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CN1303218C - 过氧化物酶体增长因子活化受体拮抗剂和激动剂的筛选方法 - Google Patents

过氧化物酶体增长因子活化受体拮抗剂和激动剂的筛选方法 Download PDF

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CN1303218C
CN1303218C CNB2003101227067A CN200310122706A CN1303218C CN 1303218 C CN1303218 C CN 1303218C CN B2003101227067 A CNB2003101227067 A CN B2003101227067A CN 200310122706 A CN200310122706 A CN 200310122706A CN 1303218 C CN1303218 C CN 1303218C
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Abstract

本发明涉及利用酵母双杂交系统,通过测定α-半乳糖苷酶的活性大小筛选PPAR拮抗剂和激动剂的方法。该方法包括(1)CBP和酵母GAL4AD融合蛋白(pGADT7-CBP)的质粒构建;(2)PPARγLBD和酵母GAL4BD融合蛋白(pGBKT7-PPARγLBD)的质粒构建;(3)将质粒pGBKT7-PPARγLBD与质粒GADT7-CBP依次转入酵母细胞AH109;(4)通过测定α-半乳糖苷酶的活性筛选化合物。

Description

过氧化物酶体增长因子活化受体拮抗剂和激动剂的筛选方法
技术领域
本发明涉及利用分子和细胞生物学技术筛选PPAR拮抗剂和激动剂的方法,具体涉及利用酵母双杂交技术,通过测定α-半乳糖苷酶的活性大小筛选PPAR拮抗剂和激动剂的方法。
背景技术
近年来,在我国随着人们生活水平质量的不断提高,饮食结构及生活方式的变化,患有血脂代谢异常的人数在逐年升高,由此而引发的高血压病、高脂血症、冠心病、糖尿病、肥胖症等“富裕性疾病”的发病率亦明显上升,同时,这类疾病还是威胁中老年人健康的第一大杀手,已经引起了全社会的高度重视。有资料显示,目前,高脂血症、糖尿病、肥胖症等相关性十分密切的病症,其相加总发病率已达10%。我国90年代初期与80年代相比,人群血脂水平明显增加,尤其在北方大城市,约30~40%的人患有不同程度的超过边缘性标准的血脂和血糖代谢异常。因此,在全社会范围内重视、控制这类疾病已势在必行。
近十年来的研究表明,核受体PPAR(Peroxisome Proliferator-activated Receptors)又称过氧化物酶体增长因子活化受体,是一类由配体激活的核转录因子,属II型核受体超家族成员,能被脂肪酸以及外源性过氧化物酶体增殖剂(Peroxisome Proliferator,PP)激活。在两栖类、啮齿类动物及人类等PPAR s均有3种亚型,即PPARα、PPARβ(亦称PPARδ或NUC 1)和PPARγ。人类PPARα、β和γ分别含有468、441和479个氨基酸残基。作为甾体激素受体超家族成员之一,PPAR共有6个区域(A-F)、4个功能结构域。位于受体分子中部的C区是DNA结合区(DBD);羧基端的E/F区是配基结合区(LBD),在激素信号转换成转录激活信号过程中发挥重要作用;氨基端的A/B是调节区,PPARγ的活化可被MAPK介导的A/B区的一个丝氨酸残基的磷酸化而降低,而PPARα的磷酸化可正调节受体-配体的亲和力。活化的PPAR与视黄酸类受体(RXR)形成异二聚体,然后与所调节基因的启动子上游的过氧化物酶体增殖物反应元件(PPRE)结合而发挥转录调控作用。同时,活化的PPAR能同一系列转录共激活因子(如:CBP SRC-1;RIP140;TIF1;TIF2;SUGI;P300)结合,从而激活转录。PPAR介导的效应主要包括脂类代谢、免疫反应等,因此,动脉粥样硬化、肥胖、糖尿病、肿瘤以及炎症性疾病等的发生发展与PPAR有密切关系。
PPAR的不同亚型具有不同的生物学作用,PPARα在肝脏脂类代谢中发挥重要作用,PPARβ在脂肪细胞分化中的作用还存在着争议,而PPARγ参与脂肪形成和免疫反应,与脂肪细胞分化、肥胖及胰岛素抵抗关系密切,被认为是治疗糖尿病、肥胖症、坏脂血症、炎症、高血压和癌症药物设计的重要靶标分子,成为近年来研究热点。
对于PPARγ激动剂的研究主要集中在其在治疗II型糖尿病方面的应用。胰岛素增敏剂噻唑烷二酮类药物(TZDs)作为PPARγ的一类激动剂可以明显降低白色脂肪组织(WAT)中甘油三酯的含量,同时还可降低血浆中的葡萄糖,脂质和II型糖尿病实验动物的胰岛素水平。三类TZD类药物:罗格列酮rosiglitazone(Rezulin),皮格列酮piogitazone(ACTOS),和曲格列酮Troglitazone(Avandia)已被FDA认证通过,作为治疗II型糖尿病的药物已经在市场上销售。至于PPARγ拮抗剂,理论上可减少脂肪、防治肥胖,但临床尚未应用。
目前国内在PPARγ激动剂和拮抗剂的高通量筛选上大都局限于蛋白质水平的小分子化合物的筛选,如SPR技术,而细胞水平的筛选则基本依赖于哺乳动物细胞,成本较高,操作也相对烦琐。酵母双杂交技术是一项采用报告基因来检测蛋白质与蛋白质间相互作用的技术(美国专利No.5,283,173;Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,vol.88,pp.9578-9582,1991)。许多转录因子可以分为DNA结合域(DNA binding domain,DNA-BD)和转录激活域(transcriptional activation domain,AD),而只有DNA-BD和AD这两个结构域共存的情况下,才能激活下游基因的表达。酵母双杂交系统中,将待检测的蛋白X、Y分别与DNA-BD、AD表达为融合蛋白DNA-BD-X、AD-Y,只有在X、Y有相互作用的情况下,DNA-BD、AD方形成完整的复合物,激活下游报告基因的表达。目前通常选用LacZ作为酵母双杂交的报告基因,然而β-半乳糖苷酶是一种胞内酶,因此酵母细胞的裂解彻底与否会对酶活的测定造成直接影响,且操作相对复杂。
发明内容
本发明的目的在于提供一种利用酵母双杂交系统来筛选PPAR拮抗剂和激动剂的新方法。
本发明的另一个目的是提供一种通过测定α-半乳糖苷酶的活性大小,来方便而快捷的检测小分子化合物对PPAR与共激活因子间相互作用影响的方法。
本发明的再一个目的是提供用于本发明方法筛选PPAR拮抗剂和激动剂的酵母筛选系统。该系统包括:(1)小鼠共激活因子CBP和酵母转录因子GAL4-AD融合蛋白表达质粒pGADT7-CBP(Escherichia E.coli DH5α)保藏号为CGMCC No.1076,保藏日期:2003年12月15日,地址:北京中关村中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,邮编:100080;(2)含人PPARγLBD和酵母转录因子GAL4-BD融合蛋白表达质粒pGBKT7-PPARγLBD(Escherichia E.coli DH5α)保藏号为CGMCC No.1077,保藏日期:2003年12月15日,地址:北京中关村中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,邮编:100080;(3)宿主酵母AH109。
本发明采用了酵母双杂交这一有利的研究蛋白质与蛋白质之间相互作用的技术,在PPARs与共激活因子的结合是配体依赖性前提下,实现了PPAR的激动剂和拮抗剂的筛选。本发明采用GAL4转录因子,其DNA-BD、AD区域则已分别构建在酵母表达质粒pGBKT7与pGADT7中。本发明采用酵母AH109基因组自带的MEL1基因作为双杂交的报告基因,通过测定其分泌型的产物α-半乳糖苷酶的活性来检测小分子化合物对PPARγ与其共激活因子相互作用程度的影响。
本发明利用酵母双杂交系统来筛选PPAR拮抗剂与激动剂的方法由下列步骤组成:
1、CBP和酵母GAL4AD融合蛋白(pGADT7-CBP)的质粒构建;
本步骤是借助细胞分子生物学方法,选用pGADT7载体构建CBP和酵母GAL4AD融合蛋白的质粒(pGADT7-CBP)。
(1)用PCR技术从CMV-mCBP中获得CBP(1-464aa)的DNA片段:
引物:FW:5’AACATATGATGGCCGAGAACTTGCTGGACG 3’
RV:5’AAGGATCCCTGTTGCCCTGCACCAACAG 3’
95℃变性8min,开始循环95℃ 1min,65℃ 1min,72℃ 1min30s,重复30循环,72℃ 10min。
采用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物,回收DNA。
(2)将CBP(1-464aa)的PCR产物克隆到pGADT7载体上:CBP(1-464aa)的PCR产物和pGADT7分别用Nde I和BamH I酶切;用试剂盒回收酶切产物,其中回收CBP(1-464aa)的PCR酶切产物近1400bp,pGADT7酶切产物近8.0kb。用T4 DNA连接酶连接;连接产物转化入感受态细胞DH5α;通过酶切鉴定挑选正确的克隆。
2、PPARγLBD和酵母GAL4BD融合蛋白(pGBKT7-PPARγLBD)的质粒构建;
本步骤是借助细胞分子生物学方法,选用pGBKT7载体构建PPARγLBD和酵母GAL4DNA-BD融合蛋白的质粒(pGBKT7-PPARγLBD)。
(1)利用PCR技术从pCDNA3.1-PPARγ中获得PPARγLBD(193aa-475aa)的DNA片段:
引物:FW:5’AACATATGGCGGAGATCTCCAGT 3’
RV:5’AAGTCGACCTAGTACAAGTCCTT 3’
95℃变性5min,开始循环95℃ 30s,60℃ 30s,72℃ 1min,重复30循环,72℃10min。
采用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物,回收DNA。
(2)将PPARγLBD的PCR产物克隆到pGBKT7载体上:PPARγLBD的PCR产物和pGBKT7分别用Nde I和Sal I酶切;用试剂盒回收酶切产物,其中回收PPARγLBD的PCR酶切产物近850bp,pGBKT7酶切产物近7.3kb;用T4 DNA连接酶连接;连接产物转化入感受态细胞DH5α;通过酶切鉴定挑选正确的克隆。
3、将质粒pGBKT7-PPARγLBD和pGADT7-CBP依次转入酵母细胞AH109,得到酵母PPARγLBD-CBP AH109(Saccharomyces cerevisiae AH109)保藏号为CGMCC No.1075,保藏日期:2003年12月15日,地址:北京中关村中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,邮编:100080:
采用LiAc转化法。先将pGBKT7-PPARγLBD质粒转入酵母细胞AH109,用色氨酸缺陷(T-)的培养基筛选阳性克隆,然后将pGADT7-CBP质粒转入含有pGBKT7-PPARγLBD质粒的酵母中,用色氨酸,亮氨酸双缺陷(T-L-)的培养基筛选阳性克隆,得到同时含有pGADT7-CBP质粒和pGBKT7-PPARγLBD质粒的酵母细胞。
4、通过测定α-半乳糖苷酶的活性筛选化合物:
在得到的含pGADT7-CBP和pGBKT7-PPARγLBD双质粒的阳性酵母细胞中分别加入阳性对照物、阴性对照物及待筛选的化合物,孵育后测定α-半乳糖苷酶的活性,并计算其激动率,根据各个待筛选药物的激动率的比较,筛选出PPAR拮抗剂和激动剂。
本发明提供了利用酵母双杂交系统定量检测小分子化合物对蛋白质相互作用强度影响方法:采用酵母基因组自带的MEL1基因作为双杂交的报告基因,通过测定其分泌型的产物α-半乳糖苷酶的活性来检测小分子化合物对PPARγ与其共激活因子相互作用程度的影响。
本发明利用载体pGADT7构建的pGADT7-CBP质粒的核苷酸序列如下:
TGCATGCCTGCAGGTCGAGATCCGGGATCGAAGAAATGATGGTAAATGAAATAGG
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TTTTACAAAAATGAAGCACAGATTCTTCGTTGGTAAAATAGCGCTTTCGCGTTGCATTT
CTGTTCTGTAAAAATGCAGCTCAGATTCTTTGTTTGAAAAATTAGCGCTCTCGCGTTGC
ATTTTTGTTCTACAAAATGAAGCACAGATGCTTCGTTGCT
pGADT7-CBP质粒表达的氨基酸序列为:
Met Asp Lys Ala Glu Leu Ile Pro Glu Pro Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Glu Leu Gly Thr Ala
Ala Asn Phe Asn Gln Ser Gly Asn Ile Ala Asp Ser Ser Leu Ser Phe Thr Phe Thr Asn Ser Ser
Asn Gly Pro Asn Leu Ile Thr Thr Gln Thr Asn Ser Gln Ala Leu Ser Gln Pro Ile Ala Ser Ser
Asn Val His Asp Asn Phe Met Asn Asn Glu Ile Thr Ala Ser Lys Ile Asp Asp Gly Asn Asn Ser
Lys Pro Leu Ser Pro Gly Trp Thr Asp Gln Thr Ala Tyr Asn Ala Phe Gly Ile Thr Thr Gly
Met Phe Asn Thr Thr Thr Met Asp Asp Val Tyr Asn Tyr Leu Phe Asp Asp Glu Asp Thr Pro
Pro Asn Pro Lys Lys Glu Ile Phe Asn Thr Thr His Tyr Arg Ala Ser Ala Ala Met Glu Tyr Pro Tyr
Asp Val Pro Asp Tyr Ala His Met Met Ala Glu Asn Leu Leu Asp Gly Pro Pro Asn Pro Lys Arg
Ala Lys Leu Ser Ser Pro Gly Phe Ser Ala Asn Asp Asn Thr Asp Phe Gly Ser Leu Phe Asp
Leu Glu Asn Asp Leu Pro Asp Glu Leu Ile Pro Asn Gly Glu Leu Ser Leu Leu Asn Ser Gly
Asn Leu Val Pro Asp Ala Ala Ser Lys His Lys Gln Leu Ser Glu Leu Leu Arg Gly Gly Ser Gly
Ser Ser Ile Asn Pro Gly Ile Gly Asn Val Ser Ala Ser Ser Pro Val Gln Gln Gly Leu Gly Gly
Gln Ala Gln Gly Gln Pro Asn Ser Thr Asn Met Ala Ser Leu Gly Ala Met Gly Lys Ser Pro
Leu Asn Gln Gly Asp Ser Ser Thr Pro Asn Leu Pro Lys Glh Ala Ala Ser Tnr Ser Gly Pro
Thr Pro Pro Ala Ser Gln Ala Leu Asn Pro Gln Ala Gln Lys Gln Val Gly Leu Val Thr Ser Ser
Pro Ala Thr Ser Gln Thr Gly Pro Gly Ile Cys Met Asn Ala Asn Phe Asn Gln Thr His Pro
Gly Leu Leu Asn Ser Asn Ser Gly His Ser Leu Met Asn Gln Ala Gln Gln Gly Gln Ala Gln
Val Met Asn Gly Ser Leu Gly Ala Ala Gly Arg Gly Arg Gly Ala Gly Met Pro Tyr Pro Ala
Pro Ala Met Gln Gly Ala Thr Ser Ser Val Leu Ala Glu Thr Leu Thr Gln Val Ser Pro Gln
Met Ala Gly His Ala Gly Leu Asn Thr Ala Gln Ala Gly Gly Met Thr Lys Met Gly Met Thr
Gly Thr Thr Ser Pro Phe Gly Gln Pro Phe Ser Gln Thr Gly Gly Gln Gln Met Gly Ala Thr
Gly Val Asn Pro Gln Leu Ala Ser Lys Gln Ser Met Val Asn Ser Leu Pro Ala Phe Pro Thr Asp
Ile Lys Asn Thr Ser Val Thr Thr Val Pro Asn Met Ser Gln Leu Gln Thr Ser Val Gly Ile Val
