JP2010509570A - エクスビボフローサイトメトリーの方法および装置 - Google Patents
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Abstract
【選択図】図19
Description
本出願は、2006年11月3日に出願された米国仮特許出願第60/856,667号および2007年8月17日に出願された米国仮特許出願第60/956,562号に対する優先権を主張し、これらの開示全体は参照することにより本明細書に組み入れられる。
<材料>
Fmoc−Lys(Mtt)−ワング樹脂、Fmoc−Glu−OtBu、HOBT(1−ヒドロキシベンゾトリアゾール)およびHBTU(2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート)を、ノバビオケム(Novabiochem)社(サンディエゴ)から購入した。ピペリジン、DIPEA(ジイソプロピルエチルアミン)、ローダミンBイソチオシアネート(Rd−ITC)およびトリイソプロピル生理食塩水(TIPS)は、アルドリッチ(Aldrich)社(ミルウォーキー)からであった。DiIC18(3)およびフルオレセインイソチオシアネート(FITC)は、モレキュラー・プローブ(Molecular Probes)社(インビトロゲン(Invitrogen)社)から購入した。PD−10カラム(セファデックスG−25M)は、アマシャム(Amersham)社からであった。EC17(フォレート−FITC)、ウサギ血清およびフォレート結合カラムは、エンドサイト(Endocyte)社によって提供された。
<細胞培養>
鼻咽頭癌細胞(KB細胞)を、フォレート欠損RPMI1640(ギブコ(Gibco)社)プラス10%ウシ胎仔血清(または子ウシ血清)中でpH7で培養し、37℃でインキュベートした。
<フォレート結合体の固相合成>
フォレートの前駆体(N10−TFA−プテロイン酸)を標準手順に従って合成した。Fmoc−Lys(Mtt)−ワング樹脂を、反応の前に窒素バブリングと共に20分間DMF中に浸漬した。20%ピペリジンを追加してFmoc保護基を切断した。4当量のDIPEAに加えて、DMF中に溶解した2.5当量のFmoc−Glu−OtBu、HOBTおよびHBTUも、反応漏斗に追加した。室温での2時間の窒素バブリング後に、Fmoc切断工程は、20%ピペリジンにより繰り返された。次に、4当量のDIPEAに加えて、1:1のDMF/DMSO(ジメチルホルムアミド/ジメチルスルホキシド)中に溶解した、1.5当量のN10−TFA−プテロイン酸および2.5当量のHOBTおよびHBTUも、窒素によるバブリングと共に、4時間かけて反応に追加した。次に生成物を、DMF、DCM(ジクロロメタン)、メタノールおよびイソプロピルアルコールにより完全に洗浄し、窒素下で乾燥した。1%TFA/DCM(トリフルオロ酢酸/ジクロロメタン)を使用してMtt(Mtt=4−メチル−トリチル)基を切断した。2.5当量のRd−ITC(DMF中に溶解した)および4当量のDIPEAを樹脂に追加し、反応を減光条件下で室温で一晩行なった。結合体の切断をTFA:TIPS:H2O(95:2.5:2.5)によって行なった。粗製生成物を冷エーテルによる沈殿によって回収した。粗製生成物を一晩凍結乾燥した。第2日目に、粗製生成物を、窒素バブリングと共に10%水酸化アンモニウム(pH=10)を使用して45分間加水分解した。生成物を凍結乾燥によって回収した。分取HPLC(リゲル(Rigel))を使用して、精製を実行した。
<抗体精製および結合体化>
抗フォレート受容体ポリクローナル抗体のPU9、PU10およびPU17は、フォレート親和性カラムを使用して、抗ウサギ血清から精製した。サンプルはPD−10カラムを使用して脱塩し、次にサンプルはPBS(pH8.0)中で緩衝した。結合体化は、抗体1mgあたり80μgのFITCの比率で減光条件下で室温で4時間かけて実行した。結合体化後に、標識抗体を親和性カラムクロマトグラフイーによって精製した。サンプルはPD−10カラムを使用して脱塩し、次にサンプルはPBS(pH=7.4)中で緩衝した。抗体濃度およびFITC対タンパク質比率は、以下のように、UV/可視光線吸光度を使用してそれぞれ計算した:C(mg/ml)=[A(280)−0.31*A(495)]/1.4、F/P比率=3.1*A(495)/[A(280)−0.31*A(495)]。
<血液サンプル>
多光子フローサイトメトリー分析を実行するために、卵巣癌患者から抗凝血剤中に回収した新鮮血サンプルを使用して、実験を実行した。血液サンプルは、フローサイトメトリーによる検査の前にフォレート−アレクサフルオル488により処理した。
イメージングフローサイトメトリーは、共焦点イメージング、非共焦点イメージングおよび2光子励起蛍光(TPEF)イメージングを可能にするレーザー走査顕微鏡(IX70/FV300、オリンパス(Olympus)社)により実行された。543nmのヘリウム‐ネオンレーザーを、対物レンズからの1mWの出力で、非共焦点イメージングおよび共焦点蛍光イメージングのために使用した。フェムトセカンドチタンサファイアレーザー(Mira900、コヒレント(Coherent)社)を、対物レンズからの35mWの出力で、TPEFのために使用した。パルス継続期間は800nmで100fsであり、反復率は77MHzである。データーは、血液サンプルの二次元XYスキャニング、または一次元スキャニングによって得られた。
