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JP2010279389A - 結合構築体およびその使用方法 - Google Patents

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JP2010279389A JP2010203772A JP2010203772A JP2010279389A JP 2010279389 A JP2010279389 A JP 2010279389A JP 2010203772 A JP2010203772 A JP 2010203772A JP 2010203772 A JP2010203772 A JP 2010203772A JP 2010279389 A JP2010279389 A JP 2010279389A
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Jeffrey A Ledbetter
エー. レッドベター ジェフリー
Martha S Hayden-Ledbetter
エス. ハイデン−レッドベター マーシャ
Peter A Thompson
エー. トンプスン ピーター
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Trubion Pharmaceuticals Inc
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Abstract

【課題】 CH1以外の免疫グロブリン重鎖からの1以上の天然または作成された定常領域を含む結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供すること。
【解決手段】 上記タンパク質は、以下:i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、この結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、この重鎖可変領域は1以上のアミノ酸残基においてアミノ酸置換または失欠を含む、ポリペプチド;ii)この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;およびiii)この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である。
【選択図】なし

Description

本出願が優先権を主張する全ての出願は、その全体において参照として本明細書中に援用される。
(発明の分野)
本発明は、一般に、研究、診断、および療法、例えば、免疫療法での使用を含めた種々の用途を有する化合物に関する。本発明の化合物は免疫学的に活性なタンパク質およびタンパク質結合体を含む。そのようなタンパク質は、例えば、単鎖Fv−免疫グロブリン融合タンパク質、および単鎖Fv−免疫グロブリンを含有する化合物を含むことができる、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のような組換えまたは作成された結合タンパク質を含む。また、本発明は、自己抗体生産および/または炎症によって特徴付けられる病気を含めた、例えば、悪性疾患およびB細胞障害を含めた、例えば、本発明のポリペプチドおよび/または核酸構築体の投与から改善され、容易とされ、または軽減されるであろう疾患、病気および障害を治療するための組成物および方法に関する。
(発明の背景)
免疫系は、身体の多くの込み入ったシステムの最も複雑な1つである。多くの異なるタイプの細胞で構成され、かつ多くの異なる種類の分子が関与する膨大かつ複雑な配置である、ヒト免疫系は、身体が細菌、ウイルス、および他の感染性因子、ならびに花粉のような外来性物質のごとき外来性侵入者に応答するのを可能とする。一般に、ヒト免疫系は2つの部分、抗体−媒介免疫(「液性」または「循環」免疫とも呼ばれる)および細胞−媒介免疫に分けられ、その双方はリンパ球によって管理される。リンパ球は、血液中を循環する5つの種類の白血球細胞(白血球)の1つである。いくつかの種類のリンパ球があり、各々は実行すべき異なる機能を有する。最も普通のタイプのリンパ球はBリンパ球(B細胞)であり、これは抗体、およびTリンパ球(T細胞)を作成することを担う。免疫系の細胞はT細胞およびB細胞のみならず、ナチュラルキラー細胞、顆粒球(または多形核白血球)(PML)白血球、マクロファージ、および樹状細胞も含む。液性系はT細胞の助けを借りてB細胞によって管理され、身体の血液および組織中の感染性因子を扱う。細胞−媒介系はT細胞によって管理され、感染された体の細胞を扱う。
抗原は、免疫応答を刺激または誘導する物質、通常はマクロ分子である。その複雑なマクロ分子構造のため、単一の微生物は多数の抗原(例えば、細胞壁成分、房、鞭毛などのような表面構造、または微生物によって生産されるトキシンまたは酵素のような細胞外タンパク質)よりなる。コートタンパク質および動物ウイルスのエンベロープタンパク質のいくつかもまた通常は抗原性である。宿主は、一般には、その免疫系の成分と接触するようになる抗原に対して特異的に応答することが可能である。抗体−媒介免疫および細胞−媒介免疫系の双方は、それらが免疫反応をほとんどのいずれの抗原に対しても設置するのを可能とする複雑な相互関係を含む。換言すれば、免疫系は、該系を刺激して、抗体−媒介免疫、細胞−媒介免疫または双方を生じさせる外来性物質(抗原)を認識することが可能である。
免疫系複合体は、身体全体に散らばった種々の異なる細胞型および器官によって構成される。これらは一次および二次リンパ性器官を含む。一次リンパ性器官は骨髄および胸腺である。免疫系の全ての細胞は、最初、造血と呼ばれるプロセスにおいて骨髄に由来する。造血の間に、骨髄−由来幹細胞は、免疫系の成熟細胞(「B」細胞)、または骨髄から移動して胸腺で成熟する細胞の前駆体(「T」細胞)のいずれかに分化する。赤血球細胞、血小板、およびB細胞に加えて、骨髄もまたナチュラルキラー細胞、顆粒球および未成熟胸腺細胞を生産する。胸腺の機能は、成熟T細胞を生産することである。プロ胸腺細胞としても知られる未成熟胸腺細胞は骨髄を去って、胸腺まで移動し、そこで、それは成熟し、次いで、血流に放出される。免疫系複合体は二次リンパ系器官、例えば、脾臓、リンパ節など、ならびに血管とは別の循環系も含む。
B細胞、T細胞、マクロファージ、樹状細胞、ナチュラルキラー細胞、および赤血球細胞から構成される脾臓は血液の免疫学的フィルターである。移動性マクロファージおよび樹状細胞は、脾臓を通過する血液からの抗原を捕獲する。また、移動性マクロファージおよび樹状細胞は血流を介して抗原を脾臓に運ぶ。マクロファージまたは樹状細胞が抗原を適当なBまたはT細胞に提示し、B細胞が活性化され、多量の抗体を生産するときに、免疫応答は脾臓で開始される。
リンパ管およびリンパ節は、リンパを運ぶ特殊な循環系の一部である。リンパは白血球細胞、主にリンパ球を含有する透明な流体である。リンパは身体の組織を洗い、次いで、リンパ管に集められる。リンパ節はリンパ管のネットワークに点在し、求心性リンパ管が抗原を含有するリンパを節に運ぶと、リンパのための免疫学的フィルターとして機能する。ほとんどが、T細胞、B細胞、樹状細胞およびマクロファージから構成され、リンパ節はほとんどの組織からの流体を排出する。リンパが循環に戻る前に、抗原はリンパ節においてリンパから濾過される。また、抗原を捕獲するマクロファージおよび樹状細胞はこれらの外来性物質をリンパ節中のTおよびB細胞にやはり提示し、その結果、B細胞が刺激されて、そこで抗体−分泌形質細胞へと発展する。抗体は、血流に注ぐ求心性管によってリンパ節を去る。リンパ球も求心性管によって節を去り、リンパ系における他の部位まで移動するか、または血液循環に入ることができる。単一リンパ球は24時間毎に1回循環血液およびリンパ系を通って循環を完成する。
また、扁桃、アデノイド、パイアー斑、および垂もまたリンパ系組織である。パイアー斑(リンパ球の塊)は扁桃に似ており、身体全体で、特に消化管および呼吸器管の粘膜ライニングで見出される。例えば、腸壁を通過し、血流に進入する不適切に消化された食物粒子に対して身体を防御し、およびそれらが依然として腸にある間に望まない外来性侵入者を攻撃するのはパイアー斑および他のリンパ系凝集体小胞で見出される食細胞の機能である。
B細胞の主な機能は、細菌、ウイルス、および腫瘍細胞の外来性タンパク質に応答しての抗体の生産である。T細胞は、通常は、2つの主な群、すなわち、細胞傷害性Tリンパ球(「Tc」細胞またはCTL)およびヘルパーT細胞(「Th」細胞またはTヘルパー細胞)に分けられる。CD4+T細胞ともいわれるTh細胞は、他の白血球細胞を活性化して、感染と戦わせる特殊化された因子の分泌によって免疫応答を増大させまたは増強するように機能する。それらはB細胞による抗体の生産を増強する。CD8+T細胞とも呼ばれるTc細胞はある種の腫瘍細胞、ウイルス−感染細胞および、時々は、寄生虫を直接的に殺すことができる。また、Tc細胞は免疫応答のダウン−レギュレーションで重要である。T細胞の双方のタイプは、しばしば、活性化が起こる部位としての二次リンパ系器官(リンパ節および脾臓)に依存しているが、それは、肝臓、肺、血液および腸および生殖管を含めた身体の他の組織でも見出される。
NK細胞としばしば呼ばれるナチュラルキラー細胞は別のタイプのリンパ球を表し、Tc細胞サブセットと同様である。それらは、メラノーマおよびリンパ腫のようなある異種の腫瘍、およびウイルス−感染細胞を直接的に殺すエフェクター細胞として機能する。それらは「ナチュラル」キラーと呼ばれる。なぜならば、細胞傷害性T細胞とは異なり、それらはその機能を行う前に特異的抗原を認識する必要がないからである。NK細胞は、Tc細胞とは異なり、リンパ系器官中での先行する活性化無くしてその標的を殺すのに対し、Th細胞分泌によって活性化されたNK細胞は腫瘍またはウイルス−感染標的をより効果的に殺すであろう。NK細胞は腫瘍細胞を標的とし、広く種々の感染性微生物に対して保護する。AIDSを含めたいくつかの免疫不全病においては、ナチュラルキラー細胞の機能は異常である。ナチュラルキラー細胞は、高レベルの影響を及ぼすリンホカインを分泌することによって免疫調節に寄与することもできる。
いくつかのNK細胞は、IgG抗体のFc部分についての表面レセプター(CD16とも呼ばれるFcγRIII)を有する。それらは、標的細胞上の抗原と反応した抗体のFc部分に対するレセプターを介して標的細胞に結合する。このタイプの細胞−媒介免疫は抗体−依存性細胞−媒介細胞傷害性(ADCC)と呼ばれる。また、NK細胞は別の免疫防御系である補体のC3成分に対するレセプターを有し、従って、標的としてのC3でコートされた細胞を認識する。ADCCは、例えば、原生動物および蠕虫によって引き起こされる種々の寄生体感染に対して重要な防御であると考えられる。
小さなリンパ球は同一に見えるが、それらはその細胞表面に担持された分子によって識別することができる。そのようなマーカーがB細胞およびT細胞を区別するのみならず、それらは異なって挙動する細胞の種々のサブセット間を識別する。各成熟T細胞は、例えば、T3(またはCD3)として知られたマーカーを運ぶ。加えて、ほとんどのヘルパーT細胞は、クラスII主要組織適合性複合体(「MHC」)抗原を認識する分子であるT4(CD4)マーカーを運ぶ。クラスI MHC抗原を認識するT8(CD8)として知られた分子は、多くのサプレッサー/細胞傷害性T細胞で見出される。
集合的に顆粒球または多形核白血球(PMN)といわれる白血球細胞の別の群は3つの細胞型から構成される。これらの細胞である好中球、好酸球および好塩基球は身体からの細菌および寄生虫の除去で重要である。好中球は毛細血管壁を通って感染した組織へ移動し、そこでそれは侵入者(例えば、細菌)を殺し、次いで、食作用によって残骸を飲み込む。好酸球は細胞傷害性であり、その顆粒の内容物を侵入者に放出する。好塩基球は血液を去り、感染または他の炎症の部位に集積し、その顆粒の内容物を放出し、例えば、該領域への血流を増加させるヒスタミン、セロトニン、プロスタグランジンおよびロイコトリエンのような種々のメディエーターを放出する。好塩基球によって放出されたメディエーターは、枯草熱のようないくつかのアレルギー性応答および昆虫刺傷に対するアナフィラキシー応答で重要な役割も演じる。
単球は骨髄から血液循環に放出される大きな食作用白血球細胞である。単球が組織に入ると、それは発達してマクロファージとなる。マクロファージもまた、身体に入る外来性物質(抗原)、ならび身体の死滅したおよび死滅しつつある細胞を飲み込む大きな食作用細胞である。マクロファージは免疫応答の調節で重要であり、しばしば、スカベンジャーまたは抗原−提示細胞(APC)と呼ばれる。なぜならば、それは外来性物質をピックアップし、それを摂食し、それらの抗原をT細胞およびB細胞のような免疫系の他の細胞に提示するからである。これは免疫応答の開始における重要な最初の工程の1つである。刺激されたマクロファージは増大したレベルの食作用を呈し、また、B細胞およびT細胞を活性化するのを助ける産物であるインターロイキン−1(IL−1)を分泌する。
樹状細胞もまた、骨髄に由来し、APCとして機能する。それらは、通常、胸腺、リンパ節および脾臓のようなリンパ系器官の構造的区画に見出されるが、血流および他の組織にも見出される。樹状細胞は抗原を捕獲し、またはそれをリンパ系器官に運び、そこで、免疫応答が開始されると信じられている。
病原体微生物に対する宿主の防御および/または免疫に関連する免疫学的系の重要な特徴は特異性、記憶および寛容を含む。例えば、抗体または反応性T細胞はその形成を誘導した抗原と特異的に反応すると理解され;それは他の抗原とは反応しない。一般に、この特異性は、酵素−反応性が可能であるが、酵素−基質特異性またはレセプター−リガンド特異性のそれと同次元である。免疫応答の特異性はクローン選択によって説明される。一次免疫応答の間に、特異的抗原は特異的リンパ球の予め存在するクローンを選択し、その活性化、増殖および分化を刺激する。また、一旦免疫系が応答して、特異的タイプの抗体または反応性T細胞を生じたならば、それはより多くの抗体または活性化されたT細胞をより迅速にかつ大量に生産することができると理解され;これは二次(または記憶)応答と呼ばれる。また、動物は、一般には、それ自身(潜在的−抗原性)の成分に対する免疫学低応答を受けないと認識されている。該動物は寛容であるか、またはそれ自身の潜在的抗原性成分に反応できないといわれる。これは、正常な条件下では、(自己免疫応答と呼ばれる)「自己」抗原に対する免疫応答は起こらないことを確実とする。寛容は多数の方法で実現されるが、本質的には、免疫系は「自己」成分を「非−自己」(外来性)抗原から区別することができ;それは「非−自己」に応答するが、「自己」には応答しない。時々、動物においては、寛容が「破られる」ことが可能であり、これは自己免疫疾患をもたらし得る。
抗体−媒介および細胞−媒介免疫応答の生物学的活性は異なり、1つのタイプの感染と別のタイプの感染とで変化する。抗体−媒介免疫に関与するいくつかのクラスまたはタイプの抗体(および種々のタイプのサブクラス)がある。特異的抗原に応答して生産された抗体のクラスの全てはその抗原と立体化学的に反応し、他の(異なる)抗原とは反応しない。宿主は数千の異なる抗原に対して特異的抗体を生産する遺伝的能力を有するが、適当な(特異的)抗原刺激があるまでそのようにはしない。クローン選択により、宿主は、前記したように、血液(血漿)、リンパおよび多くの血管外組織で見出されるその抗原と反応する相同抗体のみを生産する。Bリンパ球と抗原との相互作用、およびそれらの抗体−分泌形質細胞への分化に続いて一旦抗体−媒介免疫応答が起これば、分泌された抗体は抗原に結合し、それは、今度は、その中和または身体からの排出をもたらす。
他方、細胞−媒介免疫は、「休止T細胞」(pT細胞)としての前駆体形態で存在するエフェクターT細胞と呼ばれるT−リンパ球の特異的サブ集団によって媒介される。これらの細胞は特異的抗原に対するレセプターを担い、他の細胞の表面のこれらの抗原を認識する。その抗原での刺激の結果、T細胞が活性化される。T細胞は拡大され、有糸分裂周期に入り、再生され、その活性がこのタイプの免疫を担うエフェクターT細胞へと発展する。また、それらは記憶T細胞と呼ばれる同一の反応性T細胞のクローンへと発達する。前記したように、身体中のT細胞のほとんどは2つのサブセットのうちの1つに属し、CD4およびCD8と命名される2つの糖タンパク質の一方または他方のその表面での存在によって識別される。これらの分子のいずれが存在するかは、T細胞が結合する細胞のタイプを決定する。CD8を担持するT細胞(CD8T細胞)は、常に、クラスI MHCタンパク質と会合する抗原を認識し、典型的には、細胞傷害性T細胞として機能する。身体のほとんど全ての細胞はクラスI MHC分子を発現する。CD4を担持するT細胞(CD4T細胞)は、常に、他の細胞の表面のクラスII MHCタンパク質と会合する抗原を認識する。樹状細胞、マクロファージのような食細胞、およびB細胞を含めた、特殊化された抗原−提示細胞のみがクラスII MHC分子を発現する。CD4Tリンパ球は、一般には、Tヘルパー細胞として機能する。
Th1細胞およびTh2細胞を含むTヘルパー細胞は、リンホカインの生産で抗原に応答する。Th1およびTh2細胞はそのリンホカインプロフィールに基づいて識別することができる。全てのT細胞と同様に、Th細胞は胸腺で生起する。それらが抗原−提示樹状細胞によって抗原と共に提示されると、それらは増殖を開始し、活性化する。2つの種類の樹状細胞、(単球から下った)DC1細胞および(リンパ球に由来するように見える)DC2細胞がある。
Th1細胞(小胞区画にて細胞外に存在する病原体の排出に関与する炎症性Th1細胞)は、DC1−タイプ樹状細胞が抗原を抗原に対するT細胞レセプター(TCR)に提示し、インターロイキン12(IL−12)を分泌すると生産される。このパラクリン刺激はTh1細胞を活性化して、それ自身のリンホカイン、特に、腫瘍−壊死因子−ベータ(TNF−β)(リンホトキシンとしても知られている)およびインターフェロン−ガンマ(IFN−γ)を分泌させる。これらのリンホカインはマクロファージを刺激して、それらが食作用によって飲み込んだ細菌を殺し、それらは他の白血球を炎症を生じる部位に動員する。Th1細胞は細胞−媒介免疫、および例えば、ListeriaおよびMycoBacterium tuberculosisのような細胞内病原体の制御で必須である。
Th2細胞(B細胞による抗体生産で必要な「真の」ヘルパーTh2細胞)は、DC2−タイプの樹状細胞が抗原を抗原に対するT細胞レセプターに提示すると生産され、恐らくは、1以上のパラクリン刺激体が生産される。Th2細胞によって分泌される主なリンホカインはインターロイキン4(IL−4)であり、これはB細胞におけるクラス−スイッチングを刺激し、IgE抗体のその合成を促進し、より多くのプレ−Th細胞がTh2経路に入るよう促進する正の−フィードバックデバイスとして作用し、IL−12レセプターの発現をブロックし、それにより、胸腺におけるプレ−Th細胞がTh1経路に入るのを阻害する。また、IL−4はB細胞を増殖させ、抗体−分泌形質細胞および記憶B細胞に分化させる。IL−4はそれ自体が抗原を結合した近隣のB細胞のみを活性化し、他のB細胞は活性化せず、免疫応答の特異性を維持する。また、Th2細胞はインターロイキン5(好酸球をひきつけ、それを活性化するIL−5)、インターロイキン10(DCによるIL−12生産を阻害し、プレ−Th細胞のTh1細胞への成熟を妨げるIL−10)、およびインターロイキン13(やはりIgE抗体の合成を促進するIL−13)を生産する。
Th2細胞の活性化はそれがインターロイキン−2(IL−2)の生産を開始させ、IL−2に対する膜レセプターを発現させる。分泌されたIL−2はTh2細胞の増殖を自己刺激する。例えば、IL−2は(抗原を結合した)他のT細胞上のIL−2レセプターに結合し、その増殖を刺激する。IL−2に加えて、刺激されたTh2細胞はやはりIFN−γおよびインターロイキン6(IL−6)を生産し、これは免疫応答の種々の態様を媒介する。IFN−γはナチュラルキラー細胞をその十分な細胞溶解能力まで活性化し、それはマクロファージのアクチベーターであって、かくして、その抗腫瘍活性を増大させる。もしマクロファージが細胞内寄生虫によって感染されれば、それはマクロファージを活性化し、これは、今度は、寄生虫を破壊する。IFN−γは細胞傷害性リンパ球の抗腫瘍活性を補強し、NK−細胞の非特異的活性を増加させ、これはB細胞の分化を制御し、免疫グロブリンの分泌を増大させる因子の1つである。IL−6はいくつかのタイプの白血球、ならびに肝臓中の急性相タンパク質の生産を刺激する。それは、B細胞を誘導して、抗体形成(形質)細胞へ分化させるのに特に重要である。かくして、Th2細胞はB細胞に対する助けを提供し、抗体−媒介免疫で必須である。
細胞傷害性Tリンパ球は、その表面に新しいまたは外来性抗原(例えば、ウイルス−感染細胞、または腫瘍細胞、または移植された組織細胞)を示す細胞を殺すことができる。CD8CTLもまた2つのサブセット:Th1細胞のようにIFN−γを分泌するTh1、およびTh2細胞のようにIL−4を分泌するTc2に分けられる。
また、細胞−媒介免疫応答は、腫瘍細胞の破壊、および動物における組織移植の拒絶で役割を演じる。組織移植における主な問題は拒絶であり、これは、しばしば、「外来性」細胞に対する細胞−媒介免疫応答に基づく(なぜならば、それらは完全な抗原性マッチではないからである)。腫瘍細胞は正常な細胞で見られない特異的抗原を含む故に、それらは外来と認識され、細胞−媒介免疫の力によって破壊され得る。もし腫瘍細胞が動物においてレギュラーベースで発生すれば、それはそれらを排除し、またはそれらをチェックする細胞−媒介免疫であり得る。年齢が進んだヒトにおける多くのタイプの癌(腫瘍)の発生の増加は、約25歳で起こる免疫系のピークの効率の減衰に相関し得る。
細胞−媒介免疫の発現に関与する細胞のタイプのまとめは以下の通りである。Tcリンパ球は、クラスI MHCと会合した表面に外来性抗原を担持する細胞を殺し、感染した細胞がその表面に微生物抗原を提示する限り、細胞内寄生体(細菌またはウイルスいずれか)を保有する細胞を殺すことができる。Tc細胞は腫瘍細胞を殺し、移植された細胞の拒絶を説明する。Tc細胞は標的細胞上の抗原−クラスI MHC複合体を認識し、それに接触し、顆粒の内容物を直接標的細胞膜に放出し、それは細胞を溶解させる。Thリンパ球は、B細胞の抗体−分泌形質細胞への発展のための「ヘルパー」因子であるリンホカインを生産する。それらは、エフェクターTリンパ球の分化およびマクロファージの活性を刺激するある種のリンホカインも生産する。Th1細胞はクラスII MHCと会合したマクロファージ上の抗原を認識し、(IL−1によって)活性化して、マクロファージおよびNK細胞を活性化するIFN−γを含めたリンホカインを生産する。これらの細胞は、遅延したタイプの過敏反応を含めた細胞−媒介免疫応答の種々の態様を媒介する。Th2細胞はAPC上のクラスII MHCと会合した抗原を認識し、次いで、インターロイキン、および特異的B細胞およびT細胞増殖および活性を刺激する他の物質を生産する。マクロファージは、T細胞の相互作用、発生および増殖を開始させる抗原−提示細胞として重要である。マクロファージさ細胞−媒介免疫の発現にも関与している。なぜならば、それは細胞―媒介免疫応答で生じたIFN−γによって活性化されるからである。活性化されたマクロファージは増大した食作用能力を有し、炎症を引き起こす可溶性物質を放出し、多くの細菌および他の細胞を破壊する。ナチュラルキラー細胞は、そのMHCタイプに関わらず新しい抗原を担う細胞を溶解し、MHCタンパク質を担わない細胞でさえ溶解する細胞傷害性細胞である。NK細胞は、MHCタイプに関わらず、かつ抗原に対する以前の感作(暴露)に関わらず、外来性抗原(例えば、腫瘍細胞)を提示する細胞を殺すその能力によって規定される。NK細胞はIL−2およびIFN−γによって活性化でき、細胞傷害性Tリンパ球と同様にして細胞を溶解させる。いくつかのNK細胞はIgG抗体のFcドメインに対するレセプターを有し、かくして、標的細胞の表面のIgGのFc部分に結合することができ、抗体−依存性細胞−媒介細胞障害性を介して標的細胞を殺す細胞溶解性成分を放出する。
細胞の増殖および分化に影響する細胞外因子はサイトカインと提示されてきた。これらは、細胞−媒介免疫の発現に関与する種々の細胞の分化、増殖および活性に対して効果を有するT−リンパ球によって生産されるタンパク質であるリンホカインを誘導する。一般に、(1)循環白血球およびリンパ球を免疫学的遭遇の部位に集中させ;(2)B細胞およびT細胞の発生および増殖を刺激し;(3)それらの食作用仕事につきマクロファージを刺激し、調整し;(4)ナチュラルキラー細胞を刺激し;および(5)抗ウイルスのカバーおよび活性を供することによってリンホカインは機能する。種々の重要なリンホカインの要約は以下のとおりである。最初は、リンパ球活性化因子と呼ばれたIL−1は主としてマクロファージの産物であって、種々のタイプの細胞に対して多用な効果を有する。それはT細胞およびB細胞の増殖レギュレーターとして作用し、およびそれは、造血細胞のような他の細胞を誘導して、宿主防御に関連するタンパク質を生産する。IL−1は好中球に対する化学走性グラジエントを形成し、熱を生じる内因性パイロジェンとして機能する。かくして、IL−1は免疫応答および炎症応答の双方で重要な役割を演じる。IL−2はT細胞の増殖を刺激し、NK細胞を活性化する。IL−3は幹細胞の増殖および肥満細胞の分化を調節する。IL−4はB細胞増殖および増強された抗体合成を引き起こす。(インターフェロン−ベータ2、ハイブリドーマ成長因子、B−細胞分化因子、および肝細胞刺激因子ともいわれる)IL−6はB細胞の分化、および抗体の生産、およびT細胞の活性化、成長および分化に対して効果を有し、恐らくは、感染または負傷によって開始される炎症および免疫応答の媒介で主な役割を有する。IL−8は好中球に対する化学走性誘引物質である。IL−13はIL−4の特性の多くを共有し、炎症および免疫応答の優れたレギュレーターである。IFN−γはT細胞によって生産され、リンホカインと考えることができる。それは、時々、「免疫インターフェロン」と呼ばれる(インターフェロン−αは「白血球インターフェロン」と言われ、インターフェロン−ベータは「線維芽細胞インターフェロン」といわれる)。IFN−γは、感染した細胞におけるウイルスタンパク質合成の阻害を含めたいくつかの抗ウイルス効果を有する。また、それはマクロファージおよびNK細胞を活性化し、IL−1、IL−2、および抗体の生産を刺激する。リンホトキシンは腫瘍壊死因子を含む。T細胞はTNF−ベータを生産し、他方、TNF−αはT細胞ならびに他のタイプの細胞によって生産される。TNFは(ある距離で)腫瘍細胞を含めた細胞を殺すように機能する。全てのタイプの食作用白血球細胞を分化させ、分裂させる顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GMCSF)を含めたいくつかのコロニー刺激因子(CSF)がある。
B細胞およびT細胞についての抗原に対する膜レセプターの性質はかなりよく理解されている。各B細胞は、該細胞が生産するようにプログラムされている抗体に対する特異性において応答するほぼ10膜−結合抗体分子(IgDまたはIgM)を有する(これらのレセプターはBCRといわれる)。B細胞上のCD32(FcγRII)はIgGのFc領域に対するレセプターである。B細胞上のCD21およびCD35は、補体成分に対するレセプターである。各T細胞は、その表面に露出された特異的抗原−結合T細胞レセプター(TCR)の約10分子を有する。該TCRは抗体に似ているが、同一ではない。そのTCRが異なる二つのタイプのT細胞、アルファ/ベータ(αβ)T細胞およびガンマ/デルタ(γδ)T細胞がある。アルファ/ベータT細胞のTCRは、抗原−提示細胞の表面のクラスI MHC分子によって提示された生体分子複合体に結合する。前記したように、ほとんどのTh細胞はCD4を発現し、他方、ほとんどのTc細胞はCD8を発現する。
BCRおよびTCRの双方は、それらが一体的膜タンパク質であり、それらが細胞表面に露出された数千の同一コピーで存在し、それらが細胞が抗原に遭遇する前に作成され、それらがDNAのセグメントの組換えによって組み立てられた遺伝子によってコードされ、それらが非共有結合力を介して、レセプターの表面およびエピトープの表面の相補性、および抗原レセプターのエピトープへの成功した結合に依存し、もしさらなるシグナルが伴えば、該細胞の刺激をもたらして、Gを去って、同一抗原レセプターを担う細胞のクローン、すなわち、同一の特異性の細胞のクローンの発生に導く細胞周期および反復された有糸分裂に入る、エピトープ(または抗原決定基)と呼ばれる抗原の部分に結合するユニークな結合部位を有する点で同様である。BCRおよびTCRは、その構造、それらをコードする遺伝子、およびそれらが結合するエピトープのタイプにおいて異なる。
一次免疫応答の誘導は、抗原が上皮表面に侵入した場合に開始する。それは、結局はマクロファージ、あるいはB細胞、単球、樹状細胞、ランゲルハンス細胞、内皮細胞を含めた抗原提示細胞のある種の他のクラスと接触するようになる。細菌細胞のような抗原はエンドサイトーシスによって内部化され、APCによって「処理され」、次いで、免疫応答性リンパ球に「提示されて」、免疫応答の初期の工程を開始させる。(例えば)マクロファージによるプロセッシングの結果、細胞の表面のクラスII MHC分子と会合した膜の表面へ抗原物質を付着させる。抗原−クラスII MHC複合体はT−ヘルパー(Th2)細胞に提示され、これはマクロファージの膜上のクラスII MHC分子と会合した、処理された抗原を認識する。マクロファージによって分泌されたIL−1による刺激と一緒になって、この相互作用はTh2細胞を活性化させる。
前記で示したように、B細胞はそれ自体でAPCとして挙動する。B細胞の表面上の抗体レセプターに結合した架橋抗原は、クラスII MHC分子と一緒に抗原のいくつかの内部化およびB細胞膜上の発現を引き起こす。Th2細胞はクラスII MHC分子と共に抗原を認識し、B細胞を活性化して抗体−分泌形質細胞および記憶B細胞となる種々のリンホカインを分泌する。たとえ抗原がレセプターを架橋できなくても、それはB細胞によって内部に取り込むことができ、処理され、クラスII MHCと会合して表面に戻され、そこで、それは特異的Th2細胞によって認識でき、それは活性化されて、B細胞の分化および増殖を開始させる。いずれの場合にも、全B細胞の応答は抗体−媒介免疫に至る。
B細胞表面上の抗原レセプターは、遺伝的に生産されるようにプログラムされた特異的タイプの抗体であると考えられる。よって、ユニークな抗体分子を生産するその能力によって区別されるB細胞の数千のサブ−集団がある。また、B細胞はマクロファージの表面の相同抗原、または可溶性抗原と反応することもできる。B細胞が抗原に結合し、同時に、近くのTh2細胞によって生産されたIL−4によって刺激されると、該B細胞は刺激されて、成長し、分裂して、同一のB細胞のクローンを形成し、各々は同一の抗体分子を生産することができる。活性化されたB細胞は、さらに、大量の抗体を合成し、分泌する形質細胞へ、および記憶B細胞へ分化する。形質細胞によって生産され、分泌された抗体は、その形成を誘導した相同抗原と特異的に反応する。これらの反応の多くは宿主の防御、および病原体による再感染の予防に導く。記憶細胞は二次免疫応答で役割を演じる。形質細胞は比較的寿命が短い(約1週間)が、この期間の間に大量の抗体を生じる。他方、記憶細胞は比較的長い寿命であり、引き続いての抗原への暴露に際して、それらは素早く抗体−生産形質細胞へ形質転換される。
細胞媒介免疫の発生は、例えば、細胞傷害性T細胞が細胞(通常は改変された自己細胞、しかし恐らくは移植された組織細胞、または真核生物寄生体の膜上のクラスI MHCと会合した処理抗原を認識すると開始される。Th2細胞によって生産されたIL−2による刺激下で、Tc細胞は活性化されて、その表面に新しい外来性抗原を示す細胞を溶解することができる細胞傷害性Tリンパ球となり、これは細胞−媒介免疫の1次発現である。抗原−提示マクロファージおよびTh細胞の間の相互作用はマクロファージを刺激して、Th細胞に対して局所的に作用するインターロイキン−1を生産し、それを分泌し、これはTh−細胞を刺激して、(それらはリンパ球から生起するゆえにリンホカインとここでは呼ぶことができる)それ自身のサイトカインを分化し、生産する。これらのリンホカインは種々の機能を有する。IL−4は近くのB細胞に対して直ちに効果を有する。前記したように、IL−2はT細胞に対して直ちに効果を有する。
また、白血球は、細胞間および細胞−マトリックス相互作用を媒介する接着―促進レセプターも発現する。これらの接着相互作用は造血および胸腺成熟化の調節、白血球の組織を通っての輸送および移動の指令および制御、および免疫および非―免疫炎症応答の発生にとって非常に重要である。接着レセプターのいくつかのファミリーが同定されている。白血球インテグリンファミリーは、CD18と命名される、共通のベータサブユニットを有する3つのアルファ−ベータヘテロダイマー膜糖タンパク質を含む。3つのメンバー、リンパ球機能関連抗原−1(LFA−1)、マクロファージ抗原−1(Mac−1)、およびp150の各々のアルファサブユニットは、各々、CD11a、bおよびcと命名される。これらの接着分子は、白血球の免疫および炎症応答において臨界的な役割を演じる。白血球インテグリンファミリーは、今度は、そのメンバーが進化的に、構造的にかつ機能的に関連するインテグリンスーパーファミリーの一部である。白血球で見出されるもう1つのインテグリンスーパーファミリーはいわゆるVLA群である。なぜならば、「非常に遅い活性化抗原」VLA−1およびVLA−2はT−細胞活性化において遅く出現することが元来見出されているからである。このファミリーの、メンバーは、主として、細胞外マトリックス接着レセプターとして機能し、造血および非−造血細胞双方で見出されている。それらは、組織の組織化、リンパ球の再循環およびT−細胞免疫応答を含めた多様な細胞の機能で役割を演じる。もう1つのインテグリンスーパーファミリーであるサイトアドヘシンは、細胞外マトリックスタンパク質に結合する血小板および内皮細胞上のレセプターである。接着レセプターの第2のファミリーは、そのメンバーが、T−細胞接着相互作用に参画するCD2、LFA−3、およびICAM−1、ならびにTおよびB細胞、CD4,CD8,およびMHCクラスIおよびII分子の抗原−特異的レセプターを含む免疫グロブリンスーパーファミリーである。接着レセプターのもう1つの認められているファミリーは、共通のレクチンドメインによって特徴付けられるセレクチンである。マウスホーミングレセプターMEL−14のヒトホモログである白血球接着分子―1(LAM−1)は白血球上で発現され、他方、内皮白血球接着分子−1(ELAM−1)および顆粒膜タンパク質(GMP−140)は刺激された内皮細胞および活性化された血小板で発現される。
免疫応答の活性化は、サイトカインに加えて物理的細胞−細胞接触を必要とする。かくして、例えば、BおよびT細胞前駆体の発生は、間質細胞との親密な接触を必要とする。少なくとも3つの臨界的細胞−細胞接触事象が免疫応答の発生で必要である。第1のものは、特異的抗原とナイーブなT細胞との最初の接触である。MHC提示のための要件のため、これは肝要な細胞接触事象である。正常な状況においては、臨界的抗原提示細胞は樹状細胞である。MHC/ペプチド−TCR相互作用に加えて、樹状細胞−T細胞相互作用で重要な他の非−抗原特異的膜結合リガンド−レセプター対がある。主なものは、樹状細胞上の、2つのリガンドB7.1(CD80)およびB7.2(CD86)のいずれと、T細胞上のCD28分子との会合である。これらの分子はアクセサリー分子といわれ、CD28分子は、それがなければ、T細胞が活性化されない、必須の第2のシグナルをT細胞に送達すると理解されている。
第2の必須の細胞−細胞接触は、活性化されたT細胞および抗原−特異的B細胞の間である。ほとんどの抗原はT細胞−依存性であり、すなわち、抗原に対する抗体の応答は絶対的にT細胞の助けを必要とすることができる。この助けはサイトカイン、および細胞−細胞接触の双方によって送達される。細胞は表面Igを介して特異的抗原に結合し、次いで、内部化し、処理し、それをクラスII MHC分子に提示する。これは、それを、特異的抗原からのヘルパーエピトープに特異的なT細胞によって認識されるのを可能とする。この細胞−細胞相互作用は、B細胞上のB7に結合するCD28も必要とする。加えて、その発現がT細胞活性化によって誘導されるCD40リガンドまたはCD154と呼ばれる分子は、B細胞上のCD40に結合する。CD40の架橋はB細胞増殖を促進し、胚−中心B細胞のアポトーシスを妨げ、免疫グロブリンイソタイプスイッチングを促進する。CD28−B7およびCD40−CD40Lレセプターリガンド相互作用は、共に、その相互活性化を引きおこすBおよびT細胞のダイアログで必須である。
免疫応答で必須である第3の細胞−細胞相互作用は、小胞樹状細胞(FDC)への(胚中心と呼ばれるリンパ系器官における特殊化された構造へ移動してしまった)活性化B細胞の結合である。FDCは、寿命が長い免疫複合体の形態で、その表面の抗原を無傷、すなわち、未処理で保持する特殊化された間質細胞である。他の分子の中では、FDCは、CR2レセプターを介して胚中心B細胞に結合し、形質細胞への分化を刺激するCD23を発現する。
1次免疫応答が宿主の防御として有効となる前に時間を要する。抗原がAPCによって認識され、摂取され、消化され、処理され、提示されなければならない。小数の選択されたTh細胞が抗原と反応し、応答しなければならず;予め存在するBまたはTリンパ球が抗原と遭遇し、増殖し、エフェクター細胞(形質細胞またはTc細胞)に分化しなければならない。抗体−媒介免疫の場合は、抗体レベルはその宿主を抵抗性とする有効な生理学的濃度まで形成されなければならない。この免疫は抗体の存在のため数ヶ月、または数年、または一生でさえ存続し得るが、効果的な免疫のレベルに到達するには数日または数週間かかるであろう。天然の感染においては、接種物は小さく、抗原刺激は微生物複製の間に増大するが、最初の数日以内には少量の抗体が形成されるに過ぎず、感染後約1週間までは循環抗体は検出できない。
2次免疫応答の誘導に関しては、微生物抗原への再暴露(抗原への2次暴露)に際して、加速された免疫学的応答、すなわち、2次または記憶応答があると理解される。ただ1ないし2日以内により多量の抗体が形成される。これは、1次免疫応答の間に形成された投機的記憶B細胞または記憶T細胞の活性によるものである。これらの記憶細胞は、相同抗原によって刺激されると、以前に該抗原を見たことを「思い出し」、迅速に分裂し、エフェクター細胞に分化することができる。記憶細胞を刺激して、迅速に非常に高い(有効な)レベルの持続循環抗体を生産させるのは、ヒトおよびペットへの「ブースター」タイプのワクチン接種を与える基礎である。かくして、(血清中の特異的抗体の濃度によって証明されるように)抗原への第1の暴露に続いて、免疫応答は数日間にわたって徐々に発達し、2ないし3週間以内に皮膚にプラトーに到達し、通常、比較的短時間で減衰を始める。抗原に2回目に遭遇すると、2次(記憶)応答は抗体の濃度の迅速な上昇を引き起こし、血清中のかなり高いレベルに到達し、これは比較的長時間継続し得る。抗体の保護的レベルは1次暴露のみによって到達できるが、通常は、長時間継続する高レベルの保護的抗体を確保するには、免疫系の反復した抗原刺激を有することが必要である。
免疫グロブリン分子(Igと省略される)は、および鎖内ジスルフィド結合、すなわち、隣接するシステイン残基のスルフヒドリル基の間の共有結合によって連結されてマクロ分子複合体となる、2つの同一の軽鎖ポリペプチドおよび2つの同一の重鎖ポリペプチド(H)から構成されるマルチマータンパク質である。その各々が形質細胞の特異的クローンによって生産される種々のクラスのヒト抗体タンパク質がある。5つのヒト免疫グロブリンクラスはその重鎖組成に基づいて定義され、IgG、IgM、IgA、IgEおよびIgDと命名される。IgG−クラスおよびIgAクラスの抗体はさらにサブクラス、すなわち、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4、ならびにIgA1およびIgA2に分けられる。鎖内ジスルフィド結合は同一ポリペプチド鎖の異なる領域を接合し、その結果、隣接するアミノ酸と共に、免疫グロブリンドメインを構成するループを形成する。(「NH−末端」または「N−末端」とも呼ばれる)アミノ−末端部分において、各軽鎖および各重鎖は、1つの抗体ともう1つの抗体とでアミノ酸組成のかなりの変動を示す単一可変領域を有する。軽鎖可変領域Vは重鎖の可変領域Vと会合して、Fと呼ばれる免疫グロブリンの抗原結合部位を形成する。
可変領域に加えて、抗体鎖の各々は1以上の定常領域を有する。軽鎖は単一の定常領域ドメインを有する。かくして、軽鎖は1つの可変領域および1つの定常領域を有する。重鎖はいくつかの定常領域ドメインを有する。IgG、IgAおよびIgD抗体における重鎖はCH1、CH2およびCH3と命名される3つの定常領域ドメインを有し、IgMおよびIgE抗体における重鎖は4つの定常領域ドメイン、CH1、CH2、CH3およびCH4を有する。かくして、重鎖は1つの可変領域および3つまたは4つの定常領域を有する。免疫グロブリンの構造および機能は、例えば、非特許文献1でレビューされている。
免疫グロブリンの重鎖の3つの機能的領域:Fd領域(VおよびCH1、すなわち、重鎖の2つのN−末端ドメインを含む断片)、ヒンジ領域、およびFc領域(定常領域に由来し、かつペプシン消化後に形成される「断片結晶性」領域)に分けることもできる。軽鎖と組み合わされたFd領域はFab(「断片抗原−結合」)を形成する。抗原は各Fabのアミノ末端にある抗原−結合領域と立体化学的に反応するので、IgG分子が2価であり、すなわち、それは2つの抗原分子に結合することができる。Fcは、細胞上の免疫グロブリンレセプターと、および補体カスケードの最初のエレメントと相互作用するドメインを含む。かくして、Fc断片は、一般に、補体固定およびFcレセプターへの結合のような免疫グロブリンのエフェクター機能を担うと考えられる。ペプシンは、時々、重鎖の第3の定常ドメイン(CH3前を切断して、より大きな断片F(abc)およびより小さな断片pFcbを与える。これらの用語は他の免疫グロブリンの類似の領域でも用いられる。IgG、IgAおよびIgDクラス抗体で見出されるヒンジ領域はフレキシブルなスペーサーとして作用し、Fab部分を空間中を自由に移動させる。定常領域とは対照的に、ヒンジドメインは構造的に多様であり、免疫グロブリンのクラスおよびサブクラスの間で配列および長さが共に変化する。
例えば、ヒンジ領域の長さおよび柔軟性は、IgGサブクラスの間で変化する。IgG1のヒンジ領域は、報告されているところによると、アミノ酸216−231を含み、かつそれは自由にフレキシブルであるので、Fab断片はその対称の軸の周りを回転し、2つの重鎖間ジスルフィドブリッジの最初のものを中心とする球内を移動することができる。IgG2はIgG1よりも短いヒンジを有し、報告されているところによると、12のアミノ酸残基および4つのジスルフィドブリッジを有する。IgG2のヒンジ領域はグリシン残基を欠き、それは比較的短く、過剰の重鎖間ジスルフィドブリッジによって安定化された剛直なポリ−プロリン2重ラセンを含む。これらの特性はIgG2分子の柔軟性を制限する。IgG3はそのユニークな延長されたヒンジ領域(IgG1ヒンジの約4倍の長さ)によって他のサブクラスとは異なる、(21のプロリンおよび11のシステインを含めた)62アミノ酸を含むと報告されており、柔軟でないポリ−プロリン2重ラセンを形成する。IgG3において、Fab断片はFc断片から比較的遠く、分子により大きな柔軟性を与える。IgG3における細長いヒンジは、他のサブクラスと比較してそのより高い分子量の原因でもある。IgG4のヒンジ領域はIgG1のそれよりも短く、その柔軟性はIgG1およびIgG2のそれの中間である。ヒンジ領域の柔軟性は、報告されているところによると、IgG3>IgG1>IgG4>IgG2の順序で減少する。4つのIgGサブクラスはそのエフェクター機能に関して相互に異なる。この差は、可変領域、Fab断片、および定常Fc断片の間の相互作用に関連するのを含めた、構造の差に関連する。それにも関わらず、CH2領域内のグリコシル化とは別に、例えば、この知識に関わらず、異なる機能、例えば、ADCC、CDC、および他の機能を変化させ、制御し、加え、または除去するためのこれらの分子のサブクラスの配列を含めた、特徴を変化させるための手段または方法に関して規則または約束は設定されていない。
結晶学的研究によると、免疫グロブリンヒンジ領域はさらに3つの領域:上方ヒンジ領域、コア領域、および下方ヒンジ領域に機能的にサブ分割できる。非特許文献2。上方ヒンジ領域は、CH1のカルボキシル末端から、動きを制限するヒンジ中の第1の残基、一般には、2つの重鎖の間で鎖間ジスルフィド結合を形成する第1のシステイン残基までのアミノ酸を含む。上方ヒンジ領域の長さは抗体のセグメント柔軟性と相関する。コアヒンジ領域は重鎖間ジスルフィドブリッジを含み、下方ヒンジ領域はCH2ドメインのアミノ末端を接合し、CH2における残基を含む。Id。ヒトIgG1のコアヒンジ領域は配列Cys−Pro−Pro−Cysを含み、これは、ジスルフィド結合の形成によって2量体化すると、枢軸として作用すると信じられている環状オクタペプチドをもたらし、かくして、柔軟性を付与する。また、ヒンジ領域は、炭水化物付着用の多数の構造的に区別されるタイプの部位を含む1以上のグリコシル化部位も含むことができる。例えば、IgA1はヒンジ領域の17アミノ酸セグメント内に5つのグリコシル化部位を含み、ヒンジ領域ポリペプチドの抵抗性を腸プロテアーゼに付与し、これは分泌性免疫グロブリンに対する有利な特性と考えられる。
免疫グロブリンヒンジ領域のペプチド配列の構造および柔軟性によって許容される立体配座変化も抗体のFc部分のエフェクター機能に影響し得る。Fc領域に関連したエフェクター機能の3つの一般的なカテゴリーは(1)古典的な補体カスケードの活性化、(2)エフェクター細胞との相互作用、および(3)免疫グロブリンの区画化を含む。異なるヒトIgGサブクラスは、それによりそれらが補体を固定し、あるいは補体カスケードの工程を活性化し増幅する相対的効率が変化する。例えば、非特許文献3;非特許文献4;非特許文献5;非特許文献6;非特許文献7参照。
補体−依存性細胞傷害性(CDC)は、腫瘍細胞のような特異的標的細胞のクリアランスについての重要なメカニズムにあると考えられる。CDCは、カスケード状に相互によって活性化された状態となる一連の酵素よりなる事象の流れである。補体は、その4つの主な機能:(1)局所的血管膨張;(2)免疫細胞、特に食細胞の誘因(化学走性);(3)食作用についての外来性生物のタギング(オプソニン作用);および(4)膜攻撃複合体(MAC攻撃)による侵入生物の破壊によって達成される、抗原を取り除くにおいて重要な役割を有する。中心的分子はC3タンパク質である。それは、古典的経路または代替経路いずれかの成分によって2つの断片に分裂する酵素である。抗体、特にIgGおよびIgMは古典的経路を誘導し、他方、代替経路はリポ多糖(LPS)のような細菌産物によって非特異的に刺激される。簡単に述べれば、分裂したC3の産物は、食作用免疫細胞に対して化学走性であって、C5からのC5a断片の放出を引き起こすことによって局所的血管膨張をもたらす小さなペプチドC3aを含む。C3の他の部分C3bは外来性生物の表面の抗原を被覆し、破壊のために生物をオプソニン化するよう作用する。C3bは補体系の他の成分と反応して、C5b、C6、C7、C8およびC9よりなるMACを形成する。
一般に、IgG1およびIgG3は最も効果的に補体を固定し、IgG2は効率が低く、IgG4は補体を活性化しない。補体活性化は、カスケードにおける第1の成分C1のサブユニットであるC1qの抗原−抗体複合体への結合によって開始される。C1qについての結合部位は抗体のCH2ドメインに位置するが、ヒンジ領域はカスケードを活性化する抗体の能力に影響する。例えば、ヒンジ領域を欠く組換え免疫グロブリンは、報告されているところによると、補体を活性化することができない。非特許文献2。ヒンジ領域によって付与された柔軟性なくして、抗原に結合した抗体のFab部分は、C1qをCH2に結合させるのに要求される立体配座を採用することができないであろう。同上参照。ヒンジの長さおよびセグメント柔軟性は、補体活性化と相関すると報告されている;しかしながら、該相関は絶対的ではない。IgG4と同程度に剛直な改変されたヒンジ領域を持つヒトIgG3分子は、例えば、カスケードを依然として効果的に活性化することができる。
ヒンジ領域の不存在、あるいは機能的ヒンジ領域の欠如もまた、免疫エフェクター細胞上のFcレセプターに結合するある種のヒトIgG免疫グロブリンの能力に影響し得る。Fcレセプターへの免疫グロブリンの欠乏は、前記したように、腫瘍細胞の排除についての重要なメカニズムであると推定される抗体−依存性細胞−媒介細胞傷害性を容易とする。ヒトIgG Fcレセプター(FcR)ファミリーは、3つの群、高い親和性でもってIgGに結合することができるFcγRI(CD64)、ならびにその双方がより低い親和性のレセプターであるFcγRII(CD32)およびFCγRIII(CD16)に分けられる。3つのレセプターの各々および免疫グロブリンの間の分子相互作用は正確には規定されていないが、実験的証拠は、CH2ドメインのヒンジ基部側領域における残基が、抗体およびFcレセプターの間の相互作用の特異性に重要であろうことを示す。IgG1ミエローマタンパク質、およびヒンジ領域を欠く組換えIgG3キメラ抗体は、報告されているところによると、おそらくはCH2への接近性が減少するのでFcγRIに結合することができない。非特許文献8。
通常の抗体のH構造に対する異常なかつ見掛け上進化に関係しない例外は、ラクダ科(ラクダ、ヒトコブラクダおよびラマ;非特許文献9;非特許文献10)、テンジクザメ(非特許文献11)、およびギンザメ(非特許文献12)で見出された免疫グロブリンのいくつかのイソタイプで起こる。これらの抗体は、重鎖可変領域のみを用いて抗原−結合領域を明らかに形成でき、すなわち、これらの機能的抗体は(「重鎖抗体」「HCAbs」と言われる)重鎖のみのホモダイマーである。双方の種において、これらの可変領域は、しばしば、重鎖可変領域の欠如を補うのを助けることができる延長された第3の相補性決定領域(CDR3)を含み、推定によると結合部位を安定化するのを助けるCDR領域の間に頻繁なジスルフィド結合がある。非特許文献13;非特許文献11。しかしながら重鎖のみの「抗体」の正確な機能は知られておらず、その形成に導いた進化圧は同定されていない。例えば、非特許文献12,前掲参照。ラクダ、ラマおよびアルパカを含めたラクダ科もまた通常のH抗体を発現し、重鎖のみの抗体は、かくして、単に別の抗体構造としてこれらの動物に存在するようには見えない。
ラクダ科動物の重鎖のみの免疫グロブリンの可変領域(VH)および通常の(H)重鎖可変領域は、通常のVおよびVドメインの間の界面に関与し得るいくつかの位置における差を含めたアミノ酸の差を含む。非特許文献14;非特許文献15。ラクダ科動物VHは、報告されているところによると、ヒンジ、CH2およびCH3ドメインを含み、CH1ドメインを欠くIgG2およびIgG3定常領域と組み換えられる。非特許文献16。興味深いことには、VHはV遺伝子座(非特許文献14 前掲)とは区別される染色体遺伝子座によってコードされ、ラクダ科動物B細胞は抗原認識および分化の進化した複雑なメカニズムを有することを示す。かくして、例えば、ラマIgG1は、Vがヒンジ、CH1、CH2およびCH3ドメインを含む定常領域と組み換えられた通常の(H)抗体イソタイプであり、他方、ラマIgG2およびIgG3は、CH1ドメインを欠き、軽鎖を含まない重鎖のみのイソタイプである。
免疫グロブリンのクラスは異なる物理的および化学的特徴を有し、それらはユニークな生物学的特性を呈する。それらの合成は免疫応答の間に、および/または感染の経過の間に異なる段階および速度で起こる。宿主抵抗性(免疫)におけるそれらの重要性および機能は異なる。
免疫グロブリンG(IgG)、約150,000ダルトン(150kD)の分子量を持つタンパク質は血清において圧倒的なIgである。それは、いずれかの与えられた時点において動物で見出される全抗体の約80%をなし、全血清抗体の75%である。それは血流から血管外空間に拡散し、それはそこで見出される最も普通のIgである。組織流体におけるその濃度は、炎症の間に増大し、それは細菌細胞外トキシンおよびウイルスの中和で特に有効である。それはオプソニン化能力および個体−固定能力も有する。全てのIgG1抗体分子のFc領域のポリペプチド組成は抗体特異性にかかわらず比較的一定しており;しかしながら、前記したように、Fab領域は、常に、それらの抗原特異性に応じてその正確なアミノ酸配列において異なる。当該分子のFc部分の特異的アミノ酸領域は食細胞およびある種の他の細胞上のレセプターによって認識され、Fcドメインは、抗体−媒介免疫の発現でしばしば必要とされる個体に結合し、それを活性化するであろうペプチド領域を含む。IgG分子は二価であるので、それは抗原分子を架橋させることができ、これは抗原の沈殿または凝集に導き得;もしIgGが微生物細胞または表面の抗原に結合すれば、そのFc領域は食細胞上の特異的レセプターによって認識されるであろう外因性リガンドを供することができる。IgG分子で被覆された微生物細胞またはウイルスは食作用のためにオプソニン化され、オプソニン化された病原体はその非−オプソニン化カウンターパートよりも食細胞によってかなり容易に摂取され、破壊される。IgG、ならびにIgMおよびIgAは細菌エキソトキシンを含めたトキシンの活性を中和するであろう。さらに、細胞の表面の架橋されたIgG分子は血清からの補体に結合し、それを活性化することができ、細胞の破壊に導くことができる反応のカスケードを誘発することができる。
IgMは感染の経過の間に血流に出現する第一の免疫グロブリンである。それは、主として、血流に閉じ込められ、血液で生じた病原体に対する保護を提供する。IgMは約10%の血清免疫グロブリンをなし、それらのFcドメインによってそれと一緒に連結された(約900kDの分子量を有する)。5つの免疫グロブリン分子のペンタマーに似るように配置される。モノマーサブユニットの間の共有結合に加えて、該ペンタマーはJ鎖と呼ばれる15kdポリペプチドによって安定化される。IgMは、従って、10の理論的「価」を有する(すなわち、それは10の露出されたFabドメインを有する)。恐らくは、IgMの最も重要な役割は、特定の抗原を凝集させるにおけるその有効性を仮定すれば、血液で生じた病原体に対する免疫応答において初期に機能するその活性である。IgMも補体に強力に結合し、微生物表面に結合したIgM抗体はオプソニンとして作用し、微生物を食作用により感受性とする。補体およびIgMの不存在下では全微生物細胞が殺され、溶解され得る。前記したように、IgMは膜貫通モノマーとして成熟B細胞の表面に出現し、そこで、それは抗体に結合するとB細胞を活性化することができる抗原レセプターとして機能する。
リンパ系発生の間における免疫グロブリン遺伝子座の遺伝子再配列は、抗原レセプターの多様性を発現するBリンパ球のレパートリーを生じさせる。再配列−活性化遺伝子(「RAG」)レコンビナーゼによって触媒される遺伝子再配列は免疫グロブリンV、DおよびJ遺伝子セグメントを一体化させて、IgM抗体の重鎖および軽鎖をコードする生産的に再編成された免疫グロブリン遺伝子を得る。この一次レパートリーにおけるIgM抗体の多様性は、コンビナトーリアルメカニズム(特定の抗体で利用されるV、DおよびJ遺伝子セグメントの選択)、ならびに接合多様性を介して達成される。V、DおよびJ遺伝子セグメントの接合は、幾分、不正確であって、ヌクレオチドは非−鋳型様に接合にて挿入できる。従って、V−D−J境界において非常に高度な得られた多様性がある。これは、抗体の第3の相補性決定領域、しばしば、抗原認識において臨界的な役割を演じる領域の構造的多様性に対して主として寄与する。IgM抗体のこの一次レパートリーは数百万の異なる構造を含む。このレパートリーのサイズは、いずれかの入ってくる抗原は、許容される親和性でもってそれを認識する抗体に遭遇するようであることを意味する。高−親和性結合部位はほとんどの入ってくる抗原で利用できないようである(該レパートリーは十分に大きくない)が、一次レパートリーにおける利用可能なIgM抗体の親和性は抗原の間で変化するであろう。もしエピトープが抗原の表面で高密度で再反復すれば(例えば、ウイルスまたは細菌の表面の反復した構造)、IgM抗体は、それにもかかわらず、抗原エピトープおよび免疫グロブリン組換え部位の間の個々の相補作用の低い親和性にもかかわらず、生物のクリアランスを媒介するにおいて有効であり得る。エピトープの密度はIgMとの多価相互作用を可能とすることができ、高−親和性交互作用に導き、但し抗原性エピトープの適当な間隔が起こり得るものとする。それにもかかわらず、効果的かつ特異的応答を確実とするために、特に、抗原の濃度が(身体が非常に少数の感染ウイルス粒子に直面する場合に起こり得るように)低い場合には、高−親和性抗体が、例えば、感染性生物を中和するために入手可能であれば好ましいであろう。一次レパートリーのサイズは、このレパートリーに存在するそのような高−親和性抗体の尤度を邪魔する。免疫系は、従って、2−段階戦略を用いて作動する。IgM抗体の一次レパートリーは遺伝子再編成のプロセスによって生じ、初期リンパ球発生の間における抗原遭遇に先立って起こる。しかしながら、一旦外来性抗原と遭遇してしまえば、適当な(しかし低−親和性)抗体をコードする一次レパートリーにおけるB細胞は選択的に拡大培養され、指令された過剰突然変異および抗原−媒介選択の反復改変に付される。これは、生じる抗原−特異的抗体の親和性における有意な成熟化を可能とする。抗原トリガリングもまたイソタイプスイッチ組換えを駆動する。かくして、外部抗原刺激およびいずれかの母性駆動免疫グロブリンの不存在下では、血清は、遺伝子再編成によって生じた多様な突然変異していないIgM分子を含有するに過ぎない。このレパートリーは、より年齢が高い動物における血清免疫グロブリンの大部分が、その特異性が抗原選択の結果として発生した変異したIgG(およびIgA)分子よりなるように、連続的抗原暴露の結果として年齢と共にシフトする。
IgAは血清において約160kDのHモノマーとしておよび、分泌において、約400kDのHモノマーのダイマーとして存在する。IgMに関しては、重合(二量体化)はJ−鎖を介するものである。IgAは異なる重鎖IgA1およびIgA2に基づいて2つのサブクラスを有する。IgA1は骨髄で生産され、血清IgAのほとんどを構成する。IgA1およびIgA2は共にGALT(腸関連リンパ系組織)で合成され、粘膜表面に分泌される。IgAは局所的に合成され、身体の漿粘液性分泌物で分泌されるので、それは、時々、分泌性抗体またはsIgAと言われる。定量的には、IgAはIgGよりも多量に合成されるが、それは血清中で短い半減期(6日)を有し、それは分泌性産物で失われる。血清中のIgAの濃度は全抗体の約15%である。ダイマーIgAの分泌は、分泌成分と呼ばれる100kD糖タンパク質によって媒介される。身体を出て外分泌腺を介して粘膜表面に至るその能力を説明するのは、分泌ピースのIgA分子への付加である。IgMは同様に輸送でき、分泌性抗体の小さな割合を占める。分泌性IgAは胃腸流体、鼻分泌、唾液、類液、および身体の他の粘性分泌物に存在する圧倒的免疫グロブリンである。IgA抗体は、身体の粘膜表面,特に呼吸器系、腸および尿生殖器管の感染に対する抵抗性において重要である。IgAは、微生物接着または初期集落化に対する粘膜表面に対する保護的コーティングとして作用する。それは粘膜表面のトキシンン活性を中和することもできる。呼吸器系粘膜に由来する単球および好中球で見出されるIgA−被覆微生物についてのFcレセプターは、IgAが肺において、少なくとも病原体のオプソニン化で役割を有し得ることを示唆する。また、分泌性IgAは乳飲み子の母親から新生児へ乳、すなわち、初乳を介しても移動され、これは、多くの病原体、特に、GI管によって侵入するものに対する受動的免疫を供する。
IgEは、全血清免疫グロブリンの約0.002%を占める約190kDの免疫グロブリンである。それは呼吸器系および腸上皮下方で形質される細胞によって生産される。IgEの大部分は組織細胞、特に肥満細胞に結合する。もし感染製剤がIgAバリアを提示するのに成功すれば、それは防御の次のライン、IgEによって管理されるMALT(粘膜−関連リンパ系組織)系まで来る。IgEは脂肪細胞上の特異的IgE Fcレセプターに非常にしっかりと結合する。抗原との接触は、脂肪細胞からの炎症のメディエーターの放出に導き、これは、補体、食細胞、T細胞等に対する化学走性因子を含めた免疫応答の種々の剤を効果的に動員する。この反応のよく知られた発現はアトピーアレルギーと呼ばれる即時の過敏反応のタイプ(例えば、蕁麻疹、喘息、枯草熱等)であるが、MALT応答は防御メカニズムとして作用する。なぜならば、それらは炎症性応答を増幅し、病原体の拒絶を容易とすることができるからである。
IgDはそのモノマー形態のIgGに似ている約175kdの分子である。IgD抗体は、ほとんどの場合、Bリンパ球の表面で見出される。また、同一細胞はIgM抗体を運ぶこともできる。前記したように、IgDおよびIgMは、B細胞の活性化および抑制の制御に対する相互に作用する抗原レセプターとして機能すると考えられる。よって、IgDは免疫調節機能を有することができる。
補体、およびADCCのオプソニン化、活性化に加え、抗体は立体障害、トキシン中和、凝集および沈殿を含めた宿主防御における他の機能を有する。立体障害に関しては、抗体は微生物の表面と合わされ、感受性細胞または粘膜表面へのその付着をブロックまたは予防することができると理解される。ウイルス成分に対する抗体は感受性宿主細胞へのウイルスの付着をブロックすることができ、それにより感染性を低下させることができる。分泌性IgAは病原体の粘膜表面への付着をブロックすることができる。トキシン−中和抗体(抗トキシン)もまた可溶性細菌トキシンと反応し、トキシンとその特異的標的細胞または基質との相互作用をブロックすることができる。また、抗体は微生物の表面または可溶性抗原と合わされ、それらを凝集または沈殿させることもできる。これは別々の感染性ユニットを低下させ、それらをより容易に飲み込まれるようにする。なぜならば、粒子もクランプはサイズがより大きいからである。食細胞は侵されたトキシンのフロキューレまたは凝集体を除去することもできる。
抗体は療法での使用が提案されている。ヒトおよびマウスを含めた動物は、抗体が、いずれの抗原決定基も実質的に(それに対して結合することによって)認識し、同様なエピトープの間を区別することができるようにする能力を有する。これは病気生物に対する保護の基礎を提供するのみならず、それは抗体を、正常細胞の表面に存在するレセプターまたは他のタンパク質、および癌細胞の表面にユニークに存在する分子のよう身体で見出される他のタイプの分子を標的化する魅力的候補とする。かくして、抗体の顕著な特異性は、それらをヒト用法に対する有望な剤とする。
静脈内ガンマグロブリンのような使用のために入手可能な初期の抗体製剤は、感染した個体の血液中で細菌(破傷風、pneumococcus)を破壊し、ウイルス(AおよびB型肝炎、狂犬病、サイトメガロウイルス、および帯状水痘)を中和するためにイン・ビボで用いられた動物およびヒト抗血清を含むものであった。恐らくは、最も重要な所期の適用はエンドトキシンの使用であった。しかしながら、ヒト療法には抗体の使用に関連する問題があった。なぜならば、最も単純であっても、いずれかの抗原に対する免疫系の応答は「ポリクローナル」であり、すなわち、該系はその結合領域ならびにそのエフェクター領域双方における広い範囲の構造の抗体を製造するからである。ポリクローナル抗体処置は望まない副作用とも関連した。これらの抗体製剤のポリクローナル性質に加えて、汚染性ウイルスからの感染の危険性があった。血清病気およびアナフィラキシーも限定的因子と考えられた。さらに、もし単一の抗体−分泌細胞を単離し、それを培養に置いてさえ、全ての正常な体細胞の限定された増殖能力のため数世代後に死滅するであろう。
1970年代後半に至るまで、免役化動物の血清から得られたポリクローナル抗体は、病気の研究または治療のための唯一の抗体の源を提供した。特異的抗体の単離は、KohlerおよびMilsteinが、単一の特異性を有し、全てが形質細胞の単一クローンによる製造のため似ており、無限に増殖できる「モノクローナル抗体」をどのようにして作成するかを発見するまでは本質的に不可能であった。この技術は非特許文献17に記載されており、KohlerおよびMilsteinは彼らの業績に対して医療において1984年のノーベル賞を受賞した。
モノクローナル抗体の生産のためのKohlerおよびMilsteinの技術における最初の工程は、実験動物を注目する抗体で免役化かすることを含む。彼らの実験のほとんどにおいて、KohlerおよびMilsteinはマウスに羊赤血球細胞を注射した。マウスの体は免疫応答を開始し、当該抗原に対して特異的な抗体を生産し始める。次いで、マウスの脾臓を摘出し、注目する抗体を生産するB細胞を単離する。次いで、培養で成長させた腫瘍−生産細胞を、ポリエチレングリコールを用いるBリンパ球と融合させ、「ハイブリドーマ」を生産させる。融合から得られたハイブリドーマのみが生き残る。脾臓リンパ球は限定された寿命を有し、従って、骨髄種と融合しなかったB細胞は培養中に死滅する。加えて、B細胞の抗体−生産態様を欠く細胞は、ヒポキサンチン−アミノプテリンチミジン(HAT)培地での増殖に必要な酵素HGPRTを分泌しない。その上で細胞が増殖するHAT培養基はヌクレオチド合成のための経路を阻害する。HGPRTを生産する。細胞はこの経路を迂回し、増殖し続ける。融合した細胞をHAT培地に入れることによって,真のハイブリドーマを単離することができる。次いで、単離したハイブリドーマ細胞を、所望の抗原に対する特異性についてスクリーニングする。各ハイブリドーマは1つのB細胞から由来するゆえに、それはただ1つの抗体のコピーを作成する。作成する。注目する生産を交代するハイブリドーマを培養で増殖させ、大量のモノクローナル抗体を生産させ、次いで、これを更なる使用のために単離する。該技術は体細胞ハイブリダイゼーションと呼ばれ、(注目する特異的抗体の不滅性および生産の双方について選択された)得られたハイブリドーマは無限に培養することができ、すなわち、それは潜在的に不滅の細胞系である。
モノクローナル抗体は、今日、診断および研究試薬として広く用いられてきている、しかしながら、それらのヒト療法への導入はかなり遅かった。1つの主な困難は、マウス抗体がヒト免疫系によって外来と「見られる」ことである。ヒト患者はそれらに対する免役応答を増大させ、HAMA(「ヒト抗−マウス抗体」)を生産する。これらは治療的抗体を宿主から迅速に排除させるのみならず、腎臓に対する損傷を引き起こす免役複合体を形成する。
HAMAの問題を減少させる試みにおいて、2つのアプローチが用いられた。第一のものはキメラ抗体の生産であり、そこでは、マウスモノクローナル抗体の抗原−結合部分(可変領域)を、遺伝子工学を用いてヒト抗体をエフェクター部分(定常領域)に融合させる。第二のアプローチにおいて、相補性決定領域(CDR移植)または「ヒト化」として知られた技術を介してげっ歯類抗体が改変された。このプロセスにおいて、重鎖の3つのCDRおよび軽鎖の3つのCDRによって形成された抗原結合部位がげっ歯類mAbを分泌する細胞から切り出され、ヒト抗体のフレームワークをコードするDNAに移植される。げっ歯類抗体の全可変領域よりはむしろ抗原−結合部位CDRのみが移植される故に、得られるヒト化抗体(第二世代または「過剰キメラ」抗体)は、報告されているところによると、第一世代のキメラ交代よりも免役原性が低い。このプロセスは「再シェーピング」と言われる変化を含むようにさらに改良された(非特許文献18;非特許文献19;非特許文献20), 「過剰キメラ化」(非特許文献21;非特許文献22;非特許文献23)および「ベニアリング」(非特許文献24)。
相同性に基づく再シェーピングプロセスにおいて、げっ歯類の可変領域を、それが属するタンパク質配列サブ群の共通配列と比較する。同様に、フレームワークを許容する選択されたヒト定常領域をそのファミリーの共通配列と比較する。非特許文献25。該配列分析は、アフィニティー成熟化手法の間に成熟を受けるかもしれず、従って、特有であり得る残基を同定する。より普通のヒト残基を含めるのは、ヒトアクセプター特有残基を置き換えることによって免役原性の問題を少なくすると言われる。さらに、再シェーピングプロセスは、ヒトおよびげっ歯類の共通配列の比較を可能として、いずれの系統的「種」の差も同定すると言われる。RSV19抗体は、この手法を使用することによってヒト化された。非特許文献26;非特許文献27。
過剰キメラ化は、結合活性の復元に関与するらしいCDR領域の外部の残基を同定する代替方法である。この方法において、ヒト配列をマウス可変領域配列と比較し、最高の相同性を持つものをアクセプタフレ−ムワークとして選択する。再シェーピング手法におけるように、「特有」残基をより普通に生じるヒト残基によって置き換える。CDR配列と相互作用し得る非−CDR残基を同定する。最後に、これらの残基のいずれの1つが可変領域フレームワークに含まれるべきかを決定する。CD33抗原に対するヒト化抗体は、報告されているところによると、この方法によって開発された。非特許文献28。また、非特許文献29も参照。
該タンパク質の提示された表面はその免役原性の一次決定基である。かくして、ヒト化マウス抗体は、ヒト抗体で通常見出されるものとは異なる露出された残基を置き換えることによって免疫原性をひどくすることができる。ヒト化のこの方法は「ベニアリング」と言われる。他の残基の適当な置き換えは内部ドメインまたはドメイン間フレームワークに対してほとんどまたは全くインパクトを有しないであろう。ベニアリングは2−工程プロセスである。最初の工程において、最も相同なヒト可変領域を選択し、対応するマウス可変領域と各単一残基だけ比較する。第二の工程において、ヒトホモログに存在する残基で、そのヒトホモログとは異なるマウスフレームワーク残基を置き換える。この置き換えは、表面にあって、少なくとも部分的に露出された残基のみを含む。
それにも関わらず、ヒト病気の治療のための免役グロブリン分子のための開発がもたらされるには、モノクローナル抗体技術および遺伝子工学方法で4分の1世紀を超える研究を要した。事実、過去5年までは、モノクローナル抗体が拡大するクラスの療法とはならなかた。非特許文献30;非特許文献31参照。また、非特許文献32も参照。
常に、1年当たり平均1未満の治療抗体が市場に導入され、これは1986年に開始され、モノクローナル抗体の公表の後11年後であった。(T細胞の表面の分子に結合し、器官移植の急性拒絶を防止するために1986年に着手された「ムロモナブ−CD3(mcrononab−CD3)」(OrthoClone OKT3(登録商標));結直腸癌の治療のために1995年に着手された「エドレコロマブ(edrecolomab)」(Panorex(登録商標));移植拒絶で用いるための1997年に着手された「オデュヂボマブ(odulimomab)」(Antilfa(登録商標));および非−ホジキンリンパ腫で用いるための2002年に着手された「イブリツモバブ(ibritumomab)」(Zevalin(登録商標) yiuxetan)を含めた、5つのマウスモノクローナル抗体が1986年から1995年の10年間にわたってヒト医薬に導入された。加えて、1つのモノクローナルFab、「アブシキマブ(abciximab)」(ReoPro(登録商標))が1995年に着手された。それは、チ通常はフィブリノーゲンによって連結されるその表面のレセプターに結合することによって血小板クランピングを阻害し、脈管形成術を受けた患者において冠動脈の再閉塞を防止するにおいて助けとなり得る。また、3つのキメラモノクローナル抗体が着手された:ほとんどのB細胞に見出されるCD20分子に結合し、B細胞リンパ腫を治療するのに用いられる、1997年における「リツキシマブ(rituximab)」(Rituxan(登録商標));移植拒絶のための1998年における「バシリキシマブ(basiliximab)」(Simulect(登録商標));および慢性関節リウマチおよびクローン病の治療のための1998年における、腫瘍壊死因子−アルファ(TNF−α)に結合する「インプリキシマブ(infliximab)」(Remicade(登録商標))。加えて、「アブシキシマブ(abciximab)」(ReoPro(登録商標))、ヒト血小板の糖タンパク質(GP)IIb/IIIaレセプターに結合するキメラヒト−マウスモノクローナル抗体7E3の47.6kD Fab断片が、経皮冠介入を受けている患者において心臓虚血合併症の予防のための経皮冠介入に対する添加剤として1995年に着手された。最後に、7の「ヒト化」モノクローナルが1997年ないし2003年に着手された:活性化されたT細胞の表面で生産されたIL−2レセプターの一部に結合し、移植された腎臓の急性拒絶を予防するのに用いられる1997年における「ダクリズマブ(daclizumab)」(Zenapax(登録商標));RSVのための1998年における「パリビズマブ(palivizumab)」(Synagis(登録商標));乳癌細胞で見出された成長因子レセプターである、HER−2に結合する1998年における「トラツズマブ(trastuzumab)」(Herceptin(登録商標));急性骨髄性白血病(AML)における癌性細胞によって発現されるが、骨髄を再集団化させるのに必要な正常な幹細胞には見出されない細胞−表面分子である、CD33に結合することができる。モノクローナル抗体の結合体である2000年における「ゲムツズマブ(gemtuzumab)」(Mylotarg(登録商標));白血球細胞で見出される分子であるCD52に結合し、慢性リンパ性白血病の一時的緩解を生じた2001年における「アレムツズマブ(alemtuzumab)」(MabCampath(登録商標));ヒト−由来重鎖および軽鎖可変領域およびヒトIgG:κを含むヒト抗−TNFモノクローナルであり:ここに、κ定常領域は慢性関節リウマチの治療のために2002年に着手された「アダリムマブ(adalimumab)」(Humira(登録商標)(D32E7));およびIgEに結合し、それが肥満細胞に結合するのを妨げる「オマリズマブ(omalizumab)」(Xolair(登録商標))は、陽性皮膚テスト、または終始起こる空中アレルゲンに対するイン・ビトロ反応性を有し、その徴候が吸入されたコルチコステロイドで不適切に制御された中程度ないし重症の継続する喘息を持つ12歳を超える成人および若者の治療のために2003年に認可された。
かくして、投与された組換え免役グロブリンポリペプリド免役原性に関連する問題を減少させ、および抗体のエフェクター機能を改変しようと試みる努力において、タンパク質工学が適用された。しかしながら、問題は依然として存在する。例えば、リツキシマブで治療した癌患者の大部分は、一般に、約6ないし12ヶ月以内に再発し、リツキシマブ注入から24時間以内の致死的注入反応が報告されている。これらの致死的反応は、低酸素症、肺浸潤、急性呼吸逼迫症候群、心筋梗塞、心室細動または心臓性ショックを含む注入反応合併症に従ったものである。致死的結果の例を伴う透析を必要とする急性腎不全もまた、いくつかは致死的結果を招き、ひどい粘膜皮下反応を有するように、リツキシマブへの治療に続いて腫瘍溶解症候群の状況で報告されている。加えて、高用量のリツキシマブは静脈内注射を必要とする。なぜならば、当該分子は大きく、ほぼ150kDaであり、拡散は多くの腫瘍細胞が存在するリンパ系組織に限定されているからである。
トラスツズマブの投与は心室機能不全および鬱血性心不全の発症を招きかねず、心臓機能不全の発生および重症度は、アントラサイクリンおよびシクロホスファミドと組み合わせてトラスツズマブを受容した患者で特に高いと報告されている。また、トラスツズマブの投与はひどい過敏反応(アナフィラキシーを含む)注入反応、および肺事象をもたらしかねない。
ダクリズマブ免役抑制療法を受けている患者は、リンパ増殖障害および日和見感染を発症する増大した危険性があり、ダクリズマブの使用が、ダクリズマブ−誘導免役抑制の間に最初に遭遇した抗原に応答する免疫系の能力に対して長期の影響を有するか否かは知られていない。
ひどい肝臓静脈−閉塞病(VOD)を含めた肝臓毒性もまた、組合せ化学療法レジメンの一部として、および肝臓病または造血系幹−細胞移植体(HSCT)の履歴のない患者において、単一剤としてのゲムツズマブの使用に関連して報告されている。HSCTの前または後いずれかにゲマツズマブを受容する患者、基礎となる肝臓病または異常な肝臓機能を持つ患者、および他の化学療法と組み合わせてゲムツズマブを受けている患者は、ひどいVODを発症する増大した危険性があり得る。肝臓不全からの、およびVODからの死亡は、ゲマツズマブを受けた患者で報告されており、注意深いモニタリングでさえ、肝臓毒性の合併症の危険性がある全ての患者を同定し、またはそれを予防することができないことに注意されてきた。
また、アレムツズマブを受けている患者において肝臓毒性が報告された。ひどいおよび、ある稀な場合には、致死的な汎血球減少症/骨髄形成不全、自己免疫特発性血小板減少症、および自己免疫溶血性貧血が、アレムツズマブ療法を受けている患者で起こった。また、アレムツズマブはひどい注入反応ならびに日和見感染をもたらしかねない。
アダリムマブで治療した患者において、臨床的徴候の悪化および/または脱髄病のラジオグラフィー症候を有するように、死亡を含めたひどい感染および敗血症が報告されており、臨床試験でアダリムマブで治療した患者は一般的集団で予測される率よりも高いリンパ腫の発生を有した。
オマリズマブでの臨床実験におけるひどい有害反応は悪性疾患およびアナフィラキシーを含み、そこでは、オマリズマブ−治療患者のうち悪性疾患の観察された発生(0.5%)は対照群における患者(0.2%)内よりも数値は高かった。
より小さな免役グロブリン分子が、全免役グロブリン療法に関連する種々の問題を克服する努力において構築された。単鎖免疫グロブリン可変領域断片ポリペプチド(scFvs)は、短いリンカーペプチドを介して免疫グロブリン軽鎖可変ドメインに連結された免疫グロブリン重鎖可変領域よりなる。非特許文献33。scFv分子のより小さなサイズは、全免疫グロブリンよりも血漿からのより迅速なクリアランスおよび組織へのより効果的な進入に導き得ることが提唱されている。例えば、非特許文献34参照。抗−腫瘍scFvは、対応するキメラ抗体よりも腫瘍塊を介したより迅速な腫瘍進入およびより均一な分布を有することが報告された。非特許文献35。
scFv分子が血清療法に関連し得るという利点にもかかわらず、この治療アプローチに対する欠点も存在する。例えば、scFvの迅速なクリアランスは最小有効用量の標的組織への送達を妨げかねない。加えて、患者への投与用の適量のscFvの製造は、収率に悪影響を及ぼすscFvの発現および単離における困難性のため挑戦的なものであった。発現の間に、scFv分子は安定性を欠き、しばしば、異なる分子からの可変領域の対合のため凝集する。さらに、哺乳動物発現系におけるscFv分子の生産レベルは報告されるところによると低く、これは、療法のためのscFv分子の効果的な製造の潜在能力を限定しかねない。非特許文献36;非特許文献37。生産を改良するための手段に対する戦略が開発され、報告されているところによると、それはグリコシル化部位の可変領域への付加を含む。例えば、特許文献1;非特許文献38参照。療法に対するscFvsの使用でのもう1つの不利はエフェクター機能の欠如である。細胞溶解機能、ADCC、および個体依存性−細胞傷害性を欠くscFvは、病気を治療するのに有効性が低く、または効果的でないであろう。scFv技術の開発は12年前以上に始まったが、現在、治療で認可されたscFv製品はない。
別法として、トキシンのようなもう1つの分子へのscFvの融合は、該トキシンを標的組織に送達するためのscFvの特異的抗原−結合活性および小さなサイズを利用できることが提唱されている。非特許文献39;非特許文献40。トキシンのscFvsへの結合体化または融合は、しばしば、優れた抗原−特異的分子を提供するための代替戦略として供されているが、そのような結合体またはキメラでの投与は、そのような製剤のトキシン部位のため過剰および/または非−特異的毒性によって制限され得る。毒性効果は肝臓酵素の超生理学的上昇、および血管遺漏症候群、および他の望まない効果を含み得る。加えて、免疫トキシンは宿主への投与に際してそれ自体高度に免役原性であり、免役トキシンに対して生じた宿主の抗体は、個体の反復治療的処置での潜在的有用性を限定する。
免疫グロブリン定常領域ポリペプチド配列が存在し、非免疫グロブリン配列が抗体可変領域に代えて置き換えられた融合タンパク質も研究されている。例えば、HIVによって認識されるT細胞表面タンパク質であるCD4は免疫グロブリンFcエフェクタードメインに組換えにより融合され、IL−2−IgG1融合タンパク質は、報告されているところによると、IL−2レセプター−担持細胞の補体−媒介溶解を行った。非特許文献41参照。組換え抗体技術の全ての態様についての広範な導入ならびに詳細な情報は非特許文献42に見出すことができる。詳細な抗体作成labプロトコルの包括的コレクションは非特許文献43に見出すことができる。
いくつかのタイプの免役グロブリン療法に適用できると考えられる病気および障害は癌および免疫系障害を含む。癌は、世界中で4人の個人のうちほぼ1人に影響する広い範囲の病気を含む。悪性細胞の迅速かつ調節されない増殖は血液学的悪性疾患を含めた多くのタイプの癌のホールマークである。血液学的悪性疾患を持つ患者は過去20年間において癌療法の進歩から利益を受け(非特許文献44)、かつ緩解の回数は増加したが、ほとんどの患者は依然として再発し、その病気で亡くなる。細胞傷害性薬物での治癒に対するバリアは、例えば、腫瘍細胞抵抗性および化学療法の高い毒性を含み、これは多くの患者において最適な投与を妨げる。
それにも関わらず、患者は、悪性細胞、すなわち、腫瘍細胞で発現された抗原を標的とする免疫療法で治療されてきた。免疫療法標的として用いるのに適した腫瘍細胞表面抗原の選択に関しては、特に、そのような組織の維持が宿主生存に重要である場合、そのような標的抗原は正常な組織によって発現されていないのが好ましい。血液学的悪性腫瘍の場合には、悪性細胞は、幹細胞または他の必須細胞の表面で発現されない多くの抗原を発現する。血液学的起源の正常および悪性腫瘍の双方を枯渇する治療レジメンを用いる血液学的悪性疾患の治療は、先祖からの正常細胞の再生が治療が終わった後に起こり得る場合に許容されてきた。加えて、標的抗原は、望ましくは、腫瘍細胞の全てまたは実質的に全てのクローン原性集団で発現され、免疫グロブリン療法からの選択圧にかかわらず発現が継続するのが最良である。B細胞悪性疾患の療法に対する標的としての細胞表面イディオタイプ(例えば、特定のイディオトープ)の選択を使用する戦略は、当該抗原が高度な腫瘍選択性を呈する場合においてさえ、改変された表面イディオタイプ発現を持つ腫瘍細胞変種の派生物によって制限されてきた。非特許文献45。選択された抗原は、免疫グロブリンがそれに結合した後に適切に輸送もされるべきである。免疫グロブリンが抗原に結合する後における細胞表面標的抗原の放出または内部化は、腫瘍細胞が破壊を免れるのを可能とし、かくして、血清療法の有効性を制限する。最後に、細胞活性化シグナルを伝達しまたは変換する細胞表面標的抗原への免役グロブリンの結合の結果、腫瘍細胞における免疫療法に対する改良された機能的応答がもたらされ得、成長の阻止および/またはアポトーシスに至り得る。これらの特性の全ては重要であるが、免疫グロブリンが標的抗原に結合した後におけるアポトーシスのトリアリングもまた、成功した血清療法を達成するにおいて非常に重要な因子であり得る。
BおよびT細胞悪性疾患の血清療法に対する標的としてテストされてきた抗原はIgイディオタイプ(非特許文献46)、CD19(非特許文献47,非特許文献48)、CD20(非特許文献49,非特許文献50)、CD21(非特許文献51)、CD5(非特許文献52)、およびCD52(CAMPATH)(非特許文献53)を含む。これらのうち、B細胞リンパ腫の療法についてのより大きな利点は、CD20を標的とする分子を用いて得られてきた。他の標的は抗原の生物学的特性によって制限されてきた。例えば、表面イディオタイプは体細胞突然変異を介して改変され得、腫瘍細胞を逃がしてしまう。CD5、CD21、およびCD19はモノクローナル抗体の結合後に迅速に内部化され、モノクローナル抗体がトキシン分子と結合体化するのでなければ腫瘍細胞が破壊を免れるようにする。CD22はB細胞リンパ腫のサブセットのみに発現され、それにより、その有用性を制限され、他方、CD52はT細胞およびB細胞の双方で発現され、したがって、枯渇によって逆生産的免役抑制を生じ得る。
キメラCD20モノクローナル抗体を用いる低グレードのまたは小胞B細胞リンパ腫を持つ患者の試料は、患者において部分的または完全な応答を誘導すると報告されている。非特許文献54;非特許文献55。しかしながら、前記したように、腫瘍の再発が6ヶ月ないし1年以内に通常は起こる。血清療法における更なる改善は、例えば、低グレードB細胞リンパ腫においてより持続性のある応答を誘導し、高グレードのリンパ腫および他のB細胞病の効果的な治療を可能とする必要がある。
もう1つのアプローチは、CD20に特異的なモノクローナル抗体を用いて放射性同位体をB細胞リンパ腫に標的化してきた。療法の有効性は報告されているところによると増大するが、放射性抗体の長いイン・ビボ 半減期らの関連毒性も増加し、時々、患者が幹細胞救済を受けることを必要とする。非特許文献56;非特許文献57。また、CD20に対するモノクローナル抗体プロテアーゼで切断され、放射性同位体の付着に先立って、F(ab’)またはFab断片を生じた。これは、放射性同位体結合体腫瘍への進入を改良し、イン・ビボ半減期を短くし、かくして、正常な細胞に対する毒性を低下すると報告されている。しかしながら、これらの細胞は、補体固定および/またはADCCを含めたエフェクター機能を欠く。
CD20は、モノクローナル抗体によって同定された最初のヒトB細胞系−特異的表面分子であった。それは、細胞質に位置するアミノおよびカルボキシ両末端を有する非−グリコシル化疎水性35kDa B細胞膜貫通リンタンパク質である。非特許文献58。CD20は全ての正常な成熟B細胞によって発現されるが、前駆体B細胞によって発現されない。CD20に対する天然リガンドは同定されておらず、B細胞生物学におけるCD20の機能は依然として不完全にしか理解されていない。
抗−CD20モノクローナル抗体はB細胞の生存性および増殖に影響する。非特許文献59。CD20の広範な架橋はBリンパ腫細胞系においてアポトーシスを誘導でき(非特許文献60)、細胞表面のCD20の架橋は、大きさを増大させ、例えば、細胞基質のチロシンリン酸化を測定することによって形質されるように、シグナル変換のキネティックスを増強すると報告されている。非特許文献61。従って、補体およびADCCメカニズムによる細胞枯渇に加え、イン・ビボでのCD20モノクローナル抗体によるFcレセプター結合はCD20架橋による悪性B細胞のアポトーシスを促進し、これは、SCIDマウスモデルにおけるヒトリンパ腫のCD20療法の有効性が、CD20モノクローナル抗体によるFc−レセプター結合に依存し得るという理論に合致する。非特許文献62。CD20ポリペプチド中の複数膜スパンニングドメインの存在(非特許文献63;非特許文献64;非特許文献65)は、抗体結合におけるCD20内部化を妨げ、これは、マウスCD20モノクローナル抗体1F5がB細胞リンパ腫を持つ患者に注射され、その結果、悪性細胞の有意な枯渇および部分的臨床応答がもたらされた時に、B細胞悪性疾患の療法で重要な特徴として認識された。非特許文献66。
正常な成熟B細胞はCD20も発現するので、正常B細胞は抗−CD20抗体療法によって枯渇される。非特許文献67。しかしながら、治療が完了した後、正常なB細胞はCD20陰性B細胞前駆体から再生でき;従って、抗−CD20療法で治療した患者は有意な免役抑制は経験しない。正常なB細胞の枯渇は、自己抗体の不適切な生産、およびB細胞が役割を演じるであろう他の病気を含む病気でやはり有益であり得る。ヒトIgG1重鎖およびヒトカッパ軽鎖定常領域に融合したマウス起源の重鎖および軽鎖可変領域よりなる、CD20に特異的なキメラモノクローナル抗体は、報告されているところによると、CD20への結合、およびADCCを媒介し、および補体を結合する能力を保有した。非特許文献68。前記にて議論したリツキシマブの抗−腫瘍活性のメカニズムは、ADCC、補体固定化、および悪性B細胞におけるアポトーシスを促進するシグナルのトリアリングを含めたいくつかの活性の組合であると考えられるが、リツキシマブの大きなサイズは、悪性B細胞を含有するリンパ系組織への当該分子の最適な拡散を妨げ、それにより、これらの抗−腫瘍活性を制限する。自己免疫疾患は自己免疫甲状腺病を含み、これはグレーヴス病およびハシモト甲状腺炎を含む。合衆国単独においては、何らかの形態の自己免疫甲状腺病を有する約2000万の人がいる。自己免疫甲状腺病は、甲状腺を刺激して甲状腺機能亢進を引き起こす(グレーヴス病)か、あるいは甲状腺を破壊して甲状腺機能低下を引き起こす(ハシモト甲状腺炎)自己抗体の生産に由来する。甲状腺の刺激は、甲状腺刺激ホルモン(TSH)レセプターに結合し、それを活性化する自己抗体によって引き起こされる。甲状腺の破壊は、他の甲状腺抗原と反応する自己抗体によって引き起こされる。グレーヴス病に対する現行の療法は外科的処置、放射性ヨウ素、または抗−甲状腺薬物療法を含む。放射性ヨウ素は広く用いられている。というのは、抗甲状腺投薬はかなりの副作用を有し、病気の再発が高いからである。外科的処置は大きな甲状腺種を持つ患者に対して、あるいは甲状腺機能の迅速な正常化が必要な場合に維持される。TSHレセプターを刺激することを担う自己抗体の生産を標的とする療法はない。ハシモト甲状腺炎に対する現行の療法はレボチロキシンナトリウムであって、療法は緩解の低い尤度のため通常は寿命が長い。抑制的療法はハシモト甲状腺炎において甲状腺腫を修飾させることが示されているが、病気メカニズムを標的化するために自己抗体生産を低下させる療法は知られていない。
慢性関節リウマチ(RA)は関節の炎症によって特徴付けられている慢性病であり、膨潤、疼痛、および機能の喪失に導く。RAは合衆国において推定250万人の人々に影響している。RAは初期の感染または負傷、異常な免役応答、遺伝的因子を含めた事象の組合せによって引き起こされる。自己反応性T細胞およびB細胞がRAに存在するが、リウマチ因子と呼ばれる関節に集まる高レベルの抗体の検出がRAの診断で用いられる。RAの現行の療法は、疼痛を管理し、当該病気の進行を示す多くの投薬を含む。該病気を治癒できる療法は見出されていない。投薬は、非ステロイド抗炎症薬物(NSAIDS)、および病気修飾抗リウマチ薬剤(DMARDS)を含む。NSAIDSは良性病で有用であるが、ひどいRAにおける関節の破壊および衰弱への進行を妨げることができない。NSAIDSおよびDMARDSは共にかなりの副作用と関連付けられる。1つの新しいDMARD、レフルノマイドのみが10年以上にわたって認可されている。レフルノマイドは自己抗体の生産をブロックし、炎症を低下させ、およびRAの進行を遅くする。しかしながら、この薬物は、嘔吐、下痢、毛髪喪失、発疹、および肝臓損傷を含めたひどい副作用も引き起こす。
全身性エリテマトーデス(SLE)は、腎臓、皮膚および関節を含めた多数の器官において血管に対する再発負傷によって引き起こされる自己免疫疾患である。SLEは合衆国において5000,000を超える人々に影響していると推定される。SLEを持つ患者では、T細胞およびB細胞の間の誤った相互作用の結果、細胞核を攻撃する自己抗体の生産がもたらされる。これらは抗−二本鎖DNAおよび抗−Sm抗体を含む。リン脂質に結合する自己抗体はSLE患者の約半分で見出されており、これは血管損傷および低い血液カウントの原因である。免役複合体はSLE患者の腎臓、血管および関節に蓄積し、そこでは、それは炎症および組織損傷を引き起こす。当該病気を治癒するSLEに対する治療は見出されていない。NSAISDSおよびDMARDSは、当該病気の重症度に応じて療法で用いられている。自己抗体を除去するための血漿交換を用いるプラズマフェレシスは、SLE患者において一時的な改善を引き起こし得る。自己抗体がSLEの原因であるという一般的な合意があり、従って、免疫系を新しいB細胞が前駆体から生じるにつれリセットさせるB細胞系を枯渇させる新しい療法は、SLE患者において長く継続する利点に対する希望を与えるであろう。
シェーグレン症候群は、身体の水分−生産腺の破壊によって特徴付けられる自己免疫疾患である。シェーグレン症候群は最も流行する自己免疫障害の1つであり、合衆国においては推定400万の人々を襲う。シェーグレン症候群に罹った人々の約半分はRAのような結合組織病も有しており、他方、他の半分は、他の同時自己免疫疾患を持たない一次シェーグレン症候群を有する。抗−核抗体、リウマチ因子、抗−フォドリン、および抗−ムスカリン様レセプターを含めた自己抗体は、しばしば、シェーグレン症候群を持つ患者に存在する。慣用的な療法はコルチコステロイドを含み、追加のより効果的な療法は役に立つであろう。
免疫性血小板減少性紫斑病(ITP)は、血液血小板に結合し、その破壊を引き起こす自己抗体によって引き起こされる。薬物はITPのいくつかの症例を引き起こし、他のものは感染、妊娠、またはSLEのような自己免疫疾患に関連付けられる。全ての症例の約半分は「特発性」として分類され、これは原因が知られていないことを意味する。ITPの治療は徴候の重症度によって決定される。いくつかの症例においては、療法は必要ないが、ほとんどの場合には、コルチコステロイドを含めた免役抑制薬物、または免疫グロブリンのT細胞を枯渇するための静脈内注入が提案されている。通常、血小板の増大した数をもたらすもう1つの治療は脾臓、抗−被覆血小板を破壊する器官の摘出である。サイクロスポリン、シクロホスファミドまたはアザチオプリンを含めたより優れた免役抑制薬物は、ひどい症例の患者で用いられる。患者の血漿をプロテインAカラムに通過させることによる自己抗体の除去は、ひどい病気に罹った患者における第二ラインの治療として用いられる。追加のさらなる有効な療法が望まれる。
多発性硬化症(MS)もまた自己免疫疾患である。それは、中枢神経系の炎症、および脳、脊髄および身体における神経細胞線維を絶縁するミエリンの破壊によって特徴付けられる。MSの原因は知られていないが、自己免疫T細胞が当該病気の病因に対する第一の寄与者であると広く信じられている。しかしながら、高レベルの抗体がMSを持つ患者の脳脊髄液に存在し、いくつかの理論は、抗体生産に至るB細胞応答が当該病気を媒介するのに重要であると予測している。B細胞枯渇療法はMSを持つ患者で調べられておらず、MSに対する治癒はない。現行の療法はコルチコステロイドであり、これは攻撃の持続およびひどさを低減させることができるが、経時的にMSの進行に影響しない。MSに対する新しいバイオテクノロジーインターフェロン(IFN)療法が、最近認可されたが、追加のより効果的な療法が望まれる。
重症筋無力症(MG)は、随意筋グループの弱化によって特徴付けられる慢性自己免疫神経筋肉障害である。MGは合衆国において約40,000の人々に影響する。MGは、神経筋肉接合において発現されるアセチルコリンレセプターに結合する自己抗体によって引き起こされる。該自己抗体はアセチルコリンレセプターを低下させ、またはブロックし、神経からの筋肉へのシグナルの伝達を妨げる。MGに対する知られた治癒はない。通常の試料は、コルチコステロイド、サイクロスポリン、シクロホスファミド、またはアザチオプリンでの免役抑制を含む。胸腺の外科的摘出が、しばしば、自己免疫応答の効果を無くするのに用いられる。血液中の自己抗体レベルを低下させるのに用いられるプラズマフォレシスはMGで効果的であるが、寿命が短い。なぜならば、自己抗体の生産が続くからである。プラズマフォレシスは、外科的処置に先立ってのひどい筋肉弱化のために保持される。新しくかつ効果的な療法が役に立つであろう。
乾癬はほぼ500万人の人々に影響し、これは皮膚における自己免疫炎症によって特徴付けられる。また、乾癬は30%において関節炎と関連付けられている(乾癬性関節炎)。ステロイド、紫外光レチノイド、ビタミンD誘導体、サイクロスポリン、メトトレキセートを含めた多くの治療が用いられてきたが、乾癬は新しくかつ効果的な療法から利点を受けるのも明白である。強皮症は、全身硬化症としても知られた結合組織の慢性自己免疫疾患である。強皮症はコラーゲンの過剰生産によって特徴付けられ、皮膚の厚化をもたらし、合衆国においてほぼ300,000の人々が強皮症を有し、これもまた新しくかつ効果的な療法によって利点を受けるであろう。
B細胞悪性疾患を含めた悪性疾患、および自己免疫疾患、障害および状態を含めた障害、ならびに他の病気、障害および疾患を治療する改良された組成物および方法に対する明らかな要求が存在する。本明細書中に記載し、特許請求する本発明の組成物および方法は、そのような改良された組成物および方法ならびに利点を提供する。
米国特許第5,888,773号明細書
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(発明の要旨)
本発明の目的は、CH1以外の免疫グロブリン重鎖からの1以上の天然または作成された定常領域、例えば、IgGおよびIgAのCH2およびCH3領域、またはIgEのCH3およびCH4領域を含む領域に融合した、または他の方法で結合した、免疫グロブリンヒンジまたはヒンジ−作用領域ポリペプリドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチドを含む結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供することにある。該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、さらに、ヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプリド(またはIgEの全てまたはIgEからの部分に誘導された構築体の場合にはCH3)、およびCH2定常領域ポリペプリド(IgEの全てまたはIgEからの部分に誘導された構築体の場合にはCH3)に融合した、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチド(またはIgEの全てまたはIgEからの部分に誘導された構築体の場合にはCH4)を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる領域をさらに含む。そのような結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定よりなる群から選択される少なくとも1つの免疫学的活性が可能である。そのような結合ドメインポリペプチドは標的、例えば、標的抗原への結合または特異的結合も可能である。
ある具体例においては、例えば、該結合ドメインポリペプチドは、天然または作成された免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび/または天然または作成された免役グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドから選択される少なくとも1つの免役グロブリン可変領域ポリペプチドを含む。あるさらなる具体例において、該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は天然または作成された免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含み、ここに、該重鎖可変領域ポリペプチドはアミノ酸位置9、10、11、12、108、110および/または112のいずれか1以上に対応する位置においてアミノ酸の突然変異、置換または欠失を含む作成されたヒト免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチド(または非−ヒト種からの作成された免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチド)である。
重鎖可変領域におけるアミノ酸位置9、10、11、12、108、110および/または112のいずれか1以上に対応する位置におけるアミノ酸の突然変異、置換または欠失は、例えば、配列番号: に対応する構築体のような構築体内に含むことができる。ある他のさらなる具体例において、該融合タンパク質は配列番号: または配列番号: から選択される配列を有するポリペプチドを含む。ある具体例において、該免疫グロブリン可変領域ポリペプチドは、例えば、ヒト免疫グロブリンに由来し、ある他の具体例においては、該免疫グロブリン可変領域ポリペプチドはヒト化免疫グロブリンポリペプチド配列を含む。ある具体例において、該免疫グロブリン可変領域ポリペプチドは、ヒト化されているか否かにかかわらず、マウス免疫グロブリンに由来し、あるいは例えば、ラット、ブタ、サル、ラクダ科動物を含めたもう1つの種からの免疫グロブリンに由来する。
本発明のある具体例によると、該結合ドメインポリペプチドは、(a)少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチド;(b)少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチド;および(c)(a)のポリペプチドに、および(b)のポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した少なくとも1つのリンカーポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。ある他のさらなる具体例において、該天然または作成された免疫グロブリン軽鎖可変領域および重鎖可変領域ポリペプチドはヒト免疫グロブリンに由来し、またはそれから構築され、ある他のさらなる具体例において、該リンカーポリペプチドはアミノ酸配列Gly−Gly−Gly−Gly−Ser[配列番号: ]を含む、またはそれを有する少なくとも1つのポリペプチドを含む。他の具体例において、該リンカーポリペプチドはアミノ酸配列Gly−Gly−Gly−Gly−Ser[配列番号: ]を有するポリペプチドの少なくとも2つまたは3つの反復を含む。他の具体例において、該リンカーは、あるさらなる具体例においては、アスパラギン−結合グリコシル化部位、O−結合グリコシル化部位、C−マンノシル化部位、グリピエーション部位またはホスホグリケーション部位であるグリコシル化部位を含む。もう1つの具体例において、天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチドおよび天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドの少なくとも1つはIgGまたはIgAヒト免疫グロブリン重鎖に由来する。もう1つの具体例において、天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドおよび天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH4定常領域ポリペプチドの少なくとも1つはIgEヒト免疫グロブリン重鎖に由来する。
免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは(1)天然に生じるいずれかのヒンジまたはヒンジ−作用ペプチドまたはポリペプチド、例えば、野生型ヒトIgGヒンジまたはその部分、野生型ヒトIgAヒンジまたはその部分、野生型ヒトIgDヒンジまたはその部分、または野生型ヒトIgEヒンジ−作用領域、すなわち、IgE CH2、またはその部分を含めたヒト免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、野生型ラクダ科動物ヒンジ領域またはその部分(IgG1ラマヒンジ領域またはその部分、IgG2ラマヒンジ領域またはその部分、およびIgG3ラマヒンジ領域またはその部分)、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、および/またはギンザメヒンジ領域またはその部分;(2)システイン残基を含有せず、かつ1以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに由来する、またはそれから構築された変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒンジ領域ポリペプチド;(3)1つのシステイン残基を含有し、かつ1以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに由来する変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒンジ領域ポリペプチド;(4)1以上のグリコシル化部位、例えば、アスパラギン−結合グリコシル化部位、O−結合グリコシル化部位、C−マンノシル化部位、グリピエーション部位またはホスホグリケーション部位を含むように、またはそれを加えるように変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒンジ領域ポリペプチド;(5)システイン残基の数がアミノ酸置換または欠失によって低下した変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒンジ領域ポリペプチド、例えば、0、1または2のシステイン残基を含有する変異した、または他の方法で改変された、または作成されたIgG1またはIgG4ヒンジ領域、例えば、0、1、2または3のシステイン残基を含有する変異した、または他の方法で改変された、または作成されたIgG2ヒンジ領域、例えば、0、1、2、3、または4ないし10のシステイン残基を含有する変異した、または他の方法で改変された、または作成されたIgG3ヒンジ領域、または0、または1または2のみのシステイン残基を含有する変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒトIgA1またはIgA2ヒンジ領域ポリペプチド(例えば、「SCC」ヒンジ)、システイン残基を含有しない変異した、または他の方法で改変された、または作成されたIgDヒンジ領域、または0、または1、2、3または4のみのシステイン残基を含有する変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒトIgEヒンジ−作用領域、すなわち、IgE CH2領域ポリペプチド;または(6)本明細書中に記載された、または参照された、あるいは例えば、CH1ドメインおよびCH2ドメインのような隣接免疫グロブリンドメインを結合するのに有用なことが知られた、または後に発見されたいずれかの他の結合領域分子のいずれかを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができる。例えば、ヒンジ領域ポリペプチドは(i)野生型ヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、(ii)3以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに由来する、またはそれから構築された変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒトIgG1、または他の免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、ここに、該変異したヒトIgG1または他の免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは2つのシステイン残基を含有し、およびここに野生型ヒンジ領域の第一のシステインが突然変異していない、(iii)3以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに由来する変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒトIgG1、または他の免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、ここに、該変異したヒトIgG1、または他の免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは1以下のシステイン残基を含有する、および(iv)3以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに由来する変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒトIgG1、または他の免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、ここに、該変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒトIgG1、または他の免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドはシステイン残基を含有しない;よりなる群から選択することができる。ある具体例においては、例えば、該免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは変異した、または他の方法で改変された、または作成されたヒンジ領域ポリペプチドであって、野生型ヒト免疫グロブリンG、または他の野生型ヒンジ領域またはヒンジ−作用ポリペプチドと比較して、二量体化する能力の低下を呈する。
