DE10033583A1 - Superparamagnetische Perlpolymerisate - Google Patents
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Abstract
Die Erfindung betrifft vernetzte Perlpolymerisate dotiert mit superparamagnetischen Eisenoxid, ein Verfahren zur Herstellung der Perlpolymerisate, sowie deren Verwendung in der Nucleinsäure Diagnostik.
Description
Die Erfindung betrifft vernetzte Perlpolymerisate dotiert mit superparamagnetischen
Eisenoxid, ein Verfahren zur Herstellung der Perlpolymerisate, sowie deren Verwen
dung in der Nucleinsäuren Diagnostik.
In jüngster Zeit gewinnt die sogenannte Gen-Diagnostik zunehmend an Bedeutung.
Die Gen-Diagnostik hat Eingang gefunden in die Diagnostik humaner Erkrankungen
(u. a. Nachweis von Infektionserregern, Nachweis von Mutationen des Genoms,
Entdeckung von zirkulierenden Tumorzellen und Identifizierung von Risikofaktoren
für die Prädisposition einer Erkrankung). Aber auch in der Veterinärmedizin, der
Umweltanalytik und Nahrungsmitteltestung findet die Gen-Diagnostik mittlerweile
ihre Anwendung. Ein weiteres Anwendungsgebiet stellen Untersuchungen an patho
logischen-/zytologischen Instituten oder im Rahmen forensischer Fragestellungen
dar. Aber auch im Rahmen der Qualitätskontrolle (z. B. Untersuchungen von
Blutproben auf Infektionserreger-Freiheit) wird die Gen-Diagnostik mittlerweile
eingesetzt und der Gesetzgeber plant, solche Tests per Gesetz in Zukunft
anzuordnen. Methoden, die auch bei der Gen-Diagnostik zum Einsatz kommen (wie
z. B. Hybridisierungs- oder Amplifikationstechniken wie die PCR, bDNA oder
NASBA Technologie) gehören auch bei wissenschaftlichen Grundlagenarbeiten zu
den Routineverfahren.
Bei der Gen-Diagnostik ist die Gewinnung von Gen-Proben aus biologischem
Material, wie Zellen, Blut, Serum oder Urin ein wichtiger Teilschritt.
In der EP 0 707 077 wird eine Methode zur Isolierung von Nucleinsäuren aus
biologischem Material unter Verwendung von löslichem, schwach basischem Poly
mer beschrieben. Bei dieser Methode wird in einem sauren pH-Bereich einen
Fällungsprodukt aus dem löslichen, schwach basischen Polymer und der Nuclein
säure erzeugt, das Fällungsprodukt von den nicht gefällten Bestandteilen des
biologischen Materials abgetrennt und gewaschen und die Nucleinsäure aus dem
Fällungsprodukt durch Einstellung eines basischen pH-Wertes wieder freigesetzt.
Ein Nachteil der Methode nach EP 0707 077 besteht darin, dass die Handhabung,
insbesondere die Abtrennung und Reinigung des Fällungsproduktes schwierig und
sehr zeitaufwendig ist. Diese Methode lässt sich auch nicht bzw. nur unter er
schwerten Bedingungen mit Hilfe automatisierter Analysegeräte ausführen.
Die US 4339337 und US 5356713 beschreiben Methoden zur Herstellung von
magnetischen Beads aus vinylaromatischen Polymer unter Verwendung von magne
tischen Partikeln. Diese Perlpolymerisate enthalten allerdings keine funktionellen
Gruppen zur Anbindung von Nucleinsäuren. Außerdem zeigen die Beads einen deut
lichen Restmagnetismus (Remanenz), wodurch ihre Dispergierbarkeit erschwert
wird.
In der WO 8303920 wird eine Methode zur Herstellung von magnetischen Polymer
partikeln beschrieben, bei der Polymerpartikel mit Lösungen aus beispielsweise
Eisensalz behandelt werden, wobei das Eisen in Form von Eisenhydroxid ausgefällt
wird. Bei dieser Methode befindet sich die ausgefällte Eisenverbindung sowohl in
den Polymerpartikeln als auch an der Oberfläche der Polymerpartikel. Für einige
Anwendungen, beispielsweise für die Amplifikation von Nucleinsäuren durch
Taqman-PCR kann die Eisenverbindung an der Oberfläche stören.
Die US 5206159 offenbart ein Verfahren zur Herstellung von superparamagnetischen
Polyacrylamid-Trägern. Allerdings sind diese Träger zur Abtrennung von Nuclein
säuren ungeeignet.