Pro Thr Gln Ala Ile Ala Thr Gly Pro Thr Ala Asp Pro Glu Lys Arg Lys Leu Ile Gln Gln Gln
Leu Val Leu Leu Leu His Ala His Lys Cys Gln Arg Arg Glu Gln Ala Asn Gly Glu Val Arg
Ala Cys Ser Leu Pro His Cys Arg Thr Met Lys Asn Val Leu Asn His Met Thr His Cys Gln
Ala Pro Lys Ala Cys Gln Val Ala His Cys Ala Ser Ser Arg Gln Ile Ile Ser His Trp Lys Asn
Cys Thr Arg His Asp Cys Pro Val Cys Leu Pro Leu Lys Asn Ala Ser Asp Lys Arg Asn Gln
Gln Thr Ile Leu Gly Ser Pro Ala Ser Gly Ile Gln Asn Thr Ile Gly Ser Val Gly Ala Gly Gln
Gln Gly Ser Ile Glu Leu Glu Leu Gln Met Asn Arg Arg Tyr***
本发明利用载体pGBKT7构建的pGBKT7-PPARγLBD质粒,具有如下核苷酸序列:
CGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGATCCTTTTGTTGTTTCCGGGTGTACAA
TATGGACTTCCTCTTTTCTGGCAACCAAACCCATACATCGGGATTCCTATAATACCTTCG
TTGGTCTCCCTAACATGTAGGTGGCGGAGGGGAGATATACAATAGAACAGATACCAGAC
AAGACATAATGGGCTAAACAAGACTACACCAATTACACTGCCTCATTGATGGTGGTACA
TAACGAACTAATACTGTAGCCCTAGACTTGATAGCCATCATCATATCGAAGTTTCACTAC
CCTTTTTCCATTTGCCATCTATTGAAGTAATAATAGGCGCATGCAACTTCTTTTCTTTTTT
TTTCTTTTCTCTCTCCCCCGTTGTTGTCTCACCATATCCGCAATGACAAAAAAAATGATG
GAAGACACTAAAGGAAAAAATTAACGACAAAGACAGCACCAACAGATGTCGTTGTTC
CAGAGCTGATGAGGGGTATCTCGAAGCACACGAAACTTTTTCCTTCCTTCATTCACGCA
CACTACTCTCTAATGAGCAACGGTATACGGCCTTCCTTCCAGTTACTTGAATTTGAAATA
AAAAAAGTTTGCTGTCTTGCTATCAAGTATAAATAGACCTGCAATTATTAATCTTTTGTTT
CCTCGTCATTGTTCTCGTTCCCTTTCTTCCTTGTTTCTTTTTCTGCACAATATTTCAAGCT
ATACCAAGCATACAATCAACTCCAAGCTTGAAGCAAGCCTCCTGAAAGATGAAGCTAC
TGTCTTCTATCGAACAAGCATGCGATATTTGCCGACTTAAAAAGCTCAAGTGCTCC
AAAGAAAAACCGAAGTGCGCCAAGTGTCTGAAGAACAACTGGGAGTGTCGCTAC
TCTCCCAAAACCAAAAGGTCTCCGCTGACTAGGGCACATCTGACAGAAGTGGAAT
CAAGGCTAGAAAGACTGGAACAGCTATTTCTACTGATTTTTCCTCGAGAAGACCT
TGACATGATTTTGAAAATGGATTCTTTACAGGATATAAAAGCATTGTTAACAGGAT
TATTTGTACAAGATAATGTGAATAAAGATGCCGTCACAGATAGATTGGCTTCAGTG
GAGACTGATATGCCTCTAACATTGAGACAGCATAGAATAAGTGCGACATCATCATC
GGAAGAGAGTAGTAACAAAGGTCAAAGACAGTTGACTGTATCGCCGGAATTTGTAA
TACGACTCACTATAGGGCGAGCCGCCATCATGGAGGAGCAGAAGCTGATCTCAGAGGA
GGACCTGCATATGgcggagatctccagtgatatcgaccagctgaatccagagtccgctgacctccgggccctggcaaaaca
tttgtatgactcatacataaagtccttcccgctgaccaaagcaaaggcgagggcgatcttgacaggaaagacaacagacaaaatcaacc
attcgttatctatgacatgaattccttaatgatgggagaagataaaatcaagttcaaacacatcacccccctgcaggagcagagcaaa
gaggtggccatccgcatctttcagggctgccagtttcgctccgtggaggctgtgcaggagatcacagagtatgccaaaagcattcctg
gttttgtaaatcttgacttgaacgaccaagtaactctcctcaaatatggagtccacgagatcatttacacaatgctggcctccttgatga
ataaagatggggttctcatatccgagggccaaggcttcatgacaagggagtttctaaagagcctgcgaaagccttttggtgactttatg
gagcccaagtttgagtttgctgtgaagttcaatgcactggaattagatgacagcgacttggcaatatttattgctgtcattattctcagtg
gagaccgcccaggtttgctgaatgtgaagcccattgaagacattcaagacaacctgctacaagccctggagctccagctgaagctga
accaccctgagtcctcacagctgtttgccaagctgctccagaaaatgacagacctcagacagattgtcacggaacacgtgcagctact
gcaggtgatcaagaagacggagacagacatgagtcttcacccgctcctgcaggagatctacaaggacttgtactagGTCGACC
TGCAGCGGCCGCATAACTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGT
TTTTTGCGCGCTTGCAGCCAAGCTAATTCCGGGCGAATTTCTTATGATTTATGATTTTTAT
TATTAAATAAGTTATAAAAAAAATAAGTGTATACAAATTTTAAAGTGACTCTTAGGTTTT
AAAACGAAAATTCTTATTCTTGAGTAACTCTTTCCTGTAGGTCAGGTTGCTTTCTCAGGT
ATAGCATGAGGTCGCTCTTATTGACCACACCTCTACCGGCATGCAAGCTTGGCGTAATC
ATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG
AGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGGTAACTCACATTA
ATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTA
ATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCTCTTCCGCTTCC
TCGCTCACTGACTCGCTGCGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTATCAGCTCACT
CAAAGGCGGTAATACGGTTATCCACAGAATCAGGGGATAACGCAGGAAAGAACATGTG
AGCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGGCGTTTTT
CCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCAAGTCAGAGGTGG
CGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGC
GCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGA
AGCGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCG
CTCCAAGCTGGGCTGTGTGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCC
GGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGACACGACTTATCGCCACTGGCAGCAG
CCACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGAGTTCTTGAA
GTGGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGGACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGA
AGCCAGTTACCTTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGC
TGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTTGCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCT
CAAGAAGATCCTTTGATCTTTTCTACGGGGTCTGACGCTCAGTGGAACGAAAACTCAC
GTTAAGGGATTTTGGTCATGAGATTATCAAAAAGGATCTTCACCTAGATCCTTTTAAATT
AAAAATGAAGTTTTAAATCAATCTAAAGTATATATGAGTAACCTGAGGCTATGGCAGGG
CCTGCCGCCCCGACGTTGGCTGCGAGCCCTGGGCCTTCACCCGAACTTGGGGGGTGGG
GTGGGGAAAAGGAAGAAACGCGGGCGTATTGGCCCCAATGGGGTCTCGGTGGGGTAT
CGACAGAGTGCCAGCCCTGGGACCGAACCCCGCGTTTATGAACAAACGACCCAACAC
CGTGCGTTTTATTCTGTCTTTTTATTGCCGTCATAGCGCGGGTTCCTTCCGGTATTGTCTC
CTTCCGTGTTTCAGTTAGCCTCCCCCTAGGGTGGGCGAAGAACTCCAGCATGAGATCCC
CGCGCTGGAGGATCATCCAGCCGGCGTCCCGGAAAACGATTCCGAAGCCCAACCTTTC
ATAGAAGGCGGCGGTGGAATCGAAATCTCGTGATGGCAGGTTGGGCGTCGCTTGGTCG
GTTCATTTCGAACCCCAGAGTCCCGCTCAGAAGAACTCGTCAAGAAGGCGATAGAAGG
CGATGCGCTGCGAATCGGGAGCGGCGATACCGTAAAGCACGAGGAAGCGGTCAGCCC
ATTCGCCGCCAAGCTCTTCAGCAATATCACGGGTAGCCAACGCTATGTCCTGATAGCGG
TCCGCCACACCCAGCCGGCCACAGTCGATGAATCCAGAAAAGCGGCCATTTTCCACCA
TGATATTCGGCAAGCAGGCATCGTCATGGGTCACGACGAGATCCTCGCCGTCGGGCATG
CTCGCCTTGAGCCTGGCGAACAGTTCGGCTGGCGCGAGCCCCTGATGCTCTTCGTCCA
GATCATCCTGATCGACAAGACCGGCTTCCATCCGAGTACGTGCTCGCTCGATGCGATGT
TTCGCTTGGTGGTCGAATGGGCAGGTAGCCGGATCAAGCGTATGCAGCCGCCGCATTG
CATCAGCCATGATGGATACTTTCTCGGCAGGAGCAAGGTGAGATGACAGGAGATCCTG
CCCCGGCACTTCGCCCAATAGCAGCCAGTCCCTTCCCGCTTCAGTGACAACGTCGAGC
ACAGCTGCGCAAGGAACGCCCGTCGTGGCCAGCCACGATAGCCGCGCTGCCTCGTCTT
GCAGTTCATTCAGGGCACCGGACAGGTCGGTCTTGACAAAAAGAACCGGGCGCCCCT
GCGCTGACAGCCGGAACACGGCGGCATCAGAGCAGCCGATTGTCTGTTGTGCCCAGTC
ATAGCCGAATAGCCTCTCCACCCAAGCGGCCGGAGAACCTGCGTGCAATCCATCTTGTT
CAATCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAG
CGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATAGGGGTTCCGCGCACATTTCC
CCGAAAAGTGCCACCTGAACGAAGCATCTGTGCTTCATTTTGTAGAACAAAAATGCAA
CGCGAGAGCGCTAATTTTTCAAACAAAGAATCTGAGCTGCATTTTTACAGAACAGAAA
TGCAACGCGAAAGCGCTATTTTACCAACGAAGAATCTGTGCTTCATTTTTGTAAAACAA
AAATGCAACGCGAGAGCGCTAATTTTTCAAACAAAGAATCTGAGCTGCATTTTTACAG
AACAGAAATGCAACGCGAGAGCGCTATTTTACCAACAAAGAATCTATACTTCTTTTTTG
TTCTACAAAAATGCATCCCGAGAGCGCTATTTTTCTAACAAAGCATCTTAGATTACTTTT
TTTCTCCTTTGTGCGCTCTATAATGCAGTCTCTTGATAACTTTTTGCACTGTAGGTCCGTT
AAGGTTAGAAGAAGGCTACTTTGGTGTCTATTTTCTCTTCCATAAAAAAAGCCTGACTC
CACTTCCCGCGTTTACTGATTACTAGCGAAGCTGCGGGTGCATTTTTTCAAGATAAAGG
CATCCCCGATTATATTCTATACCGATGTGGATTGCGCATACTTTGTGAACAGAAAGTGAT
AGCGTTGATGATTCTTCATTGGTCAGAAAATTATGAACGGTTTCTTCTATTTTGTCTCTAT
ATACTACGTATAGGAAATGTTTACATTTTCGTATTGTTTTCGATTCACTCTATGAATAGTT
CTTACTACAATTTTTTTGTCTAAAGAGTAATACTAGAGATAAACATAAAAAATGTAGAGG
TCGAGTTTAGATGCAAGTTCAAGGAGCGAAAGGTGGATGGGTAGGTTATAATAGGGATAT
AGCACAGAGATATATAGCAAAGAGATACTTTTGAGCAATGTTTGTGGAAGCGGTATTCG
CAATATTTTAGTAGCTCGTTACAGTCCGGTGCGTTTTTGGTTTTTTGAAAGTGCGTCTTC
AGAGCGCTTTTGGTTTTCAAAAGCGCTCTGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAA
CTTCGGAATAGGAACTTCAAAGCGTTTCCGAAAACGAGCGCTTCCGAAAATGCAACGC
GAGCTGCGCACATACAGCTCACTGTTCACGTCGCACCTATATCTGCGTGTTGCCTGTATA
TATATATACATGAGAAGAACGGCATAGTGCGTGTTTATGCTTAAATGCGTACTTATATGCG
TCTATTTATGTAGGATGAAAGGTAGTCTAGTACCTCCTGTGATATTATCCCATTCCATGCG
GGGTATCGTATGCTTCCTTCAGCACTACCCTTTAGCTGTTCTATATGCTGCCACTCCTCAA
TTGGATTAGTCTCATCCTTCAATGCTATCATTTCCTTTGATATTGGATCATATTAAGAAAC
CATTATTATCATGACATTAACCTATAAAAATAGGCGTATCACGAGGCCCTTTCGTCTCGC
GCGTTTCGGTGATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGCAGCTCCCGGAGACGGTCACA
GCTTGTCTGTAAGCGGATGCCGGGAGCAGACAAGCCCGTCAGGGCGCGTCAGCGGGT
GTTGGCGGGTGTCGGGGCTGGCTTAACTATGCGGCATCAGAGCAGATTGTACTGAGAG
