JP5892661B2 - 多能性幹細胞から生殖細胞への分化誘導方法 - Google Patents
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Description
本発明は、多能性幹細胞からエピブラスト様細胞(EpiLC)を介して始原生殖細胞様細胞(PGC様細胞)を誘導する方法、そのための試薬キット、該方法から得たEpiLCを含む細胞集団、及びエピブラストに由来する生殖細胞系列に属する細胞を該細胞集団から誘導する方法に関する。
発生生物学における主要な課題は、必須の発生経路をin vitroで再構成することであり、これは、新たな実験の機会を提供するだけでなく医学的応用の基礎としても役立つものである。多細胞生物において、生殖細胞系列には新たな生物の創出を確保する必須の機能が与えられており、それにより世代を超えて遺伝情報及びエピジェネティック情報が継承される。従って、生殖細胞系列の発生をin vitroで再構成することは、通常、ライフサイエンスにおける本来的意義である。マウス(非特許文献1、2、3、4及び5)及びヒト(非特許文献6、7、8、9、10及び11)の胚盤胞の内部細胞塊(ICM)に由来する胚性幹細胞(ESC)から、in vitroで配偶子又はその前駆細胞(始原生殖細胞:PGC)を作り出す試みがいくつかなされている(非特許文献12、13及び14のレビューも参照されたい)。しかし、これらの試みは全て、定義されていない(undefined)条件下、胚葉体としてESCのランダムな分化を伴い、1種以上のマーカー遺伝子の自発的な発現に依存していた。結果として、これら試みは関心ある細胞を得るには非効率的であった。さらに、作製された細胞が健常な子孫の創出に貢献することは何ら実証されていない。
従って、本発明の目的は、高効率で高い再現性を有する、多能性幹細胞からEpiLCを誘導する方法を提供し、それによりin vitroにおいて、ESC及びiPSCを含む多能性幹細胞からの生殖細胞分化決定経路の機能的再構成を達成することである。本発明の別の目的は、無血清及び無フィーダー条件下で多能性幹細胞から生殖細胞を誘導する方法を提供することである。
[1]多能性幹細胞からエピブラスト様細胞(EpiLC)を製造する方法であって、前記多能性幹細胞をアクチビンAの存在下で培養する、方法。
[2]EpiLCが、分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Fgf5、Wnt3及びDnmt3bから選択される少なくとも1つの遺伝子発現の上昇を示す、上記[1]記載の方法。
[3]EpiLCが、分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Gata4、Gata6、Sox17及びBlimp1から選択される少なくとも1つの遺伝子発現の低下を示す、上記[1]又は[2]記載の方法。
[4]さらに塩基性線維芽細胞増殖因子(bFGF)及び/又はKnockOut(商標)Serum Replacement(KSR)の存在下で培養を実施する、上記[1]〜[3]のいずれかに記載の方法。
[5]無血清及び無フィーダー条件下で培養を実施する、上記[1]〜[4]のいずれかに記載の方法。
[6]培養を3日未満実施する、上記[1]〜[5]のいずれかに記載の方法。
[7]培養を約2日間実施する、上記[6]記載の方法。
[8]多能性幹細胞から始原生殖細胞様(PGC様)細胞を製造する方法であって、以下の工程I)及びII)を含む、方法:
I)上記[1]〜[7]のいずれかに記載の方法でEpiLCを製造する工程、
II)工程I)で得られたEpiLCをBMP4及びLIFの存在下で培養する工程。
[9]PGC様細胞が、分化誘導前のEpiLCに比して、Blimp1及び/又はStella(Dppa3)遺伝子発現の上昇を示す、上記[8]記載の方法。
[10]PGC様細胞が、正常な精子形成に貢献できる、上記[8]又は[9]記載の方法。
[11]前記工程II)の培養をさらにSCF及び/又はBMP8b及び/又はEGFの存在下で実施する、上記[8]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[12]前記工程II)の培養を無血清条件下で実施する、上記[8]〜[11]のいずれかに記載の方法。
[13]前記工程I)の培養をアクチビンA、bFGF及びKSRの存在下で実施し、前記工程II)の培養をBMP4、LIF、SCF、BMP8b及びEGFの存在下で実施する、上記[8]記載の方法。
[14]さらに、
III)前記工程II)で得られた細胞からBlimp1陽性細胞を選択する工程
を含む、上記[8]〜[13]のいずれかに記載の方法。
[15]さらに、
III)前記工程II)で得られた細胞からSSEA1−及びインテグリン−β3−二重陽性細胞を選択する工程
を含む、上記[8]〜[13]のいずれかに記載の方法。
[16]多能性幹細胞が、人工多能性幹細胞(iPSC)又は胚性幹細胞(ESC)である、上記[1]〜[15]のいずれかに記載の方法。
[17]アクチビンA、bFGF及びKSRを含む、多能性幹細胞からEpiLCへの分化誘導用試薬キット。
[18]以下の(1)及び(2)を含む、多能性幹細胞からPGC様細胞への分化誘導用試薬キット:
(1)アクチビンA、bFGF及びKSRを含む、多能性幹細胞からEpiLCへの1以上の誘導用試薬、
(2)BMP4、LIF、SCF、BMP8b及びEGFを含む、EpiLCからPGC様細胞への1以上の誘導用試薬。
[19]多能性幹細胞がiPSC又はESCである、上記[17]又は[18]記載の試薬キット。
[20]上記[1]〜[7]のいずれかに記載の方法により製造された、EpiLCを含む細胞集団。
[21]EpiLCが、以下の(1)及び(2)の特徴を有する、上記[20]記載の細胞集団:
