JP2024095771A - 抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩 - Google Patents
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Abstract
Description
〔1〕下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩。
〔2〕前記親和性物質がペプチドである、〔1〕の化合物またはその塩。
〔3〕前記ペプチドが、モノクローナル抗体の定常領域に対する結合能を有するペプチドである、〔2〕の化合物またはその塩。
〔4〕前記ペプチドが、モノクローナル抗体のFc領域に対する結合能を有するペプチドである、〔2〕または〔3〕の化合物またはその塩。
〔5〕前記ペプチドが、IgGのFc領域に対する結合能を有するペプチドである、〔4〕の化合物またはその塩。
〔6〕前記ペプチドが、10~40のアミノ酸残基を有する、〔2〕~〔5〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔7〕前記ペプチドが、
(a)(a-1-1)FNMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号11)のアミノ酸配列、または、
(a-1-2)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号12)のアミノ酸配列において、
配列中のいずれかの1~3つのアミノ酸残基が、同一でも異なってもよく、リジン残基、アスパラギン酸残基、およびグルタミン酸残基からなる群より選ばれる各々1つのアミノ酸残基により置換されているか、
(a-2-1)β-Ala-NMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号13)のアミノ酸配列、または、
(a-2-2)β-Ala-NMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号14)のアミノ酸配列において、
配列中のいずれかの1~3つのアミノ酸残基が、同一でも異なってもよく、リジン残基、アスパラギン酸残基、およびグルタミン酸残基からなる群より選ばれる各々1つのアミノ酸残基により置換されており、かつ
(b)配列番号11~14の前記アミノ酸配列各々に対して85%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む、〔2〕~〔6〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔8〕前記ペプチドが、
式1-1:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-I-I-W-C-(X0-3)b(配列番号15)
式1-2:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-I-V-W-C-(X0-3)b(配列番号16)
式1-3:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-V-V-W-C-(X0-3)b(配列番号17)
式1-4:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-A-V-W-C-(X0-3)b(配列番号18)
式1-5:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-L-L-W-C-(X0-3)b(配列番号19)
式1-6:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-L-I-W-C-(X0-3)b(配列番号20)
式1-7:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-L-V-F-C-(X0-3)b(配列番号21)
式1-8:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Q-V-W-C-(X0-3)b(配列番号22)
式1-9:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-E-V-W-C-(X0-3)b(配列番号23)
〔式中、
(X0-3)aは、なし、アルギニン残基-グリシン残基-アスパラギン残基、グリシン残基-アスパラギン残基、アスパラギン酸残基、またはアスパラギン残基であり、
(X0-3)bは、なし、スレオニン残基-チロシン残基-ヒスチジン残基、またはスレオニン残基であり、
Xaa1は、アラニン残基であり、
Xaa2は、チロシン残基、トリプトファン残基、またはヒスチジン残基であり、
Xaa3は、ヒスチジン残基、フェニルアラニン残基、チロシン残基、トリプトファン残基、アルギニン残基、またはグリシン残基であり、
Xaa4は、リジン残基、アスパラギン酸残基、またはグルタミン酸残基であり、
Xaa5は、グリシン残基、セリン残基、アスパラギン残基、グルタミン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、フェニルアラニン残基、チロシン残基、トリプトファン残基、ヒスチジン残基、スレオニン残基、ロイシン残基、アラニン残基、バリン残基、イソロイシン残基、またはアルギニン残基であり、
Xaa6は、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基である。〕、あるいは
式2-1:(X0-3’)a-C-(Xaa1’)-(Xaa2’)-(Xaa3’)-(Xaa4’)-(Xaa5’)-(Xaa6’)-L-V-W-C-(X0-3’)b(配列番号24)
〔式中、
(X0-3’)aおよび(X0-3’)bはそれぞれ、前記(X0-3)aおよび(X0-3)bと同じであり、
Xaa1’、Xaa2’、Xaa3’、Xaa4’、Xaa5’、Xaa6’はそれぞれ、前記Xaa1、Xaa2、Xaa3、Xaa4、Xaa5、Xaa6と同じである。〕のいずれかのアミノ酸配列を含む、〔2〕~〔6〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔9〕前記脱離基が、(1)-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、または(2)ヘテロアリーレンである、〔1〕~〔8〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔10〕前記求核基が、リジン残基の側鎖におけるNH2、チロシン残基の側鎖におけるOH、セリン残基の側鎖におけるOH、スレオニン残基の側鎖におけるOH、およびシステイン残基の側鎖におけるSHからなる群より選ばれる基である、〔1〕~〔9〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔11〕前記求電子基が、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基である、〔1〕~〔10〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔12〕前記生体直交性官能基が、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、ハロゲン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、チオエステル残基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、およびセレン残基からなる群より選ばれる基である、〔1〕~〔11〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔13〕前記生体直交性官能基が、アジド残基、チオール残基、アルキン残基、マレイミド残基、およびジスルフィド残基からなる群より選ばれる基である、〔1〕~〔12〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔14〕前記式(I)で表される化合物が、下記式(I-1):
A-L1-L2-E1-E2-E3-B (I-1)
〔式中、
AおよびBは、前記式(I)のものと同じであり、
L1は、結合または2価の基であり、
L2は、脱離基であり、
E1は、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりE1から切断されて脱離する能力を有する。〕で表される化合物である、〔1〕~〔13〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔15〕前記L2が、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、〔14〕の化合物またはその塩。
〔16〕前記L2が、下記構造式からなる群より選ばれる基である、〔14〕または〔15〕の化合物またはその塩:
mは、0~4の整数であり、
nは、0~3の整数であり、
Rは、水素原子、または炭素原子数1~6のアルキルであり、
○(白丸)は、L1に対する結合手であり、●(黒丸)は、E1に対する結合手である。)。
〔17〕AとEとを連結するLまたはL1-L2の主鎖が20個以下の原子からなる、〔1〕~〔16〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔18〕前記式(I-1)で表される化合物が、下記式(I-2):
A-L1-L2-E1-X-Y-E3-B (I-2)
〔式中、
A、L1、X、Y、およびBは、前記式(I-1)のものと同じであり、
L2は、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である。〕で表される化合物である、〔14〕~〔17〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔19〕前記式(I-1)で表される化合物が、下記式(I-3):
A、L1、環Z、およびBは、前記式(I-1)のものと同じであり、
L2は、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕で表される化合物である、〔14〕~〔17〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔20〕下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を含む、生体直交性官能基による抗体の位置選択的修飾試薬。
〔21〕生体直交性官能基を有する抗体またはその塩の製造方法であって、
下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を、抗体と反応させて、
下記式(II):
Ab-E-B (II)
〔式中、
EおよびBは、前記式(I)のものと同じであり、
Abは、抗体である。〕で表される、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩を生成することを含む、方法。
〔22〕機能性物質を有する抗体またはその塩の製造方法であって、
(1)下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を、抗体と反応させて、
下記式(II):
Ab-E-B (II)
〔式中、
EおよびBは、前記式(I)のものと同じであり、
Abは、抗体である。〕で表される、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩を生成すること;ならびに
(2)前記式(II)で表される、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩を、生体直交性官能基を介して機能性物質と反応させて、
下記式(III):
Ab-E-B’-F (III)
〔式中、
Abは、前記式(II)のものと同じであり、
Eは、前記式(I)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、機能性物質を有する抗体またはその塩を生成することを含む、方法。
〔23〕下記式(II-1):
Ab-E1-E2-E3-B (II-1)
〔式中、
Abは、抗体であり、
E1は、抗体中の求核基と連結している求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基である。〕で表される、生体直交性官能基を位置選択的に有する抗体またはその塩。
〔24〕前記抗体が、モノクローナル抗体の定常領域のみに生体直交性官能基を有する抗体である、〔23〕の抗体またはその塩。
〔25〕前記抗体が、モノクローナル抗体のFc領域のみに生体直交性官能基を有する抗体である、〔23〕または〔24〕の抗体またはその塩。
〔26〕前記抗体が、ヒトIgG Fc領域における246~248位または288~290位のアミノ酸残基からなる領域において、生体直交性官能基を位置選択的に有するヒトIgGである、〔23〕~〔25〕のいずれかの抗体またはその塩。
〔27〕前記式(II-1)で表される前記抗体が、下記式(II-2):
Ab-E1-X-Y-E3-B (II-2)
〔式中、
Ab、X、Y、およびBは、前記式(II-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を位置選択的に有する抗体である、〔23〕~〔26〕のいずれかの抗体またはその塩。
〔28〕前記式(II-1)で表される前記抗体が、下記式(II-3):
Ab、環構成原子X’、環Z、およびBは、前記式(II-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を位置選択的に有する抗体である、〔23〕~〔26〕のいずれかの抗体またはその塩。
〔29〕下記式(III-1):
Ab-E1-E2-E3-B’-F (III-1)
〔式中、
Abは、抗体であり、
E1は、抗体中の求核基と連結している求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、機能性物質を位置選択的に有する抗体またはその塩。
〔30〕前記抗体が、モノクローナル抗体の定常領域のみに生体直交性官能基を有する抗体である、〔29〕の抗体またはその塩。
〔31〕前記抗体が、モノクローナル抗体のFc領域のみに生体直交性官能基を有する抗体である、〔29〕または〔30〕の抗体またはその塩。
〔32〕前記抗体が、ヒトIgG Fc領域における246~248位または288~290位のアミノ酸残基からなる領域において、機能性物質を位置選択的に有するヒトIgGである、〔29〕~〔31〕のいずれかの抗体またはその塩。
〔33〕前記式(III-1)で表される前記抗体が、下記式(III-2):
Ab-E1-X-Y-E3-B’-F (III-2)
〔式中、
Ab、X、Y、B’およびFは、前記式(III-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である〕で表される、機能性物質を位置選択的に有する抗体である、〔29〕~〔32〕のいずれかの抗体またはその塩。
〔34〕前記式(III-1)で表される前記抗体が、下記式(III-3):
Ab、環構成原子X’、環Z、B’およびFは、前記式(III-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕で表される、機能性物質を位置選択的に有する抗体である、〔29〕~〔32〕のいずれかの抗体またはその塩。
〔35〕下記式(IV):
A-L-E-F (IV)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および機能性物質を有する化合物またはその塩。
〔36〕下記式(IV):
A-L-E-F (IV)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および機能性物質を有する化合物またはその塩を含む、機能性物質による抗体の位置選択的修飾試薬。
〔37〕機能性物質を有する抗体またはその塩の製造方法であって、
下記式(IV):
A-L-E-F (IV)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および機能性物質を有する化合物またはその塩を、抗体と反応させて、
下記式(III):
Ab-E-F (III)
〔式中、
Abは、抗体であり、
EおよびFは、前記式(IV)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を有する抗体またはその塩を生成することを含む、方法。
生体直交性官能基を位置選択的に有する本発明の抗体またはその塩は、例えば、機能性物質を位置選択的に有する抗体またはその塩の調製における中間体として有用である。
機能性物質を位置選択的に有する本発明の抗体またはその塩は、例えば、医薬、または試薬(例、診断薬、研究用試薬)として有用である。
1-1.概要
本発明は、式(I)で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を提供する。
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕
他の式においても、抗体に対する親和性物質(A)または抗体(Ab)は、式中の特定構造単位(AまたはAbを除く構造単位)を、共有結合を介して含むことを示す。したがって、他の式においても、抗体に対する親和性物質(A)または抗体(Ab)は、1個の特定構造単位、または複数(例えば2~5個、好ましくは2~4個、より好ましくは2または3個)の特定構造単位(同種または異種)を有していてもよい。
式(I)において、Aは、抗体に対する親和性物質である。抗体に対する親和性物質とは、抗体に対して非共有結合による結合能を有する物質である。
(1)露出リジン残基
CH2ドメイン(246位、248位、274位、288位、290位、317位、320位、322位、338位)
CH3ドメイン(360位、414位、439位)
(2)露出チロシン残基
CH2ドメイン(278位、296位、300位)
CH3ドメイン(436位)
(3)露出セリン残基
CH2ドメイン(254位、267位、298位、324位)
CH3ドメイン(375位、400位、415位、440位、442位)
(4)露出スレオニン残基
CH2ドメイン(256位、289位、307位)
CH3ドメイン(335位、359位、393位、437位)
したがって、ヒトIgG1等のヒトIgGがリジン残基またはチロシン残基で修飾される場合、上記位置での修飾が好ましい。
(1’)露出リジン残基
CH2ドメイン(246位、248位、274位、288位、290位、317位、320位、322位)
CH3ドメイン(360位、414位、439位)
(2’)露出チロシン残基
CH2ドメイン(278位、296位、300位)
CH3ドメイン(436位)
(3’)露出セリン残基
CH2ドメイン(254位、267位、298位)
CH3ドメイン(400位、415位、440位)
(4’)露出スレオニン残基
CH2ドメイン(256位、289位)
CH3ドメイン(335位、359位)
したがって、ヒトIgG1等のヒトIgGがリジン残基、チロシン残基、セリン残基またはスレオニン残基で修飾される場合、上記位置での修飾がより好ましい。
(1)Lys248残基(以下、本明細書では単に「Lys248」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の18番目の残基に相当する)またはLys246残基(以下、本明細書では単に「Lys246」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の16番目の残基に相当する):
(2)Lys288残基(以下、本明細書では単に「Lys288」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の58番目の残基に相当する)またはLys290残基(以下、本明細書では単に「Lys290」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の60番目の残基に相当する);
(3)Lys317残基(以下、本明細書では単に「Lys317」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の87番目の残基に相当する)。
