する任意の作用について、例えば、下記のアッセイによって試験され得る。このようなアッセイは、当技術分野で周知であり、常套的である。ＳＭＡＤ応答性のレポーター遺伝子が、このような細胞株において、下流のシグナル伝達に対する影響をモニターするために使用され得る。

天然に存在するＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに対して、選択的効力を有する、組み合わせで得られる（ｃｏｍｂｉｎａｔｏｒｉａｌｌｙ−ｄｅｒｉｖｅｄ）改変体が作製され得る。このような改変体タンパク質は、組換えＤＮＡ構築物から発現されたとき、遺伝子治療のプロトコルにおいて使用され得る。同様に、変異誘発は、対応する野生型ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドとは劇的に異なる細胞内半減期を有する改変体を生じ得る。例えば、変更されたタンパク質は、タンパク質分解、または、天然のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの崩壊もしくは他の方法で不活性化をもたらす他のプロセスに対してより安定性であるかもしくは安定性が低いかのいずれかにされ得る。このような改変体およびこれをコードする遺伝子は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの半減期を調節することによってＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドレベルを変更するために利用され得る。例えば、短い半減期は、より一過性の生物学的作用を生じ得、そして、誘導性の発現系の一部である場合、細胞内での組換えＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドレベルのより厳しい制御を可能にし得る。

特定の実施形態では、本発明のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、さらに、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド中に天然に存在する任意のものに加えて、翻訳後修飾を含み得る。このような修飾としては、アセチル化、カルボキシル化、グリコシル化、リン酸化、脂質化およびアシル化が挙げられるがこれらに限定されない。結果として、修飾されたＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、ポリエチレングリコール、脂質、多糖類もしくは単糖類およびホスフェイトのような非アミノ酸成分を含み得る。このような非アミノ酸成分の、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの機能に対する影響は、他のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド改変体について本明細書中に記載されるようにして試験され得る。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの新生形態を切断することによってＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドが細胞内で生成される場合、翻訳後プロセシングもまた、このタンパク質の正確な折り畳みおよび／または機能にとって重要となり得る。様々な細胞（例えば、ＣＨＯ、ＨｅＬａ、ＭＤＣＫ、２９３、ＷＩ３８、ＮＩＨ−３Ｔ３またはＨＥＫ２９３）が、このような翻訳後の活性のための特定の細胞機構および特徴的なメカニズムを有し、そして、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの正確な修飾およびプロセシングを保証するように選択され得る。

特定の態様では、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの機能的改変体または修飾形態は、少なくともＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの一部分と１または複数の融合ドメインとを有する融合タンパク質を含む。このような融合ドメインの周知の例としては、ポリヒスチジン、Ｇｌｕ−Ｇｌｕ、グルタチオンＳトランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、チオレドキシン、プロテインＡ、プロテインＧ、免疫グロブリン重鎖定常領域（例えば、Ｆｃ）、マルトース結合タンパク質（ＭＢＰ）、またはヒト血清アルブミンが挙げられるがこれらに限定されない。融合ドメインは、所望される特性を与えるように選択され得る。例えば、いくつかの融合ドメインが、アフィニティクロマトグラフィーによる融合タンパク質の単離に特に有用である。アフィニティ精製の目的では、グルタチオン−、アミラーゼ−、およびニッケル−もしくはコバルト−結合化樹脂のような、アフィニティクロマトグラフィーのための適切なマトリクスが使用される。このようなマトリクスの多くは、Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＧＳＴ精製システムおよび（ＨＩＳ_６）融合パートナーと共に有用なＱＩＡｅｘｐｒｅｓｓ^ＴＭシステム（Ｑｉａｇｅｎ）のような「キット」の形態で利用可能である。別の例としては、融合ドメインは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの検出を容易にするように選択され得る。このような検出ドメインの例としては、種々の蛍光タンパク質（例えば、ＧＦＰ）、ならびに、「エピトープタグ」（これは、特定の抗体に利用可能な、通常は短いペプチド配列である）が挙げられる。特定のモノクローナル抗体に容易に利用可能な周知のエピトープタグとしては、ＦＬＡＧ、インフルエンザウイルスヘマグルチニン（ＨＡ）およびｃ−ｍｙｃタグが挙げられる。いくつかの場合、融合ドメインは、関連のプロテアーゼが融合タンパク質を部分的に消化し、それによって、そこから組換えタンパク質を解放することを可能にする、第Ｘａ因子またはトロンビンのようなプロテアーゼ切断部位を有する。解放されたタンパク質は、次いで、その後のクロマトグラフィーによる分離によって、融合ドメインから単離され得る。特定の好ましい実施形態では、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、インビボでＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを安定化させるドメイン（「安定化」ドメイン）と融合される。「安定化」とは、それが、崩壊の減少によるものであるか、腎臓によるクリアランスの減少によるものであるか、他の薬物動態作用によるものであるかとは無関係に、血清半減期を増加させる任意のものを意味する。免疫グロブリンのＦｃ部分との融合は、広範囲のタンパク質に対して所望の薬物動態特性を与えることが公知である。同様に、ヒト血清アルブミンへの融合は、所望の特性を与え得る。選択され得る融合ドメインの他のタイプとしては、多量体化（例えば、二量体化、四量体化）ドメインおよび機能的ドメイン（例えば、筋肉の成長のさらなる刺激のような付加的な生物学的機能を与えるもの）が挙げられる。

具体例として、本発明は、Ｆｃドメインに融合された細胞外（例えば、ＢＭＰ７結合）ドメインを含む、ＢＭＰ７アンタゴニストとしての融合タンパク質を提供する。（例えば、配列番号１３）

任意選択で、Ｆｃドメインは、Ａｓｐ−２６５、リジン３２２およびＡｓｎ−４３４のような残基における１または複数の変異を有する。特定の場合、これらの変異のうち１または複数（例えば、Ａｓｐ−２６５変異）を持つ変異型Ｆｃドメインは、野生型Ｆｃドメインに対する、Ｆｃγ受容体への結合能の低下を有する。他の場合では、これらの変異のうち１または複数（例えば、Ａｓｎ−４３４変異）を持つ変異型Ｆｃドメインは、野生型Ｆｃドメインに対する、ＭＨＣクラスＩ関連のＦｃ受容体（ＦｃＲＮ）への結合能の増加を有する。

融合タンパク質の様々な成分は、所望の機能と両立するあらゆる様式で配列され得ることが理解される。例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、異種ドメインに対してＣ末端側に配置されても、あるいは、異種ドメインが、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに対してＣ末端側に配置されてもよい。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドドメインと異種ドメインとは、融合タンパク質において隣接している必要はなく、そして、さらなるドメインもしくはアミノ酸配列が、いずれかのドメインに対してＣ末端もしくはＮ末端側に、または、これらのドメイン間に含められてもよい。

特定の実施形態では、本発明のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを安定化させ得る１または複数の修飾を含む。例えば、このような修飾は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのインビトロ半減期を増強させるか、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの循環半減期を増強させるか、または、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのタンパク質分解を減少させる。このような安定化修飾としては、融合タンパク質（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドと安定化ドメインとを含む融合タンパク質が挙げられる）、グリコシル化部位の修飾（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドへのグリコシル化部位の付加が挙げられる）、および糖質部分の修飾（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドからの糖質部分の除去が挙げられる）が挙げられるがこれらに限定されない。融合タンパク質の場合、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、ＩｇＧ分子（例えば、Ｆｃドメイン）などの安定化ドメインに融合される。本明細書中で使用される場合、用語「安定化ドメイン」は、融合タンパク質の場合のように融合ドメイン（例えば、Ｆｃ）を指すだけでなく、糖質部分のような非タンパク質性修飾、または、ポリエチレングリコールのような非タンパク質性ポリマーも含む。

特定の実施形態では、本発明は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの単離および／または精製された形態（他のタンパク質から単離されたか、そうでなければ他のタンパク質を実質的に含まないもの）を利用可能にする。

特定の実施形態では、本発明のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド（修飾されていないか、または修飾された）は、種々の当該分野で公知の技法によって生成され得る。例えば、このようなＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、Ｂｏｄａｎｓｋｙ、Ｍ． Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ｏｆ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ、Ｓｐｒｉｎｇｅｒ Ｖｅｒｌａｇ、Ｂｅｒｌｉｎ（１９９３年）およびＧｒａｎｔ Ｇ． Ａ．（編）、Ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ Ｐｅｐｔｉｄｅｓ： Ａ Ｕｓｅｒ’ｓ Ｇｕｉｄｅ、Ｗ． Ｈ． Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９９２年）に記載されているものなどの、標準のタンパク質化学の技法を使用して合成され得る。さらに、自動ペプチド合成装置が市販されている（例えば、Ａｄｖａｎｃｅｄ ＣｈｅｍＴｅｃｈ Ｍｏｄｅｌ ３９６；Ｍｉｌｌｉｇｅｎ／Ｂｉｏｓｅａｒｃｈ ９６００）。あるいは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド、そのフラグメントまたは改変体は、当該分野で周知のように、種々の発現系（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ、チャイニーズハムスター卵巣細胞、ＣＯＳ細胞、バキュロウイルス）（下記もまた参照のこと）を使用して組換えにより生成され得る。さらなる実施形態では、修飾されたか、または修飾されていないＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、例えば、プロテアーゼ、例えばトリプシン、サーモリシン、キモトリプシン、ペプシン、または対の塩基性アミノ酸変換酵素（ＰＡＣＥ）を使用して、天然に存在するかまたは組換えにより生成された完全長ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを消化することによって生成され得る。コンピュータ解析（市販のソフトウェア、例えば、ＭａｃＶｅｃｔｏｒ、Ｏｍｅｇａ、ＰＣＧｅｎｅ、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎ，Ｉｎｃ．を使用する）は、タンパク質分解の切断部位を同定するために使用され得る。あるいは、このようなＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、化学的切断によって（例えば、臭化シアン、ヒドロキシアミン）などの当該分野で公知の標準技法などで天然に存在するかまたは組換えにより生成された完全長ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドから生成され得る。

