JP4975031B2 - 薬物リン酸化酵素 - Google Patents
薬物リン酸化酵素 Download PDFInfo
- Publication number
- JP4975031B2 JP4975031B2 JP2008527798A JP2008527798A JP4975031B2 JP 4975031 B2 JP4975031 B2 JP 4975031B2 JP 2008527798 A JP2008527798 A JP 2008527798A JP 2008527798 A JP2008527798 A JP 2008527798A JP 4975031 B2 JP4975031 B2 JP 4975031B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- group
- methyl
- compound
- polypeptide
- amino
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 0 CC(*)(CO)N* Chemical compound CC(*)(CO)N* 0.000 description 2
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/48—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving transferase
- C12Q1/485—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving transferase involving kinase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
- C12N9/1205—Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1), e.g. protein kinases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P17/00—Preparation of heterocyclic carbon compounds with only O, N, S, Se or Te as ring hetero atoms
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2500/00—Screening for compounds of potential therapeutic value
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Description
(1)下記の工程1)乃至3)を含む、ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kによってリン酸化される物質のスクリーニング方法:
1)以下のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドと被験物質を接触させる工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)被験物質のリン酸エステルの生成量を測定する工程;
3)被験物質を上記a)乃至c)から選択されるポリペプチドと接触させない場合に測定された、被験物質のリン酸エステルの量と上記2)で測定されたリン酸エステルの生成量を比較する工程、
(2)下記の工程1)乃至4)を含む、ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kによってリン酸化される物質のスクリーニング方法:
1)以下のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドと被験物質を接触させる工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)被験物質のリン酸エステルの生成量を測定する工程;
3)被験物質を上記a)乃至c)から選択されるポリペプチドと接触させない場合に測定された、被験物質のリン酸エステルの量と上記2)で測定されたリン酸エステルの生成量を比較する工程;
4)被験物質を上記a)乃至c)から選択されるポリペプチドと接触させない場合に測定された、リン酸エステルの量と比較して、上記2)で測定されたリン酸エステルの量が多い場合に被験物質がリン酸化されたと判定する工程。
(3)下記の工程1)乃至3)を含む、免疫抑制活性を有する物質のスクリーニング方法:
1)以下のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドと被験物質を接触させる工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)被験物質のリン酸エステルの生成量を測定する工程;
3)被験物質を上記a)乃至c)から選択されるポリペプチドと接触させない場合に測定された、被験物質のリン酸エステルの量と上記2)で測定されたリン酸エステルの生成量を比較する工程、
(4)下記の工程1)乃至4)を含む、免疫抑制活性を有する物質のスクリーニング方法:
1)以下のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドと被験物質を接触させる工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)被験物質のリン酸エステルの生成量を測定する工程;
3)被験物質を上記a)乃至c)から選択されるポリペプチドと接触させない場合に測定された、被験物質のリン酸エステルの量と上記2)で測定されたリン酸エステルの生成量を比較する工程。
4)被験物質を上記a)乃至c)から選択されるポリペプチドと接触させない場合に測定された、リン酸エステルの量と比較して、上記2)で測定されたリン酸エステルの量が多い場合に被験物質が免疫抑制活性を有すると判定する工程、
(5)被験物質が、下記一般式(I)(式中、R1及びR2は、水素原子である。R3は、C1−C6アルキル基又はヒドロキシメチル基である。R4は、水素原子、ハロゲン原子又はC1−C6アルキル基である。R5は、水素原子、ハロゲン原子、シアノ基、C1−C6アルキル基、C1−C6アルコキシ基、C3−C6シクロアルキル基、ハロゲノC1−C6アルキル基、フェニル基及びベンジルオキシ基からなる群より選択される基で1乃至3個置換されたフェニル基、ハロゲン原子又は水素原子であり、Xは、ビニレン基(CH=CH基)、酸素原子、硫黄原子又はメチルアミノ基である。Yは、単結合、酸素原子、硫黄原子又はカルボニル基である。Zは、単結合又はC1−C8アルキレン基である。nは、2又は3である。)で表される化合物であることを特徴とする、(1)乃至(4)のいずれか1項に記載のスクリーニング方法、
1)一般式(I)を有する化合物と以下のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドとを接触させる工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)1)における反応溶液から一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを取得する工程、
(7)下記の工程1)乃至3)を含む、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを生成する能力を判定する方法
1)被験者より採取した検体より全RNAを抽出する工程;
2)全RNAにおける、下記のa)乃至c)からなる群から選択されるポリヌクレオチドの発現量を測定する工程;
a) 配列表の配列番号1のヌクレオチド番号6乃至935に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
b)配列表の配列番号3のヌクレオチド番号27から956に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
c)上記a)又はb)に記載のヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
3)2)で測定されたポリヌクレオチドの発現量と一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有することが確認されている検体における、該ポリヌクレオチドの発現量を比較し、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を検定する工程、
(8)下記の工程1)及び2)を含む、患者の一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを生成する能力を判定する方法
1)被験者より採取した検体における、下記のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドの発現量を測定する工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)1)で測定されたポリペプチドの発現量と一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有することが確認されている検体における、該ポリペプチドの発現量を比較し、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を検定する工程、
(9)下記の工程1)及び2)を含む、患者の一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを生成する能力を判定する方法
1)被験者より採取した検体における、下記のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドの酵素活性を測定する工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)1)で測定されたポリペプチドの酵素活性と一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有することが確認されている検体における、該ポリペプチドの酵素活性を比較し、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を検定する工程、
(10)下記の工程1)乃至3)を含む、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを生成する能力を判定する方法
1)被験者より採取した検体における以下のa)乃至c)からなる群から選択されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列を調べる工程;
a) 配列表の配列番号1のヌクレオチド番号1乃至1466に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
b)配列表の配列番号3のヌクレオチド番号1から1781に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
c)上記a)又はb)に記載のヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
2) 上記ポリヌクレオチドにおける酵素活性に影響のあるヌクレオチド配列の変異の有無を調べる工程;
3) 該ポリヌクレオチドがコードするポリペプチドのリン酸化活性を低下させるヌクレオチド配列の変異がある被験者は一般式(I)を有する化合物のリン酸化能が低いと判定し、該ポリペプチドのリン酸化活性を低下させるヌクレオチド配列の変異がない被験者は一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を有すると判定する工程、
