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JP5342145B2 - EphA2に結合する抗体およびその使用方法 - Google Patents

EphA2に結合する抗体およびその使用方法 Download PDF

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Description

技術分野
本発明は、生物学および免疫療法の分野にある。より具体的には、本発明はEphA2と結合する抗体のファミリーの発見に関する。本発明はさらに、抗EphA2ファミリー抗体を用いる、EphA2に関連する種々のヒト疾患および癌の診断および/または治療を提供する。
発明の背景
抗体は、それらの既知の診断における使用に加えて、治療薬として有用であることが示されている。例えば、免疫療法、または治療目的のための抗体の使用は、ここ数年、癌を治療するために用いられている。受動的な免疫療法は、癌治療でのモノクローナル抗体の使用を含む。例えば、Cancer:Principles and Practice of Oncology,6th Edition(2001)Chapt.20 pp.495−508を参照されたい。これらの抗体は、腫瘍細胞増殖もしくは生存の直接阻害、および身体の免疫系の天然の殺細胞活性を補充するそれらの能力の双方による固有の治療的生物活性を有し得る。これらの薬剤は単独で、あるいは放射線療法または化学療法薬と併用して投与することができる。リツキシマブおよびトラスツズマブは、それぞれ非ホジキンリンパ腫および乳癌の治療に認可されていて、そのような治療薬の2つの例である。あるいは、抗体を用いて、抗体が毒素と結合し、腫瘍と特異的に結合することによりその毒素を腫瘍に向ける抗体複合体を作製することができる。ゲムツズマブ・オゾガマイシンは、白血病の治療に用いられる認可された抗体複合体の例である。癌細胞と結合し、診断および治療に利用可能性を有するモノクローナル抗体が刊行物に開示されている。例えば、とりわけ、多少の分子量の標的タンパク質を開示する以下の特許出願:米国特許第6,054,561号(200KD c−erbB−2(Her2)、およびサイズ40〜200KDのその他の未知の抗原)および米国特許第5,656,444号(50KDおよび55KD、癌胎児性タンパク質)を参照されたい。臨床実験中の抗体および/または固形腫瘍の治療に認可された抗体の例としては、トラスツズマブ(抗原:180kD、HER2/neu)、エドレコロマブ(抗原:40〜50kD、Ep−CAM)、抗ヒト乳脂肪球(HMFG1)(抗原>200kD、HMW ムチン)、セツキシマブ(抗原:150kDおよび170kD、EGF受容体)、アレムツズマブ(抗原:21〜28kD、CD52)、ならびにリツキシマブ(抗原:35kD、CD20)が挙げられる。
乳癌の治療に用いられるトラスツズマブ(Her−2受容体)の抗原標的、および数種類の癌の治療のための臨床実験中のセツキシマブ(EGF受容体)は、いくらかの検出可能なレベルで皮膚、結腸、肺、卵巣、肝臓、および膵臓をはじめとする多数の正常なヒト成体組織に存在する。これらの治療薬を用いる際の安全域は、おそらくこれらの部位での抗体の発現レベル、抗体のアクセス、または抗体の活性の差によって提供される。
別の種類の免疫療法は、能動免疫療法、あるいは、特定の癌に存在する抗原、または抗原の発現を指示するDNA構築物を用いるワクチン接種であり、それはその後個体に免疫応答を誘起する、すなわち、それら独自の癌に対する抗体を活発に産生するよう個体を誘導する。能動免疫療法は受動免疫療法または免疫毒素ほど頻繁には用いられていない。
疾患(癌を含む)進行のモデルがいくつか提案されている。理論は、単一の感染/形質転換事象による因果関係から、次第に「疾患様」または「癌様」組織種へ進化し、最終的に完全に病原性のまたは悪性の可能性をもつ組織へと導くものまで多岐にわたる。例えば、癌に関して、単一の突然変異による事象が悪性腫瘍を引き起こすために十分であるという議論もあれば、その後の変更も必要であるという議論もある。別の誰かは、細胞レベルでの一連の突然変異−選択事象による新生組織形成の開始ならびに発達の双方に、突然変異荷重および腫瘍の異型度の増加が必要であると示唆している。腫瘍組織にしか見出されない癌標的もあれば、正常な組織に存在して腫瘍組織を上方制御および/または過剰発現する癌標的もある。そのような状況において、一部の研究者は過剰発現が悪性腫瘍の獲得に関連していると示唆し、その一方で、他の研究者は過剰発現が単に高まりつつある疾病状態の進路に沿った動向を示すマーカーであると示唆している。
理想的な診断用および/または治療用抗体に求められる一態様は、種々の癌に関連する抗原の発見および特性決定である。非癌細胞での発現が制限されている、多くの種類の癌で発現する少数の抗原(例えば、「汎癌」抗原)がある。そのような抗原の単離および精製は、抗原を標的化する抗体(例えば、診断用または治療用の)の作製に有用であろう。「汎癌」抗原との抗体結合は、異なる組織で見出される種々の癌を標的にすることができ、1つの特定の種類の癌のみと関連のある抗原に対する抗体と大きく異なっている。また、抗原は、創薬(例えば、小分子)、ならびに細胞調節、増殖、および分化のさらなる特性決定にも有用であろう。
必要とされるものは、疾患細胞および/または癌細胞の表面の新規な標的であり、その標的はそのような疾患および/または癌を、細胞表面標的を特異的に認識する抗体およびその他の薬剤で治療するために用いることができる。本明細書に開示される発見に基づいて、EphA2の疾患を促進する活性を(低下させるかまたは高めることにより)調節することのできる、細胞の表面で標的を特異的に認識する新規な抗体およびその他の薬剤に対してさらなる必要性が存在する。
以前はECKとして知られていたEphA2は、130kDの膜貫通型受容体チロシンキナーゼであり、成体上皮細胞に発現する。Lindberg,ら(1990)MoI.Cell.Biol.10:6316−6324を参照されたい。EphA2は、受容体チロシンキナーゼのEphファミリーの1メンバーであり、Ephファミリーは、隣接する細胞の膜に固定される、エフリンとして公知のリガンドを認識する、という点で独特である。Bartley,ら(1994)Nature 368:558−560を参照されたい。ヒト受容体EphA2の配列は文献中で公知である。それは534アミノ酸の細胞外ドメイン、24アミノ酸の膜貫通ドメイン、およびチロシンキナーゼドメインを含む418アミノ酸の細胞質ドメインを包含する。
EphA2は、多数の癌細胞、例えば、乳房、前立腺、肺、および結腸の癌腫において、ならびに攻撃的な黒色腫で過剰発現するが、報告によれば、これらの同じ組織の非癌性の病変では過剰発現しない。例えば、Rosenberg,ら(1997)Am.J.Physiol.273:G824−G832;Easty,ら(1995)Int.J.Cancer 60:129−136;Walker−Daniels,ら(1999)Prostate 41:275−280;Zantekら(1999)Cell Growth & Differ.10:629−638;Zantekら(2001)Clin.Cancer Res.7:3640−3648;Zelniskiら(2001)Cancer Res.61:2301−2306;WO01/121172;およびWO01/12840を参照されたい。さらに、EphA2を過剰発現するように形質変換されている細胞は、悪性増殖およびリガンド結合を示し、それによりEphA2は内在化され、分解されて、EphA2過剰発現の発癌作用が逆になる。Zelniskiら(2001)Cancer Res.61:2301−2306;およびWalker−Daniels,ら(2002)Mol.Cancer Res.1:79−87を参照されたい。
EphA2を治療標的として用いることは、当技術分野の研究者らにより提案されてきた。一人の執筆者は、ヒト免疫グロブリンGとのエフリンA1融合体などのEphA2リガンドの使用を提案した。EphA2を発現している細胞のエフリンA1−Fc融合タンパク質への曝露の結果、EphA2発現の下方制御がもたらされた。非特許文献1を参照されたい。
eck/EphA2に対する抗体は公知である。例えば、非特許文献2を参照されたい。抗EphA2抗体を用いる、抗体に基づく標的化の使用は、他の研究者らに記載されている。例えば、ヒト免疫グロブリンと融合したEphA2の細胞外ドメインを用いる、EphA2に対するモノクローナル抗体の作製が記載されている、非特許文献3を参照されたい。これらの抗EphA2モノクローナル抗体を用いる癌細胞の処置の結果、軟寒天上での細胞増殖の形態学的変化および細胞増殖の阻害がもたらされた。
EphA2に対する抗体が作製され、癌の治療に有用であることが提案されている(例えば、特許文献1;特許文献2および特許文献3;米国特許仮出願第60/379,322号および同60/379,368号;特許文献4を参照されたい)。WO2003US15044号には、EphA2と結合してEphA2を作動させ、それにより、EphA2のリン酸化を増加させてEphA2レベルを低下させる、有効量の抗体の投与を含む方法が記載されている。他の実施形態では、その特許出願には、EphA2と結合して軟寒天での癌細胞コロニー形成を阻害する有効量の抗体の投与が、3次元の基底膜または細胞外マトリックス調製物での管状のネットワーク形成を阻害し、癌細胞に露出しているが非癌細胞には露出していないEphA2エピトープと選択的に結合し、かつ/または低いKoffを有し、それにより、腫瘍細胞増殖および/または転移を阻害することが記載されている。特許文献1には、EphA2のホスホチロシン含量を増加させる抗体を用いて腫瘍細胞の増殖を阻害する抗体が記載されている。
特許文献5には、EphA2に由来するペプチドおよびそれらの抗腫瘍免疫療法での使用が記載されている。それにはEphA2を過剰発現する腫瘍細胞への細胞傷害性Tリンパ球の細胞応答を誘導または模倣するために用いることのできるEphA2エピトープに基づくペプチドワクチン接種または免疫療法が記載されている。
EphA2抗体は公知であるが、腫瘍細胞増殖の阻害に、先行技術で示されるEphA2抗体の示す有効性のレベルを超えて、極めて効果的な特定の抗EphA2抗体に対する必要性がなお残っている。
本明細書に開示される全ての参照文献、刊行物、および特許出願は、参照によりその全文が本明細書に組み込まれる。
米国特許第6,927,203号明細書 国際公開第01/12840号パンフレット 国際公開第01/12172号パンフレット 米国特許第5,824,303号明細書 国際公開第200391383号パンフレット Duxbury,ら(2004)BBRC 320:1096−1102 Lindberg,ら(1990)Mol.Cell.Biol.10:6316−6324 Charles−Kinchら(2002)Cancer Res.62:2840−2847
発明の概要
本明細書に開示される本発明は、種々のヒト癌で発現するEphA2という抗原と結合する抗体に関する。従って、一態様では、本発明は、抗原EphA2と選択的に結合する、抗体の1ファミリー、または1つの抗体もしくは1つのポリペプチド(抗体であってもなくてもよい)である。本発明において特許請求される抗体は、先行技術で示されるEphA2抗体の示す有効性のレベルを超えて、腫瘍細胞増殖の阻害に意外にも且つ非常に効果的である。これらの抗体のうちのいくつかは、本明細書においてLUCA19、SPL1、LUCA40、またはSG5と呼ばれている。本発明の態様では、腫瘍細胞の増殖を阻害する能力を有するが、EphA2のホスホチロシン含量を増加させない特定の抗体が発見された。
別の態様では、本発明は、以下の宿主細胞株:2003年3月20日American Type Culture Collectionに寄託されたPTA−5070、2004年6月8日American Type Culture Collectionに寄託されたPTA−6056、2004年6月8日American Type Culture Collectionに寄託されたPTA−6059、および2006年2月2日American Type Culture Collectionに寄託されたSG5産生宿主細胞株(SG.3.15.B4.1F9)のうちのいずれか1つから産生されたモノクローナル抗体、抗EphA2である。
別の態様では、本発明は、抗体、または抗EphA2抗体とEphA2との特異的結合を競合的に阻害するポリペプチド(抗体であってもなくてもよい)である。別の態様では、本発明は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40が選択的に結合するように、EphA2の同一エピトープと選択的に結合する抗体またはポリペプチド(抗体であってもなくてもよい)である。
別の態様では、本発明は、抗EphA2抗体の断片または領域を含む抗体である。一実施形態では、断片は抗EphA2抗体の軽鎖である。もう1つの実施形態では、断片は抗EphA2抗体の重鎖である。さらに別の実施形態では、断片は、抗EphA2抗体の軽鎖および/または重鎖由来の1またはそれ以上の可変領域を含む。さらに別の実施形態では、断片は、抗EphA2抗体の軽鎖および/または重鎖由来の1またはそれ以上の相補性決定領域(CDR)を含む。
別の態様では、本発明は、次の、抗EphA2抗体の:a)1またはそれ以上のCDR;b)軽鎖由来の3つのCDR;c)重鎖由来の3つのCDR;d)軽鎖由来の3つのCDRおよび重鎖由来の3つのCDR;e)軽鎖可変領域;f)重鎖可変領域、のいずれかを含むポリペプチド(抗体であってもなくてもよい)を提供する。
別の態様では、本発明は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40に由来するヒト化抗体である。一部の実施形態では、ヒト化抗体は、抗EphA2抗体の1またはそれ以上のCDRを含む。別の態様では、本発明は、抗EphA2抗体と同一のエピトープと結合するヒト化抗体を提供する。概して、本発明のヒト化抗体は、抗EphA2抗体のCDRと同一の、かつ/または抗EphA2抗体のCDRに由来する、1またはそれ以上(1、2、3、4、5、6)のCDRを含む。別の態様では、本発明は、抗EphA2抗体と同一のEphA2上のエピトープと結合するヒト抗体を提供する。
別の態様では、本発明は、抗EphA2抗体の重鎖および軽鎖の可変領域由来の可変領域およびヒト抗体の重鎖および軽鎖の定常領域由来の定常領域を含むキメラ抗体である。
さらにもう1つの態様では、本発明は、宿主細胞(ATCC番号PTA−5070、PTA−6056、PTA−6059、またはSG.3.15.B4.1F9(ATCC番号PTA−XXXX))またはモノクローナル抗EphA2抗体を産生するその後代である。
別の態様では、本発明は、ATCC寄託番号PTA−5070、PTA−6056、もしくはPTA−6059または宿主細胞SG.3.15.B4.1F9(ATCC番号PTA−XXXX)の宿主細胞あるいはその後代により産生される抗EphA2抗体をコードする単離されたポリヌクレオチドである。別の態様では、本発明は、本明細書に記載される抗体(抗体断片を含む)のいずれか、ならびにその他のいずれかのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供する。
別の態様では、本発明は、本明細書に記載される抗体またはポリペプチドのいずれかにより結合されているEphA2の複合体である。一部の実施形態では、EphA2は、黒色腫細胞、乳癌細胞、結腸癌細胞、肺癌細胞、または前立腺癌細胞に存在する。一部の実施形態では、本発明は、抗EphA2抗体、または抗EphA2抗体が選択的に結合するエピトープと選択的に結合する抗体により結合しているEphA2の複合体である。一実施形態では、抗EphA2抗体、または抗EphA2抗体が選択的に結合するエピトープと選択的に結合するいずれかの抗体は、治療薬(毒素など)と結合されている。
別の態様では、本発明は、本明細書に記載される抗体またはポリペプチドのいずれかにより結合されているEphA2を発現している癌細胞の複合体である。一部の実施形態では、癌細胞は、黒色腫細胞、乳癌細胞、結腸癌細胞、肺癌細胞、または前立腺癌細胞である。一部の実施形態では、抗体は、SPL1、LUCA19、SG5またはLUCA40、あるいはこれらの抗EphA2抗体のいずれかが選択的に結合するエピトープと選択的に結合するいずれかの抗体である。一部の実施形態では、SPL1、LUCA19、SG5またはLUCA40抗体、あるいはこれらの抗EphA2抗体のいずれかが選択的に結合するエピトープと選択的に結合するいずれかの抗体は、治療薬(毒素など)と結合されている。
別の態様では、本発明は、SPL1、LUCA19、SG5またはLUCA40が選択的に結合し、それが次に本明細書に記載される抗体またはポリペプチドのいずれかにより結合されているEphA2上のエピトープの複合体である。一部の実施形態では、エピトープは黒色腫細胞、乳癌細胞、結腸癌細胞、肺癌細胞、または前立腺癌細胞上にある。一部の実施形態では、抗体は、SPL1、LUCA19、SG5またはLUCA40、あるいはこれらの抗EphA2抗体のいずれかが選択的に結合するエピトープと選択的に結合するいずれかの抗体である。一部の実施形態では、SPL1、LUCA19、SG5またはLUCA40、あるいはこれらの抗EphA2抗体のいずれかが選択的に結合するエピトープと選択的に結合するいずれかの抗体は、治療薬(毒素など)と結合されている。
別の態様では、本発明は、本明細書に記載されるポリペプチド(抗EphA2抗体などのいずれかの抗体を含む)またはポリヌクレオチドのいずれかを含む医薬組成物、例えば、抗EphA2抗体(抗EphA2抗体は治療薬と結合し、抗体は抗EphA2抗体の断片、抗EphA2抗体のヒト化抗体、抗EphA2抗体の可変領域に由来する可変領域とヒト抗体の定常領域に由来する定常領域とを含むキメラ抗体、または抗EphA2抗体の1またはそれ以上の特性をもつヒト抗体を含む)および薬学的に受容可能な賦形剤を含む医薬組成物である。
さらに別の態様では、本発明は、(a)宿主哺乳類を免疫原で免疫化する工程;(b)哺乳類からリンパ球を得る工程;(c)リンパ球(b)を骨髄腫細胞株で融合してハイブリドーマを作製する工程;(d)(c)のハイブリドーマを培養してモノクローナル抗体を作製する工程;および(e)抗体をスクリーニングして、疾患細胞および/または癌細胞あるいは疾患細胞株および/または癌細胞株と結合するが、非癌細胞または正常細胞あるいは非癌細胞株または正常細胞株と結合しない、あるいは低いレベルで正常細胞と結合するかまたは異なる方法で正常細胞と結合する抗体のみを選択する工程を含む、疾患細胞および/または癌細胞と反応性のモノクローナル抗体、抗EphA2を生成する方法である。
別の態様では、本発明は、抗体の産生を可能にする条件下で、そのような抗体またはその後代をコードする宿主細胞を培養する工程、および抗EphA2抗体を精製する工程を含む、抗EphA2ファミリー抗体を生成する方法である。
別の態様では、本発明は、抗体の産生を可能にする条件下で、宿主細胞またはその後代を培養する工程、および抗EPHA2抗体を精製する工程を含む、抗EphA2ファミリー抗体を生成する方法である。
別の態様では、本発明は、本明細書に記載される抗体(またはポリペプチド)のいずれかを、適した細胞において、抗体(1つのベクターから単一の軽鎖または重鎖として別々に発現してもよいし、または軽鎖および重鎖の双方が発現してもよい)をコードする1またはそれ以上のポリヌクレオチドを発現させることにより、一般に、その後目的の抗体またはポリペプチドを回収することおよび/または単離することにより、生成する方法を提供する。
別の態様では、本発明は、抗EphA2抗体のEphA2との選択的な結合を競合的に阻害する、抗EphA2抗体またはポリペプチド(抗体であってもなくてもよい)である。一部の実施形態では、本発明は、他の抗EphA2抗体と同一または異なるEphA2上のエピトープと選択的に結合する、抗体またはポリペプチド(抗体であってもなくてもよい)である。
さらに別の態様では、本発明は、EphA2のエピトープに特異的な抗体により結合されているEphA2を含む組成物である。一実施形態では、抗体は抗EphA2である。他の実施形態では、2またはそれ以上の抗EphA2抗体がEphA2の2またはそれ以上の異なるエピトープにマッピングする抗体とともに投与される。一部の実施形態では、抗EphA2抗体は、治療薬または検出可能な標識と結合されている。
別の態様では、本発明は、抗EphA2抗体の断片または領域を含む抗体である。一実施形態では、断片は抗体の軽鎖である。別の実施形態では、断片は抗体の重鎖である。さらに別の実施形態では、断片は、抗体の軽鎖および/または重鎖由来の1またはそれ以上の可変領域を含む。さらに別の実施形態では、断片は抗体の軽鎖および/または重鎖由来の1またはそれ以上の相補性決定領域(CDR)を含む。
別の態様では、本発明は、次の、抗EphA2抗体の:a)軽鎖または重鎖由来の1またはそれ以上のCDR(またはその断片);b)軽鎖由来の3つのCDR;c)重鎖由来の3つのCDR;d)軽鎖由来の3つのCDRおよび重鎖由来の3つのCDR;e)軽鎖可変領域;f)重鎖可変領域、のいずれかを含むポリペプチド(抗体であってもなくてもよい)を提供する。
別の態様では、本発明は、ヒト化抗体である。一部の実施形態では、ヒト化抗体は、非ヒト抗EphA2抗体の1またはそれ以上のCDRを含む。一部の実施形態では、ヒト化抗体は、他の抗EphA2抗体と同一または異なるエピトープと結合する。概して、本発明のヒト化抗体は、本来の非ヒト抗EphA2抗体のCDRと同一である、かつ/またはCDRに由来する1またはそれ以上の(1、2、3、4、5、6またはそれらの断片)CDRを含む。一部の実施形態では、ヒト抗体は、他の抗EphA2抗体と同一または異なるエピトープと結合する。別の態様では、本発明は、非ヒト抗EphA2抗体の重鎖および軽鎖の可変領域に由来する可変領域、ならびにヒト抗体の重鎖および軽鎖の定常領域由来の定常領域を含むキメラ抗体である。
別の態様では、本発明は、それぞれATCC寄託番号PTA−5070、PTA−6056、またはPTA−6059の宿主細胞、および宿主細胞SG.3.15.B4.1F9(ATCC番号PTA−XXXX)またはその後代により産生される抗体SPL1、LUCA19、SG5またはLUCA40のいずれか1つをコードする、単離されたポリヌクレオチドである。本発明は、上記の抗体のいずれかの固有の結合または生物活性を有する抗体ポリペプチドを包含する。別の態様では、本発明は、本明細書に記載されるいずれかの抗体(抗体断片を含む)ならびにその他の任意のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供する。
