JP2018504378A - 免疫修飾因子 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2014年12月19日に提出した米国仮出願番号第62/094,281号に対する優先権を主張するものであって、その全てを参照により本明細書に組み込むものである。
[式中、
Aは、結合、
zは、0、1、または2である;
wは、1または2であり;
nは、0または1であり;
mは、1または2であり;
m’は、0または1であり;
pは、0、1または2であり;
Rxは、水素、アミノ、ヒドロキシおよびメチルから選択され;
R14およびR15は、水素およびメチルから独立して選択され;および
Rzは、水素および−C(O)NHR16から選択され;ここでR16は、水素、−CHR17C(O)NH2、−CHR17C(O)NHCHR18C(O)NH2および−CHR17C(O)NHCHR18C(O)NHCH2C(O)NH2から選択され;ここでR17は、水素および−CH2OHから選択され、ここでR18は、水素およびメチルから選択され;
Rvは、水素または天然のアミノ酸側鎖であり;
Rc、Rf、Rh、RiおよびRmは、水素であり;
Rnは、水素またはメチルであるか、あるいはRvおよびRnは、ピロリジン環を形成しており;
Ra、Re、RjおよびRkは、水素およびメチルから各々独立して選択され;
各R20は、水素およびC1−C6アルキルから独立して選択され;
各R21は、水素およびC1−C6アルキルから独立して選択され;
R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12およびR13は、天然のアミノ酸側鎖および非天然のアミノ酸側鎖から独立して選択されるか、あるいは3〜6員炭素環式環あるいは対応するジェミナルR20基と共に酸素または窒素原子を含有する6員環を各々独立して形成することができ、ここで該環は、C1−C3アルコキシ、C1−C3アルキル、C2−C4アルケニル、ハロ、ヒドロキシおよびアミノから独立して選択される1、2または3つの置換基で所望により置換されていてもよく、ここで該5および6員環は、フェニル環と所望により縮合されていてもよく;あるいは
R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12およびR13は、各々独立して、以下に記載した通りの対応するビシナルR基と共に環を形成していてもよい;
ReおよびRkは、対応するビシナルR基およびそれらに結合している原子と共に、
アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジンおよびテトラヒドロチアゾールから選択される環を各々形成する;ここで各環は、所望により、アミノ、シアノ、メチル、ハロおよびヒドロキシから独立して選択される1〜4つの基で置換されていてもよく;
Rbはメチルであるか、あるいはRbおよびR2は、それらに結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジンおよびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成しており;ここで各環は、所望により、アミノ、シアノ、メチル、ハロおよびヒドロキシから独立して選択される1〜4つの基で置換されていてもよく;または、R2およびジェミナルR20が双方水素以外である場合、Rbは水素である;
Rdは、水素またはメチルであるか、あるいはRdおよびR4は、それらに結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジンおよびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成することができ;ここで各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ヒドロキシおよびフェニルから独立して選択される1〜4つの基で所望により置換されていてもよく;
Rgは、水素またはメチルであるか、あるいはRgおよびR7は、それらに結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジンおよびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成することができ;ここで各環は、アミノ、ハロ基で所望により置換されていてもよいベンジル、ベンジルオキシ、シアノ、シクロヘキシル、メチル、ハロ、ヒドロキシ、メトキシ基で所望により置換されていてもよいイソキノリニルオキシ、ハロ基で所望により置換されていてもよいキノリニルオキシおよびテトラゾリルから独立して選択される1〜4つの基で置換されていてもよく;ここで該ピロリジンおよび該ピペリジン環は、シクロヘキシル、フェニルまたはインドール基と所望により縮合していてもよく;および
Rlは、メチルであるか、あるいはRlおよびR12は、それらに結合している原子と一緒になって、アゼチジンおよびピロリジンから選択される環を形成しており、ここで各環は、所望により、アミノ、シアノ、メチル、ハロおよびヒドロキシから独立して選択される1〜4つの基で置換されていてもよい;
但し、式(I)の化合物は、水素以外の4つの置換基を有しており、かつα−メチル置換された環ではない環の骨格上に少なくとも1つの炭素を含有する]
の化合物、またはその医薬的に許容される塩を提供する。
(式中、Aは、特許請求の範囲に記載したような環であって、かつ
のα−メチル置換された環ではない環の骨格上に少なくとも1つの炭素が存在する。
C2−C7アルケニル、C1−C3アルコキシC1−C3アルキル、C1−C6アルコキシカルボニルC1−C3アルキル、C1−C7アルキル、C1−C3アルキルスルファニルC1−C3アルキル、アミドC1−C3アルキル、アミノC1−C3アルキル、アザインドリルC1−C3アルキル、ベンゾチアゾリルC1−C3アルキル、ベンゾチエニルC1−C3アルキル、ベンジルオキシC1−C3アルキル、カルボキシC1−C3アルキル、C3−C14シクロアルキルC1−C3アルキル、ジフェニルメチル、フラニルC1−C3アルキル、イミダゾリルC1−C3アルキル、ナフチルC1−C3アルキル、ピリジニルC1−C3アルキル、チアゾリルC1−C3アルキル、チエニルC1−C3アルキル;
ビフェニルC1−C3アルキル:前記ビフェニルは、メチル基で所望により置換されていてもよい;
ヘテロサイクリル:これは、C1−C4アルコキシ、C1−C4アルキル、C1−C3アルキルスルホニルアミノ、アミド、アミノ、アミノC1−C3アルキル、アミノスルホニル、カルボキシ、シアノ、ハロ、ハロC1−C3アルキル、ヒドロキシ、−NC(NH2)2、ニトロおよび−OP(O)(OH)2から独立して選択される1、2、3、4または5つの基で所望により置換されていてもよい;
インドリルC1−C3アルキル:前記インドリル部分は、C1−C3アルキル、カルボキシC1−C3アルキル、ハロ、ヒドロキシおよびフェニルから選択される1つの基で所望により置換されていてもよい、ここで前記フェニルは、C1−C3アルコキシ、C1−C3アルキルおよびハロから独立して選択される1、2または3つの基により所望により更に置換されていてもよく;
NRyRy’(C1−C7アルキル)、ここでRyおよびRy’は、水素、C2−C4アルケニルオキシカルボニル、C1−C3アルキル、C1−C3アルキルカルボニル、C3−C14シクロアルキルカルボニル、フラニルカルボニルおよびフェニルカルボニルから独立して選択される。アルキルリンカーが1以上の炭素を含有する場合、追加のNRyRy’基は、鎖上に存在し得る;
NRqRtカルボニルC1−C3アルキル、ここでRqおよびRtは、水素、C1−C3アルキルおよびトリフェニルメチルから独立して選択される;
フェニル:C1−C4アルコキシ、C1−C4アルキル、C1−C3アルキルスルホニルアミノ、アミド、アミノ、アミノC1−C3アルキル、アミノスルホニル、カルボキシ、シアノ、ハロ、ハロC1−C3アルキル、ヒドロキシ、−NC(NH2)2、ニトロおよび−OP(O)(OH)2から独立して選択される1、2、3、4または5つの基で所望により置換されていてもよく;
NRa’Rb’(C1−C7アルキル)、ここでRa’およびRb’は、水素、C2−C4アルケニルオキシカルボニル、C1−C3アルキル、C1−C3アルキルカルボニル、C3−C6シクロアルキルカルボニル、フラニルカルボニルおよびフェニルカルボニルから独立して選択される。アルキルリンカーが1以上の炭素を含有する場合、追加のNRa’Rb’基 は、鎖上に存在し得る;
NRc’Rd’カルボニルC1−C3アルキル、ここでRc’およびRd’は、水素、C1−C3アルキルおよびトリフェニルメチルから独立して選択される;
フェニルC1−C3アルキル、ここで前記フェニル部分は、C1−C4アルコキシ、C1−C4アルキル、C1−C3アルキルスルホニルアミノ、アミド、アミノ、アミノC1−C3アルキル、アミノスルホニル、カルボキシ、シアノ、ハロ、ハロC1−C3アルキル、ヒドロキシ、−NC(NH2)2、ニトロおよび−OP(O)(OH)2から独立して選択される1、2、3、4または5つの基で所望により置換されていてもよい;および
フェノキシC1−C3アルキル:ここで前記フェニルは、C1−C3アルキル基で所望により置換されていてもよい。
本明細書で使用する用語“アミノ”は、−NH2をいう。
本明細書で使用する用語“カルボキシ”は、−CO2Hをいう。
本明細書で使用する用語“シアノ”は、−CNをいう。
GENBANK(登録商標)Accession No. U64863として存在し得る。
本発明はまた、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%および少なくとも約100%まで、参照抗PD−L1抗体(MDX−1105)の結合と競合できる大環状ペプチドに関する。このような大環状ペプチドは、PD−L1と特異的に結合する限り、変異体、保存的置換、機能的置換および欠失形態を含む1個以上の本明細書に開示する大環状ペプチドと構造相同性を共有し得る。例えば、大環状ペプチドがPD−L1の参照抗PD−L1抗体と同じ領域に実質的に結合するならば、大環状ペプチドは、抗PD−L1モノクローナル抗体が結合するPD−L1エピトープと少なくとも部分的に一致(重複)するPD−L1のエピトープと結合するはずである。重複領域は、アミノ酸残基から数百アミノ酸残基の範囲であり得る。そうであれば、大環状ペプチドは、抗PD−L1モノクローナル抗体のPD−L1への結合と競合および/または遮断し、それにより抗PD−L1モノクローナル抗体のPD−L1への結合を、競合アッセイにおいて好ましくは少なくとも約50%減少させるはずである。
別の局面において、本発明は、本発明の大環状ペプチドを1個または組み合わせて含み、医薬的に許容される担体と共に製剤された組成物、例えば、医薬組成物を提供する。このような組成物は、本発明の1個または複数の(2以上の異なる)大環状ペプチドまたは免疫コンジュゲートまたは二重特異性分子を含み得る。例えば、本発明の医薬組成物は、標的抗原上の異なるエピトープに結合するか、または相補的活性を有する大環状ペプチド(または免疫コンジュゲートまたは二重特異性物質)の組み合わせを含み得る。
本発明の大環状ペプチド、組成物および方法は、例えば、PD−L1検出またはPD−L1遮断による免疫応答を含む、多くのインビトロおよびインビボ有用性を有する。例えば、これらの分子を、培養細胞に、インビトロまたはエクスビボで、またはヒト対象に、例えば、インビボで投与し、様々な状況での免疫を増強する。したがって、一つの面において、本発明は、本発明の大環状ペプチドを、対象における免疫応答が修飾されるように対象に投与することを特徴とする、対象における免疫応答を修飾する方法を提供する。好ましくは、応答は、増強、刺激または上方制御される。他の点では、大環状ペプチドは、抗カニクイザル、抗マウスおよび/または抗マーモット(woodchuck)結合活性および治療活性を有し得る。
大環状ペプチドによるPD−1の遮断は、患者における癌細胞に対する免疫応答を増強できる。PD−1に対するリガンドであるPD−L1は、正常なヒトの細胞では発現されないが、多様なヒトの癌において多く存在する(Dong et al., Nat. Med., 8:787−789(2002))。PD−1とPD−L1の相互作用は、腫瘍浸潤性リンパ球減少、T細胞受容体仲介増殖減少および癌細胞の免疫回避をもたらす(Dong et al., J. Mol. Med., 81:281−287(2003); Blank et al., Cancer Immunol. Immunother., 54:307−314(2005); Konishi et al., Clin. Cancer Res., 10:5094−5100(2004))。免疫抑制は、PD−1とPD−L1の局所相互作用の阻害により逆転され得て、PD−1とPD−L2の相互作用が同様に遮断されたとき、この効果は相加的である(Iwai et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 99:12293−12297(2002); Brown et al., J. Immunol., 170:1257−1266(2003))。先の研究では、T細胞増殖が、PD−1のPD−L1への相互作用の阻害により回復できることが示されているが、PD−1/PD−L1相互作用の遮断によるインビボ癌腫瘍増殖に対する直接の効果についての報告はない。一つの面において、本発明は、癌性腫瘍の増殖が阻害されるように大環状ペプチドを使用するインビボでの対象の処置に関する。大環状ペプチドを、癌性腫瘍増殖阻害のために単独で使用してもよい。あるいは、大環状ペプチドを、下に記戴するとおり、他の免疫原性剤、標準的癌処置または他の大環状ペプチドと組み合わせて使用してもよい。
本発明の他の方法は、特定の毒素または病原体に曝されている患者の処置に使用される。したがって、本発明の他の面は、対象の感染性疾患が処置されるように、対象に本発明の大環状ペプチドを投与することを特徴とする、対象における感染性疾患の処置方法を提供する。