TGCACCATAGATCAACGACATTACTATATATATAATATAGGAAGCATTTAATAGAACAGCA
TCGTAATATATGTGTACTTTGCAGTTATGACGCCAGATGGCAGTAGTGGAAGATATTCTT
TATTGAAAAATAGCTTGTCACCTTACGTACAATCTTGATCCGGAGCTTTTCTTTTTTTGC
CGATTAAGAATTAATTCGGTCGAAAAAAGAAAAGGAGAGGGCCAAGAGGGAGGGCAT
TGGTGACTATTGAGCACGTGAGTATACGTGATTAAGCACACAAAGGCAGCTTGGAGTAT
GTCTGTTATTAATTTCACAGGTAGTTCTGGTCCATTGGTGAAAGTTTGCGGCTTGCAGA
GCACAGAGGCCGCAGAATGTGCTCTAGATTCCGATGCTGACTTGCTGGGTATTATATGT
GTGCCCAATAGAAAGAGAACAATTGACCCGGTTATTGCAAGGAAAATTTCAAGTCTTG
TAAAAGCATATAAAAATAGTTCAGGCACTCCGAAATACTTGGTTGGCGTGTTTCGTAAT
CAACCTAAGGAGGATGTTTTGGCTCTGGTCAATGATTACGGCATTGATATCGTCCAACT
GCATGGAGATGAGTCGTGGCAAGAATACCAAGAGTTCCTCGGTTTGCCAGTTATTAAA
AGACTCGTATTTCCAAAAGACTGCAACATACTACTCAGTGCAGCTTCACAGAAACCTCA
TTCGTTTATTCCCTTGTTTGATTCAGAAGCAGGTGGGACAGGTGAACTTTTGGATTGGA
ACTCGATTTCTGACTGGGTTGGAAGGCAAGAGAGCCCCGAAAGCTTACATTTTATGTTA
GCTGGTGGACTGACGCCAGAAAATGTTGGTGATGCGCTTAGATTAAATGGCGTTATTGG
TGTTGATGTAAGCGGAGGTGTGGAGACAAATGGTGTAAAAGACTCTAACAAAATAGCA
AATTTCGTCAAAAATGCTAAGAAATAGGTTATTACTGAGTAGTATTTATTTAAGTATTGTT
TGTGCACTTGCCGATCTATGCGGTGTGAAATACCGCACAGATGCGTAAGGAGAAAATAC
CGCATCAGGAAATTGTAAACGTTAATATTTTGTTAAAATTCGCGTTAAATTTTTGTTAAAT
CAGCTCATTTTTTAACCAATAGGCCGAAATCGGCAAAATCCCTTATAAATCAAAAGAAT
AGACCGAGATAGGGTTGAGTGTTGTTCCAGTTTGGAACAAGAGTCCACTATTAAAGAA
CGTGGACTCCAACGTCAAAGGGCGAAAAACCGTCTATCAGGGCGATGGCCCACTACGT
GAACCATCACCCTAATCAAGTTTTTTGGGGTCGAGGTGCCGTAAAGCACTAAATCGGA
ACCCTAAAGGGAGCCCCCGATTTAGAGCTTGACGGGGAAAGCCGGCGAACGTGGCGA
GAAAGGAAGGGAAGAAAGCGAAAGGAGCGGGCGCTAGGGCGCTGGCAAGTGTAGCG
GTCACGCTGCGCGTAACCACCACACCCGCCGCGCTTAATGCGCCGCTACAGGGCGCGT
CCATTCGCCATTCAGGCTGCGCAACTGTTGGGAAGGGCGAT
pGBKT7-PPARγLBD质粒表达的氨基酸序列如下:
Met Lys Leu Leu Ser Ser Ile Glu Gln Ala Cys Asp Ile Cys Arg Leu Lys Lys
Leu Lys Cys Ser Lys Glu Lys Pro Lys Cys Ala Lys Cys Leu Lys Asn Asn Trp Glu Cys Arg
Tyr Ser Pro Lys Thr Lys Arg Ser Pro Leu Thr Arg Ala His Leu Thr Glu Val Glu Ser Arg
Leu Glu Arg Leu Glu Gln Leu Phe Leu Leu Ile Phe Pro Arg Glu Asp Leu Asp Met Ile Leu
Lys Met Asp Ser Leu Gln Asp Ile Lys Ala Leu Leu Thr Gly Leu Phe Val Gln Asp Asn Val
Asn Lys Asp Ala Val Thr Asp Arg Leu Ala Ser Val Glu Thr Asp Met Pro Leu Thr Leu Arg
Gln His Arg Ile Ser Ala Thr Ser Ser Ser Glu Glu Ser Ser Asn Lys Gly Gln Arg Gln Leu Thr
Val Ser Pro Glu Phe Val Ile Arg Leu Thr Ile Gly Arg Ala Ala Ile Met Glu Glu Gln Lys Leu Ile Ser
Glu Glu Asp Leu His Met Ala Glu Ile Ser Ser Asp Ile Asp Gln Leu Asn Pro Glu Ser Ala Asp
Leu Arg Ala Leu Ala Lys His Leu Tyr Asp Ser Tyr Ile Lys Ser Phe Pro Leu Thr Lys Ala Lys
Ala Arg Ala Ile Leu Thr Gly Lys Thr Thr Asp Lys Ser Pro Phe Val Ile Tyr Asp Met Asn Ser
Leu Met Met Gly Glu Asp Lys Ile Lys Phe Lys His Ile Thr Pro Leu Gln Glu Gln Ser Lys Glu
Val Ala Ile Arg Ile Phe Gln Gly Cys Gln Phe Arg Ser Val Glu Ala Val Gln Glu Ile Thr Glu
Tyr Ala Lys Ser Ile Pro Gly Phe Val Asn Leu Asp Leu Asn Asp Gln Val Thr Leu Leu Lys Tyr
Gly Val His Glu Ile Ile Tyr Thr Met Leu Ala Ser Leu Met Asn Lys Asp Gly Val Leu Ile Ser
Glu Gly Gln Gly Phe Met Thr Arg Glu Phe Leu Lys Ser Leu Arg Lys Pro Phe Gly Asp Phe
Met Glu Pro Lys Phe Glu Phe Ala Val Lys Phe Asn Ala Leu Glu Leu Asp Asp Ser Asp Leu
Ala Ile Phe Ile Ala Val Ile Ile Leu Ser Gly Asp Arg Pro Gly Leu Leu Asn Val Lys Pro Ile Glu
Asp Ile Gln Asp Asn Leu Leu Gln Ala Leu Glu Leu Gln Leu Lys Leu Asn His Pro Glu Ser
Ser Gln Leu Phe Ala Lys Leu Leu Gln Lys Met Tnr Asp Leu Arg Gln Ile Val Thr Glu His Val
Gln Leu Leu Gln Val Ile Lys Lys Thr Glu Thr Asp Met Ser Leu His Pro Leu Leu Gln Glu Ile
Tyr Lys Asp Leu Tyr***
上述两个质粒的核苷酸序列中:带下划线的碱基表示的是克隆该基因时所用的酶切位点;加粗的碱基序列表示融合蛋白的序列;ATG和TGA也加粗表示起始密码子和终止密码子;小写加粗的碱基序列表示插入基因的序列; tag表示终止密码子。
上述两个质粒所表达的氨基酸序列中:加黑的氨基酸序列表示的是融合蛋白的氨基酸序列;加黑并有下划线的氨基酸序列表示的是插入基因的氨基酸序列;***表示终止。
附图说明
图1为pGADT7-CBP质粒构建策略图。
图2为CBP(1-464aa)PCR产物琼脂糖电泳鉴定图谱,图谱左列为CBP(1-464aa)PCR产物电泳条带,该条带大小为1400bp,右列为100bp DNA marker。
图3为pGADT7-CBP质粒酶切鉴定结果图,其中0号为1kb DNA Marker;1号-9号为转化平板上挑出的克隆。
图4为pGADT7-CBP测序结果图。
图5为PGBKT7-PPARγLBD质粒构建策略图。
图6为PPARγLBD(193aa-475aa)PCR产物琼脂糖电泳鉴定图谱,图谱左列为DNA长度标记,右列为PPARγLBD(193aa-475aa)PCR产物电泳条带,该条带大小为850bp。
图7为PGBKT7-PPARγLBD质粒酶切鉴定结果,图谱左列为转化平板上挑出的克隆8号,右列为1kb DNA标记。
图8为pGBKT7-PPARγLBD测序结果图。
图9为质粒pGBKT7-PPARγLBD转化结果的PCR鉴定图,其中1为100bp的DNAladder,2-4依次为所挑取的1-3号克隆,5为阳性对照(pGBKT7-PPARγLBD为模板)。
图10为质粒pGADT7-CBP转化结果的PCR鉴定图,其中1为1kb的DNA标记,2为阴性对照(H2O为模板),3为阳性对照(pGADT7-CBP为模板),4-5为所挑取的1-2号克隆。
图11为罗格列酮对CBP与PPARγ相互作用影响图,其中1表示酵母菌株P1(含质粒pGBKT7-PPARγLBD)、2表示加入二甲亚砜后的酵母菌株P1、3表示加入罗格列酮(溶于二甲亚砜)后的酵母菌株P1、4表示酵母菌株P1C2(含双质粒pGBKT7-PPARγLBD和pGADT7-CBP)、5表示加入二甲亚砜后的酵母菌株P1C2、6表示加入罗格列酮(溶于二甲亚砜)的酵母菌株P1C2。
图12为药物作用时间对检测灵敏度的影响图。
图13为罗格列酮EC50的测定结果图。
图14为化合物筛选结果图。
有益效果:
1、利用本发明可进行PPARγ拮抗剂和激动剂的高通量筛选,本发明采用酵母基因组自带的MEL1基因作为双杂交的报告基因,通过测定其分泌型的产物α-半乳糖苷酶的活性来检测小分子化合物对PPARγ与其共激活因子相互作用程度的影响,无需裂解酵母细胞,是一种非常方便快捷且准确的方法,加之酵母细胞的易操作性有利于实现真核水平的高通量筛选。
2、利用本发明,首次在酵母水平进行了已知PPARγ激动剂-罗格列酮EC50的测定。
3、利用本发明可实现PPARγ拮抗剂和激动剂的高通量筛选,为药物的结构修饰和天然先导化合物的发现提供实验基础。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明作进一步阐述,但不限制本发明。
下述实施例中,所用的试验材料及其来源包括:
酵母菌株AH109(基因型为MATa,trp1-901,leu2-3,112,ura3-52,his3-200,gal4,gal80口...LYS2::GAL1UAS-GAL1TATA-HIS3,MEL1UAS-MEL1TATA-MMEL1UAS-MEL1TATA-MEL1,GAL2UAS-GAL2TATA-ADE2,URA3::MEL1UAS-MEL1TATA-lacZ)、酵母表达质粒pGBKT7和pGADT7为中科院上海生命科学学院龚毅教授惠赠;
模板CMV-mCBP由M.G.Rosenfeld提供;
模板pCDNA3.1-PPARγ由成都地奥公司提供;
限制性内切酶、DNA聚合酶、连接酶、dNTP等均购自TaKaRa公司;
10×buffer随pyrobestTM DNA聚合酶一起购自TaKaRa公司;
胶回收试剂盒购自华舜公司;
氨苄西林、卡那霉素、LiAc、PEG 3500、PNP-α-Gal、各培养基的配制原料均购自sigma公司;
SS-carrier DNA购自Strategene;
DNA marker购自鼎国生物公司;
引物合成与DNA测序由上海博亚公司完成;
96孔板购自Nunclon公司。
下述实施例中常规的基因操作参照有关文献,其中限制性酶切方法参照分子克隆第二版:P259-P262;用T4 DNA连接酶连接方法参照分子克隆第二版:P282-P283;连接产物转化入感受态细胞DH5α方法参照分子克隆第二版:P55-P56;用酶切鉴定方法参照分子克隆第二版:P259-P262;琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物方法参照分子克隆第二版:P680-P682;胶回收按照华舜公司的试剂盒说明书;质粒提取方法参照C.Hoffman andF.Winston,Gene 57:267;1987;LB培养基的配制方法参照分子克隆第二版:P908;酵母各培养基的配制方法参照Yeast Protocol Handbook(CLONTECH)。
实施例1 CBP和酵母GAL4AD融合蛋白(pGADT7-CBP)的质粒构建:
(一)试验方法:
1)以CMV-mCBP为模板,用PCR技术复制扩增获得CBP(1-464aa)的DNA片段(基因序列依据S66385(GENEBANK)):
引物设计:FW:5’AACATATGATGGCCGAGAACTTGCTGGACG 3’
RV:5’AAGGATCCCTGTTGCCCTGCACCAACAG 3’
PCR扩增反应(100μl):
CMV-mCBP模板:2μl;10×buffer:10μl;dNTP(2.5mM):8μl;FW:4μl;RV:4μl;pyrobestTM DNA聚合酶:1μl;水:71μl。
反应条件为95℃变性8min,开始循环95℃ 1min,65℃ 1min,72℃ 1min30s,重复30循环,72℃ 10min。
采用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物,回收DNA。
2)将CBP(1-464aa)的PCR产物克隆到pGADT7载体上
CBP(1-464aa)的PCR产物和pGADT7分别用Nde I和BamH I酶切;用试剂盒方法回收酶切产物,其中回收CBP(1-464aa)的PCR酶切产物近1400bp;pGADT7酶切产物近8.0kb;用T4 DNA连接酶连接;连接产物转化入感受态细胞DH5α;涂布在含氨苄西林(100mg/l)的平板上;用酶切鉴定挑选正确的克隆。
(二)试验结果:
1、采用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物的结果见图2。
2、酶切鉴定结果:在载体上1480bp,2280bp处有两个Hind III的酶切位点,1480bp-2280bp间存在着多克隆位点,CBP就克隆在这个区域内,因而正确的克隆应切出约2200bp和7.2kb左右的片段。如图3所示,经进一步酶切鉴定结果显示确实有正确的克隆(5号和9号)。
3、DNA测序报告:pGADT7-CBP表达载体测序报告如图4所示,pGADT7-CBP DNA测序结果和CBP(1-464aa)原DNA序列比较,原序列1131处是一个未知碱基N,5号在该处测出的是A,但这个位置是密码子的第三位,所以无论是AGCT哪种,都不影响氨基酸编码。
实施例2 PPARγLBD和酵母GAL4BD融合蛋白(pGBKT7-PPARγLBD)的构建:
(一)试验方法:
以pCDNA3.1-PPARγ为模板,用PCR技术复制扩增获得PPARγLBD(193aa-475aa)的DNA片段(基因序列依据NM005037(GENEBANK)):
引物设计:FW:5’AACATATGGCGGAGATCTCCAGT 3’
RV:5’AAGTCGACCTAGTACAAGTCCTT 3’
PCR扩增反应(100μl):
pCDNA3.1-PPARγ模板:2μl;10×buffer:10μl;dNTP(2.5mM):8μl;FW:4μl;RV:4μl;pyrobest聚合酶:1μl;水:71μl。
反应条件为95℃变性5min,开始循环95℃30s,60℃30s,72℃1min,重复30循环,72℃10min。
采用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物,回收DNA。
2)将PPARγLBD的PCR产物克隆到pGBKT7载体上:
PPARγLBD的PCR产物和pGBKT7分别用Nde I和Sal I酶切;用试剂盒方法回收酶切产物,其中回收PPARγLBD的PCR酶切产物近850bp;pGBKT7酶切产物近7.3kb;用T4DNA连接酶连接;连接产物转化入感受态细胞DH5α;涂布在含卡那霉素(50mg/l)的平板上用酶切鉴定,挑选正确的克隆。
(二)试验结果:
1、采用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物的结果见图6。
2、酶切鉴定结果:在载体上6313bp处有一个EcoRV的酶切位点,PPARγLBD基因内部16bp处也有一个EcoRV的酶切位点,因而正确的克隆应切出约2200bp和6kb左右的片段。如图7所示,经进一步酶切鉴定结果显示确实有正确的克隆(8号)。
