JP2019518050A - 抗菌薬としての複素環式化合物 - Google Patents
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Abstract
Description
(式中、
R1はC1〜6アルキルまたは水素を表し;
L1はリンカー基−C(Ra)(Rb)−を表し;
X1は任意選択の炭素環芳香族リンカー基(そのリンカー基は、それ自体、任意選択によりフルオロ、−OH、−OC1〜6アルキルおよびC1〜6アルキルから選択される1つ以上の置換基により置換され得、後の2つのアルキル部分は、それら自体、任意選択により1つ以上のフルオロ原子により置換されている)を表し;
RaおよびRbは、独立して、水素またはC1〜6アルキル(任意選択により1つ以上のフルオロ原子により置換されている)を表し;
R2およびR3は:
(i)独立して、任意選択によりQ1および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜6アルキルを表し;
(ii)独立して、アリールまたはヘテロアリールを表し、それぞれが、任意選択によりQ2から選択される1つ以上の置換基により置換されており;または
(iii)独立して、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを表し、それぞれが、任意選択によりQ3および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されており;
Q1、Q2およびQ3は、それぞれ独立して、ハロ、C1〜6アルキル、−OC1〜6アルキル(後の2つのアルキル部分は、それら自体、任意選択により=Oおよびハロ、例えば、フルオロ原子から選択される1つ以上の置換基により置換され得る)、アリールおよびヘテロアリール(後の2つの芳香族基は、それら自体、任意選択によりハロ、C1〜6アルキルおよび−OC1〜6アルキル(後の2つのアルキル部分は、それら自体、1つ以上のフルオロ原子により置換され得る)から選択される1つ以上の置換基により置換され得る)から選択される1つ以上の置換基を表し;
環Aは、少なくとも1つのヘテロ原子を含有する(好ましくは、少なくとも1つの窒素原子を含有する)5員芳香族環であり;
環Bは、任意選択により1〜4つのヘテロ原子(好ましくは、窒素、酸素および硫黄から選択される)を含有する芳香族または非芳香族であり得る5または6員環であり;
環Aおよび/または環Bのいずれも、任意選択によりハロ、C1〜6アルキル(任意選択により1つ以上のハロ、例えば、フルオロ原子により置換されている)および/または−OC1〜6アルキル(それ自体、任意選択により1つ以上のフルオロ原子により置換されている)から選択される1つ以上の置換基により置換され得る)
またはその薬学的に許容される塩が提供され、その化合物は本明細書において「本発明の化合物」と言及され得る。
R1は水素を表し;
RaおよびRbは、独立して、水素を表し;
L1は−CH2−を表し;
X1が存在する場合、それは炭素環芳香族リンカー基、例えば、フェニル基または二環式(炭素環)芳香族リンカー基(二環の環の少なくとも一方は芳香族である)を表し、例えば、その結果、二環は互いと縮合している、それぞれの環が5または6員である2つの個別の環からなり、したがって、6,6−、5,6−または5,5縮合二環式環)を形成しており、したがって、それには、例えば、フェニル、ナフチル(完全芳香族ナフチルおよび1,2,3,4−テトラヒドロナフチルを含む)などの基が含まれ、したがって、例えば、特に:
−フェニレン−(特に1,4−フェニレン)、例えば、
−ナフチレン、例えば、
を形成しているものが挙げられる。
R2およびR3は:
(i)独立して、任意選択によりQ1および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜3アルキルを表し;
(ii)独立して、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキル(例えば、窒素原子を含有する4〜6員環、したがって、例えば、アゼチジニル基を形成する)を表し、それぞれが、任意選択によりQ3および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されており;かつ/または
Q1、Q2およびQ3は、それぞれ独立して:
−任意選択により、ハロ、C1〜6アルキルおよび−OC1〜6アルキル(後の2つのアルキル部分は、それら自体、1つ以上のフルオロ原子により置換され得る)から選択される1つ以上の置換基により置換されているアリール(例えば、フェニル)
−任意選択により、本明細書において定義されているとおりに置換されているヘテロアリール(例えば、1または2つのヘテロ原子を含有する5または6員のヘテロアリール基、したがって、例えば、ピリジニル基またはチアゾリル基を形成する)(しかし、一態様では、このようなヘテロアリール基は非置換である)
−任意選択により、=Oおよびフルオロから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜6アルキル(例えば、C1〜3アルキル)(例えば、したがって、−C(O)−CF3基を形成する)
を表すものが含まれる。
R2およびR3の1つは:
−シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキル(例えば、窒素原子を含有する4〜6員環、したがって、例えば、アゼチジニル基を形成する)を表し、それぞれが、任意選択によりQ3および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されており;かつ
−他の1つ(R2またはR3の1つ)は、任意選択により、Q1および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜6(例えば、C1〜3アルキル)を表す、本発明の化合物が提供される。
R2またはR3がシクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを表す場合、そのような環式基は、Q3から選択される少なくとも1つの置換基により置換されており;