(1)分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Fgf5、Wnt3及びDnmt3bから選択される少なくとも1つの遺伝子発現が上昇している、
(2)分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Gata4、Gata6、Sox17及びBlimp1から選択される少なくとも1つの遺伝子発現が低下している。
[22]1つ以上の初期化遺伝子が、細胞集団を構成する細胞のゲノム中に組み込まれた、上記[20]又は[21]記載の細胞集団。
[23]初期化遺伝子が、Oct3/4、Sox2、Klf4及びc−Mycからなる4種の遺伝子、又はOct3/4、Sox2及びKlf4からなる3種の遺伝子である、上記[22]記載の細胞集団。
[24]上記[20]〜[23]のいずれかに記載の細胞集団を細胞源として用いる、エピブラストに由来する種々の細胞種の製造方法。
本発明は、多能性幹細胞からEpiLCを製造する方法であって、前記多能性幹細胞をアクチビンAの存在下で培養する、方法を提供する。
(i)ES細胞
多能性幹細胞は自体公知の方法により取得することができる。例えば、ES細胞の作製方法としては、哺乳動物の胚盤胞ステージにおける内部細胞塊を培養する方法(例えば、Manipulating the Mouse Embryo:A Laboratory Manual,Second Edition,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1994)を参照)、体細胞核移植によって作製された初期胚を培養する方法(Wilmut et al., Nature, 385, 810(1997);Cibelli et al.,Science, 280, 1256(1998);入谷明ら, 蛋白質核酸酵素, 44, 892(1999);Baguisi etal., Nature Biotechnology, 17, 456(1999);Wakayama et al., Nature, 394, 369(1998);Wakayama et al., Nature Genetics, 22, 127(1999);Wakayama et al., Proc.Natl. Acad. Sci. USA, 96, 14984(1999);RideoutIII et al., Nature Genetics, 24,109(2000))などが挙げられるが、これらに限定されない。また、ES細胞は、所定の機関より入手でき、さらには市販品を購入することもできる。例えば、ヒトES細胞株であるH1及びH9は、ウィスコンシン大学のWiCell Instituteより入手可能であり、KhES−1、KhES−2及びKhES−3は、京都大学再生医科学研究所より入手可能である。ES細胞を体細胞核移植により作製する場合、体細胞の種類や体細胞を採取するソースは下記iPS細胞作製の場合に準ずる。
iPS細胞は、体細胞に核初期化物質を導入することにより作製することができる。
iPS細胞作製のための出発材料として用いることのできる体細胞は、哺乳動物(例えば、マウス又はヒト)由来の生殖細胞以外のいかなる細胞であってもよい。例えば、角質化する上皮細胞(例、角質化表皮細胞)、粘膜上皮細胞(例、舌表層の上皮細胞)、外分泌腺上皮細胞(例、乳腺細胞)、ホルモン分泌細胞(例、副腎髄質細胞)、代謝・貯蔵用の細胞(例、肝細胞)、境界面を構成する内腔上皮細胞(例、I型肺胞細胞)、内鎖管の内腔上皮細胞(例、血管内皮細胞)、運搬能をもつ繊毛のある細胞(例、気道上皮細胞)、細胞外マトリックス分泌用細胞(例、線維芽細胞)、収縮性細胞(例、平滑筋細胞)、血液と免疫系の細胞(例、Tリンパ球)、感覚に関する細胞(例、桿細胞)、自律神経系ニューロン(例、コリン作動性ニューロン)、感覚器と末梢ニューロンの支持細胞(例、随伴細胞)、中枢神経系の神経細胞とグリア細胞(例、星状グリア細胞)、色素細胞(例、網膜色素上皮細胞)、及びそれらの前駆細胞(組織前駆細胞)等が挙げられる。細胞の分化の程度に特に制限はなく、未分化な前駆細胞(体性幹細胞も含む)であっても、最終分化した成熟細胞であっても、同様に本発明における体細胞の起源として使用することができる。ここで未分化な前駆細胞としては、例えば、脂肪由来間質(幹)細胞、神経幹細胞、造血幹細胞、間葉系幹細胞、歯髄幹細胞等の組織幹細胞(体性幹細胞)が挙げられる。
本発明において「核初期化物質」とは、体細胞からiPS細胞を誘導することができる物質(群)であれば、タンパク性因子又はそれをコードする核酸(ベクターに組み込まれた形態を含む)、あるいは低分子化合物等のいかなる物質から構成されてもよい。核初期化物質がタンパク性因子又はそれをコードする核酸の場合、好ましくは以下の組み合わせが例示される(以下においては、タンパク性因子の名称のみを記載する)。
(1)Oct3/4、Klf4、c−Myc
(2)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2(ここで、Sox2はSox1、Sox3、Sox15、Sox17又はSox18で置換可能である。また、Klf4はKlf1、Klf2又はKlf5で置換可能である。さらに、c−MycはT58A(活性型変異体)、N−Myc又はL−Mycで置換可能である。)
(3)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、Fbx15、Nanog、Eras、ECAT15−2、TclI、β−catenin(活性型変異体S33Y)
(4)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、TERT、SV40 Large T antigen(以下、SV40LT)
(5)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、TERT、HPV16 E6
(6)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、TERT、HPV16 E7