Aus der US 5705628 ist eine Methode zur Bindung von DNA an magnetische Micro
partikel bekannt. Die magnetischen Mikropartikel haben vorzugsweise eine Teilchen
größe von 1 µm und besitzen eine mit Carboxylgruppen beschichtete Oberfläche. Um
eine Anbindung der DNA an die Partikel zu erreichen müssen spezielle Salzkon
zentration angewendet werden und Polyethylenglycol in definierter Konzentration
und mit speziellem Molekulargewicht zugesetzt werden.
Es wurde nun gefunden, dass bestimmte vernetzte Perlpolymerisate, die mit super
paramagnetischen Eisenoxid dotiert sind und basische Aminogruppen enthalten, in
hervorragender Weise zur direkten und automatisierten Isolierung von Nucleinsäuren
geeignet sind.
Gegenstand der Erfindung sind vernetzte Perlpolymerisate dotiert mit superpara
magnetischen Eisenoxid und enthaltend basische Aminogruppen, die dadurch
gekennzeichnet sind, dass die Perlpolymerisate einpolymerisierte Einheiten aus
hydrophilem (Meth)acrylat und Amino(meth)acrylate erhalten.
Unter der Bezeichnung (Meth)acrylat werden die Derivate der Acrylsäure und Meth
acrylsäure verstanden.
Hydropile (Meth)acrylate sind solche, deren Homopolymerisate in Wasser bei 25°C
zu mehr als 2,5% löslich sind. Beispielhaft seien genannt. 2-Hydroxyethylmeth
acrylat, 2-Hydroxypropylmethacrylat, 2-Hydroxyethylacrylat, 2-Hydroxypropyl
acrylat, Triethylenglycolmonomethacrylat, Tetraethylenglycolmonomethacrylat,
Glycerinmonomethacrylat, Acrylamid, Methacrylamid und N,N-Dimethylacrylamid.
Acrylamid ist bevorzugt.
Amino(meth)acrylate im Sinne der vorliegenden Erfindung sind Derivate der
Acrylsäure und Methacrylsäure mit vorzugsweise sekundären und tertiären Amino
gruppen. Die Aminogruppen können auch Teil eines cycloaliphatischen oder aroma
tischen Rings sein. Geeignete Amino(meth)acrylate sind z. B. N-(3-Amino
propyl)methacrylamid, N-(3-Imidazoylpropyl)methacrylamid, N-(2-Imidazoyl
ethyl)methacrylamid, N-(3-Aminopropyl)acrylamid, N-(3-Imidazoylpropyl)-
acrylamid, N-(2-Imidazoylethyl)acrylamid, N-(1,1-Dimethyl-3-Imidazoylpropyl)-
methacrylamid, N-(1,1-Dimethyl-3-Imidazoylpropyl)acrylamid, N-(3-Benzimida
zoylpropyl)-methacrylamid und (3-Benzimidazoylpropyl)acrylamid. Bevorzugte
Amino(meth)acrylate sind Aminoalkyl(meth)acrylate, wie z. B. N,N-Dimethyl
aminoethylmethacrylat, N,N-Dimethylaminopropylmethacrylat, N,N-Dimethyl
aminoethylacrylat, und N-tert.-Butylaminopropylmethacrylat. N,N-Dimethylamino
ethylmethacrylat und N,N-Dimethylaminopropylmethacrylat sind besonders bevor
zugt. Die Aminogruppen können in den erfindungsgemäßen Perlpolymerisaten ganz
oder teilweise in protonierter Form, z. B. als Hydrochloride vorliegen.
Als Vernetzer kommen in Frage: Ethylenglycoldimethacrylat, Butandiol
dimethacrylat, Hexandioldimethacrylat, Pentaerytritoldimethacrylat, 1,2-Glycerin
dimethacrylat, 1,3-Glycerindimethacrylat, Triethylenglycoldimethacrylat, Tetra
etylenglycoldimethacrylat, Trimethylolpropantrimethacrylat, Pentaerytritoltrimeth
acrylat, Pentaerytritoltetramethacrylat, Ethylenglycoldiacrylat, Butandioldiacrylat,
Pentaerytritoldiacrylat, 1,3-Glycerindiacrylat, Triethylenglycoldiacrylat, Trimethylol
propantriacrylat, Pentaerytritaltriacrylat, Pentaerytritoltetraacrylat, Allylmethacrylat,
Allylacrylat, Diethylenglycoldivinylether und Methylen-N,N'-bisacrylamid.
Methylen-N,N'-bisacrylamid ist bevorzugt.
