EA009216B1 - Способы идентификации средств, модулирующих активность аспартилпротеазы asp2 человека - Google Patents
Способы идентификации средств, модулирующих активность аспартилпротеазы asp2 человека Download PDFInfo
- Publication number
- EA009216B1 EA009216B1 EA200100387A EA200100387A EA009216B1 EA 009216 B1 EA009216 B1 EA 009216B1 EA 200100387 A EA200100387 A EA 200100387A EA 200100387 A EA200100387 A EA 200100387A EA 009216 B1 EA009216 B1 EA 009216B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- sequence
- bei
- acp2
- app
- azr
- Prior art date
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 211
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 152
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 71
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 50
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 50
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 46
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract description 45
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract description 45
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims abstract description 29
- 108010090849 Amyloid beta-Peptides Proteins 0.000 claims abstract description 11
- 102000013455 Amyloid beta-Peptides Human genes 0.000 claims abstract description 11
- 230000007423 decrease Effects 0.000 claims abstract description 7
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 180
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 157
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 142
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 99
- DZHSAHHDTRWUTF-SIQRNXPUSA-N amyloid-beta polypeptide 42 Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)[C@@H](C)CC)C(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC=1N=CNC=1)NC(=O)[C@H](CC=1N=CNC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1N=CNC=1)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)C(C)C)C(C)C)C1=CC=CC=C1 DZHSAHHDTRWUTF-SIQRNXPUSA-N 0.000 claims description 91
- 101710137189 Amyloid-beta A4 protein Proteins 0.000 claims description 84
- 101710151993 Amyloid-beta precursor protein Proteins 0.000 claims description 84
- 102100022704 Amyloid-beta precursor protein Human genes 0.000 claims description 84
- 108010043324 Amyloid Precursor Protein Secretases Proteins 0.000 claims description 56
- 102000002659 Amyloid Precursor Protein Secretases Human genes 0.000 claims description 56
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 41
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 40
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 40
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 40
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 40
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 37
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 34
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 34
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 27
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 24
- 101150065296 ACP2 gene Proteins 0.000 claims description 21
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 claims description 16
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 claims description 16
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 claims description 16
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 claims description 15
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 claims description 13
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 12
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims description 12
- 230000028327 secretion Effects 0.000 claims description 12
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims description 10
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 7
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 7
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 5
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims description 4
- 101000823051 Homo sapiens Amyloid-beta precursor protein Proteins 0.000 claims description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 3
- 102000046783 human APP Human genes 0.000 claims description 3
- 108010017640 Aspartic Acid Proteases Proteins 0.000 claims description 2
- 102000004580 Aspartic Acid Proteases Human genes 0.000 claims description 2
- 102100021257 Beta-secretase 1 Human genes 0.000 claims description 2
- 101710150192 Beta-secretase 1 Proteins 0.000 claims 1
- 239000000556 agonist Substances 0.000 claims 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 claims 1
- 229940000406 drug candidate Drugs 0.000 claims 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract description 86
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 abstract description 57
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 159
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 154
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 69
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 69
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 64
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 57
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 56
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 56
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 56
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 56
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 49
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 43
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 41
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 31
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 29
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 29
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 26
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 24
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 21
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 20
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 20
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 20
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 20
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 18
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 18
- 101100460719 Mus musculus Noto gene Proteins 0.000 description 17
- 101100187345 Xenopus laevis noto gene Proteins 0.000 description 17
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 17
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 17
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 16
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 16
- RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 15
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 15
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 15
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 14
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 14
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 13
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 13
- 108010064539 amyloid beta-protein (1-42) Proteins 0.000 description 12
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 12
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 12
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 12
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 12
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 11
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 11
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 11
- 101100000208 Mus musculus Orm2 gene Proteins 0.000 description 10
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 10
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 10
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 10
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 10
- 239000000047 product Substances 0.000 description 10
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 9
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 9
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 9
- 208000024827 Alzheimer disease Diseases 0.000 description 8
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 8
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 8
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 8
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 8
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 8
- 239000000463 material Substances 0.000 description 8
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 8
- 108090000783 Renin Proteins 0.000 description 7
- 230000009471 action Effects 0.000 description 7
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 7
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 7
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 7
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 7
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 7
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 7
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 7
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 7
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 7
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 7
- 101150023060 ACR2 gene Proteins 0.000 description 6
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 6
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 6
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 6
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 6
- 101150034852 agr2 gene Proteins 0.000 description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 6
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 6
- PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N nickel Substances [Ni] PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- HEGSGKPQLMEBJL-RKQHYHRCSA-N octyl beta-D-glucopyranoside Chemical compound CCCCCCCCO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O HEGSGKPQLMEBJL-RKQHYHRCSA-N 0.000 description 6
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 6
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 6
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 6
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 6
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 5
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 5
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 5
- 102100028255 Renin Human genes 0.000 description 5
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 5
- 108010064397 amyloid beta-protein (1-40) Proteins 0.000 description 5
- 210000004900 c-terminal fragment Anatomy 0.000 description 5
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 5
- 239000003636 conditioned culture medium Substances 0.000 description 5
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 5
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 5
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 5
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 5
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 5
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 5
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 5
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 5
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 5
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 5
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 4
- 102000004091 Caspase-8 Human genes 0.000 description 4
- 108090000538 Caspase-8 Proteins 0.000 description 4
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 4
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 4
- 108010047320 Pepsinogen A Proteins 0.000 description 4
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 4
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 4
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 4
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 4
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 4
- 238000012761 co-transfection Methods 0.000 description 4
- 238000010835 comparative analysis Methods 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 4
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 4
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 description 4
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 4
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 4
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 4
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 4
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 4
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 4
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 4
- 102000005600 Cathepsins Human genes 0.000 description 3
- 108010084457 Cathepsins Proteins 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010010369 HIV Protease Proteins 0.000 description 3
- 108090000284 Pepsin A Proteins 0.000 description 3
- 102000057297 Pepsin A Human genes 0.000 description 3
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 3
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 3
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 3
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 3
- 210000004671 cell-free system Anatomy 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 3
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 3
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 3
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 108010048367 enhanced green fluorescent protein Proteins 0.000 description 3
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 3
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 3
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 3
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 229940111202 pepsin Drugs 0.000 description 3
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 3
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 3
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 3
- 238000003146 transient transfection Methods 0.000 description 3
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 2
- 102000004178 Cathepsin E Human genes 0.000 description 2
- 108090000611 Cathepsin E Proteins 0.000 description 2
- 108010062466 Enzyme Precursors Proteins 0.000 description 2
- 102000010911 Enzyme Precursors Human genes 0.000 description 2
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 2
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N Guanidine Chemical compound NC(N)=N ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N Hygromycin-B Natural products OC1C(NC)CC(N)C(O)C1OC1C2OC3(C(C(O)C(O)C(C(N)CO)O3)O)OC2C(O)C(CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- 239000006137 Luria-Bertani broth Substances 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 101100298319 Mus musculus Acp2 gene Proteins 0.000 description 2
- SEQKRHFRPICQDD-UHFFFAOYSA-N N-tris(hydroxymethyl)methylglycine Chemical compound OCC(CO)(CO)[NH2+]CC([O-])=O SEQKRHFRPICQDD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 2
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 2
- 101710180319 Protease 1 Proteins 0.000 description 2
- 101710180316 Protease 2 Proteins 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 101710137710 Thioesterase 1/protease 1/lysophospholipase L1 Proteins 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 2
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 2
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 2
- -1 aspartyl Chemical group 0.000 description 2
- 239000002439 beta secretase inhibitor Substances 0.000 description 2
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 210000005013 brain tissue Anatomy 0.000 description 2
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 2
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 2
- ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N coumarin Chemical compound C1=CC=C2OC(=O)C=CC2=C1 ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 229940042399 direct acting antivirals protease inhibitors Drugs 0.000 description 2
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 2
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 2
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- 239000003540 gamma secretase inhibitor Substances 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 2
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- LEQAOMBKQFMDFZ-UHFFFAOYSA-N glyoxal Chemical compound O=CC=O LEQAOMBKQFMDFZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960000789 guanidine hydrochloride Drugs 0.000 description 2
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 2
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 2
- GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N hygromycin B Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](NC)C[C@@H](N)[C@H](O)[C@H]1O[C@H]1[C@H]2O[C@@]3([C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](C(N)CO)O3)O)O[C@H]2[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N 0.000 description 2
- 229940097277 hygromycin b Drugs 0.000 description 2
- 230000000951 immunodiffusion Effects 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 229910052759 nickel Inorganic materials 0.000 description 2
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 2
- 210000004923 pancreatic tissue Anatomy 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 2
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 2
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000001376 precipitating effect Effects 0.000 description 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 2
- 230000037452 priming Effects 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 2
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 2
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 239000012679 serum free medium Substances 0.000 description 2
- 239000013605 shuttle vector Substances 0.000 description 2
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- DAEPDZWVDSPTHF-UHFFFAOYSA-M sodium pyruvate Chemical compound [Na+].CC(=O)C([O-])=O DAEPDZWVDSPTHF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 230000010473 stable expression Effects 0.000 description 2
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 2
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 2
- LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K tripotassium phosphate Chemical compound [K+].[K+].[K+].[O-]P([O-])([O-])=O LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 2
- UFBJCMHMOXMLKC-UHFFFAOYSA-N 2,4-dinitrophenol Chemical compound OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1[N+]([O-])=O UFBJCMHMOXMLKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IQUPABOKLQSFBK-UHFFFAOYSA-N 2-nitrophenol Chemical group OC1=CC=CC=C1[N+]([O-])=O IQUPABOKLQSFBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AGKRHAILCPYNFH-DUQSFWPASA-N 7,7-dimethyl-5,8-Eicosadienoic Acid Chemical compound CCCCCCCCCCC\C=C/C(C)(C)\C=C/CCCC(O)=O AGKRHAILCPYNFH-DUQSFWPASA-N 0.000 description 1
- 102100040079 A-kinase anchor protein 4 Human genes 0.000 description 1
- 101150031810 AGP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100022463 Alpha-1-acid glycoprotein 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100022460 Alpha-1-acid glycoprotein 2 Human genes 0.000 description 1
- 108090000663 Annexin A1 Proteins 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- 101100165241 Arabidopsis thaliana BCP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 240000003291 Armoracia rusticana Species 0.000 description 1
- 235000011330 Armoracia rusticana Nutrition 0.000 description 1
- 241000182988 Assa Species 0.000 description 1
- 101150000810 BVES gene Proteins 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 101100324465 Caenorhabditis elegans arr-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100167365 Caenorhabditis elegans cha-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000011727 Caspases Human genes 0.000 description 1
- 108010076667 Caspases Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 241000867607 Chlorocebus sabaeus Species 0.000 description 1
- 206010011703 Cyanosis Diseases 0.000 description 1
- 108010014080 DNA Polymerase gamma Proteins 0.000 description 1
- 102000016903 DNA Polymerase gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010025600 DNA polymerase iota Proteins 0.000 description 1
- 102100035472 DNA polymerase iota Human genes 0.000 description 1
- 101000804902 Drosophila melanogaster Xaa-Pro aminopeptidase ApepP Proteins 0.000 description 1
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 101000609762 Gallus gallus Ovalbumin Proteins 0.000 description 1
- 108090001072 Gastricsin Proteins 0.000 description 1
- 102100030875 Gastricsin Human genes 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- 101000890604 Homo sapiens A-kinase anchor protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000678191 Homo sapiens Alpha-1-acid glycoprotein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000894895 Homo sapiens Beta-secretase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000958041 Homo sapiens Musculin Proteins 0.000 description 1
- 241000701109 Human adenovirus 2 Species 0.000 description 1
- 241000701024 Human betaherpesvirus 5 Species 0.000 description 1
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 1
- 108020005350 Initiator Codon Proteins 0.000 description 1
- 108700001097 Insect Genes Proteins 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 241000283953 Lagomorpha Species 0.000 description 1
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 1
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N Leupeptin Natural products CC(C)CC(NC(C)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 description 1
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 1
- 241000282553 Macaca Species 0.000 description 1
- 101710175625 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein Proteins 0.000 description 1
- 108700005443 Microbial Genes Proteins 0.000 description 1
- 101100000206 Mus caroli Orm1 gene Proteins 0.000 description 1
- CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N N-methyl-guanidine Natural products CNC(N)=N CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 206010029260 Neuroblastoma Diseases 0.000 description 1
- PVNIIMVLHYAWGP-UHFFFAOYSA-N Niacin Chemical compound OC(=O)C1=CC=CN=C1 PVNIIMVLHYAWGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000035823 Non-specific autoimmune cerebellar ataxia without characteristic antibodies Diseases 0.000 description 1
- 101150110809 ORM1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 108010014475 Pepsinogens Proteins 0.000 description 1
- 102000023022 Pepsinogens Human genes 0.000 description 1
- 241001505332 Polyomavirus sp. Species 0.000 description 1
- 108010076039 Polyproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000015499 Presenilins Human genes 0.000 description 1
- 108010050254 Presenilins Proteins 0.000 description 1
- FELJDCNGZFDUNR-WDSKDSINSA-N Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 FELJDCNGZFDUNR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091036333 Rapid DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 108020005091 Replication Origin Proteins 0.000 description 1
- 240000005499 Sasa Species 0.000 description 1
- 241001047198 Scomberomorus semifasciatus Species 0.000 description 1
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 description 1
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 description 1
- 102100024483 Sororin Human genes 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- UZMAPBJVXOGOFT-UHFFFAOYSA-N Syringetin Natural products COC1=C(O)C(OC)=CC(C2=C(C(=O)C3=C(O)C=C(O)C=C3O2)O)=C1 UZMAPBJVXOGOFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 1
- 102100036407 Thioredoxin Human genes 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 239000007997 Tricine buffer Substances 0.000 description 1
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091023045 Untranslated Region Proteins 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 description 1
- 108010084455 Zeocin Proteins 0.000 description 1
- 239000008351 acetate buffer Substances 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical group 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 238000012870 ammonium sulfate precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000005349 anion exchange Methods 0.000 description 1
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 description 1
- 239000003429 antifungal agent Substances 0.000 description 1
- 229940121375 antifungal agent Drugs 0.000 description 1
- 239000012062 aqueous buffer Substances 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000000149 argon plasma sintering Methods 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 210000001130 astrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- RIIWUGSYXOBDMC-UHFFFAOYSA-N benzene-1,2-diamine;hydron;dichloride Chemical compound Cl.Cl.NC1=CC=CC=C1N RIIWUGSYXOBDMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 235000015895 biscuits Nutrition 0.000 description 1
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- 235000012467 brownies Nutrition 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 1
- 239000011545 carbonate/bicarbonate buffer Substances 0.000 description 1
- 238000005341 cation exchange Methods 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001364 causal effect Effects 0.000 description 1
- 238000000423 cell based assay Methods 0.000 description 1
- 239000013553 cell monolayer Substances 0.000 description 1
- 210000001638 cerebellum Anatomy 0.000 description 1
- 210000003710 cerebral cortex Anatomy 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 239000013256 coordination polymer Substances 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 229960000956 coumarin Drugs 0.000 description 1
- 235000001671 coumarin Nutrition 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- OOTFVKOQINZBBF-UHFFFAOYSA-N cystamine Chemical compound CCSSCCN OOTFVKOQINZBBF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940099500 cystamine Drugs 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- AAOVKJBEBIDNHE-UHFFFAOYSA-N diazepam Chemical compound N=1CC(=O)N(C)C2=CC=C(Cl)C=C2C=1C1=CC=CC=C1 AAOVKJBEBIDNHE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KCFYHBSOLOXZIF-UHFFFAOYSA-N dihydrochrysin Natural products COC1=C(O)C(OC)=CC(C2OC3=CC(O)=CC(O)=C3C(=O)C2)=C1 KCFYHBSOLOXZIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N dimethylaminoamidine Natural products CN(C)C(N)=N SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000001506 fluorescence spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000011010 flushing procedure Methods 0.000 description 1
- 210000001652 frontal lobe Anatomy 0.000 description 1
- 108091008053 gene clusters Proteins 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 229940015043 glyoxal Drugs 0.000 description 1
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 1
- 229960004198 guanidine Drugs 0.000 description 1
- 102000046949 human MSC Human genes 0.000 description 1
- 210000003917 human chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 238000012872 hydroxylapatite chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 239000012133 immunoprecipitate Substances 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 239000003999 initiator Substances 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- WABPQHHGFIMREM-UHFFFAOYSA-N lead(0) Chemical compound [Pb] WABPQHHGFIMREM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 1
- GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N leupeptin Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(C)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 108010052968 leupeptin Proteins 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 230000002132 lysosomal effect Effects 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 230000001617 migratory effect Effects 0.000 description 1
- 239000003595 mist Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000004264 monolayer culture Methods 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 1
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 1
- 238000012261 overproduction Methods 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 230000007030 peptide scission Effects 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 102000013415 peroxidase activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N phleomycin D1 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC[C@@H](N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCCCNC(N)=N)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 229940080469 phosphocellulose Drugs 0.000 description 1
- 210000002826 placenta Anatomy 0.000 description 1
- 229920000771 poly (alkylcyanoacrylate) Polymers 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229910000160 potassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011009 potassium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 239000012460 protein solution Substances 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 210000002637 putamen Anatomy 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 229910052594 sapphire Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010980 sapphire Substances 0.000 description 1
- 238000007790 scraping Methods 0.000 description 1
- 238000010845 search algorithm Methods 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 239000006152 selective media Substances 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- CMZUMMUJMWNLFH-UHFFFAOYSA-N sodium metavanadate Chemical compound [Na+].[O-][V](=O)=O CMZUMMUJMWNLFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940054269 sodium pyruvate Drugs 0.000 description 1
- 238000005063 solubilization Methods 0.000 description 1
- 230000007928 solubilization Effects 0.000 description 1
- 210000000278 spinal cord Anatomy 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- 210000003478 temporal lobe Anatomy 0.000 description 1
- 108060008226 thioredoxin Proteins 0.000 description 1
- 229940094937 thioredoxin Drugs 0.000 description 1
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 229940072690 valium Drugs 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 229910000166 zirconium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
- C12N9/6421—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
- C12N9/6478—Aspartic endopeptidases (3.4.23)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
- A61P25/28—Drugs for disorders of the nervous system for treating neurodegenerative disorders of the central nervous system, e.g. nootropic agents, cognition enhancers, drugs for treating Alzheimer's disease or other forms of dementia
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4711—Alzheimer's disease; Amyloid plaque core protein
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
- C12Q1/37—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving peptidase or proteinase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2799/00—Uses of viruses
- C12N2799/02—Uses of viruses as vector
- C12N2799/021—Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid
- C12N2799/026—Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid where the vector is derived from a baculovirus
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
- G01N2333/914—Hydrolases (3)
- G01N2333/948—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- G01N2333/95—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99)
- G01N2333/964—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue
- G01N2333/96425—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals
- G01N2333/96427—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals in general
- G01N2333/9643—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals in general with EC number
- G01N2333/96472—Aspartic endopeptidases (3.4.23)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Neurology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Neurosurgery (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Psychiatry (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Настоящее изобретение относится к способам идентификации средства, модулирующего активность аспартилпротеазы Asp2 человека, вовлеченной в процессинг предшественника амилоидного белка (APP) до бета-амилоида, а также к связанным нуклеиновым кислотам, пептидам, векторам и клеткам.
Description
Изобретение относится к любому выделенному или очищенному пептиду или белку, содержащему аминокислотный полипептид, кодирующий протеазу, способную расщеплять сайт расщепления АРР бета-секретазой, который содержит два или более наборов специальных аминокислот, разделенных положениями примерно 100-300 аминокислот, в которых могут находиться любые аминокислоты, из которых первый набор специальных аминокислот состоит из аминокислот ΌΤΟ, причем первая аминокислота первого специального набора аминокислот является первой специальной аминокислотой Ό, и второй набор аминокислот представляет собой ΌδΟ или ΌΤΟ, причем последняя аминокислота второго набора специальных аминокислот является последней специальной аминокислотой С и первая специальная аминокислота функционально связана с аминокислотами, кодирующими любое число положений из 0-81 аминокислоты, в которых могут находиться любые аминокислоты. В одном из вариантов осуществления первая специальная аминокислота функционально связана с пептидом, имеющим положения примерно 64-77 аминокислот, в которых могут находиться любые аминокислоты. В конкретном варианте осуществления первая специальная аминокислота функционально связана с пептидом, состоящим из 71 аминокислоты. Еще в одном частном варианте осуществления первая специальная аминокислота функционально связана с 71 аминокислотой и первая из этих 71 аминокислоты является аминокислотой Τ. Например, полипептид содержит последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична последовательности аспартилпротеазы, описанной в настоящем описании. Еще в одном варианте осуществления первая специальная аминокислота функционально связана с любым числом аминокислот, от 40 до 54, в которых могут находиться любые аминокислоты. В частном варианте осуществления первая специальная аминокислота функционально связана с аминокислотами, кодирующими пептид, состоящий из 47 аминокислот. Еще в одном конкретном варианте осуществления первая специальная аминокислота функционально связана с пептидом, состоящим из 47 аминокислот, причем первая из этих 47 аминокислот является аминокислотой Е. Например, полипептид содержит последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична 8ЕО ΙΌ N0: 3, описанной в примере 10, или полноразмерной полипептидной последовательности 8ЕО ΙΌ N0: 30, описанной в примере 10.
Еще в одном связанном аспекте любой выделенный или очищенный аминокислотный полипептид представляет собой протеазу, способную расщеплять сайт расщепления АРР бета(в)-секретазой, который содержит два или более наборов специальных аминокислот, разделенных положениями примерно 100300 аминокислот, в которых могут находиться любые аминокислоты, из которых первый набор специальных аминокислот состоит из аминокислот, кодирующих ЭТС. причем первая аминокислота первого специального набора аминокислот является первой специальной аминокислотой Ό, и второй набор аминокислот представляет собой Э8С или ЭТС, причем последняя аминокислота второго набора специальных аминокислот является последней специальной аминокислотой С, которая функционально связана с любым числом из 50-170 аминокислот, которые могут быть любыми аминокислотами. В частном варианте осуществления последняя специальная аминокислота функционально связана с пептидом, состоящим примерно из 100-170 аминокислот. Еще в одном варианте осуществления последняя специальная аминокислота функционально связана с пептидом, состоящим примерно из 142-163 аминокислот. В одном из конкретных вариантов осуществления последняя специальная аминокислота функционально связана с пептидом, состоящим примерно из 142 аминокислот. Например, полипептид содержит последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична 8ЕО ΙΌ N0: 22, описанной в примере 9, или 8Е0 ΙΌ N0: 30, описанной в примере 10. В одном из конкретных вариантов осуществления последняя специальная аминокислота функционально связана с пептидом, состоящим примерно из 163 аминокислот. Например, полипептид содержит последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична 8Е0 ΙΌ N0: 22, описанной в примере 9, или 8Е0 ΙΌ N0: 30, описанной в примере 10, или полноразмерной последовательности 8Е0 ΙΌ N0: 22, описанной в примере 9, или последовательности 8Е0 ΙΌ N0: 30, описанной в примере 10. В одном из вариантов осуществления последняя специальная аминокислота функционально связана с пептидом, состоящим примерно из 170 аминокислот. В частном варианте осуществления второй набор специальных аминокислот включает пептид, имеющий аминокислотную последовательность Э8С. Необязательно, аминокислотный полипептид функционально связан с меткой очистки пептида, например с меткой очистки пептида, состоящей из шести остатков гистидина. В одном из вариантов осуществления первый набор специальных аминокислот относится к одному полипептиду и второй набор специальных аминокислот относится ко второму полипептиду, причем как первый, так и второй полипептиды имеют по крайней мере 50 аминокислот, которые могут быть любыми аминокислотами. В другом варианте осуществления первый набор специальных аминокислот относится к одному полипептиду и второй набор специальных аминокислот относится ко второму полипептиду, причем как первый, так и второй полипептиды имеют по крайней мере 50 аминокислот и оба указанных полипептида находятся в одном сосуде. Изобретение также относится к вектору, содержащему полипептид, описанный в настоящем описании. Изобретение, кроме того, относится к клетке или линии клеток, содержащей полинуклеотид, описанный в настоящем описании. Изобретение также относится к способу получения любых полинуклеотидов, векторов или клеток, описанных здесь, и к процессу получения полипептидов, описанных здесь.
Любой выделенный или очищенный пептид или белок включает аминокислотный полипептид, кодирующий протеазу, способную расщеплять сайт расщепления АРР бета-секретазой, который содержит два
- 4 009216 или более наборов специальных аминокислот, разделенных положениями примерно 100-300 аминокислот, в которых могут находиться любые аминокислоты, из которых первый набор специальных аминокислот состоит из аминокислот ΌΤΟ, причем первая аминокислота первого специального набора аминокислот является первой специальной аминокислотой Ό, и второй набор аминокислот представляет собой Ό8Ο или ΌΤΟ, последняя аминокислота второго набора специальных аминокислот является последней специальной аминокислотой С и первая специальная аминокислота функционально связана с аминокислотами, кодирующими положения любого числа из 0-81 аминокислот, в которых могут находиться любые аминокислоты.
Настоящее изобретение относится к аминокислотному полипептиду, описанному в настоящем описании, в котором первая специальная аминокислота функционально связана с пептидом, включающим положения примерно 30-77 аминокислот, в которых могут находиться любые аминокислоты. Изобретение также относится к аминокислотному полипептиду, описанному здесь, где первая специальная аминокислота функционально связана с пептидом, состоящим из 35, 47, 71 или 77 аминокислот.
Изобретение относится к аминокислотному полипептиду, описанному в настоящем описании, в котором первая специальная аминокислота функционально связана с соответствующими пептидами 8ЕО ΙΌ N0: 3, состоящими из 35, 47, 71 или 77 аминокислот, при отсчете от аминокислот в первой специальной последовательности ΌΤΟ в направлении Ν-конца 8ЕЦ ΙΌ N0: 3.
Изобретение относится к аминокислотному полипептиду, описанному в настоящем описании, включающему последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична соответствующим аминокислотам в 8Е0 ΙΌ N0: 4, то есть идентична части последовательностей в 8ЕЦ ΙΌ N0: 4, включая все последовательности от первой и/или второй специальных нуклеиновых кислот в направлении №конца до 71, 47, 35 аминокислот включительно перед первыми специальными аминокислотами (примеры 10 и 11).
Изобретение относится к аминокислотному полипептиду, описанному в настоящем описании, включающему полный пептид из 71 аминокислоты, где первая аминокислота является Τ и вторая аминокислота является О. Также изобретение относится к полинуклеотиду нуклеиновых кислот, описанному здесь, где полинуклеотид содержит последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична соответствующим аминокислотам в 8Е0 ΙΌ N0: 3, то есть идентична последовательностям в 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, включая последовательности от первой и/или второй специальных нуклеиновых кислот в направлении №конца до 71 аминокислоты включительно, см. пример 10, начиная от сайта ΌΤΟ и включая нуклеотиды из этого кода для 71 аминокислоты.
Настоящее изобретение относится к полинуклеотиду нуклеиновых кислот, описанному в настоящем описании, который содержит полную последовательность, идентичную соответствующим аминокислотам в 8Е0 ΙΌ N0: 3, то есть идентичную последовательностям в 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, включая последовательности от первой и/или второй специальных нуклеиновых кислот в направлении №конца до 71 аминокислоты включительно (см. пример 10), начиная от сайта ΌΤΟ и включая нуклеотиды из этого кода для 71 аминокислоты.
Изобретение относится к полинуклеотиду нуклеиновых кислот, описанному в настоящем описании, в котором первая специальная нуклеиновая кислота функционально связана с нуклеиновыми кислотами, кодирующими любое число из 30-54 аминокислот, где каждый кодон может кодировать любую аминокислоту.
Изобретение относится к полинуклеотиду нуклеиновых кислот, описанному в настоящем описании, в котором первая специальная нуклеиновая кислота функционально связана с 47 кодонами, где первая из этих 35 или 47 аминокислот является аминокислотой Е или С.
Изобретение относится к полинуклеотиду нуклеиновых кислот, описанному в настоящем описании, включающему последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична соответствующим аминокислотам в 8Е0 ΙΌ N0: 3, то есть идентична этой части последовательностей в 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, включая последовательности от первой и/или второй специальных нуклеиновых кислот в направлении Оконца до 35 или 47 аминокислот включительно (см. пример 11 для 47 аминокислот, начиная от сайта ΌΤΟ и включая нуклеотиды из этого кода для предыдущих 35 или 47 аминокислот до сайта ΌΤΟ). Полинуклеотид нуклеиновых кислот по настоящему изобретению идентичен соответствующим аминокислотам в 8Е0 ΙΌ N0: 3, то есть идентичен последовательностям в 8Е0 ΙΌ N0: 3, включая последовательности от первой и/или второй специальных нуклеиновых кислот в направлении №конца до 35 или 47 аминокислот включительно, см. пример 11 для 47 аминокислот, начиная от сайта ΌΤΟ и включая нуклеотиды из этого кода для предыдущих 35 или 47 аминокислот до сайта ΌΤΟ.
Выделенная молекула нуклеиновой кислоты включает полинуклеотид, кодирующий полипептид Ни-Лкр и имеющий нуклеотидную последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична последовательности, выбираемой из группы, состоящей из:
(a) нуклеотидной последовательности, кодирующей полипептид Ни-Лкр, выбираемый из группы, состоящей из Ни-Л8р1, Ни-Л8р2(а) и Ни-Л8р2(Ь), где указанные полипептиды Ни-Л8р1, Ни-Л8р2(а) и Ни-Л8р2(Ь) имеют соответственно полную аминокислотную последовательность 8ЕЦ ΙΌ N0: 2, 8ЕЦ ΙΌ N0: 4 и 8ЕЦ ΙΌ N0: 6; и (b) нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности по п.(а).
Изобретение относится к молекуле нуклеиновой кислоты, в которой указанный полипептид Ни-Лкр является Ни-Л8р1 и указанная молекула полинуклеотида включает нуклеотидную последовательность 8Е0 ΙΌ N0: 1; и к молекуле нуклеиновой кислоты, в которой указанный полипептид Ни-Лкр является Ни-Л8р2(а) и указанная молекула полинуклеотида включает нуклеотидную последовательность 8ЕЦ ΙΌ
- 5 009216
N0: 3; и к молекуле нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид Ни-Акр, который является НиАкр2(Ь) и указанная молекула полинуклеотида включает нуклеотидную последовательность 8ЕЦ ΙΌ N0: 5. Настоящее изобретение относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, включающей полинуклеотид, который гибридизирует в строгих условиях с полинуклеотидом, имеющим нуклеотидную последовательность, описанную выше. Изобретение также относится к вектору, включающему молекулу нуклеиновой кислоты, описанную в настоящем описании. Необязательно, вектор по п.97 содержит молекулу нуклеиновой кислоты, которая функционально связана с промотором для экспрессии полипептида Ни-Акр, такого как Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) или Ни-Акр2(Ь). Настоящее изобретение относится к клетке-хозяину, содержащей вектор, описанный выше. Изобретение относится к способу получения полипептида Ни-Акр, предусматривающему культивирование клетки-хозяина, описанной выше, и выделение указанного полипептида Ни-Акр. Изобретение относится к выделенному полипептиду Ни-Акр1, содержащему аминокислотную последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична последовательности, включающей аминокислотную последовательность 8ЕЦ ΙΌ N0: 2, к выделенному полипептиду Ни-Акр2(а), содержащему аминокислотную последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична последовательности, включающей аминокислотную последовательность 8ЕЦ ΙΌ N0: 4, к выделенному полипептиду Ни-Акр2(а), содержащему аминокислотную последовательность, которая по крайней мере на 95% идентична последовательности, содержащей аминокислотную последовательность 8ЕЦ Ш N0: 8. Изобретение также относится к выделенному антителу, которое специфически связывается с полипептидом Ни-Акр, описанным здесь.
Далее приведено несколько способов анализа этого фермента.
Изобретение относится к способу идентификации клетки, предназначенный для скрининга ингибиторов активности β-секретазы, который включает:
(а) идентификацию клетки, экспрессирующей протеазу, способную расщеплять АРР на сайте βсекретазы, в процессе которой производят:
ί) сбор клеток или супернатанта с идентифицируемых клеток;
ίί) измерение продуцирования требуемого пептида, который выбирают из группы, состоящей из Сконцевого пептида АРР или растворимого АРР;
ϊϊΐ) отбор клеток, продуцирующих требуемый пептид.
В одном из вариантов осуществления собирают клетки и требуемый пептид определяют как С-концевой пептид АРР, полученный в результате расщепления β-секретазой. В другом варианте осуществления, собирают супернатант и требуемый пептид представляет собой растворимый С-концевой АРР, полученный в результате расщепления β-секретазой. В одном из вариантов осуществления клетки содержат любые нуклеиновые кислоты или полипептиды, описанные выше, и было показано, что клетки могут расщеплеплять сайт β-секретазы любого пептида со следующей структурой Р2, Р1, Р1', Р2' , где Р2 обозначает К или N Р1 обозначает М или Ь, Р1' обозначает Ό и Р2' обозначает А. Еще в одном варианте осуществления Р2 обозначает К и Р1 обозначает М или Р2 обозначает N и Р1 обозначает Ь.
Изобретение относится к любой бактериальной клетке, содержащей любые нуклеиновые кислоты или пептиды, описанные в настоящем описании, например к бактериальной клетке, такой как Е. со11. Изобретение также отнсоится к любой эукариотической клетке, содержащей любые нуклеиновые кислоты или полипептиды, описанные в настоящем описании.
Настоящее изобретение относится к клеткам насекомых, содержащим любые нуклеиновые кислоты или полипептиды, описанные в настоящем описании. Эти клетки насекомых включают в себя кГ9 и Н1дй 5. Изобретение также относится к клеткам млекопитающих, содержащим любые нуклеиновые кислоты или полипептиды, описанные здесь. Примеры клеток млекопитающих могут быть выбраны из группы, состоящей из человека, грызуна, лагоморфа и примата. Характерная клетка человека может быть выбрана из группы, состоящей из НЕК293 и ΙΜΚ32. Характерной клеткой примата может быть клетка С08-7. Клетка грызуна может быть выбрана из клеток СН0-К1, №иго-2А и 3Т3. Изобретение также относится к дрожжевой клетке или клетке птицы, содержащей любые нуклеиновые кислоты или полипептиды, описанные в настоящем описании.
Изобретение относится к изоформе АРР, в которой две последние аминокислоты карбоксильного конца являются остатками лизина. Изоформой является любой полипептид АРР, включая варианты АРР (в том числе мутации) и фрагменты АРР, существующие в организме человека, которые аналогичны описанным в патенте США № 57 6684 6, столбец 7, строки 45-67, включенном в это описание изобретения в качестве ссылки. В одном из вариантов осуществления изоформа АРР включает изоформу, известную как АРР695, модифицированную так, что две ее последние аминокислоты имеют два остатка лизина аналогично двум ее последним аминокислотам карбоксильного конца. Например, изоформа АРР включает 8ЕЦ ΙΌ N0: 16 или вариант изоформы АРР включает 8ЕЦ ΙΌ N0: 18 или 20. Изобретение также относится к любой линии эукариотических клеток, содержащих нуклеиновые кислоты, кодируемые модифицированной изоформой АРР, или полипептидам, содержащим модифицированные изоформы АРР. Линией клеток может быть любая линия клеток млекопитающего (НЕК293, №иго2а). Изобретение также относится к способу идентификации ингибиторов фермента, расщепляющего сайт АРР, расщепляемый бета-секретазой, в котором предусмотрено:
- 6 009216
a) культивирование клеток в культуральной среде в условиях, в которых фермент вызывает процессинг АРР и высвобождение амилоидного бета-пептида в среду, а также вызывает накопление фрагментов СТР99 АРР в клеточных лизатах;
b) подвергание культивируемых клеток воздействию испытуемого соединения и специфическое определение способности испытуемого соединения ингибировать функцию этого фермента, измеряя количество амилоидного бета-пептида, высвобождаемого в среду, или количество фрагментов СТР99 АРР в клеточных лизатах;
c) идентификацию испытуемых соединений, уменьшающих количество растворимого амилоидного бета-пептида в культуральной среде и уменьшающих количество фрагментов СТР99 АРР в клеточных лизатах, в качестве ингибиторов Акр2.
В характерном варианте осуществления культивируемыми клетками являются клетки линии человека, грызуна или насекомого. Также в рамках настоящего изобретения предусмотрена линия клеток человека или грызуна, которая характеризуется активностью β-секретазы, вызывающей процессинг АРР с высвобождением амилоидного бета-пептида в культуральную среду и накоплением СТР99 в клеточных лизатах. Также среди рассматриваемых исследуемых соединений находятся антисмысловые олигомеры, направленные на фермент, обладающий активностью β-секретазы, уменьшающие высвобождение растворимого амилоидного бета-пептида в культуральную среду и накопление СТР99 в клеточных лизатах. Способ идентификации агента, уменьшающего активность полипептида Ни-Акр, выбираемого из группы, включающей Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь), включает:
a) определение активности указанного полипептида Ни-Акр в присутствии и в отсутствие испытуемого агента и
b) сравнение активности указанного полипептида Ни-Акр, определенной в присутствии и в отсутствие указанного испытуемого агента;
при этом более низкая активность в присутствии или в отсутствие указанного испытуемого агента свидетельствует о том, что указанный испытуемый агент уменьшает активность указанного полипептида Ни-Акр. Далее описаны нуклеиновые кислоты, пептиды, белки, векторы, клетки, линии клеток и анализы.
Настоящее изобретение представляет выделенные молекулы нуклеиновых кислот, включающие полинуклеотид, кодирующие полипептид, выбираемый из группы, включающей аспарагилпротеазы человека, в частности аспарагилпротеазу человека 1 (Ни-Акр1) и два альтернативных сплайсированных варианта аспарагилпротеазы человека 2 (Ни-Акр2), именуемых здесь Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь). В используемом здесь значении все ссылки на Ни-Акр относятся ко всем Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь). Кроме того, в используемом здесь значении все ссылки на Ни-Акр2 относятся как к Ни-Акр2(а), так и к НиАкр2(Ь). Ни-Акр1 наиболее широко экспрессирована в тканях поджелудочной и предстательной железы, в то время как Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь) наиболее широко экспрессированы в тканях поджелудочной железы и головного мозга. Изобретение также представляет выделенные полипептиды Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь), а также их фрагменты, обладающие активностью аспарагилпротеазы.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения молекулы нуклеиновой кислоты включают полинуклеотид, имеющий нуклеотидную последовательность, выбираемую из группы, состоящей из остатков 1-1554 8ЕС ГО N0: 1, кодирующих Ни-Акр1, остатков 1-1503 8ЕЦ ГО N0: 3, кодирующих Ни-Акр2(а), и остатков 1-1428 8ЕЦ ГО N0: 5, кодирующих Ни-Акр2(Ь). Другим объектом этого изобретения является выделенная молекула нуклеиновой кислоты, включающая полинуклеотид, гибридизирующий в строгих условиях с полинуклеотидом, кодирующим Ни-Акр1, Ни-Акр2(а), Ни-Акр2(Ь) или их фрагменты. В европейской патентной заявке ЕР 0848062 описан полипептид, именуемый Акр1, который характеризуется значительной гомологией с Ни-Акр1, и в международной заявке \¥0 98/22597 описан полипептид, именуемый Акр2, который характеризуется значительной гомологией с Ни-Акр2(а).
Настоящее изобретение относится также к векторам, содержащим выделенные молекулы нуклеиновой кислоты по этому изобретению, к клеткам-хозяевам, в которые вводят такие векторы, и к методам рекомбинантных ДНК для получения полипептида Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) или Ни-Акр2(Ь), которые включают культивирование вышеописанной клетки-хозяина и выделение требуемого полипептида.
Другим объектом этого изобретения являются выделенные полипептиды Ни-Акр 1, Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь), а также их фрагменты. В предпочтительном варианте осуществления изобретения полипептиды Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь) имеют аминокислотную последовательность, приведенную соответственно в 8ЕС ГО N0: 2, 8ЕЦ ГО N0: 4 или 8ЕЦ ГО N0: 6. Настоящее изобретение относится также к активным формам Ни-Акр2, способам получения таких активных форм, способам получения растворимых форм, способам измерения активности Ни-Акр2 и субстратам для расщепления Ни-Акр2. Изобретение относится также к антисмысловым олигомерам, нацеленным на транскрипты мРНК Ни-Акр1, НиАкр2(а) и Ни-Акр2(Ь), и к применению таких антисмысловых реагентов для уменьшения такой мРНК и последующего получения соответствующего полипептида. Это изобретение относится также к выделенным антителам, как поликлональным, так и моноклональным, которые специфически связываются с любыми полипептидами Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь) по изобретению.
Изобретение относится также к способу идентификации агента, модулирующего активность любого Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь). В этом изобретении описаны способы испытания таких агентов при
- 7 009216 помощи бесклеточных анализов, к которым добавляют полипептид Ни-А§р2, а также способы испытания таких агентов в клетках человека или других млекопитающих, в которых присутствует Ни-А§р2.
Краткое описание последовательностей
Последовательность ГО N0: 1 - А§р1 человека, нуклеотидная последовательность. Последовательность ГО N0: 2 - А§р1 человека, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 3 - А§р2(а) человека, нуклеотидная последовательность. Последовательность ГО N0: 4 - А§р2(а) человека, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 5 - А§р2(Ь) человека, нуклеотидная последовательность. Последовательность ГО N0: 6 - А§р2(Ь) человека, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 7 - А§р2(а) мыши, нуклеотидная последовательность. Последовательность ГО N0: 8 - А§р2(а) мыши, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 9 - АРР695 человека, нуклеотидная последовательность. Последовательность ГО N0: 10 - АРР695 человека, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 11 - АРР695-8те человека, нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 12 - АРР695-5>\у человека, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 13 - АРР695-УГ человека, нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 14 - АРР695-УЕ человека, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 15 - АРР695-КК человека, нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 16 - АРР695-КК человека, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 17 - АРР695-8^-КК человека, нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 18 - АРР695-Бет-КК человека, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 19 - АРР695-УР-КК человека, нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 20 - АРР695-УЕ-КК человека, предполагаемая аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 21 - Т7-пре-А§р2(а)ДТМ человека, нуклеотидная последовательность. Последовательность ГО N0: 22 - Т7-пре-А§р2(а)ДТМ человека, аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 23 - Т7-Са8ра8е-пре-А8р2(а)ДТМ человека, нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 24 - Т7-Са8ра8е-пре-А8р2(а)ДТМ человека, аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 25 - пре-А§р2(а)ДТМ человека (нижний СС), нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 26 - пре-А§р2(а)ДТМ человека (нижний СС), аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 27 - Т7-Са5ра5е-Са8ра8е-8 расщепление-пре-А§р2(а)ДТМ человека, нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 28 - Т7-Са5ра5е-Са8ра8е-8 расщепление-пре-А§р2(а)ДТМ человека, аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 29 - А§р2(а)ДТМ человека, нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 30 - А§р2(а)ДТМ человека, аминокислотная последовательность.
Последовательность ГО N0: 31 - А8р2(а)ДТМ(Нщ)6 человека, нуклеотидная последовательность.
Последовательность ГО N0: 32 - А8р2(а)ДТМ(Нщ)6 человека, аминокислотная последовательность. Последовательности ГО N0: 33-46 описаны ниже в разделе Подробное описание изобретения.
Краткое описание чертежей
Фиг. 1. На фиг. 1 показаны нуклеотидная последовательность (8Е0 ГО N0: 1) и предполагаемая аминокислотная последовательность (8Е0 ГО N0: 2) А§р1 человека.
Фиг. 2. На фиг. 2 показаны нуклеотидная последовательность (8Е0 ГО N0: 5) и предполагаемая аминокислотная последовательность (8Е0 ГО N0: 6) А§р2(Ь) человека.
Фиг. 3. На фиг. 3 показаны нуклеотидная последовательность (8Е0 ГО N0: 3) и предполагаемая аминокислотная последовательность (8Е0 ГО N0: 4) А§р2(а) человека.
Фиг. 4. На фиг. 4 показаны нуклеотидная последовательность (8Е0 ГО N0: 7) и предполагаемая аминокислотная последовательность (8Е0 ГО N0: 8) А§р2(а) мыши.
Фиг. 5. На фиг. 5 показан сравнительный анализ по программе ВейРй предполагаемых аминокислотных последовательностей Ни-А§р2(а) (8ЕЦ ГО N0: 4) человека и А§р2(а) (8ЕЦ ГО N0: 8) мыши.
Фиг. 6. На фиг. 6 показаны нуклеотидная последовательность (8Е0 ГО N0: 21) и предполагаемая аминокислотная последовательность (8Е0 ГО N0: 22) Т7-пре-А§р2(а)ДТМ человека.
Фиг. 7. На фиг. 7 показаны нуклеотидная последовательность (8Е0 ГО N0: 23) и предполагаемая
- 8 009216 аминокислотная последовательность (8ЕО ΙΌ N0: 24) Т7-каспаз-пре-Акр2(а)ДТМ человека.
Фиг. 8. На фиг. 8 показаны нуклеотидная последовательность (8Е0 ГО N0: 25) и предполагаемая аминокислотная последовательность (8Е0 ГО N0: 26) пре-Акр2(а)ДТМ человека (нижний ОС).
Фиг. 9. Вестерн-блот, показывающий уменьшение продуцирования СТЕ99 клетками НЕК125.3, трансфецированными антисмысловыми олигомерами, нацеленными на Ни-Акр2 Мгла.
Фиг. 10. Вестерн-блот, показывающий, что увеличение продуцирования СТР99 в клетках №иго-2а мыши, котрансфецированных АРР-КК с Ни-Акр2 и без Ни-Акр2, наблюдается только в клетках, котрансфецированных Ни-Акр2. Дальнейшее увеличение продуцирования СТР99 в клетках, котрансфецированных АРР-8\г-КК с Ни-Акр2 и без Ни-Акр2, наблюдается только в клетках, котрансфецированных Ни-Акр2.
Фиг. 11. На фиг. 11 показана предполагаемая аминокислотная последовательность (8Е0 ГО N0: 30) Акр2(а)ДТМ человека.
Фиг. 12. На фиг. 12 показана предполагаемая аминокислотная последовательность (8Е0 ГО N0: 30) Акр2(а)ДТМ(Н1к)6 человека.
Подробное описание изобретения
Далее дано определение нескольких терминов, используемых в этом описании изобретения, причем большинство используемых терминов имеют обычное значение, известное специалистам в этой области.
Термин β-амилоидный пептид означает любой пептид, получаемый в результате расщепления АРР бета-секретазой. Этот термин относится к пептидам, состоящим из 39, 40, 41, 42 и 43 аминокислот, которые расположены от сайта расщепления β-секретазой и включают 39, 40, 41, 42 и 43 аминокислоты. В определение β-амилоидного пептида входят также последовательности 1-6, 8Е0 ГО N0: 1-6, описанные в патенте США № 575034 9, выданном 12 мая 1998г. (включен в это описание изобретения в качестве ссылки). Рассматриваемый здесь фрагмент расщепления β-секретазой именуется СТЕ-99 и расположен от сайта расщепления β-секретазой до карбоксильного конца АРР.
Термин изоформа АРР означает любой полипептид АРР, включая варианты АРР (в том числе мутации) и фрагменты АРР, имеющиеся в организме человека, аналогичные описанным в патенте США № 5766846, столбец 7, строки 45-67, который включен в это описание изобретения в качестве ссылки (см. ниже).
Термин предшественник β-амилоидного белка (АРР) в используемом здесь значении означает полипептид, кодируемый геном того же названия, локализованным в организме человека на длинном плече хромосомы 21, и включающий βАР, именуемый здесь β-амилоидный белок (см. выше) в своей карбоксильной трети. АРР является гликозилированным, одномембранным соединяющим белком, экспрессированным в целом ряде клеток во многих тканях млекопитающего. Примерами специфических изотипов АРР, обнаруженных у человека, являются полипептид, состоящий из 695 аминокислот, описанный Капд с1 а1. (1987) №1Шгс 325: 733-736, который назван нормальным АРР; полипептид, состоящий из 751 аминокислоты, описанный Роп1с с1 а1. (1988) №1Шгс 331: 525-527 анб Тан/ί с1 а1. (1988) №1Шгс 331: 528530; и полипептид, состоящий из 770 аминокислот, описанный КйадисЫ е1 а1. (1988) №11игс 331: 530-532. Примерами специфических вариантов АРР являются точковая мутация, которая может быть различной в обоих положениях, и фенотип (для ознакомления с известной вариантной мутацией см. Нагбу (1992) №1Шгс СспсЕ 1: 233-234). Все приведенные материалы включены в это описание изобретения в качестве ссылки. Термин фрагменты АРР в используемом здесь значении означает любые фрагменты АРР кроме тех, которые состоят только из βАР или фрагментов βАР. То есть фрагменты АРР включают дополнительные аминокислотные последовательности АРР помимо тех, которые образуют интактный 3АР или фрагмент βАР.
Термин любая аминокислота означает аминокислоты, выбираемые из нижеследующего списка, сопровождаемого трехбуквенными и однобуквенными аббревиатурами: алании, А1а, А; аргинин, Агд, К; аспарагин, Акп, N аспарагиновая кислота, Акр, Ό; цистеин, Сук, С; глутамин, С1п. О; глутаминовая кислота, О1и, Е; глицин, О1у, О; гистидин, Н1к, Н; изолейцин, 11с, I; лейцин, Ьси, Ь; лизин, Ьук, К; метионин, МсЕ М; фенилаланин, Рйс, Е; пролин, Рго, Р; серии, 8сг, 8; треонин, Тйг, Т; триптофан, Тгр, ^; тирозин, Туг, Υ; валин, Уа1, V; аспарагиновая кислота или аспарагин, Акх, В; глутаминовая кислота или глутамин, О1х, Ζ; любая аминокислота, Хаа, X.