３．ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードする核酸
特定の態様では、本発明は、本明細書に開示されている任意の改変体を含めた、任意のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド（例えば、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）をコードする、単離された核酸および／または組換え型の核酸を提供する。例えば、以下の配列は、天然に存在するヒトのＡｃｔＲＩＩＢ前駆体ポリペプチドをコードする（配列番号４）（ＮＭ＿００１１０６のヌクレオチド５〜１５４３、１５３９ｂｐ）：

以下の配列は、ヒトの可溶性の（細胞外）ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードする（配列番号３）（３４８ｂｐ）。

主題の核酸は、一本鎖であっても二本鎖であってもよい。このような核酸は、ＤＮＡ分子もしくはＲＮＡ分子であり得る。これらの核酸は、例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを作製するための方法において、または（例えば、遺伝子治療アプローチにおいて）直接的な治療剤として使用され得る。

特定の態様では、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードする本主題の核酸はさらに、配列番号３の改変体である核酸を含むものと理解される。改変体ヌクレオチド配列は、対立遺伝子改変体のような、１または複数のヌクレオチドの置換、付加もしくは欠失によって異なる配列を含み、したがって、配列番号４に指定されるコード配列のヌクレオチド配列とは異なるコード配列を含む。

特定の実施形態では、本発明は、配列番号３に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％または１００％同一な単離されたかまたは組換えの核酸配列を提供する。当業者は、配列番号３に対して相補的な核酸配列、および配列番号３の改変体もまた、本発明の範囲内であることを理解する。さらなる実施形態では、本発明の核酸配列は、異種ヌクレオチド配列と共に、または、ＤＮＡライブラリーにおいて、単離、組換えおよび／または融合され得る。

他の実施形態では、本発明の核酸はまた、配列番号３に指定されるヌクレオチド配列に対して高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列、配列番号３の相補配列、あるいは、これらのフラグメントを含む。上述のように、当業者は、ＤＮＡのハイブリダイゼーションを促進する適切なストリンジェンシー条件が変更され得ることを容易に理解する。当業者は、ＤＮＡのハイブリダイゼーションを促進する適切なストリンジェンシー条件が変更され得ることを容易に理解する。例えば、約４５℃における６．０×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）でのハイブリダイゼーションの後に、５０℃における２．０×ＳＳＣの洗浄を行い得る。例えば、洗浄工程における塩濃度は、５０℃における約２．０×ＳＳＣの低ストリンジェンシーから、５０℃における約０．２×ＳＳＣの高ストリンジェンシーまで選択され得る。さらに、洗浄工程における温度は、室温（約２２℃）の低ストリンジェンシー条件から、約６５℃の高ストリンジェンシー条件まで上昇され得る。温度と塩の両方が変更されても、温度または塩濃度が一定に保たれ、他の変数が変更されてもよい。一実施形態では、本発明は、室温における６×ＳＳＣとその後の室温で２×ＳＳＣでの洗浄の低ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズする核酸を提供する。

遺伝子コードにおける縮重に起因して配列番号３に示される核酸と異なる単離された核酸もまた、本発明の範囲内である。例えば、多数のアミノ酸が１を超えるトリプレットによって示される。同じアミノ酸を特定するコドンまたは同義語（例えば、ＣＡＵおよびＣＡＣはヒスチジンに対する同義語である）は、タンパク質のアミノ酸配列に影響を及ぼさない「サイレント」変異を生じ得る。しかしながら、哺乳動物細胞の中には、本主題のタンパク質のアミノ酸配列に変化をもたらすＤＮＡ配列の多型が存在することが予想される。当業者は、天然の対立遺伝子改変に起因して、所与の種の個体間に、特定のタンパク質をコードする核酸の１または複数のヌクレオチド（約３〜５％までのヌクレオチド）におけるこれらの改変が存在し得ることを理解する。任意およびあらゆるこのようなヌクレオチドの改変と、結果として生じるアミノ酸の多型とは、本発明の範囲内である。

特定の実施形態では、本発明の組換え核酸は、発現構築物において１または複数の調節性ヌクレオチド配列に作動可能に連結され得る。調節性のヌクレオチド配列は、一般に、発現のために使用される宿主細胞に対して適切なものである。種々の宿主細胞について、多数のタイプの適切な発現ベクターおよび適切な調節性配列が当該分野で公知である。代表的には、上記１または複数の調節性ヌクレオチド配列としては、プロモーター配列、リーダー配列もしくはシグナル配列、リボソーム結合部位、転写開始配列および転写終結配列、翻訳開始配列および翻訳終結配列、ならびに、エンハンサー配列もしくは活性化因子配列が挙げられ得るがこれらに限定されない。当該分野で公知の構成的もしくは誘導性のプロモーターが、本発明によって企図される。プロモーターは、天然に存在するプロモーター、または、１を超えるプロモーターの要素を組み合わせたハイブリッドプロモーターのいずれかであり得る。発現構築物は、プラスミドのようにエピソーム上で細胞中に存在し得るか、または、発現構築物は、染色体中に挿入され得る。好ましい実施形態では、発現ベクターは、形質転換された宿主細胞の選択を可能にするために、選択可能なマーカー遺伝子を含む。選択可能なマーカー遺伝子は、当該分野で周知であり、そして、使用される宿主細胞により変化する。

本発明の特定の態様では、本主題の核酸は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードし、そして、少なくとも１つの調節性配列に作動可能に連結されたヌクレオチド配列を含む発現ベクターにおいて提供される。調節性配列は当該分野で認識され、そして、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの発現を誘導するように選択される。したがって、用語、調節性配列は、プロモーター、エンハンサーおよび他の発現制御エレメントを含む。例示的な調節性配列は、Ｇｏｅｄｄｅｌ；Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ（１９９０年）に記載される。例えば、作動可能に連結されたときにＤＮＡ配列の発現を制御する広範な種々の発現制御配列のいずれかが、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードするＤＮＡ配列を発現させるためにこれらのベクターにおいて使用され得る。このような有用な発現制御配列としては、例えば、ＳＶ４０の初期および後期プロモーター、ｔｅｔプロモーター、アデノウイルスもしくはサイトメガロウイルスの前初期プロモーター、ＲＳＶプロモーター、ｌａｃシステム、ｔｒｐシステム、ＴＡＣもしくはＴＲＣシステム、Ｔ７ ＲＮＡポリメラーゼによってその発現が誘導されるＴ７プロモーター、ファージλの主要なオペレーターおよびプロモーター領域、ｆｄコートタンパク質の制御領域、３−ホスホグリセリン酸キナーゼもしくは他の糖分解酵素のプロモーター、酸性ホスファターゼのプロモーター（例えば、Ｐｈｏ５）、酵母α−接合因子（ｍａｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ）のプロモーター、バキュロウイルス系の多角体プロモーター、ならびに、原核生物もしくは真核生物の細胞、または、そのウイルスの遺伝子の発現を制御することが公知である他の配列、ならびにこれらの種々の組合せが挙げられる。発現ベクターの設計は、形質転換される宿主細胞の選択および／または発現されることが所望されるタンパク質のタイプのような要因に依存し得ることが理解されるべきである。さらに、ベクターのコピー数、コピー数を制御する能力およびベクターによってコードされる任意の他のタンパク質（例えば、抗生物質マーカー）の発現もまた考慮されるべきである。

本発明の組換え核酸は、クローニングされた遺伝子またはその一部を、原核生物細胞、真核生物細胞（酵母、鳥類、昆虫または哺乳動物）のいずれか、または両方において発現させるために適切なベクター中に連結することによって生成され得る。組換えＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの生成のための発現ビヒクルとしては、プラスミドおよび他のベクターが挙げられる。例えば、適切なベクターとしては、以下のタイプのプラスミドが挙げられる：原核生物細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）における発現のための、ｐＢＲ３２２由来のプラスミド、ｐＥＭＢＬ由来のプラスミド、ｐＥＸ由来のプラスミド、ｐＢＴａｃ由来のプラスミドおよびｐＵＣ由来のプラスミド。

いくつかの哺乳動物発現ベクターは、細菌中でのベクターの増殖を促進するための原核生物の配列と、真核生物細胞において発現される１または複数の真核生物の転写単位との両方を含む。ｐｃＤＮＡＩ／ａｍｐ、ｐｃＤＮＡＩ／ｎｅｏ、ｐＲｃ／ＣＭＶ、ｐＳＶ２ｇｐｔ、ｐＳＶ２ｎｅｏ、ｐＳＶ２−ｄｈｆｒ、ｐＴｋ２、ｐＲＳＶｎｅｏ、ｐＭＳＧ、ｐＳＶＴ７、ｐｋｏ−ｎｅｏおよびｐＨｙｇ由来のベクターは、真核生物細胞のトランスフェクションに適切な哺乳動物発現ベクターの例である。これらのベクターのいくつかは、原核生物細胞および真核生物細胞の両方における複製および薬物耐性選択を容易にするために、細菌プラスミド（例えば、ｐＢＲ３２２）からの配列を用いて修飾される。あるいは、ウシパピローマウイルス（ＢＰＶ−１）またはエプスタイン−バーウイルス（ｐＨＥＢｏ、ｐＲＥＰ由来およびｐ２０５）のようなウイルスの誘導体が、真核生物細胞におけるタンパク質の一過的な発現のために使用され得る。他のウイルス（レトロウイルスを含む）発現系の例は、遺伝子治療送達系の説明において以下に見出され得る。プラスミドの調製および宿主生物の形質転換において用いられる種々の方法は、当該分野で周知である。原核生物細胞および真核生物細胞の両方についての他の適切な発現系、ならびに、一般的な組換え手順については、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、２ｎｄ Ｅｄ．、Ｓａｍｂｒｏｏｋ、ＦｒｉｔｓｃｈおよびＭａｎｉａｔｉｓ編（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、１９８９年）第１６および１７章を参照のこと。いくつかの場合において、バキュロウイルス発現系を用いて組換えポリペプチドを発現させることが望ましくあり得る。このようなバキュロウイルス発現系の例としては、ｐＶＬ由来のベクター（例えば、ｐＶＬ１３９２、ｐＶＬ１３９３およびｐＶＬ９４１）、ｐＡｃＵＷ由来のベクター（例えば、ｐＡｃＵＷｌ）およびｐＢｌｕｅＢａｃ由来のベクター（例えば、β−ｇａｌを含むｐＢｌｕｅＢａｃ ＩＩＩ）が挙げられる。

