JP2003504051A - β−チューブリンをコードするDNAおよびその使用 - Google Patents
β−チューブリンをコードするDNAおよびその使用Info
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Abstract
(57)【要約】
本発明は、ストロンギルス科(Strongylidae)の線虫類由来のβ−チューブリンをコードするDNA、このDNAによってコードされているポリペプチド、当該線虫類における駆虫剤耐性の診断および寄生線虫種の同定のためのDNAの使用、ワクチンの成分としてのβ−チューブリンの使用、および新規な駆虫剤または抗生物質化合物の同定方法に関する。
Description
【0001】
(技術分野)
本発明は、ストロンギルス科(Strongylidae)の線虫類由来のβ
−チューブリンをコードするDNA、このDNAによってコードされているポリ
ペプチド、これらの線虫類の駆虫剤耐性の診断およびこれらの線虫類の種の同定
のためのDNAの使用、ワクチンの成分としてのβ−チューブリンの使用、およ
び新規な駆虫剤または抗生物質化合物の同定方法に関する。
−チューブリンをコードするDNA、このDNAによってコードされているポリ
ペプチド、これらの線虫類の駆虫剤耐性の診断およびこれらの線虫類の種の同定
のためのDNAの使用、ワクチンの成分としてのβ−チューブリンの使用、およ
び新規な駆虫剤または抗生物質化合物の同定方法に関する。
【0002】
寄生蠕虫類(蠕形動物(worm))は、ヒトおよび動物にとっての健康問題
であり、そしてかなりの経済的損失を引き起こす。1996年には、世界中の駆
虫剤に対する支出は20億USドル以上であった。現在使用されるもっとも重要
な駆虫剤は、それらの作用機構によって3グループに分けることができる: 1.環式アミジン類ピランテルおよびモランテルは、寄生虫の神経系に対する
コリン作用化合物として、イミダゾチアゾール類テトラミソールおよびレバミソ
ールとともに作用する。
であり、そしてかなりの経済的損失を引き起こす。1996年には、世界中の駆
虫剤に対する支出は20億USドル以上であった。現在使用されるもっとも重要
な駆虫剤は、それらの作用機構によって3グループに分けることができる: 1.環式アミジン類ピランテルおよびモランテルは、寄生虫の神経系に対する
コリン作用化合物として、イミダゾチアゾール類テトラミソールおよびレバミソ
ールとともに作用する。
【0003】
2.ベンズイミダゾール類は、微小管の重合のインヒビターであり、そしてチ
ューブリンの分解と、それに続く細胞内輸送および細胞分裂のような多くの細胞
機能の損失をもたらす。
ューブリンの分解と、それに続く細胞内輸送および細胞分裂のような多くの細胞
機能の損失をもたらす。
【0004】
3.大環状ラクトン類は、グルタミン作用塩素チャンネルに結合して開口し、
したがって、線虫類および節足動物の神経系のインヒビターとして作用する。
したがって、線虫類および節足動物の神経系のインヒビターとして作用する。
【0005】
微小管は、チューブリンサブユニットから構成される。チューブリンは、α−
およびβ−チューブリンからなり、そしてチューブリンと微小管の間の動的平衡
において存在する二量体タンパク質である。この平衡は、微小管インヒビターと
して計画された外因性物質によって影響を受けることができる。これらのインヒ
ビターのあるもの、例えばベンズイミダゾールは、チューブリンへのそれらの結
合によって作用し、その結果、それらは、成長する微小管へのこれらのサブユニ
ットの自己会合を防ぎ、一方、反対側の末端では微小管の分解が継続される。こ
のために、生存にとって重要である細胞内のプロセスにおいて機能障害が起こり
、そして最後には、細胞および完全な生物体の死が起きる(Lacey,E.(
1990)Mode of action of benzimidazole
s.Parasitology Today 6,112−115)。そのよう
な微小管インヒビターは合成的に生成されるか、または種々の生物によって生産
される種々の類の化合物を含む。
およびβ−チューブリンからなり、そしてチューブリンと微小管の間の動的平衡
において存在する二量体タンパク質である。この平衡は、微小管インヒビターと
して計画された外因性物質によって影響を受けることができる。これらのインヒ
ビターのあるもの、例えばベンズイミダゾールは、チューブリンへのそれらの結
合によって作用し、その結果、それらは、成長する微小管へのこれらのサブユニ
ットの自己会合を防ぎ、一方、反対側の末端では微小管の分解が継続される。こ
のために、生存にとって重要である細胞内のプロセスにおいて機能障害が起こり
、そして最後には、細胞および完全な生物体の死が起きる(Lacey,E.(
1990)Mode of action of benzimidazole
s.Parasitology Today 6,112−115)。そのよう
な微小管インヒビターは合成的に生成されるか、または種々の生物によって生産
される種々の類の化合物を含む。
【0006】
種々の生物由来のチューブリンに対する微小管インヒビターの結合は、結合の
親和力に関して大きな差を示す。それ故、駆虫剤オクスフェンダールおよびチア
ベンダールは、アスカリジア・ガリ(Ascaridia galli)由来の
チューブリンには高い親和力を示すが、ヒツジのような哺乳動物由来のチューブ
リンには弱い親和力しか示さない(Dawson et al(1983)Pu
rification and characterisation of t
ubulin from the parasitic nematode,A
scaridida galli,Molecular and Bioche
mical Parasitology 7,267−277)。ベンズイミダ
ゾールの選択毒性は、この選択的親和力によって説明することができる(Lac
ey,E.(1988)The role of the cytoskele
tal protein,tubulin,in the mode of a
ction and mechanism of drug resistan
ce to benzimidazole,International Jo
urnal for Parasitology 18,885−936)。
親和力に関して大きな差を示す。それ故、駆虫剤オクスフェンダールおよびチア
ベンダールは、アスカリジア・ガリ(Ascaridia galli)由来の
チューブリンには高い親和力を示すが、ヒツジのような哺乳動物由来のチューブ
リンには弱い親和力しか示さない(Dawson et al(1983)Pu
rification and characterisation of t
ubulin from the parasitic nematode,A
scaridida galli,Molecular and Bioche
mical Parasitology 7,267−277)。ベンズイミダ
ゾールの選択毒性は、この選択的親和力によって説明することができる(Lac
ey,E.(1988)The role of the cytoskele
tal protein,tubulin,in the mode of a
ction and mechanism of drug resistan
ce to benzimidazole,International Jo
urnal for Parasitology 18,885−936)。
【0007】
これらの駆虫剤の広範な使用は、特に家畜における全3種類(class)に
対する無視できない耐性問題をもたらした(Bauer et al.(199
4)Anthelmintic resistance in nematod
es of farm animals.A seminar organis
ed for the European Commission,Bruss
els,Belgium,8 to 9 November 1993,pp.
17−24)。もっとも汎用される駆虫剤の種類はベンズイミダゾールである。
ベンズイミダゾールに対する耐性は、ヒツジ、ウシ、ブタおよびウマの寄生虫の
場合において世界的に報告されている。ベンズイミダゾールは、線虫類、条虫類
および吸虫類に対する作用をもつ広スペクトルの駆虫剤である。ドイツの種馬飼
育場における研究は、症例の80%以上においてベンズイミダゾールに対する小
ストロンギルド(small strongylids)の耐性を示した(Ul
lrich et al.(1988)Benzimidazole resi
stance in small strongylids(Cyathost
ominae):distribution in horse stock
in Northrhine−Westphalia,Berliner Mu
enchner Tieraeztliche Wochenschrift 101 ,406−408)。
対する無視できない耐性問題をもたらした(Bauer et al.(199
4)Anthelmintic resistance in nematod
es of farm animals.A seminar organis
ed for the European Commission,Bruss
els,Belgium,8 to 9 November 1993,pp.
17−24)。もっとも汎用される駆虫剤の種類はベンズイミダゾールである。
ベンズイミダゾールに対する耐性は、ヒツジ、ウシ、ブタおよびウマの寄生虫の
場合において世界的に報告されている。ベンズイミダゾールは、線虫類、条虫類
および吸虫類に対する作用をもつ広スペクトルの駆虫剤である。ドイツの種馬飼
育場における研究は、症例の80%以上においてベンズイミダゾールに対する小
ストロンギルド(small strongylids)の耐性を示した(Ul
lrich et al.(1988)Benzimidazole resi
stance in small strongylids(Cyathost
ominae):distribution in horse stock
in Northrhine−Westphalia,Berliner Mu
enchner Tieraeztliche Wochenschrift 101 ,406−408)。
【0008】
したがって、駆虫剤による効果的な治療では、1頭のウマまたはウマの群れ内
で可能性のある寄生蠕虫類の耐性についての情報を得ることが非常に重要である
。小ストロンギルドの寄生蠕虫集団の可能性のある耐性を検査するために、寄生
虫の発生段階(卵、幼生)における駆虫剤の活性に基づく診断操作が、既に開発
されている(Coles et al.(1992)World Associ
ation for the Advancement of Veterin
ary Parasitology(W.A.A.V.P.)Methods
for the detection of anthelmintic re
sistance in nematodes of veterinary
importance,Veterinary Parasitology、4 4 ,35−44)。「幼生発生アッセイ」(LDA)は、使用される駆虫剤濃度
の関数として、非寄生性の第1幼生段階における駆虫剤の阻害効果を記述する。
同様にして、第2のアプローチ、「卵孵化アッセイ」(EHA)が、使用される
駆虫剤濃度の関数として、幼生の孵化に及ぼす駆虫剤の阻害作用を使用する。両
アプローチの欠点は、結果の低い再現性にある。さらに、両アプローチは時間浪
費と労力集中を要する。
で可能性のある寄生蠕虫類の耐性についての情報を得ることが非常に重要である
。小ストロンギルドの寄生蠕虫集団の可能性のある耐性を検査するために、寄生
虫の発生段階(卵、幼生)における駆虫剤の活性に基づく診断操作が、既に開発
されている(Coles et al.(1992)World Associ
ation for the Advancement of Veterin
ary Parasitology(W.A.A.V.P.)Methods
for the detection of anthelmintic re
sistance in nematodes of veterinary
importance,Veterinary Parasitology、4 4 ,35−44)。「幼生発生アッセイ」(LDA)は、使用される駆虫剤濃度
の関数として、非寄生性の第1幼生段階における駆虫剤の阻害効果を記述する。
同様にして、第2のアプローチ、「卵孵化アッセイ」(EHA)が、使用される
駆虫剤濃度の関数として、幼生の孵化に及ぼす駆虫剤の阻害作用を使用する。両
アプローチの欠点は、結果の低い再現性にある。さらに、両アプローチは時間浪
費と労力集中を要する。
【0009】
さらに両アプローチの感度は低い。耐性の存在は、集団の25%以上が耐性で
ある場合にのみ検出される(Roos et al.(1995)New ge
netic and practical impications of s
election for anthelmintic resistance
in parasitic nematodes,Parasitology
Today 11,148−150)。
ある場合にのみ検出される(Roos et al.(1995)New ge
netic and practical impications of s
election for anthelmintic resistance
in parasitic nematodes,Parasitology
Today 11,148−150)。
【0010】
したがって、敏感で、急速な、そして再現性のある診断操作に対する緊急の要
求が存在する。ヒツジの寄生虫、ヘモンカス・コントルタス(Haemonch us contortus )およびテラドルサギア・サーカムシンクタ(Tel adorsagia circumcincta )では、PCR技術に基づく操
作が記述されている。これは、β−チューブリンイソタイプ1遺伝子のコドン2
00における少なくとも1つの点突然変異に基づく(Elard et al.
(1999)PCR diagnosis of benzimidazole
−susceptibility or −resistance in na
tural populations of the small rumin
ant parasite、Teladorsagia circumcinc ta ,Veterinary Parasitology 80,231−23
7)。コドン200における点突然変異は、フェニルアラニンのチロシンによる
アミノ酸置換をもたらし、そして変異タンパク質のベンズイミダゾール耐性と相
関する(Kwa et al.(1995)β−tubulin genes
from parasitic nematode Haemonchus c ontortus modulate drug resistance in
Caenorhabditis elegans,Journal of M
olecular Biology 246,500−510)。
求が存在する。ヒツジの寄生虫、ヘモンカス・コントルタス(Haemonch us contortus )およびテラドルサギア・サーカムシンクタ(Tel adorsagia circumcincta )では、PCR技術に基づく操
作が記述されている。これは、β−チューブリンイソタイプ1遺伝子のコドン2
00における少なくとも1つの点突然変異に基づく(Elard et al.
(1999)PCR diagnosis of benzimidazole
−susceptibility or −resistance in na
tural populations of the small rumin
ant parasite、Teladorsagia circumcinc ta ,Veterinary Parasitology 80,231−23
7)。コドン200における点突然変異は、フェニルアラニンのチロシンによる
アミノ酸置換をもたらし、そして変異タンパク質のベンズイミダゾール耐性と相
関する(Kwa et al.(1995)β−tubulin genes
from parasitic nematode Haemonchus c ontortus modulate drug resistance in
Caenorhabditis elegans,Journal of M
olecular Biology 246,500−510)。
【0011】
ヘモンカス・コントルタスにおける研究から、チューブリンをコードする線虫
類の配列が種特異的であることが知られている(WO92/03549)。
類の配列が種特異的であることが知られている(WO92/03549)。
【0012】
ウマの小ストロンギルドの種々の種は、それらの疫学的頻度において異なる。
もっとも重要であり、そして世界的にもっとも高頻度に見いだされる種は、シリ
コシクルス・ナッサタス(Cylicocyclus nassatus)、シ
アトストマム・コロナタム(Cyathostomum coronatum)
およびシアトストマム・カチナタム(Cyathostomum catina tum )を含む。ベンズイミダゾールに対するこれらの種の耐性は、種々の国に
おいて、なかでもドイツにおいてもまた記述された(Burger,H.−J.
and Bauer,C.(1987)Efficacy of four a
nthelmintics against benzimidazole−r
esistance cyathosomes of horse,Veter
inary Record 120,293−296)。
もっとも重要であり、そして世界的にもっとも高頻度に見いだされる種は、シリ
コシクルス・ナッサタス(Cylicocyclus nassatus)、シ
アトストマム・コロナタム(Cyathostomum coronatum)
およびシアトストマム・カチナタム(Cyathostomum catina tum )を含む。ベンズイミダゾールに対するこれらの種の耐性は、種々の国に
おいて、なかでもドイツにおいてもまた記述された(Burger,H.−J.
