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JP2023011710A - S.aureus溶血素a毒素に対するヒト抗体 - Google Patents

S.aureus溶血素a毒素に対するヒト抗体 Download PDF

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Abstract

Figure 2023011710000001
【課題】Staphylococcusaureus溶血素A毒素に結合する抗体、およびその使用方法を提供する。
【解決手段】特定の実施形態によると、抗体は、溶血素Aに結合する完全ヒト抗体である。本発明の抗体は、溶血素A活性を阻害または中和するのに有用であり、したがって、S.aureus感染症などの溶血素A関連疾患または障害を予防または治療する手段を提供する。いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、S.aureus感染症の少なくとも1つの症状または合併症の治療に使用される。
【選択図】図7a

Description

本発明は、Staphylococcus aureus溶血素A毒素に特異的に結合するヒト抗体およびそれらの抗原結合断片、ならびにそのような抗体および断片を使用する治療的および診断的方法に関する。
Staphylococcus aureusは、グラム陽性の通性好気性細菌であり、健康な個人の皮膚および鼻に定着することが多い。この細菌は、日和見病原体と考えられており、多くの身体部位でさまざまな疾患/状態を引き起こす可能性がある。これは、血流、皮膚、および軟組織、ならびに世界中の呼吸器感染症の主な原因である。S.aureusによって引き起こされるヘルスケアおよびコミュニティ関連感染症の頻度は増加しており、これらの感染症と闘うための努力は、薬物耐性株、特にメチシリン耐性またはMRSA株の出現によって妨げられてきた。
S.aureusは、宿主における細菌の侵入および播種を助ける、いくつかの毒性因子(細胞表面発現および分泌の両方)を発現する。分泌された毒性因子の中には、いくつかの毒素があり、そのうち最も顕著なものは、孔形成毒素である溶血素Aである。S.aureus溶血素Aは、宿主細胞の膜内で七量体構造へとオリゴマー化して、細胞溶解、上皮関門破壊、炎症、および組織損傷につながる孔を形成する、33kDa分泌単量体である(非特許文献1)。
血小板、単球、内皮細胞、および上皮細胞を含む複数の哺乳動物細胞型が、溶血素Aによって溶解される。ヒトRBCは、高濃度の溶血素Aに曝露された場合にのみ溶解しやすいため、これらの細胞型のうちの1つ以上が、赤血球(RBC)よりもむしろ溶血素Aの生理学的に適切な標的であると提唱されている(非特許文献2;非特許文献3;非特許文献4)。
溶血素Aは、S.aureus感染症の動物モデルでは、肺炎、皮膚壊死、心内膜炎、および敗血症において役割を果たすことが示されている(非特許文献5;非特許文献6)。S.aureusは、皮膚および軟組織感染症の主な原因であり(非特許文献7)、蜂巣炎および皮膚膿瘍を引き起こすことが多い。マウスモデルでは、非毒素化型溶血素Aによる能動免疫、または溶血素A特異的抗血清もしくはモノクローナル抗体(mAb)による受動免疫によって、皮膚病変のサイズが大幅に減少し、溶血素A産生S.aureus株によって引き起こされる皮膚壊死が予防される(非特許文献8;非特許文献9)。S.aureusはまた、入院患者の肺炎の主な原因であり(非特許文献10);(非特許文献11)、肺感染症のマウスモデルにおいて役割を果たすことが示されている(非特許文献12)。非毒素化型溶血素Aによる能動免疫または溶血素A特異的抗血清もしくはmAbにより受動免疫は、肺炎のマウスモデルにおける罹患率および死亡率を大幅に減少させる(非特許文献13;非特許文献14)。
Staphylococcus aureusは、病院およびコミュニティにおける感染症の主な原因である。標準タイプの抗生物質による治療がより困難である、メチシリン耐性Staphylococcus aureus(MRSA)などのS.aureusの抗生物質耐性株の出現は、臨床医学における現在の問題であり、抗菌予防および治療に対する新たなアプローチの開発を必要とする(非特許文献15)。
Berube et al.,(2013),Toxins 5:1140-1166 Hildebrand et al.,(1991),J.Biol.Chem.266:17195-17200 Wilke et al.,(2010),Proc. Natl.Acad.Sci.U S A 107:13473-13478 Berube et al.,(2013),Toxins 5:1140-1166 Tkaczyk et al.,(2012)、Clin.Vaccine Immunol.19:377-385, Kennedy et al.,(2010),J.Infect.Dis.202:1050-1058 Moran,et al.(2006),N.Engl.J.Med.355:666-674 Kennedy et al.,(2010),J.Infect.Dis.202:1050-1058 Tkaczyk et al.,(2012),Clin.Vaccine Immunol.19:377-385 Kollef et al.,(2005),Chest 128:3854-3862Erratum in Chest 129:831 Shorr et al.,(2006),Crit.Care 10:R97 Bubeck Wardenberg et al.,(2007),Infect.Immun.75:1040-1044 Bubeck Wardenburg and Schneewind,(2008),J.Exp.Med.205:287-294 Hua et al.,(2014),Antimicrob.Agent Chemother.58:1108-1117 Kennedy et al.,(2010),J.Infect.Dis.202:1050-1058
本発明は、Staphylococcus aureus溶血素Aに特異的に結合する完全ヒトモノクローナル抗体(mAb)およびその抗原結合断片を提供する。このような抗体は、溶血素Aの活性を中和するのに有用であり得る。抗体は、S.aureus感染症を予防し、その進行を食い止め、もしくはその重症度を軽減するか、または感染再発の数、期間、もしくは重症度を低減するか、または感染症に関連する少なくとも1つの症状を改善するように作用し得る。いくつかの場合では、抗体は、例えば、皮膚壊死、皮膚および軟組織感染症(膿瘍を含む)、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症候群、乳房炎、ならびにせつ腫症およびカルブンケル症(吹出物)などのS.aureus感染症に関連する状態もしくは兆候を予防または治療するために使用され得る。そのような抗体は、単独で、またはS.aureus感染症を治療するのに有用な第2の薬剤と併用して使用することができる。特定の実施形態では、溶血素Aに特異的な抗体は、S.aureus感染症の重症度を軽減するため、または感染再発の数、期間、もしくは重症度を低減するため、またはS.aureus感染症に関連する少なくとも1つの症状を改善するために、第2の薬剤と併用して治療的に与えられ得る。いくつかの場合では、併用療法を使用して、皮膚壊死、皮膚および軟組織感染症(膿瘍を含む)、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症
候群、乳房炎、ならびにせつ腫症およびカルブンケル症(吹出物)などのS.aureus感染症に関連する状態または兆候を治療することができる。特定の実施形態では、抗体は、S.aureus感染症を発症するリスクがある患者を保護するために、独立型の治療として予防的に使用することができる。例えば、高齢患者、免疫系が弱まった患者、術後患者などの院内感染のリスクが高い患者を含む、特定の患者集団は、S.aureus感染症を発症するリスクがある場合がある。これらの患者集団のうちのいずれも、単独でまたは第2の薬剤と併用して投与された場合に、本発明の抗体による治療から利益を得ることができる。
本発明の抗体を使用して、患者におけるStaphylococcus aureus感染症を治療することができる。抗体は、完全長(例えば、IgG1抗体もしくはIgG4抗体)であってもよく、または抗原結合部分(例えば、Fab断片、F(ab’)断片、もしくはscFv断片)のみを含んでいてもよく、かつ機能性に影響するように、例えば、残存するエフェクター機能を排除するように(Reddy et al.,(2000),J.Immunol.164:1925-1933)、あるいはmAb半減期を増加させるように(Zalevsky et al.,(2010),Nature Biotechnology 28:157-159)、修飾されていてもよい。本発明は、ガンマ(例えば、ガンマ-1、ガンマ-2、ガンマ-3、もしくはガンマ-4)、デルタ、アルファ、ミュー、もしくはイプシロンなどの重鎖定常領域(例えば、ヒト定常領域)に連結された本明細書で特定されるV領域、および/またはラムダもしくはカッパなどの軽鎖定常領域(例えば、ヒト定常領域)に連結された本明細書で特定される任意のV領域のうちのいずれかを含む、任意の抗体もしくはその抗原結合断片を含む。
したがって、第1の態様では、本発明は、溶血素Aに特異的に結合する単離された完全ヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合断片を提供する。
いくつかの場合では、ヒトモノクローナル抗体は、野生型溶血素A(配列番号291)または修飾溶血素A(配列番号295)に結合する。
一実施形態では、単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片は、表面プラズモン共鳴によって測定して10-7M以下のKにより溶血素Aに結合する。
いくつかの態様では、単離された抗体またはその抗原結合断片は、(a)表面プラズモン共鳴によって測定して約80nM未満の結合解離平衡定数(K)による37℃での野生型溶血素Aへの結合と、(b)表面プラズモン共鳴によって測定して約0.5分超の解離半減期(t1/2)による37℃での野生型溶血素Aへの結合と、(c)表面プラズモン共鳴によって測定して約30nM未満のKによる25℃での野生型溶血素Aへの結合と、(d)表面プラズモン共鳴によって測定して約1.5分超のt1/2による25℃での野生型溶血素Aへの結合と、(e)表面プラズモン共鳴によって測定して約20nM未満の結合解離平衡定数(K)による37℃での修飾溶血素Aへの結合と、(f)表面プラズモン共鳴によって測定して約0.5分超の解離半減期(t1/2)による37℃での修飾溶血素Aへの結合と、(g)表面プラズモン共鳴によって測定して約10nM未満のKによる25℃での修飾溶血素Aへの結合と、(h)表面プラズモン共鳴によって測定して約1.5分超のt1/2による25℃での修飾溶血素Aへの結合と、からなる群から選択される1つ以上の特性を表す。
いくつかの場合では、溶血素Aに結合する単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片は、配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択される重鎖可変領域(HCVR)配列のうちのいずれか1つの内部に含有される3つの重鎖相補性決定領域(
CDR)(HCDR1、HCDR2、およびHCDR3)、ならびに/または、配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択される軽鎖可変領域(LCVR)配列のうちのいずれか1つの内部に含有される3つの軽鎖CDR(LCDR1、LCDR2、およびLCDR3)を含む。HCVRアミノ酸配列およびLCVRアミノ酸配列内のCDRを同定するための方法および技術は、当該技術分野においてよく知られており、それらを使用して、本明細書に開示される同定された重鎖可変領域(複数可)(HCVR)および/または軽鎖可変領域(複数可)(LCVR)アミノ酸配列内のCDRを同定することができる。CDRの境界を同定するために使用することができる例示的な規則は、例えば、Kabat定義、Chothia定義、およびAbM定義を含む。一般的にいえば、Kabat定義は、配列の可変性に基づいており、Chothia定義は、構造ループ領域の位置に基づいており、AbM定義は、KabatのアプローチとChothiaのアプローチとの間の折衷案である。例えば、Kabat,“Sequences of Proteins of Immunological Interest,”National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991);Al-Lazikani et al.,(1997),J.Mol.Biol.273:927-948;およびMartin et al.,(1989),Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:9268-9272を参照されたい。抗体内のCDR配列を同定するために、公開データベースも利用可能である。
いくつかの実施形態では、溶血素Aに結合する単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片は、配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するHCVRを含む。
いくつかの実施形態では、溶血素Aに結合する単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片は、配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するLCVRを含む。
いくつかの場合では、溶血素Aに結合する単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片は、(a)配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するHCVRと、(b)配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するLCVRと、を含む。
一実施形態では、溶血素Aに結合する単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片は、(a)配列番号4、24、44、64、84、104、124、144、164、184、204、224、244、264、および284からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するHCDR1ドメインと、
(b)配列番号6、26、46、66、86、106、126、146、166、186、206、226、246、266、および286からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するHCDR2ドメインと、
(c)配列番号8、28、48、68、88、108、128、148、168、188、208、228、248、268、および288からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するHCDR3ドメインと、
(d)配列番号12、32、52、72、92、112、132、152、172、192、212、232、252、および272からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するLCDR1ドメインと、
(e)配列番号14、34、54、74、94、114,134、154、174、194、214、234、254、および274からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するLCDR2ドメインと、
(f)配列番号16、36、56、76、96、116、136、156、176、196、216、236、256、および276からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するLCDR3ドメインと、を含む。
様々な実施形態では、本発明は、溶血素Aに結合する完全ヒトモノクローナル抗体もしくはその抗原結合断片であって、以下の特徴:(i)配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するHCVRを含むこと、(ii)配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するLCVRを含むこと、(iii)配列番号8、28、48、68、88、108、128、148、168、188、208、228、248、268、および288、536、552、568、および584からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するHCDR3ドメイン、ならびに配列番号16、36、56、76、96、116、136、156、176、196、216、236、256、および276からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するLCDR3ドメインを含むこと、(iv)配列番号4、24、44、64、84、104、124、144、164、184、204、224、244、264、および284からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するHCDR1ドメイン、配列番号6、26、46、66、86、106、126、146、166、186、206、226、246、266、および286からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するHCDR2ドメイン、配列番号12、32、52、72、92、112、132、152、172、192、212、232、252、および272からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するLCDR1ドメイン、ならびに配列番号14、34、54、74、94、114、134、154、174、194、214、234、254、および274からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するLCDR2ドメインを含むこと、ならびに/または(v)表面プラズモン共鳴によって測定して10-7M以下のKによる溶血素Aとの結合のうちの1つ以上を表す、完全ヒトモノクローナル抗体もしくはその抗原結合断片を提供する。
別の態様では、本発明は、配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(HCVR)の相補性決定領域(CDR)、ならびに配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択されるアミノ酸配列を
含む軽鎖可変領域(LCVR)のCDRを含む参照抗原または抗原結合断片と、溶血素Aへの結合について競合する単離された抗体またはその抗原結合断片を提供する。
別の態様では、本発明は、配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(HCVR)のCDR、ならびに配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(LCVR)のCDRを含む参照抗体または抗原結合断片と同じ溶血素Aのエピトープに結合する単離された抗体またはその抗原結合断片を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、溶血素Aに結合する単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片であって、配列番号2/10、22/30、42/50、62/70、82/90、102/110、122/130、142/150、162/170、182/190、202/210、222/230、242/250、262/270、および282/270からなる群から選択されるHCVR/LCVRアミノ酸配列対を含む、単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片を提供する。
別の態様では、本発明は、抗溶血素A抗体またはそれらの断片をコードする核酸分子を提供する。本発明の核酸を保有する組換え発現ベクター、およびそのようなベクターが導入された宿主細胞もまた、抗体の産生を可能にする条件下で宿主細胞を培養することによって、および産生された抗体を回収することによって、抗体を産生する方法と同様に本発明に含まれる。
いくつかの実施形態では、本発明は、配列番号1、21、41、61、81、101、121、141、161、181、201、221、241、261、および281からなる群から選択される核酸配列、またはそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の相同性を有する実質的に同一の配列によってコードされるHCVRを含む、抗体もしくはその断片を提供する。
いくつかの実施形態では、抗体またはその断片は、配列番号9、29、49、69、89、109、129、149、169、189、209、229、249、および269からなる群から選択される核酸配列、またはそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の相同性を有する実質的に同一の配列によってコードされるLCVRをさらに含む。