(11)下記の工程1)乃至3)を含む、以下のa)乃至c)からなる群から選択されるポリヌクレオチドがコードするポリペプチドのリン酸化活性に影響のあるヌクレオチド配列の変異を同定する方法。
a) 配列表の配列番号1のヌクレオチド番号1乃至1466に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
b)配列表の配列番号3のヌクレオチド番号1から1781に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
c)上記a)又はb)に記載のヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
1)被験者より採取した検体における上記a)乃至c)からなる群から選択されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列を調べる工程;
2)上記ポリヌクレオチドにおけるヌクレオチド配列の変異の有無を調べる工程;
3) 該ポリヌクレオチド配列の変異と該ポリヌクレオチドがコードするポリペプチドのリン酸化活性の関連を調べ、リン酸化活性に影響のある、ポリヌクレオチド配列の変異を同定する工程、
(12)検体が、末梢血であることを特徴とする、(7)乃至(11)のいずれか1項に記載の方法、
(13)下記の1)乃至5)からなる群から選択される少なくとも1以上を含む薬物代謝能診断用キット
1)配列表の配列番号1または3に記載のヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドの一部乃至全部を特異的に増幅するための15から30塩基長の連続したオリゴヌクレオチドプライマー;
2)配列表の配列番号1または3に記載のヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、該ポリヌクレオチドを検出するための15ヌクレオチド以上の連続したポリヌクレオチドプローブ;
3)上記1)に記載のオリゴヌクレオチドプライマーまたは上記2)に記載のポリヌクレオチドプローブのいずれか一つのポリヌクレオチドが固定された固相化試料;
4)下記のa)乃至c)から選択されるポリペプチドに特異的に結合し、該タンパク質を検出するための抗体;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
5)上記4)に記載の抗体に結合する二次抗体、
からなる。
本明細書中において、「遺伝子」という語には、DNAのみならずそのmRNA、cDNA及びそのcRNAも含まれるものとする。また、本明細書中において、「ポリヌクレオチド」という語は核酸と同じ意味で用いており、DNA、RNA、プローブ、オリゴヌクレオチド、及びプライマーも含まれている。本明細中においては、「ポリペプチド」と「蛋白質」は区別せずに用いている。また、本明細書中において、「RNA画分」とは、RNAを含んでいる画分をいう。また、本明細書中において、「細胞」には、動物個体内の細胞、培養細胞も含んでいる。本明細書中における「全RNA画分」とは、全RNAを含む画分をいい、血液、各種臓器、各種組織、培養細胞等からRNAの抽出用の溶媒等、通常の方法によって抽出された全RNAが含まれている画分のことをいう。本明細書中において、「ストリンジェントな条件でハイブリダイズする」とは、市販のハイブリダイゼーション溶液ExpressHyb Hybridization Solution(クロンテック社製)中、68℃でハイブリダイズすること、または、DNAを固定したフィルターを用いて0.7-1.0MのNaCl存在下68℃でハイブリダイゼーションを行なった後、0.1-2倍濃度のSSC溶液(1倍濃度SSCとは150mM NaCl、15mM クエン酸ナトリウムからなる)を用い、68℃で洗浄することにより同定することができる条件またはそれと同等の条件でハイブリダイズすることをいう。
本発明で用いるヒト フルクトサミン−3−キナーゼ(human fructosamine-3-kinase: ヒトFN3K)及びヒト フルクトサミン−3−キナーゼ関連タンパク質(human fructosamine-3-kinase-related protein:ヒトFN3KRP)はその全長タンパク質に限らず、本発明で用いることができる化合物のリン酸化反応を行うことができる限りにおいて、その一部の配列からなる部分ペプチドでも良い。また、ヒト由来細胞より取得された天然のタンパク質でもよいし、PCR法等によってクローニングされた遺伝子によって当該タンパク質を発現するように遺伝子組換えされた細胞より取得されたタンパク質でもよい。また、これらのタンパク質は、精製されたものの他に、部分精製されたものでもよい。
(1)ヒトFN3K cDNA
ヒトFN3K cDNAは市販品を用いることができ、例えばGeneCopoeia社より入手できる(カタログNo. GC-W1392)。
5’- atggagcagctgctgcgcgccgagctgcgc -3’(プライマー1:配列表の配列番号:5)及び、
5’- ctacttgagcagccttcgcatggtgcccaa -3’(プライマー2:配列表の配列番号:6)。
ヒトFN3KRP遺伝子を発現しているcDNAライブラリーから、コロニーハイブリダイゼーション法等、公知の方法に従い、完全長cDNAを取得する。この完全長cDNAを鋳型としてPCR法を用いてヒトFN3KRP cDNAを取得できる。cDNAライブラリーは例えば、ヒト骨髄由来のcDNAライブラリーを用いることができる。市販のヒトcDNAライブラリーとして例えば、クロンテック社のCreator SMART Human cDNA Librariesを用いることもできるし、自らcDNAライブラリーを調製することもできる。
5’- ataagaatgcggccgccaccatggaggagctgctgaggcg -3’(プライマー3:配列表の配列番号:7)及び、
5’- atagtttagcggccgctcacttgaccagattcctcat-3’(プライマー4:配列表の配列番号:8)。
(1)ヒトFN3K及びヒトFN3KRP発現ベクターの構築
ヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPはin vitroにて合成する、あるいは遺伝子操作により宿主細胞に産生させることによって生産することができる。具体的には、ヒトFN3K遺伝子及び/又はヒトFN3KRP遺伝子を発現可能なベクターに組み込んだ後、転写と翻訳に必要な酵素、基質およびエネルギー物質を含む溶液中で合成する、あるいは他の原核生物、または真核生物の宿主細胞を形質転換させることによってヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPを発現させることにより、ヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPを得ることが出来る。
本発明においてヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPの基質として用いることができる化合物は、ヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPによってリン酸化される限りにおいて特に制限はないが例えば、下記一般式(I)を有する化合物である。
2−アミノ−2−メチル−4−[1−メチル−5−(5−フェニルペンタノイル)ピロール−2−イル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(2−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(4−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(2,3−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(2,4−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(2,5−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3,4−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3,5−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3−メチル−4−メトキシフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3−メトキシ−4−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(4−シアノフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(2−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(2,3−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(2,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(2,5−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3,5−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メチル−4−メトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メトキシ−4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール及び
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−シアノフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール並びに、
2−アミノ−2−[2−(4−オクチルフェニル)エチル]プロパン−1,3−ジオール、
2−アミノ−2−[2−(4−ヘプチルオキシフェニル)エチル]プロパン−1,3−ジオール、
2−アミノ−2−{2−[4−(5−フェニルペンタノイル)フェニル]エチル}プロパン−1,3−ジオール、
2−アミノ−2−{2−[4−(5−シクロヘキシルペンタノイル)フェニル]エチル}プロパン−1,3−ジオール、
2−アミノ−2−{2−[4−(7−フェニルヘプタノイル)フェニル]エチル}プロパン−1,3−ジオール、
2−アミノ−2−(2−{4−[2−(4−メトキシフェニル)エトキシ]フェニル}エチル)プロパン−1,3−ジオール、
2−アミノ−2−(2−{4−[2−(4−エトキシフェニル)エトキシ]フェニル}エチル)プロパン−1,3−ジオール、
2−アミノ−2−(2−{4−[2−(3−フルオロ−4−メトキシフェニル)エトキシ]フェニル}エチル)プロパン−1,3−ジオール、
2−アミノ−2−メチル−4−[4−(4,4,5,5,5−ペンタフルオロペンチルオキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−[4−(3−ビフェニル−4−イルプロポキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−[4−(3−ビフェニル−4−イルプロピオニル)フェニル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−[3−メトキシ−4−(4−フェニルブトキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−[4−(5−フェニルペンチルオキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−[4−(5−フェニルペンタノイル)フェニル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−(4−ヘキシルオキシフェニル)ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−[4−(3−フェニルプロポキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−[4−(3−シクロヘキシルプロポキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−[4−(5−シクロヘキシルペンタノイル)フェニル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−(4−ヘプチルオキシフェニル)ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−[4−(3−ベンジルオキシフェノキシ)−2−クロロフェニル]プロピル−1,3−プロパンジオール、