3、DNA测序报告:pGADT7-CBP表达载体测序报告如图8所示,PPARγLBDDNA测序结果和PPARγLBD原DNA序列比较,结果完全一致。
实施例3 将pGADT7-CBP与pGBKT7-PPARγLBD分步转入酵母细胞AH109中
(一)试验方法
1)按LiAC法将质粒pGBKT7-PPARγLBD转入酵母细胞AH109:
接种酵母菌株AH109于约3ml YPDA中,30℃、250rpm培养16-18h(OD600约为1.4);
菌液按1∶5转接于新鲜的YPDA中,30℃、200rpm培养5-7h(OD600至0.8~1.2);
取10ml菌液,4000rpm*5min离心收集酵母细胞;
弃上清,1ml无菌水重悬,转移入另一离心管中,再加入约10ml无菌水,混匀;
4000rpm*5min再次离心收集酵母细胞;
弃上清,1ml无菌水重悬,转移入1.5ml eppendorf管中;
4000rpm*5min再次离心收集酵母细胞,小心吸去上清;
依次加入:240μl PEG 3500(50%W/V)、36μl 1.0M LiAc(pH7.5)、5μl煮沸的SS-carrier DNA(10mg/ml)、60μl无菌水和10μl待转化质粒。
剧烈振荡1min;
30℃静置30min;
42℃水浴静置30min,每隔5min颠倒混匀一次;
4000rpm*5min离心收集转化的酵母细胞;
吸去上清,1ml无菌水重悬,取200μl涂于涂布于色氨酸缺陷(以下简称为T-)的选择平板上,30℃培养3-4d;
2)鉴定携带pGBKT7-PPARγLBD质粒的阳性克隆:
以上T-选择平板上长出的克隆中,挑取1-3号至T-液体培养基中,30℃、250rpm培养16-18h;
收集酵母,提取质粒,PCR鉴定所提质粒:
引物序列:FW:5’GTAATACGACTCACTATAGGGCGA 3’
RV:5’TCCGAGTCACTTTAAAATTTGTAT 3’
PCR扩增反应(20μl):
模板(所提质粒):14μl;10×buffer:2μl;dNTP(2.5mM):2μl;
FW:1μl;RV:1μl;taq DNA polymerase:0.5μl。
反应条件为95℃变性5min,开始循环95℃45s;50℃45s;72℃1min,重复35循环,72℃变性10min。
3)PCR鉴定得到拥有pGBKT7-PPARγLBD质粒的阳性克隆1,结果如图9所示。
4)将质粒pGADT7-CBP转入到上述1号克隆中
接种1号克隆于约3ml T-液体培养基中,30℃、250rpm培养16-18h(OD600约为1.4);
菌液按1∶5转接于新鲜的T-液体培养基中,30℃、200rpm培养5-7h(OD600至0.8~1.2):
按以上所述步骤转化1号克隆,最终涂布于色氨酸、亮氨酸双缺陷(以下简称为T-L-)平板,30℃培养3-4d;
5)PCR鉴定质粒pGADT7-CBP是否转入1号克隆
挑取T-L-平板上的1-3号克隆至T-L-液体培养基中,30℃、250rpm,培养16-18h后提质粒(方法同前),PCR鉴定:
引物序列:FW:5’GTAATACGACTCACTATAGGGCGA 3’
RV:5’AGATGGTGCACGATGCACAGTT 3’
PCR扩增反应(20μl):
模板(所提质粒):14μl;10×buffer:2μl;dNTP(2.5mM):2μl;FW:1μl;RV:1μl;taq DNA聚合酶:0.5μl。
反应条件:95℃变性5min,开始循环95℃45s;50℃45s;72℃1min,重复35循环;72℃变性10min
6)鉴定得到拥有pGBKT7-PPARγLBD&pGADT7-CBP两个质粒的阳性克隆2,结果如图10所示。
实施例4筛选化合物
1、罗格列酮(阳性化合物)对CBP与PPARγ相互作用影响的鉴定:
1)将拥有pGBKT7-PPARγLBD质粒的1号克隆(以下简称为P1)和拥有双质粒pGBKT7-PPARγLBD&pGADT7-CBP的2号克隆(以下简称P1C2)分别划线于T-、T-L-平板,30℃培养3-4d后,取新鲜克隆(1-3周),分别接种于2ml T-、T-L-液体培养基中,30℃、250rpm,过夜培养16-18h;
2)分别用T-、T-L-液体培养基稀释P1、P1C2过夜菌(至OD600约0.3),按1∶100加入罗格列酮(自制合成,溶于二甲亚砜(DMSO),10mM)或DMSO,实验分组情况如下表:
  实验组号   1   2   3   4   5   6
  菌株名称   P1   P1   P1   P1C2   P1C2   P1C2
  所含质粒   pGBKT7-PPAR.γLBD   +   +   +   +   +   +
  pGADT7-CBP   -   -   -   +   +   +
  所加药物   二甲亚砜(DMSO)   -   +   +   -   +   +
  罗格列酮(10-4M)   -   -   +   -   -   +
*每组均设三份平行。
30℃培养6h后,测定α-半乳糖苷酶活性(按照Yeast Protocol Handbook(CLONTECH)进行):
混匀酵母培养液,取200μl测定OD 600(HITACHI,分光光度计U-2010);
另取200μl菌液于1.5ml eppendorf管中,10,000rpm*5min离心;
取16μl上清于96孔板中(T-、T-L-液体培养基分别用作空白对照),每孔加入48μl分析缓冲液(100mM PNP-a-Gal水溶液与0.5M醋酸钠,pH 4.5按体积比1∶2混合);
30℃避光孵育30min;
加入136μl 10X终止缓冲液(1M Na2CO3),终止反应;测定410nm处的OD值(BIO-RAD酶标仪MODEL 550)。
α-半乳糖苷酶活性的计算公式为:
α-半乳糖苷酶活性[mIU/(mlxcell)]=OD410×Vf×1,000/[(ε×b)×t×Vi×OD600]
其中,t=反应时间(分)
Vf=测值时的终体积(200ul)
Vi=加入酵母培养液上清的体积(16ul)
OD600=酵母培养液中酵母在600nm处的吸光度
ε×b=对-硝基苯酚在410nm处的摩尔吸光度×比色杯的底边边长(cm)
=10.5(ml/μmol)(对于200μl菌液而言)
3)试验结果,各试验组的α-半乳糖苷酶活性检测结果如图11所示
由图11可见,加入罗格列酮能有效提高实验菌株P1C2的α-半乳糖苷酶活性,作为溶剂的DMSO对酶活则基本无影响;而相同条件下对P1菌株进行α-半乳糖苷酶活性检测,结果均为阴性。可见,罗格列酮作为一种已知的PPAR.γ激动剂,其与PPAR.γ的结合改变了PPAR.γ的构象,使得配体依赖性的PPAR.γ与CBP的结合得以增强,最终促进了GAL4依赖的MEL1基因表达其产物α-半乳糖苷酶。
2、药物孵育时间对检测灵敏性的影响:
由于目前尚无用α-半乳糖苷酶做为报告基因来定量检测药物效力,借以筛选新的先导化合物的相关报道,而文献报道的采用β-半乳糖苷酶做为酵母双杂交中的报告基因进行药物筛选时,有关加药时间的确定也并不统一,从4-5h至过夜孵育不等,更无人做过加药时间与灵敏度间相关性的有关工作。
接P1C2于T-L-液体培养基中,30℃、250rpm培养过夜,基于更灵敏地检测,用T-L-液体培养基对过夜菌作不同程度的稀释(按下表),以便测酶活时,各组菌均能达到对数生长中期。
 药物孵育时间(h)   2   4   6   8   10   12   14
 稀释后菌液的OD600   0.60   0.40   0.30   0.24   0.12   0.08   0.05
按1∶100加入罗格列酮(10mM)或DMSO,30℃孵育。在孵育2h、4h、6h、8h、10h、12h、14h时(每隔2h)取样,按照试验1所述的方法,测定各试验组α-半乳糖苷酶活性。并计算α-半乳糖苷酶相对活性,其公式为:
结果如图12所示,延长药物作用的时间可提高该系统检测的灵敏度,12-14小时的孵育时间可使本系统灵敏度足以满足药物筛选的需要。
由以上实验,可以看出,PPAR.γ、CBP间这种配体依赖性的相互作用在以上的实验系统中灵敏稳定地被定量检测与衡量,可用于筛选能充当PPAR.γ配体的天然化合物(激动剂或拮抗剂)。
3、罗格列酮(阳性化合物)EC50的测定
接P1C2于T-L-液体培养基中,30℃、250rpm培养过夜,用T-L-液体培养基稀释过夜菌至OD600约0.08后,以1∶100分别加入不同浓度的罗格列酮(10-9M、10-8M、10-7M、10-6M、10-5M、10-410-5M)或DMSO,30℃培养12h后,按照试验1所述的方法,测定各试验组α-半乳糖苷酶活性,并计算α-半乳糖苷酶相对活性。结果如图13所示,罗格列酮对CBP与PPARγ间相互作用的促进作用是浓度依赖性的,并据此可得到其在该系统中EC50为1.3E-6。由此,罗格列酮在本系统中可作为阳性化合物来衡量待筛药物的活性。
4、药物筛选
接P1C2于T-L-液体培养基中,30℃、250rpm培养过夜,T-L-液体培养基稀释后,按1∶100分别加入罗格列酮(10mM)、DMSO以及待筛药物(10mM),30℃孵育12h后,进行α-半乳糖苷酶活性测定,并计算其激动率:
Figure C20031012270600312
本试验中待筛药物包括:H001-H007:为计算机药物辅助设计所得,并经BIOCORE筛选;
Z001-Z013:为本实验室所提取的中药(初提物或纯化合物);结果如图14所示:H007、Z007表现出了强的激动效应,H001、H003、Z001、Z002也表现出了较好的激动效应;而H002、Z004则表现出了强的抑制效应。活性强的化合物可进一步测试其细胞或动物水平上的药效,活性不强的则可通过计算机辅助设计进行结构修饰,以提高其活性。
                            序列表
(1)一般信息
(i)发明名称:PPAR拮抗剂和激动剂的筛选方法
(ii)序列数目:4
(2)序列SEQ NO.1的信息:(pGADT7-CBP的DNA序列)
(i)序列特征:
(A)长度:9337bp
(B)类型:核苷酸
(C)链性:双链
(D)拓扑结构:环状
(ii)分子类型:DNA
(iii)序列描述:SEQ NO.1
TGCATGCCTGCAGGTCGAGATCCGGGATCGAAGAAATGATGGTAAATGAAATAGGAAA
TCAAGGAGCATGAAGGCAAAAGACAAATATAAGGGTCGAACGAAAAATAAAGTGAAA
AGTGTTGATATGATGTATTTGGCTTTGCGGCGCCGAAAAAACGAGTTTACGCAATTGCA
CAATCATGCTGACTCTGTGGCGGACCCGCGCTCTTGCCGGCCCGGCGATAACGCTGGG
CGTGAGGCTGTGCCCGGCGGAGTTTTTTGCGCCTGCATTTTCCAAGGTTTACCCTGCGC
TAAGGGGCGAGATTGGAGAAGCAATAAGAATGCCGGTTGGGGTTGCGATGATGACGAC
CACGACAACTGGTGTCATTATTTAAGTTGCCGAAAGAACCTGAGTGCATTTGCAACATG
AGTATACTAGAAGAATGAGCCAAGACTTGCGAGACGCGAGTTTGCCGGTGGTGCGAAC
AATAGAGCGACCATGACCTTGAAGGTGAGACGCGCATAACCGCTAGAGTACTTTGAAG
AGGAAACAGCAATAGGGTTGCTACCAGTATAAATAGACAGGTACATACAACACTGGAA
ATGGTTGTCTGTTTGAGTACGCTTTCAATTCATTTGGGTGTGCACTTTATTATGTTACAAT
ATGGAAGGGAACTTTACACTTCTCCTATGCACATATATTAATTAAAGTCCAATGCTAGTA
GAGAAGGGGGGTAACACCCCTCCGCGCTCTTTTCCGATTTTTTTCTAAACCGTGGAATA
TTTCGGATATCCTTTTGTTGTTTCCGGGTGTACAATATGGACTTCCTCTTTTCTGGCAAC
CAAACCCATACATCGGGATTCCTATAATACCTTCGTTGGTCTCCCTAACATGTAGGTGGC
GGAGGGGAGATATACAATAGAACAGATACCAGACAAGACATAATGGGCTAAACAAGAC
TACACCAATTACACTGCCTCATTGATGGTGGTACATAACGAACTAATACTGTAGCCCTAG
ACTTGATAGCCATCATCATATCGAAGTTTCACTACCCTTTTTCCATTTGCCATCTATTGAA
GTAATAATAGGCGCATGCAACTTCTTTTCTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCCCCCGTTGTTG
TCTCACCATATCCGCAATGACAAAAAAAATGATGGAAGACACTAAAGGAAAAAATTAA
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GCACACGAAACTTTTTCCTTCCTTCATTCACGCACACTACTCTCTAATGAGCAACGGTAT
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GTCGTGTAGATAACTACGATACGGGAGGGCTTACCATCTGGCCCCAGTGCTGCAATGAT
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CCCAACGATCAAGGCGAGTTACATGATCCCCCATGTTGTGCAAAAAAGCGGTTAGCTC
CTTCGGTCCTCCGATCGTTGTCAGAAGTAAGTTGGCCGCAGTGTTATCACTCATGGTTAT
GGCAGCACTGCATAATTCTCTTACTGTCATGCCATCCGTAAGATGCTTTTCTGTGACTGG
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CGGCGTCAATACGGGATAATACCGCGCCACATAGCAGAACTTTAAAAGTGCTCATCATT
GGAAAACGTTCTTCGGGGCGAAAACTCTCAAGGATCTTACCGCTGTTGAGATCCAGTT
CGATGTAACCCACTCGTGCACCCAACTGATCTTCAGCATCTTTTACTTTCACCAGCGTTT
CTGGGTGAGCAAAAACAGGAAGGCAAAATGCCGCAAAAAAGGGAATAAGGGCGACA
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ATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATAGGGGTTC
CGCGCACATTTCCCCGAAAAGTGCCACCTGACGTCTAAGAAACCATTATTATCATGACA
TTAACCTATAAAAATAGGCGTATCACGAGGCCCTTTCGTCTCGCGCGTTTCGGTGATGA
CGGTGAAAACCTCTGACACATGCAGCTCCCGGAGACGGTCACAGCTTGTCTGTAAGCG
GATGCCGGGAGCAGACAAGCCCGTCAGGGCGCGTCAGCGGGTGTTGGCGGGTGTCGG
GGCTGGCTTAACTATGCGGCATCAGAGCAGATTGTACTGAGAGTGCACCATAACGCATT
TAAGCATAAACACGCACTATGCCGTTCTTCTCATGTATATATATATACAGGCAACACGCA
GATATAGGTGCGACGTGAACAGTGAGCTGTATGTGCGCAGCTCGCGTTGCATTTTCGGA
AGCGCTCGTTTTCGGAAACGCTTTGAAGTTCCTATTCCGAAGTTCCTATTCTCTAGCTAG
AAAGTATAGGAACTTCAGAGCGCTTTTGAAAACCAAAAGCGCTCTGAAGACGCACTTT
CAAAAAACCAAAAACGCACCGGACTGTAACGAGCTACTAAAATATTGCGAATACCGCT
TCCACAAACATTGCTCAAAAGTATCTCTTTGCTATATATCTCTGTGCTATATCCCTATATAA
CCTACCCATCCACCTTTCGCTCCTTGAACTTGCATCTAAACTCGACCTCTACATTTTTTAT
GTTTATCTCTAGTATTACTCTTTAGACAAAAAAATTGTAGTAAGAACTATTCATAGAGTG
AATCGAAAACAATACGAAAATGTAAACATTTCCTATACGTAGTATATAGAGACAAAATA
GAAGAAACCGTTCATAATTTTCTGACCAATGAAGAATCATCAACGCTATCACTTTCTGTT
CACAAAGTATGCGCAATCCACATCGGTATAGAATATAATCGGGGATGCCTTTATCTTGAA
AAAATGCACCCGCAGCTTCGCTAGTAATCAGTAAACGCGGGAAGTGGAGTCAGGCTTT
TTTTATGGAAGAGAAAATAGACACCAAAGTAGCCTTCTTCTAACCTTAACGGACCTACA
GTGCAAAAAGTTATCAAGAGACTGCATTATAGAGCGCACAAAGGAGAAAAAAAGTAAT
CTAAGATGCTTTGTTAGAAAAATAGCGCTCTCGGGATGCATTTTTGTAGAACAAAAAAG
AAGTATAGATTCTTTGTTGGTAAAATAGCGCTCTCGCGTTGCATTTCTGTTCTGTAAAAA
TGCAGCTCAGATTCTTTGTTTGAAAAATTAGCGCTCTCGCGTTGCATTTTTGTTTTACAA
AAATGAAGCACAGATTCTTCGTTGGTAAAATAGCGCTTTCGCGTTGCATTTCTGTTCTGT
AAAAATGCAGCTCAGATTCTTTGTTTGAAAAATTAGCGCTCTCGCGTTGCATTTTTGTTC
TACAAAATGAAGCACAGATGCTTCGTTGCT
(3)序列SEQ ID NO.2的信息:(pGADT7-CBP表达的氨基酸序列)
(i)序列特征:
(A)长度:638AA
(B)类型:氨基酸
(C)拓扑结构:单链肽链
(ii)分子类型:蛋白质
(iii)序列描述:SEQ NO.2
Met Asp Lys Ala Glu Leu Ile Pro Glu Pro Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Glu Leu Gly Thr Ala Ala
Asn Phe Asn Gln Ser Gly Asn Ile Ala Asp Ser Ser Leu Ser Phe Thr Phe Thr Asn Ser Ser Asn
Gly Pro Asn Leu Ile Thr Thr Gln Thr Asn Ser Gln Ala Leu Ser Gln Pro Ile Ala Ser Ser Asn
Val His Asp Asn Phe Met Asn Asn Glu Ile Thr Ala Ser Lys Ile Asp Asp Gly Asn Asn Ser Lys
Pro Leu Ser Pro Gly Trp Thr Asp Gln Thr Ala Tyr Asn Ala Phe Gly Ile Thr Thr Gly Met
Phe Asn Thr Thr Thr Met Asp Asp Val Tyr Asn Tyr Leu Phe Asp Asp Glu Asp Thr Pro Pro
Asn Pro Lys Lys Glu Ile Phe Asn Thr Thr His Tyr Arg Ala Ser Ala Ala Met Glu Tyr Pro Tyr Asp
Val Pro Asp Tyr Ala His Met Met Ala Glu Asn Leu Leu Asp Gly Pro Pro Asn Pro Lys Arg Ala
Lys Leu Ser Ser Pro Gly Phe Ser Ala Asn Asp Asn Thr Asp Phe Gly Ser Leu Phe Asp Leu
Glu Asn Asp Leu Pro Asp Glu Leu Ile Pro Asn Gly Glu Leu Ser Leu Leu Asn Ser Gly Asn
Leu Val Pro Asp Ala Ala Ser Lys His Lys Gln Leu Ser Glu Leu Leu Arg Gly Gly Ser Gly Ser
Ser Ile Asn Pro Gly Ile Gly Asn Val Ser Ala Ser Ser Pro Val Gln Gln Gly Leu Gly Gly Gln
Ala Gln Gly Gln Pro Asn Ser Thr Asn Met Ala Ser Leu Gly Ala Met Gly Lys Ser Pro Leu
Asn Gln Gly Asp Ser Ser Thr Pro Asn Leu Pro Lys Gln Ala Ala Ser Thr Ser Gly Pro Thr Pro
Pro Ala Ser Gln Ala Leu Asn Pro Gln Ala Gln Lys Gln Val Gly Leu Val Thr Ser Ser Pro Ala
Thr SerGln Thr Gly Pro Gly Ile Cys Met Asn Ala Asn Phe Asn Gln Thr His Pro Gly Leu
Leu Asn SerAsn Ser Gly His Ser Leu Met Asn Gln Ala Gln Gln Gly Gln Ala Gln Val Met
Asn Gly Ser Leu Gly Ala Ala Gly Arg Gly Arg Gly Ala Gly Met Pro Tyr Pro Ala Pro Ala
Met Gln Gly Ala Thr Ser Ser Val Leu Ala Glu Thr Leu Thr Gln Val Ser Pro Gln Met Ala Gly
His Ala Gly Leu Asn Thr Ala Gln Ala Gly Gly Met Thr Lys Met Gly Met Thr Gly Thr Thr
Ser Pro Phe Gly Gln Pro Phe Ser Gln Thr Gly Gly Gln Gln Met Gly Ala Thr Gly Val Asn
Pro Gln Leu Ala Ser Lys Gln Ser Met Val Asn Ser Leu Pro Ala Phe Pro Thr Asp Ile Lys Asn
Thr Ser Val Thr Thr Val Pro Asn Met Ser Gln Leu Gln Thr Ser Val Gly Ile Val Pro Thr Gln
Ala Ile Ala Thr Gly Pro Thr Ala Asp Pro Glu Lys Arg Lys Leu Ile Gln Gln Gln Leu Val Leu
Leu Leu His Ala His Lys Cys Gln Arg Arg Glu Gln Ala Asn Gly Glu Val Arg Ala Cys Ser
Leu Pro His Cys Arg Thr Met Lys Asn Val Leu Asn His Met Thr His Cys Gln Ala Pro Lys
Ala Cys Gln Val Ala His Cys Ala Ser Ser Arg Gln Ile Ile Ser His Trp Lys Asn Cys Thr Arg
His Asp Cys Pro Val Cys Leu Pro Leu Lys Asn Ala Ser Asp Lys Arg Asn Gln Gln Thr Ile Leu
Gly Ser Pro Ala Ser Gly Ile Gln Asn Thr Ile Gly Ser Val Gly Ala Gly Gln Gln Gly Ser Ile Glu
Leu Glu Leu Gln Met Asn Arg Arg Tyr***
(4)序列SEQ NO.3的信息:(pGBKT7-PPARγLBD的DNA序列)
(i)序列特征:
(A)长度:8128bp
(B)类型:核苷酸
(C)链性:双链
(D)拓扑结构:环状
(ii)分子类型:DNA
(iii)序列描述:SEQ NO.3
CGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGATCCTTTTGTTGTTTCCGGGTGTACAATATG
GACTTCCTCTTTTCTGGCAACCAAACCCATACATCGGGATTCCTATAATACCTTCGTTGG
TCTCCCTAACATGTAGGTGGCGGAGGGGAGATATACAATAGAACAGATACCAGACAAG
ACATAATGGGCTAAACAAGACTACACCAATTACACTGCCTCATTGATGGTGGTACATAA
CGAACTAATACTGTAGCCCTAGACTTGATAGCCATCATCATATCGAAGTTTCACTACCCT
TTTTCCATTTGCCATCTATTGAAGTAATAATAGGCGCATGCAACTTCTTTTCTTTTTTTTT
CTTTTCTCTCTCCCCCGTTGTTGTCTCACCATATCCGCAATGACAAAAAAAATGATGGA
AGACACTAAAGGAAAAAATTAACGACAAAGACAGCACCAACAGATGTCGTTGTTCCA
GAGCTGATGAGGGGTATCTCGAAGCACACGAAACTTTTTCCTTCCTTCATTCACGCACA
CTACTCTCTAATGAGCAACGGTATACGGCCTTCCTTCCAGTTACTTGAATTTGAAATAAA
AAAAGTTTGCTGTCTTGCTATCAAGTATAAATAGACCTGCAATTATTAATCTTTTGTTTCC
TCGTCATTGTTCTCGTTCCCTTTCTTCCTTGTTTCTTTTTCTGCACAATATTTCAAGCTAT
ACCAAGCATACAATCAACTCCAAGCTTGAAGCAAGCCTCCTGAAAGATGAAGCTACT
GTCTTCTATCGAACAAGCATGCGATATTTGCCGACTTAAAAAGCTCAAGTGCTCCA
AAGAAAAACCGAAGTGCGCCAAGTGTCTGAAGAACAACTGGGAGTGTCGCTACT
CTCCCAAAACCAAAAGGTCTCCGCTGACTAGGGCACATCTGACAGAAGTGGAATC
AAGGCTAGAAAGACTGGAACAGCTATTTCTACTGATTTTTCCTCGAGAAGACCTT
GACATGATTTTGAAAATGGATTCTTTACAGGATATAAAAGCATTGTTAACAGGATT
ATTTGTACAAGATAATGTGAATAAAGATGCCGTCACAGATAGATTGGCTTCAGTGG
AGACTGATATGCCTCTAACATTGAGACAGCATAGAATAAGTGCGACATCATCATCG
GAAGAGAGTAGTAACAAAGGTCAAAGACAGTTGACTGTATCGCCGGAATTTGTAAT
ACGACTCACTATAGGGCGAGCCGCCATCATGGAGGAGCAGAAGCTGATCTCAGAGGAG
GACCTGCATATGgcggagatctccagtgatatcgaccagctgaatccagagtccgctgacctccgggccctggcaaaacatt
tgtatgactcatacataaagtccttcccgctgaccaaagcaaaggcgagggcgatcttgacaggaaagacaacagacaaatcacca
ttcgttatctatgacatgaattccttaatgatgggagaagataaaatcaagttcaaacacatcacccccctgcaggagcagagcaaag
aggtggccatccgcatctttcagggctgccagtttcgctccgtggaggctgtgcaggagatcacagagtatgccaaaagcattcctgg
ttttgtaaatcttgacttgaacgaccaagtaactctcctcaaatatggagtccacgagatcatttacacaatgctggcctccttgatgaat
aaagatggggttctcatatccgagggccaaggcttcatgacaagggagtttctaaagagcctgcgaaagccttttggtgactttatgg
agcccaagtttgagtttgetgtgaagttcaatgcactggaattagatgacagcgacttggcaatatttattgctgtcattattctcagtgg
agaccgcccaggtttgctgaatgtgaagcccattgaagacattcaagacaacctgctacaagccctggagctccagctgaagctgaa
ccaccctgagtcctcacagctgtttgccaagctgctccagaaaatgacagacctcagacagattgtcacggaacacgtgcagctactg
caggtgatcaagaagacggagacagacatgagtcttcacccgctcctgcaggagatctacaaggacttgtactagGTCGACCT
GCAGCGGCCGCATAACTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTT
TTTTGCGCGCTTGCAGCCAAGCTAATTCCGGGCGAATTTCTTATGATTTATGATTTTTATT
ATTAAATAAGTTATAAAAAAAATAAGTGTATACAAATTTTAAAGTGACTCTTAGGTTTTA
AAACGAAAATTCTTATTCTTGAGTAACTCTTTCCTGTAGGTCAGGTTGCTTTCTCAGGTA
TAGCATGAGGTCGCTCTTATTGACCACACCTCTACCGGCATGCAAGCTTGGCGTAATCA
TGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGA
GCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGGTAACTCACATTAA
TTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAA
TGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCTCTTCCGCTTCCT
CGCTCACTGACTCGCTGCGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTATCAGCTCACTC
AAAGGCGGTAATACGGTTATCCACAGAATCAGGGGATAACGCAGGAAAGAACATGTGA
GCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGGCGTTTTTC
CATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCAAGTCAGAGGTGGC
GAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCG
CTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAA
GCGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCGC
TCCAAGCTGGGCTGTGTGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCCG
GTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGACACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCC
ACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGAGTTCTTGAAGT
GGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGGACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAG
CCAGTTACCTTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTG
GTAGCGGTGGTTTTTTTGTTTGCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCA
AGAAGATCCTTTGATCTTTTCTACGGGGTCTGACGCTCAGTGGAACGAAAACTCACGTT
AAGGGATTTTGGTCATGAGATTATCAAAAAGGATCTTCACCTAGATCCTTTTAAATTAAA
AATGAAGTTTTAAATCAATCTAAAGTATATATGAGTAACCTGAGGCTATGGCAGGGCCTG
CCGCCCCGACGTTGGCTGCGAGCCCTGGGCCTTCACCCGAACTTGGGGGGTGGGGTG
GGGAAAAGGAAGAAACGCGGGCGTATTGGCCCCAATGGGGTCTCGGTGGGGTATCGA
CAGAGTGCCAGCCCTGGGACCGAACCCCGCGTTTATGAACAAACGACCCAACACCGT
GCGTTTTATTCTGTCTTTTTATTGCCGTCATAGCGCGGGTTCCTTCCGGTATTGTCTCCTT
CCGTGTTTCAGTTAGCCTCCCCCTAGGGTGGGCGAAGAACTCCAGCATGAGATCCCCG
CGCTGGAGGATCATCCAGCCGGCGTCCCGGAAAACGATTCCGAAGCCCAACCTTTCAT
AGAAGGCGGCGGTGGAATCGAAATCTCGTGATGGCAGGTTGGGCGTCGCTTGGTCGGT
