DE10112107A1 - Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae - Google Patents
Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie EnterobacteriaceaeInfo
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Abstract
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminoäuren, insbesondere L-Threonin, in dem man folgende Schritte durchführt: DOLLAR A a) Fermentation der die gewünschte L-Aminosäure produzierenden Mikroorganismen der Familie Enterobactericeae, in denen man zumindest das poxB-Gen oder dafür kodierende Nukleotidsequenzen abschwächt, insbesondere ausschaltet, DOLLAR A b) Anreicherung der L-Aminosäure im Medium oder in den Zellen der Bakterien, und DOLLAR A c) Isolieren der L-Aminosäure.
Description
Diese Erfindung betrifft ein Verfahren zur fermentativen
Herstellung von L-Aminosäuren, insbesondere L-Threonin, L-
Lysin und L-Valin, unter Verwendung von Stämmen der Familie
Enterobacteriaceae, in denen das poxB-Gen abgeschwächt
wird.
L-Aminosäuren, insbesondere L-Threonin, L-Lysin und L-
Valin, finden in der Humanmedizin und in der
pharmazeutischen Industrie, in der Lebensmittelindustrie
und ganz besonders in der Tierernährung Anwendung.
Es ist bekannt L-Aminosäuren durch Fermentation von Stämmen
der Enterobacteriaceae, insbesondere Escherichia coli (E.
coli) und Serratia marcescens, herzustellen. Wegen der
großen Bedeutung wird ständig an der Verbesserung der
Herstellverfahren gearbeitet. Verfahrensverbesserungen
können fermentationstechnische Maßnahmen, wie z. B. Rührung
und Versorgung mit Sauerstoff, oder die Zusammensetzung der
Nährmedien wie z. B. die Zuckerkonzentration während der
Fermentation, oder die Aufarbeitung zur Produktform, durch
z. B. Ionenaustauschchromatographie, oder die intrinsischen
Leistungseigenschaften des Mikroorganismus selbst
betreffen.
Zur Verbesserung der Leistungseigenschaften dieser
Mikroorganismen werden Methoden der Mutagenese, Selektion
und Mutantenauswahl angewendet. Auf diese Weise erhält man
Stämme, die resistent gegen Antimetabolite wie z. B. das
Threonin-Analogon α-Amino-β-Hydroxyvaleriansäure (AHV) oder
auxotroph für regulatorisch bedeutsame Metabolite sind und
L-Aminosäuren wie z. B. L-Threonin produzieren.
Seit einigen Jahren werden ebenfalls Methoden der
rekombinanten DNA-Technik zur Stammverbesserung L-
Aminosäuren produzierender Stämme der Familie
Enterobacteriaceae eingesetzt, indem man einzelne
Aminosäure-Biosynthesegene amplifiziert und die Auswirkung
auf die Produktion untersucht.
Die Erfinder haben sich die Aufgabe gestellt, neue
Maßnahmen zur verbesserten fermentativen Herstellung von L-
Aminosäuren, insbesondere L-Threonin, L-Lysin und L-Valin,
bereitzustellen.
Gegenstand der Erfindung ist ein Verfahren zur
fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren, insbesondere
L-Threonin, unter Verwendung von Mikroorganismen der
Familie Enterobacteriaceae, die insbesondere bereits L-
Threonin produzieren, und in denen die für das Enzym
Pyruvat-Oxidase (EC 1.2.2.2) kodierende Nukleotidsequenz
(poxB-Gen) abgeschwächt wird.
Der Begriff "Abschwächung" beschreibt in diesem
Zusammenhang die Verringerung oder Ausschaltung der
intrazellulären Aktivität eines oder mehrerer Enzyme
(Proteine) in einem Mikroorganismus, die durch die
entsprechende DNA kodiert werden, indem man beispielsweise
einen schwachen Promotor oder ein Gen bzw. Allel verwendet,
das für ein entsprechendes Enzym mit einer niedrigen
Aktivität kodiert bzw. das entsprechende Enzym (Protein)
oder Gen inaktiviert und gegebenenfalls diese Maßnahmen
kombiniert.
Das Verfahren ist dadurch gekennzeichnet, daß man folgende
Schritte durchführt:
- a) Fermentation von Mikroorganismen der Familie Enterobacteriaceae, in denen zumindest das poxB-Gen abgeschwächt wird,
- b) Anreicherung der entsprechenden L-Aminosäure im Medium oder in den Zellen der Mikroorganismen der Familie Enterobacteriaceae, und
- c) Isolieren der gewünschten L-Aminosäure.
Die Mikroorganismen, die Gegenstand der vorliegenden
Erfindung sind, können L-Aminosäuren aus Glucose,
Saccharose, Lactose, Fructose, Maltose, Melasse,
gegebenenfalls Stärke, gegebenenfalls Cellulose oder aus
Glycerin und Ethanol herstellen. Es handelt sich um
Vertreter der Familie Enterobacteriaceae, ausgewählt aus
den Gattungen Escherichia, Erwinia, Providencia und
Serratia. Die Gattungen Escherichia und Serratia werden
bevorzugt. Bei der Gattung Escherichia ist insbesondere die
Art Escherichia coli und bei der Gattung Serratia
insbesondere die Art Serratia marcescens zu nennen.
Geeignete, insbesondere L-Threonin produzierende Stämme der
Gattung Escherichia, insbesondere der Art Escherichia coli
sind beispielsweise
Escherichia coli TF427
Escherichia coli H4578
Escherichia coli KY10935
Escherichia coli VNIIgenetika MG442
Escherichia coli VNIIgenetika M1
Escherichia coli VNIIgenetika 472T23
Escherichia coli BKIIM B-3996
Escherichia coli kat 13
Escherichia coli KCCM-10132.
Escherichia coli TF427
Escherichia coli H4578
Escherichia coli KY10935
Escherichia coli VNIIgenetika MG442
Escherichia coli VNIIgenetika M1
Escherichia coli VNIIgenetika 472T23
Escherichia coli BKIIM B-3996
Escherichia coli kat 13
Escherichia coli KCCM-10132.
Geeignete L-Threonin produzierende Stämme der Gattung
Serratia, insbesondere der Art Serratia marcescens sind
beispielsweise
Serratia marcescens HNr21
Serratia marcescens TLr156
Serratia marcescens T2000.
Serratia marcescens HNr21
Serratia marcescens TLr156
Serratia marcescens T2000.