and Bauer,C.(1987)Efficacy of four a
nthelmintics against benzimidazole−r
esistance cyathosomes of horse,Veter
inary Record 120,293−296)。
【0013】
本発明による小ストロンギルドの種由来のβ−チューブリンcDNAの核酸配
列は95%を超える同一性を有した。しかしながら、ヒツジ寄生虫の既知の上記
β−チューブリン配列との同一性は、わずかに75.4−82.6%である。
列は95%を超える同一性を有した。しかしながら、ヒツジ寄生虫の既知の上記
β−チューブリン配列との同一性は、わずかに75.4−82.6%である。
【0014】
推定アミノ酸配列は、本発明による配列内で非常に類似している。また、これ
は、ヒツジ寄生虫の推定β−チューブリンアミノ酸配列についても事実である。
ここでの同一性は95〜99.8%である。非常にまれな位置においてのみアミ
ノ酸置換が起きる。ここで強調されるのはコドン200であり、この位置でフェ
ニルアラニンからチロシンへの変化が起きる。
は、ヒツジ寄生虫の推定β−チューブリンアミノ酸配列についても事実である。
ここでの同一性は95〜99.8%である。非常にまれな位置においてのみアミ
ノ酸置換が起きる。ここで強調されるのはコドン200であり、この位置でフェ
ニルアラニンからチロシンへの変化が起きる。
【0015】
しかしながら、従来公表された種々の蠕虫種からの非コーディングβ−チュー
ブリン配列は有意な同一性を示さない。したがって、ここに提示される本出願の
小ストロンギルドの種々の種の、コーディング配列のみならず非コーディング配
列の一部もまた高い同一性を有することは驚くべきことである。
ブリン配列は有意な同一性を示さない。したがって、ここに提示される本出願の
小ストロンギルドの種々の種の、コーディング配列のみならず非コーディング配
列の一部もまた高い同一性を有することは驚くべきことである。
【0016】
したがってまた、これらの領域は、互いに小ストロンギルドの種々の種と他の
線虫種を区別するのに適している。これらのイントロン領域由来のPCRプライ
マーは、また他の蠕虫生物体からの遺伝材料を含有するサンプルにおいて、小ス
トロンギルドの特異的検出のために使用することができる。
線虫種を区別するのに適している。これらのイントロン領域由来のPCRプライ
マーは、また他の蠕虫生物体からの遺伝材料を含有するサンプルにおいて、小ス
トロンギルドの特異的検出のために使用することができる。
【0017】
線虫類由来のβ−チューブリンもしくはその一部は、予防的な、免疫学的可能
性をもつことが知られている(Bughio et al.(1993)Cha
racterisation and biological activit
ies of anti−Brugia pahangi tubulin m
onoclonal antibodies,International J
ournal for Parasitology,7,913−924)。上
記DNAによってコードされている小ストロンギルドのβ−チューブリンは、モ
ノクローナル抗体が、まさにβ−チューブリンに対して使用できるように、ワク
チンとして使用することができる。
性をもつことが知られている(Bughio et al.(1993)Cha
racterisation and biological activit
ies of anti−Brugia pahangi tubulin m
onoclonal antibodies,International J
ournal for Parasitology,7,913−924)。上
記DNAによってコードされている小ストロンギルドのβ−チューブリンは、モ
ノクローナル抗体が、まさにβ−チューブリンに対して使用できるように、ワク
チンとして使用することができる。
【0018】
チューブリンもしくはそのサブユニットの相互作用のインヒビター、例えばベ
ンズイミダゾール類、コルチジンおよびタキソールは、ヒト、動物もしくは植物
病に対向される一連の治療剤の重要な先導構造物である。これらの化合物の標的
としてのチューブリンの重要性は、これらの病気の防除のための新しい活性化合
物探求のそれの可能性にまで及び、そしてそれの可能性を明白に示している。
ンズイミダゾール類、コルチジンおよびタキソールは、ヒト、動物もしくは植物
病に対向される一連の治療剤の重要な先導構造物である。これらの化合物の標的
としてのチューブリンの重要性は、これらの病気の防除のための新しい活性化合
物探求のそれの可能性にまで及び、そしてそれの可能性を明白に示している。
【0019】
本発明は、ストロンギルス科、特に亜科シアトストミナエ(Cyathost
ominae)の線虫類由来のβ−チューブリンをコードするDNAまたはこの
DNAのフラグメントに関する。β−チューブリンDNAは、この場合には、ゲ
ノムDNAもしくはcDNAであってもよい。本発明が関係するDNA配列は、
目円虫類(Strongylida)、特に亜科シアトストミナエの寄生線虫類
のチューブリン遺伝子ファミリーの新メンバーと見なすことができる。非常に特
別には、本発明は、属シアトストマムおよびシリコシクルスの寄生線虫類由来の
β−チューブリンをコードするDNA配列に関する。
ominae)の線虫類由来のβ−チューブリンをコードするDNAまたはこの
DNAのフラグメントに関する。β−チューブリンDNAは、この場合には、ゲ
ノムDNAもしくはcDNAであってもよい。本発明が関係するDNA配列は、
目円虫類(Strongylida)、特に亜科シアトストミナエの寄生線虫類
のチューブリン遺伝子ファミリーの新メンバーと見なすことができる。非常に特
別には、本発明は、属シアトストマムおよびシリコシクルスの寄生線虫類由来の
β−チューブリンをコードするDNA配列に関する。
【0020】
同様に本発明は、配列番号:2,4,6,8もしくは10において示されるよ
うなアミノ酸配列の1つをコードするポリヌクレオチドに対して85%以上の同
一性をもつDNA配列に関する。
うなアミノ酸配列の1つをコードするポリヌクレオチドに対して85%以上の同
一性をもつDNA配列に関する。
【0021】
同様に本発明は、配列番号:2,4,6,8もしくは10において示されるよ
うなアミノ酸配列の1つをコードするポリヌクレオチドに対して95%以上の同
一性をもつ好適なDNA配列に関する。
うなアミノ酸配列の1つをコードするポリヌクレオチドに対して95%以上の同
一性をもつ好適なDNA配列に関する。
【0022】
本発明は、特に、属シリコシクルスおよびシアトストマムの寄生線虫類に由来
するβ−チューブリンをコードするDNA配列、非常に特別には、種シリコシク
ルス・ナッサタスの寄生線虫類に由来するそれらの配列、好ましくは配列番号:
3,5,7,9もしくは11に示されるようなDNAか、またはシアトストマム
・コロナタムに由来するそれらの配列、好ましくは配列番号:1によるDNAに
関する。
するβ−チューブリンをコードするDNA配列、非常に特別には、種シリコシク
ルス・ナッサタスの寄生線虫類に由来するそれらの配列、好ましくは配列番号:
3,5,7,9もしくは11に示されるようなDNAか、またはシアトストマム
・コロナタムに由来するそれらの配列、好ましくは配列番号:1によるDNAに
関する。
【0023】
同様に本発明は、これらの配列に対して、コドン200において少なくとも1
つの点突然変異または1つのヌクレオチド置換をもつ、上記DNA配列に関する
。これらの点突然変異は、このDNAによってコードされているアミノ酸配列に
おける変化、例えばチロシンによるアミノ酸フェニルアラニンの置換をもたらし
、そしてベンズイミダゾールに対する適当な変異をもつチューブリンの耐性に相
関する。
つの点突然変異または1つのヌクレオチド置換をもつ、上記DNA配列に関する
。これらの点突然変異は、このDNAによってコードされているアミノ酸配列に
おける変化、例えばチロシンによるアミノ酸フェニルアラニンの置換をもたらし
、そしてベンズイミダゾールに対する適当な変異をもつチューブリンの耐性に相
関する。
【0024】
同様に本発明は、上記DNAまたはこのDNAのフラグメントに相補的である
DNA配列、およびこれらのDNA配列のフラグメントに関する。これらのDN
A配列もしくはこれらのフラグメントは、上記のまたは配列番号:1,3,5,
7,9もしくは11の下に記されるDNA配列またはそれらに85%同一である
配列、好ましくは95%同一である配列から誘導されるオリゴヌクレオチド、お
よびそれらに相補的な鎖から誘導され、これらにハイブリダイズできるオリゴヌ
クレオチドを含む。
DNA配列、およびこれらのDNA配列のフラグメントに関する。これらのDN
A配列もしくはこれらのフラグメントは、上記のまたは配列番号:1,3,5,
7,9もしくは11の下に記されるDNA配列またはそれらに85%同一である
配列、好ましくは95%同一である配列から誘導されるオリゴヌクレオチド、お
よびそれらに相補的な鎖から誘導され、これらにハイブリダイズできるオリゴヌ
クレオチドを含む。
【0025】
本発明は、この場合、好ましくは、上記DNA配列に、好ましくはβ−チュー
ブリン遺伝子の非コーディング配列部分の領域においてハイブリダイズする、配
列番号:12〜配列番号:51において示されるような配列からなるか、または
配列の1つを含むオリゴヌクレオチドに関する。
ブリン遺伝子の非コーディング配列部分の領域においてハイブリダイズする、配
列番号:12〜配列番号:51において示されるような配列からなるか、または
配列の1つを含むオリゴヌクレオチドに関する。
【0026】
同様に本発明は、好ましくは、上記配列のコーディング領域にハイブリダイズ
する、配列番号:12〜配列番号:51において示されるような配列からなるか
、または配列の1つを含むオリゴヌクレオチドに関する。
する、配列番号:12〜配列番号:51において示されるような配列からなるか
、または配列の1つを含むオリゴヌクレオチドに関する。
【0027】
同様に本発明は、上記DNAまたはこのDNAのフラグメントに相補的である
RNA配列、およびこれらのRNA配列のフラグメントに関する。これらのRN
A配列もしくはこれらのフラグメントは、上記のまたは配列番号:1,3,5,
7,9もしくは11の下に記されるDNA配列、それらに相補的な配列またはそ
れらに85%同一、好ましくは95%同一なDNA配列の1つの領域に対応し、
そしてこれらにハイブリダイズできるリボオリゴヌクレオチドを含む。
RNA配列、およびこれらのRNA配列のフラグメントに関する。これらのRN
A配列もしくはこれらのフラグメントは、上記のまたは配列番号:1,3,5,
7,9もしくは11の下に記されるDNA配列、それらに相補的な配列またはそ
れらに85%同一、好ましくは95%同一なDNA配列の1つの領域に対応し、
そしてこれらにハイブリダイズできるリボオリゴヌクレオチドを含む。
【0028】
同様に本発明は、上記DNA配列の1つを含有する発現構築物、およびDNA
の発現を可能にするそれに結合されたDNA配列に関する。これらは、例えば、
構成的もしくは誘導的発現のための少なくとも1つのプロモーターあるいはまた
エンハンサーを含む。E.コリ(E.coli)における発現に適当なプロモー
ターは、天然のハイブリッドもしくはバクテリオファージプロモーター、好まし
くはλ−ファージ、hsp、ompまたは例えば、WO98/5625、ドイツ
特許第3430683号もしくは欧州特許第0173149号に挙げられるよう
な合成プロモーターの群のプロモーターである。
の発現を可能にするそれに結合されたDNA配列に関する。これらは、例えば、
構成的もしくは誘導的発現のための少なくとも1つのプロモーターあるいはまた
エンハンサーを含む。E.コリ(E.coli)における発現に適当なプロモー
ターは、天然のハイブリッドもしくはバクテリオファージプロモーター、好まし
くはλ−ファージ、hsp、ompまたは例えば、WO98/5625、ドイツ
特許第3430683号もしくは欧州特許第0173149号に挙げられるよう
な合成プロモーターの群のプロモーターである。
【0029】
同様に本発明は、上記DNA配列の1つを含有し、そして宿主細胞において本
発明によるβ−チューブリンもしくはそのフラグメントの発現を可能にするベク
ターに関する。
発明によるβ−チューブリンもしくはそのフラグメントの発現を可能にするベク
ターに関する。
【0030】
同様に本発明は、上記DNA、上記のような発現構築物、またはベクターを含
有し、そしてβ−チューブリンもしくはそのフラグメントの発現を可能にする宿
主細胞に関する。
有し、そしてβ−チューブリンもしくはそのフラグメントの発現を可能にする宿
主細胞に関する。
【0031】
同様に本発明は、上記DNA配列またはこれらのDNA配列のフラグメントの
1つによってコードされているポリペプチド、およびこれらのポリペプチドのフ
ラグメントに関する。
1つによってコードされているポリペプチド、およびこれらのポリペプチドのフ
ラグメントに関する。
【0032】
本発明は、この場合好ましくは、配列番号:1,3,5,7,9もしくは11
を含むDNAによって、これらの配列に85%、好ましくは95%の同一性をも
つDNA配列、またはこのDNAのフラグメントのDNA配列によってコードさ
れているポリペプチドに関する。
を含むDNAによって、これらの配列に85%、好ましくは95%の同一性をも
つDNA配列、またはこのDNAのフラグメントのDNA配列によってコードさ
れているポリペプチドに関する。
【0033】
また本発明は、上記DNA配列によってコードされ、上記のようにコドン20
0において少なくとも1つの点突然変異を含有し、そしてベンズイミダゾールに
耐性を示すポリペプチド、およびこれらのポリペプチドのフラグメントに関する
。
0において少なくとも1つの点突然変異を含有し、そしてベンズイミダゾールに
耐性を示すポリペプチド、およびこれらのポリペプチドのフラグメントに関する
。
【0034】
本発明は、この場合、非常に特に好ましくは、配列番号:2,4,6,8もし
くは10において記述されたアミノ酸配列またはそのフラグメントの1つを含有
するポリペプチドに関する。
くは10において記述されたアミノ酸配列またはそのフラグメントの1つを含有
するポリペプチドに関する。
【0035】
本発明は、この場合、ポリペプチド、特に精製されたポリペプチドまたは組み
換え技術によって作成されたポリペプチドに関する。
換え技術によって作成されたポリペプチドに関する。
【0036】
本発明は、完全長のポリペプチドおよびまたこれらのポリペプチドの対応する
フラグメント、例えばある種のモチーフもしくはドメインに関する。これらのフ
ラグメントは、種々の長さをもち、そして例えば5,10,25,50,100
,150,200,250もしくは300アミノ酸を含有してもよい。
フラグメント、例えばある種のモチーフもしくはドメインに関する。これらのフ
ラグメントは、種々の長さをもち、そして例えば5,10,25,50,100
,150,200,250もしくは300アミノ酸を含有してもよい。
【0037】
同様に本発明は、上記のようなポリペプチドを含有する融合タンパク質に関す
る。融合タンパク質は、この場合、β−チューブリンに関係しないさらなるポリ
ペプチド成分(例えば、LexA,B42,グルタチオンS−トランスフェラー
ゼ、Hisタグ、アルカリホスファターゼのような酵素活性をもつポリペプチド
またはエピトープタグ)を含有してもよい。
る。融合タンパク質は、この場合、β−チューブリンに関係しないさらなるポリ
ペプチド成分(例えば、LexA,B42,グルタチオンS−トランスフェラー
ゼ、Hisタグ、アルカリホスファターゼのような酵素活性をもつポリペプチド
またはエピトープタグ)を含有してもよい。
【0038】
また本発明は、適当な原核または真核生物発現系における上記ポリペプチドの
製造方法に関する。発現は、この場合、各場合に対応する細胞系または対応する
宿主細胞において上記のように永続的または一時的に実施することができる。適
当な原核生物発現系は、既知の宿主−ベクター系、例えば細菌(例えば、ストレ
プトミセス(Streptomyces)、バチルス・ズブチリス(Bacil lus sutilis )、サルモネラ・チフィムリウム(Salmonell a typhimurium )、セラチア・マルセッセンス(Serratia marcescens )および特にE.コリ)である。
製造方法に関する。発現は、この場合、各場合に対応する細胞系または対応する
宿主細胞において上記のように永続的または一時的に実施することができる。適
当な原核生物発現系は、既知の宿主−ベクター系、例えば細菌(例えば、ストレ
プトミセス(Streptomyces)、バチルス・ズブチリス(Bacil lus sutilis )、サルモネラ・チフィムリウム(Salmonell a typhimurium )、セラチア・マルセッセンス(Serratia marcescens )および特にE.コリ)である。
【0039】
真核生物系における発現は、好ましくは、バキュロウイルス系、特に翻訳後修
飾の導入を可能にする系において実施される。
飾の導入を可能にする系において実施される。
【0040】
同様に本発明は、ストロンギルス科、好ましくは亜科シアトストミナエ、特に
好ましくは属シアトストマムおよびシリコシクルス、非常に特に好ましくは種シ
アトストマム・コロナタムおよびシリコシクルス・ナッサタスの線虫類由来のD
NAの検出のための上記DNAの使用に関する。本発明は、この場合、β−チュ
ーブリンをコードするDNAまたはそれの相補鎖に相補的であり、そしてこのD
NAにハイブリダイズできる上記オリゴヌクレオチドに関する。好ましくは、こ
れらのオリゴヌクレオチドは、イントロン領域、すなわち非コーディングDNA
配列にハイブリダイズする。
好ましくは属シアトストマムおよびシリコシクルス、非常に特に好ましくは種シ
アトストマム・コロナタムおよびシリコシクルス・ナッサタスの線虫類由来のD
NAの検出のための上記DNAの使用に関する。本発明は、この場合、β−チュ
ーブリンをコードするDNAまたはそれの相補鎖に相補的であり、そしてこのD
NAにハイブリダイズできる上記オリゴヌクレオチドに関する。好ましくは、こ
れらのオリゴヌクレオチドは、イントロン領域、すなわち非コーディングDNA
配列にハイブリダイズする。
【0041】
本発明は、
a)ノザンもしくはサザンブロットアッセイにおけるサンプル、
b)当該線虫類のDNAがプライマーおよびPCR技術を用いて特異的に同定お
よび増幅される、上記線虫類の検出のための診断操作におけるPCRプライマー
、としてのこれらのオリゴヌクレオチドまたはそれらの一部の使用に関する。
よび増幅される、上記線虫類の検出のための診断操作におけるPCRプライマー
、としてのこれらのオリゴヌクレオチドまたはそれらの一部の使用に関する。
【0042】
本発明は、この場合好ましくは、配列番号:12〜配列番号:51において示
される配列からなるか、または配列の1つを含有するオリゴヌクレオチドに関す
る。
される配列からなるか、または配列の1つを含有するオリゴヌクレオチドに関す
る。
【0043】
同様に本発明は、ベンズイミダゾールに耐性であるβ−チューブリンまたはそ
のフラグメントをコードする、ストロンギルス科、好ましくは亜科シアトストミ
ナエ、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ま
しくは種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫
類由来のDNAの検出のための上記DNAの使用に関する。本発明は、この場合
、ベンズイミダゾールに対する耐性をもつβ−チューブリンをコードするDNA
またはこのDNAの相補鎖に相補的であり、そしてこのDNAに特異的にハイブ
リダイズできる上記オリゴヌクレオチドに関する。
のフラグメントをコードする、ストロンギルス科、好ましくは亜科シアトストミ
ナエ、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ま
しくは種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫
類由来のDNAの検出のための上記DNAの使用に関する。本発明は、この場合
、ベンズイミダゾールに対する耐性をもつβ−チューブリンをコードするDNA
またはこのDNAの相補鎖に相補的であり、そしてこのDNAに特異的にハイブ
リダイズできる上記オリゴヌクレオチドに関する。
【0044】
また本発明は、
a)ノザンもしくはサザンブロットアッセイにおけるサンプル、
b)当該線虫類のDNAがプライマーおよびPCR技術を用いて特異的に同定お
よび増幅される、ベンズイミダゾールに対する耐性をもつ上記線虫類の検出のた
めの診断操作におけるPCRプライマー、 としてのこれらのオリゴヌクレオチドまたはそれらの一部の使用に関する。
よび増幅される、ベンズイミダゾールに対する耐性をもつ上記線虫類の検出のた
めの診断操作におけるPCRプライマー、 としてのこれらのオリゴヌクレオチドまたはそれらの一部の使用に関する。
【0045】
本発明は、この場合好ましくは、配列番号:12〜配列番号:51において示
された配列からなるか、または配列の1つを含有するオリゴヌクレオチドに関す