TCATTTCGAACCCCAGAGTCCCGCTCAGAAGAACTCGTCAAGAAGGCGATAGAAGGC
GATGCGCTGCGAATCGGGAGCGGCGATACCGTAAAGCACGAGGAAGCGGTCAGCCCAT
TCGCCGCCAAGCTCTTCAGCAATATCACGGGTAGCCAACGCTATGTCCTGATAGCGGTC
CGCCACACCCAGCCGGCCACAGTCGATGAATCCAGAAAAGCGGCCATTTTCCACCATG
ATATTCGGCAAGCAGGCATCGTCATGGGTCACGACGAGATCCTCGCCGTCGGGCATGCT
CGCCTTGAGCCTGGCGAACAGTTCGGCTGGCGCGAGCCCCTGATGCTCTTCGTCCAGA
TCATCCTGATCGACAAGACCGGCTTCCATCCGAGTACGTGCTCGCTCGATGCGATGTTT
CGCTTGGTGGTCGAATGGGCAGGTAGCCGGATCAAGCGTATGCAGCCGCCGCATTGCA
TCAGCCATGATGGATACTTTCTCGGCAGGAGCAAGGTGAGATGACAGGAGATCCTGCC
CCGGCACTTCGCCCAATAGCAGCCAGTCCCTTCCCGCTTCAGTGACAACGTCGAGCAC
AGCTGCGCAAGGAACGCCCGTCGTGGCCAGCCACGATAGCCGCGCTGCCTCGTCTTGC
AGTTCATTCAGGGCACCGGACAGGTCGGTCTTGACAAAAAGAACCGGGCGCCCCTGC
GCTGACAGCCGGAACACGGCGGCATCAGAGCAGCCGATTGTCTGTTGTGCCCAGTCAT
AGCCGAATAGCCTCTCCACCCAAGCGGCCGGAGAACCTGCGTGCAATCCATCTTGTTC
AATCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGC
GGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATAGGGGTTCCGCGCACATTTCCC
CGAAAAGTGCCACCTGAACGAAGCATCTGTGCTTCATTTTGTAGAACAAAAATGCAAC
GCGAGAGCGCTAATTTTTCAAACAAAGA ATCTGAGCTGCATTTTTACAGAACAGAAAT
GCAACGCGAAAGCGCTATTTTACCAACGAAGAATCTGTGCTTCATTTTTGTAAAACAAA
AATGCAACGCGAGAGCGCTAATTTTTCAAACAAAGAATCTGAGCTGCATTTTTACAGA
ACAGAAATGCAACGCGAGAGCGCTATTTTACCAACAAAGAATCTATACTTCTTTTTTGT
TCTACAAAAATGCATCCCGAGAGCGCTATTTTTCTAACAAAGCATCTTAGATTACTTTTT
TTCTCCTTTGTGCGCTCTATAATGCAGTCTCTTGATAACTTTTTGCACTGTAGGTCCGTTA
AGGTTAGAAGAAGGCTACTTTGGTGTCTATTTTCTCTTCCATAAAAAAAGCCTGACTCC
ACTTCCCGCGTTTACTGATTACTAGCGAAGCTGCGGGTGCATTTTTTCAAGATAAAGGC
ATCCCCGATTATATTCTATACCGATGTGGATTGCGCATACTTTGTGAACAGAAAGTGATA
GCGTTGATGATTCTTCATTGGTCAGAAAATTATGAACGGTTTCTTCTATTTTGTCTCTATA
TACTACGTATAGGAAATGTTTACATTTTCGTATTGTTTTCGATTCACTCTATGAATAGTTC
TTACTACAATTTTTTTGTCTAAAGAGTAATACTAGAGATAAACATAAAAAATGTAGAGGT
CGAGTTTAGATGCAAGTTCAAGGAGCGAAAGGTGGATGGGTAGGTTATATAGGGATATA
GCACAGAGATATATAGCAAAGAGATACTTTTGAGCAATGTTTGTGGAAGCGGTATTCGC
AATATTTTAGTAGCTCGTTACAGTCCGGTGCGTTTTTGGTTTTTTGAAAGTGCGTCTTCA
GAGCGCTTTTGGTTTTCAAAAGCGCTCTGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAAC
TTCGGAATAGGAACTTCAAAGCGTTTCCGAAAACGAGCGCTTCCGAAAATGCAACGCG
AGCTGCGCACATACAGCTCACTGTTCACGTCGCACCTATATCTGCGTGTTGCCTGTATAT
ATAATACATGAGAAGAACGGCATAGTGCGTGTTTATGCTTAAATGCGTACTTATATGCGT
CTATTTATGTAGGATGAAAGGTAGTCTAGTACCTCCTGTGATATTATCCCATTCCATGCGG
GGTATCGTATGCTTCCTTCAGCACTACCCTTTAGCTGTTCTATATGCTGCCACTCCTCAAT
TGGATTAGTCTCATCCTTCAATGCTATCATTTCCTTTGATATTGGATCATATTAAGAAACC
ATTATTATCATGACATTAACCTATAAAAATAGGCGTATCACGAGGCCCTTTCGTCTCGCG
CGTTTCGGTGATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGCAGCTCCCGGAGACGGTCACAG
CTTGTCTGTAAGCGGATGCCGGGAGCAGACAAGCCCGTCAGGGCGCGTCAGCGGGTG
TTGGCGGGTGTCGGGGCTGGCTTAACTATGCGGCATCAGAGCAGATTGTACTGAGAGT
GCACCATAGATCAACGACATTACTATATATATAATATAGGAAGCATTTAATAGAACAGCAT
CGTAATATATGTGTACTTTGCAGTTATGACGCCAGATGGCAGTAGTGGAAGATATTCTTT
ATTGAAAAATAGCTTGTCACCTTACGTACAATCTTGATCCGGAGCTTTTCTTTTTTTGCC
GATTAAGAATTAATTCGGTCGAAAAAAGAAAAGGAGAGGGCCAAGAGGGAGGGCATT
GGTGACTATTGAGCACGTGAGTATACGTGATTAAGCACACAAAGGCAGCTTGGAGTAT
GTCTGTTATTAATTTCACAGGTAGTTCTGGTCCATTGGTGAAAGTTTGCGGCTTGCAGA
GCACAGAGGCCGCAGAATGTGCTCTAGATTCCGATGCTGACTTGCTGGGTATTATATGT
GTGCCCAATAGAAAGAGAACAATTGACCCGGTTATTGCAAGGAAAATTTCAAGTCTTG
TAAAAGCATATAAAAATAGTTCAGGCACTCCGAAATACTTGGTTGGCGTGTTTCGTAAT
CAACCTAAGGAGGATGTTTTGGCTCTGGTCAATGATTACGGCATTGATATCGTCCAACT
GCATGGAGATGAGTCGTGGCAAGAATACCAAGAGTTCCTCGGTTTGCCAGTTATTAAA
AGACTCGTATTTCCAAAAGACTGCAACATACTACTCAGTGCAGCTTCACAGAAACCTCA
TTCGTTTATTCCCTTGTTTGATTCAGAAGCAGGTGGGACAGGTGAACTTTTGGATTGGA
ACTCGATTTCTGACTGGGTTGGAAGGCAAGAGAGCCCCGAAAGCTTACATTTTATGTTA
GCTGGTGGACTGACGCCAGAAAATGTTGGTGATGCGCTTAGATTAAATGGCGTTATTGG
TGTTGATGTAAGCGGAGGTGTGGAGACAAATGGTGTAAAAGACTCTAACAAAATAGCA
AATTTCGTCAAAAATGCTAAGAAATAGGTTATTACTGAGTAGTATTTATTTAAGTATTGTT
TGTGCACTTGCCGATCTATGCGGTGTGAAATACCGCACAGATGCGTAAGGAGAAAATAC
CGCATCAGGAAATTGTAAACGTTAATATTTTGTTAAAATTCGCGTTAAATTTTTGTTAAAT
CAGCTCATTTTTTAACCAATAGGCCGAAATCGGCAAAATCCCTTATAAATCAAAAGAAT
AGACCGAGATAGGGTTGAGTGTTGTTCCAGTTTGGAACAAGAGTCCACTATTAAAGAA
CGTGGACTCCAACGTCAAAGGGCGAAAAACCGTCTATCAGGGCGATGGCCCACTACGT
GAACCATCACCCTAATCAAGTTTTTTGGGGTCGAGGTGCCGTAAAGCACTAAATCGGA
ACCCTAAAGGGAGCCCCCGATTTAGAGCTTGACGGGGAAAGCCGGCGAACGTGGCGA
GAAAGGAAGGGAAGAAAGCGAAAGGAGCGGGCGCTAGGGCGCTGGCAAGTGTAGCG
GTCACGCTGCGCGTAACCACCACACCCGCCGCGCTTAATGCGCCGCTACAGGGCGCGT
CCATTCGCCATTCAGGCTGCGCAACTGTTGGGAAGGGCGAT
(5)序列SEQ NO.4的信息:(pGBKT7-PPARγLBD表达的氨基酸序列)
(i)序列特征:
(A)长度:458AA
(B)类型:氨基酸
(C)拓扑结构:单链肽链
(ii)分子类型:蛋白质
(iii)序列描述:SEQ NO.4
Met Lys Leu Leu Ser Ser Ile Glu Gln Ala Cys Asp Ile Cys Arg Leu Lys Lys Leu Lys Cys Ser
Lys Glu Lys Pro Lys Cys Ala Lys Cys Leu Lys Asn Asn Trp Glu Cys Arg Tyr Ser Pro Lys
Thr Lys Arg Ser Pro Leu Thr Arg Ala His Leu Thr Glu Val Glu Ser Arg Leu Glu Arg Leu
Glu Gln Leu Phe Leu Leu Ile Phe Pro Arg Glu Asp Leu Asp Met Ile Leu Lys Met Asp Ser
Leu Gln Asp Ile Lys Ala Leu Leu Thr Gly Leu Phe Val Gln Asp Asn Val Asn Lys Asp Ala Val
Thr Asp Arg Leu Ala Ser Val Glu Thr Asp Met Pro Leu Thr Leu Arg Gln His Arg Ile Ser
Ala Thr Ser Ser Ser Glu Glu Ser Ser Asn Lys Gly Gln Arg Gln Leu Thr Val Ser Pro Glu Phe
Val Ile Arg Leu Thr Ile Gly Arg Ala Ala Ile Met Glu Glu Gln Lys Leu Ile Ser Glu Glu Asp Leu
His Met Ala Glu Ile Ser Ser Asp Ile Asp Gln Leu Asn Pro Glu Ser Ala Asp Leu Arg Ala Leu
Ala Lys His Leu Tyr Asp Ser Tyr Ile Lys Ser Phe Pro Leu Thr Lys Ala Lys Ala Arg Ala Ile
Leu Thr Gly Lys Thr Thr Asp Lys Ser Pro Phe Val Ile Tyr Asp Met Asn Ser Leu Met Met
Gly Glu Asp Lys Ile Lys Phe Lys His Ile Thr Pro Leu Gln Glu Gln Ser Lys Glu Val Ala Ile
Arg Ile Phe Gln Gly Cys Gln Phe Arg Ser Val Glu Ala Val Gln Glu Ile Thr Glu Tyr Ala Lys
Ser Ile Pro Gly Phe Val Asn Leu Asp Leu Asn Asp Gln Val Thr Leu Leu Lys Tyr Gly Val His
Glu Ile Ile Tyr Thr Met Leu Ala Ser Leu Met Asn Lys Asp Gly Val Leu Ile Ser Glu Gly Gln
Gly Phe Met Thr Arg Glu Phe Leu Lys Ser Leu Arg Lys Pro Phe Gly Asp Phe Met Glu Pro
Lys Phe Glu Phe Ala Val Lys Phe Asn Ala Leu Glu Leu Asp Asp Ser Asp Leu Ala Ile Phe Ile
Ala Val Ile Ile Leu Ser Gly Asp Arg Pro Gly Leu Leu Asn Val Lys Pro Ile Glu Asp Ile Gln
Asp Asn Leu Leu Gln Ala Leu Glu Leu Gln Leu Lys Leu Asn His Pro Glu Ser Ser Gln Leu
Phe Ala Lys Leu Leu Gln Lys Met Thr Asn Leu Arg Gln Ile Val Thr Glu His Val Gln Leu
Leu Gln Val Ile Lys Lys Thr Glu Thr Asp Met Ser Leu His Pro Leu Leu Gln Glu Ile Tyr Lys
Asp Leu Tyr***

Claims (7)

1、一种PPAR拮抗剂和激动剂的筛选方法,其特征在于利用酵母双杂交系统,采用酵母AH109基因组自带的MEL1基因作为双杂交的报告基因,通过测定α-半乳糖苷酶的活性来检测小分子化合物对PPAR与其共激活因子相互作用程度的影响,从而筛选PPAR拮抗剂和激动剂,包括如下步骤:
(1)小鼠共激活因子CBP和酵母转录因子GAL4AD融合蛋白的表达质粒pGADT7-CBP的构建;
(2)PPARγLBD和酵母转录因子GAL4BD融合蛋白的质粒pGBKT7-PPARγLBD的构建;
(3)将质粒pGBKT7-PPARγLBD与质粒pGADT7-CBP转入酵母细胞AH109,得到酵母PPARγLBD-CBP AH109(保藏号为CGMCC No.1075,菌种于2003年12月15日保藏在北京中关村中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心);
(4)通过测定α-半乳糖苷酶的活性筛选化合物。
2、根据权利要求1所述的PPAR拮抗剂和激动剂的筛选方法,其特征在于将质粒pGBKT7-PPARγLBD与质粒pGADT7-CBP依次转入酵母细胞AH109的方法为:
采用LiAc转化法,先将pGBKT7-PPARγLBD质粒转入酵母细胞中,用色氨酸缺陷的培养基筛选阳性克隆,然后将pGADT7-CBP质粒转入含有pGBKT7-PPARγLBD质粒的酵母中,用色氨酸,亮氨酸双缺陷的培养基筛选阳性克隆,得到同时含有pGADT7-CBP质粒和pGBKT7-PPARγLBD质粒的酵母细胞;
3、根据权利要求1所述的PPAR拮抗剂和激动剂的筛选方法,其特征在于通过测定α-半乳糖苷酶的活性筛选化合物的方法为:
在得到的含pGADT7-CBP和pGBKT7-PPARγLBD双质粒的阳性酵母细胞中分别加入阳性对照物、阴性对照物及待筛选的化合物,孵育后,测定α-半乳糖苷酶的活性,并计算其激动率,根据各个待筛选药物的激动率的比较,筛选出PPAR拮抗剂和激动剂。
4、根据权利要求3所述的PPAR拮抗剂和激动剂的筛选方法,其特征在于通过测定α-半乳糖苷酶的活性筛选化合物时,药物孵育时间为12-14小时。
5、根据利用权利要求1所述的PPAR拮抗剂和激动剂的筛选方法,其特征在于该方法筛选PPAR拮抗剂和激动剂所利用的酵母筛选系统包括:(1)小鼠共激活因子CBP和酵母转录因子GAL4-AD融合蛋白表达质粒pGADT7-CBP菌种保藏号为CGMCC No.1076,菌种于2003年12月15日保藏在北京中关村中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心;(2)含人PPARγLBD和酵母转录因子GAL4-BD融合蛋白表达质粒pGBKT7-PPARγLBD菌种保藏号为CGMCC No.1077,菌种于2003年12月15日保藏在北京中关村中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心;(3)宿主酵母AH109。
6、根据权利要求5所述的PPAR拮抗剂和激动剂的筛选方法,其特征在于小鼠共激活因子CBP和酵母转录因子GAL4-AD融合蛋白表达质粒pGADT7-CBP具有如下序列:
(1)利用载体pGADT7构建的pGADT7-CBP质粒具有如下核苷酸序列:
TGCATGCCTGCAGGTCGAGATCCGGGATCGAAGAAATGATGGTAAATGAAATAGGAAATCAAGGAGCATGAAGGCAAAAGACAAATATAAGGGTCGAACGAAAAATAAAGTGAAAAGTGTTGATATGATGTATTTGGCTTTGCGGCGCCGAAAAAACGAGTTTACGCAATTGCACAATCATGCTGACTCTGTGGCGGACCCGCGCTCTTGCCGGCCCGGCGATAACGCTGGGCGTGAGGCTGTGCCCGGCGGAGTTTTTTGCGCCTGCATTTTCCAAGGTTTACCCTGCGCTAAGGGGCGAGATTGGAGAAGCAATAAGAATGCCGGTTGGGGTTGCGATGATGACGACCACGACAACTGGTGTCATTATTTAAGTTGCCGAAAGAACCTGAGTGCATTTGCAACATGAGTATACTAGAAGAATGAGCCAAGACTTGCGAGACGCGAGTTTGCCGGTGGTGCGAACAATAGAGCGACCATGACCTTGAAGGTGAGACGCGCATAACCGCTAGAGTACTTTGAAGAGGAAACAGCAATAGGGTTGCTACCAGTATAAATAGACAGGTACATACAACACTGGAAATGGTTGTCTGTTTGAGTACGCTTTCAATTCATTTGGGTGTGCACTTTATTATGTTACAATATGGAAGGGAACTTTACACTTCTCCTATGCACATATATTAATTAAAGTCCAATGCTAGTAGAGAAGGGGGGTAACACCCCTCCGCGCTCTTTTCCGATTTTTTTCTAAACCGTGGAATATTTCGGATATCCTTTTGTTGTTTCCGGGTGTACAATATGGACTTCCTCTTTTCTGGCAACCAAACCCATACATCGGGATTCCTATAATACCTTCGTTGGTCTCCCTAACATGTAGGTGGCGGAGGGGAGATATACAATAGAACAGATACCAGACAAGACATAATGGGCTAAACAAGACTACACCAATTACACTGCCTCATTGATGGTGGTACATAACGAACTAATACTGTAGCCCTAGACTTGATAGCCATCATCATATCGAAGTTTCACTACCCTTTTTCCATTTGCCATCTATTGAAGTAATAATAGGCGCATGCAACTTCTTTTCTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCCCCCGTTGTTGTCTCACCATATCCGCAATGACAAAAAAAATGATGGAAGACACTAAAGGAAAAAATTAACGACAAAGACAGCACCAACAGATGTCGTTGTTCCAGAGCTGATGAGGGGTATCTCGAAGCACACGAAACTTTTTCCTTCCTTCATTCACGCACACTACTCTCTAATGAGCAACGGTATACGGCCTTCCTTCCAGTTACTTGAATTTGAAATAAAAAAAAGTTTGCTGTCTTGCTATCAAGTATAAATAGACCTGCAATTATTAATCTTTTGTTTCCTCGTCATTGTTCTCGTTCCCTTTCTTCCTTGTTTCTTTTTCTGCACAATATTTCAAGCTATACCAAGCATACAATCAACTCCAAGCTTTGCAAAGATGGATAAAGCGGAATTAATTCCCGAGCCTCCAAAAAAGAAGAGAAAGGTCGAATTGGGTACCGCCGCCAATTTTAATCAAAGTGGGAATATTGCTGATAGCTCATTGTCCTTCACTTTCACTAACAGTAGCAACGGTCCGAACCTCATAACAACTCAAACAAATTCTCAAGCGCTTTCACAACCAATTGCCTCCTCTAACGTTCATGATAACTTCATGAATAATGAAATCACGGCTAGTAAAATTGATGATGGTAATAATTCAAAACCACTGTCACCTGGTTGGACGGACCAAACTGCGTATAACGCGTTTGGAATCACTACAGGGATGTTTAATACCACTACAATGGATGATGTATATAACTATCTATTCGATGATGAAGATACCCCACCAAACCCAAAAAAAGAGATCTTTAATACGACTCACTATAGGGCGAGCGCCGCCATGGAGTACCCATACGACGTACCAGATTACGCT CATATGatggccgagaacttgctggacggaccgcccaaccccaaacgagccaaactcagctcgcccggcttctccgcgaatgacaacacagattttggatcattgtttgacttggaaaatgaccttcctgatgagctgatccccaatggagaattaagccttttaaacagtgggaaccttgttccagatgctgcgtccaaacataaacaactgtcagagcttcttagaggaggcagcggctctagcatcaacccagggataggcaatgtgagtgccagcagccctgtgcaacagggccttggtggccaggctcaggggcagccgaacagtacaaacatggccagcttaggtgccatgggcaagagccctctgaaccaaggagactcatcaacacccaacctgcccaaacaggcagccagcacctctgggcccactccccctgcctcccaagcactgaatccacaagcacaaaagcaagtagggctggtgaccagtagtcctgccacatcacagactggacctgggatctgcatgaatgctaacttcaaccagacccacccaggccttctcaatagtaactctggccatagcttaatgaatcaggctcaacaagggcaagctcaagtcatgaatggatctcttggggctgctggaagaggaaggggagctggaatgccctaccctgctccagccatgcagggggccacaagcagtgtgctggcggagaccttgacacaggtttccccacaaatggctggccatgctggactaaatacagcacaggcaggaggcatgaccaagatgggaatgactggtaccacaagtccatttggacaaccctttagtcaaactggagggcagcagatgggagccactggagtgaacccccagttagccagcaaacagagcatggtcaatagtttacctgcttttcctacagatatcaagaatacttcagtcaccactgtgccaaatatgtcccagttgcaaacatcagtgggaattgtacccacacaagcaattgcaacaggccccacagcagaccctgaaaaacgcaaactgatacagcagcagctggttctactgcttcatgcccacaaatgtcagagacgagagcaagcaaatggagaggttcgagcctgttctctcccacactgtcgaaccatgaaaaacgttttgaatcacatgacacattgtcaggctcccaaagcctgccaagttgcccattgtgcatcttcacgacaaatcatctctcattggaagaactgcacacgacatgactgtcctgtttgcctccctttgaaaaatgccagtgacaagcgaaaccaacaaaccatcctgggatctccagctagtggaattcaaaacacaattggttctgttggtgcagggcaacag GGATCCATCGAGCTCGAGCTGCAGATGAATCGTAGATACTGAAAAACCCCGCAAGTTCACTTCAACTGTGCATCGTGCACCATCTCAATTTCTTTCATTTATACATCGTTTTGCCTTCTTTTATGTAACTATACTCCTCTAAGTTTCAATCTTGGCCATGTAACCTCTGATCTATAGAATTTTTTAAATGACTAGAATTAATGCCCATCTTTTTTTTGGACCTAAATTCTTCATGAAAATATATTACGAGGGCTTATTCAGAAGCTTTGGACTTCTTCGCCAGAGGTTTGGTCAAGTCTCCAATCAAGGTTGTCGGCTTGTCTACCTTGCCAGAAATTTACGAAAAGATGGAAAAGGGTCAAATCGTTGGTAGATACGTTGTTGACACTTCTAAATAAGCGAATTTCTTATGATTTATGATTTTTATTATTAAATAAGTTATAAAAAAAATAAGTGTATACAAATTTTAAAGTGACTCTTAGGTTTTAAAACGAAAATTCTTATTCTTGAGTAACTCTTTCCTGTAGGTCAGGTTGCTTTCTCAGGTATAGCATGAGGTCGCTCTTATTGACCACACCTCTACCGGCCGGTCGAAATTCCCCTACCCTATGAACATATTCCATTTTGTAATTTCGTGTCGTTTCTATTATGAATTTCATTTATAAAGTTTATGTACAAATATCATAAAAAAAGAGAATCTTTTTAAGCAAGGATTTTCTTAACTTCTTCGGCGACAGCATCACCGACTTCGGTGGTACTGTTGGAACCACCTAAATCACCAGTTCTGATACCTGCATCCAAAACCTTTTTAACTGCATCTTCAATGGCCTTACCTTCTTCAGGCAAGTTCAATGACAATTTCAACATCATTGCAGCAGACAAGATAGTGGCGATAGGGTTGACCTTATTCTTTGGCAAATCTGGAGCAGAACCGTGGCATGGTTCGTACAAACCAAATGCGGTGTTCTTGTCTGGCAAAGAGGCCAAGGACGCAGATGGCAACAAACCCAAGGAACCTGGGATAACGGAGGCTTCATCGGAGATGATATCACCAAACATGTTGCTGGTGATTATAATACCATTTAGGTGGGTTGGGTTCTTAACTAGGATCATGGCGGCAGAATCAATCAATTGATGTTGAACCTTCAATGTAGGAAATTCGTTCTTGATGGTTTCCTCCACAGTTTTTCTCCATAATCTTGAAGAGGCCAAAACATTAGCTTTATCCAAGGACCAAATAGGCAATGGTGGCTCATGTTGTAGGGCCATGAAAGCGGCCATTCTTGTGATTCTTTGCACTTCTGGAACGGTGTATTGTTCACTATCCCAAGCGACACCATCACCATCGTCTTCCTTTCTCTTACCAAAGTAAATACCTCCCACTAATTCTCTGACAACAACGAAGTCAGTACCTTTAGCAAATTGTGGCTTGATTGGAGATAAGTCTAAAAGAGAGTCGGATGCAAAGTTACATGGTCTTAAGTTGGCGTACAATTGAAGTTCTTTACGGATTTTTAGTAAACCTTGTTCAGGTCTAACACTACCTGTACCCCATTTAGGACCACCCACAGCACCTAACAAAACGGCATCAACCTTCTTGGAGGCTTCCAGCGCCTCATCTGGAAGTGGGACACCTGTAGCGTCGATAGCAGCACCACCAATTAAATGATTTTCGAAATCGAACTTGACATTGGAACGAACATCAGAAATAGCTTTAAGAACCTTAATGGCTTCGGCTGTGATTTCTTGACCAACGTGGTCACCTGGCAAAACGACGATCTTCTTAGGGGCAGACATTAGAATGGTATATCCTTGAAATATATATATATATTGCTGAAATGTAAAAGGTAAGAAAAGTTAGAAAGTAAGACGATTGCTAACCACCTATTGGAAAAAACAATAGGTCCTTAAATAATATTGTCAACTTCAAGTATTGTGATGCAAGCATTTAGTCATGAACGCTTCTCTATTCTATATGAAAAGCCGGTTCCGGCGCTCTCACCTTTCCTTTTTCTCCCAATTTTTCAGTTGAAAAAGGTATATGCGTCAGGCGACCTCTGAAATTAACAAAAAATTTCCAGTCATCGAATTTGATTCTGTGCGATAGCGCCCCTGTGTGTTCTCGTTATGTTGAGGAAAAAAATAATGGTTGCTAAGAGATTCGAACTCTTGCATCTTACGATACCTGAGTATTCCCACAGTTGGGGATCTCGACTCTAGCTAGAGGATCAATTCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATTAGGTCTGAAGAGGAGTTTACGTCCAGCCAAGCTAGCTTGGCTGCAGGTCGAGCGGCCGCGATCCGGAACCCTTAATATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCTCTTCCGCTTCCTCGCTCACTGACTCGCTGCGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTATCAGCTCACTCAAAGGCGGTAATACGGTTATCCACAGAATCAGGGGATAACGCAGGAAAGAACATGTGAGCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAGCGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTGTGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGACACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCCACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGAGTTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGGACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAGCCAGTTACCTTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTTGCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAAGAAGATCCTTTGATCTTTTCTACGGGGTCTGACGCTCAGTGGAACGAAAACTCACGTTAAGGGATTTTGGTCATGAGATTATCAAAAAGGATCTTCACCTAGATCCTTTTAAATTAAAAATGAAGTTTTAAATCAATCTAAAGTATATATGAGTAAACTTGGTCTGACAGTTACCAATGCTTAATCAGTGAGGCACCTATCTCAGCGATCTGTCTATTTCGTTCATCCATAGTTGCCTGACTCCCCGTCGTGTAGATAACTACGATACGGGAGGGCTTACCATCTGGCCCCAGTGCTGCAATGATACCGCGAGACCCACGCTCACCGGCTCCAGATTTATCAGCAATAAACCAGCCAGCCGGAAGGGCCGAGCGCAGAAGTGGTCCTGCAACTTTATCCGCCTCCATCCAGTCTATTAATTGTTGCCGGGAAGCTAGAGTAAGTAGTTCGCCAGTTAATAGTTTGCGCAACGTTGTTGCCATTGCTACAGGCATCGTGGTGTCACGCTCGTCGTTTGGTATGGCTTCATTCAGCTCCGGTTCCCAACGATCAAGGCGAGTTACATGATCCCCCATGTTGTGCAAAAAAGCGGTTAGCTCCTTCGGTCCTCCGATCGTTGTCAGAAGTAAGTTGGCCGCAGTGTTATCACTCATGGTTATGGCAGCACTGCATAATTCTCTTACTGTCATGCCATCCGTAAGATGCTTTTCTGTGACTGGTGAGTACTCAACCAAGTCATTCTGAGAATAGTGTATGCGGCGACCGAGTTGCTCTTGCCCGGCGTCAATACGGGATAATACCGCGCCACATAGCAGAACTTTAAAAGTGCTCATCATTGGAAAACGTTCTTCGGGGCGAAAACTCTCAAGGATCTTACCGCTGTTGAGATCCAGTTCGATGTAACCCACTCGTGCACCCAACTGATCTTCAGCATCTTTTACTTTCACCAGCGTTTCTGGGTGAGCAAAAACAGGAAGGCAAAATGCCGCAAAAAAGGGAATAAGGGCGACACGGAAATGTTGAATACTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATAGGGGTTCCGCGCACATTTCCCCGAAAAGTGCCACCTGACGTCTAAGAAACCATTATTATCATGACATTAACCTATAAAAATAGGCGTATCACGAGGCCCTTTCGTCTCGCGCGTTTCGGTGATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGCAGCTCCCGGAGACGGTCACAGCTTGTCTGTAAGCGGATGCCGGGAGCAGACAAGCCCGTCAGGGCGCGTCAGCGGGTGTTGGCGGGTGTCGGGGCTGGCTTAACTATGCGGCATCAGAGCAGATTGTACTGAGAGTGCACCATAACGCATTTAAGCATAAACACGCACTATGCCGTTCTTCTCATGTATATATATATACAGGCAACACGCAGATATAGGTGCGACGTGAACAGTGAGCTGTATGTGCGCAGCTCGCGTTGCATTTTCGGAAGCGCTCGTTTTCGGAAACGCTTTGAAGTTCCTATTCCGAAGTTCCTATTCTCTAGCTAGAAAGTATAGGAACTTCAGAGCGCTTTTGAAAACCAAAAGCGCTCTGAAGACGCACTTTCAAAAAACCAAAAACGCACCGGACTGTAACGAGCTACTAAAATATTGCGAATACCGCTTCCACAAACATTGCTCAAAAGTATCTCTTTGCTATATATCTCTGTGCTATATCCCTATATAACCTACCCATCCACCTTTCGCTCCTTGAACTTGCATCTAAACTCGACCTCTACATTTTTTATGTTTATCTCTAGTATTACTCTTTAGACAAAAAAATTGTAGTAAGAACTATTCATAGAGTGAATCGAAAACAATACGAAAATGTAAACATTTCCTATACGTAGTATATAGAGACAAAATAGAAGAAACCGTTCATAATTTTCTGACCAATGAAGAATCATCAACGCTATCACTTTCTGTTCACAAAGTATGCGCAATCCACATCGGTATAGAATATAATCGGGGATGCCTTTATCTTGAAAAAATGCACCCGCAGCTTCGCTAGTAATCAGTAAACGCGGGAAGTGGAGTCAGGCTTTTTTTATGGAAGAGAAAATAGACACCAAAGTAGCCTTCTTCTAACCTTAACGGACCTACAGTGCAAAAAGTTATCAAGAGACTGCATTATAGAGCGCACAAAGGAGAAAAAAAGTAATCTAAGATGCTTTGTTAGAAAAATAGCGCTCTCGGGATGCATTTTTGTAGAACAAAAAAGAAGTATAGATTCTTTGTTGGTAAAATAGCGCTCTCGCGTTGCATTTCTGTTCTGTAAAAATGCAGCTCAGATTCTTTGTTTGAAAAATTAGCGCTCTCGCGTTGCATTTTTGTTTTACAAAAATGAAGCACAGATTCTTCGTTGGTAAAATAGCGCTTTCGCGTTGCATTTCTGTTCTGTAAAAATGCAGCTCAGATTCTTTGTTTGAAAAATTAGCGCTCTCGCGTTGCATTTTTGTTCTACAAAATGAAGCACAGATGCTTCGTTGCT
(2)利用载体pGADT7构建的pGADT7-CBP质粒表达的氨基酸序列如下:
Met Asp Lys Ala Glu Leu Ile Pro Glu Pro Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Glu Leu Gly Thr AlaAla Asn Phe Asn Gln Ser Gly Asn Ile Ala Asp Ser Ser Leu Ser Phe Thr Phe Thr Asn Ser SerAsn Gly Pro Asn Leu Ile Thr Thr Gln Thr Asn Ser Gln Ala Leu Ser Gln Pro Ile Ala Ser SerAsn Val His Asp Asn Phe Met Asn Asn Glu Ile Thr Ala Ser Lys Ile Asp Asp Gly Asn Asn ScrLys Pro Leu Ser Pro Gly Trp Thr Asp Gln Thr Ala Tyr Asn Ala Phe Gly Ile Thr Thr GlyMet Phe Asn Thr Thr Thr Met Asp Asp Val Tyr Asn Tyr Leu Phe Asp Asp Glu Asp Thr ProPro Asn Pro Lys Lys Glu Ile Phe Asn Thr Thr His Tyr Arg Ala Ser Ala Ala Met Glu Tyr Pro TyrAsp Val Pro Asp Tyr Ala His Met Met Ala Glu Asn Leu Leu Asp Gly Pro Pro Asn Pro Lys Arg Ala Lys Leu Ser Ser Pro Gly Phe Ser Ala Asn Asp Asn Thr Asp Phe Gly Ser Leu Phe Asp Leu Glu Asn Asp Leu Pro Asp Glu Leu Ile Pro Asn Gly Glu Leu Ser Leu Leu Asn Ser Gly Asn Leu Val Pro Asp Ala Ala Ser Lys His Lys Gln Leu Ser Glu Leu Leu Arg Gly Gly Ser Gly Ser Ser Ile Asn Pro Gly Ile Gly Asn Val Ser Ala Ser Ser Pro Val Gln Gln Gly Leu Gly Gly Gln Ala Gln Gly Gln Pro Asn Ser Thr Asn Met Ala Ser Leu Gly Ala Met Gly Lys Ser Pro Leu Asn Gln Gly Asp Ser Ser Thr Pro Asn Leu Pro Lys Gln Ala Ala Ser Thr Ser Gly Pro Thr Pro Pro Ala Ser Gln Ala Leu Asn Pro Gln Ala Gln Lys Gln Val Gly Leu Val Thr Ser Ser Pro Ala Thr Ser Gln Thr Gly Pro Gly Ile Cys Met Asn Ala Asn Phe Asn Gln Thr His Pro Gly Leu Leu Asn Ser Asn Ser Gly His Ser Leu Met Asn Gln Ala Gln Gln Gly Gln Ala Gln Val Met Asn Gly Ser Leu Gly Ala Ala Gly Arg Gly Arg Gly Ala Gly Met Pro Tyr Pro Ala Pro Ala Met Gln Gly Ala Thr Ser Ser Val Leu Ala Glu Thr Leu Thr Gln Val Ser Pro Gln Met Ala Gly His Ala Gly Leu Asn Thr Ala Gln Ala Gly Gly Met Thr Lys Met Gly Met Thr Gly Thr Thr Ser Pro Phe Gly Gln Pro Phe Ser Gln Thr Gly Gly Gln Gln Met Gly Ala Thr Gly Val Asn Pro Gln Leu Ala Ser Lys Gln Ser Met Val Asn Ser Leu Pro Ala Phe Pro Thr Asp Ile Lys Asn Thr Ser Val Thr Thr Val Pro Asn Met Ser Gln Leu Gln Thr Ser Val Gly Ile Val Pro Thr Gln Ala Ile Ala Thr Gly Pro Thr Ala Asp Pro Glu Lys Arg Lys Leu Ile Gln Gln Gln Leu Val Leu Leu Leu His Ala His Lys Cys Gln Arg Arg Glu Gln Ala Asn Gly Glu Val Arg Ala Cys Ser Leu Pro His Cys Arg Thr Met Lys Asn Val Leu Asn His Met Thr His Cys Gln Ala Pro Lys Ala Cys Gln Val Ala His Cys Ala Ser Ser Arg Gln Ile Ile Ser His Trp Lys Asn Cys Thr Arg His Asn Cys Pro Val Cys Leu Pro Leu Lys Asn Ala Ser Asp Lys Arg Asn Gln Gln Thr Ile Leu Gly Ser Pro Ala Ser Gly Ile Gln Asn Thr Ile Gly Ser Val Gly Ala Gly Gln GlnGly Ser Ile Glu Leu Glu Leu Gln Met Asn Arg Arg Tyr***
7、根据权利要求5所述的PPAR拮抗剂和激动剂的筛选方法,其特征在于含人PPARγLBD和酵母转录因子GAL4-BD融合蛋白表达质粒pGBKT7-PPARγLBD具有如下序列:
(1)利用载体pGBKT7构建的pGBKT7-PPARγLBD质粒,具有如下核苷酸序列:
CGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGATCCTTTTGTTGTTTCCGGGTGTACAATATGGACTTCCTCTTTTCTGGCAACCAAACCCATACATCGGGATTCCTATAATACCTTCGTTGGTCTCCCTAACATGTAGGTGGCGGAGGGGAGATATACAATAGAACAGATACCAGACAAGACATAATGGGCTAAACAAGACTACACCAATTACACTGCCTCATTGATGGTGGTACATAACGAACTAATACTGTAGCCCTAGACTTGATAGCCATCATCATATCGAAGTTTCACTACCCTTTTTCCATTTGCCATCTATTGAAGTAATAATAGGCGCATGCAACTTCTTTTCTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCCCCCGTTGTTGTCTCACCATATCCGCAATGACAAAAAAAATGATGGAAGACACTAAAGGAAAAAATTAACGACAAAGACAGCACCAACAGATGTCGTTGTTCCAGAGCTGATGAGGGGTATCTCGAAGCACACGAAACTTTTTCCTTCCTTCATTCACGCACACTACTCTCTAATGAGCAACGGTATACGGCCTTCCTTCCAGTTACTTGAATTTGAAATAAAAAAAGTTTGCTGTCTTGCTATCAAGTATAAATAGACCTGCAATTATTAATCTTTTGTTTCCTCGTCATTGTTCTCGTTCCCTTTCTTCCTTGTTTCTTTTTCTGCACAATATTTCAAGCTATACCAAGCATACAATCAACTCCAAGCTTGAAGCAAGCCTCCTGAAAGATGAAGCTACTGTCTTCTATCGAACAAGCATGCGATATTTGCCGACTTAAAAAGCTCAAGTGCTCCAAAGAAAAACCGAAGTGCGCCAAGTGTCTGAAGAACAACTGGGAGTGTCGCTACTCTCCCAAAACCAAAAGGTCTCCGCTGACTAGGGCACATCTGACAGAAGTGGAATCAAGGCTAGAAAGACTGGAACAGCTATTTCTACTGATTTTTCCTCGAGAAGACCTTGACATGATTTTGAAAATGGATTCTTTACAGGATATAAAAGCATTGTTAACAGGATTATTTGTACAAGATAATGTGAATAAAGATGCCGTCACAGATAGATTGGCTTCAGTGGAGACTGATATGCCTCTAACATTGAGACAGCATAGAATAAGTGCGACATCATCATCGGAAGAGAGTAGTAACAAAGGTCAAAGACAGTTGACTGTATCGCCGGAATTTGTAATACGACTCACTATAGGGCGAGCCGCCATCATGGAGGAGCAGAAGCTGATCTCAGAGGAGGACCTG 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(2)利用载体pGBKT7构建的pGBKT7-PPARγLBD质粒表达的氨基酸序列如下:
Met Lys Leu Leu Ser Ser Ile Glu Gln Ala Cys Asp Ile Cys Arg Leu Lys LysLeu Lys Cys Ser Lys Glu Lys Pro Lys Cys Ala Lys Cys Leu Lys Asn Asn Trp Glu Cys ArgTyr Ser Pro Lys Thr Lys Arg Ser Pro Leu Thr Arg Ala His Leu Thr Glu Val Glu Ser ArgLeu Glu Arg Leu Glu Gln Leu Phe Leu Leu Ile Phe Pro Arg Glu Asp Leu Asp Met Ile LeuLys Met Asp Ser Leu Gln Asp Ile Lys Ala Leu Leu Thr Gly Leu Phe Val Gln Asp Asn ValAsn Lys Asp Ala Val Thr Asp Arg Leu Ala Ser Val Glu Thr Asp Met Pro Leu Thr Leu ArgGln His Arg Ile Ser Ala Thr Ser Ser Ser Glu Glu Ser Ser Asn Lys Gly Gln Arg Gln Leu ThrVal Ser Pro Glu Phe Val Ile Arg Leu Thr Ile Gly Arg Ala Ala Ile Met Glu Glu Gln Lys Leu Ile SerGlu Glu Asp Leu His Met Ala Glu Ile Ser Ser Asp Ile Asp Gln Leu Asn Pro Glu Ser Ala Asp Leu Arg Ala Leu Ala Lys His Leu Tyr Asp Ser Tyr Ile Lys Ser Phe Pro Leu Thr Lys Ala Lys Ala Arg Ala Ile Leu Thr Gly Lys Thr Thr Asp Lys Ser Pro Phe Val Ile Tyr Asp Met Asn Ser Leu Met Met Gly Glu Asp Lys Ile Lys Phe Lys His Ile Thr Pro Leu Gln Glu Gln Ser Lys Glu Val Ala Ile Arg Ile Phe Gln Gly Cys Gln Phe Arg Ser Val Glu Ala Val Gln Glu Ile Thr Glu Tyr Ala Lys Ser Ile Pro Gly Phe Val Asn Leu Asp Leu Asn Asp Gln Val Thr Leu Leu Lys Tyr Gly Val His Glu Ile Ile Tyr Thr Met Leu Ala Ser Leu Met Asn Lys Asp Gly Val Leu Ile Ser Glu Gly Gln Gly Phe Met Thr Arg Glu Phe Leu Lys Ser Leu Arg Lys Pro Phe Gly Asp Phe Met Glu Pro Lys Phe Glu Phe Ala Val Lys Phe Asn Ala Leu Glu Leu Asp Asp Ser Asp Leu Ala Ile Phe Ile Ala Val Ile Ile Leu Ser Gly Asp Arg Pro Gly Leu Leu Asn Val Lys Pro Ile Glu Asp Ile Gln Asp Asn Leu Leu Gln Ala Leu Glu Leu Gln Leu Lys Leu Asn His Pro Glu Ser Ser Gln Leu Phe Ala Lys Leu Leu Gln Lys Met Thr Asp Leu Arg Gln Ile Val Thr Glu His Val Gln Leu Leu Gln Val Ile Lys Lys Thr Glu Thr Asp Met Ser Leu His Pro Leu Leu Gln Glu Ile Tyr Lys Asp Leu Tyr***
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