いくつかの場合では、本発明は、配列番号7、27、47、67、87、107、127、147、167、187、207、227、247、267、および287からなる群から選択されるヌクレオチド配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列によってコードされるHCDR3ドメイン、ならびに配列番号15、35、55、75、95、115、135、155、175、195、215、235、255、および275からなる群から選択されるヌクレオチド配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列によってコードされるLCDR3ドメインを含む抗体もしくは抗体の抗原結合断片を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、配列番号3、23、43、63、83、103、123、143、163、183、203、223、243、263、および283、563、および579からなる群から選択されるヌクレオチド配列、または少なくとも90
%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列によってコードされるHCDR1ドメイン、配列番号5、25、45、65、85、105、125、145、165、185、205、225、245、265、および285からなる群から選択されるヌクレオチド配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列によってコードされるHCDR2ドメイン、配列番号11、31、51、71、91、111、131、151、171、191、211、231、251、および271からなる群から選択されるヌクレオチド配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列によってコードされるLCDR1ドメイン、ならびに配列番号13、33、53、73、93、113、133、153、173、193、213、233、253、および273からなる群から選択されるヌクレオチド配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列によってコードされるLCDR2ドメインをさらに含む抗体もしくはその断片を提供する。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、溶血素Aに結合する抗体またはその抗原結合断片は、放射性核種標識またはMRI検出可能な標識などの検出可能な標識に連結され得る。
別の態様では、本発明は、上記または本明細書に記載されるように、溶血素Aに結合する単離された完全ヒトモノクローナル抗体もしくはその抗原結合断片、および薬学的に許容される担体もしくは希釈剤を含む医薬組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、上記または本明細書に記載される特徴のうちのいずれか1つ以上を有する溶血素Aに結合する完全ヒトモノクローナル抗体を含む。一実施形態では、抗体は、10-7M以下のKにより溶血素Aに結合する。様々な実施形態では、組成物は、溶血素Aに結合し、かつ配列番号2/10、22/30、42/50、62/70、82/90、102/110、122/130、142/150、162/170、182/190、202/210、222/230、242/250、262/270、および282/270からなる群から選択されるHCVR/LCVRアミノ酸配列対を有する抗体を含む。本発明はまた、単離されたヒト抗体もしくは抗原結合断片であって、(i)配列番号20に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号18に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(ii)配列番号40に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号38に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(iii)配列番号60に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号58に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(iv)配列番号80に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号78に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(v)配列番号100に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号98に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(vi)配列番号120に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号118に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(vii)配列番号140に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号138に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(viii)配列番号160に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号158に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(ix)配列番号180に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号178に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(x)配列番号200に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号198に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(xi)配列番号220に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号218に記載のアミノ酸配列
を含む重鎖免疫グロブリン、(xii)配列番号240に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号238に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(xiii)配列番号260に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号258に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、(xiv)配列番号280に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号278に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、または(xv)配列番号280に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号290に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリンを含む。
いくつかの場合では、本発明は、本発明の抗体または抗体の抗原結合断片と第2の治療薬との組み合わせである組成物を特徴とする。第2の治療剤は、小分子薬物、タンパク質/ポリペプチド、抗体、そのようなアンチセンスオリゴヌクレオチド、またはsiRNAなどの核酸分子であり得る。第2の治療剤は、合成であっても天然由来であってもよい。第2の治療剤は、本発明の抗体またはその断片と有利に組み合わされる任意の薬剤であり得る。
特定の実施形態では、第2の治療剤は、本発明の抗体または抗体の抗原結合断片に関連する何らかの起こり得る副作用(複数可)が生じるであろう場合、そのような副作用(複数可)を抑制または低減するのを助ける薬剤であり得る。
また、本発明の抗体および薬学的に許容される組成物は、併用療法において用いることができること、すなわち、抗体および薬学的に許容される組成物は、1つ以上の他の所望の治療薬もしくは医療処置と同時に、その前に、またはそれに続いて投与され得ることも理解されるであろう。併用レジメンで用いる治療(治療薬または処置)の特定の組み合わせは、所望の治療薬および/または処置の適合性ならびに達成されるべき所望の治療効果を考慮したものであろう。用いられる治療は、同じ障害に対して所望の効果を達成し得る(例えば、抗体は、同じ障害を治療するために使用される別の薬剤と同時に投与され得る)か、またはそれらが異なる効果を達成し得る(例えば、有害作用)ことも理解されるであろう。本明細書で使用されるように、特定の疾患または状態を治療または予防するために通常投与される追加の治療薬は、治療される疾患または状態に適している。関連技術分野で認識されるように、複数の治療薬を同時投与する場合、用量は、それに応じて調整することができる。
別の態様では、本発明は、Staphylococcus aureusによって引き起こされる一次感染症を予防、治療、または管理し、かつS.aureus感染症の再発を低減、排除、または予防するための方法を提供する。いくつかの場合では、本発明は、皮膚壊死、皮膚および軟組織感染症(膿瘍を含む)、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症候群、乳房炎、ならびにせつ腫症およびカルブンケル症(吹出物)などのS.aureus感染症に関連する疾患もしくは障害を予防および/または治療するための方法を含む。特定の実施形態では、本発明は、S.aureus感染症を罹患している患者を治療するため、またはS.aureus感染症に関連する少なくとも1つの症状もしくは合併症を治療するか、またはS.aureus感染症の進行を食い止めるための方法を提供し、本方法は、Staphylococcus aureus感染症関連状態もしくは疾患が予防されるか、またはその重症度および/もしくは期間が軽減されるか、あるいは状態もしくは疾患に関連する少なくとも1つの症状もしくは合併症が予防または改善されるか、あるいはS.aureus感染症の頻度および/もしくは期間もしくは重症度が低減されるように、溶血素Aに結合する抗体もしくはその抗原結合断片の有効量、または溶血素Aに結合する抗体もしくはその抗原結合断片の有効量を含む医薬組成物を患者に投与することを含む。上記に考察される方法の様々な実施形態では、S.aureusの細菌は、抗生
物質治療の1つ以上のタイプに対して耐性であり得る。一実施形態では、細菌は、メチシリン耐性S.aureus(MRSA)である。
方法のいくつかの実施形態では、本発明の抗体を含む医薬組成物は、第2の治療薬と組み合わせて患者に投与される。
本発明の実施形態では、抗体もしくはその抗原結合断片または抗体を含む医薬組成物は、皮下に、静脈内に、皮内に、経口的に、もしくは筋肉内に投与される。
関連する実施形態では、本発明は、S.aureus感染症もしくは溶血素A毒素の存在に関連するか、またはそれらによって引き起こされる疾患もしくは障害の予防または治療のための薬剤の製造における、本発明の単離された抗溶血素A抗体もしくは抗体の抗原結合部分の使用を含む。本発明はまた、S.aureus感染症または溶血素A毒素の存在に関連するか、またはそれらによって引き起こされる疾患もしくは障害を予防または治療するための、単離された抗溶血素A抗体もしくはその抗原結合部分の使用を含む。様々な実施形態では、これらの疾患または障害は、皮膚壊死、皮膚および軟組織感染症(膿瘍を含む)、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症候群、乳腺炎、ならびにせつ腫瘍症およびカルブンケル症(吹出物)を含む。一実施形態では、本発明は、S.aureus感染症の治療用の薬剤の製造における、単離された抗溶血素A抗体またはその抗原結合断片の使用を含む。いくつかの場合では、本発明は、Staphylococcus aureus感染症を離間しているか、または発症するリスクのある患者を治療するための、上記もしくは本明細書で考察されるような抗溶血素A抗体もしくはその抗原結合断片の使用を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、皮膚壊死、皮膚および軟組織感染症(膿瘍を含む)、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症候群、乳房炎、ならびにせつ腫症およびカルブンケル症(吹出物)を罹患している患者を治療するための、上記もしくは本明細書で考察されるような抗溶血素A抗体もしくはその抗原結合断片の使用を含む。
他の実施形態は、後述の詳細な説明の総説から明らかとなるであろう。
S.aureus溶血素Aへの抗溶血素A抗体の結合を示す。 S.aureus二成分毒素のFサブユニットへの抗溶血素A抗体の結合を示し、図2aは、LukFへの結合を示す。 S.aureus二成分毒素のFサブユニットへの抗溶血素A抗体の結合を示し、図2bは、LukDへの結合を示す。 S.aureus二成分毒素のFサブユニットへの抗溶血素A抗体の結合を示し、図2cは、HIgBへの結合を示す。 S.aureus二成分毒素の成分への抗溶血素A抗体H1H15381Pの結合を示し、図3aは、LukF、LukS、およびLukEへの結合を示す。 S.aureus二成分毒素の成分への抗溶血素A抗体H1H15381Pの結合を示し、図3bは、HlgAおよびHlgCへの結合を示す。 S.aureus二成分毒素の成分への抗溶血素A抗体H1H15381Pの結合を示し、図3cは、デルタ毒素への結合を示す。 図4aは、抗溶血素A抗体H1H15377P、H1H15381P、またはH1H15399Pによる毒素誘発ADAM10活性の遮断を示す。 図4bは、抗溶血素A抗体H1H15377またはH1H15399による、ウサギ赤血球膜への溶血素Aの結合の防止を示す。 S.aureus CA-127を感染させ、様々な抗体(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)で治療したマウスにおける皮膚壊死病変のサイズを、5、0.5、または0.125mg/kgで示す。 S.aureus CA-127を感染させ、様々な抗体(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)で治療したマウスにおける皮膚壊死病変のサイズを、5、0.5、または0.125mg/kgで示す。 S.aureus CA-127を感染させ、様々な抗体(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)で治療したマウスにおける皮膚壊死病変のサイズを、5、0.5、または0.125mg/kgで示す。 S.aureus Newmanを感染させ、様々な抗体(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)で治療したマウスにおける皮膚壊死病変のサイズを、5、0.5、または0.125mg/kgで示す。 S.aureus Newmanを感染させ、様々な抗体(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)で治療したマウスにおける皮膚壊死病変のサイズを、5、0.5、または0.125mg/kgで示す。 S.aureus Newmanを感染させ、様々な抗体(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)で治療したマウスにおける皮膚壊死病変のサイズを、5、0.5、または0.125mg/kgで示す。 様々な抗溶血素A mAb(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)を投与したマウスの皮膚におけるS.aureus CA-127(MRSA)またはS.aureus Newman(MSSA)細菌数を示す。 様々な抗溶血素A mAb(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)を投与したマウスの皮膚におけるS.aureus CA-127(MRSA)またはS.aureus Newman(MSSA)細菌数を示す。 様々な抗体(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)で治療したS.aureus CA-127を感染させたマウスの肺における細菌負荷を、1.25または0.325mg/kgで示す。 様々な抗体(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、または対照抗体)で治療したS.aureus CA-127を感染させたマウスの肺における細菌負荷を、1.25または0.325mg/kgで示す。
本発明の方法を説明する前に、本発明は、特定の方法および説明される実験条件が変わり得るので、このような方法および条件に限定されないことが理解されるべきである。本明細書で使用される用語は、特定の実施形態のみを説明するためのものであり、本発明の範囲が添付の特許請求の範囲によってのみ限定されるので、限定することを企図するものではないことも理解されるべきである。
別段定義されない限り、本明細書で使用される技術用語および科学用語は全て、本発明の属する技術分野の当業者によって通常理解されるのと同じ意味を有する。本明細書に説明されるものと類似のまたは等価の何らかの方法および材料を本発明の実施または試験に
使用することができるが、好ましい方法および材料をこれより説明する。本明細書で言及される全ての出版物は、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
定義
「溶血素A」および「溶血素A毒素」という用語は、宿主細胞の膜内の七量体構造にオリゴマー化して細胞溶解、炎症、および組織損傷を引き起こす孔を形成する、S.aureusによって分泌される33kDaの単量体タンパク質を互換的に指す。野生型溶血素Aのアミノ酸配列は、配列番号291に示されている。修飾溶血素A(H35L変異体)のアミノ酸配列は、配列番号295に示されている。別段留意されない限り、溶血素Aへの言及は、野生型形態を指す。HlaH35Lは、35位のヒスチジンがロイシンに変化された溶血素Aである。これにより、毒素が孔形成前段階まで宿主細胞膜上に集合することが可能になるが、完全に機能的な孔は形成されない。これにより、溶血素Aは無毒になる。
本明細書で使用される「抗体」という用語は、4つのポリペプチド鎖、すなわちジスルフィド結合によって相互接続された2つの重(H)鎖および2つの軽(L)鎖から構成される免疫グロブリン分子(すなわち、「完全抗体分子」)、ならびにこれらの多量体(例えば、IgM)またはその抗原結合断片を指すことが企図される。各重鎖は、重鎖可変領域(「HCVR」または「V」)および重鎖定常領域(C1ドメイン、C2ドメイン、およびC3ドメインから構成される)から構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(「LCVRまたは「V」)および軽鎖定常領域(C)から構成される。V領域およびV領域は、フレームワーク領域(FR)と呼ばれる、より保存された領域が点在する、相補性決定領域(CDR)と呼ばれる超可変領域へとさらに細分することができる。各VおよびVは、以下:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4の順でアミノ末端からカルボキシ末端へと配置された3つのCDRおよび4つのFRから構成される。本発明の特定の実施形態では、抗体(またはその抗原結合断片)のFRは、ヒト生殖系列配列と同一であり得るか、または天然にもしくは人工的に修飾され得る。アミノ酸コンセンサス配列は、2つ以上のCDRの並列分析に基づいて定義され得る。
1つ以上のCDR残基の置換または1つ以上のCDRの省略も可能である。抗体は、1つまたは2つのCDRが結合のために省かれる場合がある科学文献に記載されている。Padlan et al.(FASEB J.1995,9:133-139)は、公開された結晶構造に基づいて、抗体とこれらの抗原との間の接触領域を分析し、CDR残基の約1/5~1/3のみが実際に抗原と接触すると結論付けた。Padlanは、1つまたは2つのCDRが抗原と接触しているアミノ酸を有さない多くの抗体も発見した(Vajdos et al.2002 J Mol Biol 320:415-428も参照されたい)。
抗原と接触していないCDR残基は、先行研究(例えば、CDRH2中の残基H60~H65は必要とされないことが多い)に基づいて、ChothiaのCDRの外側にあるKabatのCDRの領域から、分子モデリングによって、かつ/または演繹的に識別することができる。CDRまたはその残基(複数可)が省略される場合、そのCDRもしくはその残基(複数可)は、通常、別のヒト抗体配列もしくはこのような配列のコンセンサスにおける対応する位置を占有するアミノ酸と置換される。CDR内の置換のための位置および置換すべきアミノ酸も演繹的に選択することができる。演繹的な置換は、保存的置換または非保存的置換であり得る。
本明細書に開示される完全ヒト抗溶血素Aモノクローナル抗体は、対応する生殖系列配列と比較して、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインのフレームワークおよび/またはCDR領域に1つ以上のアミノ酸置換、挿入、および/または欠失を含み得る。このよ