該免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドは、例えば、ヒトIgGまたはヒトIgAであるイソタイプの天然または作成されたCH2およびCH3ドメインであり得る。該免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドは、例えば、ヒトIgEであるイソタイプの天然、または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域CH3およびCH4ポリペプチドでもあり得る。
ある他の具体例において、該標的または標的抗原は、例えば、CD19(B−リンパ球表面抗原B4、またはLeu−12ともいわれるB−リンパ球抗原CD19)、CD20(B−リンパ球表面抗原B1、Leu−16、またはBp35ともいわれるB−リンパ球抗原20)、CD22(Leu−14、B−リンパ球細胞接着分子、またはBL−CAMともいわれるB−細胞レセプターCD22)、CD37(白血球抗原CD37)、CD40(腫瘍壊死因子レセプタースーパーファミリーメンバー5、CD40Lレセプター、またはBp50ともいわれるB−細胞表面抗原CD40)、CD80(活性化B7−1抗原、B7、B7−1、またはBB1ともいわれるTリンパ球活性化抗原CD80)、CD86(活性化B7−2抗原、B70、FUN−1、またはBU63ともいわれるTリンパ球活性化抗原CD86)、CD137(腫瘍壊死因子レセプタースーパーファミリーメンバー9ともいわれる)、CD152(細胞傷害性T−リンパ球タンパク質4またはCTLA−4ともいわれる)、CD45(L−CA、T200、およびEC3.1.3.48ともいわれる白血球共通抗原)、CD45RA(CD45のイソ形態、ナイーブまたは未成熟リンパ球上に発現される抗原)、CD45RB(CD45のイソ形態)、CD45RO(CD45のイソ形態、および記憶BおよびT細胞上に発現される共通の白血球抗原)、L6(膜貫通4スーパーファミリーメンバー1、膜成分表面マーカー1、またはM3S1ともいわれる腫瘍−関連抗原L6)、CD2(T−細胞表面抗原T11/Leu−5、LFA−2、LFA−3レセプター、赤血球レセプター、またはロゼットレセプターともいわれるT−細胞表面抗原CD2)、CD28(Tp44ともいわれるT−細胞−特異的ホモダイマー表面タンパク質CD28)、CD30(腫瘍壊死因子レセプタースーパーファミリーメンバー8、CD30Lレセプター、またはKi−1ともいわれるリンパ球活性化抗原CD30)、CD50(細胞間接着分子−3(ICAM3)、またはICAM−Rともいわれる)、CD54(細胞間接着分子−1(ICAM1)、または主要群リノウイルスレセプターともいわれる)、B7−H1(活性化されたT細胞、B細胞およびミエロイド細胞によって発現される免疫抑制レセプターに対するリガンド、またPD−L1ともいわれる;Dong,et al.,「B7−H1, a third member of the B7 family, co−stimulates T−cell proliferation and interleukin−10 secretion」,1999 Nat.Med.5:1365−1369参照)、CD134(腫瘍壊死因子レセプタースーパーファミリーメンバー4、OX40、OX40Lレセプター、ACT35抗原、またはTAX−転写的に活性化された糖タンパク質1レセプターともいわれる)、41BB(4−1BBリガンドレセプター、T−細胞抗原4−1BB、またはT−細胞抗原ILA)、CD153(腫瘍壊死因子リガンドスーパーファミリーメンバー8、CD30リガンド、またはCD30−Lともいわれる)、CD154(腫瘍壊死因子リガンドスーパーファミリーメンバー5、CD40リガンド、CD40−L、TNF−関連活性化タンパク質、TRAP、またはT細胞抗原Gp39ともいわれる)、ICOS(誘導性コスティミュレーター)、CD3(デルタ、イプシロン、ガンマ、イータおよび/またはゼータ鎖の1以上、単独または組合せ)、CD4(T−細胞表面抗原T4/Leu3ともいわれるT−細胞表面糖タンパク質CD4)、CD25(インターロイキン−2レセプターアルファ鎖、IL−2レセプターアルファサブユニット、p55、またはTac抗原ともいわれる)、CD8α(T−リンパ球分化抗原、T8/Leu−2、およびLyt−2ともいわれるT−細胞表面糖タンパク質CD8アルファ鎖)、CD11b(インテグリンアルファ−M、細胞表面糖タンパク質MAC−1アルファサブユニット、CR−3アルファ鎖、白血球接着レセプターMo1、または好中球接着レセプターともいわれる)、CD14(ミエロイド細胞−特異的ロイシン−リッチ糖タンパク質、またはLPSレセプターともいわれる単球分化抗原CD14)、CD56(中性細胞接着分子1ともいわれる)、またはCD69(初期T−細胞活性化抗原p60、Gp32/28、Leu−23、MLR−3、活性化インデューサー分子またはAIMともいわれる)、およびTNF因子(例えば、TNF−α)であり得る。構築体標的および/または標的抗原の前記リストは例示に過ぎず、網羅的ではない。
もう1つの態様において、本発明は、CD154細胞外ドメイン、またはその所望の機能的部分を含む結合構築体(またはそのような構築体をコードするポリヌクレオチド)を含む。本発明のこの態様の1つの具体例において、例えば、該結合構築体は第二の結合ドメインに融合した、または他の方法で結合したCD154細胞外ドメインを含む。該第二の結合ドメインは、例えば、少なくとも1つの免疫グロブリン可変領域ポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができる。該少なくとも1つの免疫グロブリン可変領域ポリペプチドは天然、または作成されたscFvであり得る。該天然または作成されたscFvは、本明細書中に開示されたまたは記載された天然または作成されたscFvであり得る。天然または作成されたscFvを含めた第二の結合ドメインは、例えば、限定されるものではないが、例えば、B7−H1、ICOS、L6、CD2、CD3、CD8、CD4、CD11b、CD14、CD19、CD20、CD22、CD25、CD28、CD30、CD37、CD40、CD45、CD50、CD54、CD56、CD69、CD80、CD86、CD134、CD137、CD152、CD153、またはCD154のいずれかを含めた、本明細書中に開示したまたは記載した標的抗原を含めた、標的のいずれかに結合するものであり得る。
もう1つの具体例において、該結合ドメインポリペプチドはCTLA−4細胞外ドメイン、またはその所望の機能的部分を含み、さらなる具体例において、CH2定常領域ポリペプチドおよびCH3定常領域ポリペプチドから選択される免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドの少なくとも1つは、天然または作成されたヒトIgG1定常領域ポリペプチドである。
もう1つのさらなる具体例において、CH2定常領域ポリペプチドおよびCH3定常領域ポリペプチドから選択される免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドの少なくとも1つは、天然または作成されたヒトIgA定常領域ポリペプチドである。
もう1つのさらなる具体例において、CH3定常領域ポリペプチドおよびCH4定常領域ポリペプチドから選択される免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドの少なくとも1つは、天然または作成されたヒトIgE定常領域ポリペプチドである。
もう1つの具体例に転じ、本発明は、(a)免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド;(b)該ヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH2(またはIgE CH3)定常領域ポリペプチド;および(c)該CH2(またはIgE CH3)定常領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH3(またはIgE CH4)定常領域ポリペプチドを含む、それから本質的になる、またはそれよりなる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供し、ここに(1)該結合ドメインポリペプチドは、CD80およびCD86よりなる群から選択される少なくとも1つのCTLA−4リガンドに結合し、または特異的に結合することができるCTLA−4細胞外ドメイン、またはその部分を含み、(2)該免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは前記または本明細書中に記載したものであり得、例えば、天然または作成されたヒトIgAヒンジ領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgG1ヒンジ領域ポリペプチド、および天然または作成されたIgE CH2領域ポリペプチドよりなる群から選択されるポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができ、(3)天然または作成されたヒトIgA重鎖CH2定常領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgG1重鎖CH2定常領域ポリペプチド、および天然または作成されたヒトIgE重鎖CH3定常領域ポリペプチドよりなる群から選択されるポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、(4)天然または作成されたヒトIgA重鎖CH3定常領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgG1重鎖CH3定常領域ポリペプチド、および天然または作成されたヒトIgE重鎖CH4定常領域ポリペプチドよりなる群から選択されるポリペプチドを含み、それより実質的になり、またはそれよりなる免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、および(5)該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、CDC、および補体固定よりなる群から選択される少なくとも1つの免疫学的活性を誘導することができる。さらなる具体例において、該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、CDC、および補体固定よりなる群から選択される2つの免疫学的活性を誘導することができる。
もう1つの具体例において、本発明は、(a)免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド、ここに、該ヒンジ領域ポリペプチドは前記または本明細書中で記載した通りであってよく、かつ例えば、天然または作成されたヒトIgEヒンジ−作用領域、すなわち、IgE CH2領域ポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができ;(b)該ヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した第一の天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、ここに、該天然または作成された定常領域ポリペプチドは天然または作成されたヒトIgE CH3定常領域ポリペプチドを含み、それより実質的になり、またはそれよりなる;および(c)該第一の天然または作成された定常領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した第二の天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、ここに、該天然または作成された第二の定常領域ポリペプチドは天然または作成されたヒトIgE CH4定常領域ポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる;を含む、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供し、ここに、(1)該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、およびアレルギー応答メカニズムの誘導から選択される少なくとも1つの免疫学的活性を誘導することができ、および(2)該結合ドメインポリペプチドは抗原に結合し、または特異的に結合することができる。さらなる具体例において、該抗原は腫瘍抗原である。
ある他の具体例において、本発明は、(a)免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド、ここに、該結合ドメインポリペプチドは免疫エフェクター細胞に存在する少なくとも1つの抗原に結合し、または特異的に結合することができ、およびここに、該ヒンジ領域ポリペプチドは前記または本明細書中に記載した通りであってよく、かつ例えば、天然または作成されたヒトIgAヒンジ領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgGヒンジ領域ポリペプチド、および天然または作成されたヒトIgEヒンジ−作用領域、すなわち、IgE CH2領域ポリペプチドよりなる群から選択されるポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができ;(b)該ヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した第一の天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、ここに、該第一の天然または作成された定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたヒトIgA CH2定常領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgG CH2定常領域ポリペプチド、および天然または作成されたヒトIgE CH3定常領域ポリペプチドよりなる群から選択されるポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなり;(c)該第一の定常領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した第二の天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、ここに、該第二の定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたヒトIgA CH3定常領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgG CH3定常領域ポリペプチド、および天然または作成されたヒトIgE CH4定常領域ポリペプチドよりなる群から選択されるポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなり;および(d)天然または作成された原形質膜アンカードメインポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供する。この具体例の1つの例において、該原形質膜アンカードメインポリペプチドは天然または作成されたグリコシル−ホスファチジルイノシトール−結合を介して膜に結合する。さらなる具体例において、該原形質膜アンカードメインポリペプチドは天然または作成された膜貫通ドメインポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。もう1つのさらなる具体例において、該膜アンカードメインポリペプチドは天然または作成された膜貫通ドメインポリペプチド、および天然または作成された細胞質テイルポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。なおさらなる具体例において、該細胞質テイルポリペプチドは、なおさらなる具体例において、天然または作成されたレセプター死滅ドメインポリペプチド、死滅ドメイン、またはいずれかの機能的部分に由来する、またはそれより構築された天然または作成されたアポトーシスシグナリングポリペプチド配列を含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。さらなる具体例において、該天然または作成された死滅ドメインポリペプチドは、例えば、ITIMドメイン(免疫レセプターTyr−ベースの阻害モチーフ)、ITAMドメイン(免疫レセプターTyr−ベースの活性化モチーフ)、TRAF、RIP、CRADD、FADD(Fas−関連死滅ドメイン)、TRADD(腫瘍壊死因子レセプター1型関連DEATHドメインタンパク質)、RAIDD(RAIDともいう)、CD95(FASLレセプター、アポトーシス−媒介表面抗原FAS、FAS、およびApo−1抗原ともいわれる腫瘍壊死因子レセプタースーパーファミリーメンバー6)、TNFR1および/またはDR5(死滅レセプター−5)から選択される天然または作成されたポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。もう1つの具体例において、該天然または作成されたアポトーシスシグナリングポリペプチド配列は、例えば、カスパーゼ8/FLICE/MACH/Mch5およびカスパーゼ10/Flice2/Mch4を含めた、カスパーゼ−3またはカスパーゼ8またはカスパーゼ−10である天然または作成されたカスパーゼポリペプチドに由来するポリペプチド配列を含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。もう1つの具体例において、該原形質膜アンカードメインポリペプチドは、例えば、天然または作成されたグリコシル−ホスファチジルイノシトール−結合を含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。もう1つの具体例において、免疫エフェクター細胞に存在する抗原は、例えば、CD2、CD16、CD28、CD30、CD32、CD40、CD50、CD54、CD64、CD80、CD86、B7−H1、CD134、CD137、CD152、CD153、CD154、ICOS、CD19、CD20、CD22、CD37、L6、CD3、CD4、CD25、CD8、CD11b、CD14、CD56またはCD69である。もう1つの具体例において、該ヒトIgGは天然または作成されたヒトIgG1である。これらの結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、例えば、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性および/または補体固定および/またはCDCから選択される少なくとも1つの免疫学的活性を誘導することができ、かつ例えば、標的抗原を含めた標的に結合し、または特異的に結合することができる。他の具体例において、該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、例えば、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性および/または補体固定および/またはCDCから選択される2つの免疫学的活性を誘導することができ、かつ標的に結合し、または特異的に結合することができる。免疫エフェクター細胞は、例えば、顆粒球、肥満細胞、単球、マクロファージ、樹状細胞、好中球、好酸球、好塩基球、NK細胞、T細胞(Th1細胞、Th2細胞、Tc細胞、記憶T細胞、ヌル細胞、および大顆粒リンパ球などを含む)、およびB細胞を含む。本発明のこの具体例は、さらに、そのようなタンパク質の療法のための使用、例えば、イン・ビボおよびエクス・ビボ遺伝子治療のためのそのようなベクターの使用を含む。構築体成分および標的の前記リストは網羅的ではなく、本明細書中に記載したように、機能でき、または目的に有用であるいずれの所望の標的または成分も含むことができる。
もう1つの具体例において、本発明は、(2)天然または作成されたCH2定常領域ポリペプチド(または天然または作成されたIgE CH3定常領域ポリペプチド)に融合した、または他の方法で結合した(1)天然または作成された免疫グロブリンヒンジ領域またはヒンジ−作用領域(例えば、IgE CH2)ポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる第一のタンパク質モチーフを有するタンパク質を提供する。該第1のタンパク質モチーフを1以上の他のそのような第1のタンパク質モチーフと融合し、または他の方法で結合して、第2のタンパク質モチーフを形成することができ、該第2のタンパク質モチーフは(3)天然または作成されたCH3定常領域(または天然または作成されたIgE CH4定常常域)に融合し、または他の方法で結合して、第3のタンパク質モチーフを形成する。該第1、第2または第3のタンパク質モチーフは、例えば、天然または作成されたレセプター死滅ドメインポリペプチド、死滅ドメイン、またはいずれかの機能的部分に由来し、またはそれから構築できる、例えば、天然または作成されたアポトーシスシグナリングポリペプチド配列のような、天然または作成された膜貫通ドメインポリペプチド、および天然または作成された膜貫通ドメインポリペプチド、および天然または作成された細胞質テイルポリペプチドを含めた、本明細書中に記載された天然または作成された原形質膜アンカードメインポリペプチドの1以上に融合し、または他の方法で結合することができる。かくして、本発明のこの態様内のタンパク質またはポリヌクレオチドは、例えば、ヒンジ−CH2−CH3−膜貫通ドメイン−死滅ドメイン構築体であり得る。また、それは、例えば、(ヒンジ−CH2)−CH3−膜貫通ドメイン−死滅ドメイン構築体であり得、ここに、Xは2ないし約5、あるいは所望の長さ、またはFcレセプター結合および/または補体固定機能を達成するのに必要であろうそのような他の数である。本発明のこの具体例は、そのようなタンパク質をコードするポリヌクレオチド、そのようなポリヌクレオチドを含むベクター、およびそのようなポリヌクレオチドおよびベクターを含む宿主細胞も含む。本発明のこの具体例は、さらに、そのようなタンパク質の療法での使用、例えば、そのようなポリヌクレオチドおよび/またはベクターのイン・ビボおよびエクス・ビボ遺伝子治療のための使用を含む。本発明は、もう1つの具体例において、(a)免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド、ここに、該結合ドメインポリペプチドは、癌細胞表面に存在する少なくとも1つの抗原に結合し、またはそれに特異的に結合することができ、およびここに、該ヒンジ領域ポリペプチドは前記または本明細書中に記載した通りであってよく、例えば、天然または作成されたヒトIgAヒンジ領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgGヒンジ領域ポリペプチド、および天然または作成されたヒトIgEヒンジ−作用領域、すなわち、IgE CH2領域ポリペプチドよりなる群から選択されるポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができ;(b)該ヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した第一の天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、ここに、該第一の定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたヒトIgA CH2定常領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgG CH2定常領域ポリペプチド、または天然または作成されたヒトIgE CH3定常領域ポリペプチドであるポリペプチドを含み、実質的それよりなり、またはそれよりなり;および(c)該第一の定常領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した第二の天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、ここに、該第二の定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたヒトIgA CH3定常領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgG CH3定常領域ポリペプチド、または天然または作成されたヒトIgE
CH4定常領域ポリペプチドであるポリペプチドを含み、実質的それよりなり、またはそれよりなり;を含む、実質的それよりなる、またはそれよりなる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供する。さらなる具体例において、該ヒトIgGポリペプチドは天然または作成されたヒトIgG1ポリペプチドである。
もう1つの具体例において、本発明は、(a)免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド、ここに、該ヒンジ領域ポリペプチドは前記または本明細書中に記載した通りであってよく、かつ例えば、野生型または作成されたヒトIgAヒンジ領域ポリペプチドを含み、実質的それよりなり、またはそれよりなることができ;(b)該ヒンジ領域ポリペプチドに融合し、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチド、ここに、該天然または作成されたCH2定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたヒトIgA CH2定常領域ポリペプチドを含み、実質的それよりなり、またはそれよりなり;および(c)該天然または作成されたCH2定常領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチド、ここに、該天然または作成されたCH3定常領域ポリペプチドは、(i)J鎖と会合することができる、野生型ヒトIgA CH3定常領域ポリペプチド、または好ましくはヒトまたはヒト化された他のIgA領域で、(ii)例えば、J鎖と会合することができない、変異した、改変された、または他の方法で作成されたヒトIgA CH3定常領域ポリペプチドであるポリペプチドを含み、実質的それよりなり、またはそれよりなり;を含む、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供し、ここに、(1)該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、CDC、および補体固定よりなる群から選択される少なくとも1つの免疫学的活性が可能であり、および(2)該結合ドメインポリペプチドは、例えば、抗原のような標的に結合し、または特異的に結合することができる。あるさらなる具体例において、J鎖と会合することができない該変異したヒトIgA CH3定常領域ポリペプチドは、(i)配列番号: に記載されたアミノ酸配列を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなるポリペプチド、または(ii)配列番号: に記載されたアミノ酸配列を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなるポリペプチドである。他の具体例において、該IgAヒンジ領域ポリペプチドは天然または作成されたIgA1ヒンジ領域ポリペプチド、または天然または作成されたIgA2ヒンジ領域ポリペプチドである。なお他の具体例において、該IgAヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、当該野生型ヒンジ領域内のシステイン残基の1以上の改変、置換または欠失によって野生型IgA1またはIgA2ヒンジ領域ポリペプチドとは異なる。
ある他の具体例において、本発明は、(a)免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド;(b)該ヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチド、ここに、該天然または作成されたCH2定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたラマIgG1 CH2定常領域ポリペプチド、天然または作成されたラマIgG2 CH2定常領域ポリペプチド、または天然または作成されたラマIgG3 CH2定常領域ポリペプチドである天然または作成されたラマCH2定常領域ポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなり;および(c)該天然または作成されたCH2定常領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチド、ここに、該天然または作成されたCH3定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたラマIgG1 CH3定常領域ポリペプチド、天然または作成されたラマIgG2 CH3定常領域ポリペプチド、および天然または作成されたラマIgG3 CH3定常領域ポリペプチドよりなる群から選択される天然または作成されたラマCH3定常領域ポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる;を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供し、ここに、(1)該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体の固定、およびCDCよりなる群から選択される少なくとも1つの免疫学的活性が可能であり、および(2)該結合ドメインポリペプチドは、標的、例えば、標的抗原に結合し、または特異的に結合することができる。該免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドのさらなる具体例において、該天然または作成されたラマCH2定常領域ポリペプチド、および該天然または作成されたラマCH3定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたラマIgG1ポリペプチドに由来する配列を含み、該融合タンパク質は天然または作成されたラマIgG1 CH1ドメインを含まない。ある具体例において、本発明は、前記した結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のいずれかを提供し、ここに、該ヒンジ領域ポリペプチドは、ある具体例においては、アスパラギン−結合グリコシル化部位、O−結合グリコシル化部位、C−マンノシル化部位、グリピエーション部位、またはホスホグリケーション部位であるグリコシル化部位を含むように突然変異され、作成され、または他の方法で改変されている。
本発明のある具体例において、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた、前記または本明細書中に記載された結合構築体いずれかが提供され、ここに、結合領域または結合ドメインポリペプチドは2以上の結合ドメインポリペプチド配列を含み、ここに、該結合ドメインポリペプチド配列の各々は、抗原のような標的に結合し、または特異的に結合することができ、その標的または抗原は同一または異なってもよい。天然、より好ましくは作成されたIgDヒンジは、本発明の二特異的分子、すなわち、2以上の結合ドメイン、好ましくは2つの結合ドメインを持つものの結合ドメインの間の所望の結合領域である。野生型ヒトIgDヒンジは、天然IgD構造において軽鎖とでジスルフィド結合を形成する1つのシステインを有する。例えば、二特異的分子の結合ドメインの間の結合領域として用いるために、ヒトIgDヒンジにおけるこのシステインを突然変異させ、または欠失させるのが望ましい。望まないヒンジ非柔軟性をもたらさないIgDヒンジにおける他のアミノ酸の変化または欠失または改変は本発明の範囲内のものである。非−ヒト種からのヒト化された天然または作成されたIgDヒンジであるように、他の種からの天然または作成されたIgDヒンジ領域もまた本発明の範囲内である。また、本発明は、ある具体例において、(a)免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド、ここに、該ヒンジ領域ポリペプチドは前記または本明細書中で記載したものであってよく、かつ例えば、代替ヒンジ領域ポリペプチド配列を含み、実質的それよりなり、またはそれよりなることができ;(b)該ヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合したIgGまたはIgA CH2定常領域ポリペプチド(またはIgE CH3定常領域ポリペプチド)のような第一の天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域、および(c)該第一の定常領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合したIgGまたはIgA CH3定常領域ポリペプチド(またはIgE CH4定常領域ポリペプチド)のような第二の天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域を含む、実質的それよりなる、またはそれよりなる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供し、ここに:(1)該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、CDC、および補体固定よりなる群から選択される、少なくとも1つの免疫学的活性が可能であり、および(2)該結合ドメインポリペプチドは抗原のような標的に結合し、または特異的に結合することができる。
もう1つの具体例に転じ(a)免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド、ここに、該結合ドメインポリペプチドは、癌細胞表面に存在する抗原のような少なくとも1つの標的に結合し、または特異的に結合することができ、およびここに、該ヒンジ領域ポリペプチドは前記または本明細書中に記載したものであってよく、かつ例えば、代替ヒンジ領域ポリペプチド配列を含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができ;(b)該ヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した第一の天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、ここに、該天然または作成された定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたヒトIgA CH2定常領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgG CH2定常領域ポリペプチド、および天然または作成されたヒトIgE CH3定常領域ポリペプチドよりなる群から選択されるポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなり;および(c)該第一の定常領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した第二の免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、ここに、該第二の定常領域ポリペプチドは、天然または作成されたヒトIgA CH3定常領域ポリペプチド、天然または作成されたヒトIgG CH3定常領域ポリペプチド、または天然または作成されたヒトIgE CH4定常領域ポリペプチドであるポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなり;を含む、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質が提供される。あるさらなる具体例において、該代替ヒンジ領域ポリペプチド配列は、配列番号: ないし から選択される配列において存在する少なくとも10連続アミノ酸のポリペプチド配列を含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。
ある具体例において、本発明は、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含む本発明の前記または本明細書中に記載されたポリペプチドまたはタンパク質構築体のいずれか1つをコードする、またはそれを含有する、単離されたまたは精製されたまたは純粋なポリヌクレオチド、ベクター、および単離された形質転換されたもしくはトランスフェクトされた細胞を含めた、ポリヌクレオチドまたは(クローニングベクターおよび発現ベクターを含めた)ベクター、または形質転換された、またはトランスフェクトされた細胞を提供する。かくして、種々の具体例において、本発明は、プロモーターに作動可能に連結したいずれかのそのようなポリヌクレオチドを含む組換えクローニングまたは発現構築体を提供する。
他の具体例において、いずれかのそのような組換えクローニングまたは発現構築体で形質転換された、またはそれでトランスフェクトされた、あるいは他の方法でそれを含有する宿主細胞が提供される。宿主細胞は、例えば、エクス・ビボ遺伝子治療を含めたエクス・ビボ細胞療法を受けている被験体の細胞を含む。
関連する具体例において、(a)当該構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の発現を可能とする条件下で、本明細書中で記載した、または本明細書中で提供した宿主細胞を培養し;次いで、(b)該構築体、例えば、該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を宿主細胞または宿主細胞培養物から単離する工程を含む、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた、本発明のポリペプチドまたはタンパク質または他の構築体を生産する方法が提供される。
もう1つの具体例において、生理学上許容される担体と組み合わせた、例えば、(例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた)前記または本明細書中に記載した本発明のポリペプチドまたはタンパク質または他の構築体のいずれか1つを含む医薬組成物が提供される。
もう1つの具体例において、本発明は、生理学上許容される担体と組み合わせた、または例えば、遺伝子治療送達ビークルまたはベクターと組み合わせた、またはその中の、例えば、(例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた)本発明のポリペプチドまたはタンパク質構築体のいずれか1つをコードする、例えば、単離された、精製された、または純粋なポリヌクレオチドを含む医薬組成物を提供する。
もう1つの具体例において、本発明は、本明細書中に記載した、または特許請求する医薬組成物のいずれかの治療有効量を患者に投与することを含む、悪性疾患またはB細胞障害を有する、またはそれを有することを疑われる被験体を治療する方法を提供する。
あるさらなる具体例において、該悪性疾患またはB細胞障害はB細胞リンパ腫またはB細胞白血病、または自己抗体生産によって特徴付けられる病気であり、ある他のさらなる具体例において、B細胞障害は、例えば、関節リウマチ、重症筋無力症、グレーヴス病、I型真性糖尿病、多発性硬化症または自己免疫疾患である。ある他の具体例において、該悪性疾患は、例えば、メラノーマ、骨髄腫、神経膠腫、星状細胞腫、リンパ腫、白血病、癌腫、または肉腫等である。
本発明のもう1つの態様は、(a)免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド、ここに、該ヒンジ領域ポリペプチドは前記した通りであって、(i)システイン残基を含有せず、かつ1以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに由来する、変異した、作成された、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチド、(ii)1つのシステイン残基を含有し、かつ2以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに由来する、変異した、作成された、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチド、(iii)野生型ヒトIgAヒンジ領域ポリペプチド、(iv)システイン残基を含有しない、変異した、作成された、または他の方法で改変されたヒトIgAヒンジ領域ポリペプチド、(v)1つのシステイン残基を含有する、変異した、作成された、または他の方法で改変されたヒトIgAヒンジ領域ポリペプチド、および(vi)2つのシステイン残基を含有する、変異した、作成された、または他の方法で改変されたヒトIgAヒンジ領域ポリペプチドよりなる群から選択することができ;(b)該ヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチド;および(c)該CH2定常領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供するものであり、ここに:(1)該結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、および補体固定よりなる群から選択される少なくとも1つの免疫学的活性が可能であり、および(2)該結合ドメインポリペプチドは抗原に結合し、または特異的に結合することができる。1つの具体例において、該免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは変異したヒンジ領域ポリペプチドであり、例えば、該得られた構築体は、野生型ヒト免疫グロブリンGヒンジ領域ポリペプチドを含有する構築体に比べ、二量体化する能力の低下を呈する。もう1つの具体例において、該結合ドメインポリペプチドは、天然または作成された免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび/または天然または作成された免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドである少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン可変領域ポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。さらなる具体例において、該天然または作成された免疫グロブリン可変領域ポリペプチドはヒト免疫グロブリンに由来し、例えば、ヒト化することができる。
もう1つの具体例において、本発明は、(a)少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチド;(b)少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチド;および(c)(a)のポリペプチドに、および(b)のポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した少なくとも1つのリンカーペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる結合ドメインポリペプチドを含む結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を提供する。さらなる具体例において、該天然または作成された免疫グロブリン軽鎖可変領域、および該天然または作成された重鎖可変領域ポリペプチドはヒト免疫グロブリンに由来し、例えば、ヒト化することができる。
もう1つの具体例において、該天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH2(またはIgE CH3)定常領域ポリペプチド、および該天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH3(またはIgE CH4)定常領域ポリペプチドの少なくとも1つはヒト免疫グロブリン重鎖に由来し、またはそれから構築される。もう1つの具体例において、該天然または作成された免疫グロブリン重鎖定常領域CH2およびCH3ポリペプチドは、ヒトIgGおよびヒトIgAから選択されるイソタイプのものであり、またはそれに由来し、または他の方法でそれから調製され、または構築される。もう1つの具体例において、該標的、例えば、標的抗原はCD16、CD19、CD20、CD37、CD40、CD45RO、CD80、CD86、CD137、CD152、およびL6よりなる群から選択される。前記した融合タンパク質構築体のあるさらなる具体例において、該結合ドメインがscFvを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなり、該scFvはアミノ酸配列Gly−Gly−Gly−Gly−Ser[配列番号: ]を含む、またはそれを有する少なくとも1つのポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなるリンカーポリペプチドを含み、ある他の具体例において、該リンカーポリペプチドはアミノ酸配列Gly−Gly−Gly−Gly−Ser[配列番号: ]を有するポリペプチドの少なくとも3つの反復を含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。ある具体例において、該免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、天然または作成されたヒトIdG、IgA、IgDヒンジ領域ポリペプチド、または天然または作成されたIgE CH2領域ポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。ある具体例において、該結合ドメインポリペプチドは天然または作成されたCD154細胞外ドメインを含み、実質的にそれよりなり、またはそれを含む。ある具体例において、該結合ドメインポリペプチドは、天然または作成されたCD154細胞外ドメインおよび少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン可変領域ポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。
他の具体例において、本発明は、本発明の構築体のいずれか、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた本発明のタンパク質またはポリペプチド構築体をコードする単離されたポリヌクレオチドを提供し、関連する具体例において、本発明はそのようなポリヌクレオチドを含む組換え発現構築体を提供し、あるさらなる具体例において、本発明はそのような組換え発現構築体で形質転換された、またはトランスフェクトされた、または他の方法でそれを含有する宿主細胞を提供する。もう1つの具体例において、本発明は、(a)当該構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードする構築体の発現を可能とする条件下で、本発明のポリヌクレオチド構築体で形質転換された、またはトランスフェクトされた、または他の方法でそれを含有するようにされた宿主細胞を培養し、(b)該構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を宿主細胞培養物から単離する工程を含む、本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のような本発明のタンパク質またはポリペプチド構築体を生産する方法を提供する。
本明細書中で記載した、および特許請求する発明は、例えば、治療剤、および診断および研究目的を含めた他の目的として有用な新規な分子を含む。そのような分子は、例えば、抗原結合または他の結合機能、および1以上のエフェクター機能を有する。本発明のDNA構築体は、例えば、イン・ビボおよびエクス・ビボ遺伝子治療を含めた遺伝子治療で有用である。
1つの態様において、本発明の分子の種々の構築体は、「結合領域」、「テイル」領域、および結合領域およびテイル領域を連結する「結合」領域を含む分子を含む。
本発明の分子内にある結合領域は、例えば、抗原−結合標的を含めた、所望の標的のための結合ドメインを含むことができる。抗原−結合標的のための結合ドメインは、例えば、単鎖FvsおよびscFvドメインを含むことができる。ある具体例において、本発明の分子は、軽鎖または重鎖可変領域ポリペプチドであってよい少なくとも1つの免疫グロブリン可変領域ポリペプチドを有する結合領域を含むことができる。ある具体例において、本発明の分子は、少なくとも1つのそのような軽鎖V−領域、および1つのそのような重鎖V−領域、および該V−領域を結合する少なくとも1つのリンカーペプチドを含むことができる。本発明で有用なscFvは、キメラ結合または他のドメインまたは配列を持つものを含む。本発明で有用な他のscFvはヒト化結合または他のドメインまたは配列も含む。そのような具体例において、非−ヒト供給源に由来する免疫グロブリン結合または他の配列の全てまたは部分は、ヒト化抗体、すなわち、ヒト免疫系がそのようなタンパク質を外来性と認める程度を低下させるためにヒトIg配列を導入した免疫グロブリン配列を生成させるための認められた手法に従って「ヒト化」することができる。
本発明で有用なscFvの例は、全部または部分的に、マウスまたは他のscFv(ヒトscFvを含む)、キメラscFv、またはヒト化scFvとして含まれているか否かを問わず、抗−ヒトCD20 scFv(例えば、「2H7」scFv)、抗−ヒトCD37 scFv(例えば、「G28−1」scFv)、抗−ヒトCD40 scFv(例えば、「G28−5」scFvおよび「40.2.220」scFv)、抗−癌腫−関連抗原scFv(例えば、「L6」scFv)、抗−CTLA−4(CD152)scFv(例えば、「10A8」scFv)、抗−ヒトCD28 scFv(例えば、「2E12」scFv)、抗−マウスCD3 scFv(例えば、「500A2」scFv)、抗−ヒトCD3 scFv(例えば、G19−4 scFv)、抗−マウス4−1BB scFv(例えば、「1D8」scFv)、抗−ヒト4−1BB scFv(例えば、「5B9」scFv)、抗−ヒトCD45RO(例えば、「UCHL−1」scFv)および抗−ヒトCD16(例えば、「Fc2」scFv)を含む。
本発明で有用なscFvは、1以上のアミノ酸置換を有するキメラおよびヒト化scFvを含めたscFvも含む。好ましいアミノ酸置換は可変重鎖(V)におけるアミノ酸位置11におけるものである。そのような置換は本明細書中においては「XXX11ZXX」ということができる。かくして、例えば、位置V11における正常に生じるアミノ酸がロイシンであって、セリンアミノ酸残基がそれに代えて置換されている場合、該置換は「L V11S」または「LeuV11Ser」として確認される。本発明の他の好ましい具体例はscFvを含有する分子を含み、ここに、位置V11で通常見出されるアミノ酸残基は欠失されている。本発明のなお他の好ましい具体例はscFvを含有する分子を含み、ここに、位置V10および/またはV11および/またはV12で通常見出されるアミノ酸残基は置換されているか、または欠失されている。
本発明の分子内の他の結合領域は、グリコシル化、例えば、単糖またはオリゴ糖のような炭水化物部分の共有結合のための部位を含むドメインを含むことができる。
本発明の分子内のなお他の結合領域は、抗原を含めた、もう1つの分子に特異的に結合する能力を保有するタンパク質またはその部分を含むことができるポリペプチドを含む。かくして、結合領域はホルモン、サイトカイン、ケモカイン等;そのようなポリペプチドリガンドのための細胞表面または可溶性レセプター;レクチン;特異的白血球インテグリン、セレクチン、免疫グロブリン遺伝子スーパーファミリーメンバー、細胞間接着分子(ICAM−1、−2、−3)等のような細胞間接着レセプター;組織適合性抗原;等を含むか、またはそれに由来することができる。そのような分子に由来する結合領域は、一般には、標的への結合に必要な、またはそれで望まれる分子の部分を含む。
ある構築体は、レセプターまたはレセプター−結合ドメインを含む結合領域を含む。標的への結合で有用なレセプタードメインは、例えば、CD154細胞外ドメイン、またはCTLA−4細胞外ドメインを含む。もう1つの例において、結合ドメインがCD154細胞外ドメインを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる第一の部分、および少なくとも1つの免疫グロブリン可変領域ポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる第二の部分を含むことができ、該第二の部分が、例えば、scFvまたはVを含むことができる。結合領域または結合ドメインポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる、またはその部分がそれを供することができる他の細胞表面レセプターの例は、例えば、HER1、HER2、HER3、HER4、表皮成長因子レセプター(EGFR)、血管内皮細胞成長因子、血管内皮細胞成長因子レセプター、インスリン−様成長因子−I、インスリン−様成長因子−II、トランスフェリンレセプター、エストロゲンレセプター、プロゲステロンレセプター、卵胞刺激ホルモンレセプター(FSH−R)、レチノイン酸レセプター、MUC−1、NY−ESO−1、Melan−A/MART−1、チロシナーゼ、Gp−100、MAGE、BAGE、GAGE、SSX2遺伝子によってコードされた特にHOM−MEL−40抗原を含めたレセプターのCTAクラスのいずれか、癌胎児性抗原(CEA)、およびPyLTを含む。結合領域または結合ドメインポリペプチドの源であり得るさらなる細胞表面レセプターは、例えば、CD2、4−1BB、4−1BBリガンド、CD5、CD10、CD27、CD28、CD152/CTLA−4、CD40、インターフェロン−γ(IFN−γ)、インターロイキンン−4(IL−4)、インターロイキン−17(IL−17)およびインターロイキン−17レセプター(IL−17R)を含む。結合領域および/または結合ドメインポリペプチドの源であり得るなお他の細胞表面レセプターは、例えば、CD59、CD48、CD58/LFA−3、CD72、CD70、CD80/B7.1、CD86/B7.2、B7−H1/B7−DC、IL−17、CD43、ICOS、CD3(例えば、ガンマサブユニット、イプシロンサブユニット、デルタサブユニット)、CD4、CD25、CD8、CD11b、CD14、CD56、CD69およびVLA−4(αβ)を含む。以下の細胞表面レセプターは、典型的には、B細胞に関連している:CD19、CD20、CD22、CD30、CD153(CD30リガンド)、CD37、CD50(ICAM−3)、CD106(VCAM−1)、CD54(ICAM−1)、インターロイキン−12、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD83、およびDEC−205。これらのリストは網羅的ではない。前記したもののような結合領域は、例えば、天然または作成されたIgDヒンジ領域ポリペプチド、好ましくは、ヒトまたはヒト化天然または作成されたIgDヒンジ領域ポリペプチドによって結合させることができる。本発明は、かくして、さらに、第三の分子、例えば、本明細書中に記載したようなIgDヒンジ領域ポリペプチドによって結合され、2つの結合領域、例えば、scFvおよび細胞表面レセプター(またはその部分)を含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる構築体を提供する。
本明細書中で記載した、かつ特許請求した本発明の種々の分子は当該分子の1つの端部をもう1つの端部に連結する連結領域を含む。そのような連結領域は、例えば、天然に生じるいずれのヒンジペプチドまたはポリペプチドも含めた、免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含むことができる。また、連結領域は、例えば、テイル領域および結合領域を連結するのに有用ないずれの人工的ペプチドまたは他の分子(例えば、非−ペプチド分子、部分的ペプチド分子およびペプチドミメティックス等を含む)も含むことができる。これらは、例えば、CH1およびCH2領域において鎖内免疫グロブリンドメインジスルフィド結合を形成することを担うアミノ酸残基の間の免疫グロブリン重鎖ポリペプチドに位置した分子の改変を含むことができる。天然に生じるヒンジ領域は免疫グロブリンの定常領域ドメイン、CH1およびCH2の間に位置するものを含む。有用な免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、ヒト免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドおよびラマまたは他のラクダ科動物免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む。他の有用な免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、テンジクザメおよびギンザメ免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む。ヒト免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、野生型ヒトIgG1ヒンジを含めた野生型IgGヒンジ、ヒトIgG−由来免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、ヒトIgGヒンジもしくはIgG−由来免疫グロブリンヒンジ領域の部分、野生型ヒトIgAヒンジ領域ポリペプチド、ヒトIgA−由来免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、ヒトIgAヒンジ領域ポリペプチドもしくはIgA−由来免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドの部分、野生型ヒトIgDヒンジ領域ポリペプチド、ヒトIg−D由来免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、ヒトIgDヒンジ領域ポリペプチドもしくはIgD−由来免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドの部分、野生型ヒトIgEヒンジ−作用領域、すなわち、(一般には5つのシステイン残基を有する)IgE CH2領域ポリペプチド、ヒトIgE−由来免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、ヒトIgEヒンジ−作用領域、すなわち、IgE CH2領域ポリペプチドもしくはIgE−由来免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドの部分等を含む。ヒンジ機能を有するとみなされる免疫グロブリンポリペプチド鎖領域「に由来する」または「その部分または断片」であるポリペプチドは、ペプチド結合した1以上のアミノ酸、例えば、15ないし115アミノ酸、好ましくは95ないし110、80ないし94、60ないし80、または5ないし65アミノ酸、好ましくは10ないし50、より好ましくは15ないし35、なおより好ましくは18ないし32、なおより好ましくは20ないし30、なおより好ましくは21、22、23、24、25、26、27、28または29アミノ酸を有する。ラマ免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、IgG1ラマヒンジを含む。連結領域は免疫グロブリンヒンジ領域からの連続アミノ酸のストレッチを含むことができる。例えば、連結領域は、例えば、IgGヒンジ領域、IgGヒンジ領域、IgGヒンジ領域、IgGヒンジ領域、およびIgGヒンジ領域を含めた、ヒトIgGヒンジ、ヒトIgAヒンジ、ヒトIgEヒンジ、ラクダ科動物ヒンジ領域、IgG1ラマヒンジ領域、テンジクザメヒンジ領域、およびギンザメヒンジ領域からの少なくとも5つの連続ヒンジ領域アミノ酸、少なくとも10の連続ヒンジ領域アミノ酸、少なくとも15の連続ヒンジ領域アミノ酸、少なくとも20の連続ヒンジ領域アミノ酸、および少なくとも25以上の連続ヒンジ領域アミノ酸を含むことができる。
そのような連結領域は、例えば、変異した、または他の方法で改変されたまたは作成された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドも含む。変異した、または他の方法で改変されたまたは作成された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、いずれかの含まれた天然または作成されたCH2およびCH3ドメインのそれと同一または異なる種、免疫グロブリンイソタイプまたはクラス、または免疫グロブリンサブクラスの免疫グロブリンにその起源を有するヒンジ領域を含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができる。変異した、または他の方法で改変されたまたは作成された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、1以上のシステイン残基を含有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域、例えば、天然では3つのシステインを含む野生型ヒトIgGまたはIgAヒンジ領域に由来する、またはそれから構築されたものを含む。そのようなポリペプチドにおいて、システイン残基の数は、例えば、アミノ酸の置換または欠失または切断によって低下させることができる。これらのポリペプチドは、例えば、0、1または2のシステイン残基を含有する変異したヒトまたは他のIgG1またはIgG4ヒンジ領域ポリペプチド、および0、1または2のシステイン残基を含有する変異したヒトまたは他のIgA1またはIgA2ヒンジ領域ポリペプチドを含む。変異した、または他の方法で改変されたまたは作成された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、3以上のシステイン残基を含有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域、例えば、(4のシステインを有する)野生型ヒトIgG2ヒンジ領域、または(11のシステインを有する)IgG4ヒンジ領域に由来する、またはそれから構築されたものを含む。変異した、または他の方法で改変されたまたは作成された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、一般には5つのシステイン残基を含有するIgE CH2野生型免疫グロブリン領域に由来する、またはそれから構築されたものを含む。そのようなポリペプチドにおいて、システイン残基の数は、例えば、アミノ酸の置換または欠失または切断によって1以上のシステイン残基だけ低下させることができる。ヒンジ領域におけるシステイン残基がセリン、あるいは極性がより低い、疎水性がより低い、より親水性であり、および/または中性である1以上の他のアミノ酸で置き換えられた、改変されたヒンジ領域ポリペプチドも含まれる。そのような変異した免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、1つのシステイン残基を含有し、かつ野生型ヒトIgGまたはIgA領域ポリペプチドに由来する変異したヒトIgGまたはIgAヒンジ領域ポリペプチドのような、1つのシステイン残基を含有し、かつ2以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに由来する変異したヒンジ領域ポリペプチドを含む。連結領域ポリペプチドは、鎖内ホモダイマージスルフィド結合を形成するその能力が減じられた免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む。
また、変異した免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、野生型ヒト免疫グロブリンGヒンジ領域ポリペプチドに比べ、二量体化する能力の低下を呈する変異したヒンジ領域ポリペプチド、およびモノマーおよびダイマー分子の混合物の発現を可能とする変異したヒンジ領域ポリペプチドを含む。また、変異した免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、グリコシル化部位を含有するように作成されたヒンジ領域ポリペプチドも含む。グリコシル化部位は、例えば、アスパラギン−結合グリコシル化部位、O−結合グリコシル化部位、C−マンノシル化部位、グリピエーション部位、およびホスホグリケーション部位を含む。
本明細書中に記載し、特許請求する本発明の分子で有用な特異的連結領域は、例えば、以下の18アミノ酸配列、DQEPKSCDKTHTCPPCPA、DQEPKSSDKTHTSPPSPA、およびDLEPKSCDKTHTCPPCPAを含む。他の特異的連結領域は、例えば、「2H7 scFv(SSS−S)H WCH2 WCH3」および「2H7 scFv(CSS)H WCH2 WCH3」と本明細書では言う配列内の突然変異体ヒンジ、および「2H7 scFv IgAH WCH2 WCH3」と本明細書では言うヒトIgA−由来ヒンジを含む。
本発明の分子内のテイル領域は重鎖定常領域免疫グロブリン配列を含むことができる。テイル領域は、かくして、例えば、免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドのうちの少なくとも1つを有するポリペプチドを含むことができる。該免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチドおよび該免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドのうちの少なくとも1つはヒト免疫グロブリン重鎖に由来することができる。かくして、例えば、CH2および/またはCH3ポリペプチドはヒトIgG、ヒトIgAまたはヒトIgD分子に由来することができる。また、テイル領域は、例えば、免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖CH4定常領域ポリペプチドのうちの少なくとも1つを有するポリペプチドを含む。該免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドおよび該免疫グロブリン重鎖CH4定常領域ポリペプチドのうちの少なくとも1つはヒト免疫グロブリン重鎖に由来することができる。かくして、例えば、CH3および/またはCH4ポリペプチドはヒトIgEに由来することができる。本発明の分子内に含まれる免疫グロブリン重鎖CH2領域ポリペプチドは、例えば、IgG1、IgG2、IgG3および/またはIgG4サブクラスからのものであり得る。本発明の分子内に含まれる免疫グロブリン重鎖CH3領域ポリペプチドは、例えば、IgG1、IgG2、IgG3および/またはIgG4サブクラスからのものであってもよい。加えて、本発明の分子に含まれる該免疫グロブリン重鎖CH2領域ポリペプチドおよび該免疫グロブリン重鎖CH2領域ポリペプチドの双方は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3および/またはIgG4サブクラスからのものであってよい。本発明の他の分子において、CH2定常領域ポリペプチドおよびCH3定常領域ポリペプチドから選択される免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドのうちの少なくとも1つはヒトIgA定常領域ポリペプチドである。本発明の分子内に含まれる免疫グロブリン重鎖CH2領域ポリペプチドは、例えば、IgA1および/またはIgA2サブクラスからのものであってよい。また、本発明の分子に含まれる免疫グロブリン重鎖CH3領域ポリペプチドは、例えば、IgA1および/またはIgA2サブクラスからのものであってよい。本発明の分子に含まれる免疫グロブリン重鎖CH2領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖CH2領域ポリペプチドの双方は、例えば、IgA1および/またはIgA2サブクラスからのものであってよい。本発明のなお他の分子において、テイル領域はヒトIgAおよび/またはヒトIgEからのポリペプチドを含むCH2および/またはCH3定常領域ポリペプチドを含み、または実質的にそれよりなることができる。他の具体例において、例えば、本発明の分子内のテイル領域は、変異した免疫グロブリン重鎖CH2および/またはCH3定常領域ポリペプチドを含むことができる(例えば、J鎖と会合することができない変異したIgA CH3定常領域ポリペプチド、ここに、例えば、IgA CH3定常領域ポリペプチドはヒト起源である)。テイル領域は、TNFスーパーファミリー、例えば、CD154からのタンパク質の細胞外部分を含み、実質的にそれよりなり、または、それよりなることもできる。
ヒトで用いることを意図した本発明の分子では、これらの領域は、典型的には、実質的にまたは完全にヒトであって、当該分子に対する潜在的ヒト免疫応答を最小化し、および適切なエフェクター機能を供する。本発明のある具体例において、例えば、テイル領域はヒトIgG1 CH3領域配列、J鎖と会合できる、またはできない野生型IgA重鎖定常領域ポリペプチド配列を含む。
本発明の好ましい具体例において、CH1ドメインは当該分子のテイル領域に含まれず、かつ結合領域のカルボキシル末端はテイル領域のCH2部分のアミノ末端に直接的にまたは間接的にいずれかにて連結される。結合領域は、例えば、連結領域ポリペプチドまたは他の連結分子を介してテイル領域に間接的に連結することができる。
本発明はテイル領域内に変異したCH2および/またはCH3配列を有する分子も含む。例えば、本発明の分子は、CH2、CH3および/またはCH4ドメインに導入された1以上の突然変異を有する変異したFcドメインを含むことができる。本発明のある具体例において、分子は、ヒトIgA CH3定常領域ポリペプチドのようなIgA CH3定常領域ポリペプチドを含むことができ、ここに、C−末端からの2以上の残基は欠失されて、切断されたCH3定常領域ポリペプチドが形成されている。本発明の他の具体例において、分子は、4または18アミノ酸のC−末端欠失を含むJ鎖と会合できない変異したヒトIgA CH3定常領域ポリペプチドを含む。しかしながら、本発明はそのように限定される必要がなく、従って、融合タンパク質が抗原に特異的に結合でき、かつADCC、CDCまたは補体固定のような少なくとも1つの免疫学的活性が可能である限り、変異したIgA CH3定常領域ポリペプチドを含む分子は2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21ないし25、26ないし30以上のアミノ酸の欠失を含むことができる。また、本発明は、鎖間ジスルフィド結合形成を妨げるように、終わりから2番目のシステインの置換によって、またはそのアミノ酸残基の化学的修飾によって、J鎖と会合することができない変異したIgA CH3定常領域ポリペプチドを含むテイル領域を含有する分子も含む。
本発明の種々の分子は、例えば、(a)少なくとも1つの免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチド、(b)少なくとも1つの免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチド、および(a)のポリペプチドおよび(b)のポリペプチドを連結させる少なくとも1つのリンカーペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる結合ドメインポリペプチドを有する結合ドメインscFv−融合タンパク質を含む。そのようなポリペプチドは、例えば、ヒト免疫グロブリンまたは非−ヒト免疫グロブリンに由来することができる。
かくして、1つの態様において、本発明は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合したフレキシブルまたは他の所望のリンカーを含む第二のポリペプチド、テイル領域、例えば、該第二のポリペプチドに結合したN−末端切断免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド(または所望のその部分)を含む第三のポリペプチドを含めた、天然に生じない単鎖タンパク質および/またはVタンパク質および/またはVタンパク質、または前記のいずれかの所望の部分を含む。該フレキシブルリンカーは、変異した、または他の方法で改変されたまたは作成された免疫グロブリンヒンジ領域またはその部分、例えば、野生型免疫グロブリンヒンジ領域または部分に存在するシステイン残基の数(例えば、IgG1またはIgG4の場合には0、1または2のシステイン)未満であるシステイン残基の数を含むものを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができ、ここに、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性、例えば、ADCC、CDC、および/または補体固定が可能である。単鎖タンパク質は、例えば、ADCC、CDC、および/または補体固定を含めた2つの免疫学的活性が可能である。このタンパク質は、単鎖Fvである結合ドメインポリペプチドを含むことができる。別法として、このタンパク質は単鎖Fvである結合ドメインポリペプチドを含むことができ、ここに、該単鎖Fvの重鎖可変領域はアミノ酸位置9、10、11、12、108、110および112のうちの1以上においてアミノ酸の欠失または置換を有する。該タンパク質は、単鎖Fvである結合ドメインポリペプチドを含むことができ、ここに、該単鎖Fvの軽鎖可変領域はアミノ酸位置12、80、81、83、105、106および107の1以上においてアミノ酸の欠失または置換を有する。
もう1つの態様において、本発明は、該V領域のアミノ酸位置9、10、11、12、108、110および112のうちの1以上においてアミノ酸の欠失または置換を有するV領域またはその部分単独、またはいずれかの他の分子または構築体と組み合わせてそれを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる天然に生じないVタンパク質、またはその所望の部分を含む。アミノ酸は、天然に生じるまたは天然に生じないアミノ酸いずれか、またはいずれかの他の所望の有用な分子で置換することができる。
また、当該V領域のアミノ酸位置9、10、11、12、108、110および112の1以上においてアミノ酸の欠失または置換を有するV領域またはその部分の単独、またはいずれかの他の分子または構築体と組み合わせてそれを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなるVタンパク質、またはその所望の部分の使用も記載し、特許請求する。そのような使用がファージ表示、酵母表示、およびリボソーム表示システムおよび方法における使用を含む。
なおもう1つの態様において、本発明は、当該V領域のアミノ酸位置12、80、81、83、105、106および107の1以上においてアミノ酸欠失または置換を有するV領域またはその部分単独、またはいずれかの他の分子と組み合わせてそれを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる天然に生じないVタンパク質、またはその所望の部分を含む。アミノ酸は天然に生じるまたは天然に生じないアミノ酸、またはいずれかの他の所望の有用な分子いずれかで置換されていてもよい。
また、当該V領域のアミノ酸位置12、80、81、83、105、106、および107の1以上においてアミノ酸の欠失または置換を有するV領域またはその部分を単独で、またはいずれかの他の分子と組み合わせてそれを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなるVタンパク質、またはその所望の部分の使用を記載し、特許請求する。そのような使用はファージ表示、酵母表示、およびリボソーム表示システムおよび方法における使用を含む。
なおもう1つの態様において、本発明は、(1)Vタンパク質、またはその所望の部分、ここに、該Vタンパク質またはその部分は、アミノ酸位置9、10、11、12、108、110および112の1以上においてアミノ酸の欠失または置換を有する、および(2)単独で、またはいずれかの他の分子と組み合わせた天然に生じないVタンパク質、またはその所望の部分、ここに、該Vタンパク質またはその部分がアミノ酸位置12、80、81、83、105、106および107の1以上においてアミノ酸欠失または置換を有する;を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる分子を含む。アミノ酸は、天然に生じるまたは天然に生じないアミノ酸、またはいずれかの他の所望の有用な分子いずれかで置換することができる。
また、(1)Vタンパク質、またはその所望の部分、ここに、該Vタンパク質またはその部分はアミノ酸位置9、10、11、12、108、110および112の1以上においてアミノ酸の欠失または置換を有し、および(2)単独で、またはいずれかの他の分子と組み合わせた天然に生じないVタンパク質、またはその所望の部分、ここに、該Vタンパク質またはその部分はアミノ酸位置12、80、81、83、105、106および107の1以上においてアミノ酸の欠失または置換を有する;を含み、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる分子の使用を記載し、特許請求する。そのような使用はファージ表示、酵母表示、およびリボソーム表示システムおよび方法における使用を含む。
また、本発明は分子構築体を含み、ここに、結合ドメインは単鎖Fvであって、該単鎖Fvの重鎖可変領域はアミノ酸位置11においてアミノ酸置換を有する。単鎖Fv重鎖可変領域の位置11におけるアミノ酸に代えて置換するアミノ酸はセリン、スレオニン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンよりなる群から選択することができる。かくして、本発明は、例えば、結合ドメインが単鎖Fvであって、該単鎖Fvの重鎖可変領域がアミノ酸位置11においてセリンアミノ酸置換を有する構築体を含む。他のアミノ酸位置の変化、置換および欠失は本明細書中に記載する。
また、本発明は、例えば、結合ドメインが単鎖Fvであって、該単鎖Fvの重鎖可変領域の位置10および/または11におけるアミノ酸が欠失されている構築体を含む。
もう1つの態様において、本発明は、結合領域が腫瘍または腫瘍−関連抗原に結合する構築体を含む。本発明の構築体の結合領域は、例えば、癌細胞抗原に結合することができる。本発明の構築体が結合する癌細胞抗原は癌細胞表面抗原、および細胞内癌細胞抗原を含む。
なおもう1つの態様において、本発明は、結合領域が免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する構築体を含む。
もう1つの態様において、本発明は、結合領域が、例えば、CD19、CD20、CD22、CD37、CD40、CD80およびCD86よりなる群から選択されるB細胞抗原を含めたB細胞抗原に結合する構築体を含む。そのようなB細胞抗原に結合する本発明の構築体は、例えば、単鎖Fvを含む結合領域を含む。そのような単鎖Fv結合領域の例は、HD37単鎖Fv、2H7単鎖Fv、G28−1単鎖Fv、および4.4.220単鎖Fvよりなる群から選択される単鎖Fvを含む、または実質的にそれよりなる分子を含む。他の例は、CTLA−4の細胞外ドメインを含み、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる結合領域を含む。
もう1つの態様において、本発明は、結合領域がB細胞分化抗原に結合する構築体を含む。B細胞分化抗原は、例えば、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD37、CD40、CD45RO、CD80、CD86、およびHLAクラスIIを含む。
もう1つの態様において、本発明は、結合領域がCD2、CD3、CD4、CD5、CD6、CD8、CD10、CD11b、CD14、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD28、CD30、CD37、CD40、CD43、CD50(ICAM3)、CD54(ICAM1)、CD56、CD69、CD80、CD86、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD152(CTLA−4)、CD153(CD30リガンド)、CD154(CD40リガンド)、ICOS、L6、B7−H1、およびHLAクラスIIよりなる群から選択される標的に結合する構築体を含む。
また、本発明は、結合領域、テイル領域、および連結領域を有するタンパク質構築体を含み、ここに、該タンパク質構築体はモノマーとして、または実質的にモノマー形態にて溶液中に存在することができる。
また、本発明は、結合領域、テイル領域、および連結領域を有するタンパク質構築体を含み、ここに、該タンパク質構築体は、例えば、当該複合体がダイマーである場合を含めた、該タンパク質構築体の2以上を含む複合体を形成することができる。
もう1つの態様において、本発明の構築体は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体−依存性細胞傷害性(または補体−媒介溶解)、補体固定、アポトーシスの誘導、1以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、1以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、1以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和よりなる群から選択される少なくとも1つの免疫学的活性を直接的にまたは間接的に誘導するあるいは惹起するあるいは誘導または惹起の手助けをするのに参画するか、または誘導し、または惹起し、あるいは誘導または惹起を助けることができる。
もう1つの態様において、本発明の結合構築体は、プロテインキナーゼ、プロテインホスファターゼ、G−タンパク質、環状ヌクレオチドもしくは他の2次メッセンジャー、イオンチャンネル、および分泌経路成分よりなる群から選択される1以上の分子の活性化または阻害によって生物学的活性シグナルを誘導することができる。そのような生物学的に活性な分子は、例えば、プロテアーゼである。他の生物学的に活性な分子は、例えば、モノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンを例として含めたサイトカインである。
もう1つの態様において、本発明の構築体はNK細胞、単球、マクロファージ、B細胞、T細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球よりなる群から選択される1以上の免疫エフェクター細胞の誘導、または誘導への参画が可能である。
もう1つの態様において、本発明の構築体は、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、または1以上の生物学的活性分子の放出をもたらす1以上の免疫エフェクター細胞の誘導、または誘導への参画が可能である。
もう1つの態様において、本発明の構築体は、例えば、1以上のシグナリングメカニズムまたは分子を活性化することによって、標的細胞内でのアポトーシスの開始に参画し、および/またはアポトーシスを開始させることができる。
もう1つの態様において、本発明の構築体は細胞活性化の誘導、または誘導への参画が可能であり、ここに、該活性化は細胞転写活性の変化に導く。1つの具体例において、細胞転写活性は増加される。もう1つの具体例において、細胞転写活性は減少される。
もう1つの態様において、IgAまたはIgE分子からの定常領域を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなるテイル領域を有する本発明の構築体は好中球および/または肥満細胞の脱顆粒の誘導、該誘導への参画が可能である。
もう1つの態様において、本発明の構築体は感染性因子の中和の促進、または該促進への参画が可能であり、ここに、該感染性因子は、例えば、細菌、ウイルス、寄生虫、または真菌である。
もう1つの態様において、本発明の構築体は、トキシンの中和を促進し、または該促進に参画することができ、ここに該トキシンはエンドトキシンおよびエキソトキシンよりなる群から選択される。そのようなトキシンは、例えば、炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、E.coli熱−不安定トキシンLT、E.coli熱安定トキシンST、シガトキシン、PseudomonasエキソトキシンA、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Bordetella pertussis ACトキシン、およびBacillus anthracis EFトキシンよりなる群から選択されるエキソトキシンを含む。他のトキシンは、例えば、サキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、(アマトキシン、ジロミトリン、オレラニン等)、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチミン、およびグライアノトキシンを含む。
もう1つの態様において、本発明の構築体は細胞内標的に結合して、例えば、細胞機能を行う(行うのに参画する)ことができる。そのような構築体は、例えば、天然または作成されたIgA CH2ドメイン領域および天然または作成されたIgA CH3ドメイン領域を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなるテイル領域を含む構築体を含み、該テイル領域はJ鎖に結合することができる。そのようなテイル領域は、例えば、2H7 scFv IgAH WIgACH2 WCH3+J鎖構築体に見出される。かくして、本発明は、例えば、「抗−細胞内標的」結合ドメイン(例えば、および「抗−細胞内標的」scFv)、連結領域、およびJ鎖に結合することができる天然または作成されたIgA定常領域(例えば、WIgACH2 WCH3)を有する構築体を含む。
なおもう1つの態様において、本発明の構築体は、N−末端免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプリドが、免疫グロブリン重鎖IgG CH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドを含む分子を含む。
さらにもう1つの態様において、本発明は、例えば、HPLCおよび非−還元性ゲルによって測定して約120kK未満、または約150kD未満であって、(a)当該標的細胞集団内の細胞に結合することができる第一のタンパク質またはペプチド分子、および(b)(i)Fcレセプターに結合することができ、および/または(ii)標的細胞アポトーシスを誘導でき、および/または(iii)補体を結合することができる第二のタンパク質またはペプチド分子から本質的になるタンパク質分子の治療有効量を被験体に投与することを含み、ここに、該第一のタンパク質またはペプチド分子は該第二のタンパク質またはペプチド分子に直接的に連結され、あるいは所望により、該第一のタンパク質またはペプチド分子および該第二のタンパク質またはペプチド分子は第三のタンパク質またはペプチド分子によって連結され、ここに、該タンパク質分子は抗体、TNFファミリーまたはTNFレセプターファミリーのメンバーではなく、かつバクテリアトキシン、細胞傷害性薬物、または放射性同位体と結合体していない、該被験体において標的細胞集団を減少させる方法を含む。
もう1つの態様において、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインオポリペプチドを有する第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端で切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む、実質的それよりなる、またはそれよりなる単鎖タンパク質を含み、ここに、該単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能であり、但し、(a)連結領域ポリペプチドがシステイン残基を有しないIgGヒンジ領域ペプチドを含む場合、結合ドメインポリペプチド標的はCD20またはL6ではなく、あるいは(b)連結領域ポリペプチドがシステイン残基を有しないIgGヒンジ領域ポリペプチドを含む場合、単鎖タンパク質はCD20に結合することができる1F5 scFvではない。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有す第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる単鎖タンパク質も含み、ここに該単鎖タンパク質は標的細胞上または中の標的分子に結合することができ、かつイン・ビボで標的細胞の数を減少することができ、および/またはイン・ビボで標的細胞の集団を枯渇させることができる。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる単鎖タンパク質も含み、ここに、該単鎖タンパク質は抗体−依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定を誘導することができる。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる単鎖タンパク質を含み、ここに、該単鎖タンパク質は(1)抗体−依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定を誘導することができ、および(2)標的細胞上または中の標的分子に結合することができ、かつイン・ビボで標的細胞の数を減少させることができ、および/またはイン・ビボで標的細胞の集団を枯渇させることができる。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる単鎖タンパク質も含み、ここに、該連結領域が少なくとも第一、第二および第三のシステイン残基を有するIgGヒンジ領域ポリペプチドを含む場合、該第一のシステインは該第二のシステインに対してN−末端側であって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してN−末端側であり、該第二および第三のシステイン残基の一方または双方は置換または欠失されており、およびここに、該単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる単鎖タンパク質も含み、ここに、該連結領域が少なくとも第一、第二、および第三のシステイン残基を有するIgGヒンジ領域ポリペプチドを含む場合、該第一のシステインは該第二のシステインに対してN−末端側であって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してN−末端側であり、該第二および第三のシステイン残基の一方または双方は置換または欠失されており、およびここに、該単鎖タンパク質は(a)抗体−依存性細胞−媒介細胞傷害性および(b)補体固定から選択される少なくとも1つの免疫学的活性を誘導することができる、また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC―末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる単鎖タンパク質も含み、ここに、該連結領域が少なくとも第一、第二、および第三のシステイン残基を有するIgGヒンジ領域ポリペプチドを含む場合、該第一のシステインは該第二のシステインに対してN−末端側であって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してN−末端側にあり、該第二および第三のシステイン残基の一方または双方は置換または欠失されており、およびここに、該単鎖タンパク質は抗体―依存性−細胞−媒介細胞傷害性および補体固定が可能である。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC―末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる単鎖タンパク質も含み、ここに、該連結領域が少なくとも第一、第二および第三のシステイン残基を有するIgGヒンジ領域ポリペプチドを含む場合、該第一のシステインは該第二のシステインに対してN−末端側であって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してN−末端側であり、該第二および第三のシステインン残基の一方または双方は置換または欠失されており、および、ここに、該単鎖タンパク質は標的細胞の上または中の標的分子に結合することができ、およびイン・ビボで標的細胞の数を減少させることができ、および/またはイン・ビボで標的細胞の集団を枯渇させることができる。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる単鎖タンパク質も含み、ここに、該連結領域が少なくとも第一、第二、および第三のシステイン残基を有するIgGヒンジ領域ポリペプチドを含む場合、該第一のシステインは該第二のシステインに対してN−末端側にあって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してN−末端側にあり、該第二および第三のシステイン残基の一方または双方は置換または欠失されており、およびここに、該単鎖タンパク質は、抗体−依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定から選択される少なくとも1つの免疫学的活性を誘導することができ、およびここに、該単鎖タンパク質は標的細胞の上または中の標的分子に結合することができ、かつイン・ビボにて標的細胞の数を減少させることができ、および/またはイン・ビボにて標的細胞の集団を枯渇させることができる。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド;(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる単鎖タンパク質も含み、ここに、該連結領域が少なくとも第一、第二、および第三のシステイン残基を有するIgGヒンジ領域ポリペプチドを含む場合、該第一のシステインは該第二のシステインに対してN−末端側であって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してN−末端側にあり、該第二および第三のシステイン残基の一方または双方は置換または欠失されており、およびここに、該単鎖タンパク質は抗体−依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定を誘導することができ、およびここに、該単鎖タンパク質は標的細胞の上または中の標的分子に結合することができ、かつイン・ビボにて標的細胞の数を減少させることができおよび/またはイン・ビボにて標的細胞の集団を枯渇させることができる。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド、該結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、ここに、該重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域における位置11におけるロイシンは欠失されているか、またはもう1つのアミノ酸で置換されており;(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる単鎖タンパク質を含み、ここに、該単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能であり、但し、該結合ドメインポリペプチドがCD20に結合できる場合、該連結領域は3つのシステインを含み、ここに、該3つのシステイン残基の1つまたは2つはもう1つのアミノ酸で置換または置き換えられている。また、本発明は、(i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド、該結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、ここに、重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域における位置11のロイシンは欠失されているか、またはもう1つのアミノ酸で置換されており、(ii)該第一のポリペプチドのC−末端に結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドのC−末端に結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる単鎖タンパク質も含み、ここに、該単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性を誘導することができ、但し、結合ドメインポリペプチドがCD20に結合することができる2H7scFvであって、該連結領域が少なくとも第一、第二、および第三のシステイン残基を有するIgGヒンジ領域ポリペプチドを含む場合、該第一のシステインが該第二のシステインに対してN−末端側であって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してN−末端側にあり、該システイン残基の1つまたは2つは置換または欠失されている。また、本発明は、(i)標的細胞の上または中の標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド、該結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、ここに、重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域における位置11のロイシンは欠失されているかまたはもう1つのアミノ酸で置換されており;(ii)該第一のポリペプ


チドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および(iii)該第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる単鎖タンパク質を含み、ここに、該単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能であり、但し、該単鎖タンパク質は、CD20に結合することができる結合ドメインポリペプチド、および(a)3つのシステイン残基を有するIgGヒンジ、または(b)システイン残基に代えて置換された3つのセリン(または同様なアミノ酸)残基を含むIgGヒンジを含む連結領域を含まず、または実質的にそれよりなるものではない。多くの可能な変動およびこれらの単鎖タンパク質の変種がある。例えば、結合ドメインポリペプチドは天然に生じるおよび/または天然に生じないVおよびVポリペプチドを含めた単鎖抗体またはscFvであってもよく、結合ドメインポリペプチドは多数の標的のいずれかに結合することができる。天然に生じないVポリペプチドは、限定されるものではないが、その例として、アミノ酸位置9、10、11、12、108、110および/または112のいずれかの1以上に対応する位置においてアミノ酸の突然変異、置換または欠失を含むヒト重鎖可変領域ポリペプチドを含む。天然に生じないVポリペプチドは限定されるものではないが、その例として、アミノ酸位置12、80、81、83、105、106および107のいずれか1以上に対応する位置においてアミノ酸の突然変異、置換または欠失を含むヒト軽鎖可変領域ポリペプチドを含む。標的は、限定されるものではないが、その例として、CD19、CD20、CD28、CD30、CD37、CD40、L6、HER2、表皮成長因子レセプター(EGFR)、血管内皮細胞成長因子(VEGF)、腫瘍壊死因子(例えば、TNF−アルファ)、ならびに現在知られているかまたは後に発見されたかを問わず、本明細書中にて記載したまたは言及した、または他の方法で有用な他の標的を含む。加えて、連結領域ポリペプチドは、天然に生じるおよび天然に生じない双方の多数の分子のいずれであってもよい。連結領域ポリペプチドは限定されるものではないが、その例として、天然に生じる、および天然に生じない免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む。天然に生じる免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、限定されるものではないが、例えば、ヒトIgG1ヒンジ領域ポリペプチド、ヒトIgAヒンジ領域ポリペプチド、ヒトIgDヒンジ領域ポリペプチド、ヒトIgEヒンジ−作用領域(例えば、IgE CH2)、ラクダ科動物免疫グロブリンヒンジ領域、あるいは現在知られているか、または後に発見されたかを問わず、本明細書中で記載したまたは言及した、または他の方法で有用ないずれかの他の天然に生じるヒンジ領域ペプチドのような野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む。天然に生じない免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、限定されるものではないが、その例として、システインの野生型数未満を含む免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、例えば、0、1または2のシステイン、および本明細書中に記載されたまたは引用された、または他の方法で有用な、または現在知られている、または例えば、CH1ドメインおよびCH2ドメインのような免疫グロブリンドメインを連結するのに有用なことが後に発見されたいずれかの他の連結領域分子を含む、変異した天然に生じる免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含めた、変異した天然に生じる免疫グロブリンヒンジを含む。N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドは、単鎖タンパク質の他の部分を含む、または含まずして、本明細書中に記載したもののような1以上のエフェクター機能を供する天然に生じるおよび天然に生じないN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域を含む。天然に生じたN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドは限定されるものではないが、その例として、ヒトIgG、ヒトIgA,およびヒトIgE、および本明細書中で記載されたまたは引用されたまたは他の方法で現在知られている、または有用であることが後に発見されたいずれかの他の免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドから別々にまたは一緒に採られたCH2CH3定常領域ポリペプチドを含めたCH2CH3定常領域ポリペプチドを含む。天然に生じないN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドは限定されるものではないが、その例として、本明細書中に記載した、または引用したまたは他の方法で現在知られている、または後に有用であることが発見されたいずれの変異した天然に生じる重鎖定常領域ポリペプチドを含む。
本発明の種々の具体的な構築体は、その例として、以下のものを含む:
Figure 2010279389
Figure 2010279389
Figure 2010279389
Figure 2010279389
本発明のこれらおよび他の態様は、以下の詳細な記載および添付の図面を参照するとより明らかになるであろう。本明細書中に記載したように、全ての引用特許、論文、書籍、および本明細書中で開示し確認した他の資料は、ここに引用して、その全体を、あたかも各々が個々に一体化されるように援用する。
したがって、本発明は、以下の項目を提供する:
(項目1)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、以下:
i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、この結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、この重鎖可変領域は1以上のアミノ酸残基においてアミノ酸置換または失欠を含む、ポリペプチド;
ii)この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および
iii)この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目2)
上記結合ドメインポリペプチドが単鎖Fvである、項目1に記載のタンパク質。
(項目3)
上記重鎖可変領域における1以上のアミノ酸置換または失欠が、この失欠または置換のないタンパク質に対してこのタンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、項目1に記載のタンパク質。