別の態様では、本発明は、本明細書に記載されるポリペプチド(本明細書に記載される抗体のいずれかを含む)またはポリヌクレオチドのいずれかを含む医薬組成物で、例えば、化学療法薬と結合されている抗EphA2抗体、抗EphA2抗体の断片を含む抗体、非ヒト抗EphA2抗体のヒト化抗体、非ヒト抗EphA2抗体の可変領域に由来する可変領域およびヒト抗体の定常領域に由来する定常領域を含むキメラ抗体、または非ヒト抗EphA2抗体の1またはそれ以上の特性を持つヒト抗体、あるいは、化学療法薬(放射性部分など)と結合している本明細書に記載される抗EphA2抗体のいずれか、ならびに薬学的に受容可能な賦形剤を含む医薬組成物である。
一態様では、本発明は、疾患細胞または癌細胞上に存在するEphA2と結合した抗EphA2抗体を含む組成物である。好ましい実施形態では、癌細胞は、卵巣癌細胞、肺癌細胞、前立腺癌細胞、膵癌細胞、結腸癌細胞、および乳癌細胞からなる群から選択される。一部の実施形態では、癌細胞は単離されている。一部の実施形態では、癌細胞は生体サンプル中に存在する。概して、生体サンプルは個体、例えばヒトに由来する。
別の態様では、本発明は、個体の細胞上のEphA2を検出することにより、個体における疾患、特に個体における炎症反応または自己免疫応答に関連する疾患または障害を診断する方法である。本発明の他の態様では、方法は、個体における炎症反応または自己免疫応答を調節するために提供される。本発明の組成物および方法を用いて治療され得る疾患、ならびに炎症および自己免疫疾患から生じる状態としては、例示目的であって限定目的ではないものとして、多発性硬化症、髄膜炎、脳炎、卒中、その他の脳外傷、炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎およびクローン病を含む)、重症筋無力症、狼瘡、慢性関節リウマチ、喘息、急性若年型糖尿病、AIDS、認知症、アテローム性動脈硬化症、腎炎、網膜炎、アトピー性皮膚炎、乾癬、心筋虚血および急性白血球媒介性肺損傷が挙げられる。
本発明の抗体およびその他の治療薬の治療用途のためのさらに他の適応としては、臓器または移植片拒絶反応のリスクがある個体への投与が含まれる。ここ数年、皮膚、腎臓、肝臓、心臓、肺、膵臓および骨髄などの組織および臓器を移植するための外科的手法の効率には相当な改善があった。おそらく、主な目立った問題は、レシピエントにおいて移植した同種移植片または臓器に対する免疫寛容を低下させる満足のいく薬剤がないことである。同種異系細胞または臓器が宿主に移植される(すなわち提供者および被提供者が同一の種の異なる個体である)場合、宿主免疫系は、移植片中の外来抗原に対する免疫応答を開始し(宿主対移植片病)、移植組織の破壊をもたらす可能性がある。
別の態様では、本発明は、選択された個体由来細胞でEphA2の発現があるかどうかを判定する工程を含む、個体が癌を有しているかどうかを診断する方法であり、この際、前記細胞でのEphA2の発現が前記の癌を示している。一部の実施形態では、EphA2の発現は、抗EphA2抗体を用いて判定される。一部の実施形態では、本方法は、細胞からEphA2発現のレベルを検出する工程を含む。本明細書において用語「検出」には、対照の参照を含むまたは含まない定性的および/または定量的検出が含まれる(レベル測定)。
さらに別の態様では、本発明は、個体由来の細胞上のEphA2または細胞から放出されたEphA2を検出することによる、個体において癌を診断する方法であり、癌は、限定されないが、副腎腫瘍、AIDS関連の癌、胞状軟部肉腫、星状細胞腫、膀胱癌(扁平上皮癌および移行上皮癌)、骨癌(アダマンチノーマ、動脈瘤様骨嚢胞、骨軟骨腫、骨肉腫)、脳腫瘍脳癌および脊髄癌、転移性脳腫瘍、乳癌、頚動脈球腫瘍、子宮頸癌、軟骨肉腫、脊索腫(dhordoma)、嫌色素細胞性腎癌、明細胞癌、結腸癌、結腸直腸癌、皮膚良性線維性組織球腫、線維形成性小円形細胞腫瘍、脳室上衣腫、ユーイング腫瘍、骨外性粘液性軟骨肉腫、骨の線維形成不全症(fibrogenesis imperfecta ossium)、線維性骨異形成症、胆嚢癌および胆管癌、妊娠性絨毛性疾患、胚細胞腫瘍、頭頸部癌、膵島腫瘍、カポジ肉腫、腎臓癌(腎芽細胞腫、乳頭状腎細胞癌)、白血病、脂肪腫/良性の脂肪性腫瘍、脂肪肉腫/悪性の脂肪性腫瘍、肝臓癌(肝芽腫、肝細胞癌)、リンパ腫、肺癌(小細胞癌、腺癌、扁平上皮癌、大細胞癌、など)、髄芽細胞腫、黒色腫、髄膜腫、多発性内分泌腫瘍症、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、神経芽腫、神経内分泌腫瘍、卵巣癌、膵癌、甲状腺乳頭癌、副甲状腺癌、小児癌、末梢神経鞘腫瘍、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、前立腺癌、後部ブドウ膜黒色腫(posterious unveal melanoma)、珍しい血液病、腎転移癌、ラブドイド腫瘍、横紋筋肉腫、肉腫、皮膚癌、軟部組織肉腫、扁平上皮癌、胃癌、滑膜肉腫、精巣癌、胸腺癌、胸腺腫、甲状腺転移癌、および子宮癌(頚部の癌、子宮内膜癌、および平滑筋腫)からなる群から選択される。
別の態様では、本発明は、個体由来の生体サンプル中のEphA2の発現を判定する工程を含む、個体において癌(限定されないが卵巣癌、肺癌、前立腺癌、膵癌、結腸癌、または乳癌など)の診断を助けるための方法である。一部の実施形態では、EphA2の発現は、抗EphA2抗体を用いて判定される。一部の実施形態では、抗EphA2抗体は、本明細書において具体的に名前を付けたファミリーメンバーである。一部の実施形態では、本方法は、細胞からEphA2発現のレベルを検出する。
さらに別の態様では、本発明は、癌細胞の増殖を低下させるために十分な、EphA2と結合する有効量の抗体を投与することにより癌を治療する方法である。一部の実施形態では、抗体は抗EphA2抗体である。特定の実施形態では、癌細胞は、限定されないが、副腎腫瘍、AIDS関連の癌、胞状軟部肉腫、星状細胞腫、膀胱癌(扁平上皮癌および移行上皮癌)、骨癌(アダマンチノーマ、動脈瘤様骨嚢胞、骨軟骨腫、骨肉腫)、脳癌および脊髄癌、転移性脳腫瘍、乳癌、頚動脈球腫瘍、子宮頸癌、軟骨肉腫、脊索腫(dhordoma)、嫌色素細胞性腎癌、明細胞癌、結腸癌、結腸直腸癌、皮膚良性線維性組織球腫、線維形成性小円形細胞腫瘍、脳室上衣腫、ユーイング腫瘍、骨外性粘液性軟骨肉腫、骨の線維形成不全症(fibrogenesis imperfecta ossium)、線維性骨異形成症、胆嚢癌および胆管癌、妊娠性絨毛性疾患、胚細胞腫瘍、頭頸部癌、膵島腫瘍、カポジ肉腫、腎臓癌(腎芽細胞腫、乳頭状腎細胞癌)、白血病、脂肪腫/良性の脂肪性腫瘍、脂肪肉腫/悪性の脂肪性腫瘍、肝臓癌(肝芽腫、肝細胞癌)、リンパ腫、肺癌(小細胞癌、腺癌、扁平上皮癌、大細胞癌、など)、髄芽細胞腫、黒色腫、髄膜腫、多発性内分泌腫瘍症、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、神経芽腫、神経内分泌腫瘍、卵巣癌、膵癌、甲状腺乳頭癌、副甲状腺癌、小児癌、末梢神経鞘腫瘍、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、前立腺癌、後部ブドウ膜黒色腫(posterious unveal melanoma)、珍しい血液病、腎転移癌、ラブドイド腫瘍、横紋筋肉腫、肉腫、皮膚癌、軟部組織肉腫、扁平上皮癌、胃癌、滑膜肉腫、精巣癌、胸腺癌、胸腺腫、甲状腺転移癌、および子宮癌(頚部の癌、子宮内膜癌、および平滑筋腫)からなる群から選択される。特定の好ましい実施形態では、癌細胞は、限定されないが、乳癌、結腸癌、前立腺癌、肺癌、肉腫、腎転移癌、甲状腺転移癌、および明細胞癌をはじめとする、固形腫瘍からなる群から選択される。
さらに別の態様では、本発明は、EphA2と特異的に結合する抗体のファミリーの少なくとも1つの有効量を投与する工程を含む、癌を有する個体において転移の発生を遅らせる方法である。一実施形態では、抗体は抗EphA2抗体である。別の態様では、本発明は、化学療法薬と会合している(結合しているものも含む)抗EphA2抗体を含む有効量の組成物を細胞培養もしくはサンプルへ、または個体へ投与する工程を含む、インビトロで、または個体において、癌細胞の成長および/または増殖を阻害する方法である。
さらに別の態様では、本発明は、EphA2と選択的に結合する抗体のファミリーの少なくとも1つのメンバーの有効量を個体へ投与することによる、個体において治療薬を癌細胞へ送達する方法である。他の実施形態では、抗EphA2抗体は、別の治療薬と組み合わせて(結合しているものも含む)個体へ送達される。
一部の実施形態では、抗EphA2抗体は、本明細書において名前を付けた抗体ファミリーメンバーに由来するヒト化抗体である(一般に、しかしそうとは限らないが、抗体の一部または完全CDRを1またはそれ以上含む)。一部の実施形態では、抗EphA2抗体は、名前を付けた抗体ファミリーメンバーの1またはそれ以上の特性を有するヒト抗体である。一部の実施形態では、化学療法薬(毒素または放射性分子など)は癌細胞の中へ送達される(内部に取り入れられる)。一部の実施形態では、治療薬はサポリンである。
別の態様では、本発明は、化学療法薬と会合している(結合しているものも含む)抗EphA2抗体を含む有効量の組成物を個体に投与する工程を含む、個体において癌を治療する方法である。
本発明は、EphA2の細胞質シグナル伝達パートナーとの会合を促進または低下させることによって調節する方法をさらに提供する。EphA2の細胞質シグナル伝達パートナーとの会合は、細胞表面に提示されるEphA2分子を、シグナル伝達パートナーとEphA2との結合を調節する薬剤と接触させることにより大きな影響を与えることができる。その結合および/またはシグナル伝達パートナーとEphA2の会合を阻害または低下させる薬剤を用いて、EphA2に媒介される炎症または免疫応答に関与する生物学的過程および病理過程を調節することができる。この作用を伴う病理過程としては、腫瘍関連細胞増殖が挙げられる。
薬剤を、結合パートナー、例えば抗EphA2抗体とのEphA2の会合を阻害、低下、促進、またあるいは調節するその能力について試験することができる。具体的に言えば、EphA2相互作用部位を(一般に無傷な生細胞に存在するようなそのネイティブな立体構造で)含むペプチドを結合パートナーおよび試験薬剤とともにインキュベートし、試験薬剤が結合パートナーとEphA2ペプチドとの結合を低下または促進したかどうかを判定することにより、そのような相互作用を調節する能力について薬剤を試験することができる。アゴニスト、アンタゴニスト、およびその他のモジュレーターが特に意図される。
特定の態様では、本発明は、(i)個体から得た血液または組織サンプル中のEphA2の存在を分析する工程;(ii)前記サンプルが、正常な(発病していない)血液または組織サンプルと比較してEphA2マーカーの量が増加していないかどうか判定する工程;および(iii)前記マーカーの増加量と陽性診断とを相互に関連付けるか、または前記マーカーの増加量の不在と疾患の陰性診断とを相互に関連付ける工程を含む、個体において疾患の診断を助ける方法である。特定の実施形態では、マーカーは、抗EphA2抗体を用いて検出される。特定の実施形態では、本方法は、放射性核種イメージング、フローサイトメトリー、および免疫組織化学からなる群から選択される技術によって達成される。
別の態様では、本発明は、本明細書に記載される抗EphA2抗体または任意のEphA2結合部分(限定されないが、種々の抗体および抗体誘導体を含むポリペプチド)を用いて個体由来の細胞上のEphA2を検出することにより、個体において癌または転移癌を診断する方法である。一部の実施形態では、癌は、黒色腫、乳癌、結腸癌、肺癌、および前立腺癌である。一部の実施形態では、本方法は、細胞からEphA2のレベルを検出することである。EphA2の存在は、EphA2とEphA2結合部分との間の複合体を検出することにより検出される。本明細書において用語「検出」には、対照の参照を含むまたは含まない定性的および/または定量的検出が含まれる(レベル測定)。
別の態様では、本発明は、限定されないが、治療薬と会合した抗EphA2抗体、抗EphA2抗体の断片または領域を含む抗体、ヒト化抗体(一般に、しかしそうとは限らないが、抗EphA2抗体の1またはそれ以上のCDRを含む)、抗EphA2抗体の可変領域に由来する可変領域とヒト抗体の定常領域に由来する定常領域とを含むキメラ抗体、あるいは、抗EphA2抗体の1またはそれ以上の特性を持つヒト抗体をはじめとする、本明細書に記載される抗EphA2抗体、または任意の抗体(ポリペプチドを含む)もしくはポリヌクレオチド実施形態を含む組成物の、癌細胞の増殖を低下させるために十分な有効量を投与することによる、癌を治療する方法である。一部の実施形態では、癌は、黒色腫、乳癌、結腸癌、肺癌、および前立腺癌である。
特定の実施形態では、本発明は、患者において癌を治療する方法であり、前記方法は、EphA2と特異的に結合し、次のSPL1、LUCA19、SG5またはLUCA40の特性:
a.癌細胞上でEphA2と結合する能力;
b.インビトロまたはインビボで生きた癌細胞の表面に露出しているEphA2の一部と結合する能力;
c.EphA2のホスホチロシン含量を増加させずに腫瘍細胞の増殖を阻害する能力;
d.EphA2を発現している癌細胞に治療薬または検出可能なマーカーを送達する能力;ならびに
e.EphA2を発現している癌細胞の中に治療薬または検出可能なマーカーを送達する能力;
のうちの少なくとも1つ、さらに好ましくは2またはそれ以上を有する、治療上有効な量のEphA2抗体を前記患者に投与する工程を含む。
別の態様では、本発明は、限定されないが、治療薬と会合した抗EphA2抗体、抗EphA2抗体の断片または領域を含む抗体、ヒト化抗体(一般に、しかしそうとは限らないが、抗EphA2抗体の1またはそれ以上のCDRを含む)、抗EphA2抗体の可変領域に由来する可変領域とヒト抗体の定常領域に由来する定常領域とを含むキメラ抗体、あるいは、抗EphA2抗体の1またはそれ以上の特性を持つヒト抗体をはじめとする、本明細書に記載される抗EphA2抗体、または任意の抗体(ポリペプチドを含む)もしくはポリヌクレオチド実施形態を含む組成物の、癌細胞の増殖を低下させるために十分な有効量を個体へ投与することによる、個体において癌細胞の成長および/または増殖を阻害する方法である。一部の実施形態では、癌は、黒色腫、乳癌、結腸癌、肺癌、および前立腺癌である。
別の態様では、本発明は、限定されないが、治療薬と会合した抗EphA2抗体、抗EphA2抗体の断片または領域を含む抗体、ヒト化抗体(一般に、しかしそうとは限らないが、抗EphA2抗体の1またはそれ以上のCDRを含む)、抗EphA2抗体の可変領域に由来する可変領域とヒト抗体の定常領域に由来する定常領域とを含むキメラ抗体、あるいは、抗EphA2抗体の1またはそれ以上の特性を持つヒト抗体をはじめとする、本明細書に記載される抗EphA2抗体、または任意の抗体(ポリペプチドを含む)もしくはポリヌクレオチド実施形態を含む組成物の、癌細胞の増殖を低下させるために十分な有効量を投与することによる、癌を有する個体において、転移の発生を防ぐまたは遅延させる、転移癌を治療する、または転移癌細胞の増殖を阻害する方法である。一部の実施形態では、癌は、黒色腫、乳癌、結腸癌、肺癌、および前立腺癌である。
別の態様では、本発明は、治療薬(毒素または放射性分子など)と結合している、本明細書に記載されるEphA2結合抗体または任意のEphA2結合部分(限定されないが抗体もしくは抗体誘導体を含むポリペプチド)の有効量を個体へ投与することによる、個体において、治療薬(毒素または放射性分子など)を癌細胞へ送達する方法である。EphA2結合部分としては、限定されないが、抗EphA2抗体、抗EphA2抗体の断片または領域を含む抗体、またはヒト化抗体(一般に、しかしそうとは限らないが、抗EphA2抗体の1またはそれ以上のCDRを含む)、抗EphA2抗体の可変領域に由来する可変領域とヒト抗体の定常領域に由来する定常領域とを含むキメラ抗体、または抗EphA2抗体の1またはそれ以上の特性を持つヒト抗体が挙げられる。一部の実施形態では、癌細胞は、黒色腫、乳癌、結腸癌、肺癌、および前立腺癌に由来する。別の実施形態では、治療薬(毒素または放射性分子など)は癌細胞の中に送達される(内部に取り入れられる)。従って、本発明は、治療薬がそれらの癌細胞の中へ送達されるように、癌細胞の成長および/または増殖を阻害する方法を提供する。
発明の詳細な説明
本明細書において開示される本発明は、抗原であるEphA2と結合する抗体およびポリペプチド、ならびにこれらの抗体およびポリペプチドを作製し、これらの抗体およびポリペプチドを用いてEphA2の発現および/または過剰発現に関連する種々の疾患ヒト癌を診断および治療する方法を提供する。EphA2は種々のヒト癌に存在することが示されており、その発現は種々のヒト癌で増加している。以下の項に特定される宿主細胞のいずれか1つにより産生されたものなどの抗EphA2抗体が生成され、それらはEphA2と選択的に結合することが示されている。
ブダペスト条約に従って、mLUCA19を産生するハイブリドーマを1993年3月20日、American Type Culture Collection(ATCC)10801 University Blvd.,Manassas VA20110−2209に特許寄託指定番号PTA−5070で寄託し、SPL1を産生するハイブリドーマを2004年6月8日、American Type Culture Collection(ATCC)に特許寄託指定番号PTA−6059で寄託し、LUCA40を産生するハイブリドーマを2004年6月8日、American Type Culture Collection(ATCC)に特許寄託指定番号PTA−6056で寄託し、SG5を産生するハイブリドーマを2006年2月2日、American Type Culture Collection(ATCC)に特許寄託指定番号PTA−XXXXで寄託した。
I.一般的手法
本発明の実践には、特に示さない限り、この分野の技術の範囲内にある、分子生物学(組み換え技術を含む)、細菌学、細胞生物学、生化学および免疫学の従来の手法が用いられる。そのような手法は文献、例えばMolecular Cloning:A Laboratory Manual,second edition(Sambrookら1989)Cold Spring Harbor Press;Oligonucleotide Synthesis(MJ.Gait,ed.,1984);Methods in Molecular Biology,Humana Press;Cell Biology:A Laboratory Notebook(J.E.Cellis,ed.,1998)Academic Press;Animal Cell Culture(R.I.Freshney,ed.,1987);Introduction to Cell and Tissue Culture(J.P.Mather and P.E.Roberts,1998)Plenum Press;Cell and Tissue Culture:Laboratory Procedures(A.Doyle,J.B.Griffiths,and D.G.Newell,eds.,1993−8)J.Wiley and Sons;Methods in Enzymology(Academic Press,Inc.);Handbook of Experimental Immunology(D.M.Weir and C.C.Blackwell,eds.);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells(J.M.Miller and M.P.Calos,eds.,1987);Current Protocols in Molecular Biology(F.M.Ausubelら、eds.,1987);PCR:The Polymerase Chain Reaction,(Mullisら、eds.,1994);Current Protocols in Immunology(J.E.Coliganら、eds.,1991);Short Protocols in Molecular Biology(Wiley and Sons,1999);Immunobiology(CA.Janeway and P.Travers,1997);Antibodies(P.Finch,1997);Antibodies:a practical approach(D.Catty.,ed.,IRL Press,1988−1989);Monoclonal antibodies:a practical approach(P.Shepherd and C.Dean,eds.,Oxford University Press,2000);Using antibodies:a laboratory manual(E.Harlow and D.Lane(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1999);The Antibodies(M.Zanetti and J.D.Capra,eds.,Harwood Academic Publishers,1995);and Cancer:Principles and Practice of Oncology(V.T.DeVitaら、eds.,J.B.Lippincott Company,1993)に十分に説明されている。
II.定義
EphA2とは、分子量約130kDのポリペプチド抗原を指し、本発明の抗体はこれを対象としている。本明細書にさらに詳細に記載されるように、この抗原は2以上の異なるエピトープを有する。本発明の好ましい抗体の実施形態のいくつかは、該EphA2抗原の2またはそれ以上の特異的なエピトープのうちの1つを対象としている。現在、EphA2は対応する正常組織と比較して、ある種の癌細胞において過剰発現すると考えられている。
