JP2015192644A - スフェロイドの評価方法およびスフェロイド評価装置 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】スフェロイドおよびその周囲領域を含む画像のうちスフェロイドが占めるスフェロイド領域を特定する工程と、スフェロイド領域の画像濃度から、スフェロイドの光学濃度の平均値および該光学濃度の前記スフェロイド内でのばらつきを求める工程と、スフェロイド領域の輪郭から、スフェロイドの円形度を求める工程と、スフェロイド領域の周縁部および中央部それぞれの画像濃度からスフェロイドの鮮明度を求める工程と、光学濃度の平均値およびばらつきと、円形度と、鮮明度とを所定の演算式に代入してスフェロイドの崩壊度を求める工程とを備える。
【選択図】図3
Description
Sh=log10{Is/(Is−Sa/4)}
の左辺Shとして鮮明度が定義されてもよい。詳しくは後述するが、このような定義に基づく鮮明度を導入することで、スフェロイドの崩壊度をより精度よく評価することが可能となる。
OD=log10(I2/I1)
により求めることができる。また、光学濃度の標準偏差SD(Standard Deviation)については、例えば、スフェロイド領域のうち撮像原理上濃度のばらつきが不可避的に大きくなる周縁部を除いた領域(例えばスフェロイド領域の面積の50%に相当する面積を有するスフェロイド中央領域)内の各画素の輝度値分布における標準偏差の値として求めることができる。
Cr=4πS/L2
により求めることができる。
Sh=ODp/OD
により鮮明度Shを表すことができる。ここで、値ODpは、スフェロイド周縁部の光学濃度であり、スフェロイドの周縁領域、具体的には例えばスフェロイドの輪郭から一定範囲(例えば直径の10%に相当する幅)内のスフェロイド内部領域の輝度平均値I3と背景領域の輝度平均値I2とから、次式:
ODp=log10(I2/I3)
により表すことができる。
Sh=log10{Is/(Is−Sa/4)}
により鮮明度Shを定義する。ここで、値Isはスフェロイドの背景領域の輝度平均値であり、前出の輝度平均値I2と同じものである。背景領域の輝度を加味した光学濃度の次元で示すことにより、スフェロイドの背景領域や照明ばらつきの影響を排して各スフェロイドの鮮明度Shを客観的に表し、異なるスフェロイド間でも比較可能な数値として表すことが可能となる。
H=F0(SD,OD,Cr,Sh) … (式1)
と表すことができる。ただし、この実施形態では、各特徴量の値を一定の数値範囲にスケーリングした上で計算式に当てはめるようにしている。これは、各特徴量の数値範囲がまちまちであることに起因して計算が煩雑になったり誤差が増大したりすることを避けるためである。
H1=F5(F1(SD),F2(OD),F3(Cr),F4(Sh)) … (式2)
により、崩壊度を表すこととする。なお、詳しくは後述するが、(式2)右辺で与えられる値はスフェロイドの崩壊度を指標するものであるが、本実施形態において最終的に求めようとする崩壊度Hと同じものではない。その意味で、ここでは崩壊度を符号H1により表している。各特徴量のスケーリングについては、各細胞の活性が高く崩壊していないスフェロイドにおいて数値が1となり、崩壊の度合いが進むにつれて数値が大きくなるように、適宜に定めることができる。
F1(SD)={i×(SD−SDmin)+1}p … (式3)
により表すことができる。これにより、光学濃度のばらつきの観点から見たスフェロイドの崩壊度が数値化される。
F2(OD)={j×(OD/ODmax−1)+1}q … (式4)
により表すことができる。ただし、光学濃度の平均値ODがODmax以下であるスフェロイドについては、一律にF2(OD)=1とする。
F3(Cr)={k×(m−Cr)+1)r … (式5)
で表される関数を定義することができる。
F4(Sh)={l×(n−Sh)+1)s … (式6)
で表される関数を定義することができる。
F5={F1(SD)×F2(OD)×F3(Cr)×F4(Sh)}t … (式7)
F5={a×F1(SD)+b×F2(OD)
+c×F3(Cr)+d×F4(Sh)}t … (式8)
のいずれかを用いることができる。なお、指数tは、数値の上昇傾向を整えるために導入されるパラメータである。ここでは(式8)を用いることとするが、細胞種や培地の状態に応じて(式7)および(式8)を使い分けるようにしてもよい。
・H1>H2maxのとき、H2=H2max
・H1<H2minのとき、H2=H2min
・H2min≦H1≦H2maxのとき、H2=H1
と場合分けして表すことができる。
H=3×(H2−H2min)/(H2max−H2min) … (式9)
に代入することで、崩壊度Hが最終的に求められる。ここで右辺の定数3は、崩壊度Hを0から3までの値で表すための正規化係数である。この実施形態では判定者による崩壊度の判定が0から3までの4段階で行われることに対応して正規化係数が3となっている。
H=(z−1)×(H2−H2min)/(H2max−H2min) … (式10)
によって、崩壊度Hを0から(z−1)までの値として求めることができる。ここで、値H2は、スフェロイドの特徴量SD、OD、Cr、Shの値を前記(式1)から(式8)までに代入することで求まる値であり、(式10)の右辺は、特徴量SD、OD、Cr、Shを独立変数とする関数F0に他ならない。
11 ホルダ(保持部)
13 撮像部(撮像部、画像取得手段)
141 CPU(画像処理手段、崩壊度算出手段)
142 インターフェース部
Sp1,Sp2,Sp3 スフェロイド
W ウェル
WP ウェルプレート(容器)
Claims (15)
- スフェロイドを撮像した画像から当該スフェロイドの崩壊度を評価するスフェロイドの評価方法において、
前記スフェロイドおよびその周囲領域を含む前記画像のうち前記スフェロイドが占めるスフェロイド領域を特定する工程と、
前記スフェロイド領域の画像濃度から、前記スフェロイドの光学濃度の平均値および該光学濃度の前記スフェロイド内でのばらつきを求める工程と、
前記スフェロイド領域の輪郭から、前記スフェロイドの円形度を求める工程と、
前記スフェロイドおよびその周囲領域の画像濃度から、前記スフェロイドの鮮明度を求める工程と、
前記光学濃度の平均値およびばらつきと、円形度と、鮮明度とを所定の演算式に代入して前記スフェロイドの崩壊度を求める工程と
を備えるスフェロイドの評価方法。 - 前記演算式は、
崩壊度を指標する数値が付与されたスフェロイドの画像を複数収集し、
収集された画像のそれぞれについて求めたスフェロイドの光学濃度の平均値およびばらつきと、円形度と、鮮明度とを原因系とし、当該画像の崩壊度の数値を結果系とする回帰分析を実行することにより求められる、請求項1に記載のスフェロイドの評価方法。 - 前記演算式による演算結果では、前記スフェロイドの光学濃度の平均値が高いほど崩壊度が高くなる請求項1または2に記載のスフェロイドの評価方法。
- 前記演算式による演算結果では、前記スフェロイドの光学濃度のばらつきが大きいほど崩壊度が高くなる請求項1ないし3のいずれかに記載のスフェロイドの評価方法。
- 前記演算式による演算結果では、前記スフェロイドの円形度が小さいほど崩壊度が高くなる請求項1ないし4のいずれかに記載のスフェロイドの評価方法。
- 前記演算式による演算結果では、前記スフェロイドの鮮明度が小さいほど崩壊度が高くなる請求項1ないし5のいずれかに記載のスフェロイドの評価方法。
- 前記スフェロイドの鮮明度は、前記スフェロイドの周縁部の光学濃度と前記スフェロイド全体の光学濃度との比の値として定義される請求項1ないし6のいずれかに記載のスフェロイドの評価方法。
- 前記スフェロイドの鮮明度は、前記スフェロイド領域の輪郭におけるエッジ強度に対応する画素値を有する画素の光学濃度として定義される請求項1ないし6のいずれかに記載のスフェロイドの評価方法。
- 前記スフェロイドの鮮明度は、前記スフェロイド領域の輪郭に対応する各画素について画素の輝度値に基づきエッジ検出フィルタ演算によりそれぞれ求めたエッジ強度の平均値をSa、前記スフェロイドの周囲領域の画素の輝度の平均値をIsとしたとき、次式:
Sh=log10{Is/(Is−Sa/4)}
の左辺Shとして定義される請求項8に記載のスフェロイドの評価方法。 - 前記スフェロイドを形成する細胞種に応じて前記演算式を異ならせる請求項1ないし9のいずれかに記載のスフェロイドの評価方法。
- スフェロイドを撮像した画像から当該スフェロイドの崩壊度を判定するスフェロイド評価装置において、
前記スフェロイドおよびその周囲領域を含む画像を取得する画像取得手段と、
前記画像のうち前記スフェロイドが占めるスフェロイド領域を特定し、前記スフェロイド領域の画像濃度から、前記スフェロイドの光学濃度の平均値および該光学濃度の前記スフェロイド内でのばらつきを求め、前記スフェロイド領域の輪郭から前記スフェロイドの円形度を求め、前記スフェロイドおよびその周囲領域の画像濃度から前記スフェロイドの鮮明度を求める画像処理手段と、
前記光学濃度の平均値およびばらつきと、円形度と、鮮明度とに基づき前記スフェロイドの崩壊度を求める崩壊度算出手段と
を備えるスフェロイド評価装置。 - 前記崩壊度算出手段は、前記スフェロイドとその崩壊度を指標する数値とが対応付けられた複数の画像それぞれについて、スフェロイドの光学濃度の平均値およびばらつきと、円形度と、鮮明度とを求めて原因系とし、当該画像の崩壊度の数値を結果系として回帰分析を実行し、その結果に基づき求めた演算式と、前記光学濃度の平均値およびばらつきと、円形度と、鮮明度とから、前記スフェロイドの崩壊度を求める請求項11に記載のスフェロイド評価装置。
- 前記画像取得手段は、前記スフェロイドを含む培地を担持する容器を保持する保持部と、前記保持部に保持された前記容器内の前記スフェロイドを撮像して前記画像を取得する撮像部とを有する請求項11または12に記載のスフェロイド評価装置。
- 前記撮像部は、前記スフェロイドを非侵襲で撮像する請求項13に記載のスフェロイド評価装置。
- 前記画像取得手段は、外部の撮像装置により撮像された、または外部の記憶装置に記憶された前記スフェロイドの画像データを受け入れる請求項11または12に記載のスフェロイド評価装置。
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