Die Menge an hydrophilem (Meth)acrylat beträgt 30 bis 89 Gew.-%, vorzugsweise
40 bis 75 Gew.-%, die Menge und Amino(meth)acrylate 10 bis 69 Gew.-%, vorzugs
weise 20 bis 50 Gew.-% und die Menge an Vernetzer 1 bis 25 Gew.-%, jeweils
bezogen auf die Summe aus hydrophilem (Meth)acrylat, Amino(meth)acrylate und
Vernetzer.
Der Gehalt an Eisenoxid in den erfindungsgemäßen superparamagnetischen Perl
polymerisaten beträgt 2 bis 80 Gew.-%, vorzugsweise 4 bis 50 Gew.-%, besonders
bevorzugt 5 bis 35 Gew.-%, bezogen auf das Gewicht der ungequollenen Perlpoly
merisate.
Die erfindungsgemäßen Peripolymerisate sind superparamagnetisch, das heißt sie
besitzen eine niedrige Restmagnetisierung (Remanenz) und eine kleine Koerzitiv
kraft. Ihre magnetische Sättigung ist hoch, sie werden von einem inhomogenen
Magnetfeld stark angezogen. Nach Ausschalten des Magnetfeldes lassen sie sich
leicht und vollständig in Wasser oder wässrigen Pufferlösungen dispergieren.
Die Teilchengröße der erfindungsgemäßen superparamagnetischen Perlpolymerisate
beträgt 1 bis 200 µm, vorzugsweise 5 bis 100, besonders bevorzugt 10 bis 50 µm.
Zur Bestimmung der mittleren Teilchengröße (∅) und der Teilchengrößenverteilung
ist die mikroskopische Bildanalyse gut geeignet.
Als Maß für die Breite der Teilchengrößenverteilung der Perlpolymerisate wird das
Verhältnis aus dem Mittelwert der Volumenverteilung (DV) und dem Mittelwert der
Anzahlverteilung (DZ) gebildet. Enge Teilchengrößenverteilungen im Sinne der
Erfindung bedeuten DV/DZ ≦ 2,5, bevorzugt DV/DZ
≦ 2, besonders bevorzugt DV/DZ ≦ 1,5. Es wurde gefunden, dass erfindungsgemäße Perlpolymerisate mit enger
Teilchengrößenverteilung besonders gut zur Isolierung von Nucleinsäuren geeignet
sind und bei Amplifikationsverfahren an der Oberfläche der Perlpolymerisate
besonders gut reproduzierbare Ergebnisse liefern.
Die erfindungsgemäßen Peripolymerisate besitzen eine Quellbarkeit in Wasser. Sie
besitzen einen Quellungsindex von 1,25 bis 8, vorzugsweise 2 bis 6 (gemessen bei
25°C). Als Quellungsindex ist der Quotient aus dem Volumen des gequollenen
Perlpolymerisates und dem Volumen des nicht gequollenen Perlpolymerisates
definiert.
Zur experimentellen Bestimmung des Quellungsindex werden 10 ml getrocknetes,
gesiebtes Perlpolymerisat in einem 100 ml-Standzylinder eingewogen. Der Quotient
aus dem Volumen der Schüttung (V0) und der eingewogener Menge (m) ergibt das
Schüttvolumen (Vsch). Der Standzylinder wird mit Wasser auf 100 ml aufgefüllt und
10 bis 20 h bei 25° stehen gelassen. Dabei wurde öfter geschüttelt und darauf
geachtet, dass eventuell auftretende Luftblasen entweichen können. Das Volumen der
gequollenen Schüttung wird abgelesen und ergibt V1. Der Quotient aus V1 und V0 ist
der Quellungsindex.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein Verfahren zur Her
stellung vernetzter Perlpolymerisate, welches dadurch gekennzeichnet ist, dass man
ein Monomergemisch aus hydrophilem (Meth)acrylat, Amino(meth)acrylat, Ver
netzer und gegebenfalls weiterem Monomer zu Perlen durch umgekehrte Sus
pensionspolymerisation polymerisiert und diese anschließend durch eine Nachbe
handlung mit Eisensalz-Lösung mit superparamagnetischen Eisenoxid dotiert.
Unter umgekehrter Suspensionspolymerisation im Sinne der Erfindung wird ein
Verfahren verstanden, bei dem das Monomergemisch aus hydrophilem (Meth)-
acrylat, Amino(meth)acrylat, Vernetzer und gegebenfalls weiterem Monomer mit
einem im Monomergemisch löslichen Radikalbildner aktiviert wird und das akti
vierte Monomergemisch unter Zusatz eines Dispergierhilfsmittels in einem nicht
wässerigem Lösungsmittel zu Tröpfchen emulgiert wird und dann die gebildeten
Tröpfchen durch Temperaturerhöhung ausgehärtet werden.