好ましい実施形態では、ベクターは、ＣＨＯ細胞における本主題のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの生成のために設計される（例えば、Ｐｃｍｖ−Ｓｃｒｉｐｔベクター（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ，Ｌａ Ｊｏｌｌａ，Ｃａｌｉｆ．）、ｐｃＤＮＡ４ベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，Ｃａｌｉｆ．）およびｐＣＩ−ｎｅｏベクター（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃ））。明らかであるように、本主題の遺伝子構築物は、例えば、タンパク質（融合タンパク質または改変体タンパク質を含む）を生成するため、精製のために、培養物において増殖させた細胞において本主題のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの発現を引き起こすために使用され得る。

本発明はまた、１または複数の本主題のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのコード配列（例えば、配列番号４）を含む組換え遺伝子をトランスフェクトされた宿主細胞に関する。宿主細胞は、任意の原核生物細胞または真核生物細胞であり得る。例えば、本発明のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、Ｅ．ｃｏｌｉのような細菌細胞、昆虫細胞（例えば、バキュロウイルス発現系を用いる）、酵母細胞または哺乳動物細胞において発現され得る。他の適切な宿主細胞は、当業者に公知である。

したがって、本発明はさらに、本主題のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを生成する方法に関する。例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードする発現ベクターでトランスフェクトされた宿主細胞は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの発現を起こすことが可能な適切な条件下で培養され得る。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを含む細胞および培地の混合物から分泌および単離され得る。あるいは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、細胞質または膜画分に保持され得、そして、細胞が回収、溶解され、そして、タンパク質が単離される。細胞培養物は、宿主細胞、培地および他の副産物を含む。細胞培養に適切な培地は、当該分野で周知である。本主題のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、タンパク質の精製についての当該分野で公知の技術（イオン交換クロマトグラフィー、ゲル濾過クロマトグラフィー、限外濾過、電気泳動、およびＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの特定のエピトープに特異的な抗体を用いた免疫親和性精製を含む）を用いて、細胞培養培地、宿主細胞またはこの両方から単離され得る。好ましい実施形態では、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、その精製を促進するドメインを含む融合タンパク質である。

別の実施形態では、精製用リーダー配列（例えば、組換えＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの所望の部分のＮ末端に位置するポリ−（Ｈｉｓ）／エンテロキナーゼ切断部位の配列）をコードする融合遺伝子は、Ｎｉ^２＋金属樹脂を用いる親和性クロマトグラフィーによる、発現された融合タンパク質の精製を可能にし得る。その後、精製用リーダー配列は、引き続いて、エンテロキナーゼでの処理によって除去され、精製ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを提供し得る（例えば、Ｈｏｃｈｕｌｉら、（１９８７年）Ｊ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ ４１１巻：１７７頁；およびＪａｎｋｎｅｃｈｔら、ＰＮＡＳ ＵＳＡ ８８巻：８９７２頁を参照のこと）。

融合遺伝子を作製するための技術は周知である。本質的には、異なるポリペプチド配列をコードする種々のＤＮＡフラグメントの接合は、ライゲーションのための平滑末端もしくはスタガード（ｓｔａｇｇｅｒｅｄ）末端、適切な末端を提供するための制限酵素消化、必要に応じた粘着末端のフィルイン（ｆｉｌｌｉｎｇ−ｉｎ）、所望されない接合を回避するためのアルカリ性ホスファターゼ処理、および酵素によるライゲーション、を用いる従来の技術に従って行われる。別の実施形態では、融合遺伝子は、自動ＤＮＡ合成装置を含む従来の技術によって合成され得る。あるいは、遺伝子フラグメントのＰＣＲ増幅は、２つの連続した遺伝子フラグメント間の相補的なオーバーハング（ｏｖｅｒｈａｎｇ）を生じるアンカープライマーを用いて行われ得、これらのフラグメントは、その後、キメラ遺伝子配列を生じるようにアニーリングされ得る（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ：１９９２年を参照のこと）。

４．抗体および他のアンタゴニスト
本発明の別の態様は、本明細書に開示されている標的に結合するタンパク質および本明細書に開示されている標的の発現を阻害する核酸を含めた、抗体および他のアンタゴニストに関する。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド（例えば、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）に特異的に反応する抗体およびＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドと競合的に結合する抗体が、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの活性のアンタゴニストとして使用され得る。例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに由来する免疫原を使用することにより、標準のプロトコルによって抗タンパク質／抗ペプチドの抗血清またはモノクローナル抗体が作製され得る（例えば、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ編（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ：１９８８年）を参照されたい）。マウス、ハムスターまたはウサギなどの哺乳動物を、免疫原性の形態のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドもしくはＡｃｔＲＩＩＢリガンド、抗体応答を惹起することができる抗原性フラグメント、または融合タンパク質を用いて免疫化することができる。タンパク質またはペプチドに免疫原性を付与するための技法としては、担体への結合体化または当技術分野で周知の他の技法が挙げられる。ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはＡｃｔＲＩＩＢリガンドの免疫原性部分は、アジュバントの存在下で投与され得る。免疫化の進行は、血漿中または血清中の抗体価を検出することによってモニターされ得る。抗体のレベルを評価するために、標準のＥＬＩＳＡまたは他のイムノアッセイが、免疫原としての抗原と一緒に使用され得る。

ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはＡｃｔＲＩＩＢリガンドの抗原性調製物を用いて動物を免疫化した後、抗血清を得ることができ、所望であれば、ポリクローナル抗体が血清から単離され得る。モノクローナル抗体を生成するために、免疫化した動物から抗体産生細胞（リンパ球）を回収し、標準の体細胞融合手順によって骨髄腫細胞などの不死化細胞と融合してハイブリドーマ細胞を生じさせることができる。このような技法は当技術分野で周知であり、それらとしては、例えば、ハイブリドーマ技法（ＫｏｈｌｅｒおよびＭｉｌｓｔｅｉｎ、１９７５年、Ｎａｔｕｒｅ、２５６巻：４９５〜４９７頁によって最初に開発された）、ヒトＢ細胞ハイブリドーマ技法（Ｋｏｚｂａｒら、１９８３年、Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ Ｔｏｄａｙ、４巻：７２頁）、およびヒトモノクローナル抗体を生成するためのＥＢＶ−ハイブリドーマ技法（Ｃｏｌｅら、１９８５年、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ ＡｎｔｉｂｏｄｉｅｓおよびＣａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ、Ａｌａｎ Ｒ． Ｌｉｓｓ、Ｉｎｃ．７７〜９６頁）が挙げられる。ハイブリドーマ細胞は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに特異的に反応する抗体の産生について、免疫化学的にスクリーニングされ得、そしてこのようなハイブリドーマ細胞を含む培養物からモノクローナル抗体が単離され得る。

用語「抗体」は、本明細書中で使用される場合、対象のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはＡｃｔＲＩＩＢリガンドにも特異的に反応するそのフラグメントを包含することが意図される。抗体は、従来の技法を使用してフラグメント化され得、そして、そのフラグメントは、有用性について、上記の全抗体についてと同様にスクリーニングされ得る。例えば、抗体をペプシンで処理することによって、Ｆ（ａｂ）_２フラグメントが作製され得る。生じたＦ（ａｂ）_２フラグメントは、Ｆａｂフラグメントを作製するために、ジスルフィド架橋を還元させるように処理され得る。本発明の抗体は、抗体の少なくとも１のＣＤＲ領域によって付与されるＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに対する親和性を有する二重特異性分子、単鎖分子、キメラ分子およびヒト化分子を包含することがさらに意図される。好ましい実施形態において、抗体は、抗体に付着し、検出され得る標識をさらに含む（例えば、標識は、放射性同位元素、蛍光化合物、酵素または酵素の補因子であり得る）。

特定の好ましい実施形態では、本発明の抗体は、モノクローナル抗体であり、特定の実施形態では、本発明は、新規の抗体を作製するための方法を利用可能にする。例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはＡｃｔＲＩＩＢリガンドに特異的に結合するモノクローナル抗体を作製するための方法は、マウスに、ある量の、検出可能な免疫応答を刺激するために有効なＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはＡｃｔＲＩＩＢリガンドを含む免疫原性組成物を投与するステップと、マウスから抗体産生細胞（例えば、脾臓からの細胞）を得るステップと、抗体産生細胞を骨髄腫細胞と融合して抗体産生ハイブリドーマを得るステップと、抗体産生ハイブリドーマを試験して、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはＡｃｔＲＩＩＢリガンドに特異的に結合するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを同定するステップとを含み得る。ハイブリドーマが得られたら、それを細胞培養物中で、任意選択で、ハイブリドーマ由来の細胞が、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはＡｃｔＲＩＩＢリガンドに特異的に結合するモノクローナル抗体を産生する培養条件において、増殖させることができる。モノクローナル抗体は細胞培養物から精製され得る。

