JP2007528192A - 組換えヘテロカルピンの製造方法 - Google Patents
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Abstract
Description
− 配列番号8のポリヌクレオチド配列又はその断片の一つ、あるいは、
− 配列番号9のポリヌクレオチド配列又はその断片の一つ
からなる単離ポリヌクレオチド(但し、前記の単離ポリヌクレオチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有する単離ポリペプチドをコードするようなものである)に関する。
− 配列番号8のポリヌクレオチド配列又はその断片の一つ、あるいは、
− 配列番号9のポリヌクレオチド配列又はその断片の一つ
からなる単離ポリヌクレオチド(但し、前記の単離ポリヌクレオチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有する単離ポリペプチドをコードするようなものである)を、製薬学的に許容し得る賦形剤の1種又はそれ以上と一緒に含有してなる医薬組成物である。
− 配列番号8のポリヌクレオチド配列又はその断片の一つ、あるいは、
− 配列番号9のポリヌクレオチド配列又はその断片の一つ
からなる単離ポリヌクレオチド(但し、前記の単離ポリヌクレオチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有する単離ペプチドをコードするようなものである)の使用である。
(a) 適当な条件下で培養して、配列番号9又は配列番号13のポリヌクレオチド配列、配列番号9又は配列番号13のポリヌクレオチド配列に相補的な配列、又はその断片の一つからなる単離ポリヌクレオチドを含有する発現ベクターを用いて形質転換又は形質導入された宿主細胞の前記ポリペプチドを発現させる工程(但し、前記の単離ポリペプチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有するものである)及び
(b) 宿主細胞培養物から前記ポリペプチドを単離する工程
からなる前記の単離ペプチドの製造方法を提供する。
(a) 適当な条件下で培養して、配列番号9又は配列番号13のポリヌクレオチド配列、配列番号9又は配列番号13のポリヌクレオチド配列に相補的な配列、又はその断片の一つからなる単離ポリヌクレオチドを含有する発現ベクターを用いて形質転換又は形質導入された宿主細胞の前記ポリペプチドを発現させる工程(但し、前記の単離ポリペプチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有するものである)及び
(b) 宿主細胞培養物から前記ポリペプチドを単離する工程
からなる前記の単離ペプチドの製造方法に関する。
(a) 適当な条件下で培養して、配列番号9又は配列番号13のポリヌクレオチド配列あるいは配列番号9又は配列番号13のポリヌクレオチド配列に相補的な配列からなる単離ポリヌクレオチドを含有する発現ベクターを用いて形質転換又は形質導入された宿主細胞の前記ポリペプチドを発現させる工程(但し、前記の単離ポリペプチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有するものである)及び
(b) 宿主細胞培養物から前記ポリペプチドを単離する工程
からなる。
(a) 各候補化合物を、
− 配列番号9のポリヌクレオチド配列によってコードされるか又は配列番号9のポリヌクレオチド配列に相補的な配列によってコードされるタンパク質の断片、あるいは
− 配列番号13のポリヌクレオチド配列によってコードされるか又は配列番号13のポリヌクレオチド配列に相補的な配列によってコードされるタンパク質の断片、
からなる単離ポリペプチドと、前記候補化合物が前記ポリペプチドに結合することを可能にするのに十分な条件及び時間のもとで接触させる工程(但し、前記の単離ポリペプチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有するものである)、及び
(b) 前記ポリペプチドに対する各候補化合物の結合を検出し、候補化合物の中からヒトGHRHを結合することができ且つ細胞増殖を調節することができる化合物を同定する工程
からなるヒトGHRHを結合することができ且つ細胞増殖を調節することができる化合物の同定方法を提供する。
(a) 各候補化合物を、前記候補化合物と下記細胞が相互作用することを可能にする十分な条件及び時間の下で、
− 配列番号9のポリヌクレオチド配列によってコードされるか又は配列番号9のポリヌクレオチド配列に相補的な配列によってコードされるタンパク質の断片、あるいは
− 配列番号13のポリヌクレオチド配列によってコードされるか又は配列番号13のポリヌクレオチド配列に相補的な配列によってコードされるタンパク質の断片、
からなる単離ポリペプチドを発現することができる細胞と接触させる工程(但し、前記の単離ポリペプチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有するものである)、及び