うな変異は、本明細書に開示されるアミノ酸配列を、例えば、公共の抗体配列データベースから入手可能な生殖系列配列と比較することによって容易に確認することができる。本発明は、本明細書に開示するアミノ酸配列のいずれかに由来する抗体およびその抗原結合断片を含み、1つ以上のフレームワークおよび/またはCDR領域内の1つ以上のアミノ酸は、抗体が由来した生殖系列配列の対応する残基(複数可)へ、または別のヒト生殖系列配列の対応する残基(複数可)へ、または対応する生殖系列残基(複数可)の保存的アミノ酸置換へ変異する(このような配列変化はまとめて、「生殖系列変異」と本明細書で呼ばれる)。当業者であれば、本明細書に開示される重鎖可変領域配列および軽鎖可変領域配列から出発して、1つ以上の個々の生殖系列変異またはこれらの組み合わせを含む多数の抗体および抗体結合断片を容易に産生することができる。特定の実施形態では、Vおよび/もしくはVドメイン内のフレームワークおよび/もしくはCDR残基のうちの全てが、抗体が由来した元の生殖系列配列において見出される残基へと再び変異する。他の実施形態では、特定の残基のみが元の生殖系列配列へと変異し戻され、例えば、変異した残基は、FR1の最初の8つのアミノ酸内に、もしくはFR4の最後の8つのアミノ酸内に見出されるか、または変異した残基は、CDR1、CDR2、もしくはCDR3内にのみ見出される。他の実施形態では、フレームワークおよび/またはCDR残基(複数可)のうちの1つ以上は、異なる生殖系列配列(すなわち、抗体が本来由来した生殖系列配列とは異なる生殖系列配列)の対応する残基(複数可)へ変異する。さらに、本発明の抗体は、フレームワークおよび/またはCDR領域内に2つ以上の生殖系列変異の任意の組み合わせを含有してもよく、例えば、特定の個々の残基は、特定の生殖系列配列の対応する残基へ変異するのに対し、元の生殖系列配列とは異なる特定の他の残基は、維持されるか、または異なる生殖系列配列の対応する残基へ変異する。いったん得られれば、1つ以上の生殖系列変異を含有する抗体および抗体結合断片は、結合特異性の改善、結合親和性の増加、アンタゴニストもしくはアゴニストの生物学的特性の改善もしくは増強(場合によって)、免疫原性の低下などの1つ以上の所望の特性について容易に試験することができる。この一般的な方法で得られる抗体および抗体結合断片は、本発明の範囲内に包含される。
本発明は、1つ以上の保存的置換を有する本明細書に開示されるHCVRアミノ酸配列、LCVRアミノ酸配列、および/またはCDRアミノ酸配列のうちのいずれかの変異体を含む完全ヒト抗溶血素Aモノクローナル抗体も含む。例えば、本発明は、本明細書に開示されるHCVR、LCVR、および/またはCDRアミノ酸配列のうちのいずれかに関連する、例えば10個以下、8つ以下、6つ以下、または4つ以下などの保存的アミノ酸置換を有するHCVR、LCVR、および/またはCDRアミノ酸配列を有する抗溶血素A抗体を含む。
「ヒト抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域および定常領域を有する抗体を含むことが企図される。本発明のヒトmAbは、例えば、CDR、特にCDR3における、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列(例えば、インビトロでのランダムもしくは部位特異的変異誘発によって、またはインビボでの体細胞突変異によって導入された変異)によってコードされないアミノ酸残基を含み得る。しかしながら、「ヒト抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、別の哺乳動物種(例えば、マウス)の生殖系列に由来するCDR配列がヒトFR配列へと移植されたmAbを含むことは企図されない。
「~を特異的に結合する」もしくは「~へ特異的に結合する」という用語、またはこれらに類するものは、抗体もしくはその抗原結合断片が、生理学的条件下で比較的安定的である抗原と複合体を形成することを意味する。特異的結合は、少なくとも約1×10-6M以下の平衡解離定数を特徴とし得る(例えば、より小さなKは、より緊密な結合を示す)。2つの分子が特異的に結合するかどうかを決定するための方法は、当該技術分野で
よく知られており、例えば、平衡透析、表面プラズモン共鳴、およびこれらに類するものを含む。本明細書に記載されるように、溶血素Aに特異的に結合する抗体は、表面プラズモン共鳴、例えば、BIACORE(商標)によって識別されている。そのうえ、溶血素Aにおける1つのドメインおよび1つ以上のさらなる抗原に結合する多重特異性抗体、または溶血素Aの2つの異なる領域に結合する二重特異性は、それにもかかわらず、本明細書で使用されるような「特異的に結合する」抗体とみなされる。
「高親和性」抗体という用語は、表面プラズモン共鳴、例えば、BIACORE(商標)または溶液親和性ELISAによって測定して、少なくとも10-7M、好ましくは10-8M、より好ましくは10-9M、さらにより好ましくは10-10M、さらにより好ましくは10-11MのKとして表される溶血素Aに対する結合親和性を有するmAbを指す。
「緩徐なオフ速度」、「Koff」、または「kd」という用語は、表面プラズモン共鳴、例えば、BIACORE(商標)によって測定して、1×10-3-1以下、好ましくは1×10-4-1以下の速度定数で溶血素Aから解離する抗体を記載することを意味する。
抗体の「抗原結合部分」、抗体の「抗原結合断片」という用語、およびこれらに類するものは、本明細書で使用される場合、任意の天然に生じる、酵素処理で入手可能な、合成の、または遺伝子操作された、抗原を特異的に結合して複合体を形成するポリペプチドもしくは糖タンパク質を含む。抗体の「抗原結合断片」または「抗体断片」という用語は、本明細書で使用される場合、溶血素Aに結合する能力を保持する抗体の1つ以上の断片を指す。
特定の実施形態では、本発明の抗体もしくは抗体断片は、抗生物質、第2の抗溶血素A抗体、もしくはIL-1、IL-6、もしくはTGF-βなどのサイトカインに対する抗体などの治療部分(「免疫抱合体」)、またはStaphylococcus aureus感染症、皮膚および軟組織感染症(膿瘍を含む)、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症候群、乳房炎、ならびにせつ腫症およびカルブンケル症(吹出物)を含む疾患もしくは状態を治療するのに有用な任意の他の治療部分に接合され得る。
「単離された抗体」は、本明細書で使用される場合、異なる抗原特異性を有する他の抗体(Ab)を実質的に含まない抗体を指すことが企図される(例えば、溶血素Aを特異的に結合する単離された抗体またはその断片は、溶血素A以外の抗原を特異的に結合するAbを実質的に含まない)。
「表面プラズモン共鳴」という用語は、本明細書で使用される場合、例えば、BIACORE(商標)システム(Pharmacia Biosensor AB、スウェーデン国ウプサラ市および米国ニュージャージー州ピスカタウェイ郡区)を使用して、バイオセンサマトリックス内のタンパク質濃度の変化の検出によって実時間での生体分子相互作用の分析を可能にする光学現象を指す。
「K」という用語は、本明細書で使用される場合、特定の抗体・抗原相互作用の平衡解離定数を指すことが企図される。
「エピトープ」という用語は、パラトープとして知られる抗体分子の可変領域における特異的抗原結合部位と相互作用する抗原決定基を指す。単一の抗原は、1つ超のエピトープを有し得る。したがって、異なる抗体は、抗原上の異なる領域に結合し得、かつ異なる
生物学的効果を有し得る。「エピトープ」という用語は、B細胞および/またはT細胞が応答する抗原上の部位も指す。この用語は、抗体が結合する抗原の領域も指す。エピトープは、構造的または機能的と定義され得る。機能的エピトープは、概して、構造エピトープのサブセットであり、相互作用の親和性に直接寄与する残基を有する。エピトープは、立体配座的でもあり得、すなわち、非線形アミノ酸から構成され得る。特定の実施形態では、エピトープは、アミノ酸、糖側鎖、ホスホリル基、またはスルホニル基などの分子の化学的に活性のある表面群である決定基を含み得、特定の実施形態では、特異的三次元構造特徴および/または比電荷特徴を有し得る。
「実質的な同一性」または「実質的に同一である」という用語は、核酸またはその断片を指す場合、別の核酸(またはその相補鎖)との適切なヌクレオチド挿入または欠失と最適に整列したときに、以下に考察されるように、FASTA、BLAST、またはGAPなど、配列同一性の任意の周知であるアルゴリズムによって測定して、ヌクレオチド塩基の少なくとも約90%、より好ましくは少なくとも約95%、96%、97%、98%、または99%のヌクレオチド配列同一性があることを示す。参照核酸分子と実質的な同一性を有する核酸分子は、特定の場合では、参照核酸分子によってコードされるポリペプチドと同じまたは実質的に類似のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードすることができる。
ポリペプチドに適用される場合、「実質的な類似性」または「実質的に類似の」という用語は、2つのペプチド配列が、既定のギャップ重みを使用してプログラムGAPもしくはBESTFITなどによって最適に整列された場合、少なくとも90%の配列同一性、さらにより好ましくは少なくとも95%、98%、または99%の配列同一性を共有することを意味する。好ましくは、同一ではない残基位置は、保存的アミノ酸置換だけ異なる。「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、類似の化学的特性(例えば、電荷または疎水性)を備えた側鎖(R基)を有する別のアミノ酸残基によって置換されたものである。概して、保存的アミノ酸置換は、タンパク質の機能的特性を実質的に変化させないであろう。2つ以上のアミノ酸配列が保存的置換だけ互いに異なる場合、相同性の百分率または程度は、置換の保存的性質を補正するために上向きに調整してもよい。この調整を行うための手段は、当業者によく知られている。例えば、参照により本明細書に組み込まれる、Pearson(1994)Methods Mol.Biol.24:307-331を参照されたい。類似の化学的特性を備えた側鎖を有するアミノ酸基の例としては、1)脂肪族側鎖:グリシン、アラニン、バリン、ロイシンおよびイソロイシン、2)脂肪族-ヒドロキシル側鎖:セリンおよびトレオニン、3)アミド含有側鎖:アスパラギンおよびグルタミン、4)芳香族側鎖:フェニルアラニン、チロシン、およびトリプトファン、5)塩基性側鎖:リジン、アルギニン、およびヒスチジン、6)酸性側鎖:アスパラギン酸およびグルタミン酸、ならびに7)含硫側鎖:システインおよびメチオニンが挙げられる。好ましい保存的アミノ酸置換基は、バリン-ロイシン-イソロイシン、フェニルアラニン-チロシン、リジン-アルギニン、アラニン-バリン、グルタミン酸-アスパラギン酸、およびアスパラギン-グルタミンである。代替的に、保存的置換とは、参照により本明細書に組み込まれる、Gonnet et al.(1992)Science 256:1443 45に開示されるPAM250対数尤度マトリックスにおいて正の値を有する任意の変化である。「適度に保存的な」置換とは、PAM250対数尤度マトリックスにおいて負以外の値を有する任意の変化である。
ポリペプチドについての配列類似性は、典型的には、配列解析ソフトウェアを使用して測定される。タンパク質解析ソフトウェアは、保存的アミノ酸置換を含む様々な置換、欠失、および他の修飾に割り当てられた類似性の測定値を使用して類似の配列と一致させる。例えば、GCGソフトウェアは、異なる種の生物由来の相同ポリペプチドのような密接に関連するポリペプチド間の、または野生型タンパク質とその変異タンパク質の間の配列相同性もしくは配列同一性を決定するための既定パラメータとともに使用することができ
るGAPおよびBESTFITなどのプログラムを含有する。例えば、GCG第6.1版を参照されたい。ポリペプチド配列は、GCG第6.1版におけるプログラムである、既定パラメータまたは推奨パラメータを備えたFASTAを使用して比較することもできる。FASTA(例えば、FASTA2およびFASTA3)は、問い合わせ配列と検索配列の間の最良重複の領域の整列およびパーセント配列同一性を提供する(Pearson(2000)上述)。本発明の配列を、異なる生物由来の多数の配列を含有するデータベースと比較する場合の別の好ましいアルゴリズムは、既定パラメータを使用するコンピュータプログラムBLAST、特にBLASTPまたはTBLASTNである。例えば、Altschul et al.(1990)J.Mol.Biol.215:403-410および(1997)Nucleic Acids Res.25:3389-3402(これらの各々が、参照により本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
特定の実施形態では、本発明の方法において使用するための抗体または抗体断片は、単一特異性、二重特異性、または多重特異性であり得る。多重特異性抗体は、1つの標的ポリペプチドの異なるエピトープに特異的であり得るか、または1つ超の標的ポリペプチドのエピトープに特異的な抗原結合ドメインを含有し得る。本発明の背景において使用することができる例示的な二重特異性抗体フォーマットは、第1の免疫グロブリン(Ig)C3ドメインおよび第2のIgC3ドメインの使用を包含し、第1および第2のIgC3ドメインは、少なくとも1つのアミノ酸だけ互いに異なっており、少なくとも1つのアミノ酸の相違は、このアミノ酸の相違を欠失する二重特異性抗体と比較して、タンパク質Aへの二重特異性抗体の結合を低減させる。一実施形態では、第1のIgC3ドメインは、タンパク質Aに結合し、第2のIgC3ドメインは、H95R修飾(IMGTエクソン番号付けによる、EU番号付けによるH435R)などのタンパク質A結合を低減または消失させる変異を含有する。第2のC3は、さらに、Y96F修飾(IMGTによる、EUによるY436F)を含み得る。第2のC3の内部に見出され得るさらなる修飾には、IgG1 mAbの場合、D16E、L18M、N44S、K52N、V57M、およびV82I(IMGTによる、EUによるD356E、L358M、N384S、K392N、V397M、およびV422I)、IgG2 mAbの場合、N44S、K52N、およびV82I(IMGT、EUによるN384S、K392N、およびV422I)、ならびにIgG4 mAbの場合、Q15R、N44S、K52N、V57M、R69K、E79Q、およびV82I(IMGTによる、EUによるQ355R、N384S、K392N、V397M、R409K、E419Q、およびV422I)が含まれる。上記に記載される二重特異性抗体フォーマットの変形は、本発明の範囲内で熟慮される。
「治療有効量」という語句は、所望の効果のために投与されて所望の効果を生じる量を意味する。正確な量は、治療の目的によることになっており、既知の技術を使用して当業者によって確認できるであろう(例えば、Lloyd(1999)The Art,Science and Technology of Pharmaceutical Compoundingを参照されたい)。
一般的な説明
Staphylococcus aureus溶血素A毒素は、33kDaの分泌型単量体タンパク質であり、宿主細胞の膜内で七量体構造にオリゴマー化して、細胞溶解、炎症、および組織損傷につながる孔を形成する。溶血素Aは、肺炎、皮膚壊死、心内膜炎、および敗血症において役割を果たすことが示されている。
本明細書に記載される抗体は、溶血素Aへの特異的な結合を実証しており、いくつかの実施形態では、、S.aureus感染症を罹患している患者を治療するか、またはそのような感染症を予防するのに有用であり得る。そのような抗体の使用は、S.aureu
s感染症を罹患している患者を治療する有効な手段であってもよいし、またはS.aureus感染症の症状の重症度を軽減するために使用されてもよい。これらは、単独で、または限定されないが、抗生物質、非ステロイド性抗炎症薬物(NSIAD)(または他の緩和療法)、もしくはプレドニゾンなどのコルチコステロイドなどのStaphylococcus aureus感染症を治療するための当該技術分野で知られている他の治療部分もしくは様式との補助療法として使用され得る。それらは、溶血素A以外の抗原に特異的なさらなる抗体と併用して使用され得るか、または他のタイプの治療と組み合わされ得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載される抗体は、皮膚壊死、皮膚および軟組織感染症(膿瘍を含む)、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症候群、乳房炎、ならびにせつ腫症およびカルブンケル症(吹出物)を含むがこれらに限定されない、Staphylococcus aureus感染症の疾患もしくは状態の予防、治療、または管理に有用であり得る。
特定の実施形態では、本発明の抗体は、天然の全長溶血素A(配列番号291)などの一次免疫原、または修飾形態の溶血素A(配列番号295)もしくは溶血素A断片で免疫され、続いて二次免疫原、または溶血素Aの免疫原的に活性な断片で免疫されたマウスから得られる。
免疫原は、溶血素Aの免疫原性断片またはその断片をコードするDNAであり得る。免疫原は、ヒスチジンタグおよび/または抗体のFc領域の断片に連結された溶血素Aであり得る。
全長溶血素Aのアミノ酸配列は、配列番号291として示されている。修飾溶血素Aの全長アミノ酸配列は、配列番号295として示されている。
特定の実施形態では、溶血素Aに特異的に結合する抗体は、上記の領域の断片、または本明細書に記載される領域のNもしくはC末端のいずれかもしくは両方から約5~約20個のアミノ酸残基だけ指定領域を超えて延在するペプチドを使用して調製され得る。特定の実施形態では、上記の領域またはその断片の任意の組み合わせを、溶血素A特異性抗体の調製において使用され得る。特定の実施形態では、溶血素Aの上記の領域のうちの任意の1つ以上、またはその断片は、単一特異性抗体、二重特異性抗体、または多重特異性抗体を調製するために使用され得る。
抗体の抗原結合断片
別段具体的に示されない限り、「抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、2つの免疫グロブリン重鎖および2つの免疫グロブリン軽鎖を含む抗体分子(すなわち、「完全抗体分子」)ならびにその抗原結合断片を包含すると理解されるものとする。抗体の「抗原結合部分」、抗体の「抗原結合断片」という用語、およびこれらに類するものは、本明細書で使用される場合、任意の天然に生じる、酵素処理で入手可能な、合成の、または遺伝子操作された、抗原を特異的に結合して複合体を形成するポリペプチドもしくは糖タンパク質を含む。抗体の「抗原結合断片」または「抗体断片」という用語は、本明細書で使用される場合、溶血素Aに特異的に結合する能力を保持する抗体の1つ以上の断片を指す。抗体断片は、Fab断片、F(ab’)断片、Fv断片、dAb断片、CDRを含有する断片、または単離されたCDRを含み得る。抗体の抗原結合断片は、例えば、DNAコード抗体可変ドメインおよび(任意選択的に)定常ドメインの操作および発現を包含するタンパク質消化技術または組換え遺伝子操作技術などの任意の好適な標準的技術を使用した完全抗体分子に由来し得る。このようなDNAは、知られており、かつ/または
例えば、市販の供給源、DNAライブラリー(例えば、ファージ抗体ライブラリーを含む)から容易に入手可能であるか、あるいは合成することができる。DNAは、例えば、1つ以上の可変ドメインおよび/もしくは定常ドメインを好適な配置へと配置するか、またはコドンを導入し、システイン残基を創造し、アミノ酸を修飾、付加、もしくは欠失などするために、化学的に、または分子生物学技術を使用することによって配列決定および操作され得る。
抗体結合断片の非限定例としては、(i)Fab断片、(ii)F(ab’)2断片、(iii)Fd断片、(iv)Fv断片、(v)一本鎖Fv(scFv)分子、(vi)dAb断片、および(vii)抗体の超可変領域(例えば、CDR3ペプチドなどの単離された相補性決定領域(CDR))を模倣するアミノ酸残基、または拘束FR3-CDR3-FR4ペプチドからなる最小認識単位が挙げられる。ドメイン特異性抗体、単一ドメイン抗体、ドメイン欠失抗体、キメラ抗体、CDR移植抗体、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、ミニボディ、ナノボディ(例えば、一価ナノボディ、二価ナノボディなど)、小モジュラー免疫薬(SMIP)、およびサメ可変IgNARドメインなどの他の工学操作された分子もまた、本明細書で使用されるような「抗原結合断片」の表現内に包含される。
抗体の抗原結合断片は、典型的には、少なくとも1つの可変ドメインを含むであろう。可変ドメインは、任意のサイズまたはアミノ酸組成物であり得、概して、1つ以上のフレームワーク配列に隣接しているか、または1つ以上のフレームワーク配列とともにインフレームである、少なくとも1つのCDRを含むであろう。Vドメインに関連するVドメインを有する抗体結合断片において、VドメインおよびVドメインは、任意の好適な配置で互いに対して位置付けられ得る。例えば、可変領域は、二量体であり、かつV-V、V-VまたはV-V二量体を含有し得る。代替的に、抗体の抗原結合断片は、単量体のVドメインまたはVドメインを含有し得る。