PD-L1、GD2、PDGFRα(血小板由来成長因子受容体)、CD22、HER2、ホスファチジルセリン(PS)、EpCAM、フィブロネクチン、PD-1、VEGFR-2、CD33、HGF、gpNMB、CD27、DEC-205、葉酸受容体、CD37、CD19、Trop2、CEACAM5、S1P、HER3、IGF-1R、DLL4、TNT-1/B、CPAAs、PSMA、CD20、CD105(エンドグリン)、ICAM-1、CD30、CD16A、CD38、MUC1、EGFR、KIR2DL1,2,、NKG2A、tenascin-C、IGF(Insulin-like growth factor)、CTLA-4、mesothelin、CD138、c-Met、Ang2、VEGF-A、CD79b、ENPD3、葉酸受容体α、TEM-1、GM2、グリピカン3、macrophage inhibitory factor、CD74、Notch1、Notch2、Notch3、CD37、TLR-2、CD3、CSF-1R、FGFR2b、HLA-DR、GM-CSF、EphA3、B7-H3、CD123、gpA33、Frizzled7受容体、DLL4、VEGF、RSPO、LIV-1、SLITRK6、Nectin-4、CD70、CD40、CD19、SEMA4D(CD100)、CD25、MET、Tissue Factor、IL-8、EGFR、cMet、KIR3DL2、Bst1(CD157)、P-カドヘリン、CEA、GITR、TAM(tumor associated macrophage)、CEA、DLL4、Ang2、CD73、FGFR2、CXCR4、LAG-3、GITR、Fucosyl GM1、IGF-1、Angiopoietin 2、CSF-1R、FGFR3、OX40、BCMA、ErbB3、CD137(4-1BB)、PTK7、EFNA4、FAP、DR5、CEA、Ly6E、CA6、CEACAM5、LAMP1、tissue factor、EPHA2、DR5、B7-H3、FGFR4、FGFR2、α2-PI、A33、GDF15、CAIX、CD166、ROR1、GITR、BCMA、TBA、LAG-3、EphA2、TIM-3、CD-200、EGFRvIII、CD16A、CD32B、PIGF、Axl、MICA/B、Thomsen-Friedenreich、CD39、CD37、CD73、CLEC12A、Lgr3、トランスフェリン受容体、TGFβ、IL-17、5T4、RTK、Immune Suppressor Protein、NaPi2b、ルイス血液型B抗原、A34、Lysil-Oxidase、DLK-1、TROP-2、α9インテグリン、TAG-72(CA72-4)、CD70
IL-17、IL-6R、IL-17R、INF-α、IL-5R、IL-13、IL-23、IL-6、ActRIIB、β7-Integrin、IL-4αR、HAS、Eotaxin-1、CD3、CD19、TNF-α、IL-15、CD3ε、Fibronectin、IL-1β、IL-1α、IL-17、TSLP(Thymic Stromal Lymphopoietin)、LAMP(Alpha4 Beta 7 Integrin)、IL-23、GM-CSFR、TSLP、CD28、CD40、TLR-3、BAFF-R、MAdCAM、IL-31R、IL-33、CD74、CD32B、CD79B、IgE(免疫グロブリンE)、IL-17A、IL-17F、C5、FcRn、CD28、TLR4、MCAM、B7RP1、CXCR1,2 Ligands、IL-21、Cadherin-11、CX3CL1、CCL20、IL-36R、IL-10R、CD86、TNF-α、IL-7R、Kv1.3、α9インテグリン、LIFHT
CGRP、CD20、βアミロイド、βアミロイドプロトフィブリン、Calcitonin Gene-Related Peptide Receptor、LINGO(Ig Domain Containing1)、αシヌクレイン、細胞外tau、CD52、インスリン受容体、tauタンパク、TDP-43、SOD1、TauC3、JCウイルス
Clostridium Difficile toxin B、サイトメガロウイルス、RSウイルス、LPS、S.Aureus Alpha-toxin、M2eタンパク、Psl、PcrV、S.Aureus toxin、インフルエンザA、Alginate、黄色ブドウ球菌、PD-L1、インフルエンザB、アシネトバクター、F-protein、Env、CD3、病原性大腸菌、クレブシエラ、肺炎球菌
アミロイドAL、SEMA4D(CD100)、インスリン受容体、ANGPTL3、IL4、IL13、FGF23、副腎皮質刺激ホルモン、トランスサイレチン、ハンチンチン
Factor D、IGF-1R、PGDFR、Ang2、VEGF-A、CD-105(Endoglin)、IGF-1R、βアミロイド
Sclerostin、Myostatin、Dickkopf-1、GDF8、RNAKL、HAS、Siglec-15
vWF、Factor IXa、Factor X、IFNγ、C5、BMP-6、Ferroportin、TFPI
BAFF(B cell activating factor)、IL-1β、PCSK9、NGF、CD45、TLR-2、GLP-1、TNFR1、C5、CD40、LPA、プロラクチン受容体、VEGFR-1、CB1、Endoglin、PTH1R、CXCL1、CXCL8、IL-1β、AT2-R、IAPP
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。
(1)ヒトIgG全般(すなわち、ヒトIgG1、IgG2、IgG3およびIgG4。以下同様)の特定領域(CH2領域)に親和性を有するIgG結合ペプチド(例、国際公開第2016/186206号、国際公開2013/027796号、国際公開第2008/054030号を参照);
(2)ヒトIgG全般の特定領域(CH2領域)に親和性を有するProteinA Mimetic(PAM) peptide(例、Fassina G et al.,JOURNAL OF MOLECULAR RECOGNITION,1996,VOL.6,564-569を参照);
(3)ヒトIgG全般の特定領域(CH2領域)に親和性を有するEPIHRSTLTALL(配列番号25)(例、Ehrlich G.K et al.,J.Biochem.Biophys.Methods,2001,VOL.49,443-454を参照);
(4)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有する(NH2-Cys1-X1-X2-X3-X4)2-Lys-Gly-OH(例、Ruvo M et al.,ChemBioChem,2005,VOL.6,1242-1253を参照);
(5)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するFARLVSSIRY(配列番号26)、FGRLVSSIRY(配列番号27)、およびTWKTSRISIF(配列番号28)(例、Krook M et al.,Journal of Immunological Methods,1998,VOL.221,151-157を参照);
(6)ヒトIgG全般の特定領域に親和性を有するQSYP(配列番号29)(例、Jacobs J.M. et al.,Bio.Techniques,2003,VOL.34,132-141を参照);
(7)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するHWRGWV(配列番号30)、HYFKFD(配列番号31)、およびHFRRHL(配列番号32)(例、Carbonell R.G. et al.,Journal of Chromatography A,2009,VOL.1216,910-918を参照);
(8)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するDAAG(配列番号33)(例、Lund L.N. et al.,Journal of Chromatography A,2012,VOL.1225,158-167を参照);
(9)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するFc-I、Fc-II、およびFc-III(例、Warren L.Delano et al.,Science,2000,VOL.287,1279-1283;国際公開2001/045746号を参照);ならびに
(10)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するNARKFYKG(配列番号34)、およびNKFRGKYK(配列番号35)(例、Biochemical Engineering Journal,2013,VOL.79,33-40を参照)。
(a-1-1)FNMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号11)のアミノ酸配列(例、化合物22~24、29を参照)、または、
(a-1-2)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号12)のアミノ酸配列(公知配列Z34Cにおいて2つのKがRで置換されているアミノ酸配列)において、配列中のいずれかの1~3つのアミノ酸残基が、同一でも異なってもよく、リジン残基、アスパラギン酸残基、およびグルタミン酸残基からなる群より選ばれる各々1つのアミノ酸残基により置換されているか、
(a-2-1)β-Ala-NMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号13)のアミノ酸配列(例、化合物26~28を参照)、または、
(a-2-2)β-Ala-NMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号14)のアミノ酸配列(公知配列Z34Cにおいて2つのKがRで置換されており、かつN末端のFがβ-Alaで置換されているアミノ酸配列)において、配列中のいずれかの1~3つのアミノ酸残基が、同一でも異なってもよく、リジン残基、アスパラギン酸残基、およびグルタミン酸残基からなる群より選ばれる各々1つのアミノ酸残基により置換されており、かつ
(b)配列番号11~14の前記アミノ酸配列各々に対して85%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むペプチド。
このようなペプチドは、モノクローナル抗体のFc領域に対する結合能を有する。
(c)以下(1)~(16)のアミノ酸配列からなる群より選ばれるアミノ酸配列:
(1)FNMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIKDD(配列番号5);
(2)FNMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIKSIRDD(配列番号6);
(3)β-Ala-NMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号7);
(4)FNMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNAKIKSIKDD(配列番号8);
(5)KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号37);
(6)FNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号38);
(7)FNMQCQRRFYEAKHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号39);
(8)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRKARIRSIRDDC(配列番号40);
(9)FNMQCQRRFYEALHDPNLNKEQRNARIRSIRDDC(配列番号41);
(10)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIKDDC(配列番号42);
(11)FNKQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号43);
(12)FNMQCKRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号44);
(13)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRKDC(配列番号45);
(14)β-Ala-NMQQQRRFYEALHDPNLEEQRNARIRSI(配列番号97);
(15)FNMQQQRRFYEALHDPNLNKEQRNARIRSIRDD(配列番号98);および
(16)β-Ala-NMQQQRRFYEALHDPNLEEQRNARIRSIKDD(配列番号100);あるいは
(d)上記(1)~(16)のいずれかのアミノ酸配列において、1つのリジン残基および2つのシステイン残基以外の位置(例、1位、3位、6位、7位、13位、20位、24位、31位、および32位の位置)において、リジン残基以外の19種のアミノ酸残基の変異を有する、上記(1)~(16)のいずれかのアミノ酸配列に対して90%以上の同一性(上述したような個数のアミノ酸残基の修飾であってもよい)を有するアミノ酸配列。
このようなアミノ酸配列を含むペプチドは、IgGのFc領域に対する結合能を有することが確認されている。(d)の上記アミノ酸配列を有する親和性ペプチドは、モノクローナル抗体の定常領域に対する結合能を有するペプチドが好ましく、モノクローナル抗体のFc領域に対する結合能を有するペプチドがより好ましく、IgGのFc領域に対する結合能を有するペプチドがさらにより好ましい。
式1-1:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-I-I-W-C-(X0-3)b(配列番号15)
式1-2:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-I-V-W-C-(X0-3)b(配列番号16)
式1-3:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-V-V-W-C-(X0-3)b(配列番号17)
式1-4:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-A-V-W-C-(X0-3)b(配列番号18)
式1-5:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-L-L-W-C-(X0-3)b(配列番号19)
式1-6:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-L-I-W-C-(X0-3)b(配列番号20)
式1-7:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-L-V-F-C-(X0-3)b(配列番号21)
式1-8:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Q-V-W-C-(X0-3)b(配列番号22)
式1-9:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-E-V-W-C-(X0-3)b(配列番号23)
〔式中、
(X0-3)aは、なし、アルギニン残基-グリシン残基-アスパラギン残基、グリシン残基-アスパラギン残基、アスパラギン酸残基、またはアスパラギン残基であり、
(X0-3)bは、なし、スレオニン残基-チロシン残基-ヒスチジン残基、またはスレオニン残基であり、
Xaa1は、アラニン残基であり、
Xaa2は、チロシン残基、トリプトファン残基、またはヒスチジン残基であり、
Xaa3は、ヒスチジン残基、フェニルアラニン残基、チロシン残基、トリプトファン残基、アルギニン残基、またはグリシン残基であり、
Xaa4は、リジン残基、アスパラギン酸残基、またはグルタミン酸残基であり、
Xaa5は、グリシン残基、セリン残基、アスパラギン残基、グルタミン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、フェニルアラニン残基、チロシン残基、トリプトファン残基、ヒスチジン残基、スレオニン残基、ロイシン残基、アラニン残基、バリン残基、イソロイシン残基、またはアルギニン残基であり、
Xaa6は、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基である。〕、あるいは
式2-1:(X0-3’)a-C-(Xaa1’)-(Xaa2’)-(Xaa3’)-(Xaa4’)-(Xaa5’)-(Xaa6’)-L-V-W-C-(X0-3’)b(配列番号24)
〔式中、
(X0-3’)aおよび(X0-3’)bはそれぞれ、前記(X0-3)aおよび(X0-3)bと同じであり、
Xaa1’、Xaa2’、Xaa3’、Xaa4’、Xaa5’、Xaa6’はそれぞれ、前記Xaa1、Xaa2、Xaa3、Xaa4、Xaa5、Xaa6と同じである。
〕。
このようなペプチドは、モノクローナル抗体のFc領域に対する結合能を有する。
(1’) RGNCAYHKGQIIWCTYH(配列番号46);
(2’) RGNCAYHKGQIVWCTYH(配列番号47);
(3’) RGNCAYHKGQVVWCTYH(配列番号48);
(4’) RGNCAYHKGQAVWCTYH(配列番号49);
(5’) RGNCAYHKGQLLWCTYH(配列番号50);
(6’) RGNCAYHKGQLIWCTYH(配列番号51);
(7’) DCAYHKGQIVWCT (配列番号52);
(8’) DCAYHKGQVVWCT (配列番号53);
(9’) DCAYHKGQAVWCT (配列番号54);
(10’)RGNCAYHKSQIIWCTYH(配列番号55);
(11’)RGNCAYHKNQIIWCTYH(配列番号56);
(12’)RGNCAYHKDQIIWCTYH(配列番号57);
(13’)RGNCAYHKQQIIWCTYH(配列番号58);
(14’)RGNCAYHKEQIIWCTYH(配列番号59);
(15’)RGNCAYHKFQIIWCTYH(配列番号60);
(16’)RGNCAYHKYQIIWCTYH(配列番号61);
(17’)RGNCAYHKWQIIWCTYH(配列番号62);
(18’)RGNCAYHKHQIIWCTYH(配列番号63);
(19’)RGNCAYHKTQIIWCTYH(配列番号64);
(20’)RGNCAYHKLQIIWCTYH(配列番号65);
(21’) CAYHKLQIVWC (配列番号66);
(22’) CAYHKLQLIWC (配列番号67);
(23’) CAYHKSQIVWC (配列番号68);
(24’)RGNCAYHKGQLVFCTYH(配列番号69);
(25’)RGNCAYHKGQQVWCTYH(配列番号70);
(26’)RGNCAYHKGQEVWCTYH(配列番号71);
(27’) CAYHKGQLVWC (配列番号72);
(28’)RGNCAYHKAQLVWCTYH(配列番号73);
(29’)RGNCAYHKVQLVWCTYH(配列番号74);
(30’)RGNCAYHKLQLVWCTYH(配列番号75);
(31’)RGNCAYHKIQLVWCTYH(配列番号76);
(32’)RGNCAYHKSQLVWCTYH(配列番号77);
(33’)RGNCAYHKTQLVWCTYH(配列番号78);
(34’)RGNCAYHKNQLVWCTYH(配列番号79);
(35’)RGNCAYHKDQLVWCTYH(配列番号80);
(36’)RGNCAYHKQQLVWCTYH(配列番号81);
(37’)RGNCAYHKEQLVWCTYH(配列番号82);
(38’)RGNCAYHKFQLVWCTYH(配列番号83);
(39’)RGNCAYHKRQLVWCTYH(配列番号84);
(40’)RGNCAYHKHQLVWCTYH(配列番号85);
(41’)RGNCAYHKWQLVWCTYH(配列番号86);
(42’)RGNCAYHKYQLVWCTYH(配列番号87);
(43’)RGNCAYFKGQLVWCTYH(配列番号88);
(44’)RGNCAYYKGQLVWCTYH(配列番号89);
(45’)RGNCAYWKGQLVWCTYH(配列番号90);
(46’)RGNCAYRKGQLVWCTYH(配列番号91);
(47’)RGNCAYGKGQLVWCTYH(配列番号92);
(48’) DCAYHKGQLVWC (配列番号93);
(49’) NCAYHKGQLVWC (配列番号94);
(50’) CAYHKGQLVWCT (配列番号95);
(51’) CAYHKSQLVWC (配列番号96);
(52’) GNCAYHKGQIIWCTYH(配列番号99);および
(53’)RGNCAYHEGQIIWCTYH(配列番号108)。
このようなアミノ酸配列を含むペプチドは、IgGのFc領域に対する結合能を有することが確認されている。
式(I)において、Lは、脱離基を含む2価の基である。
(1)-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、または-O-N(R)-からなる基;あるいは
(2)-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、または-O-N(R)-およびその脱離する能力を高める基を含む基。
(i)ハロゲン原子;
(ii)1価の炭化水素基;
(iii)アラルキル;
(iv)1価の複素環基;
