CN105002213A - 一种不整合可删除新型非病毒载体及其构建方法和用途 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种不整合可删除新型非病毒载体及其构建方法和用途。所述的非病毒载体包含S/MAR序列、SV40复制原点和Cre-ERT2表达序列,所述的S/MAR序列的上游和下游均具有一个loxP序列,且其中一个loxP序列位于S/MAR序列和SV40复制原点之间。本发明的非病毒载体能游离于基因组外,并伴随着细胞周期稳定遗传,不表达病毒蛋白,并且在适当的时候能通过Tamoxifen的诱导从细胞中删除,安全性更高,有利于促进诱导多功能干细胞技术和转分化技术早日应用于临床治疗。
Description
【技术领域】
本发明涉及生物领域的一种非病毒载体,具体地说,涉及一种不整合可删除非病毒载体及其构建方法和用途。
【背景技术】
如今,转基因技术不单单用于科学研究,还已经广泛应用于社会生产生活中。在诱导多功能干细胞技术及转分化技术发明以后,转基因技术大量应用于临床已是必然趋势。现在转基因技术用于临床的其中一个障碍就是安全性:首先,外源基因随机插入到基因组上,存在造成基因突变、基因沉默等潜在风险;其次,外源目的基因无法及时清除,特别是当目的基因具有成瘤作用时,这是非常危险的;最后,有的载体需要表达病毒蛋白,一些病毒蛋白本身具有致癌作用,并且有较高的免疫原性,在临床应用中受到很大限制。
转基因技术出现以后,研究者对转基因载体的安全性的提高一直做着不懈的努力。首先是一类以SV40、BPV、EBV病毒为基础的载体的出现。这类载体实现了在真核细胞中以游离基因的形式进行复制遗传,从而解决了载体基因在宿主细胞基因组中随机插入的难题。但是这类载体的复制都需要表达病毒来源的反式作用因子,而这类蛋白会转变宿主细胞,例如:基于SV40病毒的载体复制,需要表达大T抗原(其他蛋白由宿主细胞提供),而大T抗原能永生化原代细胞,在应用于动物时,就会导致肿瘤的发生。
1999年,H.J.Lipps实验室发现将人类来源的S/MAR元件替代了SV40大T抗原基因,而保留SV40的复制原点(origin),构建的载体pEPI-1仍然可以在CHO细胞中以游离基因的形式复制遗传,并且在没有抗性筛选的情况下,可以在CHO细胞中保留100代以上。S/MAR序列来源于人类β干扰素基因5’端支架粘连区,这类区域是典型的A/T富集序列,在维持染色体结构中起重要作用。pEPI-1经过了多次改善,都集中在精简序列和减少CpG原件上,从而提高载体的转染效率以及表达效率,如pEPito。后来H.J.Lipps实验室和Anthony Atala分别在动物实验以及人类诱导多功能干细胞中,验证了基于S/MAR-SV40-Origin系列载体的可行性。
作为不整合的非病毒载体,S/MAR-SV40-Origin载体已经提高了很大的安全性,但是仍然存在着隐患。在诱导体细胞重编程过程中为了提高表达效率和转化效率,常常会使用强启动子,而应用于临床需要重编程细胞再次分化,这时持续的表达分化早期的外源基因是我们不想看到的。
综上所述,还亟需构建一种更安全的转染载体,以促进诱导多功能干细胞技术和转分化技术早日应用于临床治疗。
【发明内容】
本发明的目的是针对现有技术中的不足,提供一种不整合可删除新型非病毒载体。
本发明的再一的目的是,提供一种如上所述的非病毒载体的构建方法。
本发明的另一的目的是,提供如上所述的非病毒载体的用途。
为实现上述目的,本发明采取的技术方案是:
一种不整合非病毒载体,所述的非病毒载体包含S/MAR序列、SV40复制原点和Cre-ERT2表达序列,所述的S/MAR序列的上游和下游分别具有一个loxP序列,两个loxP方向相同,且其中一个loxP序列位于S/MAR序列和SV40复制原点之间。
所述的非病毒载体还包括外源目的基因,优选的为EGFP。
所述的S/MAR序列、Cre-ERT2表达序列和外源目的基因共用启动子和终止子,所述的启动子优选为真核表达的启动子。
所述的Cre-ERT2表达序列与外源目的基因用IRES序列连接。
一个LoxP序列在所述启动子上游连接,另一loxP序列在S/MAR序列的下游连接。
所述的S/MAR序列如SEQ ID NO.6所示,所述的SV40复制原点的序列如SEQ ID NO.4所示,所述的Cre-ERT2表达序列如SEQ ID NO.2所示,所述的loxP序列与SEQ ID NO.8有85%-100%相似度,优选的LoxP序列如SEQ ID NO.8所示。
所述的非病毒载体是通过以下方法构建的:
a)从序列如SEQ ID NO.1所示的pEP4-Cre-EGFP质粒中克隆出Cre-ERT2-IRES-EGFP片段,
b)将Cre-ERT2-IRES-EGFP片段插入pcDNA3.1(-)质粒的CMV Promoter下游,得到pcDNA-Cre-EGFP质粒,
c)用EF1α Promoter替换pcDNA-Cre-EGFP中的CMV Promoter得到pECG质粒,
d)将S/MAR片段插入到pECG载体中,得到pECG-S/MAR质粒,
e)利用SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.19所示的引物以pECG-S/MAR质粒为模板克隆出Afl II-LoxP片段,
f)将pECG-S/MAR质粒和Afl II-LoxP片段用Afl II和Xma I双酶切,分别得到pECG-S/MAR载体和Afl II-LoxP-XmaI片段,
g)将Afl II-LoxP-Xma I片段插入到pECG-S/MAR载体中,得到pECG-S/MAR-Afl IILoxP质粒,
h)用与步骤g)同样的方法将另一个loxP插入到pECG-S/MAR-Afl IILoxP质粒的EF1α promoter 5’端,得到pECG-S/MAR-LoxP。
所述的非病毒载体还具有药物筛选标记基因和/或实时筛选标记基因。
为实现上述第二个目的,本发明采取的技术方案是:
一种如上所述的非病毒载体的构建方法,包括以下步骤:将S/MAR序列、SV40复制原点、Cre-ERT2表达序列构建于骨架载体中,并于所述的S/MAR序列的上游和下游各插入一个loxP序列,同时保证其中一个loxP序列位于S/MAR序列和SV40复制原点之间。
为实现上述第三个目的,本发明采取的技术方案是:
如上任一所述的非病毒载体的用途,用于介导外源目的基因进入宿主细胞并在宿主细胞中表达。
本发明中,所述的“序列”、“表达序列”、“元件”、“基因”、“片段”可以互换使用;所述的Cre-ERT2即Cre recombinase - estrogen receptor T2,所述的Cre-ERT2表达序列、基因、元件或序列都为表达Cre-ERT2的多核苷酸序列;所述的S/MAR序列或元件,都为表达S/MAR的多核苷酸序列,其为人类来源,与SV40复制原点合用,能够保证载体不插入基因组内而实现表达和复制遗传。凡是可实现上述目的的S/MAR序列、SV40复制原点均包括在本发明的范围内。所述的“loxP” (locus of X-over P1)序列,来源于P1噬菌体,是由两个13bp反向重复序列和中间间隔8bp序列共同组成,8bp的间隔序列同时也确定了loxP 的方向。loxP序列包括如:ATAACTTCGTATA(13bp)-NNNTANNN(8bp)-TATACGAAGTTAT(13bp)所示序列,“N”表示任意核苷酸;所述loxP序列还可包括上述一个13bp的反向重复序列或8bp的间隔序列突变的序列,例如下表中所列序列:
所述的Cre-ERT2表达序列能表达Cre-ERT2蛋白,用Tamoxifen处理后,Cre-ERT2蛋白会入核特异性诱导S/MAR序列两侧的同向的loxP序列重组,使S/MAR序列与SV40复制原点分离,从而使得本发明的非病毒载体失去复制遗传功能。所述的“S/MAR序列的上游和下游分别具有一个loxP序列”是指两个loxP序列分别位于S/MAR序列的上游和下游,两个loxP方向相同,而且两个loxP序列并不是必须与S/MAR基因片段的上、下游序列紧密相连,其和S/MAR序列之间还可包含其它片段,只要能保证两个loxP序列重组后S/MAR序列与SV40复制原点分离。所述的S/MAR序列、SV40复制原点、Cre-ERT2表达序列、loxP序列的具体核苷酸序列均不限于本发明的实施例,通常优选其与本发明实施例中所示的序列具有85%-100%的相似度。为保证构建的非病毒载体的转染效率和兼顾构建载体的便利性,所述的S/MAR序列、Cre-ERT2表达序列和外源目的基因可共用启动子和终止子,如本发明中共用EF1α Promoter和BGH pA,但是显然的,三者可分别具有各自的启动子和终止子。所用的启动子优选为真核表达的启动子,如EF1α Promoter,保证其在真核生物体内能启动编码区的转录。优选地,所述的Cre-ERT2表达序列位于外源目的基因上游,且二者之间设有IRES序列,IRES 是核糖体结合序列,所以转录出来是一条RNA,保证表达出来的是Cre-ERT2蛋白和外源目的蛋白,而不是融合蛋白。所述的药物筛选标记基因可以是Amp基因、卡那霉素基因等,所述的实时筛选标记基因为EGFP基因、GFP基因等。所述的“骨架载体”是指基本表达载体,在表达载体构建过程中,我们通常选择一个载体作为骨架载体,发挥基本骨架的作用,将其它目的片段依次连接入该骨架载体中。本发明的非病毒载体可用于介导外源目的基因进入宿主细胞并在宿主细胞中表达,该用途优选为非治疗目的的,如利用本发明的非病毒载体携带外源目的目的基因进入宿主细胞表达,然而这种做法并不是直接用于疾病诊断或治疗,又如将本发明的非病毒载体用于制备介导外源目的基因进入宿主细胞并在宿主细胞中表达的产品。所述的“外源目的基因”是指可用于表达目的蛋白的基因,例如可表达实时筛选标记蛋白、对靶细胞生理生化或基因表达产生影响的蛋白等。
本发明优点在于:
本发明将人源的染色体支架/基质粘区S/MAR序列,以及Cre-ERT2表达序列、LoxP序列等整合到载体上,该载体能游离于基因组外,并伴随着细胞周期稳定遗传,不表达病毒蛋白,并且在适当的时候能通过Tamoxifen的诱导从细胞中删除,安全性更高。以往基因治疗大都是针对基因缺陷的,研究者关注更多的是怎样能让外源基因持久表达,通常不考虑怎样删除,本发明弥补了该方面的不足。
作为本发明的一个实施例,以pcDNA-3.1为骨架,克服了loxP序列在插入到载体时容易形成发卡结构等困难,同时两个loxP序列之间的距离设置合理,成功构建了pECG-S/MAR-LoxP载体。在正常的培养条件下,由于S/MAR-SV40-origin的作用,载体能够不插入基因组内而实现表达和复制遗传。而用Tamoxifen处理后,Cre-ERT2蛋白会入核特异性诱导S/MAR序列两侧的同向的loxP序列重组,使S/MAR序列与SV40-origin分离,从而实现整个载体在细胞中删除。我们将载体转染到了HEK293细胞中并成功得到了稳转细胞系。稳转细胞系在没有抗性筛选压力情况下可以稳定表达GFP100代以上并且可以冻存和复苏。稳转细胞系在Tamoxifen处理后,载体有较高的删除效率,在第五天GFP阴性率已经超过50%。