(b) ポリペプチドの細胞濃度に対する各候補化合物の影響を調べ、候補化合物の中からヒトGHRHを結合することができ且つ細胞増殖を調節することができる化合物を同定する工程
からなる。
− 配列番号9のポリヌクレオチド配列によってコードされるか又は配列番号9のポリヌクレオチド配列に相補的な配列によってコードされるタンパク質の断片、あるいは
− 配列番号13のポリヌクレオチド配列によってコードされるか又は配列番号13のポリヌクレオチド配列に相補的な配列によってコードされるタンパク質の断片、
からなり、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有する単離ポリペプチド、及び前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、本発明に従って、癌患者に投与されてその腫瘍の進行を鈍化させるか又は腫瘍を退縮させることができる。
前述のように、本発明は、一般的に細胞増殖を調節すること及び癌を治療することを目的とした化合物及び方法に関する。本発明は、部分的には、細胞増殖の調節に関係するポリペプチド及びポリヌクレオチド配列である“細胞増殖の調節に関係する配列”の同定に基づく。このようなcDNA分子は、RNA又はmRNAの調製物から逆転写などの標準的な技法を使用して調製することができる。同様に、分化に関係するタンパク質又はポリペプチドは、細胞分化に関係するmRNAによってコードされる配列からなる。
本発明の具体的な主題は、配列番号8、配列番号9又は配列番号13の配列のポリヌクレオチド及び配列番号14の配列のポリペプチド又はタンパク質である。
100−100×(N´/N)
但し、N´は配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号13又は配列番号14について修飾されたヌクレオチド又はアミノ酸の個数を表し且つNは配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号13又は配列番号14のヌクレオチドの個数を表す。
Tm=81.5 + 0.41×(% G+C)+ 16.6×log[陽イオン] − 0.63×(%ホルムアミド) − (600/塩基の個数)
本発明に関して、Tmよりも10℃低いハイブリダイゼーション温度と、6×SSC(0.9M塩化ナトリウム及び0.09Mクエン酸ナトリウム)溶液を含有するハイブリダイゼーション緩衝液とを使用する場合に、緊縮条件が“高”いと呼ぶ。このような条件下で、特異配列のポリヌクレオチドは、配列番号8、配列番号9又は配列番号13の配列に相補的な配列のポリヌクレオチドとハイブリダイズしないであろう。
本明細書に記載のようにポリペプチド又はその部分もしくは変異体をコードし、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するポリヌクレオチドは、本発明によって保護される。このようなポリヌクレオチドは、一本鎖(コード鎖又はアンチセンス鎖)又は二本鎖であることができ且つDNA(ゲノムDNA、cDNA又は合成DNA)又はRNA分子であることができる。
開示の範囲内で、本発明のポリペプチドは、細胞増殖の調節に関係するタンパク質の少なくとも一つの部分又はその変異体を含む。前記の部分は、免疫学的に及び/又は生物学的に活性である。このようなポリペプチドは、任意の長さ、例えば完全タンパク質、オリゴペプチド(すなわち、ペプチド結合によって結合された比較的限定された個数、例えば8〜10残基のアミノ酸からなる)又は中間サイズのペプチドを有することができる。ポリペプチドはまた、追加の配列を含有することもできる。
一般的に、本発明に記載されたポリペプチド及びポリヌクレオチドが単離される。“単離”ポリペプチド又はポリヌクレオチドは、その元の環境から取り出されたポリヌクレオチド又はペプチドである。例えば、天然タンパク質は、天然系に共存する生物材料 から分離される場合に単離される。ポリヌクレオチドは、例えば、天然環境の一部を形成していないベクター中でクローン化される場合に単離されるとみなされる。
本発明は、GHRHの結合に関係し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質を特異的に結合する抗体などの結合剤を提供する。このような結合剤は、細胞増殖の調節に関係するタンパク質又はその部分もしくは変異体を用いて検出できる(例えば、ELISA試験によって)レベルで反応し且つその他のタンパク質と検出可能な方法で反応しない場合には、細胞増殖調節タンパク質に“特異的に結合する”といわれる。“結合”とは、複合体を形成するような2つの別々の分子の間の非共有的結合をいう。結合能は、例えば、複合体の形成について結合定数を測定することによって評価することができる。結合定数は、複合体の濃度の値をその成分同士の濃度の値の生成物で乗する場合に得られる値である。一般的に、2つの生成物は、結合定数が103 1/molに到達する場合に“結合された”と呼ばれる。結合定数は、当業者に周知の方法を使用して測定することができる。