(v)Ra-O-、Ra-C(=O)-、Ra-O-C(=O)-、もしくはRa-C(=O)-O-(Raは、水素原子、もしくは1価の炭化水素基を示す。);または
(vi)NRbRc-、NRbRc-C(=O)-、NRbRc-C(=O)-O-、もしくはRb-C(=O)-NRc-(RbおよびRcは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは1価の炭化水素基を示す。);
(vii)ニトロ基、硫酸基、スルホン酸基、シアノ基、およびカルボキシル基。
(i’)ハロゲン原子;
(ii’)炭素原子数1~12のアルキル、フェニル、もしくはナフチル;
(iii’)炭素原子数3~15のアラルキル;
(iv’)5員または6員の複素環;
(v’)Ra-O-、Ra-C(=O)-、Ra-O-C(=O)-、もしくはRa-C(=O)-O-(Raは、水素原子、もしくは炭素原子数1~12のアルキルを示す。);または
(vi’)NRbRc-、NRbRc-C(=O)-、NRbRc-C(=O)-O-、もしくはRb-C(=O)-NRc-(RbおよびRcは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは炭素原子数1~12のアルキルを示す。);
(vii’)上記(vii)で列挙したものと同じ基。
(i’’)ハロゲン原子;
(ii’’)炭素原子数1~12のアルキル;
(iii’’)Ra-O-、Ra-C(=O)-、Ra-O-C(=O)-、もしくはRa-C(=O)-O-(Raは、水素原子、もしくは炭素原子数1~12のアルキルを示す。);または
(iv’’)NRbRc-、NRbRc-C(=O)-、NRbRc-C(=O)-O-、もしくはRb-C(=O)-NRc-(RbおよびRcは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは炭素原子数1~12のアルキルを示す。);
(v’’)上記(vii)で列挙したものと同じ基。
(i’’’)ハロゲン原子;
(ii’’’)炭素原子数1~6のアルキル;
(iii’’’)Ra-O-、Ra-C(=O)-、Ra-O-C(=O)-、もしくはRa-C(=O)-O-(Raは、水素原子、もしくは炭素原子数1~6のアルキルを示す。);または
(iv’’’)NRbRc-、NRbRc-C(=O)-、NRbRc-C(=O)-O-、もしくはRb-C(=O)-NRc-(RbおよびRcは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは炭素原子数1~6のアルキルを示す。);
(v’’’)上記(vii)で列挙したものと同じ基。
(i’’’’)ハロゲン原子;
(ii’’’’)炭素原子数1~4のアルキル;
(iii’’’’)Ra-O-、Ra-C(=O)-、Ra-O-C(=O)-、もしくはRa-C(=O)-O-(Raは、水素原子、もしくは炭素原子数1~4のアルキルを示す。);または
(iv’’’’)NRbRc-、NRbRc-C(=O)-、NRbRc-C(=O)-O-、もしくはRb-C(=O)-NRc-(RbおよびRcは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは炭素原子数1~4のアルキルを示す。);
(v’’’’)上記(vii)で列挙したものと同じ基。
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕
mは、0~4の整数であり、
nは、0~3の整数であり、
Rは、水素原子、または炭素原子数1~6のアルキルであり、
○(白丸)は、L1に対する結合手であり、●(黒丸)は、E1に対する結合手である。)。
電子吸引性基、および炭素原子数1~6のアルキルの詳細は、上述のとおりである。mは、好ましくは1~4の整数であり、より好ましくは1、2または3である。nは、好ましくは1~3の整数であり、より好ましくは1または2である。
(a)の場合、最短経路は太字経路であるため、主鎖の原子数として数えられる2価の環構造中の原子数は、2である。
(b)の場合、最短経路は太字経路であるため、主鎖の原子数として数えられる2価の環構造中の原子数は、3である。
(c)の場合、いずれの経路も最短経路(等距離)であるため、主鎖の原子数として数えられる2価の環構造中の原子数は、4である。
(d)の場合、縮合部位の経路が最短経路であるため、主鎖の原子数として数えられる2価の環構造中の原子数は、4である。
式(I)において、Lは、(i)脱離基と連結しており、かつ(ii)抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基である。
(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕;あるいは
(b)下記式(i):
(1)脱離基が-N(R)-または-N(OR)-である場合、Xとしては、C(R1)(R2)、またはN(R3)が好ましく、C(R1)(R2)がより好ましい。
(2)脱離基が-O-である場合、Xとしては、C(R1)(R2)、N(R3)、またはOが好ましく、C(R1)(R2)、またはN(R3)がより好ましく、C(R1)(R2)がさらにより好ましい。
(3)脱離基が-S-である場合、Xとしては、C(R1)(R2)、N(R3)、O、またはSが好ましく、C(R1)(R2)、N(R3)、またはOがより好ましく、C(R1)(R2)、またはN(R3)がさらにより好ましく、C(R1)(R2)がなおさらにより好ましい。
(4)脱離基が-Se-である場合、Xとしては、C(R1)(R2)、N(R3)、O、S、またはSeが好ましく、C(R1)(R2)、N(R3)、O、またはSがより好ましく、C(R1)(R2)、N(R3)、またはOがさらにより好ましく、C(R1)(R2)、またはN(R3)がなおさらにより好ましく、C(R1)(R2)が最も好ましい。
(5)脱離基がヘテロアリーレンである場合、Xとしては、C(R1)(R2)、N(R3)、O、S、またはSeが好ましく、C(R1)(R2)、N(R3)、O、またはSがより好ましく、C(R1)(R2)、N(R3)、またはOがさらにより好ましく、C(R1)(R2)、またはN(R3)がなおさらにより好ましく、C(R1)(R2)が最も好ましい。
式(I)において、Bは、生体直交性官能基である。
R1f、単一もしくは複数のR1gおよび単一もしくは複数のR1hは、同一もしくは異なって、(a)~(g)からなる群より選ばれる原子もしくは基、または電子吸引基であり、
・は、結合手である。)
(a)水素原子、またはハロゲン原子;
(b)1価の炭化水素基;
(c)アラルキル;
(d)1価の複素環基;
(e)Ra-O-、Ra-C(=O)-、Ra-O-C(=O)-、もしくはRa-C(=O)-O-(Raは、水素原子、もしくは1価の炭化水素基を示す。);または
(f)NRbRc-、NRbRc-C(=O)-、NRbRc-C(=O)-O-、もしくはRb-C(=O)-NRc-(RbおよびRcは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは1価の炭化水素基を示す。);
(g)ニトロ基、硫酸基、スルホン酸基、シアノ基、もしくはカルボキシル基
からなる群より選ばれる基。
(a)~(g)におけるハロゲン原子、1価の炭化水素基、アラルキル、1価の複素環基、およびRa~Rcにおける1価の炭化水素基の定義、例および好ましい例は、上記(i)~(vii)におけるものと同じである。特に好ましくは、(a)~(g)からなる群より選ばれる原子もしくは基は、(a)または(b)の原子もしくは基である。
好ましい実施形態では、式(I)で表される化合物は、下記式(I-1):
A-L1-L2-E1-E2-E3-B (I-1)
〔式中、
AおよびBは、式(I)のものと同じであり、
L1は、結合または2価の基であり、
L2は、脱離基であり、
E1は、(i)脱離基と連結しており、かつ(ii)抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
脱離基は、上記求核基と上記求電子基との間の反応によりE1から切断されて脱離する能力を有する。〕で表される化合物であってもよい。
A-L1-L2-E1-X-Y-E3-B (I-2)
〔式中、
A、L1、X、Y、およびBは、式(I-1)のものと同じであり、
L2は、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である。〕で表される化合物であってもよい。
A、L1、環Z、環構成原子X’、およびBは、前記式(I-1)のものと同じであり、
L2は、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕で表される化合物であってもよい。
A、L1、およびBは、前記式(I-1)のものと同じであり、
L2は、(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
環Zは、E1と結合する環構成原子およびその両隣の環構成原子の全てが炭素原子である2価の環基である。)で表される基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕で表される化合物であってもよい。
抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩は、適宜調製することができる。抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩は、式(I)、好ましくは式(I-1)、より好ましくは式(I-2)、(I-3)または(I-4)で表される。
後述の発明〔例、式(II)、(III)およびその下位概念の式、ならびに部分構造式で表される発明〕では、任意の記号(例、A、L、E、B)、および当該記号に関連して表される用語の詳細(例えば、定義、例および好ましい例)は、上記式(I)またはその下位概念の式で表される化合物またはその塩の発明と共通する。また、後述の発明を規定することができる特定の基(例、生体直交性官能基、2価の基、置換基)、および特定の数値等の任意の技術要素(例、定義、例および好ましい例)についても、上記で説明したものと共通にすることができる。したがって、これらの事項は、特に言及することなく、後述の発明において適宜援用することができる。同様に、後述の発明で述べた特定の発明の技術要素は、本発明および他の発明の技術要素として、適宜援用することができる。
本発明は、以下を含む、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩の製造方法を提供する。
(1)下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)脱離基と連結しており、かつ(ii)抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
脱離基は、上記求核基と上記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を、抗体と反応させて、
下記式(II):
Ab-E-B (II)
〔式中、
EおよびBは、式(I)のものと同じであり、
Abは、抗体である。〕で表される、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩を生成すること。
Ab-E1-E2-E3-B (II-1)
〔式中、
Abは、抗体であり、
E1は、抗体中の求核基と連結している求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基である。〕
Ab-E1-X-Y-E3-B (II-2)
〔式中、
Ab、X、Y、およびBは、式(II-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である。〕
Ab、環構成原子X’、環Z、およびBは、式(II-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕
Ab、環Z、およびBは、式(II-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕
本発明は、以下を含む、機能性物質を有する抗体またはその塩の製造方法を提供する。
(1)下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)脱離基と連結しており、かつ(ii)抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
脱離基は、上記求核基と上記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を、抗体と反応させて、
下記式(II):
Ab-E-B (II)
〔式中、
EおよびBは、前記式(I)のものと同じであり、
Abは、抗体である。〕で表される、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩を生成すること;ならびに
(2)前記式(II)で表される、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩を、生体直交性官能基を介して機能性物質と反応させて、
下記式(III):
Ab-E-B’-F (III)
〔式中、
Abは、式(II)のものと同じであり、
Eは、式(I)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、機能性物質を有する抗体またはその塩を生成すること。
R1f、単一もしくは複数のR1gおよび単一もしくは複数のR1hは、同一もしくは異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子もしくは基、または電子吸引基であり、・は、機能性物質に対する結合手である。)
複数のR2a、複数のR2b、および複数のR2cは、同一または異なって、水素原子または上述の置換基であり、
Jは、-CH2-、-O-、または-S-であり、
rは、1~4の任意の整数であり、
○(白丸)はF側の部分に対する結合を示し、●(黒丸)はB’側の部分に対する結合を示す。
化学構造が、切断性部分を中心にして非対称である場合、●がB’側の部分に対する結合を示し、○がF側の部分に対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する残基を含む2価の基であってもよい。
Ab-E1-E2-E3-B’-F (III-1)
〔式中、
Abは、抗体であり、
E1は、抗体中の求核基と連結している求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕
Ab-E1-X-Y-E3-B’-F (III-2)
〔式中、
Ab、X、Y、B’およびFは、前記式(III-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である。〕
Ab、環構成原子X’、環Z、B’およびFは、式(III-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕
Ab、環Z、B’およびFは、式(III-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕
本発明は、生体直交性官能基または機能性物質を位置選択的に有する抗体またはその塩を提供する。
本発明は、式(IV)で表される、抗体に対する親和性物質、および機能性物質を有する化合物またはその塩を提供する。
A-L-E-F (IV)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕
A-L1-L2-E1-E2-E3-F (IV-1)
〔式中、
AおよびFは、式(IV)のものと同じであり、
L1は、結合または2価の基であり、
L2は、脱離基であり、
E1は、(i)脱離基と連結しており、かつ(ii)抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
脱離基は、上記求核基と上記求電子基との間の反応によりE1から切断されて脱離する能力を有する。〕で表される化合物であってもよい。
A-L1-L2-E1-X-Y-E3-F (IV-2)
〔式中、
A、L1、X、YおよびFは、式(IV-1)のものと同じであり、
L2は、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である。〕で表される化合物であってもよい。
A、L1、環Z、環構成原子X’およびFは、前記式(IV-1)のものと同じであり、
L2は、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕で表される化合物であってもよい。
A、L1およびFは、前記式(IV-1)のものと同じであり、
L2は、(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
環Zは、E1と結合する環構成原子およびその両隣の環構成原子の全てが炭素原子である2価の環基である。)で表される基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕で表される化合物であってもよい。
本発明は、以下を含む、機能性物質を有する抗体またはその塩の製造方法を提供する。
下記式(IV):
A-L-E-F (IV)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および機能性物質を有する化合物またはその塩を、抗体と反応させて、
下記式(V):
Ab-E-F (V)
〔式中、
Abは、抗体であり、
EおよびFは、前記式(IV)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を有する抗体またはその塩を生成すること。
Ab-E1-E2-E3-F (V-1)
〔式中、
Abは、抗体であり、
E1、E2、E3およびFは、上記式(IV-1)のものと同じである。〕
Ab-E1-X-Y-E3-F (V-2)
〔式中、
Abは、抗体であり、
E1、X、Y、E3およびFは、上記式(IV-2)のものと同じである。〕
Abは、抗体であり、
E1、環Z、環構成原子X’、E3およびFは、上記式(IV-3)のものと同じである。〕
Abは、抗体であり、
E1、環Z、E3およびFは、上記式(IV-4)のものと同じである。〕
本発明において、塩としては、例えば、無機酸との塩、有機酸との塩、無機塩基との塩、有機塩基との塩、およびアミノ酸との塩が挙げられる。無機酸との塩としては、例えば、塩化水素、臭化水素、リン酸、硫酸、硝酸との塩が挙げられる。有機酸との塩としては、例えば、ギ酸、酢酸、トリフルオロ酢酸、乳酸、酒石酸、フマル酸、シュウ酸、マレイン酸、クエン酸、コハク酸、リンゴ酸、ベンゼンスルホン酸、p-トルエンスルホン酸との塩が挙げられる。無機塩基との塩としては、例えば、アルカリ金属(例、ナトリウム、カリウム)、アルカリ土類金属(例、カルシウム、マグネシウム)、および亜鉛、アルミニウム等の他の金属、ならびにアンモニウムとの塩が挙げられる。有機塩基との塩としては、例えば、トリメチルアミン、トリエチルアミン、プロピレンジアミン、エチレンジアミン、ピリジン、エタノールアミン、モノアルキルエタノールアミン、ジアルキルエタノールアミン、ジエタノールアミン、トリエタノールアミンとの塩が挙げられる。アミノ酸との塩としては、例えば、塩基性アミノ酸(例、アルギニン、ヒスチジン、リジン、オルニチン)、および酸性アミノ酸(例、アスパラギン酸、グルタミン酸)との塩が挙げられる。塩は、好ましくは、無機酸(例、塩化水素)との塩、または有機酸(例、トリフルオロ酢酸)との塩である。
抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する本発明の化合物またはその塩は、例えば、生体直交性官能基による抗体の位置選択的な修飾に有用である。したがって、本発明は、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を含む、生体直交性官能基による抗体の位置選択的修飾試薬を提供する。生体直交性官能基による抗体の位置選択的修飾試薬において、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩の詳細(例えば、定義、例および好ましい例)は、上述したものと同じである。
(1-1)抗体に対する親和性ペプチドの合成
抗体に対する親和性物質である下記に示したペプチドは、全て同様の方法にて調製した。Fmoc法によるRink amide樹脂をもちいたペプチド固相合成によって、N末端をアセチル基でキャッピングしたもの(化合物1,2,32~53)、N末端を3-(トリフェニルメチルチオ)プロピオン酸でキャッピングしたもの(化合物3,31,54)を調製し、トリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液にて3時間攪拌することで樹脂からの切り出しと脱保護を行った。樹脂をフィルトレーションにより除去し、ジエチルエーテルを加え沈殿を行い、ジエチルエーテルをデカンテーションすることで除去し、ペプチドを粗結晶として得た。これを分取HPLCにて精製し、生成物である親和性ペプチドを得た。