大環状ペプチドは自己免疫応答を誘発および増幅する。実際、腫瘍細胞およびペプチドワクチンを使用した抗腫瘍応答の誘発は、多くの抗腫瘍応答が抗自己反応性を含むことを示す(van Elsas et al., supraにおける抗CTLA−4+GM−CSF修飾B16黒色腫で観察される色素脱失;Trp−2ワクチン接種マウスにおける色素脱失(Overwijk, W. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96:2982−2987(1999));TRAMP腫瘍細胞ワクチンにより誘発される自己免疫性前立腺炎(Hurwitz, A., supra(2000))、ヒト臨床試験において見られる黒色腫ペプチド抗原ワクチン接種および白斑症(Rosenberg, S.A. et al., J. Immunother. Emphasis Tumor Immunol., 19(1):81−84(1996))。
大環状ペプチドを、抗PD−1大環状分子と目的の抗原(例えば、ワクチン)の共投与により抗原特異的免疫応答を刺激するために使用し得る。従って、他の面において、本発明は、対象における抗原に対する免疫応答を増強する方法であって、対象に(i)抗原;および(ii)対象における抗原に対する免疫応答が増強されるような抗PD−1大環状分子を投与することを特徴とする方法が提供される。抗原は、例えば、腫瘍抗原、ウイルス抗原、細菌抗原または病原体からの抗原であり得る。このような抗原の非限定的例は、上記の腫瘍抗原(または腫瘍ワクチン)または上記のウイルス、細菌または他の病原体からの抗原を含む。
本発明の大環状ペプチドと他のPD−L1アンタゴニストおよび/または別の免疫修飾剤の組み合わせは、過増殖性疾患に対する免疫応答の増強に有用である。例えば、これらの分子を、インビトロまたはエクスビボで培養中の細胞またはヒト対象に、例えばインビボで投与して、多様な状況における免疫を増強する。したがって、一つの面において、本発明は、本発明の大環状ペプチドを、対象における免疫応答が修飾されるように対象に投与することを特徴とする、対象における免疫応答を修飾する方法を提供する。好ましくは、応答は、増強、刺激または上方制御される。他の態様において、本発明は、対象に本発明の大環状ペプチドおよび別の免疫修飾剤の治療以下の投与量を投与することを特徴とする、免疫刺激性治療剤での過増殖性疾患の処置と関係する有害事象を変える方法を提供する。
適切な式Iのペプチドまたはより具体的には本明細書に記戴する大環状ペプチドを、化合物の単独および/または許容される担体との混合物で医薬製剤の形態で糖尿病および他の関連疾患の処置のために患者に投与できる。糖尿病処置の分野における当業者は、このような処置を必要とするヒトを含む哺乳動物への化合物の投与量および投与経路を容易に決定できる。投与経路は、経口、口腔内、直腸、経皮、バッカル、鼻腔内、肺、皮下、筋肉内、皮内、舌下、結腸内、眼内、静脈内または腸管投与を含むが、これらに限定されない。化合物を、認可された調剤実務に基づき、投与経路に従って製剤する(Fingl et al., in The Pharmacological Basis of Therapeutics, Chapter 1, p.1(1975); Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Edition, Mack Publishing Co., Easton, PA(1990))。
多くの単位カプセルを、100mgの粉末活性成分、150mgのラクトース、50mgのセルロースおよび6mgのステアリン酸マグネシウムを、標準的な2ピースの硬ゼラチンカプセルに注入することにより製造できる。
ダイズ油、綿実油またはオリーブ油のような消化可能油中の活性成分の混合物を製造し、ゼラチンに陽圧式排出ポンプにより注入して、100mgの活性成分を含む軟ゼラチンカプセルを製造する。カプセルは、洗浄および乾燥されるべきである。
錠剤を、投与量単位が、例えば100mgの活性成分、0.2mgのコロイド状二酸化ケイ素、5mgのステアリン酸マグネシウム、275mgの微結晶セルロース、11mgのデンプンおよび98.8mgのラクトースであるように、慣用の方法で製し得る。嗜好性を高めるため、または吸収を遅延するために適当なコーティングを施してよい。
本明細書に記戴するペプチド組成物の注射可能製剤は、規制機関により承認されているような添加物の使用を必要としても、または必要としない可能性がある。これらの添加物は、溶媒および共溶媒、可溶化、乳化または濃化剤、キレート剤、抗酸化剤および還元剤、抗微生物防腐剤、緩衝液およびpH調節剤、充填剤、保護剤および張性調節剤および特殊な添加物を含むが、これらに限定されない。注射可能製剤は、無菌、無発熱物質、溶液の場合、無粒状物質でなければならない。
水性懸濁液を、例えば、各々5mLが100mgの微粉化活性成分、20mgのナトリウムカルボキシメチルセルロース、5mgの安息香酸ナトリウム、1.0gのソルビトール溶液、U.S.P.および0.025mLのバニリンまたは別の味の良い風味剤を含む、経口および/または非経腸投与用として製造できる。
注射による投与に適する徐放性非経腸組成物は、例えば、適切な生分解性ポリマーを溶媒に溶解し、活性剤をポリマー溶液に添加して導入し、溶媒をマトリクスから除去し、それによりマトリクス中に活性剤が分散したポリマーのマトリクスを形成させることにより製造され得る。
本明細書の記述は、化学結合の法則および原理に即して解釈されるべきである。本開示に含まれる化合物は、医薬剤として使用するために適切で安定なものであると理解されるべきである。当業者は、化学結合および安定性についての一般原理に基づいて、化合物が安定であるもの、および安定でないものを知っている。
質量スペクトル分析法:“ESI−MS(+)”とは、ポジティブイオンモードで実施したエレクトロスプレーイオン化質量スペクトル分析法を示す;“ESI−MS(−)”とは、ネガティブイオンモードで実施したエレクトロスプレーイオン化質量スペクトル分析法を示す;“ESI−HRMS(+)”とは、ポジティブイオンモードで実施された高分解エレクトロスプレーイオン化質量スペクトル分析法を示す;“ESI−HRMS(−)”とは、ネガティブイオンモードで実施した高分解エレクトロスプレーイオン化質量スペクトル分析法を示す。検出された質量は、“m/z”単位表記に従って報告された。1000より大きい精密質量を有する化合物は、しばしば二重電荷イオンまたは三重電荷イオンとして検出された。
カラム:BEH C18,2.1 x 50 mm,1.7μm粒子;移動相A:水(0.05%TFAを含む);移動相B:アセトニトリル(0.05%TFAを含む);温度:50℃;グラジエント:2分かけて2%B〜98%B、次いで0.5分間98%Bで保持;流量:0.8mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:BEH C18,2.1 x 50 mm,1.7μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(0.05%TFAを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(0.05%TFAを含む);温度:50℃;グラジエント:3分かけて0〜100%B、次いで0.75分間100%Bで保持;流量:1.11mL/分.
カラム:BEH C18,2.1 x 50 mm,1.7μm粒子;移動相A:水(0.2%ギ酸および0.01%TFA);移動相B:アセトニトリル(0.2%ギ酸および0.01%TFAを含む);温度:50℃;グラジエント:2分かけて2%B〜80%B、0.1分かけて80%B〜98%B、次いで0.5分間98%Bで保持;流量:0.8mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18,2.1 x 50 mm,1.7μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);温度:50℃;グラジエント:3分かけて0〜100%B、次いで0.75分間100%Bで保持;流量:1.11mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18,2.1 x 50 mm,1.7μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(0.1%トリフルオロ酢酸を含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(0.1%トリフルオロ酢酸を含む);温度:50℃;グラジエント:3分かけて0〜100%B、次いで0.75分間100%Bで保持;流量:1.11mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:Waters Xbridge C18,2.1 x 50 mm;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);温度:35℃;グラジエント:4分かけて0〜100%B、次いで、1分間100%Bで保持;流量:4mL/分;検出:220nmのUV.
Finnigan LTQ Mass Spectrometer;カラム:Phenomenex Jupiter C4, 1 x 50 mm;移動相A:1%ギ酸/水;移動相B:0.1%ギ酸/アセトニトリル;温度:30℃;グラジエント:1%B、1分間保持;3分かけて1〜95%B、次いで3分間、95%Bで保持;流量:0.15mL/分.
カラム:Waters BEH C18,2.0 x 50 mm,1.7μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);温度:50℃;グラジエント:3分かけて0〜100%B、次いで100%Bで0.5分保持;流量:1.0mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:Waters BEH C18,2.0 x 50 mm,1.7μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);温度:50℃;グラジエント:3分かけて0〜100%B、次いで100%Bで0.5分保持;流量:0.5mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:YMC Pack ODS-AQ 3um 150 x 4.6mm;移動相A:水(0.1%TFAを含む);移動相B:アセトニトリル(0.1%TFAを含む);温度:60℃;グラジエント:25分かけて35%B〜80%B;流量:1mL/分;検出:217nmのUV.
カラム:YMC Pack ODS-AQ 3um 150 x 4.6mm;移動相A:水(0.1%TFAを含む);移動相B:アセトニトリル(0.1%TFAを含む);温度:60℃;グラジエント:25分かけて25%B〜75%B;流量:1mL/分;検出:217nmのUV.
カラム:YMC Pack ODS-AQ 3um 150 x 4.6mm;移動相A:水(0.1%TFAを含む);移動相B:アセトニトリル(0.1%TFAを含む);温度:60℃;グラジエント:25分かけて20%B〜70%B;流量:1mL/分;検出:217nmのUV.
カラム:YMC Pack ODS-AQ 3um 150 x 4.6mm;移動相A:水(0.1%TFAを含む);移動相B:アセトニトリル(0.1%TFAを含む);温度:60℃;グラジエント:25分かけて15%B〜65%B;流量:1mL/分;検出:217nmのUV.
カラム:YMC Pack ODS-AQ 3um 150 x 4.6mm;移動相A:水(0.1%TFAを含む);移動相B:アセトニトリル(0.1%TFAを含む);温度:60℃;グラジエント:20分かけて25%B〜60%B;流量:1.25mL/分;検出:217nmのUV.
カラム:YMC Pack ODS-AQ 3um 150 x 4.6mm;移動相A:水(0.1%TFAを含む);移動相B:アセトニトリル(0.1%TFAを含む);温度:60℃;グラジエント:20分かけて25%B〜65%B;流量:1.25mL/分;検出:217nmのUV
カラム:Sunfire C18 3.5um, 3.0 x 150mm;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(0.05%トリフルオロ酢酸を含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(0.05%トリフルオロ酢酸を含む);温度:50℃;グラジエント:12分かけて10〜100%B、次いで3分間100%Bで保持;流量:1mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:Xbridge Phenyl 3.5 x 150um,移動相A:5:95 アセトニトリル:水(0.05%トリフルオロ酢酸を含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(0.05%トリフルオロ酢酸を含む);温度:50℃;グラジエント:12分かけて10〜100%B、次いで3分間100%Bで保持;流量:1mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:Phenomenex Luna 5u C18(2)150 x 4.6 mm;移動相A:水(0.1%トリフルオロ酢酸を含む);移動相B:アセトニトリル(0.1%トリフルオロ酢酸を含む);グラジエント:20分かけて5〜100%B、次いで100%Bで5分間保持;流量1mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:Phenomenex Luna 5u C18(2)150 x 4.6 mm;移動相A:水(0.1%トリフルオロ酢酸を含む);移動相B:アセトニトリル(0.1%トリフルオロ酢酸を含む);グラジエント:20分かけて10〜100%B、次いで100%Bで5分間保持;流量1mL/分,検出:220nmのUV.