Das hydrophile (Meth)acrylat, das Amino(meth)acrylat und der Vernetzer ent
sprechen den oben genannten Verbindungen. Das Amino(meth)acrylat kann dabei in
vorteilhafter Weise zumindest teilweise in der Ammoniumform, beispielsweise als
Hydrochlorid eingesetzt werden. Als weiteres Monomer kommen in Mengen von bis
zu ca. 25 Gew.-% bezogen auf das Gesamtmonomergemisch beispielsweise N-
Vinylpyrrolidon, Vinylimidazol, Styrol, alfa-Methylstyrol, Chlormethylstyrol, Acryl
nitril, Vinylacetat und Maleinsäureanhydrid in Frage. Es ist günstig, das Monomer
gemisch mit Wasser oder Wasser-Alkoholgemischen zu verdünnen. Geeignete
Mengen an Verdünnungsmittel sind beispielsweise 10 bis 200 Gew.-%, vorzugsweise
50 bis 150 Gew.-% bezogen auf das Monomergemisch.
Als Radikalbildner sind Azoverbindungen und Peroxiverbindungen geeignet. Bei
Verwendung von Wasser als Verdünnungsmittel ist Kaliumperoxodisulfat und
Natriumperoxodisulfat, auch in Kombination mit Bisulfit oder Hydrogensulfit, gut
geeignet. Weitere bevorzugte Radikalbildner sind die Azoverbindungen, wie 2,2'-
Azobis[2-(2-imidazolin-2-yl)propane]dihydrochlorid und 2,2'-Azobis(2-amidino
propan)dihydrochlorid. Der Radikalbildner wird in Mengen von 0,02 bis 2,5 Gew.-%,
vorzugsweise von 0,1 bis 1 Gew.-% bezogen auf Gesamtmonomergemisch ver
wendet.
Als nicht wässriges Lösungsmittel im Sinne der vorliegenden Erfindung sind in
erster Linie Kohlenwasserstoffe und Halogenkohlenwasserstoffe, sowie niedrig vis
kose Siliconöle geeignet. Bevorzugt sind lineare, verzweigte und cyclische alipha
tische Kohlenwasserstoffe. Beispielhaft sei erwähnt Hexan, Heptan, n-Octan, iso-
Octan, iso-Dodecan und Cyclohexan. Natürlich können auch Mischungen aus unter
schiedlichen Kohlenwasserstoffe verwendet werden.
Als Dispergierhilfsmittel sind öllösliche Polymerisate mit einem Molekulargewicht
von 2000 bis 1 000 000 geeignet. Bevorzugt sind Polymerisate mit einem Anteil von
einpolymerisierten Einheiten von C6- bis C22-Alkyl(meth)acrylaten und/oder Vinyl
ester von C6- bis C22-Carbonsäuren. Beispielhaft seien Polymerisate mit einpoly
merisierten Einheiten von Stearylmethacrylat, Laurylmethacrylat und Vinylstearat
genannt. Besonders gut geeignet sind Copolymerisate aus C6- bis C22-Alkyl-
(meth)acrylaten bzw. Vinylester von C6- bis C22-Carbonsäuren und hydrophilen
Monomeren. Unter hydrophilen Monomeren werden in diesem Zusammenhang poly
merisierbare olefinisch ungesättigte Verbindungen, die ganz oder teilweise (zu mehr
als 2,5 Gew.-% bei 20°C) in Wasser löslich sind, verstanden. Als Beispiele seien
genannt: Acrylsäure und ihre Alkali- und Ammoniumsalze, Methacrylsäure und ihre
Alkali- und Ammoniumsalze, Hydroxyethylmethacrylat, Hydroxyethylacrylat,
Diethylenglykolmonoacrylat, Diethylenglykolmonomethacrylat, Triethylenglykol
monoacrylat, Triethylenglykolmonomethacrylat, Tetraethylenglykolmonoacrylat,
Tetraethylenglykolmonomethacrylat, Glycerinmonoacrylat, Aminoethylmethacrylat,
N,N-Dimethylaminoethylmethacrylat, Acrylamid, Methacrylamid, Vinylpyrolidon
und Vinylimidazol. Bevorzugt werden Hydroxyethylmethacrylat, Aminoethyl
methacrylat, N,N-Dimethylaminoethylmethacrylat, Acrylamid, Methacrylamid,
Vinylpyrolidon und Vinylimidazol.
Besonders bevorzugte Dispergierhilfsmittel sind Copolymerisate aus
- - 75 bis 99 Gew.-% C6- bis C22-Alkyl(meth)acrylat und/oder Vinylester von C6- bis C22-Carbonsäuren und
- - 1 bis 25 Gew.-% hydrophiles Monomer aus der Gruppe Hydroxyethylmeth acrylat, Aminoethylmethacrylat, N,N-Dimethylaminoethylmethacrylat, Acryl amid, Methacrylamid, Vinylpyrolidon und Vinylimidazol.
Die Einsatzmenge des Dispergierhilfsmittels beträgt im allgemeinen 0,1 bis 8, vor
zugsweise 0,5 bis 5 Gew.-%, bezogen auf das nicht wässrige Lösungsmittel.
Die Rührgeschwindigkeit bei der Polymerisation ist wichtig für die Einstellung der
Teilchengröße. Beim erfindungsgemäßen Verfahren nimmt die Größe der erhaltenen
Perlpolymerisate mit zunehmender Rührerdrehzahl ab. Die exakte Rührdrehzahl zur
Einstellung einer bestimmten vorgegebenen Perlgröße hängt im Einzelfall stark von
der Reaktorgröße, der Reaktorgeometrie und der Rührergeometrie ab. Es hat sich als
zweckmäßig erwiesen, die notwendige Rührdrehzahl experimentell zu ermitteln. Für
Laborreaktoren mit 0,5 l-Reaktionsvolumen, die mit Gitterrühr ausgestattet sind,
werden bei Verwendung von Copolymerisaten aus Methacrylsäure-C13-Ester und
Hydroxyethylmethacryl als Dispergierhilfsmittel im allgemeinen Perldurchmesser
von 10 bis 25 µm bei Drehzahlen von 800 bis 1000 Upm erreicht.
Die Polymerisationstemperatur richtet sich nach der Zerfallstemperatur des ein
gesetzten Initiators und der Siedetemperatur des nicht wässrigen Lösungsmittels. Sie
liegt im allgemeinen zwischen 50 bis 150°C, vorzugsweise zwischen 55 und 100°C.
Die Polymerisation dauert 0.5 bis einige Stunden (beispielsweise 10 Stunden).
Nach der Polymerisation kann das Polymerisat mit üblichen Methoden, z. B. durch
Filtrieren oder Dekantieren, isoliert und gegebenenfalls nach ein oder mehreren
Waschvorgängen getrocknet werden. Es ist möglich, das erhaltene Perpolymerisat
durch physikalischen Methoden zu fraktionieren, um eine engere Teilchen
größenverteilung einzustellen. Geeignete Fraktionierungsmethoden sind beispiels
weise Sieben, Sedimentieren und Windsichten.
Die Nachbehandlung zur Dotierung mit superparamagnetischen Eisenoxid erfolgt mit
Mischungen aus wässrigen Fe2+- und Fe3+-salz-Lösungen. Gut geeignet sind die ent
sprechende Chloride. Das molare Verhältnis von Fe2+ : Fe3+ soll dabei 2 : 1 bis 1 : 2
betragen. Dabei ist es möglich von Eisensalzlösungen mit einem anderen
Fe2+ : Fe3+-Verhältnis auszugehen und das optimale Verhältnis von Fe2+ : Fe3+ durch Verwen
dung von Oxidations- bzw. Reduktionsmitteln einzustellen. Beispiele für Oxidations
mittel sind Peroxo- und Nitroverbindungen, als Reduktionsmittel ist z. B. Natrium
bisulfit geeignet. Die Konzentration der Eisensalzlösungen beträgt im allgemeinen
10 bis 50 Gew.-%, vorzugsweise 20 bis 40 Gew.-%.
Die Eisensalzlösung wird vorzugsweise mit getrocknetem, wasserfreien Perlpoly
merisat in Kontakt gebracht. Dabei ist es besonders vorteilhaft, wenn die gesamte
Eisensalzlösung in das Perlpolymerisat einquillt und keine überschüssige Eisen
salzlösung in den Zwischenräumen der Perlen oder an der Oberfläche der Perlen
verbleibt.
Die in das Perlpolymerisat eingequollenen Eisensalze werden durch Zusatz von
Basen in die entsprechende Eisenhydroxide überführt. Gut geeignet sind alkalische
Lösungen aus Natriumhydroxid, Natriumcarbonat oder Ammoniak. Ammoniak ist
bevorzugt, da ein Überschuss leicht durch Abdampfen entfernt werden kann.
Gebildete Ammoniumsalze werden durch gründliches Waschen mit Wasser entfernt.