下記に示したペプチド-アジド付加体(化合物4,5)は以下の通り合成した。後に官能基化する残基のLysのみmtt基で保護されたアミノ酸を用い、Fmoc法によるRink amide樹脂を持ちいたペプチド固相合成によって、N末端をアセチル基でキャッピングしたものを調製した。ジクロロメタン:トリフルオロ酢酸:トリイソプロピルシラン=90:5:5の溶液にて1時間攪拌させ、mtt基のみを脱保護した。樹脂をDMFで洗浄した後に、トリエチルアミン(50モル当量)、アジドアセチル酸NHSエステル(10モル当量),DMF4mL)に溶解させて添加し、16時間攪拌した。溶液を除去した後トリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン=95:2.5:2.5の溶液にて1時間攪拌することで樹脂からの切り出しと脱保護を行った。樹脂をフィルトレーションにより除去し、ジエチルエーテルを加え沈殿を行い、ジエチルエーテルをデカンテーションすることで除去し、ペプチドを粗結晶として得た。これを分取HPLCにて精製し、生成物である親和性ペプチドアジド付加体を得た。
実施例1で合成した親和性ペプチドアジド体(化合物4)と実施例2で合成したイミダゾリルカルボニル化合物(化合物6,7,9)は全て同様の方法で連結させた。ペプチドアジド体を100mMのリン酸緩衝液(pH7.0)に溶解させ、アミノグアニジン塩酸塩(20モル当量)、アスコルビン酸ナトリウム(20モル当量)、100mg/mLのイミダゾリルカルボニル化合物(3モル当量)ジメチルスルホキシド溶液を加えた。この反応混合物に対して、別途調製した硫酸銅一水和物(4モル当量)とトリス(3-ヒドロキシプロピルトリアゾリルメチル)アミン (20モル当量)の水溶液を添加し、攪拌した。LC-MSで反応モニタリングを行い、原料の消失を確認した後、これを限外濾過(Amicon Ultra, 3K MWCO))にて濃縮と水希釈を4回繰り返し、得られた水溶液を凍結乾燥して下記に示すぺプチド-イミダゾリルカルボニル化合物(化合物10,11,12)を取得した。
(1-1)IgG抗体トラスツズマブ-ペプチド複合体の合成
抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)20μgを100mMのHEPES緩衝液(pH 7.2)2.0μLに溶解させ、実施例2の(2-2)で合成したぺプチド-イミダゾリルカルボニル化合物(化合物10,11,12)をそれぞれ抗体に対して20モル当量加えて、37度で4時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 3K MWCO))により水置換しペプチド試薬を取り除くことで反応を停止させ、IgG抗体トラスツズマブ-ペプチド複合体を得た。
3種のぺプチド-イミダゾリルカルボニル化合物(化合物10,11,12)を用いて(1-1)で得られたIgG抗体トラスツズマブ-ペプチド複合体の3種ををSDS-PAGE(Mini-PROTEAN TGX gel,4~20%,Bio-RAD;還元条件下;Coomasie Brilliant Blue G-250 Stainにより染色)にて分析した結果を、図2に示す。この結果から、化合物10,11を用いたときには抗体の修飾反応が進行し、化合物12を用いた際には進行しないことが分かった。
実施例1で合成した親和性ペプチドアジド体(化合物5)と(4-1-1)、(4-1-2)で合成した保護チオール化合物(化合物17,18)は同様の方法で連結させた。ペプチドアジド体を100mMのリン酸緩衝液(pH7.0)に溶解させ、アミノグアニジン塩酸塩(20モル当量)、アスコルビン酸ナトリウム(20モル当量)、100mg/mLの保護チオール化合物(3モル当量)ジメチルスルホキシド溶液を加えた。この反応混合物に対して、別途調製した硫酸銅一水和物(4モル当量)とトリス(3-ヒドロキシプロピルトリアゾリルメチル)アミン(20モル当量)の水溶液を添加し、攪拌した。LC-MSで反応モニタリングを行い、原料の消失を確認した後、これを限外濾過(Amicon Ultra-4, 3K MWCO)にて濃縮と水希釈を4回繰り返し、得られた水溶液を凍結乾燥してぺプチド-保護チオール連結体(化合物17,18)を取得した。
(3-2)で合成した親和性ペプチド-保護チオール連結体(化合物16,17,18)を、トリフルオロ酢酸:ジクロロメタン=1:1溶液で1時間攪拌することにより、トリフェニルメチル基を除去した。反応終結をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるチオール-ペプチド連結体(化合物19,20,21)を得た。
(3-3)で合成したチオール-ペプチド連結体(化合物19,20,21)をジメチルスルホキシドに溶解させ、N-ヒドロキシマレイミド(20モル当量)のジメチルスルホキシド溶液を加え、1時間攪拌した。原料消失をLC-MSで確認した後、トランス-4-[(2,5-ジヒドロ-1H-ピロリ-1-イル)メチル)]シクロヘキサンカルボン酸(40モル当量)、1-エチル―3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(30モル当量)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(30モル当量)を加え、4時間攪拌した。反応終結をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるマレイミド-親和性ペプチド試薬(化合物22,23,24)を得た。
(3-5-1)N-ヒドロキシスクシンイミド―ペプチド連結体(化合物55)の合成
(1-1)で合成した化合物3をジメチルスルホキシドに溶解させ、トリエチルアミン(1当量)、N-ヒドロキシマレイミド(1.2当量)のジメチルスルホキシド溶液を加えて室温で1時間撹拌した。反応終結をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるN-ヒドロキシスクシンイミド―ペプチド連結体(化合物55)を得た。
(3-5-1)で得られたN-ヒドロキシスクシンイミド―ペプチド連結体、4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサンカルボン酸N-スクシンイミジル(20当量)をジメチルスルホキシドに溶解させ、トリエチルアミン(8当量)を加えた。室温で2時間撹拌後、LC-MSにて反応進行を確認した。分取HPLCにて精製、目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し目的物であるマレイミドを搭載した抗体親和性ペプチド試薬(化合物56)を得た。
実施例1で合成した抗体親和性ペプチド(化合物36)をジメチルスルホキシドに溶解させ、2-イミノチオラン塩酸塩(10モル当量)、ジイソプロピルエチルアミン(15モル当量)を加え、1時間攪拌した。原料消失をLC-MSで確認した後、N-ヒドロキシマレイミド(20モル当量)のジメチルスルホキシド溶液を加え、1時間攪拌した。反応進行をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるヒドロキシマレイミド-親和性ペプチド体(化合物57)を得た。
(3-5-2)で得られたN-ヒドロキシスクシンイミド-ペプチド連結体(H1)、4-〔(2,5-ジオキソー2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)メチル〕ベイゾイックアシッド(20当量)をジメチルスルホキシドに溶解させ、トリエチルアミン(8当量)を加えた。室温で2時間撹拌後、LC-MSにて反応進行を確認した。分取HPLCにて精製、目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し目的物であるマレイミドを搭載した抗体親和性ペプチド試薬(化合物58)を得た。
(4-1)チオールを有するペプチド試薬の合成
下記の化合物25をFmoc法による2-クロロトリチルレジンを用いたペプチド固相合成によって合成した。固相合成後、トリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン=95:2.5:2.5の溶液にて1時間攪拌することで樹脂からの切り出しと脱保護を行った。樹脂をフィルトレーションにより除去し、ジエチルエーテルを加え沈殿を行い、ジエチルエーテルをデカンテーションすることで除去し、ペプチドを粗結晶として得た。これを分取HPLCにて精製し、生成物である下記化合物25を得た。化合物25は、親和性ペプチドではなく、生体直交性官能基であるマレイミドを位置選択的に有する抗体に対して、マレイミド基を介して導入されるべき、薬剤の代わりのモデルペプチド化合物である。
実施例4の(4-4)で合成したマレイミド-親和性ペプチド試薬(化合物22,23,24)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.18mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)20.0μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)14.8μLに溶解させ、ペプチド試薬(10~40モル当量)を抗体に対して加えて、37度で4時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO))により20mM 酢酸緩衝液(pH4.5)へと溶媒置換した。同操作を3回繰り返すことで親和性ペプチド試薬を取り除き、IgG抗体トラスツズマブ-マレイミド修飾体を得た。
実施例5の(5-2)で合成したIgG抗体トラスツズマブ-マレイミド修飾体を限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO)により50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)へ溶媒置換することで、系内のpHを中性に戻し、10mg/mLに調製した化合物25水溶液(抗体に対して80モル当量)を加え、16時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO)により水置換しペプチド試薬を取り除くことで反応を停止させ、IgG抗体トラスツズマブ-ペプチド複合体を得た。
(4-3)で得られたIgG抗体トラスツズマブ-ペプチド複合体のをSDS-PAGE(Mini-PROTEAN TGX gel,4~20%,Bio-RAD;還元条件下;Coomasie Brilliant Blue G-250 Stainにより染色)にて分析した結果を、図3に示す。この結果から、マレイミドの位置選択的導入反応(5-2)において化合物22,23を用いたときには抗体の修飾反応が進行し、化合物24を用いた際には進行しないことが分かった。
(4-5-1)IgG抗体トラスツズマブ-マレイミド修飾体の合成(1)
実施例3の(3-5-2)で合成したマレイミドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物56)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.0mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)250μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)230μLに溶解させ、2.0mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、37度で16時間攪拌した。限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-マレイミド修飾体を得た。
(4-5-1)で合成したトラスツズマブ-マレイミド修飾体に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50596,50757に重鎖ピーク、23439に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィンと反応したマレイミドが導入された51062,51224、および原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。ESI-TOFMS解析結果を図4に示す。
(4-5-1)と同様に実施例3の(3-5-4)で合成したマレイミドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物58)を用いて、IgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾体を得た。
(4-5-2)と同様に処理を行い、ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50602,50764に重鎖ピーク、23443に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にN-アセチルシステインと反応したマレイミドが導入された50818,50979、および原料と同じ23443に軽鎖ピークが観測された。
(6-1)抗体修飾基(求電子基)のβ位に炭素原子を有する抗体修飾試薬での抗体修飾反応
(6-1-1)親和性ペプチド試薬(化合物27、化合物59)を用いた抗体修飾反応(アジド修飾抗体1,2)
実施例5で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物27)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.22mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)200μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)1200μLに溶解させ、0.22mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、37度で16時間攪拌した。反応液に10mg/mLのLys水溶液を50μL加え、30分攪拌することで反応を停止させた。反応混合物をProtein A(Aspire Protein A Tips,Thermo)にて精製し、溶出液を 9.57mM PBS緩衝液(pH7.0)へと置換し限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾体(アジド修飾抗体1)を得た。
実施例5で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物28)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.22mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)200μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)1200μLに溶解させ、0.22mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、37度で16時間攪拌した。反応液に10mg/mLのLys水溶液を50μL加え、30分攪拌することで反応を停止させた。反応混合物をProtein A(Aspire Protein A Tips,Thermo)にて精製し、溶出液を 9.57mM PBS緩衝液(pH7.0)へと置換し限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾体(アジド修飾抗体3)を得た。
実施例5で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物29)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.22mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)200μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)1200μLに溶解させ、0.22mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、37度で16時間攪拌した。反応液に10mg/mLのLys水溶液を50μL加え、30分攪拌することで反応を停止させた。反応混合物をProtein A(Aspire Protein A Tips,Thermo)にて精製し、溶出液を 9.57mM PBS緩衝液(pH7.0)へと置換し限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾体を得た(アジド修飾抗体5)。
実施例5で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物66)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.0mMとした。抗TNF-α IgG抗体アダリムマブ(エーザイ)200μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)1200μLに溶解させ、2.0mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、25度で16時間攪拌した。反応液に10mg/mLのLys水溶液を50μL加え、30分攪拌することで反応を停止させた。反応混合物をProtein A(Aspire Protein A Tips,Thermo)にて精製し、溶出液を 9.57mM PBS緩衝液(pH7.0)へと置換し限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO)により濃縮することでIgG抗体アダリムマブ-アジド修飾体を得た(アジド修飾抗体28)。
(6-2-1)修飾反応に化合物27、化合物59を用いた際のトラスツズマブ-アジド修飾体(アジド修飾抗体1,2)の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
実施例6の(6-1-1)で合成したトラスツズマブ-アジド修飾体(アジド修飾抗体1)に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50595,50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にアルキルアジドが導入された50733,50895、および原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。ESI-TOFMS解析結果を図5に示す。
実施例6の(6-1-2)で合成したトラスツズマブ-アジド修飾体(アジド修飾抗体3)に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50595,50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にアミン安息香酸が導入された50714,50876、および原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。なお、測定前処理の7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩の還元反応により、アジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。ESI-TOFMS解析結果を図6に示す。
実施例6の(6-1-3)で合成したトラスツズマブ-アジド修飾体(アジド修飾抗体5)に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50595,50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にアミン安息香酸が導入された50714,50876、および原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。なお、測定前処理でアジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。
実施例6の(6-1-4)で合成したアダリムマブ-アジド修飾体(アジド修飾抗体28)に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のアダリムマブは50645,50764に重鎖ピーク、23412に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にアミン安息香酸が導入された50763,50926、および原料と同じ23412に軽鎖ピークが観測された。なお、測定前処理の7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩の還元反応により、アジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている(以下同様)。ESI-TOFMS解析結果を図10に示す。