L-Threonin produzierende Stämme aus der Familie der
Enterobacteriaceae besitzen bevorzugt, unter anderen, ein
oder mehrere der genetischen bzw. phänotypischen Merkmale
ausgewählt aus der Gruppe: Resistenz gegen α-Amino-β-
Hydroxyvaleriansäure, Resistenz gegen Thialysin, Resistenz
gegen Ethionin, Resistenz gegen α-Methylserin, Resistenz
gegen Diaminobernsteinsäure, Resistenz gegen α-
Aminobuttersäure, Resistenz gegen Borrelidin, Resistenz
gegen Rifampicin, Resistenz gegen Valin-Analoga wie
beispielsweise Valinhydroxamat, Resistenz gegen
Purinanaloga wie beispielsweise 6-Dimethylaminopurin,
Bedürftigkeit für L-Methionin, gegebenenfalls partielle und
kompensierbare Bedürftigkeit für L-Isoleucin, Bedürftigkeit
für meso-Diaminopimelinsäure, Auxotrophie bezüglich
Threonin-haltiger Dipeptide, Resistenz gegen L-Threonin,
Resistenz gegen L-Homoserin, Resistenz gegen L-Lysin,
Resistenz gegen L-Methionin, Resistenz gegen L-
Glutaminsäure, Resistenz gegen L-Aspartat, Resistenz gegen
L-Leucin, Resistenz gegen L-Phenylalanin, Resistenz gegen
L-Serin, Resistenz gegen L-Cystein, Resistenz gegen L-
Valin, Empfindlichkeit gegenüber Fluoropyruvat, defekte
Threonin-Dehydrogenase, gegebenenfalls Fähigkeit zur
Saccharose-Verwertung, Verstärkung des Threonin-Operons,
Verstärkung der Homoserin-Dehydrogenase I-Aspartatkinase I
bevorzugt der feed back resistenten Form, Verstärkung der
Homoserinkinase, Verstärkung der Threoninsynthase,
Verstärkung der Aspartatkinase, gegebenenfalls der feed
back resistenten Form, Verstärkung der Aspartatsemialdehyd-
Dehydrogenase, Verstärkung der Phosphoenolpyruvat-
Carboxylase, gegebenenfalls der feed back resistenten Form,
Verstärkung der Phosphoenolpyruvat-Synthase, Verstärkung
der Transhydrogenase, Verstärkung des RhtB-Genproduktes,
Verstärkung des RhtC-Genproduktes, Verstärkung des YfiK-
Genproduktes, Verstärkung einer Pyruvat-Carboxylase, und
Abschwächung der Essigsäurebildung.
Es wurde gefunden, daß Mikroorganismen der Familie
Enterobacteriaceae nach Abschwächung, insbesondere
Ausschaltung des für die Pyruvat-Oxidase (EC 1.2.2.2)
kodierenden poxB-Gens in verbesserter Weise L-Aminosäuren,
insbesondere L-Threonin produzieren.
Darüber hinaus wurde gefunden, daß Mikroorganismen der
Familie Enterobacteriaceae nach Abschwächung, insbesondere
Ausschaltung des für die Pyruvat-Oxidase (EC 1.2.2.2)
kodierenden poxB-Gens geringere Konzentrationen des
unerwünschten Nebenproduktes Essigsäure bilden.
Die Nukleotidsequenz des poxB-Gens von Escherichia coli
wurde von Grabau und Cronan (Nucleic Acids Research. 14
(13), 5449-5460 (1986)) publiziert und kann ebenfalls der
von Blattner et al. (Science 277, 1453-1462 (1997))
publizierten Genomsequenz von Escherichia coli unter der
Accession Number AE000188 entnommen werden. Die
Nukleotidsequenz des poxB-Gens von Escherichia coli ist in
SEQ ID No. 1 und die Aminosäuresequenz des dazugehörigen
Genproduktes in SEQ ID No. 2 dargestellt.
Die in den angegebenen Textstellen beschriebenen poxB-Gene
können erfindungsgemäß verwendet werden. Weiterhin können
Allele des poxB-Gens verwendet werden, die sich aus der
Degeneriertheit des genetischen Codes oder durch
funktionsneutrale Sinnmutationen ("sense mutations")
ergeben.
Zur Erzielung einer Abschwächung können beispielsweise die
Expression des poxB-Gens oder die katalytischen
Eigenschaften des Enzymproteins herabgesetzt bzw.
ausgeschaltet werden. Gegebenenfalls können beide Maßnahmen
kombiniert werden.
Die Verringerung der Genexpression kann durch geeignete
Kulturführung, durch genetische Veränderung (Mutation) der
Signalstrukturen der Genexpression oder auch durch
Antisense-RNA Technik erfolgen. Signalstrukturen der
Genexpression sind beispielsweise Repressorgene,
Aktivatorgene, Operatoren, Promotoren, Attenuatoren,
Ribosomenbindungsstellen, das Startkodon und Terminatoren.
Angaben hierzu findet der Fachmann unter anderem
beispielsweise bei Jensen und Hammer (Biotechnology and
Bioengineering 58: 191-195 (1998)), bei Carrier und
Keasling (Biotechnology Progress 15, 58-64 (1999), Franch
und Gerdes (Current Opinion in Microbiology 3, 159-164
(2000)) und in bekannten Lehrbüchern der Genetik und
Molekularbiologie wie beispielsweise dem Lehrbuch von
Knippers ("Molekulare Genetik", 6. Auflage, Georg Thieme
Verlag, Stuttgart, Deutschland, 1995) oder dem von
Winnacker ("Gene und Klone", VCH Verlagsgesellschaft,
Weinheim, Deutschland, 1990).
Mutationen, die zu einer Veränderung bzw. Herabsetzung der
katalytischen Eigenschaften von Enzymproteinen führen, sind
aus dem Stand der Technik bekannt. Als Beispiele seien die
Arbeiten von Qiu und Goodman (Journal of Biological
Chemistry 272: 8611-8617 (1997)), Yano et al. (Proceedings
of the National Academy of Sciences, USA 95, 5511-5515
(1998), Wente und Schachmann (Journal of Biological
Chemistry 266, 20833-20839 (1991) genannt. Zusammenfassende
Darstellungen können bekannten Lehrbüchern der Genetik und
Molekularbiologie wie z. B. dem von Hagemann ("Allgemeine
Genetik", Gustav Fischer Verlag, Stuttgart, 1986) entnommen
werden.
Als Mutationen kommen Transitionen, Transversionen,
Insertionen und Deletionen in Betracht. In Abhängigkeit von
der Wirkung des Aminosäureaustausches auf die
Enzymaktivität wird von Fehlsinnmutationen ("missense
mutations") oder Nichtsinnmutationen ("nonsense mutations")
gesprochen. Insertionen oder Deletionen von mindestens
einem Basenpaar in einem Gen führen zu
Rasterverschiebungsmutationen ("frame shift mutations"),
die dazu führen, daß falsche Aminosäuren eingebaut werden
oder die Translation vorzeitig abbricht. Deletionen von
mehreren Kodonen führen typischerweise zu einem
vollständigen Ausfall der Enzymaktivität. Anleitungen zur
Erzeugung derartiger Mutationen gehören zum Stand der
Technik und können bekannten Lehrbüchern der Genetik und
Molekularbiologie wie z. B. dem Lehrbuch von Knippers
("Molekulare Genetik", 6. Auflage, Georg Thieme Verlag,
Stuttgart, Deutschland, 1995), dem von Winnacker ("Gene und
Klone", VCH Verlagsgesellschaft, Weinheim, Deutschland,
1990) oder dem von Hagemann ("Allgemeine Genetik", Gustav
Fischer Verlag, Stuttgart, 1986) entnommen werden.