<フォレート結合体および抗フォレート受容体ポリクローナル抗体を使用するフォレート受容体陽性腫瘍細胞の標識同士の比較>
フォレート−FITC(1)、およびFITCと結合体化した3つの異なる抗FRポリクローナル抗体(PU9(2)、PU10(3)およびPU17(4))の標識強度のフローサイトメトリー分析を実行した。未標識KB細胞(5)、および50nMフォレート−FITCプラス5μM葉酸と共にインキュベートしたKB細胞(6、完全に競合させた)を、陰性対照とした。培養したKB細胞は、フローサイトメトリーによる分析の前に上述のプローブの各々と共に37℃で30分間インキュベートした。フォレート−FITC標識KB細胞の平均蛍光強度は、任意の抗フォレート受容体(FR)ポリクローナル抗体標識KB細胞よりも2桁高い大きさである(図1)。フォレート−FITCはただ1つのFITCを保有するが、抗体は複数のFITC分子で標識できるので、この結果は意外なものであった。さらに、ポリクローナル抗体はFR上の複数のエピトープに結合することができるが、フォレート−FITCは単一部位のみに結合する。この結果は、蛍光抗腫瘍細胞抗体による任意のCTCの検出がうまくいかないことについて説明する(データー不掲載)。
<フォレート−アレクサフルオル488による腫瘍細胞標識の前に、全血の赤血球濃縮画分から腫瘍細胞濃縮画分を分離する方法の比較>
全血サンプル中の他のすべての細胞(すなわち腫瘍細胞画分)から赤血球を分離する方法を解析した。これらの方法は以下の通りであった:1)実施例9および図3中に詳細に記載される抗体カクテル法、2)白血球からの分離をよりよくするために、RBCを収縮させることができるカルシウムイオノフォアであるA23187の使用、3)赤血球から白血球を分離するために一般に使用されるフィコール密度分離、4)全血中の他の細胞集団を溶解せずに、RBCを破裂させる十分な浸透圧を生じることができる塩化アンモニウム溶解、5)癌患者の末梢血サンプルからのCTCの迅速な分離のために市販で入手可能な濃縮キット(オンコクイック(Oncoquick)、グライナー・バイオワン(Greiner Bio-One)社)、6〜8)異なる平衡密度による異なるタイプの密度遠心分離溶媒、9)フィルターの上の白血球を保持するが、赤血球の濾過を可能にする、下部から〜3mlの多孔質膜インサートを備えた遠心分離チューブである、スピンディスク(Spin Disk)チューブ(グライナー・バイオワン社)。結果を図2中に示す。フィコール密度分離プラス抗体カクテル法により最良の%回収が得られた。
<循環腫瘍細胞濃縮の手順:抗体カクテル法>
図3において、以下の略語を使用する。CTC:循環腫瘍細胞、MNC:単核細胞、GNC:顆粒球、RBC:赤血球、フィコール:分離溶媒、Abカクテル:上皮性CTC濃縮抗体のカクテル。抗体カクテル中の四量体の抗体複合体は、両方の細胞タイプを枯渇させるように不要な白血球を赤血球に架橋し、癌細胞がより純粋な集団であることを可能にする。
<検出のためのエクスビボ患者サンプルの調製、およびフローサイトメトリー分析による病原性細胞の定量化>
癌患者からの2mlの血液サンプルを30分間室温で暖めた。50μL/mLのロゼットセップ(RosetteSep)(商標)の循環ヒト上皮性腫瘍細胞広汎濃縮カクテル(Circulating Human Epithelial Tumor Cell Extensive Enrichment Cocktail)(ステムセル・テクノロジーズ(StemCell Technologies)社)を全血サンプルに追加し、穏やかに混合し、次に室温で20分間インキュベートした。サンプルをPBSF(PBS+2%FBS)の等容量で希釈し、十分に混合した。3:4の容量比率で希釈したサンプルの下にフィコール−パック(Ficoll-Paque)を重層した。次にサンプルは、ブレーキはオフにして室温400gで30分間遠心分離した。上清を、フィコール−パックから他のチューブへと移した。6〜8mlのPBSFを追加して細胞を洗浄し、次に細胞を500g15分間の遠心分離によりペレットにした。およそ500〜1000μlの液体をサンプル中に残して細胞およびフォレート−造影剤488(100nM)を再懸濁した。CD45−Cy5(1:300)およびヘキスト(Hoechst)(5μg/ml)をサンプルに追加した。1時間氷上でサンプルをインキュベートした。5mlの容量に達するようにPBSFをサンプルに追加した。次に細胞を200g10分間の遠心分離によりペレットにした。10倍容量のPBSFを追加して色素を洗浄した。フローサイトメトリー分析を実行するために1mlのPBSF中に細胞を再懸濁した。すべての細胞がフローサイトメーターによりカウントされることを確実にするために、さらに500μlのPBSFを追加してフローサイトメトリー分析の実行前にチューブを洗浄した。上述のプロトコールを実行するときに、すべての薬剤は滅菌されるべきである。チューブを移すときに、すべての細胞の回収を促進するためにチューブを数回洗浄するべきである。プラスチック壁に対する細胞の非特異的吸着を減少させるために、新しいチューブはPBSFで洗い流されるべきである。