「抗体」は、免疫グロブリン分子の可変領域に位置する少なくとも1つの抗原認識部位を介して、炭水化物、ポリヌクレオチド、脂質、ポリペプチドなどの標的と特異的に結合できる免疫グロブリン分子である。本明細書において、この用語は、無傷なポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体だけでなく、それらの断片(例えば、Fab、Fab’、F(ab’)、Fvなど)、一本鎖(ScFv)、その突然変異体、天然に存在する変異体、必要な特異性を持つ抗原認識部位を有する抗体部分を含む融合タンパク質、ヒト化抗体、キメラ抗体、および必要な特異性を持つ抗原認識部位を含む免疫グロブリン分子のその他の任意の修飾された構造も包含する。
用語「モノクローナル抗体」は、無傷なモノクローナル抗体および全長モノクローナル抗体だけでなく、それらの断片(例えば、Fab、Fab’、F(ab’)、Fvなど)、一本鎖(ScFv)、その突然変異体、抗体部分を含む融合タンパク質、ヒト化モノクローナル抗体、キメラモノクローナル抗体、ならびに必要な特異性をもつ抗原認識部位および抗原との結合能を含む免疫グロブリン分子の、その他の任意の修飾された構造も包含する。それは、抗体の源に関して、または作製方法に関して(例えば、ハイブリドーマ、ファージ選択、組換え発現、トランスジェニック動物等により)制限されることを意図しない。
「ヒト化」抗体とは、実質的に非ヒト種由来の免疫グロブリンから得られた抗原結合部位を有し、かつ、分子の免疫グロブリンの残りの構造はヒト免疫グロブリンの構造および/または配列に基づく分子を指す。抗原結合部位は、定常領域上に融合した完全な可変領域か、または可変領域中の適切なフレームワーク領域上に移植された相補性決定領域(CDR)のみのいずれかを含み得る。抗原結合部位は野生型であってもよく、または1以上のアミノ酸置換により修飾されていてもよい(例えばヒト免疫グロブリンにさらによく似るように修飾されている)。ヒト化抗体の一部の種類は、全てのCDR配列を保存する(例えば、マウス抗体由来のCDRを6つ全て含むヒト化マウス抗体)。ヒト化抗体の他の種類は、元の抗体に対して変化している1以上(1、2、3、4、5、6)のCDRを有し、また、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の1以上のCDRに「由来する」1以上のCDRとも呼ばれる。
「キメラ抗体」とは、重鎖および軽鎖の各アミノ酸配列の一部は特定の種由来または特定のクラスに属する抗体の対応する配列と相同であるが、鎖の残りの部分は別の抗体の対応する配列と相同である抗体を指す。一般に、これらのキメラ抗体では、軽鎖および重鎖双方の可変領域は、哺乳類の1つの種由来の抗体の可変領域を模倣しているが、定常部分は別の抗体由来の配列に対して相同である。そのようなキメラ構造の1つの明らかな利点は、例えば、可変領域が、例えばヒト細胞調製物由来の定常領域と組み合わせた、容易に入手できる非ヒト宿主生物由来のハイブリドーマまたはB細胞を用いて、現在公知の源から好適に導かれてよいことである。可変領域は調製が容易であり、特異性はその源の影響を受けないという利点を有するが、ヒト由来である定常領域は、抗体が注射された場合に、定常領域がヒト由来でないものよりもヒト被験体から免疫応答を誘起する可能性が低い。しかし、この定義はこの特定の例に限定されない。
抗体またはポリペプチドと「特異的に結合する」または「選択的に結合する」(本明細書では同義的に用いられる)エピトープは、当技術分野でよく理解されている用語であり、そのような特異的または選択的結合を判定する方法も当技術分野で十分に公知である。分子が、別の細胞または物質よりも、より頻繁に、より迅速に、より長い持続時間および/またはより高い親和性で、特定の細胞または物質と反応または会合する場合に、その分子は「特異的結合」または「選択的結合」を示すと言われる。抗体は、他の物質と結合する場合よりも、より高い親和性、結合力で、より容易におよび/またはより長い持続時間で結合する場合に、標的と「特異的に結合する」または「選択的に結合する」という。例えば、特異的または選択的にEphA2エピトープと結合する抗体は、他のEphA2エピトープまたは非EphA2エピトープと結合する場合よりも、より高い親和性、結合力で、より容易におよび/またはより長い持続時間でこのEphA2エピトープと結合する抗体である。この定義を読めば、例えば、第1の標的に特異的または選択的に結合する抗体(または部分もしくはエピトープ)が、第2の標的と特異的または選択的に結合するかどうかは分からないことも理解される。そのようなものとして、「特異的結合」または「選択的結合」は、必ずしも排他的結合を必要としない(が含み得る)。一般に、しかし必ずしもそうではないが、結合に言及する場合には選択的結合を意味する。
エピトープに関して、用語「免疫学的に活性である」、または「免疫学的活性が残っている」とは、抗体(例えば、抗EphA2抗体)が、異なる条件下(例えば、エピトープが還元条件または変性条件に付された後など)で抗体がエピトープと結合する能力を指す。
本明細書において、用語「LUCA19、SPL1、LUCA40、またはSG5」「抗EphA2抗体」および「モノクローナル抗EphA2抗体」とは、ATCC寄託番号PTA−5070、PTA−6056、もしくはPTA−6059の宿主細胞、または宿主細胞SG.3.15B4.1F9(ATCC番号PTA−XXXX)もしくはその後代のいずれかにより産生された免疫グロブリンを指すために同義的に用いられる。異なる生物学的機能がLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40に付随し、それには、限定されないが、EphA2に結合する能力;EphA2細胞外ドメインに結合する能力;インビトロまたはインビボの生細胞の表面に露出した癌細胞上のEphA2と結合する能力;EphA2を発現している癌細胞(卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、膵臓癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞または乳癌細胞など)に化学療法薬を送達する能力;EphA2を発現している癌細胞中へ治療薬または検出可能なマーカーを送達する能力などが挙げられる。本明細書において考察されるように、本発明のポリペプチド(抗体を含む)は、これらの特徴のうちのいずれか1つ以上を有し得る。
「抗EphA2同等抗体」または「抗EphA2同等ポリペプチド」とは、抗EphA2抗体に関連する1以上の生物学的機能(例えば結合特異性など)を有する抗体またはポリペプチドを指す。
本明細書において、「薬剤」とは、生体化合物、医薬品、または化合物を指す。限定されない例としては、単純もしくは複雑な有機もしくは無機分子、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、抗体、抗体誘導体、抗体断片、ビタミン誘導体、炭水化物、毒素、または化学療法化合物が挙げられる。例えば、小分子およびオリゴマー(例えば、オリゴペプチドおよびオリゴヌクレオチド)、ならびに様々なコア構造に基づく合成有機化合物などの、様々な化合物を合成することができる。さらに、植物または動物抽出物などの様々な天然源が、スクリーニングのための化合物を提供し得る。当業者であれば、本発明の薬剤の構造的性質に関して制限がないことが容易に認識できる。
本発明の方法で用いられる薬剤は、無作為に選択されるか、または合理的に選択もしくは設計され得る。本明細書において、EphA2とその固有の結合パートナーまたは既知の抗体との会合に関与する特定の配列を考慮せずに薬剤が無作為に選択される場合に、その薬剤は無作為に選択されると言われる。無作為に選択される薬剤の例は、化学ライブラリーまたはペプチド組み合わせライブラリーの使用である。
本明細書において、薬剤の作用に関連して標的部位の配列および/またはその構造を考慮に入れ、薬剤が非無作為に選択される場合に、その薬剤は合理的に選択または設計されると言われる。抗EphA2薬剤に関して、現在、EphA2上には抗体が惹起され得るエピトープが少なくとも3つ存在し、従ってEphA2/抗EphA2の相互作用を阻害する薬剤の作用部位は少なくとも3つ存在すると考えられている。本発明は、EphA2とその固有の結合パートナーとの間の相互作用部位で作用する薬剤も包含するが、他のリガンドおよびそれらの活性EphA2相互作用部位もまた、現在公知であるかまたは後に確認されるかどうかにかかわらず本発明の範囲に包含される。薬剤は、受容体/リガンドおよび/またはEphA2/抗EphA2抗体複合体の接触部位を構成するペプチド配列を利用することにより、合理的に選択または合理的に設計され得る。例えば、合理的に選択されたペプチド薬剤は、そのアミノ酸配列が、天然の環境において生細胞の表面上に露出したEphA2上に現れるエピトープと同一のペプチドであり得る。そのような薬剤は、所望のように、抗EphA2抗体または固有のリガンドと結合することにより、抗EphA2抗体とEphA2との会合、またはEphA2とその固有リガンドとの会合を低下または阻害するであろう。
本明細書において、抗体に関して用語「標識された」は、放射性薬剤またはフルオロフォア(例えば、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)もしくはフィコエリトリン(PE))などの検出可能な物質を抗体にカップリング(すなわち物理的に連結)させることによる抗体の直接標識、ならびに検出可能な物質との反応性によるプローブまたは抗体の間接的標識を包含することを意図する。
本明細書において、抗体に関して用語「会合」は、薬剤(例えば、化学療法薬)との共有付着および非共有付着または共有結合および非共有結合を含む。抗体は、直接結合により、または共通のプラットフォームへの付着を介する間接結合により、抗体が結合している癌細胞に対する薬剤の局在性を抗体が誘導するように(その際、抗体が結合している同じ癌細胞を薬剤が標的としないように、または薬剤の有効性が低減されることがないように、抗体と薬剤とは生理学的条件下では実質的に解離しない)、薬剤(例えば、化学療法薬)と会合することができる。
「生体サンプル」は、個体から得られ、診断またはモニタリングアッセイに用いることができる様々な種類のサンプルを包含する。その定義は、血液および生体起源の他の液体サンプル、生検検体または組織培養物もしくはそれに由来する細胞、およびその後代、例えば、癌の疑いがある個体から採取された組織サンプルから得られた細胞、好ましい実施形態においては卵巣、肺、前立腺、膵臓、結腸、および乳房組織由来の細胞などの固形組織サンプルを包含する。その定義にはまた、それらの調達後に、試薬による処理、可溶化、またはタンパク質もしくはポリヌクレオチドなどの特定成分の濃縮、または切片作製のための半固形もしくは固形マトリックス中への包埋など、何らかの方法で操作されたサンプルも含む。用語「生体サンプル」は、臨床サンプルを包含し、また培養細胞、細胞上清、細胞溶解物、血清、血漿、体液、および組織サンプルも含まれる。
用語「ポリペプチド」、「オリゴペプチド」、「ペプチド」および「タンパク質」は、本明細書では同義的に用いられ、任意の長さのアミノ酸ポリマーを指す。ポリマーは直線状または分枝状であってよく、修飾アミノ酸を含んでよく、また非アミノ酸により中断されてよい。また、この用語は天然に、または介入(例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化、または標識成分との複合体化などの他の操作もしくは修飾)により修飾されているアミノ酸ポリマーも包含する。また、定義には、例えば、1以上のアミノ酸類似体を含むポリペプチド(例えば、非天然アミノ酸等を含む)、ならびに当技術分野で公知の他の修飾物も含まれる。本発明のポリペプチドは抗体に基づいているために、ポリペプチドは一本鎖または会合した鎖として存在し得ることが当然理解されよう。
抗体の「可変領域」とは、抗体軽鎖の可変領域または抗体重鎖の可変領域の、単独または組み合わせのいずれかを指す。
抗体の「定常領域」とは、抗体軽鎖の定常領域または抗体重鎖の定常領域の、単独または組み合わせのいずれかを指す。
本明細書において、「実質的に純粋な」とは、物質が少なくとも50%純粋(すなわち混入物質が存在しない)、より好ましくは、少なくとも90%純粋、より好ましくは、少なくとも95%純粋、より好ましくは、少なくとも98%純粋、より好ましくは、少なくとも99%純粋であることを指す。
「宿主細胞」には、ポリヌクレオチド挿入物の組み込みのための、ベクターに対するレシピエントであり得るか、または既にレシピエントである、個々の細胞または細胞培養物が含まれる。宿主細胞には、単一の宿主細胞の後代が含まれ、後代は、自然突然な、偶然な、または意図的な突然変異の結果、元の親細胞と必ずしも(形態学的に、またはゲノムDNA相補体が)完全に同一でなくてもよい。宿主細胞には、本発明のポリヌクレオチドを用いてインビボでトランスフェクトされた細胞が含まれる。
本明細書において、「転移の進行を遅らせる」とは、転移の進行を延期し、妨げ、減速し、遅らせ、安定させ、および/または先送りすることを意味する。この遅れは、癌の病歴および/または治療される個体の病歴によって様々な時間の長さであり得る。当業者に明らかなように、十分な、または大幅な遅れというのは、個体が転移を発現しないという点で、実質的に予防を含み得る。
薬剤、化合物、または医薬組成物の「有効量」は、限定されないが、腫瘍サイズの縮小(癌の状況において、例えば乳癌または前立腺癌)、癌細胞の成長の遅延、転移の進行の遅れ、疾患の結果生じる症状の1以上の減少、疾患に苦しむ人々の生活の質の向上、疾患の治療に必要な他の薬物の用量の低減、標的化および/または内部移行によるなど別の薬物の効果の向上、疾患の進行の遅延、および/または個体の生存時間の延長などの臨床結果を含む、有益なまたは望ましい結果をもたらすために十分な量である。有効量は、1回以上の投与で投与することができる。本発明の目的上、薬剤、化合物、または医薬組成物の有効量とは、直接的あるいは間接的に、新生細胞の増殖(もしくは破壊)を低下させるために、および/または、新生細胞の転移の進行または成長を低下および/または遅延させるために十分な量である。
癌の臨床状況において理解されるように、薬剤、化合物、または医薬組成物の有効量は、別の薬剤、化合物、または医薬組成物と併せて達成されてもよく、そうでなくともよい。従って、「有効量」は、1以上の治療薬を投与する状況において考慮されてよく、単一の薬剤は、もし1以上の他の薬剤と併せて望ましい結果が達成される可能性があるか、または達成される場合に、有効量が投与されたとみなされ得る。
本明細書において「治療」または「治療する」とは、好ましい臨床結果を含む、有益な、または望ましい結果を得るためのアプローチである。本発明の目的上、有益な、または望ましい臨床結果としては、限定されないが、次の、新生細胞の増殖(または破壊)の低下、癌において見られる新生細胞の転移の低下、腫瘍サイズの縮小、疾患により生じる症状の軽減、疾患に苦しむ人々の生活の質の向上、疾患の治療に必要な他の薬物の用量の低減、疾患の進行の遅延、および/または患者の生存時間の延長、のうちの1以上の結果が挙げられる。
本明細書において、「転移の進行を遅らせる」とは、転移の進行を延期し、妨げ、減速し、遅らせ、安定させ、および/または先送りすることを意味する。この遅れは、癌の病歴および/または治療される個体の病歴によって様々な時間の長さであり得る。当業者に明らかなように、十分な、または大幅な遅れは、実質的に、個体が転移を発現しない、阻止を包含する。
「生体サンプル」は、個体から得られ、診断またはモニタリングアッセイに用いることができる様々な種類のサンプルを包含する。その定義は、血液および生体起源の他の液体サンプル、生検検体または組織培養物もしくはそれに由来する細胞、およびその後代などの固形組織サンプルを包含する。その定義にはまた、それらの調達後に、試薬による処理、可溶化、またはタンパク質もしくはポリヌクレオチドなどの特定成分の濃縮、または切片作製のための半固形もしくは固形マトリックス中への包埋など、何らかの方法で操作されたサンプルも含む。用語「生体サンプル」は、臨床サンプルを包含し、また培養細胞、細胞上清、細胞溶解物、血清、血漿、体液、および組織サンプルも含まれる。
「個体」は、脊椎動物、好ましくは哺乳類、より好ましくはヒトである。哺乳類としては、限定されないが、家畜、競技動物、ペット(ネコ、イヌ、ウマなど)、霊長類、マウスおよびラットが挙げられる。
「毒素」または「細胞毒素」とは、細胞の中で有害反応をもたらす任意の物質を指す。例えば、癌細胞に向けられた毒素は、癌細胞に負の影響、場合によっては悪影響を及ぼし得る。
本明細書において、「薬剤」とは、生体化合物、医薬品、または化合物を指す。限定されない例としては、単純もしくは複雑な有機もしくは無機分子、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、抗体、抗体誘導体、または抗体断片が挙げられる。例えば、小分子およびオリゴマー(例えば、オリゴペプチドおよびオリゴヌクレオチド)、ならびに様々なコア構造に基づく合成有機化合物などの、様々な化合物を合成することができる。さらに、植物または動物抽出物などの様々な天然源が、スクリーニングのための化合物を提供し得る。
本明細書において、「治療薬」とは、抗腫瘍薬剤、毒素または細胞毒素、細胞毒素薬剤、および放射性薬剤をはじめとする、治療(ここでは、一般に癌における治療)に有用な任意の薬剤を意味する。
「能動免疫応答」とは、抗原、またはその抗原をコードするDNAベクターの、アジュバント有りまたは無しの、静脈内、筋肉内、皮下、または他の投与方法による宿主哺乳類への投与に反応して起こる、インビボでの抗原に対して作られる抗体出現および進行中の産生をさす。能動免疫応答はまた、細胞免疫応答などの免疫応答の他の態様も含み得る。
組成物および組成物の作成方法
本発明は、EphA2と結合する抗体、ポリペプチドおよびタンパク質を含む医薬組成物、ならびにEphA2と結合する抗体、ポリペプチドおよびタンパク質をコードする配列を含むポリヌクレオチドをはじめとする組成物を包含する。本明細書において、組成物は、EphA2と結合する1またはそれ以上の抗体、ポリペプチドおよび/またはタンパク質、および/またはEphA2と結合する1またはそれ以上の抗体、ポリペプチドおよびタンパク質をコードする配列を含む1またはそれ以上のポリヌクレオチドを含む。これらの組成物は、当技術分野で周知の、バッファーを含む薬学的に受容可能な賦形剤などの好適な賦形剤をさらに含んでよい。
また、本発明は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の様々な製剤、および同等な抗体またはポリペプチド断片(例えば、Fab、Fab’、F(ab’)、Fv、Fc等)、キメラ抗体、一本鎖(ScFv)、その突然変異体、抗体部分を含む融合タンパク質、ヒト化抗体、および必要な特異性をもつ抗原認識部位である、抗原(EphA2)を含むLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の修飾された構造を包含する。また、本発明は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の1またはそれ以上の生物学的特徴を提示するヒト抗体も提供する。LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の同等な抗体(ヒト化抗体およびヒト抗体を含む)、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40のポリペプチド断片、およびこれらの断片のいずれかを含むポリペプチドは、同定され、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の1またはそれ以上の特性決定により特徴付けられる。
一部の実施形態では、EphA2と結合する本発明の抗体、ポリペプチドおよびタンパク質は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40のEphA2との選択的結合を競合的に阻害するか、または抗EphA2抗体が選択的に結合するものと同一のEphA2上のエピトープと選択的に結合する抗体、ポリペプチドおよびタンパク質である。
従って、本発明は、以下に示すいずれかを含む、以下に示すいずれか(または医薬組成物を含む組成物)を提供する:(a)ATCC寄託番号PTA−5070、PTA−6056、もしくはPTA−6059の宿主細胞、または宿主細胞SG3.15B4.1F9(PTA−XXXX)もしくはその後代により産生される抗EphA2抗体;(b)ヒト化型の抗EphA2抗体;(c)抗EphA2抗体の1またはそれ以上の軽鎖および/または重鎖可変領域を含む抗体;(d)抗EphA2抗体の重鎖および軽鎖の可変領域と相同であるか、またはそれに由来する可変領域、ならびにヒト抗体の重鎖および軽鎖の定常領域と相同であるか、またはそれに由来する定常領域を含む、キメラ抗体;(e)LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の1またはそれ以上(少なくとも1、2、3、4、5、または6)の軽鎖および/または重鎖のCDRを含む抗体;(f)LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の重鎖および/または軽鎖を含む抗体;(g)LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40と同等であるヒト抗体。ヒト化型の抗体は、LUCA19、SPL1、LUCA40、もしくはSG5、あるいはATCC寄託番号PTA−5070、PTA−6056もしくはPTA−6059の宿主細胞、または宿主細胞SG3.15B4.1F9(ATCC番号PTA−XXXX)により産生される抗体と同一のCDRを持っていてもいなくてもよい。CDR領域の決定は、十分この分野の技術の範囲内である。一部の実施形態では、本発明は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の少なくとも1つのCDR、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つのCDRと実質的に相同な少なくとも1つのCDRを含む(または、一部の実施形態ではLUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40の6つ全てのCDRと実質的に相同であるか、またはLUCA19、SPL1、LUCA40、またはSG5由来の)抗体、あるいはATCC寄託番号PTA−5070、PTA−6056、PTA−6059の宿主細胞、またはSG3.15B4.1F9(ATCC番号PTA−XXXX)の宿主細胞により産生される抗体を提供する。その他の実施形態としては、LUCA19、SPL1、LUCA40、もしくはSG5の少なくとも2、3、4、5もしくは6つのCDRと実質的に相同であるか、またはLUCA19、SPL1、LUCA40、もしくはSG5に由来する、少なくとも2、3、4、5、または6つのCDRを有する抗体、あるいは、ATCC寄託番号PTA−5070、PTA−6056、PTA−6059の宿主細胞、またはSG3.15B.1F9の宿主細胞により産生された抗体を含む。本発明の目的上、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40に比べて活性の程度が変化し得る(高くなるか、または低くなり得る)が、結合特異性および/または全体的な活性(癌細胞の成長および/または増殖の低下、癌細胞におけるアポトーシス細胞死の誘発、転移の進行の遅延、および/または緩和医療という観点からであり得る)は、一般に保持されることが理解されよう。本発明はまた、これらの抗体を作製する方法を提供する。抗体を作製する方法は、当技術分野で公知であり、本明細書に記載されている。