る。
された配列からなるか、または配列の1つを含有するオリゴヌクレオチドに関す
る。
【0046】
また本発明は、ストロンギルス科、好ましくは亜科シアトストミナエ、特に好
ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ましくは種シリ
コシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類の検出方法
であって、上記オリゴヌクレオチドが、前記生物に由来し、そしてPCR技術を
用いて増幅できるDNA配列に特異的にハイブリダイズする方法に関する。ハイ
ブリダイゼーションは、好ましくは、β−チューブリン遺伝子の非コーディング
領域(イントロン)において実施される。
ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ましくは種シリ
コシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類の検出方法
であって、上記オリゴヌクレオチドが、前記生物に由来し、そしてPCR技術を
用いて増幅できるDNA配列に特異的にハイブリダイズする方法に関する。ハイ
ブリダイゼーションは、好ましくは、β−チューブリン遺伝子の非コーディング
領域(イントロン)において実施される。
【0047】
上記のような生物の検出は、例えば、
a)β−チューブリンをコードする上記DNAまたはそれの相補鎖、またはそれ
の5’−もしくは3’−隣接領域にハイブリダイズできるオリゴヌクレオチドプ
ローブもしくはプライマーを取得し、 b)オリゴヌクレオチドプローブもしくはプライマーを、適当に作成されたプロ
ーブ含有DNAと接触させ、 c)オリゴヌクレオチドもしくはプライマーのハイブリダイゼーションを検出し
(例えば、ポリメラーゼ連鎖反応を用いて)、 d)β−チューブリン遺伝子の検出された配列を配列決定し、そして e)先に記述された本発明によるDNA配列、好ましくは配列番号:1,3,5
,7,9もしくは11に示されたDNA配列と、この配列を比較すること、 によって実施することができる。
の5’−もしくは3’−隣接領域にハイブリダイズできるオリゴヌクレオチドプ
ローブもしくはプライマーを取得し、 b)オリゴヌクレオチドプローブもしくはプライマーを、適当に作成されたプロ
ーブ含有DNAと接触させ、 c)オリゴヌクレオチドもしくはプライマーのハイブリダイゼーションを検出し
(例えば、ポリメラーゼ連鎖反応を用いて)、 d)β−チューブリン遺伝子の検出された配列を配列決定し、そして e)先に記述された本発明によるDNA配列、好ましくは配列番号:1,3,5
,7,9もしくは11に示されたDNA配列と、この配列を比較すること、 によって実施することができる。
【0048】
また本発明は、ベンズイミダゾールに対して耐性である、ストロンギルス科、
好ましくは亜科シアトストミナエ、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシア
トストマム、非常に特に好ましくは種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアト
ストマム・コロナタムの線虫類の検出方法であって、上記オリゴヌクレオチドが
、前記生物に由来し、そしてPCR技術を用いて増幅できるDNA配列に特異的
にハイブリダイズする方法に関する。ハイブリダイゼーションは、好ましくは、
β−チューブリン遺伝子の非コーディング領域(イントロン)において実施され
る。
好ましくは亜科シアトストミナエ、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシア
トストマム、非常に特に好ましくは種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアト
ストマム・コロナタムの線虫類の検出方法であって、上記オリゴヌクレオチドが
、前記生物に由来し、そしてPCR技術を用いて増幅できるDNA配列に特異的
にハイブリダイズする方法に関する。ハイブリダイゼーションは、好ましくは、
β−チューブリン遺伝子の非コーディング領域(イントロン)において実施され
る。
【0049】
上記のような生物の検出は、例えば、
a)β−チューブリンをコードする上記DNAまたはそれの相補鎖、またはそれ
の5’−もしくは3’−隣接領域にハイブリダイズできるオリゴヌクレオチドプ
ローブもしくはプライマーを取得し、 b)オリゴヌクレオチドプローブもしくはプライマーを、適当に作成されたプロ
ーブ含有DNAと接触させ、 c)オリゴヌクレオチドもしくはプライマーのハイブリダイゼーションを検出し
(例えば、ポリメラーゼ連鎖反応を用いて)、 d)β−チューブリン遺伝子の検出された配列を配列決定し、そして e)ベンズイミダゾールに対してこれらの配列によってコードされているβ−チ
ューブリンの耐性をもたらす、コドン200において少なくとも1つの点突然変
異をもつ、先に記述された本発明によるDNA配列、好ましくは配列番号:1,
3,5,7,9もしくは11に示されたDNA配列とこの配列を比較すること、
によって実施することができる。
の5’−もしくは3’−隣接領域にハイブリダイズできるオリゴヌクレオチドプ
ローブもしくはプライマーを取得し、 b)オリゴヌクレオチドプローブもしくはプライマーを、適当に作成されたプロ
ーブ含有DNAと接触させ、 c)オリゴヌクレオチドもしくはプライマーのハイブリダイゼーションを検出し
(例えば、ポリメラーゼ連鎖反応を用いて)、 d)β−チューブリン遺伝子の検出された配列を配列決定し、そして e)ベンズイミダゾールに対してこれらの配列によってコードされているβ−チ
ューブリンの耐性をもたらす、コドン200において少なくとも1つの点突然変
異をもつ、先に記述された本発明によるDNA配列、好ましくは配列番号:1,
3,5,7,9もしくは11に示されたDNA配列とこの配列を比較すること、
によって実施することができる。
【0050】
同様に本発明は、ストロンギルス科、好ましくは亜科シアトストミナエ、特に
好ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ましくは種シ
リコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類の検出お
よび同定のための診断試験キットであって、なかでも、上記オリゴヌクレオチド
を利用可能にし、前記種の検出方法において使用することができるキットに関す
る。同様に本発明は、配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に示された配
列、それに相補的な配列、コドン200において少なくとも1つの点突然変異を
もつ配列、またはこれらの配列のフラグメントに特異的にハイブリダイズするオ
リゴヌクレオチドを利用可能にさせる。この場合、配列番号:12〜配列番号:
51において示された配列からなるか、またはこの配列を含有するオリゴヌクレ
オチドが特に好適である。
好ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ましくは種シ
リコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類の検出お
よび同定のための診断試験キットであって、なかでも、上記オリゴヌクレオチド
を利用可能にし、前記種の検出方法において使用することができるキットに関す
る。同様に本発明は、配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に示された配
列、それに相補的な配列、コドン200において少なくとも1つの点突然変異を
もつ配列、またはこれらの配列のフラグメントに特異的にハイブリダイズするオ
リゴヌクレオチドを利用可能にさせる。この場合、配列番号:12〜配列番号:
51において示された配列からなるか、またはこの配列を含有するオリゴヌクレ
オチドが特に好適である。
【0051】
同様に本発明は、ベンズイミダゾールに対する耐性をもつ、ストロンギルス科
、好ましくは亜科シアトストミナエ、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシ
アトストマム、非常に特に好ましくは種シリコシクルス・ナッサタスおよびシア
トストマム・コロナタムの線虫類の検出のための診断試験キットであって、なか
でも、上記オリゴヌクレオチドを利用可能にし、挙げられた種の検出方法におい
て使用することができるキットに関する。同様に本発明は、配列番号:1,3,
5,7,9もしくは11に示された配列、それに相補的な配列、コドン200に
おいて少なくとも1つの点突然変異をもつ配列、またはこれらの配列のフラグメ
ントに特異的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドを利用可能にさせる。こ
の場合、配列番号:12〜配列番号:51において示された配列からなるか、ま
たはこの配列を含有するオリゴヌクレオチドが特に好適である。
、好ましくは亜科シアトストミナエ、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシ
アトストマム、非常に特に好ましくは種シリコシクルス・ナッサタスおよびシア
トストマム・コロナタムの線虫類の検出のための診断試験キットであって、なか
でも、上記オリゴヌクレオチドを利用可能にし、挙げられた種の検出方法におい
て使用することができるキットに関する。同様に本発明は、配列番号:1,3,
5,7,9もしくは11に示された配列、それに相補的な配列、コドン200に
おいて少なくとも1つの点突然変異をもつ配列、またはこれらの配列のフラグメ
ントに特異的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドを利用可能にさせる。こ
の場合、配列番号:12〜配列番号:51において示された配列からなるか、ま
たはこの配列を含有するオリゴヌクレオチドが特に好適である。
【0052】
同様に本発明は、このキットにおいて利用可能にされたオリゴヌクレオチドが
検出可能なマーカーとともに提供される、上記のような診断試験キットに関する
。そのような検出可能なマーカーは、なかでも、酵素、酵素基質、補講素、酵素
阻害剤、蛍光マーカー、発色団、発光マーカーおよびラジオアイソトープを含ん
でもよい。
検出可能なマーカーとともに提供される、上記のような診断試験キットに関する
。そのような検出可能なマーカーは、なかでも、酵素、酵素基質、補講素、酵素
阻害剤、蛍光マーカー、発色団、発光マーカーおよびラジオアイソトープを含ん
でもよい。
【0053】
同様に本発明は、ストロンギルス科、好ましくは亜科シアトストミナエ、特に
好ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ましくは種シ
リコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類由来のβ
−チューブリンのエピトープと特異的に反応する抗体に関する。
好ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ましくは種シ
リコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類由来のβ
−チューブリンのエピトープと特異的に反応する抗体に関する。
【0054】
同様に本発明は、特に、ストロンギルス科、好ましくは亜科シアトストミナエ
、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ましく
は種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類由
来のβ−チューブリンのエピトープと特異的に反応するモノクローナル抗体に関
する。
、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシアトストマム、非常に特に好ましく
は種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類由
来のβ−チューブリンのエピトープと特異的に反応するモノクローナル抗体に関
する。
【0055】
同様に本発明は、殺線虫剤としての上記抗体の使用に関する。
【0056】
また本発明は、少なくとも1つの上記β−チューブリンポリペプチドまたはそ
れらのフラグメントを含有するワクチンの製造のための、ストロンギルス科、好
ましくは亜科シアトストミナエ、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシアト
ストマム、非常に特に好ましくは種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアトス
トマム・コロナタムの線虫類由来の上記β−チューブリンポリペプチドまたはそ
れらのフラグメントの使用に関する。ワクチンは、この場合、上記β−チューブ
リンに特異的である免疫応答を生成することができる。
れらのフラグメントを含有するワクチンの製造のための、ストロンギルス科、好
ましくは亜科シアトストミナエ、特に好ましくは属シリコシクルスおよびシアト
ストマム、非常に特に好ましくは種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアトス
トマム・コロナタムの線虫類由来の上記β−チューブリンポリペプチドまたはそ
れらのフラグメントの使用に関する。ワクチンは、この場合、上記β−チューブ
リンに特異的である免疫応答を生成することができる。
【0057】
好適な実施態様では、ワクチンは、抗原決定基、例えば、配列番号:2,4,
6,8もしくは10に示されるアミノ酸配列をもつポリペプチドまたは上記DN
Aまたはそのフラグメントの1つによってコードされているポリペプチドの個々
の決定基を含有する。
6,8もしくは10に示されるアミノ酸配列をもつポリペプチドまたは上記DN
Aまたはそのフラグメントの1つによってコードされているポリペプチドの個々
の決定基を含有する。
【0058】
同様に本発明は、少なくとも1つの本発明による上記β−チューブリンポリペ
プチドまたはそれらのフラグメント、または少なくとも1つの上記抗体からなる
、哺乳動物の免疫化のための免疫原性組成物の製造方法に関する。
プチドまたはそれらのフラグメント、または少なくとも1つの上記抗体からなる
、哺乳動物の免疫化のための免疫原性組成物の製造方法に関する。
【0059】
同様に本発明は、寄生線虫類由来のβ−チューブリンに対向される宿主におけ
る予防的免疫応答の活性化のためにこの宿主に投与される免疫原性組成物の製造
のための、本発明によるβ−チューブリン、好ましくは配列番号:1,3,5,
7,9もしくは11に示された配列をコードする核酸、それらのフラグメントま
たはそれに相同的な配列を含有する上記発現ベクターの使用に関する。
る予防的免疫応答の活性化のためにこの宿主に投与される免疫原性組成物の製造
のための、本発明によるβ−チューブリン、好ましくは配列番号:1,3,5,
7,9もしくは11に示された配列をコードする核酸、それらのフラグメントま
たはそれに相同的な配列を含有する上記発現ベクターの使用に関する。
【0060】
同様に本発明は、ベクター(本発明によるβ−チューブリンをコードする核酸
、好ましくは配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に示される配列、それ
らのフラグメントまたはそれに相同的な配列および該核酸配列に機能的に結合さ
れ、そして免疫応答を生成する本発明によるβ−チューブリンの発現を制御する
プロモーター配列を含有する)および製薬学的目的に適当な媒質(vehicl
e)を含んでなる免疫原性組成物に関する。
、好ましくは配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に示される配列、それ
らのフラグメントまたはそれに相同的な配列および該核酸配列に機能的に結合さ
れ、そして免疫応答を生成する本発明によるβ−チューブリンの発現を制御する
プロモーター配列を含有する)および製薬学的目的に適当な媒質(vehicl
e)を含んでなる免疫原性組成物に関する。
【0061】
同様に本発明は、チューブリンの相互作用またはチューブリンのサブユニット
の相互作用をモジュレートする物質の同定方法に関する。方法は、チューブリン
の使用、好ましくは寄生線虫類由来のチューブリン、特に好ましくは目、円虫類
の寄生線虫類由来のβ−チューブリン、非常に特に好ましくはストロンギルス科
の寄生線虫類由来のβ−チューブリン、もっとも好ましくは亜科シアトストミナ
エの寄生線虫類由来のβ−チューブリンに基づく。この方法において使用される
β−チューブリンの特に好適な群は、属シリコシクルスおよびシアトストマムの
寄生線虫類由来のβ−チューブリンである。
の相互作用をモジュレートする物質の同定方法に関する。方法は、チューブリン
の使用、好ましくは寄生線虫類由来のチューブリン、特に好ましくは目、円虫類
の寄生線虫類由来のβ−チューブリン、非常に特に好ましくはストロンギルス科
の寄生線虫類由来のβ−チューブリン、もっとも好ましくは亜科シアトストミナ
エの寄生線虫類由来のβ−チューブリンに基づく。この方法において使用される
β−チューブリンの特に好適な群は、属シリコシクルスおよびシアトストマムの
寄生線虫類由来のβ−チューブリンである。
【0062】
本発明は、チューブリンタンパク質分子またはそのサブユニットどうしの相互
作用をモジュレートする物質、例えば小有機分子の同定に関する。好ましくは、
本発明は、相互作用を阻害する化合物の同定に関する。
作用をモジュレートする物質、例えば小有機分子の同定に関する。好ましくは、
本発明は、相互作用を阻害する化合物の同定に関する。
【0063】
同様に本発明は、
a)チューブリン分子どうしの相互作用およびチューブリンへの試験物質の結合
を可能にする条件で、試験されるべき物質をチューブリンと接触させ、 b)互いに相互作用するチューブリンタンパク質分子の能力を決定することによ
って、生じた結合を検出し、そして c)試験物質の存在下で互いに相互作用するチューブリンタンパク質分子の能力
を、試験物質の不在下で互いに相互作用する能力と比較すること、 に基づく上記の方法に関する。
を可能にする条件で、試験されるべき物質をチューブリンと接触させ、 b)互いに相互作用するチューブリンタンパク質分子の能力を決定することによ
って、生じた結合を検出し、そして c)試験物質の存在下で互いに相互作用するチューブリンタンパク質分子の能力
を、試験物質の不在下で互いに相互作用する能力と比較すること、 に基づく上記の方法に関する。
【0064】
同様に本発明は、互いに相互作用するチューブリン分子の能力をモジュレート
する物質の同定方法に関する。特に好ましくは、本発明は、この場合、上記DN
Aまたはそれらのフラグメントによって、特に、配列番号:1,3,5,7,9
もしくは11において示される配列からなるか、または配列を含むDNAによっ
て、およびそれらに85%、好ましくは95%の同一性をもち、そして配列番号
:2,4,6,8もしくは10において示されるアミノ酸配列をもつβ−チュー
ブリンをコードする配列によって、コードされている上記ポリペプチドの1つを
使用する方法に関する。
する物質の同定方法に関する。特に好ましくは、本発明は、この場合、上記DN
Aまたはそれらのフラグメントによって、特に、配列番号:1,3,5,7,9
もしくは11において示される配列からなるか、または配列を含むDNAによっ
て、およびそれらに85%、好ましくは95%の同一性をもち、そして配列番号
:2,4,6,8もしくは10において示されるアミノ酸配列をもつβ−チュー
ブリンをコードする配列によって、コードされている上記ポリペプチドの1つを
使用する方法に関する。
【0065】
同様に本発明は、上記のように、互いに相互作用するチューブリンの能力をモ
ジュレートする物質の同定方法であって、使用される方法が、細胞に基づく試験
システムを用いて試験物質の存在下でチューブリン相互作用のモジュレーション
を検出することに基づく方法に関する。そのような試験システムの好適な実施態
様は、「ツーハイブリッドシステム」である(米国特許第5283317号、Z
ervos et al.(1993)Cell 72,223−232;WO
94/10300)。このシステムは、検出できるシグナルをもたらす相互作用
によって2種のタンパク質の相互作用を記録または記述するために適当である。
また、そのようなシステムは、高処理数をもつ試験システムに適合させることが
できる。
ジュレートする物質の同定方法であって、使用される方法が、細胞に基づく試験
システムを用いて試験物質の存在下でチューブリン相互作用のモジュレーション
を検出することに基づく方法に関する。そのような試験システムの好適な実施態
様は、「ツーハイブリッドシステム」である(米国特許第5283317号、Z
ervos et al.(1993)Cell 72,223−232;WO
94/10300)。このシステムは、検出できるシグナルをもたらす相互作用
によって2種のタンパク質の相互作用を記録または記述するために適当である。