<フローサイトメトリーおよび共焦点顕微鏡によるエクスビボ患者サンプル中の循環腫瘍細胞の検出>
新鮮血サンプルを6人の卵巣癌患者から抗凝血剤中に回収し、実施例10中に記載される手順を使用して処理した。卵巣癌患者サンプルからの500マイクロリットルの全血を、フローサイトメトリーによる分析の前に、100nMフォレート−アレクサフルオル488と共に37℃で30分間インキュベートした。図4中で見られるように、6つのサンプルはすべて、15〜210細胞/500μlの範囲の測定可能なCTCを示した。これとは対照的に、3人の健康なドナーからの同種のサンプルは500μl中に蛍光粒子を含まないことが見出された。卵巣癌患者における標識細胞が悪性であることを確実にするために、同一の末梢血サンプルを、ローダミン−Xと結合体化した適切な二次抗体を加えた抗ヒトCA125モノクローナル抗体により標識した。図6中に示される卵巣癌患者からの血液塗抹標本の共焦点顕微鏡によって示されるように、フォレート−アレクサフルオル488の緑色蛍光は、ローダミン−Xの赤色蛍光と共局在することが見出され、フォレート−アレクサフルオル標識細胞が確かに卵巣癌に由来することが実証される。赤色(ローダミン−X標識抗サイトケラチン抗体)蛍光と緑色(フォレート−アレクサフルオル488)の重複は、黄色蛍光として表示され、パネルAおよび図6のBにおいて見られる。
<エクスビボフローサイトメトリーを使用する卵巣癌患者における循環腫瘍細胞の定量化>
卵巣癌患者からの血液サンプルをフローサイトメトリーによって解析した。実施例10中に記載されるように、サンプルを処理した。次に、患者1〜11からの500μlの全血を、フローサイトメトリーによる分析の前に、100nMフォレート−アレクサフルオル488と共に37℃で30分間インキュベートした。各患者サンプルのための対照サンプルは、上述される同一の処理の前に、10μM葉酸と共に37℃30分間インキュベートした。患者12〜17については、2mlの全血を抗体カクテル(上皮性CTC濃縮抗体カクテル)により処理し、赤血球をフィコール分離媒質の使用によって除去した。次に濃縮腫瘍細胞画分をフローサイトメトリー分析の前に洗浄し、フォレート−アレクサフルオル488により4℃で30分間標識した。結果を図5中に示す。黒いドットは各分析におけるCTCカウントを表わす。バーは、同一の血液サンプルに対する2つまたは3つの独立した測定において得られたCTCの平均数を表わす。上部の点線は、すべての患者についての平均CTCカウントを表わす。中央の点線は、すべての患者についての中央値CTCカウントを表わす。下部の黒い点線は、すべての健康なドナーについての平均CTCカウントを表わす。癌患者についての血液の平均CTC/2mlは、約103のCTC/2mlであり、中央値は約45CTC/2mlである。約5から10CTC/2mlが検出される、CTCの最低数は患者3、5および6で観察された。これらの数は、正常な血液において見出されるバックグラウンドレベル(平均1.25CTC/2ml)以上である。
<健康なドナーの血液中の循環腫瘍細胞の定量化>
フィコール+Abカクテル法を使用して、8人の健康なドナーからの6mlの全血から赤血球を除去し、白血球/癌細胞画分を洗浄し、1.5mlPBS(2%PBS)中に再懸濁した。1つの小分け(500μlの細胞懸濁物)を標識せずに、陰性対照(右に向いた三角形)とした。第2の小分け(上に向いた三角形)を、フローサイトメトリーの前に、100nMフォレート−アレクサフルオル488と共に4℃で30分間インキュベートした。第3の小分け(左に向いた三角形)は、FR特異的結合をブロックするために、フォレート−アレクサフルオル488によるインキュベーションの前に、10μM葉酸と共に4℃で30分間インキュベートした。これらのデーターは、6/2mlまでのCTCカウント(FR発現細胞のカウント)が正常となりえることを示唆する(図7)。
<フォレート−Cys−テキサスレッドの合成>
テキサスレッドC2−マレイミド(モレキュラー・プローブ社、ユージーン、オレゴン)を、ジメチルスルホキシド(DMSO)(200μlのDMSO中に1mg)中に溶解した。1.4モル当量(1mg)のフォレート−システインを溶液に追加し、室温で4時間混合した。フォレート−Cys−テキサスレッド(フォレート−テキサスレッド)を、C18カラム上で逆相HPLCによって1ml/分の流速で精製した。10mMのNH4HCO3バッファー(pH7.0)(溶出液A)およびアセトニトリル(溶出液B)からなる移動相を、最初の5分間はA:Bが99:1の比率で維持し、その後次の30分にわたり直線的勾配でA:Bは70:30へ、続いて最後の15分にわたり直線的勾配でA:Bは1:99へ変化させた。フォレート−Cys−テキサスレッドは44.5分および45.8分で2つの異性体ピークとして溶出された。生成物を質量分析法によって確認し、生物学的活性を、培養におけるフォレート受容体陽性のM109細胞上の細胞表面のフォレート受容体に対するその結合の蛍光測定によって確認した。
<フォレート−オレゴングリーン514の合成>