Ein Beispiel für ein Plasmid, mit Hilfe dessen das poxB-Gen
von Escherichia coli durch ortsspezifische Mutagenese
abgeschwächt, insbesondere ausgeschaltet werden kann, ist
das Plasmid pMAK705ΔpoxB (Fig. 1). Es enthält neben
Resten von Polylinkersequenzen lediglich einen Teil der 5'-
und einen Teil der 3'-Region des poxB-Gens. Ein 340 bp
langer Abschnitt der Kodierregion fehlt (Deletion). Die
Sequenz dieser für die Mutagenese des poxB-Gens
einsetzbaren DNA ist in SEQ ID No. 3 dargestellt.
Die Deletionsmutation des poxB-Gens kann durch Gen- bzw.
Allelaustausch in geeignete Stämme eingebaut werden.
Eine gebräuchliche Methode ist die von Hamilton et al.
(Journal of Bacteriology 174, 4617-4622 (1989))
beschriebene Methode des Genaustauschs mit Hilfe eines
konditional replizierenden pSC101-Derivates pMAK705. Andere
im Stand der Technik beschriebene Methoden wie
beispielsweise die von Martinez-Morales et al. (Journal of
Bacteriology 1999, 7143-7148 (1999)) oder die von Boyd et
al. (Journal of Bacteriology 182, 842-847 (2000)) können
gleichfalls benutzt werden.
Nach erfolgtem Austausch liegt in dem betreffenden Stamm
die in SEQ ID No. 4 dargestellte Form des ΔpoxB-Allels vor,
die ebenfalls Gegenstand der Erfindung ist.
Es ist ebenfalls möglich, Mutationen im poxB-Gen oder
Mutationen, die die Expression des poxB-Gens betreffen,
durch Konjugation oder Transduktion in verschiedene Stämme
zu überführen.
Weiterhin kann es für die Produktion von L-Aminosäuren,
insbesondere L-Threonin mit Stämmen der Familie
Enterobacteriaceae vorteilhaft sein, zusätzlich zur
Abschwächung des poxB-Gens ein oder mehrere Enzyme des
bekannten Threonin-Biosyntheseweges oder Enzyme des
anaplerotischen Stoffwechsels oder Enzyme für die
Produktion von reduziertem Nicotinamid-Adenin-Dinukleotid-
Phosphat zu verstärken.
Der Begriff "Verstärkung" beschreibt in diesem Zusammenhang
die Erhöhung der intrazellulären Aktivität eines oder
mehrerer Enzyme bzw. Proteine in einem Mikroorganismus, die
durch die entsprechende DNA kodiert werden, indem man
beispielsweise die Kopienzahl des Gens bzw. der Gene
erhöht, einen starken Promotor oder ein Gen verwendet, das
für ein entsprechendes Enzym bzw. Protein mit einer hohen
Aktivität kodiert und gegebenenfalls diese Maßnahmen
kombiniert.
So können beispielsweise gleichzeitig eines oder mehrere
der Gene, ausgewählt aus der Gruppe
- - das für die Aspartatkinase, die Homoserin-Dehydrogenase, die Homoserinkinase und die Threoninsynthase kodierende thrABC-Operon (US-A-4,278,765),
- - das für die Pyruvat-Carboxylase kodierende pyc-Gen (DE-A-198 31 609),
- - das für die Phosphoenolpyruvat-Synthase kodierende pps- Gen (Molecular and General Genetics 231: 332 (1992)),
- - das für die Phosphoenolpyruvat-Carboxylase kodierende ppc-Gen (Gene 31: 279-283 (1984)),
- - die für die Transhydrogenase kodierenden Gene pntA und pntB (European Journal of Biochemistry 158: 647-653 (1986)),
- - das Homoserinresistenz vermittelnde Gen rhtB (EP-A-0 994 190),
- - das für die Malat : Chinon Oxidoreduktase kodierende mqo- Gen (DE 100 34 833.5),
- - das Threoninresistenz vermittelnde Gen rhtC (EP-A-1 013 765),
- - das für den Threoninexport kodierende thrE-Gen von Corynebacterium glutamicum (DE 100 26 494.8) und
- - das für die Glutamat-Dehydrogenase kodierende gdhA-Gen (Nucleic Acids Research 11: 5257-5266 (1983); Gene 23: 199-209 (1983))
verstärkt, insbesondere überexprimiert werden.
Weiterhin kann es für die Produktion von L-Aminosäuren,
insbesondere L-Threonin vorteilhaft sein, zusätzlich zur
Abschwächung des poxB-Gens eines oder mehrere der Gene
ausgewählt aus der Gruppe
- - das für die Threonin-Dehydrogenase kodierende tdh-Gen (Ravnikar und Somerville, Journal of Bacteriology 169, 4716-4721 (1987)),
- - das für die Malat-Dehydrogenase (E.C. 1.1.1.37) kodierende mdh-Gen (Vogel et al., Archives in Microbiology 149, 36-42 (1987)),
- - das Genprodukt des offenen Leserahmens (orf) yjfA (Accession Number AAC77180 des National Center for Biotechnology Information (NCBI, Bethesda, MD, USA),
- - das Genprodukt des offenen Leserahmens (orf) ytfP (Accession Number AAC77179 des National Center for Biotechnology Information (NCBI, Bethesda, MD, USA) und
- - das für das Enzym Phosphoenolpyruvat-Carboxykinase kodierende pckA-Gen (Medina et al. (Journal of Bacteriology 172, 7151-7156 (1990))
abzuschwächen, insbesondere auszuschalten oder die
Expression zu verringern.
Weiterhin kann es für die Produktion von L-Aminosäuren,
insbesondere L-Threonin vorteilhaft sein, zusätzlich zur
Abschwächung des poxß-Gens unerwünschte Nebenreaktionen
auszuschalten (Nakayama: "Breeding of Amino Acid Producing
Microorganisms", in: Overproduction of Microbial Products,
Krumphanzl, Sikyta, Vanek (eds.), Academic Press, London,
UK, 1982).
Die erfindungsgemäß hergestellten Mikroorganismen können im
batch - Verfahren (Satzkultivierung), im fed batch
(Zulaufverfahren) oder im repeated fed batch-Verfahren
(repetitives Zulaufverfahren) kultiviert werden. Eine
Zusammenfassung über bekannte Kultivierungsmethoden sind im
Lehrbuch von Chmiel (Bioprozesstechnik 1. Einführung in die
Bioverfahrenstechnik (Gustav Fischer Verlag, Stuttgart,
1991)) oder im Lehrbuch von Storhas (Bioreaktoren und
periphere Einrichtungen (Vieweg Verlag,
Braunschweig/Wiesbaden, 1994)) beschrieben.
Das zu verwendende Kulturmedium muß in geeigneter Weise den
Ansprüchen der jeweiligen Stämme genügen. Beschreibungen
von Kulturmedien verschiedener Mikroorganismen sind im
Handbuch "Manual of Methods for General Bacteriology" der
American Society for Bacteriology (Washington D. C., USA,
1981) enthalten.