2−アミノ−2−[4−(3−ベンジルオキシフェニルチオ)−2−クロロフェニル]プロピル−1,3−プロパンジオール、
2−アミノ−2−メチル−5−[4−(3−ベンジルオキシフェノキシ)−2−クロロフェニル]ペンタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−5−[4−(3−ベンジルオキシフェニルチオ)−2−クロロフェニル]ペンタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−[4−(3−ベンジルオキシフェニルチオ)−2−クロロフェニル]プロピル−1,3−プロパンジオール(ROX−2127)、
2−アミノ−2−[4−(3−ベンジルオキシフェニルチオ)−2−クロロフェニル]エチル−1,3−プロパンジオール(KRP−203)、
2−アミノ−2−メチル−4−[1−メチル−5−(5−フェニルペンタノイル)ピロール−2−イル]ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{3−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{3−メチル−5−[4−(3,4−ジメトキシフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{3−クロロ−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1,3−ジメチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−3−クロロ−5−[4−(3,4−ジメトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−4−{1,3−ジメチル−5−[4−(3,4−ジメトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−3−(4−ヘプタノイルフェノキシ)プロパン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−5−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ペンタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−5−{5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ペンタン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−3−{4−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]フェニルメトキシ}プロパン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−3−{2−クロロ−4−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]フェニルメトキシ}プロパン−1−オール、
2−アミノ−2−メチル−3−{5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イルメトキシ}プロパン−1−オール、及び
2−アミノ−2−[2−(4−オクチルフェニル)エチル]プロパン−1,3−ジオール(FTY720)
であり、
更に好適な化合物は、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[1−メチル−5−(5−フェニルペンタノイル)ピロール−2−イル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(2−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(4−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(2,3−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(2,4−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(2,5−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3,4−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3,5−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3−メチル−4−メトキシフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3−メトキシ−4−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(4−シアノフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(2−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(2,3−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(2,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(2,5−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3,5−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メチル−4−メトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メトキシ−4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール及び
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−シアノフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール並びに、
(2R)−2−アミノ−2−[2−(4−オクチルフェニル)エチル]プロパン−1,3−ジオール、
(2R)−2−アミノ−2−[2−(4−ヘプチルオキシフェニル)エチル]プロパン−1,3−ジオール、
(2R)−2−アミノ−2−{2−[4−(5−フェニルペンタノイル)フェニル]エチル}プロパン−1,3−ジオール、
(2R)−2−アミノ−2−{2−[4−(5−シクロヘキシルペンタノイル)フェニル]エチル}プロパン−1,3−ジオール、
(2R)−2−アミノ−2−{2−[4−(7−フェニルヘプタノイル)フェニル]エチル}プロパン−1,3−ジオール、
(2R)−2−アミノ−2−(2−{4−[2−(4−メトキシフェニル)エトキシ]フェニル}エチル)プロパン−1,3−ジオール、
(2R)−2−アミノ−2−(2−{4−[2−(4−エトキシフェニル)エトキシ]フェニル}エチル)プロパン−1,3−ジオール、
(2R)−2−アミノ−2−(2−{4−[2−(3−フルオロ−4−メトキシフェニル)エトキシ]フェニル}エチル)プロパン−1,3−ジオール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[4−(4,4,5,5,5−ペンタフルオロペンチルオキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[4−(3−ビフェニル−4−イルプロポキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[4−(3−ビフェニル−4−イルプロピオニル)フェニル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[3−メトキシ−4−(4−フェニルブトキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[4−(5−フェニルペンチルオキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[4−(5−フェニルペンタノイル)フェニル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−(4−ヘキシルオキシフェニル)ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[4−(3−フェニルプロポキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[4−(3−シクロヘキシルプロポキシ)フェニル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[4−(5−シクロヘキシルペンタノイル)フェニル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−(4−ヘプチルオキシフェニル)ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−[4−(3−ベンジルオキシフェノキシ)−2−クロロフェニル]プロピル−1,3−プロパンジオール、
(2R)−2−アミノ−2−[4−(3−ベンジルオキシフェニルチオ)−2−クロロフェニル]プロピル−1,3−プロパンジオール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−5−[4−(3−ベンジルオキシフェノキシ)−2−クロロフェニル]ペンタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−5−[4−(3−ベンジルオキシフェニルチオ)−2−クロロフェニル]ペンタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−[4−(3−ベンジルオキシフェニルチオ)−2−クロロフェニル]プロピル−1,3−プロパンジオール(ROX−2127)、
(2R)−2−アミノ−2−[4−(3−ベンジルオキシフェニルチオ)−2−クロロフェニル]エチル−1,3−プロパンジオール(KRP−203)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[1−メチル−5−(5−フェニルペンタノイル)ピロール−2−イル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{3−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{3−メチル−5−[4−(3,4−ジメトキシフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{3−クロロ−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1,3−ジメチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−3−クロロ−5−[4−(3,4−ジメトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1,3−ジメチル−5−[4−(3,4−ジメトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2S)−2−アミノ−2−メチル−3−(4−ヘプタノイルフェノキシ)プロパン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−5−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ペンタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−5−{5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ペンタン−1−オール、