標準的なFmocペプチド化学を使用して、葉酸のγ−COOHへ結合したオレゴングリーン(モレキュラー・プローブ社、ユージーン、オレゴン)へ結合されたフォレートペプチドを合成した。配列Lys−Glu−プテロイン酸(フォレート−Cys)は、塩基としてジイソプロピエチルアミン、およびFmoc基の脱保護のためにジメチルホルムアミド(DMF)中の20%のピペリジンに加えて、HBTUおよび活性化剤としてN−ヒドロキシベンゾトリアゾールによるFmoc化学によって構築された。α−t−Boc−保護N−α−Fmoc−L−グルタミン酸、続いてN10−トリフルオロアセチルプテロイル酸を、ε−アミン上に4−メチルトリチル保護基を含むFmoc−保護リジンワング樹脂へ結合した。リジンのε−アミン上のメトキシトリチル保護基をジクロロメタン中の1%トリフルオロ酢酸により除去し、オレゴングリーンを結合させた(フォレート−オレゴングリーン)。1.5モル当量のオレゴングリーンカルボン酸を、ペプチドと共にスクシンイミジルエステルを一晩反応させ、その後ペプチド樹脂ビーズから完全に洗浄した。次に、フォレート−オレゴングリーンを、95%トリフルオロ酢酸−2.5%水−2.5%トリイソプロピルシラン溶液により樹脂から切断した。ジエチルエーテルを使用して生成物を沈殿させ、沈殿物を遠心分離によって回収した。生成物をジエチルエーテルにより2回洗浄し、真空下で一晩乾燥した。N10−トリフルオルアセチル(trifluoracetyl)保護基を除去するために、生成物を10%水酸化アンモニウム溶液中に溶解し、室温で30分間撹拌した。生成物を、イソプロパノールおよびエーテルの組み合わせにより沈殿させ、沈殿物を遠心分離によって回収した。
<フォレート−R−フィコエリトリンの合成>
フォレート−フィコエリトリンを、Pharmaceutical Research, Vol. 20(5); 2003中のKennedy M.D.らによって出版された手順に従って合成した。簡潔には、10倍過剰量のフォレート−システインを、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)(pH7.4)中のR−フィコエリトリンピリジルジスルフィド(シグマ(Sigma)社、セントルイス、ミズーリ)の溶液へ追加した。溶液を一晩4℃で反応させ、標識タンパク質(分子量約260kDa)を、G−15脱塩カラムを使用するゲル濾過クロマトグラフィーによって精製した。100倍過剰量の葉酸の存在下および非存在下においてフォレート−フィコエリトリンと共にインキュベートしたM109細胞の蛍光顕微鏡によって、フォレート標識を確認した。1時間のインキュベーションおよびPBSによる3回の細胞洗浄後に、処理された細胞は強度に蛍光性であったが、過剰の葉酸の存在下におけるサンプルは細胞蛍光をほとんど示さなかった。
<フォレート−フルオレセインの合成>
Pharmaceutical Research, Vol. 20(5); 2003中にKennedy, M.D.らによって記載されるように、フォレート−FITCを合成した。
<循環前立腺癌細胞検出のための化合物例>
本明細書において記述された化合物は、従来の有機合成法によって調製できる。加えて、以下に示されるように、本明細書において記述される化合物は調製できる。特別の指示の無い限り、出発材料および試薬はすべて市販の供給から入手可能である。すべてのアミノ酸出発材料はケム−インペクス・インターナショナル(Chem-Impex Int)社(シカゴ、イリノイ)から購入した。1H NMRスペクトルは、特別の指示の無い限りブルカー(Bruker)社500MHzのクリオプローブを使用して得た。
nが0〜約12の整数である関連した類縁体もまた、本明細書において記述されるプロセスに従って調製できる。
nが0〜約12の整数である関連した類縁体もまた、本明細書において記述されるプロセスに従って調製できる。
nが0〜約12の整数である関連した類縁体もまた、本明細書において記述されたプロセスに従って調製できる。
PC01SK45:C67H87BF2N13O20S;分子量=1475.35g/mol;橙色固体(Rt=7.6分);LC−MS=1475.3 (M+H)+;
PC01SK49:C71H76F2N10O24S;分子量=1523.48g/mol;橙色固体(Rt=6.7分);LC−MS=I 524 (M+H)+。
<蛍光励起細胞分取装置(FACS)を使用する蛍光団依存解析>
LNCaP細胞をT75フラスコ中に播種し、37℃、5%−CO2雰囲気中で、グルタミン含有RPMI(2mM、ギブコ社RPMI培地1640、カタログ番号22400)プラス10%FBS(ウシ胎仔血清)、1%ピルビン酸ナトリウム(100mM)および1%PS(ペニシリン・ストレプトマイシン)中で接着単層に48時間増殖させた。細胞をトリプジナイス(trypzinysed)し、等量の細胞(50,000細胞/チューブ)を7本の遠心分離チューブへ移した。
チューブ番号 基質
1 基質なし;1.0mLの培地=>陰性対照(図9a)
2 1.0mLの培地中の1μMのPC01SK59(図9b)
3 1.0mLの培地中の1μMのPC01SK58(図10b)
4 1.0mLの培地中の1μMのPC01SK51(図11b)
5 1.0mLの培地中の1μMのPC01SK56(図12b)
6 1.0mLの培地中の1μMのPC01SK45(図13b)
7 1.0mLの培地中の1μMのPC01SK49(図14b)
<共焦点顕微鏡を使用する蛍光標識解析>