(項目4)
上記結合ドメインポリペプチドが、免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む項目1に記載のタンパク質。
(項目5)
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、この第二の結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む項目4に記載のタンパク質。
(項目6)
上記第一の標的分子および上記第二の標的分子が異なる、項目5に記載のタンパク質。
(項目7)
上記第一の標的分子および上記第二の標的分子が同一である、項目5に記載のタンパク質。
(項目8)
上記結合ドメインポリペプチドが、上記重鎖可変領域における位置9、10、11、12、108、110、112に1以上のアミノ酸置換を含む単鎖Fvである、項目1に記載のタンパク質。
(項目9)
上記結合ドメインポリペプチドが、上記重鎖可変領域における位置11にアミノ酸置換を含む単鎖Fvである、項目1に記載のタンパク質。
(項目10)
上記単鎖Fv重鎖可変領域の11の位置におけるアミノ酸に代えて置換したアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンから選択される、項目9に記載のタンパク質。
(項目11)
上記単鎖Fv重鎖可変領域の位置11のロイシンがセリン以外のアミノ酸で置き換えられた項目9に記載のタンパク質。
(項目12)
ロイシンが位置11においてセリンによって置き換えられ、上記タンパク質が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定が可能であって、標的細胞の数を減少させる上記標的分子に結合することができる、項目9に記載のタンパク質。
(項目13)
ロイシンが位置11においてデス−ロイシンによって置き換えられた項目9に記載のタンパク質。
(項目14)
位置11においてアミノ酸置換を有しない上記タンパク質に対して増加した組換え発現または安定性を有する、項目12に記載のタンパク質。
(項目15)
位置11においてアミノ酸置換を有する上記タンパク質の発現が、位置11において置換が無いこのタンパク質よりも10〜100倍大きい、項目14に記載のタンパク質。
(項目16)
上記発現が哺乳動物細胞におけるものである、項目14記載のタンパク質。
(項目17)
上記結合ドメインポリペプチドが単鎖Fvであって、この単鎖Fvの重鎖可変領域の位置11におけるアミノ酸が失欠されている、項目1記載のタンパク質。
(項目18)
上記結合ドメインポリペプチドが単鎖Fvであって、この結合ドメインポリペプチドが軽鎖可変領域を含み、ここで、この軽鎖可変領域がアミノ酸位置12、80、81、83、105、106および107の1以上においてアミノ酸失欠または置換を有す1に記載のタンパク質。
(項目19)
位置106におけるアミノ酸が置換または失欠されている、項目18に記載のタンパク質。
(項目20)
上記結合ドメインポリペプチドが腫瘍抗原に結合する、項目2記載のタンパク質。
(項目21)
上記結合ドメインポリペプチドが免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する、項目2に記載のタンパク質。
(項目22)
上記結合ドメインポリペプチドが癌細胞抗原に結合する、項目2に記載のタンパク質。
(項目23)
上記癌細胞抗原が表面抗原である、項目22に記載のタンパク質。
(項目24)
上記癌細胞抗原が細胞内抗原である、項目22に記載のタンパク質。
(項目25)
上記結合ドメインポリペプチドがB細胞抗原に結合する、項目1に記載のタンパク質。
(項目26)
上記B細胞抗原がCD19、CD20、CD22、CD37、CD40、CD80、およびCD86から選択される、項目25に記載のタンパク質。
(項目27)
上記単鎖FvがB細胞抗原に結合する、項目2に記載のタンパク質。
(項目28)
上記B細胞抗原がCD19、CD20、CD22、CD37、CD40、CD80、およびCD86から選択される、項目27に記載のタンパク質。
(項目29)
上記単鎖FvがHD37単鎖Fv、2H7単鎖Fv、G28−1単鎖Fv、および4.4.220単鎖Fvから選択される、項目28に記載のタンパク質。
(項目30)
上記単鎖FvがHD37単鎖Fv、2H7単鎖Fv、G28−1単鎖Fv、FC2−2、UCHL−1、5B9、L6,10A8、2e12、40.2.36、G19−4、1D8、および4.4.220単鎖Fvから選択される、項目2に記載のタンパク質。
(項目31)
上記結合ドメインポリペプチドがB細胞分化抗原に結合するscFvである、項目1に記載のタンパク質。
(項目32)
上記B細胞抗原がCD19、CD20、CD22、CD37、およびCD40から選択される、項目31に記載のタンパク質。
(項目33)
上記結合ドメインポリペプチドがCD2、CD3、CD4、CD5、CD6、CD8、CD10、CD11b、CD14、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD28、CD30、CD37、CD40、CD43、CD50(ICAM3)、CD54(ICAM1)、CD56、CD69、CD80、CD86、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD152(CTLA−4)、CD153(CD30リガンド)、CD154(CD40リガンド)、ICOS、L6、B7−H1、およびHLAクラスIIから選択される標的に結合する、項目1に記載のタンパク質。
(項目34)
上記タンパク質がこのタンパク質の2以上を含む複合体を形成することができる、項目1に記載のタンパク質。
(項目35)
上記複合体がダイマーである、項目34に記載のタンパク質。
(項目36)
上記タンパク質がモノマーである、項目1に記載のタンパク質。
(項目37)
薬物、トキシン、免疫調節因子、ポリペプチドエフェクター、同位体、標識、またはエフェクター部位にカップリングした項目1に記載のタンパク質。
(項目38)
上記少なくとも免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、1以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、1以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、1以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子、またはトキシンの中和から選択される、項目1に記載のタンパク質。
(項目39)
上記免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、1以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、1以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、1以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和から選択される2つの免疫学的活性を含む項目38に記載のタンパク質。
(項目40)
タンパク質キナーゼ、タンパク質ホスファターゼ、G−タンパク質、環状ヌクレオチドまたは他の第二メッセンジャー、イオンチャネル、および分泌経路成分から選択される1以上の分子の活性化または阻害による生物学的に活性なシグナルを誘導することができるか、またはNK細胞、単球、マクロファージ、B細胞、T細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球から選択される1以上の免疫エフェクター細胞を誘導できる、項目38に記載のタンパク質。
(項目41)
1以上の免疫エフェクター細胞の上記誘導が、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、または1以上の生物学的に活性な分子の放出に導く項目40に記載のタンパク質。
(項目42)
細胞活性化が可能であり、ここで、この活性化は細胞転写活性の変化を導く、項目38に記載のタンパク質。
(項目43)
上記細胞転写活性が増加される、項目42に記載のタンパク質。
(項目44)
上記細胞転写活性が減少される、項目42に記載のタンパク質。
(項目45)
上記1以上の生物学的に活性な分子がプロテアーゼである、項目38に記載のタンパク質。
(項目46)
上記1以上の生物学的に活性な分子がサイトカインである、項目38に記載のタンパク質。
(項目47)
上記サイトカインがモノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンから選択される、項目46に記載のタンパク質。
(項目48)
感染性因子の中和が可能であり、ここで、この感染性因子が細菌、ウイルス、寄生体または真菌である、項目38に記載のタンパク質。
(項目49)
トキシンの中和が可能であり、ここで、このトキシンがエンドトキシンおよびエキソトキシンから選択される、項目38に記載のタンパク質。
(項目50)
トキシンの中和が可能であり、ここで、このトキシンが炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、E.coli熱−不安定トキシンLT、E.coli熱安定性トキシンST、シガトキシン、PseudomonasエンドトキシンA、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Bordetella pertussis ACトキシン、およびBacillus anthracis EFから選択されるエキソトキシンである、項目38に記載のタンパク質。
(項目51)
トキシンの中和が可能であり、ここで、このトキシンがサキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチニン、およびグラヤノトキシンから選択されるエンドトキシンである、項目38に記載のタンパク質。
(項目52)
上記タンパク質が細胞内標的に結合して、細胞機能に影響する、項目1に記載のタンパク質。
(項目53)
上記結合ドメインポリペプチドが結合ドメインリンカーによって上記重鎖可変領域に結合した軽鎖可変領域を含み、ここで、この結合ドメインリンカーが配列Gly−Gly−Gly−Gly−Serを有する1以上のペプチドを含む項目1に記載のタンパク質。
(項目54)
3つのGly−Gly−Gly−Gly−Serペプチドを含む項目53に記載のタンパク質。
(項目55)
上記結合ドメインポリペプチドが、ヒト、マウス、ラット、ブタ、およびサルから選択される種から得られる野生型または遺伝子操作された免疫グロブリン可変領域を含む項目1に記載のタンパク質。
(項目56)
上記結合ドメインポリペプチドがヒト化免疫グロブリン可変領域を含む項目1に記載のタンパク質。
(項目57)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖IgG CH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドを含む、項目2に記載のタンパク質。
(項目58)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖IgG CH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドから本質的になる、項目2に記載のタンパク質。
(項目59)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖IgG CH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドを含む項目2に記載のタンパク質。
(項目60)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖IgG CH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドから本質的になる、項目2に記載のタンパク質。
(項目61)
上記結合ドメインポリペプチドが、ヒト定常領域の少なくとも部分を含む単鎖Fvである、項目1に記載のタンパク質。
(項目62)
上記結合ドメインポリペプチドが、ヒト定常領域の少なくとも部分を含む単鎖Fvである、項目2に記載のタンパク質。
(項目63)
上記連結領域が、ヒトヒンジまたはその部分、ヒトIgGヒンジまたはその部分、ヒトIgAヒンジまたはその部分、ヒトIgEヒンジまたはその部分、ラクダヒンジ領域またはその部分、IgG1ラマヒンジ領域またはその部分、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、およびギンザメヒンジ領域またはその部分から選択される天然に生じるヒンジ領域を含む項目1に記載のタンパク質。
(項目64)
上記連結領域がヒトIgEヒンジまたはその部分を含む項目1に記載のタンパク質。
(項目65)
上記連結領域が、0または1いずれかのシステイン残基を有するヒトIgG1、IgG2、IgG3またはIgG4ヒンジ領域を含む項目1に記載のタンパク質。
(項目66)
上記連結領域が、0と2との間のシステイン残基を有するヒトIgGAヒンジ領域を含む項目1に記載のタンパク質。
(項目67)
上記連結領域が野生型ヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域を含む項目1に記載のタンパク質。
(項目68)
上記連結領域がグリコシル化部位を含む項目1に記載のタンパク質。
(項目69)
上記連結領域が、ジスルフィド結合を形成できるシステイン残基を有しない項目1に記載のタンパク質。
(項目70)
上記連結領域が1つのシステイン残基を有する、項目1に記載のタンパク質。
(項目71)
上記連結領域が、わずか1つのシステイン残基を含む、変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む項目1に記載のタンパク質。
(項目72)
上記連結領域が、上記タンパク質が低下した二量体化する能力を有するように改変された項目1に記載のタンパク質。
(項目73)
上記連結領域が3つのシステイン残基および1つのプロリン残基を含み、ここで、このシステイン残基の1以上が失欠または置換され、かつこのプロリン残基が置換または失欠されている、項目1に記載のタンパク質。
(項目74)
上記連結領域が、第一、第二および第三のシステイン残基を含む変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステインに対してN−末端側であり、かつこの第二のシステインはこの第三のシステインに対してN−末端側であり、ここで、この第一のシステイン残基は置換または失欠されている、項目1に記載のタンパク質。
(項目75)
上記野生型ヒンジ領域ポリペプチドがヒトIgG1からのものである、項目74に記載のタンパク質。
(項目76)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、以下:
i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、この結合ドメインポリペプチドは、位置9、10、11、12、108、110、112において1以上のアミノ酸失欠または置換を含む重鎖可変領域を含む、ポリペプチド;
ii)この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および
iii)この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能であり、このタンパク質は、アミノ酸の失欠または置換を有しないこのタンパク質に対して増大した組換え体発現または安定性を有する、タンパク質。
(項目77)
天然に生じない単鎖Fvタンパク質であって、このタンパク質は、以下:
i)標的細胞上の標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、この結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、ここで、この重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域における位置11において、ロイシンは失欠しているかまたは別のアミノ酸で置換されている、ポリペプチド;
ii)この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および
iii)この第二のポリペプチドに結合したN―末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は、(1)この標的分子に結合することができ、(2)抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定が可能であり、および(3)標的細胞の数を減少させることができる、タンパク質。
(項目78)
さらに、上記重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域において、位置10のアミノ酸の置換または失欠を含む、項目77に記載のタンパク質。
(項目79)
位置11の上記アミノ酸置換が、上記失欠または置換が無い単鎖Fvタンパク質に対してこの単鎖Fvタンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、項目77に記載のタンパク質。
(項目80)
上記残基のナンバリングが、KabatによるEU指数である、項目77に記載のタンパク質。
(項目81)
上記連結領域がプロリン、および第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステインに対してN−末端側にあって、この第二のシステインはこの第三のシステインに対してN−末端側にあり、この第三のシステイン残基はこのプロリン残基に対してN−末端側にある、項目77に記載のタンパク質。
(項目82)
上記連結領域がIgAヒンジ領域またはその部分を含む、項目77に記載のタンパク質。
(項目83)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基は連結領域におけるセリンによって置き換えられ、かつ上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目81に記載のタンパク質。
(項目84)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、上記連結領域はマウスIgAヒンジまたはその部分を含み、かつ上記重鎖定常領域はマウスIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3が、このIgA重鎖定常領域がJ鎖ポリペプチドと会合できないようにする4つのアミノ酸における失欠または置換を含む、項目82に記載のタンパク質。
(項目85)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域における上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、この連結領域における上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、リシンがこのCH2領域における位置322のセリンによって置き換えられた、項目81に記載のタンパク質。
(項目86)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、リシンがこのCH2領域における位置322のセリンによって置き換えられた、項目81に記載のタンパク質。
(項目87)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域における位置331のセリンによって置き換えられた項目81に記載のタンパク質。
(項目88)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンがこのCH2領域における位置331のセリンによって置き換えられた、項目81に記載のタンパク質。
(項目89)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置きかえられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、スレオニンがこのCH2領域における位置256のアスパラギンによって置き換えられた項目81に記載のタンパク質。
(項目90)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からの2H7単鎖Fv CH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH2ドメインにおいて、アルギニンは位置255のグルタミンによって置き換えられ、スレオニンは位置256のアスパラギンによって置き換えられ、プロリンは位置257のアラニンによって置き換えられ、およびグルタミン酸は位置258のリシンによって置き換えられた、項目81に記載のタンパク質。
(項目91)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、リシンはこのCH2領域における位置290のグルタミンによって置き換えられた、項目81に記載のタンパク質。
(項目92)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、アラニンはこのCH2領域における位置339のプロリンによって置き換えられた項目81に記載のタンパク質。
(項目93)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目81に記載のタンパク質。
(項目94)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目81に記載のタンパク質。
(項目95)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目81に記載のタンパク質。
(項目96)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一および第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からおCH2およびCH3ドメインを含む項目81に記載のタンパク質。
(項目97)
上記単鎖タンパク質がFC2−2ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目81に記載のタンパク質。
(項目98)
上記単鎖タンパク質がUCHL−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目81に記載のタンパク質。
(項目99)
上記単鎖タンパク質が5B9ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目81に記載のタンパク質。
(項目100)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目81に記載のタンパク質。
(項目101)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目81に記載のタンパク質。
(項目102)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目81に記載のタンパク質。
(項目103)
上記単鎖タンパク質が連結領域を含むG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、この重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目81に記載のタンパク質。
(項目104)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目81に記載のタンパク質。
(項目105)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はマウスIgAヒンジ領域を含み、上記重鎖定常領域はマウスIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、このCH3は、このIgA重鎖定常領域をJ鎖ポリペプチドと会合できなくする4つのアミノ酸における失欠または置換を含む、項目82に記載のタンパク質。
(項目106)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はヒトIgAヒンジ領域を含み、上記重鎖定常領域はヒトIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3は、IgA重鎖定常領域をJ鎖ポリペプチドと会合できなくする4つのアミノ酸における失欠または置換を含む項目82に記載のタンパク質。
(項目107)
上記単鎖タンパク質がHD37ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目81に記載のタンパク質。
(項目108)
上記単鎖タンパク質がL6単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域がIgG からのCH2およびC3ドメインを含む項目81に記載のタンパク質。
(項目109)
天然に生じない単鎖Fvタンパク質であって、このタンパク質は、以下:
i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、この結合ドメインポリペプチドは、重鎖可変領域を含み、ここで、この重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域において、ロイシンが位置11のセリンのよって置き換えられ;ここで、このタンパク質は、このアミノ酸置換を有しないタンパク質に対して哺乳動物細胞において増加した発現または安定性を有する、ポリペプチド;
ii)この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および
iii)この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、この天然に生じない単鎖Fvタンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目110)
天然に生じない単鎖Fvタンパク質であって、このタンパク質は、以下:
i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド、この結合ドメインポリペプチドは、重鎖可変領域を含み、ここで、この重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域において、ロイシンは位置11のセリンによって置き換えられ;および
ii)この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断されたIgE免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第二のポリペプチド、
を含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目111)
位置11の上記アミノ酸置換が、上記失欠または置換がない単鎖Fvタンパク質に対してこの単鎖Fvタンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、項目110に記載のタンパク質。
(項目112)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、かつ上記重鎖定常領域がIgEからのCH2、CH3およびCH4ドメインを含む、項目110に記載のタンパク質。
(項目113)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、かつ上記重鎖定常領域がマウスIgEからのCH2、CH3およびCH4ドメインを含む、項目110に記載のタンパク質。
(項目114)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記重鎖定常領域がマウスIgEからのCH2、CH3およびCH4ドメインを含む、項目110に記載のタンパク質。
(項目115)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記重鎖定常領域がヒトIgEからのCH2、CH3およびCH4ドメインを含む、項目110に記載のタンパク質。
(項目116)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、標的分子に結合できる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、この連結領域は第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステイン残基に対してN−末端側にあり、かつこの第二のシステインはこの第三のシステインに対してN−末端側にあり、ここで、この第二および第三のシステイン残基の一方または両方は置換または失欠されており、そしてここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目117)
上記結合ドメインポリペプチドが単鎖Fvである、項目116に記載のタンパク質。
(項目118)
上記結合ドメインポリペプチドが、免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目119)
さらに、第二の標的分子に結合できる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、この第二の結合ドメインポリペプチドは、免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む、項目118に記載のタンパク質。
(項目120)
上記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Fvであり、ここで、この重鎖可変領域はアミノ酸位置9、10、11、12、108、110、112の1以上においてアミノ酸の失欠または置換を有する、項目116に記載のタンパク質。
(項目121)
上記結合ドメインポリペプチドが軽鎖可変領域を含む単鎖Fvであり、ここで、この軽鎖可変領域はアミノ酸位置12、80、81、83、105、106および107の1以上においてアミノ酸の失欠または置換を有する、項目117に記載のタンパク質。
(項目122)
上記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Fvであり、ここで、この重鎖可変領域はアミノ酸位置11においてアミノ酸置換を有する、項目116に記載のタンパク質。
(項目123)
上記単鎖Fv重鎖可変領域の位置11におけるアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンから選択される、項目122に記載のタンパク質。
(項目124)
上記単鎖Fv重鎖可変領域の位置11のアミノ酸に代えて置換したアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギンおよびグルタミンから選択される、項目122に記載のタンパク質。
(項目125)
ロイシンが位置11においてセリンによって置き換えられた項目122に記載のタンパク質。
(項目126)
ロイシンが位置11においてデス−ロイシンによって置き換えられた、項目122に記載のタンパク質。
(項目127)
上記結合ドメインポリペプチドが単鎖Fvであって、この単鎖Fvの重鎖可変領域の位置11のアミノ酸が失欠されている、項目116に記載のタンパク質。
(項目128)
ロイシンが位置106においてセリンによって置き換えられた、項目121に記載のタンパク質。
(項目129)
上記結合ドメインポリペプチドが腫瘍抗原に結合する、項目117に記載のタンパク質。
(項目130)
上記結合ドメインポリペプチドが免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する、項目117に記載のタンパク質。
(項目131)
上記結合ドメインポリペプチドが癌細胞抗原に結合する、項目117に記載のタンパク質。
(項目132)
上記癌細胞抗原が表面抗原である、項目131に記載のタンパク質。
(項目133)
上記癌細胞抗原が細胞内抗原である、項目131に記載のタンパク質。
(項目134)
上記結合ドメインポリペプチドがB細胞抗原に結合する、項目116に記載のタンパク質。
(項目135)
上記B細胞抗原がCD19、CD20、CD22、CD37、CD40、CD80、およびCD86から選択される、項目135に記載のタンパク質。
(項目136)
上記単鎖FvがB細胞抗原に結合する、項目117に記載のタンパク質。
(項目137)
上記B細胞抗原がCD19、CD20、CD22、CD37、CD40、CD80、およびCD86から選択される、項目136に記載のタンパク質。
(項目138)
上記単鎖FvがHD37単鎖Fv、2H7単鎖Fv、G28−1単鎖Fv、および4.4.220単鎖Fvから選択される、項目137に記載のタンパク質。
(項目139)
上記単鎖FvがHD37単鎖Fv、2H7単鎖Fv、G28−1単鎖Fv、FC2−2、UCHL−1、5B9、L6、10A8、2e12、40.2.36、G19−4、1D8、および4.4.220単鎖Fvから選択される、項目117に記載のタンパク質。
(項目140)
上記結合ドメインポリペプチドが、B細胞分化抗原に結合するscFvである、項目116に記載のタンパク質。
(項目141)
上記B細胞抗原がCD19、CD20、CD22、CD37、およびCD40から選択される、項目136に記載のタンパク質。
(項目142)
上記結合ドメインポリペプチドがCD2、CD3、CD4、CD5、CD6、CD8、CD10、CD11b、CD14、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD28、CD30、CD37、CD40、CD43、CD50(ICAM3)、CD54(ICAM1)、CD56、CD69、CD80、CD86、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD152(CTLA−4)、CD153(CD30リガンド)、CD154(CD40リガンド)、ICOS、L6、B7−H1、およびHLAクラスIIから選択される標的に結合する、項目116に記載のタンパク質。
(項目143)
上記タンパク質がこのタンパク質の2以上を含む複合体を形成することができる、項目116に記載のタンパク質。
(項目144)
上記複合体がダイマーである、項目143に記載のタンパク質。
(項目145)
上記タンパク質がモノマーである、項目116に記載のタンパク質。
(項目146)
薬物、トキシン、免疫調節因子、ポリペプチドエフェクター、同位体、標識、またはエフェクター部分にカップリングした、項目116に記載のタンパク質。
(項目147)
上記免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、1以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、1以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、1以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和から選択される、項目116に記載のタンパク質。
(項目148)
タンパク質キナーゼ、タンパク質ホスファターゼ、G−タンパク質、環状ヌクレオチドまたは他の第二メッセンジャー、イオンチャネル、および分泌経路成分から選択される1以上の分子の活性化または阻害によって生物学的に活性なシグナルを誘導することができる、項目147に記載のタンパク質。
(項目149)
NK細胞、単球、マクロファージ、B細胞、T細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球から選択される1以上の免疫エフェクター細胞を誘導することができる、項目147に記載のタンパク質。
(項目150)
1以上の免疫エフェクター細胞のこの誘導が、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性または1以上の生物学的に活性な分子の放出を導く項目149に記載のタンパク質。
(項目151)
細胞活性化が可能であり、ここで、この活性化は細胞転写活性の変化を導く、項目147に記載のタンパク質。
(項目152)
上記細胞転写活性が増加される、項目151に記載のタンパク質。
(項目153)
上記細胞転写活性が減少される、項目151に記載のタンパク質。
(項目154)
上記1以上の生物学的に活性な分子がプロテアーゼである、項目147に記載のタンパク質。
(項目155)
上記1以上の生物学的に活性な分子がサイトカインである、項目147に記載のタンパク質。
(項目156)
上記サイトカインがモノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンから選択される、項目155に記載のタンパク質。
(項目157)
感染性因子の中和が可能であり、ここで、この感染性因子が細菌、ウイルス、寄生体、または真菌である、項目147に記載のタンパク質。
(項目158)
トキシンの中和が可能であり、ここで、このトキシンがエンドトキシンおよびエキソトキシンから選択される、項目147に記載のタンパク質。
(項目159)
トキシンの中和が可能であり、ここで、このトキシンが炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、E.coli熱−不安定トキシンLT、E.coli熱安定性トキシンST、シガトキシン、PseudomonasエンドトキシンA、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Bordetella pertussis ACトキシン、およびBacillus anthracis EFから選択されるエキソトキシンである、項目147に記載のタンパク質。
(項目160)
トキシンの中和が可能であり、ここで、このトキシンがサキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチニン、およびグラヤノトキシンから選択されるエンドトキシンである、項目147に記載のタンパク質。
(項目161)
上記結合ドメインポリペプチドが、結合ドメインリンカーによって上記重鎖可変領域に結合した軽鎖可変領域を含み、ここで、この結合ドメインリンカーが配列Gly−Gly−Gly−Gly−Serを有する1以上のペプチドを含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目162)
3つのGly−Gly−Gly−Gly−Serペプチドを含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目163)
上記結合ドメインポリペプチドがヒト、マウス、ラット、ブタおよびサルから選択される種から得られた野生型または遺伝子操作された免疫グロブリン可変領域を含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目164)
上記タンパク質が細胞内標的に結合して、細胞機能を行うことができる、項目116に記載のタンパク質。
(項目165)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖IgG CH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドを含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目166)
上記免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが機能的に活性なCH1ドメインが無い、項目116に記載のタンパク質。
(項目167)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖IgG CH3定常領域ポリペプチドから本質的になる、項目116に記載のタンパク質。
(項目168)
ヒト定常領域の少なくとも一部を含む項目116に記載のタンパク質。
(項目169)
上記連結領域がヒトヒンジまたはその部分、ヒトIgGヒンジまたはその部分、ヒトIgAヒンジまたはその部分、ヒトIgEヒンジまたはその部分、ラクダヒンジ領域またはその部分、IgG1ラマヒンジ領域またはその部分、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、およびギンザメヒンジ領域またはその部分から選択される天然に生じるヒンジ領域を含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目170)
上記連結領域がヒトIgEヒンジまたはその部分を含む項目116に記載のタンパク質。
(項目171)
上記連結領域が、0または1のシステイン残基を有するヒトIgG1、IgG2、IgG3またはIgG4ヒンジ領域を含む項目116に記載のタンパク質。
(項目172)
上記連結領域が、0と2との間のシステイン残基を有するヒトIgGAヒンジ領域を含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目173)
上記連結領域が野生型ヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域を含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目174)
上記連結領域がグリコシル化部位を含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目175)
上記連結領域が、ジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を有しない、項目116に記載のタンパク質。
(項目176)
上記連結領域が1つのシステイン残基を有する、項目116に記載のタンパク質。
(項目177)
上記連結領域が、わずか1つのシステイン残基を含む変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む、項目116に記載のタンパク質。
(項目178)
上記連結領域が、このタンパク質が低下した二量体化する能力を有するように変更された、項目116に記載のタンパク質。
(項目179)
上記連結領域がプロリンおよび第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステインに対してN−末端側にあって、この第二のシステインはこの第三のシステインに対してN−末端側にあり、この第三のシステイン残基がこのプロリン残基に対してN−末端側にある、項目116に記載のタンパク質。
(項目180)
上記単鎖タンパク質がCTLA−4単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2ドメインにおいて位置238におけるセリンによって置き換えられた項目179に記載のタンパク質。
(項目181)
上記単鎖タンパク質がCTLA−4単鎖Fv結合ドメインを含み、かつこの重鎖定常領域がIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目179に記載のタンパク質。
(項目182)
上記単鎖タンパク質がFC2−2単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目179に記載のタンパク質。
(項目183)
上記単鎖タンパク質がUCHL−1単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目179に記載のタンパク質。
(項目184)
上記単鎖タンパク質が5B9単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目179に記載のタンパク質。
(項目185)
上記単鎖タンパク質が2H7 scFv単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域においては、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目179に記載のタンパク質。
(項目186)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目187)
上記単鎖タンパク質が、連結領域を含む2H7単鎖Fvを含み、ここで、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、フェニルアラニンはこのCH3領域において位置405のチロシンによって置き換えられた、項目179に記載のタンパク質。
(項目188)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、フェニルアラニンはこのCH3領域において位置405のアラニンによって置き換えられる、項目179に記載のタンパク質。
(項目189)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、チロシンはこのCH3領域において位置407のアラニンによって置き換えられた項目179に記載のタンパク質。
(項目190)
約75kDaの見掛けの分子量を有する、項目189に記載のタンパク質。
(項目191)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3領域において、フェニルアラニンは位置405のアラニンによって置き換えられ、かつチロシンは位置407のアラニンによって置き換えられた、項目179に記載のタンパク質。
(項目192)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目179に記載のタンパク質。
(項目193)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目179に記載のタンパク質。
(項目194)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一および第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む、項目179に記載のタンパク質。
(項目195)
上記単鎖タンパク質が連結領域を含む2H7単鎖Fvを含み、ここで、上記第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目196)
上記単鎖タンパク質が連結領域を含む2H7単鎖Fvを含み、ここで、上記第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目197)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一のシステイン残基がセリンによって置き換えられ、ここで、上記重鎖定常領域は2H7単鎖Fv CH2およびCH3ドメインを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目198)
上記単鎖タンパク質がHD37単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつプロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目199)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、かつ上記重鎖定常領域がラマIgG からのCH2およびCH3定常領域ポリペプチドを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目200)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、かつ上記重鎖定常領域がラマIgG からのCH2およびCH3定常領域ポリペプチドを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目201)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖Fv結合ドメインを含み、かつ上記重鎖定常領域がラマIgG からのCH2およびCH3定常領域ポリペプチドを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目202)
上記単鎖タンパク質がCD−16−6単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられた、項目179に記載のタンパク質。
(項目203)
上記単鎖タンパク質がCD−16レセプター結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基がセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられた、項目179に記載のタンパク質。
(項目204)
上記単鎖タンパク質が2e12単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、ここで、このCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した、項目179に記載のタンパク質。
(項目205)
上記単鎖タンパク質が10A8 scFv単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、ここで、このCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した、項目179に記載のタンパク質。
(項目206)
上記単鎖タンパク質が40.2.36ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、ここで、このCH3ドメインはCD80膜貫通および脂肪質テイルドメインを含むポリペプチドに結合された、項目179に記載のタンパク質。
(項目207)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、ここで、このCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した、項目179に記載のタンパク質。
(項目208)
上記単鎖タンパク質がG19−4ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、ここで、このCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目209)
上記単鎖タンパク質がG19−4ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、上記CD3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目210)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目211)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域においては、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびこのCH3ドメインはmFADD膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目212)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはmFADD膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目213)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、該CH3ドメインはmcasp3膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目214)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびC3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのC2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびこのCH3ドメインはmcasp3膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目215)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはmcasp8膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目216)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびこのCH3ドメインはmcasp8膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目217)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、上記CH3ドメインはhcasp3膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目218)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびこのCH3ドメインはhcasp3膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目219)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3はhcasp8膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合された項目179に記載のタンパク質。
(項目220)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびこのCH3ドメインはhcasp8膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目221)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目222)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびこのCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目223)
上記単鎖タンパク質が1D8 scFvハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目224)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、かつこのCH3ドメインはmFADD膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目225)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはmFADD膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目226)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、この重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはmcasp3膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目227)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびこのCH3ドメインはmcasp3膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目228)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはmcasp8膜貫通および細胞質ドメインを含むポリペプチドに結合された項目179に記載のタンパク質。
(項目229)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびこのCH3ドメインはmcasp8膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目230)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはhcasp3膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目231)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびCH3ドメインはhcasp3膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目232)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3ドメインはhcasp8膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目233)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、プロリンはこのCH2領域において位置238のセリンによって置き換えられ、およびこのCH3ドメインはhcasp8膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目179に記載のタンパク質。
(項目234)
上記単鎖タンパク質がL6単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域において、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目235)
上記単鎖タンパク質が連結領域を含むG28−1単鎖Fvを含み、ここで、上記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ上記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、ここで、上記重鎖定常領域はG28−1単鎖Fv CH2およびCH3ドメインを含む項目179に記載のタンパク質。
(項目236)
被験体において標的細胞集団を減少させる方法であって、この方法は、以下:
a)標的細胞集団を、この標的細胞集団内の細胞に結合する第一のタンパク質またはペプチドで処理し、次いで、
b)i)Fcレセプターに結合する、ii)標的細胞のアポトーシスを誘導する、またはiii)補体を固定する、の少なくとも1つが可能である第二のタンパク質またはポリペプチドでこの標的細胞集団を処理する工程を包含し、ここで、この第一のタンパク質またはペプチド分子はこの第二のタンパク質またはペプチド分子に直接結合し、または所望により、この第一のタンパク質またはペプチド分子およびこの第二のタンパク質またはペプチド分子は第三のタンパク質またはペプチド分子によって連結され、ここで、このタンパク質分子は抗体、TNFファミリーまたはTNFレセプターファミリーのメンバーではなく、細菌トキシン、細胞傷害性薬物、または放射性同位体と結合体化しない、約150kD未満であるタンパク質の治療有効量を被験体に投与する工程を包含する、方法。
(項目237)
被験体において標的細胞集団を減少させる方法であって、この方法は、以下:
a)標的細胞集団を、この標的細胞集団内の細胞に結合する第一のタンパク質またはペプチドで処理し、次いで、
b)i)Fcレセプターに結合する、ii)標的細胞のアポトーシスを誘導する、またはiii)補体を固定する、の少なくとも1つが可能である第二のタンパク質またはポリペプチドでこの標的細胞集団を処理する工程から本質的になり、ここで、この第一のタンパク質またはペプチド分子はこの第二のタンパク質またはペプチド分子に直接結合し、または所望により、この第一のタンパク質またはペプチド分子およびこの第二のタンパク質またはペプチド分子は第三のタンパク質またはペプチド分子によって連結され、ここで、このタンパク質分子は抗体、TNFファミリーまたはTNFレセプターファミリーのメンバーではなく、細菌トキシン、細胞傷害性薬物、または放射性同位体と結合体化しない、約150kD未満であるタンパク質の治療有効量を被験体に投与する工程を包含する、方法。
(項目238)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、以下:
i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、この結合ドメインポリペプチドは1以上のアミノ酸の欠失または置換を含む軽鎖可変領域を含む、ポリペプチド;
ii)この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および
iii)この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目239)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、以下:
i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、この結合ドメインポリペプチドは、位置12、80、81、83、105、106および107において1以上のアミノ酸の欠失または置換を含む軽鎖可変領域を含み;
ii)この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド;および
iii)この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、
を含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目240)
上記軽鎖可変領域における1以上のアミノ酸の置換または欠失は、この欠失または置換が無いタンパク質に対してこのタンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、項目238に記載のタンパク質。
(項目241)
上記結合ドメインポリペプチドが単鎖Fvである、項目238に記載のタンパク質。
(項目242)
上記結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む項目238に記載のタンパク質。
(項目243)
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、この第二の結合ドメインポリペプチドは免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む項目242に記載のタンパク質。
(項目244)
上記結合ドメインポリペプチドが単鎖Fvであって、この単鎖Fvの上記軽鎖可変領域が位置106においてアミノ酸の欠失または置換を有する、項目241に記載のタンパク質。
(項目245)
上記結合ドメインポリペプチドが単鎖Fvであって、この単鎖Fvの重鎖可変領域の位置106のアミノ酸が欠失されている、項目241に記載のタンパク質。
(項目246)
上記結合ドメインポリペプチドが単鎖Fvであって、この単鎖Fvの上記軽鎖可変領域が位置106にアミノ酸置換を有する、項目238に記載のタンパク質。
(項目247)
ロイシンが106の位置においてセリンによって置き換えられた項目244に記載のタンパク質。
(項目248)
ロイシンが106の位置においてデス−ロイシンによって置き換えられた項目244に記載のタンパク質。
(項目249)
上記単鎖Fv軽鎖可変領域の位置106のアミノ酸に代えて置き換えたアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンから選択される、項目244に記載のタンパク質。
(項目250)
上記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Fvであり、ここで、上記重鎖可変領域がアミノ酸位置11にアミノ酸置換を有する、項目244に記載のタンパク質。
(項目251)
上記結合ドメインポリペプチドが腫瘍抗原に結合する、項目241に記載のタンパク質。
(項目252)
上記結合ドメインポリペプチドが免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する、項目241に記載のタンパク質。
(項目253)
上記結合ドメインポリペプチドが癌細胞抗原に結合する、項目241に記載のタンパク質。
(項目254)
上記癌細胞抗原が表面抗原である、項目253に記載のタンパク質。
(項目255)
上記癌細胞抗原が細胞内抗原である、項目253に記載のタンパク質。
(項目256)
上記結合ドメインポリペプチドがB細胞抗原に結合する、項目238に記載のタンパク質。
(項目257)
上記B細胞抗原がCD19、CD20、CD22、CD37、CD40、CD80およびCD86から選択される、項目256に記載のタンパク質。
(項目258)
上記単鎖FvがB細胞抗原に結合する、項目241に記載のタンパク質。
(項目259)
上記B細胞抗原がCD19、CD20、CD22、CD37、CD40、CD80、およびCD86から選択される、項目258に記載のタンパク質。
(項目260)
上記単鎖FvがHD37単鎖Fv、2H7単鎖Fv、G28−1単鎖Fv、および4.4.220単鎖Fvから選択される、項目259に記載のタンパク質。
(項目261)
上記結合ドメインポリペプチドが、B細胞分化抗原に結合するscFvである、項目238に記載のタンパク質。
(項目262)
上記B細胞抗原がCD19、CD20、CD22、CD37およびCD40から選択される、項目261に記載のタンパク質。
(項目263)
上記結合ドメインポリペプチドがCD2、CD3、CD4、CD5、CD6、CD8、CD10、CD11b、CD14、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD28、CD30、CD37、CD40、CD43、CD50(ICAM3)、CD54(ICAM1)、CD56、CD69、CD80、CD86、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD152(CTLA−4)、CD153(CD30リガンド)、CD154(CD40リガンド)、ICOS、L6、B7−H1、およびHLAクラスIIから選択される標的に結合する、項目238に記載のタンパク質。
(項目264)
上記タンパク質がこのタンパク質の2以上を含む複合体を形成することができる、項目238に記載のタンパク質。
(項目265)
上記複合体がダイマーである、項目264に記載のタンパク質。
(項目266)
上記タンパク質がモノマーである、項目238に記載のタンパク質。
(項目267)
上記免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、1以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、1以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、1以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和から選択される、項目238に記載のタンパク質。
(項目268)
タンパク質キナーゼ、タンパク質ホスファターゼ、G−タンパク質、環状ヌクレオチドまたは他の第二メッセンジャー、イオンチャネルおよび分泌経路成分から選択される1以上の分子の活性化または阻害によって生物学的に活性なシグナルを誘導することができる、項目267に記載のタンパク質。
(項目269)
NK細胞、単球、マクロファージ、B細胞、T細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球から選択される1以上の免疫エフェクター細胞を誘導することができる、項目267に記載のタンパク質。
(項目270)
1以上の免疫エフェクター細胞のこの誘導が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性または1以上の生物学的に活性な分子の放出を導く項目267に記載のタンパク質。
(項目271)
細胞活性化が可能であり、ここで、この活性化が細胞転写活性の変化を導く項目267に記載のタンパク質。
(項目272)
上記細胞転写活性が増加される、項目271に記載のタンパク質。
(項目273)
上記細胞転写活性が減少される、項目271に記載のタンパク質。
(項目274)
上記1以上の生物学的に活性な分子がプロテアーゼである、項目267に記載のタンパク質。
(項目275)
上記1以上の生物学的に活性な分子がサイトカインである、項目267に記載のタンパク質。
(項目276)
上記サイトカインがモノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンから選択される、項目275に記載のタンパク質。
(項目277)
感染性因子の中和が可能であり、この感染性因子が細菌、ウイルス、寄生体または真菌である、項目267に記載のタンパク質。
(項目278)
トキシンの中和が可能であり、ここで、このトキシンがエンドトキシンおよびエキソトキシンから選択される、項目267に記載のタンパク質。
(項目279)
トキシンの中和が可能であり、ここで、このトキシンが炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、E.coli熱−不安定トキシンLT、E.coli熱安定性トキシンST、シガトキシン、PseudomonasエンドトキシンA、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Bordetella pertussis ACトキシン、およびBacillus anthracis EFから選択されるエキソトキシンである、項目267に記載のタンパク質。
(項目280)
トキシンの中和が可能であり、ここで、このトキシンがサキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチニン、およびグラヤノトキシンから選択されるエンドトキシンである、項目267に記載のタンパク質。
(項目281)
上記タンパク質が細胞内標的に結合して、細胞機能に影響する、項目238に記載のタンパク質。
(項目282)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが免疫グロブリン重鎖IgG GH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドを含む項目238に記載のタンパク質。
(項目283)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖IgG GH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドから本質的になる、項目238に記載のタンパク質。
(項目284)
ヒト定常領域の少なくとも一部を含む項目238に記載のタンパク質。
(項目285)
上記連結領域が、ヒトヒンジまたはその部分、ヒトIgGヒンジまたはその部分、ヒトIgAヒンジまたはその部分、ヒトIgEヒンジまたはその部分、ラクダヒンジ領域またはその部分、IgG1ラマヒンジ領域またはその部分、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、ギンザメヒンジ領域またはその部分から選択される天然に生じるヒンジ領域を含む項目238に記載のタンパク質。
(項目286)
上記連結領域がヒトIgEヒンジまたはその部分を含む項目238に記載のタンパク質。
(項目287)
上記連結領域が0または1のシステイン残基いずれかを有するヒトIgG1、IgG2、IgG3またはIgG4ヒンジ領域を含む項目238に記載のタンパク質。
(項目288)
上記連結領域が0と2との間のシステイン残基を有するヒトIgGAヒンジ領域を含む項目238に記載のタンパク質。
(項目289)
上記連結領域が野生型ヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域を含む項目238に記載のタンパク質。
(項目290)
上記連結領域がグリコシル化部位を含む項目238に記載のタンパク質。
(項目291)
上記連結領域が、ジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を有しない項目238に記載のタンパク質。
(項目292)
上記連結領域が1つのシステイン残基を有する、項目238に記載のタンパク質。
(項目293)
上記連結領域が、1以下のシステイン残基を含む変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド含む項目238に記載のタンパク質。
(項目294)
上記連結領域が、このタンパク質が低下した二量体化する能力を有するように変更された項目238に記載のタンパク質。
(項目295)
上記連結領域がプロリンおよび第一、第二および第三のシステイン残基を含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステインに対してN−末端側にあり、かつ第二のシステインはこの第三のシステインに対してN−末端側にあり、この第三のシステイン残基はこのプロリン残基に対してN−末端側にある、項目238に記載のタンパク質。
(項目296)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、この連結領域はIgAヒンジ領域の少なくとも一部を含み、この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目297)
上記結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む項目296に記載のタンパク質。
(項目298)
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、この第二の結合ドメインポリペプチドは免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む項目297に記載のタンパク質。
(項目299)
上記連結領域がIgAヒンジ領域の少なくとも一部から本質的になる、項目296に記載のタンパク質。
(項目300)
上記連結領域がIgAヒンジ領域から本質的になる、項目296に記載のタンパク質。
(項目301)
少なくとも約70kDaの見掛けの分子量を有するタンパク質として発現される、項目300に記載のタンパク質。
(項目302)
約70kDaと約700kDaとの間の見掛けの分子量を有するタンパク質として発現される、項目300に記載のタンパク質。
(項目303)
上記連結領域が10と50との間のアミノ酸を含む項目296に記載のタンパク質。
(項目304)
上記連結領域が修飾されたヒトIgA免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む項目296に記載のタンパク質。
(項目305)
上記連結領域が唯1つのシステイン残基を有する、項目296に記載のタンパク質。
(項目306)
上記連結領域が2つのシステイン残基を有する、項目296に記載のタンパク質。
(項目307)
第三のポリペプチドにおけるこのN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドがIgA免疫グロブリン重鎖定常領域を含む項目296に記載のタンパク質。
(項目308)
IgA免疫グロブリン重鎖定常領域からのCH2およびCH3ドメインを含む項目307に記載のタンパク質。
(項目309)
上記IgA CH3定常領域ドメインが、IgA重鎖定常領域をJ鎖ポリペプチドと会合できなくする1以上のアミノ酸における置換または欠失を含む項目308に記載のタンパク質。
(項目310)
上記IgA重鎖定常領域がJ鎖ポリペプチドと会合することができる、項目308に記載のタンパク質。
(項目311)
上記IgA CH3領域ドメインが4と2と0の間のアミノ酸における欠失を含む項目309に記載のタンパク質。
(項目312)
上記IgA領域ドメインが4つのアミノ酸の欠失を含む項目309に記載のタンパク質。
(項目313)
上記IgA領域ドメインが20のアミノ酸の欠失を含む項目309に記載のタンパク質。
(項目314)
上記単鎖タンパク質がL6単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目296に記載のタンパク質。
(項目315)
上記単鎖タンパク質がL6ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目296に記載のタンパク質。
(項目316)
上記単鎖タンパク質がCTLA−4ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、上記重鎖定常領域はマウスIgAからのCH2およびCH3ドメインを含む項目296に記載のタンパク質。
(項目317)
上記単鎖タンパク質がCTLA−4ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、上記重鎖定常領域はマウスIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、かつCH3は、IgA重鎖定常領域がJ鎖ポリペプチドを会合できなくする4つのアミノ酸における欠失または置換を含む項目296に記載のタンパク質。
(項目318)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、上記重鎖定常領域はマウスIgAからのCH2およびCH3ドメインを含む項目296に記載のタンパク質。
(項目319)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、上記連結領域はIgAヒンジまたはその部分を含み、かつ上記重鎖定常領域はIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3は、IgA重鎖定常領域がJ鎖ポリペプチドと会合できなくする18のアミノ酸における欠失または置換を含む項目296に記載のタンパク質。
(項目320)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、上記連結領域はIgAヒンジまたはその部分を含み、かつ上記重鎖定常領域はIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3は、IgA重鎖定常領域がJ鎖ポリペプチドと会合できなくする4つのアミノ酸における欠失または置換を含み、かつこのCH3ドメインは、CD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目296に記載のタンパク質。
(項目321)
上記単鎖タンパク質が2e12ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、上記連結領域はIgAヒンジまたはその部分を含み、上記重鎖定常領域はIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3は、IgA重鎖定常領域がJ鎖ポリペプチドと会合できなくする4つのアミノ酸における欠失または置換を含み、かつこのCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目296に記載のタンパク質。
(項目322)
上記単鎖タンパク質が1D8ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、上記連結領域はIgAヒンジまたはその部分を含み、上記重鎖定常領域はIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3は、IgA重鎖定常領域がJ鎖ポリペプチドと会合できなくする4つのアミノ酸における欠失または置換を含み、かつこのCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目296に記載のタンパク質。
(項目323)
上記単鎖タンパク質がG28−1ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、上記重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目296に記載のタンパク質。
(項目324)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、この重鎖定常領域はIgG からのCH2およびCH3ドメインを含む項目296に記載のタンパク質。
(項目325)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、上記重鎖定常領域はIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このCH3は、このIgA重鎖定常領域をJ鎖ポリペプチドと会合できなくする4つのアミノ酸における欠失または置換を含み、およびこのCH3ドメインはCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した項目296に記載のタンパク質。
(項目326)
上記単鎖タンパク質が2H7ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、上記重鎖定常領域はIgAからのCH2およびCH3ドメインを含み、ここで、このIgA重鎖定常領域はJ鎖ポリペプチドと会合できる、項目296に記載のタンパク質。
(項目327)
上記単鎖タンパク質がHD37ハイブリドーマからの単鎖Fv結合ドメインを含み、ここで、上記連結領域はIgAヒンジ領域またはその部分を含み、上記重鎖定常領域はIgAからのCH2およびCH3ドメインを含む項目296に記載のタンパク質。
(項目328)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、以下:
i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、および
ii)この第二のポリペプチドに結合したIgE免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドの少なくとも一部を含む第二のポリペプチドを含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目329)
上記結合ドメインポリペプチドが非−IgE可変領域を含む項目328に記載のタンパク質。
(項目330)
上記結合ドメインポリペプチドがHD37単鎖Fv、2H7単鎖Fv、G28−1単鎖Fv、FC2−2、UCHL−1、5B9、L6、10A8、2e12、40.2.36、G19−4、1D8、および4.4.220単鎖Fvから選択される単鎖Fvである、項目328に記載のタンパク質。
(項目331)
上記結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む項目328に記載のタンパク質。
(項目332)
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチド含み、この第二の結合ドメインポリペプチドは免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む項目331に記載のタンパク質。
(項目333)
上記免疫グロブリン軽鎖および重鎖がIgG免疫グロブリン軽鎖および重鎖またはそれらの部分を含む項目332に記載のタンパク質。
(項目334)
上記結合ドメインポリペプチドがIgG免疫グロブリン可変領域の少なくとも部分を含む項目328に記載のタンパク質。
(項目335)
上記IgG可変領域が重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む項目334に記載のタンパク質。
(項目336)
IgEに特異的なFcレセプターに結合することができる、項目328に記載のタンパク質。
(項目337)
IgE可変鎖領域を有しない項目328に記載のタンパク質。
(項目338)
上記結合ドメインがIgG免疫グロブリン軽鎖領域およびIgG免疫グロブリン軽鎖および重鎖領域から本質的になる、項目328に記載のタンパク質。
(項目339)
上記IgE免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドがCH2およびCH3ドメインを含む項目328に記載のタンパク質。
(項目340)
上記IgE免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドがCH2、CH3およびCH4ドメインを含む項目328に記載のタンパク質。
(項目341)
上記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Fvであり、ここで、この重鎖可変領域がアミノ酸位置11においてアミノ酸置換を有する、項目328に記載のタンパク質。
(項目342)
上記単鎖タンパク質がHD37単鎖Fv、2H7単鎖Fv、G28−1単鎖Fv、および4.4.220単鎖Fvから選択される単鎖Fvである、項目328に記載のタンパク質。
(項目343)
上記単鎖タンパク質が2H7単鎖FvまたはG28−1単鎖Fvを含む単鎖Fvである、項目328に記載のタンパク質。
(項目344)
被験体における標的細胞集団を減少させる方法であって、この方法は、この被験体に、治療有効量の天然に生じない単鎖タンパク質を投与する工程を包含し、ここで、このタンパク質は結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチドであって、この結合ドメインポリペプチドはIgG可変領域の少なくとも部分を含み、かつ標的分子に結合することができる、ポリペプチド、この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、この第二のポリペプチドに結合したIgE免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質が少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、方法。
(項目345)
上記タンパク質が患者の血流に投与される、項目344に記載の方法。
(項目346)
上記タンパク質の投与の結果として、単球が活性化されるが、肥満細胞は活性化されない項目344に記載の方法。
(項目347)
上記タンパク質が投与されるか、またはヒスタミン放出ブロッカーと共に投与される、項目344に記載の方法。
(項目348)
動物において細胞を枯渇させる方法であって、この方法は、修飾されたIgEタンパク質を動物の血流に投与する工程を包含する、方法。
(項目349)
上記修飾されたIgEタンパク質が投与されるか、またはヒスタミン放出ブロッカーと共に投与される、項目348に記載の方法。
(項目350)
上記連結領域がIgGヒンジまたはその部分を含み、かつ上記重鎖定常領域がIgE由来であって、CH2ドメインを含まないCH3およびCH4ドメインを含む項目328に記載のタンパク質。
(項目351)
上記単鎖タンパク質が2e12からの単鎖Fv結合ドメインを含み、かつ上記重鎖定常領域がIgE CH2、CH3、およびCH4ドメインを含み、ここで、この重鎖定常領域はCD80膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合された項目328に記載のタンパク質。
(項目352)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、以下:
i)標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド;
ii)この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチドであって、この連結領域は3つのシステイン残基および1つのプロリン残基を含み、ここで、このシステイン残基の1以上は欠失または置換される、ポリペプチド;および
iii)この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも1つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目353)
上記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステインに対してN−末端側にあり、かつこの第二のシステインはこの第三のシステインに対してN−末端側にあり、ここで、この第一のシステイン残基は置換または欠失されておらず、ここで、この第二および第三のシステインは置換または欠失されている、項目352に記載のタンパク質。
(項目354)
上記第二および第三のシステイン残基が別のアミノ酸によって置換された項目353に記載のタンパク質。
(項目355)
上記第二および第三のシステイン残基がセリン残基によって置換された項目354に記載のタンパク質。
(項目356)
約75kDaの見掛けの分子量を有する同種タンパク質として発現される、項目352に記載のタンパク質。
(項目357)
上記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステインに対してN−末端側にあり、かつこの第二のシステインはこの第三のシステインに対してN−末端側にあり、ここで、この第一のシステイン残基は置換または欠失されている、項目352に記載のタンパク質。
(項目358)
上記連結領域中の上記第二および第三のシステイン残基が置換または欠失されていない項目352に記載のタンパク質。
(項目359)
上記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステインに対してN−末端側にあり、かつこの第二のシステインはこの第三のシステインに対してN−末端側にあり、ここで、この第二のシステイン残基は置換または欠失されている、項目352に記載のタンパク質。
(項目360)
上記連結領域における上記第一および第三のシステイン残基が置換または欠失されていない項目352に記載のタンパク質。
(項目361)
上記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステインに対してN−末端側にあり、かつこの第煮のシステイン残基はこの第三のシステイン残基に対してN−末端側にあり、ここで、この第三のシステイン残基は置換または欠失されている、項目352に記載のタンパク質。
(項目362)
上記連結領域における上記第一および第二のシステイン残基が置換または欠失されていない項目10に記載のタンパク質。
(項目363)
上記連結領域が5と65との間のアミノ酸を含む項目352に記載のタンパク質。
(項目364)
上記連結領域が10と50との間のアミノ酸を含む項目352に記載のタンパク質。
(項目365)
上記連結領域が15と35との間のアミノ酸を含む項目352に記載のタンパク質。
(項目366)
上記連結領域が少なくとも5つの連続ヒンジ領域アミノ酸を含む項目352に記載のタンパク質。
(項目367)
上記連結領域が少なくとも10の連続ヒンジ領域アミノ酸を含む項目352に記載のタンパク質。
(項目368)
上記連結領域が少なくとも15の連続ヒンジ領域アミノ酸を含む項目352に記載のタンパク質。
(項目369)
上記第二および第三のシステインがセリン残基によって置き換えられ、かつ上記連結領域がIgG ヒンジ領域の少なくとも部分を含む項目353に記載のタンパク質。
(項目370)
上記連結領域がIgG ヒンジ領域の少なくとも5つの連続アミノ酸を含む項目369に記載のタンパク質。
(項目371)
上記第二および第三のシステインがセリン残基によって置き換えられ、かつ上記連結領域がIgG ヒンジ領域の少なくとも部分を含む項目353に記載のタンパク質。
(項目372)
上記連結領域がIgG ヒンジ領域の少なくとも5つの連続アミノ酸を含む項目371に記載のタンパク質。
(項目373)
上記第二および第三のシステイン残基がセリン残基によって置き換えられ、かつ上記連結領域がIgG ヒンジ領域の少なくとも部分を含む項目353に記載のタンパク質。
(項目374)
上記連結領域がIgG ヒンジ領域の少なくとも5つの連続アミノ酸を含む項目373に記載のタンパク質。
(項目375)
上記第二および第三のシステイン残基がセリン残基によって置き換えられ、かつ上記連結領域がIgG ヒンジ領域の少なくとも部分を含む項目353に記載のタンパク質。
(項目376)
上記連結領域がIgG ヒンジ領域の少なくとも5つの連続アミノ酸を含む項目375に記載のタンパク質。
(項目377)
上記第二および第三のシステイン残基が置換または欠失されており、かつ上記プロリン残基が置換または欠失されており、ここで、上記重鎖定常領域ポリペプチドはCH3ドメインを含み、ここで、チロシンは位置407のアラニンによって置換され、ここで、このタンパク質は約75kDaの見掛けの分子量を有する、項目352に記載のタンパク質。
(項目378)
上記第一および第三のシステイン残基が置換または欠失されており、および上記プロリン残基が置換または欠失されており、ここで、上記重鎖定常領域ポリペプチドはCH3ドメインを含み、ここで、チロシンは位置407においてアラニンによって置換されており、ここで、このタンパク質は約75kDaの見掛けの分子量を有する、項目352に記載のタンパク質。
(項目379)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、標的分子に結合することができる、結合ドメインポリペプチド含む第一のポリペプチド、この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、この第二のポリペプチドに結合したN−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、この連結領域は第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、この第一のシステイン残基はこの第二のシステインに対してN−末端側にあり、かつこの第二のシステインはこの第三のシステインに対してN−末端側にあり、ここで、この第二および第三のシステイン残基の一方または双方は置換または欠失されており、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも一つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目380)
上記連結領域が修飾されたヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む項目352に記載のタンパク質。
(項目381)
上記連結領域が唯1つのシステイン残基を有する、項目352に記載のタンパク質。
(項目382)
上記連結領域が修飾されたヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド含む項目381に記載のタンパク質。
(項目383)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖IgG CH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドを含む項目352に記載のタンパク質。
(項目384)
上記N−末端が切断された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖IgG CH3定常領域ポリペプチドに結合したIgG CH2定常領域ポリペプチドから本質的になる、項目352に記載のタンパク質。
(項目385)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチド含む第三のポリペプチドを含み、ここで、このCH3定常領域ポリペプチドはこのタンパク質の2つが一緒に会合して非共有結合ダイマーを形成するのを阻害する1以上のアミノ酸置換または欠失を含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも一つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目386)
天然に生じない単鎖タンパク質であって、このタンパク質は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、この第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドを含み、ここで、このCH3定常領域ポリペプチドは位置405および407において1以上のアミノ酸の置換または欠失を含み、ここで、この天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも一つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
(項目387)
位置405および位置407においてアミノ酸置換を含む項目252または253に記載のタンパク質。
(項目388)
フェニルアラニンが位置405においてアラニンで置き換えられ、チロシンが位置407においてアラニンで置換された項目387に記載のタンパク質。
(項目389)
約40kDaと約50kDaとの間の見掛けの分子量を有する、項目387に記載のタンパク質。
(項目390)
アゴニストまたはアンタゴニストの生物学的活性を有する、項目387に記載のタンパク質。
(項目391)
アンタゴニストの生物学的活性を有する、項目390に記載のタンパク質。
(項目392)
位置405および407における唯1つのアミノ酸が置換された項目387に記載のタンパク質。
(項目393)
約70kDaと約80kDaとの間の見掛けの分子量を有する、項目392に記載のタンパク質。
(項目394)
フェニルアラニンが位置405においてアラニンによって置き換えられた項目387に記載のタンパク質。
(項目395)
フェニルアラニンが位置405においてチロシンによって置き換えられた項目387に記載のタンパク質。
(項目396)
チロシンが位置407においてアラニンによって置き換えられた項目386に記載のタンパク質。
(項目397)
位置405および位置407においてアミノ酸置換を含む項目386に記載のタンパク質。
(項目398)
フェニルアラニンが位置405においてアラニンによって置き換えられ、かつチロシンが位置407においてアラニンによって置き換えられた項目393に記載のタンパク質。
(項目399)
項目1、8、9、12、18、30、および112〜109のいずれか1項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
(項目400)
項目116、120、121、および180〜235のいずれか1項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
(項目401)
項目238、239、296、328、352、353、385および386いずれか1項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
(項目402)
細胞中の上記ポリヌクレオチドの発現を増強するプロモーターまたは他の配列に操作可能に連結した項目399〜401のいずれか1項に記載のポリヌクレオチド。
(項目403)
項目399〜401のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドを含有する細胞。
(項目404)
項目1、8、9、12、18、30、および112〜109のいずれか1項に記載のタンパク質を発現することができる組換えベクター。
(項目405)
項目116、120、121および180〜235のいずれか1項に記載のタンパク質を発現させることができる組換えベクター。
(項目406)
上記タンパク質が発現される条件下で項目1、8、9、12、18、30および112〜109のいずれか1項に記載のタンパク質を発現する方法。
(項目407)
上記タンパク質が発現される条件下で項目116、120、121、および180〜235のいずれか1項に記載のタンパク質を発現する方法。
(項目408)
上記タンパク質が発現される条件下で項目238、239、296、328、352、353、385、および386のいずれか1項に記載のタンパク質を発現する方法。
(項目409)
1以上のさらなる治療化合物と組み合わせた項目238、239、296、328、352、353、385および386のいずれか1項に記載のタンパク質を含む組成物。
(項目410)
被験体を処置する方法であって、この方法は、この被験体に、項目238、239、296、328、352、353、385および386のいずれか1項に記載の1以上の第一の化合物を投与する工程、第一の化合物と組み合わせてこの被験体に第二の化合物を投与または同時投与する工程を包含し、ここで、この処置は疾患、病気または望ましくない状態を処置または予防するのに有効である、方法。
(項目411)
上記第二の化合物が化学療法化合物、治療薬物、脈管形成インヒビター、ステロイド、B−細胞アクチベーター、T−細胞アクチベーター、コロニー刺激因子、腫瘍壊死因子、インターフェロン、抗体、本発明の結合構築体、遺伝子治療、レチノイド、外科的手法、アルキル化剤、ヌクレオシドアナログ、トポイソメラーゼII、VEGF、IFN−アルファ、DMAR剤、インターロイキン−1、グルココルチコイド、p38インヒビター、インターロイキン−4、インターロイキン−6、インターロイキン−2、インターロイキン−12、IFN−γ、GM−CSF、G−CSF、M−CSF、抗−CTLA−4、Bcl−2アンチセンス、ビタミンA、抗−CD19、抗−CD20、抗−CD22、抗−CD28または抗−CD3から選択される、項目410に記載の方法。
(項目412)
組換え分子を表示する方法であって、この分子は天然または遺伝子操作された免疫グロブリン重鎖可変領域を含み、その改良はこの重鎖可変領域における位置9、10、11、12、108、110、および112に対応する1以上のアミノ酸残基において1以上の突然変異、置換、改変および/または欠失を含む免疫グロブリン重鎖領域を含む、方法。
(項目413)
天然に生じない単鎖抗原結合タンパク質であって、このタンパク質は、
Figure 2010279389
Figure 2010279389
Figure 2010279389
から選択された式を有するタンパク質を有する、タンパク質。