Zur Überführung des Eisenhydroxids in Eisenoxid (Dehydratisierung) wird das Perl
polymerisat erhitzt. Die Wärmebehandlung kann dabei in einfacher Weise in
wässriger Suspension bei 65 bis 100°C erfolgen. Geeignete Zeiten für die Erhitzung
sind 0,5 bis 5 Stunden. Die Umwandlung des Eisenhydroxids in Eisenoxid ist an
einen Wechsel der Farbe von hell braun nach dunkelbraun bis schwarz erkennbar.
Danach wird das Perlpolymerisat abgetrennt und getrocknet.
Falls gewünscht können die so erhaltenen getrockneten mit superparamagnetischen
Eisenoxid dotierten Perlpolymerisate ein weiteres Mal in der oben beschriebenen
Weise behandelt werden, wobei der Gehalt an superparamagnetischen Eisenoxid
gesteigert wird. Auf diese Weise gelingt es Eisenoxidgehalte von mehr als 50 Gew.-%
einzustellen.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein Verfahren zur Isolierung
von Nucleinsäuren aus einer Probe, umfassend die nachfolgenden Schritte
- A) Vermischen der Probe mit einem Perlpolymerisat bei einem pH-Wert von 7 oder weniger, wobei die Nucleinsäuren adsorbiert werden,
- B) Abtrennen des Perlpolymerisates einschließlich der adsorbierten Nuklein säuren unter Anwendung eines Magnetfeldes und
- C) Vermischen des Perlpolymerisates mit einer wässrigen Phase mit einem pH-Wert von größer 7, wobei die adsorbierten Nucleinsäuren freigesetzt werden,
welches dadurch gekennzeichnet ist, dass das Perlpolymerisat mit superparamagne
tischen Eisenoxid dotiert ist und einpolymerisierte Einheiten aus hydrophilem
(Meth)acrylat und Amino(meth)acrylate enthält.
Das erfindungsgemäße Verfahren ist zur Isolierung und/oder Reinigung von Nuclein
säuren unterschiedlicher Herkunft, beispielsweise aus Zellen, Gewebematerialien,
Blut oder Infektionserregern geeignet. Vor der Isolierung der Nucleinsäuren wird das
zu untersuchende Material durch an sich bekannte Techniken, wie z. B. Aufschluss
durch Proteaseverdau aufgeschlossen, wobei eine für die weiteren Schritte A bis C
geeignete Probe, ein Lysat, erhalten wird. Gegebenenfalls erfolgt in einem Zwischen
schritt nach Verfahrensschritt A) die Lyse des biologischen Materials. Weitere
geeignete Aufschlussverfahren sind in DE-A-43 33 805 beschrieben worden.
Es erfolgt das Vermischen der Probe mit dem erfindungsgemäßen Perlpolymerisat
bei einem pH-Wert von 7 oder weniger, vorzugsweise im Bereich von 2 bis 6,
besonders bevorzugt im Bereich von 2 bis 3 bei Raumtemperatur. Das Abtrennen des
Perlpolymerisates erfolgt mit Hilfe eines Magnetfeldes. Der so gewonnene Komplex
aus Nucleinsäure und Perlpolymerisat kann nun durch Waschen mit geeigneten
Puffern gereinigt werden.
Zur Freisetzung der gebundenen Nucleinsäuren aus dem Komplex erfolgt nun die
pH-Einstellung des Komplexes auf pH-Werte oberhalb von 7, vorzugsweise von 8
bis 14, besonders bevorzugt im Bereich 12 bis 14.
Die erfindungsgemäßen Perlpolymerisate liefern höhere Adsorption- und Wiederfrei
setzungsraten als die löslichen Polymerisate gemäß EP-A-0 707 077. Die Isolierung
lässt sich leichter, d. h. mit weniger Arbeitsschritten und in kürzeren Zeiten durch
führen. Die Reinheit der isolierten Nucleinsäuren ist höher, insbesondere enthalten
sie weniger inhibierende Nebenprodukte, so dass eine Verstärkung der Nuclein
säuren, beispielsweise durch die sogenannte "PCR-Reaktion" und die "RT-PCR"
besonders gut gelingt. Auch in Bezug auf Verdau der gewonnenen Nucleinsäuren
mittels Restriktionsenzymen ist das erfindungsgemäße Verfahren der in der
EP-A-0 707 077 beschriebenen Methode überlegen.
Die erfindungsgemäßen Perlpolymerisate sind auch gut geeignet, um eine Ver
stärkung der adsorbierten Nukleinsäuren beispielsweise durch die sogenannte
"Taqman-PCR-Reaktion" direkt auf den Perlpolymerisaten (d. h. ohne Teilschritt C)
durch zuführen.