Настоящее изобретение относится к методу поиска в базе данных по структуре гена простого мотива активного сайта, характерного для аспарагилпротеаз. Эукариотические аспарагилпротеазы, такие как пепсин и ренин, имеют двухдоменную структуру цепи, при укладке которой два остатка аспарагила располагаются рядом друг с другом на активном сайте. Они образуют короткий трипептидный мотив ЭТО или более редко Э8С. Большая часть аспарагилпротеаз существуют в виде профермента, для активации которого необходимо расщепить его №конец. Мотив активного сайта ЭТО или Ό8Ο находится примерно около остатка 65-70 в проферменте (проренин, пепсиноген) и примерно около остатка 25-30 в активном ферменте после расщепления ^концевого продомена. Ограниченная длина мотива активного сайта затрудняет его поиск в коллекциях меток коротких экспрессированных последовательностей (Е8Т) для получения новых аспарагилпротеаз. Последовательности Е8Т обычно имеют, в среднем, 250 нуклеотидов или меньше и таким образом кодируют остатки 80-90 аминокислот или меньше. Такая последовательность должна быть очень короткой, чтобы можно было соединять элементы двух активных сайтов. Предпочтительным методом является поиск в базах данных гипотетических или собранных последова
- 9 009216 тельностей, кодирующих белок. Настоящее изобретение относится к компьютерному методу идентификации предполагаемых аспарагилпротеаз в базах данных белковых последовательностей. Этот метод использован для идентификации семи предполагаемых последовательностей аспарагилпротеазы в геноме СаепогйаЬбйщ с1сдап5. Эти последовательности затем были использованы для идентификации путем выявления гомологии между Ни-А§р1 и двумя альтернативными сплайсированными вариантами Ηιι-ΛφΣ. именуемыми здесь Ни-А§р2(а) и Ни-А§р2(Ь).
Основным объектом этого изобретения является получение новых данных о процессинге АРР. Патогенный процессинг предшественника амилоидного белка (АРР) по пути образования Αβ требует последовательного действия двух протеаз. именуемых β-секретазой и γ-секретазой. Расщепление АРР βсекретазой и γ-секретазой вызывает образование соответственно Ν-конца и С-конца Λβ-пептида. Поскольку избыточное продуцирование Αβ-пептида, в частности Αβ1-42, ведет к возникновению болезни Альцгеймера, то ингибиторы β-секретазы и/или γ-секретазы могут оказаться полезными для лечения болезни Альцгеймера. Несмотря на важное значение β-секретазы и γ-секретазы в патогенном процессинге АРР, до сих пор не была изучена молекулярная структура этих ферментов. То есть не было известно, какие ферменты необходимы для расщепления по сайту расщепления β-секретазы или γ-секретазы. Сами эти сайты были известны, поскольку были известны АРР и пептид Αβ1-42 (см. патенты США №№ 5766846 и 5837672, которые включены в это описание изобретения в качестве ссылки за исключением определения растворимые пептиды). Но не было известно, какой фермент участвует в образовании пептида Αβ1-42.
Настоящее изобретение относится к определению молекулярной структуры нескольких новых аспарагилпротеаз человека, причем одна из них, именуемая Ни-А§р2(а) и Ни-А8р2(Ь), подробно рассмотрена в этом описании изобретения. Предшествующие формы Акр1 и Акр2 описаны в ЕР 0848062 А1 и ЕР 0855444 Λ2, авторы изобретения Όπνίά Ро\ге1 е1 а1., право на патент принадлежит компании 8тйй К11пе Веесйат Согр. (включены в это описание изобретения в качестве ссылки). В этом описании изобретения рассмотрены старые и новые формы Ни-А§р2. Они впервые экспрессированы в активной форме, описаны их субстраты и выявлены их специфические особенности. Если раньше для расщепления сайта β-секретазы были необходимые клетки или клеточные экстракты, то теперь при выполнении анализов, которые также рассмотрены в этом описании изобретения, можно использовать очищенный белок. На основании результатов (1) экспериментов по обработке антисмысловыми олигомерами, (2) экспериментов по временной трансфекции и (3) биохимических экспериментов с использованием очищенной рекомбинантной НиАкр2 авторы этого изобретения продемонстрировали, что Ни-А§р2 является β-секретазой, участвующей в процессинге АРР. Несмотря на то, что была обнаружена нуклеотидная и предполагаемая аминокислотная последовательность Ни-А§р2(а) (см. ЕР 0848062 Λ2 и ЕР 0855444 Λ2), не было выполнено функциональное исследование этого фермента. Авторы этого изобретения всесторонне описывают фермент Ни-А§р2 и объясняют, почему он существенен и необходим для образования пептида Αβ1-42 и, по-видимому, представляет собой существенный фактор в возникновении болезни Альцгеймера.
В другом варианте осуществления изобретения описан также новый сплайсированный вариант НиАкр2, именуемый Ни-А8р2(Ь), который ранее не был исследован.
Другой вариант осуществления изобретения относится к выделенным молекулам нуклеиновой кислоты, содержащим полинуклеотид, кодирующий полипептид, выбираемый из группы, состоящей из аспарагилпротеазы 1 человека (Ни-А§р1) и двух альтернативных сплайсированных вариантов аспарагилпротеазы человека 2 (Ни-А8р2), именуемых здесь Ни-А§р2(а) и Ни-А§р2(Ь). В используемом здесь значении все определения Ни-А§р2 относятся как к Ни-А8р2(а), так и к Ни-А§р2(Ь). Ни-А§р1 наиболее широко экспрессирована в тканях поджелудочной и предстательной железы, в то время как Ни-А§р2(а) и НиАкр2(Ь) наиболее широко экспрессированы в тканях поджелудочной железы и головного мозга. Это изобретение относится также к выделенным полипептидам Ни-А8р1, Ни-А§р2(а) и Ни-А8р2(Ь), а также к их фрагментам, которые обладают активностью аспарагилпротеазы.
Предполагаемые аминокислотные последовательности Ни-А8р1, Ни-А§р2(а) и Ни-А§р2(Ь) обладают значительной гомологией с ранее идентифицированными аспарагилпротеазами млекопитающих, такими как пепсиноген А, пепсиноген В, катепсин Ό, катепсин Е и ренин. Р.В. Зхесх 8сапб. 1. С1ш. ЬаЬ. 1пуе51. 52 (8ирр1. 210 5-22 (1992)). Эти ферменты характеризуются наличием двух мотивов последовательностей ΌΤΟ/ϋδΟ. Описанные здесь полипептиды Ни-А§р1 и Ни-А§р2 обладают также исключительно высокой гомологией с консенсусными мотивами Рго8йе для аспарагилпротеаз, полученных из базы данных 8М§&Рго1.
Нуклеотидная последовательность, выраженная остатками 1-1554 8ЕО Ш ΝΟ: 1, соответствует нуклеотидной последовательности, кодирующей Нп-АкрЕ нуклеотидная последовательность, выраженная остатками 1-1503 8ЕО Ш ΝΟ: 3, соответствует нуклеотидной последовательности, кодирующей НиАкр2(а), и нуклеотидная последовательность, выраженная остатками 1-1428 8ЕО Ш ΝΟ: 5, соответствует нуклеотидной последовательности, кодирующей Ни-А§р2(Ь). Выделение и секвенирование ДНК, кодирующей Нп-АкрЕ Ни-А§р2(а) и Ни-А8р2(Ь), описано ниже в примерах 1 и 2.
Как указано в примерах 1 и 2, для получения нуклеотидной последовательности Нп-АкрЕ НиАкр2(а) и Ни-А§р2(Ь) использованы автоматические методы секвенирования. Нуклеотидные последовательности Ни-Акр по настоящему изобретению получены для обеих цепей ДНК и, предположительно,
- 10 009216 совпадают на 100%. Однако, как известно в этой области, нуклеотидная последовательность, полученная при помощи таких автоматических методов, может содержать некоторые ошибки. Нуклеотидные последовательности, полученные автоматическими методами, идентичны действительной нуклеотидной последовательности данной молекулы нуклеиновой кислоты обычно по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95%-99,9%. Действительная последовательность может быть определена с большей степенью точности при помощи ручных методов секвенирования, которые хорошо известны в этой области. Ошибка в последовательности, ведущая к инсерции или делеции одного или нескольких нуклеотидов, может вызвать сдвиг рамки считывания в процессе трансляции, так что предполагаемая аминокислотная последовательность будет отличаться от последовательности, созданной из действительной нуклеотидной последовательности молекулы нуклеиновой кислоты, начиная с точки мутации. ДНК НиАкр по настоящему изобретению включает кДНК, химически синтезированную ДНК, ДНК, выделенную с помощью ПЦР, геномную ДНК и их комбинации. Геномную ДНК Ни-Акр можно получить путем скрининга геномной библиотеки с использованием описанной здесь кДНК Ни-Акр2 при помощи методов, известных в этой области, или с использованием олигонуклеотидов, выбираемых из последовательности Ни-Акр2, которые служат в качестве затравка для полимеразной цепной реакции (РСК.). В объем настоящего изобретения входит также РНК, транскрибированная из ДНК Ни-Акр.
Вследствие вырожденности генетического кода две последовательности ДНК могут отличаться друг от друга и при этом кодировать одинаковые аминокислотные последовательности. Таким образом, настоящее изобретение относится к выделенным молекулам нуклеиновой кислоты, имеющим полинуклеотидную последовательность, кодирующую любые полипептиды Ни-Акр по этому изобретению, причем указанная полинуклеотидная последовательность кодирует полипептид Ни-Акр, имеющий полную аминокислотную последовательность 8ЕО ΙΌ N0: 2, 8ЕЦ ΙΌ N0: 4, 8ЕЦ ΙΌ N0: 6 или их фрагменты.
Это изобретение относится также к очищенным полипептидам Ни-Акр, как рекомбинантным, так и нерекомбинантным. Важнейшей особенностью этого изобретения является то, что оно относится к способам получения полипептидов Ни-Акр2 в активной форме. Эти способы включают получение полипептидов Ни-Акр2 и их вариантов в бактериальных клетках, клетках насекомого и клетках млекопитающего, а также в формах, которые позволяют секретировать полипептид Ни-Акр2 из бактериальных клеток и клеток насекомого или млекопитающего в культуральную среду, а также к получению вариантов полипептида Ни-Акр2, содержащих аминокислотные метки, облегчающие последующую очистку. В предпочтительном варианте осуществления изобретения полипептид Ни-Акр2 превращают в протеолитически активную форму или в трансформированных клетках, или после очистки и расщепления второй протеазой в бесклеточной системе, причем такие активные формы полипептида Ни-Акр2 начинаются Νконцевой последовательностью Т0НС1К (8ЕЦ ΙΌ N0: 56) или ЕТЭЕЕР (8ЕЦ ΙΌ N0: 57). В объем этого изобретения входят также варианты и производные, в том числе фрагменты белков Ни-Акр, имеющие нативные аминокислотные последовательности, приведенные в 8Е0 ΙΌ N0: 2, 4 и 6, которые сохраняют биологическую активность Ни-Акр. Специалисты в этой области могут легко определить, обладает ли вариант, производное или фрагмент белка Ни-Акр активностью Ни-Акр, подвергая указанный вариант, производное или фрагмент стандартному анализу на аспарагилпротеазу. В объем этого изобретения входят фрагменты Ни-Акр, имеющие домен активного сайта аминокислотной последовательности ЭТО, фрагменты, имеющие домен активного сайта аминокислотной последовательности Ό80, фрагменты, содержащие обе последовательности активного сайта ЭТО и Ό80, фрагменты, в которых увеличено пространство, занимаемое последовательностями активного сайта ЭТО и Ό80, и фрагменты, в которых указанное пространство укорочено. Кроме того, в объем этого изобретения входят фрагменты Ни-Акр, в которых удален трансмембранный домен, что позволяет получить Ни-Акр2 в растворимой форме. В другом варианте осуществления изобретения две половины Ни-Акр2, каждая из которых содержит одну последовательность активного сайта ЭТО или Ό80, можно получить отдельно в виде рекомбинантных полипептидов и затем соединить их в растворе, в котором они восстанавливаются в виде активной протеазы.
Варианты Ни-Акр можно получить, например, мутацией нативных нуклеотидных последовательностей, кодирующих Ни-Акр. Вариант Ни-Акр в используемом здесь значении представляет собой полипептид, по существу, гомологичный нативному полипептиду Ни-Акр, но имеющий аминокислотную последовательность, которая отличается от такой же последовательности в нативном Ни-Акр благодаря наличию одной или нескольких делеций, инсерций или замен в аминокислотной последовательности. Вариант аминокислотной или нуклеотидной последовательности предпочтительно идентичен нативной последовательности Ни-Акр по крайней мере на 80%, более предпочтительно на 90% и наиболее предпочтительно на 95%. Таким образом, вариант нуклеотидной последовательности, который содержит, например, пять точковых мутаций на каждые сто нуклеотидов по сравнению с геном нативной Ни-Акр, будет на 95% идентичен нативному белку. Процентное значение идентичности последовательности, определяемой также термином гомология, между нативной и вариантной последовательностью Ни-Акр можно определить, например, сравнивая две последовательности при помощи компьютерных программ, обычно используемых для этой цели, таких как программа Оар (\У|ксопкш 8ес.|иепсе Апа1ук1к Раскаде, Уегкюп 8 Гог Ишх, Сепебск Сопрц1ег Огоир, Ищуегкйу Кекеагсй Рагк, Маб1коп, \У|ксопкт). в которой использован алгоритм Смита и Уотермена (Абу. Арр1. Ма1й. 2: 482-489 (1981)).
- 11 009216
Нативную аминокислотную последовательность можно изменить любыми известными методами. Например, мутации в определенных местах можно произвести при помощи хорошо известных методов, такие как олигонуклеотиднаправленный мутагенез, который описан \Уа1бсг с! а1. (Сепс 42: 133 (1986)); Ваиег с! а1. (Оспе 37: 73 (1985)); Сга1к (ВюТсс11пк|исз. 1апиагу 1985, рр. 12-19); 8тИй с! а1. (СепсИс Епдтссгтд: Ргтс1р1сз апб МеШобз, Р1спит Ргезз (1981)) и в патентах США №№ 4518584 и 4737462.
Варианты Ни-Азр, входящие в объем этого изобретения, могут содержать консервативно замещенные последовательности, т.е. в которых один или несколько аминокислотных остатков полипептида НиАзр заменены другими остатками, не изменяющими вторичную и/или третичную структуру полипептида Ни-Азр. Такие замещения могут включать замену аминокислоты остатком, имеющим аналогичные физико-химические свойства, например замещение одного алифатического остатка (11с, Уа1, Ьеи или А1а) другим или попарную замену основных остатков Ьуз и Агд, кислотных остатков С1и и Азр, амидных остатков С1п и Азп, гидроксильных остатков 8сг и Туг или ароматических остатков Рйс и Туг. Другая информация, касающаяся выполнения фенотипически молчащих замен аминокислот, приведена в работе Во\\1с с! а1., 8с1сисс 247: 1306-1310 (1990). Другими вариантами Ни-Азр, способными сохранять биологическую активность Ни-Азр, являются такие варианты, в которых замещения аминокислот произведены на участках за пределами функциональных областей белка.
Другим объектом этого изобретения является выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая полинуклеотид, который гибридизирует в строгих условиях с частью вышеописанных молекул нуклеиновых кислот, например примерно с 15 нуклеотидами, предпочтительно примерно с 20 нуклеотидами, более предпочтительно примерно с 30 нуклеотидами и еще более предпочтительно примерно с 30100 нуклеотидами одной из вышеописанных молекул нуклеиновых кислот. Такие части молекул нуклеиновых кислот, имеющие указанную длину, состоят по крайней мере из 15 смежных нуклеотидов эталонной молекулы нуклеиновой кислоты. Строгие условия гибридизации означают инкубацию примерно при 42°С в течение 2,5 ч в 6-кратном объеме 88С/0,1% 8Ό8 и последующую промывку фильтров в однократном объеме 88С при 65°С, 0,1% 8Ό8.
Рассмотренные в этом описании изобретения фрагменты молекул нуклеиновой кислоты, кодирующей Ни-Азр, а также полинуклеотиды, способные гибридизировать с такими молекулами нуклеиновой кислоты, можно использовать в качестве зонда или затравок в полимеразной цепной реакции (РСК.). Такие зонды можно использовать, например, для обнаружения наличия нуклеиновых кислот Ни-Азр при выполнении анализов ш νίίτο, а также саузерн- и нозерн-блоттинга. При помощи таких зондов можно также идентифицировать типы клеток, экспрессирующих Ни-Азр. Такие методы хорошо известны, и специалист в этой области может легко выбрать зонд требуемой длины для конкретного применения. При осуществлении ПЦР для выделения и амплификации последовательности известными методами используют 5'- и 3'-концевые затравки, соответствующие концам описанной молекулы нуклеиновой кислоты Ни-Азр.
Другими полезными фрагментами молекул нуклеиновой кислоты Ни-Азр являются антисмысловые или смысловые олигонуклеотиды, содержащие одноцепочечную последовательность нуклеиновых кислот, способную связываться с целевой мРНК Ни-Азр (с использованием смысловой цепи) или ДНК Ни-Азр (с использованием антисмысловой цепи). В предпочтительном варианте осуществления изобретения эти антисмысловые олигонуклеотиды Ни-Азр уменьшают длину мРНК Ни-Азр и продуцируют полипептиды Ни-Азр.
Другим объектом этого изобретения являются полипептиды Ни-Азр с сопутствующим гликозилированием нативной структуры или без него. Как Ни-Азр1, так и Ни-Азр2 имеют обязательные акцепторные сайты для Азп-связанных сахаров, причем Ни-Азр1 имеет два таких сайта и Ни-Азр2 имеет четыре сайта. Ни-Азр, экспрессированная в экспрессирующих системах дрожжей или млекопитающего (описанных ниже), может быть аналогична нативному полипептиду Ни-Азр или существенно отличаться от него молекулярной массой и параметрами гликозилирования. Экспрессия Ни-Азр в бактериальных экспрессирующих системах позволяет получить негликозилированную Ни-Азр.
Полипептиды по настоящему изобретению предпочтительно получают в выделенной форме и предпочтительно очищают. Полипептиды Ни-Азр можно выделить и очистить от тканей, культивируемых клеток или культур рекомбинантных клеток хорошо известными методами, включая осаждение сульфатом аммония или этанолом, анионо- или катионообменную хроматографию, фосфоцеллюлозную хроматографию, гидрофобную хроматографию, аффинную хроматографию, гидроксилапатитную хроматографию, лектинную хроматографию и высокоэффективную жидкостную хроматографию (ВЭЖХ). В предпочтительном варианте осуществления изобретения аминокислотную метку вводят в полипептид Ни-Азр при помощи генноинженерных методов, хорошо известных специалистам в этой области, которые включают добавление шести аминокислотных остатков гистидина для очистки путем связывания с никелем, иммобилизованным на приемлемой подложке, эпитопами для поликлональных или моноклональных антител, которые включают, но не ограничиваются ими, эпитоп Т7, тус-эпитоп и эпитоп У5а, и слияния Ни-Азр2 с приемлемыми белковыми партнерами, которые включают, но не ограничиваются ими, глутатион-8-трансферазу или мальтозасвязывающий белок. В предпочтительном варианте осуществления изобретения эти дополнительные аминокислотные последовательности присоединяют к С-концу Ни-Азр, но их можно присоединить и к Ν-концу или в промежуточных положениях полипептида Ни-Азр2.
Настоящее изобретение относится также к векторам, содержащим полинуклеотидные молекулы по
- 12 009216 этому изобретению, а также к клетке-хозяину, трансформированной такими векторами. Любые полинуклеотидные молекулы по этому изобретению можно присоединить к вектору, который обычно содержит селектируемый маркер и точку начала репликации для пролиферации в хозяине. Так как это изобретение относится также к полипептидам Ни-Акр, экспрессированным из вышеописанных полинуклеотидных молекул, желательно использовать векторы, предназначенные для экспрессии Ни-Акр. Векторы содержат ДНК, кодирующую любые выше- или нижеописанные полипептиды Ни-Акр, функционально связанные с приемлемыми транскрипционными или трансляционными регуляторными последовательностями, получаемыми из гена млекопитающего или насекомого, микробного или вирусного гена. Примерами регуляторных последовательностей являются транскрипционные промоторы, операторы, энхансеры, мРНК, рибосомасвязывающие сайты и приемлемые последовательности, которые регулируют транскрипцию и трансляцию. Нуклеотидные последовательности функционально связаны тогда, когда регуляторная последовательность находится в функциональной зависимости от ДНК, кодирующей Ни-Акр. Таким образом, промотор, представляющий собой нуклеотидную последовательность, функционально связан с последовательностью ДНК Ни-Акр, если этот промотор в виде нуклеотидной последовательности управляет транскрипцией последовательности Ни-Акр.
Выбор приемлемых векторов, используемых для клонирования полинуклеотидных молекул, кодирующих Ни-Акр, или для экспрессии полипептидов Ни-Акр, несомненно, зависит от клетки-хозяина, в которую переносят вектор, и в приемлемых случаях от клетки-хозяина, в которой должен быть экспрессирован полипептид Ни-Акр. Приемлемыми клетками-хозяевами для экспрессии полипептидов Ни-Акр являются прокариотические, дрожжевые и высшие эукариотические клетки, которые описаны ниже.
Полипептиды Ни-Акр, предназначенные для экспрессии в таких клетках-хозяевах, могут быть также слитыми белками, имеющими области из гетерологичных белков. Такие области могут быть введены, например, для обеспечения секреции, улучшенной стабильности или более легкой очистки полипептида. Например, в экспрессирующие векторы можно ввести последовательность, кодирующую соответствующий сигнальный пептид. Последовательность ДНК для сигнального пептида (секреторная лидерная последовательность) может быть слита в рамке считывания с последовательностью Ни-Акр так, что Ни-Акр будет транслироваться как слитый белок, содержащий сигнальный пептид. Сигнальный пептид, который является функционально активным в предполагаемой клетке-хозяине, стимулирует внеклеточную секрецию полипептида Ни-Акр. Сигнальная последовательность предпочтительно отщепляется от полипептида Ни-Акр во время секреции Ни-Акр из клетки. Неограничивающими примерами сигнальных последовательностей, которые можно использовать при осуществлении этого изобретения, являются дрожжевой Iфактор и лидерная последовательность пчелиного мелатина в клетках насекомого кГ9.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения полипептид Ни-Акр является слитым белком, который имеет гетерологичную область, используемую для облегчения очистки этого полипептида. Многие приемлемые пептиды, используемые для этой цели, обеспечивают избирательное связывание слитого белка с партнером связывания. Например, полипептид Ни-Акр можно модифицировать для получения пептида, образующего слитый белок, который специфически связывается с партнером связывания или пептидной меткой. Неограничивающими примерами таких пептидных меток являются метка 6-Н1к, тиоредоксиновая метка, гемаглутининовая метка, С8Т-метка и метка сигнальной последовательности ОтрА. Как должно быть понятно специалистам в этой области, партнер связывания, который распознает и связывается с пептидом, может быть любой молекулой или соединением, включающим ионы металла (например, аффинные колонки с металлом), антитела или их фрагменты и любой белок или пептид, который связывает такой пептид, как метка РЬАС.
Приемлемыми клетками-хозяевами для экспрессии полипептидов Ни-Акр являются прокариотические, дрожжевые и высшие эукариотические клетки. Приемлемыми прокариотическими клетками-хозяевами, предназначенными для экспрессии Ни-Акр, являются бактерии родов ЕксйепсЫа, ВасШик и 8а1топе11а, а также члены родов Ркеиботопак, 81гер!отусек и 8!арйу1ососсик. Для экспрессии, например, в Е. сой полипептид Ни-Акр может содержать Ν-концевой остаток метионина для облегчения экспрессии рекомбинантного полипептида в прокариотическом хозяине. Ν-концевой Ме! затем необязательно отщепляют от экспрессированного полипептида Ни-Акр. Для облегчения экспрессии в ЕксйепсЫа сой можно ввести другие Ν-концевые аминокислотные остатки, которые включают, но не ограничивают ими, лидерную последовательность Т7, лидерную последовательность Т7-каспазы 8, а также другие лидерные последовательности, содержащие метки для очистки, такие как метка 6-Н1к (пример 9). Полипептиды Ни-Акр, экспрессированные в Е. сой, можно укоротить, удаляя цитоплазматический конец, трансмембранный домен или область, прилегающую к мембране. Полипептиды Ни-Акр, экспрессированные в Е. сой, можно получить в растворимой или нерастворимой форме, которая может быть представлена, а может и не быть представлена тельцами включения. Нерастворимый полипептид можно сделать растворимым при помощи гуанидина-НС1, мочевины или других белковых денатурантов с последующей укладкой цепи в растворимой форме до или после очистки разведением или диализом в приемлемом водном буфере. Если при помощи методов рекомбинантных ДНК получена неактивная проформа Ни-Акр, ее можно сделать активной, отщепляя просегмент второй приемлемой протеазой, такой как протеаза вируса иммунодефицита человека.
Экспрессирующие векторы, предназначенные для использования в прокариотических хозяевах,
- 13 009216 обычно содержат один или более фенотипически селектируемых маркерных генов. Такие гены обычно кодируют, например, белок, который придает устойчивость к антибиотикам или соответствует ауксотрофным требованиям. Целый ряд таких векторов можно приобрести коммерческим путем. Примерами таких векторов являются векторы р8РОКТ, векторы рСЕМ (Рготеда), векторы рРКОЕХ (ЪТ1, ВеШекба, МО), векторы В1иекспр1 (81та1адеие), векторы рЕТ Щоуадеи) и векторы рЦЕ (фадеи).
Ни-Акр можно также экспрессировать в дрожжевых клетках-хозяевах из родов, включая 8ассйатотусек, Р1сЫа и К1иуеготусек. Предпочтительными дрожжевыми клетками-хозяевами являются 8. сетеуШае и Р. рак!опк. Дрожжевые векторы часто содержат последовательность начала репликации из дрожжевой плазмиды 2Т, автономно реплицирующую последовательность (АКБ), промоторную область, последовательности полиаденилирования, последовательности терминации транскрипции и селектируемый маркерный ген. Можно также использовать векторы, которые реплицируются как в дрожжевых клетках, так и в Е. сой (так называемые шаттл-векторы). Помимо вышеуказанных признаков дрожжевых векторов, шаттл-вектор содержит также последовательности для репликации и селекции в Е. сой. Прямую секрецию полипептидов Ни-Акр, экспрессированных в дрожжевых клетках-хозяевах, можно производить путем введения нуклеотидной последовательности, кодирующей лидерную последовательность дрожжевого 1-фактора у 5'-конца нуклеотидной последовательности, кодирующей Ни-Акр.
Системы культур клеток-хозяев насекомого можно также использовать для экспрессии полипептидов Ни-Акр. В предпочтительном варианте осуществления изобретения полипептиды Ни-Акр экспрессируют с использованием экспрессирующей системы на основе клеток насекомого (см. пример 10). Кроме того, для экспрессии в клетках насекомого можно использовать бакуловирусную экспресирующую систему, описанную Ьискоте и 8иттегк, Вю/Тес1то1оду 6: 47 (1988).
В другом предпочтительном варианте осуществления изобретения полипептид Ни-Акр экспрессируют в клетках-хозяевах млекопитающего. Неограничивающими примерами приемлемых линий клеток млекопитающего являются линия СО8-7 клеток почки макаки (С1ихтап е! а1., Се11 23: 175 (1981)), линия клеток 293 почки эмбриона человека и клетки яичника китайского хомячка (СНО). Для экспрессии белков Ни-Акр предпочтительно используют клетки яичника китайского хомячка (СНО) (пример 11).
Выбор приемлемого экспрессирующего вектора для экспрессии полипептидов Ни-Акр по этому изобретению безусловно зависит от конкретной используемой клетки-хозяина млекопитающего, что должно быть известно специалисту в этой области. Примерами приемлемых экспрессирующих векторов являются рсОЫАЗ Цпуйтодеи) и р8УЪ (Рйатташа Вю!есй.). Предпочтительным вектором для экспрессии полипептидов Ни-Акр является рсОХА3.1-Нудго Цпуйгодеп). Экспрессирующими векторами для использования в клетках-хозяевах млекопитающего могут быть транскрипционные и трансляционные регулирующие последовательности, полученные из вирусных геномов. Обычно используемыми промоторными и энхансерными последовательностями по настоящему изобретению являются, но не ограничиваются ими, последовательности, полученные из цитомегаловируса человека (СМУ), аденовируса 2, вируса полиомы и вируса обезьян 40 (8У40). Методы конструирования экспрессирующих векторов млекопитающих описаны, например, в статьях Окауата аиб Вегд (Мо1. Се11. Вю1. 3: 280 (1983); Соктап е! а1. (Мо1. 1ттипо1. 23: 935 (1986)); Соктап е! а1. (Уинге 312: 768 (1984); в ЕР-А-0367566 и в АО 91/18982.
Полипептиды по настоящему изобретению можно также использовать для индуцирования поликлональных и моноклональных антител, которые являются полезными в диагностических анализах для детектирования экспрессии полипептида Ни-Акр. Такие антитела можно получить известными методами. См., например, АийЬоб1ек: А ЬаЬота!огу Мапиа1, Нат1оте аиб Ьаиб (ебк.), Со1б 8рпид НатЬот ЬаЬота!огу Ргекк. Со1б 8рпид НагЬог, Ν.Υ., (1988); Мопос1опа1 АпйЬоб1ек, НуЬпботак: А Ыете Эппепкюп т Вю1од1са1 Апа1укек, Кеппе! е! а1. (ебк.), Р1епит Ргекк, №\ν Υо^к (1980). Синтетические пептиды, включающие части Ни-Акр из 5-20 аминокислот, можно также использовать для продуцирования поликлональных или моноклональных антител после связывания с приемлемыми белками-носителями, которые включают, но не ограничиваются ими, гемацианин блюдечка (КЬН), куриный овальбумин или бычий сывороточный альбумин, при использовании разных сшивающих реагентов, включающих карбодиимиды, глутаральдегид или в том случае, если пептид содержит цитеин, Ν-метилмалеимид. Предпочтительный пептид для иммунизации, полученный после конъюгации с КЬН, содержит С-конец Ни-Акр1 или Ни-Акр2, включающий, соответственно, ОРИРИЭРЕУУ\'ЭЕ88РУИНИАК (8ЕО ΙΌ ^: 50) или Р1ЮО111ГОРА1ГО18РРК (8ЕО ГО 51).
Молекулы нуклеиновой кислоты Ни-Акр по настоящему изобретению также пригодны для идентификации хромосом, так как они могут гибридизировать с конкретным местом в хромосоме человека. НиАкр1 локализован в хромосоме 21, в то время как Ни-Акр локализован в хромосоме 11с.|23.3-24.1. Существует насущная необходимость в идентификации конкретных участков хромосомы, так как в настоящее время имеется мало реагентов, маркирующих хромосомы, на основе фактических данных о последовательностях (полиморфизм повторов), предназначенных для мечения участков хромосомы. После того, как последовательность картирована для точного участка хромосомы, физическое положение этой последовательности в хромосоме можно коррелировать с данными генетической карты. Взаимосвязь между генами и болезнями, установленную благодаря картированию одной и той же области хромосомы, затем можно идентифицировать при помощи анализа связывания, в результате которого определяют совместное наследование физически смежных генов. Является ли ген, имеющий отношение к данной болезни,
- 14 009216 действительной причиной ее возникновения, можно определить, сравнивая последовательность нуклеиновых кислот у субъектов, страдающих и не страдающих этим заболеванием.
В соответствии с другим вариантом осуществления это изобретение относится к способу анализа функции Ни-Акр, в частности функции Ни-Акр2, который заключается в том, что полипептид Ни-Акр инкубируют в растворе с приемлемым субстратом, который включает, но не ограничивается ими, синтетический пептид, содержащий сайт расщепления АРР β-секретазой, предпочтительно пептид, имеющий мутацию, обнаруженную у большой группы населения Швеции с наследственной болезнью Альцгеймера, при которой КМ заменяется ΝΣ, причем такой пептид содержит последовательность δΕνΝΣΌΑΕΡΚ. (8ЕО ΙΌ ΝΟ: 54), в растворе с кислотным буфером, предпочтительно в растворе с кислотным буфером, имеющем рН 5,5 (см. пример 12), после чего данный пептид расщепляют, что служит мерой протеолитической активности Ни-Акр, контролируемой при помощи высокоэффективной жидкостной хроматографии. В предпочтительных анализах протеолитической активности используют внутренне погашенные субстраты для анализа пептида. Такими приемлемыми субстратами являются пептиды с присоединными к ним флуорофором и гасителем, которыми являются, но не ограничиваются ими, кумарин и динитрофенол, в результате расщепление пептида Ни-Акр вызывает увеличение флуоресценции вследствие физического разделения флуорофора и гасителя. При выполнении предпочтительных колориметрических анализов протеолитической активности Ни-Акр используют другие приемлемые субстраты, которые включают аминокислоты Р2 и Р1, включающие сайт узнавания для расщепления в положении о-нитрофенола, связанного амидной связью, в результате чего расщепление под действием Ни-Акр вызывает увеличение оптической плотности после доведения буфера до щелочного рН.
В соответствии с другим вариантом осуществления это изобретение относится к способу идентификации агента, увеличивающего активность полипептида Ни-Акр, выбираемого из группы, включающей Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь), который включает:
(a) определение активности указанного полипептида Ни-Акр в присутствии и в отсутствие испытуемого агента и (b) сравнение активности указанного полипептида Ни-Акр, определяемой в присутствии указанного испытуемого агента, с активностью указанного полипептида Ни-Акр, определяемой в отсутствие указанного испытуемого агента;
при этом более высокая активность полипептида Ни-Акр в присутствии испытуемого агента свидетельствует о том, что указанный испытуемый агент увеличивает активность указанного полипептида. Такие испытания можно выполнять с использованием полипептида Ни-Акр в бесклеточной системе и культивируемых клеток, экспрессирующих Ни-Акр, его варианты или изоформы.
В соответствии с другим вариантом осуществления это изобретение относится к способу идентификации агента, уменьшающего активность полипептида Ни-Акр, выбираемого из группы, включающей Ни-Акр1, Ни-Акр2(а) и Ни-Акр2(Ь) , который включает:
(a) определение активности указанного полипептида Ни-Акр в присутствии и в отсутствие испытуемого агента и (b) сравнение активности указанного полипептида Ни-Акр, определяемой в присутствии указанного испытуемого агента, с активностью указанного полипептида Ни-Акр, определяемой в отсутствие указанного испытуемого агента;
при этом более низкая активность полипептида Ни-Акр в присутствии испытуемого агента свидетельствует о том, что указанный испытуемый агент снижает активность указанного полипептида. Такие испытания можно выполнять с использованием полипептида Ни-Акр в бесклеточной системе и культивируемых клеток, экспрессирующих Ни-Акр, его варианты или изоформы.
В соответствии с другим вариантом осуществления это изобретение относится к новой линии клеток (клетки НЕК125.3), используемой для измерения амилоидного β-пептида (Ав), процессированного из предшественника амилоидного белка (АРР). Эти клетки являются стабильными трансформантами клеток почки эмбриона человека 293 (НЕК293) с бицистронным вектором, полученным из рШЕ8-Е6РР (С1ои1есй) и содержащим модифицированную кДНК АРР человека, внутренний сайт вхождения рибосомы внутрь клетки и кДНК усиленного зеленого флуоресцирующего белка (Е6РР) во втором цистроне. кДНК АРР модифицируют добавлением двух кодонов лизина к карбоксильному концу кодирующей последовательности АРР. Это увеличивает процессинг Λβ-пептида из АРР человека в 2-4 раза. Этот уровень процессинга Λβ-пептида в 60 раз выше, чем у ^трансформированных клеток НЕК293. Клетки НЕК125.3 можно использовать для анализа соединений, ингибирующих процессинг Ав-пептида. Это изобретение относится также к добавлению двух остатков лизина к С-концу других изоформ АРР, включая изоформы, состоящие из 751 и 770 аминокислот, изоформы АРР, имеющие мутации, обнаруженные в случае болезни Альцгеймера у человека, в том числе шведские мутации ИМ^УЬ и ν717^Ρ, к С-концевым фрагментам АРР, начинающимся с сайта расщепления β-секретазой, к С-концевым фрагментам АРР, имеющим сайт расщепления β-секретазой, которые функционально связаны с Ν-концевым сигнальным пептидом для вставки и секреции через мембрану, и к С-концевым фрагментам АРР, которые функционально связаны с Ν-концевым сигнальным пептидом для вставки и секреции через мембрану и репортерной после
- 15 009216 довательностью, которая включает, но не ограничивается ими, зеленый флуоресцирующий белок или щелочную фосфатазу, так, что расщепление β-секретазой вызывает освобождение репортерного белка с поверхности клеток, экспрессирующих полипептид.
Существо этого изобретения, изложенное в этом описании изобретения, будет более понятно со ссылкой на нижеследующие примеры, которые приведены только с целью иллюстрации и не ограничивают объем изобретения.
Примеры
Пример 1. Разработка алгоритма поиска, пригодного для идентификации аспарагилпротеаз и генов аспарагилпротеазы из С. Е1едап§ в базе данных ХУогтрср 12.
Материалы и методы
Классические аспарагилпротеазы, такие как пепсин и ренин, имеют двухдоменную структуру цепи, при укладке которой два остатка аспарагила располагаются рядом с активным сайтом. Они образуют короткий трипептидный элемент ΌΤΟ или более редко Ό8Ο. Мотив ΌΤΟ или Ό8Ο активного сайта находится рядом с остатками 25-30 в ферменте и рядом с остатками 65-70 в проферменте (проренин, пепсиноген). Этот мотив снова появляется около остатков 150-200 в нижней области. Профермент активируется в результате расщепления ^концевого продомена. Эта схема характерна для двухдоменной структуры современных аспарагиловых ферментов, которые, очевидно, образуются вследствие дупликации и дивергенции генов. Таким образом,
ХН2........................X--------------Ό25ΤΟ..........................Υ--------------Όυ+25ΤΟ------------------С где X обозначает начало фермента после ^концевого продомена и Υ обозначает центр молекулы, где снова начинается повтор гена.
В случае ретровирусных ферментов, таких как ВИЧ-протеаза, они представляют только половину двухдоменных структур хорошо известных ферментов, подобных пепсину, катепсину Ό, ренину и т.д. Они не имеют просегмента, но из них выделен предшественник полипротеина, содержащий белки вируса дад- и ро1. Их можно представить
ХН2........................Ό25ΤΟ.........................................С100
Этот мономер содержит примерно 100 аминокислот, поэтому он является исключительно бедным по сравнению с другими димерами аспарагилпротеаз, которые имеют порядка 330 или около того аминокислот, не считая ^концевого продомена.
Ограниченная длина мотива активного сайта эукариотической аспарагилпротеазы затрудняет поиск новых последовательностей в коллекциях Ε8Τ. Последовательности Ε8Τ обычно имеют, в среднем, 250 нуклеотидов, и в этом случае крайне затруднительно найти оба мотива активного сайта аспарагилпротеазы. Вместо этого авторы изобретения обратились к геному С. е1едаи8. Установлено, что геном С. е1едап8 имеет примерно 13000 генов. Из них секвенированы примерно 12000, и соответствующая гипотетическая открытая рамка считывания (0РР) помещена в базу данных \Уогтрер12. Авторы изобретения использовали эту базу данных в качестве основы для сканирования всего генома высшего эукариота с целью обнаружения новых аспарагилпротеаз при помощи алгоритма, специально разработанного для этой цели авторами. Для поиска использовали нижеследующую программу ΛνΚ, позволяющую локализовать белки, содержащие два мотива ΌΤΟ или Ό8Ο, которую выполняли 4 раза для выделения всех парных комбинаций этого мотива аспарагила.
ВЕ6ГЫ{К8=>} /*определяет > в качестве разделителя записей для формата ΡΛ8ΤΛ*/ { ро8=шбех($0, ΌΤΟ') /*находит ΌΤΟ в записи*/
1£(ро§>0) { ге81=8иЬйг($0, ро§+3) /*получает остальную часть записи после первого ΌΤΟ*/ ро82=шбех(ге81, ΌΤΟ) /*находит второй ΌΤΟ*/ |Г(ро52>0)рпи1Г /*число совпадений в отчете*/ (%8%8\И, >, $0) } }
Вышеуказанную программу ΛνΚ, загружаемую из йр.8апдег.ас.ик/риЬ/ба1аЬа8е8/теогтрер, использовали для поиска в базе данных Vо^трер12 последовательностей, содержащих по крайней мере два мотива ΌΤΟ или Ό8Ο. При помощи программы ΛνΚ каждую запись ограничивали 3000 или меньшим числом символов. Так, записи, состоящие из 35 или большего числа символов, вручную удаляли из базы данных Vо^трер12, так как в любом случае маловероятно, что они могут кодировать аспарагилпротеазы.
Результаты и выводы
База данных Vо^трер12 содержит 12178 данных, хотя некоторые из них (<10%) представляют альтернативно сплайсированные транскрипты из одного из того же гена. Число генов, кодированных в геноме С. е1едап8, составляет порядка 13000 генов, поэтому база данных Vо^трер12 содержит более 90% генома С. е1едап§.
Эукариотические аспарагилпротеазы имеют двухдоменную структуру, которая, по-видимому, образуется в результате дупликации гена-предшественника. Каждый домен содержит мотив активного сайта
- 16 009216
Ό(8/Τ)0, расположенный на расстоянии 20-25 аминокислотных остатков в каждом домене. Протеазы ретровирусов (например, ВИЧ-протеаза) или ретротранспозонов являются гомодимерами субъединиц, которые гомологичны одному домену эукариотической аспарагилпротеазы. Программу Л\УК использовали для поиска в базе данных \Уогтрер12 белков, в которых элемент Ό(8/Τ)Ο встречается по крайней мере дважды. Было идентифицировано >60 белков с двумя элементами ЭТО или Э8С. Была произведена визуальная проверка для выбора белков, в которых положение доменов аспарагила свидетельствует о том, что двухдоменная структура соответствует вышеописанным критериям.
Кроме того, для поиска в базе данных \Уогшрср12 предполагаемых аспарагилпротеаз были использованы параметры активного сайта эукариотической и вирусной аспарагилпротеазы РК081ТЕ Р80014 (Вапосб А., Висбег Р., НоЕтапп К., Тбе РКО81ТЕ ба1аЬаке: ίΐ8 ЧаЦ.15 ίη 1997, Νηοίοίο Аабк Кек. 24: 217-221 (1997)). В базе данных \Уогтрер12 был обнаружен перекрывающийся набор последовательностей. Из них семь последовательностей содержали два мотива ОТО или Э8С и имели параметры активного сайта аспарагилпротеазы РКО81ТЕ. Из этих семи последовательностей три были обнаружены в одном космидном клоне (Е21Е8.3, Е21Е8.4 и Е21Е8.7), на основании чего можно предположить, что они представляют собой семейство белков, которые образуются в результате дупликации гена-предшественника. Две другие последовательности ОКЕ, обладающие значительной гомологией с Е21Е8.3, Е21Е8.4 и Е21Е8.7, находятся в том же кластере генов (Е21Е8.2 и Е21Е8.6), однако, они содержат только один мотив ОТО. Обширный поиск при помощи программы ВЬА8Т с использованием этих семи последовательностей в базе данных \Уогтрер12 не позволил обнаружить дополнительные предполагаемые аспарагилпротеазы в геноме С.е1едап8, содержащие два повтора элемента ОТО или Ό8Ο.
Поиск при помощи программы ВЬА8ТХ с использованием каждой последовательности С. е1едап8 в базе данных 8^188-РКОТ, ОепРер и ТКЕМВЬ позволил обнаружить, что К12Н7.2 является ближайшим гомологом известных аспарагилпротеаз млекопитающего и Т18Н9.2 обладает более отдаленным родством, в то время как СЕА§р1, Е21Е8.3, Е21Е8.4 и Е21Е8.7 образуют субкластер, который обладает наименьшей гомологией последовательностей с последовательностями млекопитающего.
Обсуждение
АРР, презенилины и р35, активатор сбк5 подвергаются внутриклеточному протеолитическому процессингу на сайтах, которые соответствуют специфичности субстрата ВИЧ-протеазы. Неправильная регуляция клеточной аспарагилпротеазы с такой же специфичностью субстрата создает объединяющий механизм, определяющий причинную связь между патологией бляшек и сплетений в случае болезни Альцгеймера. Поэтому авторы изобретения пытались идентифицировать новые аспарагилпротеазы человека. Сканирование всего генома в С. е1едап8 позволило обнаружить семь открытых рамок считывания, относящихся к характеристике аспарагилпротеазы. Эти семь аспарагилпротеаз, вероятно, включают полный набор таких протеаз в простом многоклеточном эукариотическом организме. Они включают четыре близкородственные аспарагилпротеазы, уникальные для С. е1едап8, которые, по-видимому, образуются в результате дупликации гена-предшественника. Были обнаружены три другие предполагаемые аспарагилпротеазы (Т18Н9.2, К12Н7.2 и С1РО2.2), обладающие гомологией с генными последовательностями млекопитающего.
Пример 2. Идентификация новых аспарагилпротеаз человека в базе данных путем установления связи между геномами.
Материалы и методы
Компьютерный анализ баз данных Е8Т, кДНК и предполагаемых полипептидных последовательностей.
Обширный поиск гомологии в базах данных Е8Т с использованием последовательностей СЕА§р1, Е21Е8.3, Е21Е8.4 и Е21Е8.7 не позволил обнаружить новые гомологи млекопитающего. В результате поиска при помощи программы ΤВ^А8ΤN с использованием К12Н7.2 обнаружена гомология с катепсином Ό, катепсином Е, пепсиногеном А, пепсиногеном С и ренином, в частности рядом с мотивом ОТО на активном сайте, но при этом не были найдены какие-либо дополнительные новые аспарагилпротеазы млекопитающего. Это указывает на то, что геном С. е1едап8, по-видимому, содержит только одну лизосомную аспарагилпротеазу, представленную в организме млекопитающего семейством генов, образующихся в результате дупликации и последующей модификации гена-предшественника.
Поиск при помощи программы ΤВ^А8ΤN с использованием Т18Н9.2, оставшейся последовательности С. е1едап8, позволил идентифицировать несколько Е8Т, которые образуют набор смежных последовательностей, кодирующих новую аспарагилпротеазу человека (Ни-А8р1). Как описано выше в примере 1, в результате поиска при помощи программы ВЬА8ТХ с использованием набора смежных последовательностей Ни-А8р1 в базе данных 8^188-РКОТ установлено, что мотивы активного сайта в последовательности упорядочены в соответствии с активными сайтами других аспарагилпротеаз. Обширный повторный поиск при помощи программы В^А8ΤN в базах данных Ь1Ее8ед, ЫГе8ес.|ЕЕ и в доступных коллекциях Е8Т позволил выявить 102 Е8Т из множества библиотек кДНК, образующих один набор смежных последовательностей. Из 51 последовательности в наборе, обнаруженном в публичных коллекциях Е8Т, был также собран один набор (ТНС213329) в Институте исследования геномов (Т1ОК). В аннотации, представленной Т1ОК, указано, что сотрудники этого института не нашли каких-либо признаков такого набора в базе данных. Следует отметить, что набор смежных последовательностей, полученный Т1ОК, представляет собой набор с обратным расположением последовательностей по сравнению с набором Ь1Ее8ед, полу
- 17 009216 ченным авторами этого изобретения. Поиск Ни-Акр1 при помощи программы ВЙА8ТН в последовательностях Е8Т крыс и мышей в базе данных Ζοοδος позволил выявить одну гомологичную Е8Т в каждой базе данных (соответственно клон ΙηονΙο 700311523 и клон ИМЛСЕ 313341, СепВапк, № доступа \У10530).
Поиск при помощи программы ТВЕ-ААХ с использованием собранной последовательности ДНК Ни-Акр1 в базе данных ЫРеЗедРЬ и в доступных базах данных Е8Т позволил идентифицировать вторую родственную последовательность человека (Ни-А8р2), выраженную одной Е8Т (2696295). В результате трансляции этой частичной последовательности кДНК был обнаружен один мотив ЭТС, обладающий гомологией с элементом активного сайта бычьей аспарагилпротеазы, NΜ1.
Поиск при помощи ВБА8Т наборов смежных последовательностей и сравнительный анализ первичных структур нескольких последовательностей выполняли при помощи программных средств по биоинформатике, предоставленных вместе с базами данных Ь1Ре8ед, Ь1Ге8едРЬ и Ь1Ре8ед АккетЫей фирмой Iηсуΐе. Мотивы предполагаемых белков идентифицированы при помощи словаря Рто8йе (элементы в ССС 9) или базы данных РГат.
Клонирование полноразмерной кДНК Ни-Акр1.
Для работы в базах данных ЫГе8ес.| и Ь1Ре8ед-РЬ фирмы Тпсу1е использовали открытую рамку считывания гена Т18Н9.2СЕ С. е1едапк, при этом была обнаружена одна электронная упорядоченная структура, определяемая как 1863920СЕ1. Фирма Iηсуΐе предоставила клон 5'-концевых кДНК в наборе 1863920 с полным секвенированием обеих цепей. В результате трансляции открытой рамки считывания, имеющейся в клоне 1863920, обнаружен двойной мотив активного сайта аспарагилпротеазы (ЭТС/П8С), но 5'-конец был неполным. Остальная часть кодирующей последовательности Ни-Акр1 определена в результате анализа 5'-конца методом МатаШоп ВАСЕ с использованием готовой матричной кДНК плаценты человека МатаШоп (С1опе1есй). 3'-концевую антисмысловую олигонуклеотидную затравку, специфическую для 5'-конца клона 1863920, соединяли с 5'-концевой смысловой затравкой, специфической для синтетического адаптера готовой кДНК фирмы МагаШоп при выполнении РСК. Специфические продукты РСК сразу же секвенировали путем циклического секвенирования и полученную последовательность соединяли с последовательностью клона 1863920 для получения полной кодирующей последовательности Ни-Акр1 (АО ΙΌ N0: 1).
Первичная аминокислотная последовательность Ни-Акр1 (фиг. 1, 8Е0 ΙΌ N0: 2) имеет несколько интересных особенностей. Эта последовательность содержит сигнальный пептид (остатки 1-20 в АО ΙΌ N0: 2), просегмент и каталитический домен, содержащий две копии элемента активного сайта аспарагилпротеазы (ОТС/О8С). Расстояние между первым и вторым мотивами активного сайта составляет около 200 остатков, которые должны соответствовать предполагаемой длине одного домена эукариотической аспарагилпротеазы. Более интересной особенностью является то, что эта последовательность содержит предполагаемый трансмембранный домен (остатки 469-492 в АО ΙΌ N0: 2) рядом с С-концом, из чего следует, что эта протеаза связана с мембраной. Эта особенность не обнаружена у ни у каких других других аспарагилпротеаз.