(2S)−2−アミノ−2−メチル−3−{4−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]フェニルメトキシ}プロパン−1−オール、
(2S)−2−アミノ−2−メチル−3−{2−クロロ−4−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]フェニルメトキシ}プロパン−1−オール、
(2S)−2−アミノ−2−メチル−3−{5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イルメトキシ}プロパン−1−オール、及び
(2R)−2−アミノ−2−[2−(4−オクチルフェニル)エチル]プロパン−1,3−ジオール(FTY720)
であり、
更に特に好適な化合物は、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[1−メチル−5−(5−フェニルペンタノイル)ピロール−2−イル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(4−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3,4−ジメチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3−メチル−4−メトキシフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(3−メトキシ−4−メチルフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[5−(4−シアノフェニル)ペンタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メチル−4−メトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メトキシ−4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール及び
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−シアノフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール並びに、
(2R)−2−アミノ−2−[2−(4−オクチルフェニル)エチル]プロパン−1,3−ジオールであり、
更に好適には、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[1−メチル−5−(5−フェニルペンタノイル)ピロール−2−イル]ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メチル−4−メトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3−メトキシ−4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール及び
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−シアノフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール並びに、
(2R)−2−アミノ−2−[2−(4−オクチルフェニル)エチル]プロパン−1,3−ジオールである。
6.ヒトFN3KRP及び/またはヒトFN3Kを用いた化合物(I)のリン酸エステルの製造方法
上記一般式(I)を有する化合物からヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kを用いて下記一般式(II)を有する化合物を製造することができる。
化合物(I)並びに、ヒトFN3KRP及び/またはヒトFN3Kを接触させることによって上記化合物のリン酸エステルである化合物(II)を製造することができる。
(1)ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3K
化合物(II)の製造に用いることができるヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kは上記「4」の項目に記載した方法によって赤血球から取得したものを用いることができるし、ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kを発現する細胞から取得したものを用いることもできる。ヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPは精製したものを用いることもできるし、粗精製のもの、細胞抽出液そのままを用いることもできる。また、ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kを発現する細胞をそのまま用いることもできる。
(2) 酵素反応
本発明の製造方法は、種々の態様で実施することができる。例えば、(a)ヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPを発現する細胞に化合物(I)を接触させる、(b)ヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPを発現する細胞からの抽出物と化合物(I)を接触させる、(c)精製又は粗精製ヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPと化合物(I)を接触させる等の方法を挙げることができる。
以下の方法によってヒトFN3KRPまたはヒトFN3Kによってリン酸化される物質を同定することができる。本方法は以下の工程を含む。
1)
i)ヒトFN3KRP又はヒトFN3Kを被験物質と接触させる工程;
ii)被験物質のリン酸エステルの生成量を測定する工程;
iii)被験物質をヒトFN3KRP又はヒトFN3Kと接触させない場合に測定された、被験物質のリン酸エステルの量と上記ii)で測定されたリン酸エステルの生成量を比較する工程。
2)
i)ヒトFN3KRP又はヒトFN3Kを被験物質と接触させる工程;
ii)被験物質のリン酸エステルの生成量を測定する工程;
iii)被験物質をヒトFN3KRP又はヒトFN3Kと接触させない場合に測定された、被験物質のリン酸エステルの量と上記ii)で測定されたリン酸エステルの生成量を比較する工程。
iv)被験物質をヒトFN3KRP又はヒトFN3Kと接触させない場合に測定された、リン酸エステルの量と比較して、上記ii)で測定されたリン酸エステルの量が多い場合に被験物質がリン酸化されたと判定する工程。
以下、各工程を説明する。
1)−i)について
本工程で用いるヒトFN3KRP又はヒトFN3Kとしては特に制限はないが、ヒトFN3KRP又はヒトFN3Kを発現している細胞をそのまま用いることが出来るし、これらの細胞の破砕液、これらの細胞から粗精製したヒトFN3KRP又はヒトFN3K、精製したヒトFN3KRP又はヒトFN3Kを用いることも出来る。また、上記「4.ヒトFN3K及びヒトFN3KRPの発現」の項に記載の方法によって取得されたものを用いることも出来る。
反応液のpH:6〜9、好適には7.4
反応時間:30秒〜24時間、好適には3時間
反応は、例えば、384穴アッセイプレートを用いて行うことができる。
被験物質のリン酸エステルの量を測定する方法としては例えばHPLCを用いて生成物を分離定量する方法を挙げることができる。そのような方法としては例えば以下の方法を挙げることが出来るがこの方法に限定されない。
カラム:YMC−Pack ODS−A A−312(直径6.0mm×長さ150mm、粒子径5μm、(株)ワイ・エム・シー)
移動相:40%アセトニトリル/0.1%トリフルオロ酢酸
流速:1mL/分
溶出方法:イソクラティック溶出
カラム温度:40℃
検出波長:295nm
1)−iii)について
被験物質をヒトFN3KRP又はヒトFN3Kと接触させない場合に測定された被験物質のリン酸エステルの量は、上記1)−ii)に記載した方法と同様の方法によって測定することが出来る。そして、ヒトFN3KRP又はヒトFN3Kと接触させた場合と接触させない場合の被験物質のリン酸エステルの生成量を比較することが出来る。
2)−i)乃至iii)について
これらの工程は上記1)−i)乃至iii)と同様の方法によって行うことが出来る。
2)−iv) について
上記2)−iii)による比較の結果、上記ii)における被験物質のリン酸エステルの生成量がiii)に比べて多い場合に被験物質がリン酸化されたと判定することが出来る。
ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kは一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化して、一般式(II)を有するリン酸エステルに変換する機能を有する。
1)ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3K遺伝子の発現量を指標とした方法
以下の工程i)乃至iii)を含む:
i)被験者より採取した検体より全RNAを抽出する工程;
ii)全RNAにおけるヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3K遺伝子の発現量を測定する工程;
iii)ii)で測定されたヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3K遺伝子の発現量と一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有することが確認されている検体における、ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3K遺伝子の発現量を比較し、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を検定する工程。
2)ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kタンパク質の発現量を指標とした方法
以下の工程i)乃至ii)を含む:
i)被験者より採取した検体中におけるヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kタンパク質の発現量を該タンパク質に特異的に結合する抗体又はリガンドを用いて測定する工程;
ii)i)で測定されたタンパク質の発現量と、一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有することが確認されている検体における、ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kタンパク質の発現量を比較し、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を検定する工程。