形容詞「に特異的に反応する」は、抗体に関して使用される場合、当技術分野で一般に理解されているように、抗体が、対象の抗原（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）と対象でない他の抗原との間で十分に選択的であること、抗体が、最低でも、特定の種類の生物試料中の対象の抗原の存在を検出するために有用であることを意味することが意図される。治療適用などの、抗体を使用する特定の方法では、高い程度の結合の特異性が望まれ得る。モノクローナル抗体は、一般に、（ポリクローナル抗体と比較して）所望の抗原と交差反応性のポリペプチドとを有効に識別する傾向が強い。抗体：抗原相互作用の特異性に影響を及ぼす１つの特徴は、抗体の抗原に対する親和性である。所望の特異性には、種々の異なる親和性で達し得るが、一般に好ましい抗体は、約１０^−６、１０^−７、１０^−８、１０^−９またはそれ未満の親和性（解離定数）を有する。

さらに、望ましい抗体を同定するために抗体をスクリーニングするのに使用される技法は、得られる抗体の特性に影響を及ぼし得る。例えば、抗体を、溶液中の抗原と結合させるために使用する場合、溶液の結合を試験することが望ましいことがある。特に望ましい抗体を同定するために、抗体と抗原との間の相互作用を試験するための種々の異なる技法が利用可能である。このような技法としては、ＥＬＩＳＡ、表面プラズモン共鳴結合アッセイ（例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ結合アッセイ、Ｂｉａ−ｃｏｒｅ ＡＢ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）、サンドイッチアッセイ（例えば、ＩＧＥＮ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ，Ｉｎｃ．，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，Ｍａｒｙｌａｎｄの常磁性ビーズシステム）、ウェスタンブロット、免疫沈降アッセイおよび免疫組織化学が挙げられる。

特定の態様では、本開示は、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたは可溶性のＡｃｔＲＩＩＢリガンドに結合する抗体を提供する。このような抗体は、上記の通り、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたは可溶性のＡｃｔＲＩＩＢリガンドまたはそのフラグメントを抗原として使用して多量に生成され得る。この種類の抗体は、例えば、生物試料中のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを検出するため、および／または個体における可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのレベルをモニターするために使用され得る。ある場合では、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたは可溶性のＡｃｔＲＩＩＢリガンドに特異的に結合する抗体は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドおよび／またはＡｃｔＲＩＩＢリガンドの活性を調節し、それによって脂肪肝疾患を処置するために使用され得る。

ミオスタチンおよびＧＤＦ３などの特定のリガンドは、それぞれのプロペプチドの結合部分、またはその改変体を含むポリペプチドを使用することによって阻害され得る。このようなプロペプチドは、Ｆｃ融合タンパク質を含めた、融合タンパク質として調製され得る。適切なプロペプチドの例は、公開特許出願ＷＯ０２／０８５３０６およびＷＯ０６／００２３８７に開示されている。

さらに、いわゆる「トラップ」（例えば、フォリスタチン、ＦＬＲＧ、ＦＳＴＬ、ケルベロスおよびＣｏｃｏ）、可溶性のＩ型受容体、例えばＡＬＫ−７などの他の結合タンパク質が使用され得る。このようなポリペプチドの例は、公開特許出願ＷＯ０５／１１５４３９、ＷＯ０８／１０９７７９、ＷＯ０８／０６７４８０、ＷＯ０７／１０９６８６、ＷＯ０５／１００５６３、およびＷＯ０５／０２５６０１において見ることができる。

アンチセンスプローブまたはＲＮＡｉプローブなどの核酸（天然に存在するヌクレオチドおよび天然に存在しないヌクレオチドの両方を含み得る）は、ＡｃｔＲＩＩＢまたは本明細書で考察したリガンドのいずれかの発現を阻害するために使用され得る。

５．スクリーニングアッセイ
特定の態様では、本発明は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである化合物（因子）を同定するための、対象のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド（例えば、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）の使用に関する。このスクリーニングによって同定された化合物は、インビトロで組織の成長を調節するその能力を評価するために、脂肪、筋肉、骨、軟骨、および／またはニューロンなどの組織において試験され得る。任意選択で、これらの化合物は、インビボで組織の成長を調節するそれらの能力を評価するために、動物モデルにおいてさらに試験され得る。

ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを標的化することによって、組織の成長を調節するための治療剤についてスクリーニングするための多数のアプローチが存在する。特定の実施形態では、脂肪、筋肉、骨、軟骨、および／またはニューロンの成長に対するＡｃｔＲＩＩＢ媒介性の作用を混乱させる因子を同定するために、化合物のハイスループットなスクリーニングが行われ得る。特定の実施形態では、アッセイは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの、その結合パートナー、例えば、ＡｃｔＲＩＩＢリガンド（例えば、アクチビン、ＢＭＰ７、Ｎｏｄａｌ、ＧＤＦ８、またはＧＤＦ１１）などへの結合を特異的に阻害する、または減少させる化合物をスクリーニングし、同定するために行われる。あるいは、アッセイは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの、その結合タンパク質、例えばＡｃｔＲＩＩＢリガンドなどへの結合を増強する化合物を同定するために使用され得る。さらなる実施形態では、化合物は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドと相互作用するその能力によって同定され得る。

種々のアッセイ形式が十分であり、そして、本開示を考慮すれば、本明細書中に明示的に記載されない形式は、本明細書中に記載されていないにもかかわらず、当業者によって理解される。本明細書中に記載されるように、本発明の試験化合物（因子）は、任意の組み合わせ化学の方法によって作製され得る。あるいは、本主題の化合物は、インビボまたはインビトロで合成された天然に存在する生体分子であり得る。組織増殖の調節因子として作用するその能力について試験される化合物（因子）は、例えば、細菌、酵母、植物または他の生物によって生成されても（例えば、天然の生成物）、化学的に生成されても（例えば、ペプチド模倣物を含む低分子）、組換えにより生成されてもよい。本発明によって企図される試験化合物としては、非ペプチジル有機分子、ペプチド、ポリペプチド、ペプチド模倣物、糖、ホルモンおよび核酸分子が挙げられる。特定の実施形態では、試験因子は、約２０００ダルトン未満の分子量を持つ小さな有機分子である。

本発明の試験化合物は、単一の別個の実体として提供され得るか、または、組み合わせ化学によって作製されたような、より複雑度の高いライブラリーにおいて提供され得る。これらのライブラリーは、例えば、アルコール、ハロゲン化アルキル、アミン、アミド、エステル、アルデヒド、エーテルおよび有機化合物の他の分類を含み得る。試験システムに対する試験化合物の提示は、特に、最初のスクリーニング段階において、単離された形態または化合物の混合物としてのいずれかであり得る。任意選択で、化合物は、任意選択で他の化合物で誘導体化され得、そして、化合物の単離を容易にする誘導体化基を有し得る。誘導体化基の非限定的な例としては、ビオチン、フルオレセイン、ジゴキシゲニン、緑色蛍光タンパク質、同位体、ポリヒスチジン、磁気ビーズ、グルタチオンＳトランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、光活性化クロスリンカー、またはこれらの任意の組合せが挙げられる。

化合物および天然抽出物のライブラリーを試験する多くの薬物スクリーニングプログラムにおいて、所与の期間に調査される化合物の数を最大にするためには、ハイスループットアッセイが望ましい。精製もしくは半精製（ｓｅｍｉ−ｐｕｒｉｆｉｅｄ）されたタンパク質で誘導され得るような、無細胞のシステムにおいて行われるアッセイは、試験化合物によって媒介される分子標的における変更の迅速な発生と比較的容易な検出とを可能にするように作られ得るという点で、しばしば、「一次」スクリーニングとして好ましい。さらに、試験化合物の細胞毒性またはバイオアベイラビリティの作用は、一般に、インビトロのシステムでは無視され得るが、その代わりに、このアッセイは主として、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドとその結合タンパク質（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢリガンド）との間の結合親和性の変更において明らかになり得るような、分子標的に対する薬物の作用に焦点を当てている。

単なる例示として、本発明の例示的なスクリーニングアッセイでは、関心のある化合物は、アッセイの意図に応じて適宜、通常ＡｃｔＲＩＩＢリガンドに結合し得る単離および精製されたＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドと接触させられる。その後、化合物とＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドとの混合物は、ＡｃｔＲＩＩＢリガンドを含む組成物に加えられる。ＡｃｔＲＩＩＢ／ＡｃｔＲＩＩＢリガンド複合体の検出および定量は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドとその結合タンパク質との間の複合体の形成の阻害（または助長）における化合物の効力を決定するための手段を提供する。化合物の効力は、種々の濃度の試験化合物を用いて得られたデータから用量応答曲線を生成することによって評価され得る。さらに、比較のためのベースラインを提供するためのコントロールアッセイもまた行われ得る。例えば、コントロールアッセイでは、単離および精製されたＡｃｔＲＩＩＢリガンドは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを含む組成物に加えられ、そして、ＡｃｔＲＩＩＢ／ＡｃｔＲＩＩＢリガンド複合体の形成は、試験化合物の非存在下で定量される。一般に、反応物が混合され得る順序は変化し得、そして、同時に混合され得ることが理解される。さらに、適切な無細胞アッセイ系を与えるように、精製したタンパク質の代わりに、細胞の抽出物および溶解物が使用され得る。

ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドとその結合タンパク質との間の複合体の形成は、種々の技術によって検出され得る。例えば、複合体の形成の調節は、例えば、検出可能に標識されたタンパク質、例えば、放射標識（例えば、^３２Ｐ、^３５Ｓ、^１４Ｃまたは^３Ｈ）、蛍光標識（例えば、ＦＩＴＣ）、または、酵素標識されたＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはその結合タンパク質を用いて、イムノアッセイによって、あるいは、クロマトグラフィーによる検出によって定量され得る。

特定の実施形態では、本発明は、直接的または間接的のいずれかで、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドとその結合タンパク質との間の相互作用の程度を測定する、蛍光偏光アッセイおよび蛍光共鳴エネルギー遷移（ＦＲＥＴ）アッセイの使用を企図する。さらに、光導波管（ｗａｖｅｇｕｉｄｅ）（ＰＣＴ公開ＷＯ９６／２６４３２および米国特許第５，６７７，１９６号）、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）、表面電荷センサ、および表面力センサに基づくもののような、他の検出様式が、本発明の多くの実施形態と適合性がある。

さらに、本発明は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドとその結合タンパク質との間の相互作用を妨害または助長する因子を同定するための、「ツーハイブリッドアッセイ」としても公知である相互作用トラップアッセイの使用を企図する。例えば、米国特許第５，２８３，３１７号；Ｚｅｒｖｏｓら（１９９３年）Ｃｅｌｌ ７２巻：２２３〜２３２頁；Ｍａｄｕｒａら（１９９３年）Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２６８巻：１２０４６〜１２０５４頁；Ｂａｒｔｅｌら（１９９３年）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １４巻：９２０〜９２４頁；およびＩｗａｂｕｃｈｉら（１９９３年）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ８巻：１６９３〜１６９６頁を参照のこと。特定の実施形態では、本発明は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドとその結合タンパク質との間の相互作用を解離させる化合物（例えば、低分子またはペプチド）を同定するための、逆ツーハイブリッドシステムの使用を企図する。例えば、ＶｉｄａｌおよびＬｅｇｒａｉｎ（１９９９年）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ ２７巻：９１９〜２９頁；ＶｉｄａｌおよびＬｅｇｒａｉｎ（１９９９年）Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ １７巻：３７４〜８１頁；ならびに米国特許第５，５２５，４９０号；同第５，９５５，２８０号；および同第５，９６５，３６８号を参照のこと。

特定の実施形態では、本主題の化合物は、本発明のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドと相互作用するその能力によって同定される。化合物と、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドとの間の相互作用は、共有結合性であっても非共有結合性であってもよい。例えば、このような相互作用は、光架橋、放射性標識リガンド結合、およびアフィニティクロマトグラフィーを含むインビトロの生化学的な方法を用いて、タンパク質レベルで同定され得る（Ｊａｋｏｂｙ ＷＢら、１９７４年、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ４６巻：１頁）。特定の場合には、化合物は、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドに結合する化合物を検出するためのアッセイのような、機構ベースのアッセイにおいてスクリーニングされ得る。これは、固相もしくは流体相の結合事象を含み得る。あるいは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドをコードする遺伝子は、レポーターシステム（例えば、β−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼまたは緑色蛍光タンパク質）と共に細胞中にトランスフェクトされ、そして、好ましくは、ハイスループットスクリーニングによって、ライブラリーに対して、または、ライブラリーの個々のメンバーを用いてスクリーニングされ得る。他の機構ベースの結合アッセイ（例えば、自由エネルギーの変化を検出する結合アッセイ）が使用され得る。結合アッセイは、ウェル、ビーズもしくはチップに固定されているか、または、固定された抗体によって捕捉されている標的を用いて行われ得るか、あるいは、キャピラリー電気泳動によって分離され得る。結合した化合物は通常、比色または蛍光または表面プラズモン共鳴を用いて検出され得る。

特定の態様では、本発明は、アディポネクチンのシグナル伝達、インスリン抵抗性および肥満を調節するための方法および因子を提供する。

本発明のスクリーニングアッセイは、本主題のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドおよびＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドの改変体だけでなく、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたはＡｃｔＲＩＩＢシグナル伝達のアゴニストおよびアンタゴニストを含めた任意の試験化合物にも適用されることが理解される。さらに、これらのスクリーニングアッセイは、薬物の標的の確認および品質管理の目的のために有用である。

６．例示的な治療的用途
特定の実施形態では、本発明の組成物（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）は、脂肪肝疾患に関連する疾患また状態を処置または予防するために使用され得る。特定の実施形態では、本発明は、治療有効量の上記のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを個体に投与することによって、処置または予防を必要とする個体を処置または予防する方法を提供する。これらの方法は、特に動物、特に、ヒトの治療的および予防的な処置を目的としている。

本明細書中で使用される場合、障害または状態を「予防する」治療薬は、統計的試料において、無処置の対照試料に対して、処置試料における障害もしくは状態の出現を低下させるか、あるいは、無処置の対照試料に対して、障害もしくは状態の１または複数の症状の発症を遅延させるか、または、重篤度を低下させるような化合物を指す。用語「処置する」は、本明細書中で使用される場合、指定された状態の予防、または、一度確立された状態の改善もしくは除去を含む。

本明細書において実証されている通り、ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃは、白色脂肪細胞によるアディポネクチンの発現を促進し、標的組織におけるインスリン感受性を増加させ、肝臓脂肪症を阻害する。したがって、本明細書に開示されている組成物は、種々の障害、例えば、非アルコール性脂肪性肝疾患、非アルコール性脂肪性肝炎、アルコール性脂肪肝疾患、アルコール性脂肪性肝炎、肝線維症および硬変症などを処置するために使用され得る。

特定の実施形態では、本発明の組成物（例えば、可溶性ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）を使用して、肝臓脂肪症を阻害する。この作用は、循環アディポネクチンの濃度の増加を促進する作用、および／または標的組織におけるインスリン感受性の増加を引き起こす作用と一緒になり得る。１または複数のＡｃｔＲＩＩＢリガンドのインビボでの遮断機能または拮抗機能は、肝臓脂肪症を有効に阻害し、それによって望ましくない状態を処置し得る。このアプローチは、本明細書で示されるデータによって確証され、支持され、それによって、ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃタンパク質が、脂肪細胞のアディポネクチンの発現を増加させること、循環アディポネクチン濃度を増加させること、インスリン感受性の増加と一致して、循環インスリン濃度を低下させること、血清脂質プロファイルに有益な変化を生じさせること、体組成を改善すること、および肝臓脂肪症を予防することが示された。

７．薬学的組成物
特定の実施形態では、本発明の化合物（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）は、薬学的に受容可能なキャリアと共に処方される。例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドは、単独で、または、薬学的処方物（治療用組成物）の成分として投与され得る。本主題の化合物は、ヒトまたは獣医学における医薬での使用のために任意の簡便な方法で投与するために処方され得る。

特定の実施形態では、本発明の治療方法は、局所に（ｔｏｐｉｃａｌｌｙ）、全身に、または、移植物もしくはデバイスとして局所的に（ｌｏｃａｌｌｙ）組成物を投与することを包含する。投与される場合、本発明において使用するための治療用組成物は、当然のことながら、発熱物質を含まない生理学的に容認可能な形態である。さらに、組成物は、標的組織部位（例えば、骨、軟骨、筋肉、脂肪またはニューロン）、例えば、組織の損傷を有する部位へと送達するためにカプセル化されるか、または粘性の形態で注射されることが望ましい場合がある。局所投与は、創傷治癒および組織修復のために適している可能性がある。また、その代わりにまたはそれに加えて、上記の組成物中に任意選択で含められ得るＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド以外の治療上有用な因子は、本発明の方法において、本主題の化合物（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）と同時に、または逐次的に投与され得る。

特定の実施形態では、本発明の組成物は、標的組織部位に１または複数の治療用化合物（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）を送達し得、成長中の組織のための構造を提供し得、そして、最適には身体内へと再吸収され得るマトリクスを含み得る。例えば、マトリクスは、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドのゆっくりとした放出を提供し得る。このようなマトリクスは、他の移植医療用途に現在使用される材料から形成され得る。

マトリクス材料の選択は、生体適合性、生分解性、機械的特性、見かけ上の様相および界面の特性に基づく。本主題の組成物の特定の用途が、適切な処方物を画定する。組成物のための可能性のあるマトリクスは、生分解性でかつ化学的に画定された硫酸カルシウム、リン酸三カルシウム、ヒドロキシアパタイト、ポリ乳酸およびポリ無水物であり得る。他の可能性のある材料は、生分解性でかつ生物学的に十分に画定されたもの（例えば、骨または皮膚のコラーゲン）である。さらなるマトリクスは、純粋なタンパク質または細胞外マトリクスの成分を含む。他の可能性のあるマトリクスは、非生分解性でかつ化学的に画定されたもの（例えば、焼結ヒドロキシアパタイト、バイオグラス、アルミン酸塩、または他のセラミクス）である。マトリクスは、上述のタイプの材料のいずれかの組合せ（例えば、ポリ乳酸およびヒドロキシアパタイト、または、コラーゲンおよびリン酸三カルシウム）を含み得る。バイオセラミクスは、組成物中（例えば、カルシウム−アルミン酸−リン酸中）で変化され得、孔径、粒径、粒子の形状および生分解性を変更するように加工され得る。

特定の実施形態では、本発明の方法は、例えば、カプセル、カシェ、丸剤、錠剤、ロゼンジ（矯味矯臭薬を含む基材、通常はスクロースおよびアカシアまたはトラガントを用いて）、散剤、顆粒剤、または、水性もしくは非水性液体中の溶液もしくは懸濁物として、または、水中油もしくは油中水の液体エマルジョンとして、または、エリキシルもしくはシロップとして、または、トローチ（ゼラチンおよびグリセリン、または、スクロースおよびアカシアのような不活性基材を用いて）および／またはマウスウォッシュなどの形態（この各々が、活性成分として所定量の因子を含む）で、経口投与され得る。因子はまた、ボーラス、舐剤またはペーストとしても投与され得る。