特定の実施形態では、抗体の抗原結合断片は、少なくとも1つの定常ドメインに共有結合された少なくとも1つの可変ドメインを含有し得る。本発明の抗体の抗原結合断片の内部に見出すことができる可変ドメインおよび定常ドメインの非限定的で例示的な配置には、(i)V-C1、(ii)V-C2、(iii)V-C3、(iv)V-C1-C2、(v)V-C1-C2-C3、(vi)V-C2-C3、(vii)V-C、(viii)V-C1、(ix)V-C2、(x)V-C3、(xi)V-C1-C2、(xii)V-C1-C2-C3、(xiii)V-C2-C3、ならびに(xiv)V-Cが含まれる。先に列挙した例示的な配置のうちのいずれかを含む、可変ドメインおよび定常ドメインの任意の配置では、可変ドメインおよび定常ドメインは、互いに直接連結され得るか、または完全ヒンジ領域もしくは部分的ヒンジ領域もしくはリンカー領域によって連結され得るかのいずれかであり得る。ヒンジ領域は、単一のポリペプチド分子において隣接する可変ドメインおよび/または定常ドメイン間の可撓性または半可撓性の結合をもたらす少なくとも2つの(例えば、5、10、15、20、40、60またはそれより多数の)アミノ酸からなり得る。そのうえ、本発明の抗体の抗原結合断片は、互いとおよび/または1つ以上の単量体VドメインもしくはVドメインと非共有結合性会合している(例えば、ジスルフィド結合(複数可)によって)、先に列挙した可変ドメイン配置および定常ドメイン配置のいずれかのホモ二量体またはヘテロ二量体(または他の多量体)を含み得る。
完全抗体分子と同様に、抗原結合断片は、単一特異性または多重特異性(例えば、二重特異性)であり得る。抗体の多重特異性抗原結合断片は、典型的には、少なくとも2つの異なる可変ドメインを含むことになっており、各可変ドメインは、別個の抗原へまたは同じ抗原上の異なるエピトープに特異的に結合することができる。本明細書に開示される例
示的な二重特異性抗体フォーマットを含む、任意の多重特異性抗体フォーマットは、当該技術分野で利用可能な通例の技術を使用して、本発明の抗体の抗原結合断片という背景における使用に適合され得る。
本発明は、抗溶血素A抗体、および本明細書に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン鎖を有する抗原結合断片、ならびに細胞性および/またはインビトロの翻訳後修飾を有する変異体を含む。例えば、本発明は、本明細書に記載の重鎖および/または軽鎖アミノ酸配列(例えば、CDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、および/またはCDR-L3)を含む溶血素Aに特異的に結合する抗体およびその抗原結合断片、ならびに1つ以上のアミノ酸残基がグリコシル化されている抗体および断片、1つ以上のAsn残基が脱アミド化されている抗体および断片、1つ以上の残基(例えば、Met、Trp、および/またはHis)が酸化されている抗体および断片、N末端Glnがピログルタメート(pyroE)である抗体および断片、ならびに/またはC末端リジンが欠けている抗体および断片を含む。
本発明は、本発明の抗溶血素A抗体もしくはその抗原結合断片、またはその免疫グロブリン鎖を作製するための組換え方法を含み、(i)当該抗体もしくは抗原結合断片の軽鎖および/または重鎖免疫グロブリン鎖(例えば、重鎖もしくはそのV、またはそのHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含む免疫グロブリン、ならびに/またはその軽鎖もしくはそのV、またはそのLCDR1、LCDR2、およびLCDR3を含む免疫グロブリン)をコードする1つ以上のポリヌクレオチドを導入することであって、例えば、ポリヌクレオチドがベクター内にあり、かつ/またはプロモーターに動作可能に連結されている、1つ以上のポリヌクレオチドを導入することと、(ii)ポリヌクレオチド(複数可)の発現に好ましい条件下で宿主細胞(例えば、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞またはPichia細胞またはPichia pastoris細胞)を培養することと、(iii)任意選択的に、宿主細胞および/または宿主細胞が増殖する培地から抗体または断片または鎖を単離することと、を含む。1つ超の免疫グロブリン鎖を含む抗体または抗原結合断片、例えば、2つの重鎖免疫グロブリンおよび2つの軽鎖免疫グロブリンを含む抗体を作製する場合、単一の宿主細胞における鎖の同時発現が、例えば、そのような鎖が分泌される場合、細胞内または細胞表面上または細胞外に、抗体もしくは抗原結合断片分子を形成するように、鎖の会合をもたらす。本方法は、重鎖免疫グロブリンのみまたは軽鎖免疫グロブリンのみ(例えば、成熟断片および/またはその可変ドメインを含む本明細書で考察されたもののうちのいずれか)が発現されるものを含む。そのような鎖は、例えば、そのような鎖を含む抗体または抗原結合断片の発現における中間体として有用である。本発明は、そのような発現方法の生成物(例えば、抗体、抗原結合断片、V、またはV)を含む。
ヒト抗体の調製
トランスジェニックマウスにおいてヒト抗体を生成するための方法は、当該技術分野で知られている。溶血素Aに特異的に結合するヒト抗体を作製するために、何らかのこのような既知の方法を本発明の背景において使用することができる。
モノクローナル抗体を生成するためにVELOCIMMUNE(商標)技術(例えば、US6,596,541,Regeneron Pharmaceuticals,VELOCIMMUNE(登録商標)を参照されたい)または何らかの他の既知の方法を使用して、ヒト可変領域およびマウス定常領域を有する溶血素Aに対する高親和性キメラ抗体を最初に単離する。VELOCIMMUNE(登録商標)技術は、マウスが抗原刺激に対する応答においてヒト可変領域とマウス定常領域とを含む抗体を産生するように、ヒト重鎖可変領域とヒト軽鎖可変領域とを含むゲノムが内在性マウス定常領域座に動作可能に連結されたトランスジェニックマウスの生成を包含する。抗体の重鎖および軽鎖の可変領域
をコードするDNAを単離し、ヒト重鎖定常領域およびヒト軽鎖定常領域をコードするDNAに動作可能に連結する。次に、完全ヒト抗体を発現することができる細胞においてDNAを発現させる。
概して、VELOCIMMUNE(登録商標)マウスに関心対象の抗原を負荷し、抗体を発現するマウスからリンパ細胞(B細胞など)を回収する。リンパ細胞を骨髄腫細胞株と融合させて不死化ハイブリドーマ細胞株を調製し得、関心対象の抗原に特異的な抗体を産生するハイブリドーマ細胞株を同定するためにこのようなハイブリドーマ細胞株をスクリーニングおよび選択する。重鎖および軽鎖の可変領域をコードするDNAを単離し得、重鎖および軽鎖の望ましいアイソタイプ定常領域へ連結することができる。このような抗体タンパク質は、CHO細胞などの細胞において産生され得る。代替的に、抗原特異的キメラ抗体または軽鎖および重鎖の可変ドメインをコードするDNAを抗原特異的リンパ球から直接単離することができる。
最初に、ヒト可変領域とマウス定常領域とを有する高親和性キメラ抗体を単離する。以下の実験の節と同様に、抗体は、親和性、選択性、エピトープなどを含む望ましい特徴について特徴付けられ、かつ選択される。本発明の完全ヒト抗体、例えば野生型または修飾IgG1もしくはIgG4を生成するために、マウス定常領域を所望のヒト定常領域と置換する。選択された定常領域は特異的用途に応じて変化し得るが、高親和性抗原結合特徴および標的特異性特徴は、可変領域に存在する。
概して、本発明の抗体は、固相または液相のいずれかに固定化された抗原への結合によって測定された場合、非常に高い親和性を有し、典型的には、約10-12~約10-7MのKを保有する。マウス定常領域を所望のヒト定常領域と置換して、本発明の完全ヒト抗体を生成する。選択された定常領域は特異的用途に応じて変化し得るが、高親和性抗原結合特徴および標的特異性特徴は、可変領域に存在する。
生物学的等価物
本発明の抗溶血素A抗体および抗体断片は、記載される抗体のものとは異なるアミノ酸配列を有するが、溶血素Aに結合する能力を保持しているタンパク質を包含する。そのような変異抗体および抗体断片は、親配列と比較して、アミノ酸の1つ以上の付加、欠失、または置換を含むが、記載される抗体のものと本質的に同等である生物学的活性を示す。同様に、本発明の抗体コードDNA配列は、開示された配列と比較して、ヌクレオチドの1つ以上の付加、欠失、または置換を含むが、本発明の抗体または抗体断片と本質的に生物学的に等価である抗体または抗体断片をコードする配列を包含する。
2つの抗原結合タンパク質または抗体は、例えば、それらが類似の実験条件下で単回用量または複数回用量のいずれかで同じモル用量で投与された場合に、吸収速度および吸収の程度が有意差を示さない医薬的等価物または医薬的選択肢である場合、生物学的等価物とみなされる。いくつかの抗体は、これらの吸収の程度において等価であるが、吸収速度は等価ではなく、また吸収速度のこのような差が意図的であり、かつ標識する際に反映されているので生物学的に等価とみなされ得る場合、等価物または医薬代替物とみなされることになっており、例えば長期使用に及ぼす有効な身体薬物濃度の達成に必須ではなく、かつ研究される特定の薬物生成物にとって医学的に有意ではないとみなされる。
一実施形態では、2つの抗原結合タンパク質は、これらの安全性、純度、または有効性において臨床的に有意性のある差がない場合、生物学的に等価である。
一実施形態では、2つの抗原結合タンパク質は、免疫原性の臨床的に有意な変化または有効性の減退を含む有害作用のリスクの期待される上昇なしで参照生成物と生物学的生成
物の間での切り替えなしで持続される療法と比較して、患者が1回以上切り替えられることができる場合、生物学的に等価である。
一実施形態では、2つの抗原結合タンパク質は、これらが両方とも、条件または使用条件についての共通の機序または作用機序によって、このような機序が既知である程度まで作用する場合、生物学的に等価である。
生物学的等価性は、インビボおよび/またはインビトロの方法によって実証され得る。生物学的等価性測定法には、例えば、(a)抗体またはその代謝産物の濃度を、血液、血漿、血清または他の生物学的流体中で時間の関数として測定する、ヒトまたは他の哺乳動物におけるインビボでの試験、(b)ヒトインビボ生物学的利用能データと相関し、このデータの十分な予測となるインビトロ試験、(c)抗体(またはその標的)の適切な急性薬理学的効果を時間の関数として測定する、ヒトまたは他の哺乳類におけるインビボ試験、および(d)抗体の安全性、有効性、または生物学的利用能もしくは生物学的等価性を確立する、よく管理された臨床試験が含まれる。
本発明の抗体の生物学的に等価な変異体は、例えば、残基もしくは配列の様々な置換を生じさせること、または生物活性に必要とされない末端もしくは内部の残基もしくは配列を欠失させることによって構築され得る。例えば、生物学的活性にとって必須ではないシステイン残基は、再生の際の不必要または不正確な分子内ジスルフィド架橋の形成を防止するために、欠失または他のアミノ酸で置換することができる。他の背景では、生物学的に等価の抗体には、抗体のグリコシル化特徴を修飾するアミノ酸変化、例えばグリコシル化を排除または除去する変異を含む、抗体変異体が含まれ得る。
Fc変異体を含む抗溶血素A抗体
本発明の特定の実施形態によると、例えば、中性pHと比較して酸性pHで、FcRn受容体への抗体結合を増強または減少させる1つ以上の突然変異を含むFcドメインを含む、抗溶血素A抗体が提供される。例えば、本発明は、FcドメインのC2またはC3領域に変異を含む抗溶血素A抗体を含み、変異(複数可)は、酸性環境において(例えば、pHが約5.5~約6.0の範囲のエンドソームにおいて)FcRnに対するFcドメインの親和性を増加させる。そのような突然変異は、動物に投与されたときに抗体の血清半減期の増加をもたらし得る。そのようなFc修飾の非限定的な例には、例えば、250位(例えば、EまたはQ)、250位および428位(例えば、LまたはF)、252位(例えば、L/Y/F/WまたはT)、254位(例えば、SまたはT)、および256位(例えば、S/R/Q/E/DまたはT)での修飾、または428位および/もしくは433位(例えば、H/L/R/S/P/QまたはK)および/もしくは434位(例えば、A、W、H、F、またはY[N434A、N434W、N434H、N434F、またはN434Y])での修飾、あるいは250位および/もしくは428位の修飾、あるいは307位もしくは308位(例えば、308F、V308F)、および434位での修飾が含まれる。一実施形態では、修飾は、428L(例えば、M428L)および434S(例えば、N434S)修飾、428L、259I(例えば、V259I)、および308F(例えば、V308F)修飾、433K(例えば、H433K)および434(例えば、434Y)修飾、252、254、および256(例えば、252Y、254T、および256E)修飾、250Qおよび428L修飾(例えば、T250QおよびM428L)、ならびに307および/または308修飾(複数可)(例えば、308Fおよび/または308P)を含む。さらに別の実施形態では、修飾は、265A(例えば、D265A)および/または297A(例えば、N297A)修飾を含む。
例えば、本発明は、250Qおよび248L(例えば、T250QおよびM248L)、252Y、254T、および256E(例えば、M252Y、S254T、およびT2
56E)、428Lおよび434S(例えば、M428LおよびN434S)、257Iおよび311I(例えば、P257IおよびQ311I)、257Iおよび434H(例えば、P257IおよびN434H)、376Vおよび434H(例えば、D376VおよびN434H)、307A、380A、および434A(例えば、T307A、E380A、およびN434A)、ならびに433Kおよび434F(例えば、H433KおよびN434F)からなる群から選択される1つ以上の変異対または変異群を含む、Fcドメインを含む抗溶血素A抗体を含む。前述のFcドメイン変異、および本明細書に開示される抗体可変ドメイン内の他の変異の全ての可能な組み合わせが、本発明の範囲内で熟慮される。
一実施形態では、本発明はまた、キメラ重鎖定常(C)領域を含む抗溶血素A抗体を含み、キメラC領域は、1つ超の免疫グロブリンアイソタイプのC領域に由来するセグメントを含む。例えば、本発明の抗体は、ヒトIgG1分子、ヒトIgG2分子、またはヒトIgG4分子に由来するC3ドメインの一部または全部と組み合わされた、ヒトIgG1分子、ヒトIgG2分子、またはヒトIgG4分子に由来するC2ドメインの一部または全部を含む、キメラC領域を含み得る。特定の実施形態によると、本発明の抗体は、キメラヒンジ領域を有するキメラC領域を含む。例えば、キメラヒンジは、ヒトIgG1ヒンジ領域、ヒトIgG2ヒンジ領域、またはヒトIgG4ヒンジ領域に由来する「下部ヒンジ」配列(EU番号付けによる位置228~236のアミノ酸残基)と組み合わされた、ヒトIgG1ヒンジ領域、ヒトIgG2ヒンジ領域、またはヒトIgG4ヒンジ領域に由来する「上部ヒンジ」アミノ酸配列(EU番号付けによる位置216~227のアミノ酸残基)を含み得る。特定の実施形態によると、キメラヒンジ領域は、ヒトIgG1またはヒトIgG4上部ヒンジに由来するアミノ酸残基と、ヒトIgG2下部ヒンジに由来するアミノ酸残基と、を含む。本明細書に記載されるようなキメラC領域を含む抗体は、特定の実施形態では、抗体の治療特性または薬物動態学的特性に悪影響を与えることなく、修飾Fcエフェクター機能を呈し得る。(例えば、2013年2月1日に出願された、米国仮特許出願第61/759,578号(その開示全体が参照により本明細書に組み込まれる)を参照されたい。)
本発明はまた、タンパク質Aの結合を妨害する1つ以上の置換(例えば、変異)が導入されている修飾重鎖定常(C)領域を含む抗溶血素A抗体も含む。例えば、いくつかの実施形態では、本発明の抗溶血素A抗体は、His435がArgに変異されているIgG1定常領域を有する。重鎖定常領域におけるこの点突然変異では、本発明の抗溶血素A抗体は、タンパク質Aに結合しないであろう。本発明の他の実施形態では、抗溶血素A抗体は、タンパク質A結合を無効にするための重鎖定常領域におけるジペプチド変異、H435R/Y436F(EU番号付け、IMGTによるH95R/Y96F)を含有する。(例えば、2010年6月25日に出願された、米国特許第8,586,713号(その開示は、その全体が参照により本明細書により組み込まれる)を参照されたい。)
抗体の生物学的特徴
概して、本発明の抗体は、溶血素Aに結合することによって機能し得る。いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、別の抗原に結合し得る(交差反応性抗体)。
特定の実施形態では、本発明の抗体は、溶血素Aに加えて他の細菌毒素または毒素サブユニットに結合し得る。本発明の抗体が結合し得るS.aureusのさらなる毒素または毒素サブユニットは、二成分孔形成白血球毒素(例えば、ロイコシジンまたはガンマ溶血素)および/またはこれらの毒素のSもしくはFサブユニット(例えば、LukF、LukD、および/またはHlgB)を含む。特定の実施形態では、本発明の抗体は、溶血素Aへの有意な結合のみを示す。特定の実施形態では、本発明の抗体は、溶血素Aに検出可能な程度にのみ結合する。
特定の実施形態では、本発明の抗体は、二重特異性抗体であり得る。本発明の二重特異性抗体は、1つのドメイン中の1つのエピトープに結合し得、かつ溶血素Aの第2のドメイン中の1つのエピトープにも結合し得る。特定の実施形態では、本発明の二重特異性抗体は、同じドメイン中の2つの異なるエピトープに結合し得る。
一実施形態では、本発明は、溶血素Aに結合する完全ヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であって、以下の特徴:(i)配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するHCVRを含むこと、(ii)配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するLCVRを含むこと、(iii)配列番号8、28、48、68、88、108、128、148、168、188、208、228、248、268、および288からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するHCDR3ドメイン、ならびに配列番号16、36、56、76、96、116、136、156、176、196、216、236、256、および276からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するLCDR3ドメインを含むこと、(iv)配列番号4、24、44、64、84、104、124、144、164、184、204、224、244、264、および284からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するHCDR1ドメイン、配列番号6、26、46、66、86、106、126、146、166、186、206、226、246、266、および286からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するHCDR2ドメイン、配列番号12、32、52、72、92、112、132、152、172、192、212、232、252、および272からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するLCDR1ドメイン、ならびに配列番号14、34、54、74、94、114、134、154、174、194、214、234、254、および274からなる群から選択されるアミノ酸配列、または少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するそれらの実質的に類似の配列を有するLCDR2ドメインを含むこと、ならびに(v)10-7以下のKによる溶血素Aとの結合のうちの1つ以上を表す、完全ヒトモノクローナル抗体もしくはその抗原結合断片を提供する。
本発明の特定の抗溶血素A抗体は、インビトロアッセイまたはインビボアッセイによって決定されるように、溶血素Aに結合して、その活性を中和することができる。本発明の抗体が溶血素Aに結合してその活性を中和する能力は、本明細書に説明されるように、結合アッセイまたは活性アッセイを含む、当業者に知られている任意の標準的な方法を使用して測定され得る。
結合活性を測定するための非限定的で例示的なインビトロアッセイは、本明細書の実施
例3および4に例示されている。実施例6では、ヒト抗溶血素A抗体の結合親和性および速度定数は、表面プラズモン共鳴によって決定され、この測定は、T200 Biacore機器で行われた。実施例5は、溶血素A特異性抗体を使用したS.aureus溶血素Aの中和を記載する。
本発明はまた、抗溶血素A抗体およびその抗原結合断片を含み、これらは、以下のタンパク質もしくはペプチド:配列番号291(完全長野生型溶血素A)、もしくは配列番号295(溶血素Aの修飾形態)のうちのいずれかの少なくとも1つの生物学的に活性な断片に結合する。本明細書に記載される溶血素Aペプチド、またはそれらの断片のうちのいずれも、抗溶血素A抗体を生成するために使用され得る。
ペプチドは、タグ付けのために、またはKLHなどの担体分子への接合の目的のために、特定の残基の付加または置換を含むように修飾され得る。例えば、システインは、ペプチドのN末端もしくはC末端のいずれかに付加されてもよく、またはリンカー配列を付加して、例えば、免疫化のためのKLHへの接合のためのペプチドを調製してもよい。
溶血素Aに特異的な抗体は、追加の標識もしくは部分を全く含有していなくてもよいか、またはN末端もしくはC末端の標識もしくは部分を含有していてもよい。一実施形態では、標識または部分は、ビオチンである。結合アッセイでは、標識(存在する場合)の位置は、ペプチドが結合された表面に対するペプチドの向きを決定し得る。例えば、表面がアビジンで被覆されている場合、N末端ビオチンを含有するペプチドは、ペプチドのC末端部分が表面から遠位になるように配向されるであろう。一実施形態では、標識は、放射性核種、蛍光色素、またはMRI検出可能な標識であり得る。特定の実施形態では、このような標識された抗体は、撮像アッセイを含む診断アッセイにおいて使用され得る。
エピトープマッピングおよび関連技術