また、そのようなシステムは、高処理数をもつ試験システムに適合させることが
できる。
【0066】
同様に本発明は、互いに相互作用するチューブリンの能力をモジュレートする
物質の同定方法であって、使用される方法が、セル・フリー試験システムを用い
て試験物質の存在下でチューブリン相互作用のモジュレーションを検出すること
に基づく方法に関する。そのような試験システムの特に好適な実施態様は、「シ
ンチレーション近似アッセイ(SPA)」である(欧州特許第015 473号
)。この試験システムは、ミクロスフェアもしくはビーズに結合されたレセプタ
ー、例えばチューブリン分子とリガンドとの相互作用の検出に基づき、ミクロス
フェアもしくはビーズはシンチレート分子を備えている。シグナルは、レセプタ
ー・リガンド複合体が分解する場合に検出される。
物質の同定方法であって、使用される方法が、セル・フリー試験システムを用い
て試験物質の存在下でチューブリン相互作用のモジュレーションを検出すること
に基づく方法に関する。そのような試験システムの特に好適な実施態様は、「シ
ンチレーション近似アッセイ(SPA)」である(欧州特許第015 473号
)。この試験システムは、ミクロスフェアもしくはビーズに結合されたレセプタ
ー、例えばチューブリン分子とリガンドとの相互作用の検出に基づき、ミクロス
フェアもしくはビーズはシンチレート分子を備えている。シグナルは、レセプタ
ー・リガンド複合体が分解する場合に検出される。
【0067】
同様に本発明は、上記方法を用いて同定され、そしてチューブリン分子の相互
作用をモジュレート、好ましくは阻害するのに適当である、これまでなお記述さ
れなかった物質に関する。
作用をモジュレート、好ましくは阻害するのに適当である、これまでなお記述さ
れなかった物質に関する。
【0068】
同様に本発明は、線虫類によって攻撃される可能性があるか、または既に攻撃
された動物もしくはヒトの予防もしくは治療処置のために使用される薬剤の製造
のための、上記方法の1つを使用して同定された、これまでなお記述されなかっ
た物質の使用に関する。本発明による薬剤は、上記方法の1つによって同定され
た少なくとも1種の物質を含有し、そして経鼻、経皮、非経口もしくは経腸的に
投与することができる。
された動物もしくはヒトの予防もしくは治療処置のために使用される薬剤の製造
のための、上記方法の1つを使用して同定された、これまでなお記述されなかっ
た物質の使用に関する。本発明による薬剤は、上記方法の1つによって同定され
た少なくとも1種の物質を含有し、そして経鼻、経皮、非経口もしくは経腸的に
投与することができる。
【0069】
さらに良く理解するために、記述において使用されるある種の言語および用語
の意味、実施例および添付された請求項が、以下に、より詳細に説明される。
の意味、実施例および添付された請求項が、以下に、より詳細に説明される。
【0070】
タンパク質およびDNAに関する用語「フラグメント」は、配列番号:1〜1
1の下で記述される核酸もしくはアミノ酸配列、それらに相補的な配列またはそ
れらに85%まで、好ましくは95%まで同一な配列の一部を記述する。DNA
およびポリペプチド配列のフラグメントは、少なくとも5個のヌクレオチドもし
くはアミノ酸を含有するが、同様に、447個までのアミノ酸もしくは1343
個までのヌクレオチド、または配列番号:11に示される配列の場合には256
5個までのヌクレオチドを含有してもよい。
1の下で記述される核酸もしくはアミノ酸配列、それらに相補的な配列またはそ
れらに85%まで、好ましくは95%まで同一な配列の一部を記述する。DNA
およびポリペプチド配列のフラグメントは、少なくとも5個のヌクレオチドもし
くはアミノ酸を含有するが、同様に、447個までのアミノ酸もしくは1343
個までのヌクレオチド、または配列番号:11に示される配列の場合には256
5個までのヌクレオチドを含有してもよい。
【0071】
用語「相同性」、「同一性」もしくは「類似性」は、2種のペプチド間または
2種の核酸間における配列類似性に関する。相同性は、各場合、各配列における
位置を互いに比較することによって決定できる。比較された配列における位置が
同じ塩基もしくはアミノ酸によって占められる場合、この位置において2種の分
子は相同である。配列間の相同性の尺度は、配列が互いに共有している対応する
または相同な位置の数の関数である。「非相同性」配列は、40%未満の同一性
、しかし好ましくは25%未満の同一性をもつ。
2種の核酸間における配列類似性に関する。相同性は、各場合、各配列における
位置を互いに比較することによって決定できる。比較された配列における位置が
同じ塩基もしくはアミノ酸によって占められる場合、この位置において2種の分
子は相同である。配列間の相同性の尺度は、配列が互いに共有している対応する
または相同な位置の数の関数である。「非相同性」配列は、40%未満の同一性
、しかし好ましくは25%未満の同一性をもつ。
【0072】
用語「相同性」は、特に、少なくとも15塩基対の長さのDNAセグメントま
たはDNAに対して相補的な鎖が、対応するDNAと少なくとも85%、好まし
くは95%合致することを意味する。相同性は、なかでも、GCGプログラムの
ようなコンピュータープログラムを用いて決定できる(Devereux et
al.(1983),Nucleic Acids Res.12,387−
395)。
たはDNAに対して相補的な鎖が、対応するDNAと少なくとも85%、好まし
くは95%合致することを意味する。相同性は、なかでも、GCGプログラムの
ようなコンピュータープログラムを用いて決定できる(Devereux et
al.(1983),Nucleic Acids Res.12,387−
395)。
【0073】
また、DNAセグメントが当該DNA鎖またはその相補鎖にハイブリダイズで
きる場合にも「相同性」は存在する。
きる場合にも「相同性」は存在する。
【0074】
用語「ハイブリダイズする」もしくは「ハイブリダイゼーション」は、一本鎖
核酸分子が相補DNA鎖と塩基対合を受ける過程を記し、一本鎖核酸分子の能力
はハイブリダイゼーション条件のストリンジェンシーに依存する。
核酸分子が相補DNA鎖と塩基対合を受ける過程を記し、一本鎖核酸分子の能力
はハイブリダイゼーション条件のストリンジェンシーに依存する。
【0075】
用語「ストリンジェンシー」はハイブリダイゼーション条件に関する。「高い
ストリンジェンシー」は、塩基対合が困難にされる場合に与えられる。「低いス
トリンジェンシー」は、塩基対合が容易にされる場合に与えられる。
ストリンジェンシー」は、塩基対合が困難にされる場合に与えられる。「低いス
トリンジェンシー」は、塩基対合が容易にされる場合に与えられる。
【0076】
用語「相補的」は、水素架橋を介して塩基対を互いに形成するプリンおよびピ
リミジンヌクレオチドの能力に関する。相補的塩基対は、なかでも、グアニンと
シトシン、アデニンとチミンおよびアデニンとウラシルである。
リミジンヌクレオチドの能力に関する。相補的塩基対は、なかでも、グアニンと
シトシン、アデニンとチミンおよびアデニンとウラシルである。
【0077】
当業者は、縮重遺伝子コード(すなわち、20アミノ酸についての64コドン
コード)によって、ヌクレオチド塩基対の多くの「サイレント」置換が、それに
よってコードされるタンパク質生産物の同一性を変えることなく、それをコード
する配列中に導入できることを理解している。すべてのそのような置換は本発明
の範囲内に含まれるべきである。
コード)によって、ヌクレオチド塩基対の多くの「サイレント」置換が、それに
よってコードされるタンパク質生産物の同一性を変えることなく、それをコード
する配列中に導入できることを理解している。すべてのそのような置換は本発明
の範囲内に含まれるべきである。
【0078】
用語「特異的にハイブリダイズする」は、上記1つのβ−チューブリン遺伝子
の少なくとも約6,12,20,30,50,100,150,200,300
,350,400もしくは440個の連続するヌクレオチドに、好ましくは配列
番号:1,3,5,7,9もしくは11に示される配列またはそれに相同か相補
的な配列の1つにハイブリダイズする本発明の核酸分子の能力、すなわち、上記
β−チューブリン以外のタンパク質をコードする細胞の核酸(例えばmRNAも
しくはゲノムDNA)に対するよりも、10倍多い分子がハイブリダイズする、
好ましくは100倍多い分子がハイブリダイズする、特に好ましくは100倍以
上多い分子がハイブリダイズするような能力に関する。
の少なくとも約6,12,20,30,50,100,150,200,300
,350,400もしくは440個の連続するヌクレオチドに、好ましくは配列
番号:1,3,5,7,9もしくは11に示される配列またはそれに相同か相補
的な配列の1つにハイブリダイズする本発明の核酸分子の能力、すなわち、上記
β−チューブリン以外のタンパク質をコードする細胞の核酸(例えばmRNAも
しくはゲノムDNA)に対するよりも、10倍多い分子がハイブリダイズする、
好ましくは100倍多い分子がハイブリダイズする、特に好ましくは100倍以
上多い分子がハイブリダイズするような能力に関する。
【0079】
用語「プラスミド」は、染色体外の遺伝要素に関する。本発明のために使用さ
れる元になるプラスミドは市販のものから得られても、自由に取得しても、また
既知の方法にしたがってそのようなプラスミドから誘導されてもよい。
れる元になるプラスミドは市販のものから得られても、自由に取得しても、また
既知の方法にしたがってそのようなプラスミドから誘導されてもよい。
【0080】
用語「ベクター」は、宿主細胞への外因性DNAの導入のために使用されるD
NA要素を述べる。ベクターは、1種以上のポリペプチドをコードするヌクレオ
チド配列を含有する。それらが含有する遺伝子の発現を制御できるベクターは「
発現ベクター」と呼ばれる。
NA要素を述べる。ベクターは、1種以上のポリペプチドをコードするヌクレオ
チド配列を含有する。それらが含有する遺伝子の発現を制御できるベクターは「
発現ベクター」と呼ばれる。
【0081】
用語「遺伝子」は、本発明の範囲では、上記β−チューブリンポリペプチドの
1つをコードする読み枠を含んでなる核酸に関する。エクソンおよび可能性のあ
るイントロン配列がさらにここに含まれる。
1つをコードする読み枠を含んでなる核酸に関する。エクソンおよび可能性のあ
るイントロン配列がさらにここに含まれる。
【0082】
用語「相互作用する」もしくは「相互作用」は、分子間に検出しうる相互作用
を述べる。用語「結合」はさらにここに含まれる。
を述べる。用語「結合」はさらにここに含まれる。
【0083】
用語「モジュレートする」は、生物化学的プロセスの刺激および抑制もしくは
阻害の両方に関する。本発明の文脈上、「モジュレーション」は、チューブリン
ポリペプチドまたはそのサブユニットもしくはフラグメント間の相互作用の阻害
もしくは抑制、または例えばチューブリンポリペプチドの互いの不可逆的結合に
おいて示すことができる相互作用の刺激を意味する。
阻害の両方に関する。本発明の文脈上、「モジュレーション」は、チューブリン
ポリペプチドまたはそのサブユニットもしくはフラグメント間の相互作用の阻害
もしくは抑制、または例えばチューブリンポリペプチドの互いの不可逆的結合に
おいて示すことができる相互作用の刺激を意味する。
【0084】
用語「核酸」は、ポリヌクレオチド、例えばデオキシリボ核酸(DNA)また
は適当ならばリボ核酸(RNA)に関する。同様に、また用語は、ヌクレオチド
類似体から作成されるRNAもしくはDNAの類似体、およびその場合には一本
鎖(「センス」もしくは「アンチセンス」)および二本鎖のポリヌクレオチドを
含む。
は適当ならばリボ核酸(RNA)に関する。同様に、また用語は、ヌクレオチド
類似体から作成されるRNAもしくはDNAの類似体、およびその場合には一本
鎖(「センス」もしくは「アンチセンス」)および二本鎖のポリヌクレオチドを
含む。
【0085】
用語「プロモーター」は、プロモーターに機能的に結合されている、特定のD
NAの発現を調節するDNA配列に関する。また、用語は、「組織特異的」プロ
モーター、すなわちある種の細胞(例えばある種の組織の細胞)においてのみ特
定のDNAの発現を制御するプロモーターを含む。同様に、「組織に非特異的な
』プロモーターおよび構成的発現をもたらすか、または誘導しうるプロモーター
が含まれる。
NAの発現を調節するDNA配列に関する。また、用語は、「組織特異的」プロ
モーター、すなわちある種の細胞(例えばある種の組織の細胞)においてのみ特
定のDNAの発現を制御するプロモーターを含む。同様に、「組織に非特異的な
』プロモーターおよび構成的発現をもたらすか、または誘導しうるプロモーター
が含まれる。
【0086】
用語「タンパク質」、「ポリペプチド」および「ペプチド」は、それらが遺伝
子産物に関する場合には、本明細書の文脈におけるそれらの使用では交換可能で
ある。
子産物に関する場合には、本明細書の文脈におけるそれらの使用では交換可能で
ある。
【0087】
「融合タンパク質」は、チューブリン配列に対して共通性(commonal
ity)または基本的な相同性をもたない第2のアミノ酸配列をもつ上記β−チ
ューブリンポリペプチドの1つをコードする第1のアミノ酸配列の融合物である
。第2のアミノ酸配列は、この場合、第1のものと同じ生物に由来してもよく、
さもなくばその他の生物(遺伝子間)に由来してもよい。一般に、融合タンパク
質は、式X−チューブリン−Yによって表すことができ、この場合「チューブリ
ン」は、上記ポリペプチドの1つを表し、そしてXおよびYは、チューブリンア
ミノ酸配列には関係しないポリペプチドを表す。XもしくはYは、各場合互いに
独立に不在であってもよい。
ity)または基本的な相同性をもたない第2のアミノ酸配列をもつ上記β−チ
ューブリンポリペプチドの1つをコードする第1のアミノ酸配列の融合物である
。第2のアミノ酸配列は、この場合、第1のものと同じ生物に由来してもよく、
さもなくばその他の生物(遺伝子間)に由来してもよい。一般に、融合タンパク
質は、式X−チューブリン−Yによって表すことができ、この場合「チューブリ
ン」は、上記ポリペプチドの1つを表し、そしてXおよびYは、チューブリンア
ミノ酸配列には関係しないポリペプチドを表す。XもしくはYは、各場合互いに
独立に不在であってもよい。
【0088】
用語「細胞」もしくは「宿主細胞」は、ここに提示される明細書の文脈では同
じ意味において使用できる。これらの用語は個々の細胞のみならず、またそのよ
うな細胞の子孫にも関することが理解される。後続する世代におけるある種の改
変(例えば変異)のために、そのような子孫は、幹細胞とは同一ではない可能性
もあるが、本発明によってさらに包含される。
じ意味において使用できる。これらの用語は個々の細胞のみならず、またそのよ
うな細胞の子孫にも関することが理解される。後続する世代におけるある種の改
変(例えば変異)のために、そのような子孫は、幹細胞とは同一ではない可能性
もあるが、本発明によってさらに包含される。
【0089】
用語「イントロン」は、転写されるが、結合している隣接配列(エクソン)を
「スプライシング」によって転写物から除去される既述の、好ましくはゲノムの
、DNAのそれらの配列を述べる。
「スプライシング」によって転写物から除去される既述の、好ましくはゲノムの
、DNAのそれらの配列を述べる。
【0090】
核酸
既に記述されたように、本発明の1つの態様は、ストロンギルス科、特に亜科
シアトストミナエ、非常に特に属シアトストマムおよびシリコシクルス、特別に
は種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類由
来の核酸であって、β−チューブリンポリペプチドまたはそのフラグメントをコ
ードする核酸、または配列番号:1,3,5,7,9および11における[空白
]に85%、好ましくは95%相同であり、そして配列番号:2,4,6,8も
しくは10において示されるような配列の1つにしたがうβ−チューブリンまた
はそのフラグメントをコードする、それに相同な核酸に関する。配列番号:3は
、β−チューブリンをコードするシリコシクルス・ナッサタス由来の核酸の退化
された配列を表し、この場合「r」はプリン(グアニンもしくはアデニン)を表
し、「y」はピリミジン(チミン、またはウラシルもしくはシトシン)を表し、
そして「w」はアデニンもしくはチミン、またはウラシルを表す。したがって、
配列番号:3は、種シリコシクルス・ナッサタスの生物体において存在すること
ができる多くの配列を含む。配列番号:5,7および11に示される配列はβ−
チューブリンをコードする3種の一定の配列を示し、これらは配列番号:3に示
されるDNAの代表的および好適な態様である。
シアトストミナエ、非常に特に属シアトストマムおよびシリコシクルス、特別に
は種シリコシクルス・ナッサタスおよびシアトストマム・コロナタムの線虫類由
来の核酸であって、β−チューブリンポリペプチドまたはそのフラグメントをコ
ードする核酸、または配列番号:1,3,5,7,9および11における[空白
]に85%、好ましくは95%相同であり、そして配列番号:2,4,6,8も
しくは10において示されるような配列の1つにしたがうβ−チューブリンまた
はそのフラグメントをコードする、それに相同な核酸に関する。配列番号:3は
、β−チューブリンをコードするシリコシクルス・ナッサタス由来の核酸の退化
された配列を表し、この場合「r」はプリン(グアニンもしくはアデニン)を表
し、「y」はピリミジン(チミン、またはウラシルもしくはシトシン)を表し、
そして「w」はアデニンもしくはチミン、またはウラシルを表す。したがって、
配列番号:3は、種シリコシクルス・ナッサタスの生物体において存在すること
ができる多くの配列を含む。配列番号:5,7および11に示される配列はβ−
チューブリンをコードする3種の一定の配列を示し、これらは配列番号:3に示
されるDNAの代表的および好適な態様である。
【0091】
同様に、本発明の一部は、場合によっては、長さ少なくとも2,5,10,2
5,50,100,150,200,250,300,350もしくは400ア
ミノ酸を含有するβ−チューブリンポリペプチドをコードするオリゴヌクレオチ
ドである。そのようなオリゴヌクレオチドは、プライマーまたはアンチセンス分
子(すなわち非コーディング核酸として)として使用することができ、そして少
なくとも約6,12,24,30,60,100,120,150もしくは21
0塩基対を含有し、一方コーディング核酸は、約200,300,400,50
0,600,700,800,900,1000,1100,1200もしくは
1300塩基対を含有する。
5,50,100,150,200,250,300,350もしくは400ア
ミノ酸を含有するβ−チューブリンポリペプチドをコードするオリゴヌクレオチ
ドである。そのようなオリゴヌクレオチドは、プライマーまたはアンチセンス分
子(すなわち非コーディング核酸として)として使用することができ、そして少
なくとも約6,12,24,30,60,100,120,150もしくは21
0塩基対を含有し、一方コーディング核酸は、約200,300,400,50
0,600,700,800,900,1000,1100,1200もしくは
1300塩基対を含有する。
【0092】
また、本発明は、配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に示される配列
の1つによって表される核酸に対してストリンジェント条件下で特異的にハイブ
リダイズするそれらのオリゴヌクレオチドを述べる。対応して、ストリンジェン
ト条件は、例えば、約45℃において6x塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム
(SSC)、続いて50℃において2xSSCによる洗浄段階であり、そして当
業者には周知である(例えば、Current protocols in M
olecular Biology,John Willey & Sons,
N.Y.(1989),6.3.1−6.3.6、参照)。したがって、洗浄段
階における塩濃度は、ストリンジェンシーが、より低い(2xSSC,50℃)
か、またはより高い(0.2xSSC,50℃)ように選ばれてもよい。さらに
また、洗浄段階における温度は、低いストリンジェンシー(例えば約22℃)に
ついての条件から、より高いストリンジェンシー(例えば約65℃)の条件まで
変えることができる。両塩濃度および温度は変えられるし、互いに合わせること
もできる。
の1つによって表される核酸に対してストリンジェント条件下で特異的にハイブ
リダイズするそれらのオリゴヌクレオチドを述べる。対応して、ストリンジェン
ト条件は、例えば、約45℃において6x塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム
(SSC)、続いて50℃において2xSSCによる洗浄段階であり、そして当
業者には周知である(例えば、Current protocols in M
olecular Biology,John Willey & Sons,
N.Y.(1989),6.3.1−6.3.6、参照)。したがって、洗浄段
階における塩濃度は、ストリンジェンシーが、より低い(2xSSC,50℃)