In einem 4 l-Reaktionsgefäß mit Gitterrührer, Gaseinlass- und Gasauslassrohr wurde
unter Stickstoffbegasung eine. Lösung aus 1324 g Cyclohexan, 511 g Methacrylsäure-
C13-Ester, 57 g Hydroxyethylmethacrylat und 3,8 g Dibenzoylperoxyd innerhalb von
2 h bei 300 Upm auf 78°C erhitzt, 10 h bei dieser Temperatur belassen, anschließend
auf 90°C erhitzt und weitere 1,5 h bei dieser Temperatur belassen. Danach wurde auf
25°C abgekühlt. Man erhielt 1835 g einer 30,5 gew.-%igen Lösung eines Disper
giermittels. Der Staudinger-Index, gemessen mit Ubbelohde-Viskosimeter bei 25°C,
betrug 72,6 ml/g.
In einem 0,5 Liter-Reaktionsgefäß mit Gitterrührer, Rückflusskühler und Thermo
fühler wurden 41,25 g Dispergiermittel-Lösung aus 1a) und 240 g Cyclohexan
vorgelegt und gerührt. 9,38 g N,N-Dimethylaminoethylmethacrylat wurde mit 13,3 g
Wasser und 5,89 g 37%iger Salzsäure 5 Minuten gerührt und mit 0,6 g 1n NaOH
neutralisiert. Anschließend wurde diese Lösung in das Reaktionsgefäß gegeben. Zu
dieser Mischung wurden 20,31 g Acrylamid und 1,56 g Methylen-N,N'-bisacryl
amid, gelöst in 8 g Methanol, zugegeben. Diese Reaktionsmischung wurde mit
0,063 g Kaliumperoxidisulfat, gelöst in einer Mischung aus 4,25 g Wasser und 2 g
Methanol, versetzt und bei 450 Upm 10 Minuten mit Stickstoffgas gespült.
Anschließend wurde die Rührgeschwindigkeit auf 1000 Upm gesteigert und die
Temperatur innerhalb von 1 Stunde auf 60°C erhöht und 10 Stunden bei dieser
Temperatur belassen. Nach dem Abkühlen wurde das entstandene Polymerisat durch
Dekantieren von der Reaktionslösung abgetrennt und je dreimal mit Cyclohexan,
Wasser und Methanol gereinigt und bei 40°C im Vakuumtrockenschrank getrocknet.
Man erhielt 14,7 g getrocknetes Perlpolymerisat mit einer mittleren Teilchengröße
von 12 µm und einem Quelllungsindex von 6 bei 25°C in Wasser.
In einem Rührgefäß mit einem Magnetrührer und Thermometer wurden 3,625 g
Eisen(II)chlorid-Tetrahydrat, 1,5 g Eisen (III)Chlorid (wasserfrei) und 0,3 g
Natriumbisulfit in 5,75 ml Wasser gelöst.
In einem 100 ml Dreihalskolben wurden 5 g getrocknetes Perlpolymerisat (1b)
vorgelegt und extern mit Eis gekühlt und anschließend mit der oben beschriebenen
Eisensalzlösung versetzt. Die entstehende Suspension wurde 35 Minuten gerührt und
anschließend mit kochendem Wasser extern erwärmt bis aus der Suspension eine
feste Mischung entstanden war. Anschließend wurde das Perlpolymerisat in einem
anderen 500 ml Kolben mit einer alkalischen Lösung aus 67,5 ml Wasser und 8,5 ml
26%iger Ammoniak-Lösung (pH = 9) 1 Stunde gerührt und mit 250 ml Wasser
verdünnt. Nach dem Abdekantieren der Lösung wurde dieser Vorgang mehrfach
wiederholt.
Das mit Eisensalzlösung behandelte Perlpolymerisat wurden mit 300 ml Wasser
versetzt und unter Luftstrom 30 Minuten gerührt und anschließend auf 72°C
erwärmt. Der pH-Wert wurde während des gesamten Vorgangs durch Zugabe von
Ammoniaklösung auf 9 eingestellt. Anschließend wurde die Lösung mit 0,155 g
Kaliumperoxodisulfat versetzt und weitere 2,5 Stunden bei 72°C erwärmt. Nach dem
Abdekantieren der Flüssigkeit wurde der Feststoff fünfmal mit Wasser gewaschen
und dabei mit Ultraschall behandelt. Man erhielt 5,1 g schwarzes Perlpolymerisat mit
einem Eisengehalt von 6 Gew.-%, welches von einem inhomogenen Magnetfeld stark
angezogen wird.