Q3は、アリールまたはヘテロアリールを表し、両方とも本明細書において定義されているとおりに置換されている、本発明の化合物が提供される。
少なくとも1〜3つ(例えば、1または2つ)のヘテロ原子を含有する、好ましくは、少なくとも1つの窒素原子を含有する芳香族環である環Aを含み;
環Bも、好ましくは、少なくとも1つの窒素原子を含有する、より好ましくは、芳香族環(例えば、5または特に6員芳香族環)であることが好ましい。
として表されることが好ましい。
式中、「SUB」は、炭素原子上、または考えられる場合、ヘテロ原子上、例えば、NH上の1つの関連の任意選択の置換基(または、考えられる場合、関連の置換基だけでない)(したがって、Hを置き換える)であり得る。
として表され得る。
式中、「SUB」は、二環上(すなわち、環A上および/または環B上)の1つ以上の考えられる置換基を表し、かつ「Sub」は、二環のN原子上の考えられる任意選択の置換基を表す(これに関連する非置換は「NH」を意味する)。
(I)前に定義されているとおりの式(I)の化合物であって、
L1は−CH2−を表し;
R2およびR3の1つは:
○ シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキル(例えば、窒素原子を含有する4〜6員環、したがって、例えば、アゼチジニル基を形成する)を表し、それぞれが、任意選択によりQ3および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されており;かつ
○ 他の1つ(R2またはR3の1つ)は、任意選択により、Q1および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜6(例えば、C1〜3アルキル)を表す化合物;
(II)前に(例えば、上記(I)において)定義されているとおりの式(I)の化合物であって、
R2またはR3がシクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを表す場合、そのような環式基は、Q3から選択される少なくとも1つの置換基により置換されており;
Q3は、アリールまたはヘテロアリールを表し、両方とも任意選択により本明細書において定義されているとおりに置換されており;
環Aおよび環Bは、互いに少なくとも1つの窒素原子(および主要な実施形態において、両方の環に共通する少なくとも1つの窒素原子)を含有する8または9員二環式環(環Aは5員環であり、かつ環Bは5または6員環であり得、両方の環は、好ましくは、芳香族である)を表し;
環Aおよび環B上の任意選択の置換基は、ハロ、C1〜3アルキルおよび−OC1〜3アルキルであり;かつ
他の整数は本明細書において定義されているとおりである化合物;ならびに/または
(III)前に(例えば、上記(I)および/または(II)において)定義されているとおりの化合物であって、さらに環Aおよび環Bの二環が本明細書において定義されているとおりであり、またはより特には以下:
として表される化合物
(または前記上の提示のうちいずれか1つ)。
本発明の化合物は、驚くべきことに、マイコバクテリア感染、特に、結核菌(Mycobacterium tuberculosis)(その潜伏性かつ薬剤耐性の形態を含む)などの病原性マイコバクテリアを原因とする疾患を含む、細菌感染の治療に適していることが示された。したがって、本発明はまた、薬剤として使用するための、特にマイコバクテリア感染を含む細菌感染の治療用薬剤として使用するための、上で定義した本発明の化合物に関する。
本発明の化合物は、一般に、それぞれが当業者に知られている一連の工程により調製することができる。
式Iの化合物は、後の実施例で用いられる技術(および当業者に知られている方法)に従って、例えば、次の技術を使用することにより調製され得る。
(i)式(II)の化合物
(式中、整数は前に定義されているとおりである)、または好適なその誘導体、例えば、カルボン酸エステル誘導体と、式(III)の化合物
(式中、整数は前に定義されているとおりである)との、アミドカップリング反応条件下、例えば、好適なカップリング試薬(例えば、1,1’−カルボニルジイミダゾール、N,N’−ジシクロヘキシルカルボジイミド、1−(3−ジメチルアミノプロピル)−3−エチルカルボジイミド(またはその塩酸塩)または炭酸N,N’−ジスクシンイミジル)の存在下、任意選択により好適な塩基(例えば、水素化ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、ピリジン、トリエチルアミン、ジメチルアミノピリジン、ジイソプロピルアミン、水酸化ナトリウム、カリウムtert−ブトキシドおよび/またはリチウムジイソプロピルアミド(またはその変種)および適切な溶媒(例えば、テトラヒドロフラン、ピリジン、トルエン、ジクロロメタン、クロロホルム、アセトニトリル、ジメチルホルムアミド、トリフルオロメチルベンゼン、ジオキサンまたはリエチルアミン)の存在下での反応。あるいは、(IV)の化合物のカルボン酸基は、最初に標準的条件下で対応する塩化アシルに変換することができ(例えば、POCl3、PCl5、SOCl2または塩化オキサリルの存在下)、その後にその塩化アシルを式(V)の化合物と、例えば、上記と同様の条件下で反応させる;
(ii)式(IV)の化合物
(式中、整数は前に定義されているとおりであり、かつLG2は、好適な脱離基、例えば、ヨード、ブロモ、クロロまたはスルホネート基(例えば、カップリングのために配置され得るタイプの基)を表す)と、式(V)の化合物
HN(R2)(R3) (V)
(式中、整数は前に定義されているとおりである)との、標準的条件下、例えば、任意選択により適切な金属触媒(またはその塩もしくは錯体)、例えば、Pd(dba)2、Pd(OAc)2、Cu、Cu(OAc)2、CuI、NiCl2などの存在下、任意選択の添加剤、例えば、Ph3P、X−phosなどを用いる、適切な塩基(例えば、t−BuONaなど)の存在下、好適な溶媒(例えば、ジオキサンなど)中での当業者に知られている反応条件下でのカップリング。