また、本発明は、本発明の抗体のアミノ酸配列を含むポリペプチド(LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40など)も提供する。一部の実施形態では、ポリペプチドは、抗EphA2抗体の1またはそれ以上の軽鎖および/または重鎖の可変領域を含む。一部の実施形態では、該ポリペプチドは、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の1またはそれ以上の軽鎖および/または重鎖のCDRを含む。一部の実施形態では、ポリペプチドは、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の軽鎖および/または重鎖の3つのCDRを含む。一部の実施形態では、該ポリペプチドは、以下に示すいずれか:LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の配列の少なくとも5個の連続するアミノ酸、少なくとも8個の連続するアミノ酸、少なくとも約10個の連続するアミノ酸、少なくとも約15個の連続するアミノ酸、少なくとも約20個の連続するアミノ酸、少なくとも約25個の連続するアミノ酸、少なくとも約30個の連続するアミノ酸(ここで、アミノ酸の少なくとも3つはLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の可変領域由来である)を有するLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40のアミノ酸配列を含む。一実施形態では、可変領域は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の軽鎖由来である。別の実施形態では、可変領域は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の重鎖由来である。別の実施形態では、5個の(またはそれ以上の)連続するアミノ酸は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の相補性決定領域(CDR)由来である。
抗体は、ポリクローナル(例えば、同種ではない)であってもモノクローナルであってもよい。モノクローナル抗体を作製する方法は当技術分野で公知である。用いられ得る一方法は、Kohler and Milstein,Nature 256:495−497(1975)の方法、またはその変法である。一般に、免疫付与にはマウスまたはラットが用いられるが、他の動物も用いてよい。免疫原は、限定されないが、初代培養細胞、培養細胞株、癌細胞、核酸、組織、またはペプチドであり得る。全長のEphA2またはEphA2の任意の断片(例えば、細胞外ドメイン)、またはEphA2発現癌細胞を免疫原として用いる。免疫原として用いられる細胞、例えばEphA2発現癌細胞は、免疫原としての使用の前に一定期間(少なくとも24時間)培養されてよい。細胞は、免疫原として単独で、またはRibiなどの非変性アジュバントと組み合わせて用いられてよい。一般に、細胞は無傷の状態で維持すべきであり、免疫原として用いられる時に生存していることが好ましい。無傷な細胞を免疫原として用いて抗体を作製する方法は、WO00/37503号に記載されている。無傷な細胞は、破裂した細胞よりも抗原を検出しやすくすることができる。さらに、無傷な細胞を免疫原として用いて作製されたモノクローナル抗体は、細胞表面の抗原決定基または膜貫通型受容体の細胞外ドメインに対抗する可能性が最も高い。変性アジュバントまたは強いアジュバント(例えば、フロインドアジュバント)の使用は、細胞を破裂させるおそれがあり、そのため推奨されない。免疫原は、例えば2週間に1回、または1週間に1回など、定期的な間隔で複数回投与されてもよいし、または動物(例えば、組織組換え体)において生存力を維持するような方法で投与してもよい。
抗体反応をモニターするために、少量の生体サンプル(例えば、血液)を動物から採取し、免疫原に対する抗体価を検査してもよい。脾臓および/またはいくつかの大リンパ節を摘出して単一細胞に分離することができる。所望であれば、脾臓細胞は(非特異的に粘着する細胞を除去した後)、抗原で被覆したプレートまたはウェルに細胞懸濁液を加えることによって選別され得る。抗原に特異的な膜結合免疫グロブリンを発現しているB細胞はプレートと結合し、懸濁液の残りの部分によってすすぎ落とされることはない。次に、得られたB細胞または全ての分離した脾臓細胞は、骨髄腫細胞(例えば、X63−Ag8.653およびのSaIk Institute,Cell Distribution Center,CA,San Diego由来のもの)と融合させることができる。脾臓またはリンパ球を骨髄腫細胞と融合させてハイブリドーマを形成するためにポリエチレングリコール(PEG)を用いてもよい。次に、そのハイブリドーマを選択培地(例えば、ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジン培地、別名「HAT培地」)中で培養する。次に、得られたハイブリドーマを制限希釈により平板培養し、免疫原(例えば、癌細胞株の表面、EphA2、など)と特異的に結合する抗体の産生について、FACS、免疫組織化学(IHCスクリーニング)、およびウエスタンブロットを用いてアッセイする。次に、選択されたモノクローナル抗体分泌型ハイブリドーマをインビトロ(例えば、組織培養瓶もしくは中空繊維反応槽において)、またはインビボ(例えば、マウス腹水において)のいずれかで培養する。抗EphA2抗体を産生する条件下でハイブリドーマを培養する方法、および抗体を精製する方法は、当技術分野で公知である。
上記のモノクローナル抗体分泌型ハイブリッドは、抗EphA2抗体が選択的に結合するEphA2上のエピトープと選択的に結合する抗体を産生するために選択され得る。そのような抗体を選択する方法は、当技術分野で公知である。例えば、結合競合アッセイを用いて、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40が結合するものと同一のエピトープに抗体が結合するかどうか判定することができる。EphA2と結合するための、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40との抗体の競合は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40が結合するエピトープにその抗体が選択的に結合することを示す。結合競合アッセイは、当技術分野で周知である。結合競合アッセイは、標識抗原または標識抗体のいずれかを用いていくつもの異なる形式で構成され得る。通常、抗原は96ウェルプレート上に固定化され、放射性標識または酵素標識を用いて、非標識抗体が標識抗体の結合を阻害する能力が測定される。抗EphA2抗体が選択的に結合するEphA2上のエピトープと選択的に結合するポリペプチドもまた同様の方法を用いて試験し、同定することもできる。
細胞融合技術の別の代替法として、EBV不死化B細胞を用いて本発明のモノクローナル抗体を産生してよい。ハイブリドーマは、必要に応じて増殖させ、サブクローニングして、慣習的なアッセイ法(例えば、FACS、IHC、放射性免疫測定法、酵素免疫測定法、蛍光免疫測定法など)により上清を抗免疫原活性についてアッセイする。
別の代替法では、抗体を組換え法により作製することができる。組換え抗体を作製する方法は、当技術分野で周知である。モノクローナル抗体LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40およびその他の同等な抗体は、配列決定し、インビトロで組換え技術により産生することができる。一実施形態では、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40を配列決定し、次にポリヌクレオチド配列を発現または増殖のためのベクターにクローニングする。目的の抗体をコードする配列は宿主細胞中のベクターに保持されてよく、したがって宿主細胞を増殖させ、後の使用のために凍結させることができる。別の代替法では、抗体をファージディスプレイ技術により組換え法によって作製してもよい。例えば、米国特許第5,565,332号、同第5,580,717号、同第5,733,743号、同第6,265,150号、およびWinterら、Annu.Rev.Immunol.(1994)12:433−455を参照されたい。
別の代替法では、抗EphA2抗体またはその他の任意の目的の抗体またはタンパク質を、当業者に十分公知のエドマン分解による配列決定に付してもよい。質量分析またはエドマン分解によりもたらされるペプチド情報は、目的のタンパク質をクローニングするために使用されるプローブまたはプライマーの設計に用いることができる。
目的のタンパク質をクローニングする別法は、目的の抗体またはタンパク質を発現する細胞に対してEphA2を使用する「パニング」によるものである。「パニング」法は、目的の抗体またはタンパク質を発現する組織または細胞からcDNAライブラリーを得て、第2の細胞種においてcDNAを過剰発現させ、トランスフェクトした第2の細胞種の細胞を、EphA2との特異的結合についてスクリーニングすることにより行われる。「パニング」による、細胞表面タンパク質をコードする哺乳類遺伝子のクローニングに用いられる方法の詳細な説明は、当技術分野に見出すことができる。例えば、Aruffo,A.and Seed,B.Proc.Natl.Acad.Sci USA,84,8573−8577(1987)and Stephen,J.ら、Endocrinology 140:5841−5854(1999)を参照されたい。
cDNAは、当技術分野の標準法に従って、特定の細胞種由来のmRNAを逆転写することにより得ることができる。具体的に言えば、mRNAは、上記のSambrookらに説明された方法に従って、様々な溶菌酵素または化学溶液を用いて単離するか、あるいは製造業者(例えば、Qiagen、Invitrogen、Promega)により提供された添付の使用説明書に従って、市販の核酸結合樹脂により抽出することができる。次に、合成されたcDNAを発現ベクターへ導入し、第2の細胞種において目的の抗体またはタンパク質を産生する。発現ベクターは、エピソームかまたは染色体DNAの不可欠な部分のいずれかとして宿主細胞中で複製可能でなくてはならないことが示唆される。適した発現ベクターとしては、限定されないが、プラスミド、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レトロウイルスなどのウイルスベクター、およびコスミドが挙げられる。
目的のポリヌクレオチドを含むベクターは、多数の適切な方法のいずれかにより宿主細胞に導入することができ、その方法としては、エレクトロポレーション、塩化カルシウム、塩化ルビジウム、リン酸カルシウム、DEAE−デキストラン、または他の物質を用いるトランスフェクション;微粒子銃;リポフェクション;および感染(例えば、ベクターがワクシニアウイルスなどの病原体である場合)などが挙げられる。導入ベクターまたはポリヌクレオチドの選択は、宿主細胞の特性に依存することが多い。
異種のDNAを過剰発現できる宿主細胞はどれも、目的の抗体、ポリペプチドまたはタンパク質をコードする遺伝子を単離する目的のために使用することができる。哺乳類宿主細胞の限定されない例には、限定されないが、COS、HeLa、およびCHO細胞が挙げられる。宿主細胞がcDNAを発現するレベルは、存在するならば宿主細胞中の対応する目的の内因性抗体またはタンパク質のレベルよりも約5倍高いことが好ましく、10倍高いことがより好ましく、20倍高いことがさらにより好ましい。EphA2との特異的結合についての宿主細胞のスクリーニングは、免疫測定法またはFACSにより行われる。目的の抗体またはタンパク質を過剰発現する細胞が同定され得る。
本発明には、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40などの、本発明の抗体のアミノ酸配列を含むポリペプチドが挙げられる。本発明のポリペプチドは、当技術分野で公知の手順により作製することができる。ポリペプチドは、抗体のタンパク質分解もしくは他の分解方法により、上記のような組換え法(すなわち一本鎖または融合ポリペプチド)により、または化学合成により生成することができる。抗体のポリペプチド、特に約50アミノ酸までの短いポリペプチドは、好都合にも化学合成により作製される。化学合成法は、当技術分野で公知であり、市販されている。例えば、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40ポリペプチドは、固相法を用いて自動ポリペプチド合成装置により生成することができる。
また、本発明は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40などの、本発明の抗体の単鎖可変領域断片(「scFv」)も包含する。単鎖可変領域断片は、短い連結ペプチドを用いて、軽鎖および/または重鎖可変領域を連結することにより作製される。Birdら(1988)Science 242:423−426。例えば、連結ペプチドは、1つの可変領域のカルボキシ末端ともう1つの可変領域のアミノ末端との間の約3.5nmを橋渡しすることができる。リンカーを、順に、薬剤の付着または固相支持体への付着などのさらなる機能のために修飾してよい。単鎖変異体は、組換えまたは合成のいずれかにより生成され得る。合成によるscFvの生成のためには、自動合成装置を用いればよい。組換えによるscFvの生成のためには、scFvをコードするポリヌクレオチドを含む適切なプラスミドを、酵母、植物、昆虫または哺乳類細胞などの真核生物、または大腸菌などの原核生物のいずれかの適した宿主細胞に導入してもよい。目的のscFvをコードするポリヌクレオチドは、ポリヌクレオチドのライゲーションなどの日常的な操作により作製することができる。得られたscFvは、当技術分野で公知の標準的なタンパク質精製技術を用いて単離することができる。
本発明は、それらの特性にはあまり影響を及ぼさない、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40と機能的に同等な抗体およびポリペプチドを含む、抗EphA2抗体などの抗体、および活性の増加または低下した変異体に対する修飾を包含する。ポリペプチドの修飾は当技術分野では日常的な作業であり、本明細書に詳細に記載する必要はない。修飾されたポリペプチドの例としては、アミノ酸残基の保存的置換、機能活性を大幅に悪化させることのない1以上のアミノ酸の欠失または付加、あるいは化学類似体の使用によるポリペプチドが挙げられる。互いに保存的置換が可能なアミノ酸残基としては、限定されないが:グリシン/アラニン;バリン/イソロイシン/ロイシン;アスパラギン/グルタミン;アスパラギン酸/グルタミン酸;セリン/トレオニン;リシン/アルギニン;およびフェニルアラニン/チロシンが挙げられる。これらのポリペプチドにはまた、グリコシル化および非グリコシル化されたポリペプチド、ならびに、例えば、異なる糖によるグリコシル化、アセチル化、およびリン酸化などの、翻訳後修飾された他のポリペプチドが含まれる。アミノ酸置換は保存的、すなわち置換アミノ酸が元のアミノ酸と同様の化学特性を有することが好ましい。そのような保存的置換は当技術分野で公知であり、その例は上記に記載されている。アミノ酸修飾は1またはそれ以上のアミノ酸の変化または修飾から、可変領域などの領域の完全な再設計まで多岐にわたる。可変領域における変化は、結合親和性および/または特異性を変化させ得る。他の修飾方法としては、当技術分野で公知のカップリング技術を用いる方法があり、限定されないが、酵素による方法、酸化的置換およびキレート化が挙げられる。修飾は、例えば、放射性免疫測定法のために放射性部分を結合するなど、免疫測定法のための標識を結合するために用いてよい。修飾されたLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40ポリペプチドは、当技術分野で確立された方法を用いて作製され、当技術分野で公知の標準的なアッセイ法を用いてスクリーニングすることができ、その一部は以下および実施例に記載されている。
また、本発明は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40などの本発明の抗体由来の1またはそれ以上の断片または領域を含む融合タンパク質を包含する。一実施形態では、軽鎖可変鎖領域の少なくとも10個の連続するアミノ酸、および重鎖可変鎖領域の少なくとも10個のアミノ酸を含む融合ポリペプチドが提供される。別の実施形態では、融合ポリペプチドは異種の免疫グロブリン定常領域を含む。別の実施形態では、融合ポリペプチドは、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の軽鎖可変領域および重鎖可変領域を含む。本発明の目的上、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40融合タンパク質は、1またはそれ以上のLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40のポリペプチドおよび天然の分子中には付着していない別のアミノ酸配列、例えば、異種配列または別の領域由来の相同配列を含む。LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40のポリペプチドは、例えば、合成または組換えなどの当技術分野で公知の方法により生成され得る。
別の実施形態では、重鎖および/または軽鎖が融合タンパク質である、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40のキメラが提供される。一部の実施形態では、該鎖の定常領域は、ある特定の種および/またはクラス由来であり、かつ、可変領域は異なる種および/またはクラス由来である。例えば、キメラ抗体は(一部の実施形態において)、定常領域がヒト由来であり、かつ、可変領域がLUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40と相同であるか、またはそれに由来する(すなわちネズミ)。また、本発明では、(一部の実施形態において)CDR領域がLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40のアミノ酸配列を含み、一方、フレームワーク領域はヒト配列由来であるヒト化可変領域を有する抗体が具体化される。ヒト化抗体のその他の形態は、当技術分野で公知であり、本明細書に記載されている。キメラの機能的断片も具体化されている。一例はヒト化Fab断片であり、これには、ヒトヒンジ領域、ヒト第1定常領域、ヒトκ軽鎖または重鎖定常領域、およびLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40由来の軽鎖および/または重鎖の可変領域が含まれる。ヒト化LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40Fab断片は、次に、Fab二量体を形成するために作製することができる。一般に、本発明のLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40融合タンパク質およびLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40キメラは、本明細書に記載の組換え法を用いて、それらをコードするポリヌクレオチドを調製し発現することにより作製されるが、当技術分野で公知の他の方法(例えば、化学合成を含む)により調製してもよい。例えば、米国特許第5,807,715号、同第4,816,567号、および同第6,331,415号を参照されたい。
また、本発明はヒト化抗体も包含する。抗体(LUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40など)またはその他の同等な抗体のポリヌクレオチド配列を遺伝的操作に用いて「ヒト化」抗体を作製するか、あるいは親和性または抗体のその他の特徴を改善してよい。抗体をヒト化する際の一般的な原則は、抗体の抗原結合部分の基本的配列を保持したまま、抗体の非ヒト残余部分をヒト抗体配列と交換することを含む。モノクローナル抗体をヒト化するためには、4つの一般的な工程がある。これらは:(1)開始抗体の軽鎖および重鎖可変領域のヌクレオチドおよび予測アミノ酸配列の決定(2)ヒト化抗体の設計、すなわちヒト化の過程の間に使用する抗体フレームワーク領域の決定(3)実際のヒト化手法/技術、ならびに(4)トランスフェクションおよびヒト化抗体の発現、である。例えば、ヒトにおける臨床試験および治療に該抗体が用いられる場合に免疫応答を避けるために、定常領域は、よりヒト定常領域に似るように改変してよい。例えば、米国特許第5,997,867号および同第5,866,692号を参照されたい。