(7)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、TERT、HPV6 E6、HPV16 E7
(8)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、TERT、Bmil
(上記因子のさらなる情報については、WO2007/069666を参照(但し、上記(2)の組み合わせにおいて、Sox2からSox18への置換、Klf4からKlf1若しくはKlf5への置換については、Nature Biotechnology, 26, 101−106(2008)を参照)。「Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2」の組み合わせについては、Cell,126, 663−676(2006)、Cell, 131, 861−872(2007)等も参照。「Oct3/4、Klf2(又はKlf5)、c−Myc、Sox2」の組み合わせについては、Nat. Cell Biol., 11, 197−203(2009)も参照。「Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、hTERT、SV40LT」の組み合わせについては、Nature, 451, 141−146(2008)も参照。)
(9)Oct3/4、Klf4、Sox2(Nature Biotechnology, 26, 101−106(2008)を参照)
(10)Oct3/4、Sox2、Nanog、Lin28(Science, 318, 1917−1920(2007)を参照)
(11)Oct3/4、Sox2、Nanog、Lin28、hTERT、SV40LT(Stem Cells, 26, 1998−2005(2008)を参照)
(12)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、Nanog、Lin28(Cell Research(2008)600−603を参照)
(13)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、SV40LT(Stem Cells, 26, 1998−2005(2008)も参照)
(14)Oct3/4、Klf4(Nature 454:646−650(2008)、Cell Stem Cell, 2:525−528(2008)を参照)
(15)Oct3/4、c−Myc(Nature 454:646−650(2008)を参照)
(16)Oct3/4、Sox2(Nature, 451, 141−146(2008)、WO2008/118820を参照)
(17)Oct3/4、Sox2、Nanog(WO2008/118820を参照)
(18)Oct3/4、Sox2、Lin28(WO2008/118820を参照)
(19)Oct3/4、Sox2、c−Myc、Esrrb(ここで、EssrrbはEsrrgで置換可能である。Nat. Cell Biol., 11, 197−203(2009)を参照)
(20)Oct3/4、Sox2、Esrrb(Nat. Cell Biol., 11, 197−203(2009)を参照)
(21)Oct3/4、Klf4、L−Myc
(22)Oct3/4、Nanog
(23)Oct3/4
(24)Oct3/4、Klf4、c−Myc、Sox2、Nanog、Lin28、SV40LT(Science, 324:797−801(2009)を参照)
Lin28 NM_145833 NM_024674
Lin28b NM_001031772 NM_001004317
Esrrb NM_011934 NM_004452
Esrrg NM_011935 NM_001438
L−Myc NM_008506 NM_001033081
核初期化物質の体細胞への導入は、該物質がタンパク性因子である場合、自体公知の細胞へのタンパク質導入方法を用いて実施することができる。ヒトへの臨床応用を念頭におく場合、その出発材料たるiPS細胞も遺伝子操作なしに作製されたものであることが好ましい。
従来iPS細胞の樹立効率が低いために、近年、その効率を改善する物質が種々提案されている。よって前記核初期化物質に加え、これら樹立効率改善物質を体細胞に接触させることにより、iPS細胞の樹立効率をより高めることが期待できる。
体細胞の核初期化工程において低酸素条件下で細胞を培養することにより、iPS細胞の樹立効率をさらに改善することができる。本明細書において「低酸素条件」とは、細胞を培養する際の雰囲気中の酸素濃度が、大気中のそれよりも有意に低いことを意味する。具体的には、通常の細胞培養で一般的に使用される5〜10% CO2/95〜90%大気の雰囲気中の酸素濃度よりも低い酸素濃度の条件が挙げられ、例えば雰囲気中の酸素濃度が18%以下の条件が該当する。好ましくは、雰囲気中の酸素濃度は15%以下(例、14%以下、13%以下、12%以下、11%以下など)、10%以下(例、9%以下、8%以下、7%以下、6%以下など)、又は5%以下(例、4%以下、3%以下、2%以下など)である。また、雰囲気中の酸素濃度は、好ましくは0.1%以上(例、0.2%以上、0.3%以上、0.4%以上など)、0.5%以上(例、0.6%以上、0.7%以上、0.8%以上、0.9%以上など)、又は1%以上(例、1.1%以上、1.2%以上、1.3%以上、1.4%以上など)である。