LNCaP細胞を6ウェルのファルコン(Falcon)社プレート中に播種し、37℃、5%CO2雰囲気中で、グルタミン含有RPMI(2mM)(ギブコ社RPMI培地1640、カタログ番号22400)プラス10%のFBS(ウシ胎仔血清)、1%ピルビン酸ナトリウム(100mM)および1%PS(ペニシリン・ストレプトマイシン)中で接着単層に48時間増殖させた。3つのウェル中の細胞を、PC01SK58(1μM;図15(a)、(i))またはPC01SK49(1μM;図15(b)、(i))またはPC01SK51(1μM;図15(c)、(i))と共に、37℃で1時間、5%CO2雰囲気中でインキュベートした。他の3つのウェル中の細胞を37℃で30分間、5%のCO2雰囲気中でPMPA(競合)と共にインキュベートし、次に5%CO2雰囲気中でPC01SK58(1μM;図15(a)、(iii))またはPC01SK49(1μM;図15(b)、(iii))またはPC01SK51(1μM;図15(c)、(iii))と共に37℃で1時間インキュベートした。細胞を1.0mLのRPMIにより3回洗い流し、次に2mLのRPMI培地を各ウェルに追加した。共焦点顕微鏡写真を各ウェルについて撮り、蛍光標識および競合(PSMAに対するリガンドの結合特異性)を示した。
<FACSを使用する血液スパイキング解析>
LNCaP細胞をT75フラスコ中に播種し、37℃、5%CO2雰囲気中で、グルタミン含有RPMI(2mM)(ギブコ社RPMI培地1640、カタログ番号22400)プラス10%FBS(ウシ胎仔血清)、1%ピルビン酸ナトリウム(100mM)および1%PS(ペニシリン・ストレプトマイシン)で、48時間接着単層に増殖させた。細胞をトリプシン処理し、2×106細胞を遠心分離チューブへ移した。LNCaP細胞を37℃、5%−CO2雰囲気中でDID(1μM)と共に20分間インキュベートした。DID標識LNCaP細胞を遠心分離チューブ中の健康なドナー血液サンプル(4.0mL)へ移した。ロゼットセップ手順は、血液(4.0mL)中のDID標識LNCaP細胞、およびさらに別個の遠心分離チューブ中のLNCaP細胞を含まない血液サンプル(1.0mL)に従った。
サンプル番号(チューブ番号) 追加した基質
1(血漿境界面) 1μMのPC01SK64=>図16(a)(i)
2(血漿境界面におけるDID標識LNCaP細胞)
1μMのPC01SK59=>図16(a)(ii)
3(血漿境界面におけるDID標識LNCaP細胞)
1μMのPC01SK63=>図16(b)(ii)
4(血漿境界面におけるDID標識LNCaP細胞)
1μMのPC01SK64=>図16(c)(ii)
5(血漿境界面におけるDID標識LNCaP細胞)
1μMのPC01SK58=>図16(d)(ii)
<FACS分析を使用する前立腺癌患者血液サンプル中の循環腫瘍細胞(CTC)の検出>
サンプル:
1)5人の健康なドナーの血液サンプル(6.0〜8.0mL/ドナー)。データーを3人のドナーについて示す(図18(a))。
2)メイヨークリニック(Mayo clinic)(ロチェスター、ミネソタ)から受け入れた5人の前立腺癌患者の血液サンプル(6.0〜8.0mL/ドナー)。3人の患者(図18(b)、(II)、(III)および(IV))について、データーを示す。
<フォレート−システインの合成>
標準的なFmocペプチド化学を、葉酸のγ−COOHに結合されたシステインによりフォレート−システインを合成するために使用した。塩基としてのジイソプロピエチルアミン、およびFmoc基の脱保護のためのジメチルホルムアミド(DMF)中の20%のピペリジンと共に、活性化剤としてのHBTUおよびN−ヒドロキシベンゾトリアゾールによるFmoc化学によって、配列Cys−Glu−プテロイン酸(フォレート−Cys)を構築した。α−t−Boc保護N−α−Fmoc−L−グルタミン酸を、2−クロロトリチル樹脂に結合されたトリチル保護Cysに結合した。次に、N10−トリフルオロアセチルプテロイル酸をGluのγ−COOHに結合した。フォレート−Cysを、92.5%トリフルオロ酢酸−2.5%水−2.5%トリイソプロピルシラン−2.5%エタンジチオ溶液を使用して、樹脂から切断した。ジエチルエーテルを使用して生成物を沈殿させ、沈殿物を遠心分離によって回収した。生成物をジエチルエーテルにより2回洗浄し、真空下で一晩乾燥した。N10−トリフルオルアセチル保護基を除去するために、生成物を10%水酸化アンモニウム溶液で溶解し、室温で30分間撹拌した。システインのジスルフィド形成を阻害するために、溶液を窒素気流下で全ての時間保った。30分後に、化合物が沈殿するまで、塩酸を溶液に追加した。生成物を遠心分離によって回収し、凍結乾燥した。生成物を質量分光分析によって解析および確認した(分子量544、M+545)。
<フォレート−Cys−アレクサフルオル488の合成>
アレクサフルオル488 C5マレイミド(モレキュラー・プローブ社、ユージーン、オレゴン)をジメチルスルホキシド(DMSO)中に溶解した(50μlのDMSO中に0.5mg)。1.5モル当量(0.57mg)のフォレート−Cysを溶液に追加し、室温で4時間混合した。フォレート−Cys−アレクサフルオル488(フォレート−アレクサフルオル)を、1ml/分の流速でC18カラムの逆相HPLCによって精製した。10mMのNH4HCO3緩衝液(pH7.0)(溶出液A)およびアセトニトリル(溶出液B)からなる移動相を、最初の1分間はA:Bが99:1の比率で維持し、次に次の29分にわたり直線的勾配でA:Bを1:99まで変化させた。フォレート−Cys−アレクサフルオル488は20分で溶出された。生成物を質量分析法によって確認し、生物学的活性を、培養におけるフォレート受容体陽性のM109細胞上の細胞表面のフォレート受容体に対するその結合の蛍光測定によって確認した。