本発明は、溶血素Aの1つ以上の領域の内部に見出される1つ以上のアミノ酸と相互作用する抗溶血素A抗体を含む。抗体が結合するエピトープは、溶血素A分子の前述の領域(例えば、ドメイン中の直線状エピトープ)のうちのいずれかの内部に位置する、3つ以上(例えば、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20以上)のアミノ酸の単一の連続配列からなり得る。代替的に、エピトープは、溶血素A分子の前述の領域(例えば、立体配座エピトープ)のうちの一方または両方の内部に位置する複数の非隣接アミノ酸(またはアミノ酸配列)からなり得る。
当業者に知られている様々な技術を使用して、抗体がポリペプチドまたはタンパク質の内部にある「1つ以上のアミノ酸と相互作用する」かどうかを判定することができる。例示的な技術としては、例えば、Antibodies,Harlow and Lane(Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor、米国ニューヨーク州)に記載されているような通例の交差遮断アッセイが挙げられる。他の方法には、アラニン走査変異分析、ペプチドブロット分析(Reineke(2004)Methods Mol Biol 248:443-63)、ペプチド切断分析、結晶学的研究、およびNMR分析が含まれる。加えて、エピトープ切除、エピトープ抽出、および抗原の化学修飾などの方法を用いることができる(Tomer(2000)Protein Science 9:487-496)。抗体が相互作用するポリペプチドの内部にあるアミノ酸を同定するために使用することができる別の方法は、質量分析によって検出される水素/重水素交換である。一般的にいえば、水素/重水素交換法は、関心対象のタンパク質を重水素標識した後、抗体を重水素標識タンパク質へ結合させることを包含する。次に、タンパク質/抗体複合体を水に移し、抗体複合体によって保護されたアミノ酸の内部にある交換可能なプロトンは、界面の一部ではないアミノ酸の内部
にある交換可能なプロトンよりも低速で重水素から水素への逆交換を受ける。結果として、タンパク質/抗体界面の一部を形成するアミノ酸は、重水素を保持することができ、それゆえ、界面に含まれないアミノ酸と比較して相対的に大きな質量を呈する。抗体の解離後、標的タンパク質をプロテアーゼ切断および質量分析に供し、それにより、抗体が相互作用する特定のアミノ酸を含有する重水素標識残基を含有するペプチドを明らかにする。例えば、Ehring(1999)Analytical Biochemistry 267(2):252-259、Engen and Smith(2001)Anal.Chem.73:256A-265Aを参照されたい。
「エピトープ」という用語は、B細胞および/またはT細胞が応答する抗原上の部位を指す。B細胞エピトープは、タンパク質の三次元折り畳みによって並置された連続的なアミノ酸または非連続的なアミノ酸の両方から形成されることができる。連続的なアミノ酸から形成されたエピトープは、典型的には、変性溶媒への曝露の際に保持されるのに対し、三次元折り畳みによって形成されたエピトープは、典型的には、変性溶媒を用いた処理の際に失われる。エピトープは、典型的には、独特の空間的立体配座で少なくとも3個、より通常は少なくとも5個または8~10個のアミノ酸を含む。
抗原構造ベースの抗体プロファイリング(ASAP)としても知られている修飾支援プロファイリング(MAP)とは、化学的にまたは酵素により修飾された抗原表面に対する各抗体の結合特性の類似性により、同じ抗原に対する多数のモノクローナル抗体(mAb)をカテゴリー分類する方法である(その全体が参照により本明細書に具体的に組み込まれるUS2004/0101920を参照されたい)。各カテゴリーは、別のカテゴリーによって表されるエピトープとは明確に異なるか、または部分的に重複するかのいずれかの独特のエピトープを反映し得る。この技術は、特徴付けが遺伝的に異なる抗体に的を絞ることができるように、遺伝的に同一の抗体の迅速なフィルタリングを可能にする。ハイブリドーマスクリーニングへ適用する場合、MAPは、所望の特徴を有するmAbを産生する稀なハイブリドーマクローンの識別を容易にし得る。MAPを使用して、本発明の抗体を、異なるエピトープに結合する抗体の群に選別することができる。
特定の実施形態では、抗溶血素A抗体またはその抗原結合断片は、配列番号291に例示されるような野生型溶血素Aに例示される領域、または配列番号295に例示されるような修飾溶血素Aのうちのいずれか1つ以上の領域内のエピトープ、またはその断片に結合する。
本発明は、本明細書に記載される特定の例示的な抗体のうちのいずれかと同じエピトープ、もしくはエピトープの一部分に結合するヒト抗溶血素A抗体、または本明細書に記載される例示的な抗体のうちのいずれかのCDR配列を有する抗体を含む。同様に、本発明はまた、本明細書に記載される特定の例示的な抗体のうちのいずれかと溶血素Aもしくは溶血素A断片への結合について競合する抗溶血素A抗体、または本明細書に記載される例示的な抗体のうちのいずれかのCDR配列を有する抗体を含む。
当該技術分野で知られている通例の方法を使用することによって、抗体が参照抗溶血素A抗体と同じエピトープに結合するか、または結合について参照抗溶血素A抗体と競合するかを容易に決定することができる。例えば、試験抗体が本発明の参照抗溶血素A抗体と同じエピトープに結合するかどうかを決定するために、参照抗体を飽和条件下で溶血素Aタンパク質またはペプチドに結合させておく。次に、溶血素A分子に結合する試験抗体の能力を評価する。試験抗体が、参照抗溶血素A抗体との飽和結合後に溶血素Aに結合することができる場合、この試験抗体は、参照抗溶血素A抗体とは異なるエピトープに結合すると結論付けることができる。その一方で、試験抗体が、参照抗溶血素A抗体との飽和結合後に溶血素Aタンパク質に結合することができない場合、試験抗体は、本発明の参照抗
溶血素A抗体によって結合されたエピトープと同じエピトープに結合し得る。
抗体が参照抗溶血素A抗体と結合について競合するかどうかを決定するために、上記に記載される結合方法論を2つの向きで実施する。第1の向きでは、参照抗体を飽和条件下で溶血素Aタンパク質に結合させておいた後、溶血素A分子への試験抗体の結合を評価する。第2の向きでは、試験抗体を飽和条件下で溶血素A分子に結合させておいた後、溶血素A分子への参照抗体の結合を評価する。両方の向きで、第1の(飽和)抗体のみが溶血素A分子に結合することができる場合、試験抗体および参照抗体は、溶血素Aへの結合について競合すると結論付けられる。当業者によって認識されるであろうように、参照抗体との結合について競合する抗体は、必ずしも参照抗体と同一のエピトープに結合する必要はない場合があるが、重複しているまたは隣接しているエピトープに結合することによって、参照抗体の結合を立体的に遮断する可能性がある。
2つの抗体は、それぞれが抗原へのその他の結合を競合的に阻害する(遮断する)場合、同じかまたは重複するエピトープに結合する。すなわち、1倍、5倍、10倍、20倍、または100倍過剰量の一方の抗体は、競合的結合アッセイにおいて測定して、少なくとも50%、しかし好ましくは75%、90%、またはさらには99%、もう一方の抗体の結合を阻害する(例えば、Junghans et al.,Cancer Res.1990 50:1495-1502を参照されたい)。代替的に、一方の抗体の結合を低減または排除する抗原における本質的に全てのアミノ酸変異が、もう一方の抗体の結合を低減または排除する場合、2つの抗体は、同じエピトープを有する。一方の抗体の結合を低減または排除するいくつかのアミノ酸変異がもう一方の結合を低減または排除する場合、2つの抗体は重複しているエピトープを有する。
次に、試験抗体の結合の観察された欠失が、実際に、参照抗体と同じエピトープへの結合によるものであるか、それとも立体遮断(または別の現象)が、観察された結合の欠失の原因であるのかを確認するために、さらなる通例の実験(例えば、ペプチド変異および結合分析)を実施することができる。この種の実験は、ELISA、RIA、表面プラズモン共鳴、フローサイトメトリーまたは当該技術分野で利用可能な任意の他の定量的または定性的な抗体結合アッセイを使用して実施することができる。
免疫抱合体
本発明は、Staphylococcus aureus感染症の重症度を低減することができるか、またはS.aureus感染症もしくはその重症度に関連する少なくとも1つの症状を改善することができる薬剤など、治療的部分(「免疫抱合体」)に接合されたヒト溶血素Aモノクローナル抗体を包含する。本明細書で使用される場合、「免疫抱合体」という用語は、放射性物質、サイトカイン、インターフェロン、標的部分もしくはレポーター部分、酵素、毒素、または治療剤に化学的に、もしくは生物学的に連結された抗体を指す。抗体は、その標的に結合することができる限り、分子に沿った任意の位置で、放射性物質、サイトカイン、インターフェロン、標的部分もしくはレポーター部分、酵素、毒素、または治療剤に連結され得る。免疫抱合体の例は、抗体薬物抱合体である。いくつかの実施形態では、薬剤は、溶血素Aに、またはそのようなIL-1、IL-6などのサイトカイン、もしくはTGF-βなどのケモカインに対する第2の異なる抗体であり得る。抗溶血素A抗体に接合され得る治療部分のタイプは、治療されるべき状態および達成されるべき所望の治療効果を考慮したものであろう。免疫抱合体を形成するのに好適な薬剤の例は、当該技術分野で知られており、例えば、WO05/103081を参照されたい。免疫抱合体および免疫毒素の調製は、当該技術分野において一般的によく知られている(例えば、米国特許第4340535号を参照されたい)。免疫複合体は、例えば、US7250492、US7420040、およびUS7411046に詳細に記載されており、これらの各々は、その全体が本明細書に組み込まれる。
多重特異性抗体
本発明の抗体は、単一特異性、二重特異性、または多重特異性であり得る。多重特異性抗体は、1つの標的ポリペプチドの異なるエピトープに特異的であり得るか、または2つ以上の標的ポリペプチドに特異的な抗原結合ドメインを含有し得る。例えば、Tutt et al.,1991,J.Immunol.147:60-69;Kufer et
al.,2004,Trends Biotechnol.22:238-244を参照されたい。本発明の抗体は、別の機能性分子、例えば、別のペプチドもしくはタンパク質に連結するか、またはそれと同時発現させることができる。例えば、抗体またはその断片は、別の抗体または抗体断片などの1つ以上の他の分子実体に(例えば、化学結合、遺伝的融合、非共有結合性会合などによって)機能的に連結されて、第2の結合特異性を有する二重特異性または多重特異性抗体を産生することができる。例えば、本発明は、免疫グロブリンの一方の腕が、溶血素Aもしくはその断片のN末端領域に対して特異的であり、かつ免疫グロブリンの他方の腕が、溶血素Aもしくは第2の治療標的のC末端領域に対して特異的であるか、または治療部分に接合された、二重特異性抗体を含む。本発明の背景において使用することができる例示的な二重特異性抗体フォーマットは、第1の免疫グロブリン(Ig)CH3ドメインおよび第2のIgCH3ドメインの使用を包含し、第1および第2のIgCH3ドメインは、少なくとも1つのアミノ酸だけ互いに異なっており、少なくとも1つのアミノ酸の相違は、このアミノ酸の相違を欠失する二重特異性抗体と比較して、タンパク質Aへの二重特異性抗体の結合を低減させる。一実施形態では、第1のIgCH3ドメインは、タンパク質Aに結合し、第2のIgCH3ドメインは、H95R修飾(IMGTエクソン番号付けによる、EU番号付けによるH435R)などのタンパク質A結合を低減または消失させる変異を含有する。第2のCH3は、Y96F修飾(IMGTによる、EUによるY436F)をさらに含み得る。第2のCH3の内部に見出され得るさらなる修飾には、IgG1抗体の場合、D16E、L18M、N44S、K52N、V57M、およびV82I(IMGTによる、EUによるD356E、L358M、N384S、K392N、V397M、およびV422I)、IgG2抗体の場合、N44S、K52N、およびV82I(IMGT、EUによるN384S、K392N、およびV422I)、ならびにIgG4抗体の場合、Q15R、N44S、K52N、V57M、R69K、E79Q、およびV82I(IMGTによる、EUによるQ355R、N384S、K392N、V397M、R409K、E419Q、およびV422I)が含まれる。上記に記載される二重特異性抗体フォーマットの変形は、本発明の範囲内で熟慮される。
本発明の背景において使用することができる他の例示的な二重特異性フォーマットには、例えば、scFv系フォーマットまたはダイアボディ二重特異性フォーマット、IgG-scFv融合、二重可変ドメイン(DVD)-Ig、Quadroma、ノブズ-イントゥ-ホールズ(knobs-into-holes)、共通の軽鎖(例えば、ノブズ-イントゥ-ホールズを有する共通の軽鎖など)、CrossMab、CrossFab、(SEED)ボディ、ロイシンジッパー、Duobody、IgG1/IgG2、二重作用型Fab(DAF)-IgG、およびMab二重特異性フォーマットが含まれるが、これらに限定されない(上述のフォーマットの総説については、例えば、Klein et al.2012,mAbs 4:6,1-11、およびそこに引用されている参考文献を参照されたい)。二重特異性抗体はまた、ペプチド/核酸接合を使用して構築することもでき、例えば、直交化学反応性を有する非天然アミノ酸を使用して、部位特異性抗体-オリゴヌクレオチド抱合体を生成し、これが次に、定義される組成物、原子価、および幾何学的形状を有する多量体複合体へと自己集合する。(例えば、Kazane et al.,J.Am.Chem.Soc.[Epub:Dec.4,2012]を参照されたい)。
治療用投与および製剤
本発明は、本明細書で考察されるような抗溶血素A抗体またはその抗原結合断片を含む治療用組成物を提供する。本発明による治療用組成物は、改善された移動、送達、寛容、およびこれらに類するものを提供するために、製剤へと組み込まれた好適な担体、賦形剤、および他の薬剤とともに投与することができる。多くの適切な製剤を、製薬化学者全員に知られている処方集:Remington’s Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Company,Easton,米国ペンシルバニア州において見出すことができる。これらの製剤には、例えば、粉末、ペースト、軟膏、ゼリー、ワックス、油、脂質、脂質(カチオン性またはアニオン性)含有ベシクル(LIPOFECTIN(商標)など)、DNA抱合体、無水吸収ペースト、水中油エマルションおよび油中水エマルション、エマルションカーボワックス(様々な分子量のポリエチレングリコール)、半固体ゲル、ならびにカーボワックスを含有する半固体混合物が含まれる。Powell et al.「Compendium of excipients for parenteral formulations」PDA(1998)J Pharm Sci Technol 52:238-311を参照されたい。
抗体の用量は、投与されることになっている対象の年齢およびサイズ、標的疾患、容態、投与経路、ならびにこれらに類するものによって変わり得る。本発明の抗体が、成人患者における、皮膚壊死、皮膚および軟組織感染症(膿瘍を含む)、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症候群、乳房炎、またはせつ腫症およびカルブンケル症(吹出物)を予防または治療するため、またはS.aureus感染症の予防もしくは治療のために使用されている場合、通常、約0.1~約100mg/kg体重、より好ましくは約5~約100、約10~約90、または約20~約70mg/kg体重の単回用量で、本発明の抗体を静脈内投与することが有益である。状態の重症度に応じて、治療の頻度および期間を調整することができる。特定の実施形態では、本発明の抗体もしくはその抗原結合断片を、少なくとも約0.1mg~約800mg、約1~約500mg、約5~約300mg、または約10~約200mg、~約100mg、または~約50mgの一次用量として投与することができる。特定の実施形態では、この一次用量に続いて、およそ一次投与と同じか、もしくはそれ未満であり得る量で、抗体またはその抗原結合断片の第2のもしくは複数のその後の用量が投与され得、その後の用量は、少なくとも1日間~3日間、少なくとも1週間、少なくとも2週間、少なくとも3週間、少なくとも4週間、少なくとも5週間、少なくとも6週間、少なくとも7週間、少なくとも8週間、少なくとも9週間、少なくとも10週間、少なくとも12週間、または少なくとも14週間離れている。
様々な送達システムが知られており、本発明の医薬組成物を投与するために使用することができ、例えば、リポソーム封入、マイクロ粒子、マイクロカプセル、変異ウイルスを発現することができる組換え細胞、受容体媒介エンドサイトーシスである(例えば、Wu
et al.(1987)J.Biol.Chem.262:4429-4432を参照されたい)。導入方法には、皮内経路、経皮経路、筋肉内経路、腹腔内経路、静脈内経路、皮下経路、鼻腔内経路、硬膜外経路、および経口経路が含まれるが、これらに限定されない。組成物は、任意の好都合な経路によって、例えば、注入もしくはボーラス注射によって、上皮もしくは粘膜皮膚内層(linings)(例えば、口腔粘膜、直腸および腸粘膜など)を介した吸収によって投与することができ、かつ他の生物学的に活性な薬剤と一緒に投与することができる。投与は、全身または局所であり得る。医薬組成物を、ベシクル、特にリポソーム中で送達することもできる(例えば、Langer(1990)Science 249:1527-1533を参照されたい)。
本発明の抗体を送達するためのナノ粒子の使用もまた、本明細書において熟慮される。
抗体結合ナノ粒子は、治療用途および診断用途の両方に使用され得る。抗体接合ナノ粒子ならびに調製方法および使用方法は、参照により本明細書に組み込まれる、Arruebo,M.,et al.2009(“Antibody-conjugated nanoparticles for biomedical applications”in J.Nanomat.Volume 2009,Article ID 439389,24 pages,doi:10.1155/2009/439389)によって詳細に記載されている。薬物送達のためのナノ粒子は、例えば、各々その全体が本明細書に組み込まれる、US8277812、US8258256、US8257740、US8246995、US8236330にも記載されている。
特定の状況では、薬学的組成物は、徐放系で送達することができる。一実施形態では、ポンプを使用することができる。別の実施形態では、ポリマー材料を使用することができる。さらに別の実施形態では、徐放系を組成物の標的の近傍に配置することができ、したがって全身用量のほんの一部しか必要としない。
注射可能な調製物には、静脈内注射、皮下注射、皮内注射および筋肉内注射、点滴注入などのための剤形が含まれ得る。これらの注射可能な調製物は、公的に既知の方法によって調製され得る。例えば、注射可能な調製物は、例えば、注射用に従来通り使用される滅菌水性媒体もしくは油性媒体中に上記に記載される抗体もしくはその塩を溶解、懸濁、または乳化させることによって調製され得る。注射用水性媒体としては、例えば、生理食塩水、グルコース含有等張液、および他の補助剤などがあり、これらは、アルコール(例えば、エタノール)、ポリアルコール(例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール)、非イオン性界面活性剤[例えば、ポリソルベート80、HCO-50(水素化ヒマシ油のポリオキシエチレン(50モル)付加物)]などの適切な可溶化剤と組み合わせて使用してよい。油性媒体としては、例えば、ゴマ油、ダイズ油などが用いられ、ベンジルベンゾエート、ベンジルアルコールなどの可溶化剤と組み合わせて使用してよい。このように調製された注射は、好ましくは適切なアンプルに充填される。
本発明の医薬組成物は、標準的な針および注射器を用いて皮下にまたは静脈内に送達することができる。加えて、皮下送達に関して、ペン送達デバイスは、本発明の医薬組成物を送達する上での適用を容易に有する。このようなペン送達デバイスは、再利用可能または使い捨て可能であり得る。再利用可能なペン送達デバイスは、概して、医薬組成物を含有する交換可能なカートリッジを利用する。いったん、カートリッジ内の薬学的組成物が全て投与され、カートリッジが空になると、この空のカートリッジは容易に廃棄することができ、薬学的組成物を含有する新しいカートリッジと容易に交換することができる。次に、ペン送達デバイスは再利用することができる。使い捨てペン送達デバイスでは、交換可能なカートリッジはない。むしろ、使い捨てペン送達デバイスは、このデバイス内の貯蔵器の中に保持された医薬組成物が事前に充填されている。いったん貯蔵器が医薬組成物に関して空になると、デバイス全体が廃棄される。
数多くの再利用可能なペン送達デバイスおよび自動注射送達デバイスは、本発明の医薬組成物の皮下送達における用途を有する。例としては、ほんの数例にすぎないが、AUTOPEN(商標)(Owen Mumford,Inc.、英国ウッドストック町)、DISETRONIC(商標)ペン(Disetronic Medical Systems、スイス国ブルクドルフ市)、HUMALOG MIX75/25(商標)ペン、HUMALOG(商標)ペン、HUMALIN 70/30(商標)ペン(Eli Lilly and Co.、米国インディアナ州インディアナポリス市)、NOVOPEN(商標)I、IIおよびIII(Novo Nordisk、デンマーク国コペンハーゲン市)、NOVOPEN JUNIOR(商標)(Novo Nordisk、デンマーク国コペンハーゲン市)、BD(商標)ペン(Becton Dickinson、米国ニ
ュージャージー州フランクリンレイク地区)、OPTIPEN(商標)、OPTIPEN