Prelude方法A:
全ての操作を、Preludeペプチド合成器(Protein Technologies)上でのオートメーション下で行った。全ての方法を、別段の記載が無ければ、底部フリットを取り付けた10または45mLポリプロピレンチューブ内で行なった。このチューブは、チューブの底部と上部の双方を介してPreludeペプチド合成器に連結している。DMFおよびDCMを、チューブの上部から加えて、チューブの側面を均等に洗い流すことができる。残存試薬を、チューブ底部から加えて、フリットを通過させて、樹脂と接触させる。全ての溶液を、チューブの底部から除去した。“周期的攪拌”とは、底部フリットからのN2ガスの短いパルスを意味する;このパルスは、おおよそ5秒間継続させ、30秒毎におこる。アミノ酸溶液を、通常は、調整してから3週間を過ぎて使用しない。DMF=ジメチルホルムアミド;DIC=N,N’−ジイソプロピルカルボジイミド;HOAt=1−ヒドロキシ 7−アザベンゾトリアゾール;Sieber=Fmoc−アミノ−キサンテン−3−イルオキシ、ここで“3−イルオキシ”は、ポリスチレン樹脂への結合性に関する位置およびタイプを示す。使用した樹脂は、Sieberリンカーを有するMerrifieldポリマー(ポリスチレン)である(窒素にてFmoc保護);100〜200メッシュ,1%DVB,0.71mmol/gローディング。使用した一般的なアミノ酸は、下記に列挙した(側鎖保護基は括弧内に示した):Fmoc−Ala−OH;Fmoc−Arg(Pbf)−OH;Fmoc−Asn(Trt)−OH;Fmoc−Asp(OtBu)−OH;Fmoc−Bzt−OH;Fmoc−Cys(Trt)−OH;Fmoc−Dab(Boc)−OH;Fmoc−Dap(Boc)−OH;Fmoc−Gln(Trt)−OH;Fmoc−Gly−OH;Fmoc−His(Trt)−OH;Fmoc−Hyp(tBu)−OH;Fmoc−Ile−OH;Fmoc−Leu−OH;Fmoc−Lys(Boc)−OH;Fmoc−Nle−OH;Fmoc−Met−OH;Fmoc−[N−Me]Ala−OH;Fmoc−[N−Me]Nle−OH;Fmoc−Phe−OH;Fmoc−Pro−OH;Fmoc−Sar−OH;Fmoc−Ser(tBu)−OH;Fmoc−Thr(tBu)−OH;Fmoc−Trp(Boc)−OH;Fmoc−Tyr(tBu)−OH;Fmoc−Val−OH.
40mLのポリプロピレン固相反応容器に、Merrifield:Sieber樹脂(140mg,0.100mmol)を加えた。樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(5.0mL)およびDCM(5.0mL)を加えて、この混合物に、10分間反応容器の底部からN2バブリングにより周期的に攪拌して、溶媒を排出した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、周期的に60秒間撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸およびHOAt(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)の溶液、次いでDIC(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)を加えた。混合物を、60分間周期的に撹拌して、次いで反応溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、周期的に60秒間撹拌して、その後この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸およびHOAt(DMF中で0.2M,5.0mL,5等量)の溶液、次いでDIC(DMF中で0.2M,5.0mL,5等量)を加えた。混合物を、300分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、その後この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、その後この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、DMF中のDIPEA(4.0mmol,0.699mL,40等量)およびクロロアセチルクロリド(2.0mmol,0.160mL,20等量)溶液(3.0mL)を加えた。混合物を、周期的に12〜18時間撹拌して、次いで溶液を排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、溶液を排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DCM(4.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、その後溶液を排出した。
全ての操作を、Preludeペプチド合成器(Protein Technologies)でオートメーションの下で行った。全ての方法を、底部フリットを備え付けた10または45mL ポリプロピレンチューブ内で行った。DMFおよびDCMを、チューブの上部から加えて、チューブの側面を均等に洗い流すことができる。残存する試薬を、チューブ底部から加えて、フリットを通過させて、樹脂と接触させる。全ての溶液を、チューブの底部から除去した。“周期的攪拌”とは、底部フリットからのN2ガスの短いパルスを意味する;このパルスは、おおよそ5秒続き、30秒毎におこる。アミノ酸溶液を、通常は、調整してから3週間を過ぎて使用しない。DMF=ジメチルホルムアミド;HCTU=2−(6−クロロ−1−H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム;DIPEA=ジイソプロピルエチルアミン;Sieber=Fmoc−アミノ−キサンテン−3−イルオキシ、この場合“3−イルオキシ”とは、ポリスチレン樹脂との結合の位置およびタイプを示す。使用した樹脂は、Sieberリンカーを有するMerrifieldポリマー(ポリスチレン)である(窒素にてFmoc保護);100〜200メッシュ,1%DVB,0.71mmol/gローディング。使用した一般的なアミノ酸を以下に挙げた(側鎖保護基は括弧内に示した)。Fmoc−Ala−OH;Fmoc−Arg(Pbf)−OH;Fmoc−Asn(Trt)−OH;Fmoc−Asp(OtBu)−OH;Fmoc−Bzt−OH;Fmoc−Cys(Trt)−OH;Fmoc−Dab(Boc)−OH;Fmoc−Dap(Boc)−OH;Fmoc−Gln(Trt)−OH;Fmoc−Gly−OH;Fmoc−His(Trt)−OH;Fmoc−Hyp(tBu)−OH;Fmoc−Ile−OH;Fmoc−Leu−OH;Fmoc−Lys(Boc)−OH;Fmoc−Nle−OH;Fmoc−Met−OH;Fmoc−[N−Me]Ala−OH;Fmoc−[N−Me]Nle−OH;Fmoc−Phe−OH;Fmoc−Pro−OH;Fmoc−Sar−OH;Fmoc−Ser(tBu)−OH;Fmoc−Thr(tBu)−OH;Fmoc−Trp(Boc)−OH;Fmoc−Tyr(tBu)−OH;Fmoc−Val−OH。
40mLのポリプロピレン固相反応容器に、Merrifield:Sieber樹脂(140mg,0.100mmol)を加えた。樹脂を、下記の通りに3回洗った(膨潤させた):反応容器に、DMF(5.0mL)およびDCM(5.0mL)を加えて、この混合物を、10分間、反応容器の底部からN2バブリングにより周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、周期的に60秒間撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)、次いでHCTU(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,2.5mL,20等量)を加えた。混合物を、30分周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、周期的に60秒間撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)、次いでHCTU(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,2.5mL,20等量)を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、容器の上部から連続して3回DMF(4.0mL)で洗い、得られる混合物を、周期的に60秒間撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)、次いでHCTU(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,2.5mL,20等量)を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,2.5mL,10等量)、次いでHCTU(DMF中で0.2M,2.5mL,10等量)、最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.5mL,12等量)を加えた。混合物を、周期的に12時間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、DMF中のDIPEA(4.0mmol,0.699mL,40等量)およびクロロアセチルクロリド(2.0mmol,0.160mL,20等量)の溶液(3.0mL)を加えた。混合物を、周期的に12〜18時間撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、CH2Cl2(2.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、DMF(2.0mL)、クロロ酢酸(1.2mmol,113mg,12等量)およびN,N'−ジイソプロピルカルボジイミド(1.2mmol,0.187mL,12等量)を加えた。混合物を、周期的に12〜18時間撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、CH2Cl2(2.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。
全ての操作を、Preludeペプチド合成器(Protein Technologies)でオートメーションの下で行った。全ての方法を、底部フリットを取り付けた10または45mL ポリプロピレンチューブ内で行った。このチューブは、チューブの底部と上部の双方を介してPreludeペプチド合成器に連結している。DMFおよびDCMを、チューブの上部から加えて、チューブの側面を均等に洗い流すことができる。残存する試薬を、チューブの底部から添加して、フリットを通して樹脂と接触させる。全ての溶液を、チューブの底部から除去する。“周期的攪拌”とは、底部フリットからのN2ガスの短時間のパルスを意味する;このパルスは、おおよそ5秒続き、30秒毎におこる。アミノ酸溶液を、一般的には、調整してから3週間を超えて使用しない。HATU溶液を、調製5日以内で使用した。DMF=ジメチルホルムアミド;HCTU=2−(6−クロロ−1−H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム;HATU=1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム3−オキシドヘキサフルオロリン酸塩;DIPEA=ジイソプロピルエチルアミン;Sieber=Fmoc−アミノ−キサンテン−3−イルオキシ、この場合“3−イルオキシ”とは、ポリスチレン樹脂との結合の位置およびタイプを示す。使用した樹脂は、Sieberリンカーを有するMerrifieldポリマー(ポリスチレン)である(窒素にてFmoc保護);100〜200メッシュ,1%DVB,0.71mmol/g ローディング。使用した一般的なアミノ酸を以下に挙げた(側鎖保護基は括弧内に示した)。Fmoc−Ala−OH;Fmoc−Arg(Pbf)−OH;Fmoc−Asn(Trt)−OH;Fmoc−Asp(OtBu)−OH;Fmoc−Bzt−OH;Fmoc−Cys(Trt)−OH;Fmoc−Dab(Boc)−OH;Fmoc−Dap(Boc)−OH;Fmoc−Gln(Trt)−OH;Fmoc−Gly−OH;Fmoc−His(Trt)−OH;Fmoc−Hyp(tBu)−OH;Fmoc−Ile−OH;Fmoc−Leu−OH;Fmoc−Lys(Boc)−OH;Fmoc−Nle−OH;Fmoc−Met−OH;Fmoc−[N−Me]Ala−OH;Fmoc−[N−Me]Nle−OH;Fmoc−Phe−OH;Fmoc−Pro−OH;Fmoc−Sar−OH;Fmoc−Ser(tBu)−OH;Fmoc−Thr(tBu)−OH;Fmoc−Trp(Boc)−OH;Fmoc−Tyr(tBu)−OH;Fmoc−Val−OH。
40mLのポリプロピレン固相反応容器に、Merrifield:Sieber樹脂(140mg,0.100mmol)を加えた。樹脂を、下記の通りに3回洗った(膨潤させた):反応容器に、DMF(5.0mL)およびDCM(5.0mL)を加えて、この混合物を、10分間、反応容器の底部からN2バブリングにより周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、周期的に60秒間撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,5.0mL,10等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,2.5mL,20等量)を加えた。混合物を、60分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,1.5mL,12等量)を加えた。混合物を、300分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記のとおりに2回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,1.5mL,12等量)を加えた。混合物を、300分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記のとおりに2回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,0.5〜2.5mL,1〜5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,0.5〜2.5mL,1〜5等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,0.5〜1.5mL,4〜12等量)を加えた。混合物を、60分〜600分間周期的に撹拌して、次いで反応溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記のとおりに2回洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
樹脂を、下記の通りに2回連続的に洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DCM(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
Noteマニュアル工程。先の工程からの樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、室温で5分間振盪して、次いで、この溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、DMF(2.0mL)、クロロ酢酸(1.2mmol,113mg,12等量)およびN,N'−ジイソプロピルカルボジイミド(1.2mmol,0.187mL,12等量)を加えた。混合物を、室温で12〜18時間振盪して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を90秒間撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、CH2Cl2(4.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。
全ての操作を、Preludeペプチド合成器(Protein Technologies)でオートメーションの下で行った。全ての方法を、底部フリットを取り付けた10または45mLポリプロピレンチューブ内で行った。このチューブは、チューブの底部と上部の双方を介してPreludeペプチド合成器に連結している。DMFおよびDCMを、チューブの上部から加えて、チューブの側面を均等に洗い流すことができる。残存する試薬を、チューブの底部から添加して、フリットを通して樹脂と接触させる。全ての溶液を、チューブの底部から除去する。“周期的攪拌”とは、底部フリットからのN2ガスの短時間のパルスを意味する;このパルスは、おおよそ5秒続き、30秒毎におこる。アミノ酸溶液を、一般的には、調整してから3週間を超えて使用しない。HATU溶液を、調製5日以内で使用した。DMF=ジメチルホルムアミド;HCTU=2−(6−クロロ−1−H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム;HATU=1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム3−オキシドヘキサフルオロリン酸塩;DIPEA=ジイソプロピルエチルアミン;Sieber=Fmoc−アミノ−キサンテン−3−イルオキシ、この場合“3−イルオキシ”とは、ポリスチレン樹脂との結合の位置およびタイプを示す。使用した樹脂は、Sieberリンカーを有するMerrifieldポリマー(ポリスチレン)である(窒素にてFmoc保護);100〜200メッシュ、1%DVB、0.71mmol/g ローディング。使用した一般的なアミノ酸を以下に挙げた(側鎖保護基は括弧内に示した)。Fmoc−Ala−OH;Fmoc−Arg(Pbf)−OH;Fmoc−Asn(Trt)−OH;Fmoc−Asp(OtBu)−OH;Fmoc−Bzt−OH;Fmoc−Cys(Trt)−OH;Fmoc−Dab(Boc)−OH;Fmoc−Dap(Boc)−OH;Fmoc−Gln(Trt)−OH;Fmoc−Gly−OH;Fmoc−His(Trt)−OH;Fmoc−Hyp(tBu)−OH;Fmoc−Ile−OH;Fmoc−Leu−OH;Fmoc−Lys(Boc)−OH;Fmoc−Nle−OH;Fmoc−Met−OH;Fmoc−[N−Me]Ala−OH;Fmoc−[N−Me]Nle−OH;Fmoc−Phe−OH;Fmoc−Pro−OH;Fmoc−Sar−OH;Fmoc−Ser(tBu)−OH;Fmoc−Thr(tBu)−OH;Fmoc−Trp(Boc)−OH;Fmoc−Tyr(tBu)−OH;Fmoc−Val−OH.