融合遺伝子は、本発明のタンパク質の細胞下の配置、特に配列番号10の配列のタンパク質の細胞下の配置を分析することを目的として当業者によって製造され得る。多数のプラスミド組立て体、例えばグルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)タンパク質、又は蛍光タンパク質、例えばGreen Fluorescent Protein(緑色蛍光タンパク質)(GFP) 又は非徹底的には(non-exhaustively) ポリヒスチジン標識は、商業的に入手できる。
本発明のある種の態様によれば、ポリペプチド、抗体及び/又は核酸などの生成物は、医薬組成物又はワクチンに配合することができる。医薬組成物は、1種又はそれ以上のこれらの生成物と、1種又はそれ以上の製薬学的に許容し得る賦形剤(担体)を含有してなる。場合によってはワクチンとして使用できるある種の医薬組成物は、1種又はそれ以上のポリペプチドと、免疫応答活性化物質、例えばアジュバント又はリポソーム(この中に前記生成物が配合される)を含有することができる。医薬組成物及びワクチンは、さらに、投与系、例えば生分解性微小球(例えば、乳酸とグリコール酸の共重合体又はPLGAからなる微小球)を含有することができる。本発明の開示の範囲内の医薬組成物及びワクチンはまた、生物学的に活性であるか又は不活性であることができるその他の生成物も含有することができる。
本発明の別の態様によれば、前記の生成物は抗癌療法に使用できる。特に、ヒトGHRHの結合に関係し且つ細胞増殖の調節に関係するポリヌクレオチド及びポリペプチドは、乳癌、前立腺癌又は肺癌に特異的な腫瘍において細胞の増殖を阻害し且つ調節を誘導することを目的として使用することができる。
1.1)ピロカルパス・ヘテロフィルス(Pilocarpus heterophyllus)の細胞からRNA類の抽出:
培養細胞を、全RNA抽出の工程の前に、−80℃で保存した。全RNA抽出は、Trizol試薬(Gibco/BRL)を使用して科学文献(Chomczynski and Sacchi, Anal. Biochem., (1987), 162, 156)に記載の方法に基づいて行った。このようにして抽出したRNAの品質を、臭化エチジウムの存在下で1%アガロースゲル上で分析した。
前記RNAを、SMART(商標) RACE cDNA 増幅キット (Clontech) を使用してRNAの5´及び3´部分を解離させ且つ逆転写を促進させるために、2種類の操作方法に従って逆転写させた。
ヘテロカルピンのcDNAに特異的な2つの配列の増幅を、配列番号4及び配列番号5のそれぞれの配列の5´特異的cDNAの生成物用のRev1プライマーと3´特異的cDNAの生成物用のFwd1プライマーとを使用して、逆転写生成物についてポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により行った。
反応条件は、最終容量50μl中に3´特異的cDNAの生成物用のFwd1 0.2μM及び5´特異的cDNAの生成物用のRev1 0.2μM、200μM dNTP類、40mM Tricine-KOH (pH 8.7)、15mM KOAc、3.5mM Mg(OAc)2 、3.75μg/ml BSA、0.005%Tween-20、0.005%Nonidet-P40、及び0.5U Taq DNA ポリメラーゼを含む。PCR反応をPerkin-Elmer 9700 サーモサイクラー中で次の熱サイクルパラメーター:すなわち、94℃で5秒間の変性、72℃でプライマーのハイブリダイゼーションからなるサイクル5回、94℃で5秒間の変性、70℃で10秒間のプライマーのハイブリダイゼーション及び72℃で3分間の重合の伸長からなるサイクル5回、並びに最後に94℃で5秒間の変性、68℃で10秒間のプライマーのハイブリダイゼーション及び72℃で3分間のポリメラーゼ伸長からなるサイクル25回を使用して行った。
配列番号9:
2.1)ピロカルパス・ヘテロフィルス(Pilocarpus heterophyllus)の細胞培養物からのRNA類の調製:
培養細胞を、全RNA抽出の工程の前に、−80℃で保存した。全RNA抽出は、Trizol試薬 (Gibco/BRL)を使用して科学文献 (Chomczynski and Sacchi, Anal. Biochem., (1987), 162, 156) に記載の方法に基づいて行った。このようにして抽出したRNAの品質を、臭化エチジウムの存在下で1%アガロースゲル上で分析した。
得られた全RNAを、製造業者(Gibco/BRL)のマニュアルに教示されているようにしてSuperscript(登録商標)逆転写酵素を使用して、Oligo(dT)プライマーを用いて逆転写した。
ヘテロカルピンのcDNAの増幅を、配列番号11及び配列番号12のそれぞれの配列のプライマーFwd2及びRev2を使用して、逆転写生成物についてポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により行った。
