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DE19916749A1 - Anordnung zur Untersuchung von Proben - Google Patents

Anordnung zur Untersuchung von Proben

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DE19916749A1
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Carl Zeiss Jena GmbH
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Abstract

Anordnung zur Untersuchung von einer oder mehreren in Probengefäßen oder auf Probenträgern angeordneten Proben im Durchlicht oder Auflicht, DOLLAR A mittels der Abbildung und/oder Erfassung mindestens eines Teils des Probenvolumens durch das Probengefäß oder den Probenträger hindurch eine CCD-Kamera, der eine Auswerteeinheit nachgeordnet ist, DOLLAR A wobei eine Auflichtbeleuchtung ebenfalls durch das Probengefäß oder den Probenträger hindurch erfolgt und die DOLLAR A Beleuchtung der Anregung der Probenemission, vorzugsweise der Fluoreszenzanregung dient, mit der Abbildung und/oder Erfassung auf einer von einer der Einfüllvorrichtung abgewandten Seite durch ein Probengefäß über eine CCD-Kamera, der eine Auswerteeinheit nachgeordnet ist.

Description

Die Erfindung betrifft ein inverses automatisiertes 1-Kanal-Mikroskop mit einem Autofokussystem und einer oder mehreren Probenkammern oder einem Probenträger.
Die Abbildung der Probe wird von einer Bildanalyse-Software ausgewertet.
Die Proben sind beispielsweise Zellen (in Lösung) am Boden von Mikrotiterplatten (MTP), aber auch Proben auf Probenträgern wie Biochips, auf planparallelen Platten aus Glas, Quarzglas oder Kunststoff.
Die MTPs oder Probenträger werden vorzugsweise automatisiert, aber auch manuell zugeführt, und das Autofokussystem fokussiert beispielsweise auf die Grenzschicht Lösung/MTB-Bo­ den.
Nach erfolgter Fokussierung und Auswahl des Anregungsfilters werden beispielsweise bei der Fluoreszenzerfassung mittels einer XBO- oder HBO-Lampe die Farbstoffe in der Probe angeregt.
Das Fluoreszenzlicht der Probe passiert den jeweils gewählten Emissionsfilter, und die Probe wird auf den Chip der CCD-Ka­ mera abgebildet.
Nach der Bildaufnahme werden evt. Anregungs- und Emissionsfilter gewechselt und ein neues Bild aufgenommen. Anschließend wird das Bild ausgewertet und ein xy-Scanning­ tisch fährt zum nächsten Bildfeld/nächsten MTP-Topf, der Autofokus wird wieder aktiviert, und der Ablauf beginnt von neuem.
Die Erfindung wird anhand der schematischen Zeichnungen näher erläutert:
Es zeigen:
Fig. 1 Den Meßstrahlengang
Fig. 2 eine Ansicht des Autofokusstrahlengangs in Richtung A in Fig. 1
Fig. 3 eine Ansicht des Autofokusstrahlengangs in Richtung B in Fig. 2a
Fig. 4 Eine Justiereinrichtung der Lichtquelle im Beleuchtungsstrahlengang
Fig. 5 Den Strahlverlauf beim Autofokus
Fig. 6 Eine schematische Gesamtanordnung
Fig. 1
An einer Standardwechselstelle WS für die Beleuchtung ist beispielsweise ein nicht dargestelltes Lichtleitkabel angeschlossen oder es kann eine Lampe (Weißlichtquelle: Xenon oder Quecksilber) vorgesehen sein.
Das eingekoppelte Licht gelangt auf eine Einkoppellinse KL zur Kollimierung und über einen Shutter S sowie eine mehrlinsige Beleuchtungsoptik BO1-3 sowie eine Aperturblende AB zwischen BO1 und BO2 und Leuchtfeldblende LF zwischen BO2 und BO3 auf einen Reflektorrevover RR mit vorzugsweise auswechselbaren Strahlteilern zur Trennung von dem Anregungsstrahlengang in Richtung des Objektives O und Auswertestrahlengang in Richtung des Empfängers CCD.
Vor der Einkoppeloptik BO1 ist bei der Fluoreszenzerfassung ein Anregungsfilter AF angeordnet.
Im Auswertestrahlengang sind Emissionsfilter EF vorgesehen, um das reflektierte bzw. elastisch gestreute Anregungslicht zu blockieren.
Vorteilhafte Wellenlängenbereiche für AF, EF sind:
Anregung der Farbstoffe 350-700 nm
Emission der Farbstoffe 420-800 nm
Die Filter AF, EF sind auswechselbar oder für andere Anwendungen auch ausschwenkbar.
Über eine Tubuslinse TL und einen Spiegel SP CCD gelangt das Auswertelicht zur CCD-Kamera.
Der vorteilhafte Autofokusstrahlengang, eingekoppelt über einen Farbteiler FT zwischen RR und O, wird anhand Fig. 2 und 3 und 6 erläutert.