Als Kohlenstoffquelle können Zucker und Kohlehydrate wie
z. B. Glucose, Saccharose, Lactose, Fructose, Maltose,
Melasse, Stärke und gegebenenfalls Cellulose, Öle und Fette
wie z. B. Sojaöl, Sonnenblumenöl, Erdnussöl und Kokosfett,
Fettsäuren wie z. B. Palmitinsäure, Stearinsäure und
Linolsäure, Alkohole wie z. B. Glycerin und Ethanol und
organische Säuren wie z. B. Essigsäure verwendet werden.
Diese Stoffe können einzeln oder als Mischung verwendet
werden.
Als Stickstoffquelle können organische Stickstoff haltige
Verbindungen wie Peptone, Hefeextrakt, Fleischextrakt,
Malzextrakt, Maisquellwasser, Sojabohnenmehl und Harnstoff
oder anorganische Verbindungen wie Ammoniumsulfat,
Ammoniumchlorid, Ammoniumphosphat, Ammoniumcarbonat und
Ammoniumnitrat verwendet werden. Die Stickstoffquellen
können einzeln oder als Mischung verwendet werden.
Als Phosphorquelle können Phosphorsäure,
Kaliumdihydrogenphosphat oder Dikaliumhydrogenphosphat oder
die entsprechenden Natrium-haltigen Salze verwendet werden.
Das Kulturmedium muß weiterhin Salze von Metallen
enthalten, wie z. B. Magnesiumsulfat oder Eisensulfat, die
für das Wachstum notwendig sind. Schließlich können
essentielle Wuchsstoffe wie Aminosäuren und Vitamine
zusätzlich zu den oben genannten Stoffen eingesetzt werden.
Dem Kulturmedium können überdies geeignete Vorstufen
zugesetzt werden. Die genannten Einsatzstoffe können zur
Kultur in Form eines einmaligen Ansatzes hinzugegeben oder
in geeigneter Weise während der Kultivierung zugefüttert
werden.
Zur pH-Kontrolle der Kultur werden basische Verbindungen
wie Natriumhydroxid, Kaliumhydroxid, Ammoniak bzw.
Ammoniakwasser oder saure Verbindungen wie Phosphorsäure
oder Schwefelsäure in geeigneter Weise eingesetzt. Zur
Kontrolle der Schaumentwicklung können Antischaummittel wie
z. B. Fettsäurepolyglykolester eingesetzt werden. Zur
Aufrechterhaltung der Stabilität von Plasmiden können dem
Medium geeignete selektiv wirkende Stoffe z. B. Antibiotika
hinzugefügt werden. Um aerobe Bedingungen
aufrechtzuerhalten, werden Sauerstoff oder Sauerstoff
haltige Gasmischungen wie z. B. Luft in die Kultur
eingetragen. Die Temperatur der Kultur liegt normalerweise
bei 25°C bis 45°C und vorzugsweise bei 30°C bis 40°C. Die
Kultur wird solange fortgesetzt, bis sich ein Maximum an L-
Aminosäuren bzw. L-Threonin gebildet hat. Dieses Ziel wird
normalerweise innerhalb von 10 Stunden bis 160 Stunden
erreicht.
Die Analyse von L-Aminosäuren kann durch
Anionenaustauschchromatographie mit anschließender
Ninhydrin Derivatisierung erfolgen, so wie bei Spackman et
al. (Analytical Chemistry, 30, (1958), 1190) beschrieben,
oder sie kann durch reversed phase HPLC erfolgen, so wie
bei Lindroth et al. (Analytical Chemistry (1979)
51: 1167-1174) beschrieben.
Eine Reinkultur des Escherichia coli K-12 Stammes
DHSα/pMAK705 wurde am 12. September 2000 bei der Deutschen
Sammlung für Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ,
Braunschweig, Deutschland) gemäß Budapester Vertrag als DSM
13720 hinterlegt.
Eine Reinkultur des Escherichia coli K-12 Stammes
MG442ΔpoxB wurde am 02. Oktober 2000 bei der Deutschen
Sammlung für Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ,
Braunschweig, Deutschland) gemäß Budapester Vertrag als DSM
13762 hinterlegt.
Das erfindungsgemäße Verfahren dient zur fermentativen
Herstellung von L-Aminosäuren, wie z. B. L-Threonin, L-
Isoleucin, L-Valin, L-Methionin, L-Homoserin und L-Lysin,
insbesondere L-Threonin.
Die vorliegende Erfindung wird im Folgenden anhand von
Ausführungsbeispielen näher erläutert.
Die Isolierung von Plasmid-DNA aus Escherichia coli sowie
alle Techniken zur Restriktion, Klenow- und alkalische
Phosphatasebehandlung werden nach Sambrook et al.
(Molecular Cloning - A Laboratory Manual (1989) Cold Spring
Harbour Laboratory Press) durchgeführt. Die Transformation
von Escherichia coli wird, wenn nicht anders beschrieben,
nach Chung et al. (Proceedings of the National Academy of
Sciences of the United States of America, USA (1989)
86: 2172-2175) durchgeführt.
Die Bebrütungstemperatur bei der Herstellung von Stämmen
und Transformanten ist 37°C. Bei dem
Genaustauschververfahren nach Hamilton et. al werden
Temperaturen von 30°C und 44°C verwendet.
Teile der 5'- und 3'-Region des poxB-Gens werden aus
Escherichia coli K12 unter Anwendung der Polymerase-
Kettenreaktion (PCR) sowie synthetischen Oligonukleotiden
amplifiziert. Ausgehend von der Nukletidsequenz des poxB-
Gens in E. coli K12 MG1655 (SEQ ID No. 1) werden folgende
PCR-Primer synthetisiert (MWG Biotech, Ebersberg,
Deutschland):
Die für die PCR eingesetzte chromosomale E. coli K12 MG1655
DNA wird nach Herstellerangaben mit "Qiagen Genomic-tips
100/G" (QIAGEN, Hilden, Deutschland) isoliert. Ein ca. 500
Basenpaare (bp) grosses DNA-Fragment aus der 5'-Region des
poxB-Gens (mit poxB1 bezeichnet) und ein ca. 750 bp grosses
DNA-Fragment aus der 3'-Region des poxB-Gens (mit poxB2
bezeichnet) kann mit den spezifischen Primern unter
Standard-PCR-Bedingungen (Innis et al. (1990) PCR
Protocols. A Guide to Methods and Applications, Academic
Press) mit der Taq-DNA-Polymerase (Gibco-BRL, Eggenstein,
Deutschland) amplifiziert werden. Die PCR-Produkte werden
den Herstellerangaben entsprechend jeweils mit dem Vektor
pCR2.1TOPO (TOPO TA Cloning Kit, Invitrogen, Groningen,
Niederlande) ligiert und in den E. coli Stamm TOP10F'
transformiert.