3)ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kタンパク質の酵素活性を指標とした方法
i)被験者より採取した検体中におけるヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kタンパク質の酵素活性を測定する工程;
ii) i)で測定されたタンパク質の酵素活性と、一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有することが確認されている検体における、ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kタンパク質の酵素活性を比較し、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を検定する工程。
i)被験者より採取した検体におけるヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3K遺伝子におけるヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3Kのヌクレオチド配列を調べる工程;
ii)i) ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3K遺伝子における酵素活性に影響のあるヌクレオチド配列の変異の有無を調べる工程;
iii) ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3K遺伝子の活性を低下させるヌクレオチド配列の変異がある被験者は一般式(I)を有する化合物のリン酸化能が低いと判定し、ヒトFN3KRP及び/又はヒトFN3K遺伝子の活性を低下させるヌクレオチド配列の変異がない被験者は一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を有すると判定する工程。
ヒトFN3K及び/又はヒトFN3KRPは生体内においてリン酸化されることによって活性を有する化合物のリン酸化能を有する。したがって、以下のキットを用いることで、被験者の薬物代謝能を調べることが出来る。該キットは具体的には以下のものである。
1)配列表の配列番号1または3に記載のヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドの一部乃至全部を特異的に増幅するための15から30塩基長の連続したオリゴヌクレオチドプライマー;
2)配列表の配列番号1または3に記載のヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、該ポリヌクレオチドを検出するための15ヌクレオチド以上の連続したポリヌクレオチドプローブ;
3)上記1)に記載のオリゴヌクレオチドプライマーまたは上記2)に記載のポリヌクレオチドプローブのいずれか一つのポリヌクレオチドが固定された固相化試料;
4)下記のa)乃至c)から選択されるポリペプチドに特異的に結合し、該タンパク質を検出するための抗体;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
5)上記4)に記載の抗体に結合する二次抗体。
(参考例)
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールの取得
以下の実験で用いる式(I)で示される、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オール(以下、「化合物1」ともいう。)は、例えば、国際公開第94/08943号パンフレット、国際公開第96/06068号パンフレット、国際公開第98/45249号パンフレット、国際公開第03/029184号パンフレット、国際公開第03/029205号パンフレット、国際公開第02/06268号パンフレット(実施例19)、国際公開第03/059880号パンフレット、国際公開第05/005383号パンフレット、国際公開第05/063671号パンフレット等に記載する方法に従って製造することができる。
(実施例1)ヒト全血の調製
匿名化された2名の供血者から約100mLずつ末梢血を採血し、抗凝固剤として3.2%(w/v)クエン酸3ナトリウム2水和物溶液をヒト末梢血100mL当り約11mL添加してヒト全血とし、常法に従って、全血から赤血球、血漿、血小板、リンパ球の各画分に分画した。
(実施例2)リン酸化活性の確認及びリン酸化活性の局在
実施例1で得た各種構成成分について化合物1に対するリン酸化活性を測定した。反応基質には化合物1を使用し、反応産物である化合物1のリン酸エステルである、リン酸 モノ(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブチル エステル(化合物1のリン酸エステル)の生成量を定量することによりリン酸化活性を測定した。
1.5mL容ポリプロピレンチューブを13本用意し、それぞれに実施例1で得た全血、血漿、赤血球、血小板、またはリンパ球を、全血、血漿、赤血球、血小板、リンパ球、赤血球+血漿、血小板+血漿、リンパ球+血漿、赤血球+血小板+リンパ球+血漿、赤血球+血小板+リンパ球、赤血球+血小板+血漿、赤血球+リンパ球+血漿、血小板+リンパ球+血漿の組み合わせで分注し氷冷した。何れのチューブの分注量も500μLとし、2種類以上の構成成分を混ぜる場合は、各々等量を混合した上で500μLとした。即ち2種類混合の場合は250μLずつ、3種類混合の場合は166.7μLずつ、四種類混合の場合は125μLずつ分注し、総分注量を500μLとした。各チューブに100mg/mL 化合物1/ジメチルスルホキシド溶液を0.5μL加えて混合(終濃度100μg/mL)した後氷冷し、これを37℃の湯浴中で30分間インキュベーションした後、氷上に移した。各チューブに1mLのメタノールを加えて混合後、HPLC測定時まで−20℃で保存した。
HPLC:LC−10AVPシステム((株)島津製作所)
カラム:YMC−Pack ODS−A A−312(直径6.0mm×長さ150mm、粒子径5μm、(株)ワイ・エム・シー)
移動相:40%アセトニトリル/0.1%トリフルオロ酢酸
流速:1mL/分
溶出方法:イソクラティック溶出
カラム温度:40℃
検出波長:295nm
保持時間:6.7分(化合物1のリン酸エステル)、11.1分(化合物1)、14.2分(1−ナフトール、内部標準物質)
反応終了後のチューブに10μg/mLの1−ナフトール/メタノール溶液を、終濃度2.5μg/mLとなるように添加した後混合し、21,600×g、3分間、4℃で遠心分離した。その上清30μLを上記HPLC装置にロードし、各保持時間に出現するピークのAUC値を測定した。化合物のAUC値を内部標準物質である1−ナフトールのAUC値で補正した後、別途作成した検量線に外挿して化合物の濃度を得た。
赤血球より常法に従って、可溶性画分と膜画分を分画した。実施例2と同様の方法で化合物1のリン酸化反応を調べたところ、図2に示すように、赤血球の可溶性画分に強いリン酸化活性が存在することが確認され、化合物1をリン酸化する酵素は主に赤血球の可溶性画分に存在することが明らかになった。
以下の方法により、ヒト赤血球の可溶性画分から化合物1をリン酸化する酵素を精製した。
(1)酵素活性測定方法
酵素活性測定用の検体45μLに対して、それぞれ終濃度で100μg/mL 化合物1、1mM ATP、0.5% CHAPS及び100mM HEPES,pH 7.0、総量75μLとなるように添加した。1−デオキシ−1−モルフォリノフルクトース(1−deoxy−1−morpholinofructose;DMF、シグマ社)を加える場合は終濃度で1mMとなるように反応液に加えた。37℃にて1時間保温することにより化合物1をリン酸化した後、150μLのメタノールを添加し、孔径0.45μmのフィルターで濾過することにより反応停止及び蛋白質除去を行った。10μLの濾液を逆相クロマトグラフィーカラム(TSK−gel ODS−100S、 直径4.6mm×長さ150mm、東ソー社)に供し、流速1mL/分、カラム温度40℃において0.1% トリフルオロ酢酸を含む40% アセトニトリルによりイソクラティック溶出した。化合物1及び化合物1のリン酸エステルの検出は295nmで行い、ピーク面積により化合物1のリン酸エステルの生成量を測定した。上記条件で1μg/mLの化合物1のリン酸エステルを生成する活性を1U/mLと定義した。以降の精製過程において、化合物1をリン酸化する酵素の活性の測定には本測定法を使用した。
(2)ヒト赤血球可溶性画分からの化合物1をリン酸化する酵素の精製
匿名化されたボランティア5名から各100mLずつ、計500mL採血し、常法に従って調製した赤血球可溶性画分から、化合物1のリン酸化活性を指標に、硫酸アンモニウム塩析、疎水性相互作用カラム(HiTrap Phenyl HP 5mL、GEヘルスケア バイオサイエンス社)、色素結合アフィニティカラム(HiTrap Blue HP 1mL、GEヘルスケア バイオサイエンス社)、陰イオン交換カラム(Resource Q 1mL、GEヘルスケア バイオサイエンス社)、陽イオン交換カラム(Resource S 1mL、GEヘルスケア バイオサイエンス社)、陽イオン交換カラム(Mono S PC 1.6/5、GEヘルスケア バイオサイエンス社)、及びゲル濾過カラム(Superdex 75 PC 3.2/30、GEヘルスケア バイオサイエンス社)によって精製した。その結果、ヒト赤血球可溶性画分中の化合物1のリン酸化活性は、表1に示した通り約10,000倍まで濃縮された。
実施例4で得られた活性画分をSDS−PAGEに供し、SDS−PAGEゲル上の各バンドをゲルより切出し、常法に従い、トリプシン(モディファイドトリプシン、プロメガ社)を加え37℃にて12時間消化反応を行った。生成した消化ペプチドは液体クロマトグラフィー(LC)/タンデム質量分析装置(MS/MS)に供した。得られた質量スペクトルデータは、データベース検索ソフトウェア(Mascot、マトリクスサイエンス社)により解析した。データベースはNational Center for Biotechnology Informationにより編纂されたGenBank nrデータベースを用いた。
ヒトFN3Kが化合物1をリン酸化する酵素であることを確認するために、ヒトFN3Kの競合阻害剤として知られているDMF(Biochem. J.(2000)vol. 352,p.835−839)を用いた阻害実験を行った。実施例4における第2精製段階の疎水性相互作用カラムの活性分画はDMFにより顕著に阻害され、そのIC50値は約1μMであった。これにより、ヒトFN3Kが化合物1をリン酸化する酵素であることが確認された。
精製された活性画分をSDS−PAGEに供して得られた33kDa付近のバンドを質量分析にかけてこのバンドの蛋白質の同定を行った。その結果、いずれのバンドもヒト配列hypothetical fructosamine kinase−like protein(FN3KRP、GenBank のprotein databaseにAccession No. Q9HA64で登録されている。)と同一であることが確認された。
(実施例8)ヒトFN3KRP発現ベクターの構築
インビトロジェン社より購入したヒトFN3KRPのcDNAクローン(クローンID:3351601)を制限酵素XhoI及びEcoRIで処理してcDNAを取り出し、XhoI及びEcoRIで処理したプラスミドベクター、pcDNA3.1(+)neo (インビトロジェン社)と結合した。結合反応産物であるプラスミドで大腸菌DH5αを形質転換した。得られた形質転換体を大量培養し、ヒトFN3KRPのcDNAを含む発現プラスミドベクター、hFN3KRP/pcDNA3.1(+)neoを得た。
(実施例9)ヒトFN3K発現ベクターの構築
ゲートウエイテクノロジー(インビトロジェン社)を用いて、GeneCopoeia社より購入したヒトFN3KのcDNAクローン(カタログNo. GC-W1392)から、哺乳類細胞用の発現プラスミドベクター、pcDNA3.2−DESTにcDNAを移し替えた。反応後のDNA溶液を用いて大腸菌DH5αを形質転換した。得られた形質転換体を大量培養し、ヒトFN3KのcDNAを含む発現プラスミドベクター、hFN3K/pcDNA3.2−DESTを得た。