図1は、2H7scFv−Ig、CD20特異的に結合することができる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のDNAおよび推定アミノ酸配列[配列番号: ]を示す。 図1は、2H7scFv−Ig、CD20特異的に結合することができる結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のDNAおよび推定アミノ酸配列[配列番号: ]を示す。 図2は、トランスフェクトされた安定なCHO系による2H7scFv−Igの生産レベル、および精製された2H7scFv−Igの、CD20を発現するCHO細胞への結合による標準曲線の作成を示す。 図3は、単離された2H7scFv−Igタンパク質の複数の調製物のSDS−PAGE分析を示す。 図4は、2H7scFv−Igによる、補体固定(図4A)および抗体−依存性細胞傷害性の介在(図4B)を示す。 図5は、正常なB細胞の増殖に対するCD20およびCD40の同時連結の効果を示す。 図6は、Bリンパ芽球細胞系における、CD95発現およびアポトーシスの誘導に対するCD20およびCD40の同時連結の効果を示す。 図7は、CD20およびCD40に特異的に結合することができる2H7scFv−CD154 L2(図7A、配列番号: )および2H7scFv−CD154 S4(図7B、配列番号: )のDNAおよび推定アミノ酸配列[配列番号: ]を示す。 図7は、CD20およびCD40に特異的に結合することができる2H7scFv−CD154 L2(図7A、配列番号: )および2H7scFv−CD154 S4(図7B、配列番号: )のDNAおよび推定アミノ酸配列[配列番号: ]を示す。 図7は、CD20およびCD40に特異的に結合することができる2H7scFv−CD154 L2(図7A、配列番号: )および2H7scFv−CD154 S4(図7B、配列番号: )のDNAおよび推定アミノ酸配列[配列番号: ]を示す。 図7は、CD20およびCD40に特異的に結合することができる2H7scFv−CD154 L2(図7A、配列番号: )および2H7scFv−CD154 S4(図7B、配列番号: )のDNAおよび推定アミノ酸配列[配列番号: ]を示す。 図8は、フローイミュノサイトフルオリメトリーによる、2H7scFv−CD154結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のCD20+CHO細胞への結合を示す。 図9は、2H7scFv−CD154結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の細胞への結合の後における、アネキシンVの、B細胞系Ramos、BJAB、およびT51への結合を示す。 図10は、2H7scFv−CD154結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の結合に続いての、B細胞系T51の増殖に対する効果を示す。 図11は、CytoxBまたはCytoxB誘導体:CytoxB−MHWTG1C(2H7 ScFv、突然変異体ヒンジ、野生型ヒトIgG1 Fcドメイン)、CytoxB−MHMG1C (2H7 ScFv、突然変異体ヒンジ、変異したヒトIgG1 Fcドメイン)、およびCytoxB−IgAHWTHG1C(2H7 ScFv、ヒトIgA−誘導ヒンジ[配列番号: ]、野生型ヒトIgG1 Fcドメイン)という2H7ScFv−Ig融合タンパク質[配列番号: ]の構造の模式図を示す。矢印は、FcR結合およびADCC活性(重矢印)および補体固定(軽矢印)に寄与すると考えられるアミノ酸残基の位置番号を示す。 図12は、単離されたCytoxBおよび2H7scFv−CD154結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のSDS−PAGE分析を示す。 図13は、CytoxB誘導体の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。 図14は、CytoxB誘導体の補体依存性細胞傷害性を示す。 図15は、マカック属サル血液試料におけるCytoxB−MHWTG1Cの血清中半減期測定を示す。 図16は、マカック属サル血液試料における循環CD40+B細胞のレベルに対するCytoxB−MHWTG1Cの効果を示す。 図17は、トランスフェクトされた哺乳動物細胞系によるHD37(CD19−特異的)ScFv−Igの生産レベル、およびCD19を発現する細胞への精製されたHD37 ScFv−Igの結合による標準曲線の作成を示す。 図18は、トランスフェクトされた安定なCHO系によるL6(癌腫抗原) ScFv−Igの生産レベル、およびL6抗原を発現する細胞への精製されたL6 ScFv−Igの結合による標準曲線の作成を示す。 図19は、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質2H7 ScFv−Ig、HD37 ScFv−IgおよびG28−1 (CD37−特異的)ScFv−Igの抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。 図20は、L6 ScFv−Ig融合タンパク質の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。 図21は、L6 ScFv−Igおよび2H7 ScFv−Ig融合タンパク質のSDS−PAGE分析を示す。 図22は、G28−1 ScFv−IgおよびHD37 ScFv−Ig融合タンパク質のSDS−PAGE分析を示す。 図23は、ヒトIgG1(配列番号: )の免疫グロブリンヒンジおよびCH2ドメインと、ラマIgG1(配列番号: )、IgG2(配列番号: )、およびIgG3(配列番号: )のヒンジおよびCH ドメインとの配列整列を示す。 図24は、10%SDSポリアクリルアミドゲルにおける精製された2H7 scFvラマIgG融合タンパク質の移動を示す。精製された融合タンパク質(試料当たり5μg)を非−還元性試料緩衝液(レーン2ないし5)および還元性試料緩衝液(レーン6ないし9)において調製した。レーン1:分子量マーカー(非−還元);レーン2および6:2H7 scFv−ラマIgG1(配列番号: )、:レーン3および7:2H7 scFv−ラマ IgG2(配列番号: ):レーン4および8:2H7 scFv−ラマIgG3(配列番号: ):およびレーン5および9:リツキシマブ(キメラ抗−CD20抗体(ヒトIgG1定常領域)) 図25は、フローイミュノサイトフルオロメトリーによって検出された、CD20+CHO細胞への、2H7 scFv−ラマIgG1(配列番号: )、2H7 scFv−ラマIgG2(配列番号: )、2H7 scFv−ラマIgG3(配列番号: )の結合を示す。 図26は、ウサギ補体の存在下における、BJAB細胞に対する、2H7 scFvラマIgG融合タンパク質、2H7 scFv−ラマIgG1(配列番号: )、2H7 scFv−ラマIgG2(配列番号: )、および2H7 scFv−ラマIgG3(配列番号: )、および2H7 scFvヒトIgG1(2H7 scFv IgG WTHWTCH2CH3)(配列番号: )のCDC活性を示す。リツキシマブは対照として含めた。 図27は、2H7 scFv−ラマIgG融合タンパク質、2H7 scFv−ラマIgG1(配列番号: )、2H7 scFv−ラマIgG2(配列番号: )、および2H7 scFv−ラマIgG3(配列番号: )の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。エフェクター細胞(ヒトPBMC)を3つの異なる比率1:25、1:50および1:100にて標的細胞(BJAB細胞)と合わせた。リツキシマブは対照として含めた。各データ点は3つの別々の測定を表す。 図28は、2H7 scFv−ラマIgG融合タンパク質、2H7 scFv−ラマIgG1(配列番号: )、2H7 scFv−ラマIgG2(配列番号: )、および2H7 scFv−ラマIgG3(配列番号: )の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。エフェクター細胞(ラマPBMC)は3つの異なる比率1:25、1:50、および1:100にて標的細胞(BJAB細胞)と合わせた。リツキシマブは対照として含めた。各データ点は3つの別々の測定を表す。 図29は、細胞表面にscFv−Ig融合タンパク質を発現するReh細胞(急性リンパ性白血病)の補体依存性細胞傷害性活性を示す。Reh細胞は、ヒトCD80膜貫通および細胞質テイルドメインと融合させた、ヒトIgG1野生型ヒンジ−CH2−CH3と融合させた、ヒト共刺激性分子CD152、CD28、CD40、およびCD20に特異的なscFv抗体をコードする構築体でトランスフェクトした。補体依存性細胞傷害性活性は、ウサギ補体(各々、+C’、およびC’無し)の存在下および不存在下で測定した。データは二連試料の平均を表す。Reh抗−hCD152 scFvIg:ポリヌクレオチド10A8 scFv IgG MTH(SSS) MT CH2CH3(配列番号: );Reh抗−hCD28scFvIg:2E12 scFv IgG MTH(SSS) MT CH2CH3(配列番号: );Reh抗−hCD40scFvIg:4.2.220 scFv IgG MTH(SSS) MT CH2CH3(配列番号: );およびReh抗−hCD20scFvIg:2H7 scFv IgG MTH(SSS) MT CH2CH3(配列番号: )でトランスフェクトされたReh細胞。 図30は、ヒトCD80膜貫通および細胞質テイルドメインに融合した、ヒト突然変異体IgG1ヒンジおよび突然変異体CH2および野生型CH3(ポリヌクレオチド500A2 scFv IgG MTH(SSS) MTCH2WTCH3 配列番号: )でトランスフェクトされたReh細胞を示すReh抗−mCD3scFv)に融合した、図29につき記載された、ヒト共刺激性分子CD152、CD28、CD40およびCD20に対して、およびマウスCD3に対して特異的なscFv抗体をコードする構築体でトランスフェクトされたReh細胞の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。データは四連試料の平均を表す。 図31は、引き続いての図面で示される実験で用いた免疫グロブリン定常領域構築体をリストする。 図32は、ウサギ補体(各々、+C’、およびC’無し)の存在下および不存在下における、CTLA−4 Ig融合タンパク質、CTLA−4 IgG WTH(CCC) WTCH2CH3(配列番号: )(2μg/ml)およびCTLA−4 IgG MTH MTCH2WTCH3(配列番号: )(2μg/ml)の補体依存性細胞傷害性活性を示す。標的細胞はReh細胞、およびCD80でトランスフェクトされたReh細胞であった(Reh CD80.10)。 図33は、CTLA−4 Ig融合タンパク質、CTLA−4 IgG WTH(CCC) WTCH2CH3(配列番号: )(2μg/ml)およびCTLA−4 IgG MTH MTCH2WTCH3(配列番号: )(2μg/ml)の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。エフェクター細胞ヒトPBMCを示された比率で標的細胞RehまたはReh CD80.1に加えた。図33Aは、いずれかのIg融合タンパク質の不存在下におけるReh CD80.1細胞での自然殺傷のレベルを示す。図33Bは、CTLA−4 IgG MTH MTCH2WTCH3によって媒介される抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性を示し、および図33Cは、CTLA−4 IgG WTH(CCC) WTCH2CH3によって媒介される抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性を示す。各データ点は、4つの試料ウエルで測定した平均パーセント特異的殺傷を表す。 図34は、フローイミュノサイトフルオリメトリーによる、(CD20+)CHO細胞への、2H7(抗−CD20)scFv Ig融合タンパク質の結合を示す。 図35は、2H7 scFv IgGおよびIgA融合タンパク質のイミュノブロットを表す。COS細胞を種々の2H7 scFv Ig融合タンパク質構築体で一過的にトランスフェクトした。発現されたポリペプチドをプロテインAで免疫沈澱させ、非−還元性SDSポリアクリルアミドゲルで分離し、次いで、ポリフッ化ビニル膜に移した。抗−ヒトIgG(Fc特異的)ホースラディッシュペルオキシダーゼ結合体を用いてタンパク質を検出した。レーン1:ベクターのみ;レーン2:2H7 scFv IgG WTH(CCC) WTCH2CH3(配列番号: );レーン3:2H7 scFv IgG MTH(CSS)WTCH2CH3(配列番号: );レーン4:2H7 scFv IgG MTH(SCS)WTCH2CH3(配列番号: );レーン5:2H7 scFv IgAH IgG WTCH2CH3(配列番号: );およびレーン6:2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(配列番号: )。 図36は、フローイミュノサイトフルオロメトリーによる、(CD20+)CHO細胞への2H7 scFv IgAH IgA CH2CH3ポリペプチド(配列番号: )および2H7 scFv IgAH IgAT4(配列番号: )の結合を示す。ポリペプチドの源は、一過的にトランスフェクトされたCOS細胞からの培養上清であった。2H7 scFv IgAH IgACH2CH3をコードする配列を含むプラスミドでトランスフェクトされたCOS細胞を、ヒトJ鎖をコードするヌクレオチド配列を含むプラスミドで共トランスフェクトした。 図37は、エフェクター細胞の源として全血を用いる、BJAB標的細胞に対する、抗−CD20(2H7)scFv Ig融合タンパク質の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。精製された2H7 scFv Ig融合タンパク質を滴定し、51Cr−標識BJAB細胞(5×10)および全血(1:4最終希釈)と合わせた。各データ点は、4つの試料ウエルで測定した平均パーセント特異的殺傷を表す。 図38は、全血の0.25、0.125、および0.625希釈における、51Cr−標識BJAB細胞に対する、2H7 scFv Ig融合タンパク質(5μg/ml)の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。各データ点は、4つの試料ウエルで測定した平均パーセント特異的殺傷を表す。 図39は、ヒトPBMCがエフェクター細胞の源である場合(図39A)、およびヒト全血がエフェクター細胞の源である場合(図39B)における、2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(5μg/ml)および2H7 scFv IgAH IgACH2CH3(5μg/ml)の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性活性を示す。 図40は、2H7 scFv IgG融合タンパク質のイミュノブロットを表す。COS細胞を種々の2H7 scFv Ig融合タンパク質構築体で一過的にトランスフェクトした。発現されたポリペプチドを含有する培養上清を非−還元性SDSポリアクリルアミドゲルで分離し、次いで、ポリフッ化ビニル膜へ移した。抗−ヒトIgG(Fc特異的)ホースラディッシュペルオキシダーゼ結合体を用いてタンパク質を検出した。レーン1ないし5:各々、レーン当たり40ng、20ng、10ng/5ng、および2.5ngにおける精製された2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3。培養上清をレーン6ないし9で分離した。レーン6:2H7 scFv IgG WTH(CCC)WTCH2CH3;レーン7:2H7 scFv IgG MTH(CSS)WTCH2CH3;レーン8:2H7 scFv IgG MTH(SCS)WTCH2CH3;およびレーン9:2H7 scFv VHSER11 IgG MTH(SSS)WTCH2CH3。マーカータンパク質の分子量(kDal)はイミュノブロットの左側に示す。 図41は、フローイミュノフルオリメトリーによる、K1735メラノーマ細胞上での1D8(抗−マウス4−1BB) scFv IgG WTH WTCH2CH3−CD80融合タンパク質の細胞表面発現を示す(図41A)。scFv融合タンパク質をフィコエリスリン−結合体化F(ab’)ヤギ抗−ヒトIgGで検出した。図41Bは、野生型K1735メラノーマ細胞(K1735−WT)での、または1D8 scFv IgG WTH WTCH2CH3−CD80でトランスフェクトされたK1735細胞(K1735−1D8)での皮下注射によって移植されたナイーブC3Hマウスにおける腫瘍の増殖を示す。腫瘍の増殖は腫瘍のサイズを測定することによってモニターした。図41Cは、動物のK1735−1D8細胞での移植に先立ってCD8、CD4、またはCD4およびCD8T細胞双方を除去するための、モノクローナル抗体で腹腔内注射したナイーブC3Hマウスにおける腫瘍増殖のキネティックスを示す。 図42は、免疫原としてK1735−1D8を用いる樹立されたK1735−WT腫瘍の治療を示す。マウスにK1735−WT腫瘍を移植してから6日後に、1つの群(5匹の動物)に対側の側面にK1735−1D8細胞(塗りつぶしていない丸印)または照射したK1735−WT細胞(塗りつぶした四角)で皮下注射した。対照群のマウスにはPBSを受けさせた(塗りつぶしていない四角)。処置は矢印によって示される日に反復した。 図43は、2×10K1735−WT細胞で皮下注射した動物における腫瘍の増殖(塗りつぶした四角)および2×10K1735−WT細胞+2×10K1735−1D8細胞で皮下注射した動物における腫瘍の増殖(塗りつぶしていない三角)を示す。 図44は、抗−ヒトIgGに対する反復ラウンドのパニング後に単離された1D8 scFv IgG WTH WTCH2CH3―CD80でトランスフェクトされた抗原104マウス肉腫腫瘍細胞のフローサイトメトリー分析を表す。1D8 scFv IgG WTH WTCH2CH3−CD80を発現するトランスフェクトされた細胞がフルオロイソチオシアネート(FITC)−結合体化ヤギ抗−ヒトIgGで検出した(黒色で表す)。トランスフェクトされていない細胞は灰色で示す。 図45は、10%SDS−PAGEゲルにおける種々の2H7 scFv Ig融合タンパク質の移動を示す。2H7は抗−CD20 scFvであって、40.2.220が抗−CD40 scFvであった。レーン1:Bio−Rad予備染色分子量標準;レーン2:抗−CD20 scFv IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3;レーン3:抗―CD20 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3;レーン4:2H7 scFv IgAH IgG WTCH2CH3;レーン5:抗−CD20−抗−CD40 scFv IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3;レーン6:リツキシマブ;レーン7:Novex Multimark(登録商標)分子量標準。 図46は、突然変異体CH2ドメインまたは野生型CH2ドメインを含む2H7 Ig融合タンパク質の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性アッセイで測定したエフェクター機能を示す。2H7 scFv IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3(菱形)によるヒトPBMCエフェクター細胞の存在下でのBJAB標的細胞のパーセント特異的殺傷を、2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(四角)および2H7 scFv IgAH IgG WTCH2CH3(三角)およびリツキシマブ(丸印)と比較した。 図47は、フローイミュノサイトフルオリメトリーを用いて線形蛍光等量(LFE)を測定することによる、Reh細胞(図47A)およびT51リンパ芽球細胞(図47B)上での抗−ヒトCD3 scFv IgG WTH WTCH2CH3−CD80(配列番号: )の細胞表面発現を示す。 図48は、トランスフェクトされていないRehおよびT51細胞のパーセント特異的殺傷、およびヒトCD80膜貫通および細胞質テイルドメイン(抗−ヒトCD3 scFv IgG WTH WTCH2CH3−CD80(配列番号: ))に融合した、ヒトIgG1野生型ヒンジ−CH2−CH3に融合した、ヒトCD3に特異的なscFv抗体をコードする構築体でトランスフェクトされたReh細胞(Reh抗−hCD3)(図48A)およびT51細胞(T51抗−hCD3)(図48B)のパーセント特異的殺傷を表す。ヒトPBMC(エフェクター細胞)は、示した比率でBJAM標的細胞と合わせた。 図49は、5B9、抗−マウスCD137(4−1BB)モノクローナル抗体、および5B9 scFv IgG融合タンパク質(5B9 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(配列番号: ))の、刺激されたヒトPBMCへの結合を示す。5B9 scFv IgG融合タンパク質の結合は、FITC結合体化ヤギ抗−ヒトIgGを用いるフローイミュノサイトフルオリメトリーによって検出した。5B9モノクローナル抗体の結合は、FITC結合体化ヤギ抗−マウスIgGで検出した。 図50は、CHO細胞系における2H7 LV11S scFv WCH2 WCH3(「CytoxB scFv Ig」;配列番号: )の発現に対するLV11S突然変異の効果を示す。 図51は、CHO細胞において一過的にトランスフェクトした場合に、2H7 LV11S scFv WCH2 WCH3(配列番号: )の発現を調べる半定量的SDS−PAGE分析を示す。レーン2ないし5は、種々の量の2H7 LV11S scFv WCH2 WCH3である。レーン6ないし10は、2H7 LV11S scFv WCH2 WCH3を発現する5つの異なるクローンからの10μl試料である。 図52は、共に一過的にトランスフェクトされたCOS細胞から得られた、G28−1 LV11S scFv Ig構築体(配列番号: )およびG28−1野生型scFv Ig結合ドメイン融合タンパク質構築体(配列番号: )の間の結合能力の差を示す。Ramos細胞への結合はフローサイトメトリーを用いて測定した。データは、V11Sタンパク質のCD37+Ramos細胞への結合の有意な増加を示す。 図53は、COSにおけるG28−1野生型scFv Ig構築体と比較したG28−1 LV11S scFv Ig構築体(配列番号: )の発現の増大したレベルを示す。双方のイムノブロットゲルは、レーン1ないし4における本発明の精製されたG28−1 scFv Ig(SSS−S)H WCH2 WCH3構築体の量を定量した。第一のイムノブロットのレーン5ないし9は、各々、G28−1 scFv(SSS−S)H WCH2 WCH3でトランスフェクトされた5つの異なるクローンを表し、他方、第二のイムノブロットのレーン5ないし9は、G28−1 LV11S scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3でトランスフェクトされた5つの異なるクローンを表す。該イムノブロットは、LV11S形態が、G28−1 scFv Ig構築体を非常に高いレベルで発現させることを示す。 図54は、改変されたヒンジを持つ2H7 scFv Ig誘導体(配列番号: )の、フローサイトメトリーによる、CD20(CD20+CHO)を発現するCHO細胞への結合を示し、また、((SSS−S)、(CSS−S)、(SCS−S)および(CSC−S)ヒンジ領域を含めた)これらの改変された連結領域ヒンジ構築体がCD20に対して結合機能を保有することを示す。 図55は、Bjab標的に対する種々の構築体の抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性を媒介する能力を示す:(A)(CSS−S)、(SCS−S)、(CSC−S)、および(SSS−S)ヒンジを含む連結領域を含有する本発明の2H7 scFv Ig構築体(配列番号: )および(B)種々の連結領域およびテイル領域を持つ本発明の2H7 scFv 構築体(配列番号: )。パーセント特異的殺傷を、洗剤によって誘導された全殺傷と比較する。対照はエフェクターを付加した標的細胞、およびIgAヒンジ連結領域を持つ2H7構築体、およびPBMCエフェクターに結合しないIgA−由来テイル領域における天然の殺傷である。 図56は、Ramos細胞における補体活性を媒介する、種々のヒンジ領域(例えば、(CSC−S)、(SSS−S)、(SCS−S)、および(CSS−S))を有する連結領域を含む本発明の種々の2H7 scFv Ig構築体(配列番号: )の能力を示す。パーセント特異的殺傷を補体のみの対照に対して測定し、100%殺傷は細胞の洗剤への暴露によって測定された。 図57は、イミュノサイトフルオリメトリーを用いる、異なるテイル領域を含有する本発明の2H7 scFv Ig構築体(配列番号: )の、CD20+CHOへの結合を示す。異なるタンパク質は、抗−IgG、抗−IgA、および抗−IgEに結合したFITCを用いて検出した。 図58Aは、フローサイトメトリーによる、CD20+CHO細胞における、疎水性電荷誘導クロマトグラフィー(HCIC)を用いて精製され、かつ異なるpH4.0および3.5で溶出した2H7 VL11S scFv IgECH2CH3CH4(配列番号: )の結合を示し、これは、pH4.0または3.5で溶出したかを問わず、タンパク質がCD20に結合したことを示す。図58Bは、例えば、Bjab標的細胞においてADCCを媒介する、本発明のこれらの2H7 VH L11S scFv IgE構築体の能力を示すデータグラフである。 図59は、フローサイトメトリーによる、G28−1 VH L11S mIgECH2CH3CH4(配列番号: )の(A)BjabおよびRamos標的細胞への、および(B)CD20+CHO細胞への結合能力を示す。 図60は、本発明の種々のタンパク質構築体(A)2H7 scFv(SSS−S)H (P238S)CH2 WCH3(配列番号: )、(B)2H7 scFv(CSS−S)H WCH2 WCH3(配列番号: )、(C)2H7 scFv(SCS−S)H WCH2 WCH3(配列番号: )および(D)2H7 scFv(SSS−S)H WCH2 (Y407ACH3)(配列番号: )の高性能液体クロマトグラフィー(HPLC)プロフィールを示し、これは、構築体Aが100kDおよび75kDの見掛けの分子量形態を有し、および構築体B、CおよびDに見られるように、ある変化を導入することによって、圧倒的な75kD分子量形態が得られることを示す。 図61は、本発明の種々のタンパク質構築体(A)2H7 scFv(SSS−S)H WCH2 WCH3(配列番号: )、(B)2H7 scFv (CSC−S)H WCH2 WCH3(配列番号: )、(C)2H7 scFv (CCC−P)H WCH2 WCH3(配列番号: )および(D)2H7 scFv IgAH WCH2 WCH3(配列番号: )のHPLCプロフィールを示し、これは、構築体Aが100kDおよび75kDの見掛けの分子量形態を有し、構築体BおよびCで見られるように、ある変化を導入することによって、圧倒的な75kD分子量形態が得られ、他方、(IgAテイル領域(regaion)を有する)構築体Dが150kDの見掛けの分子量を有することを示す。実施例40参照。 図62は本発明の種々のタンパク質構築体(A)2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3(配列番号: )、(B)2H7 scFv (SCS−S)H WCH2 WCH3(配列番号: )、(C)2H7 scFv IgA 3TCH2 WCH3(配列番号: )および(D)2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 (F405A W407A)CH3(配列番号: )のHPLCプロフィールを示し、これは、構築体Aが100kDおよび75kDの見掛けの分子量を持つ2つの形態を有し、構築体Bが75kDの見掛けの分子量を持つ圧倒的形態を有し、他方、T4突然変異を持つ構築体Cが600kD近くの見掛けの分子量を持つ3つの形態に導き、およびCH3領域に二重点突然変異を持つ構築体Dが、44kD未満の見掛けの分子量を有する圧倒的形態に導くことを示す。ここに、T4突然変異とは、CH3領域からの4つのアミノ酸の切断をいう。実施例40参照。 図63は、フローサイトメトリーによる、CH3領域におけるF405AおよびY407A改変の有りおよび無しでの、2H7 V L11S scFv Ig構築体(配列番号: )による結合CD20+CH4細胞に対する効果を比較し、これは、この二重アミノ酸変化での結合能力の喪失を示す。実施例41参照。 図64は、フローサイトメトリーによる、FITC結合体化2H7 V L11S scFv Ig誘導体(配列番号: )のCH20+CHO細胞への結合能力を示し、これは、これらの構築体が、蛍光マーカーへ結合した場合に結合能力を失わないことを示す。実施例41参照。 図65は、本発明の種々の精製された2H7 V L11S scFv Ig構築体(配列番号: )の10μg(レーン当たり)を調べる非還元性SDS−PAGE分析を示し、これは、レーン1における標準分子量マーカーを参照とする各構築体についての見掛けの分子量を示す。実施例41参照。 図66は、4つの異なるヒトIgG領域、hIgG1、hIgG2、hIgG3、hIgG4、hIgG4、および1つのラット領域rIgG2bのCH2ドメイン配列を比較する。ADCCおよびCDCに影響する点突然変異は矢印をつける。実施例52参照。 図67は、CHOおよびLec13 CHO一過的トランスフェクト細胞においてADCCを媒介する種々の2H7 V L11S scFv Ig構築体(配列番号: )の能力を示し、これは、Lec 13 CHO細胞で発現された構築体が、正規のCHO細胞で発現された同一構築体よりも特異的殺傷の20%増大を有したことを示す。実施例42参照。 図68は、可溶性CD16(ED)(SSS−S)H P283S CH2 WCH3(配列番号: )の高および低親和性対立遺伝子の、還元および非還元双方での、SDS−PAGE分析を示す。実施例43参照。 図69は、2H7 VH L11S scFv (CSC−S) WCH2 WCH3(配列番号: )または2H7 V L11S scFv (SSS−S) WCH2 WCH3(配列番号: )への、高および低親和性CD16融合タンパク質(配列番号: )の異なる結合能力を示し、これは、P238S CH2構築体を用いる高および低親和性対立遺伝子結合の喪失を示す。実施例43参照。 図70は、(A)自己−会合を排除する、変異したテイルを持つFITC結合体化CD16細胞外ドメインIg融合タンパク質を用いてFcレセプター結合の変化を検出するのに用いるアッセイ、および(B)構築体の細胞表面発現を用いる哺乳動物提示システムのダイアグラムを示す。実施例44参照。 図71は、種々のmAbs(配列番号: )および本発明のscFvIg構築体(配列番号: )によるBjabおよびRamos細胞におけるアポトーシスの誘導を示す。実施例45参照。 図72は、カスパーゼ3の活性化によって媒介されるRamos細胞におけるアポトーシスを誘導する、2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3および2H7 scFv (SSS−S)H P238CH2 WCH3構築体の能力を示す。結果は、これらの条件下で、双方の構築体がCD20に結合し、アポトーシスを誘導することを示す。 図73は、CD20陽性Bjab標的細胞において、CDC活性を媒介する、2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3および2H7 scFv (SSS−S)H P238CH2 WCH3構築体の能力を示す。結果は、双方の構築体がCDCを媒介する能力を有したことを示す。 図74は、Bjab標的細胞においてADCCを媒介する、2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3および2H7 scFv (SSS−S)H P238CH2 WCH3構築体の能力を比較する。結果は、2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3構築体が非常に効果的であり、高レベルの特異的殺傷を誘導し、他方、2H7 scFv (SSS−S)H P238CH2 WCH3構築体はADCCを媒介するのに効果的でなかったことを示す。 図75は、CD20陽性CHO細胞において、可溶性CD16(高親和性および低親和性の形態)に結合する2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3および2H7 scFv (SSS−S)H P238CH2 WCH3構築体の能力を比較する。結果は、2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3がCD16(双方の形態)に結合でき、他方、2H7 scFv (SSS−S)H P238CH2 WCH3はCD16(いずれかの形態)に結合できなかったことを示す。 図76は、CD64陽性U937細胞に結合する2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3および2H7 scFv (SSS−S)H P238CH2 WCH3構築体の能力を比較する。結果は、双方の構築体がFcγRIに対して高い親和性を有し、およびP238S突然変異がFcγRIIIへの結合を選択的に低下させたことを示す。 図77は、B細胞枯渇に対する、2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3および2H7 scFv (SSS−S)H P238CH2 WCH3構築体の効果を測定するためのマカック属サルにおけるイン・ビボ実験を示す。構築体は1週間離して投与し、完全な血球算定および2色フローサイトメトリーを用いて−7、0、1、3、7、8、10、14、28および43日にB細胞を測定した。結果は、2H7 scFv (SSS−S)H WCH2 WCB3構築体が、B細胞の迅速かつ完全な枯渇をもたらし、これは第二の注射後28日まで継続したことを示す。逆に、2H7 scFv (SSS−S)H P238CH2 WCH3構築体が、最初の2週間においてB細胞の約50%へのゆっくりとした低下をもたらした;しかしながら、B細胞はこの後間もなく正規のレベルへ迅速に復帰を始めた。これは、CD16相互作用によって媒介されるADCCは迅速かつ持続するB細胞枯渇に必要らしいことを示唆する。 図78は、G28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3およびG28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3構築体のSECプロフィールを示す。SSSヒンジを持つ構築体はほぼ75ないし100Kdにおいて単一の均一なピークを生じ、SSCヒンジを持つ構築体はより小さな形態および他の異種形態を生じ、これは、200Kdよりも大きなものを含んでいた。 図79は、B細胞リンパ腫細胞:Bjab、Ramos、WIL−2、NamalwaおよびRajiにおける、G28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3およびG28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3構築体の結合能力を示す。(a)における結果は、G28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3がBjabおよびRamos細胞に結合し、WIL−2細胞に中程度に結合し、およびより低いレベルにおいてNamalwaおよびRaji細胞に結合したことを示す。(b)における結果は、G28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3がBjab細胞に結合し、RamosおよびWIL−2細胞へ中程度に結合し、およびより低いレベルにて、NamalwaおよびRaji細胞に結合したことを示す。 図80は、G28−1 VL11−S scFv (SSS)H WCH2 WCH3およびG28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3構築体と一晩インキュベートしたRamos細胞におけるアネキシンおよびヨウ化V−プロピジウム結合を示す。結果は、双方の構築体がアポトーシスを誘導し;しかしながら、(SSC)ヒンジを持つ構築体は(SSS)ヒンジを持つ構築体よりもよりアポトーシスを誘導したことを示す。 図81は、Ramos細胞の増殖を阻害するG28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3およびG28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3構築体の能力を示す。結果は、双方の構築体が増殖を阻害したことを示す。 図82は、単独、および異なる組合せにて、RamosB細胞においてアポトーシスを誘導するG28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3およびG28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3および2H7 scFv (CSS)H WCH2 WCH3構築体の能力を示す。この実験で示された結果は、双方のG28−1構築体が2H7構築体よりもより効果的であったことを示す。また、結果は、G28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3構築体がG28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WC3構築体よりも効果的であったことも示す。しかしながら、2H7およびG28−1構築体を組み合わせて用いた場合、アポトーシスの量は最大であった。 図83は、RamosB細胞においてCDSを媒介するG28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3、G28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3および2H7 scFv (CSS)H WCH2 WCH3構築体の能力を比較する。結果は、全ての構築体がCDCを媒介したことを示す。2H7構築体が最も効果的であり、続いて、G28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3、次いで、G28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3であった。 図84は、RamosB細胞においてADCCを媒介するG28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3、G28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3および2H7 scFv (CSS)H WCH2 WCH3の能力を比較する。結果は、G28−1 VL11S scFv (SSS)H WCH2 WCH3およびG28−1 VL11S scFv (SSC)H WCH2 WCH3構築体がADCCを媒介することができ、他方、2H7 scFv (CSS)H WCH2 WCH3構築体のADCCを媒介する能力はより低かったが、天然殺傷のレベルよりは依然として高かったことを示す。
(発明の詳細な説明)
本発明は、例えば、治療剤として有用な、ならびに診断および研究目的を含めた他の目的で有用な新規な分子に指向される。そのような分子は、例えば、抗原結合または他の結合機能および、例えば、1以上のエフェクター機能を有する。本発明は、免疫治療および免疫診断適用、および研究方法で有用であって、従来技術の抗原−特異的化合物およびポリペプチドよりも優れたある種の利点を供する、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質、および関連組成物および方法を含めた分子構築体を含む。本発明の融合タンパク質を含めた構築体は、好ましくは、関連部分において、以下の融合した、または他の方法で結合したドメインまたは領域:結合ドメインまたはポリペプチドのような結合領域構築体、例えば、天然または作成された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含めた連結領域構築体、および例えば、天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチドおよび天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなることができる構築体を含めたテイル領域構築体を含む単一ポリペプチド鎖である。遺伝子治療で特に有用なある具体例によると、本発明の融合タンパク質を含めた構築体は、さらに、天然または作成された原形質膜アンカードメインを含む。ある他の好ましい具体例によると、本発明の融合タンパク質を含めた構築体は、さらに、天然または作成された免疫グロブリン重鎖CH4定常領域ポリペプチドを有するテイル領域を含むことができる。特に好ましい具体例において、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体が含むポリペプチドドメインのような結合領域は、ヒト遺伝子配列の産物であるポリペプチドに由来するが、本発明はそれに限定されず、事実、遺伝子工学により作成された、および/または変異したポリペプチドを含めたいずれかの天然または人工源に由来する本明細書で提供される結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体に関することができる。
本発明は、部分的には、本明細書中に記載された結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた新規な構築体が免疫学的活性が可能であるという驚くべき観察に関する。さらに詳しくは、これらのタンパク質は、例えば、抗体依存性細胞媒介細胞傷害性(例えば、細胞表面への抗原結合に続いての、適当な条件下での、FcRγIIIを担うナチュラルキラー細胞のような適当なFcレセプターを担う細胞傷害性エフェクター細胞の従事および誘導)、および/またはそのようなエフェクター活性を促進でき、または本明細書中に記載したようなそのような活性の促進が予測されない構造を有するにもかかわらず、補体依存性細胞傷害性における補体固定(例えば、細胞表面への抗原結合に続いて、血液補体カスケードの成分である細胞溶解性タンパク質の動員および活性化)を含めたよく知られた免疫学的エフェクター活性に参画する能力を保有する。ADCCおよびCDCのレビューについては、例えば、Carter,2001 Nat.Rev.Canc. 1:118;Sulica et al.,2001 Int.Rev.Immunol.20:371;Maloney et al.,2002 Semin. Oncol. 29:2;Sondel et al.,2001 Hematol Oncol Clin North Am 15(4):703−21;Maloney 2001 Anticanc. Drugs 12 Suppl.2:1−4参照。代替経路による補体のIgA活性化は、例えば、Schneiderman et al.,1990 J.Immunol.145:233に記載されている。後にかなり詳細に記載するように、ADCC、補体固定、およびCDCは、例えば、免疫グロブリン重鎖領域を含み、かつ本明細書中に記載された構造を有する融合タンパク質を含めた構築体についての、特に、例えば、鎖内ホモダイマージスルフィド結合を形成するその能力が弱化した免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む免疫グロブリン融合タンパク質についての予測されない機能である。
本発明によって供されるもう1つの利点は、例えば、先行技術の単鎖抗体構築体でルーチン的に達成されるものよりも典型的には大きな実質的な量で生産できる本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドを含めた構築体である。好ましい具体例において、本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドを含めた構築体は哺乳動物または他の所望のかつ有用な発現系で組換えにより発現され、これは、(例えば、生理学的条件下で)イン・ビボで安定なポリペプチドを供する利点が提供される。非限定的理論によると、そのような安定性は、部分的には、翻訳後修飾、および特にグリコシル化に由来するのであろう。組換え哺乳動物発現を介する本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質構築体を含めた構築体の生産は、1リットル培養上澄み当たり50mgを超えるタンパク質のレベルにて静的細胞培養で達成され、好ましくは、静的培養条件下で少なくとも10ないし50mg/リットルが生産できるように、10ないし50mg/リットルにてそのような培養でルーチン的に観察された;また、「供給バッチ」(すなわち、非−静的)生産のような当該分野で認められたスケールアップ方法を用いる本発明のタンパク質構築体の全部または部分的な増強された生産も考えられ、ここに、特定のタンパク質産物に応じて、少なくとも5ないし500mg/l、ある場合には、少なくとも0.5ないし1gm/lの収率が得られる。
本発明による結合ドメインポリペプチドを含めた構築体は、例えば、同族生物学的分子、または1を超える分子の複合体、あるいは例えば、安定または一過性であるかを問わず、そのような分子の組立体または凝集体を特異的に認識し、それに結合する能力を保有するいずれかのポリペプチドであり得る。そのような分子はタンパク質、ポリペプチド、ペプチド、アミノ酸、またはその誘導体;脂質、脂肪酸など、またはその誘導体;炭水化物、糖など、またはその誘導体;核酸、ヌクレオチド、ヌクレオシド、プリン、ピリミジンまたは関連分子、またはその誘導体等;または例えば、糖タンパク質、糖ペプチド、糖脂質、リポタンパク質、プロテオ脂質のようなそのいずれかの組合せ;あるいは生物学的試料に存在し得るいずれかの他の生物学的分子を含む。生物学的試料は、例えば、被験体または生物学的源から血液試料、バイオプシー検体、組織エクスプラント、器官培養物、生物学的流体、またはいずれかの他の組織または細胞または他の調製物を得ることによって供することができる。被験体または生物学的源は、例えば、ヒトまたは非−ヒト動物、限定されるものではないが、染色体に組み込まれた、またはエピソーム組換え核酸配列を含むことができる遺伝子工学作成細胞系、不滅化されたまたは不滅化可能細胞系、体細胞ハイブリッド細胞系、分化したまたは分化可能な細胞系、形質転換細胞系などを含めた一次細胞培養または培養適合細胞系であり得る。本発明のある好ましい具体例において、被験体または生物学的源は悪性病、障害または疾患、またはB細胞障害を含めた病気、障害または疾患を有することが疑われる、またはその危険性があり得るものであり、あるさらなる具体例において、自己免疫疾患であり、本発明のある他の具体例においては、被験体または生物学的源はそのような病気、障害または疾患の危険性または存在がないことが知られているであろう。
結合ドメインポリペプチドを含めた結合領域は、例えば、本明細書中においては時々「抗原」という注目する標的構造である生物学的または他の分子のための、いずれかの天然に生じる、合成、半合成および/または組換えにより生じた結合パートナーであり得るが、本発明の開示に従うと、主題の発明、例えば、融合タンパク質をそれに結合または特異的に結合させるのが望ましいいずれの標的生物学的または他の分子も含めることを意図する。結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた本発明の構築体は、「免疫特異的」または所望の程度まで結合できると定義され、もしそれらが本明細書に供される抗原のような所望の標的分子に結合するならば、例えば、約10−1よりも大きなまたはそれと同等な、好ましくは約10−1よりも大きなまたはそれと同等な、より好ましくは約10−1よりも大きなまたはそれと同等な、なおより好ましくは約10−1よりも大きなまたはそれと同等なKaでの所望のレベルにおける特異的な結合を含む。約10−1、約10−1、約10−1、約1010−1と同等またはそれよりも大きな親和性のような、約10−1よりもさらに大きい親和性はなおより好ましい。本発明による結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の親和性は慣用的技術、例えば、Scatchard et al.,1949 Ann.N.Y.Acad.Sci.51:660によって記載されたものを用いて容易に測定することができる。注目する標的抗原に結合する融合タンパク質のそのような測定は、他のタンパク質またはポリペプチドと特異的に相互作用するタンパク質を同定しそれを得るための多数の公知の方法のいずれか、例えば、米国特許第5,283,173号および米国特許第5,468,614号に記載された酵母2−ハイブリッドスクリーニングシステム、または同等なものを用いて行うこともできる。
本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の好ましい具体例は、例えば、天然または作成された重鎖および/または天然または作成された軽鎖V−領域の全てまたは部分または断片のような、少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン可変領域ポリペプチドを含むことができる結合領域または結合ドメインを含み、但し、それは結合および選択性の所望のレベルにて注目する抗原または他の所望の標的構造に結合し、または特異的に結合することができるものとする。他の好ましい具体例において、結合領域または結合ドメインは単鎖免疫グロブリン−由来Fv産物、例えば、少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン軽鎖V−領域の全てまたは部分、および少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン重鎖V−領域の全てまたは部分を含むことができるscFv、およびV−領域に融合した、または他の方法で結合したリンカーを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなり;そのような構築体の調製およびテストは本明細書中により詳細に記載する。他の調製およびテスト方法は当該分野でよく知られている。
本明細書中に記載されているように、および当該分野で知られているように、免疫グロブリンは、そのメンバーが高度な配列保存を呈する遺伝子ファミリーメンバーの産物を含む。2以上の免疫グロブリンまたは免疫グロブリンドメインまたはその領域または部分(例えば、Vドメイン、Vドメイン、ヒンジ領域、CH2定常領域、CH3定常領域)のアミノ酸配列は整列させ、分析することができる。相互に対応する配列の部分は、例えば、配列相同性によって同定することができる。配列相同性の決定は、NCBIウェブサイト(http://www/ncbi.nlm.nih.gov/cgi−bin/BLAST)で入手可能な、AlignまたはBLASTアルゴリズム(Altschul,1991 J. Mol.Biol.219:555−565;Henikoff and Henikoff,1992 Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:10915−10919)のような、当業者に良く知られたコンピューターアルゴリズムを含めた、多数の配列整列および分析ツールで行うことができる。デフォルトパラメーターを用いることができる。
例えば、特定の免疫グロブリン参照配列の、および注目するいずれかの1以上のさらなる免疫グロブリン配列の部分は参照配列と比較することができる。「対応する」配列、領域、断片などは、Kabat,Sequences of Proteins of Immunological Interest (第5版 Bethesda,MD:Public Health Service,National Institutes of Health(1991))に従って免疫グロブリンアミノ酸の位置をナンバリングするための約束に基づいて同定することができる。例えば、この約束によると、注目する免疫グロブリンの配列が属する免疫グロブリンファミリーは、免疫グロブリンファミリーについての特定のナンバリングシステムを同定するための可変領域ポリペプチド配列不変アミノ酸残基の約束に基づいて決定され、次いで、注目する配列を整列させて、そのような配列を含む個々のアミノ酸に配列位置の番号を割り当てることができる。配列の少なくとも約1000、より好ましくは約700ないし950、より好ましくは約350ないし700、なおより好ましくは約100ないし350、なおより好ましくは約80ないし100、約70ないし80、約60ないし70、約50ないし60、約40ないし50、または約30ないし40連続アミノ酸の与えられたアミノ酸配列において好ましくは少なくとも約70%、より好ましくは少なくとも約80%ないし85%、または約86%ないし89%、なおより好ましくは少なくとも約90%、約92%、約94%、約96%、約98%または約99%のアミノ酸は、例えば、前記したもののような配列整列ツールを用いて公のデータベース(例えば、Genbank,SwissProtなど)から生じさせることができるように、Kabat(1991)によって開示されたもののような参照配列における、または関連する免疫グロブリン配列の同様な一覧表における対応する位置に位置するアミノ酸と同一である。ある好ましい具体例においては、注目する免疫グロブリン配列、またはその領域、部分、誘導体または断片は、対応する参照配列に対して約95%を超えて同一であり、ある好ましい具体例において、注目するそのような配列は、約1、2、3、4、5、6、7、8、9または10アミノ酸位置以下において対応する参照とは異なり得る。
例えば、ある具体例においては、本発明は、関連部分においては、例えば、マウスV−由来配列を含む配列番号: 中のアミノ酸位置9、10、11、12、108、110、111および112の1以上に対応する1つの位置または複数位置におけるアミノ酸において突然変異、改変または欠失を含むヒトまたは他の種の免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含む構築体に指向される。例えば、位置11を含めた比較的限定された数の免疫グロブリンV配列位置において、アミノ酸保存が、哺乳動物種列を横切って分析されたV配列の圧倒的に大部分に観察される(例えば、Leu11、Val37、Gly44、Leu45、Trp47;Nguyen et al.,1998 J.Mol.Biol 275:413)。種々のそのようなアミノ酸残基および、よって、それらの側鎖は可変ドメイン(V)の表面に位置する。それらはC1(例えば、Leu11)およびVドメイン(例えば、Val37、Gly44、Leu45、およびTrp47)の残基に接触し、軽鎖の不存在下では、当該タンパク質の安定性および可溶性に寄与し得る(例えば、Chothia et al.,1985 J.Mol.Biol.186:651;Muyldermans et al.,1994 Prot.Engineer.7:1129;Desmyter et al.,1996 Nat.Struct.Biol.3:803;Davies et al.,1994 FEBS Lett.339:285参照)。ある具体例において、例えば、本発明は、関連部分において、アミノ酸位置12、80、81、82、83、105、106、107および108の1以上に対応する1つの位置または複数位置のアミノ酸において突然変異、改変または欠失を含む、ヒト免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチド、またはもう1つの種からの免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドを含む結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体にも指向される。なお他のある具体例において、例えば、本発明は、関連部分において、(1)アミノ酸位置9、10、11、12、108、110、111、および112の1以上に対応する1つの位置または複数位置において突然変異、改変または欠失を有する当該重鎖配列を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる、ヒト免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチド、またはもう1つの種からの免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチド、および(2)アミノ酸位置12、80、81、82、83、105、106、107および108の1以上に対応する1つの位置または複数位置において突然変異、改変または欠失を有する当該軽鎖配列を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる、ヒト免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチド、またはもう1つの種からの免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドを含む、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体に指向される。
前記引用したもののような免疫グロブリン配列一覧表およびデータベースを参照して、もう1つの例として、例えば、相互に対する2以上の免疫グロブリン配列の関連性は、元の動物種、特定の免疫グロブリンのクラスおよびサブクラス(例えば、イソタイプ)、または免疫グロブリン領域ポリペプチド配列の同定を可能とするような方法で、容易かつ過度な実験無くして確立することができる。天然または作成されたVおよび/またはVおよび/または単鎖可変領域(sFv)配列、または他の天然または作成されたV領域−由来配列などを含めたいずれかの免疫グロブリン可変領域ポリペプチド配列を結合領域または結合ドメインとして用いることができる。作成された配列は、例えば、重鎖可変領域配列またはscFvにおけるアミノ酸位置9、10、11、12、108、110、111および112の1以上に対応する1つの位置または複数位置のアミノ酸において突然変異、改変または欠失、および/または軽鎖可変領域配列またはscFvにおけるアミノ酸位置12、80、81、82、83、105、106、107および108の1以上に対応する1つの位置または複数位置において突然変異、改変または欠失を含む、例えば、いずれかの種、好ましくはヒトまたはマウスからの免疫グロブリン配列を含む。
種々の好ましい具体例は、例えば、トランスジェニック動物を含めた、ヒトまたはヒト化抗体またはモノクローナル抗体も含めた、マウスまたは他のげっ歯類抗体、またはヤギ、ウサギ、ウマ、ウシ、ラクダまたは他の種のような他の源に由来する抗体またはモノクローナル抗体のようなモノクローナル抗体を含めた抗体に由来する天然または作成された免疫グロブリンV領域ポリペプチド配列を含む。非限定的例は、本明細書中に参照したおよび/または以下の実施例でより詳細に記載するもの、例えば、CD20−結合または特異的マウスモノクローナル抗体(例えば、2H7)、1F5抗体ではない他のCD20−結合または特異的マウスモノクローナル抗体、モノクローナル抗体L6(ハイブリドーマHB8677として、American Type Culture Collection, Manassas,VAから入手可能な、炭水化物−規定エピトープに特異的)、およびCD28(例えば、モノクローナル抗体2E12)、CD40、CD80、CD137(例えば、CD137、41BBのマウスホモログを認識するモノクローナル抗体5B9またはモノクローナル抗体1D8)、およびCD152(CTLA−4)に結合し、それに対して特異的なモノクローナル抗体のようなモノクローナル抗体に由来する可変領域ポリペプチド配列を含む。
結合ドメインポリペプチドを含めた他の結合領域は、非−免疫グロブリンを含めた、本明細書中に提供される抗原に結合し、または特異的に結合する能力を保有するいずれかのタンパク質またはタンパク質部分を含むことができる。従って、本発明では、ホルモン、サイトカイン、ケモカインなど;そのようなポリペプチドリガンドに対する細胞表面または可溶性レセプター;レクチン;特異的白血球インテグリン、セレクチン、免疫グロブリン遺伝子スーパーファミリーメンバー、細胞間接着分子(ICAM−1、−2、−3)等;組織適合性抗原などのようなポリペプチドリガンドに由来する結合領域または結合ドメインポリペプチドを含む、融合タンパク質を含めた構築体が考えられる。
結合領域の調製で、または結合領域として有用な、あるいは結合ドメインポリペプチドを供することができる、かつ例えば、本発明の結合ドメイン−Ig融合タンパク質を含めた構築体が望ましくはそれに結合する標的分子または抗原として選択することもできる細胞表面レセプターの例は以下のもの等を含む:HER1(例えば、GenBank受託番号U48722,SEG HEGFREXS,KO3193)、HER2(Yoshino et al.,1994 J. Immunol.152:2393;Disis et al.,1994 Canc.Res.54:16;また、例えば、GenBank受託番号K03363,M17730,SEG HUMHER20参照)、HER3(例えば、GenBank受託番号U29339,M34309)、HER4(Plowman et al.,1993 Nature 366:473;また、例えば、GenBank受託番号L07868,T64105参照)、表皮成長因子レセプター(EGFR)(例えば、GenBank受託番号U48722,SEG HEGFREXS,KO3193)、血管内皮細胞増殖因子(例えば、GenBank受託番号M32977)、血管内皮細胞成長因子レセプター(VEGF)(例えば、GenBank受託番号AF022375,1680143,U48801,X62568)、インスリン−様成長因子−I(例えば、GenBank受託番号X00173,X56774,X56773,X06043,また、欧州特許GB2241703参照)、インスリン−様成長因子−II(例えば、GenBank受託番号X03562,X00910,SEG HUMGFIA,SEG HUMGFI2,M17863,M17862)、トランスフェリンレセプター(Trowbridge and Omary,1981 Proc.Nat.Acad.USA 78:3039;また、例えば、GenBank受託番号X01060,M11507参照)、エストロゲンレセプター(例えば、GenBank受託番号M38651,X03635,X99101,U47678,M12674)、プロゲステロンレセプター(例えば、GenBank受託番号X51730,X69068,M15716)、卵胞刺激ホルモンレセプター(FSH−R)(例えば、GenBank受託番号Z34260,M65085)、レチノイン酸レセプター(例えば、GenBank受託番号L12060,M60909,X77664,X57280,X07282,X06538)、MUC−1(Barnes et al.,1989 Proc.Nat.Acad.Sci.USA 86:7159;また、例えば、GenBank受託番号SEG MUSMUCIO,M65132,M64928参照)、NY−ESO−1(例えば、GenBank受託番号AJ003149,U87459)、NA 17−A(例えば、欧州特許番号WO 96/40039)、Melan−A/MART−1(Kawakami et al.,1994 Proc.Nat.Acad.Sci. USA 91:3515;また、例えば、GenBank受託番号U06654,U06452参照)、チロシナーゼ(Topalian et al.,1994 Proc.Nat.Acad.Sci. USA 91:9461;また、例えば、GenBank受託番号M26729 SEG HUMTYR0参照、また、Weber et al.,J.Clin.Invest(1998) 102:1258参照)、Gp−100(Kawakami et al.,1994 Proc.Nat.Acad.Sci.USA 91:3515;また、例えば、GenBank受託番号S73003参照、また、欧州特許EP668350;Adema et al.,1994 J.Biol.Chem.269:20126参照)、MAGE(van den Bruggen et al.,1991 Science 254:1643;また、例えば、GenBank受託番号U93163,AF064589,U66083,D32077,D32076,D32075,U10694,U10693,U10691,U10690,U10689,U10688,U10687,U10686,U10685,L18877,U10340,U10339,L18920,U03735,M77481参照)、BAGE(例えば、GenBank受託番号U19180;また、米国特許第5,683,886号および第5,571,711号参照)、GAGE(例えば、GenBank受託番号AF055475,AF055474,AF055473,U19147,U19146,U19145,U19144,U19143,U19142)、SSX2遺伝子によってコードされた特にHOM−MEL−40抗原を含めたレセプターのCTAクラスのいずれか(例えば、GenBank受託番号X86175,U90842,U90841,X86174)、癌胎児性抗原(CEA,Gold and Freedman,1985 J.Exp.Med.121:439;また、例えば、GenBank受託番号SEG HUMCEA,M59710,M59255,M29540参照)、およびPyLt(例えば、GenBank受託番号J02289,J02038)。
結合領域または結合ドメインポリペプチドまたはその部分の源となり得る、あるいは標的抗原を含めた標的となり得るさらなる細胞表面レセプターは以下のものなどを含む:CD2(例えば、GenBank受託番号Y00023,SEG HUMCD2,M16336,M16445,SEG MUSCD2,M14362)、4−1BB(CDw137,Kwon et al.,1989 Proc.Nat.Acad.Sci.USA 86:1963)、4−1BBリガンド(Goodwin et al.,1993 Eur.J.Immunol. 23:2361;Melero et al.,1998 Eur.J.Immunol. 3:116)、CD5(例えば、GenBank受託番号X78985,X89405)、CD10(例えば、GenBank受託番号M81591,X76732)、CD27(例えば、GenBank受託番号M63928,L24495,L08096)、CD28(June et al.,1990 Immunol.Today 11:211;また、例えば、GenBank受託番号J02988,SEG HUMCD28,M34563参照)、CD152/CTLA−4(例えば、GenBank受託番号L15006,X05719,SEG HUMIGCTL)、CD40(例えば、GenBank受託番号M83312,SEG MUSC040A0,Y10507,X67878,X96710,U15637,L07414)、インターフェロン−γ(IFN−γ;例えば、Farrar et al. 1993 Ann.Rev.Immunol. 11:571およびそこに引用された文献,Gray et al. 1982 Nature 295:503,Rinderknecht et
al. 1984 J.Biol.Chem.259:6790,DeGrado et al.1982 Nature 300:379)、インターロイキン−4(IL−4;例えば、53rd Forum in Immunology,1993 Research in Immunol. 144:553−643;Banchereau et al.,1994 in The Cytokine Handbook,第2版,A.Thomson編,Academic Press,NY,p.99;Keegan et al.,1994 J Leukocyt.Biol.55:272、およびそこに引用された文献参照)、インターロイキン−17(IL−17)(例えば、GenBank受託番号U32659,U43088)およびインターロイキン−17レセプター(IL−17R)(例えば、GenBank受託番号U31993,U58917)。前記にかかわらず、本発明は米国特許第5,807,734号または米国特許第5,795,572号に開示されたいずれの免疫グロブリン融合タンパク質も明示的に含まない。
結合領域または結合ドメインポリペプチドまたはその部分の源であり得る、あるいは標的抗原または結合部位を含めた標的として機能することができるさらなる細胞表面レセプターは以下のものなどを含む:CD59(例えば、GenBank受託番号SEG HUMCD590,M95708,M34671)、CD48(例えば、GenBank受託番号M59904)、CD58/LFA−3(例えば、GenBank受託番号A25933,Y00636,E12817;また、JP1997075090−A参照)、CD72(例えば、GenBank受託番号AA311036,S40777,L35772)、CD70(例えば、GenBank受託番号Y13636,S69339)、CD80/B7.1(Freeman et al.,1989 J.Immunol.43:2714;Freeman et al.,1991 J.Exp.Med.174:625;また、例えば、GenBank受託番号U33208,I683379参照)、CD86/B7.2(Freeman et al.,1993 J.Exp.Med.178:2185,Boriello et al.,1995 J.Immunol.155:5490;また、例えば、GenBank受託番号AF099105,SEG MMB72G,U39466,U04343,SEG HSB725,L25606,L25259参照)、B7−H1/B7−DC(例えば、GenBank受託番号NM 014143,AF177937,AF317088;Dong et al.,2002 Nat.Med.Jun 24[epub ahead of print],PMID 12091876;Tseng et al.,2001 J.Exp.Med.193:839;Tamura et al.,2001 Blood 97:1809;Dong et al.,1999 Nat.Med.5:1365)、CD40リガンド(例えば、GenBank受託番号SEG HUMCD40L,X67878,X65453,L07414)、IL−17(例えば、GenBank受託番号U32659,U43088)、CD43(例えば、GenBank受託番号X52075,J04536)、ICOS(例えば、GenBank受託番号AH011568)、CD3(例えば、GenBank受託番号NM 000073(ガンマサブユニット)、NM 000733(イプシロンサブユニット),X73617(デルタサブユニット))、CD4(例えば、GenBank受託番号NM 000616)、CD25(例えば、GenBank受託番号NM 000417)、CD8(例えば、GenBank受託番号M12828)、CD11b(例えば、GenBank受託番号J03925)、CD14(例えば、GenBank受託番号XM 039364)、CD56(例えば、GenBank受託番号U63041)、CD69(例えば、GenBank受託番号NM 001781)およびVLA−4(αβ)(例えば、GenBank受託番号L12002,X16983,L20788,U97031,L24913,M68892,M95632)。以下の細胞表面レセプターは、典型的には、B細胞に関連する:CD19(例えば、GenBank受託番号SEG HUMCD19W0,M84371,SEG MUSCD19W,M62542)、CD20(例えば、GenBank受託番号SEG HUMCD20,M62541)、CD22(例えば、GenBank受託番号I680629,Y10210,X59350,U62631,X52782,L16928)、CD30(例えば、GenBank受託番号M83554,D86042)、CD153(CD30リガンド,例えば、GenBank受託番号L09753,M83554)、CD37(例えば、GenBank受託番号SEG NMCD37X,X14046,X53517)、CD50(ICAM−3,例えば、GenBank受託番号NM 002162)、CD106(VCAM−1)(例えば、GenBank受託番号X53051,X67783,SEG MMVCAM1C,また米国特許第5,596,096号参照)、CD54(ICAM−1)(例えば、GenBank受託番号X84737,S82847,X06990,J03132,SEG MUSICAM0)、インターロイキン−12(例えば、Reiter et al.,1993 Crit.Rev.Immunol.13:1、およびそこに引用された文献参照)、CD134(OX40,例えばGenBank受託番号AJ277151)、CD137(41BB,例えばGenBank受託番号L12964,NM 001561)、CD83(例えば、GenBank受託番号AF001036,AL021918)、DEC−205(例えば、GenBank受託番号AF011333,U19271)。
本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体は、例えば、ある特に好ましい具体例によると、免疫エフェクター細胞上に存在する少なくとも1つの標的、例えば、標的抗原または他の結合部位に結合し、または特異的に結合できる結合ドメインポリペプチドのような結合ドメインを含む。非限定的理論によると、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めたそのような構築体は、有利には、治療的意味において所望の免疫エフェクター細胞の機能を動員でき、ここに、異なる特殊化された免疫機能を有する免疫エフェクター細胞が同定でき、または結合ドメインポリペプチドを含めた本発明の構築体がそれに特異的に結合することができる本明細書中に記載した抗原の多くを含めた、広く種々の細胞表面抗原のその異なる発現に基づいて相互に区別できるのが良く知られている。本明細書中に記載したように、免疫エフェクター細胞はそのような能力を天然でまたは遺伝子工学の結果として有する細胞を含めた、免疫系機能の成分である活性を直接的に媒介できるいずれの細胞も含む。
ある具体例において、免疫エフェクター細胞は、免疫グロブリン定常領域のためのレセプターのような、および「Fcレセプター」(「FcR」)と通常はいわれるレセプターのクラスを含めた、免疫グロブリンまたは他のペプチド結合分子に対する細胞表面レセプターを含む。多数のFcRが構造的におよび/または機能的に特徴付けられており、当該分野でよく知られており、免疫グロブリン重鎖イソタイプの制限されたサブセットと相互作用する特異的能力を有する、または種々の親和性でもってFcドメインと相互作用する、および/またはある条件下で免疫エフェクター細胞の制限されたサブセットで発現できるFcRを含む(例えば、Kijimoto−Ochichai et al.,2002 Cell Mol.Life Sci.59:648;Davis et al.,2002 Curr.Top.Microbiol.Immunol.266:85;Pawankar,2001 Curr.Opin.Allerg.Clin.Immunol.1:3;Rabaev et al.,2002 Mol.Immunol.38:1073;Wurzburg et al.,2002 Mol.Immunol.38:1063;Sulica et al.,2001 Int.Rev.Immunol.20:371;Underhill et al.,2002 Ann.Rev.Immunol.20:825;Coggeshall,2002 Curr.Dir.Autoimm.5:1;Mimura et al.,2001 Adv.Exp.Med.Biol.495:49;Baumann et al.,2001 Adv.Exp.Med.Biol.495:219;Santoso et al.,2001 Ital.Heart J.2:811;Novak et al.,2001 Curr.Opin.Immunol.13:721;Fossati et al.,2001
Eur.J.Clin.Invest.31:821)。
ADCCを媒介することができる細胞は、本発明による免疫エフェクター細胞の好ましい例である。他の好ましい例はナチュラルキラー細胞、腫瘍−浸潤Tリンパ球(TIL)、細胞傷害性Tリンパ球、およびアレルギー反応メカニズムを含む細胞のような顆粒球を含む。かくして、免疫エフェクター細胞は、限定されるものではないが、Tリンパ球、Bリンパ球、NK細胞、単球、マクロファージ、樹状細胞、好中球、好塩基球、好酸球、肥満細胞、血小板、赤血球、および前駆体、先祖(例えば、造血幹細胞)、ならびにそのような細胞の休止、活性化された成熟形態のような、骨髄系およびリンパ系内の種々の段階における、機能的細胞表面FcRの1以上のタイプを発現することができる(がその必要はない)細胞を含めた造血系起源の細胞を含む。他の免疫エフェクター細胞は、免疫機能を媒介することができる非−造血系起源の細胞、例えば、内皮細胞、ケラチノサイト、線維芽細胞、破骨細胞、上皮細胞、その他の細胞を含むことができる。また、免疫エフェクター細胞は、細胞傷害性または細胞増殖抑制性事象、エンドサイトーシス、貪食作用、または飲作用事象を媒介する、あるいはアポトーシスの誘導を行う、あるいは微生物免疫または微生物感染の中和を行う細胞、またはアレルギー、炎症、過敏および/または自己免疫反応を媒介する細胞も含むことができる。
アレルギー応答メカニズムは当該分野でよく知られており、免疫グロブリン(例えば、IgE)、ならびにアレルゲン−免疫グロブリン(例えば、IgE)遭遇に対する結果を含む細胞およびメディエーターのような抗原(例えば、アレルゲン)−特異的成分を含む(例えば、Ott et al.,2000 J.Allerg.Clin.Immunol.106:429;Barnes,2000 J.Allerg.Clin.Immunol.106:5;Togias,2000 J.Allerg.Clin.Immunol.105:S599;Akdis et al.,2000 Int.Arch.Allerg.Immunol.121:261;Beach,2000 Occup.Med.15:455)。FcRと相互作用する本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体に特に関しては、本発明のある具体例では、例えば、IgE−特異的FcRまたはその部分を含むアレルギー応答メカニズムを誘導することができるものを含めた、1以上のIgE−由来ドメインを含む融合タンパク質を含めた構築体が考えられ、そのIgE−特異的FcRは前記した、および引用した論文で記載されまたは同定されたものを含む。特定の理論またはメカニズムに拘束されるつもりはなく、かつ本明細書中に開示したごとく、本発明の融合タンパク質を含めた構築体は、細胞表面タンパク質(例えば、原形質膜アンカードメインを持つ)として、または可溶性の、または他の方法で細胞に結合していないタンパク質(例えば、原形質膜アンカードメインを持たない)として供されるかまたは発現されるかを問わず、IgE重鎖Fcドメインポリペプチドの部分、例えば、天然または作成されたIgE CH3およびCH4ドメインを含むことができる。さらに、非限定的理論によると、アレルギー応答メカニズム(例えば、FcR−イプシロンを発現する免疫エフェクター細胞)の動員および誘導は、本明細書中に記載されたIgE Fcドメインまたはその部分(例えば、FcR架橋によってアレルギーメカニズムをトリガーすることができるもの)の存在、および結合領域、例えば、結合ドメインがそれに結合し、または特異的に結合する抗原のような標的の存在のいずれかまたは双方の結果として進行することができる。本発明は、従って、本明細書中に記載した、または引用したものを含めた、悪性疾患またはB細胞障害の治療のような、前記の認識されていない意味でアレルギー応答メカニズムの誘導を開発する。
免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、人工ペプチドとして、または遺伝子工学の結果として天然に生じる、および例えば、CH1およびCH2領域において鎖内免疫グロブリン−ドメインジスルフィド結合を形成することを担うアミノ酸残基の間の免疫グロブリン重鎖ポリペプチドに位置するいずれのヒンジペプチドまたはポリペプチドも含む。本発明で用いられるヒンジ領域ポリペプチドは、変異した、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチドも含むことができる。従って、例えば、免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、本明細書中に記載したものを含めた、ヒンジ機能を有するものと古典的には見なされる免疫グロブリンポリペプチド鎖領域の部分または断片(すなわち、ペプチド結合における1以上のアミノ酸、典型的には15ないし115アミノ酸、好ましくは約95ないし110、約80ないし94、約60ないし80、または約5ないし65アミノ酸、好ましくは約10ないし50、より好ましくは約15ないし35、なおより好ましくは約18ないし32、なおより好ましくは約20ないし30、なおより好ましくは約21、22、23、24、25、26、27、28または29アミノ酸)に由来することができ、またはそれであり得るが、本発明で用いられるヒンジ領域ポリペプチドはそのように制限される必要はなく、IgG、IgAおよびIgDの場合に、(またはIgEの場合のCH1ドメインおよび/またはCH3ドメインのような隣接免疫グロブリンドメインにおける)、またはある人工的に作成された免疫グロブリン構築体、免疫グロブリン可変領域ドメインの場合に、CH1ドメインおよび/またはCH2ドメインのような隣接免疫グロブリンドメインにおいて(当該分野で知られたように、変化し得る特定のドメインに特定の残基を割り当てる構造的基準に従って)位置する1以上のアミノ酸を含むことができる。
野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、免疫グロブリン、例えば、ヒト免疫グロブリンの定常領域ドメインCH1およびCH2の間(またはIgEのような免疫グロブリンのあるタイプのCH1およびCH3領域の間)に位置するいずれかの公知の、または後に発見された天然に生じるヒンジ領域を含む。1つのタイプの連結領域を構築する使用では、野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、好ましくは、ヒトIgG、IgAまたはIgD免疫グロブリンからのヒンジ領域(またはIgE免疫グロブリンのCH2領域)、より好ましくは、例えば、本明細書中に記載された野生型または変異したヒトIgG1イソタイプからのヒンジ領域ポリペプチドを含むヒト免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドである。
当該分野で知られたように、免疫グロブリンアミノ酸配列における途方もない全多様性にかかわらず、免疫グロブリンの一次構造は、そのスルフヒドリル基によって、他の利用可能なスルフヒドリル基とでのジスルフィド結合形成に対する能力を供するシステイン残基の出現に顕著に関連して、免疫グロブリンポリペプチド鎖の特別な部分において高度な配列保存を呈する。従って、本発明の意味において、連結領域として用いられる野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、(例えば、統計学的に有意な手法で集団において支配的な)1以上の高度に保存されたシステイン残基を特徴とするものを含み、ある好ましい具体例においては、連結領域は、IgG1およびIgG4ヒンジ領域の場合に天然に生じるシステインの数、例えば、0または1または2のシステイン残基未満を含有し、そのような野生型ヒンジ領域配列から(またはそれを用いて)由来する、または構築されるように選択できる変異したヒンジ領域ポリペプチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなることができる。
連結領域がヒンジ領域ポリペプチドであって、ヒンジ領域ポリペプチドは、野生型ヒンジ領域配列から(またはそれを用いて)由来する、または構築された、変異した、作成された、または他の方法で改変されたヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドであるある好ましい具体例において、野生型ヒトIgG1ヒンジ領域ポリペプチド配列は、ポリペプチドN−末端からのヒンジ領域配列に沿ってC−末端に向かって進行する、各々、野生型ヒンジ領域の第一のシステイン、野生型ヒンジ領域の第二のシステイン、および野生型ヒンジ領域の第三のシステインと呼ばれる3つの非−隣接システイン残基を含むことに注意されたし。これは、本明細書中においては、「CCC」ヒンジ(または「WTH」、すなわち、野生型ヒンジ)ということができる。変異した、または作成されたヒンジ領域の例は、本明細書中においては「XXX」ヒンジということができるシステインを持たないもの(または、例えば、天然に生じるシステイン残基の代わりに3つのセリン残基を持つ突然変異体ヒンジという例えば、「MH−SSS」のような、天然に生じるシステインの代わりに3つのアミノ酸または他の分子を持つ突然変異体または作成されたヒンジという「MH−XXX」)を含む。用語「突然変異体」とは、天然に生じる残基の位置において異なる1つの分子または複数分子が存在するあるいは分子がないという事実のみをいい、そのような置換、改変、または欠失が行われたいずれかの特定の方法を言わないことは理解されるであろう。従って、本発明のある具体例においては、連結領域はヒンジ領域ポリペプチドであってよく、ヒンジ領域ポリペプチドは、2つのシステイン残基を含み、ここに、野生型ヒンジ領域の第一のシステインは、例えば、変化または欠失されていない、変異したヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域である。これは、「MH−CXX」ヒンジ、例えば、「MH−CSC」ということができ、その場合、システイン残基はセリン残基で置き換えられている。本発明のある他の具体例において、変異したヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは1以下のシステイン残基を含み、例えば、「MH−CSS」ヒンジまたは「MH−SSC」ヒンジまたは「MH−CSC」ヒンジを含み、ある他の具体例においては、変異したヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、「MH−SSS」ヒンジのようなシステイン残基を含まない。
本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体では、米国特許第5,892,019号に開示されたいずれの融合タンパク質も明示的には考えられない。米国特許第5,892,019号は、第一のIgG1ヒンジ領域システイン残基が変化し、または欠失されているが、野生型IgG1ヒンジ領域配列の第二および第三のシステインに対応する第二および第三双方のIgG1ヒンジ領域システイン残基を保有するヒトIgG1ヒンジ領域に言及している。該特許は、野生型IgG1ヒンジ領域の第一のシステイン残基が、そこに記載されたポリペプチドのダイマーへの適切な組み立てで、第一のシステイン残基による干渉を妨げるように置き換えられると述べている。該特許は、IgG1ヒンジ領域の第二および第三のシステインが、2つの重鎖定常領域の間に鎖間ジスルフィド結合を供して、当該分子がADCCを媒介する能力のようなエフェクター機能を有するようにダイマー形成を促進するように保持されることを要求している。
対照的に、かつ本明細書中に記載したように、その種々のものが、例えば、ADCC、CDCおよび/または補体固定が可能である本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体はそのように限定されず、関連部分において、例えば、(i)野生型ヒト免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、例えば、ヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドのような野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、(ii)変異した、または他の方法で改変されたヒト免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、例えば、3以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドまたは核酸配列であるか、またはそれから(またはそれを用いて)由来し、または構築された、変異した、または他の方法で改変されたヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドのような変異した、または他の方法で改変された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド(ここに、該変異した、または他の方法で改変したヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは2つのシステイン残基を含み、およびここに、野生型ヒンジ領域の最初のシステインは変異したり欠失したりしておらず)、(iii)変異した、または他の方法で改変されたヒト免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、例えば、3以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドまたは核酸配列であり、またはそれから(またはそれを用いて)由来し、または構築された、変異した、または他の方法で改変されたヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドのような変異した、または他の方法で改変された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド(ここに、該変異した、または他の方法で改変されたヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドは1以下のシステイン残基を含み)、または(iv)変異した、または他の方法で改変されたヒト免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド、例えば、3以上のシステイン残基を有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドまたは核酸配列である、またはそれから(またはそれを用いて)由来し、または構築された、変異した、または他の方法で改変されたヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドのような変異した、または他の方法で改変された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド(ここに、(例えば、アミノ酸変化または欠失による)変異した、または他の方法で改変されたヒトIgG1免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドはシステイン残基を含まない)を含むことができる。本発明は、IgG1ヒンジ領域鎖間ジスルフィド結合を介して二量体化する能力がIgG1ヒンジ領域の第一のシステインが、例えば、変異したりまたは他の方法で改変または欠失していない構築体においてさえ、1、2または3のヒンジ領域システイン残基の除去または置換によってなくなり、または弱くなるにもかかわらず、ADCCおよび/またはCDCおよび/または補体固定を媒介する能力の本明細書中に記載された融合タンパク質を含めた構築体によって、滞留に関連する予期せぬ利点を供する。
連結領域は、テイル領域、例えば、CH2およびCH3ドメイン(またはIgE CH3およびCH4ドメイン)を含む、または実質的にそれよりなり、またはそれよりなるテイル領域のそれとは異なる、免疫グロブリンイソタイプまたはクラス、または免疫グロブリンサブクラスの、種の免疫グロブリンにその起源を有するヒンジ領域をそれ自体が含むことができる、変異した、または他の方法で改変された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含むことができる。例えば、本発明のある具体例においては、構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、野生型ヒトIgAヒンジ領域ポリペプチド、または本明細書中に記載したような、0または1以上に過ぎないシステイン残基(野生型のシステインの数未満)を含む変異した、または他の方法で改変されたヒトIgAヒンジ領域ポリペプチドまたはIgG1ヒンジのような野生型ヒトIgGヒンジ領域ポリペプチド、または野生型ヒトIgEヒンジ−作用領域、すなわち、IgE CH2領域ポリペプチド、または0、1または2のシステイン残基を含む、または含むように突然変異し、または他の方法で改変されたIgG1ヒンジのような変異した、または他の方法で改変されたIgGヒンジ領域ポリペプチドを含む、または実質的にそれよりなる、またはそれよりなる免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチドのような結合領域を含むことができ、ここに、野生型ヒンジ領域の第一のシステインは、やはり本明細書中に記載したように、変異したりまたは改変されたり欠失したりしていない。そのようなヒンジ領域ポリペプチドは、例えば、異なるIgイソタイプまたはクラス、例えば、IgAまたはIgDまたはIgGサブクラス(またはIgEサブクラスからのCH3領域)(ある好ましい具体例においては、IgG1またはIgAまたはIgEサブクラスであり、ある他の好ましい具体例においては、IgG2、IgG3またはIgG4サブクラスのいずれか1つであり得る)からの免疫グロブリン重鎖CH2領域ポリペプチドを含む、または実質的にそれよりなる、またはそれよりなるテイルに融合し、または他の方法で結合することができる。
例えば、本明細書中でより詳細に記載されるように、本発明のある具体例においては、連結領域は、天然では3つのシステインを含む野生型ヒトIgAヒンジ領域である、またはそれに由来する免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドとなるように選択することができ、ここに、選択されたヒンジ領域ポリペプチドは、システイン残基の1または2のみが残る(例えば、配列番号:35ないし36)ように、完全なおよび/または天然に生じるヒンジ領域に対して切断され、または他の方法で改変され、または置換されている。同様に、本発明のある他の具体例においては、構築体は、システイン残基の数がアミノ酸置換または欠失によって減少した変異したまたは他の方法で改変したヒンジ領域ポリペプチド、例えば、本明細書中に記載されたように0、1または2のシステイン残基を含有する変異した、または他の方法で改変したIgG1ヒンジ領域、または0のシステイン残基を含有するIgDヒンジ領域を含む免疫グロブリンヒンジ領域にポリペプチドに融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチドを含む結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質であり得る。
変異した、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチドは、かくして、1以上のシステイン残基を含む野生型免疫グロブリンヒンジ領域から(またはそれを用いて)由来し、または構築することができる。ある具体例においては、変異した、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチドは0、または1つのみのシステイン残基を含有することができ、ここに、該変異した、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチドは、各々、1以上、または2以上のシステイン残基を含有する野生型免疫グロブリンヒンジ領域であるか、またはそれに由来する。該変異した、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチドにおいて、野生型免疫グロブリンヒンジ領域のシステイン残基は、好ましくは欠失されているか、あるいはジスルフィド結合を形成することができないアミノ酸で置換されている。本発明の1つの具体例において、変異した、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチドは、4つのヒトIgGイソタイプサブクラス、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4のいずれかを含むことができるヒトIgG野生型ヒンジ領域ポリペプチドであるか、またはそれに由来する。ある好ましい具体例において、該変異した、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチドは、ヒトIgAまたはIgD野生型ヒンジ領域ポリペプチドであるか、またはそれから(またはそれを用いて)由来する。その例として、ヒトIgG1またはIgA野生型ヒンジ領域ポリペプチドであるか、またはそれに由来する変異した、または他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチドは、野生型免疫グロブリンヒンジ領域における3つのシステイン残基の2つでの突然変異、改変または欠失、または全ての3つのシステイン残基での突然変異、改変または欠失を含むことができる。
本発明の特に好ましい具体例による、野生型免疫グロブリンヒンジ領域に存在し、および突然変異誘発またはいずれかの他の技術によって除去されるか、または改変されたシステイン残基は、鎖間ジスルフィド架橋を形成する、またはそれを形成することができるシステイン残基を含む。特定の理論または作用メカニズムに拘束されるつもりはないが、本発明では、鎖間ジスルフィド結合の形成に関与すると信じられている、そのようなヒンジ領域システイン残基の突然変異、欠失または他の改変は、驚くべきことに、ADCCおよび/またはCDCを促進し、および/または補体を固定する融合タンパク質または他の構築体の能力を無くすることなく、または該能力を望ましくなく弱めることなく、鎖間ジスルフィド結合形成を介して二量体化する(またはより高次のオリゴマーを形成する)主題の本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の能力を低下させると考えられる。特に、ADCCを媒介するFcレセプター(例えば、FcRIII、CD16)は免疫グロブリンFcドメインに対する低い親和性を呈し、これは、FcRへのFcの機能的結合が、慣用的抗体における重鎖のダイマー構造によるFc−FvR複合体の親和力安定性、および/または慣用的抗体Fc構造によるFcR凝集および架橋を必要とする言う考えを支持する。Sonderman et al.,2000 Nature 406:267;Radaev et al.,2001 J.Biol.Chem.276:16469;Radaev et al.,2001 J.Biol.Chem.276:16478;Koolwijk et al.,1989 J. Immunol.143:1656;Kato et al.,2000 Immunol.Today21:310。よって、本発明の、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体は、また予期せぬことに、1以上の免疫学的活性を保有しつつ、単鎖免疫グロブリン融合タンパク質を含めた単鎖構築体に関連する利点を提供する。同様に、補体を固定する能力は、典型的には、Fcを含むもののような重鎖定常領域に関してダイマーである免疫グロブリンに関連し、他方、ヒンジ領域システイン残基の置換または欠失のため、または本明細書中に記載された他の構造的修飾のため、例えば、鎖間ジスルフィド結合を形成する、弱められたまたは無くなった能力を有することができる本発明の、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた種々の構築体は、補体を固定する予期せぬ能力を呈する。加えて、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体が連結領域、および1以上のヒトIgEヒンジ−作用領域、すなわち、IgE CH2領域ポリペプチド、ヒトIgE CH3定常領域ポリペプチド、およびヒトIgE CH4定常領域ポリペプチドを含む、または実質的にそれよりなる、またはそれよりなるテイル領域を含むことができる本発明のある具体例によると、融合タンパク質を含めた本発明の構築体は、予期せぬことに、ADCCを媒介する、および/またはアレルギー応答メカニズムを誘導する免疫学的活性を保有する。
結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のような、主題の本発明の構築体のある具体例による連結領域としての免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドの選択は、いずれかの免疫グロブリンヒンジ領域配列それ自体から必ずしも由来しないポリペプチド配列を含む「代替ヒンジ領域」ポリペプチド配列の使用に関することができる。その代わり、代替ヒンジ領域とは、少なくとも約10の連続アミノ酸または分子、ある具体例においては、配列番号: ないし のいずれか1つから選択される配列に存在する少なくとも約11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21ないし25、26ないし30、31ないし50、51ないし60、71ないし80、81ないし90、または91ないし110アミノ酸または分子のアミノ酸配列、または他の分子配列を含むヒンジ領域ポリペプチド、例えば、CD2(例えば、GeneBank受託番号NM 001767)、CD4(例えば、GeneBank受託番号NM 000616)、CD5(例えば、GeneBank受託番号BC027901)、CD6(例えば、GeneBank受託番号NM 006725)、CD7(例えば、GeneBank受託番号XM 046782,BC009293,NM 006137)またはCD8(例えば、GeneBank受託番号M12828)、または他のIgスーパーファミリーメンバーのような免疫グロブリン遺伝子スーパーファミリーメンバーの鎖内ジスルフィド−生成免疫グロブリン−様ループドメインの間に位置する領域であるか、またはそれに由来するポリペプチド配列をいう。非限定的例として、連結領域として用いられる代替ヒンジ領域は、例えば、本明細書中で提供されるグリコシル化部位を供することができるか、あるいは融合タンパク質の「ヒト化」の程度を増強する目的でヒト遺伝子−由来ポリペプチド配列を供することができるか、あるいはマルチマーまたはオリゴマーまたは凝集体等を形成するための融合タンパク質のような本発明の構築体の能力を排除し、または低下させるアミノ酸配列を含み、または実質的にそれよりなりまたはそれよりなることができる。本明細書中に記載されたものを含めたある代替ヒンジ領域ポリペプチド配列は、現実の免疫グロブリンそれ自体ではない免疫グロブリン遺伝子スーパーファミリーメンバーのポリペプチド配列から(またはそれを用いて)由来し、または構築することができる。例えば、非限定的理論によると、免疫グロブリン遺伝子スーパーファミリーメンバータンパク質の鎖内ジスルフィド−生成免疫グロブリンループドメインの間に位置するあるポリペプチド配列は、本明細書中で提供される代替ヒンジ領域ポリペプチドとして全部または一部にて用いることができ、あるいはそのような使用のためにさらに修飾することができる。
前記したように、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた本発明の構築体は、非限定的理論によると、鎖間ジスルフィド結合形成を介して二量体化するその能力が弱められると考えられ、さらに、理論によると、この特性は、融合タンパク質構築体のような構築体の構築に含めるために選択された免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドに存在するシステイン残基の数の低下の全部または一部の結果である。多数の確立された方法を適用して、タンパク質二量体化を検出することができる場合、二量体化するポリペプチドの相対的能力の測定は関連分野の十分に知識内である(例えば、Scopes,Protein Purification:Principles and Practice,1987 Springer−Verlag,New York参照)。例えば、分子サイズ(例えば、ゲル電気泳動、ゲル濾過クロマトグラフィー、分析超遠心等)に基づいてタンパク質を分割するための生化学分離技術、および/またはスルフヒドリル−活性(例えば、ヨードアセトアミド、N−エチルマレイミド)剤またはジスルフィド−還元(例えば、2−メルカプトエタノール、ジチオスレイトール)剤の導入の前およびその後のタンパク質の物理化学的性質の比較、または他の同等な方法は、ポリペプチド二量体化またはオリゴマー化の程度を測定するために、およびそのような潜在的四次構造に対するジスルフィド結合の可能な寄与を測定するために全て使用することができる。ある具体例において、本発明は、本明細書中で提供される野生型ヒト免疫グロブリンGヒンジ領域ポリペプチドに比べ、二量体化する能力の低下(すなわち、例えば、適当なIgG−由来対照に対して統計学的に有意)を呈する構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質に関する。当業者であれば、二量体化する能力のそのような低下を特定の融合タンパク質が呈するか否かを容易に決定することができるであろう。
例えば、免疫グロブリン融合タンパク質の調製のための組成物および方法は当該分野でよく知られている。例えば、本発明による、単一コーディングポリヌクレオチドの産物であるが、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体ではない組換えタンパク質を報告する米国特許第5,892,019号参照。
構築体については、例えば、ヒトで用いることが意図された本発明の免疫グロブリン融合タンパク質において、含まれたIg定常領域は、典型的には、潜在的抗−ヒト免疫応答を最小化し、および適当なおよび/または所望のエフェクター機能を表するように、ヒト配列起源であるか、またはヒト化されている。抗体定常領域をコードする配列の操作は、MorrisonおよびOiのPCT公開、WO 89/07142で言及されている。特に好ましい具体例において、テイル領域は、CH1ドメインが存在するか、または欠失された(IgEの場合にはCH1およびCH2領域)免疫グロブリン重鎖定常領域、および結合ドメインのカルボキシル末端から調製され、あるいは結合ドメインが2つの免疫グロブリン可変領域ポリペプチドを含む場合、第二の(すなわち、C−末端に対してより基部側)可変領域が、ヒンジまたは改変された領域のような1以上の連結領域を介してCH2のアミノ末端に連結している。2つの例示的結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の構造を描く模式的ダイアグラムを図11に示す。特に好ましい具体例において、鎖間ジスルフィド結合は存在せず、他の具体例においては、もし野生型ヒンジ領域ポリペプチドがその代わりに存在すれば存在するであろうそのような結合の数に対して、限定された数の鎖間ジスルフィド結合が存在し得る。他の具体例において、例えば、融合タンパク質のような本発明の構築体は、野生型ヒトIgGヒンジ領域ポリペプチドに比べ、二量体化する能力の低下を呈する変異したまたは他の方法で改変されたヒンジ領域ポリペプチドを含み、または実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。かくして、免疫グロブリン融合タンパク質のようなそのような単鎖構築体をコードする単離されたポリヌクレオチド分子は結合領域、例えば、標的抗原のような標的に対して特異的または他の方法で所望の結合親和性および選択性を提供するドメインを有する。
また、本発明では、例えば、ある具体例において、分子「ドメインスワッピング」範例に従って、例えば、複数の遺伝子源に由来する、またはそれから調製した融合された、または他の方法で結合されたポリペプチド配列またはその部分を含む結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体が考えられる。当業者であれば、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のような構築体へ組み立てるためのそのようなポリペプチド配列の選択は、例えば各そのような配列の構造的および/または機能的特性に基づく、各成分ポリペプチド配列の適当な部分の決定を含むことができる(例えば、Carayannopoulos et al.,1996 J.Exp.Med.183:1579;Harlow et al.,編,Antibodies: A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor (1988)参照)。融合タンパク質のような構築体がそれよりなり、または調製される成分ポリペプチド配列は、従って、本明細書中で提供されるもののような、無傷または全長結合ドメイン、免疫グロブリン、リンカーおよび/または原形質膜アンカードメインポリペプチド配列、またはその切断バージョンまたはその変種を含むことができる。本発明のこれらおよび関連する具体例によると、主題の本発明の構築体、例えば、融合タンパク質がそれよりなることができる候補成分ポリペプチドのいずれかの2以上は、異なるアロタイプ、イソタイプ、サブクラス、クラス、または種の源(例えば、ゼノタイプ)の免疫グロブリン配列からのように、独立した源から由来し、または調製される。かくして、非限定的例として、結合ドメインポリペプチド(または1以上の可変領域ポリペプチドおよび/またはリンカーポリペプチドのようなその構成要素ポリペプチド)、ヒンジ領域ポリペプチド、免疫グロブリン重鎖CH2およびCH3定常領域ポリペプチド、および所望により、免疫グロブリン重鎖CH4定常領域ポリペプチドは、IgMまたはIgE重鎖から得ることができ、原形質膜アンカードメインポリペプチドは、全て、よく知られた技術を用い、かつ例えば本明細書中に記載された方法に従って、区別される遺伝子源から別々に得ることができ、キメラまたは融合タンパク質に作成することができる。