Zur Fokuskorrektur wird die gestrichelt dargestellte Einheit E, die das Objektiv, den Einkoppelfarbteiler FT und den Autofokusstrahlengang enthält, senkrecht zur Objektebene verschoben.
Eine der Laserlichtquellen LA2, LA3 (die andere ist ausgeschaltet) wird über ein Prisma P parallel eingekoppelt und über eine Optik FO fokussiert.
Zwei Laserlichtquellen können dann vorteilhaft sein, wenn das Objektiv O auswechselbar ist und wegen der unterschiedlichen Austrittpupille der Objektive ein unterschiedlicher axialer Versatz des Lichtquellenbildes über unterschiedliche Positionen der Laser zum Prisma P eingestellt werden soll.
Das Laserlicht gelangt über Umlenkspiegel ULS1,2, einen teildurchlässigen Spiegel ST2, eine Zerstreuungslinse ZS, einen Umlenkspiegel USSP, eine in Fig. 2 dargestellte Sammellinse SL und einen dem Revolver RR in Richtung der Mikrotiterplatte MTP nachgeordneten Farbteiler FT vor der Objektivanlagefläche OA in Richtung des OBJEKTIVES O.
Der Farbteiler weist vorteilhaft eine hohe Transmission über einen breiten Spektralbereich (350-780 nm) auf, d. h. vom kurzwelligen Anregungslicht einer HBO-Lampe bis zum langwelligen Emissionsspektrum von roten Farbstoffen, aber eine hohe Reflexion für Wellenlängen über 800 nm, d. h. für das Licht des Autofokuslasers.
Besonders vorteilhaft ist die Einkopplung des Autofokus-Strahlen­ gangs direkt vor dem Mikroskopobjektiv, weil nur wenige senkrechte optische Grenzflächen zu nur geringen Lichtverlusten und damit zur Genauigkeitserhöhung führen, und der Farbteiler FF über einen breiten Spektralbereich, außerhalb der für den Autofokus verwendeten IR-Wellenlänge, das Fluoreszenzlicht ungehindert passieren läßt, und dadurch nur die Reflexe der IR-Fokussierlaser in den Autofokusstrahlengang zurückreflektiert.
Durch die Stelle der Einkopplung in Beleuchtungsrichtung nach der Beleuchtung, ist eine Unabhängigkeit des Autofokus vom Justierzustand beispielsweise der Einkoppelelemente für die Beleuchtung gegeben.
Aufgrund der geringen Intensität des Fluoreszenzlichtes, das in der Probe angeregt werden kann, sind herkömmliche, auf der Auswertung des Bildkontrastes beruhende Autofokusverfahren ungeeignet, da für jedes einzelne Bild mehrere Sekunden integriert werden müßte, um überhaupt ein auswertbares Regelsignal zu erhalten.
Mit dem vorliegenden Verfahren lassen sich Fokussierungszeiten von unter einer Sekunde realisieren, was sich vorteilhaft auf die Gesamt-Meßzeit auswirkt.
Über Empfängerstrahlteiler EFST und Empfänger EF wird das an der MTP reflektierte Licht detektiert.
In Fig. 4 ist die Justage bei Einkopplung einer Lichtquelle dargestellt.
Der Strahlengang ist hierbei ab dem Reflektorrevolver in Richtung des Spiegels SP CCD um 90 Grad um die optische Achse der Einkopplung verdreht.
Durch Verschiebung von Spiegel ST3 und Strahlteiler ST4 wird in den in Fig. 1 dargestellten Beleuchtungsstrahlengang nach der Einkoppellinse KL bei eingeschobenem Spiegel SP3 das Licht der Lichtquelle in einer Justageposition auf eine Mattglasscheibe MGS umgelenkt, wodurch die Lage des Lichtquellenbildes zur optischen Achse von der Bedienperson justiert werden kann.
Auch bei der Einkopplung über eine Lichtleitfaser kann diese Anordnung zur Kontrolle der Lage dienen.
In der Normalstellung bei eingeschobenem Strahlteiler ST4 gelangt ein geringer Teil der Lichtintensität (etwa 4%) zur Erfassung und Regelung der Lichtleistung auf eine Monitordiode MTD. Dem Strahlteiler ist ein Wärmeschutzfilter WSF vorgeordnet.
Fig. 5: Autofokussystem
Ein Autofokussystem ist zur genauen Fokussierung beispielsweise auf den Boden der MTP vorteilhaft, da diese zwar an sich parallel ist, aber im allgemeinen stark gewölbt (Größenordnung 200-300 µm), so daß ein Fest-Fokus nicht funktioniert.
Höchste Priorität hat die Geschwindigkeit des Autofokus: nach Laden einer neuen Platte und erstmaliger Einrichtung/Fokussierung soll die Zeit für die Fokussierung (erforderlich z. B. nachdem die Platte verfahren wurde, um ein anderes Töpfchen auszuwerten) deutlich unter 1 sec liegen.