実施例5で合成したβ位にヘテロ原子を有するペプチド試薬(化合物26)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.22mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)200μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)1200μLに溶解させ、0.22mMのペプチド試薬を120μL(抗体に対して20モル当量)加えて、37度で16時間攪拌した。反応液に10mg/mLのLys水溶液を50μL加え、30分攪拌することで反応を停止させた。これを限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO)によりPBS溶液へと溶媒置換した後、7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50595,50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測された。同様に反応生成物も50595,50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、抗体修飾基(求電子基)のβ位にヘテロ原子を有する化合物26での抗体修飾反応は進行していないことが確認できた。
(7-1)保護チオール試薬と親和性ペプチドの連結による抗体修飾試薬(化合物84)の合成
(3-5-3)で合成したヒドロキシマレイミド-親和性ペプチド体(化合物57)をジメチルスルホキシド溶媒に溶かし、3-(アセチルチオ)プロピオン酸(40モル当量)、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(32モル当量)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(32モル当量)を加え、2時間攪拌した。反応終結をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるアセチルチオール-親和性ペプチド試薬(化合物84)を得た。
(3-5-3)で合成したヒドロキシマレイミド-親和性ペプチド体(化合物57)をジメチルスルホキシド溶媒に溶かし、(S)-3-(ベンゾイルチオ)-2-メチルプロピオン酸(40モル当量)、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(32モル当量)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(32モル当量)を加え、2時間攪拌した。反応終結をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるベンゾイルチオール-親和性ペプチド試薬(化合物85)を得た。
(8-1)チオール保護体搭載IgG1 Fc親和性ペプチド試薬での抗体修飾反応
(8-1-1)親和性ペプチド試薬(化合物84)を用いた抗体修飾反応
実施例7で合成した保護チオールを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物84)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.0mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)200μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)200μLに溶解させ、2.0mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、25度で3時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-保護チオール修飾体を得た。
実施例7で合成した保護チオールを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物85)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.0mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)200μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)200μLに溶解させ、2.0mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、25度で3時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-保護チオール修飾体を得た。
(8-2-1)修飾反応に親和性ペプチド試薬(化合物84)を用いた際のトラスツズマブ-アジド修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(8-1-1)で合成したトラスツズマブ-保護チオール修飾体に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50594,50756に重鎖ピーク、23439に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にアセチル保護チオール基が導入された50723,50885、および原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。ESI-TOFMS解析結果を図14に示す。
(8-1-2)で合成したトラスツズマブ-保護チオール修飾体に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50594,50756に重鎖ピーク、23439に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にベンゾイル保護チオール基が導入された50800,50962、および原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(8-3-1)IgG抗体トラスツズマブ-アセチル保護チオール修飾体の脱保護
(8-2-1)で得た、IgG抗体抗体トラスツズマブ-アセチル保護チオール修飾体を20mMエチレンジアミン、0.5Mヒドロキシルアミン水溶液(pH6調製品)に置換し、室温で1時間静置した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-チオール修飾体を得た。
(8-3-1)で脱保護したトラスツズマブ-チオール修飾体に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、反応生成物は重鎖にアセチル基が脱保護された50681,50844が観測され、アセチル基が外れてチオールとなっていることを確認できた。ESI-TOFMS解析結果を図15に示す。
(8-2-2)で得た、IgG抗体抗体トラスツズマブ-ベンゾイル保護チオール修飾体を20mMエチレンジアミン、0.5Mヒドロキシルアミン水溶液(pH6調製品)に置換し、室温で1時間静置した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでそれぞれのIgG抗体トラスツズマブ-チオール修飾体を得た。
(8-3-3)で脱保護したトラスツズマブ-チオール修飾体に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、反応生成物は重鎖にベンゾイル基が脱保護された50696,50858が観測されベンゾイル基が外れてチオールとなっていることを確認できた。
(9-1)2種類の親和性ペプチド試薬を段階的に用いた異なる複数標的領域の位置選択的修飾ESI-TOFMSによる解析
(9-1-1)2種類の親和性ペプチド試薬(化合物66、化合物64)を段階的に用いた複数個所位置特異的抗体修飾反応
実施例5で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物66)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.04mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)300μgを50mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH 4.7)300μLに溶解させ、2.04mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、25度で3時間攪拌した。限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)によりペプチド試薬残渣を除去し、得られた濃縮液を50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)200μLにて希釈した。ここに、実施例5で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物64)の2.0mMN,N’-ジメチルホルムアミド溶液を抗体に対して20モル当量加えて、37度で16時間攪拌した。反応液に10mg/mLのLys水溶液を50μL加え、30分攪拌することで反応を停止させた。限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾体を得た。
実施例9の(9-1-1)で合成したトラスツズマブ-アジド修飾体に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50602,50764に重鎖ピーク、23443に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖に二つアミン安息香酸が導入された50841,51002が観測された。軽鎖ピークは原料と同じ23443が観測された。なお、測定前処理でアジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。ESI-TOFMS解析結果を図16に示す。
実施例5で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物64)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.0mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)300μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)300μLに溶解させ、2.0mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、37度で16時間攪拌した。限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)によりペプチド試薬残渣を除去し、得られた濃縮液を50mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH 4.7)200μLにて希釈した。ここに、実施例5で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物66)の2.04mMN,N’-ジメチルホルムアミド溶液を抗体に対して20モル当量加えて、37度で16時間攪拌した。反応液に10mg/mLのLys水溶液を50μL加え、30分攪拌することで反応を停止させた。限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾体を得た。
実施例9の(9-1-2)と同様の方法にてESI-TOFMSにより質量を測定した。コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50602,50764に重鎖ピーク、23443に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖に二つアミン安息香酸が導入された50840,51002が観測された。軽鎖ピークは原料と同じ23443が観測された。なお、測定前処理でアジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。
実施例7で合成したチオール保護体を搭載した親和性ペプチド試薬(化合物84)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.04mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)300μgを50mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH 4.7)300μLに溶解させ、2.04mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、25度で3時間攪拌した。限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)によりペプチド試薬残渣を除去し、得られた濃縮液を50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)200μLにて希釈した。ここに、実施例5で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド試薬(化合物64)の2.0mMN,N’-ジメチルホルムアミド溶液を抗体に対して20モル当量加えて、37度で16時間攪拌した。反応液に10mg/mLのLys水溶液を50μL加え、30分攪拌することで反応を停止させた。限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾体を得た。
(9-1-5)で合成したIgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾体について、実施例9の(9-1-2)と同様の方法にてESI-TOFMSにより質量を測定した。コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50597,50757に重鎖ピーク、23439に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にアミン安息香酸とアセチル保護チオール基が導入された50843,51005が観測された。軽鎖ピークは原料と同じ23443が観測された。なお、測定前処理でアジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。ESI-TOFMS解析結果を図17に示す。
(9-2-1)複数誘導化部位を持つ親和性ペプチド(化合物86)の合成
実施例1で合成した抗体親和性ペプチド(化合物54)をジメチルスルホキシドに溶解させ、2-イミノチオラン塩酸塩(10モル当量)、ジイソプロピルエチルアミン(15モル当量)を加え、1時間攪拌した。原料消失をLC-MSで確認した後、N-ヒドロキシマレイミド(20モル当量)のジメチルスルホキシド溶液を加え、1時間攪拌した。反応進行をLC-MSで確認した後、4-アジド安息香酸(40モル当量)、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(32モル当量)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(32モル当量)を加え、2時間攪拌した。反応終結をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるジ(アジド-フェニル)-親和性ペプチド試薬(化合物86)を得た。
実施例9の(9-2-1)で合成したジ(アジド-フェニル)-親和性ペプチド試薬(化合物86)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.0mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)250μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)250μLに溶解させ、2.0mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、25度で3時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでIgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾体を得た。
実施例9の(9-2-2)で合成したトラスツズマブ-アジド修飾体に対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50602,50764に重鎖ピーク、23443に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖に二つアミン安息香酸が導入された50841,51003が観測された。軽鎖ピークは原料と同じ23443が観測された。なお、測定前処理でアジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。ESI-TOFMS解析結果を図18に示す。
(10-1)トラスツズマブの位置特異的アジド導入体とCy3-シクロアルキンとのコンジュゲーション
(10-1-1)トラスツズマブの位置特異的アジド導入体とCy3-DBCOとのコンジュゲーションおよびESI-TOFMS解析
実施例6の(6-1-2)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸導入体を20mM PBS緩衝液に溶解し0.3mMとした後、Sigma Aldrich製 Dibenzocyclooctyne-Cy3(0.94mM、ジメチルスルホキシドに溶解)を20μL添加し、室温で12時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO)により水置換し反応を停止した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、トラスツズマブは148060にピークが観測され、(6-1-2)で合成したトラスツズマブのアジド導入体は148489にピークが観測され、反応生成物はCy3が2つ導入された150487にピークが観測された(図19)。
(10-1-1)で合成したトラスツズマブ-Cy3複合体のPBS溶液に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2μL(トラスツズマブ-Cy3複合体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料である実施例6の(6-1-1)で合成したトラスツズマブのアジド導入体は50714および50876に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、トラスツズマブ-Cy3複合体は重鎖にCy3が導入された51722および51885にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された(図20)。なお、測定前処理の7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩の還元反応により、アジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。
(10-2-1)ペプチド-シクロアルキンの合成
下記の化合物30のペプチド部分をFmoc法による2-クロロトリチルレジンを用いたペプチド固相合成によって合成した。固相合成後、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(2モル当量)、1-エチル―3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩 (2モル当量)、トリエチルアミン(2モル当量)、5-(5,6-ジヒドロ-11,12-ジデヒドロジベンゾ[b,f][b,f]アゾシン-5(6H)-イル)-オキソペンタン酸(2.2モル当量)を随時添加し、19時間攪拌した。トリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン=95:2.5:2.5の溶液にて1時間攪拌することで樹脂からの切り出しと脱保護を行い、切り出し後のろ液にはトリエチルアミンを加え中和した。樹脂をフィルトレーションにより除去し、ジエチルエーテルを加え沈殿を行い、ジエチルエーテルをデカンテーションすることで除去し、ペプチドを粗結晶として得た。これを分取HPLCにて精製し、生成物である下記化合物30を得た。