40mLのポリプロピレン固相反応容器に、Merrifield:Sieber樹脂(140mg,0.100mmol)を加えた。樹脂を、下記の通りに3回洗った(膨潤させた):反応容器に、DMF(5.0mL)およびDCM(5.0mL)を加えて、この混合物を、10分間、反応容器の底部からN2バブリングにより周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、周期的に60秒間撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,2.5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,2.5等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,0.75mL,5等量)を加えた。混合物を、30分周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,2.5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,2.5等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,0.75mL,5等量)を加えた。混合物を、30分周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記のとおりに2回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ(DMF中で0.2M,1.25mL,2.5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,2.5等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,0.75mL,5等量)を加えた。混合物を、30分周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記のとおりに2回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記のとおりに2回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、周期的に30秒間撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
樹脂を、下記の通りに2回連続的に洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DCM(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
Noteマニュアル工程。先の工程からの樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、室温で5分間振盪して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、DMF(2.0mL)、クロロ酢酸(1.2mmol,113mg,12等量)およびN,N'−ジイソプロピルカルボジイミド(1.2mmol,0.187mL,12等量)を加えた。混合物を、室温で12〜18時間撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を90秒間撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、CH2Cl2(4.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、その後この溶液をフリットから排出した。
全ての操作を、CEMライブラリー・マイクロウェーブ・ペプチド合成器(CEM Corporation)でオートメーションの下に行った。全ての方法を、別段の記載が無ければ、CEMディスカバリーマイクロウェーブユニットに底部フリットを取り付けた30または125mLポリプロピレンチューブ内で行った。このチューブは、チューブの底部と上部の双方を介してCEMリバティー合成器と連結している。DMFおよびDCMは、チューブの上部および底部から加えられ、チューブの側面を均等に洗い流すことができる。全ての溶液を、上部から樹脂を移すことを除いて、チューブの底部から除去した。“周期的バブリング”とは、底部フリットからのN2ガスの短時間のバブリングをいう。アミノ酸溶液を、一般的には、調整してから3週間を超えて使用しない。HATU溶液を、調製5日以内で使用した。DMF=ジメチルホルムアミド;HCTU=2−(6−クロロ−1−H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム;HATU=1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム3−オキシドヘキサフルオロリン酸塩;DIPEA=ジイソプロピルエチルアミン;Sieber=Fmoc−アミノ−キサンテン−3−イルオキシ、この場合“3−イルオキシ”とは、ポリスチレン樹脂との結合の位置およびタイプを示す。使用した樹脂は、Sieberリンカーを有するMerrifieldポリマー(ポリスチレン)である(窒素にてFmoc保護)。;100〜200メッシュ,1%DVB,0.71mmol/gローディング。その他の一般的な樹脂、例えば、Rink、クロロトリチルまたは他の酸感受性リンカーを、合成に用いることができ、Seiberアミド樹脂を、別段の記載が無ければ、特定の実施形態に使用した。使用した一般的なアミノ酸を以下に挙げた(側鎖保護基は括弧内に示した)。Fmoc−Ala−OH;Fmoc−Arg(Pbf)−OH;Fmoc−Asn(Trt)−OH;Fmoc−Asp(OtBu)−OH;Fmoc−Bzt−OH;Fmoc−Cys(Trt)−OH;Fmoc−Dab(Boc)−OH;Fmoc−Dap(Boc)−OH;Fmoc−Gln(Trt)−OH;Fmoc−Gly−OH;Fmoc−His(Trt)−OH;Fmoc−Hyp(tBu)−OH;Fmoc−Ile−OH;Fmoc−Leu−OH;Fmoc−Lys(Boc)−OH;Fmoc−Nle−OH;Fmoc−Met−OH;Fmoc−[N−Me]Ala−OH;Fmoc−[N−Me]Nle−OH;Fmoc−Orn(Boc)−OH;Fmoc−Phe−OH;Fmoc−Pro−OH;Fmoc−Sar−OH;Fmoc−Ser(tBu)−OH;Fmoc−Thr(tBu)−OH;Fmoc−Trp(Boc)−OH;Fmoc−Tyr(tBu)−OH;Fmoc−Val−OH。
50mL ポリプロピレンコニカルチューブに、Merrifield:Sieber樹脂(140mg,0.100mmol)を加えた。次いで、DMF(7mL)を、このチューブに入れて、次いでDCM(7mL)を入れた。次いで、樹脂を、容器の上部から反応容器に移した。この方法を、さらに2回繰り返した。DMF(7mL)を加えて、続いてDCM(7mL)を加えた。樹脂を、15分間、反応容器の底部からN2バブリングにより膨潤させて、この溶媒をフリットから排出した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、HATU(DMF中で0.5M,1.0mL,5等量)およびDIPEA(NMP中で2M,0.5mL,10等量)を加えた。混合物を、50℃でカップリングされるFmoc−Cys(Trt)−OHおよびFmoc−His(Trt)−OHを除く全てのアミノ酸については、5分間75℃でN2バブリングにより混合して、反応溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、2分間65℃で周期的なバブリングを行い、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、HATU(DMF中で0.5M,1.0mL,5等量)およびDIPEA(NMP中で2M,0.5mL,10等量)を加えた。混合物を、50℃でカップリングされるFmoc−Cys(Trt)−OHおよびFmoc−His(Trt)−OHを除いた全てのアミノ酸について5分間75℃でN2バブリングにより混合して、反応溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、HATU(DMF中で0.5M,1.0mL,5等量)およびDIPEA(NMP中で2M,0.5mL,10等量)を加えた。混合物を、50℃でカップリングされるFmoc−Cys(Trt)−OHおよびFmoc−His(Trt)−OHを除いた全てのアミノ酸について5分間75℃でN2バブリングにより混合して、反応溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、2分間65℃で周期的なバブリングを行い、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、DMF(7mL)中の5%ピペラジンおよび0.1M HOBt溶液を加えた。混合物を、75℃で3分間周期的に撹拌して、次いで溶液を排出した。この方法を、1回以上繰り返した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、HCTU(DMF中で0.5M,1.0mL,5等量)およびDIPEA(NMP中で2M,0.5mL,10等量)を加えた。混合物を、全てのアミノ酸(Fmoc−Cys(Trt)−OHおよびFmoc−His(Trt)−OHについては50℃)について、5分間75℃で、その後加熱せずに6時間、N2バブリングにより混合した。排出後に、樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、2分間65℃で周期的なバブリングを行い、次いでこの溶液を排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。反応容器に、HATU(2.5等量〜10等量)を含有するアミノ酸溶液(1.25mL〜5mL,2.5等量〜10等量)、最後にDIPEA(NMP中で2M,0.5mL〜1mL,20等量)を加えた。混合物を、25℃〜75℃で、5分〜2時間、N2バブリングにより混合して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。反応容器に、無水酢酸:DIEA:DMF(10:1:89v/v/v,5.0mL)の溶液を加えた。混合物を、2分間65℃で周期的なバブリングを行い、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:DMF(7mL)を、上部から流して、次いでDMF(7mL)を底部から流して、最終的にDMF(7mL)を、上部から流した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
全ての操作を、Symphonyペプチド合成器(Protein Technologies)でオートメーションの下で行った。全ての方法を、底部フリットを取り付けたSymphonyポリプロピレンチューブ内で実施した。チューブは、チューブの底部と上部の双方を介してSymphonyペプチド合成器に連結している。全ての溶媒、DMF、DCM、アミノ酸および試薬を、チューブの底から加えて、フリットを通して樹脂と接触させる。全ての溶液を、チューブの底部から除去する。“周期的攪拌”とは、底部フリットからのN2ガスの短時間のパルスを意味する;このパルスは、おおよそ5秒続き、15秒毎に起こる。アミノ酸溶液を、一般的には、調整してから3週間を超えて使用しない。HATU溶液を、調製5日以内で使用した。DMF=ジメチルホルムアミド;HCTU=2−(6−クロロ−1−H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム;HATU=1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム3−オキシドヘキサフルオロリン酸塩;NMM=n−メチルモルホリン;DIPEA=ジイソプロピルエチルアミン;Sieber=Fmoc−アミノ−キサンテン−3−イルオキシ、この場合“3−イルオキシ”とは、ポリスチレン樹脂との結合の位置およびタイプを示す。使用した樹脂は、Sieberリンカーを有するMerrifieldポリマー(ポリスチレン)である(窒素にてFmoc保護);100〜200メッシュ、1%DVB、0.71mmol/g ローディング。他の一般的な酸感受性樹脂を、合成に使用し得る、例えばRinkまたは官能化クロロトリチル樹脂。使用した一般的なアミノ酸を以下に挙げた(側鎖保護基は括弧内に示した)。Fmoc−Ala−OH;Fmoc−Arg(Pbf)−OH;Fmoc−Asn(Trt)−OH;Fmoc−Asp(OtBu)−OH;Fmoc−Bzt−OH;Fmoc−Cys(Trt)−OH;Fmoc−Dab(Boc)−OH;Fmoc−Dap(Boc)−OH;Fmoc−Gln(Trt)−OH;Fmoc−Gly−OH;Fmoc−His(Trt)−OH;Fmoc−Hyp(tBu)−OH;Fmoc−Ile−OH;Fmoc−Leu−OH;Fmoc−Lys(Boc)−OH;Fmoc−Nle−OH;Fmoc−Met−OH;Fmoc−[N−Me]Ala−OH;Fmoc−[N−Me]Nle−OH;Fmoc−Phe−OH;Fmoc−Pro−OH;Fmoc−Sar−OH;Fmoc−Ser(tBu)−OH;Fmoc−Thr(tBu)−OH;Fmoc−Trp(Boc)−OH;Fmoc−Tyr(tBu)−OH;Fmoc−Val−OH。
Symphonyポリプロピレン固相反応容器に、Merrifield:Sieber樹脂(70mg,0.050mmol)を加えた。樹脂を、下記の通りに3回洗った(膨潤させた):反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、10分間、反応容器の底部からN2バブリングにより周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.5mL)を加えた。混合物を、2.5分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、連続的に下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、DMF(6.25mL)で洗い、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からN2バブリングにより、30秒間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からN2バブリングにより、30秒間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.5mL)を加えた。混合物を、2.5分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、DMF(6.25mL)で洗い、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からN2バブリングにより、30秒間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.5mL)を加えた。混合物を、2.5分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、300分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、DMF(6.25mL)で洗い、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、300分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からN2バブリングにより、30秒間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.5mL)を加えた。混合物を、2.5分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。この合成を、反応容器に手作業でカスタムアミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)を加えるために、Symphony softwareにより中断して、その後オートメーションを、HATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えるために再度開始する。混合物を、300分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:DMF(2.5mL)を用いて容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、Ac2O/DIPEA/DMF(v/v/v 1:1:3, 2.5mL)を加えて、混合物を、10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