胚盤胞期胚から誘導される従来のヒトES細胞は、マウスES細胞と非常に異なる生物学的(形態的、分子的及び機能的)特性を有する。マウス多能性幹細胞は、2つの機能的に区別される状態、即ちLIF依存的なES細胞と、bFGF依存的なエピブラスト幹細胞(EpiSC)とで存在し得る。分子学的解析から、ヒトES細胞の多能性状態は、マウスES細胞のそれではなく、むしろマウスEpiSCのそれに類似していることが示唆されている。最近、LIFの存在下にOct3/4、Sox2、Klf4、c−Myc及びNanogを異所的に誘導するか(Cell Stem Cells, 6:535−546, 2010参照)、LIF並びにGSK3β及びERK1/2経路阻害剤と組み合わせて、Oct3/4、Klf4及びKlf2を異所的に誘導する(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, オンライン公開doi/10.1073/pnas.1004584107参照)ことにより、マウスES細胞様の多能性状態にあるヒトES及びiPS細胞(ナイーヴヒトES及びiPS細胞とも呼ばれる)が樹立されている。これらのナイーヴヒトES及びiPS細胞は、それらの多能性が従来のヒトES及びiPS細胞に比べてより未熟であるため、本発明のための出発材料として好適であり得る。
分化誘導用の基本培地としては、例えば、Neurobasal培地、Neural Progenitor Basal培地、NS−A培地、BME培地、BGJb培地、CMRL 1066培地、最小必須培地(MEM)、Eagle MEM培地、αMEM培地、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、Glasgow MEM培地、Improved MEM Zinc Option培地、IMDM培地、Medium 199培地、DMEM/F12培地、ハム培地、RPMI 1640培地、Fischer’s培地、及びこれらの混合培地などが挙げられるが、これらに限定されない。
(1)分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Fgf5、Wnt3及びDnmt3bから選択される少なくとも1つの遺伝子発現の上昇、
(2)分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Gata4、Gata6、Sox17及びBlimp1から選択される少なくとも1つの遺伝子発現の低下。
従って、EpiLCへの分化の事実は、培養により得られた細胞中、Fgf5、Wnt3及びDnmt3bから選択される少なくとも1つ、並びに/又はGata4、Gata6、Sox17及びBlimp1から選択される少なくとも1つの発現レベルを測定し、分化誘導前の多能性幹細胞のものと発現レベルを比較することにより確認できる。
(1)Oct3/4の持続的な遺伝子発現;
(2)分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Sox2及びNanogの遺伝子発現の低下;
(3)分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Fgf5、Wnt3及びDnmt3bの遺伝子発現の上昇;及び
(4)分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Gata4、Gata6、Sox17及びBlimp1の遺伝子発現の低下。
このようにして得られたEpiLCをBMP4及びLIFの存在下で培養することにより、PGC様細胞へと分化誘導することができる(Cell, 137, 571−584(2009))。従って、本発明の第二の側面は、上記(2)の方法により得られたEpiLCを介して、多能性幹細胞からPGC様細胞を製造する方法に関する。すなわち、該方法は、
I)上記(2)に記載のいずれかの方法に従って多能性幹細胞からEpiLCを製造する工程;及び
II)工程I)で得られたEpiLCをBMP4及びLIFの存在下で培養する工程
を含む。
本発明はまた、前記工程I)及びII)により製造される、多能性幹細胞に由来するPGC様細胞を含む細胞集団も提供する。該細胞集団は、PGC様細胞の精製された集団であってよく、PGC様細胞以外に1種以上の細胞が共存してもよい。ここで、「PGC様細胞」は、分化誘導前のEpiLCに比してBlimp1及び/又はStellaの発現の上昇を示し、正常な精子形成に貢献でき、免疫不全マウスに移植された場合にテラトーマを形成しない細胞として定義される。上述のとおり、Blimp1−及び/又はStella−プロモーターの制御下にある蛍光タンパク質遺伝子を有する多能性幹細胞を出発物質として使用してPGC様細胞を誘導する場合、セルソーターを用いて、前記工程II)で得られた細胞集団をソーティングすることにより、Blimp1−及び/又はStella−陽性PGC様細胞を容易に単離し精製できる。PGC様細胞は、マーカーとして、Blimp1及びStellaとともに発現が増加する遺伝子(例、Nanog)の制御下にあるレポーターを用いてFACSにより単離し精製することもできる。
このようにして樹立された、多能性幹細胞に由来するPGC様細胞は種々の目的で使用できる。例えば、レシピエント動物の精巣に移植されたPGC様細胞は、精巣での精子形成及び健常な子孫の創出に確実に貢献できるので、不妊、又は生殖組織の遺伝性疾患の治療に使用できる。
BVSC及びP14Vトランスジェニックマウスは既に報告されており、主にC57BL/6バックグラウンドで維持された(Nat Genet 40, 1016−1022(2008);Reproduction 136, 503−514(2008))。全ての動物実験は、京都大学の倫理指針下で実施した。
1.動物
全ての動物実験は、京都大学の倫理指針下で実施した。BVSC及びP14Vトランスジェニックマウスは既に報告されており(Nat Genet 40, 1016−1022(2008);Reproduction 136, 503−514(2008))、主にC57BL/6バックグラウンドで維持された。ROSAマウス[B6;129S−Gt(ROSA)26Sor/J(ストック番号:002073)](Genes Dev 5, 1513−1523(1991))はJackson Laboratoryから購入した。W/Wvマウス(WB×C57BL/6)はSLC(Shizuoka, Japan)から購入した。交尾プラグを確認した日の正午を胎生期(E)0.5とした。