PRO(商標)、OPTIPEN STARLET(商標)、およびOPTICLIK(商標)(Sanofi-Aventis、ドイツ国フランクフルト市)が挙げられるものの、間違いなくこれらに限定されない。本発明の医薬組成物の皮下送達における用途を有する使い捨てペン送達デバイスの例としては、ほんの数例にすぎないが、SOLOSTAR(商標)ペン(Sanofi-Aventis)、FLEXPEN(商標)(Novo Nordisk)、およびKWIKPEN(商標)(Eli Lilly)、SURECLICK(商標)自動注射装置(Amgen、米国カリフォルニア州サウザンドオークス市)、PENLET(商標)(Haselmeier、ドイツ国シュトゥットガルト市)、EPIPEN(Dey,L.P.)およびHUMIRA(商標)ペン(Abbott Labs、米国イリノイ州アボットパーク地区)が挙げられるものの、間違いなくこれらに限定されない。
有益なことに、上記に記載される経口または非経口での使用のための医薬組成物は、有効成分の用量に適合するのに適した単位用量の剤形へと調製される。このような単位用量の剤形には、例えば、錠剤、ピル、カプセル、注射(アンプル)、坐薬などが含まれる。前述の含有される抗体の量は、概して、単位用量の剤形あたり約5~約500mgであり、特に注射の形態では、前述の抗体は、約5~約100mgで、他の剤形については約10~約250mgで含有されることが好ましい。本発明は、本発明の抗体もしくは抗原結合断片、または薬学的に許容される担体を含むその医薬組成物を含む注射デバイス(例えば、事前充填型シリンジまたは事前充填型自動注射器)またはバイアル(例えば、ガラスまたはプラスチックバイアル)を含む。
抗体の治療的使用
本発明の特定の実施形態では、本抗体は、Staphylococcus aureus感染症、またはS.aureus感染症に関連する少なくとも1つの症状を治療するのに有用である。いくつかの実施形態では、抗体は、皮膚壊死、皮膚および軟組織感染症(膿瘍を含む)、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症候群、乳房炎、またはせつ腫症およびカルブンケル症(吹出物)の状態もしくは症状を治療するのに有用であり得る。本発明の抗体はまた、S.aureus感染症を発症するリスクのある患者における予防的使用のために熟慮される。これらの患者は、高齢者、または疾患もしくは免疫抑制治療薬による治療のために免疫不全状態にある患者、または術後の患者など院内感染のより大きなリスクがある患者を含む。上記に考察される治療用途の様々な実施形態では、S.aureus細菌は、抗生物質治療の1つ以上のタイプに対して耐性があり得る。一実施形態では、細菌は、メチシリン耐性S.aureus(MRSA)である。本発明の抗体は、S.aureus感染症を治療するため、またはS.aureus感染症に関連する少なくとも1つの症状もしくは合併症を緩和するために、単独で、または第2の薬剤もしくは第3の薬剤と併用して使用され得ることが熟慮される。第2または第3の薬剤は、本発明の抗体と同時に送達され得るか、またはそれらは、本発明の抗体の前もしくは後のいずれかに別々に投与され得る。本発明の抗体もしくは抗原結合断片またはその医薬組成物を投与され得る患者には、例えば、ヒト(例えば、65歳以上の高齢のヒト)、ウサギ、マウス、ラット、ウシ、ブタ、イヌ、霊長類、ウマ、またはヒツジなどの哺乳動物などの動物が含まれる。
特定の実施形態では、本抗体は、個体または個体の特定の組織もしくは器官におけるStaphylococcus aureus細菌の数を減少させるのに有用である。いくつかの実施形態では、S.aureus細菌は、1つ以上のタイプの抗生物質治療に対して耐性であり得る。一実施形態では、細菌は、メチシリン耐性S.aureus(MRSA)である。特定の実施形態では、本抗体は、感染症によって生じる症状を軽減し、かつ
他の医薬品および/または患者の免疫系が感染症を制御することを可能にする、個体におけるStaphylococcus aureus細菌によって産生される溶血素Aの毒性活性を低減するのに有用である。
本発明のさらなる態様では、本抗体は、Staphylococcus aureus感染症、またはS.aureus感染症と関連する症状を罹患している患者を治療するための医薬組成物の調製のために使用される。
併用療法
併用療法には、本発明の抗溶血素A抗体、および本発明の抗体と、または本発明の抗体の生物学的に活性のある断片と有益に組み合わされ得る任意の追加の治療剤(複数可)が含まれ得る。
抗体は、抗生物質「NSAID」、抗体LTM14、抗体LC10、コルチコステロイドまたはプレドニゾンなどの他の治療と併用して使用することができる。
追加の治療的に活性な成分(複数可)は、本発明の抗溶血素A抗体の投与前、同時、または後に投与され得る。本開示の目的のために、そのような投与レジメンは、1つ以上の追加の治療的に活性である成分(複数可)「と組み合わせた」抗溶血素A抗体の投与であると考えられる。
抗体の診断用の使用
本発明の抗溶血素A抗体はまた、例えば診断目的のために、試料中の溶血素Aを検出および/または測定するために使用され得る。本発明の抗体のうちのいずれか1つ以上を使用して、Staphylococcus aureus感染症の存在および重症度を検出することができると想定される。溶血素Aについての例示的な診断アッセイは、例えば、患者から得られた試料を、本発明の抗溶血素A抗体と接触させることを含み得、抗溶血素A抗体は、検出可能な標識もしくはレポーター分子で標識されるか、または患者試料から溶血素Aを選択的に単離するために捕捉リガンドとして使用される。代替的に、標識されていない抗溶血素A抗体は、それ自体が検出可能に標識された二次抗体と組み合わせて診断用途に使用することができる。検出可能な標識もしくはレポーター分子は、H、14C、32P、35S、もしくは125Iなどの放射性同位体、フルオレセインイソチオシアナートもしくはローダミンなどの蛍光部分もしくは化学発光部分、またはアルカリホスファターゼ、β-ガラクトシダーゼ、セイヨウワサビペルオキシダーゼ、もしくはルシフェラーゼなどの酵素であり得る。試料中の溶血素Aを検出または測定するために使用することができる具体的な例示的アッセイには、酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)、放射免疫測定法(RIA)、および蛍光標示式細胞分取器(FACS)が含まれる。
本発明による溶血素A診断アッセイにおいて使用することができる試料には、正常条件もしくは病理学的条件下で、検出可能な量の溶血素Aもしくはその断片のいずれかを含有する、患者から得ることのできる任意の組織もしくは体液試料が含まれる。概して、健康な患者(例えば、Staphylococcus aureus感染症を罹患していない患者)から得られた特定の試料中の溶血素Aのレベルは、ベースライン、または標準の溶血素Aのレベルを最初に確立するために測定されるであろう。次に、S.aureus感染症に関連する状態、またはそのような状態に関連する症状を有することが疑われる個体から得られた試料において測定された溶血素Aのレベルと比較することができる。
溶血素Aに特異的な抗体は、追加の標識もしくは部分を全く含有していなくてもよいか、またはN末端もしくはC末端の標識もしくは部分を含有していてもよい。一実施形態では、標識または部分は、ビオチンである。結合アッセイでは、標識(存在する場合)の位
置は、ペプチドが結合された表面に対するペプチドの向きを決定し得る。例えば、表面がアビジンで被覆されている場合、N末端ビオチンを含有するペプチドは、ペプチドのC末端部分が表面から遠位になるように配向されるであろう。いくつかの実施形態では、標識は、放射性核種、蛍光色素、またはMRI検出可能な標識などの検出可能な標識であり得る。検出可能な標識は、抗体に連結されてもよく、そのような抗体は、撮像アッセイにおいて使用され得る。
以下の実施例は、本発明の方法および組成物をどのように作製および使用するかに関する完全な開示および説明を当業者に提供するために提示されており、本発明者らが本発明とみなすことの範囲を限定することを企図するものではない。別段示されない限り、部分は重量部分であり、分子量は平均分子量であり、温度は摂氏度であり、圧力は大気圧またはそれに近い圧力である。
実施例1溶血素Aに対するヒト抗体の生成
2つの免疫原:シグナル配列(アミノ酸27~391)を有しない完全長野生型溶血素A(Hla)、および完全長非毒性溶血素A(Hla-H35L)を使用してマウスを免疫し、両方ともE.coliで発現され、精製された組換えHisタグ化タンパク質であった。
特定の実施形態では、溶血素Aに特異的に結合する抗体は、上記の領域の断片、または指定の領域を超えて、本明細書に記載される領域のN末端もしくはC末端のいずれかもしくは両方から約5~約20個のアミノ酸残基だけ延在するペプチドを使用して調製され得る。特定の実施形態では、上記の領域またはそれらの断片の任意の組み合わせを、溶血素A特異性抗体の調製において使用することができる。特定の実施形態では、溶血素Aまたはその断片の上記のドメインのうちの任意の1つ以上が、単一特異性抗体、二重特異性抗体、または多重特異性抗体を調製するために使用され得る。H1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、およびH1H15418P2を、無毒の溶血素Aで免疫することによって産生し、H1H15381P、H1H15399P、H1H15404P、H1H15405P、H1H15408P、H1H15410P、H1H15414P、H1H15420P2を、野生型溶血素Aで免疫することによって産生した。
上記のように、免疫原として使用された完全長タンパク質、またはそれらの断片を、アジュバントとともに、DNAコードするヒト免疫グロブリン重鎖およびカッパ軽鎖可変領域を含むVELOCIMMUNE(登録商標)マウスに直接投与して、免疫応答を刺激した。抗体の免疫応答を、溶血素A特異的免疫測定法によって監視した。所望の免疫応答が達成されたときに、その全体が参照により本明細書に具体的に組み込まれるUS2007/0280945A1に記載されているように、抗溶血素A抗体を、骨髄腫細胞に融合することなく、抗原陽性B細胞から直接単離した。この方法を使用して、いくつかの完全ヒト抗溶血素A抗体(すなわち、ヒト可変ドメインとヒト定常ドメインとを有する抗体)を得、この様式で生成された例示的な抗体を、以下のように:H1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15404P、H1H15405P、H1H15408P、H1H15410P、H1H15414P、H1H15418P2、およびH1H15420P2と指定した。
この実施例の方法により生成された例示的な抗体の生物学的特性を、以下に記載の実施例において詳細に記載する。
実施例2重鎖可変領域および軽鎖可変領域のアミノ酸配列
表1は、選択された溶血素Aに特異的な抗体およびそれらの対応する抗体識別子の重鎖可変領域および軽鎖可変領域のアミノ酸配列対を記載する。抗体は、典型的には、以下の命名法により本明細書で言及される:Fc接頭語(例えば、「H4H」、「H1M」、または「H2M」)、続いて数値識別子(例えば、表1に示されるような「5375」)、続いて「P」または「N」接尾語。したがって、この命名法によると、抗体は、例えば「H1H5375」と呼ばれ得る。本明細書で使用される抗体指定上のH4H、H1M、およびH2Mという接頭語は、抗体の特定のFc領域を示す。例えば、「H2M」抗体は、マウスIgG2 Fcを有するのに対し、「H4H」抗体は、ヒトIgG4 Fcを有する。当業者には理解されるように、H1MまたはH2M抗体は、H4H抗体に変換することができ、逆もまた同様であるが、いずれの場合も、表1に示されている数値識別子によって示された可変ドメイン(CDRを含む)は、同じままであろう。同じ数字抗体の指定を有するが、N、B、またはPの文字の接尾語が異なる抗体は、CDR配列の外にある領域において(すなわち、フレームワーク領域において)同一のCDR配列を有するが、配列変異を有する、重鎖および軽鎖を有する抗体を指す。したがって、特定の抗体のN、B、およびP変異体は、それらの重鎖および軽鎖可変領域内に同一のCDR配列を有するが、それらのフレームワーク領域内では互いに異なる。
Figure 2023011710000002
実施例3S.aureus溶血素A毒素へのヒトモノクローナル抗体の結合
本発明の抗体が溶血素A単量体に結合することができたかどうかを決定するために、精製された抗体(H1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15404P、H1H15405P、H1H15408P、H1H15410P、H1H15414P、H1H15418P2、およびH1H15420P2)をELISAにより試験した。MaxiSorpマイクロタイタープレートを、1ウェルあたり10μg/mLの精製されたS.aureus溶血素Aで一晩被覆した。本発明の抗体およびアイソタイプ一致対照抗体(1:3の連続希釈で50μM~1pMの範囲)の滴定を、毒素含有ウェルに添加し、25℃で1時間インキュベートした。ウェルを3回洗浄した後、ウェルあたり100ng/mLの抗ヒトHRP二次抗体とともに25℃で
1時間インキュベートした。次に、100μLのSuperSignal ELISA Pico化学発光基質(ThermoFisher Scientific)を各ウェルに添加し、シグナルを検出した(Victor X3プレートリーダー、Perkin Elmer)。発光値を、12点反応曲線(GraphPad Prism)上の3パラメータロジスティック方程式によって分析した。
S.aureus溶血素A毒素への結合について、抗溶血素A抗体のナノモル以下のEC50結合を観察した。(表2および図1)。
Figure 2023011710000003
実施例4S.aureus溶血素AへのヒトmAbの二成分毒素への結合
S.aureus株は、さらなる孔形成毒素、ロイコシジンおよびガンマ溶血素(Hlg)を産生することができ、これらも機能的孔を形成するためにオリゴマー化を必要とする。溶血素Aとは異なり、ロイコシジンおよびHlgは、2つのサブユニット、Sサブユニット、およびFサブユニットから構成される二成分毒素である。現在、5つのSサブユニット(LukA、LukE、LukS-PV、HlgA、およびHlgC)および4つのFサブユニット(LukB、LukD、LukF-PV、およびHlgB)が同定されており、結果として5つの機能的毒素(LukAB、LukED、PVL、HlgAB、およびHlgCB)を生じる。SサブユニットおよびFサブユニットと溶血素Aとの間に低い配列同一性が観察されるが(Aman MJ and Adhikaari RP,(2014)Toxins6:950-972)、全ての成分は、溶血素Aと構造的相同性を示す。
本発明の抗溶血素A抗体か他の毒素に交差結合するかどうかを決定するために、精製された抗体(H1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15404P、H1H15405P、H1H15408P、H1H15410P、H1H15414P、H1H15418P2、およびH1H15420P2)を、S.aureus二成分毒素に対する交差反応性についてELISAにより試験した
。MaxiSorpマイクロタイタープレートを、ウェルあたり10μg/mLのS.aureus二成分毒素の個々のF成分で一晩被覆した。組換え毒素成分は、IBT BioServices(Gaithersburg、米国メリーランド州)から入手するか、またはGenScript(Piscataway Township、米国ニュージャージー州)によって生成されるかのいずれかであった。本発明の抗体およびアイソタイプ一致対照抗体(1:3希釈で50μM~100pMの範囲)の滴定を毒素含有ウェルに添加し、25℃で1時間インキュベートした。ウェルを3回洗浄した後、1ウェルあたり100ng/mLの抗ヒトHRP二次抗体とともに25℃で1時間インキュベートした。100μLのSuperSignal ELISA Pico化学発光基質(ThermoFisher Scientific)をウェルに添加し、シグナルを検出した(Victor X3プレートリーダー、Perkin Elmer)。発光値を、11点反応曲線(GraphPad Prism)上の3パラメータロジスティック方程式によって分析した。アイソタイプ一致無関係対照抗体およびS.aureusデルタ毒素を対照として含めた。
二成分毒素に対する交差反応性についての本発明における15個の抗体の試験は、溶血素Aで見られるものよりも親和性が2対数または3対数低いものではあるが、F成分のLukF、LukD、およびHlgBへの結合を示す1つのmAb、H1H15381Pを明らかにした(表3および図2a~c)。H1H15381PがS成分のLukS、LukE、HlgA、およびHlgCに対する交差反応性について試験した場合、結合親和性は、F成分への結合と比較して有意に低かった(図3a~c)。H1H15381P結合は、溶血素Aに特異的であり、二成分毒素は、それがS.aureusデルタ毒素アイソタイプ一致対照抗体への結合を実証しなかったので、二成分毒素成分へのいかなる結合も実証しなかった。
Figure 2023011710000004
実施例5THP-1細胞毒性アッセイにおけるS.aureus溶血素Aの中和
溶血素A媒介性溶解を防止するための精製されたmAbの能力を、ヒト単球細胞株であるTHP-1を使用して試験した。RPMI中の合計2.5×10THP-1細胞(1%熱不活性化FBS、L-グルタミン、および非必須アミノ酸を補充した)を、96ウェルの透明底黒色組織培養処理されたプレートに播種し、5%COとともに37℃で1時間インキュベートした。精製された抗体(H1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15404P、H1H15405P、H1H15408P、H1H15410P、H1H15414P、H1H15418P2、およびH1H15420P2)の滴定、またはアイソタイプ一致対照抗体(培地中に1:3の連続希釈で10~0μMの範囲)を、播種細胞に添加する前に、96ウェルプレート中に10nMの精製された溶血素Aとともに振とう器上で25℃で30分間インキュベートした。抗体を含まない精製された溶血素A(1:3の希釈で1.5~0μM)の滴定も、細胞のみでインキュベートした。
次に、毒素:抗体または毒素のみを含む細胞を、3時間インキュベートし(37℃、5%CO)、細胞死を、CytoTox-Gloアッセイキット(Promega)を使用して測定した。プレートリーダー(Victor X3、Perkin Elmer)を使用して、発光を検出した。本発明の全ての抗体は、溶血素Aに対して同様の中和活性を示したが、アイソタイプ一致抗体は、溶血素Aに対していかなる中和活性も示さなかった。表4を参照されたい。
Figure 2023011710000005
実施例6ウサギRBC溶血アッセイを使用した培養上清中のS.aureus溶血素Aの中和
S.aureus培養上清を使用した精製されたmAbの溶血素A中和有効性を、ウサギ赤血球(rRBC)を使用して評価した。S.aureus株(American Type Culture Collection、米国バージニア州マナッサス)をTSB中に16時間37Cで(振とうしながら)インキュベートし、遠心分離により細菌を除
去し、毒素含有培地を濾過することによって、培養上清を得た。精製された抗体H1H15399Pまたはアイソタイプ一致対照抗体(1X PBS中に1:2の連続希釈で10~0μMの範囲)の滴定を、滅菌濾過されたS.aureus培養上清とともに(結果として80%の≧細胞溶解を生じるであろう)96ウェルプレート中で30分間25℃で振とう器上でインキュベートした。30分のインキュベーション後、100μlの培養上清:mAb混合物を、1×PBS中の100μlの4%rRBC(Colorado Serum Company、米国コロラド州デンバー)を含有する96ウェルの丸底プレートに添加した。37°Cで1時間のインキュベーション後、プレートを5分間遠心分離し、100μlの上清を、新しいマイクロタイタープレートに穏やかに除去し、発光を、プレートリーダー(SpectraMax i3x、Molecular Devices)を使用して読み取った。アイソタイプ一致抗体は、溶血素Aに対していかなる中和活性を示さなかったが、本発明の全ての抗体は、溶血素Aに対して同様の中和活性を示した。表5を参照されたい。
Figure 2023011710000006
実施例7ヒト抗溶血素Aモノクローナル抗体のBiacore結合親和性および速度定数
抗溶血素A抗体に結合する、野生型および変異型(Hla-H35L)溶血素Aについての結合会合および解離速度定数(それぞれ、kおよびk)、平衡解離定数および解離半減期(それぞれ、Kおよびt1/2)を、Biacore T200機器での実時間表面プラズモン共鳴バイオセンサアッセイを使用して決定した。Biacoreセンサ表面を、モノクローナルマウス抗ヒトFc抗体(BR-1008-39、GE Healthcare)で誘導体化して、ヒトFcで発現されたおよそ150~360RUの抗溶血素Aモノクローナル抗体を捕捉した。100nM~1.56nMの範囲の異なる濃度の溶血素A毒素を、抗溶血素Aモノクローナル抗体捕捉表面上に、Biacore T200上で50μL/分の流速で注射した。25℃および37℃での溶血素A毒素の捕捉モノクローナル抗体への結合を、4分間監視し、抗体からの解離を、ランニング緩衝材としてHBS-ET(pH7.4の0.01MのHEPES、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.05%v/vの界面活性剤P20)で10分間監視した。
Scrubber 2.0c曲線適合ソフトウェアを使用してデータを処理し、データ