In Fig. 5 ist dargestellt, daß sowohl von der Plattenunterseite als auch von der Plattenoberseite Reflexe R2, R1 des eingestrahlten Lasers des Autofokus entstehen und auf dem Empfänger EF registriert werden können.
Die Reflexe liegen lateral versetzt, je nach Dicke der Platte bekommt man entweder beide Signale auf die CCD-Zeile oder bei großer Dicke liegen die Reflexe so weit auseinander, daß auf der CCD-Zeile nur ein Reflex erfaßt wird.
Wenn das Objektiv aus einer vom Objekt weit entfernten Position auf das Objekt zugefahren wird, erscheint zunächst der untere Reflex.
Bei Erfassung beider Reflexe ist anhand der Intensität der stärkere von der Oberseite vom schwächeren auf der Unterseite unterscheidbar.
Bei vorgegebener Dicke ist auch bestimmbar, ob aufgrund der Anordnung nur ein Reflex oder beide Reflexe auf dem Empfänger EF liegen werden.
Mit einem Regelalgorithmus wird bei Auftreten beider Reflexe der stärkere Reflex, d. h. der höhere Peak vernachlässigt und nur das Maximum des schwachen Peaks zur Fokuskontrolle herangezogen. Aus der Geometrie der Anordnung ist bei zwei vorhandenen Reflexen ohnehin bestimmbar, welcher von der Plattenunterseite stammt.
Die Eigenschaften des optischen Readersystems (Objektivparameter) einerseits und des Objektes (Dicke des Bodens der Mikrotiterplatte) andererseits legen also fest, ob ein oder zwei Reflexe vom Objekt gleichzeitig auf den Detektor des Autofokussystems (CCD-Zeile) abgebildet werden, wenn sich das Objekt in der Fokuslage befindet.
Fall A Zwei Reflexe gleichzeitig auf CCD-Zeile (von Plattenober- und Unter­ seite) zu erwarten aus Plattendicke
Ablauf der Regelung:
  • 1. Analyse der auf der CCD-Zeile abgebildeten Kurve anhand von Maxima, Minima, und Kehrwerten. Sub-Pixel-Auf­ lösung führt dabei zur Erhöhung der Genauigkeit.
  • 2. Aus den Ergebnissen feststellen, ob ein oder zwei Reflexe vorhanden sind.
  • 3. Sind zwei Reflexe vorhanden, wird aus der Ablage des relevanten Reflexes zum definierten Fokuspunkt auf der CCD-Zeile der Stellwert für den Fokustrieb berechnet.
  • 4. Ist nur einer der beiden Reflexe auf der Zeile abgebildet, ist die Lage des vorhandenen Reflexes zur Fangbereichsgrenze für die erste Fahrt in Richtung Fokuspunkt relevant, bis der zweite Reflex auf der CCD-Zeile erscheint.
Fall B Nur ein Reflex auf der CCD-Zeile
Ablauf der Regelung:
  • 1. Analyse der auf der CCD-Zeile abgebildeten Kurve anhand von Maxima, Minima, und Kehrwerten. Sub-Pixel-Auf­ lösung führt dabei zur Erhöhung der Genauigkeit.
  • 2. Bei eingerasteter Regelschleife wird aus der Ablage des Reflexes zum definierten Fokuspunkt auf der CCD-Zeile der Stellwert für den Fokustrieb berechnet.
  • 3. Ist zum Startzeitpunkt der Regelschleife kein Reflex auf der CCD-Zeile vorhanden oder ist nicht sichergestellt, daß sich der Reflex der Mikrotiterplatten-Innenseite im Fangbereich der Regelschleife befindet, muß zuerst ein Reflex-Such­ lauf von einer definierten Z-Position in Richtung der Mikrotiterplatte erfolgen.
Besonders vorteilhaft kann der Autufokus auch noch um einige µm elektronisch so korrigiert werden, daß nicht auf den Boden (oder den Probenträger) sondern in die Probenlösung (die Probe) hinein fokussiert wird.
Das erfolgt entweder durch einen automatischen elektronischen Korrekturwert des Autofokus vor der Objektivansteuerung oder über die Objektivverstellung selbst, die nach erfolgter Fokussierung automatisch um einen geringen Betrag verstellt wird.
In Fig. 6 ist eine Gesamtanordnung dargestellt, mit einer Mikrotiterplatte MTP auf einem X/Y-Tisch und einem Pipettor zur Probeneinführung auf die MTP und der in Fig. 1-5 dargestellten, hier schematisierten optischen Anordnung.
Bezugszeichen
WS Standard- Wechselstelle
KL Einkoppellinse
BO Beleuchtungsoptik
AP Aperturblende
S Shutter
LF Leuchtfeldblende
AF Anregungsfilter
EF Emissionsfilter
RR Reflektorrevolver
FFT Farbteiler
O Objektiv
SPCCD Spiegel zur CCD
CCD Kamera
Laser LA2, LA3 für Autofokus
P Prisma
FO Fokussieroptik
ULS1,2 Umlenkspiegel
ST2 Strahlteiler
ZS Zerstreuungslinse
EFST Empfängerstrahlteiler
EF Empfänger
USSP Umlenkspiegel
ST3,4 Strahlteiler
MTD Monitordiode
MGS Mattglasscheibe
WSF Wärmeschutzfilter
PI Pipettor
MTP Mikrotiterplatte