−求核芳香族置換反応
−他のカップリング反応、例えば、一方の化合物が、LG2に関して前に記載されたものなどの好適な脱離基(および特に、クロロ、ブロモまたはヨードを表し得る)を含有し、もう一方の化合物が、相互に適合性である「脱離基」または別の好適な基、例えば、−B(OH)2、−B(ORwx)2または−SN(Rwx)3を含み、それぞれのRwxが、独立して、C1〜6アルキル基を表し、または−B(ORwx)2の場合、それぞれのRwx基が、互いに結合して4〜6員環式基を形成してもよく、それにより、例えば、ピナコラトボロン酸エステル基(またはヨード、ブロモまたはクロロを表し得るが、ただし、「脱離基」は相互に適合性である)を形成している化合物とのカップリング反応であって、その反応が、好適な触媒系、例えば、金属(またはその塩もしくは錯体)、例えば、Pd、CuI、Pd/C、PdCl2、Pd(OAc)2、Pd(Ph3P)2Cl2、Pd(Ph3P)4、Pd2(dba)3および/またはNiCl2(など)および配位子、例えば、PdCl2(dppf).DCM、t−Bu3P、(C6H11)3P、Ph3Pなどの存在下で、好適な溶媒中で当業者に知られている反応条件下で行われ得るカップリング反応が含まれる。
中間体C’の調製
1−ヨード−4−(トリフルオロメトキシ)ベンゼン(CAS[103962−05−6]、4.9g、17.01mmol)のDMSO(30mL)溶液に、3−アゼチジン−3−オール塩酸塩(1.24g、11.34mmol)、炭酸セシウム(9.24g、28.36mmol)、ヨウ化銅(434mg、2.27mmol)およびL−プロリン(522mg、4.54mmol)を添加し、続いて、その混合物を、アルゴン雰囲気下、90℃で18時間加熱した。溶液を酢酸エチルと水で希釈し、有機層を塩水で3回洗浄し、減圧下で濃縮し、シリカゲルのカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=8:1)により精製して、黄色固体として中間体C’を2g、77%で得た。
中間体C’(1.8g、7.72mmol)のピリジン(20mL)溶液を、0℃まで冷却し、塩化メタンスルホニル(1.76g、15.36mmol)で処理した。反応を室温まで温め、3時間撹拌した。混合物を、酢酸エチル(50mL)とH2O(30mL)の間で分配し、有機層をH2Oと塩水で洗浄し、乾燥させ(Na2SO4)、濃縮して、粗生成物中間体D’を2.1g、87%で得た。
中間体D’(2.1g、6.75mmol)をDMF(50mL)中に溶解させ、メチルアミン(H2O中40%、90mL)で処理し、80℃で48時間撹拌して反応させた。室温まで冷却後、混合物をH2O(50mL)と酢酸エチル(100mL)の間で分配した。有機層を塩水で洗浄し、乾燥させ(Na2SO4)、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルのカラムクロマトグラフィー(ジクロロメタン/メタノール(15:1))により精製して、中間体E’を0.5g、30%で得た。
中間体E’(0.75g、3.04mmol)、4−ブロモベンゾニトリル(CAS[623−00−7]、0.554g、3.04mmol)、NaOtBu(1.46g、15.2mmol)およびXphos(0.29g、0.609mmol)のジオキサン中混合物を、窒素流下、室温で20分間撹拌した。次に、撹拌中溶液に、Pd(dba)2(0.175g、0.305mmol)を添加し、窒素流下で10分間撹拌した。混合物を、110℃のマイクロ波で1時間照射した。粗混合物をCelite(登録商標)で濾過し、溶媒を蒸発させた。残渣を高速液体クロマトグラフィー(Phenomenex Gemini C18 250×50mm×10μm、90ml/分、移動相:水(0.05%NH3H2O含有)/アセトニトリル、70/30から30/70の勾配)により精製した。所望の画分を集め、真空中で蒸発させてアセトニトリルを除去した。残渣を凍結乾燥させて、中間体F’を0.3g、21%で得た。
中間体F’(0.2g、0.645mmol)のMeOH中7Mアンモニア(10mL)の溶液に、N2下でラネーNi(0.1g)を添加した。懸濁液を真空下で脱気し、H2で数回パージした。混合物を、H2(15psi)下、25℃で10時間撹拌した。懸濁液をcelite(登録商標)パッドを通して濾過し、メタノール(40mL)で洗浄した。合わせた濾液を濃縮乾固させて、中間体G’を0.21g、99%で得た。
6−クロロ−2−エチルイミダゾ[3,2−a]ピリジン−3−カルボン酸(CAS[1216142−18−5]、0.19g、0.85mmol)、のDMF(30mL)溶液に、中間体G’(0.27g、0.768mmol)、HATU(0.35g、0.92mmol)およびジイソプロピルエチルアミン(0.28g、2.31mmol)を添加した。混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を水(30mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。残渣を高速液体クロマトグラフィー(Waters Xbridge Prep OBD C18 150×30×5μ、25ml/分、移動相:水(0.05%NH3.H2O含有)/アセトニトリル、勾配:40/60から10/90)により精製した。所望の画分を集め、真空中で蒸発させてアセトニトリルを除去した。残渣を凍結乾燥させて、化合物1を0.297g、66%で得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ=9.53(d,J=1.3Hz,1H),7.54(d,J=9.7Hz,1H),7.32−7.26(m,3H),7.07(d,J=8.4Hz,2H),6.77(d,J=8.8Hz,2H),6.43(d,J=8.8Hz,2H),6.04(br.s.,1H),4.61(d,J=5.7Hz,2H),4.50(quin,J=6.4Hz,1H),4.20(t,J=7.3Hz,2H),3.86−3.79(m,2H),3.01−2.91(m,5H),1.40(t,J=7.5Hz,3H).