BVSC及びROSA導入遺伝子を有する胚盤胞をE3.5で子宮から流し、マウス胚性フィーダー上(Nature 453, 519−523, doi:nature06968 [pii] 10.1038/nature06968(2008))、2i(PD0325901、0.4μM;Stemgent;CHIR99021、3μM;Stemgent)及びLIF(1000 U/ml)を有するN2B27培地(N2を添加したDMEM/F12とB27を添加したNeurobasalとの1:1混合物)(Nat Biotechnol 21, 183−186, doi:10.1038/nbt780 nbt780 [pii](2003))中、96ウェルプレートのウェル中で培養した。広がったESCコロニーをTrypLE(Invitrogen)で解離することにより継代した。4継代までESCをフィーダー上で維持した。4継代時に、ESCをCell Banker 3(ZENOAQ)によりストックした。その後、雄のESCを融解し、培養し、ポリ−L−オルニチン(0.01%;Sigma)及びラミニン(10 ng/ml;BD Biosciences)でコートされたディッシュ上、無フィーダーで維持した。
アクチビンA(20 ng/ml;Peprotech)、bFGF(12 ng/ml;Invitrogen)及びKSR(1%;Invitrogen)を含むN2B27培地中、ヒト血漿フィブロネクチン(16.7μg/ml;Millipore)でコートされた12ウェルプレートのウェル上に1.0×105 ESCを播くことにより、EpiLCを誘導した。培地は毎日交換した。サイトカインBMP4(500 ng/ml;R&D Systems)、LIF(1000 U/ml;Invitrogen)、SCF(100 ng/ml;R&D Systems)、BMP8b(500 ng/ml;R&D Systems)及びEGF(50 ng/ml;R&D Systems)の存在下、無血清培地[SFM;15%KSR、0.1 mM NEAA、1 mMピルビン酸ナトリウム、0.1 mM 2−メルカプトエタノール、100 U/mlペニシリン、0.1 mg/mlストレプトマイシン及び2 mM L−グルタミンを有するGMEM(Invitrogen)]中、低細胞結合性U底96ウェルプレート(NUNC)のウェルに1.0×103 EpiLCを播くことにより、浮遊条件でPGC様細胞を誘導した。
誘導されたPGC様細胞をTrypLE(10分、37℃)で解離し、0.1%BSAを添加したDMEM/F12で洗浄し、遠心分離により集めた。大きな細胞集塊はセルストレーナー(BD Biosciences)を用いて除去した。フローサイトメーター(ARIA II;BD Biosciences)で細胞をソーティングし分析した。BV又はEGFP及びSCの蛍光活性は、それぞれFITC及びPacific blue channelにより検出した。AAG ESC及びiPSCに由来するPGC様細胞の精製のために、PE及びAlexa Fluor 647とそれぞれ結合させた抗−インテグリンβ3抗体(BioLegend)及び抗−SSEA1抗体(eBioscience)とともに解離細胞をインキュベートした。0.1%BSAを添加したPBSで洗浄した後、フローサイトメーターで細胞をソーティングし分析した。
1)Q−PCR
単離したE5.75エピブラスト、ESC、EpiLC並びにFACSでソーティングされたPGC様細胞及び非PGC様細胞のtotal RNAをRNeasy micro Kit(QIAGEN)を用いて抽出し精製した。total RNAをSuperscript III(Invitrogen)により逆転写し、一本鎖cDNAをPower SYBR Green(ABI)を用いたQ−PCR分析に使用した。用いたプライマー配列を表1に列記する。
GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array(Affymetrix)を用いて網羅的遺伝子発現を分析した。ESC、d1、d2及びd3 EpiLC、EpiSC並びにPGC様細胞のtotal RNA 10μgを製造者の説明書に従って処理した。マイクロアレイデータはプログラムdChip(Proc Natl Acad Sci USA 98, 31−36(2001))を用いて分析した。以下の基準を使用して13,183のプローブを選択した:(1)生物学的複製の間の再現性を保証する発現レベル(<2倍)、及び(2)発現差異(サンプルのいずれかのペア間で少なくとも2倍の差)。およそ500のESC、d2 EpiLC、EpiSC、E5.75エピブラスト、PGC様細胞及びE9.5 PGCのtotal RNAを、最初のPCRで12サイクル使用した以外は、以前に記載されたように増幅した(Nucleic Acids Res 34, e42(2006);Nat Protoc 2, 739−752(2007))。再現性及び発現差異についての基準として4倍の差を使用して、増幅サンプルについて9711のプローブを選択した。UHC、PCA及び機能的カテゴリー分析は、それぞれ、プログラムTMEV4(Biotechniques 34, 374−378(2003))、R(R:A language and environment for statistical computing(Vienna, Austria, R Foundation for Statistical Computing)(2005))及びEASE(Genome Biol 4, R70(2003))を用いて実施した。