従って、本発明の構築体、例えば、本発明のある具体例による結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、従って、関連部分において、野生型IgA CH3定常領域ポリペプチドであるか、または別法として、J鎖と会合することができず、またはJ鎖と望まない程度までしか会合しない変異した、または他の方法で改変された、または置換された、または切断されたIgA CH3定常領域ポリペプチドである免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチドを含むこともでき;好ましくは、構築体のテイル領域部分で用いるIgA CH3定常領域ポリペプチドはヒト起源のものであるか、あるいはヒト化されている。簡単なバックグラウンドとして、IgA分子は、J鎖ポリペプチドを介するIgAのジスルフィド−結合ポリマー(例えば、ダイマー)への会合(例えば、Genbank受託番号XM 059628,M12378,M12759;Johansen et al.,1999 Eur.J.Immunol.29:1701)およびポリマー免疫グロブリンに対するレセプターとして作用し、膜貫通分泌成分として知られているもう1つのタンパク質と、かく形成された複合体との相互作用(SC;Johansen et al.,2000 Sc.J.Immunol.52:240;また、例えば、Sorensen et al.,2000 Int.Immunol.12:19;Yoo et al.,1999 J.Biol.Chem.274:33771;Yoo et al.,2002 J.Immunol.Meth.261:1;Corthesy,2002 Trends Biotechnol.20:65;Symersky et al.,2000 Mol.Immunol.37:133;Crottet et al.,1999 Biochem.J.341:299参照)を含むメカニズムによって分泌流体へ放出されることが知られている。IgA FcドメインおよびJ鎖の間の鎖間ジスルフィド結合の形成は、IgA重鎖定常領域CH3ドメインポリペプチドの部分を形成する18−アミノ酸C−末端延長における終わりから2番目のシステイン残基を通じて媒介される(Yoo et al.,1999;Sorensen et al.,2000)。例えば、融合タンパク質を含めた主題の本発明の構築体のある具体例では、従って、J鎖と会合することができる野生型IgA重鎖定常領域ポリペプチド配列を含めることが考えられる。しかしながら、本発明のある他の具体例では、J鎖と会合することができない変異した、または他の方法で改変された、置換された、または切断されたIgA CH3定常領域ポリペプチドを含む融合タンパク質が考えられる。そのような具体例によると、例えば、ヒトIgA CH3定常領域ポリペプチドのようなIgA CH3定常領域ポリペプチドのC−末端からの2以上の残基を欠失して、本明細書中に提供されるような切断されたCH3定常領域ポリペプチドを得ることができる。好ましい具体例において、かつ本明細書中でより詳細に記載するように、J鎖と会合することができない変異したヒトIgA CH3定常領域ポリペプチドは、4または18アミノ酸いずれかのそのようなC−末端欠失を含む。しかしながら、本発明はそのように限定される必要がなく、従って、構築体、例えば、融合タンパク質が抗原に特異的に結合でき、かつ本明細書中で提供されるような少なくとも1つの免疫学的活性が可能である限り、変異したIgA CH3定常領域ポリペプチドは約2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21ないし25、26ないし30またはそれ以上のアミノ酸の欠失を含むことができる。別法として、本発明では、構築体、例えば、望まないレベルの鎖間ジスルフィド結合またはマルチマー形成を予防し、または阻害するように、終わりから2番目のシステインの置換によって、またはアミノ酸残基の化学的修飾によって、J鎖と会合することができない変異したIgA CH3定常領域ポリペプチドを含むテイル領域を有する融合タンパク質も考えられる。構築体、例えば、融合タンパク質がJ鎖と会合することができるか否かを決定する方法は、当業者に知られており、また本明細書中に記載され、または引用される。
また、本明細書中に記載するように、かつ当該分野で公知の手法に従い、構築体、例えば、融合タンパク質は、例えば、ADCCまたはCDCアッセイにおいて免疫学的活性についてさらにルーチン的にテストすることができる。説明的例として、そのような具体例による構築体、例えば、融合タンパク質は、アポトーシスシグナリング、または他の方法でアポトーシスの促進が可能である細胞質テイルポリペプチドを含む、天然または作成されたヒト重鎖可変領域ポリペプチド配列、天然または作成されたヒトIgA−由来免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド配列、天然または作成されたヒトIgG1免疫グロブリン重鎖CH2定常領域ポリペプチド配列、天然または作成されたヒトIgG2免疫グロブリン重鎖CH3定常領域ポリペプチド配列、および所望により、天然または作成されたヒトIgE免疫グロブリン重鎖CH4定常領域ポリペプチド配列および/または天然または作成されたヒトTNF−αレセプター1型(TNFR1)原形質膜アンカードメインポリペプチド配列から(またはそれを用いて)由来する、または構築された結合ドメインポリペプチドを含むことができる。本発明では、従って、構築体、例えば、融合タンパク質に存在する2以上のポリペプチド配列が独立した遺伝子起源を有する本発明によるこれらおよび他の具体例が考えられる。
前記したように、ある具体例において、構築体、例えば、結合タンパク質−免疫グロブリン融合タンパク質は、天然または作成された軽鎖、または天然または作成された重鎖可変領域ポリペプチドであってよい少なくとも1つの天然または作成された免疫グロブリン可変領域ポリペプチドを含み、またある具体例においては、融合タンパク質は少なくとも1つのそのような天然または作成された軽鎖V−領域、および1つのそのような天然または作成された重鎖V−領域、および天然または作成されたV−領域の各々に融合した、または他の方法で結合した少なくとも1つのリンカーペプチドを含む。そのような結合ドメイン、例えば、単鎖Fvドメインの構築は当該分野で知られており、以下の実施例により詳細に記載されており、例えば、本明細書中に引用された種々の書類に記載されており;単鎖可変領域の選択および組立て、および重鎖−由来および軽鎖−由来V領域の各々に融合し、または他の方法で結合することができる(例えば、単鎖Fvポリペプチドを含む結合ドメインのような結合ドメインを生じることができる)リンカーポリペプチドの選択および組立てもまた当該分野で知られており、また本明細書中に記載される。例えば、米国特許第5,869,620号、第4,704,692号および第4,946,778号参照。ある具体例において、非−ヒト源に由来する免疫グロブリン配列の全てまたは1つの部分または複数部分は、ヒト化抗体、すなわち、ヒトIg配列が導入されて、ヒト免疫系がそのようなタンパク質を外来として認める程度を低下させる免疫グロブリン配列を生じさせるための認められた手法に従って「ヒト化」することができる(例えば、米国特許第5,693,762号;第5,585,089号;第4,816,567号;第5,225,539号;第5,530,101号;およびそこに引用された書類参照)。
本明細書中に記載された結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた本発明の構築体は、ある具体例によると、望ましくは、グリコシル化、例えば、単糖またはオリゴ糖のような炭水化物部分の共有結合のための部位を含む。例えば、その全てが当該分野で確率された基準に従って同定することができる、例えば、N−(アスパラギン)−結合グリコシル化のための古典的Asn−X−Ser/Thr部位を含有するポリペプチド配列、またはO−結合グリコシル化のための適当な基質であるSerまたはThr残基を含有する配列、またはC−マンノシル化、グリピエーション/グリコシルホスファチジルイノシトール修飾、またはホスホグリケーションに使用できる配列を得るための遺伝子工学またはタンパク質工学的方法の使用を含めた、ポリペプチドグリコシル化のための基質を供するアミノ酸配列の一体化は関連分野の範囲内のものである(例えば、Spiro,2002 Glybiology 12:43R)。いずれかの特定の理論またはメカニズムによって拘束されるつもりはないが、特定のアミノ酸配列を有する融合タンパク質のようなグリコシル化構築体は、有利には、同一または高度に類似するアミノ酸配列を有するが、グリコシル部分を欠く融合タンパク質を含めた構築体に対して、全て統計的に有意に、改良された溶解度、溶液中での増強された安定性、増強された生理学的安定性、イン・ビボ生体内分布を含めた改良された生物学的利用性、およびプロテアーゼに対する優れた抵抗性の1以上に関連する属性を保有することができる。ある好ましい具体例において、融合タンパク質構築体のような主題の本発明の構築体は、本明細書中に提供されたリンカーに存在するグリコシル化部位を含むことができ、ある他の好ましい具体例において、主題の本発明の構築体、例えば、融合タンパク質は、本明細書中に提供されたヒンジ領域ポリペプチド配列のような、連結領域に存在するグリコシル化部位を含む。
(ライブラリー表示システムおよびライブラリースクリーニングアッセイを含めた)スクリーニングアッセイのような、遺伝子治療適用、または表示システムまたはアッセイで有用なもののような本発明のある好ましい具体例において、構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質は、それが細胞表面に局所化するように、宿主細胞によって発現され得るタンパク質または糖タンパク質である。細胞表面に局所化する結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のような構築体は、例示として、かつ限定されるものではないが、分泌シグナル配列、リーダー配列、原形質膜アンカードメインポリペプチド、および疎水性膜貫通ドメインのような膜貫通ドメイン(例えば、Heuck et al.,2002 Cell Biochem.Biophys.36:89;Sadlish et al.,2002 Biochem J.364:777;Phoenix et al.,2002 Mol.Membr.Biol.19:1;Minke et al.,2002 Physiol.Rev.82:429)またはグリコシルホスファチジルイノシトール結合部位(「グリピエーション」部位、例えば、Chatterjee et al.,2001 Cell Mol.Life Sci.58:1969;Hooper,2001 Proteomics 1:748;Spiro,2002 Glycobiol.12:43R)、細胞表面レセプター結合ドメイン、細胞外マトリックス結合ドメイン、または融合タンパク質集団の少なくとも所望の部分が全体的にまたは部分的に細胞表面に局所化するようにするいずれかの他の構造的特徴を含めた、融合タンパク質を細胞表面に向ける天然に存在するまたは人工的に導入された構造的特徴によってそのようにすることができる(例えば、Nelson et al.2001 Trends Cell Biol.11:483;Ammon et al.,2002 Arch.Physiol.Biochem.110:137;Kasai et al.,2001 J.Cell Sci.114:3115;Watson et al.,2001 Am.J.Physiol.Cell Physiol.281:C215;Chatterjee et al.,200 J.Biol.Chem.275:24013)。特に好ましいのは、典型的には、原形質膜二層の内部を形成するリン脂質脂肪アシルテイルとのエネルギー的に有利な相互作用が可能な疎水性領域を含む膜にわたるドメインを含む膜貫通ポリペプチドドメインを含む原形質膜アンカードメインを含む融合タンパク質構築体である。そのような特徴は、さらに、遺伝子工学によってこれらの特徴をコードする核酸配列を主題の発現構築体に導入する方法、および生成物の細胞表面局所化を確認するためのそのような構築体のルーチン的テストに精通した当業者に知られている。
あるさらなる具体例によると、原形質膜アンカードメインポリペプチドは、そのような膜貫通ドメインポリペプチドを含み、また、原形質膜の細胞質面に接触し、および/またはサイトゾルまたは他の細胞質構成要素と接触するポリペプチド配列の領域または部分という細胞質テイルポリペプチドを含む。多数の細胞質テイルポリペプチドが知られており、これは、原形質膜貫通タンパク質の細胞内部分を含み、生物学的シグナル変換(例えば、プロテインキナーゼ、プロテインホスファターゼ、G−タンパク質、環状ヌクレオチド、および他の二次メッセンジャー、イオンチャネル、分泌経路の活性化または阻害)、生物学的に活性なメディエーター放出、1以上の細胞骨格構成要素との安定なまたは動的な会合、細胞分化、細胞活性化、有糸分裂誘発、細胞性塞栓、アポトーシスなどを含めた区別される機能が多くのそのようなポリペプチドで同定されている(例えば、Maher et al., 2002 Immunol. Cell Biol.80:131;El Far et al., 2002 Biochem J. 365:329;Teng et al., 2002 Genome Biol.2REVIEWS:3012;Simons et al., 2001 Cell Signal 13:855;Furie et al., 2001 Thromb.Haemost. 86:214;Gaffen, 2001 Cytokine 14:63;Dittel, 2000 Arch. Immunol. Ther. Exp.(Warsz.)48:381;Parnes et al., 2000 Immunol.Rev.176:75;Moretta et al., 2000 Semin.Immunol.12:129;Ben Ze’ev,1999 Ann.N.Y.Acad.Sci.886:37;Marsters et al.,Recent Prog.Horm.Res.54:225)。
図70は、例えば、フルオレセイン−結合体化FcRIII(CD16)可溶性融合タンパク質の細胞、この例ではCHO細胞によって発現されたCD20に結合した2H7 scFv−結合ドメイン構築体への結合を示す。本発明の構築体、例えば、scFv−結合ドメイン構築体へ結合するCD16は、標的化されたまたは部位特異的な突然変異、置換、欠失または他の改変を含むscFv−結合ドメイン構築体を含めた本発明の改変された構築体へのCD16結合の変化を検出し、および/または定量するのに用いることができるスクリーニングツールの1つの例を提供する。CD16結合特性の変化は、例えば、CD16高親和性タンパク質(158V)またはCD16低親和性タンパク質(158F)いずれか、または双方の結合の変化によって反映できる。
そのようなスクリーニングプロセスの1つの例の模式的代表は図70中の2番目の図面に図示され、そこでは、scFv−結合ドメイン構築体は哺乳動物細胞の細胞表面に提示される。この例におけるscFv−結合ドメイン分子は、膜貫通ドメインアンカーとして機能する分子を介して細胞表面に提示される。これらの分子は、例えば、単一scFv−結合ドメイン構築体を表すことができるか、あるいはそのような分子のライブラリーとして哺乳動物細胞の集団に導入することができる。次いで、改変された結合特性を持つトランスフェクトされた細胞を、例えば、選択条件のストリンジェンシーを変化させ、かつ結合プローブとしてCD16融合タンパク質を用いることによって、選別し、分類し、または他の方法で他の細胞から単離することができる。例えば、CD16高親和性対立遺伝子(158V)またはCD16低親和性対立遺伝子(158F)のいずれか、または双方に対する改変された結合でもってscFv−Ig分子を発現する細胞を単離することができる。
この表示システムは、例えば、ランダム化されたオリゴヌクレオチドで置き換えられたCH2配列の短いストレッチと共に突然変異された、または他の方法で改変されたテイル領域を持つ本発明の構築体のライブラリーまたは、例えば、合成アミノ酸を含めた天然または非天然の全ての可能なアミノ酸置換での単一残基のランダム化を創製するのに用いることができる。一旦そのようなライブラリーが構築されれば、それは、当該分野で公知の方法によって、適当な細胞、例えば、COS細胞にトランスフェクトすることができる。次いで、トランスフェクタントを、例えば、標識されたCD16構築体に結合させることができ、複数アレロタイプ/イソ形態に対するそれらの相対的または所望の結合特性に基づいて選別し、または分類することができる。所望の細胞を収穫することができ、DNA、例えば、プラスミドDNAを単離し、次いで、例えば細菌に形質転換することができる。このプロセスは、所望の単一クローンが哺乳動物宿主細胞から単離されるまで反復して複数回反復することができる。Seed B and Aruffo A,Pro.Nat’l Acad Sci USA 1987 84:3365−3369;Aruffo A and Seed B,Pro.Nat’l Acad Sci USA 1987 84:8573−8577参照。
このタイプのスクリーニングシステムの1つのそのような使用は、例えば、テイル領域を有する本発明の構築体、または患者の複数亜集団においてscFv−結合ドメイン構築体によって媒介されるエフェクター機能を改良する目標で、CD16の高および低親和性対立遺伝子双方に同等によく結合するテイル領域の同定および/または単離のためである。テイル領域を有する本発明の構築体、または他のFcレセプターに対して改変された結合特性を持つテイル領域もまた、そのような表示システム、例えば、記載された表示システムを用いて選択することができる。タンパク質をグリコシル化しない他の表示システム、例えば、バクテリオファージまたは酵母を用いるものは、一般には、Ig−ベースのテイル領域を有する本発明の構築体、または改変されたFcR結合特性を持つ、Ig−ベースのテイル領域の選択で望まれない。ほとんどの非−哺乳動物システムは、例えば、タンパク質をグリコシル化しない。
当該構築体への適当な分子の取り込み、例えば、膜貫通ドメインまたはGPIアンカーシグナルの取り込みによって、哺乳動物細胞の表面に発現された本発明の構築体、例えば、scFv−結合ドメイン構築体の発現もまた、例えば、より高いまたは他の所望のレベルで生産される本発明の構築体、例えば、改変されたscFv−結合ドメイン分子の選択で有用な他の表示システムで利用性を有する。1つのそのような具体例において、グリコシル化タンパク質の生産で有用な細胞、例えば、COS細胞のような哺乳動物細胞を、その発現を細胞表面に向けるプラスミド中のscFv−結合ドメイン構築体のライブラリーでトランスフェクトする。最高または他の所望のレベルのscFv−結合ドメイン分子を発現するCOS細胞のような細胞を、当該分野で知られた技術(例えば、パニング、滅菌細胞ソーティング、磁性ビーズ分離など)によって選択し、DNA、例えば、プラスミドDNAを他の細胞、例えば、細菌への形質転換のために単離する。1以上のラウンドの選択の後、高または他の所望のレベルの発現が可能なscFv−結合ドメイン分子をコードする単一クローンを単離する。次いで、単離したクローンを改変して膜アンカーを除去し、適当な細胞系、例えば、哺乳動物細胞系で発現させることができ、そこでは、scFv−結合ドメイン構築体は、例えば、培養流体への所望のレベルでの分泌によって生産される。いずれかの特定のメカニズムまたは理論に拘束されるつもりはないが、これは、分泌された糖タンパク質の通常の要件、およびシグナルペプチドのための細胞表面糖タンパク質、および発現のためのゴルジを介するプロセッシングに由来すると考えられる。かくして、細胞表面での改良された発現レベルを示す分子についての選択の結果、分泌されたタンパク質のレベルの改良を有する分子の同定をやはりもたらす。
本発明の構築体を利用するこれらの表示システムは、構築体内の結合ドメインの親和性変種をスクリーニングし、および/または同定し、および/または単離するのにも用いることができる。
特に好ましいのは、例えば、(1)天然または作成されたVおよび/またはVおよび/または単鎖可変領域(sFv)配列を含めた、例えば、(scFvまたは他の構築体内のV領域配列を含めた)V領域配列において1以上のアミノ酸位置9、10、11、12、108、110、111および112に対応する1つの位置または複数位置のアミノ酸において突然変異、改変または欠失を含む免疫グロブリン可変領域ポリペプチド配列、および/または(2)天然または作成されたVおよび/またはVおよび/または単鎖可変領域(sFv)配列を含めた、例えば、(scFvまたは他の構築体内のV領域配列を含めた)軽鎖可変領域配列においてアミノ酸位置12、80、81、82、83、105、106、107および108の1以上に対応する1つの位置または複数位置において突然変異、改変または欠失を含む免疫グロブリン可変領域ポリペプチド配列を含む構築体を含むまたは利用する表示および/またはスクリーニングシステムである。特に好ましいのは、アミノ酸位置11に対応する1つの位置または複数位置のアミノ酸において、突然変異、改変または欠失を含み、(例えば、sFvまたはscFv−含有構築体内に含まれる免疫グロブリン−由来および他の配列を含めた、1以上の他の配列と会合するか否かを問わず)作成されたV配列を含む構築体を含むまたは用いるそのような表示および/またはスクリーニングシステムである。V11アミノ酸は、もし置換されていれば、本明細書中に記載されたように、または所望によりもう1つの分子によって、もう1つのアミノ酸で置換することができる。
例えば、多数の遺伝子治療方法および関連する構築体送達技術の1以上によることを含めた、本明細書中で提供される悪性疾患またはB細胞障害の治療用の結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた本発明の構築体を用いる他の方法の文脈においては、本発明ではある具体例も考えられ、そこでは、構築体、例えば、原形質膜アンカードメインポリペプチドを含む結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質が細胞表面で発現され(または発現でき)、さらに、アポトーシスシグナリングポリペプチド配列を含む細胞質テイルポリペプチドを含むことができる。例えば、When Cells Die:A Comprehensive Evaluation of Apoptosis and Programmed Cell Death(R.A.Lockshin et al.編,1998 John Wiley & Sons,New York;また、例えば、Green et al.,1998 Science 281:1309およびそこに引用された文献;Ferreira et al.,2002 Clin.Canc.Res.8:2024; Gurumurthy et al.,2001 Cancer Metastas. Rev.20:225;Kanduc et al.,2002 Int.J.Oncol.21:165も参照)にレビューされているように、多数のアポトーシスシグナリングポリペプチド配列が当該分野で公知である。典型的には、アポトーシスシグナリングポリペプチド配列は、レセプター死滅ドメインポリペプチド、例えば、FADD(例えば、Genbank受託番号U24231,U43184,AF009616,AF009617,NM 012115)、TRADD(例えば、Genbank受託番号NM_003789)、RAIDD(例えば、Genbank受託番号U87229)、CD95(FAS/Apo−1);例えば、Genbank受託番号X89101,NM 003824,AF344850,AF344856)、TNF−α−レセプター−1(TNFR1、例えば、Genbank受託番号S63368,AF040257)、DR5(例えば、Genbank受託番号AF020501,AF016268,AF012535)、ITIMドメイン(例えば、Genbank受託番号AF081675,BC015731,NM_006840,NM 006844,NM 006847,XM 017977;例えば、Billadeau et al.,2002 J.Clin.Invest.109:161参照)、ITAMドメイン(例えば、Genbank受託番号NM 005843,NM_003473,BC030586;例えば、Billadeau et al.,2002参照)、または当該分野で公知の他のアポトーシス−関連レセプター死滅ドメインポリペプチド、例えば、TNFR2(例えば、Genbank受託番号L49431,L49432)、カスパーゼ/プロカスパーゼ−3(例えば、Genbank受託番号XM 54686)、カスパーゼ/プロカスパーゼ−8(例えば、AF380342,NM 004208,NM 001228,NM 033355,NM 033356,NM 033357,NM 033358)、カスパーゼ/プロカスパーゼ−2(例えば、Genbank受託番号AF314174,AF314175)などの全てまたは部分を含み、またはそれに由来し、またはそれから構築される。
アポトーシスを受けていることが疑われる生物学的試料中の細胞は、アポトーシス状態の指標である形態学的、透過性または他の変化につき調べることができる。例えば、説明として、かつ限定的なものではないが、多くの細胞型におけるアポトーシスは、原形質膜泡発生、細胞形状変化、基質接着特性の喪失、または当業者によって容易に検出できる他の形態学的変化のような改変された形態学的外観を引き起こすことができる。もう1つの例として、アポトーシスを受けている細胞は、顕微鏡観察および/または蛍光色素を含めた当該分野で知られたDNA−特異的またはクロマチン−特異的色素の使用を介して明らかであり得る染色体の断片化および崩壊を呈することができる。生体色素(例えば、ヨウ化プロピジウム、トリパンブルー)の使用を介して、または乳酸デヒドロゲナーゼの細胞外媒質への遺漏の検出によって容易に検出できるように、そのような細胞は改変された原形質膜透過性特性も呈することができる。形態学的基準、改変された原形質膜透過性、および関連する変化によってアポトーシス細胞を検出するためのこれらおよび他の手段は当業者に明らかであろう。
細胞表面で発現される結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のような構築体が、膜貫通ドメインを有する原形質膜アンカードメイン、およびアポトーシスシグナリングポリペプチドを含む細胞質テイルを含む本発明のもう1つの具体例において、生物学的試料中の細胞は、例えば、PS−特異的タンパク質アネキシンにより外側リーフレット結合を測定することによって検出することができる、細胞膜ホスファチジルセリン(PS)の原形質膜の内部リーフレットから外部リーフレットへの移動につきアッセイすることができる。Martin et al.,J.Exp.Med.182:1545,1995;Fadok et al.,J.Immunol.148:2207,1992。結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のような構築体が細胞表面で発現され、かつそれがアポトーシスシグナリングポリペプチドを有する原形質膜アンカードメインを含む具体例を含めた、また、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のような構築体が、膜アンカードメインを欠き、かつアポトーシスを誘導することができる可溶性タンパク質である具体例も含めた本発明のなお他の関連具体例において、アポプトゲンに対する細胞応答は、カスパーゼとして知られたアポトーシス−活性化プロテアーゼのファミリーのいずれかのメンバーにおける特異的プロテアーゼ活性の誘導につきアッセイによって決定される(例えば、Green et al.,1998 Science 281:1309参照)。当業者であれば、例えば、特異的に認識されるタンパク質基質のカスパーゼ−媒介切断の測定によってカスパーゼ活性を測定する方法に容易に精通しているであろう。これらの基質は、例えば、ポリ−(ADP−リボース)ポリメラーゼ(PARP)または他の天然に生じるもしくは合成ペプチド、および当該分野で公知のカスパーゼによって切断されるタンパク質を含むことができる(例えば、Ellerby et al.,1997 J.Neurosci.17:6165参照)。「Z」がベンゾイルカルボニル部分を示し、AFCが7−アミノ−4−トリフルオロメチルクマリンを示す合成ペプチドZ−Tyr−Val−Ala−Asp−AFC(配列番号: )(Kluck et al.,1997 Science 275:1132;Nicholson et al.,1995 Nature 376:37)は1つのそのような基質である。基質の他の非限定的例はU1−70kDaおよびDNA−PKcsのような核タンパク質を含む(Rosen and Casciola−Rosen,1997 J.Cell.Biochem.64:50;Cohen,1997 Biochem.J.326:1)。また、細胞アポトーシスは、アポトーシス細胞においてミトコンドリアから逃げたチトクロームcの測定によって検出することもできる(例えば、Liu et al.,Cell 86:147,1996)。チトクロームcのそのような検出は分光学的に、免疫化学的に、または特異的タンパク質の存在を特定する他のよく確立された方法によって行うことができる。当業者であれば、アポトーシスを定量するための他の適当な技術が存在し得ることを容易に認識するであろう。
(例えば、アポトーシスシグナリング配列を含めた)原形質膜アンカードメインおよび/または細胞質テイルポリペプチドを含む構築体を含めた、遺伝子治療適用で有用な構築体の特に好ましい具体例は、(1)天然または作成されたVおよび/またはVおよび/または単鎖可変領域(sFv)配列を含めた、例えば、(scFvまたは他の構築体内のV領域配列を含めた)V領域配列においてアミノ酸位置9、10、11、12、108、110、111および112の1以上に対応する1つの位置または複数位置のアミノ酸における突然変異、改変または欠失を含む免疫グロブリン可変領域ポリペプチド配列、および/または(2)天然または作成されたVおよび/またはVおよび/または単鎖可変領域(sFv)配列を含めた、例えば、(scFvまたは他の構築体内のV領域配列を含めた)軽鎖可変領域配列においてアミノ酸位置12、80、81、82、83、105、106、107および108の1以上に対応する1つの位置または複数位置に突然変異、改変または欠失を含む免疫グロブリン可変領域ポリペプチド配列を含むそのような構築体である。特に好ましいのは、アミノ酸位置11に対応する1つの位置または複数位置のアミノ酸において突然変異、改変または欠失を含む、(例えば、sFvまたはscFv−含有構築体内に含まれる免疫グロブリン−由来および他の配列を含めた1以上の他の配列と会合するか否かを問わず)作成されたV配列を含む構築体である。V11アミノ酸は、もし置換されていれば、本明細書中に記載したように、または所望によりもう1つの分子によってもう1つのアミノ酸で置換することができる。
一旦、例えば、本明細書中に提供された結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質のような構築体が設計されれば、該構築体をコードするDNAを含めたポリヌクレオチドは、それまたはその関連部分がポリペプチドであるか否かを問わず、例えば、Sinha et al.,Nucleic Acids Res.,12:4539−4557(1984)に記載されたようにオリゴヌクレオチド合成を介して全部または一部を合成することができ;例えば、Innis編,PCR Protocols,Academic Press(1990)およびBetter et al. J.Biol.Chem.267:16712−16118(1992)に記載されているようにPCRを介して組み立てることができ;例えば、Ausubel et al.編,Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons,New York(1989)およびRobinson et al.,Hum.Antibod.Hybridomas,2:84−93(1991)に記載されているように標準的手法を介してクローン化し、発現させることができ;および、例えば、Harlow et al.編,Antibodies:A Laboratory Manual,Chapter 14,Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor (1988)およびMunson et al.,Anal.Biochem.,107:220−239(1980)に記載されたように、例えば、標的に結合する所望の活性または特異的抗原結合活性につきテストすることができる。
Fv領域の単一ポリペプチド鎖結合分子、単鎖Fv分子の調製は当該分野で公知である。例えば、米国特許第4,946,778号参照。本発明においては、本発明の構築体に含むことができる単鎖Fv−様分子は、重鎖または軽鎖の第一の可変領域、続いて、各々、対応する軽鎖または重鎖の可変領域に対する1以上のリンカーをコードさせることによって合成することができる。2つの可変領域の間の種々の適当なリンカーの選択は米国特許第4,946,778号に記載されている(また、例えば、Huston et al.,1993 Int.Rev.Immunol.10:195参照)。本明細書中に記載された例示的リンカーは(Gly−Gly−Gly−Gly−Ser)であるが、いずれの所望の長さであってもよい。該リンカーを用いて、天然で凝集するが、化学的には別々の重鎖および軽鎖を、例えば、単一ポリペプチド鎖のアミノ末端抗原結合部分に変換し、そこでは、この抗原結合部分は、2つのポリペプチド鎖で作成された元の構造と同様の構造に折畳まれるが、あるいは他の方法で標的、例えば、標的抗原に結合する能力を有する構造に折畳まれるであろう。結合領域としてのscFv、連結領域としての天然または作成された免疫グロブリンヒンジ、および結合領域としての1以上の天然または作成された重鎖定常領域を含む構築体では、リンカーをコードする配列によって連結された、天然または作成された重鎖および軽鎖の可変領域をコードするヌクレオチド配列を、所望であれば、天然または作成された抗体定常領域をコードするヌクレオチド配列に連結させる。定常領域は、得られたポリペプチドが鎖間ジスルフィド結合を形成してダイマーを形成するようにするものであってもよく、これは、ADCC、CDCを媒介し、または補体を固定する能力のような所望のエフェクター機能を含むが、ダイマーまたは他のマルチマーの形成または凝集に好都合でない天然または作成された定常領域が好ましい。ヒトでの使用が意図された本発明の免疫グロブリン−様分子のような構築体では、定常領域および/または所望の定常領域機能を有する含めた配列は、典型的には、ヒトであるか、または実質的にヒトであるか、またはヒト化されて、潜在的抗−ヒト免疫応答を最小化し、適当なまたは所望のエフェクター機能を供する。抗体定常領域をコードする配列の操作は、Morrison and OiのPCT公開WO 89/07142に言及されている。好ましい具体例において、CH1ドメインは、天然または作成された免疫グロブリン定常領域(例えば、天然または作成されたCH2および/またはCH3定常領域、または天然または作成されたCH2および/またはCH3および/またはCH4定常領域)を含み、または実質的にそれよりなり、またはそれよりなるテイル領域から全部または部分的に欠失され、結合領域、例えば、免疫グロブリン可変領域ポリペプチドのような結合ドメインポリペプチドのカルボキシル末端は、連結領域、例えば、本明細書中で提供されるような天然または作成されたヒンジ領域ポリペプチドを介して、例えば、CH2のアミノ末端に連結される。
前記したように、本発明は、本明細書中で提供される、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた本発明の構築体の発現を指令することができる組換え発現構築体を提供する。本明細書中で言及する種々のアミノ酸配列で起こるアミノ酸は、そのよく知られた3−文字または1−文字略語に従って確認される。本明細書中で言及される種々のDNA配列またはその断片で起こるヌクレオチドは、当該分野でルーチン的に用いられる標準1文字表示で表示される。また、与えられたアミノ酸配列は、些細な変化を有するに過ぎないもの、例えば、説明のために、限定的なものではないが、保存的置換、または天然に生じないアミノ酸での置換をさらに含むことができる共有結合化学的修飾、挿入、欠失および置換のような同様であるが変化したアミノ酸配列も含むことができる。相互に同様なアミノ酸配列は、配列相同性の実質的領域を共有することができる。同様に、ヌクレオチド配列は、些細な変化を有するに過ぎない実質的に同様なヌクレオチド配列、例えば、説明として、限定的なものではないが、遺伝子暗号の縮重のためさらにサイレント突然変異を含むことができる、共有結合化学修飾、挿入、欠失および置換を含むことができる。相互に同様であるヌクレオチド配列は配列相同性の実質的領域を共有することができる。
被験体における悪性疾患の存在とは、被験体における形成異常、癌性および/またはトランスフォームド細胞の存在をいい、例えば、当該分野で公知であって、それに対する診断および分類の基準が確立されている、新形成、腫瘍、非接触阻止、または腫瘍学的に形質転換された細胞など(例えば、メラノーマ、腺癌腫、扁平上皮癌腫、小細胞癌腫、燕麦細胞癌腫のような癌腫、軟骨肉腫、骨肉腫などのような肉腫)を含む。本発明によって考えられる好ましい具体例において、例えば、そのような癌細胞は、リンパ系の形質転換された細胞、特に、B細胞リンパ腫などのような悪性造血系細胞であり;癌細胞は、ある好ましい具体例では、癌腫細胞のような上皮細胞でもあり得る。本発明では、B細胞に影響するある悪性疾患(例えば、B細胞リンパ腫)を含むことができるが、それに限定されるものではなく、かつ自己免疫疾患、特に、例えば、自己抗体生産によって特徴付けられる病気、障害および疾患を含むことも意図されたB細胞障害が考えられる。
自己抗体は、自己−抗原と反応する抗体である。自己抗体は、それらが病気活性に関与するいくつかの自己免疫疾患(すなわち、宿主の免疫系が不適切な抗−「自己」免疫反応を生じさせる病気、障害または疾患)で検出される。種々の自己免疫疾患に対する現行の治療は、継続する投与を必要とし、特異性を欠き、かなりの副作用を引き起こす免疫抑制薬物を含む。最少毒性にて自己抗体生産を排除できる新しいアプローチは、多くの人々に影響する病気のスペクトルに対する適合しない医療的要望を取り扱う。結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた本発明の構築体は、例えば、リンパ系組織への改良された進入のために設計される。Bリンパ球の枯渇は自己抗体生産周期を中断し、新しいBリンパ球が骨髄で前駆体から生産されるように免疫系をリセットさせる。
有益な効果が信じられる多数の病気、障害および疾患がB細胞枯渇療法に由来すると非限定的理論に従うと示されている。そのような病気、障害および疾患は、限定されるものではないが、グレーヴス病、ハシモト病、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、シェーグレン症候群、免疫血小板減少性紫斑病、多発性硬化症、重症筋無力症、強皮症、乾癬、クローン病および潰瘍性結腸炎を含めた炎症腸疾患を含む。クローン病および潰瘍性結腸炎を含めた炎症腸疾患は消化系の自己免疫疾患である。
本発明は、さらに、本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードするヌクレオチド構築体、および特に、例えば、そのようなポリペプチドの断片、アナログおよび誘導体として発現し得る遺伝子治療適用のためのそのようなタンパク質をコードする組換え構築体を投与する方法に関する。
用語「断片」、「誘導体」および「アナログ」は、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたは融合タンパク質を含めた本発明の構築体をいう場合、そのようなポリペプチドと実質的に同一な生物学的機能または活性を保有する結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたは融合タンパク質のようないずれの構築体もいう。かくして、アナログは構築体のプロ−またはプレプロ−形態、例えば、プロ−タンパク質部分の切断によって活性化されて、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドのような活性な構築体を生じさせることができるプロ−タンパク質を含む。
本発明の構築体、例えば、本明細書中で言及するcDNAによってコードされた結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたは融合タンパク質を含めた結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたは融合タンパク質の断片、誘導体またはアナログは(i)アミノ酸残基の1以上が保存的または非−保存的アミノ酸残基(好ましくは保存的アミノ酸残基)で置換され、そのような置換されたアミノ酸残基が遺伝子暗号によってコードされたものであってもなくてもよいもの、または(ii)アミノ酸残基の1以上が置換基を含むもの、または(iii)さらなるアミノ酸が構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたはプロタンパク質配列のような構築体を含めた構築体の検出または特異的機能改変で使用されるアミノ酸を含めた、構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドに融合、または他の方法で連結されたものであり得る。そのような断片、誘導体およびアナログは、本明細書中の教示から当業者の範囲内と見なされる。
本発明のポリペプチド構築体を含めた構築体は、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチド、および当該分野で知られた配列と同一または同様である結合ドメインポリペプチドアミノ酸配列のような結合領域を有する融合タンパク質、またはその断片または部分を含む。例えば、さらなる説明のために、限定されるものではないが、そのようなポリペプチドの部分および/または報告されたポリペプチドに対して少なくとも約70%の同様性(好ましくは70%を超える同一性)、より好ましくは約90%の同様性(なお、より好ましくは90%を超える同一性)、および報告されたポリペプチドに対して、およびそのようなポリペプチドの部分に対して、なおより好ましくは約95%の同様性(より好ましくは95%を超える同一性)を有するポリペプチドのように、ヒトCD154分子細胞外ドメイン[配列番号: ]が本発明による使用で考えられ、ここに、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドのそのような部分は、例えば、一般には、少なくとも約30のアミノ酸、より好ましくは少なくとも約50のアミノ酸を含む。細胞外ドメインは、例えば、細胞表面分子の部分を含み、特に好ましい具体例においては、内在性膜タンパク質である、または原形質膜スパンニング膜貫通ドメインを含む、好ましくは、そのような分子の細胞外ドメイン部分を細胞外環境としても知られた細胞の外部環境に露出するように当該分子が細胞表面に発現された場合に原形質膜リン脂質二層の外側リーフレットを越えて延びるように構築された細胞表面分子を含む。細胞表面分子の部分が細胞外ドメインを含むか否かを決定するための方法は当該分野でよく知られており、例えば、実験的決定(例えば、分子の直接的または間接的標識、該分子が、タンパク質分解酵素または脂質分解酵素のような、原形質膜がそれに対して透過性でない剤によって構造的に改変し得るか否かの評価)または分子の構造に基づいてのトポロジー学的予測(例えば、ポリペプチドのアミノ酸配列の分析)または他の方法を含む。
本明細書中で用いるように、「アミノ酸」は、中心炭素原子(アルファ(α)−炭素原子)が水素原子、カルボン酸基(その炭素原子を本明細書中においては「カルボキシル炭素原子」という)、アミノ基(その窒素原子を本明細書中においては「アミノ窒素原子」という)、および側鎖基Rに連結された構造を有する分子である。ペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質に一体化させる場合、アミノ酸は、1つのアミノ酸を相互に連結させる脱水反応でそのアミノおよびカルボン酸基の1以上の原子を失う。その結果、タンパク質に一体化される場合、アミノ酸は「アミノ酸残基」ということもできる。天然に生じるタンパク質の場合、アミノ酸残基のR基は、それからタンパク質が典型的には合成される20のアミノ酸を区別するが、タンパク質中の1以上のアミノ酸残基は(例えば、グリコシル化によって、および/またはタンパク質の折畳まれた立体配座を安定化させるにおいて重要な役割をしばしば演じるジスルフィド共有結合をもたらす、2つの非−隣接システインアミノ酸残基のチオール側鎖の酸化を介するシステインの形成によって)生物学的系におけるタンパク質に一体化したのち誘導体化、または修飾することができる。当業者が認識するように、天然に生じないアミノ酸もまたタンパク質、特に、固体状態および他の自動合成方法を含めた合成方法によって生じるものに一体化させることができる。そのようなアミノ酸の例は、限定されるものではないが、α−アミノイソ酪酸、4−アミノ酪酸、L−アミノ酪酸、6−アミノヘキサン酸、2−アミノイソ酪酸、3−アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルレンシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトラリン、システイン酸、t−ブチルグリシン、t−ブチルアラニン、フェニルリシン、シクロヘキシルアラニン、β−アラニン、フルオロ−アミノ酸、デザイナーアミノ酸(例えば、β−メチルアミノ酸、α−メチルアミノ酸、Nα―メチルアミノ酸)および一般にアミノ酸アナログを含む。加えて、(α炭素原子に結合した2つの水素原子を有するグリシンを除いて、タンパク質を合成するのに生物学的系によって使用される20のアミノ酸を用いる場合のように)α−炭素原子が4つの異なる基を有する場合、DおよびLと命名される各アミノ酸の2つの異なるエナンチオマー形態が存在する。哺乳動物においては、L−アミノ酸のみが天然に生じるポリペプチドに一体化される。本発明では、1以上のD−およびL−アミノ酸を一体化させるタンパク質、ならびに丁度D−またはL−アミノ酸残基から構成されるタンパク質が考えられる。
本明細書中で、以下の略語を以下のアミノ酸(およびその残基)のために用いることができる:アラニン(Ala,A);アルギニン(Arg,R);アスパラギン(Asn,N);アスパラギン酸(Asp,D);システイン(Cys,C);グリシン(Gly,G);グルタミン酸(Glu,E);グルタミン(Gln,Q);ヒスチジン(His,H);イソロイシン(Ile,I);ロイシン(Leu,L);リシン(Lys,K);メチオニン(Met,M);フェニルアラニン(Phe,F);プロリン(Pro,P);セリン(Ser,S);スレオニン(Thr,T);トリプトファン(Trp,W);チロシン(Tyr,Y);およびバリン(Val,V)。非−極性(疎水性)アミノ酸はアラニン、ロイシン、イソロイシン、バリン、プロリン、フェニルアラニン、トリプトファンおよびメチオニンを含む。中性アミノ酸はグリシン、セリン、スレオニン、システイン、チロシン、エスパラギンおよびグルタミンを含む。正に荷電した(塩基性)アミノ酸はアルギニン、リシンおよびヒスチジンを含む。負に荷電した(酸性)アミノ酸はアスパラギン酸およびグルタミン酸を含む。
「タンパク質」とは、ペプチド結合を介して結合した(天然に生じるまたは生じないを問わず)2以上の個々のアミノ酸のいずれのポリマーもいい、1つのアミノ酸(またはアミノ酸残基)のα−炭素に結合したカルボン酸基のカルボキシル炭素原子が、隣接アミノ酸のα−炭素に結合したアミノ基のアミノ窒素原子に共有結合するようになる場合に起こる。用語「タンパク質」は、その意味の中に(時々、本明細書中では相互交換可能に用いることができる)用語「ポリペプチド」および「ペプチド」を含むことが理解される。加えて、複数ポリペプチドサブユニットまたは他の構成要素を含むタンパク質もまた、本明細書中で用いる「タンパク質」の意味内に含まれると理解されるであろう。同様に、タンパク質、ペプチドおよびポリペプチドの断片もまた本発明の範囲内にあり、本明細書中においては「タンパク質」ということができる。
生物学的系(細胞フリー系を含めた、イン・ビボまたはイン・ビトロであるかを問わず)において、与えられたタンパク質の特定のアミノ酸配列(すなわち、ポリペプチドの「一次構造」、アミノ末端からカルボキシ末端にかけて記載した場合)は、遺伝的情報、典型的にはゲノムDNA(これは、本発明の目的では、オルガネラDNA、例えば、ミトコンドリアDNAおよびクロロプラストDNAを含むと理解される)によって特定されるmRNAの暗号部分のヌクレオチド配列によって決定される。勿論、特定の生物のゲノムを構成するいずれのタイプの核酸(例えば、ほとんどの動物および植物の場合には二本鎖DNA、いくつかのウイルスの場合には単鎖または二本鎖RNAなど)も、特定の生物の遺伝子産物をコードすると理解される。メッセンジャーRNAは、その特別な同一性が、次いで、新生のポリペプチドに翻訳されるmRNAの特定のコドン(mRNAに関しては、mRNAの暗号領域における3つの隣接A、G、CまたはUリボヌクレオチド)によって特定される、遊離アミノ酸の重合を触媒するリボソーム上で翻訳される。組換えDNA技術は、生きた生物において天然で生じさせる場合と同一の一次配列を有するタンパク質およびポリペプチド(例えば、ヒトインスリン、ヒト成長ホルモン、エリスロポエチン、顆粒球コロニー刺激因子など)の大規模な合成を可能とした。加えて、そのような技術は、これらおよび他のタンパク質のアナログの合成を可能とし、そのアナログは天然タンパク質と比較して1以上のアミノ酸の欠失、挿入および/または置換を含むことができる。また、組換えDNA技術は全新規タンパク質の合成を可能とする。
非−生物学的系(例えば、固体状態合成を使用するもの)においては、(ジスルフィド(システイン)結合位置も含む)タンパク質の一次構造は使用者によって決定され得る。その結果、生物学的に生産されるタンパク質のそれを複製した一次構造を有するポリペプチドは、そのようなタンパク質のアナログが可能であるように、達成することができる。加えて、天然に生じないアミノ酸を取り込むタンパク質が可能であるように、完全に新規なポリペプチドを合成することもできる。
当該分野で知られているように、2つのポリペプチドの間の「同様性」は、1つのポリペプチドの(その中の保存されたアミノ酸置換物を含めた)核酸配列を第二のポリペプチドの配列と比較することによって決定することができる。本発明のポリペプチドをコードする核酸の断片または部分を用いて、本発明の全長アミノ酸を合成することができる。本明細書中で用いるように、「%同一性」は、例えば、the National Institutes of Health/NCBIデータベース(Bethesda,MD;www.ncbi.nlm.nih.gov/cgi−bin/BLAST/nph−newblast参照)によって供されたデフォルト重み付けに従って配列のギャップおよび配列のミスマッチを重み付けする、例えば、ギャップドBLASTアルゴリズム(例えば、Altschul et al.,1997 Nucl.Ac.Res.25:3389;Altschul et al.,1990 J.Mol.Biol.,215:403−410)を用いて、2以上のポリペプチドを整列させ、それらの配列を分析した場合に、対応するアミノ酸残基位置に位置する同一のアミノ酸のパーセンテージをいう。他の整列方法は、BLITZ(MPsrch)(Sturrock & Collins,1993)、およびFASTA(Pearson and Lipman,1988 Proc.Natl.Acad.Sci.USA.85:2444−2448)を含む。
用語「単離された」は、天然に生じる物質の場合には、該物質がその天然または元の環境であるか、またはそこから取り出されており、あるいはもはやそれを伴っていないことを意味する。例えば、生きた動物に存在する天然に生じる核酸またはタンパク質またはポリペプチドは単離されていないが、天然系において同時に存在する物質のいくつかまたは全てから分離された同一の核酸またはポリペプチドは単離されている。そのような核酸はベクターの一部であり得、および/またはそのような核酸またはポリペプチドは組成物の一部であり得、そのようなベクターまたは組成物がその天然の環境の一部ではない点で依然として単離されている。用語「単離された」は、本発明の組換えにより製造された構築体のような天然に生じない物質の場合には、好ましくは、例えば、それらが当該分野で公知の技術によって測定して少なくとも約80%純粋、より好ましくは少なくとも約90%、なおより好ましくは少なくとも約95%純粋であるように、所望の程度まで精製されたタンパク質およびペプチドのように、製造の間に通常はそれに伴う成分が実質的にまたは本質的に含まれない物質を含む。
用語「遺伝子」は、ポリペプチド鎖を生産することに関与するDNAのセグメントを意味し;それは、ポリペプチドコーディング領域の前および後の領域、例えば、「リーダーおよびトレイラー」ならびに関連する個々のコーディングセグメント(エクソン)の間の介入配列(イントロン)も含むことができる。
本明細書中で記載するように、本発明は、例えば、説明のために、限定されるものではないが、当該融合タンパク質の検出、機能的改変、単離および/または精製を可能とする、例えば、さらなる機能的ポリペプチド配列に融合した、または他の方法で結合した結合ドメインポリペプチド配列の発現を供するように、さらなる天然または作成された免疫グロブリンドメインコーディング配列にイン・フレームで融合した、または他の方法で結合した、例えば、結合ドメインコーディング配列のような結合領域コーディング配列を有する核酸によって、全部がまたは部分的にコードされ得る結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた構築体を提供する。そのような融合タンパク質は、例えば、(かつ前記したように)、ジスルフィド結合形成に参画するためのスルフヒドリル基の利用可能性を低下させることによって、およびADCCおよび/またはCDCを増強し、および/または補体を固定する能力を付与することによって、融合産物の挙動に影響するさらなる免疫グロブリン−由来ポリペプチド配列を含有することによって、結合ドメインの機動的改変を可能とすることができる。
ポリペプチドの修飾は、当業者に知られたいずれの手段によって行うこともできる。本明細書中における好ましい方法は、例えば、融合タンパク質をコードするDNAの修飾、および修飾されたDNAの発現に依拠する。本発明の構築体の1つ、例えば、本明細書中に議論する結合ドメイン−免疫グロブリン融合物の1つをコードするDNAは、例えば、後に記載するものを含めた標準的な方法を用いて改変し、または突然変異誘発させることができる。例えば、マルチマーの形成を他の方法で容易にすることができ、または特定の分子立体配座を促進することができるシステイン残基は、ポリペプチドから欠失させることができるか、または、例えば、凝集体形成を担う、またはそれに参画するシステイン残基は置き換えることができる。必要であれば、例えば、凝集体形成に寄与するシステイン残基の同一性は、システイン残基を欠失し、および/または置き換え、および得られたタンパク質が、生理学上許容される緩衝剤および塩を含有する溶液中で凝集するか否かを確認することによって、経験的に決定することができる。加えて、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合物の断片を構築し、用いることができる。前記したように、当業者が、本発明の発現構築体のコードされた産物に含めるために適当なポリペプチドドメインを容易に選択できるように、多くの候補結合ドメイン−免疫グロブリン融合のためのカウンターレセプター/リガンド結合ドメインが描かれている。
アミノ酸の保存的置換はよく知られており、一般に、得られた結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質分子の生物学的活性を変化させることなくなすことができる。例えば、極性残基、荷電した残基、疎水性残基、小さな残基等の群内で相互交換することによって、そのような置換を一般的に行う。必要であれば、そのような置換は、単に、イン・ビトロ生物学的アッセイにおいて適当な細胞表面レセプターに結合し、または適当な抗原または所望の標的分子に結合する能力につき得られた修飾タンパク質をテストすることによって単に経験的に決定することができる。
本発明は、さらに、もし配列の間に少なくとも約70%、好ましくは少なくとも約80ないし85%、より好ましくは少なくとも約90%、なおより好ましくは少なくとも約95%、約96%、97%、98%または99%同一性があれば、当業者に容易に明らかであるように、本明細書中で提供した、例えば、ポリヌクレオチド配列をコードする結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた本発明の構築体にハイブリダイズする核酸、またはその相補体に関する。
本発明は、特に、例えば、本明細書中で言及した結合ドメイン−免疫グロブリン融合をコードする核酸に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸に関する。本明細書中で用いるように、特定のストリンジェンシーの条件下で「ハイブリダイズする」ことは、2つの単鎖核酸分子の間で形成されるハイブリッドの安定性を記載するのに用いられる。ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーは、典型的には、そのようなハイブリッドがアニールされ、洗浄されるイオン強度および温度の条件で表される。用語「ストリンジェント」な条件とは、ポリヌクレオチドの間のハイブリダイゼーションを可能とする条件をいう。ストリンジェントな条件は、塩濃度、有機溶媒(例えば、ホルムアミド)の濃度、温度、および当該分野でよく知られた他の条件によって定義することができる。特に、ストリンジェンシーは、塩の濃度を低下させ、有機溶媒(例えば、ホルムアミド)の濃度を増加させ、またはハイブリダイゼーション温度を上昇させることによって増加させることができる。例えば、ストリンジェントな塩濃度は、通常は、約750mM NaClおよび75mMクエン酸三ナトリウム未満、好ましくは約500mM NaClおよび50mMクエン酸三ナトリウム未満、最も好ましくは250mM NaClおよび25mMクエン酸三ナトリウム未満であろう。低ストリンジェンシーハイブリダイゼーションは有機溶媒、例えば、ホルムアミドの不存在下で得ることができ、他方、高ストリンジェンシーハイブリダイゼーションは有機溶媒の存在下で(例えば、少なくとも約35%ホルムアミド、最も好ましくは少なくとも約50%ホルムアミドにて)得ることができる。ストリンジェントな温度条件は通常、少なくとも約30℃、より好ましくは約37℃、最も好ましくは少なくとも約42℃の温度を含む。変化する追加のパラメーター、例えば、ハイブリダイゼーション時間、洗剤、例えば、ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)の濃度、およびキャリアーDNAの包含または排除は当業者によく知られている。種々のレベルのストリンジェンシーは、必要に応じてこれらの種々の条件を組み合わせることによって達成され、これは、当分野の技量内のものである。他の典型的な「高」、「中程度」および「低」ストリンジェンシーは以下の条件、またはそれと同等な条件を含む:高ストリンジェンシー:0.1×SSPEまたはSSC、0.1%SDS、65℃;中程度ストリンジェンシー:0.2×SSPEまたはSSC、0.1%SDS、50 ℃;および低ストリンジェンシー:1.0×SSPEまたはSSC、0.1%SDS、50℃。当業者に知られたように、ハイブリダイゼーション条件のストリンジェンシーの変化は、プレハイブリダイゼーション、ハイブリダイゼーションおよび洗浄工程で用いられる時間、温度および/または溶液の濃度を変化させることによって達成することができ、適当な条件は、部分的には、用いるプローブの、およびブロットしたプロバンド核酸試料の特別なヌクレオチド配列にも依存することができる。従って、適当にストリンジェントな条件は、プローブの所望の選択性が、ある他のプロバンド配列にハイブリダイズせずに、1以上のあるプロバンド配列にハイブリダイズするその能力に基づいて同定される場合に、過度な実験なくして容易に選択できるのは認識されるであろう。
本明細書中で用いるように、好ましい「ストリンジェントな条件」とは、一般には、もし配列の間に少なくとも約90ないし95%、より好ましくは少なくとも約97%の同一性がある場合にのみ起こるハイブリダイゼーションをいう。例えば、本明細書中で言及する結合ドメイン−免疫グロブリン融合コーディング核酸配列にハイブリダイズする核酸構築体は、好ましい具体例においては、例えば、cDNAによってコードされる結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドと実質的に同一の生物学的機能または活性を保有するポリペプチドをコードする。
ポリヌクレオチドとも本明細書中でいう本発明の核酸はRNA、例えば、mRNAの形態、またはDNAの形態であってよく、そのDNAは(特異的メッセンジャーRNAに対して相補的なDNA分子である「相補的DNA」とも呼ばれる)cDNA、ゲノムDNA、および合成DNAを含む。該DNAは二本鎖または単鎖であってよく、もし単鎖であれば、コーディングストランドまたは非−コーディング(アンチセンス)ストランドであってよい。本発明の構築体、例えば、本発明に従って用いられる結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドをコードするコーディング配列は、その部分につき当該分野で知られた、または本明細書中に記載されたコーディング配列と同一である部分を含むことができ、あるいは遺伝暗号の冗長または縮重の結果として、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドの全てまたは部分を含めた、同一の構築体またはその部分をコードする異なるコーディング配列であってよい。
本発明の構築体、例えば、本発明に従って用いられる結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドをコードする核酸は、限定されるものではないが;結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドのような該構築体のためのコーディング配列のみ;結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドおよびさらなるコーディング配列のような、該構築体のためのコーディング配列;結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチド(および所望により、さらなるコーディング配列)のような、該構築体のためのコーディング配列、および例えば、さらに、限定されるものではないが、調節された、または調節可能なプロモーター、エンハンサー、他の転写調節配列、リプレッサー結合配列、翻訳調節配列、またはいずれかの他の調節核酸配列であり得る1以上の調節核酸配列を含むことができる、イントロン、または結合ドメイン―免疫グロブリン融合ポリペプチドまたはその部分についてのコーディング配列の5’および/または3’側の非−コーディング配列のような非−コーディング配列を含むことができる。かくして、構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を「コードする核酸」または「コードするポリヌクレオチド」という用語は、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドについてのコーディング配列のみを含む核酸、ならびにさらなるコーディングおよび/または非−コーディング配列を含む核酸を含む。
本明細書中で記載されたように用いられる核酸およびオリゴヌクレオチドは、当業者に知られたいずれの方法によって合成することもできる(例えば、WO 93/01286,米国出願第07/723,454号;米国特許第5,218,088号;米国特許第5,175,269号;米国特許第5,109,124号参照)。種々のオリゴヌクレオチドおよび核酸配列の同定は、当該分野で知られた方法をやはり含む。例えば、クローニングに有用な所望の特性、長さおよび他の特徴は良く知られている。ある具体例において、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、スルホネート、スルフェート、ケチル、ホスホロジチオエート、ホスホラミデート、ホスフェートエステル、およびアンチセンス適用で有用なことが証明されている他のそのような結合のような結合を含有することによって、内因性宿主細胞ヌクレオチド分解酵素による分解に抵抗する合成オリゴヌクレオチドおよび核酸配列を設計することができる。例えば、Agrwal et al.,Tetrehedron Lett.28:3539−3542(1987);Miller et al.,J.Am.Chem.Soc.93:6657−6665(1971);Stec et al.,Tetrehedron Lett.26:2191−2194(1985);Moody et al.,Nucl.Acids Res.12:4769−4782(1989);Uznanski et al.,Nucl.Acids Res.(1989);Letsinger et al.,Tetrahedron 40:137−143(1984);Eckstein,Annu.Rev.Biochem.54:367−402(1985);Eckstein,Trends Biol.Sci.14:97−100(1989); Stein In:Oligodeoxynucleotides. Antisense Inhibitors of Gene Expression, Cohen編,Macmillan Press,London,pp.97−117(1989);Jager et al.,Biochemistry 27:7237−7246(1988)参照。
1つの具体例において、本発明は、本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質で用いられる切断された成分(例えば、結合ドメインポリペプチド、ヒンジ領域ポリペプチド、リンカー等)を提供する。もう1つの具体例において、本発明は、本発明の構築体、例えば、そのような切断された成分を有する結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードする核酸を提供する。切断された分子は、注目する分子の全長バージョン未満を含むいずれかの分子であり得る。本発明によって提供される切断された分子は切断された生物学的ポリマーを含むことができ、本発明の好ましい具体例において、そのような切断された分子は切断された核酸分子または切断されたポリペプチドであり得る。切断された核酸分子は、公知のまたは記載された核酸分子の全長未満のヌクレオチド配列を有し、ここに、当業者がそれを全長分子とみなす限り、そのような公知のまたは記載された核酸分子は天然に生じる、合成、または組換え核酸分子であり得る。かくして、例えば、遺伝子配列に対応する切断された核酸分子は、当該遺伝子がコーディングおよび非−コーディング配列、プロモーター、エンハンサーおよび他の調節配列、フランキング配列等、および当該遺伝子の部分として認識される他の機能的および非−機能的配列を含む全長未満の遺伝子を含む。もう1つの例において、mRNA配列に対応する切断された核酸分子は、種々の翻訳された、および非−翻訳領域、ならびに他の機能的および非−機能的配列を含むことができる全長未満のmRNA転写体を含む。
他の好ましい具体例において、切断された分子は、特定のタンパク質またはポリペプチド成分の全長未満のアミノ酸配列を含むポリペプチドである。本明細書中で用いるように、「欠失」は、当業者によって理解されるその普通の意味を有し、例えば、本明細書中で提供される切断された分子の場合におけるように、対応する全長分子に対して、いずれかの末端からの、または非−末端領域からの配列の1以上の部分を欠く分子をいうことができる。核酸分子またはポリペプチドのような線状生物学的ポリマーである切断された分子は、分子のいずれかの末端からの1以上の欠失および/または分子の非−末端領域からの1以上の欠失を有することができ、ここに、そのような欠失は約1ないし1500の連続ヌクレオチドまたはアミノ酸残基、好ましくは約1ないし500の連続ヌクレオチドまたはアミノ酸残基、より好ましくは約1ないし300の連続ヌクレオチドまたはアミノ酸残基の欠失であってよく、約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31ないし40、41ないし50、51ないし74、75ないし100、101ないし150、151ないし200、201ないし250、または251ないし299の連続ヌクレオチドまたはアミノ酸残基の欠失を含む。ある特に好ましい具体例において、切断された核酸分子は約270ないし330の連続ヌクレオチドの欠失を有することができる。あるより好ましい具体例において、切断されたポリペプチド分子は、例えば、約80ないし140の連続アミノ酸の欠失を有することができる。
本発明は、さらに、本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドの断片、アナログおよび/または誘導体をコードする本明細書に言及した核酸の変種に関する。本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードする核酸の変種は、そこに含まれる核酸配列の1以上の部分の天然に生じる対立遺伝子変種、または例えば、配列を変化させるための当該分野で知られた方法を用いる分子工学によって変化させた配列を含めた、そのような配列または部分または配列の天然に生じない変種であり得る。当該分野で知られているように、対立遺伝子変種は、そのいずれも、コードされた結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドの機能を実質的にまたは望ましくなく変化させない、1以上のヌクレオチドの置換、欠失または付加の少なくとも1つを有することができる核酸配列の別の形態である。
本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の変種および誘導体は、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたはそのいずれかの部分をコードするヌクレオチド配列の突然変異によって得ることができる。天然アミノ酸配列の改変は、多数の慣用的方法のいずれかによって達成することができる。突然変異は、例えば、天然配列の断片への連結を可能とする制限部位が近接する、突然変異体配列を含むオリゴヌクレオチドを合成することによって特定の遺伝子座に導入することができる。連結に続き、得られた再構築された配列は所望のアミノ酸挿入、置換または欠失を有するアナログをコードする。
別法として、例えば、オリゴヌクレオチド−指向性部位特異的突然変異誘発手法を使用して、所定のコドンが置換、欠失または挿入によって改変することができる改変された遺伝子を提供することができる。そのような改変を行う例示的方法はWalder et al.,1986 Gene 42:133;Bauer et al.,1985 Gene 37:73;Craik,January 1985 BioTechniques 12−19; Smith et al.,January 1985 Genetic Engineering:Principles and Methods BioTechniques 12−19; Costa GL, et al.,「Site−directed mutagenesis using a rapid PCR−based method」, 1996 Methods Mol Biol.57:239−48;Rashtchian A.,「Novel methods for cloning and engineering genes using the polymerase chain reaction」, 1995 Curr Opin Biotechnol.6(1):30−6;Sharon J,et al.,「Oligonucleotide−directed mutagenesis of anitibody combining Sites」, 1993 Int Rev Immunol. 10(2−3):113−27;Kunkel,1985 Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:488;Kunkel et al.,1987 Methods in Enzymol.154:367;および米国特許第4,518,584号および第4,737,462号によって開示されている。
例として、DNAの修飾は、重複延長によるPCRスプライシング(SOE)のような、DNA鋳型における改変を導入し、それを増幅するためのプライマーを用いるDNA増幅方法の使用と組み合わせた、タンパク質をコードするDNAの部位−指向性突然変異誘発によって行うことができる。部位−指向性突然変異誘発は、典型的には、よく知られ、かつ商業的に入手可能なM13ファージベクターのような単鎖および二本鎖形態を有するファージベクターを用いて行われる。単鎖ファージ複製起点を含有する他の適当なベクターを用いることができる。例えば、Veira et al.,1987 Meth.Enzymol.15:3参照。一般に、部位−指向性突然変異誘発は、注目するタンパク質(例えば、与えられた結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の全てまたは成分部分)をコードする単鎖ベクターを調製することによって行われる。単鎖ベクターにおけるDNAに対する相同性の領域内にある所望の突然変異を含むオリゴヌクレオチドプライマーはベクターにアニールされ、続いて、1つのストランドが改変された配列をコードし、他方が元の配列をコードするヘテロデュプレックスを生じさせるためのプライマーとして二本鎖領域を用いるE.coli DNAポリメラーゼI(クレノウ断片)のようなDNAポリメラーゼを加える。ヘテロデュプレックスは、適当な細菌細胞に導入され、所望の突然変異を含むクローンが選択される。得られた改変DNA分子は、適切な宿主細胞にて組換えにより発現されて、修飾されたタンパク質を生じさせることができる。
例えば、アミノ酸残基または配列の付加または置換、または生物学的活性で必要ないまたは望まない末端または内部残基または配列の欠失に関するコードを含む同等なDNA構築体もまた本発明に含まれる。例えば、前記にて議論したように、生物学的活性にとって望ましくない、または必須でないCys残基をコードする配列を改変して、Cys残基を欠失し、または他のアミノ酸で置き換えることができ、例えば、かくして、合成または再生に際して正しくないまたは望まない分子内ジスルフィドブリッジの形成を妨げることができる。
「宿主細胞」または「組換え宿主細胞」は、ベクター、例えば、発現ベクターを含む細胞、または注目するタンパク質を発現させる組換え技術によって他の方法で操作されている細胞である。宿主生物は、イン・ビトロおよびイン・ビボ発現を含めた細菌(例えば、E.coli)、酵母(例えば、Saccharomyces cerevisiaeおよびPichia pastoris)、昆虫細胞、および哺乳動物細胞のような、本発明の構築体、例えば、本発明の組換え構築体によってコードされる結合ドメイン−免疫グロブリン融合生産物の組換え生産が起こり得る生物を含む。宿主生物は、かくして、本明細書中で提供される組成物の生産における構築、増殖、発現または他の工程のための生物を含むことができる。宿主は、本明細書中に記載したように、免疫応答が起こる被験体を含む。グリコシル化タンパク質を生産する本発明の構築体の生産のための現在好ましい宿主生物は、グリコシル化タンパク質の発現および回収を可能とする哺乳動物細胞または他の細胞系である。他の細胞系は、同系繁殖マウス株およびマウス細胞系、およびヒト細胞および細胞系を含む。
本発明の所望の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードするDNA構築体はベクター、例えば、適当な宿主における発現のためのプラスミドに導入される。好ましい具体例において、宿主は哺乳動物宿主、例えば、哺乳動物細胞系である。リガンドまたは核酸結合ドメインをコードする配列は、好ましくは、特定の宿主における発現のためにコドンが最適化されている。かくして、例えば、もし構築体が、例えば、ヒト結合ドメイン−免疫グロブリン融合であって、細菌で発現されるならば、コドンは細菌用法のために最適化されることができる。小さなコーディング領域では、遺伝子は単一オリゴヌクレオチドとして合成することができる。より大きなタンパク質では、複数オリゴヌクレオチドのスプライシング、突然変異誘発、または当該分野で知られた他の技術を用いることができる。プロモーターおよびオペレーターのような調節領域であるプラスミドまたは他のベクター中のヌクレオチドの配列は、転写のために相互に操作可能に連結される。結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードするヌクレオチドの配列は、分泌シグナルをコードするDNAも含むことができ、それにより得られたペプチドは前駆体タンパク質である。得られたプロセッシングされたタンパク質はペリプラズム空間または発酵培地から回収することができる。
好ましい具体例において、DNAプラスミドは転写ターミネーター配列も含むことができる。本明細書中で用いるように、「転写ターミネーター領域」は、転写の終了をシグナリングする配列である。全転写ターミネーターは、挿入された結合ドメイン−免疫グロブリン融合コーディング遺伝子またはプロモーターの源と同一であってもまたは異なっていてもよいタンパク質−コーディング遺伝子から得ることができる。転写ターミネーターは、本明細書中の発現系の任意の成分であるが、好ましい具体例で使用される。
本明細書中で用いるプラスミドまたはベクターは、注目するタンパク質またはポリペプチドをコードするDNAと操作可能に会合したプロモーターを含み、これは、プラスミドの所望の使用(例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合コーディング配列を含むワクチンの投与)に応じて前記した適当な宿主(例えば、細菌、マウスまたはヒト)におけるタンパク質の発現のために設計される。本明細書中においてタンパク質およびポリペプチドの発現のための適当なプロモーターは広く入手可能であって、当該分野でよく知られている。調節領域に連結された誘導性プロモーターまたは構成的プロモーターが好ましい。そのようなプロモーターは、例えば、限定されるものではないが、T3、T5、SP6プロモーターのようなT7ファージプロモーターおよび他のT7−様ファージプロモーター、E.coliからのlacUV5のようなtrp、lppおよびlacプロモーター;バキュロウイルス/昆虫細胞発現系のP10またはポリヘドリン遺伝子プロモーター(例えば、米国特許第5,243,041号、第5,242,687号、第5,266,317号、第4,745,051号および第5,169,784号参照)および他の真核生物発現系からの誘導性プロモーターを含む。タンパク質の発現では、そのようなプロモーターは、lacオペロンのような制御領域と作動可能に連結させてプラスミドに挿入される。
好ましいプロモーター領域は、例えば、哺乳動物細胞で誘導性であり機能的なプロモーター領域である。細菌発現のための適当な誘導性プロモーターおよびプロモーター領域の例は、限定されるものではないが:イソプロピルβ−D−チオガラクトピラノシドに応答性のE.coli lacオペレーター(IPTG;Nakamura et al.,1979 Cell 18:1109−1117参照);重金属(例えば、亜鉛)誘導に対して応答性のメタロチオネインプロモーター金属−調節−エレメント(例えば、米国特許第4,870,009号参照);IPTGに対して応答性のファージT7lacプロモーター(例えば、米国特許第4,952,496号;およびStudier et al., 1990 Meth.Enzymol.185:60−89参照)およびTACプロモーターを含む。用いる発現宿主系に応じて、プラスミドは、所望により、宿主で機能的である選択マーカー遺伝子または複数遺伝子を含むことができる。かくして、例えば、選択マーカー遺伝子は、形質転換された細菌細胞がほとんどの未形質転換細胞の中から同定され、選択的に増殖されるのを可能とする表現型を細菌に付与するいずれの遺伝子も含む。例えば、細菌宿主に適当な選択マーカー遺伝子はアンピシリン耐性遺伝子(Amp)、テトラサイクリン耐性遺伝子(Tc)およびカナマイシン耐性遺伝子(Kan)を含む。カナマイシン耐性遺伝子が細菌発現で現在好ましい。
種々の発現系において、プラスミドまたは他のベクターは、操作可能に連結したタンパク質の分泌用のシグナルをコードするDNAも含むことができる。用いるのに適した分泌シグナルは広く入手でき、当該分野でよく知られている。E.coliで機能的な原核生物および真核生物分泌シグナルを使用することができる。発現系に応じて、現在好ましい分泌シグナルは限定されるものではないが、以下のE.coli遺伝子:ompA、ompT、ompF、OmpC、ベータ−ラクタマーゼおよびアルカリ性ホスファターゼなどによってコードされるものを含むことができる(von Heijne,J.Mol.Biol.184:99−105,1985)。加えて、細菌pelB遺伝子分泌シグナル(Lei et al.,J.Bacteriol.169:4379,1987)、phoA分泌シグナル、および昆虫細胞で機能的なcek2を使用することができる。ある発現系のための最も好ましい分泌シグナルはE.coli ompA分泌シグナルである。当業者に公知の他の原核生物および真核生物分泌シグナルを使用することもできる(例えば、von Heijne,J.Mol.Biol.184:99−105,1985)。本明細書中で記載された方法を用い、当業者であれば、例えば、酵母、昆虫または哺乳動物細胞で機能的な分泌シグナルを置き換えて、それらの細胞からタンパク質を分泌させることができる。
E.coli細胞の形質転換のための好ましいプラスミドはpET発現ベクター(例えば、pET−11a,pET−12a−c,pET−15b;米国特許第4,952,496号参照;Novagen,Madison、WIから入手可能)を含む。他の好ましいプラスミドは、tacプロモーターを含有するpKKプラスミド、特にpKK223−3を含む(Brosius et al.,1984 Proc.Natl.Acad.Sci.81.6929;Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology;米国特許第5,122,463号、第5,173,403号、第5,187,153号、第5,204,254号、第5,212,058号、第5,212,286号、第5,215,907号、第5,220,013号、第5,223,483号、および第5,229,279号)。プラスミドpKKは、アンピシリン耐性遺伝子のカナマイシン耐性遺伝子での置換によって修飾されている(Pharmaciaから入手可能;pUC4Kから得られる、例えば、Vieira et al.,(1982 Gene 19:259−268;および米国特許第4,719,179号参照)。(pJVETLおよびその誘導体とも呼ばれる)pBlueBacのようなバキュロウイルスベクター、特にpBlueBac III(例えば、米国特許第5,278,050号、第5,244,805号、第5,243,041号、第5,242,687号、第5,266、317号、第4,745,051号および第5,169,784号参照;Invitrogen,San Diegoから入手可能)を昆虫細胞におけるポリペプチドの発現で用いることもできる。他のプラスミドはpIN−IIIompA2のようなpIN−IIIompAプラスミド(米国特許第4,575,013号参照;またDuffaud et al.,Meth.Enz.153:492−507,1987も参照)を含む。
好ましくは、もし1以上のDNA分子を細菌細胞で複製するならば、好ましい宿主はE.coliである。好ましいDNA分子はそのような系であって、細菌の世代間でのDNA分子の維持を確実とするために細菌複製起点も含む。このようにして、大量のDNA分子を細菌での複製によって生産することができる。そのような発現系において、好ましい細菌複製起点は、限定されるものではないが,fl−oriおよびcol E1複製起点を含む。そのような系についての好ましい宿主は、lacUVプロモーターのような、誘導性プロモーターに操作可能に連結したT7 RNAポリメラーゼをコードするDNAの染色体コピーを含む(米国特許第4,952,496号参照)。そのような宿主は、限定されるものではないが、溶原菌E.coli株HMS174(DE3)pLysS、BL21(DE3)pLysS、HMS174(DE3)およびBL21(DE3)を含む。株BL21(DE3)が好ましい。pLys株は低レベルのT7リゾチーム、T7 RNAポリメラーゼの天然インヒビターを供する。
提供されたDNA分子は、リプレッサータンパク質をコードする遺伝子を含むこともできる。リプレッサータンパク質は、リプレッサータンパク質が結合したヌクレオチドの配列を含むプロモーターの転写を抑制することもできる。プロモーターは、細胞の生理学的条件を改変することによって抑制解除ができる。例えば、改変は、オペレーター、または調節タンパク質、またはDNAの他の領域と相互作用する能力を阻害する分子を増殖培地に加えることによって、あるいは増殖培地の温度を変化させることによって達成することができる。好ましいリプレッサータンパク質は、限定されるものではないが、IPTG誘導に対して応答性のE.coli lacIリプレッサー、温度感受性λ cI857リプレッサー等を含む。E.coli lacIリプレッサーが好ましい。
一般に、本発明の組換え構築体は、転写および翻訳に必要なエレメントも含むであろう。特に、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードする核酸配列を含有する組換え発現構築体が宿主細胞または生物での発現で意図されている場合に、そのようなエレメントが好ましい。本発明のある具体例において、細胞結合ドメイン−免疫グロブリン融合コーディング遺伝子の細胞型優先または細胞型特異的発現は、遺伝子をプロモーターの調節下に置くことによって達成することができる。プロモーターの選択は、形質転換すべき細胞型、および所望の制御の程度またはタイプに依存するであろう。プロモーターは構成的であるか、または活性であり得、さらに、細胞型特異的、組織特異的、個々細胞特異的、事象特異的、一時的に特異的または誘導性であってよい。細胞型特異的プロモーターおよび事象タイプ特異的プロモーターが好ましい。構成的または非特異的プロモーターの例はSV40初期プロモーター(米国特許第5,118,627号)、SV40後期プロモーター(米国特許第5,118,627号)、CMV初期遺伝子プロモーター(米国特許第5,168,062号)、およびアデノウイルスプロモーターを含む。ウイルスプロモーターに加えて、細胞プロモーターは本発明の文脈内で使用することもできる。特に、いわゆるハウスキーピング遺伝子のための細胞プロモーターは有用である。ウイルスプロモーターは一般には細胞プロモーターよりも強力なプロモーターである故にそれらが好ましい。特別な宿主で使用される適当なプロモーターが当業者によって容易に選択できるように、高等真核生物を含めた多くの真核生物の遺伝子でプロモーター領域が同定されている。
誘導性プロモーターも用いることができる。これらのプロモーターはデキサメタゾンによって誘導可能なMMTV LTR(PCT WO 91/13160);重金属によって誘導可能なメタロチオネインプロモーター;およびcAMPによって誘導可能なcAMP応答エレメントを持つプロモーターを含む。誘導性プロモーターを用いることによって、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードする核酸配列は本発明の発現構築体によって細胞に送達することができ、インデューサーの添加まで休止しているであろう。これは、さらに、遺伝子産物の生産のタイミングの制御を可能とする。
事象タイプ特異的プロモーターは、腫瘍形成またはウイルス感染のような事象の出現に際してのみ活性であるか、またはアップレギュレートされる。HIV LTRは事象−特異的プロモーターのよく知られた例である。該プロモーターは、tat遺伝子産物が存在するのでなければ、不活性であり、これはウイルス感染に際して起こる。いくつかの事象−タイププロモーターは組織−特異的でもある。
加えて、特別な細胞遺伝子で協調的に調節されるプロモーターを用いることができる。例えば、本発明の特別な結合構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質−コーディング遺伝子の発現が、1以上のさらなる内因性または外因性に導入された遺伝子の発現と協調して望まれる場合、協調して発現される遺伝子のプロモーターを用いることができる。このタイプのプロモーターは、その組織内での特異的免疫応答性細胞が活性化されて、または他の方法で動員されて、免疫応答に参画できるように、免疫系の特別な組織における免疫応答の誘導に関連した遺伝子発現のパターンが知られている場合に特に有用である。
プロモーターに加えて、リプレッサー配列、負レギュレーター、または組織−特異的サイレンサーを挿入して、例えば、治療戦略の一部として一過的に免疫無防備状態となる宿主のような、ある状況で結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質コーディング遺伝子の非−特異的発現を低下させることができる。複数のリプレッサーエレメントをプロモーター領域に挿入することができる。転写の抑制は、リプレッサーエレメントの向きまたはプロモーターからの距離から独立している。1つのタイプのリプレッサー配列はインシュレータ配列である。そのような配列は転写を阻害し(Dunaway et al.,1997 Mol Cell Biol 17:182−9;Gdula et al.,1996 Proc Natl Acad Sci USA 93:9378−83、Chan et al.,1996 J Virol 70:5312−28;Scott and Geyer,1995 EMBO J 14:6258−67;Kalos and Fournier,1995 Mol Cell Biol 15:198−207;Chung et al.,1993 Cell 74:505−14)、望まないバックグラウンド転写を沈黙させるであろう。
リプレッサーエレメントはタイプII(軟骨)コラーゲン、コリンアセチルトランスフェラーゼ、アルブミン(Hu et al.,1992 J.Cell Growth Differ.3(9):577−588)、ホスホグリセレートキナーゼ(PGK−2)(Misuno et al.,1992 Gene 119(2):293−297)についての遺伝子のプロモーター領域で、および6−ホスホフルクト−2−キナーゼ/フルクトース−2,6−ビスホスファターゼ遺伝子においても同定されている(Lemaigre et al.,Mol.Cell Biol.11(2):1099−1106)。さらに、負調節エレメントTse−1は多数の肝臓特異的遺伝子において同定されており、肝細胞における遺伝子活性化のcAMP応答エレメント(CRE)−媒介誘導をブロックすることが示されている(Boshart et al.,1990 Cell 61(5):905−916)。
好ましい具体例において、所望の産物の発現を増加させるエレメントを構築体に取り込む。そのようなエレメントは内部リボソーム結合部位を含む(IRES;Wang and Siddiqui,1995 Curr.Top.Microbiol.Immunol 203:99;Ehrenfeld and Smeler 1995 Curr.Top.Microbiol. Immunol.203:65;Rees et al.,1996 Biotechniques 20:102;Sugimoto et al.,1994 Biotechnoloy 12:694)。IRESは翻訳の効率を増大させる。同様に、他の配列は発現を増強させることができる。いくつかの遺伝子では、特に5’末端の配列は転写および/または翻訳を阻害する。これらの配列は、通常、ヘアピン構造を形成することができるパリンドロームである。送達すべき核酸におけるいずれのそのような配列も一般には欠失される。転写体または翻訳された生産物の発現レベルをアッセイして、いずれの配列が発現に作用するするかを確認し、または確実とする。転写体のレベルが、ノーザンブロットハイブリダイゼーション、RNaseプローブ保護等を含めたいずれの公知の方法によってもアッセイすることができる。タンパク質レベルは、ELISA、ウェスタンブロット、免疫細胞化学または他のよく知られた技術を含めたいずれの公知の手法によってアッセイすることもできる。
他のエレメントを本発明の構築体に、例えば、本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質コーディング構築体に取り込むことができる。好ましい具体例において、構築体は、ポリアデニル化配列、スプライスドナーおよびアクセプター部位、およびエンハンサーを含めた転写ターミネーター配列を含む。哺乳動物細胞および他の真核生物細胞における構築体の発現および維持に有用な他のエレメントもまた取り込むことができる(例えば、複製起点)。該構築体は便宜には細菌細胞で生産されるので、細菌での増殖に必要な、またはそれを増強するエレメントを一体化させる。そのようなエレメントは複製起点、選択マーカー等を含む。
本明細書中で提供するように、本発明の構築体、例えば、遺伝子治療のために細胞に送達される結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードする核酸の発現を制御するさらなるレベルは、同時に2以上の異なって調節される核酸構築体を送達することによって供することができる。そのような複数核酸構築体アプローチの使用は、例えば、もう1つの発現されるコードされた成分の細胞タイプおよび/または存在に依存する空間時間的協調のような免疫応答の協調された調節を可能とすることができる。当業者であれば、調節された遺伝子発現の複数のレベルは、限定されるものではないが、プロモーター、エンハンサーおよび他のよく知られた遺伝子調節エレメントを含めた適当な調節配列の選択によって同様に達成することができる。
また、本発明はベクター、本発明の核酸を含む公知のベクターから調製した構築体、特に、例えば、本発明による本明細書中で提供された結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質およびポリペプチドをコードするいずれかの核酸を含む、遺伝子治療で有用な、送達構築体を含めた、種々の公知の構築体のいずれかを含む「組換え発現構築体」;本発明のベクターおよび/または他の構築体で遺伝子工学により作成された宿主細胞、および組換え技術によって、例えば、本発明の結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドおよび融合タンパク質、またはその断片または変種をコードする核酸配列を含む発現または他の構築体を投与する方法にも関する。
例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質を含めた本発明の種々の構築体は、構築体の性質(例えば;前記したプロモーターのタイプ)、および所望の宿主細胞の性質(例えば、有糸分裂後に最終的に分化したか、または活動的に分裂しているか;例えば、発現構築体がエピソームとして宿主細胞で起こるか、または宿主細胞ゲノムに一体化されるか)に応じて、適当なプロモーターの制御下で、遺伝子治療で用いる場合にはイン・ビボ宿主細胞を含めた実質的にいずれの宿主細胞においても発現させることができる。
原核生物および真核生物宿主で用いられる適当なクローニングおよび発現ベクターは、例えば、Sambrook, et al., Molecular Cloning; A Laboratory Manual, 第2版 Cold Spring Harbor,NY,(1989)によって記載されており;本明細書中で記載するように、本発明の特に好ましい具体例においては、組換え発現は、本発明の組換え発現構築体でトランスフェクトされた、または形質転換された哺乳動物細胞で行われる。また、例えば、Machida, CA.,「Viral Vectors for Gene Therapy:Methods and Protocols」;Wolff,JA,「Gene Therapeutics:Methods and Applcations of Direct Gene Transfer」(Birkhauser 1994);Stein,U and Walther,W(eds.P「Gene Therapy of Cancer: Methods and Protocols」(Humana Press 2000); Robbins, PD(ed.)、「Gene Therapy Protocols」(Humana Press 1997); Morgan, JR(ed.),「Genen Therapy Protocols」(Humana Press 2002);Meager, A(ed.),「Gene Therapy Technologies, Applications and Regulations: From Laboratory to Clinic」(Johon Wiley & Sons Inc. 1999);MacHida, CA and Constant, JG, 「Viral Vectors for Gene Therapy: Methods and Protocols」(Humana Press 2002);「New Methods Of Gene Therapy For Genetic Metabolic Diseases NIH Guide,」 Volume 22, Number 35, October 1, 1993。また、米国特許第6,384,210号(「Solvent for biopolimer synthesis, solvent microdroplets and methods of use」;第6,384,203号(「Family of immunoregulators designated leukocyte immunoglobulin−like receptors(LIR)」);第6,384,202号(「Cell−specific active compounds regulated by the cell cycle」);第6,384,018号(「Polynucleotide tuberculosis vaccine」);第6,383,814号(「Cationic amphiphiles for intracellular delivery of therapeutic molecules」);第6,383,811号(「Polyampholytes for delivering polyions to a cell」);第6,383,795号(「Efficient purification of adenovirus」);第6,383,794号(「Methods of producing high titer recombinant adeno−associated virus」);第6,383,785号(「Self−enhancing, pharmacologically controllable expression systems」);第6,383,753号(「Yeast mammalian regulators of cell proliferation」);第6,383,746号(「Functional promoter for CCR5」);第6,383,743号(「Method for serial analysis of gene expression」);第6,383,738号(「Herpes simplex virus ORF P is a repressor of viral protein synthesis」);第6,383,737号(「Human oxalyl−CoA Decarboxylase」);第6,383,733号(「Methods of screening for pharmacologically active compounds for the treatment of tumour diseases」);第6,383,522号(「Toxicity reduced composition containing an anti−neoplactic agent and a shark cartilage extract」);第6,383,512号(「Vesicular complexes and methods of making and using the same」);第6,383,481号(「Method for transplantation of hemopoietic stem cells」);第6,383,478号(「Polymeric encapsulation system promoting angiogenesis」);第6,383,138号(「Method for transdermal sampling of analytes」);第6,380,382号(「Gene encoding a protein having diagnostic, preventive, therapeutic, and other uses」);第6,380,371号(「Endoglycan: a novel protein having selectin ligand and chemokine presentation activity」);第6,380,369号(「Human DNA mismatch repair proteins」);第6,380,362号(「Polynucleotides, polypeptides expressed by the polynucleotides and methods for their use」);第6,380,170号(「Nucleic acid construct for the cell cycle regulated expression of structural genes」);第6,380,169号(「Metal complex contining oligonucleoside cleavage compounds and therapies」);第6,379,967号(「Herpesvirus saimiri as viral vector」);第6,379,966号(「Intravascular delivery of non−viral nucleic acid protease proteins, and uses thereof」)を含む、ワクチンを含めた遺伝子治療に関する最近の米国特許も参照されたし。
典型的には、例えば、発現構築体はプラスミドベクターに由来する。一つの好ましい構築体は修飾されたpNASSベクター(Clontech, Palo Alto CA)であり、これは、アンピシリン耐性遺伝子、ポリアデニル化シグナルおよびT7プロモーター部位をコードする核酸配列を有する。他の適当な哺乳動物発現ベクターはよく知られている(例えば、Ausubel et al.、1995;Sambrook et al.,前掲参照;また、例えば、Invitrogen, San Diego,CA;Novagen, Madison,WI; Pharmacia, Piscataway, NJ;その他からのカタログも参照)。増強された生産レベルの結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質(そのレベルは、適当な選択剤(例えば、メトトレキセート))の適用に続いて遺伝子増幅に由来する)を促進するための、適当な調節制御下にあるジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)コーディング配列を含む現在好ましい構築体を調製することができる。
一般に、組換え発現ベクターは複製起点、および宿主細胞の形質転換を可能とする選択マーカー、および前記したような下流構造配列の転写を指令する高度に発現される遺伝子に由来するプロモーターを含むであろう。異種構造配列を翻訳開始および終止配列と共に適当な相に組み立てる。かくして、例えば、本明細書中で提供される結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質コーディング核酸は、宿主細胞中で結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドを発現させるための組換え発現構築体としての種々の発現ベクター構築体のいずれか1つに含めることができる。ある好ましい具体例において、構築体はイン・ビボで投与される処方物に含める。そのようなベクターおよび構築体は染色体、非染色体および合成DNA配列、例えば、SV40の誘導体;細菌プラスミド;ファージDNA;酵母プラスミド;後に記載するようなワクシニア、アデノウイルス、鶏痘ウイルス、および偽狂犬病、または複製欠損レトロウイルスのようなプラスミドおよびファージDNA、ウイルスDNAの組合せに由来するベクターを含む。しかしながら、いずれかの他のベクターを組換え発現構築体の調製で用いることができ、好ましい具体例においては、そのようなベクターは宿主で複製可能であって、生存可能であろう。
適当なDNA配列は、例えば、種々の手法によってベクターに挿入することができる。一般にDNA配列は、当該分野で知られた手法によって、適当な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入される。クローニング、DNA単離、増幅および精製、DNAリガーゼ、DNAポリメラーゼ、制限エンドヌクレアーゼなどを含む酵素反応のための標準的な技術、および種々の分離技術は知られたものであり、当業者によって通常使用される。多数の標準的な技術が、例えば、Ausubel et al.(1993 Current Protocols in Molecular Biology, Greene Publ. Assoc.Inc.& John Wiley & Sons,Inc.,Boston,MA);Sambrook et al.(1989 Molecular Cloning, 第2版 Cold Spring Harbor Laboratory, Plailview,NY);Maniatis et al.(1982 Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory, Plainview,NY);Glover(編)(1985 DNA Clonig Vol.I and II,IRL Press,Oxford,UK);Hames and Higgins(編),(1985 Nucleic Acid Hybridization,IRL Press,Oxford,UK)その他に記載されている。
発現ベクター中のDNA配列は、mRNA合成を指令するために、少なくとも1つの適当な発現制御配列(例えば、構成的プロモーターまたは調節されたプロモーター)に操作可能に連結される。そのような発現制御配列の代表的な例は、前記したような、真核生物細胞またはそれらのウイルスのプロモーターを含む。プロモーター領域は、選択マーカーとともにCAT(クロラムフェニコールトランスフェラーゼ)ベクターまたは他のベクターを用いていずれかの所望の遺伝子から選択することができる。真核生物プロモーターはCMV即時型、HSVチミジンキナーゼ、初期および後期SV40、レトロウイルスからのLTR、およびマウスメタロチオネイン−Iを含む。適当なベクターおよびプロモーターの選択は十分に当業者のレベル内のものであり、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドをコードする核酸に操作可能に連結された少なくとも1つのプロモーターまたは調節されたプロモーターを含む、特に好ましい組換え発現構築体の調製を本明細書中に記載する。