中間体G’(0.09g、0.256mmol)のCH2Cl2(20mL)溶液に、6−エチル−2−メチルイミダゾ[2,1−b]チアゾール−5−カルボン酸(CAS[1131613−58−5]、0.054g、0.256mmol)、HATU(0.127g、0.333mmol)およびジイソプロピルエチルアミン(0.099g、0.768mmol)を添加した。混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を水(20mL)で希釈し、ジクロロメタン(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。残渣を高速液体クロマトグラフィー(YMC−Actus Triart C18 150×30×5μ、25ml/分、移動相:水(0.05%NH3.H2O含有)/アセトニトリル、29/71から0/100の勾配)により精製した。所望の画分を集め、真空中で蒸発させてアセトニトリルを除去した。残渣を凍結乾燥させて、化合物2を0.101g、73%で得た。
中間体G’(0.13g、0.370mmol)のDMF(20mL)溶液に、2−エチル−5H,6H,7H,8H−イミダゾ[1.2−a]ピリジン−3−カルボン酸(CAS[1529528−99−1]、0.072g、0.370mmol)、HATU(0.183g、0.481mmol)およびジイソプロピルエチルアミン(0.144g、1.11mmol)を添加した。混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。残渣を高速液体クロマトグラフィー(YMC−Actus Triart C18 150×30×5μ、25ml/分、移動相:水(0.05%NH3.H2O含有)/アセトニトリル、44/56から14/86の勾配)により精製した。所望の画分を集め、真空中で蒸発させてアセトニトリルを除去した。残渣を凍結乾燥させて、化合物3を0.066g、34%で得た。
中間体Jの調製
NBS(45.1g、254mmol)およびNH4OAc(5.33g、69.2mmol)を、3−オキソ吉草酸メチル(CAS[30414−53−0]、30g、231mmol)のメチルt−ブチルエーテル(600mL)溶液に添加した。混合物を室温で48時間撹拌した。混合物を濾過し、H2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過した。濾液を真空下で濃縮した。残渣をシリカゲルのカラムクロマトグラフィー(溶離液:石油エーテル/酢酸エチル 20/1)により精製して、中間体J(20.0g、収率:35%)を得た。
5−クロロ−2−ピリジンアミン(CAS[5428−89−7]、12.0g、93.0mmol)および中間体J(25.0g、112mmol)のエタノール(60mL)溶液を、一晩還流した。混合物を真空下で濃縮した。残渣を酢酸エチル(100mL)中で溶解させた。溶液を水(2×100mL)、塩水(100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮した。残渣をシリカゲルのカラムクロマトグラフィー(溶離液:石油エーテル/酢酸エチル 3/1)により精製して、中間体K(700mg、収率:3%)を得た。
中間体K(700mg、2.10mmol)と水酸化ナトリウム(252mg、6.30mmol)のエタノール(2mL)とH2O(2mL)中混合物を、室温で一晩撹拌した。水(20mL)を添加し、溶液を2M塩酸水溶液で約pH3まで酸性化した。溶液を凍結乾燥させて、粗中間体L(2g)を得た。
中間体L(0.1g、0.26mmol、純度=58%)のDMF(10mL)溶液に中間体G’(0.082g、0.234mmol)、HATU(0.106g、0.28mmol)およびジイソプロピルエチルアミン(0.09g、0.70mmol)を添加した。混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を水(20mL)で希釈し、ジクロロメタン(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。残渣を高速液体クロマトグラフィー(Waters Xbridge Prep OBD C18 150×30×5μ、25ml/分、移動相:水(0.05%NH3.H2O含有)/アセトニトリル、25/75から0/100の勾配)により精製した。所望の画分を集め、真空中で蒸発させてアセトニトリルを除去した。残渣を凍結乾燥させて、化合物4を0.074g、56%で得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ=9.85(d,J=2.6Hz,1H),8.57(d,J=2.2Hz,1H),7.29(s,2H),7.08(d,J=8.4Hz,2H),6.78(d,J=8.4Hz,2H),6.44(d,J=8.8Hz,2H),6.11(br.s.,1H),4.62(d,J=5.7Hz,2H),4.52(quin,J=6.3Hz,1H),4.21(t,J=7.3Hz,2H),3.87−3.80(m,2H),3.02(q,J=7.5Hz,2H),2.96(s,3H),1.45(t,J=7.5Hz,3H).