ヒト定常領域と融合させた、げっ歯類V領域およびそれらが関連する相補性決定領域(CDR)を有するキメラ抗体をはじめとする、非ヒト免疫グロブリン由来の抗原結合部位を含む多数の「ヒト化」抗体分子が記載されている。例えば、Winterら、Nature 349:293−299(1991);Lobuglioら、Proc.Nat.Acad.Sci.USA 86:4220−4224(1989);Shawら/Immunol.138:4534−4538(1987);およびBrownら、Cancer Res.47:3577−3583(1987)を参照されたい。他の参照文献には、適切なヒト抗体定常領域との融合に先立ち、ヒト支持フレームワーク領域(FR)中に移植されたげっ歯類のCDRが記載されている。例えば、Riechmannら、Nature 332:323−327(1988);Verhoeyenら、Science 239:1534−1536(1988);およびJonesら、Nature 321:522−525(1986)を参照されたい。別の参照文献には、組換え法によりはり合わされたげっ歯類フレームワーク領域により支持されるげっ歯類CDRが記載されている。例えば、欧州特許公報第519,596号を参照されたい。これらの「ヒト化」分子は、ヒトレシピエントにおけるそれらの部分の治療適用の持続時間および有効性を制限する、げっ歯類抗ヒト抗体分子に対する望ましくない免疫応答を最小限に抑えるために設計されている。利用してもよいその他の抗体をヒト化する方法は、Daughertyら、Nucl.Acids Res.,19:2471−2476(1991)、および米国特許第6,180,377号、同第6,054,297号、同第5,997,867号、同第5,866,692号、同第6,210,671号、同第6,350,861号、ならびにPCTWO01/27160号に開示されている。
さらに別の代替法では、特異的ヒト免疫グロブリンタンパク質を発現するように設計された市販のマウスを用いて完全ヒト抗体を得ることができる。より望ましい(例えば、完全なヒト抗体)免疫応答、または、より強い免疫応答を生じるように設計されたトランスジェニック動物を用いてヒト化またはヒト抗体を作製してもよい。そのような技術の例としては、Abgenix,Inc.(Fremont,CA)製のXenomouse(商標)、ならびにMedarex,Inc.(Princeton,NJ)製のHuMAb−Mouse(登録商標)およびTC Mouse(商標)である。
また、本発明は、治療薬(放射性分子、毒素(例えば、カリチアマイシン)、もしくは化学療法薬分子など)、または化学療法化合物を含有するリポソームもしくは他の小胞と共役コンジュゲートさせた(例えば、連結させた)、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40、あるいは、LUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40の同等な抗体またはポリペプチドを含む組成物も提供する。該組成物は、個体に投与された場合、抗体またはポリペプチドにより認識されるEphA2を発現している癌細胞をこれらの薬剤の標的とすることができ、従って、例えば、癌細胞を除去し、かつ/あるいは、癌細胞の増殖および/または成長を抑制することができる。簡単にするために、これらの方法が本明細書に記載されるいずれかのEphA2結合の実施形態に適用するという理解の下で、参照は、一般にLUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40または抗体に対して行う。これらの方法では、一般にコンジュゲーションとは、本明細書に記載されたこれらの成分を連結することを指す。連結(一般に、少なくとも投与のためにこれらの成分を会合に近似した状態で固定すること)は、下記のように多数の方法により達成することができる。
本発明の放射性分子には、癌細胞の破壊に効果的な任意の放射性同位元素が含まれる。その例としては、限定されないが、コバルト60およびX線が挙げられる。さらに、一般に放射性同位元素の混合物を代表する、ウラン、ラジウム、およびトリウムなどの天然の放射性元素は、放射性分子の適した例である。
本発明の毒素には、限定されないが、タキソール、サイトカラシンB、グラミシジンD、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンD、1−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、ならびにピューロマイシンおよびその類似体または同族体が挙げられる。本発明の抗体は、それらが結合する癌細胞内に取り込まれることが可能であり、従って、例えば、その有害な働きのために、取り込まれる必要のある毒素を細胞中へ送達するなど、治療適用に特に有用である。そのような毒素の例としては、限定されないが、サポリン、カリチアマイシン、オーリスタチン、およびマイタンシノイドが挙げられる。
本発明の抗体またはポリペプチドは、放射性分子、毒素、もしくは他の治療薬と、または治療薬を含有するリポソームもしくは他の小胞と、共役的または非共役的に、直接的または間接的に、コンジュゲート(連結)され得る。抗体は、抗体がその標的であるEphA2と結合できる限り、抗体に沿った任意の位置で、放射性分子、毒素、または治療分子と連結されていてよい。
毒素または治療薬は、適したモノクローナル抗体と直接的あるいは間接的に(例えば、リンカー基を介して、あるいは、米国特許第5,552,391号に記載のプラットフォーム分子などの適切な付着部位を有する連結分子を介して)結合(例えば、共有結合)させてよい。本発明の毒素および治療薬は、当技術分野で公知の方法を用いて、特定の標的タンパク質に直接結合させることができる。例えば、薬剤と抗体との間の直接反応は、各々が他方と反応できる置換基を有している場合に可能である。例えば、一方の求核基(アミノ基もしくはスルフヒドリル基など)は、他方のカルボニル含有基(無水物もしくは酸ハロゲン化物など)と、または適した脱離基(例えば、ハロゲン化物)を含有するアルキル基と反応することができる。
また、抗体またはポリペプチドは、マイクロキャリアを介して治療薬に連結することもできる。マイクロキャリアとは、水に不溶で、サイズが約150、120または100mmよりも小さく、より一般的には約50〜60μmよりも小さく、好ましくは、約10、5、2.5、2または1.5μmよりも小さい、生分解性または非生分解性の粒子を指す。マイクロキャリアには、約1μm未満のサイズの、好ましくは、約500nm未満のマイクロキャリアである、「ナノキャリア」が含まれる。そのような粒子は、当技術分野で公知である。固相マイクロキャリアは、生体適合性のある天然に存在するポリマー、合成ポリマーまたは合成コポリマーから形成された粒子であってよく、アガロースまたは架橋アガロース、ならびに当技術分野で公知の他の生分解性材料から形成されたマイクロキャリアを含んでも、含まなくてもよい。生分解性固相マイクロキャリアは、分解性ポリマー(例えば、ポリ(乳酸)、ポリ(グリコール酸)およびそのコポリマー)、または哺乳類の生理学的条件下で浸食され得る(例えば、ポリ(3,9−ジエチリデン−2,4,8,10−テトラオキサピロ[5.5]ウンデカン)(DETOSU)などのポリ(オルトエステル)、またはセバシン酸のポリ(無水物)などのポリ(無水物)から形成されてよい)。液相マイクロキャリアが生分解性であるならば、マイクロキャリアは、リポソーム、抗原を含まない免疫刺激複合体(コレステロール、およびリン脂質、アジュバント活性サポニンの安定な複合体である免疫刺激複合体)、あるいは液滴または水中油型もしくは油中水型エマルジョン中に見出されるミセルなどの液相(例えば、油または脂質ベースの)であってもよい。生分解性の液相マイクロキャリアは一般に、スクアレンおよび植物油を含む生分解性の油を内蔵し、その多くが当技術分野で公知である。マイクロキャリアは一般に球形であるが、球形から逸脱しているマイクロキャリアも許容される(例えば、楕円、棒状等)。その(水に対して)不溶性の性質に起因して、マイクロキャリアは水および水ベースの(水性)溶液から濾過することができる。
本発明の抗体またはポリペプチド複合体は、毒性のある薬剤または治療薬と結合できる基、および抗体と結合できる基の双方を含む二官能性リンカーを含んでよい。リンカーは、結合能力への干渉を避けるために、薬剤から抗体を遠ざけるスペーサーとして機能し得る。リンカーは、切断可能であっても切断不可能であってもよい。また、リンカーは、薬剤または抗体上の置換基の化学反応性を高め、従って結合効率を高める役割を果たすこともできる。化学反応性の増大はまた、そうでなければ可能でない、薬剤または薬剤上の官能基の使用を容易にする可能性もある。二官能基を有するリンカーは、当技術分野で公知の方法により、抗体に結合させることができる。例えば、N−ヒドロキシスクシンイミドエステルなどの活性エステル部分を含むリンカーは、アミド結合を介する、抗体中のリシン残基に結合させるために使用できる。別の例では、求核アミンまたはヒドラジン残基を含有するリンカーは、抗体の炭水化物残基の解糖酸化により生じたアルデヒド基と結合し得る。これらの直接的な結合法に加えて、リンカーは、アミノデキストランなどの中間担体により間接的に抗体に結合することができる。これらの実施形態において、修飾された連結は、リシン、炭水化物、または中間担体のいずれかを介する。一実施形態において、リンカーはタンパク質中の遊離チオール残基と位置選択的に結合する。タンパク質上のチオール基への選択的結合に適した部分は、当技術分野で周知である。その例としては、ジスルフィド化合物、α−ハロカルボニルおよびα−ハロカルボキシル化合物、ならびにマレイミドが挙げられる。同じ分子中にα−ハロカルボニルまたはカルボキシル基として求核アミン官能基が存在する場合には、アミンの分子内アルキル化を介して環化が起こる可能性がある。この問題を回避する方法は当業者に周知であり、立体化学的に不利な望ましくない環化を起こす柔軟性のない基(アリール基またはトランス−アルケンなど)によってアミンおよびα−ハロ官能基が分離されている分子を調製することにより回避される。例えば、ジスルフィド部分を介するマイタンシノイドと抗体との複合体の調製については米国特許第6,441,163号を参照されたい。
抗体−薬剤複合体の調製に用いられ得る、切断可能なリンカーの1つは、受容体仲介エンドサイトーシス中に遭遇するエンドソーム、およびリソソームなどの異なる細胞内コンパートメントの酸性環境をうまく利用する、シス−アコニット酸に基づく酸に不安定なリンカーである。例えば、ダウノルビシンと高分子担体との複合体調製のためには、Shenら、Biochem.Biophys.Res.Commun.102:1048−1054(1981);ダウノルビシンと抗黒色腫抗体との複合体調製のためには、Yangら、J.Natl.Canc.Inst.80:1154−1159(1988);ダウノルビシンと抗T細胞抗体との複合体調製と同様の方法で酸に不安定なリンカーを使用するためには、Dillmanら、Cancer Res.48:6097−6102(1988);ペプチドスペーサーアームを介してダウノルビシンを抗体に連結するためには、Trouetら、Proc.Natl.Acad.Sci.79:626−629(1982)を参照されたい。
本発明の抗体(またはポリペプチド)は、当技術分野で公知の任意の方法により、放射性分子とコンジュゲートされ得る。放射性標抗体のための方法の考察に関しては、「Cancer Therapy with Monoclonal AntibodiesT”、D.M.Goldenberg ed.(CRC Press,Boca Raton,1995)を参照されたい。
本発明の抗体(またはポリペプチド)は、蛍光分子、放射性分子または当技術分野で公知の他の標識などの標識薬剤(あるいは「標識」と呼ばれる)と連結させてもよい。標識は、当技術分野で公知であり、一般に(直接的あるいは間接的に)シグナルをもたらす。
本発明の抗体、ポリペプチドおよびタンパク質の能力、例えば、EphA2を発現している癌細胞の成長を阻害する能力、EphA2を発現している癌を有する個体において転移の進行を遅らせる能力、EphA2を発現している癌細胞に、毒素または放射性化合物などの治療薬を送達する能力(EphA2を発現している癌細胞の中に治療薬を送達する能力を含む)などの、当技術分野で公知の方法を用いて試験することができ、それらのいくつかは実施例に記載されている。
また、本発明は、抗EphA2抗体またはLUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40と同等な抗体(本開示が明らかにするように、本明細書に記載の全ての抗体が含まれる)またはポリペプチドおよび治療薬を含む、組成物(医薬組成物を含む)を提供する。
モノクローナル抗体のスクリーニング方法
いくつかの方法を用いて、癌細胞でEphA2と結合するモノクローナル抗体をさらにスクリーニングすることができる。用いることのできる1つの方法は、免疫組織化学(IHC)である。標準的な免疫組織化学手法は平均的な当業者に公知である。例えば、Animal Cell Culture Methods(J.P.Mather and D.Barnes,eds.,Academic Press,Vol.57,Ch.18 and 19,pp.314−350,1998)を参照されたい。生体サンプル(例えば、組織)は、生検、剖検(autopsies)、または剖検(necropsies)から得ることができる。EphA2が癌細胞にしか存在しないことを確かめるため、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40を用いて、癌を有する個体由来の組織でのEphA2の存在を検出することができ、一方では、癌を患っている個体由来のその他の非癌組織、または癌を有さない個体由来の組織を対照として用いる。組織は、凍結中の損傷を防ぐ固体または半固体物質(例えば、アガロースゲルまたはOCT)に包埋した後、染色のために分割することができる。異なる臓器および異なる程度の癌を用いてモノクローナル抗体をスクリーニングすることができる。スクリーニングの目的に用いられ得る組織の例としては、限定されないが、卵巣、乳房、肺、前立腺、結腸、腎臓、皮膚、甲状腺、脳、心臓、肝臓、胃、神経、血管、骨、上部消化管、および膵臓が挙げられる。スクリーニングの目的に用いられ得る異なる癌の種類の例としては、限定されないが、癌腫、腺癌、肉腫、腺肉腫、リンパ腫、および白血病が挙げられる。
さらに別の代替法では、癌細胞株、例えばSK−Ov−3(ATCC #HTB 77)、LnCap(ATCC #CRL−1740)、COLO205(ATCC #CCL 222)、A549(ATCC #CCL 185)、PANC−1(ATCC #CRL 1469)、SK−BR−3(ATCC #HTB 30)、SK−MES−1(ATCC #HTB 58)、HT−29(HTB−38)、SW480(ATCC #CCL 228)、AsPC−1(ATCC #CRL 1682)、Capan−1(ATCC #HTB 79)、CFPAC−1(ATCC #CRL 1918)、HPAF−II(ATCC #CRL−1997)、HS−700T(ATCC #HTB 147)、Du−145(ATCC #HTB− 81)、CaLu−1(ATCC #HTB−54)、786−O(ATCC #CRL−1932)、CaKi−2(ATCC #HTB−47)、A498(ATCC #HTB−44)、BT474(ATCC #HTB−20)、およびPC−3(ATCC #CRL 1435)ならびにそれらのそれぞれの組織由来の正常細胞を用いて、癌組織に特異的なモノクローナル抗体についてスクリーニングしてよい。異なる臓器の正常組織に由来する初代または低継代細胞培養(限定されないが、卵巣、乳房、肺、前立腺、結腸、腎臓、皮膚、甲状腺、大動脈平滑筋、および内皮細胞を含む)を陰性対照として用いてよい。癌細胞または非癌細胞は、スライドガラスもしくはカバーガラス上で、またはプラスチック表面上で増殖させるか、あるいはWO01/43869号に記載されるようにCellArray(商標)中に調製し、上記のようにIHCを用いて、組織について抗体の結合をスクリーニングすることができる。あるいは、非タンパク質分解方法を用いて細胞を増殖表面から取り出してペレットにし、次にそれを上に記載したIHC分析のために組織として包埋して処理してよい。別の代替法では、単一の細胞を、蛍光分子と結合した二次「リポーター」抗体である、一次抗体とともにインキュベートすることによりスクリーニングした後、蛍光活性化細胞選別(FACS)機を用いて分析してよい。
いくつかの異なる検出系を利用して抗体と組織切片との結合を検出してよい。一般に、免疫組織化学は一次抗体と組織との結合を含み、次に、一次抗体の種に対して反応性である二次抗体を作成し、検出可能なマーカー(例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、HRP、またはジアミノベンジジン、DAB)とコンジュゲートさせた。用いられ得る1つの代替方法は、ポリクローナルミラーイメージ相補的抗体またはpolyMICAである。D.C.ManghamおよびP.G.Isaacsonに記載されるPolyMICA(ポリクローナルミラーイメージ相補的抗体)技術(Histopathology(1999)35(2):129−33)は、一次抗体(例えば、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40)と正常組織および癌組織との試験結合に用いることができる。数種類のpolyMICA(商標)検出キットがThe Binding Site Limited(P.O.Box 4073 Birmingham B29 6AT England)から市販されている。製品番号HK004.Dは、DAB色素原を用いるpolyMICA(商標)検出キットである。製品番号HK004.Aは、AEC色素原を用いるpolyMICA(商標)検出キットである。あるいは、一次抗体を検出可能なマーカーで直接標識してもよい。
適当な抗体を選択するためのIHCスクリーニングの第1工程は、マウスにおいて作製した一次抗体(例えば、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40)と1またはそれ以上の免疫原(例えば、細胞もしくは組織サンプル)との結合である。一実施形態では、組織サンプルは、異なる臓器の凍結組織の切片である。細胞もしくは組織サンプルは癌細胞もしくは組織であってもよく、または非癌細胞もしくは組織であってもよい。
凍結組織は、当業者に公知の多数の方法のうちのいずれかにより、調製し、固定化するかまたはせずに分割し、IHCを行うことができる。例えば、Stephanら、Dev.Biol.212:264−277(1999)、およびStephanら、Endocrinology 140:5841−54(1999)を参照されたい。
癌細胞もしくは組織と結合するが、正常な細胞もしくは組織と同じ程度まで結合しない、ヒト細胞と交差反応性のモノクローナル抗体を選択する。1またはそれ以上の癌種に発現するが正常細胞には発現しない抗原と結合するモノクローナル抗体も選択する。LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40は、多数の異なる癌に存在する抗原EphA2と結合するが、正常組織との結合が限定されている抗体の例である。エピトープマッピングを用いて抗体をさらに特徴付けてもよい。商業的に入手可能なサービス(例えば、Pepscan Systems,P.O.Box 2098,8203 AB Lelystad,The Netherlands)を用いて、抗原EphA2上の、抗体、例えばLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の結合するエピトープを判定してよい。
EphA2と結合するLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40、同等の抗体またはポリペプチドを用いる癌の診断方法
モノクローナル抗EphA2抗体、および、本明細書に開示される方法により作製される、EphA2と結合するLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の同等の抗体またはポリペプチド誘導体を用いて、種々の組織(限定されないが、卵巣、乳房、肺、前立腺、結腸、腎臓、皮膚、甲状腺、脳、心臓、肝臓、胃、神経、血管、骨、上部消化管、および膵臓を含む)において癌細胞の存在または不在を診断目的のために識別または検出することができる。簡単にするために、これらの方法が本明細書に記載されるいずれかのEphA2結合の実施形態に適用するという理解の下で、参照は、一般にLUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40または抗体に対して行う。検出は、一般に、本明細書に記載されるEphA2と結合する抗体またはポリペプチドと細胞とを接触させること、およびEphA2と特異的に結合する抗体(例えば、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40のヒト化抗体、ヒト抗体またはその他の任意のEphA2結合部分)との間の複合体の形成を含む。そのような複合体の形成は、インビトロであってもインビボであってもよい。理論に縛られることなく、モノクローナル抗EphA2抗体は、EphA2の細胞外ドメインを介してEphA2と結合することができる。本明細書において、検出には定性的および/または定量的検出が含まれ、さらに、癌細胞において増加したEphA2の発現レベルに関して、測定したレベルを正常細胞と比較することが含まれ得る。
診断用の抗体の一使用法は、抗体と標識部分(例えば、蛍光剤、放射性薬剤または放射線不透過性物質)を結合させること、抗体を患者へ投与すること、およびX線またはその他のイメージング装置を用いて、抗原を発現している癌細胞表面での標識された抗体の局在性を視覚化することによる、インビボでの腫瘍イメージングである。標識部分は当技術分野で公知である。
その他の方法では、癌細胞を取り出して、当技術分野で周知の方法(例えば、凍結化合物への包埋、固定化するかまたはしない凍結および分割;抗原回収および対比染色の種々の方法を用いるかまたは用いない固定化およびパラフィン包埋)により、組織を免疫組織化学のために調製する。また、モノクローナル抗体を用いて異なる発生段階の新生物を同定してもよい。また、抗体を用いてどの患者の腫瘍がその表面で所定のレベルの抗原を発現しているか、従って前記抗原に対する抗体を用いる免疫療法の候補であるかを判定してもよい。