実施例6の(6-1-2)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸導入体を20mM PBS緩衝液に溶解し0.3mMとした後、実施例7の(7-2-1)で合成したペプチド-シクロアルキン(化合物29)0.94mM水溶液を20μL添加し、室温で12時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10K MWCO)により水置換し反応を停止した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、トラスツズマブは148060にピークが観測され、(6-1-2)で合成したトラスツズマブのアジド導入体は148489にピークが観測され、反応生成物はペプチドが2つ導入された150912にピークが観測された(図21)。
(10-2-2)で合成したトラスツズマブ-ペプチド複合体のPBS溶液に7mMトリス (2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2μL(トラスツズマブ-ペプチド複合体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料である実施例6の(6-1-1)で合成したトラスツズマブのアジド導入体は50714および50876に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、トラスツズマブ-ペプチド複合体は重鎖にペプチドが導入された51941および52102にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された(図22)。なお、測定前処理の7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩の還元反応により、アジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。
(10-3-1)トラスツズマブの位置特異的チオール導入体とマレイミド化合物とのコンジュゲーションおよびESI-TOFMS解析
実施例8の(8-3-1)で合成したトラスツズマブのチオール導入体を20mM PBS緩衝液に溶解し0.3mMとした後、m-dPEG(登録商標)24-MALを5モル当量添加し、室温で12時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により処理した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、トラスツズマブは14822にピークが観測され、(8-3-3)で合成したトラスツズマブのチオール導入体は148243にピークが観測され、反応生成物はm-dPEG(登録商標)24-MALが二つ導入された150880にピークが観測された(図23)。
(10-3-1)で合成したトラスツズマブ-ペグ複合体のPBS溶液に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2μL(トラスツズマブ-ペグ複合体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料である実施例8の(8-3-3)で合成したトラスツズマブのチオール導入体は50682および50844に重鎖ピーク、23449に軽鎖ピークが観測され、反応生成物は重鎖にm-dPEG(登録商標)24-MALが導入された51922および52083にピークが観察され、原料と同じ23449に軽鎖ピークが観測された(図24)。
(11-1)トラスツズマブの生体直交性官能基導入体の糖鎖切断
(11-1-1)トラスツズマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断(1)
実施例6の(6-1-2)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸導入体(アジド修飾抗体3)をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/191817の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例6の(6-1-3)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸導入体(アジド修飾抗体5)をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/191817)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例4の(4-5-1)で合成したトラスツズマブのマレイミド導入体を3-メルカプトプロピオン酸(20モル当量)存在下、PNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例6の(6-1-1)で合成したトラスツズマブのアルキルアジド導入体(アジド修飾抗体2)をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例6の(6-1-3)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸導入体(アジド修飾抗体6)をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例6の(6-1-3)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸導入体(アジド修飾抗体8)をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例6の(6-1-3)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸導入体(アジド修飾抗体10)をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例8の(8-1-3)で合成したトラスツズマブのアセチル保護チオール導入体をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例9の(9-1-3)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸複数標的領域導入体をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例9の(9-1-4)で合成したトラスツズマブのアジドーチオール複数標的領域導入体をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例6の(6-1-4)で合成したデノスマブのアジド安息香酸導入体(アジド修飾抗体29)をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
実施例6の(6-1-4)で合成したデュピルマブのアジド安息香酸導入体(アジド修飾抗体30)をPNGase F(NEW ENGLAND BioLabs,カタログ番号P0704)を用い、製造者プロトコルおよび特許(WO2017/19181757)の手法に従い、糖鎖の切断と後処理を行った。
(11-2-1)トラスツズマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のトリプシン処理(1)
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-1)で得たトラスツズマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を3.4μL、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を6.6μL添加して計10μLとし、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液、20%トリフルオロエタノールに溶解した20mMのジチオスレイトール水溶液10μLを加えて65℃で1時間加温後、50mMのヨードアセトアミド水溶液10μLを添加し、遮光下室温にて30分間300rpmで振盪し反応させた。反応後、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を40μL加えて撹拌し、20ng/μLのトリプシン水溶液を10μL添加して37℃で18時間酵素消化した。消化後、20%トリフルオロ酢酸水溶液を2μL添加し反応を止めた。その後、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液、0.5%トリフルオロ酢酸を用いて10倍希釈し、LC-MS/MS測定に使用した。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-2)で得たトラスツズマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液、20%トリフルオロエタノールに溶解した20mMのジチオスレイトール水溶液10μLを加えて65℃で1時間加温後、50mMのヨードアセトアミド水溶液10μLを添加し、遮光下室温で30分間300rpmで振盪し反応させた。反応後、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を40μL加えて撹拌し、20ng/μLのトリプシン水溶液を10μL添加して37℃で18時間酵素消化した。消化後、20%トリフルオロ酢酸水溶液を2μL添加し反応を止めた。その後、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液、0.5%トリフルオロ酢酸を用いて10倍希釈し、LC-MS/MS測定に使用した。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-3)で得たトラスツズマブのマレイミド導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-4)で得たトラスツズマブのアルキルアジド導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-5)で得たトラスツズマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-6)で得たトラスツズマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-7)で得たトラスツズマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-8)で得たトラスツズマブのアセチルチオール導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-9)で得たトラスツズマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-8)で得たトラスツズマブのアセチルチオールおよびアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-11)で得たデノスマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに(11-1-12)で得たデュピルマブのアジド安息香酸導入体の糖鎖切断物のサンプル溶液を10μL加え、11-2-1と同様の処理を行いLC-MS/MS測定用サンプルを得た。
(分析装置)
ナノHPLC:EASY-nLC 1000(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
質量分析計:トライブリッド質量分析計Orbitrap Fusion(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
トラップカラム:Acclaim PepMap(登録商標) 100,75μmx2cm(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
分析カラム:ESI-column(NTCC-360/75-3-125,75μm×12.5cm,3μm(日京テクノス))
移動相A:0.1%ギ酸水溶液
移動相B:0.1%ギ酸、アセトニトリル溶液
ローディング溶液:0.1%トリフルオロ酢酸水溶液
流速:300nL/min
サンプル注入量:0.3-1μL
グラジエント条件(B%):2%(0.0-0.5分)、2%→30%(0.5-23.5分)、30%→75%(23.5-25.5分)、75%(25.5-35.0分)
イオン化法:ESI, Positiveモード
スキャンタイプ:Data Dependent Aquisition
Activation Type:Collision Induced Dissociation(CID)
データの取得は付属ソフトであるXcalibur 3.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)およびThermo Orbitrap Fusion Tune Application 2.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
LC-MS/MS測定結果に対する修飾部位解析については、BioPharma Finder 3.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
(11-5-1)トリプシン消化物のLC-MS/MSによる修飾部位の解析結果(1)
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-1)で得たトラスツズマブアジド修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号11)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 945.73328、理論値:945.73350、4価)が観測され(図29)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位もしくは248位のリジン残基の修飾を示す、2価のy19に相当するm/z 1125.49(理論値:1125.11)のプロダクトイオンが確認された(図30)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-2)で得たトラスツズマブアジド修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸18残基からなるペプチド、FNWYVDGVEVHNAKTKPR(配列番号12)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 760.38287、理論値:760.38390、3価)が観測され(図31)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける288位もしくは290位のリジン残基の修飾を示す、2価のy16に相当するm/z 1009.83(理論値:1009.52)のプロダクトイオンが確認された(図32)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-3)で得たトラスツズマブマレイミドMPA修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(メルカプトプロピオン酸付加マレイミド導入体(+325.098Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号11)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 997.24986、理論値:997.24908、4価)が観測され(図33)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位もしくは248位のリジン残基の修飾を示す、2価のy20に相当するm/z 1256.96(理論値:1256.65)のプロダクトイオンが確認された(図34)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-4)で得たトラスツズマブアルキルアジド修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アルキルアジド導入体(+139.075Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号11)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 950.74263、理論値:950.74313、4価)が観測され(図35)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位もしくは248位のリジン残基の修飾を示す、2価のy20に相当するm/z 1163.92(理論値:1163.64)のプロダクトイオンが確認された(図36)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-5)で得たトラスツズマブアジド安息香酸修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸19残基からなるペプチド、VVSVLTVLHQDWLNGKEYK(配列番号101)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 783.08731、理論値:783.08690、3価)が観測され(図37)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける317位のリジン残基の修飾を示す、2価のy17に相当するm/z 1075.31(理論値:1075.06)のプロダクトイオンが確認された(図38)。また、BioPharma Finderでの解析により、317位のリジン残基への修飾が高選択的に起こっていることが示された(図39)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-6)で得たトラスツズマブアジド安息香酸修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸18残基からなるペプチド、FNWYVDGVEVHNAKTKPR(配列番号12)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 570.54026、理論値:570.53991、4価)が観測され(図40)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける288位もしくは290位のリジン残基の修飾を示す、3価のy16に相当するm/z 673.48(理論値:673.35)のプロダクトイオンが確認された(図41)。また、BioPharma Finderでの解析により、288位もしくは290位のリジン残基への修飾が高選択的に起こっていることが示された(図42)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-7)で得たトラスツズマブアジド安息香酸修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号11)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 945.73501、理論値:945.73376、4価)が観測され(図43)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位もしくは248位のリジン残基の修飾を示す、2価のy20に相当するm/z 1153.87(理論値:1153.62)のプロダクトイオンが確認された(図44)。また、BioPharma Finderでの解析により、246位もしくは248位のリジン残基への修飾が高選択的に起こっていることが示された(図45)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-8)で得たトラスツズマブアセチルチオール修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(カルバミドメチル化を受けたアセチルチオール導入体(+145.020Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号11)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 952.23368、理論値:952.22942、4価)が観測され(図46)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位もしくは248位のリジン残基の修飾を示す、2価のy20に相当するm/z 1166.95(理論値:1166.61)のプロダクトイオンが確認された(図47)。