高等真核生物による本発明内に含まれるタンパク質およびポリペプチドをコードするDNAの転写は、エンハンサー配列をベクターに挿入することによって増大させることができる。エンハンサーは、プロモーターに作用してその転写を増大させる通常は約10ないし300bpのDNAのシス−作用エレメントである。複製起点bp100ないし270の後期側のSV40エンハンサー、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後期側のポリオーマエンハンサー、およびアデノウイルスエンハンサーを含む例。
遺伝子治療は病気を治療するための遺伝物質の使用である。それは、欠陥遺伝子を置き換え、または新しい遺伝子を細胞および/または組織に加える戦略を含み、それは、癌の治療、代謝障害の修正において、および免疫療法の分野で適用するために開発されている。本発明の遺伝子治療は、本明細書中に記載された病気、障害および/または疾患の治療のための、別々の担体または送達ビークルまたは構築体の有りまたは無しでの本発明の種々の構築体の使用を含む。そのような構築体は、本明細書中に記載された病気、障害および/または疾患の治療または予防のためのワクチンとして用いることもできる。DNAワクチンは、例えば、免疫原性タンパク質をコードするポリヌクレオチド、および核酸決定基を用いて、病原体または腫瘍細胞に対して免疫系を刺激する。そのような戦略は後天性または先天性いずれかの免疫を刺激することができ、あるいはサイトカイン発現を介して免疫機能の修飾を含むことができる。イン・ビボ遺伝子治療は、患者またはヒト病気の動物モデルへの遺伝物質の直接的注入を含む。ワクチンおよび免疫調節は全身療法である。癌を治療する目的のものを含めた組織−特異的イン・ビボ療法に関しては、局所化された遺伝子送達および/または発現/標的化システムが好ましい。多様な遺伝子療法ベクターが特異的組織を標的化するように設計されており、例えば、その全てが本明細書で考えられるカテーテル−ベースの技術を用い、特異的組織を物理的に標的とする手法が開発されている。遺伝子治療に対するエクス・ビボアプローチも本明細書では考えられ、それは、患者自身の細胞の取り出し、遺伝的修飾、拡大培養および再投与を含む。その例は、癌の治療またはリンパ系先祖細胞の遺伝的モディベーションのための骨髄移植を含む。エクス・ビボ遺伝子治療は、容易に接近可能であって、遺伝子導入プロセスの間に培養で生存できる(血液または皮膚細胞のような)細胞の治療に好ましくは適用される。
有用な遺伝子治療ベクターはアデノウイルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノ−関連ウイルス(AAV)ベクター、単純疱疹ウイルス(Hsv)ベクター、およびレトロウイルスベクターを含む。また、「裸のDNA」、リポソーム−ベースの送達、脂質−ベースの送達(正に荷電した脂質に付着させたDNAを含む)、およびエレクトロポレーションを用いて遺伝子治療を行うこともできる。
本明細書中で提供するように、限定されるものではないが、遺伝子治療の具体例を含めたある具体例において、ベクターは、例えば、レトロウイルスベクターのようなウイルスベクターであり得る。Miller et al.,1989 BioTechniques 7:980;Coffin and Varmus,1996 Retroviruses,Cold Spring Harbour Laboratory Press,NY。例えば、レトロウイルスプラスミドベクターが由来することができるレトロウイルスは、限定されるものではないが、モロニーマウス白血病ウイルス、脾臓壊死ウイルス、ラウス肉腫ウイルスのようなレトロウイルス、ハーベイ肉腫ウイルス、鳥類白血症ウイルス、テナガザル白血病ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、アデノウイルス、ミエロ増殖肉腫ウイルス、および乳腺癌ウイルスを含む。
レトロウイルスは、複製でき、かつDNA中間体を介して宿主細胞のゲノムに組み込むことができるRNAウイルスである。このDNA中間体、またはプロウイルスは宿主細胞DNAに安定に組み込むことができる。本発明のある具体例によると、発現構築体は、外来性タンパク質をコードする外来性遺伝子を正常なレトロウイルスRNAの代わりに組み込むレトロウイルスを含むことができる。レトロウイルスRNAが感染と同時に宿主細胞に進入すると、外来性遺伝子も細胞に導入され、次いで、あたかもそれがレトロウイルスゲノムの1部であるかのように宿主細胞DNAに組み込むことができる。宿主内でのこの外来性遺伝子の発現の結果、外来性タンパク質が発現される。
遺伝子治療のために開発されてきたほとんどのレトロウイルスベクター系はマウスレトロウイルスに基づく。そのようなレトロウイルスは、ビリオンという遊離ウイルス粒子として、または宿主細胞DNAに組み込まれるプロウイルスとして2つの形態で存在する。ウイルスのビリオン形態は(酵素逆転写酵素を含めた)レトロウイルスの構造および酵素タンパク質、ウイルスゲノムの2つのRNAコピー、およびウイルスエンベロープ糖タンパク質を含有する源細胞原形質膜の部分を含有する。レトロウイルスゲノムは4つの主要な領域:転写の開始および終止に必要なシス−作用エレメントを含有し、かつコーディング遺伝子の5’および3’両側に位置するロングターミナルリピート(LTR)、3つのコーディング遺伝子gag、polおよびenvに組織化される。これらの3つの遺伝子gag、polおよびenvは、各々、内部ウイルス構造、(インテグラーゼのような)酵素タンパク質、およびウイルスの感染性および宿主域特異性を付与する(gp70およびp15eと命名される)エンベロープ糖タンパク質、ならびに決定されていない機能の「R」ペプチドをコードする。
別のパッケージング細胞系およびベクター生産細胞系が、本発明によって提供される発現構築体でのそれらの使用を含めて、レトロウイルスの使用に関連する安全性関心のため開発されてきた。簡単に述べると、この方法は2つの成分、レトロウイルスベクターおよびパッケージング細胞系(PCL)の使用を用いる。レトロウイルスベクターはロングターミナルリピート(LTR)、導入すべき外来DNA、およびパッケージング配列(y)を含有する。このレトロウイルスベクターはそれ自身によって再生されない。なぜならば、構造およびエンベロープタンパク質をコードする遺伝子がベクターゲノム内に含まれないからである。PCLはgag、polおよびenvタンパク質をコードする遺伝子を含有するが、パッケージングシグナル「y」を含有しない。かくして、PCLはそれ自体で空のビリオン粒子を形成できるに過ぎない。この一般的方法内で、レトロウイルスベクターはPCLに導入され、それにより、ベクター−生産細胞系(VCL)を作り出す。このVCLは、レトロウイルスベクターの(外来性)ゲノムのみを含有するビリオン粒子を製造し、従って、治療的使用のための安全なレトロウイルスベクターであると以前は考えられていた。
「レトロウイルスベクター構築体」とは、すなわち、本発明の好ましい具体例内では、結合ドメイン−免疫グロブリン融合コーディング核酸配列のような配列または注目する遺伝子の発現を指令することができる組み立てのことをいう。簡単に述べれば、レトロウイルスベクター構築体は5’LTR、tRNA結合部位、パッケージングシグナル、第2ストランドDNA合成の起点、および3’LTRを含まなければならない。例えば、タンパク質(例えば、細胞傷害性タンパク質、病気−関連抗原、免疫アクセサリー分子、または、置き換え遺伝子)をコードする、または分子それ自体として(例えば、リボザイムまたはアンチセンス配列として)有用である配列を含めた、広く種々の異種配列をベクター構築体に含めることができる。
本発明のレトロウイルスベクター構築体は、例えば、B、CおよびDタイプのレトロウイルスならびにスプマウイルスおよびレンチウイルスを含めた広く種々のレトロウイルスから容易に構築することができる。(例えば、RNA Tumor Viruses,第2版, Cold Spring Harbor Laboratory,1985参照)。そのようなレトロウイルスはAmerican Type Culture Collection (「ATCC」;Rockville,Maryland)のような寄託所またはコレクションから容易に入手することができるか、あるいは普通に利用可能な技術を用いて知られた源から単離することができる。前記レトロウイルスのいずれも容易に利用して、本明細書中に提供された開示、および標準的な組換え技術(例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第2版,Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989;Kunkle,1985 PNAS 82:488)を考慮して、本発明のレトロウイルスベクター構築体、パッケージング細胞、またはプロデューサー細胞を組み立て、または構築することができる。
ウイルスベクターで用いる適当なプロモーターは、一般には、限定されるものではないが、レトロウイルスLTR;SV40プロモーター;およびMiller,et al.,1989 Biotechniques 7:980−990に記載されたヒトサイトメガロウイルス(CMV)プロモーター、またはいずれかの他のプロモーター(例えば、限定されるものではないが、ヒストン、pol IIIおよびβ−アクチンプロモーターを含めた真核生物細胞プロモーターのような細胞プロモーター)を含むことができる。使用できる他のウイルスプロモーターは、限定されるものではないが、アデノウイルスプロモーター、チミジンキナーゼ(TK)プロモーター、およびB19パルボウイルスプロモーターを含む。適当なプロモーターの選択は本明細書に含まれる教示から当業者に明らかであり、調節されたプロモーターまたは前記した調節されたプロモーターいずれか内のものからであってよい。
前記したように、レトロウイルスプラスミドベクターを使用して、パッケージング細胞系を変換して、プロデューサー細胞系を形成する。トランスフェクトすることができるパッケージング細胞の例は、限定されるものではないが、Miller,Human Gene Therapy,1:5−14(1990)に記載されたPE501、PA317、ψ−2、ψ−AM、PA12、T19−14X、VT−19−17−H2、ψCRE、ψCRIP、GP+E−86、GP+envAm12、およびDAN細胞系を含む。該ベクターは当該分野で知られたいずれかの手段を介してパッケージング細胞を変換することができる。そのような手段は、限定されるものではないが、エレクトロポレーション、リポソームの使用、およびCaPO沈殿を含む。1つの代替法において、レトロウイルスプラスミドベクターをリポソームにカプセル化することができ、または脂質にカップリングさせることができ、次いで、宿主に投与することができる。
プロデューサー細胞系は、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたは融合タンパク質をコードする核酸配列を含む感染性レトロウイルスベクター粒子を生じる。次いで、そのようなレトロウイルスベクター粒子を使用して、真核生物細胞をイン・ビトロまたはイン・ビボいずれかで変換することができる。変換された真核生物細胞は、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたは融合タンパク質をコードする核酸配列を発現するであろう。変換できる真核生物細胞は、限定されるものではないが、胚幹細胞、ならびに造血系幹細胞、肝細胞、線維芽細胞、骨髄性単球を含めた循環末梢血液単核および多形核細胞、リンパ球、筋芽細胞、組織マクロファージ、樹状細胞、クッパー細胞、リンパ節および脾臓のリンパ系および網内皮細胞、ケラチノサイト、内皮細胞、および気管上皮細胞を含む。
ウイルスベクターを用いて、例えば、組換え結合ドメイン−免疫グロブリン融合発現構築体を調製する本発明の具体例のもう1つの例として、1つの好ましい具体例においては、結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたは融合タンパク質の発現を指令する組換えウイルス構築体によって変換される宿主細胞は、ウイルス出芽の間にウイルス粒子によって取り込まれた宿主細胞膜の部分に由来する発現された結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたは融合タンパク質を含有するウイルス粒子を生産することができる。
もう1つの態様において、本発明は、例えば、組換え結合ドメイン−免疫グロブリン融合発現構築体のような本明細書中に記載された核酸構築体を含有する宿主細胞に関する。宿主細胞は、例えば、クローニングベクター、シャトルベクター、または発現構築体であり得る本発明のベクターおよび/または発現構築体で遺伝子工学的に作成される(形質導入される、形質転換される、またはトランスフェクトされる)。ベクターまたは構築体は、例えば、プラスミド、ウイルス粒子、ファージなどの形態であってよい。作成された宿主細胞は、プロモーターを活性化し、形質転換体を選択し、または結合ドメイン−免疫グロブリン融合ポリペプチドまたは結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードする遺伝子のような特定の遺伝子を増幅するために、適切に改変した慣用的な栄養培地中で培養することができる。温度、pHなどのような、発現のために選択された特定の宿主細胞についての培養条件は当業者に容易に明らかであろう。
本発明の構築体の生産または発現のための宿主細胞は、例えば、哺乳動物細胞のような高等真核生物細胞、または酵母細胞のような下等真核生物細胞であり得、あるいは宿主細胞は細菌細胞のような原核細胞であり得る。本発明による適当な宿主細胞の代表的な例は、限定されるものではないが、E.coli、Streptomyces、Salmonella tvphimuriumのような細菌細胞;酵母のような真菌細胞;Drosophila S2およびSpodoptera Sf9のような昆虫細胞;CHO、COSまたは293細胞のような動物細胞;アデノウイルス;植物細胞、またはイン・ビトロ増殖に既に適合されるかまたはデ・ノボ確立されたいずれかの適当な細胞を含む。適当な宿主の選択は、本明細書中の教示から当業者の範囲内とみなされる。
種々の哺乳動物細胞培養系を使用して、組換えタンパク質を発現させることもできる。哺乳動物発現系の例はGluzman,1981 Cell 23:175によって記載されたサル腎臓線維芽細胞のCOS−7系、および適合するベクターを発現することができる他の細胞系、例えば、C127、3T3、CHO、HeLaおよびBHK細胞系を含む。哺乳動物発現ベクターは、結合ドメイン−免疫グロブリン融合発現構築体の調製に関連する例えば本明細書中に記載された複製起点、適当なプロモーターおよびエンハンサー、また、いずれかの必要なリボソーム結合部位、ポリアデニル化部位、スプライスドナーおよびアクセプター部位、転写終止配列、および5’フランキング非転写配列を含む。SV40スプライスに由来するDNA配列、およびポリアデニル化部位を用いて、必要な非転写遺伝子エレメントを供することができる。構築体の宿主細胞への導入は、限定されるものではないが、例えば、リン酸カルシウムトランスフェクション、DEAE−デキストラン媒介トランスフェクションまたはエレクトロポレーション(Davis et al.,1986 Basic Methods in Molecular Biology)を含めた当業者が精通している種々の方法によって行うことができる。
本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質、または(例えば、例えば、とりわけ遺伝子治療のために、イン・ビボまたはイン・ビトロで宿主細胞において結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質の発現を可能とするのに十分な条件下および時間にて投与すべき)本明細書中に記載されたものと同じものをコードする1以上のポリヌクレオチドを含む組成物は、よく知られた方法に従って投与用の医薬組成物に処方することができる。医薬組成物は、一般には、医薬上許容される担体、賦形剤または希釈剤と組み合わせた、1以上の組換え発現構築体、および/またはそのような構築体の発現産物を含む。そのような担体は使用する用量および濃度において受容者に無毒性であろう。核酸−ベースの処方物のためには、または本発明の組換え構築体の発現産物を含む処方物のためには、例えば、典型的には、皮内、皮下、筋肉内、または静脈内経路によって、または他の経路によって、約0.01μg/kgないし約100mg/kg体重を投与する。好ましい用量は、例えば、約1μg/kgないし約1mg/kgであり、約5μg/kgないし約200μg/kgが特に好ましい。投与の数および頻度は宿主の応答に依存することは当業者に明らかであろう。治療的使用のための「医薬上許容される担体」は、製薬分野でよく知られており、例えば、Remingtons Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Co.(A.R.Gennaro編1985)に記載されている。例えば、生理的pHにおける滅菌食塩水およびリン酸塩−緩衝化食塩水を用いることができる。保存剤、安定化剤、色素およびフレーバー剤でさえ医薬組成物中に供することができる。例えば、安息香酸ナトリウム、ソルビン酸およびp−ヒドロキシ安息香酸のエステルは保存剤として添加することができる。前出1449。加えて、抗酸化剤および懸濁化剤を用いることができる。前出。
「医薬上許容される塩」とは、そのような化合物と有機または無機酸(酸付加塩)または有機または無機塩基(塩基付加塩)の組合せに由来する本発明の化合物の塩、を言う。本発明の化合物は遊離塩基または塩いずれかの形態で用いることができ、双方の形態は本発明の範囲内にあると考えられる。
本発明の1以上の核酸構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質コーディング構築体(またはそれらの発現された産物)を含有する医薬組成物は、患者に組成物を投与するのを可能とするいずれの形態であってもよい。例えば、組成物は固体、液体または気体(エアロゾル)の形態であってよい。投与の典型的な経路は限定されるものではないが、経口、局所、非経口(例えば、舌下またはバッカル)、舌下、直腸、膣および鼻腔内を含む。本明細書中で用いる用語非経口は、皮下注射、静脈内、筋肉内、胸骨内、洞内、クモ膜下腔内、道内、尿道内注射または技術を含む。医薬組成物は、患者への組成物の投与に際して、そこに含有される有効成分が生物学的に利用できるようにするように処方される。患者に投与される組成物は1以上の投与単位の形態を取り、ここに、例えば、錠剤は単一の投与単位とすることができ、エアロゾル形態の本発明の1以上の化合物の容器は複数の投与単位を保有することができる。
経口投与では、賦形剤および/または結合剤を存在させることができる。その例はスクロース、カオリン、グリセリン、澱粉デキストリン、アルギン酸ナトリウム、カルボキシメチルセルロースおよびエチルセルロースである。着色剤および/またはフレーバー剤を存在させることができる。コーディングシェルを使用することができる。
組成物は液体、例えば、エリキシル、シロップ、溶液、エマルジョンまたは懸濁液の形態とすることができる。液体は、2つの例として、経口投与または注射による送達のためとすることができる。経口投与を意図する場合、好ましい組成物は、1以上の結合ドメイン−免疫グロブリン融合構築体または発現された産物に加えて、甘味剤、保存剤、色素/着色剤およびフレーバー促進剤を含有する。注射によって投与すべき組成物においては、例えば、界面活性剤、保存剤、湿潤剤、分散剤、懸濁化剤、緩衝剤、安定化剤、等張剤の1以上を含めることができる。
本明細書中で用いる液体医薬組成物は、溶液、懸濁液または他の同様な形態の形態であるかを問わず、以下の佐剤:注射用水、食塩溶液、好ましくは生理食塩水、リンゲル液、等張塩化ナトリウムのような滅菌希釈剤、溶媒または懸濁化媒体として機能することができる合成モノまたはジグリセリド、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の溶媒のような不揮発性油;ベンジルアルコールまたはメチルパラベンのような抗菌剤;アスコルビン酸または亜硫酸水素ナトリウムのような抗酸化剤;エチレンジアミンテトラ酢酸のようなキレート化剤;アセテート、シトレートまたはホスフェートのような緩衝剤、および塩化ナトリウムまたはデキストロースのような等張性の調整のための剤の1以上を含むことができる。非経口製剤は、ガラスまたはプラスチックで作成されたアンプル、ディスポーザブルシリンジまたは多用量バイアルに入れることができる。生理食塩水が好ましい佐剤である。注射医薬組成物は好ましくは滅菌される。
限定されるものではないが、アルミニウム塩、油中水型エマルジョン、生分解性油ビヒクル、水中油型エマルジョン、生分解性マイクロカプセル、およびリポソームを含めた送達ビヒクルのような他の成分を製剤に含めるのも望ましいであろう。そのようなビヒクルで用いるための免疫刺激物質(アジュバント)の例はN−アセチルムラミル−L−アラニン−D−イソグルタミン(MDP)、リポ多糖(LPS)、グルカン、IL−12、GM−CSF、ガンマインターフェロンおよびIL−15を含む。
当業者に公知のいずれの適当な担体も本発明の医薬組成物で用いることができるが、担体のタイプは、投与の態様、および徐放が望まれるか否かに依存して変化されるであろう。皮下注射のような非経口投与では、担体は好ましくは水、食塩水、アルコール、脂肪、ワックスまたは緩衝剤を含む。経口投与では、マンニトール、ラクトース、澱粉、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、タルク、セルロース、グルコース、スクロースおよび炭酸マグネシウムのような前記担体または固体担体のいずれも使用することができる。生分解性マイクロスフィア(例えば、ポリ乳酸ガラクタイド)もまた本発明の医薬組成物のための担体として使用することができる。適当な生分解性マイクロスフィアは、例えば、米国特許第4,897,268号および第5,075,109号に開示されている。この点に関して、マイクロスフィアはほぼ25ミクロンよりも大きいのが好ましい。
医薬組成物は緩衝液のような希釈剤、アスコルビン酸のような抗酸化剤、低分子量(約10残基未満)ポリペプチド、タンパク質、アミノ酸、グルコース、スクロースまたはデキストリンを含めた炭水化物、EDTAのようなキレート化剤、グルタチオンおよび他の安定化剤および賦形剤を含有することもできる。中性緩衝化食塩水または非特異的血清アルブミンと混合された食塩水は例示的な適当な希釈剤である。好ましくは、生成物は希釈剤として適当な賦形剤溶液(例えばスクロース)を用いて凍結乾燥物として処方される。
前記したように、本発明は、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質をコードする核酸分子を送達することができる組成物を含む。そのような組成物は組換えウイルスベクター(例えば、レトロウイルス(WO 90/07936、WO 91/02805、WO 93/25234、WO 93/25698、およびWO 94/03622参照)、アデノウイルス(Berkner,1988 Biotechniques 6:616−627;Li et al.,1993 Hum.Gene Ther.4:403−409;Vincent et al., Nat.Genet.5:130−134;およびKolls et al., 1994 Proc.Natl.Acad.Sci.USA91:215−219参照)、ポックスウイルス(米国特許第4,769,330号;米国特許第5,017,487号;およびWO 89/01973号))、ポリカチオン分子に複合体化した組換え発現構築体核酸分子(WO 93/03709参照)、およびリポソームと会合した核酸(Wang et al., 1987 Proc.Natl.Acad.Sci.USA 84:7851参照)を含む。ある具体例においては、DNAは殺傷されたまたは不活化されたアデノウイルスに連結させることができる(Curiel et al., 1992 Hum.Gene Ther.3:147−154;Cotton et al., 1992 Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:6094参照)。他の適当な組成物はDNA−リガンド(Wu et al., 1989 J.Biol.Chem.264:16985−16987)および脂質−DNA組合せ(Felgner et al., 1989 Proc.Natl.Acad.Sci.USA 84:7413−7417参照)を含む。
イン・ビボ手法を指令するに加えて、エクス・ビボ手法を用いることができ、ここに、細胞が宿主から取り出され、修飾され、同一またはもう1つの宿主動物に入れられる。本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質、または結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質コーディング核酸分子のエクス・ビボの意味において組織細胞への導入に前記した組成物のいずれかを利用することができるのは明らかであろう。摂取のウイルス、物理的および化学的方法のプロトコルは当該分野でよく知られている。
従って、本発明はB細胞障害または悪性疾患を有する患者を治療するのに、またはそのような患者に由来する細胞培養を処置するのに有用である。本明細書中で用いるように、用語「患者」とは、いずれの温血動物も、好ましくはヒトをいう。患者はB細胞リンパ腫のような癌または悪性疾患に罹ったものでよく、または正常(すなわち、検出可能な疾患および感染がない)なものでよい。「細胞培養」は、エクス・ビボ処置に使用できるいずれの調製物も、例えば、(限定されるものではないが、T細胞、マクロファージ、単球、B細胞および樹状細胞を含めた)免疫系の免疫応答性細胞または単離された細胞を含有する調製物を含む。そのような細胞は当業者によく知られた種々の技術のいずれか(例えば、Ficoll−ヒパック密度遠心)によって単離することができる。細胞はB細胞障害または悪性疾患に罹った患者から単離することができ(必ずしも必要ないが)処置後に患者に再度導入することができる。
非経口または経口投与いずれかを意図した液体組成物は、適当な用量が得られるような量の本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質コーディング構築体または発現された産物を含有すべきである。典型的には、この量は組成物中にて結合ドメイン−免疫グロブリン融合構築体または発現産物の少なくとも0.01wt%である。経口投与を意図する場合、この量は組成物の0.1および約70%の重量の間で変化させることができる。好ましい経口組成物は、約4%および約50%の間の結合ドメイン−免疫グロブリン融合構築体または発現産物を含有する。好ましい組成物および製剤は、例えば、非経口投与単位が0.01ないし1重量%の間の有効成分を含有するように調製される。
医薬組成物は局所投与を意図することができ、その場合、担体は適当には溶液、エマルジョン、軟膏またはゲル基剤を含むことができる。基剤は、例えば、以下の:ペテロラタム、ラノリン、ポリエチレングリコール、ミツロウ、鉱油、水およびアルコールのような希釈剤、および乳化剤および安定化剤の1以上を含むことができる。増粘剤を局所投与用の医薬組成物に存在させることができる。もし経皮投与を意図するのであれば、組成物は経皮パッチまたはイオン導入デバイスを含むことができる。局所処方は、ある濃度の本発明の構築体、例えば、約0.1ないし10%w/v(単位用量当たりの重量)の結合ドメイン−免疫グロブリン融合構築体または発現産物を含有することができる。
組成物は、例えば、直腸で融解し、薬物を放出する坐薬の形態にて直腸投与を意図することができる。直腸投与用の組成物は適当な非刺激性賦形剤として油性基剤を含有することができる。そのような基剤は、限定されるものではないが、ラノリン、カカオバターおよびポリエチレングリコールを含む。
本発明の方法において、本発明の構築体、例えば、結合ドメイン−免疫グロブリン融合コーディング構築体または発現産物は、インサート、ビーズ、適時放出処方、パッチまたは速放出処方の使用を介して投与することができる。
本発明の構築体、例えば、本発明の抗原−結合構築体は、他の化合物と組み合わせて、またはそれと同時にまたはほぼ同時に動物または患者に投与または共供与することができる。1つの態様において、例えば、1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を、アルキル化剤、ヌクレオシドアナログ等のような1以上の化学療法化合物と組み合わせて動物または患者に投与する。本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体、および1以上の化学療法剤の投与または共投与を動物または患者における腫瘍および癌の治療で用いることができる。癌の例は、限定されるものではないが、頭部または首部癌、乳癌、結直腸癌、胃癌、肝癌、膀胱癌、頸癌、子宮内膜癌、肺癌(非−小細胞)、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、絨毛癌(肺癌);毛様細胞白血病、慢性リンパ性白血病、急性リンパ性白血病(乳房および膀胱)、急性骨髄性白血病、髄膜白血病、慢性骨髄性白血病、赤血球白血病を含む。より普通には、治療される癌は非−ホジキンリンパ腫(骨形成肉腫、成人軟組織肉腫)、T−細胞リンパ腫、慢性リンパ性白血病、ゆっくりと増殖する非−ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫および卵巣癌を含む。
本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた以上の構築体で共投与することができるアルキル化剤の例はメクロレタミン、クロラムブシル、イフォスファミド、メルファラン、ブスルファン、カルムスチン、ロムスチン、プロカルバジン、ダカルダジン、シスプラチン、カルボプラチン、マイトマイシンC、シクロホスファミド、イソスファミド、ヘキサメチルメラミン、チオテパ、およびダカルバジン、およびそのアナログを含む。例えば、クロラムブシルの合成を記載する米国特許第3,046,301号、イフォスファミドの合成を記載する米国特許第3,732,340号、シクロホスファミドの合成についての米国特許第3,018,302号、メルファランの合成を記載する米国特許第3,032,584号、およびシクロホスファミド、クロラムブシル、メルファラン、イフォスファミド、プロカルバジン、ヘキサメチルメラニン、シスプラチンおよびカルボプラチンの臨床的態様についてのBraunwald et al.,「Harrison‘s Principles of Internal Medicine」,第15版,McGraw−Hill,New York,NY,pp.536−544(2001)参照。ヌクレオシドアナログの例は、限定されるものではないが、フルダラビンペントスタチン、メトトレキセート、フルオロウラシル、フルオロデオキシウリジン、CB3717、アザシチジン、シタラビン、フロクスウリジン、メルカプトプリン、6−チオグアニン、クラドリビン、およびそのアナログを含む。1つの例は、CD20に結合する抗原−結合構築体を含めた構築体の組合せである。この構築体は化学感作剤として作用し、抗腫瘍または抗癌効果を達成するのに必要な化学療法剤がより少なくなるように化学療法剤と一緒に働く。例えば、ペントスタチンの合成を記載する米国特許第3,923,785号、メトトレキセートの合成を記載する米国特許第4,080,325号、フルオロウラシルの合成を記載する米国特許第2,802,005号、およびメトトレキセート、5−フルオロウラシル、シトシンアラビノシド、6−メルカプトプリン、6−チオグアニン、およびフルダラビンホスフェートの臨床的態様についてのBraunwald et al.,「Harrison’s Principles of Internal Medicine」,第15版,McGraw−Hill,NewYork,NY,pp.536−544(2001)参照。
もう1つの態様において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与することができるか、あるいはトポイソメラーゼIIを阻害する化合物、または細胞中で核酸と他の方法で相互作用する化合物と共投与することができる。そのような化合物は、例えば、ドキソルビシン、エピルビシン、エトポシド、テニポシド、ミトキサントロンおよびそのアナログを含む。1つの例において、この組合せは、高用量化学療法と組み合わせた末梢血液先祖細胞(PBSC)、およびオートロガス幹細胞支持体(HDC−ASCT)の腫瘍細胞の混入を低下させるために処置で用いられる。Geroniらに対する米国特許第6,586,428号参照。
もう1つの態様において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与することができるかまたは、治療薬物と共投与することができる。例えば、腫瘍細胞によってイン・ビトロで腫瘍壊死因子TNF−αの放出を刺激し、マクロファージ細胞の活性化を刺激すると信じられているビルルジン(Lorus Therapeutics)。これは、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体と組み合わせて用いて、癌細胞アポトーシスを増加させ、膵臓癌、悪性メラノーマ、カポシ肉腫(KS)、肺癌、乳癌、子宮、卵巣および頸癌を含めた種々のタイプの癌を治療することができる。もう1つの例はCpG7909(Coley Pharmaceutical Group)であり、これは、NK細胞および単球を活性化し、ADCCを増強すると信じられている。この薬物は、抗−CD20構築体のような、本発明の抗原−結合構築体を含めた癌または腫瘍特異的構築体と組み合わせて、非−ホジキンンリンパ腫および他の癌を治療することができる。
また、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を脈管形成インヒビターと組み合わせて、抗−腫瘍効果を増加させることができる。脈管形成は、新規な血管の成長である。このプロセスは腫瘍を増殖させ、転移させる。脈管形成の阻害は転移を妨げ、腫瘍細胞の拡大を停止させるのを助けることができる。脈管形成インヒビターは、限定されるものではないが、アンジオスタチン、エンドスタチン、トロンボスポンジン、血小板第4因子、軟骨−由来インヒビター(CDI)、レチノイド、インターロイキン−12、メタロプロテイナーゼ1、2および3の組織インヒビター(TIMP−1、TIMP−2、およびTIMP−3)、および抗−VEGF(血管内皮成長因子)およびIFN−アルファのような脈管形成シグナリングカスケードをブロックするタンパク質を含む。脈管形成インヒビターを投与することができるかまたは例えば、ADCCおよび/または補体固定または本発明の化学療法−結合体化抗原−結合を媒介して、種々のタイプの癌、例えば、肺癌および乳癌のような固体腫瘍癌と闘うことができる抗原−結合構築体を含めた腫瘍特異的構築体と共投与することができる。
もう1つの態様において、慢性関節リウマチ、乾癬、潰瘍性結腸炎、全身エリテマトーデス(SLE)、クローン病、強直性脊髄炎、および種々の炎症病プロセスの治療のために、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与することができるか、または病気修飾抗−リウマチ剤(DMAR剤)と共投与することができる。そのような処置において、本発明の構築体、例えば、抗原−結合構築体は、通常、アザチオプリン、サイクロスポリン、金、ヒドロキシクロロキン、メトトレキセート、ペニカラミン、スルファサラジン等のような化合物と組み合わせて投与される。
もう1つの態様において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与することができるか、あるいは例えばインターロイキン−1インヒビターおよびインターロイキン−1レセプターアンタゴニストを含めたインターロイキン−1の生物学的効果と逆作用する剤または化合物と共投与することができる。インターロイキン−1は慢性関節リウマチ(RA)、炎症、および関節の破壊の発生で役割を有すると考えられる。IL−1インヒビターは、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体と組み合わせて用いて、関節炎、炎症性腸疾患、敗血症および敗血症ショック、虚血性傷害、再灌流、脳性麻痺のような虚血性の脳傷害、および多発性硬化症を治療することもできる。Thompson et al.,に対する米国特許第6,159,460号参照。もう1つの態様において、例えば本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を動物または患者に投与することができるか、あるいは1以上のグルココルチコイド、例えば、メチルプレドニシロン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン等と組み合わせて共投与することができる。グルココルチコイドはADCCおよびCDCとは独立してアポトーシスを誘導し、増殖を阻害するのに用いられてきた。これらの化合物は、癌細胞においてアポトーシスに誘導することができる本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体と組み合わせることができる。1つの例において、B―細胞においてアポトーシスを誘導するのに用いることができる抗−CD20、および抗−CD40抗原−結合構築体をグルココルチコイドと組み合わせて、B−細胞非−ホジキンリンパ腫(NHL)を治療する。
もう1つの態様において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与することができるか、あるいはp38インヒビターまたはアンタゴニストと共投与することができる。p38マイトゲン−活性化プロテインキナーゼ経路は、慢性関節リウマチの発症に対して役に立つ多数の細胞プロセスに関与する。例えば、白血球の活性化および浸潤ならびに炎症性サイトカインの生産はp38−依存性プロセスである。
もう1つの態様において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与し、またはB−細胞の分化および増殖を促進する化合物と共投与する。インターロイキン−4(IL−4)およびインターロイキン−6(IL−6)のようなサイトカインは、他の生物学的活性に加えて、抗体合成および活性化されたBリンパ球による分泌を刺激することが示されている。本発明の特別な態様において、CD20を認識し、それに結合する抗原−結合構築体を含めた構築体を、インターロイキン−4(IL−4)およびインターロイキン−6(IL−6)の1以上と共投与する。
もう1つの態様において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与できるか、あるいはインターロイキン−2(IL−2)と共投与することができる。インターロイキン−2(IL−2)は、CD4+T−ヘルパー細胞、CD8細胞傷害性細胞、抗体生産B細胞、ナチュラルキラー細胞(NK)、および単球/マクロファージのようなエフェクター細胞の生産を増大させるリンホカインである。IL−2はT−細胞を生産するのを助け、T−細胞は、今度は、より多くのIL−2を分泌する(「オートクリンループ」)。IL−2を用いて、抗体−依存性細胞−媒介細胞障害(ADCC)および本発明の構築体と関連する免疫療法を増大させることができる。1つの例において、本発明の抗−CD20構築体およびIL−2を用いて、再発したまたは難治性、小胞非−ホジキンリンパ腫を持つ患者を治療する。もう1つの例において、IL−2を投与するか、またはHIV免疫治療剤と共投与して、T細胞回復を助ける。
もう1つの態様において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与することができるか、あるいはインターロイキン−12(IL−12)と共投与することができる。IL−12は細胞障害性T−細胞応答を増強し、ヘルパーT細胞の発生を促進し、ナチュラルキラー(NK)細胞の活性を増強し、TおよびNK細胞におけるIFL−γの分泌を誘導することが知られている。また、IL−2はアポトーシスを媒介する多くのヘルパーおよびエフェクター細胞を増大させる。本発明のもう1つの態様において、腫瘍または癌を持つ動物または患者の治療において、1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与するか、あるいはIL−12と共投与する。例えば、CD20に結合する、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体は、B−細胞非−ホジキンリンパ腫(NHL)を持つ患者の治療のためにIL−2と組み合わされる。
また、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体は、本発明の抗原−結合構築体の効率を増加させるために免疫モジュレータと組み合わせることもできる。免疫モジュレータは、限定されるものではないが、コロニー刺激因子(CSF)、腫瘍壊死因子(TNF)、およびインターフェロン(IFN)を含む。
CSFは顆粒球−マクロファージCSF(GM−CSF)、顆粒球−CSF(G−CSF)、およびマクロファージCSF(M−CSF)を含むことができる。GM−CSFは、好中球、マクロファージ、単球、および好酸球の発生を調節すると考えられている。G−CSFは、好中球の生産、およびM−CSF生産を誘導することが示されている。M−CSFはマクロファージおよび単球を刺激することが示されている。癌患者において好中球減少症を治療するためのCSFの使用は長く確立されている。1つの例において、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体はGM−CSF、G−CSFまたはその組合せと組み合わせて、骨髄移植および化学療法後に患者において好中球減少症からの回復を加速させることができる。好中球は細菌、真菌および寄生体のような微生物と戦うにおいて重要な役割を演じる。好中球減少症を持つ患者は細菌および広く拡大した真菌感染に対して特に感受性である。もう1つの例において、本発明の抗原結合構築体を含めた構築体はGM−CSF−処置好中球、単球およびマクロファージと組み合わせて、恐れられているPneumocystis cariniiを含めた細菌、真菌等に対する活性を増加させることができる。
IFNの例はインターフェロンアルファ(IFN−α)である。IFN−αは、身体が癌またはウイルス感染に反応する場合、免疫応答の一部としていくつかのタイプの白血球細胞によって天然で作成される。それは、攻撃の2つの主な態様を有し、癌細胞の成長および増殖に干渉し、それは癌を攻撃するキラーT細胞および他の細胞の生産を増強させる。インターフェロンは、癌細胞が、免疫系にとってそれらを良好な標的とする化学シグナルを退けるのを容易とすると考えられており、近年、いくつかの異なるタイプの癌、特に腎臓癌、メラノーマ、多発性骨髄腫、およびいくつかのタイプの白血病で用いられてきた。また、それは肝炎のようなウイルス感染を治療するのにも用いられる。インターフェロン−アルファ2aは、例えば、ADCCを増強させ、本発明の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体と組み合わせて、当該構築体に関連するADCC活性の効果を増加させることができるもう1つの例において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与するか、あるいはB細胞および骨髄形質細胞(BMPC)に対する抗−CD20抗原の数を増加させることが示されているインターフェロン−ガンマ(IFN−γ)と共に動物または患者に共投与される。これは、それらのB細胞および骨髄形質細胞(BMPC)におけるCD20の低下した発現を有する多発性骨髄腫を持つ患者の治療で特に有用である。従って、本発明の抗原−結合構築体、特に、CD20と結合する構築体での多発性骨髄腫患者の治療は、有用には、IFN−γと組み合わせて共投与することができる。
TNFは抗癌特性を持つ天然化学物質のクラスである。TNFの1つの例はTNF−アルファである。TNF−アルファは、IFN−ガンマおよびIL−12とで相乗効果を有することが示されている。もう1つの例において、TNFを投与することができるか、あるいは本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の腫瘍特異的構築体と共投与することができ、これは、IFN−ガンマ、IL−12またはその種々の組み合わせと一緒にした本発明の化学療法−結合体化抗原結合構築体を含む。TNFは炎症調節分子であることも知られている。TNF−アルファ抗体またはアンタゴニストは、本発明の抗原−結合構築体を含めた抗−T細胞構築体と組み合わせて、慢性関節リウマチ、乾癬、潰瘍性結腸炎、全身エリテマトーデス(SLE)、クローン病、強直性脊髄炎、および種々の炎症疾患プロセスを持つ患者を治療することができる。
もう1つの態様において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与することができるか、あるいはもう1つの抗体または本発明の抗原−結合構築体と共投与することができる。1つの例は、構築体、例えば、CD22、CD19またはその組合せと結合することができる構築体と組み合わせた、CD20に結合することができる本発明の抗原−結合構築体である。この組合せは、B−細胞リンパ腫の、無痛および攻撃的形態、およびリンパ性白血病の急性および慢性形態に対する治療として効果的である。Goldbergに対する米国特許第6,306,393号参照。もう1つの例において、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体は、アポトーシスを媒介するのを助ける本発明の抗原−結合構築体のような他の構築体と共投与される。例えば、CD28、CD3、CD20またはその組合せに結合することができる本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体の組合せ。抗−CD28およびCD3の組合せはT−細胞の延長された増殖のための方法を提供する。June et al.,に対する米国特許第6,352,694号参照。この延長されたT−細胞増殖は免疫依存性細胞傷害性の効果、特に、抗−CD20に関連するものを増加させる。
もう1つの態様において、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体を投与することができるか、または1以上のT−細胞調節分子と投与することができる。1つの例はインターロイキン−12(IL−12)との組合せである。IL−12サイトカインは細胞−媒介免疫を刺激し、アンジオスタティックス活性を有し、種々の腫瘍モデルにおいて有意な抗−腫瘍効果を保有する。IL−12はインターフェロン−ガンマ(IFN−γ)の生産を刺激することも示されている。従って、本発明の1以上の抗原−結合構築体、特に、CD20に結合するものを含めた1以上の構築体での多発性骨髄腫患者の治療は、IL−12と組み合わせて共投与した場合により効果的であると予測される。もう1つの例において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与することができるか、あるいはCTLA−4に結合することができる本発明の他のタンパク質の結合−ドメイン構築体と共投与して、T−細胞活性化のダウンレギュレーションを阻害することによって抗−腫瘍免疫応答を増強することができる。
もう1つの態様において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を遺伝子治療と組み合わせることができる。1つの例において、本発明の化学療法−結合体化構築体が投与されるか、またはBcl−2アンチセンスオリゴヌクレオチドと共投与される。Bcl−2は抗癌療法に対する腫瘍耐性に関連しており、それは化学療法−誘導細胞死滅をブロックすると信じられている。もう1つの例において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体が投与されるか、または「自殺遺伝子」の送達用のアデノウイルスと共投与される。アデノウイルスは遺伝子を腫瘍細胞に直接的に挿入し、これはこれらの細胞をその他の点では有効ではない薬物に対して感受性とする。次いで、薬物処置は、健康な細胞はタッチされずに残しつつ、腫瘍細胞を破壊する。しかしながら、一旦療法が完了すると、療法から逃れた例外的癌細胞は再確立し、転移することができる。1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体と遺伝子治療を組み合わせると、例外的癌細胞を殺傷し、癌の再発を最小化するのを助けるであろう。
同様な組合せを緩和(過激でない)操作と共に用いて腫瘍を外科的に除去することができる。この例において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を腫瘍の外科的抽出の前および後に投与して、免疫応答を増加させ、外科的処置の間に除去されなかったいずれの癌細胞も殺傷することによって再発の可能性を低下させることができる。
もう1つの態様は、癌または抗原ワクチンおよびT−細胞レギュレーター分子を組み合わせる。例えば、構築体の結合部分、例えば、抗原−結合部分は癌細胞または抗原、または癌細胞または抗原からのタンパク質断片に対して特異的であり得る。これは、特別な腫瘍または抗原に対して免疫応答を媒介するのを助けることができる。そのような構築体をT―細胞レギュレーターと組み合わせて、免疫応答の有効性を増加させることができる。
もう1つの例において、本発明の1以上の抗原−結合構築体を含めた1以上の構築体を投与するか、またはレチノイドと共投与する。レチノイドはビタミンAおよびその誘導体を含み、これは細胞が分裂するのを停止させ、細胞を分化させる能力を有する。ビタミンAは本発明の抗原−結合構築体を含めた抗癌構築体と組み合わせて、種々の形態の癌と戦うことができる。
本明細書中で用いられる用語「結合構築体」および「抗原−結合構築体」とは、例えば、標的、例えば、抗原に結合することができる作成されたポリペプリド、組換えポリペプチド、合成、半合成または他の融合タンパク質をいうことができる。本発明の抗原−結合構築体は、抗体または関連免疫グロブリン−タイプ構築体を適用できる種々の使用内のものを含めた、種々の適用で用いることができる。
本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体は、治療、診断、研究および他の目的でイン・ビボおよびイン・ビトロ実験で用いることができる。そのような使用は、例えば、以下のものを含む。本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体は、免疫組織化学適用で用いることができる。例えば、それらは、組織において特別な抗原または抗原の群の免疫学的局在決定で用いることができる。組織を固定し、注目する抗原−結合構築体と共にインキュベートすることができる。次いで、標識、例えば、ホースラディッシュペルオキシダーゼまたはベータ−ガラクトシダーゼのような化学反応を与える金粒子または酵素にカップリングした本発明の二次抗体または結合構築体を用いてこれらの構築体を局所化することができる。例えば、一次結合構築体の部分に対して反応性である二次抗体または結合構築体がしばしば作成される。かくして、例えば、もし一次結合構築体がヒトテイル部分を有すれば、二次抗体または結合構築体は、例えば、ベータ−ガラクトシダーゼに連結された抗−マウス抗体または抗原−結合構築体であり得る。別法として、本発明の抗体または結合構築体は精製し、次いで、もう1つの分子に結合体化して、蛍光抗体または結合構築体を生じさせることができる。
また、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体を用いて、細胞の表面上の抗原または複数抗原の位置を検出し、あるいは例えば、免疫電子顕微鏡観察を用いて細胞内物質の位置を検出することもできる。フェリチンまたはコロイド状金のような電子が密な物質は、例えば、抗原−結合構築体に結合体化することができる。走査型電子顕微鏡を用いて、抗原/結合構築体複合体の位置を検出することができる。
本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体を用いて、種々の免疫アッセイフォーマット、例えば、放射性免疫アッセイ(RIA)フォーマットまたは酵素結合イミュノソルベントアッセイ(ELISA)フォーマットの1つを用いて抗原または複数抗原の存在を定量することができる。これらのアプローチの多くの変形があるが、それらは同様な考えに基づいている。例えば、もし抗原を固体支持体または表面に結合させることができれば、それは、本発明の特異的抗原−結合構築体と反応させることによって検出することができる。次いで、構築体の存在または量を、それを例えば、標識を一次抗体に直接的に一体化させることにより本発明の二次抗体または第二の抗原−結合構築体いずれかと反応させることによって検出し、定量することができる。別法として、例えば、本発明の抗原−結合ポリペプチドを固体表面に結合させ、抗原を加えることができる。次いで、抗原上の区別されるエピトープを認識する本発明の第二の抗体または抗原−結合ポリペプチドを加え、検出することができる。この技術は通常「サンドイッチアッセイ」といわれ、これは、とりわけ、高バックグラウンドまたは非特異的反応の問題を回避するためにしばしば用いられる。
本発明の結合構築体は特定のエピトープまたは複数エピトープに対して高い親和性/親和性(複数)および/または選択性/選択性(複数)を有することができるので、それらは、例えば、タンパク質または抗原精製において親和性試薬として用いることもできる。そのようなプロセスの1つの例において、本発明の抗原−結合構築体は適当な支持体、例えば、Sephadex樹脂または濾紙上に固定化される。固定化された構築体は、標的タンパク質または抗原を含有する、または含有することが疑われる試料に暴露される。支持体は、望まない物質を除去するであろう、適当な緩衝液で濯ぐ。支持体は、結合したタンパク質または抗原を放出するであろうもう1つの緩衝液で洗浄する。
本発明の特別な結合構築体は高い親和性および選択性でもってタンパク質または他の抗原に結合することができる故に、それらは特定の反応における特定の酵素または他のマクロ分子の重要性についての基準として用いることもできる。もし本発明の抗原−結合構築体が溶液中の反応と干渉できるならば、これは、構築体がその反応に関与するタンパク質または他の抗原性物質に特異的に結合することができることを示す。
また、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体はレセプターブロッカーまたはインヒビターまたはアンタゴニストとして用いることもできる。
本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体は、タンパク質の機能を同定し、それを調べるのに用いることもできる。もし本発明の抗原−結合構築体が特異的タンパク質と反応するならば、例えば、そのタンパク質は引き続いて溶液から沈殿させることができる。沈殿は、典型的には、一緒に一次複合体を連結させる本発明の二次抗体または抗原−結合構築体を用いることによって行われる。別法として、溶液をプロテインAまたは、例えば、構築体に応じて、例えば、容易に溶液から除去できるように、例えば、ビーズに付着された抗−Fc抗体いずれかと溶液を反応させることによって、複合体を除去することができる。
また、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体は、ゲル−シフト実験と組み合わせて用いて、DNA−結合タンパク質のような特異的核酸−結合タンパク質を同定することもできる。例えば、DNA−結合タンパク質は、高い親和性でもって特定のオリゴヌクレオチドに結合するそれらの能力によってアッセイすることができる。タンパク質に会合したオリゴヌクレオチドの移動度は、遊離オリゴヌクレオチドの移動度とはかなり異なり、ゲル移動パターン、および通常はゲルシフトといわれるシグナルをもたらす。結合アッセイへの構築体の付加は2つの効果のうちいずれかを有することができる。もし構築体がDNA結合に関与しないタンパク質の領域に結合すれば、それは、より遅い移動度さえを有する複合体をもたらし、これは、移動度のより大きなシフト(スーパーシフト)として検出される。別法として、もし構築体がDNAを認識するのに関与するタンパク質の領域に結合すれば、それは結合を破壊し、シフトを排除する。いずれの場合においても、これらの実験からのデータは、例えば、DNA−結合タンパク質を同定するための基準として働くことができる。
また、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体を用いて、例えば、SDS−PAGEによる分画後にウエスタンブロティングによってタンパク質を検出することができる。一旦分画されたタンパク質をニトロセルロースシートのような膜に移すと、それを、ブロットに固定化されたタンパク質を特異的に認識し、または所望の程度の選択性まで認識する本発明の特別な抗原−結合構築体に暴露する。これは特定のタンパク質が同定されるのを可能とする。このアプローチは、もしタンパク質の移動度が実験の間に変化すれば特に有用である。例えば、ホスフェートまたは炭水化物の取り込み、またはタンパク質の切断の結果、移動度の変化がもたらされ、これはウエスタン分析によって直接的に追跡することができる。適当な対照にて、このアプローチを用いて、実験的操作に応答してのタンパク質の豊富さを測定することができる。
SDSゲルおよび免疫沈澱の組合せは極端に効果的であり得る。もし特定のタンパク質を溶液中で免疫沈澱させることができれば、上清および沈殿した画分を共にSDSゲルで分離し、本発明の抗原−結合構築体を用いて調べることができる。
時々、1つのタンパク質に向けられた本発明の結合構築体は、第一のタンパク質と相互作用する第二のタンパク質も沈殿させるであろう。第二のタンパク質を、ならびに第一のタンパク質は、次いで、ゲルを染色することによって、またはオートラジオグラフィーによって観察することができる。この関係は、しばしば、タンパク質が複合体の一部として機能し、それを用いて、他の証拠(例えば、2ハイブリッドスクリーニングまたはサプレッサー突然変異)に基づいて相互作用すると仮定される2つのタンパク質の物理的相互作用を証明することもできる。このアプローチは、いくつかの極端な有効な方法で、ウエスタンブロッティング分析と組み合わせることができる。
かくして、例えば、本発明の抗原−結合構築体は、例えば、シグナル変換およびタンパク質プロセッシングの実験において免疫沈澱およびウエスタン分析の組合せで用いることができる。例えば、引き続いて、タンパク質に結合する本発明の異なる抗体または抗原−結合構築体を用いるウエスタン分析によって、免疫沈澱タンパク質を調べることができる。最も有用なのは、タンパク質に存在し得る特定の構造決定基に対して向けられるものである。かくして、タンパク質分解プロセッシングを受けているタンパク質の領域に対して向けられた本発明の抗体または抗原−結合構築体は、タンパク質分解プロセッシングを追跡するのに有用であり得る。加えて、本発明の構築体、またはリン酸化ペプチド(例えば、抗−PYリン酸化チロシン)を認識する本発明の抗原−結合構築体の混合物を用いて、それが沈殿した後に(ウエスタン分析を用い)タンパク質のリン酸化の程度を追跡することができる。グリコシル化反応は、炭水化物エピトープに対して向けられた本発明の抗原−結合構築体によって(またはレクチン、すなわち、炭水化物を認識するンタンパク質によって)追跡することもできる。同様に、リン酸化エピトープを特異的に認識する、例えば、リン酸化の後にチロシンまたはセリン残基を認識するが、ホスフェートの不存在下ではエピトープに結合しない(または検出可能に結合しない)本発明のいくつかの抗原−結合構築体を作成することができる。このアプローチを用いて、特別なタンパク質のリン酸化状態を測定することができる。例えば、CREB(cAMP応答エレメント結合タンパク質)のリン酸化は、セリン133のリン酸化に依存するようにエピトープを特異的に認識する抗体によって追跡することができる。
また、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体を用いて、発現ライブラリーをスクリーニングし、特定のエピトープを発現する、または表すか、あるいは特定の親和性または発現特徴を有する候補ポリヌクレオチドを単離することもできる。
細胞表面に結合する本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体をマーカーとして用いて、フローサイトメトリーを用いてそのマーカーを発現する細胞の画分を定量することもできる。もし本発明の異なる抗原結合構築体/蛍光色素組合せを用いると、例えば、いくつかの抗原を発現する細胞の画分を決定することができる。
抗−イディオタイプ抗体、すなわち、もう1つの抗体の結合ドメインに対する抗体のように機能する本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体を、抗原の構造を模倣するのに望ましいまたは有用である多数の方法のいずれかで用いることができる。そのような使用は、例えば、(分子アジュバントを一体化させる本発明の抗原−結合構築体を含めた)癌ワクチンとしての、レセプターに対するプローブとしての、レセプターアゴニストとして、レセプターアンタゴニストとして、レセプターブロッカーまたはインヒビターとしても使用を含む。
もう1つの態様において、本発明の抗原−結合構築体を含めた構築体は二特異的であって、同一または異なる細胞型に存在し得る2つの区別されるエピトープに結合することができる。
抗原−結合構築体を含めた本発明の構築体のイン・ビボ使用は、例えば、癌を含めた種々の病気、ならびに自己免疫疾患を含めたB−細胞傷害のための、単独で、または1以上の他の療法と組み合わせた療法を含む。いくつかの場合において、本発明の構築体は患者に投与される。他の場合には、構築体は、当該分野で知られた技術によるもう1つの分子、例えば、蛍光分子にカップリングさせて、標的、または治療薬物をイメージするのを助けおよび/または標的を殺すのを助けるためにトキシンにカップリングさせることができる。
例えば、標識分子または原子を本発明の抗原−結合構築体に結合体化させ、または他の方法で連結させて、イメージングにおいて、または診断剤として助けることができる。これらは、限定されるものではないが、酵素標識、放射性同位体または放射性化合物または元素、蛍光化合物または金属、ケミルミネセント化合物およびバイオルミネセント化合物を含む。かくして、本発明の結合構築体または抗原−結合構築体は薬物に結合体化させることができ、これは、一旦薬物が標的に到達すれば、特異的薬物標的化および増大した効率を可能とすることができる。これは、全身毒性および副作用を低下させつつ、薬物療法を容易とする。これは、他の方法で、全身投与した場合に許容できない薬物の使用を可能とする。投与は、薬物の能力およびキャリアー構築体の有効性に依存するであろう。イン・ビボ使用の他の例は本発明の結合構築体または抗原−結合構築体の使用を含み、そこでは、トキシンが本発明のポリペプチドに化学的に連結され、または結合体化され、例えば、「免疫結合体」または「イミュノトキシン」ということができる分子を形成する。典型的には、例えば、そのようなトキシンは1以上の放射性同位体(例えば、ヨウ素−131、イットリウム−90、レニウム−186、銅−67および/またはビスマス−212)、天然トキシン、化学療法剤、生物学的応答モディファイヤー、または標的細胞に損傷を与え、または殺傷し、標的細胞複製を阻害するのを助けることができる、または標的細胞における所望の細胞機能を破壊するのに効果的ないずれかの他の物質を含むことができる。
イミュノトキシンのトキシン部分は種々の源から由来することができる。トキシンは通常は植物または細菌に由来するが、例えば、ヒト起源のトキシン、または合成トキシンは同様に用いることができる。細菌または植物に由来するトキシンの例は、限定されるものではないが、アブリン、α−サルシン、ジフテリアトキシン、リシン、サポリン、およびシウドモナスエキソトキシンを含む。哺乳動物酵素の例は、限定されるものではないが、リボヌクレアーゼ(RNAse)およびデオキシリボヌクレアーゼを含む。本発明の1以上の構築体で用いることができる多数のイミュノトキシンが当該分野で記載されている。例えば、Frankel et al.,に対する米国特許第4,753,894号;Pastan et al.,に対する米国特許第6,099,842号;Nevelle,et al.,1982 Immunol Rev.62:75−91;Pastan et al.,1992 Ann Rev Biochem 61:331−354;Chaudary et al.,1989 Nature 339:394;およびBatra et al.,1991 Mol.Cell.Biol.11:2200参照。本明細書中に記載された修飾されたトキシンおよび種々の刊行物に記載されたものはやはり本発明の範囲内にある。
一般に、イミュノトキシンおよび本発明の他の治療剤は、腫瘍および悪性疾患の治療、自己免疫疾患、アレルギーおよび炎症等の治療用のように、特定の病気、障害または疾患を治療しまたは予防するのに治療的に有効な濃度で投与される。この有効な用量および投与の形態は、治療すべき動物または患者、治療すべき病気または疾患、免疫結合体またはイミュノトキシンの強度、および結合体の有効性に依存するであろう。この目標を達成するためには、当該分野で公知の種々の許容できる処方および賦形剤を用いて処方することができる。典型的には、例えば、イミュノトキシンは注射によって(静脈内または腹腔内いずれか)投与される。この投与を達成するための方法は当業者に知られている。もう1つの態様において、本発明は、粘膜を横切って伝達することができるエアロゾルまたはクリームまたはパッチのような局所または経口投与される組成物を含む。
処方は、治療すべき患者への投与の前に本発明の免疫結合体またはイミュノトキシンに加えることができる。液体処方は最も普通であるが、他の処方は本発明の範囲内である。処方は、例えば、油、ポリマー、ビタミン、炭水化物、アミノ酸、塩、緩衝剤、アルブミン、界面活性剤、または増量剤を含むことができる。炭水化物は、単糖、二糖または多糖、または水溶性グルカンのような糖または糖アルコールを含むことができる。糖またはグルカンは、例えば、フルクトース、デキストロース、ラクトース、グルコース、マンノース、ソルボース、キシロース、マルトース、スクロース、デキストラン、プルラン、デキストリン、アルファシクロデキストリンおよびベータシクロデキストリン、可溶性澱粉、ヒドロキシエチル澱粉およびカルボキシメチルセルロース、またはその混合物を含むことができる。「糖アルコール」は−OH基を有するCないしC炭化水素と定義でき、例えば、ガラクチトール、イノシトール、マンニトール、キシリトール、ソルビトール、グリセロール、およびアラビトールを含む。前記したこれらの糖または糖アルコールは個々に、または組み合わせて用いることができる。糖または糖アルコールが水性製剤に 可溶性である限り、用いる量に固定された限定はない。1つの態様において、糖または糖アルコール濃度は0.5w/v%および15w/v%の間、典型的には、1.0w/v%および7.0w/v%の間、より典型的には2.0および6.0w/v%の間である。
例示的アミノ酸はカミチン、アルギニンおよびベタインの左旋(L)形態を含み;しかしながら、他のアミノ酸を加えることもできる。普通に使用されるポリマーは2,000および3,000の間の平均分子量を持つポリビニルピロリドン(PVP)、例えば、3,000および5,000の間の平均分子量を持つポリエチレングリコール(PEG)を含む。緩衝液を組成物で用いて、凍結乾燥の前、または復元の後に、溶液におけるpH変化を最小とすることができる。いずれの生理学的緩衝液も用いることができるが、クエン酸、リン酸、酒石酸、およびグルタミン酸緩衝液またはその混合物はより通常に利用される。濃度は、例えば、0.01ないし0.3モルであり得る。より高いまたはより低い濃度を用いることができる。
本発明のイミュノトキシンが、ポリマーへの共有結合性の結合体化によって化学的に修飾して、例えば、それらの循環半減期を増加させることができる。それらをペプチドに結合させるための例示的ポリマーおよび方法はKatre et al.,に対する米国特許第4,766,106号;Davis et al.,に対する第4,179,337号;Shimizu et al.,に対する第4,495,285号;およびHirataniに対する第4,609,546号に参照されている。
以下の実施例が説明として供するものであって、限定するものではない。
(実施例1)
(2H7可変領域のクローニング、および2H7 scFv−Igの構築および配列決定)
本実施例は、モノクローナル抗体2H7の重鎖および軽鎖可変領域をコードするcDNA分子のクローニングを説明する。また、本実施例は、2H7scFv−Igの構築、配列決定および発現を示す。
収穫に先立って、CD20に特異的に結合する2H7モノクローナル抗体を発現する細胞を、グルタミン、ピルベート、DMEM非必須アミノ酸、およびペニシリン−ストレプトマイシンで補足したRPMI 1640倍地(Invitrogen/Life Technologies,Gaithersburg,MD)中で数日間log期増殖に維持した。培養基からの遠心によって細胞をペレット化し、2×10細胞を用いてRNAを調製した。キットに伴う製造業者の指示に従い、Pharmingen(San Diego,CA)全RNA単離キット(カタログ番号45520K)を用い、RNAを2H7−生産ハイブリドーマ細胞から単離した。1マイクログラム(1μg)全RNAを鋳型として用いて、逆転写によってcDNAを調製した。該RNAおよび300ngランダムプライマーを合わせ、酵素の添加に先立って72℃にて10分間変性した。Superscript II逆転写酵素(Life Technologies)を、酵素とともに提供された5×第二ストランド緩衝液および0.1M DTTの存在下で25μlの全容量中のRNA+プライマー混合物に加えた。逆転写反応は42℃にて1時間進行させた。
ランダム起点逆転写酵素反応で生じた2H7 cDNAおよびV領域特異的プライマーを用いて、PCRによって、2H7抗体の軽鎖および重鎖のための可変領域を増幅した。V領域特異的プライマーは、公表された配列(GeneBank受託番号、VについてはM17954、およびVについてはM17953)をガイドとして用いて設計した。scFvが増幅および制限酵素消化の後に2つのV領域の連結によって組み立てることができるように、2つの可変鎖を適合末端配列を有するように設計した。
2つのV領域の間に挿入すべき(GlySer)ペプチドリンカーは、過剰のヌクレオチドを2H7のV用のアンチセンスプライマーに加えることによって一体化させた。また、SacI制限部位を2つのV領域の間の連結部に導入した。HindIII制限部位および軽鎖リーダーペプチドを含む2H7 Vを増幅するのに用いたセンスプライマーは、
Figure 2010279389
(配列番号: )であった。アンチセンスプライマーは
Figure 2010279389
(配列番号; )であった。V領域のリーディングフレームは太文字で下線を施したコドンとして示される。HindIIIおよびSacI部位は下線を施したイタリック体配列によって示される。
ドメインはリーダーペプチドなくして増幅したが、Vへの融合のための5’SacI制限部位および種々のテイルへの融合のための3’末端におけるBclI制限部位を含み、ヒトIgG1 FcドメインおよびCD40リガンドの切断形態、CD154を含めた。センスプライマーは
Figure 2010279389
(配列番号: )であった。SacI部位はイタリック体かつ下線を施したフォントで示し、Vドメインの最初のアミノ酸についてのコドンのリーディングフレームは太文字の下線を施したタイプで示される。アンチセンスプタイマーは
Figure 2010279389
(配列番号: )であった。BclI部位はイタリック体で下線を施したタイプで示し、Vドメイン配列の最後のセリンは太文字の下線を施したタイプで示す。
制限酵素HindIIIおよびBclIで消化された、ヒトIgG1ヒンジ、CH2およびCH3領域を含有するpUC19に2H7 scFv HindIII−BclI断片を挿入することによって、scFv−Igを組み立てた。連結の後、連結産物をDH5α細菌に形質転換した。陽性クローンを、診断部位としての2H7のV−V接合におけるSacI部位を用いて適切に挿入された断片につきスクリーニングした。96 ℃にて10秒間変性し、50 ℃にて30秒間アニールし、72 ℃4分間伸長することによって、2H7scFv−Ig cDNAを25−サイクルプログラムを用いるPE9700サーモサイクラーでのサイクル配列決定に付した。配列決定プライマーはpUC順方向および逆方向プライマーおよび内部プライマーであり、これはIgG定常領域部分においてCH2ドメインヒトにアニールした。配列決定反応は、製造業者の指示に従い、Big Dye Terminator Ready Sequencing Mix(PE−Applied Biosystems,Foster City,CA)を用いて行った。引き続いて、試料はCentrisepカラム(カタログ番号CS−901,Princeton Separations,Adelphia,N.J.)を用いて精製し、溶出物はSavant真空ドライヤー中で乾燥し、鋳型抑制試薬(PE−ABI)で変性し、ABI 310 Genetic Analizer(PE−Applied Biosystems)で分析した。配列を編集し、翻訳し、ベクターNtiバージョン6.0(Informax,North Bethesda,MD)を用いて分析した。図1は、2H7scFv−Ig構築体のcDNAおよび予測されたアミノ酸配列を示す。
(実施例2)
(安定なCHO細胞系における2H7 scFv−Igの発現)
本実施例は、真核生物細胞系における2H7scFv−Igの発現、およびADCCおよび補体固定を含めた、SDS−PAGEによる、および機能的アッセイによる発現された2H7scFv−Igの特徴付を示す。
正しい配列を持つ2H7scFv−Ig HindIII−XbaI(〜1.6kb)断片を哺乳動物発現ベクターpD18に挿入し、陽性クローンからのDNAを、QIAGENプラスミド調製キット(QIAGEN,Valencia,CA)を用いて増幅した。次いで、AscIでの消化によって、組換えプラスミドDNA(100μg)を非必須領域において線状化し、フェノール抽出によって精製し、組織培養基Excell 302(カタログ番号14312−79P,JRH Biosciences,Lenexa,KS)に再懸濁した。トランスフェクション用の細胞、CHO DG44細胞を対数増殖に維持し、各トランスフェクション反応に対して10細胞を収穫した。線状化されたDNAをエレクトロポレーションのための合計容量0.8mlにてCHO細胞に加えた。
2H7 scFv−Ig融合タンパク質(配列番号:10)の安定な生産は、CMVプロモーターの制御下で2H7scFv−Ig cDNAを含有する選択可能な増幅可能プラスミドpD18のチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞(特記しない限り、全ての細胞系はAmerican Type Culture Collection,Manassas,VA)へのエレクトロポレーションによって達成された。2H7発現カセットを〜1.6kb HindIII−XbaI断片としてのベクターマルチクローニング部位へCMVプロモーターの下流にサブクローンした。pD18ベクターは、プラスミドに対する選択圧を増加させるための、弱められたプロモーターでのDHFR選択マーカーをコードするpcDNA3の修飾されたバージョンである。プラスミドDNAはQiagen maxiprepキットを用いて調製し、精製されたプラスミドを、フェノール抽出およびエタノール沈殿に先立ってユニークなAscI部位において線状化した。サケ精子DNA(Sigma−Aldrich,St.Louis,MO)をキャリアーDNAとして加え、各100μgのプラスミドおよびキャリアーDNAを用いて、エレクトロポレーションによって10CHO DG44細胞をトランスフェクトした。以下「Excell302完全」培地という、グルタミン(4mM)、ピルベート、組換えインスリン、ペニシリン−ストレプトマイシンおよび2×DMEM非必須アミノ酸(全てLife Technologies,Gaithersburg,Maryland)を含有するExcell302培地(JRH Biosciences)中にて細胞を対数期まで増殖させた。未トランスフェクト細胞用の培地もまた(ヒポキサンチンおよびチミジンの100×溶液から希釈した)HT(Invitrogen/Life Technologies)を含有した。選択下のトランスフェクション用の培地は、50nMないし5μMの範囲である、選択剤としての種々のレベルのメトトレキセート(Sigma−Aldrich)を含有した。エレクトロポレーションは275ボルト、950μFで行った。125細胞/ウエルないし2000細胞/ウエルの範囲の種々の系列希釈にて96ウエル平坦底プレート(Costar)での選択的平板培養に先立って、トランスフェクトされた細胞を非−選択的培地中で一晩回復させた。細胞クローニング用の培養基は、100nMメトトレキセートを含有するExcell302完全であった。一旦クローンの増殖が十分であれば、マスターウエルからの培養上清の系列希釈を、CD20−CHOトランスフェクト細胞への結合につきスクリーニングした。融合タンパク質を最も多く生産するクローンをT25、次いでT75フラスコに拡大培養して、凍結のための、および2H7scFvIgの生産をスケールアップするために、適当な数の細胞を供した。生産レベルは、メトトレキセート含有培養基における漸次増幅によって3つのクローンからの培養でさらに増大した。細胞の各引き続いての継代において、Excell302完全培地が、DHFRプラスミドを増幅した細胞のみが生き残れるように、増加させた濃度のメトトレキセートを含有した。
2H7scFv−Igを発現するCHO細胞から上清を収集し、0.2μm PES発現フィルター(Nalgene,Rochester,NY)を通して濾過し、プロテインAアガロース(IPA300架橋アガロース)カラム(Repligen,Needhahm,MA)を通した。カラムをPBSで洗浄し、次いで、0.1Mクエン酸緩衝液、pH3.0を用いて結合したタンパク質を溶出した。画分を収集し、PBS中での一晩の透析に先立って、1Mトリス、pH8.0を用いて溶出されたタンパク質を中和した。精製された2H7scFv−Ig(配列番号: )の濃度を280nmにおける吸収によって測定した。1.77の吸光率は、Vector Ntiバージョン6.0ソフトウェアパッケージ(Informax,North Bethesda,MD)におけるタンパク質分析ツールを用いて決定した。このプログラムは、吸光率を計算するのにアミノ酸組成のデータを用いる。
トランスフェクトされた安定なCHO細胞による2H7scFv−Igの生産レベルは、フローサイトメトリーによって分析した。CHO細胞に対する精製された2H7scFv−Igは、CD20を発現したCHO細胞(CD20 CHO)に結合させ、フルオレセイン−結合体化抗−ヒトIgG第二工程試薬(カタログ番号H10101およびH10501,CalTag,Burlingame,CA)を用いてフルオロサイトメトリーによって分析した。図2(頂部)は、CH20 CHOへの2H7scFv−Ig結合の滴定によって作成された標準曲線を示す。各濃度の2H7scFv−Igにおいて、直線単位でのフルオレセインシグナルの平均輝度を示す。次いで、2H7scFv−Igを発現する安定なCHO細胞クローンを含有するTフラスコから収集された上清をCD20 CHOに結合させ、結合はフローサイトメトリーによって分析した。上清に含まれる2H7scFv−Igによって生じたフルオレセインシグナルを測定し、上清中の2H7scFv−Ig濃度を標準曲線(図2,底部)から計算した。
精製された2H7scFv−Ig(配列番号: )は、SDS−ポリアクリルアミドゲルでの電気泳動によって分析した。独立したプロテインAアガロースカラム実行によって精製された2H7scFv−Igの試料を、ジスルフィド結合の還元無くしてSDS試料緩衝液中で沸騰し、SDS 10%トリス−BISゲル(カタログ番号NP0301,Novex,Carlsbe,CA)に適用した。20マイクログラムの各精製されたバッジをゲルに負荷した。クーマシーブルー染色(Pierce Gel Code Blue Stain Reagent,カタログ番号24590,Pierce,Rockford,IL)による電気泳動、および蒸留水での脱色の後、タンパク質を可視化した。分子量マーカーは同一ゲルに含めた(Kaleidoscope Prestained Standards,カタログ番号161−0324,Bio−Rad,Hercules,CA)。結果を図3に示す。レーン上方の数は独立精製バッジを示す。サイズマーカーのキロダルトンで表した分子量は図面の左側に示される。代替試料調製条件下でのさらなる実験は、DTTまたは2−メルカプトエタノールを含有するSDS試料緩衝液中でタンパク質を沸騰することによるジスルフィド結合の還元は2H7scFv−Igを凝集させたことを示した。
多くの他の免疫学的パラメーターは当該分野でよく知られたルーチンアッセイを用いてモニターすることができる。これらは、例えば、抗体依存性細胞―媒介細胞傷害性(ADCC)アッセイ、二次イン・ビトロ抗体応答、確立されたマーカー抗原系を用いる種々の末梢血液またはリンパ系単核細胞亜集団のフローイミュノサイトフルオリメトリー分析、免疫組織化学または他の関連アッセイを含むことができる。これらおよび他のアッセイは、例えば、Rose et al.(編), Manual of Clinical Laboratory Immunology,第5版, 1997 American Society of Microbiology,Washington,DCに見出すことができる。
補体存在下でCD20陽性細胞を殺す2H7scFv−Igの能力はB細胞系RamosおよびBjabを用いてテストした。ウサギ補体(Pel−Freez,Rogers,AK)を1/10の最終希釈にてアッセイで用いた。精製された2H7scFv−IgをB細胞および補体と共に37℃にて45分間インキュベートし、続いて、トリパンブルー排除によって生きたおよび死んだ細胞をカウントした。図4Aにおける結果は、ウサギ補体の存在下では、2H7scFv−IgがCD20を発現するB細胞を溶解させたことを示す。
末梢血液単核細胞(PBMC)の存在下におけるCD20陽性細胞を殺す2H7scFv−Igの能力は、Bjab細胞に対するPBMCの100:1比を用い、4時間アッセイにおいて標識されたBjab細胞からの51Crの放出を測定することによってテストした。図4Bで示した結果は、2H7scFv−Igが抗体依存性細胞傷害(ADCC)を媒介できることを示した。何故ならば、51Crの放出は、PBMCまたは2H7scFv−Ig単独いずれかの存在下におけるよりもPBMCおよび2H7scFv−Igの双方の存在下においてより高かったからである。
(実施例3)
(正常B細胞の増殖、およびCD95発現に対するCD20およびCD40の同時連結の効果、およびアポトーシスの誘導)
本実施例は、細胞表面に発現されるCD20およびCD40の架橋の細胞増殖に対する効果を示す。
Percoll工程グラジエントによって、密な休止B細胞をヒト扁桃から単離し、T細胞をE−ロゼッティングによって除去した。休止する密な扁桃B細胞の増殖は、4日実験の最後の12時間の間における[H]−チミジンの取り込みによって測定した。増殖は四連培養で測定し、平均および標準偏差は示した通りである。マウス抗−ヒトCD20モノクローナル抗体1F5(抗−CD20)は単独で用いるか、または抗−マウスκモノクローナル抗体187.1(抗−CD20XL)で架橋させた。CD40の活性化はマウスCD8と融合させた可溶性ヒトCD154(CD154)を用いて達成し(Hollenbaugh et al.,EMBO J.11:4212−21(1992))、CD40架橋は抗−マウスCD8モノクローナル抗体53−6(CD154XL)を用いて達成した。この手法は細胞表面でのCD20およびCD40の同時架橋を可能とした。結果を図5に示す。
Ramos細胞、Bリンパ腫細胞系に対するCD20およびCD40架橋の効果を調べた。Ramos細胞を、CD20(1F5)およびCD40(G28−5)に特異的に結合するマウスモノクローナル抗体を用い、処理(ヤギ抗−マウスIgG(GAM)無し)および/または架橋(+GAM)から18時間後にCD95(Fas)発現およびパーセントアポトーシスにつき分析した。対照細胞は、CD3に特異的な非−結合性イソタイプ対照(64.1)で処理した。
処理されたRamos細胞を収穫し、FITC−抗−CD95と共にインキュベートし、フローサイトメトリーによって分析して、CD20またはCD40架橋後に細胞表面でのFasの相対的発現レベルを測定した。データは、示した刺激での処理後における細胞の平均蛍光としてプロットする(図6A)。
同一実験からの処理されたRamos細胞を収穫し、アネキシンVの結合を測定して、処理された培養におけるパーセンテージアポトーシスを示す。アポトーシスは、1F5およびG28−5を用いるCD20およびCD40の架橋から18時間後にアネキシンVを結合させ、続いて、GAMで架橋させることによって測定した。アネキシンVの結合は、FITC−アネキシンVキット(カタログ番号PN−IM2376,Immunotech,Marseille,フランス国)を用いて測定した。アネキシンV結合は、細胞のアポトーシスへの進行における初期事象であることが知られている。アポトーシスまたはプログラムされた細胞死滅は、自殺による細胞死滅に至る異化反応のカスケードによって特徴づけられるプロセスである。アポトーシスの初期相においては、細胞が形態を変化させ、DNAを加水分解する前に、細胞膜の一体性を維持するか、細胞はその膜リン脂質の非対称性を失い、細胞表面においてホスファチジルセリンのような負に荷電したリン脂質を露出させる。アネキシンV、カルシウムおよびリン脂質結合タンパク質は、優先的に、かつ高い親和性をもってホスファチジルセリンに結合する。FASレセプター(CD95)の発現に対するCD20およびCD40双方を架橋させる効果を示す結果は、図6Bに示す。細胞へのアネキシンV結合に対するCD20およびCD40双方の架橋の効果を図6Bに示す。
(実施例4)
(2H7 scFv−CD154融合タンパク質の構築および特徴付け)
CD20およびCD40双方に結合することができる分子を構築するために、2H7 scFvをコードするcDNAを、CD154、該CD40リガンドをコードするcDNAと融合させた。HindIII−BclI断片にコードされた2H7 scFv cDNAを2H7 scFvIg構築体から取り出し、ヒトCD154の細胞外ドメインをコードするBamHI−XbaI cDNA断片と共にpD18ベクターに挿入した。細胞外ドメインは、他のタイプII膜タンパク質と同様に、CD154のカルボキシ末端においてコードされている。
ヒトCD154の細胞外ドメインは、ランダムプライマー、およびPHA(フィトヘマグルチニン)で活性化されたヒトTリンパ球からのRNAで生じさせたcDNAを用いてPCR増幅した。該プライマー組は2つの異なる5’またはセンスプライマーを含み、それは、CD154の細胞外ドメイン内の2つの異なる位置に融合接合部を生じた。共にBamHI−XbaI断片として構築された、CD154の細胞外ドメインの、アミノ酸108(Glu)ないし261(Leu)+(Glu)を含めた短いまたは切断された形態(形態S4)、およびアミノ酸48(Arg)ないし261(Leu)+(Glu)を含めた長いまたは完全な形態(形態L2)をもたらす2つの異なる融合接合部を設計した。2つの異なる切断された細胞外ドメインを2HFscFvに融合させるセンスプライマーは、クローニングのためのBamHI部位を含む。CD154 cDNAのS4形態のためのセンスプライマーは配列番号:11またはCD154BAM108と命名され、以下の配列:
Figure 2010279389
を持つ34merをコードし、他方、アンチセンスプライマーは配列番号:12またはCD154XBAと命名され、以下の配列:
Figure 2010279389
を持つ44merをコードする。
アミノ酸48(Arg)ないし261(Leu)+(Glu)をコードするCD154細胞外ドメインの長い形態(L2)を増幅するのに用いるオリゴヌクレオチドプライマーは以下の通りであった:CD154 BAM48(配列番号:13)と命名されたセンスプライマーは以下の配列:
Figure 2010279389
を持つ35−merをコードした。CD154XBA(配列番号: )と命名されるアンチセンスプライマーは44−mer:
Figure 2010279389
をコードした。他のPCR反応条件は、2H7 scFvを増幅するのに用いたのと同一であった(実施例1参照)。PCR断片をPCR quick kit(QIAGEN, San Diego,GA)によって精製し、30μlのddHOで溶出し、40μlの反応容量中で、37℃にて3時間、BamHIおよびXbaI(Roche)制限エンドヌクレアーゼで消化した。断片をゲル精製し、製造業者の指示(QIAGEN)に従ってQIAEXキットを用いて精製し、HindIII+XbaIで消化されたpD18発現ベクターへ、2H7 HindIII−BclI断片と共に連結させた。連結反応をDH5−アルファ 化学的なコンピテント細菌に形質転換し、100μg/mlアンピシリンを含有するLBプレート上で平板培養した。形質転換体を37℃にて一晩増殖させ、単離されたコロニーを用いて、100μg/mlアンピシリンを含有するルリアブロス中の3ml液体培養に接種した。2H7 scFvおよびCD154細胞外ドメイン断片双方の挿入につき、クローンをミニ−プラスミド調製(QIAGEN)後にスクリーニングした。
2H7scFv−CD154構築体cDNAを、96℃における10秒間の変性、50℃における5秒間のアニーリング、および60℃における4分間の伸長を含む25−サイクルプログラムを用いるPE 9700サーモサイクラーでのサイクル配列決定に付した。用いた配列決定プライマーはpD18順方向(配列番号:
Figure 2010279389
)およびpD18逆方向(配列番号:
Figure 2010279389
)プライマーであった。加えて、ヒトCD154配列(配列番号:
Figure 2010279389
)に対する相同性を有する内部プライマーを用いた。配列決定反応は3.2pモルのプライマー、ほぼ200ngのDNA鋳型、および8μlの配列決定ミックスを含んだ。配列決定反応は、製造業者の指示に従って、Big Dye Terminator Ready Sequencing Mix(PE−Applied Biosystems,Foster City,CA)を用いて行った。引き続いて、Centrisepカラム(Princeton Separations, Adelphia,NJ)を用いて試料を精製した。溶出物をSavantスピード−真空ドライヤー中で乾燥し、20μlの鋳型抑制試薬(ABI)中で95℃にて2分間変性し、ABI 310 Genetic Analyzer (PE−Applied Biosystems)で分析した。配列を編集し、翻訳し、ベクターNtiバージョン6.0(Infornax,North Bethesda,MD)を用いて分析した。2H7scFv−CD154 L2 cDNA配列および予測されるアミノ酸配列を図7Aに示し、2H7scFv−CD154 S4 cDNA配列および予測されるアミノ酸配列を図7Bに示す。
CD20およびCD40への2H7 scFv−CD154融合タンパク質(配列番号: および )の同時結合活性はフローサイトメトリーによって決定した。該アッセイは、CD20を発現するCHO細胞標的を用いた。2H7 scFv−CD154発現プラスミドでトランスフェクトされた細胞からの上清と一緒でのCD20 CHO細胞の45分間のインキュベーションの後、CD20 CHO細胞を2回洗浄し、PBS/2%FBS中のビオチン−結合体化CD40−Ig融合タンパク質と共にインキュベートした。45分後、細胞を2回洗浄し、PBS/2%FBS(Molecular Probes,Eugene OR)中1:100のフィコエリスリン(PE)−標識ストレプトアビジンと共にインキュベートした。さらに30分間のインキュベーションの後、細胞を2×洗浄し、フローサイトメトリーによって分析した。結果は、2H7 scFv−CD154分子は細胞表面のCD20に結合でき、溶液からビオチン−結合体化CD40を捕獲することができることを示す(図8)。
Bリンパ腫およびリンパ芽球様細胞系の増殖および生存に対する2H7scFv−CD154の効果を測定するために、細胞を2H7scFv−CD154 L2(配列番号: )と共に12時間インキュベートし、次いで、アネキシンVの結合につき調べた。FITC−アネキシンVキット(Immunotech,Marseille,France国、カタログ番号PN−IM2376)を用い、アネキシンVの結合を測定した。B細胞系を、2H7scFv−CD154融合タンパク質の分泌形態を発現する細胞からの、濃縮され、透析された上清の希釈物と共に1ml培養中でインキュベートした。結果を図9に示す。
2H7scFv−CD154の存在下におけるRamos Bリンパ腫細胞系の増殖速度を、24時間培養の最後の6時間におけるH−チミジンの摂取によって調べた。細胞増殖に対する2H7scFv−CD154の効果を図10に示す。
(実施例5)
(CytoxB抗体誘導体の構築および特徴付け)
2H7 scFv−IgGポリペプチドを用い、CytoxB抗体を調製した。2H7 scFv(実施例1参照)を、改変されたヒンジドメイン(図11参照)を介してヒトIgG1 Fcドメインに連結した。ヒンジ領域中のシステイン残基を部位―特異的突然変異誘発および当該分野で知られた他の方法によって、セリン残基で置換した。突然変異体ヒンジを野生型Fcドメインと融合させて、CytoxB−MHWTG1Cと命名された一つの構築体が得られ、あるいはCH2ドメインに導入された更なる突然変異を有する変異したFcドメイン(CytoxB−MHMG1C)に融合させた。エフェクター機能に関連するCH2中のアミノ酸残基を図11に示す。これらの残基の一以上の突然変異はFcR結合およびエフェクター機能の媒介を低下させることができる。本発明実施例においては、Fcレセプター結合に対して重要であることが当該分野で知られたロイシン残基234を、2H7 scFv融合タンパク質、CytoxB−[MG1H/MG1C]において突然変異させた。もう一つの構築体において、ヒトIgG1ヒンジ領域を、野生型ヒトFcドメインに融合させたヒトIgAヒンジの部分で置き換えた(CytoxB−IgAHWTHG1C)(図11参照)。この変異したヒンジ領域は、ヒトIgG1 CH2およびCH3ドメインの機能的特性を保有するモノマーおよびダイマー分子の混合物の発現を可能とする。これらの分子のための合成組換えcDNA発現カセットを構築し、実施例2に記載された方法に従って、ポリペプチドをCHOGD44細胞で発現させた。
実施例2に記載された方法に従い、CytoxB−scFvIg分子の精製された融合タンパク質誘導体をSDS−PAGEによって分析した。ポリアクリルアミドゲルを、非−還元および還元条件下で実行した。二つの異なる分子量のマーカーセットBioRad予備染色マーカー(BioRad,Hercules,CA)およびNovex Multimark分子量マーカーを各ゲルに負荷した。RituximabTMの異なる構築体の移動パターンを図12に示す。
ADCCを媒介するCytoxB−scFvIg分子の異なる誘導体の能力を、標的としてのBjab Bリンパ腫細胞およびエフェクター細胞としての新たに調製されたヒトPBMCを用いて測定した(実施例2参照)。標的に対するエフェクターの比率は以下の通り変化させた:70:1、35:1、および18:1であり、ウエル当たりのBjab細胞の数は一定のままとしたが、PBMCの数は変化させた。Bjab細胞を51Crで2時間標識し、平坦―底96ウエルプレートの各ウエルに対して5×10細胞/ウエルの細胞密度にてアリコットした。精製された融合タンパク質またはリツキシマブを10μg/mlの濃度にてPBMCの種々の希釈物に加えた。PBMCまたは融合タンパク質の添加なくして自然発生放出を測定し、洗剤(1%NP−40)の適当なウエルへの添加によって、最大放出を測定した。反応を四時間インキュベートし、100μlの培養上清をLumaplate(Packard Instruments)に収穫し、放出されたcpmをカウントするに先立って一晩乾燥した。結果を図13に示す。
また、CytoxB誘導体の補体依存性細胞傷害性(CDC)活性も測定した。実質的に実施例2に記載したように反応を行った。融合タンパク質の各濃度につき全細胞に対する死滅細胞のパーセントとして結果を図14に示す。
(実施例6)
(マカック属サルにおけるイン・ビボ実験)
CytoxB誘導体での初期イン・ビボ実験は非ヒト霊長類で行った。図15は、サルにおけるCytoxBの血清半減期を特徴付けるデータを示す。矢印で示した日、6mg/kgの用量を各サルに投与した後に、二匹の異なるマカック属サル(J99231およびK99334)から得られた血清試料について測定を行った。各試料につき、精製されたCytoxB−(MHWTG1C)−Ig融合タンパク質のCD20 CHO細胞への結合によって作成した標準曲線との比較によって存在する、2H7scFvIgのレベルを見積もった(実施例2参照)。データを図15底部パネル中で表とした。
マカック属サルにおける循環CD40+細胞のレベルに対するCytoxB−(MHWTG1C)Ig融合タンパク質の効果を調べた。完全な血液カウントを、図16に示した日の各々に行った。加えて、CD40−特異的フルオレセイン結合体化抗体を用い、FACS(蛍光活性化細胞ソーター)アッセイを末梢血液リンパ球で行って、細胞集団中のB細胞を検出した。次いで、陽性細胞のパーセンテージを用いて、元の試料中のB細胞の数を計算した。データは、注射後の示した日に測定した。血液のマイクロリットル当たりのB細胞の千単位としてグラフ化する(図16)。
(実施例7)
(抗−CD19 scFv−Ig融合タンパク質の構築および発現)
抗−CD19 scFv−Ig融合タンパク質を構築し、真核生物細胞にトランスフェクトし、実施例1、2および5に示した方法および当該分野における標準に従って発現させた。可変重鎖領域および可変軽鎖領域を、CD19に特異的に結合する抗体HD37を生産するハイブリドーマ細胞から単離されたRNAからクローン化した。HD37scFv−IgAHWTG1CおよびHD37scFv−IgMHWTG1Cの発現レベルを測定し、精製されたHD37 scFvIgを用いて作成された標準曲線と比較した。結果を図17に示す。
(実施例8)
(抗−L6 scFv−Ig融合タンパク質の構築および発現)
抗−癌腫モノクローナル抗体L6に由来する可変領域を用いてscFv−Ig融合タンパク質を構築した。実施例1、2および5に示した方法および当該分野における標準に従い、融合タンパク質を構築し、真核生物細胞にトランスフェクトし、発現させた。L6 scFv−IgAH WCH2 CH3およびL6 scFv−(SSS−S)H WCH2 WCH3の発現レベルを測定し、精製されたL6 scFvIgを用いて作成された標準曲線と比較した。結果を図18に示す。
(実施例9)
(種々のscFv−Ig融合タンパク質の特徴付け)
既に記載したscFv−Ig融合タンパク質に加えて、実質的に実施例1および5に記載されているようにして、G28−1(抗−CD37)scFv−Ig融合タンパク質を調製した。重鎖および軽鎖の可変領域を当該分野で知られた方法に従ってクローン化した。2H7−MHWTG1C、2H7−IgAHWTG1C、G28−1−MHWTG1C、G28−1 IgAHWTG1C、HD37−MHWTG1C、およびHD37−IgAHWTG1CのADCC活性を前記した方法に従って測定した(実施例2参照)。結果を図19に示す。2981ヒト肺癌腫細胞系を用いてL6scFv−IgAHWTG1CおよびL6scFv−IgMHWTG1CのADCC活性を測定した。結果を図20に示す。マウスL6モノクローナル抗体はADCC活性を呈しないことが知られている。
精製されたタンパク質を還元および非−還元条件下でSDS−PAGEによって分析した。実質的に実施例2および5に記載されているように、試料を調製し、ゲルを実行した。L6および2H7 scFv−Ig融合タンパク質についての結果を図21に示し、G28−1およびHD37 scFv−Ig融合タンパク質についての結果を図22に示す。
(実施例10)
(抗−CD20 scFv−ラマIg融合タンパク質の構築および発現)
本実施例は、ラマIgG1、IgG2およびIgG3定常領域ドメインのクローニング、および三つの定常領域の各々および抗−CD20 scFvとの免疫グログリン融合タンパク質の構築を説明する。
ラマIgG1、IgG2およびIgG3免疫グログリンの定常領域をクローン化し、抗−CD20単鎖Fv、2H7 scFvを含有する哺乳動物ベクター構築体に挿入した。製造業者の指示に従い、TRIzol(登録商標)(Invitrogen Life Technologies,Carlsbad,CA)中のリンパ球を溶解させることによって、全RNAをラマ血液(Triple J Farms,Bellingham,WA)からの末梢血液単核細胞(PBMC)から単離した。1マイクログラム(1μg)の全RNAを鋳型として用いて、逆転写によってcDNAを調製した。RNAおよび200ngランダムプライマーを合わせ、酵素の添加に先立って72℃にて10分間変性した。Superscript II逆転写酵素(Invitrogen Life Technologies)を、該酵素とともに提供された5×第二ストランド緩衝液および0.1M DTTの存在下で、25μlの合計容量にてRNA+プライマー混合物に加えた。逆転写反応を42℃にて一時間進行させた。配列特異的プライマーを用い、cDNAをPCRによって増幅させた。ラクダのVHHおよびVドメインについての公表された配列に従い、5‘プライマーを設計した。全ての3つのイソタイプを増幅するのに用いた3’プライマーは、哺乳動物CH3ドメイン配列をガイドとして用いて設計した。以下の特異的プライマーを用いたBclおよびXbaI部位は下線を施したイタリック体配列によって示される。
Figure 2010279389
予測されたサイズのPCR断片をTOPO(登録商標)クローニングベクター(Invitrogen Life Technologies)にクローン化し、次いで、配列決定した。センス配列決定プライマーLLseqsenseは配列
Figure 2010279389
(配列番号: )を有し、アンチセンスプライマーLLseqASは配列
Figure 2010279389
(配列番号: )を有した。配列決定は実施例1に記載したように行った。図23はヒンジ、CH2およびCH3ドメインを含有する三つのイソタイプラマ定常領域のアミノ酸配列を、ヒトIgG1ヒンジ、CH2、およびCH3ドメインのアミノ酸配列と比較する。
配列を確認した後、増幅されたPCR産物を制限酵素BclIおよびXbalで消化して、適合する制限部位を生じさせた。次いで、消化された断片をゲル−精製し、QIAquickGel Extraction Kit(QIAGEN,Valencia,CA)を用いてDNAを溶出させた。2H7scFv−Ig pD18哺乳動物発現ベクター構築体(実施例2参照)をBclIおよびXbaIで消化して、ヒトIgGヒンジ、CH2、およびCH3ドメインを除去した。pD18ベクターは哺乳動物発現用の選択マーカーとして機能する(Hayden et al.,Tissue Antigens 48:242−54(1996))減弱されたDHFR遺伝子を含有するpCDNA3の修飾された誘導体である。製造業者の指示に従い、精製されたラマIgG1、IgG2、およびIgG3定常領域PCR産物をT4 DNAリガーゼ(Roche Molecular Biochemicals, Indianapolis,IN)によって室温にて一晩、二重―消化2H7 scFv−pD18ベクターに連結した。連結後、標準的な分子生物学手法および製造業者の指示に従い、連結産物をE.coli DH5α細菌(BD Biosciences, Palo Alto,CA)に形質転換し、平板培養した。単離されたコロニーを選択して、正しいインサートを含有する形質転換体についてスクリーニングした。
コードされたポリペプチドの発現のために、陽性クローンからのプラスミドDNAを、DEAE−デキストランを用いてCOS−7細胞に一過的にトランスフェクトした(Hayden et al.,Ther Immunol.1:3−15(1994))。COS−7細胞を150mmプレート当たりほぼ3×10細胞にて接種し、細胞が約75%密集するまで一晩増殖させた。次いで、細胞を無血清DMEM(Invitrogen Life Technologies, Grand Island,NY)で一回洗浄した。400μg/ml DEAE−デキストラン、0.1mMのクロロキン、および5μg/mlのDNA構築体を含有するトランスフェクション上清(10ml)を細胞に加え、次いで、これを37℃にて3ないし4時間にてインキュベートした。インキュベーションの後、細胞を1×PBS中の10mlの10%ジメチルスルホキシド(DMSO)で室温にて二分間パルスした。次いで、細胞を十分に補足されたDMEM/10%FBS(1%L−グルタミン、1%ペニシリン/ストレプトマイシン、1%ピルビン酸ナトリウム、1%MEM必須アミノ酸)(Invitorogen Life Technologies)に戻した。24時間後、培地を無血清の十分に補足されたDMEM(Invitorogen Life Technologies)で交換し、細胞を、培地を3ないし4日ごとに交換しつつ、21日まで維持した。
COS細胞培養上清をプロテインAアガロース(Repligen,Cambridge,MA)カラムを通すことによって、Ig−融合タンパク質を精製した。培養上清の適応の後、次いで、プロテインAカラムを1×PBS(Invitrogen Life Technologies)で洗浄した。結合したIg−融合タンパク質を0.1Mクエン酸pH2.8で溶出させ収集された画分をトリス塩基(pH10.85)で直ちに中和した。光学密度(A280)を測定することによってタンパク質を含有する画分を同定し、次いで、プールし、1×PBS(Invitrogen Life Technologies)に対して透析し、0.2μmフィルターを通して濾過した。
精製されたIg−融合タンパク質をSDS−PAGEによって分析した。2H7 scFv−ラマIgG1、2H7 scFv−ラマIgG2、2H7 scFv−ラマIgG3、およびRituxan(登録商標)(リツキシマブ、抗−CD20抗体、Genentech,Inc.およびIDEC Pharmaceuticals Corp.)(5μgタンパク質)のアリコットを25μlの2× NuPAGE(登録商標) SDS試料緩衝液(Invitrogen Life Technologies)(非−還元試料)と合わせた。各タンパク質の試料もまた、5%2−メルカプトエタノール(Sigma−Aldrich,St.Louis,MO)を含有する還元性試料緩衝液中で調製した。分子量マーカー(Invitrogen Life Technologies)を非−還元緩衝液のみ中のゲルに適用した。タンパク質をNuPAGE(登録商標) 10%ビス−トリスゲル(Invitrogen Life Technologies)で分画した。電気泳動(ほぼ一時間)後にゲルを蒸留水(Invitrogen Life Technologies)で各々5分で3回洗浄し、次いで、50ml Bio−Safeクーマシー染色(BioRad,Hercules,CA)中で室温にて一晩染色した。蒸留水中での洗浄の後、ゲルを写真に撮った。各Ig融合タンパク質の移動パターンを図24に示す。