Клонирование полноразмерной кДНК Ни-Акр2.
Как описано выше в примере 1, обширное сканирование генома в базе данных ^огтРер12 СаепотйаЬФйк е1едапк с целью обнаружения предполагаемых аспарагилпротеаз и последующий поиск в базах данных Е8Т человека позволили выявить ортогональный аналог гена С. е1едапк Т18Н9.2, определяемый как НиАкр1. Собранный набор смежных последовательностей Ни-Акр1 использовали для поиска параллельных аналогов с использованием программы ВЬА8Т в базах данных Е8Т человека, при этом в базе данных Ь1Ге8едРЬ было обнаружено одно существенное соответствие (2696295СЕ1), характеризующееся примерно 60% общей идентичностью. Аналогичный поиск в базе данных дЬ105РиЬЕ8Т или в нескольких базах данных человека, предоставленных фирмой ТЮК, не позволил идентифицировать подобные клоны Е8Т. Клон кДНК 2696295, идентифицированный в результате однократного анализа последовательностей из библиотеки кДНК матки человека, предоставлен фирмой Тпсу1е с полностью секвенированными обеими цепями. Этот клон содержал неполную открытую рамку считывания, включающую 1266 п.о., которая кодировала полипептид, состоящий из 422 аминокислот, но не имела инициатора АТС у 5'конца. В результате проверки предполагаемой последовательности выявлены два элемента активного сайта аспарагилпротеазы ЭТС/О8С, разделенные 194 аминокислотными остатками. Последующие поиски в более поздних выпусках баз данных Е8Т Б|Ге8ед позволили обнаружить дополнительные Е8Т, секвенированные из библиотеки кДНК астроцитов человека (4386993), которые содержали дополнительную 5'-концевую последовательность по сравнению с клоном 2696295. Клон 4386993 предоставлен фирмой Iηсуΐе с полностью секвенированными обеими цепями. Сравнительный анализ клонов 4386993 и 2696295 подтвердил, что клон 4386993 имеет открытую рамку считывания из 31 аминокислотного остатка, включая два внутрирамочных кодона инициации трансляции. Несмотря на наличие двух внутрирамочных элементов АТС, вверху от АТС не было обнаружено ни одного внутрирамочного терминирующего кодона, что свидетельствует о том, что клон 4386993 не может быть полноразмерным. Кроме того, сравнительный анализ последовательностей клонов 2696295 и 4386993 позволил выявить вставку из 75 пар оснований в клоне 2696295 по сравнению с клоном 4386993, что указывает на наличие вставки из 25 дополнительных аминокислотных остатков в клоне 2696295. Остальная часть кодирующей последователь
- 18 009216 ности Ни-А§р2 определена анализом 5'-конца методом МагаГйоп КАСЕ с использованием готовой матричной кДНК из гиппокаппа человека МагаГйоп (С1опеГесй). З'-Концевую антисмысловую олигонуклеотидную затравку. специфическую для общей 5'-концевой области клонов 2696295 и 4386993. соединяли с 5'-концевой смысловой затравкой. специфической для синтетического адаптера готовой кДНК МагаГйоп. при выполнении РСК. Специфические продукты РСК сразу же секвенировали путем циклического секвенирования и полученную последовательность соединяли с последовательностью клонов 2696295 и 4386993 для получения полной кодирующей последовательности. соответственно. Ни-А§р2(а) (8ЕО ΙΌ N0: 3) и Ни-А§р2(Ь) (8ЕО ΙΌ N0: 5).
Первичные аминокислотные последовательности Ни-А§р2(а) (фиг. 3. 8Е0 ΙΌ N0: 4) и Ни-А§р2(Ь) (фиг. 2. 8Е0 ΙΌ N0: 6) имеют несколько интересных особенностей. Обе последовательности содержат сигнальный пептид (остатки 1-21 в 8Е0 ΙΌ N0: 4 и 8Е0 ΙΌ N0: 6). просегмент и каталитический домен. содержащий две копии мотива активного сайта аспарагилпротеазы (ΌΤ0/Ώ80). Расстояние между первым и вторым мотивами активного сайта изменяется из-за делеции 25 аминокислотных остатков в НиАкр2(Ь) и составляет. соответственно. 168 и 194 аминокислотных остатка для Ни-А§р2(Ь) и Ни-А§р2(а). Более интересной особенностью является то. что обе последовательности имеют предполагаемый трансмембранный домен (остатки 455-477 в 8Е0 ΙΌ N0: 4 и 430-452 в 8Е0 ΙΌ N0: 6) около С-концов. что свидетельствует о том. что эта протеаза связана с мембраной. Эта особенность не обнаружена ни у каких других аспарагилпротеаз. за исключением Ни-АкрЕ
Пример 3. Молекулярное клонирование кДНК Акр2 мыши и геномной ДНК.
Клонирование и исследование кДНК Акр2 мыши
Ортологический аналог Ни-А§р2 мыши клонирован с использованием ряда методов. включающих скрининг бибилиотеки кДНК. РСК и геномное клонирование. Исследовано примерно 500000 независимых клонов из библиотеки кДНК головного мозга мышей с использованием 32Р-меченого зонда кодирующей последовательности. полученного из Ни-А§р2. В положительных репликах анализировали последовательности ДНК. при этом установлено. что самая длинная кДНК имеет полную 3'-концевую нетранслированную область и 47 аминокислот в кодирующей области. Амплификации при помощи РСК той же библиотеки кДНК головного мозга мышей при помощи антисмысловой олигонуклеотидной затравки. специфической для вышеуказанной 5'-концевой последовательности кДНК. и смысловой затравки. специфической для 5'-концевой области последовательности Акр2 человека. с последующим анализом последовательности ДНК позволили получить еще 980 п.о. кодирующей последовательности. Остальная часть 5'-концевой последовательности Акр2 мыши получена из геномной последовательности (см. ниже).
Выделение и анализ последовательности гена Акр2 мыши
Последовательность Е8Т мыши. кодирующую часть кДНК Акр2 мыши. идентифицировали в базе данных Е8Т ОепБапк при помощи программы поиска ВБА8Т и кодирующей последовательности Ни-А§р2 в качестве эталона. Клон §3160898 характеризовался 88% общей идентичностью с указанной последовательностью человека на протяжении 352 п.о. Затем синтезировали пары олигонуклеотидных затравок. специфических для этой области Акр2 мыши. и использовали для амплификации областей гена мыши. Геномную ДНК мыши. полученную из штамма 129/δν.Τ. амплифицировали. выполняя РСК (25 циклов) с использованием разных наборов затравок. специфических для Акр2 мыши. и продукты анализировали электрофорезом в агарозном геле. При помощи набора затравок 2оо-1 и 2оо-4 амплифицировали фрагмент длиной 750 п.о.. который содержал последовательность интрона длиной около 600 п.о.. выявленную в результате сравнения с известной последовательностью кДНК. Этот набор затравок затем использовали для скрининга библиотеки ВАС мыши путем выполнения РСК. при этом был выделен один геномный клон и при помощи анализа последовательности ДНК было подтверждено. что этот клон содержит ген Акр2 мыши. В результате секвенирования ДНК этого геномного клона Акр2 методом дробовика и сравнения с последовательностями кДНК Ни-А§р2 и частичными последовательностями кДНК мыши была определена полноразмерная последовательность Акр2 мыши (8Е0 ΙΌ N0: 7). Предполагаемая аминокислотная последовательность Акр2 мыши (8Е0 ΙΌ N0: 8) характеризуется 96.4% общей идентичностью (алгоритм ОСО ВейЕй) с заменами 18/501 аминокислотного остатка по сравнению с последовательностью человека (фиг. 4).
Пример 4. Распределение в тканях экспрессии транскриптов Ни-А§р2.
Материалы и методы
Распределение в тканях экспрессии Ни-А§р2 определяли при помощи нозерн-блотов множества тканей. предоставленных фирмой С1опе1есй (Ра1о Айо. СА). Клон 2696295 фирмы ШсуГе в векторе рШС’У полностью расщепляли ЕсоШ/ЫоП и вставку кДНК длиной 1.8 т.п.о. очищали препаративным электрофорезом в агарозном геле. Этот фрагмент метили радиоактивными изотопами до достижения удельной активности >1х109 распадов/мин/мкг с использованием произвольной затравки в присутствии [а-32Р6АТР](>3000 С1/ммоль. Атегайат. АгйпдГоп НещйК ГЬ) и фрагмента Кленова ДНК-полимеразы Ι. Найлоновые фильтры. содержащие денатурированную. фракционированную поли-А+ РНК. выделенную из разных тканей человека. гибридизировали с зондом. обеспечивающим 2х106 распадов/мин/мл в буфере ЕхргеккНуЬ (С1опеГесй. Ра1о Айо. СА) в течение 1 ч при 68°С и промывали в соответствии с указаниями производителя. Сигналы гибридизации визуализировали при помощи авторадиографии с использовани
- 19 009216 ем пленки ВюМах ХК (Кобак, Косйейет, УУ) и усилением яркости изображения при -80°С.
Результаты обсуждения
В результате анализа базы данных получена ограниченная информация о распределении в тканях экспрессии транскриптов Ни-Акр2 из-за относительно небольшого числа Е8Т, обнаруженных при помощи вышеописанных способов (<5). Чтобы получить дополнительную информацию об экспрессии гена Ни-Акр2, выполняли нозерн-блоттинг для определения размеров и количества транскриптов Ни-Акр2. Поли-А+ РНК, выделенную из нескольких периферических тканей и областей головного мозга, помещали на твердую подложку после отделения в денатурирующих условиях и транскрипты Ни-Акр2 визуализировали путем гибридизации в очень строгих условиях с меченой радиоактивными изотопами вставкой из клона 2696295. При помощи зонда кДНК 2696295 был визуализирован набор мигрирующих транскриптов размером 3,0, 4,4 и 8,0 т.п.о., причем два последних транскрипта встречались наиболее часто.
Из исследованных тканей транскрипты Ни-Акр2 в наибольшем количестве обнаружены в поджелудочной железе и головном мозге, при этом более низкие, но детектируемые количества присутствовали во всех других изученных тканях, за исключением тимуса и РВЬ. Наряду с определением относительного содержания транскриптов Ни-Акр2 в головном мозге были также исследованы степени экспрессии на разных участках мозга. Одинаковые уровни транскриптов были обнаружены на всех исследованных участках головного мозга (мозжечок, кора головного мозга, затылочная область, лобная доля, височная доля и путамен), при этом наибольшая концентрация характерна для костного и спинного мозга.
Пример 5. Обнаружение транскриптов Ни-Акр 1 и Ни-Акр2 в линиях клеток человека при помощи нозерн-блоттинга.
Разные линии клеток человека испытывали в отношении их способности продуцировать мРНК НиАкр1 и Ни-Акр2. Клетки почки эмбриона человека (НЕК293), клетки зеленой мартышки (Сок-7), клетки яичника китайского хомячка (СН0), клетки НЕЬА и линия клеток нейробластомы 1МК32 были получены АТСС. Клетки культивировали в среде ΌΜΕ, содержащей 10% РС8, за исключением клеток СН0, которые культивировали в среде а-МЕМ/10% РС8 при 37°С в 5% СО2 почти до полного слияния. Промытые монослои клеток (3х107) лизировали на планшетах и экстрагировали поли-А+ РНК, используя набор для прямого получения мРНК Οίη^οη 01що1сх. Образцы, содержащие 2 мкг поли-А+ РНК из каждой линии клеток, фракционировали в денатурирующих условиях (обработка глиоксалем), переносили капиллярным путем на твердую подложку из найлоновой мембраны и транскрипты визуализировали гибридизацией с зондами кодирующей последовательности, меченными радиоактивными изотопами (32Р), с использованием произвольной затравки, которые выделяли из Ни-Акр1 или Ни-Акр2.
Радиоактивные сигналы детектировали на рентгеновской пленке и производили анализ изображения при помощи Рйокрйойтадег.
При помощи кДНК-зонда Ни-Акр1 обнаружен аналогичный набор транскриптов (2,6 и 3,5 т.п.о.), которые ранее были детектированы в тканях человека. Относительное содержание, установленное количественным подсчетом радиактивных сигналов, составило Сок-7>НЕК292=НЕЬА>1МК32.
При помощи кДНК-зонда Ни-Акр2 обнаружен такой же набор транскриптов, что и в тканях (3,0, 4,4 и 8,0 т.п.о.), при наличии следующего относительного содержания: НЕК293>Сок-7>1МК32>НЕЬА.
Пример 6. Модификация АРР с целью увеличения процессинга Λβ-пептида для выполнения скрининга ίη уйто.
Линии клеток человека, способные процессировать Λβ-пептид из АРР, использованы в качестве средства для скрининга ингибиторов β- и γ-секретазы при выполнении клеточных анализов.
Продуцирование и высвобождение Λβ-пептида в культуральный супернатант контролируют твердофазным иммуноферментным анализом (Е1А). Хотя АРР широко экспрессирован в разных тканях и Аβ-пептид процессируют и высвобождают как нейроны, так и другие линии клеток, уровни процессинга эндогенного АРР являются низкими и могут быть с трудом обнаружены Е1А. Процессинг Аβ-пептида можно увеличить, экспрессируя в трансформированных линиях клеток мутации АРР, которые усиливают процессинг Аβ-пептида. Авторы этого изобретения установили, что добавление двух остатков лизина к карбоксильному концу АРР695 еще больше увеличивает процессинг Λβ-пептида. Это позволило создать трансформированную линию клеток, которая высвобождает Λβ-пептид в культуральную среду в значительном количестве 20000 пг/мл.
Материалы и методы
Материалы.
Линия клеток почки эмбриона человека 293 (клетки НЕК293) получена в лаборатории. Вектор р1КЕ8-ЕОРР предоставлен фирмой С1оп1ее11. Олигонуклеотиды для мутации при помощи полимеразной цепной реакции (РСК) приобретены в фирме Оепокук. Плазмида, содержащая АРР695 человека (8ЕО ΙΌ N0: 9 [нуклеотидная последовательность] и 8ЕО ГО N0: 10 [аминокислотная последовательность]) предоставлена медицинским факультетом северо-западного университета. Эту плазмиду субклонировали в р8К (81та1адепе) на сайте №11 с получением плазмиды рАРР695.
Выполнение мутагенеза.
Шведскую мутацию (К670М М671Ь) вводят в рАРР695 с использованием набора для быстрого мутагенеза 81га1адепе с целью получения плазмиды рАРР695№· (8Е0 ГО N0: 11 [нуклеотидная последовательность] и
- 20 009216
8ЕЦ ΙΌ N0: 12 [аминокислотная последовательность]). Чтобы ввести мотив из двух остатков лизина в С-конец АРР695, используют верхнюю затравку № 276 5'-САСТСАССАСТССАССАССТТС (8ЕЦ ΙΌ N0: 47), соединяющую затравку № 274 5'-С0ААТТАААТТССА0САСАСТ00СТАСТТСТТ0ТТСТ0САТСТСААА0ААС (8ЕС) ΙΌ N0: 48) и фланкирующую затравку № 275 С0ААТТАААТТССЛ0САСАСТ00СТА (8ЕС) ΙΌ N0: 49) для модификации 3'-конца кДНК АРР695 (8ЕЦ ΙΌ N0: 15 [нуклеотидная последовательность] и 8Е0 ΙΌ N0: 16 [аминокислотная последовательность]). В результате выполнения вышеуказанной операции вводят также сайт рестрикции Вк1ХЕ который совместим с сайтом Вк(Х 1 в сайте множественного клонирования рЖЕЗ-ЕОРР. Амплификацию РСК. выполняют при помощи набора для РСК кДНК С1оп1ес11 НР АбуагИаде с использованием полимеразной смеси и буферов, предоставленных производителем. Для выполнения связывания при помощи РСК используют соединяющую затравку в количестве 1/20 молярной концентрации фланкирующих затравок. Продукты амплификации РСК очищают с использованием набора для очистки РСК рТЛцшск (Ц1адеп). Продукты, полученные в результате расщепления рестрикционными ферментами, разделяют на 0,8% агарозных гелях и вырезанные фрагменты ДНК очищают с использованием набора для экстракции в геле Ц^дшск (Ц1адеп).
Для повторной сборки модифицированной кДНК АРР695-8те 5'-концевой фрагмент N011 -Вд12 кДНК АРР695-8\г и 3'-концевой фрагмент кДНК АРР695 Вд12-Вк1Х1, полученные при помощи РСК, лигируют в ДНК плазмиды рГКЕЗ-ЕСРР, открытой на сайтах N011 и Вк1Х1. Лигирования производят в течение 5 мин при комнатной температуре, используя набор для быстрого лигирования ДНК (ВоеЬппдег МаппНеип) и производя трансформацию в компетентных клетках из библиотеки ЭН5а (С1ЬсоВКЬ-Ь1£е Тес11по1од1е8). В бактериальных колониях производят скрининг инсерций, выполняя амплификацию при помощи РСК с использованием затравок № 276 и № 275. Плазмидную ДНК очищают для трансфекции клеток млекопитающего с использованием набора 0ΙАргер 8рт М1шргер (Ц1адеп). Полученная конструкция названа рМС125.3 (АРР8^-КК, 8ЕЦ ΙΌ N0: 17 [нуклеотидная последовательность] и 8ЕЦ ΙΌ N0: 18 [аминокислотная последовательность]).
Трансфекция клеток млекопитающего.
Клетки НЕК293, используемые для трансфекции, выращивают до 80% слияния в модифицированной по способу Дульбекко среде Игла (ЭМЕМ) с 10% фетальной телячьей сывороткой (РВ8). Котрансфекцию выполняют с использованием ЫроГайАтте (01Ьсо-ВКЬ) в 3 мкг ДНК рМС125.3 и 9 мкг ДНК рсОХА3.1 на 10х106 клеток. В течение 3 дней после трансфекции клетки пассируют в среде, содержащей 0418 в концентрации 400 мкг/мл. Клетки выращивают в течение 3 дней в селективной среде и сортируют на основе их флуоресценции.
Клональная селекция клеток 125.3 при помощи клеточного сортера с возбуждением флуоресценции (РАС8).
Образцы клеток анализируют в проточном цитометре ЕРГС8 Е1йе Е8Р (СоиИег, Н1а1еаД РЬ), оснащенном линией возбуждения 488 нм, питание которой обеспечивает аргоновый лазер с воздушным охлаждением. Излучение Е0РР измеряют через полосовой фильтр 525 нм и интенсивность флуоресценции определяют по 4-разрядной логарифмической шкале после селекции жизнеспособных клеток с учетом рассеяния света в прямом направлении и под прямым углом. Отдельные зеленые клетки отделяют во всех лунках одного 96-луночного планшета, содержащего питательную среду без 0418. По истечении четырехдневного периода выделения к питательной среде добавляют 0418 до конечной концентрации 400 мкг/мл. После селекции установлено, что в 32% лунок находятся увеличивающиеся в объеме клоны. Лунки с клонами переносят из 96-луночного планшета на 24-луночный планшет и затем на 6-луночный планшет, причем при каждом пассировании для дальнейшего роста выбирают наиболее быстро растущие колонии. Последняя выбранная линия клеток представляет собой наиболее быстро растущую линию клеток на протяжении последних шести пассирований. Этот клон, обозначенный 125.3, выдерживают в 0418 в количестве 400 мкг/мл и через каждые 4 дня переносят в свежую среду. На протяжении 23 пассирований не отмечено уменьшения флуоресценции Е0РР при продуцировании Аβ-пептида.
Твердофазный иммуноферментный анализ (Е^) Аβ-пептида (двойной иммуносэндвич 1ιΛβ 1-40/42 для ЕЫ8А).
Супернатанты культур клеток, собранные через 48 ч после трансфекции, анализируют, выполняя стандартный твердофазный иммуноферментный анализ (Е^) Аβ-пептида. Количество Аβ-пептида человека 1-40 или 1-42 измеряют с использованием моноклонального антитела (тАЬ) 6Е10 (8епе1ек, 81.Ьои18, М0) и биотинилированной антисыворотки кролика 162 или 164 (Яете Уогк 81а1е ОткШгЧе Гог Вакю Кекеагск, 81а1еп Ыапб, ΧΥ) в двойном иммуносэндвиче для ЕЬЖА. Иммобилизованное антитело 6Е10 является специфическим к эпитопу, имеющемуся в ^концевых аминокислотных остатках 1-16 Аβ-пептида человека (1Αβ). Конъюгированные детектирующие антитела 162 и 164 являются специфическими соответственно к 1Αβ 1-40 и 1-42. Этот способ можно кратко охарактеризовать следующим образом: 96-луночный планшет для проведения реакции иммунодиффузии Мшс Мах1когр покрывают 100 мкл/лунку тАЬ 6Е10 (5 мкг/мл), разведенного в 0,1М растворе карбонатбикарбонатного буфера, рН 9,6, и инкубируют в течение ночи при 4°С. Планшет трижды промывают 0,01М 0РВ8 (модифицированная среда Дульбекко, содержащая физиологический раствор с фосфатным буфером (0,008М фосфата натрия, 0,002М фосфата калия, 0,14М хлорида натрия, 0,01М хлорида калия, рН 7,4) фирмы Р1егсе, КоскГогб, Ι1) и 0,05% Т\гееп-20
- 21 009216 (ЭРВ8Т) и блокируют в течение 60 мин 200 мкл 10% нормальной овечьей сыворотки (81дта) в 0,01М ЭРВ8 во избежание неспецифического связывания. В культуральную среду после промывки планшета добавляют эталоны Άβ-пептида человека 1-40 или 1-42 в количестве 100 мкл/лунку (Васйет, Тоггапсе, СА), разведенные из 1 мг/мл маточного раствора в ДМСО, и образец в количестве 100 мкл/лунку, например кондиционированную среду трансфецированных клеток. Планшет инкубируют в течение 2 ч при комнатной температуре и в течение ночи при 4°С. На следующий день после промывки планшета добавляют 100 мкл/лунку биотинилированной антисыворотки кролика 162 1:400 или 164 1:50, разведенной в ΌΡΒδΤ+0,5% В8А, и инкубируют при комнатной температуре в течение 1 ч 15 мин. После выполнения промывки вводят 100 мкл/лунку нейтравидинапероксидазы хрена (Р1егсе, ЯоскГотб, 11), разведенного в отношении 1:10000 в ЭРВ8Т, и инкубируют в течение 1 ч при комнатной температуре. После выполнения последней промывки в качестве субстрата добавляют 100 мкл/лунку дигидрохлорида о-фенилендиамина (81дта Сйет1са1к, 8ΐ. Ьошк, МО) в буфере, содержащем 50 мМ лимонной кислоты/100 мМ фосфата натрия (8щта Сйет1са1к, 8ΐ. Ьошк, МО), рН 5,0, и контролируют изменение цвета при 450 нм в кинетическом спектрофотометре для считывания микропланшетов в течение 20 мин при помощи программы 8оГ( тах Рго. Все эталоны и образцы исследуют в трех копиях. Образцы, у которых значения оптической плотности соответствуют стандартной кривой, экстраполируют из стандартных кривых при помощи программы 8оГ( тах Рго и выражают в пг/мл культуральной среды.
Результаты
Добавление двух остатков лизина к карбоксильному концу ΆΡΡ695 значительно увеличивает процессинг Άβ-пептида в клетках НЕК293, о чем свидетельствуют результаты временной экспрессии (табл. 1). Добавление к ΆΡΡ695 мотива из двух остатков лизина увеличивает процессинг Άβ-пептида по сравнению с процессингом ΆΡΡ695, содержащего шведскую мутацию. Объединение мотива из двух остатков лизина со шведской мутацией увеличивает процессинг еще в 2,8 раза.
Котрансфекция клеток НЕК293 векторами рМО125.3 и рс^NА3.1 делает возможной двойную селекцию трансформированных клеток, характеризующихся устойчивостью к С418 и высоким уровнем экспрессии ЕОРР. Благодаря клональной селекции при помощи РАС8 полученная линия клеток позволяет получить 20000 пг Άβ-пептида на мл культуральной среды после выращивания в течение 36 ч на 24луночных планшетах. Продуцирование Άβ-пептида в разных условиях выращивания суммировано в табл. 2.
Таблица 1
Высвобождение Άβ-пептида в культуральную среду через 48 ч после временной трансфекции клеток НЕК293 указанными векторами, содержащими дикий или модифицированный АР Р
| Конструкция АРРА | Αβ-пептид 1-40 (пг/мл) | Увеличение (число раз) | Р-значение |
| вектор р1НЕЗ-Е6ГР | 147 + 28 | 1,0 | |
| АРР695 (142,3) дикого типа | 194 + 15 | 1,3 | 0,051 |
| АРР695-КК (124,1) дикого типа | 424 + 34 | 2,8 | 3 х 10-5 |
| АРР695-ЗН (143,3) | 457 + 65 | 3,1 | 2 х 10-3 |
| ΑΡΡ695-5νΚΚ(125, 3) | 1308 + 98 | 8,9 | 3 х 10-4 |
Приведенные в таблице значения представляют собой средние значения + стандартное отклонение и β-значение для попарного сранения с использованием 1-критерия Стьюдента с учетом неравных дисперсий.
Таблица 2
Выделение Άβ-пептида из клеток НЕК125.3 в разных условиях выращивания
| Тип культурального планшета | Объем среды | Продолжительность культивирования | АЬ 1-40 (пг/мл) | АЬ 1-42 (пг/мл) |
| 24-луночный планшет | 400 мкл | 36 час | 28036 | 1439 |
Пример 7. Ингибирование антисмысловым олигомером процессинга Άбета в клетках НЕК125.3.
Последовательности Ни-Акр1 и Ни-Акр2 предоставлены фирмой Зецийит, 1пс. ЩаБск, МА) для отбора целевых последовательностей и конструирования химерных антисмысловых олигомеров 2-го поколения патентованным методом (находящийся на рассмотрении патент на имя 8ес.|шЦ1г Ует. Ό № 3002). Άнтисмысловые олигомеры №№ 8644, 8645, 8646 и 8647 обладают целенаправленным действием против Акр1. Άнтисмысловые олигомеры №№ 8648, 8649, 8650 и 8651 обладают целенаправленным действием против Акр2. Контрольные антисмысловые олигомеры №№ 8652, 8653, 8655 и 8674 обладают целенаправленным действием против постороннего гена, и антисмысловые олигомеры №№ 8656, 8657, 8658 и 8659 обладают целенаправленным действием против второго постороннего гена.
Для трансфекции антисмысловыми олигомерами клетки НЕК125.3 выращивают примерно до 50% слияния на 6-луночных планшетах в минимальной поддерживающей среде (МЕМ), содержащей 10% фетальную телячью сыворотку. Исходный раствор олигофектина О (8ес.|шЦ1г 1пс., №йск, МА) с концентрацией 2 мг/мл разводят до 50 мкг/мл в бессывороточной МЕМ. Исходный раствор антисмыслового
- 22 009216 олигомера с концентрацией 100 мкМ отдельно разводят до 800 нМ в оптимальной МЕМ (С1ВС0-ВКЕ, Сгапб 1з1апб, ΝΥ). Разведенные исходные растворы олигофектина С и антисмыслового олигомера смешивают в отношении 1:1 и инкубируют при комнатной температуре. Инкубацию продолжают в течение 15 мин, после чего 10-кратный объем реагента разводят в МЕМ, содержащей 10% фетальную телячью сыворотку, и после первого удаления старой среды в каждую лунку 6-луночного планшета добавляют 2 мл полученной смеси. После трансфекции клетки выращивают при постоянном присутствии олигофектина С/антисмыслового олигомера. Для контроля за высвобождением АЬ пептида из лунки с культурой периодически удаляют 400 мкл кондиционированной среды и заменяют свежей средой, начиная выполнять эту операцию через 24 ч после трансфекции. Приведенные данные получены из культуральных супернатантов, собранных через 48 ч после трансфекции.
Результаты
Клетки НЕК125.3 по отдельности трансфецируют 16 разными антисмысловыми олигомерами, предоставленными фирмой 8сс|иИиг 1пс., чтобы определить их влияние на процессинг Ав-пептида. Только антисмысловые олигомеры, направленные на Азр1 и Азр2, уменьшают процессинг Ав-пептида в клетках НЕК125.3, причем более эффективное ингибирующее действие направлено против Азр2. Процессинг Ав-пептида (1-40) и Ав-пептида (1-42) ингибируется в одинаковой степени. В табл. 3 приведены процентные значения ингибирования, высчитанные по сравнению с нетрансфецированными клетками. Реагенты на основе антисмысловых олигомеров, обеспечивающие более чем 50% ингибирование, отмечены звездочкой. Из всех испытанных реагентов 3 из 4 антисмысловых олигомеров, направленных на Азр1, обеспечивают, в среднем, 52% ингибирование процессинга Ав-пептида 1-40 и 47% ингибирование процессинга Ав-пептида 1-42. В случае Азр2 4 из 4 антисмысловых олигомеров характеризуются более чем 50% ингибированием, при этом среднее ингибирование процессинга Ав-пептида 1-40 составляет 62% и Ав-пептида 1-42 составляет 60%.
Таблица 3 Ингибирование высвобождения Ав-пептида из клеток НЕК125.3, обработанных антисмысловыми олигомерами
| Ген-мишень | Антисмысловой олигомер | Αβ-пептид (1-40) | Αβ-пептид (1-42) |
| Азр1-1 | £644 | 62%* | 5б%* |
| Азр1-2 | 5645 | 41%* | 38%* |
| Азр1-3 | 5646 | 52%* | 46%* |
| Азр1-4 | 5647 | 6% | 25% |
| Азр2-1 | 3648 | 71%* | 67%* |
| Азр2-2 | 5649 | 83%* | 76%* |
| Азр2-3 | 3650 | 4б%* | 50%* |
| Азр2-4 | 5651 | 47%* | 46%* |
| Соп1-1 | 5652 | 13% | 18% |
| Соп1-2 | 5653 | 35% | 30% |
| Соп1-3 | 5655 | 9% | 18% |
| Соп1-4 | 5674 | 29% | 18% |
| Соп2-1 | 5656 | 12% | 18% |
| СОП2-2 | 5657 | 16% | 19% |
| Соп2-3 | 5658 | 8% | 35% |
| Соп2-4 | 8659 | 3% | 18% |
Пример 8. Демонстрация активности в-секретазы Ни-Азр2 в культивируемых клетках.
Установлено, что несколько мутаций в АРР, происходящих в начале возникновения болезни Альцгеймера, изменяют процессинг Ав-пептида. Они фланкируют Ν- и С-концевые сайты расщепления, в результате чего происходит выделение Ав-пептида из АРР. Эти сайты расщепления определяются соответственно как сайты расщепления в-секретазой и γ-секретазой. Расщепление АРР на сайте в-секретазы вызывает образование С-концевого фрагмента АРР, содержащего 99 аминокислот с молекулярной массой 11145 Да. Шведская мутация КМ^-ИЬ, находящаяся вверху рядом с сайтом расщепления всекретазой, вызывает общее увеличение продуцирования аминокислотных форм 1-40 и 1-42 Ав-пептида. Лондонская мутация УР (У717^Е в изоформе АРР770) не оказывает значительного влияния на общее продуцирование Ав-пептида, но, по-видимому, увеличивает процентное содержание более длинной аминокислотной формы 1-42 Ав-пептида, влияя на выбор сайта расщепления γ-секретазой во время процессинга АРР. Таким образом, авторы этого изобретения поставили целью определить, изменяют ли эти му
- 23 009216 тации количество и тип Ав-пептида, продуцируемого культивируемыми клетками, котрансфецированными конструкцией, направляющей экспрессию Ни-А§р2.
Были выполнены два эксперимента, которые демонстрируют активность β-секретазы Ни-А§р2 в культивируемых клетках. В первом эксперименте клетки НЕК125.3 обрабатывали антисмысловыми олигомерами, направленными против транскриптов Ни-А8р2, как описано в примере 7, в результате чего было установлено, что такая обработка уменьшает величину С-концевого фрагмента АРР, образованного вследствие расщепления β-секретазой (СТЕ99) (фиг. 9). Это показывает, что Ни-А§р2 прямо или косвенно облегчает процесс расщепления β-секретазой. Во втором эксперименте было установлено, что повышенная экспрессия Ни-А§р2 в трансфецированных клетках №иго2А мыши увеличивает накопление фрагмента, полученного вследствие расщепления β-секретазой СТЕ99 (фиг. 10). Это увеличение особенно хорошо видно, когда для трансфекции использован мутантный клон АРР-КК, содержащий мотив из двух остатков лизина у С-конца. Дальнейшее увеличение наблюдается в том случае, когда Ни-А8р2 котрансфецируют вместе с ЛРР-8^-КК, содержащим шведскую мутацию КМЖНБ. Известно, что шведская мутация увеличивает расщепление ЛРР β-секретазой.
Вторая серия экспериментов показывает, что Ни-А8р2 облегчает активность γ-секретазы в экспериментах по котрансфекции клеток почки эмбриона человека НЕК293. Котрансфекция Ни-А8р2 вместе с клоном ЛРР-КК значительно увеличивает продуцирование и высвобождение растворимых Аβ-пептидов 1-40 и 1-42 из клеток НЕК293. При этом наблюдается значительно большее в пропорциональном отношении высвобождение Аβ-пептида 1-42. Дальнейшее увеличение продуцирования Аβ-пептида 1-42 наблюдается тогда, когда Ни-А8р2 котрансфецируют вместе с клоном ЛРР-УЕ (8Е0 ГО N0: 13 [нуклеотидная последовательность] и 8Е0 ГО N0: 14 [аминокислотная последовательность]) или клоном ЛРР-УЕКК (8Е0 ГО N0: 19 [нуклеотидная последовательность] и 8Е0 ГО N0: 20[аминокислотная последовательность], содержащими лондонскую мутацию У717^Е. Известно, что мутация У717^Е изменяет специфичность расщепления АРР γ-секретазой так, что увеличивается расщепление на сайте Аβ42. Таким образом, А§р2 прямо или косвенно облегчает процессинг ЛРР γ-секретазой на сайте расщепления β42.
Материалы
Антитела 6Е10 и 4С8 предоставлены фирмой 8еие1ек (81. Боищ, М0). Антитело 369 получено из лаборатории Пауля Грингарда в Рокфеллеровском университете. Антитело С8 получено из лаборатории Денниса Селкое в Гарвардском медицинском институте и больницы Вгщйап аиб Аотеи'к Но§рйа1.
Используемые конструкции АРР.
В экспериментах по трансфекции использованы нижеследующие конструкции ЛРР.
АРР
ЛРР-8\\
ЛРР-УЕ АРР-КК ЛРР-8\\-КК ЛРР-УЕ-КК
АРР695 дикого типа (8Е0 ГО N0: 9 и N0: 10)
АРР695, содержащий шведскую мутацию КМЖНБ (8Е0 ГО N0: 11 и N0: 12) АРР695, содержащий лондонскую мутацию У^Е (8Е0 ГО N0: 13 и N0: 14) АРР695, содержащий С-концевой мотив КК (8Е0 ГО N0: 15 и N0: 16) ЛРР695-8\\\ содержащий С-концевой мотив КК (8Е0 ГО N0: 17 и N0: 18) АРР695-УЕ, содержащий С-концевой мотив КК (8Е0 ГО N0: 19 и N0: 20)
Эти конструкции вставляли в вектор р1КЕ8-ЕСЕР (С1ои1есй, Ра1о А11о, СА) между сайтами N011 и В§1Х1, используя соответствующие линкерные последовательности, вводимые при помощи РСК.
Трансфекции клеток НЕК293, клеток НЕК125.3 и клеток Деиго-2Л конструкциями антисмысловых олигомеров или плазмидной ДНК.
Клетки почки эмбриона человека НЕК293 и клетки Деиго-2а мыши трансфецируют экспрессирующими конструкциями с использованием реагента липофектамина Р1и5 фирмы С1Ьсо/ВКБ. Клетки высевают на 24-луночные планшеты для культуры ткани с плотностью до 70-80% слияния. Четыре лунки на планшете трансфецируют 2 мкг ДНК (3:1, ЛРР:котрансфектант), 8 мкл реагента Р1и§ и 4 мкл липофектамина в оптимальной минимальной поддерживающей среде (0рбМЕМ). 0р11МЕМ добавляют до общего объема 1 мл, распределяют по 200 мкл/лунку и инкубируют в течение 3 ч. Особое внимание уделяют сохранению постоянных соотношений двух плазмид, используемых для котрансфекции, а также общего количества ДНК, используемой для трансфекции.
Среды для трансфекции заменяют БМЕМ, 10% ЕВ8, пируватом натрия с антибиотиком/противогрибковым средством и клетки инкубируют в нормальных условиях (37°С, 5% СО2) в течение 48 ч. Кондиционированную среду переносят в полипропиленовые пробирки и хранят при -80°С до анализа на содержание Аβ-пептида 1-40 и Аβ-пептида 1-42 при помощи Е1А, как это описано в предшествующих примерах. Трансфекцию клеток НЕК125.3 антисмысловыми олигомерами производят аналогично описанию в примере 7.
Получение клеточных экстрактов, выполнение вестерн-блоттинга.
Клетки собирают после их трансфекции плазмидной дНК в течение примерно 60 ч. Сначала клетки переносят с планшета в 15 мл коническую пробирку и центрифугируют со скоростью 1500 об./мин, чтобы удалить среду. Клеточный осадок 1 раз промывают РВ8. Затем клетки лизируют с использованием буфера для лизиса (10 мМ НЕРЕ8, рН 7,9, 150 мМ ЫаС1, 10% глицерина, 1 мМ ЕСТА, 1 мМ ЕБТА, 0,1 мМ ванадата натрия и 1% №-40). Смеси лизированных клеток центрифугируют со скоростью 5000 об./мин и
- 24 009216 супернатанты хранят при -20°С в виде клеточных экстрактов. Равные количества экстрактов из клеток НЕК125.3, трансфецированных антисмысловыми олигомерами Акр2, и контрольные образцы осаждают антителом 369, который распознает С-конец АРР, и детектируют СТЕ99 в иммунопреципитате при помощи антитела 6Е10. Этот эксперимент повторяют с использованием С8, второго осаждающего антитела, которое также распознает С-конец АРР. Для выполнения вестерн-блоттинга экстрактов из клеток №ито-2а мыши, котрансфецированных Ни-Акр2 и АРР-КК, АРР-8^-КК, АРРАЕ-КК или АРР-νΕ, равные количества клеточных экстрактов подвергают электрофорезу в градиенте гелей с 4-10% или 10-20% трицина (N0VЕX, 8ап Оюдо, СА). Полимеразный АРР и продукт расщепления β-секретазой СТЕ99 определяют при помощи антитела 6Е10.
Результаты
Трансфекция клеток НЕК125.3 антисмысловыми олигомерами Акр2-1 или Акр2-2 уменьшает продуцирование продукта расщепления β-секретазой СТЕ по сравнению с клетками, которые аналогичным образом трансфецированы контрольными олигомерами, имеющими обратную последовательность (обратная последовательность Акр2-1 и Акр2-2). В экспериментах по котрансфекции введение Ни-Акр2 в клетки №иго-2а мыши вместе с конструкцией АРР-КК увеличивает образование СТЕ99. Продуцирование этого продукта еще больше увеличивается в случае экспрессии Ни-Акр2 вместе с АРР-8^-КК, мутантной формой АРР, содержащей шведскую мутацию КМАНЬ, которая усиливает процессинг β-секретазой.
Котрансфекция Ни-Акр2 с АРР не оказывает существенного влияния на продуцирование Аβ40, но увеличивает продуцирование Аβ42 по сравнению с фоновым значением (табл. 4). Добавление мотива из двух остатков лизина к С-концу АРР увеличивает процессинг Аβ-пептида почти в 2 раза, хотя продуцирование Аβ40 и Аβ42 остается достаточно низким (соответственно, 352 и 21 пг/мл). Котрансфекция Акр2 с АРР-КК еще больше увеличивает продуцирование Аβ40 и Аβ42. Продуцирование Аβ40 под действием Ни-Акр2 увеличивается более чем в 3 раза, в то время как продуцирование Аβ42 возрастает более чем в 10 раз. Таким образом, котрансфекция Ни-Акр2 с конструкциями АРР-КК предпочтительно увеличивает продуцирование Аβ42.
Установлено, что мутация АРР ν717^Ε увеличивает процессинг γ-секретазой на сайте расщепления Аβ42. Котрансфекция Ни-Акр2 с конструкциями АРР-νΕ или АРР-VΕ-КК увеличивает продуцирование Аβ42 (двухкратное увеличение при использовании АРР-νΕ и четырехкратное увеличение при использовании АРР-VΕ-КК, табл. 4), но оказывает смешанное действие на продуцирование Аβ40 (незначительное уменьшение при использовании АРР-νΕ и двукратное увеличение при использовании АРР-νΕКК по сравнению с контрольным образцом, котрансфецированным пкДНК). Таким образом, влияние Акр2 на продуцирование Аβ42 в пропорциональном отношении больше, что ведет к увеличению соотношения Аβ42/общего Аβ. Действительно, соотношение Аβ42/общего Аβ достигает очень высокого значения, равного 42%, в клетках НЕК293, котрансфецированных Ни-Акр2 и АРР-VΕ-КК.
Вестерн-блот, показывающий уменьшение продуцирования С1Е99 клетками НЕК125.3, трансфецированными антисмысловыми олигомерами, направленными на мРНК Ни-Акр2. (справа) Вестерн-блот, показывающий увеличение продуцирования С1Е99 в клетках №ито-2а мыши, котрансфецированных НиАкр2 и АРР-КК. Дальнейшее увеличение продуцирования СТΕ99 имеет место в клетках, котрансфецированных Ни-Акр2 и АРР-8\\-1<К.
Таблица 4 Результаты котрансфекции плазмидной ДНК Ни-Акр2 или пкДНК разными конструкциями АРР, содержащими мутацию ν717^Ε, модифицирующую процессинг γ-секретазой
| Котрансфекция пкДНК | Котрансфекция Азр2А | |||||
| Αβ4 0 | Αβ42 | Αβ42/06ωρΜ Αβ | Αβ4 0 | Αβ42 | Αβ42/ΟΟΐφΦί Αβ | |
| АРР | 192+18 | <4 | <2% | 188+40 | 8±10 | 3, 9% |
| ΑΡΡ-νΡ | 118+15 | 15±19 | 11,5% | 85±7 | 24±12 | 22,4% |
| АРР-КК | 352+24 | 21±6 | 5,5% | 1062±101 | 226±49 | 17,5% |
| АРР-УР-КК | 230+31 | 88±24 | 27,7% | 491±35 | 355±36 | 42% |
Котрансфекция Акр2 значительно увеличивает соотношение Аβ42/общего Аβ. Приведенные в таблице значения представляют собой количество пептида Аβ (пг/мг).
Пример 9. Экспрессия Акр2Ь человека в бактериальных клетках. Экспрессия рекомбинантного НиАкр2Ь в Е. со11.
Ни-Акр2Ь можно экспрессировать в Е. сой после добавления ^концевых последовательностей, таких как метка Т7 (8ЕО ΙΌ N0: 21 и N0: 22) или метка Т7, с последующим введением лидерной последовательности каспазы 8 (8Е0 ΙΌ N0: 23 и N0: 24). Альтернативно уменьшение числа ОС 5'-концевой последовательности при помощи сайтнаправленного мутагенеза можно использовать для увеличения выхода Ни-Акр2 (8Е0 ΙΌ N0: 25 и N0: 26). Кроме того, Акр2 можно сконструировать, используя сайт протеолити
- 25 009216 ческого расщепления (8Е0 ΙΌ N0: 27 и N0: 28). Чтобы получить растворимый белок после экспрессии и повторной укладки цепи, желательно удалить трансмембранный домен и цитоплазматический конец или удалить мембранную проксимальную область, трансмембранный домен и цитоплазматический конец.
Методы
Для слияния кодирующей последовательности Акр2 с модификациями ^концевой последовательности, включающими метку Т7 (8Е0 ΙΌ N0: 21 и 22) или лидерную последовательность Т7-сакраке 8 (8Е0 ΙΌ N0: 23 и 24), выполняют РСК с использованием затравок, содержащих соответствующие линкерные последовательности. Эти конструкции клонируют в экспрессирующем векторе ре(23а(+) Щоуедеп], в котором промотор Т7 направляет экспрессию метки Т7, предшествующей последовательности сайтов множественного клонирования. Чтобы клонировать последовательности Ни-Акр2 позади лидерной последовательности Т7 в векторе ре(23а+, используют нижеследующие олигонуклеотиды для амплификации выбранной последовательности Ни-Акр2:
№ 553=СΤССАΤССАСССАССАССССАΤСССССΤС (8ЕО ΙΌ N0: 35) № 554=САААССΤΤΤСАΤСАСΤСАΤСΤСΤСΤСΤССААΤСΤΤС (8ЕО ΙΌ N0:36) которые располагают сайты ВатНЧ и НшбШ, фланкирующие, соответственно, 5'- и 3'-концы вставки. Последовательность Акр2 амплифицируют из полноразмерной кДНК Акр2(Ь), клонированной в рс^NА3.1, с использованием набора для РСК. кДНК Абуав1аде-СС |С1оп1ес11| в соответствии с инструкциями производителя, производя отжиг и удлинение при 68°С в результате выполнения двухстадийной РСК на протяжении 25 циклов. Вставку и вектор разрезают ВатНЧ и НшбШ, очищают электрофорезом в агарозном геле и лигируют с использованием набора для быстрого лигирования ДНК [ВоегЫпдег Маппкеш]. Реакцию лигирования выполняют для трансформации штамма ДМ109 Е. со11 (Рготеда), колонии собирают для очистки плазмиды (Раздев, Оааргер т1Ш8рш) и анализа последовательности ДНК. Для индуцируемой экспрессии путем индукции изопропил-Ь-Э-тиогалактопиранозидом (ΙΕΤΟ) экспрессирующий вектор переносят в штамм ВЬ21 Е. сой (8(а(адепе). Бактериальные культуры выращивают в жидкой среде ЬВ в присутствии ампициллина в концентрации 100 мкг/мл и индуцируют рост в логарифмической фазе при оптической плотности 0Ό600 0,6-1,0, добавляя 1 мМ ΦΤΟ, в течение 4 ч при 37°С. Клеточный осадок собирают центрифугированием.
Чтобы клонировать последовательности Ни-Акр2 позади метки Т7 и лидерной последовательности каспазы (8Е0 ΙΌ N0: 23 и 24), созданную выше конструкцию, содержащую последовательность Т7-Ни-Акр2 (8Е0 ΙΌ N0: 21 и 22), открывают на сайте ВатН, после чего фосфорилированные лидерные олигонуклеотиды сакраке 8 № 559=САΤССАΤСАСΤАΤСΤСΤСАСΤСΤСССССΤСААСАССАСС (8ЕО ΙΌ N0: 37), № 560=САΤСССΤССΤСΤΤСАСССССАСАСΤСАСАСАΤАСΤСАΤС (8ЕО ΙΌ N0: 38) отжигают и лигируют в векторную ДНК. Свисающий 5'-конец для каждого набора олигонуклеотидов сконструирован таким образом, что он делает возможным лигирование с сайтом ВатН1 и препятствует последующему расщеплению ВатНЕ Продукт реакции лигирования трансформируют в ДМ109, как это описано выше, для анализа экспрессии белка после переноса в штамм ВЬ21 Е. сой.
Чтобы уменьшить число СС у 5'-конца Акр2, конструируют пару антипараллельных олигонуклеотидов для замены оснований вырожденного кодона в положениях 15 аминокислот от С/С на А/Т (8Е0 ΙΌ N0: 25 и 26). Новая нуклеотидная последовательность у 5'-конца Акр2 не изменяет кодируемую аминокислоту, поэтому ее выбирают с возможностью оптимизации экспрессии в Е. со11. Последовательность смыслового линкера представляет собой 5'-ССССАΤСССССΤСССССΤСССΤАССССΤСΤСССΤССΤСС ΤССАСΤСССΤСΤСССΤСΤССССССССАСАСССАССААС3' (8ЕО ΙΌ N0: 39). Последовательность антисмыслового линкера представляет собой 5'-СΤΤССΤСССΤСΤССССССССАСАСССАСАСССАСΤС САССАССАСССАСАССССТАСССАСССССАСССССАТСССС3' (8ЕО ΙΌ N0: 40). Фосфорилированные линкеры отжигают в 0,1М №1С1 - 10 мМ Τηκ, рН 7,4, и лигируют в уникальные сайты С1а Ι и 8та Ι в Ни-Акр2 в вектор рТАС. Для индуцируемой экспрессии путем индукции изопропил-Ь-Э-тиогалактопиранозидом (ΙΕΤΟ) бактериальные культуры выращивают в бульоне ЬВ в присутствии ампициллина при 100 мкг/мл и индуцируют рост в логарифмической фазе при оптической плотности 0Ό600 0,6-1,0, добавляя 1 мМ ΡΤΟ, в течение 4 ч при 37°С. Клеточный осадок собирают центрифугированием.
Чтобы создать вектор, в котором лидерные последовательности можно удалить ограниченным протеолизом с использованием каспазы 8 так, что в результате этого выделяется полипептид Ни-Акр2, начинающийся ^концевой последовательностью С8РУ (8Е0 ΙΌ N0: 27 и 28), выполняют следующую процедуру. Два фосфорилированных олигонуклеотида, содержащих сайт расщепления каспазы 8 ΙΒΤΌ, № 571=5'САΤССАΤСАСΤАΤСΤСΤСАСΤСΤССССΤССАСΤСΤССΤАΤССАААСССАСС (8ЕО ΙΌ N0: 41) и № 572=САΤСССΤСССΤΤΤССАΤАССАСАСΤССАССССАСАСΤСАСАСАΤАСΤСАΤС (8ЕО ΙΌ N0: 42), отжигают и лигируют в вектор рЕТ23а+, открытый ВатНЕ После трансформации в ДМ 109 очищенную векторную ДНК выделяют и ориентацию вставки подтверждают анализом последовательности ДНК. Для амплификации выбранной последовательности Ни-Акр2 используют нижеследующие олигонуклеотиды: № 573=5'-ААССАΤССΤΤΤСΤССАСАΤССΤССАСААССΤС (8ЕО ΙΌ N0: 43) и № 554=САААССΤΤΤ САΤСАСΤСАΤСΤСΤСΤСΤССААΤСΤΤС (8ЕО ΙΌ N0: 44), которые располагают сайты ВатШ и Нт6ΙΙΙ, фланкирующие, соответственно, 5'- и 3'-концы вставки. Последовательность Акр2 амплифицируют из полноразмерной кДНК Акр2, клонированной в рс^NА3.1, с использованием набора для РСК кДНК
- 26 009216
АЙуап1адс-СС |С1оп1ес11| в соответствии с инструкциями производителя, производя гибридизацию и удлинение при 68°С в результате выполнения двухстадийной РСК на протяжении 25 циклов. Вставку и вектор разрезают ВатН1 и НшйШ, очищают электрофорезом в агарозном геле и лигируют с использованием набора для быстрого лигирования ДНК [ВоегЫпдег Мапп11спп|. Реакцию лигирования выполняют для трансформации штамма ДМ109 Е. сой (Рготеда), колонии собирают для очистки плазмиды (О|адеп. О1аргер тгшкрт) и анализа последовательности ДНК. Для индуцируемой экспрессии путем индукции изопропил-Ь-О-тиогалактопиранозидом (1РТ6) экспрессирующий вектор переносят в штамм ВЬ21 Е. сой (81а!адепе). Бактериальные культуры выращивают в бульоне ЬВ в присутствии ампициллина при 100 мкг/мл и индуцируют рост в логарифмической фазе при оптической плотности ΟΌ600 0,6-1,0, добавляя 1 мМ 1РТС, в течение 4 ч при 37°С. Клеточный осадок собирают центрифугированием.