(実施例10)ヒトFN3KRP/FN3K発現ベクターの遺伝子導入及び一過的発現細胞からの細胞質画分の調製
ヒトFN3KRP及びヒトFN3Kが実際に化合物1のリン酸化活性を有するか確認する為、両遺伝子の発現ベクターを培養細胞に導入して一過的に発現させ、その細胞質画分を調製した。
(実施例11)細胞質画分の化合物1をリン酸化する活性の測定
1.5mL容ポリプロピレンチューブに、以下の終濃度となるように各成分を添加し、総量を250μLとして氷上に静置した(100mM HEPES, pH 7.4、5mM 塩化マグネシウム、1mM ATP、1mM ジチオスレイトール、0.5% CHAPS、100μg/mL 化合物1、実施例10で得た各々の細胞質画分:18.2、54.6、163.8μg相当量または無添加)。これを37℃の湯浴中で3時間インキュベーションした後、氷上に移した。各チューブに0.5mLのメタノールを加えて混合後、HPLC測定時まで−20℃で保存した。
(実施例12)FTY720及びスフィンゴシンに対するリン酸化能の確認
スフィンゴシンキナーゼ1及び2は、生体内においてスフィンゴシンをスフィンゴシン−1−リン酸(S1P)に変換する酵素であるが、FTY720をリン酸化してFTY720リン酸エステルを生成することが知られている
(J Biol Chem. (2003) vol.278, p.47408−47415)(FEBS Lett. (2003) vol.554, p.189−193)。そこで逆に、ヒトFN3KRP及びヒトFN3KがFTY720またはスフィンゴシンをリン酸化するか否かを検討した。
HPLC装置名:アジレント 1100シリーズ(アジレント テクノロジーズ社)
オートサンプラー名:HTC PAL(CTC アナリティクス社)
MS/MSシステム:
装置名:API4000(アプライド バイオシステムズ/MDS Sciex社)
その結果、ヒトFN3KRP及びヒトFN3Kの両者共、FTY720をわずかにリン酸化するが、スフィンゴシンに対するリン酸化能は有さないことが明らかとなった(図4)。よってヒトFN3KRP及びヒトFN3Kは、化合物1及びFTY720をリン酸化する酵素であることが明らかになった。
実施例10で調製したヒトFN3KRP発現細胞質画分を用いて、以下の化合物のリン酸化反応を行った。
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オール(化合物1)、
2−アミノ−2−[4−(3−ベンジルオキシフェニルチオ)−2−クロロフェニル]プロピル−1,3−プロパンジオール(ROX−2127)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[1−メチル−5−(5−フェニルペンタノイル)ピロール−2−イル]ブタン−1−オール(化合物2)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール(化合物3)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{3−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ブタン−1−オール(化合物4)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{3−メチル−5−[4−(3,4−ジメトキシフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ブタン−1−オール(化合物5)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール(化合物6)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{3−クロロ−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ブタン−1−オール(化合物7)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1,3−ジメチル−5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール(化合物8)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1−メチル−3−クロロ−5−[4−(3,4−ジメトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール(化合物9)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−{1,3−ジメチル−5−[4−(3,4−ジメトキシフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ブタン−1−オール(化合物10)、
2−アミノ−2−メチル−3−(4−ヘプタノイルフェノキシ)プロパン−1−オール(化合物11)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−5−{1−メチル−5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]ピロール−2−イル}ペンタン−1−オール(化合物12)、
(2R)−2−アミノ−2−メチル−5−{5−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イル}ペンタン−1−オール(化合物13)、
2−アミノ−2−メチル−3−{4−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]フェニルメトキシ}プロパン−1−オール(化合物14)、
2−アミノ−2−メチル−3−{2−クロロ−4−[4−(4−メチルフェニル)ブタノイル]フェニルメトキシ}プロパン−1−オール(化合物15)、
2−アミノ−2−メチル−3−{5−[4−(3,4−ジメチルフェニル)ブタノイル]チオフェン−2−イルメトキシ}プロパン−1−オール(化合物16)
反応溶液:100mM HEPES, pH 7.4、5mM 塩化マグネシウム、5mM ATP、1mM ジチオスレイトール、0.5% CHAPS、0.328mg/mL ヒトFN3KRP発現細胞質画分
反応容量:100μL
反応基質:100μM
反応条件:37℃、3時間
反応終了後、メタノール200μLを加えて攪拌し、遠心分離(16,000×g、10分間、4℃)を行い、上清20μLをHPLCに供して以下に示す条件で分析を行った。
カラム:YMC−pack ODS A−312
カラム温度:40℃
流速:1mL/分
移動相:30% アセトニトリル(0.1% トリフルオロ酢酸)→
90% アセトニトリル(0.1% トリフルオロ酢酸)
溶出方法:グラジエント溶出を実施。初期アセトニトリル濃度及びグラジエント勾配は化合物により変更した。典型的な方法は、
30% アセトニトリル(0.1% トリフルオロ酢酸)→
90% アセトニトリル(0.1% トリフルオロ酢酸)、
グラジエント勾配:2%アセトニトリル/分
検出波長:295nm 又は254nm 又は230nm
各化合物のリン酸化効率は、以下の式に示すようにリン酸エステル及び未反応基質のピーク面積を用いて算出した。
以上の測定の結果、ヒトFN3KRPが種々の化合物をリン酸化する酵素であることが確認された(表3)。
実施例10で調製したヒトFN3K発現細胞質画分を用いて、以下に示す条件で実施例13と同じ化合物1及び化合物1の類縁体のリン酸化反応を行った。
5mM ATP、1mM ジチオスレイトール、0.5% CHAPS、
0.3mg/mL ヒトFN3K発現細胞質画分
反応容量:100μL
反応基質:100μM
反応条件:37℃、3時間
反応終了後、メタノール200μLを加えて攪拌し、遠心分離(16,000×g、10分間、4℃)を行い、上清20μLをHPLCに供して、実施例13に示した条件で分析を行った。各類縁体のリン酸化効率は実施例13に示した式を用いて算出した。
Wistar−Imamichiラット(財団法人動物繁殖研究所より購入)から実施例1と同様にして赤血球を調製し、以下に示す条件で実施例13と同じ化合物1及び化合物1の類縁体のリン酸化反応を行った。
反応容量:500μL
反応基質:100μg/mL
反応条件:37℃、3時間
反応終了後、メタノール1mLを加えて攪拌し、遠心分離(16,000×g、5分間、4℃)を行った。上清を再度遠心分離し(16,000×g、10分間、4℃)、改めて得た上清20μLをHPLCに供して、実施例13に示した条件で分析を行った。各類縁体のリン酸化効率は実施例13に示した式を用いて算出した。
Claims (6)
- 以下の工程1)及び2)を含む、リン酸エステルの製造方法。
1)下記一般式(I)を有する化合物と以下のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドとを接触させる工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)1)における反応溶液から一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを取得する工程
――――――――――――――――――――――――――
(式中、R 1 及びR 2 は、水素原子である。R 3 は、C1−C6アルキル基又はヒドロキシメチル基である。R 4 は、水素原子、ハロゲン原子又はC1−C6アルキル基である。R 5 は、水素原子、ハロゲン原子、シアノ基、C1−C6アルキル基、C1−C6アルコキシ基、C3−C6シクロアルキル基、ハロゲノC1−C6アルキル基、フェニル基及びベンジルオキシ基からなる群より選択される基で1乃至3個置換されたフェニル基、ハロゲン原子又は水素原子であり、Xは、ビニレン基(CH=CH基)、酸素原子、硫黄原子又はメチルアミノ基である。Yは、単結合、酸素原子、硫黄原子又はカルボニル基である。Zは、単結合又はC1−C8アルキレン基である。nは、2又は3である。) - 下記の工程1)乃至3)を含む、被験者の下記一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを生成する能力を判定する方法。
1)被験者より採取した検体より全RNAを抽出する工程;
2)全RNAにおける、下記のa)乃至c)からなる群から選択されるポリヌクレオチドの発現量を測定する工程;
a) 配列表の配列番号1のヌクレオチド番号6乃至935に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
b)配列表の配列番号3のヌクレオチド番号27から956に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
c)上記a)又はb)に記載のヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
3)2)で測定されたポリヌクレオチドの発現量と一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有することが確認されている検体における、該ポリヌクレオチドの発現量を比較し、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を検定する工程
――――――――――――――――――――――――――