本发明构建的更安全的转染载体将促进诱导多功能干细胞技术和转分化技术早日应用于临床治疗。
【附图说明】
图1、pEP4 EO2S EN2K质粒图谱。
图2、pEP4-Cre-EGFP质粒图谱。
图3、pcDNA3.1(-)质粒图谱。
图4、pcDNA-Cre-EGFP质粒图谱。
图5、显示酶切位点的pEP4-Cre-EGFP质粒图谱。
图6、pECG质粒图谱。
图7、pECG、pECG-S/MAR、pECG-S/MAR-LOXP质粒酶切鉴定,1、2、3分别为pECG-S/MAR-LOXP、pECG、pECG-S/MAR经Hind III酶切后的结果。
图8、pECG-S/MAR质粒图谱。
图9、pECG-S/MAR-LoxP质粒图谱。
图10、pECG、pECG-S/MAR、pECG-S/MAR-LoxP转染HEK293的转染效率及筛选2周后,细胞的GFP阳性率。上排为转染48小时的结果,下排为筛选2周后结果。
图11、pECG-S/MAR-LoxP转染的HEK293细胞在冻存前及复苏后GFP阳性率的变化。
图12、Tamoxifen处理后,第二天到第五天GFP阳性细胞的变化。
【具体实施方式】
下面结合附图对本发明提供的具体实施方式作详细说明。
实施例1
1、构建pEP4-Cre-EGFP质粒
1)利用附表 1中的引物IRES-EGFP-S和IRES-EGFP-AS,以LV-EF1α-IRES-EGFP为模板克隆出IRES-EGFP片段。
用PCR回收试剂盒回收PCR的IRES-EGFP片段。
2)将回收的IRES-EGFP片段用BamH I和Asc I双酶切。
37℃保温,酶切6小时。用PCR回收试剂盒回收酶切片段。
3)利用附表 1中的引物Cre-ERT2-S和Cre-ERT2-AS,以Cre-ERT2小鼠鼠尾DNA为模板克隆出Cre-ERT2片段。
用PCR回收试剂盒回收PCR的Cre-ERT2片段。
4)将回收的Cre-ERT2片段用HindIII和Asc I双酶切。
37℃保温,酶切6小时。用PCR回收试剂盒回收酶切片段。
5)将pEP4 EO2S EN2K质粒(质粒图谱见图1)用Hind III和BamH I双酶切。
37 ℃保温,酶切6小时。回收酶切产物pEP4片段(8510bp)。
6)将以上2)、4)、5)步骤得到的酶切片段用T4连接酶连接。
16℃反应4h后,取3μl连接产物转化TBE180感受态细胞,37℃培养14h,挑取单克隆,抽取质粒pEP4-Cre-EGFP,并通过酶切验证(pEP4-Cre-EGFP质粒图谱见图2,质粒序列如SEQ ID NO.1所示)。
、构建pECG、pECG-S/MAR、pECG-S/MAR-loxP质粒
1)利用附表 1中的引物Cre-EGFP-S和Cre-EGFP-AS,以上述构建的pEP4-Cre-EGFP质粒为模板克隆出Cre-ERT2-IRES-EGFP片段(最终连入载体中的Cre-ERT2片段序列如SEQ ID NO.2所示)。
2)利用PCR回收试剂盒回收PCR的Cre-ERT2-IRES-EGFP片段。
3)将第2)步得到的Cre-ERT2-IRES-EGFP片段连接至pEASY-Blunt载体(购于全式金公司)中,得到pEASY-Cre-EGFP质粒。
室温反应25mins后,取3μl连接产物转化E.coli DH5ɑ感受态细胞,37℃培养14h,挑取单克隆,抽取质粒,测序验证。
4)将pEASY-Cre-EGFP和 pcDNA3.1(-)质粒(质粒图谱见图3,质粒序列如SEQ ID NO.3所示,该质粒自带SV40 origin,SV40 origin序列如SEQ ID NO.4所示)用Not I和Nhe I双酶切。
37 ℃保温,酶切6小时。
37 ℃保温,酶切6小时。
回收酶切产物Cre-ERT2-IRES-EGFP片段与pcDNA3.1(-)载体。
5)将Cre-ERT2-IRES-EGFP片段插入到pcDNA3.1(-)中得到pcDNA-Cre-EGFP质粒(质粒图谱见图4)。
16℃反应4h后,取3μl连接产物转化E.coli DH5ɑ感受态细胞,37℃培养14h,挑取单克隆,抽取质粒,并通过酶切验证。
6)将pcDNA-Cre-EGFP用Xba I和Mfe I双酶切,将pEP4-Cre-EGFP(显示酶切位点的质粒图谱见图5)用Xba I和Mfe I双酶切得到EF1α Promoter片段。
37 ℃保温,酶切6小时。
37 ℃保温,酶切6小时。
回收酶切产物EF1α Promoter片段和pcDNA-Cre-EGFP载体。
7)用EF1α Promoter(最终连入载体的EF1α Promoter的序列如SEQ ID NO.5所示)替换pcDNA-Cre-EGFP中的CMV Promoter得到pECG(质粒图谱见图6)。
16℃反应4h后,取3μl连接产物转化TBE180感受态细胞,37℃培养14h,挑取单克隆,抽取质粒,并通过酶切验证,酶切结果见图7。
8)利用附表 1中的引物S/MAR-AS1和S/MAR-Ps,以293T细胞基因组DNA为模板克隆出S/MAR片段。
利用PCR回收试剂盒回收PCR的S/MAR片段。
9)将pECG和S/MAR片段用EcoR I和Not I双酶切,分别得到pECG载体和S/MAR片段(其中最终连入到载体中的S/MAR片段的序列如SEQ ID NO.6所示)。
37℃保温,酶切6小时。
37 ℃保温,酶切6小时。
回收酶切产物pECG载体和S/MAR片段。
10)将S/MAR片段插入到pECG载体中,得到pECG-S/MAR质粒(质粒图谱见图8)。
16℃反应4h后,取3μl连接产物转化TB4180感受态细胞,37℃培养14h,挑取单克隆,抽取质粒,并通过酶切验证,酶切结果见图7。
11)利用附表 1中的引物Afl II-LoxP和Neo-BX-AS,以pECG-S/MAR为模板克隆出Afl II-LoxP片段。
利用PCR回收试剂盒回收PCR的Afl II-LoxP片段。
12)将pECG-S/MAR质粒和Afl II-LoxP片段用Afl II和Xma I双酶切,分别得到pECG-S/MAR载体和Afl II-LoxP-XmaI片段(Afl II-LoxP-XmaI片段序列如SEQ ID NO.7所示,其中第6-39位核苷酸为LoxP序列:ataacttcgtatagcatacattatacgaagttat,记为SEQ ID NO.8)。
37℃保温,酶切6小时。
37℃保温,酶切6小时。
回收酶切产物pECG-S/MAR载体和Afl II-LoxP-Xma I片段。
13)将Afl II-LoxP-Xma I片段插入到pECG-S/MAR载体中,得到pECG-S/MAR-Afl IILoxP质粒。
16℃反应4h后,取3μl连接产物转化TB4180感受态细胞,37℃培养14h,挑取单克隆,抽取质粒,并通过酶切验证。
14)用同样的方法将另一个loxP(此处含有loxP片段的序列如SEQ ID NO.9所示,其中第6-39位核苷酸为LoxP序列:ataacttcgtatagcatacattatacgaagttat)插入到pECG-S/MAR-Afl IILoxP质粒的EF1α promoter 5’端,得到pECG-S/MAR-LoxP(质粒图谱见图9),并通过酶切及测序验证,酶切结果见图7。
、筛选pECG-S/MAR-LoxP等载体稳转细胞系
1)在转染前一天铺适量的 HEK293细胞于6-well-dish中。
2)待细胞密度达到80%时,用FuGen-HD将pECG-S/MAR-LoxP转到HEK293细胞中,并用pECG及pECG-S/MAR作为对照。
3)在转染48小时后收集细胞,取部分细胞,用流式细胞仪检测转染效率(图10),发现S/MAR及loxP对质粒转染效率影响不是很大。
4)余下细胞开始用含有500μg/ml G418的培养基筛选。
5)在筛选两周后用流式细胞仪再次检测GFP阳性细胞(图10),这时发现GFP阳性细胞GFP的表达水平趋于一致,转染pECG-S/MAR和pECG-S/MAR-LOXP的细胞的GFP阳性率分别为31.8%和23.8%,高于转染了不含S/MAR序列的pECG的细胞的阳性率15.1%。
6)在筛选三周后,收集细胞,用流式细胞仪分选出GFP阳性的细胞群。分选得到大约3×105个细胞,继续在含有500μg/ml G418的培养基中培养。
、pECG-S/MAR-LoxP稳转细胞系的冻存与复苏
1)取一个长满的10cm培养皿,消化细胞,将细胞收集于15ml离心管。
2)1000rpm离心5分钟,弃上清液。
3)加入8ml PBS,重新悬浮细胞,留样检测GFP阳性率,重复第2步。
4)加入1.5ml培养基重新悬浮细胞。
5)配制2x冻存液:取0.3ml DMSO溶于1.2ml FBS中。
6)将2x冻存液缓缓加入细胞悬浮液中,轻轻混合。DMSO终浓度为10%。
7)将3ml混合液分装到3支冻存管中,每管1ml。
8)将冻存管放入冻存盒中,放人-80℃冰箱。
9)1个月后复苏细胞。
10)取一支冻存的细胞,在37℃水浴中迅速融化。
11)将细胞悬浮液转移至15ml离心管中,稀释于10ml培养液。
12)1000rpm离心5分钟,弃上清液。
13)用5ml培养液重新悬浮细胞,转移至10cm培养皿中,补助培养基。
14)第二天,弃上清,加入新鲜培养基。
15)第三天,细胞传代,并留样检测GFP阳性率。细胞冻存前有96.3%的阳性率,复苏后仍然有93.1%GFP阳性率,见图11。
、检验在Tamoxifen处理下载体pECG-S/MAR-LoxP在细胞中的删除效率
1)铺5×104个每孔的GFP阳性细胞于24-well-dish,用不含G418的基础培养基培养。
2)Tamoxifen预先溶于无水乙醇中,配制成2mg/ml的溶液。以1:1000的比例加入到培养基中,使终浓度为2μg/ml。
3)6小时后,弃掉上清,加入新鲜培养基。
48小时后,每24小时收集细胞检测GFP阳性率一次,连续检测4天(图12)。从图中我们可以看到,pECG-S/MAR-LoxP转染的细胞从第二天开始逐渐从GFP阳性向阴性偏移并且最终成为GFP阴性细胞,而这种现象在另外两个对照组中没有观察到。
附表1 引物序列
以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员,在不脱离本发明方法的前提下,还可以做出若干改进和补充,这些改进和补充也应视为本发明的保护范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 中国科学院上海巴斯德研究所
<120> 一种不整合可删除新型非病毒载体及其构建方法和用途
<130> /
<160> 19
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 11840
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