Для облегчения очистки метку 6-Н1к можно ввести в любую из вышеуказанных конструкций после лидерной последовательности Т7 путем открытия конструкции на сайте ВатН1 и последующего лигирования с фосфорилированными олигонуклеотидами, подвергшимися отжигу, содержащими последовательность из шести остатков гистидина № 565=6АТС6САТСАТСАССАТСАССАТ6 (8ЕО ΙΌ ΝΟ: 45), № 566=6АТССАТ66Т6АТ66Т6АТ6АТ6С (8ЕО ΙΌ ΝΟ: 46). Свисающий 5'-конец для каждого набора олигонуклеотидов сконструирован так, что он делает возможным лигирование в сайт ВатН1 и препятствует последующему расщеплению ВатН1.
Получение бактериального осадка
36,34 г бактериального осадка, предназначенного для получения 10,8 л питательной среды, диспергируют в общем объеме, равном 200 мл, и гомогенизируют при помощи 20 мм зонда тканевого гомогенизатора со скоростью 3000-5000 об./мин в 2М КС1, 0,1М Тпк, 0,05М ЕЭТА, 1 мМ ОТТ. Проводимость доводят примерно до 193 ММйок, добавляя воду.
К диспергированному осадку добавляют дополнительное количество раствора КС1, доводя общий объем до 500 мл. Эту суспензию гомогенизируют при помощи того же зонда в течение примерно 3 мин со скоростью 5000 об./мин. Затем смесь пропускают через гомогенизатор высокого давления Ранни под давлением 700 атм (10000 фунтов/кв.дюйм).
Во всех случаях осадок подвергают дальнейшей обработке, а растворимую фракцию удаляют. Полученный раствор центрифугируют в течение 1 ч в роторе 68А со скоростью 12500 об./мин. Осадок повторно суспендируют в аналогичном растворе (без ОТТ), используя тот же самый зонд тканевого гомогенизатора со скоростью 2000 об./мин. После гомогенизации в течение 5 мин со скоростью 3000 об./мин объем доводят до 500 мл, добавляя тот же раствор, и центрифугируют в течение 1 ч со скоростью 12500 об./мин. Осадок вновь суспендируют как и раньше, но теперь конечный объем доводят до 1,5 л, добавляя тот же раствор, после чего его гомогенизируют в течение 5 мин. После центрифугирования с той же скоростью в течение 30 мин эту процедуру повторяют еще раз. Осадок повторно суспендируют примерно в 150 мл холодной воды, собирают осадок из шести центрифужных пробирок, используемых в роторе С8А. Осадок гомогенизируют в течение 5 мин со скоростью 3000 об./мин, объем доводят до 250 мл, добавляя холодную воду, и центрифугируют в течение 30 мин. Масса полученного осадка равна 17,75 г.
Краткий обзор
Для первоначального получения осадка производят лизис бактериального осадка в растворе КС1 с последующим центрифугированием в роторе С8А. Для повторного суспендирования/гомогенизации трижды используют одинаковый раствор. Конечную промывку водой/гомогенизацию выполняют с целью удаления избытка КС1 и ЕЭТА.
Солюбилизация гНиАкр2Ь
Для солюбилизации гНцАкр2Ь из вышеописанного осадка используют соотношение, равное 9-10 мл/г осадка. Оттаивают 17,75 г осадка и добавляют 150 мл 8М раствора гидрохлорида гуанидина, 5 мМ вМе, 0,1% ЭЕА. Полученную смесь титруют до рН 8,6, используя 3М раствор Тпк. Сначала осадок повторно суспендируют в растворе гуанидина, производя гомогенизацию 20 мм зондом тканевого гомогенизатора со скоростью 1000 об./мин. Затем смесь перемешивают при 4°С в течение 1 ч и центрифугируют со скоростью 12500 об./мин в течение 1 ч в роторе С8А. Полученный супернатант центрифугируют в течение 30 мин со скоростью 40000 х градиент в роторе 88-34. Конечный супернатант хранят при -20°С, за исключением 50 мл. Аффинная хроматография на иммобилизованном никеле солюбилизованного гНиАкр2Ь
Используют нижеследующие растворы:
А) 6М гидрохлорида гуанидина, 0,1М NАР, рН 8,0, 0,01М Тпк, 5 мМ вМЕ, 0,5 мМ имидазола;
А') 6М мочевины, 20 мМ NАР, рН 6,80, 50 мМ №С1;
В') 6М мочевины, 20 мМ NАР, рН 6,20, 50 мМ №С1, 12 мМ имидазола;
С) 6М мочевины, 20 мМ NАР, рН 6,80, 50 мМ №С1, 300 мМ имидазола.
Примечание. Буферы А' и С' смешивают в соответствующих отношениях, чтобы получить промежуточные концентрации имидазола.
мл солюбилизованного вещества смешивают с 50 мл буфера А и добавляют к 100-125 мл О|адеп Νΐ-ΝΊΆ 8ирегР1о\у (предварительно уравновешенного буфером А) в колонке 5х10 см Вю-Най есопо. Колонку осторожно встряхивают в течение ночи при 4°С в холодном помещении.
- 27 009216
Стадии выполнения хроматографии
1) Полученное вещество проточно дренируют.
2) Промывают 50 мл буфера А (собирая проточную фракцию).
3) Промывают 250 мл буфера А (промывка 1).
4) Промывают 250 мл буфера А (промывка 2).
5) Промывают 250 мл буфера А'.
6) Промывают 250 мл буфера В'.
7) Промывают 250 мл буфера А'.
8) Элюируют 250 мл 75 мМ имидазола.
9) Элюируют 250 мл 150 мМ имидазола (150-1).
10) Элюируют 250 мл 150 мМ имидазола (150-2).
11) Элюируют 250 мл 300 мМ имидазола (300-1).
12) Элюируют 250 мл 300 мМ имидазола (300-2).
13) Элюируют 250 мл 300 мМ имидазола (300-3).
Результаты хроматографии гНиАкр элюируют имидазолом в количестве от 75 до 300 мМ. 75 мМ фракция, а также первая фракция, элюированная 150 мМ имидазола (150-1), содержат загрязняющие белки, которые визуализируют на геле, окрашенном кумассии голубым. Поэтому для экспериментов по повторной укладке цепи используют фракции 150-2 и 300-1, так как они содержат наибольшее количество белка (см. гель, окрашенный кумассии голубым).
Эксперименты по повторной укладке цепи гНцАкр2Ь
Эксперимент 1.
К 40 мл фракции 150-2 добавляют 1М ОТТ, 3М Тпк. рН 7,4, и ЭЕА до конечной концентрации, соответственно, равной 6 мМ, 50 мМ и 0,1%. Эту смесь быстро разводят (при перемешивании) 200 мл (4°С) холодного раствора 20 мМ NАР, рН 6,8, 150 мМ №С1. В результате этого разведения получают конечную концентрацию мочевины, равную 1М. Этот раствор остается светлым, даже если его оставляют открытым на воздухе при комнатной температуре или при температуре 4°С.
Этот раствор выдерживают открытым на воздухе в течение 4-5 ч при 4°С и диализуют в течение ночи против 20 мМ NАР, рН 7,4, 150 мМ №С1, 20% глицерина. Этот способ позволяет эффективно удалить мочевину из раствора без осаждения белка.
Эксперимент 2.
Некоторое количество элюата 150-2 дважды концентрируют в устройстве Ашюоп Сепйтргер, 10000 М^С0, и обрабатывают так же, как в эксперименте 1. Это вещество также остается в растворе без какого-либо видимого осаждения.
Эксперимент 3.
На 89 мл элюата 150-2 поливают 1М ОТТ, 3М Тпк, рН 7,4, и ЭЕА до конечной концентрации, соответственно, равной 6 мМ, 50 мМ и 0,1%. Эту смесь быстро разводят (при перемешивании) 445 мл (4°С) холодным раствором 20 мМ NАР, рН 6,8, 150 мМ №С1. Раствор остается светлым без каких-либо видимых признаков осаждения. Этот раствор доводят до комнатной температуры и перемешивают в течение 10 мин, после чего добавляют МЕА до конечной концентрации, равной 0,1 мМ. Раствор медленно перемешивают при комнатной температуре в течение 1 ч. Цистамин и Си804 добавляют до конечных концентраций, равных, соответственно, 1 мМ и 10 мкМ. Раствор медленно перемешивают при комнатной температуре в течение 10 мин, переносят в холодное помещение с температурой 4°С и медленно встряхивают в течение ночи, оставляя открытым на воздухе.
На следующий день раствор (по-прежнему светлый, без каких-либо видимых признаков осаждения) центрифугируют со скоростью 100000 х градиент в течение 1 ч. Собирают супернатанты из нескольких серий экспериментов и основную массу стабилизованного белка диализуют против 20 мМ NАР, рН 7,4, 150 мМ №С1, 20% глицерина. После диализа вещество хранят при -20°С.
Некоторое количество (примерно 10 мл) раствора белка (в 1М растворе мочевины) отбирают для биохимических анализов и хранят в замороженном виде при -20°С.
Пример 10. Экспрессия Ни-Акр2 и его производных в клетках насекомого.
Экспрессия путем инфецирования бакуловируса.
Кодирующую последовательность Ни-Акр2 и несколько производных конструируют для экспрессии в клетках насекомого при помощи РСК. Для получения полноразмерной последовательности 5'концевую смысловую олигонуклеотидную затравку, которая модифицирует сайт инициации трансляции в соответствии с согласованной последовательностью Козака, спаривают с 3'-концевой антисмысловой затравкой, которая имеет природный терминирующий трансляцию кодон в последовательности Ни-Акр2. Матрицу рс^NА3.1(йудΐо)/Ни-Акр2 амплифицируют при помощи РСК (см. пример 12). Выполняя РСК, конструируют также два производных Ни-Акр2, которые удаляют С-концевой трансмембранный домен (8ЕЦ ΙΌ N0: 29 и N0: 30) или трансмембранный домен и вводят метку из шести остатков гистидина в Сконец (8ЕЦ ΙΌ N0: 31 и N0: 32). При помощи РСК вышеуказанную 5'-концевую смысловую олигонук- 28 009216 леотидную затравку спаривают с 3'-концевой антисмысловой затравкой, которая вводит (1) терминирующий трансляцию кодон после кодона 453 (8ЕО ΙΌ N0: 3) или (2) метку из шести остатков гистидина с последующим терминирующим трансляцию кодоном, используя в качестве матрицы рсЭНЛ3.1(11удго)/Ни-Л5р2Е. Во всех случаях при помощи полимеразных цепных реакций производят амплификацию на протяжении 15 циклов, используя ДНК-полимеразу Γ\\όΙ (Воейппдег-Маппйет) в соответствии с инструкциями поставщика. Продукты реакции полностью расщепляют ВатН1 и №6 и лигируют с бакуловирусным вектором переноса рУЬ1393, расщепленным ВатН1 и (1пуйгодеп).
Часть лигирований используют для превращения компетентных клеток ΌΗ5α Е. со11, после чего производят отбор клеток при помощи антибиотика на ЬВ-Атр. Плазмидную ДНК получают путем стандартного щелочного лизиса и связывания в С§С1, что дает бакуловирусные векторы переноса рУЫ393/А8р2, рV^1393/А8р2ΔΤΜ и рV^1393/А8р2ΔΤΜ(Н^8)6. Для создания рекомбинантных бакуловирусов и инфецирования клеток насекомого Г9 используют стандартные методы.
Экспрессия трансфекцией
Временную и стабильную экспрессию Ηυ^^ΔΤΜ и Ни-А8р2ΔΤΜ(Н^8)6 в клетках насекомого Ηί§1ι 5 производят, используя экспрессирующий вектор р12/У5-Н18 для клеток насекомого. ДНК-вставки из экспрессирующих плазмидных векторов рУЫ393/А8р2, рV^1393/А8р2ΔΤΜ и рV^1393/А8р2ΔΤΜ(Н^8)6 вырезают путем двойного расщепления ВатН1 и №6 и субклонируют в р12/У5-Н18, расщепленном ВатН1 и №П, при помощи стандартных методов. Полученные экспрессирующие плазмиды, именуемые рIΖ/Ни-А8р2ΔΤΜ и рIΖ/Ни-А8р2ΔΤΜ(Н^8)6, получают так, как описано выше.
Для выполнения трансфекции клетки насекомого Ηί§1ι 5 культивируют в бессывороточной среде Ηί§1ι Р1уе, содержащей 10 мкг/мл гентамицина, при 27°С в герметично закрытых колбах. Трансфекцию выполняют, используя клетки Ηί§1ι Р1уе, бессывороточную среду Ηί§1ι Р1уе, содержащую 10 мкг/мл гентамицина, и липосомы 1п8есбпР1и8 (1пуйгодеп, СагкЬаб, СА) при помощи стандартных методов.
Для выполнения крупномасштабной временной трансфекции 1,2х107 клеток Ηί§1ι Р1уе помещают в 150 мм чашку для культуры ткани и оставляют для прикрепления при комнатной температуре в течение 15-30 мин. Во время прикрепления получают смесь ДНК/липосом, смешивая 6 мл бессывороточной среды, 60 мкг ДНК А8р2ΔΤΜ/рIΖ (+/-Н18) и 120 мкл Иъесйп Р1и8, и инкубируют при комнатной температуре в течение 15 мин. Среду для чашек Петри удаляют из чашки с клетками, заменяют ее смесью ДНК/липосом и оставляют на 4 ч при комнатной температуре и постоянном покачивании со скоростью 2 об./мин. В чашку добавляют еще 6 мл среды и инкубируют в течение 4 дней при 27°С во влажном термостате. Через 4 дня после трансфекции среду собирают, очищают центрифугированием со скоростью 500 х градиент и анализируют экспрессию А§р2 при помощи вестерн-блоттинга. Для достижения стабильной экспрессии клетки обрабатывают 50 мкг/мл зеоцина и выжившую популяцию используют для получения клональных клеток, производя ограниченное разведение и анализ степени экспрессии, как было описано выше.
Очистка Ηυ^^ΔΤΜ и Ни-А8р2ΔΤΜ(Н^8)6
Удаление трансмембранного сегмента из Ни-А8р2 вызывает секрецию полипептида в культуральную среду. После продуцирования белка путем инфецирования или трансфекции бакуловируса кондиционированную среду собирают, очищают центрифугированием и диализуют против ΤΠ5-ΗΟ1 (рН 8,0). Затем это вещество очищают последовательным выполнением анионообменной хроматографии (Τπ5НС1, рН 8,0) и катионообменной хроматографии (ацетатный буфер при рН 4,5) с использованием градиентов №С1. Параметры элюции контролируют (1) вестерн-блоттингом и (2) анализом активности с использованием пептидного субстрата, описанного в примере 12. Для Ни-А8р2ΔΤΜ(Н^8)6 кондиционированную среду диализуют против Τπ5 буфера (рН 8,0) и очищают последовательным выполнением хроматографии на смоле 1МАС и анионообменной хроматографии.
Анализ последовательности очищенного белка Ни-А8р2ΔΤN(Н^8)6 показывает, что произошло отщепление сигнального пептида [’ГрНСЖЬРЬК].
Пример 11. Экспрессия Ни-А8р2 в клетках яичника китайского хомячка (СН0).
Гетерологичная экспрессия Ни-А8р2Ь в клетках СН0-К1
Полную кодирующую последовательность Ни-А8р2 клонируют в экспрессирующем векторе рс^NА3.1(+)Нуд^о для клеток млекопитающего (1пуйгодеп, СагкЬаб, СА), который содержит промежуточный ранний промотор СМУ и сигнал полиаденилирования ЬСН для стимуляции экспрессии. Экспрессирующую плазмиду рс^NА3.1(+)Нуд^о/Ни-А8р2 получают путем щелочного лизиса, связывания в С§С1 и полного секвенирования обеих цепей для проверки целостности кодирующей последовательности.
Клетки яичника китайского хомячка дикого типа (СН0-К1) получены из АТСС. Эти клетки помещают в монослойные культуры, находящиеся в среде α-МЕМ, содержащей 10% РС8, при 37°С в 5% С02. Клетки СН0-К1 (60% слияние) в двух 100 мм чашках трансфецируют только рсОНА3.1(+)Нудго (контрольная плазмида) или рс^NА3.1(+)Нуд^о/Ни-А8р2, используя катионную липосому ^0ΤΛР в соответствии с рекомендациями поставщика. Клетки обрабатывают смесями плазмидной ДНК/липосом в течение 15 ч, после чего используемую среду заменяют питательной средой, содержащей 500 ед./мл гигромицина В. В случае клеток СН0-К1, трансфецированных рсОНА3.1(+)Нудго/Ни-А8р2, клонируют отдельные клетки, устойчивые к гигромицину В, производя ограниченное разведение. После клональной
- 29 009216 экспансии отдельных линий клеток экспрессию белка Ни-Акр2 оценивают при помощи вестернблоттинга, используя поликлональную антисыворотку кролика против рекомбинантного Ни-А8р2, полученного экспрессией в Е. сой. Почти полностью слитые линии клеток во всех чашках собирают, производя соскоб в РВ8, и отделяют клетки центрифугированием. Клеточный осадок повторно суспендируют в холодном буфере для лизиса (25 мМ Тп5-НС1 (8,0)/5 мМ БОТА), содержащем ингибиторы протеазы, и лизируют клетки ультразвуком. Растворимые и мембранные фракции отделяют центрифугированием (105000 х градиент, 60 мин) и нормализованные количества белка из каждой фракции отделяют при помощи 8Э8-РАСЕ. Отделенные полипептиды гибридизируют методом электропереноса с мембранами РУЭР, после чего детектируют белок Ни-А8р2Ь, используя антисыворотку против Ни-Акр2 кролика (1/1000 разведение), и визуализируют комплексы антиген-антитело, используя щелочную фосфатазу, конъюгированную с антителами козы против кролика (1/2500). Специфический иммунореактивный белок с кажущейся молекулярной массой (Мг) 65 кДа обнаружен в клетках, трансфецированных рс^NΑ3.1(+)Нуд^о/Ни-Α8р2, и не обнаружен в клетках, трансфецированных контрольной плазмидой. Кроме того, полипептид Ни-А§р2 обнаружен только в мембранной фракции при наличии сигнального пептида и сигнального трансмембранного домена в предполагаемой последовательности. На основании этого анализа можно сделать вывод о том, что клон № 5 характеризуется наибольшей экспрессией белка НиАкр2, поэтому эти линии продуцирующих клеток размножены с целью получения материала для очистки.
Очистка рекомбинантного Ни-А8р2Ь из клона № 5 СНО-К1/Ни-А§р2
Для выполнения типичной очистки в качестве исходного материала используют клеточный осадок клона № 5, полученный из 20 150 мм чашек слитых клеток. Клеточный осадок повторно суспендируют в 50 мл холодного буфера для лизиса, как это описано выше. Клетки лизируют гомогенизацией в политроне (2х20 с) и лизат центрифугируют со скоростью 338000 х градиент в течение 20 мин. Мембранный осадок повторно суспендируют в 20 мл холодного буфера для лизиса, содержащего 50 мМ β-октилглюкозида, с последующим покачиванием при 4°С в течение 1 ч. Экстракт детергента очищают центрифугированием со скоростью 338000 х градиент в течение 20 мин и супернатант собирают для последующего анализа.
Экстракт β-октилглюкозида вводят в анионообменную колонку Мопо О, которую предварительно уравновешивают 25 мМ Тгщ-НС1 (рН 8,0)/50 мМ β-октилглюкозида. После введения образца колонку элюируют линейным градиентом №10'1 с возрастающей концентрацией (0-1,0М в течение 30 мин), отдельные фракции анализируют вестерн-блоттингом и определяют активность β-секретазы (см. ниже). Фракции, обладающие иммунореактивностью Ни-А§р2Ь и активностью β-секретазы, собирают и диализируют против 25 мМ №1ОАс (рН 4,5)/50 мМ β-октилглюкозида. После выполнения диализа осажденное вещество удаляют центрифугированием и растворимое вещество хроматографируют на катионообменной колонке Мопо8, которую предварительно уравновешивают 25 мМ №ЮАс (рН 4,5)/50 мМ β-октилглюкозида. Колонку элюируют линейным градиентом №1С1 с возрастающей концентрацией (0-1,0М в течение 30 мин), отдельные фракции анализируют вестерн-блоттингом и определяют активность β-секретазы. Фракции, обладающие иммунореактивностью Ни-Акр2 и активностью β-секретазы, объединяют и при помощи 8Ь8-РАСА/окрашивания кумассии голубым определяют их чистоту, которая составляет >90%.
Пример 12. Анализ активности β-секретазы Ни-А§р2 с использованием пептидных субстратов.
Анализ β-секретазы
Активность β-секретазы определяют в количественном отношении, измеряя степень гидролиза синтетического пептида, содержащего шведскую мутацию АРР, при помощи ВЭЖХ с обращенной фазой (КР-НРЬС) и детектирования в ультрафиолетовом свете. Каждая реакционная смесь содержит 50 мМ ΝιМЕ8 (рН 5,5), 1% β-октилглюкозида, пептидный субстрат (8ЕУЫЬПАЕРК, 70 мкМ) и фермент (1-5 мкг белка). Реакционные смеси инкубируют при 37°С в течение разных периодов времени и продукты реакции выделяют при помощи КР-НРЬС, используя линейный градиент 0-70 В в течение 30 мин (А=0,1% ТФУ в воде, В=1% ТФУ/10% воды/90% АсСЩ. Параметры элюции контролируют по оптической плотности при 214 нм. В предварительных экспериментах пики двух продуктов, которые элюировали перед субстратом из интактного пептида, подтвердили наличие последовательности ОАЕРК и 8ЕУНЬ при выполнении секвенирования Эдмана и масс-спектрометрии МАОЫ-ТОР. Процентное значение гидролиза пептидного субстрата высчитывают, сравнивая интегрированные площади пиков для двух пептидных продуктов и исходного вещества, полученного при оптической плотности 214 нм. Специфичность реакции расщепления протеазой определяют, выполняя анализ β-секретазы в присутствии смеси ингибиторов протеазы (8 мкМ пепстатина А, 10 мкМ лейпептина, 10 мкМ Е64 и 5 мМ ЕЬТА).
При выполнении альтернативного анализа β-секретазы используют субстраты с внутренне погашенной флуоресценцией, контролируя активность фермента при помощи флуоресцентной спектроскопии в одном образце или многолуночном формате. Каждая реакционная смесь содержит 50 мМ №а-МЕ8 (рН 5,5), пептидный субстрат МСА-ЕУКМОАЕР|К-ЬНР| (Вю8оигсе 1п1егпа1юпа1) (50 мкМ) и очищенный фермент Ни-А§р2. Эти компоненты уравновешивают при 37°С в течение разных периодов времени и инициируют реакцию, добавляя субстрат. Реакционную смесь осуществляют при 330 нм и контролируют кинетику реакции, измеряя флуоресцентное излучение при 390 нм. Чтобы обнаружить соединения, модулирующие активность Ни-А8р2, испытуемые соединения добавляют во время фазы предварительной
- 30 009216 инкубации и контролируют кинетику реакции так, как это описано выше. Активаторами являются соединения, увеличивающие скорость появления флуоресценции, и ингибиторами являются соединения, уменьшающие скорость появления флуоресценции.
Очевидно, что существуют другие варианты осуществления этого изобретения помимо рассмотренных в приведенном выше описании изобретения и примерах.
С учетом вышеизложенного возможны многочисленные модификации и варианты настоящего изобретения, поэтому все они входят в объем этого изобретения.
Все приведенные публикации полностью включены в это описание изобретения в качестве ссылки. Список последовательностей <110> Сигпеу, Маек Е.
ВЕепконзкх, М±сИае1 Ц. Нехпгхкаоп, КоЬегЕ Ь. РагосН, 1л1±з А.
Уап, РЪагтасха & Цр]окп Сотрапу <120> Роль секретаэы в болезни Альцгеймера <130> 6177.Р СР <140>
<141>
<150> 60/101594 <151> 1998-09-24 <160>49 <170> Программа РаЕеггЫп, версия 2.0 <210> 1 <211>1804 <212> ДНК <213> Человек (Нолю зархепз) <400> 1 аЕдддсдсас Еддсссддде дскдсЕдсЕд ссЕсЕдсЕдд сссадЕддсЕ ссЕдсдсдсс60 дссссддадс Еддсссссдс дсссЕЕсасд сЕдссссЕсо дддЕддесдс ддссасдаас120 сдсдЕадЕЕд сдсссасссс дддасссддд ассссЕдссд адсдссасде сдасддсЕЕд180 дсдсЕсдссс ЕддадссЕдс ссЕддсдЕсс сссдсдддсд ссдссаасЕЕ сЕЕддссаЕд240 дсадасаасс Едсаддддда сЕсЕддссдс ддсЕасЕасс ЕддадасдсЕ даЕсдддасс300 сссссдсада адсЕасадаЕ ЕсЕсдЕЕдас асЕддаадса дЕаасЕЕЕдс сдЕддсадда360 ассссдсасЕ ссЕасагада сасдсасЕЕЕ дасасадада ддССЕадсас асассдсЕсс420 аадддсЕЕЕд асдЕсасадС даадЕасаса сааддаадсс ддасдддсЕЕ сдЕЕддддаа480 дассЕсдЕса ссаЕссссаа аддсЕЕсааЕ асЕЕсЕЕЕЕс ЕЕдЕсаасаЕ ЕдссасЕаЕЕ540
ЕЕЕдааЕсад адааЕЕЕсЕЕ ЕЕЕдссЕддд аЕЕаааЕдда аЕддааЕасЕ ЕддссЕадсЕ600
ЕаЕдссасас ЕЕдссаадсс аЕсаадЕСсЕ сЕддадассЕ ЕсЕЕсдасЕс сссддЕдаса660 саадсаааса ЕссссаасдЕ ЕЕЕсЕссаЕд садаЕдЕдЕд дадссддсЕЕ дсссдЕЕдсЕ720 ддаЕсЕддда ссаасддадд ЕадЕсЕЕдьс ЕСдддЕддаа ЕЕдаассаад ЕЕСдЕаЕааа780 ддадасаЕсЕ ддгаЕасссс ЕаЕЕааддаа дадЕддЕасЕ ассадаЕада ааЕЕсЕдааа840
ЕЕддаааЕЕд даддссааад ссЕЕааЕсЕд дасЕдсадад адЕаЕааедс адасааддсс900 аЕсдЕддаса дЕддсассас дсЕдсЕдсдс сЕдссссада аддЕдЕЕЕда ЕдсддЕддЕд960 даадсЕдсдд сссдсдсаЕс ЕсЕдаЕЕсса дааЕЕсЕсЕд аЕддЕЕЕсЕд дасЕдддЕсс1020 садсЕддсдЕ дсЕддасдаа ЕЕсддаааса ссЕЕддЕсЕЕ асЕЕсссЕаа ааЕСЕссаЕс1080
ЕассЕдадад аЕдадаассс садсаддЕса ЕЕссдЕаЕса сааЕссЕдсс ЕсадсЕЕЕас1140
- 31 009216 аЕЕсадссса ЕдаЕдддддс сддссЕдааЕ ЕаЕдааЕдЕЕ ассдаЕЕсдд саЕЕЕсссса 1200 ЕссасаааЕд сдеЕддЕдаС сддсдссасд дЕдаЕддадд дсЕЕсЕасдЕ саЕсЕЕсдас 1260 ададсссада ададддЕддд сЕЕсдсадсд адссссЕдЕд садаааЕЕдс аддЕдсЕдса 1320 дсдсссдааа ЕЕЕссдддсс ЕЕЕсгсааса даддаЕдЕад ссадсаасЕд ЕдЕссссдсЕ 1380 садЕСЕЕЕда дсдадсссаЕ ЕЕЕдЕддаЕЕ дЕдЕссЕаЕд сдсЕсаЕдад сдЕсрдЕдда 1440 дссаЕссЕсс ЕЕдЕссЕааЕ сдЕссЕдсЕд сгдсЕдссдЕ ЕссддЕдЕса дсдЕсдсссс 1500 сдЕдасссЕд аддЕсдЕсаа ЕдаЕдадЕсс ЕсЕсЕддЕса дасаЕсдсЕд даааЕдааЕа 1560 дссаддссЕд ассссаадса ассаЕдаасЕ садсЕаЕЕаа дааааъсаса ЕЕЕссадддс 1620 адсадссддд аЕсдаЕддЕд дсдсЕЕЕсЕс сЕдЕдсссас ссдЕСЕЕсаа ЕсЕсЕдЕЕсЕ 1680 дсЕсесадаЕ дссЕЕсЕада ЕЕсасЕдЕсЕ ЕЕЕдаЕЕсЕЕ даЕЕСЕсаад сЕЕЕсаааЕс 1740 сЕсссЕасЕЕ ссаадааааа ЕааЕЕааааа ааааасЕЕса ЕЕсЕааасса аааааааааа 1800 аааа 1804 <210> 2 <211> 518 <212> Белок <213> Человек (Ното зархепз)
| <400> 2 | Ьеи | Ьеи Ьеи Рго Ьеи Ьеи А1а С1п | Тгр | ||||||||||||
| ИеЕ 1 | О1у | А1а | Ьеи | А1а Агд А1а 5 | |||||||||||
| 10 | 15 | ||||||||||||||
| Ьеи | Ьеи | Агд | А1а | А1а | Рго | С1и | Ьеи | А1а | Рго | А1а | Рго | РЬе | ТЫ | Ьеи | Рго |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ьеи | Агд | νβΐ | А1а | А1а | А1а | ТЬг | Азп | Агд | Уа1 | Уа1 | А1а | Рго | ТЬг | Рго | С1у |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Рго | О1у | ТЬг | Рго | А1а | С1и | Агд | Н13 | А1а | Азр | <31у | Ьеи | А1а | Ьеи | А1а | Ьеи |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| 61и | Рго | А1а | Ьеи | А1а | Бег | Рго | А1а | С1у | А1а | А1а | Азп | РЬе | Ьеи | А1а | МеЕ |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Уа1 | Азр | Азп | Ьеи | С1п | С1у | Азр | Зег | О1у Агд | (31у Тут | Туг | Ьеи | С1и | МеЕ | ||
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ьеи | Не | С1у | ТЬг | Рго | Рго | С1п | Ьуз | Ьеи | С1П | 11е | Ьеи | Уа1 | Азр | ТЫ | С1у |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Бег | Бег | Лап | РЬе | А1а | Уа1 | А1а | С1у | ТЬг | Рго | ΗΪ3 | Бег | Туг | 11е | Азр | ТЫ |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Туг | РЬе | Азр | ТЬг | С1и | Агд | Бег | Бег | ТЬг | Туг | Агд | Бег | Ьуз | С1у | РЬе | Азр |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| νβΐ | ТЬг | Уа1 | Ьуз | Туг | ТЬг | С1п | С1у | Бег | Тгр | ТЬг | С1у | РЬе | ναΐ | С1у | С1и |
| 145 | 150 | 155 | 160 |
- 32 009216
| Азр Ьеи Уа1 ТЬг Не | Рго Ьуз С1у РЬе Азп ТЬг Бег РЬе Ьеи ναΐ | Азп | |||||||||||||
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Не | А1а | ТЬг | Не 180 | РЬе | С1и | Бег | С1и | Азп 185 | РЬе | РЬе | Ьеи | Рго | С1у 190 | Не | Ьуз |
| Тгр | А$П | С1у 195 | Не | Ьеи | С1у | Ьеи | А1а 200 | Туг | А1а | ТЬг | Ьеи | А1а 205 | Ьуз | Рго | Бег |
| Бег | Бег 210 | Ьеи | С1и | ТЬг | РЬе | РЬе 215 | Авр | Бег | Ьеи | Уа1 | ТЬг 220 | <31п | А1а | Азп | Не |
| Рго 225 | Авп | Уа1 | РЬе | Бет | Мес 230 | С1п | МеС | Суз | С1у | А1а 235 | С31у | Ьеи | Рго | νβΐ | А1а 240 |
| С1у | Бег | С1у | ТЬг | Авп 245 | С1у <31у | Бег | Ьеи | Уа1 250 | Ьеи | <31у | С1у | Не | С1и 255 | Рго | |
| Бег | Ьеи | Туг | Ьуб 260 | О1у | Азр | Не | Тгр | Туг 265 | ТЬг | Рго | Не | Ьуз | С1и 270 | <31и | Тгр |
| Туг | Туг | С1п 275 | 11е | <31и | Не | Ьеи | Ьуз 280 | Ьеи | С1и | Не | С1у | С1у 285 | С1п | Бег | Ьеи |
| Азп | Ьеи 290 | Азр | Суз | Агд | С1и | Туг 295 | Азп | А1а | Азр | Ьуз | А1а 300 | Не | Уа1 | Азр | Бег |
| С1у 305 | ТЬг | ТЬг | Ьеи | Ьеи | Агд 310 | Ьеи | Рго | С1п | Ьуз | Уа1 315 | РЬе | Азр | А1а | Уа1 | Уа1 320 |
| <31и | А1а | ν*ι | А1а | Агд 325 | А1а | Бет | Ьеи | Не | Рго 330 | С1и | РЬе | Бег | Азр | С1у 335 | РЬе |
| Тгр | ТЬг | <31у | Бег 340 | С1п | Ьеи | А1а | Суз | Тгр 345 | ТЬг | Азп | Бег | С1и | ТЬг 350 | РГО | Тгр |
| Зег | Туг | РЬе 355 | Рго | Ьуз | Не | Бег | Не 360 | Туг | Ьеи | Агд | Азр | С1и 365 | Азп | Бег | Бег |
| Агд | Бег 370 | РЬе | Агд | Не | ТЬг | Не 375 | Ьеи | Рго | С1п | Ьеи | Туг 380 | Не | <31п | Рго | мес |
| Мес 385 | С1у | А1а | С1у | Ьеи | Азп 390 | Туг | <31и | Суз | Туг | Агд 395 | РЬе | С1у | Не | Бег | Рго 400 |
| Бег | ТЬг | Авп | А1а | Ьеи | Уа1 | Не | С1у | А1а | ТЬг | νβΐ | Мес | <31и | С1у | РЬе | Туг |
405 410 415
- 33 009216
| Уа1 | Не РЬе Азр Агд А1а С1п Ьуз Агд Уа1 С1у РЬе А1а А1а | Зег | Рго | ||||||||||||
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Суз | А1а | С1и | 11е | А1а | С1у | А1а | А1а | Ча1 | Зег | С1и | Не | Зег | С1у | Рго | РЬе |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Зег | ТЬг | С1и | Азр | Уа1 | А1а | Зег | Азп | Суз | Ча1 | Рго | А1а | С1п | Зег | Ьеи | Зег |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| <Пи | Рго | 11е | Ьеи | Тгр | 11е | νβΐ | Зег | Туг | А1а | Ьеи | МеЕ | Зег | Уа1 | Суз | 61у |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| А1а | 11е | Ьеи | Ьеи | ν»1 | Ьеи | 11е | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Ьеи | Ьеи | Рго | РЬе | Агд | Суз |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| С1п | Агд | Агд | Рго | Агд | Азр | Рго | С1и | Уа1 | Уа1 | Азп | Азр | С1и | Зег | Зег | Ьеи |
| 500 | 505 | 510 |
V»! Агд Ηίβ Агд Тгр Ьуз
515 <2Ю> 3 <211> 2070 <212> ДНК <213> Человек (Ното вархепз) <400> 3 аЕддсссаад сссЕдсссЕд дсЕссЕдсЕд Еддасдддсд сдддадЕдсЕ дссЕдсссас 60 ддсасссадс асддсаЕссд дсЕдссссЕд сдсадсддсс Еддддддсдс сссссЕдддд 120 седсддсЕдс сссдддадас сдасдаадад сссдаддадс ссддссддад дддсадсЕЕЕ 180 дЕддадагдд ЕддасаассЕ даддддсаад Есддддсадд дсЕасЕасдЕ ддадаЕдасе 240 дЕдддсадсс ссссдсадас дсЕсаасаЕО сЕддсддаса саддсадсад ЕаасЕЕЕдса 300 дЕдддЕдсЕд ссссссассс сЕЕссЕдсаЕ сдсЕасЕасс ададдсадсЕ дЕСсадсаса 360 Еассдддасс Ессддааддд ЕдЕдЕаЕдЕд сссЕасассс адддсаадЕд ддааддддад 420 сЕдддсассд ассЕддЕаад саЕсссссаЕ ддссссаасд ЕсасЕдЕдсд ЕдссаасаЕЕ 480 дсЕдссасса сЕдааСсада саадЕЕсЕЕс аСсаасддсг ссаасЕддда аддсаСссЕд 540 дддсЕддссЕ аЕдсЕдадаЕ ЕдссаддссЕ дасдасЕссс ЕддадссЕЕЕ сЕЕЕдасЕсЕ 600 сЕддсааадс адассеасдС ЕсссаассЕс ЕЕсЕсссЕдс ассЕЕЕдЕдд ЕдсЕддсссс 660 ссссЕсаасс адЕсЕдааде дсЕддссЕсЕ дЕсддаддда дсаЕдаЕсаЕ ЕддаддЕаЕс 720 дассасЕсдс ЕдЕасасадд садСсЕсЕдд ЕаЕасассса Ессддсддда дЕддЕаЕЕаЕ 780 даддЕсаЕса ЕЕдЕдсдддС ддадаЕсааЕ ддасаддаСс ЕдааааЕдда сЕдсааддад 840 ЕасаасЕаЕд асаададсаЕ ЕдЕддасадЕ ддсассасса ассЕЕсдЕЕЕ дсссаадааа 900 дСдЕЕЕдаад сЕдсадсеаа аЕссассаад дсадссЕссЕ ссасддадаа дЕЕсссЕдас 960 ддЕЕЕсЕддс Еаддададса дсЕддЕдЕдс Еддсаадсад дсассасссс ЕЕддаасаЕЕ 1020 ЕЕсесадЕса ЕсЕсасЕсЕа ссЕааЕдддЕ даддЕЕасса ассадЕССЕЬ ссдсаЕсасс 1080 аЕссЕЕссдс адсааЕассЕ дсддссадЕд даадаЕдЕдд ссасдСссса адасдасЕдЕ 1140
- 34 009216
ЕасаадЕЕЕд ддсЕЕсЕасд саЕдЕдсасд даадасЕдгд дгсаЕддсЕд сдсЕдссЕсс аадЕдаддад сЕЕЕддЕсас ссасссасса ддасЕдЕасс сЕЕддЕсасс ЕЕдгссасса дЕасЕддсаЕ адассаадсг ЕдсЕЕЕадад ссаЕсЕсаса ЕЕдЕСЕЕЕда аЕдадЕЕсад дсЕасаасаЕ ссаЕсЕдсдс дсЕдссЕдсд дсссаЕдддс аадЕаддада ааЕдссЕсЕд Едсаддааас ЕсаааЕЕЕаа ЕЕссЕЕЕааа сасаедсадд ЕдЕЕЕсссЕд асадддасЕд дЕсаЕссасд Есдддсссда дасддсадсд Еесасадаса ссЕсЕЕсаЕд ссадсадсаЕ адаадасада сасадаЕддс ссЕЕдаЕдда адаааадада дЕсдддаааЕ ЕЕсЕссаасс ЕЕассЕЕддс сЕддссааад ЕаЕааасаад ддсаСЕдЕЕа ааасдааЕЕд дЕддааддсс даЕдадЕсаа сЕдссасЕсЕ даЕдасЕЕЕд даЕЕссссЕд ассЕдЕддсс дааддаааад адааадаадс ЕсЕдсЕдсЕЕ сааадЕаЕЕс дЕдЕдЕсссЕ ЕсадЕаддад ссЕааеаЕЕд
ЕдддадсЕдЕ дсЕЕЕдсЕдЕ сЕЕЕЕдЕсас сссЕсаЕдас дссЕсаЕддЕ сЕдаЕдасаЕ дассасасеЕ ададсассЕс дсЕддсаадд асЕсЕдсЕдд давасЕЕсад ЕЕСЕЕЕЕоЕЕ дЕддЕасссЕ аддаЕдсаса дЕдсааадаЕ
ЕаЕсаЕддад садсдсЕЕдс сЕЕддасаЕд саЕадссЕас дЕдЕсадЕдд сЕсссЕдсЕд ссдЕддЕЕса аддасссЕсс ЕдддЕЕссад сдддааЕасЕ СССЕдаассЕ адЕЕЕсадаа ддсададаад дЕЕЕдсЕаЕЕ ЕдссЕСЕЕда
1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 аЕЕааааааа аааааааааа аааааааааа
2070 <210> 4 <211> 501 <212> Белок <213> Человек (Ното зарХепз)
| <400> 4 Мег А1а СХп 1 | А1а | Ьеи Рго Тгр Ьеи Ьеи Ьеи Тгр МеЕ <31 у А1а СХу | Уа1 | ||||||||||||
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Ьеи | Рго | АХа | Ηίε | С1у | ТЬг | СХп | Нхз | С1у | Не | Агд | Ьеи | Рго | Ьеи | Агд | Бег |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| С1у | Ьеи | С1у С1у | А1а | Рго | Ьеи | СХу | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Агд | С1и | ТЫ | Азр | |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| С1и | С1и | Рго | С1и | С1и | Рго | С1у | Агд | Агд | С1у | Бег | РЬе | Уа1 | СХи | МеЕ | Уа1 |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Азр | Азп | Ьеи | Агд | СХу | Ьуз | Зег | СХу | С1п | С1у | Туг | Туг | УаХ | СХи | МеЕ | ТЬг |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Уа1 | С1у | 5ег | Рго | Рго | СХп | ТЬг | Ьеи | Азп | Не | Ьеи | УаХ | Азр | ТЬг | С1у | Бег |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Зег | Авп | РЬе | АХа | Уа1 | С1у | А1а | А1а | Рго | Нхз | Рго | РЬе | Ьеи | Н1в | Агд | Туг |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Туг | С1п | Агд | С1п | Ьеи | Бег | Бег | ТЫ | Туг | Агд | Азр | Ьеи | Агд | Ьуз | С1у | УаХ |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Туг | Уа1 | Рго | туг | ТЬг | С1п | С1у | Ьуз | Тгр | С1и | С1у | СХи | Ьеи | СХу | ТЫ | Азр |
130 135 140
| Ьеи Уа1 Зег 145 | Не | Рго Ηίβ С1у Рго Азп Уа1 ТЬг Уа1 Агд А1а Азп Не | |||||||||||||
| 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
| А1а | А1а | Не | ТЬг | С1и 165 | Бег | Азр | Ьуз | РЬе | РЬе 170 | Не | Азп | С1у | Бег | Азп 175 | Тгр |
| й1и | С1у | Не | Ьеи 180 | С1у | Ьеи | А1а | Туг | А1а 185 | С1и | Не | А1а | Агд | Рго 190 | Азр | Азр |
| Зег | Ьеи | С1и 195 | Рго | РЬе | РЬе | Азр | Зег 200 | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1п | ТЫ 205 | Н13 | Уа1 | Рго |
| Азп | Ьеи 210 | РЬе | Зег | Ьеи | ΗΪ3 | Ьеи 215 | Суз | С1у | А1а | С1у | РЬе 220 | Рго | Ьеи | Азп | С1п |
| Зег 225 | С1и | Уа1 | Ьеи | А1а | Зег 230 | Уа1 | <31у | О1у | Зег | Мес 235 | Не | Не | С1у | С1у | Не 240 |
| Азр | Ηΐ$ | Зег | Ьеи | Туг 245 | ТЬг | С1у | Зег | Ьеи | Тгр 250 | Тух | ТЫ | Рго | Не | Агд 255 | Агд |
| С1и | Тгр | Туг | Туг 260 | 01и | Уа1 | 11е | Не | Уа1 265 | Агд | Уа1 | С1и | Не | Аяп 270 | С1у | С1п |
| Азр | Ьеи | Ьуз 275 | Мес | Азр | Суз | Ьуз | С1и 280 | Туг | Азп | Туг | Азр | Ьуз 285 | Зег | Не | Уа1 |
| Азр | Зег 290 | С1у | ТЬг | ТЬг | Азп | Ьеи 295 | Агд | Ьеи | Рго | Ьуз | Ьуз 300 | Уа1 | РЬе | С1и | А1а |
| А1а 305 | Уа1 | Ьуз | Зег | Не | Ьуз 310 | А1а | А1а | Зег | Зег | ТЫ 315 | С1и | Ьуз | РЬе | Рго | Азр 320 |
| С1у | РЬе | Тгр | Ьеи | С1у 325 | С1и | С1п | Ьеи | Уа1 | Суя 330 | Тгр | С1п | А1а | С1у | ТЫ 335 | ТЬг |
| Рго | Тгр | Азп | 11е 340 | РЬе | Рго | Уа1 | Не | Зег 345 | Ьеи | Туг | Ьеи | Мес | (31у 350 | С1и | Уа1 |
| ТЬг | Азп | С1п 355 | Зег | РЬе | Агд | Не | ТЬг 360 | Не | Ьеи | Рго | С1п | С1п 365 | Туг | Ьеи | Агд |
| Рго | Уа1 370 | С1и | Азр | Уа1 | А1а | ТЫ 375 | Зег | <Пп | Азр | Авр | Суз 380 | Туг | Ьуз | РЬе | А1а |
| Не | Зег | О1п | Зег | Зег | ТЬг | С1у | ТЬг | Уа1 | МеС | С1у | А1а | Уа1 | Не | Мес | С1и |
- 36 009216
| ЭВ5 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| С1у | РЪе | Туг | Уа1 | Уа1 | РЬе | Азр | Агд | А1а | Агд | Ьуз | Агд | 11е | С1у | РЬе | А1а |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Уа1 | 5ег | А1а | Суз | Ηΐε | Уа1 | Ηίε | Азр | <31и | РЬе | Агд | ТЬг | А1а | А1а | ν*ι | С1и |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| С1у | Рго | РЪе | Уа1 | ТЬг | Ьеи | Азр | Нее | О1и | Азр | Суз | С1у | Туг | Азл | Не | Рго |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| С1п | ТЬг | Азр | С1и | Зег | ТЬг | Ьеи | МеЕ | ТЬг | 11е | А1а | Туг | Уа1 | МеЕ | А1а | А1а |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Не | Суз | А1а | Ьеи | РЬе | МеЕ | Ьеи | Рго | Ьеи | Суз | Ьеи | МеЕ | Уа1 | Суз | С1п | Тгр |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Агд | Суз | Ьеи | Агд | Суз | Ьеи | Агд | С1л | <31п | Ηίβ | Азр | Азр | РЬе | А1а | Азр | Азр |
| 485 | 490 | 495 |
Не £ег Ьеи Ьеи Ьуз
500 <210> 5 <211> 1977 <212> ДНК <213> Человек (Ното зарЬепз) <400> 5 аЕддсссаад сссЕдсссЕд дсЕссЕдсЕд еддаЕдддсд сдддадЕдсЕ дссЕдсссас 60 ддсасссадс асддсаЕссд дсЕдссссЕд сдсадсддсс Еддддддсдс сссссЕдддд 120 сЕдсддсЕдс сссдддадас сдасдаадад сссдаддадс ссддссддад дддсадсЕЕЕ 180 дЕддадаЕдд ЕддасаассЕ даддддсаад Есддддсадд дсСасЕасдЕ ддадагдасс 240 дедддсадсс ссссдсадас дсЕсаасаес седдеддаЕа саддсадсад Еаасесгдса 300 дЕдддЕдсЕд ссссссассс сЕЕссЕдсаЕ сдсЕасЕасс ададдсадсЕ дЕссадсаса 360 Сассдддасс Ессддааддд ЕдЕдЕаЕдЕд сссЕасассс адддсаадЕд ддааддддад 420 сЕдддсассд асеЕддЕаад саЕсссссаЕ ддссссаасд ЕсасЕдЕдсд ЕдссаасаЕЕ 480 дсЕдссаЕса сЕдааЕсада саадЕЕсЕЕс аЕсаасддсЕ ссаасЕддда аддсаЕссЕд 540 дддсЕддссе аЕдседадаЕ ЕдссаддсЕЕ Едеддедсед дсЕЕсссссЕ саассадСсе 600 даадЕдсЕдд ссгсСдЕсдд адддадсаЕд аесаЕЕддад дЕаесдасса сЕсдсЕдЕас 660 асаддсадЕс ЕсЕддЕаЕас асссаЕссдд сдддадЕддЕ аЕЕаЕдадде даЕсаЕЕдЕд 720 сдддЕддада ЕсааЕддаса ддаЕсЕдааа аЕддасЕдса аддадЕасаа сЕаЕдасаад 780 адсаЕЕдЕдд асадЕддсас сассаассЕЕ сдЕЕЕдссса адааадЕдЕЕ ЕдаадсЕдса 840 дЕсаааЕсса Есааддсадс сЕссЕссасд дадаадЕЕсс сЕдаеддЕЕЕ сЕддсЕадда 900 дадсадсЕдд ЕдЕдсЕддса адсаддсасс ассссЕЕдда асаЕЕЕЕссс адЕсаЕсЕса 960 сЕСЕассЕаа ЕдддЕдаддЕ Еассаассад ЕссЕЕссдса ЕсассаЕссЕ Ессдаадсаа 1020 ЕассЕдсддс садЕддаада ЕдЕддссасд Есссаадасд асСдЕЕасаа дЕЕЕдссаЕс 1080