中間体BLの調製
2−アミノピラジン(CAS[5049−61−6]、12g、126.18mmol)および中間体J(39.6g、189.27mmol)のEtOH(10mL)中混合物を、100℃で12時間混合した。溶媒を真空中で除去した。粗生成物をカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=5/1〜1/1)により精製した。生成物画分を集め、溶媒を蒸発させて、中間体BLを2g、8%で得た。
中間体BL(5g、24.36mmol)のMeOH(20mL)溶液に、二酸化白金(500mg)をN2下で添加し、次いで1滴の濃HClを添加した。懸濁液を真空下で脱気し、H2で数回パージした。混合物を、H2(15psi)下、25℃で10時間撹拌した。懸濁液をCelite(登録商標)パッドを通して濾過し、パッドをメタノール(50mL)で洗浄した。合わせた濾液を濃縮乾固させて、中間体BMを5g、98%で得た。
中間体BM(5g、23.89mmol)のMeOH(75mL)溶液に、ホルムアルデヒド水溶液(9.7g、119.47mmol、37%)を0℃で添加し、次いでシアノ水素化ホウ素ナトリウム(7.5g、119.47mmol)および1滴の酢酸(0.2mL)を添加した。その後、混合物を室温で一晩撹拌した。10%NH4Cl溶液(25mL)を滴加した。混合物を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を塩水で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、溶媒を真空下で蒸発させた。残渣をシリカゲルのカラムクロマトグラフィー(ジクロロメタン/メタノール=15:1〜10:1)により精製して、中間体BNを1.3g、24%で得た。
中間体BN(0.55g、2.46mmol)のMeOH(25mL)および水(5mL)溶液に、水酸化リチウム一水和物(0.52g、12.32mmol)を添加した。混合物を室温で10時間撹拌した。溶媒を真空中で除去して乾燥させた。残渣を高速液体クロマトグラフィー(DuraShell 150×25mm×5μm、25ml/分、水(0.05%HCl含有)/アセトニトリル 100/0〜70/30)により精製した。所望の画分を集め、真空中で蒸発させてアセトニトリルを除去した。残渣を凍結乾燥させて、中間体BOを0.4g、78%で得た。
中間体BO(0.045g、0.22mmol)のDMF(20mL)溶液に、中間体G’(0.069g、0.196mmol)、HATU(0.097g、0.25mmol)およびジイソプロピルエチルアミン(0.076g、0.58mmol)を添加した。混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。残渣を高速液体クロマトグラフィー(Waters Xbridge Prep OBD C18 150×30×5μ、25ml/分、移動相:水(0.05%NH3.H2O含有)/アセトニトリル、勾配:40/60から10/90)により精製した。所望の画分を集め、真空中で蒸発させてアセトニトリルを除去した。残渣を凍結乾燥させて、化合物5を0.056g、51%で得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ=7.24(d,J=8.4Hz,2H),7.08(d,J=8.4Hz,2H),6.76(d,J=8.8Hz,2H),6.44(d,J=8.8Hz,2H),5.89(br.s.,1H),4.56−4.45(m,3H),4.33(t,J=5.3Hz,2H),4.20(t,J=7.3Hz,2H),3.87−3.79(m,2H),3.65(s,2H),2.94(s,3H),2.80(t,J=5.5Hz,2H),2.72(q,J=7.5Hz,2H),2.48(s,3H),1.26(t,J=7.7Hz,3H).
中間体H’の調製
トリフェニルホスフィン(18.25g、69.56mmol)、イミダゾール(7.10g、104.34mmol)およびヨウ素(13.24g、52.17mmol)を、tert−ブチルN−(3−ヒドロキシシクロブチル)−N−メチルカルバマート(CAS[1392804−89−5]、7g、34.78mmol)のトルエン(30mL)溶液に添加した。得られた混合物を1時間還流した。酢酸エチル(50mL)を添加し、混合物を、水(2×50mL)および塩水(50mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸マグネシウムで乾燥させ、濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残渣をシリカゲルのフラッシュカラムクロマトグラフィー(溶離液:石油エーテル/酢酸エチル、1/0〜5/1)により精製して、中間体H’を、8g、74%で得た。
(4−(トリフルオロメトキシ)フェニル)ボロン酸(CAS[1399301−27−2]、2.65g、12.86mmol)、トランス−2−アミノ−シクロヘキサノール(0.148g、1.28mmol)およびヨウ化ニッケル(0.2g、0.64mmol)のイソプロパノール(30mL)中混合物を、25℃で30分間、窒素流下で撹拌した。NaHMDS(12.9mL、12.86mmol、THF中1M)を添加し、混合物を10分間、窒素流下で撹拌した。イソプロパノール(20mL)中の中間体H’(2g、6.43mmol)を添加し、混合物を70℃で10時間撹拌した。混合物をジクロロメタン(100mL)で希釈し、水(2×50mL)および塩水(20mL)で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルのカラムクロマトグラフィー(溶離液:石油エーテル/酢酸エチル 0〜10/1)により精製して、中間体I’を、1.6g、72%で得た。
ギ酸(25mL)を中間体I’(2g、5.79mmol)に、窒素雰囲気下、0℃で添加した。混合物を25℃で10時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、中間体J’を1.4g、98%で得た。
中間体J’(1.6g、6.52mmol)、4−ブロモベンゾニトリル(CAS[623−00−7]、1.43g、7.83mmol)、Pd(dba)2(0.37g、0.01mmol)、Ruphos(0.609g、1.31mmol)およびナトリウムter−ブトキシド(3.14g、32.62mmol)のジオキサン(3mL)中混合物を、N2下、100℃で16時間撹拌した。混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4で乾燥させ、真空中で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=5:1)により精製した。生成物画分を集め、溶媒を蒸発させて、淡黄色油として中間体K’を1.4g、62%で得た。