配列番号13:
ヘテロカルピンをコードするcDNAの部分を、pQE-TriSystem (Qiagen) 発現ベクターのBamH1/Xho1部位に挿入し、大腸菌M15を宿主細菌として使用して発現させた。100μg/mlのアンピシリンと25μg/mlのカナマイシンを含有するLB培地20mlに接種し、前記細菌を攪拌下で12時間37℃にした。この培養物から、100μg/mlのアンピシリンと25μg/mlのカナマイシンを含有するLB培地1リットルに接種し、600nmで0.6の光学濃度が得られるまで細菌を37℃で攪拌した。
ヘテロカルピンをコードするcDNAの部分を、pQE-TriSystem (Qiagen) 発現ベクターのBamH1/Xho1部位に挿入した。pQE-TriSystemベクターは、相同的組換えを可能にするAutographa California核多核体病ウイルス(AcNPV)のウイルス配列を含有する。ヘテロカルピン配列を含有する組換えバキュロウイルスは、pQE-TriSystemベクターと、ヨトウガ(Spodoptera frugiperda)幼虫の卵巣組織から確立されたsf9又はsf21昆虫細胞中のバキュロウイルスのゲノム線状化DNAとの同時トランスフェクションにより調製される。移入された細胞をリン酸緩衝液で洗浄し、1000×gで5分間遠心分離することにより回収した。得られたペレットを、50mM NaH2PO4 、300mM NaCl及び10mMイミダゾールからなるpH8.0の溶解用緩衝液に懸濁した。溶解は音波粉砕工程により最終的に完結させ、砕片を遠心分離で除去した。このようにして浄化した溶菌液(4ml)を、200μlのニッケルマトリックス懸濁液と混合し、4℃で60分間攪拌した。反応媒体全部をカラムに入れ、50mM NaH2PO4 、300mM NaCl及び20mMイミダゾールの存在下で洗浄した。ヘテロカルピンを、50mM NaH2PO4 、300mM NaCl及び250mMイミダゾールからなる緩衝液4×0.5 mlで最終的に溶出した。
ヘテロカルピンをコードするcDNAの部分を、pQE-TriSystem (Qiagen) 発現ベクターのBamH1/Xho1部位に挿入した。pQE-TriSystemベクターは、極めて著しい多様な発現を可能にするニワトリのβ-アクチンプロモーターに融合されたサイトメガロウイルス(CMV)の活性化配列を含有する。ヒト胎児腎(HEK-293)細胞を、100 U/mlのペニシリン及び100μg/mlのストレプトマイシン硫酸塩を含有し、10%ウシ胎児血清を補足したDMEM培地(ダルベッコの変性イーグル培地)中で培養した。細胞の正常な代謝及びよりよいトランスフェクション効率を可能にするトランスフェクションの前に、細胞を24時間継代培養した。ヘテロカルピンをコードするcDNAを含有するpQE-TriSystem 1μgのトランスフェクションを、Effectene(登録商標)試薬を使用して製造業者(Qiagen)の推奨に従って行った。
ヒトGHRH受容体(hGHRH-R)の安定なトランスフェクション:
ヒトGHRH受容体を安定に発現するHEK-293ヒト胎児腎細胞(Dr. Stuart Sealfon, Mount Sinai Medical School, New York, New Yorkによって開発された細胞系)を、Dr. Kelly Mayo (Northwestern University, Chicago, IL) から入手した。
前記のヒトGHRH受容体を用いて安定した方法で移入されたHEK-293細胞を、10%ウシ胎児血清及び4mMのL-グルタミン(Life Technologies)の存在下で0.4mg/mlのG418 (Life technologies)を補足したDMEM (ダルベッコの変性イーグル培地、高グルコース含有;Life technologiesから供給される)中で培養した。この細胞を50mM HEPES (pH7.4)、5mMの塩化マグネシウム (MgCl2)、2mMのエチレングリコール-ビス(2-アミノ-エチル)-N,N,N´,N´-四酢酸 (EGTA) 及び50μg/mlのバシトラシン(細胞壁合成阻害)を含有する緩衝液A中でホモジナイズし、次いで上記と同じ緩衝液A中で音波粉砕に供した。このようにしてホモジナイズされた細胞を、4℃で39,000 gで10分間遠心分離し、緩衝液Aに懸濁し、4℃で40,000 gで10分間再度遠心分離した。全膜タンパク質をBradford法で定量した。ペレット化膜このようにしてその後の使用のために−80℃で保存した。