また、BioPharma Finderでの解析により、246位もしくは248位のリジン残基への修飾が高選択的に起こっていることが示された(図48)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-9)で得たトラスツズマブアジド安息香酸修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号11)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 945.74114、理論値:945.73376、4価)が観測され(図49)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位もしくは248位のリジン残基の修飾を示す、2価のy20に相当するm/z 1153.94(理論値:1153.62)のプロダクトイオンが確認された(図50)。また、リジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸18残基からなるペプチド、FNWYVDGVEVHNAKTKPR(配列番号12)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 570.54470、理論値:570.53991、4価)が観測され(図51)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける288位もしくは290位のリジン残基の修飾を示す、3価のy14に相当するm/z 557.18(理論値:556.97)のプロダクトイオンが確認された(図52)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-10)で得たトラスツズマブアセチルチオールおよびアジド安息香酸修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(カルバミドメチル化を受けたアセチルチオール導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号11)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 952.23028、理論値:952.22942、4価)が観測され(図53)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位もしくは248位のリジン残基の修飾を示す、2価のy20に相当するm/z 1166.90(理論値:1166.61)のプロダクトイオンが確認された(図54)。また、リジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸18残基からなるペプチド、FNWYVDGVEVHNAKTKPR(配列番号12)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 570.54030、理論値:570.53991、4価)が観測され(図55)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける288位もしくは290位のリジン残基の修飾を示す、3価のy16に相当するm/z 673.52(理論値:673.35)のプロダクトイオンが確認された(図56)。さらに、BioPharma Finderでの解析により、246位もしくは248位のリジン残基へのカルバミドメチル化を受けたアセチルチオール修飾、および、288位もしくは290位のリジン残基へのアミン安息香酸修飾が高選択的に起こっていることが示された(図57)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-11)で得たデノスマブアジド安息香酸修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、CCVECPPCPAPPVAGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号102)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 961.72078、理論値:961.71980、4価)が観測され(図58)、CIDスペクトルより重鎖の配列中の番号(すなわち、N末のアミノ酸を1番目とする。以下同様)における247位もしくは249位のリジン残基の修飾を示す、3価のy23に相当するm/z 872.08(理論値:871.81)のプロダクトイオンが確認された(図59)。また、BioPharma Finderでの解析により、247位もしくは249位のリジン残基への修飾が高選択的に起こっていることが示された(図60)。
LC-MS/MSを用いた解析の結果、(11-2-12)で得たデュピルマブアジド安息香酸修飾体のトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アミン安息香酸導入体(+119.037Da))を含むアミノ酸34残基からなるペプチド、YGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号103)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 972.99064、理論値:972.98886、4価)が観測され(図61)、CIDスペクトルより重鎖の配列中の番号における251位もしくは253位のリジン残基の修飾を示す、3価のy29に相当するm/z 1105.98(理論値:1105.58)のプロダクトイオンが確認された(図62)。また、BioPharma Finderでの解析により、251位もしくは253位のリジン残基への修飾が高選択的に起こっていることが示された(図63)。
(12-1)トラスツズマブの位置特異的アジド導入体とDBCO-DM1とのコンジュゲーション
(12-1-1)位置選択的トラスツズマブ-DM1コンジュゲートの合成
実施例6の(6-1-2)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸導入体(アジド抗体3)0.9mgを473μLの100mM PBS、10mM EDTAバッファーに溶解させたのち、51μLのN,N’-ジメチルアセトアミドとDBCO-DM1(Abzena社製、化合物87)をN,N’-ジメチルアセトアミドに溶解し4mMとしたものを2μL添加し25℃で16時間攪拌した。反応後、NAP-5カラムにより抽出し、DM1を取り除いた。
ESI-TOFMSはアジレント社製のAgilent 6550 coupled to Agilent 1290 UPLC with DAD detector, Autosampler cooling and Thermostatted column compartmentを使用した。ソフトウェアはMassHunterを使用し、DARを算出した。生成物はDM1が2つ導入された150531およびDM1が1つ導入された149827にピークが観測され、平均DARは1.8と算出された(図64)。
(12-1-1)で合成したトラスツズマブ-DM1コンジュゲートのPBS溶液に7mMトリス (2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2μL(トラスツズマブ-DM1コンジュゲートに対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料である実施例6の(6-1-1)で合成したトラスツズマブのアジド導入体は50715および50877に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、トラスツズマブ-DM1コンジュゲートは重鎖にDM1が導入された51748および519097にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された(図65)。なお、測定前処理の7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩の還元反応により、アジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。
(12-2-1)位置選択的トラスツズマブ-MMAEコンジュゲートの合成
実施例6の(6-1-2)で合成したトラスツズマブのアジド安息香酸導入体(アジド抗体3)を0.5mgを実施例12の(12-1-1)と同様の手法にて、DBCO-MMAE(Abzena社製、化合物88)と反応させた。反応後、NAP-5カラムにより抽出し、DBCO-MMAEを取り除いた。
実施例12の(12-1-2)と同様の手法にてDARを算出した。生成物はMMAEが2つ導入された151336およびMMAEが1つ導入された149972にピークが観測され、平均DARは1.8と算出された(図66)。
(12-2-1)で合成したトラスツズマブ-MMAEコンジュゲートのPBS溶液に7mMトリス (2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2μL(トラスツズマブ-DM1コンジュゲートに対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料である実施例6の(6-1-1)で合成したトラスツズマブのアジド導入体は50715および50877に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、トラスツズマブ-MMAEコンジュゲートは重鎖にMMAEが導入された52154および52316にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された(図67)。なお、 測定前処理の7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩の還元反応により、アジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。
(12-3-1)位置選択的リツキシマブ-DM1コンジュゲートの合成
実施例6の(6-1-4)で合成したリツキシマブのアジド安息香酸導入体(アジド修飾抗体101)を実施例12の(12-1-1)と同様の手法にて、DBCO-DM1(Abzena社製、化合物87)と反応させた。反応後、NAP-5カラムにより抽出し、DBCO-DM1を取り除いた。
実施例12の(12-1-2)と同様の手法にてDARを算出した。生成物はDM1が2つ導入された149549およびDM1が1つ導入された148845にピークが観測され、平均DARは1.8と算出された(図68)。
(12-3-1)で合成したリツキシマブ-DM1コンジュゲートのPBS溶液に7mMトリス (2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2μL(トラスツズマブ-DM1コンジュゲートに対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料である実施例6の(6-1-4)で合成したリツキシマブのアジド導入体は50635および50797に重鎖ピーク、23040に軽鎖ピークが観測され、リツキシマブ-DM1コンジュゲートは重鎖にDM1が導入された51668および51831にピークが観察され、原料と同じ23040に軽鎖ピークが観測された(図69)。なお、 測定前処理の7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩の還元反応により、アジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。
(12-4-1)位置選択的リツキシマブ-MMAEコンジュゲートの合成
実施例6の(6-1-4)で合成したリツキシマブのアジド安息香酸導入体(アジド修飾抗体101)を実施例12の(12-1-1)と同様の手法にて、DBCO-MMAE(Abzena社製、化合物88)と反応させた。反応後、NAP-5カラムにより抽出し、DBCO-MMAEを取り除いた。
実施例12の(12-2)と同様の手法にてDARを算出した。生成物はMMAEが2つ導入された150354およびMMAEが1つ導入された148994にピークが観測され、平均DARは1.6と算出された(図70)。
(12-4-1)で合成したリツキシマブ-MMAEコンジュゲートのPBS溶液に7mMトリス (2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2μL(リツキシマブ-MMAEコンジュゲートに対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料である実施例6の(6-1-4)で合成したリツキシマブのアジド導入体は50635および50797に重鎖ピーク、23040に軽鎖ピークが観測され、リツキシマブ-MMAEコンジュゲートは重鎖にMMAEが導入された52071および52233にピークが観察され、原料と同じ23040に軽鎖ピークが観測された(図71)。なお、測定前処理の7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩の還元反応により、アジド安息香酸導入体は還元されアミン安息香酸導入体となっている。
(13-1)ペイロードモデル搭載IgG1 Fc親和性ペプチド試薬の合成
(13-1-1)ペイロードモデル搭載IgG1 Fc親和性ペプチド試薬(化合物89)の合成
実施例1で合成した抗体親和性ペプチド(化合物36)をジメチルスルホキシドに溶解させ、2-イミノチオラン塩酸塩(10モル当量)、ジイソプロピルエチルアミン(15モル当量)を加え、1時間攪拌した。原料消失をLC-MSで確認した後、N-ヒドロキシマレイミド(20モル当量)のジメチルスルホキシド溶液を加え、1時間攪拌した。反応進行をLC-MSで確認した後、Fmoc-N-アミド-dPEG12酸(40モル当量)、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(32モル当量)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(32モル当量)を加え、2時間攪拌した。反応終結をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるFmoc-N-amido-dPEG12-親和性ペプチド試薬(化合物89))を得た。
実施例(13-1-1)と同様にして、ビオチン-親和性ペプチド試薬(化合物90)を得た。
(13-2-1)ペイロードモデルdPEG12搭載IgG1 Fc親和性ペプチド試薬によるIgG1 Fcの位置特異的ペイロードモデル導入およびESI-TOFMS解析
(13-1-1)で合成したペイロードモデル搭載した親和性ペプチド試薬(化合物89)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し2.0mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)200μgを50mMHEPES緩衝液(pH 7.2)200μLに溶解させ、2.0mMのペプチド試薬を抗体に対して20モル当量加えて、25度で3時間攪拌した。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することでIgG抗体ペイロードモデルdPEG12導入体を得た。
(13-1-2)で合成したペイロードモデル搭載した親和性ペプチド試薬(化合物90)を用い、(13-2-1)と同様の検討を行い、IgG抗体ペイロードモデルビオチン導入体を得た。
(13-3-1)ペイロードモデルdPEG12搭載IgG1 Fc親和性ペプチド試薬によるIgG1 Fcの位置特異的ペイロードモデル導入の還元条件でのESI-TOFMSによる解析
(13-2-1)で合成したトラスツズマブ-ペイロードモデルに対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50602,50764に重鎖ピーク、23443に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にFmoc-dPEG12が導入された51425,51584、および原料と同じ23443に軽鎖ピークが観測された。
(13-2-2)で合成したトラスツズマブ-ペイロードモデルに対して7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分放置した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50596,50757に重鎖ピーク、23439に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にビオチンが導入された50820,50982、および原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(14-1)MMAE搭載IgG1 Fc親和性ペプチド試薬(化合物91)の合成
実施例5で合成したFc親和性ペプチド試薬(化合物66)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.22mMとした。DBCO-MMAE(Abzena社製、化合物91)を加え、25度で16時間攪拌した。原料消失をLC-MSで確認し、生成物であるMMAE搭載Fc親和性ペプチド試薬を得た。
抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)200μgを用い、(14-1)で合成したMMAE搭載Fc親和性ペプチド試薬(化合物91)と実施例13の(13-2)と同様の手法にて反応させた。反応液を限外濾過(Amicon Ultra, 10k MWCO)により濃縮することで位置選択的トラスツズマブ-MMAEコンジュゲートを得た。
(15-1)抗体に対する親和性ペプチドの合成
(1-1)に示す方法で、化合物92を合成、取得した。
(15-1)で合成した抗体親和性ペプチドをジメチルスルホキシドに溶解させ、1-エチル―3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(40モル当量)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(40モル当量)を加え、攪拌した。そこへ2-アミノエタノール溶液(40モル当量)とトリエチルアミン(1モル当量)を加え、室温で1時間撹拌した。LC-MSを測定し後、逆相HPLCで分離精製を行った。各フラクションをMSにて確認し、目的物が含まれるフラクションを凍結乾燥した。得られた化合物をジメチルスルホキシドに溶かし、トリエチルアミン(1モル当量)とN-ヒドロキシマレイミド(1.2モル当量)を加えて室温で1時間撹拌し、LC-MS測定を行い反応の進行を確認した。4-アジド安息香酸(40モル当量)、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(32モル当量)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(32モル当量)を加え、2時間攪拌した。反応終結をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるアジド-フェニル-親和性ペプチド試薬(化合物93)を得た。
(15-2)で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド(化合物93)を用い、(6-1-3)に示す方法で反応を行い、IgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾抗体を得た。
(15-3)で得られたトラスツズマブ-アジド修飾体を、実施例6の(6-2-3)に示す方法で還元、ESI-TOFMS解析を行った。コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50602,50764に重鎖ピーク、23443に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にアミン安息香酸が導入された50725,50885、および23446に軽鎖ピークが観測された。
(16-1)チオグリコール酸エステル脱離基とするリンカー(化合物95)の合成
ジチオジグリコール酸をジクロロメタンに溶解し、グリシン t-ブチルエステル(2.2モル当量)、N,N-ジイソプロピルアミン(4.8モル当量)、1-エチル―3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(2.4モル当量)を加え1時間撹拌した。反応液を水で分液洗浄後、得られた有機層を減圧下濃縮した。得られた残渣をN,N-ジメチルホルムアミド/水(1:1)で溶解し、トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩(1.3モル当量)を加え、室温で1時間撹拌した。酢酸エチルにて抽出後、減圧濃縮し、酢酸エチル/ヘキサンでシリカゲルカラム処理を行い、化合物94を得た。