ESC、FACSでソーティングされたPGC様細胞、PGC様細胞に由来する子孫の尾、及び野生型マウスの尾からゲノムDNAを単離し、EpiTect Bisulfite Kit(QIAGEN)を用いてバイサルファイト反応を実施した。Igf2r、Snrpn、H19及びKcnq1ot1のメチル化可変領域のPCR増幅は、以前に記載されたプライマーセット及び条件(Genomics 79, 530−538(2002);Nature 450, 908−912(2007))(表1)を用いて実施した。PCR産物をpGEM−T Easy vector(Promega)にサブクローニングし、配列決定した。
AP染色及び免疫組織化学は以前に記載されたように実施した(Reproduction 136, 503−514(2008);Reproduction 139, 381−393, doi:REP−09−0373[pii]10.1530/REP−09−0373(2010);J Histochem Cytochem 47, 1443−1456(1999))。使用した一次抗体は以下のとおりであった:抗−Oct3/4(マウスモノクローナル;BD Bioscience)、抗−Sox2(ウサギポリクローナル;Santa Cruz)、抗−Nanog(ラットモノクローナル;eBioscience)、抗−H3K9me2(ウサギポリクローナル;Upstate)、抗−H3H27me3(ウサギポリクローナル;Upstate)及び抗−Dnmt3b(マウスモノクローナル;Abcam)。使用した二次抗体は以下のとおりであった:Alexa Fluor 488抗−ウサギIgG、Alexa Fluor 568抗−ウサギ又はラット又はマウスIgG、Alexa Fluor 633抗−マウスIgG(これらは全てヤギポリクローナルである;Invitrogen)。免疫蛍光画像は、共焦点顕微鏡(Olympus FV1000)により得た。
BrdU取込みの分析のために、BrdU標識及び検出キット(Roche)を使用した。PGC様細胞のために4日間誘導された集合体を10μMのBrdUで6時間インキュベートした。インキュベート後、集合体をTrypLE処理により解離し、Cytospin4(Thermo Scientific)によりスライドガラス上に広げ、50 mMグリシン中70%EtOHで固定し、PBSで洗浄した。次いで、細胞を抗−BrdU及び抗−GFP、それに続いてAlexa Fluor 568抗−マウスIgG及びAlexa 488抗−ラットIgGでインキュベートした。免疫蛍光画像は、共焦点顕微鏡(Olympus FV1000)により得た。
BVSC ESC(C57BL/6バックグラウンド)からのPGC様細胞誘導の全集合体[実験当たり約192(2つの96ウェルプレート)集合体]をTripLE(Invitrogen)により単一の細胞に解離した。レシピエント動物[WB×C57BL/6 F1バックグラウンド(SLC)からの、内因性精子形成を欠損した新生児(7〜9日齢)W/Wvマウス(J Exp Zool 134, 207−237(1957))]に氷上で低体温麻酔を導入し、ドナー細胞懸濁液[全細胞解離物(dissociates)、又はFACSでソーティングされたBV陽性細胞(約2μl)(表3)]を各精巣の輸出管に注入した(Int J Dev Biol 41, 111−122(1997))。術後、レシピエント動物を同腹子に戻し、10週間後に分析した。
雄のiPSC(MEF−Ng−20D−17:Nature 448, 313−317(2007);MEF−Ng−178B−5:Nat Biotechnol 26, 101−106(2008);MEF−Ng−492B−4:Science 322, 949−953(2008))はRIKEN BRCから得た。iPSCは、ポリ−L−オルニチン(0.01%;Sigma)及びラミニン(10 ng/ml;BD Biosciences)でコートされたディッシュ上、2i(PD0325901、0.4μM;Stemgent;CHIR99021、3μM;Stemgent)及びLIF(1000 U/ml)を有するN2B27培地(N2を添加したDMEM/F12とB27を添加したNeurobasalとの1:1混合物)中で維持した。
C57BL/6バックグラウンドで、Blimp1−mVenus and stella−ECFPレポーター(BVSC)(Reproduction 136, 503−514(2008))を有する雄のESCを得、MAPKシグナリング阻害剤(PD0325901、0.4μM)、GSK3阻害剤(CHIR99021、3μM)及びLIF(1000 U/ml)[2i+LIF]を有するN2B27培地中(~E3.5〜E4.5 ICM/初期エピブラスト様状態(基底状態)にESCを保つ条件(Nature 453, 519−523, doi:nature06968 [pii] 10.1038/nature06968(2008);Development 136, 3215−3222, doi:dev.038893 [pii] 10.1242/dev.038893(2009)))で維持した。検証した種々の条件のうち、フィブロネクチンでコートされたディッシュ上、アクチビンA(20 ng/ml)、bFGF(12 ng/ml)及びKnockout(商標)Serum Replacement(KSR)(1%)で刺激することにより、非常にコンパクトなESCコロニーが、エピブラストに類似したより扁平な上皮性構造に、3日にわたって均一に誘導されることを発見した(図1A、B)。刺激すると、細胞は、最初の2日間は比較的急速に増殖したが、その後、かなりの程度の細胞死を起こし、3日目の生存細胞数は2日目のものと類似した(図1C(a))。3日目の細胞は、より伸長し突起のある形態を示した(図1B)。