CD20を発現する細胞に結合する2H7 scFv−ラマIg融合タンパク質の能力はフローサイトメトリーによって証明した。25μg/mlの精製された2H7 scFv−ラマIgG1、2H7 scFv−ラマIgG2、および2H7 scFv−ラマIgG3で出発する系列希釈を調製し、1%FBS 1×PBS培地(Invitrogen Life Technologies)中の(Dr.S.skov, Institute of Medical Microbiology and immnunology, Copenhagen Denmarkからの)CD20トランスフェクト(CD20+)CHO細胞と共に氷上で一時間インキュベートした。インキュベーションの後、次いで、細胞を遠心し、1× PBS中の1%FBSで洗浄した。結合した2H7 scFv−ラマIgを検出するために、細胞をフルオレセイン−結合体化ヤギ抗−ラクダIgG(重鎖および軽鎖)(1:100)(Triple J Farms)と共に氷上で一時間インキュベートした。次いで、細胞を遠心し、1%FBS−1× PBSに再懸濁させ、Coulter Epics XLセルソーター(Beckman Coulter,Miami,FL)を用いて分析した。データ(最大輝度のパーセント)を図25に示す。
(実施例11)
(抗−CD20 scFv−ラマIg融合タンパク質のエフェクター機能)
本実施例は補体依存性細胞傷害性(CDC)および抗体依存性細胞―媒介細胞傷害性(ADCC)を媒介する抗−CD20ラマIgG1、IgG2、およびIgG3融合タンパク質の能力を示す。
補体の存在下においてCD20陽性細胞を殺す2H7 scFv−ラマIgG融合タンパク質の能力は、BJABヒトB細胞系を用いてテストした。ウサギ補体は3ないし4週齢ウサギ(Pel−Freez,Brown Deer,WI)から入手した。BJAB細胞(2×10細胞/ml)をウサギ補体(最終希釈1:10)および精製された2H7 Ig融合タンパク質と合わせた。2H7 scFv−ラマIgG1、2H7 scFv−ラマIgG2、2H7 scFv−ラマIgG3、および2H7 scFv−ヒトIgG1野生型ヒンジ−CH2−CH3(実施例1)を30μg/mlの濃度で開始して1:3系列希釈にて加えた。37℃における一時間の後、血球計(Bright−line、Horsham,PA)を用い、トリパンブルー排除(0.4%)(Invitrogen Life Technologies)によって生きたおよび死滅した細胞をカウントすることによって、細胞生存率を決定した。パーセント殺傷は、死滅した細胞の数を全細胞の数(死滅した+生きた細胞)で割ることによって計算した。図26に示したデータは、全てのIg融合タンパク質がCDC活性を有することを示す。
標的細胞としてのBJAB細胞、およびエフェクター細胞としてのヒトまたはラマ末梢血液単核細胞(PBMC)を用い、2H7 scFv−ラマIgG融合タンパク質のADCC活性を測定した。15%FBSを含有する十分に補足されたIMDM(Invitrogen Life Technologies)中の51Cr(100μCi)(Amersham Biosciencies, Piscataway, NJ)と共にBJAB細胞をほぼ2時間プレインキュベートした。細胞をプレ−インキュベーションの間、間歇的に混合した。新鮮な休止ヒトPBMCは、リンパ球分離培地(LSM)(ICN)(Pharmaceuticals, New York, NY)を用いて、全血から精製した。PBMCは25:1、50:1、および100:1の比率にて、標識されたBJAB細胞(96ウエル組織培養プレート当たり5×10細胞)と合わせた。各組合せに、10μg/mlの精製された2H7 scFv−ラマIgG1、2H7 scFv−ラマIgG2、2H7 scFv−ラマIgG3、リツキシマブを加え、または抗−CD20抗体を加えなかった。混合物を37℃にて6時間インキュベートした。溶解された細胞から放出された51Crを含有する各反応からの上清をLumaPlate−96フィルタープレート(Packard,Meriden,CT)上に収集し、これを一晩乾燥した。51Crの量をTopCount NXTプレートリーダー(Packard)によって測定した。図27は、2H7 scFv−ラマIgG2融合タンパク質が、ADCCを媒介するにおいて最も有効なラマ融合タンパク質であることを示す。各データ点は三連ウエルの平均測定を表す。
ADCC活性は、エフェクター細胞の源によって影響されなかった。ラマPBMCは、LSMを用い、ラマ血液(Triple J Farms)から単離した。ラマエフェクター細胞は、ヒトエフェクター細胞を用い、ADCCアッセイについて記載したのと同一のBJAB標的細胞に対する比率で加えた。細胞を10μg/mlの精製された2H7 scFv−ラマIgG1、2H7 scFv−ラマIgG2、2H7 scFv−ラマIgG3、リツキシマブ、または抗−CD20抗体無しと合わせた。結果を図28に示す。
(実施例12)
(細胞表面に発現されたscFv−Ig融合タンパク質の構築および特徴付け)
本実施例は、共刺激性レセプターに結合するscFvよりなる遺伝子工学作成細胞表面レセプターの異所性表面発現のためのレトロウイルストランスフェクション系を記載する。該実施例は、標的細胞の表面に発現されたこれらの種々のscFv Ig融合タンパク質のエフェクター機能も示す。
重鎖および軽鎖可変領域を種々の共刺激性レセプターに対して特異的なマウスモノクローナル抗体からクローン化し、単鎖Fv構築体は実質的には実施例1に記載されているように調製した。抗体は2H7、抗−ヒトCD20;40.2.220、抗−ヒトCD40;2E12、抗−ヒトCD28;10A8、抗−ヒトCD152(抗−CTLA−4);および500A2、抗−マウスCD3を含んだ。各抗体の重鎖および軽鎖可変領域は、免疫グログリン遺伝子をクローン化するための標準的方法に従い、実施例1に記載されたようにクローン化した。単鎖Fv構築体は、各々、40.2.220、2E12、10A8、および500A2(各々、配列番号: )のVL領域ヌクレオチド配列、および各々、40.2.220、2E12、10A8、および500A2(各々、配列番号: )のVH領域ヌクレオチド配列の間に、(glyser)ペプチドリンカーをコードするヌクレオチド配列を挿入することによって実施例1に記載したように調製した。40.2.220、2E12、10A8、および500A2のVLについてのポリペプチド配列は、各々、配列番号: に記載され、40.2.220、2E12、10A8、および500A2のVHについてのポリペプチド配列は、各々、配列番号: に記載されている。次いで、実施例5および11に記載された方法に従い、各scFvポリヌクレオチド(各々、40.2.220、2E12、10A8、および500A2については配列番号: )を、ヒトIgG1突然変異体ヒンジ(CCC→SSS)および突然変異体CH2(残基238におけるプロリンからセリンへの突然変異)(EU命名法に従う238ナンバリング、Ward et al.,1995 Therap.Immuno.2:77−94;Kabat et al.に従う残基251)および野生型CH3ドメインに融合させた。次いで、融合タンパク質がトランスフェクトされた細胞で発現される場合、CD80がscFv Ig融合タンパク質の表面発現用のアンカーを供するように、次いで、各scFv突然変異体IgG1融合ポリヌクレオチド配列を、ヒトCD80の膜貫通ドメインおよび細胞質テイルをコードする配列(配列番号: )にイン・フレームにて融合させた。標準的な分子生物学手法および販売業者の指示に従い、scFv−IgG−SD80融合タンパク質(各々、40.2.220−、2E12−、10A8−、および500A2scFv−IgG−CD80につき配列番号: )をコードするcDNAをレトロウイルスベクターpLNCX(BD Biosciences Clontech,Palo Alto,CA)に挿入した。scFv−Ig−CD80 cDNAは5’LTR−ネオマイシン耐性遺伝子―CMVプロモーター配列および3’LTR配列の間に挿入した。レトロウイルス構築体はReh、急性リンパ性白血病細胞系(ATCC CRL−8236)にトランスフェクトした。トランスフェクトされた細胞をスクリーニングして、細胞表面でscFv−Ig融合タンパク質を発現しているクローンを選択した。
CDCおよびADCCアッセイをトランスフェクトされたReh細胞で行って、細胞表面でのscFv−Igポリペプチドの発現がエフェクター細胞機能を増大させたかを決定した。抗−ヒトCD152 scFv−突然変異体IgG−CD80(配列番号: )を発現するReh細胞;Reh抗−ヒトCD28 scFv−突然変異体IgG−CD80(配列番号: );Reh抗−ヒトCD28 scFv−突然変異体IgG−CD80(配列番号: );Reh抗−ヒトCD40 scFv−突然変異体IgG−CD80(配列番号: );Reh抗―ヒトCD20 scFv−突然変異体IgG−CD80(配列番号: )をヒトPBMC(実施例11参照)およびウサギ補体(10μg/ml)と37℃にて1時間で合わせた。未トランスフェクトReh細胞を対照として含めた。細胞の生存率はトリパンブルー排除によって測定し、殺傷された細胞のパーセントを計算した(実施例11参照)。図29は、腫瘍細胞の細胞表面で発現され、補体依存性細胞傷害性を媒介する場合、scFv−IgG−CD80融合タンパク質の有効性を示す。
CDCアッセイでテストした同一のトランスフェクトされたReh細胞+抗−マウスCD3−scFv−IgCD80(配列番号: )をコードするポリヌクレオチド構築体でトランスフェクトされたReh細胞をADCC活性につき分析した(実施例11参照)。未トランスフェクトおよびトランスフェクトされたReh細胞を51Cr(100μCi)(Amersham)で37℃にて2時間プレ―標識した。ヒトPBMCはエフェクター細胞として供し、5:1、2.5:1、および1.25:1の比率にて、Reh標的細胞(96ウエルプレートのウエル当たり5×10細胞)に加えた。37℃における5時間の後、実施例11に記載されているように培養上清を収穫し、分析した。パーセント比殺傷は以下の方程式に従って計算した:((実験放出−自然放出)/(最大放出−自然放出))×100。データを図30に示す。各データ点は四連試料の平均を表す。
前記したのと同一の手法を用い、sFvの源として以下のモノクローナル抗体:CD20については、1F5(Genbank AY058907およびAY058906);CD40については、2.36およびG28.5;CD28については、9.3を用いて、他の結合ドメインと同一の結果が得られた。
抗体結合ドメインの細胞表面発現は、抗−scFvをIgGAヒンジおよび定常領域およびIgEヒンジ−作用領域、すなわちIgE CH2、および定常領域に融合されることによって達成される。CD80膜貫通および細胞質ドメインおよびIgE Fc領域に融合したIgAH IgA T4(欠失された4つの末端CH3残基)に融合した抗−4−1BB scFv、5B9(抗−ヒト4−1BB)scFv、および2e12(抗−ヒトCD40)をコードするポリヌクレオチドを配列番号: に示す。コードされたポリペプチドは配列番号: に示される。
(実施例13)
(ヒトIgヒンジ―CH2―CH3突然変異体および2H7可変領域突然変異体の構築および配列)
本実施例は、突然変異体ヒトIgG1およびIgA定常領域を含有するscFv融合タンパク質の構築を記載する。また、本実施例は、可変重鎖領域に単一の点突然変異を持つ2H7 scFv突然変異体の構築も記載する。本明細書中に記載し、かつ分子生物学の分野で知られた方法に従い、突然変異を可変および定常領域ドメインに導入した。図31はIg定常領域構築体に対する命名法を表す。
2H7 scFvヒトIgG1ヒンジ―CH2−CH3融合タンパク質のヒトIgG1ヒンジ領域を、全免疫グログリンにおいては、2つの重鎖分子の間でジスルフィド結合を形成するのに関与するシステイン残基を置換するように突然変異させた。1つの突然変異体、全ての3つのシステイン残基をセリン残基に突然変異にさせた(MTH(SSS))ヒトIgG1ヒンジ領域に融合した2H7 scFvを実施例5に記載したように調製し、(実施例5においては、CytoxB−MHWTG1Cと命名(野生型IgG1 CH2およびCH3ドメインを含む))(今回、2H7 scFv MTH(SSS)WTCH2CH3という)、それは、配列する番号: に記載されたポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列、配列番号: を含む。この突然変異体をコードするポリヌクレオチド配列(配列番号: )を鋳型として用いて、最初の2つのシステイン残基がセリン残基で置き換えられた(IgG MTH(SSC))突然変異体ヒンジ領域を作成した。オレゴヌクレオチドは、システインで第三のセリン残基を置換するように設計され、それは、以下の配列:
Figure 2010279389
(HuIgGMHncs3、配列番号: )を有した。突然変異体のヒンジが、第一および第三のシステイン残基を置き換えるセリン残基を有する(IgG MTH(SCS))第二の突然変異体を調製した。この突然変異体を作成するためのオリゴヌクレオチドの配列は以下の通りであった:
Figure 2010279389
(HuIgGMHncs2、配列番号: )。第三の突然変異体は、第二および第三の位置において置換されたシステイン残基にて(IgG MTH(CSS))、またIgG MTH(SSS)突然変異体を鋳型として、および配列
Figure 2010279389
(HuIgGMHncsl、配列番号: )を有するオレゴヌクレオチドを用いて調製した。
突然変異をヒンジ領域に導入するオリゴヌクレオチドを、鋳型およびXbaI部位(下線を施したイタリック体)を含有する3’オリゴヌクレオチド(
Figure 2010279389
(配列番号: ))と組み合わせて、PCRによって突然変異体ヒンジ−野生型(WT)−CH2−CH3配列を増幅した。IgG MTH CSSおよびIgG MTH SCS突然変異体配列は、94℃の変性プロフィール、52℃における30秒間のアニーリング、および72℃における30秒間の伸長での25サイクルで増幅した。IgG MTH SSC突然変異体配列は僅かに異なる条件:94℃の変性プロフィール、45℃における30秒間のアニーリング、および72℃における45秒間の伸長下で増幅した。増幅されたポリヌクレオチドをTOPO(登録商標)クローニングベクター(Invitrogen Life Technologies)に挿入し、次いで、実施例1に記載したように配列決定して、突然変異の存在を確認した。2H7 scFvを含有するpD18ベクターを消化して、実施例10に実質的に記載されているように、定常領域配列を除去した。突然変異体ヒンジ−野生型CH2−CH3領域を消化されたベクターDNAにイン・インフレーム挿入して、2H7 scFv MTH(CSS) WTCH2CH3コーディングDNA(配列番号: );2H7 scFv MTH(SCS) WTCH2CH3コーディングDNA(配列番号: );および2H7 scFv MTH(SSC) WTCH2CH3コーディングDNA(配列番号: )を含むベクターを得た。
重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域中の位置11におけるロイシンからセリンへの突然変異(Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 第五版、Bethesda,MD:Public Health Service, National Institutes of Health (1991)に従ったナンバリング)を2H7 scFv MTH(SSS) WTCH2CH3融合タンパク質(配列番号: )に導入した。オリゴヌクレオチドVhser11:
Figure 2010279389
(配列番号: ):(この配列、またはそれがコードするアミノ酸配列は、所望により、本発明の特定の特許請求される具体例から排除され得る)を用いる部位―特異的突然変異誘発によって、野生型ロイシン残基をセリンで置き換えた。PCR用の3‘−プライマーは配列
Figure 2010279389
(配列番号: )(XbaI部位は下線を施しイタリック体)を有するhuIgG1−3’であった。PCR増幅の後、断片をTOPO(登録商標)クローニングベクターに挿入し、配列決定して、VH11のロイシンからセリンへの突然変異の存在を確認した。2H7 scFv−IgG MTH(SSS) WTCH2CH3コーディングDNAをPSL1180クローニングベクター(Pharmacia Biotech,Inc.,Piscataway,NJ)にシャトルした。構築体PSL1180−2H7 scFv−IgG MTH(SSS) WTCH2CH3をSacおよびXbaIで消化して野生型VHドメインおよびヒンジおよびCH2およびCH3ドメインを除去した。VH11突然変異体を含むPCR産物をSacおよびXbaIで消化し次いで、標準的な分子生物学手法に従い、消化されたPSL1180構築体に挿入した。次いで、構築体をHindIIIおよびXbaIで消化し、哺乳動物発現ベクターpD18に挿入した(実施例1および実施例10に記載された方法参照)。突然変異体は2H7 scFv VH11SER IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(図31)と命名される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される:(これらの配列は、所望により、本発明の特定の特許請求された具体例から排除され得る)。
IgA定常領域ドメインを含む4つの構築体を調製した。一つの構築体はヒト−IgG1 CH2およびCH3に融合した野生型IgAヒンジを含有した(IgAH IgG WTCH2CH3)(図31)。引き続いてのPCR増幅を行って、2H7 scFv構築体のヒトIgG1ヒンジを、IgAヒンジをコードするヌクレオチド配列で置き換えた。第一のPCR反応のための5’オリゴヌクレオチドプライマー(huIgA/Gchim5)は配列
Figure 2010279389
(配列番号: )を有した。よりIgA特異的ヒンジ領域を加え、BclI制限酵素部位(イタリック体かつ下線)を加えるための第二のPCR反応用のプライマー(huIgAhg−5’)は配列
Figure 2010279389
(配列番号: )を有した。双方の増幅工程用の3‘プライマーは配列
Figure 2010279389
(配列番号: )を有するhuIgG1−3’であった。PCR産物の配列は前記したTOPO(登録商標)クローニングによって確認した。ゲル−精製した断片をBclIおよびXbaIで消化し、次いで、BclIおよびXbaIで消化して、全てのIgG1定常領域ドメインを除去してある2H7 scFv−pD18ベクターに挿入した。実施例10に記載したように連結を行って、2H7 scFv IgAヒンジ−IgG1 CH2−CH3ポリペプチド(配列番号: )をコードするヌクレオチド配列(配列番号: )を含む哺乳動物発現ベクターを得た。
第二のpD18哺乳動物発現ベクターを構築し、これは、野生型IgAヒンジ、CH2、およびCH3ドメイン(配列番号: )に融合した2H7 scFvをコードするポリヌクレオチド配列(配列番号: )を有した。ヒトIgA定常領域配列は、実質的に実施例10に記載されたように、ヒト扁桃から単離された全RNAを逆転写するためにランダムプライマーを用い、続いて、配列特異的プライマーを用いてcDNAのPCR増幅を行うことによって得られた。IgA−CH2−CH3ポリペプチド(IgAH IgA CH2CH3、図31)(配列番号: )をコードするヒトIgAヒンジ−CH2−CH3ヌクレオチド配列(配列番号: )は、5’オリゴヌクレオチドhuIgAhg−5’(配列番号: :( 前記と同一)および配列
Figure 2010279389
(配列番号: )を有する3’オリゴヌクレオチドhuIgA3’を用いて増幅した。トランスフェクトされた哺乳動物細胞からの2H7−IgAヒンジ−IgA CH2−CH3ポリペプチドの分泌は、ジスルフィド結合を介して2つのIgA CH3ドメインに共有結合するヒトJ鎖の共発現を必要とした。全RNAは扁桃B細胞から単離し、前記したように逆転写して、cDNAを作成した。J鎖をコードするヌクレオチド配列のPCR増幅はJ鎖特異的プライマーで行った。5’PCRプライマーHUJCH5nlは配列
Figure 2010279389
(配列番号: )を有し、3’プライマーHUJCH3の配列は
Figure 2010279389
(配列番号: )であった。実施例10に記載されたように、配列決定のために該cDNAをTOPO(登録商標)にクローン化した。J鎖コーディングcDNA(配列番号: )を、次いで、2H7 scFv IgAヒンジ−CH2−CH3構築体との共トランスフェクションのために、pD18およびpCDNA3−Hygro(+)(Invitrogen Life Technology)ベクターに挿入した。J鎖は配列番号: に記載された予測されたアミノ酸配列を有する。
J鎖の不存在下におけるscFv IgA定常領域構築体の分泌は、J鎖とでジスルフィド結合を形成するシステイン残基を含む、4つのカルボキシ末端アミノ酸の欠失を持つ切断CH3ドメイン(GTCY、配列番号: )(IgAH IgA−T4、図31)を操作することによって達成された。配列
Figure 2010279389
(配列番号: )(BclI部位は下線を施したイタリック体)を有する5’PCRプライマー(huIgAhg−5’)、および配列
Figure 2010279389
(配列番号: )を有する3’PCRプライマー(HUIGA3T1)を用いて、CH3に欠失を含むIgAヒンジ−CH2−CH3ヌクレオチド配列(配列番号: )を調製した。2H7 IgAH IgA−T4ポリヌクレオチド(配列番号: )をコードするポリヌクレオチド配列(配列番号: )を含む先の2H7 scFv−Ig構築体(実施例1および本実施例参照)の作成のために記載したように、この変異したIgA定常領域ヌクレオチド配列を2H7 scFv pD18ベクターに挿入した。
そのほとんどがIgA CH3のカルボキシ末端からの疎水性残基である14のさらなるアミノ酸の欠失を持つ2H7 scFv−IgA定常領域融合タンパク質をコードする第四の構築体を調製した。2H7 scFv−IgAH IgA−T4コーディングポリヌクレオチドを鋳型として用いて、
Figure 2010279389
(配列番号: )をコードするヌクレオチド配列の欠失を作成した。5’オリゴヌクレオチドプライマーは配列
Figure 2010279389
(配列番号: )を有した(BclI部位は下線を施しイタリック体で示す)。3’オリゴヌクレオチド配列は
Figure 2010279389
(配列番号: )であった。欠失されたIgA CH3領域を前記オリゴヌクレオチドを用いて増幅して、cDNAが18アミノ酸についての欠失されたカルボキシ末端コーディング領域を含むように、ヒト扁桃から単離されたRNAからのIgA定常領域を増幅した。IgAH IgA−T18定常領域を、前記したように、2H7 IgAH IgA−T18ポリヌクレオチド(配列番号: )をコードするポリヌクレオチド配列(配列番号: )を含む2H7 scFv pD18ベクターに挿入した。
(実施例14)
(CTLA−4 IgG融合タンパク質のエフェクター機能)
該実施例は、CDCおよびADCCアッセイにおいてCTLA−4 Ig融合タンパク質のエフェクター機能を比較する。
2つのCTLA−4 IgG融合タンパク質を構築した。1つの融合タンパク質は、ヒトIg1野生型ヒンジ、CH2、およびCH3ドメインに融合したCTLA−4の細胞外ドメインを含み、CTLA−4 IgG WTH(CCC)WTCH2CH3(配列番号: )と命名される。CTLA−4 IgG WTH(CCC)WTCH2CH3(配列番号: )をコードするポリヌクレオチド配列を含むpD18哺乳動物発現ベクターは、CTLA−4の細胞外ドメインをコードするヌクレオチド配列(配列番号: )(米国特許第5,844,095号参照)を、実施例1および10に記載された方法に従って、IgG WTH(CCC)WTCH2CH3(配列番号: )をコードするヌクレオチド配列にイン・フレーム融合することによって調製した。該細胞外ドメインヌクレオチド配列は、3’末端におけるBclI制限酵素部位、およびoncoMリーダーペプチド(配列番号: )をコードするリーダーペプチドヌクレオチド配列(配列番号: )も含む。CTLA−4 IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3と命名される第二のCTLA−4 IgG融合タンパク質は、全ての3つのシステイン残基がセリン残基で置き換えられた突然変異体IgGヒンジに融合されたCTLA−4の細胞外ドメイン(+oncoMリーダーペプチド配列)を含むものであった。ヒンジ領域は、IgG1野生型CH3(米国特許第5,844,095号)に融合された、イソタイプ位置238(EUナンバリング,Ward et al.,前掲、Kabad et al.,前掲に従ったナンバリングを用いて位置251;ナンバリングがIgG1 CH1の第一の残基で始まる位置209;すなわち、野生型IgG1 CH2のPAPELLDGPS(配列番号: )はPAPELLDGSS(配列番号: )に修飾される)において突然変異を有する突然変異体IgG1 CH2ドメインに融合させた。CTLA−4 IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3ポリヌクレオチドは配列番号: におけるヌクレオチド配列を含み、推定アミノ酸配列は配列番号: に供される配列を含む。また、リーダーペプチド(配列番号: )無くしてCTLA−4細胞外膜コーディング配列を用い、CTLA−4融合タンパク質を調製した。
CDC活性を測定するために、ウサギ補体(10μg/ml)の存在下または不存在下において、CD80が細胞表面で発現されるように(Reh CD80.10;Doty et al.,1998 J.Immunol.161:2700;Doty et al.,1996 J.Immunol.157:3270)、Reh細胞に(実施例12参照)、および共刺激性分子CD80でトランスフェクトされたReh細胞に、精製されたCTLA−4 IgG WTH(CCC)WTCH2CH3(2μg/ml)またはCTLA−4 IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3(2μg/ml)を添加した。精製されたCTLA Ig融合タンパク質は、実施例10に記載された方法に従って、一過的にトランスフェクトされたCOS細胞の培養上清から調製した。アッセイは実質的に実施例11および12に記載されたように行った。図32に示されるデータは、CD80−トランスフェクトReh細胞のみが補体およびCTLA−4 IgG WTH(CCC)WTCH2CH3融合タンパク質の存在下で殺傷されることを示す。
精製されたCTLA−4 Ig融合タンパク質もまたADCCアッセイでテストした。エフェクター細胞として供するヒトPBMCを1.25:1、2.5:1、5.0:1および10:1の比率にてRehまたはReh CD80.1標的細胞に加えた。細胞を標識し、実質的に実施例11および12に記載されたように、アッセイを行った。結果を図33に示す。各データ点は、各エフェクター:標的細胞比率において、4つの独立した培養ウエルの平均を表す。データは、CTLA−4 IgG WTH(CCC)WTCH2CH3のみが、Reh CD80.10細胞の有意なADCCを媒介することを示す。
(実施例15)
(CTLA−4 IgA融合タンパク質のエフェクター機能)
CTLA−4 IgA融合タンパク質は、IgG融合タンパク質について記載されたように調製する(実施例1、13および14参照)。CTLA−4細胞外ドメインヌクレオチド配列(配列番号: )を、IgAH IgACH2CH3(配列番号: )をコードするヌクレオチドにイン・オープンリーディングフレームにて融合して、CTLA−4 IgAH IgACH2CH3融合タンパク質(配列番号: )をコードするヌクレオチド配列(配列番号: )を得た。融合タンパク質はCOS細胞で一過的に発現され(実施例10参照)、またはCHO細胞で安定に発現される(実施例1参照)。CTLA−4 IgAH IgACH2CH3融合タンパク質の分泌は、ヒトJ鎖(配列番号: )をコードするポリヌクレオチド配列(配列番号: )を含む構築体との共トランスフェクションを必要とする。CTLA−4 IgAH IgACH2CH3融合タンパク質は実施例10および14に記載されたように単離する。J鎖の存在無くしてCTLA−4 IgA構築体を発現させるために、CTLA−4 IgAH IgA−T4構築体を調製し、哺乳動物細胞にトランスフェクトする。野生型IgAヒンジ−CH2CH3に融合されたCTLA−4細胞外断片について記載したのと同様に、CTLA−4細胞外ドメインヌクレオチド配列(配列番号: )を、IgAH IgA−T4ポリペプチド(配列番号: )をコードするヌクレオチド配列(配列番号: )にイン・オープンリーディングフレームにて融合して、CTLA−4 IgAH IgA−T4ポリペプチド(配列番号: )をコードする配列番号: を含むヌクレオチド配列を得た。各構築体のエフェクター機能は、実施例14に記載されたように、CDCおよびADCCによって評価する。
(実施例16)
(抗−CD20 scFvヒトIg融合タンパク質のCD20を発現するCHO細胞への結合)
本実施例は、CD20を発現するCHO細胞への、2H7 scFv Ig融合タンパク質の結合を記載する。分析はフローサイトメトリーによって行った。2H7 scFv IgG WTH(CCC)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgG MTH(CSS)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgG MTH(SCS)WTCH2CH3(配列番号: );および2H7 scFv VHSER11 WTH WTCH2CH3(配列番号: )を発現する一過的にトランスフェクトされたCOS細胞から培養上清を収集し、2倍系列希釈を調製した。精製された2H7 scFv IgG MTH(SSC)WTCH2CH3(配列番号: )の系列2倍希釈を5μg/mlの濃度で出発して調製した。培養上清および精製された融合タンパク質試料を(CD20+)CHO細胞と共に氷上で1時間インキュベートした。細胞を2回洗浄し、次いで、1:100 FITC−結合体化ヤギ抗−ヒトIgG(CalTag)と共に40分間インキュベートした。次いで、細胞を洗浄することによって未結合結合体を除去し、Coulter Epics XLセルソーターを用いてフローサイトメトリー分析を行った。結果を図34に示す。
(実施例17)
(抗−CD20 scFvヒトIgGおよびIgA融合タンパク質のイムノブロット分析)
本実施例は、トランスフェクトされた細胞培養上清から免疫沈澱させた2H7 scFv IgGおよび2H7 scFv IgA融合タンパク質のイムノブロット分析を記載する。
実質的に実施例10に記載された方法に従って、2H7 scFv IgG WTH(CCC)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgG MTH(CSS)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgG MTH(SCS)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgA H IgG WTCH2CH3(配列番号: );およびscFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(配列番号: )についてのヌクレオチド配列を含むプラスミドでCOS細胞を一過的にトランスフェクトした。また、細胞をベクターのみでもトランスフェクトした。37℃における48ないし72時間後、細胞培養上清を収穫し、プロテインA−アガロースビーズ(Repligen)と4℃にて1時間で合わせた。ビーズを遠心し、TNEN[20mMトリス塩基、100mM NaCl、1mM EDTA、および0.05% NP−40、pH8.0]中で数回洗浄した。免疫沈澱物を25μlの2× NuPAGE(登録商標) SDS試料緩衝液(Invitrogen Life Technologies)(非−還元試料)と合わせた。タンパク質をNuPAGE(登録商標) 10%ビス−トリスゲル(Invitrtogen Life Technologies)で分画した。電気泳動(ほぼ1時間)の後、半乾燥ブロッター(Ellard Instrumentation, Monroe,WA)を用い、タンパク質をゲルからImmobilon ポリフッ化ビニリデン(PVDF)膜(Millipore,Bedford,MA)に移した。5%無脂肪乳を含有するPBS中でPVDF膜をブロックし、次いで、HRP−結合体化ヤギ抗−ヒトIgG(Fc特異的)(CalTag)でプローブした。イムノブロットをPBS中で数回洗浄した後、ECL(Amersham Biosciences)を用いてブロットを展開した。結果を図35に示す。
(実施例18)
(抗−CD20 scFvヒトIgA融合タンパク質の、CD20+CHO細胞への結合)
本実施例は、2H7 scFv IgAH IgACH2CH3(配列番号: )および2H7 scFv IgAH IgAT4(配列番号: )融合タンパク質の(CD20+)CHO細胞への結合のフローイミュノサイトフルオリメトリー分析を記載する。
COS細胞を、実施例10に記載したように、2H7 scFv IgAH IgACH2CH3ポリペプチド(配列番号: )をコードするポリヌクレオチド配列(配列番号: )を含むプラスミドDNAで、およびヒトJ鎖ポリペプチド(配列番号: )をコードするポリヌクレオチド配列(配列番号: )を含む別のプラスミドで一過的に共トランスフェクトした。また、COS細胞を、CH3のカルボキシ末端において4つのアミノ酸の欠失を有する2H7 scFv IgA融合タンパク質(2H7 scFv IgAHIgA−T4、配列番号: )をコードするポリヌクレオチド配列(配列番号: )でトランスフェクトした。トランスフェクションは実施例10に記載されているように行った。トランスフェクトされたCOS細胞からの培養上清を(CD20+)CHO細胞(実施例1参照)と合わせ、氷上で1時間インキュベートした。細胞をPBS−2%FDSで2回洗浄し、次いで、FITC−結合体化ヤギ抗−ヒトIgA鎖(CalTag)(1:100)と40分間で合わせた。細胞を再度洗浄し、次いで、Coulter Epics XLセルソーターを用いてフローサイトメトリーによって分析した。図36は、2H7 scFv IgAH IgAT4、切断CH3カルボキシ末端を持つ2H7 IgA融合タンパク質(配列番号: )の分泌には、J鎖での共トランスフェクションは必要なかったことを示す。
(実施例19)
(抗−CD20 scFvヒトIgA融合タンパク質のエフェクター機能)
本実施例は、CD20を発現する細胞に対する2H7 IgGおよびIgA融合タンパク質のADCC活性を説明する。BJAB細胞を51Cr(100μCi)(Amersham)で37℃にて2時間でプレ標識した。エフェクター細胞は、凝固を防止するために等容量のAlsever溶液で希釈した、新鮮な休止ヒト全血から得た。2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgG MTH(SCS)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgG WTH(CCC)WTCH2CH3(配列番号: );および2H7 scFv IgAH IgACH2CH3(配列番号: )融合タンパク質は、実施例10に記載されているように、プロテインAクロマトグラフィーによって、一過的にトランスフェクトされたCOS細胞上清(100ないし200ml)から精製した。2H7 scFv IgAH IgACH2CH3をコードするプラスミドでトランスフェクトされたCOS細胞を、実施例18に記載されたように、ヒトJ鎖をコードするプラスミドで共トランスフェクトした。5μg/mlで出発する精製された2H7 Ig融合タンパク質の2倍系列希釈を、全血(Alsever溶液中1:1希釈した全血100μl、最終希釈1:4)の存在下で、標識されたBJAB細胞(96ウエル組織培養プレートのウエル当たり5×10細胞)に加え、37℃にて5時間インキュベートした。培養上清を収穫し、実施例11に記載したように分析した。パーセント比殺傷は以下の方程式に従って計算した:((実験放出−自然放出)/最大放出−自然放出))×100。データは図37に示す。各データ点は、四連試料の平均を表す。
第二のADCCアッセイにおいて、標識されたBJAB標的細胞の数を各試料中で一定に保持し、全血を0.25、0.125および0.0625の希釈にて加えた。精製された2H7 IgGおよびIgA融合タンパク質を5μg/mlの濃度で加えた。BJAB細胞、全血、および融合タンパク質をインキュベートし、上清を収穫し、パーセント比殺傷を前記したように計算した。2H7融合タンパク質の各々についてのパーセント比殺傷を図38に示す。
精製された2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(5μg/ml)および精製された2H7 scFv IgAH IgACH2CH3(5μg/ml)のADCC活性を、異なるエフェクター細胞集団の存在下で比較した。実施例11および12に記載したように、PBMCを全血から単離した。PBMCを50:1,25:1、および12.5:1の比率にて、標識されたBJAB標的細胞(96ウエル組織培養プレートのウエル当たり5×10)と合わせた。前記したようにして、アッセイを行い、データを分析した。図39Aは、PBMCがエフェクター細胞として供される場合、2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3融合タンパク質のみがADCC活性を有したことを示す。図39Bは、全血が(図38に示すように)エフェクター細胞の源である場合、2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3および2H7 scFv IgAH IgACH2CH3双方がADCC活性を呈することを示す。
(実施例20)
(2H7 scFv VH11Ser IgG MTH(SSS)WTCH2CH3融合タンパク質の発現レベル)
本実施例は、2H7 scFv VH11Ser IgG MTH(SSS)WTCH2CH3融合タンパク質(配列番号: )の発現レベルを、可変重鎖ドメインに突然変異を含まない他の2H7 scFv IgG構築体と比較する。ヌクレオチド配列2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgG MTH(CSS)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgG MTH(SCS)WTCH2CH3(配列番号: );2H7 scFv IgG WTH(CCC)WTCH2CH3(配列番号: );および2H7 scFv VHSER11 IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(実施例1および13参照)を含む哺乳動物ベクターpD18を、実施例10に記載したように、COS細胞に一過的にトランスフェクトした。37℃における72時間後、細胞上清を収穫し、各上清の1μlを非−還元試料緩衝液と合わせた(実施例10に記載された方法参照)。培養上清試料および精製された2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3のアリコット(40ng、20ng、10ng/5ng、および2.5ng)を10%ビス−トリス(MOPS) NuPAGE(登録商標)ゲル(Invitrogen Life Technologies)で分画した。また、Multimark(登録商標)タンパク質標準(Invitrogen Life Technologies)もゲルで分離した。実施例17に記載したように、タンパク質をPDVF膜に写し、イムノブロットした。該イムノブロットを図40に示す。融合タンパク質の量は、ScionImage for Windows(登録商標) Softwareを用いるブロットのデンシトメトリー分析、および標準曲線との比較によって定量した。2H7 scFv
IgG WTH(CCC)WTCH2CH3構築体はほぼ12ng/ulまたは12マイクログラム/mlを生じ、2H7 scFv IgG MTH(CSS)WTCH2CH3はほぼ10ng/ulまたは10マイクログラム/mlを生じ、2H7 scFv IgG MTH(SCS)WTCH2CH3構築体はほぼ1ng/ulまたは1マイクログラム/mlを生じ、および2H7 scFv VHSER11 IgG MTH(SSS)WTCH2CH3構築体はほぼ30ng/mlまたは30マイクログラム/mlを生じた。特定の特許請求する具体例の本発明において、2H7 scFv VHSER11 IgG MTH(SSS)WTCH2CH3のアミノ酸配列、または2H7 scFv VHSER11 IgG MTH(SSS)WTCH2CH3をコードするポリヌクレオチド配列は、所望により、本発明から排除することができる。同様に、2H7 scFv VHSER11 IgG WTH(CCC)WTCH2CH3のアミノ酸配列、または2H7 scFv VHSER11 IgG WTH(CCC)WTCH2CH3をコードするポリヌクレオチド配列は本発明の特定の特許請求する具体例から所望により排除することができる。加えて、可変重鎖ドメインにおいて位置11のロイシンのセリンへのアミノ酸置換、または可変重鎖ドメインにおける位置11のロイシンのセリンへのアミノ酸置換をコードするポリヌクレオチドは、所望により、本発明の特定の特許請求された具体例から排除することができる。
(実施例21)
(突然変異体CH3ドメインを持つ2H7 scFv IgG融合タンパク質の構築)
アミノ酸突然変異を2H7 IgG融合タンパク質のCH3ドメインに導入した。2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(配列番号: )を含むpD18ベクターをBclIおよびXbaIで消化して、MTH WTCH2CH3(配列番号: )断片を除去し、次いで、これを、BelIおよびXbaIで二重消化したpShuttleベクター(BD Biosciences Clontech,Palo Alto,CA)にサブクローンした。サブクローニングはカナマイシン耐性ベクターで行った。なぜならば、アンピシリン耐性遺伝子は、このクローニング手法で必要なXmnI部位を有するからである。5つの構築体を以下の置換にて調製した:(1)位置405(Kabad et al.に従うナンバリング、前掲)におけるフェニルアラニン残基を、オリゴヌクレオチドCH3Y405を用いてチロシンで置き換えた;(2)405におけるフェニルアラニン位置をオリゴヌクレオチドCH3A405を用いてアラニン残基で置き換えた;(3)位置407におけるチロシン残基を、オリゴヌクレオチドCH3A407を用いてアラニンで置き換えた;(4)位置405および407における双方の野生型アミノ酸を、オリゴヌクレオチドCH3Y405A407を用い、各々、チロシンおよびアラニンで置き換えた;および(5)位置405および407における双方の野生型アミノ酸を、オリゴヌクレオチドCH3A405A407を用いてアラニンで置き換えた。オリゴヌクレオチドは、CH3ドメインの部分のPCR増幅用の3’プライマーであった。各3’オリゴヌクレオチドについてのヌクレオチド配列は以下の通りであった。
Figure 2010279389
鋳型は突然変異体ヒンジMHWTCH2CH3ヒトIgG1であった。5’PCRオリゴヌクレオチドプライマーはhuIgGMHWC[配列番号: ]であった。増幅された産物は、実施例1および10に記載されたように、TOPO(登録商標)にクローン化し、配列決定した。正しい配列を持つクローンからのDNAをBclIおよびXmnIで消化し、やはり同一制限酵素で消化したMTH WTCH2CH3配列を含有するpSHUTTLEに移した。次いで、BclIおよびXbaIでの消化によって、変異したIgG配列を除去し、やはりBclIおよびXbaIで消化した2H7 scFvを含有するpD18ベクターに挿入した。変異したCH3ドメイン、MTCH3 Y405、MTCH3 A405、MTCH3 A407、MTCH3 Y405A407、およびMTCH3 A405A407についてのポリヌクレオチド配列は、各々、配列番号: に示し、各々についてのポリペプチド配列は、各々、配列番号: に示される。各々、2H7 scFv MTH WTCH2 MTCH3 Y405、2H7 scFv MTH WTCH2 MTCH3 A405、scFv MTH WTCH2 MTCH3 A407、scFv MTH WTCH2 MTCH3 Y405A407、およびscFv MTH WTCH2 MTCH3 A405A407についてのポリヌクレオチド配列、および推定アミノ酸配列は、各々、配列番号: に示される。
(実施例22)
(ヒンジ突然変異を持つ2H7 scFv IgG融合タンパク質の構築)
2H7 scFv IgG融合タンパク質は、セリン残基で置換されたIgG1ヒンジ領域における第三のシステイン残基で構築された。突然変異の導入用の鋳型は、2H7 scFv WTH WTC2CH3(配列番号: )をコードするポリヌクレオチドであった。突然変異を導入するオリゴヌクレオチドは、配列
Figure 2010279389
を有する5’PCRプライマーオリゴヌクレオチドHIgGMHcys3であった。ヒンジ領域に突然変異を導入するオリゴヌクレオチドを、鋳型、およびXbaI部位(下線を施したイタリック体)を含有する3’オリゴヌクレオチド(
Figure 2010279389
(配列番号: ))と合わせて、PCRによって突然変異体ヒンジ野生型(WT)−CH2−CH3配列を増幅した。IgG MTH CCS突然変異体配列は、94℃の変性プロフィール、50℃における30秒間のアニーリング、および72℃における30秒間の伸長での30サイクルで増幅した。増幅されたポリヌクレオチドをTOPO(登録商標)クローニングベクター(Invitrogen Life Technologies)に挿入し、次いで、実施例1に記載したように配列決定して、突然変異の存在を確認した。2H7 scFvを含有するpD18ベクターを消化して、実質的に実施例10に記載されているように、定常領域配列を除去した。突然変異体ヒンジ−野生型CH2−CH3領域を消化されたベクターDNAにイン・フレーム挿入して、2H7 scFv MTH(CCS)WTCH2CH3コーディングDNA(配列番号: )を含むベクターを得た。推定ポリペプチド配列は配列番号: に示される。
(実施例23)
(抗−CD20 IgE融合タンパク質の構築)
結合ドメインを、発現されたポリペプチドがアレルギー応答メカニズムを誘導できるように、IgE定常領域配列に融合する。40.2.220(配列番号: )の単鎖Fvヌクレオチド配列、抗−CD40抗体を、他のscFv免疫グロブリン定常領域構築体につき記載された方法に従い(実施例1、5、10および13参照)、IgE CH2−CH3−CH4に融合する。IgE CH2−CH3−CH4ドメインをPCR増幅するために、配列
Figure 2010279389
を有する5’オリゴヌクレオチドプライマーhIgE5Bcl、および配列
Figure 2010279389
を有する3’オリゴヌクレオチドプライマーhIgE3stopを用いる。
実施例12に記載された共刺激性レセプターに結合するscFvよりなる遺伝子工学作成細胞表面レセプターの異所性表面発現のためのレトロウイルストランスフェクション系を用いて、40.2.220 scFv IgE−CD80融合タンパク質を構築する。40.2.220 scFv IgE融合ポリペプチド配列を、融合タンパク質がトランスフェクトされた細胞で発現する場合に、CD80がscFv Ig融合タンパク質の表面発現用のアンカーを供するように、ヒトCD80(配列番号: )の膜貫通ドメインおよび細胞質テイルをコードする配列にイン・フレーム融合させる。抗−CD40 scFv−IgE−CD80融合タンパク質をコードするcDNA(配列番号: )を、標準的な分子生物学手法および販売業者の指示に従い、レトロウイルスベクターpLNCX(BD Biosciences Clontech)に挿入する。40.2.220 scFv−Ig−CD80 cDNAは、5’LTR−ネオマイシン耐性遺伝子−CMVプロモーター配列および3’LTR配列の間に挿入される。レトロウイルス構築体を癌腫細胞系にトランスフェクトし、トランスフェクトされた細胞をスクリーニングして、細胞表面で40.2.220 scFv−Ig−CD80融合タンパク質を発現するクローンを選択する。
(実施例24)
(細胞表面で発現されるIgA−T4突然変異体の構築)
実施例12に記載された共刺激性レセプターに結合するscFvよりなる遺伝子工学作成細胞表面レセプターの異所性表面発現のためのレトロウイルストランスフェクション系を用いて、2H7 scFv IgAヒンジIgA−T4−CD80融合タンパク質を構築する。2H7 scFv IgAH IgA−T4融合ポリヌクレオチド配列(配列番号: )を、融合タンパク質がトランスフェクトされた細胞で発現される場合に、CD80がscFv Ig融合タンパク質の表面発現用のアンカーを供するように、ヒトCD80(配列番号: )の膜貫通ドメインおよび細胞質テイルをコードする配列にイン・フレーム融合させる。標準的な分子生物学手法、および販売業者の指示に従い、2H7 scFv IgAH IgA−T4−CD80融合タンパク質をコードするcDNA(配列番号: )をレトロウイルスベクターpLNCX(BD Biosciences Clontech)に挿入する。2H7 scFv IgAH IgA−T4−CD80 cDNAは、5’LTR−ネオマイシン耐性遺伝子−CMVプロモーター配列および3’LTR配列の間に挿入される。レトロウイルス構築体はReh、急性リンパ系白血病細胞系(ATCC CRL−8286)にトランスフェクトされる。トランスフェクトされた細胞をスクリーニングして、細胞表面に2H7 scFv−Ig融合タンパク質を発現するクローンを選択する。
(実施例25)
(腫瘍細胞の細胞表面で発現される抗−4−1BB scFv Ig−CD80融合タンパク質の特徴付けおよびイン・ビボでの腫瘍細胞の増殖)
本実施例は、CD80膜貫通および細胞質ドメインに融合したIg野生型ヒンジおよびCH2およびCH3ドメインを有する抗−マウス4−1BB(CD137)scFv融合タンパク質の構築を記載する。また、該実施例は、トランスフェクトされた腫瘍細胞がマウスに移植される場合に、抗−4−1BB scFv IgG CD80ポリペプチドの細胞表面発現の効果を説明する。
ラット抗−4−1BB(CD137)モノクローナル抗体(1D8)の重鎖および軽鎖可変領域をクローン化し、実質的に実施例1に記載されているように、単鎖Fv構築体を調製した。免疫グロブリン遺伝子をクローニングするための標準的方法に従い、かつ実施例1に記載されたように、各抗体の重鎖および軽鎖可変領域をクローン化した。単鎖Fv構築体は、実施例1に記載されているように、(glyser)ペプチドリンカーをコードするヌクレオチド配列を、1D8のVL領域ヌクレオチド配列(配列番号: )および1D8のVH領域ヌクレオチド配列(配列番号: )の間に挿入することによって調製した。1D8 VLについてのポリペプチド配列は配列番号: に示され、VHドメインについてのポリペプチド配列は配列番号: に示される。次いで、実施例1に記載された方法に従い、scFvポリヌクレオチド(配列番号: )をヒトIgG1野生型ヒンジ−CH2−CH3ドメインに融合させる。次いで、scFv IgG1融合ポリヌクレオチド配列を、融合タンパク質がトランスフェクトされた細胞で発現される場合に、CD80がscFv Ig融合タンパク質の表面発現用のアンカーを供するように、実施例12に実質的に記載されるように、ヒトCD80の膜貫通ドメインおよび細胞質テイルをコードする配列(配列番号: )にイン・フレーム融合させた。scFv−IgG−CD80融合タンパク質をコードするcDNA(配列番号: )を、標準的な分子生物学手法および販売業者の指令に従い、レトロウイルスベクターpLNCX(BD Biosciences Clontech)に挿入した。scFv−Ig−CD80 cDNAは、5’LTR−ネオマイシン耐性遺伝子−CMVプロモーター配列および3’LTR配列の間に挿入した。
レトロウイルス構築体は、Dr.I.Hellstrom,PNRI,Seattle,WAによって供給されたK1735(メラノーマ細胞系)の転移性M2クローンにトランスフェクトした。トランスフェクトされた細胞をスクリーニングして、細胞表面にscFv−Ig融合タンパク質を発現するクローンを選択した。1D8 scFv IgG−CD80構築体が腫瘍細胞の細胞表面で発現されることを示すために、トランスフェクトされた細胞をフローイミュノサイトフルオリメトリーによって分析した。トランスフェクトされた細胞(K1735−1D8)をフィコエリスリン−結合体化F(ab’)ヤギ抗−ヒトIgG中にて氷上で1時間インキュベートした。次いで、細胞を洗浄することによって未結合結合体を除去し、Coulter Epics XLセルソーターを用いてフローサイトメトリー分析を行った。結果を図41Aに示す。
K1735−1D8トランスフェクト細胞の増殖をイン・ビボで調べた。K1735−WT細胞は、ナイーブC3Hマウスに皮下(s.c.)移植した場合に漸次に増殖した。同一用量のK1735−1D8細胞は最初にほぼ30mm表面積の腫瘍を形成したが、腫瘍は7日頃に退行し始め、図41Bに示すように20日までに消失した。非−結合性scFvをコードする同様に構築されたベクター、ヒト抗−CD28 scFv構築体でトランスフェクトされた腫瘍細胞は、トランスフェクトされていない腫瘍細胞と同様に増殖した。ヒトIgG1構築体ドメインまたはラット可変領域である外来性タンパク質の存在は、トランスフェクトされたK1735−WT細胞を免疫原性とはせず;C3Hマウス中でのK1735−1D8細胞の増殖はK1735−WT細胞(未トランスフェクト)のそれと同一であった。
K1735−1D8腫瘍の退行におけるCD4およびCD8Tリンパ球およびNK細胞の役割を調べるために、ナイーブマウスにモノクローナル抗体(モノクローナル抗体、典型的には容量0.1ml中50μg)で腹腔内(i.p.)注射して、CD8、CD4またはCD4およびCD8の双方のT細胞を除去し、または抗−アシアロ−GM1ウサギ抗体を注射して、NK細胞を除去した。12日後、同一に処理されたマウスからの脾臓細胞のフローサイトメトリー分析が、標的化T細胞集団が枯渇したことを示すと、K1735−1D8細胞を各T細胞−枯渇群にs.c.移植した。K1735−1D8は、抗−CD8 MAbまたは対照ラットIgGで注射したマウスにおいて同様な増殖キネティックスを有し、他方、CD4T細胞の除去の結果、K1735−WTと同一のキネティックスを持つK1735−1D8の増殖が得られた。CD4T細胞除去の後に腫瘍細胞を増殖できなかったことは、CD8T細胞の存在または不存在にかかわらず観察された。CD4−枯渇群におけるよりもゆっくりであったが、K1735−1D8は全てのNK−枯渇マウスで増殖した。結果を図41Cに示す。
(実施例26)
(抗−4−1BB scFv IgG−CD80融合タンパク質を発現する腫瘍細胞の治療効果)
本実施例は、マウスにおいて十分な免疫応答を生じて、樹立された未トランスフェクト野生型腫瘍の拒絶を媒介する、細胞表面で抗−CD137 scFvを発現するK1735−1D8トランスフェクト腫瘍細胞の能力を調べる。C3HマウスにK1735−WT腫瘍(2×10細胞/動物)を移植し、ほぼ6日間増殖させた。30mm表面積の樹立されたK1735−WT腫瘍を持つマウスを用いて実験を行った。マウスに、対側性側にて、K1735−1D8または照射されたK1735−WT細胞の皮下注射によって接種した。図42に示す時点において、同一の注射を反復した。動物の1つの群にK1735−1D8細胞の注射を4週間与えた。同一のスケジュールに従って、もう1つの群に照射された(12,000ラド)K1735−WT細胞を与え、第三の群にはPBSを注射した。データを図42でプロットする。WT腫瘍は全ての対照マウスにおいて、および照射されたK1735−WT細胞を受容した全てのマウスにおいて漸次増殖した。対照的に、腫瘍は、K1735−1D8での免役化によって処理した5匹のマウスのうち4匹で退行した。実験が3ヵ月後に終了したときに、動物は腫瘍が無いままであり、毒性の徴候がなかった。15番目のマウスにおいて、マウスはK1735−1D8細胞を受容した限りは腫瘍節はサイズが減少したが、療法を終了した後は腫瘍は増殖して元に戻った。
5匹のマウス/群でのもう1つの実験において、マウスには3×10K1735−WT細胞を腹腔内(i.v.)注射して、肺転移を開始させた。3日後、K1735−1D8細胞をs.c.移植した。この手法を1ヶ月の間1週間に1回反復し;対照マウスにはPBSを注射した。K1735−WT細胞を受容してから37日後に、対照群における1匹のマウスが死亡すると実験を停止した。その時点で、対照マウスの肺は>500の転移性病巣を有した。対照的に、10未満の転移性病巣が免疫化マウスの肺で存在した。
第三の実験において、K1735−WT細胞およびK1735−1D8細胞の混合物を免疫応答性同系C3Hマウスに注射した。マウスには、K7135−WT細胞単独、あるいは2×10K1735−WT細胞および2×10K1735−1D8細胞の混合物を皮下注射した。腫瘍増殖を5日間隔でモニターした。
(実施例27)
(肉腫細胞の細胞表面での抗−4−1BB scFv IgG−CD80融合タンパク質の発現)
本実施例は、マウス肉腫細胞系を抗−CD137scFv IgG−CD80構築体でトランスフェクトすることによる、腫瘍細胞の第二のタイプの細胞表面での抗−CD137 scFvの発現を示す。
標準的な分子生物学方法に従って、制限酵素消化および連結工程を用い、1D8 scFv IgG WTH WTCH2CH3−CD80ポリヌクレオチド(配列番号: )をpLNCXベクターからpCDNA3−hygroベクターへ移した。構築体をHindIII+ClaIで切断し、thesFv断片にクレノウ(Roche)で充填し、平滑末端断片をpcDNA3のEcoR5部位に連結した。Ag104マウス肉腫腫瘍細胞を、1D8 scFv IgG CD80融合タンパク質を含有するpCDNA3−hygroベクターでトランスフェクトした。ヒグロマイシン−耐性クローンを、FITC抗−ヒトIgG抗体を用いるフローサイトメトリーによってスクリーニングして、導入遺伝子の発現を検出した。ほぼ15%の耐性クローンが最初に検出可能な融合タンパク質を有したに過ぎなかった。フローサイトメトリーによって同定された陽性細胞を、標準的な方法に従って、固定化抗−ヒトIgG(10μg/ml)で被覆したフラスコ上で反復してパニングした。パニングは被覆されたプレート上で37℃にて30分間細胞をインキュベートすることによって行い;次いで、プレートをベルセンまたはPBS中で2ないし3回洗浄した。各ラウンド後に、FACSによって細胞をIgG発現につきテストした。図44におけるヒストグラムは、4ラウンドの抗−ヒトIgGに対するパニング後における染色パターンを示す(黒色)。未トランスフェクト細胞を染色し、灰色で示す。集団中の細胞の全ては陽性であった。
(実施例28)
(二特異的scFv Ig融合タンパク質、およびIgG1 CH2ドメインに突然変異を持つscFv Ig融合タンパク質の構築および特徴付け)
突然変異体ヒンジ(MT(SSS))および突然変異体CH2ドメインを有する抗−CD20(2H7) scFv IgG融合タンパク質を構築し、ここに、残基(Ward et al.,前掲に従った位置番号238)におけるプロリンはセリンで置換されていた。実施例1、5および13に記載された方法に実質的に従って、2H7 scFv IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3をコードするポリヌクレオチド(配列番号: )を構築した。IgG突然変異体ヒンジ−突然変異体CH2−野生型CH3ドメインもまた抗−CD20(2H7)−抗−CD40(40.2.220)二特異的scFvに融合させた。抗−CD20−抗−CD40 scFv IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3コーディングポリヌクレオチド配列を配列番号: に示し、コードされポリペプチドを配列番号: に示す。
実施例10に記載したように、COS細胞を、2H7 scFv IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3(配列番号: );抗−CD20−抗−CD40 scFv IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3(配列番号: );2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3(配列番号: );および2H7 scFv IgAH IgG WTCH2CH3(配列番号: )をコードするポリヌクレオチド配列を含むベクターで一過的にトランスフェクトした。培養上清を収集し、プロテインAクロマトグラフィーによって融合タンパク質を精製した(実施例10参照)。実施例10に記載された方法に従い、精製されたポリペプチドをSDS−PAGEによって分画した。リツキシマブ(抗−CD20モノクローナル抗体)、およびBio−Rad予備染色分子量標準(Bio−Rad,Hercules,CA)、およびMultimark(登録商標)分子量標準(Invitrogen Life Technologies)もまたゲルに適用した。結果を図45に示す。
CH2ドメインに突然変異を含む2H7 scFv Ig融合タンパク質を、ADCCアッセイにおいて、野生型CH2ドメインを有する融合タンパク質と比較した。アッセイは、実質的に実施例11および19に記載されたように行った。新鮮な休止PBMC(エフェクター細胞)を図46に示した比率にて51Cr−標識BJAB細胞(標的細胞)に加えた。精製された2H7 scFv IgG MTH(SSS)MTCH2WTCH3、2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3、2H7 scFv IgAH IgG WTCH2CH3、およびリツキシマブを、各々10μg/mlにて、エフェクター/標的細胞混合物に加え、37℃にて5時間インキュベートした。上清を収穫し、実施例11および19に記載されているように、放出されたクロムの量を測定した。各融合タンパク質によるパーセント比殺傷を図46に示す。
(実施例29)
(抗−ヒトCD3 scFv IgG融合タンパク質の腫瘍細胞表面発現)
抗−ヒトCD3 scFv Ig CD80融合タンパク質は、実質的に実施例1および12に記載されているように調製した。融合タンパク質は、抗−CD3 scFvの細胞表面発現を可能とするための、CD80膜貫通および細胞質ドメイン(配列番号: )に融合した、野生型IgG1ヒンジ(配列番号: )および野生型CH2(配列番号: )およびCH3(配列番号: )ドメインに融合した抗−ヒトCD3 scFvを含んだ。ポリペプチド(配列番号: )をコードする抗−ヒトCD3 scFv IgG WTH WTCH2CH3−CD80ポリヌクレオチド(配列番号: )をReh細胞に、およびT51細胞(リンパ芽球様細胞系)にトランスフェクトした。抗−ヒトCD3 scFv IgG融合タンパク質の発現は、FITC結合体化ヤギ抗−ヒトIgGを用いるフローサイトメトリーによって検出した(実施例4、10、16、18の方法参照)。図47Aは、Reh細胞の細胞表面における抗−ヒトCD3融合タンパク質の発現を示し、図47BはT41細胞での融合タンパク質の発現を示す。
ADCCアッセイをトランスフェクトされたRehおよびT51細胞で行って、細胞表面でのscFv−Igポリペプチドの発現がエフェクター細胞機能を増大させたかを判断した。未トランスフェクトおよびトランスフェクトReh細胞、および未トランスフェクトおよびトランスフェクトT51細胞を37℃にて2時間51Cr(100μCi)(Amersham)でプレ−標識した。ヒトPBMCはエフェクター細胞として供し、20:1、10:1、5:1、および2.5:1の比率にて、標的細胞(96ウエルプレートのウエル当たり5×10細胞)に加えた。37℃における4時間後、培養上清を収穫し、実施例11および12に記載されたように分析した。パーセント比殺傷は実施例12に記載されたように計算した。結果を図48に示す。
(実施例30)
(細胞表面で抗−CD28 scFvを発現する腫瘍細胞におけるサイトカイン発現の誘導)
本実施例は、抗−ヒトCD28 scFv IgG−CD80融合タンパク質でトランスフェクトされた腫瘍細胞と共培養された刺激リンパ球におけるサイトカインmRNA誘導に対する細胞表面発現scFvの効果を記載する。
リアルタイムPCR分析を、Reh、Reh−抗−CD28(2e12)(2e12 scFv IgG WTH WHTCH3CH2−CD80の構築およびReh細胞のトランスフェクションについては実施例12参照)、およびReh−CD80(実施例14参照)で刺激したヒトPBMCからのRNA試料で行って、PBMCエフェクター細胞によるサイトカイン生産に対する表面発現scFvの効果を測定した。リアルタイムPCRアッセイでは、SYBR Green (QIAGEN)(Morrison et al.,Biotechniques 24:954−8,960,962(1998))を用い、各増幅サイクル後にPCR産物の形成を測定するABI PRISM(登録商標) 7000 Sequence Detection System (Applied Biosystems, Foster City,CA)によって測定した。細胞を培養から収穫し、全RNAを、細胞溶解物をホモゲナイズするためのQIAシュレッダーカラム精製システムおよびRNAの精製のためのRNeasy(登録商標)ミニ−カラムを含めたQIAGEN RNAキットを用いて調製した。cDNAは、各細胞型からの等しい量のRNAおよびSuperscript II逆転写酵素(Life Technologies)を用いて逆転写した。次いで、鋳型としての調製されたcDNA、およびサイトカイン遺伝子産物に特異的なプライマー対を用い、SYBR GreenリアルタイムPCR分析を行った。増幅されたPCR産物の平均長さは150ないし250塩基対の範囲であった。IFNγ、TNFα、GM−CSF、IL−4、IL−5、IL−6、IL−8、IL−10、IL−12、IL−15、ICOSL、CD80およびCD86を含めた多くの活性化応答分子についてのcDNAレベルをアッセイした。GAPDH、β−アクチン、およびCD3を含めた構成的に発現された遺伝子についての対照参照cDNAを各アッセイで測定した。特異的mRNAの最も有意な誘導はIFN−γで観察され、より穏やかな誘導はCTLA−4およびICOSで観察された。
(実施例31)
(抗−ヒト4−1BB抗体のクローニング、および抗−ヒト4−1BB scFv Ig融合タンパク質の構築)
マウス抗−ヒトモノクローナル抗体(5B9と命名)を発現するハイブリドーマ細胞系はDr.Robert Mittler,Emory University Vaccine Center,Atlanta,GAから入手した。可変重鎖および軽鎖領域は、免疫グロブリン遺伝子のクローニング用の公知の方法に従い、かつ本明細書中に記載されたようにクローン化した。細胞は、IMDM/15%FBS(Invitrogen Life Technologies)培地中で数日間培養した。対数増殖における細胞を培養から収穫し、細胞溶解物をホモゲナイズするためのQIAシュレッダーカラム精製システム、およびRNAの精製のためのRNeasy(登録商標)ミニ−カラムを含めたQIAGEN RNAキットを用い、製造業者の指令に従い、全RNAを調製した。ランダムへキサマープライマーおよびSuperscript II逆転写酵素(Invitrogen Life Technologies)を用いてcDNAを逆転写した。
ターミナルトランスフェラーゼおよびdGTPを用い、cDNAをアンカー−テイルした。次いで、アンカー−テイル相補的プライマー、およびマウスCk(VLの増幅用)または適当なイソタイプマウスCH1(VHの増幅用)いずれかの定常領域のアンチセンスストランドに特異的にアニールしたプライマーを用いてPCRを行った。増幅された可変領域断片をTOPO(登録商標)クローン化し(Invitrogen Life Technologies)、次いで、正しいサイズのインサートを持つクローンを配列決定した。各可変ドメインについてのコンセンサス配列を、少なくとも4つの独立したクローンの配列から決定した。5B9 VLおよびVHポリヌクレオチド配列は、各々、配列番号: および に示し、推定アミノ酸配列は配列番号: および に示す。scFvは、軽鎖および重鎖可変領域の間に挿入された合成(GlySer)リンカードメインを含有する重複プライマーを用いるソーイングPCR方法によって構築した(実施例1参照)。5B9 scFvポリペプチド(配列番号: )は、配列番号: を含むポリヌクレオチド配列によってコードされる。
実施例5、10および13に記載された方法に従い、5B9 scFvポリヌクレオチド配列は、ヒトIgG1突然変異体ヒンジおよび野生型CH2およびCH3(MTH(SSS)WTCH2CH3、配列番号: )をコードするポリヌクレオチド配列にイン・フレーム融合させた。COS細胞を、5B9 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3ポリヌクレオチド配列(配列番号: )を含むベクターで一過的にトランスフェクトした。上清を収集し、実質的に実施例4、10、16および18に記載されているように、5B9 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3ポリペプチド(配列番号: )の結合をフローイミュノサイトフルオリメトリーによって測定した。5B9ハイブリドーマ細胞系からの培養上清もまた結合アッセイに含めた。新鮮なヒトPBMCは、結合実験に先立って4日間、固定化抗−CD3の存在下でインキュベートして、活性化されたT細胞の表面でのCD137の発現を誘導した。刺激されたPBMCを洗浄し、各々、COS、または5B9 scFv IgG融合タンパク質もしくは5B9マウスモノクローナル抗体を含有するハイブリドーマ培養上清と共に氷上で1時間インキュベートした。5B9 scFv IgG融合タンパク質または5B9マウスモノクローナル抗体の結合は、各々、FITC結合体化抗−ヒトIgGまたは抗−マウスIgGで検出した。結果を図49に示す。
(実施例32)
(ヒンジ突然変異を持つ2H7 scFv IgG融合タンパク質の構築)
2H7 scFv IgG融合タンパク質は、セリン残基で置換されたIgG1ヒンジ領域における第一のシステイン残基および第二のシステインで構築して、MTH(SCC)およびMTH(CSC)を得た。突然変異の導入のための鋳型は、2H7 scFv WTH WTCH2CH3(配列番号: )をコードするポリヌクレオチドである。突然変異を導入するオリゴヌクレオチドは5’PCRプライマーオリゴヌクレオチドHIgGMHcys1(配列番号: )およびHIgGMHcys2(配列番号: )である。構築体は配列番号: に記載されているように調製する。突然変異体のコーディングポリヌクレオチドは配列番号: に示され、ポリペプチドの配列は配列番号: に供される。
(実施例33)
(2H7 VL11S scFv(SSS−S)HWCH2 WCH3の構築)
重鎖可変領域における位置11(Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Bethesda,MD:Public Health Service,National Institutes of Health (1991)に従ったナンバリング)におけるロイシンからセリンへの変化を、2H7 scFv MTH(SSS)WTCH2CH3融合タンパク質(配列番号: )に導入した。野生型ロイシン残基を、オリゴヌクレオチドVhser11:
Figure 2010279389
(配列番号: )を用いる部位−特異的突然変異誘発によってセリンで置換した。PCRのための3’プライマーは配列
Figure 2010279389
(配列番号: )(XbaI部位は下線を施すイタリック体)を有するhuIgG1−3‘であった。PCR増幅の後、断片をTOPO(登録商標)クローニングベクターに挿入し、配列決定して、VH11のロイシンからセリンへの突然変異の存在を確認した。2H7 scFv−IgG(SSS−S)H WCH2 WCH3コーディングDNAをPSL1180クローニングベクター(Pharmacia Biotech,Inc.,Piscataway,NJ)にシャトルした。構築体PSL1180−2H7 scFv−IgG(SSS−S)H WCH2 WCH3をSacおよびXbaIで消化して、野生型VHドメインおよび連結領域およびCH2およびCH3ドメインを除去した。VH11突然変異体を含むPCR産物をSacおよびXbaIで消化し、次いで、標準的な分子生物学手法に従い、消化されたPSL1180構築体に挿入した。次いで、構築体をHindIIIおよびXbaIで消化し、哺乳動物発現ベクターpD18に挿入した(実施例1および実施例10に記載された方法参照)。突然変異体は2H7 scFv VH L11S IgG(SSS−S)H WCH2 WCH3と命名する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例34)
(安定なCHO系における2H7 scFv VHL11S(SSS−S)H WCH2 WCH3の発現)
CHO DG44細胞を、2H7 VH L11S scFv(SSS−S) H WCH2 WCH3をコードする線状化発現プラスミドのほぼ150マイクログラムでエレクトロポレーションによってトランスフェクトした。培養を、125ないし2000の範囲の種々の数の細胞/ウエルにて、96ウエル平坦平底組織培養プレート中で、100nMメトトレキセートを含有する選択培地で平板培養した。メトトレキセート耐性クローンを選択し、培養上清を、図1に記載されたのと同様なCD20CHO結合アッセイを用い、融合タンパク質の最高エクスプレッサーにつきスクリーニングした。徐々に増大させる用量のメトトレキセートでの初期の選択の後に、クローンを増幅させた。濃度を次に高い用量に調整するに先立って、細胞をより高い濃度において2台継代させた。クローンを1マイクロモラーのメトトレキセートの最終濃度まで増幅させた。
図50Bは、2H7 VH L11S scFv(SSS−S)H WCH2 WCH3の生産レベルを説明する。この分子を発現し、静止T25フラスコ中で増殖する増幅されたCHO細胞からの消費された上清を、フローサイトメトリーによって、CD20 CHO細胞への定量的結合につきテストした。プロテインAアフィニティークロマトグラフィーで上清から精製された同分子を用いる標準曲線の作成によって、活性をタンパク質濃度に変換した(図50A)。組換えタンパク質(ベクターNTI)のアミノ酸組成によって供される吸光率を用い、A280によって、精製されたタンパク質の濃度を決定した。生産のレベルはテストしたクローンの間で変化したが、多数のクローンは1ml/mlを超えて生産された。このレベルのタンパク質発現は、Vにおけるアミノ酸変化を除いて同一分子よりも10倍を超えて高い。
図51は、SDS−PAGEでの半定量的分析による2H7 VH L11S scFv(SSS−S)H WCH2 WCH3の生産レベルを説明する。この分子を発現し、静止T25フラスコ中で増殖する増幅されたCHO細胞からの消費された上清10マイクロリットルを、10マイクロリットルの2×非−還元SDS試料緩衝液と混合し、SDS−PAGEゲルに流し、クーマシーブルーで染色した。
(実施例35)
(G28−1 scFv Ig構造の構築および結合能力)
G28−1(抗−CD37) scFvの構築は、製造業者の指令に従い、Trizol(Invitrogen)試薬を用い、G28−1ハイブリドーマから単離された全RNAを用いて行った。cDNAは、実施例1において2H7のクローニングについて先に記載されたランダムプライマーおよびプロトコルを用いて調製した。scFvの可変ドメインは2つの方法のうちの1つを用いてクローン化した:第一の方法は、(Ig−Prime Kit Mouse Ig−Primer Set,Novagen)に記載された方法およびプライマーを用い、各V領域遺伝子ファミリーに対して特異的な縮重5’オリゴヌクレオチドのファミリー、および軽鎖または重鎖いずれかの定常領域に対して特異的な単一3’プライマーを用いた。第二のアプローチは(Gilliland LK et al.,Tissue Antigens 47:1−20(1995))に記載されたアンカー−テイリング方法およびプライマーを用いた。いずれの場合にも、PCR増幅産物をTOPOクローニングベクター(Invitrogen)にクローン化した。クローンをEcoRIで消化し、適当なサイズのインサートにつきスクリーニングした。陽性クローンを実施例1にて先に記載したように配列決定した。
次いで、特異的プライマーを各V領域につき設計し、1つはリーダー配列を持つものであり、他方は持たないものであった。また、プライマー末端に所望のリンカーおよび/または制限部位を含めるようにプライマーを設計した。以下のプロフィール:94℃、30秒;55℃、30秒;72℃、30秒、続いて72℃における8分間の最終伸長での25サイクルプログラムを用い、PCR反応をTOPOクローン化DNAにつき行った。PCR産物をゲル精製し、QIAQUICKゲル抽出キット(QIAGEN,Valencia,CA)を用いて断片を回収した。断片を1:50希釈し、1マイクロリットルを、実施例1に記載された方法に従ってSEWING PCR反応で用いた。以下のオリゴヌクレオチドをG28−1 scFvについてのVドメインの二次PCR反応で用いた:
リーダー無しのSalI部位を持つ5’プライマー:
Figure 2010279389
BcII部位を持つ3’アンチセンスプライマー:
Figure 2010279389
重鎖可変領域中の位置11(Kabatナンバリング)におけるロイシンからセリンへの変化を、部位−特異的突然変異誘発によって、G28−1 scFvに導入した。G28−1 scFvの野生型形態をまずソーイング/オーバーラップPCRによって構築して、(gly4ser)3リンカーを前記したようにVLドメインおよびVHドメインの間に挿入した。しかしながら、SacI部位は可変ドメインのこの融合の一部として導入されず、従って、別法として、ロイシン11に近い近くの制限部位(HaeIIおよびPvuII)を用いて、VL+変異したVHドメインを合成した。プライマーは、これらの部位の1つ、およびLからSへの変化を含むDNA配列、続いての12の野生型塩基対を含むように設計した。この戦略の時点におけるいくつかの試みは失敗し、そこで、部位特異的突然変異誘発のGenetailor(Invitrogen)方法を用いる別の戦略を用いて、所望の突然変異を導入した。該突然変異誘発は製造業者の指示に従って行った。簡単に述べると、該手法はDNAメチラーゼでのプラスミドDNAのメチル化、その1つは標的突然変異を含む2つの重複プライマーでの突然変異誘発反応におけるDNAの増幅、全てのメチル化DNAを消化し、未メチル化突然変異増幅産物のみを残す野生型E.coliへのプラスミドの形質転換を含む。双方のプライマーは長さがほぼ30ヌクレオチドである(突然変異誘発プライマー上に突然変異部位を含まず、突然変異誘発産物の効果的な末端接合のための重複領域が15ないし20ヌクレオチドの5’末端にある)。突然変異誘発反応のための鋳型は、野生型G28−1 scFvIg構築体を含有する100ngのプラスミドであり、G28−1 VH突然変異誘発で用いたプライマーは以下の通りである:
Figure 2010279389
PCR反応は、前記したように、15ngメチル化鋳型、前記プライマー、および通常の反応成分を用いて行った。以下のプロフィールを持つ20サイクルプログラムを増幅で用いた:94℃30秒;55℃30秒;68℃、8分、続いての10分間の最終68℃伸長工程。PCR産物は野生型細菌に形質転換し、コロニーは配列決定によってスクリーニングした。所望の突然変異のみを持つクローンを単離し、実施例33にすでに記載したようにプラスミドを調製した。突然変異体はG28−1 scFv VH L11S(SSS−S)H WCH2 WCH3と命名される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
実施例17に記載された方法に従い、イムノブロット分析を用い、G28−1融合タンパク質の発現レベルを確認した。図53は、突然変異の無いG28−1融合タンパク質と比較した、VH L11S突然変異体G28−1融合タンパク質におけるタンパク質発現の大きな増加を示す。
実施例10に記載された方法に従い、G28−1 scFv Ig融合タンパク質を一過的にトランスフェクトし、COS細胞で発現させた。図52は、CD37に結合する、COS上清からのG28−1 scFv Ig融合タンパク質の能力を示す。RamosおよびBJAB細胞は、共に、ヒトCD37を発現し、従って、機能的活性につきG28−1上清をスクリーニングするのに用いた。CD37+Ramos細胞への、G28−1 scFv(SSS−S)H WCH2 WCH3およびG28−1 scFv VH L11S(SSS−S)H WCH2 WCH3の結合は、実施例2に記載された方法に従って、フローサイトメトリーによって測定した。グラフ上の各点は五連のトランスフェクションの平均を表す。グラフは、G28−1 scFv VH L11−S(SSS−S)H WCH2 WCH3がCD37+Ramos細胞に結合できることを示す。
更なる構築体を異なる連結領域で作成した。pD18 G28−1 scFv VHL11S(SSS−S)H WCH2 WCH3ベクターをBclIおよびXbaIで消化して、連結領域、CH2およびCH3を除去した。実施例13に記載された方法に従い、これらを各異なる連結領域、CH2およびCH3で置き換えた。新しい構築体は以下のように命名された:G28−1 scFv VHL11S(CSS−S)H WH2 WH3(配列番号: )、G28−1 scFv VHL11S(CSC−S)H WH2 WH3(配列番号: )、G28−1 scFv VHL11S(CSS−S)H WH2 WH3(配列番号: )、G28−1 scFv VHL11S(SSC−P)H WH2 WH3(配列番号: )、G28−1 scFv VHL11S(SCS−S)H WH2 WH3(配列番号: )、G28−1 scFv VHL11S(CCS−P)H WH2 WH3(配列番号: )、およびG28−1 scFv VHL11S(SCC−P)H WH2 WH3(配列番号: )。
G28−1 scFvは、IgA連結領域、CH2、CH3およびIgE CH2、CH3、CH4にも結合させた。pD18 G28−1 scFv VHL11S(SSS−S)H WCH2 WCH3プラスミドを前記した方法を用いて消化して、連結領域CH2およびCH3を除去した。IgA領域を、実施例13に記載された方法を用いて挿入した。構築体はG28−1 scFv VHL11S IgAH IgACH2 T4CH3(配列番号: )と命名された。IgE CH2 CH3 CH4領域を、実施例39に記載された方法を用い、前記した消化されたpD18ベクターに挿入した。構築体はG28−1 scFv VHL11S IgECH2 CH3 CH4(配列番号: )と命名された。
(実施例36)
(2H7 scFv Ig突然変異体融合タンパク質の特徴付け)
図54は、精製された2H7 scFv Ig構築体のCD20+CHO細胞への結合能力を示す。実施例2に記載された方法に従い、タンパク質を安定なCHO細胞にトランスフェクトした。実施例2に記載された方法に従い、フローサイトメトリーを用いて結合を測定した。図54中のグラフは、これらのタンパク質は、改変された連結領域を持つCD20に対する結合機能を保有することを示す。比較結果は、改変された連結領域の各タイプを持つ2H7 scFv VHL11S突然変異体の各々で得られた(結果は省略する)。
ADCCを介して末梢血液単核細胞(PBMC)の存在下でCD20陽性細胞を殺す変異した連結領域を持つ2H7scFv−Ig構築体の能力は、BJAB細胞に対するPBMCの100:1比率を用い、4時間のアッセイにおける標識されたBJAB細胞からの51Crの放出を測定することによってテストした。図55に示される結果は、2H7scFv−Ig突然変異体が抗体依存性細胞傷害性(ADCC)を媒介できることを示す。というのは、51Crの放出は、PBMCまたは2H7scFv−Igいずれか単独の存在下におけるよりもPBMCおよび2H7scFv−Ig双方の存在下で有意に高かったからである。比較結果は、改変された連結領域の各タイプを持つ2H7 scFv VHL11S突然変異体の各々で得られた(結果は省略する)。
補体の存在下でCD20陽性細胞を殺す2H7scFv−Ig突然変異体融合タンパク質の能力は、B細胞系Ramos標的細胞を用いてテストした。ウサギ補体はPel−Freez(Rogers,AK)から購入し、1/10の最終濃度にてアッセイで用いた。精製された2H7scFv−IgをB細胞および補体と共に37℃にて45分間インキュベートし、続いて、トリパンブルー排除によって生きたおよび死んだ細胞をカウントした。図56中の結果は、ウサギ補体の存在下での2H7scFv−Ig突然変異体が、CD20を発現するB細胞を溶解したことを示す。
(実施例37)
(IgA、IgG、およびIgE 2H7 scFv構築体の比較結合)
各Igテイルに特異的な商業的に入手可能な(Caltag)第二工程を用い、実施例2に記載された方法に従ってフローサイトメトリーを用い、Ig構築体IgA、IgGおよびIgGの結合能力を測定した。図57中の結果は、全てのIgE構築体が、IgGおよびIgAの結合能力と匹敵して、CD20+CHO細胞に結合できたことを示す。また、これらの結果は、IgE構築体がIgE第二工程で検出されたが、IgAまたはIgG第二工程で検出されなかったことも示す。
(実施例38)
(2H7 VH L11S IgE構築体の構築および特徴付け)
QIAGEN QIAシュレッダーホモゲナイゼーションおよびRNAミニキットを用い、IgEテイルRNAをSKO−007細胞(ATCC)から単離した。通常のプロトコルに従って、QIAGENカラムから溶出した4マイクロリットルのRNAでランダム−起点cDNAを作成した。CH1の始まりからCH4(ほぼ1.2kb)までのヒトIgEを、35サイクルの94℃、60秒;72℃、2分間の増幅プロフィール、および以下のプライマーにて、5マイクロリットルのcDNAのPCR増幅によって単離した:
Figure 2010279389
PCR断片をPCR2.1−TOPOベクターに連結し、実施例1に記載された方法に従って、EcoRIでの消化によって、形質転換体を正しいサイズのインサートにつきスクリーニングした。正しい配列を持つクローンの1つを鋳型として用いて、可溶性または細胞表面(ORF)形態としてのサブクローニングのために結合する適当な制限部位を持つCH2−CH4ドメインを増幅した。以下のプライマーを94℃、60秒;55℃、60秒;72℃、2分間;35サイクルの増幅プロフィールで用いて、ほぼ950bpの断片を増幅した:
Figure 2010279389
停止コドンを持つIgE CH2CH3CH4テイルをBclIおよびXbaIで消化し、2H7 VHL11S scFvを含むpD18ベクターに挿入した。この構築体を2H7 IgECH2CH3CH4と命名した。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。停止コドン無し(ORF)のIgE CH2CH3CH4をBclIおよびSfuIで消化し、2H7 VHL11S scFvを含有するpD18ベクターに挿入した。この構築体を2H7 IgECH2CH3CH4(ORF)と命名した。ポリヌクレオチド配列は配列番号:
に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
また、CH3およびCH4ドメインのみがヒトIgG1ヒンジに結合した、CH1およびCH2ドメインを欠く断片としてヒトIgEを増幅した。重複する5’オリゴヌクレオチドを用いる引き続いてのPCR反応を用いて、IgG1ヒンジをヒトIgEのCH3ドメインに結合させた。PCR反応の最初の工程用のプライマーは以下の通りであった:
Figure 2010279389
実施例1に記載された方法に従って、PCR産物をEcoRIで消化し、配列決定した。陽性クローンを、2H7 VHL11S scFv(SSS−S)Hを含有するpD18プラスミドに挿入した。構築体は2H7 VHL11S scFv(SSS−S) H IgE CH3CH4と命名された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
2H7 scFv VH L11S IgECH2 CH3 CH4の結合能力は、実質的に実施例2に従って、フローサイトメトリーを用いて測定した。タンパク質はMEP HyperCel(Ciperden,カタログ番号12035−010、ロット番号200920/0271)クロマトグラフィー樹脂および疎水性電荷誘導クロマトグラフィー(HCIC)を用いて精製した。HCIC吸着剤は、細胞培養上清を含めた種々の源からのモノクローナルおよびポリクローナル抗体の捕獲および精製のために設計された高キャパシティー、高選択性の吸着剤である。カラムに10mlビーズ容量のMEP Hypercelを充填し、0.1%NaN3を含有するPBS、pH7.4で平衡化した。次いで、ほぼ1リットルの2H7 scFv VHL11S IgE CH2CH3CH4 CHO培養上清をカラムに流した。pH3ないし6の範囲の一連のクエン酸緩衝液を融合タンパク質の溶出のために調製した。カラムをPBSで洗浄した。タンパク質はpH6、5および4にて15の1ml画分に溶出された。最終の15ml画分はpH3.5で収集された。各画分からのアリコットをA280につき分析し、また、A280の読みに基づいて概略10マイクログラム/ウエルを負荷するSDS−PAGEに付した。これらの2つの分析の結果は、タンパク質のバルクはより高いpHでクエン酸緩衝液中に溶出されないが、pH4で溶出され、pH3.5における溶出後洗浄は有意な量のタンパク質を含有した。
CD20+CHO細胞に結合するこれらの2H7 VH L11S IgE精製タンパク質の能力は、FITC−結合体化ヤギ−抗−ヒトIgEを用い、実施例2に記載された方法に従ってフローサイトメトリーを用いて測定した。図58Aは、精製されたタンパク質の双方がCD20+CHO細胞に結合できることを示す。
PBMCエフェクターでBJAB標的細胞に対してADCCを媒介するこれらの2H7
VH L11S IgE精製タンパク質の能力は、実施例2に記載された方法に従って測定した。図58Bは、双方のタンパク質が同様なレベルでADCCを媒介できることを示す。
(実施例39)
(マウスIgAおよびIgEテイル領域を持つscFv VH L11S突然変異体の構築および結合能力)
実施例38においてヒトIgEテイルをクローン化するのに用いたのと実質的に同一な方法を用い、マウスIgAをマウス脾臓RNAからクローン化した。PCR反応は35サイクルでの94℃60秒;52℃60秒;72℃2分の増幅プロフィールで行った。
CH1−CH4領域をクローン化するのに用いたPCRプライマーは以下の通りであった:
Figure 2010279389
停止コドンを持つマウスIgACH2T4CH3テイルをBclIおよびXbaIで消化し、2H7 VHL11S scFvおよびIgAHを含有するpD18ベクターに挿入した。この構築体は2H7 VHL11S scFv IgAH mIgACH2 T4CH3と命名された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
停止コドン無し(ORF)のマウスIgACH2 T4CH3テイルをBclIおよびSfuIで消化し、2H7 VHL11S scFvおよびIgAHを含有するpD18ベクターに挿入した。この構築体は2H7 VHL11S scFv IgAH mIgACH2 T4CH3(ORF)と命名された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
マウスIgEは、実質的に実施例38に記載された方法に従って、マウスIgE La2(ATCC)RNAにクローン化した。PCR反応は35サイクルでの94℃60秒;52℃60秒;72℃2分間の増幅プロフィールで行った。CH1−CH4をクローン化するのに用いた最初のPCRプライマー:
Figure 2010279389
停止コドンを持つマウスIgE CH2CH3CH4テイルをBclIおよびXbaIで消化し、2H7 VHL11S scFvを含有するpD18ベクターに挿入した。この構築体を2H7 VHL11S mIgECH2CH3CH4と命名した。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
停止コドン無し(ORF)のマウスIgE CH2CH3CH4テイルをBclIおよびSfuIで消化し、2H7 VHL11S scFvを含有するpD18ベクターに挿入した。この構築体は2H7 VHL11S scFv mIgECH2CH3CH4(ORF)と命名された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
CH20+CHO細胞に対する(マウステイル領域を持つ)2H7 VH L11S mIgEおよびmIgAの結合能力もまた、商業的に入手可能なIgEまたはIgA第二工程試薬(Caltag)を用い、実施例2に記載された方法に従ってフローサイトメトリーによって測定した。図59中の各点は、第二工程単独の結合を差し引くことによって修正された輝度を持つ集団の平均を表す。この図面は、CD20+CHO細胞に結合する能力をこれらの構築体が有することを示す。
(実施例40)
(2H7 scFv Ig突然変異体融合タンパク質のHPLCプロフィール)
改変された連結およびCH3領域を持つ精製された2H7 scFv−Ig突然変異体融合タンパク質のHPLC分析。各タンパク質は、トランスフェクトされたCOSまたはCHO細胞の上清からプロテインAアフィニティークロマトグラフィーによって精製した。25ないし50マイクログラムの各試料を、TSK−GEL G3000SWXL 30cmカラム(Tosoh Biosep,Stuttgart,ドイツ国)にてPBS中1ml/分で流した。各プロフィールの始まり近くの矢印は試料注入点を表す。ゲル濾過標準(Bio−Rad)はチログロブリン(670kDa)、ガンマグロブリン(158kDa)、オボアルブミン(44kDa)、ミオグロビン(12.5kDa)、およびビタミンB−12(1.35kDa)を含んだ。標準を各実験の最初および最後に流した。標準の移動位置を示し、それは実験間で変化しなかった(図60ないし62)。
(実施例41)
(2H7 VH L11S突然変異体融合タンパク質の結合能力)
CH3突然変異体の結合能力を、非−突然変異CH3融合タンパク質と比較した。実施例2に記載されたプロテインAカラム精製技術を用い、構築体をCOS細胞にトランスフェクトし、上清から精製した。図63は、実施例2に記載された方法に従ってフローサイトメトリーを用いる結合に対するCH3突然変異の異なる効果を示す。この図面は、二重点突然変異がCH3領域に導入されると、いくらかの結合能力が失われることを示す。
フルオレセインイソチオシアネート(FITC)結合体化2H7 VH L11S突然変異体融合タンパク質の結合はフローサイトメトリーを用いて測定した。FITCの1ml/ml溶液をDMSO中で調製した。融合タンパク質を2リットルの容量にてpH9.3の炭酸水素塩緩衝液中で4℃にて一晩透析した。タンパク質の濃度は結合体化に先立って1ないし5mg/mlに調製した。一連のFalcon 5mlチューブを、FITC/タンパク質比率を15ないし60の範囲で変化させたが、最小20および40の比率にて設定した。結合体化反応は、光から保護して、37℃にて30分間インキュベートした。蛍光標識タンパク質は、PBS、0.5M NaCl、および1%NaN3で平衡化した2mlのSephadex G−25カラムにて遊離フルオレセインから分離した。フルオレセイン標識タンパク質はカラムから最初に溶出し、5mlチューブに集めた。標識の程度は、280および494nmにおける希釈された結合体の吸光度を測定し、Molecular Probes(Eugene,OR)の技術サービスによって供された式を利用することによって決定した。データはFITC:タンパク質比率につき修正した。図64は、蛍光マーカーに結合体化すると、これらの構築体は結合能力を失わないことを示す。
実施例2に記載された方法に従い、精製された2H7 VH L11S構築体を非−還元SDSゲルに流した。移動パターンは図65に示す。
(実施例42)
(Lec13 CHO細胞における2H7 scFv VH L11S(CSC−S)H WCH2 WCH3の特徴付け)
2H7 scFv VH L11S(CSC−S)H WCH2 WCH3を一過的にトランスフェクトし、Lec13 CHO細胞で発現させた。サイドバイサイドトランスフェクションにおいて2H7 scFv VHS11 hIgG1(CSS−S)H WCH2 WCH3および(CSC−S)H WCH2 WCH3発現プラスミドいずれかのための哺乳動物細胞宿主として、Lec13CHO細胞を用いた。全てのトランスフェクションは100mm組織培養皿で行った。製造業者の指示に従い、リポフェクタミン2000(Invitrogen,カタログ番号:11668−027、0.75ml)を用いてほぼ90%密集となれば、細胞はトランスフェクトされた。双方の細胞系を血清の存在下で増殖させて、細胞培養皿への接着を促進し、維持し、トランスフェクション操作、洗浄、および上清収穫を単純化した。DNA:リポフェクタミン複合体を、製品インサートに記録された提唱されるプロトコル/条件に従い、血清および抗生物質の非存在下で形成させた。培養上清をトランスフェクションから72時間後に、次いで、最初の収穫から72時間後に再度収穫した。2つのCHO源からの融合タンパク質を先に記載したようにプロテインA精製によって単離し、CD20結合およびADCCアッセイで用いた。
CD20陽性細胞におけるADCCを媒介する変異した融合タンパク質の能力を、実施例2に記載された方法を用いて測定した。Lec13 CHO細胞で発現された構築体は、CD20 CHO標的細胞への良好な結合を呈し、また、図67に示したように、同等濃度でのCHO DG44由来タンパク質に対して、ADCCアッセイで有意に改良された活性を示した。
(実施例43)
(高および低アフィニティーCD14対立遺伝子の構築)
ヒトCD16細胞外ドメインの位置158における低(V)および高(F)親和性対立遺伝子は、PCRアッセイを用い、ヒトPBMCに由来するcDNAからクローン化した。PCR反応は、収穫に先立って、固定化抗−CD3抗体(64.1)で3日間刺激したPBMCから作成したランダム起点cDNAを用いた。PCR反応は2、4、6または8マイクロリットルのcDNA、25pモルの各プライマー、および35サイクルでの、94℃60秒;55℃60秒;72℃2分間の増幅プロフィールを含んだ。PCRプライマーは以下にリストする:
Figure 2010279389
陽性クローンを配列決定し、効果的なリーダーペプチドおよび(SSS−S)H P238SCH2 WCH3ヒトIgGテイルを含むベクターに挿入した。CD16 ED融合タンパク質の2つの異なるバージョンを発現させた。第一のものは、F158(高親和性)を含み、第二のものは、V158(低親和性)対立遺伝子を含んだ。構築体は(SSS−S)H P238S CH2 WCH3 pD18プラスミドにクローン化し、実施例1および10にて先に記載したように、COSおよびCHO細胞で発現させた。以下のプロトコルを用い、CHOクローンをIgGサンドイッチELISAを用いて発現につきスクリーニングして、培養上清における融合タンパク質の相対的発現レベルを測定した:Immulon 1Vプレートを、PBS緩衝液中の0.4マイクログラム/mlヤギ抗−ヒトIgG(マウス吸着)(CalTag,カタログ番号H10500)で4℃にて被覆した。次いで、プレートをPBS/1.5%無脂肪乳中で4℃にて一晩ブロックした。プレートをPBS/0.1% Tween20中で3回洗浄し、次いで、CHOクローン培養上清からの100マイクロリットル希釈系列と共に室温にて3時間インキュベートした。クローン当たり4つの希釈物を引き続いてのウエルに加え、1:5から1:375までの5倍増加分にて希釈した。加えて、濃度標準としてのCTLA4 hIgG1 (SSS−S)H P238 SCH2 WCH3を用いて標準曲線を誘導した。系列希釈は、0.5マイクログラム/mlで出発する5倍希釈を利用した;8ウエルの第二の組を用いて、0.34マイクログラム/mlで出発する2倍希釈系列を作成した。プレートをPBS/0.1% Tween20中で3回洗浄し、PBS/0.5% BSA中で、1:5000にてホースラディッシュペルオキシダーゼ(GAH IgG−HRP)に結合体化したヤギ抗−ヒトIgGと共に1時間インキュベートした。プレートをPBS/0.1% Tween20で4回洗浄し、次いで、TMBクロマゲン基質(BD−Pharmingen)を10分間で加え、100マイクロリットルの1N硫酸の添加によって反応を停止した。次いで、SpectraCountプレートリーダーにて415nmでプレートを読んだ。融合タンパク質の濃度は、直線範囲におけるODを、各プレートで実行したCTLA4Ig標準曲線と比較することによって見積もった。
タンパク質はプロテインA精製を用いて精製し、実施例42に記載したように、フルオレセインイソチアシアネート(FITC)に直接的に結合体化させた。これらのタンパク質は、実施例2に記載した方法に従い、還元および非還元条件下でSDSゲルに流した。これらのタンパク質の移動は図68に示す。
2H7 VHl11S(CSC−S)H WCH2 WCH3に結合する、またはCD20+CHO標的細胞の細胞表面に発現する2H7 VHl11S (SSS−S) H (P238S)CH2 WCH3に結合する高および低CD16対立遺伝子の能力は、実施例2に記載された方法に従い、フローサイトメトリーを用いて測定する。図69中の結果は、高および低親和性対立遺伝子は、共に、2H7 VHL11S (CSC−S)H WCH2 WCH3(配列番号: )に結合することができ、P238S突然変異を構築体のCH2領域(配列番号: )に導入すると、ある程度の結合能力を失ったことを示す。
(実施例44)
(哺乳動物表示系)
図70Aは、どのようにして、FcRIII(CD16)可溶性融合タンパク質のFITC結合体が、CHO細胞によって発現されるCD20に付着する2H7 scFv−Ig構築体に結合するかを図示する。scFv−IgへのCD16結合は、標的化または部位−特異的突然変異を含む改変されたscFv−Ig構築体へのCD16結合の変化を検出するためのスクリーニングツールを提供する。CD16結合特性の変化は、CD16高親和性タンパク質(158F)またはCD16低親和性タンパク質(158V)または双方の結合の変化であり得る。
そのようなスクリーニングプロセスの模式的表示を図70Bに図示し、そこでは、scFv−Ig構築体は哺乳動物細胞の細胞表面に表示される。本実施例におけるscFv−Ig分子は膜貫通ドメインアンカーを含む故に細胞表面に表示される。これらの分子は単一scFV−Ig構築体を表すことができるか、あるいはそのような分子のライブラリーとして哺乳動物細胞の集団に導入することができる。次いで、改変された結合特性を持つトランスフェクト細胞をパニングし、分類し、または他の方法で、選択条件のストリンジェンシーを変化させ、CD16融合タンパク質を結合プローブとして用いることによって、他の細胞から単離することができる。CD16高親和性対立遺伝子(158F)またはCD16低親和性対立遺伝子(158V)いずれか、または双方への改変された結合を持つscFv−Ig分子を発現する細胞を単離することができる。例えば、この表示システムを用いて、ランダム化されたオリゴヌクレオチドで置き換えられたCH2配列の短いストレッチ、あるいは恐らくは、合成アミノ酸を含めた全ての可能なアミノ酸置換を持つ単一残基のランダム化を備えた変異したIgテイルのライブラリーを作成することができる。一旦そのようなライブラリーが構築されれば、当該分野でよく知られた方法によってCOS細胞にトランスフェクトすることができる。次いで、トランスフェクタントを標識されたCD16構築体に結合し、複数アレロタイプ/イソ形態に対するそれらの相対的結合特性に基づいてパニングし、または分類することができる。パニングされた細胞を収穫し、プラスミドDNAを単離し、次いで、細菌に形質転換する。このプロセスは、単一クローンが哺乳動物宿主細胞から単離されるまで、複数回反復的に反復することができる(Seed B and Aruffo A, PNAS 84:3365−3369(1987)およびAruffo A and Seed B, PNAS 84:8573−8577(1987)参照)。このタイプのスクリーニングシステムの1つのそのような使用は、患者の複数亜集団においてscFv−Ig構築体によって媒介されるエフェクター機能を改良する目標で、CD16の高および低親和性対立遺伝子双方に等しくよく結合するIgテイルを単離するであろうことである。他のFcレセプターへの改変された結合特性を持つIgテイルもまた、記載した表示システムを用いて選択することができる。他の表示システム、例えば、バクテリオファージまたは酵母を用いるものは、非−哺乳動物系で起こらないであろうIg CH2ドメインにおけるグリコシル化の要件のため、改変されたFcR結合特性を持つIgテイルの選択に適しない。
また、このシステムは、より高いレベルで生産されるであろう改変されたscFv−Ig分子の選択で有用である。本実施例においては、COS細胞のような哺乳動物細胞を、細胞表面へのそれらの発現を指令するプラスミド中のscFv−Ig複合体のライブラリーでトランスフェクトすることができる。最高レベルのscFv−Ig分子を発現するCOS細胞は、当該分野でよく知られた技術(例えば、パニング、滅菌セルソーティング、磁性ビーズ分離など)によって選択することができ、プラスミドDNAは細菌への形質転換のために単離される。数ラウンドの選択の後、高レベルの発現が可能なscFv−Ig分子をコードする単一クローンが単離される。単離されたクローンが膜アンカーを除去するように改変され、次いで、哺乳動物細胞で発現されると、scFv−Ig構築体は高レベルで培養流体中に分泌されるであろう。これは、細胞表面での発現レベルの改善を示す分子についての選択が、やはり、分泌されたタンパク質のレベルの改良を示す分子についても選択するであろうように、単一ペプチドについての分泌された糖タンパク質および細胞表面糖タンパク質、および発現のためのゴルジを通ってのプロセッシングの共通の要件を反映する。
(実施例45)
(G28−1 mAbおよびscFvの特徴付け)
アポトーシスを誘導するG28−1 mAbおよびscFvの能力は、実施例3に記載された方法を用い、結合性アネキシンVによって測定した。図71中の結果は、G28−1抗体およびscFvのアネキシンV結合は、2H7抗体およびscFv構築体とで一緒に処理されると増大することを示す。
(実施例46)
(FC2−2 scFv構築体の構築)
FC2−2(抗−CD16) scFvの構築はFC2−2ハイブリドーマから単離された全RNAを用いて行われ、実施例35に記載された方法を用いてクローン化される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。二次PCR反応用の具体的プライマーは以下にリストする。以下のものは軽鎖可変領域用のプライマーである:
Figure 2010279389
重鎖可変領域における位置11(Kabatナンバリング)におけるロイシンからセリンへの変化は、実施例33に記載された方法に従って、部位−特異的突然変異誘発によってFC2−2 scFvに導入された。scFvは、実施例33に記載された方法に従って、(SSS−S) H WCH2 WCH3 IgGテイルに結合させた。突然変異体は、FC2−2 scFv VH L11S(SSS−S)H WCH2 WCH3と命名される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例47)
(5B9 scFv構築体の構築)
5B9(抗−CD137) scFvの構築は、5B9ハイブリドーマから単離された全RNAを用いて行い、実施例35に記載された方法を用いてクローン化した。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。二次PCR反応用の具体的プライマーを以下にリストする。以下のものは軽鎖可変領域用のプライマーである:
Figure 2010279389
重鎖可変領域中の位置11(Kabatナンバリング)におけるロイシンからセリンへの変化は、実施例33に記載された方法に従い、部位−特異的突然変異誘発によって5B9 scFvに導入され、(SSS−S) H WCH2 WCH3に結合させた。この構築体は、5B9 scFv VHL11S (SSS−S) H WCH2 WCH3と命名された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例48)
(UCHL1 scFv構築体の構築)
UCHL1(抗−CD45RO) scFvの構築は、UCHL1ハイブリドーマから単離された全RNAを用いて行われ、実施例35に記載された方法を用いてクローン化した。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。以下のものは軽鎖可変領域用のプライマーである:
Figure 2010279389
実施例33に記載された方法に従い、重鎖可変領域中の位置11(Kabatナンバリング)におけるロイシンからセリンへの変化は部位−特異的突然変異誘発によって5B9 scFvに導入され、(SSS−S) H WCH2 WCH3に結合させた。突然変異体は、UCHL1 scFv VH L11S(SSS−S) H WCH2 WCH3と命名される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例49)
(L6 VHL11S scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)
実施例33に記載された方法に従い、重鎖可変領域中の位置11(Kabatナンバリング)におけるロイシンからセリンへの変化は、部位−特異的突然変異誘発によって、(実施例106に記載された方法に従って構築された)L6 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3に導入した。L6scFvIg (SSS−S) H WCH2 WCH3 pD18プラスミドは鋳型として用いた。陽性クローンは、実施例33に記載された方法に従い、(SSS−S) H WCH2 WCH3を含有するpD18プラスミドに挿入した。突然変異体は、L6 scFv VH L11S (SSS−S) H WCH2 WCH3と命名される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
PCRプライマーは以下にリストされる:
Figure 2010279389
(実施例50)
(HD37 scFv VHL11S構築体の構築)
重鎖可変領域中の位置11(Kabatナンバリング)におけるロイシンからセリンへの変化は、実施例33に記載された方法に従い、部位−特異的突然変異誘発によって、HD37 scFvに導入された。HD37 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3 pD18プラスミドは鋳型として用いた。陽性クローンは、実施例33に記載された方法に従い、(SSS−S) H WCH2 WCH3を含むpD18プラスミドに挿入された。突然変異体は、HD37 scFv VH L11S (SSS−S) H WCH2 WCH3と命名される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。PCRプライマーは以下にリストする:
Figure 2010279389
(実施例51)
(2H7 scFv VHL11S構築体)
さらなる2H7 VHL11S構築体は異なる連結領域で作成した。pD18 2H7 scFv VHL11S (SSS−S) H WCH2 WCH3ベクターをBclIおよびXbaIで消化して、連結領域、CH2およびCH3を除去した。これらを、実施例13に記載された方法に従って、各異なる連結領域、CH2およびCH3で置き換えた。新しい構築体は:2H7scFv VHL11S (CSS−S) H WH2 WH3(配列番号: )、2H7 scFv VHL11S(CSC−S) H WH2 WH3(配列番号: )と命名された。また、2H7 scFv VHL11SをIgA連結領域、CH2、CH3およびIgE CH2、CH3、CH4に結合させた。pD18 2H7 scFv VHL11S (SSS−S) H WCH2 WCH3プラスミドを前記方法を用いて消化して、連結領域CH2、およびCH3を除去した。IgA領域は実施例13に記載された方法を用いて挿入した。構築体は2H7 scFv VHL11S IgAH IgACH2 T4CH3(配列番号: )と命名された。IgE CH2 CH3 CH4領域は実施例39に記載された方法を用いて前記消化されたpD18ベクターに挿入された。構築体は2H7 scFv CHL11S IgECH2 CH3 CH4(配列番号: )と命名された。
(実施例52)
(2H7 scFv VH L11S(CSC−S)H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域をヒトIgG1連結領域、CH2およびCH3領域に結合され、そこでは、実施例32に記載されたように、連結領域における第二のセリンおよびプロリンはセリンに変化されている(SSS−S)。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例53)
(2H7 scFv VH L11S IgE CH2 CH3 CH4)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例38に記載されているように、CH2、CH3およびCH4を含むヒトIgE定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例54)
(2H7 scFv VH L11S mIgE CH2 CH3 CH4)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例39に記載されたように、CH2、CH3およびCH4を含むマウスIgE定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例55)
(2H7 scFv VH L11S mIgAH WIgACH2 T4CH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載されたように、ヒトIgAからの連結領域に結合される。この連結領域は、野生型CH2領域、および実施例39に記載したように3’停止コドンに先立って4アミノ酸残基の切断がある変異したCH3領域よりなるマウスIgA定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例56)
(2H7 scFv VH L11S(SSS−S) H K322S CH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG連結領域に結合される。連結領域は、変異したIgG CH2領域および野生型IgG CH3領域に結合される。CH2領域中のK322S突然変異は残基322におけるものであり、ここに、リシンは重複PCRアッセイを用いてセリンに変化されている。pD18ベクター中の(SSS−S) H WCH2 WCH3 IgG1鋳型をPCR増幅で用いて、これらのCH2突然変異を含む(SSS−S) H誘導体を作成した。PCR反応は、反応を完了させるために、37サイクルでの、94℃、30秒;55℃、30秒;72℃、30秒のサイクリングプロフィールを用いた。このIgG1誘導体は、一次および二次反応において重複オリゴヌクレオチドでの引き続いてのPCR反応を用いることによって構築された。一次増幅プライマーは突然変異を導入したが、Fcドメインの1つの端部を欠失した。二次反応プライマーは、重複プライマーを用いてこれらの端部を再度結合させた。第一の重複プライマーはPCRの始めに加えられ、反応を12サイクル進行させ、休止し、次いで、第二の重複プライマーを反応に加え、続いて、さらに25サイクルを行って、重複伸長PCR反応を完了させた。
第一のPCR反応用のプライマー:
Figure 2010279389
PCR産物をTOPOベクターにクローン化し、確認するために配列決定した。陽性ベクターを、第二の重複PCR反応用の鋳型として用いた。
Figure 2010279389
PCR産物をTOPOベクターにクローン化し、配列決定した。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例57)
(2H7 scFv VH L11S(CSS−S) H K322S CH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例13に記載された方法に従って、第二および第三のシステインがセリンに変化され、かつプロリンがセリンに変化されている(CSS−S)突然変異体IgG連結領域に結合される。連結領域は変異したIgG CH2領域および野生型IgG CH3領域に結合される。CH2領域中のK322S突然変異は残基322におけるものであり、そこでは、重複PCRアッセイを用いてリシンがセリンに変化されている。該領域は変異したIgG CH2領域および野生型IgG CH3領域に結合される。CH2領域中の突然変異は、以下にリストされる、第一のPCR反応における鋳型としての(CSS−S) H WCH2 WHC3 IgG1 pD18ベクター、および第二のPCR反応におけることなるプライマーにて、実質的に実施例57に従って、重複PCR反応によって付加される。
Figure 2010279389
PCR産物をTOPOベクターにクローン化し、配列決定した。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例58)
(2H7 scFv VH L11S(SSS−S) H P331S CH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7 (抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。連結領域は変異したIgG1 CH2領域および野生型IgG1 CH3領域に結合される。(SSS−S) H WCH2 WCH3 pD18鋳型、および37サイクルでの、94℃、30秒;55℃、30秒;72℃、30秒のサイクリングプロフィールを用い、単一PCR反応を用いて、残基331のプロリンがセリンに変化されているCH2領域中の突然変異P331S突然変異を組み込んだ。反応用の具体的プライマーは以下にリストする。
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例59)
(2H7 scFv VH L11S(CSS−S) HP331S CH2 WCH3)
この結合領域は、実施例13に記載された方法に従って、第二および第三のシステインがセリンに変化され、かつプロリンがセリンに変化されている(CSS−S)突然変異体IgG連結領域に結合される。連結領域は変異したIgG CH2領域および野生型IgG CH3領域に結合される。(CSS−S) H WCH2 WCH3 pD18鋳型、および37サイクルでの、94℃、30秒;55℃、30秒;72℃、30秒のサイクリングプロフィールを用い、残基331のプロリンがセリンに変化されているCH2領域中の突然変異P331S突然変異を単一PCR反応を用いて組み込んだ。反応用の具体的プライマーは以下にリストされる。
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例60)
2H7 scFv VH L11S(SSS−S) H T256N CH2 WCH3
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG連結領域に結合される。連結領域は変異したIgG CH2領域および野生型IgG CH3領域に結合される。実施例56に記載された重複PCR方法を用い、残基256におけるスレオニンがアスパラギンに変化されているCH2領域におけるT256N突然変異。具体的プライマーを以下にリストする。
第一のPCR反応用のプライマー:
Figure 2010279389
PCR産物をTOPOベクターにクローン化し、配列決定した。この産物は第二のPCR反応で鋳型として用いた。第二のPCR反応用のプライマー:
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例61)
(2H7 scFv VH L11S(SSS−S) H RTPE/QNAK(255−258) CH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG連結領域に結合される。連結領域は変異したIgG CH2領域および野生型IgG CH3領域に結合される。実施例56に記載された重複PCR反応を用いて、残基255ないし258は、各々、アルギニン、スレオニン、プロリン、グルタミン酸からグルタミン、アスパラギン、アラニンおよびリシンに突然変異されているCH2領域中のRTPE/QNAK突然変異。具体的プライマーは以下にリストされる。
第一のPCR反応用のPCRプライマー:
Figure 2010279389
PCR産物をTOPOベクターにクローン化し、配列決定し、第二のPCR反応用の鋳型として用いた。第二のPCR反応のプライマー:
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例62)
(2H7 scFv VH L11S(SSS−S) H K290Q CH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載したように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。連結領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。実施例58に記載された方法に従って、単一PCR反応を用いて、残基290におけるロイシンがグルタミンに変化されたCH2領域中のK290Q突然変異。この反応で用いる具体的プライマーを以下にリストする。
Figure 2010279389
PCR産物をTOPOにクローン化し、配列決定した。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例63)
(2H7 scFv VH L11S(SSS−S) H A339P CH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。連結領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1CH3領域に結合される。実施例58に記載された方法に従って、単一PCR反応を用い、残基339におけるアラニンがプロリンに変化されているCH2領域中のA339P突然変異。この反応で用いる具体的プライマーを以下にリストする:
Figure 2010279389
PCR産物をTOPOにクローン化し、配列決定した。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例64)
(G28−1 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例35に記載された方法に従って作成されたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3領域に結合される。この構築体はG28−1−MHWTG1CおよびG28−1 scFv Igと以前は言われ、共に、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例65)
(G28−1 scFv IgAH WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例35に記載された方法に従って作成されたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されたように、ヒトIgA連結領域および野生型ヒトIgG CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体はG28−1−IgAHWTG1Cと以前は言われた。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例66)
(G28−1 scFv VH L11S(SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸11において点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされるポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例67)
(G28−1 scFv VH L11S(CSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例13に記載された方法に従って、第二および第三のシステインがセリンに変化され、かつプロリンがセリンに変化されている(CSS−S)突然変異されたヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例68)
(G28−1 scFv VH L11S(CSC−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例32に記載された方法に従って、第二のシステインおよびプロリンがセリンに変化されている(CSC−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例69)
(G28−1 scFv VH L11S(SSC−P) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例13に記載された方法に従って、第一および第二のシステインがセリンに変化されている(SSC−P)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されているように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例70)
(CTLA4(SSS−S) H P238SCH2 WCH3)
この構築体は、実施例14に記載されているように、細胞外CTLA−4結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されている方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されたP238S突然変異は、PCRアッセイを用いて導入された。PCR反応は、ヒト扁桃B細胞RNAから調製されたランダム起点cDNAを用いて行った。PCR増幅は、94℃4分;30サイクルでの、94℃1分;55℃1分;72℃1分;続いての、72℃における6分間の最終伸長工程の増幅プロフィールを用いる。PCR断片をTOPOクローン化し、ほぼ800bpのEcoRIインサートを持つクローンを実施例1に記載されているように配列決定した。PCRで用いるプライマーは以下にリストする:
Figure 2010279389
この構築体はCTLA−4 IgG MTH(SSS) MTCH2WTCH3と以前は言われており、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例71)
(CTLA4(CCC−P) WH WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例14に記載されているようなCTLA−4結合領域を有する。この結合領域は、実施例1に記載されているように、野生型ヒトIgG1連結領域(CCC−P)に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されているように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3領域に結合される。この構築体はCTLA−4 IgG WTH(CCC) WTCH2CH3と以前は言われており、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例72)
(FC2−2 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例46に記載された方法に従って作成されたFC2−2(抗−CD16)単鎖Fvを有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例73)
(FC2−2 scFv VHL11S (SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたFC2−2(抗−CD16)単鎖Fvを有し、そこでは、実施例46に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例74)
(UCHL−1 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は実施例48に記載された方法に従って作成されたUCHL−1(抗−CD45RO)単鎖Fvを有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例75)
(UCHL−1 scFv VHL11S (SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたUCHL−1(抗−CD45RO)単鎖Fvを有し、そこでは、実施例48に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例76)
(5B9 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は実施例47に記載された方法に従って作成された5B9(抗−CD137)単鎖Fvを有する。この結合領域は、実施例5に記載した方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載したように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は5B9 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例77)
(5B9 scFv VHL11S(SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた5B9 (抗−CD137)単鎖Fvを有し、そこでは、実施例47に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例78)
(2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型IgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7−MHWTG1C、CytoxB−(MHWTG1C)−Ig、抗−CD20 scFv IgG MTH (SSS) WTCH2CH3、CytoxB−MHWTG1C、2H7 scFv−ヒトIgG1野生型ヒンジ−CH2−CH3、および2H7 scFv IgG MTH(SSS)WTCH2CH3と以前は言われ、これらは全て、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例79)
(2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合されている。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合している。残基238におけるプロリンはセリンに変化しているP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。この構築体は2H7 scFv IgG MTH (SSS) MTCH2WTCH3、抗−CD20 scFv IgG MTH (SSS) MTCH2CH3、およびCytoxB−MHMG1Cと以前は言われ、これらは、全て、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例80)
(2H7 scFv IgAH WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されたように、ヒトIgA連結領域および野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv IgAH IgG WTCH2CH3、2H7 scFv IgAヒンジ−IgG1 CH2−CH3、およびCytoxB−IgAHWTHG1Cと以前は言われ、これらは、全て、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例81)
(2H7 scFv IgAH WIgACH2 T4CH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されたように、ヒトIgAからの連結領域に結合される。この連結領域は、実施例13に記載されたように、野生型CH2領域、および3’停止コドンに先立って4つのアミノ酸残基の切断がある変異したCH3領域よりなるヒトIgA定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv IgAH IgAT4と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例82)
(2H7 scFv IgAH WIgACH2 WCH3+J鎖)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されたように、野生型ヒトIgA連結領域に結合される。この連結領域は、実施例13に記載された方法に従って、野生型ヒトIgA CH2およびCH3定常領域に結合される。この定常領域は、実施例13に記載されたように、J−鎖領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例83)
(2H7 scFv (CCC−P) WH WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1連結領域(CCC−P)に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv Ig WTH (CCC) WTCH2CH3、2H7 scFv IgG WTH WTCH2CH3、および2H7 scFv−Igと以前は言われ、これらは、共に前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例84)
(2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 F405YCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載した方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、野生型ヒトIgG1 CH2および変異したヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基405におけるフェニルアラニンがチロシンに変化されているF405Y突然変異は、実施例21に記載された方法に従って導入された。この構築体は2H7 scFv MTH WTCH2 MTCH3 Y405と以前は言われ、これは、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例85)
(2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 F405ACH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は野生型ヒトIgG1 CH2および変異したヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基405におけるフェニルアラニンがアラニンに変化されているF405A突然変異は実施例21に記載された方法に従って導入された。この構築体は2H7 scFv MTH WTCH2 MTCH3 A405と以前は言われ、これは、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例86)
(2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 Y407ACH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従い、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は野生型ヒトIgG1 CH2および変異したヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基407におけるチロシンがアラニンに変化されているY407A突然変異は実施例21に記載された方法に従って導入された。この構築体はscFv MTH WTCH2 MTCH3 A407と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例87)
(2H7 scFv (SSS−S) HWCH2 F405A,Y407ACH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は野生型ヒトIgG1 CH2および変異したヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基405におけるフェニルアラニンがアラニンに変化されており、かつ残基407におけるチロシンがアラニンに変化されているF405AおよびY407A突然変異が実施例21に記載された方法に従って導入された。この構築体はscFv MTH WTC2 MTCH3 A405A407と以前は言われ、これは、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例88)
(2H7 scFv (CSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例13に記載された方法に従って、第二および第三のシステインがセリンに変化されており、かつプロリンがセリンに変化されている(CSS−S)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv MTH (CSS) WTCH2CH3と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例89)
(2H7 scFv (SCS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7 (抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例13に記載された方法に従って、第一および第三のシステインがセリンに変化されており、かつプロリンがセリンに変化されている(SCS−S)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv IgG MTH(SCS) WTCH2CH3と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例90)
(2H7 scFv (SSC−P) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例13に記載された方法に従って、第一および第二のシステインがセリンに変化されている(SSC−P)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv MTH(SSC) WTCH2CH3と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号:
に供される。
(実施例91)
(2H7 scFv (CSC−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例32に記載された方法に従って、第二のシステインおよびプロリンがセリンに変化されている(CSC−S)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv MTH(CSC) WTCH2CH3と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例92)
(2H7 scFv (CCS−P) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例22に記載された方法に従って、第三のシステインがセリンに変化されている(CCS−P)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv MTH(CCS) WTCH2CH3と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例93)
(2H7 scFv (SCC−P) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例1に記載されているように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例32に記載された方法に従って、第一のシステインがセリンに変化されている(SCC−P)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv MTH(SCC) WTCH2CH3と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例94)
(2H7 scFv VH L11S(SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載したように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されているように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体は2H7 scFv VH11SER IgG MTH (SSS) WTCH2CH3および2H7 scFv VHSER11 WTH WTCH2CH3と以前は言われ、これは、共に、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例95)
(2H7 scFv VH L11S(CSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されているように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例13に記載された方法にしたがって、第二および第三のシステインがセリンに変化されており、かつプロリンがセリンに変化されている(CSS−S)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例96)
(G28−1 scFv VH L11S(SCS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例13に記載された方法に従って、第一および第三のシステインがセリンに変化されており、かつプロリンがセリンに変化されている(SCS−S)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例97)
(G28−1 scFv VH L11S(CCS−P) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11に点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例22に記載された方法に従って、第三のシステインがセリンに変化されている(CCS−P)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例98)
(G28−1 scFv VH L11S(SCC−P) H WCH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載したように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例32に記載された方法に従って、第一のシステインがセリンに変化されている(SCC−P)突然変異体ヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例99)
(G28−1 scFv VH L11S mIgE CH2 CH3 CH4)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例39に記載された方法を用いて、野生型マウスIgE CH2 CH3およびCH4領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例100)
(G28−1 scFv VH L11S mIgAH WIgACH2 T4CH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例39に記載されたように、マウスIgAからの連結領域に結合される。この連結領域は、実施例39に記載されたように、野生型CH2領域、および残基において4つのアミノ酸切断がある変異したCH3領域よりなるマウスIgA定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例101)
(G28−1 scFv VH L11S hIgE CH2 CH3 CH4)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたG28−1(抗−C37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例38に記載されているように、CH2、CH3およびCH4を含む野生型ヒトIgE定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例102)
(G28−1 scFv VH L11S hIgAH WIgACH2 T4CH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えたG28−1(抗−CD37)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例35に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載されたように、ヒトIgAからの連結領域に結合される。この連結領域は、実施例13に記載されたように、野生型CH2領域、および3’停止コドンに先立つ4つのアミノ酸残基の切断がある変異したCH3領域よりなるヒトIgA定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例103)
(HD37 scFv IgAH WCH2 WCH3)
Novagen−Igファミリープライマー組、TOPOクローニングおよび配列決定、およびソーイングPCRアッセイを用い、HD37 scFvをHD37ハイブリドーマからクローン化した。ソーイングに先立っての最初のPCR反応では、25サイクルでの、94℃、30秒;55℃、30秒;72℃、30秒の増幅プロフィールと共に、TOPOクローン鋳型HD37 VH C−1およびHD37 KVL B−9を1:100で用いた。二次ソーイングPCR反応のための鋳型を供するために、一次反応産物をゲル精製し、QIAQUICK精製し、溶出物を50倍希釈した。1マイクロリットルの各VLおよびVH重複鋳型をPCR反応に加え、反応は以下の増幅プロフィールを有するものであった:30サイクルでの、94℃、60秒;55℃、60秒;72℃、60秒。2サイクルの後、マシーンを休止させ、フランキング5’VLおよび3’VHプライマーを各々25pモルにて反応に加え、PCR反応を再開した。PCR産物を750ないし800bp断片の存在につきゲルでチェックし、反応産物をQIAQUICK精製し、pD18 Ig発現ベクターへの挿入のために適当な制限酵素で消化した。
Figure 2010279389
この結合領域は、実施例5に記載されたように、野生型ヒトIgA連結領域および野生型ヒトIgG CH2およびCH3定常領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体はHD37 scFv−IgAHWTG1CおよびHD37−IgAHWTG1Cと以前は言われ、これは、共に前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例104)
(HD37 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は実施例103に記載されたようにHD37単鎖Fvを有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合している。この連結領域は、実施例1に記載されているように野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体はHD37−MHWTG1CおよびHD37 scFv IgMHWTG1Cと以前は言われ、これらは、共に、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例105)
(HD37 scFv VH L11S(SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体はアミノ酸残基11において重鎖可変領域中に突然変異を備えたHD37単鎖Fvを有し、そこでは、実施例50に記載された方法に従って、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例106)
(L6 scFv IgAH WCH2 WCH3)
L6 scFvは、1996からのTissue Antigens Paperに記載されたアンカー−テイリング方法を用いてL6ハイブリドーマー(I Hellstrom)からクローン化した。PCRプロフィールは94℃、1分;50℃、2分;72℃、2分の35サイクルであった。一旦コンセンサス配列が少なくとも4つのTOPOクローンからVLおよびVH領域につき得られれば、ソーイングPCR反応に先立ってプライマーをPCR反応のために以下のように注文した:ソーイングに先立っての最初のPCR反応では、25サイクルでの94℃、30秒;55℃、30秒;72℃、30秒の増幅プロフィールと共に、TOPOクローン化鋳型L6VKおよびL6VHを1:100で用いた。二次ソーイングPCR反応用の鋳型を供するために、一次反応産物をゲル精製し、QIAQUICK精製し、溶出物を50倍希釈した。以下の増幅プロフィール:30サイクルでの、94℃、60秒;55℃、60秒;72℃、60秒でのPCR反応に、1マイクロリットルの各VLおよびVH重複鋳型を加えた。2サイクルの後、マシーンを停止させ、フランキング5’VLおよび3’VHプライマーを各25pモルにて反応に加え、PCR反応を再開した。PCR産物を750ないし800bp断片の存在につきゲル上でチェックし、反応産物をQIAQUICK精製し、pD18 Ig発現ベクターへの挿入のために適当な制限酵素で消化した。
Figure 2010279389
この結合領域は、実施例5に記載されたように、ヒトIgA連結領域および野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体はL6 scFv−IgAHWTG1Cと以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例107)
(L6 scFv VHL11S(SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体はアミノ酸残基11において重鎖可変領域中に突然変異を備えたL6単鎖Fvを有し、そこでは、実施例49に記載された方法に従って、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例108)
(2H7 scFv−ラマIgG1)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例10に記載された方法に従って、ラマIgG1ヒンジ、CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例109)
(2H7 scFv−ラマIgG2)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例10に記載された方法に従って、ラマIgG2ヒンジ、CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例110)
(2H7 scFv−ラマIgG3)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例10に記載された方法に従って、ラマIgG3ヒンジ、CH2およびCH3領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例111)
(CD16低(ED)(SSS−S) H P238SCH2 WCH3)
この構築体は、実施例43に記載されたように、細胞外CD16低親和性対立遺伝子結合ドメインを有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されたP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例112)
(CD16−9高(ED)(SSS−S) H P238SCH2 WCH3)
この構築体は、実施例43に記載されたように、細胞外CD16高親和性対立遺伝子結合ドメインを有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例113)
(2e12 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3−hCD80TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載されたように、2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよびプロリンの1つがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。CH3領域はヒトCD80膜貫通および細胞質テイル領域に結合される(hCD80 TM/CT)。hCD80 TM/CTは、実施例12に記載された方法に従って、BJAB細胞系に由来するランダム起点cDNAを用いてクローン化された。このTM/CT領域はオープンリーディングフレーム(ORF)を持つIg CH3領域に結合された。注目するscFvIg構築体のオープンリーディングフレームバージョンは、各−Igテイルの可溶性バージョンの、これらのテイルのORF(オープンリーディングフレームバージョン)での置き換えによって作成された。PCRプライマーは、停止コドンを欠失させ、1以上の制限部位を新しい−Igカセットの3’端部に加える可溶性−Igテイルの現存クローンのために設計した。次いで、所望の膜貫通および細胞質テイル配列をこれらの新しい−Igカセットの下流にサブクローン化することができる。各構築体は、PCR反応用のテイルの可溶性バージョンを増幅するのに用いられる現存する利用可能な5’BCLIオリゴヌクレオチドを利用した。3’オリゴヌクレオチドは、アポトーシスのアップレギュレーションに関与するタンパク質ドメイン用のコーディング領域に融合したフレームを合わせない制限部位で停止コドンを置き換える。
PCR増幅は、25pモルの各プライマー、標準PCR試薬、および種々の容量のクローン化されたドメインまたはPBMC、脾臓、もしくは胸腺RNAから得られたcDNAのいずれかで行った。反応は、35サイクルでの、94℃、60秒;55℃、60秒;72℃、2分のサイクリングプロフィールを用いた。IgG ORF用のプライマーを以下にリストする。
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例114)
(10A8 scFv(SSS−S)H P238SCH2 WCH3−hCD80TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された10A8(抗−CD2152)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。このCH3領域は実施例113に記載された方法に従ってhCD80 TM/CTに結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例115)
(40.2.220 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3−hCD80TM/CT)
この構築体は実施例12に記載された40.2.220(抗−CD40)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従い、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。このCH3領域は、実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CTに結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例116)
(2H7 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−hCD80TM/CT)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。このCH3領域は、実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CTに結合される。この構築体は以前は:と呼ばれていた。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例117)
(G19−4 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−hCD80TM/CT)
この構築体は、実施例29に記載されたG19(抗−CD3)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。このCH3領域は、実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CTに結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例118)
(2e12 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−hCD80TM/CT)
この構築体は実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されるように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。このCH3領域は、実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CTに結合される。この構築体は2e12 scFv IgG WTH WHTCH3CH2−CD80と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例119)
(2e12 scFv IgAH IgACH2 T4CH3−hCD80TM/CT)
この構築体は実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されたように、ヒトIgAからの連結領域に結合される。この連結領域は、実施例13に記載されたように、野生型CH2領域、および3’停止コドンに先立って4つのアミノ酸残基の切断がある変異したCH3領域よりなるヒトIgA定常領域に結合される。このCH3領域は、実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CTに結合される。IgA ORFを作成するのに用いられる具体的プライマーを以下にリストする。
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例120)
(2e12 scFv IgE CH2CH3CH4−hCD80TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例38に記載されたように、CH2、CH3およびCH4を含むヒトIgE定常領域に結合される。このCH4領域は、実質的には実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CTに結合される。IgE ORFを作成するのに用いられた具体的プライマーを以下にリストする。
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例121)
(2e12 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−mFADD−TM/CT)
この構築体は実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。CH3領域はマウスFADD膜貫通および細胞質テイル領域(mFADD TM/CT)に結合される。この領域は、実質的には実施例113に記載されたのと同一の方法を用いてクローン化される。該ドメインは、マウス脾臓RNAからのランダム起点cDNAからPCR増幅した。具体的プライマーは以下にリストする。
Figure 2010279389
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例122)
(2e12 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−mFADD−TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されているように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。CH3領域は、実施例113および121に記載された方法に従って、mFADD TM/TM領域に結合させた。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例123)
(2e12 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−mcasp3−TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されているように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。CH3領域は、実施例113および121に記載された方法に従って、マウスcasp3膜貫通および細胞質テイル領域に結合される。mcasp3 TM/CT領域を単離するのに用いる具体的プライマーを以下にリストする:
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例124)
(2e12 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−mcasp3−TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに交換されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は、変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113、121および123に記載された方法に従って、mcasp3 TM/CT領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例125)
(2e12 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−mcasp8−TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。CH3領域は、実質的には実施例113および121に記載された方法に従って、マウスcasp8膜貫通および細胞質テイル領域(mcasp8 TM/CT)に結合される。mcasp8 TM/CT領域をクローン化するのに用いる具体的プライマーを以下にリストする。
5’プライマー:
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例126)
(2e12 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−mcasp8−TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合ドメインを有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113、121および125に記載された方法に従って、mcasp8 TM/CT領域に結合された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例127)
(2e12 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−hcasp3−TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。CH3領域は、実質的には実施例113に記載された方法に従って、ヒトcasp3膜貫通および細胞質テイル領域(hcasp3 TM/CT)に結合させた。hcasp3 TM/CT領域をクローン化するのに用いた具体的プライマーを以下にリストする。
5’プライマー:
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例128)
(2e12 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−hcasp3−TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113および127に記載された方法に従って、hcasp3 TM/CT領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例129)
(2e12 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−hcasp8−TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。CH3領域は、実施例133に記載された方法に従って、ヒトcasp8膜貫通および細胞質テイル領域(hcasp8 TM/CT)に結合される。hcasp8 TM/CT領域をクローン化するのに用いられる具体的プライマーは以下にリストする。
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例130)
(2e12 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−hcasp8−TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化された(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113および129に記載された方法に従って、hcasp8 TM/CTに結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例131)
(1D8 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−CD80TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CT領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例132)
(1D8 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−hCD80TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されているように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。CH3領域は、実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CT領域に結合される。この構築体は1D8 scFv IgG WTH WTCH2CH3−CD80と以前は言われ、これは前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例133)
(1D8 scFv−mIgAH WIgA CH2T4CH3−hCD80TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されたように、ヒトIgAからの連結領域に結合される。この連結領域は、実施例39に記載されたように、野生型CH2領域、および3’停止コドンに先立って4つのアミノ酸残基の切断がある変異したCH3領域よりなるマウスIgA定常領域に結合される。CH3領域は、IgA ORFを作成するプライマーを用い、実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CT領域に結合することができる。
(実施例134)
(1D8 scFv IgE CH2CH3CH4−hCD80TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例38に記載されたように、CH2、CH3およびCH4を含むヒトIgE定常領域に結合される。CH4領域は、実施例113および120に記載された方法に従って、hCD80 TM/CTに結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例135)
(1D8 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−mFADD−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113および121に記載された方法に従って、mFADD−TM/TM領域に結合された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例136)
(1D8 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−mFADD−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3に結合される。CH3領域は、実施例113および121に記載された方法に従って、mFADD−TM/TM領域に結合された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例137)
(1D8 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−mcasp3−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3に結合される。CH3領域は、実施例113、121および123に記載される方法に従って、mcasp3 TM/TM領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例138)
(1D8 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−mcasp3−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載された方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113、121および123に記載される方法に従って、mcasp3 TM/TM領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例139)
(1D8 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−mcasp8−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。CH3領域は、実施例113、121および125に記載される方法に従って、mcasp8 TM/TM領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例140)
(1D8 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−mcasp8−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載される方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113、121および125に記載される方法に従って、mcasp8 TM/TM領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例141)
(1D8 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−hcasp3−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。CH3領域は、実施例113および127に記載される方法に従って、hcasp3 TM/TM領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例142)
(1D8 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−hcasp3−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載される方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113および127に記載される方法に従って、hcasp3 TM/CT領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例143)
(1D8 scFv (SSS−S)H WCH2 WCH3−hcasp8−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。CH3領域は、実施例113および129に記載される方法に従って、hcasp8 TM/TM領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例144)
(1D8 scFv (SSS−S)H P238SCH2 WCH3−hcasp8−TM/CT)
この構築体は、実施例25に記載された1D8(抗−4−1BB)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。このヒンジ領域は変異したヒトIgG1 CH2領域および野生型ヒトIgG1 CH3領域に結合される。残基238におけるプロリンがセリンに変化されるP238S突然変異は実施例70に記載される方法に従って導入された。CH3領域は、実施例113および129に記載される方法に従って、hcasp8 TM/CT領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例145)
(L6 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)
この構築体は、実施例105に記載されたL6 scFv結合ドメインを有する。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、実施例1に記載された野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。この構築体はL6 scFv−IgMHWTG1Cと以前は言われており、これは前記構築体と同一配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例146)
(2H7 scFv CD154(L2))
この構築体は、実施例1に記載された2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例4に記載された方法に従って、CD154細胞外ドメインに結合されている。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例147)
(2H7 scFv CD154(S4))
この構築体は、実施例1に記載された2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、結合の方法の結果、実施例146に記載された構築体と比較して切断されたバージョンがもたらされるように、実施例4に記載された方法に従って、CD154細胞外ドメインに結合されている。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例148)
(CTLA4 IgAH IgACH2CH3)
この構築体は、実施例14に記載されているように、細胞外CTLA−4結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されているように、野生型ヒトIgA連結領域に結合される。この連結領域は、実施例13に記載された方法に従って、野生型ヒトIgA CH2およびCH3定常領域に結合される。この定常領域は、実施例13に記載されているように、J−鎖領域に結合される。この構築体はCTLA−4 IgAH IgACH2CH3と以前は言われており、これは前記構築体と同一配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例149)
(CTLA4 IgAH IgACH2 T4CH3)
この構築体は、実施例14に記載されているように、細胞外CTLA−4結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されているように、ヒトIgAからの連結領域に結合される。この連結領域は、実施例13に記載されているように、野生型CH2領域、および3’停止コドンに先立って4つのアミノ酸残基の切断がある変異したCH3領域よりなるヒトIgA定常領域に結合される。この構築体は、CTLA−4 IgAH IgA−T4と以前は言われており、これは前記構築体と同一配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例150)
(2H7 scFv IgAH IgACH2CH3)
この構築体は、実施例1に記載されているように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されているように、野生型ヒトIgA連結領域に結合される。この連結領域は、実施例13に記載された方法に従って、野生型ヒトIgA CH2およびCH3定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例151)
(2H7 scFv IgAH IgAHCH2 T18CH3)
この構築体は、実施例1に記載されているように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されているように、ヒトIgAからの連結領域に結合される。この連結領域は、実施例13に記載されるように、野生型CH2領域、および3’停止コドンに先立って18アミノ酸残基の切断がある変異したCH3領域よりなるヒトIgA定常領域に結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例152)
(2H7−40.2.220 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)
二特異的融合タンパク質は、共にB細胞レセプターを標的とする2H7 scFv(抗−CD20)および40.2.220(抗−CD40)の間に構築された。発現ベクターpD18中の2H7 scFv hIgG1 (SSS−S)H WCH2 WCH3構築体をdam細菌を通して、BclI部位における切断を可能とした。BclI切断リンカー−CD40 scFv断片への連結に先立って、切断されたプラスミドをアルカリ性ホスファターゼで処理した。重複プライマーでの引き続いてのPCR反応によって、この断片を存在する40.2.220scFvから合成した。結合されたリンカーは、多数のリシンおよびグルタミン酸残基を持つ以前に特許された(発効されたBMS特許)ラセン型リンカーに結合させる。CD40のためのscFvを、SalI−BclI断片としてのリーダーペプチドなくしてPCR増幅したが、テイルは、CD20のための現存scFvIg構築体(2H−scFv hIgG1構築体)を含んだ。3’端部は、VHドメインの端部におけるVTVSSタイプ配列に融合させたフレームを合わせないBclI部位を持つ他のscFv VH分子と同様であった。
PCRオリゴ:
40.2.220 scFv:
Figure 2010279389
リンカープライマー:
相補的オリゴヌクレオチドをアニールすることによって作成されたBclI−SalI断片。次いで、この断片をSalI−BclI scFvと共にBclI消化ベクターに連結して、シャッフリングが望まれる(リンカー−scFv)BclI断片を得る。
Figure 2010279389
次いで、このBclI断片をpD18−Ig中の2H7 scFvの下流に連結した。形質転換体を2.4kb HindIII−Xbaインサートの存在につきスクリーニングし、さらなる実験に先立って陽性クローンを配列決定した。この構築体でCOS細胞一過性トランスフェクションを行い、培養上清を、予測されるサイズのタンパク質の存在につき、およびCD20への、およびCD40トランスフェクトCHO細胞への結合につきスクリーニングした。
新しい二特異的構築体は、リンカーのいずれかの端部の1つのまたは好ましくは2つの制限部位に取り込まれるヒンジタイプのリンカーを設計し、非対称消化物、および異なる構築体の間の(リンカー−scFv)または(scFv−リンカー)カセットの移動を容易とすることによって作成することができる。また、これらの構築体はVH L11Sおよび他のV領域置換も取り込み、これは、恐らくは、適切な折り畳みを容易とし、それらが挿入される分子の増大した発現をもたらす。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この結合領域は、野生型ヒトIgG1 CH2に結合される。前記構築体と同一の配列。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例153)
(2H7 scFv IgAH IgACH2 T4CH3−HCD80 TM/CT)
この構築体は、実施例1に記載されたように、2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例5に記載されたように、ヒトIgAからの連結領域に結合される。この連結領域は、実施例13に記載されたように、野生型CH2領域、および3’停止コドンに先立って4つのアミノ酸残基の切断がある突然変異されたCH3領域よりなるヒトIgA構築体に結合される。このCH3領域は、実施例113および119に記載される方法に従って、hCD80 TM/CTに結合される。この構築体は2H7 scFv IgAヒンジIgA−T4−CD80および2H7 scFv IgAH
IgA−T4−CD80と以前は言われており、それらは、共に、前記構築体と同一の配列を有する。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例154)
(G19−4 scFv (CCC−P) WH WCH2 WCH3−hCD80 TM/CT)
この構築体は、実施例29に記載されたG19(抗−CD3)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1連結領域(CCC−P)に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。このCH3領域は、実施例113に記載された方法に従い、hCD80 TM/CTに結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例155)
(2e12 scFv (CCC−P) WH WCH2 WCH3−hCD80 TM/CT)
この構築体は、実施例12に記載された2e12(抗−CD28)単鎖Fv結合領域を有する。この結合領域は、実施例1に記載された野生型ヒトIgG1連結領域(CCC−P)に結合される。この連結領域は、実施例1に記載されたように、野生型ヒトIgG1 CH2およびCH3定常領域に結合される。このCH3領域は、実施例113に記載された方法に従って、hCD80 TM/CTに結合される。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例156)
(2H7 VHL11S scFv (SSS−S) IgECH3CH4)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸残基11において点突然変異を備えた2H7(抗―CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されているように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG1連結領域に結合される。この連結領域は、ヒトIgE CH3およびCH4定常領域に結合される。この切断された定常領域は実施例38に記載された方法に従って作成された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例157)
(IgDヒンジ)
所望の領域を単離するためのPCRアッセイを用いることによって、代替ヒンジ領域をヒトIgD免疫グロブリンヒンジ領域から単離することができる。PCR反応は実施例1で用いたのと同一である。このヒンジは3’端部において6つのアミノ酸残基だけ切断されている。このPCR反応で用いるプライマーを以下にリストする。
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例158)
(hCD28 TM/CT)
細胞表面ORF構築体のいくつかでは、CD80の膜貫通ドメインをヒトCD28の膜貫通ドメインで置き換えた。なぜならば、それはCD80のようにモノマーではなく細胞表面でダイマーを形成するからである。アポトーシスプログラムを駆動する分子のいくつかは、シグナリング複合体を形成するのにオリゴマー化/トリマー化を必要とし;従って、細胞表面でのこれらの組み換えレセプターのオリゴマー化の程度を制御することによって、シグナリングの開始を制御することができることが重要である。
CD28テイルのPCR増幅で用いられるプライマーを下記に掲げる:
Figure 2010279389
ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例159)
(2H7 scFv VH L11S (SSS−S) H K322L CH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例5に記載された方法に従って、システインの全ておよび1つのプロリンがセリンに変化されている(SSS−S)変異したヒトIgG連結領域に結合される。この連結領域は変異したIgG CH2領域および野生型IgG CH3領域に結合される。CH2領域中のK322L突然変異は残基322におけるものであり、ここに、実施例56に記載された重複PCRを用いてリシンがロイシンに変化されているが、第1のPCR反応では異なるプライマーが用いられ、それを以下にリストする。
Figure 2010279389
PCR産物をTOPOベクターにクローン化し、配列決定した。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例160)
(2H7 scFv VH L11S(CSS−S) H K322L CH2 WCH3)
この構築体は重鎖可変領域中のアミノ酸11において点突然変異を備えた2H7(抗−CD20)単鎖Fv結合領域を有し、そこでは、実施例33に記載されたように、ロイシンがセリンに変化されている。この結合領域は、実施例13に記載された方法に従って、第2および第3のシステインがセリンに変化され、かつ該プロリンがセリンに変化されている(CSS−S)突然変異体IgG連結領域に結合される。連結領域は変異したIgG CH2領域および野生型IgG CH3領域に結合される。CH2領域中のK322L突然変異は残基322におけるものであり、ここに、第1のPCR反応では実施例159からのプライマー、および第2のPCR反応では実施例57からのプライマーを用い、実施例56に記載された重複PCRを用いてリシンがロイシンに変化されている。
PCR産物はTOPOベクターにクローン化され、配列決定された。ポリヌクレオチド配列は配列番号: に供され、コードされたポリペプチド配列は配列番号: に供される。
(実施例161)
(2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3および2H7 scFv(SSS−S) H P238SCH2 WCH3によるイン・ビボB細胞枯渇)
本実施例は、抗−CD20構築体(2H7 scFv (SSS−S) H WCH2WCH3)およびCH2ドメインにおいてプロリンからセリンへのアミノ酸置換を持つ抗―CD20構築体(2H7 scFv(SSS−S) H P238SCH2 WCH3)の活性の比較を通じて、B細胞の枯渇におけるADCCエフェクターメカニズムに関する実験を記載する。図72は、これらの構築体によるアポトーシス誘導についての実験の結果を示す。該結果は、双方の分子がCD20に結合し、カスパーゼ3の活性化によって媒介されるアポトーシスを誘導することを示した。
図73は、抗―CD20構築体がCD20陽性標的細胞に向けてのCDC活性を媒介することを示す。2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3構築体、2H7 scFv(SSS−S) H P238SCH2 WCH3構築体、またはリツキシマブを、100マイクロリットルの容量中の10Bjab標的細胞およびウサギ補体(PelFreez)の1:10希釈と共に増大させる濃度にて60分間インキュベートした。アリコットをトリパンブルー(Invitrogen)で染色し、血球計を用いてカウントして、処理の間に殺された細胞集団のパーセンテージを測定した。細胞を含む陰性対照および試薬のみも含めた。図74は、2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3構築体が末梢血液単核細胞でのADCCで有効であることを示す。2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3またはリツキシマブのADCC活性を、標的細胞としてのBJAB Bリンパ球細胞系に対して、かつ新鮮なヒトPBMCをエフェクター細胞として用いてイン・ビトロで測定した。標的に対するエフェクターの比率を100:1、50:1および25:1で変化させ、ウエル当たりのBJAB細胞の数は一定のままとしたが、PBMCの数は変化させた。BJAB細胞を51Crで2時間標識し、5×10細胞/ウエルの細胞密度で、平底96ウエルプレートの各ウエルに小分けした。精製された融合タンパク質またはリツキシマブを10μg/mlの濃度で加え、PBMCを200μlの最終容量中にて、1.25×10細胞/ウエル(25:1)、2.5×10細胞/ウエル(50:1)、または5×10細胞/ウエル(100:1)で加えた。構築体またはMAbの省略によって、天然殺傷を各エフェクター:標的の比率において測定した。PBMCまたは融合タンパク質を加えることなく自然放出を測定し、洗剤(1%NP40)を適当なウエルに加えることによって、最大放出を測定した。反応を5時間インキュベートし、100μl培養上清をLumaplate(Packard Instruments)に収穫し、Packard Top Count NXTマイクロプレートシンチレーションカウンターにて放出されたCPMのカウンティングに先立って一晩乾燥させた。図75は、2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3構築体が(高または低親和性対立遺伝子(158V/F)いずれかから構築された)可溶性CD16融合タンパク質に結合し、他方、2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3構築体が検出可能な結合を示さなかったことを示す。CD20 CHO細胞(10)を、PBS/2%FBS中、飽和量の2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3または2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3(10ug/ml)と共に氷上で1時間インキュベートした。細胞をPBS/2%FBS中で洗浄し、0.5mg/mlのFITC−CD16の系列希釈物と共に氷上で1時間インキュベートした。細胞を洗浄し、Beckman−Coulter Epics Cマシーンを用いるフローサイトメトリーによって特異的結合を測定した。Expo分析ソフトウェアを用いて結果を分析し、正規化した蛍光単位を濃度の関数としてグラフ化した。図76は、U937細胞に結合する2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3および2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3構築体の能力についての実験を示す。CD64を発現するU937細胞(10)を、PBS/2%FBS中で2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3または2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3と共に氷上で1時間インキュベートした。細胞を洗浄し、1:100の最終希釈にて、FITC−ヤギ抗−ヒトIgG1(Fc特異的)(Caltag)と共に氷上で1時間インキュベートした。細胞を洗浄し、Beckman−Coulter Epics Cフローサイトメーターにて蛍光分析した。データをExpo分析ソフトウェアを用いて分析し、2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3または2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3の濃度の関数として蛍光強度をグラフ化した。この図面は、2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3構築体および2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3構築体が共に同等滴定曲線にてU937細胞に結合したことを示す。結果は、2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3構築体は、高親和性FcレセプターFcγRI(CD64)へのその結合が損なわれなかったことを示した。U937細胞についての高親和性FcγRCへの結合がこの実験において2つの分子で同様であったという事実は、P238Sアミノ酸変化がFcγRIIIへの結合を選択的に低下させたことを示した。図77は、マカック属サルにおけるB細胞枯渇が、CH2ドメイン突然変異を持つ抗−CD20構築体(2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3)および抗−CD20 scFvによって媒介されたことを示す。2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3または2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3を6mg/kgでの静脈内注射によってマカック属サル(M.fasicularis)に投与し、1週間離して2回の注入を与えた。循環B細胞に対する効果は、末梢血液中のCD40陽性B細胞の検出によって測定した。血液試料は7、0、1、3、7、8、10、14、28および43日に注射した動物から吸い取った。B細胞枯渇は、サル血液に対してCBC(完全血液カウント)および2色フローサイトメトリー分析を行うことによって見積もった。CD40、CD19、CD20、IgG、CD3、CD8に対する抗体のFITCまたはPE結合体を種々の組合せで用いた。データは、B細胞の初期プレ−注射時点のレベル(最大)に対する経時的なマイクロリットル当たりの1000単位の細胞においてまとめたCD40陽性血液B細胞の数としてプロットした。この実験は、2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3 scFv注射の結果、第二の注射に続いて28日よりも長く継続した循環B細胞の迅速かつ完全な枯渇がもたらされたことを示した。CD20エピトープは飽和されなかったが、2H7 scFv (SSS−S) H P238SCH2 WCH3 scFvの注射は、完全にはB細胞を枯渇させなかった。初期レベルのほぼ50%までのB細胞におけるゆっくりとした低下が最初の2週間の間に観察されたが、B細胞はこれらの動物において出発レベルまで迅速に復帰した。これらの結果は、高親和性FcγRIに結合し、および補体依存性細胞傷害性を媒介する能力が、循環B細胞を完全に枯渇させるのにCytoxB20G分子では十分ではなく、CD16との相互作用によって媒介されるADCCは迅速かつ維持されるB細胞枯渇には必要なようであることを示す。
これらの実験は、2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3 scFvが、3つの異なる作用メカニズム、(1)アポトーシスの誘導、(2)CDCエフェクターメカニズム、および(3)ADCCエフェクターメカニズムを介してB細胞枯渇機能をトリガーできることを示す。これらのメカニズムの全ての3つは、恐らくは、イン・ビボにてB細胞の枯渇に寄与する。データは、B細胞の完全かつ維持された枯渇が無傷のADCCエフェクターメカニズムを必要とすることを示す。しかしながら、ADCC陰性突然変異体で得られた部分的枯渇もまた、アポトーシスおよびCDCメカニズムが全B細胞枯渇効果の一部の媒介に寄与することを示す。結果は、CD20陽性B細胞悪性疾患または自己免疫疾患を持つ患者において2H7 scFv (SSS−S) H WCH2 WCH3 scFvの使用を裏付ける。
(実施例162)
(抗−CD37 GS−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2 WCH3構築体によるB細胞におけるアポトーシスの誘導)
本実施例においては、抗−CD37 GS−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2WCH3構築体を、標的細胞に結合するそれらの能力につき、およびアポトーシスを誘導するそれらの能力につき見積もった。また、サイズ−排除クロマトグラフィー(SEC)によって構築体を物理的に特徴付けた。図78は、SSCヒンジドメイン形態を有するG28−1(抗−CD37)構築体(GS−1 VL11S scFv (SSC) H WCH2WCH3)のSECプロフィールを示す。プロテインAアフィニティークロマトグラフィーによって、G28−1(抗−CD37)構築体をCHO培養上清から精製した。10ないし25mgの精製されたアリコットを、ポアサイズが5mmであるTosoh Biosep,Inc.TSK 3000 SWXL HPLCカラムでのHPLCに付した。流速はPBS、pH7.2実行緩衝液中1ml/分であった。分子量標準の移動速度を追跡下に示す。GS−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2WCH3構築体を青色で示し、他方、GS−1 VL11S scFv (SSC) H WCH2WCH3構築体は赤色で示す。GS−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2WCH3構築体はほぼ75ないし100kDaの均一なピークを生じ、他方、GS−1 VL11S scFv (SSC) H WCH2WCH3構築体はより小さな形態および他の異種形態を生じ、これは、200kDaよりも大きな高分子量形態を示す。図79は、G28−1(抗−CD37)構築体の、B細胞リンパ腫細胞系への結合を示す。精製されたGS−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2WCH3またはGS−1 VL11S scFv (SSC) H WCH2WCH3の系列希釈物を、各細胞型の10細胞と共に、PBS/2%FBS中で氷上にて60分間インキュベートした。試料を2回洗浄し、FITCヤギ抗−ヒトIgGおよびFITCヤギ抗−ヒトIgG F(AB’)2(CalTag)の各々1:100の混合物と共に氷上で45分間インキュベートした。試料を洗浄し、FACsCalibur(Becton−Dickinson)を用いるフローサイトメトリーによって分析した。この実験の結果は、GS−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2WCH3およびGS−1 VL11S scFv (SSC) H WCH2WCH3構築体は共にBJABおよびRamos細胞に結合し、WIL−2細胞に中程度に結合したことを示す。G28−1(抗−CD37)(SSS) H G scFvまたはG28−1(SSC)H G scFv構築体分子は、これらの実験においてはより低いレベルにて、RajiおよびNamalwa細胞に結合した。全ての系への結合は有意であった。なぜならば、バックグラウンド蛍光は図79で示されるデータから差し引かれているからである。図80は、scFvのCS−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2WCH3またはGS−1 VL11S scFv (SSC) H WCH2WCH3形態との一晩のインキュベーション後におけるアネキシンおよびヨウ化v−プロピジウムのRamos細胞への結合を示す。Ramos細胞のアネキシンV−PI染色はG28−1(抗−CD37) scFvと共に24時間インキュベートした。10細胞/mlのRamosB細胞を10mg/mlのG28−1(抗−CD37) scFvと共に2mlの合計容量中で12ウエルディッシュ中で24時間インキュベートした。製造業者の指示に従い、細胞を、Immunotechから得られたキットでのアネキシンVおよびヨウ化プロピジウムで染色した。試料は、FACsCaliburフローサイトメーター(Becton−Dickinson)を用いる2色フローサイトメトリーによって分析した。各象限における全細胞の%を各ドットプロットの次に示す。図83は、GS−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2WCH3またはGS−1 VL11S scFv (SSC) H WCH2WCH3との一晩のインキュベーションの後におけるアネキシンV−ヨウ化プロピジウムの細胞への結合を示す。結果は、GS−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2WCH3およびGS−1 VL11S scFv (SSC) H WCH2WCH3構築体は共にアポトーシスを誘導できたが、SSC形態はSSC形態よりもよりアポトーシスを誘導したことを示した。図81は、G28−1(抗−CD37)構築体の存在下で成長したRamos細胞の増殖の阻害を示す。RamosB細胞を、(SSS)Hまたは(SSC)Hいずれかと同定されたIgG1ヒンジを含有する精製されたG28−1(抗−CD37)構築体の系列希釈と共にインキュベートした。48時間のインキュベーションの最後の12時間のH−チミジン(0.75mCi/ウエル)でのパルシングに先立って、96ウエル平底組織培養皿(Coster)中で、培養を37℃、5%COにて36時間インキュベートした。Packardハーベスターを用いて細胞を96−ウエルGFCプレートに収穫し、乾燥し、TopCount NXTマイクロプレート(Packard)シンチレーションカウンターでのカウンティングに先立ち、25mlのMicroscintシンチレーション流体を各ウエルに加えた。データは、取り込まれたcpm−対−タンパク質濃度としてプロットする。各構築体は、増大するタンパク質濃度での増殖の増大する阻害を示した。図82は、2H7(抗−CD20)およびG28−1(抗−CD37)構築体の存在下で培養したRamosB細胞におけるアポトーシスの誘導を示す。RamosB細胞を、溶液中で、CD20および/またはCD37標的化構築体(10mg/ml)と共に20時間インキュベートした。次いで、細胞を収穫し、洗浄し、FACsCaliburフローサイトメーター(Beckton−Dickinson)を用いる2色フローサイトメトリーに先立って、Immunotechからの染色キットを用いて、アネキシンVおよびヨウ化プロピジウム中でインキュベートした。グラフは、ドットブロットの右側象限におけるそれらの染色によって同定されるアネキシンV陽性細胞のパーセンテージを示す。この実験の結果は、双方のG28−1構築体は2H7構築体よりも効果的であり、G28−1 VL11S scFv (SSS) H WCH2 WCH3構築体がG28−1 VL11S scFv (SSC) H WCH2 WCH3構築体よりも効果的であることを示す。しかしながら、Ramos細胞のアポトーシスの量は、2H7およびG28−1構築体を組み合わせて用いた場合に最大であった。図83は、ヒンジ領域突然変異を持つ2H7(抗−CD20)構築体およびG28−1(抗−CD37)構築体によって誘導された補体依存性細胞傷害性(CDC)によるRamos細胞の殺傷を示す。2H7 scFv (CSS−S) H WCH2 WCH3(抗−CD20)、G28−1 scFv (SSS)H G、G28−1 (SCS)H(抗−CD37−scFv)、G28−1 (CSS)H (抗−CD37−scFv)、またはG28−1 (SSC)H (抗−CD37−scFv)を、150mlの容量中、10Ramos標的細胞およびウサギ補体(PelFreez)の1:10希釈と共に10mg/mlにて90分間インキュベートした。アリコットをトリパンブルー(Invitrogen)で染色し、血球計を用いてカウントして、処理の間に殺された細胞集団のパーセンテージを測定した。細胞および1つの試薬のみを含む陰性対照もまた含めた。G28−1(SSS)(抗−CD37 scFv)およびG28−1 (SSC)(抗−CD37 scFv)は、本実験においては、ウサギ補体の存在下でRamos細胞を迅速に殺した。G28−1 (SSC)(抗−CD37 scFv)の活性は、G28−1 (SSS)(抗−CD37 scFv)のそれよりも高く、このアッセイにおいては、CD20−指向性2H7 scFv (CSS−S) H WCH2 WCH3 scFv分子とほとんど同様な効力であった。図84は、G28−1 (抗−CD37) scFvと共にインキュベートしたRamos細胞のADCCの誘導を示す。10mg/mlのG28−1(抗−CD37)構築体を、10 51Cr−標識Ramos細胞および休止ヒトPBMCと共に、0ないし100の範囲の異なるエフェクター:標的比率にて、平底96ウエルプレート中でインキュベートした。全てのインキュベーションは、各エフェクター:標的比率において三連で行った。天然殺傷は、構築体を省略することによって各エフェクター:標的比率で測定した。自然放出はPBMCまたは融合タンパク質を加えること無く測定し、最大放出は、洗剤(1%NP−40)を適当なウエルに加えることによって測定した。反応を6時間インキュベートし、100ml細胞上清をLumaplate (Packard Instruments)に収穫し、Packard Top Count NXTマイクロプレートシンチレーションカウンターでの放出されたcpmのカウンティングに先立ち一晩乾燥した。これらの実験からの結果は、G28−1(抗−CD37)構築体が標的細胞に結合し、それらはB細胞系においてアポトーシスを誘導し、およびCDCおよびADCCを含めたエフェクター機能を媒介することを示した。
本発明内の、または本発明内で有用なさらなる非−限定的代表的な構築体または配列は以下の通りである。
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これまでより、本発明の特定の具体例を説明の目的でここに記載してきたが、発明の精神および範囲を逸脱すること無く種々の修飾をなすことができるのは当業者に明らかであろう。従って、本発明は添付の請求の範囲によるのを除いて限定されない。
本明細書中で引用したまたは言及した全ての特許、特許出願、刊行物、科学論文、ウェブサイト、および他の書籍および資料は本発明が属する分野の当業者のレベルを示し、各そのような参照された書籍および資料は、あたかもそれが引用によりその全体を個々に取り込むように、あるいはその全体をここに記載するように、同程度までここに引用して援用する。加えて、本出願における全ての請求項、および元の請求項に限定されないがそれを含めた全ての優先権基礎出願はここにその全体を本発明の記載に一体化させ、またはその一部を形成させる。出願人は、いずれのそのような特許、出願、刊行物、科学論文、ウェブサイト、電子的に利用可能な情報、および他の参照された資料または書籍からのいずれのおよび全ての資料および情報も本明細書中に物理的に取り込む権利を留保する。出願人は、限定されるものではないがいずれの元の請求項も含めた前記で言及した請求項、記載のいずれの部分も含めて、本書類のいずれかの部分に物理的に取り込む権利を留保する。
本明細書中に記載された具体的な方法および組成物は好ましい具体例の代表であり、例示的なものであって、本発明の範囲を限定する意図のものではない。本明細書中を考慮すると、他の目的、態様および具体例が明らかとなり、それらは特許請求の範囲によって定義される発明の精神の範囲内に含まれる。本発明の範囲および精神を逸脱することなく、本明細書中に開示された発明に対して種々の置換および修飾をなすことができるのは当業者に容易に明らかであろう。本明細書中に説明的に記載された発明は、必須として特に具体的に明細書中で開示されたいずれかの要素または複数要素、または限定または複数の限定の不存在下で適切に実施することができる。かくして、例えば、本明細書中における各例において、本発明の具体例または例では、「を含む」、「から本質的になる」、および「よりなる」のいずれも、本明細書中における他の2つの用語のいずれかで置き換えることができる。また、用語「を含む」、「含めた」、「含有する」等は限定なくして広く読まれるべきである。本明細書中に説明的に記載された方法および製法は、異なる順序の工程で行うことができ、それらは、本明細書中に、または特許請求の範囲に示された順序の工程に必ずしも限定されない。また、本明細書中で用いるように、および添付の請求の範囲で用いられるように、単数形「ある」および「該」は、文脈が明瞭にそうでないことを示す以外は、複数の言及を含む。かくして、例えば、「ある宿主細胞」への言及は、複数のそのような宿主細胞(例えば、培養または集団)等を含む。特許は、本明細書中に具体的に開示された特別な例または具体例または方法に断じて限定されて解釈されるべきものではない。特許は、陳述が出願人による応答の書面において具体的にかつ資格または留保なくして明示的に採用されるのでなければ、いずれかの審査官、または特許商標局の他の職員または従業者によってなされたいずれの陳述によっても断じて限定されて解釈されるべきではない。
使用されてきた用語および表現は記載の用語として用いられ、限定するものではなく、示され、かつ記載された特徴またはその部分のいずれかの同等物を排除するためにそのような用語および表現を用いる意図ではないが、種々の修飾が特許請求する発明の範囲内で可能であると認識される。かくして、好ましい具体例および任意の特長によって本発明が具体的に開示されてきたが、開示された本明細書中の概念の修飾および変形は当業者によってなすことができ、そのような修飾および変形は添付の請求の範囲のよって定義された発明の範囲内であると考えられることが理解されよう。
発明は本明細書中においては広くかつ上位概念的に記載されてきた。上位概念的開示内に入るより狭い種および亜上位概念グループも本発明の一部を形成する。これは、切り取った材料はここに具体的に引用されるか否かに関わらず、これは、上位概念からいずれの主題も除去する但書または否定的限定を備えた本発明の上位概念的記載を含む。例えば、本発明の主題は、所望により、「結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質」なる発明の名称の、Ledbetter et al.による、2003年6月26日にU.S.S.N.2003/0118592 A1として公開された関連出願で記載されたまたはそれに含まれる主題または配列(およびUSPTOによって公開された配列番号:1ないし427の配列表)のいずれかを排除することができる。
他の具体例は以下の請求の範囲内にある。加えて、発明の特徴または態様がマーカッシュ群の擁護で記載される場合、当業者であれば、本発明は、それにより、マーカッシュ群のいずれかの個々のメンバーまたはメンバーのサブグループの用語でも記載されることを認識するであろう。

Claims (1)

  1. 本明細書に記載の天然に生じない単鎖タンパク質。
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