経口投与のための固体投薬形態（カプセル、錠剤、丸剤、糖衣錠、散剤、顆粒剤など）において、本発明の１または複数の治療用化合物は、１または複数の薬学的に受容可能なキャリア（例えば、クエン酸ナトリウムまたはリン酸二カルシウム）および／または、以下のうちのいずれかと共に混合され得る：（１）充填剤または増量剤（例えば、デンプン、ラクトース、スクロース、グルコース、マンニトールおよび／またはケイ酸）；（２）結合剤（例えば、カルボキシメチルセルロース、アルギン酸塩、ゼラチン、ポリビニルピロリドン、スクロースおよび／またはアカシアなど）；（３）湿潤剤（例えば、グリセロール）；（４）崩壊剤（例えば、寒天（ａｇａｒ−ａｇａｒ）、炭酸カルシウム、ポテトもしくはタピオカデンプン、アルギン酸、特定のケイ酸塩、および炭酸ナトリウム）；（５）溶液抑制因子（ｓｏｌｕｔｉｏｎ ｒｅｔａｒｄｉｎｇ ａｇｅｎｔ）（例えば、パラフィン）；（６）吸収加速剤（例えば、四級アンモニウム化合物）；（７）加湿剤（例えば、セチルアルコールおよびモノステアリン酸グリセロールなど）；（８）吸着剤（例えば、カオリンおよびベントナイトクレイ）；（９）潤滑剤（例えば、滑石、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固体ポリエチレングリコール、ラウリル硫酸ナトリウムおよびこれらの混合物）；および（１０）着色剤。カプセル、錠剤および丸剤の場合には、薬学的組成物はまた、緩衝剤を含み得る。同様のタイプの固形組成物もまた、ラクトースすなわち乳糖ならびに高分子量ポリエチレングリコールなどのような賦形剤を用いて、軟充填ゼラチンカプセルおよび硬充填ゼラチンカプセル中の充填物として用いられ得る。

経口投与のための液体投薬形態としては、薬学的に受容可能なエマルジョン、マイクロエマルジョン、溶液、懸濁物、シロップおよびエリキシルが挙げられる。活性成分に加え、液体投薬形態は、当該分野で一般に用いられる不活性希釈剤、例えば、水または他の溶媒、可溶化剤および乳化剤、例えば、エチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、１，３−ブチレングリコール、油（特に、綿実油、ピーナッツ油、トウモロコシ油、胚芽油、オリーブ油、ヒマシ油およびゴマ油）、グリセロール、テトラヒドロフリルアルコール、ポリエチレングリコールおよびソルビタンの脂肪酸エステル、ならびにこれらの混合物を含み得る。不活性な希釈剤に加え、経口用組成物はまた、加湿剤、乳化剤および懸濁剤、甘味剤、矯味矯臭剤、着色剤、芳香剤および保存剤のようなアジュバントを含み得る。

懸濁物は、活性な化合物に加えて、懸濁剤、例えば、エトキシル化イソステアリルアルコール、ポリオキシエチレンソルビトールおよびソルビタンエステル、微結晶性セルロース、アルミニウムメタヒドロキシド、ベントナイト、寒天およびトラガント、ならびにこれらの混合物を含み得る。

本明細書に開示されている特定の組成物は、皮膚または粘膜のいずれかに局所的に投与され得る。局所用処方物は、皮膚または角質層への浸透賦活剤（ｐｅｎｅｔｒａｔｉｏｎ ｅｎｈａｎｃｅｒ）として有効であることが公知の多種多様の因子の１または複数をさらに含み得る。これらの例は、２−ピロリドン、Ｎ−メチル−２−ピロリドン、ジメチルアセトアミド、ジメチルホルムアミド、プロピレングリコール、メチルアルコールまたはイソプロピルアルコール、ジメチルスルホキシド、およびアゾンである。さらなる因子が、化粧品として容認される処方物を作製するためにさらに含められ得る。これらの例は、脂肪、ワックス、油、色素、芳香剤、保存料、安定剤、および表面活性剤（ｓｕｒｆａｃｅ ａｃｔｉｖｅ ａｇｅｎｔ）である。当技術分野で公知のものなどの角質溶解薬（ｋｅｒａｔｏｌｙｔｉｃ ａｇｅｎｔ）も含められ得る。例は、サリチル酸および硫黄である。

局所投与または経皮投与するための剤形としては、散剤、スプレー剤、軟膏剤、ペースト剤、クリーム剤、ローション剤、ゲル剤、液剤、パッチ剤、および吸入剤が挙げられる。活性化合物は、滅菌条件下で、薬学的に受容可能なキャリアと共に、および必要であり得る任意の保存料、緩衝剤、または噴霧剤（ｐｒｏｐｅｌｌａｎｔ）と共に混合され得る。軟膏剤、ペースト剤、クリーム剤およびゲル剤は、本発明の本主題の化合物（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）に加えて、賦形剤、例えば、動物および植物の脂肪、油、ワックス、パラフィン、デンプン、トラガント、セルロース誘導体、ポリエチレングリコール、シリコーン、ベントナイト、ケイ酸、タルクおよび酸化亜鉛、またはそれらの混合物などを含み得る。

散剤およびスプレー剤は、本主題の化合物に加えて、賦形剤、例えば、ラクトース、タルク、ケイ酸、水酸化アルミニウム、ケイ酸カルシウム、およびポリアミド粉末、またはこれらの物質の混合物などを含み得る。スプレー剤は、ブタンおよびプロパンなどの、クロロフルオロヒドロカーボンおよび揮発性の非置換型炭化水素などの通例の噴霧剤をさらに含み得る。

特定の実施形態では、非経口投与に適した薬学的組成物は、１または複数のＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドを、１または複数の薬学的に受容可能な無菌かつ等張の水性もしくは非水性の溶液、分散物、懸濁液もしくはエマルジョン、または、使用直前に無菌の注射可能な溶液もしくは分散物へと再構成され得る無菌粉末と組み合わせて含み得、この組成物は、抗酸化物質、緩衝剤、静菌剤、処方物を意図されるレシピエントの血液と等張にする溶質、または懸濁剤もしくは増粘剤を含み得る。本発明の薬学的組成物中で採用され得る適切な水性および非水性のキャリアの例としては、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど）およびこれらの適切な混合物、植物油（例えば、オリーブ油）、ならびに、注射可能な有機エステル（例えば、オレイン酸エチル）が挙げられる。適切な流動性は、例えば、コーティング材料（例えば、レシチン）の使用によって、分散物の場合には必要とされる粒径の維持によって、そして、界面活性剤の使用によって維持され得る。

本発明の組成物はまた、保存剤、加湿剤、乳化剤および分散剤のようなアジュバントを含み得る。微生物の作用の阻止は、種々の抗細菌剤および抗真菌剤（例えば、パラベン、クロロブタノール、ソルビン酸フェノールなど）を含めることによって保証され得る。糖、塩化ナトリウムなどのような等張化剤を組成物中に含めることも望ましくあり得る。さらに、注射可能な薬学的形態の吸収の延長は、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンのような吸収を遅らせる因子を含めることによってもたらされ得る。

投薬レジメンは、本発明の主題の化合物（例えば、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチド）の作用を修飾する種々の要因を考慮して主治医によって決定されることが理解される。種々の要因は、処置されるべき疾患に依存する。

特定の実施形態では、本発明はまた、ＡｃｔＲＩＩＢポリペプチドまたは本明細書に開示される他の化合物のインビボ産生のための遺伝子治療を提供する。このような治療は、上に列挙したような障害を有する細胞または組織中にＡｃｔＲＩＩＢポリヌクレオチド配列を導入することによってその治療作用を達成する。ＡｃｔＲＩＩＢポリヌクレオチド配列の送達は、キメラウイルスのような組換え発現ベクターまたはコロイド分散系を用いて達成され得る。ＡｃｔＲＩＩＢポリヌクレオチド配列の治療的送達には、標的化されたリポソームの使用が好ましい。

本明細書中で教示されるような遺伝子治療に利用され得る種々のウイルスベクターとしては、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ワクシニア、または、好ましくはレトロウイルスのようなＲＮＡウイルスが挙げられる。好ましくは、レトロウイルスベクターは、マウスもしくはトリのレトロウイルスの誘導体である。単一の外来遺伝子が挿入され得るレトロウイルスベクターの例としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：モロニーマウス白血病ウイルス（ＭｏＭｕＬＶ）、ハーベーマウス肉腫ウイルス（ＨａＭｕＳＶ）、マウス乳腺癌ウイルス（ＭｕＭＴＶ）およびラウス肉腫ウイルス（ＲＳＶ）。多数のさらなるレトロウイルスベクターが多数の遺伝子を組み込み得る。これらのベクターは全て、形質導入された細胞が同定および生成され得るように、選択マーカーについての遺伝子を移送または組み込み得る。レトロウイルスベクターは、例えば、糖、糖脂質またはタンパク質を付着させることによって、標的特異的とされ得る。好ましい標的化は、抗体を用いて達成される。当業者は、ＡｃｔＲＩＩＢポリヌクレオチドを含むレトロウイルスベクターの標的特異的な送達を可能にするために、特定のポリヌクレオチド配列がレトロウイルスゲノム中に挿入され得るか、または、ウイルスエンベロープに付着され得ることを認識する。 一つの好ましい実施形態において、このベクターは、骨、軟骨、筋肉またはニューロンの細胞／組織に標的化される。