か、またはより高い(0.2xSSC,50℃)ように選ばれてもよい。さらに
また、洗浄段階における温度は、低いストリンジェンシー(例えば約22℃)に
ついての条件から、より高いストリンジェンシー(例えば約65℃)の条件まで
変えることができる。両塩濃度および温度は変えられるし、互いに合わせること
もできる。
【0093】
存在する、例えばゲノムの、DNAの同定および特性決定のために、プライマ
ーとして、またはハイブリダイゼーションのために使用できる特に好適なオリゴ
ヌクレオチドは、配列番号:12−51において記述される。しかしながら、ま
た、他のオリゴヌクレオチドが、配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に
示される配列から誘導されてもよく、次いで、これらがプライマーとして、また
はハイブリダイゼーションのために使用できる。存在するDNAが指定できる種
もしくは属の同定のために特に好適なものは、存在する(ゲノムの)DNAのイ
ントロンの領域においてハイブリダイズするそれらのオリゴヌクレオチドである
。上記線虫類から単離できるβ−チューブリンをコードするゲノムDNAのイン
トロンは、配列番号:11においてシリコシクルス・ナッサタスの例によって記
述される。かくして、イントロンは、コーディングエクソン間に位置しているそ
れらの配列である。好適な実施態様では、既述プライマーもしくはハイブリダイ
ゼーションプローブは、オリゴヌクレオチドの検出を可能にする標識基、すなわ
ち例えばラジオアイソトープ、蛍光基、酵素もしくは酵素コファクターを含有す
る。
ーとして、またはハイブリダイゼーションのために使用できる特に好適なオリゴ
ヌクレオチドは、配列番号:12−51において記述される。しかしながら、ま
た、他のオリゴヌクレオチドが、配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に
示される配列から誘導されてもよく、次いで、これらがプライマーとして、また
はハイブリダイゼーションのために使用できる。存在するDNAが指定できる種
もしくは属の同定のために特に好適なものは、存在する(ゲノムの)DNAのイ
ントロンの領域においてハイブリダイズするそれらのオリゴヌクレオチドである
。上記線虫類から単離できるβ−チューブリンをコードするゲノムDNAのイン
トロンは、配列番号:11においてシリコシクルス・ナッサタスの例によって記
述される。かくして、イントロンは、コーディングエクソン間に位置しているそ
れらの配列である。好適な実施態様では、既述プライマーもしくはハイブリダイ
ゼーションプローブは、オリゴヌクレオチドの検出を可能にする標識基、すなわ
ち例えばラジオアイソトープ、蛍光基、酵素もしくは酵素コファクターを含有す
る。
【0094】
そのようなオリゴヌクレオチドは、存在するDNAの起源(すなわち生物)を
決定するために、診断試験キットにおいて用いることができる。オリゴヌクレオ
チドは、特定の配列を認識するために、配列番号:1,3,5,7,9および1
1に示されるDNA[空白]それらのフラグメント、それらに相同な配列および
それらに相補的な配列とのそれらの特異的なハイブリダイゼーションに適当であ
る。したがって、また、それらは、コドン200における1つ以上の点突然変異
により、ベンズイミダゾール耐性β−チューブリンの発現をもたらすβ−チュー
ブリンをコードするそれらの配列の認識および同定を可能にする。その結果、配
列番号:1,3,5,7,9および11の配列、好ましくは配列番号:12〜5
1において記述された態様から誘導されるこれらのオリゴヌクレオチドは、頻繁
に存在する亜科シアトストミナエの線虫種の同定のために、そしてベンズイミダ
ゾールに対して存在する耐性の認識のために適当である。
決定するために、診断試験キットにおいて用いることができる。オリゴヌクレオ
チドは、特定の配列を認識するために、配列番号:1,3,5,7,9および1
1に示されるDNA[空白]それらのフラグメント、それらに相同な配列および
それらに相補的な配列とのそれらの特異的なハイブリダイゼーションに適当であ
る。したがって、また、それらは、コドン200における1つ以上の点突然変異
により、ベンズイミダゾール耐性β−チューブリンの発現をもたらすβ−チュー
ブリンをコードするそれらの配列の認識および同定を可能にする。その結果、配
列番号:1,3,5,7,9および11の配列、好ましくは配列番号:12〜5
1において記述された態様から誘導されるこれらのオリゴヌクレオチドは、頻繁
に存在する亜科シアトストミナエの線虫種の同定のために、そしてベンズイミダ
ゾールに対して存在する耐性の認識のために適当である。
【0095】
本発明によるオリゴヌクレオチドは、当業者には周知である標準的方法、例え
ばド・ノボDNA合成によって作成することができる。
ばド・ノボDNA合成によって作成することができる。
【0096】
ここに述べれれる核酸は、完全な細胞中または細胞溶解物中に部分精製形態ま
たは生物学的に純粋な形態において、すなわち、他の細胞成分もしくは化学的前
駆物質および副生物がDNAの化学的合成の場合に除去されれば、存在すること
もできる。
たは生物学的に純粋な形態において、すなわち、他の細胞成分もしくは化学的前
駆物質および副生物がDNAの化学的合成の場合に除去されれば、存在すること
もできる。
【0097】
上記のβ−チューブリンをコードする核酸は、多くの真核細胞において存在し
ているmRNAから出発して得ることができる。また、当該線虫細胞由来のゲノ
ムDNAから出発して本発明によるDNAを得ることも可能である(また、次の
実施例参照)。β−チューブリンをコードする遺伝子は、例えば、cDNAライ
ブラリーもしくはゲノムDNAライブラリーから得ることができる。cDNAは
、細胞、例えば線虫細胞の全mRNAを単離することによって得られてもよい。
mRNAから出発して、次いで、二本鎖cDNAが作成され、そして適当なプラ
スミドもしくは適当なベクター中に挿入できる。本発明によるDNAは、既知の
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を用いる増幅によるか、あるいはまたド・ノボ
DNA合成によって作成することができる(J.Sambrook et al
.(1989)Molecular Cloning,2nd Edition
,Chap.14、参照)。
ているmRNAから出発して得ることができる。また、当該線虫細胞由来のゲノ
ムDNAから出発して本発明によるDNAを得ることも可能である(また、次の
実施例参照)。β−チューブリンをコードする遺伝子は、例えば、cDNAライ
ブラリーもしくはゲノムDNAライブラリーから得ることができる。cDNAは
、細胞、例えば線虫細胞の全mRNAを単離することによって得られてもよい。
mRNAから出発して、次いで、二本鎖cDNAが作成され、そして適当なプラ
スミドもしくは適当なベクター中に挿入できる。本発明によるDNAは、既知の
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を用いる増幅によるか、あるいはまたド・ノボ
DNA合成によって作成することができる(J.Sambrook et al
.(1989)Molecular Cloning,2nd Edition
,Chap.14、参照)。
【0098】
ベクターおよびプラスミド
また本発明は、転写調節配列に機能的に結合される本発明による核酸配列の1
つを含有する発現ベクターを含む。「機能的に結合される」は、核酸配列によっ
てコードされているタンパク質の発現が制御できるように、核酸配列が調節配列
に連結されていることを意味する。「転写調節配列」は、例えば、プロモーター
、エンハンサーおよび他の調節要素を含む。発現ベクターは、例えば、本発明に
よるβ−チューブリンをコードする遺伝子またはそのフラグメントを含有する。
これらのベクターは、対応するポリペプチドあるいはまた融合タンパク質が、後
に生成される細胞中への組み込みのために使用することができる。E.コリにお
ける本発明によるタンパク質の発現のために適当なプロモーターは、天然のハイ
ブリッドまたはバクテリオファージプロモーターを含む。好ましくは、それらは
、ファージλプロモーター、ompプロモーターまたは合成プロモーター(また
WO98/15625、ドイツ特許第3430683号、欧州特許第01731
49号、参照)の群からのプロモーターである。適当なベクターは、市販品、例
えば、pETシリーズ(pET3a,pET23a,pET28aおよびHis
タグまたはHisタグをもつpET3a)またはグルタチオンシンテターゼ融合
物をもつpGEXの発現ベクターを得ることができる。次に、発現ベクターは、
例えば、DE3溶原性E.コリ菌株、例えばBL21(DE3),HMS174
(DE3)またはAD494(DE3)を形質転換することができる。
つを含有する発現ベクターを含む。「機能的に結合される」は、核酸配列によっ
てコードされているタンパク質の発現が制御できるように、核酸配列が調節配列
に連結されていることを意味する。「転写調節配列」は、例えば、プロモーター
、エンハンサーおよび他の調節要素を含む。発現ベクターは、例えば、本発明に
よるβ−チューブリンをコードする遺伝子またはそのフラグメントを含有する。
これらのベクターは、対応するポリペプチドあるいはまた融合タンパク質が、後
に生成される細胞中への組み込みのために使用することができる。E.コリにお
ける本発明によるタンパク質の発現のために適当なプロモーターは、天然のハイ
ブリッドまたはバクテリオファージプロモーターを含む。好ましくは、それらは
、ファージλプロモーター、ompプロモーターまたは合成プロモーター(また
WO98/15625、ドイツ特許第3430683号、欧州特許第01731
49号、参照)の群からのプロモーターである。適当なベクターは、市販品、例
えば、pETシリーズ(pET3a,pET23a,pET28aおよびHis
タグまたはHisタグをもつpET3a)またはグルタチオンシンテターゼ融合
物をもつpGEXの発現ベクターを得ることができる。次に、発現ベクターは、
例えば、DE3溶原性E.コリ菌株、例えばBL21(DE3),HMS174
(DE3)またはAD494(DE3)を形質転換することができる。
【0099】
β−チューブリンポリペプチドの発現
また、本発明は、本発明による核酸配列を含有する(例えば、ベクター中また
はゲノム中に挿入された)細胞を含む。これらの宿主細胞は原核または真核細胞
であってもよい。適当な原核生物発現系は、例えばストレプトミセス種、バチル
ス・ズブチリス、サルモネラ・チフィムリウム、セラチア・マルセッセンスおよ
び好ましくはE.コリのような細菌の系である。
はゲノム中に挿入された)細胞を含む。これらの宿主細胞は原核または真核細胞
であってもよい。適当な原核生物発現系は、例えばストレプトミセス種、バチル
ス・ズブチリス、サルモネラ・チフィムリウム、セラチア・マルセッセンスおよ
び好ましくはE.コリのような細菌の系である。
【0100】
好適な真核生物発現系は、バキュロウイルス系、特に好ましくは翻訳後修飾を
可能にするものである。
可能にするものである。
【0101】
他の真核生物発現系(例えば酵母、昆虫細胞)も同様に使用できる。
【0102】
ポリペプチド
同様に本発明は、本発明によるDNA、好ましくは配列番号:1,3,5,7
,9および11に示されるDNA配列、それらのフラグメントまたは上記のよう
な相同性DNA配列によってコードされているβ−チューブリンポリペプチドを
含む。これらのβ−チューブリンの好適な実施態様は、配列番号:2,4,6,
8および10に示される配列において記述される。好適な実施態様では、前記ポ
リペプチドは、本発明によるポリペプチドが生産された細胞の混入タンパク質を
含有しない精製されたポリペプチドである。
,9および11に示されるDNA配列、それらのフラグメントまたは上記のよう
な相同性DNA配列によってコードされているβ−チューブリンポリペプチドを
含む。これらのβ−チューブリンの好適な実施態様は、配列番号:2,4,6,
8および10に示される配列において記述される。好適な実施態様では、前記ポ
リペプチドは、本発明によるポリペプチドが生産された細胞の混入タンパク質を
含有しない精製されたポリペプチドである。
【0103】
上記ポリペプチドは、完全長のタンパク質、または長さ少なくとも5,10,
25,50,75,100,125,150,200,250,300,350
もしくは400アミノ酸を含有するそれらのフラグメント、モチーフもしくはド
メインである。ポリペプチドフラグメントは、配列番号:1,3,5,7,9お
よび11に示される配列から得られた核酸フラグメントによってコードされてい
るポリペプチドの試験によって得られ、そして選択することができる。
25,50,75,100,125,150,200,250,300,350
もしくは400アミノ酸を含有するそれらのフラグメント、モチーフもしくはド
メインである。ポリペプチドフラグメントは、配列番号:1,3,5,7,9お
よび11に示される配列から得られた核酸フラグメントによってコードされてい
るポリペプチドの試験によって得られ、そして選択することができる。
【0104】
ポリペプチドフラグメントは、また、既知の方法で化学的に合成されてもよい
。
。
【0105】
また本発明は、配列番号:3に示される退化配列によってコードされているポ
リペプチドを含む。DNA配列の特定の位置における種々の可能な塩基のために
、各場合に得られるコドンによってコードされているアミノ酸をもつ種々のポリ
ペプチドがもたらされる。配列番号:3に示される退化配列によってコードされ
ているポリペプチドは配列番号:4において記述され、変更可能なアミノ酸が「
Xaa」によって印される。
リペプチドを含む。DNA配列の特定の位置における種々の可能な塩基のために
、各場合に得られるコドンによってコードされているアミノ酸をもつ種々のポリ
ペプチドがもたらされる。配列番号:3に示される退化配列によってコードされ
ているポリペプチドは配列番号:4において記述され、変更可能なアミノ酸が「
Xaa」によって印される。
【0106】
ポリペプチドの好適な実施態様は、配列番号:2,4,6,8および10にお
いて記述される。
いて記述される。
【0107】
本発明は、本発明によるポリペプチドのすべての製造方法を含む。
【0108】
本発明のポリペプチドは、種々の方法、例えば、固相法のような化学的方法に
よって得ることができることは当業者には周知である。大量のタンパク質の取得
のためには、組み換え方法の使用が推奨される。
よって得ることができることは当業者には周知である。大量のタンパク質の取得
のためには、組み換え方法の使用が推奨される。
【0109】
組み換えβ−チューブリンの調製のための強調すべき段階は次のとおりである
: 1.本発明によるβ−チューブリンをコードする天然、合成または半合成DNA
の取得。 2.それ自体でも、また融合タンパク質としても、いずれでも本発明によるβ−
チューブリンを発現するために適当である発現ベクター中へのこのDNAの組み
込み。 3.この発現ベクターを用いて適当な、好ましくは原核生物の宿主細胞の形質転
換。 4.本発明によるβ−チューブリンを発現するために適当である方式で形質転換
された宿主細胞の増殖。 5.細胞の収穫および適当な既知の方法によるβ−チューブリンの精製。
: 1.本発明によるβ−チューブリンをコードする天然、合成または半合成DNA
の取得。 2.それ自体でも、また融合タンパク質としても、いずれでも本発明によるβ−
チューブリンを発現するために適当である発現ベクター中へのこのDNAの組み
込み。 3.この発現ベクターを用いて適当な、好ましくは原核生物の宿主細胞の形質転
換。 4.本発明によるβ−チューブリンを発現するために適当である方式で形質転換
された宿主細胞の増殖。 5.細胞の収穫および適当な既知の方法によるβ−チューブリンの精製。
【0110】
例えば、発現ベクターは、λDE3溶原性E.コリ菌株、例えばBL21(D
E3),HM S174(DE3)またはAD494(DE3)において形質転
換することができる。当業者には周知の標準条件下での細胞の増殖後、発現はI
PTGを用いて誘導される。細胞の誘導後、培養が温度18〜37℃で3〜24
時間実施される。細胞が破壊され、発現されたタンパク質がクロマトグラフィー
法によって、Hisタグをもって発現されたタンパク質の場合にはNi−NTA
カラムにおけるFPLC法によって、そしてまたイオン交換クロマトグラフィー
、ゲル濾過クロマトグラフィー、限外濾過、電気泳動あるいはまた本発明による
ポリペプチドに特異的であるイムノアフィニティー精製によって精製される。
E3),HM S174(DE3)またはAD494(DE3)において形質転
換することができる。当業者には周知の標準条件下での細胞の増殖後、発現はI
PTGを用いて誘導される。細胞の誘導後、培養が温度18〜37℃で3〜24
時間実施される。細胞が破壊され、発現されたタンパク質がクロマトグラフィー
法によって、Hisタグをもって発現されたタンパク質の場合にはNi−NTA
カラムにおけるFPLC法によって、そしてまたイオン交換クロマトグラフィー
、ゲル濾過クロマトグラフィー、限外濾過、電気泳動あるいはまた本発明による
ポリペプチドに特異的であるイムノアフィニティー精製によって精製される。
【0111】
本発明によるポリペプチドの同族体もしくはフラグメントは、突然変異誘発、
例えば部位特異的(点)突然変異誘発、または欠失によって生成できる。
例えば部位特異的(点)突然変異誘発、または欠失によって生成できる。
【0112】
また、本発明によるポリペプチドは、例えば、グリコシル基、脂質、燐酸エス
テル、アセチル基または類似の基を用いて化学的に改変されてもよい。共有結合
誘導体は、改変する基と、ポリペプチドのアミノ酸側鎖またはN末端もしくはC
末端の官能基との結合によって得ることができる。
テル、アセチル基または類似の基を用いて化学的に改変されてもよい。共有結合
誘導体は、改変する基と、ポリペプチドのアミノ酸側鎖またはN末端もしくはC
末端の官能基との結合によって得ることができる。
【0113】
本発明によるポリペプチドの発現では、最適発現を可能にするために、ある種
のコドンを変化させることが有利であるかもしれない。このことは、異種の発現
系におけるある種のコドンの使用(「コドン使用(codon usage)」
)が本発明による生物体の1種とは異なる場合には真実である。さらにまた、い
くつかの不安定化配列モチーフ(例えばATTTA)がcDNAの3’領域に存
在する場合には、5’−もしくは3’−非翻訳領域の欠失が可能である。
のコドンを変化させることが有利であるかもしれない。このことは、異種の発現
系におけるある種のコドンの使用(「コドン使用(codon usage)」
)が本発明による生物体の1種とは異なる場合には真実である。さらにまた、い
くつかの不安定化配列モチーフ(例えばATTTA)がcDNAの3’領域に存
在する場合には、5’−もしくは3’−非翻訳領域の欠失が可能である。
【0114】
融合タンパク質
本発明によるポリペプチドは、また、融合タンパク質の一部として存在するこ
とができる。そのような融合タンパク質は本発明によって完全に包括される。融
合タンパク質は、β−チューブリンの免疫原性フラグメントを得ることが望まれ
る状況下で有用である(例えば、欧州特許第0259149号;Schlien
ger et al.(1992)J.Virol.66,2、参照)。ある環
境下では、融合タンパク質はポリペプチドの発現を助長する。例えば、本発明に
よるポリペプチドは、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)融合タン
パク質として作成されてもよい。そのようなGST融合タンパク質はポリペプチ
ドの精製を容易にする(例えば、Current protocols in
Molecular Biology,eds.Ausubel et al.
(John Willey & Sons,N.Y.1991)、参照)。融合
タンパク質は、例えば、精製のために使用される「リーダー」配列であって、例
えばNi2+NTAカラムにおけるクロマトグラフィー手段によってその精製が[
空白]されるタンパク質のN末端(しかしまたC末端においても)におけるポリ
−His配列を与える、配列を含有してもよい(例えば、Hachuli et
al.(1987)J.Chromatography 411,177、参
照)。
とができる。そのような融合タンパク質は本発明によって完全に包括される。融
合タンパク質は、β−チューブリンの免疫原性フラグメントを得ることが望まれ
る状況下で有用である(例えば、欧州特許第0259149号;Schlien
ger et al.(1992)J.Virol.66,2、参照)。ある環
境下では、融合タンパク質はポリペプチドの発現を助長する。例えば、本発明に
よるポリペプチドは、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)融合タン
パク質として作成されてもよい。そのようなGST融合タンパク質はポリペプチ
ドの精製を容易にする(例えば、Current protocols in
Molecular Biology,eds.Ausubel et al.