(式中、R 1 及びR 2 は、水素原子である。R 3 は、C1−C6アルキル基又はヒドロキシメチル基である。R 4 は、水素原子、ハロゲン原子又はC1−C6アルキル基である。R 5 は、水素原子、ハロゲン原子、シアノ基、C1−C6アルキル基、C1−C6アルコキシ基、C3−C6シクロアルキル基、ハロゲノC1−C6アルキル基、フェニル基及びベンジルオキシ基からなる群より選択される基で1乃至3個置換されたフェニル基、ハロゲン原子又は水素原子であり、Xは、ビニレン基(CH=CH基)、酸素原子、硫黄原子又はメチルアミノ基である。Yは、単結合、酸素原子、硫黄原子又はカルボニル基である。Zは、単結合又はC1−C8アルキレン基である。nは、2又は3である。) - 下記の工程1)及び2)を含む、患者の下記一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを生成する能力を判定する方法。
1)被験者より採取した検体における、下記のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドの発現量を測定する工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)1)で測定されたポリペプチドの発現量と一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有することが確認されている検体における、該ポリペプチドの発現量を比較し、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を検定する工程
――――――――――――――――――――――――――
(式中、R 1 及びR 2 は、水素原子である。R 3 は、C1−C6アルキル基又はヒドロキシメチル基である。R 4 は、水素原子、ハロゲン原子又はC1−C6アルキル基である。R 5 は、水素原子、ハロゲン原子、シアノ基、C1−C6アルキル基、C1−C6アルコキシ基、C3−C6シクロアルキル基、ハロゲノC1−C6アルキル基、フェニル基及びベンジルオキシ基からなる群より選択される基で1乃至3個置換されたフェニル基、ハロゲン原子又は水素原子であり、Xは、ビニレン基(CH=CH基)、酸素原子、硫黄原子又はメチルアミノ基である。Yは、単結合、酸素原子、硫黄原子又はカルボニル基である。Zは、単結合又はC1−C8アルキレン基である。nは、2又は3である。) - 下記の工程1)及び2)を含む、患者の下記一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを生成する能力を判定する方法。
1)被験者より採取した検体における、下記のa)乃至c)からなる群から選択されるポリペプチドの酵素活性を測定する工程;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
2)1)で測定されたポリペプチドの酵素活性と一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有することが確認されている検体における、該ポリペプチドの酵素活性を比較し、被験者の一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を検定する工程
――――――――――――――――――――――――――
(式中、R 1 及びR 2 は、水素原子である。R 3 は、C1−C6アルキル基又はヒドロキシメチル基である。R 4 は、水素原子、ハロゲン原子又はC1−C6アルキル基である。R 5 は、水素原子、ハロゲン原子、シアノ基、C1−C6アルキル基、C1−C6アルコキシ基、C3−C6シクロアルキル基、ハロゲノC1−C6アルキル基、フェニル基及びベンジルオキシ基からなる群より選択される基で1乃至3個置換されたフェニル基、ハロゲン原子又は水素原子であり、Xは、ビニレン基(CH=CH基)、酸素原子、硫黄原子又はメチルアミノ基である。Yは、単結合、酸素原子、硫黄原子又はカルボニル基である。Zは、単結合又はC1−C8アルキレン基である。nは、2又は3である。) - 下記の工程1)乃至3)を含む、被験者の下記一般式(I)を有する化合物のリン酸エステルを生成する能力を判定する方法。
1)被験者より採取した検体における以下のa)乃至c)からなる群から選択されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列を調べる工程;
a) 配列表の配列番号1のヌクレオチド番号1乃至1466に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
b)配列表の配列番号3のヌクレオチド番号1から1781に示されるヌクレオチド配列を含むことからなるポリヌクレオチド
c)上記a)又はb)に記載のヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、一般式(I)を有する化合物を生体内でリン酸化する能力を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
2) 上記ポリヌクレオチドにおける酵素活性に影響のあるヌクレオチド配列の変異の有無を調べる工程;
3) 該ポリヌクレオチドがコードするポリペプチドのリン酸化活性を低下させるヌクレオチド配列の変異がある被験者は一般式(I)を有する化合物のリン酸化能が低いと判定し、該ポリペプチドのリン酸化活性を低下させるヌクレオチド配列の変異がない被験者は一般式(I)を有する化合物のリン酸化能を有すると判定する工程
――――――――――――――――――――――――――
(式中、R 1 及びR 2 は、水素原子である。R 3 は、C1−C6アルキル基又はヒドロキシメチル基である。R 4 は、水素原子、ハロゲン原子又はC1−C6アルキル基である。R 5 は、水素原子、ハロゲン原子、シアノ基、C1−C6アルキル基、C1−C6アルコキシ基、C3−C6シクロアルキル基、ハロゲノC1−C6アルキル基、フェニル基及びベンジルオキシ基からなる群より選択される基で1乃至3個置換されたフェニル基、ハロゲン原子又は水素原子であり、Xは、ビニレン基(CH=CH基)、酸素原子、硫黄原子又はメチルアミノ基である。Yは、単結合、酸素原子、硫黄原子又はカルボニル基である。Zは、単結合又はC1−C8アルキレン基である。nは、2又は3である。) - 下記の1)乃至5)からなる群から選択される少なくとも1以上を含む下記一般式(I)を有する化合物のリン酸化能診断用キット。
1)配列表の配列番号1または3に記載のヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドの一部乃至全部を特異的に増幅するための15から30塩基長の連続したオリゴヌクレオチドプライマー;
2)配列表の配列番号1または3に記載のヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、該ポリヌクレオチドを検出するための15ヌクレオチド以上の連続したポリヌクレオチドプローブ;
3)上記1)に記載のオリゴヌクレオチドプライマーまたは上記2)に記載のポリヌクレオチドプローブのいずれか一つのポリヌクレオチドが固定された固相化試料;
4)下記のa)乃至c)から選択されるポリペプチドに特異的に結合し、該タンパク質を検出するための抗体;
a)配列表の配列番号2のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
b)配列表の配列番号4のアミノ酸番号1乃至309に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
c)上記a)又はb)から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、(2R)−2−アミノ−2−メチル−4−[5−(5−フェニルペンタノイル)チオフェン−2−イル]ブタン−1−オールのリン酸化能を有するポリペプチド;
5)上記4)に記載の抗体に結合する二次抗体
――――――――――――――――――――――――――
(式中、R 1 及びR 2 は、水素原子である。R 3 は、C1−C6アルキル基又はヒドロキシメチル基である。R 4 は、水素原子、ハロゲン原子又はC1−C6アルキル基である。R 5 は、水素原子、ハロゲン原子、シアノ基、C1−C6アルキル基、C1−C6アルコキシ基、C3−C6シクロアルキル基、ハロゲノC1−C6アルキル基、フェニル基及びベンジルオキシ基からなる群より選択される基で1乃至3個置換されたフェニル基、ハロゲン原子又は水素原子であり、Xは、ビニレン基(CH=CH基)、酸素原子、硫黄原子又はメチルアミノ基である。Yは、単結合、酸素原子、硫黄原子又はカルボニル基である。Zは、単結合又はC1−C8アルキレン基である。nは、2又は3である。)
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2008527798A JP4975031B2 (ja) | 2006-08-04 | 2007-08-03 | 薬物リン酸化酵素 |
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2006213734 | 2006-08-04 | ||
| JP2006213734 | 2006-08-04 | ||
| PCT/JP2007/065232 WO2008016133A1 (en) | 2006-08-04 | 2007-08-03 | Drug-phosphorylating enzyme |
| JP2008527798A JP4975031B2 (ja) | 2006-08-04 | 2007-08-03 | 薬物リン酸化酵素 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPWO2008016133A1 JPWO2008016133A1 (ja) | 2009-12-24 |
| JP4975031B2 true JP4975031B2 (ja) | 2012-07-11 |
Family
ID=38997306
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2008527798A Expired - Fee Related JP4975031B2 (ja) | 2006-08-04 | 2007-08-03 | 薬物リン酸化酵素 |
Country Status (6)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US8071300B2 (ja) |
| EP (1) | EP2045325B1 (ja) |
| JP (1) | JP4975031B2 (ja) |
| ES (1) | ES2396713T3 (ja) |
| TW (1) | TW200815600A (ja) |
| WO (1) | WO2008016133A1 (ja) |
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2003089601A2 (en) * | 2002-04-17 | 2003-10-30 | Dynamis Therapeutics, Inc. | 3-deoxyglucosone and skin |
| WO2003093311A1 (en) * | 2002-04-29 | 2003-11-13 | Protemix Corporation Limited | Proteins with deglycating activities and methods of using same |
| WO2005079463A2 (en) * | 2004-02-17 | 2005-09-01 | Dynamis Therapeutics, Inc. | Fructoseamine 3 kinase and the formation of collagen and elastin |
| WO2006138609A2 (en) * | 2005-06-17 | 2006-12-28 | Dynamis Therapeutics, Inc. | Treatment of inflammatory conditions |