<フォレート結合体の固相合成>
フォレートの前駆体(N10−TFA−プテロイン酸)を標準手順に従って合成した。反応前にFmoc−Lys(Mtt)−ワング樹脂を窒素バブリングと共に20分間DMF中で浸漬した。20%ピペリジンを追加し、Fmoc保護基を切断した。4当量のDIPEAに加えて、DMF中で溶解した2.5当量のFmoc−Glu−OtBu、HOBTおよびHBTUも、反応漏斗へ追加した。室温での2時間の窒素バブリング後に、Fmoc切断工程を20%ピペリジンにより繰り返した。次に、4当量のDIPEAに加えて、1:1のDMF/DMSO(ジメチルホルムアミド/ジメチルスルホキシド)中に溶解した1.5当量のN10−TFA−プテロイン酸ならびに2.5当量のHOBTおよびHBTUも、窒素によるバブリングと共に反応へ4時間かけて追加した。次に生成物を、DMF、DCM(ジクロロメタン)、メタノールおよびイソプロピルアルコールにより完全に洗浄し、窒素下で乾燥した。1%TFA/DCM(トリフルオロ酢酸/ジクロロメタン)を使用してMtt(Mtt=4−メチル−トリチル)基を切断した。2.5当量のRd−ITC(DMF中に溶解)および4当量のDIPEAを樹脂へ追加し、反応は減光条件下で室温で一晩行なった。結合体の切断をTFA:TIPS:H2O(95:2.5:2.5)によって行なった。粗製生成物を冷エーテルによる沈殿によって回収した。粗製生成物を一晩凍結乾燥した。2日目に、窒素バブリングと共に10%水酸化アンモニウム(pH=10)を45分間使用して、粗製生成物を加水分解した。生成物を凍結乾燥によって回収した。分取HPLC(リゲル)を使用して、精製を実行した。
<フォレートオレゴングリーン488の合成>
<フォレートダイライト680の合成>
<ローダミンPEG結合体の合成>
標準的なFmocペプチド化学を使用して、葉酸のγ−COOH末端に結合された2つのリジンからなるスペーサー経由でローダミンB−イソチオシアネートへ結合したフォレートを合成した。配列Lys−Lys−(γ)Glu−プテロイン酸を、塩基としてのジイソプロピエチルアミン(DIPEA)と共に、活性化剤としてHBTUおよびHOBT(ノバビオケム社、サンディエゴ、カリフォルニア)によるFmoc化学によって構築した。Fmoc基をジメチルホルムアミド(DMF)中の20%ピペリジンにより脱保護した。ε−アミン上に4−メチルトリチル保護基を含むα−Fmoc保護リジンをロードしたワング樹脂を、フォレートについてのアンカーとして使用した。N10−トリフルオロアセチルプテロイル酸(シグマ社、セントルイス、ミズーリ)をグルタミン酸アミンへ結合した後に、Fmoc−Glu−OtBuをリジンのα−アミンへ結合し、フォレートのγ結合結合体を形成した。リジンのε−アミン上にメトキシトリチル(Mtt)保護基をジクロロメタン中の1%トリフルオロ酢酸により除去し、第2のFmoc−Lys(Mtt)−OHを結合させた。第2のリジンのMtt保護基の除去後に、S−トリチル保護3−メカプトプロピオン酸(mecaptopropionic acid)を、カップリング試薬(HOBTおよびHBTU)を使用して、上述されるように、第2のリジンのα−アミンへカップリングした。最後に、第2のリジンのMtt保護基を除去し、DIPEAの存在下においてペプチドと共にDMF中に溶解したローダミンBイソチオシアネート(シグマ社、セントルイス、ミズーリ)を一晩反応させ、次にペプチド樹脂ビーズから完全に洗浄した。樹脂をジクロロメタンおよびメタノールにより数回洗浄し、数時間N2下で放置して乾燥させた。次にフォレート−Lys−Lys−メルカプトプロピオン酸−ローダミンペプチドを、95%TFA/2.5H2O/2.5%TIS/2.5%EDT溶液により3〜4時間かけて樹脂から切断した。氷冷ジエチルエーテルを使用して生成物を沈殿させ、沈殿物を遠心分離によって回収した。次に生成物をジエチルエーテルにより3回洗浄し、真空下で乾燥した。フォレート部分からN10−トリフルオルアセチル保護基を除去するために、生成物を10%水酸化アンモニウム溶液中で溶解し、アルゴン下で室温で30分間撹拌してジスルフィド結合の形成を阻害した。次に乾燥するまで生成物を凍結乾燥し、アルゴン下で保存した。生成物を質量分光分析によって確認した([M−]計算されたもの、1286.5;見出されたもの、1285.08)。
上述されるように合成されたフォレート−ローダミン−SHアンカーを使用して、マレイミド活性化PEG(5k)、PEG(20k)またはPEG(60k)(ネクター・セラピューティックス(Nektar Therapeutics)社、サンカルロス、カリフォルニア)と共に反応させた。PEG−MAL分子をPBS中で溶解し、5倍モル過剰のフォレート−ローダミン−SHを溶液へ追加し、窒素下で室温で一晩撹拌した。次に、未反応フォレート−ローダミンを、水中で平衡化した粗粒セファデックスG−50カラム(球状タンパク質についての分画範囲:1,500〜30,000、シグマ社、セントルイス、ミズーリ)を使用、およびサンプルを流すために重力を使用して、ゲル濾過クロマトグラフィーによってフォレート−PEG−ローダミン結合体から分離した。フォレート−PEG−ローダミンのピークを回収し、凍結乾燥し、動物研究のためにリン酸緩衝生理食塩水(PBS)中で再懸濁した。