(John Willey & Sons,N.Y.1991)、参照)。融合
タンパク質は、例えば、精製のために使用される「リーダー」配列であって、例
えばNi2+NTAカラムにおけるクロマトグラフィー手段によってその精製が[
空白]されるタンパク質のN末端(しかしまたC末端においても)におけるポリ
−His配列を与える、配列を含有してもよい(例えば、Hachuli et
al.(1987)J.Chromatography 411,177、参
照)。
【0115】
そのような融合タンパク質を製造する技術は当業者には周知である。
【0116】
抗体
本発明のその他の態様は、本発明によるβ−チューブリンポリペプチドと特異
的に反応する抗体に関する。
的に反応する抗体に関する。
【0117】
例えば、抗タンパク質もしくは抗ペプチド血清またはモノクローナル抗体は、
本発明によるβ−チューブリンポリペプチドから得られた免疫源の使用によって
標準的プロトコールにしたがって作成することができる(例えば、Antibo
dies:A.Laboratory Manual ed.by Harlo
w and Lane(Cold Spring Harbor Press,
1988))。
本発明によるβ−チューブリンポリペプチドから得られた免疫源の使用によって
標準的プロトコールにしたがって作成することができる(例えば、Antibo
dies:A.Laboratory Manual ed.by Harlo
w and Lane(Cold Spring Harbor Press,
1988))。
【0118】
哺乳動物、例えばマウス、ハムスターもしくはウサギが、本発明によるポリペ
プチドの免疫原性形態または免疫原性画分を用いて、例えば抗体応答を生じるこ
とができるポリペプチドを用いて免疫化される。適当な技術は当業者には周知で
ある。かくして、β−チューブリンの免疫原性画分が、アジュバントの存在下で
投与される。免疫化の過程は、血漿もしくは血清中の抗体タイターを、例えばE
LISAアッセイもしくは他のイムノアッセイによって検査することによって観
察できる。
プチドの免疫原性形態または免疫原性画分を用いて、例えば抗体応答を生じるこ
とができるポリペプチドを用いて免疫化される。適当な技術は当業者には周知で
ある。かくして、β−チューブリンの免疫原性画分が、アジュバントの存在下で
投与される。免疫化の過程は、血漿もしくは血清中の抗体タイターを、例えばE
LISAアッセイもしくは他のイムノアッセイによって検査することによって観
察できる。
【0119】
好適な実施態様では、本発明による抗体は、本発明によるβ−チューブリンポ
リペプチド、例えば配列番号:2,4,6,8もしくは10に示されるポリペプ
チドあるいは配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に示されるDNAまた
はそれと85%まで同一な配列、好ましくは95%まで同一な配列によってコー
ドされているそれらのポリペプチドの抗原決定基に対して免疫特異的である。
リペプチド、例えば配列番号:2,4,6,8もしくは10に示されるポリペプ
チドあるいは配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に示されるDNAまた
はそれと85%まで同一な配列、好ましくは95%まで同一な配列によってコー
ドされているそれらのポリペプチドの抗原決定基に対して免疫特異的である。
【0120】
哺乳動物の免疫化後、ポリクローナル抗β−チューブリン抗体が血清から単離
することができる。モノクローナル抗体の製造では、抗体産生細胞(リンパ球)
が、免疫化された動物から得られ、そしてハイブリドーマ細胞を得るためには、
既知の方法にしたがって骨髄腫細胞のような不死細胞と融合される(例えば、K
oehler and Milstein(1975)Nature 256,
495−497;Kozbar et al.(1983)Immunolog
y Today 4,72;Cle et al.(1985)Monoclo
nal Antibodies and Cancer Therapy,Al
an R.Liss,Inc.pp.77−96、参照)。
することができる。モノクローナル抗体の製造では、抗体産生細胞(リンパ球)
が、免疫化された動物から得られ、そしてハイブリドーマ細胞を得るためには、
既知の方法にしたがって骨髄腫細胞のような不死細胞と融合される(例えば、K
oehler and Milstein(1975)Nature 256,
495−497;Kozbar et al.(1983)Immunolog
y Today 4,72;Cle et al.(1985)Monoclo
nal Antibodies and Cancer Therapy,Al
an R.Liss,Inc.pp.77−96、参照)。
【0121】
ここに述べられる「抗体」は、また、本発明によるβ−チューブリンと特異的
に反応する抗体のフラグメントも含む。抗体は、慣用の技術を用いてフラグメン
ト化され、そしてフラグメントが試験される。
に反応する抗体のフラグメントも含む。抗体は、慣用の技術を用いてフラグメン
ト化され、そしてフラグメントが試験される。
【0122】
好適な実施態様は、検出可能な標識(例えば、ラジオアイソトープ、蛍光基、
酵素もしくは酵素コファクター)を担持している上記のような抗体に関する。
酵素もしくは酵素コファクター)を担持している上記のような抗体に関する。
【0123】
また、本発明によるβ−チューブリンポリペプチドに特異的に結合する抗体は
、組織サンプルの免疫組織化学的染色に使用して特異的β−チューブリンの発現
を検出することができる。抗β−チューブリン抗体は、同じく、診断目的のため
に、例えば免疫沈降もしくはイムノブロッティングのために使用できる。
、組織サンプルの免疫組織化学的染色に使用して特異的β−チューブリンの発現
を検出することができる。抗β−チューブリン抗体は、同じく、診断目的のため
に、例えば免疫沈降もしくはイムノブロッティングのために使用できる。
【0124】
診断試験操作
同様に本発明は、診断目的のために使用できる核酸分子を利用可能にさせる。
【0125】
これらは、上記のような核酸分子、配列番号:1,3,5,7,9もしくは1
1において記述されるDNA配列またはそれに相補的なDNA配列を含む。例え
ば、配列番号:12〜51に示されるオリゴヌクレオチドが利用可能にされ、こ
れらは、β−チューブリンをコードするセンスもしくはアンチセンス配列、およ
び配列番号:11において例として記述されるイントロン配列部分にハイブリダ
イズすることができる。
1において記述されるDNA配列またはそれに相補的なDNA配列を含む。例え
ば、配列番号:12〜51に示されるオリゴヌクレオチドが利用可能にされ、こ
れらは、β−チューブリンをコードするセンスもしくはアンチセンス配列、およ
び配列番号:11において例として記述されるイントロン配列部分にハイブリダ
イズすることができる。
【0126】
この操作では、細胞の核酸はハイブリダイゼーション可能なようにされ、DN
Aプローブがオリゴヌクレオチドと接触させられ、そしてサンプルのハイブリダ
イゼーションがオリゴヌクレオチドを用いて検出される。
Aプローブがオリゴヌクレオチドと接触させられ、そしてサンプルのハイブリダ
イゼーションがオリゴヌクレオチドを用いて検出される。
【0127】
この方式では、DNAプローブへの本発明によるオリゴヌクレオチドの特異的
ハイブリダイゼーションによって、好ましくはβ−チューブリンをコードするD
NAのイントロン領域にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドを用いて、種々
の種の小ストロンギルドおよび/または他の線虫種間を区別することをできる方
法が利用可能にされる。特に好適な実施態様では、本発明によるオリゴヌクレオ
チドは、例えばウマにおける小ストロンギルドルド(シアトストミナエ)におけ
る耐性、特に種シリコシクルス・ナッサタス、シアトストマム・コロナタムおよ
びシアトストマム・カチナタムの耐性の同定を可能にさせる。この操作では、β
−チューブリンの耐性型が、それをコードする本発明によるDNAにおいて、例
えば、Elard et al.(1998)PCR diagnosis o
f benzimidazole−susceptibility or −r
esistanece in natural populations of
the small ruminant parasite,Telador sagia circumcincta ,Veterinary Parasi
tology 80,231−237において記述されているようなPCRによ
って検出できる、少なくとも1つの点突然変異を担持するという事実が使用でき
る。
ハイブリダイゼーションによって、好ましくはβ−チューブリンをコードするD
NAのイントロン領域にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドを用いて、種々
の種の小ストロンギルドおよび/または他の線虫種間を区別することをできる方
法が利用可能にされる。特に好適な実施態様では、本発明によるオリゴヌクレオ
チドは、例えばウマにおける小ストロンギルドルド(シアトストミナエ)におけ
る耐性、特に種シリコシクルス・ナッサタス、シアトストマム・コロナタムおよ
びシアトストマム・カチナタムの耐性の同定を可能にさせる。この操作では、β
−チューブリンの耐性型が、それをコードする本発明によるDNAにおいて、例
えば、Elard et al.(1998)PCR diagnosis o
f benzimidazole−susceptibility or −r
esistanece in natural populations of
the small ruminant parasite,Telador sagia circumcincta ,Veterinary Parasi
tology 80,231−237において記述されているようなPCRによ
って検出できる、少なくとも1つの点突然変異を担持するという事実が使用でき
る。
【0128】
前記方法は、線虫類に罹ったヒトおよび動物、例えばウマ、ヒツジ、ブタ、ヤ
ギ、ラクダ、バッファロー、ロバ、野ウサギ、ノロ、毛皮動物、トリ(例えばニ
ワトリ、シチメンチョウ、アヒル)、淡水および塩水魚(例えばニジマス、コイ
)における可能な治療戦略の調査のために特に有用である。それは、寄生線虫類
の同定および区別ならびにその耐性集団の認識を可能にさせ、活性のない殺線虫
剤による治療を回避する。
ギ、ラクダ、バッファロー、ロバ、野ウサギ、ノロ、毛皮動物、トリ(例えばニ
ワトリ、シチメンチョウ、アヒル)、淡水および塩水魚(例えばニジマス、コイ
)における可能な治療戦略の調査のために特に有用である。それは、寄生線虫類
の同定および区別ならびにその耐性集団の認識を可能にさせ、活性のない殺線虫
剤による治療を回避する。
【0129】
ここに記述される方法は、例えば、即時使用剤形において製造される上記核酸
分子または前記抗体の少なくとも1つを含有するプレハブ診断試験キットの形態
において利用可能にさせる。
分子または前記抗体の少なくとも1つを含有するプレハブ診断試験キットの形態
において利用可能にさせる。
【0130】
殺線虫物質の発見方法
本発明は、チューブリンもしくはそのフラグメントを用いて、新規な特異的駆
虫物質が同定できる方法に関する。
虫物質が同定できる方法に関する。
【0131】
好適な実施態様では、本発明によるβ−チューブリンポリペプチドがこのため
に使用される。しかしながら、方法は、また、ここに記述されるもの以外の種由
来のチューブリンを用いても実施できる。本発明によるもの以外のβ−チューブ
リンポリペプチドを使用する方法は、本発明によって完全に包含される。特に好
ましくは、配列番号:2,4,6,8もしくは10に示されるβ−チューブリン
ポリペプチドが、前記方法のために使用される。したがって、本発明では、しば
しば存在している寄生線虫類由来のβ−チューブリンポリペプチドが、さらに利
用可能にされる。これらは、チューブリン相互作用、またはチューブリンサブユ
ニットの相互作用の新規インヒビターの同定のための種々の試験システムにおい
て使用できる。
に使用される。しかしながら、方法は、また、ここに記述されるもの以外の種由
来のチューブリンを用いても実施できる。本発明によるもの以外のβ−チューブ
リンポリペプチドを使用する方法は、本発明によって完全に包含される。特に好
ましくは、配列番号:2,4,6,8もしくは10に示されるβ−チューブリン
ポリペプチドが、前記方法のために使用される。したがって、本発明では、しば
しば存在している寄生線虫類由来のβ−チューブリンポリペプチドが、さらに利
用可能にされる。これらは、チューブリン相互作用、またはチューブリンサブユ
ニットの相互作用の新規インヒビターの同定のための種々の試験システムにおい
て使用できる。
【0132】
セル・フリー試験システム
それらの目的としての化合物および天然抽出物の試験をする多くの試験システ
ムは、与えられた期間内に検討される物質の数を最大にするために高い処理数を
ねらっている。セル・フリーの研究に基づく試験システムは精製または半精製タ
ンパク質を使用する。それらは、標的タンパク質への物質の可能性のある影響を
検出することを主なねらいとする「最初の」試験に適している。
ムは、与えられた期間内に検討される物質の数を最大にするために高い処理数を
ねらっている。セル・フリーの研究に基づく試験システムは精製または半精製タ
ンパク質を使用する。それらは、標的タンパク質への物質の可能性のある影響を
検出することを主なねらいとする「最初の」試験に適している。
【0133】
細胞毒性のような効果は、これらのイン・ビトロ系において一般に無視される
。この場合の試験システムは、物質の阻害および抑制効果、および刺激効果の両
方をチェックする。物質の有効性は濃度依存試験シリーズによってチェックでき
る。試験物質を含まない対照バッチが使用されて効果が検査される。
。この場合の試験システムは、物質の阻害および抑制効果、および刺激効果の両
方をチェックする。物質の有効性は濃度依存試験シリーズによってチェックでき
る。試験物質を含まない対照バッチが使用されて効果が検査される。
【0134】
チューブリンもしくはそのサブユニットの相互作用をモジュレートする物質の
同定のための1つの可能性は、「シンチレーション近似アッセイ」(SPA)で
ある、欧州特許第015473号、参照。この試験システムは、放射能標識され
たリガンド(例えば、小有機分子もしくは第2の放射能標識タンパク質分子)と
レセプター(例えばチューブリン)との相互作用を使用する。レセプターは、こ
の場合、シンチレート分子を備えている小球(「ミクロスフェア」)もしくはビ
ーズに結合される。放射能の崩壊過程において、ミクロスフェア中のシンチレー
ト物質は、放射能標識の亜原子粒子によって励起され、そして検出しうる光子が
放出される。リガンドから発するそれらの粒子のみが、レセプターもしくはチュ
ーブリンに結合されたリガンドから発するシグナルをもたらすように、試験条件
が最適化される。
同定のための1つの可能性は、「シンチレーション近似アッセイ」(SPA)で
ある、欧州特許第015473号、参照。この試験システムは、放射能標識され
たリガンド(例えば、小有機分子もしくは第2の放射能標識タンパク質分子)と
レセプター(例えばチューブリン)との相互作用を使用する。レセプターは、こ
の場合、シンチレート分子を備えている小球(「ミクロスフェア」)もしくはビ
ーズに結合される。放射能の崩壊過程において、ミクロスフェア中のシンチレー
ト物質は、放射能標識の亜原子粒子によって励起され、そして検出しうる光子が
放出される。リガンドから発するそれらの粒子のみが、レセプターもしくはチュ
ーブリンに結合されたリガンドから発するシグナルをもたらすように、試験条件
が最適化される。
【0135】
1つの可能な実施態様では、チューブリンは、相互作用または結合する試験物
質の有無によらずビーズに結合される。α−もしくはβ−チューブリンサブユニ
ットがここでは使用できる。放射能標識リガンドは、例えば、標識されたベンズ
イミダゾールまたはさらなる標識されたβ−チューブリン分子であってもよい。
固定されたチューブリンへのリガンドの結合の場合には、このリガンドは、接触
表面の領域にそれ自体を結合するために、固定化チューブリンと遊離チューブリ
ン間に存在する相互作用を阻害または阻止するにちがいない。生じた固定化チュ
ーブリンへの結合が、次に光のフラッシュによって検出できる。対応して、固定
化および遊離の、標識チューブリン間に存在する複合体は、試験物質の結合によ
って壊され、この物質は光のフラッシュの検出される強度を減少させる。そこで
、試験システムは補足的阻害システムに対応する。
質の有無によらずビーズに結合される。α−もしくはβ−チューブリンサブユニ
ットがここでは使用できる。放射能標識リガンドは、例えば、標識されたベンズ
イミダゾールまたはさらなる標識されたβ−チューブリン分子であってもよい。
固定されたチューブリンへのリガンドの結合の場合には、このリガンドは、接触
表面の領域にそれ自体を結合するために、固定化チューブリンと遊離チューブリ
ン間に存在する相互作用を阻害または阻止するにちがいない。生じた固定化チュ
ーブリンへの結合が、次に光のフラッシュによって検出できる。対応して、固定
化および遊離の、標識チューブリン間に存在する複合体は、試験物質の結合によ
って壊され、この物質は光のフラッシュの検出される強度を減少させる。そこで
、試験システムは補足的阻害システムに対応する。
【0136】
細胞に基づく試験システム
本発明によって利用しうるβ−チューブリン、しかしまた他の種由来のチュー
ブリンは、チューブリン相互作用を阻害する物質の同定のために、細胞に基づく
試験システムの開発を可能にする。
ブリンは、チューブリン相互作用を阻害する物質の同定のために、細胞に基づく
試験システムの開発を可能にする。
【0137】
そのような試験システムの例は「ツーハイブリッド系」である。この特定の例
は「相互作用トラップ」である。これは、酵母において相互作用するタンパク質
の遺伝的選択である(例えば、Gyuris et al.(1993)Cdi
1,a human G1 and S phase protein ph
osphatase that associates with Cdk 2
.Cell 75,791−803、参照)。試験システムは、生じた相互作
用が検出可能なシグナルをもたらすことにおいて、2種のタンパク質の相互作用
を検出し、記録するように設計される。
は「相互作用トラップ」である。これは、酵母において相互作用するタンパク質
の遺伝的選択である(例えば、Gyuris et al.(1993)Cdi
1,a human G1 and S phase protein ph
osphatase that associates with Cdk 2
.Cell 75,791−803、参照)。試験システムは、生じた相互作
用が検出可能なシグナルをもたらすことにおいて、2種のタンパク質の相互作用
を検出し、記録するように設計される。
【0138】
そのような試験システムは、また、与えられた期間内の多数の試験物質の試験
処理に適合できる。
処理に適合できる。
【0139】
システムは、2種のベクター、「バイト(えさ、bait)」ベクターおよび
「プレイ(捕食、prey)」ベクターの構築に基づく。チューブリンをコード
する遺伝子、好ましくは本発明によるβ−チューブリンをコードする遺伝子が、
バイトベクターにおいてクローン化され、次いでLexAタンパク質、DNA結
合タンパク質との融合タンパク質として発現される。チューブリン、好ましくは
本発明によるβ−チューブリンをコードする第2の遺伝子は、プレイベクター中
にクローン化され、この場合、それは、B42プレイタンパク質との融合タンパ
ク質として発現される。両ベクターは、サッカロミセス・セレビシエ(Sacc haromyces cerevisiae )宿主において存在し、これは、l
acZまたはHIS3レポーター遺伝子の5’側においてLexA結合DNAの
コピーを含有している。相互作用が2つのチューブリン(融合)タンパク質間に
起きる場合、レポーター遺伝子の転写の活性化が生じる。試験物質の存在がチュ
ーブリン相互作用の阻害または妨害をもたらす場合、2つのチューブリン(融合
)タンパク質は、もはや相互作用できず、そしてレポーター遺伝子の生産物は、
もはや生産されない。
「プレイ(捕食、prey)」ベクターの構築に基づく。チューブリンをコード
する遺伝子、好ましくは本発明によるβ−チューブリンをコードする遺伝子が、
バイトベクターにおいてクローン化され、次いでLexAタンパク質、DNA結
合タンパク質との融合タンパク質として発現される。チューブリン、好ましくは
本発明によるβ−チューブリンをコードする第2の遺伝子は、プレイベクター中
にクローン化され、この場合、それは、B42プレイタンパク質との融合タンパ
ク質として発現される。両ベクターは、サッカロミセス・セレビシエ(Sacc haromyces cerevisiae )宿主において存在し、これは、l
acZまたはHIS3レポーター遺伝子の5’側においてLexA結合DNAの
コピーを含有している。相互作用が2つのチューブリン(融合)タンパク質間に
起きる場合、レポーター遺伝子の転写の活性化が生じる。試験物質の存在がチュ
ーブリン相互作用の阻害または妨害をもたらす場合、2つのチューブリン(融合
)タンパク質は、もはや相互作用できず、そしてレポーター遺伝子の生産物は、
もはや生産されない。
【0140】
チューブリン、特に本発明によるβ−チューブリンまたはそのフラグメント、
および上記方法により、新規な、そして特異的な抗寄生虫化合物を同定すること
が可能である。
および上記方法により、新規な、そして特異的な抗寄生虫化合物を同定すること
が可能である。
【0141】
上記方法およびポリペプチドにより見いだされる化合物は、ヒト、または農業
動物、ペット、動物園動物ならびに研究室動物および試験動物の病原性内部寄生
虫に感染しているヒトおよび動物の治療のために有用である。
動物、ペット、動物園動物ならびに研究室動物および試験動物の病原性内部寄生
虫に感染しているヒトおよび動物の治療のために有用である。
【0142】
化合物は、正常な、感受性株およびまた耐性株の発生の全段階に対して活性が
ある。これらの化合物の1種以上を含有する薬剤による治療によって、農業動物
の場合の経済的損失ならびにヒトおよび動物における疾病の両方が、回避または
治療することができる。次の寄生虫が、発見された活性化合物の標的としてこの
場合特に興味がある: 有針類(Enoplida)目、例えば:トリキュリス種(Trichuri s spp.),カピラリア種(Capillaria spp.),トリコモ
ソイデス種(Trichomosoides spp.),トリキネラ種(Tr ichinella spp.)。
ある。これらの化合物の1種以上を含有する薬剤による治療によって、農業動物
の場合の経済的損失ならびにヒトおよび動物における疾病の両方が、回避または
治療することができる。次の寄生虫が、発見された活性化合物の標的としてこの
場合特に興味がある: 有針類(Enoplida)目、例えば:トリキュリス種(Trichuri s spp.),カピラリア種(Capillaria spp.),トリコモ
ソイデス種(Trichomosoides spp.),トリキネラ種(Tr ichinella spp.)。
【0143】
桿線虫類(Rhabditia)目、例えば:ミクロネマ種(Microne ma
spp.),ストロンジロイデス種(Strongyloides sp
p.)。
p.)。
【0144】
円虫類(Strongylida)目、例えば:ストロンギルス種(Stro ngylus
spp.),トリオドントホラス種(Triodontopho rus
spp.),エソファゴドンタス種(Oesophagodontus
spp.),トリコネマ種(Trichonema spp.),ジアロセフ
ァルス種(Gyalocephalus spp.),シリンドロファリンクス
種(Cylindropharynx spp.),ポテリオストマム種(Po teriostomum spp.),シクロコセルカス種(Cyclococ ercus spp.),シリコステファナス種(Cylicostephan us spp.),エソファゴストマム種(Oesophagostomum
spp.),チャベルチア種(Chabertia spp.),ステファヌラ
ス種(Stephanurus spp.),アンシロストマ種(Ancylo stoma spp.),アンシナリア種(Uncinaria spp.),
ブノストマム種(Bunostomum spp.),グロボセファルス種(G lobocephalus spp.),シンガムス種(Syngamus s
pp.),シアトストマム種(Cyathostomum spp.),シリコ
シクルス種(Cylicocyclus spp.)、ネオストロンジルス種( Neostrongylus spp.),シストカウルス種(Cystoca ulus spp.),ニウモストロンジルス種(Pneumostrongy lus spp.),スピコカウルス種(Spicocaulus spp.)