次に我々は、EpiLCが、in vivoにおける原腸陥入前エピブラストの場合と同様に、PGC様細胞に誘導されるかを検証した。このような誘導は、EpiLCが原腸陥入前エピブラストの機能的特性を有するか否かの重要な指標であると考えられた。我々は、BVSC ESC並びに1日目(day−1)、2日目(day−2)及び3日目(day−3)のEpiLCを、浮遊条件下(低細胞結合性U底96ウェルプレートのウェル当たり1,000細胞)、SFM単独、又はLIF(1000 U/ml)を有するSFM中、又はBMP4(500 ng/ml)を有するSFM中、又はBMP4及びLIFを有するSFM中で2日間培養した。図2Aに示すように、SFM単独又はLIFを有するSFM中で培養した集合体のいずれも、有意なBV誘導は観察されなかった。対照的に、BMP4を有するSFM、又はBMP4及びLIFを有するSFM中で培養した場合には、顕著且つ比較的均一なBV誘導が、day−2 EpiLC由来の集合体において明確に見られたが、ESC又はday−1 EpiLC由来の集合体では見られなかった(図2A)。day−3 EpiLC由来の集合体もBV誘導を呈したが、他の起源のものと比較して、非常に小さく、あまり組み込まれていないようであった(図2A)。SCは、2日の培養の間、いずれの条件下でも誘導されていないようであった。これらの発見は、E5.5〜E6.0エピブラストと同様に、EpiLC、特にday−2 EpiLCが、BMP4に応答して特異的にBlimp4を発現する能力を有することを示す。
PGC様細胞誘導プロセスについて、より重要な見解を得るために、我々は、day−2 EpiLCからのPGC様細胞誘導と関連する遺伝子発現ダイナミクスをQ−PCRにより評価した(図2E)。Oct3/4は、BV陽性細胞及びBVSC陽性細胞(それぞれ、2日目、及び4/6日目)でわずかに上方制御された一方、day−2 EpiLCで下方制御されたSox2及びNanog(図1E)は、これらPGC様細胞において有意に回復した。PGC分化決定時に特異的に上方制御される遺伝子(Blimp1、Prdm14、Tcfap2c、Nanos3、stella(Dppa3)、Tdrd5及びDnd1を含む)は、BV陽性及びBVSC陽性細胞において、すべて高度に上昇した。対照的に、Hoxa1、Hoxb1、Snai1などの壁側中胚葉のプログラムと関連する遺伝子は、2日目のBV陽性細胞では一時的な上方制御を示したが、その後、4日目及び6日目のBVSC陽性細胞では、大幅な抑制を呈した。他方、Dnmt3a及び3b、Dnmt1の重要な補助因子(co−factor)をコードするNp95、並びにc−mycは、単調に下方制御された。Mvh、Dazlなどの生殖細胞発生後期と関連する遺伝子は、BVSC陽性細胞において、わずかな上方制御を示した。従って、in vitroにおけるPGC様細胞誘導と関連する遺伝子発現ダイナミクスは、in vivoにおけるPGC分化決定のものと酷似する(Genes Dev 22, 1617−1635(2008), Nature 418, 293−300(2002), Biol Reprod 75, 705−716(2006))。
次に、我々は、完全誘導条件下、6日目における、day−2 EpiLCから誘導されたBVSC陽性細胞のエピジェネティックな特性を決定した。我々は、BVSC陽性細胞が、有意に減少したH3K9me2と、その代わり高く上昇したH3K27me3を有するようであることを発見した(図3A(a)、(b))。Q−PCR分析と一致して、BVSC陽性細胞は、Dnmt3bに対して陰性であった(図3A(c))。次いで、我々は、母方で発現した(Snrpn、Kcnq1ot1)インプリンティング遺伝子及び父方で発現した(Igf2r、H19)インプリンティング遺伝子のインプリンティング状態を、これら遺伝子のメチル化可変領域についてのバイサルファイト配列決定分析により測定した。図3Bに示すように、BVSC陽性PGC様細胞は、Igf2r及びSnrpnのメチル化インプリントは保持していたが、H19及びKcnqlot1のメチル化インプリントレベルは減少しているようであり、これは、day−6 BVSC陽性細胞が、インプリント消去プロセスを開始することを示唆する(Mech Dev 117, 15−23(2002))。集約すると、これらの結果は、day−2 EpiLCからのPGC様細胞の発生は、遺伝子発現及びエピジェネティックなリプログラミングに関してPGC分化決定及び発生を正確に再現しており、day−6 BVSC陽性細胞は、およそ約E9.5頃の移動PGC(migrating PGC)と、同一でないまでも、酷似した特性を有することを明確に実証する(Development 134, 2627−2638(2007))。
次に我々は、PGC様細胞の機能を評価するために、内因性生殖細胞を欠損した新生児W/Wvマウス精細管にPGC様細胞を移植することにより、PGC様細胞が適切な精子形成を起こすかどうかを検証した(Development 132, 117−122(2005))。精子形成に貢献する細胞の能力は、当該細胞が雄性生殖細胞となるかどうかの最も厳密な指標である(Cold Spring Harb Symp Quant Biol 73, 17−23, doi:sqb.2008.73.033 [pii]10.1101/sqb.2008.73.033(2008))。我々は、BVSC ESC株からPGC様細胞を6日間誘導し、集合体全体又はFACSによりソーティングしたBV陽性細胞から解離した単一細胞をレシピエントの精巣に移植し、10週間後にこれを評価した。集合体全体の細胞を移植した精巣は全て(8/8及び6/6)三胚葉の細胞を含む明らかなテラトーマを生じた(図8及び表3)。際立って対照的に、FACSソーティングされたBV陽性細胞を移植した精巣は、テラトーマ形成を示さなかった。その代わり、驚くべきことに、6つの精巣のうち3つが、見かけ上適切な精子形成を有する精細管を有した;移植された精細管は、外見上排精に相当する暗い中心のセクションを含み、これら精細管は、精子形成していないものよりも、かなり厚いものであった(図4A(a)及び表3)。厚い精細管内を調べることにより、正常な形態を有する豊富な精子の存在が実際に明らかとなった(図4A(b))。厚い精細管の組織学的検査により、確固たる断続的な精子形成が明確に示され、一方、薄い精細管にはセルトリ細胞しか含まれていなかった(図4A(c)、(d))。PGC様細胞のコロニー形成効率は、我々が実施したin vivoでのPGCのものと類似した(Cell 137, 571−584(2009))。これらの発見は、ESCから誘導されたPGC様細胞は、in vivoにおけるPGCと機能的に類似した特性を有することを示す。