フォレート−PEG−ローダミン結合体の見かけの分子量を明らかにするために、それらのVe/Vo比率を、既知の分子量のタンパク質スタンダードのVe/Voと比較した(Veは溶出量であり、Voはボイド容量である)。カラムは、5ml/分の流速で室温のリン酸緩衝生理食塩水(PBS(pH7.4))中で流した。カラムのボイド容量(Vo)を、サンプル適用の時点から流出ピークの中央までに回収される流出物の容量の測定によって、610nmでのブルーデキストラン(分子量、およそ2,000,000、シグマ社、セントルイス、ミズーリ)についての溶出量で、分光測光的に決定した。個々のタンパク質スタンダードをPBS中に溶解し、280nmでの吸光度読み取りはそれらの溶出時間に従った。タンパク質スタンダードの溶出量(Ve)を、サンプル適用の時点から流出ピークの中央までに回収される流出物の容量の測定によって決定した。フォレート−PEG−ローダミン結合体のVeを決定するために、サンプルをカラム上に適用し、ブルーデキストランおよびタンパク質スタンダードについて使用されるのと同一の流速で流した。フォレート−PEG−ローダミン結合体のVeを、スタンダードへ適用されものと同一の方法を使用して決定された。タンパク質スタンダードの既知の分子量の対数・対・それぞれのVe/Vo値のプロットにより、直線検量線を生成する。すべてのフォレート−PEG結合体の分離の目的のために、2つの異なるセファクリルHRカラムを使用した。24cm×1.0cmセファクリル100−HR(分子量範囲1000〜10,000Da)は、フォレート−PEG(5k)−ローダミン結合体を分離できたが、フォレート−PEG(20k)−ローダミン結合体およびフォレート−PEG(60k)−ローダミン結合体は分離できなかった。後者の2つの結合体は、22cm×1.0cmのセファクリル200−HR(分子量範囲5〜250kDa)上で分離された。セファクリル100−HR上で使用するタンパク質スタンダードは、ブラジキニンフラグメント2−9(MW〜904)、ウシ肺からのアプロチニン(MW6,511.44)、ウマ心臓からのミオグロビン(MW〜17,000)、ウシ赤血球からのカルボニックアンヒドラーゼ(MW〜29,000)、アルブミン(MW〜66,000)、アルドラーゼ(MW〜161,000)であった。セファクリル200−HR上で使用するタンパク質スタンダードは、ウマ心臓からのミオグロビン(MW〜17,000)、ウシ赤血球からのカルボニックアンヒドラーゼ(MW〜29,000)、アルブミン(MW〜66,000)、酵母からのアルコール脱水素酵素(MW〜150,000)、サツマイモからのβ−アミラーゼ(MW〜200,000)、ウマ脾臓からのアポフェリチン(MW〜443,000)、ウシチログロブリン(MW〜669,000)であった。
すべてのフォレート−PEG−ローダミン結合体のローダミンに対するフォレートの比率を決定するために、最初に水中の葉酸およびローダミン−イソチオシアネートの吸光係数を、2つの異なる波長(280nmおよび560nm)のこれらの両方の波長で構築するスタンダード曲線によって決定した。これらのスタンダード曲線の勾配は、水中の葉酸およびローダミン−イソチオシアネートの吸光係数に相当する。次にフォレート−PEG−ローダミン結合体のサンプルを水中に溶解し、それらの280nmおよび560nmの吸光度を測定した。これらの波長でのフォレート−PEG−ローダミン結合体の吸光度は、葉酸(FA)の吸光度およびローダミン(Rhod)の両方についてであり、したがって:
A280=A280(FA)+A280(Rhod)およびA560=A560(FA)+A560(Rhod)
A280=ε280(FA・1・c(FA)+ε280(Rhod)・1・c(Rhod)
A560=B560(FA)・1・c(FA)+ε560(Rhod)・1・c(Rhod)
<フォレートCW800の合成>
他の部分で報告されるように、N10−TFAプテロイン酸を合成した。最初に、Fmoc−Lys(Mtt)−ワング樹脂を20分間DMF中で膨潤させた。樹脂のFmoc基の脱保護をDMF中の20%ピペリジンによって行なった。2.5当量のFmoc−(γ)Glu−OtBu、HOBT、HBTUおよび4当量のDIPEAを、反応に追加した。2時間後に、グルタミン酸のFmoc基を20%ピペリジンにより脱保護した。次に、2.5当量のN10−TFAプテロイン酸、HOBTおよびHBTUを3:1のDMF/DMSO中に溶解し、4当量のDIPEAを反応に追加し、4時間反応させた。生成物をDMF、DCMおよびメタノールにより洗浄した。1%TFA/DCMを使用してMtt保護基を切断した。結合体の切断をTFA:TIPS:H2O(95:2.5:2.5)によって行なった。次に粗製生成物を冷エーテルにより沈殿させた。次に粗製生成物を20分間水酸化アンモニウム(pH=10)により加水分解した。フォレート−リジンをHPLCによって精製し、MSおよびNMRによって特性を評価した。フォレート−リジンおよびCW800スクシンイミジルエステル(1:1)を18時間暗中で0.1M炭酸緩衝液(pH9.0)中で撹拌した。フォレート−CW800結合体をHPLCによって精製し、MSおよびNMRによって特性を評価した。