中間体K’(1.54g、4.43mmol)のMeOH中4Mアンモニア(25mL)の溶液に、N2下でラネーニッケル(0.01gg)を添加した。懸濁液を真空下で脱気し、H2で数回パージした。混合物を、H2(15psi)下、25℃で10時間撹拌した。懸濁液をCelite(登録商標)パッドを通して濾過し、パッドをメタノール(80mL)で洗浄した。合わせた濾液を濃縮して、黄色油として中間体L’を1.4g、90%で得た。
6−クロロ−2−エチルイミダゾ[3,2−a]ピリジン−3−カルボン酸(CAS[1216142−18−5]、0.25g、1.11mmol)のDMF(5mL)溶液に、中間体L’(0.3g、0.86mmol)、HATU(0.39g、1.03mmol)およびジイソプロピルエチルアミン(0.332g、2.57mmol)を添加した。混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を水(20mL)で希釈し、ジクロロメタン(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。残渣を高速液体クロマトグラフィー(Waters Xbridge Prep OBD C18 150×30×5μ、25ml/分、移動相:水(0.05%NH3.H2O含有)/アセトニトリル、勾配:35/65〜5/95)により精製した。所望の画分を集め、真空中で蒸発させてアセトニトリルを除去した。残渣を凍結乾燥させて、化合物6を0.277g、58%で得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ=9.54(s,1H),7.54(d,J=9.7Hz,1H),7.37−7.27(m,3H),7.26−7.13(m,4H),6.88−6.76(m,2H),6.02(br.s.,1H),4.61(d,J=5.3Hz,2H),4.17(quin,J=7.6Hz,0.5H),4.02−3.90(m,1H),3.52(td,J=4.8,9.4Hz,0.7H),3.29−3.14(m,1H),2.97(q,J=7.5Hz,2H),2.93−2.85(m,3H),2.83−2.73(m,1.5H),2.70−2.58(m,1H),2.49(ddd,J=4.4,7.7,12.6Hz,1H),2.24−2.12(m,1.5H),1.40(t,J=7.5Hz,3H)
中間体M’の調製
適宜、中間体M’を、中間体H’および4−(トリフルオロメチル)フェニル)ボロン酸(CAS[128796−39−4])から出発して中間体I’と同じ方法で調製して、0.22g、52%で得た。
適宜、中間体N’を、中間体M’から出発して中間体J’と同じ方法で調製して、0.13g、82%で得た。
適宜、中間体O’を、中間体N’から出発して中間体K’と同じ方法で調製して、0.33g、26%で得た。
適宜、中間体P’を、中間体O’から出発して中間体L’と同じ方法で調製して、0.02g、100%で得た。
6−クロロ−2−エチルイミダゾ[3,2−a]ピリジン−3−カルボン酸(CAS[1216142−18−5]、0.0135g、0.06mmol)、中間体P’(0.02g、0.06mmol)、HATU(0.03g、0.078mmol)およびジイソプロピルアミン(0.023g、0.18mmol)のDMF(4mL)中混合物を25℃で16時間撹拌した。酢酸エチル(20mL)を添加し、混合物を水(20mL)および塩水(20mL)で洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムで乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮した。残渣をシリカゲルのカラムクロマトグラフィー(溶離液:石油エーテル/酢酸エチル 1/1〜0/1)により精製して、F1を得た。F1をPhenomenex Gemini 150×25mm×10μmの高速液体クロマトグラフィーにより精製した(溶離液:0.5%アンモニア水/アセトニトリル 26/74〜0/100)。所望の画分を集め、凍結乾燥させて、F2を得た。F2をシリカゲルのフラッシュカラムクロマトグラフィー(溶離液:石油エーテル/酢酸エチル 1/1〜0/1)により精製して、化合物7を0.0046g、13%で得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ=9.53(dd,J=0.8,2.0Hz,1H),7.63−7.58(m,0.5H),7.55(t,J=8.5Hz,2.5H),7.43(d,J=8.3Hz,0.5H),7.34(d,J=8.5Hz,1.5H),7.31−7.27(m,2H),7.26−7.23(m,1H),6.87−6.75(m,2H),6.02(br.s.,1H),4.61(d,J=5.5Hz,2H),4.05−3.94(m,1H),3.35−3.19(m,1H),2.96(q,J=7.6Hz,2H),2.93−2.86(m,3H),2.84−2.60(m,2H),2.56−2.15(m,2H),1.43−1.37(m,3H)
LCMS
一部の化合物の質量を、LCMS(液体クロマトグラフィー質量分析)を用いて記録した。使用した方法を以下に記載する。
高速液体クロマトグラフィー(HPLC)測定は、それぞれの方法に記載したLCポンプ、ダイオードアレイ(DAD)検出器またはUV検出器、およびカラムを使用して行った。必要ならば、追加の検出器を含めた(下の方法の表を参照されたい)。
結核菌(M.tuberculosis)に対する試験化合物のMIC測定
試験1
実験および参照化合物の適切な溶液を、7H9培地を有する96ウェルプレート中で作製した。結核菌(Mycobacterium tuberculosis)株H37Rvの試料を対数増殖期の培養菌から採取した。これらを最初に希釈して600nmの波長における0.3の光学密度を得、次に1/100希釈し、ウェル当たり約5×10exp5コロニー形成単位の接種材料を得た。蒸発を防ぐためにプレートをポリ袋に入れて37℃でインキュベートした。7日後、レサズリンを全てのウェルに添加した。2日後、蛍光をGemini EM Microplate Reader上で543の励起波長および590nmの発光波長で測定し、MIC50値および/またはpIC50値(など、例えば、IC50、IC90、pIC90、など)を計算した(または計算することができる)。