gctagcggct ccggtgcccg tcagtgggca gagcgcacat cgcccacagt ccccgagaag 60
ttggggggag gggtcggcaa ttgaaccggt gcctagagaa ggtggcgcgg ggtaaactgg 120
gaaagtgatg tcgtgtactg gctccgcctt tttcccgagg gtgggggaga accgtatata 180
agtgcagtag tcgccgtgaa cgttcttttt cgcaacgggt ttgccgccag aacacaggta 240
agtgccgtgt gtggttcccg cgggcctggc ctctttacgg gttatggccc ttgcgtgcct 300
tgaattactt ccacctggct ccagtacgtg attcttgatc ccgagctgga gccaggggcg 360
ggccttgcgc tttaggagcc ccttcgcctc gtgcttgagt tgaggcctgg cctgggcgct 420
ggggccgccg cgtgcgaatc tggtggcacc ttcgcgcctg tctcgctgct ttcgataagt 480
ctctagccat ttaaaatttt tgatgacctg ctgcgacgct ttttttctgg caagatagtc 540
ttgtaaatgc gggccaggat ctgcacactg gtatttcggt ttttgggccc gcggccggcg 600
acggggcccg tgcgtcccag cgcacatgtt cggcgaggcg gggcctgcga gcgcggccac 660
cgagaatcgg acgggggtag tctcaagctg gccggcctgc tctggtgcct ggcctcgcgc 720
cgccgtgtat cgccccgccc tgggcggcaa ggctggcccg gtcggcacca gttgcgtgag 780
cggaaagatg gccgcttccc ggccctgctc cagggggctc aaaatggagg acgcggcgct 840
cgggagagcg ggcgggtgag tcacccacac aaaggaaaag ggcctttccg tcctcagccg 900
tcgcttcatg tgactccacg gagtaccggg cgccgtccag gcacctcgat tagttctgga 960
gcttttggag tacgtcgtct ttaggttggg gggaggggtt ttatgcgatg gagtttcccc 1020
acactgagtg ggtggagact gaagttaggc cagcttggca cttgatgtaa ttctcgttgg 1080
aatttgccct ttttgagttt ggatcttggt tcattctcaa gcctcagaca gtggttcaaa 1140
gtttttttct tccatttcag gtgtcgtgaa cacgtggtcg cggccaattc tgcagtcgag 1200
ctcaagcttc ctgcaggccg ccaccatgtc caatttactg accgtacacc aaaatttgcc 1260
tgcattaccg gtcgatgcaa cgagtgatga ggttcgcaag aacctgatgg acatgttcag 1320
ggatcgccag gcgttttctg agcatacctg gaaaatgctt ctgtccgttt gccggtcgtg 1380
ggcggcatgg tgcaagttga ataaccggaa atggtttccc gcagaacctg aagatgttcg 1440
cgattatctt ctatatcttc aggcgcgcgg tctggcagta aaaactatcc agcaacattt 1500
gggccagcta aacatgcttc atcgtcggtc cgggctgcca cgaccaagtg acagcaatgc 1560
tgtttcactg gttatgcggc ggatccgaaa agaaaacgtt gatgccggtg aacgtgcaaa 1620
acaggctcta gcgttcgaac gcactgattt cgaccaggtt cgttcactca tggaaaatag 1680
cgatcgctgc caggatatac gtaatctggc atttctgggg attgcttata acaccctgtt 1740
acgtatagcc gaaattgcca ggatcagggt taaagatatc tcacgtactg acggtgggag 1800
aatgttaatc catattggca gaacgaaaac gctggttagc accgcaggtg tagagaaggc 1860
acttagcctg ggggtaacta aactggtcga gcgatggatt tccgtctctg gtgtagctga 1920
tgatccgaat aactacctgt tttgccgggt cagaaaaaat ggtgttgccg cgccatctgc 1980
caccagccag ctatcaactc gcgccctgga agggattttt gaagcaactc atcgattgat 2040
ttacggcgct aaggatgact ctggtcagag atacctggcc tggtctggac acagtgcccg 2100
tgtcggagcc gcgcgagata tggcccgcgc tggagtttca ataccggaga tcatgcaagc 2160
tggtggctgg accaatgtaa atattgtcat gaactatatc cgtaacctgg atagtgaaac 2220
aggggcaatg gtgcgcctgc tggaagatgg cgatctcgag ccatctgctg gagacatgag 2280
agctgccaac ctttggccaa gcccgctcat gatcaaacgc tctaagaaga acagcctggc 2340
cttgtccctg acggccgacc agatggtcag tgccttgttg gatgctgagc cccccatact 2400
ctattccgag tatgatccta ccagaccctt cagtgaagct tcgatgatgg gcttactgac 2460
caacctggca gacagggagc tggttcacat gatcaactgg gcgaagaggg tgccaggctt 2520
tgtggatttg accctccatg atcaggtcca ccttctagaa tgtgcctggc tagagatcct 2580
gatgattggt ctcgtctggc gctccatgga gcacccagtg aagctactgt ttgctcctaa 2640
cttgctcttg gacaggaacc agggaaaatg tgtagagggc atggtggaga tcttcgacat 2700
gctgctggct acatcatctc ggttccgcat gatgaatctg cagggagagg agtttgtgtg 2760
cctcaaatct attattttgc ttaattctgg agtgtacaca tttctgtcca gcaccctgaa 2820
gtctctggaa gagaaggacc atatccaccg agtcctggac aagatcacag acactttgat 2880
ccacctgatg gccaaggcag gcctgaccct gcagcagcag caccagcggc tggcccagct 2940
cctcctcatc ctctcccaca tcaggcacat gagtaacaaa ggcatggagc atctgtacag 3000
catgaagtgc aagaacgtgg tgcccctcta tgacctgctg ctggaggcgg cggacgccca 3060
ccgcctacat gcgcccacta gccgtggagg ggcatccgtg gaggagacgg accaaagcca 3120
cttggccact gcgggctcta cttcatcgca ttccttgcaa aagtattaca tcacggggga 3180
ggcagagggt ttccctgcca cagcttgagg cgcgcccctc tccctccccc ccccctaacg 3240
ttactggccg aagccgcttg gaataaggcc ggtgtgcgtt tgtctatatg ttattttcca 3300
ccatattgcc gtcttttggc aatgtgaggg cccggaaacc tggccctgtc ttcttgacga 3360
gcattcctag gggtctttcc cctctcgcca aaggaatgca aggtctgttg aatgtcgtga 3420
aggaagcagt tcctctggaa gcttcttgaa gacaaacaac gtctgtagcg accctttgca 3480
ggcagcggaa ccccccacct ggcgacaggt gcctctgcgg ccaaaagcca cgtgtataag 3540
atacacctgc aaaggcggca caaccccagt gccacgttgt gagttggata gttgtggaaa 3600
gagtcaaatg gctctcctca agcgtattca acaaggggct gaaggatgcc cagaaggtac 3660
cccattgtat gggatctgat ctggggcctc ggtacacatg ctttacatgt gtttagtcga 3720
ggttaaaaaa acgtctaggc cccccgaacc acggggacgt ggttttcctt tgaaaaacac 3780
gatgataata tggccacaac ccatggtgag caagggcgag gagctgttca ccggggtggt 3840
gcccatcctg gtcgagctgg acggcgacgt aaacggccac aagttcagcg tgtccggcga 3900
gggcgagggc gatgccacct acggcaagct gaccctgaag ttcatctgca ccaccggcaa 3960