<フォレート−EDA−テトラメチルローダミン>
<フォレート−LYS−ローダミンの合成>
Claims (33)
- 病原性細胞によって仲介される病状を診断する方法であって、一般式
Ab−X
(上式において、基Abは病原性細胞に結合するリガンドを含み、基Xは造影剤を含む)の結合体または複合体を含む組成物を、エクスビボ患者サンプルと混合する工程、および、フローサイトメトリーを使用して、リガンドに対する受容体を発現する病原性細胞を検出する工程を含む方法。 - 前記病原性細胞が多光子フローサイトメトリーによって検出される、請求項1に記載の方法。
- Abがフォレート受容体結合リガンド、またはその類縁体もしくは誘導体を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記エクスビボ患者サンプルが患者の体液である、請求項1に記載の方法。
- 前記体液が、髄液、リンパ液、尿、粘液および血液からなる群から選択される、請求項4に記載の方法。
- 前記病原性細胞が癌細胞である、請求項1に記載の方法。
- 前記癌細胞が転移性癌細胞である、請求項6に記載の方法。
- Abが前立腺特異的膜抗原に結合するリガンドを含む、請求項6に記載の方法。
- Ab−Xが、フォレート−フルオレセイン、フォレート−オレゴングリーン、フォレート−ローダミン、フォレート−フィコエリトリン、フォレート−システイン−テキサスレッド、フォレート−アレクサフルオル(AlexaFluor)およびフォレート−ダイライト(DyLight)からなる群から選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記造影剤が発色団を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記発色団が蛍光性発色団である、請求項10に記載の方法。
- 前記発色団が、フルオレセイン、オレゴングリーン、ローダミン、フィコエリトリン、テキサスレッド、ダイライト680およびアレクサフルオル488からなる群から選択される化合物を含む、請求項11に記載の方法。
- 前記エクスビボ患者サンプル中の前記病原性細胞を定量する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- エクスビボ患者サンプル中の癌細胞の検出によって、癌の予後を決定する方法であって、
フローサイトメトリーによってエクスビボ患者サンプル中の癌細胞を検出する工程、および
癌についての予後を決定する工程
を含む方法。 - 前記癌細胞が多光子フローサイトメトリーによって検出される、請求項14に記載の方法。
- 前記エクスビボ患者サンプルが体液である、請求項14に記載の方法。
- 前記体液が、髄液、リンパ液、粘液、尿および血液からなる群から選択される、請求項16に記載の方法。
- 前記癌細胞が転移性癌細胞である、請求項14に記載の方法。
- 前記癌細胞がフォレート受容体を発現する、請求項14に記載の方法。
- エクスビボ患者サンプル中の癌細胞を定量する工程をさらに含む、請求項14に記載の方法。
- 病原性細胞を定量する方法であって、一般式
Ab−X
(上式において、基Abは病原性細胞に結合するリガンドを含み、基Xは造影剤を含む)の結合体または複合体を含む組成物を、エクスビボ患者サンプルと混合する工程、および、フローサイトメトリーを使用して、エクスビボ患者サンプル中の前記病原性細胞を定量する工程を含む方法。 - 前記病原性細胞が多光子フローサイトメトリーを使用して定量される、請求項21に記載の方法。
- Abがフォレート受容体結合リガンド、またはその類縁体もしくは誘導体を含む、請求項21に記載の方法。
- 前記エクスビボ患者サンプルが体液である、請求項21に記載の方法。
- 前記体液が、髄液、リンパ液、尿、粘液および血液からなる群から選択される、請求項24に記載の方法。
- 前記病原性細胞が癌細胞である、請求項21に記載の方法。
- 前記癌細胞が転移性癌細胞である、請求項26に記載の方法。
- Abが前立腺特異的膜抗原に結合するリガンドを含む、請求項26に記載の方法。
- Ab−Xが、フォレート−フルオレセイン、フォレート−オレゴングリーン、フォレート−ローダミン、フォレート−フィコエリトリン、フォレート−システイン−テキサスレッド、フォレート−ダイライトおよびフォレート−アレクサフルオルからなる群から選択される、請求項21に記載の方法。
- 前記造影剤が発色団を含む、請求項21に記載の方法。
- 前記発色団が蛍光性発色団である、請求項30に記載の方法。
- 前記発色団がフルオレセイン、オレゴングリーン、ローダミン、フィコエリトリン、テキサスレッド、ダイライト680およびアレクサフルオル488からなる群から選択される化合物を含む、請求項31に記載の方法。
- Ab−Xが、少なくとも7原子のリンカーを有することを特徴とする、請求項8に記載の方法。
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