全ての操作を、Symphonyペプチド合成器(Protein Technologies)でオートメーションの下で行った。全ての方法を、別段の記載が無ければ、底部フリットを取り付けたSymphonyポリプロピレンチューブ内で実施した。チューブは、チューブの底部と上部の双方を介してSymphonyペプチド合成器に連結している。全ての溶媒、DMF、DCM、アミノ酸および試薬を、チューブの底から加えて、フリットを通して樹脂と接触させる。全ての溶液を、チューブの底部から除去する。“周期的攪拌”とは、底部フリットからのN2ガスの短時間のパルスを意味する;このパルスは、おおよそ5秒続き、15秒毎に起こる。アミノ酸溶液を、一般的には、調整してから3週間を超えて使用しない。HATU溶液を、調製5日以内で使用した。DMF=ジメチルホルムアミド;HCTU=2−(6−クロロ−1−H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム;HATU=1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム3−オキシドヘキサフルオロリン酸塩;NMM=n−メチルモルホリン;DIPEA=ジイソプロピルエチルアミン;Sieber=Fmoc−アミノ−キサンテン−3−イルオキシ、この場合“3−イルオキシ”とは、ポリスチレン樹脂との結合の位置およびタイプを示す。使用した樹脂は、Sieberリンカーを有するMerrifieldポリマー(ポリスチレン)である(窒素にてFmoc保護);100〜200メッシュ,1%DVB,0.71mmol/g ローディング。他の一般的な酸感受性樹脂を、合成に使用し得る(例えば、Rinkまたは官能化クロロトリチル樹脂など)。使用した一般的なアミノ酸を以下に挙げた(側鎖保護基は括弧内に示した)。Fmoc−Ala−OH;Fmoc−Arg(Pbf)−OH;Fmoc−Asn(Trt)−OH;Fmoc−Asp(OtBu)−OH;Fmoc−Bzt−OH;Fmoc−Cys(Trt)−OH;Fmoc−Dab(Boc)−OH;Fmoc−Dap(Boc)−OH;Fmoc−Gln(Trt)−OH;Fmoc−Gly−OH;Fmoc−His(Trt)−OH;Fmoc−Hyp(tBu)−OH;Fmoc−Ile−OH;Fmoc−Leu−OH;Fmoc−Lys(Boc)−OH;Fmoc−Nle−OH;Fmoc−Met−OH;Fmoc−[N−Me]Ala−OH;Fmoc−[N−Me]Nle−OH;Fmoc−Phe−OH;Fmoc−Pro−OH;Fmoc−Sar−OH;Fmoc−Ser(tBu)−OH;Fmoc−Thr(tBu)−OH;Fmoc−Trp(Boc)−OH;Fmoc−Tyr(tBu)−OH;Fmoc−Val−OH。
Symphonyポリプロピレン固相反応容器に、Merrifield:Sieber樹脂(70mg,0.050mmol)を加えた。樹脂を、下記の通りに3回洗った(膨潤させた):反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からN2バブリングにより、10分間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.5mL)を加えた。混合物を、2.5分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、連続的に下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、DMF(6.25mL)で洗い、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からN2バブリングにより、30秒間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からN2バブリングにより、30秒間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.5mL)を加えた。混合物を、2.5分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、Ac2O/DIPEA/DMF(v/v/v 1:1:3, 2.5mL)を加えて、混合物を、10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、連続的に下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からN2バブリングにより、30秒間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.5mL)を加えた。混合物を、2.5分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸を加えて(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的に NMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、DMF(6.25mL)で洗い、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)および最終的にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して3回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、Ac2O/DIPEA/DMF(v/v/v 1:1:3, 2.5mL)を加えて、混合物を、10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、連続的に下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からN2バブリングにより、30秒間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.5mL)を加えた。混合物を、2.5分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。この系を、反応容器にカスタムアミノ酸(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)を手動で加えるためのシステムにより中断して、その後反応容器に、HATU(DMF中で0.2M,1.25mL,5等量)、最後にNMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えるためにオートメーションを再度開始した。混合物を、周期的に15分間撹拌して、次いで反応溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、Ac2O/DIPEA/DMF(v/v/v 1:1:3, 2.5mL)を加えて、混合物を10分間周期的に撹拌して、反応溶液をフリットから排出した。樹脂を、連続的に下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
樹脂を下記の通りに3回洗った:反応容器に、DMF(2.5mL)を加えて、この混合物を、反応容器の底部からのN2バブリングにより、30秒間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.5mL)を加えた。混合物を、2.5分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、NMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)、続いて、クロロ無水酢酸(DMF中で0.4M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、DMF(6.25mL)で洗い、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、NMM(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)、続いてクロロ無水酢酸(DMF中で0.4M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに6回洗った:DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、Ac2O/DIPEA/DMF(v/v/v 1:1:3, 2.5mL)を加えて、混合物を10分間周期的に撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、連続的に下記の通りに6回洗った:各洗いのために、DMF(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DCM(2.5mL)を、容器の底部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次いで窒素流で10分間乾燥させた。
全ての操作を、別段の記載が無ければ手動により行った。“包括的脱保護方法A”の方法は、0.100mmolスケールで行った実験を述べたものであり、この場合のスケールは、樹脂に結合したSieberリンカーの量により決定される。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。“脱保護溶液”を、トリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:ジチオスレイトール(92.5:2.5:2.5:2.5 v:v:v:w)を用いて調製した。樹脂を、反応容器から除去して、フリットを備えた25mLシリンジに移した。シリンジに、“脱保護溶液”(5.0mL)を加えた。混合物を、85分間シェーカー内で混合した。この溶液を、濾過して、濃縮して、ジエチルエーテル(30mL)で希釈した。沈殿した固体を、3分間遠心分離した。上清溶液を傾捨して、固体をジエチルエーテル(25mL)に再懸濁した。懸濁液を、3分間遠心分離した。上清を傾捨して、残留固体を、ジエチルエーテル(25mL)に再懸濁させた。懸濁液を、3分間遠心分離した。上清を傾捨して、残存固体を高真空下にて乾燥させた。粗製ペプチドを、白色からオフホワイトの固体として得た。
全ての操作を、別段の記載が無ければ手動により行った。“包括的脱保護方法B”の方法は、0.04mmolスケールで行った実験を記述したものであり、この場合のスケールは、樹脂に結合したSieberリンカーの量により決定される。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.04mmolのスケールを超えて拡大できる。“脱保護溶液”を、トリフルオロ酢酸:トリイソプロピルシラン(96:4;v:v)用いて調製した。樹脂を、反応容器から除去して、フリットを備えた10mLのシリンジに移した。シリンジに、“脱保護溶液”(2.0〜3.0mL)を加えた。混合物を、1時間または1.5時間シェーカー内で混合した。溶液を、濾過して、脱保護溶液(0.5mL)で洗い、濃縮して、ジエチルエーテル(30mL)に希釈した。沈殿した固体を、3分間遠心分離した。上清溶液を傾捨して、固体を、ジエチルエーテル(25mL)に再懸濁した。懸濁液を、3分間懸濁した。上清を傾捨して、残存固体を、ジエチルエーテル(25mL)に懸濁した。懸濁液を、3分間懸濁した。上清を傾捨して、残存固体を高真空下にて乾燥させた。粗製ペプチドを、白色からオフホワイトの固体として得た。
全ての操作を、記載が無ければ手動により行った。“包括的脱保護方法C”の方法は、0.100mmolスケールで行った実験を記述したものであり、この場合のスケールは、樹脂に結合したSieberリンカーの量により決定される。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。“脱保護溶液”を、トリフルオロ酢酸:トリイソプロピルシラン:ジチオスレイトール(95:2.5:2.5 v:v:w)を用いて調製した。樹脂を、反応容器から取り出して、Bio−Radチューブに移した。Bio−Radチューブに、“脱保護溶液”(4.0mL)を加えた。
全ての操作を、別段の記載が無ければ手動により行った。“包括的脱保護方法B”の方法は、0.100mmolスケールで行った実験を記述したものであり、この場合のスケールは、樹脂に結合したSieberリンカーの量により決定される。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。“脱保護溶液”を、トリフルオロ酢酸:トリイソプロピルシラン:ジチオスレイトール(94:3:3 v:v:w)を用いて調製した。樹脂を、反応容器から除去して、フリットを備えた25mLシリンジに移した。シリンジに、“脱保護溶液”(5.0mL)を加えた。混合物を、シェーカー内で5分間混合した。溶液を、濾過して、ジエチルエーテル(30mL)に希釈した。沈殿した固体を、3分間遠心分離した。上清溶液を傾捨して、固体を、ジエチルエーテル(25mL)に再懸濁した。懸濁液を、3分間懸濁した。上清を傾捨して、残存固体を、ジエチルエーテル(25mL)に懸濁した。懸濁液を、3分間懸濁した。上清を傾捨して、残存固体を高真空下にて乾燥させた。粗製ペプチドを、白色からオフホワイトの固体として得た。
全ての操作を、記載が無ければ手動により行った。“包括的脱保護方法E”の方法は、0.100mmolのスケールで行った実験を述べたもので、この場合のスケールは、樹脂に結合したFmoc Gly−ClTrtリンカーの量により決定される。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。“脱保護溶液”を、トリフルオロ酢酸:トリイソプロピルシラン:ジチオスレイトール(95:2.5:2.5 v:v:w)を用いて調製した。樹脂を、反応容器から取り出して、Bio−Radチューブに移した。Bio−Radチューブに、“脱保護溶液”(2.0mL)を加えた。混合物を、3分間シェーカー内で混合した。溶液を、濾過して、遠心分離チューブに集めた。Bio−Radチューブに、“脱保護溶液”(2.0mL)を加えた。混合物を、3分間シェーカー内で混合した。溶液を、濾過して、遠心分離チューブに集めた。Bio−Radチューブに、“脱保護溶液”(2.0mL)を加えた。混合物を、3分間シェーカー内で混合した。溶液を、濾過して、遠心分離チューブに集めた。遠心分離用チューブ内の溶液を、60分間静置させた。次いで、集めた溶液をジエチルエーテル(30mL)で希釈して、沈殿が形成した。沈殿した固体を、3分間遠心分離した。上清溶液を傾捨して、固体を、ジエチルエーテル(25mL)に再懸濁した。懸濁液を、3分間懸濁した。上清を傾捨して、残存固体を、ジエチルエーテル(25mL)に懸濁した。懸濁液を、3分間懸濁した。上清を傾捨して、残存固体を高真空下にて乾燥させた。粗製ペプチドを、白色からオフホワイトの固体として得た。
全ての操作を、記載が無ければ手動により行った。“包括的脱保護方法F”の方法は、0.100mmolスケールで行った実験を述べたものであり、この場合のスケールは、樹脂に結合したRinkリンカーの量により決定される。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。“脱保護溶液”を、トリフルオロ酢酸:トリイソプロピルシラン:ジチオスレイトール(95:2.5:2.5 v:v:w)を用いて調製した。樹脂を、反応容器から取り出して、6mlのBio−Radチューブに移した。Bio−Radチューブに、“脱保護溶液”(4.0mL)を加えた。混合物を、シェーカー内で90分間混合した。溶液を、濾過して、ジエチルエーテル(30mL)に希釈した。沈殿した固体を、3分間遠心分離した。上清溶液を傾捨して、固体をジエチルエーテル(25mL)に再懸濁した。懸濁液を、3分間懸濁した。上清を傾捨して、残存固体を、ジエチルエーテル(25mL)に懸濁した。懸濁液を、3分間遠心分離した。上清を傾捨して、残存固体を高真空下にて乾燥させた。粗製ペプチドを、白色からオフホワイトの固体として得た。