Die Selektion Plasmid tragender Zellen erfolgt auf LB Agar,
der mit 50 µg/ml Ampicillin versetzt ist. Nach der Plasmid
DNA Isolierung wird der Vektor pCR2.1TOPOpoxB1 mit den
Restriktionsenzymen Ech136II und XbaI gespalten und das
poxB1-Fragment nach der Auftrennung im 0,8%igen Agarosegel
mit Hilfe des QIAquick Gel Extraction Kit (QIAGEN, Hilden,
Deutschland) isoliert. Der Vektor pCR2.1TOPOpoxB2 wird nach
der Plasmid DNA Isolierung mit den Enzymen EcoRV und XbaI
gespalten und mit dem isolierten poxB1-Fragment ligiert.
Der E. coli Stamm DH5α wird mit dem Ligationsansatz
transformiert und Plasmid tragende Zellen auf LB Agar, der
mit 50 µg/ml Ampicillin versetzt ist, selektioniert. Nach
der Plasmid DNA Isolierung werden durch die
Kontrollspaltung mit den Enzymen HindIII und XbaI solche
Plasmide nachgewiesen, in denen die in SEQ ID No. 3
dargestellte mutagene DNA Sequenz kloniert vorliegt. Eines
der Plasmide wird als pCR2.1TOPOΔpoxB bezeichnet.
Das in Beispiel 1 beschriebene poxB-Allel wird aus dem
Vektor pCR2.1TOPOΔpoxB nach der Restriktion mit den Enzymen
HindIII und XbaI und Auftrennung im 0,8%igen Agarosegel
isoliert und mit dem Plasmid pMAK705 (Hamilton et al.
(1989) Journal of Bacteriology 174, 4617-4622), das mit
den Enzymen HindIII und XbaI verdaut wurde, ligiert. Der
Ligationsansatz wird in DH5α transformiert und Plasmid
tragende Zellen auf LB Agar, der mit 20 µg/ml
Chloramphenicol versetzt ist, selektioniert. Die
erfolgreiche Klonierung wird nach Plasmid DNA Isolierung
und Spaltung mit den Enzymen HindIII und XbaI nachgewiesen.
Der entstandene Austauschvektor pMAK705ΔpoxB (=
pMAK705deltapoxB) ist in Fig. 1 dargestellt.
Der L-Threonin produzierende E. coli Stamm MG442 ist in der
Patentschrift US-A-4,278,765 beschrieben und bei der
Russischen Nationalsammlung für industrielle
Mikroorganismen (VKPM, Moskau, Russland) als CMIM B-1628
hinterlegt.
Für den Austausch des chromosomalen poxB-Gens gegen das
Plasmid-kodierte Deletionskonstrukt wird MG442 mit dem
Plasmid pMAK705ΔpoxB transformiert. Der Genaustausch
erfolgt mit dem von Hamilton et al. (1989) Journal of
Bacteriology 174, 4617-4622) beschriebenen
Selektionsverfahren und wird durch Standard-PCR-Methoden
(Innis et al. (1990) PCR Protocols. A Guide to Methods and
Applications, Academic Press) mit folgenden Oligonukleotid
Primern verifiziert:
Der erhaltene Stamm wird als MG442ΔpoxB bezeichnet.
MG442ΔpoxB wird auf Minimalmedium mit der folgenden
Zusammensetzung vermehrt: 3,5 g/l Na2HPO4.2H2O, 1,5 g/l
KH2PO4, 1 g/l NH4Cl, 0,1 g/l MgSO4.7H2O, 2 g/l Glucose,
20 g/l Agar. Die Bildung von L-Threonin wird in batch Kulturen
von 10 ml, die in 100 ml Erlenmeierkolben enthalten sind,
überprüft. Dazu wird 10 ml Vorkulturmedium der folgenden
Zusammensetzung: 2 g/l Hefeextrakt, 10 g/l (NH4)2SO4, 1 g/l
KH2PO4, 0,5 g/l MgSO4.7H2O, 15 g/l CaCO3, 20 g/l Glucose
beimpft und für 16 Stunden bei 37°C und 180 rpm auf einem
ESR Inkubator der Firma Kühner AG (Birsfelden, Schweiz)
inkubiert. 250 µl dieser Vorkultur werden in 10 ml
Produktionsmedium (25 g/l (NH4)2SO4, 2 g/l KH2PO4, 1 g/l
MgSO4.7H2O, 0,03 g/l FeSO4.7H2O, 0,018 g/l MnSO4.1H2O, 30 g/l
CaCO3, 20 g/l Glucose) überimpft und für 48 Stunden bei
37°C inkubiert. Nach der Inkubation wird die optische
Dichte (OD) der Kultursuspension mit einem LP2W-Photometer
der Firma Dr. Lange (Berlin, Deutschland) bei einer
Messwellenlänge von 660 nm bestimmt.
Anschließend wird die Konzentration an gebildetem L-
Threonin im steril filtrierten Kulturüberstand mit einem
Aminosäureanalysator der Firma Eppendorf-BioTronik
(Hamburg, Deutschland) durch Ionenaustauschchromatographie
und Nachsäulenreaktion mit Ninhydrindetektion bestimmt.
In Tabelle 1 ist das Ergebnis des Versuches dargestellt.
Das Glutamat-Dehydrogenase-Gen aus Escherichia coli K12
wird unter Anwendung der Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
sowie synthetischen Oligonukleotiden amplifiziert.
Ausgehend von der Nukleotidsequenz für das gdhA-Gen in E.
coli K12 MG1655 (GenBank: Accession Nr. AE000270 und Nr.
AE000271) werden PCR-Primer synthetisiert (MWG Biotech,
Ebersberg, Deutschland):
Die für die PCR eingesetzte chromosomale E. coli K12 MG1655
DNA wird nach Herstellerangaben mit "QIAGEN Genomic-tips
100/G" (QIAGEN, Hilden, Deutschland) isoliert. Ein ca. 2150 bp
großes DNA-Fragment, das den gdhA-Kodierbereich und ca.
350 bp 5'-flankierende und ca. 450 bp 3'-flankierende
Sequenzen umfaßt, kann mit den spezifischen Primern unter
Standard-PCR-Bedingungen (Innis et al.: PCR protocols. A
guide to methods and applications, 1990, Academic Press)
mit der Pfu-DNA Polymerase (Promega Corporation, Madison,
USA) amplifiziert werden. Das PCR-Produkt wird in das
Plasmid pCR2.1TOPO kloniert und in den E. coli Stamm TOP10
transformiert (Invitrogen, Leek, Niederlande,
Produktbeschreibung TOPO TA Cloning Kit, Cat. No.
K4500-01). Die erfolgreiche Klonierung wird durch Spaltung des
Plasmids pCR2.1TOPOgdhA mit den Restriktionsenzymen EcoRI
und EcoRV nachgewiesen. Dazu wird die Plasmid DNA mittels
des "QIAprep Spin Plasmid Kits" (QIAGEN, Hilden,
Deutschland) isoliert und nach der Spaltung in einem
0,8%igen Agarosegel aufgetrennt.