あるいは、組織培養細胞は、従来のリン酸カルシウムトランスフェクション法によって、レトロウイルスの構造遺伝子ｇａｇ、ｐｏｌおよびｅｎｖをコードするプラスミドを用いて直接トランスフェクトされ得る。これらの細胞は、次いで、関心のある遺伝子を含むベクタープラスミドでトランスフェクトされる。得られた細胞は、培養培地中にレトロウイルスベクターを放出する。

ＡｃｔＲＩＩポリヌクレオチドのための別の標的化送達システムは、コロイド分散系である。コロイド分散系としては、高分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズおよび脂質ベースの系（水中油エマルジョン、ミセル、混合型ミセルおよびリポソームを含む）が挙げられる。本発明の好ましいコロイド系は、リポソームである。リポソームは、インビトロおよびインビボで送達ビヒクルとして有用な人工の膜小胞である。ＲＮＡ、ＤＮＡおよびインタクトなビリオンが、水性の内部に封入され得、そして、生物学的に活性な形態で細胞へと送達され得る（例えば、Ｆｒａｌｅｙら、Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｃｈｅｍ． Ｓｃｉ．、６巻：７７頁、１９８１年を参照のこと）。リポソームビヒクルを用いた効率的な遺伝子移入のための方法は当該分野で公知であり、例えば、Ｍａｎｎｉｎｏら、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、６巻：６８２頁、１９８８年を参照のこと。リポソームの組成は、通常リン脂質の組合せであり、通常ステロイド（特に、コレステロール）と組合わされる。他のリン脂質または他の脂質もまた使用され得る。リポソームの物理的特性は、ｐＨ、イオン強度および二価のカチオンの存在に依存する。

リポソームの生成において有用な脂質の例としては、ホスファチジル化合物（例えば、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルコリン、ホスファチジルセリン、ホスファチジルエタノールアミン、スフィンゴ脂質、セレブロシドおよびガングリオシド）が挙げられる。例示的なリン脂質としては、卵ホスファチジルコリン、ジパルミトイルホスファチジルコリンおよびジステアロイルホスファチジルコリンが挙げられる。例えば、器官特異性、細胞特異性および細胞小器官特異性に基づいたリポソームの標的化もまた可能であり、当該分野で公知である。

本発明は、ここで、一般的に記載されてきたが、単に特定の実施形態および本発明の実施形態を例示する目的のために含められ、本発明を限定することは意図されない以下の実施例を参照するとより容易に理解される。

（実施例１）
ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合タンパク質の作製
出願人は、間に最小限のリンカー（３つのグリシンアミノ酸）を用いて、ヒトもしくはマウスのＦｃドメインに融合させたヒトＡｃｔＲＩＩＢの細胞外ドメインを有する可溶性のＡｃｔＲＩＩＢ融合タンパク質を構築した。この構築物を、それぞれＡｃｔＲＩＩＢ（２０〜１３４）−ｈＦｃおよびＡｃｔＲＩＩＢ（２０〜１３４）−ｍＦｃと呼ぶ。

ＡｃｔＲＩＩＢ（２０〜１３４）−ｈＦｃを、ＣＨＯ細胞から精製されたものとして以下に示す（配列番号５）

ＡｃｔＲＩＩＢ（２０〜１３４）−ｈＦｃタンパク質およびＡｃｔＲＩＩＢ（２０〜１３４）−ｍＦｃタンパク質をＣＨＯ細胞株中で発現させた。３つの異なるリーダー配列を検討した：
（ｉ）ミツバチメリチン（ＨＢＭＬ）：ＭＫＦＬＶＮＶＡＬＶＦＭＶＶＹＩＳＹＩＹＡ（配列番号７）
（ｉｉ）組織プラスミノーゲンアクチベーター（ＴＰＡ）：ＭＤＡＭＫＲＧＬＣＣＶＬＬＬＣＧＡＶＦＶＳＰ（配列番号８）
（ｉｉｉ）天然：ＭＧＡＡＡＫＬＡＦＡＶＦＬＩＳＣＳＳＧＡ（配列番号９）。

選択された形態は、ＴＰＡリーダーを採用し、そして、以下のプロセシングを受けていないアミノ酸配列を有する：

このポリペプチドは、以下の核酸配列によってコードされる（配列番号１０）：

ＣＨＯ細胞が産生した物質のＮ末端の配列決定により、主要な配列である−ＧＲＧＥＡＥ（配列番号１１）が明らかになった。特に、文献において報告された他の構築物は、−ＳＧＲ…配列で始まる。

精製を、例えば、以下のうちの３またはそれ以上を任意の順序で含む一連のカラムクロマトグラフィーステップによって達成し得る：プロテインＡクロマトグラフィー、Ｑセファロースクロマトグラフィー、フェニルセファロースクロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィー、およびカチオン交換クロマトグラフィー。精製は、ウイルス濾過およびバッファーの交換で完了し得る。

ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合タンパク質を、ＨＥＫ２９３細胞およびＣＯＳ細胞においても発現させた。すべての細胞株由来の材料および妥当な培養条件により、インビボで筋肉増強活性（ｍｕｓｃｌｅ−ｂｕｉｌｄｉｎｇ ａｃｔｉｖｉｔｙ）を持つタンパク質がもたらされたが、観察された効力の変動性は、おそらく、細胞株の選択および／または培養条件に関連する。

（実施例２）
ＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ変異体の作製
出願人は、ＡｃｔＲＩＩＢの細胞外ドメインに一連の変異を生じさせ、これらの変異体タンパク質を細胞外ＡｃｔＲＩＩＢとＦｃドメインとの可溶性の融合タンパク質として作製した。バックラウンドのＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合物はこの配列を有した（Ｆｃ部分に下線を付した）（配列番号１２）：

Ｎ末端およびＣ末端の切断を含めた、さまざまな変異をバックラウンドのＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃタンパク質に導入した。実施例１において提示されたデータに基づいて、これらの構築物は、ＴＰＡリーダーを用いて発現させる場合、Ｎ末端のセリンを欠くことが予想される。ＰＣＲ変異誘発によって、ＡｃｔＲＩＩＢ細胞外ドメインにおいて変異を発生させた。ＰＣＲの後、フラグメントをＱｉａｇｅｎカラムによって精製し、ＳｆｏＩおよびＡｇｅＩを用いて消化し、ゲル精製した。これらのフラグメントを、発現ベクターのｐＡＩＤ４（ＷＯ２００６／０１２６２７参照）に、ライゲーションすると、ヒトＩｇＧ１との融合キメラが創出されるようにライゲーションした。Ｅ．ｃｏｌｉ ＤＨ５アルファ中へ形質転換し、コロニーを採集し、ＤＮＡを単離した。マウスの構築物（ｍＦｃ）については、ヒトＩｇＧ１をマウスＩｇＧ２ａに置き換えた。すべての変異体について配列を確認した。

変異体は全て、ＨＥＫ２９３Ｔ細胞において一過性のトランスフェクションによって作製した。要約すると、５００ｍｌのスピナー中、ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を、２５０ｍｌ体積のＦｒｅｅｓｔｙｌｅ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）培地中、１ｍｌ当たり細胞６×１０^５個で準備し、一晩成長させた。次の日に、これらの細胞を、ＤＮＡ：ＰＥＩ（１：１）複合体を最終的なＤＮＡ濃度０．５μｇ／ｍｌで用いて処理した。４時間後、２５０ｍｌの培地を加え、細胞を７日間成長させた。細胞を遠心して沈降させることにより馴化培地を回収し、濃縮した。

変異体を、例えば、プロテインＡカラムを含めたさまざまな技法を使用して精製し、低ｐＨ（３．０）のグリシンバッファーを用いて溶出した。中和した後、これらをＰＢＳに対して透析した。

変異体は、ＣＨＯ細胞においても同様の方法論によって作製した。

変異体を、結合アッセイおよび／またはバイオアッセイにおいて試験した。ある場合には、精製されたタンパク質ではなく馴化培地を用いてアッセイを実施した。改変体は、例えば、公開特許出願ＷＯ０６／０１２６２７およびＷＯ０８／０９７５４１に記載されている。このような改変体は、本明細書に記載の方法において使用され得る。

（実施例３）
食餌誘導性の肥満のマウスモデルにおける、肝臓脂肪症に対する切断された改変体ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃの効果
非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）は、メタボリックシンドロームの肝臓での症状発現であり、しばしば有害作用を伴う肝臓への脂肪沈着（脂肪変性）を特徴とすると広く考えられている、ますます一般的になっている一連の肝障害である。ＮＡＦＬＤ患者のサブセットでは、肝臓の線維症、硬変症、および肝細胞癌にさらに進行し得る非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）と称される炎症性の状態を発症する（Ｐｅｒｌｅｍｕｔｅｒら、２００７年、Ｎａｔ Ｃｌｉｎ Ｐｒａｃｔ Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ Ｍｅｔａｂ ３巻：４５８〜４６９頁）。出願人は、ＡｃｔＲＩＩＢ（２０〜１３４）−ｈＦｃに関して上記したものと同じリーダーおよび方法論を使用して、切断された融合タンパク質ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃを作製した（図１〜２）。ＣＨＯ細胞において発現させた後に精製した成熟タンパク質は、以下に示す配列を有する（配列番号６）：