全ての操作を、別段の記載が無ければ、手動により行った。“環化方法A”の方法は、0.100mmolのスケールで行った実験を述べたもので、この場合のスケールは、ペプチドを生成するために使用した樹脂に結合したSieberリンカーの量により決定される。このスケールは、この方法で使用したペプチドの量の直接的な測定に基づくものではない。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。粗製ペプチド固体を、アセトニトリル:8Mグアニジン水溶液/50mM TRIS(1:3)(pH8.6)(7mL:18mLまたは同様の割合)に溶解して、次いで該溶液を、必要であれば、NaOH水溶液(1.0M)を用いて、pH=8.5〜9.0に調整した。次いで、この溶液を、シェーカーを用いて12〜18時間混合した。反応溶液を濃縮して、次いで残留物を、アセトニトリル:水に溶解した。この溶液を、逆相HPLC精製に供して、目的とする環状ペプチドを得た。
全ての操作を、記載が無ければ手動により行った。“環化方法C”の方法は、0.100mmolのスケールで行った実験を述べたもので、この場合のスケールは、ペプチドを生成するために使用した樹脂に結合したSieberリンカーの量により決定される。このスケールは、この方法で使用したペプチドの量の直接的な決定に基づくものではない。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。粗製ペプチド固体を、アセトニトリル:0.1M 炭酸水素アンモニウム緩衝水溶液(11mL:24mLまたは同様の割合)の溶液に溶解して、次いでこの溶液を、NaOH(1.0M)水溶液を用いてpH=8.5〜9.0に注意深く調整した。次いで、溶液を、シェーカーを用いて12〜18時間混合した。反応溶液を濃縮して、次いで残留物を、アセトニトリル:水に溶解した。この溶液を、逆相HPLC精製に供して、目的とする環状ペプチドを得た。
全ての操作を、別段の記載が無ければ手動により行った。“環化方法D”の方法は、0.100mmolのスケールで行った実験を述べたもので、この場合のスケールは、ペプチドを生成するために使用した樹脂に結合したSieberリンカーの量により決定される。このスケールは、この方法で使用したペプチドの量の直接的な測定に基づくものではない。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。粗製ペプチド固体を、アセトニトリル:0.1M 炭酸水素アンモニウム緩衝水溶液(11mL:24mL)の溶液に溶解して、次いでこの溶液を、NaOH(1.0M)水溶液を用いてpH=8.5〜9.0に注意深く調整した。次いで、溶液を、12〜18時間撹拌しながら混合した。反応溶液を濃縮して、次いで残留物を、アセトニトリル:水に溶解した。この溶液を、逆相HPLC精製に供して、目的とする環状ペプチドを得た。
全ての操作を、別段の記載が無ければ手動により行った。“環化方法E”の方法は、0.100mmolスケールで行った実験を述べたものであり、この場合のスケールは、ペプチドを生成するために使用した樹脂に結合したSieberリンカーの量により決定される。このスケールは、この方法で使用したペプチドの量の直接的な決定に基づくものではない。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。粗製ペプチド固体を、6MグアニジンHCl緩衝水溶液(15mL)に溶解して、次いで溶液を12〜18時間間撹拌しながら混合した。反応溶液を濃縮して、DMSO(15mL)を、その残留物に加えて、濾過されたスラリーを得た。濾液を、逆相HPLC精製に付して、目的とする環状ペプチドを得た。
先の工程から得た樹脂を含有するBio−Rad反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,5.0mL)を加えた。混合物を、5分間周期的に振盪して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して5回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、60秒間振盪して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(1.2〜10当量)通常(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、次いでHATU(1.210当量)通常(DMF中で0.2M,2.5mL,5等量)、最後にDIPEA(2.4〜20当量)通常(DMF中で0.8M,1.25mL,10等量)を加えた。混合物を、60分間〜18時間振盪した。反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続して4回洗った:各洗いのために、DMF(4.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、60秒間振盪して、この溶液をフリットから排出した。
全ての操作を、別段の記載が無ければ手動により実施した。“樹脂上でのN−メチル化”の方法は、0.100mmolのスケールで実施した実験を述べたもので、この場合のスケールは、ペプチドを生成するために使用した樹脂に結合したSieberリンカーの量により決定される。このスケールは、この方法で使用したペプチドの量の直接的な測定に基づくものではない。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。
少量の<10mg樹脂の試料に、TISの2滴およびt−トリフルオロ酢酸(1mL)を加えて、室温で振盪した。1時間後に、少量のアリコートを取り出して、アセトニトリル(0.5mL)を用いて希釈して、濾過して、LC−MSにより分析した。
実施例1001を、Rink樹脂で下記の一般的な合成方法に従い製造した:
Fmoc−Gly−OH“Symphony方法B:樹脂膨潤化方法”を行った。
Fmoc−Cys(Trt)−OH“Symphony方法B:標準カップリング方法”を行った。
Fmoc−Arg(Pbf)−OH“Symphony方法B:標準カップリング方法”を行った。
Fmoc−nメチル−Nle−OH“Symphony方法B:標準カップリング方法”を行った。
Fmoc−nメチル−Nle−OH“Symphony方法B:第二級アミンカップリング方法”を行った。
Fmoc−Trp(Boc)−OH“Symphony方法B:第二級アミンカップリング方法”を行った。
Fmoc−Ser(tBu)−OH“Symphony方法B:標準カップリング方法”を行った。
Fmoc−Trp(Boc)−OH“Symphony方法B:標準カップリング方法”を行った。
Fmoc−シクロペンチル−Gly−OH“マニュアルカップリング方法A”を行った。
Fmoc−Leu−OH“Symphony方法B:第二級アミンカップリング方法”を行った。
Fmoc−His(Trt)−OH“Symphony方法B:標準カップリング方法”を行った。
Fmoc−Pro−OH“Symphony方法B:標準カップリング方法”を行った。
Fmoc−Asn(Trt)−OH“Symphony方法B:第二級アミンカップリング方法”を行った。
Fmoc−nメチル−Ala−OH“Symphony方法B:標準カップリング方法”を行った。
Fmoc−Phe−OH“Symphony方法B:第二級アミンカップリング方法”を行った。
“Symphony方法B:最終カップリング方法”を行った。
“包括的脱保護方法F”を行った。
“環化方法D”を行った。
分析LCMS条件D:保持時間=1.67分;ESI−MS(+)m/z 947.2(M+2H).
分析LCMS条件E:保持時間=1.57分;ESI−MS(+)m/z 946.7(M+2H).
実施例1002を、以下の一般的な方法から構成される実施例1001の製造のために記述した一般的な合成手順に従って、Rink樹脂上で製造した:“Symphony方法B:樹脂膨潤化方法”、“Symphony方法B:標準カップリング方法”、“Symphony方法B:第二級アミンカップリング方法”、“マニュアルカップリング方法A”、“Symphony方法B:最終カップリング方法”、“包括的脱保護方法F”および“環化方法D”。
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:Waters XBridge C18,19 x 200 mm, 5μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:25分かけて15〜65%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は6.0mgであり、LCMS分析によるその算出純度は100%であった。
分析LCMS条件D:保持時間=1.60分;ESI−MS(+)m/z 934.0(M+2H).
分析LCMS条件E:保持時間=1.52分;ESI−MS(+)m/z 933.9(M+2H).
実施例1003を、以下の一般的な方法から構成される実施例1001の製造のために記述された一般的な合成手順に従って、Rink樹脂上で製造した:“Symphony方法B:樹脂膨潤化方法”、“Symphony方法B:標準カップリング方法”、“Symphony方法B:第二級アミンカップリング方法”、“マニュアルカップリング方法A”、“Symphony方法B:最終カップリング方法”、“包括的脱保護方法F”および“環化方法D”。
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:Waters XBridge C18,19 x 200 mm, 5μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:25分かけて15〜65%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は2.2mgであり、LCMS分析によるその算出純度は100%であった。
分析LCMS条件D:保持時間=1.58分;ESI−MS(+)m/z 926.7(M+2H).
分析LCMS条件E:保持時間=1.51分;ESI−MS(+)m/z 926.2(M+2H).
質量スペクトル分析法:“ESI−MS(+)”は、ポジティブイオンモードにおいて行なったエレクトロスプレーイオン化質量スペクトル分析法を意味する;“ESI−MS(−)”は、ネガティブイオンモードで行なったエレクトロスプレーイオン化質量スペクトル分析法を意味する;“ESI−HRMS(+)”は、ポジティブイオンモードで行なった高分解エレクトロスプレーイオン化質量スペクトル分析法を意味する;“ESI−HRMS(−)”ネガティブイオンモードで行なった高分解エレクトロスプレーイオン化質量スペクトル分析法を意味する。検出された質量は、“m/z”単位表示に従って報告された。1000より大きい精密質量を有する化合物は、二重電荷イオンまたは三重電荷イオンとして高頻度で検出された。
カラム:Waters BEH C18,2.0 x 50 mm,1.7μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);温度:50℃;グラジエント:0%B、3分かけて0〜100%B、次いで100%Bで0.5分保持;流量:1mL/分;検出:220nmのUV.
カラム:Waters BEH C18,2.0 x 50 mm,1.7μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);温度:50℃;グラジエント:0%B、3分かけて0〜100%B、次いで100%Bで0.5分保持;流量:0.5mL/分;検出:220nmのUV.
実施例5001を、下記の通りに製造した。10mLのポリプロピレン固相反応容器に、Rink−Merrifield樹脂(178mg,0.100mmol)を加えて、反応容器を、Preludeペプチド合成器上に置いた。“Prelude方法A:樹脂膨潤化方法”を行った。次いで、一連のアミノ酸カップリングを、樹脂結合ペプチドのN−末端が第一級アミンであるならば“Prelude方法A:単カップリング方法”に従って、または樹脂結合ペプチドのN−末端が第二級アミンであるならば“Prelude方法A:ダブルカップリング方法”に従ってPrelude上で実施した。“Prelude方法A:クロロアセチルクロリドカップリング方法”を行い;次いで、“包括的脱保護方法A”を行い;次いで、“環化方法A”を行った。記載した通り、1−((((9H−フルオレン−9−イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)シクロプロパンカルボン酸(Fmoc−AcPc−OH)を、合成に使用した。粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて10〜50%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は14.1mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、95%であった。
分析条件A:保持時間=2.10分;ESI−MS(+)m/z 888.3(M−2H).
分析条件B:保持時間=2.85分;ESI−MS(+)m/z 890.5(M+2H).
一般的な合成手順A:
“一般的な合成手順A”は、本明細書に記述した環化ぺプチドを得るために使用した方法の一般的な手順を述べる。この一般的な手順の目的のためには、“Symphony方法A”の方法は、“Prelude方法A”の方法と相互に置き換えられる。10mLのポリプロピレン固相反応容器に、Rink−Merrifield樹脂(178mg,0.100mmol)を加えて、反応容器をPreludeペプチド合成器に置いた。“Prelude方法A:樹脂膨潤化方法”を行った。次いで、一連のアミノ酸カップリングを、樹脂結合ペプチドのN−末端が第一級アミンであるならば“Prelude方法A:単カップリング方法”に従って、または樹脂結合ペプチドのN−末端が第二級アミンであるならば“Prelude方法A:ダブルカップリング方法”に従ってPrelude上で行った。“Prelude方法A:クロロアセチルクロリドカップリング方法”を行い;次いで、“包括的脱保護方法A”を行い;次いで、“環化方法A”を行った。
Prelude方法A:
全ての操作を、Preludeペプチド合成器(Protein Technologies)でオートメーションの下で行った。全ての方法を、底部フリットを取り付けた10mLポリプロピレンチューブ内で実施した;反応の規模が0.100mmolを超える場合は、底部フリットを取り付けた40mLポリプロピレンを使用した。このチューブは、チューブの底部と上部の双方を介してPreludeペプチド合成器に連結している。DMFおよびDCMを、チューブの上部から加えて、チューブの側面を均等に洗い流すことができる。残存する試薬を、チューブの底部から添加して、フリットを通して樹脂と接触させる。全ての溶液を、チューブの底部から除去する。“周期的攪拌”とは、底部フリットからのN2ガスの短時間のパルスを意味する;このパルスは、おおよそ5秒続き、30秒毎におこる。クロロアセチルクロリド/DMF溶液を、調整24時間以内で使用した。アミノ酸溶液を、一般的には、調整してから3週間を超えては使用しない。HATU溶液を、調製5日以内で使用する。DMF=ジメチルホルムアミド;HATU=1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム3−オキシドヘキサフルオロリン酸塩;DIPEA=ジイソプロピルエチルアミン;Rink=(2,4−ジメトキシフェニル)(4−アルコキシフェニル)メタンアミン、この“4−アルコキシ”の場所は、ポリスチレン樹脂との結合の位置およびタイプを示す。使用した樹脂は、Rinkリンカー(窒素にてFmoc保護)を有するMerrifieldポリマー(ポリスチレン)である;100〜200メッシュ,1%DVB,0.56mmol/g ローディング。使用した一般的なアミノ酸を以下に挙げた(側鎖保護基は括弧内に示した)。Fmoc−Ala−OH;Fmoc−Arg(Pbf)−OH;Fmoc−Asn(Trt)−OH;Fmoc−Asp(OtBu)−OH;Fmoc−Bzt−OH;Fmoc−Cys(Trt)−OH;Fmoc−Dab(Boc)−OH;Fmoc−Dap(Boc)−OH;Fmoc−Gln(Trt)−OH;Fmoc−Gly−OH;Fmoc−His(Trt)−OH;Fmoc−Hyp(tBu)−OH;Fmoc−Ile−OH;Fmoc−Leu−OH;Fmoc−Lys(Boc)−OH;Fmoc−Nle−OH;Fmoc−Met−OH;Fmoc−[N−Me]Ala−OH;Fmoc−[N−Me]Nle−OH;Fmoc−Phe−OH;Fmoc−Pro−OH;Fmoc−Sar−OH;Fmoc−Ser(tBu)−OH;Fmoc−Thr(tBu)−OH;Fmoc−Trp(Boc)−OH;Fmoc−Tyr(tBu)−OH;Fmoc−Val−OH.