プラスチック製滅菌丸底96ウェルマイクロタイタープレートに、100μlのMiddlebrook(1×)7H9ブロス培地を満たす。続いて、100μlの培地を列2に追加する。化合物の原液(200×最終試験濃度)を、細菌増殖に対するそれらの効果を評価するために、列2の一連の複製ウェルに2μlの容量で加える。マルチピペットを使用し、列2〜11のマイクロタイタープレート内で、直接、2段階希釈を行う。疎水性が高い化合物に伴うピペッティング誤差を最小限に抑えるために、希釈を3回行う度にピペットチップを交換する。各マイクロタイタープレートには、接種菌を含む(列1)および含まない(列12)無処理対照試料が含まれる。1ウェル当たり約10000CFUの結核菌(Mycobacterium tuberculosis)(H37RV株)を、Middlebrook(1x)7H9ブロス培地中、100μlの容量で、列12を除いて行Aから行Hに加える。接種菌を含まない同じ容量のブロス培地を、行A〜Hの列12に添加する。加湿雰囲気下、37℃で7日間、培養菌をインキュベートする(インキュベータは外気バルブを備え、連続的に換気する)。7日目に、目視により細菌の増殖を確認する。
目視で細菌の増殖が認められない濃度を、90%最小発育阻止濃度(MIC90)と決定する。
化合物の殺菌または静菌活性を、液体希釈法を使用して、タイム・キル・アッセイで測定することができる。結核菌(Mycobacterium tuberculosis)(H37RV株)のタイム・キル・アッセイでは、結核菌(M.tuberculosis)の出発接種量は、Middlebrook(1x)7H9ブロス中、106CFU/mlとする。抗菌化合物をMIC90の0.1〜10倍の濃度で使用する。抗菌薬を入れないチューブを培養菌増殖の対照とする。微生物および試験化合物を含有するチューブを37℃でインキュベートする。0、1、4、7、14および21日間のインキュベーション後、Middlebrook 7H9培地中での段階希釈(10−1〜10−6)およびMiddlebrook 7H11寒天培地上への播種(100μl)による生菌数の決定のために試料を取り出す。プレートを、37℃で21日間インキュベートして、コロニー数を測定する。時間に対して1ml当たりのlog10CFUをプロットすることにより、殺菌曲線を作成することができる。殺菌効果があるとは、一般に、無処理接種菌と比較して、1ml当たりのCFU数が3log10減少することと定義される。薬剤の持ち越し効果の可能性は、段階希釈および播種に使用した最高希釈でのコロニーのカウントにより除去される。
実験および参照化合物の適切な溶液を、7H9培地を有する96ウェルプレート中で作製した。結核菌(Mycobacterium tuberculosis)株EH4.0(361.269)の試料を増殖静止期の培養菌から採取した。これらを最初に希釈して600nmの波長における0.3の光学密度を得、次に1/100希釈し、ウェル当たり約5×10exp5コロニー形成単位の接種材料を得た。蒸発を防ぐためにプレートをポリ袋に入れて37℃でインキュベートした。7日後、レサズリンを全てのウェルに添加した。2日後、蛍光をGemini EM Microplate Reader上で543nm励起波長および590nmの発光波長で測定し、MIC50および/またはpIC50値(など、例えば、IC50、IC90、pIC90、など)を計算した(または計算することができる)。pIC50値は、μg/mLで以下に記録され得る。
本発明/実施例の化合物は、例えば上記の試験1または試験2で試験した場合、典型的にはIC90値が0.01〜10μg/mlであり得る。本発明/実施例の化合物は、例えば上記の試験1または試験2で試験した場合、典型的にはpIC50が3〜10(例えば4.0〜9.0、例えば5.0〜8.0)であり得る。
Claims (18)
- 結核の治療に使用するための式(I)の化合物
(式中、
R1はC1〜6アルキルまたは水素を表し;
L1はリンカー基−C(Ra)(Rb)−を表し;
X1は任意選択の炭素環芳香族リンカー基(そのリンカー基は、それ自体、任意選択によりフルオロ、−OH、−OC1〜6アルキルおよびC1〜6アルキルから選択される1つ以上の置換基により置換され得、後の2つのアルキル部分は、それら自体、任意選択により1つ以上のフルオロ原子により置換されている)を表し;
RaおよびRbは、独立して、水素またはC1〜6アルキル(任意選択により1つ以上のフルオロ原子により置換されている)を表し;
R2およびR3は、独立して:
(i)任意選択によりQ1および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜3アルキル;または
(ii)シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキル(例えば、窒素原子を含有する4〜6員環、したがって、例えば、アゼチジニル基を形成する)を表し、それぞれが、任意選択によりQ3および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されており;
Q1およびQ3は、それぞれ独立して、
−任意選択により、ハロ、C1〜6アルキルおよび−OC1〜6アルキル(後の2つのアルキル部分は、それら自体、1つ以上のフルオロ原子により置換され得る)から選択される1つ以上の置換基により置換されているアリール(例えば、フェニル)
−任意選択により、本明細書において定義されているとおりに置換されているヘテロアリール(例えば、1または2つのヘテロ原子を含有する5または6員のヘテロアリール基、したがって、例えば、ピリジニル基またはチアゾリル基を形成する)(しかし、一態様では、このようなヘテロアリール基は非置換である)
−任意選択により、=Oおよびフルオロから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜6アルキル(例えば、C1〜3アルキル)(例えば、したがって、−C(O)−CF3基を形成する)
から選択される1つ以上の置換基を表し、
環Aは、少なくとも1つのヘテロ原子を含有する(好ましくは、少なくとも1つの窒素原子を含有する)5員芳香族環であり;
環Bは、任意選択により1〜4つのヘテロ原子(好ましくは、窒素、酸素および硫黄から選択される)を含有する芳香族または非芳香族であり得る5または6員環であり;
環Aおよび/または環Bのいずれも、任意選択によりハロ、C1〜6アルキル(任意選択により1つ以上のハロ、例えば、フルオロ原子により置換されている)および/または−OC1〜6アルキル(それ自体、任意選択により1つ以上のフルオロ原子により置換されている)から選択される1つ以上の置換基により置換され得る)