を1:1結合モデルにあてはめることによって、動的結合(k)および動的解離(k)速度定数を決定した。次に、結合解離平衡定数(K)および解離半減期(t1/2)を、動的速度定数から以下のように計算した:K(M)=k/kおよびt1/2(分)=[ln2/(60*k)]。
25℃および37℃での異なる抗溶血素Aモノクローナル抗体への野生型溶血素Aおよび変異型溶血素Aの結合についての結合動力学パラメータを、表6~9にまとめた。表6に示されるように、25℃で、本発明の全ての抗溶血素A抗体は、171pM~26.2nMの範囲のK値で野生型溶血素Aに結合した。表7に示されるように、37℃で、本発明の全ての抗溶血素A抗体は、260pM~76.3nMの範囲のK値で溶血素Aに結合した。表8に示されるように、25℃で、本発明の全ての抗溶血素A抗体は、52.3pM~8.89nMの範囲のK値で変異型溶血素Aに結合した。表9に示されるように、37℃で、本発明の全ての抗溶血素A抗体は、74.7pM~18.7nMの範囲のK値で変異型溶血素Aに結合した。
Figure 2023011710000007
Figure 2023011710000008
Figure 2023011710000009
Figure 2023011710000010
実施例8抗溶血素A mAb遮断作用の機序
溶血素A mAbが毒素とその特異的受容体であるADAM10との相互作用を遮断することによってそれらの機能を発揮するかどうかを決定するために、溶血素AとともにインキュベートしたA549細胞を使用する蛍光ペプチド基質アッセイを使用して、宿主細胞関連メタロプロテアーゼ活性を測定した。HamのF-12K中の2.5×10個のA549細胞を含有する96ウェルプレート(10%の熱不活性化FBSおよびLグルタミンを補った)に添加する前に、mAb(H1H15377P、H1H15381PおよびH1H15399P)を、37℃で15分間3nMの精製された溶血素Aとともに予めプレインキュベートした。37℃での60分間のインキュベートの後、5μMの蛍光発生ペプチド基質(Mca-PLAVQ-Dpa-RSSSR-NH2、R&D Systems、、米国ミネソタ州ミネアポリス)を添加し、37℃で15分間インキュベートし、プレートリーダー(320nMの励起フィルタおよび405nMの発光フィルタ、SpectraMax i3x、Molecular Devices)を使用して強蛍光度を読み取り、相対蛍光単位として表した。アイソタイプ一致抗体は、毒素誘発増加ADAM10活性(図4a)にはいかなる影響も示さなかったが、本発明の抗体は、ADAM10活性の毒素誘発性増加を遮断した。これは、本発明の抗体が溶血素Aとその受容体との相互作用を遮断することを示唆した。
溶血素A mAbが宿主細胞膜への毒素の結合を防止することをさらに実証するために、ウサギRBC(rRBC)を使用して溶血素A mAbの存在下で、膜結合実験を実施し、毒素とrRBC膜との会合を、ウエスタンブロット分析によって検出した。rRBCの溶解を回避するために、結合実験を、4℃で実施した。溶血素A mAb(H1H15
377PおよびH1H15399P)の滴定を、洗浄されたrRBCへの添加(250μlのPBS中に10%)の前に、37℃で15分間10nMの溶血素Aにより予めインキュベートし、かつ4℃で60分間インキュベートした。rRBCをペレット化し、上清を除去し、1mlのddHO中の再懸濁、25℃での10分間のインキュベーション、および16,100xgでの遠心分離の3つのサイクルによって、細胞を溶解した。pH7.4の10mMのトリス-HCl、150mMのNaCl、1%トリトンX-100、および1%デオキシコール酸ナトリウム中で、膜を可溶化した。可溶化された試料を、PVDF膜(Invitrogen、米国カリフォルニア州カールズバッド)に転写された4~12%SDS-PAGEゲル(Invitrogen、米国カリフォルニア州カールズバッド)上で還元、煮沸、および分離し、溶血素A単量体を、pAb(IBT BioServices、米国メリーランド州ロックビル)により検出した。アイソタイプ一致抗体はいかなる効果も示さなかったが、本発明の抗体は、rRBCへの溶血素Aの結合を防止する(図4b)。
実施例9皮膚壊死マウスモデルにおいて予防的に投与されたヒト抗溶血素A mAbのインビボ有効性
本発明の抗溶血素A mAbがS.aureus誘発性皮膚病変を減少または予防することができるかどうかを判定するために、精製抗体を、雌性BALB/cマウス(n=3~5)を使用したインビボ皮膚壊死モデルにおいて予防的に試験した(Bubeck Wardenburg et al.,(2008)J.Infect.Dis.198:1166-1170)。感染の2日前に、毛皮を剃毛し、脱毛ローションを適用することによって、腹部領域から除去した。感染の1日前に、マウスの腹部の左側に、5mg/kgまたは0.5mg/kgのいずれかの個々の抗体の単回用量:H1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15404P、H1H15405P、H1H15408P、H1H15410P、H1H15414P、H1H15418P2、H1H15420P2、またはアイソタイプ一致対照抗体を腹腔内注射した。感染の日に、37℃のTSB中で対数期(OD600≦1)まで増殖させ、PBS中に懸濁した50μlのS.aureus CA-127(約1~2×10CFU/マウス)を腹部の右側に皮下投与した。感染後2日目に、マウスの病変をデジタルノギスで測定した。
本発明の全ての抗体は、両方の試験用量で有効であった。5mg/kgで投与された場合、全ての抗体が同様の有効性を示し、アイソタイプ一致対照抗体と比較して、皮膚壊死性病変を80~90%減少させた(表10)。同様に、0.5mg/kgで動物に投与された場合、本発明の全ての抗体(H1H15410Pを除く)は、アイソタイプ一致抗体で治療されたものと比較して、病変サイズの減少を示した(表10)。しかしながら、病変サイズの減少は、40~80%の範囲であり、H1H15410Pは、この用量では効果を示さなかった。抗体H1H15380P、H1H15381P、H1H15405P、およびH1H15414Pは、0.5mg/kgで投与された場合に最も有効であり、病変サイズは、>80%減少した。5mg/kg群と0.5mg/kg群との比較は、用量依存的効果を示した:5mg/kg用量で抗体を投与されたマウスは、0.5mg/kg用量で同じ抗体を投与されたマウスと比較して、より小さい病変を有した。
Figure 2023011710000011
抗溶血素A mAbの病変サイズを減少させる能力をさらに調べるために、mAbを3つの異なる用量で予防的に投与し、2つの他の抗溶血素A mAb、LTM14(例えば、米国特許第8715673号の配列番号:1および2;またはFoletti et al.,Mechanism of Action and In Vivo Efficacy of a Human-Derived Antibody against
Staphylococcusα-Hemolysin,J.Mol.Biol.42
5:1641-1654 (2013)を参照されたい)およびLC10(例えば、WO2012/109285の配列番号:57および58を参照されたい)と比較した。感染の約2日前に、上記に記載されるように雌BALB/cマウスから毛皮を除去した。感染の1日前に、マウス(1群あたりn=5)の腹部の左側に、5mg/kg、0.5mg/kg、または0.125mg/kgの各個々の抗体:H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、またはアイソタイプ一致対照抗体の単回用量を腹腔内注射した。感染の日に、マウスの腹部の右側に、TSB中に37℃で対数期(OD600≦1)まで増殖させ、PBS中に懸濁した、50μlのS.aureus CA-127(MRSA株、2.5×10CFU/マウス)またはS.aureus Newman(MSSA株、2.5×10CFU/マウス)を皮下投与した。感染後2日目に、マウスの病変をデジタルノギスで測定した。
本発明の全ての抗体は、MRSAおよびMSSAのS.aureus株の両方を使用した3つの試験用量全てにおいて有効であった。5mg/kgで投与された場合、LC10およびLTM14を含む全ての抗体は、S.aureus CA-127(図5a)およびNewman(図6a)の両方に対して同様の有効性を示し、アイソタイプ一致対照抗体と比較して、病変を≧85%減少させた。同様に、0.5mg/kgでマウスに投与された場合、全ての抗体は、アイソタイプ一致抗体で治療されたものと比較して、病巣サイズにおいて50~60%の同様の減少を示した(図5bおよび6b)。しかしながら、病変サイズの減少は、アイソタイプ一致抗体で治療されたものと比較して、30~40%の範囲のS.aureus CA-127(図5c)およびNewman(図6c)の両方を使用して0.125mg/kgで投与された場合、H1H15381P、LC10、およびLTM14と比較して、H1H15377PおよびH1H15399Pでより大きかった。全ての抗体について、5mg/kg、0.5mg/kg、および0.125mg/kgの群の比較は、用量依存性効果を示した:より高い濃度で抗体を投与されたマウスは、より小さな病変(5mg/kg用量の病変<0.5mg/kg用量の病変<0.125mg/kg用量の病変)を有した。
実施例10抗溶血素A mAbを予防的に投与したマウスの皮膚中の細菌数。
本発明の3つの精製された抗体、H1H15377P、H1H15381P、およびH1H15399Pを皮膚壊死モデルにおいて試験して、抗体で予防的に治療されたマウスの皮膚における細菌負荷に何らかの変化が観察されたかどうかを決定した。本発明の抗体を、他の2つの抗溶血素A mAb、LC10、およびLTM14とも比較した。感染の2日前に、毛皮を剃毛し、脱毛ローションを適用することによって、雌のBALB/cマウスの腹部領域から毛皮を除去した。感染の1日前に、マウスの腹部の左側に、5mg/kgの各個々の抗体:H1H15377P、H1H15381P、およびH1H15399P、LTM14、LC10、またはアイソタイプ一致対照抗体の単回用量を腹腔内注射した。感染の日に、マウス(1群あたりn=5)の腹部の右側に、TSB中に37℃で対数期(OD600≦1)まで増殖させ、洗浄し、PBS中に懸濁した、50μlのS.aureus CA-127(MRSA株、2.5×10CFU/マウス)またはNewman(MSSA株、2.9×10CFU/マウス)を皮下投与した。感染後2日目に、マウスを麻酔で安楽死させ、8mmの皮膚生検パンチを使用して、病変領域(および周囲の皮膚)を切除し、均質化した。皮膚溶解物の連続希釈物をTSAプレートに播種した。プレートを37℃で一晩(16~18時間)インキュベートし、翌日、細菌コロニーを細菌負荷の決定のために計数した。
抗体H1H15377PおよびH1H15399Pは、S.aureus CA-127(図7a)およびNewman(図7b)の両方に感染させたマウスの皮膚における細菌負荷を減少させ、具体的には、5mg/kgのいずれかの抗体は、結果として、アイソタイプ一致対照抗体で治療された動物について決定された細菌負荷のレベルと比較して、皮膚細菌負荷の1~1.5対数減少をもたらした。同じ用量のH1H15381P、LTM14、またはLC10は、結果として、皮膚の細菌負荷を0~0.5対数減少させた。結果は、H1H15377PおよびH1H15399Pが感染したマウスの皮膚における細菌負荷を減少させるのに最も有効であることを示す。
実施例11治療的に投与された抗溶血素A mAbのインビボ有効性
本発明のmAbが感染後に投与された場合にも病変サイズを減少させることができるかどうかを決定するために、精製された抗体を、雌BALB/cマウスを使用してインビボ皮膚壊死モデルにおいて治療的に試験した(n=5)。感染の2日前に、毛皮を剃毛し、脱毛ローションを適用することによって、腹部領域から除去した。感染の日に、マウスの腹部の右側に、TBS中に37℃で対数期(OD600≦1)まで増殖させ、洗浄し、P
BS中に懸濁した、50μlのS.aureus CA-127(約1~2×10CFU/マウス)を皮下投与した。感染の2時間後、マウスの腹部の左側に、0.5mg/kgの各個々の抗体:H1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15404P、H1H15405P、H1H15408P、H1H15410P、H1H15414P、H1H15418P2、H1H15420P2、またはアイソタイプ一致対照抗体の単回用量を腹腔内注射した。感染後2日目に、マウスの病変をデジタルノギスで測定した。
本発明の全ての抗体は、感染の2時間後に0.5mg/kgで動物に投与された場合に病変サイズを減少させるのに有効であった(表11)。皮膚壊死性病変サイズの減少は、50~83%の範囲であった。抗体のうちの8つ(H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15399P、H1H15418P2、および H1H15420P2)は、病変サイズにおいて>70%の減少を示した。
Figure 2023011710000012
実施例12メチシリン感受性Staphylococcus aureus(MSSA)株を使用した急性肺炎モデルにおける抗溶血素A mAbのインビボ有効性
5mg/kgの抗体を予防的に投与したマウスの生存。予防的に投与された場合のMSSA株に対するmAbの有効性を決定するために、以下の抗体H1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、およびH1H15414P
を、S.aureus Newmanを使用した急性肺炎モデルにおける研究のために選択した(modified from Bubeck Wardenburg et al.,(2007)Infect.Immun.75:1040-1044)。雌C57BL/6マウス(n=5)に、5mg/kgの単回用量のH1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15414P、またはアイソタイプ一致対照抗体を腹腔内注射した。mAbの注射後1日目に、マウスに、TSB中に37℃で対数期(OD600≦1)まで増殖させ、洗浄し、PBS中に懸濁した、50μlのS.aureus Newman(1.7×10CFU/マウス)でマウスを気管内投与した。感染後合計6日間生存率についてマウスを監視した。
表12に見られるように、抗体H1H15375P、H1H15376P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、またはH1H15414Pの投与は、結果として100%の生存率をもたらした。H1H15377Pの投与は、結果として6日目までに80%の生存率をもたらした。本発明の全ての抗体は、感染症の急性肺炎モデルにおいて5mg/kgで予防的に与えられた場合にS.aureus MSSA株に感染したマウスの生存を増加させた。
Figure 2023011710000013
2.5mg/kgで抗体を予防的に投与したマウスの生存。抗体がMSSA株に対して急性肺炎モデルにおいてより低い用量でも有効であるかどうかを決定するために、C57BL/6雌マウス(n=5)に、2.5mg/kgのH1H15375P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15414P、またはアイソタイプ一致抗体の単回用量を腹腔内注射した。mAbの注射後1日目に、TSB中に37℃で対数期(OD600≦1)まで増殖させ、洗浄し、PBS中に再懸濁した、50μlのS.aureus Newman(7.5×10CFU/マウス)を気管内投与した。感染後合計6日間生存率についてマウスを監視した。
表12に見られるように、抗体H1H15376P、H1H15377P、H1H15379P、H1H15381P、H1H15399P、またはH1H15414Pの投与
は、6日目まで100%の生存率をもたらしたが、抗体H1H15378PまたはH1H15380Pの投与は、80%の生存率をもたらした。抗体H1H15375Pは他の抗体と比較して有効性が低く、60%の防御しか提供しなかった(表13)。
結果は、抗体H1H15375P、H1H15376P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15414P、およびH1H15377Pが、溶血素Aの細胞毒性効果において有効であり、mAbがより低容量で投与された場合であっても、S.aureus MSSA株を使用したマウスの急性肺炎モデルにおいて生存を増加させていることを示す。
Figure 2023011710000014
実施例13メチシリン耐性Staphylococcus aureus(MRSA)株を使用した急性肺炎モデルにおける抗溶血素A mAbのインビボ有効性
5mg/kgの抗体を予防的に投与したマウスの生存。MRSA株に対するmAbの有効性を試験するために、以下の抗体H1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、およびH1H15414Pを、S.aureus CA-127を使用した予防的急性肺炎モデルにおける研究のために選択した。雌C57BL/6マウス(n=5)に、5mg/kgのH1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15414P、またはアイソタイプ一致対照抗体の単回用量を腹腔内注射した。mAbの注射後1日目に、マウスに、TSB中に37℃で対数期(OD600≦1)まで増殖させ、洗浄し、PBS中に再懸濁した、S.aureus CA-127の2.2×10CFU(低接種物)または4.8×10CFU(高接種物)のいずれかを含有する50μlを気管内投与した。感染後合計6日間、生存率についてマウスを監視した。
9つの発明抗体のうちの8つは、マウスに低接種物を投与した場合に有効性を示した。具体的には、抗体H1H15375P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、およびH1H15399Pは、等しく有効であり、結果として、6日目まで100%の生存率をもたらした(表14
)。抗体H1H15414Pの投与は、80%の生存率をもたらした。この抗体を投与されたマウスは6日目まで生存しなかったので、H1H15376Pは、防御を実証しなかった。アイソタイプ一致抗体で治療された動物のうちのいずれも、6日目まで生存しなかった(表13)。
より高い接種物では、本発明の抗体間の有効性のより大きな差が観察された。表13に見られるように、抗体H1H15377PおよびH1H15399Pが、試験された抗体の中で最も有効であり、結果として、6日目まで100%の生存率をもたらした。抗体H1H15414P、H1H15378P、H1H15379P、およびH1H15381Pの投与は、6日目まで60%の生存率をもたらしたが、アイソタイプ一致対照抗体で治療された群の動物のうちのいずれも、6日目まで生存しなかった。抗体H1H15375P、H1H15376P、およびH1H15380Pは、試験された他の本発明抗体よりも低い有効性を有し、それぞれ6日目までに20%、0%、または40%の生存率をもたらした(表13)。
結果は、H1H15375P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、およびH1H15414Pは、溶血素Aの細胞毒性効果を減少させるのに有効であり、S.aureus MRSA株の低接種物を急性肺炎モデルにおいて5mg/kgで予防的に与えられた場合に生存率を増加させるのに有効であることを示す。S.aureus MRSA株のより高い接種物をこのモデルに使用した場合、2つの抗体、H1H15377PおよびH1H15399Pもまた、100%有効であった。
Figure 2023011710000015
2.5mg/kgで抗体を予防的に投与したマウスの生存。抗体が急性肺炎モデルにおいてMRSA株に対してより低い用量でも有効であるかどうかを決定するために、雌C57BL/6マウス(n=5)に、2.5mg/kgのH1H15375P、H1H15376P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、H1H15414P、またはアイソ
タイプ一致対照抗体の単回用量を腹腔内注射した。mAbの注射後1日目に、マウスに、TSB中に37℃で対数期(OD600≦1)まで増殖させ、洗浄し、PBS中に再懸濁した、50μlのS.aureus CA-127(3.0×10CFU/マウス)を気管内投与した。感染後合計6日間、生存率についてマウスを監視した。
試験された全ての発明抗体(H1H15375P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、またはH1H15414P)は、等しく有効であり、結果として6日目まで100%の生存率をもたらしたが、アイソタイプ一致対照抗体で治療された群の動物のうちのいずれも、6日目まで生存しなかった(表15)。結果は、H1H15375P、H1H15377P、H1H15378P、H1H15379P、H1H15380P、H1H15381P、H1H15399P、およびH1H15414Pが、溶血素Aの細胞毒性効果を減少させるのに有効であり、S.aureus MRSA株による感染の急性肺炎モデルにおいて2.5mg/kgで予防的に与えられた場合の生存率を増加させることに有効であることを示す。
Figure 2023011710000016
H1H15399PおよびH1H15376Pを予防的に投与したマウスの肺中の細菌数。本発明の2つの精製された抗体、H1H15399PおよびH1H15376Pを、急性肺炎研究において試験して、抗体で予防的に治療されたマウスの肺における細菌負荷の何らかの変化が観察されたかどうかを決定した。雌C57BL/6マウス(n=5)の群に、3つの用量のH1H15399P、単回用量のH1H15376P、またはアイソタイプ一致対照抗体(5mg/kg)のうちの1つを腹腔内注射した。注射後1日目、マウスに、TSB中に37℃で対数期(OD600≦1)まで増殖させ、洗浄し、PBS中に再懸濁した、50μlのS.aureus CA-127(1.6×10CFU/マウス)を気管内投与した。感染の18時間後に、マウスを麻酔で安楽死させ、肺を摘出して均質化した。肺溶解物の連続希釈物をTSAプレートに播種した。プレートを37℃で一晩(16~18時間)インキュベートし、翌日、細菌コロニーを細菌負荷の決定のために計数した。