10mLのポリプロピレン固相反応容器に、Merrifield:Rink樹脂(178mg,0.100mmol)を加えた。樹脂を、下記の通りに洗った(膨潤した):反応容器に、DMF(2.0mL)を加えて、この混合物を、10分間周期的に撹拌して、この溶媒をフリットから排出した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続的に洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸を加えて(DMF中で0.2M,1.0mL,2等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.0mL,2等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,0.5mL,4等量)。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記の通りに4回連続的に洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸(2.0mL)を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに4回連続的に洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程から得た樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続的に6回洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.0mL,2等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.0mL,2等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,0.5mL,4等量)を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記のとおりに2回洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中で0.2M,1.0mL,2等量)、次いでHATU(DMF中で0.2M,1.0mL,2等量)、最後にDIPEA(DMF中で0.8M,0.5mL,4等量)を加えた。混合物を、周期的に15分間撹拌して、反応溶液を、フリットから排出した。樹脂を、下記のとおりに2回洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、無水酢酸(2.0mL)を加えた。混合物を、10分間周期的に撹拌して、次いで溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに4回連続的に洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、次の工程に直接使用した。
先の工程からの樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80v/v,2.0mL)を加えた。混合物を、3分間周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに連続的に洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部から加えて、得られる混合物を、30秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。反応容器に、DIPEA(DMF中で0.8M,3.0mL,24等量)、次いでクロロアセチルクロリド(DMF中で0.8M,1.65mL,13.2等量)を加えた。混合物を、30分周期的に撹拌して、次いでこの溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに3回連続的に洗った:各洗いのために、DMF(2.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。樹脂を、下記の通りに4回連続的に洗った:各洗いのために、CH2Cl2(2.0mL)を、容器の上部に加えて、得られる混合物を、90秒間周期的に撹拌して、この溶液をフリットから排出した。得られる樹脂を、15分間、N2ストリーム下に置いた。
この方法のコレクションは、注記を除いて“Prelude方法A”と同一の方法である。全ての方法について、SymphonyXペプチド合成器(Protein Technologies)を、Preludeペプチド合成器の代わりに使用して、全ての試薬を、反応容器の上部から加えた。
樹脂膨潤化方法:
この方法は、“Prelude方法A:樹脂膨潤化方法”と同一である。
単カップリング方法:
この方法は、DIPEA溶液の濃度が0.4Mであり、この溶液の1.0mLがこの反応に移されたことを除いて、“Prelude方法A:単カップリング方法”と同一である。
ダブルカップリング方法:
この方法は、DIPEA溶液の濃度が0.4Mであり、この溶液の1.0mLがこの反応に移されたことを除いて、“Prelude方法A:ダブルカップリング方法”と同一である。
この方法は、“Prelude方法A:クロロアセチルクロリドカップリング方法”と同一である。
全ての操作を、別段の記載が無ければ手動により行った。“包括的脱保護方法A”の方法は、0.100mmolスケールで行った実験を述べたものであり、この場合のスケールは、樹脂に結合したRinkリンカーの量により決定される。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。“脱保護溶液”を、40mL ガラスバイアル中で、トリフルオロ酢酸(22mL)、フェノール(1.325g)、水(1.25mL)およびトリイソプロピルシラン(0.5mL)を合わせて調製した。樹脂を、反応容器から取り出して、4mL ガラスバイアルに移した。バイアルに、“脱保護溶液”(2.0mL)を加えた。混合物を、シェーカー内で激しく混合した(1000RPMで1分間、次いで500RPMで1〜2時間)。混合物を、0.2ミクロンシリンジフィルターにより濾過して、固体を、“脱保護溶液”(1.0mL)またはTFA(1.0mL)で抽出した。合わせた濾液を入れた24mL試験管に、Et2O(15mL)を加えた。混合物を、激しく混合して、これに有意な量の白色固体が沈殿した。混合物を、5分間遠心分離して、次いで溶液を傾斜して、固体と分けて、廃棄した。固体を、Et2O(20mL)中に懸濁した;次いで、混合物を、5分間遠心分離して;溶液を傾斜して、固体と分けて、廃棄した。最後に、固体を、Et2O(20mL)に懸濁した;混合物を、5分間遠心分離した;および溶液を傾斜して、固体と分けて、廃棄して、粗製ペプチドを、白色からオフホワイトの固体として得た。
全ての操作を、記載が無ければ手動により行った。“環化方法A”の方法は、0.100mmolスケールで行った実験を述べたものであり、この場合のスケールは、ペプチドを生成するために使用した樹脂に結合したRinkリンカーの量により決定される。このスケールは、この方法で使用したペプチドの量の直接的な測定に基づくものではない。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。粗製ペプチド固体を、MeCN:0.1M NH4OAc水溶液(30mL:30mL)に溶解して、次いでこの溶液を、NaOH(1.0M)水溶液を用いて注意深くpH=8.5〜9.0に調整した。次いで溶液を、12〜18時間撹拌せずに静置させた。反応溶液を濃縮して、次いで、残留物を、DMSO:MeOHに溶解した。この溶液を、逆相HPLC精製に付して、目的とする環状ペプチドを得た。
全ての操作を、記載が無ければ手動により行った。“環化方法B”の方法0.100mmolスケールで行った実験を述べたものであり、この場合のスケールは、ペプチドを生成するために使用した樹脂に結合したRinkリンカーの量により決定される。このスケールは、この方法で使用したペプチドの量の直接的な測定に基づくものではない。この方法は、記戴した体積をスケールの倍数で調整することにより、0.100mmolのスケールを超えて拡大できる。粗製ペプチド固体を、全容量18〜22mLまでMeCN:0.1M NH4OAc水溶液(1:1)に溶解して、次いでこの溶液を、NaOH(1.0M)水溶液を用いて注意深くpH=8.5〜9.0に調整した。次いで、溶液を、12〜18時間撹拌せずに静置させた。反応溶液を濃縮して、次いで、残留物を、DMSO:MeOHに溶解した。この溶液を、逆相HPLC精製に供して、目的とする環状ペプチドを得た。
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、19.4mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、100%であった。
分析条件A:保持時間=1.62分;ESI−MS(+)m/z 963.4(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.84分;ESI−MS(+)m/z 963.8(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて40〜80%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、24.0mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、100%であった。
分析条件A:保持時間=1.63分;ESI−MS(+)m/z 954.75(M+2H).
分析条件B:保持時間=3.11分;ESI−MS(+)m/z 954.25(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて15〜55%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、35.5mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、97%であった。
分析条件A:保持時間=1.61分;ESI−MS(+)m/z 964.3(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.84分;ESI−MS(+)m/z 964.1(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて45〜85%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、23.9mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、99%であった。
分析条件A:保持時間=1.48分;ESI−MS(+)m/z 956.0(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.67分;ESI−MS(+)m/z 955.7(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて40〜80%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、18.8mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、99%であった。
分析条件A:保持時間=1.64分;ESI−MS(+)m/z 901.6(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて50〜90%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、40.5mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、100%であった。
分析条件A:保持時間=1.59分;ESI−MS(+)m/z 900.3(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて45〜90%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。この物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより更に精製した:カラム:Waters CSH C18,19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて5〜45%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、19.3mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、100%であった。
分析条件A:保持時間=1.95分;ESI−MS(+)m/z 907.8(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて45〜85%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、14.1mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、98%であった。
分析条件A:保持時間=1.90分;ESI−MS(+)m/z 906.6(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて40〜80%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。この物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより更に精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて5〜45%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は2.2mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、91%であった。
分析条件A:保持時間=1.73分;ESI−MS(+)m/z 901.4(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて40〜85%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、29.2mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、98%であった。
分析条件A:保持時間=1.81分;ESI−MS(+)m/z 914.8(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて40〜85%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。この物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより更に精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて15〜55%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は、16.4mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、96%であった。
分析条件A:保持時間=1.97分;ESI−MS(+)m/z 914.3(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて45〜85%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は21.9mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、97%であった。
分析条件A:保持時間=1.78分;ESI−MS(+)m/z 901.4(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 メタノール:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて50〜90%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は35.3mgであり、LCMS分析によるその算出純度は97%であった。
分析条件A:保持時間=1.76分;ESI−MS(+)m/z 900.2(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて15〜55%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は15.8mgであり、LCMS分析によるその算出純度は99%であった。
分析条件A:保持時間=1.56分;ESI−MS(+)m/z 914.3(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:Waters CSH c-18,19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(0.1%トリフルオロ酢酸を含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(0.1%トリフルオロ酢酸を含む);グラジエント:30分かけて15〜55%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は17.1mgであり、LCMS分析によるその算出純度は94%であった。
分析条件A:保持時間=1.65分;ESI−MS(+)m/z 938.1(M+2H).
粗製物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:30分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。この物質を、以下の条件を用いて、プレパラティブLC/MSにより更に精製した:カラム:Waters CSH C18,19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて25〜65%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は20.3mgであり、LCMS分析によるその算出純度は97%であった。
分析条件A:保持時間=1.76分;ESI−MS(+)m/z 927.9(M+2H).
分析条件A:保持時間=184分;ESI−MS(+)m/z 951.9(M+2H).
実施例10001の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は16.5mgであり、LCMS分析によるその算出純度は95%であった。
分析条件A:保持時間=1.82分;ESI−MS(+)m/z 962.8(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.98分;ESI−MS(+)m/z 962.8(M+2H).
実施例10002の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は3.9mgであり、LCMS分析によるその算出純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.81分;ESI−MS(+)m/z 970.9(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.98分;ESI−MS(+)m/z 970.8(M+2H).
実施例10003の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は33.4mgであり、LCMS分析によるその算出純度は97%であった。
分析条件A:保持時間=1.76分;ESI−MS(+)m/z 957.0(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.97分;ESI−MS(+)m/z 956.8(M+2H).
ESI−HRMS(+)m/z:計算値:955.9633(M+2H);実測値:955.9610(M+2H).
実施例10004の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は17.2mgであり、LCMS分析によるその算出純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.72分;ESI−MS(+)m/z 964.8(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.97分;ESI−MS(+)m/z 964.7(M+2H).
ESI−HRMS(+)m/z:計算値:963.9607(M+2H);実測値:963.9581(M+2H).
実施例10005の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は10.0mgであり、LCMS分析によるその算出純度は、100%であった。
分析条件A:保持時間=1.65分;ESI−MS(+)m/z 956.6(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.87分;ESI−MS(+)m/z 956.7(M+2H).