また、抗原を認識する抗体(またはポリペプチド)を用いて、体液(限定されないが、血液、唾液、尿、肺液、または腹水が含まれる)中の生きた癌細胞または死んだ癌細胞から放出または分泌された抗原を検出するための診断用の免疫測定法を作ってもよい。実施例でさらに詳細に考察されるように、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40は、組織由来の異なる段階の様々な形態の癌(限定されないが、黒色腫、乳房、肺、前立腺、および結腸が含まれる)と結合することができる。診断目的のためにLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40を使用する方法は、何らかの形態の抗癌治療(例えば、化学療法または放射線療法)の前および後の双方で、所定の治療に対してどの腫瘍が最も応答する可能性が高いか、患者の予後、腫瘍のサブタイプまたは転移性疾患の起源、および疾患の進行または治療に対する応答を判定するために有用である。
LUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40または同等な抗体もしくはポリペプチドの治療目的での使用方法
本明細書に開示される方法により作製されるモノクローナル抗EphA2抗体および同等な抗体(ならびに本発明のその他のポリペプチドの実施形態)は、限定されないが、黒色腫、乳癌、肺癌、結腸癌、または前立腺癌をはじめとする癌を有する個体において治療目的のために用いられ得る。また、これらの治療法は、前記の連結された実施形態にも適用される。簡単にするために、これらの方法が本明細書に記載されるいずれかのEphA2結合の実施形態に適用されるという理解の下で、参照は、一般にLUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40または抗体(限定されないが、本明細書に記載される連結された実施形態を含むヒト化抗体およびヒト抗体を含む)に対して行う。LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40を用いる治療は、上記のように、インビトロおよび/またはインビボの双方で、そのような抗体とEphA2との複合体の形成を必要とし得る。一実施形態では、モノクローナル抗EphA2抗体は、癌細胞と結合して癌細胞の成長および/または増殖を低下させ得る。別の実施形態では、モノクローナル抗EphA2抗体は癌細胞と結合して癌細胞でのアポトーシス細胞死を誘導し得る。別の実施形態では、モノクローナル抗EphA2抗体は癌細胞と結合して転移の発生を遅延させ得る。別の実施形態では、モノクローナル抗EphA2抗体は癌細胞と結合してLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40と連結された治療薬(毒素、または放射性化合物など)を癌細胞へ送達し得る。一部の実施形態のためには、治療薬(毒素など)が細胞へ導入される(すなわち内部に取り入れられる)。これらの方法に特に適した薬剤としては、細胞の内部で活性のある薬剤が挙げられる。そのような薬剤の例としては、限定されないが、サポリン、カリチアマイシン、オーリスタチン、およびメイタンシノイドが挙げられる。一般に、これらの実施形態において有効量(治療薬を標的癌細胞へ、および/または標的癌細胞の中に送達するために十分な量)が個体へ投与される。さらに別の実施形態では、癌を有する個体にLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40での緩和治療を行う。癌患者の緩和治療は、癌の進行に直接影響を及ぼさずに、疾患の有害症状、または疾患に対してなされた他の治療によって生じる医原性の症状を治療するかまたは軽減することを伴う。これには、疼痛、栄養補給、性的問題、心理的苦悩、鬱病、疲労、精神障害、悪心、嘔吐などの緩和が含まれる。
また、本発明は、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40抗体またはLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40のうちのいずれかが選択的に結合するエピトープと同一のエピトープと選択的に結合する抗体を用いて、癌細胞の成長および/または増殖を阻害する方法も提供する。
さらに別の実施形態では、LUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40または本明細書に記載されるいずれかのEphA2の実施形態は、癌細胞を発現しているEphA2と結合し、EphA2を発現している癌細胞に対して活発な免疫応答を誘導し得る。いくつかの場合、活発な免疫応答は、癌細胞の死を引き起こす(例えば、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40が癌細胞と結合し、アポトーシスまたは腫脹による細胞死を誘導する)か、または癌細胞の増殖を阻害する(例えば、細胞周期の進行を阻害する)ことができる。その他の場合、LUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40または本明細書に記載されるいずれかのEphA2抗体は、癌細胞と結合することができ、抗体依存性細胞傷害(ADCC)により、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40が結合している癌細胞を排除できる。従って、本発明は、本明細書に記載されるいずれかの組成物を投与する工程を含む、免疫応答を刺激する方法を提供する。
抗EphA2抗体は、個体自身の免疫応答を促進または指示する薬剤(ADCCを強化する薬剤など)とともに投与してよい。一実施形態では、抗EphA2抗体中に存在する少なくとも1つのフコース残基を抗体のオリゴ糖から除去し、ADCCを促進させる修飾をする。類似の実施形態では、抗EphA2抗体中に存在するフコース残基を修飾して本来の修飾されていない抗体と比較してADCCを促進するために必要な程度までそれらの組成を変える。
いくつかの場合、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の結合は、細胞応答および体液性免疫応答の双方を活性化させ、より多くのナチュラルキラー細胞または個体の免疫系をさらに活性化して癌細胞を破壊するサイトカイン(例えば、IL−2、IFN−g、IL−12、TNF−a、TNF−b、その他)の産生の増加を補充することもできる。さらに別の実施形態では、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40は癌細胞と結合することができ、マクロファージまたはその他の食細胞は癌細胞をオプソニン化できる。
一部の実施形態では、本発明は、本明細書に記載されるいずれかの組成物を投与する工程を含む、受動免疫を付与する方法を提供する。
本発明は、本明細書に記載されるいずれかの組成物(コンジュゲートを含む)を、EphA2を発現している細胞、例えばEphA2発現癌細胞へ送達する方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載される組成物(コンジュゲートを含む)を個体へ投与することを伴う。一部の実施形態では、この方法は、例えば、コンジュゲートを標的細胞の中へ導入するために提供される。さらに別の実施形態では、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40を治療薬(放射性分子、毒素、例えば、サポリン、カリチアマイシン、オーリスタチン、もしくはメイタンシノイド、またはその他の化学療法分子)またはリポソームまたは化学療法化合物を含むその他の小胞とコンジュゲートし、個体へ投与して、抗体により認識される抗原を含む癌細胞をこれらの化合物の標的とし、従って癌細胞を排除する。さらに別の実施形態では、転移の発生を遅らせるために、抗原を発現している癌を外科的に切除した時点で抗体をアジュバント治療として用いてもよい。また、腫瘍のサイズを減少させるため、および従って手術を可能または平易にし、手術中の組織を控え、かつ/または傷跡による外見の損傷を減少させるため、手術の前に抗原を発現している腫瘍を有する患者へ抗体を投与してもよい(ネオアジュバント療法)。
LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40および同等な抗体または断片(例えば、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv、Fc、その他)の様々な構築物、例えば、キメラ抗体、一本鎖(ScFv)、その変異体、融合タンパク質(必要な特異性をもつ抗原EphA2の認識部位を含むLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の抗体部分、ヒト化抗体、および任意のその他の修飾された配置を含む)、を投与に用いてよい。一部の実施形態では、LUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40抗体、またはそれらのLUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40の様々な構築物をそのまま投与され得る。他の実施形態では、LUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40、またはLUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40の様々な構築物(本明細書に記載される任意の組成物実施形態を含む)および薬学的に受容可能な賦形剤が投与され、それは様々な構築物であってもよい。薬学的に受容可能な賦形剤は当技術分野で公知であり、薬理学的に有効な物質の投与を促進する比較的不活性な物質である。例えば、賦形剤は形またはコンシステンシーを与えるか、または希釈液として働くことができる。適した賦形剤としては、限定されないが、分解防止剤、湿潤剤および乳化剤、モル浸透圧濃度を変えるための塩、カプセル化剤、バッファー、ならびに皮膚浸透促進剤が挙げられる。非経口および非−非経口薬剤送達のための賦形剤ならびに製剤は、Remington,The Science and Practice of Pharmacy 20th Ed.Mack Publishing(2000)に記載されている。
概して、これらの薬剤は注射(例えば、腹膜内、静脈内、皮下、筋肉内、など)による投与のために処方されるが、その他の投与形態(例えば、経口、粘膜、など)を用いることもできる。従って、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40抗体およびそれらの同等物は、薬学的に受容可能な担体、例えば生理食塩水、リンゲル液、デキストロース溶液、およびその他同種類のものと組み合わせることが好ましい。特定の投与計画、すなわち、用量、タイミングおよび反復は、特定の個体およびその個体の病歴によって決まる。一般に、次の用量のいずれかが用いられ得る:少なくとも約50mg/体重kg;少なくとも約10mg/体重kg;少なくとも約3mg/体重kg;少なくとも約1mg/体重kg;少なくとも約750μg/体重kg;少なくとも約500μg/体重kg;少なくとも約250ug/体重kg;少なくとも約100μg/体重kg;少なくとも約50μg/体重kg;少なくとも約10μg/体重kg;少なくとも約1μg/体重kg、またはそれ以上の用量が投与される。半減期などの経験的な考察は、一般に投薬量の決定に寄与する。ヒト化抗体または完全ヒト抗体など、ヒト免疫系と両立する抗体を用いると、抗体の半減期を延長し、抗体が宿主の免疫系から攻撃を受けることを防ぐことができる。
いくつかの個体では、1以上の用量が必要となる可能性がある。投与の頻度は治療を通して判断し、調節してよく、それは癌細胞の数を減少させること、癌細胞の減少を維持すること、癌細胞の成長および/または増殖を低減すること、あるいは転移の発生を遅延させることに基づいている。癌細胞の存在は当業者に公知の、または本明細書に考察されている多数の方法により確認することができる(例えば、生検または生体サンプルの免疫組織化学またはフローサイトメトリーによる検出)。いくつかの場合、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40抗体の持続連続放出製剤が適当であり得る。持続放出を達成するための種々の製剤および装置が当技術分野で公知である。
一実施形態では、LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40抗体の投薬量は、1回またはそれ以上の投与を受けた個体において経験的に判断してよい。個体にはLUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40の漸増する投薬量が与えられる。LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40またはその他の同等な抗体の有効性を評価するため、特定の癌疾患状態のマーカーをモニターしてよい。これらのマーカーとしては、触診または目で観察することによる腫瘍サイズの直接測定;X線またはその他のイメージング技術による腫瘍サイズの間接測定;腫瘍サンプルの直接の腫瘍生検および顕微鏡検査により評価される改善;間接的な腫瘍マーカー(例えば、前立腺癌のPSA)の測定、疼痛または麻痺の減少;発声、視力、呼吸またはその他の腫瘍に関係する能力障害の改善;食欲の増加;あるいは承認された試験または生存の延長で測定される生活の質の向上、が挙げられる。個体、癌の種類、癌の病期、個体において癌が別の位置へ転移したかどうか、およびこれまでの治療および同時に用いられている治療によって、投薬量が変動することは当業者には明らかであろう。
その他の製剤としては、当技術分野で公知の適した送達形態が挙げられ、限定されないが、リポソームなどの担体が含まれる。例えば、Mahatoら(1997)Pharm.Res.14:853−859を参照されたい。リポソーム製剤には、限定されないが、シトフェクチン(cytofectins)、多重膜小胞および単層小胞が含まれる。
一部の実施形態では、1より多い抗体が存在し得る。抗体はモノクローナルであってもポリクローナルであってもよい。そのような組成物には、癌腫、腺癌、肉腫、または腺肉腫に対して反応性の少なくとも1つの、少なくとも2つの、少なくとも3つの、少なくとも4つの、少なくとも5つの異なる抗体が含まれ得る。LUCA19、SPL1、SG5またはLUCA40抗体は、限定されないが、卵巣、乳房、肺、前立腺、結腸、腎臓、皮膚、甲状腺、骨、上部消化管、および膵臓をはじめとする臓器の癌腫、腺癌、肉腫、または腺肉腫に対して反応性の1またはそれ以上の抗体と混合してよい。抗体の混合物は、当技術分野でしばしば示されるように、より広範囲の個体集団の治療に特に有用であり得る。
疾患の評価は、当技術分野での標準法、例えばイメージング法および適当なマーカーのモニタリングを用いて行う。
EphA2と結合する本発明の抗体およびポリペプチドを含むキット
また、本発明は、診断および/または治療で用いる、本明細書に記載されるEphA2と結合する抗体または任意の組成物を含むキットを提供する。従って、キットはEphA2と選択的に結合する、かつ/またはEphA2と複合体を形成することができる抗体(例えば、乳癌細胞、結腸癌細胞、肺癌細胞、または前立腺癌細胞の検出に有用である)を含む。一部の実施形態では、キットは、抗EphA2抗体、または、LUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40が選択的に結合するエピトープと同一のエピトープに選択的に結合する抗体を含む。一部の実施形態では、キットは、治療薬または標識薬剤と結合した、抗EphA2抗体または、LUCA19、SPL1、SG5もしくはLUCA40が選択的に結合するエピトープと同一のエピトープに選択的に結合する抗体を含む。これらのキットには、前記抗体または本明細書に記載される任意の抗体もしくはポリペプチド実施形態と治療薬または標識薬剤とを結合させるための使用説明書および/または試薬がさらに含まれ得る。いくつかの態様では、抗体(例えば、モノクローナル、ポリクローナル、ヒト、ヒト化、その他)のEphA2との結合は、個体において癌を診断するため、例えば、癌細胞の存在または不在を検出するためのキット、および乳房癌細胞、結腸癌細胞、肺癌細胞、または前立腺癌細胞の存在または不在を検出するためのキットに用いられる。その他の態様では、キットは、例えば、癌または癌の家族歴を有する個体を治療するために用いられ得る。癌を有する個体を治療するためのキットとしては、限定されないが、癌細胞の成長および/または増殖を阻害するためのキット、治療薬を癌細胞へ送達するためのキット、治療薬を癌細胞の中へ送達するためのキットが挙げられる。本発明のキットは適した包装がされており、所望により、さらなる構成要素、例えば、バッファーおよびEphA2との結合を判定する説明書(捕獲試薬、現像試薬、標識、反応表面、検出手段、対照サンプル、および解釈データなど)を提供する。説明書は、抗原結合の任意の測定(限定されないが、本明細書に記載されるアッセイ法を含む)のためであってよい。他の実施形態では、説明書は、癌細胞(乳癌細胞、肺癌細胞、結腸癌細胞、または前立腺癌細胞など)の成長および/または増殖を阻害するための説明書、治療薬を癌細胞へ送達するための説明書、治療薬を癌細胞の中へ送達するための説明書をはじめとする、本明細書に記載される任意の方法のためであってよい。一部の実施形態では、上記の試薬は複数の測定が行われ得るように、同じ個体での経時的測定または複数個体での測定が可能となるように、供給される。標識された抗ヒト抗体など、抗体の結合を検出するためのいずれかの適当な手段を用いて(そしてキットに含めて)よい(標識は酵素、フルオロフォア、化学発光物質、放射性同位元素または補酵素であってよい)。一般に、用いられる標識は酵素である。
以下の実施例は本発明を説明するために提供され、本発明を限定するためではない。
実施例1.免疫原としての癌細胞株の調製
組織または細胞培養から単離した全細胞を、特定の細胞種を代表する表面抗原に特異的なモノクローナル抗体産生のための免疫原として用いた。そのような、本発明の実践に適した方法は米国特許第6,541,225号に記載されている。概して、特定の細胞種の細胞表面抗原に対するモノクローナル抗体を産生するために、形質転換されていないB細胞をその種類の生存可能かつ無傷な細胞で、好ましくは、表面に血清を含まない細胞で免疫化することが望ましい。抗原EphA2に対するモノクローナル抗体(限定されないが、LUCA19、LUCA40、またはSPL1など)の産生に適した細胞株としては、BT−474(ATCC# HTB−20)、MDA−MB−175VII(ATCC# HB−25)、MDA−MB−361(ATCC# HB−27)、SKBR3(ATCC# HTB−30)、SKMES−1(ATCC# HTB−58)、ES−2(ATCC# CRL−1978)、SKOV3(ATCC# HTB−77)、HPAFII(ATCC# CRL−1997)、Hs700T(ATCC# HTB−147)、Colo205(ATCC# CCL−222)、HT−29(ATCC# HTB−38)、SW480(ATCC# CCL−228)、SW948(ATCC# CCL−237)、A498(ATCC# HTB−44)およびCaki−2(ATCC# HTB−47)が挙げられる。
増殖因子を補給した、血清を含まない適当な栄養培地で細胞を増殖させた。血清を補給した培地で増殖された細胞での免疫化は、極度な不都合を有し得る。血清には、定義されていない活性を持つ大小の生体分子の複雑な混合物が含まれる。これらの生体分子は細胞の表面に付着し、それにより特定の細胞種を代表しない分子と交差反応する抗体の産生をもたらし得る。その上、血清生体分子の細胞表面との結合は、所望の細胞表面抗原標的のマスキングをもたらし得る。多数の無血清培地調製物が商業的に公知であり、公的に入手可能である(例えば、次の栄養補助剤:インスリン(終濃度10μg/ml)、上皮成長因子(EGF)(終濃度5ng/ml)、亜セレン酸(終濃度2.5×10−8M)、およびブタ下垂体抽出物(PPE)(終濃度5μl/ml)を含むF12/DME(1:1)栄養培地)。
細胞を回収するため、細胞単層をカルシウムおよびマグネシウムを含まないハンクス生理食塩水溶液で1回すすぎ、ハンクス生理食塩水溶液中10mM EDTA中で37℃にて15分間インキュベートした。穏やかにピペッティングして細胞を培養表面から切り離した。1000×gで5分間の遠心分離により細胞懸濁液をペレット化した。上清を除去し、細胞を無血清培地で、必要に応じて非変性アジュバントとともに再懸濁した。
実施例2.モノクローナル抗体の産生
非変性アジュバント(Ribi、R730、Corixa,Hamilton MT)をリン酸緩衝生理食塩水で2mlに再水和した。次に、この再水和アジュバント100μlを、免疫化に用いる実施例1からのいくつかの細胞ペレットとともに穏やかに混合した。BaIb/cマウスの足の裏からマウス1匹あたり約10細胞を、週に約1回または2回注入した。正確な免疫化スケジュールは次の通り。0日目、免疫化+Ribi。3日目、免疫化+Ribi。7日目、免疫化+Ribi。24日目、免疫化−Ribi。29日目、免疫化−Ribi。32日目、免疫化−Ribi。36日目、免疫化−Ribi。44日目、免疫化−Ribi。51日目、免疫化−Ribi。69日目、抗体価検査のため出血。71日目、免疫化+Ribi。74日目、免疫化+Ribi。81日目、免疫化+Ribi。91日目、融合前の追加免疫(Ribi無し)。104日目、融合のため結節を収集。
69日目に、各免疫化動物の尾から一滴の血液を抜き、FACS分析を用いて免疫化に用いた細胞株に対する抗体の力価を検査した。力価が少なくとも1:2000に達すると、COを用いてマウスを犠牲にし、続いて頚椎脱臼した。ハイブリドーマ調製のためにリンパ節を収集した。