またはその薬学的に許容される塩。 - 結核の治療に使用するための式(I)の化合物
(式中、
R1はC1〜6アルキルまたは水素を表し;
L1はリンカー基−C(Ra)(Rb)−を表し;
X1は任意選択の炭素環芳香族リンカー基(そのリンカー基は、それ自体、任意選択によりフルオロ、−OH、
−OC1〜6アルキルおよびC1〜6アルキルから選択される1つ以上の置換基により置換され得、後の2つのアルキル部分は、それら自体、任意選択により1つ以上のフルオロ原子により置換されている)を表し;
RaおよびRbは、独立して、水素またはC1〜6アルキル(任意選択により1つ以上のフルオロ原子により置換されている)を表し;
R2およびR3は:
(i)独立して、任意選択によりQ1および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜6アルキルを表し;
(ii)独立して、アリールまたはヘテロアリールを表し、それぞれが、任意選択によりQ2から選択される1つ以上の置換基により置換されており;または
(iii)独立して、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを表し、それぞれが、任意選択によりQ3および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されており;
Q1、Q2およびQ3は、それぞれ独立して、ハロ、C1〜6アルキル、−OC1〜6アルキル(後の2つのアルキル部分は、それら自体、任意選択により=Oおよびハロ、例えば、フルオロ原子から選択される1つ以上の置換基により置換され得る)、アリールおよびヘテロアリール(後の2つの芳香族基は、それら自体、任意選択によりハロ、C1〜6アルキルおよび−OC1〜6アルキル(後の2つのアルキル部分は、それら自体、1つ以上のフルオロ原子により置換され得る)から選択される1つ以上の置換基により置換され得る)から選択される1つ以上の置換基を表し;
環Aは、少なくとも1つのヘテロ原子を含有する(好ましくは、少なくとも1つの窒素原子を含有する)5員芳香族環であり;
環Bは、任意選択により1〜4つのヘテロ原子(好ましくは、窒素、酸素および硫黄から選択される)を含有する芳香族または非芳香族であり得る5または6員環であり;
環Aおよび/または環Bのいずれも、任意選択によりハロ、C1〜6アルキル(任意選択により1つ以上のハロ、例えば、フルオロ原子により置換されている)および/または−OC1〜6アルキル(それ自体、任意選択により1つ以上のフルオロ原子により置換されている)から選択される1つ以上の置換基により置換され得る)
またはその薬学的に許容される塩。 - 請求項1または請求項2に記載された使用のための化合物であって、
R1が水素を表し;
RaおよびRbが、独立して、水素を表し;かつ/または
L1が−CH2−を表す、化合物。 - 請求項1〜4のいずれか一項に記載の化合物であって、
R2およびR3が:
(i)独立して、任意選択によりQ1および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜3アルキルを表し;
(ii)独立して、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを表し、それぞれが、任意選択によりQ3および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されており;かつ/または
Q1、Q2およびQ3が、それぞれ独立して、任意選択により、ハロ、C1〜6アルキルおよび−OC1〜6アルキル(後の2つのアルキル部分は、それら自体、1つ以上のフルオロ原子により置換され得る)から選択される1つ以上の置換基により置換されているアリール(例えば、フェニル)から選択される1つ以上の置換基を表す、化合物。 - 請求項1に記載の式(I)の化合物であるが、
L1が−CH2−を表し;
R2およびR3の1つが:
−シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキル(例えば、窒素原子を含有する4〜6員環、したがって、例えば、アゼチジニル基を形成する)を表し、それぞれが、任意選択によりQ3および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されており;かつ
−他の1つ(R2またはR3の1つ)が、任意選択により、Q1および=Oから選択される1つ以上の置換基により置換されているC1〜6(例えば、C1〜3アルキル)を表す、化合物。 - 請求項8に記載の化合物であって、
R2またはR3がシクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルを表す場合、そのような環式基は、Q3から選択される少なくとも1つの置換基により置換されており;
Q3が、アリールまたはヘテロアリールを表し、両方とも任意選択により請求項1において定義されているとおりに置換されている、化合物。 - 請求項8または請求項9に記載の化合物であって、
環Aおよび環Bが、互いに少なくとも1つの窒素原子(および主要な実施形態において、両方の環に共通する少なくとも1つの窒素原子)を含有する8または9員二環式環(環Aは5員環であり、かつ環Bは5または6員環であり得、両方の環は、好ましくは、芳香族である)を表し;
環Aおよび環B上の任意選択の置換基が、ハロ、C1〜3アルキルおよび−OC1〜3アルキルであり;かつ
他の整数が本明細書において定義されているとおりである、化合物。 - 医薬品として使用するための請求項8〜10のいずれか一項に記載の化合物。
- 薬学的に許容される担体および活性成分として、治療有効量の請求項8〜10のいずれか一項に定義される化合物を含む医薬組成物。
- 結核の治療に使用するための、請求項8〜10のいずれか一項に記載の化合物。
- 結核の治療用薬剤の製造のための、請求項1〜10のいずれか一項に記載の化合物の使用。
- 細菌感染の治療の方法であって、前記方法が、治療有効量の請求項1〜10のいずれか一項に記載の化合物の投与を含む、方法。
- (a)請求項1〜10のいずれか一項に記載の化合物と、(b)1つ以上の他の抗結核薬との組合せ。
- 細菌感染の治療における同時使用、個別使用または逐次使用のための組合せ製剤としての(a)請求項1〜10のいずれか一項に記載の化合物と、(b)1つ以上の他の抗結核薬を含有する製品。
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