抗体H1H15399Pは、感染されたマウスの肺における細菌負荷を減少させ(表16)、具体的には、試験された3つの用量のH1H15399Pのうちの全てが、アイソ
タイプ一致対照抗体で治療された動物について決定された細菌負荷のレベルと比較して、肺細菌負荷の1~1.5対数減少をもたらした。加えて、肺の細菌負荷のこの減少は、用量依存的であった。抗体H1H15376Pは、このモデルにおいていかなる有効性も示さず、アイソタイプ一致抗体と同様の肺細菌性肺負荷を示した。結果は、H1H15399Pが、感染されたマウスの肺における細菌負荷を減少させることができたことを示す。
Figure 2023011710000017
抗溶血素A mAbが肺内の細菌負荷を減少させる能力をさらに調べるために、生存率の増加が実証された3つのmAb(H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P)を2つの異なる用量で予防的に投与し、2つの他の抗溶血素A mAbであるLC10およびLTM14と比較した。雌C57BL/6マウスの群(n=5)に、各個々の抗体:H1H15377P、H1H15381P、H1H15399P、LTM14、LC10、またはアイソタイプ一致を対照抗体の1.25mg/kgまたは0.325mg/kgの単回用量を腹腔内注射した。注射後1日目、マウスに、TSB中に37℃対数期(OD600≦1)まで増殖させ、洗浄し、PBS中に再懸濁した、50μlのS.aureus CA-127(1.3×10CFU/マウス)を気管内投与した。感染の18時間後に、マウスを麻酔で安楽死させ、肺を摘出して均質化した。肺溶解物の連続希釈物をTSAプレートに播種した。プレートを37℃で一晩(16~18時間)インキュベートし、翌日、細菌コロニーを細菌負荷の決定のために計数した。
試験された本発明の3つの抗体は全て、LTM14、LC10、およびアイソタイプ一致対照抗体と比較して1.25mg/kgで投与された場合に有効であり、肺における細菌負荷を1対数だけ減少させた(図8a)。0.325mg/kgで投与された場合、H1H15399Pは、細菌量の減少にも有効であった(図8b)。試験された他の全ての溶血素A mAbは、このより低い用量ではマウスの肺中の細菌を有意に減少させなかった(図8b)。
実施例14プレ複合方法を使用した、異なる抗溶血素Aモノクローナル抗体間オクテット交差競合
2つの抗体が溶血素A(Staphylococcus aureusから精製された)上でエピトープに結合するために互いに競合するかどうかを評価するために、抗溶血素Aモノクローナル抗体間の結合競合を、Octet RED384バイオセンサ(Pall ForteBio Corp.)上の実時間の無標識生体層干渉法を使用して決定した。実験全体を、pH7.4の0.01MのHEPES、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.05%v/vのTween-20、1.0mg/mLのBSA(Octet HBS-ET緩衝液)中に25℃で、プレートを1000rpmの速度で振とうしながら実施した。約1.5~2.5nmの抗溶血素Aモノクローナル抗体を、抗hFc抗
体被覆Octetバイオセンサチップ(Pall ForteBio Corp.、#18~5060)上に、抗溶血素Aモノクローナル抗体(mAb-1)の50μg/mL溶液を含有するウェルに2分間浸すことによって、最初に捕捉した。次に、抗体捕捉バイオセンサチップを、遮断mAbの100μg/mL溶液を含有するウェルに3分間浸漬することによって、遮断H4Hアイソタイプ対照モノクローナル抗体(遮断mAb)で飽和させた。次に、バイオセンサチップを、1μMの第2の抗溶血素Aモノクローナル抗体(mAb-2)とともに2時間予めインキュベートされた100nMの溶血素Aを含有するウェルに4分間浸した。実験の各工程の間に、バイオセンサチップをOctet HBS-ET緩衝液中で洗浄した。実時間の結合応答を、実験の過程の間監視し、各工程の終了時の結合応答を記録した。mAb-1への溶血素Aプレ複合体化mAb-2結合の応答を、バックグラウンド結合について補正し、比較し、異なる抗溶血素Aモノクローナル抗体の競合的/非競合的挙動を決定した。表17は、結合の桁数とは独立して、両方向で競合する抗体の関連性を明白に定義する。
Figure 2023011710000018
Figure 2023011710000019
本発明は、本明細書に記載された特定の実施形態によって範囲が限定されるべきではない。実際、本明細書に記載されたものに加えて本発明の様々な修正は、前述の記載および添付の図から当業者には明らかであろう。そのような修正は、添付の特許請求の範囲の範囲内に該当することが企図されている。
Figure 2023011710000039
配列番号13のDNA配列はgtggcatccである。配列番号14のアミノ酸配列はVASである。配列番号33のDNA配列はgctgcatccである。配列番号34のアミノ酸配列はAASである。配列番号53のDNA配列はgcaacatccである。配列番号54のアミノ酸配列はATSである。配列番号73のDNA配列はgctacatccである。配列番号74のアミノ酸配列はATSである。配列番号93のDNA配列はgctgcatccである。配列番号94のアミノ酸配列はAASである。配列番号113のDNA配列はggtacatccである。配列番号114のアミノ酸配列はGTSである。配列番号133のDNA配列はgaggcgtctである。配列番号134のアミノ酸配列はEASである。配列番号153のDNA配列はactgcatccである。配列番号154のアミノ酸配列はTASである。配列番号173のDNA配列はgctgcatctである。配列番号174のアミノ酸配列はAASである。配列番号193のDNA配列はactacatccである。配列番号194のアミノ酸配列はTTSである。配列番号213のDNA配列はgctgcatccである。配列番号214のアミノ酸配列はAASである。配列番号233のDNA配列はgctgcatccである。配列番号234のアミノ酸配列はAASである。配列番号253のDNA配列はaaggcgtctである。配列番号254のアミノ酸配列はKASである。配列番号273のDNA配列はgctgcatccである。配列番号274のアミノ酸配列はAASである。

Claims (22)

  1. 溶血素Aに特異的に結合する単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であって、前記抗体または抗原結合断片が、
    (a)表面プラズモン共鳴によって測定して約80nM未満の結合解離平衡定数(K)による37℃での野生型溶血素Aへの結合と、
    (b)表面プラズモン共鳴によって測定して約0.5分超の解離半減期(t1/2)による37℃での野生型溶血素Aへの結合と、
    (c)表面プラズモン共鳴によって測定して約30nM未満のKによる25℃での野生型溶血素Aへの結合と、
    (d)表面プラズモン共鳴によって測定して約1.5分超のt1/2による25℃での野生型溶血素Aへの結合と、
    (e)表面プラズモン共鳴によって測定して約20nM未満の結合解離平衡定数(K)による37℃での修飾溶血素Aへの結合と、
    (f)表面プラズモン共鳴によって測定して約0.5分超の解離半減期(t1/2)による37℃での修飾溶血素Aへの結合と、
    (g)表面プラズモン共鳴によって測定して約10nM未満のKによる25℃での修飾溶血素Aへの結合と、
    (h)表面プラズモン共鳴によって測定して約1.5分超のt1/2による25℃での修飾溶血素Aへの結合と、
    (i)GA201、CA-127、TCH1516、GA229、8:03、27-05、94:1013、および7031からなる群から選択される、S.aureus株による溶血素A媒介ウサギ赤血球溶血の阻害と、
    (j)溶血素AとADAM10との間の相互作用の遮断と、からなる群から選択される1つ以上の特性を表す、単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合断片。
  2. 溶血素Aに特異的に結合する単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片であって、配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択される重鎖可変領域(HCVR)配列のうちのいずれか1つの内部に含有される3つの重鎖相補性決定領域(CDR)(HCDR1、HCDR2、およびHCDR3)と、配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択される軽鎖可変領域(LCVR)配列のうちのいずれか1つの内部に含有される3つの軽鎖CDR(LCDR1、LCDR2、およびLCDR3)と、を含む、単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片。
  3. 配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むHCVRを含む、請求項1または2に記載の単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片。
  4. 配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むLCVRを含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片。
  5. (a)配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むHCVRと、(b)配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択
    されるアミノ酸配列を含むLCVRと、を含む、請求項1~4のいずれか一項に記載の単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片。
  6. (a)配列番号4、24、44、64、84、104、124、144、164、184、204、224、244、264、および284からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むHCDR1ドメイン、
    (b)配列番号6、26、46、66、86、106、126、146、166、186、206、226、246、266、および286からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するHCDR2ドメイン、
    (c)配列番号8、28、48、68、88、108、128、148、168、188、208、228、248、268、および288からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むHCDR3ドメイン、
    (d)配列番号12、32、52、72、92、112、132、152、172、192、212、232、252、および272からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むLCDR1ドメイン、
    (e)配列番号14、34、54、74、94、114、134、154、174、194、214、234、254、および274からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むLCDR2ドメイン、ならびに/または
    (f)配列番号16、36、56、76、96、116、136、156、176、196、216、236、256、および276からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むLCDR3ドメイン、を含む、請求項1~5のいずれか一項に記載の単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片。
  7. 配列番号2/10、22/30、42/50、62/70、82/90、102/110、122/130、142/150、162/170、182/190、202/210、222/230、242/250、262/270、および282/270からなる群から選択されるHCVR/LCVRアミノ酸配列対を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の単離されたヒト抗体または抗原結合断片。
  8. (i)配列番号20に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号18に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (ii)配列番号40に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号38に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (iii)配列番号60に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号58に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (iv)配列番号80に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号78に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (v)配列番号100に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号98に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (vi)配列番号120に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号118に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (vii)配列番号140に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号138に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (viii)配列番号160に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号158に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (ix)配列番号180に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号178に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (x)配列番号200に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号198に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (xi)配列番号220に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号218に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (xii)配列番号240に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号238に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (xiii)配列番号260に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および配列番号258に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、
    (xiv)配列番号280に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号278に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、ならびに/または
    (xv)配列番号280に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖免疫グロブリン、および
    配列番号290に記載のアミノ酸配列を含む重鎖免疫グロブリン、を含む、請求項1~7のいずれか一項に記載の単離されたヒト抗体または抗原結合断片。
  9. Fab断片、F(ab’)断片、Fd断片、Fv断片、単鎖Fv(scFv)分子、またはdAb断片である、請求項1~8のいずれか一項に記載の抗原結合断片。
  10. 配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(HCVR)の相補性決定領域(CDR)と、配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(LCVR)のCDRと、を含む参照抗体と同じ溶血素Aのエピトープに結合する、単離された抗体またはその抗原結合断片。
  11. 配列番号2、22、42、62、82、102、122、142、162、182、202、222、242、262、および282からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(HCVR)、ならびに配列番号10、30、50、70、90、110、130、150、170、190、210、230、250、および270からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(LCVR)の相補性決定領域(CDR)を含む参照抗体と、溶血素Aへの結合について競合する、単離された抗体またはその抗原結合断片。
  12. (i)前記抗体または断片の免疫グロブリン軽鎖および前記抗体または断片の免疫グロブリン重鎖をコードする1つ以上のポリヌクレオチドを宿主細胞に導入することと、
    (ii)前記ポリヌクレオチド(複数可)の発現に有利な条件下で増殖培地において前記宿主細胞を培養することと、ならびに
    (iii)任意選択的に、前記宿主細胞および/または前記宿主細胞が増殖される培地から前記抗体または断片を単離することと、を含む、請求項1~11のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片を作製するための方法。
  13. 請求項12に記載の方法の生成物である、抗体または抗原結合断片。
  14. 請求項1~11および13のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片を含む、注射デバイスまたは容器。
  15. 請求項1~11および13のいずれか一項に記載の溶血素Aに結合する単離されたヒト抗体またはその抗原結合断片と、薬学的に許容される担体または希釈剤と、任意選択的に、1つ以上の追加の治療薬と、を含む、医薬組成物。
  16. 抗生物質、NSAID、コルチコステロイド、LC10、LTM14、および/またはプレドニゾンである前記追加の治療薬を含む、請求項15に記載の医薬組成物。
  17. Staphylococcus aureus感染症の予防または治療を、それを必要とする患者において行うための方法であって、請求項1~11および13のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合断片の有効量、または請求項15もしくは16に記載の医薬組成物を前記患者に投与することを含む、方法。
  18. 前記抗体またはその抗原結合断片が、皮下に、静脈内に、皮内に、経口で、または筋肉内に投与される、請求項17に記載の方法。
  19. 前記Staphylococcus aureus感染症により、皮膚壊死、皮膚および軟組織感染症、膿瘍、手術部位感染症、人工関節感染症、菌血症、敗血症、敗血症性関節炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、中毒性ショック症候群、乳房炎、せつ腫症、カルブンケル症、吹出物からなる群から選択される状態が生じ、
    前記抗体または抗原結合断片の投与により、前記状態が治療されるか、または前記状態の1つ以上の症状の重症度が低減される、請求項17または18に記載の方法。
  20. Staphylococcus aureus感染症を有する患者の治療に使用するための、請求項1~11および13のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
  21. Staphylococcus aureus感染症の治療に使用するための、請求項1~11および13のいずれか一項に記載の1つ以上の抗体またはその抗原結合断片を含む、組成物。
  22. Staphylococcus aureus感染症を有する患者を治療するための薬剤の製造における、請求項1~11および13のいずれかに一項に記載の単離された抗体またはその抗原結合断片の使用。
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