- 37 009216
ЕсасадСсаЕ ссасдддсас СдЕЕаСддда дсЕдЕСаСса Еддадддссс ссасдЕЕдсс 1140 сссдассддд сссдаааасд ааЕЕддсЕЕС дссдссадсд сЕЕдссаЕдс дсасдаедад 1200 Егсаддасдд садсддЕдда аддсссЕЕЕЕ дСсассЕСдд асаСддаада сЕдСддсЕас 1260 аасаЕЕссас адасадасда дссаассссс аедассаСад сссаЕдЕсаС ддсСдссасс 1320 СдсдсссСсС ЕсаСдсСдсс асЕсСдссСс «СддСдСдСс адсддсдсСд ссСссдсСдс 1380 седсдссадс адсаСдаЕда сЕЕСдсЕдаЕ дасаЕсЕссс ЕдсЕдаадЕд аддаддесса 1440 сдддсадаад аЕададасЕс сссЕддасса сассСссдсд дЕЕсасЕЕСд дссасаадЕа 1500 ддадасасад аСддсассСд Еддссададс ассЕсаддас ссЕссссасс сассаааЕдс 1560 сссСдссЕЕд асддадаадд ааааддсЕдд сааддсдддЕ ЕссадддасЕ дЕасссдЕад 1620 дааасадааа ададаадааа даадсасЕсЕ дссддсддда аЕасссЕЕдд ЕсассЕсааа 1680 сссаадссдд даааЕСсЕдс ЕдссСдааас ЕЕсадсссЕд аассЕЕсдСс сассасЕссЕ 1740 ЕСааассссс оаасссааад Еасссссссс ЕЕсЕЕадЕЕЕ садаадсасЕ ддеассасас 1800 дсаддССасс ссддсдсдсд ЕсссСдсддС асссЕддсад адаададасс аадсссдЕЕЕ 1860 сссСдсЕддс сааадЕсадЕ аддададдаЕ дсасадЕЕЕд сЕаЕЕЕдСЕЕ Еададасадд 1920 дассдсаСаа асаадсссаа саЕЕддЕдса аадаЕЕдссЕ сЕЕдаааааа ааааааа 1977 <210> 6 <211> 476 <212> Белок <213> Человек (Ното зархепз) <400> 6
| Мес А1а 01л А1а 1 | Ьеи 5 | Рго Тгр Ьеи | Ьеи Ьеи Тгр Мес 01у А1а С1у Уа1 | ||||||||||||
| 10 | 15 | ||||||||||||||
| Ьеи | Рго | А1а | ΗΪ3 20 | С1у | ТЫ | С1п | Н1з | (31у 25 | Не | Агд | Ьеи | Рго | Ьеи 30 | Агд | Зег |
| С1у | Ьеи | С1у С1у 35 | А1а | Рго | Ьеи | С1у 40 | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Агд 45 | С1и | ТЬг | Азр | |
| С1и | С1и 50 | Рго | С1и | С1и | Рго | С1у 55 | Агд | Агд | С1у | Зег | РЬе 60 | Уа1 | С1и | МеС | Уа1 |
| Азр 65 | Азл | Ьеи | Агд | С1у | Ьуз 70 | Зег | ©1у | 61п | С1у | Туг 75 | Тут | Уа1 | 01 и | Мес | ТЬг 80 |
| Уа1 | <31у | Зег | Рго | Рго 85 | О1п | ТЬг | Ьеи | Азп | 11е 90 | Ьеи | Уа1 | Азр | ТЬг | <31у 95 | Зег |
| Бег | Азп | РЬе | А1а 100 | Уа1 | С1у | А1а | А1а | Рго 105 | Н1з | Рго | РЬе | Ьеи | Ηίβ 110 | Агд | Туг |
| Туг | ©1п | Агд 115 | б1п | Ьеи | Зег | Зег | ТЬг 120 | Туг | Агд | Авр | Ьеи | Агд 125 | Ьув | ©1у | Уа1 |
| Туг | Ча1 130 | Рго | Тут | ТЫ | С1п | С1У 135 | Ьуз | Тгр | О1и | <яу | С1и 140 | Ьеи | О1у | ТЬг | Азр |
- 38 009216
| Ьеи 145 | Уа1 | Зег | 11е | Рго | Ηίβ 150 | С1у Рго Азп Уа1 | ТЬг Уа1 Агд А1а Азп Не | ||||||||
| 155 | 160 | ||||||||||||||
| А1а | А1а | Не | ТЬг | С1и 165 | Зег | Азр | Ьуз | РЬе | РЬе 170 | Не | Азп | С1у | Бег | Азп 175 | Тгр |
| С1и | С1у | Не | Ьеи 180 | С1у | Ьеи | А1а | Туг | А1а 185 | С1и | 11е | А1а | Агд | Ьеи 190 | Суз | С1у |
| А1а | <31у | РЬе 195 | Рго | Ьеи | Азп | О1п | Зег 200 | С1и | Уа1 | Ьеи | А1а | Зег 205 | Уа1 | С1у | С1у |
| Зег | Нес 210 | 11е | Не | С1у О1у | 11е 215 | Азр | Ηίβ | Зех | Ьеи | Тух 220 | ТЬг | С1у | Зег | Ьеи | |
| Тгр 225 | Тух | ТЬг | Рго | Не | Агд 230 | Агд | С1и | Тгр | Туг | Туг 235 | С1и | Уа1 | Не | Не | νβΐ 240 |
| Агд | Уа1 | О1и | Не | Азп 245 | С1у | С1п | Азр | Ьеи | Ьуз 250 | Мес | Азр | Суз | Ьуз | С1и 255 | Туг |
| Азп | Туг | Азр | Ьуз 260 | Зег | Не | Уа1 | Азр | Зег 265 | С1у | ТЬх | ТЬг | Азп | Ьеи 270 | Агд | Ьеи |
| Рго | Ьуз | Ьуз 275 | Уа1 | РЬе | С1и | А1а | А1а 280 | Уа1 | Ьуз | Зех | Не | Ьуз 285 | А1а | А1а | Зег |
| Зег | ТЬХ 290 | С1и | Ьуз | РЬе | Рго | Азр 295 | С1у | РЬе | Тгр | Ьеи | С1у 300 | С1и | С1п | Ьеи | Уа1 |
| Суз 305 | Тгр | С1п | А1а | <31у | ТЬг 310 | ТЬг | Рго | Тгр | Азп | 11· 315 | РЬе | Рго | Уа1 | Не | Зег 320 |
| Ьеи | Туг | Ьеи | МеС | <31у 325 | 61и | Уа1 | ТЬг | Азп | <31п 330 | Зег | РЬе | Агд | Не | ТЬх 335 | 11е |
| Ьеи | Рго | С1п | С1п 340 | Тух | Ьеи | Агд | Рго | Уа1 345 | С1и | Азр | Уа1 | А1а | ТЬг 350 | Зег | С1п |
| Авр | Азр | Суз 355 | Туг | Ьуз | РЬе | А1а | 11е 360 | Зег | С1п | Зег | Зег | ТЬг 365 | С1у | ТЬг | Уа1 |
| Мее | С1у 370 | А1а | ν«ι | Не | Мес | С1и 375 | С1у | РЬе | Туг | Уа1 | Уа1 380 | РЬе | Азр | Агд | А1а |
| Агд 385 | Ьуз | Агд | Не | С31у | РЬе 390 | А1а | Уа1 | Зег | А1а | Суз 395 | Ηίβ | Уа1 | ΗΪ5 | Азр | С1и 400 |
- 39 009216
| РЬе Агд ТЬг А1а А1а | Уа1 | О1и | О1у Рго РЬе Уа1 ТЬг 410 | Ьеи | Азр Мес 415 | С1и | |||||||||
| 405 | |||||||||||||||
| Азр | Суз | С1у | Туг | Азп | 11е | Рго | С1п | ТЬг | Азр | С1и | Зег | ТЫ | Ьеи | МеС | ТЬг |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Не | А1а | Туг | νβΐ | МеС | А1а | А1а | 11е | Суз | А1а | Ьеи | РЬе | МеС | Ьеи | Рго | Ьеи |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Суй | Ьеи | МеС | Уа1 | Суз | С1п | Тгр | Агд | Суз | Ьеи | Агд | Суя | Ьеи | Агд | <31 η | С1п |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| ΗΪ5 | Азр | Азр | РЬе | А1а | Айр | Азр | 11е | 5ег | Ьеи | Ьеи | Ьув | ||||
| 465 | 470 | 475 |
<210>7 <211>2043 <212> ДНК <213> Мышь домовая (Миз шизси1из) <400> 7 аеддссссад сдсСдоассд дсСсседсса СдддСдддсс сдддааСдсс дссСдсссад60 ддаасссаСс есддсаСссд десдсссссс сдсадсддсс Сддсадддсс асссссдддс120 ссдаддссдс сссдддадас Сдасдаддаа ссддаддадс сСддссддад аддсадсссс1В0 дСддадаСдд СддасаассС даддддааад Сссддссадд дсЕасСаСдс ддадаСдасс240 дсаддсадсс ссссасадас дсссаасасс сСддСддаса сдддсадЬад СаассСЕдса300 дСдддддсСд ссссасассс СССсссдсаС сдсСасСасс ададдсадсС дСссадсаса360 саСсдадасс Сссдаааддд сдСдЪаСдСд ссссасассс адддсаадСд ддадддддаа420 сСдддсассд ассСддСдад саСсссСсаС ддссссаасд СсасСдСдсд СдссаасаСС480 дсСдссаСса сСдааСсдда саадССсССс аСсааСддСС ссаассддда дддсаСссСа540 дддсСддссС аСдсСдадаС Сдссаддссс дасдасСсСС СддадсссСС ссссдассос600 сСддСдаадс адасссасас ссссаасасс ССССсссСдс адссссдсдд сдссддсССс660 ссссСсаасс адассдаддс асСддссСсд дСдддаддда дсаСдаСсаС СддСддСаСс720 дассасСсдс СаСасасддд садСсСсСдд Сасасассса Ъссддсддда дСддСаССаС780 даадСдасса ССдСасдСдС ддаааСсааС ддСсаадаСс СсаадаСдда сСдсааддад840 сасаасСасд асаададсас сдсддасадс дддассасса асссесдссс дсссаадааа800 дсасссдаад сСдссдссаа дсссассаад дсадссСссС сдасддадаа дССсссддас960 ддсссссддс Саддддадса дссддсдсдс Сддсаадсад дсасдасссс ссддаасасс1020 сссссадсса ссссасссса ссСсасдддс даадссасса аСсадСсссс ссдсассасс1080 аСссССссСс адсааСассС асддссддСд даддасдСдд ссасдСссса адасдасСдС1140
СасаадСссд сСдСсСсаса дСсаСссасд ддсасСдССа СдддадссдС саСсаСддаа1200 ддСССссаСд СсдСсССсда есдадсссда аадсдааССд дсСССдсСдС садсдсССдс1260 саСдСдсасд аСдадССсад дасддсддса дСддааддСС сдсССдССас ддсадасаСд1320 даадассдсд дсСасаасаС Сссссадаса дасдадСсаа сасССаСдас саСадссСас1380 дссасддсдд ссаСсСдсдс сссссссасд ссдссаоСсс дссСсасддс асдссадсдд1440 сдсСдссСдс дССдссСдсд ссассадсас даСдасСССд сСдаСдасаС сссссСдсЬс1500
- 40 009216 аадСааддад асССддйсас сассаассСд дддсесдсас ссССаддсас сСдсссадса сддсдСсаса аассСсаССс СдаСадддас дсСсдСдддс аСдадССдда ссааСдсССс ссдСаддаса сасааасссд ссссссадад сСсаддсСас ссСдссддсс СдсадасСса адаедасдда дсСаСддаСд СддсдСдаса саддададдд адссддааас Сссссаассс ссддсаСдсд ааадСсадса адссСасасС дасдссссСд дСассСдСдд даасададаа ааддаадсад СССдсСдсСС ааадСаССсС СсссСдСддС даадааддбд ддСасааада дассасаСсС ссададсасс аСсаддсаад сдССсСддСд даадсССсад ССаСдСссСС ассссддсад аадСССдсса сСдсдСсССд дддСддССсс Ссаддасссс ссддассаса дсаддаасас сссСдасссС ссадаадСас адааадддсс дССдсСССад адасааасаа
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1920
1980
2040 даа
2043 <210> 8 <211> 501 <212> Белок <213> Мышь домовая (Низ тизсиГиз) <400> 8
| Мес А1а 1 | Рго А1а | Ьеи Η15 Тгр Ьеи Ьеи Ьеи Тгр Уа1 (31 у Зег С1у МеС | |||||||||||||
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Ьеи | Рго | А1а | С1п | О1у | ТЬг | Н1з | Ьеи | С1у | Не | Агд | Ьеи | Рхо | Ьеи | Агд | Зег |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| С1у | Ьеи | А1а | С1у | Рго | Рго | Ьеи | С1у | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Агд | С1и | ТЬг | Азр |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| С1и | О1и | Зех | С1и | С1и | Рхо | С1у | Агд | Агд | (31у | Зег | РЬе | Уа1 | С1и | МеС | Уа1 |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Азр | Азп | Ьеи | Агд | С1у | Ьуз | Зег | С1у | С1п | С1У | Туг | Тут | Уа1 | О1и | Мес | ТЬг |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Уа1 | С1у | Зег | Рго | Рго | <31п | ТЬг | Ьеи | АЗП | Не | Ьеи | Уа1 | Азр | ТЬг | <31у | Зег |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Бег | АЗП | РЬе | А1а | Уа1 | О1у | А1а | А1а | Рго | Н13 | Рго | РЬе | Ьеи | ΗΪ8 | Агд | Туг |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Туг | С1п | Агд | С1п | Ьеи | Зег | Зег | ТЬг | Тут | Агд | Азр | Ьеи | Агд | Ьуз | С1у | Уа1 |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Тут | νβΐ | РГО | Туг | ТЬг | С1п | С1у | Ьуз | Тгр | 61и | С31у | (31и | Ьеи | О1у | ТЬг | Азр |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ьеи | νβΐ | Зег | Не | Рго | Н15 | С1у | Рго | Азп | Уа1 | ТЬг | Уа1 | Агд | А1а | Азп | Не |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| А1а | А1а | Не | ТЬг | 61и | Зег | Азр | Ьуз | РЬе | РЬе | Не | Азп | (Ну | Зег | Азп | Тхр |
- 41 009216
165 170 175
| С1и С1у Не Ьеи <31у Ьеи А1а Туг А1а С1и 11е А1а Агд Рго Аар Азр | |||||||||||||||
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Зег | Ьеи | С1и | Рго | РЬе | РЬе | Авр | Зег | Ьеи | Уа1 | Ьув | С1п | ТЬг | Нхз | 11е | Рго |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Азп | 11е | РЬе | Зег | Ьеи | <31п | Ьеи | Суз | С1у | А1а | С1у | РЬе | Рго | Ьеи | Азп | (31п |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| ТЬг | С1и | А1а | Ьеи | А1а | Зег | Уа1 | С1у | □1у | Зег | МеС | 11е | 11е | С1у | С1у | 11е |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Азр | Ηϊβ | Зег | Ьеи | Туг | ТЬг | С1у | Зег | Ьеи | Тгр | Туг | ТЬг | Рго | Не | Агд | Агд |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| С1и | Тгр | Туг | Туг | С1и | Уа1 | 11е | 11е | Уа1 | Агд | Уа1 | С1и | 11е | Авп | С1у | С1п |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Азр | Ьеи | Ьуз | Мес | Азр | Суз | Ьуз | С1и | Туг | Авп | Туг | Авр | Ьув | Зег | 11е | Уа1 |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Азр | Бег | С1у | ТЬг | ТЬг | Азп | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Ьуз | Ьув | Уа1 | РЬе | С1и | А1а |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| А1в | νβΐ | Ьуз | Зег | 11е | Ьуз | А1а | А1а | Зег | Зег | ТЬг | <31и | Ьув | РЬе | Рго | Авр |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| С1у | РЬе | Тгр | Ьеи | О1у | С1и | С1п | Ьеи | Уа1 | Сув | Тгр | С1п | А1а | □1у | ТЬг | ТЬг |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Рго | Тгр | Азп | 11е | РЬе | Рго | Уа1 | 11е | Зег | Ьеи | Туг | Ьеи | Мес | <31у | С1и | Уа1 |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| ТЫ | Азп | С1п | Зег | РЬе | Агд | 11е | ТЬг | 11е | Ьеи | Рго | С1п | (31п | Туг | Ьеи | Агд |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Рго | Уа1 | <31и | Азр | νβΐ | А1а | ТЬг | Зет | С1п | Азр | Авр | Сув | Туг | Ьув | РЬе | А1а |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Уа1 | Зег | <31П | Зег | Зег | ТЬг | <31у | ТЫ | Уа1 | Мес | <31у | А1а | Уа1 | 11е | МеС | (Пи |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| 61у | РЬе | Туг | Уа1 | νβΐ | РЬе | Авр | Агд | А1а | Агд | Ьуз | Агд | 11е | С1у | РЬе | А1а |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Уа1 | Зег | А1а | Суз | Нхз | Уа1 | Н£з | Азр | С1и | РЬе | Агд | ТЬг | А1а | А1а | νβΐ | С1и |
- 42 009216
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| О1у | Рго | РЬе | Ча1 | ТЬг | А1а | Азр | Мес | .С1и | Азр | Суз | (31у | Тут | Азп | Не | Рго |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| С1п | ТЫ | Азр | С1и | Зег | ТЬг | Ьеи | Мес | ТЬг | 11е | А1а | Туг | νβΐ | Мес | А1а | А1а |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Не | Суз | А1а | Ьеи | РЬе | Мес | Ьеи | Рго | Ьеи | Суз | Ьеи | МеС | Уа1 | Суз | С1п | Тгр |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Агд | Суз | Ьеи | Агд | Суз | Ьеи | Агд | ΗΪ8 | С1п | Нхз | Азр | Азр | РЬе | А1а | Азр | Азр |
485 490 495
Не Зег Ьеи Ьеи Ьуз
500 <210> 9 <211> 2088
| <212> ДНК <213> Человек (Ното зараепз) | ||||||
| <400> 9 | ||||||
| аСдсбдсссд | дсссддеасс | дсСссСдсСд | дссдссСдда | сддсСсдддс | дсСддаддСа | 60 |
| сссасСдабд | дСааСдсСдд | ссСдсСддсС | даассссада | ссдссасдеь | ссдеддсада | 120 |
| сСдаасаСдс | асасдаасдс | ссадааеддд | аадСдддаСС | садаСссаСс | адддассааа | 180 |
| асссдсассд | аеассаадда | аддсаСссСд | садСассдсс | аадаадссса | сссСдаасСд | 240 |
| садассасса | аСдСддсада | адссаассаа | ссадСдасса | СссадаасСд | дСдсаадсдд | 300 |
| ддссдсаадс | адСдсаадас | ссаСссссас | СССдСдаССс | ссСассдсСд | сссадссдде | 360 |
| дадСССдСаа | дсдаСдссес | СсСсдсСссс | дасаадсдса | ааССсССаса | ссаддададд | 420 |
| аСддаСдССС | дсдааасСса | ССССсасСдд | сасассдСсд | ссааададас | асдсадСдад | 480 |
| аададСасса | асССдсаСда | ссасддсаСд | Ссдссдессс | дсддааССда | саадССссда | 540 |
| ддддсададс | ссдсдсдссд | сссассддсс | даадааадСд | асааСдСдда | сссСдсСдаС | 600 |
| дсддаддадд | асдасседда | СдСССддСдд | ддсддадсад | асасадасСа | СдсадаСддд | 660 |
| адСдаадаса | аадСадсада | адСадсадад | даддаадаад | СддоСдаддС | ддаадаадаа | 720 |
| даадссдаСд | асдасдадда | сдаСдаддаС | ддСдаСдадд | Сададдаада | ддссдаддаа | 780 |
| сссСасдаад | аадссасада | дадаассасс | адсассдсса | ссассассас | сассассаса | 840 |
| дадсссдсдд | аададдсддс | есдадссосс | асаасадсад | ссадСасссс | СдаСдссдСС | 900 |
| дасаадСаСс | Ссдадасасс | сддддасдад | аасдаасасд | сссаСССеса | дааадссааа | 960 |
| дададдсссд | аддссаадса | ссдададада | аСдСсссадд | Сеасдадада | асдддаадад | 1020 |
| дсадаасдСс | аадсааадаа | сССдссСааа | дсСдаСаада | аддсадССаС | осадсасссс | 1080 |
| саддадааад | сддаасессс | ддаасаддаа | дсадссаасд | ададасадса | дссддсддад | 1140 |
| асасасасдд | ссададсдда | адссаСдсСс | аасдассдсс | дссдсссддс | сссддадаас | 1200 |
| СасаСсассд | ссссдсаддо | СдССсеСссС | сддссСсдСс | асдСдССсаа | СаСдсСааад | 1260 |
| аадСасдссс | дсдсадааса | дааддасада | садсасассс | СааадсаССС | сдадсаедсд | 1320 |
| сдсасддСдд | аСсссаадаа | адссдсесад | аСссддсссс | аддссаСдас | асассСссдс | 1380 |
| дсдасссасд | адсдсасдаа | ссадсссссс | СсссСдсгсс | аеаасдСдсс | Сдсадсддсс | 1440 |
- 43 009216 даддадаЕЕс аддаЕдаадг сдаЕдадсЕд сЕСсадааад адсаааасса ЕЕсадасдас 1500 дЕсССддсса асасдаСЕад Едаассаадд агсадССасд дааасдаЕдс ЕсЕсаЕдсса 1560 ЕссЕСдассд ааасдаааас сассдЕддад сЕссЕЕСссд ЕдааЕддада дЕЕсадсссд 1620 дасдаЕсссс адссдсддса СЕспЕЕЕддд дсСдасЕсЕд Едссадссаа сасадаааас 1680 даадссдадс сЕдсЕдаСдс ссдсссЕдсС дссдассдад дасЕдассас Есдассаддс 1740 ксЕдддЕЕда саааСаЕеаа дасддаддад аЕсЕсЕдаад Едаадасдда сдсадааеес 1800 сдасаЕдасг саддасагда адЕЕсаесас саааааегдд ЕдЕЕссЕЕдс адаадасдЕд 1860 ддсссаааса ааддЕдсааС саЕСддассс аЕддЕдддсд дЕдЕЕдЕсаЕ адсдасадЕд 1920 аЕсдЕсаЕса ссЕЕддЕдаЕ дсЕдаадаад ааасадсаса саЕссаЕЕса ЕсаЕддСдСд 1980 дЕддаддсЕд асдссдсЕдС сассссадад дадсдссасс ЕдЕссаадаЕ дсадсадаас 2040
| ддсЕасдааа аессаассЕа саадЕЕсЕЕС дадсадаЕдс адаасЕад | 2088 | ||
| <210> | 10 | ||
| <211> | 695 | ||
| <212> | Белок | ||
| <213> | Человек {Ното | зархепз) | |
| <400> | 10 |
| МеЕ Ьеи Рго <31 у Ьеи | А1а Ьеи | Ьеи Ьеи | Ьеи А1а А1а Тгр ТЫ А1а | Агд | |||||||||||
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| А1а | Ьеи | С1и | Уа1 | Рго | ТЫ | Азр | 01у | Азп | А1а | С1у | Ьеи | Ьеи | А1а | С1и | Рго |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| С1П | Не | А1а | МеЕ | РЬе | Суз | С1у | Агд | Ьеи | Ляп | Мес | Ηίβ | МеЕ | Авп | Уа1 | <31п |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| АЗП | С1у | Ьуз | Тгр | Азр | Зег | Азр | Рго | Зег | <Э1у | ТЬг | Ьуз | ТЬг | Суз | Не | Азр |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| ТЬг | Ьуз | С1и | С1у | Не | Ьеи | С1п | Туг | Суз | С1п | <31и | νβΐ | Туг | Рго | С1и | Ьеи |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| С1п | Не | ТЬг | Азп | Уа1 | Уа1 | <31и | А1а | Азп | <31п | Рго | Уа1 | ТЫ | Не | 61п | Азп |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Тгр | Суз | Ьуз | Агд | С1у | Агд | Ьуз | С1п | Суз | Ьуз | ТЫ | ΗΪ3 | Рго | Н1з | РЬе | Уа1 |
| 100 | 105 | НО | |||||||||||||
| Не | Рго | туг | Агд | Суз | Ьеи | νβΐ | С1у | С1и | РЬе | Уа1 | Зег | Азр | А1а | Ьеи | Ьеи |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Уа1 | Рго | Азр | Ьуз | Суз | Ьуз | РЬе | Ьеи | Н15 | С1п | С1и | Агд | МеЕ | Азр | ν«ι | Суз |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| (31и | ТЬг | ΗΪ8 | Ьеи | Ηίβ | Тгр | Ηίβ | ТЫ | Уа1 | А1а | Ьуз | О1и | ТЫ | Суз | Зег | С1и |
| 145 | 150 | 155 | 160 |
| Ьув | Зег | ТЬг | Азп Ьеи 165 | Ηίβ Азр Туг С1у Мес Ьеи Ьеи Рго Суз О1у 11е | |||||||||||
| 170 | 175 | ||||||||||||||
| Аар | Ьув | РЬе | Агд | С1у | Уа1 | С1и | РЬе | Уа1 | Суз | Суз | Рго | Ьеи | А1а | С1и | С1и |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Зег | Азр | Азп | Уа1 | Азр | Зег | А1а | Азр | А1а | <31и | С1и | Азр | Азр | Зег | Азр | Уа1 |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Тгр | Тгр | С1у | 01у | А1а | Авр | ТЬг | Азр | ТуГ | А1а | Азр | (31у | Зег | С1и | Азр | Ьуз |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Уа1 | Уа1 | С1и | Уа1 | А1а | СЯи | С1и | С1и | С1и | Уа1 | А1а | <31и | Уа1 | С1и | С1и | С1и |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| С1и | А1а | Азр | Авр | Азр | (31и | Азр | Авр | О1и | Азр | С1у | Азр | С1и | Уа1 | С1и | С1и |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| (31и | А1а | С1и | 01и | Рго | Туг | <31и | С1и | А1а | ТЬг | С1и | Агд | ТЬг | ТЬг | Зег | Не |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| А1а | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | С1и | Зег | Уа1 | С1и | С1и | Уа1 | Уа1 | Агд |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| ν*1 | Рго | ТЬг | ТЬг | А1а | А1а | Зег | ТЬг | Рго | Авр | А1а | ν<1 | Азр | Ьуз | Туг | Ьеи |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| <31и | ТЬг | Рго | С1у | Азр | С1и | Азп | С1и | ΗΪ3 | А1а | Н1з | РЬе | С1п | Ьуз | А1а | Ьуз |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| <31и | Агд | Ьеи | С1и | А1а | Ьуз | ΗΪ3 | Агд | С1и | Агд | Мее | Зег | αΐη | Уа1 | Мее | Агд |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| 01и | Тгр | С1и | С1и | А1а | С1и | Агд | О1П | А1а | Ьуз | Азп | Ьеи | Рго | Ьу® | А1а | Азр |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ьув | Ьуз | А1а | νβΐ | Не | 31п | ΗΪ3 | РЬе | С1п | С1и | Ьуз | Уа1 | С1и | Зег | Ьеи | С1и |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| 01п | <31и | А1а | А1а | Азп | С1и | Агд | С1п | <31п | Ьеи | ν&1 | С1и | ТЬг | ΗΪ3 | мее | А1а |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Агд | Уа1 | С1и | А1а | Мее | Ьеи | Азп | Азр | Агд | Агд | Агд | Ьеи | А1а | Ьеи | С1и | Азп |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Туг | Не | ТЬг | А1а | Ьеи | <31п | А1а | Уа1 | Рго | Рго | Агд | Рго | Агд | Ηίβ | Уа1 | РЬе |
| 405 | 410 | 415 |
- 45 009216
| Азп МеС Ьеи Ьув Ьуз Туг Уа1 Агд А1а С1и С1п Ьуз Азр Агд С1п Нхз | |||||||||||||||
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| ТЬг | Ьеи | Ьуз | Нхз | РЬе | С1и | Нхз | Уа1 | Агд | МеС | Уа1 | Азр | Рго | Ьуз | Ьуз | А1а |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| А1а | С1п | Не | Агд | Бег | С1п | иа1 | Мес | ТЬг | Нхз | Ьеи | Агд | Уа1 | Не | Туг | С1и |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Агд | МеС | АЗП | С1п | Бег | Ьеи | Бег | Ьеи | Ьеи | Туг | Азп | Уа1 | Рго | А1а | Уа1 | А1а |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| С1и | С1и | Не | С1п | Азр | С1и | Уа1 | Азр | С1и | Ьеи | Ьеи | С1п | Ьуз | С1и | С1п | Азп |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Туг | Бег | Азр | Авр | Уа1 | Ьеи | А1а | Азп | МеС | 11е | Бег | <31и | Рго | Агд | Не | Бег |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Туг | С1у | Азп | Азр | А1а | Ьеи | Мес | Рго | Бег | Ьеи | ТЫ | О1и | ТЫ | Ьуз | ТЬг | ТЫ |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| νβΐ | 01и | Ьеи | Ьеи | Рго | Уа1 | Азп | С1у | 01 и | РЬе | Бег | Ьеи | Азр | Азр | Ьеи | С1п |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Рго | Тгр | Нхз | Бет | РЬе | (31у | А1а | Азр | Бег | Уа1 | Рго | А1а | Азп | ТЫ | <Э1и | Азп |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| <31 и | Уа1 | С1и | Рго | Уа1 | Азр | А1а | Агд | Рго | А1а | А1а | Азр | Агд | С1у | Ьеи | ТЬг |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| ТЫ | Агд | Рго | 01у | Бег | С1у | Ьеи | ТЬг | Азп | Не | Ьуз | ТЬг | С1и | С1и | Не | Бег |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| С1и | Уа1 | Ьуз | Мес | Азр | А1а | С1и | РЬе | Агд | Нхз | Азр | Бег | С1у | Туг | С1и | Уа1 |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Нхз | Нхз | С1п | Ьуз | Ьеи | Уа1 | РЬе | РЬе | А1а | <31и | Азр | Уа1 | С1у | Бег | Азп | Ьуз |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| 01у | А1а | Не | Не | С1у | Ьеи | Мес | Уа1 | (31у | С31у | νβΐ | Уа1 | Не | А1а | ТЬг | νβΐ |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Не | 7а1 | Не | ТЬг | Ьеи | νβΐ | Мес | Ьеи | Ьуз | Ьуз | Ьуз | 61п | Туг | ТЫ | Бег | Не |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| ΗΪ5 | Нхз | С1у | Уа1 | Уа1 | С1и | Уа1 | Азр | А1а | А1а | Уа1 | ТЫ | Рго | С1и | 61и | Агд |
660 665 670
- 46 009216
| ΗΪ5 | Ьеи 5ег Ьуз МеЕ С1п 61п Азп С1у Туг С1и Азп Рго ТЫ Туг Ьуз | ||
| 675 | 680 | 685 | |
| РЬе | РЬе (31и С1п МеС | С1п Азп | |
| 4 | 690 | 695 |
| <210> | 11 |
| <211> | 2088 |
| <212> | ДНК |
| <213> | Человек (Ното зар±епз) |
| <400> | 11 |
аЕдсЕдсссд дЕЕЕддсасЕ дсЕссЕдсЕд дссдссЕдда сддсЕсдддс дссддаддЕа 60 сссасЕдаЕд дЕааЕдсЕдд ссЕдсЕддсЕ даассссада ЕЕдссаЕдЕЕ сЕдЕддсада 120 сЕдаасаЕдс асаЕдааЕдЕ ссадааЕддд аадЕдддаСЕ садаЕссаЕс адддассааа 180 ассЕдсаЕЕд аСассаадда аддсаСссСд садЕаСЕдсс аадаадЕсЕа сссЕдаасЕд 240 садаЕсасса аЕдгддЕада адссаассаа ссадсдасса ЕссадаасЕд дСдсаадсдд 300 ддссдсаадс адСдсаадас ссаСссссас сссдсдассс ссЕассдсСд сссадссддс 360 дадСЕЕдЕаа дЕдаСдсссЕ ЕсЕсдЕЕссЕ дасаадЕдса ааСЕсЕЕаса ссаддададд 420 асддаЕдЕЕЕ дсдааасЕса ЕсЕЕсасЕдд сасассдгсд ссааададас аСдсадСдад 480 дададЕасса асЕЕдсаЕда сЕасддсаЕд ЕЕдссдсссЕ дсддааЕЕда саадсЕссда 540 ддддЕададС ЕЕдЕдЕдСЕд сссасЕддсЕ даадааадЕд асааЕдЕдда ЕЕсЕдсЕдаЕ 600 дсддаддадд аЕдасЕсдда ЕдЕсЕддСдд ддсддадсад асасадасЕа Едсадасддд 660 адЬдаадаса аадсадеада адСадсадад даддаадаад Еддссдаддс ддаадаадаа 720 даадесдаед аЕдасдадда сдасдаддас ддСдаСдадд Сададдаада ддсЕдаддаа 780 сссЕасдаад аадссасада дадаассасс адсаЕЕдсса ссассасоас сассассаса 840 дадСссдсдд аададдСддС СсдадССссС асаасадсад ссадСасссс СдаСдссдсс 900 дасаадбаСс Ссдадасасс ЕддддаСдад ааСдаасаСд сссаСССсеа дааадссааа 960 дададдсЕЕд аддссаадса ссдададада аСдСсссадд ЕсаЕдадада аедддаадад 1020 дсадаасдСс аадсааадаа сЕЕдссЕааа дсЕдаСаада аддсадСЕаЕ ссадсаЕЕЕС 1080 саддадааад СддааСсССС ддаасаддаа дсадссаасд ададасадса дсЕддСддад 1140 асасасаедд ссададсдда адссаЕдсес ааЕдассдсс дссдссЕддс ссЕддадаас 1200 ЕасаЕсассд сСсСдсаддс СдССссСссС сддссссдСс асдсдССсаа сасдссааад 1260 аадЕаЕдЕсс дсдсадааса дааддасада садсасассс СааадсаССС сдадсаСдСд 1320 сдсаЕддЕдд аСсссаадаа адссдсСсад аессддСссс аддСЕаЕдас асассЕссдЕ 1380 дСдаСссасд адсдсасдаа СсадСсСсСс СсссСдсСсС асаасдСдсс СдсадСддсс 1440 даддадаЕЕс аддаЕдаадЕ сдасдадссд сЕЕсадааад адсаааасСа ЕЕсадаЕдас 1500 дСсЕЕддсса асаЕдаСЕад Едаассаадд аЕсадЕЕасд дааасдаЕдс ЕсЕсаЕдсеа 1560 ЕсЕЕЕдассд ааасдаааас сассдЕддад сЕссЕЕсссд ЕдааСддада дЕЕсадссЕд 1620 дасдаЕсСсс адесдеддса ЕЕсЕЕЕЕддд дсЕдасЕсЕд Едссадссаа сасадаааас 1680 даадЕЕдадс сЕдСЕдаедс ссдсссЕдсЕ дссдассдад даседассас ЕсдассаддЕ 1740 ЕссдддЕЕда саааЕассаа даеддаддад аСсСседаад СдааСсСдда сдсадааССс 1800 сдасаЕдасс саддасаеда адЕЕсаЕсаЕ саааааЕЪдд сдЕЕсЕЕЕдс адаадасдЕд 1860 ддЕСсаааса ааддЕдсааС саЕСддасСс аеддЕдддед дсдссдсеас адсдасадЕд 1920 аЕсдЕсаЕса ссЕЕддЕдаЕ дсЕдаадаад ааасадсаса саЕссаСЕса ЕсаЕддЕдЕд 1980 дЕддаддСЕд асдссдсСдС сассссадад дадедссасс ЕдСссаадаЕ дсадсадаас 2040 ддсЕасдааа аЕссаассЕа саадСЕсССС дадсадаЕде адаасЕад 2088
- 47 009216 <210> 12 <211> 695 <212> Белок <213> Человек (Ното аарл-Впе) <400> 12
| МеЕ Ьеи Рго С1у Ьеи А1а Ьеи Ьеи Ьеи Ьеи А1а А1а Тгр ТЬг А1а | Агд | ||||||||||||||
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| А1а | Ьеи | 01 и | Уа1 20 | РГО | ТЫ | Азр | С1у | Азп 25 | А1а | С1у | Ьеи | Ьеи | А1а 30 | 01 и | Рго |
| С1п | 11е | А1а 35 | МеЕ | РЬе | Сув | О1у | Агд 40 | Ьеи | Азп | МеЕ | Ηΐε | МеЕ 45 | АЗП | Уа1 | С1п |
| Азп | С1у 50 | Ьуз | Тгр | Азр | Зег | А5Р 55 | Рго | Зет | <Э1у | ТЫ | Ьуз 60 | ты | Суз | Не | Азр |
| ТЫ 65 | Ьуз | С1и | 51у | Не | Ьеи 70 | С1п | Туг | Суз | 01п | С1и 75 | νβΐ | Тут | Рго | С1и | Ьеи 80 |
| 01 η | Не | ТЬг | Азп | νβΐ 85 | Уа1 | С1и | А1а | Азп | <31п 90 | Рго | νβΐ | ТЫ | Не | С1п 95 | Азп |
| Тгр | Суз | Ьуз | Агд С1у 100 | Агд | Ьуз | С1п | Суз 105 | Ьув | ты | Ηίβ | Рго | Ηίβ но | РЬе | Уа1 | |
| Не | РГО | Туг 115 | Агд | Суз | Ьеи | ν»1 | б1у 120 | 61и | РЬе | Уа1 | Зег | АЗр 125 | А1а | Ьеи | Ьеи |
| ν«ι | Рго 130 | Азр | Ьуз | Суз | Ьуз | РЬе 135 | Ьеи | ΗΪ5 | С1п | С1и | Агд 140 | МеЕ | Азр | Уа1 | Суз |
| <31 и 145 | ТЫ | Н1з | Ьеи | ΗΪ3 | Тгр 150 | Н13 | ТЬг | Уа1 | А1а | Ьуз 155 | (31и | ТЫ | Сув | Зег | С1и 160 |
| Ьуз | Зег | ТЬг | Азп | Ьеи 165 | ΗΪ3 | Азр | Туг | <31у | МеЕ 170 | Ьеи | Ьеи | Рго | Суз | С1у 175 | Не |
| Азр | Ьуз | РЬе | Агд 180 | (31у | Уа1 | <31и | РЬе | Уа1 185 | Суз | Суз | Рго | Ьеи | А1а 190 | С1и | С1и |
| 5ег | Азр | Азп 195 | ν»ι | Азр | Зег | А1а | Азр 200 | А1а | С1и | С1и | Азр | Азр 205 | Зег | Азр | νβΐ |
| Тгр | Тгр 210 | С1у | С1у | А1а | Азр | ТЫ 215 | Азр | Туг | А1а | Азр | С1У 220 | Зег | О1и | Азр | Ьуз |
- 48 009216
| Уа1 Уа1 С1и 225 | Уа1 | А1а С1и О1и С1и <31 и Уа1 А1а | С1и | ν·ι | <31и <31и | С1и 240 | |||||||||
| 230 | 235 | ||||||||||||||
| О1и | А1а | Азр | Азр | Азр | С1и | Азр | Азр | С1и | Азр | С1у | Авр | С1и | Уа1 | С1и | (Пи |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| С1ц | А1а | С1и | С1и | Рго | Туг | С1и | <31и | А1а | ТЬг | <31 и | Агд | ТЬг | ТЬг | 5ег | Не |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| А1а | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | С1и | 5ег | Уа1 | <31 и | С1и | Уа1 | Уа1 | Агд |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| ν&ι | Рго | ТЬг | ТЬг | А1а | А1а | 5ег | ТЬг | Рго | Азр | А1а | Уа1 | Авр | Буа | Туг | Беи |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| С1и | ТЬг | Рго | С1у | Азр | С1и | Азп | <31 и | Ηίβ | А1а | Ηίβ | РЬе | С1п | Буз | А1а | Буз |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| С1и | Агд | Беи | С1и | А1а | Буз | Ηίβ | Агд | С1и | Агд | МеЪ | 5ег | С1п | Уа1 | Меъ. | Агд |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| С1и | Тгр | С1и | 01и | А1а | С1и | Агд | С1п | А1а | Був | Азп | Беи | Рго | Був | А1а | Авр |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Буз | Буе | А1а | Уа1 | Не | 01п | Ηίβ | РЬе | С1п | С1и | Буз | Уа1 | С1и | £ег | Беи | С1и |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| С1п | С1и | А1а | А1а | Азп | <31и | Агд | 01» | 61п | Беи | Уа1 | <31 и | ТЬг | ΗΪ3 | Мес | А1а |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Агд | Уа1 | (31и | А1а | МеЪ | Беи | АЗП | Азр Агд | Агд | Агд | Беи | А1а | Беи | <31и | Азп | |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Туг | Не | ТЬг | А1а | Беи | С1п | А1а | Уа1 | Рго | Рго | Агд | Рго | Агд | Ηίβ | Уа1 | РЬе |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Аап | МеЪ | Беи | Буз | Буз | Туг | Уа1 | Агд | А1а | С1и | С1п | Буз | Азр | Агд | (31п | Ηίβ |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| ТЬг | Беи. | Буз | Ηίβ | РЬе | С1и | Ηίβ | Уа1 | Агд | Меъ | Уа1 | Азр | РГО | Буз | Буз | А1а |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| А1а | ΰΐη | Не | Агд | 5ег | С1п | Уа1 | Меь | ТЬг | Ηίβ | Беи | Агд | Уа1 | 11е | Туг | 01и |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Агд | МеЪ | Азп | 01п | Бег | Беи | 5ег | Беи | Беи | Туг | Азп | Уа1 | Рго | А1а | Уа1 | А1а |
465 470 475 480
- 49 009216
| С1и С1и | Не | С1п Азр 485 | <31 и Уа1 Азр С1и Ьеи Ьеи С1п Ьуз С1и С1п Азп | ||||||||||||
| 490 | 495 | ||||||||||||||
| Туг | Зег | Азр | Азр | Уа1 | Ьеи | А1а | АЗП | МеС | Не | Зет | С1и | Рго | Агд | Не | Зег |
| * | 500 | 505 | 510 | ||||||||||||
| Туг | С1у | Азп | Азр | А1а | Ьеи | Мес | Рго | Бег | Ьеи | ТЬг | 61и | ТЬг | Ьуз | ТЬг | ТЬг |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ча1 | С1и | Ьеи | Ьеи | Рго | Уа1 | Азп | С1у | 61и | РЬе | Зег | Ьеи | Азр | Азр | Ьеи | 01п |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Рго | Тгр | Ηίβ | Зег | РЬе | С1у | А1а | Азр | Бег | Ча1 | Рго | А1а | Азп | ТЬг | С1и | Азп |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| С1и | Уа1 | С1и | Рго | Уа1 | Азр | А 1а | Агд | Рго | А1а | А1а | Азр | Агд | С1у | Ьеи | ТЬг |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| ТЬг | Агд | Рго | С1у | Бег | О1у | Ьеи | ТЬг | Азп | Не | Ьуз | ТЬг | С1и | 61и | Не | Зег |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| С1и | Уа1 | Азп | Ьеи | АЗр | А1а | 61 и | РЬе | Агд | ΗΪ3 | АЗр | Зег | С1у | Туг | С1и | Ча1 |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Н1з | Ηίβ | (31п | Ьуз | Ьеи | Уа1 | РЬе | РЬе | А1а | С1и | Азр | Ча1 | <31у | Зег | Азп | Ьуз |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| С1у | А1а | 11е | Не | С1у | Ьеи | мес | Ча1 | С1у О1у | Ча1 | Ча1 | Не | А1а | ТЬг | ν«1 | |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Не | Уа1 | Не | ТЬг | Ьеи | УаХ | МеС | Ьеи | Ьуз | Ьуз | Ьуз | <31п | Туг | ТЬг | Зег | Не |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Ηίβ | Ηίε | <31у | Уа1 | Уа1 | С1и | Ча! | Азр | А1а | А1а | Ча1 | ТЬг | Рго | 01и | <31и | Агд |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Ηίβ | Ьеи | Зег | Ьуз | Мес | С1п | 61п | Азп | <31у | Туг | 61и | АЗП | Рго | ТЬг | Туг | ьуз |
| 675 | 680 | 685 |
РЬе РЬе С1и 61п МеС С1п Азп
690 695 <210> 13 <211> 2088 <212> ДНК <213> Человек (Ново зар1епз)
- 50 009216 <400> 13
| аЕдсЕдссед дййЕддсасй дсйссйдсйд дссдссйдда сддсЕсдддс дсЕддаддЕа 60 | ||||||
| сссасйдайд | дйаайдсйдд | ссйдсйддсс | даассссада | ЕйдссайдЕй | сйдйддсада | 120 |
| сЕдаасасдс | асаЕдааЕдЕ | ссадаайддд | аадЕдддайй | садайссайс | адддассааа | 180 |
| ассЕдсаЕЕд | айассаадда | аддсайссйд | садЕаййдсс | аадаадйсйа | сссйдаасйд | 240 |
| садайсасса | айдйддйада | адссаассаа | ссадйдасса | ЕссадаасЕд | дйдсаадсдд | 300 |
| ддссдсаадс | адйдсаадас | ссайссссас | ййЕдйдаййс | СсЕассдсЕд | сййадййддй | 360 |
| дадйййдйаа | дЕдаЕдсссЕ | ЕсйсдЕйссй | дасаадйдса | ааЕЕОЕЕаСа | ссаддададд | 420 |
| айддайдййй | дсдааасЕса | йсййсасйдд | сасассдйсд | ссааададас | айдсадйдад | 480 |
| аададйасса | асЕЕдсаЕда | ссасддсайд | ййдсйдсссй | дсддаайЕда | саадйЕссда | 540 |
| ддддйададС | ййдЕдсдййд | сссасЕддсЕ | даадааадйд | асаайдйдда | ййсйдсйдай | 600 |
| деддаддадд | айдасйсдда | йдЕсйддйдд | ддсддадсад | асасадасйа | йдсадайддд | 660 |
| адйдаадаса | аадЕадСада | адЕадсадад | даддаадаад | ЕддсЕдаддЕ | ддаадаадаа | 720 |
| даадссдайд | айдасдадда | сдайдаддай | ддйдайдадд | Еададдаада | ддсйдаддаа | 780 |
| сссЕасдаад | аадссасада | дадаассасс | адсаййдсса | есассассас | сассассаса | 840 |
| дадЕсЕдЕдд | аададдйддЕ | йсдадййссй | асаасадсад | ссадЕасссс | йдайдссдйй | 900 |
| дасаадЕаЕс | Есдадасасс | Еддддайдад | аайдаасайд | сссаЕЕЕсса | дааадссааа | 960 |
| дададдсЕЕд | аддссаадса | ссдададада | айдйсссадд | ЕсаЕдадада | айдддаадад | 1020 |
| дсадаасдЕс | аадсааадаа | сЕйдссйааа | дсйдайаада | аддсадйЕаЕ | ссадсайййс | 1080 |
| саддадааад | ЕддааЕсЕЕЕ | ддаасаддаа | дсадссаасд | ададасадса | дсйддйддад | 1140 |
| асасасаЕдд | ссададйдда | адссайдсйс | аайдассдсс | дссдссЕддс | ссйддадаас | 1200 |
| ЕасаЕсассд | СЕсЕдсаддс | ЕдЕЕссЕссй | сддссйсдйс | асдйдЕЕсаа | йайдсйааад | 1260 |
| аадйайдйсс | дсдсадааса | дааддасада | садсасассс | ЕааадсаЕЕЕ | сдадсайдйд | 1320 |
| сдсаЕддЕдд | айсссаадаа | адссдсЕсад | аЕссддЕссс | аддЕЕаЕдас | асассйседй | 1380 |
| дЕдаЕЕЕаЕд | адсдсайдаа | йсадйсйсйс | йсссйдсйсй | асаасдйдсс | йдсадйддсс | 1440 |
| даддадаййс | аддайдаадй | йдайдадсйд | сййсадааад | адсаааасйа | ййсадайдас | 1500 |
| дЕсЕЕддсса | асайдаЕйад | Едаассаадд | айсадййасд | дааасдайдс | йсйсайдсса | 1560 |
| йсйййдассд | ааасдаааас | сассдйддад | сйссййсссд | йдаайддада | дййсадссйд | 1620 |
| дасдаЕсЕсс | адссдйддса | ЕЕсЕЕЕЕддд | дсйдасссйд | Едссадссаа | сасадаааас | 1680 |
| даадЕйдадс | ейдййдайдс | ссдсссйдсй | дссдаесдад | дасЕдассас | йсдассаддй | 1740 |
| йсйдддййда | сааайайсаа | дасддаддад | айсйсйдаад | Едаадайдда | йдсадааййс | 1800 |
| сдасаЕдасЕ | саддайайда | адЕЕсайсай | саааааЕйдд | ЕдййсЕйЕдс | адаадайдйд | 1860 |
| ддЕЕсаааса | ааддйдсаай | саййддасйс | айддйдддсд | дЕдййдйсаЕ | адсдасадйд | 1920 |
| айсйссайса | ссйЕддЕдаЕ | дсЕдаадаад | ааасадЕаса | саЕссаЕЕса | Есайддйдйд | 1980 |
| дйддаддЕЕд | асдссдсйдй | сасессадад | дадсдссасс | ЕдЕссаадай | дсадсадаас | 2040 |
| ддсйасдааа | айссаассйа | саадЕБсЕЕЕ | дадсадайдс | адаасйад | 2088 | |
| <210> 14 | ||||||
| <211> 695 | ||||||
| <212> Белок | ||||||
| <213> Человек (Ното | аархепз) |
<400* 14
МеЕ Ьеи Рго <51у Ьеи А1а Ьеи Ьеи Ьеи Ьеи А1а А1а Тгр ТЬг А1а Агд 15 10 15
А1а Ьеи С1и Уа1 Рго Пит Аар С1у Аап А1а 01у Ьеи Ьеи А1а С1и Рго
- 51 009216
25 30
| 61п Не | А1а МеЕ РЬе Суз С1у Агд Ьеи Азп МеЕ Н1з МеЕ Азп Уа1 С1п | ||||||||||||||
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Азп | 61у | Ьуз | Тгр | Азр | 2ег | Азр | Рго | Бег | 61у | ТЬг | Ьув | ТЬг | Суз | 11е | Азр |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| ТЬг | Ьуз | 61и | С1у | Не | Ьеи | 61п | Туг | Суз | С1п | С1и | ν*1 | Туг | рго | С1и | Ьеи |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| 61п | 11е | ТЬГ | Азп | Уа1 | Уа1 | 61и | А1а | Авп | 61п | Рго | Уа1 | ТЬг | 11е | С1п | Азп |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Тгр | Суз | Ьуз | Агд | 61у | Агд | Ьуз | С1п | Суз | Ьуз | ТЬг | Ηίε | Рго | ΗΪ8 | РЬе | Уа1 |
| 100 | 105 | но | |||||||||||||
| Не | Рго | Туг | Агд | Суз | Ьеи | Уа1 | 61у | 61и | РЬе | Уа1 | Бег | АЗр | А1а | Ьеи | Ьеи |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Уа1 | Рго | Азр | Ьув | Суз | Ьуз | РЬе | Ьеи | ΗΪ5 | (31п | (31и | Агд | МеЕ | Азр | Уа1 | Суз |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| С1и | ТЬг | Н1з | Ьеи | ΗΪ3 | Тгр | Нхз | ТЬг | Уа1 | А1а | Ьуз | С1и | ТЬг | Суз | Бег | (31 и |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ьув | Зег | ТЬг | Азп | Ьеи | ΗΪ3 | Азр | Тух | С1у | МеЕ | Ьеи | Ьеи | Рго | Суз | 61у | 11е |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Азр | Ьуз | РЬе | Агд | С1у | Уа1 | С1и | РЬе | Уа1 | Суз | Суз | Рго | Ьеи | А1а | 61и | 61и |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| 5ег | Азр | Азп | Уа1 | Азр | Бег | А1а | Азр | А1а | С1и | С1и | Азр | Азр | Бег | Азр | Уа1 |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Тгр | Тгр | С1у 61у | А1а | Азр | ТЬг | Азр | Туг | А1а | Азр | 61у | Бег | 61и | Азр | Ьуз | |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Уа1 | Уа1 | С1и | Уа1 | А1а | <31 и | 61и | С1и | С1и | Уа1 | А1а | 61и | Уа1 | <31 и | <31и | 61и |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| С1и | А1а | Азр | Азр | Азр | (31и | Азр | Азр | С1и | Азр | 61у | Азр | 61ц | Уа1 | 61и | С1и |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| 61ц | А 1а | С1и | 61и | Рго | Тут | 6111 | 61и | А1а | ТЬг | С1и | Агд | ТЬг | ТЬг | Зег | 11е |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| А1а | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | С1и | Бег | Уа1 | 61и | С1и | Уа1 | Уа1 | Агд |