gctgcccgtg ccctggccca ccctcgtgac caccctgacc tacggcgtgc agtgcttcag 4020
ccgctacccc gaccacatga agcagcacga cttcttcaag tccgccatgc ccgaaggcta 4080
cgtccaggag cgcaccatct tcttcaagga cgacggcaac tacaagaccc gcgccgaggt 4140
gaagttcgag ggcgacaccc tggtgaaccg catcgagctg aagggcatcg acttcaagga 4200
ggacggcaac atcctggggc acaagctgga gtacaactac aacagccaca acgtctatat 4260
catggccgac aagcagaaga acggcatcaa ggtgaacttc aagatccgcc acaacatcga 4320
ggacggcagc gtgcagctcg ccgaccacta ccagcagaac acccccatcg gcgacggccc 4380
cgtgctgctg cccgacaacc actacctgag cacccagtcc gccctgagca aagaccccaa 4440
cgagaagcgc gatcacatgg tcctgctgga gttcgtgacc gccgccggga tcactctcgg 4500
catggacgag ctgtacaagt aagtcgacgg atccgatcca gacatgataa gatacattga 4560
tgagtttgga caaaccacaa ctagaatgca gtgaaaaaaa tgctttattt gtgaaatttg 4620
tgatgctatt gctttatttg taaccattat aagctgcaat aaacaagtta acaacaacaa 4680
ttgcattcat tttatgtttc aggttcaggg ggaggtgtgg gaggtttttt aaagcaagta 4740
aaacctctac aaatgtggta tggctgatta tgatccggct gcctcgcgcg tttcggtgat 4800
gacggtgaaa acctctgaca catgcagctc ccggagacgg tcacagcttg tctgtaagcg 4860
gatgccggga gcagacaagc ccgtcaggcg tcagcgggtg ttggcgggtg tcggggcgca 4920
gccatgaggt cgatcgactc tagctagagg atcgatgccc cgccccggac gaactaaacc 4980
tgactacgac atctctgccc cttcttcgcg gggcagtgca tgtaatccct tcagttggtt 5040
ggtacaactt gccaactggg ccctgttcca catgtgacac ggggggggac caaacacaaa 5100
ggggttctct gactgtagtt gacatcctta taaatggatg tgcacatttg ccaacactga 5160
gtggctttca tcctggagca gactttgcag tctgtggact gcaacacaac attgccttta 5220
tgtgtaactc ttggctgaag ctcttacacc aatgctgggg gacatgtacc tcccaggggc 5280
ccaggaagac tacgggaggc tacaccaacg tcaatcagag gggcctgtgt agctaccgat 5340
aagcggaccc tcaagagggc attagcaata gtgtttataa ggcccccttg ttaaccctaa 5400
acgggtagca tatgcttccc gggtagtagt atatactatc cagactaacc ctaattcaat 5460
agcatatgtt acccaacggg aagcatatgc tatcgaatta gggttagtaa aagggtccta 5520
aggaacagcg atatctccca ccccatgagc tgtcacggtt ttatttacat ggggtcagga 5580
ttccacgagg gtagtgaacc attttagtca caagggcagt ggctgaagat caaggagcgg 5640
gcagtgaact ctcctgaatc ttcgcctgct tcttcattct ccttcgttta gctaatagaa 5700
taactgctga gttgtgaaca gtaaggtgta tgtgaggtgc tcgaaaacaa ggtttcaggt 5760
gacgccccca gaataaaatt tggacggggg gttcagtggt ggcattgtgc tatgacacca 5820
atataaccct cacaaacccc ttgggcaata aatactagtg taggaatgaa acattctgaa 5880
tatctttaac aatagaaatc catggggtgg ggacaagccg taaagactgg atgtccatct 5940
cacacgaatt tatggctatg ggcaacacat aatcctagtg caatatgata ctggggttat 6000
taagatgtgt cccaggcagg gaccaagaca ggtgaaccat gttgttacac tctatttgta 6060
acaaggggaa agagagtgga cgccgacagc agcggactcc actggttgtc tctaacaccc 6120
ccgaaaatta aacggggctc cacgccaatg gggcccataa acaaagacaa gtggccactc 6180
ttttttttga aattgtggag tgggggcacg cgtcagcccc cacacgccgc cctgcggttt 6240
tggactgtaa aataagggtg taataacttg gctgattgta accccgctaa ccactgcggt 6300
caaaccactt gcccacaaaa ccactaatgg caccccgggg aatacctgca taagtaggtg 6360
ggcgggccaa gataggggcg cgattgctgc gatctggagg acaaattaca cacacttgcg 6420
cctgagcgcc aagcacaggg ttgttggtcc tcatattcac gaggtcgctg agagcacggt 6480
gggctaatgt tgccatgggt agcatatact acccaaatat ctggatagca tatgctatcc 6540
taatctatat ctgggtagca taggctatcc taatctatat ctgggtagca tatgctatcc 6600
taatctatat ctgggtagta tatgctatcc taatttatat ctgggtagca taggctatcc 6660
taatctatat ctgggtagca tatgctatcc taatctatat ctgggtagta tatgctatcc 6720
taatctgtat ccgggtagca tatgctatcc taatagagat tagggtagta tatgctatcc 6780
taatttatat ctgggtagca tatactaccc aaatatctgg atagcatatg ctatcctaat 6840
ctatatctgg gtagcatatg ctatcctaat ctatatctgg gtagcatagg ctatcctaat 6900
ctatatctgg gtagcatatg ctatcctaat ctatatctgg gtagtatatg ctatcctaat 6960
ttatatctgg gtagcatagg ctatcctaat ctatatctgg gtagcatatg ctatcctaat 7020
ctatatctgg gtagtatatg ctatcctaat ctgtatccgg gtagcatatg ctatcctcat 7080
gcatatacag tcagcatatg atacccagta gtagagtggg agtgctatcc tttgcatatg 7140
ccgccacctc ccaagggggc gtgaattttc gctgcttgtc cttttcctgc tggttgctcc 7200
cattcttagg tgaatttaag gaggccaggc taaagccgtc gcatgtctga ttgctcgaat 7260
tcaccaggta aatgtcgcta atgttttcca acgcgagaag gtgttgagcg cggagctgag 7320
tgacgtgaca acatgggtat gcccaattgc cccatgttgg gaggacgaaa atggtgacaa 7380
gacagatggc cagaaataca ccaacagcac gcatgatgtc tactggggat ttattcttta 7440
gtgcggggga atacacggct tttaatacga ttgagggcgt ctcctaacaa gttacatcac 7500
tcctgccctt cctcaccctc atctccatca cctccttcat ctccgtcatc tccgtcatca 7560
ccctccgcgg cagccccttc caccataggt ggaaaccagg gaggcaaatc tactccatcg 7620
tcaaagctgc acacagtcac cctgatattg caggtaggag cgggctttgt cataacaagg 7680
tccttaatcg catccttcaa aacctcagca aatatatgag tttgtaaaaa gaccatgaaa 7740
taacagacaa tggactccct tagcgggcca ggttgtgggc cgggtccagg ggccattcca 7800
aaggggagac gactcaatgg tgtaagacga cattgtggaa tagcaagggc agttcctcgc 7860
cttaggttgt aaagggaggt cttactacct ccatatacga acacaccggc gacccaagtt 7920
ccttcgtcgg tagtcctttc tacgtgactc ctagccagga gagctcttaa accttctgca 7980