Das Plasmid pCR2.1TOPOgdhA wird mit dem Enzym EcoRI
gespalten, der Spaltungsansatz im 0,8%igen Agarosegel
aufgetrennt und das 2,1 kbp große gdhA-Fragment mit Hilfe
des "OIAquick Gel Extraction Kit" (QIAGEN, Hilden,
Deutschland) isoliert. Das Plasmid pMW218 (Nippon Gene,
Toyama, Japan) wird mit dem Enzym EcoRI gespalten und mit
dem gdhA-Fragment ligiert. Der E. coli Stamm DH5α wird mit
dem Ligationsansatz transformiert und pMW218 tragende
Zellen durch Ausplattieren auf LB Agar (Lennox, Virology
1955, 1: 190), der mit 20 µg/ml Kanamycin versetzt ist,
selektioniert.
Die erfolgreiche Klonierung des gdhA-Gens kann nach der
Plasmid DNA-Isolierung und Kontrollspaltung mit EcoRI und
EcoRV nachgewiesen werden. Das Plasmid wird als pMW218gdhA
(Fig. 2) bezeichnet.
Der in Beispiel 3 erhaltene Stamm MG442ΔpoxB und der Stamm
MG442 werden mit dem Plasmid pMW218gdhA transformiert und
Transformanten auf LB-Agar selektioniert, der mit 20 µg/ml
Kanamycin supplementiert ist. Auf diese Weise entstehen die
Stämme MG442ΔpoxB/pMW218gdhA und MG442/pMW218gdhA.
Die Herstellung von L-Threonin durch die Stämme
MG442ΔpoxB/pMW218gdhA und MG442/pMW218gdhA wird wie in
Beispiel 4 beschrieben geprüft. Das Minimalmedium und das
Vorkulturmedium werden bei diesen beiden Stämmen zusätzlich
mit 20 µg/ml Kanamycin supplementiert.
In Tabelle 2 ist das Ergebnis des Versuches
zusammengefasst.
Das rhtC-Gen aus Escherichia coli K12 wird unter Anwendung
der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) sowie synthetischen
Oligonukleotiden amplifiziert. Ausgehend von der
Nukleotidsequenz für das rhtC-Gen in E. coli K12 MG1655
(GenBank: Accession Nr. AE000458, Zakataeva et al. (FEBS
Letters 452, 228-232 (1999)) werden PCR-Primer
synthetisiert (MWG Biotech, Ebersberg, Deutschland):
Die für die PCR eingesetzte chromosomale E. coli K12 MG1655
DNA wird nach Herstellerangaben mit "QIAGEN Genomic-tips
100/G" (QIAGEN, Hilden, Deutschland) isoliert. Ein ca. 800 bp
großes DNA-Fragment kann mit den spezifischen Primern
unter Standard-PCR-Bedingungen (Innis et al.: PCR
protocols. A guide to methods and applications, 1990,
Academic Press) mit der Pfu-DNA Polymerase (Promega
Corporation, Madison, USA) amplifiziert werden.
Das Plasmid pMW219 (Nippon Gene, Toyama, Japan) wird mit
dem Enzym SmaI gespalten und mit dem rhtC-PCR-Fragment
ligiert. Der E. coli Stamm DH5α wird mit dem
Ligationsansatz transformiert und pMW219 tragende Zellen
auf LB Agar, der mit 20 µg/ml Kanamycin supplementiert ist,
selektioniert. Die erfolgreiche Klonierung kann nach der
Plasmid DNA-Isolierung und Kontrollspaltung mit KpnI,
HindIII und NcoI nachgewiesen werden. Das Plasmid
pMW219rhtC ist in Fig. 3 dargestellt.
Der in Beispiel 3 erhaltene Stamm MG442ΔpoxB und der Stamm
MG442 werden mit dem Plasmid pMW219rhtC transformiert und
Transformanten auf LB-Agar selektioniert, der mit 20 µg/ml
Kanamycin supplementiert ist. Auf diese Weise entstehen die
Stämme MG442ΔpoxB/pMW219rhtC und MG442/pMW219rhtC.
Die Herstellung von L-Threonin durch die Stämme
MG442ΔpoxB/pMW219rhtC und MG442/pMW219rhtC wird wie in
Beispiel 4 beschrieben geprüft. Das Minimalmedium und das
Vorkulturmedium werden bei diesen beiden Stämmen zusätzlich
mit 20 µg/ml Kanamycin supplementiert.
In Tabelle 3 ist das Ergebnis des Versuches
zusammengefasst.
Der L-Lysin produzierende E. coli Stamm pDA1/TOC21R ist in
der Patentanmeldung F-A-2511032 beschrieben und bei der
Collection Nationale de Culture de Microorganisme (CNCM,
Institut Pasteur, Paris, Frankreich) unter der Nummer I-167
hinterlegt. Der Stamm und der plasmidfreie Wirt sind
ebenfalls bei Dauce-Le Reverend et al. (European Journal of
Applied Microbiology and Biotechnology 15 : 227-231 (1982))
unter der Bezeichnung TOCR21/pDA1 beschrieben.
Von Stamm pDA1/TOC21R wird nach Kultur im Antibiotika
freien LB-Medium für ungefähr sechs Generationen ein
Derivat isoliert, das das Plasmid pDA1 nicht mehr enthält.
Der entstandene Stamm ist Tetracyclin-sensitiv und wird als
TOC21R bezeichnet.
Für den Austausch des chromosomalen poxB-Gens gegen das
Plasmid-kodierte Deletionskonstrukt wird TOC21R mit dem
Plasmid pMAK705ΔpoxB (Beispiel 2) transformiert. Der
Genaustausch erfolgt mit dem von Hamilton et al. (1989)
Journal of Bacteriology 174, 4617-4622) beschriebenen
Selektionsverfahren und wird durch Standard-PCR-Methoden
(Innis et al. (1990) PCR Protocols. A Guide to Methods and
Applications, Academic Press) mit folgenden Oligonukleotid
Primern verifiziert:
Der erhaltene Stamm wird als TOC21RΔpoxB bezeichnet.
Die Bildung von L-Lysin durch die Stämme TOC21RΔpoxB und
TOC21R wird in batch Kulturen von 10 ml, die in 100 ml
Erlenmeierkolben enthalten sind, überprüft. Dazu wird 10 ml
Vorkulturmedium der folgenden Zusammensetzung: 2 g/l
Hefeextrakt, 10 g/l (NH4)2SO4, 1 g/l KH2PO4, 0, 5 g/l
MgSO4.7H2O, 15 g/l CaCO3, 20 g/l Glucose beimpft und für 16
Stunden bei 37°C und 180 rpm auf einem ESR Inkubator der
Firma Kühner AG (Birsfelden, Schweiz) inkubiert. 250 µl
dieser Vorkultur werden in 10 ml Produktionsmedium (25 g/l
(NH4)2SO4, 2 g/l KH2PO4, 1 g/l MgSO4.7H2O, 0,03 g/l
FeSO4.7H2O, 0,018 g/l MnSO4.1H2O, 30 g/l CaCO3, 20 g/l
Glucose, 25 mg/l L-Isoleucin und 5 mg/l Thiamin) überimpft
und für 72 Stunden bei 37°C inkubiert. Nach der Inkubation
wird die optische Dichte (OD) der Kultursuspension mit
einem LP2W-Photometer der Firma Dr. Lange (Berlin,
Deutschland) bei einer Messwellenlänge von 660 nm bestimmt.