,エラホストロンジルス種(Elaphostrongylus spp.),
パレラホストロンジルス種(Parelaphostrongylus spp
.),クレノソマ種(Crenosoma spp.),パラクレノソマ種(P aracrenosoma spp.),アンジオストロンジルス種(Angi ostrongylus spp.),エルロストロンジルス種(Aeluro strongylus spp.),フィラロイデス種(Filaroides spp.),パラフィラロイデス種(Parafilaroides spp
.),トリコストロンジルス種(Trichostrongylus spp.
),ハエモンカス種(Haemonchus spp.),オステルタジア種( Ostertagia spp.),マルシャラジア種(Marshallag ia spp.),クーペリア種(Cooperia spp.),ネマトジラ
ス種(Nematodirus spp.),ヒオストロンジルス種(Hyos trongylus spp.),オベリスコイデス種(Obeliscoid es spp.),アミドストマム種(Amidostomum spp.),
オルラヌス種(Ollulanus spp.)。
ァルス種(Gyalocephalus spp.),シリンドロファリンクス
種(Cylindropharynx spp.),ポテリオストマム種(Po teriostomum spp.),シクロコセルカス種(Cyclococ ercus spp.),シリコステファナス種(Cylicostephan us spp.),エソファゴストマム種(Oesophagostomum
spp.),チャベルチア種(Chabertia spp.),ステファヌラ
ス種(Stephanurus spp.),アンシロストマ種(Ancylo stoma spp.),アンシナリア種(Uncinaria spp.),
ブノストマム種(Bunostomum spp.),グロボセファルス種(G lobocephalus spp.),シンガムス種(Syngamus s
pp.),シアトストマム種(Cyathostomum spp.),シリコ
シクルス種(Cylicocyclus spp.)、ネオストロンジルス種( Neostrongylus spp.),シストカウルス種(Cystoca ulus spp.),ニウモストロンジルス種(Pneumostrongy lus spp.),スピコカウルス種(Spicocaulus spp.)
,エラホストロンジルス種(Elaphostrongylus spp.),
パレラホストロンジルス種(Parelaphostrongylus spp
.),クレノソマ種(Crenosoma spp.),パラクレノソマ種(P aracrenosoma spp.),アンジオストロンジルス種(Angi ostrongylus spp.),エルロストロンジルス種(Aeluro strongylus spp.),フィラロイデス種(Filaroides spp.),パラフィラロイデス種(Parafilaroides spp
.),トリコストロンジルス種(Trichostrongylus spp.
),ハエモンカス種(Haemonchus spp.),オステルタジア種( Ostertagia spp.),マルシャラジア種(Marshallag ia spp.),クーペリア種(Cooperia spp.),ネマトジラ
ス種(Nematodirus spp.),ヒオストロンジルス種(Hyos trongylus spp.),オベリスコイデス種(Obeliscoid es spp.),アミドストマム種(Amidostomum spp.),
オルラヌス種(Ollulanus spp.)。
【0145】
蟯虫類(Oxyurida)目、例えば:オキシウリス種(Oxyuris
spp.),エンテロビウス種(Enterobius spp.),パサルラ
ス種(Passalurus spp.),シファシア種(Syphacia
spp.),アスピクルリス種(Aspiculuris spp.),ヘテラ
キス種(Heterakis spp.)。
spp.),エンテロビウス種(Enterobius spp.),パサルラ
ス種(Passalurus spp.),シファシア種(Syphacia
spp.),アスピクルリス種(Aspiculuris spp.),ヘテラ
キス種(Heterakis spp.)。
【0146】
回虫類(Ascaridida)目、例えば:アスカリス種(Ascaris
spp.)、トキサスカリス種(Toxascaris spp.)、トキソ
カラ種(Toxocara spp.)、パラスカリス種(Parascari s spp.)、アニサキス種(Anisakis spp.)、アスカリジア
種(Ascaridia spp.)。
カラ種(Toxocara spp.)、パラスカリス種(Parascari s spp.)、アニサキス種(Anisakis spp.)、アスカリジア
種(Ascaridia spp.)。
【0147】
旋尾線虫類(Spirurida)目、例えば:グナトストマ種(Gnath ostoma
spp.),フィサロプテラ種(Physaloptera s
pp.),テラジア種(Thelazia spp.),ゴンジロネマ種(Go ngylonema spp.),ハブロネマ種(Habronema spp
.),パラブロネマ種(Parabronema spp.),ドラスキア種( Draschia spp.),ドラカンクルス種(Dracunculus
spp.)。
pp.),テラジア種(Thelazia spp.),ゴンジロネマ種(Go ngylonema spp.),ハブロネマ種(Habronema spp
.),パラブロネマ種(Parabronema spp.),ドラスキア種( Draschia spp.),ドラカンクルス種(Dracunculus
spp.)。
【0148】
糸状虫類(Filariida)目、例えば:ステファノフィラリア種(St ephanofilaria
spp.),パラフィラリア種(Parafil aria
spp.),セタリア種(Setaria spp.),ロア種(L oa
spp.),ジロフィラリア種(Dirofilaria spp.),
リトモソイデス種(Litomosoides spp.),ブルジア種(Br ugia spp.),ブケレリア種(Wuchereria spp.),オ
ンコセルカ種(Onchocerca spp.)。
リトモソイデス種(Litomosoides spp.),ブルジア種(Br ugia spp.),ブケレリア種(Wuchereria spp.),オ
ンコセルカ種(Onchocerca spp.)。
【0149】
鉤頭虫類(Gigantorhynchida)目、例えば:フィリコリス種
(Filicollis spp.),モニリホルミス種(Monilifor mis spp.),マクラカントリンカス種(Macracanthorhy nchus spp.),プロテノルキス種(Prothenorchis s
pp.)。
(Filicollis spp.),モニリホルミス種(Monilifor mis spp.),マクラカントリンカス種(Macracanthorhy nchus spp.),プロテノルキス種(Prothenorchis s
pp.)。
【0150】
鞭毛藻類(Mastigophora(Flagellata))
トリパノソマ科(Trypanosomatidae)、例えば、トリパノソ
マ b.ブルセイ(Trypanosoma b.brucei)、T.b.ガ
ムビエンセ(T.b.gambiense)、T.コンゴレンセ(T.cong
olense)、T.クルジ(T.Cruzi),T.エバンシ(T.evan si ),T.エクイナム(T.equinum),T.レビシ(T.lewis i ),T.ペルカエ(T.percae),T.シミエ(T.simiae),
T.ビバックス(T.vivax),ライシュマニア・ブラシリエンシス(Le ishmania brasiliensis ),L.ドノバニ(L.dono vani ),L.トロピカ(L.tropica)、 トリコモナド科(Trichomonadidae)、例えば、ギアルジア・
ラムビリア(Giardia lambilia),G.カニス(G.cani s ). 有毛根足虫類(根足虫類)(Sarcomastigophora(Rhiz opoda) )、例えば、エンタモエバ・ヒストリチカ(Entamoeba histolytica ) ハルトマネラ科(Hartmanellidae),例えば、アカンタモエバ
種(Acanthamoeba sp.),ハルトマネラ種(Hartmane lla spp.) 胞子虫類(Apicomplexa(Sporozoa))、例えば、エイメ
リア・アセルブリナ(Eimeria acervulina),E.アデノイ
デス(E.adenoides),E.アラバメンシス(E.alabahme nsis ),E.アナチス(E.anatis),E.アンセリス(E.ans eris ),E.アルロインギ(E.arloingi),E.アシャタ(E. ashata ),E.アウブルネンシス(E.auburnensis),E.
ボビス(E.bovis),E.ブルネッチ(E.brunetti),E.カ
ニス(E.canis),E.チンチラエ(E.chinchillae),E
.クルペアルム(E.clupearum),E.コルムバエ(E.colum bae ),E.コントルタ(E.contorta),E.クランダリス(E. crandalis ),E.デルブリエッキ(E.debliecki),エ.
ジスペルサ(E.dispersa),E.エリプソイダレス(E.ellip soidales ),E.ファルシフォルミス(E.falciformis)
,E.ファウレイ(E.faurei),E.ラベアナ(E.labbeana ),E.ロイカルチ(E.leucarti),E.マグナ(E.magna)
,E.マキシマ(E.maxima),E.メジア(E.media),E.メ
レアグリジス(E.meleagridis),E.メレアグリミチス(E.m eleagrimitis ),E.ミチス(E.mitis),E.ネカトリッ
クス(E.necatrix),E.ニナコーリアキモバエ(E.ninako hlyakimovae ),E.オービス(E.ovis),E.パルバ(E. parva ),E.パボニス(E.pavonis),E.ペルホランス(E. perforans ),E.ファサニ(E.phasani),E.ピリホルミ
ス(E.piriformis),E.プラエコックス(E.praecox)
,E.レシヅア(E.residua),E.スカブラ(E.scabra), E.spec. ,E.スチエダイ(E.stiedai),E.スイス(E.s uis ),E.テネラ(E.tenella),E.トルンカタ(E.trun cata ),E.トルッタエ(E.truttae),E.ズエルニイ(E.z uernii ),グロビジウム種(Globidium spec.),イソス
ポラ・ベリイ(Isospora belli),I.カニス(I.canis ),I.フェリス(I.felis),I.オヒオエンシス(I.ohioen sis ),I.リボルタ(I.rivolta),I.spec.,I.スイス
(I.suis),エオスポラ・カニナム(Neospora caninum ),シスチソスポラ種(Cystisospora spec.),クリプトス
ポリジウム種(Cryptosporidium spec.)、 トキソプラスマ科(Toxoplasmadidae)、例えば、トキソプラ
スマ・ゴンジイ(Toxoplasma gondii) サルコシスト科(Sarcocystidae)、例えば、サルコシスチス・
ボビカニス(Sarcocystis bovicanis),S.ボビホミニ
ス(S.bovihominis),S.ノイボナ(S.neuvona),S
.オビカニス(S.ovicanis),S.オビフェリス(S.ovifel is ),S.spec.,S.スイホミニス(S.suihominis) ロイコゾイド(Leucozoide)、例えば、ロイコジドズーン・シモン
ジ(Leucozytozoon simondi) プラスモジウム科(Plasmodiidae)、例えば、プラスモジウム・
ベルゲイ(Plasmodium berghei),P.ファルシパルム(P .falciparum ),P.マラリアエ(P.malariae),P.オ
バレ(P.ovale),P.ビバックス(P.vivax),P.spec. ピロプラスマ類(Piroplasmea)、例えば、バベシア・アルジェン
チナ(Babesia argentina),B.ボビス(B.bovis)
,B.カニス(B.canis),B.spec.,テイレリア・パルバ(Th eileria parva ),T.spec. アデレイナ(Adeleina),例えば、ヘパトズーン・カニス(Hepa tozoon canis ),H.spec. 次のものはさらに重要である: 粘液胞子虫類(Myxospora)および微胞子虫類(Microspor a )、例えば、グルゲア種(Glugea spec.)およびノセマ種(No sema spec. )およびニューモシスチス・カリニイ(Pneumocy stis carinii )、有毛類(繊毛虫類)(Ciliophora(C iliata) )、例えば、バランチジウム・コリ(Balantidium coli ),イクチオフチリウス種(Ichthiophthirius sp ec. ),トリコンジナ種(Trichondina spec.)またはエピ
スチリス種(Epistylis spec.)。
マ b.ブルセイ(Trypanosoma b.brucei)、T.b.ガ
ムビエンセ(T.b.gambiense)、T.コンゴレンセ(T.cong
olense)、T.クルジ(T.Cruzi),T.エバンシ(T.evan si ),T.エクイナム(T.equinum),T.レビシ(T.lewis i ),T.ペルカエ(T.percae),T.シミエ(T.simiae),
T.ビバックス(T.vivax),ライシュマニア・ブラシリエンシス(Le ishmania brasiliensis ),L.ドノバニ(L.dono vani ),L.トロピカ(L.tropica)、 トリコモナド科(Trichomonadidae)、例えば、ギアルジア・
ラムビリア(Giardia lambilia),G.カニス(G.cani s ). 有毛根足虫類(根足虫類)(Sarcomastigophora(Rhiz opoda) )、例えば、エンタモエバ・ヒストリチカ(Entamoeba histolytica ) ハルトマネラ科(Hartmanellidae),例えば、アカンタモエバ
種(Acanthamoeba sp.),ハルトマネラ種(Hartmane lla spp.) 胞子虫類(Apicomplexa(Sporozoa))、例えば、エイメ
リア・アセルブリナ(Eimeria acervulina),E.アデノイ
デス(E.adenoides),E.アラバメンシス(E.alabahme nsis ),E.アナチス(E.anatis),E.アンセリス(E.ans eris ),E.アルロインギ(E.arloingi),E.アシャタ(E. ashata ),E.アウブルネンシス(E.auburnensis),E.
ボビス(E.bovis),E.ブルネッチ(E.brunetti),E.カ
ニス(E.canis),E.チンチラエ(E.chinchillae),E
.クルペアルム(E.clupearum),E.コルムバエ(E.colum bae ),E.コントルタ(E.contorta),E.クランダリス(E. crandalis ),E.デルブリエッキ(E.debliecki),エ.