以下に示す通り、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃは、食餌誘導性の肥満のマウスモデルにおいて、肝臓脂肪症を阻害しながら、密接に関連するパラメータに有益な変化を生じさせ得る。１０週齢のＣ５７ＢＬ／６マウスを、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃ、１０ｍｇ／ｋｇ、ｓ．ｃ．で、またはトリス緩衝生理食塩水（ＴＢＳ）ビヒクルで、週２回、６０日間処置した。この期間中、マウスは、４．５％の脂肪を含有する標準の固形飼料の代わりに、５８％の脂肪を含有する食餌を無制限に食べることができた。標準の固形飼料の食餌で維持したさらなるマウス群も、ＴＢＳビヒクルで処置し、食餌性の対照として追跡した。

肝臓の生検は、ＮＡＦＬＤの診断についてのゴールドスタンダードと考えられているので、試験完了時に肝臓を取り出し、組織学的に分析した。高脂肪食を与えたマウスの肝臓の組織は、オイルレッドＯを用いた染色によって評価された通り、多数の密集した脂肪滴を示したが、標準食を与えたマウスは、肝臓の脂質沈着物の証拠を示さなかった（図３）。ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃで処置することにより、高脂肪食にもかかわらず、肝臓の脂質沈着がほぼ完全に妨げられ、肝臓の組織の外観が正常化された。したがって、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃは、高脂肪食によって引き起こされる肝臓脂肪症の有効なインヒビターであった。

また、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃ処置は、エンドポイントにおいてアルコール性型および非アルコール性型の脂肪肝疾患における肝臓脂肪症と強力に相関する有益な変化を誘導した。アディポネクチンは、その濃度が脂肪量（ｆａｔ ｍａｓｓ）／肥満と逆に変動する脂肪由来のホルモンであり、標的組織において重要なインスリン感作作用を発揮する（Ｙａｍａｕｃｈｉら、２００１年、Ｎａｔ Ｍｅｄ ７巻：９４１〜９４６頁；Ｍａｅｄａら、２００２年、Ｎａｔ Ｍｅｄ ８巻：７３１〜７３７頁；Ｋａｄｏｗａｋｉら、２００５年、Ｅｎｄｏｃｒ Ｒｅｖ ２６巻：４３９〜４５１頁）。アディポネクチンの濃度は、アルコール性型の脂肪肝疾患においても重要である（Ｙｏｕら、２００９年、Ｅｘｐ Ｂｉｏｌ Ｍｅｄ ２３４巻：８５０〜８５９頁）。ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃ処置により、精巣上体の白色脂肪におけるアディポネクチンｍＲＮＡのレベル（図４）ならびにアディポネクチン循環濃度（図５）が上昇した。重要なことに、これらの変化は、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃで処置したマウスにおいて、インスリンの循環濃度（図６）、トリグリセリド、遊離の脂肪酸、高密度リポタンパク質（ＨＤＬ）および低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）の強い減少を伴い、これらのパラメータのほぼ全ての正常化をもたらした。最終的に、上述の作用は、ベースラインおよび４８日目に核磁気共鳴（ＮＭＲ）によって決定された通り、体組成の有益な変化を伴った。詳細には、ビヒクルで処置した対照における総脂肪量は、高脂肪食条件下で、この４８日の間で３倍になり、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃ処置により、この増加がほぼ４０％削減された。要約すると、高脂肪食条件下でのＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｈＦｃ処置により１）肝臓脂肪症が妨げられ、２）循環アディポネクチン濃度が増加し、３）インスリン感受性の増加と一致して、循環インスリン濃度が低下し、４）血清脂質プロファイルに有益な変化が生じ、そして５）体組成が改善される。

（実施例４）
アテローム発生のマウスモデルにおける肝臓脂肪症に対する切断された改変体ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｍＦｃの効果
低密度リポタンパク質受容体（ＬＤＬＲ）が遺伝的に欠損したマウスは、広く使用されているアテローム発生の実験モデルである。高脂肪かつ高コレステロールの食餌を与えた場合、ｌｄｌｒ^−／−マウスは、高コレステロール血症およびアテローム性の病変を発生する（Ｂｒｅｓｌｏｗ、１９９６年、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２７２巻：６８５〜６８８頁）。したがって、出願人は、このモデルにおいて、治療的に投与された際の（食餌による前処置段階の後に）肝臓脂肪症を改善するＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｍＦｃの能力を調査した。５カ月齢から始めて、雄のｌｄｌｒ^−／−マウス（Ｃ５７ＢＬ／６バックラウンド）を、標準の固形飼料の食餌（Ｈａｒｌａｎ Ｔｅｋｌａｄ Ｄｉｅｔ ２０１８、５．８％の脂肪を含有する）または高脂肪かつ高コレステロールの食餌（Ｈａｒｌａｎ Ｔｅｋｌａｄ Ｄｉｅｔ ９４０５９、コール酸塩を含まない「Ｐａｉｇａｎ」食餌、およそ１５．８％の脂肪および１．２５％のコレステロールを含有する）のいずれかを継続して食べられるようにした。これらのそれぞれの食餌を開始して８週間後から始めて、マウスを、週２回、皮下にＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｍＦｃ（１０ｍｇ／ｋｇ）で、または、ビヒクル（トリス緩衝生理食塩水）で１６週間にわたって処置し、食餌レジメンを継続的に施行した。ビヒクルで処置した、標準食で維持した野生型マウスがさらなる対照としての機能を果たした。

アテローム発生モデルにおける肝臓脂肪症の明らかな証拠が存在した。標準食を与えた野生型マウスと比較して、２４週間にわたって高脂肪食を与えたｌｄｌｒ^−／−マウスは、マイクロコンピュータ断層撮影法（ｍｉｃｒｏ−ＣＴ）によって決定された通り肝組織の密度の顕著な低下を示した（図７）。全体的な肝臓の密度の、水の密度（この分析ではゼロであると定義する）を下回っている値までの低下は、肝臓の膨大を伴い、肝臓脂肪症を示している。ビヒクルで処置したアテローム発生性マウスと比較して、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｍＦｃで処置したマウスは、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｍＦｃを受けさせる前に８週間にわたって高脂肪食を与えたにもかかわらず、肝臓の密度の有意な増加（改善）を示した（図７）。さらに、ＡｃｔＲＩＩＢ（２５〜１３１）−ｍＦｃで処置したアテローム発生性マウスは、体組成、糖化ヘモグロビン（Ａ１Ｃ）濃度、蓄積脂肪（ｆａｔ ｄｅｐｏｔ）の重量、および血清トリグリセリドレベルの、野生型対照において観察された値（データは示していない）への正常化も示した。

総合すると、これらのデータは、可溶性のＡｃｔＲＩＩＢ−Ｆｃ融合タンパク質が、循環アディポネクチン濃度を増加させ、標的組織におけるインスリン感受性を改善し、それによって非アルコール性脂肪性肝疾患、アルコール性脂肪肝疾患、および、潜在的に他の状態も同様に処置するために、ＴＧＦ−β−ファミリーのリガンドによるシグナル伝達のアンタゴニストとして使用され得ることを示している。

参考としての援用
本明細書中で言及される全ての刊行物および特許は、各個々の刊行物または特許が、具体的かつ個別に参考として援用されると示されるかのように、その全体が本明細書に参考として援用される。

本主題の特定の実施形態が考察されてきたが、上記明細書は、例示的であり、限定的なものではない。本明細書および以下の特許請求の範囲を精査すれば、多くの変更が当業者に明らかとなる。本発明の完全な範囲は、その等価物の完全な範囲と共に特許請求の範囲を、そして、このような変更と共に明細書を参照することによって決定されるべきである。

Claims (27)

1. 脂肪肝疾患の処置を必要とする患者において脂肪肝疾患を処置するための組成物であって、該組成物は、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドの有効量を含み、該ポリペプチドは、アクチビンおよび／またはミオスタチンに結合する、組成物。
2. 前記ポリペプチドが、ＡｃｔＲＩＩＢに対して異種である部分を含む融合タンパク質である、請求項１に記載の組成物。
3. 前記ポリペプチドが二量体である、請求項１または２に記載の組成物。
4. 前記ポリペプチドが、免疫グロブリンの定常ドメインに融合している、請求項２または３に記載の組成物。
5. 前記ポリペプチドが、免疫グロブリンのＦｃ部分に融合している、請求項２から４までのいずれか一項に記載の組成物。
6. 前記免疫グロブリンがヒトＩｇＧ１である、請求項５に記載の組成物。
7. 前記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
8. 前記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列と少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
9. 前記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２９〜１０９の配列と少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
10. 前記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２５〜１３１の配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
11. 前記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２５〜１３１の配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
12. 前記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２５〜１３１の配列と少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
13. 前記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸２５〜１３１の配列と少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
14. 前記ポリペプチドが、配列番号５と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
15. 前記ポリペプチドが、配列番号５と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
16. 前記ポリペプチドが、配列番号５の配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
17. 前記ポリペプチドが、配列番号６と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
18. 前記ポリペプチドが、配列番号６と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
19. 前記ポリペプチドが、配列番号６の配列を含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載の組成物。
20. 前記ポリペプチドがアクチビンに結合する、請求項１から１９までのいずれか一項に記載の組成物。
21. 前記ポリペプチドがアクチビンＡに結合する、請求項２０に記載の組成物。
22. 前記ポリペプチドがアクチビンＢに結合する、請求項２０または２１に記載の組成物。
23. 前記ポリペプチドがミオスタチンに結合する、請求項１から２２までのいずれか一項に記載の組成物。
24. 前記患者がインスリン抵抗性を有する、請求項１から２３までのいずれか一項に記載の組成物。
25. 前記患者がインスリン抵抗性および代謝障害を有する、請求項１から２３までのいずれか一項に記載の組成物。
26. 前記組成物の投与によって、処置される前記患者における肝臓脂肪症が阻害される、請求項１から２５までのいずれか一項に記載の組成物。
27. 前記患者が、非アルコール性脂肪性肝疾患について処置される、請求項２６に記載の組成物。