Claims (21)

1. Anordnung zur Untersuchung von einer oder mehreren in Probengefäßen oder auf Probenträgern angeordneten Proben im Durchlicht oder Auflicht, mittels der Abbildung und/oder Erfassung mindestens eines Teils des Probenvolumens durch das Probengefäß oder den Probenträger hindurch über eine CCD-Kamera, der eine Auswerteeinheit nachgeordnet ist.
2. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei eine Auflichtbeleuchtung ebenfalls durch das Probengefäß oder den Probenträger hindurch erfolgt.
3. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei die Beleuchtung der Anregung der Probenemission, vorzugsweise der Fluoreszenzanregung dient.
4. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, mit der Abbildung und/oder Erfassung auf einer von einer der Einfüllvorrichtung abgewandten Seite durch ein Probengefäß über eine CCD-Kamera, der eine Auswerteeinheit nachgeordnet ist.
5. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei sich mehrere Probengefäße auf einer Mikrotiterplatte befinden.
6. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei zur genauen Fokussierung der Abbildung ein Autofokussystem vorgesehen ist, das einem Abbildungsobjektiv in Richtung der Abbildung unmittelbar nachgeordnet ist.
7. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei über mindestens einen Strahlteiler eine Trennung von Anregungs- und Abbildungsstrahlengang erfolgt.
8. Anordnung nach Anspruch 7, wobei das Autofokussystem zwischen einem Abbildungsobjektiv und diesem Strahlteiler eingeblendet wird.
9. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei die Einblendung des Autofokus über einen Farbteiler erfolgt.
10. Anordnung nach Anspruch 9, wobei der Farbteiler eine hohe Transmission über einen breiten Spektralbereich (350-780 nm) aufweist, d. h. vom kurzwelligen Anregungslicht einer HBO-Lampe bis zum langwelligen Emissionsspektrum von roten Farbstoffen, aber eine hohe Reflexion für Wellenlängen über 800 nm, insbesondere für das Licht eines Autofokuslasers.
11. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei das Autofokussystem in Richtung der Beleuchtung nach der Lichtquelle/der Einkoppelstelle für die Beleuchtung eingeblendet wird.
12. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, mit einer Fokussierung auf Zellen am oder in der Nähe des Bodens der Probengefäße.
13. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, mit einem x/-y Tisch zur Einbringung unterschiedlicher Probengefäße in den Anregungsstrahlengang.
14. Anordnung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei für jede Probe eine separate Fokussierung erfolgt.
15. Anordnung zur Justage bei Einkopplung einer Lichtquelle zur Probenbeleuchtung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei von einem einschiebbaren Spiegel das Licht der Lichtquelle in einer Justageposition auf eine Mattglasscheibe MGS umgelenkt wird, wodurch die Lage des Lichtquellenbildes zur optischen Achse von der Bedienperson justiert werden kann.
16. Anordnung nach Anspruch 15, wobei in einer Normalstellung mit eingeschobenem Strahlteiler ST4 ein geringer Teil der Lichtintensität (etwa 4%) zur Erfassung und Regelung der Lichtleistung auf eine Monitordiode MTD gelangt.
17. Verfahren zur automatischen Fokussierung, insbesondere nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei über mindestens einen Fokussierstrahl das Probengefäß von unten beleuchtet wird und die vom Probengefäß reflektierten Strahlungsanteile mittels eines CCD-Empfängers ausgewertet werden.
18. Verfahren nach Anspruch 17, wobei von unterschiedlichen Grenzschichten des Probengefäßes stammende Strahlungsanteile identifiziert werden und eine Fokussierung auf eine Grenzschicht erfolgt.
19. Verfahren nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei eine Fokussierung auf den Gefäßboden erfolgt.
20. Verfahren nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei das Probengefäß eine Mikrotiterplatte ist.
21. Verfahren nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei bei der Fokussierung ein Korrekturwert für den Autofokus und/oder eine Verstelleinrichtung zur Fokussierung auf die Probe/ins Innere des Probengefäßes berechnet und/oder eingestellt wird.
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