- 52 009216
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| УаХ | Рго | ты | ТЬг | А1а | А1а | Зег | ТЫ | Рго | Азр | АХа | Уа1 | Азр | Ьуз | Туг | Ьеи |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| ТЫ | Рго | С1у | Азр | ОХи | АЗП | ОХи | Ηίβ | А1а | Нхз | РЬе | <31п | Ьуз | А1а | ьуз | |
| 305 | 310 | 3X5 | 320 | ||||||||||||
| С1и | Агд | Ьеи | С1и | АХа | Ьуз | Ηίβ | Агд | О1и | Агд | МеЕ | Зег | С1п | УаХ | МеЕ | Агд |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| С1и | Тгр | СХи | СХи | АХа | С1и | Агд | С1П | А1а | Ьуз | Азп | Ьеи | Рго | Ьуз | А1а | Азр |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ьуз | Ьуз | А1а | Уа1 | 11е | С1п | Ηίβ | РЬе | С1п | С1и | Ьуз | Уа1 | ОХи | Бег | Ьеи | 01и |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| С1п | СХи | АХа | А1а | Азл | С1и | Агд | ОХп | С1п | Ьеи | УаХ | С1и | ТЫ | ΗΪ3 | МеЕ | А1а |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Агд | Уа1 | СХи | А1а | МеЕ | Ьеи | АЗП | Азр | Агд | Агд | Агд | Ьеи | АХа | Ьеи | СХи | Азп |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Туг | Не | ТЬг | А1а | Ьеи | С1п | А1а | Уа1 | Рго | Рго | Агд | Рго | Агд | Ηίβ | Уа1 | РЬе |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Азп | МеЕ | Ьеи | Ьуз | Ьуз | Туг | УаХ | Агд | АХа | С1и | СХп | Ьуз | Азр | Агд | СХп | Ηίβ |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| ТЬг | Ьеи | Ьуз | НХз | РЬе | С1и | Нхз | УаХ | Агд | МеЕ | Уа1 | Азр | Рго | Ьуз | Ьуз | А1а |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| А1а | СХп | Не | Агд | Зег | С1п | Уа1 | МеЕ | ТЫ | Ηίβ | Ьеи | Агд | Уа1 | 1Хе | туг | СХи |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Агд | МеЕ | Азп | С1п | Зег | Ьеи | Зег | Ьеи | Ьеи | Туг | Азп | Уа1 | Рго | А1а | УаХ | А1а |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| СХи | С1и | Не | С1п | Азр | СХи | Уа1 | Азр | С1и | Ьеи | Ьеи | С1п | Ьуз | С1и | С1п | Азп |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Туг | Зег | Азр | Азр | УаХ | Ьеи | А1а | Азп | МеЕ | Не | Зег | С1и | Рго | Агд | Не | 5ег |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Туг | С1у | Азп | Азр | А1а | Ьеи | МеЕ | Рго | Зег | Ьеи | ТЫ | О1и | ТЬг | Ьуз | ТЫ | ТЫ |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| УаХ | С1и | Ьеи | Ьеи | Рго | Уа1 | Азп | О1у | ОХи | РЬе | Зег | Ьеи | Азр | Азр | Ьеи | С1п |
- 53 009216
| 530 | 535 | ||||||
| Рго 545 | Тгр | ΗΪ3 | Зег | РЬе | С1у 550 | А1а | Авр |
| С1и | Уа1 | С1и | Рго | Уа1 565 | Азр | А1а | Агд |
| ТЫ | Агд | Рго | О1у 580 | Зег | О1у | Ьеи | ТЬг |
| О1и | νβΐ | Ьув 595 | мее | Азр | А1а | С1и | РЬе 600 |
| Н1з | Ηϊε 610 | С1п | Ьув | Ьеи | Уа1 | РЬе 615 | РЬе |
| С1у 625 | А1а | Не | Не | 61у | Ьеи 630 | МеС | Уа1 |
| Не | РЬе | Не | ТЬг | Ьеи 645 | Уа1 | мес | Ьеи |
| Ηϊβ | ΗΪ5 | С1у | Уа1 660 | Уа1 | С1и | ν«1 | Азр |
| Нхз | Ьеи | Зег 675 | Ьуз | Мее | С1п | С1п | Азп 680 |
| РЬе | РЬе 690 | С1и | С1п | МеС | <31п | Азп 695 | |
| <210> 15 <211> 2094 <212> ДНК <213> Человек | (Ногао зархепз) |
<400> 15
540
| Зег | Уа1 | Рго 555 | А1а | АЗП | ТЬг | (31и | Азп 560 |
| Рго | А1а 570 | А1а | Азр | Агд | О1у | Ьеи 575 | ТЬг |
| Азп 585 | Не | Ьуз | ТЬг | С1и | С1и 590 | 11е | Зег |
| Агд | ΗΪ3 | Азр | Зег | С1у 605 | Туг | <31и | Уа1 |
| А1а | С1и | Азр | Уа1 620 | С1у | Зег | Азп | Ьуз |
| <31у | С1у | Уа1 635 | V»! | Не | А1а | ТЫ | Уа1 640 |
| Ьуз | Ьуз 650 | Ьуз | С1п | Туг | ТЬг | Зег 655 | Не |
| А1а 665 | А1а | Уа1 | ТЫ | Рго | С1и 670 | С1и | Агд |
| 01у | Туг | С1и | Азп | Рго 685 | ТЫ | Туг | Ьуз |
асдссдсссд дсссддсасс дсСссСдсСд дссдсссдда сддсСсдддс десддаддса 60 сссасСдаСд дСааСдсСдд ссСдсСддсС даассссада ССдссаСдСС сСдСддсада 120 ссдаасаСдс асасдаасдс ссадаасддд аадСдддаСС садасесаСс адддассааа 180 ассСдсаССд аСассаадда аддсаСссСд садСасСдсс аадаадСсСа сссОдаассд 240 садассасса аСдСддСада адссаассаа ссадсдасса сссадаасСд дсдсаадсдд 300 ддссдсаадс адСдсаадас ссаСссссас СССдСдаССс ссСассдсСд оссадссддс 360 дадСССдСаа дСдаСдсссС СсСсдсСссС дасаадСдса аассессаеа ссаддададд 420 аСддаСдсСС дсдааасСса СсССсасСдд сасассдСсд ссааададас аЬдсадсдад 480 аададсасеа асССдсаСда ссасддсасд ссдссдсссс дсддаассда саадссосда 540
- 54 009216 ддддСададС ЕЕдЕдЕдЕЕд сссасСддсЕ даадааадЕд асааСдЕдда ССсЕдсЕдаЕ 600 дсддаддадд аЕдасЕсдда ЕдЕсЕддЕдд ддсддадсад асасадасЕа ЕдсадаЕддд 660 адгдаадаса аадсадЕада адсадсадад даддаадаад ЕддсЕдаддс ддаадаадаа 720 даадссдаЕд асдасдадда сдаЕдаддас ддЕдаЕдадд Сададдаада ддсЕдаддаа 780 сссЕасдаад аадссасада дадаассасс адсаЕЕдсса ссассассас сассассаса 840 дадгссдсдд аададдЕддс ЕсдадЕЕссс асаасадсад ссадсасссс ЕдасдссдЕЕ 900 дасаадЕаЕс есдадасасс ЕддддаЕдад аасдаасаЕд сссаЕЕСсса дааадссааа 960 дададдсЕЕд аддссаадса ссдададада аЕдЕсссадд ЕсаЕдадада асдддаадад 1020 дсадаасдЕс аадсааадаа сЕЕдссЕааа дсЕдаЕаада аддсадЕЕаЕ ссадсаЕЕЕс 1080 саддадааад ЕддааЕсЕЕЕ ддаасаддаа дсадссаасд ададасадса дсЕддЕддад 1140 асасасаЕдд ссададЕдда адссаЕдсЕс ааЕдассдсс дссдссЕддс ссЕддадаас 1200 ЕасаЕсассд сЕсЕдсаддс ЕдЕЕссЕссЕ сддссЕСдЕс асдЕдЕЕсаа ЕаЕдсЕааад 1260 аадЕаЕдЕсс дсдсадааса дааддасада садсасаесс ЕааадсаЕЕЕ сдадсаЕдЕд 1320 сдсаЕддЕдд ассссаадаа адссдсЕсад аЕссддЕссс аддЕЕаЕдас асассЕссдЕ 1380 дЕдаЕСЕаЕд адсдсаЕдаа ЕсадЕсЕсЕс ЕсссЕдсЕсЕ асаасдЕдсс ЕдсадЕддсс 1440 даддадаЕЕс аддаЕдаадЕ ЕдаЕдадсЕд сЕЕсадааад адсаааасЕа ЕЕсадаЕдас 1500 дЕсЕЕддсса асасдаЕЕад Едаассаадд аСсадЕЕасд дааасдаЕдс ЕоЕсаЕдсса 1560 ЕсЕЕЕдассд ааасдаааас сассдЕддад сЕссЕЕсссд ЕдааЕддада дЕЕсадссЕд 1620 дасдаЕсЕсс адссдсддса ЕЕСЕЕЕЕддд дсЕдасЕсЕд Едссадссаа еасадаааас 1680 даадЕЕдадс сЕдЕЕдаЕдс ссдсссЕдсЕ дссдассдад дасЕдассас ЕсдассаддЕ 1740 ЕсЕдддССда саааЕаЕсаа дасддаддад аЕсСесдаад ЕдаадаЕдда ЕдсадааЕЕс 1800 сдасаЕдасЕ саддаЕаЕда адсесаЕсаЕ саааааЕЕдд ЕдЕЕсЕЕЕдс адаадаЕдЕд 1860 ддЕЕсаааса ааддЕдсааЕ СаЕЕддйСЕс аЕддЕдддсд дЕдЕЕдЕсаЕ адсдасадЕд 1920 аЕсдЕсаЕса ссЕЕддЕдаЕ дсЕдаадаад ааасадЕаса саЕссаЕЕса СсаЕддЕдЕд 1980 дЕддаддЕЕд асдссдсЕдЕ сассссадад дадсдссасс ЕдЕссаадаЕ дсадсадаас 2040 ддсЕасдааа аЕссаассЕа саадЕЕсЕЕЕ дадсадаЕдс адаасаадаа дЕад 2094 <210> 16 <211> 697 <212> Белок <213> Человек (Ното зардепз) <400> 16
| МеЕ 1 | Ьеи | Рго <31у Ьеи А1а Ьеи Ьеи Ьеи Ьеи А1а А1а Тгр ТЬг А1а Агд | ||||||||||||
| 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| А1а | Ьеи | С1и | Уа1 20 | Рго | ТЬг | Азр С1у | Азп 25 | А1а | С1у | Ьеи | Ьеи | А1а 30 | С1и | Рго |
| С1п | 11е | А1а 35 | Мес | РЬе | Сув | С1у Агд 40 | Ьеи | Азп | МеЕ | Н1з | МеЕ 45 | Азп | Уа1 | С1п |
| Азп | (Пу 50 | Ьуз | Тгр | Авр | Зег | Азр Рго 55 | Зег | С1у | ТЬг | Ьуз 60 | ТЬг | Суз | 11е | Азр |
| ТЬг | Ьуз | С1и | (31у | 11е | Ьеи | О1П Туг | Суз | ©1П | С1и | Ча1 | Тут | Рго | С1и | Ьеи |
70 75 80
- 55 009216
| 01η 11е ТЬг Азп ν«1 85 | Уа1 | 01и | А1а Азп | С1п Рго Уа1 ТЬг 11е С1п Азп | |||||||||||
| 90 | 95 | ||||||||||||||
| Тгр | Суз | Ьуз | Агд 100 | С1у | Агд | Ьуз | С1п | Суз 105 | Ьуз | ТЬг | Нхз | Рго | Н15 но | РЬе | Уа1 |
| Не | Рго | Туг 115 | Агд | Суз | Ьеи | νβΐ | С1у 120 | С1и | РЬе | Уа1 | Бег | Азр 125 | А1а | Ьеи | Ьеи |
| Уа1 | Рго 130 | Азр | Ьуз | Суз | Ьуз | РЬе 135 | Ьеи | ΚΪ3 | С1п | С1и | Агд 140 | МеС | Азр | Уа1 | |
| С1и 145 | ТЬг | Н13 | Ьеи | Н1з | Тгр 150 | Н13 | ТЬг | νβΐ | А1а | Ьуз 155 | <31и | ТЬг | Суз | Бег | С1и 160 |
| Ьуз | Зег | ТЬг | Азп | Ьеи 165 | Ηίβ | Азр | Туг | С1у | МеС 170 | Ьеи | Ьеи | Рго | Суз | С1у 175 | Х1е |
| Азр | Ьуз | РЬе | Агд 180 | С1у | Уа1 | <31и | РЬе | Уа1 185 | Суз | Суз | Рго | Ьеи | А1а 190 | <31и | С1и |
| Бег | Азр | Азп 195 | νβΐ | Азр | Бег | А1а | Азр 200 | А1а | С1и | 01и | Азр | Азр 205 | Бег | Азр | Уа1 |
| Тгр | Тгр 210 | <31у | (31у | А1а | Азр | ТЬг 215 | Азр | ТУГ | А1а | Азр | С1у 220 | Бег | С1и | Азр | ьуз |
| Уа1 225 | Уа1 | С1и | Уа1 | А1а | С1и 230 | Э1и | С1и | <31 и | Уа1 | А1а 235 | 01и | Уа1 | С1и | 61и | <31и 240 |
| С1и | А1а | Азр | Азр | Азр 245 | С1и | Азр | Азр | С1и | Азр 250 | С1у | Азр | С1и | ν«ι | С1и 255 | С1и |
| С1и | А1а | С1и | С1и 260 | Рго | Туг | <31и | О1и | А1а 265 | ТЬг | С1и | Агд | ТЬг | ТЬг 270 | Бег | Не |
| А1а | ТЬг | ТЬг 275 | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг 280 | О1и | Бег | Уа1 | О1и | С1и 285 | Уа1 | Уа1 | Агд |
| Уа1 | Рго 290 | ТЬг | ТЬг | А1а | А1а | Бег 295 | ТЬг | Рго | Авр | А1а | ν«ι 300 | Авр | Ьув | Туг | Ьеи |
| С1и 305 | ТЬг | Рго | С1у | Азр | С1и 310 | Азп | <31и | ΗΪ8 | А1а | Нхз 315 | РЬе | С1п | Ьуз | А1а | Ьуз 320 |
| С1и | Агд | Ьеи | С1и | А1а | Ьуз | Н1з | Ахд | С1и | Агд | мес | Бег | С1п | Уа1 | МеС | Агд |
325 330 335
- 56 009216
| С1и Тгр 61 и С1и А1а С1и Агд С1п А1а Ьуз Азп Ьеи Рго Ьуз А1а Аер | |||||||||||||||
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ьуз | ьуз | А1а | Уа1 | 11е | 61п | Ηίβ | РЬе | С1п | С1и | Ьуз | Уа1 | С1и | Зег | Ьеи | (31и |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| С1п | С1и | А1а | А1а | Азп | <31и | Агд | С1п | С1п | Ьеи | ν«ι | С1и | ТЬг | ΗΪ5 | Мес | А1а |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Агд | νβΐ | <31и | А1а | МеС | Ьеи | Азп | Азр | Агд | Агд | Агд | Ьеи | А1а | Ьеи | (31и | Азп |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Туг | 11е | ТЬг | А1а | Ьеи | С1п | А1а | Уа1 | Рго | Рго | Агд | Рго | Агд | ΗΪ3 | νβΐ | РЬе |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Азп | МеС | Ьеи | Ьуз | Ьуе | Туг | Уа1 | Агд | А1а | <31и | 51п | Ьуз | Азр | Агд | (31п | Ηίβ |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| ТЬг | Ьеи | Ьуз | ΗΪ5 | РЬе | С1и | ΗΪ3 | Уа1 | Агд | Мес | Уа1 | Азр | Рго | Ьуз | Ьуз | А1а |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| А1а | С1п | 11е | Агд | Зег | С1п | νβΐ | МеС | ТЬг | ΗΪ8 | Ьеи | Агд | ¥а1 | 11е | Туг | О1и |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Агд | МеС | Азп | 61п | Зег | Ьеи | Зег | Ьеи | Ьеи | Туг | Азп | Уа1 | Рго | А1а | Уа1 | А1а |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| С1и | С1и | 11е | С1п | Азр | 61и | Уа1 | Азр | (31и | Ьеи | Ьеи | С1п | Ьуз | С1и | С1п | Азп |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Туг | Зег | Азр | Азр | ν&ι | Ьеи | А1а | Азп | МеС | 11е | Зег | С1и | Рго | Агд | Не | Зег |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Туг | (31у | Азп | Азр | А1а | Ьеи | Мес | Рго | Зег | Ьеи | ТЬг | С1и | ТЬг | Ьу5 | ТЬг | ТЬг |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Уа1 | 61и | Ьеи | Ьеи | Рго | Уа1 | Азп | С1у | С1и | РЬе | Зег | Ьеи | Азр | Азр | Ьеи | σΐη |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Рго | Тгр | Нхз | Зег | РЬе | 01у | А1а | Азр | Зег | Уа1 | Рго | А1а | Азп | ТЬг | 61и | Азп |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| С1и | νβΐ | С1и | Рго | Уа1 | Азр | А1а | Агд | Рго | А1а | А1а | Азр | Агд | б1у | Ьеи | ТЬг |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| ТЬг | Агд | Рго | С1у | Зег | С1у | Ьеи | ТЬг | Азп | 11е | Ьуз | ТЬг | С1и | С1и | 11е | Зег |
580 585 590
- 57 009216
| С1и | Уа1 Ьуз МеС Азр А1а 595 | С1и | РЬе Агд Н1з Азр Зег О1у Туг С1и Уа1 | ||||||||||||
| 600 | 605 | ||||||||||||||
| Н1з | Н1з | С1п | Ьуз | Ьеи | Уа1 | РЬе | РЬе | А1а | О1и | Азр | Ча1 | <31у | Зег | Азп | Ьуз |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| С1у | А1а | 11е | 11е | О1у | Ьеи | Мес | Уа1 | 01 у <31у | Уа1 | νβΐ | 11е | А1а | ТЬг | Ча1 | |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| 11е | Уа1 | 11е | ТЬг | Ьеи | Ча1 | МеС | Ьеи | Ьуз | Ьуз | Ьуз | О1п | Туг | ТЬг | Зег | 11е |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| ΗΪ5 | Ηίβ | <31у | Уа1 | Уа1 | 01« | Уа1 | Азр | А1а | А1а | Уа1 | ТЬг | Рго | О1и | С1и | Агд |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| ΗΪ2 | Ьеи | Зег | Ьуз | Мес | С1п | <31 η | Азп | С1у | Туг | С1и | АЗП | Рго | ТЬг | Туг | Ьуз |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| РЬе | РЬе | С1и | О1п | МеС | О1п | Азп | Ьуз | Ьуз | |||||||
| 690 | 695 |
<210> 17 <211> 2094 <212> ДНК <213> Человек (Ното зархепз) <400>
асдсСдсссд сссасСдаСд сСдаасаСдс асссдсассд садассасса ддссдсаадс дадСССдСаа аСддаСдССС аададсасса ддддСададС дсддаддадд адСдаадаса даадссдаСд сссСасдаад дадсссдсдд дасаадСаСс дададдсССд дсадаасдСс саддадааад асасасасдд дСССддсасС дСааСдсСдд асаСдаасдс аСассаадда аСдСддсада адСдсаадас дСдаСдсссС дсдааассса асССдсаСда ССдСдСдССд асдасСсдда аадСадСада аСдасдадда аадссасада аададдсддс Ссдадасасс дсСссСдсСд ссСдсСддсС ссадааСддд аддсаСссСд аддссаадса аадсааадаа сддааСсССС ссададСдда адссаассаа ссаСссссас СсСсдССссС СсССсасСдд сСасддсаСд сссасСддсс СдСсСддСдд адСадсадад сдаСдаддаС дадаассасс ссдадссссе СддддаСдад ссдададада сссдсссааа ддаасаддаа адссасдссс дссдссСдда даассссада аадСдддаСС садСаССдсс ссадСдасса СССдСдаССс дасаадсдса сасассдСсд ССдсСдсссС даадааадСд ддсддадсад даддаадаад ддСдаСдадд адсаССдсса асаасадсад ааСдаасаСд аСдСсссадд дссдаСаада дсадссаасд ааСдассдсс сддсссдддс ссдссасдсс садаСссасс аадаадссса СссадаасСд ссСассдсСд ааССсССаса ссааададас дсддааССда асаасдсдда асасадасса СддсСдаддС Сададдаада ссассассас ссадСасссс сссаСССсса
СсаСдадада аддсадССаС ададасадса дссдссСдде дсСддаддса сСдСддсада адддассааа сссСдаасСд дСдсаадсдд сССадССддС ссаддададд аСдсадСдад саадССссда сСссдсСдас СдсадаСддд ддаадаадаа ддссдаддаа сассассаса СдаСдссдСС дааадссааа аСдддаадад ссадсаСССс дсСддСддад ссСддадаас
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
- 58 009216
Еасассассд сЕсЕдсаддс ЕдЕЕссЕссЕ сддссЕсдЕС асдЕдЕЕсаа ЕаЕдсЕааад 1260 аадЕвЕдЕсс дсдсадааса дааддасада садсасассс ЕааадсаЕЕЕ сдадсаЕдЕд 1320 сдсаЕддЕдд аЕсссаадаа адссдсЕсад аЕссддЕссс аддЕЕаЕдас асассЕссдЕ 1380 дЕдаЕЕЕаЕд адсдсаЕдаа ЕсадЕсЕСЕс ЕсесЕдсЕСЕ асаасдЕдсс сдсадЕддсс 1440 даддадаЕЕс аддаЕдаадЕ ЕдаЕдадсЕд сЕЕсадааад адсаааасЕа ЕЕсадаЕдас 1500 дЕсЕЕддсса асаЕдаЕЕад Едаассаадд аЕсадЕЕасд дааасдаЕдс ЕСЕсаЕдсеа 1560 ЕсЕЕЕдассд ааасдаааас сассдкддад сЕссЕЕсссд ЕдааЕддада дЕЕсадссЕд 1620 дасдаЕСЕсс адссдЕддса ЕЕсЕЕЕЕддд дсЕдасЕсЕд Едссадссаа сасадаааас 1680 даадЕЕдадс сЕдЕЕдаЕдс седсссЕдсЕ дссдассдад дасЕдассас ЕсдассаддЕ 1740 ЕсЕдддсЕда саааЕаЕсаа дасддаддад аЕсЕсЕдаад ЕдааЕсЕдда ЕдсадааЕЕС 1800 сдасаЕдасЕ саддаЕаЕда адЕЕсаЕсаЕ саааааЕЕдд ЕдЕЕсЕЕЕдс адаадаЕдкд 1860 ддЕЕсаааса ааддСдсааЕ саЕЕддасЕс вЕддЕдддсд дсдЕЕдЕсаЕ адсдасадЕд 1920 аЕсдЕсаЕса ссЕЕддЕдаЕ дсЕдаадаад ааасадЕаеа саЕссаЕЕса ЕсаЕддЕдЕд 1980 дЕддаддЕЕд асдссдсЕдЕ сассссадад дадсдссасс ЕдЕссаадаЕ дсадсадаас 2040 ддсЕасдааа аЕссаассЕа саадЕЕсЕЕЕ дадсадаЕдс адаасаадаа дЕад 2094 <210> 1В <211> 697 <212> Белок <213> Человек (Ното гархепз)
| <400> 18 | <31у Ьеи 5 | А1а Ьеи Ьеи Ьеи Ьеи А1а А1а Тгр 10 | ТЬг | А1а 15 | Агд | ||||||||||
| МеЕ 1 | Ьеи | Рго | |||||||||||||
| А1а | Ьеи | <31и | Уа1 | Рго | ТЬг | Азр | С1у | Азп | А1а | С1у | Ьеи | Ьеи | А1а | С1и | Рго |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| О1п | Не | А1а | Мег | РЬе | Суз | <51у | Агд | Ьеи | Азп | мес | Ηίβ | МеЕ | Азп | Уа1 | <31п |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Азп | С1у | Ьуз | Тгр | Азр | Бег | Азр | Рго | Бег | С1у | ТЬг | Ьуз | ТЬг | Суз | Не | АЗр |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| ТЬг | Ьуз | С1и | С1у | Не | Ьеи | <31п | Туг | Суз | 61п | (31и | Уа1 | Туг | Рго | С1и | Ьеи |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| С1п | 11е | ТЬг | Авп | Уа1 | Уа1 | О1и | А1а | Азп | С1п | Рго | Уа1 | ТЬг | 11е | С1п | Азп |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Тгр | Суз | Ьуз | Агд | <31у | Агд | Ьуз | <31п | Суз | Ьуз | ТЬг | Ηί8 | Рго | Ηίβ | РЬе | Уа1 |
| 100 | 105 | но | |||||||||||||
| Не | Рго | Туг | Агд | Суз | Ьеи | νβΐ | <Э1у | <31 и | РЬе | Уа1 | Бег | Азр | А1а | Ьеи | Ьеи |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Уа1 | Рго | Азр | Ьуз | Суз | Ьуз | РЬе | Ьеи | Ηίβ | С1п | (Пи | Агд | МеЕ | Азр | Уа1 | Суз |
| 130 | 135 | 140 |
- 59 009216
| С1и ТЫ Нхз 145 | Ьеи | Нхз Тгр Нхз ТЬг Уа1 А1а Ьув С1и ТЬг Суз Зег С1и | |||||||||||||
| 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
| Ьуз | Бег | ТЬг | Авп | Ьеи | Ηΐε | Авр | Туг | С1у | Мес | Ьеи | Ьеи | Рго | Сув | С1у | Не |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Азр | Ьув | РЬе | Агд | С1у | νβΐ | С1и | РЬе | Уа1 | Сув | Сув | Рго | Ьеи | А1а | О1и | <31и |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Бег | Авр | АВП | Уа1 | Авр | Зег | А1а | Авр | А1а | С1и | <31и | Авр | Авр | Зег | Авр | ν»ι |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Тгр | Тгр | (31у | С1у | А1а | Авр | ТЫ | Авр | Туг | А1а | Авр | С1у | Зег | С1и | Азр | Ьув |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Уа1 | ν»1 | С1и | Уа1 | А1а | С1и | £1и | С1и | С1и | 7а1 | А1а | <31и | Уа1 | С1и | С1и | С1и |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| С1и | А1а | Авр | Аар | Авр | (31и | Авр | Авр | С1и | Авр | С1у | Авр | С1и | νβΐ | □1и | С1и |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| С1и | А1а | 31и | С1и | Рго | Туг | С1и | С1и | А1а | ТЬг | (31и | Агд | ТЬг | ТЫ | Бег | 11е |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| А1а | ТЫ | ТЬг | ТЬг | ТЫ | ТЫ | ТЬг | ТЬг | С1и | Зег | νβΐ | С1и | С1и | Уа1 | Уа1 | Агд |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Уа1 | Рго | ТЫ | ТЫ | А1а | А1а | Зег | ТЬг | Рго | Авр | А1а | Уа1 | Авр | Ьув | Туг | Ьеи |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| 61и | ТЫ | Рго | С1у | Авр | С1и | Авп | □1и | Ηχε | А1а | Ηΐε | РЬе | 61П | Ьув | А1а | Ьуз |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| С1и | Агд | Ьеи | С1и | А1а | Ьуз | Нхв | Агд | С1и | Агд | МеС | Зег | С1п | Уа1 | Мес | Агд |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| О1и | Тгр | С1и | С1и | А1а | С1и | Агд | 01п | А1а | Ьуз | Авп | Ьеи | Рго | Ьуз | А1а | Адр |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ьуз | Ьуз | А1а | Уа1 | Не | <31п | НХЗ | РЬе | С1п | С1и | Ьув | Уа1 | <31и | Зег | Ьеи | С1и |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| С1п | С1и | А1а | А1а | Авп | <31и | Агд | С1п | С1п | Ьеи | Уа1 | С1и | ТЫ | Нхз | МеС | А1а |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Агд | Уа1 | <31и | А1а | МеС | Ьеи | Авп | Авр | Агд | Агд | Агд | Ьеи | А1а | Ьеи | С1и | Авп |
385 390 395 400
- 60 009216
| Туг | Не ТЬг А1а | Ьеи 405 | С1п А1а Уа1 | Рго Рго Агд Рго Агд Ηίε Уа1 | РЬе | ||||||||||
| 410 | 415 | ||||||||||||||
| Азп | Мее | Ьеи | Ьуз | Ьуз | Тут | Уа1 | Агд | А1а | 01 и | С1п | Ьув | Азр | Агд | С1п | Ηίβ |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| ТЬг | Ьеи | Ьуз | Ηίβ | РЬе | (Пи | Ηίβ | Уа1 | Агд | Мее | Уа1 | Азр | Рго | Ьуз | Ьуз | А1а |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| А 1а | С1п | 11е | Агд | Зег | С1п | Уа1 | Мее | ТЬг | Ηίβ | Ьеи | Агд | Уа1 | Не | туг | <31 и |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Агд | Мее | Азп | αΐη | Зег | Ьеи | Зег | Ьеи | Ьеи | Туг | Азп | Уа1 | Рго | А1а | Уа1 | А1а |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| С1и | С1и | Не | αΐη | Азр | С1и | Уа1 | Азр | <31и | Ьеи | Ьеи | С1п | Ьуз | С1и | С1п | Азп |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Туг | Зег | Азр | Азр | Уа1 | Ьеи | А1а | Азп | мае | Не | Зег | С1и | Рго | Агд | Не | Зег |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Тут | С1у | Азп | Азр | А1а | Ьеи | Мее | Рго | Зег | Ьеи | ТЬг | С1и | ТЬг | Ьуз | ТЬг | ТЬг |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Уа1 | 01и | Ьеи | Ьеи | Рго | Уа1 | Азп | 01у | 01и | РЬе | Зег | Ьеи | Азр | Азр | Ьеи | С1п |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Рго | Тгр | Ηίβ | Зег | РЬе | 61у | А1а | Азр | Зег | Уа1 | Рго | А1а | Азп | ТЬг | 01и | Азп |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| <31и | Уа1 | С1и | Рго | Уа1 | Азр | А1а | Агд | Рго | А1а | А1а | Авр | Агд | С1у | Ьеи | ТЬг |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| ТЬг | Агд | Рго | С1у | Зег | С1у | Ьеи | ТЬг | Азп | Не | Ьуз | ТЬг | 01и | С1и | Не | Зег |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| С1и | Уа1 | Азп | Ьеи | Азр | А1а | СПи | РЬе | Агд | ΗΪ3 | Азр | Зег | С1у | Туг | С1и | Уа1 |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Ηίβ | ΗΪ5 | С1п | Ьуз | Ьеи | Уа1 | РЬе | РЬе | А1а | С1и | Азр | Уа1 | С1у | Зег | Азл | Ьув |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| 61у | А1а | Не | Не | О1у | Ьеи | Мее | Уа1 | (31у С1у | Уа1 | Уа1 | Не | А1а | ТЬг | Уа1 | |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Не | Уа1 | Не | ТЬг | Ьеи | Уа1 | Мее | Ьеи | Ьуз | Ьуз | Ьуз | С1п | Туг | ТЬг | Зег | Не |
| 645 | 650 | 655 |
- 61 009216
Ηί8 ΗΪ3 С1у Уа1 νβΐ С1и Уа1 Азр А1а А1а Уа1 ТЫ Рго С1и 61и Агд
660 665670 (Из Ьеи Зег Ьуз МеЕ С1п С1п Азп <31 у Туг С1и Азп Рго ТЫ Туг Ьуз
675 680685
РЬе РЬе С1и С1п МеЕ <31п Азп Ьуз Ьуз
690695 <210>19 <211>2094 <212> ДНК <213> Человек (Ново зархепз) <400> 19 аЕдсЕдсссд дЕЕЕддсасЕ дсЕссЕдсЕд дссдссСдда сддсСсдддс дсЕддаддСа 60 сссасЕдаЕд дсааЕдссдд ссЕдсЕддсЕ даассссада ЕЕдссасдсЕ сЕдЕддсада 120 сЕдаасаедс асаЕдааЕдЕ ссадааЕддд аадЕдддаЕЕ садаЕссасс адддассааа 180 ассЕдсаЕЕд аЕассаадда аддсаЕссЕд садЕаСЕдсс аадаадЕсЕа сссЕдаасЕд 240 садаЕсасса аЕдЕддЕада адссаассаа ссадЕдасса сссадаасЕд дСдсаадсдд 300 ддссдсаадс адсдсаадас ссаЕссссас ЕЕЕдЕдаЕЕс ссЕассдсЕд сЕЕадЕЕддЕ 360 дадЕЕЕдсаа дЕдаЕдсссЕ ЕсЕсдЕЕссЕ дасаадЕдса аасЕсЕЕаса ссаддададд 420 аСддаЕдЕЕЕ дсдааасЕса ЕсЕЕсасЕдд сасассдЕсд ссааададас аЕдсадЕдад 480 аададЕасса асЕЕдсаЕда сЕасддсаЕд ЕЕдсЕдсссЕ дсддааЕЕда саадЕЕссда 540 ддддСададЕ ЕЕдЕдСдЕЕд сссасЕддсЕ даадааадЕд асааЕдЕдда ЕЕсЕдсЕдас 600 дсддаддадд аЕдасЕсдда ЕдЕсЕддЕдд ддсддадсад асасадасЕа ЕдсадаЕддд 660 адедаадаса аадЕадЕада адЕадсадад даддаадаад ЕддсЕдаддЕ ддаадаадаа 720 даадссдагд асдасдадда сдаЕдаддаЕ ддЕдаЕдадд Еададдаада ддсЕдаддаа 780 сссЕасдаад аадссасада дадаассасс адсаЕЕдсса ссассассас сассассаса 840 дадЕсЕдЕдд аададдЕддЕ ЕсдадЕЕСсЕ асаасадсад ссадЕасссс ЕдаЕдссдЕЕ 900 дасаадЕаЕс Есдадасасс ЕддддаЕдад ааСдаасаЕд сссаЕЕЕсса дааадссааа 960 дададдсЕЕд аддссаадса ссдададада аЕдЕсссадд ЕсаЕдадада аЕдддаадад 1020 дсадаасдЕс аадсааадаа сЕЕдссЕааа дсЕдаЕаада аддсадЕЕаЕ ссадсаЕЕЕс 1080 саддадааад ЕддааЕсЕЕЕ ддаасаддаа дсадссаасд ададасадса дсЕддЕддад 1140 асасасаЕдд ссададгдда адссасдсЕс ааЕдассдсс дссдссЕддс ссЕддадаас 1200 ЕасаЕсассд сЕсЕдсаддс ЕдЕЕссЕссЕ сддссЕсдЕс асдЕдЕЕсаа ЕаЕдсеааад 1260 аадЕаСдЕсс дсдсадааса дааддасада садсасассс ЕааадсаЕЕЕ сдадсаЕдсд 1320 сдсаЕддЕдд аЕсссаадаа адссдсЕсад аЕссддЕссс аддЕЕасдас асассЕссдЕ 1380 дЕдаЕЕЕаЕд адсдсаЕдаа ЕсадссссЕс ЕсссЕдсесс асаасдсдсс едсадЕддсс 1440 даддадаЕЕс аддаЕдаадЕ ЕдаЕдадсЕд сЕЕсадааад адсаааасЕа ЕЕсадаЕдас 1500 дЕсЕЕддсса асасдассад Едаассаадд аСсадЕЕасд дааасдаЕдс ЕсЕсаЕдсса 1560 ЕсЕЕЕдассд ааасдаааас сассдЕддад сЕссЕЕсссд ЕдааЕддада дЕЕсадссЕд 1620 дасдаЕсЕсс адссдЕддса ЕЕсЕЕЕЕддд дсЕдасЕсЕд Едссадссаа сасадаааас 1680 даадЕЕдадс ссдЕЕдасдс ссдсссСдсЕ дссдассдад дасЕдассас Есдассадде 1740 ЕсЕдддЕЕда саааЕаЕсаа дасддаддад аЕсЕсЕдаад ЕдаадаЕдда ЕдсадааЕЕс 1800 сдасаСдасЕ саддаЕаЕда адЕЕсаЕсаЕ саааааЕЕдд ЕдЕЕсЕЕЕдс адаадаЕдЕд 1860
- 62 009216 ддССсаааса ааддСдсааС саССддасСс аСддсдддсд дсдссдссас адсдасадСд 1920 асссссасеа ссССддсдаС дсСдаадаад ааасадСаса саСссаССса СсаСддСдСд 1980 дСддаддССд асдссдссдс сассссадад дадсдссасс сдсссаадаг дсадсадаас 2040 ддсСасдааа аСссаассСа саадСССССС дадсадаСдс адаасаадаа дСад 2094
| <210> | 20 |
| <211> | 697 |
| <212> | Белок |
| <213> | Человек (Ното зархепа) |
<400> 20
| Мес Ьеи Рго С1у Ьеи | А! а Ьеи Ьеи Ьеи Ьеи А1а А1а Тгр ТЬг А1а | Агд | |||||||||||||
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| А1а | Ьеи | С1и | Ча1 | Рго | ТЬг | Авр | С1у | Авп | А1а | <31у | Ьеи | Ьеи | А1а | С1и | Рго |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| С1п | 11е | А1а | МеС | РЬе | Суз | О1у | Агд | Ьеи | АЗП | МеС | Ηίβ | МеС | АЗП | Ча1 | С1п |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Аап | С1у | Ьуа | Тгр | Аар | Бег | Азр | Рго | Бег | С1у | ТЬг | Ьуз | ТЬг | Суз | 11е | Азр |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| ТЬг | Ьуа | 61и | С1у | Не | Ьеи | С1п | Туг | Суз | О1п | С1и | Ча1 | Туг | Рго | <31и | Ьеи |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| С1п | 11е | ТЬг | Азп | Ча1 | Ча1 | (31 и | А1а | Азп | С1п | Рго | Ча1 | ТЬг | Х1е | С1п | Азп |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Тгр | Суз | Ьуа | Агд | 31у | Агд | Ьуз | С1п | Суз | Ьуз | 1Ьг | Ηίβ | Рго | Ηίβ | РЬе | Ча1 |
| 100 | 105 | но | |||||||||||||
| 11е | Рго | Туг | Агд | Суз | Ьеи | Ча1 | С1у | С1и | РЬе | Ча! | Бег | Азр | А1а | Ьеи | Ьеи |
| 115 | < | 120 | 125 | ||||||||||||
| Ча1 | Рго | Азр | Ьуз | Суз | Ьуз | РЬе | Ьеи | Н1з | С1п | С1и | Агд | МеС | Азр | Ча1 | Сув |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| С1и | ТЬг | ΗΪ5 | Ьеи | ΗΪ3 | Тгр | Н13 | ТЬг | Ча1 | А1а | Ьуз | С1и | ТЬг | Суз | Бег | С1и |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ьуа | Бег | ТЬг | Азп | Ьеи | Ηίβ | Азр | Туг | С1у | Мес | Ьеи | Ьеи | Рго | Суз | С1у | Не |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Азр | Ьуз | РЬе | Агд | С1у | Ча1 | 61и | РЬе | Ча1 | Суз | Суз | Рго | Ьеи | А1а | С1и | С1и |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Бег | Авр | Азп | Ча1 | АЗр | Бег | А1а | Азр | А1а | С1и | С1и | Азр | Азр | Бег | Азр | Ча1 |
- 63 009216
195 200 205
| Тгр Тгр 210 | С1у С1у | А1а | Азр | ТЬг Азр Туг А1а Азр <31у | Бег | (Ни | Азр | Ьуз | |||||||
| 215 | 220 | ||||||||||||||
| νβΐ | Уа1 | С1и | Уа1 | А1а | С1и | <31и | О1и | С1и | Уа1 | А1а | 61и | Уа1 | (Пи | С1и | (Пи |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| С1и | А1а | Азр | Азр | Азр | 61и | Азр | Азр | С1и | АЗр | С1у | Азр | С1и | Уа1 | С1и | С1и |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| С1и | А1а | <31и | (Пи | Рго | Туг | <31и | <31и | А1а | ТЬг | СП и | Агд | ТЫ | ТЬг | Бег | Не |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| А1а | ТЫ | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | С1и | Бег | Уа1 | (31и | О1и | Уа1 | Уа1 | Агд |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| ν*ι | Рго | ТЬг | ТЬг | А1а | А1а | Бег | ТЬг | Рго | Азр | А1а | Уа1 | Азр | Ьуз | Туг | Ьеи |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| 61и | ТЬг | Рго | <31у | Азр | С1и | Азп | 61и | ΗΪ8 | А1а | ΗΪ8 | РЬе | 61п | Ьуз | А1а | Ьуз |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| 61и | Агд | Ьеи | 61и | А1а | Ьуз | Шз | Агд | (Пи | Агд | МеЕ | Бег | С1п | Уа1 | МеЕ | Агд |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| С1и | Тгр | С1и | <31и | А1а | <31и | Агд | С1п | А1а | Ьуз | Азп | Ьеи | Рго | Ьуз | А1а | Азр |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ьуз | Ьуз | А1а | Уа1 | Не | С1п | ΗΪ3 | РЬе | 61п | <31и | ьуз | Уа1 | С1и | Бег | Ьеи | С1и |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| С1п | С1и | А1а | А1а | Азп | С1и | Агд | О1П | С1п | Ьеи | ν»ι | 61и | ТЬг | ΗΪ8 | МеЕ | А1а |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Агд | Уа1 | С1и | А1а | МеЕ | Ьеи | Азп | Азр | Агд | Агд | Агд | Ьеи | А1а | Ьеи | 01и | Азп |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Туг | Не | ТЬг | А1а | Ьеи | С1п | А1а | Уа1 | Рго | Рго | Агд | Рго | Агд | Нхз | Уа1 | РЬе |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| АЗП | МеЕ | Ьеи | Ьув | Ьуз | Туг | Уа1 | Агд | А1а | С1и | С1П | Ьуз | АЗр | Агд | 61п | Нхз |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| ТЬг | Ьеи | Ьуз | Ηίδ | РЬе | С1и | ΗΪ3 | Уа1 | Агд | МеЕ | νβΐ | Азр | Рго | Ьуз | Ьуз | А1а |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| А1а | С1п | Не | Агд | Бег | О1п | Уа1 | МеЕ | ТЬг | Н1з | Ьеи | Агд | Уа1 | 11е | Туг | (Пи |
- 64 009216
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Агд | Мег | АЗП | С1п | Зег | Ьеи | Зег | Ьеи | Ьеи | Туг | Азп | Уа1 | Рго | АХа | Уа1 | А1а |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| С1и | СХи | 11е | С1п | Азр | СХи | Уа1 | Азр | С1и | Ьеи | Ьеи | СХп | Ьуз | СХи | С1п | Азп |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Туг | Бег | Азр | Азр | Уа1 | Ьеи | АХа | Азп | МеЕ | 11е | Зег | С1и | Рго | Агд | 11е | Зег |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Туг | С1у | Азп | Азр | АХа | Ьеи | МеЕ | Рго | Зег | Ьеи | ТЬг | С1и | ТЫ | Ьуз | ТЬг | ТЬг |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Уа1 | СХи | Ьеи | Ьеи | Рго | УаХ | Азп | СХу | С1и | РЬе | Зег | Ьеи | Азр | Азр | Ьеи | С1п |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Рго | Тгр | Нхз | Зег | РЬе | СХу | А1а | Авр | Зег | Уа1 | Рго | АХа | Азп | ТЬг | С1и | Авп |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| С1и | УаХ | СХи | Рго | Уа1 | Азр | А1а | Агд | Рго | А1а | АХа | Азр | Агд | СХу | Ьеи | ТЬг |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| ТЫ | Агд | Рго | С1у | Зег | С1у | Ьеи | ТЫ | Азп | Не | Ьуз | ТЫ | СХи | СХи | 11е | Зег |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| С1и | Уа1 | Ьуз | Мее | Азр | А1а | С1и | РЬе | Агд | Нхз | Азр | Зег | С1у | Туг | С1и | УаХ |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Нхз | Нхз | С1п | Ьуз | Ьеи | Уа1 | РЬе | РЬе | АХа | С1и | Азр | Уа1 | С1у | Зег | Азп | Ьув |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| С1у | АХа | Не | 11е | С1у | Ьеи | МеЕ | УаХ | СХу С1у | Уа1 | УаХ | 11е | А1а | ТЬг | Уа1 | |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| 11е | РЬе | 11е | ТЬг | Ьеи | УаХ | МеЕ | Ьеи | Ьуз | Ьуз | Ьуз | СХп | Туг | ТЬг | Зет | Х1е |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Нхз | Нхз | С1у | УаХ | УаХ | СХи | УаХ | Азр | А1а | А1а | УаХ | ТЬг | Рго | С1и | С1и | Агд |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Нхз | Ьеи | Бег | Ьуз | МеЕ | СХп | С1п | Азп | С1у | Туг | С1и | Азп | Рго | ТЬг | Туг | Ьуз |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| РЬе | РЬе | С1и | СХп | МеЕ | СХп | Азп | Ьуз | Ьуз | |||||||
| 690 | 695 |
- 65 009216 <210> 21 <211> 1341 <212> ДНК <213> Человек (Ново зархепз) <400> 21 аеддсЕадса ЕдасСддЕдд асадсаааЕд ддссдсддаЕ ссасссадса сддсаЕссдд 60 ссдссссЕдс дсадсддссЕ ддддддсдсс ссссСдддде ЕдсддсЕдсс ссдддадасс 120 дасдаададс ссдаддадсс сддссддадд ддсадсЕЕЕд ЕддадаЕддЕ ддасаасссд 180 аддддсаадС сддддсаддд сЕасЕасдСд дадаЕдассд Едддсадссс сссдсадасд 240 СЕсаасаЕсс сддЕддаЕас аддсадсадЕ аассЕЕдсад ЕдддЕдсЕдс сссссасссс 300 ЕЕссЕдсаЕО дсЕасЕасса даддсадсСд ЕссадсасаЕ ассдддассЕ ссддаадддЕ 360 дСдСаЕдЕдс ссЕасасеса дддсаадЕдд дааддддадс Едддсассда ссЕддСаадс 420 аЕсссссаЕд дссссаасдЕ сасЕдЕдсдЕ дссаасаСЕд сЕдссаЕсас ЕдааЕсадас 480 аадЕЕссЕса ЕсаасддсЕс саасЕдддаа ддсаЕссЕдд ддсЕддссСа ЕдсЕдадаЕЕ 540 дссаддсоЕд аодасЕсссЕ ддадссЕЕЕс ЕЕЕдасЕсЕс ЕддЕааадса дасссасдЕЕ 600 сссаассЕсъ ссЕеесЕдса ссЕЕЕдЕддС дсЕддсЕЕсс сссЕсаасса дЕсЕдаадъд 660 съддссЕсЕд Есддадддад саЕдаЕсаЕЕ ддаддЕаЕсд ассасЕсдсЕ дЕасасаддс 720 адЕсЕсЕддъ аЕасасссаЕ ссддсдддад ЕддъаЕЕаЕд аддСсаЕсас ЕдЕдедддъд 780 дадаЕсааЕд дасаддаЕСЕ дааааЕддас ЕдсааддадЕ асаасЕЭЕда саададсаЕЕ 840 дъддасадъд дсассассаа ссЕЕсдЕЕЕд сссаадааад ЕдЕЕЕдаадс ЕдсадЕсааа 900 ЕссаЕсаадд садссЕссЕс сасддадаад ЕЕсссЕдаЕд дЕЕЕсЕддсЕ аддададсад 960 сЕддЕдЕдсЕ ддсаадсадд сассассссЕ ЕддаасаСЕЕ ЕсссадЕсаЕ сЕсасЕсЕас 1020 сЕааЕдддЕд аддЕЕассаа ссадЕссЕЕс сдсаъсасса ЕссЕЕссдса дсааЕассЕд 1080 еддссадЕдд аадаЕдЕддс сасдЕсссаа дасдасЕдЕЕ асаадЕЕЕдс саЕсЕсасад 1140 ЕсаЕссасдд дсасъдЕЕаЕ дддадеСдЕЕ аЕсаЕддадд дсЕЕсЕасдЕ ЕдЕсЕЕЕдаЕ 1200 сдддсссдаа аасдааЕЕдд сЕЕЕдсЕдЕс адсдсЕЕдсс аЕдЕдсасда ЕдадЕЕсадд 1260 асддсадсдд Еддааддссс СЕЕЕдъсасс ъъддасаъдд аадасЕдъдд сЕасаасаЕЕ 1320 ссасадасад асдадЕсаЕд а 1341 <210> 22 <211> 446 <212> Белок <213> Человек (Ното зар±епз) <400> 22
| МеЪ | А1а | Зег | Мес | ТЬг | <31у | С1у | (31 η | С1п | Мес | С1у Агд С1у | Зег | ТЬг | С1п | |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||
| ΗΪ3 | 01у | 11е | Агд | Беи | Рго | Беи | Агд | Зег | (Пу | Беи | О1у (31у | А1а | Рго | Беи |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||||||
| С1у | Ьеи | Агд | Беи | Рго | Агд | С1и | ТЬг | АЗР | С1и | (31и | Рго С1и | О1и | Рго | (Пу |
| 35 | 40 | 45 | ||||||||||||
| Агд | Агд | С1у | Зег | РЬе | Уа1 | б1и | Мес | Уа1 | Азр | Азп | Беи Агд | С1у | Буз | Бег |
55 60
- 66 009216
| С1у С1п С1у 65 | Туг | Туг Уа1 С1и МеС ТЬг Уа1 С1у Бег Рго Рго С1п ТЬг | |||||||||||||
| 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
| Ьеи | Азп | Не | Ьеи | νβΐ | Азр | ТЬг | (Пу | Бег | Бег | Азп | РЬе | А1а | Уа1 | С1у | Л 1а |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| А1а | Рго | Н15 | Рго | РЬе | Ьеи | ΗΪ3 | Агд | Туг | Туг | С1п | Агд | С1п | Ьеи | Бег | Бег |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| ТЬг | Туг | Агд | Азр | Ьеи | Агд | Ьув | С1у | Уа1 | Туг | νβΐ | Рго | Туг | ТЬг | О1п | С1у |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ьуз | Тгр | С1и | С1у | С1и | Ьеи | (Ну | ТЬг | Азр | Ьеи | Уа1 | Бег | Не | Рго | Н15 | (Пу |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Рго | Азп | Уа1 | ТЬг | Уа1 | Агд | А1а | Азп | Не | А1а | А1а | Не | ТЬг | С1и | Бег | Азр |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| ьуз | РЬе | РЬе | Не | Азп | С1у | Бег | Азп | Тгр | С1и | (Пу | 11е | Ьеи | С1у | Ьеи | А1а |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Туг | А1а | С1и | Не | А1а | Агд | Рго | Азр | Азр | Бег | Ьеи | (Ни | Рго | РЬе | РЬе | Азр |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Бег | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1п | ТЬг | Н13 | νβΐ | Рго | Азп | Ьеи | РЬе | Бег | Ьеи | Нхз | Ьеи |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Суз | С1у | А1а | С1у | РЬе | Рго | Ьеи | Авп | 01п | Бег | В1и | Уа1 | Ьеи | А1а | Бег | Уа1 |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| С1у | С1у | Бег | МеС | 11е | Не | <Пу | (Пу | Не | Азр | Ηίβ | Бег | Ьеи | Туг | ТЬг | (Ну |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Бег | Ьеи | Тгр | Туг | ТЬг | Рго | 11е | Агд | Агд | С1и | Тгр | Туг | Туг | С1и | Уа1 | Не |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| 11е | Уа1 | Агд | Уа1 | (Пи | Не | Азп | С1у | С1п | Азр | Ьеи | Ьуз | МеС | Азр | Суз | Ьуз |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| <31и | Туг | Азп | Туг | Азр | Ьуз | Бег | Не | Уа1 | Азр | Бег | □1у | ТЬг | ТЬг | Азп | Ьеи |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Агд | Ьеи | Рго | Ьуз | Ьуз | Уа1 | РЬе | С1и | А1а | А1а | Уа1 | Ьуз | Бег | Не | Ьуз | А1а |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| А1а | Бег | Бег | ТЬг | (Пи | Ьув | РЬе | Рго | Азр | (Пу | РЬе | Тгр | Ьеи | (Ну | С1и | С1п |