Family Cites Families (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5604229A (en) | 1992-10-21 | 1997-02-18 | Yoshitomi Pharmaceutical Industries, Ltd. | 2-amino-1,3-propanediol compound and immunosuppressant |
| DE69524962D1 (de) | 1994-08-22 | 2002-02-14 | Welfide Corp | Benzolderivate und deren medizinische verwendung |
| ES2226110T3 (es) | 1997-04-04 | 2005-03-16 | Mitsubishi Pharma Corporation | Compuestos de 2-aminopropano-1,3-diol, su uso medico, e intermedios para sintetizarlos. |
| NZ533997A (en) | 2000-07-13 | 2005-11-25 | Sankyo Co | Amino alcohol derivatives |
| JP4152884B2 (ja) | 2001-09-27 | 2008-09-17 | 杏林製薬株式会社 | ジアリールエーテル誘導体とその付加塩及び免疫抑制剤 |
| MXPA04002679A (es) | 2001-09-27 | 2004-07-30 | Kyorin Seiyaku Kk | Derivados de sulfuro de diarilo, sales de los mismos y agentes inmunosupresores que utilizan los mismos. |
| WO2003059880A1 (en) | 2002-01-11 | 2003-07-24 | Sankyo Company, Limited | Amino alcohol derivative or phosphonic acid derivative and medicinal composition containing these |
| WO2005005383A1 (ja) | 2003-07-11 | 2005-01-20 | Sankyo Company, Limited | アミノアルコール化合物 |
| JP2005047899A (ja) | 2003-07-11 | 2005-02-24 | Sankyo Co Ltd | アミノアルコール化合物 |
| JP2005046141A (ja) | 2003-07-11 | 2005-02-24 | Sankyo Co Ltd | リン酸エステルの製造方法 |
| JP2005206586A (ja) | 2003-12-25 | 2005-08-04 | Sankyo Co Ltd | エーテル誘導体 |
| TW200526548A (en) | 2003-12-25 | 2005-08-16 | Sankyo Co | Ether derivatives |
-
2007
- 2007-08-02 TW TW096128340A patent/TW200815600A/zh unknown
- 2007-08-03 ES ES07791906T patent/ES2396713T3/es active Active
- 2007-08-03 WO PCT/JP2007/065232 patent/WO2008016133A1/ja not_active Ceased
- 2007-08-03 US US12/376,434 patent/US8071300B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2007-08-03 EP EP07791906A patent/EP2045325B1/en not_active Not-in-force
- 2007-08-03 JP JP2008527798A patent/JP4975031B2/ja not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2003089601A2 (en) * | 2002-04-17 | 2003-10-30 | Dynamis Therapeutics, Inc. | 3-deoxyglucosone and skin |
| WO2003093311A1 (en) * | 2002-04-29 | 2003-11-13 | Protemix Corporation Limited | Proteins with deglycating activities and methods of using same |
| WO2005079463A2 (en) * | 2004-02-17 | 2005-09-01 | Dynamis Therapeutics, Inc. | Fructoseamine 3 kinase and the formation of collagen and elastin |
| WO2006138609A2 (en) * | 2005-06-17 | 2006-12-28 | Dynamis Therapeutics, Inc. | Treatment of inflammatory conditions |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| ES2396713T3 (es) | 2013-02-25 |
| EP2045325B1 (en) | 2012-09-19 |
| EP2045325A4 (en) | 2010-04-07 |
| JPWO2008016133A1 (ja) | 2009-12-24 |
| WO2008016133A1 (en) | 2008-02-07 |
| US20100248227A1 (en) | 2010-09-30 |
| US8071300B2 (en) | 2011-12-06 |
| TW200815600A (en) | 2008-04-01 |
| EP2045325A1 (en) | 2009-04-08 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP3472584B2 (ja) | IKK−βタンパク質、核酸及び方法 | |
| Vitari et al. | WNK1, the kinase mutated in an inherited high-blood-pressure syndrome, is a novel PKB (protein kinase B)/Akt substrate | |
| US5843721A (en) | Nucleic acids encoding human NIK protein | |
| Feng et al. | Polo-like kinase interacts with proteasomes and regulates their activity | |
| Menegay et al. | Biochemical characterization and localization of the dual specificity kinase CLK1 | |
| JP2003501038A (ja) | 蛋白質キナーゼ | |
| Goel et al. | The unique N‐terminal region of SRMS regulates enzymatic activity and phosphorylation of its novel substrate docking protein 1 | |
| JP4475945B2 (ja) | 糖尿病処置のための作用物質同定法 | |
| EP1005539B1 (en) | Ikk-alpha proteins, nucleic acids and methods | |
| Su et al. | Membrane bound catechol-O-methytransferase is the dominant isoform for dopamine metabolism in PC12 cells and rat brain | |
| AU2001263952B2 (en) | Tumour suppressor and uses thereof | |
| JP4975031B2 (ja) | 薬物リン酸化酵素 | |
| Morquecho-León et al. | Isoforms of protein kinase C involved in phorbol ester-induced sphingosine 1-phosphate receptor 1 phosphorylation and desensitization | |
| JP2003527824A (ja) | ポリペプチドおよび核酸をシグナリングする新規細胞 | |
| JP2002517998A (ja) | p27(KIP1)のFKBP−12との相互作用 | |
| US8058009B2 (en) | Target protein and target gene in drug designing and screening method | |
| GB2402938A (en) | Kinase assay | |
| JPWO2007026969A1 (ja) | 創薬標的タンパク質及び標的遺伝子、並びにスクリーニング方法 | |
| WO2020231503A9 (en) | Treatment of heart disease by disruption of the anchoring of pp2a | |
| KR101419999B1 (ko) | Akt 음성 조절제로서의 Hades의 용도 | |
| US20090181003A1 (en) | Regulation of S6 Kinsase Protein Activity and Related Methods | |
| JP4476805B2 (ja) | 精製PKBSer473キナーゼおよびその用途 | |
| WO2001096575A1 (en) | Ceramide kinase and dna encoding the same | |
| Matsiulka | Regulation by Glycogen Synthase Kinase-3 Beta of CBP transcriptional coactivator involved in insulin-dependent glucagon gene transcription | |
| JP2003061698A (ja) | がん細胞の脱分化抑制物質の探索方法 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20100219 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20120110 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20120307 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20120406 |
|
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20120410 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
| FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20150420 Year of fee payment: 3 |
|
| FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20150420 Year of fee payment: 3 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |