JP2011519950A - 親和性成熟CRIg変異体 - Google Patents
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Abstract
Description
補体系は、通常、不活性なプロ酵素の形態で存在する一連の血清糖タンパク質から構成される複雑な酵素のカスケードである。3つの主要な経路、古典経路、第二経路、及びマンノース結合レクチン経路は、2つの類似しているC3コンベルターゼによって、C3が切断されC3a及びC3bとなるC3のレベルで結合する補体を活性化させることができる。
補体レセプタの3つの遺伝子上科が知られている:CR1及びCR2をコードする短いコンセンサス反復(SCR)モジュール、ベータ-2インテグリンファミリーのメンバーであるCR3及びCR4、 及び免疫グロブリンIgスーパーファミリーであるCRIg。
5つのソフトランダム化されたライブラリーから選択されたCRIg抗C3b突然変異体。各パネルは、C3bに対する結合親和性に基づいて各ライブラリーから選ばれたクローンを示す。シークエンスは、一文字のアミノ酸コードによって示される。各パネルは、個々の突然変異体をコンセンサス及び親野生型(WT)シークエンスと比較する。残基は適宜色がつけられている:青−ソフトランダム化された位置;灰色−ランダム化されてない;黄色−野生型(WT)とは異なる、選択された残基。表2は、それぞれ出現順に配列番号21〜63及び63〜67を開示する。
用語「CRIg」、「PRO362」、「JAM4」、および「STIgMA」は同じ意味で使用され、天然配列と変異体CRIgポリペプチドとを意味する。
酸性:残基は生理学的pHにおけるHイオンの喪失によって負の電荷を帯びており、この残基は水溶液によって、ペプチドが水溶液中にある際に含まれているペプチドの立体配置における表面位置を求めるように誘引される。
塩基性:残基は生理学的pHにおけるHイオンとの結合により正の電荷を帯びており、この残基は水溶液によって、ペプチドが生理学的pHの水性媒体中にある際に含まれているペプチドの立体配置における表面位置を求めるように誘引される。
中性/非極性:残基は生理学的pHで荷電せず、この残基は水溶液に反発して、ペプチドが水性媒体中にある際に含まれているペプチドの立体配置における内部位置を求める。これらの残基は「疎水性残基」とも呼ばれる。
中性/極性:残基は生理学的pHで荷電していないが、この残基は水溶液によって、ペプチドが水性媒体中にある際に含まれているペプチドの立体配置における外部位置を求めるように誘引される。
補体は、先天性及び適応性免疫応答の重要な成分であるが、3つの補体経路(古典、第二、及びレクチン)それぞれの活性化を通して生成された補体分解産物は炎症及び組織破壊の原因になり得る。したがって、適切な補体調節機能の欠落による制御されていない補体活性化は種々の慢性炎症性疾患に関連してきた。この炎症性カスケードにおける優性遺伝子は、補対分解産物C3a及びC5aであり、これらはC3a及びC5aレセプタを介した好中球及び炎症性マクロファージの化学誘引物質及び活性化因子として機能する(Mollnes, T.E., W.C. Song, and J.D. Lambris. 2002. Complement in inflammatory tissue damage and disease. Trends Immunol. 23:61〜64)。
したがって、本発明はC3bに対する改善された結合親和性及び増加した阻害効果等の改善された特性を有するCRIg変異体に関する。
実施例にさらに詳しく記載されているように、タンパク質又はペプチドライブラリーのファージディスプレーは、C3bに対する改善された結合親和性及び/又は増加した生物活性等のほかの改善された特性を有するCRIg変異体を選択するための有用な方法論を提供する(Smith, G. P., (1991) Curr. Opin. Biotechnol. 2:668-673)。M13遺伝子IIIコートタンパク質との融合として一価の形で表示される高親和性タンパク質(Clackson, T., (1994) et al., Trends Biotechnol. 12:173-183)は、複数ラウンドの結合選択後にファージミド粒子にパッケージ化された対応するDNAのクローン化及び塩基配列決定によって同定することが可能である。
この方法はまた、米国特許第5750373号明細書(1998年5月12日出願)に記載されている。
本発明のCRIg変異体の組換え合成のためにタンパク質をコード化できるDNAを生産するために用いることができる様々な技術が利用可能である。例えば、生成されたタンパク質のアミノ酸配列の変化をコードする自然発生的なDNA配列に基づいてDNAを誘導することが可能である。これらの突然変異DNAを使用して、本発明のCRIg変異体を得ることができる。これらの技術は、簡略化された形で、天然CRIgポリペプチドをコードする遺伝子を得、下記に述べる組換え技術によって遺伝子を修飾し、適切な発現ベクターに遺伝子を挿入し、適切な宿主細胞にベクターを挿入し、宿主細胞を培養して、所望のCRIg変異体の発現を引き起こし、そしてこれにより生産された分子を精製することを含む。
この方法はまた、CRIgの置換、欠失、及び挿入変異体を調製するための好適な方法でもある。この方法は、Wells et al. Gene 34: 315 (1985)に記載されている方法に基づいている。開始材料は、遺伝子1、突然変異させるべき遺伝子を含むプラスミド(又は他のベクター)である。開始CRIgをコードする核酸において突然変異させるべきコドン(単数又は複数)を同定する。同定した(単数又は複数の)突然変異点の両側にユニーク制限エンドヌクレアーゼがなければならない。このような制限部位が存在しない場合、上述したオリゴヌクレオチド媒介突然変異生成方法を使用して制限部位を生成し、遺伝子1の適切な位置に導入することができる。制限部位がプラスミドに導入された後に、プラスミドをこれらの部位で切断して線形化する。制限部位の間でDNAの配列をコードするが、所望の(単数又は複数の)突然変異作用を含む二本鎖オリゴヌクレオチドを、標準の手順を用いて合成する。二本の鎖は別々に合成し、その後標準の技術を用いて一緒に混成させる。この二本鎖オリゴヌクレオチドはカセットと呼ばれる。このカセットは、線形化プラスミドの端と混合可能である3’及び5’端を有するように設計され、これにより、プラスミドに直接結紮することができる。このプラスミドはここで、CRIgの突然変異したDNA配列を含む。
変異体をコードするDNAを次に適切なプラスミド又はベクターに挿入する。ベクターは宿主細胞を形質変換させるのに使用される。一般には、宿主細胞と混合可能な生物種から生じた複製及び制御配列を含むプラスミドベクターが、それらの宿主に関連して使用される。ベクターは通常、形質変換された細胞に表現型選択を提供できるタンパク質をコードする配列だけでなく、複製部位を保有する。
本発明のCRIg変異体はまた、ある程度修飾して、別の、異種ポリペプチド又はアミノ酸配列に融合するCRIgの断片を含めた、CRIg変異体を含むキメラ分子を形成することもできる。ある実施形態では、この種のキメラ分子は、CRIg変異体又はCRIgの断片の、抗タグ抗体が選択的に結合することができるエピトープを提供するタグ・ポリペプチドとの融合を含む。エピトープタグは通常、変異体CRIgポリペプチドのアミノ末端又はカルボキシル末端に配置される。この種のエピトープにタグを付けられた形態のCRIg変異体の存在は、タグ・ポリペプチドに対して抗体を使用して検出することができる。また、エピトープタグの提供により、CRIgポリペプチドを抗タグ抗体を使用して親和性浄化又はエピトープタグと結合する他の種類の親和性マトリックスによって容易に浄化することを可能にする。様々なタグ・ポリペプチド及びそれらの各抗体は、公知技術である。実施例は、ポリヒスチジン(poly−his)又はポリ・ヒスチジン・グリシン(poly−his−gly)タグ;インフルエンザHAタグ・ポリペプチド及びその抗体12CA5[Field et al., Mol. Cell. Biol., 8:2159-2165 (1988)];c−mycタグ及びそれに対する8F9、3C7、6E10、G4、 B7及び9E10抗体(Evan et al., Molecular and Cellular Biology, 5:3610-3616 (1985));及び、単純ヘルペスウイルス・グリコプロテインD(gD)タグ及びその抗体(Paborsky et al., Protein Engineering, 3(6):547-553 (1990))を含む。他のタグ・ポリペプチドは、フラグ-ペプチド(Hopp et al., BioTechnology, 6:1204-1210 (1988));KT3エピトープ・ペプチド(Martin et al., Science, 255:192-194 (1992);クァドラチュア-チューブリン・エピトープ・ペプチド[Skinner et al., J. Biol. Chem., 266:15163-15166 (1991)];及び、T7遺伝子10タンパク質ペプチド・タグ(Lutz-Freyermuth et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87:6393-6397 (1990)を含む。
本発明のCRIg変異体を、病状が補体第二経路を含む疾患の治療のために投与することができる。
補体活性化、特に補体第二経路を阻害する能力を受けて、本発明のCRIg変異体は補体が関連している疾患及び病的な状態の防止及び/又は治療に有用性があることが分かる。このような疾患及び状態は、非限定的に、補体が関連している炎症性及び自己免疫性疾患を含む。
親和性成熟CRIg変異体の調製
材料及び方法
材料:
材料−酵素およびM13−K07ヘルパー・ファージ(New England Biolabs);Maxisorp免疫プレート・プレート(Nunc. Roskilde, Denmark); 96ウェルU底ポリプロピレンプレート(COSTAR;Cat.#3365);96ウェル平底、非結合型プレート(NUNC;Cat.#269620);セイヨウワサビ・ペルオキシダーゼ/抗M13抗体結合体(Pharmacia);3,3’、5,5’-テトラメチル-ベンジジン、H2O2ペルオキシダーゼ基体(TEB)(Kirkegaard and Perry Laboratories, Inc);大腸菌XL1-blueおよび大腸菌BL21(DE3)(Stratagene);ウシ血清アルブミン(BSA)およびトゥイーン20(Sigma);Ni−NTAアガロース(Qiagen);ラビットRBC(Colorado Serum Company; Cat. #CS1081);ゼラチンベロナール緩衝液(GVB)[100mlのベロナール緩衝液] (BioWhittaker; Cat. #12-624E);ゼラチン(Bovine Skin Type B; SIGMA; Cat. #G9391-100G);C1q欠損血清(CompTech; Cat. #A300);fHタンパク質(Complement Technology; Cat. #A137);抗FLAG−HRP、50%のグリセロール中のmAb、Sigma Cat#A-8592 1.1mg/mL
CRIgをコードしているDNA断片は、XhoI及びSpeI消化されたファージミドベクター(p3DvlzPDZ−gD)(Kunkel et al., Methods Enzymol. 154:367-382 (1987))に、野生型コントロール及びCRIg変異体を設計するためのテンプレートとしてライゲーションされた。その後、ランダム化の対象となる各残基にTAA終止コドンを有するテンプレートが、CJ239大腸菌細胞(Kunkel et al., 1987, supra)から調製された。ソフトランダムストラテジーがCRIg変異体の選択のために用いられ、ここではほぼ50%の突然変異率が、野生型ヌクレオチドに適切なベースの70−10−10−10混合物を有する毒入りのオリゴヌクレオチドストラテジーを用いて、選択された位置に導入された。ライブラリー設計では:5=50% A、10% G、10% C及び10% T;6=50% G、10% A、10% C及び10% T;7=50% C、10% A、10% G及び10% T;8=50% T、10% A、10% G及び10% Cである。
ライブラリー1は、BCR1、ATC CTG GAA GTG CAA 656(配列番号:7) AGT GTA ACA GGA CCT 866(配列番号:8) 555GGG GAT GTG AAT CTT(配列番号:9);
ライブラリー2は、BCR2、AAG TGG CTG GTA CAA 768(配列番号:10) 668 TCA 657 775 688 577 ATC TTT(配列番号11) 786 CGT 657 TCT TCT GGA GAC CAT(配列番号:12);
ライブラリー3は、BCR3、TTT CTA CGT GAC TCT(配列番号:13) 877 668 657 757 588 756 756 678 555 TAC 756 GGC CGC CTG CAT GTVG(配列番号:14);
ライブラリー4は、BCR4、CAA TTG AGC ACC CTG(配列番号:15) 656 586 657 GAC 768 AGC CAC TAC ACG TGT 656 (配列番号:16) GTC ACC TGG 756(配列番号:17) ACT CCT GAT GGC AAC(配列番号:18);
ライブラリー5は、BCR5、CCT GAT GGC AAC 756(配列番号:19) GTC 688 768 657 555 ATT ACT GAG CTC CGT(配列番号:20)。
Maxisorp免疫プレートを、C3b(5μg/ml)で4℃において一晩中コーティングして、リン酸塩緩衝食塩水(PBS)及び0.05%(w/v)ウシ血清アルブミン(BSA)で室温において1時間ブロッキングした。ファージライブラリーをC3bコートプレートに加えて、3時間室温において培養した。プレートを10回洗浄し、結合したファージを50mMのHClで溶離して、等量の1.0Mのトリス・ベース(pH7.5)で中和した。回収されたファージを大腸菌XL1−blueの継代により増幅させ、結合選択の追加のラウンドに使用した。5ラウンドの後、各ライブラリーから12の個別のクローンを選択し、カルベニシリンおよびM13−KO7ヘルパー・ファージで補足された500μlの2YTブロスの96ウェルフォーマットにおいてそれらを増殖させた。二倍の連続希培養液上清を、計画された位置としてC3b、抗gD、BSA及び非同族タンパク質でコーティングすることによって、384のウェルプレートに直接加えた。ファージ濃度を推定するために結合親和性を測定したところ、C3bはBSA及び非同族タンパク質に対しては高くないが抗gDよりも著しく高かった。同じフォーマットの各ライブラリーから約200のクローンを選別してファージ濃度を調節し、各ライブラリーから抗gDよりもC3bに著しく結合することを示した24〜48のクローンを選択して、それらを分析のために配列した。
結合親和性を推定するために、修飾されたファージELISAを用いた。96ウェルマイクロタイタープレートを、4℃で一晩50mM炭酸塩緩衝液(pH9.6)の2μg/mlの 3Cbでコーティングした。プレートを次に、室温で1時間、PBS、0.5%BSAでブロッキングした。ファージが提示するCRIg変異体を連続的にPBT緩衝液で希釈し、ファージ濃度を推定するために結合を測定したところ、飽和シグナルが50%であった。ファージの非飽和濃度を調節し、C3bの連続的な希釈によって2時間プレインキュベートした後、混合物をC3bでコーティングしたアッセイプレートに移した。15分インキュベートした後に、プレートをPBS、0.05%Tween20で洗浄し、ワサビペルオキシダーゼ/抗M13抗体複合体(PBT緩衝液で1:5000の希釈)で30分インキュベートした。プレートを洗浄し、TMB基体で現像して、1.0MのH3PO4で急冷し、450nmにおいて分光光度法で読み取った。親和性(Ic50)は、競合C3bの濃度として計算し、この結果最大半限のファージミド結合が得られた。
発現プラスミドを有している大腸菌BL21(DE3)の単一コロニーを、50μg/mLのカルベニシリン(LB/carb媒体)で補足される30mLのLB媒体に植菌し、37℃で一晩増殖させた。バクテリアを回収し洗浄し再懸濁させて、500mLのLB/carb媒体に植菌した。培養菌は37℃で対数増殖中期(A600 =0.8)まで増殖させた。タンパク質発現を0.4mMのイソプロピル 1−チオ−−D−ガラクトピラノシドによって誘発し、培養菌を30℃で24時間増殖させた。バクテリアを4000gで15分間の遠心分離によってペレット化し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で二回洗浄して、−80℃で8時間凍らせた。ペレットを50mLのPBSで再懸濁させ、そしてバクテリアをマイクロフルイダイザープロセッサー又は超音波分解機器を通過させることによって溶解させる。CRIg変異体タンパク質を、2mlのNI−NTAアガロース及びゲル濾過によって精製した。
huCRIg(L)−LFHを2ug/mLのPBS(pH 7.4)で希釈し、4℃(25ul/ウェル)で一晩中(16〜18時間)インキュベートすることによって、Maxisorp 384ウェル平底プレート(Nunc, Neptune, NJ)にコーティングした。プレートをWash Buffer(PBS、pH7.4、0.05%Tween 20)で3回洗浄し、50ul/ウェルのBlock Buffer (PBS、pH 7.4、0.5%BSA)を各ウェルに加えた。プレートを、1〜3時間ブロックした;この培養及びそれに続く全ての培養は、室温及び軌道シェーカで実行した。ブロッキング・ステップの間、(ジェネンテックで精製された)C3bを20nMのAssay Buffer(PBS pH7.4、0.5%BSA、0.05%Tween−20)で希釈し、mutCRIg−huFc分子を20000〜0.34nMの濃度範囲で連続的に希釈した。次にC3b及びmutCRIg−huFc分子を1:1で混合し、0.5〜1時間プレインキュベートした。ブロックされたプレートを(上述したように)3回洗浄し、C3b:mutCRIg−huFc複合体を点滴板に加えた(25ul/ウェル)。1〜2時間インキュベートした後で(上述したように)ELISAプレートを3回洗浄し、プレート結合C3bを抗ヒトC3b抗体(clone 5F202, US Biological, Swampscott, MA; 600ng/mL, 25ul/well)を添加することにより検出した。プレートは、上述したように1〜2時間インキュベートし洗浄した。1:2000に希釈されたHRP抱合型抗ネズミFc IgG(Jackson ImmunoResearch, West Grove, PA)を次に加えて(25ul/ウェル)、プレートを1〜2時間インキュベートした。最終洗浄の後、25ul/ウェルのTMB基体(Kirkegaard & Perry Laboratories, Gaithersburg, MD)をELISAプレートに加えた。顕色は、25ul /ウェル1.0Mリン酸を加えることによって約8分後に停止させた。450nm及び650nmの吸収度を、Spectra Max 250マイクロタイタプレートリーダ(Molecular Devices, Sunnyvale, CA)を使用して測定した。
mutCRIg−Fcの補体活性化を阻害する能力を、Wieslab(登録商標)補体系第二経路キット(Alpco Diagnostics, Salem, NH)を使用して評価した。連続的に希釈されたmutCRIg−Fc(400〜0.2nM)およびC1q欠損ヒト血清(5%)(Complement Technology, Tyler, TX)を所望の最終濃度の2倍の濃度で調製して1:1で混合し、LPSコートELISAプレート(100ul/ウェル)に加える前に300RPMで軌道シェーカ上で5分間プレインキュベートした。残りのアッセイは、製造業者の指示に従った。簡潔には、ELISAプレートのサンプルを 37℃で60〜70分間インキュベートし、次にWash Buffer(PBS、pH7.4、0.05%Tween20)で3回洗浄した。100ul/ウェルの抗C5b−9抱合体をELISAプレートに加えた。室温で30分間インキュベートした後、上述したようにELISAプレートを洗浄して、100ulの基体を各ウェルに加え、プレートをさらに30分間の室温でインキュベートした。発色現像は、50ul/ウェルの5mMEDTAを加えることによって停止させた。405nmでの吸収度を、MultiSkan Ascentマイクロタイタプレートリーダ(Thermo Fisher Scientific, Milford, MA )を使用して測定した。
ウサギの赤血球(Colorado Serum Company, Denver, CO)を、0.1%のウシの皮膚ゼラチン(Sigma)(GVB)を含むベロナール緩衝液(Sigma, St. Louis, MO)で3回洗浄し、各洗浄に対し10分間1500rpmで4℃において遠心分離させた。最終的な遠心分離ステップの後、細胞を最終濃度2×109セル/mLでGVBの中に再懸濁した。GVBに連続的に希釈した補体阻害剤を、50μL/ウェルで96ウェルU底ポリプロピレンプレート(Costar, Cambridge, MA)に加え、続いて0.1MMgCl2/0.1MEGTA/GVBに1:2で希釈したウサギの赤血球を20μL/ウェル加えた。プレート内補体カスケードを、GVBに予め1:3で希釈したC1q欠損血清(Complement Technology, Tyler, TX)を30μL/ウェルで加えることによって誘発した。100μL/ウェルの10mMEDTA/GVBで反応を停止させる前に、プレート(単数又は複数)を、室温において30分間穏やかに攪拌することによってインキュベートした。プレートを5分間1500rpmで遠心分離させた後に、上澄みを透明な平底で非結合型の96ウェルプレート(単数又は複数)(Nunc, Neptune, NJ)に移し、マイクロプレートリーダ(Molecular Devices, Sunnyvale, CA)を使用して、412nmにおける光学密度を読み取った。
C3に対する変異体CRIg分子の交差反応性を、アルファスクリーン(登録商標)ヒスチジン(ニッケルキレート)検出キット(PerkinElmer, Waltham, MA)を使用して評価した。連続的に希釈したヒトのC3及びC3b(3000〜0.7nM)のほかに、ビオチン化iC3b(30nM)、および変異体CRIg(mutCRIg)と野生型CRIg分子(15〜60nM)を、所望の最終濃度の3倍の濃度に調製して1:1:1で混合し、そして、3000TPMにおいて軌道シェーカ上で30分間、外気温でプレインキュベートした。(各0.1mg/mL)ストレプトアビジンドナービーズとニッケルキレートアクセプタービーズの1:1の混合物を所望の最終濃度の4倍の濃度で調製し、反応に加えた。反応プレートを光から保護しながら3000rpmで軌道シェーカ上で60分間、外気温でインキュベートした。プレートを、AlphaQuest(登録商標)-HTSマイクロプレート・アナライザー(PerkinElmer, Waltham, MA)で分析した。
突然変異体および野生型CRIgに対するC3bの親和性を、 Biacore(登録商標)A100計測器(GE healthcare)の表面プラズモン共鳴測定値を用いて測定した。抗Fc捕獲フォーマットを採用し、KDを平衡結合測定値から算出した。センサチップは、製造業者によって供給された指示に従って、抗muFc捕獲キット(BR-1008〜38)を使用して準備した。突然変異体または野生型CRIgを、流れている緩衝液(10mMHEPES pH 7.4、150mMNaCl、0.01%Tween-20)で1μg/mLに希釈し、〜100 RUの融合タンパク質がチップ表面の一点に捕獲されるように、60μLの注入を行った。CRIg以外の捕捉抗体を含む参照スポットに対する信号の減算を有する、CRIgスポット上の様々なC3b濃度の溶液の10分注入についてのセンサーグラムを記録した。10μL/分の流量及び25℃の温度で、4μM〜15.6nMの濃度範囲のC3bの2倍希釈系列についてのデータが得られた。表面は、10mMGly-HCl pH 1.7の30秒間の注入によって、結合サイクル間で再生させた。各C3b注射終了後に得られたプラトー値を使用して、Biacore A100 評価ソフトウェア v1.1の親和性アルゴリズムを利用しKDを算出した(Safsten et al. (2006) Anal. Biochem. 353:181)。
ファージライブラリーの設計
目的のライブラリーを設計するために、C3bを複合したCRIgの結晶構造を使用した。5つのライブラリーは、CRIgおよびC3b間の接触領域をカバーするように設計された(図4)。CRIgライブラリーは、一価のファージディスプレーベクターのg3pマイナーコートタンパク質に対する融合物として構築された(Zhang et al., J Biol Chem 281(31): 22299-311 (2006))。ランダム化されるべき各残基において、ファージプラスミドのCRIgコード部分に突然変異生成によって停止コドンを導入した。停止コドンを含む各構築物を次に、ファージディスプレーライブラリー(材料および方法を参照)を生成するために用いた。ある「ソフトランダム化」ストラテジーを使用してバインダを選択し、野生型配列バイアスを維持することにより、選択位置が50%の確率で変異した。平均的多様性が一ライブラリーにつき>1010の独立配列である5つのライブラリー全てが得られた。(表1)。
結合選択4ラウンド後に、5つのライブラリーから38のユニーククローンが得られた。(表2)。ライブラリー1には、位置15のリジンが保存された。位置8においてグルタミン酸が芳香族残基(チロシンおよびトリプトファン)に置き換えられた。位置14は、親トリプトファン又は同種のフェニルアラニンによって占有された。ライブラリー2において、24のクローンを配列し、その全部がコンセンサスを明示した。位置42、46および47は、野生型として保存された。アスパラギン、ヒスチジンおよびフェニルアラニンにより、野生型配列が位置43、44および45において置き換えられた。ライブラリー3において10の位置をランダム化し、そして、配列は位置54、55、56、57、58、61、62および63において完全に保存された。イソロイシンまたはリジンは、位置60で占有された。位置64において、グルタミンはアルギニンと置き換えられるか、保存された。ライブラリー4では、芳香族残基が位置86を占有し、同種の塩基性残基(アルギニンおよびリジン)が位置99を占有した。位置85、87および95もまたソフトランダム化されたが、高度に保存されているようであった。ライブラリー5では、2つの重要な同種の塩基性残基であるリジンおよびアルギニンが位置105においてグルタミンよりも優先された。負に帯電しているアスパラギン酸または酸性残基、アスパラギンは位置110で優先された。
溶血阻害アッセイにおいてC3bに対する結合親和性及び有効性を増加させる必須残基を同定するための次の方法は、優位な単一の突然変異を組み込み、他の位置を野生型として保つことによって、又はファージELISAによって判定された第1世代ファージライブラリーから2〜3の高親和性クローンを選択することによって第2世代のCRIg変異体の第2世代を設計することであった。正確にこれらの突然変異体の親和性および有効性を測定するために、全ての変異体を単離タンパク質として発現させた。溶血阻害アッセイからの結果(表3)は、ライブラリー1からのL12、ライブラリー3からのL33が、溶血アッセイでの野生型に比べて4〜10倍有効性を大幅に増加させることを示した。ライブラリー3からのL32は、野生型CRIgと比較して10倍改良されたIC50を示した。データはまた、細胞ベースアッセイからの結合親和性及び有効性が相関していないことを証明した。
第2世代ライブラリーからの結果に基づいて、更に溶血アッセイにおける有効性及び結合親和性を高めるために、突然変異体の第3世代を設計した。生物学上最も有力な突然変異体(L12−8W、L33−Q60I/L32−Q64R及びL41−M86Y)のうちの3つ、およびテンプレートとして最も高い結合親和性を有する突然変異体(L32−Q64R)のうちの1つを選択した。次に、溶血アッセイにおける有効性及び結合親和性を高める最適な一連の突然変異体を判定するために、これらの突然変異体をライブラリーの第2世代において得られた他の生物学的に有力なクローンと結合させた。詳細な分析のために、CRIg変異体を発現させ精製した。データは、WL41及びWL59突然変異体の結合親和性よりも3〜6倍高かったにも関わらず、L12からの組合せ突然変異体の阻害活性が上がらず、親突然変異体と比較してより低い活性さえ示した(表4)。L32からの突然変異体の中では、RL41は、野生型よりも1.8倍優れた結合親和性と、6倍優れた溶血アッセイにおける有効性を示した。L33グループからの全ての突然変異体は、溶血アッセイにおける有効性が有意に上がらなかったにもかかわらず、野生型と比較して約27〜226倍の大幅に増加した結合親和性を示した。また、我々は親和性が改善された組合せクローンの大部分には、60I−64Rおよび86Yが関係していることに気づいた。
競合ELISA(図4及び表3)において最も高い親和性を有する突然変異体Q64R M86Yを、更なる分析のために選択した。C3bに対するCRIg wt及びCRIg Q64R M86Yの結合親和性を判定するために、CRIg wtおよびCRIg Q64R M86YのBiacore分析を実施した。CRIg Q64R M86Yの親和性は、野生型CRIg(図6)よりも5倍改善された。以前の研究において、CRIg wtはC3bに選択的に結合するが天然C3には結合しないことを示した(Wiesman et al., Nature, 444(7116):217-20, 2006)。突然変異生成によりこの選択性が変わる可能性があるため、アルファスクリーン流体相競合アッセイにおいてC3と対比したC3bに対するCRIg Q64R M86Yの親和性を比較した。CRIg Q64R M86Yは可溶性C3とではなく可溶性C3bと競合し、これにより突然変異生成が活性成分C3b(図7)に対するCRIgの選択性に影響を及ぼさなかったことを示した。この選択性は、C3bと複合するCRIg Q64R M86Yの構造のこれらの残基の分析によって更に確認された(データ図示せず)。
モニタリング及び評価:
各足のスコア
0= 紅斑および腫張なし
1=足の中央(足根骨)又は足首に限定された紅斑および軽度の腫張
2=足首から足の中央まで拡がった紅斑および軽度の腫張
3=足首から中足骨の関節まで拡がった紅斑および中程度の腫張
4=足首、足及び指を含む紅斑および重症の腫張
平均スコア=4つの足のスコアの合計
疾病段階、軽度(平均スコア1〜3)、中程度(平均スコア4〜8)及び重度の疾病(平均スコア9以上)。平均スコアは、関連する関節の数を反映する。
第6日に、血液サンプルを屠殺前に麻酔をして心臓穿刺によって収集した。hCRIg−Fc融合タンパク質の量は、血清を使用して測定した。関節は、組織学評価のために収集した。
Claims (38)
- 配列番号:2のアミノ酸配列のE8−K15、R41−T47、S54−Q64、E85−Q99、及びQ105−K111からなる群から選択される領域のアミノ酸置換を含むCRIg変異体。
- C3よりもC3bに対して選択的に結合する、請求項1に記載の変異体、又はその断片。
- 配列番号:2の天然配列ヒトCRIgよりもC3bに対して増加した結合親和性を有する、請求項1に記載の変異体。
- 結合親和性が少なくとも2倍増加した、請求項3に記載の変異体。
- 結合親和性が少なくとも5倍増加した、請求項3に記載の変異体。
- 結合親和性が少なくとも10倍増加した、請求項3に記載の変異体。
- 結合親和性が少なくとも90倍増加した、請求項3に記載の変異体。
- 配列番号:2の天然配列ヒトCRIgよりも強力な補体第二経路の阻害剤である、請求項1に記載の変異体。
- 配列番号:2の天然配列ヒトCRIgよりも少なくとも2倍強力である、請求項8に記載の変異体。
- 配列番号:2の天然配列ヒトCRIgよりも少なくとも5倍強力である、請求項8に記載の変異体。
- 配列番号:2の天然配列ヒトCRIgよりも少なくとも10倍強力である、請求項8に記載の変異体。
- 配列番号:2のアミノ酸配列の位置8、14、18、42、44、45、60、64、86、99、105及び110からなる群から選択されるアミノ酸の位置に一又は複数のアミノ酸置換を含む、請求項1に記載の変異体。
- 配列番号:2のアミノ酸配列のアミノ酸位60、64、86、99、105および110における一又は複数のアミノ酸置換を含む、請求項1に記載の変異体。
- E8W、W14F、E84Y/W14F;P45F;G42D/D44H/P45F;Q60I;Q64R;Q60I/Q64R;M86Y;M86W、M86F、M86W/Q9R;M86F/Q99R;K110D、K11N;Q105R/K110N;Q105R/K110Q;及びQ105K/K110Dからなる群から選択される一又は複数の置換を含む、請求項1に記載の変異体。
- Q64R/M86Y;Q60I/Q64R/E8Y;Q60I/Q64R/G42D;Q60I/Q64R/P45F;Q60I/Q64R/G42D/D44H/P45F;Q60I/Q64R/M86Y;Q60I/Q64R/Q105R;Q60I/Q64R/Q105K;Q60I/Q64R/K110N;Q60I/Q105R/K110N;M86Y/E8Y;M86Y/G42D/D44H/P45F;M86Y/P45F;M86Y/G42D/D44H/P45F;及びM86Y/Q99K/M86Y/Q99R/M86Y/Q105R/M86Y/Q105K/M86Y/Q105R/K110Nからなる群から選択される一又は複数の置換を含む、請求項1に記載の変異体。
- Q60I;Q64R;Q60I/Q64R;M86Y;Q99L;Q105K/K110D;E8W/Q105R/K110N;Q64R/M86Y;Q60I/Q64R/E8Y;Q60I/Q64R/G42D;Q60I/Q64R/P45F;Q60I/Q64R/G42D/D44H/P45F;Q60I/Q64R/M86Y;Q60I/Q64R/Q105R;Q60I/Q64R/Q105K;Q60I/Q64R/K110N;M86Y/P45F;及びM86Y/Q105Kからなる群から選択される一又は複数の置換を含む、請求項1に記載の変異体。
- Q60I/Q64R/M86Y又はQ60I/Q64R/G42D/D44H/P45Fの置換を含む、請求項1に記載の変異体。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載の変異体を含むキメラ分子。
- イムノアドヘシンである請求項18に記載のキメラ分子。
- 前記CRIg変異体が配列番号:2の全長CRIgよりも短い、請求項19に記載のキメラ分子。
- CRIg細胞外ドメインを含む、請求項20に記載のキメラ分子。
- 薬学的に許容可能な賦形剤と混合して、請求項1〜17のいずれか1項に記載のCRIg変異体を含む医薬組成物。