PGC様細胞の純粋な集団を区別する表面マーカーの同定は、ヒトを含む種々の哺乳動物種由来のiPSCやESCなどの、適切なトランスジェニックレポーターを有さないPSCからPGC様細胞を単離するために必須である(Reproduction 139, 931−942(2010))。我々は、BV(+)集団を定義するものを同定するために、表面マーカー(SSEA1、PECAM1、EPCAM、N−カドヘリン、インテグリン−β3、インテグリン−αV、CXCR4及びKIT)及びそれらの組合せをスクリーニングした。6日間誘導されたBVSC d2 EpiLCの集合体を、SSEA1及びインテグリン−β3によりFACSソーティングした場合に、それらは、3つの主要な亜集団に分類された[P1(SSEA1高、インテグリン−β3高)、P2(SSEA1高、インテグリン−β3低)及びP3(SSEA1低、インテグリン−β3高/低)]。特に、P1では、99%超の細胞がBV(+)であったが、P2及びP3では、それぞれ、わずか1.2%及び1.7%の細胞しかBV(+)細胞を含まず(図13A)、P1が、BV(+)集団とほぼ同一であることが示された。
実施例1及び2と同様の方法でiPSCからEpiLC及びPGC様細胞を誘導し、免疫蛍光法及びQ−PCRにより特徴付けた。マウスiPSCとして、3遺伝子(Oct3/4、Sox2、Klf4)の導入により作製されたiPS178B−5(Nat Biotechnol 26, 101−106(2008))、並びに4遺伝子(Oct3/4、Sox2、Klf4、c−Myc)の導入により作製されたiPS492B−4(Science 322, 949−953(2008))及び20D17(Nature 448, 313−317(2007))を使用した(これらは全てNanog−EGFP(NG)導入遺伝子を有している)。分析結果を図9に示す。iPSCをEpiLCに2日間分化誘導すると、ESCの場合と同様に、エピブラスト様の構造に形態的に変化した。免疫蛍光法により、EpiLC誘導の間、Nanog発現が急激に消失することが明らかとなった(図9A〜9C、(a))。次に、Q−PCRを実施して、実施例1と同様の方法で得られたEpiLCを特徴付けた。その結果、iPSCを2日間分化誘導して得られたEpiLCは、ESC由来のEpiLCと類似して、ICM状態と密接に関連する遺伝子の下方制御を示し、エピブラストで上方制御される遺伝子の発現上昇を示した。さらに、内胚葉マーカーも、ESC由来EpiLCと同様に下方制御された(図9D)。
Claims (15)
- 多能性幹細胞からエピブラスト様細胞(EpiLC)を製造する方法であって、前記多能性幹細胞をアクチビンA、塩基性線維芽細胞増殖因子(bFGF)及びKnockOut(商標)Serum Replacement(KSR)の存在下で培養する、方法。
- EpiLCが、分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Fgf5、Wnt3及びDnmt3bから選択される少なくとも1つの遺伝子発現の上昇を示す、請求項1記載の方法。
- EpiLCが、分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Gata4、Gata6、Sox17及びBlimp1から選択される少なくとも1つの遺伝子発現の低下を示す、請求項1又は2記載の方法。
- 無血清及び無フィーダー条件下で培養を実施する、請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。
- 培養を3日未満実施する、請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法。
- 多能性幹細胞から始原生殖細胞様(PGC様)細胞を製造する方法であって、以下の工程I)及びII)を含む、方法:
I)請求項1〜5のいずれか1項に記載の方法でEpiLCを製造する工程、
II)工程I)で得られたEpiLCをBMP4及びLIFの存在下で培養する工程。 - PGC様細胞が、分化誘導前のEpiLCに比して、Blimp1及び/又はStella(Dppa3)遺伝子発現の上昇を示す、請求項6記載の方法。
- PGC様細胞が、正常な精子形成に貢献できる、請求項6又は7記載の方法。
- 前記工程II)の培養をさらにSCF及び/又はBMP8b及び/又はEGFの存在下で実施する、請求項6〜8のいずれか1項に記載の方法。
- 前記工程I)の培養をアクチビンA、bFGF及びKSRの存在下で実施し、前記工程II)の培養をBMP4、LIF、SCF、BMP8b及びEGFの存在下で実施する、請求項9記載の方法。
- 前記工程II)の培養を無血清条件下で実施する、請求項7〜10のいずれか1項に記載の方法。
- さらに、
III)前記工程II)で得られた細胞からBlimp1陽性細胞を選択する工程を含む、請求項6〜11のいずれか1項に記載の方法。 - さらに、
III)前記工程II)で得られた細胞からSSEA1−及びインテグリン−β3−二重陽性細胞を選択する工程
を含む、請求項6〜12のいずれか1項に記載の方法。 - 多能性幹細胞が、人工多能性幹細胞(iPSC)又は胚性幹細胞(ESC)である、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
- BMP4、LIF、SCF、BMP8b及びEGFを含む、EpiLCからPGC様細胞への分化誘導用試薬キット。
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