(1-1)で合成した抗体親和性ペプチド(化合物36)に、(16-1)で合成したリンカー(化合物95)(40モル当量)、1-エチル―3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(32モル当量)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(32モル当量)を加え、2時間攪拌した。反応終結をLC-MSで確認した後、分取HPLCにて精製した。目的物を含むフラクションをESI-MSで確認した後、凍結乾燥し生成物であるアジド-フェニル-親和性ペプチド試薬(化合物96)を得た。
(16-2)で合成したアジドを搭載した親和性ペプチド(化合物96)を用い、(6-1-3)に示す方法で反応を行い、IgG抗体トラスツズマブ-アジド修飾抗体を得た。
(16-3)で得られたトラスツズマブ-アジド修飾体を、実施例6の(6-2-3)に示す方法で還元、ESI-TOFMS解析を行った。コントロールとして用いた原料のトラスツズマブは50602,50764に重鎖ピーク、23443に軽鎖ピークが観測された。反応生成物は重鎖にアミン安息香酸が導入された50720,50882、および原料と同じ23443に軽鎖ピークが観測された。
以上の結果をまとめると、実施例で使用した親和性ペプチドのアミノ酸配列、および実施例で製造した化合物を用いて製造することができる、生体直交性官能基を有する抗体の概要は、以下のとおりである。
(1)246位及び/又は248位のリジン残基
例えば、トラスツズマブの246位及び/又は248位のリジン残基の修飾に関する実施例11(11-5-1)、(11-5-3)、(11-5-4)、(11-5-7)、(11-5-8)、(11-5-9)、および(11-5-10)、デノスマブの247位及び/又は249位のリジン残基(EU numberingにおけるヒトIgGの246位及び/又は248位のリジン残基に相当)の修飾に関する実施例11(11-5-11)、ならびにデュピルマブの251位及び/又は253位のリジン残基(EU numberingにおけるヒトIgGの246位及び/又は248位のリジン残基に相当)の修飾に関する実施例11(11-5-12)を参照;
(2)288位及び/又は290位のリジン残基
例えば、実施例11(11-5-2)、(11-5-6)、(11-5-9)、および(11-5-10)を参照;
(3)317位のリジン残基
例えば、実施例11(11-5-5)を参照。
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕
Claims (37)
- 下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩。 - 前記親和性物質がペプチドである、請求項1記載の化合物またはその塩。
- 前記ペプチドが、モノクローナル抗体の定常領域に対する結合能を有するペプチドである、請求項2記載の化合物またはその塩。
- 前記ペプチドが、モノクローナル抗体のFc領域に対する結合能を有するペプチドである、請求項2または3記載の化合物またはその塩。
- 前記ペプチドが、IgGのFc領域に対する結合能を有するペプチドである、請求項4記載の化合物またはその塩。
- 前記ペプチドが、10~40のアミノ酸残基を有する、請求項2~5記載のいずれか一項記載の化合物またはその塩。
- 前記ペプチドが、
(a)(a-1-1)FNMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号11)のアミノ酸配列、または、
(a-1-2)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号12)のアミノ酸配列において、
配列中のいずれかの1~3つのアミノ酸残基が、同一でも異なってもよく、リジン残基、アスパラギン酸残基、およびグルタミン酸残基からなる群より選ばれる各々1つのアミノ酸残基により置換されているか、
(a-2-1)β-Ala-NMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号13)のアミノ酸配列、または、
(a-2-2)β-Ala-NMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号14)のアミノ酸配列において、
配列中のいずれかの1~3つのアミノ酸残基が、同一でも異なってもよく、リジン残基、アスパラギン酸残基、およびグルタミン酸残基からなる群より選ばれる各々1つのアミノ酸残基により置換されており、かつ
(b)配列番号11~14の前記アミノ酸配列各々に対して85%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項2~6のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 - 前記ペプチドが、
式1-1:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-I-I-W-C-(X0-3)b(配列番号15)
式1-2:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-I-V-W-C-(X0-3)b(配列番号16)
式1-3:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-V-V-W-C-(X0-3)b(配列番号17)
式1-4:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-A-V-W-C-(X0-3)b(配列番号18)
式1-5:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-L-L-W-C-(X0-3)b(配列番号19)
式1-6:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-L-I-W-C-(X0-3)b(配列番号20)
式1-7:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-L-V-F-C-(X0-3)b(配列番号21)
式1-8:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Q-V-W-C-(X0-3)b(配列番号22)
式1-9:(X0-3)a-C-Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-E-V-W-C-(X0-3)b(配列番号23)
〔式中、
(X0-3)aは、なし、アルギニン残基-グリシン残基-アスパラギン残基、アスパラギン酸残基、グリシン残基-アスパラギン残基、またはアスパラギン残基であり、
(X0-3)bは、なし、スレオニン残基-チロシン残基-ヒスチジン残基、またはスレオニン残基であり、
Xaa1は、アラニン残基であり、
Xaa2は、チロシン残基、トリプトファン残基、またはヒスチジン残基であり、
Xaa3は、ヒスチジン残基、フェニルアラニン残基、チロシン残基、トリプトファン残基、アルギニン残基、またはグリシン残基であり、
Xaa4は、リジン残基、アスパラギン酸残基、またはグルタミン酸残基であり、
Xaa5は、グリシン残基、セリン残基、アスパラギン残基、グルタミン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、フェニルアラニン残基、チロシン残基、トリプトファン残基、ヒスチジン残基、スレオニン残基、ロイシン残基、アラニン残基、バリン残基、イソロイシン残基、またはアルギニン残基であり、
Xaa6は、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基である。〕、あるいは
式2-1:(X0-3’)a-C-(Xaa1’)-(Xaa2’)-(Xaa3’)-(Xaa4’)-(Xaa5’)-(Xaa6’)-L-V-W-C-(X0-3’)b(配列番号24)
〔式中、
(X0-3’)aおよび(X0-3’)bはそれぞれ、前記(X0-3)aおよび(X0-3)bと同じであり、
Xaa1’、Xaa2’、Xaa3’、Xaa4’、Xaa5’、Xaa6’はそれぞれ、前記Xaa1、Xaa2、Xaa3、Xaa4、Xaa5、Xaa6と同じである。〕のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項2~6のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 - 前記脱離基が、(1)-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、または(2)ヘテロアリーレンである、請求項1~8のいずれか一項記載の化合物またはその塩。
- 前記求核基が、リジン残基の側鎖におけるNH2、チロシン残基の側鎖におけるOH、セリン残基の側鎖におけるOH、スレオニン残基の側鎖におけるOH、およびシステイン残基の側鎖におけるSHからなる群より選ばれる基である、請求項1~9のいずれか一項記載の化合物またはその塩。
- 前記求電子基が、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基である、請求項1~10のいずれか一項記載の化合物またはその塩。
- 前記生体直交性官能基が、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、ハロゲン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、チオエステル残基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、およびセレン残基からなる群より選ばれる基である、請求項1~11のいずれか一項記載の化合物またはその塩。
- 前記生体直交性官能基が、アジド残基、チオール残基、アルキン残基、マレイミド残基、およびジスルフィド残基からなる群より選ばれる基である、請求項1~12のいずれか一項記載の化合物またはその塩。
- 前記式(I)で表される化合物が、下記式(I-1):
A-L1-L2-E1-E2-E3-B (I-1)
〔式中、
AおよびBは、前記式(I)のものと同じであり、
L1は、結合または2価の基であり、
L2は、脱離基であり、
E1は、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
(ここで、環Zは、E1と結合する環構成原子X’およびその両隣の環構成原子の全てが炭素原子である2価の環基であるか、またはE1と結合する環構成原子X’が窒素原子であり、かつ窒素原子の両隣の環構成原子が炭素原子である2価の複素環基である。・は結合手である。)で表される基であり、
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりE1から切断されて脱離する能力を有する。〕で表される化合物である、請求項1~13のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 - 前記L2が、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕である、請求項14記載の化合物またはその塩。 - AとEとを連結するLまたはL1-L2の主鎖が20個以下の原子からなる、請求項1~16のいずれか一項記載の化合物またはその塩。
- 前記式(I-1)で表される化合物が、下記式(I-2):
A-L1-L2-E1-X-Y-E3-B (I-2)
〔式中、
A、L1、X、Y、およびBは、前記式(I-1)のものと同じであり、
L2は、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である。〕で表される化合物である、請求項14~17のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 - 前記式(I-1)で表される化合物が、下記式(I-3):
〔式中、
A、L1、環Z、およびBは、前記式(I-1)のものと同じであり、
L2は、
(a)環P-Q-〔ここで、環Pが、電子吸引性基で置換されていてもよいアリーレン、電子吸引性基で置換されていてもよいヘテロアリーレン、縮環していてもよい2,5-ジケトピロリジン、縮環していてもよい2,6-ジケトピペリジン、縮環していてもよい2-ケトピロリジン、縮環していてもよい2-ケトピペリジン、2-ピリドンからなる群より選ばれる基であり、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、
(b)ヘテロアリーレン、あるいは
(c)-Q-〔ここで、Qが、-O-、-S-、-Se-、-SO2-O-、-SO2-N(R)-、-SO2-、-C≡C-CH2-O-、-N(OR)-、-N(R)-、および-O-N(R)-からなる群より選ばれる基(ここで、Rは、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕であり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、結合または2価の基である。〕で表される化合物である、請求項14~17のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 - 下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を含む、生体直交性官能基による抗体の位置選択的修飾試薬。 - 生体直交性官能基を有する抗体またはその塩の製造方法であって、
下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を、抗体と反応させて、
下記式(II):
Ab-E-B (II)
〔式中、
EおよびBは、前記式(I)のものと同じであり、
Abは、抗体である。〕で表される、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩を生成することを含む、方法。 - 機能性物質を有する抗体またはその塩の製造方法であって、
(1)下記式(I):
A-L-E-B (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および生体直交性官能基を有する化合物またはその塩を、抗体と反応させて、
下記式(II):
Ab-E-B (II)
〔式中、
EおよびBは、前記式(I)のものと同じであり、
Abは、抗体である。〕で表される、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩を生成すること;ならびに
(2)前記式(II)で表される、生体直交性官能基を有する抗体またはその塩を、生体直交性官能基を介して機能性物質と反応させて、
下記式(III):
Ab-E-B’-F (III)
〔式中、
Abは、前記式(II)のものと同じであり、
Eは、前記式(I)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、機能性物質を有する抗体またはその塩を生成することを含む、方法。 - 下記式(II-1):
Ab-E1-E2-E3-B (II-1)
〔式中、
Abは、抗体であり、
E1は、抗体中の求核基と連結している求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
(ここで、環Zは、E1と結合する環構成原子X’およびその両隣の環構成原子の全てが炭素原子である2価の環基であるか、またはE1と結合する環構成原子X’が窒素原子であり、かつ窒素原子の両隣の環構成原子が炭素原子である2価の複素環基である。・は結合手である。)で表される基であり、
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
Bは、生体直交性官能基である。〕で表される、生体直交性官能基を位置選択的に有する抗体またはその塩。 - 前記抗体が、モノクローナル抗体の定常領域のみに生体直交性官能基を有する抗体である、請求項23記載の抗体またはその塩。
- 前記抗体が、モノクローナル抗体のFc領域のみに生体直交性官能基を有する抗体である、請求項23または請求項24記載の抗体またはその塩。
- 前記抗体が、ヒトIgG Fc領域における246~248位または288~290位のアミノ酸残基からなる領域において、生体直交性官能基を位置選択的に有するヒトIgGである、請求項23~25のいずれか一項記載の抗体またはその塩。
- 前記式(II-1)で表される前記抗体が、下記式(II-2):
Ab-E1-X-Y-E3-B (II-2)
〔式中、
Ab、X、Y、およびBは、前記式(II-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を位置選択的に有する抗体である、請求項23~26のいずれか一項記載の抗体またはその塩。 - 下記式(III-1):
Ab-E1-E2-E3-B’-F (III-1)
〔式中、
Abは、抗体であり、
E1は、抗体中の求核基と連結している求電子基であり、
E2は、(a)-X-Y-〔ここで、E1と結合するXは、C(R1)(R2)(ここで、R1およびR2はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、N(R3)(ここで、R3は、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)、O、S、またはSeであり、E3と結合するYは、C(R4)(R5)(ここで、R4およびR5はそれぞれ独立して、水素原子または炭素原子数1~6のアルキルである。)である。〕、あるいは(b)下記式(i):
(ここで、環Zは、E1と結合する環構成原子X’およびその両隣の環構成原子の全てが炭素原子である2価の環基であるか、またはE1と結合する環構成原子X’が窒素原子であり、かつ窒素原子の両隣の環構成原子が炭素原子である2価の複素環基である。・は結合手である。)で表される基であり、
E3は、E2が-X-Y-の場合には2価の基であり、E2が式(i)で表される基の場合には結合または2価の基であり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、機能性物質を位置選択的に有する抗体またはその塩。 - 前記抗体が、モノクローナル抗体の定常領域のみに生体直交性官能基を有する抗体である、請求項29記載の抗体またはその塩。
- 前記抗体が、モノクローナル抗体のFc領域のみに生体直交性官能基を有する抗体である、請求項29または請求項30記載の抗体またはその塩。
- 前記抗体が、ヒトIgG Fc領域における246~248位または288~290位のアミノ酸残基からなる領域において、機能性物質を位置選択的に有するヒトIgGである、請求項29~31のいずれか一項記載の抗体またはその塩。
- 前記式(III-1)で表される前記抗体が、下記式(III-2):
Ab-E1-X-Y-E3-B’-F (III-2)
〔式中、
Ab、X、Y、B’およびFは、前記式(III-1)のものと同じであり、
E1は、-C(=O)-、-SO2-、および-CH2-からなる群より選ばれる基であり、
E3は、2価の基である〕で表される、機能性物質を位置選択的に有する抗体である、請求項29~32のいずれか一項記載の抗体またはその塩。 - 下記式(IV):
A-L-E-F (IV)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および機能性物質を有する化合物またはその塩。 - 下記式(IV):
A-L-E-F (IV)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および機能性物質を有する化合物またはその塩を含む、機能性物質による抗体の位置選択的修飾試薬。 - 機能性物質を有する抗体またはその塩の製造方法であって、
下記式(IV):
A-L-E-F (IV)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、脱離基を含む2価の基であり、
Eは、(i)前記脱離基と連結しており、かつ(ii)前記抗体中の求核基と反応する能力を有する求電子基を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
前記脱離基は、前記求核基と前記求電子基との間の反応によりEから切断されて脱離する能力を有する。〕で表される、抗体に対する親和性物質、および機能性物質を有する化合物またはその塩を、抗体と反応させて、
下記式(III):
Ab-E-F (III)
〔式中、
Abは、抗体であり、
EおよびFは、前記式(IV)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を有する抗体またはその塩を生成することを含む、方法。
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