ヒトGHRH受容体を安定した方法で移入されたHEK-293細胞の膜を、50mM HEPES(pH7.4)、5mMのMgCl2 、2mMのEGTA、50μg/mlのバシトラシン及び0.5%ウシ血清アルブミン(BSA)を含有する反応緩衝液に100μg/mlの濃度まで希釈した。この膜を最終容量200μl中で0.05 nMの[125I]GHRH(1-44アミド) (Amersham)と共にヘテロカルピンの存在下でヘテロカルピンの濃度を高めながら23℃で2時間インキュベートした。ポリエチレンイミン0.1%を予め加えたGF/C 96ウエルフィルターを用いて迅速に濾過することにより反応を停止させた。次いで、フィルターを、Packard 96ウエルフィルターステーションを使用して50 mM Tris(pH 7.4)を含有する洗浄用緩衝液を用いて4℃で3回洗浄した。このようにして乾燥したフィルターを20μlのシンチレーション混合液(Microscint 0, Packard)に浸し、Topcount (Packard)によるカウントに供した。非特異活性を100 nMのhGHRHの存在下で測定した。容量応答曲線をhGHRH (0.001 nM〜100 nM) について作成し、50%ヒトGHRHがヒトGHRH受容体に結合しないタンパク質/ポリペプチドの阻止濃度IC50を測定することができた。
Claims (18)
- 配列番号8の配列又はその断片の一つからなる単離ポリヌクレオチド。
- 配列番号8の配列のポリヌクレオチドであることを特徴とする請求項1に記載の単離ポリヌクレオチド。
- 配列番号9の配列のポリヌクレオチドであることを特徴とする請求項1に記載の単離ポリヌクレオチド。
- 配列番号4、配列番号5、配列番号11又は配列番号12の配列のポリヌクレオチド。
- 配列番号13の配列のポリヌクレオチド。
- 配列番号14の配列又はその断片の一つからなる単離ポリペプチド。
- 配列番号14の配列のポリペプチドであることを特徴とする請求項6に記載の単離ポリペプチド。
- 配列番号13の配列のポリヌクレオチドを含有する発現ベクター。
- 請求項8に記載の発現ベクターによって形質転換又は形質導入された宿主細胞。
- 配列番号9又は配列番号13のポリヌクレオチド配列又はその断片の一つによってコードされるか、あるいは配列番号9のポリヌクレオチド配列又はその断片の一つに相補的な配列によってコードされるタンパク質からなる単離ポリペプチド(但し、前記の単離ポリペプチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有するものである)の製造方法であって、次の連続する工程:すなわち、
(a) 適当な条件下で培養して、配列番号9又は配列番号13のポリヌクレオチド配列、配列番号9又は配列番号13のポリヌクレオチド配列に相補的な配列、又はその断片の一つからなる単離ポリヌクレオチドを含有する発現ベクターを用いて形質転換又は形質導入された宿主細胞の前記ポリペプチドを発現させる工程(但し、前記の単離ポリペプチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有するものである)及び
(b) 宿主細胞培養物から前記ポリペプチドを単離する工程
からなる、前記単離ペプチドの製造方法。 - 配列番号14の配列のタンパク質を特異的に結合するが配列番号10の配列のタンパク質を結合しない抗体又はその抗原結合断片。
- 医薬としての請求項1〜3のいずれか1項に記載のポリヌクレオチド。
- 医薬としての請求項6又は7に記載のポリペプチド。
- 有効成分として請求項1〜3のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドを含有してなる医薬組成物。
- 有効成分として請求項6又は7に記載のポリペプチドを含有してなる医薬組成物。
- 増殖性疾患を治療する医薬を製造するための請求項1〜3のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドの使用。
- 増殖性疾患を治療する医薬を製造するための請求項6又は7に記載のポリペプチドの使用。
- ヒトGHRHを結合することができ且つ細胞増殖を調節することができる化合物の同定方法であって、次の連続する工程:すなわち、
(a) 各候補化合物を、
− 配列番号9のポリヌクレオチド配列によってコードされるか又は配列番号9のポリヌクレオチド配列に相補的な配列によってコードされるタンパク質の断片、あるいは
− 配列番号13のポリヌクレオチド配列によってコードされるか又は配列番号13のポリヌクレオチド配列に相補的な配列によってコードされるタンパク質の断片、
からなる単離ポリペプチドと、前記候補化合物が前記ポリペプチドに結合することを可能にするのに十分な条件及び時間のもとで接触させる工程(但し、前記の単離ポリペプチドは、ヒトGHRHを結合し且つ細胞増殖の調節に関係するタンパク質に特有の少なくとも一つの免疫学的及び/又は生物学的活性を有するものである)、及び
(b) 前記ポリペプチドに対する各候補化合物の結合を検出し、候補化合物の中からヒトGHRHを結合することができ且つ細胞増殖を調節することができる化合物を同定する工程
からなるヒトGHRHを結合することができ且つ細胞増殖を調節することができる化合物の同定方法。
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