atgttctcaa atttcgggtt ggaacctcct tgaccacgat gctttccaaa ccaccctcct 8040
tttttgcgcc tgcctccatc accctgaccc cggggtccag tgcttgggcc ttctcctggg 8100
tcatctgcgg ggccctgctc tatcgctccc gggggcacgt caggctcacc atctgggcca 8160
ccttcttggt ggtattcaaa ataatcggct tcccctacag ggtggaaaaa tggccttcta 8220
cctggagggg gcctgcgcgg tggagacccg gatgatgatg actgactact gggactcctg 8280
ggcctctttt ctccacgtcc acgacctctc cccctggctc tttcacgact tccccccctg 8340
gctctttcac gtcctctacc ccggcggcct ccactacctc ctcgaccccg gcctccacta 8400
cctcctcgac cccggcctcc actgcctcct cgaccccggc ctccacctcc tgctcctgcc 8460
cctcctgctc ctgcccctcc tcctgctcct gcccctcctg cccctcctgc tcctgcccct 8520
cctgcccctc ctgctcctgc ccctcctgcc cctcctgctc ctgcccctcc tgcccctcct 8580
cctgctcctg cccctcctgc ccctcctcct gctcctgccc ctcctgcccc tcctgctcct 8640
gcccctcctg cccctcctgc tcctgcccct cctgcccctc ctgctcctgc ccctcctgct 8700
cctgcccctc ctgctcctgc ccctcctgct cctgcccctc ctgcccctcc tgcccctcct 8760
cctgctcctg cccctcctgc tcctgcccct cctgcccctc ctgcccctcc tgctcctgcc 8820
cctcctcctg ctcctgcccc tcctgcccct cctgcccctc ctcctgctcc tgcccctcct 8880
gcccctcctc ctgctcctgc ccctcctcct gctcctgccc ctcctgcccc tcctgcccct 8940
cctcctgctc ctgcccctcc tgcccctcct cctgctcctg cccctcctcc tgctcctgcc 9000
cctcctgccc ctcctgcccc tcctcctgct cctgcccctc ctcctgctcc tgcccctcct 9060
gcccctcctg cccctcctgc ccctcctcct gctcctgccc ctcctcctgc tcctgcccct 9120
cctgctcctg cccctcccgc tcctgctcct gctcctgttc caccgtgggt ccctttgcag 9180
ccaatgcaac ttggacgttt ttggggtctc cggacaccat ctctatgtct tggccctgat 9240
cctgagccgc ccggggctcc tggtcttccg cctcctcgtc ctcgtcctct tccccgtcct 9300
cgtccatggt tatcaccccc tcttctttga ggtccactgc cgccggagcc ttctggtcca 9360
gatgtgtctc ccttctctcc taggccattt ccaggtcctg tacctggccc ctcgtcagac 9420
atgattcaca ctaaaagaga tcaatagaca tctttattag acgacgctca gtgaatacag 9480
ggagtgcaga ctcctgcccc ctccaacagc ccccccaccc tcatcccctt catggtcgct 9540
gtcagacaga tccaggtctg aaaattcccc atcctccgaa ccatcctcgt cctcatcacc 9600
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aagccaggcc tcaaattcct cgtccccctt tttgctggac ggtagggatg gggattctcg 9720
ggacccctcc tcttcctctt caaggtcacc agacagagat gctactgggg caacggaaga 9780
aaagctgggt gcggcctgtg aggatcagct tatcgatgat aagctgtcaa acatgagaat 9840
taattcttga agacgaaagg gcctcgtgat acgcctattt ttataggtta atgtcatgat 9900
aataatggtt tcttagacgt caggtggcac ttttcgggga aatgtgcgcg gaacccctat 9960
ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat gtatccgctc atgagacaat aaccctgata 10020
aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag tatgagtatt caacatttcc gtgtcgccct 10080
tattcccttt tttgcggcat tttgccttcc tgtttttgct cacccagaaa cgctggtgaa 10140
agtaaaagat gctgaagatc agttgggtgc acgagtgggt tacatcgaac tggatctcaa 10200
cagcggtaag atccttgaga gttttcgccc cgaagaacgt tttccaatga tgagcacttt 10260
taaagttctg ctatgtggcg cggtattatc ccgtgttgac gccgggcaag agcaactcgg 10320
tcgccgcata cactattctc agaatgactt ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca 10380
tcttacggat ggcatgacag taagagaatt atgcagtgct gccataacca tgagtgataa 10440
cactgcggcc aacttacttc tgacaacgat cggaggaccg aaggagctaa ccgctttttt 10500
gcacaacatg ggggatcatg taactcgcct tgatcgttgg gaaccggagc tgaatgaagc 10560
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tgataaatct ggagccggtg agcgtgggtc tcgcggtatc attgcagcac tggggccaga 10800
tggtaagccc tcccgtatcg tagttatcta cacgacgggg agtcaggcaa ctatggatga 10860
acgaaataga cagatcgctg agataggtgc ctcactgatt aagcattggt aactgtcaga 10920
ccaagtttac tcatatatac tttagattga tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat 10980
ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt 11040
ccactgagcg tcagaccccg tagaaaagat caaaggatct tcttgagatc ctttttttct 11100
gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc 11160
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aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc 11280
gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt accagtggct gctgccagtg gcgataagtc 11340
gtgtcttacc gggttggact caagacgata gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg 11400
aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt ggagcgaacg acctacaccg aactgagata 11460
cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta 11520
tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc 11580
ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg 11640
atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt 11700
cctggccttt tgctggcctt gaagctgtcc ctgatggtcg tcatctacct gcctggacag 11760
catggcctgc aacgcgggca tcccgatgcc gccggaagcg agaagaatca taatggggaa 11820
ggccatccag cctcgcgtcg 11840
<210> 2
<211> 3313
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
cctgcaggcc gccaccatgt ccaatttact gaccgtacac caaaatttgc ctgcattacc 60
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gtgcaagttg aataaccgga aatggtttcc cgcagaacct gaagatgttc gcgattatct 240
tctatatctt caggcgcgcg gtctggcagt aaaaactatc cagcaacatt tgggccagct 300
aaacatgctt catcgtcggt ccgggctgcc acgaccaagt gacagcaatg ctgtttcact 360
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agcgttcgaa cgcactgatt tcgaccaggt tcgttcactc atggaaaata gcgatcgctg 480
ccaggatata cgtaatctgg catttctggg gattgcttat aacaccctgt tacgtatagc 540
cgaaattgcc aggatcaggg ttaaagatat ctcacgtact gacggtggga gaatgttaat 600
ccatattggc agaacgaaaa cgctggttag caccgcaggt gtagagaagg cacttagcct 660
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taaggatgac tctggtcaga gatacctggc ctggtctgga cacagtgccc gtgtcggagc 900
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ggtgcgcctg ctggaagatg gcgatctcga gccatctgct ggagacatga gagctgccaa 1080
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gaccctccat gatcaggtcc accttctaga atgtgcctgg ctagagatcc tgatgattgg 1380
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ggccaaggca ggcctgaccc tgcagcagca gcaccagcgg ctggcccagc tcctcctcat 1740
cctctcccac atcaggcaca tgagtaacaa aggcatggag catctgtaca gcatgaagtg 1800
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cgtcttttgg caatgtgagg gcccggaaac ctggccctgt cttcttgacg agcattccta 2160
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catcctgggg cacaagctgg agtacaacta caacagccac aacgtctata tcatggccga 3060
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gctgtacaag taa 3313
<210> 3
<211> 5427
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
gacggatcgg gagatctccc gatcccctat ggtgcactct cagtacaatc tgctctgatg 60
ccgcatagtt aagccagtat ctgctccctg cttgtgtgtt ggaggtcgct gagtagtgcg 120
cgagcaaaat ttaagctaca acaaggcaag gcttgaccga caattgcatg aagaatctgc 180
ttagggttag gcgttttgcg ctgcttcgcg atgtacgggc cagatatacg cgttgacatt 240
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tggagttccg cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc 360
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atctgatcaa gagacaggat gaggatcgtt tcgcatgatt gaacaagatg gattgcacgc 2160
aggttctccg gccgcttggg tggagaggct attcggctat gactgggcac aacagacaat 2220
cggctgctct gatgccgccg tgttccggct gtcagcgcag gggcgcccgg ttctttttgt 2280
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ggactggctg ctattgggcg aagtgccggg gcaggatctc ctgtcatctc accttgctcc 2460
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cgatgcctgc ttgccgaata tcatggtgga aaatggccgc ttttctggat tcatcgactg 2760
tggccggctg ggtgtggcgg accgctatca ggacatagcg ttggctaccc gtgatattgc 2820
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gggttcgaaa tgaccgacca agcgacgccc aacctgccat cacgagattt cgattccacc 3000
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ggaaacctgt cgtgccagct gcattaatga atcggccaac gcgcggggag aggcggtttg 3480
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gcagcagcca ctggtaacag gattagcaga gcgaggtatg taggcggtgc tacagagttc 4080
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gctggtagcg gtttttttgt ttgcaagcag cagattacgc gcagaaaaaa aggatctcaa 4260
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tgttgccggg aagctagagt aagtagttcg ccagttaata gtttgcgcaa cgttgttgcc 4740
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ttcggtcctc cgatcgttgt cagaagtaag ttggccgcag tgttatcact catggttatg 4920
gcagcactgc ataattctct tactgtcatg ccatccgtaa gatgcttttc tgtgactggt 4980
gagtactcaa ccaagtcatt ctgagaatag tgtatgcggc gaccgagttg ctcttgcccg 5040
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aaacgttctt cggggcgaaa actctcaagg atcttaccgc tgttgagatc cagttcgatg 5160
taacccactc gtgcacccaa ctgatcttca gcatctttta ctttcaccag cgtttctggg 5220
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tgaatactca tactcttcct ttttcaatat tattgaagca tttatcaggg ttattgtctc 5340
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
cctaactccg cccatcccgc ccctaactcc gcccagttcc gcccattctc cgccccatgg 60
ctgactaatt ttttttattt atgcagaggc cgaggccgcc tctgcctctg agctattcca 120
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ta 182
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
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ctccagtacg tgattcttga tcccgagctg gagccagggg cgggccttgc gctttaggag 300
ccccttcgcc tcgtgcttga gttgaggcct ggcctgggcg ctggggccgc cgcgtgcgaa 360
tctggtggca ccttcgcgcc tgtctcgctg ctttcgataa gtctctagcc atttaaaatt 420
tttgatgacc tgctgcgacg ctttttttct ggcaagatag tcttgtaaat gcgggccagg 480
atctgcacac tggtatttcg gtttttgggc ccgcggccgg cgacggggcc cgtgcgtccc 540
agcgcacatg ttcggcgagg cggggcctgc gagcgcggcc accgagaatc ggacgggggt 600
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caggatcagg gttaaagata tctcacgtac tgacggtggg agaatgttaa tccatattgg 1740
cagaacgaaa acgctggtta gcaccgcagg tgtagagaag gcacttagcc tgggggtaac 1800
taaactggtc gagcgatgga tttccgtctc tggtgtagct gatgatccga ataactacct 1860
gttttgccgg gtcagaaaaa atggtgttgc cgcgccatct gccaccagcc agctatcaac 1920
tcgcgccctg gaagggattt ttgaagcaac tcatcgattg atttacggcg ctaaggatga 1980
ctctggtcag agatacctgg cctggtctgg acacagtgcc cgtgtcggag ccgcgcgaga 2040
tatggcccgc gctggagttt caataccgga gatcatgcaa gctggtggct ggaccaatgt 2100
aaatattgtc atgaactata tccgtaacct ggatagtgaa acaggggcaa tggtgcgcct 2160
gctggaagat ggcgatctcg agccatctgc tggagacatg agagctgcca acctttggcc 2220
aagcccgctc atgatcaaac gctctaagaa gaacagcctg gccttgtccc tgacggccga 2280
ccagatggtc agtgccttgt tggatgctga gccccccata ctctattccg agtatgatcc 2340
taccagaccc ttcagtgaag cttcgatgat gggcttactg accaacctgg cagacaggga 2400
gctggttcac atgatcaact gggcgaagag ggtgccaggc tttgtggatt tgaccctcca 2460
tgatcaggtc cacctt 2476
<210> 6
<211> 1983
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
agatctaaat aaacttataa attgtgagag aaattaatga atgtctaagt taatgcagaa 60
acggagagac atactatatt catgaactaa aagacttaat attgtgaagg tatactttct 120
ttccacataa atttgtagtc aatatgttca ccccaaaaaa gctgtttgtt aacttgccaa 180
cctcattcta aaatgtatat agaagcccaa aagacaataa caaaaatatt cttgtagaac 240
aaaatgggaa agaatgttcc actaaatatc aagatttaga gcaaagcatg agatgtgtgg 300
ggatagacag tgaggctgat aaaatagagt agagctcaga aacagaccca ttgatatatg 360
taagtgacct atgaaaaaaa tatggcattt tacaatggga aaatgatgat ctttttcttt 420
tttagaaaaa cagggaaata tatttatatg taaaaaataa aagggaaccc atatgtcata 480
ccatacacac aaaaaaattc cagtgaatta taagtctaaa tggagaaggc aaaactttaa 540
atcctttaga aaataatata gaagcatgcc atcatgactt cagtgtagag aaaaatttct 600
tatgactcaa agtcctaacc acaaagaaaa gattgttaat tagattgcat gaatattaag 660
acttattttt aaaattaaaa aaccattaag aaaagtcagg ccatagaatg acagaaaata 720
tttgcaacac cccagtaaag agaattgtaa tatgcagatt ataaaaagaa gtcttacaaa 780
tcagtaaaaa ataaaactag acaaaaattt gaacagatga aagagaaact ctaaataatc 840
attacacatg agaaactcaa tctcagaaat cagagaacta tcattgcata tacactaaat 900
tagagaaata ttaaaaggct aagtaacatc tgtggcaata ttgatggtat ataaccttga 960
tatgatgtga tgagaacagt actttacccc atgggcttcc tccccaaacc cttaccccag 1020
tataaatcat gacaaatata ctttaaaaac cattacccta tatctaacca gtactcctca 1080
aaactgtcaa ggtcatcaaa aataagaaaa gtctgaggaa ctgtcaaaac taagaggaac 1140
ccaaggagac atgagaatta tatgtaatgt ggcattctga atgagatccc agaacagaaa 1200
aagaacagta gctaaaaaac taatgaaata taaataaagt ttgaacttta gtttttttta 1260
aaaaagagta gcattaacac ggcaaagcca ttttcatatt tttcttgaac attaagtaca 1320
agtctataat taaaaatttt ttaaatgtag tctggaacat tgccagaaac agaagtacag 1380
cagctatctg tgctgtcgcc taactatcca tagctgattg gtctaaaatg agatacatca 1440
acgctcctcc atgttttttg ttttcttttt aaatgaaaaa ctttattttt taagaggagt 1500
ttcaggttca tagcaaaatt gagaggaagg tacattcaag ctgaggaagt tttcctctat 1560
tcctagttta ctgagagatt gcatcatgaa tgggtgttaa attttgtcaa atgctttttc 1620
tgtgtctatc aatatgacca tgtgattttc ttctttaacc tgttgatggg acaaattacg 1680
ttaattgatt ttcaaacgct gaaccaccct tacatatctg gaataaattc tacttggttg 1740
tggtgtatat tttttgatac attcttggat tctttttgct aatattttgt tgaaaatgtt 1800
tgtatctttg ttcatgagag atattggtct gttgttttct tttcttgtaa tgtcattttc 1860
tagttccggt attaaggtaa tgctggccta gttgaatgat ttaggaagta ttccctctgc 1920
ttctgtcttc tgaaagagat tgtagaaagt tgatacaatt tttttttctt taaatatttg 1980
ata 1983
<210> 7
<211> 1110
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
ttaagataac ttcgtatagc atacattata cgaagttatt ttaaaccgct gatcagcctc 60
gactgtgcct tctagttgcc agccatctgt tgtttgcccc tcccccgtgc cttccttgac 120
cctggaaggt gccactccca ctgtcctttc ctaataaaat gaggaaattg catcgcattg 180
tctgagtagg tgtcattcta ttctgggggg tggggtgggg caggacagca agggggagga 240
ttgggaagac aatagcaggc atgctgggga tgcggtgggc tctatggctt ctgaggcgga 300
aagaaccagc tggggctcta gggggtatcc ccacgcgccc tgtagcggcg cattaagcgc 360
ggcgggtgtg gtggttacgc gcagcgtgac cgctacactt gccagcgccc tagcgcccgc 420
tcctttcgct ttcttccctt cctttctcgc cacgttcgcc ggctttcccc gtcaagctct 480
aaatcggggg ctccctttag ggttccgatt tagtgcttta cggcacctcg accccaaaaa 540
acttgattag ggtgatggtt cacgtagtgg gccatcgccc tgatagacgg tttttcgccc 600
tttgacgttg gagtccacgt tctttaatag tggactcttg ttccaaactg gaacaacact 660
caaccctatc tcggtctatt cttttgattt ataagggatt ttgccgattt cggcctattg 720
gttaaaaaat gagctgattt aacaaaaatt taacgcgaat taattctgtg gaatgtgtgt 780
cagttagggt gtggaaagtc cccaggctcc ccagcaggca gaagtatgca aagcatgcat 840
ctcaattagt cagcaaccag gtgtggaaag tccccaggct ccccagcagg cagaagtatg 900
caaagcatgc atctcaatta gtcagcaacc atagtcccgc ccctaactcc gcccatcccg 960
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tatgcagagg ccgaggccgc ctctgcctct gagctattcc agaagtagtg aggaggcttt 1080
tttggaggcc taggcttttg caaaaagctc 1110
<210> 8
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
ataacttcgt atagcataca ttatacgaag ttat 34
<210> 9
<211> 1171
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
aattgataac ttcgtatagc atacattata cgaagttata accggtgcct agagaaggtg 60