In einem 0,5 Liter-Reaktionsgefäß mit Gitterrührer, Rückflusskühler und Thermo
fühler wurden 41 g Dispergierhilfsmittel-Lösung aus 1a) und 240 g Cyclohexan
vorgelegt und gerührt. 9,38 g N,N-Dimethylaminoethylmethacrylat wurde mit 13,3 g
Wasser und 6 g 37%ige Salzsäure 5 Minuten gerührt. Anschließend wurde diese
Lösung in das Reaktionsgefäß gegeben. Zu dieser Mischung wurde 18,75 g Acryl
amid und 3,13 g Methylen-N,N'-bisacrylamid, gelöst in 8 g Methanol, zugegeben.
Diese Reaktionsmischung wurde mit 0,313 g 2,2'-Azobis(2-amidinopropan)-
dihydrochlorid, gelöst in einer Mischung aus 4,25 g Wasser und 2 g Methanol, ver
setzt und bei 450 Upm 10 Minuten mit Stickstoffgas gespült. Anschließend wurde
die Temperatur innerhalb von 1 Stunde bei 800 Upm auf 60°C erhöht und
10 Stunden bei dieser Temperatur reagieren lassen. Nach dem Abkühlen wurde das
entstandene Polymerisat durch dekantieren von der Reaktionslösung abgetrennt und
je dreimal mit Cyclohexan, Wasser und Methanol gereinigt und bei 40°C im
Vakuumtrockenschrank getrocknet. Man erhielt 15 g getrocknetes Perlpolymerisat
mit einer mittleren Teilchengröße von 20 µm und einem Quelllungsindex von 5 bei
25°C in Wasser.
5 g des Perlpolymerisates aus 2a) wurde wie unter 1d) beschrieben mit Eisenoxid
dotiert. Dabei wurde der gesamte Vorgang zweifach durchgeführt. Man erhielt 5,4 g
schwarzes Perlpolymerisat mit einem Eisengehalt von 8,3 Gew.-%, welches von
einem inhomogenen Magnetfeld stark angezogen wird.
Claims (10)
1. Vernetzte Perlpolymerisate dotiert mit superparamagnetischen Eisenoxid und
enthaltend basische Aminogruppen, dadurch gekennzeichnet, dass die Perl
polymerisate einpolymerisierte Einheiten aus hydrophilem (Meth)acrylat und
Amino(meth)acrylate erhalten.
2. Vernetzte Perlpolymerisate nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass
das hydrophile (Meth)acrylat (Meth)acrylamid ist.
3. Vernetzte Perlpolymerisate nach Anspruch 1 bis 2, dadurch gekennzeichnet,
dass das Amino(meth)acrylat ein Aminoalkylmethacrylat ist.
4. Vernetzte Perlpolymerisate nach Anspruch 3, dadurch gekennzeichnet, dass
die Perlpolymerisate einpolymerisierte Einheiten aus (Meth)acrylamid und
Dialkylaminoalkyl(meth)acrylate und Methylenbis(meth)acrylamid als Ver
netzer enthalten.
5. Vernetzte Perlpolymerisate nach Anspruch 1 bis 4, dadurch gekennzeichnet,
dass sie eine Teilchengröße von 5 bis 100 µm besitzen.
6. Vernetzte Perlpolymerisate nach Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet, dass
die Teilchengrößenverteilung DV/DZ kleiner als 2,5 ist.
7. Verfahren zur Isolierung von Nucleinsäuren unter Verwendung der Perlpoly
merisaten gemäß Anspruch 1 bis 6.
8. Verfahren zur Herstellung vernetzter Perlpolymerisate, dadurch gekenn
zeichnet, dass man ein Monomergemisch aus hydrophilem (Meth)acrylat,
Amino(meth)acrylate, Vernetzer und gegebenfalls weiteren Monomeren zu
Perlen durch umgekehrte Suspensionspolymerisation polymerisiert und diese
durch eine Nachbehandlung mit Eisensalzlösung mit superparamagnetischen
Eisenoxid dotiert.
9. Verfahren zur Herstellung vernetzter Perlpolymerisate nach Anspruch 8,
dadurch gekennzeichnet, dass Amino(meth)acrylate teilweise oder ganz in
Form eines Ammoniumsalzes eingesetzt wird.
10. Verfahren zur Amplifikation von Nucleinsäuren durch PCR, insbesondere
Taqman PCR auf der Oberfläche von Partikeln, dadurch gekennzeichnet, dass
die Partikel Perlpolymerisate gemäß Anspruch 1 bis 6 sind.
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