305 310 315 320
- 67 009216
| Ьеи Уа1 | Суз Тгр С1п А1а С1у ТЬг ТЬг Рго Тгр Азп 11е РЬе Рго Уа1 | ||||||||||||||
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Не | Бег | Ьеи | Туг | Ьеи | МеС | С1у | С1и | Уа1 | ТЬг | Азп | 01Л | Бег | РЬе | Агд | Не |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| ТЫ | 11е | Ьеи | Рго | О1п | С1п | Туг | Ьеи | Агд | Рго | Уа1 | С1и | Азр | Уа1 | А1а | ты |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Бег | σΐη | Азр | Азр | Суз | Туг | Ьуз | РЬе | А1а | Не | Бег | С1п | Бег | Бег | ТЫ | С1у |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| ТЬг | Уа1 | МеС | 61у | А1а | Уа1 | 11е | МеЕ | С1и | 61у | РЬе | Туг | Уа1 | Уа1 | РЬе | Азр |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Агд | А1а | Агд | Ьуз | Агд | Не | 01у | РЬе | А1а | Уа1 | Бег | А1а | Суз | Нхз | Уа1 | Н1з |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Азр | С1и | РЬе | Агд | ТЬг | А1а | А1а | Уа1 | С1и | 01у | Рго | РЬе | Уа1 | ТЬг | Ьеи | Азр |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Мес | О1и | Азр | Суз | Н1у | Туг | Азп | Не | Рго | С1п | ТЬг | Азр | 01и | Бег | ||
| 435 | 440 | 445 |
| <210> <211> <212> <213> | 23 1380 ДНК Человек (Ното зар±епз) |
<400* 23 аЕддсСэдса ЕдасЕддедд асадсаааЕд ддЕсдсддаС сдаЕдасЕаС сЕсЕдасЕсЕ 60 ссдсдЕдаас аддасддаСс сасссадсас ддсаЕссддс ЕдссссЕдсд садсддссЕд 120 дддддсдссс сссЕддддсс дсддседссс сдддадассд асдаададсс сдаддадссс 180 ддссддаддд дсадсЕЕЕдс ддадаСддСд дасаассЕда ддддсаадЕс ддддсадддс 240 сассасдЕдд адаЕдассде дддсадсссс ссдсадасдс ЕсаасаЕссЕ ддсддасаса 300 ддсадсадса асЕЕЕдсадс дддЕдсСдсс ссссассссЕ ЕссЕдсаЕсд сЕасЕассад 360 аддсадсСдЕ ссадсасаса ссдддассСс сддаадддсд ЕдсаЕдЕдсс сЕасасссад 420 ддсаадсддд ааддддадсс дддсассдас сЕддЕаадса Есссссасдд ссссаасдЕс 480 асСдЕдсдЕд ссаасаЕЕдс ЕдссассасС дааЕсадаса адСЕсЕЕсаЕ еаасддсссс 540 аасЕдддаад дсаЕссЕддд дсЕддссЕаЕ дсЕдадаЕЕд ссаддссЕда сдасЕсссСд 600 дадссЕЕЕсЕ ССдасЕсЕсс ддеааадсад асссаедЕЕс ссаассЕсЕЕ сЕсссЕдсас 660 сСЕЕдЕддЪд сСддсСЕссс ссЕсаассад ЕсЕдаадЕдс ЕддссЕСЕдЕ сддадддадс 720 аЕдассаЕСд даддЕаЕсда ссасЕсдсЕд Еасасаддса дЕсЕсЕддЕа Сасасссасс 780 сддсдддадЕ ддЕасЕаСда ддЕсаЕсаЕЕ дСдсдддСдд адаЕсааЕдд асаддаесЕд 840 ааааеддасЕ дсааддадЕа саасЕаЕдас аададсаЕСд СддасадСдд сассассаас 900 сеседЕЕЕдс ссаадаааде дЕЕЕдаадсЕ дсадссаааЕ ссаЕсааддс адссЕссЕсс 960 асддадаадс ссссЕдаЕдд СЕЕСЕддсЕа ддададсадс СддСдСдсЕд дсаадсаддс 1020
- 68 009216 ассасссеСС садессССсс асдСсссаад ддадссдсса сссдссдсса СССдссассС ддаасаСССС дсассассас асдасСдсса СсаСддаддд дсдсССдсса СддасаСдда сссадссасс ссССссдсад саадССБдес сссссаедсс сдсдсасдас адассдСддс ссассссасс СааСдддСда ддССассаас 1080 сааСассСдс ддссадедда адасдСддсс 1140 аСсСсасадС саСссасддд сасСдССаСд 1200 дсссссдасе дддсссдааа асдааССддс 1280 дадессадда сддсадсддс ддааддсссс 1320 СасаасаССс сасадасада СдадСсаСда 1380 <210> 24 <211> 459 <212> Белок <213> Человек (Ното вархепв) <400> 24
| МеС А1а Зег Мес ТЬг | С1у | С1у | С1п С1п Мес <31у Агд 31у Зег МеС ТЬг | ||||||||||||
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Не | Зег | Авр | Зег | Рго | Агд | З1и | С1п | Авр | С1у | Зег | ТЬг | С1п | Н15 | С1у | 11е |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Агд | Ьеи | Рго | Ьеи | Агд | Зег | (Ну | Ьеи | <31у | С1у | А1а | Рго | Ьеи | С1у | Ьеи | Агд |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ьеи | Рго | Агд | (Ни | ТЬг | Авр | (Ни | С1и | Рго | 01и | С1и | Рго | С1у | Агд | Агд | 01у |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Зег | РЬе | ν«ι | С1и | МеС | Уа1 | Азр | Азп | Ьеи | Агд | (Пу | Ьуз | Зег | <31у | (Нп | (Ну |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Туг | Туг | Уа1 | <31и | МеС | ТЬг | Уа1 | □1у | Зег | Рго | Рго | 51п | ТЬг | Ьеи | Авп | Не |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ьеи | Уа1 | Азр | ТЬг | С1у | Зег | Зег | Авп | РЬе | А1а | Уа1 | <31у | А1а | А1а | Рго | Ηϊβ |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Рго | РЬе | Ьеи | Н18 | Агд | Туг | Туг | С1п | Агд | С1п | Ьеи | Зег | Зег | ТЬг | Туг | Агд |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Авр | Ьеи | Агд | Ьуз | С1у | Уа1 | Туг | Уа1 | Рго | Туг | ТЬг | С1п | С1у | Ьуз | Тгр | С1и |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| е1у | С1и | Ьеи | О1у | ТЬг | Авр | Ьеи | Уа1 | Зег | Не | Рго | ΗΪΒ | (Ну | Рго | Азп | Уа1 |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| ТЬг | Уа1 | Агд | А1а | Азп | Не | А1а | А1а | Не | ТЬг | О1и | Зег | Авр | Ьув | РЬе | РЬе |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Не | Авп | (Ну | Зег | Авп | Тгр | С1и | (Ну | Не | Ьеи | С1у | Ьеи | А1а | Туг | А1а | (Ни |
| 180 | 185 | 190 |
- 69 009216
| 11е | А1а | Агд 195 | Рго | Азр Азр 5ег | Ьеи О1и Рго РЬе РЬе Азр Зег Ьеи Ча1 | ||||||||||
| 200 | 205 | ||||||||||||||
| Ьуз | О1п | ТЬг | Нхз | Уа1 | Рго | Азп | Ьеи | РЬе | Зег | Ьеи | ΗΪ3 | Ьеи | Суз | <31у | А1а |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| 01у | РЬе | Рго | Ьеи | Азп | С1п | Зег | С1и | νβΐ | Ьеи | А1а | Зег | ν»1 | С1у | С1у | Зег |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Мей | Не | 11е | <31у С1у | Не | Азр | Ηΐε | Зег | Ьеи | Туг | ТЬг | С1у | Зег | Ьеи | Тгр | |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Туг | ТЬг | Рго | Не | Агд | Агд | (31и | Тгр | Туг | Туг | С1и | Уа1 | Не | Не | Уа1 | Агд |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Уа1 | <31и | 11е | Азп | <31 у С1п | Азр | Ьеи | Ьуз | Мей | Азр | Суз | Ьуз | О1и | Тух | Азп | |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Туг | Азр | Ьуз | бег | 11е | νβΐ | Азр | Зег | О1у | ТЬг | ТЬг | Азп | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ьуз | Ьуз | Уа1 | РЬе | С1и | А1а | А1а | Ча1 | Ьуз | Зег | 11е | Ьуз | А1а | А1а | Зег | Зег |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| ТЬг | С1и | Ьуз | РЬе | Рго | Азр | (31у | РЬе | Тгр | Ьеи | О1У | О1и | 01п | Ьеи | νβΐ | Суз |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Тгр | С1п | А1а | 01у | ТЬг | ТЬг | Рго | Тгр | Азп | Не | РЬе | Рго | Уа1 | Не | Зег | Ьеи |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Тух | Ьеи | мей | <31у | С1и | Уа1 | ТЬг | АЗП | 01п | Зег | РЬе | Агд | Не | ТЬг | Не | Ьеи |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Рго | <31П | <31 η | Туг | Ьеи | Агд | Рго | Уа1 | 01и | Азр | ν&ι | А1а | ТЬг | Зег | О1п | Азр |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Азр | Суз | Туг | Ьуз | РЬе | А1а | Не | Зег | С1п | Зег | Зег | ТЬг | О1у | ТЬг | νβΐ | МеЕ |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| С1у | А1а | Уа1 | Не | Мей | С1и | О1у | РЬе | Туг | Уа1 | ν&1 | РЬе | Азр | Агд | А1а | Агд |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ьуз | Агд | 11е | С1у | РЬе | А1а | Уа1 | Зег | А1а | Суз | ΗΪ5 | Уа1 | ΗΪ5 | Азр | О1и | РЬе |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Агд | ТЬг | А1а | А1а | Уа1 | С1и | 01у | Рго | РЬе | Уа1 | ТЬг | Ьеи | Азр | Мей | <31и | Азр |
| 435 | 440 | 445 |
- 70 009216
Сув 61у Туг Авп 11е рго <31 п ТЫ Авр С1и Зег
450455 <210>25 <211>1302 <212> ДНК <213> Человек (Ното зар±епз) <400> 25 асдасСсадс аСддСаССсд СсСдссасСд сдСадсддСс СдддСддСдс сееасСдддс 60 сСдсдСсСдс сссдддадас сдасдаадад сссдаддадс ссддссддад дддсадсССС 120 дсддадаСдд сддасаассС даддддсаад Ссддддсадд дсСасСасдС ддадасдасс 180 дсдддсадсс ссссдсадас дсссаасаСс ссддсддаса саддсадсад саассссдеа 240 дсдддсдесд ссссссассс сССссСдсаС сдсьассасс ададдсадсс дсссадсаса 300 Сассдддасс Сссддааддд СдСдСаСдСд сссГасассс адддсаадСд ддааддддад 360 сСдддсассд ассСддСаад саСсссссаС ддссссаасд сеассдСдсд сдссаасасс 420 дссдссаСса сСдааЕсада саадССсССс аСсаасддсС ссаасСддда аддсаСссСд 480 дддссддссс аСдсСдадаС СдссаддссС дасдассссс СддадссССС ссссдаессс 540 ссддсааадс адаоссасдС ссссааоссс ССсСсссСдс аоссссдсдд сдсСддсССс 600 ссссСоаасс адСсСдаадС дсСддссСсС дСсддаддда дсаСдассаС СддаддСасс 660 дассасссдс СдСасасадд садссссСдд СаСасассса Сссддсддда дсддсассас 720 даддСсаСоа ССдСдсдддС ддадаСсааС ддасаддаСс СдааааСдда ссдсааддад 780 СасаасСаСд асаададсас СдСддасадС ддсассаеса асссссдссс дсссаадааа 840 дсдсссдаад сСдсадСсаа асссассаад дсадсссссс ссасддадаа дссссссдас 900 ддСССсСддс Саддададса дсСддСдСдс Сддсаадсад дсассасссс седдаасасс 960 ССсссадСса СссоасСсСа ссСаасдддЕ даддССасса аосадСсссс ссдсаСсасс 1020 аСссССссдс адсааСассС дсддссадСд даадасдСдд ссасдсссса адасдассдс 1080 СасаадСССд ссаСсСсаса дСсаСссасд ддсасСдССа СдддадсСдС Сассасддад 1140 ддсССсСаед седСсСССда Ссдддсссда аааедааССд дсСССдеСдС садсдсССдс 1200 сасдсдсасд асдадсссад дасддсадсд дсддааддсс сесесдссас сссддасасд 1260 даадасСдСд дсСасаасаС Сссасадаса даСдадСсаС да 1302 <210> 26 <211> 433 <212> Белок <213> Человек (Ното зархвпз)
| <400> 26 | 11е Агд | Ьеи | Рго | Ьеи Агд Зег 61у Ьеи С1у 61у | |||||||||||
| МеС ТЬг 1 | С1п | Ηίβ 61у 5 | |||||||||||||
| 10 | 15 | ||||||||||||||
| А1а | Рго | Ьеи | 61у | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Агд | С1и | ТЬг | Азр | 61и | О1и | Рго | С1и |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| 61ч | Рго | С1у | Агд | Агд | 61у | Зег | РЬе | Уа1 | 61ч | МеС | ν*ι | Азр | Азп | Ьеи | Агд |
| 35 | 40 | 45 |
- 71 009216
| (31у Ьуз 50 | Зег С1у С1п Е1у | Туг 55 | Туг Уа1 С1и МеЕ | ТЫ νβΐ 60 | С1у | Зег | Рго | ||||||||
| Рго | С1п | ТЬг | Ьеи | Азп | Не | Ьеи | νβΐ | Азр | ТЬг | С1у | Зег | Зег | Азп | РЬе | А1а |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Уа1 | (31у | А1а | А1а | Рго | Ηίε | Рго | РЬе | Ьеи | Н13 | Агд | Туг | Туг | С1п | Агд | С1п |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ьеи | Зег | Зег | ТЬг | Туг | Агд | Азр | Ьеи | Агд | Ьуз | С1у | νβΐ | Туг | Уа1 | Рго | Туг |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| ТЫ | С1п | С1у | Ьуз | Тгр | С1и | С1у | О1и | Ьеи | <31у | ТЫ | Азр | Ьеи | Уа1 | Зег | Не |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Рго | ΗΪ5 | С1у | Рго | АЗП | Уа1 | ТЫ | Уа1 | Агд | А1а | Азп | 11е | А1а | А1а | Не | ТЫ |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| (31и | Зег | Азр | Ьуз | РЬе | РЬе | 11е | Азп | С1у | Зег | Азп | Тгр | С1и | С1у | 11е | Ьеи |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| 01у | Ьеи | А1а | Туг | А1а | С1и | Не | А1а | Агд | Рго | Азр | Азр | Зег | Ьеи | С1и | Рго |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| РЬе | РЬе | Азр | Зет | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1п | ТЫ | Ηί3 | V·! | Рго | Азп | Ьеи | РЬе | Зег |
| 130 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ьеи | ΗΪ5 | Ьеи | Суз | (31у | А1а | О1у | РЬе | Рго | Ьеи | Азп | С1п | Зег | С1и | ν<ι | Ьеи |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| А1а | Зег | ν*1 | С1у | С1у | Зег | Мес | Не | 11е | С1у | С1у | 11е | Азр | Η1Ξ | Зег | Ьеи |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Туг | ТЫ | 61у | Зег | Ьеи | Тгр | Туг | ТЬг | Рго | Не | Агд | Агд | С1и | Тгр | Туг | Туг |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| С1и | Уа1 | Не | 11е | Уа1 | Агд | V*! | С1и | Не | Азп | С1у | С1п | Азр | Ьеи | Ьуз | МеС |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Азр | Суз | Ьуз | С1и | Туг | Азп | Туг | Азр | Ьуз | Зег | Не | Уа1 | Азр | Зег | С1у | ты |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| ТЫ | Азп | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Ьуз | Ьуз | Уа1 | РЬе | 01и | А1а | А1а | Уа1 | Ьуз | Зег |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Не | Ьуз | А1а | А1а | Зег | Зег | ТЫ | <31и | Ьуз | РЬе | Рго | Азр | С1у | РЬе | Тгр | Ьеи |
290 295 300
- 72 009216
| С1у С1и С1п Ьеи Уа1 Суз Тгр С1п | |||||||
| 305 | 310 | ||||||
| РЬе | Рго | V»! 11е | Зег Ьеи | Туг | Ьеи | ||
| 325 | |||||||
| РЬе | Агд | Не ТЬг | 11е Ьеи | Рго | αΐη | ||
| 340 | |||||||
| ν<1 | А1а | ТЬг Зег | 01п Азр | Азр | Суз | ||
| 355 | 360 | ||||||
| Зег | ТЬг | С1у ТЬг | Уа1 МеЕ | (31у | А1а | ||
| 370 | 375 | ||||||
| Уа1 | РЬе | Азр Агд | А1а Агд | Ьуз | Агд | ||
| 385 | 390 | ||||||
| Н1з | ν*1 | Н1з Азр | <Э1и РЬе | Агд | ТЬг | ||
| 405 | |||||||
| ТЬг | Ьеи | Азр Мее | С1и Азр | Суз | С1у | ||
| Л Л | |||||||
| Зег | |||||||
| <210> 27 | |||||||
| <211> 1276 | |||||||
| <212> ДНК | |||||||
| <213> Человек | (Ното | зархепз) | |||||
| <400 | > 27 | ||||||
| аЕддсСадса | ЕдасЕддедд | асадсаааед | |||||
| ссдсЕддасЕ | сЕддЕаЕсда | аассдасдда | |||||
| ддсаадСсдд | ддсадддсСа | сСаедЕддад | |||||
| аасаЕссСдд | ЕддаЕасадд | садсадЕаас | |||||
| сЕдсаЕсдсЕ | асеассадад | дсадседесс | |||||
| СаЕдСдсссЕ | асасссаддд | саадЕдддаа | |||||
| ссссаЕддсс | ссаасдЕсас | ЕдЕдсдЕдсс | |||||
| ЕЕсЕЕсаСса | асддсЕссаа | сЕдддааддс | |||||
| аддссЕдасд | асЕсссЕдда | дссЕЕЕсЕСЕ | |||||
| аассЕсЕСсЕ | ссседсассЕ | ЕЕдЕддЕдсЕ | |||||
| дссесЕдСсд | дадддадсаЕ | даесаЕЕдда | |||||
| сСсЕддЕаСа | сасссаессд | дсдддад^дд | |||||
| аЕсааЕддас | аддаЕсЕдаа | ааЕддасЕдс |
| А1а | С1у | ТЬг 315 | ТЬг | Рго | Тгр | Азп | 11е 320 |
| МеЕ | □1у 330 | 61и | Уа1 | ТЬг | АЗП | С1п 335 | Зег |
| С1П 345 | Туг | Ьеи | Агд | Рго | Уа1 350 | £1и | Азр |
| Туг | Ьуз | РЬе | А1а | 11е 365 | Зег | С1п | Зег |
| Уа1 | 11е | Мес | С1и 380 | С1у | РЬе | Туг | Уа1 |
| 11е | С1у | РЬе 395 | А1а | Уа1 | Зег | А1а | Суз 400 |
| А1а | А1а 410 | Уа1 | С1и | С1у | Рго | РЬе 415 | Уа1 |
| Туг л η ₽ 4Ζ3 | Азп | Не | Рро | (31п | ТЬг □* *! Л ч и | Азр | С1и |
ддСсдсддае сдаедасСаЕ сЕсЕдасЕсЕ 60
ЕссЕЕСдЕдд адаеддЕдда саассСдадд 120 аСдасодЕдд дсадсссссс дсадасдсЕс 180
ЕЕЕдсадЕдд дЕдсЕдсссс ссассссЕЕс 240 адсасаЕасс дддассСссд даадддсдЕд 300 ддддадсЕдд дсассдассс ддЕаадсаЕс 360 аасаЕЕдсСд ссассасЕда аСсадасаад 420 аесседдддс Еддссеаедс ЕдадаЕЕдсс 480 дасссссгдд Еааадсадас ссасдЕЕссс 540 ддсЕСссссс СсаассадЕс ЕдаадЕдсЕд 600 ддСаеедасс асЕсдсЕдСа сасаддсадС 660
Еасеасдадд сеасеаСЕдЕ дсдддЕддад 720 ааддадЕаса асеаедасаа дадсаеедсд 780
- 73 009216 дасадЕддса ссассаассЕ ЕсдЕЕЕдссс аадааадсдс ЕЕдаадсЕдс адЕсаааЕсс 840 аЕсааддсад ссЕсоЕссас ддадаадЕЕС есЕдаЕддЕЕ ЕсЕддсЕадд ададсадсЕд 900 дЕдЕдсЕддс аадсаддсас сассссЕЕдд аасаЕЕЕЕсс садЕсаЕсгс асЕсЕассЕа 960 агдддсдадд ЕЕассаасса дЕссЕЕссдс аЕсассаЕсс ЕЕссдсадса аЕассЕдсдд 1020 ссадЕддаад аЕдЕддссас дЕсссаадас дасЕдЕЕаса адЕЕЕдссаЕ сЕсасадЕоа 1080 Ессасдддса сЕдЕЕаЕддд адсЕдЕЕаЕс аЕддадддсЕ ЕсЕасдЕЕдЕ сЕЕЕдаЕсдд 1140 дсссдаааас дааЕЕддсЕЕ ЕдсЕдЕсадс дсЕЕдссаЕд Едсаодагда дЕЕсаддасд 1200 деадеддЕдд ааддсссЕЕЕ ЕдЕсассЕЕд дасаЕддаад асЕдЕддсЕа саасаЕЕсса 1260 садасадаЕд адЕсаЕда 1278 <210> 28 <211> 425 <212> Белок <213> Человек (Ното зархёпз) <400> 28
| МеЕ 1 | А1а Зег МеЕ | ТЬг СХу СХу С1п С1п МеЕ СХу Агд | С1у | Зег МеЕ 15 | ТЬг | ||||||||||
| 5 | 10 | ||||||||||||||
| Ле | Бег | Азр | Бег | Рго | Ьеи | Азр | Бег | С1у | Ле | С1и | ТЬг | Авр | С1у | Зег | РЬе |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| УаХ | С1и | МеЕ | νβΐ | Азр | АЗП | Ьеи | Агд | С1у | Ьуз | Бег | С1у | С1п | СХу | Туг | Туг |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Уа1 | С1и | МеЕ | ТЬг | УаХ | С1у | Бег | Рго | Рго | С1п | ТЬг | Ьеи | АЗП | Ле | Ьеи | Уа1 |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Азр | ТЬг | С1у | Бег | Бег | Азп | РЬе | А1а | УаХ | О1у | А1а | А1а | Рго | Нхз | Рго | РЬе |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ьеи | ΗΪ5 | Агд | Тут | Туг | С1п | Агд | С1п | Ьеи | Зег | Зег | ТЬг | Туг | Агд | Азр | Ьеи |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Агд | Ьуз | <ЗХу | Уа1 | Туг | Уа1 | Рго | Тух | ТЬг | С1П | С1у | Ьув | Тгр | С1и | С1у | СХи |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ьеи | СХу | ТЬг | Азр | Ьеи | Уа1 | Бег | Ле | Рго | Н1Б | С1у | Рго | Авп | Уа1 | ТЬг | УаХ |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Агд | А1а | Азп | Ле | А1а | А1а | Ле | ТЬг | СХи | Зег | Азр | Ьуз | РЬе | РЬе | Ле | Азп |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| СХу | Бег | Азп | Тгр | С1и | С1у | Ле | Ьеи | С1у | Ьеи | АХа | Туг | А1а | С1и | Ле | А1а |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Агд | Рго | Аар | Азр | Бег | Ьеи | СХи | Рго | РЬе | РЬе | Азр | Бег | Ьеи | УаХ | Ьув | С1п |
165 170 175
- 74 009216
| ТЬг | ΗΪ5 | Ча1 | Рго 180 | Азп | Ьеи | РЬе Зег Ьеи 185 | Ηίβ | Ьеи Сув С1у А1а 190 | С1у | РЬе | |||||
| Рго | Ьеи | Авп | С1п | 2ег | С1и | Ча1 | Ьеи | А1а | Зег | Ча1 | <31у | В1у | Зег | мес | Не |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| 11е | С1у | С1у | Не | Авр | Η15 | Зег | Ьеи | Туг | ТЬг | С1у | Зег | Ьеи | Тгр | туг | ТЬг |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Рго | 11е | Агд | Агд | <31и | Тгр | Туг | Туг | С1и | Ча1 | Не | Не | Ча1 | Агд | Ча! | С1и |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Не | Азп | С1у | С1п | Авр | Ьеи | Ьув | Мес | Авр | Суз | Ьув | 01и | Туг | Авп | Туг | Авр |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ьуа | Бег | 11е | Ча1 | Аар | Бег | 01у | ТЬг | ТЬг | Азп | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Ьуз | Ьув |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ча1 | РЬе | С1и | А1а | А1а | Ча1 | Ьув | Зег | Не | ьуз | А1а | А1а | Зег | Зег | ТЬг | С1и |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ьуз | РЬе | Рго | Авр | С1у | РЬе | Тгр | Ьеи | 01у | С1и | С1п | Ьеи | Ча1 | сув | Тгр | С1п |
| 2Э0 | 295 | 300 | |||||||||||||
| А1а | <31у | ТЬг | ТЬг | Рго | Тгр | Авп | Не | РЬе | Рго | Ча1 | 11е | Бег | Ьеи | Туг | Ьеи |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| МеС | 01у | С1и | Ча1 | ТЬг | Аап | С1п | Зег | РЬе | Агд | Не | ТЬг | Не | Ьеи | Рго | С1п |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| С1п | Туг | Ьеи | Агд | Рго | Ча1 | С1и | Авр | Ча1 | А1а | ТЬг | Зег | С1п | Аар | Авр | Сув |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Туг | Ьув | РЬе | А1а | Не | Бег | <31п | Зег | Зег | ТЬг | <31у | ТЬг | Ча1 | МеС | С1у | А1а |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ча1 | 11е | МеС | С1и | С1у | РЬе | Туг | Ча1 | Ча1 | РЬе | Азр | Агд | А1а | Агд | Ьув | Агд |
| 370 | 375 | ЗВО | |||||||||||||
| Пе | 01у | РЬе | А1а | Ча1 | Зег | А! а | Суа | Н1в | Ча1 | Ηίε | Аар | О1и | РЬе | Агд | ТЬг |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| А1а | А1а | Ча! | С1и | С1у | Рго | РЬе | Ча1 | ТЬг | Ьеи | Аар | Мес | 01и | Азр | Суа | С1у |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Туг | Азп | 11е | Рго | <31п | ТЬг | Аар | <31и | Зег | |||||||
| 420 | 425 |
- 75 009216 <210> 29 <211> 1362 <212> ДНК <213> Человек (Ното зар!епз) <400> 29 аЕддсссаад сссЕдсссЕд дсЕссЕдсЕд ЕддаЕдддсд сдддадЕдсЕ дссЕдсссас 60 ддсасссадс асддсаЕссд дсЕдссссЕд сдсадсддсс Еддддддсдс сссссЕдддд 120 сЕдсддсЕдс сссдддадас сдасдаадад сссдаддадс ссддссддад дддсадсЕЕЕ 180 дЕддадаЕдд ЕддасаассЕ даддддсаад Есддддсадд дсЕасгасдЕ ддадасдасс 240 дЕдддсадсс ссссдсадас дсЕсаасаЕс сЕддЕддаЕа саддсадсад ЕаасЕЕЕдса 300 дЕдддЕдсЕд ссесссассс сЕЕссЕдсаЕ сдсЕасЕасс ададдсадсЕ дЕссадсаса 360 Еассдддасс Еседдааддд ЕдЕдЕаЕдЕд сссЕасассс адддсаадЕд ддааддддад 420 сЕдддсассд ассЕддЕаад саЕсссссаЕ ддссссаасд есассдЕдсд ЕдссаасаЕЕ 480 дсЕдссаЕса сЕдааЕсада саадЕЕсЕЕс аЕсаасддсЕ ссаасСддда аддсаЕссЕд 540 дддсЕддссЕ аЕдсЕдадаЕ ЕдссаддссЕ дасдассссс ЕддадссЕЕЕ сЕЕЕдасЕсЕ 600 СЕддЕааадс адасссасдЕ ЕсссаассЕс ЕЕсЕссссдс ассЕЕЕдЕдд ЕдсЕддсЕЕс 660 ссссЕсаасс адЕсЕдаадЕ дсЕддссЕсЕ дЕсддаддда дсаЕдаСсаЕ ЕддаддЕаЕс 720 дассасЕсдс ЕдЕасасадд садЕсЕсЕдд ЕаЕасассса Ессддсддда дЕддЕаЕЕаЕ 780 даддЕсаЕса ЕЕдЕдсдддЕ ддадаЕсааЕ ддасаддаЕс ЕдааааЕдда сЕдсааддад 840 ЕасаасЕаЕд асаададсаЕ ЕдЕддасадЕ ддсассасса ассЕЕсдЕЕЕ дсссаадааа 900 дЕдЕЕЕдаад сЕдсадЕсаа аЕссаЕсаад дсадссЕссЕ ссасддадаа дЕЕСссЕдаЕ 960 ддЕСЕсЕддс Еаддададса дсЕддЕдЕдс Еддсаадсад дсассасссс ЕЕддаасаЕЕ 1020 ЕЕсссадЕса ЕсЕсасЕсЕа ссЕааЕдддЕ даддЕЕасса ассадЕссЕЕ ссдсаЕсасс 1080 аЕссЕЕссдс адсааЕассЕ дсддссадЕд даадаЕдЕдд ссасдЕссса адасдасЕдЕ 1140 ЕасаадЕЕЕд ссассЕсаса дЕсаСссасд ддсасЕдЕЕа ЕдддадсЕдЕ ЕаЕсаЕддад 1200 ддсЕЕсЕасд ЕЕдЕсЕЕЕда Есдддсссда ааасдааЕЕд дсЕЕЕдсЕдЕ садсдсЕЕдс 1260 саЕдЕдсасд аЕдадЕЕсад дасддсадсд дЕддааддсс сЕЕЕЕдЕсас сЕЕддасаЕд 1320 даадасЕдЕд дсЕасаасаЕ Ессасадаса даЕдадЕсаЕ да 1362 <210> 30 <211> 453 <212> Белок <213> Человек (Ното зархепз) <400> 30
| МеЕ | А1а | С1п | А1а | Ьеи | Рго | Тгр | Ьеи | Ьеи | Ьеи | Тгр | МеЕ | С1у | А1а | С1у | Уа1 |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ьеи | Рго | А1а | Н15 | <31у | ТЬг | С1п | Ηίβ | С1у | Не | Агд | Ьеи | Рго | Ьеи | Агд | Зег |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| <31у | Ьеи | С1у С1у | А1а | Рго | Ьеи | С1у | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Агд | С1и | ТЬг | Азр | |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| <Э1и | С1и | Рго | С1и | <31 и | Рго | <31у | Агд | Агд | О1у | Зег | РЬе | Уа1 | С1и | МеЕ | Уа1 |
- 76 009216
55 60
| Азр Азп Ьеи 65 | Агд | С1у Ьуз Зег С1у 01п С1у Туг Туг Уа1 (31и МеС ТЫ | |||||||||||||
| 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
| νβΐ | С1у | Зег | Рго | Рго | С1п | ТЫ | Ьеи | Азп | Не | Ьеи | Уа1 | Авр | ТЬг | С1у | Зег |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Зег | АЗП | РЬе | А1а | Уа1 | С1у | А1а | А1а | Рго | Н1з | Рго | РЬе | Ьеи | ΗΪ3 | Агд | Туг |
| 100 | 105 | но | |||||||||||||
| Туг | С1п | Агд | С1п | Ьеи | Зег | Зег | ТЫ | Туг | Агд | Азр | Ьеи | Агд | Ьуз | С1у | Уа1 |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Туг | Уа1 | Рго | Туг | ТЫ | С1п | (Пу | Ьуз | Тгр | <31и | С1у | <31и | Ьеи | С1у | ТЬг | Азр |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ьеи | Уа1 | Зег | Не | Рго | ΗΪ8 | б1у | Рго | Азп | Уа1 | ТЬг | Уа1 | Агд | А1а | Азп | Не |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| А1а | А1а | Не | ТЬг | С1и | Зег | Азр | Ьуз | РЬе | РЬе | Не | Азп | С1у | Зег | Азп | Тгр |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| С1и | С1у | Не | Ьеи | С1у | Ьеи | А1а | Туг | А1а | С1и | Не | А1а | Агд | Рго | Азр | Азр |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Зег | Ьеи | б1и | Рго | РЬе | РЬе | Азр | Зег | Ьеи | νβΐ | Ьуз | <31п | ТЫ | Н1з | Уа1 | Рго |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Азп | Ьеи | РЬе | Зег | Ьеи | С1п | Ьеи | Суз | <31у | А1а | (31у | РЬе | Рго | Ьеи | Азп | С1п |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Зег | □1и | νβΐ | Ьеи | А1а | Зег | Уа1 | С1у | <31у | Зег | МеС | Не | Не | <31у | С1у | Не |
| 225 | 230 | - | 235 | 240 | |||||||||||
| Азр | ΗΪ5 | Зег | Ьеи | Туг | ТЫ | С1у | Зег | Ьеи | Тгр | Туг | ТЬг | Рго | Не | Агд | Агд |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| С1и | Тгр | Туг | Т“уг | С1и | Уа1 | Не | Не | Уа1 | Агд | Уа1 | С1и | Не | Азп | С1у | С1п |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Азр | Ьеи | Ьуз | МеС | Азр | Суз | Ьуз | С1и | Туг | Азп | Туг | Азр | Ьуз | Зег | Не | Уа1 |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Азр | Зег | 61у | ТЫ | ТЬг | Азп | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Ьуз | Ьуз | Уа1 | РЬе | С1и | А1а |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| А1а | 7а1 | Ьуз | Зег | 11с | Ьуз | А1а | А1а | Зег | Зег | ТЫ | С1и | Ьуз | РЬе | Рго | Азр |
- 77 009216
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| С1у | РЬе | Тгр | Ьеи | С1у | С1и | С1п | Ьеи | Уа1 | Суг | тгр | С1п | А1а | С1у | ТЫ | ТЬг |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Рго | Тгр | А5П | 11е | РЬе | Рго | νβΐ | 11е | Бег | Ьеи | Туг | Ьеи | МеС. | С1у | С1и | Уа1 |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| ТЫ | Азп | <31 η | Бег | РЬе | Агд | Не | ТЫ | 11е | Ьеи | Рго | <?1п | С1п | Туг | Ьеи | Агд |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Рго | νβΐ | (Ни | Агр | Уа1 | А1а | ТЬг | Бег | С1п | Агр | Агр | Суз | Туг | Ьув | РЬе | А1а |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Не | Бег | С1п | Бег | Бег | ТЫ | С1у | ТЬг | Уа1 | Мес | <31у | А1а | Уа1 | 11е | МеС | С1и |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| С1у | РЬе | Туг | Уа1 | νβΐ | РЬе | Агр | Агд | А1а | Агд | Ьуз | Агд | 11 е | С1у | РЬе | А1а |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Уа1 | Бег | А1а | Суз | Ηίδ | Уа1 | Н1в | Агр | С1и | РЬе | Агд | ТЬг | А1а | А1а | ν31 | С1и |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| С1у | Рго | РЬе | Уа1 | ТЬг | Ьеи | Агр | МеС | С1и | Азр | Суг | □1у | Туг | Азп | 11е | Рго |
| 435 | 440 | 445 |
<31п ТЫ Адр С1и Бег
450 <210>31 <211>1380 <212> ДНК <213> Человек (Ното зар!епз) <400> 31 асддсссаад ссссдсссСд дсСссСдсСд ЕддаСдддсд сдддадСдсС дссСдсссас60 ддсасссадс асддсаСссд дсСдссссСд сдсадсддсс сддддддсдс сссссСдддд120 ссдсддсЕдс сссдддадас сдасдаадад сссдаддадс ссддссддад дддеадсссс180 дсддадасдд сддасаассс даддддсаад ссддддсадд дсСассасдс ддадасдасс240 дСдддсадсс ссссдсадас дсСсаасаСс сСддсддаСа саддсадсад саассссдса300 дсдддсдссд ссссссассс ссссссдеас сдсс.асСасс ададдсадсс дСссадсаеа360
Сассдддасс сссддааддд ЕдСдСаСдСд ссссасассс адддсаадСд ддааддддад420 ссдддсассд ассСддСаад саСсссссаС ддссссаасд СсасСдСдсд СдссаасаСС480 дсСдссаСса сЕдааСсада саадЕСссЕс аЕсаасддсС ссаасСддда аддсаСссСд540 дддсСддссс аЕдсСдадаС Едссаддссс дасдасЕссс сддадссЕСС сСССдаессЕ600 ссддсааадс адасссасдС СсссаассСс ССсссссСдс асесссдсдд сдссддсСЕс660 ссссСсаасс адсосдаадс дсСддссСсс дссддаддда дсасдассас сддаддсасс720
- 78 009216 дассасЕсдс ЕдЕасасадд садЕсЕсЕдд ЕаЕасассса Ессддсддда дЕддЕаЕЕаЕ 780 даддЕсасса ЕЕдЕдсдддЕ ддадаЕсааЕ ддасаддаЕс ЕдааааЕдда сЕдсааддад 840 ЕасаасЕаЕд асаададсаЕ ЕдЕддасадЕ ддсассасса ассЕЕсдЕЕЕ дсссаадааа 900 дСдЕЕЕдаад сЕдсадЕсаа аЕссаЕсаад дсадссгссЕ ссасддадаа дЕЕсссЕдаЕ 960 ддЕЕЕсЕддс Еаддададса дсЕддЕдЕдс Еддсаадсад дсассасссс ЕЕддаасаЕЕ 1020 ЕЕсссадЕса ЕСЕсасЕсЕа ссЕааЕдддЕ даддЕЕасса ассадЕссЕЕ ссдсаЕсасс 1080 аЕссЕЕссдс адсааЕассЕ дсддссадЕд даадаЕдЕдд ссасдЕссса адасдасЕдЕ 1140 ЕасаадЕЕЕд ссаЕсЕсаса дЕсаЕссасд ддсасЕдЕЕа ЕдддадсЕдЕ ЕаЕсаЕддад 1200 ддсЕЕсЕасд ЕЕдЕСЕЕЕда Есдддсссда ааасдааЕЕд дсЕЕЕдсгдЕ садсдсЕЕдс 1260 саЕдЕдсасд агдадЕЕсад дасддсадсд дЕддааддсс сЕЕЕЕдЕсас сЕЕддасаЕд 1320 даадасЕдЕд дсЕасаасаЕ Ессасадаса даЕдадЕсас адсадсадса дсадсадсда 1380 <210> 32 <211> 459 <212> Белок <213> Человек (Ното зархепз) <400> 32
| МеЕ Л1а 1 | С1П А1а | Ьеи Рго Тгр Ьеи Ьеи Ьеи Тгр МеЕ <31у А1а 61у Уа1 | |||||||||||||
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Ьеи | Рго | А1а | ΗΪ3 | С1у | ТЫ | <31п | Ηίβ | 61у | 11е | Агд | Ьеи | Рго | Ьеи | Агд | Бег |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| С1у | Ьеи | (31у | (31у | А1а | Рго | Ьеи | 61у | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Агд | (Пи | ТЬг | Азр |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| <31и | (31и | Рго | С1и | С1и | Рго | <31у | Агд | Агд | С1у | Бег | РЬе | Уа1 | С1и | МеЕ | Уа1 |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Азр | Азп | Ьеи | Агд | С1у | Ьуз | Бег | С1у | С1п | С1у | Туг | Туг | Уа1 | (Ии | МеЕ | ТЬг |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Уа1 | О1у | Бег | Рго | Рго | С1п | Т»рг | Ьеи | Азп | Пе | Ьеи | Уа1 | Азр | ТЫ | 61у | Бег |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Бег | Азп | РЬе | А1а | 17а1 | 61у | А1а | А1а | Рго | Ηίβ | Рго | рИе | Ьеи | Ηίβ | Агд | Туг |
| 100 | 105 | но | |||||||||||||
| Туг | 61п | Агд | С1п | Ьеи | Бег | Бег | ТЫ | Туг | Агд | Азр | Ьеи | Агд | Ьув | О1у | Уа1 |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Туг | Уа1 | Рго | Туг | ТЫ | Э1п | (31у | Ьуз | Тгр | <31и | 61у | 61ц | Ьеи | (31у | ТЬг | Азр |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ьеи | Уа1 | Бег | 11е | Рго | Ηίβ | (Пу | Рго | Азп | Уа1 | ТЬг | Уа1 | Агд | А1а | Азп | 11е |
| 145 | 150 | 155 | 160 |
- 79 009216
| А1а | А1а | Не ТЬг (Пи 165 | Бег | Азр Ьуз | РЬе РЬе Не Азп С1у Бег Азп Тгр | ||||||||||
| 170 | 175 | ||||||||||||||
| С1и | С1у | Не | Ьеи | О1у | Ьеи | А1а | Туг | А1а | С1и | Не | А1а | Агд | Рго | Азр | Азр |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Бег | Ьеи | (Пи | Рго | РЬе | РЬе | Азр | Бег | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1п | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Рго |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Азп | Ьеи | РЬе | Бег | Ьеи | С1п | Ьеи | Сув | С1у | А1а | (31у | РЬе | Рго | Ьеи | Азп | (Нп |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Бег | С1и | Уа1 | Ьеи | А1а | Бег | Уа1 | (Ну | С1у | Бег | Мес | 11е | Не | (Пу | С1у | Не |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Азр | Н1з | Бег | Ьеи | Туг | ТЬг | (Ну | Бег | Ьеи | Тгр | Туг | ТЬг | Рго | Не | Агд | Агд |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| С1и | Тгр | Туг | Туг | С1и | Уа1 | Не | Не | Уа1 | Агд | Уа1 | С1и | Не | Азп | <31у | С1п |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Азр | Ьеи | Ьуз | «ее | Азр | Суз | Ьув | (Ни | Туг | Азп | Туг | Азр | Ьуз | Бег | Не | Уа1 |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Азр | Бег | С1у | ТЬг | ТЬх | Азп | Ьеи | Агд | Ьеи | Рго | Ьуз | Ьуз | Уа1 | РЬе | С1и | А1а |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| А1а | Уа1 | ьуз | Бег | 11е | ьуз | А1а | А1а | Зег | Бег | ТЬг | (Ни | Ьуз | РЬе | Рго | Азр |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| С1у | РЬе | Тгр | Ьеи | (Пу | С1и | С1п | Ьеи | Уа1 | Суз | Тгр | С1п | А1а | О1у | ТЬг | ТЬх |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Рхо | Тгр | Авп | Не | РЬе | Рго | Уа1 | 11е | Бег | Ьеи | Туг | Ьеи | МеС | О1у | С1и | Уа1 |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| ТЬГ | Азп | С1П | Бег | РЬе | Агд | Не | ТЬх | Не | Ьеи | Рго | <Э1п | (Нп | Туг | Ьеи | Агд |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Рхо | Уа1 | (Пи | Азр | Уа1 | А1а | ТЬг | Зег | С1п | Азр | Азр | Суз | Туг | Ьуз | РЬе | А1а |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Не | Бег | <31п | Бег | Бег | ТЬг | С1у | ТЬг | Уа1 | МеС | (Ну | А1а | Уа1 | Не | Мес | <31 и |
| 385 | 390 | 395 | - | 400 | |||||||||||
| Б1у | РЬе | Туг | Уа1 | Уа1 | РЬе | Азр | Агд | А1а | Агд | Ьуз | Агд | Не | (Пу | РЬе | А1а |
| 405 | 410 | 415 |
- 80 009216
| Уа1 | Зег | А1а | Суз | ΗΪ& | Уа1 | Н15 | Азр | С1и | РЬе | Агд | ТЫ | А1а | А1а | Уа1 | С1и |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| С1у | Рго | РЬе | Уа1 | ТЬг | Ьеи | Азр | МеЕ | <51и | Азр | суз | С1у | туг | Азп | 11е | Рго |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| <51п | ТЫ | Азр | С1и | Зег | Н1з | ΗΪ8 | Н1з | ΗΪ8 | Н13 | Η13 | |||||
| 450 | 455 |
| <210> | 33 | |
| <211> | 25 | |
| <212> | Белок | |
| <213> | Человек | (Ното зархепз) |
| <400> 33 | ||
| Зег С1и | С1п С1п | Агд Агд Рго Агд Азр Рго С1и Уа1 Уа1 Азп Азр С1и |
| 1 | 5 | 10 | 15 |
| Зег Зег | Ьеи Уа1 Агд Ηίβ Агд Тгр | ЬуЗ | |
| 20 | 25 | ||
| <210> | 34 | ||
| <211> | 19 | ||
| <212> | Белок | ||
| <213> | Человек (Ното зархепе) |
<400> 34
Зет С1и С1п Ьеи Агд С1п С1п Ηίε Азр Αερ РЬе А1а Αερ Азр 11е Зег
Ьеи Ьеи Ьуз
| <210> | 35 | ||
| <211> | 29 | ||
| <212> | ДНК | ||
| <213> | Человек (Ното | зархепз) | |
| <400> | 35 | ||
| дЕддаЕссас ссадсасддс | аЕссддсЕд | 29 | |
| <210> | 36 | ||
| <211> | 36 | ||
| <212> | ДНК | ||
| <213> | Человек (Ното | зархепз) |
- 81 009216 <400> 36 дааадсйййс айдасйсайс йдйсйдйдда айдййд <210>37 <211>39 <212> ДНК <213> Человек (Ното зархепз) <400> 37 дайсдайдас йайсйсйдас йсйссдсдйд аасаддасд39 <2Ю>39 <211>39 <212> ДНК <213> Человек (Ново зархепз) <400> 38 дайссдйссй дййсасдедд ададйсадад айадйсайс <210> 39 <211> 77 <212> ДНК <213> Синтетическая последовательность <220>
<223> Описание синтетической последовательности: Ни-Аер2 <400> 39 сддсайссдд сйдссссйдс дйадсддйсй дддйддйдсй ссасйдддйс йдсдйсйдсс 60 ссдддадасс дасдаад77 <210>40 <211>77 <212> ДНК <213> Синтетическая последовательность <220>
<223> Описание синтетической последовательности: Ни-Азр2 <400> 40 сййсдйсддй сйсссддддс адасдсадас ссадйддадс ассасссада ссдсйасдса 60
<210>
<211>
<212>
<213>
ДНК
Синтетическая последовательность
- 82 009216 <220>
<223> Описание синтетической последовательности: сайт расщепления сазразе 8 <400> 41 дассдасдас Саеесседас ьеессдсСдд ассседдсае сдааассдас д51 <210>42 <211>51 <212> ДНК <213> Синтетическая последовательность <220>
<22 3> Описание синтетической последовательности: сайт расщепления сазраее 8 <400> 42 даСссдСсдд ссссдасасс ададсссадс ддададесад адаСадСсаС с51 <210>43 <211>32 <212> ДНК <213> Человек (Ното зархепз) <400> 43 ааддаСсссС Сдсддадасд дсддасаасс Сд32 <210>44 <211>36 <212> ДНК <213> Человек (Ното зархепа) <400> 44 дааадсГССс аЬдасСсаСс СдСсСдСдда аьдССд36 <210>45 <211>24 <212> ДНК <213> Синтетическая последовательность <220>
<223> Описание синтетической последовательности: метка 6-Н±з <400> 45 дассдсаСса ссассассас саСд 24 <210> 46
- 83 009216 <211> 24 <212> ДНК <213> Синтетическая последовательность <220>
<223> Описание синтетической последовательности: метка 6-Н±з <400> 46 даЕссаЕддЕ даЕддЕдаЕд аЕдс 24 <210> 47 <211> 22 <212> ДНК <213> Синтетическая последовательность <220>
<223> Описание синтетической последовательности: элемент введения КК <400> 47 дасЕдассас ЕсдассаддЕ Ес22 <210>48 <211>51 <212> ДНК <213> Синтетическая последовательность <220>
<223> Описание синтетической последовательности: элемент введения КК <400> 48 сдааЕЕаааЕ Ессадсасас ЕддссасЕЕс ЕсдЕЕсЕдса гсЕсааадаа с 51 <210> 49 <211> 26 <212> ДНК <213> Синтетическая последовательность <220>
<223> Описание синтетической последовательности: элемент введения КК <400> 49 сдааЕЕаааЕ Ессадсасас ЕддсЕа 26
Claims (36)
- ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ1. Способ идентификации средства, которое модулирует активность аспартилпротеазы Азр2 человека, участвующей в процессинге предшественника амилоидного белка (АРР) в в-амилоид, включающий стадии:(a) обеспечение контактирования Азр2 и ее субстрата АРР, содержащего сайт процессинга в-амилоида, в присутствии и в отсутствие исследуемого средства, где Азр2 кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, которая гибридизируется с последовательностью, комплементарной 8Е0 ΙΌ N0: 3 или 8Е0 ΙΌ Ν0: 5 в следующих жестких условиях гибридизации:(1) гибридизация при 42°С в течение около 2,5 ч в 6х88С и 0,1% 8Ό8 и (2) промывка при 65°С в 1х88С и 0,1% 8Ό8; и (b) определение и сравнение соответствующих активностей Азр2 в отношении процессинга АРР в присутствии и в отсутствие исследуемого средства, где средство, которое является ингибитором Азр2, снижает активность процессинга АРР, а средство, которое является агонистом Азр2, повышает эту ак- 84 009216 тивность.