gcgcggggta aactgggaaa gtgatgtcgt gtactggctc cgcctttttc ccgagggtgg 120
gggagaaccg tatataagtg cagtagtcgc cgtgaacgtt ctttttcgca acgggtttgc 180
cgccagaaca caggtaagtg ccgtgtgtgg ttcccgcggg cctggcctct ttacgggtta 240
tggcccttgc gtgccttgaa ttacttccac ctggctccag tacgtgattc ttgatcccga 300
gctggagcca ggggcgggcc ttgcgcttta ggagcccctt cgcctcgtgc ttgagttgag 360
gcctggcctg ggcgctgggg ccgccgcgtg cgaatctggt ggcaccttcg cgcctgtctc 420
gctgctttcg ataagtctct agccatttaa aatttttgat gacctgctgc gacgcttttt 480
ttctggcaag atagtcttgt aaatgcgggc caggatctgc acactggtat ttcggttttt 540
gggcccgcgg ccggcgacgg ggcccgtgcg tcccagcgca catgttcggc gaggcggggc 600
ctgcgagcgc ggccaccgag aatcggacgg gggtagtctc aagctggccg gcctgctctg 660
gtgcctggcc tcgcgccgcc gtgtatcgcc ccgccctggg cggcaaggct ggcccggtcg 720
gcaccagttg cgtgagcgga aagatggccg cttcccggcc ctgctccagg gggctcaaaa 780
tggaggacgc ggcgctcggg agagcgggcg ggtgagtcac ccacacaaag gaaaagggcc 840
tttccgtcct cagccgtcgc ttcatgtgac tccacggagt accgggcgcc gtccaggcac 900
ctcgattagt tctggagctt ttggagtacg tcgtctttag gttgggggga ggggttttat 960
gcgatggagt ttccccacac tgagtgggtg gagactgaag ttaggccagc ttggcacttg 1020
atgtaattct cgttggaatt tgcccttttt gagtttggat cttggttcat tctcaagcct 1080
cagacagtgg ttcaaagttt ttttcttcca tttcaggtgt cgtgaacacg tggtcgcggc 1140
caattctgca gtcgagctca agcttcctgc a 1171
<210> 10
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
gcttagaagc ttcctgcagg ccgccaccat gtccaattta ctgaccgtac ac 52
<210> 11
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
gcttagggcg cgcctcaagc tgtggcaggg aaaccctc 38
<210> 12
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 12
gcttagggcg cgcccctctc cctcccc 27
<210> 13
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
gcttagggat ccgtcgactt acttgtacag ct 32
<210> 14
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 14
gctagccctg caggccgcca ccatgt 26
<210> 15
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
gcggccgctt acttgtacag ctcgtcca 28
<210> 16
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 16
aacaggaagc acaatgccca 20
<210> 17
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 17
aaggaaaaaa gcggccgcag atctaaataa acttata 37
<210> 18
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 18
gcggcccaat tgataacttc gtatagcata cattatacga agttatcatg aagaatctgc 60
ttaggg 66
<210> 19
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 19
gagcacagct gcgcaaggaa 20
Claims (10)
1.一种不整合非病毒载体,其特征在于,所述的非病毒载体包含S/MAR序列、SV40复制原点和Cre-ERT2表达序列,所述的S/MAR序列的上游和下游分别具有一个loxP序列,两个loxP方向相同,且其中一个loxP序列位于S/MAR序列和SV40复制原点之间。
2.根据权利要求1所述的非病毒载体,其特征在于,所述的非病毒载体还包括外源目的基因,优选的为EGFP。
3.根据权利要求2所述的非病毒载体,其特征在于,所述的S/MAR序列、Cre-ERT2表达序列和外源目的基因共用启动子和终止子,所述的启动子优选为真核表达的启动子。
4.根据权利要求3所述的非病毒载体,其特征在于,所述的Cre-ERT2表达序列与外源目的基因用IRES序列连接。
5.根据权利要求3所述的非病毒载体,其特征在于,一个LoxP序列在所述启动子上游连接,另一loxP序列在S/MAR序列的下游连接。
6.根据权利要求1所述的非病毒载体,其特征在于,所述的S/MAR序列如SEQ ID NO.6所示,所述的SV40复制原点的序列如SEQ ID NO.4所示,所述的Cre-ERT2表达序列如SEQ ID NO.2所示,所述的loxP序列与SEQ ID NO.8有85%-100%相似度,优选的LoxP序列如SEQ ID NO.8所示。
7.根据权利要求1所述的非病毒载体,其特征在于,它是通过以下方法构建的:
a)从序列如SEQ ID NO.1所示的pEP4-Cre-EGFP质粒中克隆出Cre-ERT2-IRES-EGFP片段,
b)将Cre-ERT2-IRES-EGFP片段插入pcDNA3.1(-)质粒的CMV Promoter下游,得到pcDNA-Cre-EGFP质粒,
c)用EF1α Promoter替换pcDNA-Cre-EGFP中的CMV Promoter得到pECG质粒,
d)将S/MAR片段插入到pECG载体中,得到pECG-S/MAR质粒,
e)利用SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.19所示的引物以pECG-S/MAR质粒为模板克隆出Afl II-LoxP片段,
f)将pECG-S/MAR质粒和Afl II-LoxP片段用Afl II和Xma I双酶切,分别得到pECG-S/MAR载体和Afl II-LoxP-XmaI片段,
g)将Afl II-LoxP-Xma I片段插入到pECG-S/MAR载体中,得到pECG-S/MAR-Afl IILoxP质粒,
h)用与步骤g)同样的方法将另一个loxP插入到pECG-S/MAR-Afl IILoxP质粒的EF1α promoter 5’端,得到pECG-S/MAR-LoxP。
8.根据权利要求1所述的非病毒载体,其特征在于,所述的非病毒载体还具有药物筛选标记基因和/或实时筛选标记基因。
9.一种权利要求1所述的非病毒载体的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:将S/MAR序列、SV40复制原点、Cre-ERT2表达序列构建于骨架载体中,并于所述的S/MAR序列的上游和下游各插入一个loxP序列,同时保证其中一个loxP序列位于S/MAR序列和SV40复制原点之间。
10.权利要求1-9任一所述的非病毒载体的用途,其特征在于,用于介导外源目的基因进入宿主细胞并在宿主细胞中表达。
Priority Applications (1)
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|---|---|---|---|
| CN201410166521.4A CN105002213A (zh) | 2014-04-24 | 2014-04-24 | 一种不整合可删除新型非病毒载体及其构建方法和用途 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201410166521.4A CN105002213A (zh) | 2014-04-24 | 2014-04-24 | 一种不整合可删除新型非病毒载体及其构建方法和用途 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
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| CN105002213A true CN105002213A (zh) | 2015-10-28 |
Family
ID=54375075
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN201410166521.4A Pending CN105002213A (zh) | 2014-04-24 | 2014-04-24 | 一种不整合可删除新型非病毒载体及其构建方法和用途 |
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| Country | Link |
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2014
- 2014-04-24 CN CN201410166521.4A patent/CN105002213A/zh active Pending
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