ESI−HRMS(+)m/z:計算値:955.9633(M+2H);実測値:955.9601(M+2H).
実施例10006の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は12.1mgであり、LCMS分析によるその算出純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.61分;ESI−MS(+)m/z 965.1(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.85分;ESI−MS(+)m/z 965.0(M+2H).
ESI−HRMS(+)m/z:計算値:963.9580(M+2H);実測値:963.9607(M+2H).
実施例10007の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は13.3mgであり、LCMS分析によるその算出純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.51分;ESI−MS(+)m/z 956.7(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.66分;ESI−MS(+)m/z 956.3(M+2H).
ESI−HRMS(+)m/z:計算値:955.4801(M+2H);実測値:955.4766(M+2H).
実施例10008の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は16.1mgであり、LCMS分析によるその算出純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.73分;ESI−MS(+)m/z 971.8(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.96分;ESI−MS(+)m/z 971.7(M+2H).
ESI−HRMS(+)m/z:計算値:970.9686(M+2H);実測値:970.9667(M+2H).
実施例10009の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は44.3mgであり、LCMS分析によるその算出純度は97%であった。
分析条件A:保持時間=1.67分;ESI−MS(+)m/z 963.2(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.86分;ESI−MS(+)m/z 963.3(M+2H).
ESI−HRMS(+)m/z:計算値:962.4880(M+2H);実測値:962.4857(M+2H).
実施例10010の粗製物質を、以下の条件を用いてプレパラティブLC/MSにより精製した:カラム:XBridge C18, 19 x 200 mm, 5 μm粒子;移動相A:5:95 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);移動相B:95:5 アセトニトリル:水(10mM 酢酸アンモニウムを含む);グラジエント:15分かけて20〜60%B、次いで100%Bで5分間保持;流量:20mL/分。目的とする生成物を含有する画分を合わせて、遠心エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収量は31.1mgであり、LCMS分析によるその算出純度は99%であった。
分析条件A:保持時間=1.71分;ESI−MS(+)m/z 955.2(M+2H).
分析条件B:保持時間=2.89分;ESI−MS(+)m/z 955.4(M+2H).
ESI−HRMS(+)m/z:計算値:954.4905(M+2H);実測値:954.4881(M+2H).
本発明の大環状ペプチドがPD−L1に結合する能力をPD−1/PD−L1均一時間分解蛍光(HTRF)結合アッセイを使用して試験した。
可溶性PD−1の可溶性PD−L1への結合に関する均一時間分解蛍光(HTRF)アッセイ。可溶性PD−1および可溶性PD−L1は、膜貫通領域を排除するカルボキシル末端切除型のタンパク質であって、かつ異種性配列、特にヒト免疫グロブリンG配列(Ig)のFc部分またはヘキサヒスチジンエピトープタグ(His)と融合されているものを指す。全ての結合研究を、0.1%(w/v)ウシ血清アルブミンおよび0.05%(v/v)Tween−20を添加したdPBSからなるHTRFアッセイ緩衝液中で行った。PD−1−Ig/PD−L1−His結合アッセイについて、阻害剤をPD−L1−His(10nM最終)と、15分、4μlのアッセイ緩衝液と共にプレインキュベートし、続いて1μlのアッセイ緩衝液中のPD−1−Ig(20nM最終)を添加し、さらに15分インキュベートした。ヒト、カニクイザル、マウスまたはその他の種のいずれかからのPD−L1融合タンパク質を使用した。HTRF検出を、ユウロピウムクリプテート標識抗Igモノクローナル抗体(1nM最終)およびアロフィコシアニン(APC)標識抗Hisモノクローナル抗体(20nM最終)を使用して達成した。抗体を、HTRF検出緩衝液で希釈し、5μlを分配して、結合反応に加えた。反応を30分間平衡化させて、EnVision蛍光光度計を使用してシグナル(665nm/620nm比)を得た。さらなる結合アッセイをPD−1−Ig/PD−L2−His(それぞれ20nMおよび5nM)、CD80−His/PD−L1−Ig(各々100nMおよび10nM)およびCD80−His/CTLA4−Ig(各々10nMおよび5nM)で確立した。ビオチニル化化合物番号71とヒトPD−L1−Hisの間の結合/競合研究を次のとおり行った。大環状ペプチド阻害剤をPD−L1−His(10nM最終)と、4μlのアッセイ緩衝液中で60分間プレインキュベートし、1μlのアッセイ緩衝液中のビオチニル化化合物番号71(0.5nM最終)を添加した。結合を30分間平衡化して、5μlのHTRF緩衝液中のユウロピウムクリプテート標識ストレプトアビジン(2.5pM最終)およびAPC標識抗His(20nM最終)を添加した。反応を30分平衡化させて、シグナル(665nm/620nm比)を、EnVision蛍光光度計を使用して得た。
Claims (17)
- 式(I):
[式中、
Aは、結合、
から選択され;
は、カルボニル基との結合点を表し、
は、窒素原子との結合点を表し;
zは、0、1または2であり;
wは、1または2であり;
nは0または1であり;
mは1または2であり;
m’は、0または1であり;
pは、0、1または2であり;
Rxは、水素、アミノ、ヒドロキシおよびメチルから選択され;
R14およびR15は、水素およびメチルから独立して選択され;ならびに
Rzは、水素および−C(O)NHR16から選択され;ここでR16は、水素、−CHR17C(O)NH2、−CHR17C(O)NHCHR18C(O)NH2および−CHR17C(O)NHCHR18C(O)NHCH2C(O)NH2から選択され;ここでR17は、水素および−CH2OHから選択され、ここでR18は、水素およびメチルから選択され;
Rvは、水素または天然のアミノ酸側鎖であり;
Rc、Rf、Rh、RiおよびRmは、水素であり;
Rnは、水素またはメチルであるか、あるいはRvおよびRnは、ピロリジン環を形成しており;
Ra、Re、RjおよびRkは、水素およびメチルから各独立して選択され;
各R20は、水素およびC1−C6アルキルから独立して選択され;
各R21は、水素およびC1−C6アルキルから独立して選択され;
R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12およびR13は、天然アミノ酸側鎖および非天然アミノ酸側鎖から独立して選択されるか、あるいは、各々独立して、対応するジェミナルR20基と共に、3〜6員炭素環式環、または酸素または窒素原子を含有する6員環を形成できる、ここで該環は、C1−C3アルコキシ、C1−C3アルキル、C2−C4アルケニル、ハロ、ヒドロキシおよびアミノから独立して選択される1、2または3つの置換基で所望により置換されていてもよく、およびここで該5および6員環は、フェニル環と所望により縮合されていてもよく;あるいは
R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12およびR13は、各々独立して、以下に記載した通りの対応するビシナルR基と共に環を形成することができ;
ReおよびRkは、対応するビシナルR基およびそれらに結合している原子と共に、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジンおよびテトラヒドロチアゾールから選択される環を各々形成でき;ここで各環は、所望により、アミノ、シアノ、メチル、ハロおよびヒドロキシから独立して選択される1〜4つの基で置換されていてもよい;
Rbは、メチルであるか、あるいはRbおよびR2が、それらに結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジンおよびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成しており;ここで各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロおよびヒドロキシから独立して選択される1〜4つの基で所望により置換されていてもよいか;あるいは、R2およびジェミナルR20が、両方水素以外である場合、Rbは水素である;
Rdは、水素またはメチルであるか、あるいはRdおよびR4は、それらに結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジンおよびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成することができ;ここで各環は、所望により、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ヒドロキシおよびフェニルから独立して選択される1〜4つの基で置換されていてもよく;
Rgは、水素またはメチルであるか、あるいはRgおよびR7は、それらに結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジンおよびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成することができ;ここで各環は、アミノ、ハロ基で所望により置換されていてもよいベンジル、ベンジルオキシ、シアノ、シクロヘキシル、メチル、ハロ、ヒドロキシ、メトキシ基で所望により置換されていてもよいイソキノリニルオキシ、ハロ基で所望により置換されていてもよいキノリニルオキシおよびテトラゾリルから独立して選択される1〜4つの基で所望により置換されていてもよく;ここで該ピロリジンおよび該ピペリジン環は、シクロヘキシル、フェニルまたはインドール基と所望により縮合していてもよく;および
Rlは、メチルであるか、あるいはRlおよびR12は、それらに結合している原子と一緒になって、アゼチジンおよびピロリジンから選択される環を形成しており、ここで各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロおよびヒドロキシから独立して選択される1〜4つの基で所望により置換されていてもよい;
但し、式(I)の化合物は、水素以外の4つの置換基を有しており、かつα−メチル置換された環ではない環の骨格上に少なくとも1つの炭素を含有する]
の化合物、あるいはその医薬的に許容される塩。 - zおよびwが各々1であり;
R14およびR15が水素であり;および
Rzが、−C(O)NHR16であり;ここでR16が−CHR17C(O)NH2である、
請求項2記載の化合物、あるいはその医薬的に許容される塩。 - R1が、ヒドロキシで所望により置換されていてもよいベンジルであり;
R2が、メチルであるか、またはジェミナルR20と共に、シクロプロピル環を形成しており;
R8が、−(CH2)インドリルであり;
R10が、−(CH2)インドリルおよび−(CH2)ベンゾチエニルから選択され、これらは各々所望により−CH2CO2Hで置換されていてもよい;
R11が、ブチルであり;
R12が、ブチルであり;
Raが、水素であり;
Reが、水素であり;
Rjが、メチルであり;
Rkが、メチルであり;および
Rlが、水素である、請求項3記載の化合物。 - 実施例1001、実施例1002、実施例1003、実施例5001、実施例9001、実施例9002、実施例9003、実施例9004、実施例9005、実施例9006、実施例9007、実施例9008、実施例9009、実施例9011、実施例9012、実施例9013、実施例9014、実施例9015、実施例9016、実施例9017、実施例9018、実施例10001、実施例10002、実施例10003、実施例10004、実施例10005、実施例10006、実施例10007、実施例10008、実施例10009および実施例10010から選択される化合物;またはその医薬的に許容される塩。
- 治療上有効な量の請求項1記載の化合物またはその治療上許容し得る塩を対象に投与することを特徴とする、その必要のある対象において免疫応答を増強、刺激および/または増加させる方法。
- 請求項1に記載の化合物またはその治療上許容し得る塩を、別の薬剤の投与前、後または同時に投与することを更に特徴とする、請求項6記載の方法。
- 別の薬剤が、殺菌剤、抗ウイルス剤、細胞毒性剤および/または免疫応答修飾剤である、請求項7記載の方法。
- 別の薬剤が、HDAC阻害剤である、請求項7記載の方法。
- 別の薬剤が、TLR7および/またはTLR8アゴニストである、請求項7記載の方法。
- 治療上有効な量の請求項1記載の化合物またはその治療上許容し得る塩を対象に投与することを特徴とする、その必要のある対象における癌細胞の成長、増殖または転移を阻害する方法。
- 癌が、黒色腫、腎細胞癌、扁平非小細胞性肺癌(NSCLC)、非扁平NSCLC、結腸直腸癌、去勢抵抗性前立腺癌、卵巣癌、胃癌、肝細胞癌、膵臓癌、頭頸部の扁平上皮細胞癌、食道、消化管および乳房の癌ならびに造血器腫瘍から選択される、請求項11記載の方法。
- 治療上有効な量の請求項1記載の化合物またはその治療上許容し得る塩を対象に投与することを特徴とする、その必要のある対象における感染性疾患の治療方法。
- 感染性疾患がウイルスを原因とする、請求項13記載の方法。
- ウイルスがHIV、A型肝炎、B型肝炎、C型肝炎、ヘルペスウイルスおよびインフルエンザから選択される、請求項14記載の方法。
- 治療上有効な量の請求項1記載の化合物またはその治療上許容し得る塩を対象に投与することを特徴とする、その必要のある対象における敗血症性ショックの治療方法。
- 治療上有効な量の請求項1記載の化合物またはその治療上許容し得る塩を対象に投与することを特徴とする、PD−L1とPD−1および/またはCD80の相互作用を遮断する方法。
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