- 2. Способ по п.1, где субстрат АРР содержит сайт, который расщепляется β-секретазой.
- 3. Способ по п.2, где указанный сайт расщепления содержит последовательность Р2-Р1-Э-А, где Р2 представляет собой К или Ν, а Р1 представляет собой М или Ь.
- 4. Способ по п.3, где сайт расщепления содержит последовательность КМЭА.
- 5. Способ по п.3, где сайт расщепления содержит последовательность ИЕ-ЭА.
- 6. Способ по п.2, где сайт расщепления содержит последовательность ЕУКМОАЕР.
- 7. Способ по п.2, где сайт расщепления содержит последовательность ЖУИЕОАЕРК.
- 8. Способ по любому из предшествующих пунктов, где субстрат АРР содержит карбоксиконцевой дилизин (КК).
- 9. Способ по любому из предшествующих пунктов, где субстрат АРР включает в себя пептид, содержащий спаренный флуорофор и гаситель флуоресценции.
- 10. Способ по любому из предшествующих пунктов, где АРР представляет собой изоформу АРР человека.
- 11. Способ по любому из предшествующих пунктов, где стадию (а) осуществляют в клетке, которая экспрессирует АРР.
- 12. Способ по п.11, где указанное определение активности Акр2 включает измерение продукции βамилоида клеткой в присутствии и в отсутствие исследуемого агента.
- 13. Способ по любому из предшествующих пунктов, где Акр2 стадии (а) является очищенной или выделенной.
- 14. Способ по любому из предшествующих пунктов, где Акр2 содержит аминокислотную последовательность, которая представляет собой:(a) 8Е0 ΙΌ ИО: 6 или ее фрагмент;(b) 8Е0 ΙΌ ИО: 4 или ее фрагмент;(c) последовательность, идентичную (а) или (Ь), за исключением консервативных замен.
- 15. Способ по любому из предшествующих пунктов, где Акр2 содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности БЕЦ ΙΌ ИО: 4, или 8ЕЦ ΙΌ ИО: 6, или их фрагментам, и где аминокислотная последовательность содержит трипептиды ЭТС и Ό8Ο активных сайтов аспартилпротеазы последовательностей 8ЕЦ ΙΌ ИО: 4 или 8ЕЦ ΙΌ ИО: 6.
- 16. Способ по п.15, где идентичность составляет по меньшей мере 95%.
- 17. Способ по п.15, где Акр2 содержит последовательность 8ЕЦ ΙΌ ИО: 4 или ее фрагмент.
- 18. Способ по п.17, где Акр2 содержит аминокислоты 93-291 последовательности 8ЕЦ ΙΌ ИО: 4.
- 19. Способ по п.15, где Акр2 содержит последовательность 8ЕЦ ΙΌ ИО: 6 или ее фрагмент.
- 20. Способ по п.19, где Акр2 содержит аминокислоты 93-266 последовательности 8ЕЦ ΙΌ ИО: 6.
- 21. Способ по любому из предшествующих пунктов, где Акр2 не содержит трансмембранного домена.
- 22. Выделенный или очищенный полипептид Акр2, который характеризуется признаками, раскрытыми в пп.14-21.
- 23. Выделенный или очищенный полинуклеотид, кодирующий полипептид Акр2 по п.22.
- 24. Полинуклеотид по п.23, который содержит полинуклеотиды 277-873 последовательности БЕЦ ΙΌ ИО: 3.
- 25. Полинуклеотид по п.23, который содержит полинуклеотиды 277-798 последовательности БЕЦ ΙΌ ИО: 5.
- 26. Полинуклеотид по п.23, который гибридизируется с последовательностью, комплементарной БЕЦ ΙΌ ИО: 3 или 8ЕЦ ΙΌ ИО: 5, в жестких условиях, определенных в п.1, и который кодирует Акр2, в которой отсутствует трансмембранный домен.
- 27. Полинуклеотид по любому из пп.23-26, который содержит последовательность, которая кодирует сигнальный пептид, слитый с полипептидом Акр2;где сигнальный пептид обеспечивает внеклеточную секрецию Акр2 клеткой-хозяином, трансфицированной полинуклеотидом; иАкр2 секретируется клеткой-хозяином.
- 28. Вектор, который содержит полинуклеотид по любому из пп.23-27.
- 29. Вектор по п.28, который является вектором экспрессии.
- 30. Вектор по п.29, в котором указанный полинуклеотид функционально связан с гетерологичным промотором и экспресируется в клетке-хозяине млекопитающего.
- 31. Вектор по п.30, в котором полинуклеотид функционально связан с гетерологичным промотором и экспрессируется в клетке-хозяине насекомого.
- 32. Клетка-хозяин, трасформированная или трасфицированная полинуклеотидом по любому из пп.23-27 или вектором по любому из пп.28-31.
- 33. Клетка-хозяин по п.32, которая является клеткой млекопитающего.
- 34. Способ получения полипептида Акр2 человека, включающий культивирование клетки-хозяина по п.32 или 33, в условиях, при которых клетка экспрессирует указанный полипептид.- 85 009216
- 35. Способ по п.34. дополнительно включающий выделение полипептида из среды для роста клеток.
- 36. Способ идентификации средства. которое модулирует активность Акр2 человека. раскрытой в пп.14-21. который включает измерение и сравнение соответствующих активностей Акр2 в присутствии и в отсутствие исследуемого средства. где высокий уровень активности Акр2 в присутствии исследуемого средства указывает на то. что средство повышает активность Акр2. а более низкий уровень активности Акр2 указывает на то. что средство понижает активность Акр2.АКХКСССАСТС^ССО^^ОСтаПССТКСТСТЗСТОЗСССАСГГСОСТССТССССССС И С А Ь А Р. АЬЬЬРЬЬАОМАЬЙАСССС<РЗАрГТСССССССССССгсТГСАСаСТОССССТСС<55СТО<>еСОССОССАС<1ААС АРЕЬАРАРГТЬРЦЯУАААТКССХХГ17)С/ГПХХЮа1АССССОСаАСССО»»ССССТССейАССгССАСйСССАСОССТГС ΚννΑΡΤΡαΡΟΤΡΑΕλΗΛΟβί (х^^свссстсслмяжсстоосатсссссосаоасосссссААСТТсттокслтс ЛЬАЬЕРАЬАВРЛСААИРЬАМСТАСАСААССТскэиимасАСТСтоассамвстАстаеетваАЯА'гоствАтаязоАсс уоыьосввскиууьЕмьхстΡΡ(1ΚΙ.0ΙΙ<νΡΤββ5ΝΡΛνΛΟ ассссссаст^ стасатасасасстастттсаслсаслсасрзтстассасатасссстссТРЯ371РТУРЦТЕЯ35ТУН5 ллс«р?гго1м:зтсАСАсталАОТАСлсАСААа<1ААаст(Х5АССсссттсст1ххюаАА κοΓπντνκγτοαεΜτβρνβΕ аАССТСаТСАССАТССССАААаСС'ГГСААТАСТТГТГГГС'ГРСТСААСА'ТТСССАеТАТТ ε Ь V Т I РКСРВТ5РЬУВ1АТ1 ти'вААгаилиААТПХГГПЯтисстамАтаААЛтоаААтааллтасттосссТАост РЕЗЕИЕР1,РС1КЫИС1ЬС1.А тлтоссАслстттсслАскатсАлоттсгстаслйлссттсттсалстссстостаАслТАТЬАХР585ЪЕТЕЕ05Ь¥Т (1ААеСАААСАТССССААССтТтеТССАТКАаАТСТСТОаАССССССТТССССаГ1ССТ 0 а ν ι ΡΜνρίΜΟΜεοχαυρνΑ ашсткшсаидоэдаэдатсттотсттвавтваААтткмссмктпстАТААА сзатнссзъуьввтЕРзьук аСДСАСАТСТЮМТАесССХАТХШиХААСкСТОСТАСЛЪССЛаАПиШАПСТаААА аО1М¥ТР1КЕЕЯУУ81Е1ЬКТТХХ^ААТТОаА<ХИСЛ4ААСССТТМТСТЗОАСТОСА<;АСАСТА1ЛАСССЛСАСААССССЬЕ1СС08ЬМ1.ПСЯЕУМАВКА АТСЗТООЛСАаГОвСАСХАСМТвСТОСОСС1вССССАШЙ<»ИОТТтаАТОС<»К«ТОI ν05βΤΤΕϋΒΕ₽2ΚνΡϋΑνν <мииастзтоассс(косАТСТМгатгсст10АлттсгстситсаггтствмстсзатссΕΑνΑΒλεείΡΕΡεϋβΡΗταεСЛОСТСОССТССТОСАСвААТТСССАААСАС1.ТИДЛ'.1,1ЛСТ1ССС'1АААЛТС'1ССАТС βΙ>λεΚΤΝ9ΕΤΡΗ5ϊΡΡΚΙ8]ТАССТ«лаАаАто^1Алстссл1х^иэатс*ттсх?атАТСЛСААТСстосстсАастт1АС УЬВСЕН53В5РК1'Г1ЬРйЬУ лттоих^слтслтосоосхетжхстелАттатоАлта'тгАссмттсоасА’птссссА 1ЙРМИОАС1,Я¥ЕСУЯГС13Р тссАСАААтсаилпсттатсаи®ХА«1<и«АТ80Ааюст1«лсиКАТ1ЛТсалсΪΤΗλίνίΟΛΤνΜΕΟΓΥνίΡη АаюсссАтлшпймавсттакшжшзсссстатссАсгмпссмктостасА
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US10159498P | 1998-09-24 | 1998-09-24 | |
| PCT/US1999/020881 WO2000017369A2 (en) | 1998-09-24 | 1999-09-23 | Alzheimer's disease secretase |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| EA200100387A1 EA200100387A1 (ru) | 2001-10-22 |
| EA009216B1 true EA009216B1 (ru) | 2007-12-28 |
Family
ID=22285461
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| EA200100387A EA009216B1 (ru) | 1998-09-24 | 1999-09-23 | Способы идентификации средств, модулирующих активность аспартилпротеазы asp2 человека |
Country Status (28)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US6835565B1 (ru) |
| EP (1) | EP1115874B1 (ru) |
| JP (3) | JP2002526081A (ru) |
| KR (8) | KR20070013361A (ru) |
| CN (4) | CN1300320C (ru) |
| AT (1) | ATE420185T1 (ru) |
| AU (2) | AU772812C (ru) |
| BR (1) | BR9913920A (ru) |
| CA (1) | CA2343004A1 (ru) |
| CY (1) | CY1111006T1 (ru) |
| CZ (1) | CZ2001966A3 (ru) |
| DE (1) | DE69940265D1 (ru) |
| DK (1) | DK1115874T3 (ru) |
| EA (1) | EA009216B1 (ru) |
| ES (1) | ES2318902T3 (ru) |
| HK (1) | HK1042730B (ru) |
| HU (1) | HUP0103838A3 (ru) |
| IL (2) | IL142207A (ru) |
| IS (1) | IS5905A (ru) |
| NO (1) | NO20011505L (ru) |
| NZ (2) | NZ527053A (ru) |
| PL (1) | PL205294B1 (ru) |
| PT (1) | PT1115874E (ru) |
| SG (1) | SG113454A1 (ru) |
| SK (1) | SK3902001A3 (ru) |
| TR (3) | TR200200662T2 (ru) |
| WO (1) | WO2000017369A2 (ru) |
| ZA (1) | ZA200102387B (ru) |
Families Citing this family (113)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB9701684D0 (en) | 1997-01-28 | 1997-03-19 | Smithkline Beecham Plc | Novel compounds |
| WO1999033963A1 (en) | 1997-12-31 | 1999-07-08 | Chiron Corporation | Metastatic cancer regulated gene |
| US6699671B1 (en) * | 1998-09-24 | 2004-03-02 | Pharmacia & Upjohn Company | Alzheimer's disease secretase, APP substrates therefor, and uses therefor |
| US20040234976A1 (en) * | 1998-09-24 | 2004-11-25 | Gurney Mark E. | Alzheimer's disease secretase, app substrates therefor, and uses therefor |
| DK1115874T3 (da) | 1998-09-24 | 2009-04-20 | Pharmacia & Upjohn Co Llc | Alzheimer's sygdom-sekretase |
| US7456007B1 (en) | 1998-12-31 | 2008-11-25 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | β-secretase enzyme compositions and methods |
| US7115410B1 (en) * | 1999-02-10 | 2006-10-03 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | β-secretase enzyme compositions and methods |
| AU4000900A (en) * | 1999-02-10 | 2000-08-29 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Beta-secretase enzyme compositions and methods |
| WO2000058479A1 (en) | 1999-03-26 | 2000-10-05 | Amgen Inc. | Beta secretase genes and polypeptides |
| ATE482233T1 (de) * | 1999-06-28 | 2010-10-15 | Oklahoma Med Res Found | Inhibitoren des memapsin 2 und ihre verwendung |
| EP1496124A1 (en) * | 1999-06-28 | 2005-01-12 | Oklahoma Medical Research Foundation | Catalytically active recombinant memapsin and methods of use thereof |
| ATE431419T1 (de) * | 1999-09-23 | 2009-05-15 | Pharmacia & Upjohn Co Llc | Alzheimer krankheit sekretase, app (amyloid vorlaüfer-protein) substrate dafür und verwendungen |
| US7514408B1 (en) | 1999-12-02 | 2009-04-07 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | β-secretase enzyme compositions and methods |
| US8273866B2 (en) | 2002-02-20 | 2012-09-25 | Merck Sharp & Dohme Corp. | RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (SINA) |
| US8202979B2 (en) | 2002-02-20 | 2012-06-19 | Sirna Therapeutics, Inc. | RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid |
| EP1265849B1 (en) | 2000-03-23 | 2006-10-25 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Compounds and methods to treat alzheimer's disease |
| US6846813B2 (en) | 2000-06-30 | 2005-01-25 | Pharmacia & Upjohn Company | Compounds to treat alzheimer's disease |
| PE20020276A1 (es) | 2000-06-30 | 2002-04-06 | Elan Pharm Inc | COMPUESTOS DE AMINA SUSTITUIDA COMO INHIBIDORES DE ß-SECRETASA PARA EL TRATAMIENTO DE ALZHEIMER |
| EP1666452A2 (en) | 2000-06-30 | 2006-06-07 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Compounds to treat Alzheimer's disease |
| CA2410972A1 (en) | 2000-06-30 | 2002-01-10 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Compounds to treat alzheimer's disease |
| US6686449B2 (en) | 2000-06-30 | 2004-02-03 | Pharmacia & Upjohn Company | Mutant presenilin 1 polypeptides |
| TW200628612A (en) | 2000-07-19 | 2006-08-16 | Pharmacia & Up John Company | Substrates and assays for β-secretase activity |
| US20030190635A1 (en) * | 2002-02-20 | 2003-10-09 | Mcswiggen James A. | RNA interference mediated treatment of Alzheimer's disease using short interfering RNA |
| US7806980B2 (en) | 2000-12-23 | 2010-10-05 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Method for crystallizing human beta secretase in complex with an inhibitor |
| CA2438832A1 (en) | 2001-02-23 | 2002-09-06 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Transgenic knockouts of bace-1 |
| US7524668B1 (en) | 2001-05-10 | 2009-04-28 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Crystal of human beta secretase having monoclinic space group symmetry C2 and methods for crystallization thereof |
| US7517864B2 (en) | 2001-05-18 | 2009-04-14 | Sirna Therapeutics, Inc. | RNA interference mediated inhibition of vascular endothelial growth factor and vascular endothelial growth factor receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA) |
| US9994853B2 (en) | 2001-05-18 | 2018-06-12 | Sirna Therapeutics, Inc. | Chemically modified multifunctional short interfering nucleic acid molecules that mediate RNA interference |
| EP1390497A2 (en) | 2001-05-25 | 2004-02-25 | Genset | Human cdnas and proteins and uses thereof |
| CA2448834A1 (en) | 2001-06-01 | 2002-12-12 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Hydroxy alkyl amine derivatives as beta-secretase inhibitors and their use for the treatment of alzheimer's disease and similar diseases |
| WO2002100410A1 (en) * | 2001-06-08 | 2002-12-19 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Methods of treating alzheimer's disease |
| AU2002315131A1 (en) | 2001-06-13 | 2002-12-23 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Aminediols as agents for the treatment of alzheimer's disease |
| BR0210721A (pt) | 2001-06-27 | 2004-07-20 | Elan Pharm Inc | Composto, sal ou éster farmaceuticamente aceitável, método para fabricar um composto, e, método para tratar um paciente que tem, ou para evitar que o paciente adquira uma doença ou condição |
| BR0211121A (pt) | 2001-07-10 | 2004-10-26 | Elan Pharm Inc | Composto, métodos para o tratamento ou prevenção de doenças e para fabricar um composto, intermediário, e, uso de um composto ou sal |
| WO2003006021A1 (en) | 2001-07-10 | 2003-01-23 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Alpha-hydroxyamide statine derivatives for the treatment of alzh eimer's disease |
| US7067542B2 (en) | 2001-07-10 | 2006-06-27 | Pharmacia & Upjohn Company | Diaminediols for the treatment of Alzheimer's disease |
| US7186539B1 (en) | 2001-08-31 | 2007-03-06 | Pharmacia & Upjohn Company | Method for refolding enzymes |
| WO2003029169A2 (en) | 2001-10-04 | 2003-04-10 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Hydroxypropylamines |
| AU2002359301B2 (en) | 2001-10-23 | 2008-07-03 | Comentis, Inc. | Beta-secretase inhibitors and methods of use |
| EP1453789A2 (en) | 2001-11-08 | 2004-09-08 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | N,n'-substituted-1,3-diamino-2-hydroxypropane derivatives |
| JP2005514370A (ja) * | 2001-11-21 | 2005-05-19 | イーラン ファーマスーティカルズ、インコーポレイテッド | アルツハイマー病の治療に有用なアミノ酸誘導体 |
| US9657294B2 (en) | 2002-02-20 | 2017-05-23 | Sirna Therapeutics, Inc. | RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (siNA) |
| US9181551B2 (en) | 2002-02-20 | 2015-11-10 | Sirna Therapeutics, Inc. | RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (siNA) |
| DE60327250D1 (de) | 2002-02-21 | 2009-05-28 | Pharmacia & Upjohn Co Llc | Modifizierte bace |
| AU2003303141A1 (en) | 2002-04-30 | 2004-07-22 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Hydroxypropyl amides for the treatment of alzheimer's disease |
| US7442537B1 (en) | 2002-05-10 | 2008-10-28 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Crystals of unliganded beta secretase and/or beta secretase-like proteins and the use thereof |
| US9321832B2 (en) | 2002-06-28 | 2016-04-26 | Domantis Limited | Ligand |
| US7923547B2 (en) | 2002-09-05 | 2011-04-12 | Sirna Therapeutics, Inc. | RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid (siNA) |
| UY27967A1 (es) | 2002-09-10 | 2004-05-31 | Pfizer | Acetil 2-hindroxi-1,3-diaminoalcanos |
| AU2003293155A1 (en) | 2002-11-27 | 2004-06-23 | Elan Pharmaceutical, Inc. | Substituted ureas and carbamates |
| US7521481B2 (en) | 2003-02-27 | 2009-04-21 | Mclaurin Joanne | Methods of preventing, treating and diagnosing disorders of protein aggregation |
| WO2004094384A2 (en) | 2003-04-21 | 2004-11-04 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | (hetero) arylamide 2-hydroxy-3-diaminoalkanes for use in the treatment of alzheimer’s disease |
| US7482136B2 (en) | 2003-05-02 | 2009-01-27 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Glycosylation variants of BACE |
| WO2005087751A2 (en) | 2004-03-09 | 2005-09-22 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Substituted hydroxyethylamine aspartyl protease inhibitors |
| US10508277B2 (en) | 2004-05-24 | 2019-12-17 | Sirna Therapeutics, Inc. | Chemically modified multifunctional short interfering nucleic acid molecules that mediate RNA interference |
| CA2573138A1 (en) | 2004-07-09 | 2006-01-26 | Elan Pharmaceuticals Inc. | Oxime derivative substituted hydroxyethylamine aspartyl protease inhibitors |
| US20060128715A1 (en) | 2004-07-09 | 2006-06-15 | Jennifer Sealy | Oxime derivative hydroxyethylamine aspartyl-protease inhibitors |
| CA2589860A1 (en) | 2005-01-24 | 2006-08-03 | Amgen Inc. | Humanized anti-amyloid antibody |
| ES2400287T3 (es) * | 2005-03-14 | 2013-04-08 | High Point Pharmaceuticals, Llc | Derivados de benzazol, composiciones y procedimientos de uso como inhibidores de beta-secretasa |
| EP1746092A1 (en) | 2005-07-22 | 2007-01-24 | Exonhit Therapeutics SA | Compounds and methods for treatment of amyloid-B-peptide related disorders |
| WO2007047305A1 (en) | 2005-10-12 | 2007-04-26 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Methods of treating amyloidosis using cyclopropyl derivative aspartyl protease inhibitors |
| US7745484B2 (en) | 2005-11-21 | 2010-06-29 | Amgen Inc. | Beta-secretase modulators and methods of use |
| US7838676B2 (en) | 2005-11-21 | 2010-11-23 | Amgen Inc. | Beta-secretase modulators and methods of use |
| US7872009B2 (en) | 2005-11-21 | 2011-01-18 | Amgen Inc. | Beta-Secretase modulators and methods of use |
| US20070292895A1 (en) * | 2006-05-19 | 2007-12-20 | Xiao-Ping Shi | Assays and methods to detect beta-secretase and its activity in body fluids and tissue extracts |
| ES2373048T3 (es) * | 2006-06-08 | 2012-01-30 | Fu Berlin | Análisis para el diagnóstico de la enfermedad de alzheimer basado en la determinación de la proporción de productos de escisión ab de secretasa. |
| TW200815349A (en) | 2006-06-22 | 2008-04-01 | Astrazeneca Ab | New compounds |
| MX2009012608A (es) | 2007-05-25 | 2009-12-07 | Amgen Inc | Compuestos de hidroxietil amina substituidos como moduladores de beta-secretasa y metodos de uso. |
| TW200901991A (en) | 2007-05-25 | 2009-01-16 | Amgen Inc | Substituted hydroxyethyl amine compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| EP2164834A2 (en) | 2007-07-06 | 2010-03-24 | Boehringer Ingelheim International GmbH | Substituted amino-quinazolinones, medicaments comprising said compound, their use and their method of manufacture |
| US7803809B2 (en) | 2008-11-12 | 2010-09-28 | Amgen Inc. | Substituted pyrano [2,3-b] pyridinamine compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| CN102209721A (zh) * | 2008-09-11 | 2011-10-05 | 安姆根有限公司 | 作为β-分泌酶调节剂的螺四环化合物及其使用方法 |
| TW201020244A (en) | 2008-11-14 | 2010-06-01 | Astrazeneca Ab | New compounds |
| EP2281824A1 (en) | 2009-08-07 | 2011-02-09 | Noscira, S.A. | Furan-imidazolone derivatives, for the treatment of cognitive, neurodegenerative or neuronal diseases or disorders |
| EP2504330A1 (en) | 2009-11-23 | 2012-10-03 | Amgen Inc. | Amino heteroaryl compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| WO2011063233A1 (en) | 2009-11-23 | 2011-05-26 | Amgen Inc. | Amino heteroaryl compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| AU2011207679B2 (en) | 2010-01-19 | 2013-10-10 | Amgen Inc. | Amino heteroaryl compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| MX2012010657A (es) | 2010-03-15 | 2013-02-07 | Amgen Inc | Compuestos de espiro amino-dihidrooxazina y amino-dihidrotiazina como moduladores de beta-secretasa y su uso medico. |
| AU2011227511B2 (en) | 2010-03-15 | 2014-02-20 | Amgen Inc. | Spiro-tetracyclic ring compounds as Beta - secretase modulators |
| EP2601197B1 (en) | 2010-08-05 | 2014-06-25 | Amgen Inc. | Amino-iso-indole, amino-aza-iso-indole, amino-dihydroisoquinoline and amino-benzoxazine compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| US10449177B2 (en) | 2010-08-19 | 2019-10-22 | Buck Institute For Research On Aging | Methods of treating mild cognitive impairment (MCI) and related disorders |
| DK2632472T3 (en) | 2010-10-29 | 2018-03-19 | Sirna Therapeutics Inc | RNA INTERFERENCE-MEDIATED INHIBITION OF GENE EXPRESSION USING SHORT INTERFERRING NUCLEIC ACIDS (SINA) |
| JP2013542973A (ja) | 2010-11-22 | 2013-11-28 | ノスシラ、ソシエダッド、アノニマ | 神経変性疾患または神経変性状態を治療するためのビピリジンスルホンアミド誘導体 |
| US8957083B2 (en) | 2010-11-23 | 2015-02-17 | Amgen Inc. | Spiro-amino-imidazolone and spiro-amino-dihydro-pyrimidinone compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| US9346827B2 (en) | 2011-02-07 | 2016-05-24 | Amgen Inc. | 5-amino-oxazepine and 5-amino-thiazepane compounds as beta secretase antagonists and methods of use |
| US8962859B2 (en) | 2011-02-15 | 2015-02-24 | Amgen Inc. | Spiro-amino-imidazo-fused heterocyclic compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| US9296759B2 (en) | 2011-09-21 | 2016-03-29 | Amgen Inc. | Amino-oxazine and amino-dihydrothiazine compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| WO2013142370A1 (en) | 2012-03-19 | 2013-09-26 | Varghese John | APP SPECIFIC BACE INHIBITORS (ASBIs) AND USES THEREOF |
| WO2014059185A1 (en) | 2012-10-12 | 2014-04-17 | Amgen Inc. | Amino - dihydrothiazine and amino - dioxido dihydrothiazine compounds as beta-secretase antagonists and methods of use |
| WO2014078314A1 (en) | 2012-11-15 | 2014-05-22 | Amgen Inc. | Amino-oxazine and amino-dihydrothiazine compounds as beta-secretase modulators and methods of use |
| WO2014120658A1 (en) | 2013-01-29 | 2014-08-07 | Amgen Inc. | Fused multicyclic 3-amino-5,6-dihydro-2h-1,4-thiazine derivatives and their use as beta-secretase inhibitors |
| DK2956443T3 (da) | 2013-02-12 | 2020-01-20 | Buck Inst Res Aging | Hydantoiner som modulatorer af BACE-medieret APP-forarbejdning |
| US9296734B2 (en) | 2013-03-01 | 2016-03-29 | Amgen Inc. | Perfluorinated 5,6-dihydro-4H-1,3-oxazin-2-amine compounds as beta-secretase inhibitors and methods of use |
| PE20151794A1 (es) | 2013-03-08 | 2015-12-03 | Amgen Inc | Compuestos de 1,3-oxazin-2-amina fusionados con ciclopropilo perfluorado como inhibidores de beta-secretasa y metodos de uso |
| WO2015017407A1 (en) | 2013-07-30 | 2015-02-05 | Amgen Inc. | Bridged bicyclic amino thiazine dioxide compounds as inhibitors of beta- secretase |
| KR101791296B1 (ko) | 2014-04-17 | 2017-10-27 | 제주대학교 산학협력단 | 알츠하이머병 관련 돌연변이 유전자를 포함하는 발현 카세트, 벡터, 및 이를 이용하여 형질전환된 세포주 |
| CN106795147B (zh) | 2014-08-08 | 2020-09-22 | 美国安进公司 | 作为β-分泌酶抑制剂的环丙基稠合噻嗪-2-胺化合物和使用方法 |
| WO2016172955A1 (zh) * | 2015-04-30 | 2016-11-03 | 江苏挪贝肽医药科技有限公司 | 一种筛选用于治疗阿尔茨海默病的药物和治疗靶点的方法 |
| WO2017024180A1 (en) | 2015-08-06 | 2017-02-09 | Amgen Inc. | Vinyl fluoride cyclopropyl fused thiazin-2-amine compounds as beta-secretase inhibitors and methods of use |
| JP2018525447A (ja) | 2015-08-27 | 2018-09-06 | ナントネウロ,エルエルシー | App選択的bace阻害のための組成物およびそのための使用 |
| US20190134000A1 (en) | 2016-05-12 | 2019-05-09 | Buck Institute For Research On Aging | Compounds to promote normal processing of app |
| EP3555084B1 (en) | 2016-12-15 | 2022-03-16 | Amgen Inc. | Thiazine derivatives as beta-secretase inhibitors and methods of use |
| JP7159161B2 (ja) | 2016-12-15 | 2022-10-24 | アムジエン・インコーポレーテツド | β-セクレターゼ阻害剤としてのシクロプロピル縮合チアジン誘導体および使用方法 |
| US10947223B2 (en) | 2016-12-15 | 2021-03-16 | Amgen Inc. | Substituted oxazines as beta-secretase inhibitors |
| JP7148518B2 (ja) | 2016-12-15 | 2022-10-05 | アムジエン・インコーポレーテツド | β-セクレターゼ阻害剤としての二環式チアジンおよびオキサジン誘導体ならびに使用方法 |
| EP3555086B1 (en) | 2016-12-15 | 2021-09-01 | Amgen Inc. | 1,4-thiazine dioxide and 1,2,4-thiadiazine dioxide derivatives as beta-secretase inhibitors and methods of use |
| CN107576785A (zh) * | 2017-08-25 | 2018-01-12 | 广州市雷德生物科技有限公司 | 一种样本处理液及其应用 |
| GB201803010D0 (en) * | 2018-02-26 | 2018-04-11 | Royal Holloway & Bedford New College | Neurodegenerative disorders |
| WO2021055670A1 (en) | 2019-09-20 | 2021-03-25 | Avx Corporation | Somatic cell-based electrical biosensor |
| CN111518793A (zh) * | 2020-05-20 | 2020-08-11 | 谭骏 | 年轻人血源APPα-分泌酶在阿尔茨海默病中的应用 |
| CN114480494B (zh) * | 2022-02-10 | 2024-07-05 | 中国科学技术大学 | 蛋白探针以及其在检测bace1活性中的应用 |
| WO2024087429A1 (zh) * | 2023-02-28 | 2024-05-02 | 湖南乾康科技有限公司 | 用于检测蛋白生物标志物组的抗体在制备诊断ad、mci和其它类型老年痴呆的试剂盒中的用途 |
| CN118831181B (zh) * | 2024-09-20 | 2025-02-11 | 江苏集萃药康生物科技股份有限公司 | 一种三突变阿尔兹海默症小鼠模型的构建方法及其应用 |
Citations (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1996040885A2 (en) * | 1995-06-07 | 1996-12-19 | Athena Neurosciences, Inc. | β-SECRETASE, ANTIBODIES TO β-SECRETASE, AND ASSAYS FOR DETECTING β-SECRETASE INHIBITION |
| EP0848062A2 (en) * | 1996-12-14 | 1998-06-17 | Smithkline Beecham Corporation | Aspartic protease ASP1 |
| WO1998026059A1 (en) * | 1996-12-11 | 1998-06-18 | Athena Neurosciences, Inc. | Beta-secretase isolated from human 293 cells |
| EP0855444A2 (en) * | 1997-01-28 | 1998-07-29 | Smithkline Beecham Plc | Aspartic proteinase 2 (ASP2) |
| US5795963A (en) * | 1992-06-04 | 1998-08-18 | Alzheimer's Institute Of America | Amyloid precursor protein in alzheimer's disease |
| WO1999034004A2 (en) * | 1997-12-31 | 1999-07-08 | Chiron Corporation | Metastatic breast and colon cancer regulated genes |
| WO1999046281A2 (en) * | 1998-03-10 | 1999-09-16 | Genentech, Inc. | Novel polypeptides and nucleic acids encoding the same |
Family Cites Families (38)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5200339A (en) | 1990-08-17 | 1993-04-06 | Abraham Carmela R | Proteases causing abnormal degradation of amyloid β-protein precursor |
| US5292652A (en) | 1990-10-05 | 1994-03-08 | Athena Neurosciences, Inc. | Amyloidin protease and uses thereof |
| AU652997B2 (en) | 1991-01-21 | 1994-09-15 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Test and model for alzheimer's disease |
| US5604131A (en) * | 1992-01-07 | 1997-02-18 | Athena Neurosciences, Inc. | cDNA-genomic DNA hybrid sequence encoding APP770 containing a genomic DNA insert of the KI and OX-2 regions |
| TW327194B (en) * | 1992-05-01 | 1998-02-21 | American Cyanamid Co | Novel amyloid precursor proteins and methods of using same |
| IL105793A0 (en) | 1992-05-28 | 1993-09-22 | Lilly Co Eli | Protease and related dna compounds |
| US5766846A (en) | 1992-07-10 | 1998-06-16 | Athena Neurosciences | Methods of screening for compounds which inhibit soluble β-amyloid peptide production |
| US5837672A (en) | 1992-07-10 | 1998-11-17 | Athena Neurosciences, Inc. | Methods and compositions for the detection of soluble β-amyloid peptide |
| US5605811A (en) * | 1992-10-26 | 1997-02-25 | Athena Neurosciences, Inc. | Methods and compositions for monitoring cellular processing of beta-amyloid precursor protein |
| JPH08508464A (ja) * | 1992-12-16 | 1996-09-10 | ベイヤー コーポレイション | カテプシンdはアルツハイマー病におけるアミロイド生成プロテアーゼである |
| EP0608546A3 (en) * | 1992-12-22 | 1995-09-27 | Takeda Chemical Industries Ltd | Glia activating factor (gaf), antibodies against it and their uses. |
| EP1308461A3 (en) | 1993-01-25 | 2004-02-11 | Takeda Chemical Industries, Ltd. | Antibodies to beta-amyloids or their derivatives and use thereof |
| DK0730643T3 (da) | 1993-10-27 | 2001-05-14 | Elan Pharm Inc | Transgene dyr, som huser APP-allel med svensk mutation |
| JPH10504964A (ja) | 1994-09-01 | 1998-05-19 | メルク エンド カンパニー インコーポレーテッド | 家族性型ヒトアミロイド前駆タンパク質を発現するトランスジェニック動物 |
| WO1996031122A1 (en) | 1995-04-04 | 1996-10-10 | Eli Lilly And Company | Amyloid precursor protein protease |
| US5744346A (en) | 1995-06-07 | 1998-04-28 | Athena Neurosciences, Inc. | β-secretase |
| US6221645B1 (en) | 1995-06-07 | 2001-04-24 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | β-secretase antibody |
| DE19641180A1 (de) | 1996-09-24 | 1998-03-26 | Schering Ag | Verfahren zur Darstellung von APP-Sekretase Modulation und deren Verwendung als Mittel zur Behandlung der Alzheimer'schen Erkrankung |
| WO1998021589A1 (en) | 1996-11-15 | 1998-05-22 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Screening for modulators of amyloid processing |
| GB9626022D0 (en) | 1996-12-14 | 1997-01-29 | Smithkline Beecham Plc | Novel compounds |
| GB9721094D0 (en) * | 1997-10-03 | 1997-12-03 | Unilever Plc | Autophobic hairspray compositions |
| EP1037977B1 (en) | 1997-12-17 | 2009-08-26 | Serono Genetics Institute S.A. | EXTENDED cDNAs FOR SECRETED PROTEINS |
| CA2330242A1 (fr) | 1998-06-05 | 1999-12-16 | Aventis Pharma S.A. | Polypeptides possedant une activite de type beta-secretase |
| US6844148B1 (en) | 1998-09-24 | 2005-01-18 | Pharmacia & Upjohn Company | Alzheimer's disease secretase, APP substrates therefor, and uses therefor |
| DK1115874T3 (da) | 1998-09-24 | 2009-04-20 | Pharmacia & Upjohn Co Llc | Alzheimer's sygdom-sekretase |
| US6699671B1 (en) | 1998-09-24 | 2004-03-02 | Pharmacia & Upjohn Company | Alzheimer's disease secretase, APP substrates therefor, and uses therefor |
| US6245884B1 (en) | 1998-10-16 | 2001-06-12 | Vivian Y. H. Hook | Secretases related to alzheimer's dementia |
| US6313268B1 (en) | 1998-10-16 | 2001-11-06 | Vivian Y. H. Hook | Secretases related to Alzheimer's dementia |
| AU4000900A (en) * | 1999-02-10 | 2000-08-29 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Beta-secretase enzyme compositions and methods |
| DE19910108C2 (de) | 1999-03-08 | 2001-02-22 | Falk Fahrenholz | Zellen, die ein Amyloidvorläuferprotein und eine alpha-Sekretase coexprimieren, ein Testverfahren zur Identifikation alpha-Sekretase-aktiver Substanzen sowie eines zur Identifikation weiterer Sekretasen, ein Testverfahren zur Bestimmung der Anfälligkeit gegenüber Morbus Alzheimer und Verwendung von Nukleinsäuren, die für eine alpha-Sekretase codieren, für die Gentherapie |
| WO2000058479A1 (en) | 1999-03-26 | 2000-10-05 | Amgen Inc. | Beta secretase genes and polypeptides |
| AU4640600A (en) | 1999-05-11 | 2000-11-21 | Eli Lilly And Company | Amyloid precursor protein protease and related nucleic acid compounds |
| US7087399B1 (en) | 1999-05-13 | 2006-08-08 | Scios, Inc. | β-secretase and modulation of β-secretase activity |
| ATE482233T1 (de) | 1999-06-28 | 2010-10-15 | Oklahoma Med Res Found | Inhibitoren des memapsin 2 und ihre verwendung |
| GB9924957D0 (en) | 1999-10-21 | 1999-12-22 | Smithkline Beecham Plc | Novel treatment |
| GB9925136D0 (en) | 1999-10-22 | 1999-12-22 | Smithkline Beecham Plc | Novel treatment |
| US6361975B1 (en) | 1999-11-16 | 2002-03-26 | Smithkline Beecham Corporation | Mouse aspartic secretase-2(mASP-2) |
| US6291223B1 (en) | 1999-11-23 | 2001-09-18 | Smithkline Beecham Corporation | Mouse aspartic secretase-1 (mASP1) |
-
1999
- 1999-09-23 DK DK99948189T patent/DK1115874T3/da active
- 1999-09-23 KR KR1020077000411A patent/KR20070013361A/ko not_active Withdrawn
- 1999-09-23 JP JP2000574268A patent/JP2002526081A/ja active Pending
- 1999-09-23 DE DE69940265T patent/DE69940265D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1999-09-23 HK HK02104092.7A patent/HK1042730B/zh not_active IP Right Cessation
- 1999-09-23 NZ NZ527053A patent/NZ527053A/xx not_active IP Right Cessation
- 1999-09-23 TR TR2002/00662T patent/TR200200662T2/xx unknown
- 1999-09-23 KR KR1020047015170A patent/KR100866676B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 1999-09-23 CA CA002343004A patent/CA2343004A1/en not_active Abandoned
- 1999-09-23 BR BR9913920-0A patent/BR9913920A/pt not_active Application Discontinuation
- 1999-09-23 TR TR2006/01231T patent/TR200601231T2/xx unknown
- 1999-09-23 CN CNB2003101196656A patent/CN1300320C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1999-09-23 ES ES99948189T patent/ES2318902T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1999-09-23 WO PCT/US1999/020881 patent/WO2000017369A2/en not_active Ceased
- 1999-09-23 CN CNB99811202XA patent/CN1198936C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1999-09-23 AT AT99948189T patent/ATE420185T1/de active
- 1999-09-23 KR KR1020047015172A patent/KR100691601B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 1999-09-23 CZ CZ2001966A patent/CZ2001966A3/cs unknown
- 1999-09-23 HU HU0103838A patent/HUP0103838A3/hu unknown
- 1999-09-23 TR TR2001/01484T patent/TR200101484T2/xx unknown
- 1999-09-23 SG SG200301440A patent/SG113454A1/en unknown
- 1999-09-23 KR KR1020067023390A patent/KR20060126626A/ko not_active Withdrawn
- 1999-09-23 US US09/806,194 patent/US6835565B1/en not_active Expired - Fee Related
- 1999-09-23 NZ NZ510708A patent/NZ510708A/en not_active IP Right Cessation
- 1999-09-23 PL PL348629A patent/PL205294B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1999-09-23 KR KR1020067025867A patent/KR20070004143A/ko not_active Abandoned
- 1999-09-23 EP EP99948189A patent/EP1115874B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-09-23 KR KR1020017003744A patent/KR100839284B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 1999-09-23 PT PT99948189T patent/PT1115874E/pt unknown
- 1999-09-23 CN CNA2003101196641A patent/CN1502696A/zh active Pending
- 1999-09-23 EA EA200100387A patent/EA009216B1/ru not_active IP Right Cessation
- 1999-09-23 SK SK390-2001A patent/SK3902001A3/sk unknown
- 1999-09-23 KR KR1020067020982A patent/KR20060111905A/ko not_active Withdrawn
- 1999-09-23 AU AU61418/99A patent/AU772812C/en not_active Ceased
- 1999-09-23 CN CNA2003101196637A patent/CN1502692A/zh active Pending
- 1999-09-23 KR KR1020047015171A patent/KR100768381B1/ko not_active Expired - Fee Related
-
2001
- 2001-03-22 IS IS5905A patent/IS5905A/is unknown
- 2001-03-22 ZA ZA200102387A patent/ZA200102387B/en unknown
- 2001-03-22 IL IL142207A patent/IL142207A/en not_active IP Right Cessation
- 2001-03-23 NO NO20011505A patent/NO20011505L/no not_active Application Discontinuation
-
2004
- 2004-08-04 AU AU2004203588A patent/AU2004203588B2/en not_active Ceased
- 2004-09-14 US US10/940,867 patent/US7812123B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2007
- 2007-03-20 IL IL182070A patent/IL182070A0/en not_active IP Right Cessation
- 2007-12-12 JP JP2007320832A patent/JP2008113665A/ja not_active Withdrawn
-
2009
- 2009-02-18 CY CY20091100178T patent/CY1111006T1/el unknown
- 2009-06-10 JP JP2009139454A patent/JP2009201517A/ja active Pending
Patent Citations (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5795963A (en) * | 1992-06-04 | 1998-08-18 | Alzheimer's Institute Of America | Amyloid precursor protein in alzheimer's disease |
| WO1996040885A2 (en) * | 1995-06-07 | 1996-12-19 | Athena Neurosciences, Inc. | β-SECRETASE, ANTIBODIES TO β-SECRETASE, AND ASSAYS FOR DETECTING β-SECRETASE INHIBITION |
| WO1998026059A1 (en) * | 1996-12-11 | 1998-06-18 | Athena Neurosciences, Inc. | Beta-secretase isolated from human 293 cells |
| EP0848062A2 (en) * | 1996-12-14 | 1998-06-17 | Smithkline Beecham Corporation | Aspartic protease ASP1 |
| EP0855444A2 (en) * | 1997-01-28 | 1998-07-29 | Smithkline Beecham Plc | Aspartic proteinase 2 (ASP2) |
| WO1999034004A2 (en) * | 1997-12-31 | 1999-07-08 | Chiron Corporation | Metastatic breast and colon cancer regulated genes |
| WO1999046281A2 (en) * | 1998-03-10 | 1999-09-16 | Genentech, Inc. | Novel polypeptides and nucleic acids encoding the same |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| YAN RIQIANG ET AL.: "Membrane-anchored aspartyl protease with Alzheimer's disease beta-secretase activity", NATURE, vol. 402, 2 December 1999 (1999-12-02), pages 533-537, XP002136300, LONDON, GB * |
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EA009216B1 (ru) | Способы идентификации средств, модулирующих активность аспартилпротеазы asp2 человека | |
| Dissing et al. | Autoproteolysis and feedback in a protease cascade directing Drosophila dorsal–ventral cell fate | |
| Cuervo et al. | Unique properties of lamp2a compared to other lamp2 isoforms | |
| Izumi et al. | A metalloprotease–disintegrin, MDC9/meltrin‐γ/ADAM9 and PKCδ are involved in TPA‐induced ectodomain shedding of membrane‐anchored heparin‐binding EGF‐like growth factor | |
| Ito et al. | SgIGSF: a new mast-cell adhesion molecule used for attachment to fibroblasts and transcriptionally regulated by MITF | |
| Adrain et al. | Mammalian EGF receptor activation by the rhomboid protease RHBDL2 | |
| TWI294462B (en) | Methods for assaying α-secretase activity and for screening for a candidate alzheimer's disease therapeutic | |
| Almalki et al. | Mutation of the human mitochondrial phenylalanine-tRNA synthetase causes infantile-onset epilepsy and cytochrome c oxidase deficiency | |
| US7427498B2 (en) | Composition, methods and reagents for the synthesis of a soluble form of human PHEX | |
| JPH11505705A (ja) | Mch2、アポトーシス性システインプロテアーゼ、ならびに組成物、ならびにそれを製造および使用する方法 | |
| KR20040077928A (ko) | 아그레카나제 분자 | |
| JPH08268911A (ja) | アミロイド前駆体タンパク質プロセシング酵素を検出する方法 | |
| IL186120A (en) | Method for determining whether a test compound is an inhibitor of neurotrypsin | |
| CA2195385C (en) | An artificial recombinant substrate (ragg 1) and native aggrecan to study the proteolytic activity of 'aggrecanase' in cell culture systems | |
| US20220017964A1 (en) | Cornulin (CRNN) Variants And Uses Thereof | |
| US20070212707A1 (en) | Cell cycle markers | |
| Shih et al. | Biochemical properties of lens-specific calpain Lp85 | |
| EA005853B1 (ru) | N-ацетилглюкозамин-6-фосфатдеацетилаза человека, взаимодействующая с каспазой-8, и способы ее применения | |
| WO2005093057A1 (ja) | 切断型dance、dance複合体、及びこれらを用いる方法 | |
| Su et al. | Protein kinase C phosphorylates nonmuscle myosin-II heavy chain from Drosophila but regulation of myosin function by this enzyme is not required for viability in flies | |
| CA2355968A1 (en) | Novel protein and dna thereof | |
| Yang et al. | Demonstration of the interaction of transforming growth factor beta 2 and type X collagen using a modified tandem affinity purification tag | |
| JP2025141928A (ja) | ガラクトース検出用キット、細胞及び形質転換体 | |
| JP2001521742A (ja) | Svph1−26dnaおよびポリペプチド | |
| CN103940982B (zh) | 肿瘤坏死因子-α转化酶的多肽抑制剂的筛选方法及其应用 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s) |
Designated state(s): AM AZ BY KZ KG MD TJ TM RU |