ジスペルサ(E.dispersa),E.エリプソイダレス(E.ellip soidales ),E.ファルシフォルミス(E.falciformis)
,E.ファウレイ(E.faurei),E.ラベアナ(E.labbeana ),E.ロイカルチ(E.leucarti),E.マグナ(E.magna)
,E.マキシマ(E.maxima),E.メジア(E.media),E.メ
レアグリジス(E.meleagridis),E.メレアグリミチス(E.m eleagrimitis ),E.ミチス(E.mitis),E.ネカトリッ
クス(E.necatrix),E.ニナコーリアキモバエ(E.ninako hlyakimovae ),E.オービス(E.ovis),E.パルバ(E. parva ),E.パボニス(E.pavonis),E.ペルホランス(E. perforans ),E.ファサニ(E.phasani),E.ピリホルミ
ス(E.piriformis),E.プラエコックス(E.praecox)
,E.レシヅア(E.residua),E.スカブラ(E.scabra), E.spec. ,E.スチエダイ(E.stiedai),E.スイス(E.s uis ),E.テネラ(E.tenella),E.トルンカタ(E.trun cata ),E.トルッタエ(E.truttae),E.ズエルニイ(E.z uernii ),グロビジウム種(Globidium spec.),イソス
ポラ・ベリイ(Isospora belli),I.カニス(I.canis ),I.フェリス(I.felis),I.オヒオエンシス(I.ohioen sis ),I.リボルタ(I.rivolta),I.spec.,I.スイス
(I.suis),エオスポラ・カニナム(Neospora caninum ),シスチソスポラ種(Cystisospora spec.),クリプトス
ポリジウム種(Cryptosporidium spec.)、 トキソプラスマ科(Toxoplasmadidae)、例えば、トキソプラ
スマ・ゴンジイ(Toxoplasma gondii) サルコシスト科(Sarcocystidae)、例えば、サルコシスチス・
ボビカニス(Sarcocystis bovicanis),S.ボビホミニ
ス(S.bovihominis),S.ノイボナ(S.neuvona),S
.オビカニス(S.ovicanis),S.オビフェリス(S.ovifel is ),S.spec.,S.スイホミニス(S.suihominis) ロイコゾイド(Leucozoide)、例えば、ロイコジドズーン・シモン
ジ(Leucozytozoon simondi) プラスモジウム科(Plasmodiidae)、例えば、プラスモジウム・
ベルゲイ(Plasmodium berghei),P.ファルシパルム(P .falciparum ),P.マラリアエ(P.malariae),P.オ
バレ(P.ovale),P.ビバックス(P.vivax),P.spec. ピロプラスマ類(Piroplasmea)、例えば、バベシア・アルジェン
チナ(Babesia argentina),B.ボビス(B.bovis)
,B.カニス(B.canis),B.spec.,テイレリア・パルバ(Th eileria parva ),T.spec. アデレイナ(Adeleina),例えば、ヘパトズーン・カニス(Hepa tozoon canis ),H.spec. 次のものはさらに重要である: 粘液胞子虫類(Myxospora)および微胞子虫類(Microspor a )、例えば、グルゲア種(Glugea spec.)およびノセマ種(No sema spec. )およびニューモシスチス・カリニイ(Pneumocy stis carinii )、有毛類(繊毛虫類)(Ciliophora(C iliata) )、例えば、バランチジウム・コリ(Balantidium coli ),イクチオフチリウス種(Ichthiophthirius sp ec. ),トリコンジナ種(Trichondina spec.)またはエピ
スチリス種(Epistylis spec.)。
【0151】
さらに、発見された化合物および薬剤は、昆虫類の原生動物、例えば株、微胞
子虫類(Microsporidia)、特に目ノセマ(Nosema)、非常
に特には、ミツバチの寄生虫である種ノセマ・アピス(Nosema apis )に対して効果的である。
子虫類(Microsporidia)、特に目ノセマ(Nosema)、非常
に特には、ミツバチの寄生虫である種ノセマ・アピス(Nosema apis )に対して効果的である。
【0152】
実施例
例1
β−チューブリンcDNAおよびゲノムDNAの取得
mRNAは、C.ナッサタス蠕虫からQuick PrepRMicro m
RNAキット(Biotech,Freiburg,Germany)を用いて
、そしてC.コロナタムおよびC.カチナタム蠕虫からDynalRmRNA
Directキット(Dynal,Hamburg,Germany)を用いて
得られた。蠕虫類は、ウマの大腸から分離され、そして頭部および尾部の特徴的
構造にしたがって顕微鏡的に区別された(R.S.Lichtenfeld(1
975),Helminths of domestic equids,Pr
oceedings of the Helminthological So
ciety,Washington,42(Special issue),1
−92、参照)。
RNAキット(Biotech,Freiburg,Germany)を用いて
、そしてC.コロナタムおよびC.カチナタム蠕虫からDynalRmRNA
Directキット(Dynal,Hamburg,Germany)を用いて
得られた。蠕虫類は、ウマの大腸から分離され、そして頭部および尾部の特徴的
構造にしたがって顕微鏡的に区別された(R.S.Lichtenfeld(1
975),Helminths of domestic equids,Pr
oceedings of the Helminthological So
ciety,Washington,42(Special issue),1
−92、参照)。
【0153】
cDNAの合成は、C.ナッサタス由来のmRNAの場合には「逆転写系」(
Promega,Madison,USA)を用いて、そしてC.コロナタムお
よびC.カチナタム由来のmRNAの場合にはsuperscript RTI
I逆転写酵素(Gibco BRL Life Technologies)を
用いて実施された。上記場合には、長さ15塩基対をもつオリゴヌクレオチドが
使用された。インキュベーションは、42℃で1時間実施された。
Promega,Madison,USA)を用いて、そしてC.コロナタムお
よびC.カチナタム由来のmRNAの場合にはsuperscript RTI
I逆転写酵素(Gibco BRL Life Technologies)を
用いて実施された。上記場合には、長さ15塩基対をもつオリゴヌクレオチドが
使用された。インキュベーションは、42℃で1時間実施された。
【0154】
ゲノムDNAは、QIA Amp−tissueキット(Qiagen,Hi
lden,Germany)を用いて4〜40匹の成蠕虫から得られた。この操
作では、蠕虫類はプロテアーゼKにより55℃で2時間消化され、そしてゲノム
DNAは「スピンカラム」を用いて抽出された。
lden,Germany)を用いて4〜40匹の成蠕虫から得られた。この操
作では、蠕虫類はプロテアーゼKにより55℃で2時間消化され、そしてゲノム
DNAは「スピンカラム」を用いて抽出された。
【0155】
例2
β−チューブリン配列の増幅
全長のβ−チューブリン配列またはフラグメントの増幅は、例えば、Ampl
iTaq GoldTMポリメラーゼ(Perkin Elmer,Foster
City,California,USA)を用いて実施できる。
iTaq GoldTMポリメラーゼ(Perkin Elmer,Foster
City,California,USA)を用いて実施できる。
【0156】
配列番号:1,3,5,7,9もしくは11に示されるβ−チューブリン配列
またはそのフラグメントの増幅は、配列番号:12−51に示されるプライマー
を用いて実施できる。
またはそのフラグメントの増幅は、配列番号:12−51に示されるプライマー
を用いて実施できる。
【0157】
C.コロナタム由来のcDNAの増幅では、例えば、配列番号:43および4
4に示される配列が適当であり、C.カチナタム由来のcDNAの増幅では、配
列番号:40および42に示される配列が特に適当である。
4に示される配列が適当であり、C.カチナタム由来のcDNAの増幅では、配
列番号:40および42に示される配列が特に適当である。
【0158】
C.ナッサタスcDNAおよび本発明によるあらゆる種のゲノムDNAの増幅
は、10xバッファー5μl、MgCl2(25mM)2.5μl、dNTP混
合液(各NTPについて2mM)2μl、各特異的プライマー(配列番号:12
−47)(50pmol/μl)1μl、ポリメラーゼ0.5μl(2.5U)
およびDNA鋳型1−5μlを含有する総容量50μlにおいて実施された。退
化プライマー(配列番号:48−51)を用いる場合は、濃度500pmol/
μlの各プライマー1μlが用いられた。アニーリングは、退化プライマーの場
合には46℃において実施され、特異的プライマーの場合は、温度は計算される
融解温度にしたがって変えられた。PCRサイクルは次のように選ばれた: 10分間96℃、次いで94℃で1分変性により35−40サイクル、1分アニ
ーリング、72℃で1分および10分間72℃の最終段階。C.コロナタムおよ
びC.カチナタム由来のcDNAの増幅では、次のプロフィルをもつ「タッチダ
ウン」PCR温度プログラムが実施された: 最初に、30秒間94℃で15サイクル、次いで60℃で1分および72℃で1
分、続いて95℃で30秒により15サイクル、1分間55℃および1分間72
℃、そして最後に、30秒間95℃で10サイクル、次いで1分間45℃および
1分間72℃。比較的大きいフラグメント(>1000塩基対)の増幅では、7
2℃における伸長相が2.30分に延長された。
は、10xバッファー5μl、MgCl2(25mM)2.5μl、dNTP混
合液(各NTPについて2mM)2μl、各特異的プライマー(配列番号:12
−47)(50pmol/μl)1μl、ポリメラーゼ0.5μl(2.5U)
およびDNA鋳型1−5μlを含有する総容量50μlにおいて実施された。退
化プライマー(配列番号:48−51)を用いる場合は、濃度500pmol/
μlの各プライマー1μlが用いられた。アニーリングは、退化プライマーの場
合には46℃において実施され、特異的プライマーの場合は、温度は計算される
融解温度にしたがって変えられた。PCRサイクルは次のように選ばれた: 10分間96℃、次いで94℃で1分変性により35−40サイクル、1分アニ
ーリング、72℃で1分および10分間72℃の最終段階。C.コロナタムおよ
びC.カチナタム由来のcDNAの増幅では、次のプロフィルをもつ「タッチダ
ウン」PCR温度プログラムが実施された: 最初に、30秒間94℃で15サイクル、次いで60℃で1分および72℃で1
分、続いて95℃で30秒により15サイクル、1分間55℃および1分間72
℃、そして最後に、30秒間95℃で10サイクル、次いで1分間45℃および
1分間72℃。比較的大きいフラグメント(>1000塩基対)の増幅では、7
2℃における伸長相が2.30分に延長された。
【0159】
例3
C.ナッサタス、C.コロナタムおよびC.カチナタム由来のcDNAもしく
はゲノムDNAの増幅からのPCR生成物が、「Original TA Cl
oning Kit」/Invitrogen,Leek,Netherlan
ds)を用いて、すなわち「Original TA CloningR」ベク
ターにおいてクローン化された。
はゲノムDNAの増幅からのPCR生成物が、「Original TA Cl
oning Kit」/Invitrogen,Leek,Netherlan
ds)を用いて、すなわち「Original TA CloningR」ベク
ターにおいてクローン化された。
【配列表】
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考)
C07K 14/435 C12N 1/15 4C084
16/18 1/19 4C085
C12N 1/15 1/21 4H045
1/19 C12P 21/02 C
1/21 C12Q 1/02
5/10 1/68 A
C12P 21/02 G01N 33/15 Z
C12Q 1/02 33/50 Z
1/68 33/53 D
G01N 33/15 33/566
33/50 33/569 A
33/53 33/577 B
33/566 33/58 A
33/569 C12P 21/08
33/577 C12N 15/00 ZNAA
33/58 5/00 A
// C12P 21/08 A61K 37/02
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY,
DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I
T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ
,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML,
MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K
E,LS,MW,MZ,SD,SL,SZ,TZ,UG
,ZW),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,
RU,TJ,TM),AE,AG,AL,AM,AT,
AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,BZ,C
A,CH,CN,CR,CU,CZ,DE,DK,DM
,DZ,EE,ES,FI,GB,GD,GE,GH,
GM,HR,HU,ID,IL,IN,IS,JP,K
E,KG,KP,KR,KZ,LC,LK,LR,LS
,LT,LU,LV,MA,MD,MG,MK,MN,
MW,MX,MZ,NO,NZ,PL,PT,RO,R
U,SD,SE,SG,SI,SK,SL,TJ,TM
,TR,TT,TZ,UA,UG,US,UZ,VN,
YU,ZA,ZW
(72)発明者 シユニーダー,トマス
ドイツ・デー−30539ハノーバー・インデ
アベビエ38
(72)発明者 パペ,ミヒヤエラ
ドイツ・デー−30173ハノーバー・エルカ
ルトアレー21
Fターム(参考) 2G045 AA28 AA40 CB21 DA12 DA13
DA14 DA36 FB02 FB03 FB07
4B024 AA01 AA11 BA31 BA43 CA04
DA02 DA06 EA04 GA01 GA03
GA11 HA14 HA15
4B063 QA01 QA18 QQ08 QQ42 QR32
QR38 QR55 QR77 QR80 QS24
QS25 QS28 QS34 QX02
4B064 AG01 AG27 AG31 CA19 CC24
DA01 DA13 DA20
4B065 AA26X AA90Y AA91X AA92X
AB01 AB05 AC14 BA02 CA24
CA25 CA44 CA45 CA46
4C084 AA02 AA03 AA06 AA07 AA13
BA03 CA53 NA14 ZB392
4C085 AA13 AA14 DD62
4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 BA10
CA50 DA76 DA86 EA29 EA31
EA50 FA74
Claims (45)
- 【請求項1】 シアトストミナエ(Cyathostominae)由来の
β−チューブリンをコードするDNAまたはそのフラグメント。 - 【請求項2】 a)配列番号:2において示されるようなアミノ酸配列をコ
ードするポリヌクレオチドに対して少なくとも85%同一性をもつポリヌクレオ
チド; b)配列番号:4において示されるようなアミノ酸配列をコードするポリヌクレ
オチドに対して少なくとも85%同一性をもつポリヌクレオチド; c)配列番号:6において示されるようなアミノ酸配列をコードするポリヌクレ
オチドに対して少なくとも85%同一性をもつポリヌクレオチド; d)配列番号:8において示されるようなアミノ酸配列をコードするポリヌクレ
オチドに対して少なくとも85%同一性をもつポリヌクレオチド; e)配列番号:10において示されるようなアミノ酸配列をコードするポリヌク
レオチドに対して少なくとも85%同一性をもつポリヌクレオチド; を含んでなる、請求項1記載のDNA。 - 【請求項3】 a)配列番号:2において示されるようなアミノ酸配列をコ
ードするポリヌクレオチドに対して少なくとも95%同一性をもつポリヌクレオ
チド; b)配列番号:4において示されるようなアミノ酸配列をコードするポリヌクレ
オチドに対して少なくとも95%同一性をもつポリヌクレオチド; c)配列番号:6において示されるようなアミノ酸配列をコードするポリヌクレ
オチドに対して少なくとも95%同一性をもつポリヌクレオチド; d)配列番号:8において示されるようなアミノ酸配列をコードするポリヌクレ
オチドに対して少なくとも95%同一性をもつポリヌクレオチド; e)配列番号:10において示されるようなアミノ酸配列をコードするポリヌク
レオチドに対して少なくとも95%同一性をもつポリヌクレオチド; を含んでなる、請求項1記載のDNA。 - 【請求項4】 配列番号:1において示されるような配列を含んでなる、請
求項1〜3の1つに記載のDNA。 - 【請求項5】 配列番号:3において示されるような配列を含んでなる、請
求項1〜3の1つに記載のDNA。 - 【請求項6】 配列番号:5において示されるような配列を含んでなる、請
求項1〜3の1つに記載のDNA。 - 【請求項7】 配列番号:7において示されるような配列を含んでなる、請
求項1〜3の1つに記載のDNA。 - 【請求項8】 配列番号:9において示されるような配列を含んでなる、請
求項1〜3の1つに記載のDNA。 - 【請求項9】 配列番号:11において示されるような配列を含んでなる、
請求項1〜3の1つに記載のDNA。 - 【請求項10】 DNAがシリコシクルス(Cylicocyclus)に
由来することを特徴とする、請求項1〜3および5〜9の1つに記載のDNA。 - 【請求項11】 DNAがシアトストマム(Cyathostomum)に
由来することを特徴とする、請求項1〜4の1つに記載のDNA。 - 【請求項12】 DNAがシリコシクルス・ナッサタス(Cylicocy clus nassatus )に由来することを特徴とする、請求項1〜3およ
び5〜10の1つに記載のDNA。 - 【請求項13】 DNAがシアトストマム・コロナタム(Cyathost omum coronatum )に由来することを特徴とする、請求項1〜4お
よび11の1つに記載のDNA。 - 【請求項14】 DNAが、駆虫剤耐性をもつポリペプチドの発現をもたら
すコドン200における少なくとも1つの塩基置換を含有することを特徴とする
、請求項1〜13の1つに記載のDNA。 - 【請求項15】 DNAが、請求項1〜14の1つに記載のDNAまたはそ
のフラグメントに相補的であることを特徴とする、DNA。 - 【請求項16】 RNAが、請求項1〜15の1つに記載のDNAに相補的
であることを特徴とする、RNA。 - 【請求項17】 発現構築物が、DNAの発現を可能にさせる請求項1〜1
4の1つに記載のDNAおよびそれに機能的に結合された配列を含有することを
特徴とする、構築物。 - 【請求項18】 ベクターが、請求項1〜14の1つに記載のDNAを含有
することを特徴とする、ベクター。 - 【請求項19】 請求項1〜14の1つに記載のDNA、請求項17に記載
の発現構築物、または請求項18に記載のベクターを含んでなる、宿主細胞。 - 【請求項20】 請求項1〜14の1つに記載のDNAまたはそのフラグメ
ントによってコードされているポリペプチド。 - 【請求項21】 配列番号:2において示されるようなアミノ酸配列からな
るか、または含んでなる、請求項20に記載のポリペプチド。 - 【請求項22】 配列番号:4において示されるようなアミノ酸配列からな
るか、または含んでなる、請求項20に記載のポリペプチド。 - 【請求項23】 配列番号:6において示されるようなアミノ酸配列からな
るか、または含んでなる、請求項20に記載のポリペプチド。 - 【請求項24】 配列番号:8において示されるようなアミノ酸配列からな
るか、または含んでなる、請求項20に記載のポリペプチド。 - 【請求項25】 配列番号:10において示されるようなアミノ酸配列から
なるか、または含んでなる、請求項20に記載のポリペプチド。 - 【請求項26】 請求項14に記載のDNAによってコードされているポリ
ペプチド。 - 【請求項27】 原核生物もしくは真核生物発現系におけるポリペプチドま
たはそのフラグメントの発現を含む、請求項20〜26の1つに記載のポリペプ
チドの製造方法。 - 【請求項28】 シアトストミナエに由来するDNAの検出のための、請求
項1〜15の1つに記載のDNA、好ましくは非コーディングDNA部分に特異
的にハイブリダイズするDNAオリゴヌクレオチドの使用。 - 【請求項29】 シアトストミナエに由来し、そして請求項26に記載のポ
リペプチドをコードするDNAの検出のための、請求項1〜15の1つに記載の
DNAに特異的にハイブリダイズするDNAの使用。 - 【請求項30】 請求項28に記載のDNAが、請求項1〜15の1つに記
載のDNAにハイブリダイズされ、そしてこれがPCRの手段によって増幅され
ることを特徴とする、シアトストミナエの検出法。 - 【請求項31】 請求項29に記載のDNAが、請求項1〜15の1つに記
載のDNAにハイブリダイズされ、そしてこれがPCRの手段によって増幅され
ることを特徴とする、駆虫剤耐性をもつシアトストミナエの検出法。 - 【請求項32】 配列番号:12〜配列番号:51において示されるような
配列の1つか、または請求項1〜15に記載のDNA配列の1つから誘導された
配列を含んでなるDNAオリゴヌクレオチド。 - 【請求項33】 請求項32に記載のオリゴヌクレオチドおよび/または請
求項35もしくは36に記載の抗体の少なくとも1つを含んでなる診断試験キッ
ト。 - 【請求項34】 DNAオリゴヌクレオチドが検出可能な標識を備えている
ことを特徴とする、請求項33に記載の診断試験キット。 - 【請求項35】 抗体が請求項20〜26の1つに記載のポリペプチドのエ
ピトープと特異的に反応することを特徴とする、抗体。 - 【請求項36】 抗体がモノクローナルであることを特徴とする、請求項3
5に記載の抗体。 - 【請求項37】 殺線虫剤としての請求項35もしくは36に記載の抗体の
使用。 - 【請求項38】 ワクチンの生産のための、請求項20〜26の1つに記載
のポリペプチドの使用。 - 【請求項39】 チューブリンの相互作用をモジュレートする物質の同定法
。 - 【請求項40】 a)試験物質が、チューブリン分子どうしの相互作用およ
びチューブリンへの試験物質の結合を可能にする条件で、チューブリンと接触さ
せられ、 b)生じた試験物質の結合が、互いに相互作用するチューブリンタンパク質分子
の能力を決定することによって検出され、そして c)試験物質の存在下で互いに相互作用するチューブリンタンパク質分子の能力
が、試験物質の不在下で互いに相互作用するそれらの能力と比較される、 ことを特徴とする、請求項39に記載の方法。 - 【請求項41】 使用されるチューブリンが、請求項20〜26の1つに記
載のポリペプチドであることを特徴とする、請求項39もしくは40に記載の方
法。 - 【請求項42】 試験物質の存在下のチューブリン相互作用のモジュレーシ
ョンの検出のために、細胞に基づく試験システムが使用されることを特徴とする
、請求項39〜41の1つに記載の方法。 - 【請求項43】 試験物質の存在下のチューブリン相互作用のモジュレーシ
ョンの検出のために、セル・フリー試験システムが使用されることを特徴とする
、請求項39〜41の1つに記載の方法。 - 【請求項44】 請求項39〜43の1つに記載の方法において同定される
物質。 - 【請求項45】 線虫攻撃の予防的もしくは治療的処置用の薬剤の製造のた
めの、請求項44に記載の物質の使用。
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