Anschließend wird die Konzentration an gebildetem L-Lysin
im steril filtrierten Kulturüberstand mit einem
Aminosäureanalysator der Firma Eppendorf-BioTronik
(Hamburg, Deutschland) durch Ionenaustauschchromatographie
und Nachsäulenreaktion mit Ninhydrindetektion bestimmt.
In Tabelle 4 ist das Ergebnis des Versuches dargestellt.
Der L-Valin produzierende E. coli Stamm AJ 11502 ist in der
Patentschrift US-A-4391907 beschrieben und bei dem National
Center for Agricultural Utilization Research (Peoria,
Illinois, USA) als NRRL B-12288 hinterlegt.
Von Stamm AJ 11502 wird nach Kultur im Antibiotika-freien
LB-Medium für ungefähr sechs Generationen ein plasmidfreies
Derivat isoliert. Der entstandene Stamm ist Ampicillin
sensitiv und wird als AJ11502kur bezeichnet.
Für den Austausch des chromosomalen poxB-Gens gegen das
Plasmid-kodierte Deletionskonstrukt wird AJ11502kur mit dem
Plasmid pMAK705ΔpoxB (Siehe Beispiel 2) transformiert. Der
Genaustausch erfolgt mit dem von Hamilton et al. (1989)
Journal of Bacteriology 174, 4617-4622) beschriebenen
Selektionsverfahren und wird durch Standard-PCR-Methoden
(Innis et al. (1990) PCR Protocols. A Guide to Methods and
Applications, Academic Press) mit folgenden Oligonukleotid
Primern verifiziert:
Der erhaltene Stamm wird als AJ11502kurΔpoxB bezeichnet.
Aus Stamm NRRL B-12288 wird das in der Patentschrift
US-A-4391907 beschriebene Plasmid isoliert, welches die
genetische Information bezüglich der Valin-Produktion
trägt. Der Stamm AJ11502kurΔpoxB wird mit diesem Plasmid
transformiert. Eine der erhaltenen Transformanten wird als
B-12288ΔpoxB bezeichnet.
Die Bildung von L-Valin durch die Stämme B-12288ΔpoxB und
NRRL B-12288 wird in batch Kulturen von 10 ml, die in
100 ml Erlenmeierkolben enthalten sind, überprüft. Dazu wird
10 ml Vorkulturmedium der folgenden Zusammensetzung: 2 g/l
Hefeextrakt, 10 g/l (NH4)2SO4, 1 g/l KH2PO4, 0,5 g/l
MgSO4.7H2O, 15 g/l CaCO3, 20 g/l Glucose und 50 mg/l
Ampicillin beimpft und für 16 Stunden bei 37°C und 180 rpm
auf einem ESR Inkubator der Firma Kühner AG (Birsfelden,
Schweiz) inkubiert. 250 µl dieser Vorkultur werden in 10 ml
Produktionsmedium (25 g/l (NH4)2SO4, 2 g/l KH2PO4, 1 g/l
MgSO4.7H2O, 0,03 g/l FeSO4.7H2O, 0,018 g/l MnSO4.1H2O, 30 g/l
CaCO3, 20 g/l Glucose, 5 mg/l Thiamin und 50 mg/l
Ampicillin) überimpft und für 72 Stunden bei 37°C
inkubiert. Nach der Inkubation wird die optische Dichte
(OD) der Kultursuspension mit einem LP2W-Photometer der
Firma Dr. Lange (Berlin, Deutschland) bei einer
Messwellenlänge von 660 nm bestimmt.
Anschließend wird die Konzentration an gebildetem L-Valin
im steril filtrierten Kulturüberstand mit einem
Aminosäureanalysator der Firma Eppendorf-BioTronik
(Hamburg, Deutschland) durch Ionenaustauschchromatographie
und Nachsäulenreaktion mit Ninhydrindetektion bestimmt.
In Tabelle 5 ist das Ergebnis des Versuches dargestellt.
Fig. 1 pMAK705ΔpoxB (= pMAK705deltapoxB)
Fig. 2 pMW218gdhA
Fig. 3 pMW219rhtC
Längenangaben sind als ca. -Angaben aufzufassen. Die
verwendeten Abkürzungen und Bezeichnungen haben folgende
Bedeutung:
cat: Chloramphenicolresistenzgen
rep-ts: temperatursensitive Replikationsregion des Plasmides pSC101
poxB1: Teil der 5'-Region des poxB-Gens
poxB2: Teil der 3'-Region des poxB-Gens
kan: Kanamycinresistenzgen
gdhA: Glutamat-Dehydrogenase-Gen
rhtC: Threoninresistenz vermittelndes Gen
cat: Chloramphenicolresistenzgen
rep-ts: temperatursensitive Replikationsregion des Plasmides pSC101
poxB1: Teil der 5'-Region des poxB-Gens
poxB2: Teil der 3'-Region des poxB-Gens
kan: Kanamycinresistenzgen
gdhA: Glutamat-Dehydrogenase-Gen
rhtC: Threoninresistenz vermittelndes Gen
Die Abkürzungen für die Restriktionsenzyme haben folgende
Bedeutung:
BamHI: Restriktionsendonuklease aus Bacillus amyloliquefaciens
BglII: Restriktionsendonuklease aus Bacillus globigii
ClaI: Restriktionsendonuklease aus Caryphanon latum
Ecl136II Restriktionsendonuklease aus Enterobacter cloacae RFL136 (= Ecl136)
EcoRI: Restriktionsendonuklease aus Escherichia coli
EcoRV: Restriktionsendonuklease aus Escherichia coli
HindIII: Restriktionsendonuklease aus Haemophilus influenzae
KpnI: Restriktionsendonuklease aus Klebsiella pneumoniae
PstI: Restriktionsendonuklease aus Providencia stuartii
PvuI: Restriktionsendonuklease aus Proteus vulgaris
SacI: Restriktionsendonuklease aus Streptomyces achromogenes
SalI: Restriktionsendonuklease aus Streptomyces albus
SmaI: Restriktionsendonuklease aus Serratia marcescens
XbaI: Restriktionsendonuklease aus Xanthomonas badrii
XhoI: Restriktionsendonuklease aus Xanthomonas holcicola
BamHI: Restriktionsendonuklease aus Bacillus amyloliquefaciens
BglII: Restriktionsendonuklease aus Bacillus globigii
ClaI: Restriktionsendonuklease aus Caryphanon latum
Ecl136II Restriktionsendonuklease aus Enterobacter cloacae RFL136 (= Ecl136)
EcoRI: Restriktionsendonuklease aus Escherichia coli
EcoRV: Restriktionsendonuklease aus Escherichia coli
HindIII: Restriktionsendonuklease aus Haemophilus influenzae
KpnI: Restriktionsendonuklease aus Klebsiella pneumoniae
PstI: Restriktionsendonuklease aus Providencia stuartii
PvuI: Restriktionsendonuklease aus Proteus vulgaris
SacI: Restriktionsendonuklease aus Streptomyces achromogenes
SalI: Restriktionsendonuklease aus Streptomyces albus
SmaI: Restriktionsendonuklease aus Serratia marcescens
XbaI: Restriktionsendonuklease aus Xanthomonas badrii
XhoI: Restriktionsendonuklease aus Xanthomonas holcicola
Claims (19)
1. Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-
Aminosäuren, dadurch
gekennzeichnet, daß man folgende Schritte
durchführt:
- a) Fermentation der die gewünschte L-Aminosäure produzierenden Mikroorganismen der Familie Enterobacteriaceae, in denen man zumindest das poxB-Gen oder dafür kodierende Nukleotidsequenzen abschwächt, insbesondere ausschaltet,
- b) Anreicherung der L-Aminosäure im Medium oder in den Zellen der Bakterien, und
- c) Isolieren der L-Aminosäure.
2. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß L-Threonin, L-Valin
oder L-Lysin hergestellt wird.
3. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man Mikroorganismen
einsetzt, in denen man zusätzlich weitere Gene des
Biosyntheseweges der gewünschten L-Aminosäure
verstärkt.
4. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man Mikroorganismen
einsetzt, in denen die Stoffwechselwege zumindest
teilweise ausgeschaltet sind, die die Bildung der
gewünschten L-Aminosäure verringern.
5. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man die Expression des
(der) Polynukleotides (e), das (die) für das poxB-Gen
kodiert (kodieren) abschwächt, insbesondere
ausschaltet.
6. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man die
regulatorischen und/oder katalytischen Eigenschaften
des Polypeptids (Enzymprotein) verringert, für das das
Polynukleotid poxB kodiert.
7. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man zur Herstellung
von L-Aminosäuren Mikroorganismen der Familie
Enterobactericeae fermentiert, in denen man
gleichzeitig eines oder mehrere der Gene, ausgewählt
aus der Gruppe:
- 1. 7.1 das für die Aspartatkinase, die Homoserin- Dehydrogenase, die Homoserinkinase und die Threoninsynthase kodierende thrABC-Operon,
- 2. 7.2 das für die Pyruvat-Carboxylase kodierende pyc- Gen,
- 3. 7.3 das für die Phosphoenolpyruvat-Synthase kodierende pps-Gen,
- 4. 7.4 das für die Phosphoenolpyruvat-Carboxylase kodierende ppc-Gen,
- 5. 7.5 die für die Transhydrogenase kodierende Gene pntA und pntB,
- 6. 7.6 das Homoserinresistenz vermittelnde Gen rhtB,
- 7. 7.7 das für die Malat : Chinon Oxidoreduktase kodierende mqo-Gen,
- 8. 7.8 das Threoninresistenz vermittelnde Gen rhtC,
- 9. 7.9 das für den Threoninexport kodierende thrE-Gen, und
- 10. 7.10 das für die Glutamat-Dehydrogenase kodierende gdhA-Gen
8. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch
gekennzeichnet, daß man zur Herstellung
von L-Aminosäuren Mikroorganismen der Familie
Enterobacteriaceae fermentiert, in denen man
gleichzeitig eines oder mehrere der Gene, ausgewählt
aus der Gruppe:
- 1. 8.1 das für die Threonin-Dehydrogenase kodierende tdh- Gen,
- 2. 8.2 das für die Malat-Dehydrogenase kodierende mdh- Gen,
- 3. 8.3 das Genprodukt des offenen Leserahmens (orf) yjfA,
- 4. 8.4 das Genprodukt des offenen Leserahmens (orf) ytfP, und
- 5. 8.5 das für das Enzym Phosphoenolpyruvat-Carboxykinase kodierende pckA-Gen,
9. Verfahren gemäß Anspruch 1 oder 2, dadurch
gekennzeichnet, daß man zur Herstellung
von L-Threonin den Stamm MG442ΔpoxB transformiert mit
dem Plasmid pMW218gdhA, dargestellt in Fig. 2,
einsetzt.
10. Verfahren gemäß Anspruch 1 oder 2, dadurch
gekennzeichnet, daß man zur Herstellung
von L-Threonin den Stamm MG442ΔpoxB transformiert mit
dem Plasmid pMW219rhtC, dargestellt in Fig. 3,
einsetzt.
11. Verfahren gemäß Anspruch 1 oder 2, dadurch
gekennzeichnet, daß man zur Herstellung
von L-Lysin den Stamm TOC21RΔpoxB einsetzt.
12. Verfahren gemäß Anspruch 1 oder 2, dadurch
gekennzeichnet, daß man zur Herstellung
von L-Valin den Stamm B-12288ΔpoxB einsetzt.
13. L-Aminosäuren produzierende Mikroorganismen der Familie
Enterobacteriaceae, in denen das poxB-Gen oder dafür
kodierende Nukleotidsequenzen abgeschwächt,
insbesondere ausgeschaltet sind, die eine Resistenz
gegen α-Amino-β-Hydroxyvaleriansäure und gegebenenfalls
eine kompensierbare partielle Bedürftigkeit für L-
Isoleucin aufweisen.
14. Escherichia coli K-12 Stamm MG442ΔpoxB hinterlegt bei
der Deutschen Sammlung für Mikroorganismen und
Zellkulturen (DSMZ, Braunschweig, Deutschland) unter
der Nr. DSM 13762.
15. Plasmid pMAK705ΔpoxB, das Teile der 5'- und der 3'-Region
des poxB-Gens, entsprechend SEQ ID No. 3, enthält,
dargestellt in Fig. 1.
16. Plasmid pMW218gdhA dargestellt in Fig. 2.
17. Plasmid pMW219rhtC dargestellt in Fig. 3.
18. Isoliertes Polynukleotid aus Mikroorganismen der
Familie Enterobactericeae, enthaltend eine für die 5'-
und 3'-Region des poxB-Gens kodierende
Polynukleotidsequenz dargestellt in SEQ ID No. 4
insbesondere geeignet als Bestandteil von Plasmiden für
die ortsspezifische Mutagenese des poxB-Gens.
19. L-Threonin produzierende Stämme der Familie
Enterobacteriaceae, enthaltend eine Mutation im poxB-
Gen entsprechend SEQ ID No. 4.
Priority Applications (9)
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| ES01992788T ES2344681T3 (es) | 2000-11-04 | 2001-09-28 | Proceso para la preparacion por fermentacion de l-aminoacidos utilizando cepas de la familia enterobacteriaceas. |
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Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE10054748 | 2000-11-04 | ||
| DE10112107A DE10112107A1 (de) | 2000-11-04 | 2001-03-14 | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| DE10112107A1 true DE10112107A1 (de) | 2002-05-08 |
Family
ID=7662166
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| DE10112107A Withdrawn DE10112107A1 (de) | 2000-11-04 | 2001-03-14 | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| DE (1) | DE10112107A1 (de) |
| ES (1) | ES2344681T3 (de) |
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| CN116103215A (zh) * | 2023-03-07 | 2023-05-12 | 浙江工业大学 | 一种高产l-2-氨基丁酸的无质粒基因工程菌及其应用 |
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2001
- 2001-03-14 DE DE10112107A patent/DE10112107A1/de not_active Withdrawn
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