マウス由来のリンパ球を、35%ポリエチレングリコール4000を用いてマウス骨髄腫株X63−Ag8.653と融合した。融合後10日目に、ハイブリドーマ上清を、蛍光活性化セルソーター(FACS)で免疫細胞特異的モノクローナル抗体の存在についてスクリーニングした。各ハイブリドーマ由来の馴化培地を、ヒト胎児腎細胞の一定分量で30分間インキュベートした。インキュベーションの後、細胞サンプルを洗浄し、0.1ml希釈液に再懸濁し、4℃にて30分間、ヤギ抗マウスIgGのFITCコンジュゲートF(ab’)2断片1μg/mlとともにインキュベートした。細胞を洗浄し、0.2ml FACS希釈液に再懸濁し、FACScan細胞分析装置(Becton Dickinson;San Jose,CA)を用いて分析した。ハイブリドーマクローンを、FACSによる、ヒト胎児腎細胞の表面との結合に基づいて、さらなる増殖、クローニング、および特性決定用に選択した。Ag−SPL1と名付けられた抗原と、その抗原上のAg−SPL1.1と名付けられたエピトープを結び付ける、mu−SPL1と名付けられたモノクローナル抗体を作るハイブリドーマを選択した。Ag−LUCA19と名付けられた抗原と、その抗原上のAg−LUCA19.1と名付けられたエピトープとを結び付ける、mu−LUCA19と名付けられたモノクローナル抗体を作るハイブリドーマを選択した。Ag−LUCA40と名付けられた抗原と、その抗原上のAg−LUCA40.1と名付けられたエピトープとを結び付ける、mu−LUCA40と名付けられたモノクローナル抗体を作るハイブリドーマを選択した。Ag−SG5と名付けられた抗原と、その抗原上のAg−SG5.1と名付けられたエピトープとを結び付ける、mu−SG5と名付けられたモノクローナル抗体を作るハイブリドーマを選択した。モノクローナル抗体、mu−SPL−1、mu−LUCA19、mu−LUCA40およびmu−SG5を産生するハイブリドーマを、モノクローナル抗体の増殖および抗体精製を支持することのできる培地中でモノクローナル抗体精製のために拡大培養した。
実施例3.抗EphA2抗体の精製
ヒト癌細胞、例えば、限定されないが、SKMES−1、786−O、およびColo205細胞株を、10.0mM EDTAの存在下、組織培養フラスコから分離し、1400rpmで5分間遠心分離し、1% BSAおよび2mM EDTAを含むPBS(FACS希釈液)に再懸濁した。細胞を計数し、10細胞/mlに調整した。約0.1mlの細胞を、100μl FACS希釈液とともに37℃にて30分間インキュベートした。タンパク質Gアフィニティークロマトグラフィーを用いてヒト癌細胞株と結合するモノクローナル抗体を組織培養上清から精製した。必要であれば、過剰なウシIgGを除去するために、抗体精製の前に組織培養上清をウシIgGカラムに通してもよい。次の物質が抗体精製プロセスに用いられた:ハイブリドーマ組織培養上清、Immunopure(G)IgG結合バッファー(Pierce #21011 Rockford,IL)、Immunopure IgG溶出バッファー(Pierce #21009)、濃HCl(pH調節用)、Corning 1リットルPES(ポリエーテルスルホン)、0.22μmフィルター(Corning #431098,Corning,NY)、Amersham Pharmacia AKTA Explorer System(Amersham Biosciences,Piscataway,NJ)、Protein−G Sepharose 4 Fast Flow(Amersham Biosciences #17−0618−03)、3M チオシアン酸カリウム/50mM Tris pH7.8で構成されるストリッピングバッファー、およびPBS(リン酸緩衝生理食塩水)、3M Tris pH9.0。
マウス抗ヒトSPL1、マウス抗ヒトLUCA19およびマウス抗ヒトLUCA40抗体(本明細書において、それぞれmu−SPL1、mu−LUCA19およびmu−LUCA40と呼ばれる)を精製するため、上清の量を測定し、等量の結合バッファーを上清に加えた。混合物を室温と平衡になるまで放置した。0.22μmフィルターに通して上清を浄化した。AKTA Explorer system(Amersham Biosciences)を用いて上清をプロテインGセファロースカラムに付加した後、5〜10カラム量の結合バッファーで洗浄した。モノクローナル抗体を溶出バッファーで溶出し、画分を回収した。溶出時に3M Tris、pH 9.0を添加して画分を中和してチューブを空にした(画分の1/60量)。モノクローナル抗体を含むピーク画分をプールした。プールしたサンプルを予め湿らせたスライドAライザー・カセット(分子量カットオフ10,000;Pierce #66810)に注入し、1×PBS中で4℃にて透析した(3回のバッファー交換(1回の交換につき少なくとも4時間の透析)を含む)。精製されたモノクローナル抗体を滅菌濾過し(0.2μm Acrodisc)、2〜8℃で保存した。
精製された抗体のサンプルは、UV吸光度(A280)およびSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)による濃度決定のために取っておく。分子量の分析、モノクローナル抗体の典型的な結合パターンの同定および純度の評価のために、SDS−PAGEを非還元条件下および還元条件下の双方で行う。
ハイブリドーマ上清由来のmu−SPL1、mu−LUCA19およびmu−LUCA40モノクローナル抗体の精製後、対象の個々の免疫細胞または標的細胞との結合について再検査した。細胞サンプルを上記のように調製し、様々な濃度の精製抗体とともにインキュベートした。インキュベーションの後、細胞を洗浄し、0.1ml希釈液に再懸濁し、ヤギ抗マウスIgGのFITCコンジュゲートF(ab)’2断片1μgとともに4℃にて30分間インキュベートした。細胞を洗浄し、0.5ml FACS希釈液に再懸濁し、FACScanセルソーター(Becton Dickinson,San Jose,CA)を用いて分析した。FACScanヒストグラムの右へのシフトにより、精製抗体がまだ細胞と結合していることが示された。
別の実験では、mu−SPL1、mu−LUCA19およびmu−LUCA40抗体と、それぞれSPL1、LUCA19およびLUCA40との結合を試験し、生細胞ELISAを用いて確認した。次の方法が用いられたが、当分野で一般に知られているその他の方法も適用できる。細胞(HT−29、SKOV3、SKMES−1、SW480、SKBR−3、およびHPAFII)を、組織培養処理した96ウェルプレート(Falcon)上で培地を含む10%ウシ胎児血清(FBS)中でコンフルエントに達するまで増殖した。細胞をPBSで洗浄した後、1%BSAおよび0.1%アジ化ナトリウムを含有するハンクス平衡塩(HBSS)中、所望の濃度の所望の抗体50μlとともに室温にて1時間インキュベートした。次に、細胞をウェルあたり100μlのHBSSで3回洗浄した後、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)二次抗体(HBSSに希釈、ウェルあたり50μl)とともに室温にて30分間インキュベーションした。細胞を最後にHBSSで3回洗浄し、変色基質(TMB基質、KPL)をウェルあたり100μlで各ウェルに添加した。ウェルあたり100μlの1M リン酸を添加して変色反応を停止させた。次に、プレートをO.D.450nmで読み取った。
実施例4.癌細胞株SW480でのSPL1、LUCA19およびLUCA40発現のウエスタンブロット解析
腎細胞癌細胞株SW480(ATCC# CCL−228)を175cm培養皿でコンフルエントに達するまで増殖させた。コンフルエントな単層をハンクス平衡塩(重炭酸ナトリウムまたはフェノールレッドを含まないHBSS+;10mM HEPES、pH7.4;Sigma Chemicalsで緩衝)で3回洗浄し、200μgのスルホ−NHS−LC−ビオチン(Pierce Endogen)で室温にて30分間ビオチン化した。次に、細胞を0.1M Trisを含むHBSS+、pH7.4(Sigma Chemicals)で洗浄し、0.1M Trisを含むHBSS+、pH7.4中で室温にて15分間インキュベートした。細胞を最後にHBSS+で3回洗浄し、氷上で、溶解バッファー(2% Triton X−100、2mM PMSF、0.1%アジ化ナトリウム、および溶解バッファー5mlあたり1錠のEDTAフリー、コンプリート・ミニ−プロテアーゼカクテル(Roche Molecular Biochemicals)を含むHBSS+)中、5分間のインキュベーションにより溶解した。
細胞を溶解バッファー中でこすり、ライセートを回収した。ライセートを14,000−×gで1時間4℃にて遠心分離した。次に、浄化したライセートを4℃にて2時間、5μlのヒトIgGコンジュゲート(1mg/ml)CNBr 4MB セファロースビーズ(Amersham Pharmacia)で事前に洗浄した。ヒトIgGビーズを遠心分離して除去した後、事前に洗浄したライセートを、次にCNBr 4MB セファロースビーズと結合したモノクローナル抗体(1mg/mlで結合)mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40とともに4℃にて2時間インキュベートした。2時間のインキュベーションの後、mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40ビーズを遠心分離して取り除いた。ヒトIgGおよびmu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40ビーズの双方を個別に1mlの溶解バッファーで3回洗浄した後、1ml HBSS+で3回洗浄した。30μlのSDS−PAGEサンプルバッファーの添加および99℃にて5分間の沸騰により、洗浄したビーズを溶出した。
次に、サンプルを4〜20% Novex勾配ゲル(Invitrogen)上で分離し、0.2μmニトロセルロース膜(Invitrogen)に移し、セイヨウワサビペルオキシダーゼ(HRP)コンジュゲートストレプトアビジン(Pierce Endogen)により視覚化するか、または5μg/ブロットのmu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5もしくはmu−LUCA40でウエスタンブロットを行った。
HRPコンジュゲートストレプトアビジンを用いる検出のため、ニトロセルロースを最初にブロッキングバッファー(0.05% Tween−20(TBST)を含むTris緩衝生理食塩水中5%の脱脂粉乳)で1時間ブロッキングした。HRPコンジュゲートストレプトアビジンをTBST中に1μg/mlで希釈し、室温にて30分間ニトロセルロースに曝露した。ECL+(Amersham)で視覚化する前にニトロセルロースをTBST中で3回洗浄した。
mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40でのウエスタンブロッティングのため、ニトロセルロースを同様にブロッキングバッファー中で1時間ブロッキングした。次に、ブロッキングバッファーに希釈した5μg/mlのmu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40の1mlを含有する熱封着したプラスチックポーチ中でニトロセルロースをインキュベートした。ニトロセルロースを、10mlの1μg/ml HRPコンジュゲートロバ抗マウスIgG(重鎖および軽鎖特異的、ウシ、ニワトリ、ヤギ、モルモット、シリアンハムスター、ウマ、ヒト、ウサギ、ヒツジ血清タンパク質に対して交差吸収済;Jackson Immunoresearch カタログ番号709−035−149)とともに室温にて1時間のインキュベーションの前に、TBSTで3回洗浄した。ニトロセルロースを最後にTBSTで3回洗浄し、ECL+(Amersham)で視覚化した。
実施例5.免疫組織化学法
癌患者由来の凍結した組織サンプルをOCT化合物中に包埋し、ドライアイスを用いてイソペンタン中で急速冷凍した。凍結切片を、ライカ3050CMミクロトームを用いて厚さ8〜10μmに切り、SuperFrost Plusスライド(VWR #48311−703)に解凍マウントした。切片を75%アセトン/25%エタノールで10℃にて固定し、室温にて2〜4時間風乾させた。固定した切片を使用するまで−80℃で保存した。
免疫組織化学のため、組織切片を回収し、Tris緩衝0.05%Tween(TB−T)中で洗浄し、室温にて30分間、ブロッキングバッファー(TB−T、5%正常ヤギ血清および100μg/mlアビジン)中でブロッキングした。次に、スライドをmu−LUCA19、mu−LUCA40、mu−SG5またはmu−SPL1、およびブロッキングバッファーに希釈した(1μg/ml)対照モノクローナル抗体とともに室温にて60〜90分間インキュベートした。次に、切片をブロッキングバッファーで3回洗浄した。結合したモノクローナル抗体を、0.1M酢酸ナトリウムバッファー中のヤギ抗マウスIgG+IgM(H+L)F(ab’)−ペルオキシダーゼコンジュゲートおよびペルオキシダーゼ基質ジアミノベンジジン(1mg/ml、Sigma カタログ番号D5637)pH5.05、ならびに0.003%過酸化水素(Sigma カタログ番号H1009)で検出した。染色したスライドをヘマトキシリンで対比染色し、ニコン顕微鏡で検査した。
いくつかの場合、ホルムアルデヒドで固定されたパラフィン包埋組織を、適当な抗原回収手法を用いた後に免疫組織化学に用いることができる。そのような抗原回収手法の1つがManghamおよびIsaacson,Histopathology 35:129−33(1999)に記載されている。抗原回収および/または検出のその他の方法も当業者により用いられ得る。凍結組織、または、適切な場合には、固定組織を用いて行われる抗原回収およびpolyMICA検出と類似の実験の結果が行われた。抗LUCA19、抗LUCA40および抗SPL1抗体と種々の正常組織および癌組織との結合を評価した。全ての場合において、対照固定組織での抗体結合を、凍結組織のものと相関させた。凍結組織の結果は対照中の2つが一致しなかった場合にのみ用いた。
便宜上、異なる供給源由来の凍結手術組織を用いるいくつかの実験の総合結果の概要を下表1〜7に示す。表1〜4は、正常ヒト組織上でのLUCA19、LUCA40、SPL1、およびSG5抗原の分布をまとめる。表5〜7は、様々なヒト腫瘍組織上でのLUCA19、LUCA40およびSPL1抗原の分布をまとめる。
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実施例6.免疫細胞化学結果
モノクローナル抗体mu−LUCA19、mu−LUCA40およびmu−SPL1を用いて異なる組織種由来の様々な細胞株との反応を試験した。弱い陽性染色を「+」、中程度の陽性染色を「++」、強い陽性染色を「+++」および陰性の染色を「−」として結果を記録した。
免疫組織化学結果は、WO01/43869号に記載のCellArray(商標)技術を用いて得た。確立された異なる細胞株由来の細胞を、プロテアーゼを用いずに増殖表面から取り出し、パックしてOCT化合物中に包埋した。細胞を凍結し切片を作製した後、標準的なIHCプロトコールを用いて染色した。
mu−LUCA19、mu−LUCA40およびmu−SPL1抗体と様々な確立されたヒト正常細胞株および腫瘍細胞株との結合の結果を、便宜上、表8〜10にまとめる。表8に表される実験には、本明細書に記載される方法を用いるmu−LUCA19での生細胞ELISA、Sarcoma ArrayおよびCellArray(商標)結合実験が含まれる。表9に表される実験には、本明細書に記載される方法を用いるmu−LUCA40での生細胞ELISA、Sarcoma ArrayおよびCellArray(商標)結合実験が含まれる。表10に表される実験には、本明細書に記載される方法を用いるmu−SPL1での生細胞ELISA、Sarcoma ArrayおよびCellArray(商標)結合実験が含まれる。
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本明細書に記載される方法を用いる、mu−LUCA19、mu−LUCA40およびmu−SPL1抗体と、米国国立癌研究所(NCI)の確立された様々な腫瘍細胞株との結合の結果を、便宜上、表11にまとめる。
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モノクローナル抗体mu−LUCA19、mu−LUCA40およびmu−SPL1を用いて神経膠腫由来細胞株での反応性を試験した。免疫細胞化学結果は、CellArray(商標)技術に関する上記と同様のプロトコールを用いて得た。神経膠腫由来細胞株を、プロテアーゼを用いずに増殖表面から取り出し、パックしてOCT化合物中に包埋した。細胞を凍結し切片を作製した後、標準的なIHCプロトコールを用いて染色した。mu−LUCA19はスクリーニングした25の神経膠腫由来細胞株のうち17で陽性であった。染色強度の範囲は+/−から3+染色であった。Mu−LUCA40はスクリーニングした25の神経膠腫由来細胞株のうち18で陽性であった。染色強度の範囲は+/−から3+染色であった。mu−SPL−1はスクリーニングした25の神経膠腫由来細胞株のうち14で陽性であった。染色強度の範囲は+/−から3+染色であった。
実施例7.抗原Ag−SPL1、Ag−LUCA19、Ag−SG5およびAg−LUCA40の単離および特性決定
SPL1、LUCA19、SG5およびLUCA40が反応性である抗原を同定するため、免疫沈降(Ippt)実験を行った。免疫沈降のために、175cmフラスコ30個のSW480細胞を30mlの溶解バッファーで溶解した。溶解バッファーは、2% Triton X−100、プロテアーゼ阻害剤カクテル(溶解バッファー5mlあたり1錠のRoche Molecular Biochemicals製コンプリート・ミニ、EDTAフリー、プロテアーゼカクテル)、0.1%アジ化ナトリウム、および2mM PMSFで強化されたHanks緩衝塩溶液(HBSS+)で構成された。細胞ライセートを4℃にて30分間24,000×gで浄化した後、1mlのタンパク質G(Amersham Pharmacia)からなるカラムに通した。次に、事前に洗浄したSW480ライセートを、mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40に吸収させたタンパク質G(10μgのmu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40を5μlのタンパク質Gとともに室温にて30分間プレインキュベートした)とともに4℃にて2時間インキュベートした。次に、ビーズ(事前に洗浄したタンパク質Gビーズとタンパク質Gを吸収したmu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40ビーズの双方)を溶解バッファーで3回洗浄し、30μlのSDSサンプルバッファー(3% SDS、20%グリセロール、10mM DTT、2% ブロモフェノールブルー、0.1M Tris、pH8.0)で溶出した。次に、25μlの溶出液をSDS−PAGEで分離し、クーマシー染色により視覚化した。5μlの溶出液をSDS−PAGEで分離し、さらにウエスタンブロッティングのためにニトロセルロースに移した。
次に、ブロットをmu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40でプローブし、ウエスタンブロッティングキット(Invitrogen カタログ番号WB7103)を用いて発色させて抗原認識を確認した。mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40、および、mu−SPL1、mu−LUCA19 mu−SG5もしくはmu−LUCA40に対するマウスIgG溶出液をウエスタンブロット解析することより、mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40溶出液に特有のタンパク質が観察された。染色したタンパク質のバンドを清潔な外科用メスの刃を用いてNuPAGEゲルから切り出し、清潔なエッペンドルフチューブに入れた。切り出したバンドは、質量分析によるタンパク質同定に使用するまで−20℃で保存した。
実施例8.mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40と結合する抗原のタンデム質量分析(MSlMS)を用いる特性決定
Mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5およびmu−LUCA40と結合する抗原を実施例7に記載されるように単離し、Kaneら、J Bio Chem.2002 June 21;277(25):22115−8、Epub May 06の方法に従ってタンデム質量分析に付した。タンパク質をSDS−PAGEで分離し、ゲルをコロイド状のクーマシーブルー試薬(Invitrogen)で染色する。対象のタンパク質をゲル中でトリプシン消化させる。トリプシンペプチドを、Wuら、Nature 405:477−482(2000)に記載されるように、イオントラップ質量分析計(Thermo−Finnigan LCDQ DECA XP)でマイクロキャピラリー液体クロマトグラフィーMS/MSにより配列決定する。
あるいは、一般に知られているその他の質量分析の方法、例えばMALDI質量分析も本発明の実践に用いられる。質量分析法による分析の結果は、mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5およびmu−LUCA40と結合する抗原がEphA2であることを示した。
実施例9.mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5およびmu−LUCA40のエピトープマッピングのためのサンドイッチELISA
mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5およびmu−LUCA40と結合するEphA2上の特異的なエピトープを、競合サンドイッチELISAを用いて評価した。50μl/ウェルの10μg/ml濃度のmu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5またはmu−LUCA40をHBSS(重炭酸ナトリウムおよびフェノールレッドを含まないハンクス平衡塩)に希釈し、室温にて2時間放置して96ウェルMaxisorbマイクロタイタープレートと結合させた。次に、コーティングされたプレートを、1% BSA(W/V)を含有するHBSSで30分間ブロッキングした。HT−29細胞を実施例7に記載されるように溶解させた。次に、ブロッキングしたマイクロタイターウェルに、ライセートをウェルあたり150μlの量で適用する。ライセートを室温にて1時間置いてインキュベートさせる。インキュベーション後、プレートを次にブロッキングバッファーで完全に洗浄する。ビオチン化したmu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5およびmu−LUCA40(濃度50μl/ウェル、1μg/ml)をマイクロタイターウェルに添加し、室温にて1時間置いてインキュベートさせる。ビオチン化したmu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5およびmu−LUCA40は、精製抗体1mgにつき1μlのDMSOに希釈した200mg/mlスルホ−NHS−LC−ビオチンを室温にて2時間インキュベートすることにより調製した。次に、終濃度0.1M Tris、pH7.4で室温にて30分間ビオチン化抗体をクエンチする。次にビオチン化した抗体を分子量30kDaのカットオフフィルターに通して濃縮することにより遊離ビオチンから分離する。ビオチン化抗体を1時間インキュベートした後、プレートをHBSSで完全に洗浄する。西洋ワサビペルオキシダーゼ結合ストレプトアビジン(SA−HRP)をHBSSに濃度1:10,000にて希釈する。希釈したSA−HRPを洗浄したマイクロタイターウェルに50μl/ウェルで加え、室温にて30分間インキュベートさせる。SA−HRPのインキュベーションの後、プレートを最後にHBSSで完全に洗浄し、色変化反応用の1−Step TMB基質100μl/ウェルを添加して発色させる。発色は、ミリQ水に希釈した1Mリン酸100μl/ウェルを添加して停止させる。次に、ThermoMaxマイクロタイタープレートリーダーを用いて発色したプレートを450nmで分析する。
競合サンドイッチELISAの結果から、本発明者らは、mu−SPL1、mu−LUCA19、mu−SG5およびmu−LUCA40が、1つはmu−LUCA40に表され、2つ目はmu−SPL1に表される、2つの個別のエピトープを介してEphA2と結合している3つの抗体を表すことを結論付けることができる。mu−LUCA19は共有していると思われるが、mu−SPL1に表されるエピトープと直接オーバーラップすることはない。このオーバーラップはmu−LUCA40エピトープに表されるエピトープに及ぶことはない。
実施例10.mu−LUCA19およびmu−SG5のさらなる特性決定
内因性のEphA2を発現する神経膠腫細胞株であるG55細胞におけるEphA2の刺激をmu−LUCA19およびmu−SG5を用いて調査した。細胞を30μg/mlまでの漸増濃度のmu−LUCA19かまたはmu−SG5で処理し、免疫沈降したEphA2のホスホチロシン含量を、ホスホチロシン特異的抗体(4G10、Upstate Cell Signaling Solutions,New York)を用いてウエスタンブロット解析により測定した。mu−LUCA19かまたはmu−SG5のいずれかで処理したG55細胞から免疫沈降したEphA2中のホスホチロシン含量には差は見られなかった。全EphA2含量の対照ウエスタンブロットを行って、各々の処理条件について免疫沈降した全EphA2タンパク質が同一であることを確認した。A549細胞およびmu−LUCA19およびmu−SG5抗体を用いて類似の結果が見られた。これらの結果は、内因性EphA2を発現している細胞をmu−LUCA19かまたはmu−SG5のいずれかで処理してもEphA2のホスホチロシン含量を増加も減少もさせないことを示す。
実施例11.癌細胞株でのmu−SPL1、mu−LUCA19およびmu−LUCA40の効果
抗体が、単層としてインビトロで増殖された場合に細胞数を減少させる能力は、様々な量の試験抗体または対照精製抗体の存在下または不在下で増殖された細胞単層を用いて評価することができ、細胞数の変化はMTTを用いて評価することができる。MTTは、ミトコンドリア酵素の活性を測定し、相対生存細胞数を相互に関連付ける染料である。目的の細胞を96ウェルプレート中の10%ウシ胎児血清を補給したF12/DMEM(1:1)成長培地に蒔いて増殖させた。細胞株を、濃度範囲1500〜2500細胞/ウェルで96ウェル皿のウェルに3つ組で蒔いた。播種した直後に、mu−SPL1、mu−LUCA19またはmu−LUCA40を添加した。細胞を5% CO/空気にて5日間、加湿インキュベーター中で37℃にてインキュベートした。アッセイの終わりに、MTTをPBS(5mg/ml)に溶かし、直接ウェルに1:10希釈で添加した。プレートをインキュベーター内に戻して4時間置いた。インキュベーションの後、培地を除去し、100μl DMSOを添加してMTTの沈殿を可溶化した。プレートをO.D.540nmで読み取った。これらの実験において、mu−LUCA40は786−O、A549、Caki−2、ES−2、SKMES−1、およびSKOV3細胞株の増殖を阻害し、SPL1およびLUCA19の増殖は阻害しなかった。
実施例12.mu−LUCA19、mu−SG5およびmu−LUCA40ならびに毒素とコンジュゲートした抗マウスIgGの内部移行
Mab−ZAP(Advanced Targeting Systems,San Diego,CA)は、タンパク質合成を阻害する毒素であるサポリンにコンジュゲートした抗マウスIgGである。この毒素は細胞膜に対して不透過性である。モノクローナル抗体が内部移行可能な細胞表面抗原と結合していると、毒素コンジュゲートは結合しているモノクローナルと結合することができ、それにより、細胞の内部に取り込まれることができ、最終的に細胞を死滅させることができる。毒性作用の実証は内部移行に依存しているため、Mab−ZAPは、細胞毒性効果を表するために内部移行に依存している任意の毒素の適した標的として所定の表面抗原が役立つかどうかを評価するために役立ち得る。そのようなものとして、Mab−ZAPはそのような内部移行に依存する毒素、例えばメイタンシノイドおよびカリチアマイシンのモデルとして役立つ。
腫瘍細胞によるmu−LUCA19およびmu−LUCA40およびサポリンとコンジュゲートした抗マウスIgGの内部移行、およびサポリンの内部移行後の腫瘍細胞の死滅効果を試験するため、ヒト神経膠腫細胞G130を、10mM EDTAを用いて保存フラスコから取り出し、遠心分離した。適当な媒質中で細胞を50,000/mlで再懸濁し、ウェルあたり100μlを96ウェルプレートに蒔いた。抗体mu−SPL1、mu−LUCA19またはmu−LUCA40を10倍濃縮物として直ちに適当なウェルに添加して、終濃度を10ug/mlとした。15分後、室温にてMab−ZAP(カタログ番号IT−04、Advanced Targeting Systems,San Diego CA)を適当なウェルに10倍濃縮物として添加して、終濃度0.001nM〜10nMとした。増殖4日後、MTTを37℃にて4時間添加した(保存5mg/ml PBS、ウェル中1:10希釈)。次に、全てのウェルから培地を除去し、100μl/ウェルのDMSOを添加した。プレートを穏やかにかき混ぜて青色のMTT沈殿物を可溶化し、プレートをO.D.540nmで読み取った。
mu−LUCA19およびmu−LUCA40の存在下でのG130細胞でのMTT染色には、それらの抗体の不在下での染色と比較して低下が見られた。このことは、G130細胞の増殖がmu−LUCA19およびmu−LUCA40およびMab−ZAPの存在下で阻害されたことを示し、これらの結果はmu−LUCA19およびmu−LUCA40ならびに毒素とコンジュゲートした抗マウスIgGがG130細胞の内部に取り込まれたことを示している。ES−2細胞、卵巣癌細胞株、およびmu−SG5抗体を用いて、類似の結果が見られた。mu−SG5の存在下でのES−2細胞でのMTT染色には、この抗体の不在下での染色と比較して低下が見られた。このことは、ES−2細胞の増殖がmu−SG5およびMab−ZAPの存在下で阻害されたことを示す。この結果はmu−SG5ならびに毒素とコンジュゲートした抗マウスIgGがES−2細胞の内部に取り込まれたことを示している。
実施例13.ヌードマウスにおけるヒト細胞と抗EphA2抗体SPL1およびLUCA40の有効性
ヒト腫瘍細胞をヌード(nu/nu)マウスの腎被膜下に移植した。3つの腫瘍細胞株を用いた。ES−2およびSKOV3−3卵巣腫瘍由来細胞株、およびCaki−2腎腫瘍由来細胞株をATCCから入手した。一部の研究では、両方の腎臓に異種移植を行った。処置動物には、移植は腎被膜に行った(コラーゲンゲル中500K細胞)。抗EphA2モノクローナル抗体SPL1またはLUCA40を濃度50mg/kgおよび0.01mL/体重gの量で腹膜内に注射した。移植後2日目に投薬を開始し、SPL1、LUCA40またはPBSの用量を単回の急速注射として週に3回投与した。対照マウスにはPBSのみを注射した。最後の注射から3日後、動物を安楽死させ、移植片を含む腎臓を調べた。
腫瘍におけるヒトDNAの量を、公開されている方法に従って、Applied Biosystems(Foster City,CA)SDS7000システムでヒトリボソーム遺伝子RPL19に特異的なプライマーおよびプローブを用いるリアルタイムPCRを用いて定量化した。各腫瘍サンプルを3通りのPCR反応で解析し、平均DNA濃度を測定した。平均DNA濃度および標準誤差を腫瘍サンプルの各群について測定した。スチューデントT検定を用いて統計的有意性を判定した(両側、1型)。腫瘍増殖阻害を[(処置群の平均腫瘍容積/PBS対照群の平均腫瘍容積)×100]−100の絶対値として計算した。
示されていないデータでは、Caki−2およびES−2細胞株を用いる、対照と比較して腫瘍サイズを低減させるための目視および手検査にSPL1が現れた。Caki−2腫瘍を移植したLUCA40処置マウスで類似の結果が見られた。LUCA40抗体で処置したマウスのCaki−2腫瘍のDNA定量化により、LUCA40処置マウスが対照と比べて小さな腫瘍を有していたことを確認した。表12は、SPL1抗体でのその他の腎被膜下異種移植調査デザイン、およびこれらの研究によりもたらされるDNA定量化を示す。
Figure 0005342145
TGI=PBS対照群に対する腫瘍増殖阻害;p値は対のないスチューデントT検定により決定した。
実施例14.ヒト卵巣腫瘍皮下モデルにおけるSPL1の抗腫瘍効力
この調査は、卵巣癌および肺癌の皮下モデルにおけるSPL1抗体の用量反応性抗腫瘍データを試験するようデザインされた。
ES−2卵巣腫瘍由来細胞株を、試験的な皮下腫瘍モデル調査において同定された急速に増殖する腫瘍から再び得た。A549肺腫瘍由来細胞は、ATCCから得た。培養した細胞をトリプシン処理し、培地中で洗浄し、遠沈し、培地1ミリリットルにつき細胞1億個を培地に再懸濁し(容量0.05mLにつき細胞500万個)、その後、最終の注射量0.1mLのために等量のMatrigel(登録商標)中で混合した。雌CRL.nu/nuホモ接合体マウスを用いた。マウスの首の後部への皮下注射により細胞を接種した。移植の当日か、または腫瘍が定着して測定可能になった日のいずれかから投薬を開始した。投薬0日目のため、午前中に腫瘍を移植し、同日の午後に動物に投薬した。定着腫瘍に対して、動物を次のような群に無作為化した:腫瘍容積を測定し、動物を腫瘍容積に従って分類し、平均値を測定して、適当な数の平均値前後の動物(モデルに応じて1つの群につき12〜15匹)を選択し、小さな腫瘍または大きな腫瘍をもつ動物を調査から取り除いた。残りの動物を耳のタグ番号で治療群および対照群へ無作為化した。最後の群のランダム分布をT検定により確認した(p>0.1を無作為化されたとみなした)。
各処置用量群に対して、SPL1を適当な濃度用量でPBS(ES2細胞の調査に対して50mg/kg、ならびにA549細胞の調査に対して10mg/kg、30mg/kgおよび100mg/kgの濃度範囲)およびPBS対照に希釈し、0.01mL/体重gの量を投与した。SPL1またはPBSの用量は週に2回腹腔への単回急速注射として投与した。対照マウスにはPBSのみを注射した。調査に依って、12〜15匹のマウスの群で腫瘍が適当な大きさに達した時に投薬を開始した。
最初の腫瘍測定に先立ち、およそ6日間腫瘍を増殖させた。その後に3次元のデジタルノギスで腫瘍を週に2回測定し、3回の測定値の積の2分の1として腫瘍容積を計算した。経時的な腫瘍容積が全ての調査の主要エンドポイントであった。臨床観察は毎日行った。週に2回各動物の体重を測定した。
平均腫瘍容積および標準誤差を測定ごとに各群に対して決定した。スチューデントT検定(両側、1型)を用いて統計的優位性を判定した。腫瘍増殖阻害を、[(処置群の平均腫瘍容積/PBS対照群の平均腫瘍容積)×100]−100の絶対値として計算した。表13は皮下異種移植調査デザインおよび結果を示す。
Figure 0005342145
TGI=PBS対照群に対する腫瘍増殖阻害
図1に示すように、SPL1処置A549腫瘍異種移植片のサブセットは、投薬の停止後に徐々に再び増殖したことが見出された(腫瘍の再増殖は投薬の停止後に2倍またはそれ以上の量での増大と定義する)。100mg/kg治療群の16匹のマウスのうち7匹には腫瘍の再増殖が見られたが、100mg/kg治療群の16匹のマウスのうち9匹は投薬の停止後も腫瘍のないままであった。同様に、30mg/kg治療群の15匹のマウスのうち3匹に腫瘍の再増殖が見られたが、30mg/kg治療群の15匹のマウスのうち12匹は投薬の停止後も腫瘍のないままであった。図1にグラフで示した、「投薬停止」後の時点での結果は、腫瘍の再増殖したマウスの腫瘍サイズのみが表されている。
当然のことながら、本明細書に記載される実施例および実施形態は説明目的のためであって、それを踏まえた種々の改変または変更が当業者に示唆されるが、それも本願の精神および範囲内に含まれる。本明細書に引用した全ての刊行物、特許および特許出願は、あらゆる目的において、各個別の刊行物、特許または特許出願が具体的に、かつ個別に、参照により本明細書に組み込まれることを示すのと同一程度に、参照によりその全文が本明細書に組み込まれる。
SPL1で皮下処理したA549腫瘍異種移植片およびそれらの投薬の停止後の緩慢な再増殖の結果を示す。

Claims (27)

  1. EphA2に結合する単離された抗体、またはその抗原結合断片であって、
    前記抗体または前記断片は、
    (A) ATCC番号PTA−5070を有する宿主細胞によって、または
    (B) 前記宿主細胞の後代によって
    産生され、
    ATCC番号PTA−5070を有する細胞株によって産生された抗体LUCA19の結合特異性を保持している単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  2. 前記単離された抗体はヒト化抗体である、請求項1に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  3. 前記単離された抗体は、ATCC番号PTA−5070を有する細胞株によって産生された抗体LUCA19の、重鎖および軽鎖可変領域由来の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含むキメラ抗体である、請求項1に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  4. 前記キメラ抗体は、ヒト抗体由来の重鎖定常領域および軽鎖定常領域を含む、請求項3に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  5. 前記単離された抗体が、治療薬に結合されている、請求項1〜4のいずれか1項に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  6. 前記抗原結合断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、およびFvからなる群より選択される、請求項1〜5のいずれか1項に記載の単離された抗体の抗原結合断片。
  7. EphA2に結合する単離された抗体、またはその抗原結合断片であって、
    前記抗体または前記断片は、
    (A) ATCC番号PTA−6059を有する宿主細胞によって、または
    (B) 前記宿主細胞の後代によって
    産生され、
    ATCC番号PTA−6059を有する細胞株によって産生された抗体SPL1の結合特異性を保持している単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  8. 前記単離された抗体はヒト化抗体である、請求項7に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  9. 前記単離された抗体は、ATCC番号PTA−6059を有する細胞株によって産生された抗体SPL1の、重鎖および軽鎖可変領域由来の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含むキメラ抗体である、請求項7に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  10. 前記キメラ抗体は、ヒト抗体由来の重鎖定常領域および軽鎖定常領域を含む、請求項9に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  11. 前記単離された抗体が、治療薬に結合されている、請求項7〜10のいずれか1項に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  12. 前記抗原結合断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、およびFvからなる群より選択される、請求項7〜11のいずれか1項に記載の単離された抗体の抗原結合断片。
  13. EphA2に結合する単離された抗体、またはその抗原結合断片であって、
    前記抗体または前記断片は、
    (A) ATCC番号PTA−6056を有する宿主細胞によって、または
    (B) 前記宿主細胞の後代によって
    産生され、
    ATCC番号PTA−6056を有する細胞株によって産生された抗体LUCA40の結合特異性を保持している単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  14. 前記単離された抗体はヒト化抗体である、請求項13に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  15. 前記単離された抗体は、ATCC番号PTA−6056を有する細胞株によって産生された抗体LUCA40の、重鎖および軽鎖可変領域由来の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含むキメラ抗体である、請求項13に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  16. 前記キメラ抗体は、ヒト抗体由来の重鎖定常領域および軽鎖定常領域を含む、請求項15に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  17. 前記単離された抗体が、治療薬に結合されている、請求項13〜16のいずれか1項に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  18. 前記抗原結合断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、およびFvからなる群より選択される、請求項13〜17のいずれか1項に記載の単離された抗体の抗原結合断片。
  19. EphA2に結合する単離された抗体、またはその抗原結合断片であって、
    前記抗体または前記断片は、
    (A) ATCC番号PTA−7356を有する宿主細胞によって、または
    (B) 前記宿主細胞の後代によって
    産生され、
    ATCC番号PTA−7356を有する細胞株によって産生された抗体SG5の結合特異性を保持している単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  20. 前記単離された抗体はヒト化抗体である、請求項19に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  21. 前記単離された抗体は、ATCC番号PTA−7356を有する細胞株によって産生された抗体SG5の、重鎖および軽鎖可変領域由来の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含むキメラ抗体である、請求項19に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  22. 前記キメラ抗体は、ヒト抗体由来の重鎖定常領域および軽鎖定常領域を含む、請求項21に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  23. 前記単離された抗体が、治療薬に結合されている、請求項19〜22のいずれか1項に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片。
  24. 前記抗原結合断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、およびFvからなる群より選択される、請求項19〜23のいずれか1項に記載の単離された抗体の抗原結合断片
  25. 治療薬又は検出可能なマーカーとコンジュゲートさせた請求項1〜24のいずれか1項に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片の治療上有効な量を薬学的に受容可能な担体とともに含む医薬組成物。
  26. 請求項7〜18のいずれか1項に記載の単離された抗体、またはその抗原結合断片の治療上有効な量を薬学的に受容可能な担体とともに含む医薬組成物。
  27. 受託番号PTA−5070、PTA−6056、PTA−6059、またはPTA−7356を有する、American Type Culture Collectionに寄託されたハイブリドーマ。
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