- 薬学的に許容可能な賦形剤と混合して、請求項19に記載のイムノアドヘシンを含む医薬組成物。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載のCRIg変異体又は上記変異体を含むイムノアドヘシンの予防的又は治療的な有効量を、上記治療を必要とする対象に投与することを含む、補体関連疾患又は状態の予防又は治療のための方法。
- 前記補体関連疾患が、炎症性疾病または自己免疫疾病である、請求項24に記載の方法。
- 前記補体関連疾患が、慢性関節リウマチ(RA)、成人呼吸窮迫症候群(ARDS)、虚血及び再灌流後の遠隔組織損傷、心肺バイパス手術中の補体活性化、皮膚筋炎、天疱瘡、狼瘡腎炎及び結果として生じる糸球体腎炎及び脈管炎、心肺バイパス、心臓麻痺によって誘発された冠状動脈内皮機能不全、II型膜性増殖性糸球体腎炎、IgA腎障害、急性腎不全、クリオグロブリン血症、抗リン脂質症候群、年齢関連性黄斑変性、ブドウ膜炎、糖尿病性網膜症、同種移植、超急性拒否反応、血液透析、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、喘息、吸収性肺炎、蕁麻疹、慢性特発性蕁麻疹、溶血性尿毒症症候群、子宮内膜症、心臓性ショック、虚血再かん流障害及び多発性硬化症(MS)からなる群から選択される、請求項25に記載の方法。
- 前記補体関連疾患が、炎症性腸疾患(IBD)、全身性エリテマトーデス、関節リウマチ、若年性慢性関節炎、脊椎関節症、全身性硬化症(硬皮症)、特発性炎症性筋疾患(皮膚筋炎、多発性筋炎)、シェーグレン症候群、全身性脈管炎、類肉腫症、自己免疫溶血性貧血(免疫性の汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症)、自己免疫血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫性の血小板減少)、甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎)、真性糖尿病、免疫介在性腎疾患、(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎)、多発硬化症、特発性多発性神経障害等の中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、伝染性肝炎(A、B、C、D、E型肝炎、及びその他の非肝向性ウイルス)、自己免疫慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変症、肉芽腫性肝炎、及び硬化性胆管炎等の胆道胆嚢疾患、炎症性及び線維性肺疾患(例えば嚢胞性線維症)、グルテン過敏性腸疾患、ウィップル病、水疱性皮膚病、多形性紅斑及び接触皮膚炎を含む自己免疫又は免疫介在性皮膚病、乾癬、好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎等の肺のアレルギー性疾患、移植片拒絶反応及び移植片対宿主病を含む移植関連の疾病、アルツハイマー病、発作性夜間ヘモグロビン尿症、遺伝性血管性浮腫、アテローム性動脈硬化症、及び膜性増殖性II型糸球体腎炎からなる群から選択される、請求項25に記載の方法。
- 前記補体関連疾患が慢性関節リウマチ(RA)である、請求項25に記載の方法。
- 前記補体関連疾患が補体が関連している目の症状である、請求項25に記載の方法。
- 補体が関連している目の症状が、加齢性黄斑変性(AMD)、ブドウ膜炎、糖尿病性及びその他の虚血関連の網膜症、眼内炎及び他の眼内新生血管病の全ての段階からなる群から選択される、請求項29に記載の方法。
- 眼内新生血管病が、糖尿病性黄斑浮腫、病的近視、フォン・ヒッペル・リンドウ病、目のヒストプラスマ症、網膜中心静脈閉塞症(CRVO)、角膜新血管形成及び網膜新血管形成からなる群から選択される、請求項30に記載の方法。
- 前記補体が関連している目の症状が、加齢性黄斑変性(AMD)、脈絡膜新血管形成(CNV)、糖尿病性網膜症(DR)及び眼内炎からなる群から選択される、請求項29に記載の方法。
- 前記AMDが滲出型AMDである、請求項32に記載の方法。
- 前記AMDが乾性又は萎縮性AMDである、請求項32に記載の方法。
- 前記対象が哺乳類である、請求項24に記載の方法。
- 前記哺乳類がヒトである、請求項35に記載の方法。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載のCRIg変異体、又は上記変異体を含むイムノアドヘシンの有効量を前記哺乳類に投与することを含む、哺乳類におけるC3b補体断片の生産を阻害する方法。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載のCRIg変異体、又は上記変異体を含むイムノアドヘシンの有効量を前記哺乳類に投与することを含む、哺乳類の補体第二経路の選択的阻害のための方法。
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